CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP013773	Piscirickettsia salmonis strain PM37984A, complete genome	3 crisprs	DinG,DEDDh,cas3,RT,csa3	1	2	27	20
NZ_CP013774	Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence	1 crisprs	RT	0	3	2	11
NZ_CP013776	Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p3PS4, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP013775	Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p2PS4, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	5	0
NZ_CP013777	Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p4PS4, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0

1. NZ_CP013773

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP013773_1

• CRISPR_ID: NZ_CP013773_1
• CRISPR_location: 409009-409115
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP013773_1

Consensus_repeat	Method
GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP013773_1

>1.1|409047|31|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder
CCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013773_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP013773_1

>merge|NZ_CP013773|1|409009-409115|CRISPRCasFinder
GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGACCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAAGCGCTTAATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA

>NZ_CP013773|1|1|409009-409115|CRISPRCasFinder
GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA	CCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAA
GCGCTTAATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP013773.1|WP_016210791.1|416680_416881_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013773.1|WP_054300334.1|406957_407446_+|protein-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|270916
NZ_CP013773.1|WP_016210800.1|412880_413708_-|DsbA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|239321
NZ_CP013773.1|WP_155046973.1|400708_400867_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013773.1|WP_016212182.1|401223_401409_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013773.1|WP_016210749.1|397826_398288_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013773.1|WP_016212185.1|401742_402732_+|rhodanese-related-sulfurtransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|223982
NZ_CP013773.1|WP_016210752.1|396859_397657_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|368573
NZ_CP013773.1|WP_016211834.1|406105_406420_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013773.1|WP_036779544.1|410076_411084_+|IS3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|366234
NZ_CP013773.1|WP_054300338.1|411108_412674_-|APC-family-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223605
NZ_CP013773.1|WP_052104738.1|417255_418062_+|methyltransferase-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226472
NZ_CP013773.1|WP_016210799.1|415304_416258_+|chemotaxis-protein-CheV	unknown	unknown	gnl|CDD|223905
NZ_CP013773.1|WP_016210751.1|394570_396376_-|DEAD/DEAH-box-helicase	unknown	unknown	gnl|CDD|236941
NZ_CP013773.1|WP_075273540.1|414074_414686_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013773.1|WP_051307365.1|406677_406938_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013773.1|WP_098082828.1|409819_410077_+|transposase	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013773.1|WP_129556527.1|414870_415131_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013773.1|WP_016210748.1|398586_400542_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|183236
NZ_CP013773.1|WP_016210795.1|418167_419139_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270361

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP013773.1|WP_016210799.1|415304_416258_+|chemotaxis-protein-CheV	gnl|CDD|223905	COG0835, CheW, Chemotaxis signal transduction protein [Cell motility and secretion / Signal transduction mechanisms].	4.08417e-34
NZ_CP013773.1|WP_054300338.1|411108_412674_-|APC-family-permease	gnl|CDD|223605	COG0531, PotE, Amino acid transporters [Amino acid transport and metabolism].	2.08501e-34
NZ_CP013773.1|WP_054300334.1|406957_407446_+|protein-kinase	gnl|CDD|270916	cd14014, STKc_PknB_like, Catalytic domain of bacterial Serine/Threonine kinases, PknB and similar proteins. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. This subfamily includes many bacterial eukaryotic-type STKs including Staphylococcus aureus PknB (also called PrkC or Stk1), Bacillus subtilis PrkC, and Mycobacterium tuberculosis Pkn proteins (PknB, PknD, PknE, PknF, PknL, and PknH), among others. S. aureus PknB is the only eukaryotic-type STK present in this species, although many microorganisms encode for several such proteins. It is important for the survival and pathogenesis of S. aureus as it is involved in the regulation of purine and pyrimidine biosynthesis, cell wall metabolism, autolysis, virulence, and antibiotic resistance. M. tuberculosis PknB is essential for growth and it acts on diverse substrates including proteins involved in peptidoglycan synthesis, cell division, transcription, stress responses, and metabolic regulation. B. subtilis PrkC is located at the inner membrane of endospores and functions to trigger spore germination. Bacterial STKs in this subfamily show varied domain architectures. The well-characterized members such as S. aureus and M. tuberculosis PknB, and B. subtilis PrkC, contain an N-terminal cytosolic kinase domain, a transmembrane (TM) segment, and mutliple C-terminal extracellular PASTA domains. The PknB subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	6.10209e-13
NZ_CP013773.1|WP_036779544.1|410076_411084_+|IS3-family-transposase	gnl|CDD|366234	pfam00665, rve, Integrase core domain. Integrase mediates integration of a DNA copy of the viral genome into the host chromosome. Integrase is composed of three domains. The amino-terminal domain is a zinc binding domain pfam02022. This domain is the central catalytic domain. The carboxyl terminal domain that is a non-specific DNA binding domain pfam00552. The catalytic domain acts as an endonuclease when two nucleotides are removed from the 3' ends of the blunt-ended viral DNA made by reverse transcription. This domain also catalyzes the DNA strand transfer reaction of the 3' ends of the viral DNA to the 5' ends of the integration site.	8.8404e-24
NZ_CP013773.1|WP_016210751.1|394570_396376_-|DEAD/DEAH-box-helicase	gnl|CDD|236941	PRK11634, PRK11634, ATP-dependent RNA helicase DeaD; Provisional.	0
NZ_CP013773.1|WP_016210795.1|418167_419139_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|270361	cd13643, PBP2_BCP_2, Substrate-binding domain of osmoregulatory ABC-type glycine betaine/choline/L-proline transport system-like; the type 2 periplasmic-binding protein fold. This subfamily is part of a high affinity multicomponent binding-protein-dependent transport system specific to certain quaternary ammonium compounds for osmoregulation. The periplasmic substrate-binding domain, which is often fused to the permease component of the ATP-binding cassette transporter complex, is involved in uptake of osmoprotectants (also termed compatible solutes) such as glycine betaine, proline betaine, choline, and carnitine. Many microorganisms accumulate these compatible solutes in response to high osmolarity to offset the loss of cell water. This domain belongs to the type 2 periplasmic binding fold protein superfamily (PBP2). The PBP2 proteins are typically comprised of two globular subdomains connected by a flexible hinge and bind their ligand in the cleft between these domains in a manner resembling a Venus flytrap.	1.06046e-118
NZ_CP013773.1|WP_052104738.1|417255_418062_+|methyltransferase-domain-containing-protein	gnl|CDD|226472	COG3963, COG3963, Phospholipid N-methyltransferase [Lipid metabolism].	1.28417e-38
NZ_CP013773.1|WP_016210800.1|412880_413708_-|DsbA-family-protein	gnl|CDD|239321	cd03023, DsbA_Com1_like, DsbA family, Com1-like subfamily; composed of proteins similar to Com1, a 27-kDa outer membrane-associated immunoreactive protein originally found in both acute and chronic disease strains of the pathogenic bacteria Coxiella burnetti. It contains a CXXC motif, assumed to be imbedded in a DsbA-like structure. Its homology to DsbA suggests that the protein is a protein disulfide oxidoreductase. The role of such a protein in pathogenesis is unknown.	1.60773e-43
NZ_CP013773.1|WP_016212185.1|401742_402732_+|rhodanese-related-sulfurtransferase	gnl|CDD|223982	COG1054, COG1054, Predicted sulfurtransferase [General function prediction only].	3.74089e-160
NZ_CP013773.1|WP_016210748.1|398586_400542_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein	gnl|CDD|183236	PRK11619, PRK11619, lytic murein transglycosylase; Provisional.	1.01987e-91
NZ_CP013773.1|WP_016210752.1|396859_397657_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|368573	pfam05708, Peptidase_C92, Permuted papain-like amidase enzyme, YaeF/YiiX, C92 family. Amidase_YiiX is a family of permuted papain-like amidases. It has amidase specificity for the amide bond between a lipid and an amino acid (or peptide). From the structure, a tetramer, each monomer is made up of a layered alpha-beta fold with a central, 6-stranded, antiparallel beta-sheet that is protected by helices on either side. The catalytic Cys154 in UniProtKB:Q74NK7, Structure 3kw0, is located on the N-terminus of helix alphaF. The two additional helices located above Cys154 contribute to the formation of the active site, where the lysine ligand is bound.	2.13986e-06

Protein sequences

>NZ_CP013773.1|WP_054300334.1|406957_407446_+|protein-kinase
MPFFPGDSFNAALTKDPDSVDEIILAVALELQRIHQSGVIHGDIRSDNIIIEEKNGIFNAKFIDFGWAYEYPSDDNVIVTKCSYFAPERAKIDLKAHPSQDIYSFGWMLGIAHDLVKEIPEKFYGFLIGANEEDPVLRPELRLLIKANLCPTLGECYTQLVK
>NZ_CP013773.1|WP_051307365.1|406677_406938_+|hypothetical-protein
MPILEYQRPRSGSVIERRLESGVVESYQSIRDLGQGGNGSVRLFASKTALERYAVKRPLEVQRHSLDYLKLEERLSKRRSFIFSNF
>NZ_CP013773.1|WP_016211834.1|406105_406420_-|hypothetical-protein
MNQDTELSLSEEKEQKNFESLCDMLYECTIKTINQHTASFNEDELIFKQPIFMHINAAAQVLNAMINDAGDVLAEQHNEVTPELAVNELKKLTHSILFGDDHSH
>NZ_CP013773.1|WP_016212185.1|401742_402732_+|rhodanese-related-sulfurtransferase
MNQVVVAAMYKFARLPDYKDIQPKLLAFCKAQGIKGTLLLAQEGINGTVSGSRQAIDNLLNFLKSDSRLRALEHKESYLDAAEVPFYRMRVKLKKEIVTLGVDGIDPNEIVGHYVKAQNWNALISDPDVIVVDTRNDYEYDIGTFKRAENPNTETFREFPEYVEKNLDPKKHKKVAMFCTGGIRCEKSTAYMLKQGFEEVYHLEGGILKYLEEVPKEESLWEGECFVFDNRVSVNHDLEKGQYDQCHGCRYPITEQEKASSLYIEGVSCPYCYNNLSDEQKARFSERQRQMALAKHRGHQHIGDSIELAKQVKRQKRKAQVEACQTKQK
>NZ_CP013773.1|WP_016212182.1|401223_401409_+|hypothetical-protein
MKSMKKHSKLEAEIAIEPADVIEMTMTELSTRRAEAMEAIESGKFIQIVKHKKPIGMLVPF
>NZ_CP013773.1|WP_155046973.1|400708_400867_-|hypothetical-protein
MARSVRTTPPQYGSYSKQSECQNQACFLGYLIKLIIALQNNTLLLFKSLNNK
>NZ_CP013773.1|WP_016210748.1|398586_400542_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein
MPYYTFIYLIALMVSLFITQSFYAANYLNHSLDKQRIFFHQAEQHLKKSRLQSFKKELKKLTHYPLYPYLRYQELIRQLQLGFLPNNKIKHFLNQYQNTIFHDRLHRQWMIHLYNKKWWKTLIKYYQPATKSTAMQCRYLWARYQLNYQQQSLHAFKKVWLQGRSLPKVCDRLISALRKHKQLTNSLAWQRITLAMQKRNYQLAGYLARFLSSQDKKALTLWRILRRHPEKMTKTSLIRAAGNKANYIANDTLLQLAKRKPEYAITIWPRLKSKFSLTKQQKIAITKSIALHLALKKSSKTSHWMEKVPDQDQSLTLTSWNIRTALYQQRWQHALTLINTLPPNEYDSHLWQYWKARALEQLGQITQAKKVYKRLAKHRDYYGFLASNKLQQPYQLNRKAVNISKHILSNVSKKPGIRRAYEFKKTGHPGLARSEWVYAINQFTETEKLAAAKLAHDWGWYNLSVLTTTKTKHRDDLKLRFPMAHYRAILRNAKRYEISPAWVFSVARQESIFHEHAYSPVGARGIMQLMPTTARYIAGKIQIRHYTSKLLDANHNIALGTAYLKRLLERYDNRLILALAAYNAGISRVNQWLPERNPIAADLWIETIPYKETRSYIKNILAYTVVYNARLGHTTKMAQQLVNVPTLKQIS
>NZ_CP013773.1|WP_016210749.1|397826_398288_+|hypothetical-protein
MSKIKSLKPFVHEITVDVHFSKKQAMHIRKLGQNLDLRVITPKAMVRLGEQLFTAKLISAIDLMSLLQPGFNQNYGEVAAQMGVQLKQPPALMNAIQFYYESWQKKIRQKGVNSQQRLLARREYHLMLALQKSLGLPVDGKMIQAKKTVIEDL
>NZ_CP013773.1|WP_016210752.1|396859_397657_-|hypothetical-protein
MQLLNRPLVKWLLKEEPPPSTPLCDYERICYEIRPCDVLLVEGRSRLSDVIQVITRSPWSHSALYIGRSQDIENLHIRQFIEDNYDGSPQDQLVIEGYLGQGTVINLLDDYKYSHIRICRPRGLSRKDVQQVIAYAASKVGSAYNVRQIFDLFRLLLPWTILPRSWRSSLFHHNLGDPTRTVCSTMIAEAFNVVDFPILPDLHTSEDGKMALHIRNPRLFTPRDFDYSPYFEIIKYPFISIDDHMPAYKNLPWQKGRPQDLPTEK
>NZ_CP013773.1|WP_016210751.1|394570_396376_-|DEAD/DEAH-box-helicase
MSSTIGFDKLGINDNILNSISELGYETPSPIQEQSIPVLLNQQDILAQAQTGTGKTAAFALPILTQLSLKHNQPQALVLAPTRELAIQIAEAFQRYAKYLPGFHVLPIYGGQEFRSQLRALKRGVHIVVGTPGRIMDHMRRETLPLESLKTVVLDEADEMLKMGFIDDVKWILQQIPTEHQTALFSATLPPSIKGIASQHLVEPVHIQIKSTTNTVSTIEQSYMITSKHHKLEALTRYLELEEFDAVIVFARTKIATTELAERLEARGYSAAAMNGDMNQASREQVIKRIKNGAIDIVIATDVAARGIDVNRITHVVNFDIPHDPESYVHRIGRTGRAGRDGKALLFVSPRERRLLKDLERVTRQPIKAITPPTANEITEKREESFKKQIINTINETTDLDYYRNLIESLLPLSEKSELDIAAALAYMAQKQKPLQMQKEDPKALSFESPHDRGGRHEPSQRERRTRQAIQTAEHGMSRCRLEVGHRHRIQPSDIVGVLANEGNITHKAIGRIHIFDDYSLVDLTSKVTNQVIELTHQCRVKGHPIKIKPATDKDNQEGQSNNHGRRSHSRDRDSGFKRRRSNSSHNGQSQSQSRTRKKIS
>NZ_CP013773.1|WP_098082828.1|409819_410077_+|transposase
MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN
>NZ_CP013773.1|WP_036779544.1|410076_411084_+|IS3-family-transposase
MDEINKLSKEKNVTAIALCKAVSMPRATYYRQQKKGTLEKKPAFKPSNAIDNQEKDQIIELLHSERFIDSTPYQTFYTLLDEGHYYCSIRTMYRLLTEHSGTKDRRIQRNHRNAIKPELIATTPNQVWSWDITKLLSTKRLVYYHLYVILDIFSRYAVGWLIADRECQDLAYQLIEATALRQGVQKGSLTLHADNGPSMTSGTVGDLLENAGIIKSHNRPYTSNDNPFSESQFKTLKYCPQFPKRFDNIKEAELFSQDFFKWYNSMHYHSGRCFLTPESVHYGLSDGILDKRHDTLMSAYIENPSRFNNKPPVRKILKPAYINPPQTVIIQGVQK
>NZ_CP013773.1|WP_054300338.1|411108_412674_-|APC-family-permease
MIGSGWLFSSYYAAKITGAAACLSWITTSVVILLLGLCLAEIATLYPKRGLMARLLTLSHNKEFAFICTISTWLGLTAVIATEAEGSVQYISSLSDSFGPMIFNNQIHQLTSLGLIIAIVMILSFGLINFWGIKILSKSNVALTTCKIAIPLVTGLSVMFAAFHHQNFHNDHAPLLNYGPSSVFIAMIGAGMIYSFNGFQNILSFSSEARQPTRDIPLAIIFSILITLAIYLVLQIAFIGALSPHILEQGWQSLNFTSPFVQLTALLNLNFITIILYADSVISPSGTGLIYTGSTTRLLTAMSQDGQMPRFFNKIGAYNFSRRSLMFTVGFSIIFLLLFRSWSALVSFLSLFYVISYMSIPLSLSKLHQQNLVGKFRAPLPKLLLPVIFAFLSLLFIFSKFPYTGDVALFTVIAYAAYLLSQFKLATDLNHFKKTVKHSSLMVIYIIILAALSSIGPKEYGGYNLLSKLQFFPSVIFVSFIMYRLSLAWIRDKATETQVIKISPTLQRNVSGEMRQNYRFS
>NZ_CP013773.1|WP_016210800.1|412880_413708_-|DsbA-family-protein
MKKYLFASLSLVTPFVLSNAFAANTTTFTAAQQEKIGEIAAQYIINHPEVLIQAGQKLQQQQMKAQEKQQITAVLHAKKQLLSDPKTPTVGPSNAKVAVVEFFDYQCVFCSKVAPAIEKIMKDNPKVKFVFKDFPIFGQRWPTSTYAAEVGLVAYKQGGAKMYMNYHNGIYATGKDEGKLTNKDVDMVAKKAGVDLTKDKTLLSAGKTPPPSIQANFQLAGEALGLRGTPALVIMPTSGANEKNVTVFAGYPANPQGGTAAAVTAIQQAIDKASQ
>NZ_CP013773.1|WP_075273540.1|414074_414686_+|hypothetical-protein
MSKVIAICPLLVGCTFLCSTSAESESDPSVSQDAQFITEVARSVMQDDISQSIVTECKSMNTESQSALIAEKNHYVPTKKAIQHMETAILEYGSNLADHYEREHPSTMLVTYRGWITSKQCINKLKETVMRAAQALICLGKEQNAVRDSAQLLLIDTVEAVAMKQDYGVSEDQEDQPCAIGWSSTMTYYGLKALDQALVTSKH
>NZ_CP013773.1|WP_129556527.1|414870_415131_+|hypothetical-protein
MSANSNSKIDVIALTVSGQVEKKIRVECNSLATDHVTDDLASKTNRDRAWQIYSSSYERCMAEALDMMRQDLLAVSIQPQLRPEIN
>NZ_CP013773.1|WP_016210799.1|415304_416258_+|chemotaxis-protein-CheV
MRANLLENIDSRTKLVGRNRFEALVFSIHGRQYAINVFKVREVLHLPELTVLPESHPAVLGVVHIRNQSLAVIDTCQAIFAKKTLDPLSGILIVTEYNHSVQGFLVHEIHHIINATWENVIAAPEATGKDKYITSVLKINEEGATSLIQVIDVEKVIYEIHPAQYDIKVSTNTLENVVIEQAPHYTALVVDDSLIARKQVKKALDTIGVKSILMRNGREALDYLINVLPGAGGDITQKYLMVIADVEMPEIDGYAFIKACREHPGLKNLFIILNTSITGVFNENDIQQTGCNEFIGKVNPQKIIECARMQILNRASQ
>NZ_CP013773.1|WP_016210791.1|416680_416881_-|hypothetical-protein
MPGDEKKKAAKTSTRENQSSLIDSEASSLPPTLLFYTDSLSLIDQGQDIPIGSKKESSCPTCCLVM
>NZ_CP013773.1|WP_052104738.1|417255_418062_+|methyltransferase-domain-containing-protein
MKLGEGSLKEKMVFIERATDQSIPTPWQLFSRLIYRYWFLKYPWQMSKFLGRQSKRLWLWFWLSSCNRSSGLKKVDNSIKNTLEKYGLTLGFFKAAIANPRATGAVLPSSRFLVREMVTHVVQMPERYVVELGAGTGVITQELLSSGVSPGQLIAIEYDKNLARKLAARFPDILVICGNAVELERLLGEKNGCVSTVISGLPLRSLPNQAVVHILQQIPSVLVSGGSYIQFTYDFKKKEEYYPGDIELSLSKKIWLNIPPAKVDVFTK
>NZ_CP013773.1|WP_016210795.1|418167_419139_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein
MFKSKLIVLTLSIWATCFYGNVVAQTKTSTNNNTKIARVLVNDWTSQIVLSKITAHILASINYQVTFVQSTSNRQWYKLKSNLADIQVEVWQGTMADKYNQLIKSGDIVDAGNHVAKTREDWWYPEYVEKQCPGLPDWKALRKCYKIFATPKTAPKGMYLGGPWEKPDRARIRALNMNFKVIQVKNGDALWIELEKAVKQKRPIVLFNWTPNWIESKYKGKFIEFPHYSAECENNPKWGLNSKFPWDCGNPKDGWLKKIARSQFQKEQPCAFELLKNINFTNTMIANITAAVDADKMSYDEAAQDWLNQNKALWHSWIPSSCK

Crispr_ID: NZ_CP013773_2

• CRISPR_ID: NZ_CP013773_2
• CRISPR_location: 1600708-1600828
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP013773_2

Consensus_repeat	Method
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP013773_2

>2.1|1600745|47|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder
CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013773_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP013773_2

>merge|NZ_CP013773|2|1600708-1600828|CRISPRCasFinder
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCTCGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGCTTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT

>NZ_CP013773|2|2|1600708-1600828|CRISPRCasFinder
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCT	CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC
TTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP013773.1|WP_036778484.1|1609104_1609716_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|236415
NZ_CP013773.1|WP_098082812.1|1597906_1598422_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013773.1|WP_036778297.1|1592045_1592519_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
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rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP013773.1|WP_036778484.1|1609104_1609716_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	gnl|CDD|236415	PRK09220, PRK09220, methylthioribulose 1-phosphate dehydratase.	2.90159e-95
NZ_CP013773.1|WP_016210671.1|1592651_1593911_+|6-phosphofructokinase	gnl|CDD|237600	PRK14072, PRK14072, diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase.	0
NZ_CP013773.1|WP_032126312.1|1604167_1604962_-|M48-family-metallopeptidase	gnl|CDD|307807	pfam01863, DUF45, Protein of unknown function DUF45. This protein has no known function. Members are found in some archaebacteria, as well as Helicobacter pylori. The proteins are 190-240 amino acids long, with the C-terminus being the most conserved region, containing three conserved histidines. This motif is similar to that found in Zinc proteases, suggesting that this family may also be proteases.	1.59691e-55
NZ_CP013773.1|WP_016211759.1|1606111_1607299_+|S-methyl-5-thioribose-kinase	gnl|CDD|236561	PRK09550, mtnK, methylthioribose kinase; Reviewed.	0
NZ_CP013773.1|WP_016210944.1|1609762_1610782_-|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase	gnl|CDD|273112	TIGR00512, methylthioribose-1-phosphate_isomerase_predicted, S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase. The delineation of this family was based in part on a discussion and neighbor-joining phylogenetic study, by Kyrpides and Woese, of archaeal and other proteins homologous to the alpha, beta, and delta subunits of eukaryotic initiation factor 2B (eIF-2B), a five-subunit molecule that catalyzes GTP recycling for eIF-2. This clade is now recognized to include the methionine salvage pathway enzyme MtnA. [Amino acid biosynthesis, Aspartate family].	1.29472e-143
NZ_CP013773.1|WP_016210672.1|1590654_1592037_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase	gnl|CDD|130153	TIGR01081, mpl, UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate ligase. Alternate name: murein tripeptide ligase [Cell envelope, Biosynthesis and degradation of murein sacculus and peptidoglycan].	0
NZ_CP013773.1|WP_105962625.1|1602205_1603092_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	9.72465e-44
NZ_CP013773.1|WP_016210935.1|1607875_1608418_-|acireductone-dioxygenase	gnl|CDD|224704	COG1791, COG1791, Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain [Function unknown].	2.05718e-61
NZ_CP013773.1|WP_016211756.1|1605140_1605866_-|M15-family-metallopeptidase	gnl|CDD|350618	cd14843, D-Ala-D-Ala_dipeptidase_like, D-Ala-D-Ala dipeptidase, includes uncharacterized enzymes. This subfamily of D-Ala-D-Ala dipeptidase (also known as D-alanyl-D-alanine dipeptidase vanX; VanX; EC 3.4.13.22) also includes several uncharacterized proteins. This is a Zn2+-dependent enzyme that mediates resistance to the antibiotic vancomycin in Enterococci and other bacteria (both Gram-positive and Gram-negative). It is part of a gene cluster that affects cell-wall biosynthesis. The operon triggers the termination of peptidoglycan precursors by D-Ala-(R)-lactate instead of D-Ala-D-Ala dipeptides. The enzyme is stereospecific, as L-Ala-L-Ala, D-Ala-L-Ala and L-Ala-D-Ala are not substrates. It belongs in the MEROPS peptidase family M15, subfamily D.	1.11944e-66
NZ_CP013773.1|WP_016210936.1|1610883_1611678_-|thymidylate-synthase	gnl|CDD|234984	PRK01827, thyA, thymidylate synthase; Reviewed.	0
NZ_CP013773.1|WP_129556590.1|1603775_1604171_+|nucleic-acid-binding-protein	gnl|CDD|380015	pfam17775, UPF0225, UPF0225 domain. This entry represents an NTF2-like domain found in bacterial proteins.	6.66662e-47
NZ_CP013773.1|WP_016210676.1|1594366_1596448_+|kinase-domain-protein	gnl|CDD|270918	cd14016, STKc_CK1, Catalytic domain of the Serine/Threonine protein kinase, Casein Kinase 1. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. CK1 phosphorylates a variety of substrates including enzymes, transcription and splice factors, cytoskeletal proteins, viral oncogenes, receptors, and membrane-associated proteins. There are mutliple isoforms of CK1 and in mammals, seven isoforms (alpha, beta, gamma1-3, delta, and epsilon) have been characterized. These isoforms differ mainly in the length and structure of their C-terminal non-catalytic region. Some isoforms have several splice variants such as the long (L) and short (S) variants of CK1alpha. CK1 proteins are involved in the regulation of many cellular processes including membrane transport processes, circadian rhythm, cell division, apoptosis, and the development of cancer and neurodegenerative diseases. The CK1 subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	1.187e-09
NZ_CP013773.1|WP_054300492.1|1596751_1597762_+|protein-kinase	gnl|CDD|270916	cd14014, STKc_PknB_like, Catalytic domain of bacterial Serine/Threonine kinases, PknB and similar proteins. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. This subfamily includes many bacterial eukaryotic-type STKs including Staphylococcus aureus PknB (also called PrkC or Stk1), Bacillus subtilis PrkC, and Mycobacterium tuberculosis Pkn proteins (PknB, PknD, PknE, PknF, PknL, and PknH), among others. S. aureus PknB is the only eukaryotic-type STK present in this species, although many microorganisms encode for several such proteins. It is important for the survival and pathogenesis of S. aureus as it is involved in the regulation of purine and pyrimidine biosynthesis, cell wall metabolism, autolysis, virulence, and antibiotic resistance. M. tuberculosis PknB is essential for growth and it acts on diverse substrates including proteins involved in peptidoglycan synthesis, cell division, transcription, stress responses, and metabolic regulation. B. subtilis PrkC is located at the inner membrane of endospores and functions to trigger spore germination. Bacterial STKs in this subfamily show varied domain architectures. The well-characterized members such as S. aureus and M. tuberculosis PknB, and B. subtilis PrkC, contain an N-terminal cytosolic kinase domain, a transmembrane (TM) segment, and mutliple C-terminal extracellular PASTA domains. The PknB subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	6.53e-14
NZ_CP013773.1|WP_016210943.1|1608414_1609101_-|acireductone-synthase	gnl|CDD|319768	cd01629, HAD_EP, Enolase-phosphatase similar to human enolase-phosphatase E1 and and Xanthomonas oryzae pv. Oryzae enolase-phosphatase Xep. Enolase-phosphatase E1 (also called MASA) is a bifunctional enolase- phosphatase which promotes the conversion of 2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane to 1,2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene anion (an aci-reductone) in the methionine salvage pathway. The catalytic reaction is carried out continuously by enolization and dephosphorylation, and the enolase activity cannot be classified as typical enzymatic enolization. This family belongs to the haloacid dehalogenase-like (HAD) hydrolases, a large superfamily of diverse enzymes that catalyze carbon or phosphoryl group transfer reactions on a range of substrates, using an active site aspartate in nucleophilic catalysis. Members of this superfamily include 2-L-haloalkanoic acid dehalogenase, azetidine hydrolase, phosphonoacetaldehyde hydrolase, phosphoserine phosphatase, phosphomannomutase, P-type ATPases and many others. HAD hydrolases are found in all three kingdoms of life, and most genomes are predicted to contain multiple HAD-like proteins. Members possess a highly conserved alpha/beta core domain, and many also possess a small cap domain, the fold and function of which is variable. HAD hydrolases are sometimes referred to as belonging to the DDDD superfamily of phosphohydrolases.	1.88858e-105

Protein sequences

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MLSTPWLAALDLDLDTDDDIIKTKNLSALDVTCRLIISRYNLYQRENFFQVFNNPKCFYQSYQYLEILGLNQAASIQQLLDGPFEKYKDTWSTLSYLGLDCRENAQRILTNPQSFEQDFDGLIALRSAYESIVKEMEANQLKAHGLAGGNPIKFKGETVSVATSVGILHIQ
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CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013773_3

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP013773_3

>merge|NZ_CP013773|3|2450844-2450973|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

>NZ_CP013773|3|3|2450844-2450973|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP013773.1|WP_075273371.1|2449977_2450553_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP013773.1|WP_016211271.1|2457456_2458401_-|L,D-transpeptidase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|182341
NZ_CP013773.1|WP_016212010.1|2452545_2452842_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013773.1|WP_016211269.1|2458705_2459491_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|274640
NZ_CP013773.1|WP_054300520.1|2449622_2449937_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013773.1|WP_054300518.1|2452965_2453811_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013773.1|WP_016211797.1|2447647_2449051_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|143424
NZ_CP013773.1|WP_016212008.1|2451830_2452529_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013773.1|WP_016212281.1|2440137_2441592_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013773.1|WP_081007059.1|2446424_2447486_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224871
NZ_CP013773.1|WP_016212044.1|2443446_2443701_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|236153
NZ_CP013773.1|WP_075273359.1|2449101_2449677_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP013773.1|WP_016211268.1|2456253_2457438_+|fatty-acid-desaturase	unknown	unknown	gnl|CDD|224316
NZ_CP013773.1|WP_155046940.1|2454015_2454399_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013773.1|WP_016212359.1|2442454_2442673_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013773.1|WP_075273619.1|2454671_2455247_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013773.1|WP_054300516.1|2455304_2456138_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	unknown	unknown	gnl|CDD|234899
NZ_CP013773.1|WP_036794771.1|2444423_2445410_+|APC-family-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223605
NZ_CP013773.1|WP_032126227.1|2451502_2451793_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013773.1|WP_016211795.1|2445547_2445742_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP013773.1|WP_075273371.1|2449977_2450553_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	2.12687e-44
NZ_CP013773.1|WP_016211271.1|2457456_2458401_-|L,D-transpeptidase-family-protein	gnl|CDD|182341	PRK10260, PRK10260, L,D-transpeptidase; Provisional.	3.41097e-37
NZ_CP013773.1|WP_081007059.1|2446424_2447486_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	gnl|CDD|224871	COG1960, CaiA, Acyl-CoA dehydrogenases [Lipid metabolism].	5.06874e-09
NZ_CP013773.1|WP_016212044.1|2443446_2443701_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|236153	PRK08116, PRK08116, hypothetical protein; Validated.	0.00575708
NZ_CP013773.1|WP_075273359.1|2449101_2449677_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	6.00312e-45
NZ_CP013773.1|WP_016211268.1|2456253_2457438_+|fatty-acid-desaturase	gnl|CDD|224316	COG1398, OLE1, Fatty-acid desaturase [Lipid metabolism].	2.7962e-82
NZ_CP013773.1|WP_016211269.1|2458705_2459491_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|274640	TIGR03545, TIGR03545, TIGR03545 family protein. This model represents a relatively rare but broadly distributed uncharacterized protein family, distributed in 1-2 percent of bacterial genomes, all of which have outer membranes. In many of these genomes, it is part of a two-gene pair.	0.0067305
NZ_CP013773.1|WP_054300516.1|2455304_2456138_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	gnl|CDD|234899	PRK01103, PRK01103, bifunctional DNA-formamidopyrimidine glycosylase/DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase.	2.70834e-151
NZ_CP013773.1|WP_036794771.1|2444423_2445410_+|APC-family-permease	gnl|CDD|223605	COG0531, PotE, Amino acid transporters [Amino acid transport and metabolism].	3.69328e-17
NZ_CP013773.1|WP_016211797.1|2447647_2449051_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	gnl|CDD|143424	cd07106, ALDH_AldA-AAD23400, Streptomyces aureofaciens putative aldehyde dehydrogenase AldA (AAD23400)-like. Putative aldehyde dehydrogenase, AldA, from Streptomyces aureofaciens (locus AAD23400) and other similar sequences are present in this CD.	0

Protein sequences

>NZ_CP013773.1|WP_075273371.1|2449977_2450553_-|IS630-family-transposase
MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLKPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
>NZ_CP013773.1|WP_054300520.1|2449622_2449937_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MKGYLITQISKLLKISRDTLHRWRNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
>NZ_CP013773.1|WP_075273359.1|2449101_2449677_-|IS630-family-transposase
MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEGAGCHLLFLPPYSPDLNSIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETVR
>NZ_CP013773.1|WP_016211797.1|2447647_2449051_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein
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>NZ_CP013773.1|WP_081007059.1|2446424_2447486_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase
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>NZ_CP013773.1|WP_016211795.1|2445547_2445742_-|hypothetical-protein
MKLKTKKISNACKGNTFLCVNFAKSKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP013773.1|WP_036794771.1|2444423_2445410_+|APC-family-permease
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>NZ_CP013773.1|WP_016212044.1|2443446_2443701_+|hypothetical-protein
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>NZ_CP013773.1|WP_016212359.1|2442454_2442673_-|hypothetical-protein
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>NZ_CP013773.1|WP_016212281.1|2440137_2441592_-|hypothetical-protein
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>NZ_CP013773.1|WP_032126227.1|2451502_2451793_+|hypothetical-protein
MGRLFNKENPADLKSSGYFSTEPRGQSHHSVIVIVMAMISIFVMTRVICSIITWMIHSAPLTFIFTMLISFFAAPYVFIVIIIVAFFIGILVKTPS
>NZ_CP013773.1|WP_016212008.1|2451830_2452529_+|hypothetical-protein
MLKKNKSTSFVIGLALSLSFACYANALTEAEFKATKLPYSVMAYSNQYAHEYGLDASKAIDLPKGLEAIKLILYKEHIKGDEVLLPQDIYRCSAELYVDKSLSLYWPGNYPKVDKVGDRGLQKAQVSTVQLKRKGEYWVPGPYASMLYDSYDQTIKPNLAKINLGFFGCNYIPSRYTAVKDGLAIWLERKGGHNYAAIGQSEAEISSKDFYIFKLPQKLVNNYLPYARMAAN
>NZ_CP013773.1|WP_016212010.1|2452545_2452842_+|hypothetical-protein
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>NZ_CP013773.1|WP_054300518.1|2452965_2453811_+|hypothetical-protein
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>NZ_CP013773.1|WP_016211268.1|2456253_2457438_+|fatty-acid-desaturase
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>NZ_CP013773.1|WP_016211271.1|2457456_2458401_-|L,D-transpeptidase-family-protein
MGIITQRHNTVAGIALFTSSIFCTSAATAFTLPISSHNTNDVVGWQVITYSKAGDTPLKIAQRHSISIQRLQALNSKVRHWQKQRIYLPYQVILPQLIQQQQSKITVNLAEKRLYYFNAKSQVLSVYPVSIGREHWRTPTPTKTTYIIHKKKHPTWNVPASIQRYYRAQGKSLPKQVPPGPENPLGTRALYLGITGILIHGTNQPASIGTASSSGCIRLYTNDIEHLYKQAGVNTPVKLIYQPYKVGFNENVLYIEAHPVISDYDKNNQQRQIIIEKLQNMTNNSKQLQVNWSLVDKAINEAAGIPVPIGKLFY
>NZ_CP013773.1|WP_016211269.1|2458705_2459491_+|hypothetical-protein
MAKKIFYSLIIVILLLVVGSYFLFSHMDSILRSAVEKIGSKTTGTTVTLGSLKTSLKEGQVSLSRLTMSNPAGFSQANAISFKDIMVNLDPSSATQQTIVLNKVIIKDPYLLYEMKEGSSRSNLQQIQKNIQSYFASKQAKNNESNQRNSGVTQQEPSQAKVAAKNQKKFIIKELEILAGQVKVISPLLKSKEKTLSLPNIRLTNIGTGGSGLTPDQVTEQIINVLVANSGQAVAQAGLDRVKTKLKEKASGLLNNLLGNP

Self-targeting detection

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MGE targeting detection<

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NZ_CP013773_3	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	NZ_CP039213	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence	30310-30347	0	1.0
NZ_CP013773_3	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	NZ_CP048067	Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence	7350-7387	0	1.0
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18. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033943 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013780 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p2PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050943 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050946 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050947 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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67. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038909 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038912 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048070 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038915 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039207 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038974 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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112. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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113. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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114. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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115. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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116. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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117. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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118. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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119. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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120. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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121. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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122. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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123. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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124. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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125. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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126. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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127. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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128. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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129. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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130. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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131. spacer 1.1|409047|31|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP054613 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774

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. ***********.******* *** *. **

132. spacer 1.1|409047|31|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016317 (Bacillus cereus strain M3 plasmid pBCM301, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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 .  ..***************.* *******

133. spacer 1.1|409047|31|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to CP020755 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid pLDW-16, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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 .  ..***************.* *******

134. spacer 1.1|409047|31|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021062 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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 .  ..***************.* *******

135. spacer 1.1|409047|31|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NC_020385 (Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-328, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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 .  ..***************.* *******

136. spacer 1.1|409047|31|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NC_018492 (Bacillus cereus FRI-35 plasmid p01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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 .  ..***************.* *******

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	3718 : 57904	52	Staphylococcus_phage(14.29%)	tRNA,protease,transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	97264 : 222189	104	Staphylococcus_phage(23.08%)	tRNA,protease,transposase	NA
DBSCAN-SWA_3	266593 : 368966	88	Escherichia_phage(25.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_4	374991 : 436393	55	Adoxophyes_honmai_entomopoxvirus(14.29%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_5	451140 : 559174	101	Staphylococcus_phage(13.79%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_6	578782 : 633788	55	Staphylococcus_phage(36.36%)	integrase,protease,transposase	attL 604787:604846|attR 631415:631704
DBSCAN-SWA_7	672703 : 741856	60	Klosneuvirus(22.22%)	tRNA,protease,transposase	NA
DBSCAN-SWA_8	762642 : 806394	39	Acinetobacter_phage(22.22%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_9	810762 : 841420	27	Wolbachia_phage(33.33%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_10	877989 : 930082	51	uncultured_Mediterranean_phage(40.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_11	938355 : 980838	38	Tupanvirus(28.57%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_12	1010283 : 1063100	56	Acinetobacter_phage(14.29%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_13	1080672 : 1124108	48	Staphylococcus_phage(40.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_14	1145269 : 1244284	96	Staphylococcus_phage(31.25%)	tRNA,protease,transposase	NA
DBSCAN-SWA_15	1332757 : 1380186	43	Acinetobacter_phage(16.67%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_16	1468443 : 1556916	85	Escherichia_phage(39.29%)	tRNA,integrase,transposase	attL 1493753:1493812|attR 1556376:1556984
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DBSCAN-SWA_19	1900881 : 1966435	56	Erwinia_phage(18.18%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_20	1976509 : 2082863	110	Staphylococcus_phage(28.57%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_21	2142258 : 2191994	49	uncultured_Caudovirales_phage(16.67%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_22	2254150 : 2303147	57	Bacillus_phage(50.0%)	protease,transposase	NA
DBSCAN-SWA_23	2319032 : 2374289	46	Acinetobacter_phage(42.86%)	tRNA,tail,transposase	NA
DBSCAN-SWA_24	2534537 : 2644245	112	Escherichia_phage(41.18%)	tRNA,integrase,transposase	attL 2583038:2583097|attR 2617000:2617288
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DBSCAN-SWA_27	2903804 : 3029010	110	Staphylococcus_phage(13.33%)	integrase,protease,transposase	attL 2951519:2951578|attR 2966606:2966781

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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>NZ_CP013773|3718:57904|24547_26200_+|WP_016210562.1|DBSCAN-SWA
MSIELLQKEAVLLLYDDKANQSPQLAALKYLGMTDIDAIYVGEATWQTRLQSKHYAVIIYDLSHRYTEIQPKVFEDLYRANIIRLSRLFILISELTEFPQIQHFLAKNPPDIILTRPYSLDMYVNKLREQYPTKVRFKSFYESFEKGDYHNVLMACEKRIQGGGDRETLLECFRLQAMSYLFAQQFDAAKKLCNMLSKQQDQLLWLNLVHGLACLESGELGQAKRDFYKVLKQEKDDIKALDGLCEVLVQTKQLSQAHRVLSHRMALTPFDEAKQQQFIDLSLTCGNFAAAEQAIYSMMENHHNRHGSTDPESWLQLLLLLREQIKSDQDVFKAYDRVLEVMSYVDKHEKQNIDIKISQCLVGAEIAESISDIENSERFSKNAKINYDSHLFLLDDQQEVEVGLGFYRNNLLQGQGEEILKSLLWRCKTNDELNGELLVKVCSVFNGQAYLGEEANTRGVEHFYNKQYADASRLLDLATQIRPDNMAIHLNAVQALLSLLDQKKHVNSGVLVNKMAIYLEAIDLNLAQATDKQSQRYHRLLDQYNQLSIT
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MKMLFEDLRASVLALIDNIKKNMGYRQLDGLALYRSHVIHAKSFKKLLITLDNLQEYETIEDYLSVSQYEHVKQELKRYQQTTQEEIENEEKFSSLRSIISKFLISVEAHSSQLLDAPRSNFIYDLRRQTDKANSTAELSAILTDLHSDETLFKDYFFDPAHTPFRTALKDCLVACSQARILEEKMDKRELNNIEDLRDQALRLLSDVNNISRYESENESKNKAFSTLLGIITPQVHQVQSAEELFATLAKLESNETSKDYFSDPNHSDLNTELYNCLQASVDLKNLNFNYVRNRVLKLLDNVNKHENNQTTPSNGEQTTLLKNVYAQITKSQSERGLICALNNLQEAQTFQNYFSNPKNYYFKAELKYWRARCNQIEILEEQQALKDTDKKKQLLSDIETIIVNQVRGYGFDLGIGGSEHSIRLSERESFQV
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MINNRVDGTREIKANTGVKKQAKSWQTEAALRMLANNLDAAVAENPVELVVYGGIGRAARNWLCFDKIVETLKRLENNETLLIQSGKPVGVFKTHEYAPRVIIANSNLVPAWSSWETFNKLDQKGLMMYGQMTAGSWIYIGSQGIVQGTYETFVNAAKKHYQGKILGRWILTAGLGGMGGAQPLAATMAGASLLAIECDPGRIEKRLGSGYLDIKTENLNEALALIERACKEKKALSVGLLGNAAEVLPELVKRGVQPDFVTDQTSAHDPLNGYLPMGWSLAQAQKMRVENPEQVVKAAKESMAVHVKAMLEFHKLGIPTFDYGNNLQQMALEAGVSDAFAFPGFVPAYIRPLFCEGIGPFRWVALSGDPEDIYKTDEKVKALLPDNTHLHQWLDMAREKIQFQGLPARICWVGLKERMRLGLAFNDMVKSGELSAPIVIGRDHLDAGSVASPNRETEGMQDGSDAVSDWPLLNALLNTASGATWVSLHHGGGVGMGFSQHAGMVVVADGSDRAYKSLSKVLWNDPATGVMRHADAGYQQALACARAQSLDLPMMNMNNKNYQGRD
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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
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MKNKKLYLIITCILSTSALSTTQASTQCALIIDAGSSGSRAHLYQYDLNKSHFGKVAEFGKAAKLSPGLSIISADKAPDYISELLKKVNIPNSCYSDASKVQFGLYGTAGMRLLSQDAQKAIYQAIRTTLQQQPNSKKFNIFPHGIRTISGRWEGIFAWIDNNWDNAKFRLTAHTNGILEMGGASTQITFHPTTNVHNNNITRINLGHRPISIYSASYLGLGQDQLRNQFLNHTTCFPNGYKLPNGKRSQLADYATCQRSINPLITKVHQVQPINNLIDSNKTFNALSGFSYTAQFFKLQSLSADLLKQKGKQFCSTSWDQLQKTYPNNPFLYTYCINSAYFSRLLSRGYQFPSNATIIPTHTNRDGSNISWTRGALIYLENNPSTKKHLCPHYPAQETQLIKGQNDTHIKKQLSNNQNPYINQAEHKC
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MNGYQHFLFATNMSDACNKVIAKVRQFADVFEAKLSVVNFVEPVTMAYPGVIVVDDLETSRQQAAKEELVEFCKALNVSNTMQHVIVDTPKNGLFDLVESLGVDLVIIGRHNKMDFSWLLGSTTNAIIHAAHCDVLVLHE
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MLLINIDHSPLTLAMLKQVIDGPVKLKVTEAVWQDVRKSRAVVMDVIAKEKTVYGINTGFGILAKRSISHHQLETLQKNIILSHAAGVGDYLDDATVRLILVLKLKALLRGYSGISEKVVNALTALVNHEVYPCIRAQGSVGASGDLAPLSYIGAVLLGEGKVRIGGKVLPAGEGLKQLGLEPIALGAKEGLALNNGTQVSTAICLKNYFALEDLLLVSMACGALALDAAGGADSPLDERIHQARGQQGQIDVAEYYRQLLTGSALLELQRRQHGRVQDPYSLRCQPQVLGACLDQLRHAAVILVAEANSVTDNPLIFVDDNEILSGGNFHAEPVAFIADNLALVAAEIGSLSERRLALLMDEHFSGLPAFLVAGNGVHSGFMVAQVTAAALVSENKQLCYPASVDSIPTSASQEDHVSMATHGARRLGKMARNLQYTLAIELLAGCQGIDLRAPLKTSVPLMLLHANLRERVSFYEVDRFFDPDIEQSAQLLQEFVWRDLCQVHLLPSQRE
>NZ_CP013773|3718:57904|13712_14774_-|WP_054300173.1|transposase|DBSCAN-SWA
MNKELLDIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL
>NZ_CP013773|3718:57904|9330_9546_-|WP_016211035.1|DBSCAN-SWA
MPSIRVKENEPFDVALRRFKRSCEKAGVLTELRRREHYEKPTTVRRRKAAAAVKRHMKKVSRETQFRTRLY

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_054300271.1|3718_4693_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016211036.1|5040_6912_-	RNA polymerase sigma factor RpoD	A0A2I7SAT0	Vibrio_phage	2.7e-33	30.7
WP_016211039.1|7003_8749_-	DNA primase	A0A1S5RGL3	Helicobacter_phage	2.6e-46	37.1
WP_016211043.1|8828_9278_-	GatB/YqeY domain-containing protein	A0A292GL36	Xanthomonas_phage	4.1e-20	44.2
WP_016211035.1|9330_9546_-	30S ribosomal protein S21	NA	NA	NA	NA
WP_016211042.1|9792_10809_+|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex transferase subunit TsaD	A0A0R6PI74	Moraxella_phage	5.3e-100	54.2
WP_016211037.1|10857_11487_-	glycerol-3-phosphate 1-O-acyltransferase PlsY	NA	NA	NA	NA
WP_016211040.1|11837_13049_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126170.1|13276_13549_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|13712_14774_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016210569.1|15098_15713_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210561.1|15827_17162_-	dihydroorotase	NA	NA	NA	NA
WP_016210568.1|17289_17931_-	pyridoxamine 5'-phosphate oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_016210566.1|18236_18659_+	universal stress protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210559.1|19015_19978_+	formimidoylglutamase	NA	NA	NA	NA
WP_081007068.1|20016_21192_+	imidazolonepropionase	NA	NA	NA	NA
WP_155046983.1|21280_22981_+	urocanate hydratase	NA	NA	NA	NA
WP_054300273.1|22980_24519_+	histidine ammonia-lyase	A0A1V0S940	Catovirus	5.1e-70	37.2
WP_016210562.1|24547_26200_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210558.1|26273_27029_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556478.1|27309_28196_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211932.1|28606_29896_-	GDA1/CD39 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036777061.1|30091_31279_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211476.1|31596_31806_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211473.1|31789_32389_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211474.1|32463_33813_+	23S rRNA (uracil(1939)-C(5))-methyltransferase RlmD	E4ZFI6	Streptococcus_phage	5.7e-33	27.6
WP_032126518.1|33895_36097_+	GTP diphosphokinase	NA	NA	NA	NA
WP_016211478.1|36113_36929_+	nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126519.1|36908_37628_-	TIGR00730 family Rossman fold protein	A0A1D8KUT5	Synechococcus_phage	1.9e-19	34.8
WP_075273327.1|37795_38371_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|38316_38682_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211265.1|38856_39519_+	adenylate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016211263.1|39549_39918_+	thioredoxin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126514.1|39928_41245_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_051307354.1|41527_42103_+	DedA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126515.1|42178_42358_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211261.1|42530_42824_-	cold-shock protein	A0A2H4N7Y6	Lake_Baikal_phage	5.8e-15	61.5
WP_075273504.1|43013_43367_+|protease	ATP-dependent Clp protease adapter ClpS	A0A218MMY6	uncultured_virus	6.7e-10	40.0
WP_016211262.1|43421_45695_+|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA	A0A223W0B1	Agrobacterium_phage	1.0e-167	41.8
WP_016211259.1|45754_46000_-	translation initiation factor IF-1	NA	NA	NA	NA
WP_054300275.1|46124_47000_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211550.1|47077_47839_-|tRNA	leucyl/phenylalanyl-tRNA--protein transferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211548.1|47822_48779_-	thioredoxin-disulfide reductase	A0A2I2L5E1	Orpheovirus	1.6e-61	43.7
WP_016211549.1|49041_51546_+	DNA translocase FtsK	A0A218M9A2	Mycobacterium_phage	4.9e-86	43.1
WP_016211553.1|51549_52290_+	outer membrane lipocarrier LolA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|52629_52995_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046696.1|53051_53216_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007013.1|53205_53505_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126933.1|53508_54810_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300276.1|54978_55953_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	4.0e-28	32.3
WP_016209411.1|56158_56953_-	inositol monophosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016209421.1|57115_57904_+|tRNA	tRNA (cytosine(32)/uridine(32)-2'-O)-methyltransferase TrmJ	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP013773|97264:222189|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_036779556.1|132629_135434_-	response regulator	A0A1V0SGX0	Hokovirus	3.1e-57	32.0
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Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP013773|266593:368966|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211340.1|293902_294124_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211464.1|350488_350836_-	arsenate reductase (glutaredoxin)	NA	NA	NA	NA
WP_016211465.1|350986_351970_+	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	2.9e-34	32.7
WP_054300318.1|352597_353575_+	NAD(P)H-quinone oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_052104629.1|353722_354748_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_032126540.1|360410_361274_-|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211749.1|361482_362676_+	fatty acid desaturase	NA	NA	NA	NA
WP_016211748.1|362755_364360_+	cytochrome d ubiquinol oxidase subunit 1	NA	NA	NA	NA
WP_016211752.1|364375_365521_+	cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II	NA	NA	NA	NA
WP_129556531.1|365725_365923_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273313.1|365885_366224_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_081007004.1|366183_366639_+|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_081007023.1|368309_368966_-|transposase	IS1595 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP013773|374991:436393|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP013773|451140:559174|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016209778.1|492087_492462_+	iron-sulfur cluster assembly accessory protein	A0A218MM00	uncultured_virus	1.7e-11	38.5
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WP_075273327.1|498666_499242_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_032126677.1|506398_506962_-	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211664.1|508931_509660_-	single-stranded DNA-binding protein	A0A2I7QWB5	Vibrio_phage	6.2e-42	65.6
WP_016211666.1|510032_512852_+	excinuclease ABC subunit UvrA	A0A1B1IVR3	uncultured_Mediterranean_phage	1.0e-311	55.2
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WP_016210106.1|558082_559174_+|tRNA	tRNA pseudouridine(13) synthase TruD	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP013773|578782:633788|DBSCAN-SWA
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MTINKRDFFDAINYADTAVQIHEYLLNILEKQQKDFAENCNNDNDSEKSKALASISDVELRFAQLDMLSAIYRKILLNTLNEIEGCNDQELKTIKNGLLHMVATTLEACVNDFTIEAKITIDIKEEQ
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MLEFLSHNCKEKASFFLIVFFNLLILCQKLLIQRYNIDSAVAEFKDEIKTKEKEVNELHRQLGKRTAELEWAAKKLKSLDYETRKCLIESEPKNIPVTRQCELINFNRSNCYYSAQRIVSDIDFIT
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MKNYPHIDDIIDQVAKEFDCDRNRMAYEAFATDVKELIENEDFDCQTEEQARLELAKRGPHIINLYMEGLDGEDWLSQDYLPADINVTVVREFYKFVVNEEKK
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MKYYTTSFINVKSCQCALMLALLALFVITMGSTDVVYANGRYSDPNNLFLFLAKTDKNTKDFEVSVHQQQSNPEILHVHWDIAPGLQLYKDKIQFSIQPKTHQIQLGRIDMPQGNYNNDTVIGNYQVYKNALDIQIPVKNSKNLPYSLTIDYQGCQPGRYCYPPQTQTFYFNQAQSTASKPSQEQEKTSLFTTANLTTIQHLFSEQNIPLILFSFFIFGLLLSLTPCVLPMLPILMGIVLGQKNNTAKQAFLLSLAYVLGIAISYAIAGIIAAKLGQSLQVFLQNPWVISVFSLIFIVLALSLFGAYNLQLPIKIQNSLHNINQKFRGGSYLSAAMMGMISSLVASPCLTAPLAGALVYLSSTGNQFIGGSALFSLGIGFGIPMLILGASGGKLILKAGNWMKHIKTLLGLILIAMAIWMQSRVLSDTIMPLIWGAFLVITPIALGILEPAKTLWQRIYKALGITILIVGTGLILKTLISPNINNNQTNSKQQTLNKNNNSHYFNTVYTMNQLQTALDKAKIKKQPVMVDYYASWCTTCKELDATTFKNNNVLVALKNFSIIRVDITKNDLHAKQIQQAFHVFGPPTIQFFNTHGKLIPHAEVVGYIAADNLVNKIHLVK
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MPKFHQSFYIAFLADAPKRQLFGLDSYKNSFFLQKDKDLSREYTINMHTMHRRKSLLKDEIPFVRINFPYKEDLSREWRVSLDKTNKQVADEMVKAVLSKAEPFTRIYLDINRVSIDCFQQVTYHRRGNSSHEVSTKQVAELLAQSIPEYAKNNLQIKLVVSYAEIFAESLMKELDLQGFKKTSVTHLTH
>NZ_CP013773|578782:633788|632411_632528_-|WP_155047262.1|DBSCAN-SWA
MSNECCCHLLFLPPYSPDLNPIERCEPWSAKHGVSRPR

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_155046967.1|579060_579675_+|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	S5WIU1	Leptospira_phage	1.5e-33	40.1
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WP_032126362.1|581201_581567_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|581512_582088_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300355.1|582077_582263_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211563.1|582473_582635_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211564.1|582667_583543_-	ParA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_052104693.1|583708_587575_+	ATP-dependent RNA helicase HrpA	A0A1V0SBU4	Catovirus	1.9e-49	26.2
WP_080728343.1|587656_587797_-	hypothetical protein	A0A0U2RK18	Escherichia_phage	1.6e-07	69.0
WP_081007034.1|587778_588063_-|transposase	IS1 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126538.1|588327_589746_+	autotransporter outer membrane beta-barrel domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211994.1|592022_592559_-	DUF2062 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|594037_595012_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016212012.1|595055_595733_+	MBL fold metallo-hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016212013.1|595748_596132_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212011.1|596353_597475_-	calcium:proton antiporter	NA	NA	NA	NA
WP_075274660.1|597708_598578_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300148.1|598535_599597_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211974.1|600021_601143_+	alanine dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
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WP_155046942.1|602803_603689_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155764063.1|603686_604532_+|transposase	IS3 family transposase	Q6H9S3	Enterobacteria_phage	8.0e-25	34.2
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604787:604846	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_081377353.1|610052_610718_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|610757_611732_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_016211145.1|613330_615070_+	lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA	W8CYL7	Bacillus_phage	8.4e-53	30.8
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WP_016211147.1|616138_616492_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211146.1|616604_617561_+	ferrochelatase	NA	NA	NA	NA
WP_016211151.1|617570_617882_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211143.1|617897_618467_+|protease	ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit	A0A223W000	Agrobacterium_phage	7.3e-30	39.5
WP_016211148.1|618730_620059_+	sodium:alanine symporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|620230_621205_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_016210841.1|621418_621790_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126340.1|625509_626271_+	DUF4402 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556513.1|626351_628097_-	sodium:proton exchanger	NA	NA	NA	NA
WP_016210844.1|628272_629400_-	Fic family protein	D7RWK9	Brochothrix_phage	5.7e-10	23.2
WP_016210843.1|629486_629717_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556637.1|630331_631111_+|integrase	site-specific integrase	NA	NA	NA	NA
WP_016212589.1|631585_632023_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
631415:631704	attR	NA	NA	NA	NA
WP_155047262.1|632411_632528_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155046964.1|633212_633788_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP013773|672703:741856|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016209834.1|704520_705279_-	23S rRNA (guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase RlmB	NA	NA	NA	NA
WP_016209829.1|705275_707675_-	ribonuclease R	Q0GXV6	Lactococcus_phage	2.7e-70	33.5
WP_016209839.1|709054_710353_-	adenylosuccinate synthase	A0A2R8FF47	Brazilian_cedratvirus	1.2e-64	33.5
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WP_016209836.1|711443_712658_-|protease	FtsH protease activity modulator HflK	NA	NA	NA	NA
WP_032126639.1|712677_713964_-	GTPase HflX	NA	NA	NA	NA
WP_016209846.1|713979_714234_-	RNA chaperone Hfq	NA	NA	NA	NA
WP_016209830.1|714469_715837_-	glycerol-3-phosphate transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016209826.1|716167_717190_+	glycerophosphoryl diester phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
WP_016209845.1|717712_719188_+	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_129556633.1|719404_720301_+	sphingomyelin phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
WP_016209827.1|720619_722179_+	SH3 domain of the SH3b1 type family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209841.1|722254_722449_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209831.1|722668_723367_+	DUF3865 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209832.1|723645_723909_-	carbon storage regulator CsrA	A0A2I7RT00	Vibrio_phage	4.1e-12	68.6
WP_016209848.1|724215_726810_-|tRNA	alanine--tRNA ligase	A0A1V0SK38	Klosneuvirus	8.3e-89	41.3
WP_016209835.1|726806_727289_-	regulatory protein RecX	NA	NA	NA	NA
WP_016209844.1|727266_728307_-	recombinase RecA	A0A0S2MVG1	Bacillus_phage	1.3e-117	66.3
WP_016209840.1|728479_728965_-	CinA family protein	B5TK85	Pseudomonas_phage	1.2e-36	56.2
WP_032126641.1|729072_731643_+	DNA mismatch repair protein MutS	A0A1V0SJ67	Klosneuvirus	3.9e-30	22.9
WP_032126642.1|731678_732140_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211648.1|733619_734159_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211650.1|734818_736303_-	glycerol kinase GlpK	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

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Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_CP013773|810762:841420|DBSCAN-SWA
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MKVVVFATFTSAGVVRRALTQAGFVVKKILSFAGKREMMRGWKKI
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MIDLPTLQVIGWVIVGASLLSFALTSGFDSGIGILLPFIGRNDTERRLTLNVIGPTWDGNQVWLIAAGGAVFAIWPLVYSTAFSGYYVAMLLILWSLFLRPVGFEYRSKLPNQTWRNNWDIGIFIASFIPILIMGIAFGNLLLGSPFSYDPVFLRMQYTGSFIDLLSPFALLSGVIAIFMVICHGAAYLNLRTKGIIKTRAQKALRLFAWCYLIAFALAGLLITYKIPGYLLGSQAGSIHDPLINHVNRHVGAWLNNYHTYPWMTLAPVIGFLGAFLAIISTHANRAIWSFVGTSFIQMGTLLTAAFSLFPFIMPSSSEPAHSLTVWNASTSQHTLTIIAIVAVIMVPVIFCYTSFVYIKMWRDGPIHEKDIEKNQHILY
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>NZ_CP013773|810762:841420|838252_838990_-|WP_054300386.1|DBSCAN-SWA
MDKTKETVMALIDLTSLNLNDNDQTIVELCAKASNRLGKVAAICIDPKFVGLAKKLLKNQQIAVASVVNFPLGNEPVETVLADINQVLIDDADEIDLVIPYQDYLQKGSSERALHLVNTSKALCHGKLLKVILETGELKSRALIFKAACDAINAGADFIKTSTGKTAVGATVSAVKAMLDAIQVNLRYHPHVGLKVSGGIKTLAEALQYLHLAKEVYGKENIQVSSMNLRFGASYLVDDLLSNDS

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_032126139.1|816048_816978_-|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase MiaA	NA	NA	NA	NA
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WP_032126141.1|818968_820243_-	sphingomyelin phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
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WP_036776426.1|821341_822193_-	pyridoxal kinase PdxY	NA	NA	NA	NA
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WP_105962624.1|827755_829123_-	group II intron reverse transcriptase/maturase	A0A0N7AE80	Bacillus_phage	9.6e-12	24.3
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WP_032126789.1|832784_832967_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211219.1|833316_834594_-	FAD-dependent 5-carboxymethylaminomethyl-2-thiouridine(34) oxidoreductase MnmC	NA	NA	NA	NA
WP_081377356.1|834590_834728_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274667.1|835239_836841_+	cytochrome d terminal oxidase subunit 1	NA	NA	NA	NA
WP_016211221.1|836857_838000_+	cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II	NA	NA	NA	NA
WP_054300386.1|838252_838990_-	deoxyribose-phosphate aldolase	NA	NA	NA	NA
WP_016211224.1|839014_840286_-	phosphopentomutase	NA	NA	NA	NA
WP_032126790.1|840514_841420_-|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>NZ_CP013773|877989:930082|DBSCAN-SWA
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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGILITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
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MRVDFYILNTPSKQAQYHFACRLAEKAVSQNTTVYIHTHSQADAEQLDDLLWSFNDTSFVPHAIVGHPMADEDVNVLIGFGEQHSPAGLLIKLAALKHDNHFYSRIAEIVSQDKKSLQASRQAYRHYQQAGFAVHHHNSPSSNNSLT
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MLNKQLVSHNLNAGSFNDAYKVREKLICQRGDLEDISVDEQIELLACLAEFQFGRYLIEHRGLNGYWTQYIWYVIPNVAQRQA
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MLMIKPLSYTQDSAYWFSKIAHLDWPIWLDSCAPLSSGRFDILAANPYKKIINHHNQTYSTDATGNQIQVTTLDPFSFIKEHIQQVNTHITIPENYHLPFCGGALGYFGYDLGRILETLPEHAEHDLDLPDLAVGLYDWAIIIDHQNQSAYWVSPLQQKANSLDIYQQLSKSPIHDTTTNDNIKTAIPGHFTDFKLTRQFNSNLSFNDYKERFNKIQDYIHAGDCYQVNLTQRFVAPFTGHPLHAYLQLRQHNPAPFACYMDIGDNQILSCSPERFLKINHNIVETKPIKGTVPRGKTAAEDASYQEKLLNSEKDRAENIMIVDLMRNDLGRSCEIGSVITPKVCELESFKNVHHLVSTVRGTLAKQTHATDVLKLAFPGGSITGAPKIRAMEIIEELEPHRRSLHYGSIGYISYDGHMDTNITIRTLICHQNHAYCWAGGGIVADSQLEQEYQETFDKVTIIHETLYELSGLSP

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_054300394.1|880138_880501_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212000.1|880631_881360_-	peptidoglycan editing factor PgeF	NA	NA	NA	NA
WP_016212002.1|881479_881758_+	DNA-J related family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273298.1|881761_882337_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210887.1|886681_887632_-	23S rRNA pseudouridine(1911/1915/1917) synthase RluD	NA	NA	NA	NA
WP_016210886.1|887714_888494_+	outer membrane protein assembly factor BamD	NA	NA	NA	NA
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WP_054300398.1|891794_892676_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273592.1|893051_894026_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	4.3e-30	33.2
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WP_081007041.1|894834_895362_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_054300402.1|898004_902150_-	tandem-95 repeat protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211770.1|902349_903483_+	patatin-like phospholipase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211771.1|903496_903685_-	Trm112 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300403.1|903977_904952_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	2.0e-27	32.0
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WP_054300404.1|906434_907328_-	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209948.1|907436_908354_-	TIGR01777 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209943.1|908405_909161_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209939.1|909228_910503_-|tRNA	serine--tRNA ligase	A0A1B1IVT2	uncultured_Mediterranean_phage	1.7e-90	51.2
WP_016209927.1|910637_911315_-	M15 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016209944.1|911515_912943_+	aminodeoxychorismate synthase component I	S4VNU7	Pandoravirus	4.2e-42	29.8
WP_016209938.1|912917_913556_+	transglycosylase SLT domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209925.1|913765_914044_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209935.1|914277_915222_-	protein translocase subunit SecF	A0A1B1IVP7	uncultured_Mediterranean_phage	3.2e-38	35.2
WP_036777561.1|915243_917112_-	protein translocase subunit SecD	NA	NA	NA	NA
WP_016209930.1|917132_917486_-	preprotein translocase subunit YajC	A0A1B1IVR5	uncultured_Mediterranean_phage	3.1e-07	45.7
WP_036777579.1|917524_918640_-|tRNA	tRNA guanosine(34) transglycosylase Tgt	A0A1B1IVQ4	uncultured_Mediterranean_phage	4.8e-94	48.9
WP_016209932.1|918822_919863_-|tRNA	tRNA preQ1(34) S-adenosylmethionine ribosyltransferase-isomerase QueA	NA	NA	NA	NA
WP_016209945.1|919865_920900_-	LPS export ABC transporter permease LptG	NA	NA	NA	NA
WP_016209926.1|920896_921958_-	LPS export ABC transporter permease LptF	NA	NA	NA	NA
WP_016209931.1|922069_923542_+	leucyl aminopeptidase	Q6GYZ8	Mycoplasma_phage	7.9e-44	30.4
WP_052104625.1|923694_924138_+	DNA polymerase III subunit chi	NA	NA	NA	NA
WP_016209940.1|924213_926985_+|tRNA	valine--tRNA ligase	A0A1V0SK04	Klosneuvirus	1.8e-150	39.3
WP_036777555.1|927141_928371_+	multidrug effflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016209947.1|928397_929060_-	carbonic anhydrase	NA	NA	NA	NA
WP_054300405.1|929581_930082_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

>NZ_CP013773|938355:980838|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

>NZ_CP013773|1010283:1063100|DBSCAN-SWA
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MNKELLDIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNFINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL
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MKFIVSFLSSLLFSVGVMAAPTFITIGSGSTTGVYYPVAVGVAKLINKDVNGVRANARSTGGSVYNALSLQRGNLKMAIMQSDIAYYAYHGQVVKAFLDQPIKSLRGVAALYPEVVQIVANPAIHSITDLKDKRVYIGDIGSGVEQNAKQILALYGLSEKDITPIRGSASLGAQLLQDGRIDAMFYTAGVGSAAIQQITETTKVRFLPVLPEQATVLIKQYPFYTAQQIPAGSYKGQTAAIPAVAVEALLVASSDLPNKVVQAIIGQGLFKQGKIDQFVKLHANLKAYFKLNQAVEGVGIPLHPGAIAAYKALGVPGLN
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MVEDDPRRRYFRLDDQVILEWRAVSAEELVAGIEQLSQEKDYGQGGELYRIEQKLQAAISHLKSHAPDIAVCLDLMNERIDLFMHKFQAYYKLYGDNRRQQEPEKVSLSATGIAFDTFNPPATRQLEINFFLLPRYVYIRTFGTVVSCEKVSDGYYHVAVNFDVILDEDQETLIQHLLQKQTKVIQAQKAELDKMSQSEIDIK

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032126329.1|1012381_1013011_-	NAD(P)H-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_129556496.1|1013196_1014435_+	YihY family inner membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211592.1|1014709_1015372_+	HAD-IB family phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016211589.1|1015361_1016594_+	phosphoglycerate dehydrogenase	A0A1V0SBV6	Catovirus	7.4e-96	47.8
WP_032126328.1|1016722_1016974_+	VOC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_144019383.1|1017328_1017547_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126637.1|1017954_1018248_+|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	8.3e-06	36.5
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WP_075273298.1|1019786_1020362_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126332.1|1021008_1022208_-	trans-2-enoyl-CoA reductase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211366.1|1022460_1022748_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126330.1|1024867_1025827_-	TAXI family TRAP transporter solute-binding subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016211367.1|1025974_1026757_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273303.1|1026912_1027629_+	murein L,D-transpeptidase catalytic domain family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210281.1|1027642_1029034_-	flagellar hook-associated protein 3	NA	NA	NA	NA
WP_016210270.1|1029075_1032063_-	flagellar hook-associated protein FlgK	NA	NA	NA	NA
WP_016210277.1|1032132_1032966_-	mannosyl-glycoendo-beta-N-acetylglucosaminidase	NA	NA	NA	NA
WP_016210279.1|1033019_1034186_-	flagellar basal body P-ring protein FlgI	NA	NA	NA	NA
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WP_016210283.1|1034923_1035709_-	flagellar basal-body rod protein FlgG	NA	NA	NA	NA
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WP_016210271.1|1038848_1039532_-	flagellar hook assembly protein FlgD	NA	NA	NA	NA
WP_032126334.1|1039542_1039974_-	flagellar basal body rod protein FlgC	NA	NA	NA	NA
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WP_016210273.1|1040784_1041492_+	flagellar basal body P-ring formation protein FlgA	NA	NA	NA	NA
WP_016210275.1|1041556_1041859_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210276.1|1041914_1042391_+	flagellar protein FlgN	NA	NA	NA	NA
WP_016210284.1|1042445_1042967_-	peptidylprolyl isomerase	A0A1V0SCU1	Indivirus	1.7e-25	53.4
WP_016210280.1|1043048_1044143_-|tRNA	tRNA 2-thiouridine(34) synthase MnmA	NA	NA	NA	NA
WP_054300412.1|1044379_1044694_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273307.1|1044838_1045249_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300414.1|1045519_1046005_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300415.1|1046668_1047370_+	dual specificity protein phosphatase family protein	A0A068QKX9	Armadillidium_vulgare_iridescent_virus	1.6e-07	33.0
WP_032126500.1|1047503_1048220_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211118.1|1048356_1049604_-	NADP-dependent isocitrate dehydrogenase	Q77Z09	Phage_21	1.1e-14	72.2
WP_032126499.1|1049982_1050594_-	PilZ domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211122.1|1050690_1051557_-	OmpA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211119.1|1051560_1052322_-	flagellar motor protein PomA	NA	NA	NA	NA
WP_036779309.1|1052485_1053391_+	polyprenyl synthetase	NA	NA	NA	NA
WP_016211125.1|1053613_1054444_+	GTP cyclohydrolase I FolE2	NA	NA	NA	NA
WP_016211126.1|1054613_1055003_+	lipoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_054300416.1|1055135_1056086_+	methyl-accepting chemotaxis protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212585.1|1056380_1056701_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1056812_1057787_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_075273327.1|1058156_1058732_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|1058677_1059043_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274673.1|1059003_1060002_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075274674.1|1059979_1060825_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016212519.1|1061583_1061964_-	taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300423.1|1062038_1063100_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

>NZ_CP013773|1080672:1124108|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

>NZ_CP013773|1145269:1244284|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_14

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MTNFVHASEFTFQQDDGLINDDWVRLVQPSLPLGTQINSLALTQAGDTLYINTQSVGSFLCQGDIALNE
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_105962625.1|1150655_1151542_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210465.1|1156548_1157391_-	NADPH-dependent 7-cyano-7-deazaguanine reductase QueF	I6XGV6	Vibriophage	5.2e-32	35.3
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WP_016210316.1|1187096_1189250_+	bifunctional (p)ppGpp synthetase/guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase	A0A2I2L310	Orpheovirus	1.1e-12	37.1
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WP_155046953.1|1191510_1191651_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_081007046.1|1199392_1199641_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210832.1|1210956_1211379_-	transcription antitermination factor NusB	NA	NA	NA	NA
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WP_052133275.1|1211969_1212593_-	3,4-dihydroxy-2-butanone-4-phosphate synthase	A0A2H4PQS2	Staphylococcus_phage	1.1e-39	43.7
WP_016210836.1|1212622_1213297_-	riboflavin synthase	A0A2H4PQS5	Staphylococcus_phage	3.0e-30	37.7
WP_016210835.1|1213302_1214451_-	bifunctional diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase RibD	A0A1V0SE20	Indivirus	1.0e-43	35.4
WP_032126465.1|1214447_1214909_-	transcriptional regulator NrdR	NA	NA	NA	NA
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WP_016210824.1|1216361_1218041_+	energy-dependent translational throttle protein EttA	A0A2K9L3Z8	Tupanvirus	4.3e-38	26.7
WP_016210826.1|1218150_1219017_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300446.1|1220447_1221182_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.1e-09	30.9
WP_036781250.1|1221277_1222063_+	class I SAM-dependent methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_155046951.1|1222869_1223133_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211002.1|1223214_1223613_-	VOC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211001.1|1223776_1224082_-	competence protein ComEA	NA	NA	NA	NA
WP_016210998.1|1224159_1224414_-	LapA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126469.1|1224567_1226229_-	30S ribosomal protein S1	NA	NA	NA	NA
WP_016210997.1|1226288_1226972_-	(d)CMP kinase	NA	NA	NA	NA
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WP_054300447.1|1228108_1230745_-	DNA gyrase subunit A	G3M9Z5	Bacillus_virus	2.0e-98	32.6
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Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

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MHGREKSISNAFDKQAVFISKQLTIPRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_087910645.1|1332757_1333910_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	8.9e-59	44.2
WP_051307322.1|1333980_1334160_+	DDE endonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_016212612.1|1335007_1335241_-	ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_054300455.1|1335334_1335700_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556449.1|1335714_1336221_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212572.1|1336278_1336671_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|1336800_1337166_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274691.1|1337222_1337531_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|1337622_1338198_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|1338143_1338509_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_080728364.1|1338661_1338934_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126774.1|1339542_1339878_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307356.1|1340037_1341570_-	apolipoprotein N-acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211407.1|1341602_1342442_-	CBS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211411.1|1342438_1342936_-	rRNA maturation RNase YbeY	NA	NA	NA	NA
WP_016211412.1|1342939_1343932_-	PhoH family protein	A0A0S0MVD6	Pseudomonas_phage	9.3e-49	45.1
WP_016211408.1|1344046_1345393_-|tRNA	tRNA (N6-isopentenyl adenosine(37)-C2)-methylthiotransferase MiaB	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|1345616_1346678_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212287.1|1346756_1347902_+|tRNA	multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'-cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/2'phosphatase	A0A0F6YPT7	Sinorhizobium_phage	2.7e-60	41.7
WP_016211372.1|1353713_1354571_-	PIG-L family deacetylase	NA	NA	NA	NA
WP_016211371.1|1354557_1355481_-	badF/BadG/BcrA/BcrD ATPase	NA	NA	NA	NA
WP_016211368.1|1355677_1357069_+	sugar porter family MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211369.1|1357115_1358159_+	SIS domain-containing protein	F2Y1G4	Organic_Lake_phycodnavirus	5.2e-18	28.4
WP_016211370.1|1358201_1358645_-	Rrf2 family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211374.1|1358777_1359968_+	NO-inducible flavohemoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_016211373.1|1360022_1360169_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212140.1|1360719_1361637_-	EamA family transporter RarD	NA	NA	NA	NA
WP_036794860.1|1361904_1362198_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080664878.1|1362274_1362469_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300462.1|1363487_1364405_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210876.1|1364870_1365713_-	isopenicillin N synthase family oxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210873.1|1365780_1366431_-	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	4.1e-21	36.6
WP_016210874.1|1366445_1367486_-	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	Q58MH8	Prochlorococcus_phage	1.5e-68	44.0
WP_016210882.1|1367608_1368694_+	DUF2066 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210872.1|1368720_1369830_+	AI-2E family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210871.1|1369846_1370164_-	multidrug efflux SMR transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210879.1|1370160_1370520_-	multidrug efflux SMR transporter	NA	NA	NA	NA
WP_080664847.1|1373851_1374805_-	LD-carboxypeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|1374877_1375939_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212048.1|1376702_1377260_+	disulfide bond formation protein B	NA	NA	NA	NA
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WP_032126663.1|1378855_1379098_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300464.1|1379124_1380186_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_16

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16

>NZ_CP013773|1468443:1556916|DBSCAN-SWA
ATTAAGCAGCTAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGATTTTGGGCACAGATATTCTGTTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAACCATGCGCATCGCTTCCATTATGTCAATGGTAGGCCGTGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGGAAACGGGATTTGCGCTTTACCGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAGTTGTTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACACTGACTAGAAAAGACACCTTCATCTTTGGCTTTTTGGTGAGCGGGTGGAAATGAAGCGTGCTTGTCGACATTCACAACACGCGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCGATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCATCGCCGCTTTGGCATTTTGCTGTCGGCTGAGCATCCAGTCCAAAGTATGGCCATATTTATCAATGGCTCGATAAAGGTAATACCAACGACCTTTGATTTTCACCAACGTTTCATCTAACCGCCAAGAGGCACACGTTTGACGAAAGTGGGGCCTCAGCCGTTTGGCGATCTGCGAGCCATACTCGTGCACCCAGCGACAAATGGTTGAACGCTCAATCTCAAGACCTCTTTCAGCTGCTATTTCTTTGAGATCACGGTAAGATAAGGCATAGCGGCCATACCAACGCACCAGCCAAAGAATGATCTCACCGGAATAATGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATCGTTTACGTCTACCCACAGCAATTCACTCTTAACTTCCGTTGATTGCTACACCCTACTCAAATCTAAATTTTTTGCAACAGTGCCCAAGCATCAACCTTCAAGAGCAAACCATGACAACTAATGCCTTAATCCCAAGTTAAATTCATGGCATACTAGCAAACAATCTTTGATAAATTATATGAATATACTGAGGTGATATAAATTAGGCCATGAAGAGAAAAACGAATGTTGGCACCGTGCGCATTATCAGTGGGAAATATCGCGGTCGTAAAATTACCTTTCCAGCACTTGCCGGAGTGCGTCCAAGTCCGGACCGCATTCGCGAAACGCTCTTCAATTGGCTGATGGATGATATTTACCAACAACGCTGCTTAGATGTCTTTGCCGGTTCTGGAATTTTAGGCTTAGAAGCGTTATCGCGAGGAGCTGCTCACCTTACCGCTTGGGAGCAACAAAAAGACCTGGCCAACCACCTGCAGCAGCAACTTGATGCACTCAACTTTAATGATAACGCGAAGGTTCAATGTGCAGATAGTTTAACCCTTTTAAATCAAACCTGCCCTATCCCTTATAATCTTGTTTTTCTAGACCCACCTTTTTATCAAAACCTCATTCCAATCTGCCTAGAAAGGCTGATATGCAATCATTGGTTACAATCAGAGTCTTATCTATATATAGAGACTGAAGCAAGCTATGTACTGGACTTAAAGCCAAACTTAGATAATAGCTTAACACTGTTGCGCAGTAAAAAAAGTGGTGATGTTGCATATCACCTGCTAAGCTATCAGCCCACTGTATAAGGTGATGCAGATAGTGCAGCGCGACTTGCTTTACAGCAAAGCCAGGCTAACAATAGTGGTATTTTTACTCAGCTTAATTTTACAATAACAATAATTGAAGCAACTACGAATACAGGACAAACAGCTATGCCGGTGAGCTTATTTGATTTATTTTCCATAGGGATAGGGCCATCGAGTTCCCATACCGTTGGACCAATGCGCGCAGCCCACGCTTTTCTAGAAACCCTAAGCGCTGAGCAATTTAACAATATCGCCAGCCTCGAAGCCCATTTATATGGCTCACTCGCCTTAACAGGCAAAGGCCATGCCACCGATAAAGCCACCCTGATGGGGTTAGAAGGCCATCTACCTGAGTCTATCGACCCAGCAATCGTTGAACCTCGCCTCTATGAAATTATTACGCAAAAGACCTTAAATTTAGCTGGGAAAAAAGAAATTTCTTTTGATATCAATGAGCAACTTGTTTTTCACTGTGATGAATTCCTGCCCGAGCATGCCAACGGTATGCGCTTTGATGCCTTTGATGCCCAAGGCAATAAATTAATTGAAAAAACCTACTTTTCAACCGGCGGTGGTTTTATTGCCGATTTAAACAGTTTTCACCAAGAAAACAGTCAATCAAGCAATCAAAATCAGCAAGGCCCTCAACTGCCCTATTTATTTAACTCGGCCGAGCAATTACTCGCCTTGTGCAAACAGCATAATAAAACCATTGCAGAGCTGATGTGGGACAATGAACGTGCTTGGCGTAGCGATGAGCAAATAAAATCCGGCATCCTCGAGCTATGGCAAGTTATGGATGCATCGATAGAGGCTGGCACAAGAACCACAGGCCTTCTTCCTGGTGGGCTGGATGTAAAACGCCGCGCTCCCGAACTCTATAGAAAACTCAAAGAACAACAAGAAAATGGCCGTGGCTATGATGCCATGAGCTGGCTGGCCCAATATTCTATTGCTGTTAATGAAGAAAATGCCGCTGCCGGTCGCGTCGTCACAGCACCAACCAATGGGGCAGCAGGTACTATCCCAGCGACAATAAAATACTATCTTAACTTCGAGCAAGATGCCTCTGAACAAGGCTTGATCAACTTTATGTTAACCGCTGCCGCCATTGGCATTTTATACAAAAAAGGTGCCTCAATTTCAGCCGCTGAAGTCGGTTGCCAAGGCGAGGTTGGTGTCGCTTGCTCAATGGCTGCCGCAGGCTTCGCTGCTGCACTGGGAGCGACTGTTGAGCAAATTGAAAATGCCGCCGAAATTGGCATGGAGCATCATTTAGGCCTTACCTGCGACCCAATAGAGGGCCTGGTACAAATCCCCTGTATCGAACGTAATGTCATGGGGGCAACCCAAGCGATTGCCGCCGCACGCCTAGCGATGCTCGGCGATGGCGAGCATAAGGTCTCACTTGATAAAGTCATCAAGACCATGCTGCAAACCGGTAAAGATATGATGTCCACCTACAAAGAAACCTCTCAGGGGGGACTTGCCGTTAATTTACCGGAATGCTAGCCCTTCCAAGTAACACACACTAAACTAAAAATAATATAAAAAATAACATGCAGAAAAATTGCAGATCCACTGAAATTCGCTTACCCTTAGGTCAGTGAATTTCAGTTCAAATACAGGCACAGGTACGGGTAAAACAGCAATGAAAACAAAAGTAAATAATAAAATACAACGCAACTATGTCAGCGATATTAGTAAATTATTAAATACCCTGTCACAAAATCACCCTAAAACAGAATCACAACGCCAAGAAATCGACAAAGCCACGCGCATTACAGCAAAGATGACAAAATAATTACTCAATACCCGCCTTAACAAGCCATCCACAACATGGGCCTGTGCTTATTAAGGCCTTACCTTTAATATTAATAAAATCATTATCATTACATTAGCCTAGTGCAGGTTCGTTGTAACAACCCTCAGCACAATCAAGGCCAGCAAGAAAGTTGTTGGTCGATTCTTTAGTATCACCAATCCCAGTCAAGCGACGAAACCAAGGAAAACTCGGCTGATAAGTAAGAGCAACAGCCTTTATCTTTTTTATTGCTTCAAATTTTGCCTCTACAGTGAAATCAGGATTAGGGTCTTTAATAATTTCACAAACCTGAAGTGCTCTTTTTGATACAGAAAAAAACTGACCTTCCACTTCAAGCTTATAGCGAGAACCACCATACCCAAATTTAAACTCACCACTTTTTGCCTGATTTTCAATTGATAAACGTATATCCTGCAGTATTTGTTCCTTACAAGCACTTAGGCACTCAACTAACTCAGCTTTTAAACTCTCATGGCCGTCTCTGTGAAAATAAGCTTTCTGACTGCCTTTTCCCCAAAACGCTTCTTTTTGTTGTAAACCAACTAAAAAAGTGTAACTATCTCTTCCCGATCCAAGCCCATCAACTTGACCTAAGAGCTCCTTAATAACTGCAACTCGACTTCGAGAGTCAATTTGCTCCACATCCTCAGCAGAATCAATACTAGGACTCGGATCAGGCACCGGCTCCGGCTTTACATTCTTCTTGGCCAAAAACTTAGACCCGAGCGCCTTAGCCTTAGCAGCAAACTTATTCGCTATACTAGTAGCATTATCAACAACTTGATTAACATTGCGCTCGACCCCATCTCGACTCACAAACTTACTTTTTTCATGCCTTTTGATATTTAATAACAACTCTTTTATGTTATTTTTTAAATCTTGTAATGCCATACTCATTTCCACCATCAATCAGAGATACACCCATTAAGAACAATTTACATAAAAAACAATAATTTGTATATATTTTACATAAATTTAATGTAAATTTACATTATAGCTAAAACTCTAATCTAACAACTGTACAGTTTAAAGTCATAATTTCCCCTGATTCTCCTTGGCCCATTAAAACTTATTTGTAATCTCGCTTGGTCAATTAAGATGAGAAAAAATCATCGCTTAACTTAAATTTAAAGCCAATAGGCGACTGTCGTTCCCTGGTGAGGATATTAAGTTTTCAATACGGGCTGTATCAATTTAAAATATAAATAATTCAAATAGATAATTATAAAACCCGCTTCTTGCGACTATTTTTCATTATTACATTTAATATAGTTATTAAGGCTTAGTAAAATTTGACAAATTATCCGAGTAGAGTGATAATTTTCCAATTTTGCGTTATGATAAGAAGACTTGGCATTTCCTTAGAGAAGTCAGCAGCGCCACGAGGATTTAACTCTTTGTTAAGACTAACCGTTTTATTTTTGATCATTGCTTTATCCGCGCCTGGTTTTGCCGCAGATTTTATCACGGCCAACCATGAATTTCAGGCAGGCCAATTCAAACAAGCATTTGAAGATAGTATTCCCTTTGCACAAGCTGGGAACCTACAGGCATGTCTTGAAGTCGGATTTATGTATGAATTTGGCAAAGGTGCCAAACAAGATGCAAAAGCAGCAGCACAGTGGTATCTGTCTGCGGTACGCCCTAACGCATTTAACGCT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MPVSLFDLFSIGIGPSSSHTVGPMRAAHAFLETLSAEQFNNIASLEAHLYGSLALTGKGHATDKATLMGLEGHLPESIDPAIVEPRLYEIITQKTLNLAGKKEISFDINEQLVFHCDEFLPEHANGMRFDAFDAQGNKLIEKTYFSTGGGFIADLNSFHQENSQSSNQNQQGPQLPYLFNSAEQLLALCKQHNKTIAELMWDNERAWRSDEQIKSGILELWQVMDASIEAGTRTTGLLPGGLDVKRRAPELYRKLKEQQENGRGYDAMSWLAQYSIAVNEENAAAGRVVTAPTNGAAGTIPATIKYYLNFEQDASEQGLINFMLTAAAIGILYKKGASISAAEVGCQGEVGVACSMAAAGFAAALGATVEQIENAAEIGMEHHLGLTCDPIEGLVQIPCIERNVMGATQAIAAARLAMLGDGEHKVSLDKVIKTMLQTGKDMMSTYKETSQGGLAVNLPEC
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MKALAKIKPETGLWMVDVEHPKVGHNDVLIKIKKTAICGTDIHIYNWDHWASQTIPLPMHVGHEYVGEIVEIGSEVQGFNLGDRVSGEGHLTCGHCRNCRAGRRHLCRNTVGVGVNRAGAFAEYLAIPAVNAFKIPDEISDDIAAIFDPYGNAVHTALSFEMVGEDVLITGAGPIGAMAVAVARHVGARHIVITDVNDYRLALAEKMGASRIVNVARESLTTVMDELNMTEGFDVGLEMSGNGQAFGQMLEAMNHGGRVALLGIPPGEMAIDWNHVIFKGLQIKGIYGREMFETWYKMTSMLQSGLDLSPIITHHFSIDDFQQGFDAMLSGQSGKVILNWD
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MSIIKKAVFPVAGMGTRFLPATKATPKEMLPVVDKPLIQYAVEEAIEAGIKELIFVTSSNKRAIEDHFDRHYELEKRLEEAGKAQFLSIVRDILPQGVSCSYVRQAEPLGLGHAVLCAESLVGPEPFAVILADDLIANDGPLCLSQMVEKYNDKGADCILAVQEVPEGDTHKYGIVATESSDRVIHMVEKPQPENAPSRQAVVGRYILSPKIFTALKNTSQGAGGEIQLTDAIASVLQNQRVLAYPFAGKRYDCGSKLGFLEATLDYALDHPELGLACQEYLQKRFQLN
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MILSGTIFAETPIYRGNSKKTLFTRNGDGKEKLVSLAGRVEGTAQSLMDAFIGESNNKRNKGLINQMWGRLFEENIPVRLINNVTCTLKKSHYSNNNFFDLRMGLKLDEDRMASISGKNYKFETIFRNAEFNINIDVDMDEFKKAGVASKLISVFNEMKAGRFWYGAGKSKGLGRCRLVLDASLPELSQAPTVNSKVNHLTCHMSFSSKEPLLIGWNWGKVDQEAPAFMDVEGKYLIEGMRFLPKDIQSRLSSALGGGVADLESWKKEFFNTLPKAMVSWLKTSSEPNKAVLIISEADIHKFRTYALTAVLKHES
>NZ_CP013773|1468443:1556916|1541777_1542368_-|WP_016211322.1|DBSCAN-SWA
MRNTMLCEIAEIRPGYPFRGTITPVANTGTFVVQVRNTNASGEIHTSGMITTKLTGRKQPDWLQQGDILFVAKGAKYFAAYVKQLPTKTVCSPHFFIVRIKNEHSKTILPEFICWQLNQIPAQRYFKTTAEGSMYVSIRRQVLENVPIILPSIERQAQLVALHSSAVKEKKTLQKLITNRQQQLDAIAMAVLDKQT

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_054300202.1|1468443_1469172_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_016210945.1|1469365_1469956_+	16S rRNA (guanine(966)-N(2))-methyltransferase RsmD	NA	NA	NA	NA
WP_016210946.1|1470082_1471468_+	L-serine ammonia-lyase	NA	NA	NA	NA
WP_016210947.1|1471562_1471760_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126573.1|1471853_1472672_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126574.1|1473178_1473556_+	sel1 repeat family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210948.1|1473568_1473805_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210951.1|1473804_1474011_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036779389.1|1474193_1474913_+|tRNA	tRNA (guanosine(46)-N7)-methyltransferase TrmB	NA	NA	NA	NA
WP_016210954.1|1475001_1476786_+	SLC13 family permease	NA	NA	NA	NA
WP_036779399.1|1476884_1477139_+	DUF2282 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_144019244.1|1477495_1478107_+	amidohydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|1478594_1479323_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_016211812.1|1479404_1481018_-	DEAD/DEAH box helicase	A0A2I7RG64	Vibrio_phage	9.2e-62	32.6
WP_016211816.1|1481059_1481413_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|1481941_1482670_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_016211951.1|1482846_1483944_+	glutamate 5-kinase	A0A1X9I5D0	Streptococcus_phage	3.9e-48	34.3
WP_016211949.1|1483977_1485228_+	glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase	A0A1X9I5D4	Streptococcus_phage	1.6e-93	46.3
WP_054300202.1|1485367_1486096_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_016212193.1|1486218_1486557_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212195.1|1486624_1487011_-	type II toxin-antitoxin system VapC family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_016212196.1|1487007_1487253_-	type II toxin-antitoxin system Phd/YefM family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_054300475.1|1487661_1488390_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	5.6e-43	41.4
WP_016211625.1|1488873_1489743_-	UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU	A0A127AW70	Bacillus_phage	1.2e-68	47.5
WP_036779883.1|1489739_1491089_-	UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein	A0A127AXI2	Bacillus_phage	2.1e-75	37.2
WP_016211623.1|1491201_1492842_+	glucose-6-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_054300477.1|1493564_1494293_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	5.6e-43	41.4
1493753:1493812	attL	NA	NA	NA	NA
WP_054300478.1|1494572_1496309_-	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	1.3e-24	44.0
WP_054300202.1|1496648_1497377_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_016212214.1|1497535_1498036_-	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016212213.1|1498010_1498520_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|1499119_1499848_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_054300479.1|1499998_1501039_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211653.1|1501236_1502262_-	L-threonine 3-dehydrogenase	R9TPW0	Vibrio_phage	2.3e-18	78.8
WP_016211652.1|1502369_1503575_-	glycine C-acetyltransferase	V5LQ39	Emiliania_huxleyi_virus	2.5e-35	26.6
WP_016211655.1|1503834_1504248_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211654.1|1504376_1504946_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211657.1|1504949_1505282_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300480.1|1505274_1506114_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211047.1|1506201_1507836_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211051.1|1508197_1508701_+	methylated-DNA--[protein]-cysteine S-methyltransferase	A0A167R6J9	Powai_lake_megavirus	1.1e-13	43.5
WP_016211050.1|1508663_1509371_-	dethiobiotin synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016211044.1|1509439_1510300_-	malonyl-ACP O-methyltransferase BioC	NA	NA	NA	NA
WP_036777969.1|1510280_1511054_-	alpha/beta fold hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016211052.1|1511084_1512338_-	8-amino-7-oxononanoate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016211049.1|1512337_1513300_-	biotin synthase BioB	NA	NA	NA	NA
WP_016211056.1|1513343_1514096_+	ComF family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|1515631_1515997_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|1515942_1516518_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016210615.1|1517424_1517895_-	DNA starvation/stationary phase protection protein	A0A0A7RTZ1	Clostridium_phage	2.1e-19	35.7
WP_016210624.1|1517940_1518180_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036777984.1|1518198_1518648_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210617.1|1518868_1520293_+	bifunctional D-glycero-beta-D-manno-heptose-7-phosphate kinase/D-glycero-beta-D-manno-heptose 1-phosphate adenylyltransferase HldE	M4QSA2	Synechococcus_phage	1.4e-16	42.3
WP_016210618.1|1520357_1521407_-	UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_051307334.1|1521673_1522453_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556587.1|1522496_1523399_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210625.1|1523457_1524204_-	SDR family oxidoreductase	Q06VL0	Trichoplusia_ni_ascovirus	1.3e-18	30.8
WP_016210616.1|1524452_1527263_+	phosphoenolpyruvate carboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_081007053.1|1527497_1528358_+	HAD-IIB family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_054300481.1|1528459_1529188_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	9.6e-43	41.4
WP_080664881.1|1529277_1529484_+|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_081007054.1|1529646_1530879_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.1e-27	44.6
WP_054300482.1|1531394_1532684_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300201.1|1532713_1533442_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	9.6e-43	41.4
WP_036780093.1|1533545_1534367_-	M48 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016211722.1|1534376_1537679_-	type I restriction endonuclease subunit R	A0A220A398	Liberibacter_phage	1.7e-54	27.1
WP_016211323.1|1539107_1540205_-	Fic family protein	D7RWK9	Brochothrix_phage	1.0e-27	28.3
WP_016211325.1|1540194_1541715_-	type I restriction-modification system subunit M	A0A2H4PQP4	Staphylococcus_phage	7.3e-85	38.9
WP_016211322.1|1541777_1542368_-	restriction endonuclease subunit S	NA	NA	NA	NA
WP_054300483.1|1542903_1543458_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300484.1|1543954_1544902_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155046947.1|1545803_1545971_-	phosphatase	NA	NA	NA	NA
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WP_081007056.1|1548243_1548453_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_081007057.1|1549780_1550197_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_087910645.1|1550254_1551407_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	8.9e-59	44.2
WP_016212230.1|1551463_1552912_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126389.1|1554445_1554634_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046946.1|1556035_1556311_+|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	NA	NA	NA	NA
WP_054300489.1|1556313_1556916_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	6.5e-37	46.2
1556376:1556984	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_17

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17

>NZ_CP013773|1602205:1653646|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_18

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18

>NZ_CP013773|1714338:1747724|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016210384.1|1735271_1735751_-	LPS-assembly family protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_19

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19

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>NZ_CP013773|1900881:1966435|1911517_1911754_+|WP_017375944.1|DBSCAN-SWA
MSRICQITGKGPMTGNNVSHANNKTRRRFLPNLHTHRFWVESEQRFVRLRVSSKGMRIIDKKGIDSVLAEVRARGEKV
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MNDTARYQAGRRATLIGAGLNFCLAVLKIVVGLFGRSHALVADGIHSFSDLICDFFVLMAARYGMSEPDQDHPYGHGRIETVATVVLSIFLITLGVGIGIDAFYSLVQGSDARPDSYTLIIAVISIVVNEGLFRYTLKVADQINSDLLRANAWHSRGDSLSSLIVLIGIIGSLLGWSFLDAVAAIIVALMIIKMGMTWGWRALKELIDTALPEDQVADIANAIRAIPHVLAVHDLRTRKMAGYVLLDVHILIHPYISASEGHFIAEQVRAGLMQQFASIRDITVHVDVEEHAHDLNIVKLLSRDQINHDLMPVWQTILGVQQPVDFMLHYLQEKVIIDLYLPNKVIKGADAIIAQLQNSVSNYPDVEKLRAFLKVKA
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MTIIDDIRHAYRLTVGYRWKFWMAFLPVLFLLTASQLITVQKVHNPSISLNVLQILIQAIVAFAVVGLYRFGLLRAREQACGAFRTVWDVSQWRAGLAYIGASIILTVIVTLGMVLIGLLGHIVPISVVMVLSLFYLFFIFLGTVFIPLIILDGQLPWYKAVFGSFVLIRYGFSEFAQLVVAALILMIVSILTLGILFVWVLPLLFVLTSGTYLRLLNHAKR
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MLKKAQIEKESSVEAEFPGGASGGDSISTGDKVSEEEVYSVVGNNTPSEMLVSQLAELAQEAIAELEEKVNAEGSFFSFFLPPDNDGRNESIGQLEKLKLVLQGQDGGADGPLNKKPVSFIKEKIKEHCNDKIKRKNTESIGFFLQKVEVLLSSFPEIDDVCGIDWVAFKEEDVEEWVMVEPRDGNSDTVVSGTTALLFQQQHYSGLQPPESNMANEPK
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MKFKRNISTLGMLFTALSGIIGSGWLFGPYFASQIAGPAAIFGWALAGILMIIIALNFTELATMYPEAGGLARFAHKSHGPIVGFTMAWVVWISSVIVAPIETLAALQYLATYVPSLMKQTGNSHELSAMGIVFAAIVMFALCLINALGVKSAAKTNTVIVFFKFAIPLLTAIILLSHSFHATNFTSHQFLPTGVHGVLAALPAAGIAFSFMGWSAAIQMAGEAKNPQRSIPIALIGAICIGIIIYSIIQVSFIGALPADALSHGWANLSFKGDMGPFAGLLTAIGLGAFVIMIYADAVYSPLGTVLVYTTATARVTHALASHRYVPTVLTKLSSRGVPVYALAINFIVGMCFFLPFPGWQAMAEFIVSAFIISYAIGPTALIVLRDIQPEQPRPFKLPAYKAFSMLAFYVCNMLLFWTGWHTVSKLIIIIIIGYGVYFSYFKFSKQRLDAGALFKAIWLIPYLIGVTVISYLGSYGGGHDFIHFGADFFIIALFSFIIFTLAYWCGIHGVKRSQSGTTPCQLQQV
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MDTSLIGLFCIVDDFCQVFLPHWKASLLEHQDKQRNKPSRMSTSEIMTIMIYFHQSHYRNFKHYYQREVQGHLKKYFPKAVSYNRFVELMPTILLPLCFFIAAQRKTPTGIYFVDSTVLRVCHHKRSHQNRVFKGLAKKCGSTMGWFYGFKLHLIVNDMGELMAFKLSQATTDVSEIAQGLTGKIIGDKGYISQDLFNRLYEKGLQLINKIRKNMKNRLMPIIDKILLRKRGIIESVFDQLKNISQIEHSRHRSVNNFMVNILAGLAAYCLQEKKPSLNIQRNLLTS
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MSRPNNIFLIGPMGAGKSTIGRHLAQMLRMEFVDSDQELEDRTGVGIDWIYDVEGEDGLRAREQDVIADLSLRSGIVLATGGGAINSAENRKCLAGRGTVVYLYASVEQQLNRTAYDRGRPSLQYAKNRRELLEQMMDEYDKLYRSIADCTVATDARTVRSVANEIIQALATEA
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MNLNFDNIDLAKLLQLIAEFAQLNLVINDDVQGTMSLHLKKVTWQQALNVILMAEDLTENRQGNILIIKKKGLILKKANNKLNKRKMESLFVNVHYGRAEKIAMILKEGSGKIISTQGIVSFDQRTNVLLIHDYIDRIKIIKKMIKALDRPVPQVMIEARIVIANRSFEKDLGVKFGISGGGSTVATAGSISGTNAIRQGESPGIAERLNVSLPFMADSAATGLGRFALAVAKLPGNLLLDLELQALESEGEAEVISTPKLLTAHDQEAFIEQGEEIPYLESTSSGAASVSFKKAVLGLTVTPHITPDQHIILTIRLSKDSRSALSAGDGGSSANVLPPAIDTRVIKTQALVKDGETIVLGGIYEQEKQRVVRRVPFLADLPGIGWLFQSRSQSTLNKELLIFVTPKIMSAY
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MGNNIVYSQCLSNGCNRRRGDNLLYIQQRNKLNFILVIFGVIAAQAAVSLYLPSLPAIDHEWHLASGQAQLTLSAFFLTFGVSQLFYGALSDHFGRKPLLLMGLVILVLSSVWAIYATSFHSLLAARLVQGVGGGALSVLARAIIRDLFHGDELRKAISILAIAASFTPALAPSLGGWLEDHFDWRSSFVILTAYSIILLVTIFSLFTETNQYQRQPNESIDFSKVVASYYSVTKNKLFWCYGFAILIGYLSLVICLANASFLLEKKFGLSAEITGYLMFVQPGFFLVGNLLQHKLTDKISGDLFLKFGMVILGVIGLSFLFQGVFHSATLINVLLTLALAGFATSLILVNALAGVLLPFTENAGAAAALSGVLQMVGASFITALISNLHWTSIIDLGWIYLALFVVLYISLLFLHRIRLYSPCYKSA
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MILIIPYIASAMPLENTKVNMKVMVTIIPPLKLKVGNLNFDTLVKPITGKKMYQADTELYLYGAPKQSVKITLAKQVTIENKKNKLIVWLSLVNKKVILNRKGKAYSVITGAIKLTPLTKTGNYSGQTIITASYF
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MNWLSILDYLDSHALGLARTLVIAIVGFFIARWVKKRLYHFLEQHAANRTIQLYAVNIAYTFILIILMVILLGQLGVSTTSLIALLGASGITIGLALKDSFSNIASGFMIIILKPFKIGDLVEISGKIGTIDQINLITTRLKTANNEGIYIPNAKIFNDKIINKTFKETRRIDLSISISYSSDLLQAKAILNELIREDERILTVPIPTIAVKELADSAVVIAVRPWVNNSDYGKVRFSLLESIKTRFDQHGIVIPYPQMEVILHRNNQQGNKAS
>NZ_CP013773|1900881:1966435|1932115_1932442_-|WP_016210045.1|DBSCAN-SWA
MSDNILDVTDGDFDTEVLQSSTPVLVDFWASWCGPCKALSPVLAEIASQYEGKVKIVKVNVDENTQTPQKYGVRGIPTLLLVKGGAVTATKVGALNKAQLTSFVDSNI

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_054300168.1|1900881_1901745_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075274701.1|1902041_1903094_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046999.1|1903382_1903790_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_033923654.1|1904003_1904495_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211702.1|1904550_1905801_-	malic enzyme, NAD-binding domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_032127042.1|1905903_1906122_-	50S ribosomal protein L31	NA	NA	NA	NA
WP_036777591.1|1906579_1907434_+	SIS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210728.1|1907488_1907959_-	peptide-methionine (S)-S-oxide reductase MsrA	NA	NA	NA	NA
WP_016210732.1|1908265_1909645_-	phosphomannomutase/phosphoglucomutase	A0A127AWJ1	Bacillus_phage	5.1e-53	31.6
WP_016210726.1|1909672_1910131_-	dUTP diphosphatase	G0YQD9	Erwinia_phage	4.2e-52	69.6
WP_032126740.1|1910108_1911326_-	bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase CoaBC	Q9HH70	Methanothermobacter_phage	3.7e-39	34.2
WP_017375944.1|1911517_1911754_+	50S ribosomal protein L28	NA	NA	NA	NA
WP_016210730.1|1911767_1911923_+	50S ribosomal protein L33	NA	NA	NA	NA
WP_075274702.1|1912003_1912966_+	alpha/beta fold hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210735.1|1913125_1914442_+	MATE family efflux transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210727.1|1914451_1915120_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210734.1|1915482_1917297_+	translational GTPase TypA	A0A1S5SF82	Streptococcus_phage	3.8e-24	45.1
WP_054300166.1|1917414_1918203_-	sulfite exporter TauE/SafE family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211543.1|1918783_1920535_+	ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016211544.1|1920545_1921346_+	ABC transporter ATP-binding protein	G3M9Y6	Bacillus_virus	5.8e-33	38.6
WP_016211545.1|1921448_1921937_-	dihydrofolate reductase	A0A1B2IDT7	Erwinia_phage	2.4e-29	43.7
WP_032126435.1|1922110_1922425_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375799.1|1923445_1923790_+	DMT family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210038.1|1929483_1930446_-	D-2-hydroxyacid dehydrogenase	M1HUT5	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	8.8e-20	27.0
WP_016210039.1|1930632_1931892_-	transcription termination factor Rho	NA	NA	NA	NA
WP_016210045.1|1932115_1932442_-	thioredoxin TrxA	A0A1J0GW78	Streptomyces_phage	1.5e-16	46.2
WP_052104566.1|1932636_1933587_+	Ppx/GppA family phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_032126434.1|1933644_1935711_-	polyphosphate kinase 1	NA	NA	NA	NA
WP_016210049.1|1935716_1936712_-	porphobilinogen synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210042.1|1937297_1938878_+	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210041.1|1939034_1940444_-	glutamate--ammonia ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016210047.1|1940503_1941637_-	cation transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210033.1|1941776_1942601_-	mechanosensitive ion channel	NA	NA	NA	NA
WP_016210034.1|1942828_1943458_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210044.1|1943794_1944166_-	isochorismatase	NA	NA	NA	NA
WP_016210046.1|1944469_1944757_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126431.1|1944908_1945757_+	pantoate--beta-alanine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016210037.1|1945884_1946925_+	succinylglutamate desuccinylase	NA	NA	NA	NA
WP_129556667.1|1946997_1948575_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300165.1|1949218_1949878_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1950032_1951007_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_054300164.1|1951082_1952102_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155047000.1|1952149_1952296_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047001.1|1952500_1952686_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300162.1|1953584_1954667_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1
WP_054300161.1|1954714_1955776_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211201.1|1955856_1956165_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211206.1|1956279_1957596_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_081007001.1|1958057_1959344_-	multidrug effflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211205.1|1959416_1960313_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211203.1|1960399_1961398_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126430.1|1961506_1962031_-	shikimate kinase AroK	NA	NA	NA	NA
WP_129556668.1|1962278_1963517_-	type IV pilus secretin PilQ	G4WZN6	Enterobacteria_phage	6.0e-13	24.1
WP_016212222.1|1964064_1964538_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556669.1|1964534_1964930_-	PilN domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|1965859_1966435_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_20

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20

>NZ_CP013773|1976509:2082863|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_21

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21

>NZ_CP013773|2142258:2191994|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_054300546.1|2191397_2191994_-|transposase	IS1595 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_22

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22

>NZ_CP013773|2254150:2303147|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_081007013.1|2256599_2256899_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300544.1|2256989_2257436_+	HDOD domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210242.1|2267612_2267951_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210243.1|2268035_2268566_+	outer membrane family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210228.1|2268626_2270819_+	DNA helicase II	A7KV33	Bacillus_phage	1.3e-106	36.0
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WP_016210225.1|2274335_2274614_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126362.1|2283200_2283566_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_080728339.1|2283629_2283902_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300540.1|2284169_2284394_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300539.1|2285409_2286753_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210775.1|2287045_2287639_+	CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210786.1|2290487_2290934_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209863.1|2299064_2299487_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209853.1|2299727_2300171_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_23

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23

>NZ_CP013773|2319032:2374289|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_24

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24

>NZ_CP013773|2534537:2644245|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_129556623.1|2535617_2537177_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	3.0e-09	24.9
WP_051307335.1|2537198_2538233_-	EF-P beta-lysylation protein EpmB	NA	NA	NA	NA
WP_016210643.1|2538281_2538851_+	elongation factor P	NA	NA	NA	NA
WP_122940481.1|2538986_2539958_+	elongation factor P--(R)-beta-lysine ligase	A0A1V0SAC0	Catovirus	2.8e-21	25.3
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WP_054300510.1|2548587_2548770_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2548826_2549192_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126128.1|2550108_2551515_+	capsule biosynthesis protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210501.1|2551532_2552519_+	UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase (inverting)	K7Y9E1	Megavirus	4.9e-42	34.2
WP_016210490.1|2552521_2553676_+	UDP-4-amino-4, 6-dideoxy-N-acetyl-beta-L-altrosamine transaminase	A0A2D2W2B8	Stenotrophomonas_phage	1.3e-14	28.6
WP_016210502.1|2553672_2554368_+	pseudaminic acid cytidylyltransferase	A0A1B1IVD3	uncultured_Mediterranean_phage	1.5e-08	35.5
WP_016210500.1|2554502_2555993_+	UDP-2,4-diacetamido-2,4, 6-trideoxy-beta-L-altropyranose hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210494.1|2556013_2557063_+	pseudaminic acid synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210496.1|2557129_2558524_-	capsule polysaccharide biosynthesis family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210489.1|2559402_2561334_+|tRNA	threonine--tRNA ligase	A0A2K9L297	Tupanvirus	2.3e-120	36.5
WP_075273353.1|2561338_2561869_+	translation initiation factor IF-3	A0A2L0UZ54	Agrobacterium_phage	4.7e-15	33.9
WP_016210493.1|2561903_2562098_+	50S ribosomal protein L35	NA	NA	NA	NA
WP_016210495.1|2562140_2562500_+	50S ribosomal protein L20	NA	NA	NA	NA
WP_016211706.1|2562919_2563915_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit alpha	A0A2K9L3A8	Tupanvirus	2.5e-33	37.4
WP_036777440.1|2563927_2566309_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_016211707.1|2566314_2566602_+	integration host factor subunit alpha	A0A0H3UZA0	Geobacillus_virus	3.0e-08	33.7
WP_052133265.1|2566873_2567350_-	YbhB/YbcL family Raf kinase inhibitor-like protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300509.1|2567494_2567692_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|2567816_2568791_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_075273615.1|2569691_2569790_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300507.1|2570274_2571564_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300575.1|2571800_2572493_+	acid phosphatase AphA	NA	NA	NA	NA
WP_016210472.1|2572534_2573308_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210485.1|2573309_2574251_-	hypothetical protein	A0A068C8G6	Acinetobacter_phage	2.3e-20	26.5
WP_016210482.1|2574383_2575961_-	FMN-binding glutamate synthase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210484.1|2576170_2577928_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274711.1|2578476_2579235_-	ferredoxin--NADP(+) reductase	NA	NA	NA	NA
WP_032126625.1|2579442_2580015_+	DNA-3-methyladenine glycosylase I	NA	NA	NA	NA
WP_016210475.1|2580118_2580667_+	DUF2058 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210487.1|2580968_2581214_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210488.1|2581242_2581539_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_122941726.1|2581806_2582730_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
2583038:2583097	attL	NA	NA	NA	NA
WP_054300506.1|2583208_2583616_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300481.1|2583687_2584416_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	9.6e-43	41.4
WP_032126799.1|2584496_2585309_-	DNA/RNA non-specific endonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_129556452.1|2586429_2586777_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212146.1|2586779_2588519_-	PLD-like domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046941.1|2588920_2589184_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300500.1|2589855_2590584_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	2.7e-45	42.7
WP_054300502.1|2590613_2591291_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	2.9e-09	30.8
WP_016212477.1|2591463_2591709_+	type II toxin-antitoxin system Phd/YefM family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_054300501.1|2591920_2592649_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	7.8e-45	42.7
WP_016212066.1|2593009_2593786_+	N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase	NA	NA	NA	NA
WP_016212069.1|2593997_2594165_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212070.1|2594139_2594739_+	DUF1353 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375910.1|2595508_2596237_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
WP_016211714.1|2596311_2599656_-	autotransporter outer membrane beta-barrel domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375910.1|2600272_2601001_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
WP_017375910.1|2601296_2602025_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
WP_016212268.1|2602181_2602766_-	recombinase family protein	W6CWV1	Ralstonia_phage	5.9e-27	38.0
WP_016212269.1|2602769_2603453_-	Fic family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300201.1|2603934_2604663_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	9.6e-43	41.4
WP_155764079.1|2604692_2605367_-|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	A0A2L1IV36	Escherichia_phage	6.8e-27	45.9
WP_054300202.1|2605569_2606298_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
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Sequences of DBSCAN-SWA_25

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25

>NZ_CP013773|2705035:2806316|DBSCAN-SWA
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MMPKLLEQKQWDKIYLFLKDFPGIYCGSERKCRLFIEAVIWILRTGSQWRYLPEDYGYWNSVYKRFSRWDNRGVWDALFTSVQTPELDSGMVDSTVIRAHACSAGYKKRQRD

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016209523.1|2705035_2706385_-|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssK	NA	NA	NA	NA
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WP_075274721.1|2707134_2708646_+	DUF2169 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209516.1|2711574_2713044_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126187.1|2715002_2715401_+|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssE	NA	NA	NA	NA
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WP_016209506.1|2717067_2718024_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209515.1|2718066_2718582_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209526.1|2718686_2719619_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	1.2e-21	25.8
WP_016209534.1|2719838_2720225_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209530.1|2720241_2720886_-	2-polyprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016209504.1|2721066_2721906_+	carbon-nitrogen hydrolase family protein	M1I6H3	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	2.0e-15	28.8
WP_016209502.1|2721981_2722584_+	signal peptidase I	NA	NA	NA	NA
WP_016209512.1|2722584_2723439_-	RNase adapter RapZ	NA	NA	NA	NA
WP_016209537.1|2723795_2724107_-	ribosome-associated translation inhibitor RaiA	NA	NA	NA	NA
WP_016209519.1|2724131_2725523_-	RNA polymerase factor sigma-54	NA	NA	NA	NA
WP_016209538.1|2725678_2726410_-	LPS export ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	1.3e-20	30.7
WP_054300558.1|2726406_2726934_-	lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA	NA	NA	NA	NA
WP_016209499.1|2726965_2727523_-	LPS export ABC transporter periplasmic protein LptC	NA	NA	NA	NA
WP_016209498.1|2727528_2728509_-	KpsF/GutQ family sugar-phosphate isomerase	A0A2P0VNK5	Tetraselmis_virus	6.0e-32	30.4
WP_016209539.1|2728648_2729449_+	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.6e-25	32.7
WP_036780687.1|2729452_2730220_+	lipid asymmetry maintenance ABC transporter permease subunit MlaE	NA	NA	NA	NA
WP_016209535.1|2730216_2730681_+	outer membrane lipid asymmetry maintenance protein MlaD	NA	NA	NA	NA
WP_016209507.1|2730703_2731357_+	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209517.1|2731360_2731708_+	STAS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209505.1|2731741_2731993_+	BolA/IbaG family iron-sulfur metabolism protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209518.1|2732068_2733337_+	UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209527.1|2733339_2734098_+	Nif3-like dinuclear metal center hexameric protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209508.1|2734159_2735050_+	OmpA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209511.1|2735100_2735784_+	uracil-DNA glycosylase	A0A0R5YU95	Harp_seal_herpesvirus	2.3e-46	49.5
WP_075273445.1|2735869_2736127_-	DUF4286 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274722.1|2736399_2738553_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210408.1|2738544_2739417_-	DNA replication terminus site-binding family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210409.1|2739584_2741414_+	class I poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210411.1|2741576_2742218_-	BON domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273448.1|2742459_2742990_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210404.1|2743007_2743181_+	50S ribosomal protein L32	NA	NA	NA	NA
WP_016210402.1|2743239_2744289_+	phosphate acyltransferase PlsX	NA	NA	NA	NA
WP_016210405.1|2744295_2745246_+	ketoacyl-ACP synthase III	NA	NA	NA	NA
WP_016210406.1|2745299_2746244_+	ACP S-malonyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210415.1|2746271_2747009_+	3-oxoacyl-ACP reductase FabG	NA	NA	NA	NA
WP_016210413.1|2747097_2747340_+	acyl carrier protein	A0A1P8VVJ5	Erythrobacter_phage	2.0e-05	39.7
WP_016210403.1|2747414_2748638_+	beta-ketoacyl-ACP synthase II	NA	NA	NA	NA
WP_016210400.1|2748669_2749518_+	aminodeoxychorismate lyase	NA	NA	NA	NA
WP_016210401.1|2749514_2750567_+	endolytic transglycosylase MltG	NA	NA	NA	NA
WP_032126181.1|2750687_2751308_+	dTMP kinase	A0A1L2BX49	Bacteriophage	4.2e-39	44.2
WP_054300218.1|2751323_2752355_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|2752398_2753373_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_081007004.1|2753526_2753982_-|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075273313.1|2753941_2754280_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126790.1|2755072_2755978_+|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|2756024_2757086_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212599.1|2757135_2757345_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075273327.1|2759029_2759605_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_26

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26

>NZ_CP013773|2841680:2887123|DBSCAN-SWA
TATGGAACCTTTGAAACACGCAGTTAGTCCTGTTGGTGTGACGGGGTTGGGAAGCGATGATAAGGATGCGATTAGCGATGCTTTAACAAGCTGCCTGCCACGCCTGATAGGCGCACGGCAGCTGTATTTAGGTTTCAGTGGTGGTCTTGATTCCCGTGTTCTTTTAGCCGCATTGATGCGGTTAGCAGAGCATTACCCACACTATCAAATTAAAAATAAACTCACTGCAGTCCATGTTCATCATGACTTAAATGCTCAGGCGGATGCTTGGGCTGAGTACTGCCAGTGTGTTTGTCAGTCTTACCAAATTAATTTTATTTGTGAGAAAGTCAGTCTGAATTTAAGTCAATTATCTTCGGGACTTGAAGCGGCTGCTCGCACAGCCCGTTATGGGGTGTTTAAAAAATTCATGCAAGAGAGTGACCTATTATTGTTAGGTCAACATGGCGATGACCAGATTGAGACGGTCTTATTGCAGCTGTTTCGCGGTGCCGGGCCACAGGGTTTGGCAGCGATGGCTAAAGAGTCTCAATTTTCAGCTGACGATGACCGTATAGTCTTGCGGCCATTGTTAGAACTTAAGCAAATTGATTTAGCGCATTATGCGCGCGATCATCAGCTAGACTGGGTGCATGATGATTCAAATGATAATTTAAGGTTTGAGCGCAATTTTTTACGTCATCAAGTGTTACCTAATTTGCATCAACGTTATCCTGGATTAATTGATACAGTTGGTCGTAGTGCACGTTTATGTGCTAAGCATAATGAGTTGCTTAATGCCTATGTACAGGAGGATTTAGTTAAGCACCTTACTCATCAGGGTCAAAGTAACGTGGGTAATAATTATTTAAATTTAAATTTAAATAATAGTCTATGTTCTAAATATTGCTTGAGCTTATTTAAGCTTGCAGGATTTGAGGCTTATTCCTTGGCGCGTCAAAAGGCCTTGATTCGTGCTTGGCTTGCCCACTCTCAGGTGCTGATGCCAAGTGAAGTAAAGCTTACTCACTTAATTCATGATGTCTGTTTGGCTAAAGTTGATGCTCAGCCCATGCTGACATGGGGACATTGGCTATTGCGTCGTTATCATGGCCATTTGTATTTATTTGATCAACAACAAGACGATAGTCATCATTGCTGTGCTTATCATTTACAAGAACAAACCTGGGGTGGTGAAACAGTCACGCTTGAAAATGGCCAGGTCATCTCAAGTCAGCATTTAGTTGACCTGGGTGTAGATTTGGCACACTGGGATTGGCAAGGCGTGACGATTGGCTTGCGACAAGGCGGTGAGCGTTTTCACCCTCAAGGGCATCCGCATTCGCAGCCGTTAAAAAAGTTTTTACATGCACAAAAAATCCCGCCTTGGTTACGTGAGCAGCTAATTTTGGTCAAACGCGATCAAAAAACAGTGGCAATTTTAGGTCTTGCTCTGGCCGCGCAGGGCGAGTAATCAAAAAGAAATAATGGTAGAGGACTTTAATATATATGTTCGGGCTGATTAAGCAAACAACAGCAAGTGTCAAAGATGAGGTTTTATCCGGGGTTACGGTAGCGATGGCGCTGGTTCCTGAGGCGGTTGCGTTTTCCTTGGTTGCACATGTTGCCCCTTTAGTGGGTTTATATGCGGCTTTTATTATGTGTACATTGGCGGCGATTTTAGGTGGGCGACCAGGGATGATCTCTGGGGCGACCGGGGCGATGGCGGTTGTTATCGTTGGTTTGGTCTCGCAATACCCAGGTTGGCAAGGCTTACAATACCTTTTTGTGACGATTATTATGACTGGAATTTTAGAAATTTTAATCGGTGTGCTGCGCTTAGGGCGTGTGGTGCGAATGTTACCACAGCCGGTAATGTTTGGTTTTGTGAATGGCTTGGCGATTGTCATTTTCTTAGCGCAACTCAAGCAGTTTCAGTTTAACGATGCGAATGATGTGATACAGTGGGTCAGTGGCAATTCATTGTATATTATGCTGGGTTTAGTTGCATTAACGATGGTGATTGTCTATGCATTGCCTAAGATTACGCGCTTTCTACCTGCGGCATTAGTAGCGATTTTAGTAGTTACGGCACTTGTGCATATGTTTGGCTTAGAGACGCGCACAGTGGGTGATCTGGCATCAACGGCAGGAGGTTTTCCTAAGTTTCATGTGCCGGATGTTATTTTAAACTGGCAGACGATTAAAATCTGTTTGCCGTATGCGGTGATTTTAACCATTGTTGGCCTGACAGAATCACTCATGACCTTAACGTTGATTGATGAGCTGACCGAAACGCGCGGTCAGGAAAATCGAGAATGCGTAGCCCAAGGAGTTGCTAATATCACCTGTGGGTTTTTCGGTGGTATGGGGGGCTGCGCAATGATTGGTCAAAGTATGATCAATATTAACTCCGGAGCACGTCGACGTTTATCAGGTATTATTGCAGGCTTAGGCTTATTAACGATTATTCTGGTTGCCTCGCCACTCATTGCGCAGATTCCCTTAGCAGCATTAGTTGGCATTATGTTTATGGTGGTGATTGGAACGTTTGAATGGTCTAGTTTTAGAATTTTACACAAGATCCCAAAAGTCGATGCCTTTGTGTTAGTTCTCGTATCGGCAGTGACAGTATTTAGTAATCTGGCAACCGCCGTGATTGTTGGTGTGATCGTCGCAGCTTTAGCCTTCGCTTGGAAAAGTGCCAAGAATACTCACTCTAAAACCTATATTAATGAGGCAGGTAGTAAAGTCTACCAACTGGAAGGGCCATTATTTTTTGCCTCAGTATCTAATTTTAAATCGCTATTTACGCCGTATGACGACCCTGAGGATGTGATCGTTGATTTTGATAACTCGCGTGTGTGTGATCATTCGGCGTTAGAGGCGATTAACCAGCTGGCTGAACGCTATGATGCTGTGAATAAAACGTTGCACCTAAGGCATTTAAGTGCAGATTGTCGAGTCTTATTATCGAAGGCAAAAAATAAAGTTGAGGTGAATATCTTGGAAGATCCCACCTATCGAGTTGCTGAATAAAATACTAGGGAGCTTTAGCTCCCTTTTTTGTTTTTATATCAAAACAGCTGGTGTGGACAATGTGGTGTGGGTATATGAGTAGTAATTTATATGCTGCTGCTAAGAAGTAGAATTTAAGGGAGAAACTTAGATAAATTGACGCGAAACAGGTTGGTTTATCAGAGGCTGGAGACGGCAGTCAATAAGCTATTTTATTTCAAGCCCTTATTATTTAAATTAATTATTGAGTTGTAATTTTACTATCTATTTATTTTAATATGTATTGTTTATCACTTTTAATGAGTCAGAGTATGTTAAAGCAGTTAAATTTAAAGGGGCGATAGCTTCCCTTGCTTAAAATTTACTTTACATGTACAAAAAATTGCTTTAATTTTTAGATTGTAATCTCCCTATTTTAAAAGCATGAGTGCTGTGCAGTTATATTTAGGAGAACAAATCGAATACTTAAAAGCAGGTTATCACAGCAGTATTTTAGATGTAGCATAAAAATATAAAGCCTGATTATTATCCTAAAGTTAGCTTGTTCTTTTTTTAGCTAGCAGAATTATTTTTAACATTATCTGTTGGAGATGACTATGTTATTTGAAGATTTACAGGCGAGTGTGCTGAGGTTATTAGAACATGTTGCTATAAGTTTACCTGTTGCTCAACCAGACGGTAATTTTGAAGAGGAAGTTCATAGAGCTATTAGCTTTCTTAGTAAGCTTGAGAAGCAGGTAGAGAGAGCCAAATCGGCGGAAGTTCTCCTCGATATTTTAGTTTGTCTTCAAGAAAGTCACTTAGTTGGTGCATACGACTCTGTTTTACAAGACAAATTGTTAGCAGAATATATTCTAGCTTGTGAAGAAATGGTGGGGATAGCTGCTAAAGAGATAGGGGTAGCAGCTAAAGAGATTGTTGAGTGGGGACCATCATTGAGGGATGAACTATTAGTTGCTGGGGTGGCGCTAACTAGTGAAAAAGACAGTGAACTAAGCATAACTGCTTTAGAAATGGAATCTTCTAGTGAGCTTAGCCTTAGTGATGAAGAAATAGTATTAGACTCAGAGGTCACTGCACAGGAGGCAGATTCTCCTGATGGACAAGTGGAGGTTATTAGTCAGCACTGGACTGAAGAGAACGCAGCTCTTTTGGCTGTTATTCGCCAGAGATATAATATCCTTAGTCAGAAAGTAGCAGATACCCTGAAGGGAGTAGAAGACTCTCTTGATAGGCTTCCTCCTCGTCATAGCGTAAGGGTTGATGTGCAGCAAAGCGATGATACAGGTACTTTGAATCAAGTATATAATGGGGAGCTAGTCGCAGAGCCAAGTACAAGTGCTTTAGGAGCAGGAACCTCTAATCAGCTAAGTGTAGGTGTTCAAGTTGTAGAACAAAGCGCAAATATTCCAGAGACAGAATCTTCTCATCAATCTAGTACGAGTCTCCAAGTCGCAGGGCCAAGCACTAGTGCTTTAGAGGCCGAGATTTTTCTTCAATCCAGTGTTAGTGATGAAGATGAGTCTATTAGTACAGGTGCTAGCTTGTCATTAGAACAACAAGCACAGAGTGTTGGACAGAGAGCAGAAGTTACAGGCCGGGGATTTGACCTTTGTGAACGGCAATTAGAGAACTTTAAGAAGCAGGAAGCTGCTTGTGAGCAAAGGTTAGATAATTGTGTAGAATCACTCACTACTCTTGAAATACGAATACAGCACCTTCAACAAATGCTGTCTGCTAGGCGGCAAAAGCTAGGGGCTACAAGTACTCAAACTGCAGAGCCAACCCCAAGGACTCCAGAAGCAGGACCTTCGCATCAATCAAGAGCAAATGACCAAACTGTAGAGCCAAGCCCAAGTACTCCAGGAGCTGGAGCTTCTCATCAGTCAAATATGAATATTCAAGGTGGACCCTCCGCACAGCAAAGGCTAGATTTAGTAATGCAGAAGATTGTGAGGGATGCTCAAGCTGGACGTTTTGAGTTGGGGATCGGTGGCAGTACA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MDTVYLPYTDEDLENLAIQLVYQEIDEIIKHQLEDFCHCKVCIQDIAAIALNHIPPIYQTSCIEKAKTLAKQGGQLKKLARIEVLKAIRKVKINSHCLDLRQDSMQT

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_054300234.1|2847457_2848399_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209384.1|2848749_2849565_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209395.1|2849856_2852547_+	DUF4135 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209362.1|2854183_2855890_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209398.1|2856488_2857715_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|2858285_2859260_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_075273327.1|2862552_2863128_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_075273458.1|2864268_2864484_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211818.1|2866034_2867291_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_054300271.1|2872783_2873758_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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Sequences of DBSCAN-SWA_27

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211685.1|2905610_2907416_+	excinuclease ABC subunit UvrC	NA	NA	NA	NA
WP_016211684.1|2907439_2908015_+	CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_129556476.1|2908559_2909570_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273474.1|2909867_2910842_-|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	4.0e-28	31.9
WP_155046989.1|2911074_2912139_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274727.1|2912231_2913194_-|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	2.6e-27	32.0
WP_155046989.1|2913426_2914491_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300249.1|2914981_2915347_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556449.1|2915361_2915868_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300250.1|2915857_2916517_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.3e-09	31.0
WP_016209640.1|2916935_2917955_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209649.1|2918413_2919379_+	aldo/keto reductase	A0A2H4PQR8	Staphylococcus_phage	7.9e-45	39.8
WP_016209646.1|2919423_2919999_-	VOC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209651.1|2920029_2921304_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_032126159.1|2921949_2922663_+	aldolase	NA	NA	NA	NA
WP_016209641.1|2922742_2923480_+	SDR family oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_016209658.1|2923600_2924956_+	aminotransferase class I/II-fold pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_075273478.1|2925132_2925804_+	M48 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016209661.1|2925919_2926795_-	bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase FolD	A0A249XZQ2	Enterococcus_phage	1.5e-34	39.7
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WP_016209647.1|2928815_2929421_+	ATP-dependent Clp endopeptidase proteolytic subunit ClpP	A0A223W000	Agrobacterium_phage	8.4e-61	59.8
WP_016209663.1|2929502_2930804_+|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpX	G3M9Z9	Bacillus_virus	1.5e-134	57.3
WP_032126161.1|2930871_2933304_+	endopeptidase La	A0A0R6PGP8	Moraxella_phage	9.5e-220	52.7
WP_016209655.1|2933407_2933680_+	HU family DNA-binding protein	A4JWM7	Burkholderia_virus	2.0e-22	62.9
WP_075273480.1|2933762_2935661_+	surA N-terminal domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209643.1|2935692_2936577_+	lipid A biosynthesis acyltransferase	A0A1W6JP29	Morganella_phage	2.4e-40	35.3
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WP_016209662.1|2937408_2939556_+	EAL domain-containing protein	G3MA91	Bacillus_virus	1.8e-25	36.7
WP_016209652.1|2939527_2940877_-	HlyD family type I secretion periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209642.1|2940873_2942994_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	F2Y1V5	Organic_Lake_phycodnavirus	2.0e-16	28.1
WP_016209656.1|2942990_2944694_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	W8CYL7	Bacillus_phage	2.8e-21	24.8
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WP_016209659.1|2946019_2947048_-	UDP-glucose--hexose-1-phosphate uridylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_075274728.1|2947174_2948689_+	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase	NA	NA	NA	NA
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WP_075274729.1|2949596_2950664_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
2951519:2951578	attL	NA	NA	NA	NA
WP_051307360.1|2951719_2952649_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036780074.1|2953740_2954547_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211514.1|2954889_2956782_+	DNA topoisomerase IV subunit B	A0A172JHT4	Bacillus_phage	1.4e-80	32.9
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WP_080664862.1|2958336_2959035_+	P-loop NTPase	NA	NA	NA	NA
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WP_054300253.1|2961175_2962126_+	dCTP deaminase	I4AZP2	Saccharomonospora_phage	6.9e-09	34.7
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WP_075274730.1|2962327_2962621_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211530.1|2962626_2963523_-	Abi family protein	A3QSC6	Clostridium_virus	5.3e-35	32.0
WP_016211531.1|2963876_2964557_-	MBL fold metallo-hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126152.1|2964620_2965211_-|integrase	site-specific integrase	A0A1B0V4T7	Roseobacter_phage	1.1e-15	32.7
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WP_036781387.1|2965684_2965957_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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2966606:2966781	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_016212302.1|2974481_2974781_-	HU family DNA-binding protein	A0A0H3UZA0	Geobacillus_virus	3.9e-11	44.4
WP_105962625.1|2974965_2975851_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300237.1|2976040_2977102_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036781361.1|2977121_2977511_+	DNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300162.1|2977781_2978864_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1
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WP_016211583.1|2979627_2980536_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300257.1|2980812_2981622_+	DUF4942 domain-containing protein	A0A1J0GUW2	Halomonas_phage	1.8e-29	30.6
WP_075273486.1|2981598_2982573_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.2e-29	32.9
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WP_054300258.1|2983426_2984206_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211584.1|2984303_2984657_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211586.1|2984723_2984918_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211578.1|2984933_2985278_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|2985347_2985923_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2985868_2986234_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273488.1|2986318_2986954_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_052047108.1|2987009_2987408_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046984.1|2988219_2989338_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046716.1|2989759_2989906_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210555.1|2990603_2991158_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210551.1|2991594_2991777_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376905.1|2991841_2992069_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556629.1|2992299_2993046_+	DNA/RNA non-specific endonuclease	A0A2H4N7Z3	Lake_Baikal_phage	3.6e-29	33.0
WP_026063577.1|2993272_2993566_+	HU family DNA-binding protein	A3E2K9	Sodalis_phage	4.7e-17	52.8
WP_129556482.1|2993637_2994243_-	NUDIX domain-containing protein	A0A1S6L1P8	Vibrio_phage	1.2e-17	30.9
WP_016210545.1|2994391_2995369_-	malate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_054300261.1|2995465_2996908_-	TolC family outer membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210553.1|2996934_2997588_-	protein-L-isoaspartate O-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210552.1|2997712_2998279_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307331.1|2998633_3000412_+	thiol reductant ABC exporter subunit CydD	W8CYL7	Bacillus_phage	1.5e-33	30.6
WP_052104721.1|3000483_3002190_+	thiol reductant ABC exporter subunit CydC	W8CYL7	Bacillus_phage	7.3e-25	26.7
WP_054300262.1|3002181_3002472_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307332.1|3002519_3002726_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|3002934_3003300_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|3003245_3003821_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212461.1|3003824_3004199_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|3004574_3005549_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_054300263.1|3005620_3006061_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300264.1|3006048_3006387_-|transposase	IS5/IS1182 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300265.1|3006531_3006792_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273313.1|3006751_3007090_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556484.1|3007562_3009023_-	sodium:proton antiporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211426.1|3009366_3010809_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_075273490.1|3011791_3013084_+	outer membrane transport family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300560.1|3013557_3016230_+	HAD-IC family P-type ATPase	M1HX51	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	4.1e-75	30.2
WP_032126554.1|3016249_3017335_-	competence/damage-inducible protein A	NA	NA	NA	NA
WP_016210417.1|3017776_3018214_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210423.1|3018210_3019095_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210416.1|3019184_3019715_+	prokaryotic cytochrome b561 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210420.1|3019785_3020964_-	mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein	Q6A202	Oenococcus_phage	2.0e-50	32.1
WP_054300267.1|3021112_3024961_-	bifunctional proline dehydrogenase/L-glutamate gamma-semialdehyde dehydrogenase PutA	NA	NA	NA	NA
WP_016210422.1|3024947_3026450_-	sodium/proline symporter PutP	NA	NA	NA	NA
WP_016210418.1|3027000_3027636_+	peroxiredoxin C	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|3027948_3029010_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
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NZ_CP013773.1|WP_016212218.1|1093661_1094012_+|hypothetical-protein	1093661_1094012_+	116 aa aa	NA	NA	NA	1080672-1124108	yes
NZ_CP013773.1|WP_155046705.1|1114307_1114475_-|hypothetical-protein	1114307_1114475_-	55 aa aa	NA	NA	NA	1080672-1124108	yes
NZ_CP013773.1|WP_017375841.1|1547732_1547942_-|hypothetical-protein	1547732_1547942_-	69 aa aa	NA	NA	NA	1468443-1556916	yes
NZ_CP013773.1|WP_155046757.1|2015477_2015633_+|hypothetical-protein	2015477_2015633_+	51 aa aa	NA	NA	NA	1976509-2082863	yes
NZ_CP013773.1|WP_155046758.1|2051644_2051776_+|phosphatase	2051644_2051776_+	43 aa aa	NA	NA	NA	1976509-2082863	yes
NZ_CP013773.1|WP_032126148.1|2053718_2053901_-|hypothetical-protein	2053718_2053901_-	60 aa aa	NA	NA	NA	1976509-2082863	yes
NZ_CP013773.1|WP_155046702.1|2366505_2366661_+|hypothetical-protein	2366505_2366661_+	51 aa aa	NA	NA	NA	2319032-2374289	yes
NZ_CP013773.1|WP_016212022.1|2609661_2609880_+|hypothetical-protein	2609661_2609880_+	72 aa aa	NA	NA	NA	2534537-2644245	yes
NZ_CP013773.1|WP_016212024.1|2610475_2610724_+|hypothetical-protein	2610475_2610724_+	82 aa aa	NA	NA	NA	2534537-2644245	yes
NZ_CP013773.1|WP_054300218.1|2751323_2752355_-|hypothetical-protein	2751323_2752355_-	343 aa aa	NA	NA	NA	2705035-2806316	yes
NZ_CP013773.1|WP_054300559.1|2860977_2861526_+|hypothetical-protein	2860977_2861526_+	182 aa aa	NA	NA	NA	2841680-2887123	yes
NZ_CP013773.1|WP_054300240.1|2869511_2869715_-|hypothetical-protein	2869511_2869715_-	67 aa aa	NA	NA	NA	2841680-2887123	yes
NZ_CP013773.1|WP_016210742.1|2873908_2874184_+|hypothetical-protein	2873908_2874184_+	91 aa aa	NA	NA	NA	2841680-2887123	yes
NZ_CP013773.1|WP_155046989.1|2911074_2912139_-|hypothetical-protein	2911074_2912139_-	354 aa aa	NA	NA	NA	2903804-3029010	yes
NZ_CP013773.1|WP_155046989.1|2913426_2914491_-|hypothetical-protein	2913426_2914491_-	354 aa aa	NA	NA	NA	2903804-3029010	yes
NZ_CP013773.1|WP_016209640.1|2916935_2917955_-|hypothetical-protein	2916935_2917955_-	339 aa aa	NA	NA	NA	2903804-3029010	yes
NZ_CP013773.1|WP_054300258.1|2983426_2984206_+|hypothetical-protein	2983426_2984206_+	259 aa aa	NA	NA	NA	2903804-3029010	yes
NZ_CP013773.1|WP_016211584.1|2984303_2984657_+|hypothetical-protein	2984303_2984657_+	117 aa aa	NA	NA	NA	2903804-3029010	yes
NZ_CP013773.1|WP_016212461.1|3003824_3004199_-|hypothetical-protein	3003824_3004199_-	124 aa aa	NA	NA	NA	2903804-3029010	yes

Protein sequences of NZ_CP013773.1|WP_016211126.1|1054613_1055003_+|lipoprotein

>NZ_CP013773.1|WP_016211126.1|1054613_1055003_+|lipoprotein
MKIFVVLFTLILLSGCATTAKYRAQVERWKGHDVNDLIQAWGPPDTTFKMPNGNLYYSYRVNNINRLPSYYVPGNTTVSDRDGKTYITTSGGYQTGGGTIKSNCTTSFQVNKKDIIIGTHFQGNACVSN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	1059069-1059106	0

1. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 1059069-1059106, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013773.1|WP_016212218.1|1093661_1094012_+|hypothetical-protein

>NZ_CP013773.1|WP_016212218.1|1093661_1094012_+|hypothetical-protein
MPIPTLKEIQGQYLIFLAEACSKAEDCVYDRQSIKNKEGKYVNLSEVKHFFLNEDKDKKNNEIEDAYQSLKEKLKLSKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	1085716-1085753	0

1. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 1085716-1085753, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013773.1|WP_155046705.1|1114307_1114475_-|hypothetical-protein

>NZ_CP013773.1|WP_155046705.1|1114307_1114475_-|hypothetical-protein
MEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	1085716-1085753	0

1. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 1085716-1085753, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013773.1|WP_017375841.1|1547732_1547942_-|hypothetical-protein

>NZ_CP013773.1|WP_017375841.1|1547732_1547942_-|hypothetical-protein
MCREGFIFYKPATLETILTKDREYNPQHVITELEMESSFQRISTTTGMPLEEVKEKGLQAFDLEKTFIN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	1515606-1515569	0

1. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 1515606-1515569, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013773.1|WP_155046757.1|2015477_2015633_+|hypothetical-protein

>NZ_CP013773.1|WP_155046757.1|2015477_2015633_+|hypothetical-protein
MDEAGMDDTERYARKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	1976472-1976509	0
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	1979909-1979872	0

1. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 1976472-1976509, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 1979909-1979872, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013773.1|WP_155046758.1|2051644_2051776_+|phosphatase

>NZ_CP013773.1|WP_155046758.1|2051644_2051776_+|phosphatase
MFYCMRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	1976472-1976509	0
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	1979909-1979872	0

1. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 1976472-1976509, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 1979909-1979872, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013773.1|WP_032126148.1|2053718_2053901_-|hypothetical-protein

>NZ_CP013773.1|WP_032126148.1|2053718_2053901_-|hypothetical-protein
MTCDNITPLGYVFMPHHIALWRARGVEANYQGQLKMLRNIHAADSQHRNKQQCNQRKSNI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	1976472-1976509	0
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	1979909-1979872	0

1. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 1976472-1976509, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 1979909-1979872, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013773.1|WP_155046702.1|2366505_2366661_+|hypothetical-protein

>NZ_CP013773.1|WP_155046702.1|2366505_2366661_+|hypothetical-protein
MDNHSNKAGFNSLIPRFHPKTYVEVEALPTWHDEQAQLNGLVLHTLRAMEC

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	2325802-2325839	0
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	2356707-2356670	0

1. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 2325802-2325839, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 2356707-2356670, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013773.1|WP_016212022.1|2609661_2609880_+|hypothetical-protein

>NZ_CP013773.1|WP_016212022.1|2609661_2609880_+|hypothetical-protein
MSPQQEKLFWKKFERELGFDSGEAALSHLSAGRPIYYGDDRYSDAVIKEYPDGTKQLVRFDDNDNEIIIEEL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	2549218-2549255	0
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	2642036-2642073	0

1. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 2549218-2549255, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 2642036-2642073, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013773.1|WP_016212024.1|2610475_2610724_+|hypothetical-protein

>NZ_CP013773.1|WP_016212024.1|2610475_2610724_+|hypothetical-protein
MSVEVEHSLACDGHERDRDFLTTPEIQQLLEGSKKGRYPIRDQARKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	2549218-2549255	0
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	2642036-2642073	0

1. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 2549218-2549255, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 2642036-2642073, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013773.1|WP_054300218.1|2751323_2752355_-|hypothetical-protein

>NZ_CP013773.1|WP_054300218.1|2751323_2752355_-|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGEFKCPVTLEYLDETKIQIYAVKDNSKYAIHAIEKNSFSNLDKCPLTRSQLYISLTFEEYLIFNKNRHHASEFEVKVLPKAEFEEKLPNKVLLPFKTSHLASAIRRLRSDLITSENIQFIAQHANNALNLTIAINRLRTNLAIAENIQLLAQNIEDAYELASAMSELRENLAIPENLQLLTQHSRHALQLVLAINNLKENLATSTTLQLLAQNLASAAHLTAAINELKENLATAENIQLLAQHPSHALQLALAMNYLNEGLATAENLQLLAQHAENAFDLTLSINQKSAANLNVSLSAEQTEHTSLIFQNHLQDSNNEELSFASSLSN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	2759942-2759979	0
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	2805404-2805367	0

1. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 2759942-2759979, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 2805404-2805367, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013773.1|WP_054300559.1|2860977_2861526_+|hypothetical-protein

>NZ_CP013773.1|WP_054300559.1|2860977_2861526_+|hypothetical-protein
MVNSALFTQGYECLKALELNQPENIDKLLGGLALFAGNYQRLEKLGFSLNPERVKKMLDNLESFDQDYPSLQKLHAVYDGLTAKIENNQLKVHGLTGGSSIMFKGQLRCVPKGVSKIWEQVADDEGNFKWMDDADVALTQAKAQADQRQGFRGLTAVSMFFGSYRDSETKELYKEISGLLAS

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	2862216-2862179	0

1. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 2862216-2862179, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013773.1|WP_054300240.1|2869511_2869715_-|hypothetical-protein

>NZ_CP013773.1|WP_054300240.1|2869511_2869715_-|hypothetical-protein
MNKELLDIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEA

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	2862216-2862179	0

1. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 2862216-2862179, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013773.1|WP_016210742.1|2873908_2874184_+|hypothetical-protein

>NZ_CP013773.1|WP_016210742.1|2873908_2874184_+|hypothetical-protein
MNIILKNTVNILSHRSGLLKSKSYEVAMPYLLECKKLLEISEQDWEVMLAIQYGFGKFHPEHEHQTFKFYEQYMDKHDGRLDGLNLTVQPQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	2862216-2862179	0

1. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 2862216-2862179, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013773.1|WP_155046989.1|2911074_2912139_-|hypothetical-protein

>NZ_CP013773.1|WP_155046989.1|2911074_2912139_-|hypothetical-protein
MPLSTLNEVQNQYALYFKQACLNTSQSFITRGSIKNGGASVGIENIEGHFTDQEIESKFKVLKESLRGCSPSERSDLLNNFSLFINNKTNHDVDTVRVLAFFKDKDITDLTFLEILYLEAINFEASAALQIAFYKTNQTKTDTEEGVLATQAQKSLFTSVADLFLSQLNLSYHPNIFANLDKIGLGNQPEYIQGALKCSQQLNDEDYQLLKEMSEDLKEMYQAIKNHVALSSEPSSNNNSDSFLSSLFSCFATQKLDLEARFKQYQSRTIETFFDFFTPDNKNQSQEALKAQLSQLKADFLSSSDSSFQSSLSSPLNRAETQNNQPSPSSPLLFSQQQAAAAHSTAPTPEPSPY

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	2986260-2986297	0
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	3002909-3002872	0

1. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 2986260-2986297, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 3002909-3002872, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013773.1|WP_155046989.1|2913426_2914491_-|hypothetical-protein

>NZ_CP013773.1|WP_155046989.1|2913426_2914491_-|hypothetical-protein
MPLSTLNEVQNQYALYFKQACLNTSQSFITRGSIKNGGASVGIENIEGHFTDQEIESKFKVLKESLRGCSPSERSDLLNNFSLFINNKTNHDVDTVRVLAFFKDKDITDLTFLEILYLEAINFEASAALQIAFYKTNQTKTDTEEGVLATQAQKSLFTSVADLFLSQLNLSYHPNIFANLDKIGLGNQPEYIQGALKCSQQLNDEDYQLLKEMSEDLKEMYQAIKNHVALSSEPSSNNNSDSFLSSLFSCFATQKLDLEARFKQYQSRTIETFFDFFTPDNKNQSQEALKAQLSQLKADFLSSSDSSFQSSLSSPLNRAETQNNQPSPSSPLLFSQQQAAAAHSTAPTPEPSPY

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	2986260-2986297	0
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	3002909-3002872	0

1. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 2986260-2986297, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 3002909-3002872, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013773.1|WP_016209640.1|2916935_2917955_-|hypothetical-protein

>NZ_CP013773.1|WP_016209640.1|2916935_2917955_-|hypothetical-protein
MPSFNDILNQYLLHFKKYFLDLDLSLNHRTSILSSQGTTPNFQEIAKLFSDGEIEKEFESLQNKLNRYPDTSHLELYIKFNDFFKSKTDHSLESERVIGFFKDRNESIAGKKLLEIVFLESISFAASADLQESFNAELKSAINITAEEDNDSFYELIKEQFKEASTYPLSRFNLSYHPKAFEQLDQLGLGDQSNCILELLGHPPQLINIEGISNQVKEIFENAKKSIPTEIESTQQNLIAACYEKYQANVIGLIFNFFIPKEKNQEDLELQLFIYENEFLSSSNFANHGTQFESFCPKILEIIKASNKEHIQESDSQLFFSQQKEKTTFDSSASARYNQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	2986260-2986297	0
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	3002909-3002872	0

1. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 2986260-2986297, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 3002909-3002872, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013773.1|WP_054300258.1|2983426_2984206_+|hypothetical-protein

>NZ_CP013773.1|WP_054300258.1|2983426_2984206_+|hypothetical-protein
MTIKQIQLSEENRGNPKRGRKANLLSNMWQDIEASEVERLIDLNRDRHQENKDTEATITLSKYIPHKSYSAKELLHYPELTMLLRKEKQYLVKDYLLTGPLFELRTPLFMIEAGKQLLQIENDFRESLASEQKRLNNLMFLAKNKVKNIRVTGGKPSCQWSAGTIELNGVSWRVNKDSPAYLGPTGGIEALSFSYCEEIGQMDSFKIETAHIGTSIVELKVRNKGHNKGRRAFLNIEKLGLVPTAEAKALIKKQRGQAN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	2986260-2986297	0
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	3002909-3002872	0

1. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 2986260-2986297, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 3002909-3002872, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013773.1|WP_016211584.1|2984303_2984657_+|hypothetical-protein

>NZ_CP013773.1|WP_016211584.1|2984303_2984657_+|hypothetical-protein
MKTTFSFKHANAKKNRDVNIDGAISLSDGAEIFRKAFSIEKKNFSVLNRVSFILANIDAMNSQKEDYLYHLAANNSLTIFKDFEVIYRGFVWDFVGEYTNEMPAALASLKEGLGVAF

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	2986260-2986297	0
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	3002909-3002872	0

1. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 2986260-2986297, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 3002909-3002872, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013773.1|WP_016212461.1|3003824_3004199_-|hypothetical-protein

>NZ_CP013773.1|WP_016212461.1|3003824_3004199_-|hypothetical-protein
MPKNIFVFNINKTLLWAEEHPRTINQVPTQSTWPFYGCDNIHIINQEKIAKIMQAILANGDQIVFLQERAKTTKNNTREEKEKEQTEKAEFLRLCTDKYGISLQPNNIYFHHGSDGKIARLLSI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	2986260-2986297	0
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	3002909-3002872	0

1. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 2986260-2986297, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013773 position: 3002909-3002872, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. NZ_CP013774

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP013774_1

• CRISPR_ID: NZ_CP013774_1
• CRISPR_location: 45269-45492
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 3 spacers
• Cas_protein_info: RT

Consensus repeat of NZ_CP013774_1

Consensus_repeat	Method
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	CRT

spacers of NZ_CP013774_1

>1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT
ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
>1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT
TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
>1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT
ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013774_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP013774_1

>merge|NZ_CP013774|1|45269-45492|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAGAAATGGAACACAAACGGAATACAAGTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATAAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACACAAACGGAACACAAA

>NZ_CP013774|1|1|45269-45492|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
AAATGGAACACAAACGGAATACAAG	TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP013774.1|WP_075274743.1|46911_49488_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|273167
NZ_CP013774.1|WP_075273836.1|53463_54525_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013774.1|WP_155046765.1|55402_55597_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013774.1|WP_075274741.1|37209_37467_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013774.1|WP_155047014.1|51122_51464_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|227633
NZ_CP013774.1|WP_075273327.1|38814_39390_+|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP013774.1|WP_016211879.1|44037_45057_+|ParA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224113
NZ_CP013774.1|WP_054300202.1|49961_50690_-|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP013774.1|WP_155047021.1|49782_49938_-|IS3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|222853
NZ_CP013774.1|WP_036780064.1|42492_43083_+|site-specific-integrase	unknown	unknown	gnl|CDD|271175
NZ_CP013774.1|WP_075273830.1|50719_51052_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013774.1|WP_075274744.1|52554_53388_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013774.1|WP_075273824.1|39393_39648_-|transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|366690
NZ_CP013774.1|WP_075273826.1|39607_40735_-|hypothetical-protein	RT	pfam00078_RT_CAS-I:CAS-III	gnl|CDD|275209
NZ_CP013774.1|WP_081377350.1|41431_42247_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|377437
NZ_CP013774.1|WP_032126362.1|38503_38869_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379154
NZ_CP013774.1|WP_155047012.1|37535_38543_-|IS3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|222853
NZ_CP013774.1|WP_155047013.1|40955_41102_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013774.1|WP_054300202.1|51619_52348_+|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP013774.1|WP_054300202.1|45980_46709_+|IS6-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853

HMMScan for Signature genes

Protein	Cas_name	Cas_description	E-value	Identity	Coverage
NZ_CP013774.1|WP_075273826.1|39607_40735_-|hypothetical-protein	RT	pfam00078_RT_CAS-I:CAS-III	2e-50	166.1	0.1

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP013774.1|WP_075274743.1|46911_49488_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|273167	TIGR00601, UV_excision_repair_protein_RAD23_homolog_A, UV excision repair protein Rad23. All proteins in this family for which functions are known are components of a multiprotein complex used for targeting nucleotide excision repair to specific parts of the genome. In humans, Rad23 complexes with the XPC protein. This family is based on the phylogenomic analysis of JA Eisen (1999, Ph.D. Thesis, Stanford University). [DNA metabolism, DNA replication, recombination, and repair].	0.00878524
NZ_CP013774.1|WP_155047012.1|37535_38543_-|IS3-family-transposase	gnl|CDD|222853	PHA02517, PHA02517, putative transposase OrfB; Reviewed.	1.10856e-86
NZ_CP013774.1|WP_155047014.1|51122_51464_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|227633	COG5323, COG5323, Uncharacterized conserved protein [Function unknown].	1.27873e-32
NZ_CP013774.1|WP_075273327.1|38814_39390_+|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	2.58738e-46
NZ_CP013774.1|WP_016211879.1|44037_45057_+|ParA-family-protein	gnl|CDD|224113	COG1192, Soj, ATPases involved in chromosome partitioning [Cell division and chromosome partitioning].	2.24633e-33
NZ_CP013774.1|WP_054300202.1|49961_50690_-|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP013774.1|WP_155047021.1|49782_49938_-|IS3-family-transposase	gnl|CDD|222853	PHA02517, PHA02517, putative transposase OrfB; Reviewed.	0.000140996
NZ_CP013774.1|WP_036780064.1|42492_43083_+|site-specific-integrase	gnl|CDD|271175	cd00397, DNA_BRE_C, DNA breaking-rejoining enzymes, C-terminal catalytic domain. The DNA breaking-rejoining enzyme superfamily includes type IB topoisomerases and tyrosine based site-specific recombinases (integrases) that share the same fold in their catalytic domain containing conserved active site residues. The best-studied members of this diverse superfamily include Human topoisomerase I, the bacteriophage lambda integrase, the bacteriophage P1 Cre recombinase, the yeast Flp recombinase, and the bacterial XerD/C recombinases. Their overall reaction mechanism is essentially identical and involves cleavage of a single strand of a DNA duplex by nucleophilic attack of a conserved tyrosine to give a 3' phosphotyrosyl protein-DNA adduct. In the second rejoining step, a terminal 5' hydroxyl attacks the covalent adduct to release the enzyme and generate duplex DNA. The enzymes differ in that topoisomerases cleave and then rejoin the same 5' and 3' termini, whereas a site-specific recombinase transfers a 5' hydroxyl generated by recombinase cleavage to a new 3' phosphate partner located in a different duplex region. Many DNA breaking-rejoining enzymes also have N-terminal domains, which show little sequence or structure similarity.	2.06134e-23
NZ_CP013774.1|WP_075273824.1|39393_39648_-|transposase	gnl|CDD|366690	pfam01527, HTH_Tnp_1, Transposase. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This family consists of various E. coli insertion elements and other bacterial transposases some of which are members of the IS3 family.	4.34134e-11
NZ_CP013774.1|WP_081377350.1|41431_42247_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|377437	pfam04986, Y2_Tnp, Putative transposase. Transposases are needed for efficient transposition of the insertion sequence or transposon DNA. This family includes transposases IS1294 and IS801. This is a rolling-circle transposase.	2.93086e-44
NZ_CP013774.1|WP_054300202.1|45980_46709_+|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP013774.1|WP_075273826.1|39607_40735_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|275209	TIGR04416, hypothetical_protein, group II intron reverse transcriptase/maturase. Members of this protein family are multifunctional proteins encoded in most examples of bacterial group II introns. These group II introns are mobile selfish genetic elements, often with multiple highly identical copies per genome. Member proteins have an N-terminal reverse transcriptase (RNA-directed DNA polymerase) domain (pfam00078) followed by an RNA-binding maturase domain (pfam08388). Some members of this family may have an additional C-terminal DNA endonuclease domain that this model does not cover. A region of the group II intron ribozyme structure should be detectable nearby on the genome by Rfam model RF00029. [Mobile and extrachromosomal element functions, Other].	4.35291e-98
NZ_CP013774.1|WP_054300202.1|51619_52348_+|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP013774.1|WP_032126362.1|38503_38869_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein	gnl|CDD|379154	pfam13384, HTH_23, Homeodomain-like domain.	9.56809e-08

Protein sequences

>NZ_CP013774.1|WP_016211879.1|44037_45057_+|ParA-family-protein
MTKAWTPGQLISLYRTNKAKSSVLRDEQKGVIPPAKREKRGAISVRVWDEELIPLIGEQYGFLKKNFKKKRNPQSVISVYAPKGGVLKSTLAFNLARIFSINNISVLAIGLEVSQRTLTSNLELVHDHEVESLAEAQKLHSGGLWDVSEGSQSIQDVICKSSLPNLHYIPESTDLNLLEQRIKDSPRREYFLQKLLKPIMKNYEVIIFDNSPSWGSLLVQNSLTLATDVVAPFSCELESYRSVTTNIEMINDFKRDMELNWNSFSIVPTKVDQTKLSKEIETQYRVLFPEFVTASSIRFLRGVAEESGMEQLSVIENSNTSSLADDYYNLSKELWTKLS
>NZ_CP013774.1|WP_036780064.1|42492_43083_+|site-specific-integrase
MGLNKQAKILSERQEKAVLSSLQSTTYPTRNTVMFLLSIKAGLRAKEIAALTWDMLLTPEGQLCEAIHLRNTASKGKQGGRVIPLNKQLKQALSQLLDESKPKHGQRPVILSRRNSHFPTQTVVNWFAELYKNLGFEGCSSHSGRRTFVTRAAKNIIKAGGSLRDVQQLAGHTTLQTTQRYIEGDSEAKKRIVDLI
>NZ_CP013774.1|WP_081377350.1|41431_42247_+|hypothetical-protein
MLSCIFRAELSSASAEVYPQALLAPRGARNVHVHISVTRGGYDEANDSWSEIYFTRKVIMPMWRYAVTNLLRQTYKAKELTIPDEYQGEISGLTTFNRFLNREYQKFWKVHFAQPKENHQHNVDYLGRYIKRPALANARMEHYDGNVVIFRYLDHKTKQQKMKKQSIDDFIDRLTQHIPDKFFKMIRYYGFLSYRTRTIILPKIYDLVGQTIETYQQVTFTSLMKSNFNYNPLKCILCGNQLRRVSTQFGLTLREKYNYYEELATSRFRGF
>NZ_CP013774.1|WP_155047013.1|40955_41102_+|hypothetical-protein
MSNISSLNVLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP013774.1|WP_075273826.1|39607_40735_-|hypothetical-protein
MEPTETSSSTETKLERIAWLSAVDPGKVFNQVMHHFNLDSLLQCFYELNGKKAPGVDGVTKEQYEENLISNLLDLLDRMKRMAYIPGAVRLVPIPKEGRPGAMRPLGISNFEDKIIQKMTQKVLESIYDPIFLGNSYGFRPGKSCHNAIRALDYYLFSNRIESIIDVDLENYFGTIDHNLLIDMLETKIKDQRFIRYIIRMFKAGVLSKGELTMSDEGVPQGSVCSPIISNIFAHYVIDDWFEKVVKKHCQGKVEMFRYADDMVICCQFRNDAGRIKKALAKRLSKFRLKMNEDKTREIAFSKQDAARGIRQGAFDFLGFAFYLGVSVSGRAIIPKLKSSGKLIRLPYSGQINYNNPSRRNHNGKASRHQVHRRI
>NZ_CP013774.1|WP_075273824.1|39393_39648_-|transposase
MGKRHVTKYTEEFKKSSAKLAVDSNQAISHTAQELGIHSSTLHGWVNKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREI
>NZ_CP013774.1|WP_075273327.1|38814_39390_+|IS630-family-transposase
MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
>NZ_CP013774.1|WP_032126362.1|38503_38869_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
>NZ_CP013774.1|WP_155047012.1|37535_38543_-|IS3-family-transposase
MLEFLSHNCKEKASFFLIVFFNLLILCQKLLIQRYTKKSGGVLCKRNTVKYAWIKENKCVFPVDRVCSILGVSRSGYYSWLKVQPSKRMIENQKLARRIKEIFIESRATYGTRRIRKQLATQEISVSRKRVGRLMKQNQLCCKIKRKFKVTTDSKHRLPIAKNVLDRNFSATGPNQKYVGDITYIRTQQGWLYLAVVIDLFSRKVVGWAMEDHMEASLVNDALLMALWKRKPKAGLIWHSDRGSQYASESHREILKDHQIKQSMSRKGDCWDNAVSESFFHTLKTELVHHMNFKNRQEAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYEHNQKIS
>NZ_CP013774.1|WP_075274741.1|37209_37467_-|hypothetical-protein
MKKNRNKYPLRKLWEILCSKLKGHVQYYGVSFNADGVGLFLYKARRIFYKWVNRRSQRKSFNWGKFSLFVKRFPMPKAKVCHKFF
>NZ_CP013774.1|WP_054300202.1|45980_46709_+|IS6-family-transposase
MGRRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP013774.1|WP_075274743.1|46911_49488_+|hypothetical-protein
MPVRFNPIKKVSLNGKVFNVPKEVPNKALVKLGQQQPDVVEILADFFRTNPKQEFFSKLFLGDRYQISAMYVSLRNIGLNQRIYIQKVFDDPEGFSDIIQRLSNIELCQSVYVQAAFENPDLIAVFEKHKDKFTSLNQFELNQWVYVKAVLGDPDRFDDILQRLRDIALCEPVYVQAALKSPQRVVEFAKHTHRLVTLNALEPNQFVYVQKVLDDPEGFDAILQQLSDIELCQLPYIQAALDYPDRVDVFKAHQDKFALFNHLKLSQLTNIEAVLGNLEGFDEGYRSLKAVGLDQPKNIQAMLDNIEKFNENLQNLREVGLDQPKNIQAMLDNIEKFNENLQNLRKVESDQSDNIQLMLDNIEEFNENFQILRQFGLSQQLYIESILKSPNVIVNISDCSDELLMLEELGLGQTVYLQKVLDHPDRSKANLYRLIRMGLDQPVYVQSALKDLDRFDDVCQRLNDIELCESAYVQTVLDDPNRIAVFERHKDKFTSLNQFGLNQWIYVKAVLDDPKGFDDILQRLRDIALCAPVYVQAALQDPQRVAEFAKHTHRLVTLNALEPNQFVYVQKVLDNPEGFDAILQQLSDIELCQSVYVQAVLDDPNIITKLKEHQKKLVKLNQLGLSQPKYIQAVFDHPEDFERNLQTLEILGLNKTEYVQAIFDDPTRIDKLHKYHHLFFRLHMLGLSQPICVDAVFNNTEKYAQICSCLEEVKDRIETVEDTIQQSSLGQSREQGFKSHYPVYKSKVIQSSFDFLISERKDPAEMKAHLFEHEREFLCNSNIKSDRSSFGAICRSAMRALTNTIFIIVAPVVGYKRNWHKKNMSITEKCLPFYNHTESTNKVMDLTCDIQHTLVADF
>NZ_CP013774.1|WP_155047021.1|49782_49938_-|IS3-family-transposase
MTFLKFTIIFRNSAAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYEHNQKIS
>NZ_CP013774.1|WP_054300202.1|49961_50690_-|IS6-family-transposase
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11. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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12. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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13. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|45294|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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67. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.2|45361|40|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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112. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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113. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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114. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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115. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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116. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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117. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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118. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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119. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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120. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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121. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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122. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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123. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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124. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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125. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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126. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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127. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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128. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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129. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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130. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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131. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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132. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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133. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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134. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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135. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa	CRISPR spacer
attaggttttatctccgaaaataaacagacgctaaaaaataa	Protospacer
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136. spacer 1.3|45426|42|NZ_CP013774|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	0 : 107807	119	Streptococcus_phage(23.81%)	transposase,integrase	attL 32788:32847|attR 90547:91499
DBSCAN-SWA_2	116708 : 123180	9	Acinetobacter_phage(16.67%)	head,transposase,capsid,tail	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP013774|0:107807|DBSCAN-SWA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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Homologous phage analysis in the prophage region

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32788:32847	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_075273836.1|53463_54525_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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54526:55480	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_016212150.1|61663_61978_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_054300202.1|71653_72382_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
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WP_016212018.1|73795_74095_+	type II toxin-antitoxin system RelE/ParE family toxin	NA	NA	NA	NA
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WP_075274745.1|80889_81618_+|transposase	IS6-like element ISPsa2 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.2e-37	42.2
WP_075274746.1|81900_83511_+	protein kinase	NA	NA	NA	NA
WP_129556709.1|83722_83812_+	DUF1891 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556710.1|83892_84363_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273857.1|84516_85251_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	8.4e-39	43.6
WP_016212404.1|86315_86549_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273881.1|86669_88856_+	ATP-dependent RecD-like DNA helicase	A0A0K2FLP8	Brevibacillus_phage	9.2e-73	30.2
WP_036779532.1|88865_89267_-	helix-turn-helix domain-containing protein	A0A222YXG1	Escherichia_phage	3.9e-22	47.0
WP_016212456.1|89263_89551_-	type II toxin-antitoxin system HigB family toxin	A0A0P0ZE17	Stx2-converting_phage	2.9e-11	39.2
WP_054300271.1|89594_90569_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7
WP_016212579.1|91168_91366_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274748.1|92871_93072_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274749.1|93841_95884_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|96788_97154_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274751.1|97099_97675_+|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	2.1e-08	26.6
WP_075274752.1|97671_97971_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556718.1|97994_99180_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.7e-58	43.8
WP_075273747.1|99383_99974_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081377367.1|100235_100535_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126637.1|100588_100882_+|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	8.3e-06	36.5
WP_081377368.1|100998_101430_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	5.7e-19	43.5
WP_075273741.1|101466_102201_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
WP_075273749.1|102347_103073_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047019.1|103562_103715_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274753.1|103727_105458_+	PLD-like domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_081377369.1|107078_107807_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	4.6e-37	42.4

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP013774|116708:123180|DBSCAN-SWA
TTTAACTGATTTTTTGATTATGCTCGTATTCCTCAGGTGATAAATAATCATTAGCTGAGTGAATGCGTTTTCTGTTATAAAAAACTTCGATATACTCAAAGATCGCTGATTTAGCCTCCTGTCGATTTTTAAAATTCATGTGATGAACTAACTCCGTTTTTAAGGTATGAAAGAAACTCTCTGAAACAGCGTTATCCCAGCAGTCTCCCTTACGACTCATACTTTGCTTAATTTGATGATCTTTAAGAATCTCACGATGACTTTCTGAAGCATATTGGCTTCCGCGATCTGAATGCCAAATTAACCCAGCTTTAGGCTTTCGTTTCCATAAGGCCATCAACAGAGCATCATTGACGAGTGATGCTTCCATATGATCCTCCATGGCCCAGCCAACAACTTTTCGTGAGAATAAGTCAATCACAACAGCCAAGTACAACCAGCCTTGTTGGGTCCGTATGTAGGTAATATCACCAACATATTTTTGGTTAGGGCCTGTTGCTGAAAAATTCCGGTCCAACACGTTTTTTGCAATTGGCAATCGATGTTTAGAATCCGTAGTTACTTTGAATTTACGCTTTATCTTGCAGCAAAGCTGGTTCTGCTTCATTAAACGGCCAACTCGCTTACGGCTTACAGAAATTTCCTGTGTTGCCAACTGTTTTCTAATTCTTCGAGTACCATAGGTTGCACGGCTTTCGATGAATATTTCCTTGATTCGCCTAGCTAATTTTTGGTTCTCTATCATTCGCTTGGAAGGCTGTACCTTTAACCAACTGTAATAACCTGATCGGCTAACACCTAAGATTGAGCACACCCTATCTACTGGAAAAACACATTTATTTTCTTTGATCCAGGCATACTTTACTGTGTTTCGCTTGCAAAGTACGCCGCCGCTTTTTTTAGTATTTCACGTTCCTGTGTCACTCTAGCCAACTCTTTTTTTAACTGTTTTATTTCAGCAGCCATATCACTAACTTCATCTTTAACAGTATTTGGACTGTTTGGATGATATTTATTGACCCAACCATGCAGTGTACTTGAGTGAATACCCAATTCCTGTGCTGTATGACTGATTGCTTGATTTGAATCGACTGCAAGCTTGGCAGATGATTTTTTAAATTCTTCGGTGTACTTGGTGACGTGACGCTTTCCCATTGTGATTCCTCCGGCTCGGATTATTGTAATTTATTTGTCCGGAATAGGGTAGCCTGATCAAAGTGATGCACCACTTTAATCTGGATTCGCTGCTGCAATGCTTCCATGAGCTGAATGGAAAGAAGGCTCTAGGAGTTGATGGAGTCACGAAAGAGCAATACGAGGAGAATTTAATTCCGAATTTACTCGACTTGCTGGACCGCATGAAACGAATGGCCTACATTCCAGGAGCGGTACGCTTAGTACTGATTCCCAAAGAAGGAAGGCCAGGAGCAATGCGTCCACTGGGTATTAGTAATTTCGAAGATAAAATTATCCAGAAGATGACACAGAAAGTGCTAGAAAGCATTTATGATCCTATTTTTCTAGGAAACTCTTATGGCTTTAGGCCTGGAAAAAGCTGTCATAATGCTATCAGAGCACTGGATTACTATCTGTTTTCAAATCGAATCGAAAGTATTATTGATGTAGATTTAGAAAACTACTTTGGCACAATTGATCACAATCTGTTGATAGATATGTTAGAAACTAAGATTAAAGACCAGCGCTTTATCCGATATATTATTCGGATGTTCAAAGCTGGGGTTTTATCAAAAGGTGAGTTGACAATGAGCGATGAGGGAGTTCCCCAAGGCTCAGTGTGTAGCCCGATAATTTCAAATATATTTGCACACTATGTGATAGATGACTGGTTTGAAAAGGTGGTGAAGAAGCACTGTCAAGGTAAAGTAGAAATGTTTCGATATGCAGATGACATGGTTATCTGCTGTCAGTTCAGAAATGATGCTGGCCGAATAAAGAAAGCGTTAGCCAAGAGATTATCAAAGTTCAGGTTAAAAATGAATGAGGATAAGACCCGAGAAATTGCATTTTCAAAGCAAGATGCAGCTCGAGGGATACGACAGGGCGCGTTTGATTTTCTCGGCTTTACCTTTTATCTAGGGGTTTCAGTTAGTGGGAGAGCTATTATTCCCAAGCTGAAGTCGAGTGGAAAACGCCTAAGATCCAAACTGAAGAAAATATCAGAATGGATGAAGAAGAACCGCAATAAATATCCGCTACGGAAACTTTGGGAAATATTTTGCTCAAAGCTTAAGGGGCACGTCCAGTACTATGGAGTATCTTTTAATGCAGATGGAGTAGGTCTATTTCTTTATAAAGCAAGGCGAATATTTTATAAGTGGGTAAACCGACGCAGCCAGAGGAAGTCTTTTAATTGGGGCAAGTTTAGCCTATTTGTAAAACGATTTCCGATGCCAAAGGCTAAAGTATGTCACAAGTTTTTTTTTAATTCATATAGACAAGTGAAAGTAATTATCTTGAGCCTATTGCCTTAATTGGGCACGATGGGTTCTAACGAGGGGTTGATCTTGTGAAAGATCAGCCTACTCTCTATTTGAGGTCGCGGCCAAAAGTATGTATGGCTGCAAAAATGCCAATTGTAATTCCTTTATCTTTTGCAGTTTTAAGCAGAGTTTCAGCCGTTTTCTTGACAAATTCATTTAACAGCCAACGGTTATAGAGGAAGAAAATACGAAATTCTTTGGGAATGGTAAAAGTGATGTGTTGATACTCACACTGAGGAAGAACGGCATTTTGTTCCTCAATCCAAATCTCTGTTGCTTTTTTGCCACATGCACTGCAAAAACGTGACTTACAGGTATAAGGTACAACTTTGGTATGAGAGCATTCAGAGCTGCTACAACAGTATTTTGAGTGACCCATCACGGTTGTGCCGCATGCAAGTACTTTAATCACGTTTTCCACAACGACATCACGGTGCTTGTCCATGTTAGCTATGAAGTCACGCCACCAATTGTCGGCAGTTTGAAGAAGATGTTTGACTGTGTTGAGCAATTATTTTTCTCTTAAAATAATGTCCTATAGTAGTGATTACGTTGAATTTAGCAAGGCCTTCCTAAAGCTGCCGACGTTTTATATCCAACCTGATTTTAAAAGCGGTGAGGGTGATTTATTACGCGGTAAACGTGTGAATACCTCAGATTTTATGGATACCCTCGCCGCTGGAAAATGCGCCGCCTTATTTGGTGATTTTTCTAATTTTATTATTGCTGACCGGGGCGGTATCTCGCTGCGCCGATTAAATGAGCTCTATGCTGAAACCGGTGAAGTTGGTTATTTAATGTGGTTGCGTGTTGATGCGCTATTGCTTGAGACAGACGCCATTAAACAACTTAAAACCGCCGCAACTTAAAAAATAAATAAGATCAAGACTGCCCTGGAGCATTAGCTTCAGGACTCGGCTCAGAAGAAGTAACTTGAAAACTTTGAAGTGTATTAAGCACAGGAGAAGCAGTACGCCATTGACCTGCTGATTGCGCCGCTTCTGCTTCTACGCTTACTCTTTCTTTTAGCAATTTACGAGTTTCGGAACATAATCTTTTAGTTGCGCTAAATGCCCCCCAGGCAGCATTTTCAAACGCTGCAGCATAGTGGTATGTCGTTCCATCAAAACGAGAGATGCCAAAAAGCGAGTTTAAAAAATCTGAACCTCTTTTAGCCGCACCTATGTCATGTATGGACTCTTGTAAAAAGCTTTTGCATTTAAGTAACACAACTAACTTGCGGGACTGTGATACTACGATAGGATCGGCAACCCTGTTATTGTTTGTTTTAGCGAATTGTTTTAAATTTTCGTATTGTTGATAAAGTGGTAAATCTTGTGTTCTTTGTCTTTGCAAACATCGACGCAAGTTAGGATCTATATTCGCGTAAAGGTCTGCTTTTTTTTGTAAACTTGCAATTTTTGCATCAAGTTTATCAATGAGCTTTCTTGTTTTTTTTAAATTTTCTTGTGTAGGCATTATACTTTGACTCTTAGTTTATACCGAACTGGTGTTAATTTCAGAATGTAAAATACCAGATAAAAAAATAAAACATCATAAGCGTAATTATATAAAATCAAAAACTAATGTTGTTTTTATGTAAATCACTTTAACTCACATTTAAATCAAATCTAAAAGGTTTTTTATGAAAGTTAAAATCTTAGTGCCTCGGGCCGGGATAAATATTTCTTATAATATCGGCGATATTGTTGATTTACCCGATAAAACCGCAAAAGCTATGATTAAGTACGGCGATGCTGAGTCAGTTAACGTTAAAACGTTCAAGAAAAAATCAAAATGATCGATTTAACACGCTTAAAAAGCCACCTGCGGATCGACAATCATAGCGAAGATGACTATCTCACCTTACGCACTGACATGATAAACAATGTATAATGGAATCTGATAGATACAGGGATTTCATCAGGAATGAATAAAGAGCTACTGGATATTTATAGCGACTATTTAATTAGCCAGAACCATTATGCAACGGCAACAGGACTTTCAGATTTACTGGAAGGAAGTATCAGCCATGATAAAGTCACACGCTTTTTAAATAAAAACCACTTTGGATCAAAAGAGCTCTGGAGCTATGTTAAAAAGCATGTTCGTCAGTATGAAGAAGAAGTTGGAGGCGTTTTAAGTCTGGATGATACCGTGGAAGAAAAGCCTTATACAGATGAGAATGATGTGGTTTGTTGGCATTATTCACACAGCAAAAGCGCTCATGTAAAGGGAATTAATATTTTGACAAGTATGGTGACTTACAAGAAAACGTCCGTACCTATTGGTTATGAAACTGTATTAAAAGACATCAAGTTTACTGATTTAAAGGACCGAAAAGAAAAGAGAAAATCTAATATATCGAAGAATGAGTGCTTTCGTAACCTTATAAATCGTGCAATTAATAACCAGGTTAAATTTGATTATGCTGTTGCAGATAACTGGTTCAGTTCAAAAGAAAACATGAATTATATTCATGCCAAGTTAAATAAGTTGTTTATTTTAGGAATAAAATCTAATCGAATAGTTGCTTGCAGTTTAGATGATAAAATCAATAGAAATTACCAGCCAGTCAAATCTCTTGATTTAAAAGATGGTGAGGCCATAGATGTATATCTTCAGGGAATTAATTTCCCAGTGCGATTAATGAAAAAGATCTTCACAAACGAAGACGGGTCAACAGGTCACCTCTATTTAATAACAAATGATTTAGAGACGGATGGTGATGGGCTTTACAAAATCTATCAAAAACGATGGAAAATTGAAGAATATCATAAGTCGATTAAACAAAATGCAAGTTTAGCAAAATCACCAACTAAAACTGTTCGGTCACAATGCAATCATATTTTTGCATCAATCGTGGCATTTTGTAAACTAGAAACATTGAGTGTAAAAGCACAACTTAACCACTTTGCACTCAAATATAAATTACTTGTGCGGTCAAATCAAATAGCTTTTGAAGAGCTTAGGCGATTAAAATGTTTATGACCTGTGCGTAAGGTGAGTGACTATTTAGAGTTTATTCTCGCCGCCGCCCTGCAAGCCGCTGAGGATTATCTTGACCGTGTAATTGTAAACAATACGGATGATTTAGAAGCGATTGAAAACAGTGTGTTAATTAATAAATCGATAGAAATTGCCATTTTAATGTCTGCCGGTCACTTCTACGAAAACCGTGAATCAACGAGTAGTTTAACGGTGAAAGAGGTGCCAATGAGTACCCATTTTTTACTTAATCCGCATCGGTATTTAAGCGCATGAGAGCGGGCTTGTTACGCCATCGCGTGACTTTACAAAATAATTTAATCGGTGCAAATAATTATGGTGAAGCGGTGGATTATTGGCAGGATATCACCACCGTCTGGGCACGGGTCAGCCCCAGTGCAGGCCGGGAACTTTTTAGCGCCCAGCAGTTTTATCATGAAATCAGTCAAACCGTCACCCTGCGTTATCGATCTGACGTCACTCCGTCGTTGCGCCTTGTTTTTGAGGGCCGTTATTTGGAGATTTTAAGTGTGATTAATCCAGATGAGCGTAATCGTGAGCTCATTTTAGCCTGTCGGGAGTGGGTACATGCCTAAAATAAGTTTCTCTGTTGACGGGTTGCGTGATTTAGAAAAACAATTAAAACAGTTAGCACCGAAAAAAATTAAAACCTTAAACCGCCGCGCCCTGCGTAAAGCCGCAGAACCGGTTGAAACACAAATGAAAGCGAATGCACCGCAAAAGTCAGGTGCTTTAGTTGAATCGATTAAACGCCGTTCTAAAAAAGGCAAAGGCCGGCGAACCATTGTTAATGTGACGGTGGGGCCAACACGTAAAATAGACTATGCCATCGAGCAAGAATATGGCAGCAGCCACCAACCGGCACGGCCATTTATTCGCCCCGCGCTGAATGATAACGCGCAAACATCCATCGATAGTTTTAAAAATGCATTAACCCTCGCGCTGAAAAAGCAAAAGTTATGA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP013774|116708:123180|122468_122792_+|WP_016210667.1|head|DBSCAN-SWA
MRAGLLRHRVTLQNNLIGANNYGEAVDYWQDITTVWARVSPSAGRELFSAQQFYHEISQTVTLRYRSDVTPSLRLVFEGRYLEILSVINPDERNRELILACREWVHA
>NZ_CP013774|116708:123180|119786_120077_+|WP_129556716.1|capsid|DBSCAN-SWA
MPTFYIQPDFKSGEGDLLRGKRVNTSDFMDTLAAGKCAALFGDFSNFIIADRGGISLRRLNELYAETGEVGYLMWLRVDALLLETDAIKQLKTAAT
>NZ_CP013774|116708:123180|121137_122199_+|WP_075273766.1|transposase|DBSCAN-SWA
MNKELLDIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNECFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRIVACSLDDKINRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL
>NZ_CP013774|116708:123180|117927_119199_+|WP_075273762.1|DBSCAN-SWA
MHHFNLDSLLQCFHELNGKKALGVDGVTKEQYEENLIPNLLDLLDRMKRMAYIPGAVRLVLIPKEGRPGAMRPLGISNFEDKIIQKMTQKVLESIYDPIFLGNSYGFRPGKSCHNAIRALDYYLFSNRIESIIDVDLENYFGTIDHNLLIDMLETKIKDQRFIRYIIRMFKAGVLSKGELTMSDEGVPQGSVCSPIISNIFAHYVIDDWFEKVVKKHCQGKVEMFRYADDMVICCQFRNDAGRIKKALAKRLSKFRLKMNEDKTREIAFSKQDAARGIRQGAFDFLGFTFYLGVSVSGRAIIPKLKSSGKRLRSKLKKISEWMKKNRNKYPLRKLWEIFCSKLKGHVQYYGVSFNADGVGLFLYKARRIFYKWVNRRSQRKSFNWGKFSLFVKRFPMPKAKVCHKFFFNSYRQVKVIILSLLP
>NZ_CP013774|116708:123180|122784_123180_+|WP_016210658.1|DBSCAN-SWA
MPKISFSVDGLRDLEKQLKQLAPKKIKTLNRRALRKAAEPVETQMKANAPQKSGALVESIKRRSKKGKGRRTIVNVTVGPTRKIDYAIEQEYGSSHQPARPFIRPALNDNAQTSIDSFKNALTLALKKQKL
>NZ_CP013774|116708:123180|119254_119653_-|WP_052047108.1|transposase|DBSCAN-SWA
MDKHRDVVVENVIKVLACGTTVMGHSKYCCSSSECSHTKVVPYTCKSRFCSACGKKATEIWIEEQNAVLPQCEYQHITFTIPKEFRIFFLYNRWLLNEFVKKTAETLLKTAKDKGITIGIFAAIHTFGRDLK
>NZ_CP013774|116708:123180|116708_117862_-|WP_105962623.1|transposase|DBSCAN-SWA
MGKRHVTKYTEEFKKSSAKLAVDSNQAISHTAQELGIHSSTLHGWVNKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAALLCKRNTVKYAWIKENKCVFPVDRVCSILGVSRSGYYSWLKVQPSKRMIENQKLARRIKEIFIESRATYGTRRIRKQLATQEISVSRKRVGRLMKQNQLCCKIKRKFKVTTDSKHRLPIAKNVLDRNFSATGPNQKYVGDITYIRTQQGWLYLAVVIDLFSRKVVGWAMEDHMEASLVNDALLMALWKRKPKAGLIWHSDRGSQYASESHREILKDHQIKQSMSRKGDCWDNAVSESFFHTLKTELVHHMNFKNRQEAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYEHNQKIS
>NZ_CP013774|116708:123180|120090_120687_-|WP_016210655.1|DBSCAN-SWA
MPTQENLKKTRKLIDKLDAKIASLQKKADLYANIDPNLRRCLQRQRTQDLPLYQQYENLKQFAKTNNNRVADPIVVSQSRKLVVLLKCKSFLQESIHDIGAAKRGSDFLNSLFGISRFDGTTYHYAAAFENAAWGAFSATKRLCSETRKLLKERVSVEAEAAQSAGQWRTASPVLNTLQSFQVTSSEPSPEANAPGQS
>NZ_CP013774|116708:123180|122202_122472_+|WP_075273768.1|head,tail|DBSCAN-SWA
MRKVSDYLEFILAAALQAAEDYLDRVIVNNTDDLEAIENSVLINKSIEIAILMSAGHFYENRESTSSLTVKEVPMSTHFLLNPHRYLSA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_105962623.1|116708_117862_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
WP_075273762.1|117927_119199_+	group II intron reverse transcriptase/maturase	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	1.1e-22	28.3
WP_052047108.1|119254_119653_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556716.1|119786_120077_+|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	2.7e-12	42.7
WP_016210655.1|120090_120687_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273766.1|121137_122199_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075273768.1|122202_122472_+|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	Q8SBH7	Shigella_phage	2.2e-05	31.3
WP_016210667.1|122468_122792_+|head	phage head closure protein	A0A1W6JP44	Morganella_phage	1.0e-12	39.0
WP_016210658.1|122784_123180_+	hypothetical protein	Q7Y404	Yersinia_phage	1.6e-07	40.0

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
NZ_CP013774.1|WP_016211913.1|2616_3738_-|hypothetical-protein	2616_3738_-	373 aa aa	NA	NA	NA	0-107807	yes
NZ_CP013774.1|WP_016212499.1|6729_7104_+|hypothetical-protein	6729_7104_+	124 aa aa	NA	NA	NA	0-107807	yes
NZ_CP013774.1|WP_016212408.1|7729_8179_+|hypothetical-protein	7729_8179_+	149 aa aa	NA	NA	NA	0-107807	yes
NZ_CP013774.1|WP_075273814.1|29059_29521_-|hypothetical-protein	29059_29521_-	153 aa aa	NA	NA	NA	0-107807	yes
NZ_CP013774.1|WP_016212260.1|33958_34231_+|hypothetical-protein	33958_34231_+	90 aa aa	NA	NA	NA	0-107807	yes
NZ_CP013774.1|WP_016212257.1|34250_34475_+|hypothetical-protein	34250_34475_+	74 aa aa	NA	NA	NA	0-107807	yes
NZ_CP013774.1|WP_032126838.1|34811_35015_+|hypothetical-protein	34811_35015_+	67 aa aa	NA	NA	NA	0-107807	yes
NZ_CP013774.1|WP_129556706.1|65352_65982_-|hypothetical-protein	65352_65982_-	209 aa aa	NA	NA	NA	0-107807	yes
NZ_CP013774.1|WP_016212014.1|72479_72893_+|hypothetical-protein	72479_72893_+	137 aa aa	NA	NA	NA	0-107807	yes
NZ_CP013774.1|WP_155047016.1|73296_73524_+|hypothetical-protein	73296_73524_+	75 aa aa	NA	NA	NA	0-107807	yes
NZ_CP013774.1|WP_075274752.1|97671_97971_+|hypothetical-protein	97671_97971_+	99 aa aa	NA	NA	NA	0-107807	yes

Protein sequences of NZ_CP013774.1|WP_016211913.1|2616_3738_-|hypothetical-protein

>NZ_CP013774.1|WP_016211913.1|2616_3738_-|hypothetical-protein
MSFEQACAALERAGVDFQNRETELKENEKLQQVVCALAQVRLLNPETWGKIQIRNSEAQQIIIDIIDSLPLQSKDGPTGEDEQTPIEKTASAIAYRAINYFIACDWAKHISDDRYMGQAYRRFQNDKPFQQVATHLHKKIAGDFDSRTIADIQGFYQEELAALSAVWKPSFLSHHQEHERGFQAATELHQRDCLSLGDCERYQAIFSLGAGQILSQKTFDQVCSSDDPKVEAAKILILDAQSKVAEKAKDLDKGTREKISNHLQTRLKNNTDTPKKSLLSTVRMASRPLGRHFRPKRDLDNLPETYKVAEKSLKIAARLLDIPIVEITKAITGGKSEEFNTYGDLKKFMEKEQKHLRSQAVQETEMTSMTGPS

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	27738-27775	0
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	38478-38441	0

1. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 position: 27738-27775, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 position: 38478-38441, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013774.1|WP_016212499.1|6729_7104_+|hypothetical-protein

>NZ_CP013774.1|WP_016212499.1|6729_7104_+|hypothetical-protein
MSENEKSKKTLGSPAEQTTHPLGSPLISYSIDLIEFRGKLNLTNFTVRSIQSADVSGSASLEYARDAILFALEGSEEDTAIESHILSEIQTASNLVVYAWGCKSCGEWWYRKTVNGHTYCPRCR

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	27738-27775	0
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	38478-38441	0

1. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 position: 27738-27775, mismatch: 0

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**************************************

2. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 position: 38478-38441, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013774.1|WP_016212408.1|7729_8179_+|hypothetical-protein

>NZ_CP013774.1|WP_016212408.1|7729_8179_+|hypothetical-protein
MFIKRYSLLFLLVFNLNLHALSGRTIMINNQTSQDIILHFFDVNCMYTNLSDSDGIDIDSINNRIIKANNFIKVHEESKASGICFFIRSNSSEYKLKASLVVAPYIYTVMKAEAHGSAISRYMKYNTEGGSIQKFKFNFDDNKIYINHE

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	27738-27775	0
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	38478-38441	0

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**************************************

2. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 position: 38478-38441, mismatch: 0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP013774.1|WP_075273814.1|29059_29521_-|hypothetical-protein

>NZ_CP013774.1|WP_075273814.1|29059_29521_-|hypothetical-protein
MKNIKKTIGVIVLSVISSGWAVAWSPWIVCGGATHKVYPEGGGDPFDQTSYYSARCSDGQAPEGFTCAYHPTRLVNVIYINNVGGKDNYYDVSQSQMNAIDKICQKIDKSAKAEDPAYLAHRQGDNGGGMYGHYYDFRVVSNNNFFSKEKIIF

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	27738-27775	0
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	38478-38441	0

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**************************************

2. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 position: 38478-38441, mismatch: 0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP013774.1|WP_016212260.1|33958_34231_+|hypothetical-protein

>NZ_CP013774.1|WP_016212260.1|33958_34231_+|hypothetical-protein
MIIPEKSKLTAWPSPVLYAAAKATAWGGCYGVSSHQSFKENYNRSIKKYLAGQKFEVPPEVCRSIEHKGPRNSEAALSQLEKMRRNLRVH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	27738-27775	0
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	38478-38441	0

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2. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 position: 38478-38441, mismatch: 0

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Protein sequences of NZ_CP013774.1|WP_016212257.1|34250_34475_+|hypothetical-protein

>NZ_CP013774.1|WP_016212257.1|34250_34475_+|hypothetical-protein
MLGVAIDSTESLNDRCKQIVKAVDSFLKGYKLATNKKLSELGINIKDHHDLTKCLGLEPYTEISRNGVVLYGIK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	27738-27775	0
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	38478-38441	0

1. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 position: 27738-27775, mismatch: 0

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**************************************

2. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 position: 38478-38441, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013774.1|WP_032126838.1|34811_35015_+|hypothetical-protein

>NZ_CP013774.1|WP_032126838.1|34811_35015_+|hypothetical-protein
MQKAVKCEAEEIQERMRFVKNNYKSLTVKRLKILWGVNSLNVYQFLRQYDLPWLPIDELTIKQRGRI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	27738-27775	0
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	38478-38441	0

1. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 position: 27738-27775, mismatch: 0

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2. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 position: 38478-38441, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013774.1|WP_129556706.1|65352_65982_-|hypothetical-protein

>NZ_CP013774.1|WP_129556706.1|65352_65982_-|hypothetical-protein
MNREWVELSKDTSQIYLQVYALQSVQIHIIQMQQQGDSHSIVSTNDLLEERATSYELQCELGLPCGHMLIDLVFDLNDRVVSQRSLESFTKLVQPIQTLKLLDTHRLNVIEKQVINFIKILKLRQPQDIHFELKAIWPEYIQFHLEDEKTLDLKTKHLYLVEIVADGSGIKVAVNQKYQCCYLFDQDKNSLKKLLNDLHACDVPVSFKQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	27738-27775	0
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	38478-38441	0

1. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 position: 27738-27775, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 position: 38478-38441, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013774.1|WP_016212014.1|72479_72893_+|hypothetical-protein

>NZ_CP013774.1|WP_016212014.1|72479_72893_+|hypothetical-protein
MILIPNGYLIPALPQPSPNLFGIAAADLSGSQNAAVSITKDGFTVTAAGKACDGILQNTPKKSEDCEIICSGAVKATAAGAITAGDYVKVASNGQLIQAAAGDTATGAALETAKAAGDLIGIHLIPNGYLILAAPSK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	27738-27775	0
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	38478-38441	0

1. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 position: 27738-27775, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 position: 38478-38441, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013774.1|WP_155047016.1|73296_73524_+|hypothetical-protein

>NZ_CP013774.1|WP_155047016.1|73296_73524_+|hypothetical-protein
MQQRAPGTTAAQADISYNFDNTYKCEQYALLVQAWCLGNTIEVVSDFKNKYLYHIELETKVSKGNHLKHFVLYFI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	27738-27775	0
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	38478-38441	0

1. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 position: 27738-27775, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 position: 38478-38441, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013774.1|WP_075274752.1|97671_97971_+|hypothetical-protein

>NZ_CP013774.1|WP_075274752.1|97671_97971_+|hypothetical-protein
MSAITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKPPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKARLNYFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	27738-27775	0
NZ_CP013773_3	Orphan	3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder	2450890-2450927	38	38478-38441	0

1. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 position: 27738-27775, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 3.1|2450890|38|NZ_CP013773|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 position: 38478-38441, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. NZ_CP013776

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	13315 : 21214	9	Enterobacteria_phage(28.57%)	transposase,terminase,tail,capsid,head,portal,protease	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP013776|13315:21214|DBSCAN-SWA
ATCATAGTTTTTGCTTTTTAATCGCCAGCGTTAAGGTGCTTTTAAAAATATCGATGGATGTTTGCGCATTATCATTCAGCGCGGGGCGAATAAACGGCCGTGCCGGTTGGTGGCTACTGCCATATTCTTGCTCGATGGCATAGTCTATTTTACGTGTTGGCCCCACCGTCACATTAACAATGGTTCGGCGGCCTTTGCCTTTTTTAGAGCGCCGTTTAATCGACTCAACTAAAGCGCCTGATTTTTGCGGTGCATTCGCTTTCATTTGCTGCTCAAGCGGTTCGGCGGCTTTACGCAGGGCGCGGCGGTTTAAGGTTCTTATCTTTTTTGGTGCTAACTGTTTTAATTGTTTTTCTAAATCACGTAAGCCCTCAACAGAGAAACTTATTTTAGGCATGCACCCACTCCCGACACGCTAAAATGAGCTCACGATTACGCTCATCTGGATTAATCACACTTAAAATCTCCAAATAACGACCATCAAAAACAAGGCGCAATAAAGGGGTGACATCAGACCGATAACGCAGGGTGACGGTTTGGCTAATTTCATGATAAAACTGCTGCGCGCTAAAAAGTTCCCGGCCTGCACTCGGGCTGACCCGTGCCCAGACGGTAGCAATATCCTGCCAATACTCCACCGCTTCACCATAATTATTGGTACCAACTAAATTATTCTGTAAAGTCACGCGATGGCGTAACAAGCCGGCTCTCATGCGCTTAAATACCGATGCGGATTAAGTAAAAAGTGGGTACTCATCGGCACCTCTTTCACCGTTAAAGTACTCGTTGATTCACGGTTTTCATAAAAGTGACCGGCAGACATTAAGATGGTGATTTCTATCGATTTATTGATTAACACACTGTTTGCAATCGCTTCTAAATCATCCGTGTTATTTACAATCACCCGATCTAGATAATCTTCGGCAGCTTGCAGGGCAGCGGCAAGAATAAATTCTAAATACTCATCTTCGTTATTATCGTCGATGCGCAAATGGCTTTTTAAGCGTGTTAAATCGATCATTTTGATTTTTTCTTCGACGTTTTAATGTTAACCGCTTCAGCATCACCGTGCTTAATCATGGCTTTTGCAGTTTTATCGGGTAAATCAACAATATCGCCGATATTATAAGCAATATTAATCCCAGCCCTTGGCACTAAGATTTTAACTTTCATAAAGTCCCTTTTCGGTTTGATTTAAATGTGAATTAAGGTGATTTACACAAAAATAACATTAATTTTTGATTCCGCATATTCATGCTTATGATATTTTATTTTTTTATCTGGTATTTTACTCTCTAAATTAAATGAAAGTTCAATACAACGTTAAAGGTTTAAATATAATGCCTACACAGAAACATATGGAAAAAATAACGAACCTTATTGATGATCTCCAGAAGAGAATTACTAAGTTGGACGGTCAGATAGAAGCAGAGGCTAAAAGCTCATTTATTTCTTCTGGGCTATTAGAAAGAGAAAAGAGCAAAGGCTCACGACCTGTCGAATATTACCATAATGTAAGAGAGTTTAGTCGGAAACTTTTACCTAAAATCGCATCATGGGCTCGTAAGGCTCTTCTATTATGTGAATGCAAAAACTTTTTAGAAGAAATGACAAAAGATGACTCTAAAGCTCTAGAGCACGCAACTCATTTAAATGAAACCTATCTTAGACATTCCAATCTTGCAGTGTTTGAGGCTAGGTTTAGAAGCATGACAAAAAGCTTATGTTCAAAGACTTACAAGATTTTAAAAAGTATCGCGAAAGAAAATCAACAATCTGCCGTTGCAGCGACTAACTGCGGTGGAGGCGCATATGCAGTAGCTGATATTGTAAATCGACACCAGTCAAGCGGACTTACCTCAGTTGAAGAAGGTTTACAAGTAGTAGAGTTACCTCAAACGCAGCCAGCCATGCAGGGTTAAGCACAGAGTGAATAGTTTGCTGCTGAGAATTATTATTAAGCGGCAGCGGTTTTAAGTTGCTTAATGGCATCTGTCTCAAGCAATAAAGCATCCACACGCAACCACATTAAATAACCGACTTCACCAGTTTCAGCATAAAGCTCATTCAATCGACGCAGCGAGATACCCCCACGATCAGCAATAATAAAATTAGAAAAATCACCAAACAAGGCGGCGCATTTTCCGGCGGCGAGGGTGTCCATAAAATCCGAGGTATTCACACGCTTACCGCGCAATAAATCCCCTTCACCGCTTTTAAAATCAGGCTGAATAATATACTGGCCGTTACCATCTTTCATTTTTAATAATGAGCCATAGGTAGAGTCGTGCATAAGGTAGGAGGCTTTACGACGATAAGCGGCTTTGACCGAACTACGTAAGTCTAAAATATCATCTAAAGTAATACTGGTCGGTGCGGCAGCGGTAACCCCAATCGGCGCGACATTTAATAAGCCATTGGGTTTGCCGGTGCCGTCCCCGGTTAAAAAGGCTTTTTCTTGGGCTTCGCCAAAGCTGCGACCAAAGGAGTAAGCAATATGGGCACCAATATTAATCGCACTATCGGCCAGTAATTCATCCGATATTTTTAACATCCGTGATAGCTTATAGGCTTTGATGGATTTTTTCTTAAAGGTATCATCGGTGGCGGTATGGGCGGCAGTTTCACCGGTCCAGGTCGCGGCTCCATAGCTGTCGGCCATCGGTAATTCCGTGGTTGAGTCGGTTTGAATAATACGACACATTTGACGCATCACCGTCTGCTCTTCCAGAGCTTCGATTAAGGTGGTTTGTAGTTTCGTCGGCACTAAATAGCCGCCCTTATTATCCGTCCCTTCAACTTGCCCGGCACGAATATCAACCCCTGAATTTTGCCCACGCATATAGGCAAAAAAGTTCTTTTCATATTCTTCCGTCGCGAGTGGGTTGATCGGTGTATTATCAGTCGGTGATTGTACACCGGCACGTAACGGCTCAGAACTTAATGAATTAATTTCACGTTCCTGGGCTTCAACCTCTTCAATTTTAGCAATACGGTTTTTAATGTTTAATTGCTGGGTGTTTAAATCCTTATATTGCCCGTCTTCCTCATCGGTAAAGCCACGGCTTTCGCTTTCTGCATGGTCCAGCATGGCGCGTTGCTTGTTAATGACTTCAGCGCGTTGTTGGGCAAGTTCATAAATATCAGGCATAAGTCTATTCCTCCTAGAATATTAAGAGCCTTAAAAATTAAGTGTTAGAGAAAATTATAAAAGGGAGCGTTTAAGTGCGAGTTTATGGCGTTGCAGTGCTTTTGCTGCGTTATTTTCAGAATGTTTAATTAATGTTTGAGGGGTGTTTTTATATTGATTAGGTTTAACGCAAGCGGCGATATTCACCGCCTCGGTGATTTCATCAATAAAGCCATACTCTTTTGCTTCTGCTGCGGTCAACCAAGAGGTTTCATACATCATTGCTTTAATTTTATCGTCGGCTAAATTAGATTTTTGGTGATAAATGTTTACTATTTTTGCTTCATTTTTATCTAAAATCTCAATGATTTTACTCAACTCTTCAGCATCACCCACCGCATAGGCCCAAGGGCGGTGGATCATATAAAAAGCATTATCGGCCATATGCACGGTGTCACCGGTAAGTGCAATAATGCTTGCCATAGAGGCCGCGAGGCTATCAATATGAGTGATAATTTTTGCCGGATGACGATGCAGGGCATTATAAATAGCAAAGCCATCCGTGACAGAGCCGCCGGGCGAATTAATTCTAAGATTAATTTGCTCTACATCAAGCGCCTGTAATTCCATCACAAAACTTTTAGCTTCAACACCGTAATCACCGATGTAATCGTAAATATACACATCGGCAGACTTATTTGCTTGTGCTTTGATCTGATACCAGTTGTTCATTATTTTGCTCTTCATCCTCACCAATCGGGGTCATATTCAACGGACGGTAATAACGGTCCCCGTCTTCTATTGGGTTCATGTTCTCTAGTTTACGAATATCGTTTTGACTCATTACACCGATGCTAAACATGCGATTATAAAAAGACGCTCGAGCGGCCGTATCGCCACGCAATAAGCCCTCGATATTAAATTTTATAAAATATTTTTTGCGCTCATGGGCAAGTAATAAATCACGGCTAATACTCTGCTCAATCTTCACCAGCCACGGCACCAGGCTATGACGAACAAAGGCTAAATCTTGATGCTCAATATTTGAAAAAGTGGCGCGCTCTAAATCAGCAATCATATGCGGCGGCACCCGGAAAATGCCACAGATTTCATTGCGCTGGTATTTGCGTGTTTCTAAAAACTGACTGTCTTCACTACTCATCGTCAAGGTTTGCCATTTCAAGCCATTTTCTAACACAGCGACCCCATTCGAATTTTTACCGCCGTGGGATTTTTTCCAAGACTCCGCTAAGTTTTCACGGCCTTCTTTTTTTAACGCGCCGTCTGTGGTTAAGATGCCGCTGGGGCGTGCACCATTGCCAAATAACTGCGCGCCATGCGCTTGAGTTGCCGCAGATAAACCCAAAGACTCACGCTGTAAGGTAATCGGACTGCTGCCGATAATGCCATCACTGCCCATGGCATTCAGCCGCCATACTTGATCATCACGTAGCTCATAGCTTTGACCGTTTAAGATCGTGCTATAAACCAGTTTTTTAGTCTTTTCATCACGGCGTACTGTGGTGCTATCAGTGGGCAGTTGGATTAATTCACGCACTCGCCCTGCACCATCGCGAATAATCTGACAATAGGCATTACCACGCAAACATAAATGGCCCACAAGGTTTTCACGTAAATCAAAACTGGTGACTTCAGCATTGGGAAGATCATGCAAAACAGAATATAACGGGTGATCTGTAGCCAAGGCTTTACCGCCACCTGTTTCATAGCGATACACATGCAAAGGCAAGGCGGCAATAGATTCAGCTAATACACGAATACAGGCATAAACGGTTGCTAAATGCATAGCATTATCCGGGTGGATGCTTTGACCGCTGGCACTCATGGGGGTTATATCTAAAAGCTCATAGCCACCATATTCGGTGCTCGGTTCAAGTTCCGTTGCCGCACCGAACCAGCGCTTAAATAACTTCATAACTCACCTTACGCACTGACATGATAAACGATGTATAATGAAATCTGATAGATACAGGGATTTCATCAGGAATGAATAAAGAGCTACTGGATATTTATAGCGACTATTTAATTAGCCAGAACCATTATGCAACGGCAACAGGACTTTCAGATTTACTGGAAGGAAGTATCAGCCATGATAAAGTCACACGCTTTTTAAATAAAAACCACTTTGGATCAAAAGAGCTCTGGAGCTATGTTAAAAAGCATGTTCGTCAGTATGAAGAAGAAGTTGGAGGCGTTTTAAGTCTGGATGATACCGTGGAAGAAAAGCCTTATACAGATGAGAATGATGTGGTTTGTTGGCATTATTCACACAGCAAAAGCGCTCATGTAAAGGGAATTAATATTTTGACAAGTATGGTGACTTACAAGAAAACGTCCGTACCTATTGGTTATGAAACTGTATTAAAAGACATCAAGTTTACTGATTTAAAGGACCGAAAAGAAAAGAGAAAATCTAATATATCGAAGAATGAGTACTTTCGTAACCTTATAAATCGTGCAATTAATAACCAGGTTAAATTTGATTATGCTGTTGCAGATAACTGGTTCAGTTCAAAAGAAAACATGAATTATATTCATGCCAAGTTAAATAAGTTGTTTATTTTAGGAATAAAATCTAATCGAACAGTTGCTTGCAGTTTAGATGATAAAGTCAATAGAAATTACCAGCCAGTCAAATCTCTTGATTTAAAAGATGGTGAGGCCATAGATGTATATCTTCAGGGAATTAATTTCCCAGTGCGATTAATGAAAAAGATCTTCACAAACGAAGACGGGTCAACAGGTCACCTCTATTTAATAACAAATGATTTAGAGACGGATGGTGATGGGCTTTACAAAATCTATCAAAAACGATGGAAAATTGAAGAATATCATAAGTCGATTAAACAAAATGCAAGTTTAGCAAAATCACCAACTAAAACTGTTCGGTCACAATGCAATCATATTTTTGCATCAATCGTGGCATTTTGTAAACTAGAAACATTGAGTGTAAAAGCACAACTTAACCACTTTGCACTCAAATATAAATTACTTGTGCGGTCAAATCAAATAGCTTTTGAAGAGCTTAGGCGATTAAAATGTTTATGACCTGTGCGTAAGGTGAGTTCATAAGATGAGTAGCTCTCTCTCGTTATAAATCGAGTTGTGATCTTCCCCCGCAATTAAACGCCCGACGGCCATTGCCGTGGCCACCATGCCGTCAATCTTCTCTGTCGATTTACGCTTAGAAGGTTTCATATTGCCCGCATCATCTTCAACAACCACTAAATTCGAGGCCATCCAATTTAAGACCGGGTTGTTGTTGTGATGGAGTTTTGTTGAAATCACCAAGCGCTCAAGTTCTTTTAAGGCTGGGGTCATGGACTTAAAACCTTGGCGAAACTCGACCATATTCGCCCCTTCTTCAAGTAAATCATTGGCGAGCTGGGTGGCATTCCACGGGTCATAAGTAATCTCTTTAACATCAAATTCTTTATTCAACTGGTAAATATCATCTTTGATGTAGTTGTAATCGATCACATTACCCTCTGTTAGGGTTAAATAACCTTCATCGGCCCATAGCTGATAGGGCACGGGCGATTGCTTGGCTCGAGTCATTACCGTCTCTTTCGGTAAGTAAAAGCGACAAAATAGGCGCACAGAATCATCTGGCATTAAAAAAGCCGCAACTAAGGCGGCTATATCGTTGGTACTGGCCAAATCCAAGCCAATATAACAGGGCCTGTTTTCCAATGATTCACGTTTAAAGGTATATTCAGCGCAGGCTTTCCAGCGTTCTAAATCTAACCAAGCGGTTTCGGCATTCGTCCAGATATTTAAGTGCTTACATAAAAAACCATTGCGTTCGCCCTTCATTTGTTGGGCTTTTACGCACTGGCGTTGCATATCATCGAGCTTTTTACTGACGCCTAAATTCGGGTTGGCTTTGATCCAATTGCGCTCATCCGTCCAATCGTCATCCTTATCCAACGTGTAAATAATGCCGAAAAAGGTATCATCTACAATGATATTTTCCAGCACTTTAACCGCATAATCACGCAAACTATAACAAATCCCCGTTTGATCAAAGCCGGCGGTTGTAATCGCATACAGCAATGGTTGACGCCTAGAGCCGGTGCCCGTCTCTAATACGCGCCATAAATCGCCGGTTTTATGGGCATGCAACTCATCAACAATACTAGAATGCACATTTAAACCGTCCTGAGTTTGGCTATCACTGGATAACGGTTCAAATTTATTATTGGGTAAATCCTTGGGATAATGCATATTATTTTTATAAATGCCAATACGACCGGCTAAGGCTTTTGACGCCCTAACCATTTTCACCGCATCATCAAAAACGATCTTCGCTTGATCGCGTTTTGTTGCCGCAGCATACACTTCAGCGCCTGGCTCTTCATCGGCACAAAATAAATACAAGCCAGTGCCTGATAATTTCGTACTTTTGCCATTTTTACGCGCGACTTCTTCATAAACGGTACGAAAGCGCCGCATACCATCAACTTCACGCCTCCAACCAAACACGGTAGTAATAATAAACAACTGCCACGGCTCTAAAGTAATTTTCTTGCCATACCACTCACCCTTGCTGTGCTTGCAGTAGCTAAAAAATCTAACGACTTTACACGCGGCTTCTTTATCAAAGTAAAAACCACGATCACGAGCATACTTTAAATCGTTTAAATGGCGCTGACAGGCTTTTTTTACATAATCACAAGCGATCACGCGGCCGCTTAATACATCGTCGCAGTAGTTTAGGGCGGTTTTTACCGGGTCGCTTTTAAGCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP013776|13315:21214|13315_13711_-|WP_075274763.1|DBSCAN-SWA
MPKISFSVEGLRDLEKQLKQLAPKKIRTLNRRALRKAAEPLEQQMKANAPQKSGALVESIKRRSKKGKGRRTIVNVTVGPTRKIDYAIEQEYGSSHQPARPFIRPALNDNAQTSIDIFKSTLTLAIKKQKL
>NZ_CP013776|13315:21214|14654_15236_+|WP_036778347.1|DBSCAN-SWA
MPTQKHMEKITNLIDDLQKRITKLDGQIEAEAKSSFISSGLLEREKSKGSRPVEYYHNVREFSRKLLPKIASWARKALLLCECKNFLEEMTKDDSKALEHATHLNETYLRHSNLAVFEARFRSMTKSLCSKTYKILKSIAKENQQSAVAATNCGGGAYAVADIVNRHQSSGLTSVEEGLQVVELPQTQPAMQG
>NZ_CP013776|13315:21214|19531_21214_-|WP_081377377.1|terminase|DBSCAN-SWA
MLKSDPVKTALNYCDDVLSGRVIACDYVKKACQRHLNDLKYARDRGFYFDKEAACKVVRFFSYCKHSKGEWYGKKITLEPWQLFIITTVFGWRREVDGMRRFRTVYEEVARKNGKSTKLSGTGLYLFCADEEPGAEVYAAATKRDQAKIVFDDAVKMVRASKALAGRIGIYKNNMHYPKDLPNNKFEPLSSDSQTQDGLNVHSSIVDELHAHKTGDLWRVLETGTGSRRQPLLYAITTAGFDQTGICYSLRDYAVKVLENIIVDDTFFGIIYTLDKDDDWTDERNWIKANPNLGVSKKLDDMQRQCVKAQQMKGERNGFLCKHLNIWTNAETAWLDLERWKACAEYTFKRESLENRPCYIGLDLASTNDIAALVAAFLMPDDSVRLFCRFYLPKETVMTRAKQSPVPYQLWADEGYLTLTEGNVIDYNYIKDDIYQLNKEFDVKEITYDPWNATQLANDLLEEGANMVEFRQGFKSMTPALKELERLVISTKLHHNNNPVLNWMASNLVVVEDDAGNMKPSKRKSTEKIDGMVATAMAVGRLIAGEDHNSIYNERELLIL
>NZ_CP013776|13315:21214|17138_18380_-|WP_054300593.1|portal|DBSCAN-SWA
MKLFKRWFGAATELEPSTEYGGYELLDITPMSASGQSIHPDNAMHLATVYACIRVLAESIAALPLHVYRYETGGGKALATDHPLYSVLHDLPNAEVTSFDLRENLVGHLCLRGNAYCQIIRDGAGRVRELIQLPTDSTTVRRDEKTKKLVYSTILNGQSYELRDDQVWRLNAMGSDGIIGSSPITLQRESLGLSAATQAHGAQLFGNGARPSGILTTDGALKKEGRENLAESWKKSHGGKNSNGVAVLENGLKWQTLTMSSEDSQFLETRKYQRNEICGIFRVPPHMIADLERATFSNIEHQDLAFVRHSLVPWLVKIEQSISRDLLLAHERKKYFIKFNIEGLLRGDTAARASFYNRMFSIGVMSQNDIRKLENMNPIEDGDRYYRPLNMTPIGEDEEQNNEQLVSDQSTSK
>NZ_CP013776|13315:21214|13703_14027_-|WP_075274764.1|head|DBSCAN-SWA
MRAGLLRHRVTLQNNLVGTNNYGEAVEYWQDIATVWARVSPSAGRELFSAQQFYHEISQTVTLRYRSDVTPLLRLVFDGRYLEILSVINPDERNRELILACREWVHA
>NZ_CP013776|13315:21214|18451_19513_+|WP_054300392.1|transposase|DBSCAN-SWA
MNKELLDIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKVNRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL
>NZ_CP013776|13315:21214|15271_16465_-|WP_054300591.1|capsid|DBSCAN-SWA
MPDIYELAQQRAEVINKQRAMLDHAESESRGFTDEEDGQYKDLNTQQLNIKNRIAKIEEVEAQEREINSLSSEPLRAGVQSPTDNTPINPLATEEYEKNFFAYMRGQNSGVDIRAGQVEGTDNKGGYLVPTKLQTTLIEALEEQTVMRQMCRIIQTDSTTELPMADSYGAATWTGETAAHTATDDTFKKKSIKAYKLSRMLKISDELLADSAINIGAHIAYSFGRSFGEAQEKAFLTGDGTGKPNGLLNVAPIGVTAAAPTSITLDDILDLRSSVKAAYRRKASYLMHDSTYGSLLKMKDGNGQYIIQPDFKSGEGDLLRGKRVNTSDFMDTLAAGKCAALFGDFSNFIIADRGGISLRRLNELYAETGEVGYLMWLRVDALLLETDAIKQLKTAAA
>NZ_CP013776|13315:21214|16519_17191_-|WP_081007077.1|protease|DBSCAN-SWA
MKSKIMNNWYQIKAQANKSADVYIYDYIGDYGVEAKSFVMELQALDVEQINLRINSPGGSVTDGFAIYNALHRHPAKIITHIDSLAASMASIIALTGDTVHMADNAFYMIHRPWAYAVGDAEELSKIIEILDKNEAKIVNIYHQKSNLADDKIKAMMYETSWLTAAEAKEYGFIDEITEAVNIAACVKPNQYKNTPQTLIKHSENNAAKALQRHKLALKRSLL
>NZ_CP013776|13315:21214|14023_14335_-|WP_075274765.1|head,tail|DBSCAN-SWA
MIDLTRLKSHLRIDDNNEDEYLEFILAAALQAAEDYLDRVIVNNTDDLEAIANSVLINKSIEITILMSAGHFYENRESTSTLTVKEVPMSTHFLLNPHRYLSA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_075274763.1|13315_13711_-	HK97 gp10 family phage protein	Q7Y404	Yersinia_phage	6.0e-07	39.1
WP_075274764.1|13703_14027_-|head	phage head closure protein	K7PH08	Enterobacteria_phage	5.4e-14	41.7
WP_075274765.1|14023_14335_-|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	Q8SBH7	Shigella_phage	2.5e-08	31.7
WP_036778347.1|14654_15236_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300591.1|15271_16465_-|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	2.6e-69	39.5
WP_081007077.1|16519_17191_-|protease	Clp protease ClpP	Q8VNN5	Enterobacteria_phage	5.5e-45	45.8
WP_054300593.1|17138_18380_-|portal	phage portal protein	Q6DMU2	Streptococcus_phage	2.7e-85	43.6
WP_054300392.1|18451_19513_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_081377377.1|19531_21214_-|terminase	terminase large subunit	A0A1P8DTK0	Proteus_phage	6.3e-138	46.0

4. NZ_CP013775

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	0 : 412	1	Yersinia_phage(100.0%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_2	4529 : 9747	4	Moraxella_phage(50.0%)	tail	NA
DBSCAN-SWA_3	14051 : 17555	3	unidentified_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_4	20828 : 23395	3	Enterobacterial_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_5	31072 : 35785	5	Staphylococcus_phage(50.0%)	transposase,tail,head	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP013775|0:412|DBSCAN-SWA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP013775|0:412|16_412_+|WP_016211139.1|DBSCAN-SWA
MPKMSFSVEGLRELEQKLKTLEPKKIRNLNRRALRKAAEPVEAQMKANAPQKSGALAESIKRRSKKGKGRRTIVNVTVGPARKIQYAIEQEYGSSHQPARPFIRPALNDNAQTSIDIFKNALTLALKKQKL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016211139.1|16_412_+	HK97 gp10 family phage protein	Q7Y404	Yersinia_phage	2.1e-07	40.7

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP013775|4529:9747|DBSCAN-SWA
TATGAGCTTAGTCGAGTCTGCCAAGATTTATCTATTTACCCTTGATTTAACGCCTTTACAGTCTTCAATAAAATATCACTTTTGTAACAGTCCGGATGGTAATCAAGCCGTACGCTTTGGCGGGGTGGAGTATCAGCCGATTCCGTTAAAAACGGATGGTTTTGAACGTACAACGATTCACCAGCCGACGCCCTCGATTGTGCTCGGCAATGTAAAACCTATTTTGTTACCCCTTTTAAAAGCCCATGATAATTTGCGCGGTGCGTTAATTCGTCGGGTGATGACCTACGTTAGGCATTTAGACGGCCACAGCGACCCGGATGCCAGTGCCACCTTGCCCGAACAAGTCTATGTGATTGAACGCAAATCCCAGCATAACAATTTAACCATTACCTTTGAGTTGGGCAGTAAATTACCGAGTGATTTAAAACTACCTAGGCGCACCCAGCTCGCCTCATGCTCCAAAATATATCGCCAATGGGATGAAGAACAACAAGCCTGGATCGCCGGCAGCTGCCCTTATGCCGCAGCTCAGTATTACAACGAATTTGGACAACAAACGACTGATAAAACAAAGGATCAATGTGGTAAAAAACTTTCAGACTGCATGGCGCGCTTCGGCAATGGACACGCTTTACCCTTTGAAGGCTTCGAGGGCATTAAACCATTTTAAAGCCTACGCGCTCGAGCAATATCCCAGGGAAGCCGTCGGGCTGATTTTACCGGCAGATCACTTTATGCCTTGCCCTAATTTATCCACCACACCCGAAGAGAATTTTTGCATAGACCCCGCTCAACTCATTGATACCCCAAGCGGTACGATACTGATGCATTCCCACCCCGACGGCAGTGTTGAGCCGTCATTAGCGGATATGGTCAGTCAACGTGACACCGGATTATTGTGGGGGATTGTTGCACTCAACCAGCATGCAGTGACCGATGCCATTGTTTTTGGTGAGCAGTTATTCACACAACAATTACTCGAGCGTCCCTTTTTGCATGGTGTTTTTGATTGCTATTCGTTGATCCGTGATTTTTATGCCGTTGAAAAAAAGATTTTTTTGCCTGATTTTCCGCGGCAACGTTCATGGTGGGAAATCGAAAAATATAATTTATATGAGCGTTATTTTACCGAGGCCGGTTTTATTGAAGTGGATAAAGCCACCTCACTTTGCCGCGGTGATGTGTTATTGATGCGCGTTGGTCGCACCACCTGCATTAATCATGGGGCGATTTATTTGGGTGAAGATTGTCGACTGAAAGAAGACCACAATACTGTCAGCTTGCCCGGGATGATTTTACATCATGTTTGTGACAACTTAAGCCGCCGTGAAATGTTGAGTGAGTGGCAAAAGCGTATTGCCAAGGTGGTCCGTTATGAAAACTAAAATTTATTTGCATGGACGTTTGGGCCGCATTTGCGGCTCTTTTTTTGAGCTAAATATTCATCATGCCCGTGAAGCACTTTATGCCTTATCAACACAATTACCCGAATTTAAAAAAATTATTCAAGCCGGTGAGTGGGCGATTTTTCGAAAGCGTCAATCACTGAACTTAGAACAATTAGAGTTAAATTGTGCCGGCGGTGAATTACATATTGTGCCCAAGCCGAAGGGGGCGAAAAATTCAGGGTTCACGCAGATTTTAATCGGTGCGGCTTTAATTACCGCCGGTTATTTTTCAGTCGGAACGGCATTGGCGCCGATTGCTGGAGGGCTTAGCGCCGCAGGTACAGGTCTTGTGATCAGTGGGGCGTTGACCATGCTTTCACCGCAGCCGAGTTATGATAATGATTACAGTACCACCGACCCAAATGCATCGACTTTATTTAGTGGTGTCGATAATGTTGCCGCGCCCGGGGCGCCGGTGCCACTCATTTATGGTGAGCACTTGGTGGGGAGTTCAGTGGTGTCGAGTCAGTATAAAACCTTATGAAAAAAATGATTCACGGCGCCGGCGGTGGTGGCGGTAAAGGTGGCGGTAGTACTCATACACCCACCGAAGCCCCTAATACGCTTTCAACCAATGCTGTCGTTACGTTAGTTGATTTACTCGGTGAAGGCGAGATTGAGGGTTTAGTGAATGGCGCTCAATCGGTATATTTTGATGATACCCCACTACAAAATGCCGACGGCTCTTACAATTTTGAAGGGGTGACTCTTAAAAGCAATAACGGTACACCCTCGCAAGATTATTTACCCGGGTTTGCCGAGTCAGCCAGTGAGGAGGCGTTTAATGTAAAAGTCACTCATGAGCAGCCGGTGATTCGCACGGTTGGCCGCCAAGAGACCAATGAACTGCGTGTTAAAATCGGCTTGGATGCGCTCACCGAGTATGCAAATAACGGTGATATTAACGGCTCTAGCGTGCATATTCGCATGTATTTAAATAACGTGCTGGTGGTTAATCATGAAATTACCGGCAAAACAACGAGTAAACTTGAGCAGACTTTTATTATTAAAATATCCCCTGGGTATTATATTGCAGACATTGAAACCTCGGATGTTGTTCTGGATAACCTTGACGAGTATTTCAGCTGGAAGCGGGCCGGTGCACATGCAATTACGAATAATTATTATAAACCCACCCATTTTACCTATCCTTACACCTTAAAAGTTGAACGTGTCACTGAAGATAGCGACTCGAGTCGGGTGCAAAATACCGTCTATTTAACCAGCATCACCGATGTGATTGATACAAAGCTTAGCTACCCTAATAGTGCGGTTGTTGGCTTGGAGTTTAGCGCTGCGCAATTTGGTAATCAGTTGCCGAAGCGCAGTTATTTAATCCGTGGCTTAAAAATTCAAGTGCCGAGTAATTACGATCCCAGTACGCGAGTTTATAGCGGAATTTGGGATGGCAGCTTTAAAACAGAATACTCGAATAATCCGGCCTGGGTATTTTATGACTTACTGACGAATCAGCGTTATGGTGCTGGTAACTATCTCGTTGAATCTGATGTAGACAAGTGGGAGCTGTATAGCATCGCCCAATATTGTGATGAATTGGTGCCGGATGGCCGTGGCGGCAAGCAACCACGCTTTTGCTGCAATTTAGCCATTAATAACCAAAACCAAGCCCTCAACATGATTACTCAGCTGACGTCTATTTTTCGTGGAATGGCCTACGATGCGGCGGGAACCATTCAATTTAGTCAAGACCGTCCGCGTGAACCGTCGATGTTAATTACACAAACCGATGTCGTGAACGGGCAATTTGATTATCAGACGAGCAGCATTAAAGAATTGCATTCGGTCTGTGTGGTCGCCTTTAGAAATCCAGATTTAAATTATTCCATTGATCAAGAAGTGGTGGAGGATGCCAGCCGCTTAGCGCGCTTAGGTGAGCGCCGCTTGGAAATTACTGCGGTCGGTTGCACCTCCCGATCTCAAGCGATGCGCCAAGGGCTTTGGGCACTGCAATCGGAGGCACAGAGTGACATGATAAGCTACAAAGCCACGCAAGACCACATTCATTCACTGCCGAGCGATATTGTTAAAATCTTTGACCCCAATATGGATCAGGAAGAAGGGGCGGCCGGTGTCATTACCGCGGTGACTGATAATGTGGTTACTTTAGATCGTGAGGTCAGTTTATCCAGTCAAAACACCCTGATGATTTTTTCAGCGGAGCAAGGGATTGAAGAATACACAGTGATTGGTGCACCCGGGTCTAGAAGGCTGGAAATAGACCGCACCATCATCGCTGATGTAGGCACACGCTGGGTATTGTATCATGCCACTCCACCCAAACAGTGGCGCATTACGGCCATCACTGAAGAAGACGACGGCACCTATACCGTGAATGCCATCGCCCATGACCCGGATAAATATCAAAAAATCGACGAAGAGCGGGCGCTAGGCGTCAGTAAAGAAAATACCGCTATTCCAAGCTTAAAAGCACCGAGTAATTACCGCGTTGAACAAAGCGTAAGTTATCACGGCGGCATCGCCGAAGCGGTCTTGATTGTTGCCTTTGATGGCGATCCAAATGCGGCGTATTACGAGTATCAAGTGCGTAGCAATGACGGTAATTATTCCGACGTTAAAACCACCCATTTAAATCATATTGAGTTCAGTAGCACAGGTGCAACCTACACGTTTCGAGTGCGTGCGATGGGCTGGTTTGGGCAACGTAGCCATTATTCAACATACCACTGTAGCGCATCGCTGGAGCAGCAGATTCCTCAGAATGTCAGCCGTTTTGTCTCCTCGTATAGCGATAAAATCGCCGTTTTAGAATGGGCGAAAAATCCAGAGTTGTATGTTAAACACTACGAGATCAGGCACGGCACCGCTTGGGAAAACTCCATTTTAATTGCAGAACTTAATAGCACTACACTGCATCTAACACAGGCCAGACCTGGCTTTTATTTGATTAAAGCGGTGAGTCAATGGGGGATTAAATCAGCTGAAGCGAGTGTGTTAGAACTGACTGATTTAACGCCGTTAAATATTATTCAAGAATATGATTATGCCGCTAATGATTGGCCGGGTGAGTTTCATCACACCGCGGTTAATAATAATAACCATATTCGTTTATTTTCATACTACTCTTGGGGCGGTATGACTCAATCCTGGGAGGATTATAGTGACAGTTGGGAAAACACCAAAAGCGGAACCTTAGCGACGGACATTAGTGAAGGATACTACCTGAGTGCTGTTTATGATCTAGGTAAAATCATGCGCTGCCGTGTCTATGCGGATATGCAAATCAGTCAAAGCAATGATGATTTATCCTTTGATAATATGCAGAACGCGTGGAGCCATTACACGCTAGAAAATAATTGGTCGTGGTTAGGATCACCGGAAGCCTGTGGCTTTGAAGTGCAATGTTCAACGTCAGAGGATAATCAAAACTGGACGGAGTTTATACCGCTCACCGCATCCTTTAGGCATTTTCGTTATGCTCGATTTAAAGTCATTTTAAAACGCTTTGATGCGCAATATACCCCGGAATTGCAAGAATTAATATGCACCTTTGATGTGCCGGAAACCGTGTATAACGTTGATAATTTTCCGGTCAGTGCAGCCGGTTCTACCTATGTTTTCCCCGAACCGATGCAGCAAAAAGTCATTGTGATTGCGACCATTCAAAGCGGCGCGGCGGGGGATCAAGTGCAGATCAATAAAAGTTTAACTCAAGCGACCGTCAATATTTTTGATAAAGACGGCACAGCAAAAACAGGCGAAGTCGATTTATATATAGGAGGGCATTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP013775|4529:9747|5169_5916_+|WP_032126911.1|DBSCAN-SWA
MKASRALNHFKAYALEQYPREAVGLILPADHFMPCPNLSTTPEENFCIDPAQLIDTPSGTILMHSHPDGSVEPSLADMVSQRDTGLLWGIVALNQHAVTDAIVFGEQLFTQQLLERPFLHGVFDCYSLIRDFYAVEKKIFLPDFPRQRSWWEIEKYNLYERYFTEAGFIEVDKATSLCRGDVLLMRVGRTTCINHGAIYLGEDCRLKEDHNTVSLPGMILHHVCDNLSRREMLSEWQKRIAKVVRYEN
>NZ_CP013775|4529:9747|6459_9747_+|WP_054300695.1|DBSCAN-SWA
MKKMIHGAGGGGGKGGGSTHTPTEAPNTLSTNAVVTLVDLLGEGEIEGLVNGAQSVYFDDTPLQNADGSYNFEGVTLKSNNGTPSQDYLPGFAESASEEAFNVKVTHEQPVIRTVGRQETNELRVKIGLDALTEYANNGDINGSSVHIRMYLNNVLVVNHEITGKTTSKLEQTFIIKISPGYYIADIETSDVVLDNLDEYFSWKRAGAHAITNNYYKPTHFTYPYTLKVERVTEDSDSSRVQNTVYLTSITDVIDTKLSYPNSAVVGLEFSAAQFGNQLPKRSYLIRGLKIQVPSNYDPSTRVYSGIWDGSFKTEYSNNPAWVFYDLLTNQRYGAGNYLVESDVDKWELYSIAQYCDELVPDGRGGKQPRFCCNLAINNQNQALNMITQLTSIFRGMAYDAAGTIQFSQDRPREPSMLITQTDVVNGQFDYQTSSIKELHSVCVVAFRNPDLNYSIDQEVVEDASRLARLGERRLEITAVGCTSRSQAMRQGLWALQSEAQSDMISYKATQDHIHSLPSDIVKIFDPNMDQEEGAAGVITAVTDNVVTLDREVSLSSQNTLMIFSAEQGIEEYTVIGAPGSRRLEIDRTIIADVGTRWVLYHATPPKQWRITAITEEDDGTYTVNAIAHDPDKYQKIDEERALGVSKENTAIPSLKAPSNYRVEQSVSYHGGIAEAVLIVAFDGDPNAAYYEYQVRSNDGNYSDVKTTHLNHIEFSSTGATYTFRVRAMGWFGQRSHYSTYHCSASLEQQIPQNVSRFVSSYSDKIAVLEWAKNPELYVKHYEIRHGTAWENSILIAELNSTTLHLTQARPGFYLIKAVSQWGIKSAEASVLELTDLTPLNIIQEYDYAANDWPGEFHHTAVNNNNHIRLFSYYSWGGMTQSWEDYSDSWENTKSGTLATDISEGYYLSAVYDLGKIMRCRVYADMQISQSNDDLSFDNMQNAWSHYTLENNWSWLGSPEACGFEVQCSTSEDNQNWTEFIPLTASFRHFRYARFKVILKRFDAQYTPELQELICTFDVPETVYNVDNFPVSAAGSTYVFPEPMQQKVIVIATIQSGAAGDQVQINKSLTQATVNIFDKDGTAKTGEVDLYIGGH
>NZ_CP013775|4529:9747|4529_5201_+|WP_016210666.1|tail|DBSCAN-SWA
MSLVESAKIYLFTLDLTPLQSSIKYHFCNSPDGNQAVRFGGVEYQPIPLKTDGFERTTIHQPTPSIVLGNVKPILLPLLKAHDNLRGALIRRVMTYVRHLDGHSDPDASATLPEQVYVIERKSQHNNLTITFELGSKLPSDLKLPRRTQLASCSKIYRQWDEEQQAWIAGSCPYAAAQYYNEFGQQTTDKTKDQCGKKLSDCMARFGNGHALPFEGFEGIKPF
>NZ_CP013775|4529:9747|5905_6463_+|WP_054300696.1|tail|DBSCAN-SWA
MKTKIYLHGRLGRICGSFFELNIHHAREALYALSTQLPEFKKIIQAGEWAIFRKRQSLNLEQLELNCAGGELHIVPKPKGAKNSGFTQILIGAALITAGYFSVGTALAPIAGGLSAAGTGLVISGALTMLSPQPSYDNDYSTTDPNASTLFSGVDNVAAPGAPVPLIYGEHLVGSSVVSSQYKTL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016210666.1|4529_5201_+|tail	phage minor tail protein L	A0A2I6PHT9	Pseudomonas_phage	3.0e-27	32.7
WP_032126911.1|5169_5916_+	hypothetical protein	A0A0R6PHF9	Moraxella_phage	1.7e-42	42.9
WP_054300696.1|5905_6463_+|tail	tail assembly protein	K7PGY0	Enterobacteria_phage	1.3e-20	36.2
WP_054300695.1|6459_9747_+	host specificity protein J	A0A0R6PIC0	Moraxella_phage	5.2e-112	33.2

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP013775|14051:17555|DBSCAN-SWA
GATGGTTTATTGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGTGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGTCAAGCTTTTCGACAAATTTCAGAGGAGGCAAAAATGTTGATCCATCAACGGTTAAGCACCCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAGGAACTTATACGAGAGCATGATATCCAGGTGAGTGAAAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCAGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCGGGAAAACCTTATAAGAAAAAGGTGAATCGTGGTGATCAAATAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACACCGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGCGATCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACCTCTGACAATGGAACAGAGTTTGCGGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAGCACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACAGATTTTAATGAAATTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATTGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGTTATCATTTAGAAAAAATTCAACCATAACTGACTGACTCTAAGTCAAAAAGGCGCTCCCTGTGCAAGCAACTTTATTGTTGCACTAAGGAGGGCTTATATCCTGACTTAGGTGAAAGTCAGAATTCTTTGCTTATACCGACAGCTCGCCATCGTGGAAGAACAGCTAATCTACCAGCTATTTTGTCTTTTTTCTTGTGGCTTAGCCATATTGACTTTTAAGTTACGGCCACCAGAGTCTTTCCCATCAAGCTCAAGAGCTGCTTGCGCTTGTTCCTGAGTTTGAAACTCAACAAATGCAAATCCTTTTGAGCGACCCGTATCACGATCAGTAATCACTCTTGCGCTAATCACTTCACCGTACTTTGAAAACATCTCTACTAGGTCGCGGTCTTCAACAGAATATGTCAAATTCCCTACATATAATTTCTTCATAAAAAATCAGTCTCACTAAATCATTCTTAAGTTGCCGTGTTCACACCCGGCTATAAATCGACTCTAAGGCCCAGCTCCATGTTGAAGATTGAATTTCATCCAAACATAGATGGTGCATATTAACATAAGCAGCCATTCTCAGATAGTTTTGTGGTAACTACACTGAACCGTAATATGCTGATGGCATACATAACATAGAACGAGTTACCCTCTAGTCGTTTTATAGCTGTAATCGTAGCTCGTCGCACCATCCTCTTGCTCTCCCACCCACTCATCAAATGCCTCCCCAACCGCTTCTTTAGCTTTTAAGATATTTGAGTGCATCTCTTCAAATTCAACACAAAGTGTCTTTTCTGGGTAGATTAAATCAAATGTATGCAAGTAACCTGTCGTTTTACCTTATTTTTTCCTGTGTGTTGTTTTTTTAATTCCCTAAATCACTCTAATATTACAAAGGTCACTATGTTTGCAGAATCAGCGTAAATAAACAAATTTACTTTAAGCTACCCCTCAAAAACTAACCATCCCATTTGGTCGGGTAAATGTTGGCGCTATCGCACTTAAAATGCCTATTACTTTATCATAAAGTATATCCCCCGCCCTCCTTCTCTATATACACACCTTTCTAGATTGATTCACAACTTAATATAGGTACAAATATAAGAACAGATATAGGTACATATATAGATTGTGTGCTTATATCTTATTTAAAATAGTCGATAAAAATCAGCAGGCGAGACTTAAAATTTCATCTGATTATCTAATAAATTCAACTATATTATTGCAACTTACATATATAGGAACAAATATAGGAACATAAATATAAATCAAACTAAATATGGGAACATATATTAATACTAATATAGGAACAATTTAATAAGTATTCGCTAGACCGCTAATGTTCTGTCTACAAAATAAAATGAAAAACACAAAAACACCTAAACTCTAACAAAAGTTGTTAAACTTTGCTTTGTAGATACATTATCTTAAAAAATATTGCCGGTTTTCAATAATTAGTTTAAATTAAAGGTATAACAAATGCTATTTTTTTAAAAAGGTTAGAATAAATGGATATTGACCCAAAAATCACAGCTAAAGAAGTTGCGTCTTTTCTCGGTCTTACAGTTCAAGCAGTGCATAAAAGAATAAAAGTAAAAGGTGCAAAAGAAAAAAAGGCACAAAATAGAATTTATTTCGGACATGATACAGCTAGAGAGATAATCGAACCTAAAGTAAAACAGTTTAAAATAGCTACTGCTGTTGTTAAAGGTGGAGTAGGGAAAACTACCTTAGCTGAAGCATTGGCTATTCGTACCGCTTTATACGGACTTAGAGTTTTATGTATCGATATTGACCAGCAAGCAAATTTAACAAAAGGCTTGGGTATGGATAAGCAGGCCAAAGAATGCCCTGTCATGATTGATTTAATTGAGGGTAAAGCATCGCCAGAAGATTCTATATTATCAGTAATACCAGGTCTTGATCTTGTTCCTAGTCGTTTAGATAATGTTACACTAGACGGTTATATGATGTTAAATAGAGTTAATCCATCATTTATATTTAATAAACTTTTCGGTAATGTCTTTAAAAATTATGATTTGATTATTTTTGATTGCCCTCCAACTTTAGGCTCTACTGTTTGTGCAGCAATGTTATGCTCAGACTTAGTGATAGCCCCAATAAACCCTGATGTATATTCCTATGAAGGTATAGAGATTATGGGTAAAGAAATAGAAAACATTTATGGGCAATTTAATACAAAAGTGAATTGGAAAATTTTGCTTAATAAATTTGATTCAAGAACAATTCTATCAACAGACTATATTAGTCAATTACTAAAAGACCCTTCTTTTTCTTCAAAGCTGTTTAAAAGTATTGTAAGAACTAGTCAAGAATTCCCCAACATGAAGAAAAAAGAGAAAACAATTTTTGACTCACTTAGAAAATCAACTGCAAAAGAAGATATTGATGCTTTAGCCAAAGAAGTTATAGGGATGATGCAAATAAATAAAAATGACGCTACAAATAGCACTTCACTCAAAGAGCCCACTGTAGTGTAG

Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP013775|14051:17555|15231_15495_-|WP_054300690.1|DBSCAN-SWA
MKKLYVGNLTYSVEDRDLVEMFSKYGEVISARVITDRDTGRSKGFAFVEFQTQEQAQAALELDGKDSGGRNLKVNMAKPQEKRQNSW
>NZ_CP013775|14051:17555|16562_17555_+|WP_054300689.1|DBSCAN-SWA
MDIDPKITAKEVASFLGLTVQAVHKRIKVKGAKEKKAQNRIYFGHDTAREIIEPKVKQFKIATAVVKGGVGKTTLAEALAIRTALYGLRVLCIDIDQQANLTKGLGMDKQAKECPVMIDLIEGKASPEDSILSVIPGLDLVPSRLDNVTLDGYMMLNRVNPSFIFNKLFGNVFKNYDLIIFDCPPTLGSTVCAAMLCSDLVIAPINPDVYSYEGIEIMGKEIENIYGQFNTKVNWKILLNKFDSRTILSTDYISQLLKDPSFSSKLFKSIVRTSQEFPNMKKKEKTIFDSLRKSTAKEDIDALAKEVIGMMQINKNDATNSTSLKEPTVV
>NZ_CP013775|14051:17555|14051_15026_+|WP_054300276.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVYWHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEISDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYCSPNHVFLEYLMAA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_054300276.1|14051_15026_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	2.4e-25	30.8
WP_054300690.1|15231_15495_-	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300689.1|16562_17555_+	ParA family protein	A0A1X9I765	Streptococcus_phage	1.7e-10	28.9

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP013775|20828:23395|DBSCAN-SWA
AATGCTTAAATACAAAGGTTATATTGGAAAAGTTGAAGAGATTCATGAAGGTGATGAATATATTTATGGGATTGTTCCAAATATTAAAGATGTTATTTCTTTTAGAGGTAAAAATATAAAAGAGTTAACGAAAGACTTTAAGCTGGCTATTGATGATTATTTGGCTTTATGTGATGAGCGTGAAGAAGAACCCGATAAACCATTTTCTGGTAGATTTATGACTAGATTAGGTGGTGATTTGCATGAAGAGGTTTTTTTAGCTTCTATGAATGATTCAGGTGCAAAATCAATGAATGATTGGGTTGTATCTGCATGCTTGGAAAAGTTAAAGCATGATCAAACCGTTAAACGGTGAATTATGTTATGTACAGCTATTAAGAAGTTATGTTTTTGCATTTTTCTTATAAATAAGATAAAACCCTTTTGTTTGGAATTACTTACATTAGGGAATGTTACCCATGTCAAAAAAAATTTATAAAGACGACTGTCAAGAACGACTTGATACACTTCAGAAAATATTTGATCAACAGAGTTTAAAATTTATAACAGATAAGCTTGATAAGAAAAATTTAAAGTTGCTTGAGTTAGGGTGTAGAGGTAATTGTGACTTAATTATCGCACTTGCAAATAAATACCCCAATCTGATCGAGTACACTGGGATTGATGATAATCCAAAGTTTATAAAACAAGCTGAAAAACGCTTAAGTGATATTCCGTTAAAGTCTTTAAAATTAACTCATGCAATGATAACAGATGTTAGTGGTCTTGGGTTTGATCTTTATGATGTAATTTATAGCCGCCTTTATTTTATGTATATTCAAAATTATGTAGAGGCTTTAAAACAAGTTTTAAATCAACTAAAAGTAGGCGGCATTATTATTTGTGAAGAGCCAGATTTAAGAACAAACTTTTGTAACCCTGCGCATGTCGCTTATGATGAATTTCTTAATTTATTTGGAGCTTTAGGTAAAGTTAAAAAAATGAACTTTAAAATTGGCTCTGAGCTACATACAAATTTTCTAGAGCTAGGGTTGAAAATTACTGATATTCAATTTTCTCAGCCGGTTTTAATGGATGAAGAGAGAAAGCGCTTTATGGACCTCAGTATGACAGCTGCTCGTAATGATTGCATTGAGTATGGGTTAATTACGCCGGAAAGATTTGATGTAATGATAAACTCGTTAAAAAGGCTTTCAGCTGATGAGCGCTACTATTTTGCTATAGCACGTCAAACCCATATTTCTGCAATCAAAGCTTAAAAAGAGTCGAGCAAGCCTAAAGATTTTGCTTTCATTACAGTATGTAGCTTATTTTTGCAAAGCAATCGCTTTTGAGCTGAGGCGAGATATTTTTCTACCACACGGGGAGTTACCCCGATCGCTTTTGAGGTGTCTTTAGCTGTAGAACTTTAGATCTAATCTGACACTTGGGCCATATTGAACTAAATTTTCAATATGGATAATTAATCACACAAGGAGTGTTGTGATGACAAGTTTATCAGAAAAAATAATTAAGCCTAAACTAGGAGTTTTAGAATTAGCTAAACAATTAGGTAATGTTTCTAAGGCATGCGAAGTGATGGGGTATTCTCGAGATAGTTTTTATCGCTTCAAAAAGCTTTATGAAACGGGTGGCGAAGAAGCTTTGCAAGAGATTAGCAAGAAGAGGCCAAATGTGAAAAACCGTGTTCCTGAGCATATTGAGCAGGCAGTCATTGATTTAGCCATTGAAAACCCAGCGTTAGGTCAACTCCGTGCATCAAACGAACTGTTACAGAGAGGGGTCATAGTATCGAGTAGTGGTGTGCGATCAGTCTGGTTAAGGAATGGCCTTGAGACGTTCAAGAAGAGGCTCAAAGCGCTTGAAGCCAAATCAGCACAAGATGGAATTTTGCTGACGGAAGAGCAACTGCAAGCACTTGAGAAAGCAAAACAAGAAAAAGAAGCACATGGAGAAATTGAGACTGAACACCCAGGCTATCTCGGCTCCCAAGACACCTATTACGTTGGAACAATGAAAGGTGTTGGAAGAATTTATCAGCAGACATTTGTTGATACCTACAGCAGGGTTGCATTTGCTTGCCTGTATACCGAAAAAAATGCAGTGACGGCAGCTCATGCGCTGAATGAAAGTGTAATCCCCTGGTTTGAAGAGCGAGATACTCCATTGCTACGCATTTTAACTGATCGGGGAACAGAGTATTGCGGCAAGATAGAACATCACGCTTATCAGCTTTATTTAGCGATCGAAGATGTAGATCACACCAGAACAAAAGCCCGTTCACCTCAAACAAATGGTATTTGTGAACGCTTTCATCGCACGATGAAACAAGAGTTTTATGACATTGCTTTTCGTAAAAAAGTCTATAATTCACTTGAGGAGCTGCAAGTTGATGTTGATGAGTGGTTGATAAAGTACAATCAGCATCGGCCACATTCTGGGAAATACTGTTATGGAAAAACACCAATGCAAACATTTCAGGACTCAAAACATTTAGCACAAGAAAAAATAATCAATAAAAATGTGCAATCTGACAGTCTGATCAATCAGACAAATGTTGTCAGATGA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP013775|20828:23395|21276_22086_+|WP_081007088.1|DBSCAN-SWA
MLPMSKKIYKDDCQERLDTLQKIFDQQSLKFITDKLDKKNLKLLELGCRGNCDLIIALANKYPNLIEYTGIDDNPKFIKQAEKRLSDIPLKSLKLTHAMITDVSGLGFDLYDVIYSRLYFMYIQNYVEALKQVLNQLKVGGIIICEEPDLRTNFCNPAHVAYDEFLNLFGALGKVKKMNFKIGSELHTNFLELGLKITDIQFSQPVLMDEERKRFMDLSMTAARNDCIEYGLITPERFDVMINSLKRLSADERYYFAIARQTHISAIKA
>NZ_CP013775|20828:23395|22312_23395_+|WP_054300162.1|transposase|DBSCAN-SWA
MTSLSEKIIKPKLGVLELAKQLGNVSKACEVMGYSRDSFYRFKKLYETGGEEALQEISKKRPNVKNRVPEHIEQAVIDLAIENPALGQLRASNELLQRGVIVSSSGVRSVWLRNGLETFKKRLKALEAKSAQDGILLTEEQLQALEKAKQEKEAHGEIETEHPGYLGSQDTYYVGTMKGVGRIYQQTFVDTYSRVAFACLYTEKNAVTAAHALNESVIPWFEERDTPLLRILTDRGTEYCGKIEHHAYQLYLAIEDVDHTRTKARSPQTNGICERFHRTMKQEFYDIAFRKKVYNSLEELQVDVDEWLIKYNQHRPHSGKYCYGKTPMQTFQDSKHLAQEKIINKNVQSDSLINQTNVVR
>NZ_CP013775|20828:23395|20828_21182_+|WP_054300685.1|DBSCAN-SWA
MLKYKGYIGKVEEIHEGDEYIYGIVPNIKDVISFRGKNIKELTKDFKLAIDDYLALCDEREEEPDKPFSGRFMTRLGGDLHEEVFLASMNDSGAKSMNDWVVSACLEKLKHDQTVKR

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_054300685.1|20828_21182_+	type II toxin-antitoxin system HicB family antitoxin	K7PJX6	Enterobacterial_phage	8.5e-13	34.8
WP_081007088.1|21276_22086_+	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300162.1|22312_23395_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP013775|31072:35785|DBSCAN-SWA
CATGTCCATTGTTCGAATTCATAGAAAAGAGAAAGATTTTGTTGTACTTGATAAACAGTTTTTAAATGACGAAGGTTTATCTTTTCGTGCTAAAGGGGTGTTGTCTTATTTGTTGTCTTTGCCTGACGATTGGAAAGTGTCGAGATCACATCTTGCAAAAATATCTCAGGATGGGCCGACCTCAGTTAATTCTACTCTGAAGGAGTTAAAAGAGGCGGGATATATTTTACTTATTTCAGAGCGCGAAAATGGAAAAATATCGGGCTATGATTACCTTGTCTTTGAGACGAAAGCGCTTGCAGATGCTTATTTGTCCTCTTCTACCCATACAGATGTTAGTCAACCAACTAAAACGGCCCAAGGTGCTGAGCAAGAAGGAGATGAGCTGCGAGTGGGCAAGCTGTTAGCAGTAAAGCAGCTAGCGGTAAAAAGCCCCCTACTAAATAATAAGGGTACTAAGAACGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTACTCTATACTAAGCCGCCATCAAATACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCAATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTGTTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAATTTCATTAAAATCTGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGCTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCCGCAAACTCTGTTCCATTGTCAGAGGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATATAGCGCTCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGCGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCAAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCGATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTAACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCACTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTAGCATTGCAATAACCTTCAACCATCATTGGTGCGATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCTATAAAGTTAATTCGTATTGATTTTTTACCTGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGGCCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTCTCGACTTTTTCCAGGAAAGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAATTTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGAGTTTTACCCGGATTCTGATCAATAAATTTTTGAAATTCTTTCATATCACTGATTTTATGGTTATAGCCCGTTTGGTAGCCAAACCTTGCTTTGACGTCTCCTGTATGATCACGCCTATTTTTCCAACGATGCAGGGTATCTCGACTGATTTTTAAGAGCTTGGAAACTTGTGTAATAAGTATCCCTTCATCAATCATTTTTAGTGCTCGAATTCTTAAGTCATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATAGTATGTCAGAAACTGTTGATCGAGCGCTATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGATCGCGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGGTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTATTTGATCACCACGATTCACCTTTTTCTTATAAGGTTTTCCCGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTTTCACTCACCTGGATATCATGCTCTCGTATAAGTTCCTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGGGTGCTTAACCGTTGATGGATCAACATTTTTGCCTCCTCTGAAATTTGTCGAAAAGCTTGACCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCACAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAACCATCTCTACCCTCTAAGTCAAAAGGCGAACTAGAGAGTTTATCTGTATGAATATGAACTCTCTACTGAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGGTAAACGTGTGAATACCTCGGACTTTATGGACACCCTCGCCGCCGGGAAATGTGCCGCCTTGTTCGGTGATTTTTCTAATTTTATTATTGCTGATCGTGGGGGTATTTCGCTGCGTCGATTGAACGAGCTTTATGCTGAAACCGGTGAAGTTGGTTATTTAATGTGGTTGCGTGTGGATGCCTTATTGCTTGAGACAGAGGCAATTAAACAACTTAAAACAGCTGTATCTTAAAAAATTAATAAAAATTAGATGCTTTATTTATTAATAAATAAACTTTATATAATTAATTAATATACTATTTTTATTTATAAAATATTACCATGGCATTAATACATTTAAGGTATTATTGCCATGAATGCAAATCAGTTACTCGCAATTGGTGCTGCCTTAGTCACAGCAGTTCGCCGAAATATTAAATATTCAGAAAACCTTTATTTGTTGACAGGAAATTCTTTTTTTGATGAAAGATATAAAAAAGTATACTCGATTAGAGAAGGGATTAATGCTACTAGTGGTAAAATTGATGAGCAAGCTCCCTCAGCATACGCAAAAAGAGCATTAGATCATAGAGTTGGTTTTTGTAGTGAACTAAGTGAAGTTAGTACTTTCTTAGGCTCAATGTTAAATAAATTTGAAGCACCTGTTTATATATCAGTAATTAAAACTCCTCTTCATGCCTTTTGCTTAATTCATCAATCATCAAGTTTGCACCAACAAACAAAATCAAATGTTTATATTTCTGATAATATAAAAGAGCTTAGTGAGAAAACAGAACTAGAAAATGCAATTATCGTTGATACCTGGATTTATAAGGCAACCAAACTTTCCAATTATAAAAGCCATATAAACTATGCAAAAGAATTTGGAAAACAGTTTGATCTTGAAGAGTGTTTTGATGGTGAAATTAAAACAGAAGGCTATTCTGAAGCGTTTGGTACAACTCAACCTATAAAAATCGCAGAAAAAAGACTGTTAAGGGATTTTAATCTAGCTTACCAAGAAGAGAGCAGAAAGCTCTTTACTAAAGAGACATATTCTACCCAAGGTCGTAGACGTAACTCTATCGATACTAATCTAATTTGTGATAGCAAACGATGGGGGCAGTTGAAAGACCTTAAGCTATTTATTGAAAGAATAGCTTCAAAATCGAGTGATTGGTATTCTAGCTCTAGTAATCGAAAAGGTAAGAGCTATCAAGCACTAATAGATAGTTTGGACTTTGCTATCCAAAAATATATGGACATTAGTAATACCGATTTACAAGAAATTTTTAATCGAGCATTGCAGTTAGCACCTATAGTTCGAGGAACGTCTTCCTTTAAAAATCTTTGGGGTTATAGAAATCATATTACAAAAACAACTGAAGGGTTACTCAGTACAGATGTTGTACCAGAAGAATATTATAAATTTGAAACTCTACCACAGATGAATCTTTTTGAAATAAGGAACATTAGGTCTCGCCCAATATCTCAAAATGAAAAATGTACAGCCTTAATCCAATGGATAAAAAAAGAAGGTGCGGATCCTTCTTTTTATAGTGATGCGCAAAAAGCGGCTGCTTATAAAGCAGTCGATGATTTTGTCAGTCGCAGCCAAGGAGAAGCAAGCTTGTTATTTTATGACAGAGCGGAGGAAGCACCCCCTCTGGCAGCAGAAGCTTCAGCAGCATCATTTAAATCGTTTTAATTCACATTTAAATCAAATTTAAAAGTAAAAGGGACTTTATGAAAGTTAAAATCTTAGTGCCTCGGGCCGGGATAAATATTTCTTATAATATCGGCGATATTATTGATTTACCCGACAAAACCGCAAAAGCCATGATGAAGCACGGTGATGCTGAGGCAGTTAACGTTAAAACATCGAAGAAAAAACCAAAATGATCGATTTAGCACGCCTAAAAAGCCATCTACGCATCGAAGATAATAACGAAGATGATTATTTAGCGTTTATTCTTGCCGCTGCCCTACAAGCCGCCGAGGACTATCTAGACCGTGCAATTGTAAATAATACAAATGACTTAGAAACGATTGAAAACAGTGTGTTAATTAATAAATCGATAGAAATTGCCATCTTAATGTCTGCCGGTCACTTTTATGAAAACCGTGAATCAACGAGTACTTTAACGGTGAAAGAGGTGCCGATGAGTACCCATTTTTTACTCAATCCACATCGGCATTTAAGCGCATGA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP013775|31072:35785|31909_32796_-|WP_155046942.1|transposase|DBSCAN-SWA
MPSPYSYDLRIRALKMIDEGILITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
>NZ_CP013775|31072:35785|31072_31573_+|WP_054300681.1|DBSCAN-SWA
MSIVRIHRKEKDFVVLDKQFLNDEGLSFRAKGVLSYLLSLPDDWKVSRSHLAKISQDGPTSVNSTLKELKEAGYILLISERENGKISGYDYLVFETKALADAYLSSSTHTDVSQPTKTAQGAEQEGDELRVGKLLAVKQLAVKSPLLNNKGTKNALRHLKCNTTLY
>NZ_CP013775|31072:35785|35473_35785_+|WP_016211137.1|head,tail|DBSCAN-SWA
MIDLARLKSHLRIEDNNEDDYLAFILAAALQAAEDYLDRAIVNNTNDLETIENSVLINKSIEIAILMSAGHFYENRESTSTLTVKEVPMSTHFLLNPHRHLSA
>NZ_CP013775|31072:35785|33948_35283_+|WP_016211133.1|DBSCAN-SWA
MNANQLLAIGAALVTAVRRNIKYSENLYLLTGNSFFDERYKKVYSIREGINATSGKIDEQAPSAYAKRALDHRVGFCSELSEVSTFLGSMLNKFEAPVYISVIKTPLHAFCLIHQSSSLHQQTKSNVYISDNIKELSEKTELENAIIVDTWIYKATKLSNYKSHINYAKEFGKQFDLEECFDGEIKTEGYSEAFGTTQPIKIAEKRLLRDFNLAYQEESRKLFTKETYSTQGRRRNSIDTNLICDSKRWGQLKDLKLFIERIASKSSDWYSSSSNRKGKSYQALIDSLDFAIQKYMDISNTDLQEIFNRALQLAPIVRGTSSFKNLWGYRNHITKTTEGLLSTDVVPEEYYKFETLPQMNLFEIRNIRSRPISQNEKCTALIQWIKKEGADPSFYSDAQKAAAYKAVDDFVSRSQGEASLLFYDRAEEAPPLAAEASAASFKSF
>NZ_CP013775|31072:35785|32822_33503_-|WP_054300680.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVIALDQQFLTYYQ

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_054300681.1|31072_31573_+	hypothetical protein	A0A1W6JQ30	Staphylococcus_phage	8.1e-17	42.7
WP_155046942.1|31909_32796_-|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	2.6e-10	22.8
WP_054300680.1|32822_33503_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.0e-09	31.0
WP_016211133.1|33948_35283_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211137.1|35473_35785_+|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	A0A2H4J711	uncultured_Caudovirales_phage	1.1e-08	34.7