Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017270 | Geosporobacter ferrireducens strain IRF9 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP017269 | Geosporobacter ferrireducens strain IRF9 chromosome, complete genome | 5 crisprs | cas3,DEDDh,DinG,WYL,csa3,cas6,cas8b2,cas7,cas5,cas4,cas1,cas2,cas14k | 0 | 4 | 7 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017269_1 | 420770-420921 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017269_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP017269_1
>1.1|420817|58|NZ_CP017269|CRISPRCasFinder AGTGTTGATATTCTGTAATTGTGGATTGTTTGGAGGAATTGGCGGTGTCGGTGGTATC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017269_1
The CRISPR arrays of NZ_CP017269_1 >merge|NZ_CP017269|1|420770-420921|CRISPRCasFinder GGTGGTATTGGCGATAACACATCATTGTTATTCTTCTTCCTATTGCTAGTGTTGATATTCTGTAATTGTGGATTGTTTGGAGGAATTGGCGGTGTCGGTGGTATCGGTGGTATCGGCGATAACACATCATTGTTATTCTTCTTCCTATTGCT >NZ_CP017269|1|1|420770-420921|CRISPRCasFinder GGTGGTATTGGCGATAACACATCATTGTTATTCTTCTTCCTATTGCT AGTGTTGATATTCTGTAATTGTGGATTGTTTGGAGGAATTGGCGGTGTCGGTGGTATC GGTGGTATCGGCGATAACACATCATTGTTATTCTTCTTCCTATTGCT
>NZ_CP017269.1|WP_069974073.1|419612_420509_-|divergent-polysaccharide-deacetylase-family-protein MRIKKLLTGIGGFLLIVFTYLALNHVTLLNVQLGGIIDSVEKAEILEEIKGYGALQGGARLFRVEEDKKYRAKVAFLIDDFGNNGEGTAEMMTIDRPMTFAIMPFMKYSKRDAENAHKKGYEVIVHLPMETRKNSVRGLSAGAIKTSQTDDEIKSFVINAFKDVPYAVGANNHMGVLASSDRRVVNAVVSVLKKKDKYIVDSKTTPKSVISEVARAHEVPVIEMSVFLDNEKAPETIKRQINLLAYSALKRGYAIGIGHVGPLGGSNTAKMIKEMIPELEKRGIKIVFVSELMRDKYK >NZ_CP017269.1|WP_069974072.1|418588_419569_+|hypothetical-protein MANTNKSPQVSLALPDRCCTAETGCHFDGSLRNVVSEPIYVQKVYDAALFNLQGLTTVTGQPFTPALGAGARILRILDIRCRKFFNPANINDPRNLVATPTTTVAGAEFVQDGCGRPVTVIGPDGTASENLLFADTEECDELGKGTPIFGTQIIEITGNVIVEIDVVIADHKKCEKTVTLSANVPIAKEGAPLILTNFFELCIPSVFDTAFLPRFTEFCNISCETRLATNSITRDIVIDPNTGAVRANLIIALCVTCEKKIVVPVQLCVLSTGFPVLQADVSPICTTFPQLFPDQIDKKRRPCPPRKWSEDVVTEATEAAEEASIE >NZ_CP017269.1|WP_069974071.1|417091_418348_-|hypothetical-protein MSFANQKNALVTDQAGNIHSFRWDNEKIIYACFYKHTKKMEKEILVEACMPEFDVIIDKKDTIYLTCQQKEGKLLLFIYRLGIWEREVLLSSEGINIYNLSVISWKDGLYIFYCVPSFESNKVYRIYYLYRKDEIWRNAELGDIRVKTLLNPLQVLSTSQGLILGYYNLVNGAEQLFIKLYDGTLDLWRDTLQVTDGLNDKLYIDILLVEEEELNIVYSEYIDGNLVVKYEKYKMAGNKLIKKSEYELSNPGNCSYPTLIMFDNMLWTVWTEYDYVASSFSEDNGMTWSVPYQWTESKEGIFVRYKYCLNPRNSDRSYLLNYSYGKDFPDFTFLGFGSFEKAVEMPLITKKKREEEVEEILSIPENQENDLVEVNHEIIEQENLIGIKEKLLELEDRIEQIENFINRRRRGFLFPPRE >NZ_CP017269.1|WP_069974070.1|416265_416745_+|hypothetical-protein MLPIYAKNKGRKTFPITEKINTFKLMNFVKALQDITRYKFHCQVYTKNMGNSWSFRYTAQNKILITISFHDDAQEDCSYIYIQDFNFPKSCIEKQMDQKILKLFLQHFQNLDFDMLRFRLLGEETRTLSQHFAFRRTSLDEAYMSLKTVFIPLHTNNVS >NZ_CP017269.1|WP_069974069.1|414469_416056_-|DEAD/DEAH-box-helicase MNNITFKQLGLMPEILKAIDALGYEEPTPIQKAAMPAVMDGKDIIGQAQTGTGKTAAFSMPVIQKLSLDVKGPQALILTPTRELAVQVADEISKFSKYLSGVKTLAIYGGQPIERQIKALKAGVQIVVGTPGRMIDHINRKTIKLNNVHTVVLDEADQMLDMGFLEDIERILQETPENRQTLLFSATMPKEIENLARNYQKKPEKIKVVHEVLTVPLIEQYYYEVKPHEKLEVLTRLLDMEKEGLTIIFCRTKKGVDELVESLQSRGYFSEGLHGDLKQSQRDRVMKKFREGTVDLLVATDVAARGLDVNNVHIVINYDIPEDLEYYVHRIGRTGRAGKAGVTYTFVTGRQIGLLKSIERFTKSKIRRKPIPSVNDLAERQREVFKKRIVSTIEAGHLTPYISLTETLAEEYSSIEVAAALAKIIMEKERTGLVDRSEDLFDDTGATESDKARIFINIGKRDRIRAADILGAVANEGGISGREVGTIDLFDKYAFVEVPKNQAAKLVKKLNKIRIKGKKINAEPANQR >NZ_CP017269.1|WP_069974068.1|413024_414209_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKKTSYLVLTAFLIFALVLGGCAPKTQDTPAAGGEAAQEIVKVGWIGSLSGDQAVWGQCELNTVKMMFEEINEKGGLLGKKVEVVGYDTRGDATEAVNAVKRLTAQDKVVAIIGPNASGQAIAVSSVLEEMKVADIATVATNPKVTVVDDKVKPFNFRVCFIDPYQGAVAAGYATEVLGFKKAAILYDVADDYSQGLTEFFEKYFVEKGGQIVAKEAFKFGDVDFRPQLSKIKEAKPEVIFMPYFFKEVALSANQARELGIDAVLMGGDGWPSDVLLEMAKDAVEGSYFVNHLDFEDPDVQDFKAAYRTKYNSPVELNGYLAYDAVKLLEAAVNNANSLDSVAIRDALETASVKGITGQITISKDTHNPEGKDAAIIKIVDGEYVFQQKYSAK >NZ_CP017269.1|WP_069974067.1|412083_412962_-|branched-chain-amino-acid-ABC-transporter-permease MSAFMQQIINGLSIGSVYALMAVGYSLVYSIMNFSNFAHGGVIMLGSYFGFFLLTLYELPFVPAFALAAIGAGALALVIERIAYRPLRKRSAPFLYFIISAMGASIFLENIVIATIGPTFKTYPRILSPQPFTFGSLSIGRLDMMMFIISGISLTLLVYIIEKTKIGMAIRATAYNMRASALMGVNTDKIIFIVFGLGGFLGGIAGVLFGMKYTVYPQIGFITIKSFIAAVFGGLGSLQGAVIGSVLLGIIETLTSGYLSSQYRDLIAFALLIFILIVRPMGLMGKMTEDKA >NZ_CP017269.1|WP_069974066.1|411175_412072_-|branched-chain-amino-acid-ABC-transporter-permease MDWFYVQGILILSGIYLLAVLGLSLLTGFTGLFSFGHAGFMAIGAYVTAMMTVNFKIPFVFALLIGGSAAALLSLLIGRLTLNLKGDYFCIATLGLGEAIRLILDNVQYFGGARGWPGIPLKTSLVNVIVINIIAIIVMANLIRSRHGRNFIAIREEEMASQIIGINVFRYKMISLAISAMYAGIAGGMLAHYLGFLQPKMFQMAKSTELTIMVIFGGLGSISGSALGAIVLTALPELLRSFAKWRLVVYGLAVIFIMITRPQGLMGGYELTFRNIKRFFSQIGLKSKEKTSAGGDQS >NZ_CP017269.1|WP_069974065.1|410405_411179_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNILEMKNVTKQFGGLTAVGNVSIQVEKGSIFGLIGPNGAGKTTIFNLITGIYKVSEGEIIFQDQRIDQFQPYQIADMGITRTFQNIRLFKKLTAYENILTACHYNANYNILDAVIRTHRFKKEEKMLHDHAEELMEIMELKDRKDIVSSNLPYGLQRRLEIARALALNPKLLLLDEPAAGMNPDETIKLMELIRQIREQFKLTVVVIEHHMDLIMGVCDKIAVLNFGRKLAEGTAQEIQENPKVIEAYLGEEEVNC >NZ_CP017269.1|WP_069974064.1|409683_410412_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLKVENLNVYYGGIHALRGIDIEVQKGQIVSIIGANGAGKSTLLNAISGVIRPKEGSIKYRGKDLPAMPYKIVEAGISQVPEGRLIFANLTVKDNLIIGAYLRKDKEGIAQDLKNVYQLFPRLEERMNQMAGTLSGGEQQMLAMGRGLMSNPDLILLDEPSLGLAPLLVKTIFEIIEDIKKMNKTILLVEQNAYKALSIADKAYVLEQGKIIKEGNAKELTKDPSIQEAYLGKSHGTGEASK >NZ_CP017269.1|WP_069974075.1|421533_422247_-|hypothetical-protein MKQLDLLWELQEMEQLLSEKKKLLKNLQQPKEIEEKIQEHKKMKNGYETIRKQLEDTQKDIKKIEHDLKELDFKKEEVKGKLYSGKINDLKQLGILMKEQEKAEGQYTQVEANLVEKIEETESLEEKVREEEKMERKMGSKIKHMLKERKIDIEKLQVEIEALTKKIEIHLNNIEKAYIDVYEDVKRRKNNPIALVEYDICTGCHMDLPVMTMSDLKNHKLVTCNNCSRILYVQLKG >NZ_CP017269.1|WP_069974076.1|422338_423457_-|Nif3-like-dinuclear-metal-center-hexameric-protein MAESGRKIIEIIEKQAPLYLAESWDNVGLQLGNPDKLVKKIMVCLEVTEAVLQEADAKRIDMIVAHHPLIFKPMKKFTTDDPLGRMIYFLIQKDILLYCAHTNLDMAYGGLNDLLAFNIGLSEIKSLTNTYQRKYFKIVVFVPESHEEEVRSALCSAGAGFIGNYSDCSFKVKGEGTFRPLRGANPYIGSIGEVERLKESRVETIIAEDCLQTALKKMLHAHPYEEVAYDLYPLGNVYEKNGLGRMGYLKNPEKLLELCNRLKRLLGIETIKIMGDQSKIVKKVGLCTGSGAEFIYNAYQEGCDCFITGDVKYHEAQYAQQLDIPVIDAGHFDTENYACGLYAKSLEKQLADNHCHVDICFSSTNINPFCYI >NZ_CP017269.1|WP_156782311.1|423423_424143_-|tRNA-(adenine(22)-N(1))-methyltransferase-TrmK MNMKLKPRLLAIAQMVKNNSVVADIGTDHGYIPVYLINHEIARKVIAADINRGPLNSANSTIKAHGLENYIETRLGSGLEVLLPGEVDTVIIAGMGGLLIRDLLNARPDIVQTVTTFILQPMVAQDELRKWLIHNSFQIVEEKLVKEDHRIYEIMVVQKGHQEIPDDLYYDIGIKLIENKDPLLREFLLKHIQKNKVIIEGLKDQSSEEGCAKRLSCREKLEKLEEVLQWLNQEEKLLK >NZ_CP017269.1|WP_069974078.1|424174_424897_-|HAD-family-hydrolase MINTILFDLDGTLLPMDVDVFMSNYFKALGKKCAHLVDPKKLPKMILDSTECMVRSVDAVKTNQEVFMEDFAKKIESDFQSLLPVLDEFYKEEFQNLKFTTQPVEIVVEVIKILKEKGYTLVVATNPLFPRQAILHRIQWSGLEENDFSLITDYESMHFCKPNLDFYSEILQKIEKRSEECIMVGNDVQEDIIAEKLGMKTFLIEDNIINRENKEPSPEYRGSYQDLLDFVMALPNLKKE >NZ_CP017269.1|WP_069974079.1|424993_425194_+|hypothetical-protein MNEKKTQSHSMTPNPSLVHFKWGGTTTEWEEEADQLMNCLQDQLDSKENDIVKEKKIEYAKQKQYW >NZ_CP017269.1|WP_069974080.1|425288_426407_-|RNA-polymerase-sigma-factor-RpoD MSKKVEEQKVESVKTLIDKGKKRGILTYNEIMNTLEEIELDKEQVEEVYDNLASMGIDIVGERDDEDLDDIPEAEEIDDIPETEEIVDLDISIPKGINIDDPVRMYLKEIGKVPLLSAEEEIELAKKMEQGDDEAKKRLCEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNLGLIKAVEKFDWRKGYKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRISRQLLQELGREPRPEEIAKEMDLPVEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEEDSHLGDFIPDDDAPAPAEAAAFSMLKEQLIEVLDTLTPREQKVLRLRFGLDDGRARTLEEVGKKFDVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKKLKDYLE >NZ_CP017269.1|WP_069974081.1|426432_428280_-|DNA-primase MGINLHEGLIEEIRNRSDIVEAVSKYVNLKKAGSNYKGLCPFHHEKTPSFIVSEEKQLYHCFGCGEGGDIINFIMKMENLDFIDAVTTLGEKAGIRIEEASSKEEKKEFENRNRIYEMNREAALFFYSNLIKKENKGLEYLKERKVDLSTIKKFGLGYAENQWEALNNYLLKKGYTQEMILSAGLVLKRNQKDGCYDRFRNRIIFPIINTTGKVIGFGGRALGDEQPKYLNSPETSVFNKGRNLYGLNTAKKVLGKEKRMIVVEGYMDVISLSQRGISNVVASLGTALTKEQAALLKRYTDEVYIAYDGDSAGQAAALRGLEVLGEAGCDVKVVIFTQGKDPDEIITKKGKKVFLDELEGALSLIDYKITLVKKENDLTTIEGRIKFVKAIAEIIKQLKSPVEVDAYIKKISIEAQISEDAIKTEIYGNNRYNQPVKMHKPIVSGEKHRSKFERHTNKYNIESIQPTEKLGYLEAERGILKLMLMNKQYFNNVVSTFPELNFTDPVHKKIAKLVARAYEDMDVIDMDSLMNQLDINEITILHNIKKVIIPEDNTQKALIDFMNQIQKFDLMKRKKDIETELKEMEKKENKSQMEIARIRELCIQLEKILKELKHL >NZ_CP017269.1|WP_083273320.1|428361_428820_-|YaiI/YqxD-family-protein MMIIYVDGDACPVKGEIVEVSKKYDLQVIMVLSICHLTKSDGFSEYVVVDHRDQSVDMEIINRVKKGDVVITDDYGLASIVLMKEALCMSSRGMQYTAENIDLLLYKRHMNQKIMRAGGKVKGPAKRSNSEDRQFLINYEKMLKQSLYNSLL >NZ_CP017269.1|WP_069974083.1|428917_429922_-|deoxyguanosinetriphosphate-triphosphohydrolase MLFREITEKYEEERFSPYAARSQHTKGRRLTEALCEVRTEFQRDRDRILHAKAFRRLKHKTQVFLSPEGDHYRTRLTHTLEVAQISRTIARALQLNEDLTEAIALGHDLGHTPFGHSGERILNEVHPMGFHHNEQSLRVVDHLEKGKRGYGLNLTFEVRDGILHHTGADRPATLEGQIVKISDRIAYINHDIDDAIRAGVLKYEDLPKDCLENLGATHSDRIHTMIMDLIHHSIHQPKLSQSREKLFYIDKLRAFMFENVYLNKKAKREEEKAQHIIQELYHYFLKNCDRLPEEMGQRIEEFGIQETVKDYIAGMTDRYAIQKYMDIFVPTVWK >NZ_CP017269.1|WP_069974084.1|430260_431292_-|pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MLVKREKISFLDPQPTPINYLPTLSKELGVELFIKRDDLTLFGAGGNKLRKLEYILYDAIQKGATTLLTVGGAQTNHGRLTAAVAAKYGMKCAIVCVDEYPGEISANILLDGILNAEVVMKKNDGRDKDEQLAETVATVKARYEDMGETVYEIPLGGSDVVGMMGYYECAVEITAQAQKLGIEDATVVTGVGSMGTYLGLYCGLKNEGSPLGITGIAILPFNDYHDRRIVEYFENAKEEYNLSIDACRKDFNIETGYTRGAYNNSDSTVRQAIYRMARSEAILLDPCYTGKVFAGVLDMIEEGKIKKGEKIILLHTGGMPGFYTKHHRVEFEKELMGHVTIVE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017269_2 | 1535569-1535664 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017269_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP017269_2
>2.1|1535595|44|NZ_CP017269|CRISPRCasFinder ACGCAATAGGGTGCCTATGGGAAGGAGGTAGAGGAGGTATTTCT |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017269_2
The CRISPR arrays of NZ_CP017269_2 >merge|NZ_CP017269|2|1535569-1535664|CRISPRCasFinder AATTTATTAAATTTTTTGACCTTCAGACGCAATAGGGTGCCTATGGGAAGGAGGTAGAGGAGGTATTTCTAATTTATTAAATTTTTTGACGTTCAG >NZ_CP017269|2|2|1535569-1535664|CRISPRCasFinder AATTTATTAAATTTTTTGACCTTCAG ACGCAATAGGGTGCCTATGGGAAGGAGGTAGAGGAGGTATTTCT AATTTATTAAATTTTTTGACGTTCAG
>NZ_CP017269.1|WP_069975127.1|1535114_1535501_+|winged-helix-turn-helix-transcriptional-regulator MRKQVLPHNHGKDIENILKKMPDTECFLDASAVFQQLCDGSRLRILWLLCHCEECGINIAAAVGMSNAAVSHHLKSLKLNGLVTSRRAGKEVYYTLANTETAQLIHRIIDDFFQMTCPSKGIAEYIQE >NZ_CP017269.1|WP_083273433.1|1534841_1535006_-|transposase MAPCIQNNPLGFQAIERIFADFKEKYGMSYTQYRGIQKVHDEAMLDFTCVNMKK >NZ_CP017269.1|WP_069975125.1|1533720_1534641_+|hypothetical-protein MKKPNSKERHFKKSVLAAAMIIGANIIAFQGFTQAASAAVYNKTNIIPTSYANSTSVSSQTVQNSLPEGYKKANYKVGTINLPYYKNQTPAEKDMTKEAAAELVAQYLWQVYGANLEGQTIEMGYDAPTENTPRPMWIAEVELKGQNYADGYRVDRYGVWIDSVTGELYNIGLNRTLKEKVPVGPDWSLNESEYEAAAKKLAEKYNIVNSTVQSIQFTGQGASFSTNISSTYGDPTISFQVHGENGEVALMTISRYDKVLLGVMYNGQYKYDLLKIEELVQEMEAKAKADEATSADKSKVPTLMGN >NZ_CP017269.1|WP_069975123.1|1532243_1533638_+|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MKHRTFLTTLALFLFFFNLGIFIISVAIFKDTVHRAEERSLGEHYFIASALIKDFHVVESRGINIEGSLSSLLQPYSYLSGDKKAGLALYKDNQLVYSNHDTFVLQRNSLEPPKNGNRVATVRKADKKTYVIVSGNLPIPYDFYTLIYTYDTTDAIRSWSYLKNMLFLAGFVLSVLLAFGLLIILNRIFKPLKQISQTSKNIANGAYETRLPIYGHDELSEMAQSFNHMAEEIQHQMAELIDTADKKQQFIDNFAHELRTPLTAIYGYAEYMQKAVLSEDDRLSALTYIMSESRRLQTIAFQLLELANLQNNQITCEEQKISRLFEMVKQTLHGKLAEKNIYIEFNSEIETIWGDACLLESLLINLIDNAIKACGKGGHIFVCAVHEAGKKTILIRDNGKGMTPEVLSQIMEPFYRGEKSRSRSDGGAGLGLAICKQIALHHGAELSFTSFPGKGTTAKITFTT >NZ_CP017269.1|WP_069975121.1|1531593_1532247_+|response-regulator-transcription-factor MASILIVEDEVAINELIKRNLQLVGHHCTPVFDGKTAISEIQCQSYDLMILDIMLPGLDGFEVIKHANETPTIFLTAKNSLPDRIKGFSMGADDYLTKPFEMLELLARVEAVLRRTQKSRNDFEVGDVKIDFDGHQVYHKGQLVECTPKEYELLEVLVNNRNIALSRERLLELVWGYDFDGDTRTIDVHIQKLRKKLGWEDVIKTVYKLGYRLEVSQ >NZ_CP017269.1|WP_069975119.1|1530482_1531247_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MKALLESVEEYWRQRADGYCQVNLEELDSFKRRAWTDLINEYAPRISGKRLRVLDIGTGPGFFAIIMAACGYEVTAIDYTETMLQKAKNNAGIYRNAIHFERMDAHNLKFEENTFDLIVTRNLTWNLERPDMAYREWHRVLAQGGRLLNFDANWYLHVHDAEKRKAYEQDRVNCAERGFADHYIHTDTEAMEEIARKLPLSKEHRPEWDVKELRKIGFGKIMIVKEIGSSVWDEEEIVNYGSTPMFMVCAEKSK >NZ_CP017269.1|WP_069975117.1|1529478_1530420_-|ABC-transporter-permease MKKYIGRRLLQLIPIILGITFLSFALMQTAAGDAVDALYDNTSGGVSEQIKVEKRAELGLDKPFLVQYFNWLMDAVRGDMGVSYISKKQVFETFISKLPATIYLTLAAILVTVLVSIPLGILAAVKRNQFIDYFIRMMSFIGNSMPSFFISLLLIYVFALKLNILPVIGNSEGWKSIILPTLTLAIAMSSKYTRQVRAAVLEELNKDYVMGARARGIRESVIFYASVLKTAMLTIITLLALSIGSLLGGTAIIESIFMWDGVGKLAVDSITMRDYPMIQAYVIWMALIYVAVNLTTDILYHYLDPRIRILQEE >NZ_CP017269.1|WP_156782513.1|1528588_1529446_-|ABC-transporter-permease-subunit MRSGHHQDYTLIKFYVLLTLVGGLLLIAAFAHRLVPFDPYAQDLSKALQPPSSAHWLGTDRYGRDMLSRVMMGAQSTIFTSLLLVGIISIIGTWIGVVCGYIGGKIDTFIMRVSDVFLAFPGMVFAIAVAGVLGGGIMNAVIALACISWPKYARLARGQVLSVKTMPYIAAAKMSGSGTLKVIFKHIIPNIIGTILVTATLDIGTMIMELAGLSFLGLGAMPPTAEWGSMMSNGRSMLQTSPWVILAPGCAIFISVMLFNLFGDTVRDLLDPRIIQRRGKGNETI >NZ_CP017269.1|WP_069975104.1|1527054_1528602_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKQYRKIGGMLLAVALVVSSMTGCTNTKADTTEKVFNYGTMAYGVAMGNAGLNPHEGYSGWSTVRYGVGETLFKFNASMELEPWLAKDYQQVNEYTVKINLRDDVFFSNGNKMTGEAVKVCLENLVTVHDRAPKDLQIKSIAAEGQSVTIVSENKVPGLVNYLADPYGAIIDMEAGVSEDKNVVGTGPYVAVKVSDTEIHLEANNKYWNGVPKVDKVNIKSISDGDTLTMALQSGEIDAAQGLPYASLKLFQNDDRYTISSTETSRVYQAALNYHSKMIQDSAVRKAMAMCTDKEGFTAVLLQGNGSPAVGPFPDNFKFGGNAVKEVPYDIEGAKEVLESAGWVDTDGDGIREKNGQKLSIDWLTYTSRQELPLLAESVQASYKKAGIEVKVNATDSYKDFLKAGKYDVFANAFVAAPTGDPQYYFTTHLVDGSDYNRGYYHNDKVEKWVEELRNEFDLNKRSNLAVKIVQQVLDDNAYIYASHLKMSFVMKKGITGFTAHPSDYYEITADLDKN >NZ_CP017269.1|WP_069981342.1|1526237_1527023_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MQQSLLEMRHVEISYGGEPVVHDVNLVLKPGEILGVVGESGSGKSTLIKAAMGLLGNQGRITGGDILYKGNSLLHMKPEALRKMRGPEIAMVFQNCASSLCPIRRIGDQLFELMEQHNQRNREKVIDRALDLFEKMNLSDGRNILESYPFELSGGMNQRVGIVMAMMLKPALLFADEPTSALDVIVQAQVVKELMKLRDEFGTAIVIVTHNIGLVSYMADKAAVMYQGRLLEYGATKEIISNPQEAYTQRLIQAVPKIRRG >NZ_CP017269.1|WP_069975128.1|1537599_1537818_-|cation-transporter MKKTIKLQNLDCGNCAAKIENAIVKLEGVIGVKVNFMGQKMILEAPDDRFNEILEEAKKIAKKIEPDIEVMA >NZ_CP017269.1|WP_069975131.1|1538090_1539056_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MFSAILSHFSDRIIAGQGKDHISYNLKTLDGKGTASVYSVFPGIEIGNLVFQTSHLNPIKHAQMNIVEINHCKEGRAECKMSDGCFQYIGEGDLFMNTLNNYSDSIELPLGYYHGIMVLIDIDIAAPVILELFPNIPINMQELSERFFDHDKCFLIQEKPEIQHIFSGMYTIPASARLLYYRLKIQELLLYLYFFLPSKEKPKKTYPQQQVEIIKQIQKKITGEPEHRFTIEDLAREYCISPTALKSNFKGVYGVPIATYMKKYRIQQAAILLRQTQLSVAEIAAKIGYESQSKFGAAFKEIMKITPLEYRRKFAYTTNNF >NZ_CP017269.1|WP_069975133.1|1539384_1539948_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MQILKDEIRNKILDVAENLFYQNGFRDTTTRSIAKAVGISVSNLYLYYENKEAIFYGVTDGFFEYFINGFKTFVNHDDKSNGMNIDISHVFQRIIKVDQKKFIIIADKSQGTKYEGFKEQIINILSNHMLSQVNKEFVEDELIIYILAKNFMEGIIEIAKNYKDDRWLEKSIGTLVSYHINGMKHLM >NZ_CP017269.1|WP_069975135.1|1540028_1540913_+|4Fe-4S-binding-protein MKAVIVVFSPSGNTERVGKLLKTSLEQNSIGAELINIAGKEKYFLTKYTQSFLQEIVNEHDILFIGSPVYAHHLQYHVKDLIESLPRPMDGWGKIAVPFVTYGGIHSGIALDEAGKLLRKSGRKVLAGLKVSSSHHMTRAFMKEEYNKNPDEDKLISIIEDLVQLVKSVDLNSTKDYSNHLRYQSVKTYLKAKVIFKEKVWHEKRYPKVLIDYNKCIQCGKCVSVCPVCHLEQDLDSLIVKNINTQCIHCFNCIFECPQKAISPMGDLEKAKIFMENMIKKAKEHPDTCLYPTT >NZ_CP017269.1|WP_069975137.1|1540956_1541532_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MGIKKFLLDGQSENGNLIYKKMLMWLNNPKRVKYNNPDRLVQASGIQSGQTVLEIGCGSGFFTVSASKILGDEGKLYSIDIHPLAVEETQKKVDQLELKNVIVKKEDAMKSSFGDSMFDLVLLYGVVPAPVIPMKDISREIYRVLKPGGIYAIWTLSPFWSPCTALKCASFEKMKKLNGVFRLRKVNYPNQ >NZ_CP017269.1|WP_069975139.1|1541633_1542335_-|response-regulator MDNKPLILVIEDDKAIRNFISAALRTQGYKYIETENGEKGLTLIMSHNPDIIILDLGLPDMDGLRIIEKVRLWSNTPIIVVSARGQEREKVEALDLGADDYITKPFGISELLARLRVSLRHIYRHGSEQKACMSEFVLGDLKIDFEKRIVSLRNEEIHLTPIEYKILTLLSRHAGKVLTHNFILKEVWGSTIGNEAQSLRVFMASLRRKIEKEPAQPRYILTEVGVGYRMVDE >NZ_CP017269.1|WP_069975140.1|1542363_1545093_-|sensor-histidine-kinase-KdpD MNSNGIKNINLETRPDPEQLLAKIKSENNLKAKGMLKIFFGYAAGVGKTYAMLDAAHAVKKSGVDVVVGYIEPHTRPETLALLDGLEVLETKSVFYRGIYIKEFDLETAGKRKPEIILVDELAHTNAPGSKYKKRWQDIYELLDAGIDVYTTVNVQHIESLNDIVASITNVFVKETIPDKVFDEAGQVELIDIEPEDLLKRFNEGKVYRKEQAKRAQSNFFQKENLVALREIALRRTADRVNREVQIARLSKTNIKILPVKEQLLVCISPAPTSAKVIRTAARMADSLQATWIAVYVQTSENKYIDKTVQEQLQKNMTLAEQLGAEVVTLHGDNIADQLVSYAKLRNATKIVIGRNQKSRNPLLRILKKDIVNRLLDLTAYIDVHVIPGISQDYDNRTKPKHKNADLFLKFTFSKIDFLKIIGVLIFATALAYSFYAIGFAEANIIMAYIVGVLVMTLITKGYLMGMIGSVLSVLAFNYFFTEPRFTFSVYDAGYLVTFPIMLSVALITSTLTSRIQHQMVTSLKREEHTQMLYDVTRSFLNVSNRESIVVKGIEYLTSVLKRDIIVYLGDENDNLAEPILNAQGKMTQDLLDKNEEAVVNWVFKNRKNAGVGTDTLPGSVAYYVPIKTHQKIMGVIGIKCYDDILDIDQRHFLDSVTVQMAIALEREKLTEEQAKIKIEVEREKLRSDLLRALSHDLRSPLAGIAGATTTILENREILDPETVNELLNGIYEDSEWLTRLVENLLSMTRIDEGKLQLRKKPESIEEVISEAIQHIKKRAKDHVIKVQIPEDIFIVPMDGKLIEQVLINLIDNAIKYTPKGTTIEIRAFEAGESAYMEVSDNGEGVPEDSIKHIFNRFYTSESSSRDSRRGIGLGLAICKSIVEAHGGKIEAHNKKEGGARFRFSLPLD >NZ_CP017269.1|WP_069975142.1|1545140_1545512_-|NAD-binding-protein MNYVIIGGDSKACRDFINILAGSIDHLTIICPEIQYAQSLPAEFKGNLVIGNLRKESTLEKANLSSADTVLIWTKNEDINALLAAAVKKIYNVKNVVVYTCESKNSKFYEDLEIDTVAISKFL >NZ_CP017269.1|WP_069975145.1|1545539_1546115_-|potassium-transporting-ATPase-subunit-KdpC MKNNVVQQSFKFVLVMTIITGFIYPLACTAIAQIIFPDKANGSILYQNNKPVASELIGQEFTSEKYFWSRLSATSPYPYNGGDSSGSNKTPAGEEIADAVQQRIKLIRALDPENDQKIPVDFITASGSGLDPHISPAAALYQAGRISKVRNIEKAVLMNLIEKNTEKRQLGILGEPRVNVVKLNIDLDNLE >NZ_CP017269.1|WP_069975148.1|1546127_1548194_-|potassium-transporting-ATPase-subunit-KdpB MKKEENKFVTKDIFINAIKDSICKLSLKTQIKNPVMFVVYIGAILTTGLFFGALFGYADAHAGFIFGISMLLWFTVIFANFAEAIAEGRGKAQAESLRKAKKDVSAKKLENPDRNASFEMVKSSQLKKGDIVFVKAGEQIPADGEVIEGAASVDESAITGESAPVIRESGGDRSAVTGGTTVLSDWLMIRVTAEAGESFLDKMIAMVEGATRQKTPNEIALQILLTTLTIIFLVVTATLYPYSVFGVEQSGRGEVTSITALIALLVCLAPTTIGALLSAIGIAGMSRLNQANVLATSGRAIEAAGDVDTLLLDKTGTITLGNRRASEFKPVQGVSEKELADAAQLSSLADETPEGRSIVVLAKENYGLRGRNLNELKAKFIPFSAKTRMSGVDIGADEIRKGAADAVKSYVESKGGNFPKSCQEIVESISKAGGTPLVVAKNNKVLGVIYLKDIIKSGVKEKFEDLRKMGIKTIMITGDNPLTAAAIAAEAGVDDFLAEATPEAKLELIREYQQKGHLVAMTGDGTNDAPALAQADVAVAMNTGTQAAKEAGNMVDLDSSPTKLIDIVRIGKQLLMTRGALTTFSIANDIAKYFAIIPPLFVGMYPVLGKLNIMGLSSPESAVFSAVIYNAFIIIGLIPLALKGVKYQELPADKLLRKNLLVYGVGGIIAPFAAIKLIDLFITAIGIV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017269_3 | 3213821-3213906 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017269_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP017269_3
>3.1|3213844|40|NZ_CP017269|CRISPRCasFinder CAGCAGCAAAGTGAAGAATTGCAGCAGACCAATTCTCAAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017269_3
The CRISPR arrays of NZ_CP017269_3 >merge|NZ_CP017269|3|3213821-3213906|CRISPRCasFinder TGGAAGAACAGCAGCAACAGCTGCAGCAGCAAAGTGAAGAATTGCAGCAGACCAATTCTCAACTGGAAGAACAGCAGCAACAGCTG >NZ_CP017269|3|3|3213821-3213906|CRISPRCasFinder TGGAAGAACAGCAGCAACAGCTG CAGCAGCAAAGTGAAGAATTGCAGCAGACCAATTCTCAAC TGGAAGAACAGCAGCAACAGCTG
>NZ_CP017269.1|WP_069977904.1|3211081_3212371_+|hybrid-sensor-histidine-kinase/response-regulator MKRNTPYKILIVDDNHNNLFSLRTLIEEYIDAEVIEADSGKKALQEISGNVVDLIILDVQMEDMDGFEIASLIKQRKKTKDIPIVFLTASYIGEEFKKRGFQIGAVDYLTKPIDEYQLINRINIYLKLIEKERNMNILLEQKVKEQTSALQKAKEEAEAANAAKDIFLANISHELRTPLNIILGTTQMLNLYLRSDKEIDRDQIRKKVDMQVQNCYRLLRLVNNIIDISKIDTGHFEISMSKCNIVQIVEAIALSVAEYVEDKGIRLIFDTNVEEKIIACDLDAIERIILNLLSNAIKFTQTGGNIYVDVEDLQDRVKISVRDTGIGIEEDKVHLVFERFKQVDELLTRKQEGSGIGLSLIKSLVEMHDGRIYVHSEYQKGSEFIVELPVNLKCMQVSEDCSAGYMPNESVVQKIQVEFSDIYFLDAIG >NZ_CP017269.1|WP_069977900.1|3209269_3210589_-|FAD-dependent-oxidoreductase MTKIVVIGGGWAGCAAAVSAAKAGAQVTLLERTDMLLGTGLVGGIMRNNGRFTATEELIAMGGGDLFQICDQHSRHKNISFPGHDHVNLYDIADTHGAVLGHLQHLDVHIVFESRVNKAVMQEKQITAVEDQSGRVFHGDTFIDTTGTAGPMHNCVKYGNGCAMCILRCPSFGGRVSIANLAGIEEMVGKKADGSIGAMSGACKLYKESLSQEIQDALSTKGVAIIPLSQELIEDHLGVKACQQYALQEFKDNIILLDTGHAKLMAPYFSLERLRKIPGFEYARYEDPYAGGKGNSMRYFSMAPRDNHLKVEGVDNLFCAGEKAGLLVGHTEAIITGTLAGHNSVRQALNKPLLQLSKETAIGDAIAFVKEMMTTEAGMGKKYTFSGSIYFERMKEKGLYRKEQKQISKDIEALGYTGIFAQKLIKDMDSEIIKSKICS >NZ_CP017269.1|WP_069977898.1|3207790_3209155_-|hypothetical-protein MVQLTMLHYAYFFIVLIIMVTMAFRKDTVLPCILGIFAIGFLSSGSLLTGVQVVYNALIAAGNEFWGIIVVISLVVAMSHALQDIGADELMMAPIKKLMINPVVAFFGLGFMMMFFSWFIWPSPSVALVGAIMLPAALKAGLPPIWAAVAMNIFGHGVALSSDYFIQGAPSITAKAAAIENPLMLIQASIPLWLTMSIVTVACSFFMMRRDMKGFEEIAVAVEAEEITKPTMGVYLVAILTPLIFLLDVYVMYKYKLRGGDATALVGGTAILVMSFVAIVQHSLIDSLEKITDYVRGGFIFGIKIFAPVIIIGAFFFLGSEEIAKQILGENATGLLSDLGMYLADRIALSKFPVAMIQMIIGGITGLDGSGFSGLPLVGSLAQTFSSAISINKESLAVLGQISAIWVGGGTIIPWGIIPVAAICNVSPLDLARKNIIPVAVGLIATFIVSMFIL >NZ_CP017269.1|WP_069977896.1|3205466_3207650_-|glycoside-hydrolase-family-3-C-terminal-domain-containing-protein MSEIYKDPSYTPTERAQDLLSRMTMEEKVGQMCQVDGRIDADTWIYEKHIGSFLHVTGDAPIYLQEKAAHTRLGIPIFFGIDAIHGHAFCSGATVFPSPLAMSCSWNPELLETVAHITACEVIMTGLHWTFSPVLCIGRDLRWGRIDETFGEDPYLIGVLARAMIKGYQGEKLSDPYSILACAKHFAAYGETQGGRDSAEADVSERKLRSVFLPPFREAVDAGCATFMAGYNAIDGIPCSANRWLLNDVLKEEWSFKGFVVTDWNNVGHLHTTQKVAPTFEKACEIAVWAGNDMMMSTPDFYEKTVALVKEGVIGEAQLNAACLRILELKFALGLFDHKRFPDRSKAADIVGCEAHKKAAYEAALQSIVLLKNDNHVLPLSKDVKRIALIGPNCENVQSQLGDWSFGTREYPEQPTLDYHPEYDISPIVTVLKGIQQRAGKGIQVVYEKGCDLLDNKEHNFPAAVKAAEESDVIIAVVGDTNTLNGETRDRADLNLTGAQQKLLETLKEIGKPLVVILINGKPLTIPWVKDNADAILEAWNPGMEGGNAVAAILFGDFNPCGKLTISFPCHVGQQPVYYNQLPGWHGGKYVEISEDPLFPFGFGLSYTRYEYSNLTLSSTMLKEDDTLIVSVDICNVGNYTGTEIVQLYVNDLYSSVTIPIKELKGFTRVTLNPGEQQRISIHLPIASLSLVDRQCRSIVEPGEFEIMVGSSSRDEDLLKKVIRVME >NZ_CP017269.1|WP_069977894.1|3205059_3205323_-|thioredoxin-family-protein MKPILMFMMDSCPYCKEAFRWMEELKREDSRYQSLEINMIDERLQPDLANQYDYYYVPTYYVDGIKLHEGAATKEKIRSVFENALGK >NZ_CP017269.1|WP_069977892.1|3203092_3205018_+|ABC-F-family-ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MNLLSAENLSKSYSEKPLLKHISFGIDEGDKIGIIGINGTGKTTLLKIIAGAEQADEGRLIKGNDVRIEYLPQDICFDTDATVLEQVFRGDSPLMQLIRTYEEALQNPSTSNETIIKLTHDMDTLNAWNLENEAKAVLTKLGITEFSAKIRTLSGGQKKRIALAAALINPSDLLILDEPTNHLDHETIDWLEDYLNRRKGALLMITHDRYFLDRVVNQIIELDQGSLYAYKGNYNNFLEKKLEREELVAANERKRQGLFRKELAWIRRGAKARTTKQKARIERFEKLSASAADLNENRLEISIAGSRLGKKVVELEHIYKAFDEKTVIEDFSYILLRNDRVGILGPNGTGKTTFINILSGKIKPDSGKIEIGETVKIGLFSQETDHMDDHARVIEYIREGSEYLTTADGLKITASQMLERFLFPPSMQWAPIGKLSGGEKRRLYLLRVLMEGPNVLLLDEPTNDLDIETLTILEDYLEDFQGAVIAVSHDRYFLDKVAEKIFVFTGKGRIRQYTGNYTEFKENHIGDLQNTPIENKTAGKDREKESRNNHPSNKNQLNSTKEKTLKFSFKEQREFEEIDGIISGLEAQIQTVEEKIKQTTSEYTLLQQLLEEKEALEKQLDEKMKRWVYLNELAEEIEKRK >NZ_CP017269.1|WP_069981454.1|3201237_3202950_+|methyl-accepting-chemotaxis-protein MKWYLNLKTGTKIISGFLILSILIGLVGFIGITNMKVINEGMNVMYHDRLIPIQLLGEIQKNVMSIRMNLFHLLMYENKLSVSEVKKIINELKDETDELIKRYTSIALVEEEEQLLQQFTNHLTEYGYAQSKYVALVESNNMSGAAIAFENIKKTGDAVQQSLDHLINFNNQSGEEIKFRSDDLYKKSVVNMIAIIVGAVIIAVLFGSILSVIITKPLKRSLRFAEDFGNGDLTQQIRIDRRDEIGLLIAALDKSVTNIQSLLKEIILSSSEMHVSSEELSAATEEVLAQMQHIDTATNGISRGTEDASVALEQVSTSSQKVSETTGQLVQKAREGSNAAVEIKQRADQMKREAEQSKEAAEKIYQEKQNKILTAIEDGRVVKEIEVMASGISSIAERINLLSLNAAIEAARAGEHGRGFAVVAEEVRKLAEESSKTVARIQGVIQQVHTAFMNLSGNANEILQFIDEKVKKDYDTLEKTGLQYKKDAEFINELIEDFSLKIERISLITNEVSEAIESVSATSEETTASSQEISSNVSQVVDALEKAAKVSQEQAEIAEKLNEMIQRFKV >NZ_CP017269.1|WP_083273582.1|3199377_3200628_-|threonine-ammonia-lyase MKMSNASYSTQVRGGDVADSLQFKEARDRLKNVVEETNLLYSAVFSSEFGNNVYIKPENLQKTGAFKIRGAYNKISKLSLKERQKGLISSSAGNHAQGVAYAAQQLGVKATLVMPKTTPLIKVEATRNYGAQVVLSGDCYDEAYAEALRLQKENQSLFIHPFNDLDVIEGQGTIGLEILEELENVDCILVPIGGGGLIAGIAAAVKSLRPDIKIIGVEPEGAKAMKLSMENNKLTYLKTVDTIADGVAVKKPGDLTFSIIKDYVDEIVTVSDFDIMEAFLLLLEKHKLIGENAGVLSLAGLKKIQEKNKNVVCVVSGGNIDVLTISSLINRGLVSRGRIFCFSVDLPDKPGELLRISEILAKLNANVIKLNHNQFKSLDRLMDVQLEVTVETNGHKHIEQIIHEMSQMGYEIEKVY >NZ_CP017269.1|WP_069977890.1|3197986_3199348_+|cobalamin-B12-binding-domain-containing-protein MKVLLVRPPRMKQAITLGEFMYSEPIGLEMIYAMLEERHEVEILDLMSEGESLEAKLSGFHPEAVGITTLCIDVPAVKDLAERVKQVNPEIITIIGGTQTYLNSEAFFIDAVDHVMKYTTRENVEKLFSYLENKESPPLLDGVCSRSNGFQSTKVCGINEYIHPNRTSTAKYRSQYSYFGYKPAAIMGTAQGCAKTCRFCLRWRIEGYTEKYFPLDFVKEEIRSIQEDTIMVFDNDLLHNGERIEALCDFLEEEKIYKNFICYASVNSILKNQTAIRRFKGLGLKAVLVGYETFKQEELEAYEKKSSIEDNLKASRFMKEIGLDVWASFMLHPDWSTEDFKGLRKYLKALQPEISTFSPLTPFPNLPLYGEYKERLLVEKEDYESWSFGQVIIRPSKMSLQRYYYEMLKTNLYVNLFQNNTGYMIRKFGFNTVFRLGKGSIKLLRRYMKLMMQ >NZ_CP017269.1|WP_069977888.1|3196656_3197973_+|B12-binding-domain-containing-radical-SAM-protein MKKLLLIQSTPYDGDRKLIKKKKLYFVGLGLPLLAALTPEDWQVEIILETIEDIPFDTDADLIAIGSMGHAVIRSIDIATEFKRRGKTVIMGGYMVSLMAEEAKQYCDSVVIGDAEKIWKRLLRDYETNNLKDFYREELTALSTPPPRFDLIVEKNIGDFLPVQAGRGCPNSCSFCSVYCLYKNRYLKRDIAEVVRDIRQVKELGFRKFLLLDDNIVSDREYLMALCKEIKSLGMEWTSQCSITIGEDSELLQWVAESGCTALSFGLESISAESLQCMDKAWAKPARYAELIKNIQEAGIDISTEMVVGADGDTLQSIKETARFIEANKVVVPRFYILTPIPGTKYYDKMKDENRICNEDMYSYNGSEAVHIPKNMSPEKLTRAYWELYNEVFSFVSIFKRTILRKEFLKKKDRYLFYFLVNLYYRYQIKRKITPNII >NZ_CP017269.1|WP_069977911.1|3215964_3217119_+|protein-glutamate-O-methyltransferase-CheR MNINIHYDGKGIRHMAIIGELDTREKIQQLLSHMEQNIEETHITFFDSSILHWSIIEKLYALQKHKRSRVFVLKPYLYAYLSKIGIRSYYVAQEPEGCKKESEVTTRNSKALYAQQVMDFLTAIYDQYGYDYTQYQIDSIMRRIKLCMLKENIQSFEVFKRVVLENEEVFERLFLDFSINITDFFRDPEVFAAIRDKILPYLDSFHHIKIWCAGCSTGQEAYSLAIMLDELNMLNKTQIYATDINPFVVEEAENGLYPLAGIENNIRNYRNAKGSKSFMKYFKVKETYMEIDVRLKKSILFFQHSLVNSGSINEFQLILCRNVLIYFSPDLQKNILKNFYCSLNQNGFLILGKREGILNNGGHQYFCNYDPENRMFRRRALKEA >NZ_CP017269.1|WP_069977913.1|3217364_3218723_-|PFL-family-protein MINYKNIMETIRMIEKEKLDIRTITMGISLLDCCDSDGKKSRIKIYDKITKCAENLVKVGDEIETEYGIPIINKRISVTPIALVAQSSQDPDYVAYAKTLDQAAETVGINFIGGYSALVQKGYTKGDRTLIHSIPEALSVTEKVCASINVGCTKSGINMDAVRDLGLIIKKTADLTKDRDSIGCAKLVVFANAVEDNPFMAGAFHGVGEAECIINVGISGPGVVKSALEGTKGQPFDVVAETIKKTAFKITRVGQLVAQEASKRLQVPFGIVDLSLAPTPAIGDSVGRILEEMGLESCGCHGTTAALALLNDAVKKGGIMASSHVGGLSGAFIPVSEDEGMIHAVNIGSLSLDKLEAMTAVCSVGIDMVAVPGDTPASTLSAIIADEAAIGVINNKTTGVRIIPVHGKSLGDTVEFGGLLGHAPIMAVSKFSSNDFISRGGRIPAPVHSFKN >NZ_CP017269.1|WP_069977914.1|3218738_3219008_-|ACT-domain-containing-protein MKAFITVIGKDKIGIIHGVTTVLKAYQINILDITQTLLQEYFTMIMLVDLESMTIDFKELKTKLEESGQDLGMSIRIQHEDIFHSMHTI >NZ_CP017269.1|WP_069977919.1|3219354_3220944_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MITVTNISLRYGERKLFEDVNLKFTPGNCYGVIGANGAGKSTFLKILSGEIEPNTGDVSIPSTIRMSVLKQDHYQYDENQVLETVIMGNARLYEIMKEKDAIYAKEDFTDEDGIKASELEGEFAELNGWEAEAEASSLLQGLGIGTALHDKKVADLSGAEKVKVLLAQALFGKPGILILDEPTNHLDIKSINWLEEFLIEFEGIVIVVSHDRHFLNKVCTHMADVDFGKIKLFVGNYDFWYESSQLALQMMKDQNKKKEEKIKELQEFIARFSANASKSKQATSRKKLLEKITIDDIQPSSRKYPYVGFKPEREVGNDILFVEGLTKTIDGEKILDNVSFTVSKGDKIAFVGSREIVNTTLFKILMGEMEADSGTFKWGVTITKAYFPKDNSEFFNDVELNLVDWMRQFSEEKSESYLRGFLGRMLFSGEEALKQAKVLSGGERVRCMLSRMMLSSANVLILDQPTNHLDLESITAVNNGLRDFKSNVLFTSHDHQFIQTIANRIIEITPSGIIDKQMTYDEYLESIGL >NZ_CP017269.1|WP_069977924.1|3221171_3223025_+|DNA-mismatch-repair-protein MKTAKETYKKRIEHYEKKSSKLLKEMNRVSHLRIFTAAAAVFSMIFLSKTAINYVTWGIGFLFFIIFIYLVYMHHRMKSVNRYLIMLKEVNETSMKRINGEWKEFPDKGDVFQEEDHDFSKDLDIFGQGSLYQWTSTANTCMGKAKLAEMLTSPCKDKVQIEERQAAIQELAQKRWWRQRLQAESMLKGEEAQDIEELLQWAENDHPLYSRTWVRIFLRLLPVVTTITLLLAFSTNLLARYIPLLLLAVHFFLLSYDVKKRTQELALIYRCKNSIKVYGKILSHFEKVHFESSYLGSLKERLMDSRGVTAVAQIKKLEGVVDQILNRNNMAFFPINLLVLWDYQCMLAVEDWKQQAGPMLRRYLEVIGEIEGLASLALIRYDYPQWVMPEITKTPSRLNAKTIGHPLLTNKQVCNDVAIDTPAKVLLITGSNMSGKSTLLRTLGINLVLAYAGAPVCAKIMECSMLQIYTCMRISDNLEKSISSFYGELLRIKRIVEASKKDGQVFFLLDEIFKGTNSHDRHMGAKMLIQQLHHNNAIGLVSTHDLELGELEKESGQIVKNYHFQEHYRDNQIYFDYKLRPGISTTRNALYLMKMAGVEFEDGEEVLAEKHAVNAKP >NZ_CP017269.1|WP_069977926.1|3223116_3224079_+|1,4-dihydroxy-2-naphthoate-polyprenyltransferase MSLSCFLKLVEIQTKVASAIPFSLGTLYALYRFQQFNLKNFLLMFISLLAFDMVTTVINNYLDYKKAIKTHGFNYETHNAIVKYDLKESIVIATIAILLAIAVCVGFLLFLNTNKVVLLLGVISFIVGVLYSFGPMPISRMPLGEIFSGLFMGFVIVFISAYIHVYDKNIITLLYHDGMLRLEMNIVELLYLFLMSVPAVMGIANIMLANNICDIEDDMENKRYTLPIYIGKENALKLFKALYYITYADIILLLIVGVEPMISLLMLLTLIPVRKNLKIFYERQTKRDTFILAVKNFIIINVSRIFTIGTALLINFFLIH >NZ_CP017269.1|WP_069981455.1|3224093_3226283_+|DNA-topoisomerase-III MSKAIVLAEKPSVGRDIARVLNCNKKGNGYFEGERYIVTWALGHLVTLADPEVYDQKYAAWKIEDLPMLPQHLKLVVIKQSSKQYHTVKELMGRRDVNEIIIATDAGREGELVARWIIEKAQVKKPIKRLWISSVTDKAIREGFQKLRNGKEYENLYASAVARSEADWLVGINATRALTCKYNAQLSCGRVQTPTLAIIARREQEIQSFQPKTFYGITADTEKLKLTWQDKQSKDVKSFDKDKVDKILIDLQKKDAQVIEVDKVHKKSFSPQLYDLTELQRDANRVFGYSAKETLSIMQKLYEQHKLLTYPRTDSRYLSTDIVDTLKDRIKGCSVGPYAAIGGKLLRQPVKANKSFVDDGKVSDHHAIIPTEQTAFLGDLNDKERKIYDLVVKRFFAVLYPPFEYEQTTIKAKIGEELFIAKGKRVIAQGWKEVYGNHFEEEGQKEDVSEQTLPLVNQGDKLPVIVLVQTKGQTKPPAPFNEGTLLSAMENPVKYMAGEAKELIKTIGETGGLGTVATRADIIEKLFNSFLIEKRGKDIWITSKGKQLLELVPEELKSPSLTAQWEQKLGAIAKGSLKKDTFLQEMRIYAKEVVQEIKNSEENFRHDNLTKTKCPECGKYMLEVKGKKGKMLVCQDRDCGHRKRLATVTNARCPNCHKKLELRGEGEGQIFVCPCGHREKLSAFQERKKQDSNKVSKKDVAKYLNQQKKVQDEPVNTALAEALAKLKLK >NZ_CP017269.1|WP_069977928.1|3226455_3227700_+|S-methyl-5-thioribose-kinase MMIITTDNIVEYVLKNTELFTTRQLCVEDISDFNPQEEKEGFVNYIYRVYNHEKSVIVKQARPYLKYFGESYTLTPLRNLLEHETLKLRGGIVPQYTPKTFFIDKENNIFIMEDLSYLKVMRFQLNKMMYFPKFSKQIGEYLAKSNFYTSELYLDAETHRLLQASFINADMRSIMENAAFIRGAFAEIDYNTPNKRLLNVSERVWSKEEIILECYKMRDIFMKRGECLIHGDLHTSNIFIDCDRMKIIDMEYTFMGPYSFDMGYLIANFVSQFSAFTFKSNIGEEQKENYCCYLLNTIKEMYEYYVHYFNECWEKDLKEEYRSVKGYKESILDTFLSEVIGFAACANMIRLISLAGYPDYDVMEEMADKCNAQGLSIVIDQFMLLNRSKIKSIDELIHIILDIRKDYIKNTLLK >NZ_CP017269.1|WP_156782410.1|3227925_3228084_+|hypothetical-protein MKYKNPYGIDVLQQNERENKKRLERLESYIKQIADDLKDMELKLEQFEALGK >NZ_CP017269.1|WP_069977931.1|3228169_3229246_-|aminopeptidase-P-family-protein MHKERVEKVLSAMQQQHISQMIISDPASIFYLLGKWIHPGERMLVLYLSLEENHKLFINELFPVHEDLGVDKVWFKDTDQPVTLLAQHMEGENVVGIDKNWPSHFLLTLMEHKSDCNYVNGSLLIDQIRSVKDSLERDLMRKASSFNDTAMGSIIHLLSSTHTEKEMAQKLLAIYEELGTEGPSFDPIIAYGANAADPHHGPGNGILKEGDSIIIDIGCKHASYCADMTRTFFYKSASEKAQKVYNIVKEANARAISIIKPGVRFCDIDAAARSYIEEQGYGKYFTHRTGHSIGIEVHDFGDVSAVNTDSVAPGMIFSIEPGIYLPGEFGVRIEDLVLVTEDGCEVLNKFSKELSVIG |
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NZ_CP017269_4 | 3341917-3345719 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017269_4
|
57 spacers
spacers of NZ_CP017269_4
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cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6,WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017269_4
The CRISPR arrays of NZ_CP017269_4 >merge|NZ_CP017269|4|3341917-3345719|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder 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TATATTCGCTCCCTTTATGTATGGTTGCCGAGTTTC GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT ATACCACAAACACCATACAATCACCAAAAAGTATACA GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT CGAATATCCTTCTTCGCACCATATGGCCTCTATTG GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT CTGTCTTTCCCCATACAACAATTCTGAAAAAATCTGC GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT ATCATAAGCATTATCAGGTCTAACGCATCCACTTC GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT TGAAACATGATAAATTGCTCCCGGGTAAACAGGTCGA GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT TAAAAGAACTTGGTAAGACAAATAGTAAAAAAGATAG GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT TACAAACATATTCTATAAGATCATGGATGCTTACTTGT GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT GGGGTAACAAAAGCAGATACAGAACCAGAACTCGTAT GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT ATGTTTCGGCAGAAGTGGCTTGACTTTTTTACGCAAC GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT GGTATTACCACCTGCATCAGTAGCAGTACCCCTCCAG GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT CATAAAAAACCTTTATTCTGTCATCCACTTCTTTTT GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT ATATTGTACCTCTACAAAAAGTGTTATCCTGAAAAT GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAG >NZ_CP017269|4|4|3342006-3345719|CRISPRCasFinder GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT TCGTGTAATCTGAGCAAACTTATTGAAATGTGGCTG GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT TTAAGTAAAGGATGTGGATACTGTGGATATTGGAGA GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT GAATACTACATAATTGACATGGATTTTGCAGGCAAA GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT GTTAGATGATGGTTATATCACCTTCTTCGATCTATTCG GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT CTGGAACTCTCCCTGCTTCCACATTGACCCCAAGT GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT TATAAACATAATGAGAAATGGTATTATGACAAGCAA GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT TATAATAGCAGCATACTGAAGCATGATATTATCCCA GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT TAAATGCGACAGCTCTTATGTATGGTATAGGAAGGTAA GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT TCGGCATGGGGAGAGATCGGACGAAAGTTGATGATTC GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT TGCTTTTGTTCCAATTTGGAGTGATTCTGAAAATAA GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT CTGATACTTAGTGTAGGATACAATACCCTTAGGTAC GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT CTATATATTTCTTTTTTATTTACATTCTTTTCATTC GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT TAGTTCTCCTGTCGTAAAGGCGAACCATGCACCGATT GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT TCGTATCCAACCTTTTCAACTAGCTTACATACCTTTTC GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT CAAGCAGAAGAAAGGGCAGTGGCAGAGGAAAGGGCAT GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT 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CGAATATCCTTCTTCGCACCATATGGCCTCTATTG GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT CTGTCTTTCCCCATACAACAATTCTGAAAAAATCTGC GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT ATCATAAGCATTATCAGGTCTAACGCATCCACTTC GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT TGAAACATGATAAATTGCTCCCGGGTAAACAGGTCGA GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT TAAAAGAACTTGGTAAGACAAATAGTAAAAAAGATAG GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT TACAAACATATTCTATAAGATCATGGATGCTTACTTGT GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT GGGGTAACAAAAGCAGATACAGAACCAGAACTCGTAT GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT ATGTTTCGGCAGAAGTGGCTTGACTTTTTTACGCAAC GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT GGTATTACCACCTGCATCAGTAGCAGTACCCCTCCAG GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT CATAAAAAACCTTTATTCTGTCATCCACTTCTTTTT GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAT ATATTGTACCTCTACAAAAAGTGTTATCCTGAAAAT GTTTTATCTGCACTACGTGAGATGTAAAG TTAAGGGCCCGAATAACAATGAAGCCAAGAAAAATATC GTTTTATCTGTATTACGTGAAATAGAAAG
>NZ_CP017269.1|WP_069978091.1|3341558_3341822_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVIVTYDVGEKRVNKVRKHLKKYLIWVQNSVFEGEITEGKLEKCLMELSRKINKHEDSIYVYKIKIPSQITKDIIGEEKNVDDMFL >NZ_CP017269.1|WP_069978089.1|3340576_3341557_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MSRDYYIFSNGRIMRKDNTIYFEDAIGARRALPVEDVDKIHFFGETDLNSKLLNYVSKYGILLNFYNYHGFYTGTFYSRKKNVSGFLLVKQAEHYSNLSKRLYLAKSFIDSAVFHILRNLRNYAGTEEFIEKIETERNNIYKSSQIDELMGTEGRIRKIYYEAFNKVLKNGFCLEKRQKRPPTDPVNALISFGNSMIYTTVLGEIYKTQLEPTISYLHQPSTKRFSLSLDLAEIFKPLIIDPIIFRLANNRMITEDDFDEEEEVCFLNEQGKKKFLKEFEAKLETTITHRKLGRKVSYKTFIRLECYKLIKHLVDDEIYKPLKAWW >NZ_CP017269.1|WP_069978087.1|3340055_3340580_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MDYDFEKLKTQGTKVNYYYICKRKLWFFDKGISMEDNSDRVLQGKILHESSYPRIETREILIDDMLKIDIMDNDFIREIKISSKMTNADYMQTVYYLYYLKQLGIKKKGMINYVKERKREEIELTEELEKEIEKTLIDINDILSRDKPPRLEKLPYCKKCAYYGFCYIKEDDDK >NZ_CP017269.1|WP_069978085.1|3337778_3340025_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MMIYAKSKPIESLKEHTDKLIRNYYLLQECYGKKIQNPKMWNMLLTAVRYHDAGKIYCQFQNKIIENIRKEYKAEIQGVEQIVDYDLPHNYLSPAFLPHFKDLGLSKKEFQVLVQAIAYHHERNQEPDTLKIRDIIEQDLQYKIENVRNELLVEVPDKLMSQYTAYISSLKRIKSDDENYFLYVLIKGLLHRIDHSASASLQDYFEEIERDVNKNVAQYTSDYLTRKNYPLRDVQIFSQNNKEKNLIVVASTGMGKTESALLWIDNDKAFFTLPLRVSINALYDRVTKKEDIEKKEDGMGYEYTGLLHSTSMDHLDEAGYENWEEIYDHSRILSSKLTFTTIDQIFKFPFKYRGYEKLYATMAYSKVVIDEIQAYSPDIAAVLLKGLEMIHQIGGKFMIMTATLPKLYIQTLQERGVLTQDDFVMGEYLSDRIRHKIEVKDKAIMSDIDEIIKRGKEKKVLVIVNTVDRAIELYGELSRTGEADVYLLHSLFIQKHRSYLERQIKDFANMSDTKGIWITTQIVEASLDVDFDYLFTELSALDSLFQRLGRCYRKRKFDLSEPNAYIYTEEVKGIGTIYDKDIWNMGKAAITEYNFKELSERDKVNMVDHLYSEENLKETRFLKTFKNALSFLDTNNDYELSSNEAQRVLRDIESINTIPREIYESIDDLLQKYKAEADKNERKRLRREISKYTVNVPLYKVKKNKGAVSPINIAGLENFVILEREYDFPEDIMKGKGVIVDEALSNMF >NZ_CP017269.1|WP_069978083.1|3337071_3337749_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 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MGLIGFIRILKEAGKIDDNDIKKMKNNYIEFNSELLEDFHKNYFDYFLKRYDISVRECEKIDRYLLIAQKEDKFKNATDWIKGVVDNNRKKIKGKLENKVFEQQFDEIYKNLSKIKKADQIEELKDSVSQFKKLMTVKDVNNKLSINFVRSIFSKQYFGQASFLQKPCAAKSVEEQSEIMFRDYIKPVIGLSELMDQSKDIDALKMNLENELKDSSLSKNYEKMLKTISGLAKTRDSLEAVKKCFYEDMLYCSVWENFRATNDFTEGVFAPLAVSNNNAKNYMWDFCTFYPISDIAKLILLCTPAGTVDMQDEYFGFVNLDTDVYELFRQNENLRLKKEEDNVFESLIYDIVSEAREKSKWMLQNILFIEFKMDIDSKNCKLNYFNIPKNVASYFKKHAQNDLGEIKDKTFKKDLVALMLDNKTIKTITYQYNEKSKGKEQIANNIERLIEVKLRSIISSEKYSAYDALLATIAKHKFNRTKEGCEKVDSKKIWVIYKSGQELNTYFKRNQSENKIQGIAYRLLNASKAGNKKEFLDSLLRIYMTAGKEVPSIFLNVMHEQDLEFETVAHAFVSGLISSENHGVKEDK >NZ_CP017269.1|WP_069978074.1|3333620_3334349_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRLKCEYKASKIPITYQMMFVSLIKEALKISDSDYFQKLYKYGDAANKQSKNFTFAVYMKDYEIADEIFSIKDKVVLNISSPDLEFMIKVYNGLLKLNQFKYKDYLLNKIRIDLVKEKEITSSEVMLKTLSPICIKTKNHRFMKPEDETYVDELNYIADIVLRNYRGQGLQEKLDFIPLQMKKTVVKEEIRDYKANTGDKHLQIHAYAGTFKLKGNVDDLKDLYALGISFKRNQGFGMVEVI >NZ_CP017269.1|WP_069978072.1|3332598_3333555_+|transcriptional-regulator MSSIGNALKLYLLLQSKGKMKIRDIAKELEVDERTVRRYRDDLEQAMIYIDSQAGKHGGYYLHNDNYLLGLNLTCEEYLTFLMIKEELEKSNHVVLKDYDSALQKIQQVYISGKNEKDRINIFNFIAKGTKANININEERKKLIDIHAAALTKNKIQIQYTSLSSGLTERIVRPYATIQYKGDMYFTGYCERKQAIADFKLCRIHEYTVLNEKFLADKSFDLDEYMKNCIGIFKDDEIHIKLKVYHPMSQIVKEKIWVENQIITENEEDHSIIYEATMKGVEEIKSWILSMGSKVKVISPQFLADKIKNEIKNMHKIY >NZ_CP017269.1|WP_069978066.1|3331902_3332367_+|QueT-transporter-family-protein MKKTVFLVQAALIGAIYAVITIAFAPISYGEIQVRISEALTILPFFTPAAIPGLFVGCIVANIYGGGGPVDIVFGSLATLLAAFLSYKVPKKWMVPIPPIVVNGIVVGFILNYLYQVPLLAAMGWVTLGQTIACYGLGYPLIGLLERYRDKIFR >NZ_CP017269.1|WP_069978094.1|3345899_3346508_+|hypothetical-protein MNQNFFDMEVQGLLEQLDETDKKPMEMYMRMIGNPNKVKEFCQIFFRSVEENGSAFTICMKIIEKTRRKEFFPVLMEAVQKAVNPIQVQSIFKSCNALPDDMAIVKSFMKPFVEAMQNNMDTEVCYHGVCLMYRIVSKFPEIEEDLKSLQIYVNHERIQNISRRFDILDKWQTANHRGKNTPGYFMNENDFLEFALKFIRIK >NZ_CP017269.1|WP_069978096.1|3346796_3347855_-|2,3-butanediol-dehydrogenase MKAAVWYGKKDVRIMDVPEPSAPGEGKVKIKVHWCGICGSDLHEYLVGPIFIPTTEPHPLTGDVAPVILGHEFSGEIVEIGPGVTNFKVGDRVAPDACQVCHKCYACKIGKYNVCDQLAFTGLMTNGAFAEYVVVPEYTLYKIPDNMSYETAALLEPLAVGVHAVRQAPIALGESVVIFGAGTIGLATLQAVRAAGVSKIYVVEVAKARKDFAKQLGATEVFDPTKMDIKEKIKEVTKGVGADVVFECIGSHKVTPIAVEIARAGGKIVIVGVYEKETSLNFNNVVFKDKHIIGSLAYAGDFAIAIDLINDGRINVEPLITGKIRIDDLIEKGFDELVNRKEENIKIIVTPW >NZ_CP017269.1|WP_069978098.1|3348593_3349202_+|hypothetical-protein MNQNFFDMEVQGLLEQLDETDKKPMEMYMRMIGNPNKVKEFCQIFFRSVEENGSQFTICMKTIEKTRRKEFFPVLMEAVQEAVKPIQVQSIFKSCNALPDDMAIVKSFMKPIVEAMQNNMDTEVFYHGVCLMYRIVSKFPEIEEDLKSMQIYVSHEEIQNISRKFDILDKWETANHRGKNKPGYFMNENDFLEFALKFIKIR >NZ_CP017269.1|WP_069978100.1|3349396_3351274_+|diguanylate-cyclase MTAQLKSHSQDTYRALIENMLDGFAYHKIVFDDEGKPIDYIFLDVNDAFEQLTGLKKEEILGKRMTSVFENNLEEDSDWIDLYGQVAITGESIRFEKYFHPLKRWYSVSAYSNETGYFSTIFHDITNNKENEEKLSRERDVITKLMETSPAGITVVDRKGQIIFANARAEKIFGLTRSEITTRKYNEAKWRNMDINGRPLADEELIFRKVLETGEAIDDYHQMIERPDGTRVFLSINGAPLLNEEGIISGIVFAINDITQTMQAEEEIRYLSFHDKLTGLYNRAYFEEELARLDTGRQLPLSLILGDANGLKLVNDAFGHEAGDNLLKRVAEIFKEVCRQEDIIARVGGDEFAVILPNVGTDELADIIARMKDRCKEETADPIKVSIALGAATKEYESQNIQALFKLAEDRMYQNKLFESKSTRSSILASLKQSLEERTHETEEHGQRMKLLALKLGRTIGLNENQLYKLDLLAQLHDIGKIAIPDYILEKNNELTEDEWKIMRTHSEIGYRIAGASQELTVIADSILYHHEHWDGSGYPQGIQGEEIPLLARIIAVIDAYDCMTHDRPFARAKSKGEALVELRSCAGKHFDPNIVEAFIQMLAHKKQSNAQREVAVSVESEQKI >NZ_CP017269.1|WP_069978102.1|3351467_3351887_+|Hsp20/alpha-crystallin-family-protein MFGGLVPFSKRTGEMENIFERMFQEDFGLPAISTGMRVDIKEDEKGYVLEAEIPGVDKEQIHIDYRNDYLIISVENKVEVNEERENYIWRERKMAKTSRSFYVENIHSEAIEARYENGILKILLPKDEHKKTSKKIEIQ >NZ_CP017269.1|WP_069978104.1|3352096_3353131_+|HD-GYP-domain-containing-protein 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MNSIRKLTKQDSETFSRLIVNAYPGFGHTQTDRENFQSRMDSIVDTDDGGGFYGFFLDETIVGGMRLFDFQMNLFSQKINVGGIGAVCVDLLHKKERIAKELLTYFLEHYRDAGSSMVMLYPFNANFYRRMGFGYGTKMNQYRVKPESFPKGTSKEHIVYLNEKDQQAYIECYQRYMNKTNGLLAKKSFEIRNTFDGDYRIVGYKEDGKLLGYVVFTFEKEKESYRFIYNMIVKEFIYETKEALAELCTFLHTQADQVHRIHINLQEESFHYLLSDPTNGLNDTFQTFFLETDASGIGVMYRVINVEGIFKELHAHNFNDETCRLKLWIEDDFFPKNNGSWIIHFINGKAVRVSEEDYEAEVSMKICDFSSMLMGAVNFRTLYHFGLAEISDEKYVGQVNRIFMTDHKPVCMTMF >NZ_CP017269.1|WP_069978111.1|3355849_3356605_+|NYN-domain-containing-protein MIENYNDSKENRMAVLIDGENAQPSLLGKMLAETGKHGSVTVRRIYGDWTTSNMNGWKDALHNYAIQPIQQFRYTVGKNATDSALIIDAMDILHGKLVDGFCIVSSDSDYTRLATRIREEGIFVMGIGEKKTPKAFVNACDVFIYTENISPREIKPILKEDNQKKKENGKALALVQMLREAFEMVVQEDGWAHLGSMGKALLQLDPGFDPRTYGHKQLSQLIRAYSKHFVLKRIDESGPSAVYVQSKEQGA >NZ_CP017269.1|WP_069978113.1|3356656_3357484_-|phosphoenolpyruvate-hydrolase-family-protein 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017269_5 | 3857916-3858007 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017269_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP017269_5
>5.1|3857939|46|NZ_CP017269|CRISPRCasFinder CGAAGAATGCAGGCTTGATCCCACGGTGTCTTCCCGTGTTGCCCAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017269_5
The CRISPR arrays of NZ_CP017269_5 >merge|NZ_CP017269|5|3857916-3858007|CRISPRCasFinder CTGTATAACAGCGCTTATGTTGACGAAGAATGCAGGCTTGATCCCACGGTGTCTTCCCGTGTTGCCCAGCTGTATAACAGCGCTTATATTGA >NZ_CP017269|5|5|3857916-3858007|CRISPRCasFinder CTGTATAACAGCGCTTATGTTGA CGAAGAATGCAGGCTTGATCCCACGGTGTCTTCCCGTGTTGCCCAG CTGTATAACAGCGCTTATATTGA
>NZ_CP017269.1|WP_069978989.1|3856235_3856820_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MPTKGDNTKQLIKDTAKHLFSNKGYASVTMKDICDACNLSRGGLYRHYSSTKEIMLEILTDDKEEMKKLLECSFQKKVPAVQLFDGFLNMIRADIQNGANRFYFVIHEFAFVESEQNEYMENRFNSAVQMLSMLLNYGKRTLEFKEFETNAIATHIAFFRDSIVTSSISLHLSNDLIDQQLKLIKDMVIRNESE >NZ_CP017269.1|WP_069978987.1|3855583_3856249_-|chloramphenicol-acetyltransferase-CAT MNPNNFTPIDLQTWPLAQMFYYYTQMAPTTYTVNVSMDVTILRKTLKDKEMKFFPAYLYLVTKAIEKQPELRISKQDDILGHWDFLTPAYPQFHDDDKTTSLLWTEYCNDFMTFYSNYIDDTKRYGDSHGILSAKGIPPASAYIISCIPWFTFNSFSLHNHGIKDYYVPSLEAGAFYENNGKILMPLSITVHHATTDGYSLKVFFEELQQSMDNPEEWLAL >NZ_CP017269.1|WP_083273628.1|3854629_3854989_-|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MLEAMKAADRQESAYKRRTYYHRAHYTLDMGDGIANECVTKPETPEEIYIKEETTQEIEDAIENLTEAQKRRLRQRYFEGMKIQQIADMEGVNHSTICYSLRASLKSLKKQTQIKRFRE >NZ_CP017269.1|WP_069978985.1|3853724_3854354_+|chloramphenicol-acetyltransferase MGNTYEIIDESKWKRALHCQIFRNSIEPSYCVTFELDITNFLEKVRAEKISFTLSLIFAVSKCANNIEEFRYRFLDGQIVLYDRINTAFTYLDKNTELFKVVNVDMQDTLASYISVAAQKATNQKDYFTGPLGNDVFQFSPMPWVSYTHISHTNSGKKDNSTPLFDWGKYFDRDGKKILPFSVQVHHSFVDGIHIGKLVDSLQDYLNKI >NZ_CP017269.1|WP_069978981.1|3851756_3853286_-|recombinase-family-protein MKRQPDKKIYLYGRLSHEDELQGDSNSIINQRKILTKYAEENGFTPYEFIYDDGFSGADFERPSFTKMIEEVEAGNVATVIVKDMSRFGRDYLKVGFYTEILFSEKDVRLIAVNDNVDIGRGENDFTSMMNLFNEWYVKNTSKKIRAVWQAKGKSGERLAVIPPYGYRKDPDNPKQLVIDEESAANVRRIFRLSVDGYGPAQIASLLNDEHILNPSGYKYEHDIVKKARPCKDPYFWNTTTVHKPEYLGLTINFKTWSKSYKDNRPRLNPPEKQLVFEDTHPAIIDPETWDIVRSMRQHKRRAPRYGKSGLFSGVAYCADCGAKLYFYTRSIKNKWGTRYEGSYSCSEYRKDVQYQGKRKCTCHFIRESQLEQLVLEELRDLLRYIPKHEKQFARVVMDRSAQEYKRETAAKKRTAEKHRCRIAELDTLIERLYVDNVSGKITDERYEKMSGKFETEQEELTPAIVHEFIDRIIVHEPEQARGDRRQKVETIYNNIGAVDRLSLMGLGT >NZ_CP017269.1|WP_069978979.1|3849970_3851158_+|IS91-family-transposase MVELQDIFNQYGQGYREKHRLPNHILKAMSAIASCRTHTLGGHVDECDSCGHIRVSYNSCRNRHCPKCQTLTKERWIENRKKDLLPVGYFHVVFTMPEELNFMTLLNQREIYSILFKAVSETLLELGRDAKYLGGEIGFISILHTWGQNLMDHPHIHCIVPGGGLSHDGSRWISARKDFFIPVKVLSRKFRGKFLYYLKRIYSEKKLKLVGNIKILKNVGEFKYFIGKLYKREWVVYCKPPFQSAEHVLEYLGRYTHRVAISNHRIVKLDNGQVTFRWRNYRDGNKKKLMTLTVEEFIRRFLIHILPSRFVKIRHYGILSNRNRKIKITKCKVMMGVVLRKDDNAVVKLSVAELLLKLTGVDITRCPCCEKGKMLTKEKPIPKNCSPPEREIKTA >NZ_CP017269.1|WP_069978978.1|3849465_3849978_+|tyrosine-type-recombinase/integrase MPLYSYQHLAILMTIYAAGLTVSEAAKLKVSDIDSKNMQISVRCGKGKKDRYTLLSKTNLDILREYWMRYHPGDYLFMGADGKSPITARTIQRIFEEAKEKAGIKKNASVHTLRHSFATHLLEAGTDICYIQRLLGHTSINTTTIYLHLRRMDLLNIVSPLDSLTGVNNG >NZ_CP017269.1|WP_069978976.1|3848856_3849249_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MIKYHRDKKVDYNRLIDLFNQVGWRDKTNDRDRLKAMVDNSQIVVTAWDEDVMVGSARCTTDYVFNGQINNVVVDAEYRRKGIEKALINKILEHSNQVTYMLRGDTRNEGFYRRLGFEDGSIALVYKRQG >NZ_CP017269.1|WP_069978974.1|3848266_3848713_+|hypothetical-protein MKKFFKIVGIGFISGILLFTLSRHGWRVFGFSMCDSPSSLYAEMVSVENDILRIKGGTTSSASAYVGHIYVVEDRSLYVGVKHNTLLGFINRWGDFYIRIAVDTTHIENVYFKDKNREKLIWNVHEGLIRTAPQATQSIDGAAEDNQE >NZ_CP017269.1|WP_069981503.1|3846502_3848092_+|NAD(P)/FAD-dependent-oxidoreductase MIRVNEIKLSIEEDLNNIKEKIIKKLRIQPQELLSYQIYKESIDARKGDEIFFVYTVDVSLKDEGKVLKKHKNLIKTPSYSYKEIPSGKIPMNDRPVVIGTGPAGMFAGLILAQRGYKPILLERGRDVDARSKDVEDFWLRGQFQKESNVQFGEGGAGTFSDGKLTTRIKDVRVRKVLEEFVEAGAPEEILYSYKPHIGTDILKDVVKNIRKEMKKLGGDIRFDSKVTDLLIEGGKIKAVEVNCQEWIRTENVVLAIGHSARDTYEMLYQRGVQLRQKPFSIGVRIEHPQELIDQSQYKKFSGHSRLGAADYRLTYQSTKERAVYTFCMCPGGMVVAANSEEAMVVTNGMSEYSRDRENANSALLVQVNTEDFGGSHPLQGMEFQRIWEREAFKLGGSNYHAPVQRVEDFLEGVPSKRIGMVKPSYLPGVTPTDLRKCLPDFVIEAMKEAIPEMDKKLKGFALADALMTGVETRSSAPVRIERFEETLESLNVKGLYPVGEGGGYAGGIVSAAVDGIKAAEKIIQKYRV >NZ_CP017269.1|WP_069978993.1|3858436_3859210_-|2-hydroxyglutaryl-CoA-dehydratase MFFLGIDIGSSATKLVVIDKNKNIVGRSVVQLGTGTSGVENAVSNLYISHDFNPNDITGSVVTGYGRKQFRSADTEISEISCHAKGVSHLCPSVRTIIDIGGQDTKIIRIDEKGKIQDFTMNDKCAAGTGRFISVMSKVLDVDIADMGSIDKEATEIISISNTCAVFAESEVISKLSSGFSIPNIVAGIHQSVARRVAGLAYRNRIEPVLALTGGVAQNMGMIRALEQELNNQLIIPYEPQLTGALGAALFALENNR >NZ_CP017269.1|WP_069978995.1|3859416_3860814_+|sigma-54-interacting-transcriptional-regulator MTEKNLLYEVLEQSNEGFLIMDAKGTVITVNKAWIQLCTNVLDFDKNVIGTHVFEFKEYINYFSVAEYIVKNKTSYSKVYAPFEDRVIFSSGKPITDNSGKIIYFVVKVNDISDIFHLRNQVENFSRIKELYIEYSKSQTNADLNPIQADPKMQKIYQKCLAISATDATVLIMGESGSGKEIVANFIHNNSNRSEKPFVSINCGAIPGTLIESELFGYAPGAFTGANKTGKKGIFEAANTGTLLLDEIGDMPLEMQVKLLRVMENKVIRRVGSEKDISVDVRIIAATNCALPQLVKEGKFRRDLYYRLNVIRITVPPLRERPKDIVALSKYFHNLFSRKYHHTAAKKVFPDQLLEQFLLYDWPGNVRELRNIMEQLVLLSENGTLDQNIFLSIINDDMSIQNRIITENVSVKQIARLDDIIEETEKQLFKKAYRMKKTSREIAKLLNVSQTTVIRKLKKYGITTD >NZ_CP017269.1|WP_069978997.1|3861086_3862340_+|2-hydroxyacyl-CoA-dehydratase MSERRITSKQLLQKLQLDYYLDLNKARYNGRKVAWASSIVPQEFMEVMNIAVAYPENHSAAIAAKKGALPYIDQAEKMGYSNDICSYARINLAYAAMKTNEIPPLPKPNFVVCTNNICNVLIKWYESLAKHFKVPFFLIDVPFNHENCGVNEETSTFNPIPQDRIDYVKAQFEEFIKFLEDICGKKFDYEKFKEVMTISNRTAKAWSKAMNYASMMPTPLDGFNMFNYMAMMVCLRGKKESAMLYEMIAAEMEENIKAGKSQFPGEQKYRIMWDGIACWPYLKHNYTSMLKNGVVISGSTYPKAWEIVYEVGNMDELASIYAGIGNNRNLADQRDIRAVIQRSCKCDGVIYHMNRSCKVMDFMQPEMRRQISEITNIPFVSFDGDQSDPKNFSEAQFETRVEALVENMKGNKEGLAQ >NZ_CP017269.1|WP_069978999.1|3862336_3863467_+|2-hydroxyacyl-CoA-dehydratase MSRVDDLLKQMIYVTENVDKVVSDKKHSGKKVVGVLPIYAPEELVHAAGMFPVGCWGGSTNISMAAKYLPPFACSIMQAVMEYAERGTYKDLDALLVPTPCDTLKAISQNLIYACPDQKIIILTHPQNNKMEAGVIFAKSEFAKVKAQLEAVAGTTISDQVINESIEIYNDHRSALMKFTEIIANNPGVLSAVNRHYVIKSGLYMEKEEHTKLIRELNSILKAEPKMDWPGKKIVLAGILAEPNGLLEIFDEFSLAVVADELAQESRQFRTLVPEGKDPLERLARQWQNREACSVILDSEKKRAKHIAALAKANQADGVIFCQMKFCDPEEFDYPSIKKACEDAQIPLLHLESDQLSDSTGQYRTRIQAFCELLGH >NZ_CP017269.1|WP_069979000.1|3863487_3864843_+|hypothetical-protein MNYIKEYQNKLMTADDAARTVKNGDFVMYPHFAIKTPLLDEALAMRKMELEDVKINFVTLTYMPEVIKADPEGEVFIFRDGSFSAATRGFCKMGIPIVAIPSLYHEAGRNYEIEQLKHDVLFLAVTPMDDKGYFNLGPSSSYIVDMIKERGGIGRSMKIFVEVNAKLPRVPGDNHVHISQVDGIIEGEPEDMMAIPKIPPTAVDKKIAEHIMSEMVDGACLQLGIGGMPNYVGSMLADSDFKDLGCHTEMFVDAYMDLYNAGKLTNKRKNIDVGKSVFTFAMGSRKLYEFLSNNLEVECRSVSYTNNPFIIAQNHNVFSICSCIAVDMMGNVSSESVGYKQISATGGQWDYHYASMHSNGGKGFVCMPSTKKDHKGNVTSNIVPSLPVGTQISVACNTTNYVVTEYGAVNIKGLSMWERVESLVSIAHPDFREEILQAAAKAGIWRRSNKR >NZ_CP017269.1|WP_083273629.1|3864864_3867183_+|3-hydroxyacyl-CoA-dehydrogenase/enoyl-CoA-hydratase-family-protein MKYNIKKAAVIGAGVMGAGIAAILANAGITVVLLDIVPKEFLGAEGKKRSALAVGAIERLLADKKLPAFATDEMAKYITPGNLEDDLSLISDCDWIIEVVAENLEIKHKLIERLLPHIKADAILSTNTSGIPVASIAKNMPVDLQKRFLGTHFFNPPRYMRLLEIIPTAETETDVIEYMTDFGYHILGKGVVKAHDTPNFIANRIGAVVTPLAFRQMKKYGFGIDKIDVLTGKLIGRAKSATFETADLVGLDVLAHVNNNILGALTDEEEKEYFKLPEEIRAMCENGQLGNKTDAGFYKRVKDENNKKIKLVWDFAKQEYVMPDQIEVPFIEVGKKISRLRDRLCALIYSDEAESKFLWENISEIIYYSAKVKNEVADDYKDIDNAMKWGYNWEVGPFELWDLIGFEKAALRMKADGKKLPEWVEERLVKKENFYERDPDFNSFESVYPVLKKFNHSTLLDLGDGVLGLEFKSPGDSITANIRKELVTAIDQVENKNQYKGLVLLNSGGNFLVGADLKEMITSIMAGQLNDVGDKISEFQQVSLRIKYARKPVIAAVHGMVLGGGCEFALQASRIVAHVDTYMGLVEVGVGLIPAGGGLKELVQRNEKLLKSLSCNDFTPTIQKLLFQVATAQVSKNAYEALQLGYLQPTDIIIAQIDGLTERAKEEVLRLAKDGFRQVLPKQTQVTGNSGMATLRAIIMGMTEGGFITGYDAEIAEKIAKVLTGGDVPNGSQITEQELLRLEKEGFTELIQNAKTHERISGMVKNRRPVRN >NZ_CP017269.1|WP_069981505.1|3867201_3868386_+|thiolase-family-protein MKNNAVLVAMGRSAIGKAPKGTLRYTRPEELASQVLQGVLAQLPDLPQGQIDDLILGCAMPEAEQGLNVARMIALKAGLGESTPGQTINRFCASGLQSIAIAANTITSRQNDIVIAGGLESMSALPMGGNMMRPDPGLIKNSPHVYDSMGITAENVAAKYHISRENQDAFSVRSHVRAYEAAGNGKFVEEIIPVYADVIEKTENGRTVTNKIIFDKDEGIRPDSSIEALAKLKPIFKVKGSVTPGNSSQTSDGAAFVVMMSEDNAKAFGYQPIAKLIGYSVVGVPPDLMGIGPIYAIPKVLQRNGLTLKDIDLIELNEAFASQSIACINELGLNIDKVNVNGGAIALGHPLGCTGTVLTIKLLQELRRRGQKRGIVSMCIGGGMGAAGVFELIG >NZ_CP017269.1|WP_069979002.1|3868829_3869792_+|AEC-family-transporter MNTFTYILLNSIMPIFIIISLGFVLGKKFEMNIFTLSRIVVYLLVPAFIFENIFTVNFDFSMVKILLFSVVYLVSNYILAKIISNILKYDARLSDAFANSIMFNNIGNIGLPLITLAFSTAPFVVGEKTPYLNEALAALVVVMIFNNVTSNTIGFYIGGRGTVSFKKSIINTLKLPAIHAITLALIIKALHFDITLTPIWSALILLKNGLGAIALIAMGVHLSTIKLDFKDVNVYISSFIRLIIGPLLAMLLIYIFRFDSVVAQTILIAYSVPIGLTTALIAIEYNNNQDYTIQAVVASTLFSTITLPFVIYIAGMIYPA >NZ_CP017269.1|WP_069979003.1|3869846_3870554_+|RraA-family-protein MKRLNKEQLNVLKEFDTPTVCNALEGFRIRSNTVGFCHPGMVLRTSDTKPMVGYAVTAKISGWGKPTEEQKEMMFSYFRDVRDVEEPTVAVIQDIDERPIGSFWGEVQATTFKALGAVGTLTQGGIRDLNEVDALGFYFFSTEMMVARAESHLVERNTPVEICGLTIHPGDLIHADHHGATVIPAAVAPRLAEACRRVAKAELFVLEPCLKAIERGEKPTVDQLRQWREQMVRLR >NZ_CP017269.1|WP_069979004.1|3870566_3871400_+|transketolase MRRNLNKEQLIEKSRQLRINILKMLSKAGSGHPGGSLSAIDILTVLYNNILRHDPKIPGWEERDRLILSKGHVCPALYAVLADFEYFHEDELKGLRKYGSMLQGHPCMNKTPGVEVSGGSLGQGLSIATGIALGGRLDQKDFRVYCLMGDGEIQEGQIWEAAMAAGHYKLDQLCGIVDYNRLQIDGVVDEVMGINPCKDKWIAFNWNVIEVDGHDVLKVEEAFKQAEAYKGKPTVIIAHTVKGKGVSFMENSPAWHGTAPNHAQLEEALLELESKKG |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017269_4 | 4.24|3343480|36|NZ_CP017269|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3343480-3343515 | 36 | AP013434 | Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G16, isolate: uvMED-CGR-U-MedDCM-OCT-S32-C65 | 6205-6240 | 7 | 0.806 |
NZ_CP017269_4 | 4.32|3344013|36|NZ_CP017269|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3344013-3344048 | 36 | MN693914 | Marine virus AFVG_250M396, complete genome | 1462-1497 | 7 | 0.806 |
NZ_CP017269_4 | 4.13|3342754|36|NZ_CP017269|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3342754-3342789 | 36 | NZ_KT020842 | Clostridium perfringens strain JP838 plasmid pJP838B, complete sequence | 7310-7345 | 8 | 0.778 |
NZ_CP017269_4 | 4.24|3343480|36|NZ_CP017269|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3343480-3343515 | 36 | NZ_CP029455 | Bacillus cereus strain FORC087 plasmid pFORC087.1, complete sequence | 37394-37429 | 8 | 0.778 |
NZ_CP017269_4 | 4.24|3343480|36|NZ_CP017269|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3343480-3343515 | 36 | NC_010933 | Bacillus cereus strain G9241 plasmid pBC210, complete sequence | 192225-192260 | 8 | 0.778 |
NZ_CP017269_4 | 4.24|3343480|36|NZ_CP017269|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3343480-3343515 | 36 | NZ_CP009940 | Bacillus cereus strain 03BB87 plasmid pBCX01, complete sequence | 204734-204769 | 8 | 0.778 |
NZ_CP017269_4 | 4.24|3343480|36|NZ_CP017269|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3343480-3343515 | 36 | NZ_CP009591 | Bacillus cereus G9241 plasmid pBC210, complete sequence | 112250-112285 | 8 | 0.778 |
NZ_CP017269_4 | 4.24|3343480|36|NZ_CP017269|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3343480-3343515 | 36 | NZ_CP013332 | Fusobacterium hwasookii ChDC F174 plasmid unnamed1, complete sequence | 16243-16278 | 8 | 0.778 |
NZ_CP017269_4 | 4.11|3342624|36|NZ_CP017269|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3342624-3342659 | 36 | KJ603229 | Shigella phage POCJ13, complete genome | 3997-4032 | 10 | 0.722 |
NZ_CP017269_4 | 4.11|3342624|36|NZ_CP017269|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3342624-3342659 | 36 | NC_029120 | Shigella phage 75/02 Stx, complete genome | 3997-4032 | 10 | 0.722 |
NZ_CP017269_4 | 4.13|3342754|36|NZ_CP017269|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 3342754-3342789 | 36 | NZ_AP017978 | Neochlamydia sp. S13 plasmid pS13, complete sequence | 100044-100079 | 10 | 0.722 |
1. spacer 4.24|3343480|36|NZ_CP017269|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to AP013434 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G16, isolate: uvMED-CGR-U-MedDCM-OCT-S32-C65) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
---tatagagtcttttctaattcttttatatatcttttc CRISPR spacer ggataca---tcttctctaattcttttatatatttttta Protospacer **.* ****.******************.****
2. spacer 4.32|3344013|36|NZ_CP017269|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MN693914 (Marine virus AFVG_250M396, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
tgtaaaactactagaatatgtcacattttcagccaa CRISPR spacer taaagaactactagattatatcacattttcagttaa Protospacer *. *.********** ***.************..**
3. spacer 4.13|3342754|36|NZ_CP017269|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_KT020842 (Clostridium perfringens strain JP838 plasmid pJP838B, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
-ctatatatttcttttttatttacattcttttcattc CRISPR spacer cttata-atttcttttttatttaaattattttctaat Protospacer .**** **************** *** ***** .
4. spacer 4.24|3343480|36|NZ_CP017269|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP029455 (Bacillus cereus strain FORC087 plasmid pFORC087.1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
tatagagtcttttctaattcttttatatatcttttc CRISPR spacer cttattctttttactaattcttttatataccttttc Protospacer . ** *.*** ****************.******
5. spacer 4.24|3343480|36|NZ_CP017269|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_010933 (Bacillus cereus strain G9241 plasmid pBC210, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
tatagagtcttttctaattcttttatatatcttttc CRISPR spacer cttattctttttactaatttttttatatatcttttc Protospacer . ** *.*** ******.****************
6. spacer 4.24|3343480|36|NZ_CP017269|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009940 (Bacillus cereus strain 03BB87 plasmid pBCX01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
tatagagtcttttctaattcttttatatatcttttc CRISPR spacer cttattctttttactaatttttttatatatcttttc Protospacer . ** *.*** ******.****************
7. spacer 4.24|3343480|36|NZ_CP017269|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009591 (Bacillus cereus G9241 plasmid pBC210, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
tatagagtcttttctaattcttttatatatcttttc CRISPR spacer cttattctttttactaatttttttatatatcttttc Protospacer . ** *.*** ******.****************
8. spacer 4.24|3343480|36|NZ_CP017269|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013332 (Fusobacterium hwasookii ChDC F174 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
tatagagtcttttctaattcttttatatatcttttc CRISPR spacer taattatttttttctaattcttttagatatttttta Protospacer ** * *.**************** ****.****
9. spacer 4.11|3342624|36|NZ_CP017269|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to KJ603229 (Shigella phage POCJ13, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
tgcttttgttccaatttggagtgattctgaaaataa CRISPR spacer ctgttttgttccactttggattgattctggtcctca Protospacer . ********** ****** ********. * *
10. spacer 4.11|3342624|36|NZ_CP017269|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_029120 (Shigella phage 75/02 Stx, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
tgcttttgttccaatttggagtgattctgaaaataa CRISPR spacer ctgttttgttccactttggattgattctggtcctca Protospacer . ********** ****** ********. * *
11. spacer 4.13|3342754|36|NZ_CP017269|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_AP017978 (Neochlamydia sp. S13 plasmid pS13, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
ctatatatttcttttttatttacattcttttcattc CRISPR spacer ccctctatttgttttttatttaaattcttttgggat Protospacer *. * ***** *********** ******** . .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
193163 : 232876
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017269|193163:232876|DBSCAN-SWA 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32 | Erwinia_phage(12.5%) | protease,integrase,transposase | attL 193121:193136|attR 247874:247889 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
288089 : 295276
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017269|288089:295276|DBSCAN-SWA CTTATGCTCCCCCCATAGCTTCAGTTAATCTCAAAGTTCCATCTATTTCGCCTTCTGTAATTTTATCTGAAATGCTGAATTTCCCTCCCTCTTCAAATCCTTTCTCGAAAACCTTTGAATGTCCCTGAAAGGTTGTATTGGTGTCAATAATTCTCATAAATTTCTTCTTTGAATATGCCTCAACGACCTCACTGTCTTTTACCAACACTAAACCCCATTCCTGATTAGCCTTTTTCTGTTCATCAAATTTTTTTCTGAGTCCAGATATAAAGCCAATCGCATAGTCATTTTCTAGTCCTCTGGTGCTGTATCCATCTTTTGCATATTGATACCGTAACTTTTTCACAACACTGTCAATACAGTCAACTGCATATTCTAATACAATATTGCATACTGCAACATCTTCTTCTCTTCCAAAGAAAGTGATTGTGTGGGTATATCTGGTTTTAAAGAAATGATAGCAGCCAAAGTTTTCGGCGATCAACTCTGCCAGTTTGGACTTCCATTTTGCTTTTGTAAAAGAAACTGTACTCTTTTTCTCCTGAATTGCGCTGTTGAACGTTTTAAACTCCCTAACTTCTTTTAGCGATAATTTATGTTTGATAAGCATCTGCTGTGCCTTTAGCATGGACACCTGTGCCTCATGCTCATTACTGCTTTCGCTTAATGCCAAAAGCTTCTGTATTTTCTCAACGATTTTAATATCCATGTCACACCTACTTTCCTTTTTTACTCTTTGAACGGAGATCAAATAATATGCTTAAATTATGCCTCAGAAGAGATTGTATTCTTCTGCCTATTATCATGAGGCGAATTGTAAAGCCCCTGTGATAGCTTGTCCTTCTGTAAAATTTAATGCTTTTTTTCCTTTAATACAATGAGAACATAACTTATTACATCTGTACTTTTGATGATCGAATCTATACAACGATGTATCCTTTGCCAATAGTTCTTTCTATCTATCACATTCTGCTATTACAACTTGAATTCTTTTTCTCTCTTTTTCCATCTTTATTTCCTTGCATAAGAATCTCTCATGTCAGCCTTCTATATTACACAATTACAAAAATGTTTATCAGTCCCCCTTTTATTTCTGCGCGCAAATTATCGCATCAAGCACAGTTATTAGTAATCTCATCTATATTGATGCTAATCGGTGCAGCCAGTTTCATGGCATACTCCATCAGGCAACGGTTATGTACTACCCCACCATCTTCACAAAGCTGGACTTTTTCCCCTTTATAAATTGCTTCTCCACAATGATCACAGTTTGCGACTGTAATAGATTTTTTCATTTTACACCCCTCCTAGATAATTATTTCTCTATCATACTGCCTTGCTCATCTGACTCTACAGAGCTGTTTTCTTTAAATCTACTATTGATCCTATTTTCCAGCAGCTCCATATCTACATCATACTGTTCAATCATAACCACTAAGTTAAGCTTGATTACAGCAAGTAAGTCTGCTATCTGCTCTTGGCTTACCATAATTCGTTCCAATTCCTGAGTTGTAATTGGTGTATCTGATCCTTTATCTTTTAAAAAGTTTTGCAATTCCTGCGTATGTCTTATGAGCTCCTTTGCTCTTTCAATCAATATATCTAGAATAGCAAAAATGCTTTCATCCTCATTCTTAAGGATTGGAACATTGAAAAACTCTGATTTTGTCTCATAAACATACTGATTTAAAAGCCGCGGATTCTTTAAAACTACTGATGCTCTCCTTATAACATCTTCAGGTATTTGCCTTTTTTTATTCTCATATAATGACCACGTTGCCTGCGTAACTCCTACCCGTTTGGCTAACACCTTTTGAGATAATCCATATTGTATTCTGGCTTCTTTTAGCAACTGGGCAAAAAACATCCTCTTTACTTCCCTTCTTCAACTTAGATTGTGAATTTTCCTATTTATATAACAAATTGTCATATAAATTGAATGTTTCTATCTGCCTTAAATTGCTATACTTAAGATAGAAATTACTCTCAGTTCAGTACCCGCCTTTACTAGATATTAAAAAATTTCCCATCTTTCTAGGTGTCTTTAAATAAAAGGCACCTCCTACCCGATTCCTTTTTCTTCTTGCTTCGTTTTGGCTGTATATCTTCTCTGTAATGCTCTTCTGATAATTGATTTGAACTCTTTCATTCGTTGTTCGGTTTCCTCATCTGGTTCTACTTTCACAAGAACCAGTTTCAGTTCAGGTAATCTTGACATATTCTTACCTCCTATGCGGATTGATCTTCATCCAACAATTTGTTGTTTTCGTTTGCAAAAAAAATATCTTCGACTTTTCTATCAAAATACTTCGCAATTTTAGCAGCAAGATCTAAAGATGGTGTCCTCACGCCTTGTTCAATCATTCCATAATAACTTGTTGTAACTCCAAGAGATTTAGCTACATCCAGCTGATTTAAATTTTTCTTTTTCCTCATATTAATTAGTTCAGTGCGTTGAACTCTATCCACACTTACACCTCCTTACACAACTTAATGTTGTTCTTGTTTTAATTCTAGACAACATTTTGTTGTTTGTCAACAGCCAATTCAACTTTTTGTTGTATTTATTTTTTATCCAACTATCTGTTGTATAATATGTATAAGAAAATATCGGTGGTGAAGCATTCATGTTAAGTGAAAGACTGAAACAATTAAGAACGGAAAATGATTTACTTCAAAAAGATGTAGCTGATAAAATAAATATTACAACTAGTGCATATGGATTCTATGAACAAGGTAAAAGAACTCCAGATGCAGAAACATTACAGAAACTCGCGGATTTTTTTAATGTATCTGTTGATTATCTTCTAGGTAGGACAAACGAAAAGAATTCTATGAATATTAAGGAATCACCGGAAAAGAGGTACGGCTTCGCTACCAAGGCCTATCACAATCTAGATGTTGGTGGGTTGTCAGATGAGGATATCGCTAAAGTTGAAGAGTATATTGAGTTGCTGAAGCAGAAGTACAATCCCGACGGGACTTTGAAGAAGAAAGACTAGAAGACCAAATTTTGGTCTTTTTTTATTTTATGCGACAATTTTTACCTGATTTCTACATGGAATATTAGCTATAATATTGTAAAATCTCTTTTGAAGGAGGATACTATATGCGTACAACAGAAAAACTCTCAGCGGATATACCAGTGTACTGTACGATCATAGCTTGGTCACTTATAATTTGCTCTAAAGATGGATAAATCATTTCGCAAGCTCCTTATAAGCTTCAAAGTTTTTGAACAACATCTTTTTACTTACTTCTTCCCAAGCTTTTTCTTCTTCATTATTTTCTACGGTTTGAGCAATTTCCTCGAAATCTATAACAAGATACTTTGGTTTATTTTGCTTTAAAATAATAACCATCTTTTCTTCGTCAACAATTTTAGTAACTTTTGAGAAGTTTTGATTCGCTTCTGTAATGCTAACTTGTCTCTTAGGATTGATTAACATTTTCAACACCTCTTATATTTTATATTTTAACATATGAATAGGAGAAATTATACCTATTTACTTAACGTGCGAAAAAGCTAAGTTTTTTACCCATTTATTGTCTTAGCGTGGGATTTTCCGACTTTGCTGGTACTACCTCTTCTTAACGGTTTCGTAATGATAACTGGAGCGTCGCATAATTTCATGGCTAGAACACCCTTCCACATCATGCATTCTTCTGATATATTTAATATCGTCCATTGATAACATCCTCTCTGTTCCTCCTTCAGTTCGTCAAACAAACTAAAGGATAACTTAATTTGAGGGGTGTTACAGTGGACTTTTTGCATCACAGACTGTTACACTTTTATATTACATTAAACAATGATATTGATTGTATTCTAAATAAATACTCGAAATTATAATAATTGTCATGCTCTAGTAAGAAAGCTTTTGTTATTTGGAAAAATATGCTACAATTAGAACATATGTTCCATCCGGAGGTACTACTATGCTTACAACAGATGAATTAGAATCCGTTATAACGAAATGTCATATAATTAAAAGCTTTTGTCCCTTACCTGAATCCACCCTTGGGTATTATTATTATGATGGAGACTATTATTGTATCCTGATCAATGAAAGTATTAGAAATGATGAAAGACTTTATAGAATAGTTCTAGCGGAGGAAATTGGTCATTATCGGACCACCATTGGGGATATTACACCTAGAAAATATATGTGTTATCGTGATCGCTTGTTAGTGGATAAGAAAGAACTGCAGGCACTCAGGTGGGCAACAGACCTTTTGATACCTACAGATACACTATTGAAAATTATTAGAGAGAAAACTGCATCCACAGTTCAGGAACTGATTGACTACTTTTTCGTTACTTATGATTTTTTTATGCATAAATTAGATTTCATGGCCAAACAAAAAGACATGTGGGATATTGATGAGGAAAGAGTTTTGTGTCTATACAACCTCCCCTCCGTATTTATTCATCAAAAACCAAAACTTTAAAATAAAAGGAGGTATGATTCATGGCTACAGCAGGTATTTATGTACGAAAGTCCAAAGCTACCGATAAAGGTGAATCTATAGAGAATCAAACAAAACGTGGGATATCCCTCTGTGAAATGCGTGGATGGGACTACATAATCTACGAAGACTATGACTTCTCTGGAAAGACTTTGGACAGACCAGATTTTGAAAGAATGATGAAAGACGCTAAGAATAGAAATATTGATTATATTATTTGTTACAAGCTAGATAGGATCTCTAGAAGCGTAAATGACTTTTCCTCCCTAGTTGAAGAATTAGACAGCCTCGGTGTAGGTTTTATTTGCATTAAAGATAACTTTGATACTACAAGTCCAATGGGTAGAGCTATGATGTATATTACCGCAGTATTTGCCCAACTAGAGCGTGAAACAATTGCCGAACGTGTTAGAGATAATATGATTGATCGAGCTAAAATGGGCAAATGGAATGGTGGGCCTGTTCCCTTTGGCTTCGACGTACAGAGAGATACCATTGTCACTAATGGGCGTAATAAGAAAACTTCAGCA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017269|288089:295276|289403_289955_-|WP_069973924.1|DBSCAN-SWA MFFAQLLKEARIQYGLSQKVLAKRVGVTQATWSLYENKKRQIPEDVIRRASVVLKNPRLLNQYVYETKSEFFNVPILKNEDESIFAILDILIERAKELIRHTQELQNFLKDKGSDTPITTQELERIMVSQEQIADLLAVIKLNLVVMIEQYDVDMELLENRINSRFKENSSVESDEQGSMIEK >NZ_CP017269|288089:295276|292027_292540_+|WP_069973927.1|DBSCAN-SWA MLTTDELESVITKCHIIKSFCPLPESTLGYYYYDGDYYCILINESIRNDERLYRIVLAEEIGHYRTTIGDITPRKYMCYRDRLLVDKKELQALRWATDLLIPTDTLLKIIREKTASTVQELIDYFFVTYDFFMHKLDFMAKQKDMWDIDEERVLCLYNLPSVFIHQKPKL >NZ_CP017269|288089:295276|288089_288797_-|WP_069973922.1|DBSCAN-SWA MDIKIVEKIQKLLALSESSNEHEAQVSMLKAQQMLIKHKLSLKEVREFKTFNSAIQEKKSTVSFTKAKWKSKLAELIAENFGCYHFFKTRYTHTITFFGREEDVAVCNIVLEYAVDCIDSVVKKLRYQYAKDGYSTRGLENDYAIGFISGLRKKFDEQKKANQEWGLVLVKDSEVVEAYSKKKFMRIIDTNTTFQGHSKVFEKGFEEGGKFSISDKITEGEIDGTLRLTEAMGGA >NZ_CP017269|288089:295276|289200_289383_-|WP_069973923.1|DBSCAN-SWA MKKSITVANCDHCGEAIYKGEKVQLCEDGGVVHNRCLMEYAMKLAAPISINIDEITNNCA >NZ_CP017269|288089:295276|291288_291537_-|WP_069973926.1|DBSCAN-SWA MLINPKRQVSITEANQNFSKVTKIVDEEKMVIILKQNKPKYLVIDFEEIAQTVENNEEEKAWEEVSKKMLFKNFEAYKELAK >NZ_CP017269|288089:295276|290317_290524_-|WP_069981249.1|DBSCAN-SWA MRKKKNLNQLDVAKSLGVTTSYYGMIEQGVRTPSLDLAAKIAKYFDRKVEDIFFANENNKLLDEDQSA >NZ_CP017269|288089:295276|290715_291090_+|WP_069973925.1|DBSCAN-SWA MLSERLKQLRTENDLLQKDVADKINITTSAYGFYEQGKRTPDAETLQKLADFFNVSVDYLLGRTNEKNSMNIKESPEKRYGFATKAYHNLDVGGLSDEDIAKVEEYIELLKQKYNPDGTLKKKD >NZ_CP017269|288089:295276|292560_294237_+|WP_069973928.1|DBSCAN-SWA MATAGIYVRKSKATDKGESIENQTKRGISLCEMRGWDYIIYEDYDFSGKTLDRPDFERMMKDAKNRNIDYIICYKLDRISRSVNDFSSLVEELDSLGVGFICIKDNFDTTSPMGRAMMYITAVFAQLERETIAERVRDNMIDRAKMGKWNGGPVPFGFDVQRDTIVTNGRNKKTSALTINVEEAKLVKLFYEWYIQDEGSIRSNTFRANDPINGYKTKHGALWSDNQMSRLLQNPIYCIADQEAYEYFSTQTKVQIINRREDFDGSHGLMFYNRRKPHKKTSRERDEEEWILVIGDHQGIIPGEMYKKLQNKLHINKIKAPRHGQGLSSPLTGLVRCGRCGAAMSVFTSRKSKDKSQGFWAYFRCICREQKSKLLCDNTNVRADLLEQIVVGHISGLCNNKNFITELLEGSNDELENNRIPLIAKRNKLQLELDVNDKEMKNLVIALGKGILPEIVIQSRYKELEDQKKALKKQLQEVALELENNYSETYNIDMVMKYINTFNETYEYLTIEEKKKLLKQIVKEVKVDKDKVELTLYFLPTQEFNDLSLCSYKDKDSY >NZ_CP017269|288089:295276|294190_295276_-|WP_069973929.1|DBSCAN-SWA MLSKINSCVLCGLDGNIIEVEVDISNGLPSLTTVGLPDATVKESKERIRSAIKNSGYEFPIKRITINLAPADTRKEGSHLDLPMALGILEASEQIKNQDIREYGFIGEMSLNGKLNRINGALPLVIAFRDWGIKKIILPKANAKEVSVIPDVDIFPFENLSEIIDHLQGTEVQAPIFINANSNTQELNCYEEDFGDVVGQEVVKRAFQIAAAGGHNLLMIGPPGAGKTMLARRFPTILPDMTYEESLEVTKIYSIAGLLNDGRSLICSRPFRAPHHTISAVSLVGGGRIPKPGEVSLAHYGVLFLDELSEFHRSVLEVLRQPIEDEIVTISRVNASLTYPSKFMLIASMNPCPCMSKVINH >NZ_CP017269|288089:295276|290150_290306_-|WP_156782301.1|DBSCAN-SWA MSRLPELKLVLVKVEPDEETEQRMKEFKSIIRRALQRRYTAKTKQEEKGIG |
10 | Clostridium_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2080216 : 2091428
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP017269|2080216:2091428|DBSCAN-SWA CCTAATGTTTAAAATGCCGCATACCGGTAAAGATCATGGCGATCCCATATTGATTAGCCATTTCAATAGAAGCTTCATCATTTTGAGACCCCCCCGGCTGAATAATCGCGGTTATTCCAGCCTTAGCCGCAGCTTCTACACAGTCGGCAAAGGGAAAGAAAGCATCCGAAGCCAATACACTTCCCTTAATCGGAAGATTGGCCTGTCGAATGGCATTTTCTACGGCCCATATCCGGTTTACCTGTCCCGGTCCTATGCCTAAGCTTTGCAGGTCCTTGGCAAGCACAATTCCATTAGATTTAACATGCTTCACGACCTTCCAGGCAAAAAGCATATCTTCCATCTCTTTTTTTGTAGGAATCCGCTGTGTCACAACTTTCAGTTCTTCTTCTTTGTGAAGCTGCCCATCTACATTCTGGATCAGCAAACCGCCGTTGATCTTCTTTAGATCCAAGGCATTCTCCGGCTGTTTGCTTTGAATTTCCGGCAGTTTCATCAACCTTATATTCTTCTTTCCCTTTAAAATTTCCAGTGCATCTGCTTCAAAATCCGGTGCAATGATAATTTCAAGAAATATCTTATTCATTTCCTCCGCTGTTCTTCTGTCCACCTTTTGATTAGCCGCTACAATTCCGCCATAAATAGAGGTTGGATCACAACTATAGGCCTTATGATAGGCATCAAACAAATCATATCCGCTTCCCACACCACAGGCATTGGTATGTTTTACAGCTACTACGGCAGGCTCCGAGTACTCCTTTAAGAGCTCTAATGCCCCATTGGCATCGTTTATGTTATTAAAGGACAATTCCTTTCCATGAAGTTGTTCTGCATTTACCAGTGATCCCGGATTCTTTCCCGATTCTTTATAGAATACAGCCTGCTGGTGAGGGTTCTCTCCATACCTCAGATCCTGTACTTTTTCGTAGGTAAGGGTCAGCACCTCAGGGAACTCCCCTTGTATTTGTTCTCTCAAATACTGGGCTATCAGGGCATCGTAGTGTGCTGTATGTTCGAATACCTTTAGAGCCAGCCGATACTTTGTATCCCTTGACAGGGCGCCTGACTGCTCCAGCTCTTCAATTACACGGTCATAATCGGCCGGATCTATCACCACCGCCACGTCCTGATAATTCTTGGCGGCTGCCCGAAGCATCGTTGGACCTCCGATGTCGATATTTTCAATGGCATCTTCCAGGATTACATTCTCTTTTTTAATCGTTTCCTTGAAAGGATAAAGGTTAATAACGACCAGATCAATCGGCTGAATTCCGAGATTTTTCAATTGTGCCATATGTTCCTCATTCTCCCGAATGGCTAACAGGCCTCCATGAATAGCCGGATGAAGAGTTTTTACTCTACCGTCTAAACACTCTGGAAATCCTGTTACATCAGAGACAGATATTACGGAAATACCGCTTTCCATCAAAGTTTTTGCGGTTCCTCCCGTAGATAGGATTTCTACCCCCATCTCCTGAAGTTTTTTTGCAAAATCCACAATCCCACACTTATCTGATACGCTGATCAAAGCACGCTTCACCAATGAAATAACCTCCTTTAATTCGTACAATCCTTCCCTCTACAAGCAGTCTTCCCTCTGCAAAGAGCTTTACCGCTAAAGGCAGCAGCTCATGTTCTGCTGCTAACACCCGCTTTGCAAGACTTTCTACCGTATCCCCCGCTTCTACATCCGCTGCTTTTTGCAAAATGATCGGCCCGGTATCCGTACCCTCATCTACAAAGTGTACCGTAGCCCCGGTAACCTTCACCCCATACTCCAGCACTGCCCGATGGACATGCTCCCCGTAAAATCCTTGACCGCAAAAACTGGGAATCAGGGAAGGATGGATATTGATGATCCGGTTCCGATATTTTTCGATGATGCTCCCCCCAAGGATTTGCATATAGCCTGCCAACAGAATTAAGTCAATCTCTCTCTCTTCAAGGATTTTCTCTAATTTATTATTTCTCTCTTTTAAGTTCGGAAAATTTTTACTGCCTATATAAAGGTGCTCTATGCCGTGGCGTCTTGCTCTCTCTAATGCATAGGCATCTTCTCTGCTGGATACAACGACCTCGATGGAAGCAGGAATATTCCCTGCCTCGATCTGATCGATCACTGCCTGAAGATTGGTTCCACCCCCAGATACCAAAGCGGCAATCCTTATTTTTGACATAATCTCACCCCAGGACTGCCCTGTACTACTTCTCCAATTGTATAGGCCTTTTCTCCCATATCCGCTAGAGATTGAAGCAGCTTGCCGGCTTCTTCTTTCTTTACTATTAGAATCATCCCGATCCCCATATTAAAGGTTTTAAACATTTCTTCATCGGTAATGCTTCCTTGCTGCTGCATCAGTGTAAATACGGGCAGTATCGGCCAGCTTCCAAGATGGATCTCCACTCCCAAACCTGCCGGGATAATCCGTGGAATATTCTCAAAAAAACCTCCTCCGGTAATGTGAACCATCCCTGCTACTGAAAAACACTCCAATACCTTTGTGCAAACCTCTACATAGATACGGGTAGGTGTCAGCAATACTTCTCCCAAGGTGCCCTCCAGGCCCTCAATTAAATCTGCAGCGGTCAATCCCATCTTTTCAAAGAAGAGTTTTCGTACCAGAGAATAACCGTTGCTGTGAATCCCGCTGGAAGGCAGTCCGATCAAAAGATCCCCCGGAGATATTTTGCTGCCGTCAATGATCTTTTTCTTATCCACAATCCCTACGGCAAAGCCTGCCATATCATATTCTCCATCCTCATAAAACCCGGGCATTTCTGCAGTCTCTCCGCCAATCAATGCACATCCCGCCAGTTGGCAGCCATCGGCAATCCCCTTTACGATATCCGCTGCCTTTTCCGGTTGGAGCTTTCCTGTAGCCAAATAATCTAAAAAGTACAGTGGCTTTGCCCCTTGGCACAATATATCATTCACACACATCGCTACACAATCTTGCCCTACAGTATCATGCCGGTCTGCCAAGAAAGCAATCTTTAGTTTTGTTCCAACCCCATCGGTTCCGGAGACCAGTACCGGCTGTTCAATCCCTGTCAAATCCAGCTCGAACAACCCGCCAAATCCACCTAATCCACATAGGACGTTTTTGGTAAAAGTCTTCTTCACATGCTGCTTCATCAGCTCTACAGCCCTGGCGCCTTCATCCACATCTACACCGGCATCCCGGTAGGTTAAACCCTTGTTCTCCATTATCATCACCTCTATTTCTTTTCAAATAGGTATTTATTGCTCGTTTTTGGTACTTCCATCGGATAATCCCCGCTAAAACAAGCACTGCATAGTCCTGCTCCTGATTCATCAATTGATTTTAATAATCCGTCAATGCTCAGGTAGCCCAGACTATCGGCTCCTATCATCTTCCTAATTTCCTCTATGGAATGGGTAGCCCCTACCAGATTTTTTCTGTTTGGGGTGTCAATGCCAAAATAACAAGAATACTTTACGGGAGGAGAACAAACCCTCAAATGAACCTCTGTAGCCCCTGCATTCTTCAGCATTTCTACAATTCGGCCGCTGGTTGTTCCTCGTACAATGGAGTCGTCAATGAGTACGACTCTTTTTCCCTGTATATTTTCCTTTAATACATTCAGCTTTAATCGTACACTCAATTCCCGCATTTTTTGATCCGGCTGAATAAAAGTTCTGCCTACATACCGGTTTTTAATCAACCCTTCACCAAAGGGAATCTTAGATTCCTCTGCATAACCAATAGCCGCCACGGTGCCCGAATCCGGCACTGCAATGACTACGTCTGCATCCACAGGATGCTCCTTTGCCAGCATTTTCCCTGCATTTCGGCGGCTGATGTACACACTTTGTCCGTCTAATACACTGTCCGGTCTTGCAAAGTATACAAATTCAAATGAACATAGGGCCTTTTTTTCTCCACCAGCATACTGAATGCTTCGAATTTGTCCGTCTTCAATGATTACCATTTCTCCTGCCGCTACGTCCCGTACAAATTCGGCATTCAGCACATTAAAGGCACAGCTTTCAGAAGACAATACGTAACCGCCCTCTATCTTGCCGATACACAAAGGCCTCAGGCCATTGGGGTCCCTTAAGCCAATCAGCTTGTTTCCATAGGTAATCACCAAAGCATAAGAGCCTCGAATCTGCTCCATGGTCTTTTGAATGGCTTTCTCAATTCCGAAGGCATTGTATCTTGCAATGAGGTTTGCAATGACCTCGCTGTCAATGGAGGTCTGGAAAATTACCCCTTGATCTTCCAGATCATCCCGTATTTCCCCCGCGTTGATCAGATTTCCATTATGGGCGAGGGCGATACTGCCTCCCTTATAACGAACCACTAATGGTTGGGCATTGATCACATAGCTTTCTCCTGTGGTGGAGTAGCGCACATGACCTACTGTAATATCCCCTTCCAGTCTGCTAATAACGTCATCTGAGAAAACTTCCTGCACCAAGCCCATTTCTTTATAGTAGGTAATGCTGCCTTCTTTATTCACAGCAATTCCTGCACTTTCCTGCCCCCGGTGCTGTAGGGCATGAAGGCCGAAATAGGCCAATCGGGCCAGCTGCCCTCTCCCCGGTGCATGAATCCCGATTACTCCGCATTCTTCCTTTAACTTATCCAGATTTGTAGTATTGTACATGATATCCTCCAGTCTAAGGCTTTACAATCTCGCCAAAACCTCTTGATAGGTTTCTTCCACATCTCCTAGATCTCTTCTAAACCGATCCTTGTCCATCTTTTTATTGGTAGCTGCATCCCACAGTCTGCAAGTGTCAGGGGAAATCTCATCGGCAAGGATTACTTTTCCTTCATGGATACCGAATTCCAGCTTGAAATCAATCAGCTTCAGTCCTCTTTCTAAAAAGAAGGGACATAAAATCTCATTGATTTTTAATGCATACTTTCTAACCGTCTGAAGCTGATCTTCCGTAGACAGTCCTACAGCTAAAATATGATCTTCATTAACCATTGGATCGCCTAACTCATCGTTCTTATAGCAAAACT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CCAAACCGATCTGATTGCCATAAGCACTGTATCCTGCCGCTGCTCCTGTTGTAATCTTTCGTTGTGGCAGCTTTCCGGACAAAGTCTCTTCAATTTTAGCACGGGGATCACCGCTGCCCGTTACACGCATGGCCTGATATACATAGGTTCTCCCCGATAACGGATCTCGAATGGCACCACCCAGGCAGGTAGCCGCGCCGCCGAAGGGTTCTATTTCTGTAGGATGATTATGGGTTTCATTTTTAAACATTAGCAGCCATTTTTCCTTTTGTCCTTCAACATCCGCATCGATCTCAATGCTGCAGGCATTTATCTCATCGGATACATCCAAATCTTCTAATTTTCCTGCCTTTCTTAACTCCTTCATACCTATAACGGCAATATCCATTAAGGATATATCTCTTTCTGTATCTCTATAAACCCTTTCTCTTGCAGCAAGATAAGTCTCGTAGGCCTTTTTTACAGGTTCTGTAAAATTCCCCTCTTGGATCTCTACGCTTTCAATCTTCGTAAGAAATGTAGTATGGCGGCAGTGATCCGACCAGTAGGTATCAATTACCTTGATCTCTGTGATGGTTGGGTTTCGTTTTTCTTGATCCCGAAAATATCCTTGCACAAAGGCAAGGTCTTCTTCACTCATGGCAAAACCCATCTCTTCCCGATAGCTTCTCAACGCTGCCGGATCCATGTGGATAAATCCTTCCAGCACCGCTACATCTCCTGGAATTGGAACCATCATTTCTACGGTTTCCGGTTTTTCCATAGAAGCCTCCCGGGAATCTACCGGATTGATACAATAGTTTTTTATTTTTTCAAAATCCGCTTGAGATAGATCTCCTTCTAAAAGAATTACTTTCGCTGAAACAACATCCGGACGTTCTTGTTGTGTGAGAATTTGTATGCACTGAGCGCCAGAGTCTGCACGCTGGTCATATTGTCCCGGCAAATATTCCACAGCAAAGCATCGGATATTTTCACCAATTTCCAATACTTCATCCACCACTTCATCCACTGGGGGCTCTGAAAAAATAGTATTGCGCGCTTTTTGAAAGGCTTCTTCCCCAATGCCCGCAATGTCATAGCGATTGACAATCCGAAGATTTTCCAGTGCTTTCATTCCCAGATTCTCTTTTAAATCTGCAAGTAAATGCTGCGCCTCAATATCCAAACCCTTTTTCTTCTCCACAAAAATTCTACGTACCTTTTGTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP017269|2080216:2091428|2081723_2082392_-|WP_069976028.1|DBSCAN-SWA MSKIRIAALVSGGGTNLQAVIDQIEAGNIPASIEVVVSSREDAYALERARRHGIEHLYIGSKNFPNLKERNNKLEKILEEREIDLILLAGYMQILGGSIIEKYRNRIINIHPSLIPSFCGQGFYGEHVHRAVLEYGVKVTGATVHFVDEGTDTGPIILQKAADVEAGDTVESLAKRVLAAEHELLPLAVKLFAEGRLLVEGRIVRIKGGYFIGEACFDQRIR >NZ_CP017269|2080216:2091428|2083434_2084850_-|WP_069976032.1|DBSCAN-SWA MYNTTNLDKLKEECGVIGIHAPGRGQLARLAYFGLHALQHRGQESAGIAVNKEGSITYYKEMGLVQEVFSDDVISRLEGDITVGHVRYSTTGESYVINAQPLVVRYKGGSIALAHNGNLINAGEIRDDLEDQGVIFQTSIDSEVIANLIARYNAFGIEKAIQKTMEQIRGSYALVITYGNKLIGLRDPNGLRPLCIGKIEGGYVLSSESCAFNVLNAEFVRDVAAGEMVIIEDGQIRSIQYAGGEKKALCSFEFVYFARPDSVLDGQSVYISRRNAGKMLAKEHPVDADVVIAVPDSGTVAAIGYAEESKIPFGEGLIKNRYVGRTFIQPDQKMRELSVRLKLNVLKENIQGKRVVLIDDSIVRGTTSGRIVEMLKNAGATEVHLRVCSPPVKYSCYFGIDTPNRKNLVGATHSIEEIRKMIGADSLGYLSIDGLLKSIDESGAGLCSACFSGDYPMEVPKTSNKYLFEKK >NZ_CP017269|2080216:2091428|2087645_2091428_-|WP_069976037.1|DBSCAN-SWA MKQKVRRIFVEKKKGLDIEAQHLLADLKENLGMKALENLRIVNRYDIAGIGEEAFQKARNTIFSEPPVDEVVDEVLEIGENIRCFAVEYLPGQYDQRADSGAQCIQILTQQERPDVVSAKVILLEGDLSQADFEKIKNYCINPVDSREASMEKPETVEMMVPIPGDVAVLEGFIHMDPAALRSYREEMGFAMSEEDLAFVQGYFRDQEKRNPTITEIKVIDTYWSDHCRHTTFLTKIESVEIQEGNFTEPVKKAYETYLAARERVYRDTERDISLMDIAVIGMKELRKAGKLEDLDVSDEINACSIEIDADVEGQKEKWLLMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCLGGAIRDPLSGRTYVYQAMRVTGSGDPRAKIEETLSGKLPQRKITTGAAAGYSAYGNQIGLATGQVAELYDEAFVAKRMEVGAVIAAAPKANVVREKPKKGDIVILLGGKTGRDGCGGATGSSKEHTEESIFTCGAEVQKGNAPTERKIQRLFRNPEVSRLIKKCNDFGAGGVSVAIGELTDGLMIDLDRVPKKYEGLDGTELAISESQERMAVVVAADQANTFIQLAAEENLEAVVVAWVTDDRRMKMQWREKTIVDLSRDFLDTNGVKQHTRVYVEVPEEKQNYFKQLPAAVEKHKQDVVEAWLANLQDINVCSQRGLVERFDSTIGAGTVLMPFGGKYQTTPAEGMAAKIPVLTGDTTTGSLMSFGYNPKIGKWSPFHGALYAVVEAVAKIVAMGGNHKTIRLTFQEYFEKLGKEPSKWGKPFSALLGAYMVQHGLGIPAIGGKDSMSGTFKDLNVPPTLVAFAVATEDVRKVISPEFKEWGSQVVWIPIERDAQEMPNFQTIDQIYGKITECIHKGKVLAAHSVRQGGLAAAISKMCFGNQIGLRFEAHMDAETLFTPHYGSIILELPKNEAVKALLADIPYRVLGSTTADRIISFNDDTSISLEEALKAWEAPLEKIFPTKTASIQGTAQQISYADRSRCKPAVRIAKPRVFIPAFPGTNCEVDSARAFEKAGGKVETFVFRNLSASDIENSIAKMAEAIEQAQIIMLPGGFSAGDEPDGSGKFIATVFRNPRIKEAVMELLQKRDGLMLGICNGFQALVKLGLLPYGEIFDIHEDCPTLTFNRIGRHASRMVETRVASTLSPWFANLQVGDIHRIAVSHGEGRFVAKAEVLEEMIQRGQIATQYVDPSGNASYDIAYNPNGSVHAVEGITSPDGRILGKMGHSERTGSNIAVNVPGEKDQQIFRAGIDYFR >NZ_CP017269|2080216:2091428|2082379_2083423_-|WP_069976030.1|DBSCAN-SWA MENKGLTYRDAGVDVDEGARAVELMKQHVKKTFTKNVLCGLGGFGGLFELDLTGIEQPVLVSGTDGVGTKLKIAFLADRHDTVGQDCVAMCVNDILCQGAKPLYFLDYLATGKLQPEKAADIVKGIADGCQLAGCALIGGETAEMPGFYEDGEYDMAGFAVGIVDKKKIIDGSKISPGDLLIGLPSSGIHSNGYSLVRKLFFEKMGLTAADLIEGLEGTLGEVLLTPTRIYVEVCTKVLECFSVAGMVHITGGGFFENIPRIIPAGLGVEIHLGSWPILPVFTLMQQQGSITDEEMFKTFNMGIGMILIVKKEEAGKLLQSLADMGEKAYTIGEVVQGSPGVRLCQK >NZ_CP017269|2080216:2091428|2080216_2081758_-|WP_069976026.1|DBSCAN-SWA MVKRALISVSDKCGIVDFAKKLQEMGVEILSTGGTAKTLMESGISVISVSDVTGFPECLDGRVKTLHPAIHGGLLAIRENEEHMAQLKNLGIQPIDLVVINLYPFKETIKKENVILEDAIENIDIGGPTMLRAAAKNYQDVAVVIDPADYDRVIEELEQSGALSRDTKYRLALKVFEHTAHYDALIAQYLREQIQGEFPEVLTLTYEKVQDLRYGENPHQQAVFYKESGKNPGSLVNAEQLHGKELSFNNINDANGALELLKEYSEPAVVAVKHTNACGVGSGYDLFDAYHKAYSCDPTSIYGGIVAANQKVDRRTAEEMNKIFLEIIIAPDFEADALEILKGKKNIRLMKLPEIQSKQPENALDLKKINGGLLIQNVDGQLHKEEELKVVTQRIPTKKEMEDMLFAWKVVKHVKSNGIVLAKDLQSLGIGPGQVNRIWAVENAIRQANLPIKGSVLASDAFFPFADCVEAAAKAGITAIIQPGGSQNDEASIEMANQYGIAMIFTGMRHFKH >NZ_CP017269|2080216:2091428|2084871_2085570_-|WP_069976035.1|DBSCAN-SWA MTKLEMLYEGKAKKVYKTEVEDRYIVAYKDDATAFNGVKKGTIAEKGVVNNKMSALLFKLLEEKGIPTHFEKLLSDREMLVKAVKILPLEVIIRNVVAGSLAKRLGLEEGAVLKNTVLEFCYKNDELGDPMVNEDHILAVGLSTEDQLQTVRKYALKINEILCPFFLERGLKLIDFKLEFGIHEGKVILADEISPDTCRLWDAATNKKMDKDRFRRDLGDVEETYQEVLARL >NZ_CP017269|2080216:2091428|2085808_2087146_-|WP_156782363.1|DBSCAN-SWA MELTNKKPEAGILNQVFKLSEKKTNAKTEIIAGITTFMTMAYILIVNPDILSATGMDKDAVFTATALSAAIATLCMALMANLPFALAPGMGLNAFFAFSVVIGMGYSWQFALTAVLIEGFIFIALTLLNVREAIINGMPMVIKNAVSVGIGLFIAFIGFQNAGIIVNNDATLVGLGDLADPGVLLAIMGILVTGFLLIKNIKGGLLIGMIITTILGVFVGKATLPVNPVSAPPSIAPIFMQFEWHNILTFDMLLVVFTFLFVDLFDTLGTLIGVSTKANMLDSQGRVPNAKQALMADAIGTTIGAALGTSTVTTYVESASGVAEGGRTGLTALTTGILFLTATVFSPIFTAVPAEATAPVLILVGLFMMSPILKINFDDFTDAIPAFLTIIIMPLSYSIAEGLTFGVISYVVLKTLSGKSKEVHPMMYIIAVLFVVKYFADHLAG |
7 | Prochlorococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2917100 : 2956846
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP017269|2917100:2956846|DBSCAN-SWA AATGAAATCTTTAACAGAGCAACAGGCAGCAGCTATCAATACAGAAGATTCATATGAGCAAATCTCTGGGAGCGGAGAAGTAAACCGTCAAGTATCCGCCCTTTATGATATTGTCAATCACTTGATGGGCAAGGATAGAATTTCAGAAAGACTTATGAAGTTAGAAGTGCAGGATTTTATACAGTCGGAGAAAATTGAAGACAGGATTCTGGCACTCCACAGAATTGTTTTCAATTCAAAGGAGCAAGCACAGGGCCTTCAGCCAGAGGAAATTGATCCTGCTTTGAAGGCTATTGAGAGTCAGGTAGCGGATATGTTGGCTAGGCGGGCTGTAGAGAGCCGCCTAGAGAAGGAAATGGCAGAAAAGATTGAAGAGAAGCAGCTGCAGTATATGGAAGAAATGAAACTGCAGCTTTTGAAGAAAAATGCAGGGCCGGAGAATGGGTATACCCTAAAGAAGTATGCACATCTGGAAAAGTTAGAGACAAAAAAACTTTCAAAATCAGCCATGGAGCTTTTCAGACCTCAAAAGCTGGAAGATATCGTAGGACAGGAGGAAGCCATTCAATCTTTGGTATCGAAAATTGCATCTCCTTTTCCTCAGCATATACTTATCTATGGTCCACCAGGGGTAGGAAAAACAACTGCTGCCCGTTTGGCGCTAGAGTTTGCAAAGAAAATGAAATATACACCCTTTGAGCAAGATGCGCGCTTTGTAGAGGTGGATGGGACAACCCTTCGCTGGGACCCCAGAGAAATTACCAATCCGCTGCTGGGTTCCGTTCATGATCCCATTTATCAAGGCAGCAAGCGGGACTTGGCAGAGACCGGAATACCGGAGCCTAAGCTAGGTTTGGTAACAGAGGCTCACGGAGGAATTCTCTTTATTGATGAAATCGGAGAGCTGGATGACTTTTTACAAAATAAGCTGTTAAAAGTATTAGAAGATAAGCGAGTAGAGTTTGACTCCGCTTATTATGATCCAGATAATCCAGCCGTTCCGCTATATGTAAAGAAGCTTTTCGATGAAGGTGCTCCAGCAGATTTTATTTTGATTGGTGCTACTACAAGGCAGCCGCAGGAAATCAATCCTGCCCTGCGCTCCCGCTGTGCAGAGGTATTTTTTGAACCTCTCTCCAATGAAGATATCCAGAATATTGTAGAGCAGGGAGCCAGACGATTGTCTGTAGAGCTGGAAAATGGTGTATCAGAGATGATTAGTCAATACACCATTGAAGGAAGGAAAGCAATGAATATCTTATCTGATGCCTATAGTATGGCCCTTTACGAACAATCCAAGGAGGGAGAAATCCATATTACTAAAAAGCATATGGATAGTGTGGTACGGATGAGTAGATTAATATCTTACTCACAAAAAAAAGCAAGTGAGCAGCCGGAGATTGGAAAGATTTTTGGACTAGGGGTCAATGGATTCTTAGGATCTGTGATTGAGTTGGAATGTAATGCCTTTAAAGCAGTAGAGAAGGGAAAAGGCAGTTTGCGATTGAATGATACAGCAGGTTCTATGACAAAAGATTCTCTTTTCAATGCAGCCTCCCTCATCCGTAAAACAACCGGTGAAATTCTTCACGATTATGATATTCATGTAAATGTTATAGGCGGTGGCAAGATTGATGGGCCTTCTGCAGGAGCAGCGATTGTAATGACCATGATCAGTGCCATTCAGCAGAAGAAAGTCCGCCAGGATGCAGCAATAACCGGAGAGATTTCTATTCAAGGAAAAATAAAGCCCATTGGGGGCGTTAACGAAAAAATATTTGGTGCCAAACAGTCGGGTATGAAGACCGTAATTATTCCGAAAGAAAATGCAAAGGATGTAAAGGCAGGTATTTCTGGTATTGAGATCATACCTGTAGAGACAATCGAAGAAGTAATGGAGATTTTGTTTTGCAGCTAATCAAAAGGGACCAGCATGGGGCACTAAAAGGCTTGTGCTGGTCTTTGTTGAATGTATTGCTGGGAAACAGTTAAAGGAATTATTGGGACAGGGGTAAGGAGGAAGATGAAAATATGGAGTATTTAGGAAGAATTCCGCCCCATAATATTGATGCGGAACAGTCGGTATTAGGGGCGATGATATTAGATAAGGAAGCTGTGATTACAGCCTCAGAAATGATCCGTGGAGAAGATTTTTATAAAGAGGCTCATCGGGAGATTTTTGAAGCTACTATTGCCATCTATAGCCGGGATGAACCAGTGGACTTGGTGACGCTGTCAGAAGAGCTGACACAGCGCCAAACTTTAGATGTTATAGGCGGCATCACTTATCTTGCCAGTCTTTCTGCAGCTGTACCAACAACTTCCAATGTAAAATACTATGCTAAAATCGTAGAAGAAAAATCTGTTTTGAGAAGATTGATCAAGGCTTCCTCAGAAATTTTGGAAAAAGGATATCAAGCAGAAGAAGAAGTTACACAGATTCTAGATCTGGCAGAAAAGAGCATTTTCGATATTTCACAAAATCAGTCAAAGGAAGGCTTTGCCCATATTAAACATGTATTGCTGGAAAGCTTCAATAAGATTGAAGAACTGTACCAAAGCAAAGGCGGTATTACAGGGATCACTACAGGCTTTAGCGATATTGACCGAAAAACTTCGGGACTTCAACGGTCTGATTTGATTCTGGTTGCAGCGCGTCCCAGTATGGGGAAGACTGCATTTTCACTGAATCTCTGTCAAAATGCAGCCTTGAAGGGAAATGCATCTGTAGCCATCTTTAGCTTGGAGATGTCCAAGGATCAGCTGGTACAGCGTATGTTAAGTGCTGAATCTCATATTGAAATACAAAAAATTCGTACAGGAACCCTTAGCGAGGATGAGTGGCCAAGACTGGCAAAGGCGATGGGTCCTCTTGCTCAAGCTAAAATATTTATTGATGATACGCCGAGTATCTCGATTATGGAGATGAAGGCAAAATGTCGACGGCTAAAAATGGAACAGGGTTTAGACATGATTATGATTGACTACCTTCAGTTGATGTCTGGTGATGGGCGGGCGGAGAGCCGTCAGCAGGAGATATCTGGGATATCCAGAGCATTAAAGGGATTGGCCAGAGAGATGAACTGTCCCGTGGTGGCACTTTCTCAGTTATCCCGTGCTCCAGAACAGAGAGCAGATCATCGACCGATTCTTTCTGACCTGAGGGAATCAGGAGCCATCGAACAGGATGCAGATATTGTTATGTTTCTCTATCGTGATGAATACTACCATCCAGATAGTGAGAAAAAGAATATCGGGGAAGTTCTCATTGCTAAACAGCGTAATGGGGAGACTGGATCGGTAGAATTGGCATGGTTGGGCCAGTTTACTAAGTTTGCTAATCTTGAAAAGTTCAGAGATTAATAGTATGATGTTTAGAAAAGTGACGTCAGGGTAATATATTTTATAGTTTTGACGATCCAGTAAGAATGATGTAGAGAAAGGATTTCATGAGAATCCTATAAAGCGTCCATTGTATGAATAAGTCGAAAAAAGACCTAAACAAGAGGAGGAAAATGAAGTGGAAGGATTTAATGAGTTAGAGCTATTAAAAATGGCTAAAGGTGTTGAGGAAGAAGGGTATCGGTTTTACATGGAGGCTGCAGAGCGATTTCAGGATGAGGACATCAAACAGATGTTCCACTATCTAGCATTAGAAGAAGCTGAGCATGTAAAAGTTTTTGAACAGCTATATGATCGTGTAGCAGCGCGCCTAGGGGTGAGCGAGGAGTATTTAATGGAGGAAGAGGTCGTTCAGTATCTAAAGGCTATTAGTGATACTGCTATTTTTAACACCAATGGACTTACATATTATAGAGTACAACAAGTAAATACTGTAAGGGATGCACTGCTAATCGGTATGCAGGCAGAAAAAGATGCGATTTTGTTTTATGAGACCTTTCTAAAGAATACGAAAACCGATATGACACAAAAAGTATTGGAACGTTTAATAAAAGAGGAAGTTAAACATTTATATCAATTTAAGGTATTGATTCAAGAGCTAAAATAAGGAGTGAGGTTTATGGAAGGGGTAAAAGGGGCGTATCTAATTATCGGAAATGGCGTAGCCGGTATGACTGCGGCAGAAGAAATCCGGAAATGCGATAAAGATGCACATGTTACAATCATTGGAGATGAGCGGGTCTTAACTTATTATCGGGTAAAATTATCCCACTTTATTAGTAAACACTTTCAAATAAAGGAATTGCTGATCCATGATGAGAACTGGTATCGGGAAAGAAATATAGAACTGATTCTAGGAGAACGGGTACAATCTATTCATCCAAATGCGCAGAAGGTGTTTTTGGAAAGTGGTAAAGAAGTCGGATATCATAAGCTTCTATTGGCAAATGGCAGTTCGTCCTTTATTCCATCCGTAGAGGGGGCAAAGAAGGACGGTGTATTTGCTTTAAGAAACCTTCGCGATCTTGAGGAAATACAAGCATATTTGTTGGATTGCAAAGAAGTGGCTGTTATTGGTGGAGGACTGTTAGGGCTGGAGGCTGCTTGGGCCCTAAAGGAGCGAGGACTACGTGTAAATGTAGTAGAGTTCTTTCCCTATCTGTTGCCTAGACAGTTGGATCCTGAACTGGCAAGATACGTGAAGGAGCAGCTGGAGCAAAAAGGACTCAAAATCTATCTAACTGCAGAGACACAAGAAATTATTGGGACAGAAAAAGTAGAAGGGATTGCATTAAAGGATGGCCGTGTTATACCTACGGACATGGTGCTTTTTTCTACAGGGGTAAAACCGAATATCTCCATCGCAGAGAGTACAGATATCGATAAAAACAGGGGAATCAAAGTCAACGCCTTTATGGAAACATCGGTGGAGAACATCTATGCAGCTGGAGATGTGGCAGAATTTGGAGGGATGGCTATGGGACTTTGGTCAGTGGCTTCAGACCAAGGCAAGGTAGCCGGGAGAAGTATGGTAGGCGTCAAAGACGCCTATACACTGCCCCAACCAGCTACACTTCTATCTATTGGCGGGTTCAATG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39 | Bacillus_phage(27.27%) | protease,transposase,integrase | attL 2956307:2956322|attR 2962592:2962607 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
3094786 : 3108021
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP017269|3094786:3108021|DBSCAN-SWA 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18 | Clostridium_phage(75.0%) | tail,portal,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
4095485 : 4151161
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP017269|4095485:4151161|DBSCAN-SWA 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53 | Bacillus_phage(20.0%) | coat,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
4985750 : 5067314
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP017269|4985750:5067314|DBSCAN-SWA 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88 | Erysipelothrix_phage(79.63%) | tail,capsid,head,holin,portal,protease,terminase,coat | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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