Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP015626 | Staphylococcus pseudintermedius strain 063228 chromosome, complete genome | 4 crisprs | WYL,RT,PrimPol,cas3,DinG,csa3,DEDDh,cas1,cas2,cas10,csm2gr11,csm3gr7,csm4gr5,csm5gr7,csm6,cas6 | 0 | 7 | 14 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP015626_1 | 108638-108750 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP015626_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP015626_1
>1.1|108667|55|NZ_CP015626|CRISPRCasFinder TGAATTTGTATCAGCAAGTGCGTCAACGTCAGCAAGTACGTCAGCATCAACATCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP015626_1
The CRISPR arrays of NZ_CP015626_1 >merge|NZ_CP015626|1|108638-108750|CRISPRCasFinder ACAAGTGAAGCTGTAAGTACAGAAGCAAGTGAATTTGTATCAGCAAGTGCGTCAACGTCAGCAAGTACGTCAGCATCAACATCAACAAGCGAAGCTGTAAGTACAGAAGCAAG >NZ_CP015626|1|1|108638-108750|CRISPRCasFinder ACAAGTGAAGCTGTAAGTACAGAAGCAAG TGAATTTGTATCAGCAAGTGCGTCAACGTCAGCAAGTACGTCAGCATCAACATCA ACAAGCGAAGCTGTAAGTACAGAAGCAAG
>NZ_CP015626.1|WP_134950415.1|101984_103586_-|chordopoxvirus-G3-family-protein MSXLNDAESLSDTDVDVDALSESLVDVLVDLLNDAESLSDTDVDFDALSESLVDVLVDLLNDAESLSDTDVDVDALSDSLVDVLVDLLNEAESLSDADVDVDALSESLVDVLVDLLNEAESLSDTDVDVDALSKSLVDVLVDLLNEAESLSDTDVDVDALSESLVNVLVDLLNEAESLSDTDVDFDALSESLVDVLVDLLNEAESLSDTDVDVDALSESLVDVLADLLNDADVLSDADVDVDALSESLVDVLIDLLSEVDVLSESLVDVLVDLLNDVDALSESLVDVLVDLLNEAESLSDTDVDFDALSESLVDVLVDLLNDAESLSDTDVDVDALSESLVDVLVDLLNEAESLSDTDVDVDALSESLVDVLVDLLNDVDVLSDTDVDFDALSESLVDVLVDLLSDVDVLSDTDVDFDALSESLVDVLVDLLNDAESLSDTDVDFDALSESLVDVLVDLLNDAESLSDTDVDVDALSESLVDVLVDLLNEAESLSDTDVDVDALSESLVDVLVDLLNDAESLSXSXVDVDXLS >NZ_CP015626.1|WP_134950414.1|100374_100731_-|hypothetical-protein MSIYLMIRTXLSDTXXDFDALSESLVDILVDLLSDAESLSDTDVDFDTLSESLVDVLVDLLSDADVLSDADSLAATDXDLLIDWLXDILAAXLNDADLLSDTDVDFDVLXDLLIDVPH >NZ_CP015626.1|WP_065520309.1|97428_100317_+|hypothetical-protein MTRKFREFKKSLSEEKARVKLYKSGKNWVKAGIKEFQLLKALGLSFLSHDIVKDENGEVTTQFGEQLKKNALRTTAFAGGMFTVNMLHDQQAFAASDAPITSELATKSQTIGDQTSIVIEKSTSSDQSTNPITESESKHDSESISLSEHQTSESTSLSTSTSKSISTSVEESESTSKDSHTKTQDSQSDSHQSTSQEVNGSSNHEQSTPHTAQSLTSLSIESQTSTSNTSLKETKEGELSKNLSKLSQNQNIKLHEEHTMRSADLNSGYTGFRAAYYVPRSRTTPTTKVYTGQGSFRGRGRIKYDIFYKVVVTSNGKEMKIRYTLSQDNPNTSNVEKPRWAGQKRYGIKNGWDAGPGRGQLKLGSAFGKPTVRQGVTIQNYGVWAVGSNVKPVSGDHNNGYYWQPAVLSPKHGEAGYGVTAEITVPIVNPTGRFNWEFHPVGQQDGVGGMTDYFENVWIRDYDPYYKYIQTNEGRASVSNSISEVKASESRSTSLVQSESIRRSQSISESESIVAASHSASVAKSQSISRSQSVAKSQSISRSQSIAHSRSASVAKSQSISRSQSIAHSRSASVAKSQSISRRQSIAHSRSASVAKSQSISRRQSIAHSRSASVAKSQSISRSQSIAQSRSASVAKSQSISRSQSIAQSRSASVAKSQSISRSQSIAHSRSASVAESQSISRSQSIANSQSVAASESESLSISLSKKQSISMSNSESAAKSHSLSVKRSNWIKKSKAASVRKSHSLSVRKSNSAKRSHAISVRKSKSLSVKKSIAQSQSASVAKSQSISRSQSVAASESASLSKSKSTSLSNSVSAEKSTSLSRSASVAKSQSISRSQSVAASESASLSKSKSTSLSNSVSVEKSTSLSRSASVAKSQSISRSQSVAASESASLSKSTSTSTSDSDSASTSTSVSDSDSASLSKSTSTSTSDSDSASASLSKSTSTSTXRTQIARXQRNRRH >NZ_CP015626.1|WP_014612817.1|95178_96672_-|malate-dehydrogenase-(quinone) MPTQSEPKDIVIIGAGVLSTTFASMIKDLEPEWNLKLYERLDSPGVESSNERHNAGTGHAALCELNYTVKQPDGSIDIEKAKEINEEFEISKQFWSHLVKSKNIDTPRDFINPLPHISFVRGKNNVQFLKDRYNKMKDFPMFDNIEYTEDIEVMRKWMPLMMQGRSASDIMAASKIDEGTDVNFGELTRKMAKSIEAHKNADVHYNHEVRDFNRRKDGKWEVTVVNRNTGESHVQLADYIFIGAGGGAIPLLQKTGIPESKHLGGFPITGQFLMCTNPDVIEEHGVKVYGKEPPGTPPMTVPHLDTRYINGRKALLFGPFASIGPKFLKNGSNLDLFKSVKPYNITTLLAAAVKNLPLIKYSIDQILMTKEGCMNHLRTFYPEAKDQDWELYTAGKRVQVIKDTEEYGKGYIQFGTEVVNSQDHTVIALLGESPGASTSVSVALEVLERNFAEYVPEWTPKLQEMIPSYGKSLIEDVDLMRKIRQQTSKDLELNYYE >NZ_CP015626.1|WP_019169745.1|95063_95165_-|DUF2648-domain-containing-protein MKKLLVVATVLTAAFVALKRYQEHVNKAPNIEY >NZ_CP015626.1|WP_065520308.1|94446_94713_+|Txe/YoeB-family-addiction-module-toxin MGNYSVLIKNSAKNDLKKIKKSLLKEQFSKIIEVLKINPYEASQSFEMLQPKHSARYSRRLNHQHRVVYTVDDEKREVYIFSAWSHYE >NZ_CP015626.1|WP_014612814.1|94189_94447_+|type-II-toxin-antitoxin-system-Phd/YefM-family-antitoxin MIIKTPTNARKEFYELLKQVNDNHEPIIISGSKSENNAVIVSQEDWDSIQETLFLEYTGTMDKVRAREKDDSGYTNIDDIDWDNL >NZ_CP015626.1|WP_020219985.1|92091_93996_+|triacylglycerol-lipase MHKINKRNTFTLRKRPMGVSSILIASGLLMFAGHDGKAAERSASQDVGVVAKQQELSLYQQKDGDEPTRHDAPTVVNHERETTEKASVDHLHTYTHSSDTTTVSKELDNEKIYGTVPPSPRVPKDQSNEATPVKTEDSHTQLTQKPELDSEFSAIENDNKEAKEQTKHAQRPESDFSVVEQQHKDKYITREVKQAPKVVEASTEDVAPTDADKRNKGVVPDSKINTPSPRLTTHSETQATSAPTITKLDKSAVENKWKHKDPIIFVHGFSGLVGDNAPKGSNYWGGTKYKMIEELRHAGYNVFEASVSAFGSNWARAAELYAYIKGGIVDYGAAHAAKYGHQRYGKTYEGILPNWHSDQKIHLVGHSMGGQTIRLLEQLLRNGDLEEIAYQKEYGGTISELFQGNQDNRITSITTIATPHDGTVASDDLGNTEIIKRLLYEYNVFAGRTGQTIDYGLKHWGLEQREGETYAEYAKRASKSPLFTSQDTALYDLTREGAKKLNARTDLNPNIYYKTYTGSATYETIFGTQIAHPYMNIAHVLTGDLIGMTENPAWRENDGLVSVISSQHPEDEAFEFVDFTAPAVKGIWQVTPTLKGWDHTDFTGKDVLDWRRSGAELQNFYHRLVEDLVSKEEV >NZ_CP015626.1|WP_015729749.1|91337_91832_-|membrane-protein MAFIILLIFFIIRLFSLAISIKHSKQLVQQGAQAYGEKNSKWLAITHILIYVGAAIETLLNHDTWSIVNTVGLIIIVLAYLVLFHVIKTLGPIWTLKLYILPDHPIIRSGLYRVTKHPNYYLNIIPELIGVLLLTHATYTAILLIPYAYFLFVRIRQEEKLMSL >NZ_CP015626.1|WP_014612811.1|90237_91044_+|N-hydroxyarylamine-O-acetyltransferase MNIQKVDQKIEIDAQKLSFNRVEALNEYMYQFMHHVPFENISVQNGVEISTDLNELFEKIVEQSRGGFCYELNTFFAAYLEAKGYETQYLSATVHTPDGGRSIAGAHLSLGVMLDGEMYIADVGFGGASPVKAMRVTDDGSETVEDKSGVYRALRVDDDIKIQKYEDDHWETSFVASAEPRSLSDFDDKLEYNQHHPDSPFVNHLIVTKPTSTGRVTMSQSNLTVTDKKGKHKTPVTSNNYRHFLKKYFDMDIVIPRLESEEKTSTEK >NZ_CP015626.1|WP_080552900.1|109264_110488_+|accessory-Sec-system-protein-translocase-subunit-SecY2 MKNNRITKIINQYEYKIFYKRIAFTILILLIYILGSKITIVDENAMRQHDSAFYKLAVSNMGGDIHQLNVFSLGLGPWLTAMIIISLITYKNMEKAMHQTRAEKHYKEKFLTLGLSIIQGYFVINQFVRHTDAERFTELLLLLILVTGAMLMMWLADQNMRYGIAGPMPIVLLSVIKSMFTQSLPIVSIEILMLVVMVILIIVALFILLLTELIEYRIHYRDIIEMPTPGQPTYLAWKINPGGSISIMISLSVFLLLTSTINLIFNMVTGKTPHLQWLSFGHYMGVTIYLILQTVLGYLLSRLIVNTKQNTKDFLKNGNYFIGIRPGADTGNYLNHLAKRLCWFGTTIVTAIIGVPLYISLLVPDLSEYIYFAVQLMIMVYLAMNITETMRTYLYFDKYGAFLNQYW >NZ_CP015626.1|WP_014612820.1|110498_112064_+|accessory-Sec-system-protein-Asp1 MKHFIPAWYTTDDWWRSQALPFHRTLKVNEFDELISLMNIHLKNKAPFEMMVLNYSPNLRLFLHRQELFEATYWSLFDEIQGFTHQTPRPIDYRQFNWPNGTEFVHSLFLIRALTGPHMYSEIQFSQEGYLLWIETFEKGVQKNRCIFDDRGFLSSFLSCDAHGQFAEHYYMTANGDWIMKEDLLLGGVTIHPDYAHRFKYAYYDNMPALIDEYINHYKTKISSKDVIITASDVRHNPIISRHFSTQRLCFSVYQQRENALSDEGMASIKEGPYCLIDTMENERRIADCGILSSETQKRLRITPFDVRITPNVSNQLHESLIGVWIDGIDQGRLVTIVNYLINELECRPQTRVVFLTRREEYQVPEWIQAEVNRIQNFFKERHTESKVLQEFPQKGKRDSIVYASLKSVPFEIDVAEAVSTLRLVIDLNEEPDLFLQICCLGAGLPQISRMETDYVKHGRNGYVISNDADLTEGIAYFLDYLKHWNHAYAYAMKLAKAYESNEILKMLDDWLEGETHEATL >NZ_CP015626.1|WP_014612821.1|112047_113592_+|accessory-Sec-system-protein-Asp2 MKQRYKMLQIGGENYASHFKDRDEVSWTSMPLDSLSDLEELKKLVEEEKQFDFVFVQVPYSEMLMQAFRLVSQPYNTYVDQRFWNSFFEAEEVVRTRFIRCFSYDSEEDCIKRLMALAFSKQYGDRIHPIHCKVNPLFKGETYYEGRHQLVLKGNFGETYTPILSWNMYLYYDRYKVNEIWLEYTSSPHVEVSYTLRLYENLNMDNLIREFVLEGERLIEPFAIPSMDKDAYIFVTAKAKGEGTLKVGNIHKRWSRMEHGQFILGGQRWSSEDRGEFIHFFHPGDLKPPLNVYFSGYRTAEGFEGYYMMEKFKAPFLLISDLRLEGGGFYLGNDAFENQIKKVIQDTLEWLGFKEDEMIMSGLSMGSFGALYYGAQLNPAAIVVGKPLVNIGGIAENMRLMRPEDFGTALDILLTNERGLDDEAIERLNQKFWTTLNQNQIDQTLFAISYMEHDDYDLYAFQNLLSALSRQGARVMSRSTPGRHNDDTPTITSWFSHFYFMIMESQFGRVRDER >NZ_CP015626.1|WP_065520314.1|113581_114508_+|accessory-Sec-system-protein-Asp3 MSDKHPFNIRWTHVTKDTFMYGTKLKWSSTGVLFENALMPSGIVIHEWKMMTDFQTDVNVPDLPILKKNCTYHFYFDYDVQPENSIYFKVIFKRRNGTTCGFQIIKTHEADVTVPEDTFSYVIQMINAASTQLLFRQITIKEARLEIHRKDGVRISSMQNPNVNVARTTLIFAPKEGLDSELIKGIQNCMLVTGWDVKASTYEITHLVEMIKEKTKGYRCQLVGYDKRSNKMAKLIGNHLKATIFVTSDTDNAQENAPNIHDAKDSTIVIYQGNETVTQSCQWLDAVLNKSHQLRGLNVQRLNGGQIE >NZ_CP015626.1|WP_063279027.1|114504_116892_+|accessory-Sec-system-translocase-SecA2 MSQSLHKTINKMRLRRLKRILKHIQQYEKSFQTLPDDVLQQKTVTFKRQLLQKETTLEAILPEAYALVREASRRVLGMFPKDVQVLGAIVLHEGNIAEMQTGEGKTLTATMPLYLNALTGKGAYLITTNDYLAKRDYMEMKPLFEWLGLSIALGFVDIPDYEYEKGEKQAIYQHDIIYTTGGRLGFDYLIDNLAESREGKFLPTLNYGIIDEVDSIILDSAQTPLVISGAPRVQSNLFQVVNTFVQTLENKRHFKMKKTKKEIWLTADGIEAANAYFGVDNIYDAPYFDLVRNINLCLRAQFLFENNMDYFVYQGEVVLIDRINGRMMHGTKLQSGLHQAIEAKENVEMSMDMSVMATITFQNLFKQFNVFAGMSATSHLGEKEFLDLYSKVVIQIPTHRPIQRIDYPDRVFKNIEDKHQAIIERVKTLYTEQRPVLLITRTAESAEYFSAALFALDIPNNLLIAQNVAKEAQMIAEAGQLRAVTVATSMAGRGTDIKLAEGVPELGGLAVIISEHMENSRIDRQLRGRSGRQGDPGTTQIYISLEDYLVKRWSDHQISRIKRLEKFDTHTLQNSRLFQKHVRKIVKRAQRLSEEQGIKVRETSNEHEKSISVQRELVYKERNRVLQFKSLEEIQLEQLALEVFEEAFEHTHFTVSEWVDYIYKNLSFQYKGQLEGVDLRDINAVTQYLLKLFKQQLAYQRQHLDDYFYTYFVQKAILKAIDSNWIKQVDHLQRLKNSVNTRQNGKRNPIFEYHKVALESFELMTDAIKKDIVKYLCQSITEKEDDRHLIVHFPN >NZ_CP015626.1|WP_065520315.1|116907_118416_+|accessory-Sec-system-glycosyltransferase-GtfA MTIYNINFGIGWASSGVEYAQKYRAEALRGLDVPLKFVFLDFMSSENIQTLTSNLGFQDDEVIWLYQYFTDIKIAPTTYTIDDIKSSIHEEVVREEVDGSVRWLYLEQPGSFITCYLKNEDEPYVDCAEFVINNKLVRKDYYSYTRTFSEYYAPADQKAKLYMRHYYNEDGSVVYTEYIDEGTHVYAFKDQLFYTKEEFVAYFIQNLKLTSEDIVIYDRATKVGQAMLQNKGDSKVGVVVHAEHFSENATDEDHILWNNYYEYQFTNVKEIDFYITATERQNEILSQQFKQYLNAEPPIYTVPVGSLNQLNKPASPRHAYRMVTASRLASEKHIDWLVRAASIAKKEVPELTFDIYGEGGERVSIENWIEKLGAHDYIRLLGHQKLDDIYKNYPLFVAASTSEGFGLTLMEAVGSGLGMIGFDVNYGNPTFIRDGKNGYLVPIEVKEDSNEKIIDSLAQAIIRFFNDGPVDPHETSYAIATPYLIENTRQKWKELIEEVLHG >NZ_CP015626.1|WP_014612825.1|118408_119740_+|accessory-Sec-system-glycosylation-chaperone-GtfB MVNLFEYFNSDTRELYETLRISGHHDETIVLVDDGFLPEGIRSPYQFFANYQVPDKQRARYFNEVPVPRYWEIEGNNDEAWVKDMSDRRAMIYFHPSEKRRLVSHVEWLNRKGQLQYVDHYNQHGFRYAQTVYDLTGNMIFRRYLDQQGNEVIYENFVASSVILTWKGEQYHFSDSIDFYTFFLKAIDVNLENIVINSLSTPFLILYQLDIPGNDILFWQETSYGEIPGNMRVILEKDTPRHCRILIPEREEYENIYAQLTDEERQFIAHSGYLYNYQSENNYTMNILTMTNSDQIENLEAIVQSCPFAQFHIGAVTEMSSKLTAFERYANVHLYQAIELDTVETVYRKCDVYLDINNGGEIINAVKKAFDFNMLILGYSDIAHNRRFTAPENLFEKEKDASALIQALKDINLKKRYFKLRLQYQQDHANETTIEAFNQIFKA >NZ_CP015626.1|WP_065520316.1|119801_120983_-|thiolase-family-protein MREAYIVAYGRSAVAKAKKGALFHERPDDVAAEVLKGVLNRIDGAFHPDMVEDVIVGNAFPEGLQGQNIARTIALRAGLPNSVPGQTVNRYCSSGLQTIALAANQIMAGQGDILVAGGIEFMSAVPMGGNEPTNNPTLQQQDVGASYPMGLTAENVAETYQVAREDQDAYAVQSHQRATEAQQKGKFTDEIIPIRVNKVSYDENGPHVDTEIFDTDELVRPDTHMEALSQLPTVFKADGTVTAGTSAPLSDGVGFVVLMSKEKVTALGVTPIARFVGYKAVGVDPKLMGIGPAFAIPEVLDLTHLTIDDIDLIELNEAFASQTIASMREVGLSEEKTNVNGGAIALGHPLGATGAILTARLLAEMKKRSNVRHGMVTMCIGVGMGAAGVFELV >NZ_CP015626.1|WP_015729735.1|124561_126076_-|acyl--CoA-ligase MNFDWIKTRADFDVEKPAVIDHLKGTQWSYQQLNIRADHMAHYLTKQGIQKGDVVGVLAPNDVALLDLLFACFKTGAVFLPINWRLNPKEIAAIVEDSTLKLLFYAEKHLSSLNEVNPKYLHMDIDSDAYNQIVDPSQHSVFKAINVESTDLAALIYTSGTTGVPKGVMFSYESFVHNGANIELTYKFNSDYLTIISTPMFHVLGFNDTVLPTLMAGGTLVLQRYFNGEELNNMIAQYHPDFLIMIPTMYYSTLTQDNFNPEHFRAMKYVIQGGSQPLPSIQQAFKKHGINIINGYGLTEAPLVLVNTPENARQKPMSIGKAVMFVDAKVLDDNKNEVGLNEIGELAIRAKNVTPGYWNKPEETAKIFHNQYLLTGDLAKKDVDGDIFIIDRKKELIITGGENVLPSEVENALAEHPLIDRCVVVGYEHPKYGESIAAAIILREQPEDYVDQLDQHMRERLAGYKVPRMYLPVTHMPLNSTQKPDKLAITKIMNDKAQQQTSEQ >NZ_CP015626.1|WP_015729734.1|126094_127666_-|acyl-CoA:acetate/3-ketoacid-CoA-transferase MKMCTWAAIPSLVKTGDVIGLAALTVSNLPAALLSSLIEHYNQHHEPTQLTMMMANDISSRGLATELDDFVERHMVDRVIMSIMTASPRTAQAIKHNELEAYFLPQGVIATHYRQTNAITPGVITKIGLNTHIDPRYQGGRVNDKTTASLVSFLNIDGEDFLHYQLPPLDVALLRGTYADEQGNIYMDEEAHLGESYSLALNAKSNGGTVIVQVKAIVDKGQQNPNHVYIPGSLVDYVYVVEDTSQHRQVIQTMYQPTLSGQARIDIIPEPPLPFNVRKLMLRRAAQFLSVGDTMSIGYGINNELTNLLHEEHVNDLVQPIMDIGIFGGFIGSREHFGMNYNSDVRMRHELTWDYIYNGGVSIALMSFAEVDQHGNVNVSYFGNRMNGCGGFIDISQSVQKLILTGTLIAGAKLSIEDQQLSVVEEGHTQKFVETVSNIDFNASYAKSLHQEVFFVTDRAVFELQEDGLTLIEVAPGLDIEQDIIAQMGFTPKISPQLKEVDPTMYQAKWGQLRQMIQSNRIV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP015626_2 | 590452-590572 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP015626_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP015626_2
>2.1|590484|57|NZ_CP015626|CRISPRCasFinder AAAAATTTTCGAGTAACTCAAAAGAAAAATATTAAAAAATCATGTGAAACCAATGAT |
RT,PrimPol |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP015626_2
The CRISPR arrays of NZ_CP015626_2 >merge|NZ_CP015626|2|590452-590572|CRISPRCasFinder ATCAAGGGTTTTGTGAGCTTTCGAGTAAAGAGAAAAATTTTCGAGTAACTCAAAAGAAAAATATTAAAAAATCATGTGAAACCAATGATATCAAGGGTTTTGTAAGCTTTCGAGTAAAGAG >NZ_CP015626|2|2|590452-590572|CRISPRCasFinder ATCAAGGGTTTTGTGAGCTTTCGAGTAAAGAG AAAAATTTTCGAGTAACTCAAAAGAAAAATATTAAAAAATCATGTGAAACCAATGAT ATCAAGGGTTTTGTAAGCTTTCGAGTAAAGAG
>NZ_CP015626.1|WP_014613245.1|588951_590388_+|winged-helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTSSKYIEYLQNEVEGQLLDRKRASINPKDVAQHISAFANAEGGKLVIGIEDNGEISGFNHSKAKNKEVYIEAPFEHLYRIPKYTHEIIEVKKRDGTMDEILIFDIEPSYDAIITLKDDSVYLRINDKSRKLTHNQITNLEYDRGSRRFEEELVEYSSIEDVDENLVSEFKQLLDTNVDNEKLLKARGFMREGKLTVAGLLLFSNNINVYLPSARIRFMRYEGTKEESGARLNVVKDITFDKALPVAIREARAFINTQLREYTFLGKEGRFVTLPEYPEFAWFEGMINAIIHRRYDNQGDHIRIKMFDDRLEISSPGVLPASVTLENIKEERYSRNPKLAAALTQYKWVRESNEGVGRIFDEMKDYFLDDPVYSEPNNSSVQLTLKNNVVARKERETGRVSNIITPELFESLNEQHELIVRHLYNQGELTASKIANIIQRSVPTARKRLKELEEMNIISTHGSSKNDPKRTYYLLGFE >NZ_CP015626.1|WP_065520392.1|587160_588294_+|hypothetical-protein MNILISSKIVFDDLYNIRKELFDLVGMVEKTSHKIYIIARKQNKSKYFSYINSNNDLNDKLGFVDRGIISKKFTNELDYQSKDFVLIGGVDEDIRISSNNNILLLNPTWIITSSKIQKYGFDIDSPDQMIKCLNILELNSSVYSRNNISDNTELISISSARNSGATAEQNFIINSYRDYLKKSENQYKYAVFFHYLTLITQNSEFKEVDYWISAPSSSGDKKDGIYEIEDYSRYLMSKKRKSDIIIRHTPAQKSTEINSSFRRQLDSSRHFETLHLNPKFKNKLKGVTVVVLDDYVTNGHTFEAVRNLLTEAGVKKIYLITMGTFKMPYQIQQVDFKDDISNLRYKFEIISKENITLQYNENALITIDQIYEIITDK >NZ_CP015626.1|WP_065520391.1|586303_587164_+|DNA-processing-protein-DprA MNIRNDILLLSQYGFSDELLEKLYEEKEHYLEGIFNKNSSFYNENFSLFKEKDKILAEDYGKLEDFSLVFINKMKDYKSKGVKIIFKYSTDYPSNLRNTNGRLFLYVLGNKSLIKNTKKVAIVGSRSIDRYSKKLTVDIVKNYIEKDYVTVSGMALGTDTIVHKKTIDFGGKTIAVLPTSFEHIYPSENKDIFNLIINKNGLVVTEYGPFDNTYKSNFLARNTIVAAISSELVVTKARMKSGTLNTVRKSINMKKPTYYVSGINELELENHLIKMGAKKLQWSNKQ >NZ_CP015626.1|WP_014613243.1|585139_585538_+|30S-ribosomal-protein-S9 MTLAQVEYRGTGRRKNSVARVRLVPGEGNIKVNDRDVREYLPFESLILDLNQPFDVTETKGNYDVLVNVHGGGFTGQAQAIRHGIARALLEADPEYRGSLKRAGLLTRDPRMKERKKPGLKKARRSPQFSKR >NZ_CP015626.1|WP_014613242.1|584688_585126_+|50S-ribosomal-protein-L13 MRQTFMANESNIERKWYVVDAEGQTLGRLSSEVAAILRGKNKVTYTPHVDTGDYVIIINASKIELTGNKENDKIYYRHSNHPGGLKSITAGELKRTNPERLLETSIKGMLPSSRLGEKQGKKLFVYGGAEHPHAAQQPENYELRG >NZ_CP015626.1|WP_015729510.1|583676_584480_+|tRNA-pseudouridine(38-40)-synthase-TruA MQRVLVKISYNGAQFLGFQIQNQGRTIQGYFEKILKRMHQQHVRIHPSSRTDRGVHAKAQYFHFDTHLNITPERWQHAMNSALPDDIYVHDVSFIDRDFHCRYDCVGKRYRYSIYQAEHRNPFWSQLKTFEPKALDIEAMQRAAQYFVGTHNFTTFCSQKTEVESKERTIYESRVEQTADGIDFVITGSGFLYNMVRVIMAYLLEVGKGRRSADDVPNLLAQQDRNLVPHTAPAEGLYLEKIYLAAEQLTADFGDHIQIHSKKSTQI >NZ_CP015626.1|WP_065520390.1|582857_583661_+|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT MKDKLIIGRFLPLDTVIHRLDPRAKLIFVFLFIIIIFFSHAPLSYLWLALILLTVTKLARIPLWFLIKGLLPVFFFLILTFMMHLFLTKGGARLIEWGFITIDSNGIREGILIMLRLGFIMIVSTILTLTTSPLNLTDAFDRLFKPLKYIKIPVAALSMMMSIALRFIPTLMEELDKIILSQKSRGSDISSGSLAARIKAFIPLLIPLFISAFQRAEELAIAMEVRGYDANAERTSYRILKWQLKDTLLIISLVPIAAVSLWLGHTF >NZ_CP015626.1|WP_014613239.1|582001_582868_+|energy-coupling-factor-transporter-ATPase MIKFEEVSYTYQKNTPYEYQALNQISTEFLPGRYYAIIGKTGSGKSTLIQHFNGLVKPTRGKVQVLDVTVNRKTKDKHLKSIRQRIGMVFQFPESQLFEETVEKEVLFGPRNYGLDIEEARDKAMTLLGELGFDAEKVMQQSPFLLSGGQMRKIALAAILAMDPDILILDEPTAGLDPRSKAQVMALFKKLQLEEGKTIILVTHDMNDVAEFADEIKIMQGGTLIESTTPYDFFQRPDDVNALHLCLPDIVRLQRDVEAKLGVQFDKLALTEASFVAIYEEWRQRHEG >NZ_CP015626.1|WP_015729512.1|581195_582005_+|energy-coupling-factor-transporter-ATPase MEHEHLIEFDHVSFQYHEDQPKVLNDIQFKVNKGEWLSIVGHNGSGKSTLAKLLTGIEQDYQGDIRINGSSIKGVDRSAFEHHIGIVFQNPENQFVGSTVSYDVAFGLENKGLSYNEMHDIVPLVLKDVDMYDKQHHEPTALSGGQKQRVAIASVLALEPQLIILDEATAMLDPEGKRDILAMVKALNRHKGVTVIAITHDLSEVVSSDRVIVMNRGEVFLEGTVEKIFEQGEALVEIGLDLPFEMRMAQKLNLSQSFITYEGLLERLT >NZ_CP015626.1|WP_014613237.1|580346_580715_+|50S-ribosomal-protein-L17 MGYRKLGRTSDQRKAMLRDLATSLIVSERIETTEARAKELRSVVEKLITLGKKGDLASRRNAAKTLRNVQILNEDETTQTALQKLFGEIAERYQERQGGYTRILKVAPRQGDGALKVIIELV >NZ_CP015626.1|WP_110148278.1|590975_591065_+|30S-ribosomal-protein-S9 MQLYETLKFFERKKPGLKKARRSPQFSKR >NZ_CP015626.1|WP_065520393.1|591548_592835_+|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase MYRKSPSLMELVVRSDNIEKAIKKVKKNKGAPGIDGMKVSELHAHFAQYFSRITKKLLDGSYQPQAVRKVQIPKPNGKMRVLGIPVARDRVIQQAIRQVIEPGIDRTFSNHSHGFRPHRSTGTALKQCAAYYEEGYKIAVDCDLKQCFDMLNHDKLMYLFERHVQDKSISTFIRRSLQVGAIDLSGEVAERKIGAPQGGVISPLLCNIYLHELDKELEKRGHRFVRYADDFVIFVRTKRAGERVMSSVTKFIEKQLKLVVNEEKSKVGAVTRLKFLSCLITKVNGVCRFRPTTEAKRNLIRTLRKITKRNRPGTFKEIITEINQVTRGWINYFGRGFIRVFLETTQSWLNRRLRQLILKRWKRVRTKYKMLRQYGLDHRSAMKIAQSRKKYWRLSNTHEVHRALTTKQLYKWGLIPLAQLAELAYARY >NZ_CP015626.1|WP_015729508.1|593141_593687_-|cysteine-hydrolase MTKYGLLIIDVQNDYFSGGKMVLHEPEKALHHIQQLEHDFKSKNLPIIYIQHINIQPNPAFFEKGTDGVALHSELSLQDDSVIIEKHFPNSFFQTKLQATLDQLEVDTLVITGMMTHMCVDSTTRAAAELGYNPVLIHNATATRNLAFNENNVQANDVQNAFISSLSNFSTVMSTDDWIKA >NZ_CP015626.1|WP_037542450.1|593868_594741_+|sce7726-family-protein MATINILNKVFSKNVLRELIREGESDLLNKAYYQIFNDDAPHLNNHKKIEQLYNVLKKNYRNEYFFKNTMLNKLLLGKHALNTTVAMTELPIKRSKADFILINGKAIVYEIKTKLDALQRLDNQIMDYYTVFDHVEIIVDEAHLNKVKSRYLNTSVGISVLSKKNTISQKQRPSPNRQWLNHIAIYKVLRKEERKSIIKMFYGYSPEFDQFSEYQALLKMFQKIEIEPLYEQFIQLLKQRDTVKAYQNDFKNVPYELRFITYFSQFRKNDYHNLNIALGGGKDVLSISKR >NZ_CP015626.1|WP_065520394.1|594715_595636_+|sce7725-family-protein MYYPYLRGKQYELIAVRELIEKKLISKNVVPIIEPIKETATLRSTLETGIENNHQIYTIINPQVGEYSLYEENHPITGEVLDLNYDAILMNNAKDVSKNAHLLSKSEKFIAIYSSRDDLKNFAMLKEKSLVPSINFVKDGHRFSRFFRQEHQEIGLIRDAFDKQKRNVDYADESDKFFSDDHLYYRDEGYVAFSDYSIVGDHYLDNGFAPVAVAIHIVYFDSNDVLRIKHFVSESNDDNSDPAGKFREALEKLINWAEITTTLNHSDALKQFQVLWNEKRYPGLGFTKKLSIMHHLEIMDNYLSRR >NZ_CP015626.1|WP_065520765.1|596001_596721_+|RES-family-NAD+-phosphorylase MKEEFVTDNHKLIVKDNDCDKFANAIKYQNRFHTQNINLQLLNHFLKFTESIIKPEDFLLYRCRISNSEPIDISGMYAPPKEKASAGRLNSQWISHLYLGDDELACIQEVRAGFHDNVYIGEFKLKEPIKVVDLRHFEDKTLDFRDELQLEYYLNRDTFIRISNELAKPANNDDKYIHYLPLQYMSDFIKSSDEKFQGILYKSVMNENATNLLLFNPNLVECERVKKKTIKYIDYQYSR >NZ_CP015626.1|WP_020219634.1|597186_597621_+|hypothetical-protein MNKSIIIYLISYALIILGNSATFVAVYWIIGEKSTYSTLALIVSIVFFIRFLTSRVITNKIDLFHHVKLNSNLFITRICILIIALFSLKYFDDVWTVCLLTIVLNCLDVVSGSITPKFIKSFGEQQIVTLNSYLSIVEKLLYVL >NZ_CP015626.1|WP_015729500.1|597809_598346_+|hypothetical-protein MIAIAANIMITPYTTLIIPYIRENISATPDIFTATEILMMVGGVLIGILTSKYLKLDSYQSDKLFVVSAISQGILIILLSYNSSMILYFIVMFLLGACITAFNIPFSIILQSKVPIKAIGKAKSHIISISTIFSAILYVLSSFLVRYMDISHVYLIFPILGLLTLAVYKFRGKIKFGM >NZ_CP015626.1|WP_065520395.1|598626_601461_+|DEAD/DEAH-box-helicase MIKKESVHILKDGREIKVLDVIQDFKDEKQYALILYDNHQYIYEMTALKQSVAPKNNTTTNKSTDEKIALYRAYFRGNDEIVATSFRTKVGKMVYYPWCLIRKQAPCPKVKKPQFQCSKCTVHRFQKMTDDVIFNHLKGVNRYGKEVMYGLYPIVDQNQTFLLVFDFDKADWRQEVKVLAKVAQSLKLDYLIEISQSGNGAHVWLFFEDKILARKARALGDIMLTQAMKQYPELSFEAFDRMFPNQDDVSNGGFGNLIALPLQGKRVLNGFSRFVDDDLVLIDDIWSTLEQTTKISEEEVDGIINKYTHNLPSNYYKAEKKVQQDDLTLFEYASASSDKKIDVTLGSEITIPIKELTRDETVRLRFLASFYNKAYFKALNQRLNTRNIPKMISLSEVEAGEIKLPRGLYQNVLKLYPKANIIHQQVEGKTIHATFQAELYEAQQQAYDALTQHNDGLLCAGTGFGKTVIASKMIVEKGVSTLIIVHSKSLAAQWKSQIETFVDLEDDPFPEYTEKGRLKKKDKIGMIQGGKSKRSKNIDIALFQTLTTMDNLEDVFNDYGMVIVDEAHHVAAKTFEDVMAKVNSRYVYGLTATPKREDGLENIIYFRIGPIRHFAKKEVPHHIAQKLYLRFTASGEHLSNIQDQSIHDNHELIVADAQRNEVIVQDIVDCIKEKRHIIVLSRFINHIQALKRQFEKLNQETNVYILNSHMKTSQLKEEMTALKEEGKPFVLFTTGSYAGEGFDLPALDTLMLVMPIKAKGSIQQYLGRLLRNLNDKEELRVYDYVDYAIPMFYKMYMKRLRTYKTLGYILEENSGSELYQSNMIEGDYMSLLMKDLKAANWTVFMMAYLSKDMIHWLVSLDDLHSTDKIIVMSEKTERIMAKNLTPLYESGFQIQVVPKVSQNFIIIDNRLVWMLSSTREDDVKHQMSLRLFSESIAKKLVNKT >NZ_CP015626.1|WP_037542457.1|601617_602370_+|DeoR/GlpR-transcriptional-regulator MNKYERLDEIARRVNEKGTIRITDIVEDLNVSDMTVRRDLIELEEQGILTKIHGGARSNKASQYKEMSHREKHTRKSEEKLEIAKKAAKLIEDGNVIFLGPGTTVEMLAKEIDNQRLSIVTNCLPVFQILEHKRSEQFSVYLIGGSKRQLTESFVGEMANTLLEKMRFSKIFFSANGIKGNDVMTSSYEEAYTQNLAIKHSNEKYILADDSKIGKEDFVSFCELKDLTAIVTNTLNNDQLQYLQKFIEII |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP015626_3 | 2664628-2664874 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP015626_3
|
3 spacers
spacers of NZ_CP015626_3
>3.1|2664666|34|NZ_CP015626|PILER-CR ACTTCTCTCGCCATTTCTGCTAATTGTTCTACTT >3.2|2664738|31|NZ_CP015626|PILER-CR TCATCTTTCATGTCACTGATTAATTCATTTG >3.3|2664658|42|NZ_CP015626|CRISPRCasFinder GAGAATACTTCTCTCGCCATTTCTGCTAATTGTTCTACTTTG >3.4|2664730|39|NZ_CP015626|CRISPRCasFinder GAGAACTCATCTTTCATGTCACTGATTAATTCATTTGTA >3.5|2664799|41|NZ_CP015626|CRISPRCasFinder GAGAACGGTAATAGTTGCTCAATAGGTAATAAAACGTCGGT >3.6|2664663|37|NZ_CP015626|CRT TACTTCTCTCGCCATTTCTGCTAATTGTTCTACTTTG >3.7|2664735|34|NZ_CP015626|CRT CTCATCTTTCATGTCACTGATTAATTCATTTGTA >3.8|2664804|36|NZ_CP015626|CRT CGGTAATAGTTGCTCAATAGGTAATAAAACGTCGGT |
cas1,cas2,cas10,csm2gr11,csm3gr7,csm4gr5,csm5gr7,csm6,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP015626_3
The CRISPR arrays of NZ_CP015626_3 >merge|NZ_CP015626|3|2664628-2664874|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAATACTTCTCTCGCCATTTCTGCTAATTGTTCTACTTTGGATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAACTCATCTTTCATGTCACTGATTAATTCATTTGTAGATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAACGGTAATAGTTGCTCAATAGGTAATAAAACGTCGGTGATCGATAACTATCCCGAATAACAGGGGACAGAGT >NZ_CP015626|3|1|2664628-2664804|PILER-CR GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAATAC TTCTCTCGCCATTTCTGCTAATTGTTCTACTTTG GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAACTC ATCTTTCATGTCACTGATTAATTCATTTGTA GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAAC >NZ_CP015626|3|3|2664628-2664869|CRISPRCasFinder GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGAC GAGAATACTTCTCTCGCCATTTCTGCTAATTGTTCTACTTTG GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGAC GAGAACTCATCTTTCATGTCACTGATTAATTCATTTGTA GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGAC GAGAACGGTAATAGTTGCTCAATAGGTAATAAAACGTCGGT GATCGATAACTATCCCGAATAACAGGGGAC >NZ_CP015626|3|1|2664628-2664874|CRT GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAA TACTTCTCTCGCCATTTCTGCTAATTGTTCTACTTTG GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAA CTCATCTTTCATGTCACTGATTAATTCATTTGTA GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAA CGGTAATAGTTGCTCAATAGGTAATAAAACGTCGGT GATCGATAACTATCCCGAATAACAGGGGACAGAGT
>NZ_CP015626.1|WP_072093071.1|2663902_2664214_-|DUF3387-domain-containing-protein MLSDDFLKDVEGLKQKNVAVELLNRLLKGQVKSLMKTNATVSKRFSEMLRNSINKYNSRSIETSKVIEELIQLAKDIKQEQQRGNELGLNSDEIAFLRCFSFT >NZ_CP015626.1|WP_001015193.1|2663389_2663611_+|hypothetical-protein MNHETTHSDWRTVANCLASQNYISIVKGLVHHFTAIEDEEILDKIYEDFMNNGSITTVLNNDLQDIINYYLSK >NZ_CP015626.1|WP_001092190.1|2662871_2663375_+|DUF1643-domain-containing-protein MNTIKSTIHTEAIFSDDEQHRYLLKKTWDEKKPVCTVITMYPHLDGVLSLDLTTVLILNQLANSEQYGAVYLVNLFSNIKTPENLKHIKEPYDKHTDIHLMKAISESDTVILAYGAYAKRPVVVERVEQVMEMLKPHKKKVKKLINPATNDIMHPLNPKARQKWILK >NZ_CP015626.1|WP_001024805.1|2662545_2662857_+|hypothetical-protein MNINRYITRGISEQLSLDLQILLWHMVEEKDNQPHTDYLHIFKLQEDDNMLSITHEQEQPAYKLEYHYINYEKNQNALPKKVYVIREDDVDVFYYVMLLPEEY >NZ_CP015626.1|WP_080035634.1|2662451_2662544_+|hypothetical-protein MMNWIKVAQLSVTVINEVIEIMKEKQNGGK >NZ_CP015626.1|WP_000175888.1|2662113_2662452_+|hypothetical-protein MTLSKQLKTYITERFKLNYQETWACETIDAVAEDVLPEKYIKNSPLEHKILNTFTYYNDELHEISIYPFLCYLDKELVAIGYLDNFDLDFIFLNDTHQIIIDERYLLQKGGE >NZ_CP015626.1|WP_134950422.1|2658535_2660122_+|DNA-primase MIKSGYGAIDRKGLIAILTSSIGNDEMDDSEQAVMVYNELIDKLQLNIPKDVDYRPNIYSYFGIQKKPNDTILVEMMICIFHIKRFDSELFVFKDKGWQKVSEDELQGLISKMIQVLLVDYKPSLSTLKNVVDGIQKSTDIEKLVEHRQYIGCGRNMFNLKTFKVVDNDLEIFPKTRLDLELDINDTITDKIPPNFKQYMLELANYDHDLQYFLFQHMAVLLTADTKLRRGLFLYGTAKNGKSVYIKLVKSFFYSNDIVSKTLNELGGRFDKESLIGKRIMASDEVGKANIDEATVNDFKKLLSVEPIHADRKGRTQVEVTLDLKLIFNTNAVLNFPSSHAKALERRIAVIPCEYYVEKADPDLIEKLQDEKKEIFLYLMYVYKQIVKNDIEYLQNDRVTEISHDWLNFGYEFVSSKSANIAHQKACINLLRKLIEIKPGSRIKVSRLNEVIRDEIKVSSQVINDLVQANFNVQSRLNNGYKYWVDLGWKETDKKDDMISFDKNENVTDDEFLYEDDLNLGWEDFDDE >NZ_CP015626.1|WP_001058155.1|2658138_2658507_+|hypothetical-protein MNNDRGKSLQIPQSTLLKEGSIYVATLHSVYEKNFSGDIKHQFTYEVELNQETHYVNRNITVKSMSHQLSIADWIKRHSNYNVNHINYDPYIDRKHLVLVGQYNGNYYIQDVAPLDEFGGVL >NZ_CP015626.1|WP_000283873.1|2657036_2658146_+|hypothetical-protein MYQANIRDLITKLPQSNKTEHFLMNKFSNQDKVQQLQRQISQQLDQQYNELLANEKAKLDQYVEVHHNLEPLKKEIESESINLDTDKLPDIKATMLEKAKNDEHFDKIEQLFDRLDQSLNGTNRLYTQLSLIGTRTHRITTKRFNVQGLPKLVQQMILPSQFKKVYTIDFKSFEPSVAAYMTQDEQLIDYLNHEEGLYDALLRDLSLSKEKRVSVKRAFIGSFLFGGRYSSSKFKINQEVSEINWLQVMSKFKKVIEFKEQVEKYKTMPTPYGIEHDMSAFQGSSIMAIYVQTVASYIFKHILLEVYKAQCEKKTFKIIVPIHDAIMIECNDKGIAQNVAQLMKDTANQLFNGEFAHVTVEALGGIDNE >NZ_CP015626.1|WP_001038847.1|2654853_2656842_+|hypothetical-protein MNKNITALKSTENTTYMQYTVHIDDQIINNIKECTKKFKILPMEDKIPLSPLLQPEYAGEVQDFISTYEQFMINFGKVILDSQGIKIQFESESLSSIQRGIQEHCYLNERTNDIDVTKEWYLCKFSNQILEEDKNQLYNALKQLMNDSKNKKQAFQEVFKVHIDIYLYNKEKSEYKYQVSSYFNLVKENPKITYKKRHLQEKQGVKGTTFTNKLKLLNKMYGVDVAKYQPFYNSNNPEYERGQFGERYISQRSNYEFNRLQYQIIDMLSKILDKHPLPKSDNNYKHIPTIEKAILSGDSHSFYEYFEDIMKEIISMENSSLKEKLLTDFTYQSQCRWYSESEKLKLQLESFMHKVLESNYYEGNKLYRMLSHAIEETINEADEDKVHFNYFKDYFLTDGGVKNWEQISEKITEFNGKVINDIQNEYNKIQFNNANRNQKLNFNYLYHCFEFSNNLVKARVNGNRGYILYFVDKYKIKMPFLDQLLINYLNQEIGQESINYNMQTLFEKERYDRSSTIEKLVATSKFKYEKDDSDLFKQLFNDVENSIDRLGIYLLNNGINSNDENARYYRSFLKELSRIKSKLTPFSLEISKSSGREQHYPDDAIDDKDERRKNKEETYHAFDDKSDIDSKLKNKINVSIDNLLSVKIKSNLYDISPNTKKQ >NZ_CP015626.1|WP_000655859.1|2664948_2665854_+|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKDVIYVENHYFVTVKENSIKFRNVIDKSEKFYLFEEIEAIIFDHYKSYFSHKLVIKCIENDIAIIFCDKKHSPLTQLISSYGMTHRLQRIQSQFQLSGRTRDRIWKKIVVNKIINQSKCLENNLHNENVKLLVNLAKDVSSGDKSNKEAQAARIYFKDLYGKQFKRGRYNDIINSGLNYGYSILRSFIKKELALHGFEMSLGINHRSKENPFNLADDIIEVFRPFVDNIVYEIVFKKNINTFDVNEKKLLLNVLYEKCIIDKKVVRLLDSVKIVIQSLIRCYEENTPTYLLLPKMIEVGN >NZ_CP015626.1|WP_000281076.1|2665853_2666159_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYLLVSFDLPRDTKFERRVASKYRTRLLELGFSMKQFSLYERYVSDVQKKDKILEILQQEIPDTGSITLYVLPDEVNNSQITILGKEVKVVVRKEPKLIFL >NZ_CP015626.1|WP_000359017.1|2666172_2668446_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 MDKKTTLMYGSLLHDIGKIIYRSNDHAFARGTHSKLGYNFLSQFSEFKDNEVLDSIAYHHYKELAKANLANDNTAYITYIADNIASGIDRRDVIEEGDEEYEKQAFNFDKYTPLYSVFNIVNSEKLKQISGKFKFSNESNIEYPKTENIQYSSGNYTTLMKDMSYDLEHKLSIKEDTFPSLLQWTESLWQYVPSSTNKNQLIDISLYDHSRITCAIASCIFDYLNENNIHNYKDELFTKYENTKEFYQKEAFLLLSMDMSGIQDFIYNISGSKALKSLRSRSFYLEIMLEVIVDQLLEKLELTRANLLYTGGGHAYLLVSNTDKGKEKINQFNTELKNWFMSEFTTDLSLSIAFEKCSGNDLMNTSGNYRNIWRNVSSKLSDIKAHKYSSEDILKLNHFHSYGDRECKECLRSDIDINDDGLCSICEGIINISNDLRDKSFFVLSETGKLKMPFDKFISVIDYEEAERLAQNNNHIRIYSKNKPYIGVGISTNLWMCDYDYASQNKDMREKGIGSYVEREEGIKRLGVVRADIDNLGATFISGIPEKYNSISRTATLSRQLSLFFKYELNHLLENYQITAIYSGGDDLFLIGAWDDIIEVSVYINEKFKDFTLGKLTMSAGVGMFSGKYPISKMAFETGLLEEAAKTDEKNQIALWVQEKVYNWDEFKKYILEEKLLVLQHGFSQTDEHGKAFIYKMLALLRNNETINIARLAYLLARSKMTEEFTSKIFNWAQNDKDKNQLITALEYYVYQIREVD >NZ_CP015626.1|WP_000599362.1|2668448_2668874_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm2 MILAKTKSGKKIDLTFAHEVVKSNVKTVKDKRGKENQVLFNGLTTSKLRNLMEQVNRLYTIAFNSTEDQLNEEFIDELEYLKIKFYYEAGREKSVDEFLKKTLMFPIIDRVIQKESKKFFLDYCKYFEALVAYAKYYQKED >NZ_CP015626.1|WP_000286998.1|2668875_2669520_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm3 MYSKIKISGTIEVVTGLHIGGGGESSMIGAIDSPVVRDLQTKLPIIPGSSIKGKMRSLLAKHFGLKMKQENHNQDDESVLRLFGSSEKGNIQRARLQISDAFFSEKTKEHFAQNDIAYTETKFENTINRLTAVANPRQIERVTRGSEFDFVFIYNVDEESQVENDFENIEKAIHLLENDYLGGGGTRGNGRIQFNDITIETVVGEYDSTNLKIK >NZ_CP015626.1|WP_000208937.1|2669530_2670439_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm4 MTTKVFKLSFKTPVHFGKKRLSDGEMTITSDTLFSALFIEALQLGIETDWLLNDLIISDTFPYENEIYYLPKPLIKIESKEEGNHKAFKKLKYVPVHHYNQYLNGELSAEDATDLNDIFSIGHFSLQTKVSLSAQEIDSSADSEPYSVGTFTFEPEAGLYFIAKGSEETLDQLKDIMTSLQYSGLGGKRNAGYGQFEYEIINNQQLFKLLNQNGEHSILLSTAMAKEDEIKSALKEARYILNKRSGFIQSTNYSEMLVKKSDFYSFSSGSVFKNIFNGDVFNVGHNGKHPVYRYAKPLWLEV >NZ_CP015626.1|WP_000153149.1|2670441_2671464_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm5 MTIKNYEVVIKTLGPVHIGSGQVMKKQDYIYDFYNSKVYMINGNKLVKFLKRKNILDTYQNFLRYPPKNPRENGLKDYLDAQNVKQSEWKAFVSYSEKVNQGKKYGNIRPKPLNDLHLMVRDGQNKVYLPGSSIKGAIKTALVSKYNNEKNTDVYSKIKVSDSEPIDERHLAIYQKIDINKSEKPMPLYRECVDVDTEIKFKLTIEDEIYSINEIEQSIQDFYKNYYDKWLVGFKETKGGRRFALEGGMPDVLNQNILFLGAGAGFVSKTTHYQLKSREQAKRDSFDILTKKFRRTYGKMKEMPSNVPVALKGTTNQSLHVSYQQGMCKISFQELNNEVL >NZ_CP015626.1|WP_000865879.1|2671463_2672732_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm6 MKVLFSPIGNSDPWSNDRDGAMLHIVRHYKPDVVVLFFTESIWNGNRNIPGRKNFDWENIVSKVSSRTKVDIKVDSIKYENDFDSYKDIFHFYINEIRTKYSDAEILLNVTSGTPQMESTLCLEYISNPHNMKCIQVSTPAPIEGPKRSFAKLETVTEDLNKVNANEKMASNRSKSINIISFREVMVRSQIKSLVNNYDYEGALNLVSDQKSFRNGKLLRKRLLELTNQIKTHEVFPEINDKYRSVALKKSLFHYLLLNMRYNRLDVAETLIRVKSIAEFILKTYIVGHWPTLIIEKDDKPYLNAEDNLSFIYKYKLLLEKRRQNLDVSRILGLPAFIDILTVLEPNSKLLKEVNAVNDINGLRNSIAHNLETLDLDKNKNYKKIMLSVEAIKNMLHISFPEIEEKDYNYFERKNKEFRELL >NZ_CP015626.1|WP_000608705.1|2672728_2673463_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MINKITVELDLPDSIRFQYLGSILHGVLMDYLPNDIADQLHHEFAYSPLKQRIYHKNKKVIWEIVCMSDRLFNEIAELFTSKNRLFLKYYQVYIEIYSFNIEKVNVQNIMNQLLETEELNRYVRINIQTPMSFKYQSNYMIFPEVKRFFRSIMIQFDAFFEEYKMYDKETLDFLEKNINIVDYKLKSTRFNLEKVKIPSFTGEIVFKIKGPLPFLQLTHFLLKFGEFSGSGMKTSLGMGKYSII >NZ_CP015626.1|WP_080035626.1|2674563_2674731_+|hypothetical-protein MRIMKFKSKQLVIANQTKVINYRIQVLLKPQANIETQTQVKNNTLPETDEQSNAD |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP015626_4 | 2673598-2673845 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP015626_4
|
3 spacers
spacers of NZ_CP015626_4
>4.1|2673631|39|NZ_CP015626|CRISPRCasFinder AACTCTTCTAAGACGCGATATGATTCTAATTGGTCTTCA >4.2|2673703|41|NZ_CP015626|CRISPRCasFinder AACTGATATACTCCTTTACCATGTATTAATTCTGGACCACT >4.3|2673777|36|NZ_CP015626|CRISPRCasFinder,CRT AACTCATATTCGATCGTGTATATCAAAACTTTATGC >4.4|2673631|38|NZ_CP015626|CRT AACTCTTCTAAGACGCGATATGATTCTAATTGGTCTTC >4.5|2673702|42|NZ_CP015626|CRT GAACTGATATACTCCTTTACCATGTATTAATTCTGGACCACT |
cas6,csm6,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,csm2gr11,cas10,cas2,cas1,RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP015626_4
The CRISPR arrays of NZ_CP015626_4 >merge|NZ_CP015626|4|2673598-2673845|CRISPRCasFinder,CRT ATTCGATAACTACCCCGTAGAAGAGGGGACGAGAACTCTTCTAAGACGCGATATGATTCTAATTGGTCTTCATTCGATAACTACCCCCGTAGAAGAGGGGACGAGAACTGATATACTCCTTTACCATGTATTAATTCTGGACCACTATTCGATAACTACCCCGTAGAAGAGGGGACGAGAACTCATATTCGATCGTGTATATCAAAACTTTATGCATTCGATAACTACCCCGTAGAAGAGGGGACGAG >NZ_CP015626|4|4|2673598-2673845|CRISPRCasFinder ATTCGATAACTACCCCGTAGAAGAGGGGACGAG AACTCTTCTAAGACGCGATATGATTCTAATTGGTCTTCA TTCGATAACTACCCCCGTAGAAGAGGGGACGAG AACTGATATACTCCTTTACCATGTATTAATTCTGGACCACT ATTCGATAACTACCCCGTAGAAGAGGGGACGAG AACTCATATTCGATCGTGTATATCAAAACTTTATGC ATTCGATAACTACCCCGTAGAAGAGGGGACGAG >NZ_CP015626|4|2|2673598-2673845|CRT ATTCGATAACTACCCCGTAGAAGAGGGGACGAG AACTCTTCTAAGACGCGATATGATTCTAATTGGTCTTC ATTCGATAACTACCCCCGTAGAAGAGGGGACGA GAACTGATATACTCCTTTACCATGTATTAATTCTGGACCACT ATTCGATAACTACCCCGTAGAAGAGGGGACGAG AACTCATATTCGATCGTGTATATCAAAACTTTATGC ATTCGATAACTACCCCGTAGAAGAGGGGACGAG
>NZ_CP015626.1|WP_000608705.1|2672728_2673463_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MINKITVELDLPDSIRFQYLGSILHGVLMDYLPNDIADQLHHEFAYSPLKQRIYHKNKKVIWEIVCMSDRLFNEIAELFTSKNRLFLKYYQVYIEIYSFNIEKVNVQNIMNQLLETEELNRYVRINIQTPMSFKYQSNYMIFPEVKRFFRSIMIQFDAFFEEYKMYDKETLDFLEKNINIVDYKLKSTRFNLEKVKIPSFTGEIVFKIKGPLPFLQLTHFLLKFGEFSGSGMKTSLGMGKYSII >NZ_CP015626.1|WP_000865879.1|2671463_2672732_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm6 MKVLFSPIGNSDPWSNDRDGAMLHIVRHYKPDVVVLFFTESIWNGNRNIPGRKNFDWENIVSKVSSRTKVDIKVDSIKYENDFDSYKDIFHFYINEIRTKYSDAEILLNVTSGTPQMESTLCLEYISNPHNMKCIQVSTPAPIEGPKRSFAKLETVTEDLNKVNANEKMASNRSKSINIISFREVMVRSQIKSLVNNYDYEGALNLVSDQKSFRNGKLLRKRLLELTNQIKTHEVFPEINDKYRSVALKKSLFHYLLLNMRYNRLDVAETLIRVKSIAEFILKTYIVGHWPTLIIEKDDKPYLNAEDNLSFIYKYKLLLEKRRQNLDVSRILGLPAFIDILTVLEPNSKLLKEVNAVNDINGLRNSIAHNLETLDLDKNKNYKKIMLSVEAIKNMLHISFPEIEEKDYNYFERKNKEFRELL >NZ_CP015626.1|WP_000153149.1|2670441_2671464_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm5 MTIKNYEVVIKTLGPVHIGSGQVMKKQDYIYDFYNSKVYMINGNKLVKFLKRKNILDTYQNFLRYPPKNPRENGLKDYLDAQNVKQSEWKAFVSYSEKVNQGKKYGNIRPKPLNDLHLMVRDGQNKVYLPGSSIKGAIKTALVSKYNNEKNTDVYSKIKVSDSEPIDERHLAIYQKIDINKSEKPMPLYRECVDVDTEIKFKLTIEDEIYSINEIEQSIQDFYKNYYDKWLVGFKETKGGRRFALEGGMPDVLNQNILFLGAGAGFVSKTTHYQLKSREQAKRDSFDILTKKFRRTYGKMKEMPSNVPVALKGTTNQSLHVSYQQGMCKISFQELNNEVL >NZ_CP015626.1|WP_000208937.1|2669530_2670439_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm4 MTTKVFKLSFKTPVHFGKKRLSDGEMTITSDTLFSALFIEALQLGIETDWLLNDLIISDTFPYENEIYYLPKPLIKIESKEEGNHKAFKKLKYVPVHHYNQYLNGELSAEDATDLNDIFSIGHFSLQTKVSLSAQEIDSSADSEPYSVGTFTFEPEAGLYFIAKGSEETLDQLKDIMTSLQYSGLGGKRNAGYGQFEYEIINNQQLFKLLNQNGEHSILLSTAMAKEDEIKSALKEARYILNKRSGFIQSTNYSEMLVKKSDFYSFSSGSVFKNIFNGDVFNVGHNGKHPVYRYAKPLWLEV >NZ_CP015626.1|WP_000286998.1|2668875_2669520_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm3 MYSKIKISGTIEVVTGLHIGGGGESSMIGAIDSPVVRDLQTKLPIIPGSSIKGKMRSLLAKHFGLKMKQENHNQDDESVLRLFGSSEKGNIQRARLQISDAFFSEKTKEHFAQNDIAYTETKFENTINRLTAVANPRQIERVTRGSEFDFVFIYNVDEESQVENDFENIEKAIHLLENDYLGGGGTRGNGRIQFNDITIETVVGEYDSTNLKIK >NZ_CP015626.1|WP_000599362.1|2668448_2668874_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm2 MILAKTKSGKKIDLTFAHEVVKSNVKTVKDKRGKENQVLFNGLTTSKLRNLMEQVNRLYTIAFNSTEDQLNEEFIDELEYLKIKFYYEAGREKSVDEFLKKTLMFPIIDRVIQKESKKFFLDYCKYFEALVAYAKYYQKED >NZ_CP015626.1|WP_000359017.1|2666172_2668446_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 MDKKTTLMYGSLLHDIGKIIYRSNDHAFARGTHSKLGYNFLSQFSEFKDNEVLDSIAYHHYKELAKANLANDNTAYITYIADNIASGIDRRDVIEEGDEEYEKQAFNFDKYTPLYSVFNIVNSEKLKQISGKFKFSNESNIEYPKTENIQYSSGNYTTLMKDMSYDLEHKLSIKEDTFPSLLQWTESLWQYVPSSTNKNQLIDISLYDHSRITCAIASCIFDYLNENNIHNYKDELFTKYENTKEFYQKEAFLLLSMDMSGIQDFIYNISGSKALKSLRSRSFYLEIMLEVIVDQLLEKLELTRANLLYTGGGHAYLLVSNTDKGKEKINQFNTELKNWFMSEFTTDLSLSIAFEKCSGNDLMNTSGNYRNIWRNVSSKLSDIKAHKYSSEDILKLNHFHSYGDRECKECLRSDIDINDDGLCSICEGIINISNDLRDKSFFVLSETGKLKMPFDKFISVIDYEEAERLAQNNNHIRIYSKNKPYIGVGISTNLWMCDYDYASQNKDMREKGIGSYVEREEGIKRLGVVRADIDNLGATFISGIPEKYNSISRTATLSRQLSLFFKYELNHLLENYQITAIYSGGDDLFLIGAWDDIIEVSVYINEKFKDFTLGKLTMSAGVGMFSGKYPISKMAFETGLLEEAAKTDEKNQIALWVQEKVYNWDEFKKYILEEKLLVLQHGFSQTDEHGKAFIYKMLALLRNNETINIARLAYLLARSKMTEEFTSKIFNWAQNDKDKNQLITALEYYVYQIREVD >NZ_CP015626.1|WP_000281076.1|2665853_2666159_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYLLVSFDLPRDTKFERRVASKYRTRLLELGFSMKQFSLYERYVSDVQKKDKILEILQQEIPDTGSITLYVLPDEVNNSQITILGKEVKVVVRKEPKLIFL >NZ_CP015626.1|WP_000655859.1|2664948_2665854_+|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKDVIYVENHYFVTVKENSIKFRNVIDKSEKFYLFEEIEAIIFDHYKSYFSHKLVIKCIENDIAIIFCDKKHSPLTQLISSYGMTHRLQRIQSQFQLSGRTRDRIWKKIVVNKIINQSKCLENNLHNENVKLLVNLAKDVSSGDKSNKEAQAARIYFKDLYGKQFKRGRYNDIINSGLNYGYSILRSFIKKELALHGFEMSLGINHRSKENPFNLADDIIEVFRPFVDNIVYEIVFKKNINTFDVNEKKLLLNVLYEKCIIDKKVVRLLDSVKIVIQSLIRCYEENTPTYLLLPKMIEVGN >NZ_CP015626.1|WP_072093071.1|2663902_2664214_-|DUF3387-domain-containing-protein MLSDDFLKDVEGLKQKNVAVELLNRLLKGQVKSLMKTNATVSKRFSEMLRNSINKYNSRSIETSKVIEELIQLAKDIKQEQQRGNELGLNSDEIAFLRCFSFT >NZ_CP015626.1|WP_080035626.1|2674563_2674731_+|hypothetical-protein MRIMKFKSKQLVIANQTKVINYRIQVLLKPQANIETQTQVKNNTLPETDEQSNAD >NZ_CP015626.1|WP_065520733.1|2675139_2676051_+|abortive-infection-family-protein MYELASKEIVDLFLGDKRVNSESDDKFESNGYTMPYMTHSDINALAPIFGITNIEIVSDYNRLNKMAWLIEQCYKLNKENKLLKYFLDVTRYIPNKREETSIYTNEELKKETLKEVEAYFNHINNILNFSDKKLIYLNKKYKIIDLIEDSQVTHDIDKHINFDYVRNFPFRLKDNLEDENYDTVITQSRTLLEEVYIHILEYSNKDYNSAKGNLQKLNSMVKTELKMKNNRDYDKRINELLSGLNKINDAIGKMRNENSDSHGVGSKRININRREAKLVMNSAITICDYILEIFEDNKNNNKI >NZ_CP015626.1|WP_065520734.1|2680341_2681658_-|RNA-dependent-DNA-polymerase MKYYPKNYLHFDKPISFDTVEKYVKDPSKIAKHSFLPLIQFIDSFERYESKNAPNSRPVKIKNRTIMYSGHLDSYIYRYYADYLNTNYYNHVCKKLFIDQCVIAYRNNKQGKSNIDFAAEVINQIVLYDQAYIYVGDFTNYFDKINHSLLKENIKRVLNVNMLTNDWFNIYKSITKFGYYEKNFLEKNIDSEKNLRSQNKRSYFNNLKEFRTFQKNNKTKFNKNDFGIPQGTAISAVFANIYALNFDLQMNQLAFSHSGMYRRYSDDFILIIPISSNINNYTEIEVIIKNIAEECKINIKDEKTNTFLYSQHNLINLNNKSKQNMDYLGFNFDGKNVKMRNKSIYRFYRNAKKLINYANFKKNNNQLEKLPYRKRIYRLYTDLGESRSGRNSFIDYAKKAQTKFDYYSPHTNNMMMQQIKNRKKKIEKLSGIQLHTKT >NZ_CP015626.1|WP_031254373.1|2682284_2683460_+|DUF418-domain-containing-protein MQRIRVADALRGLSLAGIFLANLLIFQYGLSGKEYIEFYHLNVVNTGAFHFIKIFIEGSFMPIFAILFGFSLDKMYQSMKRKNIKRPRMKLYRRAFLLFVIGTIHTIWIWEGDILSGYALSMMLLIPFISLTKSFFKWGTVLIAITFIIMVVFSFFDDTDIPHDTHKEETFVQETKDLYQQGSYSEIISESPNNSDPYFEKLKAIFGVSPGILLLCVIIFESLVFGIGIYLSKSGWFEMDANDFWSNKLFVYLTPVVLLLKSSYLWFDNENITGTFNFVFGLFLALCYIALFKYLYQKYTQHIIFRSLESLGKMSLTFYITQSIIGVLIFYGFGLGQFGKDTLFYNVIIFIILFLIQMVIAFWYQKYLRYGPLEYVLRVFTYWTFKKQSWR >NZ_CP015626.1|WP_014612690.1|2683624_2683810_+|hypothetical-protein MFEKPQMAHNEIFNIVLIVIGILAFVLFYFVFDAGYLLSFIIAFVPIIVGIINLKEIRKKN >NZ_CP015626.1|WP_014612691.1|2684276_2685392_+|alanine-dehydrogenase MKIGIVKELKPGEGRVGCTPENAKILKDQGHEVYVEHNAGIGSGFTNEAYENAGAILVSHEKCWEADLIIKVKEPHESEFQYFKKGQVIWGFQHLASSKKTVEMMQQAGVTAIGGETIEQDGKAILLEPMSAIAGRRSMLMGAYYLEAQHQGEGILISGIDAISGIPSGKVVIFGGGSAGVNAATIALGLQAEVVIIELKDERIAWLESHFKNDNVTVVKSNEANLAREIQTADVFISTILIPGSKPPKLVTKDMVRSMKKGSVLVDIAIDQGGTVEGIRPTTISDPIYVEDGVIHYAVPNQPGAVPRTSTMVLAAGNIDFLSEISNKGIERAIQDNPVLASGVNIYQGHITNQGLAQSHDMPYEKLADLI >NZ_CP015626.1|WP_014612692.1|2685428_2686469_+|bifunctional-threonine-ammonia-lyase/L-serine-ammonia-lyase-TdcB MATNAVMIQTEKYCNIHDIKEAKMKIQDYVRETPLIKSMFLSNNITGGNVYLKLENMQYTGSFKFRGALNKILHLTDEQKAKGIITASAGNHAQGLALTGQLLGIDATVVMPEEAPISKQEATRGYGAEVILKGETFNDSRLYMEQLAAETGKTIVHPYDDVEVMAGQGTIGLEILDQIWDIDTVVVPVGGGGLIAGLATALKSFNPSIHIIGVQSENVHGMAESIKEGQITSQFTAHTIADGTEVTIPGNKTYAVVEKLVDEFVLVSEDEIANAMRHLMQRTKIITEGAGALPTAALLSGKIDPRWIKGKNIVALVSGGNVDLTRVSHIIDDLLKPADTSEGVVG >NZ_CP015626.1|WP_065520735.1|2686501_2687824_+|amino-acid-permease MSTNTSLKKNIGFFASLSLVMGSVIGAGVFFKASSVTEVTGSTSMALFVWLLGGIMTICAGLTGAELAAAIPETGGLTKYIEYTYGDFWGFLSGWAQAFIYFPANIAALAIIFGTQIINLFHLSTTLLLPIAILSAVSILLINFLGSKAGGTLQSITLVIKLIPIALIVIIGFFHSSDVSFSLFPVVNGTNSSWFEAIGAGLLATMFAYDGWIHVGNIAGEMKNPKKDLPGAITLGIGLVMVVYLLINATFLMTLPIHQIEGNLNAASEASSILFGAGGGKLVTIGILISVYGTMNGYTMTGMRIPYAMAERNQLPLKRLFLDLLPSRTPWLGGMIQIVIAVIMMLLGAFDTITNMLIFVIWTFYCMAFLAVFLLRKREPELHRPYKVPLYPVIPMIALLAGTFVLLNTLLTQPLLAITGIGVTMLGIPIYYYQKKTLKI >NZ_CP015626.1|WP_065520736.1|2688046_2690095_+|copper-translocating-P-type-ATPase MKNNQEHHHHQHVHESHHPHSHHMHHDDHAHHHHENFKMKFFVSLIFAIPIIIFSPMMGVQLPFQFTFPGSDWMVLILATILFIYGGQPFLVGAKGEITSKKPGMMTLVTLGISVAYIYSLYAFYLNHFSDATGHTMDFFWELATLILIMLLGHWVEMNAVGSAGDALKKMAALLPDKVIKVTNNQREEVKISDIALNDIVEVKAGESIPTDGMIVRGETAIDESLVTGESKKVQKKPNDQVIGGSINGSGTIQVKVTAVGEASYLSQVMDIIKQAQNDKSRAELLSDKVAGYLFYFAVSVGVIAFIAWMLIQHEIDLALERLVTVLVIACPHALGLAIPLVTARSTSIGAHHGLMIKNRAAIETAQHIDYVMMDKTGTLTEGHFSVNHYESFKAGVSDEAVLSLFASLESQSNHPLATSIVGFAKSKNIAYAQPQDVQNISGIGLEGKVGDQSYKITNVTYLEQNGFDYDQALFTKLAQQGNSISYLIDEQQVIGIIAQGDQIKDSSQQMVADLLAKGITPVMLTGDNQEVAETVAKALGINDVHAQLMPEDKESIIKAYQSKGKKVMMVGDGINDAPSLIRSDIGVAIGAGTDVAIDSGDVILVKSDPSDIIHFFTLSKRTMRKMVQNLWWGAGYNIVAVPLAAGILASIGLILSPAVGAILMSLSTVIVAINAFTLKLE >NZ_CP015626.1|WP_065520737.1|2690277_2690850_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MDVGNQIRIYRKERQLSQMALAEKIDVSTQTISNWENERTYPDLYHLIVLSSLFNVSLDQLVKGDVVEMKNIIDHYNMDRYGKLMLAFMLIAVISVGPVLKFSDGWYGLFIPFIFWAFSMYDAIKIERLKKKYDVKTYKEIVDYMEYGAKTYNDTREKKKLLIEETLIVVVFVAVSVVLMLGSLFLFNLF |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP015626_3 | 3.2|2664738|31|NZ_CP015626|PILER-CR | 2664738-2664768 | 31 | NC_013373 | Staphylococcus sp. CDC3 plasmid SAP020A, complete sequence | 26796-26826 | 2 | 0.935 |
NZ_CP015626_3 | 3.7|2664735|34|NZ_CP015626|CRT | 2664735-2664768 | 34 | NC_013373 | Staphylococcus sp. CDC3 plasmid SAP020A, complete sequence | 26794-26827 | 2 | 0.941 |
NZ_CP015626_3 | 3.4|2664730|39|NZ_CP015626|CRISPRCasFinder | 2664730-2664768 | 39 | NC_013373 | Staphylococcus sp. CDC3 plasmid SAP020A, complete sequence | 26794-26832 | 6 | 0.846 |
NZ_CP015626_3 | 3.8|2664804|36|NZ_CP015626|CRT | 2664804-2664839 | 36 | NZ_CP043848 | Staphylococcus epidermidis strain NCCP 16828 plasmid unnamed, complete sequence | 50879-50914 | 6 | 0.833 |
NZ_CP015626_4 | 4.2|2673703|41|NZ_CP015626|CRISPRCasFinder | 2673703-2673743 | 41 | MF417907 | Uncultured Caudovirales phage clone 7F_7, partial genome | 31442-31482 | 6 | 0.854 |
NZ_CP015626_4 | 4.2|2673703|41|NZ_CP015626|CRISPRCasFinder | 2673703-2673743 | 41 | KY653129 | Staphylococcus phage IME1365_01, complete genome | 11951-11991 | 6 | 0.854 |
NZ_CP015626_4 | 4.5|2673702|42|NZ_CP015626|CRT | 2673702-2673743 | 42 | KY653129 | Staphylococcus phage IME1365_01, complete genome | 11951-11992 | 7 | 0.833 |
NZ_CP015626_4 | 4.5|2673702|42|NZ_CP015626|CRT | 2673702-2673743 | 42 | MF417907 | Uncultured Caudovirales phage clone 7F_7, partial genome | 31441-31482 | 7 | 0.833 |
NZ_CP015626_3 | 3.5|2664799|41|NZ_CP015626|CRISPRCasFinder | 2664799-2664839 | 41 | NZ_CP043848 | Staphylococcus epidermidis strain NCCP 16828 plasmid unnamed, complete sequence | 50879-50919 | 9 | 0.78 |
1. spacer 3.2|2664738|31|NZ_CP015626|PILER-CR matches to NC_013373 (Staphylococcus sp. CDC3 plasmid SAP020A, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.935
tcatctttcatgtcactgattaattcatttg CRISPR spacer tcatctttcatatcattgattaattcatttg Protospacer ***********.***.***************
2. spacer 3.7|2664735|34|NZ_CP015626|CRT matches to NC_013373 (Staphylococcus sp. CDC3 plasmid SAP020A, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
ctcatctttcatgtcactgattaattcatttgta CRISPR spacer ctcatctttcatatcattgattaattcatttgta Protospacer ************.***.*****************
3. spacer 3.4|2664730|39|NZ_CP015626|CRISPRCasFinder matches to NC_013373 (Staphylococcus sp. CDC3 plasmid SAP020A, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.846
gagaactcatctttcatgtcactgattaattcatttgta CRISPR spacer tcgttctcatctttcatatcattgattaattcatttgta Protospacer * ************.***.*****************
4. spacer 3.8|2664804|36|NZ_CP015626|CRT matches to NZ_CP043848 (Staphylococcus epidermidis strain NCCP 16828 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
cggtaatagttgctcaataggtaataaaacgtcggt CRISPR spacer cgggaatagttgctcgataggtaataaaacgtttac Protospacer *** ***********.****************. ..
5. spacer 4.2|2673703|41|NZ_CP015626|CRISPRCasFinder matches to MF417907 (Uncultured Caudovirales phage clone 7F_7, partial genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.854
aactgatatactcctttaccatgtattaattctggaccact CRISPR spacer tattcatatactcccttgccatgtattaattctggaccacg Protospacer *.* *********.**.**********************
6. spacer 4.2|2673703|41|NZ_CP015626|CRISPRCasFinder matches to KY653129 (Staphylococcus phage IME1365_01, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.854
aactgatatactcctttaccatgtattaattctggaccact CRISPR spacer tattcataaactcctttgccatgtattaattctggaccacg Protospacer *.* *** ********.**********************
7. spacer 4.5|2673702|42|NZ_CP015626|CRT matches to KY653129 (Staphylococcus phage IME1365_01, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.833
gaactgatatactcctttaccatgtattaattctggaccact CRISPR spacer atattcataaactcctttgccatgtattaattctggaccacg Protospacer . *.* *** ********.**********************
8. spacer 4.5|2673702|42|NZ_CP015626|CRT matches to MF417907 (Uncultured Caudovirales phage clone 7F_7, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.833
gaactgatatactcctttaccatgtattaattctggaccact CRISPR spacer atattcatatactcccttgccatgtattaattctggaccacg Protospacer . *.* *********.**.**********************
9. spacer 3.5|2664799|41|NZ_CP015626|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP043848 (Staphylococcus epidermidis strain NCCP 16828 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.78
gagaacggtaatagttgctcaataggtaataaaacgtcggt CRISPR spacer aactacgggaatagttgctcgataggtaataaaacgtttac Protospacer .* **** ***********.****************. ..
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
340172 : 360851
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP015626|340172:360851|DBSCAN-SWA AATGAAACAACAAGAAAGTAATCCCCAATTGACGACGAAAGAACAAGCACGAACGTTATATCGACTCCTCCGATATACATTTCCGTTTAAAAAGCTGATCTTTTTAACGATGACGATGCTGACATTATCGACTGCTGCGAGTATGTCGGTCCCATATTTGGTTAAAATCTTCATTGACCAATATTTAACGCCGAGATATTTCCCAGGTAATGATATCGTGATGCTATTAATTGTGTTCATCGGCATCCAACTGATCGGCGCTGTGACGACCTATTTAAGTATTTATTATTTACAATATTTAGCATTCAAAGTCATTCAACAACTAAGAATTGATGCATTTAAACGGATCAGTCGCTTAGGTATGAAGTTTTTTGATGCGACACCAAGTGGGAGTATAGTATCACGATTGACGAATGATACAGAAGCGATTGTTGAAATGTTCACAGGTGTCTTATCATCATTTTTAATTGCCTTTTTCATGATTTTGGCAAGTTTTACGATGATGTTCGTACTAGACGTCCGCATGGCATTTTTCGCGATATTGTTTACACCATTAGTCTTTATCGTTCTCGCTGTTTATCGTAAGTATGCATCGGTTTACTTTTATGAAACGAGACGTCGCTTATCAGATTTAAATGCGAAACTCGGTGAATCCATTGAAGGTATGAAAATCATTCAAGTGTTCAATCAAGAGGCGCGCTTACGTGACGAATTTGAAACGATTAACACATCTCATTATGAATACTCCATGAAAACGATTCGCTTAGATGGGATGCTATTACGTCCAGCCATTACGATGTTGTCAACATTTTCAACCGTGATCATTTTGGCGTATTTCGGTATTTTAAGTTTTTCGACTACGGTGACAGCAGGGGTCGTATATGCCTTTATTCAATACATGCAGCGTTTTTTTGAACCCGTTAACCAAGTGAGTCAAAACTTAAATATTTTCCAACAAGCAATTGTCTCGGCCAGTCGTGTATTTAAAATGATGGATAATCCAACACACGCCCCATTACAGAATCCACAAGGTCACAGTGAAATCACAGAAGGACGTATCGTGTTTGATGACGTGTCCTTTAGTTATGACGGTGAGCATGATGTGTTAAAGCATATTTCGTTTACAGTTGAGCCGGGTCAAACAGTTGCATTGGTCGGTCATACAGGCTCGGGGAAAAGTTCGATCATCAACTTGTTTATGCGTTTTTATGAGTTTAATCGAGGTAACATTTTCATTGATGGTCAGTCGATTAAGACCTTTCCACATGAACATTTAAAGCGTAATATGGGTCTCGTGTTACAAGATCCGTTTATGTTTTATGGCACAGTTGCTTCTAACATTAAGTTGTATCATCCGACAATGACTGAAACAGAAGTGAAAGCAGCAGCGGAATTTGTACATGCACATTCGTTTATTGAGCAGTTGGATGGTGGCTATAATCATAAAGTGATTGAAAAGGGCAGTGCATTTTCAAGTGGTCAACGTCAATTGATTGCATTTGCGCGTACGATGGCAATTAACCCGAAAATTTTAATCTTGGATGAAGCAACAGCGAATATTGATTCTGAGACCGAAGAAGCGATTCAACAGTCATTGAATCGAATGCGTGCTGGACGGACAACTATTGCGATTGCCCATCGATTATCGACCATTCAAGATGCAGATGAGATTTTAGTGTTGAATCAAGGTGAGATTGTCGAGCGTGGTACGCATGATGCTTTGATTGCAAAAGGCGGCATTTATTATAAAATGTATCAGTTGCAGCTTAAAGGTGAGTGATTTGTATCGTTTAGGGAACATATTGAGACATTCACGAGGGGAAGTGTTCAAGCTTCAGATTGCTGAACCTATGCCCCTTTGATTGATTTTAATTTAAAATGGATTGCACGCTTTGGACTCGCGTTCCTAGGCGCCTCGCTACAACTAACCAACGCTTTCATTGGAAGGGGACAGAGTTGAAGCGTTGGTGGATTTTCCGCTTCGGCTGGATGCCTCAGGAGTCTCGCCCGGCTTAACAATCCATTTTTATTTGTCTGTTGAAAGCGAGCACAGGTTCTTGCAATCTGTGTTTGAACCTCAAAAAGCAAATGTGTGCATGTTAATGATGTACAAATCACTTTCACGTTAAGACTTACTGAACATTTCATGAATAATACCTTAGTGAACTTCAAAATCTCATTTTTGGTTTGTAAGATAGGTGATTACATAATGATTGCACGCTTTGGACTCGCGTTCCTAGGCGCCTCGCTACAACTAACCAACGCTTTGACTTAGCTGTTACATTTGTAGAGGTAGCGGTTGTGGATTTTGGGAGCAGCACAGAAATCTCATGTGCAACAAAGATTTCGTCGTACTGCCCCCGCAAGGCTGACTAGGCTACTCAAAAGCATGCGCATTGAGAAGTCAGACAGCTACTGCGTTAAACGTTAGCCACTTTTAAAGTTAAATGACATTAATTTGCCTTTAACTCATTCCATCAGGAGTCTTGCACGTTTTTTTGCAATCTGTGTTTGAACCTCAAGTCTCAAATGTGTGTGTTAATGACGTACAAATCACTTTCGCGTTAAGTCTGGCTGGATATTTTATAAATGAAACCTTAATGTATATCAAAGTCTTATTTTTGGTTTGTAGGATAGGTGATTGTTGAAAAAGTCATTGATTTGGTAGAAATGCGTTTTAAATGGATTGCAAAGGTTAGTAATGATAGACGTCAATTGGAAAGTACCAAGGTGACGTCTATTTTTTTATGTTTACGTATAATGCTTGATGAGTTTGTTTAGAATATAAGGCGCTTGTTCGCCAGCATATTGTTTGTAATAGGCACTGAACCGAGAGTCTTGAATATAAAGGTCTGCGAGTTGCTGATGATAGTCTGTCGAATAGTTAGGAACCATGTGCTTGAGCCAATTTTGATGTGCAAGAAAGGCTTGTTCTGCAGTTGGATGCGCGATAGGCAATGCTTGTTCCTCAATCGTTTTTATTTATAAACAAAGTATAAATTTCTAATTATCTTTTTATATTTTCTTAAATGCTCGTAAAGCCTTATTCTATGTGCTTTCGAGTATTTTTACTGTAGGAAGATACTTCACGTTTCTTTGCATATTTCCTCATGTCTTAGCTGTCAGAAGTGGTAAATAAGTAGTAAATTCATTTGTACTACTAAGCAACAAGACGCTCCTGTTGCTTCTCTTTATTCAAGCGTTTCATTTCTGCCATTGCAGAATCGAATGTTGCATGTGCGTAATAGTTCAGCGTCATGGCTATATTAGCATGTCCCATAATGTACTGTAATGCCTTTGGATTCATTCCTGCATTTGCATAGTTGGTACAGAATGTATGTCGCAAACTATGTGGAGTGATGTGTGGCAATTTATCCTCGTTATACTTATTGTATTTCTTAACAAGACCTTTCATCATGCCGTTGTGATCACTTGCCACTTTTGGATAGTTCTTTCTATTAAGAAAGAGGAAATCACTATATCCATCAATCTCAACACGCTTATCATTCTTTCGATTCGCTAACACTCGCTTAAATGCTTGATAGGCTTCTTCAACCATAGGAACTTGACGTTCGCCACTTTTGGTCTTTGGTGTTTCAATGTAGTACCCAATTTCAGTATCTCTCAATAGCTGATGGTCTATATTGACAAGACGATTCTCAAAATCTAAATCTGGAAGTGTCAAACCACCAAACTCTGAAATACGAAGACCTGTTTTTAAGAGTATCAGAATTTCATCATAATTTTTGCTGTAGGTTTTATCAGCTTTTGCAAAGGCTAACAGTTTTTCTTCCTGTTCTTCTGTTAGTACGGTCTTAGGGACAGTATCATCATCAAGAACTGCTTTCAGTTGAAAGTCAAATGGATTCTTCCGAACACAATCATCTTGTATAGCAATATAGAATGAAGCCTTTAAAGAACGTTTGTAGTTATTGATGGTTTGATAAGCATAACCATTTTCACTCATTCTAATAGCCCATTCTTTAGCGTCTGATGGCTTAATACTGTCAATACTTCTTACACCTAACTTGTCTTTCTTCAAAATATCCATAAGATATTTGCGTCCAGTTTCAGTGTTTTTTCTAACCTTTGGTCTTTGAGCGTTCTGTTTTGCGTAAAGCTGGCAGAGTGTCATTTTCTTTCCTACAACATCAATACCATCATGAATGTCTTTCTGTAACTCTGCGATTTTCTCTCTAAGTGAGATACAATCACGCTTTCCTGCTGGTACTCGGTCTGTAGCCACAAGTTTCCACGAGTAAACAAATTGCGGTTCTCCAAATGAATCTATATATTTGTATAAGTATCTTCCGTCTTTTCGTTGGCTCTCTCCAGTCTTTAAGATTCGACCTTTATTGTCACGTCTTTTTTCTGACATGGCATTTGCTCCTTTCCTTTATGGAAAGAGCCTTGATACGACTTAATACTATTTTATCATATACAAGACCCTTTGGCGACGCTAGATTGCGTCCAATGTATCTATAATTTTTTCAAATTGTTTTCGTTTAATCTGAATACGATTGCCATTCATAATCAGCCAATTTGCATTTTTATTTTCCTCTGCCAAGCGTCGTAGCTTGTTTTCGCCAATACGAAAATATTTTGACGCTTCTTCAATGGTTAGGGTATAACGTTCCCAAATAGGAATGTCAGTCTGCTTCATAAAATCCTCCTTTCCAAATCACTTATTTGGATTTCATAAAAGTTGTTTTACCAGCAATCGAACAGCTTTAGCAAAGCTCACGGGAGTTCCACCCCTGCATGGTTCTCATGTAGCCATACTCATTGCCTGCGACGGTTTTATCACGCTCGGACTATTGACTGTATGGGAGTATCATTATCACGATAAGAATGTCGTTGCAGGCAATCCTGCTAAAGATTGCTTCTCGGATCACTAACATGAATCGCTCGCTATCTTTATAAGATAGGTCATGGCGGTTAGTTCCGTTGGCTCTTTTCTTATCGAAACGTATTCGATTACTTTTATTCAGTTTTCAAAG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21 | Streptococcus_phage(94.44%) | integrase | attL 342090:342109|attR 365742:365761 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
922718 : 932898
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP015626|922718:932898|DBSCAN-SWA 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GAATGTTTTGAGTAACGCCCCATTTTCTGCTGCTTACATCCTCAGTTCTTTTAATAATTTGTGCTCCTTCGCCGATCTCTTCTATAGTGTTTGCAGCTTTGGCTTCTTCACTGTATGGGGTAATAAGTGGAAGAACTAAACTTATAGATAGTGTTGCGGCTAATAATTTATTTTTTACCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP015626|922718:932898|924382_924865_-|WP_065520445.1|DBSCAN-SWA MKNKIIVFILLLTFTISYSTNSAIALQEESIDSIGLEDNTINESLLDNMPDYIIEEEATIQPRVIGPIVKYVVKNGMTFYKSIKYAPKFPRNFRAVSGKTKHHNVNNKTLLAKLRKVEKGPWKKVYKDGYIGKKKVSVHYFQSKSGLVFDVKTKSGWSNK >NZ_CP015626|922718:932898|925847_926183_-|WP_065520447.1|DBSCAN-SWA MTNFGKNLVTLRKRKNLTLVELTNQLNSRYNIKFSKASIDRWEKGTTSPSISHASALADFFDISLDELSGRHNLEIEQQDTMAAHFDKDGLTPEEIDEVNRFIEWVRNRDK >NZ_CP015626|922718:932898|927138_927339_+|WP_065520448.1|DBSCAN-SWA MDFENVKQDIKKLFKVQNGSQISKATGLPYQTVQDLRNEKTNLDDARLRTIEKLYNYQKQLEKENE >NZ_CP015626|922718:932898|930340_930925_+|WP_065520450.1|DBSCAN-SWA MKEQWLKLSLQFFNDAGTEEAVSDENVETEPTQEVEELSESQMKLVNERVNEEMARRTKEMRQQIQDELTEKQKEADKLRKMNAEQKHQYELEKAEKERDDYKQQLESYKMRQEAMAMFNEAGMQAPESLLNMVVQDTAEATKEAVDSFVSMVNQEVQRQLESKATQNHVVGNHVTTPNNNKNTPQKVELNSPF >NZ_CP015626|922718:932898|925019_925292_-|WP_065520446.1|DBSCAN-SWA MSQNDLMILRSEMDKKEKSKGVMWLLWFFTGGIGGHRYYLGDIGYAIAMTFTLGGLGFWSLIDAFLISGRLRKKNEEIERDIIVDMGLGR >NZ_CP015626|922718:932898|928379_929954_+|WP_065520449.1|head|DBSCAN-SWA MSDYWLERAQQAIQSETLEDAAKVAEIERIVAMMIADIYKNLLAYYAKLATAEGIDWREAKQIADKFDVEAFQMQAKAYVENKDFSDEANKELKRYNTAMYVNREQLLKHELGLIVTKGYAEQENVINKHLHDSVTRTLRHQAGILGADVHVKQTDVEAIVYSNFGKLNWSERLWNNQDELRKDVERMGSHVMLRGRHPYEFVPEIRKKQQQTVANTKRLLITEAARVQTEAQKLHYLETIGKDAEYEFVAKRDEKTSKICRHYDKKVFKVKDMVPGVNAPPMHPHCRSTTVPHVGNWRDKFFKDRQGKYRLRDNDGQAIDTNNTNYNEQEPVGLNKRKKNDDYRVDMKYIHSSEYRRKIDKISDNKELNRNIYQAAKEMLQHRDGDFREDLYGFDIKTGKQLFKSTDNNNEKSMVNYTKRIDKIVKSKPYQIVSVHNHPRSTLPSLGDLTAHHLRKYAKGIIVGHNGRLIVYSVNKDIDFDFLKYTLDIELERARIKNNIQAKIQKDMLENVKKYGFMEYQEI >NZ_CP015626|922718:932898|925373_925829_-|WP_020220396.1|DBSCAN-SWA MGKYEELLIQNNSIPIIETNRLPEFQSGLYINGQIFIKDDISTHQKHAVLAEEIAHYKYTYGNILDQSNMLNRKFELKARRLANESVITLQGLINAFNYGVQNIYDLATYFEVTKDFVLDAIQHYKQKYGLRTRYGKYIIEFEPLIIYKDL >NZ_CP015626|922718:932898|924038_924383_-|WP_065520444.1|DBSCAN-SWA MLIFENKEQLEKFTLITIHGLFHQLKHNLISIENAEHIIFTPYMMEELSSLNVNSEIIDLIHKGTELEDLEAFDLSVQEAVSEFIKKTEKLLKNYQHVDFNEKILKDWNIERSI >NZ_CP015626|922718:932898|930983_931964_-|WP_014613567.1|DBSCAN-SWA MKISKVIKAATATSVALMLFSNPVYAANQITPVSEKKVDDKITLYKTTATADSDKLNISQLLTFNFIKDKSYDKDTLVLKAAGNINSGYKSPNPNDYIYSSFYWGAKYNVSISAESKGAVNVVDYAPKNQNEEFQVQNTLGYSFGGDISISKGLSGGLNGSESFSETINYKQESYRTTIDKHTDNKTIGWGVEAHKIMNAGWGPYGRDSFHDLYGNELFLGGRQSKLNAGQNFLPTSQMPLLARGNFNPEFLSVLSHKPNGAKTSKIKVTYQREMDEYTNYWNGFHWMGTNYKNQNNATFTSFYEIDWDQHTVKLIKTHSDEKNPS >NZ_CP015626|922718:932898|931965_932898_-|WP_014613568.1|DBSCAN-SWA MVKNKLLAATLSISLVLPLITPYSEEAKAANTIEEIGEGAQIIKRTEDVSSRKWGVTQNIQFDFVKDPKYNKDALIIKMQGFIKSRTSFTDVKGKGYESTKRMLWPFQYNIALKTNDPNVSLINYLPKNKIESIDVSQTLGYNVGGNFQSAPLLGGKGAFNYSKKISYTQKNYISEVAQQNSKNIRWEVKANSFNTENGQVSAYDRHLFVRSPIGPNARDFFVPNDELPPLIQSGFNPSFIATVSHEKDKGDTSEFEIAYGRNLDITYATFFPRTGIFAERRHNALMNRNLVTKYEVNWKTHEIKVKGHN >NZ_CP015626|922718:932898|922718_923765_-|WP_065520443.1|integrase|DBSCAN-SWA MASFTVTKRKNKKSSSWQYDVKHPSFKSGKKRKSGFKTKAEAVNAAQQLIRDLEDGNAIDDKTFKEYYEDWLVIKNKKSLSKRQFYWYERAIKLFEEHFGNAMLIRNITRTEYQKFLNNYGENHTDETVRKVHGCLMRCIRDAVYDGYLKKDPTYNVEVRGSKPSRKEETKFMTIKQYEKLIEYFKTRNEESYIFLFILAITGGRYSDAINMIDIDLNEKEGIIHLRGTKSVNADRFVEVPQKDIKLIKSKLSKLPKRVDGKLFKLSHTAVSKSFNHAKKETGLEDDTITPYALRHTHTSYLLSKGIPIEYISKRLGHYNISITLNTYSHLLDEHKKEQGQRVRELFS >NZ_CP015626|922718:932898|929974_930163_+|WP_020219672.1|DBSCAN-SWA MGKVLDYVKLDKLRVKALKASKQTKAPDVEDMPYDGFTNPPEGLDELTDEEFDYLIFGIKPD |
12 | Staphylococcus_phage(55.56%) | head,integrase | attL 913959:913975|attR 932618:932634 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
941494 : 962892
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP015626|941494:962892|DBSCAN-SWA 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24 | Staphylococcus_phage(95.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
966966 : 974758
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP015626|966966:974758|DBSCAN-SWA ACTACGCTCTTTTTTCAATCGCAATCACATATGGTGGTCGATTTTGTTGATTAATAAACTCATACTTCAAAACATGAGCACGTTGTTGATCAAACGCTGCCAAATGCTTCATCAAAGTCATGCTTTCTTCCTTGCCTTCTTCATGACCAGGATAAACGACTAAAACGATGATGCCTTCTGGTTGTAATATATCAAAAATCGTCTGAACAGCAGCAAGTGTAGTCGTTGATTGTGTGACGATAGATTTGTCGCCTTTCGGTAAATAACCTAAATTAAAAATGGCAGCATGTACTTGAGTGAGATGTTCGTCTCTAATATATTGTGTAATCCATTCGTGCCCTGTATGAAAAAGAGAAACATTGTTGTAATCGTGAACACGTTGTTTTGTATTTTCAATGGCTTCTTGTTGGATGTCACAGCCATAAACATGACCATGAGGGACGAGGTCTGCTAAAAATTTTGTATCATGACCGTTACCACATGTTGCATCAATGACGACACTTTCTGATGTAGTATGGCTTCGAATTAATGATTTGGCAAAAGGTAAAATACGTTCGACTATCATATGTGCACCTGAGAACTATAAGATGCGCCTTGAACAGTTCCACGACGTTCAAGTTCTGCGTCAATCTCGTTTAATACTTCCCATTTATTGACACTCCACATGGGACCGACCATTAAATCAATAGGACCATCACCTGTAATACGGTGGACGATCATTTCTGGTGGCAATTGTTCGAGTTGATCACAGACGAGTTGAATGTACTGTTCTTTCGTCATAAATTCAAGTAAACCTTTATCATATTGTTTCATCATAGGTGTACCTTTTAATAGATGTAACAAATGAATTTTAATTCCTTGGACATCCATTTGAGCAACCGCTTTTGCAGTCTCTATCATCATGTCATAATCTTCACCAGGCAAGCCATTAATAATGTGTGAACATACTTTAATGTTGTGACGGCGTAATTTTGCGACGCCTTCGTAATAACAATCCATATCATGTGCACGGTTGATTAAGTCCGATGTTTCTTGATGAATGGTCTGTAAACCTAACTCTACCCATAAATATGTACGTTCATTTAATTCGGCGAGGTAGTCCACGACGTCATCTGGTAAACAATCTGGACGTGTCCCGATAGATAATCCGACAACACCCGGTTCTTTTAATGCAGCTTCAAATTTTTCTCGCAATACAGCAACGGGCGCATGTGTATTGGTAAAGGCTTGGAAATATGCAATGTATTGACCTTCGTGCCATTTCTCGTGCATTTTATTTTTAATCTCTTTAAATTGTACTTCGATAGCATCAGCACGGTTACCCGCAAAGTCACCACTCCCTGCTGCTGAACAAAAAGTACAACCGCCGTGCGCAACTGTACCGTCTCTATTAGGGCAATCAAAACCACCATCTAAAGCAACTTTAAATATTTTTTGTCCAAATTTATTTTTTAGATGATAATTTAAAGTATGATATCGTTTCTTCTCAAAAGCATATGGGAAATAAGTGCCCATCACAATCTTCCTTTCAACTTTCTATGTTTAAACTGTTTTTATCATATCGTATTCGCCATTTTTCTTAAACAGTATTTGAAGATTTTAACATATTTTCATTATAACGTGTTATAGTGTGTGCTAGAGACAAAAAGGAGTGAAACATCAGTGAATATGCCTAAAGAAATATGGTGGCTCGTCATTGGGATGGCGATTAATATCACAGGTGCGAGTTTTTTATGGCCGTTGAATACGATCTATATGAATGAGGAACTCGACAAATCATTAAGTACTGCTGGGCTCGTACTGATGGTCAATTCATTTGGAATGATTGTAGGAAATTTACTTGGTGGGACATTGTTCGATAAACTTGGAGGATATCGGACAATTATGTTAGGCACGATTGTGAGTTTGTGCGCTACCATTTTATTAAATTTCTTCCACGGTTGGCCTTGGTATGCGATTTGGCTCATTATGCTCGGTTTTGGCGGTGGGATGATTATCCCTGCTATTTATGCGATGGCTGGAGCAGTGTGGCCTCAAGGGGGAAGACAAACGTTTAATGCGATTTACTTAGCACAAAATATCGGTGTGGCATTAGGTGCAGCGCTAGGTGGTTTTGTTGCTGAACTAAGCTTTAATTATATTTTTATGGCGAATTTGGCGATGTATGTCATTTTCTTCTTTATCGCATTATTTCAATTTAATATGGACTATCAAGCGACGGTTAAACATCAAGAAACGTTGGAAAATGTGGCGCACATTCAAAACAAGAAACATTTCACAGCACTCATTTTATTATGTGTGATGTTTGCGCTATGTTGGATTGCATACGTTCAATGGCAAACAACTATTGCGTCATTTACACAAAGTATTGGTATTTCTATGAGTCAATATAGTTTGTTATGGACAGTGAACGGGGTGCTCATTTTAGTAGGACAACCTTTAATATTACCGATTATTCACCTCATTAAAGGGCAGCTGAAAAAGCAACTTTACTTTGGATTAGTCGTATTTATATTGTCGTTTTTCGTGACAAGTTTTGCGACATCATTTTCAATTTTTGTTGTAGGGATGGTCATTATGACATTTGCAGAAATGTTCGTTTGGCCTGCTGTACCAACGATTGCTAATAATTTAGCGCCTAAAGGTAGAGAAGGGGTCTATCAAGGCATTGTGAATTCTGCTTCAACAGTGGGGAAAGCTTTCGGTCCATTAGTTGGCGGGATACTCGTCGATGTGTTCAATATGCAAATCATGTTTTTATCAATGATAGGTTTACTCGTCATCGCTATGGCATTCCTTACGATTTATGATAGAAAAGTTGATCCGAAAACGTTATATCGTTAATCACAGTAAATGACACTTGCATCTTCGTACCAAATTGCATAATATAGTAGATGATTACGAATTAAGCATGTGGTCGTACTGGACTGGAGTAGTAACTTAAAAGGGTTTCCACAGAGAGTTAGTGGTGGTGCGAACTAACGAAAAACTTTAAGTGAACTTGCCAATAAATAATGAAAAATAAATGACATCTCTTACTATTTAAAATGAAGTGCACTTCTAGGAGTGAATGAGGGTGGTACCGCGGCAAAAGTCGTCCCTTAGCATATATGAATAGTTTGAGGTGTCTTTTTATGAATGAGGAGGATTTAATTGTGAGTTACAATCATCAAGAAGTCGAAAAAAAGTGGCAAACGTATTGGCTAGAGAACAAAACGTTTAAAACAGAAGATAATATCGGGCAGAAGAAATTTTATGCATTAGATATGTTCCCTTATCCATCAGGTGCAGGGCTACATGTGGGGCATCCAGAAGGCTATACAGCAACTGACATATTGTCACGTTATAAGCGTATGCAAGGTTACAATGTATTACATCCAATGGGGTGGGACGCGTTTGGTTTACCTGCTGAACAGTATGCACTTGATACTGGAAACGACCCAGCCGAATTTACAAAACGTAACATTCAAACATTTAAGCGTCAAATTCAAGAGCTTGGTTTTAGTTATGACTGGGATCGTGAAGTCAGTACGACAGACCCTGAATATTATAAATGGACACAATGGATTTTTATTCAACTTTATAAAAAGGGATTAGCGTATATTGATGAAATTCCGGTAAACTGGTGTGAAGCGTTAGGCACAGTACTATCTAATGAAGAAGTGGTCGATGGTGTATCAGAACGTGGGGGCTACCCAGTGGTGCGACGCCCGATGAAACAATGGGTATTGAAAATCACAGAATATGCGGATCGTTTACTTGAAGACTTAGATACACTTGATTGGCCTGAATCGATTAAAGATATGCAACGTAACTGGATTGGTCGTTCTGAAGGGGCGAAAGTGAACTTTAAAGTCGAAAATATCAACACACCGATTGAAGTATTTACAACACGTCCAGATACGATTTACGGTGCAACATTTTTAGTGTTAAGTCCTGAACATACTATAGTGAATCGTATTACGACACCACAACAATATGAAAAAGTGAAACATTATCAAGATGAAGCGGCGAAAAAATCTGACTTAGAACGTACAGATCTTGCAAAAGAAAAAACAGGTGTCTTCACAGGGGCTTATGCGATTCATCCGTTTACAGGAAAGCAAGTGCCTATTTGGATTGCTGATTATGTGTTAGCCTCATATGGGACAGGGGCTGTGATGGCTGTTCCAGCACATGATGAAAGAGACTACGAATTTGCGACAACATTTGATTTACCAGTTGTGACAGTTATTGAAAACGATGCAGAGACACCTTATTACACTGGTGACGGTGCACACGTTCAGTCTGGTGAATTAGACGGTCTGAACAATGAGGCGGCGATTGCAAAAGCGATTGAACTATTAGAAGCAAAAGGCCTTGGAGAAAAGAAAGTGAATTATAAACTCCGTGACTGGTTATTTAGTCGTCAACGATACTGGGGTGAGCCGATTCCGATTATTCATTGGGAAGATGGCTCAATGACAACGGTACCGGAAAACGAATTACCTTTATTACTACCTAAAACGGATGAAATCAAGCCTTCAGGTACAGGTGAATCACCACTTGCGAATATTGATGATTTTGTGAATGTCGTTGATCCTGAAACCGGTATGAAAGGGCGTCGTGAAACAAACACAATGCCACAATGGGCGGGTAGCTGTTGGTATTACTTACGCTATATCGACCCTAAAAATGATCAAATGTTAGCCGACCCTGAAAAGCTTAAACATTGGTTGCCTGTTGACCTTTATATCGGTGGCGTTGAACATGCTGTATTACACTTATTATATGCACGCTTTTGGCATAAAGTGCTTTATGATCTTGGCATTGTTCCTACGTCTGAGCCTTTCCAAAAATTATTCAACCAAGGTATGATTTTAGGTGAAGGTAACGAAAAAATGAGCAAATCAAAAGGTAATGTGGTGAATCCAGACGATATCGTTCGTTCACATGGTGCAGACACTTTACGTTTATATGAAATGTTTATGGGGCCATTAGAAGCTTCAATTGCGTGGAGTGAAAATGGTTTAGATGGTTCACGTCGCTTCTTAGATCGTGTATGGCGCTTATTTGTCACTGAAGACAGTCAACTCACGGATAAAGTGATTGAAGGTGACACACCAGCATTACAAACGGTTTACCATCAAACAGTTAAAAAGGTCACTGAAGACTTCGAATCATTAAGTTTTAATACGGCAATTAGTCAATTGATGGTCTTTATTAATGAATGTTATAAGGCTGACAACATTTCTAAAGCTTATGCAGAAGGTTTTGTGAAAATGCTAGCCCCTATTGCACCGCATGTCGGTGAGGAATTATGGTCTATTTTAGGACATGATACAACGATTACTTACCAACCATGGCCAAGTTTCGATCCATCGCTATTAGAAGAAGATGTGGTTGAAATTGTCGTTCAAGTGAATGGTAAAGTTCGTGCTAAAATCGAAATTCCTAAAGATATGAGTGAAGCAGATATGGAAGCGACAGCGTTAGCCAATGACAACATTAAAGCTGCAGTTGAGGGCAAAGATGTTAAGAAAGTTATTGCAGTTCCACAAAAATTGGTGAATATTGTCGCGAAATAAAGAAGAATGAGGGAGCGTAGAGGATAATGAAAGAAATTACTACAGATGAATTAAAAGAGATTGTTTTAAGTTCAGAACCAGTAAATATTGTCGATGTACGCGAAGATGAAGAAGTGGCAATGGGAATGATTCCTAATGCTGAACATATTCCGATGAATGACATTCCGGATCATGTGGATGATTTCAAAAAGGATACGACGTACTACATTGTTTGTGCTGGCGGTGTGAGAAGTGCGAAAGTGGTTGCGTTTTTGAATGATCACGGGATTGATGCGGTGAATGTTGAAGGTGGTATGCGTGCTTGGGGTGAAGAAGGATTAGAGTTTAAGCGTATTTAGAATATGATGATGCACTGTTATTGTTGTGTGGGAGACCATGCGATAATAGCAGTGTTTTTGTGTTGTTGTTTGGTGAACATTTCGATTACATTTGAGTGTGTTTGTAGGTTGTTGAACATTTCGAAAAGTTTAGTTTAATATTTCTTGATTGCAGCACTTGCCTTCCCTTTCCTAGGGGCTGATCCTTCAACTAAATTCGGCTGGATTAAAGCATACACTTGATGGAGGCGGAATTGGATTTTGGGAGCAGTACAGAAATCTCATGTACAACAAAGATTTCGTCGCACTGCCCCCGCAAGGCTGACTCGACTTCTCACCGGCAAAAGCATTGAGAAGTCAGATAGCTACTGCGTTAAAAAGTAGCCACTCTCATAATTCAATGATTTGATTTTGCTTTCAACTTTCCTCTCAGGAGTCTTGCACGGTCTTGCAATATGTAGGGGGGTGGGGGGGACAAACAACAACACAAACTATCAAAAGCCACCACTCACCTTAACATAGCTCTTTGTACGCGTTGAGACGGCCAAATGCGGAGATTAATGATGTTAACATTTGAATGGATACAGCAATCAAAACCCCCCAGCTCGTTATCAATTTGAGATGGGGGAATGTTGTGTGGCAGGGTTAATTTTTATTCTACAAAGCCAGCGAAGTAACCTGCGACGTAACCCGTAACAAGGGCGCTCGTAATGTTGTAACCGCCCGTATATCCATGAATATCCAATACTTCACCGCATAAATATAGGCCAGGTGTGATTTTAGATTCCATAGTCGTGGGTACGATTTCTTTGATGGAAACGCCGCCGCCGGTTACGAAAGCTTTTTCTAACGGTAATGTGCCGTAGACTTCGAAAGTAAATGCTTTGAATTGATGTGCGAGTGTGCTAAGTTGTTGCGCGCTGATATGATGGTATGTCGTTTCAAACGGAATACCGGCGCTATCAATGATCAGTGTTAAGTAGCGTTCTTCAATCAACCCTTTGAGTGCATTTTTAATATGCTTATCGGGTTGTGATTTGAGCTGCTTCGTGATTTTTTGTTTAAGTGCTTCTTCATTGATTTCAGGAAAGGCATCAATTTGCATTTGAATGTTTTGTTGCTTCTGACTTTTTTGCTCGTGATAAATAAACTGACTACATCTCAGTGCGGCAGGGCCACTAATACCGAAATGTGTAAAGAGCATGTCCATTTGATGAGTAATGCGTTTTTTGCCATTTTTCTTTAAGACAGATAGACCGACGTTTTTTAGACTCAACCCTTTAAGTGATTGGTTTTTAATAAATGGTGCGTTTGATTTAATCGGAACTTCTGTAGGGAAAAGTTCTGTAATGTGATGACCTAGTGATTGTGCAAAGCGATAGCCATCGCCTGTTGACCCAGTTTGGGGTACACTTGTGCCACCAGTCGCAATAATGACTGTTTTTGCTTTATACGTATCACCATCTTGAAGTTGGACTTGGAAATGGTCTGAATCCACTTTTTTCACGTCCACTACAGTTTGTTCTTCTTTGACTGTAACCTTATTTTGTTTCAATTCACGAATCAATGCATCGAGTACATCTTGTGACTGATTTGATACAGGGAACATACGACCATGGTCTTCCTCTTTTAATGCAACACCACGCGATTCAAAAAATTCGATAATAGATTGGTTATCGAAAATTGAAAAAGGACTGTATAAGAATTTTCCATTTCCAGGAATGTGTTGAATAATTTCAGCATAGGGCAAGTTGTTCGTCACATTGCAACGACCCCCGCCGGATATTTTTAATTTTCGTCCTAAACCTTTCTTTTTTTCTAACAGGAGTACGGGTTGCCCGTTTTGACTTGATGAAATGGCAGCCATTAATCCGCTCGGCCCGCCACCGATCACAATTGTTTGATACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP015626|966966:974758|968627_969809_+|WP_015729341.1|DBSCAN-SWA MNMPKEIWWLVIGMAINITGASFLWPLNTIYMNEELDKSLSTAGLVLMVNSFGMIVGNLLGGTLFDKLGGYRTIMLGTIVSLCATILLNFFHGWPWYAIWLIMLGFGGGMIIPAIYAMAGAVWPQGGRQTFNAIYLAQNIGVALGAALGGFVAELSFNYIFMANLAMYVIFFFIALFQFNMDYQATVKHQETLENVAHIQNKKHFTALILLCVMFALCWIAYVQWQTTIASFTQSIGISMSQYSLLWTVNGVLILVGQPLILPIIHLIKGQLKKQLYFGLVVFILSFFVTSFATSFSIFVVGMVIMTFAEMFVWPAVPTIANNLAPKGREGVYQGIVNSASTVGKAFGPLVGGILVDVFNMQIMFLSMIGLLVIAMAFLTIYDRKVDPKTLYR >NZ_CP015626|966966:974758|970099_972532_+|WP_115877136.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNEEDLIVSYNHQEVEKKWQTYWLENKTFKTEDNIGQKKFYALDMFPYPSGAGLHVGHPEGYTATDILSRYKRMQGYNVLHPMGWDAFGLPAEQYALDTGNDPAEFTKRNIQTFKRQIQELGFSYDWDREVSTTDPEYYKWTQWIFIQLYKKGLAYIDEIPVNWCEALGTVLSNEEVVDGVSERGGYPVVRRPMKQWVLKITEYADRLLEDLDTLDWPESIKDMQRNWIGRSEGAKVNFKVENINTPIEVFTTRPDTIYGATFLVLSPEHTIVNRITTPQQYEKVKHYQDEAAKKSDLERTDLAKEKTGVFTGAYAIHPFTGKQVPIWIADYVLASYGTGAVMAVPAHDERDYEFATTFDLPVVTVIENDAETPYYTGDGAHVQSGELDGLNNEAAIAKAIELLEAKGLGEKKVNYKLRDWLFSRQRYWGEPIPIIHWEDGSMTTVPENELPLLLPKTDEIKPSGTGESPLANIDDFVNVVDPETGMKGRRETNTMPQWAGSCWYYLRYIDPKNDQMLADPEKLKHWLPVDLYIGGVEHAVLHLLYARFWHKVLYDLGIVPTSEPFQKLFNQGMILGEGNEKMSKSKGNVVNPDDIVRSHGADTLRLYEMFMGPLEASIAWSENGLDGSRRFLDRVWRLFVTEDSQLTDKVIEGDTPALQTVYHQTVKKVTEDFESLSFNTAISQLMVFINECYKADNISKAYAEGFVKMLAPIAPHVGEELWSILGHDTTITYQPWPSFDPSLLEEDVVEIVVQVNGKVRAKIEIPKDMSEADMEATALANDNIKAAVEGKDVKKVIAVPQKLVNIVAK >NZ_CP015626|966966:974758|972558_972870_+|WP_015729339.1|DBSCAN-SWA MKEITTDELKEIVLSSEPVNIVDVREDEEVAMGMIPNAEHIPMNDIPDHVDDFKKDTTYYIVCAGGVRSAKVVAFLNDHGIDAVNVEGGMRAWGEEGLEFKRI >NZ_CP015626|966966:974758|967526_968480_-|WP_014613608.1|DBSCAN-SWA MGTYFPYAFEKKRYHTLNYHLKNKFGQKIFKVALDGGFDCPNRDGTVAHGGCTFCSAAGSGDFAGNRADAIEVQFKEIKNKMHEKWHEGQYIAYFQAFTNTHAPVAVLREKFEAALKEPGVVGLSIGTRPDCLPDDVVDYLAELNERTYLWVELGLQTIHQETSDLINRAHDMDCYYEGVAKLRRHNIKVCSHIINGLPGEDYDMMIETAKAVAQMDVQGIKIHLLHLLKGTPMMKQYDKGLLEFMTKEQYIQLVCDQLEQLPPEMIVHRITGDGPIDLMVGPMWSVNKWEVLNEIDAELERRGTVQGASYSSQVHI >NZ_CP015626|966966:974758|966966_967530_-|WP_014613607.1|DBSCAN-SWA MIVERILPFAKSLIRSHTTSESVVIDATCGNGHDTKFLADLVPHGHVYGCDIQQEAIENTKQRVHDYNNVSLFHTGHEWITQYIRDEHLTQVHAAIFNLGYLPKGDKSIVTQSTTTLAAVQTIFDILQPEGIIVLVVYPGHEEGKEESMTLMKHLAAFDQQRAHVLKYEFINQQNRPPYVIAIEKRA >NZ_CP015626|966966:974758|973501_974758_-|WP_063278942.1|DBSCAN-SWA MYQTIVIGGGPSGLMAAISSSQNGQPVLLLEKKKGLGRKLKISGGGRCNVTNNLPYAEIIQHIPGNGKFLYSPFSIFDNQSIIEFFESRGVALKEEDHGRMFPVSNQSQDVLDALIRELKQNKVTVKEEQTVVDVKKVDSDHFQVQLQDGDTYKAKTVIIATGGTSVPQTGSTGDGYRFAQSLGHHITELFPTEVPIKSNAPFIKNQSLKGLSLKNVGLSVLKKNGKKRITHQMDMLFTHFGISGPAALRCSQFIYHEQKSQKQQNIQMQIDAFPEINEEALKQKITKQLKSQPDKHIKNALKGLIEERYLTLIIDSAGIPFETTYHHISAQQLSTLAHQFKAFTFEVYGTLPLEKAFVTGGGVSIKEIVPTTMESKITPGLYLCGEVLDIHGYTGGYNITSALVTGYVAGYFAGFVE |
6 | Staphylococcus_phage(100.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1094384 : 1110498
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP015626|1094384:1110498|DBSCAN-SWA 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12 | uncultured_Mediterranean_phage(40.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1594292 : 1598672
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP015626|1594292:1598672|DBSCAN-SWA TTTATTGATTTTCTTTTTCTAGTTGTTTTTGGTAGTTGTATAGTTTTTCGATCGTTCTGAGTCTGGCATCATCTAAATTAGTTTTTTCATTTCTTAAATCTTGCACAGTTTGATATGGCAAACCAGTCGCTTTTGATATTTGACTGCCATTTTGTACTTTGAATAACTTTTTTATATCTTGCTTCACGTTTTCAAAATTCAAGTTAATCACCTTTTTTGTATAGTTTAAGAATGACCAAAGTTGTTGCTAAAGTTAATGCTGTGCTTGTGAATGAATTTCCAATAAACAAATTAATCCATAGTAGTATTATTAAAATTATAGAAGTTGTTTTCATAGTTTTTAAATGCTAGAATTTAATTAGAAAGGTTGCCCCTTTTGGGGCGTAACCTTATTTCTTATTATCGTCTTTCAGTGCTTTGATGACCGCTATTGTCGATGCTACTGTAAAGACGATATTTGCTATTCTTTCGAAAGTTTCTAGCATTCTTTTTTCCTCCCTTCAACTTTCTATATATATTATATCACGATTAATCGTGATTAACAACCCTTTTCCTCATCTTTTTTTAATTTTTCTCATAAAAAACCACACCGTGAGGGTGTGGTTAAAAGAACAAGTTTATTACAATACTAATCAAACTTATAATTGCTGGAATCGATACACCAATCCAAAAGCGTTTTGATGTGACTTTTTCTAAGTTTATTTCTTCTTTCAAACTTTTTACGGCGTTATCAATTTTCAACTCTACATTATCGAATCTTGTGTCCATGTGCTTTTGATGCTGTTCAAATTCAGGGCGTGTAATATAATCTAATGACATTGTATCCACCTCCGAAATAAGAGTATTCCCAACACTTCTGATATTATAAGAATTGTAATATCTCGGTAAAGAGTTTATCTCTTTTTTATCTGTAAATTTGGGGTGATTATTGATTGGATAGGTATTAATTCGACTCATCTTTAATCACTTCGTCAAATTCGTTTTGAAGAGTATCAATATCTTTTATCGGTCCGTGAATCTCCTCATATTGATTGATTGCTTCATCAAGTGCATTCCTTAACTGTTTTGCCAAACTAGGATTCATCATTATATTCCTATTTTCAACAAAACCGTTAGGCGTGTGCTGTGTGAAGTTAATCATAAAATCTGTGATACTTGTTCTCATTTCCAAAGAATTGGTGTAAAAAATATACGGATCTATTTCTGTAGCTTGACTTAGATTTCTATCATATTCTATGCCTTTGTATGATATACCCATTCTAAATCCTCCTTTCACTACTTATTTTACAAATATATTAATAAGATTTAAAGTCCAAACATAAATACGAACACAAAAACCACCACCCTCAACTAGTATAGGTGGCGGTAAATAAAGCCGGATTGGTTACCGGTAATCTATATGTATATTATAACATAAAAAAAGAGGGTAGCCGTATAAGCTACCCTCTAATCATGTCGTGGATATACATAGTATATCATACTTTATTTTATTTCGCCCCACAACTTACCAACTTTACCAGTTTTAGCGTCCCAAGTACGTACTGGCATATATACGGTTTCTCCCTCAAATGTTTCCCAAGAAACCCATACGTGACCATCAAATTTTTGAACTTCATCATATTTAATCGTTTGACCTTTTTGTAATACGCCTGCTTGTGGATGACCAGTCCAAGGTCCTTTGTAACGAGTAATAATCCCCTCGCTTGCTGTCACAGTAAATGAAGCGTGTTCAGCTTTGTACCAAATACCGTCTTTATTTTGTTTCCAATCTGTCGCTTTAACAACTTGCTTAGCTTCTTGCTTTTTAACTTCTTGCTTAACGTCAGATTGTTTGATAGTTGCTTCTTTGCTTACTTCTAGCTTTCCACCGTCATAATAATGTTTGATGCGTTTGATGAAGTAGTCTTTCATTCTATTAATATTTGCAGTTGTGTAAGGTGCTCCTTTACCAACATGCAACTCCCATGAACGATGTGGACAAGAAGTACCAAAGAATTCGTTATGCAGACGTACAGTGTTGCGATTAACTGGTAATCCGTACGACTTCATCACGTCCGCAGCTACTTTTAATGTCGCTTCTTCATTTTCTAAGAATAATGCGTCTGAGATTCGTCCTGGATAACTTTCACACACTTCAAATCCGATTAAGTTAGCATTTGCCCATTGATTACCACAATGCCACTCTACGTAGTCTGTCGGATGATACCAAAGCACTTCGTTTCTATTTGCATAAACACTAGCCCAACCGTTAACGTGTGTACCGTTATTCTCACGTGCATATAACCATGGTAAGTATTGACTAGGTGTCATACTACCATAATCATTGTGGATGACCACACCTTGAATACTAGGTTTTGGTGCTGTAATCTTGTTACCTTTAATATGGTTTGAATAGATATGTTTCAACTCTTTCACGCTCCCATTTTTAGATTTATCTTGCTTTTTATTTAAGTTAGTAATGTCGTACTTCTCCATAGCTAAACCACTACATACTTGTGATTTTTCGTCTTTCAGTGCGTCTTTAGGTCGTAATTGAATATGCAAATGTGCGGACATAGGATTGTCGTAATAGTTGCTATTACCTTGTGAACCGACAATGTCACCTTGATTGACTTTGTCGCCTACAACAAATCGCATTGAGCCACGTTGTAGATGCCCATAGATCCATTCATTGCCGTTGTCATCTTTAATAACGAATGTACCACCAAAATTACCGTAATCGTTTGCTTCAATAACTGTTCCGCTAGTAACGGCAGGCACGTCGTTAGTTTCGTTACTGTAAACATCAAAAGCTCTATGATAGCCACCACAAAACTCATCATAATTAATGCTGTTTTCATGGTAATTTCTGTATCCATAGTTTTTAGGGTAACCATCGTAAGTGCGAGGGTCAGATGATATTTTCCAACCTTTTTTCGTAAGATAGTCAATAGCAGTTAGCATATTATTTCAGCCCTTTCTCTTTAAGGTATTCCTCTTGCTCACGTGCTGACTTTTTAACGATAAATGTATTCTTCCACACGCCATACGCCACTAATGTTAATGGTACGCCTGTATTTAACACGTTAATCCAAGCGTCAACTGCTTGTGGGTTAATCCATTCCGCACTAATTCCGCTAGCTTGTAACGCTAGATATAAAGCACCTACAAAGCCACCGATTAAAGCGATAAATTGTTTGATTTTATCTTCCATATTTAATTCCTCCTTAAAATAAAAAGTCGACACATCAGTGCCGACCTTAAAAAAAGTAATGCGCTAACCCTAGCGCTGCCATGATAACGCCGAAAATGCCAGTAATAATCGTCGTTGTAATTTGTACATTTCCTTTTTGTTTTTCTGAGATGTCGTTAGAAATGTCTTCTAGTTTTTCGTCATGTGTTTGTACTTTAAATCTAATCTCTGTAAAGTCATTACCAAATTTAAGCATTGTTTCGTTTAATGTTTCAAGATGTTTTTCTGAACGCTCTTGAGACTCAAAGGCACGCTCTTGTAGTAAAACTTGTCTATCAACTGTCTTTTCTAATTTGTTCAGTGCTTCTGTGTGTTTACGATCATTCTCGTTAATTTTCTCATATATCTTACCTCTTGAATTTTCCCATTCGTGCCTTAAAACGAATTTATTGTCGTCGTTCATAAATCGCCGCACCTCCGAGGAAACCAATCGCACCACACACAACAGTTAATACAGCAAATTGTGCCCATGTCAGCCAATTAATCGCATTGAATATACTTGCACTCGTCATCAAAAAATAGATAATAGCGCTTGATAATCCGCCCACTAAAAGCAACCAATTACATATGTTATTGTAAGGTTGTCGTGGCAGAAAAAAAGCCGATGACATCAAAATTATAGACGCAATCATCAATAAATAACCCCACGCCCAGATAGGCATAAATTCATGTAATCTCAGATAAAATTCAGAATCTTTAATGACTTTGTTTTGTTCATAAGACCAAAAAAGCGCTCTTACAAAAGTAAAAGCACTTAATCCAAAAATTAAAACAAATGCAATCGTTTCACTAAAAGTTTGCTTTTTCAAATAACTGTACCTCCTCTGTCTCTATTTGTTTAGAGGTCTATTCTGTCTCTTCTCTCATTGACGGCTCCTCTGCTGTTTCTTCGTACACTGTGCCGTCTTGATTGTACTTTGTACGCGTCACCTCTTGTTTTACATAGTATGTCTTTGTGCCGTTGTTAAAAATTCCTGCGAGCATGTTTTGGATTTTGCACGCTTGTTTCACCTTTTCTTCTTCGTTAAATTTAAAAGCTGTGTTAGGTGTTGCACCTCTCATAAAACTGTTTGAATAGTTTTGTGTCAAAGGACTTTCTTCTCCTTGTTTATTAACTTCAACTAAGTAATATTCAGTGATTTGATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP015626|1594292:1598672|1597909_1598332_-|WP_065520538.1|DBSCAN-SWA MKKQTFSETIAFVLIFGLSAFTFVRALFWSYEQNKVIKDSEFYLRLHEFMPIWAWGYLLMIASIILMSSAFFLPRQPYNNICNWLLLVGGLSSAIIYFLMTSASIFNAINWLTWAQFAVLTVVCGAIGFLGGAAIYERRQ >NZ_CP015626|1594292:1598672|1595234_1595549_-|WP_020219674.1|DBSCAN-SWA MGISYKGIEYDRNLSQATEIDPYIFYTNSLEMRTSITDFMINFTQHTPNGFVENRNIMMNPSLAKQLRNALDEAINQYEEIHGPIKDIDTLQNEFDEVIKDESN >NZ_CP015626|1594292:1598672|1598369_1598672_-|WP_065520539.1|DBSCAN-SWA MNQITEYYLVEVNKQGEESPLTQNYSNSFMRGATPNTAFKFNEEEKVKQACKIQNMLAGIFNNGTKTYYVKQEVTRTKYNQDGTVYEETAEEPSMREETE >NZ_CP015626|1594292:1598672|1595773_1597234_-|WP_020219675.1|DBSCAN-SWA MLTAIDYLTKKGWKISSDPRTYDGYPKNYGYRNYHENSINYDEFCGGYHRAFDVYSNETNDVPAVTSGTVIEANDYGNFGGTFVIKDDNGNEWIYGHLQRGSMRFVVGDKVNQGDIVGSQGNSNYYDNPMSAHLHIQLRPKDALKDEKSQVCSGLAMEKYDITNLNKKQDKSKNGSVKELKHIYSNHIKGNKITAPKPSIQGVVIHNDYGSMTPSQYLPWLYARENNGTHVNGWASVYANRNEVLWYHPTDYVEWHCGNQWANANLIGFEVCESYPGRISDALFLENEEATLKVAADVMKSYGLPVNRNTVRLHNEFFGTSCPHRSWELHVGKGAPYTTANINRMKDYFIKRIKHYYDGGKLEVSKEATIKQSDVKQEVKKQEAKQVVKATDWKQNKDGIWYKAEHASFTVTASEGIITRYKGPWTGHPQAGVLQKGQTIKYDEVQKFDGHVWVSWETFEGETVYMPVRTWDAKTGKVGKLWGEIK >NZ_CP015626|1594292:1598672|1594894_1595110_-|WP_015728850.1|DBSCAN-SWA MSLDYITRPEFEQHQKHMDTRFDNVELKIDNAVKSLKEEINLEKVTSKRFWIGVSIPAIISLISIVINLFF >NZ_CP015626|1594292:1598672|1594292_1594493_-|WP_015978022.1|DBSCAN-SWA MNFENVKQDIKKLFKVQNGSQISKATGLPYQTVQDLRNEKTNLDDARLRTIEKLYNYQKQLEKENQ >NZ_CP015626|1594292:1598672|1597530_1597926_-|WP_020219677.1|DBSCAN-SWA MNDDNKFVLRHEWENSRGKIYEKINENDRKHTEALNKLEKTVDRQVLLQERAFESQERSEKHLETLNETMLKFGNDFTEIRFKVQTHDEKLEDISNDISEKQKGNVQITTTIITGIFGVIMAALGLAHYFF >NZ_CP015626|1594292:1598672|1597235_1597484_-|WP_020219676.1|DBSCAN-SWA MEDKIKQFIALIGGFVGALYLALQASGISAEWINPQAVDAWINVLNTGVPLTLVAYGVWKNTFIVKKSAREQEEYLKEKGLK |
8 | Staphylococcus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1602973 : 1636454
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP015626|1602973:1636454|DBSCAN-SWA 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57 | Staphylococcus_phage(89.09%) | head,protease,terminase,tail,integrase,portal,capsid | attL 1594837:1594864|attR 1640448:1640475 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1723240 : 1731660
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP015626|1723240:1731660|DBSCAN-SWA CTTATCGAATAATCTTCTTAATGACTGCTGGGTACAATTCATACTCTAATGATTTAATACGTTCTTCTAATGATTGTTGTGTATCGTCTTCATAAATTGGACATGTGCGCTGTTCAATCATCTGACCTGTATCCATACCTGCATCGACGTAGTGTACTGTTGAACCTGTTTCCTTATCCCCACTGTTTAACGCTTGTCCGACTGCATTTTTACCTTTATATTTCGGCAATAATGAAGGGTGAATGTTCAAAATGCGTCCTTCATATGCTGATAACAATGTTTCATCGATTAAACGCATATAGCCTGCTAATACAATCCACTCTACACCTTCCTGACGCAACCAATTTAATACAGCCGCTTCATAAGCTACTTTATCATCGAACGTGCGTGGTTCGAATGCATGGACAGGAATGCCATGTTGTTGAGCAAGCTGAACACACGCTGCTTCAGGCTTGTCAGTGTACAATGCTGTGACTTCGATATGCACGAGTTCACCCGATTTGACACGTTTCATAATGTTATCGAAATTTGTGCCGGAACCAGATGCAAAGATTGCAATTTTAACCACTATTTTGCCTCCGTTAAGCGAATGGCACTGTCTTCTTCAGCAATATGACCGATTGTGTATGCGTCCACATTCGCATTTTTTAAGATTTCATGAACTGCTACTTCATCTTCAGGTGCAACGATGAGTGTAAAACCAATCCCCATGTTGAAGATATGGTACATTTCGTCTGTATCGATGTTACCTTGTGCTTGTAACCAATTGAAAATAGCCGGTGTTGGAAACGATGCTGTGTTCACAACAGCCGTTTTGCCTTCTGGTAAAGCTCTCGGAATATTTTCGTAAAAACCACCACCTGTTATATGTGTCATCGCTTTAATTTGAACATCTTTTTTCACCGCAAGCACAGGTGACACGTATAAAGCAGTTGGTGTTAAGAGCATGTCTAAGAAGCTTTGTTCACCTTCAAATGTATCGTTCACATCAATACCTGATTCCGCGACAAGACGACGGACTAAACTGTAACCGTTTGAATGAATGCCGTTTGAGGCAAGGCCGATGATGACGTCACCCTTTTCTACTTTTGAGCCGTCAATGTATTCTTCTTTTTCAACTGCACCGACAGCAAAGCCCGCAACATCGTATTCACCTTCATGATACATTTCACCCATTTCAGCTGTTTCGCCACCGATTAAAGCTGTGTTTGTTTCAACACAACCATCACTAATGCCTTTTACGATTTGTTCGATAATTTCCGGTACCACTTTATGTGTCGCAATATAGTCTAAAAAGTATAGCGGCTCTGCGCCAGTCGTTAAAATGTCATTTACACACATTGCAACGGCGTCAATACCGATTGTGTCATGTTTGTCATAGTCGATAGCGAGCTTTAACTTTGTACCGACACCATCTGTTCCTGATACGAGTACGGGGGCTTTCATATTGAGTTGTGATAAATCAAATGTTGCACCAAATCCTCCTAAGCCGCCAAGTACTTCTTTACGCATCGTTCGTTCAACGTGGCTTGACATTCGTTTTACCGCTTCATAGCCAGCTTCGATATCGACACCAGCCTTTTTATATGATTCAGCCATTGATTACACTCCTCTTCTTTTCATTTCCTTAACTTCTGGTAGTTCATGATCCACAATTTCAATCGGATATTCACCCGTAAAACAAGCGTTACATTCGCCTTTAGAATCATGGGCTTTAAACACTTCATGCATGCCTTCAACAGATAAATATGTCAATGTATCTGCGCCAATCATTTCGCGAATTTCTTCTACAGTATGTTGAGCCGCCATCAATTCTGCATGAGTAGACACGTCAATACCGTAGTAACACGGATCTTTTAATGGGGGTGAAGAAATGCCCATATGCACTTCTTTCGCACCTGCAGATTTCAATGCTTTAACGATATATTTACTTGTCGTTCCGCGCACGATCGAGTCATCAATCACGACCACACGTTTGCCTTCAATCACATCACGAATCGGTGAATGCTTCATACGGACCTGTCTTTCTCTCACAGACTGATCTGGTGTAATAAACGTACGACCGATATAACGGTTTTTCAGCAACCCTTGTTCGTTCGGAATCCCTGTTTGTTCAGAAAAGCCTTTCGCCGCTTGTAATGAAGAATCGGGAACACCAATCACGATATCCGCATCGATGCCCATTTCTTCAGCTAATTTACGTCCAAGTGCTTTACGGACATTGTAAATCGAGTGTCTGTGAAATTCTGAATCCGGACGTGCAAAGTAGACATATTCCATCGAGCACATCTTATGACCGATATCTTGTGTATACATGTCGTAGTCCACTTCGTTCTCACCAGAAAATGTAATCAATTCACCTGGTTCGATGTCACGGATGTATTCTGCACCAATTGCTGTAAAGGCACATGTTTCACTCGCAACACAGTATGCGCCATCGACTTGACCTAACATCAATGGGCGGACGCCACGATTGTCACGTGTCGCTGTCAGTTGTTCTTCGTTTAAAATGACACAACTGAATGCCCCTTTCACTTGATTCAATGCTGCTTTTTGGTTTGTTTTAATATTTTCCGATTTTCCTTTAATCAACAGATGAGCAAGTACTTCTGAGTCACTCGTCGTTTGGAAAATGCCGCCTGTTGATTCAATGGCTAAACGAATTTGATGTGCATTCGTTAAGTTTCCATTGTGTGCCAAACCTAAGTCCCCTTTAGAATGTTTGAACAAAAACGGTTGCACGTTGGAAATCTCGCTCGCTCCTGTGGTCGCATAACGGACATGACCAATGGCGTTCGGATAACCTTGTAATGACTCCAATTGTTGTTGTGAAATTGCCTCAGTTAACAATCCCATACCACGCGCACCAAAAAGTTGTTCACCGTTCGAGCACACAATCCCTGCACCTTCTTGACCGCGATGTTGCAAACTGTGCAATGCCATGTAAGTCAAATAGGCTGCATGAGGATGGTTCCAGATGCCGAAAACACCGCATTCTTCGTTTAGTCCACGGATGTCATACATGACTCAATAGCTCCTTCCCATTCACGTTTAAGTTCAGATGTACGACGTTCAATCACACTGTCTTGTGCAACGACTTTAAAGTCATCTGTATCCGTCAATGTACCGATACGTGTTGCGCCTTCGATATTTAATGTTTGACCTGCTTTCACTGCAACGATATAACGTCCTTGCGTTTCACTAAATAATTGTGCATTTGTTAAATTGACTTCAGCGTCAATACCTAGGCTGTAATGCGCGCTAATTTTAGCAAGTGTAATCGCAATACCCCCTTTACCGACAGTTTGTGTATGTGAAATCACACCTTCACGAATCGCACCACGTATTGCTTCACCTTTCGCTGCTTCTTGTGATAAATCGACTTTTTCAACTTCATGATTCACATCGCTATACAATAATTTTTCAATTTGACTCCCACCATAGCTATCTGTCGTTTCACCGATGACATAAAGTGTGTCACCTATAGACGGTTGATATGATTTTAAGAAGTCGATGTTTTCAATTAAACCTACCATCCCTACAACAGGTGTTGGGAAAATAGAAGATGTACGTGTTTCATTATAAAGTGAAACGTTACCTGATACGACAGGTGTTGCAAGTGCTTCACATGCTTCTGCCATCCCACGTGTTGAGTCTGTCAATTGTTGATAAATGTGCTTTTTCTCAGGTGAACCATAGTTTAAGCAGTCCGTCATCGCTAATGGTTTTGCACCGACAGCAATTAAGTTACGGTATGCTTCGGCTACGACCATTTTGCCGCCTTCATACGGATCATTAAAGACATAACGTGCTTCACCATCAATCGTAGACGCAATTGCTTTGTTTGTACCTTCTACACGGACCACAGACGCTTGTAAACCTGGTTTAATAATTGTATTTGCACCAACTTGTTGATCATATTGGTCATATAAATAATGTTTTGATGCAATCGTTGGATGTGTTAATAAACGATCAAAAACATCATTCACGTCAATATCATCATAACGGTTCGGTGCTGTATCGTGTTGTAACGGTTCACCTTCAAGGATGTATACTGGCGCTTCATCCGCGAGTGGTTCGACAGGAATATCTGCAAATACTTCACCTTCATAAGTGAGGACGAAGCGGTTCGTATCCGTCACTTCACCAATCACTGCACTGTCTAGTTCATGATAGTCAAACAAATCTAAAAACTTTTGTTCAGTCTCTTTTTTAACGACAAGTAACATACGTTCTTGTGTTTCAGACAACATCATTTCATATGGAGAAATACCTTTTTCACGTACTGGGACTTTTTCGAGCTCAAGATGAATCCCGCTGCCCCCTTTAGCTGCCATTTCAGATGATGAAGATGTTAAACCAGCCGCACCCATGTCTTGAATACCGACAAGTTCGTCATAAGTAATCGCTTCTAAAGTGGCTTCCATTAATTTTTTACCAACAAATGGGTCACCGATTTGAACAGAAGGACGTTTGCTTTCACTTTCTTCACTGAGCTCTTCTGATGCAAATGTCGCACCATGAATACCGTCACGTCCTGTTTTCAAACCAACGTAAATGACAGAGTTACCGACACCTTTAGCTGTACCTTTTTGAATCATATCGTGATCAATGACACCGACACACATCGCATTGACAAGTGGATTGCCGTCATAACGTTCGTCAAATTCGATTTCACCTGCAGTTGTCGGAATACCGATACAGTTACCGTAACCACCAATACCTGCAACGACACCACGTAATAAACGACGGTTTGTTTTTTCAGTCAGTTCACCAAAACGTAAGCTGTTCAATAAGTTAATTGGACGCGCACCGATAGAAACAATGTCACGAATAATCCCACCGACACCTGTCGCAGCACCTTGATAAGGTTCAATTGCTGAAGGGTGGTTATGTGATTCCACTTTAAATACAACAGCCTGATTGTCACCAATATCAACTACCCCTGCACCTTCACCAGGCCCCATTAAAACATGTTCACCTGTTGTCGGGAATTGTTTTAAAAATGGTTTAGAATGTTTATATGAACAGTGTTCACTCCACATAACAGAAAAAATACCTGTTTCCGTAAAATTAGGTGTACGTCCTAAAATTTCAGTTACTTTTTCAAATTCTGCATCGCTTAACCCCATGTCACGATATAATTTTTCAACTTTGACTTCTTCTGCAGTTGGCTCTAAAAATTTAGGCATTTTGTTCCCTCCAGCTATTCACCATTGATTCAAATAATTTCACACCACTGTCTGTACCAAGAATGGCCTCTAATGCACGTTCTGGATGTGGCATCATGCCGCAAACATTCCCTGCTTTGTTGACGATTCCAGCAATATCATCATGTGAACCGTTCGGATTGTCCATATACTTTAAGATGATTTGATTATTGTCGATGAGTTCTTGATAAATCTCTTCTGTACAATAATAATGACCCTCACCATGTGCTACTGGGTAAACAACTTCTTCACCTTCACTATAACCTTTCGTAAATGGTGTTTGATTATTCACAATTTTAAGGTGTTCATTTCGACTCACGAATAAATGTGAATCGTTGTGTAATAACGCACCTGGTAATAAACCAATTTCCGTTAAAATTTGGAATCCGTTACATACGCCAAGAACGGGCTTTCCTTCATCAGCCAATCTTTTCACTTCTGCAATAATCGGTGCTACACTTGCCACCGCACCTGAACGTAAGTAGTCACCAAATGAGAAACCACCAGGAATCAATACGCCATCGTACCCTTTTAATGATGTTTCACGGTAATCGACATAATCCGCATCGACACCTGATTTCAATGCTGCATTATACATATCACGATCGCAGTTAGAACCTGGGAATCTAAGGACAGCGAACTTCATATTATTGATTCTCCTTTTCATCCAAAACTTTGTAACTATATTCTTCAATCACTGTATTCGCAAATAACTTTTCACTTAAAGTTGTCACAACATTGTGTACCGCTTCATCAGTTGCTTCATCTACTGTCATGTATAAAACTTTACCAACGCGGATATCATTGACTTGTTCATAACCTAAGTCATGTACAGCGCGAGTCAACGCTTGACCTTGTGTATCTAAAACTTGTGGTTGTAAAGTGATGTGTAATTCGATTGTTTTCATGATTAAAGTGCCTCCAATTTATTTAAGAAAGTTTGGTAAGTATCAATTAAAGATCCTGTATCTTCTCTATAAACATCTTTGTCAAAGTTTTCTTGTGTTGCTTTATCCCAAATACGACATGTATCCGGGGAAATTTCATCAGCGAGCAACAATTGACCTTCATGATCAACGCCGAATTCAATTTTAAAATCAACTAATGCTAAGCCCATTTCATCCATTAATTTGATCAATGCTTGGTTAATGCGTAATGCCTGTTCTTTCAACTGTGCAATCATTGCATCATCCGCAACCCCCAACAGCTTGACATGATCATCAGTAATAAGCGGGTCATTAAGGTCGTCATTTTTATAGAAAAACTCTACAAACGGATAATCAAACACATGTCCTTTTTCAAATCCGAGACGTTTCGTAATTGAACCCGCTGCAATGTTACGTACAACAACTTCTAAAGGAACGATGTTGACTGCTTTAACAAGTTGTTCTGTTTCTGAAAGTTGCTCAACAAAATGACTCTCGATACCTTCATTTTTAATGTATTCAAAGATGCGCGATGTAATTTGATTGTTTAAGCGCCCTTTACCTACCATTGCATCTTTTTTCGCACCATTACCAGCTGTGACTTCATCTTTATATTCAATTCTCAATACATCCGGTTGTTCTGTTGAAAAAACACGTTTTGCTTTGCCTTCATATAAAAGACTCATTTGTATTCGTCTCTCCCTTCAAATTTTACGATCAGTTGTTGTTCAGTCTTTGAAACATCATCAGTTAGTATTGTTAAATGCCCCATCTTACGTTCAGGTTTACGTGAAACTTTGCCGTAGAGGTGAACATGCCAATCAGGATGTGCAAACAATTCTTTCTCCAACAAATCCAAATCCTTACCTAACAAATTCATCATGATTGCAGGTTTTAACAATTCAATGTGTTCAGGTAAACGATGGCCTGTCACAGCTAAGATGTGGGTATCAAATTGCGAATAATCACAGGCTTCAATTGAATAATGTCCTGAATTGTGTGGACGTGGCGCAATTTCATTGACGTACAATTCATTTTGTTGATTAATAAAAAATTCCACTGTAAACGTCCCTACAAAATGTACCGCTTGGGTAATTTTGTCGACTTCACGACGTGCTTCTTGTTCGTGATTCGCCCGTGCAGGTACAACAGTTTTAAATAATACTTGGTTTCGGTGTTCATTTTCTTGTAATGGGAAATAGACCATTTGCCCTTCATTACCGATTGTGACAGTTAAAGACACTTCTTTCGCTAAGTCTAAAAATTGCTCCGCGACACATTCTTGGTTGGCAATCAATTCACGTGCTTCATCTAATTGTGCTTCTGAGGTGAGACGGATTTGACCTTTGCCATCATAACCACCAAAACGTGTTTTCAACATGAACGGAAAACCTAATGTCTGTACCGCTTCATCTAAATCCGCTACAGAAGTCACTTGAACAAATGGCACCACTTTCGTTCCTGCTTGAGCAAGTGTTTGTTTTTCTGTCAAACGGTCTTGCAACAGTTGAATGGCTTGATAACTTTGTGGCACATTATATTTCGAAACTAATGTTTGGAGCTGTTCCGCCGCGATATTTTCAAACTCATAAGTAATGACATCTGATCGTTCACCTAATCGCTCTAACGCTGGCATATCATCGTAAGCTGCGTGTATAAACTCATGAGCAACGTAACGACAAGGACACGTTTCATCAGGATCGAGCACAACTACTTTAAATCCCATTTTTTGTGCGGATTGTGCCATCATTTTTCCCAATTGACCGCCGCCGATAATGCCAACTGTTTGGCCAATTTGCAACTTATTGAAGATCATCTTGCATCGCCTCCACTTTCTCAACAAGCGATTGTTCATATACTTCGAGTTTTCGTTGTACCTCTTGATCGGTCATACCAATCATTCTTGCCGCTAAAATGCCTGCATTTTTCGCCCCTGCTTGACCAATGGCTGTCGTCGCAACGGGTATCCCTCCTGGCATTTGTACAATTGAAAGTAAAGAATCTAGCCCTTTTAAACTTTTTGACTCAATCGGTACACCGATGACAGGGAGTGTTGTCATCGAAGCCACCATTCCTGGTAAATGCGCGGCTCCCCCTGCTCCTGCAATAACGACATGATATCCATTACTGCGCGCATTTGTGGCAAAATCGACCATCATATGTGGCGTACGATGTGCAGATACTACTTTTTGATCATACGGAATGTTAAATTCTTCTAGCATGGCACATGCTTCTTTCATGACATTCCAGTCTGAAGAACTCCCCATAATGACTGCTACTTTCAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP015626|1723240:1731660|1726241_1728431_-|WP_065520580.1|DBSCAN-SWA MPKFLEPTAEEVKVEKLYRDMGLSDAEFEKVTEILGRTPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTTGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELTEKTNRRLLRGVVAGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVIDHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELSEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITYDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGIHLELEKVPVREKGISPYEMMLSETQERMLLVVKKETEQKFLDLFDYHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYEGEVFADIPVEPLADEAPVYILEGEPLQHDTAPNRYDDIDVNDVFDRLLTHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVFNDPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGAKPLAMTDCLNYGSPEKKHIYQQLTDSTRGMAEACEALATPVVSGNVSLYNETRTSSIFPTPVVGMVGLIENIDFLKSYQPSIGDTLYVIGETTDSYGGSQIEKLLYSDVNHEVEKVDLSQEAAKGEAIRGAIREGVISHTQTVGKGGIAITLAKISAHYSLGIDAEVNLTNAQLFSETQGRYIVAVKAGQTLNIEGATRIGTLTDTDDFKVVAQDSVIERRTSELKREWEGAIESCMTSVD >NZ_CP015626|1723240:1731660|1729359_1730061_-|WP_014614278.1|DBSCAN-SWA MSLLYEGKAKRVFSTEQPDVLRIEYKDEVTAGNGAKKDAMVGKGRLNNQITSRIFEYIKNEGIESHFVEQLSETEQLVKAVNIVPLEVVVRNIAAGSITKRLGFEKGHVFDYPFVEFFYKNDDLNDPLITDDHVKLLGVADDAMIAQLKEQALRINQALIKLMDEMGLALVDFKIEFGVDHEGQLLLADEISPDTCRIWDKATQENFDKDVYREDTGSLIDTYQTFLNKLEAL >NZ_CP015626|1723240:1731660|1723806_1724838_-|WP_037543348.1|DBSCAN-SWA MAESYKKAGVDIEAGYEAVKRMSSHVERTMRKEVLGGLGGFGATFDLSQLNMKAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYDKHDTIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATHKVVPEIIEQIVKGISDGCVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKEEYIDGSKVEKGDVIIGLASNGIHSNGYSLVRRLVAESGIDVNDTFEGEQSFLDMLLTPTALYVSPVLAVKKDVQIKAMTHITGGGFYENIPRALPEGKTAVVNTASFPTPAIFNWLQAQGNIDTDEMYHIFNMGIGFTLIVAPEDEVAVHEILKNANVDAYTIGHIAEEDSAIRLTEAK >NZ_CP015626|1723240:1731660|1729096_1729357_-|WP_014614277.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQALTRAVHDLGYEQVNDIRVGKVLYMTVDEATDEAVHNVVTTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDEKENQ >NZ_CP015626|1723240:1731660|1723240_1723807_-|WP_037543346.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGTNFDNIMKRVKSGELVHIEVTALYTDKPEAACVQLAQQHGIPVHAFEPRTFDDKVAYEAAVLNWLRQEGVEWIVLAGYMRLIDETLLSAYEGRILNIHPSLLPKYKGKNAVGQALNSGDKETGSTVHYVDAGMDTGQMIEQRTCPIYEDDTQQSLEERIKSLEYELYPAVIKKIIR >NZ_CP015626|1723240:1731660|1728423_1729095_-|WP_014614276.1|DBSCAN-SWA MKFAVLRFPGSNCDRDMYNAALKSGVDADYVDYRETSLKGYDGVLIPGGFSFGDYLRSGAVASVAPIIAEVKRLADEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFVSRNEHLKIVNNQTPFTKGYSEGEEVVYPVAHGEGHYYCTEEIYQELIDNNQIILKYMDNPNGSHDDIAGIVNKAGNVCGMMPHPERALEAILGTDSGVKLFESMVNSWREQNA >NZ_CP015626|1723240:1731660|1731177_1731660_-|WP_014614280.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWNVMKEACAMLEEFNIPYDQKVVSAHRTPHMMVDFATNARSNGYHVVIAGAGGAAHLPGMVASMTTLPVIGVPIESKSLKGLDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGQAGAKNAGILAARMIGMTDQEVQRKLEVYEQSLVEKVEAMQDDLQ >NZ_CP015626|1723240:1731660|1730057_1731230_-|WP_081248064.1|DBSCAN-SWA MNNRLLRKWRRCKMIFNKLQIGQTVGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGFKVVVLDPDETCPCRYVAHEFIHAAYDDMPALERLGERSDVITYEFENIAAEQLQTLVSKYNVPQSYQAIQLLQDRLTEKQTLAQAGTKVVPFVQVTSVADLDEAVQTLGFPFMLKTRFGGYDGKGQIRLTSEAQLDEARELIANQECVAEQFLDLAKEVSLTVTIGNEGQMVYFPLQENEHRNQVLFKTVVPARANHEQEARREVDKITQAVHFVGTFTVEFFINQQNELYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGHRLPEHIELLKPAIMMNLLGKDLDLLEKELFAHPDWHVHLYGKVSRKPERKMGHLTILTDDVSKTEQQLIVKFEGRDEYK >NZ_CP015626|1723240:1731660|1724841_1726263_-|WP_014614274.1|DBSCAN-SWA MYDIRGLNEECGVFGIWNHPHAAYLTYMALHSLQHRGQEGAGIVCSNGEQLFGARGMGLLTEAISQQQLESLQGYPNAIGHVRYATTGASEISNVQPFLFKHSKGDLGLAHNGNLTNAHQIRLAIESTGGIFQTTSDSEVLAHLLIKGKSENIKTNQKAALNQVKGAFSCVILNEEQLTATRDNRGVRPLMLGQVDGAYCVASETCAFTAIGAEYIRDIEPGELITFSGENEVDYDMYTQDIGHKMCSMEYVYFARPDSEFHRHSIYNVRKALGRKLAEEMGIDADIVIGVPDSSLQAAKGFSEQTGIPNEQGLLKNRYIGRTFITPDQSVRERQVRMKHSPIRDVIEGKRVVVIDDSIVRGTTSKYIVKALKSAGAKEVHMGISSPPLKDPCYYGIDVSTHAELMAAQHTVEEIREMIGADTLTYLSVEGMHEVFKAHDSKGECNACFTGEYPIEIVDHELPEVKEMKRRGV |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1823961 : 1832667
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP015626|1823961:1832667|DBSCAN-SWA ACTAATCCTTATTTTTCACAGCATAGCGCAATGACAGACAGCCATGTTCTGCATTCTCTGTTCCCTGCAATTCCAAATTAACTTTTTCAGATAACAGAAGGTTATCAAATAGTTGTTTTTCTTTATTACCTACAAAACATGGTGATATCACAAGACTGATTTCATCAATAAGTCCGTTTTCTAATAATTTGTTGGTTAATCCACCGCCACTGTCTGTCCGCATGTATTTACACCCATATTGCTCATGCAGGATCTGAAAGGCTTTTTCATAGTCCACATGATCATTTCCTGACACAATATATGGGTAATGCCTTTCCTCCAAATAATTCAAATATTCCTTCGGAGTGGCAGTTGATACCAGAATGACAATTTCCTTCAGATATCCAAGATTTCTTAAGCAATGAAGACTTCTCAAGATACCTCTGCTGTCAGGTATGACTCCTATTGGTCTGGGGTCCTCCGGGCTTGTTATGATTTTCTCAAAATCAGCCTCTGTTTCAGCAGGATATTTTTCAAATGCAGTAAAAACAGTATTGGACCCAAACAGCACCGCATCCGAATGAATTCCCCCGGCAACCTGGTAGTAAACTTCCGGATTATCAAAGCCTTTAATGCGGCCATCAAGGCTAATTTGTGTGTGCATAATTATCTTTGGTTTCATATTTTTCAATCCTCCTTTTTGATAGTAGAATATCATAATACACTGACAGCTGTATGTCAGCAGGGGATATGAAACCTTACAAAAAATACATAACAGACCAATCGCTTTCTCTAAATCAAGTTTAGGCAGTGATTCGTAATTTGTGCCAGGTGTTTACGGGTTATGCATTTTAATTCATCAGGTTGGACTATTTCAATGCCTGATCCATATTCAATCAGCTGCTTGCTCAATATCTCAAAGGAATCTGTCTGGAATTCGATTTCCATTTTACTTCCCAAATCGGTTTCTTCAAGGAAGCCGAGAGAATACCTGTTCTTGATAGAATTGTATGTCTCCCCTTTTTCAGCTCTAAGAATTACATTATATAGTTTTTTATATGAAAGCATTTGTTTTAATATTTGTTCCAAAGAGCCATCATGGCTTTGACAGAGCTCTTCTTCTATGCAAATGCTTTTAATCCGATCCACACGAAAATTCCTATATTCATTTCTTAGCCTGCAAAACCGATTAAGTACCAGTTCTGTTCATAAAACCCCAGTGATATAGGCTCTATCATTCTGCTTTCCGGTTCTTGCCCTCCTGATGCAGGATATTGAATTGATATTACCCTTTTATTGCAGATTGCAGTCTGAATTGCTGCAATAACGTTATCCGCCAATGTATTTTTCTGTCCAGATGTGCTGTACACGTTAATACTGTTCTCCAACTCCTGTGCATAGTTTTTTTCACCATGCTTCAAAATAGATTTGATTTTATACATAGCTGAATCAAAATCCTTTATAAATGATTCATCTCCATGGCAATTTAAAAATTTCCCTGCTGTAATCAATGCACCCACTTCCGCCGCTGTAAACATTACCGGCGGAAGTAGGAAGCCCTCTACAAGAAAATATCCTTTTCCGGCCTCAGATCCAATTGGTATTCCGGCTTCTTCAAGTGTCCGGATATCTCTGTAAACTGTCCTTAAGCTTATATTAAATCGCTGTGCAATTTCTTTGGCAGGAATTATTTTTTTTGATTGCAGCTGAATAAGAATAGAGGTTACTCTGTTAATCCTGTTCAAATTTTATTCCTCCTCTGTGACTTCCATAAAAAGTATATCCTATGCGTTCTTAAGCTAGCTGCTGTTAGTGCTTCTCATTGCACCCTGGTTATAAAAGCCATACTCACAAACCTCTTCACCAAAACTCTTTACATCTCTAATATAGAACTCTATCTAGCGAACTTTTAGAAAAGATATAAAACATCAGAGTATGGACAGTTGCGGATGTACTTCAGAAAAGATTAGATGTCTAAAAAGCTTGTAGTTAAAGCTTTTTAGACATCTAAATCTAGGTACTAAAACAATTCATCCAGTAAAATATAATATTTTATTTTCTCCCAATCAGGCTTGATCCCCAGTAAGTCAAAAAATAGCTCGACATACTGTTCTTCCCCGATATCCTCCCTGATCGACCGGACGCAGAAGGCAATGTCATACCACTTGTCCGCCCTGCCGCTTCTCCCAAGATCAATAAAGCCACTTACTTTGCCATCTTTCACAAAGATGTTGCTGTCTCCCAGGTCGCCGTGGGAAAAGACAAGTTCCTCTTCGGGCTTTTCCGTCTTTAAAAAATCATACAGCTCGCGCGGATCTTTAAATGGAGTGTCTTCTTCCCAGTTTTCGCAATCCACATCGGCCAGATCGTTATTCAGTAAGTAATCCAATTCGGCTAAGCGGCTGTCTAAGCTATTCGTATAGGGACAATCCGATATGTCGATGGAGTGAAAGAGCCTGATGCACTCCGCATACAGCTCGATAATCTTTTCAGGGCTTTGTTCATCTTCATACTCTTCCGAGCAAAGGACGCCATCGGCCTCACTCATGAGCAGATTGCTCCAGCCATCATGCCGTTCAAAGTGCAGGACCTTTGGAACAGGCAGCTTTCCTTCCAGCCATAGCATCATGTCCTTTTCCCGTTCCACATCATAGGTGGTCCCTTTATACCGGCTGTCCGTCATTTTTAAATATAGGTTTTCATTTTCTCCCACCAGCTTATATACCTTAGCAGGAGACATTCCTTCCGTATCTTTTACGCAGCGGTATTTTTCGATCAGTTTTTTCAATTCCGGTGATATTCTCATTTTAGCCATTTATTATTTCCTTCCTCTTTTCTACAGTATTTAAAGATACCCCAAGAAGCTAATTATAACAAGACGAACTCCAATTCACTGTTCCTTGCATTCTAAAACCTTAAATACCAGAAAACAGCTTTTTCAAAGTTGTTTTCAAAGTTGGCGTATAACATAGTATCGACGGAGCCGATTTTGAAACCACAATTATGATAGAATTTACAAGCTATAAGGTTATTGTCCTGGGTTTCAAGCATTAGTCCATGCAAGTTTTTATGCTTTGCCCATTCTATAGATATATTGATAAGCGCGCTGCCTATGCCTTGCCCCCTGAAATCCTTACATACGGCGATATCTTCTATATAAGCGTACCGGTTCCAATTTTTTCGCAGTTTAACTTTTCCGACGCATTTATCGTCTTGGTAGTAAAGATATATTATCTTATCAGTATTGTCAATATATTCAAGGCAATCTGCCTCCTCATCCTCTTCATCCTCTTCGTCTTGGTAGCTTTTTAAATATGGCGCTTCATAGAGTAATTCTGTAAAGGTCCAATTCTCGTTTTCATACCTCGGTATAATCTTACCTATCACCTCAAATGGTTCGCTGGGTTTATCGATATCTTTCAGGTGCCCTGCTTTCATTTCTGTAATCACTGTTCCCGCCTCTCTTCTATATCAGCGGCATATGTGCTATCCAGGCAGCCGGTTTTACCAGTGTATTTTTTATACATGTCCCTGGTATATTTTGTTATATTCCTATCATACTCCGGATAGGCATAATGAAGCCTTTCCGCCACCTCACCGGATACCGCCCTGAACAATTGATGGCATAGAAATAATGCTTCCCATATGTTTTCATAGGAATCCATCCGGTAGGTGGACAAAAGTTTCTCCCACAAATCCTCGGATATATACCTTTCAATAAACTTATAGTTCTTGCCTACACTTAATTTAAAGCCTGTTTCGATGCCGACCTTCCATGATATCATTCTCAGCAGCTCATGGCGAACAATCTGATTAAAATGATCAATAGCAAATAAAATTTCCTTACGGCACAATCCTTTAATAACATAAGGTGTTACATTCCAAAATTCATTGCAGCAATCATCATACTCCCTTGCGCTTGGCTTTCTTACATGATAATCTATATCAGTCGGAACTATGTCCCTTTTAATTCTACAATCTTTATCAATTAGAACCTTTATTAATTTATCGCCCTTTAGGTAATTATCTAACTCTTCCAAGGGCAATAAGGTAAGATCAATTTTATTGTAATCATCAAATAGCATAAGATAGGAAAATCCCTTTTCTTCAGGTGGGAATAATTCCATATCCTCCGGCTTTTGCATCATTATTATATTCCCAAATTGATTAAGCCAGTCATCATTAGATATAAACGGTTCTATATCACTTACAAAATATGTAATATCATAATCCTGAAATTCATCTTTAGGTATATTAATATTTGCGCGTGACCCCTCAAGGTCACAATTCGAATACGTTCATCCTGTTCTGCTAAAGAAAGTACTAAATCCATCATTTCTTTTTCTGATCTCATTTACATACTCCTCGTTTATTTTTTCTATATTATTACATCTTCTTTTTTGCCGATACAATCAGCATCATTGGGCGTCGCATTTCATCCGCCATCCCCGGAATATCCATCATGTTCTCTGGCGGCTGTGGCTCCACAATCTGATTTATTATAAAACTATTTGAAAGCAGTGTATTTAGATATGTGGTCAGTGTTCTATGATATTTTGTAACCTTTTCTTCCAAAAACATAGCTGTCCGTTTGCCCTCATAATAATAATTGTCCACCGGGAAATGCAGTATTTCTCCTTTTTCGTTATAATACCAGTCTTGTGTTCCATGAGCAGTAAAAACAGGATGTTCAACTGTAAAAACTAAATTGCCACCAGCCTTCAGCATCCTATATATCTTTTTTATTAAATTCTCATAGTCTGCTACATAATGAAACGCAAGCGAACTTAGTATTACATCAAAGCTCTCCTCTGGGAAATCCACATCTTCTATGGCACAGCATTCATATTCAATCTGTGGAAAATGGGTTTTTCCTTTTGCTACTTCGAGCATTTTATGAGAAATATCAACACCTACTACAGAGGAAGCACCGTTTTCCATCGCATATATACAGTGCCATCCATAGCCGCATCCTAAATCAAGCACACGCTTACCCTTAAAATCAGGTAGCATCTTTTTCAAAGTCTCCCATTCTCCCGCACCAGCCAGTCCTTTCTGCGAGCGACTCATTTGACTGTATTTTTGAAAAAATATATTATCATCATATTTGTTTTCTTTCATCTGAACTCTCCTCGTTTAAAAAGTTATTTATCTCCGATACAATTTCATTCACTTCATTATAAAGCTTCTCGGTCATGTCGTAGCATTCAAAAAGTGAGATACCGAGTACTTCAAAAATATGATTTACCTTCTCGGTATATTTTTCAGGTTTATGTTCAAAAGTTTCAAGCAGTTTTATAGCTTTCTTTTCGTTGATACAATAAGCATTATTACATGCAAATAACACTTGATTTAAACATGAAACTATACGAAAAACATGACCCGCAATATAATATTTATCGTCTGTTCCCGAATTTGCTTTTACAAACATTAAAGAGAACCCTGCTTCAAACATAAAAAAGTTAACTAAACTTTTCTGCAAAGCATTGGGATAAGTTTCTGCCTGTTTTTTTAATTCGCATAAGCTTTCATTCTTAGCATATAGTATTTTGCTAATCGCTAATTCTCCTCGATACATTGCACTAATATAACCATGGGGATGCCCAGTCTGATAATTGGCAGTAACAATTCCGTGCTCTGTATCTTTCATTATTTGTTCCACACGTTTAATATCACGTAAAATTAAATCCACATGATACCCGTTTATGACTAACCATCCGCCGCCATTAATCCAATCACCCCATGCTCCGGGAGGTACAACAAGGTTATTTCTATGCTCATCATCCAGCTTTGTAGCGAATTGATTAATAGTATTTATGTCAAATGATTCTGAATTGTAATAGATGCCGATATCTATATCCGAATCCTCTGTATGGGTGCCCCTTGCACGTGAACCACCTAAAACAATACCTTCTATATAAGACAGAGAGGATAATTTCTCTGCTACTGATTTAATAATATTATCTACCATCAAGCATGCTCCTTTTATCGATTCACTGCTGTAAAAATTCCAAGCCAAATCTTTTGCTTCTACTCAACATATTTATAATTTTTTTAATTTCACAAAAGATAGTTAAAACTTATCAATTGTCTTTTTATACCTCTGCTGATTAGATGAAGTCTTTTCAATAGCCTTTAAATTACCATTCATTTTGCTAACATGGTTTAAAAATAACGTTCCAAGCAGAAGTCGATCCTTTCTGGGTATCCTATTCCCCACATATCCCTTGAATAAATCTTTAACAAGAAAAACTTCGCCATCATTTAGATTTTCAGTTTCTCTAATAGCTTCTTCCAATAGCTCATTTACATCAATCATGTTGTCCACTCCTTATTAATAATGGGTCAGCCCCCTTCTACTGTTTCGGTTTGGTCAATCGCTTCAATTAATTGATTTTCCTTTTCTTCCAAAGATTGACGAATCCTTTCAATCTCTTCTATAGAAAGTTCATCCTTTAAATCATCTATTAACTCAGGTAAGATTTTTGTTTCCACCATTTGTTGGTAGTTTTCAAGGGCTTTTTGATCAAGGCTATCCTTATACTTTAAAATACTTTTTTTCCAAACGAAAGAGTATTTATTCGCATCCGCTTCAATTTTTGTACCATCAATGTATAGAGCACTGCCACTGATTAAGCCACTTTGAACCAGTAGCTCACGAAATTGAACAAATGAATGATCTAAGAATATCGTTCATAATCGRAATGAACGCGAAACGATTAATAAGTACGAAAGTTAGGGRATTGCTCYTGAGATAAGTAGCGCRTCCGAAWNACTATATATSGTATATWTTGTATTTGGNSGCCCGAWKAAACCCSTTSAAWATAGKTACAAASAAAAATGAAAAGWAGMTTAAKAGGCAAACAAAGTTGGTTTATGGTATAATTTTGATACATGATAAAGCACCTCTCTCAAATGGATTAATCACCTATATTATAGCAGAGTGTGCTTTATTTTTGTATTCACTTTCAAAAGATAAATAGAGGTCTTTCCACTACTATCTAAATGGAAAGACCTCTATTTTTCATATAGGAGCTACTTTTGGGTCAGCCCCATGTTTATTTTGAAAAAGAGATAAAATCAATATATCCCTTTTCCCCAATTTTTACAACGGCATTGTAGGGCTTTTTCTCTTTGTTTTTGATTCCTTTTACCAGGGTTTCTTTTCCCTCCAGTAATTCTTTTACATTCGTTTTGGTTAGTTTTTTCTTTCTAAAATGTTCAGCTAAAGTAAACTTACATTCAGGATAATTTGAACAACCATAAAACGATTTTTTTAATACAATATTGTTGCCACACTTAGGACATTTTCCTACAAGGGGTCCCGAGCGCTTAGTGGGAATTTGTACCCCTTATCGATACAAATTCCCCGTAGGCGCTAGGGACCTCTTTAGCTTCTTGGAAGCTGTCAGTAGTATATCTAATAATTTATCTCCATTCCCTTTAGTAACGTGTAACTTTCCAAATTTAAAAAAGCGACTCATAGAATTATTTCCTCCCGTTAAATAATAGATAACTATTAAAAATAGACAATACTTGCTCATAAGTAACGGTACTTAAATTGTTTACTTTGGCGTGTTTCATTGCTTGATGAAACTGATTTTTAGTAAACAGTTGACGATATTCTCGATTGACCCATTTTGAAACAAAGTACGTATATAGCTTCCAATATTTATCTGGAACATCTGTGGTATGGCGGGTAAGTTTTATTAAGACACTGTTTACTTTTGGTTTAGGATGAAAGCATTCCGCTGGCAGCTTAAGCAATTGCTGAATCGAGACTTGAGTGTGCAAGAGCAACCCTAGTGTTCGGTGAATATCCAAGGTACGCTTGTAGAATCCTTCTTCAACAATCAGATAGATGTCAGACGCACGGCTTTCAAAAACCACTTTTTTAATAATTTGTGTGCTTAAATGGTAAGGAATATTCCCAACAATTTTATACCTCTGTTTGTTAGGGAATTGAAACTGTAGAATATCTTGGTGAATTAAAGTGACACGAGTATTCAGTTTTAATTTTTCTGACGATAAGTTGAATAGATGACTGTCTAATTCAATAGACGTTACCTGTTTACTTATTTTAGCCAGTTTCGTCGTTAAATGCCCTTTACCTGTTCCAATTTCGTAAACGGTATCGGTTTCTTTTAAATTCAATTGTTTTATTATTTGGTTGAGTACTTTTTCACTCGTTAAAAAGTTTTGAGAATATTTTATATTTTTGTTCATGTTATCACTCCTGAAGTGATTACATCTATAAACAAATACAGAAGTTAAACGATTTGTTTGTAATTTTAGTTATCTGTTTAAAAAGTCATAAGATTAGTCACTGGTAGGAATTAATCTAACGTATTTATTTATCTGCGTAATCACTGTTTTTAGTCTGTTTCAAAACAGTAGATGTTTTATCTACATAACGCATTTGATAACGCATTTGGAATACCAACATGACGAATCCCTCCTTCTTAATTACAAATTTTTAGCATCTAATTTAACTTCAATTCCTATTATACAAAATTTTAAGATACTGCACTATCAACACACTCTTAAGTTTGCTTCTAAGTCTTATTTCCATAACTTCTTTTACGTTTCCGCCATTCTTTGCTGTTTCGATTTTTATGATATGGTGCAAGTCAGCACGAACACGAACCGTCTTATCCCCCATTATATCTTTTTTTGCGCTGATTGGCGTATCATTTCGTTTTGCTTTCTGTGCGCCTAAATTTCCCAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP015626|1823961:1832667|1831291_1831423_-|WP_000085862.1|DBSCAN-SWA MSRFFKFGKLHVTKGNGDKLLDILLTASKKLKRSLAPTGNLYR >NZ_CP015626|1823961:1832667|1829040_1829910_-|WP_000228166.1|DBSCAN-SWA MVDNIIKSVAEKLSSLSYIEGIVLGGSRARGTHTEDSDIDIGIYYNSESFDINTINQFATKLDDEHRNNLVVPPGAWGDWINGGGWLVINGYHVDLILRDIKRVEQIMKDTEHGIVTANYQTGHPHGYISAMYRGELAISKILYAKNESLCELKKQAETYPNALQKSLVNFFMFEAGFSLMFVKANSGTDDKYYIAGHVFRIVSCLNQVLFACNNAYCINEKKAIKLLETFEHKPEKYTEKVNHIFEVLGISLFECYDMTEKLYNEVNEIVSEINNFLNEESSDERKQI >NZ_CP015626|1823961:1832667|1826846_1827389_-|WP_000627290.1|DBSCAN-SWA MITEMKAGHLKDIDKPSEPFEVIGKIIPRYENENWTFTELLYEAPYLKSYQDEEDEEDEEADCLEYIDNTDKIIYLYYQDDKCVGKVKLRKNWNRYAYIEDIAVCKDFRGQGIGSALINISIEWAKHKNLHGLMLETQDNNLIACKFYHNCGFKIGSVDTMLYANFENNFEKAVFWYLRF >NZ_CP015626|1823961:1832667|1823961_1824621_-|WP_000802831.1|DBSCAN-SWA MKPKIIMHTQISLDGRIKGFDNPEVYYQVAGGIHSDAVLFGSNTVFTAFEKYPAETEADFEKIITSPEDPRPIGVIPDSRGILRSLHCLRNLGYLKEIVILVSTATPKEYLNYLEERHYPYIVSGNDHVDYEKAFQILHEQYGCKYMRTDSGGGLTNKLLENGLIDEISLVISPCFVGNKEKQLFDNLLLSEKVNLELQGTENAEHGCLSLRYAVKNKD >NZ_CP015626|1823961:1832667|1832433_1832667_-|WP_020220349.1|DBSCAN-SWA MGNLGAQKAKRNDTPISAKKDIMGDKTVRVRADLHHIIKIETAKNGGNVKEVMEIRLRSKLKSVLIVQYLKILYNRN >NZ_CP015626|1823961:1832667|1831427_1832165_-|WP_001038796.1|DBSCAN-SWA MNKNIKYSQNFLTSEKVLNQIIKQLNLKETDTVYEIGTGKGHLTTKLAKISKQVTSIELDSHLFNLSSEKLKLNTRVTLIHQDILQFQFPNKQRYKIVGNIPYHLSTQIIKKVVFESRASDIYLIVEEGFYKRTLDIHRTLGLLLHTQVSIQQLLKLPAECFHPKPKVNSVLIKLTRHTTDVPDKYWKLYTYFVSKWVNREYRQLFTKNQFHQAMKHAKVNNLSTVTYEQVLSIFNSYLLFNGRK >NZ_CP015626|1823961:1832667|1824731_1825139_-|WP_072387101.1|DBSCAN-SWA MVLNRFCRLRNEYRNFRVDRIKSICIEEELCQSHDGSLEQILKQMLSYKKLYNVILRAEKGETYNSIKNRYSLGFLEETDLGSKMEIEFQTDSFEILSKQLIEYGSGIEIVQPDELKCITRKHLAQITNHCLNLI >NZ_CP015626|1823961:1832667|1830012_1830258_-|WP_000567888.1|DBSCAN-SWA MIDVNELLEEAIRETENLNDGEVFLVKDLFKGYVGNRIPRKDRLLLGTLFLNHVSKMNGNLKAIEKTSSNQQRYKKTIDKF >NZ_CP015626|1823961:1832667|1828325_1829060_-|WP_000662263.1|DBSCAN-SWA MKENKYDDNIFFQKYSQMSRSQKGLAGAGEWETLKKMLPDFKGKRVLDLGCGYGWHCIYAMENGASSVVGVDISHKMLEVAKGKTHFPQIEYECCAIEDVDFPEESFDVILSSLAFHYVADYENLIKKIYRMLKAGGNLVFTVEHPVFTAHGTQDWYYNEKGEILHFPVDNYYYEGKRTAMFLEEKVTKYHRTLTTYLNTLLSNSFIINQIVEPQPPENMMDIPGMADEMRRPMMLIVSAKKKM >NZ_CP015626|1823961:1832667|1825959_1826754_-|WP_001096887.1|DBSCAN-SWA MAKMRISPELKKLIEKYRCVKDTEGMSPAKVYKLVGENENLYLKMTDSRYKGTTYDVEREKDMMLWLEGKLPVPKVLHFERHDGWSNLLMSEADGVLCSEEYEDEQSPEKIIELYAECIRLFHSIDISDCPYTNSLDSRLAELDYLLNNDLADVDCENWEEDTPFKDPRELYDFLKTEKPEEELVFSHGDLGDSNIFVKDGKVSGFIDLGRSGRADKWYDIAFCVRSIREDIGEEQYVELFFDLLGIKPDWEKIKYYILLDELF >NZ_CP015626|1823961:1832667|1832289_1832385_-|WP_001809736.1|DBSCAN-SWA MLVFQMRYQMRYVDKTSTVLKQTKNSDYADK >NZ_CP015626|1823961:1832667|1825111_1825279_-|WP_157135214.1|DBSCAN-SWA MADNVIAAIQTAICNKRVISIQYPASGGQEPESRMIEPISLGFYEQNWYLIGFAG |
12 | Streptococcus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2011714 : 2035512
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP015626|2011714:2035512|DBSCAN-SWA 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25 | Staphylococcus_phage(80.95%) | head,holin,tail,terminase,portal,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2038653 : 2054983
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP015626|2038653:2054983|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP015626|2038653:2054983|2045807_2046590_-|WP_065520649.1|DBSCAN-SWA MQALQTFSFEALPVRTIAVENEPYFVGADVIKILGYKNGSRDLRRHVDEEDRIIQAVPQYQNGTLVSKTTLINESGLYSLIFSSKLDSAKRFKRWVTSEVLPAIRKHGIYATDSVIEQTIQNPDYIIHVLTEFKKEREGRLVAEQQVQELKPKATYYDLVLQNKSLLSVSKIAKDYGMSARALNKLLHELGVQYKQGDIWLLYAKHQDKGYTQTSTYALDEEHSKVTTKWTQKGRLFIYELLKNKGVLPSIEKSNVVTNR >NZ_CP015626|2038653:2054983|2040618_2042571_-|WP_115877171.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP015626|2038653:2054983|2039830_2040094_-|WP_020219554.1|DBSCAN-SWA MDVNNGEATTDFVNHPQHYTYGDVEVIDYIEQVIQDYPPAIAFSIGNAIKYISRANRKAGKEDLEKARWYLKRAYDKWEEAANEYKR >NZ_CP015626|2038653:2054983|2043205_2044372_-|WP_065520647.1|DBSCAN-SWA MKLDHTNRAHAKLSASGAKQWLNCPPSIKASEGIGDRTSIFAEEGTFAHELSELYFSHKYGGLTEFEFNKAFSNYQHNEYYSEELREYVEQYVDMVEERVNEAKARDKDVITMFETRLDLGKYVPESFGTGDVIVYAGGVLEIIDLKFGKGVEVSAVNNPQLRLYGLGAYELLSVLEEVHTVKMTIIQPRIDNFSTEKMDAKMLVAWGTDYVKPRAELAFKGEGEFKAGEHCMFCKIKHSCRARSEFMQDVPNTPAHLLNDDEIAELLYKVPAIKKWAEEVESYALGQMLEHGKSYAGWKLVEGRSRRVITDTQAVQDRLVKEGYKVENITETKLLSITNLEKLVGKKAFNELAGNYIDKPPGKVTLAKETDKRKAIIQSVEDEFDKI |
21 | Staphylococcus_phage(52.94%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
2121940 : 2132762
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP015626|2121940:2132762|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP015626|2121940:2132762|2126135_2126750_-|WP_065520666.1|DBSCAN-SWA MNLFETMRLDNGEIPRLAYHAERLQRASTALGLPFDDIKWQQTIQQLCETYAVGQYRVKVTLEPSGELRTEVGTLQKKTTMTAQFVPMKNDIPEWQRVYKTSEREHVAHSHTTQLALFYDETTNKVLEFDIGNVVLTVNGIHYTPIFDRDFLQGCMRRDLLAEARIKEKYLTTVMVKEALQHGGQLWMINSLREWVLITLESKK >NZ_CP015626|2121940:2132762|2131354_2131609_+|WP_014614552.1|DBSCAN-SWA MGFIVMLIVGGLIGWAAGAILGKDIPGGIIGNIIAGLVGSAIGSWLLGHWGPEFGGVYILPALIGSIILIALASLILGKMRGKK >NZ_CP015626|2121940:2132762|2130685_2131285_+|WP_037543793.1|DBSCAN-SWA MALFVILNIIIVVGVFLIDMYRHQYQYVRLSAFLFAITVNSLLNPILLNQLNFITMSSFLMYFIWFILQIYLDRHVRTFKIHNQKFFAGITAMIISILFVVMTQTADQTIYMSVPYLAPAIFLFGAILQFSSVLHSPRFETFYRRLKMENPLFIGACFIVASMILMMLLTPFWYLYLIIYACLILIFLLEQIFILEKDD >NZ_CP015626|2121940:2132762|2128732_2129401_+|WP_065520668.1|DBSCAN-SWA MSEVLNNEKALVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFEYGQRHAKEIEVAKEIAEDQGLKHHVLDMALLSQLTPNALTSHDMTIDSHNDVPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHLITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLNLAMDRDFVIHTPLMWLNKKETWALSDDLGVLDYVRDRTLTCYNGIIAEGCGECPACQLRQRGLNQYLSERGREV >NZ_CP015626|2121940:2132762|2121940_2123878_-|WP_037543783.1|DBSCAN-SWA MEKGKKKIGIFTFFLLMVLTIALKTYFAYYVDLSLGVKGLTQNLILLMNPYSLVALILSVFLFFKGRKAFWFMFVGGFLLTFLLYANVVYFRFFSDFITFSTLNQVSNVDSMGGAVSASFQWYDFVYFLDLIVYLFVLVFKRKWLSRNVFQKKFVPVVMATAIALFFLNLAFAETDRPELLTRTFDHKYLVKYLGPYNFTVYDGVKTVQNNQQKALASEDDLTEVLNYTKQKQATPNMEYYGKAKGKNVIKIHLESFQTFLINKKIHGEEVTPFLNKLSSGNEDFRYYPHFYHQTGQGKTSDAEFTMDNSMYGLPQGSAFSLKGDNTFQSLPAIMHQQQGYTTNVMHGDYKTFWNRDQVYRHFGIDKFYDATYFDMSPENLENLGLKDKEFFKEAADYLSKEKQPFYSHLITLTNHYPFTLSDEDATIAKGDTGNSTVDGYIQTARYLDESLEQFINDLKERGLYDDSVIMIYGDHYGISENHNKAMSQLLGEEITPAKFNDLNATGFWLKAPGVEPKVDDTYAGQVDVMPTLLHLLGIDTKNYLMFGTDMLSKDHKEIVPFRNGDFVTRNYKYVNGKAYSNRDNQPLETPPADLDKDKKQVQHDLEMSDKVLNGDLFRFYKNPDFNKLNPADYKYPTGPKANQK >NZ_CP015626|2121940:2132762|2125917_2126127_-|WP_014614545.1|DBSCAN-SWA MIGLYILGFLIVMWIGQIVSQRFVARQRRLWVYLWMGGILIIQCMLIYGFVGELAQHMREILSLFYDEK >NZ_CP015626|2121940:2132762|2129824_2130538_+|WP_014614550.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDFRCSWCDSKFTWDGSMKDDIEMMEAEEILAQLRNIGGNRFNHVTISGGNPALIKGLQSFVDLCEANDIRTALETQGSQFKPWMRQINDLTLSPKPPSSGMQQNLPRLDEVIEQLDISRINLKVVVFDDADYDFAKMIHQRYPDIPFYLQVGNPYLEEHVEQHTAKLLDRYEQLIDRVTADAEMNEVFVLPQLHTLIWSNQKGV >NZ_CP015626|2121940:2132762|2126746_2127895_-|WP_065520667.1|DBSCAN-SWA MVVKFNYKYYNDPNTTTTYQYHFDQPLHQGVARELKKVGQIIEAATQYQQQGYYVALYLPYEAAPYFHEDFQTYTPDNGIYAAYYAFDAPVDAIQATTAERSQRRQGGQFQFMDDKHTITKHIRTIHDEITAGWTYQVNYTTRLKSFDQMSISALYDQLTQHTNGDYTVLIDTTEVKLASISPELFFQVGDFGNQGRTVVSKPMKGTMPRGTTVEEDERNAQALRQSEKDRAENVMIVDLLRNDIARVAKRGSVKVYHPFAIERYQTVFQMTTMVTGQITDTATYETLLHALFPCGSITGAPKVNTMRIIHRLETTPRHIYCGAIGLLHPNGRAIFNVPIRTVEQINDTLYYGVGAGITIDSNPEQEYAEFHAKMKILEGLQ >NZ_CP015626|2121940:2132762|2125223_2125907_-|WP_014614544.1|DBSCAN-SWA MKVYSQGDQAIVVSLQGDVTPAATEKLLLIRHCLINQNYPFITEIVPTETDMLISYDARMMMKHLNIDSPFLHMKAVIENINIEDMTLDKEIRCVKVPIVYGGTNGPHLDMILKELHMDRQTFIDIHTGADYFVSMMGYSPGFPYLSGVDAQIIVNHTATEPRLIPAGSVILENNKCGITTTETYSDWLVIGHTSLPLFNPKKEDFALISLGDHVKFFEVQAGGNDA >NZ_CP015626|2121940:2132762|2127878_2128472_-|WP_014614547.1|DBSCAN-SWA MIVMIDNKDSFTYNIVDYVEYERQQPVTVIDVEAVSIEKLKEMQPTALIISPGPGAPEDYPILFEVVKAFEHTTPILGVCLGFQLLVTYYGGKIIHAPRPVHGHTTRISHDQSPLFQGLPEQFEVMRYHSLMADPMTIVKPLVVSAQNEQGIVMAVRHMSRPIDGVQYHPESILSEYGHEQIRNFLRKAEVSYGCEV >NZ_CP015626|2121940:2132762|2129400_2129832_+|WP_014614549.1|DBSCAN-SWA MMQQMYPQVDHDYMFELNKDFNFSAAHFIPDERAGKCTRVHGHTYFVNLTIGGDELDSMGFLINFSELKSLIHDQFDHYLLNDLVPFQGKSPSTEIVAQTIYDIVSARLAELPNAPKCLQVFLRETPTSYVIYRPKKKEQRHG >NZ_CP015626|2121940:2132762|2131781_2132762_-|WP_020219826.1|DBSCAN-SWA MKLRVIVPCFNETDVLHQTIQELTEILEKDSLDQSYDYDMLFVDDGSQDDTMTLLQQAAAQSPHVKFISFSRNFGKEAAMIAGFEHSTDCDAVVMIDADLQHPPELIPEMVQAYREGYDQIIAKRNRAGEHASRKWVTRLYYKMINYFIEDIELEDGVGDFRMLSQRAVCSLVSLKEYNRFSKGLFSWIGYNSKVIHYENVEREAGESKWSFRSLLNYAIDGLISFNYKPLRTMIYLGLLIFGVSMIYIIYLFIDTLIHGVDVPGYFTMIAAVLFIGGIQLVSIGVIGEYIGRIYYEVKQRPKYIVEASNVGMPKSHNETQQDVSI >NZ_CP015626|2121940:2132762|2124222_2125227_-|WP_014614543.1|DBSCAN-SWA MTIIIEDSGLFSSFQDFGREGYEHMGVIRSGALDVLAHEIANRLVGNDRNEATLEMSNQMARIRFTEPTLIALSGAQGVAHTDDMRVQMNKLYLMNKGDVLAVDHLRRGSRLYLAVAGGFELDQWLGSTSTDTIAGMGGFKGRRLQAGDTIELKRDYNARHHQLFKNLAQRKTVDWGVDGYALSFNYLSDVVHVIPNKGTEDFEAEVLRQFANGEYEVTSKANRMGVVLEGMPIKAHYDDMPPHQSVKRGTIQVKKEGAPVILLNDHYTLGSYPQIGTIASYHLSKIAQKRQGSKIKFQFIDVLQAEQNLVKYHKWRKQLFQGIEFRMQKEMLK |
13 | Streptococcus_phage(14.29%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
2259622 : 2277143
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP015626|2259622:2277143|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP015626|2259622:2277143|2274857_2275010_-|WP_000879507.1|DBSCAN-SWA MLAGVAIATPALNPPYLTGGYKSTGNSQKNIRKSFGYKGFTKFQRMSNGL >NZ_CP015626|2259622:2277143|2275012_2276398_-|WP_000813488.1|DBSCAN-SWA MKQRGKRIRPSGKDLVFHFTIASLLPVFLLVVGLFHVKTIQQINWQDFNLSQADKIDIPYLIISFSVAILICLLVAFVFKRVRYDTVKQLYHRQKLAKMILENKWYESEQVKTEGFFKDSAGRTKEKITYFPKMYYRLKNGLIQIRVEITLGKYQDQLLHLEKKLESGLYCELTDKELKDSYVEYTLLYDTIASRISIDEVEAKDGKLRLMKNVWWEYDKLPHMLIAGGTGGGKTYFILTLIEALLHTDSKLYILDPKNADLADLGSVMANVYYRKEDLLSCIETFYEEMMKRSEEMKQMKNYKTGKNYAYLGLPAHFLIFDEYVAFMEMLGTKENTAVMNKLKQIVMLGRQAGFFLILACQRPDAKYLGDGIRDQFNFRVALGRMSEMGYGMMFGSDVQKDFFLKRIKGRGYVDVGTSVISEFYTPLVPKGYDFLEEIKKLSNSRQSTQATCEAEVAGVD >NZ_CP015626|2259622:2277143|2261585_2261816_-|WP_000857133.1|DBSCAN-SWA MKTQYPMIPFPLIVKATDGDTEAINQILHHYRGYITKRSLRLMKDEYGNQSMVVDEVLRGRMETRLITKILSFEIK >NZ_CP015626|2259622:2277143|2265733_2266666_-|WP_001224318.1|DBSCAN-SWA 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19 | Streptococcus_phage(100.0%) | integrase | attL 2254401:2254422|attR 2278373:2278394 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
2694861 : 2730516
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP015626|2694861:2730516|DBSCAN-SWA CTTATAAATCACCCTTCTCCAAATTCTTAATAAGTGTGGAAAAATCGACGCCAAAGTTGTCTGTAATGTTATGATCATTCACTTCATACCAATTGAAATTATCGTGTAACATAGCTTTATTGAAAGCACTTGAATTAAATCGTGGCTTACGCTTTTTATGGAGCTTCTCATTGAAAAGGATTTTGGCTCGTAAGGCATCAAACGAGTAACCTCTACCCATTCGCTCTACCTGCCTAATAATGCTGTTAATTGACTCCGTATAAGCGTTAGTGAGCCTTTTATCAAAGTAGTTGAATATTTCGACATGCCAGTTGTCTACGGCTCTCACGAGGTTTTTATATGCATCTTTAGAGTTACTGGACATACAACGGTGTCTCCATTGACTATAACGAAGACGACCTTCATCTGAATCAGGAGTATCCCATATCCAGTAAAACTCTTCTTTGAGTTCATAGGCTTCTTTTAAGGCAGGGAGATTACCTAACCAAGTCTCTAAGAGGAATGATTCACGTTCATTTAGATCGTGTTTACGCTTTAGAAGGATAAACCTTTCACGCATAAGGGTACGTCTTTCTTTTTGGCTCATATGAGCTTTCAAAGACTTTCTGACGTTATCTAAGGCTTGATTAGCCATTCTAACTACATGAAACTTATCTACGACCACTTTAGCGTGTGGAAGGATAGTGTTCACTGCGTCTTTGTAGGGCTTCCACATATCCATTGTGACGTACTCAATATAAGTCCTGTCACTGATTTCTGAAAGACGTTGGATGACTGTTTCCTTGTTACGGTTAGGCTTGATGTCATAAATAGTCCTGCGTTCAATATTAGTCAATACAAGCCGAGGTCTTCGGATAATATGTATCTCGTCTATCCCAAGCCACTTAGGAGTTTCAAACTGGTATTCACGTTCTTTGAGTGCCACATAGTCCTTAAAAACGTTCCTAATAGTTTTCTCGTCAACGCCAACGCTTTCTGCGACTTCTACAAAGGTCTTAGACATGGATTGCTCTTGAATAGACTTTAAAAGCCTTTTGGTCATACTACGCTTTTCATCTACAGATACTAGGCGTTCCCAGAAGGTAGATCCGCATTCACGACACTTGTATCGTCTACGGTTCAATTGTAAGCCCACTCGCTTTAAACGAATGGGCAAATCCATAATTAGTTGATTTCTTGAACTGTGTTTGTACAATTTGTCAAAACCACATTCAGGACAACGTTCAGGTGATCCGACTGCTTCAACTTTAAACATCATATCGATTTCATTTTCTTGTGGTGATTCTATTGTTTTAATGTCTGGTAGGGATAACAAAAACCTTGAAAACACGGTGTTTACAGCATTCTTGGGACGTTTCGGGGACGTTCTGCCTAAATTACGTTTAATAATGATACGGCTTTTTTGTTTTCTTCCTCGAAGCTCTCTTCTAACAAATGGGAGTAAACTTCAAGAGTGACTTTAATATTTTTGTGTCCTAACCTTTTGGATATATATTGTATTGATACGCCTTTAGACAATAAAAAGGAACAATGTGTGTGTCTGATCGCGTGTGATGTTATTTTTTTAATTCCTAACTTTTCACATGTGTTATTCAAAGATTTGTTGACCGCATTAATAGTAATCTTATCAAACACCCTCCCTGATATATTTTTTGGTTTTTTATTTATCCAATGCATTATATACTTCATGTCCTCGTGAGCTATTTCAACAGTTCTTGCTGATGTATCAGTTTTTTGTTCATCGATAAAGATAGTATTATTTTGAAGTTGATGAAGTCATTACTTTAATTTATAGCACCACTTATACGACATCCAGTCGCTACCATAATAAATAATACCATTGATGATTTGCTACCTTGTTTTTTTAATTCGCTCTTTAAATTTTTGAAATCATTCAATGATATAAACTTATCATCTTCTTTCTTTTCGGGTATGCAACCAGTGTAATTTATTTTATAAGCAAAGTTCTTTTTTAACAACCCTTCATGGACAGCGTCGTCTATAGAAGTTTTTATTTTACCATTTAATTTACGAATAGTTTCTTTAGAATGAGTTTTGGAAAAGTCATTAATGAACTTTTGATACTTGGTTTTTGTAATGGAATTTAACTTAAACAATCCTATTTCGTGTTCATTTAAATGCTTTTGAATGGTTTTATATGAGTCATATGTTTTGGTGGTAACATTCGGAAGTATATAAGTTTCTGACCATTCTTTGAAATAATCGTAAAGAGTTATTTCGTTGTTGATGATAAGTCCATCTAATAAATCATTTTTAGCTTTTGTTTCAGCCTCAGTGGCTTCACGTTTGGTTTTAAAACCTTTCTTTTTATATCGTTTACCTTCATGGCCGAAATCGTAATACCACTTATTCCCATATTTTCTAACACTCATTTACACCACTCCTCAAAAATATAAAAATAATAAGGTACGTGGAAGGTACCGTGAATTATAAATATTGGTTATTAGTAATTAATATATTGATAAATACATGTTATAATTAAAGAAAAAGTAGGTGAAGATTTGGAAATAATTTTATTATTGTGTAGTTCAGGTGTTGCAGGGTTATTTACTTATATTTATTTAGATTATTTAGCATTGTTCGATACTGAAAAGTTAGAAACTAAAAAGATGTTTACTATAATGTTTTCATTGTATTAGTATTGACTTTTTCATATTAATAAAATCAGTNTATANAAWTATGGGTTTCTAATGAAATAATTTCGATTATTTTGGCGTTAATAATTGCATCTTTAGTTATAATTTGCGTTTTAAATAAATTCATCTATGTTAAAGCGATTAAGTTTTTTAGAGTAATGATGAATAGCTCCAGAAAAAGCATGAATTTAAATCCTTTAACTTTTCAACATTCGATAGATAATATTTTATCTGTGGAAGACTATGTTTATTATATAGAATGTTATAAAGATGAATATGTTAATGTACCATCAATGTACGGATTACTAAAACATCATCAAATAGATGAAAATCAAGATGTTAGTTTTGTAATTTCTACTACTAAAAAATTTGATAATAAAGTGTTAAATCAATCTCAAAAGTATTATGTTTATTCATAAATCGAATTCTAGCAACTTCTATAAAATATATGCTTTTAAAAAGTAGTCACTTTCTATCTTTCTTGTAATCATCTCCAAACATTTGCTCCAATCGACTTTCGGATGGCAAAATGTGTTCTTGATTGTGATTTCTATAATTTTTCTTTAATGGCTCGTTACTTCGCTTTTCAAAGTTACCACCACCAGCTCCAGCCCTATCGGACTGTTTTGGTGGTGTATTTTGCTTTTTATTATCTTTATCCATTAAATTTCCTCCAATCCAATTTAAAAGGGTAGTCGTGCTAGCCTGGAAATTATTCGAAACTTGAAACTATAAGACTACGCACATTACTGTCATCAGATAGTGATAAAGTGACGTAATAATCGTTTTTTTATTTATAGTAAGATATTTCCAACTTTAAACCATAATTCTTTTCTTTTGTTACTATTCTTTCTTCAATATAATCAAATTCTTTATATTTCCCACCATAAATATAAGCGGTACAAGATACTATATTATTGAAATAATCGTTTAAATATTTGGCGTTTTCACTAGGAACATACCCAACATTAAAACTACCATAATCGTTAGACACCATAACTTTTATAGCATTTGAATCGTACATGTTATTTGGTTCTTTTTCTAAATAAATCCCAGGGACTTTTTCATAATTATCTATTTCAAATATTACCCCTCCAAATTCAAGCTCATCTAACAATTCCTTCCCTCTTAAATCCTCATATAAGAAAAAGAATTCTTCATTCTTTTTCATAGAATTTATCATTTTTTTCAGCTTTTTGTGTCTGTTTTCATAATTCAAACCAACTACGATGAACGAATCTTGAACAATATTATCAGTTGTTTCGGCCTCATCGTTTATTAAATCGTATTTTTCTAAATTATTTGGTTTTATAGAAGCGATATCATGGTGTGTCAGTTGAAATTCTGATTCTTTATGTAATTGTAAGTCTTTCAATTCTTTTTCCTTAGAGTTTAACAAATCTTCTTGTACTTTTAACGCCATTTTGTGTTCATTAATTGCTTGAGATAAAACTTCTATAGCTATAACAGATTCAACATTAGTGAATTTAAATGTTAAGTTCTTAGATGAATTATCATAAGTTAAGTTGATATTATTTGTTATAAATGTTTTTTTAGTAGAAATAGAGTTTATATCAGACCATGGAATTACATATATAAAATTCTTTTTTTCACATACAAAAGCTATCTCTTTGAAAGAAGATATAATTGAACCGTTGTATTCTGTTCCTTGATAATTTGTTGATCCAGTTGTTTCTATAATAATTCTGAAATCAGGAAATTTATTTAAAAGTGAATCTTTATCCCTTTGTTTAGCTTTCATAATTAATTCCTCCTACAATATAACTTTTCCTGCTACTTTAATATCGTGACTACTATCAAAATTTAAGTCAGGATATTTTGAGTTCAACGAAACTAAACGTATACCTTTGTCACTGATGAACACTTTTTTTAAATAAGCCTCACCGTCAATAACAAAGATGCCGATTTGACCACTATTTATTTGCTTTGTTTTATCGATAAAGATAATTTCTTTATCTTCGAACAATGGTTCCATAGAATCGCCGTTGACCTGCAATGCAAAGTCGTGGTTAGGTATGTGCCCGTTGTATTGTGTCGTGAACTCTACACCGTCTATTAGTGTTTCTCCAGTACCTGCTGAAGCATAACCGTATACAGCAACTTCTTCGGATATTATATTGTGTGAATTTATATGTAAGACTTTGTTATTTTGTTCATTTAATTGTTCATTAGCAAAGTCCAGTACACGTTTTTGGCGGGGAGGTGTGAGTTGGTCGTATATGGAAGTGATTGAGTTTTCTATTTCTCTGTTTTTAGATATATCAAATCCCATAAGCCAAGCTTCATTGACGTTTAAAGCTTTTGCTAATTCAAAAACTTTAT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>NZ_CP015626|2694861:2730516|2715149_2719616_+|WP_065520749.1|tail|DBSCAN-SWA MASPIGNMVIRVDLDGAGFNKGIAGLNRQMRMVSREMSANLSQFGRYDKSLEKSRLKVDGLTKRQQLQTQKVKELKAQYNRLSAETGENSAKTQAAASKYNEAYAKLNLYERELQEATNEMKRMETQQRALNTSMGKLGAKLSSWGPKLQEIGRNMQSIGRSMSLYVTAPVISGFGAAVKKSIDFDDSMRKVKATSGATSGEFQQLRDKALEMGAKTKFSASQSAEALNYMALAGWDTKEMMTGIDGVMQLAAASGEDLGAVSDIVTDSLTAFGLKAKDSGHFADVLAQASSKANTDVRGLGEAFKYAAPVAGALGYTVEDTSIAIGLMSNAGIKGEKAGTALRTMFTNLAKPTKAMKNQMDELGISITDSQGNMLPMRDVMDQLRGKFKGLSKDQQASAAATIFGKEAMSGALAVINASDEDYKKLTKSIDNSAGASKRMADEMEGGIGGSIRRMKSAIESLAISIGDVLAPYIKRLAEWVANAATKLNEMPKGTQKVVVGLGLVAAAIGPLLVTLGVMVSTIGASFKVLGPLFKGIGKLTLLTRGANRQLKIFTATQKIWNGVVSASKAIADGYRYAIARLSTSQAIATLKTKLSTAATKIWTATTKAAALATRGLGLAIRFMTGPIGLVITAVGLLVGGIIHLWRTNETFRNAVIKIWDTIKNSVLSLARGIWNGLKFIFNSSWFFIRTVFTTIKIFMTRTWIAIKNSVLNIVRNMLNGIKAVFTKLSSWTRSLFNSVYTFMRNVWTNIRNVVVRIASSLWNGVRNVWNRLFTGTRNIFSKVKSWLVSLWTSLKNRVISIGSNMWANLKRIFNNLFNGSRSIFNRVKSFMVNIWQSIRRSVTSIASSLWNTVRRTFNNMANGLKSIIGRIKSHIGGMVSAIKRGLNGLIKGLNWVGSKLSLPKIPTLSTGTQRINRHIKTTHDGRLKHGTMAVVGDKGPGNGRGIDGRRELIQYPNGRTALTPAKDTTTWLPKGSRVISGSMRQQYEEAEGAGMYPRFSVGTWLGKSTNWLANKAGAIGSAIKNSAGWLTDKIGDVMDFMDNPGKLFNKVMSLMGVDFGGLTKGMGIVGQIARAAFAKIKKGAIDWIKGGFDAQAGDGSVFDSFRILQPYSAPPKAPNPNYPFNGGVHHGVDYDTPVGTPIRTPMGGRVRSWYDNYGGGKAITVQKGRTFLWFMHLSEQLRRTGEQIKAGQLIGKSGNTGSMTNYRHLHFQVNQGGEANRFSTDPIPWLRKNDKTGGGKGYPAGSGAAYASRVISQAQSILGGRYKSRYIHDQMMRVAKRESNYQPNVVNNWDINALRGDPSRGLFQIIGSTFRANAKSGYTNFSNPLHQAISAMRYIVARYGWGGFKRAGDYAYATGGLVHKGLYQLGEDGYPEWVIPTDPSRASDAAKLLALASKDISKNKRPKNFNSSAIGSNTNGNSKLESKLDTMIGLLIKLVGSNEEIADKDYTPVIDNFGLKDFINVTMDKRERENSRKTRYGGGALI >NZ_CP015626|2694861:2730516|2725931_2726219_+|WP_096533233.1|DBSCAN-SWA MKRREHEWRIMRLEENDKDMFKKLDNIEHSLRTQEKVYDKLDRTFEELKKDRLKEEQNKKENAKNIRELKMWMLGVIGTIASTIIIAILRTFFGI >NZ_CP015626|2694861:2730516|2713495_2714440_+|WP_065520748.1|DBSCAN-SWA MEKLKLNLQHFAEATGVSGIAIGVTNFYWAPIKTDDGSKWEVKGGHRTRFLKEIEVDRPQETEEEYGDNIVAATAVSNGKLSVKTTFVSIPSEQKAFLAGAKKGEGGFKYGANDIPPDVAVVFERTNHDGSSEWVGLFKGKFTRPNLSGQTKQDKVEFQNDEVEGSFVDRLFDESSHVTGFDKKGEHKGRDYVFTETFGKTFDEFISDLNQELEIDEVEKKMPGKTSEESVRSVAFSKESTTIKKDMTEQLVVTTVPEDKPVKYEVTDGEEYISVNSNGLVTAKEVGSAEVTATSGDQSDTISIEVEEDELQTI >NZ_CP015626|2694861:2730516|2701777_2701993_+|WP_020220441.1|DBSCAN-SWA MNIQEATKLAMKKGIAIRRKNQGVYGILPTNLVNYQCLIISKNYKTKGQTAGARWQPSADDLIADDWVLDY >NZ_CP015626|2694861:2730516|2708636_2708834_+|WP_037542762.1|DBSCAN-SWA MNFDKIYTFLKLLVANIVSILFLLGLITVNIAVYIGYGTVIGLIVTGSFLIIIALIIDRESKERR >NZ_CP015626|2694861:2730516|2712144_2712435_+|WP_099984945.1|head,tail|DBSCAN-SWA MINMELLKKHCKIDHNFENDLLTMYYEWAKHDIAAAITDDFDWLETQPLFKAAIFPLTAYYFENRIAYTERKLDYAPHMVLSVVHKLRDAYAVRFE >NZ_CP015626|2694861:2730516|2726595_2726805_+|WP_065520751.1|DBSCAN-SWA MNLNDTEKLEGIGGVWAKIRMNLNDTEKLEGIGDVSEKEIKNIELQNHEKDEFIGLEADIEEDSLWDTK >NZ_CP015626|2694861:2730516|2702882_2703143_+|WP_020219720.1|DBSCAN-SWA MYFPNGEEFSGIIEVEGFKFRKHVTREDDYILIEVTDMTYKIIAETKVYDVSDVDIAQEVINAAIYDFIENETDELDKIMAQLIKN >NZ_CP015626|2694861:2730516|2703154_2703418_+|WP_065520552.1|DBSCAN-SWA MEKEKMLSIANKLNLYLALSEVHAFVQFCRSSAGSFSVHFTHFDEKYPYNNKTLFIYDWQSDERIESLVTKIKKVILREELLDDDTI >NZ_CP015626|2694861:2730516|2712747_2713125_+|WP_065520746.1|DBSCAN-SWA MPAKISRNDIEQGLMRQQLNFKANQKRVLLAGAMSLIPALKKNTPLSDRKSHAKDHISVSNVKKDKDSGESYVTIGYTKGYAHRIHATEFGTMYQQPQLFITKTEKANRDTVFKAMSTAFRRLNK >NZ_CP015626|2694861:2730516|2706003_2706360_+|WP_065354480.1|DBSCAN-SWA MAIMRRCNHPTCNTLIHHNERYCDKHKTYTNDKYNDERQRNDPEYLRFYKSKQWQNMRELVMLENDYLCKSCGRQADVVDHIIPTKVDWSKRLDKNNLQPLCNECHNRKTKREVPRAK >NZ_CP015626|2694861:2730516|2703526_2704063_+|WP_020219701.1|DBSCAN-SWA MTNTLTVDQLQELLKIQKEFDDRIPTKNLNDTVASMIIEYVEWVNTLEFFKNWKKTPGKDLDTQLDELSDFLAFNLQLALEVIDGNELNEFIDVMVNLVEEQEDLPRLHSVYFVHALHTLTGQFVNGIDSSIVQVIVMPFLYANQYYSIEQLIDAYKKKMERNHARQDGTADKEKGYV >NZ_CP015626|2694861:2730516|2706924_2708625_+|WP_065520744.1|terminase|DBSCAN-SWA MDYVTLYAQKVVSGEILASKKNIAVASRHLNDLKNPPKDCYWDVEKANKAIKFIEMLPDPKTNEPMPLMLFQKFIVGSIYGWRRKGGFRRYTKAYISMSRKQGKSLVVSGISLNELLFGQYPKYNRQIYVSSSTYKQAQTIFKMASQQIKLLRSKSDYIRKSTDVRKTDLAHIASESVFEPLSNNPDAVDGKDPTVAILDELASMPDDEMYSRFKTGMTLQKNPLTLLISTAGDNLNSQMYQEYKYITKILSGEVKADSYFVYCAEMDSEDEVNDESQWIKAMPLLESKEHRDTILRNIKSDIQDELEKGTSFHKILIKNFNLWQANKEDSLINISEWESVEVNKNEYNLYGRDVYIGVDLSRLDDLTSVGFIFPNDNESVLIDSYSFVGLRTTLEQKSKRDKINYEYIINQGEAETTTSESGMIDYKRVIEYILQVVEEYDLNVIAVCYDPWNAQSFITSLETMMIDWPLIEVGQSFKSLSQTIKQFRMWVADKKVRHFGNHLLTIAVNNAVLMYDGEDNVKINKKLNRQKIDPIISVITAFSEARMHEFETDWSSIYESEEFGF >NZ_CP015626|2694861:2730516|2713121_2713484_+|WP_065520747.1|DBSCAN-SWA MNITELIYDTIVQNKDITIEDNVFRYVVPQNFHEKTKKPIVRIVPLPYHADEYADDTELTREYDFQIDIWWSSDEPYNQAELIVQALKNINFKTYYREPLYEVETQTFREIIRANGSLLI >NZ_CP015626|2694861:2730516|2728875_2730516_-|WP_065520753.1|DBSCAN-SWA MNKFKVNIQGMTCAGCEKHVESALEKIGAKNIESSFRRGEIVFELPNEIEVESAIKAIDEANYKAREIEEVSSLENVALSNEDNYDLLIIGSGAAAFSSAIKAIEYGAKVGMIERGTVGGTCVNIGCVPSKTLLRAGEINHLSKDNPFIGLQTSAGEVDLASLITQKDKLVSELRNQKYVDLIDEYNFDLIKGEAKFVDASTVEVNGAKLSAKRFLIATGASSSLPQISGLEEMDYLTSTTLLELKKIPKRLTVIGSGYIGMELGQLFHHLGSEITLMQRSERLLKEYDPEISESVEKALIEQGISLVKGATFERVVQSEEIKKVYVTVNGSKEVIESDQLLVATGRKPNTDSLNLSAAGVETGKNNEILINDFGQTSNEKIYAAGDVTLGPQFVYVAAYEGGIITDNAIGGLNKKIDLSVVPAVTFTNPTVATVGLTEEQAKEKGYDVKTSVLPLDAVPRAIVNRETTGVFKLVADAETLKVLGVHIVSENAGDVIYAASLAVKFNLTIEDLTETLAPYLTMAEGLKLAALTFDKNVSKLSCCAV >NZ_CP015626|2694861:2730516|2712415_2712748_+|WP_065520745.1|head,tail|DBSCAN-SWA MRFDSNRLNERVTFYEDVSKSIKGLPQKPITKELYSCYASVQDAKESDTQTSIQNSTEFIKTIIIRDPRADYNPTNKHYVLHDGNRYDVVYVKKDYQDKSFIRVYCKVVI >NZ_CP015626|2694861:2730516|2708896_2710111_+|WP_096533231.1|portal|DBSCAN-SWA MMVQTLPGFQGQPIRNYTDVEAIRHSDIFTAVMMIASDLARMPIRLTNNGEIDFNNKITKLLNIRPNPFYNGYIFKLVVFANSLLTSHGYVEIARDNKGNPINLAFRKTSEIELKLSPSGRYFYEFKKIDDNGKSTSRKIKFEDMIDIKFYSLDGINGLSVLDTLSKTIDADNNGKDFLNNFLKNGTHAGGILKMKGVLNNKEARDRARKEFHKAFSGTKQAGKVVVLDESMTFEQLEVDTEVLKLIRENKSSTREIAGVFGIPLHKFGIETTNMSITDANLDYLSTLKPYTTCVCAELNFKFNDERSDVIREFKFDTTEIRVVDEKTQAEIDKINLDSGKTNIDEVRKRDGLPPIPGGKGSIHRVDLNHVNIDLVDDYQMNKSRGTDNKLKGGEENGEGDENR >NZ_CP015626|2694861:2730516|2700969_2701740_+|WP_065520743.1|DBSCAN-SWA MQELQTFNFEELPVRTLTINDEAYFVGKDIAEILGYSKARNAIAKHVDFEDKKDAPIQGPLGGTQKMTIINESGLYSLIFSSKLESAKRFKRWVTSEVLPAIRKHGIYATDNVIEQTLKDPDYIITVLTEYKKEKEQNLLLQQEIGELKPKADYVDEILKSPGTMTITQIAADYGLSAQKLNKLLHKARIQRRVGKQWILYTDHMNKGYTKSETINIVRSDGTPDTQPQTKWTQKGRLKIHEILTDFGYEAEVVEI >NZ_CP015626|2694861:2730516|2704099_2704294_+|WP_065520550.1|DBSCAN-SWA MTQYLITTFTDSTGQTFTEATKARENQTFSVVLAESKEEALEIYTNDKGWQDFIKTLKEETEWD >NZ_CP015626|2694861:2730516|2699291_2699996_-|WP_065520740.1|DBSCAN-SWA MNSFKDRLKQIMSERKISQSELSRRTGIGRNSISDYLNGKYEAKQDKVFELAKALNVNEAWLMGFDISKNREIENSITSIYDQLTPPRQKRVLDFANEQLNEQNNKVLHINSHNIISEEVAVYGYASAGTGETLIDGVEFTTQYNGHIPNHDFALQVNGDSMEPLFEDKEIIFIDKTKQINSGQIGIFVIDGEAYLKKVFISDKGIRLVSLNSKYPDLNFDSSHDIKVAGKVIL >NZ_CP015626|2694861:2730516|2721133_2725471_+|WP_082245613.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP015626|2694861:2730516|2701981_2702314_-|WP_019166715.1|DBSCAN-SWA MLTSDSKFVILHLYKIYLDRIEDGVSINTASYFGSDEESHYNYFLGMNFDKYVSSVHQLGRYGFATVAKGDNGFAALALSNKGIAYCENETNKNYSLLLKAISDLKKLII >NZ_CP015626|2694861:2730516|2704705_2704933_+|WP_020220177.1|DBSCAN-SWA MMLTITTINNKTYYAFYNTRVEHIVLKDLNNKKFIKVIDSNGHKNFLQTSVIENVLVDDSKDALEKFEKRAEVSD >NZ_CP015626|2694861:2730516|2698307_2699279_-|WP_065520739.1|DBSCAN-SWA MKAKQRDKDSLLNKFPDFRIIIETTGSTNYQGTEYNGSIISSFKEIAFVCEKKNFIYVIPWSDINSISTKKTFITNNINLTYDNSSKNLTFKFTNVESVIAIEVLSQAINEHKMALKVQEDLLNSKEKELKDLQLHKESEFQLTHHDIASIKPNNLEKYDLINDEAETTDNIVQDSFIVVGLNYENRHKKLKKMINSMKKNEEFFFLYEDLRGKELLDELEFGGVIFEIDNYEKVPGIYLEKEPNNMYDSNAIKVMVSNDYGSFNVGYVPSENAKYLNDYFNNIVSCTAYIYGGKYKEFDYIEERIVTKEKNYGLKLEISYYK >NZ_CP015626|2694861:2730516|2704284_2704566_+|WP_015978014.1|DBSCAN-SWA MGLAELLTIVFVVLKLTGVIDWSWWLVLLPEIIAILIYTVLFIITVVYARMQNKIFMSKYERAAKRTRNKHEEYLKRRQKWFENHKLDRGEKK >NZ_CP015626|2694861:2730516|2719615_2721106_+|WP_065520750.1|tail|DBSCAN-SWA MNDTILVNGKSLPWLFVQRGFKIPSFNFEIKTDAVNGRAGSVFKSRGLSEYRFDLPLVIHNDFLSHSGIKSHDDVLSELVKFFDYDEAVKLQLKSKKWYWNAYFEGPLEINNKTENNINVVTVKVILTDPYKYAIDGNQNTAISDAVSVVNAGTAETPIIVEARALQNSNYYMISKGDEDYFMIGDDDLDKPLKDYSPLILEDESQTLSGWNKQSTIDFTDNQTGGKVGGSFIVSDSKQSFYLNNDSVSGNGWNGAMYKRSFSKQAQDFTTTVKFGINQKNKGAVRFAQYIYDSDNRVIASIGYTNPNAKQAIGTIIVTLFDQSGNQQTVYKYKNNPSLYKLDSFVVYIRLTRKDNVFTVKSWKYKEFPYPLRKKAFDEHERQFVDGGNFYQRPVVALSLYSAKNGSNNVMPLYIFGTYTRELLPRPTNARDMIIKKGDLITIDMATKNVLVNEESFLSEKTFGSNYFNVDKGHTELVINPPGIFDTTVKWQDRFL >NZ_CP015626|2694861:2730516|2725635_2725911_+|WP_020220196.1|DBSCAN-SWA MEQFTEFYLVEVNKNGEESALMQNYSNSFVRGASPANAYKFKDEEQVKKVCAMQNMLAGIFNNGTKTYYVKQDVTRTKLDEKGEPYTLEDE >NZ_CP015626|2694861:2730516|2714992_2715133_+|WP_096533186.1|DBSCAN-SWA MKVARQLIEDGMDPEKVANMPIHFFLEIVNSKVETKKKAKSFADIF >NZ_CP015626|2694861:2730516|2714504_2714951_+|WP_020220192.1|DBSCAN-SWA MARTSIELITGYTKTGKPQTKKYFAKPSLSLFDTLQGSKLSARVSKLFKEPDFEELTQEELEKLSEIEQKEYQAKVAEHQERVVQQLEILEEISEFIVDGFGNQFTSEELQKSISAGFEGIKNLIGLLEKLISGDVDDTKKFVTEQKK >NZ_CP015626|2694861:2730516|2728194_2728395_+|WP_015978022.1|DBSCAN-SWA MNFENVKQDIKKLFKVQNGSQISKATGLPYQTVQDLRNEKTNLDDARLRTIEKLYNYQKQLEKENQ |
42 | Staphylococcus_phage(85.37%) | head,protease,terminase,tail,portal,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||
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NZ_CP015626.1|WP_065520771.1|2008945_2009344_-|hypothetical-protein |
2008945_2009344_-
Protein sequences of NZ_CP015626.1|WP_065520771.1|2008945_2009344_-|hypothetical-protein>NZ_CP015626.1|WP_065520771.1|2008945_2009344_-|hypothetical-protein MEKLKNKVVELENENNITLIDSLGQYFTDIENDNNGRFNVEYVLLNKVEHDNGKMYYEVQINRTEEVPFDDMVTKDNVNELEDNWLQTDQNGENYIESIFFENEQDAEIYITLVLKGNKSFAGIAKDIGVIE |
132 aa aa |
52
gnl|BL_ORD_ID|52 information
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NA | NA | No | NA |