Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP014528 | Acinetobacter baumannii strain XH858 chromosome, complete genome | 4 crisprs | DEDDh,RT,csa3,cas3,PD-DExK,WYL | 0 | 0 | 12 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP014528_1 | 1752646-1752809 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP014528_1
|
3 spacers
spacers of NZ_CP014528_1
>1.1|1752669|37|NZ_CP014528|CRISPRCasFinder GCCAGAATCTTTTTGATTAGATCCTTGTTGTTGGCCG >1.2|1752729|16|NZ_CP014528|CRISPRCasFinder CTGGTTATTTTGTTGC >1.3|1752768|19|NZ_CP014528|CRISPRCasFinder ACCGTGTTGCTGTTGATTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP014528_1
The CRISPR arrays of NZ_CP014528_1 >merge|NZ_CP014528|1|1752646-1752809|CRISPRCasFinder TGGTTGTTATTTGAGTTTTGTTGGCCAGAATCTTTTTGATTAGATCCTTGTTGTTGGCCGCGGTTATCATTTTGCTGTTGTTGCTGGTTATTTTGTTGCTGTTGATCGTTTTGCTGTTGGTTACCGTGTTGCTGTTGATTACGGTTGTCATTTTGCTGTTGTTG >NZ_CP014528|1|1|1752646-1752809|CRISPRCasFinder TGGTTGTTATTTGAGTTTTGTTG GCCAGAATCTTTTTGATTAGATCCTTGTTGTTGGCCG CGGTTATCATTTTGCTGTTGTTG CTGGTTATTTTGTTGC TGTTGATCGTTTTGCTGTTGGTT ACCGTGTTGCTGTTGATTA CGGTTGTCATTTTGCTGTTGTTG
>NZ_CP014528.1|WP_000132045.1|1752212_1752530_-|hypothetical-protein MTDQNTDHAQLVAGDHNYSDSRWRESYLTRPYYQEAQLTTPDLDYDRDFSAAYELGHRARSESKEGTQFEDMEGSLQQKWEELKAESRLKWEHAKQAIKDAWDDM >NZ_CP014528.1|WP_000498477.1|1751906_1752128_+|hypothetical-protein MFVYFTDGTCINDSEIYGVKAKYEQNKYVVEVTIKPTHVLATTPSVQFKKEVFDDPNLANQYLSHNFNMPPFF >NZ_CP014528.1|WP_001136759.1|1751390_1751819_+|hypothetical-protein MPQYLKIAEKIYQNVKEKKGFTDDPMEDLNNLMIELRQEIKGTKLKLLYNYIDFAEILIKPLQESKIKLDLSLIPKSKNTQEFVLWLAGFIERITTGGQEKLPPIRAKITLPAYAYEETYPSQKKPVNNGEEIIEYFKKNQS >NZ_CP014528.1|WP_000251635.1|1750977_1751121_+|hypothetical-protein MVRIFCAVSMVLAIAMGMSACQDRNSKNDGMHEASDPATSHDMNKNS >NZ_CP014528.1|WP_001984002.1|1749718_1750009_-|hypothetical-protein MFFLYRFVLVSLLTIGVLNLMGCRPMSKNEFNTRCVWAGHDLSACNCIYNSLEQHYSPQFVESLPKLSLQNIDAKMNFVETMNQTMQQCQLSASKH >NZ_CP014528.1|WP_000119785.1|1748811_1749717_+|LysR-family-transcriptional-regulator MSYFDINRSGELAIFIRVVELGSFSAVARACNMTPSAVSKLISRLEKRLGVRLLNRSTRQFQLTSEGCQFYEQGIQILNDLDELEQSVTANHIPKGRIRIHTSFSYWTHFLLPCISLFNQRYPEIELEAHLSDEVINLVEQRIDVAIRTGPLKSSNLVARSLGSTYKHYVCSPVYIEKYGCPEHPDELHEHQLLDVSYQRQNKTWLFKKATQEISLTPSKVLKVNHGEAILQLALAGAGIAQLNEFQIRNALQQKQLVKILEDWNIHASEEFHAVWIGHDKYVPNRVRTFLDFLVEHASIN >NZ_CP014528.1|WP_020753041.1|1747461_1748700_-|SGNH/GDSL-hydrolase-family-protein MKLYQATLFSLVLITSFAQADVEKSQWITTWSASPQKVWNKDFVFPTLIPEQVSNQTIRQMSKISLGGEAVRLVFTNQYGKQPLYIDQTTIGLANAATLKSKSTYPVYFSGQLKARILPGKQLISDPIQLPVPDHAQLVMNSFIQKSTTFKTFHWDAKQTSWLISGNQTTNLTTPTDAKTTTARLLLSAIEVKPKQKAHVVAVVGDSITDGATATLDANTRWTDFLAKRLSAHRVAVINSGISGNRLLTDGMGDSVLKRLNSEIFQYSGVKTLIVLVGINDISWPGTAFAPKQQIPSFEALTQGYRHVVSEAHKHNIQVIGATLLPFSGALPNTPLDNYYQPNKDQLRQRINHWMRTSHTFDGVLDLDKGLKDPKHPNRLNPIYDSGDHLHPNDRGNQHMAELVDLDQIIKN >NZ_CP014528.1|WP_086225857.1|1746132_1747416_+|DcaP-like-protein MKILNTTIQKSLLAVSVTLLMSSAFAGQVNPEIEQLRQEIKELRAMLQTNMEAQKSLAQKRVEQAAPVVTQAPQPIQQTLTKSGAEFNLYGYIRADASYQIKGASTMYNNISGVPLENTPEESAQKDQLHSTVYVTRFGLNFKTPTAVGDVGGKLEMDFFGAATRDQFRIRHAYLTFDKWLIGQTWSTFIAPEYYPETIDAGTFVGSALLRSPLVRYSDNLTANTSFAVSVEDPKYTAATDPDNKMRLPALVGRLNHKFANGSMLSGRSFVAEKRTNNDSEWAWGVGLGGKYQITPDTLLKADYYHVKGDGRFLLWSNSGYAIDDQNNMHSNEFDTVSLGITHQFTPQIRSTLGYGYMKAKDDNRFAELQRTSTTQNKQLWQGWVNALYNPYKPITLGIEYVYGERETFDNRNGIDNRFNMIASYDF >NZ_CP014528.1|WP_001029900.1|1745217_1745889_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MAKDFNSPKVVEGYDAHIRKLIPGYEVIHQQVDAILQSVLRPDAHILIVGCGTGYELEYLLKRHPNWQFTAVDPSLTMLQKAQEQVEILGKSAQVTFVHGETSALPLESCFDAALSILVAHFIADDIKPAFFKDIYKRLKEKAPLLTYDLMTCVNPQQLQALHYLCLAQGLTEEQCQKMLERMAEDFFSLTTEGYIKLLEETGFESVQPYTQILTYQGFIAKK >NZ_CP014528.1|WP_001183735.1|1743466_1745161_+|AMP-binding-protein MQQERLSYASGPSTQPLLGMTIGEQFDQACQQYAEKEAIVSFHQNRRLTYKALQDEVNAFACSLLKLGLKKGDRLAIWSPNCVEWTITQFAAFKAGIILVNLNTAYKSHELEYVLNKVSCKGLIIASQFKTTDYQELLTKIAPELTTCIDKVLSSERLPHLKFVIKIDDQQHTGIYRFSDLLTTPTSEQLEQLKQLARQLQFDETINIQFTSGTTGNPKGTMLTHHNILNNGYFVGEGIRLTPQDKVCISVPLFHCFGMVMGNLACVTHGATMVYPSAVFNPLETLKAIHQERCTAAYGVPTMFIATLEHEQFNDFDLSSLRTGIMAGSPCPREIMQRVIDRMHMSEITICYGMTETSPVSVQSSVNDSIDKRVSTVGHVHPHVEIKIVDLEGQIVPQGTLGELCVRGYSVMAGYWGEEEKTREVIDAAGWMHTGDIAEMDQDGFIKIKGRIKDVVIRGGENLFPKEIEDFLYTHPDVSDVQVIGLPDAKYGEELCACIILHEHHQVDEDSIRQFCKEHISHNKVPRYVRFFNEFPMTASGKAQKFKLQEIMRAELNLTGNVFD >NZ_CP014528.1|WP_000482091.1|1753141_1753621_-|CinA-family-protein MFNKCCELLAKEKIKIAFFESASAGYLAYRFSLSPYSGDILIGSLVSYDLRVKENTLHISEELIEKYTAESMQVTVEMINKGKELLHADLYVACTGLLKKGGSETPEKPVGTFFYSIYYKNNFYNFRRVLRGPAFLKLRKLIYYVTQDIKLIILEDKRR >NZ_CP014528.1|WP_001145679.1|1753936_1755346_+|iron-containing-redox-enzyme-family-protein MPVVVKKRLLDLLQDNQQNYYELFVFFLDPDVSSFEKEKKARDFLAKEIDKLEMKEIDFPSDINLIKAWCENDNKKNCQEFQAYLNRRQSGQDREYFKNVAQAFEFLIKVSPTKKVDGAWLYSSVHYWNDPIFHELIITYLEELGLGEPKANHVCIYDDLLRSLGLDSFDLLLEDEYYHQAVVQLALGYAPSEFIPEIVGFNLGYEQLPLHLLISNYELAELGIDSKYFNLHITIDNIDNGHAYKAIKVIEDIYNKYRDKELFLTKLKRGFALNNHGVSSSNIIKNLNTEDFVHRIFKRKALVGQLIHNETRQFGCKTINQWLSNPDDIAGLITHLTEHKWIKFNTDPEQSVFWRMINEENGKMFGVFNPVERQIIHDWIAGSDHSSSFLAYSRELKNSQRIQDYLFSYISDGELDALQERVQQSSDLAIKICKLTPFLAPDSHHKSIGLWSTRKYVELLFPYLGTFKN >NZ_CP014528.1|WP_085941324.1|1755400_1757545_+|catalase-HPII MDMNDNTKSTNKTSEMAGADAANKANTTQKTEQLDTVRDDATNEALTTNQGVKIADNQNSLRAGIRGSTLLEDFILREKITHFDHERIPERIVHARGVGAHGYFQAYEGNERLTKAGFLTDPTIQTPIFVRFSTVQGPRGSADTVRDIRGFAIKFYTQEGNFDLVGNNAPVFFVQDGIKFPDFVHAVKPEPDTEIPTGATAHDTFWDFVSLVPESAHAVIWAMSDRAIPRNLRSIQGFGVHTFRLINAEGKSHFVKFHWTPKQGLSALVWDEAQKLAGKDPDFHRRDLYEAIEQGFYPEWELGVQIVEEEDEMNFDFDLLDPTKIIPEELVPVTPIGRFVLNRNVDNFFAETEQVAFCPGHVVPGIDFTDDPLLQARLFSYTDTQLSRLGGPNFHQIPINKPVCPFHNNQRDGIHQHTIHKGQAAYQPNSIDGNWPVETPPAASNGGFESYPEKISGHKLRQRSETFSDYFSQPRLYYKSLAPHEQKHVVDAYTFELSKVQRKHIRERQVQQILANIDLDLARQVGANLGIEVPDLTLNYKKTAVEKSAKLSFLAFPPEDIQGRKVAVLIHNMVKSDALEAIKNWAIKEGVILHLLAPSLAPVKDHKDNVIVADGMQMSEPSIAYDAVIIPDGDNLNTVMQDGVARHYLLEAYKHLKPIVFLGNKSDLLEPLGLVADEGTLIEDEFQHVAEKFKNLIKAHRVWSREQIAAHVPA >NZ_CP014528.1|WP_061422261.1|1757599_1758478_-|SDR-family-oxidoreductase MENTTNQYPSEVPAQVQPHQPGDQEKMHPEPEIIKASHKGSEKLKGKVAVISGGDSGIGRSVAVLFAREGADIAVLYLEEDQDAEITKQLIEKEGQQCLLLKGDISDPDLAKQNIDKVLQHFGKINILVNNAGVQYQQKEIESIINEQLEKTFKTNIFAMFYLTKEAIPYMEEGDSIINTTSITSYQGHDELIDYASTKGAITSFTRSLSNNLMKQKKGIRVNGVAPGPIWTPLIPSSFDAETVEKFGKDTPMGRMVQPSEVAPAYLFLASDDASYITGQVIHVNGGQIVNG >NZ_CP014528.1|WP_000983630.1|1758619_1759033_-|hypothetical-protein MMQPTHTHSTLQYIHISVPEILLSNIQIKNSWQDYNQEWSYRLDPPHASHPFQRDLYIIKSKNIETEDIKKLLDNIVVKNNKNKDDLKNIVEAETVIKEILDLSNYIPIENWLNDTGNRSIIESMIDKNKVKLLDII >NZ_CP014528.1|WP_161794718.1|1759583_1760756_+|stress-induced-protein MDPERVREIASKGGRAAHASGNAHEFTSEEAREAGRAAHASGNAHEFTSEEAREAGALSHKNDDRNGRGRSRYDDDEDDDRGRSSGRGRGRSRYDDDDEDDDRGRSGGRGRGRSRDDDDEDDDRGRSGGRGRGRSRYDDDDEDDDRGRSGGRGRGRSRRDDDDEDDERGRSGGRGRGRSRRDDDDEDDDRGRSGGRGRGRSRYDDDDEDDDRGRSGGRGRGRSRRDDDDEDDERGRSGGRGRGRSRYDDDDEDDDRGRSGGRGRGRSRRDDDDEDDDRGRSGGRGRGRSRYDDDDEDDERGRSGGRGRGRSRRDDDDEDDDRGRSGGRGRGRSRYDDDDEDDDRGRSSGRGRGRSRRDDDDDDDDRRGRSDGRGQNSRNQKRDAYGRFTS >NZ_CP014528.1|WP_085940413.1|1760869_1761960_+|IS4-family-transposase-ISAba1 MTHLNELYLILNKYLKWNKSHLKCFALIMLVIILKQTCNLSSASKALPIKCLPQSFYRRMQRFFAGQYFDYRQISQLIFNMFSFDQVQLTLDRTNWKWGKRNINILMLAIVYRGIAIPILWTLLNKRGNSDTKERIALIQRFIAIFGKDRIVNVFADREFIGEQWFTWLIEQDINFCIRVKKNFIVTNHLGKNHKISDLFRHLKVGQIECRKRRILVGRVKLYISALQLENGELLLVVSPQFNANAIQDYALRWEIETLFSCLKGRGFNLENTRLTDPRRVKKLIAVLAISFCWCYLTGEWQHDQKKAIKIKKHGRLSMSLFRYGLDYVQMAIQRLIGFGKKEEFKEILAILRRQNPDRIRVL >NZ_CP014528.1|WP_020753044.1|1762005_1762242_-|hypothetical-protein MKNQRDAVLGYADEQHAYYIRLIENDAVLGESYGIFCENPESEAAENIMTTLFLKKSFWLNGSEFTDIVKGLHPLTHS >NZ_CP014528.1|WP_001124837.1|1762524_1763136_+|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit MPKKKEFEHGGARENAGRKAQFNEPTKVIRVPESQVNFIKNWLLNNVKTDNQTDFTSKLKIQQIHPNNDKIYHIPLATERVAAGFPSPAQDDIEQALDLNEYLIRNENATFIVKANSLSMLDAGIDIDDPLIVDRSIPAKSGDIVIALIDNDFTVKRLMIDTQFQPPKVWLKAENPDYQNIYIEEGQELVIWGVVTYNLKRMR >NZ_CP014528.1|WP_002048382.1|1763206_1763818_-|LysE-family-translocator MAFNIFIAFWSVSILFIITPGADWAYAISAGIKGKVVVPAVAGMLFGHFITILLVAAGVGLLVANNPTALMILTVAGSAYLLWMGINLLLTPPTPNQSGSEKAQSWLSWATKGVYVSGLNPKVFLLFLALLPQFIDTTASWSVTTQILAFGVVHMISCAIIYLMVGYGSEAILKTRPQAAQLVGRFSGGLMVVIATCLLIGQI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP014528_2 | 2082976-2083077 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP014528_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP014528_2
>2.1|2083000|54|NZ_CP014528|CRISPRCasFinder TCCTGAGAAGCGACTAAAGCTTCGCAAGAAGACGAGAACTATGTTCGAGTGGAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP014528_2
The CRISPR arrays of NZ_CP014528_2 >merge|NZ_CP014528|2|2082976-2083077|CRISPRCasFinder GAGGATAAACAAAGCAATGCTTTGTCCTGAGAAGCGACTAAAGCTTCGCAAGAAGACGAGAACTATGTTCGAGTGGAAGAGGATAAACAAAGCAATGGTTTG >NZ_CP014528|2|2|2082976-2083077|CRISPRCasFinder GAGGATAAACAAAGCAATGCTTTG TCCTGAGAAGCGACTAAAGCTTCGCAAGAAGACGAGAACTATGTTCGAGTGGAA GAGGATAAACAAAGCAATGGTTTG
>NZ_CP014528.1|WP_000465452.1|2080622_2081318_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MFFKQFFEKESSTYTYMLGCEETRVAVLIDPVASDIEIYAKELEQHQFTLIYTLDTHVHADHITAADLLRERFHCKSVLHRNSDVSCGDILITDGCMLKVGNLSIEARYTPGHTNACTSYLVGNMIFTGDALLIDGCGRTDFQQGSAGTLYDSIHKQLFSLPDETIVYPGHDYKGRLSSTIGYERLNNSRLGQNRSREDFIELMNNLNLPYPKQIDKALPANQACGSISQL >NZ_CP014528.1|WP_002126138.1|2079159_2080431_-|sigma-54-dependent-Fis-family-transcriptional-regulator MAKLNFELEQDFYILFEQLKALFPNAILFLVDTSTQAIHYKFNTDDISVESMAALTQDHHNQYLEINTPKMRRRFIYQEHDIYIAEHRIIGKLHILQPVSIENDIVDGVELTEQLQDLAKVFNSCSPEMTRMFSIIQRVAITEFPVLVRGESGSGKELVAKAIHDYSQRKNKIFVAINCAALNSNILESELFGHVKGAFTGAIRDHKGVFERAAGGTLFLDEIAEIPLELQAKLLRVLETGEFTPVGGEKPIQANVRIITATHKALREEAKAGRFRHDLLYRLRVIPIFIPPLRERKVDIPLIVDQILKESSTQLDTMPRHVNQKAMQVLLNYDWPGNVRELKNTLLYALTMANGKDEIEVEDLPNELLNADDYVKLPETNAELSPENVQAALEKYNHNLNMVANIFGISRTTLWRYRQKHKL >NZ_CP014528.1|WP_000637000.1|2078178_2079090_-|bestrophin MIVRDKSNVFKLLFAWKGTILPKVLPALSFVVLISACVVWLSYYHWIQIPTVPAIGFTIFGVILSICTGFRNNACYDRWWEGRKLWGALIANARHIVRDSHVLSNEQREHLIHQVLIFCNLLRDRLRQQTVEPTKFLEHAYLNNSSLNYLNEHINAPQFVLENIQKDLVKALKDGEISDIIYGTLTRHIVELGNIQAGCDRIAGTPLPYSYSVLLHRAVYCFCFILPFSLEAALGIWTPLIVGLIAYMFLGLDALSAQIEEPFGLQENDLPLDSIVRLIERESLSSLGQPLPPIIEAQNNNLL >NZ_CP014528.1|WP_000642319.1|2077072_2078131_+|2,3-butanediol-dehydrogenase MKAARFYDRGDIRIEDIPEPEVTPGTVGIKVAWCGICGTDLHEFMEGPIFIPPCGHPHPISGESAPITMGHEFSGVVYAVGEGVDDIEIGQHVVVEPYIVADDVPTGPGDNYHLSKNMNFIGLGGRGGGLSEKIAVKRRWVHPISNKIPLDQAALIEPLSVGHHAYVRSGAKAGDIALVGGAGPIGLLLSAILKAKGLKVIITELSAKRKEKAKESGVADYILDPSEVDVVSEVMKITNGDGVDVAFECSSVNKVLDTLVAAVKPTGVIVIVSIWSHPASINVHSVVMKELDVRGTIAYVNDHQETIKLVEEGKINLEPFITQRIQLDDLISQGFETLIHNNESAVKIIVHP >NZ_CP014528.1|WP_020753118.1|2076257_2077043_+|acetoin-reductase MVKGLKNKVALVTGAAQGIGRGIALRLAQEGAHIELVDMKQDRLNDVQQEIQALGVNASTFIADVSDREQVYAAINHAEQTLGGFDVMINNAGIAQVQAIADITPDEFQKIVDINIGGVLWGIQAAAAKFKQREHKGKIINACSIAGHDGFALLGIYSATKFAVRALTQAAAKEYASHGITVNGYCPGIVGTDMWVEIDKRFAEITGAAIGETYKKYVEGIALGRAQTPDDVAALVAFLASEDSDYITGQSILTDGGIVYR >NZ_CP014528.1|WP_001271394.1|2074827_2076231_+|dihydrolipoyl-dehydrogenase MSAAQFDLIVIGAGPGGYVAAIRAAQLGLKTAIVEEQHLGGICLNWGCIPTKALLAGAELATQFKHAGQFGFQVSQLDFDVQKLVQHSRQVSAQLVQGIDYLLKKNQVTVFNGRAQLTAKEKIEVTDAQGNSQVLSAPHIILATGAKARHVPQLPVDGTYVWSYKEALVPEQLPKSLLVVGSGAIGSEFASLYQDLGCQVTLIDLAKQILPTEDAEVAQFVRKQFEQKGMKVITDAVVQSIQIENEQVHCVVETANDVQTLVFDRVLSAIGVQPNTTGLGLERLGVELNPQGFVAIDDYCKTNVAGLYAIGDVAGAPCLAHKASHEAMICIEKIAGVANVHSLDRSQIPGCIFTHPQVASIGLTENAAKAKNLPIRIGKFSLTANGKALAIGDASGFVKTVVHAETGELLGAHMVGHEVTEHIQGFAIAKYLEATDESLAQVIFPHPTLSEAMHESILASMQRAIHM >NZ_CP014528.1|WP_001289733.1|2073281_2074817_+|2-oxo-acid-dehydrogenase-subunit-E2 MSEIKTLEIPKWGLSMEEGTIAQWLIKEGDSFNKGDEICEIETTKIVNVLEAPFAGTLRKILAKDGDTLPVGGLIAVCADSEVSDAEIEKFIASLGGSAAQAPEAPSEQSKAETSAPVAEKTAQPQTAAASASAPAKVAKDDYAVPESLQGYQTSNELFATPHALKLAEKHNVNLAKVTGSGREGRISVQDIQKAVQASGGQWPDVRQQTQAKVVKSTADDSQVLATPVARRLAKQWGINLNDCRVSGTRGRVCKEDVEAVYYRNNPVSVSEQPVQCAAQPQSTVTTVAMNGMRKAIASRLQAAKRNAPHFRLVVDLNVEALQKLRKQINETVPQVKLSINDMLIKAAAAALIKVPEVNVQFDEATQSILQFSQADISVAVAIPNGLITPIVKAANQKSLAQISDDMRDLATRAKTGKLQPDEFQGGSFSISNLGMLGIKQFDAIINPPQGAIMALGASESRAVVENGNVVVREIVTATLSCDHRVIDGAVGAKFLASFKQFVENPALILV >NZ_CP014528.1|WP_001133053.1|2072260_2073280_+|alpha-ketoacid-dehydrogenase-subunit-beta MPNKSFRNAIKEAIESEMRRDPTVFVVGEDVRGGHGGKNTEENQLEGFGGVLGVTKGLWTEFGSERVIDTPITESAIIGMAAGAAATGLRPVADLMFMDFYGVCHDMLYNQAAKFRYMFGGKAKAPMVVRGMIGAGFSAAAQHSQSPYNVFAAVPGLKVVVPSSPYDVKGLLIQAIRDDDPVVFCEHKMLYDIKGEVPDDAYTIPFGVANYTREGTDVTIIALGLMVHRANEVADKLAKDGISVEVVDPRTISPLDEEGILESVASTGRVVIVDESAARCGFGHDVAALIAQKGFHYLKAPVELVTPPHTPVPFSPVLEKEWIPSVERIEQAVRKTLEA >NZ_CP014528.1|WP_004841245.1|2071284_2072247_+|thiamine-pyrophosphate-dependent-dehydrogenase-E1-component-subunit-alpha MQLTEEQLLAAYKRMRDIREFEDRLHEENTNGDIPGFIHLYSGEEAVAVGICENLTDKDYITSTHRGHGHCIAKGCDIHAMMLEIFGKDDGLCRGKGGSMHIADLDKGMLGANGIVGGGPPLAIGAALTAKTLKTGGVGLSFTGDGGSNQGLTFEAMNMAVVLKLPVIFVFENNGFGEGTGHDYAVGSKDIAGRAAGFGLPAVKVDGTDFFAVYEAAQTAIDRARRGEGPSVIETITNRFYGHFEGDPGLIRSKEEVEFIKENKDPLKIFREKVKGKIDEAKLDEIDAASKANVDDAVAKARAAAYPKPEQLLTDVYVSY >NZ_CP014528.1|WP_000364551.1|2069933_2070920_-|lipoyl-synthase MDLKRQIETGIKLRGIDKVSRIPIKILPTEELPKKPEWIRAKITDFEEIQRIKNLLRQQKLHSVCEEAACPNLPECFAGGTATFMIMGDICTRRCPFCDVAHGRPMPLDENEPKHLAETVANLNLKYVVITSVDRDDLHDGGAAHFVKCIEEIRNRCPDTLIEILVPDFRGRLETALSTLSLSPPDVFNHNIETVPRLYKAMRPGSDYQHSLNLLKRFKKYCPDIKTKCGLMVGLGEIEAEVIALLNDLKDHDVDLVTIGQYLQPSKSHAPIHRFVNLQEFERYTQHGQRLGFKNIWSAPMVRSSYFADRQYFGESAPKPFSREDVLS >NZ_CP014528.1|WP_000925651.1|2083177_2083969_+|sulfite-exporter-TauE/SafE-family-protein MLLLVVEGIVIGFLLGLTGAGGGILAVPALMTSQGWSVAQAAPIGLLAVALSTLIGTIEGLFKKIVRYRAAIWIALIGAPMAHIGILIANTISPIWLMLMFSLVMFTVGYRLINNRVSDFHNPPCQVNPSTGRFIWNFKTGGVLASIGIIAGLLTGMLGVGGGFVIVPALRKVTNLDMHSIVATSLMIIFLISGMSIVMHIAEGFQYPVAITSAFALACAFGMLLGRRAIRFIPSAIVQKVFALMVFAVAIYMVIKIVNLTNI >NZ_CP014528.1|WP_000822394.1|2084078_2085083_+|hypothetical-protein MKRINVAICGFGRIGQQIAELLLNRSTYYKQKYQIDARLVGVCNSSSGLIDQEGLQASKWLDKTQYQAGLTEQKFLKQVQADVIIETGPSDYVTGGKGLFYLNYALTHSMNAIAVSKGALVVEGKKLINLAHQHNKKLFFSGATAAALPTVDLFEYNLAGCQILEIESVFTGTTNFILNDMLQHECAFTESLEKAQARGIAEPNSSFDVDGWDTAAKITILANTVLGVDVKIQDIPRQGISHVTTEHIRDWKKENIIPRLVGFIHIKNQQIQTGVELRLVPANHPFAHLQGSNKCIRVLTQEMGEFVVSGGASAPLATAAAALKDFELMLKTGC >NZ_CP014528.1|WP_001023744.1|2085115_2086033_-|EamA-family-transporter MNILLYVAVVLIWGTTWIGIAVQSHYATPVVAILWRFAISALLLWVVLLFSGKLQRIALKDHLFCMLQGLCVFGLNFICFYTAVKYVNSGLESVIFSMAVFFNAINALIFFKQKPSPNFAPAALLGLSGIVLLFWHDLINSQFNAQLLMGIGLCAIGTYGFSLGNMISVRHQKRGLNIFSTNCYAMTYGALVMLILALFTGQDLMPPMNFPFLSSVLYLAVFGTVIGFSAYFSLVGRIGAAKAAYSTLLFPLVALTVSTFFEGYEWTLNAVFGILLILLGNYLMFSKFEIGKKLFSSQKNCEKQA >NZ_CP014528.1|WP_000331400.1|2086199_2087054_+|AraC-family-transcriptional-regulator MAYQTLEQLQQSKAKLHETVVLDENMQLAFWSNQQDRVSVCSDHHTLSLYIQDGYESYQKTPAGWKNGGGPGRFCLLPEHQESTWDIRGGLKFVHLYYTDQHLRDVAEKIWDKEPNQIELNEVVFNDDERIRALYQFFLLDCDWQDSSNHLQMSTTASLLLNHLIRKYSSVQWQQPTIKGGLAPHKLKYIQEWIEDHLDQALTLSDLANVVNLSEYHFAHMFKQSMNMAPHQYVMQRRLTKAKGLIQSSQLSLQDIALVCGFSSASHLSHRFKQFYGMSPSQLR >NZ_CP014528.1|WP_004835232.1|2087050_2087446_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTVTIPHDIQSSDCQRVSQVLARVGEKWSILIVMTLASHPHRFSEIKRRINGISQRMLTLCLRGLERDGLVKRTVYPVVPSHVEYELTPLGHSLTEPVIALGQWAQQHIADIDAARAAFDAAQEKPITLDT >NZ_CP014528.1|WP_000771644.1|2087541_2088150_+|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase MKLLQIDTSILGEQSVSRQLTSSVIRQLSTAYPDAEIIHHDFALEPIPHLSDAEFLAWQGVEPNNEIAQQRVARNTQYLDEFLSSDIVVIGAPMYNFSFPSQLKAWLDRLSVAGKTFRYTENGPQGLVEGKRVIIASSRGGVYSEGSPAEALDYQETYIKAFFNFIGVTDITFVRAEGIAFGPEARQTALDNAAAQIAQLAG >NZ_CP014528.1|WP_020753120.1|2088233_2089583_-|chromate-efflux-transporter MQQKQLNTPDDSVEQVTFWQAILFWLKLGFISFGGPAGQIAVMYQELVEQKRWISEKRFLHALNYCMLLPGPEAQQLATYIGWLMHRTTGGLVAGILFVLPSLFILIGLSWVYIKFGDVPVISGIFYGIKPAVTAIVFHATYRIGSRSLKNKFLWFVAIAAFFAIFFLKLPFPLIVLSAGIAGYLASKKYPELFSSAAGHKASQKDYGPAIIDDDTPTPEHAKFHWLRLAKLIFVAIALWLLPILALGAYFGWHHSYTQMAWFFTKAALLTFGGAYAVLPYVYQGAVNHFGWLSPTQMIDGLALGETTPGPLIMVVAFVGFLGGVNHSLLGSEHLFFAGALGAVIVTWFTFLFSFVFIFAGAPIIESTHNEIKFTAPLTAITAAVVGVILNLALFFSYHVLWPQGFSGHFDIVAALITVAAFIALFRFNINVLYVIFASALVGLAVTFF >NZ_CP014528.1|WP_000080821.1|2089824_2090568_+|GntR-family-transcriptional-regulator MSQLPQDPKNHKPLYDQLRELILNKIVNGEYAVLSQIPSENEFAEQFGVSRITVRQALNQLQLEGYIFKVPGKGTFVSKPKTFQNISSLQGFAEAMSSAGHEILNRVISAELKQVPMHVVPKLKLPVKANVYEIQRVRLLNRQPVSYELTYLSEHIGLKLKEKAIDLRTTDIFKALEQECDIPLGHADLSIDATVADEELAALLQVEIGTPVLRVERLTHDANGQPIDYEYLYFSGDTFQYRLRIHR >NZ_CP014528.1|WP_020753121.1|2090596_2092330_+|fumarate-reductase/succinate-dehydrogenase-flavoprotein-subunit METKYFEFDIVVIGGGTAGPMAAIKAKQENPNLKVLLIEKANVKRSGAISMGMDGLNNAVIPGYATPEQYTKEITIANDGVVNQTTVYAYAKHSFTTIQQLDQWGIKFEKDETGEFAVKKVHHMGAYVLPMPEGHDVKKVLYRQLKRAQVKINNRIVTTKLLKNEQGAINGVLGFDCRSGDFYVIKTKAAILCCGAAGRLGLPASGYLMGTYENPTNAGDGYAMAYHAGAELANLECFQINPLIKDYNGPACAYVTGPLGGYTANSKGERFIECDYWSGQMMWEFYQELESGNGPVYLKVDHLAEETIQTIEEILHTNERPSRGRFHEGRGINYRQDMVEMHISEIGFCSGHSASGVWVNEKAVTSVKGLYSAGDMAAVPHNYMLGAFTYGWFAGVNAAQYVNAVEDSELNQSEIEAEKARIFAPLDCSEGLPPEQVEYKLRRFVNDYLQPPKTRQKMEIGLKRFEEIKQDIKRISARNPHELMRAAEVSFIRDCAEMAARASLFREESRWGLYHYRADFPQKNNSDWFCHAHLKKDEHGNMVSFKKPIEPYVVPINQDEAVSYDRLRIQKDVALAD >NZ_CP014528.1|WP_000864074.1|2092350_2092596_+|ferredoxin-family-protein MAFIFKEVQHRTVAPVIIDEDKCIADKGCTVCVDVCPMDLLAIDPTTQKAYMQFDECWYCMPCEKDCPTDAVKVNIPYLLK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP014528_3 | 2365795-2365939 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP014528_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP014528_3
>3.1|2365841|53|NZ_CP014528|CRISPRCasFinder CCGCTTTGTCTTGCTCAGGTGGCGTTTTTTTATACCTGTAAAAAGTTCAATAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP014528_3
The CRISPR arrays of NZ_CP014528_3 >merge|NZ_CP014528|3|2365795-2365939|CRISPRCasFinder AAATTAACCATAACTATGTTCATCTCGCGCTTCGCCAAAGCTTTAGCCGCTTTGTCTTGCTCAGGTGGCGTTTTTTTATACCTGTAAAAAGTTCAATACAAATTAACCATAACTATGTTCATCTTGCGCTTCGCCAAAGCTTTAG >NZ_CP014528|3|3|2365795-2365939|CRISPRCasFinder AAATTAACCATAACTATGTTCATCTCGCGCTTCGCCAAAGCTTTAG CCGCTTTGTCTTGCTCAGGTGGCGTTTTTTTATACCTGTAAAAAGTTCAATAC AAATTAACCATAACTATGTTCATCTTGCGCTTCGCCAAAGCTTTAG
>NZ_CP014528.1|WP_000616034.1|2365510_2365744_+|hypothetical-protein MIQRISHHDLEHVYATAVNTIQSQMNFQDAVAQLEEVARAGHGKAALFLAELYYQGFRVERDSMKAQYWQKLATMQA >NZ_CP014528.1|WP_000185571.1|2364935_2365295_-|hypothetical-protein MTNTIDGFVFDNPPKEEQIIELAHYHRKLLDEAIFHQEIHLGDYCLAQRKRVFDYARQLDPNQKAWFYQVYDGELRKIADEDELHPADAEEGLSIFAMLLVLVIIAAILYFSVIRSLMG >NZ_CP014528.1|WP_000955083.1|2364508_2364835_-|hypothetical-protein MLTFKENFLKLKSELKADQCFNLVVIIIIGCIFMLSYLALLRPVNSEQYQRIVQLSRQATYPRTQDMAELIMAQSEIHRAEYLKLMHAYQFEHNHIKQYPALAQEDTQ >NZ_CP014528.1|WP_020753209.1|2363294_2364401_-|signal-recognition-particle-docking-protein-FtsY MQQQSNMQNKFLIDAEIGDDDVTLPNLPAIDVPIVESPVKQEVKAEEVVEAAPSTEPEQPKSGFFGRMKEGLSKTRRNFTDGMVNILIGGKEIDDELLEEVEEQLLVADIGVDATKTIITNLTERTARGDLIYSHSLYKALQEELVALLAPRVKPLHIDLNKSPYVILMVGVNGVGKTTTIGKLAKRLQGEGKKVMLAAGDTFRAAATEQLQIWGERNDIAVVAQGHGADSASVIFDAFESARAKGIDVLIADTAGRLHNKSNLMEELKKVKRVMQKIDATAPHEIMLVVDAGTGQNAINQVQEFDQAVGLTGITITKLDGTAKGGVLFNIASRTHVPIRFIGVGEKIDDLRPFSAKSFVAALFETEK >NZ_CP014528.1|WP_000102943.1|2362509_2363106_-|nitroreductase-family-protein MSTFLDKIKNRRTIYAIGKNVALDRTKIEETIREAVKHSPSAFNSQSSRVVTLYGESHAKFWNLVREALRKIVPADAFAGTNAKIDSFVAGVGTVLFYEDQAVVKSLQEQFELYADNFPVWSEHSSAIAQFATWTALSELGLGASLQHYNPIVDADAAEAFDVPATWKLRAQLVFGSVEAPAGEKAFISDEDRFKTFN >NZ_CP014528.1|WP_000175351.1|2361612_2362284_-|DUF2057-domain-containing-protein MTLRLSVAAMGLLLSGSVFSAVTITAPEEIVILAVNGQEVNSGLFRSSKNNYKVDAGETSLSVRYQEYFEHLSGEHDIVKSGVVTIQTPALKDGQTYKLAMVDAPKQFEQAKKYAEQPTVALYNSNNELIVQQTGANNEARPWFASGLLGKVTDFTTKSSKQQPDAVYAVAKPTTTQANAPVATTMPPTGVAQTNDQRLAEIWKKSSKAERQKFMAWLAEQSN >NZ_CP014528.1|WP_000593796.1|2361015_2361540_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MIKLNFRLAEFSDIPTLVELINQSYREQQGRSWTTEVEYVKGQRINKEQLKHQLELPNSVLLIGEIDSSKVVTCIGLTFQSNTVEIGTFCTDPHVQNMKIGRCVLEYAEQFALHKVPELDSAIMYVLNVRSELIAYYERRGYIKTGNHEPYPLDANVGLPLIPIKLIEMKKDLK >NZ_CP014528.1|WP_085916945.1|2360703_2361003_+|cyd-operon-YbgE-family-protein MMATAMTASNQRKAQAFAMAISFLLALPLAVILLVHPSLMLDANGHYNHSQLMLVMVGISGGFIYGVGFVPHFWLWKWLFSPWIAWPLMLLGYYIWFLT >NZ_CP014528.1|WP_000270276.1|2360601_2360703_+|cytochrome-bd-I-oxidase-subunit-CydX MWYFAWILGILMACFAGVLSALYIEHHQNLDEE >NZ_CP014528.1|WP_000575163.1|2359442_2360588_+|cytochrome-d-ubiquinol-oxidase-subunit-II MIEYELLKIIWWVLVGVLLIGFALTDGFDMGSMALMPFVGKTDNERRAAINTIAPHWDGNQVWFITAGGALFAAWPMVYSVAFSGMYWALLLVLFALFLRPVGFDYRSKLENTQWRNSWDWGLCIGGAVPALVFGVAFGNLFLGIPFSLDSTLRSEYSGSFFALLNPFALVCGIVSLSMLCAHGGAWLMLRTDGALKQRSAKATQIMAAIFLVCFLVIGAWLYFGQVPGYSYAAAVDPNAALNPLAKEVVTNNNPGWMNNYSSYPITKVAPVLAILGAIIAFFTASKAKAGLSFAGTSLMIVGAILTAGFALFPFLLPSSVNPNSSLTMWDAVSSHRTLGVMTVAACIFVPIILIYTSWSYYKMWGVITNKHIESNSHSLY >NZ_CP014528.1|WP_077163451.1|2366221_2366554_+|DUF2750-domain-containing-protein MIKIYILRTMMYCGVLWGLFDEGWAIKSDQEDFIFPFWLNGVQAHRYAKTHWPNYKPRKITPKDFHESLLPTLTRLKVTPALFNSSHRKLKLSTQQMHHFFFNHPKWQVA >NZ_CP014528.1|WP_000156920.1|2366694_2367126_+|CBS-domain-containing-protein MTIVAQVIKNKSEQAIFTISPEATVLEAITIMAEKGIGALVVAEGEQVVGILSERDYTRKVTLMERSSYSTTVAEIMTAKVITVGLNNTVEECLQLMTDRHLRHLPVLDNGKLVGFISIGDLVKAAMEDQKVLIEQLKQYISG >NZ_CP014528.1|WP_000129938.1|2367176_2368385_-|aspartate-aminotransferase-family-protein MTDITLAPVQPDQPTHLMATYGRQAISFVRGRGAYLYAQDGTEYLDALTGIAVCGLGHAHPAIAEAIAEQAATLVHTSNLFEIPWQTAAAQKLAEVSGMEEIFFSNSGAESNEGAIKIARKFGTQQGISLPKIIVAEQSFHGRTLATLSATGNKKVQDGFAPLVEGFIRVPFGDIEAIQEAALQHPDIVAILIEPIQGEGGINTAPQGFSYLEEVRQICNQHNWLMMLDEIQTGNGRTGKYFAYQHTNIIPDVLTTAKGLGNGFPVGAVMTQGKAVGLLGPGSHGSTYGGTVLGSRVVYTVIDTIQKENAVENAAVVGNYIVDQLRAQLSDKNVQVRGFGMMIGIQLPKDCAELVAIARDEYKLIINVTAGSVVRLLPPINMTQAQADILLERLVALITNYL >NZ_CP014528.1|WP_000138830.1|2368612_2368954_+|Grx4-family-monothiol-glutaredoxin MTEQARDTEALIRDQIAKHPVLLYMKGTPQFPQCGFSARAVEALSQIGRPFAYVNILENPDIRATLPKIANWPTFPQLWVNGELIGGSDIMLEMFQNGELKPLIEQYSAAPEA >NZ_CP014528.1|WP_000121851.1|2369000_2369324_-|hypothetical-protein MSYQLVELENATANIICPICKLAVIDWTQEQYVQPCEHTVFIAMDLGFEFVADRFEQVMNQNVDELHEDPNMNIFDAITTTPYKNLTILKADLGVDGLFRYVGISVC >NZ_CP014528.1|WP_000954523.1|2369567_2370470_+|LysR-family-transcriptional-regulator MLTDLDDFYCFALVVEHGGFSAAERVTDIPKSKLSRRVYNLEENLGVRLIQRSSRHFAVTDIGMDIYRHAQVMMNAAQAAHDLVDHLSIQPRGVVKVSVPVDIAQNQLPKILPAFLKKYPEIRLQLIVSNRRVDVINEGIDIALRVRSKLDDDPSLVLRQFALIEQSLFASQAYLNEFGNIKSPDELSDHRILSLSEEHLDQQFILHGPDNQLKKVKVSPTIMGTNIYMLAQLASQNCGIALLPDTAAEDFVKSGQLVQILPDWKAAHGIFHAVYPSRRGLLPAVRVFIDYLVEHLSEHP >NZ_CP014528.1|WP_001202783.1|2370521_2371316_-|type-I-methionyl-aminopeptidase MRASTVTIKTEQDLEKLRVSGRLAAQVLEMIGEYVKPGVTTEYLDNICNDYIVNTLKVIPANVGYHGFTKTICTSVNEVVCHGIPSQNKILKDGDIINIDVAIIKDGYFGDTSRMYYVGNVNPHAKKLVETTYEAMVAGIHVVKPGATLGDIGYAIQSVAHREGYSIVREYCGHGIGKVYHEQPNILHYGQRGQGLVLKKGMVFTIEPMVNAGKPQVKELNDGWTVITQDHSLSAQWEHMVAVTDTGFELLTPWPEGVGNYPEI >NZ_CP014528.1|WP_001186687.1|2371668_2372970_+|branched-chain-amino-acid-transport-system-II-carrier-protein MQQLRTGDIIALGFMTFALFIGAGNIIFPPIVAQQAGDHVWLAAIGFLITAVGLPVITIMALSRMQGSIEIISSPLGRIASLILTVVCYLSVGPLFATPRTATVSYEIGFSSYFGTSSSSLLIYSAIYFAFVTVVSLYPNKLLDTVGHVLAPLKIIALAILGIAAVMIPAGYVPTPINHYVNSPVSEGFVNGYLTMDTLGALVFGIVIIQAIYSRGVTDNKLVTKYAIIASLISGVGLTLVYLSLFKLGLGSHEVAPNAANGAVILHAYVQHAFGNMGSLFLTGLIFLACMVTAIGLTCACAEYFAQLTKLPYKLLVFILVGFSFIISNLGLTKLIAVSVPVLSAIYPPAIVVIMLSFFWKFWHKPSFIVGSVTSIALIFGIIDGLKVAGFGDYLPNFLQHLPLNEQNLAWLIPSLVVLVVTTLIDKVKHKSI >NZ_CP014528.1|WP_000838063.1|2373161_2373581_+|heme-binding-protein MKSKYYLTLADAEFLMEEAQKYAIEHNFKVSIAIVDETSSLLLMKRLDGASPLTTHLCLEKAKCSSMSGRPSKFYEELLQNGRLGFLSMPSAKGMLEGGKAIIYEGQILGAIGVSGVQSFEDAEIAQHAIDVFLKKQSS >NZ_CP014528.1|WP_000949688.1|2373840_2374086_+|hypothetical-protein MLSLHFNKQVFINTLNSKDSVVYGVTTLALMLTLLFQGMIKGNLKPEYFMYAMVVSFVFCVWAFVDHKMRKLAKRRLSQQK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP014528_4 | 3464834-3464918 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP014528_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP014528_4
>4.1|3464858|37|NZ_CP014528|CRISPRCasFinder GATTATCAATCTTCTTTACTCTACGCGCAGTTTCACT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP014528_4
The CRISPR arrays of NZ_CP014528_4 >merge|NZ_CP014528|4|3464834-3464918|CRISPRCasFinder GCTTGTCTTGCGCCAAAATTAAAAGATTATCAATCTTCTTTACTCTACGCGCAGTTTCACTGCTTGTCTTGCGCCAAAGTTAAAA >NZ_CP014528|4|4|3464834-3464918|CRISPRCasFinder GCTTGTCTTGCGCCAAAATTAAAA GATTATCAATCTTCTTTACTCTACGCGCAGTTTCACT GCTTGTCTTGCGCCAAAGTTAAAA
>NZ_CP014528.1|WP_000077301.1|3464269_3464773_-|L,D-transpeptidase MSQFKLEDADILIDLANQTLSLPKHNKFYVVSTGKNGIGEQENTGKTPRGWHRVAKKFGMQSPKNAVFIARQPTGEVYSSELAAQFPERDWILSRILWLDGLEEGFNKGEGHDTMQRYIYIHGTPDKEPMGVPMSHGCIRMRNEEIIELFDLVSEDALVYLSEQSLT >NZ_CP014528.1|WP_001198164.1|3462407_3463193_+|YdcF-family-protein MQVSKWIRIFLAVIGSILFLDGLFLAFLNKIHVGTLVPLVLGAFFCLYALFYYHLERFFFYHYRLHTLWRFGWLCFWIWLIGLGYFFNFIKENKDASQNLPAVKAIIVLGSGVENGQPSAILAKRLDTAAPVALSQPQAKVILTGGLDFSEKEPEALVMSRYLEQHFHIAKDRMILEDKSTSTELNLKNSKPLLEQAHISINQPIAIVTSDFHTPRAAAIAKKQGYTQVYMVAAETPLITRYNVWLREYFAYASGWLLNEY >NZ_CP014528.1|WP_000473032.1|3459734_3462281_+|PepSY-domain-containing-protein MFKKFLFQIHWFLGISAGLILSIMGVTGAIYSYDQQILKWVNTDSYVVQAQSSPKLTPAQLYQHFTTIQPEIKINSITIAKDPTASSVVNIEKEGERRGYNMMVNPYTAQVLPEVQGRKLLLLIQQIHRNLTAGEFGKQITGACALMLIYFVLSGLYLRWPKKHSARQWLALKPKLKGRNFIWDLHAVVGTWVIVFYLLFACTGLYWSYDWWRSGMFKVLGVEQPKMQGHSGSGRNKDQLPKIQLDNAQLITALNQTWSGFNNQIGRDYSTLTVNLPKKDDGKIELSFVDATPQHERARNQAVYNYKTANIEKMELYEDKKLNQKIMSSMLPVHRGSFFGPVYQFVAMLASLAMPLFFVTGWMLYLKRRKQKKLTQAARQSLAGHYIDQNAKPWLITYATQTGVAEQLAWSTATSLQEAHQPVQVKSVQQLTEADLQQHEQILFVISTYGTGEAPDLASNFAKKLLKTNLELQHVKYAVLALGSKEYPDTYCSFGYTVDEWLKNNGAKALFDIIEVDNANPADIQNWNQALVKATKLDLHAVNIEKVFDNWTLQQRDLLNPNSLGQPAYNIELTASHEAVWQAGDIAEIQPGNSPERINKFLQHHHILKNAVVDSLQVSIEKALWNKDLTGEIEPFANLDHLLEQLPTLPTREYSIASIPSQQVLRLVVRQQYDESGDLGLGSGWLTQHTEINQNVALRIRTNESFHLIDDNRPIICIGNGTGIAGLMSLLHTRTRHNYTENWLIFGERQRAHDFFYASTIEAWQTMGMLKRLDLAFSRDQEQRVYVQDIIRQNAAELVNWIERGAVLYVCGSIDGMASGVDQALIHILGEEQVDELRQQGRYRRDVY >NZ_CP014528.1|WP_000125649.1|3459001_3459577_+|SdpI-family-protein MTAKTLYAYTLQPVPYEVSEAEQRNAQLLIWRSTNKISTKIWAIMGVILALAILGLIFIKNYSTVICWVAIVCVVLYYLGRKYGLEWYVKRKMNEFPVQEIKGIRLGVQPHGIVMRQQMGLQEGVGTIGWKNIYEWYNTPDFILVNFKVKDPKGQEQQGAYILPKRMDSKNFSFNTIRKHLKESVGEPKTL >NZ_CP014528.1|WP_001984830.1|3456726_3458901_+|TIGR01666-family-membrane-protein MKSWFKRLKRATYNTSFMYNVRMLIAFSGTAFVPYFLGHQLATIPLTLGVVAAGLSDIDDRFSVRIMNLIYTYIGFFITAASVQLLFPYPMLFALGLIASCIGWILLGSLGRRYATISYGCLVVSVYTMLGVHLFDQWYIQPALLVAGAAWYGLIATISFLLFPVRQLQDKLAASYASLGDFLFAKSNLFDVDMTPASYQQSMIDLSLENGKLITIFNDLKTALLTRLKGDRGQKGTRRSLHYYFVAQDIHERADSAHIDYQKLAKIFQHSDILFRFQRILAIQGKACQELNECILQRKPYIHNKRFKQSFENLRLSLVKLRDDQQYDLLWVNALFALYRNLKSIDSQLLNLETEQHIQSDKVKQAENQLKDDDLKGWNDIVVRIKQNLTPESVLFRHAIRVSIVLFIGYVFIQMTHIEYGYWIMLTALFVSQPNFNATKRRLRLRIVGTLVGIIVGLSIVFLVPSVEGQLVMLILSGVLFFELRSKQYAQATAFITILALINFNLDGSAVAAAIPRFVDTLIGCALAWFGVTFIWPDWKFRRLPRSIRRSLQAQCNYLAEVVKQYHEGHNHALNYRIVRRAAHNTDAEVASLISTLATEPDFDPTRKSDIFEFLCLNHTFLSYIAALGAHREKIQDQAVLNVLDQALDDIQGALLRDEMPDLTAQNMLQTIRQRLSQNDEDDQKSLIILQQLSLMLSVLNRFSMLKQRLSHDLDNDASELASL >NZ_CP014528.1|WP_000003701.1|3455384_3456599_-|multidrug-effflux-MFS-transporter MSEQTAQRQYSIGWIMLLALLTALGPLSIDMYLPALPQMAHDFGVSTQMVANTLPAYFFGLAIGQLVYGPLSDRIGRKKPLYFGLALYAVASLFCVLATNEWSLIAARILQALGGCVGVVMARAAIRDRLDVQGSAQAFSSMMIVMGLAPILAPMIGAWILIWFPWQAIFIALSIVGAICWLCVHFFFKETLAVDKRLKLSLYQVATLYGAIFKDASFRLPMFAGCLTGAALFCYISSAPAVFMDQYGLNQQEFAYVFGLNAFGIMLMSSLNKHLTTRVEITKRLKAGSMVQVTGASIVLIAGLISAAPLWLVMLGLFLAISGIGLTGPNAMALAMSKQGARAGTASAIMGSMQFACGLLGGVLLNFLIWSASLNMGVMMVLFTLSGFIVVLKAIRQAKSQSLS >NZ_CP014528.1|WP_001047593.1|3454652_3455357_+|nitroreductase MNLEQVRLVDEAITSRHSVRAFLSTPIEPEVIKDILRVASRAPSGTNTQPWKVYVVTGHKRDEMVERVCAAQIEVSKNPELAEQYKETFAYYPEKWVSPFIDRRRENGWGLYGLLDIKKGEKEKMAAQQLRNFKLFDAPVGIFFTVNKAMGIGSKMDIAMMIQNVMVAAKARGLDTCPQAAWNHFHPLVLDILGAADDEELVCAIALGHADPEHIVNTFITPREPVENFAVFLD >NZ_CP014528.1|WP_002010643.1|3453938_3454142_-|hypothetical-protein MSLPLINKQFMKQGLAITIATMKMNVTHATTEPQEIQQLGTDLNALFFNEKEKGTDSRVMTMACYSL >NZ_CP014528.1|WP_000490937.1|3453615_3453756_-|hypothetical-protein MFSGAMNLFYLKGAFSHVTFKGLVLGMMLLKLVTVIAIQVTLKVFP >NZ_CP014528.1|WP_001005337.1|3452040_3453516_-|alanine:cation-symporter-family-protein MNEQLNATLMSWVQFFNEPLWDFLVIFLLAVGIFYTVLTGAVQIRMFLQSIRVMKSSRTEGEDEHGLTPFQAFVTGLASRVGVGNIAGVAIAIAIGGPGAVFWMWVTAVLGMSSAFIESTLAQLFKVRDSNSKQFRGGPAYYITQGLRSKTFGVIFALALIFTYGFVFNSVQINAIANASSHAWGWDKANLIAHLGGVDLEISWVGLALVVMVALAIFGGIKRIAKFAEMFVPLKAGLYLSVALYIALSNYAILPDVLKLIVTEAFHFNAAAGGFFGAAVSMAMMQGIKRGLFSNEAGMGSAPNAAAASDVKHPVNQGLVQMLGVFVDTFIVCTSTAIIILVSGVYQDAGFVGVELTQRALETQVGHWGADFLAVLLFLFCYSAVLGNYAYAESNVQFINNNPKVMFIFRIFVLVMVYFGAIGSVPLVWSMADLFMGIMATINLVAILLLTPMARTLLKDYRAQLKQGIKEPVFKINKYPELKKKVDSDIW >NZ_CP014528.1|WP_001259501.1|3464923_3465292_-|YbaN-family-protein MRTLFWRTLVVIFITLGIIGAILPGMPTTVFLILAAWAASKGWPQMDAWLLNHPKYGPTLRDWRANGTVPRKAKWIATIMMTASGILMLFTSAPFWVKVFTDTTMLVVAIWLWLRPEPKLKD >NZ_CP014528.1|WP_001017534.1|3465396_3466305_+|DUF1853-family-protein 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
663785 : 668980
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP014528|663785:668980|DBSCAN-SWA CATGACAACTTCATTAGATGTAAAGATTTATCACAATCCTGCTTGTGGCACCTCTCGGAATACTTTGGCTTTGATTCGCAATACAGGAATTGAACCAACCGTTATTGAATATCTCATTACACCACCTAGTCATGACGAATTAGTTAAATTGATTCAGGATGCAAACTTAACAGTAAGAGAGGCTATTCGTCAGAATGTAGATCCTTATCGGGATTTACAGCTTGATCGTAGTGATTTGAGTGATGAACAACTACTCAGTTTTATGCTTGAACATCCTATTTTGATTAATCGACCATTTGTTGTTACTGAATTAGGTACTCGCTTAAGTCGTCCTTCAGAAGTTGTCTTGGATATTCTGCCATTACCACAAAAAGGTGCTTTCACTAAAGAAGATGGTGAACAAGTGATCGACGAAAATGGTCAGAGAGTAAATTAAAAAATTTAGTTCTTGTATGTGATTATCTGCATATCCAAATTTATAGGTAGCAAAGATGGATCAAGTTAATTTTTTTAAATGCTTATCAGATGAAACCCGTCTCAATATTGTCACTTTAATTGCTGAGAATAAAGAACTCTGTGTTTGTGATCTGACAGAAAAGCTACAACTGAGTCAACCAAAGATTTCTAGGCATTTAGCTTTATTACGCTCTTCTGGTCTCTTACAAGACAGACGACAAAGCCAATGGGTGTACTACAGCATTAATCAACAACTTCCAGCATGGTGTTTTGAAATTCTAGATACTTTAAAAAAAACATCATCTAGTCAAGTTGTAAGCAATACCAACACGCTTTCTATAAATAGTTATTGTGAGTAATAGATTATGAAATTCCTTTTTTTGTGTACTGGAAATAGTTGTCGTAGCATTTTGTCTGAAGTGCTTTTTAACAGTCGTGCTCCTCATGACTGGAAAGCATACAGTGCAGGTAGTAAGCCATCAGGACAGGTGCATCCATTGACTATTGAAACTTTGGAAAACCTTGGTCTTTCAACAGAAGGTTTATGGAGTAAAACCATTGATGACTGTGAGCAATATAAACCTGATGTAGTGATTACTGTGTGTGATTCAGCAGCTCAAGAAGCTTGTCCTCTTTATTTGGGGGGAGCGATCAAGGCACATTGGGGCTTGGCTGATCCATCACATTTAGACTTGCCTAAAGAGGAAAAATTAAAAGCTTTCCAAGTGACAGTAGACCATATCAACCGTCGTTTAGATGCTTTATTTGCACTTGATACAGCAAATATGTCTCGTCCTGAATTAATTGCTGCAATCAATCACATATCAGATATTGAATGAGAAAATCATGGCTCAACAAAGACTGTCATTTTTAGATCGTAACCTGACGCTATGGATTTTCATTGCGATGGGGTTGGGGATTGCGATAGGTGTCTTCTTACCTCAAGCTTCCGTTACTTTAGACAAAATGAGTGTGGATTCTGTCAATATTCCAATTGCGATTGGTTTGATTCTGATGATGTATCCACCGTTAGCCAAAGTGGACTATGCAGCTCTACCACAAGTATTTAAAGACAAAAGAACATTAACTTTGTCTTTAGTACAGAACTGGATTATTGCTCCTGTATTAATGTTTGCATTAGCAATTATTTTTTTGCATAGCTATCCAGAGTATATGACTGGACTAATCCTGATCGGATTAGCTCGTTGTATTGCAATGGTTTTAGTTTGGAATGGTTTAGCCTGCGGCGATAACCAATATGTAGCAGCATTGGTTGCATTCAATAGTATCTTTCAGATTTTGTTCTTTAGTACTTATGCTTGGTTATTTCTTACCTTCTTACCACCTTATTTTGGTATTGCTGGGCAAGTAATCAATGTGGATTTTTGGACGATTACCCACGCGGTATTAATTTACTTGGGTATTCCTTTTTTTCTTGGTTTCTTGACCCGTTTGATCTTAGTCAACGCCAAAGGCTTAGAGTGGTACCAAAATGTCTTTTTACCGAAGATCAGTCCATTAAGTCTATTGGCATTACTGTTTACTATTGTTGCTATGTTTAGTCTCAAAGGTGGAGATGTAGTGAGTCTGCCTTTGGATGTAATTCGAATTGCGATTCCATTAACAATTTACTTTATCGTAATGTTCTTCATTAGTTTCTTTATGAGTAAGTGGATGGGTAATGACTACCCAAAAACTACAGCAATTTCATTTACTGCTGCGGGTAATAATTTTGAGTTAGCACTGGCTGTAGCCATTGCAACCTTTGGTTTAGCATCGCCTGTGGCATTTACTACAGTCATTGGGCCATTAGTTGAAGTACCAGTTTTGATTGCTTTGGTCAGTGTCTCTTTATGGCTAAGAAAAAAGTATTTTGAATCGGTGTAAATCTATGAATCTCCCAAATGTTGATATGAATCTTCTTGATCGACCTACTTTAGAGAAAGTTCAAGCTAAAGCACTGGATCATGCACCACGCATCTTATTGTTATATGGCTCGAATCGTGAACGTTCTTATAGTCGTTTAGCGGTGATGGAAGCAGGACGAATCTTGGAGGAGTTTGGTGCTGAGGTGAAAATCTTTCATCCGAAAGGATTGCCTTTGCCAGAAGATGCCGATACTGAACATCCAAAAGTAAAAGAATTGCATGAACTTTTGGCTTGGTCAGAGGGTATGGTTTGGTGTTCACCTGAGCGTCATGGTTCTATGAGTTCTATTTTTAAATCCCAAATCGACTGGATTCCTTTGGCTGGTGGTGCAATACGTGCGACGCAAGGTAAAACTTTAGCACTTATGCAAGTTAGTGGTGGTTCACAATCTTTTAATAGCGTTAACCAGATGCGTATTTTGGGGCGCTGGATGCGGATGATTACAATCCCGAATCAATCTTCAATTCCTAAAGCCTTTTTAGAGTTTGAAGAAGATGGACGTATGAAAGCATCTTCTTATTACGATCGTATAGTAGATGTGATGGAAGAACTCTATAAGTTTACATTACTTACGCGTGGACAAAGCCTGTATCTAACTGATCGATATTCTGAGCGTAAAGAATCTGCTGAAGAATTATCTAAACGTGTTAACCAGCGTAGTCTGTAACACATTGGAGAGAACTAAATGCAAAGTAGACATTCACGTCTGATAATTCTCGGTTCTGGCCCTGCGGGCTATAGTGCAGCTGTCTATGCAGCGCGTGCAAACCTTAAACCTACTTTAATTGCGGGTTTACAACTAGGTGGGCAACTTACAACAACAACCGAAGTTGACAACTGGCCGGGCGATCCTGAAGGTTTAACTGGTCCTGCATTAATGGATCGTATGCAAGCACATGCTGAACGCTTTGGTACAGAACTCGTCTATGACCATATTAACGAAGTGGACTTAAACGTACGTCCTTTTGTTCTAAAAGGTGATATGGAAGAGTACACATGTGATGCTTTGATTATTGCAACTGGTGCTACAGCTCAATATCTTGGCCTAGAGTCTGAACAAAACTTTATGGGACAAGGCGTAAGCGCATGTGCAACATGTGATGGTTTCTTCTACAAAAACCAAAAAGTAATGGTTGTAGGTGGTGGTAACACTGCTGTTGAAGAAGCGCTTTATTTATCAAATATTGCTTCACATGTAACGCTAGTACACCGCCGTGATAGCTTACGTTCTGAAAAGATTTTGCAAGATCATTTATTTGCTAAAGAAAAAGAAGGCAAAATCAGCATTATCTGGAATCACGAAGTTGAAGAAGTATTGGGTGACAATACTGGTGTAACAAGTGTTCGCCTTAAATCAACTCAAGATGAGTCTAAGCAAGACGTAGAGGTTCATGGTCTATTCGTTGCAATTGGCCACAAACCAAATACTGGAATGTTTGATGGTCAATTAAACTTACGTGATGGCTATATCCAAGTACAAAGCGGTACTTCTGGTAATGCAACAGCAACTTCTGTAGCTGGTGTTTTTGCTGCTGGTGACGTCGCTGACAGCATTTATCGTCAAGCGATTACTTCAGCTGGGTCAGGCTGTATGGCTGCTCTAGATGCTGAAAAATATCTAGATCAATTGAACGATTGAAAAGCTAATTCAATCACTTGAAAGTTTTAAGAAATAAGCCCAGTCTGTTAAACAGGCTGGGCTTTTGATTTTGTTTATGACAATAAAGAAGAGGGAGAGATAATTTGTCTCAATTACAAGCTGAAGTAGATGTAGTCATTATTGGTGGTGGACAAGCAGCTCTTGCTACAGCCTATTTTTTAAAACGTAAGAAAATTCCATTTGTGATTTTAGATGACCAAAATCAGGCAGGTGGTGCATGGTTACATGCTTGGGAGTCTTTACGTCTTTTTTCTCCAAATACTTGGAGTTCGTTGTCGGGCTGGATGATGCCAAAAACTGAACAAACTTATCCAACGCGGAATGAGGTGATTCAATACTTAACTGCATACGAACAACGCTATCAATTTCCTGTCATTCGACCTATACATGTTGATCATATTGAGAAAAAAAATGACTGCTTAGATGTATATGCGGGTGATAAATATTGGCGAGCAAAGGCCGTTGTCAGTGCTACAGGTACATGGAGTCAGCCTTATATTCCACATTACGAAGGATTAGAAAGATTTAAAGGAATACAAACCCATTCAGCACATTATGTTAATCCAGAACCTTTTATTAATAAAAAGGTTCTAGTGATAGGAGGAGGTAACTCTGGTGCTCAAATTCTTGCTGAAGTTTCAGAAGTTGCAGACACTATTTGGATCACAGTAAATCCTCCTCAATTTTTATCGGATGATGTTGATGGGCGTGTTTTATTCCTTCGAGCAACAGAACGTTTGAAGGCACAACAGGAGGGACGAATAGTTGATCAACCCATTGGTGGTCTAGGGGATATTGTCATGATTGATAGTGTCAAAGATGCACGTGAACGTGGGGTATTACATAGCAGAGAACCCTTTAAAGCATTTAAAGAATATTCGGTTGTTTGGGAGGATGGTTCAACACAATTGGTTGATGCTGTGATTTGGTGTACAGGCTTCAAAGCATCCCTAAATCACTTAAGGAGTCTAGGAGTGATAGAACCTAATCAGACTGTTGCTGTCAATGATGGGCGTTCAATAAAAATAAACAACCTTTGGCTAGTTGGTTATGGTGAATGGACAGGCATGGCATCGGCAACATTAATTGGGGTTTCTAGAACAGCCAAAGCAGTAGTCGATGAAATAGCTGTTTACTTAGCTATAGATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP014528|663785:668980|665086_666127_+|WP_000068658.1|DBSCAN-SWA MAQQRLSFLDRNLTLWIFIAMGLGIAIGVFLPQASVTLDKMSVDSVNIPIAIGLILMMYPPLAKVDYAALPQVFKDKRTLTLSLVQNWIIAPVLMFALAIIFLHSYPEYMTGLILIGLARCIAMVLVWNGLACGDNQYVAALVAFNSIFQILFFSTYAWLFLTFLPPYFGIAGQVINVDFWTITHAVLIYLGIPFFLGFLTRLILVNAKGLEWYQNVFLPKISPLSLLALLFTIVAMFSLKGGDVVSLPLDVIRIAIPLTIYFIVMFFISFFMSKWMGNDYPKTTAISFTAAGNNFELALAVAIATFGLASPVAFTTVIGPLVEVPVLIALVSVSLWLRKKYFESV >NZ_CP014528|663785:668980|664275_664599_+|WP_000373080.1|DBSCAN-SWA MDQVNFFKCLSDETRLNIVTLIAENKELCVCDLTEKLQLSQPKISRHLALLRSSGLLQDRRQSQWVYYSINQQLPAWCFEILDTLKKTSSSQVVSNTNTLSINSYCE >NZ_CP014528|663785:668980|663785_664220_+|WP_000213577.1|DBSCAN-SWA MTTSLDVKIYHNPACGTSRNTLALIRNTGIEPTVIEYLITPPSHDELVKLIQDANLTVREAIRQNVDPYRDLQLDRSDLSDEQLLSFMLEHPILINRPFVVTELGTRLSRPSEVVLDILPLPQKGAFTKEDGEQVIDENGQRVN >NZ_CP014528|663785:668980|667912_668980_+|WP_038346646.1|DBSCAN-SWA MSQLQAEVDVVIIGGGQAALATAYFLKRKKIPFVILDDQNQAGGAWLHAWESLRLFSPNTWSSLSGWMMPKTEQTYPTRNEVIQYLTAYEQRYQFPVIRPIHVDHIEKKNDCLDVYAGDKYWRAKAVVSATGTWSQPYIPHYEGLERFKGIQTHSAHYVNPEPFINKKVLVIGGGNSGAQILAEVSEVADTIWITVNPPQFLSDDVDGRVLFLRATERLKAQQEGRIVDQPIGGLGDIVMIDSVKDARERGVLHSREPFKAFKEYSVVWEDGSTQLVDAVIWCTGFKASLNHLRSLGVIEPNQTVAVNDGRSIKINNLWLVGYGEWTGMASATLIGVSRTAKAVVDEIAVYLAID >NZ_CP014528|663785:668980|666131_666836_+|WP_001052988.1|DBSCAN-SWA MNLPNVDMNLLDRPTLEKVQAKALDHAPRILLLYGSNRERSYSRLAVMEAGRILEEFGAEVKIFHPKGLPLPEDADTEHPKVKELHELLAWSEGMVWCSPERHGSMSSIFKSQIDWIPLAGGAIRATQGKTLALMQVSGGSQSFNSVNQMRILGRWMRMITIPNQSSIPKAFLEFEEDGRMKASSYYDRIVDVMEELYKFTLLTRGQSLYLTDRYSERKESAEELSKRVNQRSL >NZ_CP014528|663785:668980|666854_667808_+|WP_001191832.1|DBSCAN-SWA MQSRHSRLIILGSGPAGYSAAVYAARANLKPTLIAGLQLGGQLTTTTEVDNWPGDPEGLTGPALMDRMQAHAERFGTELVYDHINEVDLNVRPFVLKGDMEEYTCDALIIATGATAQYLGLESEQNFMGQGVSACATCDGFFYKNQKVMVVGGGNTAVEEALYLSNIASHVTLVHRRDSLRSEKILQDHLFAKEKEGKISIIWNHEVEEVLGDNTGVTSVRLKSTQDESKQDVEVHGLFVAIGHKPNTGMFDGQLNLRDGYIQVQSGTSGNATATSVAGVFAAGDVADSIYRQAITSAGSGCMAALDAEKYLDQLND >NZ_CP014528|663785:668980|664605_665079_+|WP_000670223.1|DBSCAN-SWA MKFLFLCTGNSCRSILSEVLFNSRAPHDWKAYSAGSKPSGQVHPLTIETLENLGLSTEGLWSKTIDDCEQYKPDVVITVCDSAAQEACPLYLGGAIKAHWGLADPSHLDLPKEEKLKAFQVTVDHINRRLDALFALDTANMSRPELIAAINHISDIE |
7 | uncultured_Caudovirales_phage(83.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
984227 : 992324
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP014528|984227:992324|DBSCAN-SWA TATGCTATCGGATGCCCAAGTAAAGTCATTAAAACCTAAAGAATCTAGATATTCAGTAGCAGATGGGGAAGGATTAAACATTTCCGTTTTTCCTAATGGAAAAAAGAAATGGGTTTTGTCTTATCGCCAAAATGGAAAGCAAAATCAAAAGATGTTGGGTGAATATCCTATTATGGGATGTAAAGAAGCACGCCAACTAGCAAGACAATTAAAATTAGAATATCAGGGCAAGGTCGCCAATTCTCCACCAGTCCATAAGGTGGTTGAGGAATGGTTGAGTATCATGAAATCACAATGGACCAGCAAAAAATACTATGACACAGTCGAATATCGACTTGCATATCTAACCGAGGATTTTAAAAATCTTCCAATTAATGAAGTTGAAAGAAAGCACATCTCGAAGAAAATTAAAGAAATTGTTGCAAAGGGTACTTTAGAAACAGCAAGCCGAGCATTAAGACTTGGAAAGCAAGTATTTGATTTTGCAATTGCCTCAGATTATACAGATCGTAATCCATGTACATTAGTAGAGGATGTAATACCTGAATATGAATCTGACAGCCATCCTTGTTTACCTGTGAGTGAAATGCCAGAATTCTTTAAACGCATGAAAGCGAGTCATTCTAGCTCAATAGTAAAAATGGCCATGCTTTTAGTTTGTTATACCGGAACCCGAATAACAGAATTGTTAAAAGCTAGGTGGGATACTGGAGAGATAGATTTTGAAAACAAAGTCTGGATAATTCCTGCAGAGCGAATGAAAAAAAGAAAAGAATTAATGGTCCCACTGGTACCGCAAATCTATGCTTTGTTTAAGGAACTCGAAAGCGTCAAAACAGATGATGGGTACATATTTAAAAAACGTGGAAAACCTTATGAGCACATGACATCTGAGTCGGTTCTCACAATGATAAAAAGAATGGGCTACACAGATAAAATGGTTACTCATGGTTTTCGTTCATTGTTTTCGACTCATGCTAATGAAAGTAAATTGTTCCGTGGTGAGGTTATCGATTATCAAATTGCCCACGTGAACAAAACAACAAAAGCAGATAAGACAAGTAAAATTTATAACCGTGCCGAATATTGGGATGAGCGAGTAGAGCTTATGACTTGGTATGCGAATGAAGTAGAAAATTGGATTGGTACTAACTCATGAACCAAAGTTTATTTGTCGGTTTTTGGAATATAAATTTATCTCCTCCTATAGGAAATAGATGGAATAAATCAAAAGTTGATAAAAAAATAAAAGTTTCTAGGGTAATTCAAGGGCTCTTGAAACTCGATTTTGATTTTTTATGTCTTTGTGAGGTTTCACCTGAGGATATGGAGTTTATAGATAATAGTATTCAACTTATTGGGATGGGCTATGATTACAATATTTATCGAAAAAATTATGGAGGCTTATATTTTGATACATGTGTAATATTTAAAAATACTTTTGATTTTGTTCAATCAAAAGTAGAAGTCGATGGTGAAGAAAAGAATAAGCTTAAAGTCTTTCAAAAATATGAATTTCTAAGTGGGCACTTAGAAGAAAGAATTATATTTTATGTTACTCATTGGTTATCTCAATTAAATGATAATAAGGAAAAAAGAAGAACAGTCGCATCATTTATTAAAAAAGATACTAATGATGAAAAAAAATTTTTCAATAAAACGAAGTTTGTTGTTTTAGGGGATTTTAATGTTGAACCTTATGATTCGGCAATATTAGAGGGGTTAAGAAGTACTAGGGATCAAAAAGTTATCTCTAATAATTCTTCACTGTTTTACAATCCTTTTTGGAAATTTTTACAAATTAAGGAAGATCAACCCTCAGGTACCCATCACTGTACTAAAAATGAGTTCCATCACTGGCACATTTATGATCAAATCTTAGTTTCAGGAAACTTTTTCCGTGATGGATGGAATTTGGATGATAATCTAGTTCTTGTCTTTGATGATAAGATGATTAGTTCTTTACATAATGATTCATTTAGTAACCCTTCAGATCATTTGCCTATCTGTCTAAAGTTGGAGAAAACAAAATGCATTTAGATTTAAGTTTAGCAGTTGAAGAGGGTATGCAATCCTCTGTAACCAGAGACAAAAGTATTGAAGAAATTGATAATGTATTATTTGAAGTAGACCAAGCAGTTAAGAAAGCAACAAATAATAAAGTTGAATTTGGTTGGAGAAAAAAAGGGTTTAATACGTTAGGTTTATTAACGGGTCTTACTTCACTTCCAATTACAGATGTAAAAATTGAATCTCAAGAGCCTGAGTCGCGTGTTCTCTATGTTTCTGCAACAGATGACAAAACACAAAGATTTGATATAACAATATTAGTGATAAGTCCTGATGGCTTCCCATGTGAAATGAATGTTAACGGCAACAAGCTTATATCACATGATGCTGAATCCTTATTAGAGCAATTTAAACCCTTACTTTCTAGTGCTTTTGTTGGAGATAAAATAAGAAAATTAATGAAAAAAGGCGCTTAATTAGCGCCTTAAATTTTGAATCTAATCATAGCAAGTAATTATGAAAGCAATTTTTTGTAGGTTTTAAATTGAACGAATTTCTAATGTATAAAATTGATAAATGGGTAAATCAAAATGGGTAATAAATACTACGATCAATTAGTAAATAATGATTCTCATTTTGAAATTACGTTTAATGATTTTGAGGAGTTTATAACTTTTATTCGTCCAGATAAATTACATGTAAAAGATCTTATGACTCAATTAAGATTGGAATTTAACCCATCAGCTGTTAATTTTCCTTTTTTTAAGATAAAAGATTTTAAAGGGTATAGTACATTAGACAAATCGATCATTTATCGGGGACATGGAGAAAGTGATTGGGATTTAAAACCAACCTTTTATCGTAATAAAAAAAATATTGGGTGGGTTAAGACAAATTGGAGTGTAGATCAAAATTATGAGTCAGAAATTTTATTGAAATTCCAAGATTCCTGTGATTTAGCTGGTGTTCAATTACCATCAGATAATGATCAATTGAGAAGAAGACAAAAAAATAAGTTAAGTAAATATAGGAAATCGTTTGGAAGAGATCAGCTAGATTGGTTTGATGATGATTTTTTTGAGTTAGCTGTATATGCACAACATTATGGAGTTGAAACTAGATTGCTGGATTGGACCAAAAATCCGTTTGTAGCTAGTTATTTCGCTTGTTCTCATGCACTCAAAATGAATTATGATCCAAATTCAAAATTTTGCATTTGGGTATTAAATTCTGAAAGTATTACAAATGAATTGAATCAAGTACTCGAAGTGCTAGATCCACCTAAAGGCCTTAATCAGCATATTTCTCATCAACAAGGTGTCTTAACTTACACAAAAAATCACATCAAAATCTTTAATAAATTTGGAACTCGACCATGCTTAAAAGATATTCTAAAGTATTATGAAAGTGGTTACAGGTTATTAAAAATAACTTTAGGATATGAATTAATCGTTGAATTATTTAATTATTGTAATATTCATAATTTCAATGCATGTCACTTATTTCGTGGTGCCAACGGTGCTGCAATGCACACCACTGATTTATTAAATTTTGATGACTATAAATATCCTATAGAAGATTAAAGGCGCTTATTTAGCGCCTTGAATCTCAACTTTAATCTTTGCTACTGATTGAGATGTCCAACCCTTATAAGTTTTGGATTCTCGATCAGGCGGGAATTTCTCCAAATAATATTTTTTAAAAGTATTTGGAGCCATTCCGAGTTCTTTAGCTAATTGTCTTAAAGAATACCAAGACATTTAAATCTCCTGACTTTCCGCTTTAACTTCTTTCAGTGATTCAATTGACTTAATCCAACTTAAAATGTGTGGCTTAGTTATTTCATCCTGACCGTGAAACCAGTAGAACTTTTTTTCTTTTTCAAGAACGTAATAAGGTTCACCAGATCCATTAGGCACAAGAAAATAATGGGTAGCATCTTTGGGTGCTGATTCAAGTATTTCTAATTCACTCATCCCTCAGCTCCCGATTCAATATCCAACTTCATTGCACCTTCTTCTGGATATTCGGTCATCCAAAAGTAATAGCCTTTTCCACTGTGGCCATCTTCAAAGAATTTAATTGTTAGTTCAGTATCAAGTTGATCTAAATCTTTCTCACCATCTGGATTTACAAATTCGAGAAGGCTTTTTAGTTGATGACCGCTAAGTGTTATGCTCATTGTTCAGCTCCCGATACGTTTGGCACACTATGAAAATGCATCCAGTGAGAAGGTGGGTCATTATAATAATTTGCCCATACACTATTTAGATCTTCATCAATAGTTATATAGTCTTGTTCTGGAGTAACATCTGGCGCATCATCCCAACAAATAAGTACCATTATGTCTGTAGGTGGCTCTTCATCTTTTACGCTGATCCAAGTGGGCCCAGCTTGGGCTTTTGCTGCAGCCCAAGCTTTTGCACTTGTATAAAAGTCAGCTTCATATTCAGGGCTTCCATCTTTGGCCCATTTATATGCAATTGGGTCATCATTTTTATACCAATCAGCATGAGCTTGCATTTCCTTTTTCCAAAGTAACCAAGCTTTATTTGTCACTATATTAAAATAGCCATTCATGGTTTCACTAAATACAAGAATGTCATTTTTTCGAATATTGCTTTCTTGCTTGAAAGTTTCAGTTTTTTTGAAATTTTCTTCAAAAAAAGCACGGTCATAAAAAATCATGAATTAGCTCCCATTCTGCTTGAATAAAGAGCTTTATTACTTTCGACAATTTCTTCACATTCTTTTTGACTACCAACGAAGAAATAATCTTTTTTCAGTTCACCAGCCTCAAATTTAGCTACCCAAGTACCGTAGACCTTTTCGGCTGAGATATATGCATAGCGTTGCTTTGTGATTGAAATGATATCTTCAATGTCTAAACAATCACCCAAACAATTAAAGTCTTTTTCTTTATTTACGCAATTTTCAGGCTCTTCATTGTCTTGCCACATAGTTTTAATTTGGTCTTCAACAATTAGAACTGAACCTTTAGGCAAATTATGATCCTTGGCTTTATTCCAGAATTCCCACAGTTGTCGAGTTTGTTCGATCATAAAAAAGACTTGGTTATCTTCTATTATGGAATAAGAAAAAAAGTCCCGATTTGTATAAGAAGCTGCGAGATCAGGAACAAACCATAGCTCCATACTGTCTTTTTTAAAAACTTCTACTTCTGCAATTAAAGCTTCTCTTTGGTTCGCTAAATTAATCATTCGCTTGCTCCAAACAATAAGTGACAGCTTGCTCTAAAGTTTCAAATTCCTTTTCCACATCATTGTCGAGATATGCCGTCCATTCGTCATTACCGCCACATTTCGAGATAAGAACACTTCCAATCCAAACATCATCGTCATCAAATTGCACTGCAGTCTTAACTTCAAACATTTAGGCCACCATCTGATAACTTTTTTGATTTAATCTTGCTAATCCACGCAAACGTAATTGCTCAATAAAGTGTTTATCTCTGTTCATCCATGCTCTGCAGAACGAGGCAAATTTCTTTTGGCAAATATCATTCATTGGATAACCATCTTTTGTTTCATTCATTGATATCTTTGCAACTTCTTTGCCACGCTTTAAAATAATGAATCCATTTTTATGAGATGGGTAATACCCGTTTTCACACATCCAAACAGTGAAAGGAAACGACATAGAATCAGGGATGTTTCTCATCATTTAAAATCTCCAAATGGAATCTTTAACTTTTGCCTTGTAGAGCAGGGCATCTGTTTCATGAAGCGAAACATTTGAGAACACATGAGTTCTGTTTTTACCAACCACAGTGAAAGTTCTGGTTTTGCTGTTGTATATTTGGATCATTGTGGTGACTCCAATAAGAAGTTATTTTCAACTTCTAGTTCTTTTCTTCTTTTTATAACCAGCTCCATTAGGGGTTCTTGAATACGTTCATCTGCTTCTGAAATATCAATTTCAATCGCATCCAACGTAGTCAGGTCTGTAGCTCGTTTGACTCGTTCAGAAATTGAAATATTTTCTTTCGATTGACCAGCAATGATGACTAAGTGTTTATTTAACTCAGTTAAAAAAGATTTTTGATCTTCAGAAGCCCAGTCTTTCGTTTCCTCAATGAGACTATTAGCTGCATCTGCAGTTTTAGTTTTCTTTAGCTTTTCAATAAGGCCAGCTAACGGAGACTCAACAGGTTTGTCATTATGATAACGAGTCCAATTTTCCTCTTTGTTATTGGCCTTCTTCGCAGATTTTTTTGCTTGAGTTGAGTTAATTTCTTTATCTGCTTTGGGTTCAATTGGTCCCAAAACGTTTAGGATGTTGTCGTCATCTATACTTGTCAAACCTACTTCACCGCTAATAATAGCGTTAAGTAAATTCTTAAACTCCTCACACCAATAAAGTGACTTAACAAATACCCGCAACTCACCGAAATCATGCGATTTACGTTTAATAAATGCATCTGCAGCTGAACGAGTTAGATGGCAATTAACATCTTCCCAAAAATATTTACCATGGCAGATATGAATATTGCGTTCATTCCAATCAGATAAAATGTTTATTTGAGTAGAAGCTTTTACATCGAGGAAAAGTTCATCTTCCTCTTCAATTGCTAAACCATTTAAAGCATGCTTATCTGTAGCTTTAAGAGATTCAAAAAAATCATCAATTGATTTATATGTTGATTCATCATCGGCATCTACAATATTAGTGATTTCTACAGAATCACTAGCCGGATCTAAACCCCAAACAATCTTTTTTTCTTGAACAACAAAAATTGGTGAATCAGTACCAGCGTTATCTTTTTCCCAAGAATTTTTGAGTTGTTGGGTAAACTCCGCCCATGTTTCAGGCGTAAATAGAGTAGGTTTCATAGTTGCTAACCTTTAAATATTTTGAAGCGCTTTACGCAAATGTGGGTCAAGGTCTTCTTTATTCAGGAGCCATGAGATATATGGGCGCGGTAATTCTTTAAGAGGCGTTCCTTTGTGTTTACCCCATGTCATTATTTTGGGTAAACGTACAGCTTCAGACATGAGAAATAAGGAGTTCAAATCTTTAATTCCCAGTCGTTCAATTAGAGCTATTAGGATAATCCCAGTAAAATAAACATCCGCCCGTGCTGAATGTGCATGTCTTAAATGCTTACGTGCTTCTTCACGGTTACTCATTACGAAATAGTACAGAACAGCCAATTTATGACTTGTTAAATCAGGCCATACGTCCCTTGCTAAAGCTAAAGTACAAATAGCCTTTGCCTTAATTGCTGGTCCACATTTATTTAGAGCTTTGATGTCGTAATCAATATTGTGACCGACAATGAATTCAACCCCTTCAGGTAACCGGAACGATTCGCAACTTGGTTGACCTTCAATATCCGCTTCAATGATGTTGTGTACAGCCATTGCTTCTAAATCAATCGGTTCAGGACAAGAATAGAAACGGTTAAAAACTTCATCTTTATGAACTAACAATTGACCATTCTCTAAGCTAAAAGGCGCATAAGCGATTTCAATTGGATAACCATTTAATTTGTTGGTTTCAGTATCTAAAATAATTGCTTTCATTGATCATGCACCATTTAACTGTTAGGCCAACAAAAGCCGCAGTTGTGACATTCCCATTGAGCACCAGAGCCAGAATGACTAACACCTAAAGTGCATTTGTCATTAGTACATCTTGGACAAGTACCATAAATCACACGAAAAGATTTAATAACTAACATAAATATCCCCAACTAGCGTGTACCAAGAAAACCACGACGAATTTTGTAAGCTTTCCGGTCAGGGGAAGGTATGTGCGTTTTTTGAAGAATTTGACCTAATTCACGTCCTCTACGATATTTAATTTCGGTTTCTAGATTTCGTAAAATCCACTCTTTTGTATTTAACGTATATTGTGAAACAGGAGTTAATTCATTGTTTTCATTAACCGTATAAACACGAGTTAAAGTGTGATTTGCAGCATAAACTGTATAGCCAAGACGGACTTTGTATAAACCATGTTCTTCATCCTTCCCTACGAATTCACGGAAAGTTGATTTTTGGTTTACTTGACCATTCAGATTATTTTCGTAACGTTTAGATCCTCGTAAATAGTTTGTTCTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP014528|984227:992324|988208_988418_-|WP_000028957.1|DBSCAN-SWA MSITLSGHQLKSLLEFVNPDGEKDLDQLDTELTIKFFEDGHSGKGYYFWMTEYPEEGAMKLDIESGAEG >NZ_CP014528|984227:992324|985381_986266_+|WP_001076477.1|DBSCAN-SWA MNQSLFVGFWNINLSPPIGNRWNKSKVDKKIKVSRVIQGLLKLDFDFLCLCEVSPEDMEFIDNSIQLIGMGYDYNIYRKNYGGLYFDTCVIFKNTFDFVQSKVEVDGEEKNKLKVFQKYEFLSGHLEERIIFYVTHWLSQLNDNKEKRRTVASFIKKDTNDEKKFFNKTKFVVLGDFNVEPYDSAILEGLRSTRDQKVISNNSSLFYNPFWKFLQIKEDQPSGTHHCTKNEFHHWHIYDQILVSGNFFRDGWNLDDNLVLVFDDKMISSLHNDSFSNPSDHLPICLKLEKTKCI >NZ_CP014528|984227:992324|988414_988924_-|WP_000578497.1|DBSCAN-SWA MIFYDRAFFEENFKKTETFKQESNIRKNDILVFSETMNGYFNIVTNKAWLLWKKEMQAHADWYKNDDPIAYKWAKDGSPEYEADFYTSAKAWAAAKAQAGPTWISVKDEEPPTDIMVLICWDDAPDVTPEQDYITIDEDLNSVWANYYNDPPSHWMHFHSVPNVSGAEQ >NZ_CP014528|984227:992324|986256_986712_+|WP_000549863.1|DBSCAN-SWA MHLDLSLAVEEGMQSSVTRDKSIEEIDNVLFEVDQAVKKATNNKVEFGWRKKGFNTLGLLTGLTSLPITDVKIESQEPESRVLYVSATDDKTQRFDITILVISPDGFPCEMNVNGNKLISHDAESLLEQFKPLLSSAFVGDKIRKLMKKGA >NZ_CP014528|984227:992324|991101_991782_-|WP_000643997.1|DBSCAN-SWA MKAIILDTETNKLNGYPIEIAYAPFSLENGQLLVHKDEVFNRFYSCPEPIDLEAMAVHNIIEADIEGQPSCESFRLPEGVEFIVGHNIDYDIKALNKCGPAIKAKAICTLALARDVWPDLTSHKLAVLYYFVMSNREEARKHLRHAHSARADVYFTGIILIALIERLGIKDLNSLFLMSEAVRLPKIMTWGKHKGTPLKELPRPYISWLLNKEDLDPHLRKALQNI >NZ_CP014528|984227:992324|986826_987819_+|WP_000527288.1|DBSCAN-SWA MGNKYYDQLVNNDSHFEITFNDFEEFITFIRPDKLHVKDLMTQLRLEFNPSAVNFPFFKIKDFKGYSTLDKSIIYRGHGESDWDLKPTFYRNKKNIGWVKTNWSVDQNYESEILLKFQDSCDLAGVQLPSDNDQLRRRQKNKLSKYRKSFGRDQLDWFDDDFFELAVYAQHYGVETRLLDWTKNPFVASYFACSHALKMNYDPNSKFCIWVLNSESITNELNQVLEVLDPPKGLNQHISHQQGVLTYTKNHIKIFNKFGTRPCLKDILKYYESGYRLLKITLGYELIVELFNYCNIHNFNACHLFRGANGAAMHTTDLLNFDDYKYPIED >NZ_CP014528|984227:992324|984227_985385_+|WP_000947475.1|integrase|DBSCAN-SWA MLSDAQVKSLKPKESRYSVADGEGLNISVFPNGKKKWVLSYRQNGKQNQKMLGEYPIMGCKEARQLARQLKLEYQGKVANSPPVHKVVEEWLSIMKSQWTSKKYYDTVEYRLAYLTEDFKNLPINEVERKHISKKIKEIVAKGTLETASRALRLGKQVFDFAIASDYTDRNPCTLVEDVIPEYESDSHPCLPVSEMPEFFKRMKASHSSSIVKMAMLLVCYTGTRITELLKARWDTGEIDFENKVWIIPAERMKKRKELMVPLVPQIYALFKELESVKTDDGYIFKKRGKPYEHMTSESVLTMIKRMGYTDKMVTHGFRSLFSTHANESKLFRGEVIDYQIAHVNKTTKADKTSKIYNRAEYWDERVELMTWYANEVENWIGTNS >NZ_CP014528|984227:992324|989449_989629_-|WP_000464381.1|DBSCAN-SWA MFEVKTAVQFDDDDVWIGSVLISKCGGNDEWTAYLDNDVEKEFETLEQAVTYCLEQAND >NZ_CP014528|984227:992324|987996_988212_-|WP_001292077.1|DBSCAN-SWA MSELEILESAPKDATHYFLVPNGSGEPYYVLEKEKKFYWFHGQDEITKPHILSWIKSIESLKEVKAESQEI >NZ_CP014528|984227:992324|988920_989457_-|WP_000609004.1|DBSCAN-SWA MINLANQREALIAEVEVFKKDSMELWFVPDLAASYTNRDFFSYSIIEDNQVFFMIEQTRQLWEFWNKAKDHNLPKGSVLIVEDQIKTMWQDNEEPENCVNKEKDFNCLGDCLDIEDIISITKQRYAYISAEKVYGTWVAKFEAGELKKDYFFVGSQKECEEIVESNKALYSSRMGANS >NZ_CP014528|984227:992324|987825_987996_-|WP_000119264.1|DBSCAN-SWA MSWYSLRQLAKELGMAPNTFKKYYLEKFPPDRESKTYKGWTSQSVAKIKVEIQGAK >NZ_CP014528|984227:992324|990060_991089_-|WP_000805204.1|DBSCAN-SWA MKPTLFTPETWAEFTQQLKNSWEKDNAGTDSPIFVVQEKKIVWGLDPASDSVEITNIVDADDESTYKSIDDFFESLKATDKHALNGLAIEEEDELFLDVKASTQINILSDWNERNIHICHGKYFWEDVNCHLTRSAADAFIKRKSHDFGELRVFVKSLYWCEEFKNLLNAIISGEVGLTSIDDDNILNVLGPIEPKADKEINSTQAKKSAKKANNKEENWTRYHNDKPVESPLAGLIEKLKKTKTADAANSLIEETKDWASEDQKSFLTELNKHLVIIAGQSKENISISERVKRATDLTTLDAIEIDISEADERIQEPLMELVIKRRKELEVENNFLLESPQ >NZ_CP014528|984227:992324|989629_989920_-|WP_000986115.1|DBSCAN-SWA MMRNIPDSMSFPFTVWMCENGYYPSHKNGFIILKRGKEVAKISMNETKDGYPMNDICQKKFASFCRAWMNRDKHFIEQLRLRGLARLNQKSYQMVA >NZ_CP014528|984227:992324|991952_992324_-|WP_001260065.1|DBSCAN-SWA MRTNYLRGSKRYENNLNGQVNQKSTFREFVGKDEEHGLYKVRLGYTVYAANHTLTRVYTVNENNELTPVSQYTLNTKEWILRNLETEIKYRRGRELGQILQKTHIPSPDRKAYKIRRGFLGTR |
14 | Acinetobacter_phage(57.14%) | integrase | attL 979554:979568|attR 991466:991480 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1063989 : 1101297
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP014528|1063989:1101297|DBSCAN-SWA 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39 | Escherichia_phage(100.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_4 |
1262209 : 1274557
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP014528|1262209:1274557|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP014528|1262209:1274557|1272959_1273298_+|WP_000647826.1|DBSCAN-SWA MKASKLIRDKGLQYAKEIVDSAPSNATEWNEGFEFQCGQSVEISKADREKYFVDLSELKRLVESVDLVESWGGIDDVKLYDLSHCKNRPESAGYKLLQAIADYESIYGGGYV >NZ_CP014528|1262209:1274557|1265651_1265975_-|WP_000064463.1|DBSCAN-SWA MSNFKKHPDGYKSFLGRDDKGLYSVRIGWQVYASNANGSVLYKVKDGFKTPLNVFRFQTDYPKVWNELTQEIDFQRRKQLAIKLRETNIPTYDRKAYKTKRGFTGSR >NZ_CP014528|1262209:1274557|1267990_1268998_-|WP_000048052.1|DBSCAN-SWA MSKTVVKDKTVHYKKVDFLKGANLGQLLKAQLLDKDSFYYKAINRQQFVSATKDDFILINHASSHQSMFFGELIIVESGKAQAVLKIDSDDATEFPIKTYLTDDLPDDEDGVDATEVVRKEFIDSVLYFGVIDNHVAIIQSRSLTARTLESYLGWLLGEAAKALPENSALILKDAPNPTVKQKLESTPAKTISISSGIGSTELQPVHTVESSIPAKIDYKIEDNVVDVLKSAFGVDLENLKLEDGLDDANLKLKLTLTYNRKTSKSGQKVIDTVASSMRHNDDYVITLEDGTKVTADNLKMSGKISVETINNKVYNDGLKVQLYNWMTTNINFGD >NZ_CP014528|1262209:1274557|1271278_1272160_+|WP_000064627.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP014528|1262209:1274557|1273682_1274084_+|WP_000100162.1|DBSCAN-SWA MSSVSIAEYRKLFPIKKNKKRRSAKQVARQPSVGEMVLATHLRACKIGFEQEYKFHPKRKWRADFLIIGTKILIEVEGGIWSGGRHTRGKGYIGDMEKYNSAAMMGFTVLRFSTEQVKAGVAIKQIEQLVGEK >NZ_CP014528|1262209:1274557|1267485_1267989_-|WP_001129676.1|DBSCAN-SWA MAKRYLPFYNNARFIALVLVGLFAIFSIIFKYLELNITINLVQFSFVLLLPLSQIYLAYKGMLDALKLDGLNQSERDRLTSTVDIRSKSSLYVAMLFIILVFSMYILNLLGLLSAKHLLALILSVGLTSIFSFFLAWSDLREISLLEKTLKDRKESREAKAKVLSNK >NZ_CP014528|1262209:1274557|1270717_1270990_+|WP_001180660.1|DBSCAN-SWA MQNNLSNQTTERNQPEFLVGDVVVLTKECRTFKSNDLFEVKNKTLTRLWTIKSENHLILVSSKEIRTATVAELNAKRRLTSAEQALAEVS >NZ_CP014528|1262209:1274557|1271061_1271286_+|WP_000602535.1|DBSCAN-SWA MILNELHDRNRKNLRAKGYDENNAAITREEFSQTMAQRFRTNQWLAGQIVNSLANADLVQKFGGYVKPKVGVHE >NZ_CP014528|1262209:1274557|1263336_1263588_-|WP_000654846.1|DBSCAN-SWA MKDQYKKVSQKHMLGFMYYLQLLGYVIVRQGMDQAMFLTKHYAVPVAWRRITIDYHNRLNKPAQQLYKEFVEWTKEEYAEMVA >NZ_CP014528|1262209:1274557|1273290_1273683_+|WP_000462878.1|DBSCAN-SWA 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MALPIITADQTLLVQAIIVYLYADPGLGKSSMGFTAEKAISFDFDRGAHRTGELRRGAVVQVQQWSDVANLTPQDLAPYKTVVIDTVGAMLECIKTHLLLTANNRQKDGSLKLKAQGLANQTFKQYINTLISLGKDVVFIAHASEDQNGDQIIYRPDLGGKNRNELYRIADVMGYLTTVTTGEGKNARVINFKPSPTHHAKNSGALGGETGEVWVPDLKAHPTFLADLITQAKDHINTLTPAQLAAAKAQEELENWKQSCEEAEHAGDLNQLTESLDKEHMYYQNMRQAMLMRAKALNCTFDKQRGTWISPPEFNGISDQQRDELQNFIAERGLDVKTVCEHFGIDALIQIEAAKLTAVKQEIETLAKTGMTA |
24 | Acinetobacter_phage(95.65%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1278515 : 1307189
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP014528|1278515:1307189|DBSCAN-SWA 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38 | Acinetobacter_phage(93.55%) | capsid,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2135231 : 2175001
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP014528|2135231:2175001|DBSCAN-SWA 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34 | Faecalibacterium_phage(33.33%) | transposase,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2458103 : 2489764
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP014528|2458103:2489764|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP014528|2458103:2489764|2481451_2482219_-|WP_038346485.1|DBSCAN-SWA MKLKTVTIDGKVYAEVEGDKPIYVHDDGKEMPHDAPHSVATIARLNNEAKTHREAKEAAEKALKAFEGIEDPAAAKKALQTIQNLDDKKLVDAGEVEKVKAEAIKAVEEKYAPIVEQRDALEASLHKELIGGGFARSKYIQDNIAVPVDMVQATFGHHFKIEEGKVVAYDPNGEKIYSRVRPGELANVDEALESLVGGYQHKDLILKGGKGTGGGFQGGGKGGAPTGMKRSEMSVSQKADYIKEHGNDAFLKLPN >NZ_CP014528|2458103:2489764|2476659_2477013_-|WP_015451444.1|DBSCAN-SWA MSNFVFKRGDTFNLNLQLVDMDEALQYPPDDVRRAIDLTGYTFTSQVKALADGAAVATLTCTALSQSTQKGWLNIKSGTSTAAWPLGLCQMDIKAVVSGTTQHTETLTFQVIDGVTA >NZ_CP014528|2458103:2489764|2479341_2479731_-|WP_000008490.1|DBSCAN-SWA MSFITVDDANSILGSDFAPDSDKARLVKLANVWMKKRIGFVPDPIDPLLKDAACEIIKGILAKEIYNGKDQQLKRKKVKADSVESEKEYQDGSEAISSFEQIAIDFIDSLDLKDPNASFNGFGIPLYRA >NZ_CP014528|2458103:2489764|2482938_2483169_-|WP_000004359.1|DBSCAN-SWA MSESKVRHLVLKRHPILKGFLVVCDEETGMPLAGQKAVHMNSDAQDGPTTISVTFEAYGENGVRLVGDEPRALLTK >NZ_CP014528|2458103:2489764|2486257_2486881_-|WP_079393070.1|terminase|DBSCAN-SWA 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MFVEKIKSTDSIPEMITLFITFNFIIQTSYKFGFLSSYGYWTISLYNPIEIMFGNLELILTYILVFTYVIYDKFTISSLIGILITFIVPFISQFIFTGIFHIPTFSYFAITIGISGIILKKIKDNDLAETSLFSILLCILPMVYGIYENHSLKVDKLTKATLNISTDKEWYILDKFSDNLILISKDKNDLKVVKINDLKTINIK >NZ_CP014528|2458103:2489764|2482701_2482917_-|WP_032054772.1|DBSCAN-SWA MSEISVAEYVKRKEELERTLTGHIAELISKFEKDTGVNVQDVYANFSSATCLGGSEKYFLTGVTIKTSISN >NZ_CP014528|2458103:2489764|2471869_2472133_-|WP_001275792.1|DBSCAN-SWA MSAPQYKPMRESEVCNAIGWVLIALGFIAGFLFILAFGRIEVASYYGKETVWSGVMIATGIGIIFNGFLAGYLFQKVASILRYHENK >NZ_CP014528|2458103:2489764|2483705_2484809_-|WP_038346488.1|capsid|DBSCAN-SWA MAADIEKLFEALTQHQAYLYRASSKTVNELLALFNDDTSKMLSKLRDLLDELNESEKVALAGGKYTTSNLREIKDLIAQWFASVNTSLPEAFAVSATALAVYEANYVAKLYGAKINKPDGEKLFLSAKKVPLAGGALVDDLLSRIAESARQKVEYAIRDGINSGKTNQEIVQRIRGSKRLNYEDGILNGTKTDIERTVRTVRSHVANQAYLNSFNQLGFEYVRFVSVLDGRTSKLCASLDGSIWEINDPAKRVPPLHPHCRSILVPVEKDGKLLGERPFVMDERKVKDIPKDERSQLIGQLDANTTFKEFFKKTDDFFQKEWLGPKRYKLYKEGKFDFEKFFDPEGRLYSLAELRKLDEKSIKKLGL >NZ_CP014528|2458103:2489764|2465185_2465584_-|WP_002047937.1|DBSCAN-SWA MYKLKLNPQTSGYGVTPGDDVKRQQMDGGRGRYYIDVKRNSHIVDVNWNLSKTDFNKMMAFWRVYQNKPASFYADLVIDQGTRQQYLCNFIPNSFKTNEVNGNLYRVNAQLEVVQNQSNLTADIALIKDWEV |
41 | Acinetobacter_phage(91.18%) | capsid,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2493963 : 2505494
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP014528|2493963:2505494|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP014528|2493963:2505494|2496031_2496961_-|WP_000280080.1|DBSCAN-SWA MYKYLHHISDFMVATAHLSPVEECFYRRALDFYYLNEKPLPKETQSVFRRLRANTQEERDAVLIVLQEFFVEEEDGFHNKRCDSEIAAYQKVGDKNRENGKKGGRPRKEKPKENQSEGDSVNSENPQKPSGLILGSESESQKNLNHKPLTDNQYIDSSSNAREENSQFTPIQFAQYQIDDHKRYSMREFISEYSEFQYDFISLAQQRFVSVPEIDLRTMIQNFGDWYFANESSSLNTPSIWLVKWFSWVQNNEKQVAANRKKQEQITSTGQKPEESGYFANLFEEQSESQIVDVTPAKKLPMIEEVGHA >NZ_CP014528|2493963:2505494|2498304_2498505_-|WP_001077691.1|DBSCAN-SWA MNQWPNMISDLREKGLTQTQIGTEIGCSQNYVSDLERGVCGKRLSHEIATKLQKLWKKHCKTKQVA >NZ_CP014528|2493963:2505494|2504231_2505494_-|WP_000773628.1|integrase|DBSCAN-SWA 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23 | Acinetobacter_phage(95.24%) | integrase | attL 2497779:2497792|attR 2506686:2506699 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_9 |
2554706 : 2604319
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP014528|2554706:2604319|DBSCAN-SWA CTTATTGTTCTGTTCTTTCAATGCCGCAACGTTTGCACCATTGTCGTAAGTGAGTAATGATCATGTCTGCGTGATGGCTGCTCATAAATTGCAATGCACTCACGCCAACCTTGTTCTCTACAAATTTTGCTAAAGCTTTTTCGTCTTTATTTCTAACTTGACCAGCTGCATGTAGTTGCAACCATAAATGACGAATCAATTTGCTTTGGGCATCACTTGCTAAGTTTTTAACTCCAGATTTATTTTTTGATTCAACTTCAAAGCCAAGTTGTTTGAAGCGATCCAGCACAGTTTCAAGCTGTGCTAGATTCAAATCTTTTGAGCTAGTTTTACCAGTAGTGCTAGTAAGAATGTCTCGATAAAGTTCATCATCTAAACCAAGTTTTGTTTTACCCACATGGATTAGCTTGATTAGATTGGCTTTTTTATTAAATTTCATTTCTTGCGCCTTTCTCTGCTTCAATAATTGCTTCAGGAGTGGATTTAACCTGTGAATGGTCAATTATTTGATTACATAAATAAGTTTTTTCGCCGACAAAAAATCCGCCTAGACGTTCACACTCATTTGCAATCATGATGTGGGAATAAAGATGGCATAATGCCCACGCTATGATGAAACCCAGCAAGAAATTACCCATTTCACACCGTCCCTTGAAAAGCTTGGAACAAACCTATAATTGCTAGAAAAGCCAATGTGATTGATGCACCTGCTTTAAATTTATATGAGCGTTTCTCAAATATAGTTAAGCCAGTTTTGTTTCGAGTGGTCCACGCCAATTTAGCCTCTTTAAAGCAAGAACCTAAGCCCATTAGAAAGACCGCAAAGTAAGCCAGTACTGTTGCCCAATTCAGCAATTCATTCATGTAGGTGCTCCCAACTTTTCAAATTGTTTGCCACCATTCATTGCTTGATTAAGTTTTGCTGATTTACCTGATTGTTTACCAGCATGATAGTCATTAGCCGCTCTATCATTGAATGCTTTGCCTTTGTTGCGGTCTTTAGGTGTGAATGAACCAAGCTTCCCGTGAGCTTTATCCATATGTTTTTTTATACGTTCATTAGTATTTGCTGGAACTTCAATATCTAGGTCAGTTATTAAATGCTTAACTGAATCCACCCAACCTTCACAAAATAAATCCGCACGACGTACCTTGTTTTTTTTGACCGTTACACGTTTTAAGCTGTTTTCAATAAAGCTTTTTCTTGAACGAATCACTTGGCGATATAAAACATCAAAAGTATAAGAGGCAACTTCTGGTGCTGGATCGACACCAATAAATGTCCATGAAGCTTTAATGCCCCAAGTTCTACTGCCAGAGCTAAAAATAGGTTTGCACTGCATAGCTCTAGCAATTGTCATAACTAAACTTGCTTCCCAAGCTTGAGGTATCTTTGTTGCTTTACTCTCGCAACTAGCCTCAACGATATCGAGTAGATCAGGATCAATCTGAAATTCGCGCATCAAAGACTGCGCTTGACGTAGTGCAATTGCTGCTTCATTTTCATTGGCTGATTTAGCTAATGCTAAACATTTTTTGATTTTTAGAATTGCTTCTTCGCGGGTCATGCTCATTATGTTGTCTCCTTAATACTTTCAATCACTTCAGGTGGTAACTTTTCTAAATCTTCAATGCTGATCATTATGTTCTCGCTGCTCATCAGTACTGGATCACGACATCCAGCAGACACAGGCACGAATGCCTGTGTTTCGCTTATGCTTGAAGAGTGTTCAGAGCTATATCAATCGCACGTTGTTGAACTGTATGCCGTGAAATTCTCTGACCCGCCTCATTAAAAACGTGATACTCGAACCATCCGCAAATGTTGTATTTACGGGCAACACTTAAACCGTGCTTTTCAAGCATGTCTAAGCCCTTAATTTTTGTTGCCATTACTTAACAGCCTCTTTAAGTGCTTTTCCTGCTTTGAAGGAAGGTACTTTTGCCGCAGCAATTTTTAGCTCTTCGCCAGTTTTAGGATTGCGGCCTGTACGCGCAGCACGTTCTTTTACGGAAAAGGTTCCGAAGCCGATTAATGCAACGTCATCCCCAGCAGCAAGTGCTTTGCTGATGCCACTTTCAACTGCATTAAGAGCAGCTGTAGCTTGTGCTTGAGTAAGAGAAGCAGAAGAAGCGATGTGTTTGATAAGTTCTGATTTGTTCATGAGTTTAATTTCCTTCAGTAGTTGCTTGATTTTGGTTAAGTGCTGCACATGCAATTTCTGCATGTTCGTGGCGGTAGAAATGACCGACTAAAACGTCGTCATCACGGACAATTGCAAACAGGGCTTGCGGATCATCATTTAGTTGCGGTTCAAGTGCTTTAACTGTGTACATGTTGATAGCCTCAGTTTTAGGTTTAATGAGCAGCTGTAGCAGCTGGATCAACTGTTTCAATTTCATAGCCAAAGTTGTTGCGCTGTTTAAGAGTTGCACCAATTTCAGCGATTAGTTCAGGCGTGAGTTGTTTGATTGACTCCTTATCAGGTTCGGTTTTAGTACGGATGCAGTGTTCAAGCTTTAATTGCTTGAGCATCTGGCAAGTAAAAACAGGATCAGGAATAGTCACACTGGTTGATAAGCGGTAGCCAACCGAACCGTGTGTCAACTTTTTACTCTTGATTTGCAAAAACTCATTTTTGCGGTGATCACAAAATTCTTTAAGTTGAAGTTCATACGCCTTAACTCGTTCCAATAGCGGTTTAAGACGTTGTTTGGTTGCTTCCTTGAGCTTGTCGACCTGTTCATTACAAGCAGCTTCTTCAAGTGCGATGTCACGGTTGATATCAGCCATTTGTGCCAATGTTTGATCAACTGCTTCCCAACTTTGAAGTTGTGGTTCTTTGAGTGATTTACGTGCCATTAGTTTGTTTGCTCCTGTGTTTCAGCTGCTTTTAAGCGTTGGTAGCACTGTTCTAAAGTTTCATCTGGTTGCTTGTGTTTAACGACATGCGCCATAAGTTGTTCTTTTGGAATATTCTTCAGCCCACGTTCTGGCTGCTTCTCATTCATTTGGACAAAGCCCATCATTTCTTTAAAGTTGGTGTTTGGACGTTCATGTTTTTGACGTTCATGTTCCGCTTGCTCAGCTGCACGTTCAGCTTCAGTTTTAGCTAGTGGTGCAGCAGCTCGACGCTCTGTTGGTACTGGCGCATTTTCTGGTTTAAATGAACTGATCACTTCATATAAATAGCCGTGGTTTTTCAGAGGCAACTGCAACTTGCCTTGGTCACGACGCTCAAGCATTGTGTTGATTGCCCAGATCCATGCTGCTTTGGGAGCTGGGTAACTGTGGTGACCCCGTTTGATTTGCTGCGCATTAATATCCGCAGCAATTTCACCAAGTAACTTAGCTGTGCGTTCAAAAGTAAGCTCACGATTTTGAGAGCGAAACATCCCCAAATACTTGACCAGTGGCGTAGCTAAATCACCAACCAGATTTAGTGAAGCTACAAATGCTTTGCTGGCTTCACCATGTCCTAATAGGGCATCTAGGCTGTTTGTTGCTCCGCAAGCTGGGCATCTAGTTTTCATTTAGTGACTCCCAGCAAGTCGCAACAATGCGTTGTGGATAGCCTTGATAATTAAGTAAGCACAGTCTTCACCAGAATCACCATGTAAGGCTTCTTGATACAGTTCAACGAACTCTGGATCATCAGAAAGTTTTTGAAGCTGCTCCCAAGTAAGTTCATTGGGAATAACTGCATGTTTGTTATCAACCAACTTATTTAAATCTTTATTGAAATGTTGGCGTTTCTGTTTGATGTTCATAGACCACCTCGGAAATGCTTGGATTTGCTTTCAACTGCTGTTTGACAATCAATGCAAAGCTTTACGTTGCCCAATGCACGACGACGCTCTGGAATTTCTGCACCACAGTCTTCACATTCATAGTTACTGACTTGGTCAAAGTGTTTAATGTTGGCAAGTGCATGGTCTAAATCCTGTTCAGACAAAGTGCTTGCTACATCTGCAAAATCAGCCATTGCAACCTCCTAGTACAGCCATCACTACAGCGACTGCAAAAAACCAAACTGCAAAGTTCACAATCAGTAAATTTCTTAAATTAAATTTCATGGCTTAAACCCCCATCACAATGTCGCGTGTGATAACGTCCTCGCCGATTTCTGCTGCGAGGTTCATAGAACTGGTAATTAAGTTGCCAATGGCAAGTGGATATAAAAGTGAGCGTGTGGTTTTGCCAGCGCTGTTGATTTGAGTTAGACGGTCAACAACTGCTTGAATGCCTTCTTCAGTGATGATCGACTCCAGTTTTTTATCGACGCTTTTAACTCGGTGTTGTAAGTACTCAACTAATGAAGTATTTGTTAAAGGTTCCAGTGTCACACTCTCACAACGCTGTACAACTTCACGTACCGCTGGGTTGCGCTCACTTAATTTGTTTGCAAGTTCTGGCTGACCGATTAAGACGATCCCAATTAGTTTTTTGTAGCCGTCCTCTAATTCAAAGAAACGCTTTAACTGTTTAAGAGTAGCGATTGGCAAGCTGTGAGCTTCTTCAATCACTAATAAATGGCTATAACCAGCTTCACTTGAATTTTTTAAAATCATATGTACTTGGCGGAAACGAGCCTCGGCAGACATGCGTGGTTTCTCTTGACCAGCACTAACCGTATTAATAATTGCTTCAGCAATATGGCTTGATTTAAGTGTCTTACCTTGAATGTCATTATCTTCAGTCGCAATGACATATGGTTCGATAATCAAAATTGGTAATTTTTCACGACGAATACGATCTAAAAGGTCGCGTCGTAAAGTCGATTTACCTGAACCCGACTCACCTGAAATTGCAATGAATCCGCCATGTTTAGCAGTCTGATATAAGGCTTGACGCACATAGTTGATGTCGCTATTCAAGAATAGTTCTTCAACTGCACGAACTTCATTTGTGAAAGGGTTGTCAAACAAGCCAAAATGTTTTTTAGCTTGTTGAGTCAACGACTGTTTTGCGAGCAACATGGCTTGTTCGTCCTCATTTA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64 | Pseudomonas_phage(16.67%) | integrase,transposase,coat,plate,head,tail | attL 2551376:2551391|attR 2592550:2592565 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2649293 : 2679917
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP014528|2649293:2679917|DBSCAN-SWA 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MGFITEQEAIEHVEGFDALSASDKAQYLQMAEAYLLARNVKPYEDATQVPEPLKTASYQIIKGIMKGDLYQGQEQALKRKKVKADTVETEKEYQDGSVKLSAIEQFILDLIKPYCKRKTVFFVRKI |
38 | Acinetobacter_phage(93.1%) | capsid,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_11 |
2682987 : 2698742
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP014528|2682987:2698742|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP014528|2682987:2698742|2683513_2683783_-|WP_000837877.1|DBSCAN-SWA MKSKVDVDALKLTLQWQGFFLKGWFEDHWCDLKDYAEASLKLLLIILRILFSPLLIIYVIWQTRKMYEQIASGEVNREKVRNHIKKYGK >NZ_CP014528|2682987:2698742|2688994_2689153_-|WP_001109646.1|DBSCAN-SWA MNYSILADIELNRKISLFQKAVEAYVLNRTLENSMALAKAKADLAAFVLRGV >NZ_CP014528|2682987:2698742|2696865_2697075_+|WP_020753294.1|DBSCAN-SWA MSITLNGHQLKSLLEFVNPDGENDLDQLETELTIKFFEDGHSGKGYYFWMTEYPEEGAMKLESESGAEG >NZ_CP014528|2682987:2698742|2689827_2690577_+|WP_020753283.1|DBSCAN-SWA MSLHSRIRQKLEEKKLRAADLARATKKSPVAVKKWLDGTSVPTAENLKVIAKFLGVSDDWLLYGGPVEQESNNLPQLNVLDIEAFKQKYNIPDSEEAVKFVQTPTKPFPIQKRYVPVKAYSKMGMDGYFTDMGYEGNGGDGYVPTHSAGPRAYGIKGTGDSMFPAIRNGWYVVCDPDADLVPNEFVQVCLKDGRCTIKEFVGINGGVLSLLSVNGGERFFFEMDEVESITAITDIVPPSQHRQEHPYSH >NZ_CP014528|2682987:2698742|2693693_2694077_+|WP_020753288.1|DBSCAN-SWA MNMLANISFDAAVFTSLEATNVEVINDEIYFSLICPGKEHIYVVGKCSGIEKESSFEWDEGNPQYAQDVVFTMLQVTEFSRPHVEEYEFVDAIDGQPFALTSTQIQAINDELEELAREEKITELRGG 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MKLNKTNVDAIPLTESGQKIYRDSDLIGFAVRATTKSKVFIVERRNEGKLYRITIGKTNEFSVAEARKQAQVLLAEIATGKYKVKSEPAKNSPTFQEAFELYLKHKKLKQLSINTYNHSFRTFLYDWKDKDIFEISKDEVFEKFLKLSEYSESQANLSLKMFGSIWTFAKIHYSTEQNPILKTNPVDIIPAKRGWNKIKPRSRHLDEDQIPVFYKAVMEYRGEDSIRLTEFTNSTRDLVLCVMFTGCRRDEGQTLKWSEVDIEKGTFVFKDPKNGDDHLLPMGDQLWAILKERYKNRKGDYVFAGSSRKGNGGGYISTPDGVLDYVERQTGIKISLHDLRRTFATICNNLDYGQYTIKRLLNHRSGARDDVTGNYVQVSIKKLRKAMNDIEAVYRGELNPFD >NZ_CP014528|2682987:2698742|2684796_2685123_-|WP_034129340.1|DBSCAN-SWA MKRIDPVVLKVLGLTLVIALVVIGVNIGAKAYEITQAPWWLLLTLPFMPFLTVLVITLIAWSINPNLVFDSKCKHESDGISRLSNPPKNKCKKCGEFYSADVLKGGGQ >NZ_CP014528|2682987:2698742|2682987_2683503_-|WP_020753275.1|DBSCAN-SWA MNAAVNHIMQTTDWTKYSLEEWLYQFGAWMYSNSGTCGKSINPIAVAMDQAAKKRKQEVKGKEQIMADWLCSDDPVIPKGRGRITCEITDNEARAVQRLILDMQGQSEVLDGWLDAVIKRYFYNNSWSEMVVTQMNPVGDMVVVYSQNDARADVKCGLAAIHCRYSYIKYK >NZ_CP014528|2682987:2698742|2694356_2695025_+|WP_020753290.1|DBSCAN-SWA MSIATLILGQSGTGKSTSLRNLNPNEVLLIQVVKKPLPFRSAEWKYLSKDGGSIYVTDNPEVIIKRMQQTSKPIIIIDDYQYVMANEYMRRSTETGFNKFTEIGRKTWDVFTEASNLADNKRVYILSHTEEAESGKTKIKTIGKMLDEKITLEGMVTICLQTGVINEQYIFHTKNSGLNTVKSPIGLFESDHIENDLEAVDTAICDYYGIAKTETQTTTETA >NZ_CP014528|2682987:2698742|2683793_2684087_-|WP_079270956.1|DBSCAN-SWA MVFYEVGTYEQYEEGFHAFFRTRYEDKAEQVKAWAEEYQAKTPEWPTGETDEKQIQYMDLVRKLDDEFAELIGKKFPISNYSKDMYSILINKAELDD >NZ_CP014528|2682987:2698742|2689203_2689524_-|WP_038346515.1|DBSCAN-SWA MSKVSNELPASASNNESLILQALNASNQRHVAEMINVDASILSRMKTEKKSNGWTEIEFISFLLTAIGLKVVQESDVYCSPEIAEATRVYLAHAFTSPEYMRILFK >NZ_CP014528|2682987:2698742|2690909_2691851_+|WP_020753284.1|DBSCAN-SWA MTITNTDLIDDDAMSEKFHVVYDGKALEEHLMDVRDLAPAMMAISDLLTHANKEINGDKLEIQLNVKANFKTGCFGIEFVEHLSWVNQIKDLLVGPTATALANASGILGLVGFFGGATVGVIQIYKKLKGNPPVKIEETVDHAKVFYTETEYLEVDKRALRLYRSKVIASDIEKMLEPLSKDGIDSFYVVKEMLDENVELFIDKKEVEYFKFQDIDDHLSESITETFLQIESISFKEKNKWRFNNGGSTINASITDEVFLQKIDSGLLRFGKGDLLKVKLKTIQFLAHTKLKTEFEVMEVIEHKTTKQEEFDF >NZ_CP014528|2682987:2698742|2690591_2690807_+|WP_001065785.1|DBSCAN-SWA MNNSKLPINQIIARINDAAKHGEALVLTAEEVKILSKDIGDKVFIPVLTNEQVVQLVKEGKLGQKINNTKD >NZ_CP014528|2682987:2698742|2692818_2693112_+|WP_020753286.1|DBSCAN-SWA MEIRIGKEWVIQSSGNAMNIILAKVPQDLQDSTDPIDPIRLSQKFYYSTIFGAITGVFKLGIADSEARTFQDLEKEIHRIAKECQKAFDAAKEPSHG >NZ_CP014528|2682987:2698742|2689534_2689723_-|WP_000703022.1|DBSCAN-SWA MKISDLMTYHDCKNRKELSEKTGYSTVTLWKWENNGIPARTQAVLQVKTKGKLKADLQALTA >NZ_CP014528|2682987:2698742|2686507_2686759_-|WP_000644295.1|DBSCAN-SWA MKAIKRVKAFQNIFDILLFATHATQPFTMKDLHDYVLDAPNNTIQCYVQELIKSGYLEKDSYATYKATQFAKDLLNVKGELKA >NZ_CP014528|2682987:2698742|2692627_2692819_+|WP_020753285.1|DBSCAN-SWA MNQRIEKYKFSQAFRDGSKAFVAFWVITFIAFAFLRGCADEQHVNELKAKQNMYVRVQVEGAN >NZ_CP014528|2682987:2698742|2695037_2695697_+|WP_020753291.1|DBSCAN-SWA MGNYQAFNLNTESAKQADAGGRIETTGKYVGLIKSMEFVTSKQGTQGFEINFESDSKEFTNFTIWTVKADGTALSGVHKINAIMACASVKSLTPTDQKLEKYDFDLKQKVQQTCVVAPEMTNKRIGVLLQRENYLNGSGQQRHQMNFFASFNADSELMAKEILERKTSPELLPKALDRLIAMGDAQRAQQNAPQQSGGYGQYSQTQGNQSSDLDDDLPF >NZ_CP014528|2682987:2698742|2686334_2686511_-|WP_020753280.1|DBSCAN-SWA MIEFVDYNAMMKLRRDYNLGTCNEETRAAASLYEKLRKLKMLDQLKQEAMTKRYKESV >NZ_CP014528|2682987:2698742|2691985_2692189_+|WP_000845537.1|DBSCAN-SWA MKTEIIEALALELTKATIADTDPSTINIKSADLWVKTYQESLKAVEEALKELKPKPKATSKPISGMS >NZ_CP014528|2682987:2698742|2686755_2688117_-|WP_020753281.1|DBSCAN-SWA MDYLHSVPTEQGVLVSLLSLADGVDQYVQRLNRDYFSGKHQIIFDAIKAIHDRGEQIDFILVWDEIKKNPLNLHHIDEQYMLTLNAEAPTLISTLEQHIEKLHRLMVRRKFVDISVLMQGMAKDFTTNLDEMLNKTQNMIAEIGDNSEKKSLTYVNEFVARLYADLEETRIARKNGTYVETGLRTGFIALDNKIGALRRGNFVLIGARPSMGKTTFAQNIMSDMAINQDLVVQFHSLEMTEEEIRDRIVSGVGQIKLRNIKSKFLEDDDWGRLVQANKMLENAKFGIDDTANASLSDVRRQARLLKAKYGRVDAIFVDYLQIMKSPVVTDNQVRAIGEISKGLKAIAKEFDCVVFALSQLSRNLENRPNKRPVNADLRESGQLEQDADVILFIYRDEVYDKNSKEAGTAEIIIGKCRDGEVGTVRLGTDLARATFADLDPAYLASLQEFGGAA >NZ_CP014528|2682987:2698742|2686014_2686338_-|WP_038346514.1|DBSCAN-SWA MKPEHFIREYGPNTFRISMSFVNTAKYLVVHDGEIDFTDEIKPHHGDRVFEREVVKRLVESLDLIESYGGIESCKQSLYMLHELTEDPEPIREAVRDHESIYGGGDE >NZ_CP014528|2682987:2698742|2695752_2696268_+|WP_020753292.1|DBSCAN-SWA MTTLYDIGYDLAEQVERIQDLLSEGASSDSEEVQLLLEGMVAKEGEWKEKSKRVAKFVHQMMLEEKLIATEAQRLSDKAKRIKSTYGYLHDLLLDQMLEFGVREIEDPVLSIKVKENPWSVVVKNEEEIPAQFKREKTTVEVDKRALLNARESITDIKGIEFIRTKKLAFK >NZ_CP014528|2682987:2698742|2694076_2694295_+|WP_020753289.1|DBSCAN-SWA MEWISVEDKWPAYGQLILVVISGQTQTRVFFRDGSDFSGKDWIEPVNDDDCHHTTCWEKVTHWMPLPEPPKN >NZ_CP014528|2682987:2698742|2697267_2697537_+|WP_000039877.1|DBSCAN-SWA MSKLDQMSEQEKKELLEEFLEAPLEKSFGQEAVALFLKCSTHTLQAMRCNGSSLPYSKVGRCVAYQKADVLAYQASKKVFNTAQLARAS >NZ_CP014528|2682987:2698742|2696644_2696869_+|WP_000854113.1|DBSCAN-SWA MKTLKITWLDACSNCGFGDYAEVTTERGIGCYLWDGDKVQCPNCNHKGEIECDSGVAFVNWDEVEEASESGAEQ >NZ_CP014528|2682987:2698742|2688116_2688995_-|WP_020753282.1|DBSCAN-SWA MGASIPIIKLIEAMNEQPIAFNKHYVFLGCGINGALMLSQLVYWTSRTKDSEGWIFKTHHEWTQETGLTRREQDTARATLKSLKFISEKKMGVPCRVYYRVERENLYQALIEYSESIDINSMHNSAILNAQNSHTECTNAPDCMHESAILNAQIRPSNTENTYREYTENTTDIICADSAPKTQKFKAKDFLLKNGVSEQTATEYLDLRNKKKKPVTQRALQLVFKQAQEAKLSNERVFQIIVVRGWESFKAAWNWQETNAELEQLENPVVEQQETAPRNAPVLLRKEYKGAK >NZ_CP014528|2682987:2698742|2685119_2685515_-|WP_020753278.1|DBSCAN-SWA MDRKQFEEWFKTTDAFKLLEEMNYFKIDLFIFKEHRSQYQHTTVQIAYMTWQHQQAKVEELQNQLSLQRQRVKAFEEELTSSRNYGDKLQKRVGDLELFLKRIHRYGLDAYNVSTCMSIRDELEQALKEEG |
32 | Acinetobacter_phage(88.0%) | integrase | attL 2696537:2696551|attR 2707127:2707141 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
2955639 : 2971624
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP014528|2955639:2971624|DBSCAN-SWA 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11 | Acinetobacter_phage(90.91%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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