Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP015576 | Campylobacter hyointestinalis subsp. lawsonii CCUG 27631 chromosome, complete genome | 1 crisprs | csa3,DEDDh,WYL,cas4 | 0 | 1 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP015576_1 | 650501-650599 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP015576_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP015576_1
>1.1|650534|33|NZ_CP015576|CRISPRCasFinder TTAAATTTGTTTAATATTCCAAATTTTCGCTGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP015576_1
The CRISPR arrays of NZ_CP015576_1 >merge|NZ_CP015576|1|650501-650599|CRISPRCasFinder AAAATAGCCATTTAGGCTATTTGTTCTTTTGCGTTAAATTTGTTTAATATTCCAAATTTTCGCTGAAAAATAGCCATTTAGGCTATTTGTTCTTTTGCG >NZ_CP015576|1|1|650501-650599|CRISPRCasFinder AAAATAGCCATTTAGGCTATTTGTTCTTTTGCG TTAAATTTGTTTAATATTCCAAATTTTCGCTGA AAAATAGCCATTTAGGCTATTTGTTCTTTTGCG
>NZ_CP015576.1|WP_059434976.1|649737_650412_-|response-regulator-transcription-factor MINILMIEDDLELAEILTEYLEQFDIKITTNDDPYLGLSTLNTNKFDLVILDLSLPGMDGLEVCKEIRKKHNIPIIISSARHDLSDKVNAFELGADDYLPKPYNPGELLARIKSHLRRQNITQTEQKSQKKDLVCDDFKHTITLKDTPLNLTVAEYDILRYLIKKEGGAISREELIYNCNSINEESTNKSIDVIIGRIRTKLGENPKDPKYIHAIRGVGYKLVQ >NZ_CP015576.1|WP_063998009.1|648514_649741_-|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MKFSSIFYTITLIFIIATTSIFLAFLWLMDYDKQNYARELNTKYSVVARATLLHMNDLINKEEYLQQTQNLNMPRIEDKDIKDAILNGSTTIEEITADIGSSAILLYQKRHYLKIVHKGTTLLLEDKDYQPYRYDIIKFIFGLVFFILLMTYIFIIRKIKPLRKLKRQIDKFATGNLDIKNVSTGNDEISEVADAFYNAVCQIKSLNHSRQLFLRNIMHELKTPITKGRIAAEMIEKNRNQERLINVFERLESLINEFAAVERATSKLEVENAKPCKVIDIIDEAIDLAMIEKELVTINVINDLNINADFKLMSVAFKNMIDNGIKYSNDKHIIITINEDSVKFITNADKLEQSLEYYTEPFTQGSNAKKSFGLGLYIVDNILKSHGFKLEYEYKNSLNIFKFTNFKS >NZ_CP015576.1|WP_063998008.1|647241_648525_+|hypothetical-protein MVISESKTEILVFVIFCVFVFLCNVGYEFFKFKQFTQKSHQFLNVKVEQSYTKEGKNAKTYNVLRLNAGEFSFYTTLKSTQIDITDKKYLKIGVITKNLDFVNYIKHTFYLPNFKIIPIDKEPNLKDKLVDFIAHQHEIPKLKELYSALFFATAISKELRRNITNWGVAHIVSISGFHLGLLFGFLFFILKPIYKIAQNNHFPYRNANFDITFAILILMFGYLWLLDFTPSFLRSLIMACICFILLSFGLKVFNFTNLFLTIAIALSFNPSLIFSIGFYFSCLGVFFIFLYIHHFGDKKDLTSKTKMALHTLYLEIFVFSAMNIPVYYFFSSASFYQLSVIPLGYIFVVFYPMSIILHIFGYGGLLDEYMLSFLNLAYEQTKIEVPTWLFICFNVSLLFSIKFKKLALLVAFVGMALFMIPLTLASF >NZ_CP015576.1|WP_063998007.1|645949_647248_+|TolC-family-protein MKNIIYIFIGLLFVGCASKNIDYKVKEVSFYTPTWYLDFNQTVLNRLIDTALKNNEDINIAALSLRQAMLKAGVAKADFFPTPSANAKASTSRDISRDDDWKNGFSSDFSLSYELDIYGKIFDNFESLSWDAASSSLNLSNLKLTIINSITDTYFNILYINDAIRNLKQNLVNLNELDRLVITKYELGKEEILSVRQSKQNLLDLQNSLLTQQKNLQTSYEVLKNLTRSDISLDDLSLSGVELRDISLDIKFDTLKNRPDINEAISSLNAGFYSYKVAQKNLYPSISIGASLSDSDTKLSDSFGFNMIGGNLSIKLPFLDYARLSKQVKISEAEFEKRVLTYEKTLSNATNEVIKYKLYYDIDKQSYENLLSIVEQRVMIVGIYETKYALGKAQLKDLLEAKNLLISAQNSLLNQKYRLLNDEIGYYKAIAW >NZ_CP015576.1|WP_063998006.1|644021_645947_+|MacB-family-efflux-pump-subunit MIKLQNIKKKFITGGVETEVLKGINLSIERGEFVAIIGQSGSGKSTLMNILGCLDTPSSGKYLLEGQDISKFDRDALSNLRLKTFGFIFQRYNLLSSNDVKNNVALPGVYAGMGKKDRLNFAKELLSKLGLESKFDTYPNQLSGGQQQRVSIARALMNGGDILLCDEPTGALDSASGVMVMQILKDLHKSGHTIIVVTHDKDIASWADRIIEIKDGNILSDSKKQNNIYEFKKASEGIKKGFKASLDRFLESFSMSVGAIKAHKLRSFLTMLGIIIGIASVVCVVALAKGSQEKILNEINKVGTSTIMLNPGKAPGDPNKNKIKKFTLDDAELLSKLEFVDYATPTVSQSGLLVYSNQNANANLRAGSENYLKITGVKVVLGRDFSSDDIKNSESVIIIDTDVKSSFFGQNDPIGKTILFNKKPFKIIGVAKKDEGAFGSENLTVYMPYSTAVNKITGDRNLRSITVKLKSNVNAQLAESTIKEVMSVKRGDSDFHTRNSDTIMQTIKSTTDAMSLLISGIALISLMVGGIGVMNIMLVSVFERTKEIGIRMAIGAKSKDIMIQFLIEAVLLCAIGGAIGVGLAYLIGYIFNMFGASFKMIFSTTSIFIALGVSSLIGIIFGYMPARNAARLNPIDALSRE >NZ_CP015576.1|WP_063998005.1|642846_644025_+|efflux-RND-transporter-periplasmic-adaptor-subunit MKKLTILVVVLLTIGAILYYNNSNKPKDEYLTTQVRKGDLVQSIEAVGEVFASNLVDVGAQVGGQIKQLYVKVGDRVKVGDRIAQIDSVRQKNSLDQQLAALEILKAKLNSAKISSDIAKVQYNRELKLFEANATSSESLENSRSDLSLKNANLKELEAQIKQTQIEIDTARTNLDYTDIRSPLDGVVVSVPVEVGQTINVNQTTPTIVNIADLSKMEIKMQISEGDVTKIKVGDRVEYSILSDINTKYNGILSSIDPGLTTLSDGKYNTTSSSSSSTSSSSAVYYYAKLQVDNKEEILRIGMTTQSTIIVKEIKDTLLLPTFAIKSDKEGSYVIVKDGENIRKARVKTGISSSIDIQILSGVNEGDEIITSQISQDELQKRIKSSKKKMRI >NZ_CP015576.1|WP_063998004.1|642248_642638_-|flagellar-assembly-protein-FliW MKFTIKSPILGFENIKSVEITQIDDFFVKMQSLDSDISFTMINPYALIEYEFEIPTYYQELMQINDKSELKVYNILVISSPIEESSVNFIAPIVCNMTNMTLSQVILDPVNYPKYSQAEKISNFIKKGK >NZ_CP015576.1|WP_063998003.1|641680_642226_-|prepilin-type-N-terminal-cleavage/methylation-domain-containing-protein MKKAFSILELILAIVIIAIAVSVVPSIISSTSQSNSQALLQEAVLATKTILTNEMSKEFQTDTEQITRNGLDKIEDKRKIYKAKSNKETLSGKIKIENDASTDKNILNLNYEITTKNVKDPEFDKKCNCYPFTDAEDTSSDTKMIKVETTYKDIKGEDQKIVLTGYSFNIGEPKAGQIIIE >NZ_CP015576.1|WP_063998002.1|640771_641677_-|prepilin-type-N-terminal-cleavage/methylation-domain-containing-protein MKKAFTLIELVIAITITAILASIGTEIISTVYQNYIQTRSITKLEAQTELAITQISKRLQYRIKQTLVGYENGEYKDMIECGADCGIAWYMQSYESRRLGEVNKTGWSGVINKATIAGDKINLSLGYNDDKVQNLEKVNKIIESITSKEVSEKNRIALIFKQSEDKAKENYYDGNTPKKVYEAYFSGNDIIIDKKNENKDDKLEDLYYLSHTINRIYIDGDKNLKLDVIPATSPSTKANKNNSYTIAKNVTTLRFTNFANENDIASSNGLILKICIKDSNLKVGKKDNDPHLEVCKVKAII >NZ_CP015576.1|WP_063998001.1|640355_640775_-|hypothetical-protein MKRGFSLIMAIVFIVVIITIGMLSFTLSNTSVKQTTEQYLSEQAEALAMSASEYAILAIQKHDFSQNYLNEVNLTSGVLSAHVSIKYINTKSKTEDSKTDFTDKDNKIRAVILTTIVESNPDIIKDQNIRYVRITTQKP >NZ_CP015576.1|WP_063998010.1|650605_652021_-|Do-family-serine-endopeptidase MKKLTIISIIAASSLMAANISFNDASQNYTRLNPSSDQNSVLSYHSSIVKAKKSVVNISTSKTIKVKHNINSLMDDPFFQEFFGFRFNIPKEKSQKTSSLGSGVIISSDGYIVTNYHVVEDADEIIVTLLDSSKEYKAKIIGVDPKTDLAIIKVDAKNFQAISFADSSKLLEGDLVFAIGNPFGVGGSITSGIISGLNKDNIGLNQYEDFIQTDASINPGNSGGALVDSRGALVGINSAILSRSGGNNGIGFAIPSNMVKTIAQKLITDGKITRGYIGVMISNLTDDQKELYKNKEGALITNVEKDKPAELAGLKRGDLIIKVDNQDIKNANDLKNLIGSLSPNKTISITYERANQISTINLKLINMELGDISKKDTYFDNGLSLQNITDEVRYKNKIPGDIKGVLITDVKEDSSAFVAGFEPGDIIVQINQKIINSVDDYIKEIKSSKNQNSKLMIWINRKGVLMGLVLK >NZ_CP015576.1|WP_063998011.1|652184_653048_+|DnaJ-domain-containing-protein MSNSLYETLGVDKNASSDEIKKAYRKLARKYHPDINKDPGAEDKFKEINAAYEILSDDEKRTQYDTYGDNMFGGQSFHDFANAQGGADINDILRNIFGGGGGFGGFSGGFSSRGFGGFSGGFEPNLDINTKITIPFSAAVNGGEYTINISGESVKIKIPAGVNSGEKLRIRSKGKSLNGKSGDAILNLEVSEDDTYKRDGDDLYKTIDVPLKTALFGGKIEVSTFKKEVSIKISPNTKNGQKIRLKGYGVQNRKSGIYGDMYLSVNVILPNVDMLDKDLAKMMQDRL >NZ_CP015576.1|WP_034962753.1|653058_653430_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKSYEEPVYLISVVAKVLSIHPQTLRQYEREGLVEPSRTGGKMRLYSEKDLDRIKMILRLTRDLGVNLAGVDVILRLKEQIEEYESTIDELKLSMEQMSKNDTKRSLVKRKNSYDLIFLNDKK >NZ_CP015576.1|WP_063998012.1|653435_655064_+|potassium-transporter MDSFLELFLVATACAVVLNVVFKRYEMPTIIGYIITGILIAKIFGLTYDTKITHIAEFGIVFLMFTIGLEFSFKHLMTMKRDVFLNGLLQVFITGTIFSIFLQYTFDIGQKTAIIIGFALSLSSTAIVLKTLNDNGDITQIYGRKALGILLFQDIAVVPLLLMIDIFSSKVSSVDDLVITTLTSAAILLVLLYFIGKYIFNMVLYFVVKTNSQEIFITTILFTVIGASFLAHYFGFSYSLGAFIAGMLIAETQYKHQIEADLIPFRDLLLGFFFITVGMQIDFGIILKNLFVVVMLLLNVMIVKIIVVYGILLLRFKKRVAIKTALSVCQIGEFALAVFALLNSNNMLDIETTQVLTAVVVLSMVITPFILKNIGKIADQLETTEDTPEPQKIKIEPLSEHFIVCGYGRLGQEVVNRLKQQGLPYLVLESDLSLVQLGRSRNENVFYGNATQKVTLEQAFIQTCAAVIITVSNEQKLEMIANAIKNIGYNVNTVIRFTGVEEKKLYSNFGQNFHLIREERAVARVLIHEALQCRLDSNDDNI >NZ_CP015576.1|WP_063998013.1|655081_656518_+|potassium/proton-antiporter MDQTLMLFGILFLLSIIFSKISDKYGVPVLLMFLAIGMLAGSDGIFGLEFNNAKIAGDVGTIALVYILFAGGFNTGFKELKPVLKTGIVLSTLGVVVSAIVTGIFAYYIMNFSILESLLFGAIISSTDAAAVFAIMKTTKLKNNLSYLLEFESGSNDPAAIFLTVTILGLVTATALPDTFTLIKDFSLEFIFGGLMGYAFGSMIPSLMNKIKLGYWGLYPVLLISIVAILFGLTEKIGGNGYIAVYVAGIFANKREFLYKKNLVGFFEGIAWMMQIFIFLTLGLLVFPSELPKVAFLSFMMAVVIMFIARPISVFISTMFSKYTNKEKLFISWVGLRGVVPIILATYPLSAGAQNAQIIFNTVFFIAIISVLVQGITLNKVAKYFGVIDEKKKFIGAMTSVPIRYSGIRQFCIGQDSKIIGKNLSELELPDYFLILLSKRNDEYIKVSGSFEFMENDLLLILCEDERKYQKTLEVYEF >NZ_CP015576.1|WP_063998014.1|656580_657342_+|TSUP-family-transporter MEFELWHYGLLFFVAFFSGFVDAIAGGGGLITVPALLSVGLPEHIALATNKLQSTFGSFTATVNFSLKGLIDYKELFAGIIFTFIGAVLGTAFVLVIDAKILSYLIPVFLVLIFVYTILSPKIGEEDRAVKLSPKVFYIVFGLILGFYDGFFGPGTGSFWMFAMVALLGIHMKKAVAHTKALNFISNVVSLGVFIAGGQILWILGIVMGFGQILGAYFGSKMVIKKEVKFIKTIFLIVVACTILKLVYDLLFK >NZ_CP015576.1|WP_059429102.1|657409_658090_+|F0F1-ATP-synthase-subunit-A MKELFLFSNMIVDSHAFTYLFHLILVAIIVLIVAKLATRSMQLVPRGTQNLLEAYLEGIVSMGRDVMGNDELARKYLPLVATIGLIVLTSNVIGIIPGFEAPSSSLNLTLCLALCVFLYYNFEGIRTQGVIKYFAHFMGPNKILAPLMFPIEIVSHLSRIVSLSFRLFGNIKGDDLFLMVVLSLAPWVAPLPAFALLTFMALLQTFIFMILTYVYLAGAVVVSEEH >NZ_CP015576.1|WP_063998015.1|658284_658821_+|thiamine-phosphate-synthase MLSYAITDPKLYPNLKDSFFKFKRLKTADFILFRDKICNDYAKKAEIFMSLKPNFKAKFIIHNDINLALNLNADGIHFSSNLIVNLKNVPQNLIKFASTHNEKEIEDAIKFGADFITFSPIFSTPNKGEPVGIETLRKIVLNSSIKVFGLGGIVTKEHIKMVEFAKAVGFASIRYFAN >NZ_CP015576.1|WP_063998016.1|658879_660298_+|Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln)-amidotransferase-subunit-GatB MFETVIGLEVHCQLNTKTKIFCGCSTSFGDEANTHVCPTCLALPGALPVLNKEAVKKAISFGKAINATVNKKSVFDRKNYFYPDLPKAYQISQFTIPIVEKGELFIKVDGETKRIGVTRAHLEEDAGKNNHEANKSLVDLNRAGTPLLEIVSEPDLRSSDEAVAYLKKLHSILRFLNISDANMQEGSFRCDVNVSIRPKGDEKLYTRVEIKNLNSFKFIQKAIEYEVERQIVAWEDGKYDEEVYQETRLFDTNKLVTKSMRSKEDSAEYRYFPDPDLLPVIIPDEMMEEASVLPELPDEKKARYVRELGIKESDAEVIISSYEMARYFEDLIEAKNSPKLAVTWLCVELLGRLKNGVTIETSPVNSKKLSNLISLIEDGTISQKAAKDVLDYVMEHDEDISSVIEKLGLKQVSDDSAILAIIDRVLAANSDKVVEFKSGKDKLFGFFVGQVMKEGKGAFNPSKVNDLLKSKL >NZ_CP015576.1|WP_063998017.1|660299_661190_+|NAD(P)H-dependent-glycerol-3-phosphate-dehydrogenase MKIAIIGAGKWGEALFNALNENNECVISSRTKRNISNFVSIEDAFEYEYIVFALATQKIREFLSLHFKNRDQKFLIASKGIETSSGKFIDEIFGEFASPLNLAFLSGPSFASEVKQKLPCALVISSHNENLAKTWAGVFPNFIKTYISGDVIGSEICGAYKNVIAIASGICDGLSLGNNARASLISRGLVEITRFGSYFGAKNETFLGLSGAGDLFLTASSALSRNYRVGLGLAKGMPLDEILKELGEVAEGVPTAMAITKISKQNSIYTPIANEVCAMLEGKNVKESLRDLLRKK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP015576_1 | 1.1|650534|33|NZ_CP015576|CRISPRCasFinder | 650534-650566 | 33 | NZ_LR214939 | Mycoplasma salivarium strain NCTC10113 plasmid 2 | 566706-566738 | 8 | 0.758 |
NZ_CP015576_1 | 1.1|650534|33|NZ_CP015576|CRISPRCasFinder | 650534-650566 | 33 | KX513865 | Human gut gokushovirus isolate SH-CHD2, complete genome | 4632-4664 | 8 | 0.758 |
NZ_CP015576_1 | 1.1|650534|33|NZ_CP015576|CRISPRCasFinder | 650534-650566 | 33 | NZ_CP037749 | Campylobacter helveticus strain 2013D-9613 plasmid unnamed1 | 47537-47569 | 10 | 0.697 |
NZ_CP015576_1 | 1.1|650534|33|NZ_CP015576|CRISPRCasFinder | 650534-650566 | 33 | NZ_CP020479 | Campylobacter helveticus strain ATCC 51209 plasmid pHELV-1, complete sequence | 19468-19500 | 10 | 0.697 |
1. spacer 1.1|650534|33|NZ_CP015576|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR214939 (Mycoplasma salivarium strain NCTC10113 plasmid 2) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
ttaaatttgtttaatattccaaattttcgctga CRISPR spacer ctaaatttgtttaatataccaaatttaaatcta Protospacer .**************** ******** ... *
2. spacer 1.1|650534|33|NZ_CP015576|CRISPRCasFinder matches to KX513865 (Human gut gokushovirus isolate SH-CHD2, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
ttaaatttgtttaatattccaaattttcgctga CRISPR spacer atcaatttgtttaatattcaaacttttatttaa Protospacer * **************** ** **** .*.*
3. spacer 1.1|650534|33|NZ_CP015576|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP037749 (Campylobacter helveticus strain 2013D-9613 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
ttaaatttgtttaatattccaaattttcgctga CRISPR spacer cctaatttgtttaatattcgtaattttaccatt Protospacer .. **************** ****** *
4. spacer 1.1|650534|33|NZ_CP015576|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020479 (Campylobacter helveticus strain ATCC 51209 plasmid pHELV-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
ttaaatttgtttaatattccaaattttcgctga CRISPR spacer cctaatttgtttaatattcgtaattttaccatt Protospacer .. **************** ****** *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
309499 : 351523
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP015576|309499:351523|DBSCAN-SWA 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60 | Campylobacter_phage(35.0%) | tRNA,plate,capsid,tail,transposase,terminase,integrase | attL 303269:303285|attR 326877:326893 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
794501 : 804038
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP015576|794501:804038|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP015576|794501:804038|799426_799936_-|WP_063998986.1|DBSCAN-SWA MIYNHQKEIGDEAFITTKTDLKGHITYANSYFLNIVNAKNSDLIGKNHNIVRHHDMPKYVFKLLWDRIKNKQEIFAFVKNITFDGGYYWVFANVTSSLDESGNIIGYYSVRRKANPKAVEKIIPIYQKMLELEKLGGGIEASQKYIADLLATHNTTYDRFVNELQRVKG >NZ_CP015576|794501:804038|796285_796684_+|WP_063998128.1|DBSCAN-SWA MQNILNSMKNIAVVGFSPDPNKASNHVGNYLIEQGFNVFAIYPKSVEINGCQTYQSLSEIKQNIDTIVMFRKAEFATELAKEALNLGVKNLWLQLGIVNDEAKKIAQDGGLNFAQDACIMIEHKRMKNDKSK >NZ_CP015576|794501:804038|794501_795635_-|WP_148660167.1|DBSCAN-SWA MLFNSYEFIFIFLPITFFVYFYLNSKRLGHISKAFLVVSSLFFYSWWNIIYLPLILLSMIFNYTIGNTLANNKSKINTKALLCLAITSNLALLEYFKYSDFFISNVNLTFGSHIEPLHLALPLAISFFTFQQIAYLIDSYKGETSEYDFLNYALFVTFFPQLIAGPIVHHKEMMPQFANSRNLLKNYKNIALGIFIFSIGLFKKVAIADTFSIWATNGFDNAEVLTFFEAWATSLSYTFQLYFDFSGYCDMAIGSALLFNIKLPINFNSPYIALDIQDFWRRWHITLSRFLRDYIYIPLGGNRGGYWRTYRNLLATFLLGGLWHGAAWTFVFWGFLHGIALIIHRIWKNLGFCLPKVLAWIITFNFINFTWIFFRAK >NZ_CP015576|794501:804038|803360_804038_+|WP_063998132.1|DBSCAN-SWA MNKLDHLAIIMDGNGRWAKNRGLVRTKGHEAGAKAVTDIAKFCIENSIKNLTLYAFSTENWKRPKKEVDFLMKLLKDFLVSKRDLFIQNSIKFHTIGDIEPFSKDLKDEILNLKNLTSKFDKLNFILAINYGGRDEIIRAANKAIRQDGKLSEESLSQNLDTSEFGDVDLLIRTGGEQRLSNFLLWQASYAELYFTPTLWPDFKSSELKDIIQKYQKTHRKFGGL >NZ_CP015576|794501:804038|798406_799423_-|WP_082858058.1|DBSCAN-SWA MSIFSKKSKFDDIVYNEIVAVACAASKGKLEARVTNIDNDSRLVTIAKCINDLLDQVEALQRETQSSILAARNGEEYRNIYVEGFKGIFRNNAESLSEGVSGVLEGQKGGIRGILSQKFTELGNGTSGMDGVQRDLIESVNDLSKVVDSSRQTADIAKQSINNVEELSSNFSVITANSNQTTQSIYQRATDISSMVNLIKDIADQTNLLALNAAIEAARAGEHGRGFAVVADEVRKLAENTAKATADIESTVTMLSQDADELNRSTDMINKVAQTAIDNTSKLKDTLQNFSTDSTATAKISELTQNKAIGILTKIDLILAKTNAYNNALNDLGITPEQ >NZ_CP015576|794501:804038|801522_802689_+|WP_063998987.1|DBSCAN-SWA MMKNKRVLLAVCGSVSFYKAYEILSILKKEGANVRVMLSDGVLKFTNILSFEALCDEKVLSSVSEDWQKGVNHINYSKNDLIIIAPASANTINKIAYGIADSVFLQTILASTCPKLIAPSANNNMLENFATKKSLEILLQNGYEICEPVSKTLACKDFGKGALNEPKTIVAMARRILNKDEFYANKKVIITGGATTEKIDDVRGITNFSSGKMAKALADAFYYAGSEVIFISSTQFEVPYKIVKFQSSNELLETLNSQKVKDNDLLIMCAAVSDYIPKNKFNGKMKKDKNGLNLELILNKDILKNINLNCKKIGFKMEMDKKTAVQNALNLLKDKNLDAVCLNVLGDEINFGSDETTICFITKTNSKSTELKSKFEVAKEIVEFSKFI >NZ_CP015576|794501:804038|796667_797879_+|WP_063998129.1|DBSCAN-SWA MISLNKIIQAKRNIDGFVVKTPFGFAPKLSKIADAQIYLKKENLQITGAYKVRGAFNKIAHLDEAAKKCGVVAASAGNHAQGVAISARHFGVKAVIIMPEAAPLLKVAGTKALGAEVILKGDNFDEAYEFALQYAKENSMTFVHPFDDEFVQAGQGTIALEMLDEVADLDYIVAPVGGGGLISGVASCAKQINPNIKVIGVSAKGAPAMFDSFKAKKQLNSKSVRTIADGIAVRDASPITLANIIESVDEMVQVGDDEIANAILYLLEQQKIVVEGAGAVSVAALLERKFKFPDGAKIGAILSGGNIDVQMLNIIIEKGLIRSCRKMIINVTLIDKPGALMGLTDVLRSSGANIVKIDYDRFSTKLSYGDASITITLETKGKEHQEKVALALTSAGYEFTQEF >NZ_CP015576|794501:804038|795758_796163_+|WP_063998127.1|DBSCAN-SWA MKKLSFIAILALAISANAAGFTGDASQSNTTGFTGGQAPINQGGFLGPRYGVNSVKAALGAWDDTWVEIKGKIISQVGHEKYKFSDGKDTIIIEIDDDDWGGVSVGPNELITIYGKVDGNAVLPNEIDVKRIVK >NZ_CP015576|794501:804038|800225_801536_+|WP_063998130.1|DBSCAN-SWA MNDISIIILAAGNGTRMKSSKSKVLHELCGEPMITHILKKSYEITSDVRVVLSYQFEEVKSVVLAEFENTKICKQDIVNFPGTAGALRTAINDLNSKKTLIICGDMPLVQVDELKALCENNSDVTLSAFKAIDPNGYGRVITKDKKVVKIVEQKDANEDEIKVDLCNAGAYCFDTNLLKDLIPLIKNNNASKEFYLTDAIELAINRGFSVSFSLVSEANFMGINDKFALSLAEEIMQNSIKEKLMKNGVIMHLPKTIFIDSRAKFEGECIIEPNVMIIGNSVIKNSVIKSGSVIEYSQVDSSDVGPMAHLRPNSKIQKTHIGNFVELKNANLDTVKAGHLSYLGDCDISSGTNIGCGTITCNYDGKKKHKTIIGKNVFIGSDTQLVAPLSIADDTLVAAGSTITKNSNKGDLIITRNAQINKPMYFYKFFGKNDEK >NZ_CP015576|794501:804038|802685_803357_+|WP_063998131.1|DBSCAN-SWA MISKISKIQAQNTPNSTTIINASLPVIIKVIEKTGYNRYNLKFGSKFLSTKSQRDLEVGGEYFANISSQSGGVININGLIKRQSHHCLEDGASLVEYLLTNGDLDLFAKEIKNRLARAKNSTDFSIYTSMILALESGIISVPFLYENRYALIEIKLGDPLELYLLFDNFAPFKALISEGKFIKITTPYKSFSSAFYNIFGCNCEVGNVEPFWQQKENFLDFRG |
10 | Pseudomonas_phage(14.29%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
943616 : 957534
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP015576|943616:957534|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP015576|943616:957534|948597_949215_+|WP_082858069.1|DBSCAN-SWA MFANSLQIAEVFEKDHSNVLKAIDKIPNDEFKSSNFKYDSYFDKKSEQRRMINLTRDGFSLLVMGFTGQKAYRWKIEFIKAFNLMEAKLKSLKSIEQTNRIANLEAIAISKERYHAKQINGYKAQLAKHNEKIKVLKARLTIAENEAKNLSSDDELLEKLEWLFKRALADGVIYAINSSRDKIINDALKKASDEFMSNLHLLKKQ |
26 | Campylobacter_phage(30.77%) | integrase | attL 955342:955358|attR 966502:966518 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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