| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP011106 | Legionella pneumophila strain L10-023 isolate Ulm plasmid unnamed, complete sequence | 0 crisprs | WYL,DinG | 0 | 0 | 0 | 0 |
| NZ_CP011105 | Legionella pneumophila strain L10-023 isolate Ulm chromosome, complete genome | 1 crisprs | cas1,cas2,cas4,cas3,DEDDh,PD-DExK,WYL,csa3 | 0 | 3 | 6 | 0 |
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP011105_1 | 178428-181189 | TypeII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP011105_1
|
38 spacers
spacers of NZ_CP011105_1
>1.1|178465|36|NZ_CP011105|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTCATTGCAGGGTACAGTTGAAAATTCCCTTACAG >1.2|178538|34|NZ_CP011105|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAATGAATTTTCAATGATTTTAGCGGCTTCGAT >1.3|178609|33|NZ_CP011105|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCGGATAAAATCGGCAAGGCTTGTGGGTGACGA >1.4|178679|35|NZ_CP011105|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTGAAAAGGCTCATACCTTGTTACCCCTTGCAT >1.5|178751|33|NZ_CP011105|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGAGTGATCACTCTTGAAGATGCTCTTGGTTGG >1.6|178821|30|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT TGATAATTTAAGAACATATAATAATTCTTT >1.7|178888|33|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT ATGAATAAAAATGTCTCTAACATGTCAATTCTC >1.8|178958|35|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TACAATTAAAGTATATGAAGCATTCAAAGATTTCT >1.9|179030|36|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACTTTCACTGTAACAAGAAACGCCGACGGCAGAGGC >1.10|179103|35|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTATATTCTCCACGTTCATTATTTGTACAATATGA >1.11|179175|35|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTCCATTCGGCGGCACGTTCGCTGGTTGGATCAAC >1.12|179247|35|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATATAACACCAATGATTCCGGTATAAATCACTAA >1.13|179319|36|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTCTCTCCAGAAGAACAGGCCAAGCGAAATGAAGAT >1.14|179392|34|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTAATGTTCTTTGTGCAGTCATTGATTCAGGTA >1.15|179463|35|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTATCGTCTATAACTACTAGACCGTCATCAGTAAC >1.16|179535|34|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATAATACGGTTTTGTAAGCCGTCTAATTCACGTG >1.17|179606|35|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTATTAACAGCCCATTAACTGATCGACAAGGACG >1.18|179678|33|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTGCAAGCGGGTTTGATCGTGTTATTATAAGA >1.19|179748|34|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTATTTAGTCGTTTAGAAACCATGCGCCTCAAT >1.20|179819|35|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTACTGGCCGACCAGACTACGGTACTTCCTGATCC >1.21|179891|35|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAACTTTCATTTGTTAAATTACGCATTTCATTTA >1.22|179963|34|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATAGTTAGAAGATTTACTCTAGGAGTTTATTGGC >1.23|180034|35|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGTAGCGAAGGCGAGGTTCCATAATGTATAAATTT >1.24|180106|34|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTGCATGGTTTGCGCTTTGCAACCCTTCCGCTGA >1.25|180177|35|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGTGGTTATGCTTGTTCCTGTACGTGCTGTTACT >1.26|180249|35|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCATAACTCTATTCAAATTGCCAAAGTAAGCAATC >1.27|180321|37|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCAGTACAGCAGCTTTAATCTCTGCAATCGCCTTAGA >1.28|180395|35|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTCTAGCCCGTCATATTCTTCAACTACCCAATCTA >1.29|180467|36|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTGAATGTCTGTTTCAGTGTCGAAACTTAGTAAT >1.30|180540|35|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCATCTTCTGAATTAGCCACGTCTTCAAGACTGTT >1.31|180612|35|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTAACTAGTTGAGGCGCTCTAGCTTTTATTTCAG >1.32|180684|35|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AACAGAAAACATGCACAGAAGAAACTGGAAAGCAG >1.33|180756|34|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCCTATACCTTGTCACAATTTCCTCATATGGCTC >1.34|180827|35|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACACCTACACCGTACTGAGCACCATAGTGTTCAAC >1.35|180899|35|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTCCTGAATTAAACTTATTGTGTTAACTTTTTCA >1.36|180971|34|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGCTGATGCTTCTCTAGCTGCTGATTCTTGTAT >1.37|181042|36|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT CATAATTGGGAATTGGTGTGAAATGCTCACCGTCCG >1.38|181115|38|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT TTAATTGCGCCAGAAACAGCACCATTTATGGTTACAGC |
cas4,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP011105_1
The CRISPR arrays of NZ_CP011105_1 >merge|NZ_CP011105|1|178428-181189|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACCTTCATTGCAGGGTACAGTTGAAAATTCCCTTACAGCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTAAATGAATTTTCAATGATTTTAGCGGCTTCGATCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACCCGGATAAAATCGGCAAGGCTTGTGGGTGACGACCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACCTTTGAAAAGGCTCATACCTTGTTACCCCTTGCATCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACAGAGTGATCACTCTTGAAGATGCTCTTGGTTGGCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTGATAATTTAAGAACATATAATAATTCTTTCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACATGAATAAAAATGTCTCTAACATGTCAATTCTCCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTACAATTAAAGTATATGAAGCATTCAAAGATTTCTCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACACTTTCACTGTAACAAGAAACGCCGACGGCAGAGGCCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTTATATTCTCCACGTTCATTATTTGTACAATATGACCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTTCCATTCGGCGGCACGTTCGCTGGTTGGATCAACCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACAATATAACACCAATGATTCCGGTATAAATCACTAACCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACGTCTCTCCAGAAGAACAGGCCAAGCGAAATGAAGATCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTTTAATGTTCTTTGTGCAGTCATTGATTCAGGTACCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTTATCGTCTATAACTACTAGACCGTCATCAGTAACCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACATAATACGGTTTTGTAAGCCGTCTAATTCACGTGCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTCTATTAACAGCCCATTAACTGATCGACAAGGACGCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACATTGCAAGCGGGTTTGATCGTGTTATTATAAGACCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTTTATTTAGTCGTTTAGAAACCATGCGCCTCAATCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACGTACTGGCCGACCAGACTACGGTACTTCCTGATCCCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACAAAACTTTCATTTGTTAAATTACGCATTTCATTTACCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACATAGTTAGAAGATTTACTCTAGGAGTTTATTGGCCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTGTAGCGAAGGCGAGGTTCCATAATGTATAAATTTCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACGTGCATGGTTTGCGCTTTGCAACCCTTCCGCTGACCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTTGTGGTTATGCTTGTTCCTGTACGTGCTGTTACTCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTCATAACTCTATTCAAATTGCCAAAGTAAGCAATCCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTCAGTACAGCAGCTTTAATCTCTGCAATCGCCTTAGACCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACCTCTAGCCCGTCATATTCTTCAACTACCCAATCTACCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTTTTGAATGTCTGTTTCAGTGTCGAAACTTAGTAATCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACGCATCTTCTGAATTAGCCACGTCTTCAAGACTGTTCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTCTAACTAGTTGAGGCGCTCTAGCTTTTATTTCAGCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACAACAGAAAACATGCACAGAAGAAACTGGAAAGCAGCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTCCTATACCTTGTCACAATTTCCTCATATGGCTCCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACACACCTACACCGTACTGAGCACCATAGTGTTCAACCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACCTTCCTGAATTAAACTTATTGTGTTAACTTTTTCACCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTTGCTGATGCTTCTCTAGCTGCTGATTCTTGTATCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACCATAATTGGGAATTGGTGTGAAATGCTCACCGTCCGCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTTAATTGCGCCAGAAACAGCACCATTTATGGTTACAGCCCAATAATCCCTCATCTAAAAATTTAACTAATGAAAT >NZ_CP011105|1|1|178428-178820|PILER-CR CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC CTTCATTGCAGGGTACAGTTGAAAATTCCCTTACAG CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TAAATGAATTTTCAATGATTTTAGCGGCTTCGAT CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC CCGGATAAAATCGGCAAGGCTTGTGGGTGACGA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC CTTTGAAAAGGCTCATACCTTGTTACCCCTTGCAT CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC AGAGTGATCACTCTTGAAGATGCTCTTGGTTGG CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTGATAATTTAAGAACATATAATAATTCTTTCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACATGAATAAAAATGTCTCTAACATGTCAATTCTCCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TACAATTAAAGTATATGAAGCATTCAAAGATTTCT CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC ACTTTCACTGTAACAAGAAACGCCGACGGCAGAGGC CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TTATATTCTCCACGTTCATTATTTGTACAATATGA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TTCCATTCGGCGGCACGTTCGCTGGTTGGATCAAC CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC AATATAACACCAATGATTCCGGTATAAATCACTAA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC GTCTCTCCAGAAGAACAGGCCAAGCGAAATGAAGAT 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CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TCTAACTAGTTGAGGCGCTCTAGCTTTTATTTCAG CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC AACAGAAAACATGCACAGAAGAAACTGGAAAGCAG CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TCCTATACCTTGTCACAATTTCCTCATATGGCTC CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC ACACCTACACCGTACTGAGCACCATAGTGTTCAAC CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC CTTCCTGAATTAAACTTATTGTGTTAACTTTTTCA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TTGCTGATGCTTCTCTAGCTGCTGATTCTTGTAT CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC CATAATTGGGAATTGGTGTGAAATGCTCACCGTCCG CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TTAATTGCGCCAGAAACAGCACCATTTATGGTTACAGC CCAATAATCCCTCATCTAAAAATTTAACTAATGAAAT >NZ_CP011105|1|1|178428-181189|CRT CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC CTTCATTGCAGGGTACAGTTGAAAATTCCCTTACAG CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TAAATGAATTTTCAATGATTTTAGCGGCTTCGAT CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC CCGGATAAAATCGGCAAGGCTTGTGGGTGACGA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC CTTTGAAAAGGCTCATACCTTGTTACCCCTTGCAT CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC 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CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTGATAATTTAAGAACATATAATAATTCTTTCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACATGAATAAAAATGTCTCTAACATGTCAATTCTCCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TACAATTAAAGTATATGAAGCATTCAAAGATTTCT CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC ACTTTCACTGTAACAAGAAACGCCGACGGCAGAGGC CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TTATATTCTCCACGTTCATTATTTGTACAATATGA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TTCCATTCGGCGGCACGTTCGCTGGTTGGATCAAC CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC AATATAACACCAATGATTCCGGTATAAATCACTAA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC GTCTCTCCAGAAGAACAGGCCAAGCGAAATGAAGAT CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TTTAATGTTCTTTGTGCAGTCATTGATTCAGGTA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TTATCGTCTATAACTACTAGACCGTCATCAGTAAC CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC ATAATACGGTTTTGTAAGCCGTCTAATTCACGTG CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TCTATTAACAGCCCATTAACTGATCGACAAGGACG CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC ATTGCAAGCGGGTTTGATCGTGTTATTATAAGA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TTTATTTAGTCGTTTAGAAACCATGCGCCTCAAT CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC GTACTGGCCGACCAGACTACGGTACTTCCTGATCC CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC AAAACTTTCATTTGTTAAATTACGCATTTCATTTA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC ATAGTTAGAAGATTTACTCTAGGAGTTTATTGGC CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TGTAGCGAAGGCGAGGTTCCATAATGTATAAATTT CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC GTGCATGGTTTGCGCTTTGCAACCCTTCCGCTGA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TTGTGGTTATGCTTGTTCCTGTACGTGCTGTTACT CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TCATAACTCTATTCAAATTGCCAAAGTAAGCAATC CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TCAGTACAGCAGCTTTAATCTCTGCAATCGCCTTAGA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC CTCTAGCCCGTCATATTCTTCAACTACCCAATCTA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TTTTGAATGTCTGTTTCAGTGTCGAAACTTAGTAAT CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC GCATCTTCTGAATTAGCCACGTCTTCAAGACTGTT CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TCTAACTAGTTGAGGCGCTCTAGCTTTTATTTCAG CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC AACAGAAAACATGCACAGAAGAAACTGGAAAGCAG CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TCCTATACCTTGTCACAATTTCCTCATATGGCTC CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC ACACCTACACCGTACTGAGCACCATAGTGTTCAAC CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC CTTCCTGAATTAAACTTATTGTGTTAACTTTTTCA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TTGCTGATGCTTCTCTAGCTGCTGATTCTTGTAT CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC
>NZ_CP011105.1|WP_011212795.1|177618_178212_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MDTSSYKLPVNMIRQYCFCPRIVYYHMVVGLKVAYPGWVQYGEEYQHKQQVLDKRRTLSKFKPISEQAVLRQNTMLEHPSYPFYGICDGIIEDELEIIPIELKSFASKISLGQKMQLTAYGMLSELIFEKPCTRGYIITGEKAKAKLIKIDEKSKFKVIEICAKIKKIFGTETLPYSTANGLQCIQCEFLNHCNDRF >NZ_CP011105.1|WP_011212794.1|177338_177638_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MQIRLYKEYIVSYDIRDNSIRRTIYERLKDIGLTPVQKSVFWGYLNEPEKRYLTNFLKKELAKQDTAFITPCKLAQEYEVNLINLELDELRKPDGHIIV >NZ_CP011105.1|WP_027223966.1|176339_177332_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKHLTLSEQGSFCKLQGERILVFNKDQMVFEGTLNRLKTISIVKQGVTLTSNLLVACAMRGIQIFILDYSGKAVCSLQGGLHRTAKVRESQFKYIYTKEASNMAARFILAKIKNQSAVLKYFAKAKNRPENEKIILHAASQKMAGIVANITETNWIKLQDWRFTLLGFEGSAARIYWETVKEVNLVCSDFEGRRPRVNKDITNSMLNYAYSILSSWVWQAITNAGLELYAGILHTSKPGKPSLVLDLMEEFRPWCADRIIFKLHARAQKQNELTPALKKTLIGEMANLYAKPLPYHKRRISLESIIQRQVYHLSAVFSGEGKYKGYLFKW >NZ_CP011105.1|WP_038837027.1|172224_176343_+|type-II-B-CRISPR-associated-RNA-guided-endonuclease-Cas9/Csx12 MESSQILSPIGIDLGGKFTGVCLSHLEAFAELPNHANTKYSVILIDHNNFQLSQAQRRATRHRVRNKKRNQFVKRVALQLFQHILSRDLNAKEETALCHYLNNRGYTYVDTDLDEYIKDETTINLLKELLPSESEHNFIDWFLQKMQSSEFRKILVSKVEEKKDDKELKNAVKNIKNFITGFEKNSVEGHRHRKVYFENIKSDITKDNQLDSIKKKIPSVCLSNLLGHLSNLQWKNLHRYLAKNPKQFDEQTFGNEFLRMLKNFRHLKGSQESLAVRNLIQQLEQSQDYISILEKTPPEITIPPYEARTNTGMEKDQSLLLNPEKLNNLYPNWRNLIPGIIDAHPFLEKDLEHTKLRDRKRIISPSKQDEKRDSYILQRYLDLNKKIDKFKIKKQLSFLGQGKQLPANLIETQKEMETHFNSSLVSVLIQIASAYNKEREDAAQGIWFDNAFSLCELSNINPPRKQKILPLLVGAILSEDFINNKDKWAKFKNFWNTHKIGRTSLKSKCKEIEEARKNSGNAFKIDYEEALNHPEHSNNKALIKIIQTIPDIIQAIQSHLGHNDSQALIYHNPFSLSQLYTILETKRDGFHKNCVAVTCENYWRSQKTEIDPEISYASRLPADSVRPFDGVLARMMQRLAYEIAMAKWEQIKHIPDNSSLLIPIYLEQNRFEFEESFKKIKGGSSDKTLEQAIEKQNIQWEEKFQRIINASMNICPYKGASIGGQGEIDHIYPRSLSKKHFGVIFNSEANLIYCSSQGNREKKEEHYLLEHLSPLYLKHQFGTDNVSDIKNFISQNVANIKKYISFHLLTPEQQKAARHALFLDYDDEAFKTITKFLMSQQKARVNGTQKFLGKQIMEFLSTLADSKQLQLEFSIKQITAEEVHDHRELLSKQEPKLVKSRQQSFPSHAIDATLTMSIGLKEFPQFSQELDNSWFINHLMPDEVHLNPVRSKEKYNKPNISSTPLFKDSLYAERFIPVWVKGETFAIGFSEKDLFEIKPSNKEKLFTLLKTYSTKNPGESLQELQAKSKAKWLYFPINKTLALEFLHHYFHKEIVTPDDTTVCHFINSLRYYTKKESITVKILKEPMPVLSVKFESSKKNVLGSFKHTIALPATKDWERLFNHPNFLALKANPAPNPKEFNEFIRKYFLSDNNPNSDIPNNGHNIKPQKHKAVRKVFSLPVIPGNAGTMMRIRRKDNKGQPLYQLQTIDDTPSMGIQINEDRLVKQEVLMDAYKTRNLSTIDGINNSEGQAYATFDNWLTLPVSTFKPEIIKLEMKPHSKTRRYIRITQSLADFIKTIDEALMIKPSDSIDDPLNMPNEIVCKNKLFGNELKPRDGKMKIVSTGKIVTYEFESDSTPQWIQTLYVTQLKKQP >NZ_CP011105.1|WP_136643093.1|171428_171749_+|hypothetical-protein MMNDLAKILSLKNLLTKNNLNPSENFENIYSQITDDGLKKEIESRIIDYFSKLSLPEHVTIYDQLLLSLREKDAISHSNGIYFYLTHIKEIVILFHCLRYFSCMVM >NZ_CP011105.1|WP_042754844.1|168606_170622_+|M3-family-metallopeptidase MSTTVGLPQFSHIKIEHFKSHLDALLKNHLEEIDRLLKENHHYTWDNLIYPLDSLADELERFWSPFAHMHAVMDSEAIRESYEACLPLLSAYDAAIGHNQDLYEAIKSIDQHSLNPAQKKIIADSIQDFELSGVALSKANKKRFEAIQSRLAELSSKFENNVLDATHAYTIHITEAERVEGLPEHALNTAKELAHEKGLDGFVLTLEYPCFQAVITHAEDRALREEMYRAYITRASDQGPNAGTFDNTPLIDEILSLRHEKAELLGFNNFAELSLATKMAASTNQVTEFIYDLISRTRDKGKAEFRQLEVFAQDKWNLSPVNPWDVAYLSEKRRQDLYSLSQEELRPYFPQPKVMQGLFAIVKKLFGMSIEEIEGVDVWHKDVQCYCIVDESNQTRGYIYTDLFARPHKRNGAWMDSMQSRRKLEDGTVQLPIATLTCNFAKPSANRPAMLSHDEVVTLFHEFGHCLHHVLTQVDYLSGSGINGVEWDAVELPSQFFENWCWDEHALSLLTSHVDTGETLPSALYERLIAAKNFQSAMAMLRQMEFALFDFRIHQEYQTGKASYVANILADVRSKTSVVPIVPYNRFQHSFSHIFGGGYAAGYYSYMWAEVLSSDAFARFEEEGIFNPKTGHDFLKSILEAGGSRKAADAFVEFRGRPATIDALLRHNGIL >NZ_CP011105.1|WP_042754843.1|167172_168507_+|hypothetical-protein MTPIISHLLKIFPELNTQVKTDSLNWTFNTHLKQLGPDFYSKVARLHPILNMEYSVLCQRLRYNLSAPDYSSPEQIKEQLIDALKLAELLEYTYQHYLVVPREVVRLRRHKAIYRELLTELSGYSFALDNPEPESLKTSLSLTQAIREKTAQSNWYRIFISRSKRVINLLDNLDTGSKAFRDFVVLLDKYTNPFLAYLGWCFFAPRLFTNLFLILKHTIPGEWMGEKEKSLDWSDRFYAHLQRRWFELANDSVWFTVGILNCFVLVGALAPLSVYLSLFAFVFDVANTSLRAYIDIGRLQQLQKEYGELFDQEENEDQKKIIKEYQDSISYRIKFEILRSFLSVGGAVAVVIAMALSVPALGIINPVIPLIGAVLLLALWGVSLYLNNKLDEYRPVDNIEKPAPSVINKLSFFAPKNEKKESLHLSSKPEKDLEAEELIPTFTF >NZ_CP011105.1|WP_042754842.1|164908_166915_-|transketolase MNSFTELANAVRMLSIDAVNQAQSGHPGMPLGMADIATVLWKKFLKFNPRNPHWFNRDRFVLSNGHGSMLLYSLLHLTGYNLDISELKNFRQLHSKTPGHPEHGHTPGVETTTGPLGQGLANSVGMALAERVLASHFNHDHYNLVDHYTYTFAGDGCLMEGISHEACSLAGTLGLGKLIVFYDDNGISIDGKVESWFTDDTTSRFKAYNWQVIGPIDGHDADQIEQAISAARENTNQPSLIICKTVIGLGSSVAGSEKAHGSPLSAQDINNVREFFNWKHAPFEIPDSIYKQWDHREQGEKEEQQWLQLLHEYQQQYPSEHDEFLRRANGDLPDDWQEISAGFLKQCLDNEKAIATRKASQQCIEFFAPILPEMFGGSADLTGSNNTDWSGSKAITAHNFSGNYLYYGVREFAMAAIMNGLAVHGGFIPYGGTFLVFADYARNAIRLSALMKQRVIYVLTHDSIGLGEDGPTHQPIEHIAMLRMTPGMTVWRPADLMETAVAWQQSLEHHNGPSALLLSRQNLPALAHGADAADLIKKGGYIIADCEGKPDAILIATGSEVQLAITAAEKVKARGLHVRVVSMPCAERFLAQSDDYKNQVLPGHVRTRIAIEAASSAYWHQFVGFDGAVIGLDCFGVSAPATDAFNYLGITVEKIINTLDTLTKQTMV >NZ_CP011105.1|WP_027225352.1|163834_164827_-|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MTIRVAINGYGRIGRCILRSIFEYNRQNEFEVVAINDLSGIDVTAHLTRYDSTHGHFRSDVSIEGNMLIVDGHGIQVIAERDPAKLPWKQLDIDIVFECTGFFTSRDAAMGHINAGAKKVLISAPAKGVDTTVVYGVNHSVIKTSDVIVSNASCTTNCLAPVVKVLNDAIGIESGLVNTVHAYTKDQMLLDGSHKDLRRARSATQSIIPTKTGAAAAVGLVLPELAGKLDGFAMRVPVLNVSVVDLTFQAKRATSVEEVNDIMRKAKSRILQINEDPLVSCDFNHNPASAIFDTTETKVIGNLVKVVAWYDNEWGFSNRMIDTAHQMMNC >NZ_CP011105.1|WP_042754841.1|162633_163824_-|phosphoglycerate-kinase MNLFKMSDIDLSGKRVLIREDLNVPIKDGMITSDQRLQAALPTIKSALDSGAAVIVLSHLGRPEEGKYEKKFSLEPVADYLRKNLEYPVCFVKDYLSGVDVKPGELVVCENVRFNPGEKANDEALAKKLASLCDVFVMDAFGTAHRAQASTYGVAQYAPVAVAGPLLIRELEALNQVLKAPKKPIVAIVGGAKVSSKLSLLKQLVGMVDVLIPGGGIANTFLKAQGFEIGISLYEPDLLDEARHILILAKEKGCQIPLPTDVVVGKTFSETCPAFNKSLSNVAEDDMILDIGPETIRDYVDLIHEANTIIWNGPVGVFEFPQFAYGTRAIAIAIAESDAFSIAGGGDTLAAVDLYDLNQQISYISTGGGAFLECLEGKTLPAVAILQERAKHVKTN >NZ_CP011105.1|WP_021437110.1|181540_181978_+|DUF45-domain-containing-protein MIDDSKAKPQVKLVRGQLQIIASRNIEHRRQLLSDWYKQKAFEVFSKRLDQLLSTAPWIKECPSINLRAMRSRWGSCAVNGKITLNTHLIKAPIACIDYVILHELCHHFEHNHSDKFYRLLNQVSPNWKQVKQYLDKAANLYLMT >NZ_CP011105.1|WP_080443270.1|181967_182651_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MTELNIKKEIGKRILEARKAKGLTLKALGELAGGLKQTRLTNWEQGVRTPGPEEIKSLARALDVSPAYLMCLSDELQFKEAKNPSQLIPLLDYQQACEAKVHTGGEASCGKVFISVSTSLQPELSTDAFALKITDDSMMPEIRINDVLVIEPSVLPEPGDFVAVKINGKPETIICQYKKLSYTSSEFELLTLNDNWPNIKVSDDINVKIIGVLVQNLRCYKSPKVKS >NZ_CP011105.1|WP_011212797.1|182803_183673_+|hypothetical-protein MMDFVINGDELEAMSGLPHFQQLTYLRGIRPYMDVKTGIVGIKRRISHQSISEQLYVEPHQGIKSQNFSRDQVRRSVSGLVRAGLIEVQSEGMHLILKCLLASSHYSAQNKAAINPPQKATIKPRGESLENTGLTEFEALKADTVESQKAAIPHKDNYYIYLLSQFEKFWSLYPEKKSKNNAQAVFEELKPNAELCHTIINALTAQINYRDTMKLQGTWVPPWKYPANWLAQRCWEDELPTDALQEKNHAEHTKNTRKRHATEDLFCPPCDVKDREHNNVIQLQRYLQS >NZ_CP011105.1|WP_021437111.1|183638_184001_+|hypothetical-protein MSSSSKDTFKAERRIDLLFSKFAAFYGHVWRSQFKDEVFLKFAKKEWQEALADFTDMVLTRAILNCREFYELPPTLPQLLYCCRQIRKQESFYVVKDVYQPANKAVVSSCLQKCKELLAK >NZ_CP011105.1|WP_027224704.1|184013_184217_+|carbon-storage-regulator MLVLTRKAGQQILIGKGLIQMKVLKVDDDIISIGIKAPQHIDIDREEIYLKKLQQEHAESSMQKVAP >NZ_CP011105.1|WP_014843090.1|184213_184504_+|TrbC/VirB2-family-protein MSKLKRWSQSLGNLYLIAVCTLLPTLSHAQSIESIINRTINYLQGGLARTVGVFCIIIAGYLCLARQKFPKEYFVMILVGMGIIFGGSSLYSTLIG >NZ_CP011105.1|WP_032829408.1|184513_184795_+|hypothetical-protein MSDLEISPIFNALTRPAMTAGVTFEYHMLNLIVSMCAFIGFSPLYGLIFIPLHVFGWLVCRYDTHFFTICAKRFLLPQAPNTSLWRVRAYEPF >NZ_CP011105.1|WP_061391341.1|184781_187262_+|VirB4-family-type-IV-secretion/conjugal-transfer-ATPase MNLSKTLKHVYQEAKVSDLFPVTHLNSPSIFESQSGLVGSVIKVNGAAFEIEEAETLNHQRFLLHQALVSLDSRFIIYVTTHRQKISCPLIGEFKQGFAKDLDERYQQRFKDKNLYKNTLYITVVLKGDDTSKTGSWLQWAKSLSIKGNSELSEHHREQNIQTLNRVVEQLQANLNPFGATILGMQDEELGFSELLQFLGLVVNAGQTISFKHPVYSPPIANSIPQTFKQEIKYPEGHLGQYLSTCQLLFGECIQFQGNTQKDCVFGTMLSLKKYPTNTASILLDSMLSLDCEFISTHTFAPIGRDSALDTISKKRSKLLSAEDKALSQTTALSDLEDGVASETLLLGAHHHTVMLLAPNKSLLDAAILEATKRYGSAGIVVVKETLGQEPAFWSQLPCNQHFITRAALITSQNFVDFCPLHNTQTGFSNENFLGGAVTLLETPSKTPVYFNYHARGSNTNPSKGHAAIFGGNNAGKTTLVNFLDAQMGRFGGRSFFIDRDESSKIYILASGNSSYIKIEPSNPIAMNPLQLPDTSENRSFLKSWFATLVQEESERVIPSHIAEVINDCIDYSFEQLAPKFRTLSHLSQFLPVDFPRWPHLKRWLKRNDSRIDGEFHWFFDNQHDALNLDFDKVGFDVTYLMDQVQSVIATPVYLYLLHRMRQYLDGRLTSFIIAEAWQLFASPFWEKALREWLPTIRKKNGHFIFDTQSPKTITDSPIKHIVLDNLATLIAFPNPLADRETYMEHLKLTEAQFEAIRENTPESRIFLYKQDHEAFLCKLDLSGLSQYIRVLSANTQSVKLLDDIIEEVGQEPELWLPVFFERSKK >NZ_CP011105.1|WP_061391342.1|187258_187969_+|hypothetical-protein MKRTACFLIAALSLSSVSHADILGVEDAQLILLAMKQLSELQEQYRVLSDTYQTARSQLDNLNQLKSMNSGHYGFGDFNNSLDSLQSWQSPVSTWQDALQNLSGGNQQRYQALMEAYEKNHPALDEASYSRFTTPANAMRFKEDKAVNRAVMVQTTESYNEINKHMEALHKLSQQIEKTPNTKGAIDLNSRLITEIGFIQLMSLRLQALISQQAAQENLSALQDRAEMAKFNRLPK >NZ_CP011105.1|WP_027224707.1|188126_188522_+|hypothetical-protein MNTLIKGLMVGVMAVTIIACHHENPLKTRPAKASVTFLINASANAEKRLHFAIHKDAYGFAYLECMEGKQSSEINCGALYQGMIAFAKEGHYSGFQTITQADLTEQKVFESLADEYAETAATSFPHFVSGS |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP011105_1 | 1.6|178821|30|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT | 178821-178850 | 30 | MK250029 | Prevotella phage Lak-C1, complete genome | 228333-228362 | 6 | 0.8 |
| NZ_CP011105_1 | 1.6|178821|30|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT | 178821-178850 | 30 | MK250016 | Prevotella phage Lak-A1, complete genome | 264506-264535 | 6 | 0.8 |
| NZ_CP011105_1 | 1.6|178821|30|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT | 178821-178850 | 30 | MK250019 | Prevotella phage Lak-A2, complete genome | 185640-185669 | 6 | 0.8 |
| NZ_CP011105_1 | 1.6|178821|30|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT | 178821-178850 | 30 | NC_013940 | Deferribacter desulfuricans SSM1 megaplasmid pDF308, complete sequence | 110137-110166 | 7 | 0.767 |
| NZ_CP011105_1 | 1.6|178821|30|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT | 178821-178850 | 30 | LR588166 | Pseudomonas phage vB_PaeM_MIJ3 | 151907-151936 | 7 | 0.767 |
| NZ_CP011105_1 | 1.6|178821|30|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT | 178821-178850 | 30 | MH121069 | Pseudomonas phage vB_PaeM_PA5oct, complete genome | 268443-268472 | 7 | 0.767 |
| NZ_CP011105_1 | 1.6|178821|30|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT | 178821-178850 | 30 | MH552532 | Siphoviridae sp. isolate ctbf3, complete genome | 25843-25872 | 7 | 0.767 |
| NZ_CP011105_1 | 1.36|180971|34|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 180971-181004 | 34 | MG945230 | UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 1223-1706, complete genome | 5377-5410 | 7 | 0.794 |
| NZ_CP011105_1 | 1.6|178821|30|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT | 178821-178850 | 30 | NZ_LR214986 | Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13 | 155110-155139 | 8 | 0.733 |
| NZ_CP011105_1 | 1.6|178821|30|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT | 178821-178850 | 30 | MH552537 | Inoviridae sp. isolate ctci486, complete genome | 4928-4957 | 8 | 0.733 |
| NZ_CP011105_1 | 1.6|178821|30|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT | 178821-178850 | 30 | MH622943 | Myoviridae sp. isolate ctbc_4, complete genome | 350546-350575 | 9 | 0.7 |
| NZ_CP011105_1 | 1.30|180540|35|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 180540-180574 | 35 | NC_041917 | Serratia phage BF, complete genome | 119260-119294 | 9 | 0.743 |
| NZ_CP011105_1 | 1.30|180540|35|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 180540-180574 | 35 | MT939487 | Erwinia phage pEa_SNUABM_47, complete genome | 118545-118579 | 10 | 0.714 |
| NZ_CP011105_1 | 1.30|180540|35|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 180540-180574 | 35 | MT939486 | Erwinia phage pEa_SNUABM_12, complete genome | 119288-119322 | 10 | 0.714 |
| NZ_CP011105_1 | 1.30|180540|35|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 180540-180574 | 35 | MT939488 | Erwinia phage pEa_SNUABM_50, complete genome | 118425-118459 | 10 | 0.714 |
1. spacer 1.6|178821|30|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK250029 (Prevotella phage Lak-C1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tgataatttaagaacatataataattcttt CRISPR spacer agataatttaagtacatataataagtatga Protospacer *********** *********** * *
2. spacer 1.6|178821|30|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK250016 (Prevotella phage Lak-A1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tgataatttaagaacatataataattcttt CRISPR spacer agataatttaagtacatataataagtatga Protospacer *********** *********** * *
3. spacer 1.6|178821|30|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK250019 (Prevotella phage Lak-A2, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tgataatttaagaacatataataattcttt CRISPR spacer agataatttaagtacatataataagtatga Protospacer *********** *********** * *
4. spacer 1.6|178821|30|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_013940 (Deferribacter desulfuricans SSM1 megaplasmid pDF308, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgataatttaagaacatataataattcttt CRISPR spacer ttataatttaagaacatataagaagaataa Protospacer * ******************* ** *
5. spacer 1.6|178821|30|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT matches to LR588166 (Pseudomonas phage vB_PaeM_MIJ3) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgataatttaagaacatataataattcttt CRISPR spacer acataatttaaaaacatataaaaattatga Protospacer *********.********* **** *
6. spacer 1.6|178821|30|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH121069 (Pseudomonas phage vB_PaeM_PA5oct, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgataatttaagaacatataataattcttt CRISPR spacer acataatttaaaaacatataaaaattatga Protospacer *********.********* **** *
7. spacer 1.6|178821|30|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH552532 (Siphoviridae sp. isolate ctbf3, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgataatttaagaacatataataattcttt CRISPR spacer taataatataacaacatataataatgttgg Protospacer *.***** *** ************* .*
8. spacer 1.36|180971|34|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MG945230 (UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 1223-1706, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
ttgctgatgcttctctagctgctgattcttgtat CRISPR spacer atgctgatgcttctcttgctgctgactctgttga Protospacer *************** ********.*** *.
9. spacer 1.6|178821|30|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR214986 (Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgataatttaagaacatataataattcttt CRISPR spacer ttctaatttaagaacatctaataagaactc Protospacer * ************** ****** .*.
10. spacer 1.6|178821|30|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH552537 (Inoviridae sp. isolate ctci486, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgataatttaagaacatataataattcttt CRISPR spacer cgataatataataacatataataaaaagat Protospacer .****** *** ************ *
11. spacer 1.6|178821|30|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH622943 (Myoviridae sp. isolate ctbc_4, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tgataatttaagaacatataataattcttt CRISPR spacer aattaacttaagaacatatattaattgcaa Protospacer . ***.************* ***** .
12. spacer 1.30|180540|35|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_041917 (Serratia phage BF, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
gcatcttctgaattagccacgtcttc-----aagactgtt CRISPR spacer tcatcttctgaattagccatttcttcttgagaagg----- Protospacer ******************. ***** ***.
13. spacer 1.30|180540|35|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT939487 (Erwinia phage pEa_SNUABM_47, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
gcatcttctgaattagccacgtcttcaagactgtt CRISPR spacer tcatcttctgaattagccatttcttcttgagcagg Protospacer ******************. ***** ** ..
14. spacer 1.30|180540|35|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT939486 (Erwinia phage pEa_SNUABM_12, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
gcatcttctgaattagccacgtcttcaagactgtt CRISPR spacer tcatcttctgaattagccatttcttcttgagcagg Protospacer ******************. ***** ** ..
15. spacer 1.30|180540|35|NZ_CP011105|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT939488 (Erwinia phage pEa_SNUABM_50, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
gcatcttctgaattagccacgtcttcaagactgtt CRISPR spacer tcatcttctgaattagccatttcttcttgagcagg Protospacer ******************. ***** ** ..
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
970565 : 977401
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP011105|970565:977401|DBSCAN-SWA 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TATTCGTGACTTCAATTAAAGCGTCACTCACTGTTGCGTTTTCATTCGCTAAGGGAAGTTGCTCTCCTGTATGACATAAATCGTCTATTTTTAGCAACAATTTTTTGCCAAGTGCGCCTCCAGGATGGGAAAGAGCGAAGTCCTCTGCACTAAATCCCCGTGCTTGTAAAAGAGATATAGCCAATGCATCCCCCATAACCAGCGATACCGTAGTACTGGTTGTTGGAGCAAGACCCAGAGGGCAAGCTTCTTGTTTAATACTGACATCCAGGTTGACATCGGCAGATTTAGCCAGAGTTGATTGTTTATTGCCGGTCAATGTAATTAAGGGGACTTCAAGCCTTTTTAATAATGGAAGCAAAGTAACTATTTCATGGGTATTGCCCGAATTGGAAATGGCAACAACTATATCCTGGCGAGTTATCATACCCAAGTCTCCATGACTTGCTTCTCCAGGATGCATAAAAAAAGCGGGGCTGCCAGTGCTGGAAAAAGTAGAGGCCAGTTTATTAGCTATATGGCCAGATTTTCCCATGCCTGTGACGACGATACGCCCTTTGCATGATAAGAGTAATTCACAAGCTTTTTCAAAATGTTCATCAATTCGTTGAGTTAGCTCAAATACAGCTTGTGCTTCAGTTTCAATAACTGCTAGTCCAAGTGTGCAAAAGTTCATAGGTCATTGAGTCGTAATTTTGTTTGGTTTTCATTCTAACATAATGTATTTAAATGATGTACCCTATATTTCAGTAACTGATACCAACTAATGGCTTATAGCATTATTATTTGTTAAAATAACACTCAAGTTGAACTTAAATAATAAAAAACGTCTTTTATTTAGACTTTCCGATTAATTTTTGAAAAATTGGTATTGTAAAAAACTTTTAAAAGTTTTTTTTAATGGAAACGCAATTATTAAACACATTTTTATTTATCCAGTATATACTTCTTAATTAAAGATATAATAAAGCATTACCTGTCTTTGATAGATATCAAACTGACATCATTACCCGTTAAAATAATAAGTGGATAATAAAGCATGCCTGATAATTGGGTTGAAATAAAAAATCTATTCTTTAGCCTTGATGATCGCTGCATTTTTGATGGCATTGATATGGTAGTTAAACAAGGCAAGATTACTGCTATTATGGGACCCAGTGGTTCTGGAAAGACTACTTTACTGCGGTTAATTGGTGCGCAATTGAGGCCTGATAGTGGCCAAATTTATGTTAATGGTCAGAATATTCATCAATTATCCCGCAAGTCACTTTATGAAACCAGACGAAACATGGGATTGCTTTTTCAAAGTAGTGCCTTATTTACACACCTTTCAGTATTTGAAAATGTTGCCTTTCCATTAAGAGAACATACTGAATTAAACGCGTCCATGATAAGAAACATTGTATTAATGAAGCTCGAAGCGGTTGGTTTGCGTGGCGCTGCCCATCTAATGCCCGCTCAATTATCAGGGGGAATGTGCAGGAGAGTTGCATTAGCCAGAACCATTGCTCTTGATCCTGTATTAATGATGTATGATGAGCCTTTTACCGGTCAAGATCCAATTTCCATGGGGGTATTGGTCAGATTAATACAACGATTGAATCAATTATTGCATACCACCACTATTATCGTATCTCATGATGTTGAAGAAACTTGTTCAATTGCAGATTATATCTACTTAATATCAGGGGGTAAAATTATAGGTCAAGGTACTCCGGATGAATTAAAGCGATCTATTGAGCCTCAGATAAGACAGTTTATGCATGGAGAAGCGGATGGGGTAGTGCCTTTCCATTATCCGGCAAAACCGTATACAGAGGAGTTATTAAATGCTTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP011105|970565:977401|976603_977401_+|WP_010946577.1|DBSCAN-SWA MPDNWVEIKNLFFSLDDRCIFDGIDMVVKQGKITAIMGPSGSGKTTLLRLIGAQLRPDSGQIYVNGQNIHQLSRKSLYETRRNMGLLFQSSALFTHLSVFENVAFPLREHTELNASMIRNIVLMKLEAVGLRGAAHLMPAQLSGGMCRRVALARTIALDPVLMMYDEPFTGQDPISMGVLVRLIQRLNQLLHTTTIIVSHDVEETCSIADYIYLISGGKIIGQGTPDELKRSIEPQIRQFMHGEADGVVPFHYPAKPYTEELLNA >NZ_CP011105|970565:977401|972346_972925_-|WP_014841227.1|DBSCAN-SWA MLLIIDNYDSFTYNLVQYFQSLNQKVEIFKNDEIQIDTIRQSAPQYLVISPGPNSPDESGISIEVIKEFHKHIPILGICLGHQCIAQAFGGKIIPAPEIMHGKTSEITHHYQGLFTGIPNHFQATRYHSLAVDIMSLPNCFSIDAWADDTIMAISHRQFPLFGLQFHPEAILSQFGLQILENFLRYETQTSI >NZ_CP011105|970565:977401|973680_974190_-|WP_041174037.1|DBSCAN-SWA MTQLKVKYIILLLLMLCSISGNALPFDKEKMVQVVSDSADLNQKNHQGVYIGNVEFVQGSTNLRAEKAITQGDAKNQLTLAVAEGSKDKQAHYWTTTAPDKPPFHAYADTIKYYPLKHLIELIGNARIEQGSNSLSAAKISYDTQEQHVLSHSDEKTRTTIIIYPEKKS >NZ_CP011105|970565:977401|971334_972369_-|WP_014841226.1|DBSCAN-SWA MKPKLLFEQLLSRQDLSSDQMQEVIHACMTGEFSDVQIATFLALMRMKGETVNELTAAAQVMRQLAHKIDLGNPLIDIVGTGGDGRNTFNVSTACSFVVAAAGIKVAKHGNRSVSSRSGSADLLEQAGFILNLSDSQVQNCINQCQLAFLFAPHYHPAMQHARAARQQLGIRTLFNLLGPLINPAQVKRQVVGVFSTNWLKTIATVLANLGSERSLVISSQDGLDEISIAAKSEVVEYRDGNFKQWFISPEDYGLKHSSLDAIIVDSPEQSLHLIQSVLSGDSGPARDIVLLNSAAAIYCAKDGISFDASIEEARIAIDSGKANHCFNKLRLLTQTLNKESNHE >NZ_CP011105|970565:977401|974736_975264_-|WP_011213328.1|DBSCAN-SWA MNELLEKAKKIKCLICDVDGVLSDGLLHIDNHGNELKSFHVQDGMGLKLLMAAGIQVAIITTAQNAVVDHRMEQLGITHYYKGQVDKRSAYQHLKKTLGLNDDEFAYIGDDLPDLPLIQQVGLGVAVSNAVPQVLEFADWRTERTGGRGAVRELCDLILNAQNKAELAITGYLKQ >NZ_CP011105|970565:977401|975277_976240_-|WP_010946576.1|DBSCAN-SWA MNFCTLGLAVIETEAQAVFELTQRIDEHFEKACELLLSCKGRIVVTGMGKSGHIANKLASTFSSTGSPAFFMHPGEASHGDLGMITRQDIVVAISNSGNTHEIVTLLPLLKRLEVPLITLTGNKQSTLAKSADVNLDVSIKQEACPLGLAPTTSTTVSLVMGDALAISLLQARGFSAEDFALSHPGGALGKKLLLKIDDLCHTGEQLPLANENATVSDALIEVTNKKLGMTCVVDNHGYLVGVYTDGDIRRTLTRQFNINTTLIKDVMTKNCRTISKGMLAAEALAIMQKYSITSLVVVENDNRPYAVLHLHDLLKAGVF >NZ_CP011105|970565:977401|974170_974740_-|WP_010946574.1|DBSCAN-SWA MNITKQAIWLFLTLLILAGSGWYYAHFNQAIINKKSLSNEVDTTISQLTVKQFNSEGVLINLLTTPQVEYIPNNNLHLLKNPHIIIKQDNQPAWEINSLRAKSFDGGKQITFIEQVVVHQNPGESTRESTLKTEEITYYPKEKKATTSLFVTFEQPGNIIQSTGMNAYLDEKRVELLHKARGSYDPAKG >NZ_CP011105|970565:977401|970565_971342_-|WP_011945950.1|DBSCAN-SWA MNSILERIAKHKLEEVAVAKKNKPLHVLSKQQPGEIRDFITALKSNTSPAVIAEIKKASPSKGLIRKDFNVAEIAKIYTQNGARCLSVLTDIEFFQGHPDYLALAKSKTTLPVLRKDFIIDSYQIYESLVLGADCILLIVALLDDVQLMDFCQLAQELKMSVLVESHTQDELERALRLPTPLIGINNRSLHNFKTDIQLSIQLKQFVPKDKIIITESGINTREDIKLMQSHGINAFLIGESLMRADNIGKALQKLMTD >NZ_CP011105|970565:977401|972958_973684_-|WP_010946572.1|DBSCAN-SWA MSLLEAKQLKKSFKGRTVVNGVSIHIKQGECVGLLGPNGAGKTTCFYMIVGLQSCDEGHIILNGTDITQDAMHLRARHGISYLPQEASVFRKLTVAENIMAILELRKDLDDQKREEKLDLLLQEFHISHIENSLGMALSGGERRRVEIARALAIEPSFILLDEPFAGVDPISVIDIKKIILHLCDKGIGVLITDHNVRETLDICERAYIVSQGKILCEGTPKAILANQQVRQVYLGEEFAL |
9 | Acinetobacter_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_2 |
1126045 : 1132364
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP011105|1126045:1132364|DBSCAN-SWA TATGTGCGGTCGATTTGCTTATATTGCTTCTTATGACAAGCTAAAATACCAATTTCATCTAGCCAATGCGATTGAAATTCCTCCGCGCTTTAATATTTCTCCAGGAGCTGATGTAGTATGTCTTGTTGAAGCCGTTGGTCATGAAATTCAATGCGTATTATTGCGTTGGGGACTAATTCCCTCGTGGACAACGGACAGAAAAAAATTAGGAAATCTCATCAATGCACGCGCCGAAACAGTTTTTGAAAAGCCGACTTTTCGTCAGGCAATAAAATCGAAACGCTGTTTAATCCCTATGAGTGGCTTTTATGAATGGCACCAAGAGGATGGTGTAAAACAGCCTTATTTTTTTCAAAAAAAGAATCATGATTTGCTGGCTGTTGCTGCTATTCGAGATACCTGGCAGCAGAACGAAGAGGTGATTCATTCCTGTTGCCTGATTACTACGGATGCTAATGCATGGATGCAACCAGTGCACAATCGTATGCCGGTGATTTTAGGTGAAGAGGCTCAAGCCATTTGGCTTAACAACACGCAATGTGATAAAGCACAATTAATGGCGTTAATGAAACCTTATCCTTATGAGGATTTGGAAGGGTATCGAGTGACTACTTTAGTGAACAAAGCCAATTTTGACCATCCATTGGCGATGGAGCCATTATCTGAATAAAAAATTTAAAAATAATTTTCTTAATATTTTCGAAGACTTAGTGTTGATTTCAACTCATGTTGTTCTGAGGCGGGATTTACAGCTTATTTTTCCTTGTCTATGATATTTGTACGTAAATCAAAAAAAGAATCATCATGTCACCACGAGGCGGAAAAAGAGTAGGGGCGGGTCGCCCAAGGGGTGAGCCTACCAAAGCAGTTCGTATATCATTATCTCAACTTGCTGAATTAGAGCGTCTAAAGAGTCATGTATCGTATCAATTGCCGGTATTTGCTAGCAAAATTCAAGCAGGATTTCCATCACCGGCCGATGATTACATCGAGGGGTATCTTGATTTAAACACCAAATTTATTAAACACCCATCGTCTACCTTTGTTTTGCAAGCCACAGGGGAGTCTATGGTGGATGCTGGAATTTTTTCTGGCGACTGGCTGTTAGTCGATAGAAGCATAGAACCTTCGGATGGACGCATTGTCATTGCAGCTGTGAACGGTGAGCTTACAGTTAAACGCCTTTCGAAAAAAGGGGGAAGGGTGCAATTACTTCCTGCTAATCCCAAATTTCAACCCATTGACATTACAGAGGACAGTGAGATGGTGATTTGGGGAGTGGTGACTTTGGTTCTACATGAGCTTGCCTGAGATGTTTGCCCTTATCGACTGCAACAATTTTTACGCCAGTTGTGAGCGTTTGTTTCGTCCTGATTTAAAGGATGTCCCTATCGTGGTGCTATCCAATAACGACGGCTGTTGTATCGCACGCTCGAATGAAGCCAAAGCATTGGGCATTGCCATGGGCGAGCCATACTTCAAAATTAAACATTTGTGCAAACAGCATGGCGTGAAAGCTTTTTCCTCAAATTATACGTTGTATGGTAACATGAGTCATCGCGTGATGTGCACTATTGAAGAAGCCTGGCCTCATATCGAAATTTACTCGATTGATGAAGCGTTTCTTGATTTAAGGAGTTTACCGGTTAACTCGCATGATTTGTTTTGCGAGCAGTTACAAAAGAAAATCTTGAAGTACACGGGAATACCCACTTCCATCGGCATTGGGCCGACCAAAACACTAGCCAAAGCCGCCAATCATTTATGCAAAAAAGTTTATAAAATCCCTGTGTTTAATATCACTTCGAGTCGTGAGCGGTTATTACAACAGATTTCCGTTGGGGACATTTGGGGAGTAGGGCGGCAATGGGCCAATAAATTAATTTCGCGAGGTATTCAGACGGCTTATGATTTGGCAATGACCAATCCTCACCTTCTGAAGAAATGTTTTAACGTTGTGTTGATGCGTACCGCCATGGAGCTTCAAGGAATTGCTTGTGGCGGTTTAGAGGCAATAGAGCCTAAGCAAAGTATTATGTCATCTAAAAGTTTTGGTCAGATGCAAACCCAACTTGCTTCGATTGAGGAATCAATCAGTAGCCATTGTGCCCGTGCGGTGGAGAAAATGCGTCGCCAGCAATTGGTGGCGAAGCGCATGGTTATATTTGTGCATACGAACCGATTTCGGGAAGATTTGGCTCAGCACTTTCAGTCCATCGAATTTAAGCTGATTAATCCTACAGATGATTTGCGCTTAATTACCAAAATAGCCAAACGATGTCTGCAACGCATTTTTAAACCAGGGTATTACTATAAAAAGGCAGGGGTATGTCTTGAAGATTTAATTCCTAAAAACCCACGACAGCTTGATATGTTTCATCAACCAAGTGACGAGCATCTAAACCACACGGAACAATTGATGGGTGTTTTTGACCAAATCAATCAAAAATACGGACGAAGTACAATCCGCCTCGCAGCAGAGGGTTATTCAAAACCTTGGGCGATGCGTGCTGAACTGAAATCGCCTGCCTATACCACACGATGGTCTGAGGTTCCGCAGGTTCGTTTATTTTGAATAGGGAAGGGATCTAGTTAAGGAGGGGGGGAGGGTTATTACAACTTGGAATTAGGCAGCACAGGCATTTGGGTAACGTCCAGACATGCCAACATCTCAAGCTTTGAAGGTATATCGCTGCCTCATCATATGCTCTGTACTCATGGTGGTATATGGAAAAACAAGTTAGAACATTAGAAACTTATTTCCATAAAATGATGGGTTTGTGAACACTCAAAATCGATGTTTAAAAATTTGTAATTCACAGCGAAAACCAATTCGAAAACCTTTTGCATTAATCAAAGTTCATTTTAATCTATTCTTTTAGTCTTTCTGAACCACAAGGAATAATAATGAGAATAGGGTATGCCAGAGTTTCTACACATGAACAAAATTTGGACTTGCAACTTGATGAACTTAAAGGGCAGGATGTGAGCAAATTTTTACAGATAAAATAAGCTGCTCCGTTTCCGAGCGACCTGGATTAGAAAAAATTGAAAATTTCCTTAGAGAGGGAGATGTTTTGGTTGTATGGCGTTAGACAGGTTGGGCCGACCACTAAAACATCTTATTTTATATGTAAGTAAGCTAGAAGATAAGGGAATAGGTTATCATAGCGTTACAGAAGCAATCAATACAGAAACACCATCAGGTAAGTTTATGCTTCATGTGTTTGGAGCTCTCTCTGAGTTTGAGCGAAACTTAATTAAAGAACGAACCCTTGCTGGACTTGAAGCAGCAAGAGCTAGAGGACGGCAAGGAGGAAGGCCTGAAAGCTAAGTGGTGAGCAGAAAGAGTTAGTAAAAATGCTTTACTCCAATAAAAAACACTCAATTCAATCAATTTGTAAAATGGTTGGAGTAGGAAAGACTACACTATATAAATATATTAATAGTAAGTGATAAATTATGTATAGTGATGAACAAATAACGGAAGCCCTTGCATCAAATAATAAGGAAGTCCTAGAAACTCTCGCTGTATATATATTGTTAGAAAGTCAAAATTTAGAATTTGATTCAAGGGATATAAAACCTGTTCCTCAGGATGATCCTCGAAGGTTAGATGTTATCTATAAAGATTGTAATTTTCAGATTAAAGAGATTATGAATTTACAACAAGATTGCCTGTTAGAGAATTATAATGGAGATCAAGGTGAGTGGGATAAATTAAATATTGGAATCTACAGAAGAAGTGATATATATAAAAGAATATTAAAGGGAGAGAGGTCAATAGGAGAGGTAGTTGATGGAGTTTTTTTCGATCTTGGATTGGCAATAAAAAAAGAAGTTGAGTCAGCTATAACAACTTACTCAGATATTTCAATTAGAAAGAATATGGATTTATTTTTATTTGTTACTCAGCCTCGAATTTTTTATGGGTCGACTGATCAAGTAAAGCAGCAAGTACAAAATAGTGGATTTCGAAGTATTTTTGCGCTTATTTACGATAAAAAATTTATAAATATACTTCAAACCAAAAATTCTCCATCTATCATTAAGCAATTTATTGAATAATGATTTCTTATATTTATAAAATCATATAGTTTGGTTACCTTATCTTTTCATTCCTTCGAATTTAAGTAAGGCTAAAAAGCTTGTGGTCCATTAGTTTCATCAGTTTTGTTTCTTCTGGTTCGAAGCTCATCTTACTAAAAATTGATTGCTGAGTTTGGATAATCATATTTAAACCAATACGAAGTAAAATTTTGTTCTCTGAATTATAACATAGGACCTAAAAGAAGCGTGCTAAATAGAAAAGCATACGTCTAGATTGTATAGTCCCAATCAGTTGGTCTGATCTCACCTGTTTGATAAAACTGTCTTATATTTTTAATATAATCTTGAAAATCAGAGTTTTGTTCAACAAGCCTATTAACTGTATCCCAATCAACCAGGGTACGTTCTTTTGCAGGGATTATAATTTGGCTTTCAGAGGGATTTTCTGCATCTAATCGCATAAAGCCAATTCCATGAAGACTCGCAAGCATTCGGAGTTCTTTTAAAGTTACAGATCCTTCAATTTCACCAGAAACCAAATAACCAAAATTAGCCCATGATGAATTGCTTACAGCTTGAAAAAATGCTTCTCTAACATTTGATTGATTTATAAGAAGTTTTACTTCGAAAGACCACAGCTTAGTTTTTTTGTCCGAGTAATGTTGTACGCAGTCTTTAACTTCTCGATTCCAGTCAGAGCTTAGGTTTTCAAGTCCCACTAAATCTGGATAAAGCCATCTGTTTCCATTTGGCCCCCTTTTATTTTTTGAACGTTTTTCGTCGATTCGCTTGCTGTATAGATTTAACTCTGTCCATAGAAATTCAGATAAAACTGGATATAAATCGTGTTCCTTTTGGGGGCTTTTGTCTTGATTTATTAGAGCAACGACTTCATTTTCTGCGTTTTCAATTTCATCTCTGTCTGTTTTTTCAGAGAAATAATATTTTCGCGGTCTACTTTCTGTAGTTTTGATATTTGGGTTTCTTTGGATTCGTGGTCTCTGAGCCCCAATTTCAGCAATAATTTGTTGAATAAGTGCATTATCATTATCCAGAGGATTTACTGTAGCAGTAGAGCGATTTTGCTTTTCACGACATTCATTGGGAAAATTCTCAAAAATCCACAAAGCAATTTCACGTGCGGTAAATTTTTCTTCAGGGTGATCAGCAAGGAATGTGGTTACAGTATTTGAGAGATTTAGGGCCATTTTTAAGTTTGTAGGTTAATAATGATAAAATTTTAGCACAAAGTGAAGCTAAGCCCCAAGCTGGGGCTTAATAATTAGAAAAAACATGAGTTTGACCATAATGTTCAACCGAAGAGTAATCATTGATAAAAAGATCCTGGGCAAAAGTCTCAAAATCAAAATAGCAGATCAAACAATCCGGCATTTGATGGGCATAACAGTCATCAAATAACTGCCTGGCAAAATCAACCTCTGAATCATAACAACCGTGGTAACGATCCTCCAACATGGTTTGGGCATCATCGACTGAATAATCACAGAGAAGGGCTAAGCCTAGCTCTCCGTGTTCTTGAATAAATGAGGCATACTCCGCAATGTTGTTTATTCCTTCATATTCATGAATTCTCATGCTGCCGAATCCTTCATAATCGTGTATGGCGTACTCTTCAGCATTGGGTTCTGGGCTGTTATCCAGCATTTCCCAGATTTCTTTCATGATGTCATCTTCGCTTTGTGTAGCATTTATCCAAATACCATGCAGGATGGCGTTATTGTATGATGCTAAACAGGCGACGTAGATTGAAGGGGTGTCCATGGGATTATCTCCTTGTATTAAGGGGGCAATCCCACATGGGAGCTTGCTCCCGTGGTTGGGTTTGATTAAAACGGAATTTCTTCTGAATCCGGTTGCAACATTTCACGCATCTGAGCCATGTGCTCTTCTGCGGTTTTGTTGCTGGATTCGTCAGCTGATTTTGGTGGGCTGAGAAGCTGAATGTGGCTAACAATAATACTTAAAGCTTGACGTGCTTTGCCTTCATTGTCAGTCCATTGATTGGAACGCAATTTACCTTCGAGGTAGACTTGTGAACCTTTCTTTAAATATTCAGCGACTTTAGTCAGCTTGCCAAAAAGCACCAGCTGATGCCATTCCACTCTGGTTTGCCATTCATCATTCTGCTTGAATGACTCATTGGTAGCCAAAGTGGCAGTGACAAAAGATTGTCCGTCTTTTCCGGCGATGCTTTTAGGATCAGCACCGAGATTACCTATTAATTGAACGCGATTTAAAGATGCAGTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP011105|1126045:1132364|1131369_1131876_-|WP_027265457.1|DBSCAN-SWA MDTPSIYVACLASYNNAILHGIWINATQSEDDIMKEIWEMLDNSPEPNAEEYAIHDYEGFGSMRIHEYEGINNIAEYASFIQEHGELGLALLCDYSVDDAQTMLEDRYHGCYDSEVDFARQLFDDCYAHQMPDCLICYFDFETFAQDLFINDYSSVEHYGQTHVFSNY >NZ_CP011105|1126045:1132364|1126848_1127355_+|WP_011215133.1|DBSCAN-SWA MSPRGGKRVGAGRPRGEPTKAVRISLSQLAELERLKSHVSYQLPVFASKIQAGFPSPADDYIEGYLDLNTKFIKHPSSTFVLQATGESMVDAGIFSGDWLLVDRSIEPSDGRIVIAAVNGELTVKRLSKKGGRVQLLPANPKFQPIDITEDSEMVIWGVVTLVLHELA >NZ_CP011105|1126045:1132364|1129506_1130112_+|WP_042755010.1|DBSCAN-SWA MYSDEQITEALASNNKEVLETLAVYILLESQNLEFDSRDIKPVPQDDPRRLDVIYKDCNFQIKEIMNLQQDCLLENYNGDQGEWDKLNIGIYRRSDIYKRILKGERSIGEVVDGVFFDLGLAIKKEVESAITTYSDISIRKNMDLFLFVTQPRIFYGSTDQVKQQVQNSGFRSIFALIYDKKFINILQTKNSPSIIKQFIE >NZ_CP011105|1126045:1132364|1126045_1126714_+|WP_013101291.1|DBSCAN-SWA MCGRFAYIASYDKLKYQFHLANAIEIPPRFNISPGADVVCLVEAVGHEIQCVLLRWGLIPSWTTDRKKLGNLINARAETVFEKPTFRQAIKSKRCLIPMSGFYEWHQEDGVKQPYFFQKKNHDLLAVAAIRDTWQQNEEVIHSCCLITTDANAWMQPVHNRMPVILGEEAQAIWLNNTQCDKAQLMALMKPYPYEDLEGYRVTTLVNKANFDHPLAMEPLSE >NZ_CP011105|1126045:1132364|1129129_1129378_+|WP_050598142.1|DBSCAN-SWA MALDRLGRPLKHLILYVSKLEDKGIGYHSVTEAINTETPSGKFMLHVFGALSEFERNLIKERTLAGLEAARARGRQGGRPES >NZ_CP011105|1126045:1132364|1130363_1131302_-|WP_027265458.1|DBSCAN-SWA MALNLSNTVTTFLADHPEEKFTAREIALWIFENFPNECREKQNRSTATVNPLDNDNALIQQIIAEIGAQRPRIQRNPNIKTTESRPRKYYFSEKTDRDEIENAENEVVALINQDKSPQKEHDLYPVLSEFLWTELNLYSKRIDEKRSKNKRGPNGNRWLYPDLVGLENLSSDWNREVKDCVQHYSDKKTKLWSFEVKLLINQSNVREAFFQAVSNSSWANFGYLVSGEIEGSVTLKELRMLASLHGIGFMRLDAENPSESQIIIPAKERTLVDWDTVNRLVEQNSDFQDYIKNIRQFYQTGEIRPTDWDYTI >NZ_CP011105|1126045:1132364|1129404_1129500_+|WP_080275907.1|DBSCAN-SWA MLYSNKKHSIQSICKMVGVGKTTLYKYINSK >NZ_CP011105|1126045:1132364|1127341_1128619_+|WP_027266380.1|DBSCAN-SWA MSLPEMFALIDCNNFYASCERLFRPDLKDVPIVVLSNNDGCCIARSNEAKALGIAMGEPYFKIKHLCKQHGVKAFSSNYTLYGNMSHRVMCTIEEAWPHIEIYSIDEAFLDLRSLPVNSHDLFCEQLQKKILKYTGIPTSIGIGPTKTLAKAANHLCKKVYKIPVFNITSSRERLLQQISVGDIWGVGRQWANKLISRGIQTAYDLAMTNPHLLKKCFNVVLMRTAMELQGIACGGLEAIEPKQSIMSSKSFGQMQTQLASIEESISSHCARAVEKMRRQQLVAKRMVIFVHTNRFREDLAQHFQSIEFKLINPTDDLRLITKIAKRCLQRIFKPGYYYKKAGVCLEDLIPKNPRQLDMFHQPSDEHLNHTEQLMGVFDQINQKYGRSTIRLAAEGYSKPWAMRAELKSPAYTTRWSEVPQVRLF >NZ_CP011105|1126045:1132364|1131941_1132364_-|WP_027265456.1|DBSCAN-SWA MTASLNRVQLIGNLGADPKSIAGKDGQSFVTATLATNESFKQNDEWQTRVEWHQLVLFGKLTKVAEYLKKGSQVYLEGKLRSNQWTDNEGKARQALSIIVSHIQLLSPPKSADESSNKTAEEHMAQMREMLQPDSEEIPF |
9 | Escherichia_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1363810 : 1369747
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP011105|1363810:1369747|DBSCAN-SWA TATGCACGAACAGTTTCTGCTTGCAGCACTTGAACAAGGCAAACTGGGGAGAGGCTTTTGTGCCCCCAATCCCAGCGTTGGGGCGGTTGCTGTGCAAAATGGTAATATTATAGCACAGGCATGGCATAGAGGTGCAGGTACACCGCATGCAGAACAATTATTGTTATCACAAATTCCACCCCAAACGCCAGGGGTTACGCTTTATGTCACACTGGAGCCTTGTAATCATTGGGGTAAAACTCCCCCTTGTGTTGATGCTATTATCAATCATGGTATACAGGAGGTTGTTTTTTCCTATTTTGACCCAAACCCCATTGTTGCCAAAAGTAACTCCTCAGAAAAATTACGTGAACATGGAATACAAGTCAGGCATATTCCTATAAAGGCAATTGATGTGTTCTATAAAAGCTATGCTTATTGGACTATGACCCATAAACCAAGAGTCACTGTTAAAATAGCACAAACTTTTGATGGTAAAATTGGAAAGTCTGAGGGAGCTCGAGTGGTTTTGTCCAATGCTTTATGCGAACAGTTCACTCATCAAATGCGCGCTGCCAGTGACGTCATATTAACCAGTGCCAAGACAGTTCAAATGGATAATCCAAGAATGAACGCCAGATTAGATAGTGGATTGGTAGCAAAGCCAGTTGCCATTGTTGACCGCAATTTAAGTTTGTCTGATGACACAATCATTTTTTCGACAGCAAAACATTGCCACATTTATCATCAACCACAAACAAATCAGGCAAAGACTTATCCTAATAGCACTCATTATGCGATGCCTTTGCAAAATGGGTTGATGGACTTGGAGGCAATAATAACTCATCTTGGTCAACTGGGATATCATGACGTATGGGTTGAGGCGGGCGGAGCTATTTTTTCTGCGTTACATAGTAAGGGATTGGTGCATAGAACCTATTTGTATTTAGTTCCCGGTAGTTTAGGGCATCAAGCGATTTCAGCTTATCAACAACAGGGGATTTTTGAAAAAGCTCATACGGTGAGTTGGCAAGCTATGGGTGACAATATGATAGCATGTTTGGATTGGCAGGAGGATGAGTGTTTACCGGATTGATAGAAAATACAGGCAAAGTATTAGTGAATAGGCAAGGAGAAAATTATAGTCGTTTAGTCGTTTCTTCAAGCTATCAGGATTTGAAACCTGGTGAGAGTATCGCTGTAAATGGGGTTTGTTTAACCCTTTTGCCAGCAGATTTTCCTGAACTGTGTTTTGATATTTCACCTGAGACTCTGCATGTTACCACATTGTCAAAATTATCATCTGGCGACATGGTTAATCTTGAAAGAGCTATGCTGGCATCAACCCGCTTTGGCGGTCATTATGTGTCGGGCCATGTAGACACCAGGGCCAAAGTGAAATCCATTCGTGCTGTTAATGAATTTATCGCGATGGATTTGGAGGGTTTTATCCCAGAACACAATCATTATTTAATACCCAAAGGTAGCATTACAGTAGATGGAGTTAGCTTGACTATTAATACTGTATCAGAACAAACCGTCGGACTCATGCTGGTGCCACATACATTATCAATGACCAATCTCGGTTCATTGAGAGTGGGCCAGCAAGTCAATATTGAATTTGATTATCTTACCCGTATTGTGGCTCATCAGCTTCAAATTATCGGGAAATTGAACCAAGAGGAAGTGTCATGAAACATTCATTAGCAACAATAGAAGAGGCTGTGGCGACACTTAAAGCCGGTAAAATGATTATTCTAATGGATGATGAAGATAGAGAGAATGAAGGTGATTTGGTGATTGCTGCTGAGCACGCTACTCCTGAAGCCATTAATTTTATGTCTCGTCTTGGTTGTGGTTTAATTTGTTTGCCTATGGCTGAAGAATTGATAGACAAACTCCAACTGCCCATGATGGCTCGGCATAACAAATCGCCGTATGGAACGGCGTTTACGGTTTCGATTGAAGCAGCTAACGGTGTCTCCACAGGCATCTCAGCAAGAGACAGAGCTCGAACAATTCAAGTGGCTATTGATCCAAAAAGTGGGCCATCTGATATCATTTCACCTGGACATGTTTTTCCTTTACGGGCTAGAAAGAGAGGAGTTTTAGAAAGACCAGGTCAAACAGAAGGTAGTGTTGATTTGGTAAGACTTGCCGGATTGACCCCGGCGGCAGTGATTTGTGAGATCATTAATGAAGATGGAACAATGAGCAGACGTGATGAATTAGCTCTTTTTTCAAAAAAACATCAAATACCTTTAGTCACCATTAAAGATTTGATTAATTACCGAATTCGTCACGAAAATCTTATTAATCCTGTCGCAACCACTCAGATTCCTCTGGAGGAGAATGGTGTTTTTACTATGACTGTTTTTGAGAATCAGATAGATTCCGGTGAACATTTTGTCTTGGTTAAACCCCCTTTGTATGGTAATCAAGTGCCTTTGGTTCGAATTCATTCTGAGTGCATAACAGGTGATGTTTTTGGCTCCAGAAAATGTGATTGTGGAAAGCAACTGGAGTTGTCTTTATCCCAGATCGGAGCTGAAGGTGGTATATTAATTTATTTGCGTCAGGAAGGCCGTGGAATAGGTTTGGCAAACAAATTAAAGGCGTATGCTTTGCAAGAGCAGGGGTTTGATACAGTCGATGCTAATCTGGAATTAGGATTGCCCGCTGACGATAGAGATTATGCCGTAGCATACCAAATACTGAAATATTTGGGGGTTGAAGCATTAAGGTTGCTGACAAATAATCCTTTAAAAATCGCTTCTCTTGAGCGTTACGGAATGAAAATTACTCAACGTATTCCTTTGGAAATTAAGCCTTCCAGAGAAAATCACTGTTATTTAAAAACCAAAAAAATAAAGCTGGGGCATTTATTAGCCATTGATTAGGATAAACATGAGAGAGATAAAAACAATTGTTAGTGATGGTGTCACGTTTCCAATAGCGCTAGTTGTAAGTACTTTTAATGAATTGATAACCTCTGCATTAAAAAAAGGGGCGTTAGACAGATTGACTGAACTGGGTTTTAAATCGGAGGACATTACCTTAGTTGAGGTTCCTGGCGCAGTAGAGATTCCGTTTGTTGCACAGTTGCTAGCGAAAAAGCAAAAAGTAGAAGTCATAGTGGCACTTGGAGCAGTTATCCGTGGTGAAACCTCTCATTATGATTACGTTTGTGATCAGGTCAGCCAGGGATGCCAAAGGGTTATGTTAGATTATAATATCCCGGTTATCTTTGGTGTATTGACTACTGAAAATGATGAGCAGGCTTTGGCAAGAGCAGGAGGAACTCACGGCCATAAAGGGAGAGATGCGATAGATTGTGCGGTTTCCATGCGTTCTATTAAACAACAATTACAATAGTTCTATTAATTTTGCTCAAATTTCTGTTATTTATATTTTCATTTTGATAGAATTGAATCCCGTTTACATGCAAATTTAATTGAACACCAAATTGGTGGATTCGGCATTTTGAGCGGGGTCAAAAAATGACAAAATATATTTTTATTACTGGCGGGGTTGTGTCTTCTTTAGGAAAAGGCATAGCAGCCGCATCTCTTGCAGCTATTCTTGAAGCTCGTGGTCTTCGCGTTACGTTGATAAAGCTTGATCCCTACATTAACGTTGATCCTGGTACTATGAGTCCCTTTCAGCATGGTGAGGTTTTTGTAACGAATGACGGGGCGGAGACCGATTTGGATTTGGGACATTATGAGCGCTTTGTTAAAACAACAATGACCAAGCGTAATAATTTCACTTCGGGAAAAATTTACGAAAATGTAATTAAGAAAGAAAGACGGGGTGATTATTTAGGAGGGACAGTTCAGGTTATTCCTCATATTACCAATGAAATCAAACGCTGTATCAAACTTGGTGCGGATGCATTCGATGTGGCTATGGTTGAAATAGGAGGAACTGTTGGTGATATTGAATCATTACCCTTTCTTGAAGCAATTAGGCAGATGCGTATTGAGTTAGGTTCACAACGAGCAATATTTATTCATCTTACTTTGGTTCCTTATATTGCTACTTCTGGGGAAACCAAAACCAAACCAACTCAACACTCGGTAAAGGAATTGCGTTCTATTGGTATCCAGCCAGATGTATTGATTTGCCGTTCAGAAAAACCATTATCCATGGCAGACAGGGCTAAAATCGCATTATTCACTAATGTTGAAAAAGAAGCTGTGATTTCTCTTGAGGATGCGAATAGTATTTATCAAATACCTATGATTCTACATGCGCAGCATTTAGACGAAATTGTTGTTAAGAAACTAAGCTTGGAAGCTAAGCAGGCTGATTTGAGCGAGTGGCAACGAGTAGTTGATATGCAAGCAGTTCAAACGATGACAGTGAAAATCGCTATGGTAGGTAAATATACGGAGCTGAATGATGCCTACAAGTCGATTAATGAAGCTTTATTGCATGCTGGAATTCATACGGAAACAAAAGTAGAAATTATCTATTTTGATGCTGAGATGATAGAAAAGCATGGCGCTTTATTGCTTGAATCCATTGATGCTATTTTGGTACCTGGTGGTTTTGGTGAGAGAGGAGTCGAAGGCAAAATTAAGGCTATCCAATATGCTCGGGAGCATAAGGTTCCTTTTTTAGGGATATGTTTGGGTATGCAAACAGCTGTTATTGAGTTTGCGAGAAATGTAGTTGGTTTAACAGGAGCTAATTCGACTGAGTTCAATAAAGAAACATTGTATCCAGTGCTTGGTTTAATTAGTGAATGGATGGATGCCGATGGTAGCAAGCAGATCAGGGACGAAAATACTGACTTGGGTGGAACCATGCGCTTGGGCGGACAATACTGTCATCTTGCTGAAGGCACTCTGGCAAGAAAAGTTTATGGCAAACCACAAATTATAGAGCGCCATCGACATCGATATGAAGTCAATAACAAGTATGTGGATAGTTTAGTAAAACATGGCTTAATTATTTCAGGACGATCAGCAGATAATTCACTGGTTGAGATGATAGAATTAGCAGACCACCCCTGGTTTTTAGCTTGTCAGTTTCATCCTGAGTTCACATCAAATCCAAGAGATAGTCATCCTCTATTTAAAGAATTTGTACTTGCAGCTCGTATTCACCATCAAGAGAAGGACAAAAAATGAGATTATGTGGTTTTGAAGCAGGCTTAGATAAGCCATTGTTTTTGATTGCCGGCCCTTGTGTTATTGAAAGTGAAGAACTGGCTTTAGAGACCGCAGGATATTTAAAGGAAATGTGCAGTCAATTGAATATCCCTTTCATCTATAAGTCTTCTTTTGATAAGGCAAACCGCTCATCTATTTCCAGTTACAGAGGGCCTGGCTTTGAAAAAGGGTTATCGATTCTGGAAAAGGTCAAATCACAAATAGGTGTTCCTGTTTTGACTGACGTTCATGAAGACACGCCCTTATTTGAAGTCTCCAGTGTGGTAGATGTATTACAAACGCCAGCCTTCCTATGCAGGCAAACCAATTTTATCCAAAAAGTTGCTGCCATGAATAAGCCGGTTAATATTAAAAAAGGACAGTTTCTTGCTCCCTGGGAAATGAAACATGTAATTGCGAAGGCAAAGGCGCAAGGCAATGAGCAAATTATGGCTTGTGAGCGAGGAGTGAGCTTCGGCTACAATAATTTGGTTTCTGATATGCGTTCCCTCGTTATCATGCGTGAAACCGGCTGTCCAGTGGTTTATGATGCAACACATTCGGTTCAACTGCCCGGGGGCAATAATGGTGTATCCGGGGGGCAGAGAGAATTTATTCCGGCTCTTGCAAGAGCAGCTGTAGCTGTTGGAATATCAGGGTTATTTATGGAAACTCACCCTGATCCGGATAAAGCACTAAGTGATGGTCCCAATAGTTGGCCTCTAGATAAAATGAAACAACTTTTGGAATCATTGAAAGCAGCGGATGAAGTGTATAAAAAGTACAGTACTGATTTCTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP011105|1363810:1369747|1365479_1366688_+|WP_027220753.1|DBSCAN-SWA MKHSLATIEEAVATLKAGKMIILMDDEDRENEGDLVIAAEHATPEAINFMSRLGCGLICLPMAEELIDKLQLPMMARHNKSPYGTAFTVSIEAANGVSTGISARDRARTIQVAIDPKSGPSDIISPGHVFPLRARKRGVLERPGQTEGSVDLVRLAGLTPAAVICEIINEDGTMSRRDELALFSKKHQIPLVTIKDLINYRIRHENLINPVATTQIPLEENGVFTMTVFENQIDSGEHFVLVKPPLYGNQVPLVRIHSECITGDVFGSRKCDCGKQLELSLSQIGAEGGILIYLRQEGRGIGLANKLKAYALQEQGFDTVDANLELGLPADDRDYAVAYQILKYLGVEALRLLTNNPLKIASLERYGMKITQRIPLEIKPSRENHCYLKTKKIKLGHLLAID >NZ_CP011105|1363810:1369747|1367288_1368926_+|WP_010946915.1|DBSCAN-SWA MTKYIFITGGVVSSLGKGIAAASLAAILEARGLRVTLIKLDPYINVDPGTMSPFQHGEVFVTNDGAETDLDLGHYERFVKTTMTKRNNFTSGKIYENVIKKERRGDYLGGTVQVIPHITNEIKRCIKLGADAFDVAMVEIGGTVGDIESLPFLEAIRQMRIELGSQRAIFIHLTLVPYIATSGETKTKPTQHSVKELRSIGIQPDVLICRSEKPLSMADRAKIALFTNVEKEAVISLEDANSIYQIPMILHAQHLDEIVVKKLSLEAKQADLSEWQRVVDMQAVQTMTVKIAMVGKYTELNDAYKSINEALLHAGIHTETKVEIIYFDAEMIEKHGALLLESIDAILVPGGFGERGVEGKIKAIQYAREHKVPFLGICLGMQTAVIEFARNVVGLTGANSTEFNKETLYPVLGLISEWMDADGSKQIRDENTDLGGTMRLGGQYCHLAEGTLARKVYGKPQIIERHRHRYEVNNKYVDSLVKHGLIISGRSADNSLVEMIELADHPWFLACQFHPEFTSNPRDSHPLFKEFVLAARIHHQEKDKK >NZ_CP011105|1363810:1369747|1368922_1369747_+|WP_010946916.1|DBSCAN-SWA MRLCGFEAGLDKPLFLIAGPCVIESEELALETAGYLKEMCSQLNIPFIYKSSFDKANRSSISSYRGPGFEKGLSILEKVKSQIGVPVLTDVHEDTPLFEVSSVVDVLQTPAFLCRQTNFIQKVAAMNKPVNIKKGQFLAPWEMKHVIAKAKAQGNEQIMACERGVSFGYNNLVSDMRSLVIMRETGCPVVYDATHSVQLPGGNNGVSGGQREFIPALARAAVAVGISGLFMETHPDPDKALSDGPNSWPLDKMKQLLESLKAADEVYKKYSTDF >NZ_CP011105|1363810:1369747|1364868_1365483_+|WP_027220754.1|DBSCAN-SWA MFTGLIENTGKVLVNRQGENYSRLVVSSSYQDLKPGESIAVNGVCLTLLPADFPELCFDISPETLHVTTLSKLSSGDMVNLERAMLASTRFGGHYVSGHVDTRAKVKSIRAVNEFIAMDLEGFIPEHNHYLIPKGSITVDGVSLTINTVSEQTVGLMLVPHTLSMTNLGSLRVGQQVNIEFDYLTRIVAHQLQIIGKLNQEEVS >NZ_CP011105|1363810:1369747|1366695_1367163_+|WP_050598095.1|DBSCAN-SWA MREIKTIVSDGVTFPIALVVSTFNELITSALKKGALDRLTELGFKSEDITLVEVPGAVEIPFVAQLLAKKQKVEVIVALGAVIRGETSHYDYVCDQVSQGCQRVMLDYNIPVIFGVLTTENDEQALARAGGTHGHKGRDAIDCAVSMRSIKQQLQ >NZ_CP011105|1363810:1369747|1363810_1364884_+|WP_062896155.1|DBSCAN-SWA MHEQFLLAALEQGKLGRGFCAPNPSVGAVAVQNGNIIAQAWHRGAGTPHAEQLLLSQIPPQTPGVTLYVTLEPCNHWGKTPPCVDAIINHGIQEVVFSYFDPNPIVAKSNSSEKLREHGIQVRHIPIKAIDVFYKSYAYWTMTHKPRVTVKIAQTFDGKIGKSEGARVVLSNALCEQFTHQMRAASDVILTSAKTVQMDNPRMNARLDSGLVAKPVAIVDRNLSLSDDTIIFSTAKHCHIYHQPQTNQAKTYPNSTHYAMPLQNGLMDLEAIITHLGQLGYHDVWVEAGGAIFSALHSKGLVHRTYLYLVPGSLGHQAISAYQQQGIFEKAHTVSWQAMGDNMIACLDWQEDECLPD |
6 | Staphylococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
2281611 : 2291735
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP011105|2281611:2291735|DBSCAN-SWA ATTATAAATAACAACCTACGCCATCATATCCAACGACACGACATTCTTTATAAGCTGATTGATCCAATTCATAGCTTGCGGAACCATAATAAGCATAAATCTTTCCATCCTTGGCTTTTTCAATACGCGGATTCTGGTAGCTTGCACCAGTTTCACAGCTTGACTTAGCTTGAATCCAGGTCGCAGTACTGTCATTAATGATATTTTTACCAGGTTTTAATCTATTCTCGCCACATTCATGCGTTGCCAAATCAGTCATTTTAGGCGCTGAGAATAAGACATCATAAGCATTTAATGCTGCCTGCACAGCATTATCCGCATCCAATATTCCATGTCCACAAGGTTTTTTGCCGACACAAGATTTATTCGTGTCGTTGCTTTGCCCAAACTCATGCGTAGTAACATATAAAATTTGTTCAACTTGTTCAGGTTTCAAAGCCTTATTACTGACAGCAAGAATTAACCCTGCTACACCGGCTACATGAGGCGAAGCCATACTCGTCCCTTGATAAAAATCAAAGCCTGATGAATTGTATCCACCTCCCGGGTTTACAGTAGATAAAATACCTCCCGAAGTGCCATAACGCTTATCACCTCCAGGTGCTGCAAGGGTTATACTGGGCCCATAATTTGAAAAGTACGAACGCAAGCCTTCTGGTCCGGTGGAAGCAACCTTGATCGTTCCATTGCACACTGCAGGAGCATTATAGTGTTCCCAAACATTATCATTTCCGGCAGCAACCGCGACTACGGCCCCTTTCTTGCGAGCAAAGAATAAAGCCTCTTGTAAAGCTTCGTCGCAATAATCAATTTCTTTTCCAGGCTCTAAATCGACACCAAAACTCATATTTAATACCTTGGCTGGATGTATATTTTTAGGAACTCCCGGAACATCACCTCCAACAGCCCAATAGATACTATTCACCACAGCACTTTCATAAAACATACCATTCTCGGCAGGAATTTTAACAGTCAGAATTTTTAAATCCTCACCAACTCCGTTCATAACATCGCCATAACCCGCAATGGTACCGGCAACATGGGTGCCATGGTAAGATCTGGTTTCATCAGATAAATCATTGTTATTCCCTGCAAAATTCCATCCAAATACATTACCCTCATTATCTTTTACAAGGTTATTCACCAAACTGTCATTCAATGCAATCCCAGTATCTAAAACCGCAACAACTATCGGCTTCCTGGACTTTCCTGTAGTATATGCCCATGCGCCATCTCTTAAACCAGGCTTGGATTCCAAACGAATTCCCGCTGGCCTTTCGAATTCATCCCATTGACTCTCATGGGATAACAATTGACTTAACTCCTGGTTTATTACTGGATCAGGGAGAGGCTTAAAATGTCCTATTCTGTCTTTAACTGCATAAAGTACATTGGGGTTTTTGCGCAAACGTTCTAAAACTTTGGCTGTAACATCTTCTTCCTTAGCCTTGACAATAGCATGGGAATTCGATGTATCAAAAATAAGCGAATAAGCGCCATTGGCCATAGGCTTCATTTCTTTAACGGGTATTTGAACAGATTTAATGACTTGTGATTTTAGTGAAGCCATGGTGGCTGGTTGCTGTTTATATTTAATGATAACTCTGATTGTTTCAGTTTCAGTCATAGCAAAACTGCCACAAGCAAGCGATAAAAGACTTAATCCCAATATTCCTGATTTCAAACCCATACTTCAATCTCCTTTTTAAAGTCAATCCGTATCCTTGACCAATTTTTAAAAATAAAACCACCTCAGTATGCAGGAGAATAAATATCAACTCAAGAATCAATAAGCCATGAGATTAAATTAAGATGGAACAATCATTGGACTTCATGTTTTTCCCTATATTCTGTGGGAGTGACCCCTGTCCATCGTTTGAATGCTTTTGAAAAATTGGATGTATCTTGAAAGCCCAATAAAAAACTGATCTCGGTCATGGAAATATTATTATTGAGCAAAAATGTCTTTGCTTTTTGTTCTCTTACCTCATCAAGCAACTCTTGATAAGTCACATCCAATCTCTGCAAATGACGTCTTAGAGTACGAGAAGTCATACATAATCGACTGGCTATCTCATCCATGCTGGCATGATTTAAATTCTGATTGATTAAAATAGATTTAATCTTGCTTGCCATGTCCTCTTTTAATGACATTTTTTTTTCAAGTTCTTGCAATTGCCTTTTTGCCAGCTGATAGCTGACATCGTCAGCAAAATGGATGGGGTAATTCAGTTCCTCCGCTTTAAACCAAACGCGAGTAGCCTCTGTATTAAAAACAATTTTAGTCTGAAAAATTGTTTGATAATATTTTGCATAAGGAGGTTCATCGTAATTTAACTCAATCTTGAGCAACGGGTCATTACAACTAATCAAAAAATTTCTCATTTTAATAAGATGAGTAACTGCCAATTCAGTTATAAAACGTGATAAAACCATTTCTTTTGTGTGCGGTAATAACTTGATATAAGCTCTGTTTTCATTATTAAACTGGCGTAACTCCAGAGACAACAAATTGGTTCGTGTATTAAGGTAACTGAGCACAGTCTGTATAGCAGTTCCAAATGTAGGACTGCTCATTGCTGCATACCCAAGAAAACCGTGATTGACTATAGATAAGTTTTGACCAAAAACCAAACCCAATTCCGGGCAATTGCTTAATTTATAAGCTTCCAAAATAACCTGGTTAAATTCATCCTGAGTTAAGTAGGCATCAGGATCATGTACTCTTATCAGATCAAAGCCAATTTTTTCTAAAAAATGGTTAATCCCAAATTGTTCAAGACATTTTTCCAGAGTAGAAAGATAATTTGCCGCTATAACCAGATCCATCAACAGGCTTTTCTTTTTTAAGTGAGAAGTGAATTAATTCTAATCTATATTAGAGTATAAGATCCAATAATGTAAAAAAATTCAAGATTTAGTTGTCTTGACTAAATCTTGAATAAAATTAGTTTAATAACGATAATGATCCGGCTTGTAAGGTCCATTTTTATCGACGCCGATATAATCAGCCTGCTCATTACTTAATTGAGTTAATTTTGCACCAATACGCCCCAAATGCAAACGGGCTACTTTTTCATCCAAAACTTTTGGAAGTACATATACTTGATTCTGGTATTGGCTAGAGTTTTGGAACAGCTCGATCTGCGCCAATACTTGATTGGTAAAGGAAGCAGACATAACAAAGCTTGGATGGCCTGTAGCGCAGCCCAAATTCACTAAACGCCCTTCAGCCAGGATAATAATCCGCTTTCCATCAGGAAAAATCACATGATCAACCTGAGGCTTGATATTTTCCCATTGATACTGTTTTAAGCTTTGAATATCAATTTCCGAATCAAAATGGCCTATGTTGCACAATATCGCCTGATTACGCATACGTTTCATATGATCGTGAGTTACAACATGGTAATTGCCAGTAGCTGTAACTACGATATCCACTTGTTCAGCAACATCATCTAGAGTTACGACTCTGTAGCCTTCCATTGCTGCCTGAAGTGCGCAAATAGGATCAATTTCTGCGACAAGTACTGTGGCTCCCTGTCCACGCAAGGCCTGAGCGCAACCTTTCCCTACGTCACCATAGCCTAGAATCAAGGCAACCTTACCAGCTATCATAACATCTGTTGCACGTTTTAACCCATCAAGCAGGGATTCCCGACATCCATACAAATTATCAAATTTGGATTTGGTCACCGCATTATTAACGTTAATGGCTGGAATTTTTAATTGTCCATGTTTCGCCATTTCGTACAACCTGGCTACACCTGTAGTGGTTTCCTCAGATACTCCCTTAATTGCAGTCAGTAATTTAGGATGTTTCTGGTGAACAACTTGTGTCAGATCTCCACCATCATCTAATAATAAATTAGGTGTCCAACCATTGGGGCCACTTAAAGTTTGCTCAACACACCACCAATATTCTTCTTCTGTTTCGCCCTTCCAGGCAAAGACAGGGATTCCTTTTGCAGCAATAGCGGAAGCTGCATGATCCTGAGTAGAAAAAATATTGCAGGAAGACCAGCGGACTTCAGCACCCAATGCAACCAGGGTCTCAATCAATACTGCGGTTTGAATCGTCATATGCAGACAACCTGCAATCCGAGCGCCTTGAAGTGGTTTTTTCGCAGAAAATTCCTCGCGTAAAGCCATTAAACCCGGCATTTCGGTTTCAGCTATCGCTATTTCTTTTCGCCCCCAGTCCGCTAATGAAATATCTGCTACTTTATAATCTTGTAATGTATTGATTTTCAGTACTCCTTCTTCTACCAGTTCCATTGGGGTATCCTTAAAAAAATTATAATGCCTTGCTTAATTCAGCTACTTTGTCCAATCGCTCCCATGGAAAATTCTCCCTGCCATAGTGCCCATAAGTTGCCGTCTGCCTATAAATAGGACGAAGCAAATCGTGTTGATCAATAATACCTTGCGGTGTTAAATCAAAATGCGTATGAATTAAATCAATTATTTCGCTGTTTTTTAGTCGTCCAGTACCAAAAGTATCAACAAAAATAGATGTAGGTTCAGCAACACCAATAGCATAGGAAATCTGTAACTCGCATTTATCTGCCAAACCAGCAGCCACAATATTCTTGGCAACATGTCTTGCGGCGTATGCTGCGGAGCGATCTACCTTCGAAGGATCTTTACCTGAAAAACAGCCTCCTCCATGTCTTGCCATACCACCATAAGTATCAACAATGATTTTACGGCCGGTTAAGCCACAATCGCCCAAAGGACCACCAATTACGAAGCGTCCTGTTGGATTAATGAAATACCGGGTCTTATCATTAAGCCATTCAGCAGGAAGAACTGATTTAATAATTTCTTCACGGATCGCCTCAACCAAATCTTTATGCTCAATATCAGGTGAATGCTGCGTAGAAAAAACAACAGTATCCACTTCAACCGGCATCCCTTGTTCATATTTCAAAGTAAGTTGACATTTTGCATCAGGTCTTAACCAGGGCAATTGGCCTGATTTACGAGCTTTAGCTAAT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AATGCTACGATAGAAGGAGTTGTTCTGTGACCTTCACTATTTTCAATTACCTTCGGTTTGTCACCTTCCATGACAGCCACGCAAGAGTTTGTAGTACCCAGGTCTATACCTATAATTTTAGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP011105|2281611:2291735|2281611_2283300_-|WP_011214266.1|DBSCAN-SWA MGLKSGILGLSLLSLACGSFAMTETETIRVIIKYKQQPATMASLKSQVIKSVQIPVKEMKPMANGAYSLIFDTSNSHAIVKAKEEDVTAKVLERLRKNPNVLYAVKDRIGHFKPLPDPVINQELSQLLSHESQWDEFERPAGIRLESKPGLRDGAWAYTTGKSRKPIVVAVLDTGIALNDSLVNNLVKDNEGNVFGWNFAGNNNDLSDETRSYHGTHVAGTIAGYGDVMNGVGEDLKILTVKIPAENGMFYESAVVNSIYWAVGGDVPGVPKNIHPAKVLNMSFGVDLEPGKEIDYCDEALQEALFFARKKGAVVAVAAGNDNVWEHYNAPAVCNGTIKVASTGPEGLRSYFSNYGPSITLAAPGGDKRYGTSGGILSTVNPGGGYNSSGFDFYQGTSMASPHVAGVAGLILAVSNKALKPEQVEQILYVTTHEFGQSNDTNKSCVGKKPCGHGILDADNAVQAALNAYDVLFSAPKMTDLATHECGENRLKPGKNIINDSTATWIQAKSSCETGASYQNPRIEKAKDGKIYAYYGSASYELDQSAYKECRVVGYDGVGCYL >NZ_CP011105|2281611:2291735|2287264_2288377_-|WP_027220141.1|DBSCAN-SWA MINKSAILALADGTVYEGLSVGATGDSVGELVFNTSMTGYQEMLTDPSYARQIITLTTAHVGNTGCNMEDMESTKVWAAGLVMRNCTAIPSNYRAEQSFPDWLSKNGVVAISGIDTRALTLKLREKGSIGACISTNVEKPEIAVEKAKSFAGLQGADLALEVTRQTIERWHEGRGMWSLDKQPQQLHVVAYDFGVKHNILRILHDKGCHITIVPAKTSAEEVLAMNPNGVFLSNGPGDPQACDYAIKATQVFLDNNIPLFGICLGFQILALACGGITKKMKFGHHGSNHPVVETTGKKRVFITSQNHGFAVDEDSLPNCLEVTHRSLFDNSLQGIKHKTKPAFGFQGHPEASPGPHDIDILFNEFVNLMK >NZ_CP011105|2281611:2291735|2284562_2285888_-|WP_014844301.1|DBSCAN-SWA MELVEEGVLKINTLQDYKVADISLADWGRKEIAIAETEMPGLMALREEFSAKKPLQGARIAGCLHMTIQTAVLIETLVALGAEVRWSSCNIFSTQDHAASAIAAKGIPVFAWKGETEEEYWWCVEQTLSGPNGWTPNLLLDDGGDLTQVVHQKHPKLLTAIKGVSEETTTGVARLYEMAKHGQLKIPAINVNNAVTKSKFDNLYGCRESLLDGLKRATDVMIAGKVALILGYGDVGKGCAQALRGQGATVLVAEIDPICALQAAMEGYRVVTLDDVAEQVDIVVTATGNYHVVTHDHMKRMRNQAILCNIGHFDSEIDIQSLKQYQWENIKPQVDHVIFPDGKRIIILAEGRLVNLGCATGHPSFVMSASFTNQVLAQIELFQNSSQYQNQVYVLPKVLDEKVARLHLGRIGAKLTQLSNEQADYIGVDKNGPYKPDHYRY >NZ_CP011105|2281611:2291735|2288472_2289612_-|WP_010947740.1|DBSCAN-SWA MEQRDYYELLEVSRNASDAEIKKAYRRLAMKYHPDRNPGDTSAEEKFKEIQKAYNILSDKQKRAAYDQFGHAGVDPSMGGGPGGFGGFGGFGDVFEDIFENIFSGGRGHGRQSRGQRGADLQFNVQLTLEEAAIGKEVEITVPRHGTCTVCEGSGAKKGTSPKTCETCQGMGQVRIQQGFFSIQQTCPTCHGEGKIISDPCASCHGQGRVRESKKINVKIPAGVDNGDRVRLSGEGEAGVHGGGSGDLYVQISLKKHAIFERHENDLHCEVPISFATAALGGSIEVPTLEGRVTLKIPAETQTGKVFRLRSKGMKSVRGYGQGDLLCKVVVETPVNLSREQKELLNKLQDSLENAKGTHSPKTSSWFAGVKKFFEDMKF >NZ_CP011105|2281611:2291735|2289800_2291735_-|WP_011946925.1|DBSCAN-SWA MAKIIGIDLGTTNSCVAVMEGDKPKVIENSEGHRTTPSIVAFTDDNEILVGQSAKRQSVTNPEKTLFAIKRLIGRRFDDPIVQKDIKMVPYKIMKADNGDAWVRVKDQDKAPPQISAEVLRKMKKTAEDYLGEEVKEAVITVPAYFNDSQRQATKDAGRIAGLEVKRIINEPTAAALAYGMDKKRGDSVIAVYDLGGGTFDISIIEIAEVDGEHQFEVLATNGDTFLGGEDFDLALIEYLASEFKKDTGIDLHNDPLALQRLKEAAEKAKIELSSAQQTDVNLPYITADASGPKHLNIKLTRAKLESLVEKLVERTIEPCKTALKDAGLTVSQINEVILVGGQTRMPLVQKTVEEFFGKEPRKDVNPDEAVAVGAAIQAAVLSGEVKDILLLDVTPLSLGIETMGGVMTKLIEKNTTIPTKATQVFSTADDNQTAVTVHVLQGEREQASANKSLGRFDLRDIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAKDKATGKAQSIVIKASSGLSEEEVAAMVKDAQSHAEEDKKFKEMAELRNQADSLIHSCEKSMKDLADELSEDEKKGIETAISELKEAVQGTDKARIEDKLKVLTDASAKMAERIYAKKSSEGQAAQGQTQSQESTKPAEEGVVDAEFEEVKEEDKK >NZ_CP011105|2281611:2291735|2285907_2287056_-|WP_011214269.1|DBSCAN-SWA MNEVYVFTSESVSEGHPDKIADQISDAILDAILAQDPKARVACEVLVKTGMVLVGGEITTKAWVDVEEITRHVIKDIGYNSSQMGFDWESCAVLSAIGKQSPDIAQGVDNQQTKILGAGDQGLMFGYASRETDVFMPAPIAYAHRLMEKLAKARKSGQLPWLRPDAKCQLTLKYEQGMPVEVDTVVFSTQHSPDIEHKDLVEAIREEIIKSVLPAEWLNDKTRYFINPTGRFVIGGPLGDCGLTGRKIIVDTYGGMARHGGGCFSGKDPSKVDRSAAYAARHVAKNIVAAGLADKCELQISYAIGVAEPTSIFVDTFGTGRLKNSEIIDLIHTHFDLTPQGIIDQHDLLRPIYRQTATYGHYGRENFPWERLDKVAELSKAL >NZ_CP011105|2281611:2291735|2283431_2284439_-|WP_011214267.1|DBSCAN-SWA MDLVIAANYLSTLEKCLEQFGINHFLEKIGFDLIRVHDPDAYLTQDEFNQVILEAYKLSNCPELGLVFGQNLSIVNHGFLGYAAMSSPTFGTAIQTVLSYLNTRTNLLSLELRQFNNENRAYIKLLPHTKEMVLSRFITELAVTHLIKMRNFLISCNDPLLKIELNYDEPPYAKYYQTIFQTKIVFNTEATRVWFKAEELNYPIHFADDVSYQLAKRQLQELEKKMSLKEDMASKIKSILINQNLNHASMDEIASRLCMTSRTLRRHLQRLDVTYQELLDEVREQKAKTFLLNNNISMTEISFLLGFQDTSNFSKAFKRWTGVTPTEYREKHEVQ |
7 | Bacillus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
2693658 : 2702295
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP011105|2693658:2702295|DBSCAN-SWA TTCAAGCGAGGGGCCAACGAGGTTTAACCATAACCCCCCACCCCCCATCACTCTCCCCCCGCATCATGCGCAAACATCCTGCATAAGCGACCATTGCACCATTATCTGTGCAATATTCCAGAGCGGGGAAGTACACTTCCCCTTTGATGTCTTTAATCCATTTTTGCAAAGCGCTACGCAAGGCTTTATTGGCCCCTACTCCACCGGCTACCACAAGGCGTTTTGATTGAGACTCTTTAATGGCTCTTTTGCATTTTATAATTAGTGTTTCAACTACTGCTTGTTGGAATGCTTTTGCAATTTCGGAGCGGTCGCTTTCTTTTTTTTCACTTTGGTTCCAGGTATTTAAGGCATGAGTTTTTAGTCCGCTAAAACTAAAGTCCAAGCCTGGCCTGTCAGTCATGGGGCGGGGAAATTGATAGGGAGTTGATAAACATTGATCAGCCAAATTTGCCAACACGGCTCCTCCAGGATAGGGAATCCCCATCAGTTTGGCTGTCTTGTCAAAGGCTTCTCCTACTGCATCGTCGAGAGTATCTCCTAATAATCGATACTCACCAATGTTGTTTACTTCTATTAGTTGACAATGGCCACCGGAAACTAACAGAGCAATAAAGGGAAAATCAAGGGATGGGGTTTCCATTTTTGCGGCTAACAGATGGGCTTCCAAATGGTGAATTGCCAATGCCGGAATATTTAAGGCGTAGGCGAGACTTTTGGCAAAGCAGGAACCAACTAACAAAGCGCCAATTAATCCGGGTCCTGCGGTGTAGGCTATTCCATCCAATTGGTTTTTACGAATTTGCGCTTTAGTTAGTACCTCATCGACTAAAGGAACCAAGTAATTCACATGATCTCTTGATGCCAGTTCTGGAACAACACCGCCATGTACACGATGAGTGGCAATTTGTGAATGCAAGGCGTGGGACAATAATCCTGATTCTGAATCATAGACAGCAACACCTGTTTCATCACAGGAAGACTCTATACCCAATACAAGCATGAACTACCTCAATAATCGGAATCAATTTTCCAGATTTTAATCATTTTTCAATTATATCACAGACAAAAGATACCATTAAATTAAAGAACAATGTCTTGATAATTTGCTAAAATAGCAAGAAACGTATAGATTAATCTTGACGTGTGGAAAATCTAGCACTAGAATTGCCCACCTATTAAGATTAAATAACCAGAGGACTAGTTAATGCCTACCGTTCGTGTAAAAGAAGGCGAAAACCCAGAATATGCACTACGACGTTTCAAACGCTCTTGTGAAAAAGCCGGTATTTTAACCGAATTACGTCGCCGTGAGTTTTATGAAAAACCAACCGCAGAGCGTAAGCGCAAGCAAGCTGCTGCAGTAAAACGTCATCTTAAAAAAATATCTCGTGATGTTAGTTCAAGACGAGGTGTTGGTCACCGACGTAAAAAAAGCACTACCTGATCTGATTTTTTCAAGATTGACTGCACTAAAAAGCAAGTTTGCGTGAGGCACTTAAACAGTGCCCTGTTTTGGAAGCTCTGTTATTTTTAATTGTTTTTATTTGAAATTGGCCTTCGTGGCAGTTTCGGTAGTAAATCGCAGCTCGTCCTATATTACACCAAGGTCACATTGTATGTGACCTTTTGTTTTTTAAGGAATTAAAATGACTATAAAAGAACAAATCAACAATGACATTAAAGACGCTATGCGCGCAAAGGACAAAAACTTGCTCAATGCTTTACGCTTAATCAGTGCTGCGGTAAAACAAATTGAAGTCGATGAGCGCATTGAAGTGGATGATGAGCGCATGTTAGTCATCCTGGATAAAATGTCCAAACAACGCAAAGAATCTATTGCTCAATTTGAAAAAGCAAGCCGTGACGATCTCGTTGCCCAGGAACAGTTTGAGTTGAATGTCATTTCAAAATACCTGCCTGAACCTTTAACTGACAATGAAATTGAAGAGTTAATCAGCGATGCCATCAAGTCTACTGGCGCTGAAAAAATGTCTGATATGGGTAAAGTCATGGCTATCCTTAAGCCAAAATTACAAGGACGCGCGGACATGGCCCAAGTCAGCGCCCGGATAAAGGCGAAATTAAGCTGAGTTCCAATATGTCTGGCTTAATCCCACAGCCATTCATTGATGATCTATTAAACCGCACTGATTTGGTGGAATTAATAGACGGTTATGTTCCTTTGAAAAAAAGAGGCAACAGTCATATTGCATGTTGCCCTTTCCATAATGAGAAAACACCATCATTCAATGTTGTTGCAAAAAAACAATTTTATCATTGTTTTGGTTGTGGCGCTTCAGGTAACGCCATCAGTTTTGTAATGAATTATCTGAATCAAGGTTTTACGGATGCCGTTGAAACCCTCGCGACGCGCTTGGGTTTAAGTGTCCCAAGGGATGGTACAGGAGAGAAACATAAATCATCTCTCAATCTCTATAATCTCATGTCAGAAGTCAGCCAATATTACCAAAAAAAATTAAAATATAATGGACAAGTGGCAATTGACTACCTTCGCAACCGAGGTCTTAGTGGGGAAATTGCCAAACGATATCATTTAGGCTATGCACCTGAAGGTTGGCACAACCTGGAAAAAGCTTTCCCAAACAATCAGCGTGAACTATTGAGTACCGGTATGCTCATTAAAAGCGATGAGGGTAAAATTTATGACAGATATCGTAATCGAATTATGTTCCCCATCCATGATAGAAACGGTCGTGTGATTGGTTTTGGCGGACGTGTACTCGATAAAGATCAAAAACCCAAATACCTTAACTCGCCTGAAACAGTACTTTTTCAAAAAAGTCGTGAGTTGTATGGCTTACATCAAGTCCTATCTCAACAGAAAAATCCCGACAGTATTATTGTTGTTGAAGGTTACATGGATGTCATTGCCTTGGCACAACATGGCATTTTTAATGTGGTGGCAACGTTGGGAACTGCCACCAGCACATTCCATATACAACTATTGGCAAAGCATACCAAACATCTCATTTTTTGCTTTGATGGTGATGCGGCAGGTAAGCAAGCAGCCTGGCGAGCATTGGAGAGCAGTTTACCGCATTTGAATGCCGGATTAGATGCCGGATTTATTTTCTTGCCGAATGAACATGACCCTGATAGCCTGGTAAGAAATGAAGGAAAAAACGGTTTCCTTGAGCTCTTGCAACAAGCAACACCACTCCACCGCTTTTTCTTTGATACTTTAAGTAAAGACATTAATTTGTCAAACCCTGCAGGAAAAACACAGCTTATCAATGCAGTAAAACCCTATTTGCAAAAAATGGTTGAGGGCTCATACAAACAGTTGCTTATTGATGACCTGGCACGCTTAACTCATATTGAAAGCCATCGGTTAACTAATTTGATTACTGATAAATCGGAAAGCAAGCCGGAAGTACAAGCTGCTATTTCTCGTTCACCTCTGCGTATTGCTATCGCGCTCCTCTTACAAAACCCCGAAATTTATTCAATAGCAATACAACAAATCAATCCTGCTCTGCTCCATGAACAGGAGCATCATATTTTATTGAAATTATTGCAACAATTAAAAGACAAGCCCAATGCCAATACTGCCACCCTCATTGAATTCTGGCGCAATAGCAGTTATTTTGAATTAATAGTTAAATTGGCGGCCTGGGATCATCAAGTGCCTGAGCAGGAGCTGACTAAAGAATTTATTGATGTCTTATTATTTTTACAAAAACAAAATCGTGAGATATTGATACGACAATACATAGAAAAATCCAGAAAAACTGGCTTAACAGAAGCTGAACGGCTCAGTTTACAAAATTTATTAAAGGAAAGACATGGGCAAGCTGAAATTGAAAAATAAAAATACTGAAATACTGGTATGTTGCAGCTACCCAGTTTATAATTTAAAACTTTTTGTAATTTCCCATTGTTCCAACAGAAGTGCCTATGACCATGAATGACCAAGATCAGCAAAGCTCACAAATTACGAAAGTCATTAGCCTGGGTAAAGAGCAAGGTTATTTGACTTACAGTCAAATTAATGACTTATTACCTAATATTGTGGATACAGAGCATTTTGATGTAATCATTAGCATGCTGGAAGGCATGAACATCAAAGTTTTTGAGCTTCCACCCAGTGAAGATGAACTTGCGCTCTTATTAAATACTGAGGAAGTCCCAGATATTGAAGAAGCAGCCATGGTACTCGCCTCTGTGGATAAAGAAACAGGCAGAACAACTGACCCGGTTCGTATGTATATGCGCGAAATGGGCACAGTAGAACTGCTGACTCGTGAAGGTGAAATCCGCATTGCCAAACGCATTGAAGAAGGAATTTACCAGGTTCTAAAATCCCTGGCGCATTATCCAGAAACAGTGCAACTGGTTCTTGAAGACTATGATCGTTTCCTTGCGGAAGAAATTCGCCTTAATGAAATCATTAGTGGTTTTGCAGATGTTGATGAAGAAATAGCACCTGCCACTAACATTGGTTCCATGCTGGATGAAGAGCAACAGGAAGAAATACTTCTTGATGTCGATGAGGAAGATGAAGACGGCGAAGGTGGTATATCTGATGTGGATGATGGACCCAATCCTGAGCAAGCAAAAATTTACTTTGATGAGCTGCGTGAAGCCTTTGAAAAGGCAATGAAAGCCCTCAAAGAGCATGGCCGTACGAATAAAAAAACGGTCGAGTTGCTCGATTCCATGTCGGAATCTTTTCTGAAACTCAAATTGACTTCCAGACAAGTTGATAAATTAACTCGTCATTTTCGCCAATTGCGAAATCATATCCGTGAATTTGAGAGAAGCATAATGCGTCTTTGCATCGAAAAAGCACGCATCCCCAGAAAATTGTTTATAGATACCTTCCCAGGCCAGGAAACAGATCTAAGCTGGTTAGAAACCATTATCAGCAAACATGCCAAAAAACTTGATCTTGATCGTATAGAAGAAAATCGGGAAGAAATACTACGCTTACAATCCAAGCTGGCCTCTTTTGAAATCGAATATGGTTTAACCAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP011105|2693658:2702295|2699700_2700612_-|WP_062724739.1|integrase|DBSCAN-SWA MENQHKRSISDDAGRLREVVKYIGDLPIEAIHIGSLQSFIEGRRKDEVSMRTINHGLKIVRRILNLAASEWMDEFGLTWLNSAPKIKLLPEPDLRKPYPLSWDEQHKLFQQLPEHLKNMALFAVNTGCRDREICELRWDWEIKIPELPHIIVFIVPGELVKNGEERLIVCNETVREVIEGERGKHPTHVFSFKGRPLSRMLSTGWRQAREKAKLPEVRVHDLKHTFGRRLRAAGVSFEDRQDLLGHRSGRITTHYSSAELQSLYQAANKICENRKSGVILTLLRNPKSRPASQNTLRESQVSL >NZ_CP011105|2693658:2702295|2695758_2697492_+|WP_015961446.1|DBSCAN-SWA MSGLIPQPFIDDLLNRTDLVELIDGYVPLKKRGNSHIACCPFHNEKTPSFNVVAKKQFYHCFGCGASGNAISFVMNYLNQGFTDAVETLATRLGLSVPRDGTGEKHKSSLNLYNLMSEVSQYYQKKLKYNGQVAIDYLRNRGLSGEIAKRYHLGYAPEGWHNLEKAFPNNQRELLSTGMLIKSDEGKIYDRYRNRIMFPIHDRNGRVIGFGGRVLDKDQKPKYLNSPETVLFQKSRELYGLHQVLSQQKNPDSIIVVEGYMDVIALAQHGIFNVVATLGTATSTFHIQLLAKHTKHLIFCFDGDAAGKQAAWRALESSLPHLNAGLDAGFIFLPNEHDPDSLVRNEGKNGFLELLQQATPLHRFFFDTLSKDINLSNPAGKTQLINAVKPYLQKMVEGSYKQLLIDDLARLTHIESHRLTNLITDKSESKPEVQAAISRSPLRIAIALLLQNPEIYSIAIQQINPALLHEQEHHILLKLLQQLKDKPNANTATLIEFWRNSSYFELIVKLAAWDHQVPEQELTKEFIDVLLFLQKQNREILIRQYIEKSRKTGLTEAERLSLQNLLKERHGQAEIEK >NZ_CP011105|2693658:2702295|2701656_2702295_+|WP_062730280.1|DBSCAN-SWA MTMTLSNNLQQLMRIHGNTSVSELARLTGIPQPTIHHILTGSTKNPRKKALEELSRFFSISVEQLIGQEPLPTIIPDGVKKDLQISAIPIVDWNVLKKWPASKADIRDNQEILLNKTIANDSFALIIPDDSMLPRFQQNTLLIFDSGKTPKDRDFVIVHLSKDNKIDFNRLFYENNSFYLRHDLGDGNLQLTKLDPSHDRILGVLIEERIQH >NZ_CP011105|2693658:2702295|2694864_2695104_+|WP_010948064.1|DBSCAN-SWA MPTVRVKEGENPEYALRRFKRSCEKAGILTELRRREFYEKPTAERKRKQAAAVKRHLKKISRDVSSRRGVGHRRKKSTT >NZ_CP011105|2693658:2702295|2693658_2694660_-|WP_015961445.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLVLGIESSCDETGVAVYDSESGLLSHALHSQIATHRVHGGVVPELASRDHVNYLVPLVDEVLTKAQIRKNQLDGIAYTAGPGLIGALLVGSCFAKSLAYALNIPALAIHHLEAHLLAAKMETPSLDFPFIALLVSGGHCQLIEVNNIGEYRLLGDTLDDAVGEAFDKTAKLMGIPYPGGAVLANLADQCLSTPYQFPRPMTDRPGLDFSFSGLKTHALNTWNQSEKKESDRSEIAKAFQQAVVETLIIKCKRAIKESQSKRLVVAGGVGANKALRSALQKWIKDIKGEVYFPALEYCTDNGAMVAYAGCLRMMRGESDGGWGVMVKPRWPLA >NZ_CP011105|2693658:2702295|2695306_2695750_+|WP_014842313.1|DBSCAN-SWA MTIKEQINNDIKDAMRAKDKNLLNALRLISAAVKQIEVDERIEVDDERMLVILDKMSKQRKESIAQFEKASRDDLVAQEQFELNVISKYLPEPLTDNEIEELISDAIKSTGAEKMSDMGKVMAILKPKLQGRADMAQVSARIKAKLS >NZ_CP011105|2693658:2702295|2701121_2701412_-|WP_062740844.1|DBSCAN-SWA MEMNTKLQIYKGIIQYILESTNYSLQNIADLSNSSIKNIRTIYCDNVVPSNFSSDIQLVRLYQMILEIHIQEKQFKKYLPLPKSFRQINLSIGELQ >NZ_CP011105|2693658:2702295|2700677_2701055_-|WP_062730257.1|DBSCAN-SWA MSICSILPRLIRLRDAPAYVGMDRHRFNKDVRPHLVEIPMGIQGIAFDRLDLDAWVDDYIQCSGRPAAVERRSLELWDEKERQGCKSVAASGVLTKRSSDDDFAKALVLTTSKRRKSISQGVSKR >NZ_CP011105|2693658:2702295|2697578_2699444_+|WP_014844507.1|DBSCAN-SWA MTMNDQDQQSSQITKVISLGKEQGYLTYSQINDLLPNIVDTEHFDVIISMLEGMNIKVFELPPSEDELALLLNTEEVPDIEEAAMVLASVDKETGRTTDPVRMYMREMGTVELLTREGEIRIAKRIEEGIYQVLKSLAHYPETVQLVLEDYDRFLAEEIRLNEIISGFADVDEEIAPATNIGSMLDEEQQEEILLDVDEEDEDGEGGISDVDDGPNPEQAKIYFDELREAFEKAMKALKEHGRTNKKTVELLDSMSESFLKLKLTSRQVDKLTRHFRQLRNHIREFERSIMRLCIEKARIPRKLFIDTFPGQETDLSWLETIISKHAKKLDLDRIEENREEILRLQSKLASFEIEYGLTISEIKDINRKMSIGEAKARRAKKEMVEANLRLVISIAKKYTNRGLQFLDLIQEGNIGLMKAVDKFEYRRGYKFSTYATWWIRQAITRSIADQARTIRIPVHMIETINKLNRISRQILQETGREATPEELAEKMELSEDKIRKVLKIAKEPISMETPVGDDDDSHLGDFIEDNNIESPIDMATAEGLREATLEILETLTPREAKVLRMRFGIEMNTDHTLEEVGKQFDVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSEKLRSFLEGDEG |
9 | Pseudomonas_phage(28.57%) | integrase,tRNA | attL 2689984:2689997|attR 2704568:2704581 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
2814055 : 2862541
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP011105|2814055:2862541|DBSCAN-SWA TATTGAACTCATAGAGCATTTGAACCCTGAAAATATCGTATACATTGATGAGTCCGGTATAGATAGCTTTGTATCCAGGGAGCATGCATGGAGTGAAAGAGGGAAAGCAGTTATTGGTGAAAGATCTGGTAAACGCTTCGCTAGAGAAAGTTTTGTAGCTGGTTTAATCAATAAAAAATTGGTTGCCCCAATATGCTATCAAGGCACTATGGATAGGGTTTTATTCAACTTCTGGCTAAGTAATTTTTTCCTACCTGAAATTGGAAGTGGTAAAACCATTGTAATGGATAATGCCGCTTTTCATAAATCCCCAGAAACGGCTTCTATTATCACTGAGACAGGCTGTAATTTGATTTTTCTTCCTCCTTATTCACCAGATCTGAATCCTATTGAAAAATGCTGGGCAAATTTAAAAAAGAAGATTAAGAATGAAATTACTAATTTTGACTCGTTAGCTCAGGCCATCGATCATGCTTTTCAAGGGATCGTTTAAATTTTAATTCACTATAAAGAAAAGCCTATTGAAAAAAATAAAATTTAACGCCATTCTCAACTTTTTATGATTTGAGCAACAACGCAAATTGAAGCGGTGGATTACCAATTTTTTTGTTAATGCACACACAAACCGTATGCGCCAATACCATCTCCTTGCCAACGTATTCCCGCATAGTGATTGGCTTCGATGGGGTGATAGATGTACATCCCTTGGTTAAAGGAATGTACATACATTAAACCCATTTATTAATTTTGAGCTTCACAGGTGATTTTGGTGCAATCACGACAATTTTCTGCTGCGAAAGCGAATGCTTTAGTCGCAGACAGAGCGGTCGTTGACATTTGTTTGTCTGCATCTATATCGGATGCAACCTCACTGGTGCTCGCATTGGTAGTACAAATCCATTTGGCATCCATATCTGTTTTACTTACCGCAAAACTACTTGCAGACGCTAAAATTAAACTTCCGCCAATTAAAGATAAGAGTATATTTTTCATGATTTAGTCCTTTAAAATTAATATTGATTTGCCGTTTAAATCGTTACTTGGTGCAACATCGAATAACATTCAGTTATGTTTTATTTATCCTGAAATTCCTGAACCATCTTTTCAGCTTCTTCTTTAGAATAGCCATAATGCTTTTGTAGCTTGCCATAAATTTCCTGATGGGCCCCCTCAATTTGTTTAAAATCGTCATCAGTTAATTTACCCCAAGTTTGTTTCATTTTTCCTTTCACTTCTTCCCACTTACCTTCAAAAATATCCTTATTCATTTTAATCTCCTTAGTTAGTAAGTTTGTTACATAAATAATAAACTGAGAATGAGCGTCTCTATTTGGAATATCAATTTAATATTCCAAATAGTTAATTCTTCATTTTATTAATTAAAGAATCATTGATTTCAATCAGCTGGCTTTTTTATGTTTAATATAAAATTGCTCGATTGATGTTGCTATATTAGGGGAAGTGAAATTTGGCCAATTGTCTTTATCAAATCCAGGAGCATCTTTTAACCGCTCTTTATCCAGATTCAAATTGAAACAATCCTCTTCTTCATTATAAGTAAACATATTCCAGGGAATAGCGAAGAATTTATTACCAAATCCCAAAATACCGCCGAAATCCAAAACAAGGTAAGTTACTTTGCCGTGAGCTTTATCAATCACTACTTCATTGATTTTACCCAGATTTTCACCAGTTAAATTTTTAACATCAACGCCAGTCACTTCACTGGATTTCACTACCTTTCTATAAGTCATGATAATTCTCCTTAAATTAATAAATAACTTATTTATCCAATTAACTATAGGCTACATTTGTCAGAAATGTTCTATTTTAACAAAATTATTTTTGAGCGCATTTTAAGCACATTAGAATTAAACTTATTGAAACATAAAGAGGTTCAAGCCAAGGATATAAAAAAACATAGAAAACCAGAGATACCGTGCCAACACCTCGGTGAGGAGAAGAAGAAAGAATTAATAGAAATTTACAATTAAATTAACCCACTTCAGAACTAACAATTAGCGTGACACAGGTATGCGGACCTACTTGACCTGGTATGCCTAATAGTTATAGCGCTGTCTAATTCTGCCTATTAAAAACAGAGTGTTAGTAAAGCAACAAAGCCACTCCGAGTAAATGTTTCAGAAAAATAGCTATATACCACCATAATGTATTATAGTTATTTTTCTACTCATAGTATTTCAATTATCCAGTTTAAGAATGACTGAATTTAATTCCATTTGAACAAGTCTCCAATGGGAGAAAAGTCCAAGGGGGAGTAGTATTGTAATTATGAATAACAATAGTCAGACCGCACCCGCAAAGCGGGTGGCTTGTGACGGTTTTTAGCAGCCCCAAGGGCTGCCATTGTTAAAGCTCAAACCAAGATTTAAAAATTACCTTCTTCATTAATACATACATTTACTTTTCTTTTGAGGCAACTCGGCACCAGTAATGATATTACGCATAATTAATTAACTGTACTAAAATTATCTATATGTCTTGAAAAACGCAATCACGAAGAGCCTATTCCATTGCTTCTATAACTTTAGATAGAATTAGAACGAAACATTACTCAATAAGGCCTAATAATTATCAATAGGAAATGTAATGAAAAAATATTTTATCTATACAAAACATCTTGGGATGCGATTTATCACAAAAGCAGATTCCAAGTATTTACAAATTATTGATAAGGATCCAGCGGTCAAAAAATTTTTTCCTGAAGGCACATTAACCGATGAAAAAATTAGTGAGTTCATCAATGAATGTATAGTCTCTTGCAAGAACGAACACTTGCCTTGTTTGGTCATTTTTCAGCTGAAAGATGATGACTTTGTTGGAGAAGCTTATTTTGGTCAGCTAGAAACTGGAGAGTTTAAAGTAGGTTACCTTCTTCATGAAAAATACTGGAATAAAGGTTACGCGACTGAAATATTGGAAGCGTTACTGACTTGGGCTAAAAATCATATCGATACAGAATATATTATTGCTTTTGCTGATATAGACAATACTGCTTCATTTCGTGTCATGGAAAAATGCGGAATGAAGTATTATAAAGATGGTCGTCATTTGGATATGGATTGTCATTATTATCGAATAAAAAATCGATAAATTTAAGTCTTTTCGTTAACCGTTAAATCCTCGCAGAAAAAAGTAATCACATTACGCAATACTTTTTCACAGATGTTGAGTTGCTCAATAGTGATAAATTCATTGGCACTATGCGCCTGTTCAATATTTCCAGGACCACAAATAATTGTAGGAATTCGAGCACTTTGAAATGCTCCTGCTTCTGTAGTATAAGAAACTTTAAACCGCCCCTTGACTCCAGTAACAGCCCGCACTAATCTGGTAATTGATGATTCCTCTACTGCATTAAATCCAGGTGAATCTGAAATTTCATCAAAATAAATAGCTGCTTCTGAATAGGTTTCTCTCATTTCCAGTAATAAATCACTATTAATATAGTTTTCAATTTGGTTGCGAAAATTCTCATTCGGAAATTGGTCAATATAACGAATCTCTAGAATAAACTCACACGTTCCTGGAACTACATTAGTTGCAATTCCTCCACTTATTATGTTGGTAGTAATTGTAGTGAAAGGAAAATCGAAGTCATTATCAAATGGACCATTTTTTTCCATGAATTTTGCAAGCGTATTTATATAACAGATTAAACGACTCGCATATATAATCGCATTACACCCCTCAGAGGCAAGAGAAGAATGAACGGACTTTCCTTGTACTTGACAGTGATAAAGTCTTCTTCCTTTCTCACCAATGATTGGCCGCAAATTAGATGGCTCCCCAACGATACACCCTTCAGGTCGGATTCCCATTTTTTGGAAATAATCCACTAAATAATCTACACCAACACACCCAATTTCTTCATCACAAGTAAAGGAAAAATGAATGGGTTTTAAGAGTTTTAACTTTTGCAAATCAGGGACAAAGGAGAGCAATACAGCTATAAATCCTTTCATATCACAAGTACCACGCCCGTAAATTTTACCATCCTTTTCAGTAGCAACAAAAGGGTCTGTTTTCCATATTTGCCCTACAACAGGAACCACATCAGTATGACCTGTCAGTAAAATACCTCCTTCAGTACTTCCATTACTTGCAGGTATGGTGGCGAATAAATTAGCTTTTGATTTTACTTGTCCGGGAATAATTTTAGAATTAATATTGTGTAATTTAAACCAGTCCTCAATTGCCTTAATTAATTGCATATTTGAATTGCTTGAAATGGTATTAAATGCTACGAGTTTCTCAAGCCATTGTAGGGTATTCATTTAATTCCACCATTTTCACCAATGTATAGCGGTTATCACTTAATAATAGATAGTATTAACCTAAGTTACAAATAGTGACTATTTTAATAATTTTTTAGTATTAGATTTGCCAGGTCGTGTATAGGTTAGGTTTTTAGACTTTAGGAAAAAGAGGTCAATCATGAAAGGAGGCCATGAAATTCAACGAGCTACAAGTTAATAAATTAGTGTTTTTTTACGTGCACATTTTTTACGTACGCAATTGGGTTTACATAAAATTTGAACTATACTTAATAGGTGAACTGTTTCTTTAAGGAAAGCCATCATGTTAGGAACAATTTTACTAATTGTGCTCATCCTGTTACTTTTAGGTAGCGTACCAAGATGGGGATATAGCAGGAGTTGGGGATATACGCCGATGGGTCTTATTGGACTTATCCTGGTTATCTATCTGATACTTGTTCTACTAGGTAGAGTGCCTATTGGGTTCTAATTGGAATTAGCCTTAAACAACCAGAATATGCCATGTAATGAATTTAAATTGGAGAAAAGCAAAGTATCCAATCTTGAGAATAATGTGGTACGGGGGGGCTTAAGCACAGACAATGAGGCTCCCTATGTTTTTTGGTATTTTAAATCTCACACTTTGGGGATATGTTTTAGCAACTTTTGTTCTAACTCAAATCACCATTGCTTCAGTCACTCTTTATTTGCATCGTTATC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42 | Indivirus(16.67%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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