| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP016088 | Clostridium saccharoperbutylacetonicum strain N1-504 plasmid, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
| NZ_CP016087 | Clostridium saccharoperbutylacetonicum strain N1-504 chromosome, complete genome | 12 crisprs | DEDDh,cas3,csa3,WYL,DinG,cas2,cas1,cas4,cas5,cas7,cas8b2,cas6 | 1 | 11 | 11 | 1 |
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP016087_1 | 355884-355981 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016087_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP016087_1
>1.1|355908|50|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder CAACGGAACTTATATAAAAAGAGCAGCTATGCTGCAACAATAGATCTTAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016087_1
The CRISPR arrays of NZ_CP016087_1 >merge|NZ_CP016087|1|355884-355981|CRISPRCasFinder ATAAAAAGAGCAGCTATGCTGCAACAACGGAACTTATATAAAAAGAGCAGCTATGCTGCAACAATAGATCTTAAATAAAAAGAGCAGCTATGCTGCAA >NZ_CP016087|1|1|355884-355981|CRISPRCasFinder ATAAAAAGAGCAGCTATGCTGCAA CAACGGAACTTATATAAAAAGAGCAGCTATGCTGCAACAATAGATCTTAA ATAAAAAGAGCAGCTATGCTGCAA
>NZ_CP016087.1|WP_015390486.1|355645_355855_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MAIIVNLDVMLAKRKMSMNELSEKVGITLANLSILKNNKGKAIRFSTLDAICEVLECQPGDLLEYIKED >NZ_CP016087.1|WP_077359943.1|355094_355556_+|DUF2975-domain-containing-protein MKLKADFLSKILYVIISLGLIVLTAVIIGLPWVMPIIFNESTFYSIVNHTSILVLLYLTGIPTWIILWMTKKLAENIIKREPFSDSSIFSLKCISICSIFVFICYLYTCVFLSATLGTITIAVGAFMVSLISTIIYKLVEVAVEIQRENELTI >NZ_CP016087.1|WP_015390484.1|353856_354906_-|[FeFe]-hydrogenase-H-cluster-radical-SAM-maturase-HydE MIKLIEKAKTTHNLNESEILQLLQNDDINQELFKAADDVRQKYLGDFVHLRGLIEFTNICKRNCLYCGLRRDNKNIERYRLTEEEILDFAKKAVTYGYRTLVLQGGEDDFFTIERMTKIVQEIKKLGVALTLSLGEKTYDEYKAFKAAGADRYLIRIETTDKKLYEAMDPEMSFEERLNCLNNLRDLGYEVGSGILVGLPNQTLESIAKDILFFKEINADMIGIGPFIPNEDTPLKDAEGGNLTLALKVMALTRLLLPDINIPATTAMESLAPNGRIVALQSGANVVMPNVTEGEYRKLYALYPGKICTGDTPAHCRGCITGKVTGIGRIISDGYGFRGNQNTNAHDKN >NZ_CP016087.1|WP_077359941.1|353003_353732_+|DUF3298-and-DUF4163-domain-containing-protein MGILTNIVGIIVVSSMLYTAYPQNLCISCVINGQSEIKLVEKSIEKNSDYLKEDIKIPQFIGGNDEKRVNIINNTINDDILPKINDAEKTAKEYFGKIGQEKPTFPYEIFSRYTVSEDNNKVLSLFNDYYEYLGGAHGMTIRSSYTIDKSTENLLFLKDLFAPGYNYMDIINKEIKREIKENPQNYFDSGNVFKGIKENQNFYIQDGELVIYYQLYELAPYVFGFPEFKIPLKVFDSNYIYT >NZ_CP016087.1|WP_156875881.1|351712_352699_-|polysaccharide-deacetylase-family-protein MNYIFNSNDRRSNGLFMPNLKDLNIIYFFKKILSKKYALIFISIILLAIVCFSIRYFNNSSSKNELVHNNDLESKSVDNSSAQLFNKMINEVTSKKAKLNNVILTNANIGIPVLYYHSVTEPATNEVIITPEKLKAELTYIKDQGYITLTMKDLKNYLLNHSLIPEKSILITFDDGYMDNYYNAFPILKELNMNATIFCITSNLDGNYYLSKEAIKEMSTYGIDIESHTINHPHLNKLTYEDQLKELTESKKTLEAITGKEVTSIAYPFGDYNEDSIKAAKNSGYTFGFTTNRGLADKDDNFFKLDRIYISSTYDMDTFKDVLTKTKK >NZ_CP016087.1|WP_015390481.1|350672_351698_+|anti-sigma-factor-domain-containing-protein MDGLGFKKDRYVFASAPSMMVLGDGNESNKSKQISLFLNELNTYNVLLKDLVNFPLRENDRNVSLNVAYYIISDEEILQKVIEKKDLPIGKLSKLTRLKPEYLEKLRDYILAYYIVLNNPYYKSLQDSLRIKLKEDNNVINISNKNEKIHKGLAVKLVGRAVYILTSKGEFFKIKTSDKVSVGEIAEGKEKRFFRNYRIHISILLFVLILIGSGIIIQYRTTQSTIVIETSSNIKIHINKFNKVIYMYSPTEKGKELINSIDVENKDVDEAISKTFEYAVKNQMIDLSKKTLMTISGQPLKYGTLIKTNKVISENKVPIIINNSGNQQNLPKDQSEDETKK >NZ_CP016087.1|WP_015390479.1|349769_350246_-|2-C-methyl-D-erythritol-2,4-cyclodiphosphate-synthase MRVGLGYDVHRLVENRKLILGGVEIPYEKGLLGHSDADVLLHAIMDSLLGACALGDIGKHFPDTDSKFSGISSLLLLKETGKLIFEAGYAVNNIDATIIAQKPKMLPHIQNMRENISEALNIDLDKINIKATTEEGLGFTGEMLGISAQSIASVENIK >NZ_CP016087.1|WP_015390478.1|349008_349683_+|hypothetical-protein MKENYNSFNYWENVLRENKNRRAHVLMQKLPTEKSVYFHTILFGKKNGIHNMWGYVPNIKGLVGYLQYPFLQEAFYRWVHGKDRIISQIPHMTIDKISKEGEKAKKITRETAINMRRDYDFLNSLWALPHDRIKMELEKFIIDFNRRWIGNNQRFIYIKVFNTPEEVGEFVISSSLITSTEKEFENKIGMTIEEWREVCKFAISNSDKGELFKEVLRKKLSEVY >NZ_CP016087.1|WP_015390477.1|348298_348703_-|HNH-endonuclease MSLCEICNAEADIHHIVHRSEGGFDIELNYKYLCPSHHRGKYGPHQSKEVDLRYKLDLQNKLYFILKKDYYSFKELALELNIPKNTLKRITRNLKLYKEGFKKSEVIFIIMGEKFYTEEMIVNLTLDKLIEDNY >NZ_CP016087.1|WP_077359939.1|345844_348226_+|methyl-accepting-chemotaxis-protein MNKKIKSIKVKIIMFLVPMLLIAFTALAVLGYKFASNSLKESNLNVMSEMTKIAASRADDQIQSEIKNLEVLASNPIISNENIQLEEKVKVLQASLKAVNQLDMSISNQNGEAIDISGNKKNVKTTQSFIKSIKGEAAITNPFVDPNTKKKVISYSVPIKNSAGNIIGIITSMKDCMDFSKINSEISFLKTGSSIIVDNNGNYIVAADESLVSENKNITNITSDKGSLDDLNNIGKSMTIGDQSGIGKYMYDGKAMYMTYSPIGKTGLSIGITVEEKDLLSALNSLAFIDAIVTVVMILLIAILIIVFTIKVINRLNGAKTYVDSIANGDFYSQMDKKYISVNDEISSICISVGQAKESVGNMIKSVKENASVVRTGSLSLNEISEQLAVLTEEISASIGEVAISTNKESCDFKEISNKLSIFGDEINLVKDNVNLISEDVFIINNKSFEGSRDIEQLNDGIVSVNDSFQRFSTSIEYIQGDMKNVHEITNIINGISEQINLLSFNAAIEAASAGEAGRGFNVIALEVKKLSDKSKESAQNISKIINRLMKIIQKLVEESNNMDSELQKQKDAVYNASSSFAEIAVLVSEIAPKVTNINDLFNDISNNKDLIVDTVSDLSEEIINTSNSLVQVTDSSVELAIFAEKVSNSSNLLLNRADDLIEKVKLFKIEKNEVNAEITVDKKDEKIGIESISSLEKVNNDEVNKEDSVSILDNKLKKEEVINNTLSYYENLDLPLIENLEDLDIYQLEQFEEDLQLKDFGWGGTKVTEIKDYIKQKESVCFDDDDDEFNIS >NZ_CP016087.1|WP_077359945.1|356050_357499_+|DUF4173-domain-containing-protein MIGQDGKAMIAAIIGTILFMELLIFGGWGIAVPIAVISYYILIFWQSKMLKIKQDIKNNILLIPIVMTALCFMFFDNALLKFFNILFLYGLIVLHTSQQFGINSYNPLSFRWFLEIIPVGLFMPIKNISKPINIINETIKARSKESNKIFLKIAIGLVIGFPIVFIATLLLMNTDAAFNGVIELISNKFNFDLTWILQRLICFVLIFFPLNGFFYTIRNKRESVNEQKERSKNIKFDFIIVVTIASFLCVVYMIYCLSQLTYFISAFQGILPSDYTFAAYARKGFFECIPLGGINLILIIVLTMFTNTEENKKRSFTINGFAFYLIAFTLFLVISAFSKMWLYINAYGITIMRVYVSWFLILGCIALVLIGIKTFYNQFKLTKNLFIIFTIMFLGLNYANIDYRIGEYDAQLYETGQVNTIGAFDDLSVSALEPLIRISIIDKNSKAIINEYKNRVYEERTWQEWNYANYKGREIIDKVMTK >NZ_CP016087.1|WP_077359947.1|357541_358114_+|hypothetical-protein MRKILLCFLIIVVIISFSGCGTVLLGEKYKTTNISNYSKYFGQNGQHNNEIFPYKVPSSAKIEEFCYYYYDPFDPNYVSYLVYSCNDEDYKTEIDRLAKLDSSKNYLIYSATGFNYPVCAVYADSYKGYIYALTDKQYNKLIYVEINFCNYFSDIDYEKIIDNKYLPMDFDAKPGNPTQQGFKESKLREK >NZ_CP016087.1|WP_077359949.1|358189_360859_-|cation-translocating-P-type-ATPase MEKYFSKTTEEALKNFDVTLSGLTSTRASEILNTVGENILNEKEKKSIFSVFVEQFKDLLVIILIIAAIISAMTGNMESTFVIIAVIILNAILGTIQYVKAEQSLDSLKALSAPNAKVIRDGVKIEIPSKDVVPGDILILEAGDLVVADGRILENFSLKVNESSLTGESESVDKFSEVIDKDEVALGDQKNMVFSSSLVTYGRATVLVTNTGMNTELGKIASLMESTQEKTTPLQASLNDFSKKLAIAIMGICVIVFGLSIYRGTDILDSLMFAVALAVAAIPEALSSIVTIVLAIGTQSMAKENAIIKKLKAVEGLGCVSVICSDKTGTLTQNKMTVKKIFVDNKLIDANKIDTDNSDVSFLLTSSVLCNDSTSIDGNEIGDPTEVALVNLAHKYSINELDYRNTHERLKEIPFDSDRKLMSTLHNIDGKNIMITKGALDVLLDRVTSIKTSNGTNTFTNNDKININNTNRELSSQGLRVLAFAYKELAEDRELSLEDEDNFTFLGLISMIDPPREESKAAVSDCIKASIKPIMITGDHKITASAIAKEIGILQDGDLAVEGLELDKMSDAELNSKLKHISVYARVSPEHKIRIVEAWQNKGKIVAMTGDGVNDAPALKQADIGIAMGITGTEVSKDAASMILTDDNFATIVKSVTNGRNIYANIKNSIKFLLSGNMSGILAVLYSSLLALPVPFAAVHLLFINLLTDSLPAIAIGMEKSKRDVLKDKPRDANESILTKDFITDICLQGLLIGIFTMTSYHIGLATGNHGIAMTMAFSTLCLARLFHGFNCRGKKSIFALGVFSNKFSWIAFISGVILINAVLLIPVLQGLFEITPLTTNEMLLIHLLAFIPTLIIQIVKVVRDFIETKNETINSNNIDNDKTKAHAA >NZ_CP016087.1|WP_077359951.1|361269_362109_+|patatin-family-protein MTGLVLEGGAFRGLFTAGVLDALLDIRAELKYVIGVSAGATNAYSYVSKQRGRNLEIMERFMDNKRYISYGNLIRCKSLMDLDFVFDEIPNKHCVFDYKTFYEFNGRMLAGAFNIQTGKVEYFDKELLDKRNSILRASIAIPLVFPFEKINGNYYADGGLSDPIPIKKSIEDGNDKNIIVLTRNEGYRKIQSKTNKLTYRIYKNKYPKLANVLRDRHIKYNEQLDFCKKLEENGDAMIIRPTIDMNIDRFERDKNKLKAIYQNGYDLIVNNKEKILKYI >NZ_CP016087.1|WP_015390491.1|362265_362958_+|FadR-family-transcriptional-regulator MPNKNPKVYDQVIDDIKNKIKSGEIKKGDRLPSERELSESLGVSRTSIREAIRALEVIGLVESRRGAGNYIKTNFEDSLFEPLSVMFMLQESSPREMFDVRESLELQCARLSAKNIQDNELALLAAILDRMYLAESEEESLELDIKFHYIVAKASRNVLLINVLEVISQLMDEFIKKFRMQILHVGNTKESLLEIHENLFRALKSRDEAKVYNAMKEHFNLIRKAYDYDE >NZ_CP016087.1|WP_077359953.1|363395_364913_+|L-lactate-permease MYLSFFLACIPIVWLMVSLGKLKIPGYKACPIGYLITVLIAVIILKMNITNAITATLEGVATALWPIVLVIIGAVFTYNLSIYTGSMEIIKKIMTSVTSDKRILVLILAWGFGGFLEAVAGFGTAVAIPASILAALGFEPVFAAIICLVANTTPTAFGAIGLPVSTLAQVTGLDVGQLSYITTVQLTIMIILIPFILVSLTGNGIKAIKGVFGITLASGVAFAVPQILVAKFIGAELPAVIGSIVSIAVTIFMAKKFYNDKNDEKEIDVTFKEGFMAWLPFVLVFLFVMICSPLFKAIYTPLSQIKTSILIYTGQGAKPDTFSWIVTPGVLIIIATYLGGLLQGYKLKEISVVLVKTFKQMTKSAVTIVSIVSLAKIMGYSGMINSIAQVLVLVAGGFYPAVAPVIGALGTFITGSDTSANILFGQLQVQVANAIGANPYWIAAGNVLGTTAGKMISPQSIAVATAATGLIGNEGKILNSALKVCVVYIVISGIIVFFGGSILGF >NZ_CP016087.1|WP_015390493.1|364993_365782_+|electron-transfer-flavoprotein-subunit-beta/FixA-family-protein MNILVCIKQVPGTSKVEVDPDTGVLKRDGIDSKMNPYDLYALETALKIKEDEGGTVKVLSMGPNQAMSVIKEAFTMGADGGTLLSDRKFGGADVLATSYTIAQGVKKMGDFELVICGKQTTDGDTAQVGPEMAEWLNIPHVANVKKIVKIEDEFITVEMDMPESIETVKIAYPCLITVDKGIFEPRLPSYKRKLDTQDREITVLSLNELDDKNEMNYGLNGSPTQVERIFPPEVNNDRELWTGNSSELSEKIGCKLKELKFI >NZ_CP016087.1|WP_077359955.1|365823_367014_+|electron-transfer-flavoprotein-subunit-alpha MAKLVVNQDKITNIEELIKICPFGALENNAGKVEINGACKMCKLCVKKGPKGAVEYIEDEVKEIDKSAWNGIGVYVDHVEGEIHPVTYELIGKARELAGKINHPVYAVFVGNNISHKAEELLHYGVDKVFVYDDKALEYFRIEPYTAAFEDFINKVKPTALLVGATTIGRSLAPRIAARFKTGLTADCTILDIKENTDLVQIRPAFGGNIMAQIITPNSRPQLATVRYKVMTAPKRSEEITGEIVNCNIDKEKLNSGIEALEIKKKVSEVGISDAEVIVAAGRGVKSEKDLEMLKELAKALNAEFACTRPLIESGWIDAKRQIGLSGRTVRPRLIIACGISGAVQFTAGMNNSDYIFAINTDEKAPIFKVAHYGIIGDMYEVIPELIEKIKLAKEA >NZ_CP016087.1|WP_015390495.1|367017_368421_+|FAD-binding-oxidoreductase MSYKEVELKDYEYILSVAENDKERVFFKDQINEDYSHDELGGIKKMPDIVVQATSAEEVSKVMKYAYENNIPVTPRGSGTGLVGAAVPLKGGIVIDLSRMNRILELDDENLTLTLEPGVLLMDIGKYVEEFDLFYPPDPGEKSATIGGNISTNAGGMRAVKYGVTRDYVRGLEVVLPNGEIVELGGKVVKNSSGYSLKDLMIGSEGTLGIVTKAVLKLLPLPKKALSLLVPFESLEKAIETVPKIIKSKSIPTAIEFMQREAILAAEEFLGKSFPDKSSDAYLLLTFDGNSTEEIEKAYENVAKICLESGALDVLISDTEERQESIWSARGCFLEAIKALTTEMDEVDVVVPRNKIGEFVTFTHELESKANVRIKSFGHAGDGNLHVYILRDELNEEEWKAKLSEVMQIMYDKAKELRGQVSGEHGIGFAKKGYLKQSLPDKCINIMQGIKLAFDPRNILNPGKVCE >NZ_CP016087.1|WP_077359957.1|369081_369654_+|RNA-polymerase-sigma-factor MEIEEIIMRCKQGEKEAFRELLQTVEKKELATVHFLAGNKGIAEDILQETYMKCFIEIHKLKEPQAFKVWFFRILIRTGWKMLKKQSELVPLEITSENEELFCDENQGKRNVIDNYEMKSVMENAINDLSENLKAVVILYYYNDMSIEEISKVTGCFKATIKSRLFYARAALRKQLGNCMENEHGVRIVK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP016087_3 | 596834-596993 | Orphan |
II-B
Consensus repeat of NZ_CP016087_3
|
2 spacers
spacers of NZ_CP016087_3
>3.1|596864|35|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder TCATTCCTTTGCTTTTATAAAATATTTTAATTTTT >3.2|596929|35|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder ACATTAACTCTCTTTGAAAAGAGTAATTGTTCCTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016087_3
The CRISPR arrays of NZ_CP016087_3 >merge|NZ_CP016087|3|596834-596993|CRISPRCasFinder GATTAACTTCAACATGAGATGTATTTAAATTCATTCCTTTGCTTTTATAAAATATTTTAATTTTTGATTAACTTCAACATGAGATGTATTTAAATACATTAACTCTCTTTGAAAAGAGTAATTGTTCCTTGATTAACTTTAACATAAGATGTATTAAGTT >NZ_CP016087|3|3|596834-596993|CRISPRCasFinder GATTAACTTCAACATGAGATGTATTTAAAT TCATTCCTTTGCTTTTATAAAATATTTTAATTTTT GATTAACTTCAACATGAGATGTATTTAAAT ACATTAACTCTCTTTGAAAAGAGTAATTGTTCCTT GATTAACTTTAACATAAGATGTATTAAGTT
>NZ_CP016087.1|WP_077360240.1|594491_596075_+|AAA-family-ATPase MEKEFNVTGTCIPTMHYMVDTSNKLNKTIKLINRGKYFIINRPRQYGKTTTLYLLEKLLNEDSEYLVISISFEGIGDLIFEEEKRFTKGFLNIIERTLVMGNEEISEFVKNQKNDVETMDDLSHFLTKFILKCNRKVILMIDEVDKSSNNQLFLSFLGMLRNKYLLRNTGKDYTFHSVILAGVHDVKSLKLKIRPEEESKYNSPWNIASDFNVDMSFSEEEIGTMLDDYTENKGAVLDKAYFAERLYFYTSGYPFLVSKLCKIIDEKIMAEEELKWEKDYMELAVKEILKESNTNFDSLIKNIENNNDLKVLVKRIILDGADITYNQDNLIINMAIMYGIFKNNNGKVNIHNRIYEQRIYNYMSSLIETSTEVGAYNQSAKFIKANGDLDIEKILIKFQEFLKHEYSEKREEFLEADGRLVFLAFISPVINGTGFAFKEVQGGEEKRFDIVITYNKKMYVLELKKWNGEEYHKKGMLQLAEYLEQYSLEEGYLLIFDFRKLKGEAGNVARSTVTFEGKKKEIVEVYC >NZ_CP016087.1|WP_077360238.1|593000_594266_+|YibE/F-family-protein MKVNLNWNSSIKICGKIIGPIAVLLIYIVMAVSFSSHTPIYNPYSSGAGGEMHYEKGKVVSIDEQVINPSGFSELYIGRQIVNVLIESGQYEGQTFQVNNALNYDTNFVLHKGQDIVVSINTSTGDKSLVNVYMFAPSRVVPLLVLIGIFIGVMCLVGGWRGFHSILGIIFTLTTVLFIFIPLLFHGVSVVLGTILLVIITSCVTLFLVGGFDRKSISAILGTVAGVIVSVIIMLIFSKLLGISGYTSTDADAMLNIASQTKLQVKDLLFTGIIIASLGAVMDIAISIATSINELKKQKEDATFKELFSSGMNIGRDMMGTMSNTLILAFLGESIFSFILMYSYQVQFRQLFNSNSIAIDILNAICGSLAVVLTVPIVAAIAAKLLQGSQSSYKAQDGELAENKEMTSTLKNGYALEMSRK >NZ_CP016087.1|WP_077360236.1|591227_592886_+|metallophosphoesterase-family-protein MRINKNVKFILPIAVATVMATSACIPFITNVNAEITGNSGIQGFSLPKVTGAYNINAGVGSDPKELDFAWFTQASGKAQIKIARTADMKGTDFPSSATIQDADQMAVKATQSIDQKYTVLADIKGVGNPANEGDNVYNGKKALNAPTGEYSNKAKVKDLDSDTQYSYSVSDGQGNWSSIYTINTLPEDKVTFAAFGDPQIGAFDNSKGTAKSNATGGHKNLSDDKTAWKNMLKLVTQNKDLNFLFTMGDQINDYNYLIQPSNASDGQWYQYRDFFNPDDTVNYMQSMPLAAFSGNHDHQMGEYYGYHYNQPNLGKLGATQYGNDGDYWFTAGPVLFMVLNANNYGTADHDQFIAEAIKANPNAKWKVASWHQSAYSEANHNTKNEIDDPVLTIRNTWTKMMDKYKIDVVLQGHDHYYTRTAQMLNGNVVDPSTGAPETLKNNGSAQAPGTSNPNATYATKEYPNSVTNPKGTVYFTLDTGTGSKYYDVNKGNNDSIGGSADHSFSVVGWQGYVPSYSDISFTNDTFTIKTYATSDFTVENQTLIDSYTITKK >NZ_CP016087.1|WP_077360234.1|589147_589582_+|DUF86-domain-containing-protein MNKERLIKIIEDMQECIVDINECLELLATRKDDKLIIKLSKSSLRQLFVSFHTILEDLCSIVLKEIKKYKIGITLHDSLIILKENGIINEETYVFLEKSRLLRNRISHRYKEPKHEELIEHILTYNNKFEEIVKIAKSYLGNCQ >NZ_CP016087.1|WP_077360232.1|588743_589151_+|nucleotidyltransferase-domain-containing-protein MDKEQIIDKLKSKEFVDFINKYNIITVILFGSINGNDFNEESDVDLAMIADTEMELDKVLDIELFLQNLLNREIDVLDLRSDELDLFVKINILNNGKVIYSLDNNEALEAIYNETDRIYKENENFMYFRRGDVLY >NZ_CP016087.1|WP_077360228.1|585412_587422_-|methyl-accepting-chemotaxis-protein MSKKSKSSVMKMMISILIPTSIIVCMLLASSAMYFARNAMINTGRELLTETSRLGGEEVFNVLNEKLTGVRLVASIPVMQDKNITIDEKFKILKENSNVQKNNNMGIVYEDGLIHFIDGSVVDIKDRDYFLQAMKGTPYISKPFISRIDGRLIVALSAPIKVEDKTIGSIVALRDGNDLSNISNAIKILKTGEAFIIDSSGTFIASRDESKINGEYNLIKSSKNEDENKLGEISAQMIKGSNGVDKWITSTDNAYVGYAPIGDLGWSIGIITKENELLSGLNIMNILLIITASISILVISATIFKVSLKISRPVKAVDNIIGEMEHGDFTHDIDQRHLDDVTEIGTMSRALKTMMLKINIVLKNIKGNSKKIDTQATTLAAISEELSASTNNIINSIEQVSVGTTSQATDLIEISTQLNEFSGDIKLVNDDIVIINDLSSDISVKSVASNDELKSLIEVIKNLNNNFKSFRSSLYKMINDIKQVNEMTDLISSISEQTNLLALNAAIEAARAGEFGKGFAVVADEIRKLAEMSNNSSQNIYTISQNILNSTNEINDKTDFITDDINKQNEVVDRTIKTFNNISEGINIVIPKIKNATIKFDSINTKKEHILTRIENISAISQQVAATSEEIAASSQEINLVSNEIATSAQNLSLSTNEMNEQLQFFKLK >NZ_CP016087.1|WP_077360226.1|584457_585318_+|sporulation-peptidase-YabG MEIGDIVVRKSYNKDVTFKVIDIREEDGEYNIILKGINIRIIADASMEDLELADENSGSKDKILNTRVNEAIKQAMILRSDFRDKVEKSPKIKNKNELMFGRPGKILHVDGDSEYMETCLKVYKQLSLDAVGRAIAEADQPRVIVDLVKEIKPDIVVLTGHDSVLKQPRDYLDLDNYRNSRYYLESVKNLRNYNSSYDELVIFAGACQSCYERILDVGANFASSPNRVLIHCLDPVFVCEKIAYTRIDKVVSITDVIENTITGIRGVGGLQTRGKYREGYPKSPYI >NZ_CP016087.1|WP_015390672.1|583315_584314_+|CotS-family-spore-coat-protein MMREFEIERQFNVKIEKIKANKGVYYLKTDKGERCLKKINYGPQKLLFVYGAKEHLRKNGFDNLDKYYLNINGEPFALVNEDLYTLSEWLEGRECDFHNIEEVKLAAKTLANLHEASKGYDPPENSKLKSDLGRWTHLIEKRIKSLDKMRDMVRKKSIKSDFDMLYLKSMEFYKEIGKESLQTLNESDYYELCMLAENEKSFCHHDFTYHNIILSDDMGVHVIDFDYCKREVRTFDISNFMIKVLKRVEWNIDFANAIIDSYNSVSPLKKEEYKVLYSYLQFPQRYWRLANRYYYNEVNWAQNTFASKLETIINEKEKQLDFLEKFKNEYNI >NZ_CP016087.1|WP_077360224.1|582085_583207_-|glycosyltransferase-family-4-protein MKIGIDGRAAKWYHGTGIGTYTNQLIKSLSKVDCDNNYLIFIPQCDSIDNLQSNFKMELVESAPSKSFWDDINVPNILNNADIELYHVPQNGVGLSDNIQCKKVITLHDIIPLKMPETVSDRYLKIFNDELPKILDSCDGIITVSNFSKADIANEFKFPADKIYVTPLAAEDIYRPMSKCQSKSIITQKYGIQEDFILYVGGFSPRKNILGLIEAYSALPNKLKETFKLVITGRKGPSYSKYKNRAEELHISNNVVFTDFIPIEDMPLFYNATEVLVYPSFYEGFGLPPIEAMACGTPVIASNVTSLPEVCYESALFIDPNDIDALSYDIERVLSNSLLKLTMVKKSLTRSKTFSWNKTALNTISAYEAIINS >NZ_CP016087.1|WP_015390670.1|581011_581614_-|accessory-gene-regulator-B-family-protein MIKSVSNFITGYLRKNNASLSLTDLMKIDYAIQMILGDLAKLIIISLIFISLNQFSLFLFSYVILFSTRPIAGGIHSKTFVGCLTSSIMHFLIVVIFSVLFPKLSTYYYVIFFIISLVIIGLYAPCVNTNRPIKNKAKLKVLSLISFTFWMIIFFQIQDTKISNCILMSTFLQIIQLIILYIKGVVSNGKVHKLSSSHLT >NZ_CP016087.1|WP_077360242.1|597361_598654_+|histidine--tRNA-ligase 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You can click texts colored in the table to view more detailed information
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| NZ_CP016087_2 | 596297-596586 | Orphan |
II-B
Consensus repeat of NZ_CP016087_2
|
4 spacers
spacers of NZ_CP016087_2
>2.1|596327|34|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT CATGTATGTTATTTTCAATGCAAATATTAAAAAT >2.2|596391|35|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT TATACATATTGTACAAATCCACTACAGTCAAATCC >2.3|596456|35|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT CTGCTTCCTGTTGTTTGTAAATATAACGGTGTATT >2.4|596521|35|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT GTTGTATTATTATTAGCTTTGAATAACATTAAAGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016087_2
The CRISPR arrays of NZ_CP016087_2 >merge|NZ_CP016087|2|596297-596586|CRISPRCasFinder,CRT GATTAATATTAACATGGGATGTATTTAAATCATGTATGTTATTTTCAATGCAAATATTAAAAATGATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAATTATACATATTGTACAAATCCACTACAGTCAAATCCGATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAATCTGCTTCCTGTTGTTTGTAAATATAACGGTGTATTGATTAACATTAACATAAGATGTATTTAAATGTTGTATTATTATTAGCTTTGAATAACATTAAAGCGATTAACATTAACATGAGATGTATTAAGTTT >NZ_CP016087|2|2|596297-596586|CRISPRCasFinder GATTAATATTAACATGGGATGTATTTAAAT CATGTATGTTATTTTCAATGCAAATATTAAAAAT GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT TATACATATTGTACAAATCCACTACAGTCAAATCC GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT CTGCTTCCTGTTGTTTGTAAATATAACGGTGTATT GATTAACATTAACATAAGATGTATTTAAAT GTTGTATTATTATTAGCTTTGAATAACATTAAAGC GATTAACATTAACATGAGATGTATTAAGTTT >NZ_CP016087|2|1|596297-596585|CRT GATTAATATTAACATGGGATGTATTTAAAT CATGTATGTTATTTTCAATGCAAATATTAAAAAT GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT TATACATATTGTACAAATCCACTACAGTCAAATCC GATTAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT CTGCTTCCTGTTGTTTGTAAATATAACGGTGTATT GATTAACATTAACATAAGATGTATTTAAAT GTTGTATTATTATTAGCTTTGAATAACATTAAAGC GATTAACATTAACATGAGATGTATTAAGTT
>NZ_CP016087.1|WP_077360240.1|594491_596075_+|AAA-family-ATPase MEKEFNVTGTCIPTMHYMVDTSNKLNKTIKLINRGKYFIINRPRQYGKTTTLYLLEKLLNEDSEYLVISISFEGIGDLIFEEEKRFTKGFLNIIERTLVMGNEEISEFVKNQKNDVETMDDLSHFLTKFILKCNRKVILMIDEVDKSSNNQLFLSFLGMLRNKYLLRNTGKDYTFHSVILAGVHDVKSLKLKIRPEEESKYNSPWNIASDFNVDMSFSEEEIGTMLDDYTENKGAVLDKAYFAERLYFYTSGYPFLVSKLCKIIDEKIMAEEELKWEKDYMELAVKEILKESNTNFDSLIKNIENNNDLKVLVKRIILDGADITYNQDNLIINMAIMYGIFKNNNGKVNIHNRIYEQRIYNYMSSLIETSTEVGAYNQSAKFIKANGDLDIEKILIKFQEFLKHEYSEKREEFLEADGRLVFLAFISPVINGTGFAFKEVQGGEEKRFDIVITYNKKMYVLELKKWNGEEYHKKGMLQLAEYLEQYSLEEGYLLIFDFRKLKGEAGNVARSTVTFEGKKKEIVEVYC >NZ_CP016087.1|WP_077360238.1|593000_594266_+|YibE/F-family-protein 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You can click texts colored in the table to view more detailed information
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>4.1|601026|36|NZ_CP016087|PILER-CR,CRISPRCasFinder TAATATTAATAAAAATTCCTCTAGTTTTGATACTTG >4.2|601092|34|NZ_CP016087|PILER-CR,CRISPRCasFinder ATAGATCCTCAAACTGTTTAACTTTATTTTTATC >4.3|601156|36|NZ_CP016087|PILER-CR,CRISPRCasFinder TGTAAAGTAAACTTTTGACCTGCAAATTCCATAAAC >4.4|601027|35|NZ_CP016087|CRT AATATTAATAAAAATTCCTCTAGTTTTGATACTTG >4.5|601093|33|NZ_CP016087|CRT TAGATCCTCAAACTGTTTAACTTTATTTTTATC >4.6|601157|35|NZ_CP016087|CRT GTAAAGTAAACTTTTGACCTGCAAATTCCATAAAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016087_4
The CRISPR arrays of NZ_CP016087_4 >merge|NZ_CP016087|4|600996-601222|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATTAACTTTAATATGAGATGTATTTAAATTAATATTAATAAAAATTCCTCTAGTTTTGATACTTGGATTAACTTTAATATGAGATGTATTTAAATATAGATCCTCAAACTGTTTAACTTTATTTTTATCGATTAACTTTAATATGAGATGTATTTAAATTGTAAAGTAAACTTTTGACCTGCAAATTCCATAAACGATTAACTTTAACATGAGATGTATTTAAACT >NZ_CP016087|4|1|600996-601221|PILER-CR GATTAACTTTAATATGAGATGTATTTAAAT TAATATTAATAAAAATTCCTCTAGTTTTGATACTTG GATTAACTTTAATATGAGATGTATTTAAAT ATAGATCCTCAAACTGTTTAACTTTATTTTTATC GATTAACTTTAATATGAGATGTATTTAAAT TGTAAAGTAAACTTTTGACCTGCAAATTCCATAAAC GATTAACTTTAACATGAGATGTATTTAAAC >NZ_CP016087|4|4|600996-601221|CRISPRCasFinder GATTAACTTTAATATGAGATGTATTTAAAT TAATATTAATAAAAATTCCTCTAGTTTTGATACTTG GATTAACTTTAATATGAGATGTATTTAAAT ATAGATCCTCAAACTGTTTAACTTTATTTTTATC GATTAACTTTAATATGAGATGTATTTAAAT TGTAAAGTAAACTTTTGACCTGCAAATTCCATAAAC GATTAACTTTAACATGAGATGTATTTAAAC >NZ_CP016087|4|2|600996-601222|CRT GATTAACTTTAATATGAGATGTATTTAAATT AATATTAATAAAAATTCCTCTAGTTTTGATACTTG GATTAACTTTAATATGAGATGTATTTAAATA TAGATCCTCAAACTGTTTAACTTTATTTTTATC GATTAACTTTAATATGAGATGTATTTAAATT GTAAAGTAAACTTTTGACCTGCAAATTCCATAAAC GATTAACTTTAACATGAGATGTATTTAAACT
>NZ_CP016087.1|WP_015390687.1|599615_600455_-|amino-acid-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKIFTLIVIIGLIAIIGCDTNSSKITTTNIASVKDRLQTIKEKGTLTFVSADAPPFAYINPETNKLSGIDADIIAEIAKRLGINKIEEKKIKFADLLNQLNTDDSIDLAADGIYITPEREEIVSFTQPLYKESEVVIVPKASKINFKDDLKNAVVGTIRGTKFADLIQDWKKNNLVKNVLFFEDNTNLLNAINNGEIDAGVSDSALVEYSLKNNSFYLKILSDYTPEIHGLVGIAVKKSDITLLNNLNEKINEMKADGTLYAILVDNGLDKSNTIENQ >NZ_CP016087.1|WP_077360245.1|599154_599466_+|hypothetical-protein MKNFFISLLILLFLSFNITLIPLAIGNIFKEGLYTPSDLNLPSKPSYNIQNISSTDNVYVLVFDKTHSLYQSIRMEPNSPKYVLSFDPDFRIAVIGKGEVFFS >NZ_CP016087.1|WP_077360243.1|598732_599056_+|hypothetical-protein MKKFTILFLILLCLSFNIMTISPLAQTSGIKEGLYTASDLKLAPNSTYVIQNQSSADSAFVLVFNENNVVQQSLRLETKSPKFNLFPLKSEYKILIIGNGDVSISET >NZ_CP016087.1|WP_077360242.1|597361_598654_+|histidine--tRNA-ligase MKNNKIQPSILPGFMELLPKEQQIFRDMVRKITNVYEQNGFLEMDTPIIEKSEVLLAKSAGETEKQVYRFNRGSNDLSLRFDLTVPFARFSAQYFNELTFPFKRYQIGKVYRGERNQRGRYREFYQCDIDIIGNNKLSVNNDALVISMVSKGFKAIGLKDYKFQISNRKILSAILKELEIINAIEVMVLVDKYDKIGKEEFLNSLVELIGQEKADVVNKAININGSNEEIMKQLRELAINSEEFEKGLEELSVVRNMLKIFGVEDNEYVVNLKIIRGLDYYTGTVFETFLTGNEGYGSICSGGRYDNLAQNYTDNILPGVGISIGLTRLFFVLKEIGFLKDYKIEKSIEYLIIPIGDTLEYCAEVYNGLLRKGKYAEIYLEDDKLKKKLNYANKLGIPNVILIGEDEVLNKQVKIKDMVSGEETIVGAED >NZ_CP016087.1|WP_077360240.1|594491_596075_+|AAA-family-ATPase MEKEFNVTGTCIPTMHYMVDTSNKLNKTIKLINRGKYFIINRPRQYGKTTTLYLLEKLLNEDSEYLVISISFEGIGDLIFEEEKRFTKGFLNIIERTLVMGNEEISEFVKNQKNDVETMDDLSHFLTKFILKCNRKVILMIDEVDKSSNNQLFLSFLGMLRNKYLLRNTGKDYTFHSVILAGVHDVKSLKLKIRPEEESKYNSPWNIASDFNVDMSFSEEEIGTMLDDYTENKGAVLDKAYFAERLYFYTSGYPFLVSKLCKIIDEKIMAEEELKWEKDYMELAVKEILKESNTNFDSLIKNIENNNDLKVLVKRIILDGADITYNQDNLIINMAIMYGIFKNNNGKVNIHNRIYEQRIYNYMSSLIETSTEVGAYNQSAKFIKANGDLDIEKILIKFQEFLKHEYSEKREEFLEADGRLVFLAFISPVINGTGFAFKEVQGGEEKRFDIVITYNKKMYVLELKKWNGEEYHKKGMLQLAEYLEQYSLEEGYLLIFDFRKLKGEAGNVARSTVTFEGKKKEIVEVYC >NZ_CP016087.1|WP_077360238.1|593000_594266_+|YibE/F-family-protein MKVNLNWNSSIKICGKIIGPIAVLLIYIVMAVSFSSHTPIYNPYSSGAGGEMHYEKGKVVSIDEQVINPSGFSELYIGRQIVNVLIESGQYEGQTFQVNNALNYDTNFVLHKGQDIVVSINTSTGDKSLVNVYMFAPSRVVPLLVLIGIFIGVMCLVGGWRGFHSILGIIFTLTTVLFIFIPLLFHGVSVVLGTILLVIITSCVTLFLVGGFDRKSISAILGTVAGVIVSVIIMLIFSKLLGISGYTSTDADAMLNIASQTKLQVKDLLFTGIIIASLGAVMDIAISIATSINELKKQKEDATFKELFSSGMNIGRDMMGTMSNTLILAFLGESIFSFILMYSYQVQFRQLFNSNSIAIDILNAICGSLAVVLTVPIVAAIAAKLLQGSQSSYKAQDGELAENKEMTSTLKNGYALEMSRK >NZ_CP016087.1|WP_077360236.1|591227_592886_+|metallophosphoesterase-family-protein MRINKNVKFILPIAVATVMATSACIPFITNVNAEITGNSGIQGFSLPKVTGAYNINAGVGSDPKELDFAWFTQASGKAQIKIARTADMKGTDFPSSATIQDADQMAVKATQSIDQKYTVLADIKGVGNPANEGDNVYNGKKALNAPTGEYSNKAKVKDLDSDTQYSYSVSDGQGNWSSIYTINTLPEDKVTFAAFGDPQIGAFDNSKGTAKSNATGGHKNLSDDKTAWKNMLKLVTQNKDLNFLFTMGDQINDYNYLIQPSNASDGQWYQYRDFFNPDDTVNYMQSMPLAAFSGNHDHQMGEYYGYHYNQPNLGKLGATQYGNDGDYWFTAGPVLFMVLNANNYGTADHDQFIAEAIKANPNAKWKVASWHQSAYSEANHNTKNEIDDPVLTIRNTWTKMMDKYKIDVVLQGHDHYYTRTAQMLNGNVVDPSTGAPETLKNNGSAQAPGTSNPNATYATKEYPNSVTNPKGTVYFTLDTGTGSKYYDVNKGNNDSIGGSADHSFSVVGWQGYVPSYSDISFTNDTFTIKTYATSDFTVENQTLIDSYTITKK >NZ_CP016087.1|WP_077360234.1|589147_589582_+|DUF86-domain-containing-protein MNKERLIKIIEDMQECIVDINECLELLATRKDDKLIIKLSKSSLRQLFVSFHTILEDLCSIVLKEIKKYKIGITLHDSLIILKENGIINEETYVFLEKSRLLRNRISHRYKEPKHEELIEHILTYNNKFEEIVKIAKSYLGNCQ >NZ_CP016087.1|WP_077360232.1|588743_589151_+|nucleotidyltransferase-domain-containing-protein MDKEQIIDKLKSKEFVDFINKYNIITVILFGSINGNDFNEESDVDLAMIADTEMELDKVLDIELFLQNLLNREIDVLDLRSDELDLFVKINILNNGKVIYSLDNNEALEAIYNETDRIYKENENFMYFRRGDVLY >NZ_CP016087.1|WP_077360228.1|585412_587422_-|methyl-accepting-chemotaxis-protein MSKKSKSSVMKMMISILIPTSIIVCMLLASSAMYFARNAMINTGRELLTETSRLGGEEVFNVLNEKLTGVRLVASIPVMQDKNITIDEKFKILKENSNVQKNNNMGIVYEDGLIHFIDGSVVDIKDRDYFLQAMKGTPYISKPFISRIDGRLIVALSAPIKVEDKTIGSIVALRDGNDLSNISNAIKILKTGEAFIIDSSGTFIASRDESKINGEYNLIKSSKNEDENKLGEISAQMIKGSNGVDKWITSTDNAYVGYAPIGDLGWSIGIITKENELLSGLNIMNILLIITASISILVISATIFKVSLKISRPVKAVDNIIGEMEHGDFTHDIDQRHLDDVTEIGTMSRALKTMMLKINIVLKNIKGNSKKIDTQATTLAAISEELSASTNNIINSIEQVSVGTTSQATDLIEISTQLNEFSGDIKLVNDDIVIINDLSSDISVKSVASNDELKSLIEVIKNLNNNFKSFRSSLYKMINDIKQVNEMTDLISSISEQTNLLALNAAIEAARAGEFGKGFAVVADEIRKLAEMSNNSSQNIYTISQNILNSTNEINDKTDFITDDINKQNEVVDRTIKTFNNISEGINIVIPKIKNATIKFDSINTKKEHILTRIENISAISQQVAATSEEIAASSQEINLVSNEIATSAQNLSLSTNEMNEQLQFFKLK >NZ_CP016087.1|WP_077360247.1|601308_602283_-|alpha/beta-hydrolase MYLNMWKKKQKLKNKSKKISIKYVFLSLILLILISGFIYERIGEYIDTKNFPIVGEMVEVNNHKINVFSEGKGNSTVVFCSGHTEPNSYADFYPLYNEISKYAKVVTYDRPGHGWSEVTDTPRDIDTIVEEMHEGLEKSGQRAPYILVGHSYASLQVIRFAQMYKNEVSGIVLIDGGNPEYYAENGLEISKSTAYSYKFLKSIGIARLVINHTNYYSKNLNLLPDNLQQTYLSMILTTMYNTNIIDEGNLAMSNAKTVLENGHLGDLPIKILTAPDDEVWNNSQAKLKEWSTNSEQIVVDGAGHAIYHTHPDVINNEILKLIEN >NZ_CP016087.1|WP_077360249.1|602926_603259_-|antibiotic-biosynthesis-monooxygenase MSITVNLYYTGINGNARKFAEEMENSGTATAIRNEDGNEKYEYFFPMNDPDTVLLIDSWRDQNAIDAHHASPMMTTIAHLRNKYDLHMKVERYVSNAVGVPSSDIKFIRE >NZ_CP016087.1|WP_077360251.1|603772_605494_+|methyl-accepting-chemotaxis-protein MRWLNNLKVGRKLTLLMICSLIGLFAVGITGYYFLLSSSKSVDSMYNERLLSSEWLSESRVHARAVTADIYRLMVTTDNAENESLIKDIDNRAEQFNNYMNQYKSLKLDSFETSKIKEIEDNLSKYREGRKIVISLAKENKNQEAYEYYGRNVDTYVQAFMNSLVELGDHNRQIAEKINNADKLNFKIAVVTFLIIVITASIFIIVLGVLITKRITKRLNDFVIFIGALSKGDFSLKIKPENLEDKSEFGIVSNALDKMTNNIRELVKQLGDTSKQLVSSSEELTASAEQSADASNLVATAVTTMANGADDQLAFANNSTKVVENISEKINVASENTKSVSTLTDNAQSSANAGEEAVEKAINQMEIIERKTNETSTIITELEEKSVKIGQIIDTIEGISEQTNLLALNAAIESARAGEAGKGFSVVADEIRKLAEQSQEATKEIAKIINDVQNKTNSAVSVMNENSKEVDTGAMVVNVAGTSFREILQMITAISEQIHEISKSINEISVGTKASVTSVNNIQNISMKIADETQTISAAAEEQLASVEEIASSSKILSQMSEDLGSIITKFKI >NZ_CP016087.1|WP_077360253.1|605806_606040_+|hypothetical-protein MKSLLNVFILLALILALLLAIIAIIRGYKGMKMSKNFDTADKKIKFGYWLLSAIHMWVGIVVTLCYVIAGMLILNRL >NZ_CP016087.1|WP_015390693.1|606052_606307_+|hypothetical-protein MGIILLPFIAAIIGIIIFLICFIGTCLIIIGGTGMAMNKIYLKQMKTNNVLLKPQFNISSIILGIIFIIFPLGCVLSGVIYSLA >NZ_CP016087.1|WP_077360255.1|606935_608180_+|DUF2334-domain-containing-protein MIYDKQLFSIEPNLKISFEGKLLKFISPIYRDINRYFLPLVEFIGLIGGAFNITGSKIDILFKGKSPIFINYETDDYKFTLVDSVLYLSLFDICSMLNAKSKWDYDSSSIFLYFDRNKYESYKRPPGRIALIRFEDVTAGDEYLDSDNLEKFRIVADYMFSNGVPFHIAWIPRFVDPPNSIDNDISKDYSMPNSNFLFTMEYLLSRNGVIGLHGYTHQYQKEVSADGTEFNEERNNDEKSIRKRVEAAINMAKKLELPVKFFESPHYAATQFQQSIFEQYFDVIYEGYVGIWGRKIVKSPRNHRTLYIPTPLSYVEDKDSTKEMLDRINHLSEDTLASLFYHPNIDFEYITLQNDTSGYPISNYSENSPLHRIIKKLYDKRYSFAKITDLGSNNTKNISIELVRLYKYFKNKIL >NZ_CP016087.1|WP_077360257.1|608463_609084_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MNQERETHAPRQKRSELTRSKILDTALELFCQKGYYKTTTNEIATCANISIGNLYFYFPNKETIFFEILDRYHQSFLAIHETFLSEMENLNDNFRDFLIKLMEVIIKNHEESKALNQEIQILSFSNPKVAEILETQQTHVENAVFRYFQKSKNKIKVHDIEAATSITFSLINSIVDQIVFSKNKIARKRLLEETVNAVEAYLFGVD >NZ_CP016087.1|WP_077360259.1|609135_610326_-|alpha/beta-fold-hydrolase MGFLFKNKHFDYQALRTLGTTPVGQADISEVTATSQKIKNGSCSSWCTEWKKTADRVRKFGEECLKEGLETSASESFLRASNYYRTAEFYLNYGSNKEYMDKINTLSTQCFNLAIKYGPYHIEPVEIPFEGISLPGHFYHADTKGPAPTIIVISGNDGTKEELYAIGIAAIKRGMNCLAFDGPGQGESIRRRNIPFRYNYETAISPAVDFVLKDLSVDHDRIILWGESLGGYFAPRAAAFEKRISACIANGGLYDCLSLNPKKREATLNKIHKHATTFNLISRMLMKMSVAFDWRFRHGFLTFGVDTPAEYVLSYKNFCLDGVTSKISCPVLVIGNESDKKAWNTQSKILYDKLECPKDYLFFTNNEGAGYHCQVGCRIYANDRIFNWIEKTIATI >NZ_CP016087.1|WP_077360261.1|610470_611265_-|SDR-family-oxidoreductase MKEKQKYIVITGASSGIGYETAKAFAKRNKNLVIVARSKENLEKLKEEILQENPSLDVIIKCVDLSITSNVHQLYEELKPYCIETLINNAGFGNYSSVADQDMEKIETMLRLNIDALVILSSLFVRDYKDVTGSQLINISSSGGYIIVPNAVTYCASKFFVSTFTEGLARELKACNAKLQAKVLAPAATKTNFGNIANNVQKYDYDKSFGTYHTSKQMAEFLLKLYDSNEVIGLVNRETFEFELSSPLFNYSGNSQNNQTCYTL >NZ_CP016087.1|WP_077360263.1|611373_611745_+|MerR-family-transcriptional-regulator MNYSIGEFSKLTNLSIDTLRYYEKEGLIAPERKENGRRYYSEKDVTWIAFIKRLKETRMPIKEIQEYAKLRAIGDTTMAERMEMLIKHRTALEDEIMKANENLQKLNEKIDFYRSAIDEKIIL |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP016087_5 | 1146323-1146420 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016087_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP016087_5
>5.1|1146346|52|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder TACATGGTATTACTTAAATCCAATTTCAGATGGTACTAAAGGTGCTATGAAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016087_5
The CRISPR arrays of NZ_CP016087_5 >merge|NZ_CP016087|5|1146323-1146420|CRISPRCasFinder ACTGGATGGCAATATATTGGTGGTACATGGTATTACTTAAATCCAATTTCAGATGGTACTAAAGGTGCTATGAAGACAGGATGGCAATATATTGGTGG >NZ_CP016087|5|5|1146323-1146420|CRISPRCasFinder ACTGGATGGCAATATATTGGTGG TACATGGTATTACTTAAATCCAATTTCAGATGGTACTAAAGGTGCTATGAAG ACAGGATGGCAATATATTGGTGG
>NZ_CP016087.1|WP_077360905.1|1143632_1144169_+|glutathione-peroxidase MIYDFKVKAVRGREVSMEDYKGKVLLIVNTATGCGFTPQYEGLQKLYDKYKDNGFEILDFPCNQFLEQAPGSDEEIVSFCQLKYRTTFKTFSKIDVNGENASDLYKYLREQAPKAAEDEASEGLYDKLKGLGFSTDGDEIKWNFTKFLIDKEGNVIERFAPTYEPEKIAEKIEELLKK >NZ_CP016087.1|WP_077360903.1|1143159_1143471_+|thioredoxin MVKVVEENEFKSEISEGIVVVDFFATWCGPCKMVAPILDELSTEMEGKVKFIKVDVDGCTEIVNEYEVSNIPAIFIFKNGEKKDVLVGFSPKENIKEKIDIYL >NZ_CP016087.1|WP_077360901.1|1142275_1143142_+|NAD(P)/FAD-dependent-oxidoreductase MSERYDLAIIGSGPAGLSAALNAKIRKKKFIIFGTNELSAKLTKAEKINNYLGFYGKSGAEIRNEFVKHLDFMDISITEEKINNIYAMGDYFALMVNEKMYEATSIILATGVNFGKPFKGEEEFLGKGVGYCATCDAPLYKDKVVTIIAYNRHEEAEVNFLSTIASKVYYLPMYKEKVEVNESVEIIKDIPLEIIGDKKANKLILKNSEIETDGIFILRDSVAPGQLVPGLKMDGSHIEVDKRMKTNLKGCFAAGDIVGVPYQYIKAAGEGNIAALSAVSYIDEINKK >NZ_CP016087.1|WP_077360899.1|1141758_1142232_+|glutathione-peroxidase MNFYNFTANKVNGKEIKMDEYKRKVLLIVNTASKCGLTPQLEGLENLYKEYKDKNFEILGFPCNQFANQDPGTNKEISEFCLINYGVTFTMFEKIDVNGQNAHPIYKFLKENAKGTFGSEIKWNFTKFLIDKEGNVIKRYSPITTPEKIKSDIEKLL >NZ_CP016087.1|WP_015391155.1|1141225_1141660_+|MarR-family-transcriptional-regulator MDKYNSIKLENQLCFPIYALSREIIKLYKPFLDKFNLTYTQYVTMLVMWEDEKITFKNLGKKLHLDSGTLTPVLKKLESANLIIKYRTKEDDRVVVVELTEEGRKLKDDILEVPQNMFCKLQMSGADALELKNRLNDVLKIFDN >NZ_CP016087.1|WP_077360897.1|1140211_1140976_-|dioxygenase MIKPLFLAHGSPMMAIEKSVYTKFLNSLGHSINPKAIVVFTSHWTTEKITISSIDSIYDTMYDFYGFPKELYQIKYPARGSSSLALNIQNKLITSGIQAKLDSARGLDHGTWTVLQHLYPNADIPVIQVSINYTLSVKEQIRIGAALKDLSQEDILIIGSGNTVHNLRLVNWDSSDTDSWAQEFDDWLINKIETKDFNALYDYRNSAPHANLAAPTQDHLVPLFITLGSSPNLSPKIIYRDYQLGNLSYLCYEF >NZ_CP016087.1|WP_077360895.1|1138518_1139976_+|MFS-transporter MDSRKINIMIALLVAMFLGAIEGTVVTTAIPTIVKELQGFEIISSVFSVYLLTSAISTPIYGKLSDLYGRKNILSIGIIIFLIGSFLCGLSQNMYMLIICRAIQGIGAGAIFTVTYTIIGDVFTIEERPKIQGIISAVWGIASLAGPFIGGILIDILSWHWIFFINIPFGIVSVILIQRNLNESFEKKKHKIDYAGIITLSAAMLVFLNIFMSTENTNTTSNKFIVISLVITIVLLMLFYKIEEKAEEPIVPFDIFTKSSTIVNLVSLLDSTILIGANVYMPIYIQNVLGFSPKISGLALAPMSASWLIASVFLGKMIMKHGGKAVIVISNIILFISTVLLITLDIKSSLVVVLVYVFIMGFGFGGAFTTLTIIVQESVEFNQRGVAMSTNSLLRTLGQTIGVSIFGSIFNLYIVKYFVKLGINGVEPSDLYKASSGNAILTSEQISLSLNSSLHVLFIVFVVICIVASALSVLMPKMIESYEKR >NZ_CP016087.1|WP_077360893.1|1136822_1138298_-|6-phospho-beta-glucosidase MTIRRFPEGFLWGGATAANQVEGGWKDGGKGISVSDCARHHLDVDVTNYKKHNTVTSKDIEEALKTDDESLYPKRHGSDFYHHYKEDIKLFAEMGFKVYRMSIAWSRIFPNGDDIEPNEEGLKFYDNVFDECLKYGIEPLVTMSHYEPPINLVLNYNGWYSRELVSFFEKYVTTICTIYKDKVKYWLTFNEIDSMIRHPYTTGGLIEDRFPEMNWEQVIFQAMHHQFIASALATKICHEIIPEAKVGCMLTKLTYYPYTCKPEDVLKAQQDMRATYCYSDTQVFGEYPSYLLARFKNNGIIIKKEPGDDEIMKNYPVDFVSFSYYMSSCTAASTEGLDISAGNTITAIKNPYLPSSAWGWQIDPIGLRISMVDLYDRYRKPLFIVENGLGARDEVNTDGTIDDQYRIDYFNSHFKSMLDAIEYDGVECLGYTSWGCIDIVSESTKQMSKRYGFIYVDCDDYGNGTFKRIPKKSFYWYKNVIKSNGECLFEN >NZ_CP016087.1|WP_077360891.1|1136532_1136724_-|hypothetical-protein MHNEKNRNNANTGNNSEDLIIDISSSKSPASDTEDMLETNNSNISRSSISPETIDVNDDDDDD >NZ_CP016087.1|WP_077360889.1|1135688_1136417_+|DUF523-domain-containing-protein MYIISACLCGVNCRYNGKSGSNERCLKLFREGKAVLVCPEQLGGLPTPRNPVELDNTASQIIEGNGKAMSNKGEDVTQKFLNGAYETLKIAKELGTTKAILKEGSPSCGANFVHDGTFTGNRINGKGITAQILENEGITVFSDEDLEINNSKLVYLNEFDREKAKKRRLFELEEEDDEEEEYFDLTENLTDMSELPPKVEENVKKLMISLARDLMGFEELDEIAEATGLSIEEVEEILNEEE >NZ_CP016087.1|WP_077360909.1|1146779_1148015_+|exonuclease-SbcCD-subunit-D MRILHTGDWHLGKNLEGISRMDEQEEFLNDFVEIVEENNIDLIMIAGDVYDSSNPPARAEKMFYDTLKRLSKNGERLTLVIAGNHDNPDRLVAAGPLAREHGIIMVGTPKTVVPCGGYGKHKILDSGEGFIEIEINNEKTVILTVPYPSEKRLNEVIYNYMEDEEEKAQSYSEKIFSLFDSLKSHYREDTINLVISHLFAMGSEESGSERSIQLGGTYIVDGNCFPKEAQYIALGHVHKPQVVPGTNKRARYCGSPIHYNKKEINFEKKCYIIEVKAKEECKIEELNLKVYKPIEIWKCADIEDAIAKCEKNKARKCFVYLEIETDRYIREDEIKQMKELKKDILEIMPKIKGTTEEEVDFNLNEKTFEEIFIDFYTKERGTAPEEDVVSLLLSIINEEEGEINETSKIED >NZ_CP016087.1|WP_077360911.1|1147989_1151478_+|AAA-family-ATPase MRPVRLKIRGLNSFIDEQTIDFDKLTDRGFFGIFGPTGSGKSTILDGITLALYGNLARKSSNFINTNCDRLNVNFEFQISGSETRKYIIDREFRRKKDGNINSGKCKIVDITDSEEVLADSVKNINKKVEEIIGLNLEDFTRTVVLPQGKFSEFLKLEGKDRRDMLERLFNLEQFGDNLARKLNTKISKERTENSVLIGQLSVYSDISDEKLKEKQAELQLIILNLENLKKELDDIEKNYKDNEELWKLQLELLEYKNKEKLLKEKEEEINKDIEKIRLGEAGEKVIPYIKAYENTTKEFTKNEVEFQDLKVKSEKIKEEQENIEKSWNEIKDKKENKLPQLMIQEEKIKNAIEEKKLLEKILAEINMLRTHIEEVKIKLEKGQKDLIGIEKEIKIKDKEIKDDEKRYDEIKIDELIKEKVQEGILCEEKISSLKNNISKDTEKKDKIEKENDDIIASGKALKEIIEKATKELEEKGKQYEYLLNNPPGEQKDLLNLKQFILENEQKWSNYNKFTNEIVESKKEIVKLNIEIEKIQIEEVKNNQELEELKAKEKEIMTENIAHTLRMELKDGEACPVCGATHHIKENIKVFAATDISIIENKIKEKEELIKVVNNNIVENQTKVITLNEKISSNESEIIKLGSEFKEKTLEKLQEEFINMEKALENYNKDKEGLDKVINELKNNINIKNGEINELRAVVRTNMKQLKELEENIKVNTQEFNELNNKVNLLKSETLITNFIEKNEEIKAGEKERERLAKKIKENRVAIENLENRKEKLNNEVISIKELLVKYSADLAAYEKNRDEKLLAIKSKVSEESDLDKMLSEVQANIKNINEEFLGAQKNKDRIQKEFTDNNERLIDIGSKYKELIKRKKDEEAQLEIAIDSEGFKSLEEVKANLIEKEEINKYKEKIEDYRENLSKVKGTIESLLNKIDGKTLNEEDYTKVKLLKQQKEIEFSSVNENKIKVDEELKKIKIKLNEQRELFEKKDKLEHKLALLGDLEKLFKGKKFVEFVAINKLKYISIEASKRLREITHGNYGLEVDENGKFMIRDYKNGGAERDSSTLSGGETFIASLSLALALSAQIQLKGTAPLELFFLDEGFGTLDDELLEVVMSSLERIHNEKLKVGIISHVEAIKNRVPIKLMITPAECGMGGSKVRIERS >NZ_CP016087.1|WP_077360913.1|1151551_1153198_-|hydroxylamine-reductase MVQEMFCFQCEQTAGGKGCTKIGVCGKTPEIAAMQDLLIYQLKGISIYANELIKKGEVIDKTIVSFVEDSLFMTLTNVNFDPAAHLTKLKKSQEIKEALRKKVSTDSIKAPESLYDLAASTEAMLEDAKKARIMYDENLNLDIRSVRETIKYGLKGIAAYSHQARFIKHSSDDVDNFYFKALAALTDNDLTLDDLIKLLVETGEKSVKIMETLDTANNGLYSSPTPTKVNVNIKKGPFIIVSGHDLKDLDMLLQQTEGKGINIYTHGEMLPSHGYPELSKYPHLVGNFGSAWQNQQKEFDNIPGCILMTTNCLMKPKDSYKDRLFSTSVVGWDGVKHIEKDENGHKDFSEIINKALELGGFKEDEEVKEILVGFGHKATLSHAETIINAVKDGKVKHFFLIGGCDGAKPGRNYYTEFAEKVPKDSIILTLACGKYRFNKLEFGEVAGLPRLLDVGQCNDAYSAVRIALALADAFNCGVNDLPLSIILSWYEQKAVADLLALLSLGVKGMYLGPSLPAFLTPNVLQFLIDNFDIKPISTPDEDLKQILG >NZ_CP016087.1|WP_015391164.1|1153387_1154131_-|response-regulator-transcription-factor MNIKVLIVDDEQGMRTIIKKILDKSSGFEVVGDTDNGEEAIKIFKEHRPEVVFFDIEMPGCNGIDCAKILTDIDPKTIIIFATAHQEYMSDAFQLYAFDYLVKPFKIERVLHTLDRIKTLNKPNYEDGIDKIIKHEKGLDKLMIKNKEGISFVDTKEIVLIQREDSSTVIYTQSDSFTTSISLSEIEEKLDHSQFFRSHKSYIINLSLITKIYPYGRWTYIVKLKNTEKDALLTHEKYEEIKKLFSL >NZ_CP016087.1|WP_077360915.1|1154149_1154530_-|hypothetical-protein MKSNEIFQTTLTALKDSFITNDKIGIRVNFQYPFGTLPKNEFTISTSLKPEDDNGASDVSIPVGDNKDYTEANSSYNKQQSASSNPQGVIDSITQELTSVKLQQAIILSEIVGKPRSKTRRQRRRF >NZ_CP016087.1|WP_077360917.1|1154562_1155531_-|flotillin-like-protein-FloA MINLIIVAIAVVCLVFLFITFIPIGLWISSLAANVQVSIFNLIGMRLRRVVPSKIVIPLIKSTKAGMGLNVNQLEAHYLAGGNVDNVVNALIAAHRADIDLQFEKAAAIDLAGRDVLEAVKMSVNPKVIETPNVSAVAKDGIELLVKARVTVRANLERLVGGAGEATILARVGEGIVTTVGSSTSHKIVLENPDAISKTVLSKGLDAGTAFEILSIDIADVDVGRNIGAQLQTLQAEADKNIAQAKAEERRAMAVAKEHEMRAAVVEAESEVPKAMAYALREGKLGIMDYYDMQNVIADTSMRSSISNAGNKTQISNNDTKK >NZ_CP016087.1|WP_077360919.1|1155603_1156101_-|serine-protease MSTFLPDITLLTLLLLIIGFGLVFLEMHIPGFGIPGILGAICLILAVALTAQNFAEGLVMTLGILAVLGIMLGVVLTFFTKGKFFKPLILPDVQRKEHGYISSSDLDYLLGKKGIALTDLRPSGSIDIDGVKFDVISDGEYISSGTKVEIFKVSGVKLLVKKTKD >NZ_CP016087.1|WP_077360921.1|1156300_1157149_-|GHKL-domain-containing-protein MAIKKQVYNISKIVLVSIFLNLIQIISITLFIYYKYKNPYMIEGNFILNVIAISIGVNSIITGIIFYNLLFKKGNNNLIDTLNYLEALNKTLRTQRHDYLNHIQVIYSLMELEEYDEARRYIEPVYKDIIRVSKALKTSKPAVNALLQAKLQVAEKNNIDMELEIKSDLQYLNIEPWEFCRIIGNIIDNAIFSLKEKPDNKYILVEFSEDLENIRINISNNGNMIPKDIIDKIYDAGFTTKGNKGDGMGLAIVKEIVENFSGTISVISTIQRTSFEVVIPKK >NZ_CP016087.1|WP_077360923.1|1157420_1159148_+|phospho-sugar-mutase MNYKEKYNLWIESDVINEETKNELKSISDEREIEDRFYQDLDFGTGGLRGIIGAGSNRMNIYTIAKATQGFADYLNDNFKNPSVAIAYDSRNMSKEFAKAAALTLCANNVKVFLYEGLRPTPVLSFTVRELKCCGGIVVTASHNPKIYNGYKVYDEFGGQVTDEKANIIINCVNAVDDFSKIKNIDENVALEKGLLKYIGEDIDRVYYDRVKGLTIRTDLVKEKADKLNVIYTPIHGSGNVPVRAVLKELGYSNVKVVKEQEAPDGNFPTASYPNPENPDVFKLALDMAKDENPDIIFGTDPDCDRIGVVVKDSSGEYKVLTGNQTGLLLTHYVLSSLKETNKLPQNGVVIKTIVTTEGARSIAEDFDVELMDVLTGFKYIGEKIREFEDAGNKTYLFGFEESYGYLAGNFVRDKDAVIASMLICEMCLYYKQQGKSLYDALIDLYEKYGYFTENLVSIELKGKEGQEKIASCIEAMRNDPLSEVDGVKIVKRLDYKLSTEEDTVNNTKTTIDLPKSNVLKYILENGSYFVVRPSGTEPKMKVYLAVKSNSLDNAGKDIAEFKEKVMEKINAKLS >NZ_CP016087.1|WP_077360925.1|1159447_1160548_+|tetratricopeptide-repeat-protein MSNYKTLYKDKLSKLLFLEMKKEGFKKNLNIPQEVKFKNDDLYMPISAEYVAANANNEIKLNNLPIYYFVEGMFIVFGADKNVKYIDDYGTILGYIPDSEECVKSLIADRIKKDRLEDAYILLKGLYRYTKEEEILTKLLAVGETIREKDSSFGELLLEDIDECKDNFEKSPEPYLYKALILKDKGDYKGAQVEINEYMNKGGKQTPEIKQIITDINNIGGFEKAVEYLKDEPKKAIDLLLPLSEEFKENPLIYYYLGVGYRRIENYNKAIHYLTQSLSIESGSLETVNELGMNYACLGDYEEAVKYFRKAFEASKEVEICTNIVMCYINLGDKEQAKLNLDIAKKLSPEDPIVIEIDQMLNRTVK |
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| NZ_CP016087_6 | 1555221-1555317 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016087_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP016087_6
>6.1|1555244|51|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder TGTGAAAACAAGATTATAGAGTTAAAAAGCACGCACCTATAAAAAGAGTGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016087_6
The CRISPR arrays of NZ_CP016087_6 >merge|NZ_CP016087|6|1555221-1555317|CRISPRCasFinder GAAGCACAATTAGGAACTTATTTTGTGAAAACAAGATTATAGAGTTAAAAAGCACGCACCTATAAAAAGAGTGCGAAGCACAATTAAGAACTTATTT >NZ_CP016087|6|6|1555221-1555317|CRISPRCasFinder GAAGCACAATTAGGAACTTATTT TGTGAAAACAAGATTATAGAGTTAAAAAGCACGCACCTATAAAAAGAGTGC GAAGCACAATTAAGAACTTATTT
>NZ_CP016087.1|WP_015391576.1|1554419_1555061_-|undecaprenyl-diphosphate-synthase-family-protein MRIPKHIGIIPDGNRRWAMFNSMTKDKGYQHGINPGLEVFKLCQKEQVEEVTFYGFTVDNTKRPKDQTIAFTKACIDSVILLTKEDCEILVLGNTESNCFPVELLPFTTRRKFGNGGIKVNFLINYGWEWDLNLLKNSSASNKNIQRYIHSKDISRIDLIIRWGGRRRLSGLLPIQAVYADFYVLENYWPDFKTKDFYNALAWYDEQDVTLGG >NZ_CP016087.1|WP_077361346.1|1554064_1554331_-|DUF1294-domain-containing-protein MLKIILAYLLVINLVGFIIMLIDKQKAIHKEWRIPENTLISISIIGGSIGMLFGMSAFRHKTKHIKFKFGVPFILFIQIGLIILYFNY >NZ_CP016087.1|WP_077361344.1|1553822_1554032_+|hypothetical-protein MNKENNSKHWKLGIFYYNPDDPSEVIEKNNGKGSTINFASKGGRRTFALMMIPAYIAIILVIAIYLFYV >NZ_CP016087.1|WP_077361342.1|1553147_1553753_+|DUF2238-domain-containing-protein MRREYLYKFLLISICIILILSAINCHDLFTWALEVLPAIIAGVVLIVTYNKFKFSNFTYLLIWIHAIILIIGGHYTYAEMPLFNWIKDIFHLSRNYYDRVGHFAQGFVPAIVLREVFIRNKVIKNRAWTNFIVISICLAVSASYELIEFAVATFTGEAADAFLGTQGDVWDTQWDMTFALIGAIFSIITLGKYHDKLLEKL >NZ_CP016087.1|WP_015391572.1|1552070_1552985_+|homoserine-O-succinyltransferase MPIKIPIQLPAFQVLSNENIFVMNDERANTQDIRPLKIAILNLMPKKIVAENQLLRYLSNTPLQVEITLIQTKTYISQNTPSEHLDKFYSYFDDIKDQKFDGLIITGAPVEKMEFEEVTYWNELTKIMEWSKTNVFSTIHICWASQAGLYYHYGIPKYDLEEKMFGVFPHWVNDEKADLTRGLDDVFYAPHSRHTEVKREDIEKAPELEILSESEEAGIFIVATKDRRGVFITGHMEYDRNTLKDEYIRDKEKGDNVAIPKNYFKNDDVNETPKYIWRATASLVFGNWLNYCVYQNTPFDLNKL >NZ_CP016087.1|WP_077361340.1|1550696_1551755_-|lactonase-family-protein MSNNNIAIGYIGTYTKNNSKGIYRINFNTTSGHIEKVNLAFEIENPTYLSIDRDRHILYSSCKDDKKAGVSSFKYWKDKDELNIINNYISEEKPPCHVSISKDKQILISSNYHENKMLIYKTLDGLILDSPILGSHCGHSINISRQEKPHIHCSMFTHDENYIISIDLGTDKLMFSTINDGTLNYKDNLNYTFPAGTGPRHVTYSKTFPEYYYVISELTSEIFVFKYNVNSENLFENIQILSSLPPNYTEKKSGGAIRIHNNNKFLYTSDRGNNSISLFLIDKNNGHLKYIDSFSCKGDSPRDFQLDPTGNFLLSANENSDNITIFSINQLTGVLTFIKSENIPTPTCIEFI >NZ_CP016087.1|WP_015391570.1|1548676_1550443_-|adenine-deaminase MNKQTLINTIKASRKEIKCDLVIKNITIIDVFNKDRFVGSIGIKDGYIVGIGNYDGEEIIDGTNKYICPGLIDSHCHIESSLVTPAEYSKYALLNGITSIIADPHEISNVMGTDGIDFMLNSSKDLPFDIYFMLPSCVPGTCFESSGATLLSQDLINYYKNDRILGLAEVMDYPSVAYCKENIIDKIYDAVHNNKVIDGHGAGFTPMMSNTYRSAHILTDHECINANEALEKIRRGMHILIREGTVAKNLKELLPAVNENNSSRFCFCTDDKHIDDIANNGSINNSIVYAIKNGLKPETAIQMATINPSNLYKLNDKGAIAPGYIADFIILDNLEEFKISKVFKAGKLIVDNNKITNYNASLVKKASGLYSNTVNLPFLSENSFTISIKRKDNTKLNVIEIIPNKLESIHLELNVDDIKSMNHNNYTEFKPSPKDDLAKIAVIERHKGSGNVGLGILKGLGLKEGAIGTTIAHDSHNLILAGTNDKDMLFAAKELEKMHGGIIIVKDETILAHISLEIGGLMTNRQYHEIEDDLKNLHFAIKAIAPDINFNPFLTLSFLSLPVIPDLKITDKGLFDVTKFEFIDICKN >NZ_CP016087.1|WP_015391569.1|1547422_1548529_+|HD-GYP-domain-containing-protein MRLVPIESVKPNTVLGKTLYDVDGRVLLRAGVVLREVTIAKIKEINILSIYIVDKYSDEEIDDIIKPEIRQKAIITIKEAFSNIGRLNTTDQERNKESDYTWQEQSYFYNIGKMAVNIIEDILKHKDVLLALVDIRSMDNYMYSHSVNVAVISLTIGITFQMPKKKLEALCIGALIHDIGKSFLPKRLSDIEAELTADEKEMIKQHPRLGYKYLSSTYNINSLSKMIVLQHHERPDGKGYPDRLNKDNIVDLSYIVSIADAYDNLSTDLPEKRAMFPSDVLEYLMSNAGSMFDYNIVNIFCRIVIPYPKGTIVEISTGERALVRETIPGFPLRPILKIIESQRVTRIGDEINLIKEISIVITKVVHDV >NZ_CP016087.1|WP_077361338.1|1546489_1547293_+|sugar-phosphatase MYKLIALDMDGTLLTTDKKVSIKTQAAIKAAEAKGVKVVLASGRPLIGLTKHLEELDLMKDEDYVLSFNGGLVQNAKTKEIVSKLPLKGKDLKYLYEISKKNNVNIHAFSAREGLIAPKISKYTEYEAEINEIDINVRDLNEIDDEEDIIKVMMIDPPEILDPAIEKLPSEAYEKYNVFKSSPFFLEFTNKEVDKGLGLKKLAEYLGIKQEEIIACGDAANDLSMIKYAGLGVAMANATSDVKEIADFITTSNDEDGVANVIEKFIL >NZ_CP016087.1|WP_077361336.1|1545108_1545735_-|sporulation-membrane-protein-YtaF MLESLLLVSSLCIDSFVASIAYGTSKIHIPHISKIIINLVCTITLACSLLIGSILKSFLPSNLPVILGFFLLMLLGTYRLFESIFKSYISKYSRSDKPLTFKIFDFKFILQVYADEIKADFDNSKSLNIKESFYLGLALSLDSLAVGIGSSLCNVNYFEVLVLCFIIGLIAVSFGSFLGKKFAQKLNLNLSWLSGALLILLAILRVLK >NZ_CP016087.1|WP_077361348.1|1555702_1556908_+|glutamyl-tRNA-reductase MIGLIGIKKDTPLEIREKFIIKTKKRELYLNELLTELKEAVILATCNRTEIYFNASFEKEELLEKVFLIFNWNFEYRKYIFIASDKGAYRHLFEVCCGFHSKILGEDQILGQVKEAYEEAIKFKAVSLELHRLFQEAITAGKRFRKEAKLFEIPVSSASIVINEAIKQKCNSFMVLGYGEVGQLILKYLLSHKVEIIYLVVRNAKVNDEINDKRVKVIDFEGKNNYIDNVDCIISCTSAPHAVVRKGDFNEEGNKILVYDLAVPRDVEEEVSFISRTEVYNIDTISRIDDNNKLLRKERMENNKDIMLKYLNEYEEWLKLREVSPVIQKLRTLGNEVYEKRSKTFIHKSDNDKDIILADRLIKSTSDFYINRAIEVVKEEALKGSGEEWINIMQKIFFTKE >NZ_CP016087.1|WP_015391582.1|1556865_1557546_+|NAD(P)-dependent-oxidoreductase MDKYNAKDIFHEGIDYSYISLISKKLRIGIIGGGKAGTIKAKHFVKSKSYVEVLAKTFDEEIIELAKNSKDNLKLINEPFNFRFLHDKHIVILAFNDDILKNKIKDYCDEKYKIYIDSSDFMNGMGVVPVQRNTDNLTFALNTEYGNPKGSVFLSNKIENLLKEYDSFMEFITKIRNKTKGLEPYKDDIIKFIVSDEYKKAFDDGKSEEELRNNFPKNIVDYLLEP >NZ_CP016087.1|WP_015391583.1|1557576_1558452_+|hydroxymethylbilane-synthase MDKFIIATRKSQLAQVQTEIIMKNLKDKFNINSEKLLIVTEGDRRLDVSLTKIGGKGLFVKDIEVALLEERAHGAVHSMKDVPYELSSEFEIAAITEREDIRDVLISKDNIPFKEMRSGAVIGTSSIRRACQLKLLRNDLEIVSIRGNVQTRLEKMKRENLDGIILASAGLKRLNEENLITEYFDPKEFIPAVAQGALGIECLRNSESRQYFNKLEDANAKLTVEAERSFMKELNGDCHSLIGAYSEIKGNDLYMIGIYDIGGKIVKKDILGSVDKNVELGKNLAKKILQI >NZ_CP016087.1|WP_015391584.1|1558536_1560012_+|uroporphyrinogen-III-C-methyltransferase MSQVYIIGTGPGDEELLTLKAVKALKKCTAVLYDRLVSNNILNYLNENCEVYYCGKEPGAHSKTQEEINELLVELAKKGHIVGRIKGGDPYVFGRGGEEVLELRKENISFEVVPGVTSPIAVLNYAGIPITHRGIAQSFHVVTGKSAQDLNVNFKALAGEQGTLVFMMGLSNLDNIISQLIANGKSPLTPCGVVMRGTSAKQKKVIGTLENISEKVKAANLKSPCIIVVGEVVTLNESLSWYENKPLFGKNICITRTKKQSENLKEKLVKMGAEVTSFNAIEIESCAEKLDEYLNTIENYDHIVFTSVNSVEIFFDYLVEKAYDVRRIKAKISAIGRATERALNNRGIVCFAKAKEFVGEGLVSILKPNLKVNEKLLLPCSAKSRQYIYEELVRTGVEVDRVFIYDTICGKVVNKKSFEEVDIVFFTSPSTVKNMVDMLGIDEIKKKQVIAIGPKTNEPLIELGIEAYVCKEHSEDGFLKEIENLLLRERK >NZ_CP016087.1|WP_015391585.1|1560068_1561043_+|porphobilinogen-synthase MIKRGRRLRANSAIRDMVRETILNSKDFIYPIFVVEGKNIKNEISSLPGNYHFSIDRLHEVINEVKEADIAGVLLFGIPEHKDECGSEAYNDNGIVQQAIREIKRIDKNLLVVTDVCMCEYTSHGHCGIIHDEDVDNDETLDYLAKISVSHAKAGADIIAPSDMMDGRIGAIRKALDENGFKKISIMSYSAKYCSAFYGPFRDAANSAPQFGDRKTYQMDPANRMEAIRETQMDIDEGADFIMVKPALAYLDIIRDCRENFNLPLVAYNVSGEFAMIKAAGKLGLIDEERVMMETLTSIKRAGADIIITYHALEASKIINSVRS >NZ_CP016087.1|WP_077361350.1|1561118_1562399_+|glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase MKNLEIFKESEKYMPGGVNSAVRAFKGINLNPPIIKSGKGVMITDEDDNEYIDFVLAWGPLLLGHSDEDVVKAIQKISLKAVAFGAPTKLELDMAKFMCTNLDNIEMIRMVNSGTEATMSAIKLARGYTNRNKIVKFAGCYHGHFDGFLVEAGSGVMTGGIPGSLGVPKESIENTLIGIYNDKKQIEELFEKHGNEIAGVIIEPVAGNMGVIKAEDDFMETLRKLCDSYGALLIFDEVMSGFRVDFKGAQSLFKVKPDLVTYAKIMGGGLPCGAYGGRKEIMEKLSPLGGVYQAGTMSGNSIVMAAGLATLNKIKNNLDYYDHIEKMGAKFEEGVLTISKKYNLPVVINRIGGMMTIFFTDLKVVRTYDDVKKCDVEKFNMYFEHMLKNGINIAPSQFEAIFLSAKHEENHIDKFLKTFEEFACNC >NZ_CP016087.1|WP_077361352.1|1562435_1563062_+|epoxyqueuosine-reductase-QueH MNKINYQKELDFLIENLTKEEKVPTLLLHSCCAPCSSYVLEYLSQYFKITIFFYNPNIYPLEEYARRVEEQKKFISELKVKNKIEFIEGEYDTKSFYEIAKGLEEDKEGNVRCFKCYELRLREAAIAATKAGFDYFTTTLSISPHKNSQKLNEIGKMLSEEYNVKYLYSDFKKKEGYKRSIELSKEFNLYRQDYCGCVFSKNESMKEK >NZ_CP016087.1|WP_015391588.1|1563114_1563666_+|DUF3867-domain-containing-protein MSDKIIDFNELKNKVKDKDVDKFEEYIYSMYYKLAEGKMNMADFSKNIMSYMQENNISQDKLINIQKKFLERYGIDPSTIEEQFNIPGFNMNNNNYETMKKTASFHDKYKSRIATRTMSEYFVKNEKNDLKIFLENTDVILISEKNVDLNDNELNEFLCSYKKVIDDKKINIILCENTKSYEY >NZ_CP016087.1|WP_077361354.1|1564537_1566115_+|family-43-glycosylhydrolase MIKRSPMFLLTFTLLSGFALNTYTASANTDIGTTALVTTKQAVSVVSTSALAKTPGYSNPLITQKFGADPFAMVYDGRVYVYMSSDAFMYKNGNVSDNDYSNIKTITCISSDDMVNWTDHGEIPVAGSNGAAKWASNSWAPAVTHKIINGKEKFFLYFANNGGAIGVLTADTPIGPWTDPIGKPIVTTSTPGVSGVVWLFDPAVLMDDDGTGYLYFGGGIPGGSSPSQSQIANPKTGRVIKLDSDMIHTTGNASVIDSPFMFEDSGIHKYNGKYYYSYCSNFSGTHPTGTPPQGEIAYMVSDNPMGPFTYKGTFLKNPGSYFGVGGNNHHAVFQFKNQWYVTYHAQTLGKAMGITKGYRSPHINKLEYDGSGLIKTVQADMQGVGQVANLNPYKRTEAETIGWNSGLSTEKSKASGSMVSSINLDVTNINNGDWLAVSKADFGSGAKSFKANIASTVGGTIEIHLDSLDGQLIGTLNVSPTGGEQQWKEMKCDVKSVSGVHNVYFKFNGNGTNNLFNIDYWQFIS >NZ_CP016087.1|WP_077361356.1|1566193_1567465_+|glucuronoxylanase MNVKVRRLLLSLLTISITGSLCVGLSATANAASNVSINLSAEKQVVRGFGGMNLPAWAGDLTAGQRETAFGNGENQLGLSVLRIYVDDNKNNWYKELPTAKKAIEHGAIVFATPWNPPSDMTETFNRNGDTSAKRLRYDKYAAYAQHLNDFVSYMKNNGVNLYAISIQNEPDYGKEWTWWTPQEVLKFMKENAGTINCKVMSPESFSYQKNMYNPILNDSQALANMDILGTHTYGTKVSDFAYPLFKQKGAGKELWMTEVYVPNSDANSADRWPEALDVAEHINNAMVEGDFQSYVWWYIRRSYGFIKEDGNVSKRGYMMAHFSKFVRPGYVRVDATKNPTTNVYVSAYKGNNKVVIVVINKGTSEVKQSFNVSNSKVSSVSSWQTTATANLAKSASSINVSNGSFTATLPAQSVTTFVGEIN |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NZ_CP016087_7 | 3541364-3541474 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016087_7
|
1 spacers
spacers of NZ_CP016087_7
>7.1|3541397|45|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder TAAATGATCTTGGTTGCAGATAAGTTCCGTATTGCAGCATAGCTG |
WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016087_7
The CRISPR arrays of NZ_CP016087_7 >merge|NZ_CP016087|7|3541364-3541474|CRISPRCasFinder CTCTTTTCAGATGTGCATAGCTGCTTTTTTTATTAAATGATCTTGGTTGCAGATAAGTTCCGTATTGCAGCATAGCTGCTCTTTTTAGATGTGCATAGCTGCTTTTTTTAT >NZ_CP016087|7|7|3541364-3541474|CRISPRCasFinder CTCTTTTCAGATGTGCATAGCTGCTTTTTTTAT TAAATGATCTTGGTTGCAGATAAGTTCCGTATTGCAGCATAGCTG CTCTTTTTAGATGTGCATAGCTGCTTTTTTTAT
>NZ_CP016087.1|WP_015393643.1|3540457_3541054_+|trimeric-intracellular-cation-channel-family-protein MYDIALLEYLGIFAFAASGAYVAIEEKFDLFGIYILATVTAMGGGVLRDIVTNVGIPAFFSNYKTIPFIILGATIPILLRGKLKYNTLFVVVDAIGLSAFFVSSGLKAIESGYNLMLFLFAASITGVGGGMLRDIITNRKPEIFKTDIYCVAGIVGSLLLWFFYPILGAHTAQHLSLITIFSVRMVCYMKKINLPVIN >NZ_CP016087.1|WP_077364048.1|3538684_3539902_-|MerR-family-transcriptional-regulator MKIGRFVEHNNLTIDTVRHYMDMSLIIPEKKGGQYDFDNNCQKDLENILAYKAMGFSLSEIKTIFMFKRLGKFTEYQENEYFKELFINKHNQLEQQLIEIGEMKERLESKLKELSEKKMNNESVIGVDIRALDILKCLKCGNDLELFEGKVSKNQIINGKLKCCCGEEYLIEDGILTITCINEKHTSDFDRNYINDYIKVTDSEYLDNVYRGIEWINKKVDFENLKNKVILELGSGIGFFLRNIYECLPDDSIYIAVDNDINRHKFLKNILAATNCRKNILFICSDFQKLPIKEKSIEVLIDISGTSNYSFDNEEFLLKLIDKYVKDEASIIGTYILFEKFALNSLIESKYRKNFMMDNVKDQILTLKYNIIDESISRHVESGGIYEDYFVDGEKVYSYTFIGRR >NZ_CP016087.1|WP_077364046.1|3537289_3538543_-|MFS-transporter MLYSLLSFKNIIKNKEISNIMLFSVASSISLLGTAIYNFAIGLYVLRITGSGLSFAVTLSVSVLSTILVNPFAGVLTDRLDKKLLAIITDMLNGILFIGLYVVTCRSTLNLSMIYVSTFLLNVFTTVYGISIEAVKANLVSDEKLISMNSIIKVIESTAAILGPAIGGIVFISLDIKFFVFINGLSFALSAVLQLFIDFNFNCNESNKVKAEISFIADIVEGITFLKTEKNIINMFKIFIVLNFCIGLSIEVPMPYIINNILRLDANFLGVINGAWSLGMILGAFLIKGVMKKYSYTEIVRWASILLSFSMVAIGFSVILYYELFNEIFYLIYFILIMIIAGIAISFIDIPLFYILQKDIPEEFRGRVLCIGISVAKIVLPMALIMSGGFINSVPAYFLPIAGGLVLCIFSIRKIMN >NZ_CP016087.1|WP_015393639.1|3536920_3537145_-|hypothetical-protein MNKVNVGCPRCGSLNVNVVSDVTETTKGFGAGKGCLGYICFGPIGLLCGLIGMGEGKTETNTYRVCANCGARFK >NZ_CP016087.1|WP_077364044.1|3536571_3536883_-|DUF2085-domain-containing-protein MKLGAYSCHQIYERSFTFRGYQFPVCARCTGLLLGNILGVFLSIIKIKINLKISLLLIFIMAFDGFLQLLKIKNSNNIRRLITGFFAGIGYVFTLVNIVSYFI >NZ_CP016087.1|WP_077364042.1|3535557_3536481_-|YafY-family-transcriptional-regulator MRAERFLSILIIISQKGLVTAKELAEHFEVSLRTIYRDIEKICESGVPIGATGGKGGGYYIMENYNIDNLFFNKNEIEPLLSMIESLKYIFGKNQQFNDIVLKFETLYKREKNENEKLNIDMSHFSMEQELREYLFLVNQAIEYGKLLTFGYINRKMEYAQRIVEPIQIEFTDGQWYLIGFCRIRKNYRKFKFVRIRNMKLGENFVKKNISQVEIEKIFKESYSNNSIFVKFIFSEEIGEQLSEYFSKDKIKKIDNKKYMVEGFFPNDEGLKRFVLGFGVHCEVLAPKRLRKEMQEYIKNIYYKYND >NZ_CP016087.1|WP_077364040.1|3534841_3535486_-|MBL-fold-metallo-hydrolase MKIEKVKNRSILFTKSFEEGWNLNVHLIIGEKYNYIIDTGVGSSHLESIMEYIKNDNKNIIVINTHHHWDHIFGNSFFKAGIIVAHKLCKEMIEHNLDDMSKKHKEYIKYNEEMYLPNLLFEQELYFEEDKIRIIHTPGHTVDSISVVDELDKVINVGDNLGDSVEELIPSIYCEKDKYINTLLRYSQMDFDTCISGHNIVMKRDVIDEILKEI >NZ_CP016087.1|WP_077364039.1|3534243_3534801_-|intracellular-protease/amidase MNVCLLYYEGFCEFEVVFAANEFRDSMFSAALENRIYISEEKQKFLPDKVIEDINPEDIDLFIIPGGESSKLYEEIELKEFVLKLNEKNKLIAGICGGAELMAYYGLLDNKKANGDSAGFKVDETNKNIYDKVNIVSKDVVKDGNCITAIGKAYVEFAIELGKVMKIFKNEQESIDEYNWLKNIS >NZ_CP016087.1|WP_017810513.1|3533802_3534105_-|hypothetical-protein MMDSRELFSANILTDDEIINAAIKALNVDKKEILIIRNPDGWINKKEESIIFESMGLLDEGDTEEYIGCYYYNIYFNSNEFLDKIKLLEKEFDTKVKVNI >NZ_CP016087.1|WP_077364037.1|3533038_3533590_-|hypothetical-protein MKKSILAIGAGVFVVVTILLCMNNDEKMYQKKKHFDTVNDVLSQLENNEIRKISDTGRREETNEFLECLSKRKRLTDSQMDFKNLKINNVKELNDEEKKALIEDYNKIQKKLNMPYKATKIEPVRLEAEEIFPYKDENGEISKKECDIDFVMVDEGEGMVIDYYVEGIDKNSDKKEGNMHAKG >NZ_CP016087.1|WP_077364054.1|3542916_3544164_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MESTLVILGKELEYDFLSSWIKYTRIKNGFSQEALAHGICSVSHLSYFENGKKHLRKEIIEALLKKLKITDLDKFTDIGKVRQKLNTMMNDIESYNFDGAKRIYKKLLKIEPIINHSPYSIEFKIYDLMYKTFVDGLDYKYLKDDLTLLDKISNSLSRELRYLYLLVSGDILFRNHENEKSIERQLTALNIKDTSWINFCLGKAFCFNDAMGRGAYYLEKALDSYERSGRYLNAVWCHNYIGVCFSYLKIYENAEKHFKAALMSAKHFNMDKLLWHLYTNLSDCYLSKGDYESCIKWSRLAMESSYKNILCAYNYISACIKLNRLDECDVIFDIYLSEEYKSSKHYNSIYYLYLVVHNFHEKFFYEEVKNKILPYYESMRKIDICNDIKLKLIEYLESKRRYKEANKLYKELMTI >NZ_CP016087.1|WP_015393646.1|3544233_3544596_-|hypothetical-protein MNLEREETYRDLQDLQDKCRKCMYYHINMTMTDGSTLDGIIETVDPDRIIVLVGEDVMEQENQEQQSEQQRQYYGYGHRPRRRYRRFRRQAFPLASLAALSLLPYPYYVQPPYPYYPYYY >NZ_CP016087.1|WP_077364056.1|3544750_3546616_-|APC-family-permease MLTKFLDVLLGEPLSNEQGSHEKYNVPFGLAIMASDAVSSVAYAAQEILFVLIVLGAAAYQWLTWTSFMIIGLLIILTISYIQIIRAYPQGGGAYKVASENISSKAGLVAGAGLIIDYLLTVAVSASAGADAIISAFSSLAQYKVPFVLIIIIVLTILNLRGISESSKIFAIPTYIFIFSMIFMIIYGLFKYLVLGIHPEPVFSAPLHATESLSIFLVLRAFSSGCSALTGLESVSNSVPNFKEPSTKNAKIVMILLAFLIFFIFGGTSILAIFYTAMPIENGPTVISQIATAIFGNSIMYYIIQFSTAIILLMACNTAYTGFPMLMYIVGKDGYAPRQFTIRGKRLSFSFGIAALSFIACFLVIIFKADTHSLIPLYAIGVFTSFTLGQFGMVNHWRNEKEKGWLKRAIINGCGAIVSLVTTIIILVEKFKEGAFIVAILIPIIILVQLKIKHHYDKVANGLSISQLNLKKVDLRKKYTHIVVVPIASLNKATIGALQYAQSISDNVIALNISTDKVAMERLKTRWDELDTDILLVSKYSPFRAVVTPLLKNIELIANSAAKDEKITVVVPQFITHERFGEVLHNHTSFFIRETLLKNDNIIVSTFPYHLMDECEHKHND >NZ_CP016087.1|WP_015393648.1|3546871_3547819_-|L-lactate-dehydrogenase MAIGRSKVVVVGTGAVGAAVAFDIVRNHVCDDLILIDINKEKAWAEATDLQHSLGYSGSKMRIKDGEYDECSDADIVVIAAALPYITGQTRLDMIEKAAGIMNNIVPKVMESGFSGIFIVITNPVDVMSYYVHKLSGISANKVIGTGTALDSARLRYHLADVMNVDPQSVHALCMGEHGDSQIIPWSQITVGGKKFLDIINDNKVRLEGFNINTVTEDIKKIAYRIVNAKGATTFGIAATTVQIIRAVLNDENKVIPVSAMLNGEYDEEKIYIGVPAVLNSQGVKELVEYHLSDDEMVELKKSISIIKEYNEKLN >NZ_CP016087.1|WP_015393649.1|3548019_3548568_-|ferritin-like-domain-containing-protein MSYTTNRQPQGIMNNIEGFLREGLISEMVGINDYSDFIESTDNRQLKELFHHIMLEEKRHYSIFLTLLRSLDSEEKELSEEVRDHLKISQKGKYSDLTGKVLKEINLLVVIRQAIKGELETILLYQEFVDNLTDENLIRIINEIIRDEKEHVEKLSRALIILDKDRYGDLNPSMPKKKRVDE >NZ_CP016087.1|WP_077364058.1|3548637_3550317_-|M3-family-oligoendopeptidase MTEEKFKLSELPYERITIEAFEKEASDIINQFNQAKDGEEQFSVHKKYYALMEKVSTAMVLAAMRHHGDVSDKFYEGEQEYYDTISPKIESFKVKYQKLLFNSKYRAYLEDKIGKVAFKDIEIKMKSFADVLIPLKQEENALRSRYTKLIAQTKVEFRGEILNLSLMLKYLKSKDRATRIEAAKVRCEKLLTIADELDEIFDKLVANRNKQAKSMEYENFVELGYYNMQRNSYTKEDVANFRNQVKKYLVPLASQMHENRRKRLGLEKLDFVDEGVYFLEGNPIPIGTADDIFAAGKKMYSELSPETNEFFNFMLDHELFDVLGRPNKRAGGYMDMLMLYKAPIIFANFNGTSGDVDVITHECGHAFQGFLTRNDEVAEHNNITMETAETHSMSMEFFTGKWMELFFGERAEDYRKLQLEDAIAFIPYGCMVDEFQEIVYTKPELTPKERREAWKQLEKEYKPHIAFENDEFYGDGRTWQMQRHIYNSPFYYIDYSLAQTCALQFKGLMDEDYMKAWKKYVAFSKQSAKDFFPNMLNHVDLKSPFEDGFMKELVEKIKL >NZ_CP016087.1|WP_077364060.1|3550470_3551193_+|hypothetical-protein MEFKLKPRKRFKLKNIILSVIFIFAYGISIFTTLQKPNLNIDNKINDLLSSKNDTQTSKTDTENSKNNDKRSPAKNDSSTKSTQSSSNNVIDPKDYSRLTVNEYVNLCVDQTFGKKNNIDKPFLSSIRFTNNCQLIHINIGYYGNSEQLKAAAINASVELYKSLYTLYPEKFGHTVFGITVSGRTINKKGTDTDIEEAAVSWYDDKTLKALDINKLTVDNFKNTVYRFYDYQNMAGIQRD >NZ_CP016087.1|WP_015393652.1|3551215_3552304_+|hypothetical-protein MNENKNTQRMTHYFIYLFVLIMSIDIVTYMLFPVIKNNLAFLLIGLFTIALDVILLLLIRIGINWARWTFIISLIMKCGMLVINTLDNFFIFFNFNTKYIILILYFLIICVLTFSKDINKFFELCSQGRYYVDQCNEYIKTRYNSSISLNHKFSMNSLSDNCILMAVNSAIDNCDFDIIIDNALIYDNYFERHFNDEINAKIKYNIKKYALKSNESYTNKLLNINNGSNYDRLEFNIDSSLNLFDEYKTKLPPYEVFYELNSSKGNFFNFIYSMTPDYNDLEFNVQYIYSILDLLKSFNYRFDIINFYDRSKDTSNDKIHNDSKYIIRELTYPEACDILDNQDLSLIKDKIRHYIMNSSENL >NZ_CP016087.1|WP_015393653.1|3552405_3552612_-|alpha/beta-type-small-acid-soluble-spore-protein MASSNSGSNRTLVPEAKAGLNRLKTEVASEIGLSNYENTDKGNLSSRQNGSVGGEMVKRMIESYEQGL >NZ_CP016087.1|WP_015393654.1|3552898_3553768_+|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MIKLIASDMDGTLLGSNHKISKENIEAIRLAQDKGIKFAIATGRAYEDVKPFLDEHNLKCECVVLNGGEYRNIDGKTVAGIYIDKNKASEILKVMSNYPLSVEIYTDNGYYTTNTKEETLAGMIKREKTFHPELTNKDEIYKYAIKNPHFVNMNYITDMEEFLNNNVNIGKFVSFTESLEEITILKEQLNKIDGLAISSSFITNIEINHANATKGKLLAKVAENINIEKDEVVVLGDSSNDYSMFMEFPNSFAMENAIPEIKKVAKYITSSNLEHGVAKAIYRILDSNK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP016087_8 | 3635366-3637172 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016087_8
|
27 spacers
spacers of NZ_CP016087_8
>8.1|3635396|36|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT TAACATAATTGTTATTTGCTCAATTACTCTAAAGGA >8.2|3635462|36|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTAAGTATTTTGAACTATTTGCTGGTTCAGGTAT >8.3|3635528|37|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTACTGCATTACCACACCTTGCCTTTTGCTCTGTAGT >8.4|3635595|36|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATTTTAATAGTGTAGAAATTTCTTGCTGACTTAA >8.5|3635661|35|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT GTTAAGGCTTTTTTCTTGCTATCCCTTTTATCCTT >8.6|3635726|34|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT CCGCTTCAATTAATTTTATGTAATTCATGATCCT >8.7|3635790|36|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT CTCCCATGAACTTTATTTTGAACAAAAGTAAATTAA >8.8|3635856|37|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT AACTTTTTAAACATGCTTCAATTAAAGTTTTAGCACC >8.9|3635923|36|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT ATCTTTCTTTGTTGCACAGGCATATATTTCTGCTCC >8.10|3635989|36|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT TAATACAACTTGTAAGATTTTAACTTCATTTGATAA >8.11|3636055|36|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT ACTAAAGGATTGCATAAAGTAAGTATCACAATAACA >8.12|3636121|36|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT CTATTCCTCCATGTGATTCATGATATGTTATATTTG >8.13|3636187|36|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT GATTCCAGAGCATACATGTTATATAGAATTATTCTT >8.14|3636253|36|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT GTTTTTGTAAGTTCCAAGTCTTGTATAAACATCAAT >8.15|3636319|36|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT GCCTGTTTAATAGTTGAATCATTAGCTTTCATGCTT >8.16|3636385|36|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT GTGGCCTTATCAGTTACATCAATTAAAAACTTCTCA >8.17|3636451|36|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT CCAAGAAAATGTGATTGCGGTGGAGCTAATGAATTT >8.18|3636517|36|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT GGATTTATCATTAGGAATTAAAACAAACACATTAAC >8.19|3636583|36|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT GCTTGTACTGCTGTTTCACTTCCTGTTGTATCCCAA >8.20|3636649|36|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT ATCCAATACTTACTCAAACTCAAATGATTATAAGGA >8.21|3636715|36|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT TGCTAATCAAGCATGGGAAGAAATAAAAGCTACTAT >8.22|3636781|36|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT TGTTTTTGCGTTACTCTTTTTTCGTTTCTTACTTTG >8.23|3636847|36|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT TTCTCTAGCCCGTTCTATTGTACAAGTAGTGTTAAG >8.24|3636913|36|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT TATATTCAATTAGAGGATGATAAGGGCAAAATTAAT >8.25|3636979|36|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT AGGTTCTGGGTAGCACCTGCAATTATATATATTCCC >8.26|3637045|36|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT CAACTAAAAGAAGCTAAATTCGTCACTAATTATGTA >8.27|3637111|32|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT ACTTGGTGTCGCTGCCCAGAACCTAGCTTTAT >8.28|3635661|36|NZ_CP016087|PILER-CR TGTTAAGGCTTTTTTCTTGCTATCCCTTTTATCCTT >8.29|3635727|34|NZ_CP016087|PILER-CR CCGCTTCAATTAATTTTATGTAATTCATGATCCT >8.30|3635791|36|NZ_CP016087|PILER-CR CTCCCATGAACTTTATTTTGAACAAAAGTAAATTAA >8.31|3635857|37|NZ_CP016087|PILER-CR AACTTTTTAAACATGCTTCAATTAAAGTTTTAGCACC >8.32|3635924|36|NZ_CP016087|PILER-CR ATCTTTCTTTGTTGCACAGGCATATATTTCTGCTCC >8.33|3635990|36|NZ_CP016087|PILER-CR TAATACAACTTGTAAGATTTTAACTTCATTTGATAA >8.34|3636056|36|NZ_CP016087|PILER-CR ACTAAAGGATTGCATAAAGTAAGTATCACAATAACA >8.35|3636122|36|NZ_CP016087|PILER-CR CTATTCCTCCATGTGATTCATGATATGTTATATTTG >8.36|3636188|36|NZ_CP016087|PILER-CR GATTCCAGAGCATACATGTTATATAGAATTATTCTT >8.37|3636254|36|NZ_CP016087|PILER-CR GTTTTTGTAAGTTCCAAGTCTTGTATAAACATCAAT >8.38|3636320|36|NZ_CP016087|PILER-CR GCCTGTTTAATAGTTGAATCATTAGCTTTCATGCTT >8.39|3636386|36|NZ_CP016087|PILER-CR GTGGCCTTATCAGTTACATCAATTAAAAACTTCTCA >8.40|3636452|36|NZ_CP016087|PILER-CR CCAAGAAAATGTGATTGCGGTGGAGCTAATGAATTT >8.41|3636518|36|NZ_CP016087|PILER-CR GGATTTATCATTAGGAATTAAAACAAACACATTAAC >8.42|3636584|36|NZ_CP016087|PILER-CR GCTTGTACTGCTGTTTCACTTCCTGTTGTATCCCAA >8.43|3636650|36|NZ_CP016087|PILER-CR ATCCAATACTTACTCAAACTCAAATGATTATAAGGA >8.44|3636716|36|NZ_CP016087|PILER-CR TGCTAATCAAGCATGGGAAGAAATAAAAGCTACTAT >8.45|3636782|36|NZ_CP016087|PILER-CR TGTTTTTGCGTTACTCTTTTTTCGTTTCTTACTTTG >8.46|3636848|36|NZ_CP016087|PILER-CR TTCTCTAGCCCGTTCTATTGTACAAGTAGTGTTAAG >8.47|3636914|36|NZ_CP016087|PILER-CR TATATTCAATTAGAGGATGATAAGGGCAAAATTAAT >8.48|3636980|36|NZ_CP016087|PILER-CR AGGTTCTGGGTAGCACCTGCAATTATATATATTCCC >8.49|3637046|36|NZ_CP016087|PILER-CR CAACTAAAAGAAGCTAAATTCGTCACTAATTATGTA >8.50|3637112|32|NZ_CP016087|PILER-CR ACTTGGTGTCGCTGCCCAGAACCTAGCTTTAT |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016087_8
The CRISPR arrays of NZ_CP016087_8 >merge|NZ_CP016087|8|3635366-3637172|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTTCATTCCAATATGGATATATTTAAAGTAACATAATTGTTATTTGCTCAATTACTCTAAAGGAATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGTTTTAAGTATTTTGAACTATTTGCTGGTTCAGGTATATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGCTACTGCATTACCACACCTTGCCTTTTGCTCTGTAGTATTTACATTCCAATATGGCTATATTAAAAGTAATTTTAATAGTGTAGAAATTTCTTGCTGACTTAAATTTACATTCCAATATGGAATATTAAAAGTGTTAAGGCTTTTTTCTTGCTATCCCTTTTATCCTTATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGCCGCTTCAATTAATTTTATGTAATTCATGATCCTATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGCTCCCATGAACTTTATTTTGAACAAAAGTAAATTAAATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGAACTTTTTAAACATGCTTCAATTAAAGTTTTAGCACCATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGATCTTTCTTTGTTGCACAGGCATATATTTCTGCTCCATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGTAATACAACTTGTAAGATTTTAACTTCATTTGATAAATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGACTAAAGGATTGCATAAAGTAAGTATCACAATAACAATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGCTATTCCTCCATGTGATTCATGATATGTTATATTTGATTTACATTCCAATATGAATATATTAAAAGGATTCCAGAGCATACATGTTATATAGAATTATTCTTATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGGTTTTTGTAAGTTCCAAGTCTTGTATAAACATCAATATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGGCCTGTTTAATAGTTGAATCATTAGCTTTCATGCTTATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGGTGGCCTTATCAGTTACATCAATTAAAAACTTCTCAATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGCCAAGAAAATGTGATTGCGGTGGAGCTAATGAATTTATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGGGATTTATCATTAGGAATTAAAACAAACACATTAACATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGGCTTGTACTGCTGTTTCACTTCCTGTTGTATCCCAAATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGATCCAATACTTACTCAAACTCAAATGATTATAAGGAATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGTGCTAATCAAGCATGGGAAGAAATAAAAGCTACTATATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGTGTTTTTGCGTTACTCTTTTTTCGTTTCTTACTTTGATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGTTCTCTAGCCCGTTCTATTGTACAAGTAGTGTTAAGATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGTATATTCAATTAGAGGATGATAAGGGCAAAATTAATATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGAGGTTCTGGGTAGCACCTGCAATTATATATATTCCCATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGCAACTAAAAGAAGCTAAATTCGTCACTAATTATGTAATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAGACTTGGTGTCGCTGCCCAGAACCTAGCTTTATATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG >NZ_CP016087|8|8|3635366-3637172|CRISPRCasFinder TTTTTCATTCCAATATGGATATATTTAAAG TAACATAATTGTTATTTGCTCAATTACTCTAAAGGA ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG TTTTAAGTATTTTGAACTATTTGCTGGTTCAGGTAT ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG CTACTGCATTACCACACCTTGCCTTTTGCTCTGTAGT ATTTACATTCCAATATGGCTATATTAAAAG TAATTTTAATAGTGTAGAAATTTCTTGCTGACTTAA ATTTACATTCCAATATGGAATATTAAAAGT GTTAAGGCTTTTTTCTTGCTATCCCTTTTATCCTT ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG CCGCTTCAATTAATTTTATGTAATTCATGATCCT ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG CTCCCATGAACTTTATTTTGAACAAAAGTAAATTAA ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG AACTTTTTAAACATGCTTCAATTAAAGTTTTAGCACC ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG ATCTTTCTTTGTTGCACAGGCATATATTTCTGCTCC ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG TAATACAACTTGTAAGATTTTAACTTCATTTGATAA ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG ACTAAAGGATTGCATAAAGTAAGTATCACAATAACA ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG CTATTCCTCCATGTGATTCATGATATGTTATATTTG ATTTACATTCCAATATGAATATATTAAAAG GATTCCAGAGCATACATGTTATATAGAATTATTCTT ATTTACATTCCAATATGGATATATTAAAAG GTTTTTGTAAGTTCCAAGTCTTGTATAAACATCAAT 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>NZ_CP016087.1|WP_077364163.1|3632525_3633989_+|PLP-dependent-aminotransferase-family-protein MIVLDIDSKTPLYLQIYNQLKDQIISGEIIAGSKLPSTRKLSIQLNVSRNTVESAYMQLSSEGYIESKAGSGFFSLKLDNSFISNLKNKNMSSQKIEPNTQKNSNLSNDIYNSFDNSSDDYYQYNFEYGKLSASDFPLRIWKRISNKCLSNLNADDMISYGSRTGENELQIEIMNYLKRSRGVTCKSEQIIISSGMGYCLSLLCQLLREDFSQIALEDPGYTGAKDIFINNGYKVKPINLEADGIDINELENSKSRIVYVTPSHQFPTGVVIPIAKRLKLLDWAIRNQGIIIEDDYDSEFKYNSKPIPSIQSIDSNGTVIYVGTFSKALSPSLRINYMVLPNNLLEKYHQNFKMYQSPVPLLEQKIIQQFIKLGHYERHLRKIYLINKRKYNILINAIKEFLGQNVTIHAQNAGLHILLEVNNGLKEKVLIETAKNCSVRVYPVSLFWMQKHKYKDNMVLLGFGSMLEQDIVEGIKLLKKAWFDNMY >NZ_CP016087.1|WP_077364161.1|3631978_3632350_-|pyridoxamine-5'-phosphate-oxidase-family-protein MINEKLLEVMSNEGVVSIVSWNNEEAHVVNTWNSYLTVVGSDRFLIPAAGMRRTQKNVEINDKVKITLGSKEVMGHRNMGTGFLIEGTAKFVEAGTEFEMMKDKFPFLSRVLEIIVISAKQTL >NZ_CP016087.1|WP_077364160.1|3631239_3631575_+|hypothetical-protein MSVYMITYFISDTHGHVHDENCGCGEDHSHEHEHEHENVHGAANIVGKIKSLGAWAQFMPEGFFVKTTLSANEIFQEVSSVANKGDIIFVTKIDAKTSACANPAVLDWLEN 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MKDAIENEKFDTKMETSDWRYSASIVGIIKFFNYLVERGYEVEANLYKIEDDVITYNSKAITEERYLLFTEYYFENAMHHKVIETILTNDQFTDDQIKLINDKLKANTIMKKVFGDLKFSSENKERILEKIKLNRLLLIKETYRNGDSLYKNFANTNSLFEEPSSICRIENYNIDTGKKSKSISYNWDFKTYKFEDEKEFDFIPFAFSKSYEAFFINNNYSIKQLFHTNNLINDSDNPRSTLFCELKNSADFIDFDVEVIIKNRGDDYFKTLYIRKPAIRIFAEVENYKALKMKYKVNDNYYIDIEKVVTDNILNNIKLDGLIEILLKANSNYSYNIKTLITINTLIYGGDKMDKQMKSAYASAKRVMAEIPENKVDSYKQKLISAITFKDYERFCEILLQLSSYSGVIFDFAYDLFEDFEENKNIAYTFINALNKESNKDNGGKGNE >NZ_CP016087.1|WP_077364178.1|3644724_3645462_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRFKIEIQLENEQLSLDYRPAIISMFKHCLTVYEDGKHFDNYYEVGKEKPFTFAVGIPSSKFTKEMILVPNRKINITFSTGDIGTGIVFFNALLMQKNKSYPLAYENAMIIKNISIEKEYAITTDTINVTFKSPLCVREHNKENNKDIYYSYEKDGFNESFNKVLKLQIANSNNLPEAILEGFSIIPISCKKTVIRHHSQFIESTIGIFKLTGNIALLSYLYTNGIGSRKSSGFGMFEVVGKEKL >NZ_CP016087.1|WP_077364180.1|3646176_3646764_+|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor 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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP016087_9 | 4023752-4023894 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016087_9
|
1 spacers
spacers of NZ_CP016087_9
>9.1|4023807|33|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder TTTAATATTCATAAAAAGGAGTTTTAAAATGGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016087_9
The CRISPR arrays of NZ_CP016087_9 >merge|NZ_CP016087|9|4023752-4023894|CRISPRCasFinder AAAAGCATTTATATTGGGAGTCACTGCATCATTCTTTTTTGCATTTACTTTTATATTTAATATTCATAAAAAGGAGTTTTAAAATGGCAAAAGCATTTATATTAGGAGTCACTGCATCATTCTTTTTTGCATTTACTTTTATA >NZ_CP016087|9|9|4023752-4023894|CRISPRCasFinder AAAAGCATTTATATTGGGAGTCACTGCATCATTCTTTTTTGCATTTACTTTTATA TTTAATATTCATAAAAAGGAGTTTTAAAATGGC AAAAGCATTTATATTAGGAGTCACTGCATCATTCTTTTTTGCATTTACTTTTATA
>NZ_CP016087.1|WP_015394072.1|4023019_4023574_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MKDLNLIIGNKLKDIRNKRNLSLEEVAKLTGVSKAMLGQIERGKSNPTVSTLWKIATGLKISFSLFIDENQEDLKVINQKDISPIIEDNDRMKLYPIFPFDANKGFEIFTIELEPACNHISTPHNEGVEEYIIVTEGEIEIDINNKIFKLQKGNSIRFMANCPHSYKNINQGRSVFQNIILYFK >NZ_CP016087.1|WP_077364693.1|4021565_4022684_+|NADH-dependent-flavin-oxidoreductase MELKNLIESKNLNTKITLRNPIVMAPMTTFSANEDGTVSDAELSYYKKRAKEVGMVITATTYVAPSGKGFQGEFAAYNKSFLPSLRKLAETIKGEGALAILQIFHAGRMALPDEIPGGQPISASAVAAERPGAVVPKEMTEAEIQELIKAFGETTKLAIEAGFDGVEIHGANTYLLQQFISPHSNRREDFWGGSRDKRRNFPLAVIAEVKKTVKEKGAENFIVGYRFSPEEIENPGITLEDTLSFVDILADQGLSYLHASLMNFWQSSIRDAKETSPVINKLIDQIHGRVPFIGVGAINTPEDALKALESGVDLVALGREIIIEPDWTSKIQLGKASEIRTKLNKNDREVLSVPVPLWNAIVNTPGWFPIEE >NZ_CP016087.1|WP_077364691.1|4018952_4020938_+|HAMP-domain-containing-protein MKINNIRNKLGISLVGICMLPLIILGLISYFQSKAILNQKLSTTSQQTLIEVNTGMDNYFSSFGNMVSMLSQNYDVINSDNDINVTFIPGVLKSVKDVNPDIFSAYFGTKDGKFNIYPNSKMPDDFNPTARPWYKQAMEHKGQVIVTFPFKDSQTGKSVVSIAKTVERNGEVIGVCAMNLSLETLSGKITEKKVGNSGYVFISDSDGNVIAHPNKDIINTNEASKLAVWNEIKTSDSGFTTYTYNGQKKFGAFDTNSMTGWKVVAILNESELSTDTKAILITTITSIFIMLIISILVSLFLSKGIAANIKNLKKVFEKAENGDLTVSIEPVTKDEFLDLATSFNSMMRNISNLIQNAASSSNEVLETSTNLASMSEEVTASISDVAKAIEDVAHGATQQAQNAQNGVTEMNELSKKLDKISENSTQIDMLSNNTKTLGTKGLSIINTLIDKTNKTKTSTSEVNRIIQDMNESTIKISSISEAIAEITEQTSLLSLNASIESARAGEAGKGFAVVAAEIGKLAEESKNSTEEIKSIIENIQKKSTIAVQAIKATEDIVIEQDLEVTNTQKIFDDILNSINTMINKIDEIKFSIKDVGEKKENTMIEIENISSISEETASSSEEVTASTEEIASAMDRFTKYAETLKSLAEKLDNELDNFKVR >NZ_CP016087.1|WP_077364689.1|4016223_4018623_-|transcription-antiterminator MYNLNVRQIEFINLLLEEKQYKPIKYYTEFLNVSDKTLKKDLIIIEEYLNKHNVELDKKHSIGIMIKDTMNAKLILHRVLQSQESKNNKISINYRRIEIIKNMLTDPHNNTSIQKLSDKYYVSKTSIVNDFKYIEEWFSLFNLKLEKTVEGTQINGLEVDIRRAIASLLFEYSKDGKNKNTIEELAIRLDAITLNALSELFEKEKIIYVNRLLLDLEKKYNCRINDLYYINLLTHILISMVRGSQGRKISKKSDIGKFKPEKDYEEAALCINKINKDFGMTLDESEVYYLYQYFVSFGLIKDVSEKEDTVLSELDCLAINYRNRITQCMEEILQVNISKYQNIMDKLLLHIRPMLNRMKHDIHISNPLINDIKDQYPILLNVCKAATLMVSFDMKLKHIPIDEVGYLTLYYQLGLEENYATRKRVLVVCHSGYGTSKLLMTRLKRYFPEFEIIESASASRMMNINLEEIDFIISTVPLELEKNSYLLVSTFLNEHDIKNISDFLLNNKSKHLRLTSSTKFIGEHLQENLIYFNKEENEVKKQINRNIKRSIIFNPIDINRNLKIQLGFCKDECILGLSINDIENNEKQLTFYIAMENVEIMTLILKEAFNFNIKEDYANYLMKCKKEKDVKQYFKLNGEGGMKMEVDLAKVIQKETIKLDMKATTKDEALKELTELLYDSGTLSNKEEFLEDVYYRETLGSTGIGNGIAIPHGKSKFVNKTSIAFGKTRSDIKWETLDGKPVNFIILFAVTESDKNSVHVRLLSKVAARLGDDEVCEALLGAKSSEEVYEIFTSSDEIQ >NZ_CP016087.1|WP_015394068.1|4015839_4016151_-|PTS-IIB-component,-Fru-family MKIVGIAACTSGIAHTYIAKEKLVRAAKALNHEIHIETQGTIGTEDELSPKEISEADVVIIAADIKVGGRERFKGKKVIDVSTDIVIKSPKALINKIQQELGL >NZ_CP016087.1|WP_077364687.1|4014732_4015809_-|PTS-fructose-transporter-subunit-IIC MLKKLELKKHAMTGISYMLPLVVAAGLLIAIGNLAGGNPSLISDYKASYSIWQASVTLGVFGMQLLPAVMGAAIAYSIADRPGIAPGLLMGMVANAMGAGFLGGMLGGYLSGYFVVFLKNNIKVPKWAQGLLPMMIIPLISSVVIGLVMFFVVGRPIASVSASLTSMLNNMQGGSKAIFGLIMGAMAAFDFGGPVNKVASLFADGLLLQGVYGPEAIKICASMIPPFGVALSWVIRRARYSKSESDNIKIAFPMGICMITEGVIPIAAVDPLRVIFSCSFGAAIGGMLIMLLDVGSPVPSGGMFIVPAMQNPIGFLIALGVGSVITAILLVILKKDAKEQVIEEEEEEEVDLSNLQIK >NZ_CP016087.1|WP_077364685.1|4013853_4014705_-|class-II-fructose-bisphosphate-aldolase MYVSMTEMLKKANEENYAVMAINCFNLETARSVIKAAELENAPIIINLVQEHLIDHCDSELITPIVKTLASRTSIKVALNFDHGQEVLFIKKAIDDGFSSVMVDASRFGLQGNIDMTKEVVNYAHPKGVSVEGEIGCLGGTEGGAFTNDHMYTNPDEALKFAKETGIDALAISIGTSHGNYPDGMVPEFDFERLKTIKELTKMPLVLHGGSGSGRDNILKAVKYGINKINVGCDFMNANVQAITAILKEKPDINYYVLMHQVEQDSIDIVRNYIKLSGSNNKN >NZ_CP016087.1|WP_077364683.1|4012722_4013592_-|ketose-bisphosphate-aldolase MLMNMKELLSIAQENKFAVPAFNTSSNMILRGVMEAAKEKQAPVIIAIHPDELSFLEDSFIATVKEEAFKSEVPVVIHLDHGGTFEQILRAIRCGFTSVMIDASHMSFEENIAITKKVVEAAHPLNVSVEAELGTIGTTGNGGEYGTNEIIYTDPEKAKEFVDRTGVDTLAIAIGTSHGIYPKDMKPKLKLDLLKIIRETVQIPLVLHGGSANSDDEIAESVKLGISKINISSDIKDAFYKKCREILTEDLGAREPNAIYPPCIEAMKEVIYHKISLFNDEDKVKCYNK >NZ_CP016087.1|WP_077364681.1|4009414_4012558_-|efflux-RND-transporter-permease-subunit MRITEISVKRPAAMWMAVILFIGLGIMGYKSMGADLMPSMNIPVISIMTTYNGASAEDVKKDIVKPIEDAVSGISGVDVLNSTSGEGYGTVTITFKMSANINTAYLDVQKAVEVVSARLPKAADKPTLFKMDMSAIPIMIVSINGDSSYEELYNQSDILKQKLEKIPGVGNISLMGADKKQLMIKIDKATMEYYGVNVDALMGALQASNVNIPAGDIKQENLDQAVRIIGQFNSIDAVKNLLVPAGNGVNIRLGDIAKIDLEVPDATVLTRYGGNKTIAMILGKQSDSNVVEVADSVKKELEDIRKSLPKGTEVNILMDTTTFINSSLTQIKHNLIEGIITTAIVLYLFFRSFRSSLVVLIAIPTSLVATFFMMYQMHFTLNMLSLMGLSLVVGTLVDDSIVVIENIQRHMDMGKNPIQAAIDGRKEVGMAAIAITLCDVVVFAPVSLVSGLVGQMFREFGLTIVAATMFSLIVSFTITPMLSSRLLKNQNNDEKIAPKENFLSRINSKFARKSSDKKGSFDKLVEVYRKTLIWSLDNRKKVLAFVIAGVVLSVMLIPMGMIKSEFIPVADQSSFTISLKLAPGSTLKQTDAKVSEVEKYLQGTKEVKDYFSLIGHDGESTADKSIAQIFVNLVPKGERKKSQSELASEIRAFGKKMSGVDLNVAESSSSGGSSKPVSIKIKGNDSATIRDLSKEVEKLLNTVPGITDISNSTSSRSSELRVNIDNLAATQYKISTSNIGSVVRMALAGTNVGVYRSNNEENDITLKFENGQINSAEDLKSLMITNSAGEEIPLSQVASIQKIDGAPSISREDKQDMVSVEANIQGRVLGEVTDDINSKLKALSIPDGYSISFGGNQKQMADSFSSLGLALCASLALVYMILVVLYESFLTPFIRMMALPCAIIGAFGLLALTGQTLNLMSMIGLIMLEGLASKNGTLLIDYTNTLMKRGMNLREALIESGVTRLRPIIMTSATMIVSMLPVALSMGEGTEMKKSMAIVIIGGMLASTILSPIVLPIIYTLMADLKNKVSFKKKKSHSLEGGSTYEV >NZ_CP016087.1|WP_077364679.1|4008174_4009425_-|efflux-RND-transporter-periplasmic-adaptor-subunit MKFKELMKKKKLIVGIILAVAVVAIIFSFPKSKPVDVAQEVKNVKTEKITTGTISTRVEYAGNLKPAKEVVVLPKAGGRVATVNVKVGDKVSVGQTLFTLDTTDYAAQLEQAQAGVSAASANLERTSDSGFTQQLLQAEQLVEKLQIQYNTVKDSYDKTQTLYSANAVSKKEYDDAKAQYDAITIDLKNAKDSLELLKSKSGPQATKAAAAALEQAQAGVSAVQNQINNATITSPIDGVVSEKAVEVGQIAGGQSGSVTVIDYSGLEAEVNVPDKMLTKIKEGLSVPVTINALPDAKIVGVIESISPNTSSKNNFYVVRVKVDNSNADIKAGMFAKISLPAEQKDNILMVPNETIKMENGVNYLYTVDNDEVKKIAVETGISNEKFTEVKGKVQDGLPVITEGQNLLSDGEKVNLV >NZ_CP016087.1|WP_077364697.1|4025078_4025969_-|transposase MIKTDTNFNLLNSHITTLIKKDMYLNRIIEKCPNCESKHYIKYGLFKGFQRYKCKECGKTFSKATSSLWSYSKKKPTQWVKFTEYVLERKSLRFCAEKLGLSLVTAFYWRHKVLHGLNYDSVPEKLSGDVHIAKKLIPENFKGSKNITITVRHNIWVVAAKDCEDSIIIKPISRCHWHLPSFNKKIYYLIDEKAYIVPYGDRYISLVAKAHNKKHIKEVKNDKIIWSFQIILEKWLKKYHGVASKYLEKYLALFILYITKKEINCMEIFKKLSFENKFIKILDIGRLKTQSNSVLF >NZ_CP016087.1|WP_015394075.1|4026323_4027325_-|biotin-dependent-carboxyltransferase-family-protein MRISVLNPGLQSTIQDLGRHGYQKYGVIVSGAMDAYSMRLANIAIGNTEKEGVLEITMIGPSLELEKGTLFSITGGNISPTIDGKKIPMGRPIYLKEACVLNFGACIAGCRSYLAIAGGFEVPEVMESKSTYLRAQFGGFNGRTLKKGDILNLGVKSVEAKKIIEKLQQITSKGEFTAPSWYIGDSIAENSNSTFVRVFKDRQFNNISEESVSKFFNSEFNVDNKSDRMGYRLCGEKIELKESLEMISEEVSVGTIQIPPDGNPIVLLADRQTTGGYPKLAHVASVDIQKIVQLKPNDKIKFKQITLKEAERLYLEREKYINKVKKTIKFIIS >NZ_CP016087.1|WP_015394076.1|4027324_4028035_-|5-oxoprolinase-subunit-PxpB METGKFKTEISQISETAALVEFGREISETINKKVRTFCAYLDENPFHGMIEYVPAFASVSVIYNPLDMNSEAPYEVVKGILDDIIAKLDFSSVYEENIVEIPVCYGGEFGQDIGEVAKINNISVDEVIKIHSEGKYLVYMLGFAPGFPYLGGMSEKIAAPRRETPRTAIPAGSVGIAGMQTGVYPIETPGGWQLIGKTPLKLFDLKRKSKSLLKSGDIVKFYPISYEEYVQLKEEE >NZ_CP016087.1|WP_077364699.1|4028181_4028961_-|5-oxoprolinase-subunit-PxpA MYKVDLNCDLGESFGVYKLGLDEKIISYVSSANIACGFHAADPLVMDHTVKLAKAAGVNIGAHPGFPDLVGFGRRNMNVSPKEAKAMVQYQIGALDAFCRAQGINMQHVKPHGALYNMAGKDLKLAEAICQGIYEVNSELILLALAGSEMIKAAENIGLKVAREAFADRAYEEDGSLVARVKEGAMITDEAVAIKRVIKMIKENKVTAITGKDITIKVDSVCVHGDGAKALEFVKKIKLSLEAENVEIVPLYKVLLDTL >NZ_CP016087.1|WP_077364701.1|4029319_4030108_-|putative-hydro-lyase MDYSKMKPSEVRALIREGKITGPTSGMCAGYAQANLVILPKELAYDFLLFSQRNPKSCPILEVSDVGSRSLRYIAEGADIAKDIPKYRVYEEGVLTGEYTSIEHLWRDDFVSFLIGCSFSFESELLEAGVPVRHIEENCNVPMFITNIDCEPAGIFNGKMVVSMRPIPYDQIVKSVMVTGAMPKVHGTPIHIGNPSAIGISEISRPDFGDSVKIKEGEVPVFWPCGVTPQAVVMNVKPKIVITHSPGHMLITDTKNIDIKFS >NZ_CP016087.1|WP_077364703.1|4030529_4031603_-|DUF4392-domain-containing-protein MNQQELTIFNLGENLDNIVNLDPRGYGVCRILYSAARKYTKEPLTTNAAKKLVNTLKDGDLVYIMTGFVLLPFKKAEMDGIVSSMILARALIKAFNVKPVIICPEDNMEAVKNLAQVIGVHLYDTIQELKEYPISIAAVPFTKDINEAEKQADEIIAKGLPSAVISIECPGANSIGVYHNAVGLAVTELEAKQDILFTKLQDKGVLNIAIGDLGNEIGMGTISEHLQEYVPYAAEGKCNCGCNGGIAVATKADNIITATVSDWGCYGLIAAIAYLKKDLEILHTKELQEEAMVVASRSGMIDMYGWLVPAIDGFGLSMNLSIVNLMRECVSYAIKLEDTCATWFDKVIELGFYEKVV >NZ_CP016087.1|WP_077364705.1|4031613_4032462_-|D-amino-acid-aminotransferase MENLGYYNGKFGLLEEMTVPMLDRVCYFGDGVYDATYSRNHKIFALDEHIERFYNSAGLLGIKIPHSKEQVKEILKEMVLKVDSGEQFVYWQITRGTGMRNHAFPGDEVPANLWIMLKPLNIKDMSKKLKLITLEDTRFLHCNIKTLNLLPSVIAAQKTEEAGCQEAVFHRGDRVTECAHSNVSIINDGVLKTAPTDNLILPGIARAHLIKMCKAFNIPVDETAFTLKELMEADEIIVTSSGQFCMATSEIDGKPVGGKAPELVKKLQAALLNEFLEETNVD >NZ_CP016087.1|WP_077364707.1|4032841_4033297_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator MDKMDYKILKCLKANARIKAATISNQIHLSVSAVLERIHKMEKNEVIQNYTIIVDQKKLDNDVIALMEVSLEHPKFYDTFTLAIKGNDNIVSCYYLTGDYDFMLKIICQSSDHLEKIHRSIKSIEGVSATKTHFVLKNIKNTFCVIPEVED >NZ_CP016087.1|WP_077364709.1|4033306_4034011_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLKVENINISYGAIHAIHDLSLEVKGGEIVTLIGANGAGKTSTLRAISGLNPVKSGEITYEGKVISNIGAHKIVGYGLSQVPEGRRVFGDQTIEENLLLGAYLRKSKAEIKASMEEVFNLFPRVKERRKQLAGTMSGGEQQMLAIGRALMAKPRLLLLDEPSMGLAPIVVEEIFEIIKNIRKAGTTILLVEQNANAALQIADRGYVLETGSVVLEGLAQDLLHDDSVRKAYLGE >NZ_CP016087.1|WP_077364711.1|4034012_4034783_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSLLSVENLTIRFGGLTAVSDVNMEIGEHQLIGLIGPNGAGKTTLFNMLTGVYKPTEGKIELNGERIDGTKPYNITSKHISRTFQNIRLFKDLTVLENVMISFNYQAKSSLFTSIIKTPAHILEEEKMKQEALEILKIFKLDDKAEELASNLPYGKQRRLEIARALAAKPKLLLLDEPAAGMNPQETVELTELIRWIKNQFKISILLIEHDMKLVMNVCEYIYVLSFGEIIAKGVPKEIQKNPQVIEAYLGKGAAQ |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP016087_10 | 4472836-4472970 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016087_10
|
1 spacers
spacers of NZ_CP016087_10
>10.1|4472876|55|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder TTGATTTTAATTGCGCTTAATAAGTTCCTAATTGTGCTTCGCACTCTTTTTATCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016087_10
The CRISPR arrays of NZ_CP016087_10 >merge|NZ_CP016087|10|4472836-4472970|CRISPRCasFinder GTGCGTGCTTTTTTCTAAGGTGCGTTGGTTACTTAAATTATTGATTTTAATTGCGCTTAATAAGTTCCTAATTGTGCTTCGCACTCTTTTTATCAGTGCGTGCTTTTTTCTAAGGTGCGTTGTTTACTTAAATTA >NZ_CP016087|10|10|4472836-4472970|CRISPRCasFinder GTGCGTGCTTTTTTCTAAGGTGCGTTGGTTACTTAAATTA TTGATTTTAATTGCGCTTAATAAGTTCCTAATTGTGCTTCGCACTCTTTTTATCA GTGCGTGCTTTTTTCTAAGGTGCGTTGTTTACTTAAATTA
>NZ_CP016087.1|WP_077365370.1|4472239_4472734_+|hypothetical-protein MKSKQIAENGLTVALTLVILYATSILPISTLSILTVASCLIPISIIRTSIRNTFLVYLASSIISFFLVPTNIALYYALFFGVYGIIKYFAEKIRNRPLEIALKLLGFNILLLIIYWVTINFLGLPTINYPLYLLWALAQIVFLIYDYALTIIISFYLNRIHKHI >NZ_CP016087.1|WP_077365368.1|4471515_4472121_+|J-domain-containing-protein MNPYEVLGVKPGASQDEIKSAYRKLIKQYHPDKFIDNPLQNLAEAKMAEINKAYDELTKHSSNSNSSSSNSYSNSSNDYASFDLQEIRSFIQSGNYMAAESKLNSINNRNAEWHYLNGVVMLNKGWFDAALNEMTTAVNMDPNNFEYRQGLNSLRRRGNNYSNPYYRTTNTGSSDMCDCCIKLWCLDSLCECAGGDLIGCC >NZ_CP016087.1|WP_077365366.1|4470611_4471529_+|hypothetical-protein MFGYVTPLKAEMKVKDWGRFKCYYCGLCCHIKKEFGNIPRMSLNYDMTFLGLLLDALNPEELQVSKHRCALHPAEKKTIITNNKALSYAAAMNISLFYYKLLDDVQDDKNIKSKFFSLLLSPYKKKFPSSITAINSNISDYLNKLSTLENSKSFSYIDEICDPFSALVGTIMRDYPYELRDDCPDLRNTLYSLGYSIGKWIYLIDALDDLKADMENKKFNPLNFLYNKENLNYDKFIEAIKPRIEFTILNCGYTCKENLEKLNLVRNRDILYNIIELGLMDKYINIINRSQNTKETKGEINNESI >NZ_CP016087.1|WP_015394457.1|4469065_4470358_-|phosphopyruvate-hydratase MKDYVEIIDVIGRQILDSRCFPTVEVEVYLEDGTVGRAAVPSGASTGIYEALELRDGDKDKFLGKGVLKAINNINEIIAPELIGCNVFEQTYIDKMLIDLDGTKNKEKLGANAILGVSLAVANAAAKALEIPLYRYIGGVNAKVLPVPMMNILNGGSHADNSVDLQEFMIMPAGAPDFSEALRMCAEVYHTLKKILNNKGYSTGIGDEGGFAPNLKSNQEALDVIIEAIEKAGYKPGEDIFIAIDAASSEYYEDGKYVLQHEGRTLTAAEMVDFFEDWVNKYPIISIEDGMAEEDWEGWKLITERLGKKVQLVGDDLFVTNTERLEKGIELGVANSILIKLNQIGTLTETLNAIEMANRAGYTAVVSHRSGETEDTTIADLVVAVNAGQIKTGAPARSERVAKYNQLIRINEELDDVAEYRGKKAFFNIK >NZ_CP016087.1|WP_077365364.1|4468716_4468926_-|DUF1450-domain-containing-protein MKIKFCEENKGKKSVINRIKEEYPDIDISKKKCLGKCKQCSEQPIAMIKDKLIKGKDSEELYEKIKKEL >NZ_CP016087.1|WP_015394455.1|4467308_4468571_-|divalent-metal-cation-transporter MKKLLKNKSLFTGEHKPKFMALDFIKYIGPGLIVTVGFIDPGNWASNLMAGSTYGYSLLFTITLSTIMLIILQHNAAHLGIATGYCLSEAASIYLKPWLSKSILFTAILAAVSTAMAEILGAAIALNMLFKIPIKIGSILAFALIMYMLLTNSYKKLEKWIIGFVSIVGLSFIFELFLVKVDWKDAIVSWVTPSFPTGSIPIIMSVIGAVVMPHNLFLHSEIIQSRQWNLKDEEVIQKQLKYEFADTLFSMLIGWAINSAMVLIAATTFFSNNVVVDDLSQAKQMLEPLLGNWAALIFAIGLLFAGISSTITAGMASGSIFAGMYKEPYDISDSHTKVGVAGTLIAALAVIFFVGDPFKGLVYSQMFLSIQLPITVFLQIYLTSSKRVMGKYSNDILGKIILGIIAFIITALNIMLLLDI >NZ_CP016087.1|WP_077365362.1|4465877_4467077_+|IS110-family-transposase MISVGIDISKGKSTICILKPYGEIISMPYELTHTETELSALVKCILNFNEETRVVMEATGAYHLPVLSYLKEHGIFVSVINPLVMKKYAAMALRKGKTDKIDSIKIASYGIDNWFRMVDYHASDELYSELRVLGRQYSHYIRMRVESKIVLSNMLDRTMPDIKSLLKNRSSKPDKDKLSSFVEEYWHYDNITSKSEKQFIRSYLKWAKNNGYHQNEAKAKKIYTLAQEGIPTLSSVTPSTKMLVLEAVRVLREVDKTLCLILSQMQELASSLEEYKIVREMPGVGDTLAPRLIAEIGDIRRFHSKKALIAYAGIDSPPYESGEFVGNKRRISKRGSSLLRKTGYEIMKCIKSNKPQNDAIYLYMIKKEAEGKAKKVAKIAAFNKFLRIYYARLKEIYMT >NZ_CP016087.1|WP_077365360.1|4463587_4465480_+|NAD(P)-binding-protein MDKKSNIFKPIQIGNITAQNRIEISPAGSFLCGRDGGNTPEFIAYVKSLAKSGAGIVTLGVSSIDEQSSGVPITNVGNSLYISDLADLVEVIHRYGALASIELVSGQYMLTPPEVVATQSSKEEIEHIIKLFSNAAERCMIAGFDMIMIHGGHGNVPAMFFSKKHNHRTDEYGGTFENRCRFGQELLGAIRKKVGNKIAIEYRISAEELLEGSSELEETLEYAKKIQDKVDIMHVSRGLLEEESLLPYLFQPTYFPRAMNLEAAKRFKKELNIPVSVVGSFDLDTAEEAVSNGDVDVVAMIRNILADTNCVRKAYKGKSDEIRPCVRCNTCINRTHTQFIRLRCAVNPLVGRETQFSEIKEEARSKKVVIIGGGPAGLEAARISAKKGYSVVVFEKNSELGGALRMASIAPFKKDMQRYLDWSIRSVINNPKIEVKLNTLATKENVLNEKPDAVLIGVGAKPIIPRFTLSDSEKVAWVGDVESKKASVGQDIVMVGAGFTGLEAAFTLAQEGKNVKVIDMIPEERIGADGIQISMIALKELLKKEGVTFECEVKLSDITEEGAIIEDKAGNKKIIKCDTVILSLGVKADRKQVELFEAIVNDVYAIGDCATKGGTLWNATRTGFDAAMDL >NZ_CP016087.1|WP_077365358.1|4462619_4463501_+|LysR-family-transcriptional-regulator MYINKLVYFISVAENLNFTKAAQECHLAQPAISQQINSLEHEIGFQLFIRTSKNVVLTEAGKVFYEEVKKIIGGYKTAVKKAESVAYGFEGMITIGICGGTEEVFLPQILKEFKEMYPLIGFEFRRAAFNDISKQLENKIYDIVFTWPYDLEGLKNIGYKIIFEDEACAMMSFNNKISEKPRVSRGELAMENNIMVAYEEKTKTYKHFSEFYGEYNIKPRSIITVEDSEILNLMIDLNMGISIVPKRIKELNSSRFSFVEIQGEPHSIKFCVAYLKENTNPCVELFVNNAAIR >NZ_CP016087.1|WP_015394452.1|4461863_4462388_-|ferritin MISKEMEQLLNEQLNKEFYSAYLYLSMVAYFEDKNLKGFANYFKVQVQEERDHAMMFFRYISHVQGEIKLQQIDQPNLVFNSPLDVFKEAYKHELFVTKSIYSIVDLSLDERDHKTNAFLQWFVSEQAEEESNMDDNIKKLQLIGDDVRGLLLLDSELLTRTYTPAANPAMPAE >NZ_CP016087.1|WP_077365372.1|4473152_4474172_-|pyruvate-kinase MYIIGTVGPNVKDRIILKGIIDSGVNILRFNYIHGSEAEFLEFLEMAKDIKNDIEIVLDLSGTKVRVSSKFEYIYKIYNEEEVYFCGEDIYDQIKHNISKMKKKVIPLNVENKILNQNEYDQIGIKDNTMSFSIIGKKHEFIRAVTIKGGIIRSGKGCNIKNLERENFSLNEKDKNAIEWGVENKIDTICQSFVERKEDIEEMKIFINNIKSEFKPRIWAKIETLNGVNNIENIVKEVDGVVIGRGDLIPETSIEDTPIYEEKIIKEVAKNKGKDIIIGTHLLNSMKNGKMPSITEVESIYNFIKCGVTGFLLAGETSIGKAPIKTVQFLNDLIKKYTP >NZ_CP016087.1|WP_077365374.1|4474328_4474811_+|hypothetical-protein MKKISSIFIILLLSLTLTGCDFQNPRYINFSMKPSNHYYIDKIKNRILNNYKYKLYVFDTNLYKEFQIPDEEDNIVEDFISSINSDAYTDETITSKEPFKLTIIFDNGEKYLIKVFNSSIISVAPWDGVYKEDVISIKDLPLKYNLFDFCNHVLNNPIAK >NZ_CP016087.1|WP_077365376.1|4474944_4478085_-|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase-family-protein MKKKVLSILISTAVATSQLSVISAAVNGENSGESAAKNINENTLLTASDSTTKDTLSSIENSIGGTTGPAGTTTGSAVSIGNVAEQVEWKSTRFGTTTSLQNNTISVDSANKTVTLIAGSKDGKATGGKVTGAQDGMSYYYTVIDPSQNFELSADVKVNFFEKAKPDNQAGFGIMARDTIGTENDSSISPSNMCLVGGYNGLVQSVFRNGVTKDFSEPIVMEGCHKFGNRPANDGTATYKLKLKKTNTGYIASVNDGEEVTYYRPKQLEVLDGNRIYLGFFAARVASITVSNIDLRESNVATDPEGVKEPPIVITPAISVTSSATSGTSNYDLTLKSNIDGNVNVKLGGRILYDGEIKNSVPLKIPSVLGNGDNIFDIKYTPSQAGAAVIDKTQTVNMKTYGVENGEVYVSPNGTDVGKGTEDSPLDIYSAIKYTNAGQTIKVKGGVYNLTSPIVIDNTNSGTKDKMKTLTAYDGQRPIFDFGKKSGGLTTYANYWRIYGIDVTNTLDKQHGITISGSNNLVENVKTYKNGDSGLQISGDINDKIANWPNNNLILNCESYDNMDAAMNNADGFAAKISCGYGNVFRGCVSHNNCDDGWDLYSKLENGKIGAVTIENCIAYGNGTLTDGTVTKGDGNGFKLGGEGISIKHTLKNSLSFNNNAVGITGNSNPAAVVENSTSVDNKHANYGLDYYTGAVLDYDLKNDISFRTVAGEQDNIPDMVLSDNNYFCDGVKSINKGGTEITKDYFKSVEMPKTIDRDDTGKIIWPNYMDPVNEPVISNNSSGGHHHNHVTNDYGTAVNSKTDIAKTTEADSTVGQSSSALANKEIEKQVISKLSSILGEGTQVGTSKEVQTSDGNKLSLTALANNGKNTGLVIAVEKSSPLETIKLDTAIGEVAEVYKFVPQLNKYVKVTDKVKIDKVNNTMTLPTDANAIYIAVKDKIAAADVASEGWSKVESSWYLLDKTGNLLTGWQKDNTNWTYLSTVDGKMQTGWKKDSGKWYFLKENGYMATGWLKNENKWYYLKLDGSMAANTSVDGYNLGSDGALI >NZ_CP016087.1|WP_077365378.1|4478454_4479300_+|PHP-domain-containing-protein MVKVDFHVHTNSSDGILSPSEVVKRAYKNNVKYLSITDHDTVSGLSEAIDESLKYNITLIPGIELSTQHNNESVHILGFFKDNNFRNDNLIKELAKITNHRVVRAKKMISKLKEEFNIEINFEKISKETNDTIARPHIAREIVKSGYPYTHNEIFDNFIGKGCKAYVPTLKLSTIDGLKLLKDYNATVFLAHPKLIKNTKIEEFLSMDFDGIEAIYFQNTPEENQKFIKIAKDNNLLVSCGSDFHGDLKNDDRHGDIGSIELPFEYLSKLLNTLDIEFTYS >NZ_CP016087.1|WP_015394468.1|4479391_4480297_-|HPr-kinase/phosphorylase MGVLVKKLVDDLNLEVLVEGKEDVEISVNDINRPGLQLAGFYNYFAPERIQVIGKAEWSFLDDMQIELRKKRVKKYFSFDINCLIITRGLEPHPEFIKEAQKHNIWFVRSNLVSTHFISKTTVYLADKLAPETRLHGVLVDVSGIGILITGESGIGKSETALELIKRGHRLVTDDAVDIKEIDGQLIGRSPSITVGMLEVRGLGIIDVTTLYGLSSVVQEKEIRLIMHFEHWKDDNDYDRLGIDNEYMNILGINVKKLTVPIRPGRNIAVIIEAAAVNYRHALMSKVTPVDVIESRMNDIN >NZ_CP016087.1|WP_077365380.1|4480303_4480501_-|DUF896-domain-containing-protein MDIENAKIEEVVEKINLLYKLSQERGLTEEEKELQQKLRKRYIDNVKRNFKAQLDQIEPKKSTKG >NZ_CP016087.1|WP_015394470.1|4480808_4481021_+|hypothetical-protein MRTWFISKLKYNVMIRTHLLNLLLLFFSPRNKFIIALSQNLDKYIVLYQEELLSLHHKQHNSKAVDEIAA >NZ_CP016087.1|WP_077365382.1|4481421_4481820_-|hypothetical-protein MKSSEIIEYLEDNDLADVEEIKQKSNYVIIKFYYDFDNEEISAAKAYSTEESDFEPETDEWYNECYIPYLRDIAVDNVESIIDEISDELEIEGKYKEFGMENVENGYYKFIAVFSDDLTDEEMEDVLNDYHK >NZ_CP016087.1|WP_015394472.1|4481841_4482087_-|DUF1292-domain-containing-protein MEEKEIMSFRDEDGNKVDFEAIAKIYLEEQGYLLLSPVDEESDDMFAFRIDINEEGNEELNLVEDDKEFEEIKKEYKKLLY >NZ_CP016087.1|WP_015394473.1|4482340_4482892_-|hypothetical-protein MNNKIRQMVYAGLLTALAIIIPIQFGILRIVIPPYYTATLAAHVPMMLSMLISPFVAVVVGIGSTIGFLMAGLPLPVVARAATHIIVGYVGAMMILKYKSYVKAVAVTAPIHGILEALVTIPFVGFGPAVYISLITTVVGAIIHHTADSIIAYAIVKAVAKASKKSIYNVFGDFKSKHQYSSV |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP016087_11 | 5684497-5684582 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016087_11
|
1 spacers
spacers of NZ_CP016087_11
>11.1|5684523|34|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder TGGTTGTAAGTAATACCAAGTTCCATTGTCATTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016087_11
The CRISPR arrays of NZ_CP016087_11 >merge|NZ_CP016087|11|5684497-5684582|CRISPRCasFinder AACCAACCAGTTTTCATTGCTCCTGATGGTTGTAAGTAATACCAAGTTCCATTGTCATTTAACCAACCAGTTTTCATTGCTCCTGA >NZ_CP016087|11|11|5684497-5684582|CRISPRCasFinder AACCAACCAGTTTTCATTGCTCCTGA TGGTTGTAAGTAATACCAAGTTCCATTGTCATTT AACCAACCAGTTTTCATTGCTCCTGA
>NZ_CP016087.1|WP_077366421.1|5682600_5684046_-|cell-wall-binding-protein MGRIFRSVIIGAFFCGLSFISPSSLDLVNTGVYASEKQPFLRNITLSDGPKFKFDQDVHSYIVDVDKDIDVISVKIKPDEAENTVKIDGEIVTKDDSYKKWINLKKGKNKVEIEVEDAKTEAVSKYTVFVYRGGKDAVYLKDIRVDDETIGFDNSINFYNLELDEGTEMVELNAVTEDENYTVTVNKTELKASNITRLRLHEMGKYTLTITVTDKETGRVGTYTLNIYLGIPVTPDVQGAINAVLKPNQWLIVNGRWRYNDSKGDPLKSTWFYDNKYKRYFHFSGAGNMQTGWIKDNGKSYYLNKFGMMETGWVLFEDKWYYLGADGAMRTGWLQDEGKWYFLNEDGSMETGWIIKNGKWYCLNNDGAMETGWIPYKYKWYYLNSSGEMEIGWTKIDGEWYYFNYDGSMKSGEWFKYTGDWYYLNFVGNMRHRIESIANSGWLAQNGKYYYFNEDGTMNNQTKTIDGYTYDFNQDGSVKFD >NZ_CP016087.1|WP_077366420.1|5679782_5682011_-|cell-wall-binding-protein MRTKKFSLRKIISYLLIFTVFFTVLQIGNTNKANAATQETTQVPGLVINIGDLTENVTRIVDKDSTGGYICEYLPIGKGLTLTSTSGYSITSVTSNSTNMVIGQIGNASGGQNYTISSITDYSDFILTVTIKDSAGNSVTYPIKMRFEADSSLDFNTLRVTLDSQTPQNFPYSQIDANGNYSMKADATINTAKIELLDIAGTPMTFTVNGASSNIVNLVGGDNIIKIKRTNQNVSKQYTLVITKKGLPKLQALVPSTGALTPAFDKDVNEYTVTVPTDQTTVSFIPTAVDNSSTIKVNGVSVASGSKSQNIKLSEGNNEVDIVLTTKDGDVGTYIVNVTRTPLFRSTGLTSLTLTSGTLSPTFNKGITEYTATVENSITSVGVTPTAEDPNATITVNGKKVPSAATSPNISLDEGVNTINVKVTDTKGNTQTYVVNVTRKYSKDNVNLATLSVTDGTLSPKFDPETYLYSVKVAKNIEKVRILFSAQNDSAKIKVNGKEYTNGQSDYIKLEVGANNVDVQVVAEDGTTTTTYKLSLIRGDIEGKNQWVLVAGEWRFYNAAGIQVKNDWVKYDNQWYFCDINGDRKTGWIFESGNWYYLNDDGIMITGWQYDKGYWYYLQGDGSMRTNAWATYDGKWYYFNNYGQLQTGWYFYKGKYYYMDDHGVMQKGWVTYDKNKYYLNDDGSMRTGWLYTGKIWYYLDDSGMMVRGWKNIGGKNYYFDANGVMKTGMFFLDGQWINLNNA >NZ_CP016087.1|WP_077366419.1|5678204_5679512_-|methyl-accepting-chemotaxis-protein 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MSIKHKTLLIGFLSMLSIIGITISIFNFSYFGYIDKEHERRLKRNFEVIDYLINKEEDNMQRLITDWGQWDDTYKFIDKPNQEFVNSNLQEETIENLNLKSIVFLDNNKKIVYSKESSVSKEFSKNIVEKLLGVNTNFNGNQGKNGLLSYKEKTYIVAIIPVTSSDKHAKSNGFIIMAREVDKNIINYIEEVAGVRLTLSDFQQENYKQNDEVSFINIDNNTVIYNKKYSEAVKIIKDINGESSISVSLIDNGYNNDQIGYFFKSFILQFLGLIVIVLIIDVLIINKYILKRLSKLTKFMEQVGKSKDTSLNIEISGKDEVYKLAAATNKMLSELNCANDEIRFLSYCDKLTKLNNRAYMEKILDELDDNKFENYFILMGDLNGLKLTNDALGHFEGDKLLVLVGKILKEICAEDDVISRWGGDEFVILVRNKDSYYVSDLIDRIKEKCNNETEFHFKISIAWGYAGYYEENSNTENVMSLAEKRMYRSKLMENKSARSAAIQSLLKTLHEKDSETEEHTIRIKWLSLKLGKKLGLTTEKLDELELLSSLHDIGKIGIPENILMKPGKLTDEEWVIMKTHCDIGYRIASSTPELAHISNKILAHHEKYDGTGYPNKLKGEEIPLLSRIISIVDSYDVMTHRRIYKETYEKEYVIEELKKCSGEQFDPYLVKEFIKLLEEENILL >NZ_CP016087.1|WP_077366417.1|5673457_5675461_-|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase-family-protein 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MKRELINKIVVGTIISTTLFTLAPTVASAAWVNDYQGNYYFMQDGKKVTGWKKIDGSLYYFDSYGRMQKGWIQAGDSWYFLQDDGSLKTGWIKYNKNYYYADSTGAIQTGVINIDGRVYIFDDKGIMKTSNTIINGVFYTIGSDGQVAGYRAPTPDKEFDSAGNLVQVLNSSSKTVSSPTKSEYNEVVQDKTQADYEDAKEGRKFTLTYKDSKTDGIIKTEMVKYGKKADLFAPTKTSYKFKEWNTRKDGSGTDYDGNDDIKIKGDTVLYAQWNDDTTVYVTGITISGSSYVTVGKTSQMTAQVSPSNAVTSAVKWTVTNGTGSATIDQNTGVLTGVTAGTVTVKATATDGSGVSETKDVTVSATDVVVNVGKILVTTKTGGTPVITSNGGTLDLVASILPNDATTQDVTWDVQNGTGSATVSSISGNNITIKAISNGTVTVKATAKDGSGIVGSATVTITGQTTVIPVDSVNIGTANATDTMAISKNDGTLQLAANILPATASNKEVTWSIIKAKNEDGVEVTAASDIAKVATISRNGVVSAIGNGSITVQVVTADGNKIATQDVTITGQIVKIASIDITGPNAASGTNPVQMIAVITGENSKIITTGAAVKWTVTNGTGSASINPTTGLLTPISDGTVTVKAAATDGSTASDTQSVTITGTAKQIPISNINVATATGATHAYVSEDNGTVDFIANITPTYATTTASAVTWSIVGGSDGGSAIIDPAGTSGNTVRIQAVKNGTVTISATVTDVDGKTKTGSATVSIYNQIQEVESIAINAPANGGKVGVNEGLLLTATVTGGDAKYQKVKWQVSNGVGDTGSASFDSNVNGLLIGNKTGTVTVKAISTDGKELNSTPIKITVVDPPTKTNNVTIVLPKDKNGADISTITTNQGALTLSATVDAAATSNVVKWSVENVTGKATFVDNGDSTVTLTAVENGTINVTATANGGKTAVMPITISGQDATGLTVTSVTGAAGITKIGDTLDMTYNLVPSTATTPSAITWSVSDTTKASITTSADKKTATITAKDNGAIAVTVTATTANGVTLTNSKTISINAPKSIAITNSTASVNGGSVTINNGSSLTLSAAVLPAGVTDGSVTWLVSDPSKVSVTVSADTKAALFNGTASGTVLVTVKSNGDPSVTATTTIIVQ >NZ_CP016087.1|WP_077366415.1|5668131_5669196_-|bacteriocin MKHKILKKLIASSLVSLALVTLVPVGASAAWINGSDGAWYYSMGYSFATGWKYINGSWYYFDSMGKMQTGWIPYGDNWYYADLSGAMQTGLIQIEGKIHLFSLSGEMQKGSSMVNGQLCNFDDNGVYIGSYPIAPIKAFDYYGNSTMPYASNQLITSNSTMSKDIPSDGLYHPKQYTIKFKDPDADNEDDELLKTKTVDENTQMYLYTPAKSGYTFVEWNTKSNGNGTGYLDSDRIYVTKDMTLYAQWEENTNSDNNNNGNNTDTVKVTSIAVSGASGLKSIAVGGSLQMTCIVSPGDATTQSVKWSILSEGGSATISTTGKLTGTGAGKVIVKAAATDGSGVVGTTEITIAAS >NZ_CP016087.1|WP_077366414.1|5665991_5667587_-|peptide-chain-release-factor-3 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MKKTIQIGTSDFKELIEKNNYFVDKSLLIKEFIENGAKIILTPRPRRFGKTLNLSMLRYFFDIRTKEETKSLFNGLKIENEKEIMKLQGEYPVVFVTFKNQKHLSYENFEDGIKVLLSSLYNEHEYLLESSKLSEFDKEEFRDIISRNPSQGLLAEGISNLMRYMNKHYGKEVMLFIDEYDVPIQEGYIHGYYEEMIALIRNLLTSALKDNPYVEKSLITGILRVAKESIFSGLNNLEVNTLLRYSFNDKFGFTEEEIQELVKYFDSANELEGIREWYDGYIFGGEVIYNPWSVLNYLKNKREGFMPYWINSSSNDLIKKLLLKGDYSLKIELEELIEGKSISKVIDDTIVMSEVEDSNENIWSFLLMSGYLKAVKTENIEGILNCELKIPNKEVLIFYKILIEKWFKETLNNQKYNIMLKALITKDLEVFEEIFTDFVMKNMSYFDVSGKEPEKVYHAFVLGMIVSLADKYEVKSNKESGYGRYDVMLIPKDILKLGIIIEFKRIKDTASKTIDEGVKEALDQIEKNKYEAELQERNVKNIWKLAIVFKGKRVTIVSGD >NZ_CP016087.1|WP_077366429.1|5696950_5698345_-|hypothetical-protein MYFNESGNKKRYIFIVFTIIFFIAQCFITLYPGDDTYYIETVSKSKSIISFVIMRYETWSGRIASEFFIGLFSLLPLFIWRILNTMIAVMFIAFISKIIKLSISKESFEKNSAIIDGFVCLSFFMIPISVTTRACSWFTGSFYYLWPTFFCIIAMSPFIYKIYNKDISKKHYIIAILSVLYASYMEQTAAVLICFGIMTVLYLYKRDKKFYLGLVAENLLVLINLIIYTLSPGNELRNISETKTWYPGFDSLSLFQKVYQGVCWTHSHLVRETTILMLVISLLLFIIVFNRNSKWLVRISAFIPSMYFIGSLAPINKMVLSTTSYEYPYDIQTILDKIFFNPMLDIVPAVISSVIIFSIVILMFLCIKNKNERYLCIIFYLAALACGYVLGFSPTIFASGPRIFFMTNILLLMIGGILLKNILEEVPINKMLWKISSIFYCSLASVYALIYVGGIAIKTIFKIN >NZ_CP016087.1|WP_077366430.1|5698553_5699981_-|hypothetical-protein MEQLIKKYRSKFQDNTYMPFVVLLIGEIMLHLLIKLNYGDDIMLSGVLKDNNIFQWAIGMYQGWSSRFLVQFALAIVLGTGVVLWRIIDIAMILLLALSISKLFVKNKRNNWLVVALIMIYPFQDMRTAGWGATTIGDLWSLALGIYSFVIWKKIIFDEKIKKYDYVFSTLAVLYACSVEQMCGIIIGTYVILMIYMAAKKKTIKWFMIFSFMLSIVNLMSILLCPGNKIRNSQQIIDSFPDFNQLSFLGKVQLGFSSSMAKYIFEPKFVFIIFALLIAILVAIKEKSKLKRIIGCVPIIAVITIGIGCFGIKKIFPNIPNIINSMTKYGIIDLWNYNNMFAYFPLILLVLVEVCILVSIYYCYGKTIKTLLALFILLIGLASRVVMGFSPSIWVSADRTFIFMYFSIILASIILYEEISKQAFKWIKYINYFIMIIAILSFCKLIFYVITAEIFVNKANFINYIKSKLQIGYTK >NZ_CP016087.1|WP_077366431.1|5699994_5700990_-|hypothetical-protein MGNAESYENYKKEVIFIKSNRFKILGRLITITSFIFIVKMLLSVNIEFNVIRNAKDNLLLLIILVFWCSVGLYLVAYGWSMLIKFIEPREIVNFNLASIYVKANIAKYLPGNVMNLIGRNVLAGKLGFKQISIATSTIMEIIIFGSTTMVLAFLFSITKLNYMVSIIKQYINYKVSIVVMIFLILFFTILLLYILKNKKKYVNKIKKYCTMEFLKLTIRLVFLYGIYFIYLGIMLVIILRNVLCVSTNLNNMLQVIGFFVLSYFIGYIVPGSPGGMGVREAVLILLLTSIVGENLAIAAALMHRIITITADLVLYCINYLIEKFEILPKVV >NZ_CP016087.1|WP_077366432.1|5700947_5702123_-|4Fe-4S-dicluster-domain-containing-protein MINITEDNKEYCCGCSGCFQICPVKCINMVEDKEGFKYPQINKEKCIGCNKCEKVCPIIQEKSEGSVHGRVKPKAIGGWHKDEKIREKSSSGGAFTLFAEFVLKNNGVIFGSAFNEALEVNHCDVEKIEDLDRLRGSKYVQSDIKETYIKVRENLEKNRMVLFVGTPCQTAGLSGFLNKEYDLLFKCDFICHGVPSPLVFKKYITYLEEKYEDKIIEFKFRNKDKGWRQTGQQMGTAVEFQKGKVKHFMPAFKDYFMNGFLEDLYLRPSCYECKFKTIPKNYSDVTIADFWGIDAVASELNDKKGTSLVLINTDRGEYLFNKVKEKFHYKECDFHNAIKRNPVLLNSVKPPKGRKKFFKELETKSFIILAVKYMTAFSWAMQRAMKIIRKK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP016087_12 | 5716927-5717039 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016087_12
|
1 spacers
spacers of NZ_CP016087_12
>12.1|5716956|55|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder ATGCCATTCTACTGCTTTTTCAAGTTCTTTAACTTTTTCAATGTGCCAATTTAAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016087_12
The CRISPR arrays of NZ_CP016087_12 >merge|NZ_CP016087|12|5716927-5717039|CRISPRCasFinder CTTTCTCGTATATTTTTATCATTTTCTTGATGCCATTCTACTGCTTTTTCAAGTTCTTTAACTTTTTCAATGTGCCAATTTAAGCTTTCTCGTATATTCTTATCATTTTCTTG >NZ_CP016087|12|12|5716927-5717039|CRISPRCasFinder CTTTCTCGTATATTTTTATCATTTTCTTG ATGCCATTCTACTGCTTTTTCAAGTTCTTTAACTTTTTCAATGTGCCAATTTAAG CTTTCTCGTATATTCTTATCATTTTCTTG
>NZ_CP016087.1|WP_077366445.1|5714754_5716689_-|rhamnan-synthesis-protein-F MKLSDKNEIKRLAIYFFYDKDGIVDDYIPYMLEDLNKNISELLVVCNGKLTPESRSKLEKYTSNILVRENKGFDVWAYKEGIETYGWDKLSTFDEVIFMNFTIMGPLYPFKEMFDDMDKRDLDFWGITAFHSAPFDPFGTIKYNYLPLHIQSHFIVVRNKMLNSIEFKRYWDNMPMVTRYEEAIGFHEAIFTKEFEDKGYRWDVYVNTEDLYKHSYGPIIMSPLDLVKNRRCPIIKRRSFFHNYNDFLAFNNGESSIEMMNYISQNTNYDINLIWDNILRVQNQADIKKCLHLNYILSSNIYENENIKNIDKKVALVLHIYFEDLIEYCFNYAKSMPNSSDIYVTTDTEQKRKSILKVFSKLNCNKLEVIVIENRGRDVSALLVGTKDFIMNYDYVCFAHDKKVGQLDFSIKGEAFSYKCFENVLKNNIYVENIINVFEKNPRVGLLTPPPPNHAEYYPTLSYVDWEHNFNNTVKLAKELNVNVDFNCKKESIAPLGTMFWFRPVALKKLFERNWKYSDFPSEPNNTDGTLLHAIERVYPYVVQDEGFYPAWIMVDTFAKIEITNLSYMLRELNDVAFELYGNNSFNGLVSTMRYALDQNQNEMQTDKIIRKFIKEKIKRKVPKFIWRVVKKIYHMFPGKRWVG >NZ_CP016087.1|WP_077366444.1|5714160_5714649_-|hypothetical-protein MKSRVMLIMGLAISLLISVGFATIYKYDNEIVKNINMASVRTNVPEAYKSWIDSAEIKDGALEIKGWVFKKGENLEYLNRKVVLVDNKNNVYEVNTLMERRTEITSVFNDGFNYDNAGMIARCPIKQFKDGDTFKIGYIVTEQNGDSYYIPVDKSVTIEKGE >NZ_CP016087.1|WP_156875951.1|5712711_5714157_-|hypothetical-protein MEKIKEKWSVFWKSEYAPFGYFAITLFVVMLKVGLKSGTDDFVDREELAKTTVFQWIYNHAISWQPRISSDTALALVNFNVTLWKLLTITLFTFMAMIIAYISTSRLADKNQKKNINLLICCSFFLFAPSIISNSVMWYTGSFHYLWPATAMVFALAPFCYAILGKSITYKNMYIVYFFASTFAAYVEQPFAVLLGFGAFTFLYLILAKKKIPKALVIQYIYIAINVTIYFLLGGVGNRSILELRWYRDYTMLSMPDKIFQGVNWSNYQLINSSNVLTLVFTTLIFVVIWKKNKDKVIRFFGSIPFIFMMLSVLPIDIIFKNVSYMQDPYSGKIHHLDIGRVLREGLFNCMMTRPNSFTFNLKALAPSIACLTILLFIAILLFFIFDKLEDKLIAVVLYFASLASSYVISFTPTVFASGERVFFITHVIIVLLIGMVARELFEKENILENKRFILYRGVLIFISACYALEQFAFGFMGTLR >NZ_CP016087.1|WP_077366442.1|5712084_5712507_-|GtrA-family-protein MKKFFLIFFDISFLKFLIIGGFNCILSIAIMFSLYNLFGLGYWGSSMVSFTICSVISYVLNRKISFNSSAPLLQSIIKFSIVIAVSYFIAFGVARPIVTITLRLIEINISKGVIEQLAMILAQGIFTIFNFIGQKMWTFR >NZ_CP016087.1|WP_077366441.1|5711091_5712015_-|hypothetical-protein MKSLVGYTGFVGSNLHMQYKFDGKYNSKNIREAYGTNPELLVYSGVRAEKFLANKNPEGDFELIEEAFENINRIKPKKLVLISTIDVYKNPIKVDEDTLIDTIDLHPYGYNRYKLEEMVRANFKDSLIIRLPGLYGKNIKKNFIYDLINVIPSMLTESKINELVKREPALIEYYIKHNNGFYKCRDLEEKEKYKLKECFREIGFSAMNFTDSRGCFQFYNLKYLWKHIQLAIENNINTLNLATEPITISELHEYITGKTFKNEVAEVIPNYNFESKYAKLIGGEKKYIFSKEFILEDIKNFVEEELR >NZ_CP016087.1|WP_077366440.1|5710306_5711092_-|sugar-phosphate-isomerase/epimerase MKLSISNIAWDMCYDEQMYFFLEQEGFLGLEIAPTRIFQIDPYEKLDEAKEFSEKLKKKYGIVISSLQSIWFGKNENLFRSEDERNELIKYTKKAINFAQMCGCKNLVFGCPKNRNLDKLEQYSLAVEFFRELGEYAKLHETVIAIEPNPTIYNTNFINYTNEAFKIVDDVNSSGFKVNIDLGTILYNKEDLSWIETKLDRVNHIHISEPYLEKVKINEIHESLAQQLKNKNYDKFISIEMKNNGDINSVKEILKSVKKIF >NZ_CP016087.1|WP_077366439.1|5709153_5710284_-|FAD-binding-oxidoreductase MTYDKIIIGGGLYGLYSALFCGKRNEKILLLEYDSAEYMRATYINQARVHMGYHYPRSYSTAIKSAHYFERFNKDYSYCINSEFDQVYATSADFSWSNGEQFKKFCINAGIRCDEVSTEKYFKEGKCDGVFLTKEYTYDARILKKHLLDEINYYPNIELKYDVRIDSISQKGCEYEIILESGEHYRSSFVLNATYASVNQILNKIGFEPFKIKYELCEIILCNVSDKLKNVGLTVMDGPFFSIMPFGKTGYHSLTSVTFTPHSTSYDSMPTFECQAKSNGFCSTSQLGNCNNCPAKPQSAWDYMSNLARKYMKEEYEFDYVGSLFSMKPILKASEIDDSRPTVIKQFSSNPTFISVLSGKINTVYDLDEVLKNGNE >NZ_CP016087.1|WP_077366438.1|5708225_5709167_-|glycosyltransferase MEMNKEKNFVSAVIYVRNDEDGIRHTLNEIYKVLKNNFLKFEIICVNDCSNDNSMKIIKEFSNIVEGVVVSVVNMGFYHGLESSMNAGIDFAIGDFVFEFDSVYMDYESDLVMQIYRRSLEGYDIVSATPKNIKNYTSKLFYTIFNRYSSNKYNLRTEKFRVLSRRAINRVDSISKTNPYRKAIYATCGMKIDYISYDNRVDADMAENKQEGIGREKLAIDSLILFTDIAYKMSLVLSIIMILFTISTGVYTILVYFSQDKPVAGWAPIMGLISAGLFGVFLILTLIIKYLDLILKLIFKKQKYLISSIEKLR >NZ_CP016087.1|WP_077366437.1|5707493_5708213_-|glycosyltransferase MKINILFPVLNEERRLERGIIQTIDFMDEHFKENYKISIIDNGSIDNTEAISKKLESSYHNVKYVKLKEKGVGLALREGIKLNNCEIVGYMDIDLSTKLDHLIEMKETFEKYSDIKIVNGSRLSKNSVVIGRKFSREVTSRGLKYILKIVLGMRINDALCGFKFFRKETIEDLMKISSDTNGWFYCAEILLRAEKNNIKIKEIPVVWQDDYDTTVNVKKLIKEYLKEISRLFFELRIKK >NZ_CP016087.1|WP_156875950.1|5706971_5707142_+|hypothetical-protein MFSKTSKGASSSALLYSIIEAAKANGLATEKYLVYLFEVLASSEIKEMDMLEKCMP >NZ_CP016087.1|WP_077366447.1|5718021_5718870_-|NAD(P)-dependent-oxidoreductase MGGIVVKRILVTGAGGYIGRHVVKELLDRGAEVIATDINVDNIDSRAIRRKFDIFSGNTNVYNELDCPDVVLHMAWKDGFIHNSNAHMEYLSKHYEFIKNMVEGGLKHIAVMGTMHEIGYYEGAIDENTLTNPTSMYGIAKDALRKSTQLLLKDKGVVLQWLRAYYIYGDDKRNNSIFAKIIVAEEEGKELFPFTTGKNKYDFITVDELAKQISACIMQDEINGIINCCTGVPMSLAEKVESFIKENKFNIKLNYGAFPDRPYDSPAVWGDSSKIKAICNKK >NZ_CP016087.1|WP_077366448.1|5718866_5719592_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIEAKNITMKFDLNRGKVRSLKERLFAKVDDEALEKKPFLALNDVSFDVKKGEILGIIGGNGAGKSTLLKILAGIMKPSSGQVTVKGTIAPMIELGTGFDFELSALENIYLSGAVLGYSKNFINSKVVEIFDFSELWDFKDVPVKYFSSGMVARLAFAVSTIVVPDVLIVDEILSVGDMSFQKKSYKRMKELMCSGSTVIYVSHDVESLGKMCDRVIWIDKGTIKMIGEAKKVCEAFIDAV >NZ_CP016087.1|WP_077366449.1|5719604_5720411_-|ABC-transporter-permease MESKERKNNVDLIKKIISFNRFRFLLSQLVRRDFKVKYRGSILGVLWSVLNPLLNMIVLSIVFSQVFRQVDNYKMYLLSGLTVFNFYSEATNNAINSIVGNFSLITKVYFPKFILPLSKVISTAINLGISVVVFFILGSFMGIKIWWGIVLIPFMLIFLLLFSAGISFIVSALQVFFRDTQHLYGIFLTIWMYSTPILYPIDIVPTEILPIFKANPLYIFIDFLRQITLNGVVPNITSFIYCVLWGIGTFIVGAFVFVKSQDNFIYYS >NZ_CP016087.1|WP_077366450.1|5720385_5721240_-|dTDP-4-dehydrorhamnose-reductase MILVTGVSGQLGFEVAKELNRRGIESKGIDIHNFDITKKSEVIKFITDLKPISVIHCAGYTQVDKAETEKDKCLDTNCNATQYIASACKSIGSKMLYISTDYVFDGEKEGEYDINDKTNALSVYGKSKACGEQIVIQNVEKHFIVRTSWLFGKNGNNFINTMIKLGKEKKEIDVVCDQIGSPTYSVDLANFICELIQTDKYGIYHATNEGFCSWADLAEKALEIEKIECKIKRVLATSYKSAARRPLNSKLSKNSLIDNGFNVFPTWENAVERYLKDRVKGKEE >NZ_CP016087.1|WP_077366824.1|5721253_5722225_-|glycosyltransferase MKGDNSTPLVSILLAVYKPNKKWLVEQLISLNEQSYNNLELLVYDDCPEFSVSEELFNQHITNFEYKLIRGKQNQGSNKAFEELTKVANGDFFAYCDQDDIWEQEKISVMIEGFNKNDTTLVFSDLSIIDGNSMKIANSITDIRKRIEYRSGYMLAERLLMTNFVTGCAMIVKSDIAKKAVPFEANLVHDQWIAIIAALNGRIEFLNKPLVRYRQHGSNQTGILKDVYDKKTYYTKRIADFICRYESLERRLCTYEIEESISNCLKWLNARKNYFSNPNIRDLRIMVKYKDFHKVSIAIECVLPFMPESIFKSIIKMAKKGIL >NZ_CP016087.1|WP_077366451.1|5722211_5723231_-|dTDP-glucose-4,6-dehydratase MKIVVTGGAGFIGGNFVHYMLKKYNYYKIICVDALTYAGNMETLVAVKENSNFKFYKIDIADRVKVYEMFEEENPDIVVNFAAESHVDRSIENPEVFLRTNIMGTAVLMDACRKYGIKRYHQVSTDEVYGDLPIDRPDLFFTEETPIHTSSPYSSSKASADLLVGAYHRTYGLPITISRCSNNYGPYHFPEKLIPLMIANALNDKELPVYGTGENIRDWLYVEDHCSAIDLIIHKGRVGEVYNIGGHNERTNLEVVKTILRELGKSEDLIKYVGDRKGHDMRYAIDPTKVHNELGWLPTTTFDEGIKKTIKWYLDNKIWWENIISGEYQSYYTKMYEGR >NZ_CP016087.1|WP_077366452.1|5723258_5723810_-|dTDP-4-dehydrorhamnose-3,5-epimerase MNIIKTKLEGVYIVEPQVFGDERGWFMETYSRIKTPEIACDFVQDNQSYSKGKGILRGIHFQNGAHAQAKLVRCVRGAVLDVAVDLRKGSSTYKEWVAVELSDENKKQLFIPRGFGHGFLTLTDDVEFVYKTDNYYNYESDRSICYCDPEIGIEWGIENPILSEKDKKAPLLKDSDCSFTYNK >NZ_CP016087.1|WP_077366453.1|5723840_5724722_-|glucose-1-phosphate-thymidylyltransferase-RfbA MTKGIILAGGSGTRLYPLTMVTSKQLLPVYDKPMIYYPLSTLMLAGIREILIISTPKDLPNFEKLLGDGSRYGINLHYKEQPSPDGLAQAFILGEEFIGSDNCAMILGDNIFHGNGLTKHLKKAVENEGRGTVFGYYVDDPERFGVVEFDENGKAISLEEKPEKPKSNYAVTGLYFYDNKVCEYAKNLKPSPRGELEITDLNKIYLENSKLDVITLGRGYGWLDTGTVDSLTEAAEYVKVIETRQGLKIACLEEISYKNGWINKEILLESAAQYGKSPYGQHLKNVAEGKVIY >NZ_CP016087.1|WP_077366454.1|5725034_5726438_+|undecaprenyl-phosphate-glucose-phosphotransferase MIKENQNFLNKINAVSDIAILFISMSLAYFIRFHIFSSDFEYIKLITYFQFSFIIIPINLIVFNFFNLYHSFRTKVFIKECSQIIKANTLLTAILLSLLFTLKLGNISRFVIVIFYFVNIGLITSKRLIIRKTLSNMRKKGLNLKHVVIVGAGEVANDYLEVLENNKHYGYSYSGYVANSKDFKGEKLGDYTDLYQVLDKTQPDEVVCALDISDAKYLENIVSACEKSGTKISIIPFSYKYIPSQPYIDQIGNIPLINLRRIPLDNLGNAFTKRAIDILGSIFLIICTSPIMLITSLIIKLTSDGSVIFKQKRVGLNKNLFTMYKFRSMKVNSSEETSWSKDVDPRKTKFGSFIRKFSIDELPQFFNVLKGDMSLVGPRPELPHFVDNFKDEIPLYMVKHQVKPGITGLAQVNGYRGDTSIKKRIEYDISYIENWTILLDISILFKTVFKGLKNNEKIIINDTIDMK >NZ_CP016087.1|WP_077366455.1|5726477_5727353_+|glycosyltransferase-family-2-protein MKLSIIIVNYNTYVLTKQTIESIIQKEHPFQYEILLIDNASKDDSIEKLQETFSNLILDNILKVFINTSNLGFAKANNIGMRAAEGQYILLLNSDTVINEDCLEQCLAEMDKDSNLGALGCKVVLPNGKLDHACKRGFPTPKASLYYLLKLYKINPIKYGQYDALHLKEDEVGEVDCLMGAFMLMPKTALDKSGLLDETFFMYGEDIDLCYRIKENGYKILYYPKATITHYKGGSSKKKRTKVIYDFHNAMWIFYKKHYYSKYNFAITFFVFLGIWTKYLLEILKNSVSSN |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP016087_3 | 3.2|596929|35|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder | 596929-596963 | 35 | NZ_CP016087.1 | 3073365-3073399 | 0 | 1.0 |
1. spacer 3.2|596929|35|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder matches to position: 3073365-3073399, mismatch: 0, identity: 1.0
acattaactctctttgaaaagagtaattgttcctt CRISPR spacer acattaactctctttgaaaagagtaattgttcctt Protospacer ***********************************
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP016087_4 | 4.5|601093|33|NZ_CP016087|CRT | 601093-601125 | 33 | NZ_AP018256 | Calothrix sp. NIES-4071 plasmid plasmid1 DNA, complete genome | 133229-133261 | 7 | 0.788 |
| NZ_CP016087_4 | 4.5|601093|33|NZ_CP016087|CRT | 601093-601125 | 33 | NZ_AP018256 | Calothrix sp. NIES-4071 plasmid plasmid1 DNA, complete genome | 259956-259988 | 7 | 0.788 |
| NZ_CP016087_3 | 3.1|596864|35|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder | 596864-596898 | 35 | KX905163 | Clostridioides phage phiSemix9P1, complete genome | 51178-51212 | 8 | 0.771 |
| NZ_CP016087_4 | 4.2|601092|34|NZ_CP016087|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 601092-601125 | 34 | NZ_AP018256 | Calothrix sp. NIES-4071 plasmid plasmid1 DNA, complete genome | 133228-133261 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP016087_4 | 4.2|601092|34|NZ_CP016087|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 601092-601125 | 34 | NZ_AP018256 | Calothrix sp. NIES-4071 plasmid plasmid1 DNA, complete genome | 259956-259989 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP016087_4 | 4.5|601093|33|NZ_CP016087|CRT | 601093-601125 | 33 | MN693576 | Marine virus AFVG_25M375, complete genome | 10039-10071 | 8 | 0.758 |
| NZ_CP016087_8 | 8.24|3636913|36|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT | 3636913-3636948 | 36 | EU794054 | Bacteriophage APSE-6 predicted P-loop ATPase (P3) gene, partial cds; conserved hypothetical protein (P4), Q protein (P5), cytolethal distending toxin subunit B (cdtB), phage 21-like group II holin (E), lysozyme (F), conserved hypothetical protein (P14), conserved hypothetical protein (P16), conserved hypothetical protein (P17), terminase (P18), portal protein (P19), and scaffold protein gp8 (P23) genes, complete cds; and head protein (P24) gene, partial cds | 2717-2752 | 8 | 0.778 |
| NZ_CP016087_8 | 8.24|3636913|36|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT | 3636913-3636948 | 36 | NC_011551 | Bacteriophage APSE-2, complete genome | 4041-4076 | 8 | 0.778 |
| NZ_CP016087_8 | 8.47|3636914|36|NZ_CP016087|PILER-CR | 3636914-3636949 | 36 | EU794054 | Bacteriophage APSE-6 predicted P-loop ATPase (P3) gene, partial cds; conserved hypothetical protein (P4), Q protein (P5), cytolethal distending toxin subunit B (cdtB), phage 21-like group II holin (E), lysozyme (F), conserved hypothetical protein (P14), conserved hypothetical protein (P16), conserved hypothetical protein (P17), terminase (P18), portal protein (P19), and scaffold protein gp8 (P23) genes, complete cds; and head protein (P24) gene, partial cds | 2717-2752 | 8 | 0.778 |
| NZ_CP016087_8 | 8.47|3636914|36|NZ_CP016087|PILER-CR | 3636914-3636949 | 36 | NC_011551 | Bacteriophage APSE-2, complete genome | 4041-4076 | 8 | 0.778 |
| NZ_CP016087_9 | 9.1|4023807|33|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder | 4023807-4023839 | 33 | MT708547 | Klebsiella phage Muenster, complete genome | 272141-272173 | 8 | 0.758 |
| NZ_CP016087_9 | 9.1|4023807|33|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder | 4023807-4023839 | 33 | NZ_CP054442 | Staphylococcus saprophyticus strain UTI-058y plasmid pUTI-058y-2, complete sequence | 7228-7260 | 8 | 0.758 |
| NZ_CP016087_9 | 9.1|4023807|33|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder | 4023807-4023839 | 33 | NZ_CP014058 | Staphylococcus saprophyticus strain FDAARGOS_137 plasmid unnamed, complete sequence | 8863-8895 | 8 | 0.758 |
| NZ_CP016087_9 | 9.1|4023807|33|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder | 4023807-4023839 | 33 | NZ_CP014114 | Staphylococcus saprophyticus strain FDAARGOS_168 plasmid unnamed1, complete sequence | 12631-12663 | 8 | 0.758 |
| NZ_CP016087_9 | 9.1|4023807|33|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder | 4023807-4023839 | 33 | NC_016643 | Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus plasmid pSSAP2, complete sequence | 7228-7260 | 8 | 0.758 |
| NZ_CP016087_9 | 9.1|4023807|33|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder | 4023807-4023839 | 33 | NZ_CP054435 | Staphylococcus saprophyticus strain UTI-035 plasmid pUTI-035-1, complete sequence | 7228-7260 | 8 | 0.758 |
| NZ_CP016087_9 | 9.1|4023807|33|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder | 4023807-4023839 | 33 | NZ_CP054446 | Staphylococcus saprophyticus strain UTI-056 plasmid pUTI-056-2, complete sequence | 7228-7260 | 8 | 0.758 |
| NZ_CP016087_9 | 9.1|4023807|33|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder | 4023807-4023839 | 33 | NZ_CP013717 | Staphylococcus equorum strain C2014 plasmid pC2014-3, complete sequence | 1426-1458 | 8 | 0.758 |
| NZ_CP016087_9 | 9.1|4023807|33|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder | 4023807-4023839 | 33 | NZ_CP017464 | Staphylococcus pasteuri strain JS7 plasmid pSNJS701, complete sequence | 32966-32998 | 8 | 0.758 |
| NZ_CP016087_2 | 2.1|596327|34|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT | 596327-596360 | 34 | NZ_CP048109 | Klebsiella michiganensis strain BD177 plasmid unnamed1 | 42925-42958 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP016087_4 | 4.2|601092|34|NZ_CP016087|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 601092-601125 | 34 | MN693576 | Marine virus AFVG_25M375, complete genome | 10038-10071 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP016087_9 | 9.1|4023807|33|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder | 4023807-4023839 | 33 | NC_019526 | Enterobacteria phage vB_KleM-RaK2, complete genome | 149407-149439 | 9 | 0.727 |
| NZ_CP016087_9 | 9.1|4023807|33|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder | 4023807-4023839 | 33 | AB897757 | Klebsiella phage K64-1 DNA, complete genome | 149361-149393 | 9 | 0.727 |
| NZ_CP016087_9 | 9.1|4023807|33|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder | 4023807-4023839 | 33 | NZ_CP044447 | Acinetobacter indicus strain CMG3-2 plasmid pCMG3-2-2, complete sequence | 12419-12451 | 9 | 0.727 |
| NZ_CP016087_9 | 9.1|4023807|33|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder | 4023807-4023839 | 33 | NZ_CP003562 | Flammeovirga sp. MY04 plasmid unnamed, complete sequence | 11829-11861 | 9 | 0.727 |
| NZ_CP016087_11 | 11.1|5684523|34|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder | 5684523-5684556 | 34 | NZ_CP043762 | Paenibacillus sp. 37 plasmid pART37, complete sequence | 25632-25665 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP016087_11 | 11.1|5684523|34|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder | 5684523-5684556 | 34 | NC_012961 | Photorhabdus asymbiotica plasmid pPAU1, complete sequence | 15903-15936 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP016087_3 | 3.1|596864|35|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder | 596864-596898 | 35 | NZ_CP038863 | Campylobacter jejuni strain SCJK2 plasmid unnamed1, complete sequence | 21940-21974 | 10 | 0.714 |
| NZ_CP016087_8 | 8.4|3635595|36|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3635595-3635630 | 36 | NZ_CP018790 | Campylobacter sp. RM6137 plasmid pSUIS6137, complete sequence | 4504-4539 | 11 | 0.694 |
| NZ_CP016087_8 | 8.6|3635726|34|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT | 3635726-3635759 | 34 | NC_013940 | Deferribacter desulfuricans SSM1 megaplasmid pDF308, complete sequence | 172193-172226 | 11 | 0.676 |
| NZ_CP016087_8 | 8.29|3635727|34|NZ_CP016087|PILER-CR | 3635727-3635760 | 34 | NC_013940 | Deferribacter desulfuricans SSM1 megaplasmid pDF308, complete sequence | 172193-172226 | 11 | 0.676 |
1. spacer 4.5|601093|33|NZ_CP016087|CRT matches to NZ_AP018256 (Calothrix sp. NIES-4071 plasmid plasmid1 DNA, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
tagatcctcaaactgtttaactttatttttatc CRISPR spacer tcttgccccaaattgtttaactttatttttatg Protospacer * **.****.*******************
2. spacer 4.5|601093|33|NZ_CP016087|CRT matches to NZ_AP018256 (Calothrix sp. NIES-4071 plasmid plasmid1 DNA, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
tagatcctcaaactgtttaactttatttttatc CRISPR spacer tcctgcctcaaattgtttgactttatttttatg Protospacer * *******.*****.*************
3. spacer 3.1|596864|35|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder matches to KX905163 (Clostridioides phage phiSemix9P1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tcattcctttgcttttataaaatattttaattttt CRISPR spacer aaaatattttacttttataaaatattttactttta Protospacer * * .***.****************** ****
4. spacer 4.2|601092|34|NZ_CP016087|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_AP018256 (Calothrix sp. NIES-4071 plasmid plasmid1 DNA, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
atagatcctcaaactgtttaactttatttttatc CRISPR spacer ttcttgccccaaattgtttaactttatttttatg Protospacer * **.****.*******************
5. spacer 4.2|601092|34|NZ_CP016087|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_AP018256 (Calothrix sp. NIES-4071 plasmid plasmid1 DNA, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
atagatcctcaaactgtttaactttatttttatc CRISPR spacer ttcctgcctcaaattgtttgactttatttttatg Protospacer * *******.*****.*************
6. spacer 4.5|601093|33|NZ_CP016087|CRT matches to MN693576 (Marine virus AFVG_25M375, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
tagatcctcaaactgtttaactttatttttatc CRISPR spacer ttgctttgaaaactgtttacctttttttttatc Protospacer * * *.. ********** **** ********
7. spacer 8.24|3636913|36|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT matches to EU794054 (Bacteriophage APSE-6 predicted P-loop ATPase (P3) gene, partial cds; conserved hypothetical protein (P4), Q protein (P5), cytolethal distending toxin subunit B (cdtB), phage 21-like group II holin (E), lysozyme (F), conserved hypothetical protein (P14), conserved hypothetical protein (P16), conserved hypothetical protein (P17), terminase (P18), portal protein (P19), and scaffold protein gp8 (P23) genes, complete cds; and head protein (P24) gene, partial cds) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
tatattcaattagaggatgataagggcaaaattaat CRISPR spacer tcgagtggatgaggggatgataagggcaaaattact Protospacer * * * .** **.******************** *
8. spacer 8.24|3636913|36|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011551 (Bacteriophage APSE-2, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
tatattcaattagaggatgataagggcaaaattaat CRISPR spacer tcgagtggatgaggggatgataagggcaaaattact Protospacer * * * .** **.******************** *
9. spacer 8.47|3636914|36|NZ_CP016087|PILER-CR matches to EU794054 (Bacteriophage APSE-6 predicted P-loop ATPase (P3) gene, partial cds; conserved hypothetical protein (P4), Q protein (P5), cytolethal distending toxin subunit B (cdtB), phage 21-like group II holin (E), lysozyme (F), conserved hypothetical protein (P14), conserved hypothetical protein (P16), conserved hypothetical protein (P17), terminase (P18), portal protein (P19), and scaffold protein gp8 (P23) genes, complete cds; and head protein (P24) gene, partial cds) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
tatattcaattagaggatgataagggcaaaattaat CRISPR spacer tcgagtggatgaggggatgataagggcaaaattact Protospacer * * * .** **.******************** *
10. spacer 8.47|3636914|36|NZ_CP016087|PILER-CR matches to NC_011551 (Bacteriophage APSE-2, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
tatattcaattagaggatgataagggcaaaattaat CRISPR spacer tcgagtggatgaggggatgataagggcaaaattact Protospacer * * * .** **.******************** *
11. spacer 9.1|4023807|33|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder matches to MT708547 (Klebsiella phage Muenster, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
tttaatattcataaaaaggagttttaaaatggc CRISPR spacer aaaacaattaataaaaaggatttttaaaatggt Protospacer * *** ********** ***********.
12. spacer 9.1|4023807|33|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP054442 (Staphylococcus saprophyticus strain UTI-058y plasmid pUTI-058y-2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
tttaatattcataaaaaggagttttaaaatggc CRISPR spacer cataatactaataaaaaggagttttaatagtga Protospacer . *****.* ***************** * *
13. spacer 9.1|4023807|33|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014058 (Staphylococcus saprophyticus strain FDAARGOS_137 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
tttaatattcataaaaaggagttttaaaatggc CRISPR spacer cataatactaataaaaaggagttttaatagtga Protospacer . *****.* ***************** * *
14. spacer 9.1|4023807|33|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014114 (Staphylococcus saprophyticus strain FDAARGOS_168 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
tttaatattcataaaaaggagttttaaaatggc CRISPR spacer cataatactaataaaaaggagttttaatagtga Protospacer . *****.* ***************** * *
15. spacer 9.1|4023807|33|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder matches to NC_016643 (Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus plasmid pSSAP2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
tttaatattcataaaaaggagttttaaaatggc CRISPR spacer cataatactaataaaaaggagttttaatagtga Protospacer . *****.* ***************** * *
16. spacer 9.1|4023807|33|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP054435 (Staphylococcus saprophyticus strain UTI-035 plasmid pUTI-035-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
tttaatattcataaaaaggagttttaaaatggc CRISPR spacer cataatactaataaaaaggagttttaatagtga Protospacer . *****.* ***************** * *
17. spacer 9.1|4023807|33|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP054446 (Staphylococcus saprophyticus strain UTI-056 plasmid pUTI-056-2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
tttaatattcataaaaaggagttttaaaatggc CRISPR spacer cataatactaataaaaaggagttttaatagtga Protospacer . *****.* ***************** * *
18. spacer 9.1|4023807|33|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013717 (Staphylococcus equorum strain C2014 plasmid pC2014-3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
tttaatattcataaaaaggagttttaaaatggc CRISPR spacer cataatactaataaaaaggagttttaatagtga Protospacer . *****.* ***************** * *
19. spacer 9.1|4023807|33|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017464 (Staphylococcus pasteuri strain JS7 plasmid pSNJS701, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
tttaatattcataaaaaggagttttaaaatggc CRISPR spacer tataatactaataaaaaggagttttaattatgt Protospacer * *****.* ***************** *.
20. spacer 2.1|596327|34|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP048109 (Klebsiella michiganensis strain BD177 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
catgtatgttattttcaatgcaaatattaaaaat CRISPR spacer tttcgccgttattttcaatgcaaataatataatt Protospacer . * .******************* ** ** *
21. spacer 4.2|601092|34|NZ_CP016087|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MN693576 (Marine virus AFVG_25M375, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
atagatcctcaaactgtttaactttatttttatc CRISPR spacer gttgctttgaaaactgtttacctttttttttatc Protospacer .* * *.. ********** **** ********
22. spacer 9.1|4023807|33|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder matches to NC_019526 (Enterobacteria phage vB_KleM-RaK2, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
tttaatattcataaaaaggagttttaaaatggc CRISPR spacer aaaacagttaataaaaaggatttttaaaatggt Protospacer * .** ********** ***********.
23. spacer 9.1|4023807|33|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder matches to AB897757 (Klebsiella phage K64-1 DNA, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
tttaatattcataaaaaggagttttaaaatggc CRISPR spacer aaaacagttaataaaaaggatttttaaaatggt Protospacer * .** ********** ***********.
24. spacer 9.1|4023807|33|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044447 (Acinetobacter indicus strain CMG3-2 plasmid pCMG3-2-2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
tttaatattcataaaaaggagttttaaaatggc CRISPR spacer aaaagttttcattaaaaggagttataaaatgag Protospacer *.* ***** ********** *******.
25. spacer 9.1|4023807|33|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP003562 (Flammeovirga sp. MY04 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
tttaatattcataaaaaggagttttaaaatggc CRISPR spacer taaacaattcatcaaaaggatttttaaaattca Protospacer * * ****** ******* *********
26. spacer 11.1|5684523|34|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP043762 (Paenibacillus sp. 37 plasmid pART37, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tggtt--gtaagtaataccaagttccattgtcattt CRISPR spacer --gtcagataagtcataccaagttccattctcacaa Protospacer **. .***** *************** ***.
27. spacer 11.1|5684523|34|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder matches to NC_012961 (Photorhabdus asymbiotica plasmid pPAU1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tggttgtaagtaataccaagttccattgtcattt CRISPR spacer acgtacccagtaataccaagtttcatcgtcatta Protospacer ** . **************.***.******
28. spacer 3.1|596864|35|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038863 (Campylobacter jejuni strain SCJK2 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tcattcctttgcttttataaaatattttaattttt CRISPR spacer tatgtatttttcttttataaaatcttttaattgcg Protospacer * * .*** ************ ******** .
29. spacer 8.4|3635595|36|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP018790 (Campylobacter sp. RM6137 plasmid pSUIS6137, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
taattttaatagtgtagaaatttcttgctgacttaa CRISPR spacer taattttgttagtgtagaaatttcttaagacgcttg Protospacer *******. *****************. . .* .
30. spacer 8.6|3635726|34|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_013940 (Deferribacter desulfuricans SSM1 megaplasmid pDF308, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
ccgcttcaattaattttatgtaattcatgatcct CRISPR spacer atttttcaattaattttatctgattcatcactta Protospacer . .*************** *.****** *...
31. spacer 8.29|3635727|34|NZ_CP016087|PILER-CR matches to NC_013940 (Deferribacter desulfuricans SSM1 megaplasmid pDF308, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
ccgcttcaattaattttatgtaattcatgatcct CRISPR spacer atttttcaattaattttatctgattcatcactta Protospacer . .*************** *.****** *...
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
548048 : 584314
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP016087|548048:584314|DBSCAN-SWA 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29 | Moraxella_phage(16.67%) | protease,tRNA,transposase,coat | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
666658 : 674913
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP016087|666658:674913|DBSCAN-SWA TATGGAAGTTCTAAAAGGTTTTGTTGAAAGTATAGTTTTTAAAAGTGAAGATACTGGATATGTGGTGTGTAAAATTAGAAGTGATAATAATCTAATTAGCGCAGTAGGAACAGTTCCTTTTTTAAAAGAAGGCCAAAATGTGAAGCTAACAGGATATTATACTGTACATAAACAGTTTGGAAATCAATTTAATATTCAAGATTACGAAGAACTTCTTCCAACCTCTTTAGACGGGATAGAAAAATATTTAAGTGCAGGAGTAATTCATGGAATTGGTCCTGTTACAGCTAAGAAAATAATAGAGAAGTTTGGGGAAGAAACCTTAGAAATAATGGAAAATCACATTGAAAGACTTATGGAAATTGAGGGGATTGGAGAAAAAAAGTTTCAAATTATATATGAATCGTATATTGAGCAGCAGGGGTTAAAGGATATTATATTATATTTTCATAAGCATGGAGTAACTAATAATCAATGTATTAAGATTTATAAGAAATTCGGACCAAATGCAAAGCAAATAGTATCAAATAATCCTTATATATTATGTGATGAGATTTCAGGTATTGGATTTAGAACTGCAGATAGAATTGCAAGGAGCATAGGAATTCAAAATGATTCTGAGTTTAGAATTCAAAGTGGAATTAAGTATGTAATGAATCAATTTTGTGCTGCCGGAAACACATTTATGCCTATTAAAGATATAATAGAACAGTGTGAGGAGAATCTAGTAATAGCTAAGGAATTAATTGAGAAAAGTATATATGATATGGCAGCAGAGCAAAAGATAGTCGTTGAAAATATTAATGGAATGGAAGCTGGTCTTTTACTTCAATATTACTATTGTGAGCTTGGAGTAACAAGCAAAATAATAACGTTAGGTTTGCAACAAATACAAACTATAAATTCAGATATTGATTTTGAAATAGATGTTTTTGAAAAAGAACAAAAAATACAGTTTGCCCCATCTCAAAGAGAAGCAATTATTGGAGCTTTTAATAACGGGATAGAAATAATAACAGGTGGTCCTGGAACTGGAAAAACTACCATTATAAAAGCTATTATTCACATTTATGAGAATAATGGCATGAAGGTAATACTTGGAGCTCCAACTGGAAGAGCAGCTAAAAGAATGACTGAATCAACTGGAAGAGAAGCAAAAACCATTCATAGACTTTTGGAAATGGGTATTTCGGAGGAAGATGAATCAGTTTTTGAAAGAGGAGAATCCTCGCCATTAGATTGTGATGTTATTATAATTGATGAAGCATCTATGATTGATATAATTTTAATGCAAAATTTGCTCAAGGCAATTAAATTAGGAACAAGACTAATAGTTGTTGGAGATGTTGATCAGTTACCATCAGTTGGACCAGGAAACGTATTAAAAGATCTTATAGAAAGTGAATATATAAAAGTTGTAAGGCTAAAAGAAATATTTAGGCAAGGCTCAGAAAGCTTGATTATAGTAAATGCACATAGAATTAATGAAGGAAAGATGCCTTTGTTAAATCAAAAGGATAAGGACTTTTTTTTCATTAGTGAGGAACATCAAGATAGAATTGTAGGCTTGATAATAGATTTAATAAGCAGACGACTTCCTAAATTTAATACATCATGGGATATATTAAAAGATATGCAGGTATTGACGCCCATGAGGAAGGGAACATTAGGAGTAGCTAATTTAAACGCCAGACTCCAAGAAATATTTAATCCACCATCGAAGGATAAAAAAGAAAAAACTTCTCGAGATATAGTTTTTAGAGAAGGAGATAAAGTAATGCAGACTAAAAACAATTATACATTAAAATGGATTAACATAAATAGTTATGGTGAAAATGAAGGCGTTGGAGTTTATAATGGTGATTTGGGATTTATTAAGAGTATTGATGAAGAGAGAAAAGCTTTAACAATTATTTTTGATGATGAAAGAAAAGTAATTTATGATTTTAATTTTCTAGATGAACTAGATTTAGCATATGCTACTACAATTCATAAAAGTCAAGGTAGTGAATTTAAGGTGGTTGTTATCCCTGCCTTTATGGGATCACCGTTTTTAATGAATCGTAATTTACTTTACACAGGAATAACAAGAGCCAAACAATTGGTAGTTGTAGTTGGGTTTCAAAAGGCATTAATGTATATGATTAATAATACAAATAGTATAGAAAGATATTCAGCTTTAAAATATAGAATAAGAGATATAATAGCTAAAGATGAATTTGAAGAGTAATTGAAAGGAGATTGTAATGCATGAGTAACGAATGTAAAGTGACAGATCAAGATTTAAAATATGCATTTGATAAAATAGACTATTGGTATAAAAAAAATATCAAATTTTTAACCATAGTTACAGTTCCCTTTAATACTTCATGTGTTTTTTCAAACATAATAAGTAAACTTTCAGAGGATAATGGAAAAGCGCTATATGTGTGGGGGAAAAGTGGAGAAAATAAAGAACTGCTCAGTACAATCAAAGAATTCAATTCAAGTGTAACTCATTCCTATATTGAAAAAGGAAAAACAAATTCTAATCTTACTTTTGTAAATTATAATAATTTATTTAAAGTTACCGAACTTTTTGATTTAATTATTTTTGATGATATAACTTACTTTTCTAACTTAAATAGTGGAAATGTTAGAGAGATATTAGATGTTTGTGCAGAAATAGGGGAAAGGGTTTTATTGTATAGCATAGAAAAATTAGCTTTAGTTGGGGAAAAATTTGAACTTGCAGCTTATAATTATAAGAAACCATTTGTTGAGCCGAGAATATTGACAACTAGAATTGATTTAAATACAGATATTCCTTTCACTCTGTATGATTATCTCAGATGGTTTAAAGAAAATAATCATAAAGTGGTTATTTATACACCAACTAATGAAAAATTGAATTTGGTTTACGATTATTTTTGCAATAAGTTGAAGCTTTCTGATGTAAAAATAATGAAAGCATCTAAAGAAGATGAAATAAAATTATGTGAGAAGGTATTAAAATATAAAGATAAGGCAATATTTGTAATAACAAATAAAATAGAGGAGTTACTTGAATATTGTTATATGGATGATGCTGTAATTTTATTCTCTGATAATGAGAGATATACTTATAAAAAGATATTATATATATGTGGACAAATAAGGAATATGAATTTAACATTACCAGAAGTTCTTTTAGTATCAAATGATATATCAGAAGATATGGAAAAAGCAAAAAATATGGCAAGAAATTTCAATAAAAAGGTATGGGAAAAACGTTTAATAGAATTGTAAAAAAACTCTTTGATGGATTGATTGAAATAATATATCCGAGAGAAAATTATTGCATTATTTGCAAGGAAGATGATTGCTTTGGAATATGTGATTCATGCAAGAGAAGTATAAAGACAATAGGCAAGGAATATCAAGATAAAATAATAAGCTATGGATATTATGGAGGAGTCTTAAAAGATTTAATACTAAGATTTAAGTACAAAAAAAATTTTACAGCAGGGGATATTTTATCAGAATTTCTAGAAGAATATATGATTAATAATATTGATTATAAAGGATATATATTAACATATATACCTTTATCAAAAAAATCCCAAAGAAACAGGGGCTTTAATCAGTGTGAATATATAGCCAAAAAAATAGCGAAAGACTTATCTATTGAAGTTTTTGAAATTCTAGTTAAACAAAGGGAAACAAAAGAGCAAAAGACTTTAAAAAAAGATGAAAGATATGAAAATATAAAAGATGCTTTTAAATTGAAGAATACAGTAACTATAAATAATGGAAAATTTATAGTTATTGACGATGTAACAACTACAGGTGCAACACTTTATGAAGCATATAAATTATTAAAAAAAAGCAAAGCAAAAGATATAAAACTCTTGACCTTAGCTAAAAGTCATATATAATACGTTTAAAGGTACTAAAATCAAGGTTTGTTTTAAAACGGCAAAAGAAACGGCAAAAATTTAAGATAAAAAAATTTTAGATATAGTATTACTAGCATTTTTCATCATATCGTCTGTAACATGACTATATGTGATTAATGTTTGTTTTACATCATGGCCAGCTATTTTTGCAATTGTTTTAAAATCTAATCCATTAGACACTAACAAAGTTATATACGTATGCCTAAGTTCATGAATTGTAATATTTCCAATTTGTCTTAATGTTGTATTGAAAGATGATGTTATTTGTAAATTATTAAATGGAGCAATTCTATTGTGAATATCTGTAGGAACAGTATTTTTATATTCCTTTAACTTTTTTATGAAAGCTGGCGATATAGGAACATATCTATACGCATTTTTATTTTTAAGGTTTCCAAAGTCATAATCATTTGAATTCGCACTTATTTTCCATTGCCTTGTGACATTTATTCTTAGGTTTATTTCGTCAATATCACTCCAAGTAAGTCCTAATATTTCGCCACATCTTAAACCAGTATTGGCTGCTATATAAGCAACTATGTAATACTTGCTTTTAAGCAGTCTTTTTGATGTTAATAGTTCATCAAGTTCAGATTTTGAAAGAGCTCTTTTAATGGTTGGAACTTTGTCTTTTGGAATTTCTAAATTTAAGTCAATTGAAAAGTTATTATCATAATTATCTATATAATAATTGAATAATAATTTAATTGACTGAAGATACTTCTTAAGTGTCGCGTGTTTTAAATCTGATACAACTTTATCAAAACATTTTCTAATGTCAATTTTCTTTAAGAAGACAACTTTTTTATTATCTAAATCAGAAAAAACTATAAATGCTATTTTATGATTTCTAACAGTATTATGTTCTCTGTATAGTTTTTCATGCTCCACAAATTCGTCACAGAGCATTTTAAAGGTTATTAAATTATAATCGGGACTTATTATACTCTTTTCACTTGCAAAACGTTTCTCGAGTTCCTTAATTGTATTTTCTATATAAGGTTTAGCTTCTTTTTGTGCCTTGAATCCCTGCTTAGATTTTTGTTTCCATTTTCCATTAGTATCTTTATAACTTATTATACATTGTAAACTCTTATCTTTTTTTCTATAAGTTACATTGTAGTCCATTTGAATCATCTCCTTCTTAGAATGTTTGTTCTTTTTATGTCTATAAATTAACCAGTTAGTTTTTAATTAACTGGAGTATTTTATTAATATTTTCTACAAATTCTCAGGATATTATCAAAATATAAAATAATATCTTCTGAAATATAATACTGTTGCTTAGCAGTATAATGTCTAATAGCTTCATTGAATAGATCTTCTGTTACATTTAGCATTTCGATAATATCATATTTATTCCCAGCACCCTGTCTAATGGCATTAACTATTTTTTCTAAACTGCATAAACTCTCTATTGTTATCCTATGAGCTAATTTTTCCTGTTTAATATTAGAAATTTTAGTTTGGTCAGTAATATCACCAACTGTAGTAAGATAATGTGCGATTTCTTCTTTTAAAATGCAAGCTTTTTCAGCATCGGTTTTGATACCTTTATCTATTGCTATTCTATTACCAACACAACGCCCTTTTCTAGTTAGTAAAGTTACTTCTTTTACTATTAAACCTAAACTGTGGGCTTCATGTAATAACTTCTCATATGCTGTCATAAAATCACCCTTTATTATTTGTTCCAAAAATTATCATCATTCATTATATCATCATCGTGTTTATATTCTTTATCAGTGAAAATACCAGTTTTATCATGTGAGGCTATTGGCATTAAATGCGGTTTTTCATCAAATTCAGTTCGAGTAGTTGTTATTAATTCAGTAATGTTATTTTTTACATCCATATATTTTGGAGTATCTATCAAATCATTGCTGTATTCTATTAATTTTTCTTTTCCTAAATTATTTAGTTTATTATAGTTTTCTAATATTATATTTTCTCTTTCTGATAAACCTTTATTTAAACAATCGCTTATTGGGTCGAATGTTCTTATATCAATGTTTAATACTTCACATATTTTTATAATTCTATCTACAGCCATCCCTCCTATACCTTTATCCAATGCGCTTGTTAATGTTGTGCTTGGTATTTCTGCTATTTTCGCAAATTCACGTATACTACTATATTTACTTAAAATAATTTGTTTGAGTTTCTCTGTTTTATCCATTTAAATAATTCCTCCTTACTAATGAAAATATATTATCACTTTATTTACGATATTTCAATAAGAATAAACGAAAAATCGTGCAAAACTATAAAATTTACATAAAAATAAAAAAATATCGTTGACTTTAAACGATATTTAGTTTAGTATAAATATGACGAACGAAATATCGTTTAAAACAAAAGGAGGTAGTTTTATGTGTAACAATTTAGAAGCTGAAATTGCTAGAAAAAAAATTAAAAAAGCTGATATTGCTGAAAAAATTGGACGTACTTATAATACTTTAAATTTAAAAATTTCTGGTAAATATCCATTTACTTATGATGAAGCATTAATAATTCATGAAAAATTTTTCCCAGAGTGTGATTTTAAAGAATTGTTTAAAAAATCTGATTTAAAAAACGTAAGTTAGAAATGAGTGGTGATTAAAATATGGAAAAAGCATTAATAAGCAGAAAGTCATTAGCTGAACGTTGGGATTATGATTCTACTAGAGCAATAGTAGATATGGAACAGGAAGGGATTATAACACGTATTCCGGAAGTGTCAAGCCCACGTTATTCTATGGAAGAAATACTCAGAATTGAGAATTTAGGTAGAGAAGTAAATCCGTTATCCCCTTTGGAACGTAAAAGATTAGAAAAGAAAATAGAACTATTGGAAAATGAGTTAAATTCATATAGAGAAAAATTTAATAGTGTAAAAATGTTATTTGCTTAAGGAGTGATTTTATGCAAAAGGATAATACCTGTAATGGGTTCCTATGTTCTCATGTTGATAGCTGTAATAAAAAAGGTGATTGCAAGGATTGCGAATTGTTCTGTGATTGCATTTCGTGTCTTTTTGACTATACCCCTAATTCTGAAAACTGCTATATGTTTTTTTAGGTGATATCTTATGGATGCTTATCTTTTAATTAAACCAATATCTATTTTATTTGTTTTATTTCTTTGTTTAATTATTTTTTTATATTTTGATTTATAAAATTTTGAGGTCAAAACTGGTCGCCTAAGCTAGTATTACCTTAGGCGACTTCTGACACATGACACAAACTAGGTTGAGGGTGCTTGTTAACTTGCTTTAGAGTTGCCACAAATTGTGACACAAGGCTTGCCACAGGGTAACTTCTGACACATGACACAATAGGGAGGGTTCTTTTTGAAAAATGATTCTTATTCTAGGAAGTGGCAGTTAACTATAAATAATCCAGTTGAAAAAGGTTTTACTCATGAGTTCCTTAAAGATAAACTTGGTGAATTTAAAAACCTTGTCTACTGGTGTATGTCTGATGAAATTGGCGAAAATGGTACTTATCATACACATTTATTTATTGCCTGTAGTGGTACTGTTAGATTCAGTACTATTAAAAATCGTTTTAATGGTGCTCATTTTGAAATGGCTAAGGGTACTTGTAAACAAAATCGAGAGTATGTTTTTAAAGAAGGTAAGTGGCAAGGGGATAAAAAAGAAGATACTAACTTAAAAGATACTCATGAAGAATATGGTGATTGTCCTGTTGAGCGCCAAGGTCAAAGAAATGATTTAATTGACTTGTATGACATGATTAAAAATGGATTAACTAATTTTGATATTCTTGAAGATAATCCAAGCTATATGCTTGAAATTGACCGTATAGAGAAGGTTCGACAAACTGTGCGTGATGAACAGTTTAAAAATACATTTAGAGAGTTGGAAGTCACTTATATATTTGGCTCTACTGGTTCTGGAAAAACAAGAGGCGTTATGGAACATTACGGATATTCTAATGTTTTTCGTGTAACTGATTATGACCATCCATTCGATTCTTATAAGGGTCAAGATGTAATTATCTTTGAAGAATTTAGGGATAGTTTAAAAATATCTGATATGCTCAATCTCCTTGATGGATATCCTCTTGAATTGCCTTGCAGATATGCAAATAAGATAGCTTGTTATACTAAGGTTTATATAATTACTAATTTAGATTTACATGACCAGTTTAAGGGTGTCCAATTAAAACATCCCGAAACATGGAAAGCATTTTTAAGACGTATTCACAAGGTTAAACAGTATACTAATAATTCTATTAATGAGTTTACAGTAGATGAATATATTAACCAATTAACTAAGGTTGATGAAGTTAGTCCGTTTGAACAAGAAAAAATGAATATGAAGGAAGTGTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP016087|666658:674913|672946_673162_+|WP_077360320.1|DBSCAN-SWA MCNNLEAEIARKKIKKADIAEKIGRTYNTLNLKISGKYPFTYDEALIIHEKFFPECDFKELFKKSDLKNVS >NZ_CP016087|666658:674913|673182_673470_+|WP_077360322.1|DBSCAN-SWA MEKALISRKSLAERWDYDSTRAIVDMEQEGIITRIPEVSSPRYSMEEILRIENLGREVNPLSPLERKRLEKKIELLENELNSYREKFNSVKMLFA >NZ_CP016087|666658:674913|671785_672244_-|WP_156875887.1|DBSCAN-SWA MTAYEKLLHEAHSLGLIVKEVTLLTRKGRCVGNRIAIDKGIKTDAEKACILKEEIAHYLTTVGDITDQTKISNIKQEKLAHRITIESLCSLEKIVNAIRQGAGNKYDIIEMLNVTEDLFNEAIRHYTAKQQYYISEDIILYFDNILRICRKY >NZ_CP016087|666658:674913|672258_672753_-|WP_077360318.1|DBSCAN-SWA MDKTEKLKQIILSKYSSIREFAKIAEIPSTTLTSALDKGIGGMAVDRIIKICEVLNIDIRTFDPISDCLNKGLSERENIILENYNKLNNLGKEKLIEYSNDLIDTPKYMDVKNNITELITTTRTEFDEKPHLMPIASHDKTGIFTDKEYKHDDDIMNDDNFWNK >NZ_CP016087|666658:674913|668907_669924_+|WP_077360312.1|DBSCAN-SWA MSNECKVTDQDLKYAFDKIDYWYKKNIKFLTIVTVPFNTSCVFSNIISKLSEDNGKALYVWGKSGENKELLSTIKEFNSSVTHSYIEKGKTNSNLTFVNYNNLFKVTELFDLIIFDDITYFSNLNSGNVREILDVCAEIGERVLLYSIEKLALVGEKFELAAYNYKKPFVEPRILTTRIDLNTDIPFTLYDYLRWFKENNHKVVIYTPTNEKLNLVYDYFCNKLKLSDVKIMKASKEDEIKLCEKVLKYKDKAIFVITNKIEELLEYCYMDDAVILFSDNERYTYKKILYICGQIRNMNLTLPEVLLVSNDISEDMEKAKNMARNFNKKVWEKRLIEL >NZ_CP016087|666658:674913|673908_674913_+|WP_077360324.1|DBSCAN-SWA MKNDSYSRKWQLTINNPVEKGFTHEFLKDKLGEFKNLVYWCMSDEIGENGTYHTHLFIACSGTVRFSTIKNRFNGAHFEMAKGTCKQNREYVFKEGKWQGDKKEDTNLKDTHEEYGDCPVERQGQRNDLIDLYDMIKNGLTNFDILEDNPSYMLEIDRIEKVRQTVRDEQFKNTFRELEVTYIFGSTGSGKTRGVMEHYGYSNVFRVTDYDHPFDSYKGQDVIIFEEFRDSLKISDMLNLLDGYPLELPCRYANKIACYTKVYIITNLDLHDQFKGVQLKHPETWKAFLRRIHKVKQYTNNSINEFTVDEYINQLTKVDEVSPFEQEKMNMKEV >NZ_CP016087|666658:674913|669896_670553_+|WP_015390757.1|DBSCAN-SWA MGKTFNRIVKKLFDGLIEIIYPRENYCIICKEDDCFGICDSCKRSIKTIGKEYQDKIISYGYYGGVLKDLILRFKYKKNFTAGDILSEFLEEYMINNIDYKGYILTYIPLSKKSQRNRGFNQCEYIAKKIAKDLSIEVFEILVKQRETKEQKTLKKDERYENIKDAFKLKNTVTINNGKFIVIDDVTTTGATLYEAYKLLKKSKAKDIKLLTLAKSHI >NZ_CP016087|666658:674913|666658_668887_+|WP_077360309.1|DBSCAN-SWA MEVLKGFVESIVFKSEDTGYVVCKIRSDNNLISAVGTVPFLKEGQNVKLTGYYTVHKQFGNQFNIQDYEELLPTSLDGIEKYLSAGVIHGIGPVTAKKIIEKFGEETLEIMENHIERLMEIEGIGEKKFQIIYESYIEQQGLKDIILYFHKHGVTNNQCIKIYKKFGPNAKQIVSNNPYILCDEISGIGFRTADRIARSIGIQNDSEFRIQSGIKYVMNQFCAAGNTFMPIKDIIEQCEENLVIAKELIEKSIYDMAAEQKIVVENINGMEAGLLLQYYYCELGVTSKIITLGLQQIQTINSDIDFEIDVFEKEQKIQFAPSQREAIIGAFNNGIEIITGGPGTGKTTIIKAIIHIYENNGMKVILGAPTGRAAKRMTESTGREAKTIHRLLEMGISEEDESVFERGESSPLDCDVIIIDEASMIDIILMQNLLKAIKLGTRLIVVGDVDQLPSVGPGNVLKDLIESEYIKVVRLKEIFRQGSESLIIVNAHRINEGKMPLLNQKDKDFFFISEEHQDRIVGLIIDLISRRLPKFNTSWDILKDMQVLTPMRKGTLGVANLNARLQEIFNPPSKDKKEKTSRDIVFREGDKVMQTKNNYTLKWININSYGENEGVGVYNGDLGFIKSIDEERKALTIIFDDERKVIYDFNFLDELDLAYATTIHKSQGSEFKVVVIPAFMGSPFLMNRNLLYTGITRAKQLVVVVGFQKALMYMINNTNSIERYSALKYRIRDIIAKDEFEE >NZ_CP016087|666658:674913|670613_671702_-|WP_077360314.1|integrase|DBSCAN-SWA MDYNVTYRKKDKSLQCIISYKDTNGKWKQKSKQGFKAQKEAKPYIENTIKELEKRFASEKSIISPDYNLITFKMLCDEFVEHEKLYREHNTVRNHKIAFIVFSDLDNKKVVFLKKIDIRKCFDKVVSDLKHATLKKYLQSIKLLFNYYIDNYDNNFSIDLNLEIPKDKVPTIKRALSKSELDELLTSKRLLKSKYYIVAYIAANTGLRCGEILGLTWSDIDEINLRINVTRQWKISANSNDYDFGNLKNKNAYRYVPISPAFIKKLKEYKNTVPTDIHNRIAPFNNLQITSSFNTTLRQIGNITIHELRHTYITLLVSNGLDFKTIAKIAGHDVKQTLITYSHVTDDMMKNASNTISKIFLS |
9 | Streptococcus_phage(33.33%) | integrase | attL 670533:670555|attR 679420:679442 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
794947 : 859775
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP016087|794947:859775|DBSCAN-SWA GCTATTTCATCCTTTGCTCATATTCTCTTTCTGCTTGAGGCTTTTTTAAATAAAATGGAGTGGAGTTTGGATCATCGAATTCACCATTTTCTATTAGTGAATATCCAATTTCGCCTAAAGCAGAAGCACGAACTAAATTAAGGTGATTAGGTGGAAAATAGCAATTTGGACAGTGTTCAATTAAATAGTCTTTGTATTTATCTACGCCATCACCTATGAAGATGACTTTTTCATTTTTAGATTTTATTATTTCTATAAGTTCATCAATATCTAAGGCTGAAAAATCTAATAATCTTTCTAAAGTTACTGGTATTTCAGAGGCAACTAAGCTTGGATGTCCTTTATATAACGAAGTATAAACACTATTCCTTAAAGCATCCATTATAGGACAAATTATTCCATCAAAATTAGAAGCGCTAAGAGCTAGGGCATCTAAACTAGATATACTTACATATGGCTTATTGCTTCCAAAGCTAAGTCCCTTTATAGTAGCCATGCCTATTCTAAGACCAGTGAAAGATCCAGGGCCTTTAGAAACTACATAGCCATCAATATCATCAATAGTTAGGTTATTAAGTTTTAGTAAATTATCAATTATATTCATTAGTATAACTGAATGTTCTTTTTTATCATTTAAAGTAATTTCTCCAAGTAATTTATGATTCTTCATTAAAGCAACAGTTGCTACTTTTGAAGATGAATCAATAGCAAGTATAATCATATTTTAAAGCTCCTTTATATAGTTATATCGATCTCCATAAGGAGTTAATATTATTTTTCTGTAATCTTCACCTTTTTCAAGGTCTTTCTTTATGCTTATATGAAGTAAATCTTGAGGTAAAATTTCTTCAATGTAATTTGCCCATTCTATAATAGACACTGCATCTGAAAATATGTAGTCATCAAATCCAATTGCATATATTTCATCAGGATCGCTTACTCGATAAACATCAAAATGGTTAAGTTTGAGCCTACCACCTTCATATTCATTAACAATTGTAAAAGTTGGACTTGTTATATTATCATTTATTCCTAAACCAAGGGCAATTCCTTTAGTAATATGTGTCTTGCCAGCACCTAAATCTCCAGTTAAACAAATTATATCACCAGCTTGTAGCAATTTACCTAAATTTATTCCTAATTGAGTAGTACTATCTACATTATAAACTTCGAATTCCATGAAAATCCTCCTTTAATGAGAGTTTAAATTATAATTCCCATCCTTATATTTTATATCAAAACAGAATAAAATCAAATTAATTAAACGAATACTAAAATATTATTATAAAATAGGCTTATATTTAATGTGAGTTTTATATAATATAAGAAAAGTAATAAATTTTTATATATTTATTATAAATTAATTGGTATAATGAACATAAGTATATCCAGAAATTAATTTACCGAATTCATGAAAAGTAATATGTGTTATTAAACTTGGAGGTGGCATACTTTGAAAAAGATTACCTTTGCAATGGTAATAATAACTATTGCATTGTCTTTTGGCATGAATTTATTTTCAGACCCGTTATTAGCAAATACAGAGAGTCATAAAACTGAAAATAGGGGAGATTTTTTAAACATACTAACGGTTAATAAACCTCAATATGATATGGTTAAAAAAATTGTGAAAGATAAAAATAATGTTGAATATATGCTTACTAATGAAAAAGATATTAGTGAGTTTAAGTATAATGAAGATGTTTTAAATAATATATCCAATATGGACTTATTTATATATTCCGGCACTTCATTTGAACCTTGGAGCAATTCTTTAATTGATGAATTGAAAAAAGGAGATTTAGGAATAATAAATTTATCTAGAGGCATAAGATTACTGAATTATTCACAAAATAATAGTAATAAAGAAAATCCTTATTATTTTGAGGGAATTAGTGAATATAAAATTGCATTATGTAATGTAAAATCAGCGATTCAAGATAGAGATCCCCAAAATAGAGATTATTATGAAGAAAATTATAATGAAGCCATAAAAGAATTTGATAATAAGATAAAGATATATAATGATAAAATTAAATCACTTAGTGACTATAAATTTATAACGTTAAATAATGATTTTGATTATTTAACTAAAGCATTAAATTTAAATACTATTCAGCTTGATAATCACGAAATAGCTGATTTTATTAAGCTTAATAATTTAGATGCTAAAAAGGTTATAATAATAGTTGATGGAGAAGCAGGAACTAAATTGAATTTATCAGGATACAATACAGTGAATTTATGGAAATATTATGGAGATATGTCTTTCGATGATTTGATTTTGTATAATATAAAAGAATTATCAAAATGGGCCCCATTAAAAGAGAATGGAACGGCTAATTCTACAGGTAAAGTGGCATAAGAAAAAAAGTGTTGCTTTATTTATAAATGTATTATATAATGGTTATTGTCTCGAAGGGGTATGGCTCAACGGTAGAGTAGTGGTCTCCAAAACCATTGGTTCTGGGTTCAAATCCTAGTGCCCCTGCCAAGAAGATTAAAGTTATAGTGTTTATATGCTATAACTTTTTTTGTTATAAGAAACAATATATGATTATAGCTATATTGAAGATGAATTTTGAATACTTTTAAATTTAAAATTTTGGAGTAATAATTTAATTAAAATTAAGTGGAATTTTATTCAGCTTTATATAATTAAGTATATGGATATCCTTATTGACATAGATATGAAACAACTATATAATTTCAATATTGATTAAACAATGGCGTTTAAAGAAGCAATTCTTTAAGTGCTATTTTTTTATACTTATTTTATTATGTGAATTTATGACTAGAATGATATTTAATAATCCTAAGGGACATATATGTTCTGATTATTAATGGGTATTGATCACGAAAGTGTTAGGGCGAAATTCATATAAATAAAAATCAATAAATAATTAGTTAATGTGTGTATTTATTGAATGCAATTTAATTAAAAGTAGATGAATAGGACAATGGTGTCAAATAAATAGTATTTTGGCCCATTGTTTCTTTTTTTATTTTCGGGGGGTGGAGATATATATTAAATGATGAAATATATAGTATAGGTGTTGATATTGGAACTTCAACAACTGAAGTTATAGTTAGCAAATTAAAGATTAAAAAAATTTTAGGTTCTTCGCTGATTAAGGAAACAGTAATAGAAGGGAAAGAAATAATATATAGGAGTCCTATTGTATTTACTCCACTTTGCAATGAAACAACTATAGATTTTATAAAGGTTAAAGATATTGTATCCGACGCTATAAAGTTAAGTGTAGTAGAAAAAGAAAAAATATCTACAGGAGCAGTTATTATAACAGGAGAAACTGCAAGAAAAGAAAATGCAATGGAAGTATCTAATAATCTTTCAGAGTATTTAGGAGATTTTGTAGTAGCAACAGCAGGTCCTAAGCTTGAAGCCTTACTTGCAGGTTTTGGTTCAGGTGCTTCAGATATATCAAGGAAGCTTAATAGAAGAATAATGAACCTTGATATTGGAGGAGGAACAACTAACGTAGCTATTTTCAATTGTGGTGAATGTGAGCAGACTTTTGCGTTAGATATTGGGGGACGACTTATAAAGTTTAATGATGAGGGTCAAATTATTTATATTTCTAATAGAATTCAATTTCTAATAAAAAGCCTTGATATAAACTTGCAGCTTGGAGAGAAGCCAGAACTAGAAGCTTTAAAGCTCATATGTGGAAAGCTAGCAGAAAGTTTATTGGAAGTATGTTGTTTGAAAGAAATTAACCAAAGCACAAAAAAGTTATTTATAAGTGATGGGTTTGAAGGGATTGAGGTTGACTATATAAGTTTTTCAGGGGGAGTTGGAGAATACGTAGGGAAAATTAATGAGAATATTAGTTTAAATGAAATAACAAAACACAACGATATAGGACAACTTTTGGGGAATTCTATAAGTGAGATGTTTGAAGAGCACAAGGAAATGTTACTAGCTCCAAAGGAGAAAATAAGGGCAACTGTAATTGGAGCAGGAAACCATTCTTTAACTATAAGCGGTGGTACAATAGCCTTTGATAAATCGGTGCTTCCATTAAAAAATATACCTATACTAAAACCTTTTTATGAGAATGAAAACTTAAATGATATATATGTTCAAGGCATGAAAAAACTTGATATGTATGAAGATATACCAATTGCAGTTTCACTTAAAGGCCCTAAAAGTCCAACTTATGAAGAAATTAAATTAATTGGTCAGGAGATAATTAAATTATTCAAAAAAATTAAAGGACCAATAATTGTAGTTTTAGAAAATGATTTTGCAAAAGCTTTAGGACAAATAATTTCTCTAAATTTAGAAGAAAAAAGAGAAGTTATATGTATAGACAAGATATCAACAAGCAATGGTGATTATATTGACATTGGCCTGCCAATAGGAGATGCAATCCCAGTAGTTATAAAGACTCTAATATATAGCACTTAAAGTCCTATATTTCTATAATAGTTACCTAAAAATAAGAAAATCTTAAATTAATTATATTTATATATTGTAATGACAGTTAGCAATTATACAATGTTACCAGTGTCTAAGCCATTATTTTCTAAATAAATTTTATAATCTGTAAGCTGTAAATAGCAAACTGTAAATGTGAAGCTATGCAAGTTGTAAGGGATGATGAAATTTTATCCAACTGTGAACTGTAAATGGTTAACTGTTAACTGAATTAAGGGAGTGGTTAAAATGAATAATGAATTAAAAAAGACACTTAAACCAATACAACTTTGGAGCATAATAGTTGGAATGGTTATATCAGGAATGTATTGTGGGTGGAATAATGCTTTAGATTTTACAAGTCCAGTTGGATTTATTATAGCAATTTTAATTGTTACAGTTTTTTATACTACATTTATGTTTAGCTATGCGGAGCTTTCTACTGCAATTCCTCATGCTGGGGGAGCTTCAGAATATGCTTCCAGATCACTTGGTAAGTTTGGTGGATTTATTGCTGGATTTTCATGTTTAGTAGAATTTTTGTTTGCAACACCAG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60 | Clostridium_phage(80.65%) | plate,transposase,tail,terminase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1240997 : 1250745
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP016087|1240997:1250745|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP016087|1240997:1250745|1240997_1244744_+|WP_077361019.1|DBSCAN-SWA MLDIRSVFVEKKNGFNVEAQSLLNDFKENLGIFALEDVRLVNKYIISDISEEYYKKALHTIFSEATVDVVYESKLPVNEGEVAFGVEYLPGQYDQRADSASECLALLTAEDKVEIKSAKILILKGNLSQEDIEKIKKYYINPVDSREVDIDSKELSVPSSIPNDVQILEGFINKTLEQLQAFHSEQGLAMSIDDLLMIQDYFKEEKRDPSITEIKVIDTYWSDHCRHTTFSTILEDVQIENNIYTAPIKASYKEYLKSREYVYGEKEKSKTLMDMAVIAMKELRKRGKLDDLDISEEINACSINVRIETDNGLEDYLVMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCLGGAIRDPLSGRTYVYQAMRVTGAADPTVPVKDTLEGKLPQRKITLGAAHGYSSYGNQIGLATGQVQEVYHPNYAAKRMEVGAVIAAAPKENVVREEPKLGDVIILLGGRTGRDGVGGATGSSKEHTVDSINECGAEVQKGNAPTERKLQRLFRNATVAKMIKRCNDFGAGGVSVAIGELCRGLDIDLDKVPKKYEGLDGTELAVSESQERMAVVVTKENADEFIRLSNEENLEATLVANVTDTDRLRLFWRGKNIVDLRRTFLDTNGATQKTNVKVTAPLAYPYTVGDVKVNEEWINNLKKLNISSQQGLSERFDATIGHGTVLMPFGGKYAKTPAEGMAAKIPVLNGESSDATLMTFGFNPELGTWSPYHMAYYAVIESITKLAAMGGDYKKARLTFQEYFEKLGSEASRWGKPFAALLGAYEAQMAFETAAIGGKDSMSGSFGDLDVPPTLVSFAVGVEKAKHVISPEFKEAGSSLVLLQTEKLDDGTINIEKLKKNLEVLHKLIQDEKVISASAIKYGGVSEAITKMSLGNRIGAELDNLTKDELFGFNYGTILLEVKNSINVKDEFKESLYKEVGKTIASAFIISKEYDLNLDIAALEKTYEEKLKSVFKIKTKDVQEKVETVLYDKKSTLSPKVKVTKPKVVIPVFPGNNCEYDCARAFEKEGAEVTQVVFRNITKEALNESIERLAKEISTAQILMVPGGFSAGDEPDGSGKFIANALRNEQISNSVMELLKNRDGLALGICNGFQALIKLGLVPYGEIVDIKEDMATLTYNNINRHMSSIISTKVVSNKSPWFSEVNLGDIHSVAISHGEGRFVAPESLIKELIANGQVATQYVDFDGNVSLNMPFNPNGSMYGIEGITSPDGRVLGKMAHSERIGTDLYRNIPGDFDQKIFKAGVGYFR >NZ_CP016087|1240997:1250745|1246181_1247612_+|WP_015391250.1|DBSCAN-SWA MNNSNFELIMDPSNDKFKDECGVFGVYANQPIDVATMTYYGLYALQHRGQESAGIAVADGEKIDIHKGLGLITEAFKPEDLSKLQGHIAVGHVRYSTAGGKGIENAQPIVSTSKIGSIAMAHNGNLVNDDVIRELLEDAGQIFHTSTDSEVIACLIARSAKKGLAKAVVDAMSAIRGSFALTIMSKDKLIGARDPHGIRPLSLGKIEEGYILTSESCALDAIGAELIRDIEPGEIVIIDADGIQSYRYSENTKCQTCAFEYIYFARPDSRIDGLEVHTTRVKAGEQLFKEHPLDADIVIAVPDSGIPAAIGYAKASGIPFDTGFIKNRYVGRTFISPSQEIRERAVAVKLNPLKVNLEGKRVILIDDSIVRGTTSKHLIESLRRAGVKEVNFLIASPSVKYPCYFGIDTPYRSELVAANHTVEEIRDMIGADYLGYLSEEGVYRSCGDRDGFCMGCFNGIYPVATPIEEISKDLER >NZ_CP016087|1240997:1250745|1245294_1246002_+|WP_077361021.1|DBSCAN-SWA MEKLEMMYEGKAKKIYATDKADEVIIYYKDDATAFNGEKKGQIEDKGVMNNEITAILFELLEKKGVKTHFIKKLNDREQLCKKVEIVPLEVIVRNVAAGSMAKRLGIEEGYKLKTTVFEFSYKDDELGDPLINSYHAVAIGAATFEEIDVILKMTATVNDVLKEVFAAQNINLIDFKIEFGRCADGTIVLADEISPDTCRFWDATTGEKLDKDRFRRDLGNVKDAYVEILKRISK >NZ_CP016087|1240997:1250745|1248610_1249219_+|WP_077361025.1|DBSCAN-SWA MFKIAVLVSGGGTDLQSVIDAVENKELNVKIEMVIGSRDNIYALERAKKHDIETFVISRKEYREKASDKILELTKGKVDLIVLAGFLAILDGDILKEFDNKIINIHPSLIPSFCGAGMYGLKVHEAVIKSGVKFSGCTVHFVNSEVDGGAILLQEVVPVYFEDDAETLQKRILEKEHLILPEAIRLISEGKVEFVNGKAKIS >NZ_CP016087|1240997:1250745|1247621_1248623_+|WP_077361023.1|DBSCAN-SWA MITYKEAGVNIEEGYRSVKLIKEYAAKTMSQYVLNGLGSFAGMVELPSGYEKPVLVSGTDGVGTKLEIAFKNKKYDTVGIDCVAMCVNDILCHGAKPLFFLDYIACGKLEAEVASDLVKGISDGCIDSDCALIGGETAEMPGFYSEGEYDMAGFAVGIADKDKIINGSNIKEGDKLIGIASSGVHSNGYSLIRKVFPDLNEEFKGEEVWKTLITPTKIYVKPVLKLLESYEIKGMAHVTGGGFIENVPRMFNGGNFTAVINKDSYPLPAIFERIIEKGVDKEHMYNTFNMGIGFVLAVNEKDVAPIIKELVEMGEKAYEIGYVTSGGEGICLK >NZ_CP016087|1240997:1250745|1244815_1245295_+|WP_015391248.1|DBSCAN-SWA MQVAIFFGSKSDTEVMRGAANALKEFGIEYKAFVLSAHRVPEKLEETLEEIQAQGCQVIIAGAGLAAHLPGVIASKTILPVIGVPVKAALEGVDALYSIVQMPKSIPVATVGINNSYNAGMLAVQMLSVNNNELKNKLKEFRLNMKKKFIEENAEGVEL >NZ_CP016087|1240997:1250745|1249236_1250745_+|WP_015391253.1|DBSCAN-SWA MKKRALISVFDKDGVLDFAKFLVSKDVEIVSTGGTYKYLKENGVEVIEINEVTNFPEMLDGRVKTLHPLVHAGILAIRDNEEHMNTLKGRDIHTIDYVVVNLYPFFEKVKEDLEFEEKVEFIDIGGPTMLRAAAKNFQDVVVISDKNDYNVVMEEIKTNGETSLKTKKRLAGKVFNLMSAYDGAISNFLLADDEEEYPEYLSVSYKKMQGLRYGENSHQTAAVYSATMLDGAMNTFEVLNGKELSYNNFKDCDIAWKCANEFDEPACCALKHNTPCGVAVGKDSYEAYMKAYEVDPTSIFGGIIGFNRKVDKKTAEEMVKIFLEVIAAPEYDEDALEVLKTKKNLRVLKFNNKPKADKYMVTVDGAMLIQEEDNKLIEEIKVVTDKKPTDEEMKDLLFGMKVVKYVKSNAIVVAHNGIALGIGGGQVNRIWPTEDALKRGKGATILASDAYFPFGDVAETAAKAGIKAIIQPGGSIRDQESIDVCNKYGVAMVFTGYRHFKH |
7 | Cyanophage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
1288486 : 1297674
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP016087|1288486:1297674|DBSCAN-SWA AATGTATTTATTGGAGTTAAAGAATATTAATAAGTACTATAAATTAAATGGAAACAAAAAAGTTTATGCATTAAATAATATCAACTTGAATTTTCATAAAGGTGAATTAGTATCTGTTATTGGGGAATCAGGTAGTGGAAAATCAACATTAATGAATTTAATAGGAGGATTAGATTCTGAGTATTCTGGAGAAGTAATTGTAGATGGAAAAAATATAAAAAAATATGAAATAAAAGAACTTGATAAATATAGAAAAAATACAGTTGGATTTATTTTTCAAAGCTTTAATTTAATATCACATCTATCTATTTTAGATAATGTAACAATAGCTATGACTTTATCTAATGTTAGAAAAAAGGAACGAGTTACACGTGCAAAAGAAATATTGAATGAACTTGGATTAATAAATCACATATATAAGAAGCCCAACCAATTATCTGGTGGACAAAAACAAAGGGTAGCTATTGCAAGAGCTTTAGTTAATGATCCAGAAATGATTATTGCTGATGAGCCTACAGGCAGTTTAGATTCTAAGACATCAATGAAGGTTTTGGAAATACTTAGGAAGATTGCTGAAAACGGTAAACTTGTGATTATGGTTACTCACTCTGAGAAGGTGGCTTCTTACTCCAGCAGAGTGATTAGTATAGCAGATGGAATGATAATTGAAGATAGAGAAATTTTAAAATTAGAAAGCAGCGTTAATGAAGAAAAAGTAAAGGTTAATAAAAAAGGCCAAAAATTAAATATTATTTCTGCTATAATGTTAGCTATTGTTAATATGAAAAGAAAGTTAATACGCAATATACTTATTTCTATAGGAGCTAGTATTGGAATAATGGGAGTTATTTTAATGTTATCCTTTGGAAACGGAGTTAAAGCTTATTTTAATAATACAATGAATAGTTATGTAAATCCTTTGGTAATAGAAGTTAATATGTCCAGTGATGATGCAGAAACGGTTAACTTTGATATTGCTACTGTACAAAAACCAAATATTAATACACAAAAAACATTCGAAGAAGAAGATATGCAGGCTTTATCAAAAATAGAAAATGTATCTTCAATAGAAAAAGGCTATAATATAATTTCTATGGGAGTTAATTCCCTAACTTATAATAATAAAACAAGCAATTTAATGAGATTATCAACGGTGTCATCAAACATAATAAACTCCAATATTAAAGAGGGAGCATTGCCTAAAGGTGGAGAAATATTAATTAATAAGTCTGCAAGTGACAAACTTGGAGATGATGTTATTGGTAAAAAAATTAGTATGCATATATTGGTCAATCAAAAAATCATAGATAAACAATTTGTTGTCAGCGGAATATATACTGCGGTTGGTGGGGATTTAACCTCAATAATGAAATCTGCTTTTTTGAATTACTCAGATTTAGAAAACTTGTATTCAGAAAATAAATATACATTAAAACCAAATGCAGTTTATATTAATACGAGTAGTGAAAAATATACAACTGCAATTAAAGATAAAGTTAGGGAAATGGGATATTCAGTTTCTTCGCAAGAGGAAATGATGAAACTATTTGACCAAATGATAAGTATTTTAACATATGTACTATCAGGGATTGCAGCAATATCTTTGGTAGTATCAGCAATTATGATAATAGTAGTTATGTATATTAGCGTTGTAGAAAGAACAAAAGAAATAGGGATAATTAAAGCCATTGGTGCAAGGAGAAAAGATATAAGGAGAATTTTTGTTTGTGAAGCATTTTTAATTGGAGTTTTTAGTGGTATTATAGGACTCGCTTTTGCATTCTTATTTATGAGGGGTATAAATATCATCTCAAATAAATTGTTTGGGATTAAATTAGTTTTAATAAAAAAGTCCTATGAAGTATTTGGAATAGTAGTAAGTATAATTATAAGTACAATGTCGGGATTGTTACCAGCCAATAAAGCTGCTAAGTTAGATCCTGTGGAATCGTTAAGAAGAGAGTAGAGATATGTCATGATGACATTTGCAGTATATATGATAGTTTTTAGATAGGGGTTAGGCATAAGAATAATTTAATTAGCTTAAATTAGGCTAGGAGCTATATTAAAAAAGAAATAGCTTCTATTTTTTTGAAGAAAAATAAATAATACTACAAATGACAAAAATATGGCTTTTAAATGATAGGATTACTAATGTATCCAGTAAAAATTACTCGAAAAAATTAATAATTCTAGATATATGTTAATTGAATTTGATATGTTTAAATTTGATGAAAATCAGAATGATTTTTTGTTTTAGAAAAGCAGCATATTAGTTATAATAAATGGAGAAGTAGTAAAACGAAGATAAGAATAGAAAATTGGAAATAATATCATTGATTTTGAATATATATTTATAGATATAAATATATACGGGGTGTAGAAATGGGGAATTTCAAATTTATAAAGTCTGAAATAGATGGTGCTTATATAGTAGAGCCTAAAGTTTTTGGAGATGAAAGAGGCTATTTTATGGAAGTCTATAATGAGGAAGCTTTTAAAGAAGCTGGACTTAATATGACCTTTGTCCAAGATAATGAATCAAAATCAAGTAAGGGTGTACTTCGTGGACTTCATTTTCAAAGGAAGCATAGTCAGGGAAAGCTTGTTAGAGTGACTAAAGGTGAAGTTTTTGATGTAGCTGTTGATTTGAGAATTGGTTCTGAAACTTATGGTAAATGGGAAGCAGTTATTTTAAGTGATGAAAATAAAAAACAATTTTATATTCCCAAAGGTTTTGCACATGGCTTTCTGGTATTATCAGAAGAGGCTGTATTTAACTATAAATGCACGGATTTTTATGCTGCTGAATATGATAGTGGGGTTATGTGGAATGATCCAGATATAGACATTAAATGGCCTTTAGATAGAATACAGAATATAATTTTATCTGAAAAGGACAAAAAGCATCCAAGCTTAAAAGAATTAGATTTGAGCAGATATTCAGATTATTATATTTGTCCAAAAGAGGTGTGATTACAGATGAAAATACTAATTACAGGTGCAAAAGGGCAGCTGGGTAATGAACTTCAAGATATAATAAATAGTGGAAAAGCCGAAATTGGTCAAGTTTCAGAGTTAATTATAAAATCAGAAGTTATTCCATTAGATATAGATGAATTGGATATAACTAATTTGGAAATGGTTAAAGATAAATTAAATAAATTAAAACCAGATGTAATAATTAATTGTGCAGCGGCTACTAATGTTGATGGTTGTGAAAATAATCAAGATTTTGCATTTAAGGTTAATTCAATTGGCCCAAGAAATTTAGCTATAGTATCTGAAAAAATAGGTGCTAAATTAGTTCAGGTATCAACTGATTATGTATTTAGCGGAGTTGGAAACAAGCCATTAACTGAATATGATTTAACAACTCCATATAGTGTTTATGGAAAAACTAAGCTACTCGGAGAAAATTATGTAAGAGAGTTTTCTTCAAAATATTTTATAGTTAGAACTGCATGGTTGTATGGACATATAGGCAATAATTTTGTTTATACTATGAGAAGATTAGCTAAAGAAAAGGATATGATAACTGTTGTAAATGACCAGAAAGGAAATCCGACGTATGCCAATGATTTAGCCTATCATATATTAAAACTTTTACAGACAGAAGAATATGGAATATATCATTGTACTGGTAAAGGTGAGTGCACCTGGTATGACTTTGCGAAAATGATAATTGAATTGTCAGGAGAAAATTGTAAAGTTACAGCATGTACATCAGAAGAATATAAAACTTTAGCAAAGAGGCCTAAATATTCATCACTTGATAATGTGATGCTTAGATATACTGTTGGTGATGAAATGAGAGAATGGAAGGATGCAATAAAATCTTTTATTAATAAGATAGATAGCAATTATAATTATCGGGATGGAGTAAGAGAATGAAGATATATTTAGTTACAGGTGGAGCAGGATTTATAGGTTCGAATTTCATTTTATATATGTTAACAAAATATAAAGATATTAAAATAATAAATTTAGATAAGTTAACTTATGCAGGAAACTTAGAGAATCTTAAATCTATTGAAAATGATAAGAGATATACATTTGTTCAAGGAGATATTTGTGATAAAGATTTAGTTTCAAGTCTTTTTAAAATTAATAATATAAATTATGTTGTTCATTTTGCAGCAGAATCTCATGTTGACAGAAGTATAAAAGAGCCGGAAATATTTGCTAAAACAAATGTATTAGGAACTGTAAATATGCTCAATTGTGCAAAAACTGCTTGGGAAAGTAAAGAAGGATTCATTGATGGAGTGAAATTTCTTCATGTATCAACAGATGAAGTTTATGGTTCTTTAGGAGATGAAGGCTTTTTTGTGGAAACAACACCAATAGATCCTCATAGTCCATATTCATCAAGCAAAGCAAGTTCAGACTTAATGGTTAAATCTTATTATGATACTTATAAAATGCCAGTTAATATAACAAGATGTTCAAATAACTATGGACCATTTCAATTTCCGGAGAAGTTAATACCATTATTAATCAATAACTGTTTGCAGCATAAAGATCTTCCTGTATATGGAGATGGATTAAATATAAGAGATTGGTTGTTTGTAGAAGACCATGCGAAAGCGATTGATATGGTTATTAATGGAGGTAGACTTGGAGAAGTTTATAATGTTGGAGGCCATAATGAAAGAACAAATATACAAATAGTAAAGACAGTAATTGAATATATAAATAAAAATGTAGATAAAAATGTTACTGAAAGTTTAATAAAATATATTGAAGATAGAAAAGGTCATGATAGAAGATATGGAATAGCTCCAGATAAGATAAAGACAGAACTTGGCTGGTATCCAGAAACTAGTTTTGAAGTTGGGATTAAAAAGACTATTAAGTGGTATTTAGATAATTCAAAATGGATGAAAAATGTAACTTCTGGAGAATATCAAAAGTATTATGATAAGATGTACAACTAATTTGTGGGGGGGGGCTATAGATTGGTTCGTATTAAGTTAAAAATTTATAGATATATAATCTAAGAGGTTCAAAGAAAAAAGTAGTTATTTAAAAATTGTAGTGAAAAATTCTAAGTATGAGTATTGCACCGAATTAGATTTGGTGCAATTTTTATATAATAATTATGTGAAAAGGTCTTTGTTTTAGTTCTAATTATCATGTGATGTAGTATAATTTGAAGTAATAGTTTCAAGAGGGAAAGAGGAATCAATATTGAGAAAAATAATTATTTTGTTATGTTTGTTTTGGATGGGATTTATATTCTACATGTCAAGCAATAATGGACAAATATCTCATGAACAAAGTACTAAGGTGGTTAATATAATTGAAGATTCTAAATCAAAATTAGAAAATAAATCAAATAATCAGGCTAAAGCTGAAAAAGAAAATTTAGCTTTTTTAGATATACTTATTAGAAAAAATGCACATGGATTTCTATATATGGTATTAGCAATATTAGTAAGTGCCTCATTTTTTTCTTATAAAAAATTAGGAAGAGATGCAATAGTGTATATACTTTTTATATGTCAATTTTATGCTATTACTGATGAATTTCACCAAGCTTTTGTTCCAGGAAGAACTTCTTTAGTAAGCGATGTTTTAGTTGATTTTATAGGGAGTTTAATAGGCTTGATAATTTTTTATTTGATTTATTATAAAATATATAAAGCTAGGATTAGATCTAGATTAAGCACGGAGAAATTATAGTTTTCTACTGCTTTTTTATTTTTCTAAATCTGTTATAATAATAGTTAGCAAATCAAGAAGGTATGATTATATATTATTAAAGACAAAGAGGTGCAAGCAATGCGACCACTAGCAGATTTGATGCGCCCAAATAAATTGGAAGATTTTGCGGGACAAAAGCATATTTTAAGTGAAGGGAAGCCGTTATATAATTTGATTGAGAGTAAGAATATATGTAATTGTATATTTTATGGGCCTCCTGGAACTGGTAAAACAACTTTAGCTAACATAATGGCTAATTATGTAGATAAGAAATTCTACAAATTAAATGCAACGACAGCATCTGTGAAAGATATTCAAGAAATTACGGATAATATTAATAATTTACTAAATTATAATGGAGTAGTTCTATACATAGATGAACTTCAGCATTTTAATAAAAAACAACAGCAGGCATTATTAGAATTTATTGAAGATGGAAGAATAACGCTGATTGCAAGTACTACTGAAAATCCTTATTTCGTTATACACAAAGCTATAATAAGCAGATGTAATATATTCTCATTTAAGCCATTAAATACTTCTGATATTATTATTGGACTTGAAAATTCTATTAAAAAGTTAACTTCAGAAGGAATAAAAATAGAATATTCTAATGAAGCTCTTACATATATTGCTGAGATATCTCAAGGTGATTATAGAAAAGCATATAATATTTTAGAAATTGCTATAAATTCGCAGGTAAAGAACGTTAGAGTGATTTCAAGTGAATATATAGAGAGCCTAGGACAGTCCAATATGAGGGCCGATTCTAGTGGGGATGAGTTTTATAACTTGTTAAGTGCCCTTCAAAAGAGTATTAGGGGAAGTGATGCTGATGCATCGATTCATTATTTAGCACGACTTATCAAAAGTGGTAATTTAACTTCAATTATAAGAAGGATTTCTGTTATTGCAGCTGAAGATATAGGCCTTGCTTTTCCAACAGCACTGTCTGTTGTCAATTCGGGAATAGAACTAGCTTTAAAGGTAGGATTGCCAGAAGCAAGAATAATACTTTCTGAAATAGTAATTTATTTAGCAACATTACCTAAATCAAATAGTGCAATTTTAGCTATAGATGCAGCTATGAATGATTTGGAAAATATTAATTTTGGAGATGTTCCTATGCATTTAAAAGATGCACATTATATGGGAGCAGCTAATCTTGGAGTAGGTGGATATAAATATCCACATAATTATAATGATCATTATGTAAAACAAGAATATTTGCCAAAAGAATTAGAAGGAAGAATATATTATAATGGGCAGAATAATAAATACGAAGAAAGTATAAAAAATTATTGGGAAAAAATTAAAAAGTAATAATTATCGTTTGACAAAAGCCGAGTAATTTGGTAAGATATAAACGAAATTAATATATTTTATATATAAAGAGGTGAAAGAATGAAACTTTCAACTAAAGGAAGATACGGGGTTAGAGCCATGGTAGAGTTAGCAGCTAATTATGGTGGAGCACCGGTTTCCATAAAGGCTATATCAAAAAAGGAAAATCTTTCTGAATATTATTTAGAACAATTATTTAGCCCGCTTAGGCGTGCTAATGTTATAAGAAGTATAAGAGGTGCACAGGGTGGATACGTTTTATGCAAACCTCCTAGGGAAATAACTGTTGGAGATATAATGACTATTTTGGAAGGTCCTGTTGAAATAGCGGATTGTATTGATGGAGTTGAATGCGATAGTTCAGATTGCTGTGCTACAAAAGCAGTATGGGAAAAAATAAAAAATAGTATAGATAGTGTTATGAATTCAATAACATTACAAGATATACTTGATGATCACGAAGCTCTTCAAAAGAAAAATAGTGGCATTAAGATTGCAGATAGGAGTGAATAATAATGAAAAATGTATATATGGACTATTCAGCTACAACTTATGTTAAACCAGAAGTTTTAGAAGAAATGCTTCCTTATTTTACACAAAAGTTTGGAAATCCATCTTCATTTTATGGAATATCAAGAGAAACTAAAAAAGCTATAGATAAAGCAAGAGAACAAATAGCAAAAGCATTGAATTGTTTACCAGAAGAAGTGTATTTTACTGGTGGTGGATCTGAAGCAGATAACTGGGCGATAAAAGGAATTGCTTCAGCCCATAGAAATAAAGGAAATCACATTATTACAACTAAAATAGAGCATCATGCAGTTCTTCATACTTGTGAATACTTAGAGAAGAACGGTTTTGAAGTTACATATTTAGATGTTGATGAAGAAGGTTTTGTTAGATTAGAAGATTTAAAAAATGCTATAACTGATAAAACAATTTTAGTCAGCATTATGTTTGCGAATAATGAAATTGGAACAATTGAGCCAATAAAGGAAATCGGAGAAATCTGTAGGGAAAAGAAAATTTTCTTCCATACTGATGCAGTTCAAGCTATTGGAAATGTACCTGTAGATGTTAAAGAAATGAACATTGATATGTTGTCACTAGCAGGTCATAAGCTTTATGGACCAAAAGGAATTGGAGTTTTATACATCAAAAAGGGAATTAAAATTGATAATTTAATTCATGGTGGAGCTCAAGAAAGAAATAGAAGAGCAGGAACAGAAAATATCGCATCTATTGTAGGTCTTGGTAAGGCAGTTGAGCTTGTAACAGAAAATTTAGAAGAACATATGAAAAAATTAACAGCTCTTAGAGATAAGCTTATAAATGGACTTTTAGAAATTCCTTATACAAAATTAAATGGACCAAGAGGAGATAAGAGATTACCTGGAAATGCAAATGTATGTTTCAGATTTATTGAAGGTGAATCAATTCTGTTATCTCTTGATTTTAAAGGTGTTTGTGCATCAAGTGGTAGTGCTTGTACATCAGGATCCTTAGATCCATCGCATGTATTACTTGCAATTGGACTTCCACATGAAATTGCTCATGGATCATTAAGACTTTCTATGGGTGAAGGATCAACTGAAGAAGATGTAGATTATGTTCTTGAAGTTGTACCACCAATTATTGAAAGATTAAGAAATATGTCACCATTATGGGATGACTTTTTAAAGAAGGGAGAAAAATAAGATGATATATAGTGAAAAAGTAATGGAACATTTCCAAAACCCAAGAAACGTTGGAGAAATAGAAGATGCAAATGGTGTAGGTGAAGTAGGAAACGCCAAGTGTGGAGATATAATGAAGATTTATTTAAAGGTTGAAGATAACATTATTAAAGATGTTAAATTTAAGACTTTTGGATGTGGTTCAGCTATTGCTTCATCATCAATGGCAACTGAATTAATCAAAGGAAAGACTTTAGATGAAGCTTGGGAATTAACAAATAAGGCTGTTGCAGAAGCATTAGATGGTCTTCCACCAGTAAAAATGCATTGCTCTGTACTTGCAGAAGAAGCAATCCACAAAGCTATAAATGATTATAGAGCAAATAATGGATTAGAAGTTATACCAATGGAAGAACATAGCGATGAAGATTTACATGCTGCTGTTCATGGCGAAGAGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP016087|1288486:1297674|1294272_1295517_+|WP_077361078.1|DBSCAN-SWA MRPLADLMRPNKLEDFAGQKHILSEGKPLYNLIESKNICNCIFYGPPGTGKTTLANIMANYVDKKFYKLNATTASVKDIQEITDNINNLLNYNGVVLYIDELQHFNKKQQQALLEFIEDGRITLIASTTENPYFVIHKAIISRCNIFSFKPLNTSDIIIGLENSIKKLTSEGIKIEYSNEALTYIAEISQGDYRKAYNILEIAINSQVKNVRVISSEYIESLGQSNMRADSSGDEFYNLLSALQKSIRGSDADASIHYLARLIKSGNLTSIIRRISVIAAEDIGLAFPTALSVVNSGIELALKVGLPEARIILSEIVIYLATLPKSNSAILAIDAAMNDLENINFGDVPMHLKDAHYMGAANLGVGGYKYPHNYNDHYVKQEYLPKELEGRIYYNGQNNKYEESIKNYWEKIKK >NZ_CP016087|1288486:1297674|1290870_1291461_+|WP_077361070.1|DBSCAN-SWA MGNFKFIKSEIDGAYIVEPKVFGDERGYFMEVYNEEAFKEAGLNMTFVQDNESKSSKGVLRGLHFQRKHSQGKLVRVTKGEVFDVAVDLRIGSETYGKWEAVILSDENKKQFYIPKGFAHGFLVLSEEAVFNYKCTDFYAAEYDSGVMWNDPDIDIKWPLDRIQNIILSEKDKKHPSLKELDLSRYSDYYICPKEV >NZ_CP016087|1288486:1297674|1288486_1290451_+|WP_077361069.1|DBSCAN-SWA MYLLELKNINKYYKLNGNKKVYALNNINLNFHKGELVSVIGESGSGKSTLMNLIGGLDSEYSGEVIVDGKNIKKYEIKELDKYRKNTVGFIFQSFNLISHLSILDNVTIAMTLSNVRKKERVTRAKEILNELGLINHIYKKPNQLSGGQKQRVAIARALVNDPEMIIADEPTGSLDSKTSMKVLEILRKIAENGKLVIMVTHSEKVASYSSRVISIADGMIIEDREILKLESSVNEEKVKVNKKGQKLNIISAIMLAIVNMKRKLIRNILISIGASIGIMGVILMLSFGNGVKAYFNNTMNSYVNPLVIEVNMSSDDAETVNFDIATVQKPNINTQKTFEEEDMQALSKIENVSSIEKGYNIISMGVNSLTYNNKTSNLMRLSTVSSNIINSNIKEGALPKGGEILINKSASDKLGDDVIGKKISMHILVNQKIIDKQFVVSGIYTAVGGDLTSIMKSAFLNYSDLENLYSENKYTLKPNAVYINTSSEKYTTAIKDKVREMGYSVSSQEEMMKLFDQMISILTYVLSGIAAISLVVSAIMIIVVMYISVVERTKEIGIIKAIGARRKDIRRIFVCEAFLIGVFSGIIGLAFAFLFMRGINIISNKLFGIKLVLIKKSYEVFGIVVSIIISTMSGLLPANKAAKLDPVESLRRE >NZ_CP016087|1288486:1297674|1292375_1293425_+|WP_077361074.1|DBSCAN-SWA MKIYLVTGGAGFIGSNFILYMLTKYKDIKIINLDKLTYAGNLENLKSIENDKRYTFVQGDICDKDLVSSLFKINNINYVVHFAAESHVDRSIKEPEIFAKTNVLGTVNMLNCAKTAWESKEGFIDGVKFLHVSTDEVYGSLGDEGFFVETTPIDPHSPYSSSKASSDLMVKSYYDTYKMPVNITRCSNNYGPFQFPEKLIPLLINNCLQHKDLPVYGDGLNIRDWLFVEDHAKAIDMVINGGRLGEVYNVGGHNERTNIQIVKTVIEYINKNVDKNVTESLIKYIEDRKGHDRRYGIAPDKIKTELGWYPETSFEVGIKKTIKWYLDNSKWMKNVTSGEYQKYYDKMYN >NZ_CP016087|1288486:1297674|1295598_1296051_+|WP_077361080.1|DBSCAN-SWA MKLSTKGRYGVRAMVELAANYGGAPVSIKAISKKENLSEYYLEQLFSPLRRANVIRSIRGAQGGYVLCKPPREITVGDIMTILEGPVEIADCIDGVECDSSDCCATKAVWEKIKNSIDSVMNSITLQDILDDHEALQKKNSGIKIADRSE >NZ_CP016087|1288486:1297674|1296053_1297235_+|WP_077361082.1|DBSCAN-SWA MKNVYMDYSATTYVKPEVLEEMLPYFTQKFGNPSSFYGISRETKKAIDKAREQIAKALNCLPEEVYFTGGGSEADNWAIKGIASAHRNKGNHIITTKIEHHAVLHTCEYLEKNGFEVTYLDVDEEGFVRLEDLKNAITDKTILVSIMFANNEIGTIEPIKEIGEICREKKIFFHTDAVQAIGNVPVDVKEMNIDMLSLAGHKLYGPKGIGVLYIKKGIKIDNLIHGGAQERNRRAGTENIASIVGLGKAVELVTENLEEHMKKLTALRDKLINGLLEIPYTKLNGPRGDKRLPGNANVCFRFIEGESILLSLDFKGVCASSGSACTSGSLDPSHVLLAIGLPHEIAHGSLRLSMGEGSTEEDVDYVLEVVPPIIERLRNMSPLWDDFLKKGEK >NZ_CP016087|1288486:1297674|1297236_1297674_+|WP_077361084.1|DBSCAN-SWA MIYSEKVMEHFQNPRNVGEIEDANGVGEVGNAKCGDIMKIYLKVEDNIIKDVKFKTFGCGSAIASSSMATELIKGKTLDEAWELTNKAVAEALDGLPPVKMHCSVLAEEAIHKAINDYRANNGLEVIPMEEHSDEDLHAAVHGEE >NZ_CP016087|1288486:1297674|1291467_1292379_+|WP_077361072.1|DBSCAN-SWA MKILITGAKGQLGNELQDIINSGKAEIGQVSELIIKSEVIPLDIDELDITNLEMVKDKLNKLKPDVIINCAAATNVDGCENNQDFAFKVNSIGPRNLAIVSEKIGAKLVQVSTDYVFSGVGNKPLTEYDLTTPYSVYGKTKLLGENYVREFSSKYFIVRTAWLYGHIGNNFVYTMRRLAKEKDMITVVNDQKGNPTYANDLAYHILKLLQTEEYGIYHCTGKGECTWYDFAKMIIELSGENCKVTACTSEEYKTLAKRPKYSSLDNVMLRYTVGDEMREWKDAIKSFINKIDSNYNYRDGVRE >NZ_CP016087|1288486:1297674|1293678_1294173_+|WP_077361076.1|DBSCAN-SWA MRKIIILLCLFWMGFIFYMSSNNGQISHEQSTKVVNIIEDSKSKLENKSNNQAKAEKENLAFLDILIRKNAHGFLYMVLAILVSASFFSYKKLGRDAIVYILFICQFYAITDEFHQAFVPGRTSLVSDVLVDFIGSLIGLIIFYLIYYKIYKARIRSRLSTEKL |
9 | Planktothrix_phage(14.29%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
1425703 : 1435663
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP016087|1425703:1435663|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP016087|1425703:1435663|1427510_1428704_+|WP_077361182.1|DBSCAN-SWA MKFNSIEEGIKDIQEGKMVIIVDDEGRENEGDLVIPAEVVTGENINFMIKYARGLVCAPVDEEIAAKLCLNPMVEKNTDNHETAFTVAVDHKDTTTGISAFERAYTINKLVDSNERDSFRRPGHVFPLIAKRDGVLERRGHTEAAVDLAKLAGFKGAAAICEIINDNGTMARRDDLIGFAKEHSLKIITIEDLINYRKQDNFSVTKEAEAYLPTEYGDFKILAFSEKNSSKCHIALIKGDITTDEPVLTRVHSECLTGDALGSRKCDCGEQYAAAMEMIEKEGRGILLYMRQEGRGIGLLNKIKAYHLQDTGLDTVDANLALGFKEDMRDYKVSADMLKILGISNIRLITNNPAKIKDLEKNHINVVERIPIEMPINENDEFYIRTKKERMNHLINL >NZ_CP016087|1425703:1435663|1433641_1435663_-|WP_077361189.1|DBSCAN-SWA MKTLSTHKDITKNHDITNLTLSGIIVALGVVYGDIGTSPLYVMKSILEGNGGLENVSETFILGALSLIFWTITILTTIKYVLITLNADNNGEGGIFSLFTLVRHRAKWLIVPAMVGGSALLADGMLTPAVTVTSAVEGLDLIPSFKESLGANQDSIIIIVIAIISLLFFIQHFGTDLIGKMFGPIMFLWFSCLAIFGLIGISHDWTLLRALSPYYGVRTLFSNENKLGFFILGSVFLSTTGAEALYSDLGHVGKNNIYGSWPFVKICLLLNYFGQGAWILSAKKNPTFLNSEALNPFFQLIPYKFLLFGIIISTLAAIIASQALISGSFTLVSEAIKLNLFPRLHTMYPSSSKGQLYMPSVNTLLWIVCVGIVLYFKNSARMEAAYGLSITVTMLMTTILLFNYLLKRKTPFFISISILIFFGVLEFSFFIANIVKFMHGGFIAALIASAILFVMYVWIKSYYIKMRLIENVPIENYKGQLNLLRQDPDRPKYTTNLVCLTNSSKPKKIERKLMYSILDKRPKKADVYWFVNIVVTDEPYLAEYSADTFGTSYIVKVQIKLGFRVEQKLNVFLRQISTELVESGEIQIQSRTYTTMPDRKIGDFRFLLILEQLSYESRLNFWEEFILKAKLFIKRYTVSPEKWFGLEHSDVDVENVPLFIGGNNNIKLKRISK >NZ_CP016087|1425703:1435663|1425703_1426792_+|WP_077361178.1|DBSCAN-SWA MDEKYMDRALELAKKGIGRVNPNPLVGAVIVKDNEIIGEGYHECYGMAHAERNAIKNAVRDVVGSTIYVTLEPCAHYGKTPPCVDLLIEKRFKKVVIGMLDPNELVAGKSIERLKQHGIEVVVGIREEECKKLNEIFIKYITSKLPFVVLKSGMSIDGKIATYNGESKWITSKESREDSQKLRNRLHSIMVGINTVIADDPELTCRINKDKNLIRIIVDTKLRIPLESKVILNSDKKTIIATTINADGNKKQELRELGIKIIEVPSKNNKVDLKELINRLGQEGIDSILIEGGGTLNFSALEEGIVDKVVFYIAPKILGGTNSKSSISGKGFSKLSEAVNLIDMRYRTVGKDLVVEGYVEKK >NZ_CP016087|1425703:1435663|1431236_1433228_-|WP_077361188.1|DBSCAN-SWA MKQNNINKLTLAGIVVTLGVVYGDIGTSPLYVMKSILEGNGGLQNVSENFILGVLSMVFWTITILTTIKYVIITLKADNNGEGGIFSLFTLVRNRAKWLIIPAMIGGSALLADGMLTPAVTVTSAVEGLDLIPSFKELFGHYEHSIIIIVIAIISLLFFIQHLGTDLIGKMFGPIMLIWFSSLAIFGIISLSHNWTLLRALSPYYAINTLFSSENKLGFFILGSIFLSSTGAEALYSDLGHVGRRNIYGSWPFVKICLLLNYFGQGAWILSAKNNAKFLGLSELNPFYQMVPASFLVFSIIISTLAAIIASQALISGSFTLVSEAIKLNLFPRLHTMYPSSSKGQLYLPSVNKVLWIVCIGIVLYFKNSAHMEAAYGLAITVTMLMTTILLFNYLLKKKTNLIIAISILLFFGALEISFFLANIVKFMHGGFIAALIAFSILSIMYIWIKGYYIKMRLIEHVPIDDYKDILDQLRQDKDRPKYTTNLVCLTSSSKPKQIERKIMYSILDKRPKKAEVYWFVNIVVTDEPYVAEYSVDTFGTSYIVKVQIRLGFRVEQKLNVFMRQISTDLVESGEIDVQSRNYSIMPDRKVSDFRFLLILEQLSYESDLNYWEELILKLKLFIKRYTVSPERWFGLEHSDVDIETVPLFLGHHNHAVLKRVPK >NZ_CP016087|1425703:1435663|1426806_1427460_+|WP_077361180.1|DBSCAN-SWA MFTGIIEEIGIVQEFNFVNGFGIIRVGCANVLEDTKIGDSIATNGVCLTVKEISTNSFKAEVMGETLAKSNLGVLKTGDKLNLERALRLSDRLGGHIVSGHIDGVGKIFSIKEESNGTWFTISAPKEVLKYIIYKGSITIDGISLTVVYVDDLVFKVSIIPHTLDNTILPFKKVDSKVNLECDLVGKYIEKLFTGNKSNEEVESSNITMEFLKNSGF >NZ_CP016087|1425703:1435663|1429863_1431159_+|WP_077361186.1|DBSCAN-SWA MKNKILALVLATVIISGNLIPVSATPSNEQLDASRQKYADIENKIKDIEAKIYDLDMKMEPLQASIDKNKAEIRNINIVTENTKKDIEQCKKDINDLDLALGKRVKIMYSSGDLEFNYLNFILNSDSTSEFFSRVQAVGTIIEKDKSYIDGIKSKRIELNDKVKSLDDKKTEINKLNKEVQDNLNQLASNKKAEQELAAEAQNEKSKFDVEYLSLLERDAVKTQFDVIDSSNSSSADIEGAVSQLASIRDNQIKSPIVTKEINDKIQKGKAAASKKKDQEAKAAAESQRQAQAQVSSTSTKSSSSSNKKSNSSVAAPAAGNAQAILNEAYKHLGKSYVWGATGPSNFDCSGFTEYVYEHAAGIDISRTTYTQINVGQPVSQDQLKPGDLVFPHAGHVGIYVGNGQMIHAPQTGDVVKVGPVYSFYAGRRIL >NZ_CP016087|1425703:1435663|1429032_1429497_+|WP_077361184.1|DBSCAN-SWA MNIFEGNLVSEGLKFGIIVGRFNEFIGGKLLDGALDGLKRHGAKEADIDIAWVPGAFEIPLVAKKMAQNNKYDAVICLGAVIKGATSHYDYVCSEVSKGIASVSLESEKPVIFGVLTTNTIEQAIERAGTKAGNKGYECAVSAIEMANLLRAIK |
7 | Staphylococcus_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_7 |
2424066 : 2433936
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP016087|2424066:2433936|DBSCAN-SWA TATGGCAGCGCAATTTTCTAACTCAGAAGTAAAAGCACCTACTATGGGCGGAAGACCAAAAGGAGGCGGAAGGAATCGTTTTGGTCCAACTGAGAAACCTAAAAATGCAAAGGGCACATTAATGCGAATAATTAAGATATATATGAGGTGGGGAAAAACTATCTTTGCAGCCATAGTATTAACAATTATATCTTCATTAATTTCAGTTTCGATTCCATATTACATAGGAAAAGCTTTTAATACTTTTAATATTGAAACTAGAACAGTAGATACAAAACTACTTATTTGGTTTTTGGGAACAATTACAATTTTATACTTGATAAATTGGCTTATTTCATCTGTAAATGGTGTTATTATGCTAAAGGTTTCGCAAAAACTTGTGTTTGCAGTACGAACTGAATTTTTTCAAAAACTACAGAAGCTTCCTTTAAAATTTTTTGATACTCGTTCTCATGGTGATACTATGAGCAGAATTACAAATGATGCAGATAACATAAGTTCTACTATTGCACAAACAACTACCCAATTAATATCAAGTATATTAACTTTAGCTGGAGCATTAATAATAATGATATCACTTAATGTTTTTTTAACTTTAGTTGTTTTATTATGTATTCCTTTAGTTATGCTTTTAACGAGGGCAATTGCTAGAAATAGCCGATCTCATTTTTCAGCACAGCAAAGGAGTTTAGGGAGCCTTAATGGAGTTATAGAGGAAAATATATTAGGGTTAAAAATGGTAAAAGCTTTTGGAAAACAACAGGATATTTTAAAGCAGTTTTCAACTATTAACGAAAAATTATACGAAAGCAGTACTAAAGCTCAAATATGGTCTGGATATATGATGCCTATTATGAATGTTATCAATAATTTAATCTTTGCAATAGTTGCAATTGTTGGAGGGATATTATCAGTTGGATATGGAGTATCTGTTGGAACTGTAGTTAGTTTCTTGAGTTATTCGAAACAATTTTCTATGCCATTAAATTCCATTGCAGGAATGTTTAATACAATTCAGTCAGCATTAGCAGGAGCTGAACGTGTATTTGAAATTTTAGATAGTGAAGAAGAACCTGCTGATTTAGAAAATGCAATTGAAATTATAGAGCCGAAAGGTAAAGTCGTCTTTGATAATGTGTGTTTTTCATATGATAAGTCTAGAACTATATTAAAGGATGTAAGCTTTAAGGTTGAGCCGGGAGAGACAGTTGCATTAGTTGGAGAAACTGGTGCTGGAAAGACCACTATTGTTAATCTTCTGATACGTTTCTATGATGCTTTGAGCGGACAAATTTTAATTGATAATGAACCAATTACAAATATAAAGAGGAATAGTCTTAGAAAGTGTTTCTCAGTTGTACTTCAAGATACTTGTTTTTTCACTGGTACAATTATGGATAACATTCGATATTCACAAATTAATGCAACGGATGAACAAGTGATAGCAGCAGCTAAAATTGCTCGGGCTCATGACTTTATTGATAAATTGCCAAAGGGATATAATACAAGGGTGTCTGGATCAACCGATAATCTAAGTCAGGGACAGCGCCAATTAGTTGCAATTGCTAGAGCAGTATTATGTGATAGTCCTATTTTAATTTTAGATGAGGCAACTAGCAGTGTTGATACTAAAACAGAAAAAGATATTCAGCGTGCTTTGGTAAGTTTAATGAAAAATCGAACAAGTTTTTTAATAGCCCATCGTTTATCTACTATAAGAGATGCAGATAAAATTATGGTTATTGGGGATGGAAAAATATTGGAAAGCGGAAATCATGAAGCTCTTATGGATTTAAAAGGCCAATATTATAATATGGTAATTAGTCAAATGGGAAAATTAAAATAAAAATGAAGATAAACATCAATGCTCGTTGGTTAAAATAAGTTAATCAATGAGCATTGATGTTTTTTTCAAAATTAAGCAATTTGCTTAAAAAATTAACAAACTCTATTAAAAATACTAAAAAAATAAAAAAAATGCAATTTAAATACGTTTACACTGAAAAAGTGTGATATAATATGAAAGATGGTTTGCGAATTGAAAAGGAGAGATTAAATGTCAAAGAATTTTAAATGGACAAACATTATGAAAAAGTCAATTGCTTTTGGAATGGCTTTAAGCATTTGTTTAGGTGCAAAAGCTATATCATTAGGAAATGTAGCTAATGCAGCAACAGCAAACAGAGCATTGATTTGTTCAGCAACAGCATATACTGGAGGAACTGGAAACATTACAGCAAGTGGATTACCAGTGCAAAGAGATCCAAGTGGACTTAGCACAGTGGCAGTAGATCCAAATGTAATACCGTTAGGATCGCATTTATATATTGAAGGATATGGATATGCAATTGCAGCCGATACAGGTGGAGCAATAAAAGGAAATATAATAGATGTATACTTTAATAGTTCTAGTGAATGTAATAATTGGGGTACAAAAACAGTTCACGTTACAGTATTAGGAAATAAATAACATAATTGTGCAAATGTTAATGTTCCAGTAAAATAATTTGGATGAAAAGATCTGAATTTAATGCGCAGTAGTTTTCAATTATAGTTGCAACTTGTAGTTACAATTGAATGTATGAAAAAAAGTAAAACAGTCGTAATAGACGGAAAGTTATGTTAAAAGCAGAAAACCGCGTTAAGAATGTTCAAAATTAAACAGCATAGATTGTCAAGCAAAAAAGTGTAACCATCAACGAGTTTAGTACTATTAATTTTGTACTAATAAAAAAACAATATAATTTTGGCAGTGACATCATGATAACTTTCTATTTAGATAAACTTAAGATAAGGTTATCTAAAAAAATTAAATATTATATGGGAACCCCCGATTTTTCGGGGGTTTTTGTATAATTATAATTATATTAAAGAATATCAATGCTGTTGCAATAATATTTGACAAAATGCTATAATTAAAACAATACTTATCCAATAAAATAATTATAAGATAAATCTGTCATTAATTACTATAAACATTGTGGCTAGAATATTGAGAGGTTATATATGGGGAGGGTGATTATGTCTAGGATACCTATATTAAAAAAAATTGTAATCTTCAGTAGAACATGCTCATTAAGAATTTTAATTAGTGCTTTATTTATAGCATTAATGACTACAACTATTGGAATTATAACGTTTATTGTATTTAGAAACTGGAATCTTTCAGAAAAAACTACAATAGAAAATATTCAGGAGGATACAAACAAGGATATTTTCAACGAAATACAATTACTATTTTCTATACCTTTGTATAACAATGAAATTAATCATAGTATGATTGAAAATAAAGTAATTGATATACATAATGAAAAGCAAAGAGATAAATTTTTTGCAGGAGTTGTTAAATCAGGGAATGATGAAATTTATAGCTTTAGTTTTGGAACAGAAAATGGCGAATATTATGGAGCACGAAAAAATGAAAATGATCAAATAGAAATTTATAGAAGTAATGCTGATACCAATGGTCATTCGATGTACTATAGCGTAAATGATGATTTATCAGAAGGAACTTTTGTAAAGGATTATGGTAACTTTGATCCTAGAACAAGGGATTGGTATATACAAGCAAAAGAACAAAAAAAGACTGTATTTTCCGATATTTATAAACATTTTATAAAAGATGACTTGGCTTTATCGGCAGCATATCCTATTTACAATAAAGACGGTACAATTCAAGGGGTAATGGGAACGCACATAACTCTTTCAACTCTTAATGAATCTTTAAAAAAAATAGCAGACAATAAATCAGCAACAGCATACATAATTGAAAATAACTCTGGATACTTAGTAGCAAATTCTTTAGAAAAGCCTAATTTTGAGAAGCTATCAGATGGAAATATAAAAAGAACACTAATTGGAGAATTTAGTGATAAATCAATAAATGATGCATACGAAAATTATAAAAATACTTCTAATACCACCTTTGTAACAAAAATTGGAAATGAAACTTATCATATAAAAATTTTTGAATATGAAAAAGAAGGACTAGATTGGCTTATAGTAACTTCAATGCCTGAAAGTGTCTTTACAAAAGAAATTACTAATTCCATCAATATTGCAATTTTTCTTAGTATAACAGCACTTGCTTTAGCAATAATAATTCATCTACAAAGTACTAAATTTATTTTAAGACCTATTGAAGAATTGACTATTTCAGCGGATAAATTTTCAAAAGGAGATTTATCTGAAAGAGCCAAAATTTTTCGAAATGATGAAGTTGGAAAATTATCTACGGCTTTTAATCATATGGCAGAGGAATTATATTCATTGATAAATAATCTGGAAGACAAGATTAATGAAAGAACCAATGAATTAATTGCAGCTAAAGATATTGCTGAAGAAGCGAACAGAGCTAAAAGTGAATTTTTGGCAAACATGAGCCATGAAATAAGGACACCTATGAATGGAGTAGTTGGATTTTTAAGTCTTTTAGAGAAAACTGATTTAAATACGTCTCAAAGAGAATTTATTGATACAATTAAGGTTTCCTCTGAGGCTTTGCTGGCAGTGATTAATGATATATTGGATATTTCTAAAATTGAAGCTGGAAAAATGGAACTTGAAAATATTCCTTTTAATATTACTACCATAATTGAGAGAACGGTATTCTTGTTCAATGGGAGAGCAAAGGAGAAGGGAATTAAATTGAATTTATCTATAGATTCAAAGATTCCTGATTTTTTGAAGGGGGATTCAACAAAGTTAAGGCAGGTTATAAGTAATTTAATTAGTAATGCTGTTAAATTCACAAATGAAGGTGAAATTCTTGTTGAAGCTTCATTAGTCAATCAGACTGAAGTCGATACAGAAATTTATTTTAAGGTCAGAGATACTGGAATAGGTATGAATGAACATGAAATGGCTAAATTATTCAAACCATTTAGTCAAGCTGATTCCTCATCGACTAGAAAATATGGTGGTACTGGATTAGGTCTTGCAATATGTAAGAAAATAGTTGAGCTTATGGGAGGGACAATCGGAGTTGTAAGCAAAAAAGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP016087|2424066:2433936|2429948_2431367_+|WP_077362537.1|DBSCAN-SWA MRGNILIIDDSSIERKIINQAIKNRLDDINIFEVDNGLDISKKLLENNIHACVLDVMMPQKNGFQVLQEIKEDCNLMDIPVIVCTGISDKAAVEKALSLGAFDYFAKPLTEEAIKISLPLKIKNAIDLMKRKEEIIYLSYHDQLTGLYNRRFFEEELARINTKSNLPITLIMGDLNGLKLINDSFGHAMGDEVIKRVGKMMKLGSREDDIVARLAGDEFVIISPKTDGKEACKIINNIMSLLAKEKVGSVEVSMSLGYGCKYNEEEKIEDVFKKAEDTMYGKKVFESQSMRGRTIKTVINTLREKSKIESEHSFRVSALCKRVGEALDLPINEINKLVSAGELHDIGKIIVDERTINKPGKLTADEWEEVKRHSEIGYRMISTVDDMTEIANYILYHHERWDGSGYPKGLKGEEIPFISRIITIADAYDAMVSERCYKDILSKEAAIEELKNNAGSQFDPDLVKIFINKVLK >NZ_CP016087|2424066:2433936|2426121_2426535_+|WP_015392513.1|DBSCAN-SWA MSKNFKWTNIMKKSIAFGMALSICLGAKAISLGNVANAATANRALICSATAYTGGTGNITASGLPVQRDPSGLSTVAVDPNVIPLGSHLYIEGYGYAIAADTGGAIKGNIIDVYFNSSSECNNWGTKTVHVTVLGNK >NZ_CP016087|2424066:2433936|2427086_2429927_+|WP_077362535.1|DBSCAN-SWA MSRIPILKKIVIFSRTCSLRILISALFIALMTTTIGIITFIVFRNWNLSEKTTIENIQEDTNKDIFNEIQLLFSIPLYNNEINHSMIENKVIDIHNEKQRDKFFAGVVKSGNDEIYSFSFGTENGEYYGARKNENDQIEIYRSNADTNGHSMYYSVNDDLSEGTFVKDYGNFDPRTRDWYIQAKEQKKTVFSDIYKHFIKDDLALSAAYPIYNKDGTIQGVMGTHITLSTLNESLKKIADNKSATAYIIENNSGYLVANSLEKPNFEKLSDGNIKRTLIGEFSDKSINDAYENYKNTSNTTFVTKIGNETYHIKIFEYEKEGLDWLIVTSMPESVFTKEITNSINIAIFLSITALALAIIIHLQSTKFILRPIEELTISADKFSKGDLSERAKIFRNDEVGKLSTAFNHMAEELYSLINNLEDKINERTNELIAAKDIAEEANRAKSEFLANMSHEIRTPMNGVVGFLSLLEKTDLNTSQREFIDTIKVSSEALLAVINDILDISKIEAGKMELENIPFNITTIIERTVFLFNGRAKEKGIKLNLSIDSKIPDFLKGDSTKLRQVISNLISNAVKFTNEGEILVEASLVNQTEVDTEIYFKVRDTGIGMNEHEMAKLFKPFSQADSSSTRKYGGTGLGLAICKKIVELMGGTIGVVSKKDEGTTFYFNLILNNPSEEEIFNLKQEDKNMTDIKFMEESDLRILLVEDNEINRRFFINSLKLLGLSCDIAVNGLEALNACKIKDYHIIFMDCQMPEMDGYEATRKIRQLEAGSKHTTIIAMTAHSMKGDANECFKAGMDDYLSKPFVFEQMVEMLQKHSKTDDNRTLKNSSDSSEDRINKNKDSSFDDIVKLLTEESGFDEEFCRELVEDFCIQAEKLLTEIKDNIAKDNLIEARTNLHKLKGSAGTVRANDIAKIAVEAEEKAKIGSKDLLIELIQKAENLLNKLL >NZ_CP016087|2424066:2433936|2431956_2433936_-|WP_077362541.1|DBSCAN-SWA MNIKKKFVTLVLTFAMILSFIPTLNVQAATTDYKLISESEVTSKEAKNWAKSKGASSDFLKLADLYFKYSSDHGDVNPAIAYVQAAVETGYGNFGGVLDSSYYNPCGLKKSSGSGTDKDTYQKFDSWDEGVQAHLDHLALLAGVKGYPRDSSYDEKQSSSLKGKAIKISDLSGIWATNTSYGDQIINLYKDLINSTKDNTNTDSKDNSSPNPGKPETIPNSPNITTVVGINNSPVNITSTIGWRQIYGSWYYYTSDKNKAKGWIKPDNYWYYLQEDGTMATGWIQLSGTWYYLDDSGAMIIGWRYLGGCWYYLQGDGSMVTGLRKIDGKNYLFDPSGEMLKGWKLLDNHWYYFNSDGSMATGWIKDNNLSYYLYETGAMAKGWITINGVWYYFKDNGSMQKGWFTASNGDLYYLDMSTGKMLTNTTVDPYIIGADGKAIKKSTSDTNNSSSNSKTDTTPSNTNASTNSNLIYAIDISNHDGNIDFSKVKYSGTKYVYIKATEGTTFVDPYLSTYYTNAQNVGIKTGFYHFLVGTSAPETQAQNFYNNIKNKKSDLKPCLDIETSGFNVSDYAVRFINEFKRISNMNICIYTYSNFISNLDGRLSSYPLWEANYNNTAFKNLPSNSIWTSRIGHQFTDSGKINGINANVDLDAFTQDILN >NZ_CP016087|2424066:2433936|2424066_2425911_+|WP_077362533.1|DBSCAN-SWA MAAQFSNSEVKAPTMGGRPKGGGRNRFGPTEKPKNAKGTLMRIIKIYMRWGKTIFAAIVLTIISSLISVSIPYYIGKAFNTFNIETRTVDTKLLIWFLGTITILYLINWLISSVNGVIMLKVSQKLVFAVRTEFFQKLQKLPLKFFDTRSHGDTMSRITNDADNISSTIAQTTTQLISSILTLAGALIIMISLNVFLTLVVLLCIPLVMLLTRAIARNSRSHFSAQQRSLGSLNGVIEENILGLKMVKAFGKQQDILKQFSTINEKLYESSTKAQIWSGYMMPIMNVINNLIFAIVAIVGGILSVGYGVSVGTVVSFLSYSKQFSMPLNSIAGMFNTIQSALAGAERVFEILDSEEEPADLENAIEIIEPKGKVVFDNVCFSYDKSRTILKDVSFKVEPGETVALVGETGAGKTTIVNLLIRFYDALSGQILIDNEPITNIKRNSLRKCFSVVLQDTCFFTGTIMDNIRYSQINATDEQVIAAAKIARAHDFIDKLPKGYNTRVSGSTDNLSQGQRQLVAIARAVLCDSPILILDEATSSVDTKTEKDIQRALVSLMKNRTSFLIAHRLSTIRDADKIMVIGDGKILESGNHEALMDLKGQYYNMVISQMGKLK >NZ_CP016087|2424066:2433936|2431463_2431892_-|WP_077362539.1|DBSCAN-SWA MIVRDIMSKDIVSLNSEDSIERAAQIMSQFDVGSVPVCKNEELVGIVTDRDITLRSVAPGGFSNEQKIKDVMTSNPVTGTPNMNIHDAAKIMSEQQIRRLPIIENNHLVGILSLGDISLEPSLQNNAEEALKNISEPTKNQL |
6 | Bacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
3061369 : 3114713
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP016087|3061369:3114713|DBSCAN-SWA 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67 | Clostridium_phage(42.86%) | capsid,plate,tail,integrase,portal,terminase | attL 3073960:3073975|attR 3081816:3081831 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
3667340 : 3674388
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP016087|3667340:3674388|DBSCAN-SWA TTTACCTTACCTTACTTACATTTTTATAATAAAAAGCTGTTTGTTTCCCTTCCCATTTTATATTTAAGGTTTCTCCATTCTTATAAATCCTAACTACTTTTCCAATTGACTTTATACCTTCATATTCAATATTGACATCATCATTAACTTTAAATTCTATCTCATTCATATTTACAGCTACATCTGTATTCCTATTCTCTATAGTCTGAATCTCAATACTAACTCCTATATTAAATATTTCATTTTGATGATATATGGGCTTTTGATCATATTCTAGAACCCATCCCTTAGGATTTATCACCATAGTTTTTTCTCCAGGTATTATTAAATTAGCATCCCCTTTTCTTTTTATATATTCTGTTACCTTTAGAGCTTCTAGTTTTTCTTTTTGCATTTCATTTATTTCCTTATCACTATTTGCAATGATTATTTCTTCACCTGGCATAATAGCTACGTCTTTAGTAAGTTCAAACTCATTTATTCCAGCTGAATTAAAATATAATGTTTTATCATCAAATTCAACTAGCAATGCACCACTAAGTGTTTTTACTATTCTGCTGCAGCTTTCAGAATATAATTTAACAATAGAATAAAGCTTATCTGATTTTATATTTTCCTCATTTTCAATGCTAATTTCTTTTGTTTTTATAACATCTATCACTGGTAAATCAAACATACCTATTTGGCCATCAATAAGACATTCATTTTTCATATTTAACCTTTCATTATTATTAATCTATTTTAGTTCTTTAGTAACTTGAAAAATTTTTTTAATATTTATGTTTTGACTAGAATTTGTCCATATATCATTTATGAAATAAAGATGAAGGAGGTAAAAACAAATGGCTGTAACTAAAACTATCGACTCAGCTTCACTTAGTATTGAAGTTCAAAAAGGGACTGATAAGACCGGCGATCCAATTTATACAAAGAAGGCTTTCTCAGGCATTAAAACAAATGCTGCACCTGAAAATGTATATGCTGTTGCAGAAGCAATTAAAGGTGTTATGCAAGCTAAAACTAGAGATTATTTTATAAATGAAGCTTCTATTTTAGCAAATGCTTAAGATCATTCCCAAAAATAATTTTTTAAGATTGGAGGTAAACTAAATGGAATATACTTTGTCTATGACTTTTCTAACATCATCTGGTGAAAAAAGCACTTTTAATGTTCCTGGTGTTAAAACAGATATTACTAAAGAAGCGATTAATTCGCTTATGGATACTATAATTGCCAAAGATGTTTTTGTAACTAATTCTGGCAATTTAGTTAAGAAATCAGGCGCTCAAGTTACTCAAAGACAAGTTACTAAATTTGATGTAGCTTAGTTTAGAGATTAAAAATAGAAGCTTATCTTTTTATATGGGATGGGCTTCTATTTTTTTATTAATATTCCTAATACTTTATTACTCACTAATATTTTTAAATAATATTATTTTAAATATCTTATATTTAATTATCATTTAATCACTTTTAAATTTGGTTTACTTTCTTCTTTTTCATATTCTTCGCTAAATTCATTTATAAAATATTCTAAATTACATTTCACATATAATAAACCTTTCCTATCATTCCAGCTTAAGGCATATATCTTCTTAATCTTTATCATTGTCCGTTGATTGCATATGGTCCATCCATCTTGCCACATACCAATTGGTGGAATATCACTATATAAATTAAAAGGTATCTTTTGATCTGTATTTCTAATACATCCCTTTTCATCCATATCAAAATATAAGCAACCTTCATCTCTGCTTCTAACGATACTTTTCCCTTTACATTCACCACCATGTTCTTCAGACCTTTTGCAGTATGGACATTCCAAACGGTTAGGAAAATCTTTTAGTCTGTCCATTTTACTCTTGTCCCAAATCCTTTCTGCATCCTTCACAAACAATTAAATCTTTAAATGCTAAAATACCTTTTTCACATCCACAAAAAATACAGCCTCTATGATATTTCTTAACAACTATCTCATTATTAACTTTTACTATTTCCAATGGATCTCCTTCACTAATACCAAGAACATTTCTAATTTCACTTGGTATTACAAACCTTCCTAACGCATCAACTTTTCTTACCATTCCTGATTCTTTCATATTTAAAAACACCCTTTCAATATATTTCAATTACAATTGACCATTGAACTTTAACATTTAACAATTGATAATTGCTCATTTAAGCCTATAATTATTTCCTATATCCTTTTCAATTTCAACTACATAATCCTTGCACATTTCGTATACACGCGACCCTACCCCTTCATCAAAAGCCAATAATCTATTAATAGAAAATTCACTGCTAACTATGATTGGCAGAAAGTTTAAATATCTATAATTAATTATTTCAAACATCACATTTAGATCACTTTCATTAATTTTTCCCTTGAAGAGGTCATCAATAAGAAGGACCTCGCATAATTTATACTTTGATATTATTTTTCCATAGTATTCTTGATCAATCATATTTTGTTTTATTTTTGTAATCACATCTCTATAAGGCATGTACACAACTTTAATTCGTTGTTTTAAAAAATATAATGCTATAGCAACACTAACATGTGTTTTGCCGCTGCCAACTTGTCCACATAATAAAATACTATTTCTTCTCTTATCTTTAATTTCATCAAAGTTAGTACAATAAGCTGCAGCCGTATCTTTTAATCTTTCAGATGCTCTATTCCATACCTTAAAGTTAAAAAAAGTATGTTTACTCTGCTCCACATTAATTCCAGAATACCTCCACTCACTTTTTAGCTTTTCTATTTTTCTACATTCACAACTAACAGCTAGTGGCTGACTATTCTCCTGTGGTACCAAAACCCAACCAGTATCTGAGCATTTATCGCATTTATATAAGGTTTTCCTCTGCCCACTTTCGTTGAGCTTCTGTAAGCTTTCGTGGTTCTTTTGGTTTGAATCCTGCAAATTTATTTGTATCTGTTGTGTTACTCGTTCCAGTGCTTCTAACCCCATTCTTCTTCACCTCCATATTTTCTTCTGGGTACCCTTCTCTTCTCCAGTTTTTTAATATCCCAATGGCATACTTTATATCAGGACAATTCTTCTCAAAGCCAACATCCATAGCCATCTTAACAAACTTTACTCCATGAATATCAATAGCTGCTCTAAGCGCTACATAGTCACATCCACCAACTTTACCTGTGATTTTCTCATGATATTGTATAAGTTCTAAAGCTTTGAGATTAATATCATTCTCTGAAGCTTCACTTTTGATATTATTATTTTCAAAGAGACTAGACTTGCTTACCTCATAATTGAAAGTTAAACTTTTATTATTTATATCACCCAGACTATTTTCATTCTCTATATCTATCTCTTTCTTCTTATTCTTATTCTTTTTCTTAATCTCTTTCTTATTCTGTTCCATTACTGTAACGTTACAATTAGAATTTTCAGCATTACAGGTAACATTACAATTTTCATCAGAGGAATCTTTGTTATTCTTTTCTGTAGTATCATTATTTTGACTTTCCTTGATGTCTTGATTAATATCATTTGATGTATTTTCACCCACTTGAATATCAGCTTCATTTCCAGCTGCTTTAACAACATCACTTGCAGATGAATCTAGTTTAATTTCTCCTTCACCATTATCATTAGCTGCTTTCTTTTTTGCTCTACATTTTGCAACTCTATTAATATTTAATTGTTTTGCTCTTTCCATTCCCTCAACATTTTGATGTTTTTCCCAATTCTTGATTTTAAAAACTTTATCTTCAGTAAGTTCAATCATTTCTAATTTTCTAAGTATTTTAAATGCATCTTTTACTTCTTCAACACTTCTATTAAATTCGATGGCCAATGTTTTAATTGTATGTGGCATGTTATCAGTAATGTACAAATATCCACCAAGATTTATTTTCCCAGCTAAAACAATAGATCTTGCCCAAACATAATGATATAAATCTCTTTTGTCCTCACTATCTATTATCTTGAGTTTAGTGTCTTCATACATATTTACTTTAAATTTAACCCACATAACAACATCAGCCATAATTATTCCTCTCCCACACATAAAATATTTCAAATTGCACAAGACCTTCAAAAGATGGAGTAACTCCAATTAATTTGCATGTTAAAACATAATACTTGAAGACTTTAAAATTCACCTATAATCCCTCTCTAATTTCATTGTTTTATTTTATTAATATCCCTTTGTGTTCATTAATTTTCTTTCCATCTTTCCAATCATAATAAATACATTCTTCAACTACCTTAAACGGAAAATTCTCTCCAAGTATTTGATTACATACTTTTGAATTCCTAGGATAATTACTTAGTATTTCTATTAAGTCATTAGCTGTAAAACCTTCAAATTTTCTGATCATTGTAAATCCTCCTCTTTTTTCAACAATTAACCATACTAGTATCATATTTTTATTAGCCTTAATAAATTTATTCATGCTAATTATTAGTGAATTTAAACAAATACATTTTTAGCAAGATATTTATTTTCAAATTTGAACATAATTTCTTCAACTTTATCTTCATTCTTAAATTCATGCGAAAATTTAAAATTCCGTCTATATCTGTCTATGTTCTAATGATATTTTTTGAAGCCATTCTTGTAATAAATCTCTATTTATCAATACTTTTGCTCCAACTTTAAAATAAGGAAAATCAGTATTAGGCTTATTTATTAACTCTCTTATTTTTTCTTTACTTACATTTATAAACTCTGCACATTCCAATACTGTAAGTGTCTTTCTATTTAAGCAAGAATTTTTAATAACCTCATAAAGTTTACTAAATATCATCTCTTCTTCGTTCATAATAAGTCACCTCGCATGCTGCTTTGATCTCATCAATACTCTTTTCATAAATTTTGCTTAACTTTTCCATTTTTAGCATGTCCACTTTGCATTTACCTTTTTCAATATTGCTAAACTGCATTCTGCTAATATGAAGTCTTTCTGCAATCTTATATGCCTTTATTCCACTTTCTTTTCTCAAATGTTTTAAATCCATTCTCTCCACTCCTTTCCTTAATTGTAAATTCATTCCATAACTTTGTAAAGTTATTTTTTAAAAAATTACAATTTAATAATATATTTTTGATTTTTGTAAAGTTAATATTCATTTTCGCAATAATTAATTAATTTATTGTTATTCTAATACAATAAATATACTTAATCATATCTTTACCAATTTTATTTTCCATTTTTTACAAACAAATAATTTGCAATTCTGTAAAGTTGTTTTATAATAAATTTAAGGAGGGACGCATATGTTTAATGAACACTTAGAAAAATACAGAAATGAGCTTCAACTAAGAAAAAAAGAAATAGCTGACAAATTAGAAGTTAGTGAAATTTACAATAGCTTAATAGAAAGTGGAAAATAACTCCATCTAAAAATCTTATTGAAAAGTTGGTATTAATTAGTGAATTGCCTGAGGAATTTTAGATATATGGTATAAAGAAGAGTACTATGTAAATACTAGAGATGATTTTAAAAGTTTAAAAAAAGCTTTAGATACTGTTTTAGAACTTTGGTCATTTAAAAGTGGTAATGAAATTTTCAATCAACATAATAATTAAAAATATTCTCTTGGTTAATTATTAATTGCTGCTCTTAAAGCAGATTTCAATTATATGATAGAAAAAAGTCATAAGTTACAAGCTACAATTTTATTCTACATCCTATTTTTTCTTTTATAACAACATCAGAATTAATAATTTTCTACTATTTTGTATATGCATATTATTTCTTAATATTTATATACAAAATAATACTTGATTTTTAATACATTCATATATTAGTTTTCTAACATAATTTAATGATTGTCATTTTTAAATTAACCTTAAGTTCACTAAATTAAATTACTTAAAAGAGAGGTTTTACTTATGGCTGTAAAGACTAACTTTACTTCTAATGGAAAAGAATATTATAGACTGACATGTGATATTGGAATAGATGCCAATGGTAAAAGAATCCGAAAGCAGTTCGTTGGCAAAAATAAAAAAGAAGCTGAGCAAAAGAAACAAGATTACTTGAATAAATCCCGCATGGGTATTCAAGATAAAACTCTTTGGTTTTCTCAATCAATGAGGAGCTGGTTATTTGAAGTAGTGAAAATGTCTGGAAATATTAAAGCTTCATCTTTTTCCAGGTATGCAGGCATTTATTCTAAGTATTTTGAAAACTGCTCTATATCCCATATAAGCTTAGATAAATTAGAATCTATTGACATACAAAGATATTATAATGATCTTCATAAGCAAGGGAAAAGCAGTAATATCATAAAAAACAATAATAAGTTATTAAAACAATTCCTCAATTATGCTGTAGATTGTGGCTATATATTAAGAAATCCTTGTAGTGGTAAGAGAGTGGTTATTCCAAAAGATAAAACTAAAAATATAACTGATAAACTTACCTGTGTTCCAGTATTTTCTAAAGAAAGTATGCAAAAAATACTCTCTCTAAAAGAAGATACAAAAATACGCTACTTGTCCTTAATCTCCTACGCTACTGGTATGAGGCGTGGTGAAATCTTAGGTTTAAAAGAATCTGATATTGATTATGATAATATGGAAATTCATATTAGAAGAAACTTAGTTACAACTTTAGTTTATGATGATGATGGAAATAAGCACAAAGAAACTTTTATAGATAAAACCAAAACTAATACTTCTGTTAGAGATATCCCCTTACCTAGTAACTTAATTCCAATTATAAAATCTGCTATAGCTCTAAAGAAAAAAGATATGCTAAAGTGTGGCAACAGCTATAACAGAACAAATAAAGATTTCATATTCTTAACTGAAGCTGGAGAATATATAGACGCAGGCAATATTGATAAGAGCTGGATATATTTTTTGAAAAGATGCAATGTAGCTCACCTAAAATTCCATGCCCTAAGACACACCTATGCTACTTTACAATTTGAAAATAATATTAGAATTGAAACTGTATCTAAATTACTTGGGCATGCTAGTATTGAGATAACTTCTAATATATATACTCATGTAATGAAGAAAGAGAAACAGAAGGCTGTTGATACGTTAGCATTACTAAATTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP016087|3667340:3674388|3667340_3668051_-|WP_077364214.1|DBSCAN-SWA MKNECLIDGQIGMFDLPVIDVIKTKEISIENEENIKSDKLYSIVKLYSESCSRIVKTLSGALLVEFDDKTLYFNSAGINEFELTKDVAIMPGEEIIIANSDKEINEMQKEKLEALKVTEYIKRKGDANLIIPGEKTMVINPKGWVLEYDQKPIYHQNEIFNIGVSIEIQTIENRNTDVAVNMNEIEFKVNDDVNIEYEGIKSIGKVVRIYKNGETLNIKWEGKQTAFYYKNVSKVR >NZ_CP016087|3667340:3674388|3669196_3669439_-|WP_077364222.1|DBSCAN-SWA MKESGMVRKVDALGRFVIPSEIRNVLGISEGDPLEIVKVNNEIVVKKYHRGCIFCGCEKGILAFKDLIVCEGCRKDLGQE >NZ_CP016087|3667340:3674388|3668181_3668406_+|WP_077364216.1|DBSCAN-SWA MAVTKTIDSASLSIEVQKGTDKTGDPIYTKKAFSGIKTNAAPENVYAVAEAIKGVMQAKTRDYFINEASILANA >NZ_CP016087|3667340:3674388|3672109_3672331_-|WP_077364232.1|DBSCAN-SWA MDLKHLRKESGIKAYKIAERLHISRMQFSNIEKGKCKVDMLKMEKLSKIYEKSIDEIKAACEVTYYERRRDDI >NZ_CP016087|3667340:3674388|3668799_3669195_-|WP_077364220.1|DBSCAN-SWA MDRLKDFPNRLECPYCKRSEEHGGECKGKSIVRSRDEGCLYFDMDEKGCIRNTDQKIPFNLYSDIPPIGMWQDGWTICNQRTMIKIKKIYALSWNDRKGLLYVKCNLEYFINEFSEEYEKEESKPNLKVIK >NZ_CP016087|3667340:3674388|3668449_3668668_+|WP_077364218.1|DBSCAN-SWA MEYTLSMTFLTSSGEKSTFNVPGVKTDITKEAINSLMDTIIAKDVFVTNSGNLVKKSGAQVTQRQVTKFDVA >NZ_CP016087|3667340:3674388|3671886_3672135_-|WP_077364230.1|DBSCAN-SWA MNEEEMIFSKLYEVIKNSCLNRKTLTVLECAEFINVSKEKIRELINKPNTDFPYFKVGAKVLINRDLLQEWLQKISLEHRQI >NZ_CP016087|3667340:3674388|3673209_3674388_+|WP_077364236.1|integrase|DBSCAN-SWA MAVKTNFTSNGKEYYRLTCDIGIDANGKRIRKQFVGKNKKEAEQKKQDYLNKSRMGIQDKTLWFSQSMRSWLFEVVKMSGNIKASSFSRYAGIYSKYFENCSISHISLDKLESIDIQRYYNDLHKQGKSSNIIKNNNKLLKQFLNYAVDCGYILRNPCSGKRVVIPKDKTKNITDKLTCVPVFSKESMQKILSLKEDTKIRYLSLISYATGMRRGEILGLKESDIDYDNMEIHIRRNLVTTLVYDDDGNKHKETFIDKTKTNTSVRDIPLPSNLIPIIKSAIALKKKDMLKCGNSYNRTNKDFIFLTEAGEYIDAGNIDKSWIYFLKRCNVAHLKFHALRHTYATLQFENNIRIETVSKLLGHASIEITSNIYTHVMKKEKQKAVDTLALLN >NZ_CP016087|3667340:3674388|3669514_3670159_-|WP_077364224.1|DBSCAN-SWA MVPQENSQPLAVSCECRKIEKLKSEWRYSGINVEQSKHTFFNFKVWNRASERLKDTAAAYCTNFDEIKDKRRNSILLCGQVGSGKTHVSVAIALYFLKQRIKVVYMPYRDVITKIKQNMIDQEYYGKIISKYKLCEVLLIDDLFKGKINESDLNVMFEIINYRYLNFLPIIVSSEFSINRLLAFDEGVGSRVYEMCKDYVVEIEKDIGNNYRLK >NZ_CP016087|3667340:3674388|3671499_3671691_-|WP_077364228.1|DBSCAN-SWA MIRKFEGFTANDLIEILSNYPRNSKVCNQILGENFPFKVVEECIYYDWKDGKKINEHKGILIK >NZ_CP016087|3667340:3674388|3670190_3671357_-|WP_077364226.1|DBSCAN-SWA MADVVMWVKFKVNMYEDTKLKIIDSEDKRDLYHYVWARSIVLAGKINLGGYLYITDNMPHTIKTLAIEFNRSVEEVKDAFKILRKLEMIELTEDKVFKIKNWEKHQNVEGMERAKQLNINRVAKCRAKKKAANDNGEGEIKLDSSASDVVKAAGNEADIQVGENTSNDINQDIKESQNNDTTEKNNKDSSDENCNVTCNAENSNCNVTVMEQNKKEIKKKNKNKKKEIDIENENSLGDINNKSLTFNYEVSKSSLFENNNIKSEASENDINLKALELIQYHEKITGKVGGCDYVALRAAIDIHGVKFVKMAMDVGFEKNCPDIKYAIGILKNWRREGYPEENMEVKKNGVRSTGTSNTTDTNKFAGFKPKEPRKLTEAQRKWAEENLI |
11 | uncultured_Caudovirales_phage(33.33%) | integrase | attL 3656869:3656884|attR 3675475:3675490 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_10 |
5612344 : 5621081
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP016087|5612344:5621081|DBSCAN-SWA TCTACTCCTTATCCGCATTCTCTGCTGCCACTTCATCTTCATTCTTATAGTGATAAGTTGGAACGATCTTTTGCATTTGATGTTTTATTTCACCAATATCATTTAGTTCCAATAAATTTTTCAACTGCTCAAGCTTTTGTTTTAGAGTATCCATATTTTCAAAAGTTGGTTTACCAACATGTATCTTTTTATGAACAGTATCTTCTAGTCCTTCTTCACTCATTAAAAGTTCCTCAAATAACTTTTCTCCTGGCCTAAGTCCTGTAAATACAATTTTTATATCTCTATTTGGTTCAAGACCTGAAAGCTTAATTAAGTCACAGGCTAAATCATAAATTTTAACTGGTTTTCCCATATCTAAAACAAATATCTCTCCACCTTTTGCAAATGCACCTGCTTGAAGTACCAATTGAGCTGCTTCTGGAATTAACATAAAATATCTAATAATTTTCTTATGAGTAACAGTAACAGGTCCCCCATTAGCAATTTGTCTCTTAAATAAAGGTATAACAGAACCATTACTTCCAAGAACATTACCAAATCTAACAGCAACAAATTCTGTTTTGGATTGCTTATCCATGGCTTGAATTATCATTTCACATAATCTCTTAGTTGCACCCATAATATTAGTTGGATTAACAGCTTTATCTGTTGAAATCATAACAAATCTAGATACATTAGCTTCACTAGCTTCTAAAGCTAAATTCAAGGTTCCAAATACATTATTTTTTATAGCTTCCTTTGGACTATCCTCCATTAAAGGTACATGCTTATGAGCTGCTGCATGGAATACAACATTTATTTTATATTTAGTAAATACCTCATGTAATCTTTTCCTATCTCTTACAGATCCAATTAATACAGTAAGGTTCATATCTGGAAATTCTTCTCTTAGTTCGTTTTGAATATCATATACATTATTTTCATAAATATCAAAGATTATTAATCTCTTTGGATTAAATGCAGCAATTTGCCTGCAAAGTTCTGATCCTATTGAACCACCACCACCAGATACTAGTATAGTTTTTCCTTCAATATAATCAGAAATCCCTTTGTTATCTAATTGAATTGGATCTCTTCCAAGTAAATCTTCTAAATCAACATCCTTAATTCTACTTACGGTTGCATCTCCACTTAATATTTCATACATACCTGGAATTATCTGTAGCTTACAATTAGTATCTTTGCAAATCTCAATTATTTCTGCTTTATTTTTTGCATCAAGAGATGGTATAGCAATTAAAATTAAATCTATTTCCTGCTCCCTAACAAGATACGGTATATCATATCTATTCCCTTCTATTTTAACTCCAGATATTCGCTTTCCAAGTTTAGCTTTATCATCATCTATAAGAACAATAGGATTATACTTTAACTCTCTTCTTGCCATCATTTCATTAATAATCATAGTTCCAGCAGAACCTGCTCCAACTATCATTACTCTTCTTTGATCTGATGAATATTTGAATGGTATATATAAAAGAGTTCTTCTATAAACTCTATAGAGAATTCTATATCCCAATACAAAGAAAATACTTAAAAGTATTCCTACAACACAAACATTTAAAGGAATTGTGTGTCCAAAAGAACTTCTAGTATATGCTATGGACAGTATCCCAGCCAAGATATTTCCACCAACACCTAACAAAAACTCATCCGTTCCAGTTAAATGCCATAAACTTTCATACATTTTAAATAAGTAAAAACAAACTAGATAAATTAAACTCAAAACTACACAATCTTTAGTATAGGTCGTTGCAATAAGTTTAAAACTTCCAGTATCCGTTATGTTTATTGCAAAAAGATATGCCATATTTACCATAAACATATCAATTATCATAATTATTGGTGTCTTCCAACTCTTCATTATAATCTCCTCCACTTTCAAGAGACAATATTATTACCTTAGTCCATTAAAAATTTTAAGCAATAATTTAGGGCAGTATGCCATGCCCTTAGCTTGAATAAAATATCTAAGGTTATTTTTATTAAACCTCTGCATTTTATATGCCATCAAATATCCCTTTACATCAGTTCTATTTAAAAATTCAAAAAGATCCTTATGAAAATTTGAATCTTTACTAAGCACTGAAAAAATATGTGATATTGAATAAGGAATCTTAAATTCAATCAAGAATTTTTCTATTTCCCTTAAACTTACATCTGTCTTAACTTCTTCCAATAAATCTGTATAAGAATAGTAGCCATCAAGATGTTTTAACGATACATTTTGAGTAACTGAATTTCCCCAAATAACGTAAAATGCTAAAATTTCATTGACACTTATTACTTTTTTCGAATATAGTAATGCTTTTACAATAAAGATCATATCTTCTCCATATTTTCTTTTACTATCAAATAGGAGATTATTTCCTTTAATGATTGATGCTTTATATATAGCACTTCTCATTCCTATTGTTATATCATCATTTAATTGTTTTAAAGCTGCTTCTTTCCCACTTATAAAATTACTTAAACACTTTGTTCTATTTTTAACTAAAACCTTTCCCTGTGCATCAACTTCACTGTAATCACAAAAAACCACTTCACTGCAAGTTTCTTCTGCTTTTTCGTACATTAACTCAATAAATCTAGAATCAATATAATCATCTGAATCTAGAAAGGTTATATACTCACCAGAAGCTTCTTCTATTCCCTTATTTCTTGCAGCACTAACTCCTGAATTTTTTTGAGTTATAATTTTATAATTTATAATTGATTTTTCAAGTAATTCTTTTGCTATATGAATACTTCTATCTTTAGATCCGTCATCTATTAGTAAAAATTCAAAATCCTTATTTGTCTGATTTATAACAGATTTTATACATCTTTCAATACATTCCTCTACATTATAAACAGGAGTAATTATAGATACCTTCGTCAAAACTATTCGCTCCTTTTATCTATCTATAGGTTCAACCATTAATACTTTTAATAACCTAATTGTAGTAATTAAAAACCTAATTATTTGAAATTTTAAACGCTACTTGAATTATACTAATATTGACACCTATATGCAATATTTAGTCATTTTTCTTAAGTTAAATTTCATAATTCAAATAGCAATTGTCAATGATAGATGATCAATTATCAATCGCTGATAGCTTTTTTATTGTTTTTGCATGCCATACACGATCTTCTTCCTTTGGAAGTGTCATATAGTCTCCATATAATTGAGTTAAAACCGCATCATAATTTTTAGGTGCATAAAAGTATTCTCCTTCAAACTCAACTTTTATTAAATCAAAAAAATCTTTTTTCTTATATATGTATTCACTCCAAGTAGTATCAACTCCATACCCCATATATTCAGAATTAATATCATTCCAGTTTATTAAAAAATCAAATAACTTCTGTCTTCTTTGAGTTGGAAAAATTTTAACTACAATTTTATAAATAAAATGCGTAAACTTATTTTTAAAAGTTAATTTTTCTGGTATCTCTCTACACCTAACAAAACTTCTTAAAATAAAATTACTTATTTTTCTTTGAATAGTATAGACCCATTTTTTCTTTGGTAAACTATCATAAGGTAAAATATCTATAAATAATCCATTATGCATCTTTGGATTTTCAACTATTTTTTCTTCAATAAATAAAGTATTATTATATCTAATCTTACAAGGGACCTGATAAATATCATAATAAAGATCATTTTCATGAGTTTGCAAGAATAAATGTTCAGGCAACTCATCTTTAATTATACTTAGAAACTTTCTATAGTCTTCTCTAAGCATCCCTATATCAATATCATCATCCCAAGGAATAAAGCCTTTATGTCTTACTGCTCCAATAAGCGTTCCTGCATCTAAAAAATATTTAATGCCGTATTTATCACAAATATCAGCTACTTCTTTCAAAATTCCTGCCATTATTATTTGAGCATCTCTTAGTCCTAACTCCTCATAGTTTGAATAATCAATGTCGTTCATATTTTTCTCCTTAAATTATATCAATGTAAATACAAAACTTTCATATAAGGTATCAAATTCTGATACCTTTCCTTTTTATTATATCAATGAAAATTCAAAACTCAATAAATATAATATAAAATTATCAATTGTCAATTATTTTGTCACTATTGACAATTTAACATTTATAATTGGCAATAGGACAGGTATTTCTATTTTTTTGAATATACCTATCATGTATGCTATAATTTATTACGAAATTAACCATTTAATACGGCACATGAAAATAGGCTAGCAAGAGGACTTGTTATTTATTTGATAGTGCCGAATATCTATGATTGGAGAAAATAATAATGGAAAATAATAATGATTTAATTAGTGTTATTGTACCTGTATATAATGTTGAGAAATATTTGCCTAAATGTATAGATAGCATTTTGAATCAAACCATAAAAAATCTTGAAATTATTTTAGTTGATGATGGTTCCTTAGATAATTCAGGTAAAATCTGTGATGATTTTTCTAAAACAGATAATAGAATTGTTGTTATTCATAAAGAAAATGGTGGACTGAGCTCTGCAAGAAATGCTGGTCTTGAAATTGCTAAAGGAAACTATATTGGTTTTGTCGATAGTGATGATTGGTTAGATGAAAATATGTATGAGCAGTTACTGGATTTATTAAAAGCTACTAATTCTGATATATCCTGTTGTAAATTTTTTAGAACAGCAGATGAAAAAGAAAAGGCTCCCTGCGTTGATAATGAAATCATTAAATCCTTTAATAATATTGATGGATTAGGTAATTTCTATACTGATTTATATACTCAAACAGTTGTAGCCTGGAATAAATTATATAAAAGAGAACTTTTTGACAATGTAACTTATCCAGTTGGAAAAATTCACGAAGATGAAGGAACCACTTATAAGTTATTTTACAAAGCTAATAAGATAACTTACACTAATAGGCCATTATACTATTACAGAGTAACGCCTAACAGTATCACTACTAGAAAATTTAATAAAAAAAGATTAGACATTTTAGATGTTTATGATGAGAAAATTAAATTCATGAGAACTATAAATAATG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP016087|5612344:5621081|5615426_5616275_-|WP_077366388.1|DBSCAN-SWA MNDIDYSNYEELGLRDAQIIMAGILKEVADICDKYGIKYFLDAGTLIGAVRHKGFIPWDDDIDIGMLREDYRKFLSIIKDELPEHLFLQTHENDLYYDIYQVPCKIRYNNTLFIEEKIVENPKMHNGLFIDILPYDSLPKKKWVYTIQRKISNFILRSFVRCREIPEKLTFKNKFTHFIYKIVVKIFPTQRRQKLFDFLINWNDINSEYMGYGVDTTWSEYIYKKKDFFDLIKVEFEGEYFYAPKNYDAVLTQLYGDYMTLPKEEDRVWHAKTIKKLSAIDN >NZ_CP016087|5612344:5621081|5617757_5619641_+|WP_077366390.1|DBSCAN-SWA MLIKIFKNFVIFSMIFLLNITLIDNITYAAEQTTTIATSSDTANSTQQSAKTTEESKDKDSKTSTTATKDETKPVDKLNKTLADEPKENFIDYGWKTINNKKYYIVNNKISETTGWIMEKDLNPNIKRNDKNYNAQYYLDEDFSVVIGWKQIDDNWYYFNSDGIMQTGWINNNGTYYLDDSGVMQTGWNKINGAKYFFTQTGQMVTGKSLIGDKWYFFSNIGQLQTGFYTNNGKTYFSDDDGIMLTNKWVSNSKHKFYIKSDGTIAIGDIFINGVMEKFNNNGYYQGSDPNNKNYLYIKFLNVGDADCAFIKLPTGETVLIDTGTPESAKSVVDFLNSQNLKTDFFKASKDVQAINNSNASDNKTDAENVNNTIISTNSATTAAAVRASNGKGVIDYVILTHPHSDHIGGLIELMNNFNIGKIFVPKYFEMQDYAPGATTVSASDIDIIKYDYKVYKATMDAIAKSGIPVVEADPQAFVDSEHILQFLHQNKKYSDLEANTYYKEYGALNDRSAITFLNYGDLQTLFTGDMQWHAESDFAMNKSLKNNEVDILKVPHHGNVGSSSYTFIGYVKPTIGVISRSKSRVVTNNEPYNTLIACGVKIYETSATDGVSVYATKDNWNIETAN >NZ_CP016087|5612344:5621081|5614243_5615227_-|WP_077366387.1|DBSCAN-SWA MTKVSIITPVYNVEECIERCIKSVINQTNKDFEFLLIDDGSKDRSIHIAKELLEKSIINYKIITQKNSGVSAARNKGIEEASGEYITFLDSDDYIDSRFIELMYEKAEETCSEVVFCDYSEVDAQGKVLVKNRTKCLSNFISGKEAALKQLNDDITIGMRSAIYKASIIKGNNLLFDSKRKYGEDMIFIVKALLYSKKVISVNEILAFYVIWGNSVTQNVSLKHLDGYYSYTDLLEEVKTDVSLREIEKFLIEFKIPYSISHIFSVLSKDSNFHKDLFEFLNRTDVKGYLMAYKMQRFNKNNLRYFIQAKGMAYCPKLLLKIFNGLR >NZ_CP016087|5612344:5621081|5616607_5617588_+|WP_077366389.1|DBSCAN-SWA MENNNDLISVIVPVYNVEKYLPKCIDSILNQTIKNLEIILVDDGSLDNSGKICDDFSKTDNRIVVIHKENGGLSSARNAGLEIAKGNYIGFVDSDDWLDENMYEQLLDLLKATNSDISCCKFFRTADEKEKAPCVDNEIIKSFNNIDGLGNFYTDLYTQTVVAWNKLYKRELFDNVTYPVGKIHEDEGTTYKLFYKANKITYTNRPLYYYRVTPNSITTRKFNKKRLDILDVYDEKIKFMRTINNGDLYSKTLKWYLFTLINCYFECHNGMEDSQQYISFIKSKISETYKEYKTNPKKQFHWTILFSIFNISPKLYKLILNSAKSH >NZ_CP016087|5612344:5621081|5612344_5614210_-|WP_077366386.1|DBSCAN-SWA MKSWKTPIIMIIDMFMVNMAYLFAINITDTGSFKLIATTYTKDCVVLSLIYLVCFYLFKMYESLWHLTGTDEFLLGVGGNILAGILSIAYTRSSFGHTIPLNVCVVGILLSIFFVLGYRILYRVYRRTLLYIPFKYSSDQRRVMIVGAGSAGTMIINEMMARRELKYNPIVLIDDDKAKLGKRISGVKIEGNRYDIPYLVREQEIDLILIAIPSLDAKNKAEIIEICKDTNCKLQIIPGMYEILSGDATVSRIKDVDLEDLLGRDPIQLDNKGISDYIEGKTILVSGGGGSIGSELCRQIAAFNPKRLIIFDIYENNVYDIQNELREEFPDMNLTVLIGSVRDRKRLHEVFTKYKINVVFHAAAHKHVPLMEDSPKEAIKNNVFGTLNLALEASEANVSRFVMISTDKAVNPTNIMGATKRLCEMIIQAMDKQSKTEFVAVRFGNVLGSNGSVIPLFKRQIANGGPVTVTHKKIIRYFMLIPEAAQLVLQAGAFAKGGEIFVLDMGKPVKIYDLACDLIKLSGLEPNRDIKIVFTGLRPGEKLFEELLMSEEGLEDTVHKKIHVGKPTFENMDTLKQKLEQLKNLLELNDIGEIKHQMQKIVPTYHYKNEDEVAAENADKE >NZ_CP016087|5612344:5621081|5619671_5621081_+|WP_015395412.1|DBSCAN-SWA MIFSTTLFLFIFLPLTLLIYYLPIFKNKTLKNIILFIASIIFYAWGEPTFVLILLFSIIVTWLLGLLVDKYRSTKMVTFILVITVIFNIGLLFFFKYLNFTIDNLNSLLGLHISNPRIQLPLGISFFTFQALSYVIDVYRKKIDAQKNLLNIGLYLAFFPKLAQGPIVRYETIAQEISNRKENLTDFSEGIMRFIQGLGKKVLIANNLALVADYSFQLAAAPGNNLSVSLAWLGAIAYTFQIFFDFSGYSDMAIGLGRMFGFHFLENFNYPYISKSVSEFWRRWHISLQTWFRDYIYIPLGGNRVSNLKFLFNIFIIWLLTGIWHGANWTFILWGLMYFVLLAAEKFTGFNKKLKGFGYVYTLFFVMIGWVIFRSDNISIAIEYIKIMFGIGANGILDNQFILYLSEFKYYFIAAILCSVPLKDWLSPKFKFDGIIYNTIYCVWYVLILFISISFLVKGAYNPFIYFKF |
6 | Catovirus(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_11 |
6050355 : 6082143
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP016087|6050355:6082143|DBSCAN-SWA 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MVKAVREMVNPGETLTLDQLIGQLSAEEVEKNRLLNIPSVSGCYNLISSTIASLPVKLYKKEGGKVTPIDNDPRLSLLNSNTGDTLDGFQFKQALVNDYLLYGEGYSYINRRVNTISSLHYIENVRVSVQNDNDPIFKHSTILVNGETYQLFEFLRLLRKSKNGAEGVGILTENYEALKVIFNTMRYEGLLVSSGGNKKGFIKSENRLSPEAVSELKKQWNDMYRNNNSNCVILNNGLQFQESANTSVEMQLNENKKTNAIEVCKMFNIPENILNGSCREEEYQTFIKLTILPILAQFETALNNTLLSNKESGVFYFKFDTKQLLKGDLLKRITAFGMAVKYGIMQIDEARKEEDLEPLGLDFIKLGLQDVLYDPVSTQIYTPNTNQTTEIHSTKGGEVENEDRNSSGSSNN >NZ_CP016087|6050355:6082143|6055315_6055756_-|WP_077366628.1|DBSCAN-SWA MFFPLNQDQNENINIAATQKTKFGKSFLFDFDKGDFILIDGKTHIVEGEKALKIWIKKALKTEKYKYKIYEIIDDTYGIELNEFIHSDYPTGVIYAGIQSSITEMLTNHLDITAVTSFEFTRSKQNLSVSFIVLSTYGAITEGVSI >NZ_CP016087|6050355:6082143|6063356_6063710_-|WP_077366639.1|head,tail|DBSCAN-SWA MQGLTSRLRTKLALHGKGIPFINELGEDDFKDGFIKYVYGEIIPTGGVNTSTQADSTQATTSHKITIRSKSIDQLTDDMYFIYKNQRYDIDYFNPNYKFKDSIEIMAKLIGGIYKSE >NZ_CP016087|6050355:6082143|6059999_6060392_-|WP_077366634.1|DBSCAN-SWA MKLKRPIVVTFIGDLNLLGAFLIIVSFFPIQKFVEQFGVIIIPISDLLDAVIRILSVLVMLIISYGYFRLKKWGYGLMITYNLFFLVLSMIFIAFKIKNSYNTQGIIQSLVGLIITFPSKRYFLKENEAS >NZ_CP016087|6050355:6082143|6065267_6065891_-|WP_077366642.1|head,protease|DBSCAN-SWA MRIEIRADQVIIDGYVNAICRDSKPLLSPQGLFVEQIKEGVFQRALNKAQDVKLLFNHLENRELGSIKNGNLQLFEDNIGLRAICSVTDPEVMEKAKNNQLKGWSFAFYNNKDDWQPAEPYQRRFIEDMDLLEVSILDKTPAYNGTSIEARDDKTVLNETRGDEFHAIVDYLFEDQQEDPEELQDEEKREFDNSIFELEILKLKRFS >NZ_CP016087|6050355:6082143|6060884_6061310_-|WP_077366635.1|tail|DBSCAN-SWA MSDIVNKILTGNSGKAWLNGQLLAQLKGIELKVTGKFEDINFCGDSSTHSKYTGWSGEGTVTLYKIDSTLIKLIAKAYQTGVMPDIKLITKLTDESTGKSERVAVSGITITEFTLAKFEARANVEEELPLKFSKYEILDTI >NZ_CP016087|6050355:6082143|6056985_6057411_-|WP_077366631.1|DBSCAN-SWA MYYTAFISKKDKSRMLQFPIPLEELPAVKSGQNTESFTDFFGTEYTFITGSKAREFTIKTWIPKEGTKNPFQLVRNPNKSDYTAVLNWALDKKEPIYLIVCNSAGVTVIQGLFSIDFEESRNHFGDTTLSIDCKQWRDYNS >NZ_CP016087|6050355:6082143|6079270_6079570_-|WP_077366657.1|DBSCAN-SWA MAEEKIFENKIKDFLKSLPDTWFFKHWAGAYSPKGIPDIIASVKGRFVGIEVKASNGKPSALQIRNIDLINKSGGYGVILYPKDFDKFKNEIQKIIKEC >NZ_CP016087|6050355:6082143|6071277_6071835_-|WP_077366648.1|DBSCAN-SWA MKVKFLGVRGSWNDVLNSARTTIHMEHGEKEPSSNWKRRMLLAEHSPIRLLNIKWKWFDLKYWVSTHFVRHWLGIEHYVRTQRDDRTGIARDDKGQGSFVEHEAVANAQALINISRKRLCSCASVDTRIAWKELLHSIKDEEPELYNVCVCDCVYRGYCYEHTSCGYHKTEQYKKELQAYRDGIN >NZ_CP016087|6050355:6082143|6077562_6078018_-|WP_077366654.1|DBSCAN-SWA MSIFDKFKNGIDKNAINEAITEAKENGGGFKEVPEGTYEVAVEKMEIKETKKGDDMISIWFNILDGEFKGSKLFKNQVIKENWQLGQAFDFIFSLDTGIQPTEKITSSEDFQEYLDEVLDEINDKGFEYEVKYTINKKGFTDITITETFQA >NZ_CP016087|6050355:6082143|6062460_6062925_-|WP_077366637.1|DBSCAN-SWA MLSLVQINKAVADQLRGTLVGTPFESVPISPGDLSEIERPSLKIEIDGGKLENINASFKGRNLTIRVYFFASNLKKYKLENLQVQEIIEETFIKGMWIDSYYIPINEVNAEVNDTILQVDFDILITALHIDYDQYSEGSGELMEDLDFDFNINE >NZ_CP016087|6050355:6082143|6078024_6078894_-|WP_077366655.1|DBSCAN-SWA MAIKTLILGESGTGKSTSLRNFDPGEVCYINPAKKPLPFKGKFEALTGTTDIRQISKFIRASNKKIVIVDDGQYLMSFPYMQRLKETGWDKYNDIQSDYFQLFDLADNLPDDVTVYFLSHIQIMDDGRQKIKTIGKMLDEKITIEGMFTTVLKTYVSDGKYYFLTQNSGNDTVKSPMGMFPTFAIDNDLNYVDEKIRNYYEIGEDFKSDEEMKKADEKVKNEEIEKPVDRKARRNKDKGKDEKPKRERKVKEDKIEVVEGDPIPFDEVPDSEFNPPVENKRKSRKKSEE >NZ_CP016087|6050355:6082143|6051352_6051634_-|WP_077366622.1|DBSCAN-SWA MDNINIVVTLGCTLIGAYVGVMSYKNSYKKEIKADTVQQTKIEVQLSYISQGIIDIQTKLNNQDKFNNDILVRVAKVEESTKSAHHRIDEISQ >NZ_CP016087|6050355:6082143|6072705_6073158_-|WP_077366650.1|DBSCAN-SWA MKNNLFKMTEKTLYNYKNLGLEIESLDIHINSIVNDVSIAGVSYEERSSPTNAFSSRVENEVIKRDEHHVEILEKLRSKRQGLIELDRVIKVALNSLESEEYKLVELRYFIKPKKSWVEIGMKLGLDKDTCCRMKNKIINKIMDFIYPSI >NZ_CP016087|6050355:6082143|6069365_6070223_-|WP_077366646.1|DBSCAN-SWA MKKKCLKYVLIAIVSILLFLLALGVCISIPLLIDNWAFGSDYPSNIENKDWAGFLGSYTGSLLGGIVTLVGIWVTIKFQRQQTDKDRVFQSEESEKDREFQRQQANEDRRLAIAPYLIFNVDEVGKFDCDNYDMLFFFDIDDDECTHQFDSVMKIKNIGAGPCLNIKINNIYFNDKKMHDIFDTAIKPEYEILEKNNECFAYIALKVRLDKIRTPKSNMYTMREIKGILSLKVNYNDLMENTYIQYVEIDVNTIFDFKVDKNEWVGSTLPAFNLNKKRYIEIIKK >NZ_CP016087|6050355:6082143|6075613_6077305_-|WP_077366653.1|DBSCAN-SWA MLFYDFEVFKKDWLVVVKDTDTQETHTIVNNSKALKRLYKKNIDNIWIGYNSKHYDQYILKSILLDISPQEVNEFIIERKQPGYKFTSLFNKVQLFNYDCMISPLYSLKQLEGFMGNDIRETTVRFDIPRKLTDEELKEVIFYCNHDVEQTMEVFLNTYSEFESHMSLITAFKLPLSYISKTKAQLSAIILKANKRDRNDEFNITIVDTLKVRKYRYIVEWYKNKANLDYDKELKIDVAGVPHIFAWGGLHGAKKNYIGEGIFINSDVGSYYPALMIEYGFLSRNVMNPEEFRKIRDMRLVFKKDKNPLQQPYKIVLNSTYGASKDKYNPLYDPLMANNVCVNGQLLLLDLIEHLEPHFELIQSNTDGVMFKLKSEADIPLYMEICKEWEQRSRMSLEHDRITKVIQKDVNNYMVVMEDGEIKSKGAYVKKLNTLDYDLPIVNKAIKEYFINDVPVEQTICECNELKQFQKIVKISSKFAYAVYNGQAIEGKVFRVFASRSRRDRQLWKVKQCNPFKIANTPEQCFIVNENIESAATPRKLNKQWYVDIANKRINDFKGVKTA >NZ_CP016087|6050355:6082143|6073416_6075297_-|WP_077366651.1|DBSCAN-SWA MFKGYVGMKGKRPIESIKSRSEFSSLDQVKDLEEYGGVLSDEYILIDIDSKEESEVLQKIIQDKGINCTIIKTTRGKHFYFKNTGVKANVIHKPSALGLIVDIKLGTKNAVIPLKIKGKVRPMSTTGTIDDLPKWLTPLPKCPDFNNLEEGDGRNQTLFNYILLLQRYGFNKQEIRETLNIINDYVLKDKLPDSELNTILRDESFQKESFFDEGGKWSHDLFGTFLQREYSIVKINGELHYYDNGVYVNNLLGIEKLAIKHIPSLNRAKRSEVLTYLNIIAEEVPLSPPDKIVVNNGLLDINTLELEPFDPKYIAVNKLSINYNPGAKSPVVDQTLNKIACNDPSLRLLLEEMAGYPLLRRPELGRCFILTGRGSNGKSTILDMIKSMLGEKNVSAIGMEEIEQRFKTADIVGKLANIGDDISNNYMPDNAKFKKLVTGETLLVERKGKDPFEIRNFGKLIFSANEIPRVNDTSDGLSRRLIIVPFNARFSSNDPDYDPFIKDKLMTDESLEYLLLLSIKGLKRVLSTFEFTQVESVKKELAEYERINNPIIMFIEENKVYYEPVQAVYNKYSLWCHNGGMKPVNINKFTREINEKGFATKQIRVTKNMDIKGFKPGDRVQVFVNN >NZ_CP016087|6050355:6082143|6062926_6063364_-|WP_077366638.1|DBSCAN-SWA MSDWGFDFKQLENYEKKLLETATEKMPRECRKFVNGEGTKLRRITVANARAKVKKKTGKYFKSIKKGKPYVYRGNGGYSVRVYNSPKIAPHSHLIEDGYRIVNHAGQEVGYKPGLKVVDGSRREFESQFYEDIENFIDDMLGKGL >NZ_CP016087|6050355:6082143|6078966_6079266_-|WP_077366656.1|DBSCAN-SWA MKPLEHGQMLKEVFEERINSLNITKEYYETLKESVTTEKAKAKYDILSMEVELSLVFLNDRLEALTEVLEIHEKIENADLSFTEKLACMAKVMQIMNDL >NZ_CP016087|6050355:6082143|6071794_6072205_-|WP_077366649.1|DBSCAN-SWA MLKSCSKCGRIHDKKFICQANRTERTKPGSLANKFRNSQVWKKKRRQILIRDKGLCQLCIRNLYETYGRAYNHKIIEVHHIEPIKENFDLRLDDGNLISLCTYHHKRADRGEIPREELRRLIKNESKISRGSGFME >NZ_CP016087|6050355:6082143|6064050_6065193_-|WP_077366641.1|capsid|DBSCAN-SWA MKNVQIKKILEIRALPPLLEKRNDLLEEMEALTNKANEETRSLNEEEIKRFNEIKEEIRGIDETLKIEEETRQYIMTPGKKKEVEETRSIEETNFLKYVKGEERALSVGDNGGIIPQSIANKIIVRVKELSPIYALTTIYNVNGDLIFPVYDEGGSAIVADYVEDLTELNEATGKFTTVKLTNYIVGCLAKVSKSLINRQDFDLLSFIVDRVALAISQFIERELITGSVKMSGLETCANVLTTAGATISADELIDVQMEIPEIYQSNSVWIMHKTTLKAIRKLKDTTGEYLLNKDLTTAFGWTLLGKPVYVTESCNVVLTGKKVVFYGDMSGLYTKLTKNVELQILNEKYATQHAVGCVGYVELDSKIVEPQKLVALKMK >NZ_CP016087|6050355:6082143|6068799_6069267_-|WP_077366645.1|terminase|DBSCAN-SWA MARPCKSAKILTDCSQTKDEISKRIANENKLRGKADKLKPPSHLNNEQKKLFKYIVNELEQADILGNLDVYILETCVIAIDRKREIDRLINEDITQAFDPQVIGAKKKYTDELFRCCNELSLSPQARAKLGNINIEAQKQNSDPLLKVLQGRKKE >NZ_CP016087|6050355:6082143|6080033_6081197_-|WP_156875973.1|DBSCAN-SWA MGLGKTFVATEKAEQLGTNIILLICQKSKLDDWEDHYKEFYPRYKVIKYNKPLTKIEPYTVIIINYDLTWRRAELKKLKGFTLILDESSYIKNATSKRTKFILRLKPENIILLSGTPTGGKYEELFTQLSLLGWKITKKNYWDTYIKYFMYDVGGFSRPKVTGYKHVDRLKRKLRDHGAVFMKTEDVITLPDTIEYEIPVKNIPEYKKFKKDRLIEIGGIELIGDNSLTNRLYLRQLAGMYNKHKYEKITELMESTDDRLIIFYNFNYEYDELVKICKKLNKPVSMVNGDSKNLKNYDEYLDSVTIVQYQAGAMGLNLQKCNKIIYFSLHQSSDLFEQSKKRTHRLGQDRTCIYYYLITDQSVEQDIFKTLKQRKDYTDELFKEAYK >NZ_CP016087|6050355:6082143|6053695_6054265_-|WP_077366626.1|DBSCAN-SWA MEFTKDQIMAKAPDLMKDMPEYYKNSDVAKNQLNVESYEVGRLMVTIQDVEDQLYINRTTWGLDIYEKAYNITPNPGASYEERREVIKAKRRGRGTTTKAMIKNTAEAFSGGEVDIIEHPADFSFTIKFVGAKGIPQNMVGFINMIREIKPAHLVCDVEYSYNVWNVINSKQMMWNTAEAKAWEEMKVI >NZ_CP016087|6050355:6082143|6067126_6068803_-|WP_077366644.1|terminase|DBSCAN-SWA MTILEHPSYIYTLDVLSGRIKAPKYVIIQCNQFRLMAEGKSKKYTIDQEKVELIDDILDMLVMPKGLKAGQPIKNCVAGFQFFFIVAVLCAVHRDNLARRRYETAVLEICRKNGKTFLVGLIFILLFLLEPKYSKFYSVAPDGSLSREVKEAIQEIIGSSPVLENKFKIRRDDIFCKITDNKYVPLNYSNSRLDGKLPSVFLVDEVGALPNPYAVEAMRSGQLTILNKLGCIISTKYPTVDNPFEDEVGYCKKVLDGLVNDDTIFALLYEPDDVIHWTTNDEILEHGNPLALEVPEIMEDLKKKRGVAIEVPSKRENFITKHCNIIYQGLGTESYIDVNKLREGIVPKINWFGRKVWIGLDLALTNDNCSVGMVGEEDGDILAEAIAFIPEDRIEEKSKFEKIDYHEFVRTMKAIACGDMTVDYSVIEDFILNIESNYGVEVMGIGYDRYNCLSTAQKLNEGGYKVVEVRQHSSVLHPPTKLIKECIESNRFKYESNLLLKINFQNARVTEDTNLNKYVNKKKSNGKVDMVVSLINAVYLMQQDVIFNVGGDFVIQTV >NZ_CP016087|6050355:6082143|6059491_6059884_-|WP_077366633.1|DBSCAN-SWA MSKKAIQKATFKDLLARKIQKEQEQFKSKDIEVSSLEKTLTFIKPKDNTLIDVIDEMGEGKSTGDMVQAFKTLIYHTCPMLQDPEFHAQLEIQDPDEVVSAIFDLSDIMEIGQELMELVNINAKVDEIKN >NZ_CP016087|6050355:6082143|6055757_6056081_-|WP_077366629.1|DBSCAN-SWA MNWANELAREFKKRDNESPLGAVVGTVIAVDPIKISILGDRVFLTKDMVYMCSSLLNGIDRSATIQINGGTATDGKITFKDVLKVSDQVLCLPAEGGQAFFIIDKVV >NZ_CP016087|6050355:6082143|6081765_6082143_+|WP_077366661.1|DBSCAN-SWA MNNVSIIGENIKKIRQHKNMSAVDLAQKADVSNATISQIENGRRQTLQADTLEKVAGALGVTTDHLLGDSDTVKFETNDIIDVLNIINYAEGITLDDIKLTDDEIQLLNISIKTTLNAIRFSRLK >NZ_CP016087|6050355:6082143|6054277_6055315_-|WP_077366627.1|plate|DBSCAN-SWA MADSSAVILNRMLSNVDPSYDTSNGSFFYDFNAPMSIELSEAYKLVEDIITRRNIATSTGDYLTELCSEEGIDRHLATYSVGQVILKGLPGAIISPGDLVSSGLINFEILESAVIIESGQVMVNIKSKTLGSIGNVPVGSITSFPKTLTGITEVTNAVATTSGYDQESDDSLKERYYIKVRTPATSGNPYHYLQWARDVVGVGSAKVFDTWNGWGSVKVVIADSNKRGANQDLIDQTFNYIESVRPIGANVTVISAIEKPLNVTASITLQPGGDLDTVKAQFSNALEAYLKSVAFNTAYISIAFVGNLLLDTGIKDYTNLMINGKAEPVTLTEEEIAVIGSVTFS >NZ_CP016087|6050355:6082143|6075323_6075617_-|WP_077366652.1|DBSCAN-SWA MKINIDKKQINSEEIKTIAKEVADLVERKNRDYGNSFDKTMGEYGITAYFLRIEDKISRLKSLNKSNTQLVADESKEDTLKDIIGYTLLMINYLKNQ >NZ_CP016087|6050355:6082143|6061325_6062483_-|WP_077366636.1|DBSCAN-SWA MILILMSNFNIKYFNTKEEFKKMANVTLPVLEVNFKQLLATFIERSERGIAILIVRDDTDKSYNYKKYVEQEDLDKDKALYTNDNFQYLSDVISFGVAELSVIRIDEDDEITVGLNLIATKLKTGWISTVGTAEDYTAINSWIKARANEGKTYQALTYKSTAPDHPMITNFTNPSVTFLEEARGKRNGVEYLPSLLAIACVCNVTRGMTYFVCKNLKEVEPVADVTNSLNNGELILINDFDCVRVGTAINSLVTIDESKGIFDDMRYIEIMEATNMMKDDIRDIYKTKYVGACKNSTDNQMIFISAVNTYFEGLADSEILDNAYDNYAYININKQRKAWETVKPEAKTWDDTKVKNMTFKRSTFLGADIKVLGSMMNLDFDVYMA >NZ_CP016087|6050355:6082143|6051107_6051335_-|WP_077366621.1|DBSCAN-SWA MNINLKSRLKNKAFWVYIVSTLVTLTQLFGVKVFPDNWQTILNTVLGLLVVMGVIVDNSTTGFSDNKTNDSEVLQ >NZ_CP016087|6050355:6082143|6052315_6053683_-|WP_077366625.1|DBSCAN-SWA MKNTTNYKLKKPEGTDVVNVEDFNSNADIIDGKLKELETNEIFYAVATGSANNYTVSISAISTLSTYFDGLAVCVKINNASTGASTVNVNGWGAKAIVDSMGNQITNGGLKKDMPYTLRYNGVNFILQGKGGGGNVTADKLLIGTTATGDSGAIVGTMPDNGAINITPGATAKTIPQGHTSGGTVAGDSNLITENIKEGVSIFGVTGKSSVVDTADGLATASQILAGASAYVNGLKVLGNIQSRSATTYNPSTTAQTIPQGLYLSGDQTIAPVTGTANVGHVLTGYTFSSANGINLTGTIPSKGSATITPGTTNQTIVSGQYILGNQTIAGDSNLIASNIKSGISIFGVTGNVTIQSLGGVVGAKGSITFGTTEYGTNYTKTITLGFVPTVINVYMYNGSAIRQGTWQTIDGTNNIVVVSQSGAIAVRYTVNSNVISMYVNSSGYSGTYYWMAMQ >NZ_CP016087|6050355:6082143|6050355_6051108_-|WP_077366620.1|DBSCAN-SWA MKIGLRGGHSANCIGAVGIVNEYEQMQKYFKAVSQVLTDYGHTVIDCNSNGSNAGAELSEGATKSNTAGVDLFVSLHMNASNGQGHGVETLVSSANSGAYKYALNLCNNFGSLFTNRGVKFENLYEMNHIQAPNIIFELCFCDNETDIMIYNNYSWDQLAYRFANAIDPNIPIEPPTDNQKGYVVTNYLPPLSAIYDGVNVNAVLEYFEGVTCYVRGNNNGVWIETQYLSLSKCQELKNTLDLLFYEIKR >NZ_CP016087|6050355:6082143|6056083_6056989_-|WP_077366630.1|DBSCAN-SWA MIYKLVTKGTDILIKSNNLSWGTDSQTLGSTLAFDSLHSLNMGQVVSCFIDGYEVFRGTVVKCTESKFTYSYTCFDYSFYLKSEVVKQFNDIDVTSGLSSLLLEFQIEHSIINIPTKINKFYKGDSIDKIIDDFLDQAGKDQAINYFKEMQGAKLVIDRLDNKYIYPKFLYDKDIKIDYSIENMKNKIQVVSNSEESSPILAESQDTTAQWYFGLLQHVEKVDDKDVSQSKNIADNLLKSLNRIEHSTTVSLLVLDRAETIQSNRLIYLSNDKLKEGWYKIKSANHTVTSGIHKVNISVEW |
41 | Clostridium_phage(32.0%) | capsid,plate,tail,protease,head,portal,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP016087.1|WP_077363365.1|3083686_3083890_+|hypothetical-protein |
3083686_3083890_+
Protein sequences of NZ_CP016087.1|WP_077363365.1|3083686_3083890_+|hypothetical-protein>NZ_CP016087.1|WP_077363365.1|3083686_3083890_+|hypothetical-protein MKKAYINLPDNKSAASTYQIEIEYDNGEIKKDEIIQYSYSNVFEVIKERHEGEHDRKVKSIKIDFMY |
67 aa aa | NA | NA | NA | 3061369-3114713 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 3.2|596929|35|NZ_CP016087|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016087 position: 3073399-3073365, mismatch: 0 acattaactctctttgaaaagagtaattgttcctt CRISPR spacer acattaactctctttgaaaagagtaattgttcctt Protospacer *********************************** |