Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP014673 | Thermoclostridium stercorarium subsp. leptospartum DSM 9219 chromosome, complete genome | 8 crisprs | cas10,csm3gr7,csx10gr5,csm2gr11,csx1,csa3,cas3,DinG,cas2,cas1,cas4,cas5,cas7,cas8b2,cas6,PD-DExK | 1 | 16 | 10 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP014673_1 | 206144-207224 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP014673_1
|
16 spacers
spacers of NZ_CP014673_1
>1.1|206174|37|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATAACAACTCAACTTAGTAAAGAGCCTAAGGATACT >1.2|206241|36|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCATCAGGGTTATCGGAATTTGCGCCCTCATGCATC >1.3|206307|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTGAGGATCAACATTGTTGTTTCGTTCTTTGC >1.4|206372|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATGCCGACGATGTACTGTGAAAGGTTTTCATCA >1.5|206436|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCTCTTCATCGTAGTCAACCTGTGAAATGACAAAG >1.6|206501|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTATTTAACGCAGCCGATGCAGTAGGTGATTGAAC >1.7|206566|36|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGGGCCTCGGCTAATTTCTCATTTGCCTTGCGTAG >1.8|206632|36|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATGAAATTTTTATTGTAGTTGTTAACCCTGCTTTC >1.9|206698|36|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCTTCATACTCTTCTTCTGTGAGTGAATCAAAATA >1.10|206764|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTTTTGAAAGCGCTAAAAAGAAAGGATATTCTGC >1.11|206829|36|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTAATGCAATTACATATACTAACAATTGGCTTTAA >1.12|206895|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGGTTAAATCCCTGATAATTTTACCAACTTTTGA >1.13|206960|36|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTCAACTTATGAACACATTCGTTTAACATAAAC >1.14|207026|37|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGACAGCTCATGTTCTGCTTCCACGATGCCGACAATG >1.15|207093|36|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTATCACCCCAGAAAATGAGAACGCTTCCCGGTGT >1.16|207159|36|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCATTAGGCTCCATAGTCTCAAGTTCTTTCTGCATG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP014673_1
The CRISPR arrays of NZ_CP014673_1 >merge|NZ_CP014673|1|206144-207224|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACAATAACAACTCAACTTAGTAAAGAGCCTAAGGATACTGTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACTCATCAGGGTTATCGGAATTTGCGCCCTCATGCATCGTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACTTTTTGAGGATCAACATTGTTGTTTCGTTCTTTGCGTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACGATGCCGACGATGTACTGTGAAAGGTTTTCATCAGTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACCCTCTTCATCGTAGTCAACCTGTGAAATGACAAAGGTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACGTATTTAACGCAGCCGATGCAGTAGGTGATTGAACGTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACCTGGGCCTCGGCTAATTTCTCATTTGCCTTGCGTAGGTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACCATGAAATTTTTATTGTAGTTGTTAACCCTGCTTTCGTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACTTCTTCATACTCTTCTTCTGTGAGTGAATCAAAATAGTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACGCTTTTGAAAGCGCTAAAAAGAAAGGATATTCTGCGTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACTCTAATGCAATTACATATACTAACAATTGGCTTTAAGTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACTTGGTTAAATCCCTGATAATTTTACCAACTTTTGAGTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACTTTTTCAACTTATGAACACATTCGTTTAACATAAACGTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACTGACAGCTCATGTTCTGCTTCCACGATGCCGACAATGGTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACGGTATCACCCCAGAAAATGAGAACGCTTCCCGGTGTGTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACTCATTAGGCTCCATAGTCTCAAGTTCTTTCTGCATGGTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC >NZ_CP014673|1|1|206144-207224|PILER-CR GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC AATAACAACTCAACTTAGTAAAGAGCCTAAGGATACT GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TCATCAGGGTTATCGGAATTTGCGCCCTCATGCATC GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTTTGAGGATCAACATTGTTGTTTCGTTCTTTGC GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC GATGCCGACGATGTACTGTGAAAGGTTTTCATCA GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC CCTCTTCATCGTAGTCAACCTGTGAAATGACAAAG GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC GTATTTAACGCAGCCGATGCAGTAGGTGATTGAAC GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC CTGGGCCTCGGCTAATTTCTCATTTGCCTTGCGTAG GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC CATGAAATTTTTATTGTAGTTGTTAACCCTGCTTTC GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TTCTTCATACTCTTCTTCTGTGAGTGAATCAAAATA GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC GCTTTTGAAAGCGCTAAAAAGAAAGGATATTCTGC GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TCTAATGCAATTACATATACTAACAATTGGCTTTAA GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TTGGTTAAATCCCTGATAATTTTACCAACTTTTGA GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTTTCAACTTATGAACACATTCGTTTAACATAAAC GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TGACAGCTCATGTTCTGCTTCCACGATGCCGACAATG GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC GGTATCACCCCAGAAAATGAGAACGCTTCCCGGTGT GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TCATTAGGCTCCATAGTCTCAAGTTCTTTCTGCATG GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC >NZ_CP014673|1|1|206144-207224|CRISPRCasFinder GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC AATAACAACTCAACTTAGTAAAGAGCCTAAGGATACT GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TCATCAGGGTTATCGGAATTTGCGCCCTCATGCATC GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTTTGAGGATCAACATTGTTGTTTCGTTCTTTGC GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC GATGCCGACGATGTACTGTGAAAGGTTTTCATCA GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC CCTCTTCATCGTAGTCAACCTGTGAAATGACAAAG GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC GTATTTAACGCAGCCGATGCAGTAGGTGATTGAAC GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC CTGGGCCTCGGCTAATTTCTCATTTGCCTTGCGTAG GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC CATGAAATTTTTATTGTAGTTGTTAACCCTGCTTTC GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TTCTTCATACTCTTCTTCTGTGAGTGAATCAAAATA GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC GCTTTTGAAAGCGCTAAAAAGAAAGGATATTCTGC GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TCTAATGCAATTACATATACTAACAATTGGCTTTAA GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TTGGTTAAATCCCTGATAATTTTACCAACTTTTGA GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTTTCAACTTATGAACACATTCGTTTAACATAAAC GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TGACAGCTCATGTTCTGCTTCCACGATGCCGACAATG GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC GGTATCACCCCAGAAAATGAGAACGCTTCCCGGTGT GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TCATTAGGCTCCATAGTCTCAAGTTCTTTCTGCATG GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC >NZ_CP014673|1|1|206144-207224|CRT GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC AATAACAACTCAACTTAGTAAAGAGCCTAAGGATACT GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TCATCAGGGTTATCGGAATTTGCGCCCTCATGCATC GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTTTGAGGATCAACATTGTTGTTTCGTTCTTTGC GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC GATGCCGACGATGTACTGTGAAAGGTTTTCATCA GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC CCTCTTCATCGTAGTCAACCTGTGAAATGACAAAG GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC GTATTTAACGCAGCCGATGCAGTAGGTGATTGAAC GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC CTGGGCCTCGGCTAATTTCTCATTTGCCTTGCGTAG GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC CATGAAATTTTTATTGTAGTTGTTAACCCTGCTTTC GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TTCTTCATACTCTTCTTCTGTGAGTGAATCAAAATA GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC GCTTTTGAAAGCGCTAAAAAGAAAGGATATTCTGC GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TCTAATGCAATTACATATACTAACAATTGGCTTTAA GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TTGGTTAAATCCCTGATAATTTTACCAACTTTTGA GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTTTCAACTTATGAACACATTCGTTTAACATAAAC GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TGACAGCTCATGTTCTGCTTCCACGATGCCGACAATG GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC GGTATCACCCCAGAAAATGAGAACGCTTCCCGGTGT GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TCATTAGGCTCCATAGTCTCAAGTTCTTTCTGCATG GTTTGAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC
>NZ_CP014673.1|WP_015357914.1|204478_204886_-|hemerythrin-family-protein MAIKWTPDLSVGVDFIDEQHKIWFEKVDQLFSAGQRGEGREYILKMFDFLDDYTKTHFRDEEQYMESINYPGLEEQKTAHNHFKEELARIRKEYIESGGNLVLLVKTNKMIVDWLVKHISHLDKKIGEFVAARKE >NZ_CP014673.1|WP_015357913.1|203497_204349_-|YihY/virulence-factor-BrkB-family-protein MKELLKKTYDFGKNAYNIYSKAKVPFLAAQTSFYVILAFFPFVAFILTLIQETHLDDTLFIKALSNFLPSSTYVLTLQVLESAQAHKNLFISIGGAAASIWPFTKAVQSLIVSINTVYGMDEENLLKRIGFSLILTFAFIILIILSTILLLFGHYLGRIVFEYLGSPEAFIRIWDYLRYEFSVLVLLAIFMVLYKTVPRKKVKLGEIFPGAAVATILWLVLSSAFSFFMNRSFRFATIYGGIAGIILLIIWLYWAMHVILIGAVINVANSDKKRRGSFHKSSG >NZ_CP014673.1|WP_034836513.1|202262_203333_+|peptide-chain-release-factor-1 MFDKLEAIENKYEELNIKIADPAVISDPELYAKLMKEHSELSEIVEKYREYKKYKKNLQDAKEMLEEKPDKELRDMIMAEIEEAEAGIERTTRELKILMMPKDPNDEKNVIIEIRGGAGGEEAALFSADLYRMFTRYAERKNWTYEIIDANETELGGFKEIIFSIEGKGAYSRLKYESGVHRVQRVPTTESSGRIHTSTVTVAVLPEVDDVPEVQINPSDIRVDTFRASGAGGQHVNKTSSAIRITHIPTGIVVTCQDERSQHRNREKAMRVLKAKLYELAQSKINNEIAENRRMQVGTGDRSERIRTYNFPQGRVTDHRIGLTLYKLDQILDGDLDELIDALITEDQARKIASQE >NZ_CP014673.1|WP_015357910.1|198917_202163_+|SNF2-helicase-associated-domain-containing-protein MNYLRLTEREISNFIGDPVIYNRGRIYFHSGLVEDVHFDEVRDCITARVNGNYDNRVKIFLDSNKNIYAQNCTCQYYQRHGKPCKHIAAVLLELNKRAENEQLKYKNSYKAVKAVFKRMEAETGKSLSESAREQIRIYPTLYLFNHMSDSSEIRAYLEFKTGITRPYVVKNVEEFIEAWINRKKLRFGTQLVLDSQRQYYAGRDDEIMEFLKDIYFADREISYINGYGHSGFIKGRQVVLTPSRLERFLDIMVGESIEAFIFSGDMDTVQIVREPVPVVFEIRQMDEWLSVKMNQNTVPVEIVPGSSFYYMNRKIYKVPDTQKKYLSIISEGFREAGTNEFIVPKEYHSRFVSEIVPIMKKTGDVLVTPALKEKIVQEPLRAEVYLDQYRNGVSAGVVFHYGKYRVNSVSDSNSLVPGDIYILRDVEKERLIINFLHEAGFCEDNGQYVLTDKEKIYLFVFELLPRLQQMAEVYYSEDFKKVTVKRELCITGRVSLAGNMLEISFDTGDIDPDELKGILQSLRRKKRFYRLKDGGILPLSRYSELDELLHIADQMDINPKDFVNGKIYLPIYRAFYLENLFNDTRIGIMEKTRDFDEFVRKVCEIRNRVYEIPKSLDGVLRDYQKAGFQWLKALTETGLGGILADDMGLGKTLQVLALILSEKGKSKGPALVIAPTSLVYNWMFEAEKFTPELKVAAIIGTQPQRKQFLDKMNEFDLVITSYPLIRRDIEAYQKYSFSFCIIDEAQHVKNHYTQSAKAIRKISAQTRFALTGTPMENSLMELWSIFDFIMPGYLYTQQKFHERFVKPIVYDGDKKAGEDLSRHIRPFILRRMKKDVLEELPDKIETIVTCEMTRAQQDIYLAVLAQARKEIEATVDEMGFEKSHMQILAALTRLRQICCHPASYIENYEGGSGKLDLLTELLEENLSLGHRVLLFSQFTSVLDIIEKELINRGIGCFYLSGKTSAEERASMVSKFNGGEGDVFLLSLKAGGTGLTLTGADMVIHFDPWWNPAVEDQATDRAYRIGQQKAVHVFKLITRNTIEEKILLLQKKKKELIDMVIKPGETLLNKLTMEEVRQLFEE >NZ_CP014673.1|WP_015357909.1|197919_198675_+|sulfite-exporter-TauE/SafE-family-protein MDATFFLFLIAGFIAQVIDGCIGMAYGVSSTSLLLSFGVPPAAASASVHTAEVFTTFVSGISHYKLKNVDKKLFASLVVPGVIGGIVGAYILSNIDTTIIEPVINVYLIVMGVRIIVKAFVKPGDEAAKKLEGVRLYILGVLGGFLDAIGGGGWGPVVTTTLVAGGNTPRYVIGSVNASEFFVTLAQTITFITAVGFGEYGKIILGLAAGGILAAPFAAYLVRKISPKLMMILVGTVVAALNIRNIILMLV >NZ_CP014673.1|WP_157882726.1|197326_197512_-|hypothetical-protein MEGTAIGHVADMYGVPSVVIRSISENADSNAVMDYDEFERTTAINSAMLVLNMLELLSLKI >NZ_CP014673.1|WP_015357906.1|196916_197324_+|Rrf2-family-transcriptional-regulator MRLSRKSEYALLALIDLARHYGNADPPKIVEVAERNDIPKKYLEQIFLQLKGAGYVRSIRGSKGGYELAKSPDQITLAEIIRLIDGPLASVGSASLYFFEHTPIEKNEKLLQVFKEIRDFVADKLENLTISQFVQ >NZ_CP014673.1|WP_034836519.1|195070_196885_+|GTP-binding-protein MENGEPIFNRRDLINKQDMNIVIVGHVDHGKSTVIGRLLADTNSLPEGKLEQVKEICRRNSKPFEYAFLLDALKDEQAQGITIDTARCFFQTEKRNYIIIDAPGHIEFLKNMITGAARAEAALLVIDASEGIQENSRRHGFMLSMLGIKQVCVLVNKMDLVGYGEKPFRRIERQYRRFLKKVDVEPVCFIPISAREGDNVANHSDKMPWYKGMNVLEVLDSFKSEELPEDKPFRMPVQDVYKFTRGGDNRRIIAGTIETGKISVGDEVIFYPSGKRTRIKSIEGFNRPPVTEIGAGWATGFTVTEQIYVKRGELMCKADELKPKVTGRMLVNLFWLGKNPLVKGKDYYLKLGTAKVSMRVEEIRNVIDASSLVSKKKEQVDRNEVAECILSLDRHIAFDLTADIANTSRFVIVDEYEISGGGIVISDLEDQTSWVRDKVLMRNYKWIGSEISAETRALKYGHGAALILITGEKQSPRKELGRALEKQLFDDGKLVYYLGMGSVMYGVDADLMDHELIVPSRQEHIRRLTEVAHIMLDAGMIFIISARELTAEDYNVICTGIPHEKITVIWVGEEKTTDIPVTIHISSIENIDECVRMIRKRINL >NZ_CP014673.1|WP_015357904.1|194130_195012_+|sulfate-adenylyltransferase-subunit-2 MNHLDKLENKSIHILREAYANFKNLCMLWSVGKDSTVLLWLARKAFFGHVPFPLVHIDTHFKIPEMIEYRDRLALEWGLDMIYGENREALEKKLTYPDGNVSRLECCRLLKTEALKNTLNGKWPRYRLNHEKKCYEPDTNTEPFTGVIVGVRADEEGSRSKERYFSPRDKNSDWDIGDQPPEFWGQFKTDFAPGTHLRIHPLLDWTELDIWEYIKRENIPTVSLYYDRGDGKRYRSLGCWPCTFPVESNAKTVDDIIYELKSGKFANIAERSGRAQDKEDGGGLEELRKGGYM >NZ_CP014673.1|WP_034836523.1|193323_194106_+|3'(2'),5'-bisphosphate-nucleotidase-CysQ MNLEDLTGVLEYVKKITKEAGRIILDVYKKDFQVDYKDDLTPVTEADRKSNDFIVSSLKNRYPECAVLAEESENDPERLKNDWCFIVDPLDGTKEFIQKNGEFTVNIALSYKGKPVLGVIGIPVTGELYYAVKGKGAFYEKDGHAEQIHVSTRTDDIRLVMSRSHKSQRLLELVEKNGIKNIRNVGSAIKGCLVAKGEAEVYYRFGVTMEWDTAAMQCIVEEAGGIFRQLDDTEMTYNRENSRNEKGFYAINHPANKLMF >NZ_CP014673.1|WP_157882751.1|207483_208534_-|IS3-family-transposase MHPNQLSRWKAEFISNAGRVFSKETDEVEKVKQAYEKEKDELLKQIGQLSYEVNWLKKNLADSKSREDRMKMIDREEKKLSITKQAELLSINRTSLYYKPVPANDEEYLIKRIIDEIYTAHPDYGYRRMTNILNREYHIRINRKRTRRYMREMGIHGFCPGPNLSKRLHGKYLYPYLLRGLNIDHPNQVWSIDVTYCRMKRGFMYLVAIIDWYSRYIVGFELSNTLDRTFVIEAIQKAIKRHGKPEIMNSDQGSQFTSDDYINLLKNNNIKISMDGKGRALDNQRIERFFRSYKWEKLYLEDCETGHQLRQITREYVEYYNNRRPHQSLDYKTPAEYYFGGCKQLPAVV >NZ_CP014673.1|WP_015358103.1|208600_209827_+|IS256-family-transposase MDKNTYYETVKNMAVEKVLNQYCSDSDPSRPALKKLLEDLLDWFMLSERQIYLLKNENDKGNGFYDRKLGTPMGNLDISVPRTRTGDFRPHILPEPYKRVDESYTDLLMSLVVNGYSESSLLNTLKSLNLPYSDDELNKIKDDLKSELDLFKQRELPESVFALLIDAYHCEIKDGSKVKKAACYIILGVDMEGKKDIFGLYTFFGKENRADWNKVFEDLINRGLKRVLVVVSDDFPGIIETVKAVYPYADHQLCFVHLQRNIRKYMTKADAAEFNKELDKIKFASSFDEAVQKFYDLCSKFKSKYSRYMNILMEKAEHYMAFIKYPESLRKHVYTTNSVESINSLVEKIRIRSGGYFNSVEVLEINIYLQRENLRRTKWKKAVPMINAHIYEIQQIFQLRYFNQTQNS >NZ_CP014673.1|WP_157882727.1|209794_209938_-|transposase MEKRRNFTPEEKAKIVIEVLREEKTLNEIAAEYERELSRILCLIKVT >NZ_CP014673.1|WP_054632796.1|210430_211531_+|M20/M25/M40-family-metallo-hydrolase MKKIEKILIALAVIFLFSACEGRNADNFIGLSEIDDLRQETSTKKEAESNSEACPSNTPIPSHTPNKKSLEALQMKPEETIEKHLQALTKNGPRKWGTENEQLAANYIKERMEEYGYSVQIQVFPAYEYDIAAVNNADYFNLNPYNSEVIGEGRNVIAELHTRQNTDKYLILCAHYDTVSKELGIIDNTSGVLTLLELARQISESDLPYNLRFIFFSSEERFLIGSRYYVSNLSEDDLDKIIACINIDMVGYVNGQEVVIATPYFANDPRDPLAGIGNALTDEWQRIFPQMNTLVQYSASSDHYPFEVKGIPNMMITQKYFDYETVRKKDSDFENLSIDELVNTVNLLKEYIINLNIDNIYYSGTT >NZ_CP014673.1|WP_003512473.1|212463_213684_+|IS256-like-element-ISCth5-family-transposase MATNNRMALLEQLSKYVVEKDKDFLKEALTLLINALMDAEVTSIIGAEKYERNNNRNNYRNGYRLREWDTRVGTLQLSIPKLRHGSYFPSLLEPRKMSEKALLNVVQEAYVHGVSTRKVDELVEALGMKGIDKSEVSRISKQLDEFVEEFKNRRLEGEYPYLWLDATFPKVREGGRVCSMALVIAVGVNQQGEREILGFDVGMSEDGAFWEEFLRRLVARGLKGVRLVISDAHEGLKAAIKKILTGSAWQRCRVHFMRNVLSQVPKHYQGMVSSIIRTIFAQNDQESAREQLRHVVDELKNRFPKAMKILEEAEEEILAYMAFPREHWAQIHSTNPLERLNREIRRRTDVVCIFPNREAVIRLVGAMLMEQNDEWKVGRRYFSLESMSKITSINEFTLTPVALLHK >NZ_CP014673.1|WP_015358154.1|213920_214361_+|ISL3-family-transposase MDEFIKQLDQNLDYICHEIINGRCYITVASNRKEVICPFCGWPSSKTHSTYSRTFQDLPIQGNKVFIIMRNRKMFCNNPDCNHTTFAERFDFISDKAKKTQRLEDEIVRLSLNCSSVAASKTLRENVADVGKSTICNLLKKRNTCC >NZ_CP014673.1|WP_144050590.1|214374_215706_+|ISL3-family-transposase MAVCIDDFAIRKRESYGTIMVDISKRQIIDMINSRDYETVCKWLKTYPNLHVVSRDGSVTYNNAIADAHPGALQISDRFHLLKNLTSYGKEYLKKKLKPQILIQAVSQETSNEGTGTIKQADENRKLTLKEKYERIEQLLAAGKCKTAICQSINMDIRAYDRLMSMTPEERESSFQTKMMTVHEEKVKQKMERVNEVRELKKIGCSNHEISRRTGLNRSTIRRYLDENFNPVHASYGKKKNGKLTPYIKEIDECLEKGIMGSEIEKKIRGMGYDGSSSTVRQYITDWKRCRKLYYDRSREGGRKTETIERKNIFKLLYHPIENVKSISREQFERICNEYPCFEKIHSIIWEFKGLLTGKNVDALDKWMEKAKKLGIPEIDSFICGLERDLDAVRNAIKYEYSNGLVEGSINKLKVIKRVMYGRCSFETLRTKTLRLEKMRLLN >NZ_CP014673.1|WP_065820480.1|215786_216587_-|ATP-binding-protein MFELEHTRNLLYELGLNTASELLDAKLEDAMHKDATYLSFLSELLEAEIQEKKRRSEETRIKLSRLPHRKTLEEFDFGFQPSIDVKQIKELSTLAFVARKENVIFLGPPGVGKTHLAVGLAMQALRSGMTVYYASLAHLISDLKKADLQGKLERRWRVYTRPDILIIDEVGYMQLDRASAELFFRLICTRYENGSIILTSNKYFGDWGELMNDTVIATAILDRLLHHAHIINIRGDSYRLKSRIKGGVKVVPPADIPELDNMARGV >NZ_CP014673.1|WP_065820481.1|216579_217806_-|IS21-family-transposase MIRSGTINMIHEGSQKGKSAYAISKELGISKNTAKKYMNQPKAEHGLKGRTKPSKLDPFKPQINEMIENGIFNCVVIFERLKDMGYTGGITIIKDYVKPFRPARNAPAVRRYETPPGKQAQMDWGIAHYIDEKGVIHKTPVFTMILGNSRCKYVEFTKRCDIYSLLRCMVNAFEYFGGVPEVVLTDRMKTVINGSDAGKPIWNSRFEDFAADMGFVPKVCRVKRPQTKGKVERLVDYVKDNFLPGRRFKDLHDLNSQALEWCRKVDSKVHGTTGEIPLEALNKEPLLPLPDKAIRDKYRWETRNVTRDGFVSYDGAKYGIPWQYSGKEVRVRICGDFFEAYYGEVRIARHKVEYASGKIVWLKGQYQGLAEKGGIALPLPFARKERTEAVEIRPLSVYDALAGVISNV >NZ_CP014673.1|WP_144050590.1|217915_219247_-|ISL3-family-transposase MAVCIDDFAIRKRESYGTIMVDISKRQIIDMINSRDYETVCKWLKTYPNLHVVSRDGSVTYNNAIADAHPGALQISDRFHLLKNLTSYGKEYLKKKLKPQILIQAVSQETSNEGTGTIKQADENRKLTLKEKYERIEQLLAAGKCKTAICQSINMDIRAYDRLMSMTPEERESSFQTKMMTVHEEKVKQKMERVNEVRELKKIGCSNHEISRRTGLNRSTIRRYLDENFNPVHASYGKKKNGKLTPYIKEIDECLEKGIMGSEIEKKIRGMGYDGSSSTVRQYITDWKRCRKLYYDRSREGGRKTETIERKNIFKLLYHPIENVKSISREQFERICNEYPCFEKIHSIIWEFKGLLTGKNVDALDKWMEKAKKLGIPEIDSFICGLERDLDAVRNAIKYEYSNGLVEGSINKLKVIKRVMYGRCSFETLRTKTLRLEKMRLLN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP014673_2 | 368006-368183 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP014673_2
|
2 spacers
spacers of NZ_CP014673_2
>2.1|368025|60|NZ_CP014673|PILER-CR CTAAAATGAGAGTAAAAATAGGAAATTATTAGGAGAAAAGAACAAGGAAAGTGGGTGATT >2.2|368104|63|NZ_CP014673|PILER-CR ATGGAAAGAATTAGGGAAATGGGGTTAAGGCGAGAAGGTGCAAGGGTTTGAGGAGGATGGGGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP014673_2
The CRISPR arrays of NZ_CP014673_2 >merge|NZ_CP014673|2|368006-368183|PILER-CR TGACACGACTTTTTTATCTAAAATGAGAGTAAAAATAGGAAATTATTAGGAGAAAAGAACAAGGAAAGTGGGTGATTTTTGACATGACTTTTTTATATGGAAAGAATTAGGGAAATGGGGTTAAGGCGAGAAGGTGCAAGGGTTTGAGGAGGATGGGGGTTTGACATGAGTTTTTTAT >NZ_CP014673|2|2|368006-368183|PILER-CR TGACACGACTTTTTTATCT AAAATGAGAGTAAAAATAGGAAATTATTAGGAGAAAAGAACAAGGAAAGTGGGTGATTTT TGACATGACTTTTTTATAT GGAAAGAATTAGGGAAATGGGGTTAAGGCGAGAAGGTGCAAGGGTTTGAGGAGGATGGGGGTT TGACATGAGTTTTTTAT
>NZ_CP014673.1|WP_065820512.1|366873_367305_+|EamA-family-transporter MNYLWLIFALLSAITAALVSIFGKIGLKGIDANTATAVRSIIMAAFLVFVVLIQGKLNQIPSIISNRKTIVFIVLSGIAGALSWLFYFMSLNFGKVSQVAPIDKLSVVFAVILSILFLREKVSIISGLGVGLIAIGAILVALG >NZ_CP014673.1|WP_065820511.1|366101_366851_+|hypothetical-protein MKEEIFAIPLWDAFRKDTECPLCAIQMDVEKRYIESVLDGETVMDEEFNNKLKNYTFCEKHFRKLFEYPDKLGLALIVEKLLTYEMKYLEQIKRESKPDCSFRFQIIRKARDKMFRKRNSNERNLSTDKQCYLCKHIEETMSVYTETLINLWEKNKEFRTLYESSKGYCHRHFHSVINQSDKLTDGLAKKQFLNLSVKIQQENMRRLNEELKWFIKKFDYRFASEPWKTSKDSLSRSIIKITGNFTDRV >NZ_CP014673.1|WP_003511744.1|364659_365730_-|IS30-like-element-ISCth3-family-transposase MAVQYKSTTTEHKFKHLSVYERGQIAALLKEGKSQRYIANKLGRSPSTISREIKRGTTMQMRTDLSTYKVYFPETGQAVYEKNRMNCGAKRKLAQVEDFLKFAEDKILREKWSPDAVVGLCRRDPKWQNSTIVCTKTLYNYIDLGLIKVRNIDLNLKLRLKSKIKRIRQNKRVVGKSIDQRPEEVQSRQTFGHWEIDTVTGKKSNDSVILTLTERKTRYELLFLLDAKDSNTVNEALSELKNCYGKDVSNVFRTITADNGSEFSRLSEMLQGLGIEAYFTHPYSSWERGTNERHNGLIRRFIPKGKAIKDFSEETIKRIQQWLNSLPRRILGYKTPEECFNEEIHNLVNKNISAIA >NZ_CP014673.1|WP_065820510.1|363690_364416_+|sulfite-exporter-TauE/SafE-family-protein MNTLYTYFFLFAGSFLAAAISGAAGFGGALLLLPLLSKTIGTTMAVPILTIAQLIGNLLRVFFGFKQIKWKPVYMFIIGAVPMSVLGAFSFVKVPKEIITRGIGFAIIIFVALKYFKVLKFEPSDRTLLIGGAVTGLISVLVGSAGPIGAALFLSLNLSPVSYIASEAVTAVAMHISKTVIYQRYLGIGLYVLGIGLFMGIAMIAGTWAGKKVIDKMPKEKFVKFVGILLTLIGLQMMIWG >NZ_CP014673.1|WP_065820509.1|363294_363675_+|DUF1232-domain-containing-protein MMKRMKEKTSELKKQVFALYLAYKKKETPLIAKVFTVIVVAYALSPIDLIPDFIPVLGYLDDFILIPMGVAIALKLIPAEIMEECRKEAETKLKSDIPEAKVAGVIIIMLWILILGFTIYRILAII >NZ_CP014673.1|WP_065820508.1|362472_362964_+|copper-chaperone-Copz-family-protein MINEKINNCCCCKGKELLNKIENDNTCPVCKTSGIKVKNITVRHLVVDTLTELVTDTDYYICMNEECDIVYYNPESGVKFNKQQVKVPIWFKKDANPKYACYCSKVTEEQVIDAVIKHGAKTVKDIIEITGAMKNSQCIKNNPLGKCCHKIIQEAIDKGLSMK >NZ_CP014673.1|WP_065820507.1|362031_362382_+|DsrE-family-protein MAEYKVIFHIDENNKWNLLLKNVSNLLNATDGEKVYIEILANSEAVKYYDISQDLNTDIETMENLYKKGVKFVACNNALTAHDIKKENIIEFVDVVPTGVLELVKKQNEGYAYIKP >NZ_CP014673.1|WP_003512473.1|360128_361349_+|IS256-like-element-ISCth5-family-transposase MATNNRMALLEQLSKYVVEKDKDFLKEALTLLINALMDAEVTSIIGAEKYERNNNRNNYRNGYRLREWDTRVGTLQLSIPKLRHGSYFPSLLEPRKMSEKALLNVVQEAYVHGVSTRKVDELVEALGMKGIDKSEVSRISKQLDEFVEEFKNRRLEGEYPYLWLDATFPKVREGGRVCSMALVIAVGVNQQGEREILGFDVGMSEDGAFWEEFLRRLVARGLKGVRLVISDAHEGLKAAIKKILTGSAWQRCRVHFMRNVLSQVPKHYQGMVSSIIRTIFAQNDQESAREQLRHVVDELKNRFPKAMKILEEAEEEILAYMAFPREHWAQIHSTNPLERLNREIRRRTDVVCIFPNREAVIRLVGAMLMEQNDEWKVGRRYFSLESMSKITSINEFTLTPVALLHK >NZ_CP014673.1|WP_015358031.1|358298_358898_+|recombination-protein-RecR MSMYAAPVARLIDEFEKLPGIGHKTAQRLAFHILNMPMDKAIAFANAIIDAKKTIHYCSVCGDLTDTDPCRICSNQNRDRSVICVVESPRDVVAMERIREYKGLYHVLHGVISPLDGIGPDDINMKSLIKRVGNGEVKEVILATNPDVEGEATAMYIARLLKPMGIRTTRIAHGLPVGGDLEYADEVTLAKSLEGRREI >NZ_CP014673.1|WP_015358030.1|357936_358287_+|YbaB/EbfC-family-nucleoid-associated-protein MAKRGGFPMGMGGGAMNNIMKQAMKLQKEMEKAREELAEKTVEATSGGGAVKVVATCGKEIKQIEISQDVVDPDDVEMLQDLILAAVNEALRKADEETEAVMSKFTGGLGNIPGLF >NZ_CP014673.1|WP_065820513.1|368736_369225_+|pyridoxamine-5'-phosphate-oxidase-family-protein MFREMRRKKQLLSKEETIEILKSCTSGVLGVIGDDGYPYTVPVSYALKDDKIFIHSAKEGHKIDSIKRNDKVSFCVIEKDEVIQKTFTTHFRSVSIFGRARILTDDSEKRYALESLIEKYSPDYIEEGQQEIERAWDKVCLIEVKIEHMTGKAAIEIINSRK >NZ_CP014673.1|WP_065820514.1|370201_370870_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MEDYNVVKNDFNEISELDDPKWNHNNCYFKQLMKLIPDNANTCLDIGCGKGELSFMLSQKSKRVIAVDFADKMIERAKILHANKNIEYICGNILDMKFENNSLDVIITTATAHHLPYEWLLSFAKDKLKKGGKLIILDLVKAKSLTDYIIWGSAFFPNIVMNFIKNGRLKKDDEHAKEVWERHGRHDTYMTMDEIRSLANKHIPTAKIQRKLFWRYLLVWQK >NZ_CP014673.1|WP_014253531.1|371070_371712_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MKKEIPDKNLFMMCKKLNTCALAELPNGYHVRTCRRNELDIWKKMPFDDEKTAEQYSDYMTKYFNDVYASKEDLFFNKCLFVCDKNDTPIGTCFAWKAYDRITTIHWFKVVKEYEGLGIGRALLSVVMKSIPKDEYPVFLHTQPSSFRAIKLYSDFGFALLTDPVIGYRQNDLEECLPILKTYMFKEDFEKLQFAQAPENFLKAVKSTCINEF >NZ_CP014673.1|WP_065820515.1|371832_372150_+|hypothetical-protein MRRVMIIGSGGSGKSTLARQLGKILNIEVFHLDAIHWKPGWVETPLDEWKAIIDELTKKETWIIDGNYGDCTMETRIQAADTIIFLTFFFSIFSLLWCSNQILLI >NZ_CP014673.1|WP_065820516.1|372410_372671_+|TfoX/Sxy-family-protein MTKLSDMPNIGKELEKQLKKAGVETPGQLIELGSKEAFLRIRTIDSSACINRLYALEGAIRNIRWHYLSQDIKDELKAFYLSLNVK >NZ_CP014673.1|WP_065820517.1|372766_373210_+|hypothetical-protein MLFSSEQVNRGRKIVNTGIIILIFLLLADIAISLVSNGIKGLTGKTFICGIILFNIFLYHKGNRIAFKITMLLLSGVYIFIFALLPSYLVLGLLRVLNVLDSFGGALYLVVPAIIVTAVSILVFKTEFYNDIMAFKNCYDKIYKTRI >NZ_CP014673.1|WP_065820518.1|373363_373975_+|hypothetical-protein MPNIKEKAIRIILFFILGIFSGFLAKYVDTIPSNGAIGSLINIISNISSRIGIWVFIATIIAAWSRTPRAGAIHVFTFFAGMLLAYYIYSMKLFNFFPVYYFVRWGLIALISPMAAYAVWFSRGSGWFAALCAALPIGLLVSEGYNFLYTFSPVSGFYLIAAIILFCILPKNKYQYLKVLIFTILTSVLLSKFDVLSYIIGGL >NZ_CP014673.1|WP_065820519.1|374035_374506_+|hypothetical-protein MMKTVCLQDWVLKIDVEKTKEYYDSITVEEGCDCDYCKNYIKNCKTFSQEVLDFYTMLGIDPQKEGEFMEFETDTDEHLYMGFYHLVGEIIKKPSKKAKKWDDLNIIRVDNMKFTFTDELDLVPEDFPKPVIQLEFEVVLPWLLEEKCSKKDEDIE >NZ_CP014673.1|WP_065820520.1|374524_375139_+|hypothetical-protein MKLLKSITKDEFNGIRKIPVNHEEIEGCFKKYTYGFLDVYDHCLTSEEADKLMNSFEEHNLKYEDRFVEFMQAVYKMNKSQPVVVELNLNELSSVEVLNILFCLDYKDKLLFIDQIRYLNGDSHMFLVEDEEIITLLTKLSTRELIFAIFHFIQVPVCICGNFDLSFPMFFVDSDGLNIYKDMARECRLHIRDIKVMEDKYEME >NZ_CP014673.1|WP_015358103.1|375340_376567_-|IS256-family-transposase MDKNTYYETVKNMAVEKVLNQYCSDSDPSRPALKKLLEDLLDWFMLSERQIYLLKNENDKGNGFYDRKLGTPMGNLDISVPRTRTGDFRPHILPEPYKRVDESYTDLLMSLVVNGYSESSLLNTLKSLNLPYSDDELNKIKDDLKSELDLFKQRELPESVFALLIDAYHCEIKDGSKVKKAACYIILGVDMEGKKDIFGLYTFFGKENRADWNKVFEDLINRGLKRVLVVVSDDFPGIIETVKAVYPYADHQLCFVHLQRNIRKYMTKADAAEFNKELDKIKFASSFDEAVQKFYDLCSKFKSKYSRYMNILMEKAEHYMAFIKYPESLRKHVYTTNSVESINSLVEKIRIRSGGYFNSVEVLEINIYLQRENLRRTKWKKAVPMINAHIYEIQQIFQLRYFNQTQNS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP014673_3 | 791511-792648 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP014673_3
|
17 spacers
spacers of NZ_CP014673_3
>3.1|791541|36|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTGTTCTGTGTCTCATTTTTGAACGCAAAACACAAG >3.2|791607|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGGTAATTATAGGAATAATATTCCCATCTAATAT >3.3|791672|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCGGTACAATGAGCCCTACATTACCATCATCAGGG >3.4|791737|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAGGAAAGATGGTTTTTGTATGGGCTTGCCAATGC >3.5|791802|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTGACTTCAAAGTTTTGATTTGAAAGTCTTTACG >3.6|791867|33|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAATTCATAAATGTAATCAGGGCTTCCGTTTGT >3.7|791930|36|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGAGAAAAATGCTTTTCTATTCCAAGCTTTTCATG >3.8|791996|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAGGAGTCTAGTTTTTCTCCGTCTTTTTCTAAAA >3.9|792061|36|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTGAGGACTTACCTTTTAAGGTAGGTCCTCTAT >3.10|792127|36|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTACATGTTGCTCATACAGTGGAACAGGTACCGTAA >3.11|792193|33|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTAGCGTCAAACATTACATATATCCCTCTAC >3.12|792256|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGAACACCAGGACCACAGCAAAGCGGTGCGTGATG >3.13|792321|36|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCATGATGGAATCACCAACTGTTGTCCAGGGTAAAT >3.14|792387|36|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGTGTTGATAAAGTGGATACAGCGATTGCAATTG >3.15|792453|36|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCATAGACCCCTGCACTATGTTGAAACTTCGGGCGA >3.16|792519|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCTCGACATTGGATATAGGCCCAAATTCACAAGA >3.17|792583|35|NZ_CP014673|CRISPRCasFinder,CRT ATGATCGTTGTGGAAAACGAATACTTCGTTTCCAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP014673_3
The CRISPR arrays of NZ_CP014673_3 >merge|NZ_CP014673|3|791511-792648|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACGTGTTCTGTGTCTCATTTTTGAACGCAAAACACAAGGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACATGGTAATTATAGGAATAATATTCCCATCTAATATGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACGCGGTACAATGAGCCCTACATTACCATCATCAGGGGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACGAGGAAAGATGGTTTTTGTATGGGCTTGCCAATGCGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACTCTGACTTCAAAGTTTTGATTTGAAAGTCTTTACGGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACGAATTCATAAATGTAATCAGGGCTTCCGTTTGTGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACCTGAGAAAAATGCTTTTCTATTCCAAGCTTTTCATGGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACACAGGAGTCTAGTTTTTCTCCGTCTTTTTCTAAAAGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACTTTTTGAGGACTTACCTTTTAAGGTAGGTCCTCTATGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACTTACATGTTGCTCATACAGTGGAACAGGTACCGTAAGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACCTTTAGCGTCAAACATTACATATATCCCTCTACGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACCGAACACCAGGACCACAGCAAAGCGGTGCGTGATGGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACTCATGATGGAATCACCAACTGTTGTCCAGGGTAAATGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACAAAGTGTTGATAAAGTGGATACAGCGATTGCAATTGGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACTCATAGACCCCTGCACTATGTTGAAACTTCGGGCGAGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACCCTCGACATTGGATATAGGCCCAAATTCACAAGAGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACATGATCGTTGTGGAAAACGAATACTTCGTTTCCACGTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACT >NZ_CP014673|3|3|791511-792582|PILER-CR GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC GTGTTCTGTGTCTCATTTTTGAACGCAAAACACAAG GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGGTAATTATAGGAATAATATTCCCATCTAATAT GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC GCGGTACAATGAGCCCTACATTACCATCATCAGGG GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC GAGGAAAGATGGTTTTTGTATGGGCTTGCCAATGC GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TCTGACTTCAAAGTTTTGATTTGAAAGTCTTTACG GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC GAATTCATAAATGTAATCAGGGCTTCCGTTTGT GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC CTGAGAAAAATGCTTTTCTATTCCAAGCTTTTCATG GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC ACAGGAGTCTAGTTTTTCTCCGTCTTTTTCTAAAA GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTTTGAGGACTTACCTTTTAAGGTAGGTCCTCTAT GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TTACATGTTGCTCATACAGTGGAACAGGTACCGTAA GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC CTTTAGCGTCAAACATTACATATATCCCTCTAC GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC CGAACACCAGGACCACAGCAAAGCGGTGCGTGATG GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TCATGATGGAATCACCAACTGTTGTCCAGGGTAAAT GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC AAAGTGTTGATAAAGTGGATACAGCGATTGCAATTG GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TCATAGACCCCTGCACTATGTTGAAACTTCGGGCGA GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC CCTCGACATTGGATATAGGCCCAAATTCACAAGA GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC >NZ_CP014673|3|2|791511-792648|CRISPRCasFinder GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC GTGTTCTGTGTCTCATTTTTGAACGCAAAACACAAG GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGGTAATTATAGGAATAATATTCCCATCTAATAT GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC GCGGTACAATGAGCCCTACATTACCATCATCAGGG GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC GAGGAAAGATGGTTTTTGTATGGGCTTGCCAATGC GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TCTGACTTCAAAGTTTTGATTTGAAAGTCTTTACG GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC GAATTCATAAATGTAATCAGGGCTTCCGTTTGT GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC CTGAGAAAAATGCTTTTCTATTCCAAGCTTTTCATG GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC ACAGGAGTCTAGTTTTTCTCCGTCTTTTTCTAAAA GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTTTGAGGACTTACCTTTTAAGGTAGGTCCTCTAT GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TTACATGTTGCTCATACAGTGGAACAGGTACCGTAA GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC CTTTAGCGTCAAACATTACATATATCCCTCTAC GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC CGAACACCAGGACCACAGCAAAGCGGTGCGTGATG GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TCATGATGGAATCACCAACTGTTGTCCAGGGTAAAT GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC AAAGTGTTGATAAAGTGGATACAGCGATTGCAATTG GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TCATAGACCCCTGCACTATGTTGAAACTTCGGGCGA GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC CCTCGACATTGGATATAGGCCCAAATTCACAAGA GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGATCGTTGTGGAAAACGAATACTTCGTTTCCAC GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACT >NZ_CP014673|3|2|791511-792647|CRT GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC GTGTTCTGTGTCTCATTTTTGAACGCAAAACACAAG GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGGTAATTATAGGAATAATATTCCCATCTAATAT GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC GCGGTACAATGAGCCCTACATTACCATCATCAGGG GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC GAGGAAAGATGGTTTTTGTATGGGCTTGCCAATGC GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TCTGACTTCAAAGTTTTGATTTGAAAGTCTTTACG GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC GAATTCATAAATGTAATCAGGGCTTCCGTTTGT GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC CTGAGAAAAATGCTTTTCTATTCCAAGCTTTTCATG GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC ACAGGAGTCTAGTTTTTCTCCGTCTTTTTCTAAAA GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTTTGAGGACTTACCTTTTAAGGTAGGTCCTCTAT GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TTACATGTTGCTCATACAGTGGAACAGGTACCGTAA GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC CTTTAGCGTCAAACATTACATATATCCCTCTAC GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC CGAACACCAGGACCACAGCAAAGCGGTGCGTGATG GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TCATGATGGAATCACCAACTGTTGTCCAGGGTAAAT GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC AAAGTGTTGATAAAGTGGATACAGCGATTGCAATTG GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC TCATAGACCCCTGCACTATGTTGAAACTTCGGGCGA GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC CCTCGACATTGGATATAGGCCCAAATTCACAAGA GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGATCGTTGTGGAAAACGAATACTTCGTTTCCAC GTTTAAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC
>NZ_CP014673.1|WP_015358441.1|789739_790207_+|SsrA-binding-protein-SmpB MDKDSIRIVAQNKKAKHDYFIEETFEAGIVLSGTEVKSVRQGKVNLKDSYAYIKNSEVFVRGMHISPYEQGNIFNQDPLRDRKLLLHKREINKLIGYTQQKGLTLIPTKLYFKNNWAKVELAVARGKKLYDKRRAMAERDAKRAIDKKMKEYNRQ >NZ_CP014673.1|WP_015358440.1|787902_789081_+|ROK-family-transcriptional-regulator MVKEFKSPLGKLSKNCKQIYQYIYRYGAVTRSEIERHTGFPMSTLVRAMNSLESNGLIYASETGESELGRKPRIYRICPDAGYIIAVDITRTYTQVALLDLELNILNSRTFGMYSSNTPDETIGRIIEIINEFISPLDKGKILGIGLGVVGPVDKENGVILNPEHFSASGWKNVSIKKILQEKTGFPVYIDDGANAAVLAEFRKGCGRHHHNIAYLIAGVGLRLGIIVNGKLLERQTYFGHTVIDKNGKDCICGKKGCLEEYFSLNVLLEEFIDEIKKGKSSIILEKVDYDLSSISFDHFCEAAKSGDVLANDILRKAAGNLAVGLGNLICILNPEIIVLGGTVFRKCPQLKTYVESEVSKHCPSTVFSNGELGENAVIIGAGSLVLEDYIE >NZ_CP014673.1|WP_015358439.1|787124_787718_+|chromate-transporter MIYIKLFLVFMKIGLFSFGGGYAMIPMIQKETESNGWMSPSDFVDIISISEITPGPISVNSATYIGYKVAGIPGSFSSTVGVSLPSLILIMIVSRFFFKYYEKPVNTMIFYGIRPVIAGLIWSAGISVAKTSIFKSDLVTEVFNYSFSIATSVIDFRSVGILVVVLLILVKYKVHPVLTILGAGMAGIIVYIFIPSL >NZ_CP014673.1|WP_034843310.1|786541_787138_+|chromate-transporter MRKKLKKLKEIFFTFFKIGLFTFGGGYAMIPLIERETAEKKKWVKQEEITDIIAVSQSVPGAVAINLSTFIGYRIMGKIGAITAAAGVILPSFLVILAIAMFFSRFGNNPFVKAFFAGVRPAVVALIIIAAINVGKSAIRDKIGTAVTIITVILVSFFKIHPIIAISTGGIFGFAVYKLWPSKVKEITDKKDGGNDLY >NZ_CP014673.1|WP_015358435.1|785547_786129_-|hypothetical-protein MDNKFNSFLKHRQSLLLQYKMGDLTKNEFIEANYATIERLGIEPFKRVDNVKKAIYNYHYFNVLAKFYYSMARDFPDGSKEKASLIAQSNSYYREKDKVTMTLLKLLDFRNVEAYFVKVKSKKLQNKLFEIVIKDPDVLFEINALSTPYGGMESDYIILHSTNPFILKRLKEEGVFADEKRKSLADNYINQKY >NZ_CP014673.1|WP_065820600.1|784973_785279_-|hypothetical-protein MDYREALEATRRSGSRVRGRDEQEERTLARNVCPQKEGTILRIIIPAGAEINLLNLLEISSPGGICIIVRLPFLKRFFSGKDIAELFEEIKRAGGRIEFVD >NZ_CP014673.1|WP_015358154.1|781068_781509_-|ISL3-family-transposase MDEFIKQLDQNLDYICHEIINGRCYITVASNRKEVICPFCGWPSSKTHSTYSRTFQDLPIQGNKVFIIMRNRKMFCNNPDCNHTTFAERFDFISDKAKKTQRLEDEIVRLSLNCSSVAASKTLRENVADVGKSTICNLLKKRNTCC >NZ_CP014673.1|WP_144050590.1|779723_781055_-|ISL3-family-transposase MAVCIDDFAIRKRESYGTIMVDISKRQIIDMINSRDYETVCKWLKTYPNLHVVSRDGSVTYNNAIADAHPGALQISDRFHLLKNLTSYGKEYLKKKLKPQILIQAVSQETSNEGTGTIKQADENRKLTLKEKYERIEQLLAAGKCKTAICQSINMDIRAYDRLMSMTPEERESSFQTKMMTVHEEKVKQKMERVNEVRELKKIGCSNHEISRRTGLNRSTIRRYLDENFNPVHASYGKKKNGKLTPYIKEIDECLEKGIMGSEIEKKIRGMGYDGSSSTVRQYITDWKRCRKLYYDRSREGGRKTETIERKNIFKLLYHPIENVKSISREQFERICNEYPCFEKIHSIIWEFKGLLTGKNVDALDKWMEKAKKLGIPEIDSFICGLERDLDAVRNAIKYEYSNGLVEGSINKLKVIKRVMYGRCSFETLRTKTLRLEKMRLLN >NZ_CP014673.1|WP_065820481.1|778387_779614_-|IS21-family-transposase MIRSGTINMIHEGSQKGKSAYAISKELGISKNTAKKYMNQPKAEHGLKGRTKPSKLDPFKPQINEMIENGIFNCVVIFERLKDMGYTGGITIIKDYVKPFRPARNAPAVRRYETPPGKQAQMDWGIAHYIDEKGVIHKTPVFTMILGNSRCKYVEFTKRCDIYSLLRCMVNAFEYFGGVPEVVLTDRMKTVINGSDAGKPIWNSRFEDFAADMGFVPKVCRVKRPQTKGKVERLVDYVKDNFLPGRRFKDLHDLNSQALEWCRKVDSKVHGTTGEIPLEALNKEPLLPLPDKAIRDKYRWETRNVTRDGFVSYDGAKYGIPWQYSGKEVRVRICGDFFEAYYGEVRIARHKVEYASGKIVWLKGQYQGLAEKGGIALPLPFARKERTEAVEIRPLSVYDALAGVISNV >NZ_CP014673.1|WP_065820480.1|777594_778395_-|ATP-binding-protein MFELEHTRNLLYELGLNTASELLDAKLEDAMHKDATYLSFLSELLEAEIQEKKRRSEETRIKLSRLPHRKTLEEFDFGFQPSIDVKQIKELSTLAFVARKENVIFLGPPGVGKTHLAVGLAMQALRSGMTVYYASLAHLISDLKKADLQGKLERRWRVYTRPDILIIDEVGYMQLDRASAELFFRLICTRYENGSIILTSNKYFGDWGELMNDTVIATAILDRLLHHAHIINIRGDSYRLKSRIKGGVKVVPPADIPELDNMARGV >NZ_CP014673.1|WP_015358444.1|793441_793774_+|hypothetical-protein MDLLRDYDNYMIRQILKENDEKMANEIREKENILSELKKKYYNIVLDKEFEEFLKEFDKDAAQTENTQESENLDELGRRIEELEKEIEVLKIRYRGYQLFKKKIEGQFYK >NZ_CP014673.1|WP_065820601.1|794292_794523_+|hypothetical-protein MPGAEMAQYGIGFFAIAGLIYVITKFLDKRKDMELTEVIENNTKAVEKVISVLQAIQLSLTRQEVQIDELLDRARR >NZ_CP014673.1|WP_015358450.1|796262_796784_+|peptide-methionine-(S)-S-oxide-reductase-MsrA MASEIYLAGGCFWGMEKYLSLIKGVEATQVGYANGKTLFPTYEEVCHNNTGHAETVKVVYNPEVISLKELLKLYFEAIDPTSLNRQGADVGTQYRTGIYYINERDLPVIREAIVELQKKYDKPVVIEVEPLRNYSPAEEYHQKYLDKNPGGYCHISPELFKKAANAVPSGLKE >NZ_CP014673.1|WP_015358451.1|796919_798167_+|endo-1,4-beta-xylanase MENKTGGPYRHRMGEKKITLLTKDRKPLANTEVTVKQTKHRFLFGCGAFESVPLANGELEGEKKELAEEIFNKFFKIFNYCTLPFYWARFEPVPGKPDTQSLKKAAEWLVSKGCTLKGHPLCWHTLTAPWLLDYTNAEILQMQLNRIRRDVANFAGVIDIWDVINEVVIMPVFNKYDNGITRICRELGRIRLVREVFRAAKKANPDAVLLINDFETSESYEILIEGCLEAGIPIDAIGIQSHMHQGYWGVEKTLEILERFSRFKLPIHFTENTLVSGHLMPPEIVDLNDYVVDSWPTTPEGEERQAREIVLHYKTLFTHPAVESITYWNFVDGGWLGAPAGLLRKDGTTKPSYEELSRLINEEWWTHEKTYVTDENGSLIVSGFLGEYEIYAKDALIGGFQLSRDDSEEKIILNS >NZ_CP014673.1|WP_015358452.1|798177_798723_+|hypothetical-protein MRTEKKYRDLFRVETVESGKGTKKRIIYTGDYYKSDIPQEQAKKYKMCLILISAIMAVLFFYMGLLNNDGSRVFYVVLPYVLQFLPIAYTVMSSVSLYPKDILTVVQYEKSYVRIKASGTWILILSIAGSIGDIIYIFGKYGNKIELELTFLICNFAMAILAIIILRIHNRIKFKIITRDG >NZ_CP014673.1|WP_065820602.1|798869_801251_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKNKKLVAIIAAAVVVVAVVLIAIFVPRSNETGKNDLVDATPTQAPATSTDTTTGQSEKPLVVGYQPFSQKFSPFFAQTGYDQDVVSLTHVQLLTTDRSGGIVYNAIEGETRTYNGNEHFYNGIADIKVTYDEKEDITTYYIKIRDDVKFSDGHVMDADDIIFTYYVLADPTYTGYTTLYSYDIIGMKNYRLNNSMAEQIDVTADEVKAELANPSAETTEAIKQFVADTLTSELEWVKSLYGNPSYAEYTEKYPNAKDLFAYFYSIDENYDSSAVADESQVLADIIAQYGDDWKALGNNYGGSETYFQADIESKVKDVLLNKKLAVSGGTEVDYIEGIKKLSQTEVEVKCRGFEAPAVYTICGIWVAPLHYYGDESMYDYENHKFGFPKGDLSIIESKTTQPMGAGPYKFIKYENKVVYLEANENYYKGAPKIKYLQLKETTDGEMINGVATGVIDLANPSGSVAKMNEIKKINSNGQLTGDVITSSLVDNLGYGYIGINADNVNVGGDPGSEASKNLRKAFATLFAVYRDVAIDSYYADAATVINYPISSTSWAAPQKTDEGYEVAYSKDVNGNPIYTADMVAEDKYEAALQAAIGYFKAAGYTFDESTGKFVAAPEGAKMKYEVMIPADGVGDHPAFSILKDTQAALEKIGITLEINDLTDANELWDSINANTHEMWAAAWGATIDPDMYQVYHSSNRIGRGGTDSNSYNINDPELDQIIMEARRSPDQAYRKALYKRALDIILDWGVAIPTYQRQNLVIFSTQRINTDTITPDISTYYEWFREIEKMEMR >NZ_CP014673.1|WP_065820603.1|801399_802386_+|ABC-transporter-permease MGKYIVKRLLLCLLLLFFTSLIIYTIMRCLPSSYVENMARELATRPGAKSYSEWLAQLNAKYGLDVGILKGYLFWLKNAIRGDFGDSWQFTVPVTKKFSEVIWDSFALGSISFILEILIAIPLGILAARKQYSRIDYAVTVFALLGISLPTFFFATVLKLIFSVKLGWFDLYGKVGRYHEQLDAFGKFLDIASHYVLPVVTLTIVNIGSLMRYTRTNMLEVLNSDYIRTARAKGLPESKVINKHAFRNTLIPLVTILGGSLPGLFAGAMVTETLFQIPGIGYTSYLAIRSGDIPFTMFYMTFMALLTLLGALISDILYAVVDPRVRIS >NZ_CP014673.1|WP_065820604.1|802413_804207_+|ABC-transporter-permease MGNNYIERNDNPIKPVDNADKFLGEHLSTSSRLDDEQRVKVLSPGMLVFKRFVRNKLAIAGFFIIVFMFLFSFVGGLLSPYNETQVFTHVGMMQKEYASVTHNNQLRYTVAEGKQYNDSVHAQFILAKNRGDSFFTFNDTEYFIVQEAEDFYRIMQVMPVAEITNFKGIFAVHPKDGFAVSEDLKAAILAAIDSGESKFEFEGDLYTVKSQNRGYVLGKAENAALESMLIIDPAEKDFDIGFDFKYAAEKVIRSTDSGTFSVHGENFKIDEYNEMSVVYLLKPSGEKVPYAIVSELAVQPSSPEIFLTIDFKAAIQKAVLNGETSFVFEDESGSKEYTITKLNNVYTIKTESPTHLISMYEPPSEKHWLGTDGHGMDVLTRLMYGGRVSLLIGFIVVFLETLIGIILGGIAGYFGKWVDMLIMRIVDVFNCIPFLPLVMIVGAVMDAQDVEPQVRIYYLMLILGIMSWPGIARMVRGQILSLREQEFMIATEAVGLRTSKRIFKHLVPNVIPQIIVLATLGLGNIILYESTLSYFGLGVKFPYASWGNIISAVSTAYEMTNYWFVWVPAGLLILLTVLGFNFVGDGLRDAFDPKMKR >NZ_CP014673.1|WP_015358456.1|804216_805419_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MENKNNGNRKPGIITGIALKRKIKKANYISAKEARRIAKENKKIMMEYEKRYNRKNVPEEEFRTVMRDPNNVVEIDNLHTYFFTDIGVVKAVNGVSFDIPKGKTVGVVGESGCGKSVTSLAIMQLLQRPLGQIVSGEIRFDAGDFVYDIAKTPAERMQKIRGNKIAMIFQEPMTSLNPVFRIGDQLNEAIALHNPHFSKEEVKARTIRMLEMVGIANSHGVYRMFPHELSGGMRQRVMIAMALSCEPRLIIADEPTTALDVTIQAQILDLLRNLKEKINSSIMLITHDLGVIAEMADYVVVMYAGKVVEKGTAKDIFHNPAHPYTIGLMKSKPVVNRRVDRLYSIPGNVPNPVNMPNYCYFRDRCDRCIKACDGEYPPEIHLNDTHVVSCYLYSQKEAQK >NZ_CP014673.1|WP_015358457.1|805415_806450_+|dipeptide-ABC-transporter-ATP-binding-protein MTKTLEDIQANVNKNADNEDYILVVKNLKKYYPIKKGLFSRTSGYVKAIDGVSFKIKRGTTMGLVGESGCGKTTVGKTILRLTDKTDGEVYFDGIPIFELDRKQLRKLRPRIQLIFQDPYSSLSPRLPVGEIIGEAVKDNNIVPKEEYEDYITKIMLDCGLQPYHKDRYPHEFSGGQRQRICIARAIALKPEFIVCDEPVSALDVSIQAQIINLLKDLQEKYKLTYLFISHDLSVVEHISDTVGVMYLGNLVEFADKETIFKNPLHPYTRALFSAIPIPDPDVKMKRIILEGSLPSPANPPSGCKFHTRCYECMEICKKVPPREIEVEKGHTVVCHLYDKEVVK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP014673_4 | 792792-792951 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP014673_4
|
2 spacers
spacers of NZ_CP014673_4
>4.1|792822|35|NZ_CP014673|CRISPRCasFinder TATAGCTCTTTTAACTTTTTGACGCCCTTATTATC >4.2|792887|35|NZ_CP014673|CRISPRCasFinder GAATATGTATAGCCCTTGTTGTTACCACACTCTTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP014673_4
The CRISPR arrays of NZ_CP014673_4 >merge|NZ_CP014673|4|792792-792951|CRISPRCasFinder ATTTGGAGTATACCTATGAGGAATTGAAACTATAGCTCTTTTAACTTTTTGACGCCCTTATTATCATTTTAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAACGAATATGTATAGCCCTTGTTGTTACCACACTCTTCGATTAAAGCCTTCCTGTGAGGAATTAAAAC >NZ_CP014673|4|3|792792-792951|CRISPRCasFinder ATTTGGAGTATACCTATGAGGAATTGAAAC TATAGCTCTTTTAACTTTTTGACGCCCTTATTATC ATTTTAAGTTTACCTATAAGGAATTGAAAC GAATATGTATAGCCCTTGTTGTTACCACACTCTTC GATTAAAGCCTTCCTGTGAGGAATTAAAAC
>NZ_CP014673.1|WP_015358441.1|789739_790207_+|SsrA-binding-protein-SmpB MDKDSIRIVAQNKKAKHDYFIEETFEAGIVLSGTEVKSVRQGKVNLKDSYAYIKNSEVFVRGMHISPYEQGNIFNQDPLRDRKLLLHKREINKLIGYTQQKGLTLIPTKLYFKNNWAKVELAVARGKKLYDKRRAMAERDAKRAIDKKMKEYNRQ >NZ_CP014673.1|WP_015358440.1|787902_789081_+|ROK-family-transcriptional-regulator MVKEFKSPLGKLSKNCKQIYQYIYRYGAVTRSEIERHTGFPMSTLVRAMNSLESNGLIYASETGESELGRKPRIYRICPDAGYIIAVDITRTYTQVALLDLELNILNSRTFGMYSSNTPDETIGRIIEIINEFISPLDKGKILGIGLGVVGPVDKENGVILNPEHFSASGWKNVSIKKILQEKTGFPVYIDDGANAAVLAEFRKGCGRHHHNIAYLIAGVGLRLGIIVNGKLLERQTYFGHTVIDKNGKDCICGKKGCLEEYFSLNVLLEEFIDEIKKGKSSIILEKVDYDLSSISFDHFCEAAKSGDVLANDILRKAAGNLAVGLGNLICILNPEIIVLGGTVFRKCPQLKTYVESEVSKHCPSTVFSNGELGENAVIIGAGSLVLEDYIE >NZ_CP014673.1|WP_015358439.1|787124_787718_+|chromate-transporter MIYIKLFLVFMKIGLFSFGGGYAMIPMIQKETESNGWMSPSDFVDIISISEITPGPISVNSATYIGYKVAGIPGSFSSTVGVSLPSLILIMIVSRFFFKYYEKPVNTMIFYGIRPVIAGLIWSAGISVAKTSIFKSDLVTEVFNYSFSIATSVIDFRSVGILVVVLLILVKYKVHPVLTILGAGMAGIIVYIFIPSL >NZ_CP014673.1|WP_034843310.1|786541_787138_+|chromate-transporter MRKKLKKLKEIFFTFFKIGLFTFGGGYAMIPLIERETAEKKKWVKQEEITDIIAVSQSVPGAVAINLSTFIGYRIMGKIGAITAAAGVILPSFLVILAIAMFFSRFGNNPFVKAFFAGVRPAVVALIIIAAINVGKSAIRDKIGTAVTIITVILVSFFKIHPIIAISTGGIFGFAVYKLWPSKVKEITDKKDGGNDLY >NZ_CP014673.1|WP_015358435.1|785547_786129_-|hypothetical-protein MDNKFNSFLKHRQSLLLQYKMGDLTKNEFIEANYATIERLGIEPFKRVDNVKKAIYNYHYFNVLAKFYYSMARDFPDGSKEKASLIAQSNSYYREKDKVTMTLLKLLDFRNVEAYFVKVKSKKLQNKLFEIVIKDPDVLFEINALSTPYGGMESDYIILHSTNPFILKRLKEEGVFADEKRKSLADNYINQKY >NZ_CP014673.1|WP_065820600.1|784973_785279_-|hypothetical-protein MDYREALEATRRSGSRVRGRDEQEERTLARNVCPQKEGTILRIIIPAGAEINLLNLLEISSPGGICIIVRLPFLKRFFSGKDIAELFEEIKRAGGRIEFVD >NZ_CP014673.1|WP_015358154.1|781068_781509_-|ISL3-family-transposase MDEFIKQLDQNLDYICHEIINGRCYITVASNRKEVICPFCGWPSSKTHSTYSRTFQDLPIQGNKVFIIMRNRKMFCNNPDCNHTTFAERFDFISDKAKKTQRLEDEIVRLSLNCSSVAASKTLRENVADVGKSTICNLLKKRNTCC >NZ_CP014673.1|WP_144050590.1|779723_781055_-|ISL3-family-transposase MAVCIDDFAIRKRESYGTIMVDISKRQIIDMINSRDYETVCKWLKTYPNLHVVSRDGSVTYNNAIADAHPGALQISDRFHLLKNLTSYGKEYLKKKLKPQILIQAVSQETSNEGTGTIKQADENRKLTLKEKYERIEQLLAAGKCKTAICQSINMDIRAYDRLMSMTPEERESSFQTKMMTVHEEKVKQKMERVNEVRELKKIGCSNHEISRRTGLNRSTIRRYLDENFNPVHASYGKKKNGKLTPYIKEIDECLEKGIMGSEIEKKIRGMGYDGSSSTVRQYITDWKRCRKLYYDRSREGGRKTETIERKNIFKLLYHPIENVKSISREQFERICNEYPCFEKIHSIIWEFKGLLTGKNVDALDKWMEKAKKLGIPEIDSFICGLERDLDAVRNAIKYEYSNGLVEGSINKLKVIKRVMYGRCSFETLRTKTLRLEKMRLLN >NZ_CP014673.1|WP_065820481.1|778387_779614_-|IS21-family-transposase MIRSGTINMIHEGSQKGKSAYAISKELGISKNTAKKYMNQPKAEHGLKGRTKPSKLDPFKPQINEMIENGIFNCVVIFERLKDMGYTGGITIIKDYVKPFRPARNAPAVRRYETPPGKQAQMDWGIAHYIDEKGVIHKTPVFTMILGNSRCKYVEFTKRCDIYSLLRCMVNAFEYFGGVPEVVLTDRMKTVINGSDAGKPIWNSRFEDFAADMGFVPKVCRVKRPQTKGKVERLVDYVKDNFLPGRRFKDLHDLNSQALEWCRKVDSKVHGTTGEIPLEALNKEPLLPLPDKAIRDKYRWETRNVTRDGFVSYDGAKYGIPWQYSGKEVRVRICGDFFEAYYGEVRIARHKVEYASGKIVWLKGQYQGLAEKGGIALPLPFARKERTEAVEIRPLSVYDALAGVISNV >NZ_CP014673.1|WP_065820480.1|777594_778395_-|ATP-binding-protein MFELEHTRNLLYELGLNTASELLDAKLEDAMHKDATYLSFLSELLEAEIQEKKRRSEETRIKLSRLPHRKTLEEFDFGFQPSIDVKQIKELSTLAFVARKENVIFLGPPGVGKTHLAVGLAMQALRSGMTVYYASLAHLISDLKKADLQGKLERRWRVYTRPDILIIDEVGYMQLDRASAELFFRLICTRYENGSIILTSNKYFGDWGELMNDTVIATAILDRLLHHAHIINIRGDSYRLKSRIKGGVKVVPPADIPELDNMARGV >NZ_CP014673.1|WP_015358444.1|793441_793774_+|hypothetical-protein MDLLRDYDNYMIRQILKENDEKMANEIREKENILSELKKKYYNIVLDKEFEEFLKEFDKDAAQTENTQESENLDELGRRIEELEKEIEVLKIRYRGYQLFKKKIEGQFYK >NZ_CP014673.1|WP_065820601.1|794292_794523_+|hypothetical-protein MPGAEMAQYGIGFFAIAGLIYVITKFLDKRKDMELTEVIENNTKAVEKVISVLQAIQLSLTRQEVQIDELLDRARR >NZ_CP014673.1|WP_015358450.1|796262_796784_+|peptide-methionine-(S)-S-oxide-reductase-MsrA MASEIYLAGGCFWGMEKYLSLIKGVEATQVGYANGKTLFPTYEEVCHNNTGHAETVKVVYNPEVISLKELLKLYFEAIDPTSLNRQGADVGTQYRTGIYYINERDLPVIREAIVELQKKYDKPVVIEVEPLRNYSPAEEYHQKYLDKNPGGYCHISPELFKKAANAVPSGLKE >NZ_CP014673.1|WP_015358451.1|796919_798167_+|endo-1,4-beta-xylanase MENKTGGPYRHRMGEKKITLLTKDRKPLANTEVTVKQTKHRFLFGCGAFESVPLANGELEGEKKELAEEIFNKFFKIFNYCTLPFYWARFEPVPGKPDTQSLKKAAEWLVSKGCTLKGHPLCWHTLTAPWLLDYTNAEILQMQLNRIRRDVANFAGVIDIWDVINEVVIMPVFNKYDNGITRICRELGRIRLVREVFRAAKKANPDAVLLINDFETSESYEILIEGCLEAGIPIDAIGIQSHMHQGYWGVEKTLEILERFSRFKLPIHFTENTLVSGHLMPPEIVDLNDYVVDSWPTTPEGEERQAREIVLHYKTLFTHPAVESITYWNFVDGGWLGAPAGLLRKDGTTKPSYEELSRLINEEWWTHEKTYVTDENGSLIVSGFLGEYEIYAKDALIGGFQLSRDDSEEKIILNS >NZ_CP014673.1|WP_015358452.1|798177_798723_+|hypothetical-protein MRTEKKYRDLFRVETVESGKGTKKRIIYTGDYYKSDIPQEQAKKYKMCLILISAIMAVLFFYMGLLNNDGSRVFYVVLPYVLQFLPIAYTVMSSVSLYPKDILTVVQYEKSYVRIKASGTWILILSIAGSIGDIIYIFGKYGNKIELELTFLICNFAMAILAIIILRIHNRIKFKIITRDG >NZ_CP014673.1|WP_065820602.1|798869_801251_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKNKKLVAIIAAAVVVVAVVLIAIFVPRSNETGKNDLVDATPTQAPATSTDTTTGQSEKPLVVGYQPFSQKFSPFFAQTGYDQDVVSLTHVQLLTTDRSGGIVYNAIEGETRTYNGNEHFYNGIADIKVTYDEKEDITTYYIKIRDDVKFSDGHVMDADDIIFTYYVLADPTYTGYTTLYSYDIIGMKNYRLNNSMAEQIDVTADEVKAELANPSAETTEAIKQFVADTLTSELEWVKSLYGNPSYAEYTEKYPNAKDLFAYFYSIDENYDSSAVADESQVLADIIAQYGDDWKALGNNYGGSETYFQADIESKVKDVLLNKKLAVSGGTEVDYIEGIKKLSQTEVEVKCRGFEAPAVYTICGIWVAPLHYYGDESMYDYENHKFGFPKGDLSIIESKTTQPMGAGPYKFIKYENKVVYLEANENYYKGAPKIKYLQLKETTDGEMINGVATGVIDLANPSGSVAKMNEIKKINSNGQLTGDVITSSLVDNLGYGYIGINADNVNVGGDPGSEASKNLRKAFATLFAVYRDVAIDSYYADAATVINYPISSTSWAAPQKTDEGYEVAYSKDVNGNPIYTADMVAEDKYEAALQAAIGYFKAAGYTFDESTGKFVAAPEGAKMKYEVMIPADGVGDHPAFSILKDTQAALEKIGITLEINDLTDANELWDSINANTHEMWAAAWGATIDPDMYQVYHSSNRIGRGGTDSNSYNINDPELDQIIMEARRSPDQAYRKALYKRALDIILDWGVAIPTYQRQNLVIFSTQRINTDTITPDISTYYEWFREIEKMEMR >NZ_CP014673.1|WP_065820603.1|801399_802386_+|ABC-transporter-permease MGKYIVKRLLLCLLLLFFTSLIIYTIMRCLPSSYVENMARELATRPGAKSYSEWLAQLNAKYGLDVGILKGYLFWLKNAIRGDFGDSWQFTVPVTKKFSEVIWDSFALGSISFILEILIAIPLGILAARKQYSRIDYAVTVFALLGISLPTFFFATVLKLIFSVKLGWFDLYGKVGRYHEQLDAFGKFLDIASHYVLPVVTLTIVNIGSLMRYTRTNMLEVLNSDYIRTARAKGLPESKVINKHAFRNTLIPLVTILGGSLPGLFAGAMVTETLFQIPGIGYTSYLAIRSGDIPFTMFYMTFMALLTLLGALISDILYAVVDPRVRIS >NZ_CP014673.1|WP_065820604.1|802413_804207_+|ABC-transporter-permease MGNNYIERNDNPIKPVDNADKFLGEHLSTSSRLDDEQRVKVLSPGMLVFKRFVRNKLAIAGFFIIVFMFLFSFVGGLLSPYNETQVFTHVGMMQKEYASVTHNNQLRYTVAEGKQYNDSVHAQFILAKNRGDSFFTFNDTEYFIVQEAEDFYRIMQVMPVAEITNFKGIFAVHPKDGFAVSEDLKAAILAAIDSGESKFEFEGDLYTVKSQNRGYVLGKAENAALESMLIIDPAEKDFDIGFDFKYAAEKVIRSTDSGTFSVHGENFKIDEYNEMSVVYLLKPSGEKVPYAIVSELAVQPSSPEIFLTIDFKAAIQKAVLNGETSFVFEDESGSKEYTITKLNNVYTIKTESPTHLISMYEPPSEKHWLGTDGHGMDVLTRLMYGGRVSLLIGFIVVFLETLIGIILGGIAGYFGKWVDMLIMRIVDVFNCIPFLPLVMIVGAVMDAQDVEPQVRIYYLMLILGIMSWPGIARMVRGQILSLREQEFMIATEAVGLRTSKRIFKHLVPNVIPQIIVLATLGLGNIILYESTLSYFGLGVKFPYASWGNIISAVSTAYEMTNYWFVWVPAGLLILLTVLGFNFVGDGLRDAFDPKMKR >NZ_CP014673.1|WP_015358456.1|804216_805419_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MENKNNGNRKPGIITGIALKRKIKKANYISAKEARRIAKENKKIMMEYEKRYNRKNVPEEEFRTVMRDPNNVVEIDNLHTYFFTDIGVVKAVNGVSFDIPKGKTVGVVGESGCGKSVTSLAIMQLLQRPLGQIVSGEIRFDAGDFVYDIAKTPAERMQKIRGNKIAMIFQEPMTSLNPVFRIGDQLNEAIALHNPHFSKEEVKARTIRMLEMVGIANSHGVYRMFPHELSGGMRQRVMIAMALSCEPRLIIADEPTTALDVTIQAQILDLLRNLKEKINSSIMLITHDLGVIAEMADYVVVMYAGKVVEKGTAKDIFHNPAHPYTIGLMKSKPVVNRRVDRLYSIPGNVPNPVNMPNYCYFRDRCDRCIKACDGEYPPEIHLNDTHVVSCYLYSQKEAQK >NZ_CP014673.1|WP_015358457.1|805415_806450_+|dipeptide-ABC-transporter-ATP-binding-protein MTKTLEDIQANVNKNADNEDYILVVKNLKKYYPIKKGLFSRTSGYVKAIDGVSFKIKRGTTMGLVGESGCGKTTVGKTILRLTDKTDGEVYFDGIPIFELDRKQLRKLRPRIQLIFQDPYSSLSPRLPVGEIIGEAVKDNNIVPKEEYEDYITKIMLDCGLQPYHKDRYPHEFSGGQRQRICIARAIALKPEFIVCDEPVSALDVSIQAQIINLLKDLQEKYKLTYLFISHDLSVVEHISDTVGVMYLGNLVEFADKETIFKNPLHPYTRALFSAIPIPDPDVKMKRIILEGSLPSPANPPSGCKFHTRCYECMEICKKVPPREIEVEKGHTVVCHLYDKEVVK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP014673_5 | 1524786-1524947 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of NZ_CP014673_5
|
2 spacers
spacers of NZ_CP014673_5
>5.1|1524816|36|NZ_CP014673|CRISPRCasFinder CCAACCATTACGAAATGCCATACAGCTGACTACAAC >5.2|1524882|36|NZ_CP014673|CRISPRCasFinder AAAACACCCGGTGGTATTGGGCTGTAAGATTTATGT >5.3|1524817|36|NZ_CP014673|PILER-CR CCAACCATTACGAAATGCCATACAGCTGACTACAAC >5.4|1524883|36|NZ_CP014673|PILER-CR AAAACACCCGGTGGTATTGGGCTGTAAGATTTATGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP014673_5
The CRISPR arrays of NZ_CP014673_5 >merge|NZ_CP014673|5|1524786-1524947|CRISPRCasFinder,PILER-CR GTTTACACTCCATTATGGTTAGATTAAAATCCAACCATTACGAAATGCCATACAGCTGACTACAACATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAGAAAACACCCGGTGGTATTGGGCTGTAAGATTTATGTATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAG >NZ_CP014673|5|4|1524786-1524947|CRISPRCasFinder GTTTACACTCCATTATGGTTAGATTAAAAT CCAACCATTACGAAATGCCATACAGCTGACTACAAC ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAG AAAACACCCGGTGGTATTGGGCTGTAAGATTTATGT ATTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAG >NZ_CP014673|5|4|1524787-1524947|PILER-CR TTTACACTCCATTATGGTTAGATTAAAATC CAACCATTACGAAATGCCATACAGCTGACTACAACA TTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAGA AAACACCCGGTGGTATTGGGCTGTAAGATTTATGTA TTTACATTCCATTATGGTTAGATTAAAAG
>NZ_CP014673.1|WP_015359064.1|1523808_1524570_-|polysaccharide-deacetylase-family-protein MIVIRRRTIAIFFVSLVLCLMMFLTVNGKIIEVSAPVREIPIYSVENSEGKVSITFDCAWGAQDIPEILRILKEKNVKATFFVVGEWARRNPEETKMIAEQGHELANHSENHFKMSVLSKDKIKKEIMDCSKTIEEISGVKTDLFRAPYGDYNDTVISIARQNGYFTIQWSIDSLDWKPGITQEAILERVSKVSSGDILLFHNDTSHTAKILGKVIDIIKEKGLKPVPVSELILKDNFEIRHDGRQIPAGKKQ >NZ_CP014673.1|WP_015359063.1|1521541_1523674_-|type-I-DNA-topoisomerase MAKYLVIVESPAKAKTIKKFLGSNYKIKASMGHVRDLPKSHMGVDIEHGFEPKYINIRGKGDLITELKKEAKESERVFLATDPDREGEAISWHLANIFQIDSNEKCRITFNEITKNAVLKALQAPRPIDMNLVNAQQARRVLDRIVGYKISPLLWKKVKKGLSAGRVQSAAIKIICDREREIENFIPEEYWTIETLLSKEDGRTFTAKFSGLVNEKIELKTREDVDRILGNIENKEFTIRNIKRSEKKRTPSPPFITSTLQQDAARKFGFSAKKTMMLAQQLYEGVEIEGEGSVGLITYMRTDSTRISDEALNAAREYILKNYGEKYLPEKPRVFKAKSGAQDAHEAIRPTLLEFTPERVKDSLSRDLYRLYKLIWDRFIASQMESALYDTMSVEITCGDYLFKASGSRIAFKGFLVLYEEGKDDDNGEESDETGILLPELTEGEVVKPVEIKPAQHFTQPPPRYTEATLVKTLEEKGIGRPSTYAPIISTIMSRGYVVKEKKYLYPTELGKIVNSLMEEHFKEIVDVNFTAKMETQLDLVEEGKLEWKNLLNEFYSEFSKTLKAAEESINKVELPVEESDEICEKCGRRMVIKTGKYGKFLACPGFPECRNAKPLFDDAGVKCPKCGGKVLIKKTKRGKSYLGCENYPECDFSTWDMASDKKCPKCGNFMTKRFKGKMIQYTCSLSSCGYEFEEERKQSENKSENNGND >NZ_CP014673.1|WP_015359062.1|1520280_1521495_+|CapA-family-protein MKKIKEIFYFIIVFVFFSACTLKADVTAFRSQSVKNTPVPTPTTVPTMTPTPTPTPAPVTATILAAGDVIMHEPVVKSGKNNTVEYNYNYIFDRIKPFVEEADLSIIDFEGACMETDTNYTGYPLFNAPPAIITAFAYAGFDMVNTANNHCLDRGLNGLFETRDIIKRNNLQVIGTFEDASEPRYTIRDLNGIKVGFLSYTYGCNMNENRLTEEERNIHLSLIDRDKIKNEIESLSSLVDVVVVLMHWGVEYRVEPTAEQTELADMIFSAGADIILGSHPHVIERSEIRETDGKIKYIIYSMGNFLSNQIDDNNPETKLSELTQENVMVKIKLEKDLMSGQTRIVSVKHIPAWVHRYSENNVYKYSIIPIPSLENEIFNQVDEKLAEKLKSSYIRTMEKMQDFR >NZ_CP014673.1|WP_015359061.1|1518730_1519996_-|3-isopropylmalate-dehydratase-large-subunit MGMTMTQKILAKHSGNKYVAPGMLISAKVDMVLGNDITAPVAIKEFEKIGAEKVFDTEKIALVPDHFTPNKDIKSAEQVKLMRNFARKMGIKHFFEIGQMGVEHALLPELGLVTAGDLVIGADSHTCTYGALGAFSTGVGSTDMAAAMVTGEVWLKVPEAIKFNLIGKPGEWVSGKDIILHIIGQIGVDGALYKSMEFTGEGLEFLTMDDRFTIANMAIEAGAKNGIFEVDDETLKYIAEHSSKPYEVFTADSDAEYVREYTIDLSKIKPTVALPHLPENTRPVDEIGDIPIDQVVIGSCTNGRIEDMRIAAKILAGRKVHKNVRCIIIPATQNVWKQCLKEGLFDIFIEAGCAVSTPTCGPCLGGHMGILAEGERAVATTNRNFVGRMGHVKSEVYLASPAVAAASAVAGKIVSPAAIMD >NZ_CP014673.1|WP_015359060.1|1518192_1518681_-|3-isopropylmalate-dehydratase-small-subunit MNYTGDVIKYGDNIDTDVIIPARYLNTSDPGELAKHCMEDLDKTFVSRVKNGDILVGGFNFGCGSSREHAPIAIKASGISCVVAKSFARIFYRNAINIGLPIVECPECVDETNDGDKLEVDLDNGVIINHTTGKKYKTTAFPEFIQDIIKSGGLMQYIKNKK >NZ_CP014673.1|WP_015359059.1|1517054_1518146_-|3-isopropylmalate-dehydrogenase MNSVTNTYKITVLPGDGIGPEVIKQAVKVLDKVAEVFGFGVEYNYADIGGIAIDKTGDPLPAETLELCKKSDAVLLGAVGGPKWDDLPLNKRPEAGLLGIRSGLGVFANFRPAKIFPPLKNSSPLKDRIIGDNLDILVLRELTGDVYFGEKKRTVYDGEPCAYDTMIYRKFEIERIARLAFETARKRKKKVTSVDKANVLEVSRFWREIVTEVAKDYPDVELKHLYVDNAAMQIVINPGQFDVIVTGNLFGDILSDEAAMITGSIGMLPSASLNSKGFGLYEPVHGSAPDIAGQNKANPLAAILSVAMMLEYSFNMKKAAEAVENAVLRVLQEGYATRDLATENSEVLGCEEMGDAVVSRIIG >NZ_CP014673.1|WP_015359058.1|1515355_1517026_-|biosynthetic-type-acetolactate-synthase-large-subunit MKLTGADIVIECLREQNVDTIFGFPGGAVLNIYDSLYKKGEGIRHILTSHEQGAAHAADGYARATGKPGVCIATSGPGATNLVTGIATAYMDSIPLVAITGQVPSTLIGRDSFQEVDITGITEPITKHNFLVKDVNRLAETMRMAFEIATTGRPGPVLVDICKDVTADETEFIPFDGRKRLNLDIKDLYTEKDLDEAAYAIQNAKKPVILAGGGTIIAGITDLVLELSEKMMIPVSTTLMGTSAIPSSYPLYTGLLGMHGTRVSNKAVSECDLLINIGARFSDRVISDMKRFAPYAKIMHIDADPAEINKNISVHYPLTGNTDKIMKGIIERLKKVERSEWAEQVLKWKDEYRLVIPDNGQLKPSYIIKKFSEMVPDAYVTTEVGQNQIWAAQYFDYKFPRQYISSGGLGTMGYGTGAAIGIQLAKPGRKVINFAGDGSFRMNCNELATAVYYKLPIVIALLNNGTLGMVRQWQTMFYGGRHSQSTLDRGPDFVKLAEAYGAIGIRVTKKEEVVPAIEKALSQDSVPVVIDFIIDIDERVLPIVPPGKGIDQLIYT >NZ_CP014673.1|WP_065820758.1|1513599_1515258_-|dihydroxy-acid-dehydratase MRSDIIKKGIERSPHRSLLKAMGYTDEEIERPLIGVVNSFNEIVPGHIHLSKIAEAVKAGIRLAGGTPVEFGCIGICDGIAMGHEGMKYSLASRELIADSCEAMALAHSFDGMVFIPNCDKIVPGMLMAAARINVPSIFISGGPMLSINWKGKQLDLNSVFEAVGAYKAGMMTEEEVLEYENNACPGCGSCSGMFTANSMNCLTEVLGLGLPGNGTIPAVYAQRIRLAKQAGMRIVDLVRKDIKPLDILVPEAFENALAVDMALGCSTNSVLHLLAIAHAADINLNLDIINEISARVPNLCKLAPSGPYHVQDLYMAGGVQAVMKELSKKNLLHLDLITVTGKTHRENIKNAVVRDRNVIRDIEHPYSETGGIAVLKGNIAPAGAVVKRAAVAEEMLCHSGPARVFDSEDDAIKAIYSGEIKKGDVVIIRYEGPKGGPGMREMLGPTSAIAGMELDKDVALITDGRFSGATRGASIGHVSPEAAVGGPIAAIRDGDIITINIPEGKLDVNLSREEIEERLKAWRPPEPKIRKGYLARYAKLVSSADKGAILE >NZ_CP014673.1|WP_015359056.1|1513038_1513527_-|acetolactate-synthase-small-subunit MKHVLSVLVNNHAGVLSRVSGLFSRRGFNIESLAVGVTHDPAISRMTIVVEGDENTVEQVEKQLGKLIDVIKVKRLDIEDSVHRELALFKVNADTSVRSEIMQIAEVFRANIVDISEKTLTIETSGSSKKVAAMQQMLKPFGILEDVRTGIISLERGEKTII >NZ_CP014673.1|WP_015359055.1|1512011_1513004_-|ketol-acid-reductoisomerase MAKLYYDSDCDLKLLENKTVAVIGYGSQGHAHAQNLRDSGVKVIVGLAPDSKSREKAKQDGLTVMDTAEAAKAADIIMLLVPDQVQADIYKESIEPNLEEGNMLMFAHGFNIHYSQIVPPEYVDVTMIAPKGPGHTVRSQYLEGRGVPALIAVHQDYTGKAREYALAYAAAIGAGRAGILETTFREETETDLFGEQAVLCGGITELMKAGFETLVEAGYQPECAYFECVHEMKLIVDLIYQGGFEFMRYSVSDTAEYGDYTTGKRIINEESRKAMKQVLAEIQDGTFASKWIAENKAGGRARLLTTRRKEAEHLLAKTGRELRKMMSWLK >NZ_CP014673.1|WP_015359067.1|1525348_1527130_-|beta-glucuronidase-UidA MDTKHVGNFTQNIHDEDYEIPYLSKMVTASDMIIDTGREKESLNGYWNFQIDQYDTCIRSKWYEEKYKNENGMYLPVDFDFDRWGTIKVPSCWNTQKERFYYYEGPAVYTRTFRYVNKGEKRVFLKFGAANYEAKVFLNRKYIGMHRGGSTPFYFEVTGMLEENNRLLVVVDNTRKKEAVPARNTDWFNYGGIYRDVELIRLPETFIKDFYISLVPDSGFKKIRVVLEIDGPEKNGMARLEIPKLNLYKEMECVDGKADVIINAEPELWSPEKPRLYDVKVSYLSDTIQDRIGFREIKADKNGIYLNGKKIFLKGVCAHEESVINGKAVTDDEIIENFKLAKEMNCNFMRLAHYPHTERAAKIADRMGILLWEEIPVYWAIDFSNPDTYKNAENQLTELIKRDRNRASVIIWSVGNENADTDERLQFMSSLAKKAKEVDPSRLVSAACLVDHSELKIKDRLVDYLDIIGINEYYGWYAPDFNDLIKVFNNSNPQKPVVITEFGADALKGARGTVNDLGTEDCQMHIYKMQTETLGKIPYIHGTSPWILYDFRCPRRTSALQLEYNRKGLLSEDKTYKKPAFYVMKEFYASIKD >NZ_CP014673.1|WP_065820759.1|1527279_1527645_-|hypothetical-protein MNGYYYNPGQGYYHGHNYAYGGSYPVRVQCPYCLNLFDVDVYNIQNTEYYRFTPVYPKIPYANMGHADYGYDNLYPSADNTHSIYYNKSGYICPCDNVNNPWDNNKMYTSNENSLSDQETQ >NZ_CP014673.1|WP_065820760.1|1527707_1529168_-|coproporphyrinogen-dehydrogenase-HemZ MLYIVIPEEFRSGAEELIKLFFPRNGYKFIEKTDILDPNDIFISLDINDENDKHEIKICLKHEDEILYSESACIEKKDECNRIRSQAKVLLYNCLSHYTGKKLPWGALTGIRPAKIVRSLLNMGLTSDEAYRKLTDYYKLSENKARLTVEVALNEMGFLKNAEKKVSVYIGIPFCTSRCIYCSFPSVEMSKFGNLVSDYLEALHKEMQWVAHWIRDRNLKIDTVYIGGGTPTAISESHLDYLLNFVVSVLPLENIREFTVEAGRPDTLNFEKLNIIRNAGVTRISINPQTMQEKTLKLIGRNHTASQVFEAFGMARALGFRNINCDLIAGLPDENERDFEETLARIGELSPDSVTVHTLSVKRASRLINEMEIIRQTDDETVNSMVETAGFFLRSMGMHPYYLYRQKNILANLENVGYAKPGCEGIYNILIMEEVQTILALGAGASTKIVYPEENRVERVFNVKNVEQYIRRIDEMIQRKIKLLDT >NZ_CP014673.1|WP_065820761.1|1529190_1529823_-|MBL-fold-metallo-hydrolase MIIECIPDGLIQSNVYIVAKDGEGVVIDCGCPPEKILETANGKNIKLKHVILTHGHFDHIYYIDQLRNMIDIRVHIHELDAPCLSDPFLNGLAQFPVQGSFTFRPADNLLRDGDVIECSGLFFKIIHTPGHTGGGICILVDNALFTGDTLFNSSIGRTDFPGGSMDELIRSIKGKLYILPDDTNVYPGHGITTTIGYEKKYNPFCRAVDN >NZ_CP014673.1|WP_015359071.1|1529836_1530298_-|D-tyrosyl-tRNA(Tyr)-deacylase MRAIVQRVSSSSVVVENQTVGRINKGLTVLLGVGKDDTRWDLEYLADKIVNLRIFEDENHKMNLSVLDIQGEILVVSQFTLYADCRKGNRPSFTDAAPPDMAKEMYLEFVKYLKEKYPLKVETGVFQAEMHVEIHNEGPVTIFLDSSVKRKNG >NZ_CP014673.1|WP_065821188.1|1530309_1532493_-|bifunctional-(p)ppGpp-synthetase/guanosine-3',5'-bis(diphosphate)-3'-pyrophosphohydrolase MLEEYNRLIEKLKSNGKEYNWGLIEKAYKFACIAHEGQKRSSGEPFVIHPLQVAYILAEMEMDTATVVAGMLHDTVEDSSFTYENTLKNFGEEIANLVDGVTKLAKIPYTNKQEIQAENLRKMFLAMSKDIRVIIIKLADRLHNMRTLKYKPREKQIEIAQETLDIYAPLAHRLGIYKVKWELEDLSFRYLHEKEYYDLAEKIAKKRKEREEYIENIMKTVAEKAMEMGIEAHIDGRPKHLYSIYMKMKRQHKELDQIYDLFAIRVIVNTVKDCYAVLGLVHELYKPMPGRFKDYISMPKPNMYQSLHTTVIGPEGIPFEVQIRTWEMHRIAEVGIAAHWKYKEGGRQNDDLSEKLAWLRQLLDWQKETTDPDEFMENLKIDLFTDEVFVFTPKGDVKCLKAGSTPIDFAYAIHSDIGNRMIGAKVNGRIESLDYELKNGDIVEIITSATSKGPSRDWLKKVKTSQARNKINQWFKKEKRDENIARGRELFEKELKKQGLSSQQILKPEIFAAAFKKYNYHDMDDLYLAIGLDAISSGKAVSRLKEEYRKTLPPEEQKQLLEEEKKKELSKKQKERPAPETGVIVKGIENCLVRLSRCCNPVPGDEIVGYITRGRGVSVHRKDCINIQSNLNDNERLIEVEWYKGKAASYQAELAVKAYDRTHLLLEITNVISDAGVPLKAINARTTRDNVAVMNLTVEITDTEQLEKIINRIRRVPDVFEITRNNK >NZ_CP014673.1|WP_065820762.1|1532503_1534678_-|single-stranded-DNA-specific-exonuclease-RecJ MIYMLDDFFLGNEAIWEVGQPDPVLVRQLSESLKLPTILVKVLVERGLTDPEAIMNFLKPSAGNLYDPMLLPDMEKAVNRILEAKELNEKVLIYGDYDVDGITATAIMYLFLSSLGFDVSYYIPDRIDEGYGISEAAVGYLSEHHFDLMITVDCGVTAKDRIEQIKENLALAGRKMDIIITDHHQPDIENLPDVLALINPHLPDSIYPFDKLCGAGIAFKLVQALCNRLNLGNVYFNYIDLACLGTVADIVELTGENRVIVNIGLKKIKKCPNPGIQALLNVVEIGNASVDAYKLAFIIAPRINAAGRMGDATRAVKLLTSSDLFYCEELARQLHNDNYTRQKIQNEIYQKAVEIIESDPEYIKRKVIVVSGENWHKGVIGIVASMLVERYYKPCFVLSVFNDEAVGSARSIDGFNIYDAMEYCRDLLVRYGGHEKAGGLTIKKSDINRFCAKINEFADEVLADSPMLPRLKVDADASVEEININSAQYLMAMAPFGEGNPSPLFRLREVNVLEVMRIGADQSHLKLLLGTNQNPISAVAFKMGCLEQFIRKNGKIDVIFEVGINEYMGRKNAELIVKYVRMPEKLLEKNRILLKASEKVETLDIDPNWIYNSINNHLVNCDDIALSRQELAVLYRYFQKTGSRTYTRSQLFEIACCMDNGTVKMNYFKVISGILILNELNIIRYSYAGNGNYVIDIADVNGKASLESSKIYSFLHSLADAYEK >NZ_CP014673.1|WP_015359074.1|1534914_1535091_-|30S-ribosomal-protein-S21 MSEVIVRENESLDSALRRFKRQCAKAGVLAEVRKREHYVKPSVRRKKKSEAARKRKSK >NZ_CP014673.1|WP_015359075.1|1535231_1535576_-|histidine-triad-nucleotide-binding-protein MSDCVFCKIINGEIPSSKVYENDDVIVFRDINPAAPVHVLVVPKVHIESLEALNHENIDVVGKIHAAILETTKILGINKEGYRVVVNCGKNGGQTVPHLHYHVLGGTVFGEKMV >NZ_CP014673.1|WP_065820763.1|1535629_1538269_-|alanine--tRNA-ligase MQKFGLNELREKYLSFFESKGHLRLPSFSLVPENDPSVLLINAGMTPLKPYFTGQKIPPSRRVTTCQKCIRTPDIDNVGKTSRHATFFEMLGNFSFGDYFKKEAITWAWEFFTEVLGIPEERLYVSVYFEDDEAFDIWNKVVGLPKEKIFRMGKEDNFWEHGTGPCGPCSEIYFDRGKDKGCGKETCTVGCDCDRFIEVWNLVFSQFDRQEDGTYLPLKQKNIDTGMGLERLACVVQGVDNIFEVDTVRTVLDHVCRIAGVRYGEDYKKDVSIRVITDHIRGSSMLVSDGVLPSNEGRGYVLRRLIRRAARHGRLLGIKDAFLSELAETVINVSMGAYPHMDEKRDYIKKVISIEEEKFYNTIDQGMNILEEYVDELKRQGSDTISGSMVFKLHDTYGFPVDLTREIAQEHSMKIDENGFHEEMRKQKEKAREARLKKENSAWEKDLFSGGYKSVVTEFTGYNEYETEATVRFIVFDGKLVENAQMDDEVAVVLDRTPFYAESGGQVGDTGVITGDNFKMTVNDCKKTSDGKYLHYGKIESGMVQVNDRVIAKVDIERRKCTARNHTTTHILHRALKKILGDHVHQAGSLVAPDRLRFDFTHFSPLTEEQIEAVESEVNSVILSNYPVTVREMPLEEAKKAGATALFGEKYGDIVRVVSVGDYSMELCGGTHISSSGEAGLIKIIGESGIASGVRRIEALTGTGAISWYKNKERTLRKVAEIVKSTPDDTPFKVNNLVEEIKNLQKELNSIKDKLANQSVNDLLNKAEDVSGVKVLAARLDQLDMTALRNMADTLKNKLGASVVVLASGFDGKVSLVVSATKDAVSRGIHCGKIISEAAKAAGGGGGGRPDMAQAGGKDVNGIDNAVKIAVAKIKEQLG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP014673_6 | 1828244-1829716 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP014673_6
|
22 spacers
spacers of NZ_CP014673_6
>6.1|1828274|35|NZ_CP014673|CRT TTAATTAGAATTTTTAAGCTTAATCCCACCAAAGA >6.2|1828339|35|NZ_CP014673|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATGTAACCCGGCTGCCTTAATAGCTTCTTCAGCTT >6.3|1828404|35|NZ_CP014673|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GACGGTTACATTGAAGAAATACACGTGATAGAAGA >6.4|1828469|36|NZ_CP014673|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AATGATATCCGATAAAAGTCTGTTTTTTTCCTCATA >6.5|1828535|36|NZ_CP014673|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GCCCCGGGCCTCCCGCCTACCGGTACCCAAGTTCAT >6.6|1828601|34|NZ_CP014673|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GGATAAAGGCATTCAACGTTGAATATCCAACTAT >6.7|1828665|35|NZ_CP014673|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTTTTTTAAAGTCAATTATTTCTGCTCCAGGATAA >6.8|1828730|36|NZ_CP014673|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCATATTATCCGTCGCTTGGACGCTGGGAGGATCTA >6.9|1828796|37|NZ_CP014673|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTAATTAATCAGTCCAGTATAATTGCATAAAAAAAAG >6.10|1828863|37|NZ_CP014673|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ACATCTGAAACGTGCAACCATGTAAGCCACGATCCGG >6.11|1828930|36|NZ_CP014673|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAATATAGCATATATAACACCGCAAATAGATTTTAT >6.12|1828996|36|NZ_CP014673|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GAAACCGGCCGGACAATGTCCTGGCTGGTCACAAAA >6.13|1829062|35|NZ_CP014673|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CGTATCTGCTGCCAGGCTTGCATCCCGCTTGCCTG >6.14|1829127|35|NZ_CP014673|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CCAGATCAGTTGAACTTTGATATAAGACTTCTGGA >6.15|1829192|36|NZ_CP014673|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TATCTAAGAAAGTAGCAAGAAGACTCCCACCTCTTT >6.16|1829258|35|NZ_CP014673|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CAATAAACTTCATCTGCTAATTGTTTCCTTGCTTC >6.17|1829323|35|NZ_CP014673|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AATTGGTGTTTCATAACATATCCCAACCCATCTCA >6.18|1829388|35|NZ_CP014673|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GGTAGCCCATGTTGGAGTACCACATGATTTCTCTC >6.19|1829453|36|NZ_CP014673|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GATTTTATTCTCATAAATTTTTCATGTTTTGCTTTA >6.20|1829519|35|NZ_CP014673|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TATTGAATGAAGCATATTCAATAATAAAAAGCATT >6.21|1829584|37|NZ_CP014673|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CCGCCGGTTGTTGACACAATAACAGGAGTTACATTGT >6.22|1829651|36|NZ_CP014673|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTCGCTTTCTCCGTGTTATGCTGATTTCTTACTTAA |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP014673_6
The CRISPR arrays of NZ_CP014673_6 >merge|NZ_CP014673|6|1828244-1829716|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTTACTACCACTCATGGGAAGATTCAAAGTTAATTAGAATTTTTAAGCTTAATCCCACCAAAGAATTTACACTCCAATATGGTTAGATTCAAAGATGTAACCCGGCTGCCTTAATAGCTTCTTCAGCTTATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAGGACGGTTACATTGAAGAAATACACGTGATAGAAGAATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAGAATGATATCCGATAAAAGTCTGTTTTTTTCCTCATAATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAGGCCCCGGGCCTCCCGCCTACCGGTACCCAAGTTCATATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAGGGATAAAGGCATTCAACGTTGAATATCCAACTATATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAGCTTTTTTAAAGTCAATTATTTCTGCTCCAGGATAAATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAGTCATATTATCCGTCGCTTGGACGCTGGGAGGATCTAATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAGCTAATTAATCAGTCCAGTATAATTGCATAAAAAAAAGATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAGACATCTGAAACGTGCAACCATGTAAGCCACGATCCGGATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAGTAATATAGCATATATAACACCGCAAATAGATTTTATATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAGGAAACCGGCCGGACAATGTCCTGGCTGGTCACAAAAATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAGCGTATCTGCTGCCAGGCTTGCATCCCGCTTGCCTGATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAGCCAGATCAGTTGAACTTTGATATAAGACTTCTGGAATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAGTATCTAAGAAAGTAGCAAGAAGACTCCCACCTCTTTATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAGCAATAAACTTCATCTGCTAATTGTTTCCTTGCTTCATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAGAATTGGTGTTTCATAACATATCCCAACCCATCTCAATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAGGGTAGCCCATGTTGGAGTACCACATGATTTCTCTCATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAGGATTTTATTCTCATAAATTTTTCATGTTTTGCTTTAATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAGTATTGAATGAAGCATATTCAATAATAAAAAGCATTATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAGCCGCCGGTTGTTGACACAATAACAGGAGTTACATTGTATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAGCTCGCTTTCTCCGTGTTATGCTGATTTCTTACTTAAATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAG >NZ_CP014673|6|3|1828244-1829716|CRT TTTTACTACCACTCATGGGAAGATTCAAAG TTAATTAGAATTTTTAAGCTTAATCCCACCAAAGA ATTTACACTCCAATATGGTTAGATTCAAAG ATGTAACCCGGCTGCCTTAATAGCTTCTTCAGCTT ATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAG GACGGTTACATTGAAGAAATACACGTGATAGAAGA ATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAG AATGATATCCGATAAAAGTCTGTTTTTTTCCTCATA ATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAG GCCCCGGGCCTCCCGCCTACCGGTACCCAAGTTCAT ATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAG GGATAAAGGCATTCAACGTTGAATATCCAACTAT ATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAG CTTTTTTAAAGTCAATTATTTCTGCTCCAGGATAA ATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAG TCATATTATCCGTCGCTTGGACGCTGGGAGGATCTA ATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAG CTAATTAATCAGTCCAGTATAATTGCATAAAAAAAAG ATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAG ACATCTGAAACGTGCAACCATGTAAGCCACGATCCGG ATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAG TAATATAGCATATATAACACCGCAAATAGATTTTAT ATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAG GAAACCGGCCGGACAATGTCCTGGCTGGTCACAAAA ATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAG CGTATCTGCTGCCAGGCTTGCATCCCGCTTGCCTG ATTTACATTCCAATATGGTTAGATTCAAAG CCAGATCAGTTGAACTTTGATATAAGACTTCTGGA 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>NZ_CP014673.1|WP_065820835.1|1826306_1827629_-|extracellular-solute-binding-protein MKRRVFSAMLSLIFVLTMLAGCGNTSVDKSQSTEPAKTQKNISGEKTTSTAEPVTVTYALWDSNQALGFEKMADEFTKKNPNIKIEIQLNGWSDYWTALDAAASAGTLPDTFWMHSNNFYRYASNEMLKSLDDLIASSDKIDLKNYPEGLVSLYNYNGKQYCIPKDFDTIGLWYNKTMFDEAGLEYPDENWTWDDLYEAAKKLTKPDKSQYGFLAPLHNQEGFYNFIYQNGGTVITPDKKSGYDDPKTIEAMEFYIRFVKEGLSPLIFGDAERAEAMQNGLCAMGFFGSWNLSGFAANEYMAKNFDVTVLPAAPNGGRASIYNGLGYAIAPNTKKLDAAWKWVEYLASEEGQLRQAELGIAISAYKGTADAWVESNKTFNIKCFIDMLDYAVIRPYSNTTAVWEDKVYEELRGAFTGEKTVEQACRDAAAVMNESLAQER >NZ_CP014673.1|WP_015359315.1|1825308_1826211_-|sugar-ABC-transporter-permease MIDGKSKSKINEWLWGWFLVAPAVIGLIILNIIPAIQTFYLSFFKSGDFGRGNIFIGLENYKKLINDSQVWYAVRNTLLYTLFVVPVSVFLAAVIAVLLNKNIKGRGIYRSIYYMPVIATPAAVTMVWRWLYNYHYGLINYVLKQLGLNPVNWIDDPKVALISIAIISIWSTTGYNMVLILAGLQDIPTVYYEASNIDGANAITQFFKITIPLVSPTLFFVITTSVIQCMQVFDVVYMMIDVTRPSYDSTVSLVYLFYNNSFKYLNKGYGSAIVMVLLLIISVITVIQVKLQKRWVNYMG >NZ_CP014673.1|WP_065820834.1|1824467_1825298_-|carbohydrate-ABC-transporter-permease 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP014673_7 | 1831156-1840030 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP014673_7
|
135 spacers
spacers of NZ_CP014673_7
>7.1|1831186|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTCCGGTAAGGAGCGATTTTTACAATTCTTTAAT >7.2|1831251|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCCGAAGGCTGCCGAAATGTCGCACCATGGAAAAG >7.3|1831316|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTAAGTTCAAATTCTCTTTTATCTCCGTTAAACTC >7.4|1831381|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTGATCAAGGTAATAAATTTCATCGGTTGTTAG >7.5|1831445|36|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGTTGATAATGTGCTATTATAGATGTGAAAATGA >7.6|1831511|36|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTATGAGGACGGTAAATGCTAATGTGGGGCGTTA >7.7|1831577|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAATTATTTGCGACTTATACAATGTTAAAGAATTT >7.8|1831642|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAGAGGATTAGGGAATCTATAGCATATTTGGTTA >7.9|1831707|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTATTTTCTATAAAATCGCTAATAATATCAGAATT >7.10|1831772|36|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATAAACCGCTTTTTCATACGCTCATTGAGAAGAAA >7.11|1831838|36|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT 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cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP014673_7
The CRISPR arrays of NZ_CP014673_7 >merge|NZ_CP014673|7|1831156-1840030|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT 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MKAVRIEAYQNMPCYRKASSFRLRETYPLPPYSTVIGMVHKACGFTGYHSMRISVQGEYCSTVNDIYTHYEFNPVPKGKTESKDYVERYNIGYYSKDNTHHRLNRGTGYHELLTDVRLLIHVCPDDESMVDAIYQGMLNPSYYPSLGRWEDLLRIDLVEKCEIYENIINNATFTLNRNAYIPVEFYKGNEFNYKITGTRYKINKRYTINPKTELRQWVEQIDVIYASPQSKIVKGAIYSKDSKGDAVFLA >NZ_CP014673.1|WP_065820836.1|1845267_1846143_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MKKNGLTMSLIIECGSANYGEGFGNISPLKKLTRGSGEVYTYISRQALRYNIIQQMGCDSTPVEVVSSKKVLQFHSDADIVTYPEIDLFGYMKTDSGEKATTRSAVVRLSNAISLEPYAGDTDYLTNMGLAARKKDADNSIAQSEIHQSFYAYTVAIDLDRVGIDEVKGKIIAIENSEKVKRVQNLLDTIMFLYRDIKGRRENLSPVFVIGGVYERKNPFFENRLQLFKGSLKIEIIKQVLDSDDSIKENTEIGYLAGTFRNDKDVIEQLKPVTIREFFENLKRKVEEVYR >NZ_CP014673.1|WP_015359324.1|1846145_1847840_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MSSGYITITLKDFLFNAGVVGFIKVLRQEGFNLEDQDIGNTIHVPVSLLENFHENYIKALLNTFQNETLYQSLINQFEHFAGIKPEDIPKEEYKSFIEKLCNKLTSASYKSGYQIIAEKGDDFDVLSRVKMLKTEKDIQKSVSICYELIQYMKKHRETLCMKDIIYTKIIMFWRNVAFFERSNIRKDIKECYYNYFVKPALEYLNRKNKGALQCIQCGNPINASLGMGMSWLNDVGIDMERKRSHFWNFNPDTYICPVCALVYSCVPLGFTVVGGEAIFINNNESIHTLVAEKDIFERGGEKYTTLNQLYYKVLYSFIDDAAQEQTREIQNIQIIRRVSVDTDTGKYVFNTLSKPLLEILKACKSNFKNLINWTFKKDKDTYVNVYQEVANNFFSGRNQYALVHAILQKVFTENLRAPYVRDILQIQRRRMRKFYSEEGGSEAMYISRKEFDAAYNEGLRIRREYANTVTNVKGDNDKNMKINESLRSFVYPLLLALKTKDKAKFNDTMFRFYVGRNESIPKILIEMQQSDEKFQMLGYTFIAGLQGESLNSENAENIVNEEGE >NZ_CP014673.1|WP_015359325.1|1847858_1848575_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRLKLSFELRKNIIPCDYRPFILSFLKYSISQYDQVLYRNLYENGVIPKKYTFSVWLDKPIFNSDAIQLESNRMEVQFSTGDTILGIHMYNSFLKMRLKEFNIPFNNTILLKEIDLVPEKIITERKILIQFISPLVVRSHNNGNKDFYYSVVHPEFNNELMKVLRYQLEILKDIPSYLLEDFRMTPVKPQKTVVQFYGQYIEVTLGTFMLEGDPVLLDYFYKQGIGSKRSCGFGMIAL >NZ_CP014673.1|WP_065820479.1|1848833_1850132_+|IS30-family-transposase MNKNKHLTLEERIIIEHKLKERETFKGIARELGKDPTTIAKEVKNHIQFRKSGCYGRNFNDCLFRKDCTVCHLCGNQTCKRYCSFCQKYYCSTLCSFYQKEVCQRLLKSPYVCNGCPDKNSCTLEKRIYSAARAQKEYEDVRSESRKGVQLTEEEASRLDALISPLIKNGQSLHHICVNHMDELMINERTLYNYVNAGLFTARNIDMPRVVRMGKRKRAKNEFKVDKKCRIGRTYQDFLKFMQENPGLIVVEMDTLEGKKGGKVLLTLHFTIPQFMLAFIRNSNTSQSVIDIFNWLYLKLGTNDFCRLFQVLLADNGGEFSNPSAIEYDLQGNRRTYIFYCDPQAPHQRGAAENNHLLIRRIIPKGTSIDHLTQEDINLVMNHINSYRRPNLGDKTPYEVFASLYGEDLLRKMGAELIPSDNIILRPSLLKK >NZ_CP014673.1|WP_065820837.1|1850542_1852174_-|pyridine-nucleotide-disulfide-oxidoreductase-family-protein MKVLIVGGVAGGASAAARLRRLDEHAEIIMFEKGEHISYATCGLPYYIGDVIKDRDNLFVQTPEAMKARFNIDVRTESEVISVNPQEKNITVKSKARGIYSESYDYLILAPGAKPFRPNIPGINNDKIYTVRNLHDADAVKSLACSEAVRSVVIIGGGFIGIEMAENLRKRGIEVSVVEMFPHILSQFDEDIAVLIERELEKNGVNLVLNTMVNSVEENGEKIEITLSNGEKLTADFVILATGIVPDTDFLRGSGIELGPRGHIIVNERMQTNIKEIYAVGDAVEVADFVNGRKTAKPLAGPANKQGRIAADNIAGINSVYRGTQGTSIIKVFNLTAACTGNNEKDLKLADIPYEVIYVHPMSHASYYPGASQMTLKLLFNDDGKVLGAQAVGYEGVDKRIDVIAAVIRLNGTVNDLAELELSYAPPYSSAKDPVNIAGYVAQNRLTGLSHLITWSELEQLNKNDYILVDVRTEAEYSKGHIEGAVNIPVDELRERLDELDKSKTIVVYCRVGYRGYIADRILSQNGFKVLNITGGYSSEPSG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP014673_8 | 2149249-2149575 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP014673_8
|
4 spacers
spacers of NZ_CP014673_8
>8.1|2149279|36|NZ_CP014673|CRISPRCasFinder,CRT AGTGTGAGTTACGAGCTTACAATATACGATGAAGAA >8.2|2149345|35|NZ_CP014673|CRISPRCasFinder,CRT TCTACGACAATAGCATCAGGTCTAAATGGTTGACC >8.3|2149410|36|NZ_CP014673|CRISPRCasFinder,CRT TTGTTTATAGCCTTTTCAAATGTGCAATGCAATATA >8.4|2149476|70|NZ_CP014673|CRISPRCasFinder GAATCAAGCAAATTTCGTTCTATTCTGGATGCAAATTTATATTTCGATATAAAATACGATGGAGCCACTT |
cas5,cas7,cas8b2,cas6,cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP014673_8
The CRISPR arrays of NZ_CP014673_8 >merge|NZ_CP014673|8|2149249-2149575|CRISPRCasFinder,CRT GTTAATAATTAACCATTATGGAATGTAAATAGTGTGAGTTACGAGCTTACAATATACGATGAAGAAGTTAATAATTAACCATTATGGAATGTAAATTCTACGACAATAGCATCAGGTCTAAATGGTTGACCGTTAATAATTAACCATTATGGAATGTAAATTTGTTTATAGCCTTTTCAAATGTGCAATGCAATATAGTCAATAATCAACCATTATGGAATATAAATGAATCAAGCAAATTTCGTTCTATTCTGGATGCAAATTTATATTTCGATATAAAATACGATGGAGCCACTTGTTAATAATTTACCATTACGAATGAAAACA >NZ_CP014673|8|7|2149249-2149575|CRISPRCasFinder GTTAATAATTAACCATTATGGAATGTAAAT AGTGTGAGTTACGAGCTTACAATATACGATGAAGAA GTTAATAATTAACCATTATGGAATGTAAAT TCTACGACAATAGCATCAGGTCTAAATGGTTGACC GTTAATAATTAACCATTATGGAATGTAAAT TTGTTTATAGCCTTTTCAAATGTGCAATGCAATATA GTCAATAATCAACCATTATGGAATATAAAT GAATCAAGCAAATTTCGTTCTATTCTGGATGCAAATTTATATTTCGATATAAAATACGATGGAGCCACTT GTTAATAATTTACCATTACGAATGAAAACA >NZ_CP014673|8|5|2149249-2149475|CRT GTTAATAATTAACCATTATGGAATGTAAAT AGTGTGAGTTACGAGCTTACAATATACGATGAAGAA GTTAATAATTAACCATTATGGAATGTAAAT TCTACGACAATAGCATCAGGTCTAAATGGTTGACC GTTAATAATTAACCATTATGGAATGTAAAT TTGTTTATAGCCTTTTCAAATGTGCAATGCAATATA GTCAATAATCAACCATTATGGAATATAAAT
>NZ_CP014673.1|WP_015359550.1|2148357_2149068_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKGIRIEIEQPFASYSVPGSFQLRETFPLPPYSTVIGMVHNACGFKKYVDMDVSVQGNWASVCNDIYTRYEFSPNRQFEKERHQGYFEENGRKYGVVIGVGHVELLADVNLLIHIVPKNQDIVETIYNGLLYPQNFLYLGRTEDIVRINSLETVDIIEEILDYEEILKYNAYIPVSYKVENEIGTIYRLNKKYIINKSQTRYWEERIEALFAPKEKELTIGTKIYKDSKGDLVFLA >NZ_CP014673.1|WP_015359549.1|2147369_2148293_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MNKPALHLGIITENISINYGEGFGNVATLKKFTRSDGTEYPYASPQKLSYCIKSVANFIDTPVEKSGTGKTVWQFSKSATIKEYPEIDFSGYLKTESTSKGEKKNEAEAEDNKSEGSRSRTKVLRVSPLIALEPYRADMDYQTNLSLVKRGGGEGSNIVQNEIQYSYCTYTVSVDLDRLGIDENDKIKLPNDEKIKRMNVMLDAIQFLYADIKGRRENLSPIFVIGGIYRRKNPFFLNRIKFTEGHKLNIIMLKDTIKDAGIQEDTIVGYLDTSLDNNEEIINEFNPMTIGEFFNELKKRVVKVYSE >NZ_CP014673.1|WP_015359548.1|2145667_2147377_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MPQITLRLNNFLYNASIYGFIQVLKTMENDFLDVNYTIKGNTLTFSSDVFENFTEYYLKTLINKFEKDTNYYMIIDKYHALISHDFTEDSSQYKEFLNFLSSKLKKFKGYEIIKKRNEKTDILNTLDLLKRKDIDFDTKKIYLKEIVECLEKHKDIFLLKDIVNTKVKLFWDNIAFLNNNNKNKEMSDCYKNTFIDPVIQYLNKKQRKSANQCIECGRNVSSQKEGSMRWLNDVGVDIKRKISNYWNFNPDIVVCPICKTVYSCAPLGFYIVGNNALFINSNTSIEAIIRMNNLNFKMNTLVDIENAVYYSIARAFNYLSNVESAKKQANSNIQVVKRVAYKNGTTYQFNIIVPSVLTVLSEREKEFRQLLNKYYMFSQKANKKEPRKIINIYDKTIENILNNRDLYMLLYDILKDALDSSQKVDFLYAVLKVQISNLMKGVTGMERTERINKLEKTTFFLRKCGLEIKGTFADNNEIQESGKLKSYIYKLLTALRINNVSLFMDTAIRIFNDTKKEIPITFINMLNDQNQFKILGYAFVLGLLGQDDVSDKNEFNNKNLTEKGEDENE >NZ_CP014673.1|WP_015485061.1|2145265_2145652_+|CRISPR-endoribonuclease MDISVKFRLKNNRLPLEYRKSIISFYKNILSNYKDGKWKDKFYKNQDPIQKKFKTKNIHEIKPWMIDELDIKFNNNEVKKIIVTHYGIKFPVTIGCFYLKGNPVLLNFLHCSGMGSRTSSGFGHFKVI >NZ_CP014673.1|WP_015359546.1|2144549_2144981_-|flavin-reductase MAEFRAFNYGANAVCFQKNGRKYGMICSWATQVDYDKIVMLIGAQSVTGKNISKGDIIGVSVLSTQQENVVNILGNNHSDEVDKFLNIDYTLNNSAILINSASVNMVIEVIDVLHLPGIEEDSLVYGLIKSFTKSDKPMLTIR >NZ_CP014673.1|WP_081594904.1|2143923_2144187_-|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase-subunit-E MNKEKRNMKITVCIGSSCHIKGSRQVVEEFRRLIRRYNLEDKVELAGTFCMGECLKGVCVAVDDKVCSVSHDTVEEFFNKNVLECVK >NZ_CP014673.1|WP_015485059.1|2142214_2143660_+|glycosyltransferase-family-39-protein MTKLVCFLKKILRYVEIVIVGLLCILLTVNIFKGVNKSLLVVLVYSLFYAASLVTIYFLREKFFDGNVVKRFIFILSVSVFIRFLAVYFLGLTPQGDYAIYLSVARKIKNGNLDNKLYFGIFPHALNYPIFISLFYRLLGERTWLPRIINLIFGTFEAAFGTYIMEKCTNPRIGMIGGLAIALNPSIITFTLLSGGEPIYASIIITAVFFLTVGFNSKKQHFWIVAAGITCAVANFFRPTGIILIIASILVIFLYSKVKITIKIKQSLLLVFSFAVIVWATGFVTSSVSGYTKPSYSFGWNLFIGANEQTQGRWNEKDAELFDEVKNNLGDPSEIQKHFFKLGVERYKNMGMRVIPHFRKKLGVWFDESYVSRVITEWQTQYTRFKSGDLQQTYSLIINLYNILIMSGAIAALLFLSLEEKPPLILKIISFYMIGSIMLFMVIETAARYKGAYYSVLTILAVYGYCKTGGFIKKRLSRNNQ >NZ_CP014673.1|WP_065820921.1|2139726_2141757_-|methyl-accepting-chemotaxis-protein MSIRTKMLIAFIPIILVATLLVSSVSVFESKKGLERQIEERIDTSLEKINESIEREFTSHRRIAEAIASVYKAQGNKLTKADYKAIIEKMVSLNANTLGSGLWLEKYAYDNNTKYFGPYVYKDGDSLAYTEEYETEGYDYHNKEWYIAGVNAGNGVAWTAPYYDETLGITMITTAVPINMERGIVGVVSADYDLTTIQKIVSEVKLEKSGFAFLLDSNGQFIAHKDSDKVINQNIKDDGNFGPVADKIMGNDKGSEYVKFDGKDFKAYYLTLKDTGWKLVVMAPNEELFSSVKESVKGVILITIGAIVLASAFITYYSASFTKRIKQFVDNLGFIAKGDFTRPVEVRTKDEIGKMGSYYNNVLEELKHIVNTISENSKNIAGMTEELSERTKMAANTSEEVAKTVEEIAKGAVQQAKDIENIADNIGELGNLLEQDVKYIQELNGAAAKIEKQKEDGNEILRALVEKTEKSNEAINEIYQVIVSSNESAEKIEEASAMIKSIADQTNLLALNAAIEAARAGEAGRGFGVVADEIRKLAEQTNSFTSAISAVINEIRNKSQSAVETMNEVKHIFDAQNESVKQTEDKFGGIAEAIDVIKSIIDNLNDSSEAMTEHKNKIIELIESLSAISEENAAGTEQASASMEEQSAVIQEIADFGENLAGIAEGLKQLVAKLKV >NZ_CP014673.1|WP_015359542.1|2138451_2139390_-|LysR-family-transcriptional-regulator MKLLHMKYALAVAEARSINKAAEELLVGAPALSRAIKELENTLGVTLFERSARGMFLTPEGELFISYAKKILKQIDDIETIFKEGITAKRQFSISVPRASYIADAFAEFSKRIDPKSETEIFYKETNAYRVINSILKEDCKLGILRYNEQYDSYYKALLDEKELSSELIVEFSYVLLMSRDCPLSRLDRITFDSLKSYCEIAHGDPYVPSLPLSAVKREEFPEHEGCRIFVFERCSQFELLSKNPNTYMWVSPTPQDLLDRYGLVERTCADNKRKFKDVLIHRKDYKLSDLDKMFIEELVKAKRRVFNRSEA >NZ_CP014673.1|WP_065820920.1|2135497_2138215_-|bifunctional-acetaldehyde-CoA/alcohol-dehydrogenase MENKERKIVDSVDALKKVIARVREAQRKFSTYSQEQVDEIFKAAATAANQARIPLAKMAVEETGMGVVEDKVIKNHYAAEYVYNTYKNVRTCGVLEEDKAYGIKKIAEPVGVIAAVIPTTNPTSTAIFKTLIALKTRNAVIISPHPRAKKCTIAAAKIVLDAAVAAGAPEGIIDWIDVPNIELTNLLMKEADIILATGGPGMVKAAYSSGKPAIGVGPGNTPAVIDESADVVLAVNSIIHSKTFDNGMICASEQSVIVHKNVYDAVKAEFAARGCYFLKEDEIEKVRKTIFVNGALNAQIVGQPAYKIAELAGVKVPVGTKILIGEVDSTDPSEEFAHEKLSPVLAMYKAEDIHDAFEKAERLVANGGYGHTAAIYLDVTTEQAKIDEFASRLKTCRILVNTPSSQGAIGDIYNFKLAPSLTLGCGSWGGNSVSENVGVKHLLNIKTVVERRENMLWFRAPEKIYIKKGCLPVALNELKYVMGKKRAFIVTGSFLYHNGYTKPITDRLDELGIEHTTFFDVLPDPTLSCAKAGAEQMRAFQPDTIIAFGGGSAMDAAKIMWVMYEHPEVDFMDMAMRFMDIRKRVYTFPKMGEKAYFVAIPTSAGTGSEVTPFAIITDEKSGVKYPLADYELLPDMAIIDVDFHMSAPKGLTAAAGIDALTHALEAYVSLMATDFTDGLAKQALQMIFKYLPRAYDNGQTDVEAREKMANAATIAGMAFANAFLGVCHSMAHKLGAFYHLPHGIANALMIEEVIRFNASEAPAKMGTFPQYGYPHALRRYAEIAEALNLGGENDHEKLENLIKAINDLKARVGIKSSIKEYGINEKEFLERLDEMVEQAFDDQCTGTNPRYPLMSEIRQMYLNAYYGKKHFVDEEKPNEADIAGTEDENKVKKAYLRARVGAKRA >NZ_CP014673.1|WP_065820922.1|2149602_2151816_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MEYYAKLNPTQTILEHTQKALELYKQLKLLYSRLLSNEEWELLELAIICHDLGKTNAFMQKFFYQKLNIPFPLALEHNIPQIYHNHLSCAFIDYKDVISKYGLKNYKILCNCIYYHHNRPETDKKVLKYYIKNCLPNDIENFNFPLLAYNLRSKLNCEFTPYIDIYNNGLFTDFETFKRYVMIKGLLHKVDYCASAGIDIIEDNTRDEDGLSAAKKIKCIYPNLRDIQIYMNANKDKNLIIVGSTGIGKTEGAILWIGEEKGFYTLPLQIANNSIYARIKDKIKYKNVKLLHSNAISTYIREEKENGNTDAQEEYQKAKLFSSPLTVCTVDQIFKFVFKYNGFEYLLATLAYSKIVIDEIQMYSPEIVASILYGLKLATGLGSKFAIITATFPPILGDLMERYKIPFKGPVFFHKPGLPTRHRIKFFENRDFDLELIIDLAERYKVLIITNTVSKAQKIYEKLKDKVNTWIIHSRYIRKHRRMLENKILEFAPNKKDRNSNPGVWVSTHVVEASLDIDFDYILTSMCSIESLIQRMGRVWRDRLYDAETPNVYIYDNHDGLNSVIDSQIYSFSCNAVKAYDGKLLYETDIQNDKQAMMEMVYDRKKNPDILSSEYFKEIVKRIDSLDNLLPYDLKIKEVVKLFRGINSITIIPSSIYSELKKSGKISEWEYKLNQNISMKEKQSIKDEINEYTLELPWYDKGNLIIQENIIYPHSDINLWNGEYDFDENTLKGIGLI >NZ_CP014673.1|WP_015359554.1|2155243_2157988_-|exoglucanase-2 MKRRLMKGISLLTLVFLIGIMLQLSLKSELTAYASSDDPYKQRFLELWEELHDPSNGYFSSHGIPYHAVETLIVEAPDYGHLTTSEAMSYYLWLEALYGKFTGDFSYFMKAWETIEKYMIPTEQDQPNRSMAGYNPAKPATYAPEWEEPSMYPSQLDFSAPVGIDPIYNELVSTYGTNTIYGMHWLLDVDNWYGFGRRADRISSPAYINTFQRGSQESVWETIPQPCWDDLTIGGRNGFLDLFVGDSQYSAQFKYTNAPDADARAIQATYWANQWAKEHGVNLSQYVKKASRMGDYLRYAMFDKYFRKIGDSKQAGTGYDAAHYLLSWYYAWGGGITADWAWIIGCSHVHAGYQNPMTAWILANDPEFKPESPNGANDWAKSLERQLEFYQWLQSAEGAIAGGATNSYKGRYETLPAGISTFYGMAYEEHPVYLDPGSNTWFGFQAWTMQRVAEYYYLTGDTRAEQLLDKWVDWIKSVVRLNSDGTFEIPGNLEWSGQPDTWTGTYTGNPNLHVSVVSYGTDLGAAGSLANALLYYAKTSGDDEARNLAKELLDRMWNLYRDDKGLSAPETREDYVRFFEQEVYVPQGWSGTMPNGDRIEPGVTFLDIRSKYLNDPDYPKLQQAYNEGKAPVFNYHRFWAQCDIAIANGLYSILFGSEQANDSFITPTSATFDKNNQEDISVTVTYNGNTLLGIKSGSSYLIEGVDYIVNGDVIIIKKEFLAGQATGSISLLFDFSAGLDRTLTIDIIDTGGGEEPVEPVEPVEGVLIIQSFNANTQEISNSIMPRFRIYNSGNTSIPLSEVKLRYYYTVDGDKPQNFWCDWASIGSSNVTGTFVKMDGATTGADYYLEIGFTPQAGTLEPGASIEVQGRFSKIDWTDYTQTNDYSFNPTASSYVDFNKITAYISGNLVYGIEP >NZ_CP014673.1|WP_065820923.1|2158794_2160015_-|hypothetical-protein MSYEEKILTCLVNKYRSSKKDSGTNKIYKRTQIKPEKIYKKYSANDGDFDEINRLNATVGLLEKRGYISSVRESFGTQIKCIYLIDEKVDEIERYLEEKYGFVSKNTQLEYVKNLIKLYKEASPICKEECKLLEQAVLNRKLPKNIKLLDDIFKAIAFIENNQEQLYIREVSMKIYGDSKYFEKVTLQPVCSILRKYTNKPLEDSELLDEILLYYHILREPQKICIKGNAVIYMFGTEVDISRFSDGIEIMASDLVNIESVILHASKFMTIENRTSYLRYKHPDVVTFYLGGYANRYQRDFIKMVYKANPTITYLHFGDIDPGGFWIHYNLCQVTGIEFGMFCMSVEELRNNVYQPYLRKLTDNDIIRLQELKDMDIYAKTVKFMLDNNVKLEQEIVSYTLMNTKK >NZ_CP014673.1|WP_065820924.1|2160028_2163316_-|hypothetical-protein MILLNRLRLINWYAFNNVTVPIGIFTLIAGKNGNGKSVLLDAIKYALYGDTVFNKSTENKGSRTVVSYTRGLLDVTAGTYMRPADRIPNVYTHIVLEMSEAELNHNFILGTVIETDSGNGFRTQRYVIEDKTLDDIKHTYELDGKEFPYSAAELQKEYGLKMMDATNGLLRFMQRTGLHFNNQQLATFRRKLRSIMSYDPEAKIDQFIRENVLEEKKVDLSKLIEVKSNIDDLNKNFELIDKEITELDEIINTFRELKQKENRLLADDVKIAYQKYLECEERLKDCKRNMEIAEQQMKFDIQMLENLEVHEEEIRELYNNAREHLNSMDCAKAIEDAKKALDNALAEKERLKKEKDALCCFQTKINELLSWFDKMQFDVINKKILSSLTYNTVTKAEKQNAVRMFLSQIQEYRDKLIENRAEINNFLAENQKEQNKCLKIIDAYEDKRVIFSEIPEYVALKNEINREFTRRGINSEAKFAFEYVIGISDEEWRDAIEAYLGNRRYTILVEPEYYDIADDVLNVSNNKYAHLFNTKLLMKKDIKPEPDSVVHFIEVKNPVAKKYFEWQLGKLHATAVDKVRNYENAISKEGRVSVAMDSYFLRFDRIKFYCLGLSAMELNRARAKKNLEKLRQEYMALQETLNDVNAKIAYLDKMRGFFGDYNYDACEEYDKAVSECMKKEAELKVLEEAQKNNIEYMELVQRVEILKKELENIENERGRLQEDKFRVKVMYEKYSKEKENIETEIVSVKAKLQEYECKNSEVYSKAIEDYKKYVDNGKTGPGGPLKDRQRLEREVNEARRQLISKQATYNALRATEKPLPETIESVAEYQKRRERIWVDNRQEIQAKLKEQTQRYEEIFKNEFVLTILKYCETARNDIKLINAELANLKFKSHYEFDVKYVKDGSDYEKIIEYAKYLKEREKLGVSTEQMSIEDMVLNSDNKGKELEQEIKRIVNRITESGDKEQIDSYADYRNYMTYEILLTNDVLSNAKLSKQSGYNSGAEVQIPYMLILLSALLMIYNEKNNSTRLVFIDEPFAKMDPINVKIMLDFMKKQNLQMIFCAPDKTELIGNECDVILPVLRTKPDLMEIGIVKIH >NZ_CP014673.1|WP_015359557.1|2163312_2163960_-|DUF4194-domain-containing-protein MGEIKLNLSIKEENMPLFKRCVRKLLGSTFIVGDKDENLYAFISRESNRQDVSDYLRMIGFDVLVDEKVRIAMLKPYEGDEETPGLKRSNVVVFTSEQYHLLLVLWEAYLESLGYSEQNIVFLGDLIDKMKAYNVDMDGSKLFAALKIFKKYDLIDFDPNNKSEDAIITLYPSLQFGWNIEQFRTVVEEYMKENQYEVSPEDENIDFESGEDDTE >NZ_CP014673.1|WP_034836407.1|2163952_2165389_-|hypothetical-protein MILFEKDEFDKFFNPLCCKNKKVYYECILQLIEKSKTVPLLYETEARDTLVLYLRNCTYAIEDEEGLSVDYAEISNKKSEFENASEILRYFRQCGWISERELGRSGDNIATVTPQCRKMIEAIERIFNRDNRAALTNHIFAIYDILHSAFVTDHGRTHRPYVNILVPVCDSVEDLKNELLILRDSIESIMRMVIKMTEANQLGQFLIRDEMMESFFNDYFFIKKDGLIPGYIEEIEKMLRIIPETDVYKNMIKEYQEFYKVDESTAKSVIDNQLNGIMSFISYDYVKEMDYIDKKINKYYSLYATRILMVLSNNVNLQTYLNKILMTIKDFDMDVKKEFLERLSVSFNLTEHKYVGKKSIERRKKRKPNTKSGAIITSGLSDDEKLKLTEEILYAYPDKYGVKQAQNYFDRLLKNRDELIPDESVVKSRDDAMMVAASIIYSGSMEFPYEVEFLGGTVETGVATISKVKIKRKVSENG >NZ_CP014673.1|WP_015485064.1|2165766_2167131_-|sodium:alanine-symporter-family-protein MLSIVQTINNYLSDYVLVILLVTVGVWYTVKTRFVQVRCFRESMRRTFGSLNLNGEKQKAGMSSFQALATAVAAQVGTGNIIGASGAILTGGPGAIFWMWVIAFFGMATIYAEAVLAQETRVKAPDGSIHGGPVYYITKAFKGDFGKFLSKFFAIAITLALGFFGCMVQSNSISSTCENAFGIPAWIMGIGLVVICGIIFLGGVQRLASVVEKVVPFMAVLFILGSGIVLLLRIQYLPATFGMIFKYAFRPNAIIGGSLGYALKTAVSQGAKRGLFSNEAGMGSTPHAHALANVKIPHDQGVVAMAGVFIDTFVVLTMNALVIISTMYTKDGILADGVIPDTIGKSNLAQVAFGTVFGEAVGSVFVAVCLFFFAFSTILSWNLFGKINMIYLFGEKSRNVYTITALGFIFVGTLTTSDMVWELSDMFNQLMVIPNVLALFALTNAVVDRLKSGK >NZ_CP014673.1|WP_065820925.1|2167766_2168597_-|LD-carboxypeptidase MKTVGIVACSNGQKMELKKQNEELVNYLESIGNKVILSNCIYEKDGVFSGSGKERAAELMRMFNNPDIEEIYDISGGDVANQILDDLDYAAIKNSKAIFWGYSDLTTIINAIYSQTGKCSVLYQVRHLVCSGYAEKQRYRFENRKELFNPTFVLVQGKSMEGVVVGGNIRCFLKLSGTKYFPDLRGKLLLLESYGGEVPQMTTYLAQLKQIGAFEQVKGILLGTFTKMEENKCQPDIVTLVKEFAGERIPVAKTREIGHGSDSKAIIIGERLVVSN >NZ_CP014673.1|WP_015359563.1|2168668_2169334_-|HAD-family-hydrolase MKKYTNILFDLDGTLTDPKVGITKSVAYALKSFGIEVKDLDSLCKFIGPPLRVSFRDYYGFSEEECNRAVEKYREYFSETGMFENRVYPGIEELLKSLKKNGRKLFVATSKPTVFAVKILEHFDLLRYFDDVSGSELDGSRDRKGDVIRFALQKNGLTGLTNVVMVGDREHDVVGAKENNIDVIGVLYGYGDRAELEKAGADYIVENVENLHSLLCRSGGS >NZ_CP014673.1|WP_065820926.1|2169436_2170630_-|26S-protease-regulatory-subunit MKKNRFKGRLIIVLSCVAVIAVAAAAALLNQKNGTYVKYKEFNKLLSDGKIKSVAIYTDRVEFQKEGDSRKYYTDNPETDGFKERLLLSGIDVKDNTKGEGGFAVVFDIFFDAAFIAIIVTVIYKIFGEYFTSFRVVKHTGVTFDDIAGMDDLKREMMYAVDILKHSDEYRKKGIRPTRGIVLEGPPGNGKTLFAKALAEEAGVNFIATKGADFQSMFMSVGPRKVKQLFRKARRNKPCIVFIDEFDGIGERRNFAGSGVDKENNRIITAMLNEMDGFENEDGVLVIAATNSYASLDPALIRPGRFDLKYTVPNPDQETRIKLIRMYTRKNRLSADIQTEELAKKFNGLSCSAIETVLNEAAVVMMSERKSEIDMNCIIKACRKTGILKNMSAIDLK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP014673_6 | 6.8|1828730|36|NZ_CP014673|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1828730-1828765 | 36 | NZ_CP014673.1 | 1844816-1844851 | 0 | 1.0 |
1. spacer 6.8|1828730|36|NZ_CP014673|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to position: 1844816-1844851, mismatch: 0, identity: 1.0
tcatattatccgtcgcttggacgctgggaggatcta CRISPR spacer tcatattatccgtcgcttggacgctgggaggatcta Protospacer ************************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP014673_7 | 7.53|1834592|33|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1834592-1834624 | 33 | NC_012811 | Methylorubrum extorquens AM1 megaplasmid, complete sequence | 344430-344462 | 6 | 0.818 |
NZ_CP014673_7 | 7.37|1833545|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1833545-1833578 | 34 | NZ_CP010111 | Bacillus thuringiensis serovar indiana strain HD521 plasmid pBTHD521-5, complete sequence | 169165-169198 | 7 | 0.794 |
NZ_CP014673_7 | 7.49|1834330|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1834330-1834364 | 35 | MH001446 | Mycobacterium phage Megabear, complete genome | 45628-45662 | 7 | 0.8 |
NZ_CP014673_7 | 7.49|1834330|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1834330-1834364 | 35 | AP018462 | Mycobacterium phage D12 DNA, complete genome | 46255-46289 | 7 | 0.8 |
NZ_CP014673_7 | 7.49|1834330|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1834330-1834364 | 35 | MK494131 | Mycobacterium phage GodPhather, complete genome | 46495-46529 | 7 | 0.8 |
NZ_CP014673_7 | 7.49|1834330|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1834330-1834364 | 35 | MK494114 | Mycobacterium phage Argie, complete genome | 45992-46026 | 7 | 0.8 |
NZ_CP014673_7 | 7.49|1834330|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1834330-1834364 | 35 | MK494132 | Mycobacterium phage Cepens, complete genome | 45707-45741 | 7 | 0.8 |
NZ_CP014673_7 | 7.49|1834330|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1834330-1834364 | 35 | AP018463 | Mycobacterium phage PR DNA, complete genome | 46232-46266 | 7 | 0.8 |
NZ_CP014673_7 | 7.49|1834330|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1834330-1834364 | 35 | MH001450 | Mycobacterium phage Jeon, complete genome | 46237-46271 | 7 | 0.8 |
NZ_CP014673_8 | 8.2|2149345|35|NZ_CP014673|CRISPRCasFinder,CRT | 2149345-2149379 | 35 | MN692987 | Marine virus AFVG_117M51, complete genome | 39368-39402 | 8 | 0.771 |
NZ_CP014673_3 | 3.8|791996|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 791996-792030 | 35 | MN694321 | Marine virus AFVG_250M307, complete genome | 34150-34184 | 9 | 0.743 |
NZ_CP014673_7 | 7.12|1831904|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1831904-1831938 | 35 | NZ_CP024166 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gaminara strain CFSAN070644 plasmid pCFSAN024441_01, complete sequence | 1576-1610 | 9 | 0.743 |
NZ_CP014673_7 | 7.33|1833284|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1833284-1833317 | 34 | MK813941 | Aeromonas phage 4_L372XY, complete genome | 123798-123831 | 9 | 0.735 |
NZ_CP014673_7 | 7.37|1833545|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1833545-1833578 | 34 | NC_018510 | Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid pBTHD789-3, complete sequence | 140335-140368 | 9 | 0.735 |
NZ_CP014673_7 | 7.37|1833545|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1833545-1833578 | 34 | NZ_CP024772 | Bacillus thuringiensis LM1212 plasmid pLM1, complete sequence | 187950-187983 | 9 | 0.735 |
NZ_CP014673_7 | 7.37|1833545|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1833545-1833578 | 34 | NZ_CP013280 | Bacillus thuringiensis serovar israelensis strain AM65-52 plasmid pAM65-52-5-100K, complete sequence | 19183-19216 | 9 | 0.735 |
NZ_CP014673_7 | 7.37|1833545|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1833545-1833578 | 34 | NZ_CP039726 | Bacillus thuringiensis strain BT-59 plasmid p5, complete sequence | 28233-28266 | 9 | 0.735 |
NZ_CP014673_7 | 7.37|1833545|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1833545-1833578 | 34 | NZ_CP009350 | Bacillus thuringiensis HD1002 plasmid 4, complete sequence | 48013-48046 | 9 | 0.735 |
NZ_CP014673_7 | 7.37|1833545|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1833545-1833578 | 34 | CP016195 | Bacillus thuringiensis serovar coreanensis strain ST7 plasmid pST7-1, complete sequence | 32407-32440 | 9 | 0.735 |
NZ_CP014673_7 | 7.37|1833545|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1833545-1833578 | 34 | CP016195 | Bacillus thuringiensis serovar coreanensis strain ST7 plasmid pST7-1, complete sequence | 243472-243505 | 9 | 0.735 |
NZ_CP014673_7 | 7.37|1833545|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1833545-1833578 | 34 | NZ_CP041074 | Bacillus tropicus strain LM1212-W3 plasmid p1, complete sequence | 165233-165266 | 9 | 0.735 |
NZ_CP014673_7 | 7.43|1833937|36|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1833937-1833972 | 36 | NC_013940 | Deferribacter desulfuricans SSM1 megaplasmid pDF308, complete sequence | 215575-215610 | 9 | 0.75 |
NZ_CP014673_7 | 7.53|1834592|33|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1834592-1834624 | 33 | LR134125 | Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5 | 295732-295764 | 9 | 0.727 |
NZ_CP014673_7 | 7.53|1834592|33|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1834592-1834624 | 33 | NZ_CP030828 | Neorhizobium sp. NCHU2750 plasmid pNCHU2750a, complete sequence | 551236-551268 | 9 | 0.727 |
NZ_CP014673_7 | 7.77|1836166|36|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1836166-1836201 | 36 | NZ_CP043834 | Bacillus sp. BS98 plasmid unnamed4 | 14688-14723 | 9 | 0.75 |
NZ_CP014673_7 | 7.77|1836166|36|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1836166-1836201 | 36 | NZ_CP020436 | Bacillus sp. FDAARGOS_235 plasmid 2, complete sequence | 28260-28295 | 9 | 0.75 |
NZ_CP014673_7 | 7.119|1838915|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1838915-1838949 | 35 | NZ_LR215032 | Mycoplasma gallopavonis strain NCTC10186 plasmid 2 | 171906-171940 | 9 | 0.743 |
NZ_CP014673_7 | 7.119|1838915|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1838915-1838949 | 35 | NZ_CP027186 | Acinetobacter baumannii strain AR_0052 plasmid unnamed4 | 30072-30106 | 9 | 0.743 |
NZ_CP014673_7 | 7.119|1838915|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1838915-1838949 | 35 | CP035673 | Acinetobacter baumannii strain VB23193 plasmid unnamed1, complete sequence | 2081-2115 | 9 | 0.743 |
NZ_CP014673_7 | 7.119|1838915|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1838915-1838949 | 35 | CP035673 | Acinetobacter baumannii strain VB23193 plasmid unnamed1, complete sequence | 13245-13279 | 9 | 0.743 |
NZ_CP014673_7 | 7.119|1838915|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1838915-1838949 | 35 | CP035674 | Acinetobacter baumannii strain VB23193 plasmid unnamed2, complete sequence | 7539-7573 | 9 | 0.743 |
NZ_CP014673_3 | 3.5|791802|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 791802-791836 | 35 | NZ_CP031005 | Lactobacillus curvatus strain TMW 1.1928 plasmid p-1.1928_2, complete sequence | 11565-11599 | 10 | 0.714 |
NZ_CP014673_7 | 7.17|1832231|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1832231-1832265 | 35 | NZ_LR134399 | Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 2, complete sequence | 75428-75462 | 10 | 0.714 |
NZ_CP014673_7 | 7.115|1838657|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1838657-1838690 | 34 | NZ_CP021367 | Acidovorax carolinensis strain P4 plasmid pACP4.1, complete sequence | 28333-28366 | 10 | 0.706 |
NZ_CP014673_7 | 7.115|1838657|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1838657-1838690 | 34 | NZ_CP021363 | Acidovorax carolinensis strain P3 plasmid pACP3.1, complete sequence | 14384-14417 | 10 | 0.706 |
NZ_CP014673_7 | 7.115|1838657|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1838657-1838690 | 34 | NZ_CP021360 | Acidovorax carolinensis strain NA2 plasmid pACNA2.1, complete sequence | 49761-49794 | 10 | 0.706 |
NZ_CP014673_7 | 7.115|1838657|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1838657-1838690 | 34 | NZ_CP023408 | Streptomyces fungicidicus strain TXX3120 plasmid p1, complete sequence | 719930-719963 | 10 | 0.706 |
NZ_CP014673_7 | 7.115|1838657|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1838657-1838690 | 34 | MT889376 | Arthrobacter phage Phives, complete genome | 5677-5710 | 10 | 0.706 |
NZ_CP014673_7 | 7.115|1838657|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1838657-1838690 | 34 | MT889376 | Arthrobacter phage Phives, complete genome | 39486-39519 | 10 | 0.706 |
NZ_CP014673_3 | 3.17|792583|35|NZ_CP014673|CRISPRCasFinder,CRT | 792583-792617 | 35 | NZ_CP035514 | Haematobacter massiliensis strain OT1 plasmid pOT1-4, complete sequence | 51311-51345 | 11 | 0.686 |
NZ_CP014673_6 | 6.7|1828665|35|NZ_CP014673|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1828665-1828699 | 35 | NZ_LR214986 | Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13 | 347305-347339 | 11 | 0.686 |
NZ_CP014673_7 | 7.33|1833284|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1833284-1833317 | 34 | NZ_KJ776578 | Clostridium botulinum strain CDC3875 plasmid pCDC3875, complete sequence | 13202-13235 | 11 | 0.676 |
NZ_CP014673_7 | 7.33|1833284|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1833284-1833317 | 34 | NZ_KJ776581 | Clostridium botulinum strain IFR_05/025 plasmid p05/025, complete sequence | 13202-13235 | 11 | 0.676 |
NZ_CP014673_7 | 7.33|1833284|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1833284-1833317 | 34 | NZ_KJ776580 | Clostridium botulinum strain CDC5900 plasmid pCDC5900, complete sequence | 18013-18046 | 11 | 0.676 |
NZ_CP014673_7 | 7.111|1838398|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1838398-1838431 | 34 | NC_001277 | Pediococcus pentosaceus ATCC43200 plasmid pMD136, complete sequence | 19394-19427 | 11 | 0.676 |
NZ_CP014673_7 | 7.111|1838398|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1838398-1838431 | 34 | NC_002126 | Pediococcus pentosaceus plasmid pMD136, complete sequence | 15495-15528 | 11 | 0.676 |
NZ_CP014673_8 | 8.2|2149345|35|NZ_CP014673|CRISPRCasFinder,CRT | 2149345-2149379 | 35 | AP014362 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S41-C102, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 15166-15200 | 11 | 0.686 |
NZ_CP014673_7 | 7.119|1838915|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1838915-1838949 | 35 | NZ_CP020859 | Lactobacillus salivarius strain ZLS006 plasmid unnamed1, complete sequence | 146706-146740 | 12 | 0.657 |
1. spacer 7.53|1834592|33|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_012811 (Methylorubrum extorquens AM1 megaplasmid, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.818
--gccctggccgccgccgacagaagcagagcggct CRISPR spacer cgggcctg--cgccgtcgaccgaagcagagcggcc Protospacer * **** *****.**** *************.
2. spacer 7.37|1833545|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP010111 (Bacillus thuringiensis serovar indiana strain HD521 plasmid pBTHD521-5, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
ccaccatta-atttcaaaaggtcaatatattcttc CRISPR spacer -aaagatgagattgcaaaaggtcaatatcttcttc Protospacer * ** * *** ************** ******
3. spacer 7.49|1834330|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH001446 (Mycobacterium phage Megabear, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
atagggttttgaaagggtttcggaagggtttgaaa CRISPR spacer ggagggttcggaaagggtttcggaagggtttcgga Protospacer . ******. ********************* ..*
4. spacer 7.49|1834330|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP018462 (Mycobacterium phage D12 DNA, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
atagggttttgaaagggtttcggaagggtttgaaa CRISPR spacer ggagggttcggaaagggtttcggaagggtttcgga Protospacer . ******. ********************* ..*
5. spacer 7.49|1834330|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK494131 (Mycobacterium phage GodPhather, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
atagggttttgaaagggtttcggaagggtttgaaa CRISPR spacer ggagggttcggaaagggtttcggaagggtttcgga Protospacer . ******. ********************* ..*
6. spacer 7.49|1834330|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK494114 (Mycobacterium phage Argie, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
atagggttttgaaagggtttcggaagggtttgaaa CRISPR spacer ggagggttcggaaagggtttcggaagggtttcgga Protospacer . ******. ********************* ..*
7. spacer 7.49|1834330|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK494132 (Mycobacterium phage Cepens, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
atagggttttgaaagggtttcggaagggtttgaaa CRISPR spacer ggagggttcggaaagggtttcggaagggtttcgga Protospacer . ******. ********************* ..*
8. spacer 7.49|1834330|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP018463 (Mycobacterium phage PR DNA, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
atagggttttgaaagggtttcggaagggtttgaaa CRISPR spacer ggagggttcggaaagggtttcggaagggtttcgga Protospacer . ******. ********************* ..*
9. spacer 7.49|1834330|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH001450 (Mycobacterium phage Jeon, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
atagggttttgaaagggtttcggaagggtttgaaa CRISPR spacer ggagggttcggaaagggtttcggaagggtttcgga Protospacer . ******. ********************* ..*
10. spacer 8.2|2149345|35|NZ_CP014673|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN692987 (Marine virus AFVG_117M51, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tctacgacaatagcatcaggtctaaatggttgacc CRISPR spacer ccatcaacaataccatcaggtctaaacggtttagc Protospacer .* *.****** *************.**** * *
11. spacer 3.8|791996|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694321 (Marine virus AFVG_250M307, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
acaggagtctagtttttctccgtctttttctaaaa CRISPR spacer cccatcttctagtttttctacgtctttttctaacg Protospacer * . ************ ************* .
12. spacer 7.12|1831904|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024166 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gaminara strain CFSAN070644 plasmid pCFSAN024441_01, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ataaaaatgattatttcaaaatttccgttaactta CRISPR spacer aaaagaatgattatttcataatttccgaaaaaaat Protospacer * **.************* ******** **
13. spacer 7.33|1833284|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK813941 (Aeromonas phage 4_L372XY, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ttagtctag--tatttcttatttctctatatttaat CRISPR spacer --aatacaatctatttattatttatctatatttaac Protospacer *.* .*. ***** ****** ***********.
14. spacer 7.37|1833545|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_018510 (Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid pBTHD789-3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ccaccattaatttcaaaaggtcaatatattcttc CRISPR spacer aaagatgaaattgcaaaaggtcaatatcttcttc Protospacer * **** ************** ******
15. spacer 7.37|1833545|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024772 (Bacillus thuringiensis LM1212 plasmid pLM1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ccaccattaatttcaaaaggtcaatatattcttc CRISPR spacer aaagatgaaattgcaaaaggtcaatatcttcttc Protospacer * **** ************** ******
16. spacer 7.37|1833545|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013280 (Bacillus thuringiensis serovar israelensis strain AM65-52 plasmid pAM65-52-5-100K, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ccaccattaatttcaaaaggtcaatatattcttc CRISPR spacer aaagatgaaattgcaaaaggtcaatatcttcttc Protospacer * **** ************** ******
17. spacer 7.37|1833545|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP039726 (Bacillus thuringiensis strain BT-59 plasmid p5, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ccaccattaatttcaaaaggtcaatatattcttc CRISPR spacer aaagatgaaattgcaaaaggtcaatatcttcttc Protospacer * **** ************** ******
18. spacer 7.37|1833545|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009350 (Bacillus thuringiensis HD1002 plasmid 4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ccaccattaatttcaaaaggtcaatatattcttc CRISPR spacer aaagatgaaattgcaaaaggtcaatatcttcttc Protospacer * **** ************** ******
19. spacer 7.37|1833545|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP016195 (Bacillus thuringiensis serovar coreanensis strain ST7 plasmid pST7-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ccaccattaatttcaaaaggtcaatatattcttc CRISPR spacer aaagatgaaattgcaaaaggtcaatatcttcttc Protospacer * **** ************** ******
20. spacer 7.37|1833545|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP016195 (Bacillus thuringiensis serovar coreanensis strain ST7 plasmid pST7-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ccaccattaatttcaaaaggtcaatatattcttc CRISPR spacer aaagatgaaattgcaaaaggtcaatatcttcttc Protospacer * **** ************** ******
21. spacer 7.37|1833545|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP041074 (Bacillus tropicus strain LM1212-W3 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ccaccattaatttcaaaaggtcaatatattcttc CRISPR spacer aaagatgaaattgcaaaaggtcaatatcttcttc Protospacer * **** ************** ******
22. spacer 7.43|1833937|36|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_013940 (Deferribacter desulfuricans SSM1 megaplasmid pDF308, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tatataatatcaattatgtaatgaatactatcaagc CRISPR spacer tatatcatatcaattatataatgaataaatataaat Protospacer ***** ***********.********* .**..
23. spacer 7.53|1834592|33|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gccctggccgccgccgacagaagcagagcggct CRISPR spacer accgtggccgccgccgacaggagcaggccaaac Protospacer .** ****************.*****. *.. .
24. spacer 7.53|1834592|33|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP030828 (Neorhizobium sp. NCHU2750 plasmid pNCHU2750a, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gccctggccgccgccgacagaagcagagcggct CRISPR spacer ccgctggccgccgccgactggagcagacgatcg Protospacer * *************** *.****** . *
25. spacer 7.77|1836166|36|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP043834 (Bacillus sp. BS98 plasmid unnamed4) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
gtagaatcgataaaataaatgctactaaatttaaag CRISPR spacer ttcgaatcaataaaataaatgatactaaagatagcc Protospacer * *****.************ ******* **.
26. spacer 7.77|1836166|36|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020436 (Bacillus sp. FDAARGOS_235 plasmid 2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
gtagaatcgataaaataaatgctactaaatttaaag CRISPR spacer ttcgaatcaataaaataaatgatactaaagatagcc Protospacer * *****.************ ******* **.
27. spacer 7.119|1838915|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR215032 (Mycoplasma gallopavonis strain NCTC10186 plasmid 2) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
gttttgctaatttcagtcaaatcatcatattcaaa CRISPR spacer tttttgctaatttcaggaaaatcatctaagtttca Protospacer *************** ******** * *. *
28. spacer 7.119|1838915|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP027186 (Acinetobacter baumannii strain AR_0052 plasmid unnamed4) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
gttttgctaatttcagtcaaatcatcat--attcaaa CRISPR spacer gttttgataatttcattcaaatcatttttagtttg-- Protospacer ****** ******** *********. * .**..
29. spacer 7.119|1838915|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP035673 (Acinetobacter baumannii strain VB23193 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
gttttgctaatttcagtcaaatcatcat--attcaaa CRISPR spacer gttttgataatttcattcaaatcatttttagtttg-- Protospacer ****** ******** *********. * .**..
30. spacer 7.119|1838915|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP035673 (Acinetobacter baumannii strain VB23193 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
gttttgctaatttcagtcaaatcatcat--attcaaa CRISPR spacer gttttgataatttcattcaaatcatttttagtttg-- Protospacer ****** ******** *********. * .**..
31. spacer 7.119|1838915|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP035674 (Acinetobacter baumannii strain VB23193 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
gttttgctaatttcagtcaaatcatcat--attcaaa CRISPR spacer gttttgataatttcattcaaatcatttttagtttg-- Protospacer ****** ******** *********. * .**..
32. spacer 3.5|791802|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031005 (Lactobacillus curvatus strain TMW 1.1928 plasmid p-1.1928_2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tctgacttcaaagttttgatttgaaagtctttacg CRISPR spacer gcagtgacaaaagttatgattcgaaagtctttacc Protospacer * * . ****** *****.************
33. spacer 7.17|1832231|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR134399 (Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
gataaagtcatttatttctttgagaagagcattat CRISPR spacer cgtaaagtcattgatttatttgagaagtacggcaa Protospacer .********** **** ********* .*. .*
34. spacer 7.115|1838657|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021367 (Acidovorax carolinensis strain P4 plasmid pACP4.1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gccaatgagggcggcggccttcagggcttcctct CRISPR spacer gccaatgagggcggcggccatctggtgctgggtg Protospacer ******************* ** ** .* .
35. spacer 7.115|1838657|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021363 (Acidovorax carolinensis strain P3 plasmid pACP3.1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gccaatgagggcggcggccttcagggcttcctct CRISPR spacer gccaatgagggcggcggccatctggtgctgggtg Protospacer ******************* ** ** .* .
36. spacer 7.115|1838657|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021360 (Acidovorax carolinensis strain NA2 plasmid pACNA2.1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gccaatgagggcggcggccttcagggcttcctct CRISPR spacer gccaatgagggcggcggccatctggtgctgggtg Protospacer ******************* ** ** .* .
37. spacer 7.115|1838657|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023408 (Streptomyces fungicidicus strain TXX3120 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gccaatgagggcggcggccttcagggcttcctct CRISPR spacer ccccatgacggcggcggccttcaggccgcgtccg Protospacer ** **** **************** * . ..*
38. spacer 7.115|1838657|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT889376 (Arthrobacter phage Phives, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gccaatgagggcggcggccttcagggcttcctct CRISPR spacer ggcggcttcggcggcggccttcttggcttcctcc Protospacer * *... ************* *********.
39. spacer 7.115|1838657|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT889376 (Arthrobacter phage Phives, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gccaatgagggcggcggccttcagggcttcctct CRISPR spacer gcgcgccttggcgggggccttcagggcttcgtcg Protospacer ** .. ***** *************** **
40. spacer 3.17|792583|35|NZ_CP014673|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035514 (Haematobacter massiliensis strain OT1 plasmid pOT1-4, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
atgatcgttgtggaaaacgaatacttcgtttccac CRISPR spacer gattccgttttggaaaacgaatactacgttaatag Protospacer . .**** *************** **** .*
41. spacer 6.7|1828665|35|NZ_CP014673|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_LR214986 (Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
cttttttaaagtcaattatttctgctccaggataa CRISPR spacer gttttttagactcaattatttctgctttctttttt Protospacer *******.* ***************.. *
42. spacer 7.33|1833284|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KJ776578 (Clostridium botulinum strain CDC3875 plasmid pCDC3875, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
ttagtctagtatttcttatttctctatatttaat CRISPR spacer aattttctttatttgttttttctctatatttaac Protospacer *.. ***** ** ***************.
43. spacer 7.33|1833284|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KJ776581 (Clostridium botulinum strain IFR_05/025 plasmid p05/025, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
ttagtctagtatttcttatttctctatatttaat CRISPR spacer aattttctttatttgttttttctctatatttaac Protospacer *.. ***** ** ***************.
44. spacer 7.33|1833284|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KJ776580 (Clostridium botulinum strain CDC5900 plasmid pCDC5900, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
ttagtctagtatttcttatttctctatatttaat CRISPR spacer aattttctttatttgttttttctctatatttaac Protospacer *.. ***** ** ***************.
45. spacer 7.111|1838398|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_001277 (Pediococcus pentosaceus ATCC43200 plasmid pMD136, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
gatatgaaagcgattcttgaattgccaaagatgc CRISPR spacer catttgaaagcgattcttgaatcgctgtattcat Protospacer ** ******************.**.. * ...
46. spacer 7.111|1838398|34|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_002126 (Pediococcus pentosaceus plasmid pMD136, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
gatatgaaagcgattcttgaattgccaaagatgc CRISPR spacer catttgaaagcgattcttgaatcgctgtattcat Protospacer ** ******************.**.. * ...
47. spacer 8.2|2149345|35|NZ_CP014673|CRISPRCasFinder,CRT matches to AP014362 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S41-C102, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
tctacgacaatagcatcaggtctaaatggttgacc CRISPR spacer agccagacaatagcatcaggtgaaaatggtagtgt Protospacer . **************** ******* * .
48. spacer 7.119|1838915|35|NZ_CP014673|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020859 (Lactobacillus salivarius strain ZLS006 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.657
gttttgctaatttcagtcaaatcatcatattcaaa CRISPR spacer cgacgaacaatttcagtcatatcaacatattcatt Protospacer . . .*********** **** ********
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
141463 : 234717
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP014673|141463:234717|DBSCAN-SWA AATCAGGATTGGCTCATTTGTACCTAAAAACAACATATTCCTTGCCCCTATGGCGGGCGTAACCGATATGCCGTTCAGGTACCTGTGTTCCAGAATGGGAGCAGGCCTTACATACACCGAAATGGTAAGCAGTAAAGGCATGTACTATAACGACAAAAAAACCGAGCTTTTAACGGTTACCCATCCGGAAGAGGCTCCGTGTGCGGTGCAAATATTCGGCTCAGAGCCTGAAATAATGGCAAAAGCCGCTGAAAAACTAAGCATGCGGGATGATATAGCTATAATAGACATTAACATGGGATGCCCTGCGCCGAAAATAGTAAAAAACAATGAAGGCTGCGCATTAATGAGGAATTTGAAACTGGCGTCGGAAATAATTAAGGCAGTTGTAAAGGCATCTTCAAAACCAGTAACGGTAAAGTTCCGTAAAGGCTTTAACGAAGACAATGCCGTCGAATTTGCCAAAATGGCTGAAGAGTCAGGCGCCAGCGCCGTTACTGTCCATGGCAGGACGCGGGAACAAATGTATTCGGGAAAAGCAGACTGGGATGTAATTGCCCGGGTAAAACAGGCAGTTTCAGTTCCTGTAATCGGGAACGGGGATATATTTACTCCTGAAGACGCCAGGGAAATGCTTGAAAAAACCGGGTGCGACGCAGTAATGGTGGGGAGAGGCGCGCAGGGAAATCCATGGATATTTAAAAGAATTCTTCATTATATATTATATGGTGAAATACTGCCTTACCCAACGGACGGCGAAAAATTGGAAATCATACAGGAGCATTATAGGATGATGATTGAGCTTAAGGGCGAGGAAACGGCAGTTAAGGAAATGAGAAAGCATATAGCCTGGTACCTTAAGGGTATGCCCGGAGCCGCGGCGCTGAGGGCCGAGATATTCCAGGCAAAGACCTTCAATGAGGTGCTGGATATTTTAAATGAGTATTTCAGCAGGCTGCAATAAATTTTTCAGGAAATATATTTCCAACATGAGTTAAATTGTGGTAAACTGTTGCTGCCATGATGACGATATATTAATTTGCAGGTTTATTAAAGGAATGTATTTATCCTGTTACCGGAGATTGCTATAAAGTTACAATTTGTTTACACATACCGGCGGTTTGTTGACGCACTAAAATACCAATGATATAATAACGTTGAAATTCATGATATGCTGCCGATGCATATCCTGAATTTATAAAAAAGCAAAGTTAGATTATCAGGGAAGCGGGGTAATCTGACTTTGTAAAAATAAAAAAGGCCGCTTCAAACAAATTTCAAAAGGGAGGATTTAGTTATGAGGAATCTCAAAAAGCTGTTTGCAGTTGTCATGATCGTTGCAATGCTTGCATCAATCATGGTACCTGCACTTGCAGCCAACGGCTTCGAGTATGAAGAAGAAGCTAAGAAGCTGAAGGCTCTGAACCTCTTCCAGGGATACTCCGATACCGAACTCGGTCTGGGAGACGACCTGACAAGAGAGCAGGCACTTGCACTCATGATCAGGGTCATGGGTCTTGATGCAGAAGTTAAGGCTATGACCGAAAAAGAAGTTGCCACTTACATGGCAAGAGTAATTGACGCTGAAACTGTTACTGCAACATGGGCAAGACCGTATGTTGCATACGCAATCAAAAATGGTCTTACCAAGGGTATTGATGCTTCGGTTGCTCCGAACGTTAAGTTCGCCGGAGATCTAAAAGTAACAGGTAAGGAATTCATCAACTTCATGCTGTATGGCATGGGTTATAAGGATGTAGCATGGGATTCAGTGCTTGACAAAGCTGCTGAAATCGGAATGCTCAGTGCCGGTGAAGCTGTTAGGTTCGGTACAATCCAGGTACTGACAAGAGACAATGCTGTAGGTATTATGTCAAAGGCTATGAATGGTACCACAGCTGAAGGCGTTACCTTGGCTGAATACCTGATCAACATGGGTGCCGTTGACGCTGACAAGATGGCTGAGTACGGCTACTACACACCTACACCGACTCCGACAGAAGCTCCGAAGGAACTTACAGCTGAAGCTTATGCTGACAATCTTGCACAGGTAACTGTAGTATTCAGCGATAAGGTAGATGCTGATTCAGCTAAGAATAAGGACAACTACAAGATTAATGACGGAGACATCAAGATTGACAAAGCTGAACTCCAGGATGATGGCGTAACAGTAGTATTAACTCTCGCATATGACAGTGCTGTTAAGAATAAGAACCAGGATAAGTTCAATCTTACCATCAAGGGCGTAAAGACAGTTGATGGAGTAGAAATTAAAGAAACAACCCTGAAGGATGTAGAATTCTTTGATGAAACCATTCCGACTGTTGTAGACGCTAAGGTTATTGGTAAGGACACAATTAAGGTAACCTTCTCCGAACCAATGAAGGCTACTAAAGTTGAGCCAGTAGGCAATAACAAAGTTTACTATCTTGACAAGGCTGCTTTCGTTGTTAACAATGGAAAGCTGTATGTTAAGGAAGTAACACTGCAGAACAACTACACCGAAGCCCTTGTAAAACTTTATTCAACACTCAAAGAAGGCGAAATGACAATTCAGGTTAAGAGCACAGTTGAAGACTTCGCTGGCTTTGGTGTAATAGGCAAACTGTTCACTCTGAACGTTGTTAAGGATACAGAAGCTCCGGTTGTAATTGGTTACGAAAATGCAAAACCGACAGAAGTAACCCTGATTTGGAGCGAAGATATCCAGTTTGACGGTAAGAAACTGTCAGAATGGTATCATACCAATGGTAAGAACACTGCAAGTGATGTTACCATTGACGGAAACAAGACAACTCTGACATTCAGCAAGGACAACAGACTGCCTGAAGGAACAGCATATGTATATGTTCTGAAGGAAGCTGTAAAAGACTACTGGGATAACAAGAATGATCAGCAGATGATCAGAGTAGAAGTTGAACTCGATACCACACCGCCTGAAGTTAAGGAAGTAAAACAGGGCGACACTGAAGATACAGTAATTGTAAAATTCAGTGAAAAGATGGATAAAGATAGCGTTAAGGACAGAGCTAACTACACCATCCTTAACAACAAAGGTGAAGAACAGAAGGGTCTCGTAAGATCTGTTGAAGTAAGCAGCGATCTGAAAGAAGTTACCCTCAAACTTTCAAAGAAGATCGGCGGAACTTATACACTCGTTATTAAGAACGTAAAAGATGAAGCAGGTAACAAGATTGAAGAGACAGCAGTAGAATTTACTGTTGTAGATAAGACTGCTCCGAAGCCCAGTGACTTTAAAGCTTACCTCTACAACGCTGGCAAAGCTGATCAGATGATCAGAATTACATTCGGAGAAGAAATGGCAGTTGACGGTAAGTACTCTGTAGCAGATATCGAAAAATACCATTATTATGATGTAACCTCTTCTGTCTACAAGACATTTAAGAGTCTGAAGAATGTCGAAATAGTTGTAGTAGATGACGGTAAAGCTGTTGAAATTACCGTACCTGCAACTGTTGACGGCAAAACCAACAAGGAATTCAAAGATGGCGACGTTATAAGAGTTGCAAGAGTAGCAGATGCTGCTGGAAACTACACTGCAGAGCTTGTATTTGATTTAGTACTCAATGTACCCGGCAGTGTTGCAATTAAGAGGGTAGAAGCTACAGCACGTGATACAGTTAAGATAACATTTGCTGATCAGGTTAAGTTTGAAGTAGAAGACTTCAGTGTAGTTGACGATGTATACAAAAAGCCCTATGATTTTGCTGAAGTTGATGTAACTCTTAATGATGACGGTAATACAGTTGCAACTATCAAGCTGGCTTCCAAACTCGGTTACACATGGACTGAAGGACAGATTAAGTTAGTCGTTAAGGACGAGCCTAAGACAGAAAATGCATACGGTGTACCCGTATCAAAAGCCAGCAAGAATGTCGAAGATAAGGTAGCACCTGAGCTGCTTTACGATGACGGAAGAGACGATAACGATTATGATAAGATTGGTAAAGGTCTTGGTGACTACTTAGAAATCCTCGGTAAGGACACCTTCATGTTCAAGCTCTACTTCAGCGAAGCTATGAAAGCAGTAATCAACGAAGCTTATGTAGGTGCAGATTTCATAATTAAGATTGACGGAACCACCTATGTAAACGGTAAGGATTACAGAGTAGTTGAAGTTAAAGATAATGCTATAACATTCAAAATCCTGAAGAAAGAGAAAGTAACAGGCGGATACGAAGTTAAGGGCGATCTCGAAATTTCATTGGTTGAAAGTCCTAACTACGTAACCGATATGAACGGAAATGCACCTAAGGCATTCGACACCATCGTATTTGAAGACCTGTACTTCTTCACAGCTAATTAATAAATATTGCTGATAACCGGGAGACATTTCTGTCTCCCGGTTTTGTTTTTTATGTGTAGTAACAAATCTTAAAAGTTCAATACTGTCTGTTAGTTTGTAATATTTCCAGAAATATAAGGATTCAGTTCATCCAACATAGTAATAAAAATACTTTATAACTTATTGACATAACCTAAAAACTTTGATACGATTTTGTTCAGAACTTGAACAAAATCGTTTCTTTTTTTACGGTGTTTCGGCCCGTAAGAAAAGTACGATATTAAAATATAAATTTAATTTATGGCATTTTTAGGCTAATAGATGACAGGTTGGCTTAAAAATGCTAAAGATAAAGTATTGTCAAAAATTAAAATATGATAAACGAACTTGAAATTTTAAAAAGTGTCAATGAAGAAAACAAAATAACGCAAAGAGAGTTAGCGAAAAGAACAGGGCTTTCCCTTGGTACAGTGAATGTGCTGATAAAAAGGCTTATACATAAAGGACTTATAAAGATCGAACACATTAATTCCAGAACAATAAAGTACGTTCTGACCCCAAAAGGCATAGCGGAAAAGGCACGACTTACATATCAATACATTGTTAATTCGTATTATTACATCATAAGCGTTGAACAAAAGATAGAACAAATAATAAGCAATAAAAATGAAGAAAAAAAAGTGATTTTATATGG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69 | Enterobacteria_phage(18.75%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
321574 : 377281
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP014673|321574:377281|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP014673|321574:377281|376840_377281_+|WP_015358154.1|transposase|DBSCAN-SWA MDEFIKQLDQNLDYICHEIINGRCYITVASNRKEVICPFCGWPSSKTHSTYSRTFQDLPIQGNKVFIIMRNRKMFCNNPDCNHTTFAERFDFISDKAKKTQRLEDEIVRLSLNCSSVAASKTLRENVADVGKSTICNLLKKRNTCC >NZ_CP014673|321574:377281|349343_350222_-|WP_015358024.1|DBSCAN-SWA MPYCVKCGVELDTKLKACPLCKTPVYMPDETDENANKPYPERIQKEHPRYVNLVPSKAFVYLMTFILIIPLIVCLMIDLRKNGTITWSFYPVTSIILVWILMAYPALMKRYSFLKVLTIDIYSLVLFLISLDAYSGNFLSWSVYPVASLLLVWVYFLLGFLFGKRHPFFLAFIAYISTGLYLYLIEQATGSLWFFDLALPLLTLLLALTLLTFILSRFKFFGGIALVGLIFCAISAFCFGAEFIINRFVFGNGLSLFWSLIVAGVLLPIAAFLFFVQRNEELRLYLEKKFHI >NZ_CP014673|321574:377281|324230_324665_+|WP_015358003.1|DBSCAN-SWA MKTFMANESNIERKWYVIDVEGKVLGRVASEVAKILRGKHKPEYTPHVDTGDYVIVVNASKVVLTGNKLDKKIYRHHSGWIGGLKEIQARKFLTEKPEKAFELAVKRMLPKNRLGRKMFKKLKVYAGPEHNHQAQKPEVLELDI >NZ_CP014673|321574:377281|329786_330203_+|WP_015358009.1|DBSCAN-SWA 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48 | unidentified_phage(16.67%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
842254 : 893696
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP014673|842254:893696|DBSCAN-SWA 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38 | unidentified_phage(16.67%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
971421 : 980423
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP014673|971421:980423|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP014673|971421:980423|979499_980423_+|WP_015358597.1|DBSCAN-SWA MGDFIIETKGLTKKYGEQYAVKNVNMHVKKNTIYGLLGRNGAGKTTVMKMLLGIVKPTSGEIRIFGKDIKNNEREILPRIGNLIERPGFYPNLTGTENLKIFAELRGIPQKDAVEKALDLVSLPYKEKKLFGEYSLGMKQRLGIALAIMHDPELLILDEPINGLDPIGIAEMRKLLRDLCDKKGKTIIISSHILSEIEMISDDIGIIDNGVLIEEASISDLKNKNRKSIGFCVSDTNRAAALLEDEFGIRNYGVSSEDKIFVYDFSCDVSTLIKAFVKNDIDVYDAHVYENSLEDYFKKITGGVGIA >NZ_CP014673|971421:980423|978453_979365_+|WP_015358596.1|DBSCAN-SWA MIETAVMIVLVCACIYLLYKYKQLKGSVMRVSRELAEMGEEESTRRKILIRRNAPFSEIVFSINAIIDKKNTEIEKLKLSEKAHRSLLTNLAHDLRTPLTTLIGYLEAMDMDLNREKNAEYLQTALSKAKQLKDNVNQIFEWAKLYSNTDELNLKRTDLSEYTRMVLIDWVPIFEKRNINYDIDIPDSRLDGYIDEISYQTVINNLIKNIIEHADAKNVKVRLTGEEEKIKLEISDDGVGIDPGLKEKIFEEFFKVSGARGGTGSGLGLSIVRLLVEKQKGNILVDTGKNKGTSFKITFPRVE >NZ_CP014673|971421:980423|974121_975870_+|WP_015358593.1|DBSCAN-SWA MNLYGRYFKKYWFPFLTAVFCVACEAVCDLLAPTLMSNVINMGIAQSQISQVYYWGSRMLLVTFLGACFAVTRNILASMVSQRMGADLRYDLFEKIIYFSERSVDKIESGSLITRMTNDTSQIVQFVNGIMRIFMKAPITCAGSIVLASMLNFRLSLIVYCVVAIVAALIIVSMKLSYPRYSVFQKAMDKVNSVVQEYLIGVRLVKAFGTYEEESEKFENANSNLMKSGISAQMIITLISPVITFTVGIGTVTVIYAGSRLFAVNLANPGDITAFTVYMSQMLTSLIMITNIFNTFVRTKASTARIKEVFECDGDFTGGEEKELNGDIEFENVTFAYPNGSGVPALKNLSFSVKSGETLAIIGPTGSGKSTLAWLLLRFYDVNGGRILINGCDIRELDVELLRKNIAIVPQKPMLFSGTVAENIRWGNREATDEMVRKAAKTALADDFVSRMKDGYESLLGSGGVNLSGGQKQRVSIARAILKNSPVLILDDATSALDAVTEAKVRENLMNRDRTQTVIIITQRCSTAMYADRILVLDNGEKVGYGTHEQLMKECEVYRDIYRTQIESSRGGAVNGTEYFKT >NZ_CP014673|971421:980423|971421_973905_+|WP_034843652.1|DBSCAN-SWA MRVKILVAEDSTVERTIIKDMLSDYQVLTACDGVEAMHVLNEHNDVDILILDLNMPRMDGFQVLEALRCDRRFKNLRTIILTNYDELENEIRGLRLGAVDFIRKPIHMHSLKARIDVHVTLLRAQQALEQRLDEQTLTFDMIFTQAPIGIAISHELKGHDKPVIKVNPMFEQIVGRTEEEINIIGWEKITHPDDLGEDAENLKKLRAGEIGMYCMDKRYIRPDGSVVWVHMIVAPLILPEDRIFGHICLVQDITDRKIFEEALHESERSKSVFLSHLPGLAYRCNYDREWTMQFVSDGCYALTGYRPESLLNNRELSFKDIISPEYREALWNKWKEVLAQRQQFKYEYEIITATGERKWVLELGQGIFNDNGEVEALEGIILDISDRKAVEDALKYNNEHDRTTGLYNREYLISLLENDLKKKKDIKKALIGVNLTAVQLLTVKYGFNYTQSLIKKAAAVLSALCSENRQLFHVRENRFVFYIVGYSDKNELVEFGNAVAETLESLFITDRINGGIGIVEIDQHQSEINAELLMRRMLLATDRSINLYDNDYVICFYDDELESMVNREIEIERALFAIANDTGTKDELFLHYQPILDLKSGSICGFEALCRLKTEKLGLVSPAEFIPVAEKTKLIIPIGEKVIINAFKFLSRLNENGYGNISVSVNISVIQLLKPEFTDRLLELLAKMNINPGNICLEITESVFSSDFARINKAINKLRTAGIHIAIDDFGTGYSSLAREKELNVDSLKIDKYFIDNLLDANPDKVITSDIISMSHKLGHCTVAEGVEHDIQLHYLMEHDCDRVQGYLISKPLDENNAIEFLKNYSA >NZ_CP014673|971421:980423|977764_978457_+|WP_015358595.1|DBSCAN-SWA MVVDEKRNILVVDDDEDLCKLLKDYLEKQSYNVDIKNNGVDALLSVLKREYALIVLDIMMPLLDGLDTLKKIRETSSVPVLMLTAKAETEDKVKGLNTGADDYGARVNSLIRRATEFNAAGGTKKGIYVFDNLEIDDIQKKVFLNSNEVKLNPKEYQVLLYLAQNAGRVFTKKQIYEAVWEEPYEYDDSNIMSVISRLRSKIESVSGGEKHKFIETVKGMGYRFVSGGKK >NZ_CP014673|971421:980423|975844_977722_+|WP_015358594.1|DBSCAN-SWA MGQNISRPETKMPSFGAMRPGGGPSRFAPGAKPKNAKGTMTRIIKIYMRWGKSIFLAMFLTAVSSLISVTIPYFTGKTFDAFELAARTVDTGMLVKYLLIIVALHAINWLISAFSGVIILKVSQKLVYTVRKEVFEKMQKLPLEFYDTRSHGDTMSRITNDVDNISSTIAQTTTQLISSILTLIGSLVVMVRMNIPLTLVVLLCIPLVTALTRLIASRSRAYFLEQQRNLGALNGIIEENILGLKMVKAFGKQKDVLKKFREVNEKLNESSTKAHIWSGYMMPLLNVINNLVFTATAITGGILAVNYNLPVSTVVSFLSYSKQFAHPLNSIAGMFNTIQSALAGAERVFEILDSEEEAADPEGAADLEHPKGHVVFDNVSFSYNKTTPVLRNINFSVKAGEVIALVGETGAGKTTIVNLLMRFYDPDDGRILIDNKPITGIKRNSLRKCFSVVLQDTCLFTGTIMDNIRYARKDATDEEVIRAAKIARAHDFISRLPNGYNTMVSGATDNLSQGQRQLIAIARAVLCDSPILILDEATSSVDTKTEKDIQRALVNLMKNRTCFLIAHRLSTIRDADHILVISDGRIVESGNHESLMNQRGQYYKMVISQMGINSPLYKDVCKSEL |
6 | Bacillus_phage(83.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1283800 : 1295219
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP014673|1283800:1295219|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP014673|1283800:1295219|1291463_1295219_+|WP_015358856.1|DBSCAN-SWA MAVRRIYVEKKPGFDVKARKLMEEITEYLKIKGIENVRIINRYDVEGISDEDYEKAKTLIFSEPPVDYVYEEELPLRDNERVFAVEYLPGQYDQRADSCAQCIQLLSGTERPEIRVATVIAIGGDISDKDFEKIKEYYINPIESREAALTKPETLREEYAVPDMVDVIKGFTLMDEEALEKLITELGFAMSVEDLVFCREYFKNTEKRDPTVTELRVIDTYWSDHCRHTTFLTEIEEVSFDKGSVSEKISEVYNLYLETRKKVYKDREKPVCLMDIATLAMKELKREGYLNDLDESDEVNACSIVVDVDIDGRKEPYLVMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCLGGAIRDPLSGRAYVYQAMRVTGSGDPRTPVTQTLPGKLPQRVITRKAALGYSSYGNQVGLATGQVNEIYHEGYVAKRMEIGAVIAAAPKSNVVRKKPEAGDVVILLGGRTGRDGCGGATGSSKAHTEESLTKCGAEVQKGNPPTERKIQRLFRNPEVTRLIKKCNDFGAGGVSVAIGELADGLEIDLDAVPKKYQGLDGTELAISESQERMAVVVAKEDAERFIALSAEENLEATIVARVTDTNRLVMKWNGEKIVDISREFLNTNGVKRRTKVTVKEPGNIFDNCGQKDGRDFSENFKNNLLRLNVCSQKGLIEMFDSTVGAGTVLMPLGGKNQLTPAEGMAAKIPVANGETRTGTLMSFGFDPDISSKSPFHGAVYAIVESVAKIVAMGGDHRKVRLSLQEYFEKVGDDPVKWGKPFSALMGAFYAQMKMKIPAVGGKDSMSGTFKDLNVPPTLVSFAVSVCDVTKVISPEFKNPRSTVAVVKIKRDELGLPDFEHLDRTYERLHGLITENRIVSACTVKCGGIAEAICKMAFGNDIGFSSRTGISPEKWFLPDYGNIVVEVPGGHDIDELFEGLDYEVLGETTDEPVISVGNEKWNLDELKELWQSPLESIFPTKVKEEERKPMNIMFDGMKPVHHSGTFAKPRVFIPVFPGTNCEYEAAMAFERAGAVTDIFVMKNLTPADIKESVKIMKEKIKNSQIIMLSGGFSAGDEPDGSGKFIATVFRNPELAEAVMEFLKVRDGLMLGICNGFQALIKLGLLPYGEIRSLDEKSPTLTFNKIGRHVSCVVRTKVVSTLSPWLSKCMPGDIHTIAVSHGEGRFVADDDIFEELARNGQIATQYVDFDGNPTYDIRFNPNGSLHAVEGITSPDGRIFGKMGHSERYTKYTLKNVPGEKDQKLFEAGVEYFK >NZ_CP014673|1283800:1295219|1285827_1286358_+|WP_034837886.1|DBSCAN-SWA MTVFMSWISKSAIPALIIIILLSGIIKKVPVFDTFLEGAREGLETTVRILPVLVGIMLGIEILSSSGALDMIVHLLKPLAAFLKIPEEILPMAIIRPISGSASLGLLKKQLEEYGPDSLIGRTLSVIMGSTETIFYTITVYYGAIGVKKTRYTLWVSLIAAFAGLISAVVVCRILQ >NZ_CP014673|1283800:1295219|1289834_1291220_+|WP_065820703.1|DBSCAN-SWA MGVFNNNYYDNNNSYSYQGYSSNDHQNTSSYYSYYGSYNSYSQNQSQNYDDLKTSSFYSESYEKPRKGKIREMLVPMIIVALISSVIGGAVVGAWFQFGAPAVVQNNQSSGNSQTGVQQIKQVEIVGSYESPATAIAEKVSPSIVGIKVTYWVSNYWFGAQQNSGSGSGIIIRSDGYILTNNHVIEDAISSGNEIAKGASIEVILPNQPDESYEAKVVGRDEKTDIAVLKIELSELPAAEIGNSDELKVGELAIAIGNPAGLEFMGSVTQGIISGLNREIQVGNGKTLKVIQTDAAINPGNSGGALVNSKGQVIGVNTVKISGSEYEGLGFAIPINTAMEIANSLISDGYVKGRPQLGVSIDTRFTEELAKSYNVPVGLLVADVSPLSAAYNAGIKAGDIIVEFNGVPVKTFSELENEKNKYKAGDTVTLRIYRIKNTNARGQYDGEYLDIQVTLGEDKGN >NZ_CP014673|1283800:1295219|1286486_1287173_+|WP_065820702.1|DBSCAN-SWA MNNKTRILIVDDDINICQLLKLYLDKEGYENIAVHDGKQALEVFREFTPNLVILDIMLPGMDGWQVCREIRKFSNIPIIMLSARDETFDKVLGLELGADDYVAKPFEPKELIARIKAVLRRYDRVYNSQEQLIFPGLVVNKSNYTIRVHGKEMELPPKELELLYFLASNPNKVFTREQLLENVWGFDFYGDTRTVDVHVKRLREKLEPPDPHWQLKTVWGVGYKFEVK >NZ_CP014673|1283800:1295219|1283800_1284655_+|WP_065821183.1|DBSCAN-SWA MEEVKTGTLYLVATPIGNLEDITYRALKTLKEVDLIAAEDTRHSLKLLNHFEIKKPLISYFEHNKTKRGEEIIKHLLEGKNIALITDAGTPGISDPGEDLVRLAIENNINVTVIPGCTASVTALVLSGLPIRRFAFEGFLPHDKNERKKYLELLIDEGRTMVFYISPHNCLDVLKEMKEILGDRKGTLCRELTKKYEEVIRGTLSEIIESLKSGNRMKGEMVLVIEGAPKKDDCEKEDWLSVSLDEHMNFYLSQGYDKKEAMKLVAKDRGITKREVYAQYMRKT >NZ_CP014673|1283800:1295219|1287172_1288642_+|WP_015358853.1|DBSCAN-SWA MFRSVFHKILAVFLVVLLLCFSIAAVFFNFAINKYVVEQRTQVLNVYGQKILSALDIVLKNRLDPMSSFIFQNLLEGFANNTSSLIWIADDRGYLFAYSSIPGEFANKLNMVRGIYQLPEQKQYAVSESDGVETEIGTFYGLFEDTGMKWLTVKIPFYFPDIRVDGRELRGNVLMHTPIPEIQKTGYTIFSLLIPAIFISLIISYILVYFLSKRIINPLKQMTDVAREISSGKWSTRIHLNGNDEIKVLADTFNQMLDNLENLEKMRRDFIANVSHELRTPMTSINGFIEGILDGTIPEDKQKYYLSIVKDEVKRLYRLVSDLLDIARMEAGEIKLNPAVFDVCEVIRLSVIQLQQFIESKNINFRASFEQEVMYVYADRDAIQRVLINLIHNAIKFTQENGNISVSVRNVKNKVEISVSDDGQGIPPEDIPFVFDRFHKADKSRSKDKTSVGLGLYIVKNLLNAHKENITVESELGKGTTFTFWLPAA >NZ_CP014673|1283800:1295219|1288707_1289475_-|WP_015358854.1|DBSCAN-SWA MNKKAKVFFAVLVLSSLVPTFANAATYTVVKGDSLYTLGQLFGTTSGTLMTRNGLKSTVIYPGQKLEVPATVYTVQKGDSLYLIAKKYGITLSALRKANGKWDDMIYVGQKLIIPGSASVTANSAASANNSAISYTQSDLDLLARLITAEANNQPYTAKVAVGAVVINRVKDSRFPNTIRGVIYEKSYGYYQFTPVQNGMINKPASQEALKAAYDALNGVDPTNGALYFFDKTATNKWLWSKPIALRAGDMIYAY >NZ_CP014673|1283800:1295219|1285237_1285825_+|WP_015358850.1|DBSCAN-SWA MLNYIWVGMIIVGIVCGLITGRMEQVTEAVIASSEEGVNLAILLTGVMCLWSGLMKIAQKSGMVNAITRATRDFFAGLFTGIPENHPATGAIVLSFTANLLGLGNAATPLGIKAMESLQTLNEKKDTATDDMILFMVINASCIQLIPTSVIVLRDAAGSVNPASIIPHVWISSLISTVTAILFYFIFRSFDKRRG >NZ_CP014673|1283800:1295219|1284705_1284948_-|WP_015358849.1|DBSCAN-SWA MKSTGIVRKVDELGRVVLPIELRRTLDIAEKDALEIYVDEESIILKKYEPACIFCDNAKGITVFKGKNICPDCLKELKNL |
9 | Bacillus_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1299214 : 1360634
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP014673|1299214:1360634|DBSCAN-SWA 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52 | Bacillus_phage(23.08%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1563264 : 1617901
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP014673|1563264:1617901|DBSCAN-SWA 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54 | Bacillus_phage(21.43%) | coat,integrase,tRNA,transposase,protease | attL 1563233:1563257|attR 1616981:1617005 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1971686 : 2036296
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP014673|1971686:2036296|DBSCAN-SWA 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50 | Corynebacterium_phage(14.29%) | transposase,integrase | attL 2006341:2006364|attR 2007239:2007262 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2169436 : 2206077
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP014673|2169436:2206077|DBSCAN-SWA 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32 | uncultured_virus(33.33%) | tRNA,head,transposase,tail,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2211214 : 2265515
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP014673|2211214:2265515|DBSCAN-SWA 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64 | Erysipelothrix_phage(75.68%) | holin,terminase,capsid,head,portal,tail,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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