Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP019698 | Desulfotomaculum ferrireducens strain GSS09 chromosome, complete genome | 7 crisprs | cas3,RT,WYL,cas6,cas8b1,cas7,cas5,cas4,cas1,cas2,csa3,DinG,Cas14b_CAS-V-F,DEDDh,cas8b3 | 0 | 11 | 9 | 0 |
1. NZ_CP019698
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP019698_1 | 881837-886859 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019698_1
|
75 spacers
spacers of NZ_CP019698_1
>1.1|881867|38|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGGCGACAAGGATAAAGTGCTTGCGGAGGTCAAAGAC >1.2|881935|39|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGTATTCCAGGGCATCCTGTTCAGCCTTATCTTTATCA >1.3|882004|34|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCCAATCCGCGGCTGGCCTTTGGAGCACTATCAC >1.4|882068|40|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACGGTTTCCATCGTTACACAATTTTCAAAGACTACCTGGA >1.5|882138|39|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTTTCTAAACCCTGAATAACAACAAAAGGAGAAGTGGG >1.6|882207|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTAAGTAAACCAGTAACACCAGATAAATCAACAGAAC >1.7|882274|35|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAAATGCCTGCATCGCACAAAACCACTTTAGGCA >1.8|882339|34|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGTGGTGGCTCAACCGCATCAGCAACATTTCTTC >1.9|882403|35|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATACTGATAACACCTGGATCAGTGCTTCCAGTTTC >1.10|882468|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGGGAAAGGGTTGGTTTATCACAGGAGGAAGCCGC >1.11|882534|34|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGACCGCATAGCCGCCAATGGCTGGCGGGTACC >1.12|882598|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGAACACTCACTTCTGCTCTGGCTAGTGCTGTTTTGA >1.13|882665|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGAAGTTGCAAGGATGAACTGCATACTTTAATGAAC >1.14|882732|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGGAACGTGTAGTAGATCTGCCGGCCAAGCGAATCAT >1.15|882799|39|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCGCAAAACCGTTGCCCCTCGCGCCCTCGTATTTGGCAG >1.16|882868|35|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCGGCTGAAAGCAACTGCATCCGCATTCTTTCTGC >1.17|882933|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGTCAGCGAAGTGCCAGAATTTGCCTTTGGTGTGC >1.18|882999|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAATGCTTTCAACTTCATAGGTTCAAGATGTTCAAG >1.19|883066|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTATCTTACAAACGACGTTCACATTTATTAGAGCAA >1.20|883132|38|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAAACTGAACAAAAAGGCAGCTAAATTAAACTGCCAA >1.21|883200|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTGAAAGCCTATCACGATGTGATGCTCCACGCCATG >1.22|883267|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTACTGGGATAATGACCTAGAACGGGAACCAGTAAT >1.23|883334|39|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTAAAATATCCTCCTGCTTTATCGCTTTGGATGTAGCCA >1.24|883403|35|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCTTTTGCTAAAGTCAGTTTGCATTATGGCTGTGT >1.25|883468|35|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACCCCTTATCCTTCGCACTTGGTCGTTAACCCAGT >1.26|883533|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CACTCCAAAAAGTGTAGTCGTTGTGGGGAAATCAAA >1.27|883599|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGAGGCTAGCTTTGAAAACTATAAGCCTATCAACC >1.28|883665|35|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTAAATCGCCCATAAGCTCTACCTGATGTACTCC >1.29|883730|38|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCAACGGGGGGATAACCGTTCAGCCATTAATTAAAAAA >1.30|883798|35|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTACGCAGCTGGAAATAGCAAGATAAAAACTGTGG >1.31|883863|35|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGAGTGCAATTAGCTTGTTAACTTCCTCTTTATC >1.32|883928|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAGTTGTATCGGAACTGCGGCCCACTTGGGTGCTTGG >1.33|883995|35|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTGTTTTCCAGTTAAGGAGTTAAGAGCTGCTATA >1.34|884060|39|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTTAACAGAGCCAAGGTTCCAACTTGGACTAATTCAT >1.35|884129|35|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTCTTGCTGCCGTTGCCTTTAAAGATGACTATAG >1.36|884194|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGCTGCATTGCAATCATCGGTATACTGATAAGCTT >1.37|884260|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTTAACAAAACGTCCCTTGAGAATGCACAAGTTTT >1.38|884326|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACACTGCTTTGATGGGCAATTTCATCAGTCTGGATG >1.39|884392|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACGAACTTAGAAAACTTTCAGATGCGGAGATTATTTC >1.40|884459|40|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACCCTAGTGTTGATTTGGCATCTTTAAAGGCTGGCGATG >1.41|884529|39|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CACCACATGCGATAGAGAGATTTAAGGAACGTGTAGCAG >1.42|884598|35|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAAATGAACCACCAACTGGAGGCCACACAGAACG >1.43|884663|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTGTTGAATGATGCCACTAATATTTTGTTCCTTTGT >1.44|884730|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGAAAAGGCCGTTTATAGCGGTGAGAATAACGGCG >1.45|884796|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCATGAACATCCGCTGGGCATACTGGTAAAATATTA >1.46|884862|38|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCTTTGCAGTTGCCTTTTTATAATCAATAATTAAATG >1.47|884930|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTGCTTCATCTGCTGTTGATACTGTATAGATTTCG >1.48|884996|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTGCTTCATCTGCTGTTGATACTGTATAGATTTCG >1.49|885062|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATATCGGAATCCATAACATGACCGGATTTGTCGAA >1.50|885128|35|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGGTTTCTGAGGCTCTCCTTTTAGTTTCTGAGGC >1.51|885193|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAAAACAAGTTGTAATATTTACTTGCTACCAAGAAG >1.52|885260|35|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCATATACACAACTATAATATATCAATACTATTT >1.53|885325|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACCACAATGCCGTGGTCATGTAACCTCACCAGCTTT >1.54|885391|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCGTCAAGTTTATTGACGCCCGGGGAGTTCCACCGA >1.55|885457|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCGCCAACTAGGCGCATCCTCCTGTCTCAGGTGGCTA >1.56|885524|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCAATAGCGCAGCTTTGGGCGCGAAAGTGGAGCTAAC >1.57|885591|35|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGCTCTCCGGAGTTTCAGAGCAAAGCGGCCCTGGC >1.58|885656|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GACAATTTGTAACCACTTGTGACAGATGTGGCGCAGG >1.59|885723|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTAATCTGAAAATTGTCCTAACAAACTAACCTAA >1.60|885789|35|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGGCTTATCCTCTCCACGCTCTGCGGCCTTCTCG >1.61|885854|38|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGACTGGGTTTTTAGTCTTATTGTAGATTTGCACCCC >1.62|885922|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAGGTATCCTGCAAAAATGAAACCGGTAATGTTTCC >1.63|885988|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACCAGGATCTGGCCAAGCGGTGCCAAATTGCCAACG >1.64|886054|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGTCCGTTTGGAGTTATGGCCTTTTATGTGGCTGG >1.65|886120|39|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTAAAAAGTTTTTTGTTGTGAGTCACAATAAACATGA >1.66|886189|35|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAGGTTCAATATTTTTTATGATGAAGTTACCAAC >1.67|886254|38|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAACAAGGCATGAAAATCCCTTAAAGAAAAAGCAATC >1.68|886322|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGGTGAGCGGCAGCATCAATGCCGGAGATGATGTGA >1.69|886388|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGTTTAGGAAGTTTTATATGTCGCTCTGGTCTCG >1.70|886454|38|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTATCATTTCCTCTGCTTTCTTGTCTCCATGACGTTCA >1.71|886522|38|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGGGATAAGCCCCGCTGGCCTCCGTGAGCACAACATAA >1.72|886590|40|NZ_CP019698|CRISPRCasFinder,CRT GGGCAACCGGCAGGGTGATATCCTTTTCCCGGGTGCCCCC >1.73|886660|35|NZ_CP019698|CRISPRCasFinder,CRT TTTTTCCTTCCCCCTCGTAATCCTTTGGAGTATGG >1.74|886725|40|NZ_CP019698|CRISPRCasFinder,CRT GAAGATGCCACACTGGATATCAGGTGTCACGGTTTGACTC >1.75|886795|35|NZ_CP019698|CRISPRCasFinder AGCCGCTTAACTAATGCCTATATCAAATCAATAGC |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b1,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019698_1
The CRISPR arrays of NZ_CP019698_1 >merge|NZ_CP019698|1|881837-886859|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACTGGGCGACAAGGATAAAGTGCTTGCGGAGGTCAAAGACGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCTGTATTCCAGGGCATCCTGTTCAGCCTTATCTTTATCAGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACGCCAATCCGCGGCTGGCCTTTGGAGCACTATCACGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACACGGTTTCCATCGTTACACAATTTTCAAAGACTACCTGGAGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACACTTTCTAAACCCTGAATAACAACAAAAGGAGAAGTGGGGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCTAAGTAAACCAGTAACACCAGATAAATCAACAGAACGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCAAAATGCCTGCATCGCACAAAACCACTTTAGGCAGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCGTGGTGGCTCAACCGCATCAGCAACATTTCTTCGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACATACTGATAACACCTGGATCAGTGCTTCCAGTTTCGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCAGGGAAAGGGTTGGTTTATCACAGGAGGAAGCCGCGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACTTGACCGCATAGCCGCCAATGGCTGGCGGGTACCGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACAGAACACTCACTTCTGCTCTGGCTAGTGCTGTTTTGAGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACATGAAGTTGCAAGGATGAACTGCATACTTTAATGAACGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACAGGAACGTGTAGTAGATCTGCCGGCCAAGCGAATCATGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCCGCAAAACCGTTGCCCCTCGCGCCCTCGTATTTGGCAGGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCCGGCTGAAAGCAACTGCATCCGCATTCTTTCTGCGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACATGTCAGCGAAGTGCCAGAATTTGCCTTTGGTGTGCGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACTCAATGCTTTCAACTTCATAGGTTCAAGATGTTCAAGGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACGTATCTTACAAACGACGTTCACATTTATTAGAGCAAGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACACAAACTGAACAAAAAGGCAGCTAAATTAAACTGCCAAGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCTTGAAAGCCTATCACGATGTGATGCTCCACGCCATGGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACGCTACTGGGATAATGACCTAGAACGGGAACCAGTAATGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCTAAAATATCCTCCTGCTTTATCGCTTTGGATGTAGCCAGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCCTTTTGCTAAAGTCAGTTTGCATTATGGCTGTGTGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACACCCCTTATCCTTCGCACTTGGTCGTTAACCCAGTGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCACTCCAAAAAGTGTAGTCGTTGTGGGGAAATCAAAGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCTGAGGCTAGCTTTGAAAACTATAAGCCTATCAACCGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACACTAAATCGCCCATAAGCTCTACCTGATGTACTCCGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCCAACGGGGGGATAACCGTTCAGCCATTAATTAAAAAAGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACTTACGCAGCTGGAAATAGCAAGATAAAAACTGTGGGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACAAGAGTGCAATTAGCTTGTTAACTTCCTCTTTATCGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACGAGTTGTATCGGAACTGCGGCCCACTTGGGTGCTTGGGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACTGTGTTTTCCAGTTAAGGAGTTAAGAGCTGCTATAGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCTTTTAACAGAGCCAAGGTTCCAACTTGGACTAATTCATGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACATTCTTGCTGCCGTTGCCTTTAAAGATGACTATAGGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACTTGCTGCATTGCAATCATCGGTATACTGATAAGCTTGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACTCTTAACAAAACGTCCCTTGAGAATGCACAAGTTTTGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACACACTGCTTTGATGGGCAATTTCATCAGTCTGGATGGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACACGAACTTAGAAAACTTTCAGATGCGGAGATTATTTCGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACAACCCTAGTGTTGATTTGGCATCTTTAAAGGCTGGCGATGGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCACCACATGCGATAGAGAGATTTAAGGAACGTGTAGCAGGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACTTAAATGAACCACCAACTGGAGGCCACACAGAACGGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACGCTGTTGAATGATGCCACTAATATTTTGTTCCTTTGTGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACAAGAAAAGGCCGTTTATAGCGGTGAGAATAACGGCGGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACTCATGAACATCCGCTGGGCATACTGGTAAAATATTAGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACTTCTTTGCAGTTGCCTTTTTATAATCAATAATTAAATGGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACATTGCTTCATCTGCTGTTGATACTGTATAGATTTCGGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACATTGCTTCATCTGCTGTTGATACTGTATAGATTTCGGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCATATCGGAATCCATAACATGACCGGATTTGTCGAAGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACAAGGTTTCTGAGGCTCTCCTTTTAGTTTCTGAGGCGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACGAAAAACAAGTTGTAATATTTACTTGCTACCAAGAAGGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCTCATATACACAACTATAATATATCAATACTATTTGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACACCACAATGCCGTGGTCATGTAACCTCACCAGCTTTGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCCGTCAAGTTTATTGACGCCCGGGGAGTTCCACCGAGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCCGCCAACTAGGCGCATCCTCCTGTCTCAGGTGGCTAGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCCAATAGCGCAGCTTTGGGCGCGAAAGTGGAGCTAACGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCGCTCTCCGGAGTTTCAGAGCAAAGCGGCCCTGGCGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACGACAATTTGTAACCACTTGTGACAGATGTGGCGCAGGGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACAATTAATCTGAAAATTGTCCTAACAAACTAACCTAAGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCAGGCTTATCCTCTCCACGCTCTGCGGCCTTCTCGGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACAAGACTGGGTTTTTAGTCTTATTGTAGATTTGCACCCCGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACGAGGTATCCTGCAAAAATGAAACCGGTAATGTTTCCGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACACCAGGATCTGGCCAAGCGGTGCCAAATTGCCAACGGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACATGTCCGTTTGGAGTTATGGCCTTTTATGTGGCTGGGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACTTGTAAAAAGTTTTTTGTTGTGAGTCACAATAAACATGAGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACATAGGTTCAATATTTTTTATGATGAAGTTACCAACGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACATAACAAGGCATGAAAATCCCTTAAAGAAAAAGCAATCGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCGGTGAGCGGCAGCATCAATGCCGGAGATGATGTGAGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACTTTGTTTAGGAAGTTTTATATGTCGCTCTGGTCTCGGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCTATCATTTCCTCTGCTTTCTTGTCTCCATGACGTTCAGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCGGGATAAGCCCCGCTGGCCTCCGTGAGCACAACATAAGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACGGGCAACCGGCAGGGTGATATCCTTTTCCCGGGTGCCCCCGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACTTTTTCCTTCCCCCTCGTAATCCTTTGGAGTATGGGTTACTAGACTACCTATAAGGAATTGAAACGAAGATGCCACACTGGATATCAGGTGTCACGGTTTGACTCGTTACTAGACTACCTAGATTGAAACGAAAAAGCCGCTTAACTAATGCCTATATCAAATCAATAGCGTAATTA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>NZ_CP019698|1|1|881837-886589|PILER-CR GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TGGGCGACAAGGATAAAGTGCTTGCGGAGGTCAAAGAC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CTGTATTCCAGGGCATCCTGTTCAGCCTTATCTTTATCA GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC GCCAATCCGCGGCTGGCCTTTGGAGCACTATCAC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ACGGTTTCCATCGTTACACAATTTTCAAAGACTACCTGGA GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ACTTTCTAAACCCTGAATAACAACAAAAGGAGAAGTGGG GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CTAAGTAAACCAGTAACACCAGATAAATCAACAGAAC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CAAAATGCCTGCATCGCACAAAACCACTTTAGGCA GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CGTGGTGGCTCAACCGCATCAGCAACATTTCTTC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ATACTGATAACACCTGGATCAGTGCTTCCAGTTTC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CAGGGAAAGGGTTGGTTTATCACAGGAGGAAGCCGC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TTGACCGCATAGCCGCCAATGGCTGGCGGGTACC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC AGAACACTCACTTCTGCTCTGGCTAGTGCTGTTTTGA GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ATGAAGTTGCAAGGATGAACTGCATACTTTAATGAAC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC AGGAACGTGTAGTAGATCTGCCGGCCAAGCGAATCAT 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MNIMTVSHYLKELRLPAAAKALSDLLRETQDRDFNHLEFLSVLLRYELDQREENTVARRIKQARFPQVKNLETFDFSLIPSVSKTRILALTQGQYIEEKRHIIFMGNSGTGKTHLATALGLAACQQGRKVRFYQAARWVEELVTAREEHRLLKLEKEWMRDELVILDELGYIPFSKTGAELLFQFCSTRHELGSIIVTTNLDFEKWPEVFGDVRMTEALIDRLTHRADIHLMNGESYRFRETLQQRSIANTSQQLNNE >NZ_CP019698.1|WP_077713375.1|889296_890823_-|IS21-family-transposase MIKVDTYKYIKDLHIKERKSIRQISRETGLARQTIRKILYGSVEEVTRYKRKVSPPAPLKEQFLPIIREWIVENLNAPHKQRYTASRIFERLQEEKGFTGCDSTVRGWVREIKQQLNIERAETYVPLEHDPVGRAQCDWTPATVKINGRDINGDVFLIRFSNSKAFYVRFYPHQRQEAFFDAHEKAFAFFNGVPQSILYDNLKTAVKRMLVGRKREEQDAFIKFRAHHGFDSDFCNRAKGNEKGGVESLARYVKWHIFTPVPEFPTIDALNNWIEGRCRKLNTKPRGRNRQSFWEAFTLEQDKLLPLSVHTFDCCTRKEAKVNRFSLVQFDRNQYSVPTEYTGKMVTVKGYVDKIEIYYQQTKLATHERCYEAGKQKFRLEHYLKLLERKPRSVGQAKPVRQANLPAPFAQYHQAVQRIDPAEGDRRFVNVLLLLRRYPVHILSSALILALEQSRLLPAEVEQLADIIDRPPSKPESIARTPVSITPSQIAPTQLHRYASLLKGGVGA >NZ_CP019698.1|WP_077713376.1|891172_891565_+|hypothetical-protein MNTREIAAEYRLAHWAQIVRRKNESGLSIKAFCANEGFRENTYYYWQRKLREAACEQLTEIRTEHAKLPCLVPPGFAELKITDAPEKFPVHNDAKQSEIRIELGGMRIAADSAYPVEKIAALLGLFKQLC >NZ_CP019698.1|WP_077713377.1|891558_891912_+|IS66-family-insertion-sequence-element-accessory-protein-TnpB MLSLAGKRVFLACGHTDMRKSINGLAAIVEGSFKLDPCDGALFVFCNRSRDRIKILEWDGDGFWLHFKRLEKGHFRWPTSGEEQTLVLTGEELSILLGGTRVALKLRRKELLGKRIT >NZ_CP019698.1|WP_077713378.1|891966_893514_+|IS66-family-transposase METANNWTEIIAEKDARIAELEMLVKFYEEQFRLSKHRQFGPSSEKGTLPGQLGLFDEVEKEADLQKNEPELEEITYARRKRIGKRKDDLSVLPVETVEHTLPEEERVCPECGGMLHEMGHDTRRELVIIPPQVKVVEHRRAVLSCRNCEKNGDHVPIVKAEMPKPLISGSLASPSAVAHIITQKYVQHIPLYRQEQDWKRQGVRLSRQTMANWVIRCSEDWLLPIYERMKAILLTQDVLHADESTVQVLREPGKTAVSNSYMWLYRTSGDTKRQIVLFEYQPSRSSTHPRQFLKGFRGFLHTDGYAAYHTLPGVTVVGCWVHMRRKFEDALKAIPNCERAVSSANDAVRRIGLLFHLEEQWESLTPEERYKLRLEKSKPLAEAFFGWLQTLTVLPKTAMGKAVHYALEQREWLMNVYLDGRTELSNNRAENAVRPFALGRKNWLFCNAVRGAISSSVVYSIIETAKANGLLPFEYMKFLLETVPSTSVGELDALLPWGEAIPEKCRMPFTKENA >NZ_CP019698.1|WP_077713379.1|893515_893797_+|hypothetical-protein MSRGTATKFMMTFVQEYLDGKRSRLDFDLDFNHYLIKHYAKMERENPDLAECFNYYLAEEGFDQAVGLSDDRHRRLIQKQFNEFKAALRDGFF >NZ_CP019698.1|WP_077713380.1|894133_894478_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKAINDIGNRIKNLRERSGLNQAQLAAFLDVDQSYISKCEKGERQLSVDALEKTCCLFGCTLSELSDGYDDISHLQFAFRAASISNDDLSAISDINKIALNLKQMRQLLRVAQS >NZ_CP019698.1|WP_077713381.1|894474_895233_+|ImmA/IrrE-family-metallo-endopeptidase MKEKIELNSEAVMLRKRLGEDAMSPLDVFAILGRLDNFTLIFYPFSERISGMSIKFENDMVMAINSSLSYGRQRYSAAHELYHLFIQKEFKSTICERNIESEKPEPEKEADAFASYFLAPYDALKAFVSDVLKKRPMDLSAEDVVRIEQYFQMSRQATLFRLINDGYISREFAESMKSNVIKSALRLGYDVSLYLPLPENKQYMTTGSYIKLAEELREKDIISDGKYEELLMDAFRPDIVYGFDAAGVERYD |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP019698_2 | 916882-918313 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019698_2
|
21 spacers
spacers of NZ_CP019698_2
>2.1|916912|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACCTATAACTACAGTGAGCATGAGCCCCCGGCAATC >2.2|916979|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGCATTTCCTCTTCCGGAGGTGGAATAAATGGCGA >2.3|917045|38|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCCTCCACCACTAATGGCCGCATCCCTGGCAAAGCAG >2.4|917113|38|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGTTTGGTATGGTCTTAGAATTGTCATGCGTTGGCTG >2.5|917181|38|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCACTCGTTTTCCATTTAGTTTGCCTTGGGATTTCCTT >2.6|917249|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCGTATTGCGAAGCTCCGTAAATGTCCGTGGACGTT >2.7|917315|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGGCAAATTCATGTTCAAGGGTCTTAACATCAGCT >2.8|917381|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGATTGAATACCGCAGTAATTGGAACCTGAAAATCA >2.9|917448|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAGCTACCAGCCTGGCAGAAGCAAGCCTAAGAGTA >2.10|917514|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCAAAGGACTAAGGAACAAATCAAAAAGTACCGCCTT >2.11|917581|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCACATATGCTGGCGGCGGTAATATTGGTAGCAAAC >2.12|917647|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAACTTTCAGTCGCAAAGTCAGATGGGCGAAGTAAGT >2.13|917714|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTTATGGCCGACTGGGAGTTAAAAATCGAACTTCC >2.14|917780|35|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTTTGCCAACACCCTGGCTCTGCGGTTTTCAAGC >2.15|917845|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCCGTAGAAATCAATGGTGGCAACTTTCATACATCTC >2.16|917912|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGGGGTCTCCGTGATTATGGAGTGCCCGGTCAGTTG >2.17|917979|35|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTCAATCCCCATATACTTCCGGAAATATCTCAGG >2.18|918044|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGATAATCACGCAATTCTGCCTCTATGTAGGCTCTG >2.19|918111|38|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGCTGGGCACTCAATCATGTGTGTGCTGGAAATGCAC >2.20|918179|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGACCTTGAAGTAAGGGAAATTGAGGAAGCTGCAC >2.21|918245|38|NZ_CP019698|CRISPRCasFinder,CRT AATTGTATCTGCGCATTGGCACTAATAAGGCCTACGAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019698_2
The CRISPR arrays of NZ_CP019698_2 >merge|NZ_CP019698|2|916882-918313|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACTACCTATAACTACAGTGAGCATGAGCCCCCGGCAATCGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCAGCATTTCCTCTTCCGGAGGTGGAATAAATGGCGAGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACATCCTCCACCACTAATGGCCGCATCCCTGGCAAAGCAGGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCTGTTTGGTATGGTCTTAGAATTGTCATGCGTTGGCTGGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCCACTCGTTTTCCATTTAGTTTGCCTTGGGATTTCCTTGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACGCGTATTGCGAAGCTCCGTAAATGTCCGTGGACGTTGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACTAGGCAAATTCATGTTCAAGGGTCTTAACATCAGCTGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACTTGATTGAATACCGCAGTAATTGGAACCTGAAAATCAGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACTCAGCTACCAGCCTGGCAGAAGCAAGCCTAAGAGTAGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCCAAAGGACTAAGGAACAAATCAAAAAGTACCGCCTTGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCCACATATGCTGGCGGCGGTAATATTGGTAGCAAACGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACTAACTTTCAGTCGCAAAGTCAGATGGGCGAAGTAAGTGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACTCTTATGGCCGACTGGGAGTTAAAAATCGAACTTCCGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACACTTTGCCAACACCCTGGCTCTGCGGTTTTCAAGCGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACGCCGTAGAAATCAATGGTGGCAACTTTCATACATCTCGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACTTGGGGTCTCCGTGATTATGGAGTGCCCGGTCAGTTGGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACACTCAATCCCCATATACTTCCGGAAATATCTCAGGGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACATGATAATCACGCAATTCTGCCTCTATGTAGGCTCTGGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACATGCTGGGCACTCAATCATGTGTGTGCTGGAAATGCACGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCAGACCTTGAAGTAAGGGAAATTGAGGAAGCTGCACGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACAATTGTATCTGCGCATTGGCACTAATAAGGCCTACGAAGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACT >NZ_CP019698|2|2|916882-918244|PILER-CR GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TACCTATAACTACAGTGAGCATGAGCCCCCGGCAATC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CAGCATTTCCTCTTCCGGAGGTGGAATAAATGGCGA GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ATCCTCCACCACTAATGGCCGCATCCCTGGCAAAGCAG GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CTGTTTGGTATGGTCTTAGAATTGTCATGCGTTGGCTG GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CCACTCGTTTTCCATTTAGTTTGCCTTGGGATTTCCTT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC GCGTATTGCGAAGCTCCGTAAATGTCCGTGGACGTT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TAGGCAAATTCATGTTCAAGGGTCTTAACATCAGCT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TTGATTGAATACCGCAGTAATTGGAACCTGAAAATCA GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TCAGCTACCAGCCTGGCAGAAGCAAGCCTAAGAGTA GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CCAAAGGACTAAGGAACAAATCAAAAAGTACCGCCTT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CCACATATGCTGGCGGCGGTAATATTGGTAGCAAAC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TAACTTTCAGTCGCAAAGTCAGATGGGCGAAGTAAGT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TCTTATGGCCGACTGGGAGTTAAAAATCGAACTTCC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ACTTTGCCAACACCCTGGCTCTGCGGTTTTCAAGC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC GCCGTAGAAATCAATGGTGGCAACTTTCATACATCTC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TTGGGGTCTCCGTGATTATGGAGTGCCCGGTCAGTTG GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ACTCAATCCCCATATACTTCCGGAAATATCTCAGG GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ATGATAATCACGCAATTCTGCCTCTATGTAGGCTCTG GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ATGCTGGGCACTCAATCATGTGTGTGCTGGAAATGCAC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CAGACCTTGAAGTAAGGGAAATTGAGGAAGCTGCAC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC >NZ_CP019698|2|2|916882-918313|CRISPRCasFinder GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TACCTATAACTACAGTGAGCATGAGCCCCCGGCAATC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CAGCATTTCCTCTTCCGGAGGTGGAATAAATGGCGA GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ATCCTCCACCACTAATGGCCGCATCCCTGGCAAAGCAG GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CTGTTTGGTATGGTCTTAGAATTGTCATGCGTTGGCTG GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CCACTCGTTTTCCATTTAGTTTGCCTTGGGATTTCCTT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC GCGTATTGCGAAGCTCCGTAAATGTCCGTGGACGTT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TAGGCAAATTCATGTTCAAGGGTCTTAACATCAGCT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TTGATTGAATACCGCAGTAATTGGAACCTGAAAATCA GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TCAGCTACCAGCCTGGCAGAAGCAAGCCTAAGAGTA GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CCAAAGGACTAAGGAACAAATCAAAAAGTACCGCCTT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CCACATATGCTGGCGGCGGTAATATTGGTAGCAAAC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TAACTTTCAGTCGCAAAGTCAGATGGGCGAAGTAAGT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TCTTATGGCCGACTGGGAGTTAAAAATCGAACTTCC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ACTTTGCCAACACCCTGGCTCTGCGGTTTTCAAGC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC GCCGTAGAAATCAATGGTGGCAACTTTCATACATCTC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TTGGGGTCTCCGTGATTATGGAGTGCCCGGTCAGTTG GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ACTCAATCCCCATATACTTCCGGAAATATCTCAGG GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ATGATAATCACGCAATTCTGCCTCTATGTAGGCTCTG GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ATGCTGGGCACTCAATCATGTGTGTGCTGGAAATGCAC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CAGACCTTGAAGTAAGGGAAATTGAGGAAGCTGCAC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC AATTGTATCTGCGCATTGGCACTAATAAGGCCTACGAA GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACT >NZ_CP019698|2|2|916882-918312|CRT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TACCTATAACTACAGTGAGCATGAGCCCCCGGCAATC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CAGCATTTCCTCTTCCGGAGGTGGAATAAATGGCGA GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ATCCTCCACCACTAATGGCCGCATCCCTGGCAAAGCAG GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CTGTTTGGTATGGTCTTAGAATTGTCATGCGTTGGCTG GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CCACTCGTTTTCCATTTAGTTTGCCTTGGGATTTCCTT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC GCGTATTGCGAAGCTCCGTAAATGTCCGTGGACGTT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TAGGCAAATTCATGTTCAAGGGTCTTAACATCAGCT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TTGATTGAATACCGCAGTAATTGGAACCTGAAAATCA GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TCAGCTACCAGCCTGGCAGAAGCAAGCCTAAGAGTA GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CCAAAGGACTAAGGAACAAATCAAAAAGTACCGCCTT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CCACATATGCTGGCGGCGGTAATATTGGTAGCAAAC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TAACTTTCAGTCGCAAAGTCAGATGGGCGAAGTAAGT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TCTTATGGCCGACTGGGAGTTAAAAATCGAACTTCC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ACTTTGCCAACACCCTGGCTCTGCGGTTTTCAAGC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC GCCGTAGAAATCAATGGTGGCAACTTTCATACATCTC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TTGGGGTCTCCGTGATTATGGAGTGCCCGGTCAGTTG GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ACTCAATCCCCATATACTTCCGGAAATATCTCAGG GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ATGATAATCACGCAATTCTGCCTCTATGTAGGCTCTG GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ATGCTGGGCACTCAATCATGTGTGTGCTGGAAATGCAC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CAGACCTTGAAGTAAGGGAAATTGAGGAAGCTGCAC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC AATTGTATCTGCGCATTGGCACTAATAAGGCCTACGAA GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC
>NZ_CP019698.1|WP_149026564.1|915993_916770_+|ATP-binding-protein MNIMTVSHYLKELRLPAAAKALSDLLRETQDRDFNHLEFLSVLLRYELDQREENTVARRIKQARFPQVKNLETFDFSLIPSVSKTRILALTQGQYIEEKRHIIFMGNSGTGKTHLATALGLAACQQGRKVRFYQAARWVEELVTAREEHRLLKLEKEWMRDELVILDELGYIPFSKTGAELLFQFCSTRHELGSIIVTTNLDFEKWPEVFGDVRMTEALIDRLTHRADIHLMNGESYRFRETLQQRSIANTSQQLNNE >NZ_CP019698.1|WP_077713132.1|914470_915997_+|IS21-family-transposase MIKVDTYKYIKDLHIKERKSIRQISRETGLARQTIRKILYGSVEEVTRYKRKVSPPAPLKEQFLPIIREWIVENLNAPPKQRYTASRIFERLQEEKGFTGCDSTVRGWVREIKQQLNIERAETYVPLEHDPVGRAQCDWTPATVKINGRDINGDVFLIRFSNSKAFYVRFYPHQRQEAFFDAHEKAFAFFNGVPQSILYDNLKTAVKRMLVGRKREEQDAFIKFRAHHGFDSDFCNRAKGNEKGGVESLARYVKWHIFTPVPEFPTIDALNNWIEGRCRKLNTKPRGRNRQSFWEAFTLEQDKLLPLSVHTFDCCTRKEAKVNRFSLVQFDRNQYSVPTEYTGKMVTVKGYVDKIEIYYQQTKLATHERCYEAGKQKFRLEHYLKLLERKPRSVGQAKPVRQANLPAPFAQYHQAVQRIDPAEGDRRFVNVLLLLRRYPVHILSSALILALEQSRLLPAEVEQLADIIDRPPSKPESIARTPVSITPSQIAPTQLHRYASLLKGGVGA >NZ_CP019698.1|WP_077713399.1|912818_913904_+|hypothetical-protein MLEYPDKHSIFQILNSNNFIPQSSARKLLQQKGIFILNSSRESLSSLGSKIFWGAEDIYTIKQMTDKESNLKKVSRLYLKNNELSPDNIKDMVQSASSLLAQKESIILNNPIKLEDGSYKITGSYIKENPGKVQLLDKVEKDFSVKCRQLPSKQIVIDYSFSDETDQRIIKKVFDIVQKRDPEKPAFEIESINIELLSIEKRIRLFDKFFEFSFTEWEIVKVSQLTIKKDESKERSEEERDVTTDDLEGITKAILDGSGLRRNSFVLDCISKGFYFISAKIRLEHKKDPLVIEIEISFKPKLDVKMASIKELHEDGLKNSFMNPTEQEELLNYFQDIIYGIYQNLLNQKVLNVVDHYNKEI >NZ_CP019698.1|WP_077713398.1|911857_912817_+|hypothetical-protein MSEEQGVSGNHWTKGAVGLLTKLGWEQKGACNIDIPCTQHASRKNPHGIDIFFQYFEPYENKDLGIIVETKRRVWSGASSASIEEFLEQTISTLECAPYHPTFSEKYDFYGQVETALILIWYHSKDSKRTPEYDHDKYLQYISKVKAPRKRKEMNVFIASNYDILRWCSIIDTVEKICYEKKAHFDYYYPCINHNNSLRKPYLSLVHLFSAYIFGKFSYIEDDGELGRTRHVSVVFSSDRPTLTNLMILYSAVKKYMLDDVHELWLYFYDDLLEYRSYCEQFKRSVKEELNKQQKKLKIEILELPRYIDPPGWLWNGAE >NZ_CP019698.1|WP_149026591.1|911169_911865_+|hypothetical-protein MSTTVFYKKLIIKNSGWDYLLKFFIEKQYSSERKSGFLTISSGHDYYEFNYIYRQPVYIWQYNFKTGTIDKVESFTTELAEVYIDKRLGLLEARGKKTVVSKFINELHLSGKDLVIDDLEVHPKVILRYLGHNGLDFSITRVRIRDFQINENISGNCTLRVKGYKESLQIIEDYYEQIDCINFELNYLSNKPVNVTIYKTGRMVIGKVEDLTDKDILEELRKIVSGVIKNV >NZ_CP019698.1|WP_003544130.1|909311_909620_-|transposase MTRKKYTIDFKQQVIQEALETGNNAVVARRYDLNPNMVGRWVREHKKDKLTKTSDAELVQDYNQISKENEQLKKLLGEKDLEIAILKDLIKKKNPHLLTKLK >NZ_CP019698.1|WP_149026590.1|908391_909321_-|IS3-family-transposase MEVAEKWISRGYPIAVVLRIVGVPRSTYYYRVNQHNTQRKVSGGRPIPGYSYTKQQSIVSDDQIKKWLLQFIENEGFAYGYVKLTVALRKTYGLVINKKKVYRLCKELKILRPQRKKKVNVPKRLAKNRIVTNSNQLWETDLKYGFIAGEQRFFFVLSYIDVYDREIVGYHIGLRCEGKDAARTLQQALWKRKLLNNANKPVIRTDNGPQYTCYTFQEECKKLEIEHERIPCRTPNKNAHIEAFHSILEEECLGHHEFRTYAEAYRAVSEFMYHYNNKRIHSGVRYMTPTEFYEKNRRHECTPLKEIKL >NZ_CP019698.1|WP_077713394.1|907849_908074_+|DUF5348-domain-containing-protein MIVNGVEMKYDPQQDRWVVVMGHREYGLHCGEYFEIWIGKTSIACRLELGNDWYIIMQGARFNLRTQDTYRVKI >NZ_CP019698.1|WP_077713393.1|907448_907619_+|Spo0E-family-sporulation-regulatory-protein-aspartic-acid-phosphatase MLKLGRVILELEKTRRELLAVNPGDKEKLLEASQKVDKLIVEYYRVKTVLGLRSEM >NZ_CP019698.1|WP_149026589.1|906060_907083_+|IS3-family-transposase MKATSWGKGLEDCHFNRFAKKVQPGLQDKLEIADNWIARGYAKAFVLDTLEISESTYYHRKKKGQVPQNPRTNQGGRPIPGYSWTKDQRRVSDLEIKEWLLELISGDESVYGYRKLTTCLRRKHQLAINKKKVYRLCKELDILSPQRRVSISHPRRIAINRKVSAPNQLWEIDIKYGYIQGEDRFFYFMGILDIYDRILIDYHIGLSCEGKHAAQLIQRALWKRKLLDKEQRPVIRTDNGPQFISHVFEDACETYKIEHERIPPKTPNKNAHIESFHSILERECFSRHEFRSYQEAYKKVREFMEFYNQSRIHGSLYDLSPFEFNQQMTAGEIKPFVVKV >NZ_CP019698.1|WP_077713400.1|919521_920322_-|AAA-family-ATPase MFLQYFGLKFNPFTKEVAADKLYISQDLQELEQRLKYLQNTRGIGLVAGEPGAGKSTTLRKFVSELNPSLYRHCYFSLATVTVSEFYQGLALELGEQPVHRKVAVFRQIQQAISSMYFDNRITPVIILDEIHLASNKLLEDLRLIFNFKMDSQNPFILILAGQSTIRNKLGMNINKPLRQRLVVKHIMQGLKQEEIKGYCNSRLQMAGLVEEIITDAALEAIYANSNGMPRLVNSLMTNSLIYACNQNQRRIDEEIVYHAQNELNI >NZ_CP019698.1|WP_077713402.1|922428_923475_+|hypothetical-protein 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MKIAWFCIPAHGHINPTLGLVKEMIDAGHEVTYFSFEKFRKKIEGTGATFVSCDAYDLDIDAKDGGNRVGKDLAFSIELIVESTLAMDGLISRVIPDMKPDLIVADSMAYSGKLAAMKFGIPYVCSTTTFVFNRYSAKYMDQGMGGLFSTLLALQKIKRQLKRLQVMGYPVKSFLELITNDNETYTIVYTSKEFQPYAETFSDKYCFIGPSIRPVTNPMEKTAEKTVYISMGTVVSNREMYENCVEALRGTDYQVIVSMGETTNEFSNLPENIQVYDSVDQMAVLNIADAFVTHCGMNSASEGLYFEVPLVLAPQTPEQWAVAKRTEELGAGVMLPASGRSVEEIKNAIEKVLNDGAYKAAATEISKGFKRCGGVKEARAFLEKIVKQSQISVCR >NZ_CP019698.1|WP_077713406.1|926085_926829_+|NAD(+)--rifampin-ADP-ribosyltransferase MIFDPNNPIIKLCMSGMGLEDSGNSEDAITMFQKAWDEATDYYERFIASYHLARLQKSITEKLKWMKTSLQCALKINDDNVKSAYPTLYLNIAKCYEELGDSENAKRNYELSNSAKGKPSDKGPFYHGTKADLKVGDLLTAGGISNYKPELKMDHIYFTANVNVAGLAATLAKGEGRERIYIVEPTGEFENDPNVTDKKFPGNLTRSYRSKDPLRIIGEVTEWAKLTHKERREWREEIDKNKGEIIN >NZ_CP019698.1|WP_149026724.1|927121_927670_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MWEEERVNQKITENFQASDITEIRPLTVEHLPAYADVISKSFATVARDFGLTKENCPGHKSFITNDRLKSKFKDGYYPFGLCIGDKIIGFASLTALNNGTYEMNDVSVLPEYRRYGYGKMILDFCKAKVKSFGGSKIIIGIMEESTVLKDWYTANGFVHTETKKFEHLPFTVGYMEWKAKTE >NZ_CP019698.1|WP_149026589.1|928288_929311_-|IS3-family-transposase MKATSWGKGLEDCHFNRFAKKVQPGLQDKLEIADNWIARGYAKAFVLDTLEISESTYYHRKKKGQVPQNPRTNQGGRPIPGYSWTKDQRRVSDLEIKEWLLELISGDESVYGYRKLTTCLRRKHQLAINKKKVYRLCKELDILSPQRRVSISHPRRIAINRKVSAPNQLWEIDIKYGYIQGEDRFFYFMGILDIYDRILIDYHIGLSCEGKHAAQLIQRALWKRKLLDKEQRPVIRTDNGPQFISHVFEDACETYKIEHERIPPKTPNKNAHIESFHSILERECFSRHEFRSYQEAYKKVREFMEFYNQSRIHGSLYDLSPFEFNQQMTAGEIKPFVVKV >NZ_CP019698.1|WP_077713391.1|929214_929547_-|transposase MQRKRYPKELKDQLVREVKEAGSVVQVAKRHGINDRTLSRWVRESKYSSWEKAPDEAKKMQAYVPSPQEFREMEKENNQLKQLLGEKDLKIAILTDLLKKSNPGFKTNLK >NZ_CP019698.1|WP_014256673.1|930920_931340_+|phage-holin-family-protein MKTVWNWVQAVFTAIGGFLGWFLGGLDGFLYALIAFVAIDYVTGVMCAIVDKKLSSEVGAKGIFKKVLIFVLVGVGHIIDSQVLGNGGAIRTAVIFFYLSNEGISILENAAHIGLPIPEKLKNALEQLHGHSNEEDEKK >NZ_CP019698.1|WP_077713410.1|932743_932962_+|hypothetical-protein MIEAANHLPYNPQETNYTKITQEEIQREVDYWRAYKILQKMLKAGLISEAEFHKIDKLNLKTFSPMYAQLMA |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP019698_3 | 918698-919324 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019698_3
|
9 spacers
spacers of NZ_CP019698_3
>3.1|918728|35|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGGATGTAAGGCATGTGATATTCCTCCTTGGTTT >3.2|918793|35|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCATATCTCTTGAAACTGTTCGCCAATTTAGGGT >3.3|918858|35|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCATATCTCTTGAAACTGTTCGCCAATTTAGGGT >3.4|918923|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGGTGATGCCATTGAGCAATACAAAAAACTGGCCAA >3.5|918990|38|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCTCATCTGGGATGAGTTGGACGCTAAGAACATCACCT >3.6|919058|38|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCGTCAAGTTTATTGACGCCCGGGGAGTTCCACCGAAC >3.7|919126|38|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGATACTGGGAACGGATACACAAGCAGAGGACAAGGG >3.8|919194|35|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGGCGGTGCTTAAAGAAGCATATCCCAAAGCTAA >3.9|919259|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGTTGAAGAACTTGGGGTACGACATGAAGGTCCGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019698_3
The CRISPR arrays of NZ_CP019698_3 >merge|NZ_CP019698|3|918698-919324|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACTTGGATGTAAGGCATGTGATATTCCTCCTTGGTTTGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACATCATATCTCTTGAAACTGTTCGCCAATTTAGGGTGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACATCATATCTCTTGAAACTGTTCGCCAATTTAGGGTGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACTTGGTGATGCCATTGAGCAATACAAAAAACTGGCCAAGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCCTCATCTGGGATGAGTTGGACGCTAAGAACATCACCTGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCCGTCAAGTTTATTGACGCCCGGGGAGTTCCACCGAACGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACATGATACTGGGAACGGATACACAAGCAGAGGACAAGGGGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCTGGCGGTGCTTAAAGAAGCATATCCCAAAGCTAAGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACAAGTTGAAGAACTTGGGGTACGACATGAAGGTCCGTGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC >NZ_CP019698|3|3|918698-919324|PILER-CR GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TTGGATGTAAGGCATGTGATATTCCTCCTTGGTTT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ATCATATCTCTTGAAACTGTTCGCCAATTTAGGGT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ATCATATCTCTTGAAACTGTTCGCCAATTTAGGGT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TTGGTGATGCCATTGAGCAATACAAAAAACTGGCCAA GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CCTCATCTGGGATGAGTTGGACGCTAAGAACATCACCT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CCGTCAAGTTTATTGACGCCCGGGGAGTTCCACCGAAC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ATGATACTGGGAACGGATACACAAGCAGAGGACAAGGG GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CTGGCGGTGCTTAAAGAAGCATATCCCAAAGCTAA GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC AAGTTGAAGAACTTGGGGTACGACATGAAGGTCCGT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC >NZ_CP019698|3|3|918698-919324|CRISPRCasFinder GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TTGGATGTAAGGCATGTGATATTCCTCCTTGGTTT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ATCATATCTCTTGAAACTGTTCGCCAATTTAGGGT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ATCATATCTCTTGAAACTGTTCGCCAATTTAGGGT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TTGGTGATGCCATTGAGCAATACAAAAAACTGGCCAA GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CCTCATCTGGGATGAGTTGGACGCTAAGAACATCACCT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CCGTCAAGTTTATTGACGCCCGGGGAGTTCCACCGAAC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ATGATACTGGGAACGGATACACAAGCAGAGGACAAGGG GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CTGGCGGTGCTTAAAGAAGCATATCCCAAAGCTAA GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC AAGTTGAAGAACTTGGGGTACGACATGAAGGTCCGT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC >NZ_CP019698|3|3|918698-919324|CRT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TTGGATGTAAGGCATGTGATATTCCTCCTTGGTTT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ATCATATCTCTTGAAACTGTTCGCCAATTTAGGGT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ATCATATCTCTTGAAACTGTTCGCCAATTTAGGGT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TTGGTGATGCCATTGAGCAATACAAAAAACTGGCCAA GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CCTCATCTGGGATGAGTTGGACGCTAAGAACATCACCT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CCGTCAAGTTTATTGACGCCCGGGGAGTTCCACCGAAC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ATGATACTGGGAACGGATACACAAGCAGAGGACAAGGG GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CTGGCGGTGCTTAAAGAAGCATATCCCAAAGCTAA GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC AAGTTGAAGAACTTGGGGTACGACATGAAGGTCCGT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC
>NZ_CP019698.1|WP_149026564.1|915993_916770_+|ATP-binding-protein MNIMTVSHYLKELRLPAAAKALSDLLRETQDRDFNHLEFLSVLLRYELDQREENTVARRIKQARFPQVKNLETFDFSLIPSVSKTRILALTQGQYIEEKRHIIFMGNSGTGKTHLATALGLAACQQGRKVRFYQAARWVEELVTAREEHRLLKLEKEWMRDELVILDELGYIPFSKTGAELLFQFCSTRHELGSIIVTTNLDFEKWPEVFGDVRMTEALIDRLTHRADIHLMNGESYRFRETLQQRSIANTSQQLNNE >NZ_CP019698.1|WP_077713132.1|914470_915997_+|IS21-family-transposase MIKVDTYKYIKDLHIKERKSIRQISRETGLARQTIRKILYGSVEEVTRYKRKVSPPAPLKEQFLPIIREWIVENLNAPPKQRYTASRIFERLQEEKGFTGCDSTVRGWVREIKQQLNIERAETYVPLEHDPVGRAQCDWTPATVKINGRDINGDVFLIRFSNSKAFYVRFYPHQRQEAFFDAHEKAFAFFNGVPQSILYDNLKTAVKRMLVGRKREEQDAFIKFRAHHGFDSDFCNRAKGNEKGGVESLARYVKWHIFTPVPEFPTIDALNNWIEGRCRKLNTKPRGRNRQSFWEAFTLEQDKLLPLSVHTFDCCTRKEAKVNRFSLVQFDRNQYSVPTEYTGKMVTVKGYVDKIEIYYQQTKLATHERCYEAGKQKFRLEHYLKLLERKPRSVGQAKPVRQANLPAPFAQYHQAVQRIDPAEGDRRFVNVLLLLRRYPVHILSSALILALEQSRLLPAEVEQLADIIDRPPSKPESIARTPVSITPSQIAPTQLHRYASLLKGGVGA >NZ_CP019698.1|WP_077713399.1|912818_913904_+|hypothetical-protein MLEYPDKHSIFQILNSNNFIPQSSARKLLQQKGIFILNSSRESLSSLGSKIFWGAEDIYTIKQMTDKESNLKKVSRLYLKNNELSPDNIKDMVQSASSLLAQKESIILNNPIKLEDGSYKITGSYIKENPGKVQLLDKVEKDFSVKCRQLPSKQIVIDYSFSDETDQRIIKKVFDIVQKRDPEKPAFEIESINIELLSIEKRIRLFDKFFEFSFTEWEIVKVSQLTIKKDESKERSEEERDVTTDDLEGITKAILDGSGLRRNSFVLDCISKGFYFISAKIRLEHKKDPLVIEIEISFKPKLDVKMASIKELHEDGLKNSFMNPTEQEELLNYFQDIIYGIYQNLLNQKVLNVVDHYNKEI >NZ_CP019698.1|WP_077713398.1|911857_912817_+|hypothetical-protein MSEEQGVSGNHWTKGAVGLLTKLGWEQKGACNIDIPCTQHASRKNPHGIDIFFQYFEPYENKDLGIIVETKRRVWSGASSASIEEFLEQTISTLECAPYHPTFSEKYDFYGQVETALILIWYHSKDSKRTPEYDHDKYLQYISKVKAPRKRKEMNVFIASNYDILRWCSIIDTVEKICYEKKAHFDYYYPCINHNNSLRKPYLSLVHLFSAYIFGKFSYIEDDGELGRTRHVSVVFSSDRPTLTNLMILYSAVKKYMLDDVHELWLYFYDDLLEYRSYCEQFKRSVKEELNKQQKKLKIEILELPRYIDPPGWLWNGAE >NZ_CP019698.1|WP_149026591.1|911169_911865_+|hypothetical-protein MSTTVFYKKLIIKNSGWDYLLKFFIEKQYSSERKSGFLTISSGHDYYEFNYIYRQPVYIWQYNFKTGTIDKVESFTTELAEVYIDKRLGLLEARGKKTVVSKFINELHLSGKDLVIDDLEVHPKVILRYLGHNGLDFSITRVRIRDFQINENISGNCTLRVKGYKESLQIIEDYYEQIDCINFELNYLSNKPVNVTIYKTGRMVIGKVEDLTDKDILEELRKIVSGVIKNV >NZ_CP019698.1|WP_003544130.1|909311_909620_-|transposase MTRKKYTIDFKQQVIQEALETGNNAVVARRYDLNPNMVGRWVREHKKDKLTKTSDAELVQDYNQISKENEQLKKLLGEKDLEIAILKDLIKKKNPHLLTKLK >NZ_CP019698.1|WP_149026590.1|908391_909321_-|IS3-family-transposase MEVAEKWISRGYPIAVVLRIVGVPRSTYYYRVNQHNTQRKVSGGRPIPGYSYTKQQSIVSDDQIKKWLLQFIENEGFAYGYVKLTVALRKTYGLVINKKKVYRLCKELKILRPQRKKKVNVPKRLAKNRIVTNSNQLWETDLKYGFIAGEQRFFFVLSYIDVYDREIVGYHIGLRCEGKDAARTLQQALWKRKLLNNANKPVIRTDNGPQYTCYTFQEECKKLEIEHERIPCRTPNKNAHIEAFHSILEEECLGHHEFRTYAEAYRAVSEFMYHYNNKRIHSGVRYMTPTEFYEKNRRHECTPLKEIKL >NZ_CP019698.1|WP_077713394.1|907849_908074_+|DUF5348-domain-containing-protein MIVNGVEMKYDPQQDRWVVVMGHREYGLHCGEYFEIWIGKTSIACRLELGNDWYIIMQGARFNLRTQDTYRVKI >NZ_CP019698.1|WP_077713393.1|907448_907619_+|Spo0E-family-sporulation-regulatory-protein-aspartic-acid-phosphatase MLKLGRVILELEKTRRELLAVNPGDKEKLLEASQKVDKLIVEYYRVKTVLGLRSEM >NZ_CP019698.1|WP_149026589.1|906060_907083_+|IS3-family-transposase MKATSWGKGLEDCHFNRFAKKVQPGLQDKLEIADNWIARGYAKAFVLDTLEISESTYYHRKKKGQVPQNPRTNQGGRPIPGYSWTKDQRRVSDLEIKEWLLELISGDESVYGYRKLTTCLRRKHQLAINKKKVYRLCKELDILSPQRRVSISHPRRIAINRKVSAPNQLWEIDIKYGYIQGEDRFFYFMGILDIYDRILIDYHIGLSCEGKHAAQLIQRALWKRKLLDKEQRPVIRTDNGPQFISHVFEDACETYKIEHERIPPKTPNKNAHIESFHSILERECFSRHEFRSYQEAYKKVREFMEFYNQSRIHGSLYDLSPFEFNQQMTAGEIKPFVVKV >NZ_CP019698.1|WP_077713400.1|919521_920322_-|AAA-family-ATPase MFLQYFGLKFNPFTKEVAADKLYISQDLQELEQRLKYLQNTRGIGLVAGEPGAGKSTTLRKFVSELNPSLYRHCYFSLATVTVSEFYQGLALELGEQPVHRKVAVFRQIQQAISSMYFDNRITPVIILDEIHLASNKLLEDLRLIFNFKMDSQNPFILILAGQSTIRNKLGMNINKPLRQRLVVKHIMQGLKQEEIKGYCNSRLQMAGLVEEIITDAALEAIYANSNGMPRLVNSLMTNSLIYACNQNQRRIDEEIVYHAQNELNI >NZ_CP019698.1|WP_077713402.1|922428_923475_+|hypothetical-protein MSCKVITSQLSISLRNTNLFEKYSCFILVVIWFADYLISEILGHSVQDKMRIYTWVQFEVVNREHSYPKSNTNWANHAVRTADPRKTLQFPSKDNIFSMNHKEWQELKYVFDIAQGIITNATVPVPLRFKYQDKVMSMQRKVASTVARRTDTVLIHASDPACIKDVKTQANILLHKDNSTCMAWRMDMAKLFERYVQHIVSKSINELSGTVINNGKITGKGNIPHWGLKYLEPDIMIKFSNSIYMGDAKYKAHFYARGTKSEALNETHRSDLHQLLAYCSFEPQLHKTGILFYPAKTLSFQKIHYSDRNGGICNKVILFGLPFGVAEMKDATVKIKELFQNDMLKIIN >NZ_CP019698.1|WP_077713403.1|923631_924126_+|aminoglycoside-nucleotidyltransferase MVNKADAVEIISYAEDNGIDIWLDGGWGVDALLEMETRAHNDIDIFVEKINSKKFIDIIKEKGFAEIKEAYTTASHTVWKDAKDRIIDLHIFEFTEQGYLIFEGETYPSSVFSGIGKIGDKVVKCIDAENQVLFHLGYEHDENDVHDVRLLCERFNIPVPNEYK >NZ_CP019698.1|WP_077713405.1|924775_925963_+|glucosyltransferase MKIAWFCIPAHGHINPTLGLVKEMIDAGHEVTYFSFEKFRKKIEGTGATFVSCDAYDLDIDAKDGGNRVGKDLAFSIELIVESTLAMDGLISRVIPDMKPDLIVADSMAYSGKLAAMKFGIPYVCSTTTFVFNRYSAKYMDQGMGGLFSTLLALQKIKRQLKRLQVMGYPVKSFLELITNDNETYTIVYTSKEFQPYAETFSDKYCFIGPSIRPVTNPMEKTAEKTVYISMGTVVSNREMYENCVEALRGTDYQVIVSMGETTNEFSNLPENIQVYDSVDQMAVLNIADAFVTHCGMNSASEGLYFEVPLVLAPQTPEQWAVAKRTEELGAGVMLPASGRSVEEIKNAIEKVLNDGAYKAAATEISKGFKRCGGVKEARAFLEKIVKQSQISVCR >NZ_CP019698.1|WP_077713406.1|926085_926829_+|NAD(+)--rifampin-ADP-ribosyltransferase MIFDPNNPIIKLCMSGMGLEDSGNSEDAITMFQKAWDEATDYYERFIASYHLARLQKSITEKLKWMKTSLQCALKINDDNVKSAYPTLYLNIAKCYEELGDSENAKRNYELSNSAKGKPSDKGPFYHGTKADLKVGDLLTAGGISNYKPELKMDHIYFTANVNVAGLAATLAKGEGRERIYIVEPTGEFENDPNVTDKKFPGNLTRSYRSKDPLRIIGEVTEWAKLTHKERREWREEIDKNKGEIIN >NZ_CP019698.1|WP_149026724.1|927121_927670_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MWEEERVNQKITENFQASDITEIRPLTVEHLPAYADVISKSFATVARDFGLTKENCPGHKSFITNDRLKSKFKDGYYPFGLCIGDKIIGFASLTALNNGTYEMNDVSVLPEYRRYGYGKMILDFCKAKVKSFGGSKIIIGIMEESTVLKDWYTANGFVHTETKKFEHLPFTVGYMEWKAKTE >NZ_CP019698.1|WP_149026589.1|928288_929311_-|IS3-family-transposase MKATSWGKGLEDCHFNRFAKKVQPGLQDKLEIADNWIARGYAKAFVLDTLEISESTYYHRKKKGQVPQNPRTNQGGRPIPGYSWTKDQRRVSDLEIKEWLLELISGDESVYGYRKLTTCLRRKHQLAINKKKVYRLCKELDILSPQRRVSISHPRRIAINRKVSAPNQLWEIDIKYGYIQGEDRFFYFMGILDIYDRILIDYHIGLSCEGKHAAQLIQRALWKRKLLDKEQRPVIRTDNGPQFISHVFEDACETYKIEHERIPPKTPNKNAHIESFHSILERECFSRHEFRSYQEAYKKVREFMEFYNQSRIHGSLYDLSPFEFNQQMTAGEIKPFVVKV >NZ_CP019698.1|WP_077713391.1|929214_929547_-|transposase MQRKRYPKELKDQLVREVKEAGSVVQVAKRHGINDRTLSRWVRESKYSSWEKAPDEAKKMQAYVPSPQEFREMEKENNQLKQLLGEKDLKIAILTDLLKKSNPGFKTNLK >NZ_CP019698.1|WP_014256673.1|930920_931340_+|phage-holin-family-protein MKTVWNWVQAVFTAIGGFLGWFLGGLDGFLYALIAFVAIDYVTGVMCAIVDKKLSSEVGAKGIFKKVLIFVLVGVGHIIDSQVLGNGGAIRTAVIFFYLSNEGISILENAAHIGLPIPEKLKNALEQLHGHSNEEDEKK >NZ_CP019698.1|WP_077713410.1|932743_932962_+|hypothetical-protein MIEAANHLPYNPQETNYTKITQEEIQREVDYWRAYKILQKMLKAGLISEAEFHKIDKLNLKTFSPMYAQLMA |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP019698_4 | 950478-951306 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019698_4
|
12 spacers
spacers of NZ_CP019698_4
>4.1|950508|35|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTGCTGGCAGTAATTCTTTAGGAACCGTCACGGC >4.2|950573|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCCCAATCCATACTGTTACCTCCCCGTTTAATAATT >4.3|950639|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTATTTTTCTTAATAATGTTCTTAATCCCTTTTTAG >4.4|950706|38|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAACCTACCATTTACAGCATGGTTACTGTATGTATTA >4.5|950774|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGTGCTTACTCATAGCAGAGTAGGCACAATAAAGG >4.6|950840|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCAAAAACGAAAACAATGCCATCGTATCATGGAAGCC >4.7|950907|38|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAAGGTAAAGTTGGGACTTTTTACAGTCCCATTTTAT >4.8|950975|35|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCCGGTATATCATCCAGGTTCATGGAGGTTTGCTG >4.9|951040|37|NZ_CP019698|CRISPRCasFinder,CRT GGATTTATTGCAGGACTTAAAAAGGCCATAAGAATTT >4.10|951107|35|NZ_CP019698|CRISPRCasFinder,CRT TTTTTCCTTCCCCCTCGTAATCCTTTGGAGTATGG >4.11|951172|40|NZ_CP019698|CRISPRCasFinder,CRT GAAGATGCCACACTGGATATCAGGTGTCACGGTTTGACTC >4.12|951242|35|NZ_CP019698|CRISPRCasFinder AGCCGCTTAACTAATGCCTATATCAAATCAATAGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019698_4
The CRISPR arrays of NZ_CP019698_4 >merge|NZ_CP019698|4|950478-951306|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACATTGCTGGCAGTAATTCTTTAGGAACCGTCACGGCGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCCCCAATCCATACTGTTACCTCCCCGTTTAATAATTGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACACTATTTTTCTTAATAATGTTCTTAATCCCTTTTTAGGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACTCAACCTACCATTTACAGCATGGTTACTGTATGTATTAGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACCAGTGCTTACTCATAGCAGAGTAGGCACAATAAAGGGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACGCAAAAACGAAAACAATGCCATCGTATCATGGAAGCCGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACATAAGGTAAAGTTGGGACTTTTTACAGTCCCATTTTATGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACTCCGGTATATCATCCAGGTTCATGGAGGTTTGCTGGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACGGATTTATTGCAGGACTTAAAAAGGCCATAAGAATTTGTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAACTTTTTCCTTCCCCCTCGTAATCCTTTGGAGTATGGGTTACTAGACTACCTATAAGGAATTGAAACGAAGATGCCACACTGGATATCAGGTGTCACGGTTTGACTCGTTACTAGACTACCTAGATTGAAACGAAAAAGCCGCTTAACTAATGCCTATATCAAATCAATAGCGTAATTAGCCTACCTATAGGGGTTTGAAAC >NZ_CP019698|4|4|950478-951039|PILER-CR GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ATTGCTGGCAGTAATTCTTTAGGAACCGTCACGGC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CCCCAATCCATACTGTTACCTCCCCGTTTAATAATT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ACTATTTTTCTTAATAATGTTCTTAATCCCTTTTTAG GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TCAACCTACCATTTACAGCATGGTTACTGTATGTATTA GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CAGTGCTTACTCATAGCAGAGTAGGCACAATAAAGG GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC GCAAAAACGAAAACAATGCCATCGTATCATGGAAGCC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ATAAGGTAAAGTTGGGACTTTTTACAGTCCCATTTTAT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TCCGGTATATCATCCAGGTTCATGGAGGTTTGCTG GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC >NZ_CP019698|4|4|950478-951306|CRISPRCasFinder GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ATTGCTGGCAGTAATTCTTTAGGAACCGTCACGGC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CCCCAATCCATACTGTTACCTCCCCGTTTAATAATT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ACTATTTTTCTTAATAATGTTCTTAATCCCTTTTTAG GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TCAACCTACCATTTACAGCATGGTTACTGTATGTATTA GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CAGTGCTTACTCATAGCAGAGTAGGCACAATAAAGG GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC GCAAAAACGAAAACAATGCCATCGTATCATGGAAGCC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ATAAGGTAAAGTTGGGACTTTTTACAGTCCCATTTTAT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TCCGGTATATCATCCAGGTTCATGGAGGTTTGCTG GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC GGATTTATTGCAGGACTTAAAAAGGCCATAAGAATTT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TTTTTCCTTCCCCCTCGTAATCCTTTGGAGTATGG GTTACTAGACTACCTATAAGGAATTGAAAC GAAGATGCCACACTGGATATCAGGTGTCACGGTTTGACTC GTTACTAGACTACCTAGATTGAAACGAAAA AGCCGCTTAACTAATGCCTATATCAAATCAATAGC GTAATTAGCCTACCTATAGGGGTTTGAAAC >NZ_CP019698|4|4|950478-951241|CRT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ATTGCTGGCAGTAATTCTTTAGGAACCGTCACGGC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CCCCAATCCATACTGTTACCTCCCCGTTTAATAATT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ACTATTTTTCTTAATAATGTTCTTAATCCCTTTTTAG GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TCAACCTACCATTTACAGCATGGTTACTGTATGTATTA GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC CAGTGCTTACTCATAGCAGAGTAGGCACAATAAAGG GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC GCAAAAACGAAAACAATGCCATCGTATCATGGAAGCC GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC ATAAGGTAAAGTTGGGACTTTTTACAGTCCCATTTTAT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TCCGGTATATCATCCAGGTTCATGGAGGTTTGCTG GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC GGATTTATTGCAGGACTTAAAAAGGCCATAAGAATTT GTTACTAGACTACCTATGAGGGATTGAAAC TTTTTCCTTCCCCCTCGTAATCCTTTGGAGTATGG GTTACTAGACTACCTATAAGGAATTGAAAC GAAGATGCCACACTGGATATCAGGTGTCACGGTTTGACTC GTTACTAGACTACCTAGATTGAAACGAAAA
>NZ_CP019698.1|WP_077713422.1|948522_950070_+|IS66-family-transposase METANNWTEIIAEKDARIAELEMLVKFYEEQFRLSKHRQFGPSSEKGTLPGQLGLFDEVEKEADLQKNEPELEEITYARRKRIGKRKDDLSVLPVETVEHTLPEEERVCPECGGMLHEMGHDTRRELVIIPPQVKVVEHRRAVLSCRNCEKNGDHVPIVKAEMPKPLISGSLASPSAVAHIITQKYVQHIPLYRQEQDWKRQGVRLSRQTMANWVIRCSEDWLLPIYERMKAILLTQDVLHADESTVQVLREPGKTAVSNSYMWLYRTSGDTKRQIVLFEYQPSRSSTHPRQFLKGFRGFLHTDGYAAYHTLPGVTVVGCWVHMRRKFEDALKAIPNCERAVSSANDAVRRIGLLFHLEEQWESLTPEERYKLRLEKSKPLAEAFFGWLQTLTVLPKTAMGKAVHYALEQREWLMNVYLDGRTELSNNRAENAVRPFALGRKNWLFCNAVKGAISSSVVYSIIETAKANGLLPFEYMKFLLETVPSTSIGELDALLPWGEAIPEKCRMPFTKENA >NZ_CP019698.1|WP_077713377.1|948113_948467_+|IS66-family-insertion-sequence-element-accessory-protein-TnpB MLSLAGKRVFLACGHTDMRKSINGLAAIVEGSFKLDPCDGALFVFCNRSRDRIKILEWDGDGFWLHFKRLEKGHFRWPTSGEEQTLVLTGEELSILLGGTRVALKLRRKELLGKRIT >NZ_CP019698.1|WP_077713376.1|947727_948120_+|hypothetical-protein MNTREIAAEYRLAHWAQIVRRKNESGLSIKAFCANEGFRENTYYYWQRKLREAACEQLTEIRTEHAKLPCLVPPGFAELKITDAPEKFPVHNDAKQSEIRIELGGMRIAADSAYPVEKIAALLGLFKQLC >NZ_CP019698.1|WP_077713421.1|946144_947122_+|D-alanyl-D-alanine-carboxypeptidase MVRKIKKKKSGIREFVIFLLIVVVFAFVFKFIITPGNQHEFEKEYVDKTTPIPSSDIEPDSSVSISLDKLNSTNAILIRLEDQTILMQKSSEEKIYPASLTKMMTAIVAIENLTNLQKEIQLTHYTFNGLYSSNASMAGFQPGEKVRAIDLLYGVMLRSGAEACIGLADHIAGSEQNFVTMMNQKAADLGMYNTHFENTTGLHNENHYTTVKDLAVLLSYALQNDTFREIFTSSRHSTQPTNKHPGGITFNNTMFEKLNNQNIIDGEILGGKTGYTDEAGLCLASLAKVDHKEYILITAGAKGDIYSEQYNITDALVVYNRIGKQ >NZ_CP019698.1|WP_077713420.1|944919_946053_+|vancomycin-resistance-histidine-kinase-VanS MKSDRDKRNNDYTKLKRKVFFRVLLIVFATIATVIFLRDVIQDNFNIGESIVEFLKNKFYLSESDAVIIYRYIFLYNKELITLIVIIILLIILLRFSISWFTKYFDEIGSGMDKLVEESNDEITLSPELDFMENKLNQIKNNLEKQKKAALDAEQRKNDLVVYLAHDIKTPLTSVIGYLNLLDEAPDMPPEQKSKYVGITLEKAYRLEELINEFFEITRFNLQTIVLNKEKINLLFMLQQMADEFYPMLAPQGKQISVNVPDGLTLWGDADKLARVFNNILKNAIAYSDENSVIDISAWQQDENIVIAFMNQGNPIPQTKIDTIFEKFYRLDAARSSNTGGAGLGLAIAKEIVTAHDGTISVESNPENTTFTVKLPS >NZ_CP019698.1|WP_077713419.1|944231_944930_+|VanR-ABDEGLN-family-response-regulator-transcription-factor MSINILVVDDEQAIADLIEVYLKNEGFTVYKFYNGQDAFRCVESKQLDLAILDVMLPDIDGFTICRKIREKHNFPIIMLTAKEEEIDKITGLTLGADDYITKPFRPLELVARVKAQLRRFTKYNSPEQKQEERLIAFSGLVLDMDARECTLNEKKLSLTPTEFSILWVLCSNRGRVVSSEELFREVWGDKYFSNSNNTVMVHIRHLREKMGDSAENPKYIKTVWGVGYKIEK >NZ_CP019698.1|WP_077713418.1|943970_944213_+|single-stranded-DNA-binding-protein MSDVNELLEEAIKETENLNEGEVFLVKDLFKGYVWNRIPRKYRLLLGTLFLNYVNKMEGNIKAIEKTSSNQQRYKKTIGK >NZ_CP019698.1|WP_077713417.1|942185_943775_+|IS66-family-transposase MNKINLAGLPPEIIAYITKLESQVQEQSTKIENQKVRIDNLMTMLANFQKTLYGQSSEKSRYVLGTDSNQLALFNEAEVEANRNALEPQKVTVSGHTRKAKRTKEELAAELPVVEILCELNEEEQICEECGGKLRKLGREIVREELEIIPAQVRVLRYIRQNYVCEDCEKDTGFATIVKAPTPKPVIKRSLASASTVAHVIYQKYVNGMPLNRQEKDWACQGVTLSRATLANWVIRAATDWLRPLWETMKAYLLKQAVISADETVIQVLKEEGKSPTSESRMWVYCSGNTGNPPVVLYEYQPTRSGEHARRFLEGFRGMLQTDGYAGYNKVAYVTRCGCWAHLRRKYEEAMPKKGAIEGSAAAIGFQYCNRLFDIEAELENLTADERKKQRQEQSRPVLEAYWAWVETVKPLGGSKLGEAITYSINQKEALCEFLNDGRIEISNNRAEQKIKPFVTGRKAWLFADTKKGAQSSAIAYSIVESAKANKINPYMYLVHIFQTMPGLDFKNDSTVLERLMPWSPELPDYCRL >NZ_CP019698.1|WP_077713416.1|941723_942086_+|IS66-family-insertion-sequence-element-accessory-protein-TnpB MLKDISSYDGIYLACGVTDLRHSVDGLAIIVKQQFRMDVFGNYLFLFCNRRRNRLKGLSWDKNGFVLYYKRLDGDGARFKWPNDPQDVRNISLEQLKLLMNGLSIDPPKGFGEVKSRDFY >NZ_CP019698.1|WP_077713415.1|941415_941730_+|hypothetical-protein MTNSDKRALVEECRKSAMTAKEWCASKGINYSTYMQWASRINKEDRNATSKPMQWADITSVANKIPKKETAEVKLICGKWTISVEPGFSPDLLAKVLKVVDTVC >NZ_CP019698.1|WP_077713373.1|951517_952225_-|RNA-polymerase-sporulation-sigma-factor-SigK MLSGLCTAAFLSVVHGVMALVSYIANNTFPQPLNEKEESHYLGMLAKGDEDARNVLTERNLRLVAHIVKKFDSTGEDVDDLISIGTIGLIKAINTFKPDKGTRLATYAARCIENEILMHLRFIKKVKAEVSLYDPIGVDKEGNEISLIDILGTDPEVVADTVEITFEKNRLLEKVRKLSNREKKVLEMRFGLGNSSRKTQREIARALGISRSYVSRIEKRALNKLVKELCMEGCQ >NZ_CP019698.1|WP_077713423.1|952710_953211_+|YqeG-family-HAD-IIIA-type-phosphatase MLSKLYPRRYVTNLFQIDLAELKRLGIKAILFDIDNTLIPWDRQHLDPAIETWFRKIQEQGFKVCFVSNNNEERVATLSNILQVPGVHKARKPFRTGLRKALSIVGAEAHETAMVGDQVFTDVLAGNRLGLYTILVTPLAGKEFLGTRINRQLEKLILQRIKRRHL >NZ_CP019698.1|WP_077713424.1|953311_954220_+|shikimate-dehydrogenase MGFPNLDGKTRVCGLFGFPVEHSFSPAMHNAAFQNRGLNWAYLPFAVQPEHLAKAVQGITALNLAGVNITVPHKQRVIPLLDEIDQAAAQIGAVNTIVNNQGKLVGYNTDGAGFIKSLAEEANFEPRGKRVLLLGAGGAARAVAFSLAMAGCQAIYITNRTTETAKALARELSQKCGVAAEVLPWGLELPAAAVARVDLVVQTTSLGMWPNTQACPEFPFGALHPGQLVCDLIYTPRQTAFLQQASARGATILNGLGMLLYQGVLAFELWTGHTAPVEVMKEILERQLNDSKLVERCENRKL >NZ_CP019698.1|WP_077713425.1|954250_955414_+|chorismate-synthase MLRFLTAGESHGPVLTAIVEGMVSGLPISASYVNEQLARRQGGYGRGGRMKIEKDQVQFLSGVRGGFTTGSPITLQISNRDWANWSEIMASGGEAKLTERVVTRPRPGHADLAGAIKYNQRDIRNILERASARETAARVAVGTLGRRLLEEMGITIVGFVRRIGSVEAALKDNWQANELKEKANNSQLLCPDASAEAAMMKEIDRAREQGDSLGGVFEIHAYGVPIGLGSHVHWDRKLDSRLAGALMGIQAIKGVEIGLGFTAAALPGSQVHDEIFYSPDLGFYRRTNGAGGIEGGISNGEPIVVRAAMKPIPTLYKPLLSVDINSKEAFAASVERSDVCAVPAACVVGEAVVSWELAAVMLEKFGGDSLEEIKERVKQWQLRIRQV >NZ_CP019698.1|WP_077713426.1|955415_955964_+|shikimate-kinase MKNIVLIGFMGTGKSTVGRRLARRLNYNFIDTDQAIEEITGLTVLQIFAKHGPKRFRGEEALLTSKLVNKEKLVIATGGGLVLNPENVRKLQQNSVLICLEASPEIICRRVRNKRTRPLLAKGNLQENVQNLLKERQGAYDMAEFTINTDEISPDEIVDRIMHFLGERGYCGANSNCGVSQT >NZ_CP019698.1|WP_077713427.1|955929_957018_+|3-dehydroquinate-synthase MRTVIVALAKRSYPINIGSGILQELPEQLAPLSLGQKVLVVTDSQVGPLYGPRVKELLAGAGFSVAMVQIPAGETSKTLEQAAQLYDAAFSFGLDRKCAMIALGGGVVGDITGFVAATYMRGVPFIQVPTTLLAQVDSSVGGKVAVNHPQGKNIIGAFYQPKLVQIDVATLETLNIRELRAGLAEVIKYGVIWDGEFFSWLERNHTKLINLDPEALAYAIETCCQIKAAVVEQDETEQGKRALLNYGHTLGHALEALSGYGTYLHGEAVAVGMVAAARLAVQQGLLSRNDYQRIYTLLDNLQLPTEIPTDIKPEAIIELMFSDKKVYDGKLTLILPTGIGKAKICTDFPETQLDGLFNNGVS >NZ_CP019698.1|WP_169843638.1|957058_958711_+|type-II/IV-secretion-system-protein MLIEKNIITEEQLKEALQIQRNTGERLGRILINLGYATERDITNMLEAQLGIPQVAPGYWLNHELMELIPEHIVRRYKAIPVAKDDHILTVALADPLNLVAIDDLRLITGLEIDTVLASERDIEYALQKFYGMPDLERELQDFEIVENQALQLEQPDDMMDEAPIVKLVNSIIMQAINEKASDIHVEPFDNGVRVRYRIDGILREGMVLPKRSRASLASRFKILSQLNIAEKRVPQDGRIKIKYGERELDLRISTMPTVFGEKVVIRVLDKANQITGIEQLGFSAENKLKFQKLLNAPYGMLLITGPTGSGKTTTLYTALTHINDIEKNIITIEDPVEYLLEGINQTQINPKAGLSFASGLRAMLRQDPDIIMIGEIRDKETAEIAIRAANTGHLVLSTLHTNDASGALTRLLDMGIEPFLVSSSVLGVVAQRLTRRTCQHCLQEYTPAPDSPERIFMGVGPNEPVRLFKGKGCQVCGNTGYRGRMAIQEVLTVTSEIRKLVNEKASSDEIKRQALQQGMVTLKEDGIAKALKGLTTLAEVMRAAYSEED >NZ_CP019698.1|WP_077713429.1|958722_959826_+|type-IV-pilus-twitching-motility-protein-PilT MDIDGLLRLACQVGASDVHLTVDSVAVFRISGQLLPVDDPWFVSNGYLVPSDLQVKLTHEQTDAIVKQIMPPKNLQKFTDTGESDFSYSIAGISRFRVNAYKQRGSSSLAIRLVSQHIPSYKDLGLPDVVVQLAKRPRGLILVTGPTGSGKSTTLAAMIDILNREERLHIITLEDPIEFLHRHQKCIINQREIGQDTENFTTALRSAMREDPDVILVGEMRDTETIAAAITAAETGHLVMATLHTASAAQTIDRIIDVFPPYQQQQIRVQLANTIQGVICQQLIPRLDMKSRVVACEIMVATPAIRNLIREGKTYQIDSQIQTGSKYGMQTMDWSLKSLYQGGQISLEQALAYSVDTETMKRMLKYS >NZ_CP019698.1|WP_077713430.1|959983_961216_+|type-II-secretion-system-F-family-protein MPQYAYRARDNAGQLQTGFLEAPQESSVVAHLRERNLYIVEIKPAPEKRRELNIAAVLFGPQKVKIKDLAVFCRQFATIIEAGIPILQALHILTKQAENKKLKKVLAGVVEQLEGGRTLAESLKRYQHVFPNIFISMVEAGELGGVLDQALSRLADHFEKEHDIREKVKSAMTYPVIIVCLALAAVAALLTLVLPKFITMLTDLNVELPLSTKIVMSLSNFLRDSWYLGLLGIMLTILVFRGFSRTPKGMLFFDSLKLKLPVFGKLTQKVIISRCCRTLSTLLHAGVPILVALEVVKKTAGNQLVSNAIAKAEESVREGLTIADPLERSGVFPPMVTRMMAIGENAGTLDYLLERVAVFYDREVNNMVLRLSSMLEPFLIITMGLVIGFIVISMLLPMLKIFSSAGMTGL >NZ_CP019698.1|WP_077715514.1|961836_962571_+|prepilin-peptidase MVVPFLYGLMLGSFLNVCIHRLPKGNSIVSPPSTCPQCKNRLLLRDLIPVISFLILGGRCRFCQASISLRYPLIELLTGVLFALTAYKLGYSLVTIQALILVSALIVVAFVDMDHYIIPGNVLIFLLIAWLVFLPFLPVDYLNSLAGLSTAGGLLLLIALVSRGGMGMGDIKLAAVLGLYLGWPNALLAMFIACLLAGTCGMFLILFKIKSRKDIIPFAPFIALASFITLLWGDRILSWYIGLL |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NZ_CP019698_5 | 1470161-1471586 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019698_5
|
21 spacers
spacers of NZ_CP019698_5
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019698_5
The CRISPR arrays of NZ_CP019698_5 >merge|NZ_CP019698|5|1470161-1471586|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT 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>NZ_CP019698.1|WP_077713931.1|1468931_1469489_+|hypothetical-protein MQKYFGMAFLSIIPLMILAHSLPSQPNYQNYICATILLLPILFFFHFNFILFPEAVKKSDSLFIVVKIIYSSLEETILDKELKSTVKTKINNSLLTLGATMDERRKYLTNPQMFRPTKIIALDNAWRNFFIEAFSIIEKDLKDETLATWTFNKIQHKMNDHVQGQRIRNILKEMLGDSRYSFICK >NZ_CP019698.1|WP_169843643.1|1468404_1468680_-|hypothetical-protein MGLQHQESIRFTTLDEFAQYLENLGKGQLDFTAYPIAGEPESFHYDGVEQIVTRQPDGKTFDNVEDFLRYAFQCDPEGYANTEYVDVKVQS >NZ_CP019698.1|WP_077713929.1|1467653_1468391_+|tRNA-pseudouridine(38-40)-synthase-TruA MRNLKLTIQYDGTRYKGWQRLGNTENTLQGKIEQVLSRMTGETIEIIGSGRTDMGVHAQGQVANFKTSCTKSVDEIQQYLYQYLPEDIVVSQIEEVDERFHARYHAVAKEYVYKIWNAPYHNPFLRKYVVHIPQPLNLEAMQRAVPYLLGEHDYSAFVSSRSKKKSNVRELYSIDITKQDSLIELTFRGNGFLHNMVRIITGTLLEVGHGRMKPAYLKEILERRDRTLAGPTAPAKGLHLVKVYY >NZ_CP019698.1|WP_077715552.1|1467249_1467576_-|DUF1904-domain-containing-protein MPQLILRGVDPQKILAISSEMLDDLQKIIGCPRGDLTLECLSSTFIADGQISPGYPFVEIAWFDRGQEMQDQVALAVTQALQRAGYESVDIMFTPLAKTRYYENGQHY 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MRYEAKTKAQLISKIKELGLAYDKLQQLFQMIPIGLVVTDNTGNITMTNNFAECIFDKYQQPKKLLDILQREKNQRKVEVAIPSGNKELITAVISSPISAEEQSSMGKIIIIQDITKQKMLEKERDQLIEELSNKNRILEKQRQSLEVLVKERTKKLTEANNQLNSLLESIQDCFFTLDKEFRFTYVNNQLQKRYPQEELLGKYLWEVFPEVKDSGFYHQLLAGTEQAVQDFDVYSNKNYWQFRFYPHDDGVAVLAKDITDKVKYEKEMSRLAGLDLIGQMAASISHEVRNPMTTVRGFLQMLSEKEECLAYCNYFTLMIEELDRANAIITEYLSLGRNEPSELTKQDLNTIVRALIPLIQADALGQDKYLETDLQDLPELLLNSKEIRQIILNLCRNGLEAMPRGKCLKIKTYREDDFAILAIQDQGTGIKPEVLKKLGSPFFTTKPQGNGLGLTICYNIAERHQAKIEVTTGNTGTTFRVKFKVN >NZ_CP019698.1|WP_077713936.1|1478326_1479217_+|1,4-dihydroxy-2-naphthoate-octaprenyltransferase MIKTWFLALRPWSFTAAVVPVTLGSVLAWHHGYGDFSLFVLTLIGGILLQAGTNLINTYGDYIAGVDTPESALTCPQLVKNQLKPHQMKMAGIGAFLGAALFGSYLVYLRGWPILLLGSIGIIFGYTYTLGPKPYKYAGLGSIMVFFLMGPLMVSGAYYVQTGFFDWLAFWVSLPIGFLVAGILHANDLRDVNFDYRAGIKTLALILGWDKGFLLHYLLNIGAFLSLLILLGTNKLPFTAILPLLLIPQLVSIIKKTRASWQGNQECLIMLEANAAKLHMQFGLLFIGGFLLEFIF >NZ_CP019698.1|WP_149026739.1|1479336_1479855_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MGVAATTLAILAIIWGGFPYHREQLNLRCIVIGVGSALLLYLIFFVGNYLSQLMFNFAQPQISSIYQIRSQAEAIVITLVLLFITSPGEEIFWRNFLQRWSMQRFGGFIGWLMAAGIYAGVHIASGNFMLTMAALTAGLFWGYIYWKERNTLMVTISHAIWTTSIFVFYPLM >NZ_CP019698.1|WP_077713938.1|1480014_1481688_+|ribonuclease-J MKKELFIEVIPLGGLGEIGKNMTAVKYQDEIILIDCGMAFPEDELMGIDLVLPDYTYLLDNRDKVLAVLLTHGHEDHIGGLPYFLKQINVPVYGSRLALGLVGHKLKEHHMEKDAQLKTVKPRDIVSIGSFKVEFIRVSHSIPDAMALAIHTPQGVVVHTGDFKIDHTPVDGDVIDLHRFASLGEQGVLLLMSDSTNVEREGYTFSERLVGKSFEEYFAAAEERIIIASFASNIHRLQQVIYAAEKYGRQLAVAGRSMVTVLTVASELGYLKIPEGMLIDLDEVDKLPNNKVVILTTGSQGEPMSALTRMAFGDHRQLAVMPGDTVIISATPIPGNEKSVSRNINQLFKMGAKVIYEGNSDIHVSGHPSQEELKLIINLLRPQYFLPVHGEYRMLKKHAELAQQLGIPAENTFVGEIGQVFAFNRRHGRMVGRVPAGRVLVDGLGVGDVGNIVLRDRRDMAQDGILIVVVTMDKNTHQVLAGPDIVSRGFVYVREAEALMGEARQKVIAALQKCSDQGKSGWSYIKQEIKSALGKFLFDHTHRRPIILPIIMEVDKS >NZ_CP019698.1|WP_077713939.1|1482021_1482423_+|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MYPLIQADALNSNINLSLKVNTVPDIFLNKREIRQLILNLVKNGMEAMPKGGTVLIKTFTTEEQVVLAICDEGPGIDNAILDKLGTPFFTTKENGTGLGLATCYNIAERNNAKIDVETGPSGTTFYVKFNKLN >NZ_CP019698.1|WP_077713940.1|1482568_1483225_+|trimeric-intracellular-cation-channel-family-protein MEWDILNIIAIVAFAFSGAIVALEEKYDIFGVYVLGLAASFGGGIIRNVLIGVPVIPLWEQGFLLKTALFAITIIYLLPKRWLKSWNRWNDFFDAIGLGAFTIQGALYGIALQLPPGGIILCSVATGAGGGLLRDILARRRPMILHQGIYALWALLAGLLLGFGFIQSNNPVQLYLLFLVIILLRIFSIIYQWHLRIRNLENTTSLPIVQDSIKKAEY >NZ_CP019698.1|WP_077713941.1|1483393_1484494_+|FIST-C-terminal-domain-containing-protein MISKAAFCKPSGLESWRNFLNGLQEESTHGIFLMVAENTFFDYTILQPLFKEYKTLIFGGIFPGVIFEDDYYIEGVIGCSIGQPIHLEAIQSLEQFVPSNDTQGSMLILVDGRTYHIANFLYKIFETSGNGRGFIGGGAGSLHNQQQPVLFSQEGWLEQGAIIVRTTSFIGVGVGHGWQPMFGPLVVNSSEGNEIKEINWQKAFPYYQQLLWEKEKVRVEQANFFAVAKNYPFGMVKMDGSIIVRDPIRVEENGSIILVGEMPQNSIIMLLHGDKKHLISAAGEAVEQALTRYFELTNNKGKYVLMVDCISRALFLGEDFQKELRLIRQRIPKGIPLIGFLSFGEIGSNGDKYLEFYNKTTVVGVL |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP019698_6 | 2947469-2948376 | Unclear |
I-A,I-B,II-B
Consensus repeat of NZ_CP019698_6
|
12 spacers
spacers of NZ_CP019698_6
>6.1|2947505|38|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCGGCTTTATCCCCATTGCTCTGTTTACTCTTATCTTC >6.2|2947579|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGGCGAAGATTATCTTATCAATCGCCGTATTTTCAT >6.3|2947652|38|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATTTCAACCTGCTTAACAGGTTTTTTGATTTTGCTTT >6.4|2947726|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGCTCCTCTGGGATTAGTTCAATAGATTTATATC >6.5|2947798|34|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTATACTGTTCGTCAGTTTGCGGCACCAGTCG >6.6|2947868|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTGTAATAGCACGTTTTTGGAAGCGACAAGTAAAGAA >6.7|2947941|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTATGTATCCGCTAATAGCATTTGATCTTTGTTTGC >6.8|2948014|38|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTTATATCTTCAGCACTTACTCCTATACAAACTCCTG >6.9|2948088|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCATTTAATTTACCTCCTGTTTGCCTTGACATTTATA >6.10|2948161|35|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAGTATTAGTGTTTAAGAATTTAATACTATCTGT >6.11|2948232|35|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCCCCAGGAGTGTTGCTAAAGGTTTCATACTCCA >6.12|2948303|38|NZ_CP019698|CRT ATTCCATGGCGATAAGCAGTGTTCTTGTGGTAATCCCG |
cas2,cas1,cas5,cas7,cas8b3,cas3,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019698_6
The CRISPR arrays of NZ_CP019698_6 >merge|NZ_CP019698|6|2947469-2948376|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAGCCGGCTTTATCCCCATTGCTCTGTTTACTCTTATCTTCCTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAGCTGGCGAAGATTATCTTATCAATCGCCGTATTTTCATCTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAGTATTTCAACCTGCTTAACAGGTTTTTTGATTTTGCTTTCTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAGTTTGCTCCTCTGGGATTAGTTCAATAGATTTATATCCTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAGTTTTATACTGTTCGTCAGTTTGCGGCACCAGTCGCTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAGGTGTAATAGCACGTTTTTGGAAGCGACAAGTAAAGAACTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAGGTTATGTATCCGCTAATAGCATTTGATCTTTGTTTGCCTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAGAGTTATATCTTCAGCACTTACTCCTATACAAACTCCTGCTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAGTCATTTAATTTACCTCCTGTTTGCCTTGACATTTATACTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAGATAGTATTAGTGTTTAAGAATTTAATACTATCTGTCTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAGTGCCCCAGGAGTGTTGCTAAAGGTTTCATACTCCACTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAGATTCCATGGCGATAAGCAGTGTTCTTGTGGTAATCCCGCTGCTCAACGCCTTTCGGTGTAGATTCTCAAATTAA >NZ_CP019698|6|6|2947469-2948302|PILER-CR CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG CCGGCTTTATCCCCATTGCTCTGTTTACTCTTATCTTC CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG CTGGCGAAGATTATCTTATCAATCGCCGTATTTTCAT CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TATTTCAACCTGCTTAACAGGTTTTTTGATTTTGCTTT CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TTTGCTCCTCTGGGATTAGTTCAATAGATTTATATC CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TTTTATACTGTTCGTCAGTTTGCGGCACCAGTCG CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG GTGTAATAGCACGTTTTTGGAAGCGACAAGTAAAGAA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG GTTATGTATCCGCTAATAGCATTTGATCTTTGTTTGC CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG AGTTATATCTTCAGCACTTACTCCTATACAAACTCCTG CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TCATTTAATTTACCTCCTGTTTGCCTTGACATTTATA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG ATAGTATTAGTGTTTAAGAATTTAATACTATCTGT CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TGCCCCAGGAGTGTTGCTAAAGGTTTCATACTCCA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG >NZ_CP019698|6|6|2947469-2948303|CRISPRCasFinder CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG CCGGCTTTATCCCCATTGCTCTGTTTACTCTTATCTTC CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG CTGGCGAAGATTATCTTATCAATCGCCGTATTTTCAT CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TATTTCAACCTGCTTAACAGGTTTTTTGATTTTGCTTT CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TTTGCTCCTCTGGGATTAGTTCAATAGATTTATATC CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TTTTATACTGTTCGTCAGTTTGCGGCACCAGTCG CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG GTGTAATAGCACGTTTTTGGAAGCGACAAGTAAAGAA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG GTTATGTATCCGCTAATAGCATTTGATCTTTGTTTGC CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG AGTTATATCTTCAGCACTTACTCCTATACAAACTCCTG CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TCATTTAATTTACCTCCTGTTTGCCTTGACATTTATA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG ATAGTATTAGTGTTTAAGAATTTAATACTATCTGT CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TGCCCCAGGAGTGTTGCTAAAGGTTTCATACTCCA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAGA >NZ_CP019698|6|6|2947469-2948376|CRT CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG CCGGCTTTATCCCCATTGCTCTGTTTACTCTTATCTTC CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG CTGGCGAAGATTATCTTATCAATCGCCGTATTTTCAT CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TATTTCAACCTGCTTAACAGGTTTTTTGATTTTGCTTT CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TTTGCTCCTCTGGGATTAGTTCAATAGATTTATATC CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TTTTATACTGTTCGTCAGTTTGCGGCACCAGTCG CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG GTGTAATAGCACGTTTTTGGAAGCGACAAGTAAAGAA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG GTTATGTATCCGCTAATAGCATTTGATCTTTGTTTGC CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG AGTTATATCTTCAGCACTTACTCCTATACAAACTCCTG CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TCATTTAATTTACCTCCTGTTTGCCTTGACATTTATA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG ATAGTATTAGTGTTTAAGAATTTAATACTATCTGT CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TGCCCCAGGAGTGTTGCTAAAGGTTTCATACTCCA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG ATTCCATGGCGATAAGCAGTGTTCTTGTGGTAATCCCG CTGCTCAACGCCTTTCGGTGTAGATTCTCAAATTAA
>NZ_CP019698.1|WP_077715217.1|2946133_2947198_-|DUF2157-domain-containing-protein MKGVDKLRYVSKQQYVFLRAELAYSRDQGILSQDQVERTLALYAIKPGLSFVRVMLVIGAVLVGLGILSFIAANWDELTKLVKYLIIVGMFISFMVVSYKMSEKYPKTSRSFLYLALITYGAGIFLIGQMFNFGGHFTQAFILWAIGVFPAAVLCKDKLVFLFAQLLLLIYIIGSLETTGFAYGILLIPAGYYFARSNPSDYLTFFNNLLVIAAVIYLGEFFRVEPVLTTLLLFVIGNAAFYKLQQIYKVQGTLLFCITGFILTFPGIWHIGKLSPLSTEISIAFSIGYILYLLWLVKREYFIPLVFVCATIFRYYVDLTYNFMPKSFVFISGGVLLLLLGYYIERSRRKVVRS >NZ_CP019698.1|WP_077715216.1|2945576_2946137_-|GDYXXLXY-domain-containing-protein MRKYLIIALLPLLILVGLTAKPVLTYTLGEEIILKTQPVDPYDLFRGRHMVISYEISTVDISKMPQDFTQVQGDLAPVEKDDLYMKWGENYRGKKLYAVLKKDGPYHTVERLVTEPPAGLYLPCTFQYVDKDADGQYRVRLNYNLDKYFIPEDSSSELEDAAREGLVLAKVKVYHGYPLLVDLSKH >NZ_CP019698.1|WP_077715215.1|2945122_2945470_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTNNINLSSDRIIEAQLLLLLQIKPSHGYELIQRLNDSDFTLGEVDPATVYRHLRRMDKEDLVKSHWETGPSGPGRRLYTITNNGEVLLAQWTASIRQQREKLENFIKTYEQYNL >NZ_CP019698.1|WP_077715214.1|2944277_2945102_-|extracellular-solute-binding-protein MANKDCSLKIINAGALHRVIGDCRELFLAKNPGITLEMKGVGSREGAKRLLSGEKYDIVALADQALFAELLVPELVENYFVFATDQIVIGYHRFSQGNQEINQDNWADILLQPGVKFARSDHNLDPCGYRSLMVWQLAEKFYQRPGLANQLEKACIPHTTYPKSLDLAGALMAGEVDYAFLYSSEAKQLGFPYLSLPSKINLSNPAYADYYDQAFLSVESKIPGKNIIIHGKPIEFAVGIVKTTQHPELAQAFIDLLTGPEGHTILEENGMVPC >NZ_CP019698.1|WP_077715213.1|2943095_2944256_-|putative-sulfate/molybdate-transporter MSQPPGTATQTKPLKNRYDKTEWAGAFGDLGTLIPFIVGYITVMKMDPLGVLFMFGILLIIAGSYYKTPIPIQPMKAIGGAAITQAAVITPGMVWGSGIFTGLFWLIIGATGALNWISKITTKPVIRGIVLGLGLSFIMEGTRMMKTDFLVAAIAIVITFMLLTNKRIPAMFALLIFGVIVALVKNPGLIQELAGIKFDFRLPQFALGELTWTDFVKGSLILAIPQIPLTLGNAVIAVTAENNRLFPERPVTEKKIAMSQGILNLISPIFGGIPMCHGAGGMAGHVRFGARTGGATVILGCILLVIALCFSSSVLLIFKIFPTSVLGVILFFAGLELAVSARDVGKEKSDYYTLLVTAGFAIWNMGIGFLAGLIMQECLKRKIFKV >NZ_CP019698.1|WP_077715674.1|2942475_2942724_+|spore-coat-protein-CotJB MTQLLLKIQQLEFAACELNLFLDTHPEDQQALAMFNKVHQELMQCVRNYEQLYGPLLNFGFSPALQNTWKWAELPWPWEIKY >NZ_CP019698.1|WP_077715211.1|2942134_2942428_+|spore-coat-associated-protein-CotJA MFRDDKKVAQATAQAAPMMGPLGGLGGMPYAGHPGISPYQPLPGMQPQGFPESSCPGMELARAYICIQRFGPVYDFAKALEVGTLFPELFRPYRPNK >NZ_CP019698.1|WP_159438670.1|2941944_2942082_-|hypothetical-protein MLNLLNVFHIFVNYATAAQNDVGKKDVGKKDTHGSLKRAVGVSTL >NZ_CP019698.1|WP_077715209.1|2941130_2941934_+|MFS-transporter MACAFFVSGLGFITFFLGLKYLKESPRWLVAKGRVAEAEQVIKDLTGEDIDLSDAAKNVPPKVNAWEQFIGMFSGKYLKRTSILLLFGIPAVIGSFVLSVWIPTLAGMRGFSMEQSLNIGVAFMAGAPVGMYLFSFFSDKGGRKIPLAIAILLTAVTALVYAFIGNNYILTLVVAFFLNAFVMGYGFIHMAYVPEHYPTKMRNTAVGTINAVQRLGVSFSQPFIPVVVAAYGVNGLFLGVFAIFAFAATVVFLLGQRTGGIPLEQIE >NZ_CP019698.1|WP_077715208.1|2939168_2941034_+|aryl-sulfate-sulfotransferase MTAKFKEFPHIITKQHQAEEAFLAEYRAKEHSFANPYVKLNPYLIAPLTALIMFTTPEPAKVTVTVKGKESAGDISFQFAAATEHMIPVYGLYADYDNTVELTLGSGEKTVVKIKTEPTPETVKLPTKIETSAEYFQDNIMFVSPATPAAVAGYDYQGEVRWYTTLNLSWDIKRVRNGRLLIATERLAAPPYHTSGIYEMGMIGKIYKEFRLPGGTHHDYIELEDGNLIILTNDLSRGTVEDMCVLVDRNTGEVLKVWDYQKVLPQDVGGSGSQDSHDWFHNNAVWYDKKTNSLTLSGRHQDVIINIDYETGDLNWVIGDPEGWPQEMVDKYFFKPVGEGDFDWPYEQHACIILPNGDVMAFDNGHWRAKVKEKYVPAKDNFSRGVRYRIDTDKMEIEQVWQYGKERGAEFFSTYISNVEYYGEGHYLVHSGGIGTKYGEPMDLPPSMFMGEDAEGIEMNSITVEIQDDVVKYEMHLPANFYRAEKLKLYSAEDILTLGKGELLGSFGVTEEFLTIPPATEAGLVPESYNVKIGLEEDRIILKASFEKGQMVLLQLEGESTHSYFIPTTKRPYMAMCVGTFLESDDRAVEFPISREGLAGEFKVSLIIDENKYDTGVNLLL >NZ_CP019698.1|WP_077715218.1|2950169_2950463_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MSSRKMYYLICYDIREPKRWRKCYKLLKGFGERVQYSVFKCYLTDRKLAELRWELTKILSNEDSLLIAPIQQADVNRIIYLNMNIDWQLEKERFRTV >NZ_CP019698.1|WP_077715219.1|2950464_2952108_-|type-I-MYXAN-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MVSGLNDEPLIRVMALHAIEYCERLFYLEEVEEIRVADTAIYDGRRFHEQLPEYVTLEQFVLQNEELGIRGKIDCLRTQQGMLVPYEYKKGHARILPNGDVLAWPSDQVQIAAYSLLLEKHLNRPIMEGRVFYAADHRTVSISIDEKMRNQVMSAIARAKELRASTERPPITANERLCARCSLAPVCLPEEERLVEQVGRDTVRLFPEDRDLLDIHVTSPGSKVRRAGNTLLIEDKDGQKRSFPIEEVGSITLHGNAQITTQTIHLCANKGINIHWVTGGGHYIGSVSNSAGGVQRRLRQYRALIDPELKLRLAKALVIAKVESQLRYILRLTRGSEVRKELESYINTIRDVLSSTNTANSLDELRGYEGSAAKDYFACFSRLTVDDAKNGMAFIHRNRRPPRDPANALLSFLYSLLYRDCVQAIVTVGLDPTIGFYHQPRSQAYPLALDLMELFRVTLCDMTVLGTIHRNQWKVEEDFIQAGDQVWLSDTGRKKAIAAYENRKQDKWKHPVIGYSLTYARALELEVRLLEKEWTGKPGLFAMNRIR >NZ_CP019698.1|WP_077715220.1|2952189_2952870_-|CRISPR-associated-protein-Cas5 MLNIHVVAPFAAFRTFSTGSYRPTAGFITYSAAYGLLLNIAGIEMRQQDPKYPATLIKKGLPTVKIALGVLETPGRQSIYQQLHNYPVGSTNKENLVRTKYNKNNIAPVRRTFLSNINAYICVKDNLELEQQILEGLSGNITRSYGLPFLGDSNFLPDRLEVVYELQPAKWFIKVNYEMRNIPQQVERLTIKIDRANMAYTRAENFMTTEVPSTTIPEDAWVEVGY >NZ_CP019698.1|WP_077715221.1|2952872_2953820_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MNLFATVITHTQPSSNYRGESAENRTVIQKITKGRYEYAVISPEAFKNALRDTLAILGLPCNRKRIHDEEQLAVEFQDYNDAEAYADDFFMGWMIAAGKNDRNKILEDIRKEHGEERAKRFTFKRDSILRTNLAVAIEPYRYDTIFTQSPKMLGPWSNAENSQLLHREVSYTAYQYPFALNLEDCRPHPDWTSTLLQAIGQITDVSGNHARSYFDMSPASIVMRLTRKLAAGYHTYGFKVDESEKHTFPEVIQGIKNNDLPGEEFYLGGKLVNDLDAETKKELETKNVHLYTNCQILLEHIAEQVYQYLTSPKGE >NZ_CP019698.1|WP_077715222.1|2953823_2955512_-|type-I-MYXAN-CRISPR-associated-protein-Cmx8 MSRIWQEGNYLVLEYYLYDLPTVQHKAGLAGLLLLIDTMSQEGEEPVPEVLKLDTVYAMIRFSKESFHNMFQYLYAAAIEERKVKQKRQGSQPHRTYKEVNAEGKLEKWFVYRDLKPLGKFFQFHYPAGEGKWLKLWQDMLWSVIRSSPKSRTPFEEINNGKDLSLAKKTWASLLKKSKRPDVSLLEDISGSIFIGAQAQNSELVGFQGEVLENLLLHFWQVIVMVYVPRDIKITKNKVTGGLDAERTEIGYVLALPEPSDLEWFCKEYEDFLRRLPTDKNNHYRPQRVLIDIPAEAGLEFIYRLTSSKLERGFSGCISSVEIFHLERRGNNVKVHAAESILPDEGTLNAYQRLMDGKELNPLYKVYRIRNLLNKNPWHQGMDALFYHYDWRLFVKYREETPQRIPFFGLSVWKEFDATRKALDNIKGDGKMDKDKALPPEDQLELLIYEVVQRYIWLKTDEKSPVKYEKFKDNKDEKGKVIYPKEYCEAREKICRDAFLAVRVRKSQAFLDYFTGTICSVPQYLPSKDFQLVSQALINDWEKVKTLTLLAISANSYLKGGQ >NZ_CP019698.1|WP_077715223.1|2955504_2957817_-|CRISPR-associated-helicase-Cas3' MESNYILAKRPKDPNHIRSEETLQGHTEKVVESFQIIFGTLDKPTPFARRWLEFFKLDLNQYRAFHLNTLASCVLHDIGKANSGMKQALSKEGCYVIRHEHLSGLILMLPEVKESLSANKEIDFHIVLSSVIGHHLRASREEFGQLNPNNSEKNFKIYWNGVLDCFRLLTRLVGLPPIDIKVSPLWAEEERYGHYNYTHLTRELKNALSRWKNTTRKDQTLKRLLRAVRSALIVSDSAGSGLVRRGKELSQWLASCFSEQNLLSSLDIEEKVILPRIKQIEANNGTSFRWNDFQDLAETLPDRSLLLASCGTGKTLAAWRWIKGQLAKEKRSRVIFLYPTRATATEGFKDYVAWAPEADAALIHGSSEYELEGLLENLDDERQDKDFSTEEGLYALAYWQRRIFSATVDQFLAFLQNSYKSICLLPVLADSVIVIDEVHSFDYSLFSALKNLLKEFAIPVLCMTASLPVQRVSELQKCDVYVFPSQENLPDLQRVSNMPRYKVRFLESQEQVIETVKSQTNKGKKILWVVNTVERCQELAQQMQIENKCYHSQFKLEDRKDRHREVIAAFQQRGKPVLIITTQVCEMSLDISSDVLISEIAPITSIIQRMGRNNRSARPRDGVLGEVYIYAASSITPYSQEDLAGAEEFISELVKAEAVSQTMLQELLEKYGPKERTKNPYTAFLENGPWATKEGSIRQTKDYKVPAILDTDIARYRKLLESGKAFDGLLVPVPQRFAANRLGRYPRVAPGNHYSKEFGFLNRPLEVKHE >NZ_CP019698.1|WP_159438671.1|2957819_2958464_-|type-I-MYXAN-CRISPR-associated-protein-Cas6/Cmx6 MQNKVDLAFSLIGTEIPADHGYLLFSALSKILPFIHTNKQVAIHPISGKRTENRLMYLNQNSYLTFRVPEKMVSELLQLTGSLISIGDYEVRVGVPHVRKLKPAVSLYSPLVVIKGFMEPESFFGAVHRQLHDMNVRGKPMLVWQDKPLQDVGGRTGDLHSHFVRRTLRVKDKEIVGFALRIDNLTAEESLRVQENGIGGRNRFGCGIFLPFRR >NZ_CP019698.1|WP_159438672.1|2958816_2958963_+|hypothetical-protein MKKELTPEQAKVAKAIRVMAKIALRILAEQKNNSAKPGEHSSSPSDKS >NZ_CP019698.1|WP_159438673.1|2959016_2960474_+|recombinase-family-protein MKKAACYIRVSTDEQAEQGISIPAQKSRLLAYCQAQGWEVYDFFIDDGYSGKDLQRPGMQRMLTAAKNKHFNIVLVLKLDRLSRKQRDVLYLLEDIFEPNDIGFKSATESFDTTNAFGKASLGMMAVFAQLERDTIIERVRLAKKESAKQGRFLGGTAPYGYHYNHRQKRLEIDPVPAQIIKWIYQQYREGTHSYSTLAAQLELSGVPGPTNRAWNKQYVRKILTNPVYAGFVKHQGVLYVGAHAPIIEPAVWQEVQALVQCKGIGSVTNASLLSGIIWCGECGARMRTKNVWQNYPCTEPKRVIKYYVCYSQDGAAKHMVKNPGCRCGYKKAAEIEAKVIEQLQQYSFNHHFIVQVVEEILQRDDNKPALLQTISSVKKELVAINKKINKWYDAYEKEILEPEQLRVRINELNHKKKYTEQLLSTLEHQLTDDEEINSRQIVSMISDFAKIWAEATAAEQHEIVINLVKKVTVFADNTVELEFN >NZ_CP019698.1|WP_149026693.1|2960635_2961076_+|manganese-catalase-family-protein MFPYQPVNNAKGVLTDIGTEELAHMEIVATLVYKLLEGASLEAIKAAGLGGYYAEHDKSLYWVNPEGVPWVAAYVSATGDPVADLHENLAAEQKARAVYEWLINMSDDPCVTDVLRYLREREVVHFQRFGETLMHVEECLKEKKFY |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP019698_7 | 2948690-2949874 | Unclear |
I-A,I-B,II-B
Consensus repeat of NZ_CP019698_7
|
16 spacers
spacers of NZ_CP019698_7
>7.1|2948726|35|NZ_CP019698|CRISPRCasFinder,CRT TCAATTTAATAAGATTATTACCACATACGTTGATG >7.2|2948797|38|NZ_CP019698|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTCCCGGTCCTTACAGATTTTGCAGCGATATTGAGAGT >7.3|2948871|35|NZ_CP019698|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTAATGAAAAGTAAGTATCACCTATTTCAGACA >7.4|2948942|36|NZ_CP019698|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGGCCCTGGTGGAGCTACCTGAGTTTGAACCTAAAA >7.5|2949014|35|NZ_CP019698|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTAATGAAAAGTAAGTATCACCTATTTCAGACA >7.6|2949085|35|NZ_CP019698|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGATCTGCCTTGGCAATAAATACAAAATACTGTT >7.7|2949156|36|NZ_CP019698|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATAATTTACCTGAAATAACTTTCCATCAATTAAGA >7.8|2949228|35|NZ_CP019698|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCAGGTGTCGTGGGAGCTTTTTGCAAAGTCTACGA >7.9|2949299|36|NZ_CP019698|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTGTTTACCCGTTTTTTATCGTAGATATAATCTTT >7.10|2949371|35|NZ_CP019698|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTGATTTAACTATCGACATTTTGCCGATATATTT >7.11|2949442|36|NZ_CP019698|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCATCGCAATTTTCATCTAAACAAAAGTCTGTGCAA >7.12|2949514|36|NZ_CP019698|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCACATTACCTCTGGTACCGGCCTCAACCGCTTCGA >7.13|2949586|37|NZ_CP019698|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATATTGCACTTATCTCTATGACAGAGGCTTTCGACA >7.14|2949659|37|NZ_CP019698|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGGTAGAGGATTTGCAAGGCAGGTTGAAAGAATACTA >7.15|2949732|36|NZ_CP019698|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAACATTATCTAGCTTAAACCTTTTATTGCGGGCGA >7.16|2949804|35|NZ_CP019698|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTATAGGCAGCCGCCAATTCAGCATCGGTCTTAT |
cas2,cas1,cas5,cas7,cas8b3,cas3,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019698_7
The CRISPR arrays of NZ_CP019698_7 >merge|NZ_CP019698|7|2948690-2949874|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGAGAATTGACATTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAGTCAATTTAATAAGATTATTACCACATACGTTGATGCTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAGTTCCCGGTCCTTACAGATTTTGCAGCGATATTGAGAGTCTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAGTTTTAATGAAAAGTAAGTATCACCTATTTCAGACACTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAGGGGCCCTGGTGGAGCTACCTGAGTTTGAACCTAAAACTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAGTTTTAATGAAAAGTAAGTATCACCTATTTCAGACACTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAGTTGATCTGCCTTGGCAATAAATACAAAATACTGTTCTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAGAATAATTTACCTGAAATAACTTTCCATCAATTAAGACTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAGCCAGGTGTCGTGGGAGCTTTTTGCAAAGTCTACGACTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAGGTTGTTTACCCGTTTTTTATCGTAGATATAATCTTTCTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAGATTGATTTAACTATCGACATTTTGCCGATATATTTCTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAGCCATCGCAATTTTCATCTAAACAAAAGTCTGTGCAACTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAGGCACATTACCTCTGGTACCGGCCTCAACCGCTTCGACTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAGAATATTGCACTTATCTCTATGACAGAGGCTTTCGACACTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAGTGGTAGAGGATTTGCAAGGCAGGTTGAAAGAATACTACTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAGAAACATTATCTAGCTTAAACCTTTTATTGCGGGCGACTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAGGTTATAGGCAGCCGCCAATTCAGCATCGGTCTTATCTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG >NZ_CP019698|7|7|2948690-2949874|CRISPRCasFinder TGAGAATTGACATTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TCAATTTAATAAGATTATTACCACATACGTTGATG CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TTCCCGGTCCTTACAGATTTTGCAGCGATATTGAGAGT CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TTTTAATGAAAAGTAAGTATCACCTATTTCAGACA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG GGGCCCTGGTGGAGCTACCTGAGTTTGAACCTAAAA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TTTTAATGAAAAGTAAGTATCACCTATTTCAGACA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TTGATCTGCCTTGGCAATAAATACAAAATACTGTT CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG AATAATTTACCTGAAATAACTTTCCATCAATTAAGA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG CCAGGTGTCGTGGGAGCTTTTTGCAAAGTCTACGA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG GTTGTTTACCCGTTTTTTATCGTAGATATAATCTTT CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG ATTGATTTAACTATCGACATTTTGCCGATATATTT CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG CCATCGCAATTTTCATCTAAACAAAAGTCTGTGCAA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG GCACATTACCTCTGGTACCGGCCTCAACCGCTTCGA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG AATATTGCACTTATCTCTATGACAGAGGCTTTCGACA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TGGTAGAGGATTTGCAAGGCAGGTTGAAAGAATACTA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG AAACATTATCTAGCTTAAACCTTTTATTGCGGGCGA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG GTTATAGGCAGCCGCCAATTCAGCATCGGTCTTAT CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG >NZ_CP019698|7|7|2948690-2949874|CRT TGAGAATTGACATTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TCAATTTAATAAGATTATTACCACATACGTTGATG CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TTCCCGGTCCTTACAGATTTTGCAGCGATATTGAGAGT CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TTTTAATGAAAAGTAAGTATCACCTATTTCAGACA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG GGGCCCTGGTGGAGCTACCTGAGTTTGAACCTAAAA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TTTTAATGAAAAGTAAGTATCACCTATTTCAGACA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TTGATCTGCCTTGGCAATAAATACAAAATACTGTT CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG AATAATTTACCTGAAATAACTTTCCATCAATTAAGA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG CCAGGTGTCGTGGGAGCTTTTTGCAAAGTCTACGA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG GTTGTTTACCCGTTTTTTATCGTAGATATAATCTTT CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG ATTGATTTAACTATCGACATTTTGCCGATATATTT CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG CCATCGCAATTTTCATCTAAACAAAAGTCTGTGCAA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG GCACATTACCTCTGGTACCGGCCTCAACCGCTTCGA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG AATATTGCACTTATCTCTATGACAGAGGCTTTCGACA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TGGTAGAGGATTTGCAAGGCAGGTTGAAAGAATACTA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG AAACATTATCTAGCTTAAACCTTTTATTGCGGGCGA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG GTTATAGGCAGCCGCCAATTCAGCATCGGTCTTAT CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG >NZ_CP019698|7|7|2948761-2949874|PILER-CR CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TTCCCGGTCCTTACAGATTTTGCAGCGATATTGAGAGT CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TTTTAATGAAAAGTAAGTATCACCTATTTCAGACA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG GGGCCCTGGTGGAGCTACCTGAGTTTGAACCTAAAA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TTTTAATGAAAAGTAAGTATCACCTATTTCAGACA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TTGATCTGCCTTGGCAATAAATACAAAATACTGTT CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG AATAATTTACCTGAAATAACTTTCCATCAATTAAGA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG CCAGGTGTCGTGGGAGCTTTTTGCAAAGTCTACGA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG GTTGTTTACCCGTTTTTTATCGTAGATATAATCTTT CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG ATTGATTTAACTATCGACATTTTGCCGATATATTT CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG CCATCGCAATTTTCATCTAAACAAAAGTCTGTGCAA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG GCACATTACCTCTGGTACCGGCCTCAACCGCTTCGA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG AATATTGCACTTATCTCTATGACAGAGGCTTTCGACA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG TGGTAGAGGATTTGCAAGGCAGGTTGAAAGAATACTA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG AAACATTATCTAGCTTAAACCTTTTATTGCGGGCGA CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG GTTATAGGCAGCCGCCAATTCAGCATCGGTCTTAT CTGCTCAACGCCTTTCGGCATCTCAGGTGGTTTCAG
>NZ_CP019698.1|WP_077715217.1|2946133_2947198_-|DUF2157-domain-containing-protein MKGVDKLRYVSKQQYVFLRAELAYSRDQGILSQDQVERTLALYAIKPGLSFVRVMLVIGAVLVGLGILSFIAANWDELTKLVKYLIIVGMFISFMVVSYKMSEKYPKTSRSFLYLALITYGAGIFLIGQMFNFGGHFTQAFILWAIGVFPAAVLCKDKLVFLFAQLLLLIYIIGSLETTGFAYGILLIPAGYYFARSNPSDYLTFFNNLLVIAAVIYLGEFFRVEPVLTTLLLFVIGNAAFYKLQQIYKVQGTLLFCITGFILTFPGIWHIGKLSPLSTEISIAFSIGYILYLLWLVKREYFIPLVFVCATIFRYYVDLTYNFMPKSFVFISGGVLLLLLGYYIERSRRKVVRS >NZ_CP019698.1|WP_077715216.1|2945576_2946137_-|GDYXXLXY-domain-containing-protein MRKYLIIALLPLLILVGLTAKPVLTYTLGEEIILKTQPVDPYDLFRGRHMVISYEISTVDISKMPQDFTQVQGDLAPVEKDDLYMKWGENYRGKKLYAVLKKDGPYHTVERLVTEPPAGLYLPCTFQYVDKDADGQYRVRLNYNLDKYFIPEDSSSELEDAAREGLVLAKVKVYHGYPLLVDLSKH >NZ_CP019698.1|WP_077715215.1|2945122_2945470_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTNNINLSSDRIIEAQLLLLLQIKPSHGYELIQRLNDSDFTLGEVDPATVYRHLRRMDKEDLVKSHWETGPSGPGRRLYTITNNGEVLLAQWTASIRQQREKLENFIKTYEQYNL >NZ_CP019698.1|WP_077715214.1|2944277_2945102_-|extracellular-solute-binding-protein MANKDCSLKIINAGALHRVIGDCRELFLAKNPGITLEMKGVGSREGAKRLLSGEKYDIVALADQALFAELLVPELVENYFVFATDQIVIGYHRFSQGNQEINQDNWADILLQPGVKFARSDHNLDPCGYRSLMVWQLAEKFYQRPGLANQLEKACIPHTTYPKSLDLAGALMAGEVDYAFLYSSEAKQLGFPYLSLPSKINLSNPAYADYYDQAFLSVESKIPGKNIIIHGKPIEFAVGIVKTTQHPELAQAFIDLLTGPEGHTILEENGMVPC >NZ_CP019698.1|WP_077715213.1|2943095_2944256_-|putative-sulfate/molybdate-transporter MSQPPGTATQTKPLKNRYDKTEWAGAFGDLGTLIPFIVGYITVMKMDPLGVLFMFGILLIIAGSYYKTPIPIQPMKAIGGAAITQAAVITPGMVWGSGIFTGLFWLIIGATGALNWISKITTKPVIRGIVLGLGLSFIMEGTRMMKTDFLVAAIAIVITFMLLTNKRIPAMFALLIFGVIVALVKNPGLIQELAGIKFDFRLPQFALGELTWTDFVKGSLILAIPQIPLTLGNAVIAVTAENNRLFPERPVTEKKIAMSQGILNLISPIFGGIPMCHGAGGMAGHVRFGARTGGATVILGCILLVIALCFSSSVLLIFKIFPTSVLGVILFFAGLELAVSARDVGKEKSDYYTLLVTAGFAIWNMGIGFLAGLIMQECLKRKIFKV >NZ_CP019698.1|WP_077715674.1|2942475_2942724_+|spore-coat-protein-CotJB MTQLLLKIQQLEFAACELNLFLDTHPEDQQALAMFNKVHQELMQCVRNYEQLYGPLLNFGFSPALQNTWKWAELPWPWEIKY >NZ_CP019698.1|WP_077715211.1|2942134_2942428_+|spore-coat-associated-protein-CotJA MFRDDKKVAQATAQAAPMMGPLGGLGGMPYAGHPGISPYQPLPGMQPQGFPESSCPGMELARAYICIQRFGPVYDFAKALEVGTLFPELFRPYRPNK >NZ_CP019698.1|WP_159438670.1|2941944_2942082_-|hypothetical-protein MLNLLNVFHIFVNYATAAQNDVGKKDVGKKDTHGSLKRAVGVSTL >NZ_CP019698.1|WP_077715209.1|2941130_2941934_+|MFS-transporter MACAFFVSGLGFITFFLGLKYLKESPRWLVAKGRVAEAEQVIKDLTGEDIDLSDAAKNVPPKVNAWEQFIGMFSGKYLKRTSILLLFGIPAVIGSFVLSVWIPTLAGMRGFSMEQSLNIGVAFMAGAPVGMYLFSFFSDKGGRKIPLAIAILLTAVTALVYAFIGNNYILTLVVAFFLNAFVMGYGFIHMAYVPEHYPTKMRNTAVGTINAVQRLGVSFSQPFIPVVVAAYGVNGLFLGVFAIFAFAATVVFLLGQRTGGIPLEQIE >NZ_CP019698.1|WP_077715208.1|2939168_2941034_+|aryl-sulfate-sulfotransferase MTAKFKEFPHIITKQHQAEEAFLAEYRAKEHSFANPYVKLNPYLIAPLTALIMFTTPEPAKVTVTVKGKESAGDISFQFAAATEHMIPVYGLYADYDNTVELTLGSGEKTVVKIKTEPTPETVKLPTKIETSAEYFQDNIMFVSPATPAAVAGYDYQGEVRWYTTLNLSWDIKRVRNGRLLIATERLAAPPYHTSGIYEMGMIGKIYKEFRLPGGTHHDYIELEDGNLIILTNDLSRGTVEDMCVLVDRNTGEVLKVWDYQKVLPQDVGGSGSQDSHDWFHNNAVWYDKKTNSLTLSGRHQDVIINIDYETGDLNWVIGDPEGWPQEMVDKYFFKPVGEGDFDWPYEQHACIILPNGDVMAFDNGHWRAKVKEKYVPAKDNFSRGVRYRIDTDKMEIEQVWQYGKERGAEFFSTYISNVEYYGEGHYLVHSGGIGTKYGEPMDLPPSMFMGEDAEGIEMNSITVEIQDDVVKYEMHLPANFYRAEKLKLYSAEDILTLGKGELLGSFGVTEEFLTIPPATEAGLVPESYNVKIGLEEDRIILKASFEKGQMVLLQLEGESTHSYFIPTTKRPYMAMCVGTFLESDDRAVEFPISREGLAGEFKVSLIIDENKYDTGVNLLL >NZ_CP019698.1|WP_077715218.1|2950169_2950463_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MSSRKMYYLICYDIREPKRWRKCYKLLKGFGERVQYSVFKCYLTDRKLAELRWELTKILSNEDSLLIAPIQQADVNRIIYLNMNIDWQLEKERFRTV >NZ_CP019698.1|WP_077715219.1|2950464_2952108_-|type-I-MYXAN-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MVSGLNDEPLIRVMALHAIEYCERLFYLEEVEEIRVADTAIYDGRRFHEQLPEYVTLEQFVLQNEELGIRGKIDCLRTQQGMLVPYEYKKGHARILPNGDVLAWPSDQVQIAAYSLLLEKHLNRPIMEGRVFYAADHRTVSISIDEKMRNQVMSAIARAKELRASTERPPITANERLCARCSLAPVCLPEEERLVEQVGRDTVRLFPEDRDLLDIHVTSPGSKVRRAGNTLLIEDKDGQKRSFPIEEVGSITLHGNAQITTQTIHLCANKGINIHWVTGGGHYIGSVSNSAGGVQRRLRQYRALIDPELKLRLAKALVIAKVESQLRYILRLTRGSEVRKELESYINTIRDVLSSTNTANSLDELRGYEGSAAKDYFACFSRLTVDDAKNGMAFIHRNRRPPRDPANALLSFLYSLLYRDCVQAIVTVGLDPTIGFYHQPRSQAYPLALDLMELFRVTLCDMTVLGTIHRNQWKVEEDFIQAGDQVWLSDTGRKKAIAAYENRKQDKWKHPVIGYSLTYARALELEVRLLEKEWTGKPGLFAMNRIR >NZ_CP019698.1|WP_077715220.1|2952189_2952870_-|CRISPR-associated-protein-Cas5 MLNIHVVAPFAAFRTFSTGSYRPTAGFITYSAAYGLLLNIAGIEMRQQDPKYPATLIKKGLPTVKIALGVLETPGRQSIYQQLHNYPVGSTNKENLVRTKYNKNNIAPVRRTFLSNINAYICVKDNLELEQQILEGLSGNITRSYGLPFLGDSNFLPDRLEVVYELQPAKWFIKVNYEMRNIPQQVERLTIKIDRANMAYTRAENFMTTEVPSTTIPEDAWVEVGY >NZ_CP019698.1|WP_077715221.1|2952872_2953820_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MNLFATVITHTQPSSNYRGESAENRTVIQKITKGRYEYAVISPEAFKNALRDTLAILGLPCNRKRIHDEEQLAVEFQDYNDAEAYADDFFMGWMIAAGKNDRNKILEDIRKEHGEERAKRFTFKRDSILRTNLAVAIEPYRYDTIFTQSPKMLGPWSNAENSQLLHREVSYTAYQYPFALNLEDCRPHPDWTSTLLQAIGQITDVSGNHARSYFDMSPASIVMRLTRKLAAGYHTYGFKVDESEKHTFPEVIQGIKNNDLPGEEFYLGGKLVNDLDAETKKELETKNVHLYTNCQILLEHIAEQVYQYLTSPKGE >NZ_CP019698.1|WP_077715222.1|2953823_2955512_-|type-I-MYXAN-CRISPR-associated-protein-Cmx8 MSRIWQEGNYLVLEYYLYDLPTVQHKAGLAGLLLLIDTMSQEGEEPVPEVLKLDTVYAMIRFSKESFHNMFQYLYAAAIEERKVKQKRQGSQPHRTYKEVNAEGKLEKWFVYRDLKPLGKFFQFHYPAGEGKWLKLWQDMLWSVIRSSPKSRTPFEEINNGKDLSLAKKTWASLLKKSKRPDVSLLEDISGSIFIGAQAQNSELVGFQGEVLENLLLHFWQVIVMVYVPRDIKITKNKVTGGLDAERTEIGYVLALPEPSDLEWFCKEYEDFLRRLPTDKNNHYRPQRVLIDIPAEAGLEFIYRLTSSKLERGFSGCISSVEIFHLERRGNNVKVHAAESILPDEGTLNAYQRLMDGKELNPLYKVYRIRNLLNKNPWHQGMDALFYHYDWRLFVKYREETPQRIPFFGLSVWKEFDATRKALDNIKGDGKMDKDKALPPEDQLELLIYEVVQRYIWLKTDEKSPVKYEKFKDNKDEKGKVIYPKEYCEAREKICRDAFLAVRVRKSQAFLDYFTGTICSVPQYLPSKDFQLVSQALINDWEKVKTLTLLAISANSYLKGGQ >NZ_CP019698.1|WP_077715223.1|2955504_2957817_-|CRISPR-associated-helicase-Cas3' MESNYILAKRPKDPNHIRSEETLQGHTEKVVESFQIIFGTLDKPTPFARRWLEFFKLDLNQYRAFHLNTLASCVLHDIGKANSGMKQALSKEGCYVIRHEHLSGLILMLPEVKESLSANKEIDFHIVLSSVIGHHLRASREEFGQLNPNNSEKNFKIYWNGVLDCFRLLTRLVGLPPIDIKVSPLWAEEERYGHYNYTHLTRELKNALSRWKNTTRKDQTLKRLLRAVRSALIVSDSAGSGLVRRGKELSQWLASCFSEQNLLSSLDIEEKVILPRIKQIEANNGTSFRWNDFQDLAETLPDRSLLLASCGTGKTLAAWRWIKGQLAKEKRSRVIFLYPTRATATEGFKDYVAWAPEADAALIHGSSEYELEGLLENLDDERQDKDFSTEEGLYALAYWQRRIFSATVDQFLAFLQNSYKSICLLPVLADSVIVIDEVHSFDYSLFSALKNLLKEFAIPVLCMTASLPVQRVSELQKCDVYVFPSQENLPDLQRVSNMPRYKVRFLESQEQVIETVKSQTNKGKKILWVVNTVERCQELAQQMQIENKCYHSQFKLEDRKDRHREVIAAFQQRGKPVLIITTQVCEMSLDISSDVLISEIAPITSIIQRMGRNNRSARPRDGVLGEVYIYAASSITPYSQEDLAGAEEFISELVKAEAVSQTMLQELLEKYGPKERTKNPYTAFLENGPWATKEGSIRQTKDYKVPAILDTDIARYRKLLESGKAFDGLLVPVPQRFAANRLGRYPRVAPGNHYSKEFGFLNRPLEVKHE >NZ_CP019698.1|WP_159438671.1|2957819_2958464_-|type-I-MYXAN-CRISPR-associated-protein-Cas6/Cmx6 MQNKVDLAFSLIGTEIPADHGYLLFSALSKILPFIHTNKQVAIHPISGKRTENRLMYLNQNSYLTFRVPEKMVSELLQLTGSLISIGDYEVRVGVPHVRKLKPAVSLYSPLVVIKGFMEPESFFGAVHRQLHDMNVRGKPMLVWQDKPLQDVGGRTGDLHSHFVRRTLRVKDKEIVGFALRIDNLTAEESLRVQENGIGGRNRFGCGIFLPFRR >NZ_CP019698.1|WP_159438672.1|2958816_2958963_+|hypothetical-protein MKKELTPEQAKVAKAIRVMAKIALRILAEQKNNSAKPGEHSSSPSDKS >NZ_CP019698.1|WP_159438673.1|2959016_2960474_+|recombinase-family-protein MKKAACYIRVSTDEQAEQGISIPAQKSRLLAYCQAQGWEVYDFFIDDGYSGKDLQRPGMQRMLTAAKNKHFNIVLVLKLDRLSRKQRDVLYLLEDIFEPNDIGFKSATESFDTTNAFGKASLGMMAVFAQLERDTIIERVRLAKKESAKQGRFLGGTAPYGYHYNHRQKRLEIDPVPAQIIKWIYQQYREGTHSYSTLAAQLELSGVPGPTNRAWNKQYVRKILTNPVYAGFVKHQGVLYVGAHAPIIEPAVWQEVQALVQCKGIGSVTNASLLSGIIWCGECGARMRTKNVWQNYPCTEPKRVIKYYVCYSQDGAAKHMVKNPGCRCGYKKAAEIEAKVIEQLQQYSFNHHFIVQVVEEILQRDDNKPALLQTISSVKKELVAINKKINKWYDAYEKEILEPEQLRVRINELNHKKKYTEQLLSTLEHQLTDDEEINSRQIVSMISDFAKIWAEATAAEQHEIVINLVKKVTVFADNTVELEFN >NZ_CP019698.1|WP_149026693.1|2960635_2961076_+|manganese-catalase-family-protein MFPYQPVNNAKGVLTDIGTEELAHMEIVATLVYKLLEGASLEAIKAAGLGGYYAEHDKSLYWVNPEGVPWVAAYVSATGDPVADLHENLAAEQKARAVYEWLINMSDDPCVTDVLRYLREREVVHFQRFGETLMHVEECLKEKKFY |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP019698_1 | 1.72|886590|40|NZ_CP019698|CRISPRCasFinder,CRT | 886590-886629 | 40 | NZ_CP032346 | Azospirillum brasilense strain MTCC4039 plasmid p1, complete sequence | 275084-275123 | 8 | 0.8 |
| NZ_CP019698_1 | 1.8|882339|34|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 882339-882372 | 34 | NZ_CP025513 | Neorhizobium sp. SOG26 plasmid unnamed2, complete sequence | 168969-169002 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP019698_1 | 1.17|882933|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 882933-882968 | 36 | NZ_CP021653 | Ralstonia solanacearum strain RS 488 plasmid unnamed, complete sequence | 698793-698828 | 9 | 0.75 |
| NZ_CP019698_1 | 1.17|882933|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 882933-882968 | 36 | NZ_CP012688 | Ralstonia solanacearum strain UY031 plasmid unnamed, complete sequence | 698801-698836 | 9 | 0.75 |
| NZ_CP019698_1 | 1.17|882933|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 882933-882968 | 36 | CP047139 | Ralstonia solanacearum strain CFBP 8695 plasmid unnamed, complete sequence | 717944-717979 | 9 | 0.75 |
| NZ_CP019698_1 | 1.17|882933|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 882933-882968 | 36 | CP047137 | Ralstonia solanacearum strain CFBP 8697 plasmid unnamed, complete sequence | 684662-684697 | 9 | 0.75 |
| NZ_CP019698_1 | 1.32|883928|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 883928-883964 | 37 | AP013537 | Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G6, isolate: uvMED-CGR-C59A-MedDCM-OCT-S34-C49 | 3646-3682 | 9 | 0.757 |
| NZ_CP019698_1 | 1.32|883928|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 883928-883964 | 37 | AP014007 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C59A-MedDCM-OCT-S29-C45, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 5511-5547 | 9 | 0.757 |
| NZ_CP019698_2 | 2.16|917912|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 917912-917948 | 37 | NC_012528 | Deinococcus deserti VCD115 plasmid 3, complete sequence | 146090-146126 | 9 | 0.757 |
| NZ_CP019698_5 | 5.16|1471188|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1471188-1471223 | 36 | MK757446 | Mycobacterium phage Candle, complete genome | 18610-18645 | 9 | 0.75 |
| NZ_CP019698_5 | 5.16|1471188|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1471188-1471223 | 36 | KY969628 | Mycobacterium phage Zenon, complete genome | 18612-18647 | 9 | 0.75 |
| NZ_CP019698_5 | 5.16|1471188|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1471188-1471223 | 36 | MH001447 | Mycobacterium phage Nilo, complete genome | 18607-18642 | 9 | 0.75 |
| NZ_CP019698_5 | 5.16|1471188|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1471188-1471223 | 36 | MH926059 | Mycobacterium phage Riparian, complete genome | 18068-18103 | 9 | 0.75 |
| NZ_CP019698_5 | 5.16|1471188|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1471188-1471223 | 36 | MT684602 | Mycobacterium phage Rope, complete genome | 18260-18295 | 9 | 0.75 |
| NZ_CP019698_5 | 5.16|1471188|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1471188-1471223 | 36 | NC_022053 | Mycobacterium phage Papyrus, complete genome | 18269-18304 | 9 | 0.75 |
| NZ_CP019698_5 | 5.16|1471188|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1471188-1471223 | 36 | KT591076 | Mycobacterium phage Weiss13, complete genome | 18300-18335 | 9 | 0.75 |
| NZ_CP019698_6 | 6.5|2947798|34|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2947798-2947831 | 34 | NZ_CP038636 | Cupriavidus oxalaticus strain X32 plasmid unnamed1, complete sequence | 762288-762321 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP019698_1 | 1.32|883928|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 883928-883964 | 37 | MN693271 | Marine virus AFVG_25M119, complete genome | 4282-4318 | 10 | 0.73 |
| NZ_CP019698_1 | 1.68|886322|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 886322-886357 | 36 | NC_015561 | Hoyosella subflava DQS3-9A1 plasmid pAS9A-2, complete sequence | 57922-57957 | 10 | 0.722 |
| NZ_CP019698_5 | 5.11|1470854|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1470854-1470890 | 37 | MG945634 | UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 6411-1702, complete genome | 16-52 | 11 | 0.703 |
| NZ_CP019698_5 | 5.13|1470987|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1470987-1471023 | 37 | MG945634 | UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 6411-1702, complete genome | 16-52 | 11 | 0.703 |
| NZ_CP019698_7 | 7.4|2948942|36|NZ_CP019698|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2948942-2948977 | 36 | LR721753 | Aliivibrio wodanis 06/09/160 plasmid 2 complete sequence | 25380-25415 | 12 | 0.667 |
1. spacer 1.72|886590|40|NZ_CP019698|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032346 (Azospirillum brasilense strain MTCC4039 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.8
gggcaaccggcagggtgatatccttttcccgggtgccccc CRISPR spacer gcgcgatgtgcagggtgatttccttttcctgggtgccccg Protospacer * **.*. ********** *********.*********
2. spacer 1.8|882339|34|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP025513 (Neorhizobium sp. SOG26 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
cgtggtggctcaaccgcatcagcaacatttcttc CRISPR spacer atcggtggcacaaccgcatcagcaaaattgccgt Protospacer .****** *************** *** *. .
3. spacer 1.17|882933|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021653 (Ralstonia solanacearum strain RS 488 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
atgtcagcgaagtgccagaatttgcctttggtgtgc CRISPR spacer atgtcagcgaagtaccagaaattgcccgagcggatc Protospacer *************.****** *****. * * *
4. spacer 1.17|882933|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP012688 (Ralstonia solanacearum strain UY031 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
atgtcagcgaagtgccagaatttgcctttggtgtgc CRISPR spacer atgtcagcgaagtaccagaaattgcccgagcggatc Protospacer *************.****** *****. * * *
5. spacer 1.17|882933|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP047139 (Ralstonia solanacearum strain CFBP 8695 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
atgtcagcgaagtgccagaatttgcctttggtgtgc CRISPR spacer atgtcagcgaagtaccagaaattgcccgagcggatc Protospacer *************.****** *****. * * *
6. spacer 1.17|882933|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP047137 (Ralstonia solanacearum strain CFBP 8697 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
atgtcagcgaagtgccagaatttgcctttggtgtgc CRISPR spacer atgtcagcgaagtaccagaaattgcccgagcggatc Protospacer *************.****** *****. * * *
7. spacer 1.32|883928|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP013537 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G6, isolate: uvMED-CGR-C59A-MedDCM-OCT-S34-C49) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
gagttgtatcggaactgcggcccacttgggtgcttgg CRISPR spacer gaatcatcgacgaaacgcggcccacttgggtgcttgg Protospacer **.*..* *** .*********************
8. spacer 1.32|883928|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP014007 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C59A-MedDCM-OCT-S29-C45, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
gagttgtatcggaactgcggcccacttgggtgcttgg CRISPR spacer gaatcatcgacgaaacgcggcccacttgggtgcttgg Protospacer **.*..* *** .*********************
9. spacer 2.16|917912|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_012528 (Deinococcus deserti VCD115 plasmid 3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
----ttggggtctccgtgattatggagtgcccggtcagttg CRISPR spacer
agtgttg----catggtcattctggagtgcccggtcagttg Protospacer
*** * . ** *** *******************
10. spacer 5.16|1471188|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK757446 (Mycobacterium phage Candle, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
atggtatctcgtacatctcggataccagctcaataa CRISPR spacer ttggcatctcgtacctctcggataccagagccaagg Protospacer ***.********* ************* * * ..
11. spacer 5.16|1471188|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KY969628 (Mycobacterium phage Zenon, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
atggtatctcgtacatctcggataccagctcaataa CRISPR spacer ttggcatctcgtacctctcggataccagagccaagg Protospacer ***.********* ************* * * ..
12. spacer 5.16|1471188|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH001447 (Mycobacterium phage Nilo, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
atggtatctcgtacatctcggataccagctcaataa CRISPR spacer ttggcatctcgtacctctcggataccagagccaagg Protospacer ***.********* ************* * * ..
13. spacer 5.16|1471188|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH926059 (Mycobacterium phage Riparian, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
atggtatctcgtacatctcggataccagctcaataa CRISPR spacer ttggcatctcgtacctctcggataccagagccaagg Protospacer ***.********* ************* * * ..
14. spacer 5.16|1471188|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT684602 (Mycobacterium phage Rope, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
atggtatctcgtacatctcggataccagctcaataa CRISPR spacer ttggcatctcgtacctctcggataccagagccaagg Protospacer ***.********* ************* * * ..
15. spacer 5.16|1471188|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_022053 (Mycobacterium phage Papyrus, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
atggtatctcgtacatctcggataccagctcaataa CRISPR spacer ttggcatctcgtacctctcggataccagagccaagg Protospacer ***.********* ************* * * ..
16. spacer 5.16|1471188|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KT591076 (Mycobacterium phage Weiss13, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
atggtatctcgtacatctcggataccagctcaataa CRISPR spacer ttggcatctcgtacctctcggataccagagccaagg Protospacer ***.********* ************* * * ..
17. spacer 6.5|2947798|34|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP038636 (Cupriavidus oxalaticus strain X32 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ttttatactgttcgtcagtttgcggcaccagtcg CRISPR spacer ctgcaatcaattcgtcagttgccggcaccagtcg Protospacer .* .* * .********** ************
18. spacer 1.32|883928|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693271 (Marine virus AFVG_25M119, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
gagttgtatcggaactgcggcccacttgggtgcttgg CRISPR spacer gcatcatcgacgaaacgcggcccacttgggtgcttgg Protospacer * .*..* *** .*********************
19. spacer 1.68|886322|36|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_015561 (Hoyosella subflava DQS3-9A1 plasmid pAS9A-2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
cggtgagcggcagcatcaatgccggagatgatgtga CRISPR spacer cggtgagcggcagcatcgctgccggagaacccccct Protospacer *****************. ********* . .
20. spacer 5.11|1470854|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG945634 (UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 6411-1702, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
caattcataccaactccacacaaccggcattttctgc CRISPR spacer aaattcataccaaatccacactaccgggaaaacaaac Protospacer ************ ******* ***** * . .*
21. spacer 5.13|1470987|37|NZ_CP019698|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG945634 (UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 6411-1702, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
caattcataccaactccacacaaccggcattttctgc CRISPR spacer aaattcataccaaatccacactaccgggaaaacaaac Protospacer ************ ******* ***** * . .*
22. spacer 7.4|2948942|36|NZ_CP019698|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LR721753 (Aliivibrio wodanis 06/09/160 plasmid 2 complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.667
gggccctggtggagctacctgagtttgaacctaaaa CRISPR spacer accattctctggagctacctgagttcgaacctcaat Protospacer . ... ****************.****** **
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
98262 : 160383
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP019698|98262:160383|DBSCAN-SWA ACTAAGCAATGGACTGACTGGCTTTCATCTCAGGCATTATCCGATCTAAAATTTCTTCCACCCGCTGCACGGGAATAACCTCGATACCCTTTAGATCCATCGGTACATCCTGAATGTTTTCTTTGGGTATAAATACCCTCTCAATACCCGCCTGTTTGGCCCCATAAATCTTCTCAAAAACACCGCCCACGGCTTTAACCTTGCCCTGAATGGAAACCTCGCCGGTTACCGCTATGTTTTGTGGTAGTGGCTGGTCTTGTATGGCGCTGAGCATGGCCAGCATAATGGCCACCCCGGCAGAGGGACCGTCAATTCTGCCGCCACCCACCACATTAACATGAATATCGTAGTTGCTGATATCCTGACCGGTTAGCTTTCTGATAACCGAGGCCGCATTAAATACAGAATCCTTGGCCATACTGCCGGCGGTATCATTGAAACGGATGTTGCCCTGTCCAGGGTTACGGGCGGCAAAGGCCACCGCTTCAATTTCCAGCACCGAACCCAGGTAACCCGCCACTCCTAAACCAAAAATTTTGCCCACTTCCAAATCGTCGGAGGCTTTATTAAACACATAGGGAGTTAAGCGGCTGACCTGTACAACCTCATAGACATCCTCCACGGTAATGTGAATGTGACTATGGTTATCTTGGTGCTGGCGGAAACAGGCCAGTCCATAGGCATCGGAGAGGATATTAATGGCTTTCCTACCCTCGATGGTATATTCAGAAATAATTTCCGGAATTTGCTCGTCCAACTGTACATTTAGCTTACGGGCAGCTTGTCTGATAATCCCTTGGATGGCTGCCGGAGTAAGGGGTTCAAAGAAAACCTCAGCACAACGGGAACGTATGGCAGGGTTAATATCCTCCGGCTCCCGGGTGGTGGCACCAATCAAAACAAAATCTGCCGGCGCACCATCATCAAATATCTTCTTAATATATTTGGGGACGTTATGGTCATTGGGATCGTAATAGGCAGAATCAAAAAAGACCCTTTTGTCCTCCAGCACCTTTAACAGCTTATTCTGTAATGCCGGGTCCAACTCTCCCACTTCATCAATAAACAGGACACCCCCATGGGCATCGGTAACCAGGCCCAGCTTGGGCTCTGGAATCCCTGTCTCTGCCAAATCTCGGCGCGCCCCCTGATAAATAGGGTCATGTACCGAGCCTAACAAGGGGTTGGTTACTTCCCGGGGGTCCCAACGCAGGGTGGTGCCGTCCACTTCCACAAAGGGAGCATCCTTGGCAAAGGGAGCACCCTTAATGCCCTTGGCTACTTCCAAAGCCAGCCTGGCTGCGGTGGTTTTTCCTACCCCGGGAGGTCCATAAAGTATAATATGTTGGGGGAAGGGCGAGGCCAATTTAGCCAAGAGAGCCCTGACCGCCCTTTCCTGACCGATAATTTCATCAAAACTCTCCGGCCTGAGTATTTGCATGGCCGAGGAGGCTAATTTTTTGGAATCCAGCTTTTCCAAAATGGCTAACTTCTTAAGGGTTTGCGCATTTTCAGGTCCGCTGTTATCCTTAATGATTTGCATTTTTATTTCATTAATGTAGTCTTCGTGGCGTTTATTCATCTTTTCGCCAATTTTCTTTTCCAACTCTTCTTCCACTGTACGCCGGGCTATGGCGTCAGCAATTTCATCCTGTAAGGATTCTAAGATAGCCGGGATCTCTTCTAAGGAAGGCAGTGTTTCGTATGTGGGATCTTCAAATACCAGCTTTTGCAGAGCCAGTACCCTTTCCTCAATAATTTCGGAACGTATCAAGGATAGGGCTTCCAGTTTGCCCGCCCTAAGTACCAGCTTATCCGACCCATAAAGATTACTCAACAGGCCGTACATGGCATTAACCTGCCGCTGTAACTGATCCAGAGTGGTTAACTGATTGGTATCCTGTTCTGTGGTAACGTTCGGTTTCTCGAGGAAATCTTTCATTTATGCTGCTCCTTTCCAATGCCTCGTCCTATCCCGGTTCTCGGAGCTTACTCCATTGCTGTCACTTGTACATTAATTTCAGCCTGGGCCACGGGATGAATTTTAATGGTGATTTTATGGGTACCCAGGGTCTTAATGGGATCCTTTAGTACAATTTTTTTCTTATCAATATCATAGCCGTGCTGTTGCTTTAAGCCATCGGCGATATCTTTGTTACTGATGGCGCCAAATAACCGGCCACCTTCTCCCACTTTAGCCTTTAAAACCACGGTTAAGTCATTAATCTTGGCAGCCAGTTCTTTGGCTTCCGCTTCTTGTTTTTTCTTTTTTTCCGCCTGGGCTTGCCGCTGATTGGAAATTTCCTTTAGTTTCCCTTCAGAGGCGGGAGACGCCAAATTTCTGGGGAATAAAAAGTTTCTGGCATAACCCTCGGTAACATTAACAATATCACCCTTGGCACCTAACTTGGGAACATCCTTTAACAATACAACTTGCATGGTCTTCCTCCTTATCTATGATCCTAAATCTCTTTCTTCGTAATCGGTCGACGTAAGTTAAAGATGGTATCCAGCAATCCTAAAAGAACAACTGCCATATACATAAAACTGATATAGATAATCAGCAGAAAAAGCAGCATCATTTTAAAAGGTTTAGCCAGGTTAATCTGTTGATAAAAATGTACGATTACCGATAAGCCGAAGATAAAGAAAATGAAGACAAACAGAATTAGTACGTTTTGGCCAATAATCTTCACCGTGTCCAGTTGGTATTCGTTACCCAGCAGATAGCAAAGCAAGCCGATAATGATGCCCCATATGGCATACCAGGGCAAGCGCCACTTACTAAAGGGGGGTAAAGAATTTACCTGGTAATTTAGCCGTCTGAGCACCTTTGCCCCAATAATATAGGTAAGGGTGGTGGAAATGAGATAGGCAGCAATGTAGGCTGCCGGTAATAGTAGTACCGCGGTCTGGACACCTTCTCTCAGCATTTGCTGCTGTTCCAACGGTACCGGTATGCCTGCCTCTTGATACATGGCAAATGCTTTATTCATGCTCTCGTTGAGGGAAGCCTGCAACGCCTCTAAACTAATTCCCACTACCATGACACTCAGGGCGATGACAGCCAGGGAAGAAAGGGTGGCAACAAGGGAGGCAGCCACCAGGGCATGCCCTGCGGAAACATAATTTTTATATAAAAGCCCCAAAACCAGCCCTAGAGGCCCAAATTGCATAAACATGATCAGCACCACCAGGGGATCCGGGTAGAGTACCGTCATTAAAAAGAGGGTGACCACCAGGGATAAAATTGCAACTTTTAAATTCTGACGTCTTACTAACACAGCTAAGGGAATGGGCAAAAGCATACTGCTCACGAAAAAAAACGGGGGTATATACATCCCCAACAGAGCAAGCACCGCTGTCAGGCCTGCCATAAAAGCGCCGTCCACCAATGCTCGGGTATCTCTCAAGGTAGCCAAGAAACAATCACCTCTTCTAGATATGCAAGCGGGTCCTAAAACAACTAATGATTCGCTGATACAGCTCACATTTCCTGCCTTAATCCTGTGTTATTTGTTCCCGCCTTTGGTAAATAAAATGTGCCGGGGTAACTTTCTCCATTCCCAGGAGGTGTAATTCAGATATAGACACATTTTCTTAGCTGTTGTAAAATTTCTAGCATATACCTTTTGTATTCTAAATAGTTAGTAGAGGGAGTTTATATGAAAAATCAACAGGAGCAATCCGGTTCCTTTTGGCTGCCATTATTTGTTATTGTAACCGGTGCCTTTGCCGCTATTCTTAGCAGCAGTTCAGTCAATGTGGCTATTCCTAAATTAATGGCCATTTTTGGTGTCTCTTCCAGTGAAGTACAATGGGTTTTAACCGGCTATATGTTATCCTCTGCCATTGTTATTCCCTTATCCGGGTATTTGGGGGATCGATTTGGTAACAAAAAGGTCTTTATCTATTCCCTGGCTGTTTTTACAGCCGGTTCTGTACTGTGCTCCTTTGCCTGGAGTAATCAGTCCCTCATTGTCTTTCGAGTGCTGCAGGGTCTGGGGGGCGGAATTATTATGCCAATAAGCATGGCCATTATTTACCGCATTGTCCCATTAAATCAAATTGGCCTGGCCCTGGGTGTCTGGGGTATGTCCGCGGTTATGGCTCCGGCCATTGGACCAACCTTAGGGGGCTATATTTTAGAGCACTTTTCTTGGCGTTTGCTTTTCTTAATTAATATTCCCGTTGGTCTCTTAGGCATATTTTTATCTATTCTTTTATTAAAGGAGACACCCACCAAGGAAAAAACCAAATTTGATTTCTGGGGTTTCTTTTTGTCCACCGTTGGTTGCTTTGCCCTGCTGTTAGCACTGAGTGAGGGGTCAAAGGAAGGGTGGGATTCCTATTATATAGTTATGTTATTTATAATTTCCTTTTTCTCCCTGCTGCTCTTTGTCATGCACGAGTTATCCACCCAGGAACCATTGTTAGATTTGCGTTTATTGAAGAACTCCACCTTTGCCCTTAGCGTTTTTGTTGGCGGCTTAATCAATATTGGTTTATTTGGCGGCGTGTTTCTAACCCCTTTGTTCACCCAAAACCTCATGGGTATGTCCGCCTACGATACCGGTTTACTGCTCCTGCCGGCATCCTTAATCTCCGGCATCATGATGCCAATTAGCGGTGCCCTGTTTGATAGATTTGGTGCTAAAGCAATCAGTATCGTAGGGTTAACCATTCTTGCGGTCAGTACCTGGGAATTAAAGTATCTCACCGCCGACACCAGTACCTTGGAACTTATGGTTATCCTGTCTATCCGTTCCGTAGGCATGGGACTGGCCATGATGCCTATCTCCACCGCGGGTATGAATGTGGTGGCTAAGCCTCTGGTGGGACAGGCTTCCGCCCTCAGTAATGTAATTAGGCAAATATTTGCCTCCTTTGGAATAGCGGTCCTTTCTACCATCATGCAAAACCGCCAGATATTTCATGCGGCACGACTGTCTGACGGTATCTCCTCTGGTACCCCAGGGGTAGACCTGGGACTGGCCCAA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52 | Bacillus_virus(20.0%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
642806 : 674971
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP019698|642806:674971|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP019698|642806:674971|647573_648521_+|WP_077713174.1|DBSCAN-SWA MKNSVVIFFKPKQLLKLLLVLACLITLFSVVRDNIKPPEVSPLPHSVPPEIERGEFLSWEEVDQIFRRYTNATVIDVDTGLSFQVQRRGGTYHADVQPLTAQDTAIMKIIYNGTWSWQRKAVVVQIGNRRIAASMNGMPHGSGAIRGNNFNGHFCIHFRDSKVHQSGKENLAHQMMIWKAAGKFQQMITAMGPEEVIEVLINALDQRDINLALKTLHQPGEKQRSDLNAILQQIDRIKVQRIRSEGGNPETFWVYLTLRYQGSHKDMEKKIELQAVDQGEKGWRIISDGLQEILNRQALVEIFDVRIFDDGDRCD >NZ_CP019698|642806:674971|650661_650901_-|WP_077713178.1|DBSCAN-SWA MAKVLKEGAAYNQRDVIDMLVEFSGFKDRVEKKFKDVAKELEGKPTEHELWVSLYLISSDYADEQSTRRKSVETIQKIS >NZ_CP019698|642806:674971|670126_671653_+|WP_077713193.1|transposase|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP019698|642806:674971|664610_665009_+|WP_159438605.1|transposase|DBSCAN-SWA MNISGLFRLTEKSSHAVEKALRSLTNMYGKGISQIFRSITADNGSEFSELSLITKEWGSSVYFAHPYSSWERGTNERHNGILRRFVPKGKAINDLSDETLQRIQSWINRLPRKILNYKTPEECFIEELAQIA >NZ_CP019698|642806:674971|660052_660628_+|WP_077713187.1|DBSCAN-SWA MRVLETCKRCRYGVEIIRGDYKCEKQEIKIQRDEALYPFRRCSHFVFKNCLIKIKRLHSNAEIPRRATPESAGFDLHSIDNITINPGEHKPVRTGLAFEIPPGYAMFIYPRSGLAKNHGLTLSNAVGVVDSDYRGEVVVLLHNAGEHQVSFQIGDRVAQAIIHRLPDIELVECEELTETERGRGGFGSTGL >NZ_CP019698|642806:674971|655951_656785_+|WP_077713184.1|DBSCAN-SWA MELWYTERGIVPGLGLSVQVTKVLHEEQTEFQHLAIVDTKIFGRMLWLDNIIMTSIKDEFVYHEMISHVALNTHPNPKKVLVIGGGDGGVIREVIKHPSVEKAILVEIDRRVVETSKQYLPEIACGLDDPRVEVLFEDGIKYAQEHKNEFDIIITDSTDPIGPAVGLFEGSFYKSCYEALKEDGIFVAQTESPYHDAELIPKIQKNIRSLYPITKVYLAHIPTYPGGCWTFTMGSKKYDPEAVDLSNKPTFDTRYYNHEIHKAAFVLPNFVRELINK >NZ_CP019698|642806:674971|651790_653356_-|WP_077713180.1|DBSCAN-SWA MRSKLYQIIFLFLFLCCFSVVINFQRDNHALPTSVPVPDKIDLTYALAEPIQTLDPARASNLAEAKVISNIFEGLVRYKPNSTEIEPCLATTWEVDQGGKVWTFHLRQDVKFHDQTPFNAAAVKFSVERQLPPQKKDSMLYGSFTFGMVEAVEVIDDYTVRFVLRSPYAPFIRNLAMPWAAPIISPNSVAKYGDEVGQHPVGTGPFQLAKWDKEGVVLVAFKDYWGNQASFNSLAFSHLSPEQRRTKLQDGTITLCDMDGLKTKDTPDIKLLKQPTASLGYLGLYNNKSPFNNSRVRRAVCIAVNREEISRKLFGSPSLAANSILPPGFLGYNQNLKPYTGGAAKAKAMLKECGYPEGIDITLITYRSSRPYNPLGGEELAELIKEQLAPAGIRVKVKTYPWHEFKTALRNQEGDAFLFGWVGDNLDPDNFLYTLLAADEVTNLTFYKNSEVNRLISAAQKEVDEKIRLRLYYHAQQIMLQDTPMVFLNYAQTNIACRQELTGVEFNLYGIPLLTKAHFKS >NZ_CP019698|642806:674971|653482_654343_+|WP_077713181.1|DBSCAN-SWA MSIRFGSAGAPEAFYQQGHKSSLEMPAWLANMGLNAYEYQCSRGVKIKEAMARELGERARLHDIALSIHAPYYINLSTEEEEKKQKTKGYILDSLRAARWMGATTVVFHPGGGPGKDRRSTMDRAKALFAEILQEVAAEGLDDILLAPETMGKINQMGSLEEVLELCELAPQVVPCVDFGHLNAVTQGSLTTKESYAEILDKIASALGQDALTHLHIHFSPIEFTKAGEKKHWTLKEAHLYGPPFEPLAELLWERKLEPVIICESAGTQAEDALVFKQMYEAVRGR >NZ_CP019698|642806:674971|644165_644339_+|WP_169843574.1|DBSCAN-SWA MKKYLFPLLGAVYLGLSTIGNKVYRLLYEEETKQGINIEICRPWERRRGYPHHYTSR |
31 | Streptococcus_phage(42.86%) | holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
864685 : 950070
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP019698|864685:950070|DBSCAN-SWA 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77 | Leptospira_phage(42.11%) | holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
2147192 : 2153681
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP019698|2147192:2153681|DBSCAN-SWA ATTATACCGTAAATGTCTTCAGCAGATTAGCCATTTCAATGGCGGTGTTGGCAGCTTCCCATCCTTTGTTACCTGCTTTGGTACCGGCCCTTTCAATGGCTTGTTCAATGGTGTCCACAGTTAACACACCAAAGATAACAGGTAAGTTAGCATCCAAACCTACTTTAGCCACACCTTTGGAAACTTCCGCGGATACATAGTCAAAGTGAGGTGTAGCACCCCGAATTACCGCACCCAGGGTAATCACTGCATCATAACGGTTTAAGCCGGCCATCTTTTTAGCCACCAGCGGAATTTCAAAGGCACCGGGAACCCAGGCCACCTCAATATCATCCTCTGCTACACCGTGACGCACCAGCGCATCGATAGCGCCGCTTAACAGCTTGCTGGTAATAAACTCATTAAAACGACCTGCCACAATACCGATCTTTAGTCCCTGACCTAGTAAGTGTCCTTCATATACCTTTGGCATCATTATTTCCCCTCTCTGGTTCATATTTTATAAGTCCTTTGCTACTCGTTGACAGGTTTCTTTCTTTCATTAAGGTTCAACAAATGCCCCAGCTTGCATTTCTTTGTACTGAGGTATCTTTCGTTAGATTGTCCGGCAGCCACCTCGATGGGTACCCGATCCACCACTTGCAGACCATAACCCTCCAGTCCGGCAATCTTACGGGGGTTGTTGGTCAGTAACCGTATTTTGGTAAGCCCCAGATCCGCTAAGATTTGCGCACCAATGCCATAATCCCGCAGATCTGCCGGGAATCCTAAGGCCAGATTGGCCTCCACGGTATCGGCCCCCATATCCTGTAGCTTGTAGGCTCTTATTTTATTCATCAAGCCAATGCCCCGGCCCTCCTGCCTCATATAAAGGAGGACTCCAACACCTTCCTTGGCAATGGCTTGCATGGCCTTGGCAAATTGTTCTCCACAGTCGCAGCGCAGTGAGCCAAAGACATCACCGGTTAGACACTCGGAATGCACTCTCACCAAAGGAGCCTCTACACTACTGAGATCCCCTTTTACCAATGCCACATGACCCTTGCCATCGATAGTACTTTCATAGCCCACGGCTACAAAATCACCATATTTGGTGGGCATCATTGCGGAATCTACTTTCCTCACAAATTTTTCATGATGCCTGCGGTATTTAATTAAATCGGCAATGGTGATTAGCTTTAGTTGATGGGTTTGGCAAAACTCCACTAATTCCGGAACTCTGGCCATGGTGCCATCGTCCTTCATAATTTCACAAATGACTCCGGCAGCTTTTAAACCCGCTAATCTGGCCAAATCCACCGCTGCTTCGGTATGACCGGAGCGTACCAAAACACCGCCTTCTTTAGGACGTAGTGGGAAAATGTGTCCTGGCCGGCGTAAGTCCTCGGGTTTGGTCTTAGGGTCTAAAATCTTTTGCACAGTGAGGGCCCGTTCAACGGCTGAAATACCGGTGGTACATTCTTTGGCATCCACTGAAACGGTGAATGCTGTACCATGGGGGTCGGTGTTGTTGGTAACCATGGCAGGCAGATTCAGCTCATCCAGTCGTTCGCCATAAATAGGCATGCAAATTAGCCCGCGAGCATAGGTAGCCATAAAATTAATGGCTTCGGGAGTTGCTTTTTCGGCGGCTATCACCAAATCGCCCTCGTTTTCCCGGTCCTCATCATCCACTACCACCACCATTTTACCGGCACGGATATCCTCTAAAGCTTCTTCAATGGTATTAAATTTAACCGTCATAACTAGTCCCTCCTATAAAAATCCGTTCCTGGCCAAAAACTCCATGTTTATTTTACTATTTCCCTTTACTTCCTGCTGCTCACCCTGCAGTAACCTCTCTATATATTTGCCAAGGATATCTGACTCCAGGTTAACCGTAGCCCCGATTCCTTTGCTGCCTAAGATAGTGGCCTGGGCTGTGTGGGGAATAAGGGAAACTTGAAAAGTATCCCCCACAAAATCCACCACCGTCAAACTGGTCCCGTCAATACCCACGGACCCTTTTTTAATGATATACTTCATCACCTGGGGTGGCGCCTGAATGGTAATTAAAGTGGCAATATCGCGTTTTTCTATGCGCACAATGCTGCCCACACCATCCACATGGCCTGATACCCAATGGCCGCCCAAACGATCCCCTAATCTTAGGGCCCGTTCCAGGTTAACCTTACTACCTGGCCTTAAGGCTCCTAAATTAGTTTTGGCCAGGGTTTCAGCCATGACATCAGCGGTAAAACTTCCCTCACTAAAGGCAGTGACAGTTAGGCAAACTCCATTTACCGCTATACTGTCCCCGAGTTTAACATCCTCCAATACCTTGCTGGCTAGAATGGTTAAATGGGCCGAATCCGGGCCTCGGGTAATGCCTTTAATGGTACCTATTTCCTCAACTATACCGGTAAAGATAAGCTGCCACCTCCCTTTGAGGTATATCCAGTAAGCAAGATGTCTTCACCCAGCCTCTGTACCTCCACATCATAGAGCTGGGTAGCATCCCGCAAGGTGGCTACTCCCTCGCCTCTGACGGGGCCTGGCGCGGCATCACCGCCAATAATTTTGGGAGCTATAAACCAAGCCACTTTATCCACGATACCCGCCGCCAGGGCGGAACCGTTAACTTTGCCGCCACCTTCTATAAGAATACTGGTAATTTGTTTTTCACCTAACATTTCCATCAGCTTGTTCAGGTCTACCCCCGGTCCTGTCCCGGGAACTATTAATACTTCGGCTCCCGCTGCCATCAAACTGGCCCGCCGCTCCACCGGAGCAGCCTCGGTGGTGGCCACAATGGTATGGGCCGCCGATTCCTGGAGCAGTATCTTAGCCCCGGTAGGCGTGCGGGCGTAGCTGTCTAAAATAATGCGTATGGGGTCTTTGCCTCTACCCTCGGGCAATCTTGCCGTGAGGGAAGGATCATCGGTCAAAATGGTATTAACCCCCACCATAATGGCGTCGTAACTATCCCTCAATCGGTGCCCATAGGCCCGGGCTGCTTCACCGGTAATCCATTTAGATTCACCGGTGGCAGTGGCAATTTTACCATCCAGACTGGTGGCTGCCTTAAGCACCACAAAGGGACGCTTGGTGGTGATATACTTAATAAATACTTCATTTAATCTCTTGGCTTCCTCTTCCAGGACGCCGCATTTTACTTCCAGACCGGCTTTCTTGAGGATAGCCAGTCCCTTACCTGCCACCAATGGGTTGGGGTCGGTCATGGCCGCCACCACCCTAACTACGCCGGCCTTGATCAGTGCCTCGGTGCAGGGTCCGGTACGACCATAATGACAACAGGGTTCCAGCGTGACATAGGCAGTGGCACCCCTGGCCTTTTCTCCGGCATCCGCCAGGGCCACCACTTCGGCATGGGCACTGCCTGCCTTGGCATGAAAGCCCTGGCCAACCACTTCTCCATCCTTAACCAAGACAGCTCCCACCATCGGGTTAGGACTGGTGCGCCCTCTGGCTTTCTCTGCCAATCCCAGGGCCAGTTGCATATAATGTCTATCCTGATCCACTCACAGATCATCTCCCAAGTAAATAGTAAAACCCCGGGAAACCCAGGGTTAAAGGCAAAAGGAGAATAAACCTAACAAAAAGTCATTTTTGCGAGGTTTCTTGACAACCTTCTCCCATCCAGACTTTAACTGTCGGCTCTGGCATCTCACCAGATCCTGCCCTTGCGGGCTCGCGGGCTCGGCCCAAGGCCATACCGCCGGTAAGGAATTTCACCTAACCCTGAAGGTTACTACTTATTCAATTAAGACCATTATATTCCTGTGGTTGTTCGTATGTCAATGGTTTATCAAGTATTAACCTAATGGCTAGGCTCATTTATAAGGCAAAAGTAGTTTCACCATTATTATTTTAAAAAATGTAGTGACATTTAGAAGTTAATATTATATATTACAATTAAACGATTGCTTAATTGTTTAAGAGTGGGTGATAATTATGACCTTTGAACATTGTCAGGAACACTGCGTCCATAACGAAGTCATTGCCCGTTTAAAACCGGCCGCGGAAGAGGCTGCCAAACTGGCACCTCTGTTTAAGGCTTTGTCCGATGAAACCAGGGTAAAGATTATTTATGCCTTAGCCCAGCAGGAATTATGTGTCTGTGACATTGCCGAACTAACCGGCTGTACCCTGCCGGCGGTTTCCCATCATCTGCGTATTTTGCGCCATATGGGTTTGGCTAAGAGCCGCAAGGAAGGCAAATTTATCTACTACAATATTGACGACCACCATGTTTCCCAGATTATTACCGCTGCCTTTGAACACCTAAAGGAGGACAAACAGCATGGCTAATTCTCCATTAGAATTCCGCTTGGAAGGCTTATCCTGTGCCGATTGCGCTGCCAAGCTGGAAAGACAGATTGCCTCCTTGCCAGGGGTGGAACAGGCAAAGCTTAATTTTACCGCGGCCAAGTTAACGGTTTACGGTAATGTGGCAGCAAGCCTGGTTATTGACGAAGCAAAACGGGATGGAGTCAGGGCCATTCCCGCGGCGGAATACCGGCAACAGGAAGAAACAGCCTTTTGGGAAAAGCATCGTCGGGCCATCATTAGTGGCCTAGCTGGTCTCTTGGCAGGGCTGGGCTGGTTGCTGCATGATGCTTTAGGGATGGTAACAGCAGCTAAGGCTCTTTATTTAGCTTGCATTATTGTGGGTGGTTATCCGGTGGCCCGCAAGGCTCTCTACGCCCTCAGCCGCTGTCGTCTGGATATGAATGTGCTGATGACTGTAGCTGTGCTAGGGGCAATCCTAATTGACCAATGGAGTGAAGGTGCCACGGTGGCCTTTCTCTTCTCCCTGAGTGAAGCATTGGAAGCCTATACCATGGATAAAGCTCGCAACTCCATAAGTAGCTTAATTAAGCAGGCCCCTTCGGAAGCAACCATTAGAAGAGACCACCAGGAAATAAACCTGCCAGTTAGTGAAATTAAAGTTGGTGATATTTTAGTGGTGCGTCCGGGGGAAAAAATAGCCATGGATGGGATAATCTTGAGCGGTTCCTCCACCGTCAACCAGGCTGCTATTACCGGTGAATCAGTACCGGTGGAACGCCAACCGGGCGAAGAAGTTTTTGCGGGAACGATTAACGGTGAGGGCAGCTTAGAGGTGCGAGTCACCAAGCTGGTGCAGGATAATACCCTGTCGCGGATTATTCACCTGGTGGAAGAAGCCCAGGCCCAGCGGGCGCCGGCTCAAACCTTTGTGGAGCGTTTCGCTGCCATCTATACTCCCATCGTGCTTATACTGGCGGTTCTGATTGTCACTATACCTCCCTTATTACTGGCAGAACCCTGGCAACCTTGGATTTACCGAGGTCTGGCCCTGCTGGTGGTAGCCTGTCCCTGTGCCCTGGTGGTATCCACCCCGGTGGCCATTGTTGCGGCCATTGGCAACAGCGCCCGACATGGTGTCTTAATTAAGGGGGGTGCCCATTTAGAAACCCTTGGCAGATTAAAAGCCCTGGCCTTTGATAAGACCGGCACCTTAACCCAGGGTTTACCTGAAGTTACCGAGATCATTACCGCTCCGGGAATAAGCAAAGAAACATTGTTAGCAGTGGCTGCAGCGGTGGAGCATCACTCGGAGCATCCCCTGGCCAGAGCAATTATGCGCCGGGCACAACAGGACCGGCTCAATTATCAACCGGCTACAGCTTTTCACGCCTTAACCGGACTGGGGGCCAAAGCCCTGGTTGAAGGCCAATGGGTACTGGTGGGTAACCCCCGTTTGCTGGAACAACAGGGCATCGACCTGACCGATTGGCACCCTTCCCTAACCAACCTCTCGGCCCAGGGGCAAACGGTCATTTTGGTGGCCCGAGACAATGTGGTTTGGGGCTTGATTGCCCTGGCAGATACCCTTCGTCCCCAGTCGGCAGCAACCCTGAGGACCTTAAAAGAACAAAACCTCTCTCCGCTCATTATGCTGACCGGTGATAACCAAGCAACCGCCCGCCACATTGCGACCAAAGTCGGTGTGGATCAATACCAGGCCAATTTACTCCCCCAGGATAAAGTAACCGCCCTTAAAGAGTTAAGGGAGACCCACGGGCTAATTGGCATGGTTGGTGATGGTATGAATGACGCGCCGGCCCTGGCCTCTGCCAGCGTAGGCATTGCCATGGGTACCGCCGGCAGCGACACCGCTTTGGAAACTGCCGATGTCGTCCTCATGGGAGATGATTTAACCAAGCTGCCCTTTGCCATCCAGATGGGAAGGGCCGCCCTGAGGGTGATTAAACAAAATATTTCCTTTGCCATTGGCATTAAACTACTGGCGGTGCTGGCAGTCTTTCCCGGCTGGTTGACCCTTTGGTTGGCCATTTTGGCGGATATGGGCGCCACGGTTCTGGTAACCTTGAACAGTATACGTTTAATTGGCCTAAAGCCTGCCACAGATAAAAATTCTTCCCCCACAGTCAAGCCGGCGCATACACATCATTGTGCCTGTGCCCATACCGGGGGAGGCTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP019698|2147192:2153681|2147192_2147663_-|WP_077714541.1|DBSCAN-SWA MPKVYEGHLLGQGLKIGIVAGRFNEFITSKLLSGAIDALVRHGVAEDDIEVAWVPGAFEIPLVAKKMAGLNRYDAVITLGAVIRGATPHFDYVSAEVSKGVAKVGLDANLPVIFGVLTVDTIEQAIERAGTKAGNKGWEAANTAIEMANLLKTFTV >NZ_CP019698|2147192:2153681|2149584_2150712_-|WP_077714544.1|DBSCAN-SWA MDQDRHYMQLALGLAEKARGRTSPNPMVGAVLVKDGEVVGQGFHAKAGSAHAEVVALADAGEKARGATAYVTLEPCCHYGRTGPCTEALIKAGVVRVVAAMTDPNPLVAGKGLAILKKAGLEVKCGVLEEEAKRLNEVFIKYITTKRPFVVLKAATSLDGKIATATGESKWITGEAARAYGHRLRDSYDAIMVGVNTILTDDPSLTARLPEGRGKDPIRIILDSYARTPTGAKILLQESAAHTIVATTEAAPVERRASLMAAGAEVLIVPGTGPGVDLNKLMEMLGEKQITSILIEGGGKVNGSALAAGIVDKVAWFIAPKIIGGDAAPGPVRGEGVATLRDATQLYDVEVQRLGEDILLTGYTSKGGGSLSLPV >NZ_CP019698|2147192:2153681|2148946_2149600_-|WP_077714543.1|DBSCAN-SWA MFTGIVEEIGTIKGITRGPDSAHLTILASKVLEDVKLGDSIAVNGVCLTVTAFSEGSFTADVMAETLAKTNLGALRPGSKVNLERALRLGDRLGGHWVSGHVDGVGSIVRIEKRDIATLITIQAPPQVMKYIIKKGSVGIDGTSLTVVDFVGDTFQVSLIPHTAQATILGSKGIGATVNLESDILGKYIERLLQGEQQEVKGNSKINMEFLARNGFL >NZ_CP019698|2147192:2153681|2147704_2148934_-|WP_077714542.1|DBSCAN-SWA MTVKFNTIEEALEDIRAGKMVVVVDDEDRENEGDLVIAAEKATPEAINFMATYARGLICMPIYGERLDELNLPAMVTNNTDPHGTAFTVSVDAKECTTGISAVERALTVQKILDPKTKPEDLRRPGHIFPLRPKEGGVLVRSGHTEAAVDLARLAGLKAAGVICEIMKDDGTMARVPELVEFCQTHQLKLITIADLIKYRRHHEKFVRKVDSAMMPTKYGDFVAVGYESTIDGKGHVALVKGDLSSVEAPLVRVHSECLTGDVFGSLRCDCGEQFAKAMQAIAKEGVGVLLYMRQEGRGIGLMNKIRAYKLQDMGADTVEANLALGFPADLRDYGIGAQILADLGLTKIRLLTNNPRKIAGLEGYGLQVVDRVPIEVAAGQSNERYLSTKKCKLGHLLNLNERKKPVNE >NZ_CP019698|2147192:2153681|2151145_2151502_+|WP_179946665.1|DBSCAN-SWA MTFEHCQEHCVHNEVIARLKPAAEEAAKLAPLFKALSDETRVKIIYALAQQELCVCDIAELTGCTLPAVSHHLRILRHMGLAKSRKEGKFIYYNIDDHHVSQIITAAFEHLKEDKQHG >NZ_CP019698|2147192:2153681|2151494_2153681_+|WP_077714545.1|DBSCAN-SWA MANSPLEFRLEGLSCADCAAKLERQIASLPGVEQAKLNFTAAKLTVYGNVAASLVIDEAKRDGVRAIPAAEYRQQEETAFWEKHRRAIISGLAGLLAGLGWLLHDALGMVTAAKALYLACIIVGGYPVARKALYALSRCRLDMNVLMTVAVLGAILIDQWSEGATVAFLFSLSEALEAYTMDKARNSISSLIKQAPSEATIRRDHQEINLPVSEIKVGDILVVRPGEKIAMDGIILSGSSTVNQAAITGESVPVERQPGEEVFAGTINGEGSLEVRVTKLVQDNTLSRIIHLVEEAQAQRAPAQTFVERFAAIYTPIVLILAVLIVTIPPLLLAEPWQPWIYRGLALLVVACPCALVVSTPVAIVAAIGNSARHGVLIKGGAHLETLGRLKALAFDKTGTLTQGLPEVTEIITAPGISKETLLAVAAAVEHHSEHPLARAIMRRAQQDRLNYQPATAFHALTGLGAKALVEGQWVLVGNPRLLEQQGIDLTDWHPSLTNLSAQGQTVILVARDNVVWGLIALADTLRPQSAATLRTLKEQNLSPLIMLTGDNQATARHIATKVGVDQYQANLLPQDKVTALKELRETHGLIGMVGDGMNDAPALASASVGIAMGTAGSDTALETADVVLMGDDLTKLPFAIQMGRAALRVIKQNISFAIGIKLLAVLAVFPGWLTLWLAILADMGATVLVTLNSIRLIGLKPATDKNSSPTVKPAHTHHCACAHTGGG |
6 | Staphylococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
2259089 : 2327927
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP019698|2259089:2327927|DBSCAN-SWA TTTGTATATTCTCCAACAAACCCTATTTTCCTTCGAAGAATTGATGGAACTTGAATTAAAAGAACGATTGCATCTATTTTTTTCAAACTTATCCCTGGAACCATATACTGTCAAACTAAGAAGTCGATTACCCCAAGGAGCTAAAGGTTTTAGAAGAGATGCCATCTTGAGGGCATTGCTGGCAGCTCCCCTTGTTGGTATTAGCACATTTACCGGCTTGGTAGACCGTTTGAAATCTGATATACGGTTTCGTTATCAATGCGGATTTGGCGTAGGCAGTGTACCTTCCATAGCCACATTCAGCCGGGTATTTCAGAAGATAACAACCTTAAATTTGGCAGAAGAACTTTTCCTGGCCTTGGTGAAAGAGTGCCGCGAAAAAGGCGTTATCAGCGGCGAAGTGATTGCTATAGATAGTACGGCTATTAACGCTTACGAACAAAAACAAGCACGCCATAAAAGCAAGAATACAGGCAATGGCGATTGGGGAGCTAAAAAAGACTCCTTTGGCAATACCGTAACCTGGTTTGGCTACAAACTTCATCTGGCTGTGGATACCGAAAGCGAATTGCCTATAGCATTTGAAGTTACTCCTGCTAATGTGAATGATGGTGATCTTGGCCCGGTATTAATAGAAAAAGTTAGTTCATCTGTTCCTGAGAATGAAAAACCCAAGTTTTATGTTATGGACGCAGGCTATGACCAACTAAAGAACTATGAAGCAGCTCACAAAAATTCAGCCCAGGCCATTATTCCCTTAAACCTTCGTAACGAGAAAGAACCCCCTGCTGGAATGACATCCAATGGCACTCCGGTTTGCTCCATGGGTTATGAGATGGTCTACTGGGGAGCAGATAAGAACATTTTAAAATTTCGTTGCCCCCACATTCTCGGCAAGGTAGACTGTCCATTTGGTTCTGCCTGGTGTTCCGCTTCAAATTACGGGCTGGTCAAAAAAGTCAATATTAAAGAAGATCTGCGTCGTTACTCCAGTCCTCATCGAAACACCAGAAAATGGGAAGAGTTGTATGACCAGAGAACAGCCGTCGAGAGAGTAAATTCAAGACTAAAAGTTCATCTTACAGCCAATCGGTTGCATGTTTGGGGAATCAAAAAAGTTAAAACTCATCTGTTGCTAAACATGATTGTTTTATTGGTCGGCGCTTTGGCTTGTAAGCAATCACTACAAAAAGCAGCATAAGGTCTCTTGCTTTTAAGCACTATCGTATTTTTTAGGCAACGCTAAAAATTCTGCCCTTGTCTTCTTTTTTAGTAATTAAGCTGTCAAAAGTGTGGTTTTTTTAAAATTTACCAATTGGATGCTTTGAGTAATCTGTTGATCTTTCAAAAAAACTTATTTTGCAAAATGCTCATCTTTTAACAGTGCACCATATAATTCAGGTCTTCTGTCATTTAAATAAAAGCTATTTGCCATTGAACAACTTTCTTGCCCTCTAATTAGATTAATTTTGCTAGCATCTAATTTTGCCACCAGCATCCCTTCTGTACCGTTAAAATCCTCAGCAATAACTTGTCCCTTAGGGTCAATCACCATAGCACCGCCACAGTAACTGTGTCCCTCTCCATCATCACCCACCAAGTTACAGGCTGCAACAAAAACACAATTATCATAAGCCCTGGCAATAAGATACTTCAGCCAAATATCCCTGCGATCACCCACAATAGATGGTGATGCATGGGGTGCTAAAATAAGTTCTGCGCCTTGCAAGGACAGAATGGTGGTCATTTCAGGAAAATGCAGATCATAGCAAATCTGAATACCAAAGTTTATTTTAGGTGTCTTAATTACTTTAATATCATTACCTGGGGAATAGAAGGGTTGTTCACTTCTGCCCAAATGAGTTTTGCGGTATTTGACAATGTTGCCATCTGCCAGAGCCACCACTTGAGTAATATAAGGTTTGCCATGATCGTTTTTTTCGGCCAATCCAACAATCACTGTAATACTTTTTTCCTTGGCCAGCTGACTCAACTGATCAATAATAACGCTGTTCTCCAGATCAAGGGCCAGATTTGTCATAGGTTGTCTGCTGTAACCCTGCAGGCACATCTCAGGAAAACAAATAATATCTACCTGCTTGGAGGATGCCTCCTGTACATAGTGGGCTATCTTATTTAAATTTTCTTGGATCAGACCTAATCTAGCTTGCATTTGCACCAGGGCAATGGTGATATCTTGCAAAACAAACAACCTCCAAATTTATGCCTGGCATAATTTTACCGCGCTTGCTGCGCGGTAAATGACTTATGCTTTTCCAACGTTTCTTAGTATTTCAGTAATTTGCTGGTATTTATTCATGGTATAAAGGTGAATGCCATCTACGCCGTTGTCCAGTAAATCCTGAACCTGCCGGCTGGCATACTCTATACCTGCCTTCTCCATATCTTCCGGGCTGTCACCATACTTGTCAACCAAAATTAATAACTTAGCAGGCATGGAAGCACCGCAGAGGGTAATCATTCGTTTAATTTGTTTGGCATTGAGTACCGGCATAATACCAGGAGACACCGGGCAATTAATACCGATTCTCCGTGCATTCTCGATAAAGTTATAAAAGATACGATTGTCAAAGTAAATTTGGGTTACCAGAAAATCTACGCCCTGATCTACTTTGTACTTTAACCAATGCATATCTTCACTCAGGCGTTTACAATGAACATGCCCCTCCGGGTAGGCGGCAGCTCCCACAGACATGTTACTACAGTTTTTTATATGCCTGACCAGATCAGAGGCATATTGGAAGTCACAAGCAGAAAAATCGTAGTCCGGTTGATCAGCCGGTGGGTCTCCCCTGAGAGCCAGGACATTCTCAATATTCTCACTCTCCAGATCTTTGAGAATCTTGTCTATCTCAGCGGTGGTGTGACCCACACAGGTTAAATGTGCCAGAGCTTCAACTTTATATTGATTTTTAATACGAGAGGCAATCTCCCTTGTTCTGTCTCTACTACTGCCACCTGCACCATAGGTAACACTAATGAAGTCAGGCTTTAATTTAACCATTTCTTCTAAGGTATTAAATATGGTTTCAATAGGTGTTGTAGTTTTGGGAGGAAATATTTCAAAGGATATAACTGGTTTTTTTTCTTTAAACAATGCAGATATTTTCACGTAATGATCACCTAGCCTTTATTTTCCTGAATGGTTGCCTTTTTATTATTATAGCTTGGTAATTCATGTTGCGAAATAACAAATATGTCATACTTTTCATTGTATATTGTATTTTCTATTTTAGATGGATGAGAATATTTCTTACAACATTCTAAACTCTTACTAAACTTGCTTGTTTAATTTTTGATGTAATATTATACTGGAAAATGGTAAGAATAGGATTTAGTTAACTTTACTAAGGAGGTTACCGATGTCCACTGAAAAAAATCTGAAAGCTGCCTTTGCTGGGGAATCCCAGGCAAACCGCAAATATTTGGCCTTTGCTGCTAAAGCTGATCAGGAAGGTTATCCAGCAGTTGCCAAGTTATTTAGGGCTGCAGCTGAAGCGGAAGCACTTCATGCGTTAAGTGAATTAAAGGCTTTAGGGGGCATTAAGTCCACAGCAGAGAATTTACAAGAGGCCATTAATGGTGAAACCTATGAGTTTACCGAAATGTATCCTGGCTTTATTGAAACCGCAGAGGCTGAGGGCAATAATCTGGCCAAGAGAGCTTTCCACTTTGCCAACGAAGCGGAAAAGGTACACGCCGAACTCTATAAAAAAGCCCTGGCAGCCTTAGAAAGCAAAGAAGATTTTGATTACTACCTCTGCCCTGTCTGTGGCTATATTCATGAACGCACTGCCCCGGAAAAATGTCCCATTTGTGGCGCCAATGGAAGTGCATTCAAAAATCTAGGTTAATATGTAACAAACCCATGTTCACTGAAACATGGGTTTGTTTATTTAGCCAGCTGCCTTATTTAACAGTTTTAACATAGCCTTAAAATGTTCATCCTTACGCATCATATCAGGAATAACAGAGCAGGTGTTTTCATCAACCTGGATTGTCCAAGAGGCTACCTTTGTACCATATATCACCGCTTCGCACAGGGGACGTTCATAAGTTAAACCCCAAACCGTTCCCGAGAAAAAGGCATCACCGGCACCACTGGAATCCACCACCCGGGTGGGCAAGGCCGGTTGATAACCACTTTCCTCCCTTTGGCGATCATAGAAGACAGCTCCCCTATCCCCCAAGGTTACTACCATGGCTTTCATTTTAGCATTACTGACAAAGGTTTTTAATTCATTTTGGATGACAGCAATCTCCTGACCAAGGATATTCTGGCCAAAAAGCTTGGCCGCCTCAATTTCGTTACATATAAAACAATCTGTAAAAAGCAGCAGTTCCTGATGATTTAATACTACCTCTAAATTACCAGGTAGGCCATAGACAGGCTTGCCAAAGGTTTGGGCAAGCTTAACCACTTGATAAGAGATATTTTTATTCAGATCCAACTCCAGCACCACGTGACTACAGGTTTCCATCATTTGGTGCCCATGTTCATGGATATGTTTTTCCAAGAGACTCAAATCAGGCATTTGTGATATAGACCCGGCCAAGTCACCCTTTTGATCTAATATAGCCAACCACATGCCCATGCCCTTTTCTTCCACTGTGGTTAAAAACTCTGTATTGACCTTGGTTCTCTTCAGCCTGTTAATAACCTCTTGCCCCAAGGCAGAGTTATCCACGGTGGAAACAAAATAGGTGGATAGCCCCAGGTAGGCAAGATTTTCTACCACATTGCGACCCACACCACCATGGAAAAAGCGGATATGACCGAGATTTCGACCCAAGGGGTCGTATTGTTGTTTGGCAAACCCTTTACAGTCCATAAAGGTGGTACCAATAACAGCTACTTTTGGTTTCATAGTTACCTCGCTTGTTCTCTAAACAGTATTTACGATCGAATTCGCTGGTAACACACATATTCCTTCTTTATGACCAAAATACGTCTGACTTATACATTTTTTAACAGAGAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP019698|2259089:2327927|2293776_2294247_-|WP_077714654.1|DBSCAN-SWA MKNVFYYQTELGVIGIADNGAAITDVFFGQEAAPKELVEKETPLIKKAITEIKEYLAGKRTSFDLPLEMKGTDFQKATWQALLTIPYGETRSYKQIAEQIGRPKACRAIGMANNRNPISIIVPCHRVIGANGSLVGYGGGLELKARLLSLEKANKS >NZ_CP019698|2259089:2327927|2287332_2287866_-|WP_179946666.1|DBSCAN-SWA MNLKGTRTEQNLKEAFSGESQARNKYTYWASVAKREGYEQIAAIFLETADNEKEHAKRLFKFLNGITDTKTHLKEAAAGENYEYTNMYVEFEKVAREEGFDEIADVFREIGEVEEEHEKRFLALLKNIEEGKVFKRDEEVKWKCRNCGYVHKGKEAPHICPACAHPQAHYELLCENY >NZ_CP019698|2259089:2327927|2292013_2293207_-|WP_077714652.1|DBSCAN-SWA MKAQVPLSELDSRMNRFRTKMDEACPDWQVVVIVSKVNLFYLTGTMQEGMLIIPRQDEAILWVRRSYERALDESLFRQIKPMNSYRDAAAYYQQLPNEVYLETEVMPLAFYQRMRKYFPFTDVKSVDAQIAAVRAIKSPYELSLMEQSGKIHRRVLEDLIPNILREGMSEVELGLELYTLMVKEGHQGIARFGMFDTEMIVGQLGFGDSSIYPTYFNGPGGNHGMSVAVPLLGSRERKLKKGDLVFVDVGCGVDGYHTDKTMTYMFGEPLPQEVMAIHRKCVEIQDRMAEMLRPGVTPAEIYNTIMNNLDSEFLKNFMGFGNRTVKFLGHGIGLVIDESPVIAAGFNEPLQEGMVLALEPKKGIANFGMVGIENTFIVTPQGGRCITGDNPGLIPVF 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60 | Streptococcus_phage(14.29%) | integrase,transposase | attL 2324689:2324706|attR 2327980:2327997 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
2356730 : 2388550
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP019698|2356730:2388550|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP019698|2356730:2388550|2359090_2360362_-|WP_077714704.1|transposase|DBSCAN-SWA MITKDAKLIQPKTVVVGVDIAKRVHWATVMYEGMPVGKAFAIRNTREGFENLLFTLNALKQKLGAHSIVVGMEPTGHYFKPLAYFLANTGMCQVVLVNPYHVNRSKEFDDNSPTKNDRKDARVIARLVSQGNYFFAPLNYGVWAELRNSNAERLQLIKKRWQLKNQLTTILDQFFPEFADVFKDILGKGAIYILTHYPFPADILEVEEQTLCEGLKEATTNRVGQKRARKLREAASHSIGIKEGLKGARNQVYHLVEQLELIQRQIKDVEIKMAEQIEETGMGKYLTSIKGVGVVSAAAFLAEIGNPDDYENYKQVQKKAGLNLKENSSGQHKGKTTVSKRGRPSLLQLMYQIALVSVARNPEMKNFYRYLTTRQENPLAGKQALIAVAVKMIKVMLAVCKRREYYDGSKVGKGHRDARLQAA >NZ_CP019698|2356730:2388550|2370358_2371363_-|WP_077714714.1|DBSCAN-SWA MKLFTKYMTRNDCYTAGRKITPKGIMVHSTAVPGVMAAEWFSRWNKSYKAGEINRQVCVHAFVDDKEIWQYLPWDHRGWHAGGAANNTHIGFEICEPAGFSYKSGSVMVGYDAAKQEDYFRKAWQNAVELCVMLCKKYGLNENDIICHSEGYKLGIASNHADVMHWFPKHGENMDTFRKAVKKALENSTDTNTDIGIGDMVEFKDSVKNYYPGSVEVPTWVKNDYYHRVTQTLYKGKPVIKGGKECVLLGKKVKKSGGQEIAGINTWVAKENLVIVNSIPDNKGNRTYTVQKGDTLWRIAEKELGRGTRYPEIKKLNGLTSDTIYPGQVLKLPE |
30 | Erysipelothrix_phage(70.0%) | holin,head,tail,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
2404413 : 2420136
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP019698|2404413:2420136|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP019698|2404413:2420136|2415442_2415835_+|WP_077713376.1|DBSCAN-SWA MNTREIAAEYRLAHWAQIVRRKNESGLSIKAFCANEGFRENTYYYWQRKLREAACEQLTEIRTEHAKLPCLVPPGFAELKITDAPEKFPVHNDAKQSEIRIELGGMRIAADSAYPVEKIAALLGLFKQLC >NZ_CP019698|2404413:2420136|2408447_2408672_-|WP_159438655.1|DBSCAN-SWA MREQVQAALDQVRPFLQRDGGDVELVDVDETSGVVKVKLKGACGGUPGATYTLKNGIERSLKQAVPEVKEVVSV >NZ_CP019698|2404413:2420136|2416236_2417709_+|WP_077714751.1|transposase|DBSCAN-SWA METANNWTEIIAEKDARIAELEMLVKFYEEQFRLSKHRQFGPSSEKGTLPGQLGLFDEVEKEADLQKNEPELEEITYARRKRIGKRKDDLSALPVETVEHTLPEEERVCPECGGMLREMGHDTRRELVIIPPQVKVVEHRRAVLSCRNCEKNGDHVPIVKAEMPKPLISGSLASPSAVAHIITQKYVQHIPLYRQEQDWKRQGVRLSRQTMANWVIRCSEDWLLPIYERMKAILLTQDVLHADESTVQVLREPGKTAVSNSYMWLYRTSGDTKRQIVLFEYQPSRSSTHPRQFLKGFRGFLHTDGYAAYHTLPGVTVVGCWVHMRRKFEDALKAIPNCERAVSSANDAVRRIGLLFHLEEQWESLTPEERYKLRLEKSKPLAEAFFGWLQTLTVLPKTAMGKAVHYALEQREWLMNVYLDGRTELSNNRAENAVRPFALGRKNWLFCNAVKGAISSSVVYSIIETAKANGLLPFECKRQTRRHLESHIQN 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>NZ_CP019698|2404413:2420136|2418588_2420136_+|WP_077714753.1|transposase|DBSCAN-SWA METANNWTEIIAKKDARIAELEMLVKFYEEQFRLSKHRQFGPSSEKGTLSGQLGLFDEAENEADLQKSEPGLEEITYARRKRIGKRKDDLSALPVETVEHTLPEEERVCPECGGMLHEMGHDTRRELVIIPPQVKVVEHRRAVLSCRNCEKNGDHVPIVKAEMPKPLISGSLASPSAVAHIITQKYVQHTPLYRQEQDWKRQGVRLSRQTMANWIIRCSEDWLLPIYERMKAILLTQDVLHADESTVQVLREPGKTAVSNSYMWLYRTSGDTKRQIVLFEYQPSRSSTHPRQFLKGFRGFLHTDGYAAYHTLPGVTVVGCWVHMRRKFEDALKAIPDSERAVSSANDAVRRIGLLFHLEEQWESLTPEERYKLRLEKSKPLAEAFFGWLQTLTVLPKTAMGKAVHYALEQREWLMNVYLDGRTELSNNRAENAVRPFALGRKNWLFCNAVKGAISSSVVYSIIETAKANGLLPFEYMKFLLETVPSTSVGELDALLPWGEAIPEKCRMPLTKENA >NZ_CP019698|2404413:2420136|2406725_2407472_+|WP_077714743.1|DBSCAN-SWA MARKILVLDPGHGGRDPGAIGHGLLEKDITLKLAQIIANGLANYDVTVRLTREGDIFLSLDDRAAFANKLGADYFLSIHVNAGGGTGFESFIYNGPISSNTSSLRSIIHQNIVKFLKGLGIADRGEKRANFAVLRETTMPACLLEILFIDSEKDAIYLKDTAFMKGIGDAIIAGVVQSLKLPAKTSPTPTPTPKPTQPPTPIWNPQAEVQKLIDAGIIVNDHPADAPVTWGEFATVLNRILNKMKQES >NZ_CP019698|2404413:2420136|2408807_2409032_-|WP_077714745.1|DBSCAN-SWA MREKVIQVLEQVRPFLQRDGGDVEFVDVDENGVVKVKLRGACGSCPGALYTLKNGIERTLKQHVPEVKEVVRVE >NZ_CP019698|2404413:2420136|2418163_2418517_+|WP_077714599.1|DBSCAN-SWA MLSLAGKRVFLACGHTDMRKSINGLAAIVEGSFKLDPCDGALFVFCNRSRDRIKILEWDGDGFWLHFKRLEKGHFRWPTSGEEQTLVLTGEELSILLGGTRVALKLRREELLGKRIT |
18 | Leptospira_phage(33.33%) | integrase,transposase | attL 2397457:2397472|attR 2416665:2416680 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
2510743 : 2519545
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP019698|2510743:2519545|DBSCAN-SWA GTTACTCTTTATCTTTAACTAACACCCGCCGCCCCTGTATCTCTAATCTACCTTCGGCGAACAGCTTGATGGCTGCGGGATAAAGTTTGTGTTCCTGCTCCAAGATTCTGGCAGCCAGGGTTTCCTCTGTATCGTCATCCAACACCGGTACCGCTGCTTGCAAAATAATGGGGCCGGTATCCATGCCTTCGTCCACAAAATGAACGGTACAGCCGGAAATCTTCACGCCATAATTCAGGGCGTCCCTTTGTCCGTGCAGCCCTGGGAAGGATGGCAGTAGGGCCGGGTGAATGTTCATAATTCGGTTGGGGAAGGCCTGGAGCAGTGGTTCACCAACTAAACGCATATAACCAGCCAGACACACTAACTGCACCTGGTATTGTTCCAGCAAACGCACGATTGCCTGTTCATACTCAGCCTTACTGGCAAAATCCTTGTATACCACGCTGTAAGCGGCAATTCCCGCACCTTTGGCACGTTCCAAAGCATAAGCCCCGGGCTTATCACTGATGACCACCACCACTTCGGCCGGCAGTTGCCCGGCCGCACATTGGTCCATGATGGCTTGTAAATTGGAACCCCGTCCGGAGGCTAGGACACCGATCCGTAGTTTGTCCATGACACATAACTCCTTAAAATTGGCCGTCAGCCATCAGCCTTCAGCCATCGGCTTTTTTAAACCACCACTAAGCAGGCAGACTAGCTATTCCATATGTGAAGGGGAGCGTTCGGATGCCCTCTCCAGATAATAATTAATCTAGTCGCAAGAGCGTAGCGTTGGAATTGCTAGGCTGCCAGCGTCATTATAGCAATAACCCTGACAATTCTAAGCTCCGATATACTCCACCGCCGGGCTACCCTCTGCCACTTTACCGATCAGGTAGGCCTGCTCTCCCTGACTGGCCAACTCCTGCCTAATACTTTCTGCTTCCGCCGGAGGAACCACCAGCACCATACCGATACCCATATTAAAGGTACGTAACATTTCCGCCTCGTCCACCTGACCAATTTGTTGAATTAACTGGAATATCGGCAGTACCGGCCAGGTCTTTCTATCCAATACCACCTTTACCCCGGCGGGCAGCACCCGGGGAATATTTTCGGTCAGCCCGCCACCGGTGATGTGAGCCATACCCTTGATAGTGTATTTAGCCAGTAAAGGAAGGACAGCCCTGACATAAATTCTGGTGGGAGTAATTAATTCCTCCCCCACAGTCCGCCCTAAGGCTTCTACGTAGGAAGTAACCTTATAACCGGCCACTTCCAGCAGGGCTTTGCGAGCCAGGGAATAGCCGTTACTGTGCAGCCCCGAGGAGGGTAAGCCGATCACCACGTCTCCTGCCTCAATGGTGCTGCCGTCAATAATTTTTTGTCGATCCACCACACCCACGGCAAAGCCGGCAATATCGTACTCATCCTCACCGTAAAAACCGGGCATTTCTGCCGTTTCTCCACCAATTAGGGCACAGCCCGCCTGGCGGCAGCCTTCGGCCACACCGCCAACGATATCCGCTACCCTTTCCGGCACCAGCTTGCCCACGGCTAAATAATCCAAGAAAAACAAGGGTTCTGCGCCTTGCACCAGAATATCATTAACACACATGGCCACTGCATCAATGCCAATGGTATTGTGCCGGTTGGTCAGCTGAGCCACCCTCAGTTTGGTGCCCACTCCATCGGTGCCGGAAACCAGGACCGGCTCTTGATATTTCTTAACATCCAAAGCAAACAGTCCGCCAAAGCCGCCCAGATCAGCCAGTACTCCTGGGCGAAAGGTACTGCGTACCGCTTGCTTCATTAACGATACCGCTCGATTGCCGGCTTCTATATCTACCCCCGCACTGGCATAGGTGAGGGGCTGGATTTTCTTGTCAGTCATCATACACTCCCCTATTCCAGAATGTACTTACCGCCATCCTTAGATTTTGGTATTTCTACGGGGTAACTGCCATCAAAACAGGCTGTGCAGAAACAATTTTGTTTAGGTGCAAAGATATCCAAAAGACCATCTTTGCTCAGGTAATGCAGACCATCAGCCTGAATTGTCTTTCTAATCTCTTCCAGAGGTTTTTGGGCAGCGATCAGTTCCTGCTCATCGGAGGTGTCTATGCCGTAATAACAAGAACGCAGGACCGGTGGTGAACTGATGCACAGATGTACTTCCTTGGCTCCCGCTTCCCGCAGCATAGCCACCAACTTCTGACTGGTGGTACCCCGTACAATGGAGTCGTCCACCATGACCACCCTTTTACCCTCCAACACCTCACGGATGGCATTTAATTTTAGTCGGACACCAATCTCACGCATTTGTTGGGTGGGTTGAATAAAGGTGCGGCCAATATAGCGGTTTTTCATTAATCCCTCTTCAAAGGGAATACCTGCTTCCTCAGCGTAACCCCGGGCTGCCGCCACACCGGAATCCGGTACAGGAATGACAATGTCAGCTTCCACCTGATATTCTCTGGCCAACTGGCGGCCCATTTCCCGCCGTACCCGGTTGACATTGAAACCGTCCATGGTGCTGTCCGGGCGAGCAAAGTAAATATATTCAAAAATGCAATGGGCTGGATTCTTGGCCCGCAAGCCCTGGGTAGAGCTCAGACCATCCCCATCTATCCGAATAATTTCTCCGGGCTCAAGATCCCTGATAAAGGTAGCGCCTACCGTAGTTAAGGCACAGGATTCCGAAGCCACAACATAGCCTTGTCCTAAACGCCCCAGGCATAAGGGTCGGAAACCATGGGGATCCCGGGCGGCATAGAGGGAATCTTCGGTAATCACCAACAGAGAATAGGCGCCTTTGACATCTATCATGCATTTCATTAAGGCTTCTTCCAAGCTATTGGCATTGTAGCGAGCAATTAGGTTCACCAGCACTTCACTGTCGGTGGAGGACTGAAAAACCGAGCCACTGTAAGCCAACTGGGAGCGCAATTCGCCAACATTGGTTAAATTGCCGTTGTGGGCCAGACCGATCATGCCCTTGGCATACCGAAAGACCAGGGGTTGGGCATTAAGGGGTTGGCTGCCGCCGGTGGTGGAATAACGCACATGGCCAATGGCCACATGACCGGTTAACTTGTCCAGGCTGTGGCCGGTAAAAACCTCTGCCACCAGCCCCATGCCCTTTTGTAATTCCACCCTTTGACCATTGGCCACTGCTATGCCGGCACTTTCCTGTCCCCGGTGCTGTAAAGCATAGAGGCCATAGTAGGTTAGTTTAGCCACATCCAGACCGGCACCATAAATACCAAAAACGCCACATTCCTCCACTGGCTTATCCGGTAAGACAATGGCCTCTACTGCCGCATTAGACATGGTATCGCCTCCCGCCAGGTTTCTGCCAGTTTTGCCACGGGCAGGTTCAACAGGTTCCCGCCACAGCCGCTGCAGCCGGGATTAACCACATTCAGCACTAAGGCGTTGCCAGCCACCTTACCCAGATGAGTATAGGGCACGCCGGCATCCACCAGCTTCTTCACCAGTTCCACCGAGCGGTTTTTGGGCACTGTAATTATAATGCGGGATTGAGACTCCCCAAACAGCAGGGCATCTCCCCGGAAGCGACGTACCATGGTAATGTCTGCCCCCAGGTTACCTGCGATGCAGCATTCTGCCAGAGCTACGGCCAAGCCACCTTCGGCACAATCATGGGCGGATTGGATTAAACCACTCTTAATTTCAGCCAGCACAAACTGCTGTACTTTCTTCTCCAACTCCAGATTGAGCTGCGGAGCATCTCCCTGCACCAAACCAAAATGTATTTTCAGATATTCGCTGCCCCCCAGTTCCGGCAGGGTTTCACCCACTAGGAAAATAGCGTCGTCCTCCTGTTTAAAGCCCGGGGTACAAACCTTGGTCAGTTCTTCCACCAAGCCTACCATACCAATGGTTGGTGTGGGGTAGACGGCGTTCCCTTTGGTTTCGTTATATAAACTGACATTGCCGCCGGTCACCGGTGTCTCCAGAGTGCGGCAAGCATCGGCCATACCCTCAATACATTGCCAGAAGGTCCACATCACTTCAGGTTTTTCCGGGTTGCCGAAATTGAGGCAATTGGTGACGGCCAGGGGTTTCGCGCCGGCACAAACCAGGTTACGGGCCGCCTCGGCCACCGCTATGGCCGCACCGGTTTTCGGGTTCAGATAGCAGTAACGGCCGTTGCAATCGGTGGTCATGGCGATACCTTTATTGGTGCCCTTGACCCGCAGCACCGCTGCATCGGCACCGGGTCGTACCACGGTGTTCAGTCCCACCATATGATCGTATTGCTGATAAACATACTCTTTGCTGGCAATATTGGGTGACGCCAACAGCTTTAACAATACTTCGTTATAATCTTCGGGCATGGGCAGGGAATCCAGGGAGTAATTCTGTACCTCGGCCAAATAGGGGGGCTGCGCCGTAGGACGATGATAGACCGGTGCCTCTTCCGTCAAGGCCTTGGCCGGAATTTCCGCCACCACCTGGTCCCCTTCCTTCAGCCGCAAAATACCGTCGTCAGTTACTTGGCCCACCACTACCGCGTCTAAGTCCCACTTGGCAAAGATTTCCTTGACTTTCTCCTCGGTACCCTTTTGTACCACCAGCAGCATCCGTTCCTGGGATTCTGAGAGCATCAGTTCATAGGGTGTCATACCCTCCTCCCGGCGGGGAACCAGGGCCAAATCCATCTCCAGGCCGGTGCCGGCTCGGCTGGCCATTTCACAGGAAGAACTGGTGAGACCTGCTGCTCCCATATCTTGAATTCCCACCACATATCCTGTTTTAATCACTTCCAGACAGGCTTCCAGCAGCAGTTTCTCCATGAAGGGGTCACCCACCTGGACGGCCGGACGCTTTTCCGCAGCTTCTTCGGATAACTCTTCCGAAGCAAAGGTGGCACCATGAATGCCGTCCCGACCGGTCTTGGCACCCACCACCATCACCGGGTTGCCAACGCCGGAGGCCACTCCCTTTTTGATATCTTTCTGATCGATGAGACCTACACACATGACATTGACCAGACAGTTATCTTCATAGCTATCGGCAAAGTATACTTCCCCACCCACTGTGGGTACACCGATACAGTTTCCGTAGCCACTAATACCAGCTACCACGCCATCAAACAAATAGCGTACCCGGGGGCTCTTTAATTCACCAAAGCGCAGGCTATCCAATACCGCTATGGGGCGAGCACCCATGGTGAAGATATCCCGCAAGATGCCGCCTACACCGGTGGCTGCACCTTGATAGGGTTCAATGGCCGAAGGGTGATTATGACTTTCAATCTTAAATACCACCGCTTGTCCATCACCAATATCCACTATACCGGCATTTTCGCCGGGGCCTTGTAAAATGGCAGGCCCTTCTGTGGGCAGGGTTTTCAAAGCTGGCCGGGAGGTTTTGTAACTGCAGTGTTCCGACCACATCACAGCAAAGATACCAACTTCCACATAATTGGGGTGACGACCTAAAATTTCCACTATTCTGTTATATTCATCGTCGGTGAGGCCCATCTCGCGCCAGATTTTCGGATCCAAGGACATTAGCCGCACCTCCTCAGCCACTGTTGTAAAAGGGATTGGAAAATAAGCTGACCGTCGGTATTGCCAAGAATTGCTTCGGCACAGCGCTCGGGGTGGGGCATCATACCCAGTACGTTACCTTTGCTGTTACAAATACCGGCGATGTTGTTAACGGAGCCATTGGGATTGGCGGCAGGGGTAATTTCTCCGTAGGGATCACAGTAACGGAAGATAACCTGTTTGTTTTCCTCCAGTTGCTGAATAATCTCTGGATCAGCGTAGTAGTTACCTTCGCCGTGGGCAATGGGAACACGGATTACCTGGCCCACCTCTGCCTGACAGGTGAAGGGAGTAGCATTATTTTCTATTCTCAAATAGGTATCGTCACAGATAAACTGTAGGTTTTTATTACGGTGCAAGGCACCGGGTAATAGCCCTGCCTCGGTGAGAATTTGGAAACCGTTGCAAATTCCCAGCACCAAGCCACCCTTTTGGGCAAATTCAATAACTGGTGTCATTACCGGCGAAAATCTGGCCACGGCACCACATCTTAGATAGTCTCCGTAGGAGAATCCCCCAGGCAACACAATGCAATCATAGCCATCCACACTACCTGCTTTATGCCAAATGTATTCCACTGTCTGCCCGGTCGAAGCTTTAATTGCGTGCAGGCAGTCGGCGTCACAATTGGAGCCGGGAAATACCACCACTCCAAACTTCACCCTTTACACCTCCACCAATTCAAATGTATAGTCCTCGATAACCGGATTTACCAGCAGTTTATCGCACATATCCCGAACCTGCTTTTCTGCTGCTGCCCGATCGGCAACCTCAAGATCCACGACCATATAACGACCGATGCGCACTTCCGGCACATTTTGATAACCCAGGGCATAGAGTGATTTACGCACCACACTACCCTGCGGATCGAGAACACTTTTTCTCAGGGTAACGTAGATTTTGGCTTGGAACAACGCTAGTACCCCCTTTGTTTTGATAGATTCATTGTTAGATTTTGGGACGCACGGCTATTTTTTAGCCTTTGGTCTATTCCGTACTTTCTTTCCAGGTGTAGTTTTCTATTTATCTATATTATCTGAGTCTTACAGGCACTCGGCCTAAATCTTATAAACCGTAGCCAGGGAATAATTGGCCTGGGGCCAACCTACTCCCCGGTCAATCTCCTTAATACTTCCTGATAGGCGTCTTCCACGCCGCCCATGTCTCTGCGGAACCGGTCTTTATCCAGTTTTTCACCGGTGGTTTTATCCCAAAAACGGCAGGTGTCCGGGGAAATCTCGTCGGCCAGGATGACTTCACCCTTGTGTAGACCGAATTCCAGTTTAAAGTCAATGAGATCTATATTGGCAGGAGCTAAGAACTCTCTTAAAATGTCGTTTACTTTGAGGGAAGTTTCTTTAATTACGGCCATTTGTTCCGGGGTGGCTAAATTCAGTGCAGCAATGTGAGAAGTATTAATGAGAGGATCACCCAAGGCATCATCTTTATAATAGTATTCAAGTACAGTTTGTGGCAGCAGGGTACCTTCCGGTAGACCTACCCTTTTGGCCAAACTCCCGGCCACAATATTTCTTACTACCACTTCTACCTTGATAATTTCCACAGCCTTAACCACCATTTCGCGGTCGTTAATCAGCTTCACAAAATGAGTGGCTATGCCCTTTTCTTCCAATAGTTTAAAAAAGACTGCCGATAATTTGTTGTTCACCACGCCTTTGTTATCAATGGTACCTTTTTTCAGGCCATTGAAGGCGGTGGCATCATCTTTGTACTCTACCCAGTAGTAATCGGGGCTGTCTGTACGGTACACTTTTTTGGCCTTGCCTTCATAAATCATCTCTAGTTTCTGCACAGGATATCTCCTCCTTTTTGTGCGGTGAGATGTGAGAGGTGAGAAGCAGTTGTGCCGCCACTTCCCGAGGGGGATTTGGCACTGAAGTTCTTCCCACCTTACTCACCGTTTATCTATTCTTACGCAAACCCTATAACCCAAACCTGGAGTAAATGTCGTCAATATGGGCTAAGTGGTAGCTGTAATCAAAGAGATTCTGTAGTTCTTCAGAGGTAAGCTGTTCTCTAATGTCTTCGTCGGCCTCAAGCAGTTCTATAAAACGAGTACCGGTACGCCAGGCCTCCATGGCGTTGCGTTGTACCAGTTCGTAAGCCCGTTCCCTGGTTAACCCCTTGTCTACCAGAGCCAGCAGTACCCGCTGGGAAAAGACCAGGCCCAGGGTTTTTTCCAGATTGCGCTTCATGTTCTCGGGATAGACCAGGAGTTTTTCCATAATACCGGTAAAGCGATACAGCATAAAGTCTAACGCGGTGGTGCTATCGGGGATAATCACCCGTTCAGCGGAGGAATGGGAAATATCCCGTTCGTGCCAGAGGGTTACATTATCCAAAGCTGCCATGGCGTTGGCCTTAACCACCCGACTGAGGCCAGAGACGTTTTCTGCCGTGATGGGGTTGCGCTTATGGGGCATGGCCGAGGAACCCTTTTGTCCTTTGTTAAAATACTCTTCCACCTCTAAGATGTCGGTGCGCTGCAGGTTGCGAATCTCTGTGGCAAATTTATCAAGAGAAGCAGCAATAATGGCCATGGCGCAAAGATACTCGGCATGACGATCCCGCTGAAGTATTTGGGTGGACACCCTGGCCGGCCTAAGACCCAGTTTCCGGCAAACATACGCTTCCACACGGGGATCGATGTTGGCATAGGTACCCACAGCACCAGAGATGGCTCCCACACTTACAGTGGTAATGGCCTTCTCCAGACGTTCGATGTTGCGTTCGGTTTCTGCCACCCACAGCAGCATCTTTAAACCAAAGGTCATGGGCTCCGCATGGATACCGTGGGTACGGCCAATCATTAAGGTGTGTCGATGTTCCTTAGCTTTCTCCAGCAGAACTTCCCGCAGTCGTTTTAGTCGCCGCAGAATGAGTTCACCGGCCTCTTTCATACGAACGCACTGGGCAGTATCCACAACATCCGAGGAGGTTAGGCCCATGTGGATGTATTTAGAGTCTTCCCCCACGTTTTCAGCCACACAGGTCAAAAAGGCAATCACATCGTGCTTGGTTACTTCTTCAATTTCCAAAATACGCTCTGTGCTGAAGGTTGCCTTGGCTTTAATATTTTCCACCGCTGCCGCAGGAATTTGACCCAATTCGGCCATGGCTTCACAGGCAGCAATTTCTACATCCAACCACTTTTGAAACTTGTTCTGATCCGACCAGATGTGCTTCATTTCCGGTAAGGTGTAGCGATCGATCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP019698|2510743:2519545|2514041_2516270_-|WP_077714830.1|DBSCAN-SWA MSLDPKIWREMGLTDDEYNRIVEILGRHPNYVEVGIFAVMWSEHCSYKTSRPALKTLPTEGPAILQGPGENAGIVDIGDGQAVVFKIESHNHPSAIEPYQGAATGVGGILRDIFTMGARPIAVLDSLRFGELKSPRVRYLFDGVVAGISGYGNCIGVPTVGGEVYFADSYEDNCLVNVMCVGLIDQKDIKKGVASGVGNPVMVVGAKTGRDGIHGATFASEELSEEAAEKRPAVQVGDPFMEKLLLEACLEVIKTGYVVGIQDMGAAGLTSSSCEMASRAGTGLEMDLALVPRREEGMTPYELMLSESQERMLLVVQKGTEEKVKEIFAKWDLDAVVVGQVTDDGILRLKEGDQVVAEIPAKALTEEAPVYHRPTAQPPYLAEVQNYSLDSLPMPEDYNEVLLKLLASPNIASKEYVYQQYDHMVGLNTVVRPGADAAVLRVKGTNKGIAMTTDCNGRYCYLNPKTGAAIAVAEAARNLVCAGAKPLAVTNCLNFGNPEKPEVMWTFWQCIEGMADACRTLETPVTGGNVSLYNETKGNAVYPTPTIGMVGLVEELTKVCTPGFKQEDDAIFLVGETLPELGGSEYLKIHFGLVQGDAPQLNLELEKKVQQFVLAEIKSGLIQSAHDCAEGGLAVALAECCIAGNLGADITMVRRFRGDALLFGESQSRIIITVPKNRSVELVKKLVDAGVPYTHLGKVAGNALVLNVVNPGCSGCGGNLLNLPVAKLAETWREAIPCLMRQ >NZ_CP019698|2510743:2519545|2512632_2514060_-|WP_077714829.1|DBSCAN-SWA MSNAAVEAIVLPDKPVEECGVFGIYGAGLDVAKLTYYGLYALQHRGQESAGIAVANGQRVELQKGMGLVAEVFTGHSLDKLTGHVAIGHVRYSTTGGSQPLNAQPLVFRYAKGMIGLAHNGNLTNVGELRSQLAYSGSVFQSSTDSEVLVNLIARYNANSLEEALMKCMIDVKGAYSLLVITEDSLYAARDPHGFRPLCLGRLGQGYVVASESCALTTVGATFIRDLEPGEIIRIDGDGLSSTQGLRAKNPAHCIFEYIYFARPDSTMDGFNVNRVRREMGRQLAREYQVEADIVIPVPDSGVAAARGYAEEAGIPFEEGLMKNRYIGRTFIQPTQQMREIGVRLKLNAIREVLEGKRVVMVDDSIVRGTTSQKLVAMLREAGAKEVHLCISSPPVLRSCYYGIDTSDEQELIAAQKPLEEIRKTIQADGLHYLSKDGLLDIFAPKQNCFCTACFDGSYPVEIPKSKDGGKYILE >NZ_CP019698|2510743:2519545|2516269_2516971_-|WP_077714831.1|DBSCAN-SWA MKFGVVVFPGSNCDADCLHAIKASTGQTVEYIWHKAGSVDGYDCIVLPGGFSYGDYLRCGAVARFSPVMTPVIEFAQKGGLVLGICNGFQILTEAGLLPGALHRNKNLQFICDDTYLRIENNATPFTCQAEVGQVIRVPIAHGEGNYYADPEIIQQLEENKQVIFRYCDPYGEITPAANPNGSVNNIAGICNSKGNVLGMMPHPERCAEAILGNTDGQLIFQSLLQQWLRRCG >NZ_CP019698|2510743:2519545|2511568_2512621_-|WP_077714828.1|DBSCAN-SWA MTDKKIQPLTYASAGVDIEAGNRAVSLMKQAVRSTFRPGVLADLGGFGGLFALDVKKYQEPVLVSGTDGVGTKLRVAQLTNRHNTIGIDAVAMCVNDILVQGAEPLFFLDYLAVGKLVPERVADIVGGVAEGCRQAGCALIGGETAEMPGFYGEDEYDIAGFAVGVVDRQKIIDGSTIEAGDVVIGLPSSGLHSNGYSLARKALLEVAGYKVTSYVEALGRTVGEELITPTRIYVRAVLPLLAKYTIKGMAHITGGGLTENIPRVLPAGVKVVLDRKTWPVLPIFQLIQQIGQVDEAEMLRTFNMGIGMVLVVPPAEAESIRQELASQGEQAYLIGKVAEGSPAVEYIGA >NZ_CP019698|2510743:2519545|2516974_2517223_-|WP_077714832.1|DBSCAN-SWA MFQAKIYVTLRKSVLDPQGSVVRKSLYALGYQNVPEVRIGRYMVVDLEVADRAAAEKQVRDMCDKLLVNPVIEDYTFELVEV >NZ_CP019698|2510743:2519545|2510743_2511361_-|WP_077714827.1|DBSCAN-SWA MDKLRIGVLASGRGSNLQAIMDQCAAGQLPAEVVVVISDKPGAYALERAKGAGIAAYSVVYKDFASKAEYEQAIVRLLEQYQVQLVCLAGYMRLVGEPLLQAFPNRIMNIHPALLPSFPGLHGQRDALNYGVKISGCTVHFVDEGMDTGPIILQAAVPVLDDDTEETLAARILEQEHKLYPAAIKLFAEGRLEIQGRRVLVKDKE >NZ_CP019698|2510743:2519545|2517414_2518122_-|WP_077714833.1|DBSCAN-SWA MQKLEMIYEGKAKKVYRTDSPDYYWVEYKDDATAFNGLKKGTIDNKGVVNNKLSAVFFKLLEEKGIATHFVKLINDREMVVKAVEIIKVEVVVRNIVAGSLAKRVGLPEGTLLPQTVLEYYYKDDALGDPLINTSHIAALNLATPEQMAVIKETSLKVNDILREFLAPANIDLIDFKLEFGLHKGEVILADEISPDTCRFWDKTTGEKLDKDRFRRDMGGVEDAYQEVLRRLTGE >NZ_CP019698|2510743:2519545|2518252_2519545_-|WP_077714834.1|DBSCAN-SWA MIDRYTLPEMKHIWSDQNKFQKWLDVEIAACEAMAELGQIPAAAVENIKAKATFSTERILEIEEVTKHDVIAFLTCVAENVGEDSKYIHMGLTSSDVVDTAQCVRMKEAGELILRRLKRLREVLLEKAKEHRHTLMIGRTHGIHAEPMTFGLKMLLWVAETERNIERLEKAITTVSVGAISGAVGTYANIDPRVEAYVCRKLGLRPARVSTQILQRDRHAEYLCAMAIIAASLDKFATEIRNLQRTDILEVEEYFNKGQKGSSAMPHKRNPITAENVSGLSRVVKANAMAALDNVTLWHERDISHSSAERVIIPDSTTALDFMLYRFTGIMEKLLVYPENMKRNLEKTLGLVFSQRVLLALVDKGLTRERAYELVQRNAMEAWRTGTRFIELLEADEDIREQLTSEELQNLFDYSYHLAHIDDIYSRFGL |
8 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
2892141 : 2942428
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP019698|2892141:2942428|DBSCAN-SWA AATGTTAAAAATCGTTTACCCCATCTGTTGTGGAATTGATGTCCACAAAAAGTTTCTTGTTGCTTGTATTGCCTTTACCAATGACAAAGGTGTTACCACTTACAAGTCCAGACGCTTTTCTACCTTCACAAACGATTTGCGAAAGCTGTCGGAGTGGCTTTCCTCCAATTCCTGCACACATGTTTGCATGGAATCCACCGGCAAGTATTGGGTACCTGTGTACAATATTTTGGAAGCCACCTGTAAAATTACACTGGCTCATCCAAAGTATGTCAAAGCGATTCGCGGTAAGAAAACCGATAAAAAGGATGCCAAGTGGATTGCCGACCTGTTTAAGCACGACCTTGTTGCCGGAAGCTTTATGCCACCCCTTCCAATTCGTCAATTGCGTGACTTGATGCGTTATCGTTTTAAGCTCACAAACTTTAGTTCCAGCGAGAAGAACCGGATTCAAAATTGTCTTACTGTATCAAATATCCAGCTCGCCAACGTGGTATCTGATACTTTCGGTAAGAGTTCAATGAGAATCATTGACTACTTGCTTGAAAATCCCGATGATAAGGATTTCGATTTTGTTCCTCTTCTTCACTCATCCATGCTGCATAAAGTGGACGATATCCGTCTTGCCCTGGACGGAATGATTACACCGGAACAGCGGCAAAAAATGAATATTATTCTTCAGCATTATGGCGAATTAGGAAAGTGCAAGTCCAACCTTGAATCCTTAATTCTATCGCTCTCAGAGCCTTATGCCAAGGAACGTACTTTAGTGTCCACTGTACCAGGTATCAAAAATCCCTTTTCTGCAATCGCTATAATTTCAGAAATCGGTGCTGATATGTCTGTGTTCCCTACAGCCAAACGCTTGTGTTCCTGGGCAGGAGTGACTCCTCAAAACAACGAGAGTGCGGGCAAAAAACATTCTGTTCGCATATCCCGTGCCGGTGTTTATATCAAGCCACTTTTAGTACAGTGCGCCAACGCTGTTGTTAAAAGTGATAAACACCCTGAAATCAAGGGCCGCTATTTATCCATCAAAAAGCGGCGTGGCCATAAGCGTGCTATTATAGCTATTGCACGAATGTTGCTTACTGCCATTTATCACATCCTTAAAAAAGGTGAACCTTACAACCCAGAACTTTATAAGAAAGCGCAACCTTTTCCTGCATCTCGTGAAATCACAGTAGAACAGGCTATTCTTATAGCTCGGAGGCACGGGTACTCTGTAGTTAAGGATTGATGGAAATACACAAGTTATCACTTTTCACTTTTTAAAGATCATCCCATGGATGGTCTGTTTGCTATGCTCTTTTTTAGTTTGTGCCCCCGTGGAGCTGGTTTCAGACTTTCACCTACCAATTCTCGGTAAATTCTTTTTTATTTTAGCATATTGTAAAAAAAATTGCTTGGCCGTAGCCAAGCATCAGAGTGTCGACAAAGTCAGTGTCGATACTCTTTTTATTTACACTATGCCCCAAACATAACCATTTATGGTAAAATATATATATCAGTTTGTTGGTTTGTGGGGGCGATATAAAGTGCTGAGAAAAAAAGACCGGACTATCATTAATCAGGTTGAATTCGTTAGTATTGATACATTGGTTCCTGATAATCACTTACTTCGTGCGGTAGAAGCTAGTATAGATTTTAACTTTATTTATGATGAAGTCAAAGAATTATACAGCGACAATACCGGAAGGCCTAGCATTGATCCAGTAGTACTGATTAAATTGATCATGTTACAAGCTTTGTATGGAATTAGGTCTATGCGTCAAACCATTCAAGAGGTAGAAGTCAACATTGCCTACCGTTGGTTTCTTGGCTATAGTCTGGGTGAAAAAATACCCCACTTTTCAACCTTTGGAAAAAACTATGAAAGACGGTTTAAGAAAAGTGATTTGTTTGAGAAAGTCTTTGAAAAGGTACTGATGGAAGCTATTCAATGTGGTTTTGTCAAAACAGATGCCGTATTTATCGATGCAACCCACGTAAAGGCCAGTGCTAATAAGAATAAGCACGTTAAAAAAATGGTTAAGCACCGAGTACATAAATATAAACGTAATCTATTTGTAGAGATAAATGCTGATCGTGAAGAGCACGGGAAGAAACCCTTTAGAGATGATGATGACGACGATAACAAAGGAGACGGCAATGCGTCTTCTACCCCGACTGAGACCAGAGAAGTTACGGTGAGTAAAACAGATCCTGAATGTGGAATGTTCCACAAGGGTGAAAAAGAGCGATGTTTTGCCTATATGGCTTCAGTAGCCTGTGATAAAAACAACTTTATTCTTGGAGTAGAAACTGCCCCTGGAAATATCCATGATAGTCAAGTATTCACCGATATATTTGGAAAAGTAAACAAACAATTTCCGGAAATCCAAGCAGTTGTGGTTGATGCTGGTTACAAGACCCCAGGTGTTTGTAGAGAGATCATCAAAGCAGGAAAACTTCCTATTATGCCCTACAAGAGACCCATGACTAAAAAGGGCTACTTTAAAAAATCCGAGTATGTTTACGATGAATATTACGATTGCTATATTTGCCCTCAGGATCAAATCTTAAAGTATAGTACAACTAACCGAGAAGGATATCGGGAATACAAAAGTGATCCCAAAATATGCATTAACTGCCCAAAGAGAATGGAATGTACCCAAAGCAAGAATTACACAAAGGTTGTAACCAGGCATATTTGGGAACCATATCGAGAAATTGCCGAGCATCTACGGTATACTAAGCAGGGAAAGGACTTATACAAAAAGCGGAGTGAAACCATAGAGCGAGTATTTGCCGATGCCAAAGAGAAACATGGCATGAGGTACACTCACTACCGAGGCTTGAGGAAAGTGCAAAACTACCTGACGCTTCTTTTTGCATGCATGAATTTAAAGAAAATAGCGATGTGGAAGAAAAGATTAGGAATGTTGCCACCGGCACGTTCTATTTTCTTTACGATTAGTAATATTTTTCAATTTAAATGGAAACGCCACTTTAAGTCTTTCGGCTTAAAGTGGCGTTTGTCTTCAGTCTGTTGCTTGGCCGTAGCCAAGCATCACATTTTATTAGTTTGCATCCAACACATCAGTCAGTGGGGTATAAGTCAGGTTAAGGGAATCTGCCACTGCTTTAAAGGTGCACTTACCATCAGCCACATTGACGCCCTTGGCCAAGGCGCAGTTTTCTTTAACTGCCTTTTGCCAGCCTTTATTGGCTAATTGCAGGGCATAGGGCAGGGTAACGTTGGTCAGGGCAAAGGTAGATGTGCGGGCCACAGCACCGGGCATATTGGCCACGGAGTAATGAATTACACCATATTTTTCATAGATGGGTTCACTGTGGGTGGTCACCCGATCAACGGTTTCTATGGAACCACCTTGGTCAATGGCCACATCCACAATAACCGAACCTGGCTTCATGTTTTTAACCATTGCTTCGGTTACCAACTTAGGAGCCTTAGCTCCGGGGATAAGCACTGCTCCCACCAGCAGGTCTGCCTTTTTAACAGCCTCGGCAATATTGTAACTATTGGACATCAAGGTATTAATACGACCGCCGTACAGGTCATCCAAGTAGCGCAGGCGATTTACATTAACATCAAGAATGGTCACATTGGCTCCCATGCCCATGGCCATCTTGGCAGCATTGGTACCGACAATGCCGCCACCGATAATAACAACCTCTGCGGCCGGAACACCGGGAACACCACCCAGCAATATACCCATACCGCCGGTGGTTTTTTCTAAATAGCGGGCACCAATCTGAATGGACATCCGGCCGGCCACTTCCGACATGGGATTTAACAGGGGCAGGGAACCGTTATCAAGTTGAATGGTTTCGTAGGCAATACCCACCACTTTCTTTTCCAGCAAAGCAGCAGTTAGTTCCGGTTCCGGCGCTAAGTGCAAGTAGGTAAATAGCACTTGCCCTTCCTTGAATAAACCATATTCTTGTTTTAAAGGCTCCTTAACCTTCATAATCATGTCCGCTGCCTGAAAAACCTCTTGAGGAGTTTCCAGAATCTGGGCTCCGGCCTCGATGTAAGCTTGGTCCGAAATACCACTGCCTACCCCGGCACTTTTTTCAATAACCACACGGTGGCCGTTGTTGACCAGCGCCTGTACGCCGGCAGGAGTTATAGCCACACGGTTTTCGTTATTTTTTATTTCCTTAGGTACACCAACGATCATTTAAAAACGCCTCCTCTTATGTCTTACATTTATTGGATTTCCACCTAATTAAAAATAGCAAAAAACGTGCCAGAAATATGGACACACTCATTTCCCGAAAAGTCCCAATATTAGCAATAGTTTTTCATGGCTGTAAAGAAATATTTCCGCACCGGTTGCCCTGGTGCGGAAATATGGAAAGTATTCTTGCCATAAGTGGAAATATATTTTTACACCTTTTCATACAATAACCGAATATTTTTAGGGTTTGGTTATTTTTTAAAATATAGCTTTTTACAATCCAGTTTTAAAGTTTACATAGTTTTCTTACTTAGTTGATAGTCTTGATATATCTTATTGAAAAAAACAGCAAGCTCTTCTAAGGAACTTCTGTTGACTATTAAGGATAAACAAGGTCCACTATCATTTGGCTCATTATTTAATATTTTCTTTAAGTCAAGTTCTATGCGAAATGTAAAAACATCCTTTTCTTTAGGAAAACGATATATGGAGATATTAAATAACGGTTCCATGCAACCAGTTTTAATGACTGGTAAATTGTTCATTAAACCGTAAGCGTCAAATCCTACGTCACCTGTTGCCAGCACTACGGGTATGCTAACATATATAAAAAGCGCCCAGGAATGGATGAGGGGGATATGGATAACTGGTTCCCCCTAAAAAAATCCATCACGCAGGGCCGCTTTAAATTCGTTAAATTGTTTTTGAATTAACCTTCTGTGCCGGTCGTCCGACAGGCCCACTGCTTGGTCAAATCCTTCCTCAGCCAGGTAATAATTAAAGCACTCCGCAAGATCCGGATTTTCTCGTTCC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52 | Leptospira_phage(16.67%) | tRNA,coat,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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