Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP016855 | Staphylococcus aureus subsp. aureus strain 5118.N chromosome, complete genome | 10 crisprs | csa3,cas3,DinG,DEDDh,WYL | 11 | 4 | 11 | 1 |
NZ_CP016854 | Staphylococcus aureus subsp. aureus strain 5118.N plasmid p5118.Nb, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP025482 | Staphylococcus aureus subsp. aureus strain 5118.N plasmid p5118.Na, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP016855_1 | 41702-41780 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016855_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP016855_1
>1.1|41725|33|NZ_CP016855|CRISPRCasFinder CAGAAGCTGACGAAAAGTCAGCTTACGATAATG |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016855_1
The CRISPR arrays of NZ_CP016855_1 >merge|NZ_CP016855|1|41702-41780|CRISPRCasFinder TGCAGGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGACGAAAAGTCAGCTTACGATAATGTGCAGGTTGGCGGGGCCCCAACA >NZ_CP016855|1|1|41702-41780|CRISPRCasFinder TGCAGGTTGGCGGGGCCCCAACA CAGAAGCTGACGAAAAGTCAGCTTACGATAATG TGCAGGTTGGCGGGGCCCCAACA
>NZ_CP016855.1|WP_000999713.1|40448_41435_-|aromatic-acid-exporter-family-protein MNDQWYKHLIGARTIKTGIAIFLTAVFCMALDLTPIYAILTAVVTIEPTAKASLIKGYRRLPATVIGAGFAVLFTYLFGDQSPFTYALSATFTILFCTKLKLQVGTNVAVLTSLAMIPGIHDAYIFNFLSRTLTAIIGLVTSGLINFMVFPPKYYGQVEEKLSKTDALMYKLFYNRCQELILSRLQSDKSEKAYKNIFNLNNQVETLISYQRDELSYHKKKECDWKLLNQLTKRAYTNRLFITHLSNIIYLPKNTRVNFSGDEKMALLKISSSIKDIFYDGSFKREDDSVETLRSTIKALEISGENQIKSHILYEVLMIYRLLDSRYA >NZ_CP016855.1|WP_001549145.1|39545_39959_+|hypothetical-protein MKPTKVILKDASYLHSKTSITFILKDVVIEEDNKIYYFDTSATFEDQEVKFEFALFDSDMDNLKHMDCDNPVTEIYFIEPDLHFTIIDFNQELLCIYIDFDSGLRHSNMATESGISLRINVAKSDFTKFINELASLH >NZ_CP016855.1|WP_001790257.1|39406_39517_+|hypothetical-protein MDGNNQIDVCFFVLVNNYYTMSIYPRIINSNGDYAT >NZ_CP016855.1|WP_000544969.1|38589_39321_+|type-1-glutamine-amidotransferase MHELTIYHFMSDKLNLYSDIGNIIALRQRAKKRNIKVNVVEINETEGITFDECDIFFIGGGSDREQALATKELSKIKTPLKEAIEDGMPGLTICGGYQFLGKKYITPDGTELEGLGILDFYTESKTNRLTGDIVIESDTFGTIVGFENHGGRTYHDFGTLGHVTFGYGNNDEDKKEGIHYKNLLGTYLHGPILPKNYEITDYLLEKACERKGIPFEPKEIDNEAEIQAKQVLIDRANRQKKSR >NZ_CP016855.1|WP_001250336.1|37274_38588_+|lipid-II-isoglutaminyl-synthase-subunit-MurT MRQWTAIHLAKLARKASRAVGKRGTDLPGQIARKVDTDILRKLAEQVDDIVFISGTNGKTTTSNLIGHTLKANNIQIIHNNEGANMAAGITSAFIMQSTPKTKIAVIEIDEGSIPRVLKEVTPSMMVFTNFFRDQMDRFGEIDIMVNNIAETISNKGIKLLLNADDPFVSRLKIASDTIVYYGMKAHAHEFEQSTMNESRYCPNCGRLLQYDYIHYNQIGHYHCQCGFKREQAKYEISSFDVAPFLYLNINDEKYDMKIAGDFNAYNALAAYTVLRELGLNEQTIKNGFETYTSDNGRMQYFKKERKEAMINLAKNPAGMNASLSVGEQLEGEKVYVISLNDNAADGRDTSWIYDADFEKLSKQQIEAIIVTGTRAEELQLRLKLAEVEVPIIVERDIYKATAKTMDYKGFTVAIPNYTSLAPMLEQLNRSFEGGQS >NZ_CP016855.1|WP_000949467.1|36482_36983_-|H-type-ferritin-FtnA MLSKNLLEALNDQMNHEYFAAHAYMAMAAYCDKESYEGFANFFIQQAKEERFHGQKIYNYINDRGAHAEFRAVSAPKIDFSSILETFKDSLSQEQEVTRRFYNLSEIARQDKDYATISFLNWFLDEQVEEESMFETHINYLTRIGDDSNALYLYEKELGARTFDEE >NZ_CP016855.1|WP_001790679.1|36308_36401_+|hypothetical-protein MTKNTIISLENEKTQINDSENESSDLRKAK >NZ_CP016855.1|WP_000613733.1|35539_36094_-|3'-5'-exonuclease MIQDAFVALDFETANGKRTSICSVGMVKVIDSQITETFHTLVNPQDYFSQQNIKIHGIQPEDVENAPTFDYVFPYMMQFIADLPVVAHNAAFDMNVLHQSIQNIGLPTPNLTYFCSYQLAKRTVDSYRYGLKHMMEFYQLDFHGHHDALNDAKACAMITFRLLKNYENLTYVTNIYGKNLKDKG >NZ_CP016855.1|WP_000140176.1|34401_35472_+|DNA-polymerase-IV MTERRIIHIDMDYFFAQVEMRDNPKLKGKPVIVGGKASSRGVVSTASYEARKYGVHSAMPMSQAHKLCPNGYFVTSNFGAYRETSAQIMSIFRSYTDKVEPMSLDEAYLDITELVRPDLPASKIAQYIRKDILEQTHLTASAGVSYNKFLAKLASGMNKPDGMTVIDYQNVHDILMTLDIGDFPGVGKASKKVMHDNGIFNGRDLYEKTEFELIRLFGKRGRGLYNKARGIDHSEVKSSRVRKSVGTERTFATDVNDDEEILRKVWELSGKTAERLNKLQKSAKTVTVKIKTYQFETLSKQMSLRDSVSSEEDIYNIAYLLYNDLKDPDVPIRLIGVTVGNLEQSTYKNMTIYDFI >NZ_CP016855.1|WP_000548781.1|33624_34155_+|DUF3267-domain-containing-protein MHKIDLTTNNFQMRRFIILQLVIALFVILFTYKWALGVTAVVDQNIIINLVYGFAGFIILLILHELIHRALFLLFKKDSKPMFNIKKDRILFQTADACFNKWQFSIIMLSPLILLSTGLLILIKVFGYSSLIFMFSMHTAYCFIDILLVALTISSSFKYVQQDEDSIYLYHQKPTQ >NZ_CP016855.1|WP_000636142.1|41962_42721_+|type-I-methionyl-aminopeptidase MIVKTEEELQALKEIGYICAKVRNTMQAATKPGITTKELDNIAKELFEEYGAISAPIHDENFPGQTCISVNEEVAHGIPSKRVIREGDLVNIDVSALKNGYYADTGISFVVGESDDPMKQKVCDVATMAFENAIAKVKPGTKLSNIGKAVHNTARQNDLKVIKNLTGHGVGLSLHEAPAHVLNYFDPKDKTLLTEGMVLAIEPFISSNASFVTEGKNEWAFETSDKSFVAQIEHTVIVTKDGPILTTKIEEE >NZ_CP016855.1|WP_001110179.1|42937_43324_+|hypothetical-protein MNYVERYIEQFLRATVRNNIKHYLLMLDEKMKNLDDYMRYLITKKEQLSKLIDSLMLTLENKYIDIAEAFQIQCAREINNQEIENIKSELNKVEAYYAQIETQIQQTSTEKIATEKTSYLINYMNAVA >NZ_CP016855.1|WP_000149064.1|43338_44040_+|cell-wall-active-antibiotics-response-protein MTHKYISTQMLIIFTALMIIANFYYIFFEKIGFLLVLLLGCVLVYVGYLYFHKIRGLLAFWIGALLIAFTLLSNKYTIIILFVFLLLLIVRYLIHKFKPKKVVATDEVMTSPSFIKQKWFGEQRTPVYVYKWEDVQIQHGIGDLHIDLTKAANIKENNTIVVRHILGKVQVILPVNYNINLHVAAFYGSTYVNEKSYKVENNNIHIEEMMKPDNYTVNIYVSTFIGDVEVIYR >NZ_CP016855.1|WP_001017131.1|44036_45080_+|sensor-histidine-kinase MNHYIRTIGSMLILVYSMLAAFLFIDKVFVNIIYFQGMFYTQIFGIPVFLFLNLIIILLCIIVGSVLAYKINQQNDWIKTQIERSMEGETVGINDQNIEIYSETLDLYHTLVPLNQELHKLRLKTQNLTNENYNINDVKVKKIIEDERQRLARELHDSVSQQLFAASMMLSAIKETKLEPPLDQQIPILEKMVQDSQLEMRALLLHLRPLGLKDKSLGEGIKDLVIDLQKKVPMKVVHEIQDFKVPKGIEDHLFRITQEAISNTLRHSNGTKVTVELFNKDDYLLLRIQDNGKGFNVDEKLEQSYGLKNMRERALEIGATFHIVSLPDSGTRIEVKAPLNKEDSYDD >NZ_CP016855.1|WP_000153530.1|45069_45699_+|two-component-system-response-regulator-VraR MTIKVLFVDDHEMVRIGISSYLSTQSDIEVVGEGASGKEAIAKAHELKPDLILMDLLMDDMDGVEATTQIKKDLPQIKVLMLTSFIEDKEVYRALDAGVDSYILKTTSAKDIADAVRKTSRGESVFEPEVLVKMRNRMKKRAELYEMLTEREMEILLLIAKGYSNQEIASASHITIKTVKTHVSNILSKLEVQDRTQAVIYAFQHNLIQ >NZ_CP016855.1|WP_000037075.1|45814_47032_-|YihY/virulence-factor-BrkB-family-protein MSKKDHSSSKYLNSVKEAQEESKKKNKSNPKIDVDRTYIEPQQFQSKKPKKDDQVFFLSRLNKPAKYKKDSNFLSYLIYRIGKDDASGLAAQMTYHFVLAMFPMLLFLLTLLPFFNIKQSQITNMLSNAPAETSTLIKSVIGDITQNSSGGLLSIGLILAIWSASNGMTAIMNSFNVAYDVEDSRNGIVLKLLSVVFTVVMGVVFVVALALPTLGSVISHFLFGPLGFDEQVKWIFNLIRIVLPIIIIFIIFIVLYSVAPNVKTKLKSVLPGAVFTSIIWLAGSFGFGWYISNFGNYSKTYGSIAGIIILLLWLYITSFIIIVGAEINAIIHQRSVIKGKTPEEAALEHDDNNKNHYNENTRYEYDEDSNATHQRTYHVDEHPSDTYPEDDKNIKDKIVDKLKKD >NZ_CP016855.1|WP_000428172.1|47309_47585_-|hypothetical-protein MENKFVPGILIGAVIGGAISLADKSTRQALVQSVKDAKNGNRTRKPSKVSKIKDEVLYWKDVVEEIRRNNPELERSLKDAKETFVNRKNQR >NZ_CP016855.1|WP_000228666.1|47591_48056_-|low-molecular-weight-phosphotyrosine-protein-phosphatase MVDVAFVCLGNICRSPMAEAIMRQRLKDRNIHDIKVHSRGTGSWNLGEPPHEGTQKILNKHNIPFDGMISELFEATDDFDYIVAMDQSNVDNIKSINPNLKGQLFKLLEFSNMEESDVPDPYYTNNFEGVYDMVLSSCDNLIDYIVKDANLKEG >NZ_CP016855.1|WP_000180461.1|48202_48403_+|DUF1128-family-protein MTNEEKVLAIREKLNIVNQGLLDPEKYKNANEEELTDIYDFVQSRERLSPSEVTAIADALGQLRHE >NZ_CP016855.1|WP_001795438.1|48405_49662_+|aminopeptidase MGILTNYKEKLQQYAELLVKVGMNVQPKQPVFIRSSVETLELTHLIVEEAYHCGASDVRVVYSDPTLKRLKFENESVEHFANHEIKSYDVEARMDYVKRGAANLALISEDPDLMDGIDSQKLQAFQQQNARAFKGYMESVQKNQFPWVVAAFPSKAWAKRVYPELSVEEAYIKFIDEVFDIVRIDGNDPVENWRQHIANLSVYAQKLQQKNYHALHYVSEGTDLTVGLAKNHIWEDATSYVNGKEQAFIANIPTEEVFTAPDRNRVDGYVTNKLPLSYNGTIIDQFKLMFKDGEIIDFSAGKGEAVLKDLINTDEGSRRLGEVALVPDDSPISNRNTIFYNTLFDENAACHLAIGSAYAFNIQGGTEMTVEEKIASGLNDSNVHVDFMIGSSDLTIYGIFEDGSKELVFENGNWASTF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP016855_2 | 1115328-1115636 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016855_2
|
4 spacers
spacers of NZ_CP016855_2
>2.1|1115358|53|NZ_CP016855|CRT TTGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCGCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACC >2.2|1115441|26|NZ_CP016855|CRT TCGCCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCG >2.3|1115497|28|NZ_CP016855|CRT GCTAATTTCTCTGTGTCGGGGCTCCACC >2.4|1115555|26|NZ_CP016855|CRT CCGCCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCG >2.5|1115581|33|NZ_CP016855|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTTCCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016855_2
The CRISPR arrays of NZ_CP016855_2 >merge|NZ_CP016855|2|1115328-1115636|CRT,CRISPRCasFinder CCAAATTGAAATTATCCTACTGCTGTCTTTTTGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCGCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACCCCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGAGGAGCTAATTTCTCTGTGTCGGGGCTCCACCCCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTTCCACCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCG >NZ_CP016855|2|1|1115328-1115610|CRT CCAAATTGAAATTATCCTACTGCTGTCTTT TTGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCGCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACC CCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTT TCGCCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCG CCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGAGGA GCTAATTTCTCTGTGTCGGGGCTCCACC CCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTT CCGCCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCG CCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTT >NZ_CP016855|2|2|1115558-1115636|CRISPRCasFinder CCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCG CCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTTCCA CCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCG
>NZ_CP016855.1|WP_000185319.1|1114328_1115258_+|glycerophosphodiester-phosphodiesterase MTNSSKSFTKFMAASAVFTMGFLSVPTAGAEQTNQIANKPQAIQWHTNLTNERFTTIAHRGASGYAPEHTFQAYDKSHNELKASYIEIDLQRTKDGHLVAMHDETVNRTTNGHGKVEDYTLDELKQLDAGSWFNKKYPKYARASYKNAKVPTLDEILERYGPNANYYIETKSPDVYPGMEEQLLASLKKHHLLNNNKLKNGHVMIQSFSDESLKKIHRQNKHVPLVKLVDKGELQQFNDQRLKEIRSYAIGLGPDYTDLTEQNTHHLKDLGFIVHPYTVNEKADMLRLNKYGVDGVFTNFADKYKEVIK >NZ_CP016855.1|WP_000066062.1|1112707_1114087_+|argininosuccinate-lyase MSNKAWGGRFEVQPEEWVDDFNASITFDQTLIDQDIEGSIAHATMLANQGIISQQDSEQIIQGLKSIQHDYHQDQIQFSASLEDIHLNIEHELIKRIGDAGGKLHTGRSRNDQVATDMHLYTKKQVQDIIALIKSLQSVIVDIASNNVDTIMPSYTHLQRAQPISFAHHIMTYFWMLQRDQQRFEDSLKRIDINPLGAAALSGTTYPIDRHETTALLNFGSLYENSLDAVSDRDYIIETLHNISLTMVHLSRFAEEIIFWSTDEAKFITLSDAFSTGSSIMPQKKNPDMAELIRGKVGRTTGHLMSMLMTLKGLPLAYNKDMQEDKEGLFDAVHTIKGSLRIFEGMIQTMTINKERLNQTVKEDFSNATELADYLVTKNIPFRTAHEIVGKIVLECIQQGHYLLDVPLATYQQHHSSIDADIYDYLQPENCLKRRQSYGSTGQSSVKQQLDVAKQLLSQ >NZ_CP016855.1|WP_000660045.1|1111512_1112718_+|argininosuccinate-synthase MKEKIVLAYSGGLDTSVAVQWLIDKGYDVVACCLDVGEGKDLDIVYKKALDMGAVECHIIDATKEFSDEYVSYAIKGNLMYENAYPLVSALSRPLIAKKLVEIAEKTNSVGIAHGCTGKGNDQVRFEVAIKALNPSLKAFAPVREWAWSREEEIDYAIKHNIPVSINHDSPYSIDQNLWGRANECGILEDPYAAPPEDAFDLTNALEETPDTADEIILTFDKGIPVQIDGKTYELDDLILTLNALAGKHGIGRIDHVENRLVGIKSREIYEAPAAEVILKAHKALETITLTKDVAHFKPIIEKQFAEQLYNGLWFSPLTDSLKLFIDSTQQYVSGDVRIKLFKGNAIVNGRKSPYTLYDEKLATYTKEDAFNQDAAVGFIDIYGLPTQVNAMLHGGYSNEQ >NZ_CP016855.1|WP_000148855.1|1109830_1111162_-|glucose-6-phosphate-isomerase MTHIQLDFSKTLEFFGEHELKQQQEIVKSIHKTIHEGTGAGSDFLGWVDLPVDYDKEEFSRIVEASKRIKENSDVLVVIGIGGSYLGARAAIEMLTSSFRNSNEYPEIVFVGNHLSSTYTKELVDYLADKDFSVNVISKSGTTTEPAVAFRLFKQLVEERYGKEEAQKRIFATTDKEKGALKQLATNEGYETFIVPDDVGGRYSVLTAVGLLPIATAGINIEAMMIGAAKAREELSSDKLEENIAYQYATIRNILYAKGYTTEMLINYEPSMQYFNEWWKQLFGESEGKDFKGIYPSSANYTTDLHSLGQYVQEGRRFLFETVVKVNHPKYDITIEKDSDDLDGLNYLAGKTIDEVNTKAFEGTLLAHTDGGVPNMVVNIPQLDEETFGYVVYFFELACAMSGYQLGVNPFNQPGVEAYKQNMFALLGKPGFEDLKKELEERL >NZ_CP016855.1|WP_000007967.1|1108930_1109506_-|TVP38/TMEM64-family-protein MSFHQVEEWFEIFRQFGYLPGFILLYIRAIIPVFPLALYILINIQAYGPILGILISWLGLISGTFTVYLICKRLVNTERMQRIKQRTAVQRLISFIDRQGLIPLFILLCFPFTPNTLINFVASLSHIRPKYYFIVLASSKLVSTIILGYLGKEITTILTHPLRGILMLVVLVVFWIVGKKLEQHFMGSKKE >NZ_CP016855.1|WP_000758215.1|1108401_1108926_-|signal-peptidase-I MKKVVKYLISLILAIIIVLFVQTFVIVGHVIPNNDMSPTLNKGDRVIVNKIKVTFNQLNNGDIITYRRGNEIYTSRIIAKPGQSMAFRQGQLYRDDRPVDASYAKNRKIKDFSLRNFKELDGDIIPPNNFVVLNDQDNNKHDSRQFGLIDKKDIIGNVSLRYYPFSKWTVQFKS >NZ_CP016855.1|WP_000711486.1|1107810_1108386_-|signal-peptidase-I MKKEILEWIISIAVAFVILFIVGKFIVTPYTIKGESMDPTLKDGERVAVNIVGYKTGGLEKGNVVVFHANKNDDYVKRVIGVPGDKVEYKNDTLYVNGKKQDEPYLNYNLKHKQGDYITGTFQVKDLPNANPKSNVIPKGKYLVLGDNREVSKDSRAFGLIDEDQIVGKVSFRFWPFSEFKHNFNPENTKN >NZ_CP016855.1|WP_000172342.1|1104174_1107651_-|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddB MTLHAYLGRAGTGKSTKMLTEIKQKMKADPLGDPIILIAPTQSTFQLEQAFVNDPELNGSLRTEVLHFERLSHRIFQEVGSYSEQKLSKAATEMMIYNIVQEQQKYLKLYQSQAKYYGFSEKLTEQIQDFKKYAVTPEHLEHFIADKNMQTRTKNKLEDIALIYREFEQRIQNEFITGEDSLQYFIDCMPKSEWLKRADIYIDGFHNFSTIEYLIIKGLIKYAKSVTIILTTDGNHDQFSLFRKPSEVLRHIEEIANELNISIERQYFNQLYRFNNQDLKHLEQEFDALQINRVACQGHINILESATMREEINEIARRIIVDIRDKQLRYQDIAILYRDESYAYLFDSILPLYNIPYNIDTKRSMTHHPVMEMIRSLIEVIQSNWQVNPMLRLLKTDVLTASYLKSAYLVDLLENFVLERGIYGKRWLDDELFNVEHFSKMGRKAHKLTEDERNTFEQVVKLKKDVIDKILHFEKQMSQAETVKDFATAFYESMEYFELPNQLMTERDELDLNGNHEKAEEIDQIWNGLIQILDDLVLVFGDEPMSMERFLEVFDIGLEQLEFVMIPQTLDQVSIGTMDLAKVDNKQHVYLVGMNDGTMPQPVTASSLITDEEKKYFEQQANVELSPTSDILQMDEAFVCYVAMTRAKGDVTFSYSLMGSSGDDKEISPFLNQIQSLFNQLEITNIPQYHEVNPLSLMQHAKQTKITLFEALRAWLYDEIVADSWLDAYQVIRDSDHLNQGLDYLMSALTFDNETVKLGETLSKDLYGKEINASVSRFEGYQQCPFKHYASHGLKLNERTKYELQNFDLGDIFHSVLKYISERINGDFKQLDLKKIRQLTNEALEEILPKVQFNLLNSSAYYRYLSRRIGAIVETTLSALKYQGTYSKFMPKHFETSFRRKPRTNDELIAQTLTTTQGIPINIRGQIDRIDTYTKNDTSFVNIIDYKSSEGSATLDLTKVYYGMQMQMMTYMDIVLQNKQRLGLTDIVKPGGLLYFHVHEPRIKFKSWSDIDEDKLEQDLIKKFKLSGLVNADQTVIDALDIRLEPKFTSDIVPVGLNKDGSLSKRGSQVADEATIYKFIQHNKENFIETASNIMDGHTEVAPLKYKQKLPCAFCSYQSVCHVDGMIDSKRYRTVDETINPIEAIQNININDEFGGEQ >NZ_CP016855.1|WP_000154914.1|1100520_1104174_-|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddA MTIPEKPQGVIWTDAQWQSIYATGQDVLVAAAAGSGKTAVLVERIIQKILRDGIDVDRLLVVTFTNLSAREMKHRVDQRIQEASIADPANAHLKNQRIKIHQAQISTLHSFCLKLIQQHYDVLNIDPNFRTSSEAENILLLEQTIDEVIEQHYDILDPAFIELTEQLSSDRSDDQFRMIIKQLYFFSVANPNPKNWLDQLVTPYEEEAQQAQLIQLLTDLSKVFITAAYDALNKAYDLFSMMDSVDKHLAVIEDERRLMGRVLEGGFIDIPYLTGHEFGARLPNVTAKIKEANEMMVDALEDAKLQYKKYKSLIDKVKSDYFSREADDLKADMQQLAPRVKYLARIVKDVMSEFNRKKRSKNILDFSDYEHFALQILTNEDGSPSEIAESYRQHFQEILVDEYQDTNRVQEKILSCIKTGDEHNGNLFMVGDVKQSIYKFRQADPSLFIEKYQRFTIDGDGTGRRIDLSQNFRSRKEVLSTTNYIFKHMMDEQVGEVKYDEAAQLYYGAPYDESDHPVNLKVLVEADQEHSDLTGSEQEAHFIVEQVKDILEHQKVYDMKTGSYRSATYKDIVILERSFGQARNLQQAFKNEDIPFHVNSREGYFEQTEVRLVLSFLRAIDNPLQDIYLVGLMRSVIYQFKEDELAQIRILSPNDDYFYQSIVNYINDEAADAILVDKLKMFLSDIQSYQQYSKDHPVYQLIDKFYNDHYVIQYFSGLIGGRGRRANLYGLFNKAIEFENSSFRGLYQFIRFIDELIERGKDFGEENVVGPNDNVVRMMTIHSSKGLEFPFVIYSGLSKDFNKRDLKQPVILNQQFGLGMDYFDVDKEMAFPSLASVAYRAVAEKELVSEEMRLVYVALTRAKEQLYLIGRVKNDKSLLELEQLSISGEHIAVNERLTSPNPFHLIYSILSKHQSASIPDDLKFEKDIAQIEDSSRPNVNISIVYFEDVSTETILDNDEYRSVNQLETMQNGNEDVKAQIKHQLDYRYPYVNDTKKPSKQSVSELKRQYETEESGTSYERVRQYRIGFSTYERPKFLSEQGKRKANEIGTLMHTVMQHLPFKKERISEVELHQYIDGLIDKHIIEADAKKDIRMDEIMTFINSELYSIIAEAEQVYRELPFVVNQALVDQLPQGDEDVSIIQGMIDLIFVKDGVHYFVDYKTDAFNRRRGMTDEEIGTQLKNKYKIQMKYYQNTLQTILNKEVKGYLYFFKFGTLQL >NZ_CP016855.1|WP_000670752.1|1099452_1100355_-|fumarylacetoacetate-hydrolase-family-protein MKFLSFKYNDKTSYGVKVKREDAVWDLTQVFADFAEGDFHPKTLLAGLQQNHTLDFQEQVRKAVVAAEDSGKAEDYKISFNDIEFLPPVTPPNNVIAFGRNYKDHANELNHEVEKLYVFTKAASSLTGDNATIPNHKDITDQLDYEGELGIVIGKSGEKIPKALALDYVYGYTIINDITDRKAQSEQDQAFLSKSLTGGCPMGPYIVTKDELPLPENVNIVTKVNNEIRQDGNTGEMILKIDELIEEISKYVALHPGDIIATGTPAGVGAGMQPPKFLQPGDEVKVTIDNIGTLTTYIAK >NZ_CP016855.1|WP_000138486.1|1115760_1117005_-|Glu/Leu/Phe/Val-dehydrogenase MTENNNLVTSTQGIIKEALHKLGFDEGMYDLIKEPLRMLQVRIPVRMDDGTVKTFTGYRAQHNDAVGPTKGGVRFHPDVDEEEVKALSMWMTLKCGIVNLPYGGGKGGIVCDPRQMSIHEVERLSRGYVRAISQFVGPNKDIPAPDVFTNSQIMAWMMDEYSALDKFNSPGFITGKPIVLGGSHGRDRSTALGVVIAIEQAAKRRNMQIEGAKVVIQGFGNAGSFLAKFLYDLGAKIVGISDAYGALHDPNGLDIDYLLDRRDSFGTVTNLFEETISNKELFELDCDILVPAAISNQITEDNAHDIKASIVVEAANGPTTPEATRILTERGILLVPDVLASAGGVTVSYFEWVQNNQGYYWSEEEVDEKLREKLEAAFDTIYELSQNRKIDMRLAAYIIGIKRTAEAARYRGWA >NZ_CP016855.1|WP_000167314.1|1117113_1118304_-|ornithine--oxo-acid-transaminase MTKSEKIIELTNHYGAHNYLPLPIVISEAEGVWVKDPEGNKYMDMLSAYSAVNQGHRHPKIIQALKDQADKVTLVSRAFHSDNLGEWYEKICKLAGKDKALPMNTGAEAVETALKAARRWAYDVKGIEPNKAEIIAFNGNFHGRTMAPVSLSSEAEYQRGYGPLLDGFRKVDFGDVDALKAAINENTAAVLVEPIQGEAGINIPPEGYLKAIRELCDEHNVLFIADEIQAGLGRSGKLFATDWDNVKPDVYILGKALGGGVFPISVVLADKEVLDVFTPGSHGSTFGGNPLACAASIAALDVIVDEDLPGRSLELGDYFKEQLKQIDHPSIKEVRGRGLFIGVELNESARPYCEALKEEGLLCKETHDTVIRFAPPLIITKEELDLALEKIRHVFQ >NZ_CP016855.1|WP_000838037.1|1118611_1119739_-|NADH-dependent-flavin-oxidoreductase MKSKYEPLFDKVELPNGVELRNRFVLAPLTHISSNDDGTISDVELPYIEKRSQDVGITINAASNVSDVGKAFPGQPSIAHDSNIEGLKRLATAMKKNGAKALVQIHHGGAQALPELTPDGDVVAPSPISLKSFGQKQEHSAREMTNEEIEQAIKDFGEATRRAIEAGFDGVEIHGANHYLIHQFVSPYYNRRNDVWANQYKFPVAVIEEVLKAKEAYGNKDFIVGYRLSPEEAESPGITMEITEELVNKISHMPIDYIHVSMMDTHATTREGKYAGQERLPLIHKWINGRMPLIGIGSIFTADEALDAVENVGVDLVAIGRELLLDYQFVEKIKDGREDEIINYFDPEREDNHHLTPNLWHQFNEGFYPLPRKDK >NZ_CP016855.1|WP_001067294.1|1120100_1120478_-|S1-RNA-binding-domain-containing-protein MNNYKIGQHIKVRVTGIQPYGAFVETPNHTEGLIHISEIMDDYVHNLKKFLSEGQIVKAKILSIDDEGKLNLSLKDNDYFKNYERKKEKQSVLDEIRETEKYGFQTLKERLPIWIKQSKRAIRND >NZ_CP016855.1|WP_000035058.1|1120893_1121487_-|peptidylprolyl-isomerase MANYPQLNKEVQQGEIKVVMHTNKGDMTFKLFPNIAPKTVENFVTHAKNGYYDGITFHRVINDFMIQGGDPTATGMGGESIYGGAFEDEFSLNAFNLYGALSMANSGPNTNGSQFFIVQMKEVPQNMLSQLADGGWPQPIVDAYGEKGGTPWLDQKHTVFGQIIDGETTLEDIANTKVGPQDKPLHDVVIESIDVEE >NZ_CP016855.1|WP_000781156.1|1121550_1121934_+|kinase-associated-lipoprotein-B MKLYRFSHKTGSYGVTIVEENGDDVLVKVEQVIKHPKQGDLHNPTETEGVFFHDRKALSHFEKRYTKRSQLRDFNVDVLRYEDSLQQAITDLETKLKAQQTKHAEMSLASLARLKEDYSLQYKENFK >NZ_CP016855.1|WP_000054609.1|1122064_1124470_+|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-A MSLLHIAVILPLIFALIIPILYRFFKRIHLGWFVLPVPIVIFIYMLTLIKTTMSGNTVMKTLNWMPHFGMNFDLYLDGLGLLFSLLISGIGSLVVLYSIGYLSKSEQLGNFYCYLLLFMGAMLGVVLSDNVIILYLFWELTSFSSFLLISFWRERQASIYGAQKSLIITVFGGLSLLGGIILLAIPTQSFSIQYMIQHASEIQNSPFFIFAMILIMIGAFTKSAQFPFYIWLPDAMEAPTPVSAYLHSATMVKAGLYLIARMTPIFAASQGWVWTVTLVGLITLFWASLNATKQQDLKGILAFSTVSQLGMIMAMLGIGAISYHYQGDDSKIYAAAFTAAIFHLINHATFKGALFMITGAVDHSTGTRDVKKLGGLLTIMPISFTITVITALSMAGVPPFNGFLSKESFLETTFTASQANLFSVDTLGYLFPIIGIVGSVFTFVYSIKFIMHIFFGQYKPEQLPKKAHEVSILMLLSPAILATLVIVFGLFPGILTNSIIEPATSSINHTVIDDVEFHMFHGLTPAFLSTLVIYILGILLIVTFSYWVKLLQRQPGKLTFNYWYNRSANVIPNYSEKMTNSYVTDYSRNNLVIIFGALILLTFVTIFSVPFNINFKDVSPIRIFEVCIVILLLSAAFLILFAKSRLFSIIMLSAVGYAVSVLFIFFKAPDLALTQFVVESISTALFLLCFYHLPNLNRYNEKRSFQLTNALIAGGVGLSVIIIGLIAYGNRHFESISKFYQEHVYDLAHGKNMVNVILVDFRGMDTLFESSVLGIAGLAVYTMIKLRKKRQTQGNEVKNHE >NZ_CP016855.1|WP_001081626.1|1124462_1124891_+|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-B MNRQQNDLILQFAAVIIFFMVMVFGFSLFLAGHYTPGGGFVGGLLFASSLVIITIAFDIETMRKIFPLDFKILIGIGLVFCIATPIASWFLGKNFFTHVTFDIPLFILEPVHMTTAVFFDFGVLCAVVGTVMTIIISIGENE >NZ_CP016855.1|WP_000402803.1|1124890_1125232_+|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-C MEIIMIFVSGILTAISVYLVLSKSLIRIVMGTTLLTHAANLFLITMGGLKHGTVPIYEANVKSYVDPIPQALILTAIVIAFATTAFFLVLAFRTYKELGTDNVESMKGVPEDD >NZ_CP016855.1|WP_000573080.1|1125224_1126721_+|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-D MIESNMLVLTLVIPVITAILLVFIGKRPIIKRYVALGGTLLTLVAAIINLANVVKHGPIRVELGSWKAPYSIVFVLDIFSALLIITSIIITAIVILYSYQTIGIERERYYYYFSVLFMLIGIIGAFTTGDIFNLFVYFEVFLMSSYFLLVIGSTKIQLQETIKYVLVNVVSSSFFVMGVAILYSVVGTLNLADISNKLANLSAHDSGLVNIVFILFIFVFATKAGVFPMFVWLPSAYYAPPIPIIAFFGALLTKVGVYAIARTLSLFFSDNVSFSHYVILFLALLTIIFGCVGAVAYANIKKIILYNVMIAVGVILVGVAMMTESGMIGSIYYTLHDMLVKLALFLLIGIMIKITGTADLRQFGGLIKRYPVLGWSFFIAALSLAGIPPLSGFYGKFFIVQSTFERGFYLSGVIVLLSSLVVLYSVIRIFLQGFFGQPKGYDLNNKVDVKYLTTIAIVAVVITVLYGLSADYLYPMVKAGAETFYNPSTYVKAVLGGK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP016855_3 | 1178339-1178420 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016855_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP016855_3
>3.1|1178363|34|NZ_CP016855|CRISPRCasFinder ATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016855_3
The CRISPR arrays of NZ_CP016855_3 >merge|NZ_CP016855|3|1178339-1178420|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGGG >NZ_CP016855|3|3|1178339-1178420|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGG ATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT TTCTACAGACAATGCAAGTTGGGG
>NZ_CP016855.1|WP_001018962.1|1177395_1177782_-|topiosmerase MAIVNKVIIVEGKSDKKRVQQVIAEPVNIICTHGTMSIDKLDDMIESLYDKQVFVLADSDDEGDRIRNWFKRYLSESEHIFIDKTYCQVANCPKQYLAHVLSKHGFTCKKETPLLPNINNERLVLVNE >NZ_CP016855.1|WP_001065801.1|1177106_1177403_-|thioredoxin-family-protein MNNSLDIKDVTTFYEEDKHLIFGYTPTCGTCKVSERMLDIANEILQLPLLKIDLNFYPQFCKDMQIMSTPILLLMNKDKEVKRIYAFKSVTDLLENLK >NZ_CP016855.1|WP_000571218.1|1175831_1176857_-|methionine-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIELKEVVKEYRTKNKEVLAVDHVNLSIRAGSIYGVIGFSGAGKSTLIRMFNHLEAPTSGEVIIDGDHIGQLSKNGLRAKRQKVSMIFQHFNLLWSRTVLKNIMFPLEIAGVPRRRAKQKALELVELVGLKGREKAYPSELSGGQKQRVGIARALANDPTVLLCDEATSALDPQTTDEILDLLLKIREQQNLTIVLITHEMHVIRRICDEVAVMESGKVIEQGPVTQVFENPQHTVTKRFVKDDLNDDFETSLTELEPLEKDAYIVRLVFAGSTTTEPIVSSLSTAYDIKINILEANIKNTKNGTVGFLVLHIPYISSVDFGKFEKELIERQVKMEVLRHG >NZ_CP016855.1|WP_000520233.1|1175143_1175839_-|ABC-transporter-permease MGKSFSEIINEMITMPNIQWPEVWTAIVETLYMTVVSTIFAFILGLILGVLLFLSAKGKSIGARLFYSIVSFIVNLFRAIPFIILILLLIPFTSLILGTISGPTGALPALIIGAAPFYARLVEIAFKEIDKGVIEAAWSMGANTWTVIRKVLLPEAMPALVSGITVTAIALVGSTAVAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFIGDWLTNKLDKR >NZ_CP016855.1|WP_000732326.1|1174304_1175126_-|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKLFGLILVLTFAVVLAACGNGNKSGSDDKKITVGASPAPHAEILEKAKPLLEKKGYELDIKTINDYTTPNKLLDKGEIDANYFQHTPYLNTEKKDKGYKIVSAGDVHLEPMAVYSKKYKSLKELPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDAGLIKIKKGVKIEDAKFSDITENKKDIKFNNKQSAEFLPKIYQNEDADAVIINSNFAIEQKLNPKKDSIAVESAKDNPYANLIAVKEGHQDDKKIKALIEVLQSKDIQDFINEKYNGAVIPAK >NZ_CP016855.1|WP_000266158.1|1172941_1174162_+|site-specific-integrase MWLEKFKNKNKETKYRYYEKYKDPLTAKWRRVSVVLNKNGKQSQKEAQRLLNERIEEKLNDKKPTTLKSLTFHVACDEWFQNYIKTSGSKRTTIKTKLSKLNTLKKFVDEDILINKITLSYAQQVFDEMDSKGYVYQVNKDALSIFKNVFEYTRRIYKLQDLEFLKDITLNKRIKSYDEVKAKRNKYLELNEIESIIKDINTKAQKMHSGIHKRFYLFVALMTEFQALNGMRIGEMLAIQNEDIDFDNKSLNINGTIHWFHDESGGFGVKDTTKTESSYRTIGLSSRSCEILKKAILENKKDSKWNDGYLNRNFVFTNHKGNPMQTERFNKILREAAKDVGIDKEVSSHILRHSHISLLSQQGVSLKAIMDRVGHSDHRTTLSIYSHVTEQMDKDMMNKLEQVKLG >NZ_CP016855.1|WP_000734020.1|1172125_1172854_+|staphylococcal-enterotoxin-type-K MKKLIVIILINIITLSVSNSASAQGDIGIDNLRNFYTKKDFVDLKDVKDNDTPIANQLQFSNVSYDLISESKDFNKFSNFKGKKLDVFGISYNGQCNNKYIYGGVTATNEYLDKPRNIPINIWINGNHKTISTNKVSTNKKFVTAQEIDVKLRKYLQEEYNIYGHNGTKKGEEYGHKSKFYSGFNIGKVTFHLNNNDTFSYDLFYTGDDGLPKSFLKIYEDNKTVESEKFHLDVDISYKETI >NZ_CP016855.1|WP_001033321.1|1171373_1172102_+|staphylococcal-enterotoxin-type-Q MNKIFRVLTVSLFFFTFLIKNNLAYADVGVINLRNFYTNYQPETLQGVSSGNFSTSHQLEYIDGKYTLYSQFHNEYEAKRLKDHKVDIFGISYSGLCNTKYMYGGITLANQNLDKPRNIPINLWVNGKQNTISTDEVSTQKKEVTAQEIDIKLRKYLQNEYNIYGFNKTKKGQEYGYQSKFNSGFNKGKITFHLNNETSFTYDLFYTGTGQAESFLKIYNDNKTIDAENFHLDVEISYEKTE >NZ_CP016855.1|WP_000281658.1|1170898_1171357_+|ImmA/IrrE-family-metallo-endopeptidase MYLYEKMVIENKEIPIDDGKSLGNFEGLYDNGVILINKNLSETRKAEVLYEELAHHKLTYGNILDQSKWINRKFENYARRHGFISAVPLREIVEAYNYGVRNLYELSEYLQLSEKYILEAIEQYKKIYGIGTHYGEYSITFEPLRVFKYKEI >NZ_CP016855.1|WP_001260004.1|1170554_1170887_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MRTNDEIITIIKTSMKEQNMSLSELARRVGVAKSAVSRYLNLTREFPLNRAEDFAKVLGIKTEYLLGFAEREESTKQDTIAAHLDGDFTEEELIEIRKYAELVRKAHRNQ >NZ_CP016855.1|WP_000932219.1|1178523_1179402_-|DUF1963-domain-containing-protein MLNIQDVSHLSKKEQKAYNRFVESVENGNLPVLPCIEMDLKEMQEETLNQSKIGGMPFLKYFKDIPLDENNVPMVLLAQINLDDLPEQQELFPVKEGILQFWISSEDQMYGMSENLKGNNINSRLVYIKEPITDLSLENIQAHLKSLDADNEDIPFSGAFSIEFRLSKQTITCTDYKYDEDVLALWNKVNPSFALKSMFGGYDELMEPVCNTFTAKEPFNQLGGYPYFDQIDPRTNDQELKMYDRVLLQIDSTRDGNSSIIWGDLGIANILVKSTDLEAMKFDDYMYSWDCS >NZ_CP016855.1|WP_000290485.1|1179580_1179961_-|glycine-cleavage-system-protein-GcvH MAVPNELKYSKEHEWVKVEGNVAIIGITEYAQSELGDIVFVELPETDDEINEGDTFGSVESVKTVSELYAPISGKVVEVNEELEDSPEFVNESPYEKAWMVKVEISDESQIEALLTAEKYSEMIGE >NZ_CP016855.1|WP_000589549.1|1180118_1180475_-|arsenate-reductase-family-protein MIKFYQYKNCTTCKKAAKFLDEYGVSYEPIDIVQHTPTINEFKTIIANTGVEINKLFNTHGAKYRELDLKNKLQTLSDDEKLELLSSDGMLVKRPLAVMGDKITLGFKEDQYKETWLA >NZ_CP016855.1|WP_001190695.1|1180618_1180939_+|thioredoxin-family-protein MQSIKSNESFKSVINSDTPVIVKFEAGWCPDCRAMDLWIDPIVEQYNDYQWYTVNRDELEDVVVENEVMGIPSLLVFKNGDKIAHLHSANAKSPEQVESFLAETFK >NZ_CP016855.1|WP_000422909.1|1181088_1181628_-|nitroreductase MELQQAIANRRSVKKFKRDMHIDDALLYQAIEKAADAPNHGMREPWRVVHVPKDRLGDMSKDISKFAFPNELDKQQCHYDAVTKLGGMLLLILKTDPRQRQNDENYFAFGAYAQNLMLLLYEAGIGTCWKSPLYIYDPKVRKTLGIKKDEVLAGFLYLTDLEGDMPKAPRKNRNLITLY >NZ_CP016855.1|WP_109885745.1|1181710_1182427_-|type-I-3-dehydroquinate-dehydratase MTHVEVVATIAPQSSIEETLIQKINHRIDAIDVLELRIDQIENVTVDQVAEMITKLKVMQDSFKLLVTYRTKLQGGYGQFTNDSYLNLISDLANINGIDMIDIEWQADIDIEKHQRIITHLQQYNKEVVISHHNFESTPPLDELQFIFFKMQKFNPEYVKLAVMPHNKNDVLNLLQAMSTFSDTMDCKVVGISMSKLGLISRTAQGVFGGALTYGCIGVPQAPGQIDVTDLKAQVTLY >NZ_CP016855.1|WP_000974460.1|1182574_1182997_+|organic-hydroperoxide-resistance-protein MAIHYETKATNVGGRKGHVYTDDRALDIDIVPPAQADGKATNPEQLFAAGYASCFNGAFDLILKQNKVRDAHPEVTLTVRLEDDSDSESPKLSVSIDATIKNVISQEEAEKYLQMAHEFCPYSKATQGNINVDLNVNVVD >NZ_CP016855.1|WP_000569884.1|1183395_1183890_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MIEIKTLTNNDFNEYKRLVSTVNEEFTQDSHYSQTMTDTLIHDILNQGSPKCIVFGCYENETLIATAALEQIRYVGKEHKSLIKYNFVTNNDKSINSELINFIINYARQNNYESLLTSIVSNNIGAKVFYSALGFDILGFEKNAIKIGNTYFDEHWLFYDLINK >NZ_CP016855.1|WP_000255561.1|1184044_1184662_+|amino-acid-transporter MVTAIIHGFILAIGLILPLGAQNVFIFNQGANQPKYRYVLPAIITAGLSDSLLIIIAVVGVSIIIMSLPVLQAIIYIVGLIFLMYMAWTIWHDKPSTDGETQIMSPMKQVSFALSVSLLNPHAILDTIGVIGSSAALYSGSNKIAFTIACISVSWLWFFLLAILGKMVGSIDKTGKLLTIINKISSIIIIIVALMILQKLIQLLF >NZ_CP016855.1|WP_001140686.1|1184734_1185316_-|histidine-phosphatase-family-protein MAKTLYIMRHGQTLFNFKGLIQGFGDSPLTELGIAQAQKARSYYETKGINFDLYASSTQERASDTLENVAPNQSYQRFKGLKEWHFGIFEGESVYLFDNLYKPEDLFGDRIVPFKGEARQQVEERIVKTLHDIMSQTKNNALVVSHGTIMGVFLRYCLKLDEALKHNIGNCNILKFEYDNGTFKFVELIDPNL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP016855_4 | 1214307-1214399 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016855_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP016855_4
>4.1|1214340|27|NZ_CP016855|CRISPRCasFinder CTCCTCCCAATTTCTACAGGCAATGCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016855_4
The CRISPR arrays of NZ_CP016855_4 >merge|NZ_CP016855|4|1214307-1214399|CRISPRCasFinder AGTTGGGGTGGGGCCCCAACATAGTGAAATTGGCTCCTCCCAATTTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGG >NZ_CP016855|4|4|1214307-1214399|CRISPRCasFinder AGTTGGGGTGGGGCCCCAACATAGTGAAATTGG CTCCTCCCAATTTCTACAGGCAATGCA AGTTGGGGTGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGG
>NZ_CP016855.1|WP_000654030.1|1212863_1213877_-|sugar-binding-transcriptional-regulator MKDLLQAQQKLIPDLIDKMYKRFSILTTISKNQPVGRRSLSEHMDMTERVLRSETDMLKKQDLIKVKPTGMEITAEGEQLISQLKGYFDIYADDNRLSEGIKNKFQIKEVHVVPGDADNSQSVKTELGRQAGQLLEGILQEDAIVAVTGGSTMACVSEAIHLLPYNVFFVPARGGLGENVVFQANTIAASMAQQAGGYYTTMYVPDNVSETTYNTLLLEPSVINTLDKIKQANVILHGIGDALKMAHRRQSPEKVIEQLQHHQAVGEAFGYYFDTQGQIVHKVKTIGLQLEDLESKDFIFAVAGGKSKGEAIKAYLTIAPKNTVLITDEAAAKIILE >NZ_CP016855.1|WP_000279414.1|1211800_1212811_-|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MAVKVAINGFGRIGRLAFRRIQEVEGLEVVAVNDLTDDDMLAHLLKYDTMQGRFTGEVEVVDGGFRVNGKEVKSFSEPDASKLPWKDLNIDVVLECTGFYTDKDKAQAHIEAGAKKVLISAPATGDLKTIVFNTNHQELDGSETVVSGASCTTNSLAPVAKVLNDDFGLVEGLMTTIHAYTGDQNTQDAPHRKGDKRRARAAAENIIPNSTGAAKAIGKVIPEIDGKLDGGAQRVPVATGSLTELTVVLEKQDVTVEQVNEAMKNASNESFGYTEDEIVSSDVVGMTYGSLFDATQTRVMSVGDRQLVKVAAWYDNEMSYTAQLVRTLAYLAELSK >NZ_CP016855.1|WP_001074749.1|1210471_1211662_-|phosphoglycerate-kinase MAKKIVSDLDLKGKTVLVRADFNVPLKDGEITNDNRIVQALPTIQYIIEQGGKIVLFSHLGKVKEESDKAKLTLRPVAEDLSKKLDKEVVFVPETRGEKLEAAIKDLKEGDVLLVENTRYEDLDGKKESKNDPELGKYWASLGDVFVNDAFGTAHREHASNVGISTHLETAAGFLMDKEIKFIGGVVNDPHKPVVAILGGAKVSDKINVIKNLVNIADKIIIGGGMAYTFLKAQGKEIGISLLEEDKIDFAKDLLEKHGDKIVLPVDTKVAKEFSNDAKITVVPSDSIPADQEGMDIGPNTVKLFADELEGAHTVVWNGPMGVFEFSNFAQGTIGVCKAIANLKDAITIIGGGDSAAAAISLGFENDFTHISTGGGASLEYLEGKELPGIKAINNK >NZ_CP016855.1|WP_001260089.1|1209588_1210350_-|triose-phosphate-isomerase MRTPIIAGNWKMNKTVQEAKDFVNALPTLPDSKEVESVICAPAIQLDALTTAVKEGKAQGLEIGAQNTYFEDNGAFTGETSPVALADLGVKYVVIGHSERRELFHETDEEINKKAHAIFKHGMTPIICVGETDEERESGKANDVVGEQVKKAVAGLSEDQLKSVVIAYEPIWAIGTGKSSTSEDANEMCAFVRQTIADLSSKEVSEATRIQYGGSVKPNNIKEYMAQTDIDGALVGGASLKVEDFVQLLEGAK >NZ_CP016855.1|WP_001085505.1|1208068_1209586_-|2,3-bisphosphoglycerate-independent-phosphoglycerate-mutase MAKKPTALIILDGFANRESEHGNAVKLANKPNFDRYYNKYPTTQIEASGLDVGLPEGQMGNSEVGHMNIGAGRIVYQSLTRINKSIEDGDFFENDVLNNAIAHVNSHDSALHIFGLLSDGGVHSHYKHLFALLELAKKQGVEKVYVHAFLDGRDVDQKSALKYIEETEAKFNELGIGQFASVSGRYYAMDRDKRWEREEKAYNAIRNFDAPTYATAKEGVEASYNEGLTDEFVVPFIVENQNDGVNDGDAVIFYNFRPDRAAQLSEIFANRAFEGFKVEQVKDLFYATFTKYNDNIDAAIVFEKVDLNNTIGEIAQNNNLTQLRIAETEKYPHVTYFMSGGRNEEFKGERRRLIDSPKVATYDLKPEMSAYEVKDALLEELNKGDLDLIILNFANPDMVGHSGMLEPTIKAIEAVDECLGEVVDKILDMDGYAIITADHGNSDQVLTDDDQPMTTHTTNPVPVIVTKEGVTLRETGRLGDLAPTLLDLLNVEQPEDMTGESLIKH >NZ_CP016855.1|WP_001121760.1|1206634_1207939_-|phosphopyruvate-hydratase MPIITDVYAREVLDSRGNPTVEVEVLTESGAFGRALVPSGASTGEHEAVELRDGDKSRYLGKGVTKAVENVNEIIAPEIIEGEFSVLDQVSIDKMMIALDGTPNKGKLGANAILGVSIAVARAAADLLGQPLYKYLGGFNGKQLPVPMMNIVNGGSHSDAPIAFQEFMILPVGATTFKESLRWGTEIFHNLKSILSKRGLETAVGDEGGFAPKFEGTEDAVETIIQAIEAAGYKPGEEVFLGFDCASSEFYENGVYDYSKFEGEHGAKRTAAEQVDYLEQLVDKYPIITIEDGMDENDWDGWKQLTERIGDRVQLVGDDLFVTNTEILAKGIENGIGNSILIKVNQIGTLTETFDAIEMAQKAGYTAVVSHRSGETEDTTIADIAVATNAGQIKTGSLSRTDRIAKYNQLLRIEDELFETAKYDGIKSFYNLDK >NZ_CP016855.1|WP_000785252.1|1205836_1206295_-|hypothetical-protein MADRTNKEIKTGRFIATASIVFSILLIIHYFVSLDNATAKALLNLTNQNTSDKAIDYILNSFRFTGIMYILAYLAGFITFWNRHTYVWWFMFAVYVSNSLFTLINLSITIQAIKAAHGAYLTLPILIVIIGSVALAIYMLVVSIKRKSTFNR >NZ_CP016855.1|WP_000556760.1|1205536_1205770_-|preprotein-translocase-subunit-SecG MHTFLIVLLIIDCIALITVVLLQEGKSSGLSGAISGGAEQLFGKQKQRGVDLFLNRLTIILSILFFVLMICISYLGM >NZ_CP016855.1|WP_109885746.1|1204680_1205421_-|carboxylesterase MQIKLPKPFFFEEGKRAVLLLHGFTGNSSDVRQLGRFLQKKGYTSYAPQYEGHAAPPDEILKSSPFVWFKDALDGYDYLVEQGYDEIVVAGLSLGGDFALKLCLNRDVKGIVTMCAPMGGKTEGAIYEGFLEYARNFKKYEGKDQETIDNEMDHFKPTETLKELSEALDTIKEQVDEVLDPILVIQAENDNMIDPQSANYIYDHVDSDDKNIKWYSESGHVITIDKEKEQVFEDIYQFLESLDWSE >NZ_CP016855.1|WP_001050064.1|1202274_1204647_-|ribonuclease-R 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MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >NZ_CP016855.1|WP_000134963.1|1222110_1223046_-|thioredoxin-disulfide-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >NZ_CP016855.1|WP_109885747.1|1223112_1224552_-|tetratricopeptide-repeat-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDMEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLRQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYHNELFVSENDVMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >NZ_CP016855.1|WP_001224793.1|1224559_1225045_-|acetyltransferase MRKFLSKTHHHTNPLWRVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >NZ_CP016855.1|WP_000513308.1|1225052_1225892_-|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP016855_5 | 1221664-1221749 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016855_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP016855_5
>5.1|1221694|26|NZ_CP016855|CRISPRCasFinder CGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGCGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016855_5
The CRISPR arrays of NZ_CP016855_5 >merge|NZ_CP016855|5|1221664-1221749|CRISPRCasFinder AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG >NZ_CP016855|5|5|1221664-1221749|CRISPRCasFinder AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG CGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGCGG AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG
>NZ_CP016855.1|WP_000369722.1|1220319_1221231_-|RNase-adapter-RapZ MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >NZ_CP016855.1|WP_001248939.1|1219327_1220323_-|YvcK-family-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >NZ_CP016855.1|WP_000006551.1|1218273_1219218_-|DNA-binding-protein-WhiA MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >NZ_CP016855.1|WP_001049165.1|1217112_1217700_-|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >NZ_CP016855.1|WP_000816295.1|1215967_1216870_+|TIGR01777-family-protein MKQYLITGGTGMVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQNIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKALFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGIILSNEGGALQTMKLPYEYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINNESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLIKE >NZ_CP016855.1|WP_000070826.1|1214636_1215266_-|DUF4887-domain-containing-protein MSNQNYDYNKNEDGSKKKMSTTAKVVSIATVLLLLGGLVFAIFAYVDHSNKAKERMLNEQKQEQKEKRQKENAEKERKKKQQEEKEQNELDSQANQYQQLPQQNQYQYVPPQQQAPTKQRPAKEENDDKASKDESKDKDDKASQDKSDDNQKKTDDNKQPAQPKPQPQQPTPKPNNNQQNNQSNQQAKPQAPQQNSQSTTNKQNNANDK >NZ_CP016855.1|WP_000654030.1|1212863_1213877_-|sugar-binding-transcriptional-regulator MKDLLQAQQKLIPDLIDKMYKRFSILTTISKNQPVGRRSLSEHMDMTERVLRSETDMLKKQDLIKVKPTGMEITAEGEQLISQLKGYFDIYADDNRLSEGIKNKFQIKEVHVVPGDADNSQSVKTELGRQAGQLLEGILQEDAIVAVTGGSTMACVSEAIHLLPYNVFFVPARGGLGENVVFQANTIAASMAQQAGGYYTTMYVPDNVSETTYNTLLLEPSVINTLDKIKQANVILHGIGDALKMAHRRQSPEKVIEQLQHHQAVGEAFGYYFDTQGQIVHKVKTIGLQLEDLESKDFIFAVAGGKSKGEAIKAYLTIAPKNTVLITDEAAAKIILE >NZ_CP016855.1|WP_000279414.1|1211800_1212811_-|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase 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MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDMEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLRQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYHNELFVSENDVMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >NZ_CP016855.1|WP_001224793.1|1224559_1225045_-|acetyltransferase MRKFLSKTHHHTNPLWRVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >NZ_CP016855.1|WP_000513308.1|1225052_1225892_-|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase 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MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEARTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNIDLSEHDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIEVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGVDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYDKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKIKRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDK >NZ_CP016855.1|WP_000229253.1|1230400_1232386_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrB MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVEGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >NZ_CP016855.1|WP_000638419.1|1232654_1232891_-|CsbA-family-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >NZ_CP016855.1|WP_000538141.1|1232887_1233538_-|HD-domain-containing-protein MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKRKEENE >NZ_CP016855.1|WP_000749380.1|1233711_1234551_-|CHAP-domain-containing-protein MKKSLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQHGTQVKTPVQHNYVSNVQAQTQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKAVKSPVRKASQAKKVVKQPVQQASKKVVVKQAPKQAVTKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTPEVGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP016855_6 | 1397522-1397614 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016855_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP016855_6
>6.1|1397554|29|NZ_CP016855|CRISPRCasFinder CGATTAGAGGCTTTTATGCAGTTGTGCCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016855_6
The CRISPR arrays of NZ_CP016855_6 >merge|NZ_CP016855|6|1397522-1397614|CRISPRCasFinder TAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCATCTTTAGCGATTAGAGGCTTTTATGCAGTTGTGCCTTAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCACCTTTAG >NZ_CP016855|6|6|1397522-1397614|CRISPRCasFinder TAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCATCTTTAG CGATTAGAGGCTTTTATGCAGTTGTGCCT TAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCACCTTTAG
>NZ_CP016855.1|WP_000749059.1|1396565_1397453_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKSLIAFILIFMLVLSGCGMKDNDKQGSNDNGSSKSPYHRIVSLMPSNTEILYELGLGKYIVGVSTVDDYPKDVKKGKKQFDALNLNKEELLKAKPDLILAHESQKATANKVLSSLEKQGIKVVYVKDAQSIDETYNTFKQIGKLTHHDKQAEQLVEETKDNIDKVIDSIPAHHKKSKVFIEVSSKPEIYTAGKHTFFNDMLEKLEAQNVYSDINGWNPVTKESIIKKNPDILISTEAKTRSDYMDIIKKRGGFNKINAVKNTRIEVVNGDEVSRPGPRIDEGLKELRDAIYRK >NZ_CP016855.1|WP_001790232.1|1395467_1396418_-|iron-ABC-transporter-permease MTFNKVLLSWIVILIITTSIYLFWQLGDINDVFNQSILINVRLPRLLEALLTGMILTVAGLIFQTVLNNALADSFTLGLASGATFGSGLALFLGLTTLWIPVFSITFSLITLITVLVITSVLSQGYPVRILILSGLMIGALFNSLLYFLILLKPRKLNTIANYLFGGFGDAEYSNVSIIAITFIIALFGIFIILNQLKLLQLGELKSQSLGLNVQLITYIALCIASMITAINVAYVGIIGFIGMVIPQLIRKWQWKQSLGRQLALNIVTGGQIMVMADFIGSHILSPVQIPASIIIALIGIPVLFYMLISQSKRLH >NZ_CP016855.1|WP_000365354.1|1394693_1395413_-|HAD-family-hydrolase MDLNQIKAVVFDLEGTLLDRVKSREKFIEEQYERFHDYLIHVQLADFKKAFIELDDDEDNDKPDLYKEIIKRFHVDRLTWKDLFNDFEMHFYRYVFPYYDTLYTLEKLSQKGFQIGVIANGKSKIKQFRLHSLGLMHVINYLSTSETVGFRKPHPKIFEDMIDQLGVLPEQIMYVGDDALNDVAPARAMGMVSVWYKQEDAEIEPLEEEVDFTITTVEELLTILPIKNDNKGENYGSIY >NZ_CP016855.1|WP_000362967.1|1393909_1394710_-|alpha/beta-hydrolase MDLFTRKDGTSIHYSTLGEGYPIVLIHTVLDNYSVFNKLAAELAKSFQVVLIDLRGHGYSDKPRHIEIKDFSDDIVELLKYLYIEEVAFVCHEMGGIIGADISVRYPEFTSSLTLVNPTSIEGELPEERLFRKYAHIIRNWDPEKQDKFLNKRKYYRPRKMNRFLKHVVDTNEISTKEEIQAVKEVFKNADISQTYRNVVVPTKIIAGEFGERTTRLEAKEVADLIQNADFEVYQESSAFPFVEEQERFVEDTAAFINKHHDEKHV >NZ_CP016855.1|WP_000735558.1|1393267_1393774_-|hypothetical-protein MKKLLTASIIACSVVMGVGLVNTSAEAASGNSIDTVKQLIKGDQSLENVKIGESIKDVLTKYKNPMYSYNEDGTEHYYEFHTKKGMLLVTTDGKKNNGKVTHISMMYNDANGPTYQAVKNYVGKAVTHTEYSKVAGNFGYIEKGKTTYQFASAPKDKNIKLYRIDLEK >NZ_CP016855.1|WP_001222133.1|1392389_1393106_-|hypothetical-protein MRINDKILLENIEDYFNHKGLSPHLIDDIKEKVITDIKNSEKKDQDYIEYKRKSPAQIILMIQRNLFALQMNPVIFFIINFILISYLYDKQYVQFQAITGMSLFYCLVIFPMTIVVYLRVSQKNYLRSNKIEMIMGTIIAIISLLLIILQAFNITWGVIPITNFGHQFFFFIGIILVIAGIFYKRLEFSGIGLLFCQKTVDAMIHNPQSAQIFSLIIWILLVVLVIYFTIRLSSRTRL >NZ_CP016855.1|WP_001045421.1|1391432_1392221_-|alpha/beta-hydrolase MNKVTINPQIQLTYQIEGKGDPIILLHGLDGNLAGFEDLQHQLASSYKVLTYDLRGHGKSSKSESYDLNDHVEDLKILMEKLNIHEAHILGHDLGGVVAKLFTDKYAYRVKSLTTIASKKDDLIHSFTQLLIQYQDDIAGFNKSEAYILLFSKLFRNQEKTMKWYQKQRIYSIKSEDDSAVAIRSLILHKDEPMYLKKRTCVPTLLINGEHDPLIKDKNHFKLEAHFLNVTKKIFEHSGHAPHIEEPEAFMNYYLKFLKSVS >NZ_CP016855.1|WP_001018677.1|1390807_1391182_+|transcriptional-regulator MAITKINDCFELLSMVTYADKLKSLIKKEFSISFEEFAVLTYISENKEKEYYLKDIINHLNYKQPQVVKAVKILSQEDYFDKKRNEHDERTVLILVNAQQRKKIESLLSRVNKRITEANNEIEL >NZ_CP016855.1|WP_077442703.1|1388555_1389092_+|IS30-family-transposase MGSKSINNREEFGHYEIDTVWSVRPSTYCLLTIIERKTRYLYASRLNTRKSNVVCNEIINIMKPLLPKSITMDRGKEFALFEEIEDELNCSIYFSDLGCPYQRGSIENANGLLRQYYPKGTDFANITQKSLDEAVKQINARPRMIFDYKSSEEMLKYHVSTQNCEPILNDCVRHEPVN >NZ_CP016855.1|WP_000746375.1|1388071_1388575_+|transposase MKKRKKRKELDYKTRLAIAKYLNDGLNIIQISKILGRDDAVLYREVNKRSVDGVYNPLLAEEDAIKSRSISDEQVAKRRRLNDETKAYIEEKLSLKWSPRQIASQIEKDTGYYISYPTIYRYIRNGLVKVDVKRDMRQAGKKYNKSSEKRGKLDVGSRVIKYRLKKY >NZ_CP016855.1|WP_000901764.1|1397831_1398467_-|endonuclease-III-domain-containing-protein MLGTDELYKVLYEHLGPQFWWPADNDIEMMLGAILVQNTRWRNAEIALNQIKEHTHFNPNHILELPIETLQSLIHSSGFYKSKSLTIKTLLTWLARHHFNYQEINERYKGGLRKELLSLKGIGSETADVLLVYIFGRIEFIPDSYTRKIYDKLGYENTKNYDQLKKVVTLPNHFTNQDANEFHALLDVFGKHYFRDKDIKNYDFLEPYFKK >NZ_CP016855.1|WP_001021145.1|1398854_1400516_-|arginine--tRNA-ligase MNIIDQVKQTLVEEIAASINKAGLADEIPDIKIEVPKDTKNGDYATNIAMVLTKIAKRNPREIAQAIVDNLDTEKAHVKQIDIAGPGFINFYLDNQYLTAIIPEAIEKGDQFGHVNESKGQNVLLEYVSANPTGDLHIGHARNAAVGDALANILTAAGYNVTREYYINDAGNQITNLARSIETRFFEALGDNSYSMPEDGYNGKDIIEIGKDLAEKHPEIKDYSEEARLKEFRKLGVEYEMAKLKNDLAEFNTHFDNWFSETSLYEKGEILEVLAKMKELGYTYEADGATWLRTTDFKDDKDRVLIKNDGTYTYFLPDIAYHFDKVKRGNDILIDLFGADHHGYINRLKASLETFGVDSNRLEIQIMQMVRLMENGKEVKMSKRTGNAITLREIMDEVGVDAARYFLTMRSPDSHFDFDMELAKEQSQDNPVYYAQYAHARICSILKQAKEQGIEVTAANDFTTITNEKAIELLKKVADFEPTIESAAEHRSAHRITNYIQDLASHFHKFYNAEKVLTDDIEKTKAHVAMIEAVRITLKNALAMVGVSAPESM >NZ_CP016855.1|WP_000359086.1|1400512_1400929_-|DUF1934-domain-containing-protein MDKKVSIQTKQVLKQHNEKEKFEFTTEGTWQQRQSNFIRYVEQIEDATVNVTIKVDDDSVKLIRKGDINMNLHFVEGQTTTTFYDISAGRIPLEVKTLRILHFVSGDGGKLKIHYELYQDNEKMGSYQYEINYKEIGE >NZ_CP016855.1|WP_000655099.1|1401021_1401129_-|hypothetical-protein MKDSENLVFFGFEVLFVFYKMAYIYEALIKYGIVN >NZ_CP016855.1|WP_001200748.1|1401203_1402214_-|alcohol-dehydrogenase-AdhP MRAAVVTKDHKVSIEDKKLRALKPGEALVQTEYCGVCHTDLHVKNADFGDVTGVTLGHEGIGKVIEVAEDVESLKIGDRVSIAWMFESCGRCEYCTTGRETLCRSVKNAGYTVDGAMAEQVIVTADYAVKVPEKLDPAAASSITCAGVTTYKAVKVSNVKPGQWLGVFGIGGLGNLALQYAKNVMGAKIVAFDINDDKLAFAKELGADAIINSKDVDPVAEVMKLTDNKGLDATVVTSVAKTPFNQAVDVVKAGARVVAVGLPVDKMNLDIPRLVLDGIEVVGSLVGTRQDLREAFEFAAENKVTPKVQLRKLEEINDIFEEMENGTITGRMVIKF >NZ_CP016855.1|WP_001788287.1|1402712_1403234_-|YwhD-family-protein MEVISLSEKKGFNFNIIKNDPLDGHKGTNIGSISLDNIAPVFIDVANKEAFIDIGGMHARAKVEKGVKWITDKAAVEGDEAKEYWLCWVTTERNEQGPYYAGLTACYLLVNKAIRRGYKSMPEHVNMMDKSMKHHIIIDQIGDENKAILKDFLMNHDEGMWKHSSDALHQAFN >NZ_CP016855.1|WP_000180230.1|1403261_1404557_-|HD-domain-containing-protein MTNAYVDLKLVEEKVFKDPIHRYIHVEDQLIWDLIKTKEFQRLRRIRQLGTLYLSFHTAEHSRFGHSLGVYEIVRRLIDESFIGHDAWDNKDRPLALCAALLHDLGHGPFSHSFEKIFNTDHEAYTQAIITGDTEVNAVLRKVAPEFPREVAEVINKTHHNKLVISMISSQIDADRMDYLQRDAYFTGVSYGAFDMERILRLMRPSKDEVLIKESGMHAVENFIMSRYQMYWQIYFHPVSRGGEVLLNNCLKRAKQLYNEGYEFKLHPHDFIPFFEETVTIEQYVELDEAVVTYYLEKWTKEDDAILSDLASRFINRDLFKYIPFDGSIITISELQELFEAGGINPDYYFVSEAFSDLPYDYDRPGSNRKPIHLLRQDGTIREISNQSLVIHSITGINRQDYKLYYPREMVAKIKDKTIREAIENLINELN >NZ_CP016855.1|WP_000477504.1|1404596_1405073_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MFKVRQATEKDVVQIRDVATKAWFNTYLNIYAATTVNHLLEASYNEHHLKKRLQEQLFLVVEEGNDIVGFANFIYGEELYLSAHYVKPESQHTGYGTALLNEGLSRFEDKFEGVYLEVDNKNEEAVAYYKEQGFTILRSYEPEMYGEKLDLALMYKAF >NZ_CP016855.1|WP_000633782.1|1405241_1405778_-|flavodoxin-family-protein MITVLFGGSRPNGNTAQLTKFALQDLEYQWIDVTQHQFKPIRDVRHTAETITSYDDDYLPILDKILASDTIIFASPVYWYSISAPLKAFIEHWSETLQDKRYPNFKAQMAEKDFRVILVGGDCPKIKAKPAITQMKYSLDFLGATLNGYIIGTAEKPGDIMKDNYALARATEWNSILQ >NZ_CP016855.1|WP_000808902.1|1405988_1406927_-|aldo/keto-reductase MKQFVNLGKSDVEVFPIALGTNAVGGHNLYPNLDEEQGKDVVRQAINHGINLLDTAYIYGPERSEELVGEVVKEYPREQIKIATKGSHEFDENQEVHQNNQPEYLKQQVENSLKRLQTDYIDLYYIHFPDNNTPKDQAVAALQELKEQGKIKAIGVSNFTLDQLKEANKDGYVDVVQLEYNLLHRENEAVLQYCVDHQITFIPYFPLASGILAGKYDENTKFSDHRTTRRDFKPGVFEENVRRVKALESIAAAHQTSIANIVLAFYLTRPAIDVIIPGAKRAEQVVENIKAADIVLSDDEIQYIDELFPIED |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP016855_7 | 1641857-1641958 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016855_7
|
1 spacers
spacers of NZ_CP016855_7
>7.1|1641881|54|NZ_CP016855|CRISPRCasFinder TAGCTTTGATTTAAAAACTGATTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016855_7
The CRISPR arrays of NZ_CP016855_7 >merge|NZ_CP016855|7|1641857-1641958|CRISPRCasFinder CAAATTTAATACTCAATTCATATATAGCTTTGATTTAAAAACTGATTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTTCAAATTTAATACTCAATTCATAAA >NZ_CP016855|7|7|1641857-1641958|CRISPRCasFinder CAAATTTAATACTCAATTCATATA TAGCTTTGATTTAAAAACTGATTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTT CAAATTTAATACTCAATTCATAAA
>NZ_CP016855.1|WP_000956132.1|1640883_1641840_+|hypothetical-protein MLTKEFAQRVELSEKQVRKIVQHLEERGYQLSKTEYRGREATDFKEEDIELFKDIADKVKQTNSYDLAFDELEKEKDFLQVIVKNDDKNLPTNQNVAQLVEDLRLEIQKMREERHLLGQMMNQVHQQQQELKELQNQLTSKIDSNSESLKAIQTSQEAIQEAQASQAKALAESTNKVEKNAVTEDKADSKDSKVAGVNTSTDAKTDTKAENAGDGTATKVDKEDQISATEAIEKASVEQSKNDNAAETSNKEATVDAEAQHDAEQQVAEAHAEASKQATSNDSLEAKAENDSTASQSEMSEPKPQEEKKGFFARLFNL >NZ_CP016855.1|WP_000394698.1|1640103_1640766_+|hypothetical-protein MEFKTIQSVKDPHYNEALKLYDTKLNLSLTEDKRIIKRSLENNKTENDYVFIVGLENDVVVSLATAHYEATTNSAFLIYLFAKDLPNHDELMTQTLHQIEHELNLLSNLVHSRSINFLMMEVPKEPADLTQDNGLIIEHRRQFLYEHQFERQTEIDYIHPTNDGHTKKVDLFLKKNIKLTKDIYGTSVKSNYILKYVFANGIAREIIYALLEEMDLRKPF >NZ_CP016855.1|WP_000763768.1|1639553_1639961_+|general-stress-protein MADITVVNDTGELYNVINQKKSEGYLESELTIISKSKLHLNDLHDSEISLISTSGTFSDRMTKLLTGEDGEHAVLSRYNLAPDELEKYKQLILDDKMLVVAVRDKSSHQEVHENNSAYEEIDITHFAEASKGPKA >NZ_CP016855.1|WP_000421410.1|1638462_1639041_-|xanthine-phosphoribosyltransferase MELLGQKVKEDGVVIDEKILKVDGFLNHQIDAKLMNEVGRTFYEQFKDKGITKILTIEASGIAPAIMAALHFDVPCLFAKKAKPSTLTDGYYETSIHSFTKNKTSTVIVSKEFLSEEDTVLIIDDFLANGDASLGLYDIAQQANAKTAGIGIVVEKSFQNGHQRLEEAGLTVSSLCKVASLEGNKVTLVGEE >NZ_CP016855.1|WP_000793009.1|1637194_1638463_-|purine-permease MKNLILSVQHLLAMYAGAILVPIIVGTSLKFTPEQIAYLVTVDIFMCGVATFLQANKVTGTGLPIVLGCTFTAVAPMILIGQTKGIDVLYGSLFLSGILVIIIAPFFSHLVKFFPPVVTGSVVTIIGINLMPVAMNYLAGGQGAKDYGDVKNILLGLMTLIIILLLQRFTTGFIKSIAILIGLVLGTIGAGLLGMVDINQVNHAGWLGIPVPFRFSGFSFDVTSTLVFFIVAIVSLIESTGVYHALSEITGKKLERKDFRKGYTAEGLAIVLGSIFNSFPYTAYSQNVGLVSLSGAKKNNVIYGMVVLLLICGCIPKLGALANIIPLPVLGGAMIAMFGMVMAYGVSILGHIDFKNQNNLLIIAVSVGLGTGISAVPQAFKGLGEQFAWLTQNGIVLGAISAIILNFFFNGIKYKQTEENVK >NZ_CP016855.1|WP_000264071.1|1635690_1637157_-|IMP-dehydrogenase MWESKFAKESLTFDDVLLIPAQSDILPKDVDLSVQLSDKVKLNIPVISAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVIHKNMGVEEQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEESVYEAEALMGKYRISGVPIVDNKEDRNLVGILTNRDLRFIEDFSIKIVDVMTQENLITAPVNTTLEEAEKILQKHKIEKLPLVKDGRLEGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEHGRLLVAAAIGISKDTDIRAQKLVEAGVDVLVIDTAHGHSKGVIDQVKHIKKTYPEITLVAGNVATAEATKDLFEAGADIVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCATEARKHGKAIIADGGIKFSGDIIKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGATEIFQGRQYKVYRGMGSLGAMEKGSNDRYFQEDKAPKKFVPEGIEGRTAYKGALQDTIYQLMGGVRAGMGYTGSHDLRELREEAQFTRMGPAGLAESHPHNIQITKESPNYSF >NZ_CP016855.1|WP_000424966.1|1634124_1635666_-|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase MEMAKEQELILVLDFGSQYNQLITRRIREMGVYSELHDHEISIEEIKKMNPKGIILSGGPNSVYEEGSFTIDPEIYNLGIPVLGICYGMQLTTKLLGGKVERANEREYGKAIINAKSDELFAGLPAEQTVWMSHSDKVIEIPEGFEVIADSPSTDYAAIEDKKRRIYGVQFHPEVRHTEYGNDLLNNFVRRVCDCRGQWTMENFIEIEIEKIRQRVGDRRVLCAMSGGVDSSVVAVLLHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEGDMVMEQFGEGFNMNIIRVNAKDRFMNKLKGVSDPEQKRKIIGNEFVYVFDDEASKLKGVDFLAQGTLYTDVIESGTKTAQTIKSHHNVGGLPEDMEFELIEPINTLFKDEVRKLGIELGIPEHLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEDKLEIVRESDAILRQVIREEGLEREIWQYFTVLPNIQSVGVMGDYRTYDHTVGIRAVTSIDGMTSDFARIDWEVLQKISSRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPSTIEWE >NZ_CP016855.1|WP_000551776.1|1633475_1634012_+|hypothetical-protein MHNNNEFNKKLKDFIGSDKRMALVKGYVNEYKLTTVLRALNNSDYTKGTIHTRSIGNLKQIVDNRIIPKNITQNTIFKLSNLTLEVNLYERNTIYHGDFAIYYPVESALIIETDTPRLINHINNNPVQKIFIITTNDWSFNTLELEKIVDETIIYDLKQEDPKQYEILYKNKHGKLPY >NZ_CP016855.1|WP_000041883.1|1632378_1633083_+|type-II-toxin-antitoxin-system-PemK/MazF-family-toxin MSKNINQANSKLNTSNKKLKQAYSKSDSKNMKVIYMPHWLEFYSIAIHSDVTSNKKRYYKSYSRGTVVYVKLGSNIGSEFSGNHFCVILDNKDNKGKETVTIVPLSSKGNKNYLKLNESVLNLTATDLKKQIIDISSKVQALAQKYREIDIKLSTEDKKLLSNLNQKANELYRVIGVYSKHKGKDTYVNISAITTISKRRISKINDSDPTGTIIISEDDMNEIEKQLKIKFFSN >NZ_CP016855.1|WP_000159787.1|1631707_1631980_+|transposase MTKERRTFSSEFKLQMVRLYKNGKLKNEIIRKYDLKPSIISNSIKQHQNTGPFNHQDNLKSDEKELIKLRKEVQHLKMEHDVLKQILKLI >NZ_CP016855.1|WP_001789518.1|1642630_1642732_-|hypothetical-protein MQLNVNMMKFDRWHKGICKQIVLNSVVIGGKGK >NZ_CP016855.1|WP_000991007.1|1642816_1644205_+|L-cystine-transporter MNAFLTLINIIVLVIFIVILHMMARKHISFAKRVFTALGIGIVFGVLLHLIYGTHSNVITSTSDWFNIVGQGYVALLQMIVMPLIFISIVAAFTKIQIGEKFAKIGSLIFIFLIGTVTIAAIVGVVYALVFGLDASTINLGNAEQARGSEIAKQAKDLTAHTLPQQILELLPKNPFLDFTGQRATSTIAVVIFASFIGFAYLRVARKQPDHGELLKRAIDAIYSLVMAIVTFVLRLTPYGVLAIMANTLSTSDFGAIWTLGKFLIASYAALITMYIIHLIILSLLGISPIRYVKKTLEVLIFAFTSRSSAGALPLNVQTQTRRLGVPEGIANFAATFGLSIGQNGCAGIYPAMLAIMVAPVANVEIDLQFIVTLIAVVIISSFGVAGVGGGATFASILVLSTLNLPVALAGVLISVEPLIDMGRTALNVNDSMLAGTGTAKLTKHWDKDTFDSNDNAALTSH >NZ_CP016855.1|WP_001289311.1|1644285_1645041_-|NADPH-dependent-oxidoreductase MSEHVYNLVKKHHSVRKFKNKPLSEDVVKKLVEAGQSASTSSFLQAYSIIGIDDEKIKENLREVSGQPYVVENGYLFVFVIDYYRHHLVDQHAETDMENAYGSTEGLLVGAIDAALVAENIAVTAEDMGYGIVFLGSLRNDVERVREILDLPDYVFPVFGMAVGEPADDENGAAKPRLPFDHVFHHNKYHADKETQYAQMADYDQTISEYYDQRTNGNRKETWSQQIEMFLGNKARLDMLEQLQKSGLIQR >NZ_CP016855.1|WP_000052781.1|1645532_1646102_+|peroxiredoxin MSLINKEILPFTAQAFDPKKDQFKEVTQEDLKGSWSVVCFYPADFSFVCPTELEDLQNQYEELQKLGVNVFSVSTDTHFVHKAWHDHSDAISKITYTMIGDPSQTITRNFDVLDEATGLAQRGTFIIDPDGVVQASEINADGIGRDASTLAHKIKAAQYVRKNPGEVCPAKWEEGAKTLQPGLDLVGKI >NZ_CP016855.1|WP_109885755.1|1646117_1647641_+|alkyl-hydroperoxide-reductase-subunit-F MLNADLKQQLKQLLELMEGNVEFVASLGSDDKSKELKDLLTEITDMSPRLSLSEKSLKRTPSFSVNRPGEETGVTFAGIPLGHEFNSLVLAILQVSGRAPKEKQSIIDQIKKLEGSFHFETFISLTCQKCPDVVQALNLMSVINPNITHSMIDGAVFREESENIMAVPAVFLNGEEFANGRMTIQDILSKLGSTADASEFENKEPYDVLIVGGGPASGSAAIYTARKGLRTGIVADRIGGQVNDTAGIENFITVKETTGSEFSSNLAAHIDQYDIDAMTGIRATDIEKTDEAIKVTLENGAVLESKTVIIATGAGWRKLNIPGEEQLINKGVAFCPHCDGPLFENKDVAVIGGGNSGVEAAIDLAGIVNHVTLFEFASELKADNVLQDRLRSLSNVDIKTNAKTTEVVGEDHVTGIRYEDMNTGEEHLLNLDGIFVQIGLLPNTSWLNDAVELNERGEIVIDRNNNTNVPGIFAAGDVTDQKNKQIIISMGAGANAALNAFDYIIRN >NZ_CP016855.1|WP_000746687.1|1648085_1648712_+|NDxxF-motif-lipoprotein MKKRLLLSTFLASTLILTGCASDQSDNEDHHTSTGIHAPKSAKKLETKDIFNSDKKNSDISDAEMKQAIEKYLSVNSDILDNKYIMQHKLDKQIDSQTKVTEKQAETLSHLSNLAVKNDLHFKKFVTENNIPKEYKKPVELMMNYFKALNSTIANVDEDIEKLSYQPQNKINVVDVPTKYAGDVNKKQQDKIKDFLKSKGIKSDVIDK >NZ_CP016855.1|WP_000868248.1|1648966_1649350_+|hypothetical-protein MKVRITFIILAILSTIVCLFLAAMHPTGPNTVTFEQPYLFTLNIIIMVLVALPSLVLAIYDYMSFRISSAILQFLGAISWFFLSLILSLTQFTPFTLASFITSIILFTSTIITLAIGGKSVEKNDSP >NZ_CP016855.1|WP_000158371.1|1649415_1649997_-|histidine-phosphatase-family-protein MTIYLVRHGESKSNYDNKHFRSYFCGQLDVPLTDTGTKSADDLCDYFKEKQIKHVYVSDLLRTQQTFEHIFPYDIASTTTPLLRERSLGVFEGEYKDEISANPKYDKYFNDPNFKDFRHSFSQKAPEGESYEDVYQRVEHFMNHVVNEDTQKDDIVIVAHQVVIRCLMVYFNKVSRAEAVDLKVENCKPYIIE >NZ_CP016855.1|WP_000211676.1|1650174_1650384_+|hypothetical-protein MTTQSFIFMNIILLDGATQRHPFFICQILAFLFPKFPHINLLLFNPILSTFSNIIIHIDHFHANKKDDN >NZ_CP016855.1|WP_000466748.1|1650422_1650674_-|GlsB/YeaQ/YmgE-family-stress-response-membrane-protein MFGFIGMLIVGGLIGWAAGAIMGKDIPGGILGNIIAGIIGSWVGGKLFGQWGPELGSIYILPALIGSIILIAIVTLILRAMRK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP016855_8 | 2114601-2114774 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016855_8
|
2 spacers
spacers of NZ_CP016855_8
>8.1|2114654|17|NZ_CP016855|PILER-CR AAGAATTTCGAAAAGAA >8.2|2114724|16|NZ_CP016855|PILER-CR TCAGCTTACAATAATG >8.3|2114719|32|NZ_CP016855|CRISPRCasFinder GGCCCCAACATAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016855_8
The CRISPR arrays of NZ_CP016855_8 >merge|NZ_CP016855|8|2114601-2114774|PILER-CR,CRISPRCasFinder TTGGCGAGGCCCCAACATAAAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACAAAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGGTTACAATAATGTGCAAGTTGGGGT >NZ_CP016855|8|1|2114601-2114745|PILER-CR TTGGCGAGGCCCCAACATAAAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCA AGTTGGCGGGGCCCCAA CAAAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCC CAACATAGAAGCTGGC GGAAAG >NZ_CP016855|8|8|2114695-2114774|CRISPRCasFinder TTACAATAATGTGCAAGTTGGCGG GGCCCCAACATAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGG TTACAATAATGTGCAAGTTGGGGT
>NZ_CP016855.1|WP_000842036.1|2112460_2114503_+|YSIRK-domain-containing-triacylglycerol-lipase-Lip1 MKSQNKYSIRKFSVGASSILIATLLFLSGGQAQAAEKQVNMGNSQEDTVTAQSIGDQQTRENANYQRENGVDEQQHTENLTKNLHNDKTISEENHRKTDDLNKDQLKDDKKSSLNNKNIQRDTTKNNNANPSDVNQGLEQAINDGKQSKVASQQQSKEADNSQDSNANNNLPSQSRIKEAPSLNKLDQTSQREIVNETEIEKVQPQQNNQANDKITNYNFNNEQEVKPQKDEKTLSVSDLKNNQKSPVEPTKDNDKKNGLNLLKSSAVATLPNKGTKELTAKAKDDQTNKVAKQGQYKNQDPIVLVHGFNGFTDDINPSVLAHYWGGNKMNIRQDLEENGYKAYEASISAFGSNYDRAVELYYYIKGGRVDYGAAHAAKYGHERYGKTYEGIYKDWKPGQKVHLVGHSMGGQTIRQLEELLRNGNREEIEYQKKHGGEISPLFKGNHDNMISSITTLGTPHNGTHASDLAGNEALVRQIVFDIGKMFGNKNSRVDFGLAQWGLKQKPNESYIDYVKRVKQSNLWKSKDNGFYDLTREGATDLNRKTSLNPNIVYKTYTGEATHKALNSDRQKADLNMFFPFVITGNLIGKATEKEWRENDGLVSVISSQHPFNQAYTKATDKIQKGIWQVTPTKHDWDHVDFVGQDSSDTVRTREELQDFWHHLADDLVKTEKLTDTKQA >NZ_CP016855.1|WP_025175201.1|2111560_2111740_+|hypothetical-protein MKSKLSNSGIDVTVKDVEKYMNRYNEVMKGKNGEKAKELCLSLLPINIIVVFTFFVFIL >NZ_CP016855.1|WP_000170492.1|2110735_2111368_+|bifunctional-phosphoribosyl-AMP-cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP-diphosphatase-HisIE MTKYKIDFSKGLVPAILQDNQTKQVLMLGYMNQEAFDKTIEDGVVCFYSRSKQRLWTKGETSGHTQRVKDIHVDCDNDTILIDVIPNGPTCHTGSQSCFNTEVPFSVQTLAQTVQDSAQSNNEKSYTKYLLTEGIEKITKKYGEEAFEVVIEAIKGDKKAFVSEVADELYHLFVLMHALGVDFSEIEAELARRHHKRNNFKGERQNIEQW >NZ_CP016855.1|WP_000592609.1|2109980_2110739_+|imidazole-glycerol-phosphate-synthase-subunit-HisF MIKKRIIPCLDVKDGRVVKGIQFKGLRDIGNPVDLAMYYNEAGADELVFLDISKTEEGHSLMLEVIEQTASRLFIPLTVGGGIQSLDDITQLLNHGADKVSLNSSALKNPQLIKQASDKFGRQCICIAIDSYYDPERKAHYCCTTGGKKMTNIKVYDWVQQVEQLGAGELLVTSMGHDGMKQGFDIEHLANIKSLVNIPIIASGGGGNAQHFVELFDQTDVSAGLAASILHDRETTVQSIKEVIRQGGIAVR >NZ_CP016855.1|WP_109885760.1|2109279_2109984_+|1-(5-phosphoribosyl)-5-((5--phosphoribosylamino)methylideneamino)imidazole-4--carboxamide-isomerase MIELWPAIDLIGSTSVRLTEGKYDSEEKMSRSAEESIAYYSQFECVNRIHIVDLIGAKAQHAREFDYIKSLRRLTTKDIEVGGGIRTKSQIMDYFAAGINYCIVGTKGIQDTDWLKEMAHTFPGRIYLSVDAYGEDIKVNGWEEDTELNLFSFVRRLSDIPLGGIIYTDIAKDGKMSGPNFELTGQLVKATTIPVIASGGIRHQQDIQRLASLNVHVAIIGKAAHQASFWEGLK >NZ_CP016855.1|WP_000635623.1|2108708_2109287_+|imidazole-glycerol-phosphate-synthase-subunit-HisH MIVIVDYGLGNISNVKRAIEHLGYEVVVSNTSKIIDQAETIILPGVGHFKDAMSEIKRLNLNAILAKNTDKKMIGICLGMQLMYEHSDEGDASGLGFIPGNISRIQTEYPVPHLGWNNLVSKHPMLNQDVYFVHSYQAPMSENVIAYAQYGADIPAIVQFNNYIGIQFHPEKSGTYGLQILRQAIQGGFIND >NZ_CP016855.1|WP_000640266.1|2108133_2108712_+|imidazoleglycerol-phosphate-dehydratase-HisB MIYQKQRNTAETQLNISISDDQSPSHINTGVGFLNHMLTLFTFHSGLSLNIEAQGDIDVDDHHVTEDIGIVIGQLLLEMIKDKKHFVRYGTMYIPMDETLARVVVDISGRPYLSFNASLSKEKVGTFDTELVEEFFRAVVINARLTTHIDLIRGGNTHHEIEAIFKAFSRALGIALTATDDQRVPSSKGVIE >NZ_CP016855.1|WP_000639183.1|2107151_2108165_+|histidinol-phosphate-aminotransferase-family-protein MIYIDKNESPVTPLDEKTMTSIISATPYNLYPDAAYEQFKEAYAKFYGLSPEQIIAGNGSDELIQKLMLIMPEGPALTLNPDFFMYQAYAAQVNREIAFVDAGSDLTFDLETILTKIDEVQPSFFIMSNPHNPSGKQFDTAFLTAIADKMKALNGYFVIDEAYLDYGTAYDVELAPHILRMRTLSKAFGIAGLRLGVLISTAGTIKHIQKIEHPYPLNVFTLNIATYIFRHREETRQFLTMQRQLAEQLKQIFDTHVADKMSVFPSNANFVLTKGSAAQQLGQYVYEQGFKPRFYDEPVMKGYVRYSIATASQLKQLEEIVKEWSAKYDLSKTTKHS >NZ_CP016855.1|WP_000930643.1|2105885_2107136_+|histidinol-dehydrogenase MLNAQQFLNQFSLEAPLDESLYPIIRDICQEVKVHGDKALKMYNLTFDHTKTDHLEISHEQIKAAFDTLDEKTKQALQQSYERIKAYQESIKQTNQQLEESVECYEIYHPLESVGIYVPGGKASYPSTVLMTATLAQVAGVENIVVVTPPQPNGVSQEVLAACYITQVDQVFQVGGAQSIAALTYGTETIPKVDKIVGPGNQFVAYAKKYLFGQVGIDQIAGPTEIALIIDETADLDAIVYDVFAQAEHDELARTYAISEDAQVLKDLESRIAKALPNVDRYDIVSKSIANQHYLIHASNFDEACHVMNTIAPEHASIQTVNPQPYIEKVKYVGALFIGHYSPEVIGDYVAGPSHVLPTNRTARFTNGLSVNDFLTRNTVIHLSKDTFEQIADSAQHIAHVEALYNHQQSILIRQS >NZ_CP016855.1|WP_000944150.1|2105278_2105893_+|ATP-phosphoribosyltransferase MLRIAIAKGRLMDSLINYLDVIEYTTLSETLKNRERQLLLSVDNIECILVKGSDVPIYVEQGMADIGIVGSDILDERQYNVNNLLNMPFGACHFAVAAKPETTNYRKIATSYVHTAETYFKSKGIDVELIKLNGSVELAGVVDMVDGIVDIVQTGTTLKANGLVEKQHISDINARLITNKAAYFKKSQLIEQFIRSLEVSIANA >NZ_CP016855.1|WP_000723836.1|2114949_2116002_-|polysaccharide-intercellular-adhesin-biosynthesis/export-protein-IcaC MKKIRLELVYLRAIICAIIIITHLLTQITLKHENMEGGSLVLQFYIRNIVIFGTPCFIILSQLLTTLNYQKVTYRYLTTRVKYILIPYILMGLFYSYSESLLTDSSFNKQFIENVLLGQWYGYFIVVIMQFFILSYIIFKINYNLFNSKILLLLSFILQQSFLYYFTNNTAFHDTVLHYYPLSENTIIFGWIFYFFLGAYMGYNYERVLNFLERYLVIMIVLAVATYFVFIALANGDYWNVTSFSYSLTPYNSIMFIVILGICTHFKTMLFNTIQMISAFSFFIYLLHPIILDSLFAYTNIFEDNTMVFLAISLLFILGLCIGVGMILREFYIFRFIIGKQPYKLNINAY >NZ_CP016855.1|WP_000877317.1|2115988_2116861_-|intercellular-adhesin-biosynthesis-polysaccharide-N-deacetylase MKYRKFIILVLSILIILPVSTLDGHHIANADDDSPKKLKYKENSALALNYHRVRKANFLNNFIYFFSSSKEIKNYSVSQSQFESQIKWLKSHDAKFLTLKEFLYYKKKGKFPKRSVWINFDDMDETIYENAYPILKKYKIPATGFIITGHVGEENFHNLDMISKKELKEMYKTGLWEFETHTHDLHNLSKNNKSKLMKASEATIIKDLNKSEKYLTKNFKKSQKTIAYPYGLMNDDKLPVIKKAGLKYGFSLEEKAVTPNSNDYYIPRILISDDAFEHLIKRWDGFHEKD >NZ_CP016855.1|WP_000240580.1|2116857_2117163_-|intracellular-adhesion-protein-D MVKPRQREYPTLKSSLNIVRETALIAISCVFWIYCLVVLLVYIGTIFEIHDESINTIRVALNIENTEILDIFETMGIFAIIIFVFFTISILIQKWQRGRES >NZ_CP016855.1|WP_001159430.1|2117126_2118365_-|poly-beta-1,6-N-acetyl-D-glucosamine-synthase MQFFNFLLFYPVFMSIYWIVGSIYFYFTREIRYSLNKKPDINVDELEGITFLLACYNESETIEDTLSNVLALKYEKKEIIIINDGSSDNTAELIYKIKENNDFIFVDLQENRGKANALNQGIKQASYDYVMCLDADTIVDQDAPYYMIENFKHDPKLGAVTGNPRIRNKSSILGKIQTIEYASLIGCIKRSQTLAGAVNTISGVFTLFKKSAVVDVGYWDTDMITEDIAVSWKLHLRGYRIKYEPLAMCWMLVPETLGGLWKQRVRWAQGGHEVLLRDFFSTMKTKRFPLYILMFEQIISILWVYIVLLYLGYLFITANFLDYTFMTYSFSIFLLSSFTMTFINVIQFTVALFIDSRYEKKNMAGLIFVSWYPTVYWIINAAVVLVAFPKALKRKKGGYATWSSPDRGNTQR >NZ_CP016855.1|WP_000653261.1|2118528_2119089_+|ica-operon-transcriptional-regulator-IcaR MKDKIIDNAITLFSEKGYDGTTLDDIAKSVNIKKASLYYHFDSKKSIYEQSVKCCFDYLNNIIMMNQNKSNYSIDALYQFLFEFIFDIEERYIRMYVQLSNTPEEFSGNIYGQIQDLNQSLSKEIAKFYDESKIKMTKEDFQNLILLFLESWYLKASFSQKFGAVEESKSQFKDEVYSLLNIFLKK >NZ_CP016855.1|WP_000659675.1|2119936_2120599_+|capsular-polysaccharide-biosynthesis-protein-CapA MKEKFDLVKLLNILKKNIKLLLILPAICLVVSAALTFFVMPDKYTASTQILVNMKKSSSDLAFQNVQSSLQSVNTYTEIIKSPRILDKVSREFDGQYSTAELNSFLKVTNQTNSQIITVSVTTGNKSESDKIVNKISKVFAHDMPKIMSVDNVTILSSAHDNAVKVSPIVSVNLVISIIVGIVLAILIIFLKELLDKRIKTEEDVESQLGLPILGSIQKF >NZ_CP016855.1|WP_000185864.1|2120615_2121308_+|polysaccharide-biosynthesis-tyrosine-autokinase MTNTRRSTSSLIVHEQPKSPISEKFRGIRSNIMFANPDSAVQSIVITSEAPGAGKSTIAANLAVAYAQAGYKTLIVDGDMRKPTQHYIFNLPNNEGLSSLLLNWSTYQDSIISTEIQDLDVLTSGPIPPNPSELITSRAFANLYDTLLMNYNFVIIDTPPVNTVTDAQLFSKFTGNVVYVVNSENNNRDEVKKGKELIEATGAKLLGVVLNRMPKDKSASYYAYYGTDES >NZ_CP016855.1|WP_000565310.1|2121304_2122072_+|tyrosine-protein-phosphatase MIDIHNHILVDIDDGPKTIEKSIALLKQAKDEGVTSIVATPHHLHPRYDNTFQQVLVKLAELRTHPEVQALDIKLFPGQEIRITDSILKGLDNGSIQGINRSKYLLIEFPTGEVPHYTKQLFFEIQSRGYIPIIAHPERNRSIAKNPEILYELVANGALSQLTSSSLVGGFGKNIQKLSLQFIECNLAHFVASDAHSCDQRPFLMQELFHNHKLKKYSNDIEALLRNASSVINDNFVYLDRPTKPGKVKSFLKWF >NZ_CP016855.1|WP_000244278.1|2122306_2122807_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MVLRKVIMQDLDQIIALENIGFSPEEAATREALKLRIEQIQETFIVAEKNDEVIGYINGPVIKERYISDDLFKNVSTNNSEGGYISVLGLVVAPNYQGQGIAGRLLNYFETLAKNHHRHGVTLTCRESLISFYEKYGYRNEGVSESCHGGIKWYNLVKNIKKDDEV >NZ_CP016855.1|WP_000301926.1|2122809_2123286_+|peptide-methionine-(S)-S-oxide-reductase MAVVYVAGGCLWGVEAFFATIPGIIHTEAGRANGRSSKLDGPYDGYAECVKLHFDDRMLTITDIMNYLFEIIDPYSVNQQGNDIGQKYRTGLYSCVDDHLIEARQFIERRKDRDQIAVEVLPLSNYIKSAEEHQQHLEKYPEDMHMCHISKDLLNKYK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP016855_9 | 2555713-2555906 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016855_9
|
3 spacers
spacers of NZ_CP016855_9
>9.1|2555736|33|NZ_CP016855|CRT CAGAAGCTGACAGAAAGTCAGCTTACAATAATG >9.2|2555792|36|NZ_CP016855|CRT TAGAGAATTTCAAAAAGAAATTCTACAGACAATGCA >9.3|2555851|33|NZ_CP016855|CRT CAGAAGGTGACGAAAAGTCAGCATACAATAATG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016855_9
The CRISPR arrays of NZ_CP016855_9 >merge|NZ_CP016855|9|2555713-2555906|CRT TACAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGACAGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAGAATTTCAAAAAGAAATTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGAACGGGGCCCCAACACAGAAGGTGACGAAAAGTCAGCATACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACA >NZ_CP016855|9|2|2555713-2555906|CRT TACAAGTTGGCGGGGCCCCAACA CAGAAGCTGACAGAAAGTCAGCTTACAATAATG TGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACA TAGAGAATTTCAAAAAGAAATTCTACAGACAATGCA AGTTGGGGAACGGGGCCCCAACA CAGAAGGTGACGAAAAGTCAGCATACAATAATG TGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACA
>NZ_CP016855.1|WP_000230173.1|2554548_2555571_+|GTP-3',8-cyclase-MoaA MVEQIKDKLGRPIRDLRLSVTDRCNFRCDYCMPKEVFGDDFVFLPKNELLTFDEMARIAKVYAELGVKKIRITGGEPLMRRDLDVLIAKLNQIDGIEDIGLTTNGLLLKKHGQKLYDAGLRRINVSLDAIDDTLFQSINNRNIKATTILEQIDYATSIGLNVKVNVVIQKGINDDQIIPMLEYFKDKHIEIRFIEFMDVGNDNGWDFSKVVTKDEMLTMIEQHFEIDPVEPKYFGEVAKYYRHKDNGVQFGLITSVSQSFCSTCTRARLSSDGKFYGCLFATVDGFNVKAFIRSGVTDEELKEQFKALWQIRDDRYSDERTAQTVANRQRKKINMNYIGG >NZ_CP016855.1|WP_000643988.1|2553929_2554529_+|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase-MobA MKAIILAGGHSVRFGKPKAFAEVNGETFYSRVIKTLESTNMFNEIIISTNAQLATQFKYPNVVIDDENHNDKGPLAGIYTIMKQHPEEELFFVVSVDTPMITGKAVSTLYQFLVSHLIENHLDVAAFKEDGRFIPTIAFYSPNALGAITKALHSDNYSFKNVYHELSTDYLDVRDVDAPSYWYKNINYQHDLDALIQKL >NZ_CP016855.1|WP_000866971.1|2553689_2553923_+|molybdopterin-converting-factor-subunit-1 MKVLYFAEIKDILQKAQEDIVLEQALTVQQFEDLLFERYPQINNKKFQVAVNEEFVQKSDFIQPNDTVALIPPVSGG >NZ_CP016855.1|WP_000808500.1|2553237_2553684_+|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaE MKQFEIVTEPIQTEQYREFTINEYQGAVVVFTGHVREWTKGVKTEYLEYEAYIPMAEKKLAQIGDEINEKWPGTITSIVHRIGPLQISDIAVLIAVSSPHRKDAYRANEYAIERIKEIVPIWKKEIWEDGSKWQGHQKGNYEEAKREE >NZ_CP016855.1|WP_000602937.1|2552738_2553224_+|molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-protein-B MILQIVGYKKSGKTTLMRHIVSFLKSHGYTVATIKHHGHGKEDIQLQDSDVDHMKHFEAGADQSIVQGFQYQQTVTRVDNQNLTQIIEKSVTIDTNIVLVEGFKNADFEKVVVYRNEEELQVLQQLSNVCYSINVREHEDFTAFEQWLLNKIKNDCDTQLT >NZ_CP016855.1|WP_000259718.1|2551482_2552742_+|molybdopterin-molybdotransferase-MoeA MVVEKRNPIPVKEAIQRIVNQQSSMPAITVALEKSLNHILAEDIVATYDIPRFDKSPYDGFAIRSVDSQGASGQNRIEFKVIDHIGAGSVSDKLVGDHEAVRIMTGAQIPNGADAVVMFEQTIELEDTFTIRKPFSKNENISLKGEETKTGDVVLKKGQVINPGAIAVLATYGYAEVKVIKQPSVAVIATGSELLDVNDVLEDGKIRNSNGPMIRALAEKLGLEVGIYKTQKDDLDSGIQVVKEAMEKHDIVITTGGVSVGDFDYLPEIYKAVKAEVLFNKVAMRPGSVTTVAFVDGKYLFGLSGNPSACFTGFELFVKPAVKHMCGALEVFPQIIKATLMEDFTKANPFTRFIRAKATLTSAGATVVPSGFNKSGAVVAIAHANCMVMLPGGSRGFKAGHTVDIILTESDAAEEELLL >NZ_CP016855.1|WP_000134528.1|2550925_2551420_-|cyclic-pyranopterin-monophosphate-synthase-MoaC MTEFTHINQQGHAKMVDVSDKQITKRTAVAHSSITVNETIFKQISNNTNTKGNVLNTAQIAGIMAAKNTSTLIPMCHPLPLTGIDVHFSWDETNAPLYTLNIQTTVSTTGKTGVEMEALTAASATALTIYDMTKAVDKGMIIGETYLESKSGGKSGDFQRQSNQ >NZ_CP016855.1|WP_000503817.1|2550417_2550924_+|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaB MGEHQNVKLNRTVKAAVLTVSDTRDFDTDKGGQCVRQLLQADDVEVSDAHYTIVKDEKVAITTQVKKWLEEDIDVIITTGGTGIAQRDVTIEAVKPLLTKEIDGFGELFRYLSYVEDVGTRALLSRAVAGTVNNKLIFSIPGSTGAVKLALEKLIKPELNHLIHELTK >NZ_CP016855.1|WP_000076929.1|2549382_2550387_+|ThiF-family-adenylyltransferase MSQERYSRQILFKQIGEIGQSKINQKCALIIGMGALGTHVAEGLVRAGIAKLIIVDRDYIEFSNLQRQTLFTEEDALKMMPKVVAAKKHLLALRSDVDIDDYIAHVDYYFLETHGQDVDVIIDATDNFETRQLINDFAYKYRIPWIYGGVVQSTYTEAAFIPGKTPCFNCLVPQLPALNLTCDTVGVIQPAVTMATSLQLRDAMKVLTEQPIDTKITYGDIWEGSHYSFGFSKMQRSDCTTCGDVPSYPYLNKNEQRYATLCGRDTVQYENASITHDILVQFLKQHQLNYRSNSYMVMFEFKGHRIVAFKGGRFLIHGMTRTSDATHLMNLLFG >NZ_CP016855.1|WP_000913019.1|2548607_2549213_+|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MLKINVKYQLKNTLIRINIDDTEPKIYAVRGPSGIGKTTVLNMIAGLRKADEAIIEVNGQLLTDTAKNVNVKIQQRRIGYLFQDYQLFPNMTVYKNITFMAEPSEHIDQLIQTLNIDHLMKQYPMTLSGGEAQRVALARALSTKPDLILLDEPFSSLDDTTKDESITLVKRIFNEWQIPIIFVTHSNYEAEQMAHEIITIG >NZ_CP016855.1|WP_001790034.1|2555965_2556136_-|hypothetical-protein MFRFISFGQLVVYSTTFIPKKDILQLNGMECDINVKEPLKIYYVVILKSGIEMIFS >NZ_CP016855.1|WP_000066900.1|2556261_2556612_+|HTH-type-transcriptional-regulator-SarV MSNKVQRFIEAERELSQLKHWLKTTHKISIEEFVVLFKVYEAEKISGKELRDTLHFEMLWDTSKIDVIIRKIYKKELISKLRSETDERQVFYFYSTSQKKLLDKITKEIEVLSVTN >NZ_CP016855.1|WP_000184419.1|2556713_2557925_-|MFS-transporter MTNQGSLNKSPIFTKSFTINFLVNFIVYLCMYLLLVVIAGYSKQAFDASDSLAGLVVGLFIVGSLIGRFATGKFVNQIGPKRLLFIGLIALIITQLLYFIDGSLAFLIFVRLINGIATAVVTTATGTIAAYVTPVNRKSEGISLFSLSLVLGTAIGPFLGMLLITKYAIDLLFIICVILGILGLIISLFIKVDFEVTNNKTETNVIDKPRFSIHQFIAKEAIPVAVIMLLIGVTYASILTYLQAFALERHLVTAASYFFICYAIASLITRPIAGRLMDDKNENIIVYPAFIMLFLSFVCLISSYQSWLILLAGACLGLGYGNLSSAMQSIAIKVSPPIKYGIATSTFYVGLDAGVGFGPSFLGLFTHMFSYSEIFGFMAALAIITMLVYFLIHGRHVTRNAMN >NZ_CP016855.1|WP_000951059.1|2557917_2558358_-|winged-helix-DNA-binding-protein MLSQEFFNSFITIYRPYLKLAEPILEKHNIYYGQWLILRDIAKHQPTTLIEISHRRAIEKPTARKTLKALIENDLITVENSLEDKRQKFLTLTPKGHELYEIVCLDVQKLQQAVVAKTNISQDQMQETINVMNQIHEILLREAHND >NZ_CP016855.1|WP_000600967.1|2558519_2559284_+|VOC-family-protein MILKFDHIIHYIDQLDRFSFPGDVIKLHSGGYHHKYGTFNKLGYINENYIELLDVENNEKLKKMAKTIEGGVAFATQIVQEKYEQGFKNICLRTNDIEAVKNKLQSEQVEVVGPIQMERDTHKDGKVKWQLLYIMNQDDDEIKPPFFIQWEESDSMRTKKLQKYFQKQFSIETVIVKSKNRSQTVSNWLKWFDMDIVEENDHYTDLILKNDDIYFRIEDGKVSKYHSVIIKDAQATSPYSIFIRGAIYRFEPLV >NZ_CP016855.1|WP_001549681.1|2559275_2559527_-|hypothetical-protein MRTIILSLFIIMNIVAIIMTLSQPLTVNYFSLRVILIFFTFILSIFFILIKSSRLNNILTILSIVLVIIHMGILAHSTYVYLY >NZ_CP016855.1|WP_000413865.1|2559915_2561181_+|lipid-II:glycine-glycyltransferase-FemX MEKMHITNQEHDAFVKSHPNGDLLQLTKWAETKKLTGWYARRIAVGRDGEVQGVAQLLFKKVPKLPYTLCYISRGFVVDYSNKEALNALLDSAKEIAKAEKAYAIKIDPDVEVDKGTDALQNLKALGFKHKGFKEGLSKDYIQPRMTMITPIDKNDDELLNSFERRNRSKVRLALKRGTTVERSDREGLKTFAELMKITGERDGFLTRDISYFENIYDALHEDGDAELFLVKLDPKENIAKVNQELNELHAEIAKWQQKMKTSEKQAKKAQNMINDAQNKIAKNEDLKRDLEALEKEHPEGIYLSGALLMFAGSKSYYLYGASSNEFRDFLPNHHMQYTMMKYAREHGATTYDFGGTDNDPDKDSEHYGLWAFKKVWGTYLSEKIGEFDYVLNQPLYQLIEQVKPRLTKAKIKISRKLKRK >NZ_CP016855.1|WP_000592303.1|2561297_2564465_+|efflux-RND-transporter-permease-subunit MIKKLLQFSLGNKFAIFLMVVLVVLGGVYASAKLKLELLPNVQNPVISVTTTMPGATPQSTQDEISSKIDNQVRSLAYVKNVKTQSIQNASIVTVEYENNTDMDKAEEQLKKEIDKIKFKDEVGQPELRRNSMDAFPVLAYSFSNKENDLKKVTKVLNEQLIPKLQTVDGVQNAQLNGQTNREITLKFKQNELEKYGLTADDVENYLKTATRTTPLGLFQFGDKDKSIVVDGQYQSVDAFKNINIPLTLAGGQGQSQSQSDNKQNSAMSDVNQASPQQNSKASAPNNISGMPTAKLGDLADITVGDVRTSISKTNGKDAVNLQITKAQDANTVQVAKDVQRKIDTFVDENKDFNVTKTMDTAKPVEKSLYTMVEKASLGTIVAIIVILLFLRNIRTTAISIISIPLSLLMALIALKLSDVSLNILTLGALTVAIGRVIDDSIVVVENIYRRLTDSEEQLKGENLIISATTEVFKPIMSSTLVTIIVFLPLVFVSGSVGEMFRPFALAIAFSLLASLLVSITLVPALAATLFKKGVKRRNKQHQEGLGVVSTTYKKVLHWSLNHKWIVIILSTLILVATIVFGGPRLGTSFISAGDDKFLAITYTPKPGETEQAVLNHAKDVEKYLKQKKHVKTIQYSVGGSSPVDPTGSTNSMAIMVEYDNDTPNFDVEADKVIKHADGFKHPGEWKNQDLGTGAGNKSVEVTVKGPSMDAIKSTVKDIEQKMKQVKGLANVKSDLSQTYDQYEIKVDQNKAAENGISASQLAMHLNENLPEKTVTTVKENGKTVDVKVKQNKQTDWSEDKLNNITLKKPTGGTIKLGDIATLVKTTTPSKLTQEQGDYATTVSAKVTNKDVGGTTRQVMSKINNLDKPNNVKVNIGGASDDINNAMTQLAFAMLAAIIIVYLILVITFKGGLAPFTILFSLPFTVIGVIIALLITGETISVPSLIGMLMLIGIVVTNAIVLIDRVINNEQQGMEMKEALIEAGGTRIRPILMTAIATIGALVPLLFGQDSSILISKGLAATVIGGLISSTLLTLVVVPVIYEILFTLKKRFTKR >NZ_CP016855.1|WP_001161085.1|2564651_2564969_-|hypothetical-protein MQFYLILLAILYLIVSFISIFKMEVVFTRILRIIMGVLLLFVLALTTMSFPKENWWVFIVLLLLVGNVEVTGFKMLKKDLKGVNILNLMSLFIFVIYFILTIVLF >NZ_CP016855.1|WP_000051206.1|2565213_2565378_-|hypothetical-protein MSLENQLAELKYDYVRLQGDIEKRESLNLDTSALVRQLKDIENEIRNVRAQMQD |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP016855_10 | 2679696-2679846 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016855_10
|
2 spacers
spacers of NZ_CP016855_10
>10.1|2679724|38|NZ_CP016855|CRISPRCasFinder GAAAAATAGAGGAACACAGTTGGATGCTACGCATCAAC >10.2|2679790|29|NZ_CP016855|CRISPRCasFinder TAAAAGTAGGAGCGCCTGCGCTAAGCGCA |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016855_10
The CRISPR arrays of NZ_CP016855_10 >merge|NZ_CP016855|10|2679696-2679846|CRISPRCasFinder TAGAAAGAAGCCCCTAACAACTAAAGTTGAAAAATAGAGGAACACAGTTGGATGCTACGCATCAACTGCATAAGAGCCCCTAACAACTAAAGTTTAAAAGTAGGAGCGCCTGCGCTAAGCGCATGCATAAGAGCCCCTAACAACTAAAGTT >NZ_CP016855|10|9|2679696-2679846|CRISPRCasFinder TAGAAAGAAGCCCCTAACAACTAAAGTT GAAAAATAGAGGAACACAGTTGGATGCTACGCATCAAC TGCATAAGAGCCCCTAACAACTAAAGTT TAAAAGTAGGAGCGCCTGCGCTAAGCGCA TGCATAAGAGCCCCTAACAACTAAAGTT
>NZ_CP016855.1|WP_001802298.1|2679259_2679364_+|hypothetical-protein MLLLERTSMSDFEMLMVVLTIIGLVLISTQDHKK >NZ_CP016855.1|WP_000115564.1|2677436_2678573_+|SAP-domain-containing-protein MSVNARDLLVLHTNVNRLVGEEIFANKCLANNDVQIMNSIKKLIEAELLTTTNDFEVSIYKKTRPELQSILKSFGIKTTGNKPDLIKRIDDNFHIINNLDLPYVYIPTKKGEEILKKTEYLTSFIQSYGEISLERAYYLVENYIDENCDDKVAEIYKFEFQRKYDNGEFDFNHGYNFELNMLIDHYKRDVKDYDNARKYSNIYLYFGLRDFLKKLMSNYSYYDSKGNIDLNEIQNDLNRFINSSASGMYERLIYNENLSNNIMFELFKKDTQDYSDLEEQLIEKFINYVVSNVKKESRSNTLIELSKILENGYTIDKEEFKKEDDYLSKYIFTDIDYLKKLESKINVAIDIRSGEIHLVLDDDSLDILIQNQKYGNEF >NZ_CP016855.1|WP_001790138.1|2677055_2677148_-|hypothetical-protein MFIFKTTSKSHFHNNVKSLECIKIPINKNR >NZ_CP016855.1|WP_000370924.1|2675493_2676351_+|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINQLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQITNLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAEHFLAE >NZ_CP016855.1|WP_000908176.1|2674643_2675426_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLIQLDQIGRMKQGKTILKKISWQIAKGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATSGTVNLFGKMPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEIRNEAHQLLKLVGMFAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLSILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITANFSKILLLKDGQSIQQGAVEDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE >NZ_CP016855.1|WP_000334465.1|2672606_2674412_+|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing) MCGIVGYIGYDNAKELLLKGLEKLEYRGYDSAGIAVVNDDNTTVFKEKGRIAELRKVADSSDFDGPVGIGHTRWATHGVPNHENSHPHQSSNGRFTLVHNGVIENYEELKGEYLQGVSFISETDTEVIVQLVEYFSNQGLSTEEAFTKVVSLLHGSYALGLLDAEDKDTIYVAKNKSPLLLGVGEGFNVIASDALAMLQVTSEYKEIHDHEIVIVKKDEVIIKDADGNVVERDSYIAEIDASDAEKGVYAHYMLKEIHEQPAVMRRIIQEYQDAEGNLKIDQDIINDVKEADRIYVIAAGTSYHAGLVGKEFLEKWAGVPTEVHVASEFVYNMPLLSEKPLFVYISQSGETADSRAVLVETNKLGHKSLTITNVAGSTLSREADHTLLLHAGPEIAVASTKAYTAQIAVLSILSQIVAKEHGREADIDLLRELAKVTTAIEAIVDDAPIMEQIATDFLETTRNAFFIGRTIDYNVSLEGALKLKEISYIQAEGFAGGELKHGTIALIEEGTPVVGLATQEKVNLSIRGNVKEVVARGAHPCIISMEGLEKEGDTYVIPHVHELLTPLVSVVALQLISYYAALHRDLDVDKPRNLAKSVTVE >NZ_CP016855.1|WP_000083807.1|2670387_2671926_-|PTS-mannitol-transporter-subunit-IICB MSQTEEKKGIGRRVQAFGSFLSSMIMPNIGAFIAWGFIAAIFIDNGWLPNKDLATLAGPMITYLIPLLIAFSGGRLIYDLRGGIIAATATMGVIVALPDTPMLLGAMIMGPLVGWLMKKTDQLIQPRTPQGFEMLFNNFSAGILGFIMTIAGFKILAPLMKFIMHILSVAVEALVHAHLLPLVSILVEPAKIVFLNNAINHGVFTPLGADQAAKAGQSILYTIESNPGPGLGILLAYMIFGKGTAKATSYGAGIIHFLGGIHEIYFPYVLMRPLLFIAVILGGMTGVATYQATGFGFKSPASPGSFIVYCLNAPRGEFLHMLLGVFLAALVSFVVAALIMKFTREPKQDLEAATAQMENTKGKKSSVASKLVSSDKNVNTEENASGNVSETSSSDDDPEALLDNYNTEDVDAHNYNNINHVIFACDAGMGSSAMGASMLRNKFKKAGINDITVTNTAINQLPKDAQLVITQKKLTDRAIKQTPNAIHISVDNFLNSPRYEELLNNLKKDDQA >NZ_CP016855.1|WP_000927360.1|2668220_2670353_-|BglG-family-transcription-antiterminator MLLSTREKEMIALLIKYHGQYITIHDIAQQLAVSSRTIHRELKGVEAYLTSFSLTLERANKKGLRIAGTDSDLNDLKQSIAQHQTIDLSVEEQKVIIIYALIQAKEPVKQYSLAQEIGVSVQTLAKMLDDLELDLNKYQLSLSRKRGEGIYLVGTESKKREFLSQLMVNNLNSTSVYSVIENHFVFHSLNQIHKDFVDLERIFNVERLLMDYLSALPYQLTESSYLTLTVHIVLSISRIKNGEYVALNDDIYDSVQNTFEHKVASELADKLGQIYDVTFNQAEIAFITIHLRGAKRKNLNDTSLNNRCEENKIKAFVNKVEMISGMTFADLDTLVDGLTLHLNPAINRLQANIETYNPLTDMIKFKYPRLFENVRLALNDCWPDLIFPESEIAFIVLHFGGSIKNQGNRFLNILVVCSSGMGTSRLLSTRLDQVFSEIERITQASVSDLKSLDLSQYDGIISTVNLDIDSPYLTVNPLLPDSDISYVAQFLNTKSTFQETHDKSSNMIDKDDVHVETKDVDGNTSFENEQTSYLTSVFEKHLSDEKSEQLLHHMRSGLTLLDSVKIVSTEVKQWQTYIADYLYQCDVINDPTSFAELLEQRLIDNPGWILSPYPVAIPHLRDNMIKHPMILITVLEEPLTLPSIQNDNQTIKYMISMFISDNDFMASLVSDLSEFLSLKLESIDTFMENPQELETLLRNKFLERIKKQFI >NZ_CP016855.1|WP_001292149.1|2667774_2668209_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA >NZ_CP016855.1|WP_000648718.1|2666668_2667775_-|mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKAVHFGAGNIGRGFIGYILADNNVKVTFADVNEEIINALAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEADIITTAVGVNILPIIAKSFAPFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVLDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGPELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFAGKATVLDAVEDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAAYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTADQETVEKNNYIKEHGLKAFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS >NZ_CP016855.1|WP_000495671.1|2679863_2680955_-|lytic-regulatory-protein MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYAQTIAIYSQFGQKPPVDAYLKVIAVLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKNKKVVTEPKNTKVENDKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >NZ_CP016855.1|WP_000019744.1|2681220_2682201_-|CDF-family-zinc-efflux-transporter-CzrB MSHSHHHHDHMHSHVTTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALVAFIYAEKNATTTKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHHAHHHAHVH >NZ_CP016855.1|WP_000003759.1|2682202_2682523_-|Zn(II)-responsive-metalloregulatory-transcriptional-repressor-CzrA MSEQYSEINTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIHHANHPKESGL >NZ_CP016855.1|WP_001024094.1|2682674_2683340_+|SDR-family-oxidoreductase MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVPFTAGVRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIETLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSMIASKEANIKHYVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFDGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNHQEFQIISGDQDIKDALTQFENETD >NZ_CP016855.1|WP_001127960.1|2683774_2684713_+|class-I-mannose-6-phosphate-isomerase MPLFLQPILKTKLWGGQRLSEFGYQLDNDTTGECWCVSAHPNGTSEIINGPYQGQTLDRIWSEHRELFGDFPSKDFPLLTKIVDARESLSIHVHPDNSYAYEHENGQYGKSECWYIIDAEEDAEIVIGTLAESREEVANHVQHGTIESILRYIKVKPGEFYFIPAGTVHTISSGILAYETMQSSDITYRLYDFNRQDNQYNDRPLNIEKALDVIQYNAPLPNILPESEIIENHKCTHIVSNDFFTLVKWEISGTLNYMKPREFCLVTVLEGEGQMIVDGEIFKLTTGTNFILTSEDLDSVFEGDFTLMISYV >NZ_CP016855.1|WP_000808817.1|2684743_2684974_+|hypothetical-protein MKQFLYIALVCGVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQISASLKFSALLINVLPLCGTFVASN >NZ_CP016855.1|WP_000123393.1|2685645_2687019_+|EVE-domain-containing-protein MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRISNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIGEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVQKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD >NZ_CP016855.1|WP_001123303.1|2687476_2687890_+|thiol-disulfide-oxidoreductase-DCC-family-protein MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYQFATLKGEVGQQFFKQHPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIKLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD >NZ_CP016855.1|WP_000070866.1|2688089_2688533_+|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein MSNQQDVVKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLENAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS >NZ_CP016855.1|WP_000160304.1|2688653_2689364_-|purine-nucleoside-phosphorylase MTKGTPHIQPNGVKIAKTVLMPGDPLRAKYIADNFLENVEQFNDVRNMFGYTGTYKGKEVSVMGSGMGIPSIGIYSYELYNFFDVDTIIRIGSCGALQENVNLYDVIIAQAASTNSNYVDQYNIPGHFAPIADFELVTKAKNVADQIGATTHVGNVLSSDTFYNADPTFNDAWKKMGILGIEMESAGLYLNAIHAGKKALGIFTVSDHILRDEATTPEERQNSFTQMMEIALEIAE |
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21. spacer 1.1|41725|33|NZ_CP016855|CRISPRCasFinder matches to position: 1221651-1221683, mismatch: 1, identity: 0.97
cagaagctgacgaaaagtcagcttacgataatg CRISPR spacer cagaagctgacgaaaagtcagcttacaataatg Protospacer **************************.******
22. spacer 1.1|41725|33|NZ_CP016855|CRISPRCasFinder matches to position: 2280041-2280073, mismatch: 1, identity: 0.97
cagaagctgacgaaaagtcagcttacgataatg CRISPR spacer cagaagctgacgaaaagtcagcttacaataatg Protospacer **************************.******
23. spacer 2.2|1115441|26|NZ_CP016855|CRT matches to position: 1221638-1221663, mismatch: 1, identity: 0.962
tcgccagcttctgtgttggggccccg CRISPR spacer tcgtcagcttctgtgttggggccccg Protospacer ***.**********************
24. spacer 5.1|1221694|26|NZ_CP016855|CRISPRCasFinder matches to position: 1258812-1258837, mismatch: 1, identity: 0.962
cggggccccaacacagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacacagaagcaggcgg Protospacer ******************** *****
25. spacer 8.2|2114724|16|NZ_CP016855|PILER-CR matches to position: 241568-241583, mismatch: 1, identity: 0.938
tcagcttacaataatg CRISPR spacer tcagctttcaataatg Protospacer ******* ********
26. spacer 8.2|2114724|16|NZ_CP016855|PILER-CR matches to position: 420146-420161, mismatch: 1, identity: 0.938
tcagcttacaataatg CRISPR spacer tcagcttactataatg Protospacer ********* ******
27. spacer 8.2|2114724|16|NZ_CP016855|PILER-CR matches to position: 643397-643412, mismatch: 1, identity: 0.938
tcagcttacaataatg CRISPR spacer tcagcttacaacaatg Protospacer ***********.****
28. spacer 8.2|2114724|16|NZ_CP016855|PILER-CR matches to position: 901543-901558, mismatch: 1, identity: 0.938
tcagcttacaataatg CRISPR spacer tcagcttacaaaaatg Protospacer *********** ****
29. spacer 8.2|2114724|16|NZ_CP016855|PILER-CR matches to position: 2466534-2466549, mismatch: 1, identity: 0.938
tcagcttacaataatg CRISPR spacer tcagcttacaacaatg Protospacer ***********.****
30. spacer 9.2|2555792|36|NZ_CP016855|CRT matches to position: 241679-241714, mismatch: 1, identity: 0.972
tagagaatttcaaaaagaaattctacagacaatgca CRISPR spacer tagagaatttcgaaaagaaattctacagacaatgca Protospacer ***********.************************
31. spacer 1.1|41725|33|NZ_CP016855|CRISPRCasFinder matches to position: 599252-599284, mismatch: 2, identity: 0.939
cagaagctgacgaaaagtcagcttacgataatg CRISPR spacer cagaagatgacgaaaagtcagcttacaataatg Protospacer ****** *******************.******
32. spacer 2.2|1115441|26|NZ_CP016855|CRT matches to position: 1680599-1680624, mismatch: 2, identity: 0.923
tcgccagcttctgtgttggggccccg CRISPR spacer tcgtcagcttctttgttggggccccg Protospacer ***.******** *************
33. spacer 2.4|1115555|26|NZ_CP016855|CRT matches to position: 1258812-1258837, mismatch: 2, identity: 0.923
ccgccagcctctgtgttggggccccg CRISPR spacer ccgcctgcttctgtgttggggccccg Protospacer ***** **.*****************
34. spacer 2.5|1115581|33|NZ_CP016855|CRISPRCasFinder matches to position: 1178059-1178091, mismatch: 2, identity: 0.939
ccaacttgcacactattgtaagctgactttcca CRISPR spacer ccaacttgcacattattgtaagctgacttacca Protospacer ************.**************** ***
35. spacer 5.1|1221694|26|NZ_CP016855|CRISPRCasFinder matches to position: 1258756-1258781, mismatch: 2, identity: 0.923
cggggccccaacacagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacatagaagcaggcgg Protospacer *************.****** *****
36. spacer 8.1|2114654|17|NZ_CP016855|PILER-CR matches to position: 38027-38043, mismatch: 2, identity: 0.882
aagaatttcgaaaagaa CRISPR spacer aagaattttcaaaagaa Protospacer ********. *******
37. spacer 9.1|2555736|33|NZ_CP016855|CRT matches to position: 689450-689482, mismatch: 2, identity: 0.939
cagaagctgacagaaagtcagcttacaataatg CRISPR spacer cagaagctgacgaaaagtcagcttacaataatg Protospacer ***********..********************
38. spacer 9.1|2555736|33|NZ_CP016855|CRT matches to position: 897575-897607, mismatch: 2, identity: 0.939
cagaagctgacagaaagtcagcttacaataatg CRISPR spacer cagaagctgacgaaaagtcagcttacaataatg Protospacer ***********..********************
39. spacer 9.1|2555736|33|NZ_CP016855|CRT matches to position: 1221651-1221683, mismatch: 2, identity: 0.939
cagaagctgacagaaagtcagcttacaataatg CRISPR spacer cagaagctgacgaaaagtcagcttacaataatg Protospacer ***********..********************
40. spacer 9.1|2555736|33|NZ_CP016855|CRT matches to position: 2280041-2280073, mismatch: 2, identity: 0.939
cagaagctgacagaaagtcagcttacaataatg CRISPR spacer cagaagctgacgaaaagtcagcttacaataatg Protospacer ***********..********************
41. spacer 9.2|2555792|36|NZ_CP016855|CRT matches to position: 30919-30954, mismatch: 2, identity: 0.944
tagagaatttcaaaaagaaattctacagacaatgca CRISPR spacer tagagaatttcgaaaggaaattctacagacaatgca Protospacer ***********.***.********************
42. spacer 9.2|2555792|36|NZ_CP016855|CRT matches to position: 420187-420222, mismatch: 2, identity: 0.944
tagagaatttcaaaaagaaattctacagacaatgca CRISPR spacer tagagaatttcgaaaagaaattctacaggcaatgca Protospacer ***********.****************.*******
43. spacer 9.3|2555851|33|NZ_CP016855|CRT matches to position: 599252-599284, mismatch: 2, identity: 0.939
cagaaggtgacgaaaagtcagcatacaataatg CRISPR spacer cagaagatgacgaaaagtcagcttacaataatg Protospacer ******.*************** **********
44. spacer 9.3|2555851|33|NZ_CP016855|CRT matches to position: 689450-689482, mismatch: 2, identity: 0.939
cagaaggtgacgaaaagtcagcatacaataatg CRISPR spacer cagaagctgacgaaaagtcagcttacaataatg Protospacer ****** *************** **********
45. spacer 9.3|2555851|33|NZ_CP016855|CRT matches to position: 897575-897607, mismatch: 2, identity: 0.939
cagaaggtgacgaaaagtcagcatacaataatg CRISPR spacer cagaagctgacgaaaagtcagcttacaataatg Protospacer ****** *************** **********
46. spacer 9.3|2555851|33|NZ_CP016855|CRT matches to position: 1221651-1221683, mismatch: 2, identity: 0.939
cagaaggtgacgaaaagtcagcatacaataatg CRISPR spacer cagaagctgacgaaaagtcagcttacaataatg Protospacer ****** *************** **********
47. spacer 9.3|2555851|33|NZ_CP016855|CRT matches to position: 2280041-2280073, mismatch: 2, identity: 0.939
cagaaggtgacgaaaagtcagcatacaataatg CRISPR spacer cagaagctgacgaaaagtcagcttacaataatg Protospacer ****** *************** **********
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP016855_2 | 2.1|1115358|53|NZ_CP016855|CRT | 1115358-1115410 | 53 | MG543995 | Staphylococcus phage UPMK_1, partial genome | 76246-76298 | 4 | 0.925 |
NZ_CP016855_2 | 2.2|1115441|26|NZ_CP016855|CRT | 1115441-1115466 | 26 | NZ_CP022541 | Antarctobacter heliothermus strain SMS3 plasmid pSMS3-1, complete sequence | 333735-333760 | 5 | 0.808 |
NZ_CP016855_5 | 5.1|1221694|26|NZ_CP016855|CRISPRCasFinder | 1221694-1221719 | 26 | NZ_CP022541 | Antarctobacter heliothermus strain SMS3 plasmid pSMS3-1, complete sequence | 333735-333760 | 5 | 0.808 |
NZ_CP016855_5 | 5.1|1221694|26|NZ_CP016855|CRISPRCasFinder | 1221694-1221719 | 26 | NZ_CP034332 | Tabrizicola piscis strain K13M18 plasmid unnamed4, complete sequence | 3359-3384 | 5 | 0.808 |
NZ_CP016855_5 | 5.1|1221694|26|NZ_CP016855|CRISPRCasFinder | 1221694-1221719 | 26 | NZ_CP022605 | Ochrobactrum quorumnocens strain A44 plasmid unnamed1, complete sequence | 715511-715536 | 5 | 0.808 |
NZ_CP016855_1 | 1.1|41725|33|NZ_CP016855|CRISPRCasFinder | 41725-41757 | 33 | NC_021536 | Synechococcus phage S-IOM18 genomic sequence | 159745-159777 | 10 | 0.697 |
1. spacer 2.1|1115358|53|NZ_CP016855|CRT matches to MG543995 (Staphylococcus phage UPMK_1, partial genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.925
ttgggagtgggacagaaatgatattttcgcaaaatttatttcgtcgtcccacc CRISPR spacer aagggagtgggacagaaatgatagtttctcaaaatttatttcgtcgtcccacc Protospacer ********************* **** ************************
2. spacer 2.2|1115441|26|NZ_CP016855|CRT matches to NZ_CP022541 (Antarctobacter heliothermus strain SMS3 plasmid pSMS3-1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
tcgccagcttctgtgttggggccccg CRISPR spacer acgccagcttctgtgttgaggcctta Protospacer *****************.****...
3. spacer 5.1|1221694|26|NZ_CP016855|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP022541 (Antarctobacter heliothermus strain SMS3 plasmid pSMS3-1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
cggggccccaacacagaagctggcgg CRISPR spacer taaggcctcaacacagaagctggcgt Protospacer ...****.*****************
4. spacer 5.1|1221694|26|NZ_CP016855|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP034332 (Tabrizicola piscis strain K13M18 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
cggggccccaacacagaagctggcgg CRISPR spacer gtaggcccagacacagaagctggcgg Protospacer .***** .****************
5. spacer 5.1|1221694|26|NZ_CP016855|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP022605 (Ochrobactrum quorumnocens strain A44 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
cggggccccaacacagaagctggcgg CRISPR spacer tcagggccaaacacagaagctggcgg Protospacer . .** ** *****************
6. spacer 1.1|41725|33|NZ_CP016855|CRISPRCasFinder matches to NC_021536 (Synechococcus phage S-IOM18 genomic sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
cagaagctgacgaaaagtcagcttacgataatg CRISPR spacer aggtgcttgacgaaaactcaccttacgataaaa Protospacer .* . .********* *** ********** .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
51731 : 126644
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP016855|51731:126644|DBSCAN-SWA TTTAATCAAATATGTTCATAGCTTGATGTTTTTTATCAGTATATAAATGAGAGTACGTTTGAATTGTTTCTGTAATGTTAGAGTGCCTCATTAATTCCATTAATAAATACATATCTACACCATTATTAATTAAATAGCTTGCGTACGAGTGTCTTAAATGGTGTATTTTTAGATTCGGGAATACAGATTTAAAATGATACGAATAGGTAACGTATCTAATAGGTTCTAACCCCCCGAATATAAAATAGTTTTCGTCAAAATATTTATATCTTTTAGAAGATTCATTATACATGTTTTTAAGCATCTCTCTAATTAATTTTGGTACAGGTATTATCCCTTTAGAATTTTCTTTTTTTAGATTATATTCAATTTCTCTATTACTTAAATTGATTTTCTTATTTACGTCAATTTCGCCTTTTATTTTATCGTAATCTTTCCACTGCAAAGCTAAAGCTTCGCCTATTCTAAGACCAGAATAAAATAACAGTTTAGTTAGCTGACGAGAAGTATCGTTTGTGATTTGTTCTACTTTTTCATCAAATTCTTCACGAGTGATAAATTTAGCTTGTGGTTTTGTTCTGGGAATAGGAGTTACCGATAATGTGGGGTCGTATAAGAGCTTGTAATGCTTTTTGGCGTAATTGATAACTGCTTTAAAACCTGCCCACACAGATCGTGCATAGCCAACAGAAAGACCTGCATCGTTTAACAAATAATTCCTGAAAGCAGTACATTGCGTAGTAGTGATTTTGCCAATAGGGATATTTCCGAACCTTTCTTTTATGTGAGTATTATATTCTGTAGTTCGCTTTTCTATTGAGCGTGCAGAAAGATTTTCATTTTTTAAACGATTAAAAAATATATATTCAAAGGGTTGATTGTCCGAGTATCCATATTTAACATTTTGTATAAATTCGCTTTCGGCTAGTTTGGCATCTTTCTTACGTTCAAACCCACGCTTCATTTTTCGTTTGTTATTACCGTATACATCTTTATATCTAATGGAAAAATACCATTTACCTGTATTATCATCCTTATATACTGGCATTTTGCTTCTCCCTCCTCAAAATTGGCAAAAAATAATAAGGGTAGGCGTGCTACCCGTGAAAATTGTATAAAAAAAGAGAGAGCGCAGATGCACCCTCTCATGTCGCAAATATTTCAGCGACTTGTCTAATTTGAAGCTTGCCGCAAATATTTCAGCGGCTTGTTTTGTATATATGTAATATACCATCAAAGAGAGTGTAGTTCAAGCGATTTAACTAAGAAATCTAATTTTTATACTATTTTCAATTTTATCTACTGTTTCTTTTGAATATGATATTTCTCCGGCAGGGTCATACCTATTAATTTTCGATATTCTATCCTTGCTGATTGTAGTGATATTTAAAACGTTAGCATAGGTCTTTTTATACTTGAATCGCTCATATCTTTTGCGAACCTTCGAATATTTTTTGAAGTCGTCATTCAGCGATTTGTTTTCATCAAGTAATTTTTGATCGTATGGGTTTTCTGCTTTTGACACCTTTTCAAGATTGTTCATGATTTTTTTAGCTAAATCCTTACCCGTTACGTCCATTTTTTCCAATACTAAAGGTAACAAATCTTCTTCGATATGCACATTGAATTTACTTCTGGAAGATGTAAGTGGAACTACCGTTAATATTGGATTTTTATTTGAATCGTGATTATTAAGTACCATACAAAAATGGTTTCCAGAAAACTCTCTGCCAACATTAACACCTAACTTTACATAAATTATAGTGCCTTTTTTATATCTGGTGTAACTTTTGTTTTCTTTTAACAATCTAACTTCATCCAATAAAAACTCTGAATATTCAAGACACCATGAATTCATATATTTAAATTTGTAAATCTCGCTATTTTGAATCTTTTTAAAATTATTAACTGCTGTTTCTAAAGGTGCGTTCTCTTCCATCCCTCATCCTCCTCACGCCATATAGGCGTTTATTTCTTATATTCTTCTTCAACATACTTTTTTACTAAATATTCAAGAATAAGTTCGGTCATTAGATCGTTTTCTTCGTACTCTTTATGAAGTTACTTTATTCTTTGAATTAATTTAACTTATCGCCATCTATTTTTTGTGAAATAAATTCCAAGTATTTACGCGCATTATGTGACGATAAATCTTTAGATAACTCATAAGTGAATGGTTGATTACCACTAGTTAAAACTTCATATACTATAGTTTCTTTTTTTATTTTGCAATTAGTTATTTTCATTATAAACTCCTTTTAAACACTGATGAAATAGACGTCTTTTATATTAAAGTGCCATATAGGCGCTATTAATCACAATACAACTTTGCCCATTACTTTAATATTACTAAACGAAGCGACTTTGATATCATCATACTTCGGATTTAGAGATACCAAATTAATATAGTCTTCGCATATATCTACACGCTTGATAAGACTTACTCCATCTAATACAACGAGTGCAATTGTACCATCTTTAATAGAATCTTCTTTCTTAATAAAAGCGTATGTTCCTTGTTTTAACATAGGTTCCATTGAATCACCATTAACTAAAATACAAAAATCAGCATTTGATGGCGTTTCGTCTTCTTTAAAAAATACTTCTTCATGCAATATGTCATCATATAATTCTTCTCCTATGCCAGCACCAGTTGCACCACATGCAATATACGATACTAGTTTAGACTCTTTATATTCATCTATAGAAGTGACTTTATTCTGTTCATCTAATTGCTCATTTGCGTAGTTAAGTACGTTTTTTTGTCTTGGAGGCGTGAGTTTACTGTATATGGAAGTGATGTCGTTTTTTTTATTATTTCTTGTAGGAAACAAATCATCGATACTGATATTTAAAATATGAGCAATTTCAAACAAATCATCTTGTTTAGGAGTTCTGTACCCTGTCTCATAATTTGAAATAGTAGCCTTTTTAGTGTTGAGTTTTTCTCCAAGTTGATCTTGAGTTAAGTTCAATTTGGTTCTATAGTATCTGATTTTATTGCCTATAAATTTCGCTAATTCTTTTTTATCCATTTTCTTACCTCCTTAAATTTACCTATAGTATAACCCAATTATTTTTGGTATTCAACAAAAAAAATACACGAAAAGCAAACTTTTATGTTGACTCAAGTACACGTATCGTGTATAGTTAGTTTTGTAAGCGGGAGGTGACAACATGCAATGGAATTTAATAAAGTTGAGAAAAGAAAGAAAGTGTACTCAAGAAGATTTAGCAAACCTCTTGAATATATCAACTGAAGGTTATCGTTTAAAGGAATTAGGAAAGCATCAATTTAAGAATGATGAGATGTTTATTATCGCTGATTTTTTTGACGAAAATATTGGAGATATTTTTTTACCCACAAAGTACACGAAACGCAAACAAACATCTTAAAAGGAGGAACGAACAATGCAAGCATTACAAACATTTAATTTTAAAGAGCTACCAGTAAGAACAGTGGAAATTGAAAACGAACCTTATTTTGTAGGAAAAGATATTGCTGAAATTTTAGGATATGCAAGGGCAGACAATGCCATCAGAAATCATGTTGATAGCGAGGACAAGCTGACGCACCAATTTAGTGCATCAGGTCAAAACAGAAATATGATCATTATCAATGAATCAGGATTATACAGTTTAATCTTTGACGCTTCTAAACAAAGTAAAAACGAAAAAATCAGAGAAACCGCTCGAAAATTCAAACGATGGGTAACATCAGACGTCCTACCAGCCATTCGCAAACACGGTATCTACGCAACAGACAATGTAATTGAACAAACATTAAAAGATCCAGACTACATTATTACAGTGTTGACTGAGTATAAGAAAGAAAAAGAGCAAAACTTACTTTTACAACAAGAAATCGGAGAACTAAAACCCAAAGCAGACTATGTAGATGAAATCTTAAAGTCAACTGGCACATTAGCCACAACTCAAATCGCGGCAGACTACGGTATATCAGCACAAAAGTTAAACAAACTACTACACGAAGCTAGACTACAACGAAAAGTAAATAAACAGTGGGTGCTTTACTCAGAACACATGGGCAAGAGTTACACAGATTCAGACACTATAACAATTGTGCGTTCTGATGGCAGAGAAGACACAGTTTTACAAACTAGATGGACACAAAAAGGCAGATTGAAAATACATGAAATCATGACTGAATTCGGTTATGAAGCTAATTTAGGGGGAGCGTAAATGACACCAGAACAAAAAGAAAAGCTAAACAATATAGTATTAACACTTTATGCAGTTAAAGAAAACAAAAGTCAAACATACACACACAAAGATACTCTTACTGTGACATATGCAGGCGAGATTGAGCACACTTACGAAGTCGACAGAGAGAAACACCTTGAATCAATGATTGAGTGGGCAATTGACCAAATCGAACAGCACTTTGATTTAGACGAAGAAGAATAACACACAATTGAACAAACATCTTAAAAGGAGGAACTACAAATGTTACAAAAATTTAGAATCGCTAAAGAAAAAAGTAAATTAAAACTCAATTTACTAAAACATGCAAACAGTAATTTAGAAACAAGAAACAACCCTGAACTGTTGCGAGCAGTTGCAGAGTTGCTTAAAGAGATTAATCGATAAATCCGACAACTAATCATCATTTGAATTTGAAAAACTGGTTAATAGATAGCAAAAATACGCTATAAAAAGTACCGAAATATAAAAAGGAGTATTTATTGGTTCGTTATTAATAAACTTTAATAAAAAGTCCCAAATAGCATTACCGCTTACACCTACAGAACTAGCATTAATAAAACCTAAACTGGAGTGATTAATATGCATTATGTCGACAATTTTTTTACCGCTGTAATTATTGCTTTCATGTTGTTTTCGCTCTACTGGATGGGCAGGATTGATGGATTTAATAAAGGTAGAACTATTAGCTACATCGACATTCAAATTTCTAAGAGCATAAGACATTTTCAAAATATCGTTTTTAGGAATGCTCGTAGATTTTATAAAACTATTAA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92 | Staphylococcus_phage(73.91%) | tRNA,terminase,capsid,transposase,plate,head,integrase,tail,portal,holin | attL 43570:43587|attR 70749:70766 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
157304 : 220761
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP016855|157304:220761|DBSCAN-SWA 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MSNQNLFDELEKKGYKLEDIFTKEEIKKYKAEDQLRAGKTQYVETGKDTATLYLSSAYTKTIAALGAGAISVISALTGGLVGAGVGGFLGSIAASNIDTSKGIYIKLKTKKNAAGEYVLTGEKWGYQ |
65 | Staphylococcus_phage(94.23%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
223921 : 236650
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP016855|223921:236650|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP016855|223921:236650|224481_225435_-|WP_000526539.1|DBSCAN-SWA MGNHFQYAFENKRYHTWNYHLKNKFGQKIFKVALDGGFDCPNRDGTVAHGGCTFCSAAGSGDFAGNRADSIAVQFKEIKEKMHEKWHEGKYIAYFQAFTNTHAPVEVLKEKFEPVLKEPGVVGLSIGTRPDCLPDDVVEYLADLNQRTYLWVELGLQTIHQSTSDLINRAHDMKTYYDGVAKLRKHNINVCTHIINGLPGEDYDMMMATAKEVAQMDVQGIKIHLLHLLKGTPMVKQYDKGLLTFMTQEEYTNLVVDQLEVIPPEMIVHRITGDGPIDIMVGPMWSVNKWEVLNGIDAELARRNSYQGLRYKSKVKQ >NZ_CP016855|223921:236650|229452_229764_+|WP_000836465.1|DBSCAN-SWA MKSITTDELKNKLLESKPVQIVDVRTDEETAMGYIPNAKLIPMDTIPDNLNSFNKNEIYYIVCAGGVRSAKVVEYLEANGIDAVNVEGGMHAWGDEGLEIKSI >NZ_CP016855|223921:236650|227013_229431_+|WP_001549041.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLNYNHNQIEKKWQDYWDENKTFKTNDNLGQKKFYALDMFPYPSGAGLHVGHPEGYTATDIISRYKRMQGYNVLHPMGWDAFGLPAEQYALDTGNDPREFTKKNIQTFKRQIKELGFSYDWDREVNTTDPEYYKWTQWIFIQLYNKGLAYVDEVAVNWCPALGTVLSNEEVIDGVSERGGHPVYRKPMKQWVLKITEYADQLLADLDDLDWPESLKDMQRNWIGRSEGAKVSFDVDNTEGKVEVFTTRPDTIYGASFLVLSPEHALVNSITTDEYKEKVKAYQTEASKKSDLERTDLAKDKSGVFTGAYATNPLSGEKVQIWIADYVLSTYGTGAIMAVPAHDDRDYEFAKKFDLPIIEVIEGGNVEEAAYTGEGKHINSGELDGLENEAAITKAIQLLEQKGAGEKKVNYKLRDWLFSRQRYWGEPIPVIHWEDGTMTTVPEEELPLLLPETDEIKPSGTGESPLANIDSFVNVVDEKTGMKGRRETNTMPQWAGSCWYYLRYIDPKNENMLADPEKLKHWLPVDLYIGGVEHAVLHLLYARFWHKVLYDLAIVPTKEPFQKLFNQGMILGEGNEKMSKSKGNVINPDDIVQSHGADTLRLYEMFMGPLDAAIAWSEKGLDGSRRFLDRVWRLMVNEDGTLSSKIVTTNNKSLDKVYNQTVKKVTEDFETLGFNTAISQLMVFINECYKVDEVYKPYIEGFVKMLAPIAPHIGEELWSKLGHEESITYQPWPTYDEALLVDDEVEIVVQVNGKLRAKIKIAKDTSKEEMQEIALSNDNVKASIEGKDIMKVIAVPQKLVNIVAK >NZ_CP016855|223921:236650|225544_226726_+|WP_001025061.1|DBSCAN-SWA MNIPKSVWWLVIGMALNITGSSFLWPLNTIYMKQELGKSLTVAGLVLMINSFGMVIGNLLGGSLFDKLGGYKTILIGTFTCLCSTTLLNFFHGWPWYAVWLVMLGFGGGMIIPAIYAMAGAVWPNGGRQTFNAIYLAQNIGVAVGAAMGGFVAEFSFNYIFLANLIMYVVFALVAVTQFNIEINAKVKYPTHLDITGKKNKARFISLVLICAMFAICWVAYIQWESTIASFTQSINISMAQYSVLWTINGIMILVAQPLIKPILYLLKGNLKKQMFVGIIIFMLSFFVTSFAENFTIFVVGMIILTFGEMFVWPAVPTIANQLAPDGKQGQYQGFVNSAATVGKAFGPFLGGVLVDAFNMRMMFIGMMLLLVFALILLMVFKENNTQPKKIDA >NZ_CP016855|223921:236650|230089_236650_+|WP_001050548.1|DBSCAN-SWA MNLLKKNKYSIRKYKVGIFSTLIGTVLLLSNPNGAQALTTDNNVQSDTNQATPVNSQDKDVANNRGLANSAQNTPNQSATTNQATNQALVNHNNGSIVNQATPTSVQSSTPSAQNNNHTDGNTTATETVSNANNNDVVSNNTALNVPTKTNENGSGGHLTLKEIQEDVRHSSNKPELVAIAEPASNRPKKRSRRAAPADPNATPADPAAAAVGNGGAPVAITAPYTPTTDPNANNAGQNAPNEVLSFDDNGIRPSTNRSVPTVNVVNNLPGFTLINGGKVGVFSHAMVRTSMFDSGDNKNYQAQGNVIALGRIHGTDTNDHGDFNGIEKALTVNPNSELIFEFNTMTTKNGQGATNVIIKNADTNDTIAEKTVEGGPTLRLFKVPDNVRNLKIQFVPKNDAITDARGIYQLKDGYKYYSFVDSIGLHSGSHVFVERRTMDPTATNNKEFTVTTSLKNNGNSGASLDTNDFVYQVQLPEGVEYVNNSLTKDFPSNNSGVDVNDMNVTYDAANRVITIKSTGGGTANSPARLMPDKILDLRYKLRVNNVPTPRTVTFNETLTYKTYTQDFINSAAESHTVSTNPYTIDIIMNKDALQAEVDRRIQQADYTFASLDIFNGLKRRAQTILDENRNNVPLNKRVSQAYIDSLTNQMQHTLIRSVDAENAVNKKVDQMEDLVNQNDELTDEEKQAAIQVIEEHKNEIIGNIGDQTTDDGVTRIKDQGIQTLSGDTATPVVKPNAKKAIRDKATKQREIINATPDVTEDEIQDALNQLATDETDAIDNVTNATTNADVETAKNNGINTIGAVVPQVTHKKAARDAINQATATKRQQINSNREATQEEKNAALNELTQATNHALEQINQATTNADVDNAKGDGLNAINPIAPVTVVKQAARDAVSHDAQQHIAEINANPDATQEERQAAIDKVNAAVTAANTNILNANTNADVEQVKTNAIQGIQAITPATKVKTDAKNAIDKSAETQHNTIFNNNDATLEEQQAAQQLLDQAVATAKQNINAADTNQEVAQAKDQGTQNIVVIQPATQVKTDTRNVVNDKAREAITNINATTGATREEKQEAINRVNTLKNRALTDIGVTSTTAMVNSIRDDAVNQIGAVQPHVTKKQTATGVLNDLATAKKQEINQNTNATTEEKQVALNQVDQELATAINNINQADTNAEVDQAQQLGTKAINAIQPNIVKKPAALAQINQHYNAKLAEINATPDATNDEKNAAINTLNQDRQQAIESIKQANTNAEVDQAATVAENNIDAVQVDVVKKQAARDKITAEVAKRIEAVKQTPNATDEEKQAAVNQINQLKDQAINQINQNQTNDQVDTTTNQAVNAIDNVEAEVVIKPKAIADIEKAVKEKQQQIDNSLDSTDNEKEVASQALAKEKEKALAAIDQAQTNSQVNQAATNGVSAIKIIQPETKVKPAAREKINQKANELRAKINQDKEATAEERQVALDKINEFVNQAMTDITNNRTNQQVDDTTSQALDSIALVTPDHIVRAAARDAVKQQYEAKKREIEQAEHATDEEKQVALNQLANNEKRALQNIDQAIANNDVKRVETNGIATLKGVQPHIVIKPEAQQAIKASAENQVESIKDTPHATVDELDEANQLISDTLKQAQQEIENTNQDAAVTDVRNQTIKAIEQIKPKVRRKRAALDSIEENNKNQLDAIRNTLDTTQDERDVAIDTLNKIVNTIKNDIAQNKTNAEVDRTETDGNDNIKVILPKVQVKPAARQSVGVKAEAQNALIDQSDLSTEEERLAAKHLVEQALNQAIDQINHADKTAQVNQDSINAQNIISKIKPATTVKATALQQIQNIATNKINLIKANNEATDEEQNIAIAQVEKELIKAKQQIASAVTNADVAYLLHDEKNEIREIEPVINRKASAREQLTTLFNDKKQAIEANIQATVEERNSILAQLQNIYDTAIGQIDQDRSNAQVDKTASLNLQTIHDLDVHPIKKPDAEKTINDDLARVTALVQNYRKVSNRNKADALKAITALKLQMDEELKTARTNADVDAVLKRFNVALSDIEAVITEKENSLLRIDNIAQQTYAKFKAIATPEQLAKVKVLIDQYVADGNRMIDEDATLNDIKQHTQFIVDEILAIKLPAEATKVSPKEIQPAPKVCTPIKKEETHESRKVEKELPNTGSEGMDLPLKEFALITGAALLARRRTKNEKES >NZ_CP016855|223921:236650|223921_224485_-|WP_000764419.1|DBSCAN-SWA MKLERILPFSKTLIKQHITPESIVVDATCGNGNDTLFLAEQVPEGHVYGFDIQDLALENTRDKVKDFNHVSLIKDGHENIEHHINDAHKGHIDAAIFNLGYLPKGDKSIVTKPDTTIQAINSLLSLMSIEGIIVLVIYHGHSEGQIEKHALLDYLSTLDQKHAQVLQYQFLNQRNHAPFICAIEKIS |
6 | Staphylococcus_phage(100.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
362106 : 371149
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP016855|362106:371149|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP016855|362106:371149|364160_365300_+|WP_001112045.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >NZ_CP016855|362106:371149|368335_370609_+|WP_000594993.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDINHDALQLSDMTKTIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTATTILVITLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDVEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKKGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKQVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQIIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >NZ_CP016855|362106:371149|365853_368133_+|WP_000749795.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >NZ_CP016855|362106:371149|362106_363111_+|WP_001005767.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE >NZ_CP016855|362106:371149|363112_364138_+|WP_001019172.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLIEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSSRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >NZ_CP016855|362106:371149|365318_365579_+|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >NZ_CP016855|362106:371149|370630_371149_+|WP_000364542.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
440286 : 448598
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP016855|440286:448598|DBSCAN-SWA 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GAAGCATCTACAATTAATACAGATCCATTTCAATATATTTAAACTAAAATCTCGGGATTTCTAAATTTTGAAATTTCGAGGTTTTAATATTTTTATTTAAAATAGCACATTTATACTTTATAATAGTAAAGATGAACATATAAGGAGGCCAAATCATGGCAAAACATCCATTCGAACAATTTAATCTAGAATCTAGTTTAATTGACGCTGTGAAAGACCTTAATTTTGAAAAACCAACTGAAATTCAGAATCGAATTATTCCAAGAATACTAAAGAGAACAAATTTAATTGGTCAATCTCAAACGGGTACAGGGAAATCTCATGCATTTTTATTACCATTAATGCAGTTAATTGATAGTGAAATAAAAGAACCACAAGCAATCGTAGTTGCACCAACAAGAGAACTTGCACAACAACTATACGATGCAGCGAACCATTTAAGCCAATTTAAAGCTGGTGTTTCAGTTAAAGTTTTTATTGGTGGTACAGATATAGAGAAAGATAGACAACGTTGTAATGCACAACCACAATTGATTATAGGCACCCCTACTAGAATTAATGACTTAGCTAAAACGGGACATTTACATGTGCACTTAGCATCATATTTAGTTATTGATGAAGCGGATCTTATGATTGACTTAGGATTAATTGAAGATGTAGATTACATTGCTGCAAGATTGGAAGATAATGCAAATATTGCGGTGTTTAGTGCTACAATCCCACAACAGTTACAACCATTTTTAAATAAATATTTAAGTCATCCAGAATATGTAGCTGTCGACAGTAAAAAACAAAATAAAAAGAACATCGAATTCTATTTAATACCTACTAAAGGTGCAGCTAAAGTTGAAAAGACTTTAAATTTAATTGATATACTAAATCCATACTTATGTATTATTTTCTGTAATAGTAGAGATAATGCAAATGATTTAGCACGTTCACTAAATGAAGCTGGTATTAAAGTTGGTATGATTCATGGTGGCTTAACGCCACGTGAACGTAAACAACAAATGAAACGTATACGTAATTTAGAATTCCAATACGTTATTGCCAGCGATTTAGCATCTCGTGGTATTGATATTGAAGGTGTTAGTCATGTCATCAATTTTGATGTGCCAAATGATATTGACTTCTTTACGCATAGAGTCGGACGAACTGGTCGTGGGAATTATAAAGGTGTAGCAATTACGCTTTATAGTCCTGATGAAGAACACAATATTTCATTAATAGAAGATCGCGGTTTTGTATTCAATACTGTTGATATTAAAGATGGTGAGTTAAAAGAAGTTAAAGCGCACAATCAGCGTCAAGCAAGAATGCGCAAAGATGACCATTTAACTAATCAAGTGAAGAACAAAGTTCGAAGTAAAATTAAAAACAAAGTTAAACCAGGTTATAAGAAGAAATTTAAACAAGAAGTTGAAAAAATGAAACGTCAAGAGCGTAAGCAATTTAGTAAGCAGCAAAATAGACAAAAACGTAAGCAAAACAAAAAAGGTTAGGTGTGTTTTATGTTATTAGGATCACATGTTTCAATGAGTGGTAAAAAGATGTTAGAAGGTTCTGCTATAGAAGCGCATGAATATGGTGAAACAACATTTATGATTTATACTGGTGCACCTCAAAACACGCGCCGTAAAAGTATTGAAGATTTAAATATAACTAAAGGTCATGAAGTGATGGAAAAATATGGTTTATCTAATATTGTTGTTCATGCACCATACATCATTAATATTGCAAATACAACCAAACCAGAAACGTTTAATCTTGGTGTAGATTTCTTGCAACAAGAAATTGAAAGAACGCAAGCTATAGGGGCTAAAGATATTGTATTACATCCAGGTGCGCATGTTGGAGCTGGTGTTGATGCCGGAATTAATAAGATTATTGAAGGATTAAATGAAGTTTTAACGAATGACAATAATGTACGTATTGCGCTTGAAACGATGGCAGGTAAAGGTACAGAGATTGGTCGCTCATTTGAAGAGTTAGCACGTATTATTGATGGAGTTCATAATAACGAACGTTTATCAGTATGTTTTGATACATGTCATACGCATGATGCTGGATATAATGTTAAAGAGGACTTTGATGGCGTATTAAATGAATTTGATAAAATCATTGGAGTCGACAGAATCAAAGTTGTTCATGTCAATGATTCTAAAAATGACCGTGGCGCTCAAAAAGACCGACATGAAAATATTGGCTTCGGTTACATTGGTTTTGATGCATTAAATTACATTGTGCATCATGATAGTTTTAAAGATATTCCGAAAATCTTAGAAACACCTTATGTTGGTGAAGATAAGAAAAATAAAAAACCGCCATATAAACTTGAAATTGAAATGTTAAAACAACAGCAATTTGACCCAGAATTAAAAAATAAGGTTATGCAACAATAAAATGATAATGCTCTCTTCAAGAAATGCGATAAATAAAACTTGAAGGGGGCATATCTCTTTATTTTGTCTAATTTTGAGTCGTAAACATTACTGTTTACATATGTTACTAGGAGTTGTATAGTTGAATGCGAGGTGAGAATACGATGACACCAGTCTTTGAATTGAAAAATGTCAATTACTACTATGATCATAAAAAAGTGTTAGAAAATATAAACATTAAAATAAATAAAGGTGAATTTTTAGCAATTGTTGGACCAAATGGTGCTGGTAAATCAACATTATTGAAGTTGATTCTAGGGTTATTACCTTTACAAAGTGGTGAGATTTTTGTTGAAGGTATTGATTTTAAAAATAAGAAAACATCAATTAAATTAAGCTATGTATCACAAAAAGCAAATGCCTTTAATTCAGGTTTCCCAGCAAGTGTTAAAGAAGTTGTTTTAAGCGGATTAACAAAGACAAAACGTCTTTTCCAAACATTTAATAGCAAAGATAATGAAAAAGTGATTAAAGTACTAGAAAGACTGAATATAAGTGATTTAATTCATAAAAATATAGCAGAATTATCAGGTGGTCAACAACAACGTGTAATGATTGCTCGAGCATTGATTTCAGAACCTGCAGTATTAGTACTTGATGAACCAACGAATGGTATTGATGCAAAACATGTAAGTGAATTTTATAATACTTTAGATCAATTAAAACAAGAAGGTATCACCATTATCTTAGTTACTCATGATATCGGTGTTGTAGCAGATACTGCTACTGAAGTAGCATGTTTAAATAAGCATTTGCATTTCCATGGTACAACTGATGAGTTTAAATCACTTGATGAAGTTGAAATTTCAAAAATTTATGGACATCCTGTACGTTTTGTCGATCATCAGCATAATCGAGAATGTTGTAATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP016855|440286:448598|445440_446787_+|WP_001062180.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFYLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >NZ_CP016855|440286:448598|440286_442086_+|WP_001217261.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQNLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKALNDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYNLNDEPYENEIDDYVNVINEKGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >NZ_CP016855|440286:448598|446796_447687_+|WP_000924214.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >NZ_CP016855|440286:448598|443546_444224_+|WP_000624584.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCECGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIQPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTELIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL >NZ_CP016855|440286:448598|442309_443416_+|WP_001283055.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD >NZ_CP016855|440286:448598|447812_448598_+|WP_001213908.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >NZ_CP016855|440286:448598|444226_445327_+|WP_000683931.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFSTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPYGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDAYQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKALLMNWFNTEKINLDVEASTINTDPFQYI |
7 | Caulobacter_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
988240 : 996713
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP016855|988240:996713|DBSCAN-SWA CTTATTTTACAATTTTAGCAATAACACTTGGATATAACTCATATTCCAATTTTTTTACTTTCTCTTCTAATTGTTCTTTTGAATCGTCCGGTCTAATATCACATTTTCTCTGTTCAATAATTTCTCCCGTATCCATACCACTATCAACATAATGTACTGTCGAACCAGTAATAGTATCGCCACTATGATATGCTTGGCCTATTGCGTCAATCCCCTTATATTTCGGCAATAGAGATGGATGTATATTCAATATTTTACCTTCAAATGAAGCTAATAAGTCTGGACCAATTAGACGCATGTAGCCAGCTAGAATAATCCACTCTACCTTATCTTCATTTAATAATGTTACTAAATGTTGTTCATACGCTGCTTTTGAATCAAATTGTTTTGGTTCATTAATATAAACAGGAATATCGTGCTTTTTTGCTCTATCTATACAAAACGCATTTTGATGATCCGTATATAGCGCCGTAACTTCAATATTTTCAAGTTTTCCTGATTCAACATGCTCAACTATATTTTCAAAGTTACTTCCTGAACCTGATGCAAAAATCGCAATTTTAACCATTGTTATACCCCCAACAATTCAATTGCAGTTGACTCATTTTTCACAATATGACCAATTTGATAGGCTTCCACATTTTGTTCTGCTAAAATCTTCAAAGCGCGTGATACATCTTTTTCATCAACGATAACCGTATAGCCAATACCCATATTAAAAATGTTATACATTTCATTTGTGTCTATATTGCCTTGTTGTTGTAACCAATCAAATATTTTTGGTGTTGGAAATGATGTAGTATCAATTCTAGCAGCATATCCGGCTGGCAATGCACGTGGAATATTTTCATAAAAACCTCCACCAGTAATATGATTCATTGCCTTAATAGAAACTTCTTTTTTCAAAGCAAGTACAGGTTTGACATATAATTTAGTTGGTTCTAAAAAGACATCGATAAATGGACGATTATCGAAGTTTGATGCCAAATCAATGCCTGATTCATTAATTAATTTGCGCACTAAACTGTATCCATTTGAATGAATGCCACTTGACGCAAGCCCTATAACAACTTGTCCCTCTTTCACTTCTGAACCATCTACATAGTCATCCTTTTCAACTGCTCCAACAGCAAATCCAGCTACATCATATTCGCCTTCGTGATACATTTCACCCATTTCAGCAGTCTCTCCACCGATAAGTGCAGTATTCGTTTCAACACATGCATCACTAATACCTTTAACAATTTGTTCAATAACTTCAGGAACAACTTTGTTTGTAGCAATGTAATCTAAAAAATATAATGGTTCTGCACCTGTCGTTAAAATATCATTAACACACATTGCGACTGCATCGATACCTATCGAATCATGTTTACCATAGTCGATAGCTAGTTTTAATTTCGTACCTACTCCGTCTGTTCCAGAAACTAAAACTGGCGCTGTCATATTTAATTGTGATAAATCAAATGTAGCACCGAATCCACCTAAACCACCGATAACTTCTTTACGCATCGTACGTTTAACATGACTAGACATTCTTTCTACAGCTTCATAACCAGCATGAATATTTACACCAGATTGTTCATATGCTTTAGACATTTAAATTTCCCTCGCTATCAAAAAAGTGTTTGTTTTTAGAAATATATTGCTTTTGTCGATGACTTAAATGCGCTTTATAATTTGCTTCATAATCATATAACCCTGCAGGATAATCTCCAGTGAAACTTTCTACACATAAGCCACTATATGGCGCGTCATAATCTAAACCAATTGATTCAATTAACCCATCTACAGATAGATATGCTAATGAATCAGCGCCAATATAATCTTTAATTTCTTCAGGTGATTTGCTTGCAGAAATTAATTCTGCCGTAGTTGAAACATCGATTCCGTAAAAACTTGGAAACATAAATTCCGGTGATGCTATACGCACATGCACTTTATTTGCACCAGAATCTTTTAACATTTTCACAATGCGTCGAATTGTCGTACCGCGAACAATGGAATCATCAACAAGAATGATATTTTTCCCATCTACTATATCTTTTACCGCAGATAACTTCACTCTCACACCTTGCTCACGTAATTCTTGAGTTGGTTGAATAAATGTTCTTGCAACATATTGATTTTTAACTAGTCCCATTTCATATGGCAAACCTATTTCTTCAGCATAACCACTCGCAGCTGATAGCGATGAATTGGGTACACCGATGACCATATCAGCATTTACAGGGCTTTCTTGGGCTAATTTTTTACCAGAAGCTTTACGTACTGCATGGACATTTTTACCAGCTATTGTTGAGTCTGGTCTAGCAAAATAAATATATTCCATCGCAGAAATTGCAGTTGTCGTATGATGTGTATAAGATTTAACTGTAATACCTTTATCGTTAATCACGACATATTCACCTGCATGAATATCTTGAACAAATTCTGCACCTAACACATCTATTGCACATGTTTCACTTGCAAGGATGTATGTCCCATCTTTCATTTTACCTACAACAAGTGGTCTGATAGCATTTGGATCTACTGCGCCATATAACGCATCTTTAGTTAAAATCGCAAATGTAAAACCGCCTTTAACTTTTCGCAAACTTTCTTTCAACGCTTCCTCAAAAGTAGGAGCTTTACTTCGACGTATCAAATGCATAATGACTTCAGTATCAGAAGACGAATGGAAGATAGCACCTTGTTTTTCTAAATTCTGACGCAATGATTTAGCATTAATGAGGTTACCATTATGACAAATACCTACACTCATATCATAAAAGTGATACAGAAACGGTTGAATATTTTCAATACCTTTATTACCTGAAGTAGCATAACGGACGTGACCAATTGCATGTTGATATCCTTTTAATCGTTCCATTTGATCATCTTTAATCGCTTCAGTTAGTAAGCCTAATCCTCGCTCGCCTTTTAATTCATTTTGATCAGAAACAACTATACCTGCACCTTCTTGACCACGATGTTGCAAACTATGAAGTCCCATATATGTTAGTTGCGCTGCTTCAGGATGATTCCAAATACCAAACACGCCACATTCTTCGTTTAATCCTGAGTAGTTAAACATTGAGCAATTGCCCCTTCCCATATTTGTTTAATATCTGAAACATTTTCACTAATCTCTGTATATGGTGTTGTTACCTTGAAATTATCACTATCTGTTAAAAGTCCAATTTCTATTGCATTATCAATATTTAAAGTTTTACCTGATTTAACAGAAACAACATATCGGCCTTGCGTCTCACTAAACAATTGTGCATTTGTTATATCTATTGAAGATTTTAATCCTAAACCGTAATGCGCACTTAGTTTAGCTAAGGTAATCAGTAAGCCACCTTTACCAACTGTTTGAACATGTGATAATAGTCCTTCACGAATAGCGGTCTTGATTGATTCACCTTTTTCAACTTCTGAACTCAAATCTAATGACTCAAATTCATGATTAACTTTGCCATAAATTAACTTTTCAAGTTGACTACCACCAAAGTCGTCCTTAGTATCACCGATTAAATATAATTTATCTCCAACTTGAGGTTCAAAATCATTTAAATAATTTACATTTTCAATCAAACCTACCATTCCAACAACTGGTGTTGGGAAAATAGAAGTACCTTTCGTTTCGTTATATAAAGATACATTACCAGAAACTACTGGTGTCTTAAGAATGTCGCATGCTTCTGCCATACCTTTCGTTGAATCTATCAACTGTTGATAGATTTCTTTCTTTTCAGGAGAACCATAATTTAAACAATCTGTCATTGCTAATGGTGTTGCACCCACGGCAATTAAATTTCGATAAGCTTCAGCTACTACCATCTTTCCACCTTCATATGGATTGTTATATACATAACGCGCTTCACCATCAATTGTTGAAGCAATTGCCTTATTTGTGCCTTCCACACGTACTACCGATGCTTGAAGTCCTGGCTTAATTATCGTATTGGCACCAACTTGTTGGTCGTATTGATCATATAAATAGTGTTTAGATGCTATAGTCGGATGCTTAAGTAATTTAAAGAAAGTATCTTTAACATCGATGTGTGTATAATCATTTTTAGAAGTATTATAATCTTTTTCTTCTCCTTCTAAAATATATACAGGTGCTTCATCAGCTAGTGGTTCAACTGGAATGTCAGCATAAACTTCGTCATCATATGTTAAAACAAAACGATTTGTATCTGTAACTTCACCTATAACAGCACTATCCAATTCGTGCTTATCAAATAAATCTAAGAATTTTTGTTCAGTACCTTTTTCAACAACTAGTAACATACGTTCTTGAGTTTCTGAAAGCATCATTTCATAAGGAGAAATACCTGGCTCACGTGTTGGCACTTGTTCTAATCTCAAATGTAACCCACTACCACCTTTTGCCGCCATTTCAGACGATGAAGATGTTAAACCAGCAGCACCCATATCTTGAATACCAACTAATTCATCAAATGTAATTGCTTCAAGTGTTGCTTCCATTAATTTTTTACCTACAAATGGATCACCGATTTGTACAGAAGGTCGTTTACTTTCGCTTTCTTCCGTCAATTCTTCAGATGCAAAAGTAGCACCATGAATACCATCTCGACCAGTTTTCAAACCAACATAAATGACCGAATTACCTACACCTTTTGCTGTGCCTTTTTGAATCATGTCGTGATTGATAACACCAACACACATTGCATTAACAAGTGGATTGCCATCATAACGTTCATCAAATTCGATTTCACCAGCAGTTGTTGGAATACCAATGCAGTTACCATAACCTCCGATACCCTTTACAACACCTTTAAGTAATCTTTGGTTTTGTTTATTATCTAATTCTCCAAATCTAAGACTGTTTAACAAATTAATAGGTCTAGCCCCAATAGAGACAATGTCACGAATGATTCCACCAACGCCTGTAGCAGCCCCTTGATATGGTTCAATTGCTGATGGATGATTGTGAGACTCTACTTTAAATACTACGGCTTGATTATCACCTATATCGACTACCCCTGCACCTTCACCAGGCCCCATAAGCACATGGTCACCTGACGTAGGAAATTGCTTTAAAAACGGTTTAGAATGTTTATAAGAGCAATGTTCACTCCACATAACAGAAAAGATACCTGTTTCTGTAAAGTTAGGTTGTCTGCCTAAAATATCGCAAACTTTTTCATATTCTTGATCACTTAATCCCATATCTTGATATACTTTTTCAAGTTTAATTTCTTCAACGCTTGGTTCGATAAATTTAGACATGTTGTTCCCTCCAACTTTTTACCATCGCTTCAAATAATTTCACACCACTATCAGTACCTAACAACGTTTCTAAAGCTCTTTCAGGATGTGGCATCATGCCACATACATTGCCTTTTTCGTTAACAATTCCTGCAATATCATCATATGAACCGTTCGGATTATTCACATATTTCAGAATAATTTGATTGTTAGCTTTTAATTGTTGATATATTTCATCAGTACAATAATAATGACCTTCACCGTGAGCTACAGGATATATAACTTTTTCACCTTGTTCATAAAGATTTGTAAATGCCGTTTGATTATTCACTATTTCTAACTCTTCATTTCTACTAATAAATAAATGTGAATCGTTATGCAATAATGCACCAGGTAATAAGCCTATTTCAGTTAAAATTTGAAACCCATTACAAACACCTAATACTGGCTTACCTTCAGCTGCAAGACGTTTAACTTCCGAAATAATCGGCGCTACACTAGCCATTGCCCCAGATCTTAAGTAATCCCCGAATGAAAATCCACCAGGAATAAGTACGCCATCAAATCCACTTAGTGATGTTTCTCTATAATCTACATATTCCGCTTCAACACCACTTTTAATAGCAGCATTAAACATGTCTCTATCACAATTCGAACCTGGAAAAACAAGAACCGCAAATTTCATTTTATGCATTCTCCTTTTCATCATCTAACACTTTATAGCTATATTCTTCAATCACTGTATTTGCAAACAATTTTTCACTTAGAGTTGTAATAATGTTGTGTACCTTTTCATCACTAACCTCATCCACTGTCATATATAATACTTTTCCTACACGAATATCATTCACTTGTGCATAACCTAAGTCATGTACAGCTCGAGTAAGCGTTTGTCCTTGCGTATCTAATACTTGTGGTTGTAATGTGATATGTAGTTCAATTGTTTTCATTATTTTAAATCCTCCAATTTGTTTAAAAATATTTGATATGTTTCAATCAGTGATCCAGTGTTATTTCTATATACATCTTTATCAAAGTTTGCATTGGTAGCTTTATCCCAAATTCGACATGTATCTGGAGATATTTCATCCGCTAACAAAATTTGACCAGTCTCAGTCTTTCCAAATTCGATTTTAAAATCTACTAATTTTAAATTCATAGCATCCATTAATTGTTTCAACACATTATTAATCTTTAATGCTTTGGATTTTAGTATTTCAATATCTTCATCTGATGCTATATTGAGCAATTTAACATGGTCATCCGTTATCAACGGATCATTTAACGCATCATTTTTATAGAAAAATTCTACAAGTGGTTCTCTAAAAACTTCACCATTTTCAAAACCTAAACGCTTTGTAATAGATCCACTAGCAATATTACGAACAACTACTTCTAATGGAATTATTTTCACAGGCTTAACTAATTGTTCTGTTTCAGATAATTGTTTAATAAAGTGACTTTCTATTCCATTTTCTTGTAAATATTTAAATATAATAGAAGTAATTTGATTATTTAATCGCCCCTTACCTGCCATTGTGTCTTTCTTAGCCCCGTTTCCAGCAGTAACTTCATCTTTATATTCAACTCTTAATTCATTTTCTTGATTTGTTGAGAAAATGCGCTTCGCTTTTCCTTCATATAATAATGTCATGCTTTAATTACTCCCCTCAAATTTAGCGTACATATCTTGTTCAGTTTGGTTTACATCATTCGTTAGTACAGTCATATGCCCCATTTTTCTGCTATCTTTACGCTCAGACTTACCATAAATATGTAAGTGCCACTCTGGATGTTCATTAAATTCATTTTCCAATAAATCTAAATCTTTACCTAGTAAGTTCATCATGACTGCTGGCTTTAATAATTCAATTGAATTTGGTAATGATTGTCCGGTAACTGCTAAAATATGAGTATCAAATTGTGAATAATCACATGCTTCAATTGAATAATGTCCGGAATTGTGAGGCCTTGGTGCTATCTCGTTCACATACAATTGGTTGTTACTATCTATAAAAAATTCAACTGTAAATGTTCCAATGAAATGAATCGATTGGATAATTTTATTAACTTGCTCTTTCGCCTCAGCTGTTTTATCTATTCTCGCTGGAACAATTGTTTTGAAAAGTATTTGATTTCTATGCTCATTTTCTTGTAATGGGAAAAAAGTGATTTGATTGTTGTTTCCTCTTGTAACAGTAAGAGATACTTCTTTCTTGATATTCAAATATTTTTCAGCTACGCATTCACTAGTTTCAATTAATTTAAAACCTTCTTGTAAGTCTTTTTCGTTGTTAATTAAAACTTGACCTTTGCCATCGTAGCCACCAAATCTAGTTTTTACAATAAAAGGATATCCTAATGTTTCAATTGCTTTGTCAATATCTGTAGATTCTTTTACTGAAATGAACGGGACAACTTTGGTACCAGCACTTTTTAATGTTTCTTTTTCAGTTAAGCGATCTTGTAATAACTGTATAGCTTGGTAACCTTGCGGAATATTGTACTTTTCACATAATAGTTTTAATTGTTGGGCTGAAATGTTTTCAAATTCATAAGTAATCACATCACATTTTTGTCCTAATTGATTGAGTGCCTTTTCATCGTCATACTTGGCTTGTATAAATTCGTGTGCAACGTATCTACATGGACAATCTTCAGAAGGATCCAATACAACCACTTTATAACCCATTTTTTGAGCTGATTGTGCCATCATCTTTCCAAGCTGACCACCACCAATAATGCCAATAGTCGCACCAAACTTTAATTTATTGAAGTTCATTTTGCATGTCCTCCACTTTTTGAATTAACGAAGATTCATACTGATTTAGTTTTTCAACTAAAGAAGGATTTTGAATACTTAACATTCTTGCTGCAAGTATACCTGCGTTTTTAGCACCTGCTGCACCAATTGCAGTCGTTGCAACCGGAATACCTCCTGGCATTTGAACAATTGATAATAAAGAATCTATACCCTTTAAACTTTTTGTTTCAATCGGCACTCCAATAACTGGTAGCGTCGTTAATGATGCAACCATACCTGGTAAATGTGCCGCACCGCCAGCGCCTGCAATGATAATGTTTATACCTCTTTCTCTCGCTTCAGAAGCAAATTGAACCATCATTTTTGGCGTACGATGTGCGGATACTACTTGTTTTTCGTACGGAATTTCAAAATAATCCAACATGTTACAACTCTCTTGCATAATTTTCCAATCGGAAGAACTGCCCATAATGACTGCTACTTTCAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP016855|988240:996713|989830_991315_-|WP_000483713.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NZ_CP016855|988240:996713|995119_996244_-|WP_001010412.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVVVLDPSEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITFFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >NZ_CP016855|988240:996713|993475_994147_-|WP_000666799.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NZ_CP016855|988240:996713|991293_993483_-|WP_000032727.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGDHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKDYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NZ_CP016855|988240:996713|994411_995116_-|WP_000174053.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIASDEDIEILKSKALKINNVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >NZ_CP016855|988240:996713|994148_994412_-|WP_000848350.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >NZ_CP016855|988240:996713|988240_988807_-|WP_000238664.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRKCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_CP016855|988240:996713|988809_989838_-|WP_000030812.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDVSRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NZ_CP016855|988240:996713|996230_996713_-|WP_000861572.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGINIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1016699 : 1064283
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP016855|1016699:1064283|DBSCAN-SWA TATGAATAGTTCATGTAAATCTAGAGTATTCAATATTATAAGCATCATAATGGTTTCAATGCTTATTTTATCACTAGGCGCATTTGCTAATAACAATAAAGCCAAAGCCGATTCACACTCTAAACAGCTAGAAATTAATGTTAAGAGTGACAAAGTACCTCAAAAAGTAAAAGATCTAGCACAACAACAATTTGCTGGTTATGCTAAAGCATTAGATAAACAAAGTAATGCAAAAACTGGTAAATATGAACTTGGCGAAGCTTTTAAAATTTATAAATTTAATGGTGAAGAAGATAATAGTTACTATTATCCAGTTATAAAAGACGGTAAAATTGTTTATACTTTAACACTTAGTCCTAAAAATAAAGATGATTTAAACAAATCAAAAGAAGACATGAATTACAGTGTTAAAATTTCAAACTTCATCGCTAAAGATTTAGACCAAATTAAAGATAAAAATTCAAATATCACTGTTCTTACTGATGAAAAAGGGTTTTATTTTGAAGAAGATGGCAAAGTTAGATTAGTAAAAGCTACGCCTCTACCTGGTAATGTAAAAGAAAAAGAAAGTGCTAAAACAGTTTCAGCAAAATTGAAACAAGAGTTAAAAAATACAGTAACACCTACTAAAGTTGAAGAAAACGAAGCGATACAAGAAGATCAAGTTCAATATGAAAATACATTAAAAAACTTCAAAATTAGAGAACAACAATTCGATAACTCATGGTGTGCAGGATTCAGTATGGCAGCATTATTAAATGCAACTAAAAATACAGACACTTATAATGCACATGATATTATGCGTACATTATACCCTGAAGTAAGTGAGCAAGACCTTCCTAATTGTGCAACATTCCCTAATCAAATGATTGAATACGGTAAATCACAAGGCAGAGATATTCATTATCAAGAAGGCGTACCATCATATGAACAAGTTGATCAACTTACAAAAGATAATGTAGGAATTATGATCCTTGCACAAAGTGTATCTCAAAACCCTAATGACCCACATTTAGGACATGCGCTAGCAGTTGTTGGTAATGCTAAAATTAATGACCAAGAAAAACTTATTTACTGGAATCCTTGGGATACAGAATTATCAATCCAAGATGCAGATTCAAGCCTATTACATTTATCATTCAATCGTGATTATAACTGGTATGGTTCAATGATAGGTTACTAAAAAGTAATATAGATATTGATTAAAGGCAGGTAAAACTATGTATCAACTACAATTTATAAATTTAGTTTACGACACAACCAAACTCACACATCTAGAACAAACCAATATCAATTTATTCATTGGTAATTGGAGTAATCATCAATTACAAAAATCAATTTGTATACGTCATGGCGATGATACAAGTCACAATCAATATCATATTCTTTTTATAGATACGGCACATCAACGCATTAAATTTTCATCTATTGATAATGAAGAAATCATTTATATTCTTGATTATGATGATACACAGCATATCCTCATGCAAACGTCATCCAAACAAGGTATTGGCACTTCGCGACCAATCGTTTATGAGCGCTTAGTATAACTAATTTAAATGATTTCACTTCATAAAGCGGGTTGGCGAGAATTCAATTTCTCACCAGCTCGTTTTTTCATTGTAATAATAATCTTTAACATTTATTCTTTCTCTATTAATTTTTCTCAAACTATCTTATCTTTATGATAATTAATTAAAATGCCCTTTTAAATTCTTATAAAATAAAAAAGCCACCTATCGTCGCTAATAAACGACGCAAGTGACTTAATATCATATTCAAAATAACTTATGGGAATTTAGGGAATTGATCGAAGTCAGGATCACGTTTTTCTTTAAACGCATCACGGCCTTCTTTCGCTTCATCAGTTGTGTAATAAAGCAATGTTGCATCCCCAGCCATTTGTTGTAAACCAGCTAAACCATCTGTGTCAGCATTCATAGCTGCTTTAAGGAATCGTAACGCTGTTGGTGAGTGTTTCATAATCTCTTTACACCATTGCACAGTTTCATCTTCAACTTTCTCTAAAGGTACCACTGTATTTACTAGACCCATATCTAAAGCTTCTTGTGCATTGTATTGACGACATAAGTACCAAATTTCACGTGCTTTCTTATGTCCAACGATACGTGCTAAATATCCTGAACCATAACCCGCATCAAATGAACCTACTTTAGGACCAGTTTGTCCAAAAATAGCATTATCAGCAGCAATCGTTAAGTCACAAACAACATTTAGTACATTACCGCCACCTACAGCATAACCTTTTACCATCGCGATAACCGGTTTTGGAATAATACGAATTAAACGCTGTAAATCTAATACATTTAAGCGAGGGATTTGGTCTTCACCTACATAACCACCATGTCCACGTTTCTTCTGGTCACCACCAGAACAGAATGCTAAATCACCTTCACCAGTTAATACGATAACTGAAACGTTTTGATCATCACGTGCACGTGAAAATGCGTCAATCATTTCAGCAACTGTTTTAGGTGTAAACGCATTGCGTACTTCAGGGCGATTTATTGTTACCTTAGCAATCCCTTCGTAAAATTCATATTTGATTTCATCATATTCTCTAAGTGTTTCCCATTGTCTGTTAGTCATTTTGCTCCTCCTTTAAAAATCCTAATATCATTGTATCAAATTCATCACTATCTTCCACATGAATTGTATGACCTGTAGCAGAAATTAATTTACATTTACTATTAGGAATTAAATTTGCCATTTTTTTCGCAATCTGTACAAATTTTTCATCATATTCTCCAGCTAATATTAATGTTGGTACTTTAATTTCTTTCAGGCGCGGCCATAAGTTTGGCATTTGACCTGTACCATAATCTCTTAATGCTTTGGCCATTTTATGTGGCGATTGAGACAATCGTTGTTGTCTTATTTGATGTTGTATTTCAACTGGTAATTCTAGTTGCGATTGAAATAATGGCAACTTTTCCCAATCATTAACAAATAATTCAATACCTGCTATGTCTAATACTTTAGCACGTGCATCATCAACAAGACGGCGTTCCAATTGATTTGCTTCTTCTTTAATACCTGGTGACGTACTTTCTAATATCAAATTAGATATAGGGATGTGACCATTAATTGCATAATATAATGCAACACGCCCACCCATTGAATATCCAAACAATGTTATTGATTTATCTTTATATTTATCTAAAATTCGGTCTAACAACGTCGTAATATAATCAAAATTCCACGTTTCATCCATTGAAGACTGATCTTCGCCATGGCCTGGTAAGTCTATAGTGATGACATGATAGTTATCAGTAAATTTTTCGATGTGATTATGATAAGTACGGCTGTCGCTAAGAAATCCATGCAGAAATACTAAAACTTGATTGGTCTCAACGTTTGCTTCATAAAATTTATAATGTGTCATGAATCATTTCACTCAATTTCTGGTATAAAATTTGATGCTGTTTAAAGTTATCTTCGCGATTCGTTATCAATTCATAAATCGTCGAAGTTTCAGATAACAATGTGGCATTTTTAAATTCTGAAACACTGTTAAAACGTTTAAAATCGAATTGATATAACTTAGCTGTATACTCGAAATCCAATCCCGTCGGTGTGCCAAACAACCGTTCAAAATAGTCAGTTGCACTTTCTTTTTGTGGTAAATATGAAAAAATACCGCCACCATCGTTGTTCAATAATACAATATTCATCTGAATATTATTTAATTTTGACATTAATAGTCCATTCATATCATGATAAAATGATAAATCACCTATCAATAATGTTATTCGTTTATGCACAGCCATACCCAGTGCAGTTGAAACGATACCATCAATACCATTCGCACCACGATTCGCATAGACATCTATATTTTTATTCAATAACAAGTTATCTACATCTCTGATAGGCATACTATTACTAATAAATAATGCATCTTTTTCAGATGTTTTCTTAATCAATTCACCAACGAATGCACTCTCATCTGTAGCTTGTTCCAAATAACATTTAATTTCTTTACGCCCTTTTTTCTCTAAGCATTGCCATTTTTCTAACCAACTTACGCGATTAACTGTCGTGTCTTCCATTAATGACCTAAAGAAATCATTCGCAGAAATCTCATATGAAATATCTGGCGCTATCGGAAAGACATCAATCTTATCATTGTTTTGCACTAATATTTGAAATGCATCAGTTTTCTTTAACCATTGATTTAACTTTTTAGAAATCACTGGTTTCCCAACACGAATTACGAAATCCACATTTAAGTCTAAGCCGCTTCTAAACAGCAAATCATATGTACAGATAACATTCGGATGATCAAATTTTCTTAAATGACTTAAAGGATCAGCTAAAATAGGCAAATCATATATCGTTGAATACGTTAGTATTTGATCAACTTCTTGGTGCTGCATATCCCCTACAATAATTAAACCTTTTTTCTTATTTAAAATGTGTCTTAATGCCGATGCATCTATACTTTTTTGATAGTGCGGTAAAATCTTCATCTCAGAAGTTAACAATTCTGTTGCATTCAAATCAGGTGTTAACGGATCTCTAAATGGCAAGTTAAAATGAATTGGCCCTTTATGTGGTCCATATAAATATTGACTAGCAATTTGCATTTGATAGTAAATTGCATCAATGGTCTCTTTACTATCATCCGCAATAGGCATATCGAACTCATAACTTACATAATTATTAAACATATTTACTTGATTAATCGCTTGTGGTGCGCCTACACTTCTTAATTCATGCGGACGGTCACTTGTTAAAACGATTAAAGGAATTCTACTAATTTGGCTTTCAGCAATTGCAGGCGTATAATTCGCTGCTGCTGTACCTGACGTACATAATATAGCGACAGGTCTTTCACTGCCTTTAATTAACCCAACTGCAAAAAACGCTGCACTTCGCTCATCGGGGTGTATCCATGTTTTAATATTTGGATGTGCTTCAAATGCAAGTGCAAGTGGCGTTGAGCGTGATCCCGGACTGATAACTACTTCCCTTACGCC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48 | Enterococcus_phage(20.0%) | bacteriocin,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1161029 : 1176857
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP016855|1161029:1176857|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP016855|1161029:1176857|1171373_1172102_+|WP_001033321.1|DBSCAN-SWA MNKIFRVLTVSLFFFTFLIKNNLAYADVGVINLRNFYTNYQPETLQGVSSGNFSTSHQLEYIDGKYTLYSQFHNEYEAKRLKDHKVDIFGISYSGLCNTKYMYGGITLANQNLDKPRNIPINLWVNGKQNTISTDEVSTQKKEVTAQEIDIKLRKYLQNEYNIYGFNKTKKGQEYGYQSKFNSGFNKGKITFHLNNETSFTYDLFYTGTGQAESFLKIYNDNKTIDAENFHLDVEISYEKTE |
21 | Staphylococcus_phage(64.71%) | integrase,capsid | attL 1160350:1160366|attR 1174305:1174321 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1255622 : 1270353
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP016855|1255622:1270353|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP016855|1255622:1270353|1263358_1264225_+|WP_001068497.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NZ_CP016855|1255622:1270353|1266860_1267778_+|WP_000429014.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NZ_CP016855|1255622:1270353|1262159_1262558_-|WP_000692521.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NZ_CP016855|1255622:1270353|1268401_1268944_-|WP_000197273.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLRESGFFRHLKVMPYAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >NZ_CP016855|1255622:1270353|1260091_1262197_-|WP_000855505.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_CP016855|1255622:1270353|1266668_1266770_-|WP_001790641.1|DBSCAN-SWA MVINEIDFYRVGRENIVIAVYNEHIKFLFILIS >NZ_CP016855|1255622:1270353|1269294_1270353_-|WP_000663030.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEYFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NZ_CP016855|1255622:1270353|1257323_1258295_-|WP_000876318.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >NZ_CP016855|1255622:1270353|1255622_1256384_-|WP_000616842.1|DBSCAN-SWA MIQVENLTKTINNQMILEDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFENGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMNIQIEHIRNQRICLYFKD >NZ_CP016855|1255622:1270353|1258333_1258489_-|WP_000499195.1|DBSCAN-SWA MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLWSKNATINEKYYQ >NZ_CP016855|1255622:1270353|1265085_1266591_+|WP_000193752.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAISPLIIKAMKGIR >NZ_CP016855|1255622:1270353|1259002_1259974_-|WP_000562498.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NZ_CP016855|1255622:1270353|1256380_1257337_-|WP_001245577.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITILLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >NZ_CP016855|1255622:1270353|1264244_1264745_+|WP_000930014.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR |
14 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1282325 : 1290145
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP016855|1282325:1290145|DBSCAN-SWA ATTATAACATCTCCAAAATCTTGGTTTTTGCGTAAAATTCATTCACTTCATCTTTTGGCTTAGAATCAATTGTAATACCTGCTCCGACTCCATAAATCGCTTGTCCATATTTATACTCAATAGTGCGAATCGGAATATTAAAAATCATTTTATCATCTTCAGTTGGAAGTAATAGTCCAATTGCTCCGCAGTATATACCACGAGGTGAACTTTCTAATTGTTTAATATATTTCATTGTATTCAGTTTCGGTGCACCTGTAATCGAACCACAAGGAAATAACGATGTTAAAATTTGAGTTAAGTCTGTATTATTTTTTAAAGTTCCACTTACCATCGAAGTCATTTGAAATACAGTTTTATATGCCTCAATAAAAAATAGTTTATACACCTTAATTGAGCCACTCTGTGATATTCTCCCTATATCGTTTCTTAGTAAATCAACAATCATGACATTTTCTGCACGATCTTTCGAAGAAGTTTGCAATGTTTTATAATACTGTTGATCTTCAGCTTCCGTTTTACCTCTAGGCATTGTCCCTTTCATCGGTTTGCTTATGATAACGTTATCGACATTGTTAAATTGTCCTTTTTGAAAAAATAATTCTGGTGAGATAGACGCTACTTGGATTTCATCAGTTTGTAATAACGCAGTATAATTACCATTACTAAATTGAGTTAATCGTTCATATAAAGTACTAATAGGATAATAAATGTTATCCGTTAAGCGCGCCGTATAGTTCACTTGATACGTTTCGCCTTCAACAATTGCTTGTTGGACACGTTTAATATTAGTCATCATAACCTCAGAAGATTCAACAAATGAAAAATGATACTTTGATACATAAGAAGTTTGATGTTCATATGTTGAATTTATGCTTTCCGCTTTTTCAAAACTATAAGCTGCTGCATAAATATCATCTTTAGCTAATGAATGTGTACACATAGCATGATTAAAATACTTTGCCGCTTCGTAACTTAAATATAACGAGACATATCTACCTTGTCGTTGCTGCGCTTGTGCAAAGTGTATCACTTCTCCCACATCAGCCAACTTAGTAGCAACATACTTCTTTATAAATCCCTTTAATTGAATATGGTATTGCTTATATTCATTTTCAGTTAAATAGTAGCGATAATTATATTCTATTCTCACAGTAATCACCTACCTTCGATAAAAATAATTCAACTTGTCGATAACCGTATTCACTCAAAATAGATTCAGGATGATATTGCACACCAAAAACCGGAAATCTAATATGCTCAAATGCCATAATAATCGCTTCATCGTTTTTTGCTGTAATCTTTAAGCAATTTGGAAAAGTCGCTCCGTCAGCAATTAATGAATGATAACGCATTACATTGAAATTTTGAGGCAGTCCTTGAAAAATACCTTCATTGGTATGGCGTAACTGTGTAGTATGTCCGTGTACAGGATGATAGCCGTGAATGATATTTCCACCAAAATAAGACACGATACATTGAAATCCTAAACATACACCTAGTATAGGTACACGCTGATAAAATTGTTCTAACACTTCATTCAAGATAGGATAATCATCCGGATTACCCGGCCCAGGCGAAATAACAATTGCTTTTGGCTTCATATTAATGACGTCTTCTATCAGCAGATTATCAATACCAACAACTTGAACTGTTAGTTTCGTTTGAGTCTTAATATAGTCTATTAAATTATATGTAAATGAATCATTATTATCTATGACTAGAATCATTGTATACTCCGTTCTAAATGTGTTTTATTTTTATAATATGTATTGGATGTAGCTAAAACTTTAAAAGCATTGTCATTATCCTGACCTTGATTTTAACTAATATATGGTATATTCTATTCATCGTACATAAATGAATATCAGAGGTTCCTAGCTGAAACCCTCTATAAAAAACTAGACATTGAAATTTCAAACATTCGTTGGTAAACCTTTAATATATATTATAGGAGCAACCCATTTCTTTCGTCTATCTTTTATGGAGATAGGCTTTTTTTATTTTATAAATTAAAAACGGGCTTATCAATGCCATTAACCTCTTTATTAATATTATTAATGATAGGAGCAATTACAAAATGGAAAGTGTATTAAATAATGAAAAAGCCATCGTTGTCTTTAGTGGTGGTCAAGACAGTACAACATGTCTCTTTTATGCAAAAAAACATTTCAAAGAAGTTGAACTCGTAACGTTTAATTATGGCCAAAGACATGATACTGAAATTGAAGTCGCAAAACAAATTGCACAAGATCAAGGAATGAAACATCACGTTTTAGATATGTCATTATTATCACAACTTACTCCAAACGCATTAACACAACATGATATGGAAATTACTAATAATGAAGATGGTATACCTAATACATTTGTTCCAGCTAGAAATTTACTTTTCTTGTCGTTTGCAGGCGCTCTAGCTTATCAAATTGGGGCTAAGCATATTATTACAGGCGTATGTGAAACAGACTTTTCAGGCTACCCAGACTGTCGCGATAGTTTTATAAAATCAATGAACGTAACATTAAGCCTAGCTATGGACAAAGATTTTGTCATTCATACTCCTTTAATGTGGTTAAACAAAGCAGAAACGTGGAAATTAAGTGATGAACTCGAAGTTTTAGATTATATTCGTACAAAAACATTAACATGCTATAACGGTATCATTGGGGATGGCTGTGGTGAATGTCCAGCTTGTCATTTACGTCAACGTGGACTAAATCAATATCTTGAAAGTAAAGGAGCGCTTTAAAATGTTACAACAAATCTATCCTAGTACAACGCATCCATATCAATTCGAATTAAATAAAGATTTTAATTTTTCGGCTGCACATCACATTCCATGTGAAGAAGCAGGTATTTGTCAAAATGTCCATGGTCATACTTACTTTGTTAATTTAACAATTGTCGGTGATAAACTAGATGACACTGGCTTCTTAGTGAACTTTAGCCATTTGAAAAAGATGATACACGGTAAATTTGACCATCAACTGTTAAATAACTTACCTGCTTTTAAAAACAAAATCCCTTCAACTGAAATCGTAGCGGAAACAATTTATCAAATTGTTAAAGAAAATTTGGCATCGCTCGAACACCAACCAAAATGTATTCAAGTATTTGTAAGAGAAACACCAACAAGTTATGTCGTATTTAGACCAAAGGAACAGGTGTAACTAATGGCTAAAATTCCTGTACTCGAAATATTCGGTCCAACCATTCAGGGTGAAGGTCGAGTAATCGGTAGAAAAACGATGTTTGTGAGAACAGCTGGATGTGATTATCGCTGTAGCTGGTGTGATTCTGCATTTACTTGGGATGGTAGTGCTAAAGGCGATATAAAACTCATGACCGCTGAAGAAATTTATGATGAATTAAAACGAATTGGTGGCGATTTATTTAACCACGTTACAATTTCTGGTGGTAACCCAGCATTAATTAAAGGTATCCAAGAGTTAGTTGACTTATTTCAAGATAAAGGTATTTTCAGCGCACTGGAGACACAAGGCAGTAAATTCCAACCTTGGATGACACAAATTGATGATTTAACGATTAGTCCAAAACCACCAAGTTCAACTATGACACCTGATTTAAAAAAGTTAGATGAAGTGATTACACAATGCGTACCTTCATCATTAAACTTAAAAGTAGTTGTATTCGACGATAAAGATTATGATTTTGCCAAAATGATACACCACCGTTATCCAGATATTCCCTTCTATTTACAAGTTGGTAACCCATATTTATCAGACAGCGTAGATAATCATACCGAAAAGTTGTTAGAACGCTACGAGCAGTTGGTGGATTTAGTTATGCAAAGTAATGATATGAATCACGTTTATGTGTTACCACAACTTCATACATTACTTTGGAGCAATAAAAAAGGTGTATAAAGGATAACTTATTTTACTTTTTGCAAGTCATATCTAATGAATAACAATATATTAATTGATATAATAGTTGATTGAAGTATAACGAACAGGAGTCCATCATGATTGTATATATATTAATTAATATTGCTATCGTCGTACTTATAACTGGATTCAATTTATATAGGCATCAAATGCAACATTTATCATTAAGTGCAATGTTGTTATCTATTACGATAAACGCCTTTATAAATACATTCATAATTGATAAATATAACTTTATTACTCTGTGTACTATAACGATGTTTATCATTTGGACGATACTACAGTTTTACATTGATAAAAAATTAAAACCTGTATACATTACAGACCAAAAATTTATTGCTATCATATTAACGATTGTTGTCAGTTTAACGCAACGTGTTACCGACTTTTCAAGTACACAATCAATATATATGTCTATTCCATTTTTAGCCCCTGCCATTTTCATCATTGGTGGTATTATGTTGTTTATTTCAACATTTAATAGCTTAGATGAAACTGCTGAAAATAATAACAAAATAAAGAAACTAATGATTAAAGGACTTATCATTATTAACATTTCATTTATCGTTATGATGGTTTTAACACCATATTGGTACTTGTATTTAATCGTCTATCTTATTTTCTTGTTGTTTTTATTGTGGCAAAAGGTTTATAAATTTTAATACCAAAACTATTAAACACTTCTGATATTCTTAGTTCAAAATATCAGAAGTGTTTTATAGTGTTATCTAGTTCAGATAAATATTTCCTTACTTAAAAAAACGCCCTCCTCTTATTTTGACCCCTATTTATTTAAATCAGACAATTATTTTCATTTTCAAATTATTCTTTCTTCAATATTAGTTAAGCGATATTTAAACGAAGTTAAGAATTAGTTAATGGCATATTATTTGCCTTCATTTTAAACTTAACTTATCAAATTGAAGAAATGAGGAGTTAGCATGAATACAAAATATTTTTTAGCAGCTGGTGCTGTTATCACAACATTAGCTTTAGGTGCTTGTGGTAATTCTAATTCACAAGATCAAGGTAACAAAACTGAACAAAAAACAAAGTCAGAAGATAGCAATGTTAAAACTGATAAAACAAAAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP016855|1282325:1290145|1287173_1287614_+|WP_001093553.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAAGAVITTLALGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >NZ_CP016855|1282325:1290145|1286309_1286894_+|WP_000637687.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >NZ_CP016855|1282325:1290145|1287955_1288429_+|WP_001037807.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >NZ_CP016855|1282325:1290145|1285074_1285494_+|WP_000941336.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >NZ_CP016855|1282325:1290145|1283460_1284054_-|WP_000604514.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHIRFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NZ_CP016855|1282325:1290145|1282325_1283477_-|WP_001217785.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHAMCTHSLAKDDIYAAAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKYHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKNNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >NZ_CP016855|1282325:1290145|1285497_1286211_+|WP_001062972.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_CP016855|1282325:1290145|1289089_1290145_+|WP_000244412.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCNEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENEDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NZ_CP016855|1282325:1290145|1288403_1289090_+|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >NZ_CP016855|1282325:1290145|1284404_1285073_+|WP_000446724.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL |
10 | Pandoravirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2801634 : 2859304
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP016855|2801634:2859304|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP016855|2801634:2859304|2823669_2823831_+|WP_001285960.1|DBSCAN-SWA MSDTYKSYLLAVLCFTVLAIVLMPLLYFTTAWSIAGFASIGTFIYYKEYFYEE >NZ_CP016855|2801634:2859304|2811843_2813067_-|WP_000206639.1|DBSCAN-SWA MTTFSEKEKIQLLADIVELQTENNNEIDVCNYLTDLFDKYDIKSEILKVNEHRANIVAEIGNGSPILALSGHMDVVDAGNQDNWSYPPFQLTEKDGKLYGRGTTDMKGGLMALVVSLIELKEQNELPHGTIRLLATAGEEKEQEGAKLLADKGYLDDVDSLIIAEPTGSGIYYAHKGSMSCKVTATGKAVHSSVPFIGDNAIDTLLEFYNLFKEKYSELKQQDTKHELDVAPMFKSLIGKEISEEDANYASGLTAVCSIINGGKQFNSVPDEASLEFNVRPVPEYDNDFIESFFQNIINDVDSNKLSLDIPSNHRPVTSDKNSKLITTIKDVASSYVEQDEIFVSALVGATDASSFLGDNKDNVDLAIFGPGNPLMAHQIDEYIEKDMYLKYIDIFKEASIQYLKEK >NZ_CP016855|2801634:2859304|2805439_2806030_+|WP_001293058.1|terminase|DBSCAN-SWA MSELTAKQARFVNEYIRTLNVTQSAIKAGYNANSAHVTACRLLKKPHIKQYIQEQKDKIIDENVLTAKELLHVLTNAAVGDETETKEVVVKRGEYKENPQSGKVQLVYNEHVELIEVPIKPSDRLKARDMLGKYHKLFTDKHDINGNVPIFINIGEWDGGDEGLDKAVKDVSNDNPNHTVIVDDIPLEDYESIRFL >NZ_CP016855|2801634:2859304|2813501_2814557_+|WP_000791407.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP016855|2801634:2859304|2821089_2821263_+|WP_001801500.1|DBSCAN-SWA MFLAIIIFLSLFILLTSFFLIIRNFHIIVKFFTKKTYLMLTIRKFRIILGLRKAVTT >NZ_CP016855|2801634:2859304|2827712_2828330_+|WP_071665632.1|DBSCAN-SWA MKFERVQKHFKYKTRHIAGCLITHEHGDHAKYTKQFVDNGVISYMTAGTQQAMNFESHRLCTIKAKQELRIGTWSILPFDIEHDANEPVAFLLQSTLGYKVLYVTDTKYLKYKFNGITHMMLEVNYIYEQMQENIKNGSVHSTLANRIMESHFSLEHAIGMLKANDLTRLEEIHLIHLSSQNSNAKYIKSEIQKVTGAPVYFGGL >NZ_CP016855|2801634:2859304|2840063_2840348_+|WP_000150936.1|head,tail|DBSCAN-SWA MTIDDLLVKFKSLEKIDHNSEDEYLKQLLKMSYERIKNQCGVFELENLIGQELILIRARYAYQDLLEHFNDNYRPEIIDFSLSLMEVSEDEESV >NZ_CP016855|2801634:2859304|2823063_2823294_-|WP_000549548.1|DBSCAN-SWA MHKRLLTQYLDKEIVTSLDLHLINGEVIKVQEHMKDAESKTLHIIYPKDRVVSLDHVLYFDINVKGEKNNDSPYPS >NZ_CP016855|2801634:2859304|2808185_2809493_-|WP_001045079.1|DBSCAN-SWA 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MKINKLTISNFAGIKEEKFNFDGKDAKIYGNNATGKTTTATALQWLLFDKGLDGSTKSFNPVPLNEKNEENYELIPTVFAEFEIDGKITTFKKESHPKYTINQKTNRKEYSRSRTKKQYINDESIKVKDYKARIDELIDEDVFKLITNPQAFNLLDWKKRRSLLFEIAKPINDEDVIKTNDDFKELNNILGDHEIETKKKILTDKIKQINKDIKDIPIRINQTQQNKQDVPEFDNDRYAIIKQEIEQLENERIDIQNGKEEINLRNQLADKQSELKRIEDNNSASNENKIHALTNELHVENGTVANLKTRLKQNKQQITHEENRRNQLLENHKGLKSDLEKAKNQKFEYLDDNVCSCCGQKLPVEQVDMAREKALQKFNASKSKELETIQTSINHIISEGKKIKLIIEKLEDDNNNLQIKINEAEERSARIQNKINKLKTTHVDVTQTDEYKAVMLEINEINQKRSNIRKTIQDKVSGIDDKISELTQEKSEIEVSRSIEKSNKHLDDVISELRNEEDRLLDEKEKYSHDLYILKEFTTTKVKMLTENINNEFEIAEFKLFNTLVNGELEETCSTTVNGVEYDSGLNNASRINVGLDIINTLSKHFKVTAPIFIDNAESVTELIKTESQQIQLIVNEQDKKLRMETI >NZ_CP016855|2801634:2859304|2849080_2852866_+|WP_000582165.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP016855|2801634:2859304|2843054_2847584_+|WP_001551779.1|tail|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP016855|2801634:2859304|2806889_2807333_+|WP_000022887.1|DBSCAN-SWA MSIITRLFNNSDFEKLNQLCKLYDDLGYPTNENDLKKRLKKITNHDDYFLLLLIKENKIIGLSGMCKMMFYEKNAEYMRILAFVIHSEFRKKGYGKRLLADSEEFSKRLNCKAITLNSGNRNERLSAHKLYSDNGYVSNTSGFTKQL |
80 | Staphylococcus_phage(97.18%) | terminase,capsid,head,protease,integrase,tail,portal,holin | attL 2815501:2815518|attR 2840432:2840449 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP016855.1|WP_001790641.1|1266668_1266770_-|hypothetical-protein |
1266668_1266770_-
Protein sequences of NZ_CP016855.1|WP_001790641.1|1266668_1266770_-|hypothetical-protein>NZ_CP016855.1|WP_001790641.1|1266668_1266770_-|hypothetical-protein MVINEIDFYRVGRENIVIAVYNEHIKFLFILIS |
33 aa aa | NA | NA | NA | 1255622-1270353 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.4|1115555|26|NZ_CP016855|CRT matches to NZ_CP016855 position: 1258812-1258837, mismatch: 2 ccgccagcctctgtgttggggccccg CRISPR spacer ccgcctgcttctgtgttggggccccg Protospacer ***** **.***************** 2. spacer 5.1|1221694|26|NZ_CP016855|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016855 position: 1258837-1258812, mismatch: 1 cggggccccaacacagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacacagaagcaggcgg Protospacer ******************** ***** 3. spacer 5.1|1221694|26|NZ_CP016855|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016855 position: 1258781-1258756, mismatch: 2 cggggccccaacacagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacatagaagcaggcgg Protospacer *************.****** ***** |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation |
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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