Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013213 | Erysipelothrix larvae strain LV19 chromosome, complete genome | 1 crisprs | DEDDh,cas14j,csa3,cas3,RT,c2c9_V-U4,WYL | 0 | 0 | 5 | 0 |
NZ_CP013214 | Erysipelothrix larvae strain LV19 plasmid unnamed, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP013213_1 | 1883238-1883424 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013213_1
|
2 spacers
spacers of NZ_CP013213_1
>1.1|1883269|47|NZ_CP013213|CRISPRCasFinder TCATCCCAATTGTAACCAACAGCCCCACCTACCGTATATTTTCCTGT >1.2|1883347|47|NZ_CP013213|CRISPRCasFinder GGACCACCATTGTTACCTACAAGACCACCAACATAAGACTCACCTTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013213_1
The CRISPR arrays of NZ_CP013213_1 >merge|NZ_CP013213|1|1883238-1883424|CRISPRCasFinder AACACTACCAGTAGAATAGCAATCAGATATTTCATCCCAATTGTAACCAACAGCCCCACCTACCGTATATTTTCCTGTGACACTACCAGTAGAATAAGAACCAGAAATTGGACCACCATTGTTACCTACAAGACCACCAACATAAGACTCACCTTCGACACTACCAGTAGAATAAGATCCAGAAATT >NZ_CP013213|1|1|1883238-1883424|CRISPRCasFinder AACACTACCAGTAGAATAGCAATCAGATATT TCATCCCAATTGTAACCAACAGCCCCACCTACCGTATATTTTCCTGT GACACTACCAGTAGAATAAGAACCAGAAATT GGACCACCATTGTTACCTACAAGACCACCAACATAAGACTCACCTTC GACACTACCAGTAGAATAAGATCCAGAAATT
>NZ_CP013213.1|WP_067633377.1|1876516_1877422_+|glycosyltransferase MKISCIIATYNGEHFIQDQLDSILNQTVQPDEVLIRDDCSSDNTVEFIQRFILKHSLSHWSLRINTTNMGHRENFTTLLQEATGDVIFLCDQDDVWFDHKVETLVDIMAHDASIALIASNVTPIYTSDSSVLVRKTHIKSTKKVSPLAFSSNWIRPSLPGCSYAIRKHLVDDYLKIWNKQDAHDAILWSVAYVQDSLAHYPESLMNFIRHDHNASDTGKNDPSYRIQSIQSDLDVMRRCIESLELDTKKVKAINKQINVYQQRLYILKNRHIIQQIINLKDLKYYAIPRFWLADFLYLIRS >NZ_CP013213.1|WP_067633374.1|1875257_1876196_-|hypothetical-protein MTPFKEIKKVLLKLIICFTLIIFSVSTQITQISADDTHDFAGGTGTRSDPYQIETVDHLDNVRKYLNQTVYFQLNNDIDLTTFLEDKPAGWNPIGTVKFNSFSGHFDGKGHSVTGLWFKQNNAPTNDQRNNIGLFGYTQDATITNLGVETNDTMGGINIIDDEIGLNVGILAGYSIKTKISNCYSKGKISISSYYINVGGLLGKIEGSEVLESYSDVNLRISDFIFNVSLGGLIGTSIASNVLKSFAIGRISDEIGSNITGNVGGFIGTLDTANLINAFSDNYSNMSVSTTNSWVNVGGFAGLISSGRIQKS >NZ_CP013213.1|WP_067633372.1|1873409_1875164_-|LPXTG-cell-wall-anchor-domain-containing-protein METTGLSEANGYVVSGTSCQQATGLTTSQMISMDVLNLSTGSMGSFNPSIWTKRACDTDNCYFPELSGMSQTNETVSKESTRFSRLPISMKDAVYGDFIPGETLSQVKLSASFYDQNNNPVEGIFSWVTPSTGITKGTHTYDTVFTPNDSKYKVLTGSVDVQIGTQRTLSFTVSDLTKTYGDARFDLSTLLNGNRGTGALTWTSSHPHLVSIDQLGIVTLHNATNGTVVTLSVTQADDDQYYDGSASLDLIVNKKSITVSAEDKTMIFGEMMPALTYTTTGLVGTDTLVGSLKVSDNTVGTHDIVQDKTLSHDNYNITFLKGRMVIQYPQAVNDIRDEIELIYRNLSTQKTPTTHEEALKFADEIAMLSVAYNALSEQEKGLISEETKEKLALVQKQAGETNHINDYAMVEGLPWEVRLITEPLSSTTHDYRTIRENMEDVENLTLFNMTLWNTLTNERYTLSEQEIAMITFRDYIAKEGGEIVIVHQLNDGTLEYINPTLKDGWVTFGATSFSAYGIVEKYSPPKETPPSSNVNTGNTTPDTSQETKTDETLPKTGVSQSYIPWYALGIGLILLGVSKRRKNK >NZ_CP013213.1|WP_067633370.1|1872510_1873239_-|HAD-family-hydrolase MFDNIKAIYFDLDDTLINIGGTSAQAWEVTCQQLLIAFPELDLPKAVILDEVIHEHAAYLNNPARIADFTGSVYELRRQILFAALKNLEFEKKEAVLEFMLTQFPINRNEMISLYPYVHKTLGALKQRGYKLALITNGGGEVQMEKIQHFNLDPYFDVLWISGDRGYFKPDRRVFETVSDELGVTLKEACMVGDNYSWEVKAPICYGMKAIYFDGHQKGLPREVQIKPHCIISSMSELLELF >NZ_CP013213.1|WP_067633368.1|1871657_1872488_+|hypothetical-protein MLFIQEIIKDVLVIVVSGFLTLTGASNATSISDPSIILDETHNKKSAIYDPVSEAYDVPLETVLEEAQEALDEERALEQERLRLEQEAQAALEQEAIALKKAQEAQAEVVVKTTPKQETVSASTQPETPAPQAQEPAVQAPKQSLSQYVSLNGTQYPFKELALNTQVAQNFIDTNPGSYGLWQDVTYATTFDILFAHYYAAGKLVYDANVGNTITLKFENGETRNYRVVAKTIQSVNAYYDSNSSLWDAVGTDFDLMIKTCYDVGVTDIIITLVQV >NZ_CP013213.1|WP_067633366.1|1870353_1871439_-|DUF871-domain-containing-protein MLGISIYPEKSSFEENKRYIDTSVSLGFGRVFTSLLELTGDQEQVLANFKAIVEYASSKGMQVIVDINPMIFNQLGISHDDLSFFHDLGAYGLRLDMGFTGREEAIMTRNPYGLKIELNMSMGISNVDVIMQFNPKKENLIACHNFYPMRYSGLDEAFFKKTTESFTKHNLRTAAFVTTQTGQLGPWPMQDRLCTLEMHRDLSIEAQTSYFVMEGSMDDIIIGDAFASDEELEKMSKAYFAQYPEIECVLEDNISAIEKTIVNEVVHSYRGDYNGYMIRSSMPRITYKEIPIQPVNTHDVLKRGDIIIGNNAFGQYKGELQIVLKEMKNKGQVNVVGHLTDNGYALLDCIKPWSNFRLVTK >NZ_CP013213.1|WP_157777171.1|1868493_1870026_-|sulfatase-like-hydrolase/transferase MKRFVKWANIVFWVGLVGLFVLPLYLIDSSGEMDFEQILYVMVSKGDGANYTMFFDYLWFGLPYFIGFGLLFWVGYTLTKKQPKLSFERFGKKIEKVVTFKPTLKKAVLSALAAVLALGSFANYKLNIWGYVSERLNPGSLYETYYVDPNDVSIQFPQEKQNLIYIVLESMNTNFTSIEIDDEIVNLIPNLETLANDNINFSSSYGFGGHVHARGLTWTAASLVGQTSGVPLQIPITSEPTSFGMNGEYLPGLTTLGEILQGNGYSNYFFMGSNADFAGRRQYFETHGNYEIYDLSYMKEIGYIPEDYNVFWGMEDSKMFDYAKDRILEIASNDEPFNITMLTVDSHFMDGYTDASCKTEYSVDYANAFACSDSMVREFVTWIQNQDFYKDTTVILVGDHNSMNNDFMQRTTSDQYAIYNAFLNVNREVDETRIKNRDYTVMDLFPTTLSALGATIEGDVLGLGVNLFSKEETLLERLGTDLLDEELAKKSYYYENHFFKEREPARTGTH >NZ_CP013213.1|WP_067633362.1|1866549_1868061_-|LTA-synthase-family-protein MKKIKFMLKGVCGIVVTCLFAAPIFLEQQFGEMNIDQILFVLLSSGDGANVDIVYEYLIFVIPYVLMFIGIVLVYQFISRYTISFKIKFFNKTFHPKITFEPSLLKSVIISLCVIVGLVFFVDSHLDVAGYVSDRLNPGTMYETYYVDPESVEIRFPQEKQNLIYIVLESMNTNFSEIVVDGEIVNLIPNLQVIAEENVSFSNSAQFGGAVPMANLSWTSASLVGQTGGVELHVPIDGNSYGTSGVFLPGLITLGEILEAQGYSNYFLMGSDANFGGRQIYFETHGNYTILDTKYLKEIGYVPEDYHVFWGIEDRKLFDYAKELLLEVSGFNEPFNVSLLTVDTHFMDGYTDASCETPFSIDYANAIVCSDKLLDEFLGWIEDQSFYENTTVILVGDHHSMNNSFLIESVNKVFTTYNAFMNVNVDVDESEFTYRDFTVMDLFPTTLATLGVEIEGNRLGLGTNLFAHEETLPEMLGFDNLSVELAKKSLFYERNFLRLTDDE >NZ_CP013213.1|WP_067633360.1|1865678_1866560_-|YegS/Rv2252/BmrU-family-lipid-kinase MMNNRTLLIYNPVSGKNSDDLDAIECILNQGLVHYDVLKTKNETSIDQYLRLKKDKYDMIIVAGGDGTISQTIDAMMYYDIASTMCIYPKGSTNEFAMALGITKESLKNIVNKTHETLKIDIGTYNGNRSFIYSMTFGNFTHVTYQTPQQLKNVFGHLAYWLYGFFSFYFLKLRTYEMTVRCDDRVYEGQFVFGGISNSNSVGTILQLPEVSFNDGVFELMLIRKPKKHKDFRHILKSLVLKNYDNDMFILDKGKAISFDSKRTHSWNKDGEFAGKLDSLNVTVHKKYLTLYR >NZ_CP013213.1|WP_067633358.1|1864497_1865661_-|VanZ-family-protein MTWDFNFAIKTSIFVFPFLALLLTIPFLVYQYLKYGAAHWWRSITIYSMVFYLMTALFTVVLPLPTRASVAQMTGPEMQLDFFNFLNEFRNQGLRTQGFDAWITFIQTKEFQQVFFNVLLTVPFGVYLNYYFKQNFFVTMILTFALSLCFELIQLSALFGFYPRPYRLFDVDDLFLNTLGGVIGYLITPIIVALFPTRDKMDEDQYSRAQYVTVGRRLVALAIDVGLCALIAFVVVYFTFDTPEFMKYMTQPKELIKLFIQRPILFGIPMGIGVLYFTWMPWITNGFTLGKRLVRIRLTSLKEDHLKFWRLCVRYVFIASIIFIMYGCAAQLIAIRHITTDNLEGIMTAMIILLFLGFALLIDYIYALANKKPIFYERVSTIVNQAI >NZ_CP013213.1|WP_067633381.1|1884665_1885172_-|hypothetical-protein MVNFNNIQKKVIGLLLIVTLVITNTSTSIAYATGDSNGFAGGNGTAENPYIIQTAKQLDEIRYGLDKHYKLDNDIDLTVFLENTPKGWVPIGTEDDPFTGTLDGNNHQVTGLWINAGFELGFFGWIKGGTIKNLGVVTDEEKNIIGVNTIGILASIAENVQIDNCYTI >NZ_CP013213.1|WP_067633383.1|1885966_1886326_-|nuclear-transport-factor-2-family-protein MINTHETSNQLWTGLKTQDQALLTQVLHPNAIFVHMGATMTRDQEIDTVINKGIVYKDVTFEASTLHEYGDVSVLLNTLTLCAVVGNNEVTNRFVVTEVYKQSDTLTQCISMSFTKILY >NZ_CP013213.1|WP_157777172.1|1886322_1886985_-|flavodoxin MMGLIVLVFLLSACQTSQQTPSQKQDNIEPNTNTKILVLYFSMPEDEANNTSDSNAQASIVVRNNTVYGNVESVANIIHETMGGDIIEIETNQTYPLDHEKLVEVVSQEKEAQARPELTQNFNFLNTYDTIFLGYPIWWYDLPMPLYSLLEQVDLSGITIIPFTVHGGSGFSTTQETLQTLQPEATISNQGFSLSRNNMLQAKDSVEDWLNATFNLGASS >NZ_CP013213.1|WP_067633387.1|1887020_1887872_-|aldo/keto-reductase MEYVTLNNGVLMPAVGFGVFQINDHDQCVQSVLDAIECGYRLIDTAQSYGNEKAVGEALRKTNVAREDLFITTKVWISNAGYDKAYQSILKSMDDLGVSYIDCVLIHQPLNDVYGTYRAMTQLYNEGKIRAIGVSNFYPDRLADFAMCNDIIPTINQIEVNPFHQQLKALEINEKFGVCVQAWAPFAEGQHDIFNNPVLASIGSRVGKTNAQVILRWLMQRNIVPLAKTVNKSRMKENLDIFDFSLTEEDMSLIATLNTDKSSFFDHQTPEAVERLLSLVRNV >NZ_CP013213.1|WP_067633389.1|1888159_1891993_+|hypothetical-protein MKKALLIFFSFCLAFLTMQTRVSADAKNFSVISGEELIQITQNVKSDDFVYISLIQDITVDQTITIPKDVMIHLNLSGFSLMGDFEDEAMIHEMIVIEKGGQLHVNGASQNQKKGTLYSNHPFDVVIANYGTFSATESQIGLPSAFNSIILHEASDTSFFQSLLSGEIRTQQTLESHQLYINDVISDVNLFIDSKSGFTHINQSEFKKERGVPSIIDFRSGDLLITDSILQYDIPSIENPTGIISATHSGKISAPIILAFAEDTGDRSINATIKRTQIINNMGTDLIAISNQQRHTQSTINLFIHEDTVSPSRIGIYDFEGVPYASRVNVQYPVVFYNPDGPVFREYDLPKGYVFSRNPSEIPILDNTSKITFNGWQYDMDQPILEKTDIYPDVTIKQNETIVVNFLGFDYLLKAQRSIPANTEIDEAYLMDLFQLEDGEDYIFGGWNLTFSDTSDDITVTPKSTTTQLEVSFYDYYGNFITSIYVFKGNTLTQDLTPTLKDTSRYAFDGWDHDLTNIQTDLDVHPKSTDKNPTSYTLTYLDSVGNEIATYKINTNIDLDIEEIFNRHLLPDRGSLLFKGWEGFIPIKDDIILRPLYHPETFTVVFYNYNGQAFTTANYEIGSTILDENLPILEDTSRYTFKGWDSKIENISSNLEIYPIFDTKTPEEILIKFYDHQQKVAYVEKVPFGSTIDPKRLEKAYTLEDYDFYEFMGWSWTTTDTTDDILVYPEYIRPSHTLTFYDYHNNYTSQIDLYKGETLDEIILPTLKDTSRYTFKGWDIKTNDITEDMDIYPLYEEKTPTTIQIKLFDYYGKEIQRFEVPVNSEVDFETLVEPYTLNDIGNLMFTGWNLLFFDTHDDVNIWPNYAEEYVHISFEDYRGKEFHTILIFKGDSIEPHLLPTLDSDSRYTFHGWIGDFNQIMSNFRAKPDFTEVLPETITVTLRDLYQNKSITTKVPYGSTITLEDIYALYKPAPAIKGFGKIYPFVGWDGDFTDTHYDIDLYTDYGHRGDVEGFEIIESEDFEPIIPKPVRPEIPTPPKPVQPEIPTPPKPVQPEIPVHPKPVTPINPQPDKKPHTETDPVIKQALITGNAAAYLKKTPRVAYLESVFEKPLDTINISIPTLTHDILDAYIASIKKTLTNQTISNVFVVSITPQDIDQTNITSVDGVVSITLNIPDSIDPSKTIAVYHVNHDTTMTQLKSTLNQDGTLTFEATEFSHFVITNIIETQSIHTPSTQTSKTQSPSQTLPRSGVSTHYGHYVSILLGCTLLFVESKKRTKR >NZ_CP013213.1|WP_067633391.1|1892407_1893547_-|UDP-N-acetylglucosamine-2-epimerase-(non-hydrolyzing) MNTIMVVFGTRPEAIKMCPLVKELKTRDTLNTVVCVTGQHREMLDQVLSAFNVVADYDLSIMKDRQTLFEVTISILEKMKAVLEEVKPDLVLVHGDTTTTFVTSLACFYLQIPVGHVEAGLRTYNICSPYPEEFNRQAVGIVSNYNFAPTEISKENLLKEGKNPDTVYVTGNTSIDALKTTVRKDYTHEHLKWASDSKLILITAHRRENLGAPMRSMFNAIKRIIDDKKDIKAIYPIHMNPIVRELADEIFGNTDRIRIIEPLEVLDFHNFLSRAYLILTDSGGIQEEAPSLGIPVLVMRDTTERPEGIEAGTLKLVGTDEEVIYKTCISLLEDDEAYDKMSHASNPYGDGFACKKIADIICKELIVKASSVCDNKHSI >NZ_CP013213.1|WP_067633393.1|1893564_1894785_-|nucleotide-sugar-dehydrogenase MINVIGLGYIGLPTALMFAKSGIEVIGTDLNVKLVESLSRGDLTFEEMGLNELFNEAKDKGIIFTTEYQRTDTYIIAVPTPYIKSSKKLDSQYVIAAVNSVLDVCVEGSILIIESTISPGSIDRYVRPEIEKRGMCIGKDIHIAHAPERIIPGNMIYELEHNSRTVGIDNHKIGEIVKKLYSSFCKSEIVITDIRSAEMSKVIENTYRDVNIAFANELVKICRVDNMNVYEIIRIANMHPRVNILQPGPGVGGHCISVDPWFLVGDYPELTHLIHTARDINDSMPSYVLRRTRDIMRENNITDTSKVGIYGLTYKENVDDIRDSPTIQLLNIMDAHLAFGAKVFDPYINEKIVDNQFMNFETFLNEIEILIIITAHDHIKDNLEMVRGKIILDTKNICDFDRVYKL >NZ_CP013213.1|WP_157777173.1|1895015_1896020_-|hypothetical-protein MNLSVSTFAFIRHIFYTLIIVSIGYKKFNIDYAAKTLIVIALINSLYGFIQYLAYNLLGLILPWHFSFLPLKYGRSLVENSNYLFSEFGYRFSGLFSEPAHFSQYVSIALLVILFYKSDKFKPNNVVKTIVSLIYILSLLLNGSGTGFAMIVFVIGLYFINSERKNIKSLFSKGALLSLGILFVVYITKNEIINGGLDRILSTSDVSSGNIRIFRPFYVFSTLPVLNRFIGVGYANYSNYVMNSSLATAYELSNNRAWTNTIGYILVGSGVVGFLFYISFILLLYRRTRNFYRYLVLLILLFALFTEVPLSFQFITIMGFINKGIFTKEISFIN >NZ_CP013213.1|WP_067633398.1|1896258_1897494_-|glycosyltransferase-family-4-protein MKILYISPPLYGFWECLFEGATEINGLPSFNKPLRKLIESGHQVDIVLLHNTKNLPNFNIKASWLKREMIKECLYYENKMILRPMNIINNRRIIKRLMNDEHYDFVYGHGSATEIFRSTAHKSGIPFGQRLYGTFLWNSIEKNGLFKTKIKHYIEYNSFKTEKSFLLVTNDGSRGDLTFNAINKGNHPFDFQYWINGVNIPYSITNGELIDFKRKLVSKPFLFYVARFDEWKRQERAVRILKKLIDRGHNIHLYLAGPSEKGNTWYFEYVMDLVEELGLNRNVTYMGHIDAKTIYMMCKLSIASLSLYDVCNLTNVFHEMLAAGSVVIVKNDGVVNDFIKQDENGFVVNYEEEVVDIVEKLLLNPEISKSIRQRAIETSKTKMLNWDQRIDLEIQLITKYAKNKKDSKYDK >NZ_CP013213.1|WP_067633400.1|1897641_1898754_-|hypothetical-protein MKVLVIGFTKLAYMPYMNFYTEQLKKMNSNTSLLYWDRDLKPDIEAPIVNQLYCFKKSMSDSDSMIKKIPNFISFRRFAKKVITKGDFDLIIVLHSTPAVLLSDILNRKFNEKYILDYRDFTYENIGVYKKIVHQLINHSRLTFVSSRGFQKYLPDSDKIHVSHNLLLHSYADRNCRKTLPRNNVPLRIRFWGLIRHVEINMKIIDNLANDSRFELHYHGREQEPGRLLRQYVQANEINNVYFHGEYIPIDRVDFASTTDILHNLYENDTKTTYAMGNKFYDGLTFYIPQLCNKGSFMGEEAMSSGIGVMLDPSENNFSDKIFEYYQKLDWDEFTKNCDEALSRITKEYNNGIDVLQELLFCEKESLIKQ |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
131546 : 189841
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013213|131546:189841|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013213|131546:189841|168853_169258_-|WP_067630089.1|transposase|DBSCAN-SWA MQVLDNNAHSVFLLTYHMVFVTKYRRKVINDSISKRAHEIFVSIAPNYNITCIEWNHDVDHVHILFKAHPNTPLSKFINAYKSASSRLIKKEFPKVKASLWKDAFCSKSFCFISVGGAPLEVLKQYIETQGEKR >NZ_CP013213|131546:189841|136386_137862_-|WP_067629964.1|transposase|DBSCAN-SWA MNANATLLSNEKILELFNLEHHQVQKIDIKGQSDALNVYITLQVEEQTCPICESKTSTIKDYSEKKLLHSLVTHIPCYIRYRARRYKCTTCNKCFFEHNPFAYRNMKITQLTVYNVLNDLKSPHETFTTVANRYRLSPTTVSSIFDSHVSVSRQKLPAYLLIDECYAYHSDRSDYVCVLIDAMTKNIVDILPSRKKQDLVAYFSQIPLEERKGVLGIGIDMWYSYRVVAKQFLPNAFISVDRFHVYSDLMKRIDSIRVDTMKKLKPPKNWKQTEDKVKRQEYYKRDQQYYLLKKFNWLLYKNPKATTTVKDKKYNIFDPNVPKQRNKKLGKFLNLYDIIDLILQTSNGLEDAYNMKFLLDQFFNESKAENAHENLNTLIRVMAQSRVASIVDFSRTLGKWKNEIVATFNKVEKCTKVTNKKTGETHYEVSITHINSALIENRNRIIKQIKNNASGYRNWERFRNRVLYVLNEDATYRINPIIKTTYDKGLS >NZ_CP013213|131546:189841|147320_147524_-|WP_067630029.1|DBSCAN-SWA MDSGKVKFFNAEKGFGFIIVDGSNEEIFVHYSGIAAQGYKSLNEGQAVMFDIVDGRRGKQAENVKPL 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60 | Staphylococcus_phage(21.43%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
379871 : 388854
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013213|379871:388854|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013213|379871:388854|382423_382606_+|WP_067634550.1|DBSCAN-SWA MADRKMSLKDLSQKTGISEVNLSKLKNERVKAIRFSTLNAICRELKCQPRDLLEFIYDLE >NZ_CP013213|379871:388854|385465_385915_+|WP_067630618.1|DBSCAN-SWA MLSIAKNRKAYHDYFINDTFEAGLVLTGTEIKSIRQGHVQLKESYISIRDGEAWIKGMHIAPYDFGNRFNHDETRDRKLLLHSHEIKKLFKEIQLQGNTIVPLHLYLKNGRAKLEIGVAKGKHLYDKRATERDRSLKREAQKATKERYQ >NZ_CP013213|379871:388854|387677_388082_-|WP_067630624.1|transposase|DBSCAN-SWA MQVLDNNAHSVFLLTYHMVFVTKYRRKVINDSISKRAHEIFVSIAPNYNITCIEWNHDVDHVHILFKAHPNTSLSKFINAYKSASSRLIKKEFPEVKASLWKDAFWSKSFCLISVGGAPLEVLKQYIETQGEKR >NZ_CP013213|379871:388854|383391_385491_+|WP_067630615.1|DBSCAN-SWA MKHTDTQYEKVKQALFKANGTVYSVDTWIQNLNQTLGFSSSICESVFKTMKAHEELVQIDDLLYVIDKTHFRLGTLRVVRETFGFVGDKADAIYIGGRNFNGALDRDVVLVQCNQVNKQEEGDVIKVMERKRSFILGTFEKKGKTLLFKPYENKFPYNFEIKGEATPNQRVIIAVDRVKNGVVEGHVQSVLGLADEPGIDVISVLMVHDLEVAFNQDALDQAATMPDEVDPTSFEGRIDHRNQNVITVDGEDAKDLDDAIYLERKADGYRLYVHIADVSHYVTPKSPLDVNASERTSSIYLVDRVVPMLPKNLSNGVCSLHPNVDRLTLTCMMDIDSKGVVDNYAVYPSIIQSKRRMSYNEINQNDTWGNETDMIHDMLHCAQILHYTRNQAGSIDFESDEAKYVVDHEGNVLDIYRRTQGEAEAMIEAFMVCANETVARHCKYLEIPIMYRVHEKPDLEKVKGLSHTLRTLGYRMKGSLDKIHPKTLQKAMDYFKDRPEGPVVSRLMIRSMSKARYDQEPIGHFGLALEDYAHFTSPIRRYPDLWLHQCLRKYVFNHDFSHFNDDVQMAQDCAAHVSSKERDIMEAERDVEKIKKAQYMKDKKGEAYEGFISGFSNYGIFVELENTVEGVVPFRSMRDHMVVDMASQKAIGTHTNVTYVLGQKVNVKVESVDLQEHEVEFFMKEKRGAKKRVKYRKKS >NZ_CP013213|379871:388854|383121_383355_+|WP_067630612.1|DBSCAN-SWA MAQFLEFLLLIVSALLIILSLLQSGKSEGFTGAFTGSSSLNLFSNTKERGAEKVISRITMVTGCLYFVLVVIILIVQ >NZ_CP013213|379871:388854|386547_387681_-|WP_067630621.1|transposase|DBSCAN-SWA MKRAYRFRIYPNQEQIIFFAKTFGCVRKTYNLMLEERLQMNEDYRNGLPTNDKIPTPAKYKEDYPYLKEVDSLALANAQLNLDRAFKNCYRDPKVGEPKYKSRKMEQSYTTNNQKGTISVKNHKYLKLPKLKSLVRIKMHRHPKGDIKSATISRSTTGIYHVSLLVEETIEHLPKTGSEVGIDLGLIAFAVLSDGRRIPNPRFTNQEAQTLKREQRKLSKRKREAKKRGVPLSEAKNYQKQKLNVARIHEKIANRRNDFLNKVSKELIENHDVLCIETLKVKEMMKTKRVSKSIADVSWSQFVAKLEYKADWYGKKVIKIDSWYPSSQLCSHCGHNDGKKPLEIRQWECSNCNITHDRDLNASINILNEGLRLSHQS >NZ_CP013213|379871:388854|379871_382214_-|WP_067630607.1|DBSCAN-SWA MENKLENLVILKRDNRKSKFNGEKIAVAIKKGFDSVENKKYSSDDVNEVYSAVLAVLAQSVDGDPFVSIEHIQDLIERELLRQNYIDVYESFSSYRNRRNESRKIFISKQHKFLKAIEALNQKEAHEDDSKRENANVDGNSPMGMMLQFGSTVSKEFAKAYQMSHNFYNAHDSGQIHIHDMDFLPMGTTTCNQINLAKLFENGFSTGHGHLRKPKDIMSYAALAAIAIQSNQNDQHGGQSIPAFDYYMAPGVLNTFKKQFKQRIYEYLDLQDLLLDFNMDKAVATIDAFTSIDVTLDDLRLVAGKNDAVMKLVEKAYEKALAVTNRITFQAMEAFIHNLNTMHSRAGAQVPFSSLNFGTDISPEGRMVVDNYLDALDSGLGKGETPIFPISIFKVKEGVNYNPEDPNYDLFKKSIAVSSKRLFPNFSFIDSPFNLQYYKDGDYETECTYMGCRTRVMGDITDPDNEVVTGRGNLSFTSINLVRLGIKHGLLNNETPDIDGFFEELGDLMDLVKDQLLERFDIQCAKHVSNFKFLLGQGVWKNSETLKPSENLRRVLKHGSLAFGFIGLAECLKALIGVHHGESEEAQELGLRIVGFMRAKADEYSQEYGLNFSLIATPAEGLSGRFVAIDQSIFGSIEAITDRDYYTNSFHVPVYYDVTVDKKLQLEAPYHNLTNGGHITYVELDGDTTKNLEAFEEVVRKMHDYQIGYGAINHPVDRDPACGYTGIINDVCPVCGRSEEAHNAQPFERIRRITGYLVGTLDRFNDAKRAEEHDRVKHSI >NZ_CP013213|379871:388854|388281_388854_+|WP_067630627.1|DBSCAN-SWA MNILTAISGLWIALGVVVIVVLYVVMAYNGLVSQRNLVEEAFSTMDVYLKKRYDLIPNLVETVKGYAKHESGTLEAVISARNKAVNATTDEARLQAEGDLSQVMGRLFALTESYPDLKANTNFLDLQNQLKLIETEIAQSRKYYNGTTRDFNTKIETFPSVIIANMFGFKRKPLYEVNNETERENVKVSF |
8 | Lactococcus_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1116867 : 1122522
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP013213|1116867:1122522|DBSCAN-SWA TTCATTTGAAGAGCTCATGATTTTCTCCAATCATTTCTACTTTAATTTCAGGCAATTCATCTAATGATGTCAGTTTAAATACATCAAAGAATGAAGAAGTTACTTCATATAATATGGGTCTACCCGGTGTGTCATTGCGTCCCGCTTCGCAAATAAGGTCTAGTGCTTCAAGACGGCGACACATCATATCACTGTTAACACCGCGGATTTCTTCGATCTCAACGCGTGTAATGGGTTGTTTGTAGGCGATGATTGCAAGTGTTTCAAGGGCAGCTTGAGATAATTGACGGGTGCGGTTAAATTCAAGCAGTTCACCAATAATCTCGTGATGTTTCTGTTTCGTAACAAGTTTTAAGACACCACCATATTCCACAACATCAAGACCGGATGTTGCACTTTCTTTGTAGTGGTTTTTAAAGTCTTCAACAAATGTATTACACGATCCCTCATCAAGATTGAATACAGTCTGTAATTGAAATTTAGTAATGCCTTCATCACCAAATGCAAAGAGTATTGCTTCTAATGTACCAAAATCTTCCATCTAGACTGCTCCTTTCAGATAAATTGCGTCGTTTTGAGTGCTCAAGAGTAAATCACCCATTCGTAACATATCTAAAACTGCTAGGAATGTGACAATCATAAAACTTACATTGGGTGATTTCTCGAGCAAATCATCCAATGTCATTACTTTTTTGTTTAAAAACTCCATCCGCAGTGAAATGATGCGATCATCCACTGAATATTCAACACGTTCGATGGATACTTCATGTGGATTTGCAAGCTTAAAGCGTTGCATTACCTTGACCATGGCATTCATGAGATCATAAGGCGTTTGATCATAAGAAATACTATCCTTAAGTGATGTTTTAATGTCTTTTAGAAGTTGAACAGAGATGGGTTTTGTATGTTGTTGGAGCCGTTCTTGATAGCGTACTGCAAGTTCCATACTAACTTCTTTGTAGCGTTGATATTCAAGCAACCTTTTCACCAGGTCTGTTTCTTGGTCTTCAAGTTCTTTGACATCAAGTTCACTTTTGTCACGAGGCAAAAGCTTTTTACTTTTATATTCAATAAGTCCAGCGAGTTCTGCAATGTATTCTGCAGCAATCTCGAGTTTTTGTTCTTTAGCGTGATTTAAAAAATCAGCATATTGATTCGCGAGTTCAAGGATGTTTAAGTCAAAAAGATCAAGTTTCTTATCCTTGATCAAATAAAGCATTAAGTCCAAAGGACCGGAAAATTGTTCAATTGTAACTTCAAATGCCATCCAAAATCTCTTTTCTAACTTACGATATCCGCGATTAATTGCGGTGTTTCAAGTGCATTGTCTGTGTAAGAGAATGCTAATTTGAATTCTTCAATGTGACGCGACTCAATGGGTTCATTGCTATACAAAGTACCCAGAAGTTCGCCTTCACTTACAGAATCCCCAACTTTCTTATTTAATATGATTCCAGCCTTAAAGTCAATGTCTTCATCTTTTTTTGTGCGTCCTGCACCTAAATGAAGTGAAGCCATTCCAAGTTCTAAAGCTTTTAAATCAGATACAAATCCATGGGAATCAGCGTAGACTTGTTGGGTGTAGGCTGCGTGAGTAAACGCACCAAGGTCTTCAAATACTGATGTATCGCCACCTTGTCTTGCAATCCACTCAAGGAATTTCTTATATGCTGATCCATCTTCGATGGAAGCTTTTGCTTTTTGATACCCTGCTTCATATGAATCAACTTGCTTGCCATGAACAAGCATATGTCCACATGCAACCAAACAGAGTTCTTCTAAGTCTTTCGGTCCATGTCCACACAGCGTTTCAACGGCTTCCTTTACTTCAAGCGCATTTCCAATACAAAAACCAAGGGGTTGATTCATATTCGTAAGAAGTGCTGTAACATCGCGTCCAAGGTTTTTTCCAATGGATATCATCACACGTGCTAATTCGCGTGCATCATCCAATGTCTTCATAAATGCTCCCTCGCCATATTTTACGTCGAGTACGATTGCATCGGCTCCACCTGCGATTTTCTTAGACATAATCGATGCAGCAATCAGTGGAATTGATTGAACCGTTCCCGTTACATCACGTAAAGCATAAAGCACCTTATCTGCGTATACTAGATTTCCTGTTTGACCAATGATTGCGACATTAATGTCGTTTACTTGATTTACAAATGCGTCATTTTCTAAATTAATGTCAAATCCTGGAATTGATTCAAGTTTATCAAGGGTTCCACCGGTATGTCCAAGTCCCCTTCCACTCATTTTCGCAACTTTGCCACCACATGCAGCAACAATAGGACTGATGACAAGGGATGTCTTATCCCCAACACCTCCAGTGGAGTGCTTATCGACTTTAAGACCATGAATTAAGGATAAATCAATGGTGTCACCAGAAGCAATCATCGCTTCTGTTAGTGCTGTTGTTTCTTCCATATTCATACCATTTAAAGTAATTGCCATCAACAAGGCTGAAGATTGATAATCTTCAACCGTGTGGTTTGTAAGTCCTTCAATCCAAAACTTAATTTCTTGAGAAGATAAGGCGTGTCCATCGCGTTTCTTCTCGATTATCTCAACGATTCTCATCAAATCACCCTTTCGTATATAACTAAATTATACTCTTTAAATTCACGCATTTCCTTTATTCTAAATTCATTAATTGAAAACGACGGAAAATAAGTGTCGCCAATGACGTCATTGTCTTTAATGAAGGATAATACGAGTTTATCACAGATTGGTAAAAGAAGTTCATAGATGGTTCCTCCGCCACATACGACACATTCCTTTTCACTGTTTTTATATGTTTTAAAAAATGCATTAATATCTTGAATGCTGTTTGGATATGTGGTGTCTGTTGTGATTACATGAATGTTTCGACCTCTGAGTTTTTGAGGTAATCCTTCATAAGTAACCCTCCCCATACACAAATCCTTTCCCATTGTATAGGATTTAAAATGTTTTAAGTCTTCGGATGAATGCCACGGCATCACCCCATCACGGCCGATGGTACCATACTGATTCATCGCTGCGATACAGGTAATCATTAAACGCTCACCTTGGCTTTAATGGAAGGATGATGGTTATAGTTTACGATTTCAAAGTCTTCATATTTAAAGTCTTCAATTTCTTTTTGATCCCCGTGAATGATTAATTGTGGGAGTGGTAATGGTTCACGTGATAGTTGTTCTTCAATTGCATCAACGTGATCATTATAAATGTGCGCGTCACCTAACGTATGAACGAAGTCACCAACTTCTAAGTTGCATATTTTCGCAATCATATGCACAAGCAGTGCGTATGACGCAATGTTGAATGGAACACCTAAAAAGATGTCGGCACTGCGTTGGTAGAGTTGTAGGGATAATTTGCCTGAATCACTGACATAGAATTGTAGAAATGCATGACATGGTGGCAAAGCCATCTCATGAATTAAAGGTGGATTCCAGGCACTCATTATAATCCGACGTGAAGTTGGATTGTTTCGGATTTGATCAATTACTTCTTGTAGTTGATCAACACCCCCAAAGTCACGCCATTGCTTTCCATAAACAGGACCTAAATCACCAAATTGAGCAGCGAATGCATCATCGTGAGCAATTCTCTCAATAAATTGATTCATTGTTTCGTTTTGATACATATCTGACGCTTTAAATGCAGCATATGGCCACTCGTTCCAAATCCTTACTTTGTTTTGAACGAGCCATTGTATGTTCGTATTGCCGCTGATAAACCAAAGTAATTCTTTCGCAATAGATGCGAAGTGTACGCGTTTTGTTGTGAGCAAAGGAAAGCCTTCGCTTAAATTAAACCGCATTTGGTATCCAAATACACTGCGTGTACCTGTACCAGTACGATCCATACGTTGTTCACCATGTTCCATTACAAACTGACATAAATCGAGATATGTTTTCATAAAAGTCCCCTTATCTTAAGCTAAATATTCTAAATTTTCAGCAATTAACATCAAGTCATTGCCGCGTTTTTCAATTCTGCCGTGTACAGCGATGTTATCGTCTATTTTACGAAATGACATAACTTCTGCAGCCATGCCCTGCCATAAATGAATGCGGTAGATTTCTGTTTTAAATGAGAAATCCGCTTCTCTGAAGTTTTTAATGACTTCAATATCAAATGCATGATAGATGCCCCCTTGCAGATCCGCAACTTTCGACGTTTGACTCTTCACTTTTCCGACGAGACTGAACTGGTTAATACGCTTCACCTCAATTCTAGATCCGTTAGATTTTCGGCACAAAAATCATACAAAAATTATAACATACTCTCTACGTGATTTTTTGCTTAAATCTATGATTTATGAGGTAAAAAGATAGGATTAATCAAACAATCAATTTCATACAATAATCGATGTGATGATCAAACTTAAAGCTTCTTAATCTGAATGGGTAGGTTCGTGTGGTTTCATTAGTACAAAGCTTGAATTAAAGTTTTGTAAGAAATCTAATGTATTAAGTACTCTTTTGTAATCCAAAGTCTTAATGAATTCAAGGTAATCAAAGTATTGGACCCTTTTAAACCCAGTACTTAATATATTCATGACAAAACGATCGTTGTGTTCCATTAACATAATCAGGCGTCCATATTGACGTCTTGACAATTGGGTAAAATTATCTGGGTTTACTTCTAGTTTTTGCATTACTGAATCAATGAGTTCTCTGAAAGCCTCTGGTTTTTCGGCATCGTTAAAGAAATAAACAACACCAAAGCCATCTCTCAAATCGACATCATACATGAATGAATCGCTGATAATTTCATCATCTAACCAGGATTGGTATGCATCATTCATCTCAGAGAAGTTAAGTTGAAGGATAAACCGAACCAAATATTCATCATAGACTTTGTTGGTACCATTGTACTCAAATTTATAAGAGACACTCATTTTTGGAATTAAAACATTGTCATAAATTTCTTCATAAGCACATCGTACAGTGAGTGGTTCATGTTTGAAGTGGGTTTGAACGTTTAAGACTTCATACGGATGATTTTGAGTGTGAAGTGTCACAGTCTCAAAGATTTTCTGTGGGTCTTCCCCAGTTGTAATTACTAGGCCCATTCGTGAGTCTGTGTAATTCATACGGTAGGCTGTTCGTAAATCATCTAAAAGCATTGATGAAACATCTTCTTCAGTTCCCCCAATATCAATTCGTAAAGGAAACGTGTGATAGACATTTTGGTAGGTCTTCATTAAGAGATTTGTATCCGGCATTTTGGCATACATGCGAAGTTCTTCTAAGATAATCCCCTTTTCTTTGTCGACGCGTTCTTGATTTAAAGAAAAACGACTGACAAAATCTATTAGAATCCCCAAAGGGGTTAATACATCGCCATTAGTACTAAAGTAATAAACAGTTTGTTCATGTGATGTGAAGGCATTCGCACTGGCCCCTACTTCAGCAAACTTACTGAATACATCTTCGGTTTCATCTTCAAAGAGTTTATGTTCGAGAAAATGAGCAACCCCTGTCTTGTGTTGAACTTCTAAGCCATCAATGGATTGGATTAAGTCAAGTGCACCAAATGGTGTTCCATATACTGCAACAGATTGTTTAAACCCTGGGCGATGTATAATCGTTACCCGTAGGCCACTTTCCGTTACGAATGCATACGCATTGTCAATAAAAGAATTTTTAATTTGTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP013213|1116867:1122522|1119906_1120776_-|WP_067632145.1|DBSCAN-SWA MKTYLDLCQFVMEHGEQRMDRTGTGTRSVFGYQMRFNLSEGFPLLTTKRVHFASIAKELLWFISGNTNIQWLVQNKVRIWNEWPYAAFKASDMYQNETMNQFIERIAHDDAFAAQFGDLGPVYGKQWRDFGGVDQLQEVIDQIRNNPTSRRIIMSAWNPPLIHEMALPPCHAFLQFYVSDSGKLSLQLYQRSADIFLGVPFNIASYALLVHMIAKICNLEVGDFVHTLGDAHIYNDHVDAIEEQLSREPLPLPQLIIHGDQKEIEDFKYEDFEIVNYNHHPSIKAKVSV >NZ_CP013213|1116867:1122522|1116867_1117407_-|WP_067632129.1|DBSCAN-SWA MEDFGTLEAILFAFGDEGITKFQLQTVFNLDEGSCNTFVEDFKNHYKESATSGLDVVEYGGVLKLVTKQKHHEIIGELLEFNRTRQLSQAALETLAIIAYKQPITRVEIEEIRGVNSDMMCRRLEALDLICEAGRNDTPGRPILYEVTSSFFDVFKLTSLDELPEIKVEMIGENHELFK >NZ_CP013213|1116867:1122522|1117407_1118133_-|WP_067632133.1|DBSCAN-SWA MAFEVTIEQFSGPLDLMLYLIKDKKLDLFDLNILELANQYADFLNHAKEQKLEIAAEYIAELAGLIEYKSKKLLPRDKSELDVKELEDQETDLVKRLLEYQRYKEVSMELAVRYQERLQQHTKPISVQLLKDIKTSLKDSISYDQTPYDLMNAMVKVMQRFKLANPHEVSIERVEYSVDDRIISLRMEFLNKKVMTLDDLLEKSPNVSFMIVTFLAVLDMLRMGDLLLSTQNDAIYLKGAV >NZ_CP013213|1116867:1122522|1118147_1119449_-|WP_067632140.1|DBSCAN-SWA MRIVEIIEKKRDGHALSSQEIKFWIEGLTNHTVEDYQSSALLMAITLNGMNMEETTALTEAMIASGDTIDLSLIHGLKVDKHSTGGVGDKTSLVISPIVAACGGKVAKMSGRGLGHTGGTLDKLESIPGFDINLENDAFVNQVNDINVAIIGQTGNLVYADKVLYALRDVTGTVQSIPLIAASIMSKKIAGGADAIVLDVKYGEGAFMKTLDDARELARVMISIGKNLGRDVTALLTNMNQPLGFCIGNALEVKEAVETLCGHGPKDLEELCLVACGHMLVHGKQVDSYEAGYQKAKASIEDGSAYKKFLEWIARQGGDTSVFEDLGAFTHAAYTQQVYADSHGFVSDLKALELGMASLHLGAGRTKKDEDIDFKAGIILNKKVGDSVSEGELLGTLYSNEPIESRHIEEFKLAFSYTDNALETPQLIADIVS >NZ_CP013213|1116867:1122522|1121253_1122522_-|WP_067632148.1|DBSCAN-SWA MKQIKNSFIDNAYAFVTESGLRVTIIHRPGFKQSVAVYGTPFGALDLIQSIDGLEVQHKTGVAHFLEHKLFEDETEDVFSKFAEVGASANAFTSHEQTVYYFSTNGDVLTPLGILIDFVSRFSLNQERVDKEKGIILEELRMYAKMPDTNLLMKTYQNVYHTFPLRIDIGGTEEDVSSMLLDDLRTAYRMNYTDSRMGLVITTGEDPQKIFETVTLHTQNHPYEVLNVQTHFKHEPLTVRCAYEEIYDNVLIPKMSVSYKFEYNGTNKVYDEYLVRFILQLNFSEMNDAYQSWLDDEIISDSFMYDVDLRDGFGVVYFFNDAEKPEAFRELIDSVMQKLEVNPDNFTQLSRRQYGRLIMLMEHNDRFVMNILSTGFKRVQYFDYLEFIKTLDYKRVLNTLDFLQNFNSSFVLMKPHEPTHSD >NZ_CP013213|1116867:1122522|1119448_1119907_-|WP_067632142.1|DBSCAN-SWA MITCIAAMNQYGTIGRDGVMPWHSSEDLKHFKSYTMGKDLCMGRVTYEGLPQKLRGRNIHVITTDTTYPNSIQDINAFFKTYKNSEKECVVCGGGTIYELLLPICDKLVLSFIKDNDVIGDTYFPSFSINEFRIKEMREFKEYNLVIYERVI >NZ_CP013213|1116867:1122522|1120791_1121049_-|WP_067632146.1|DBSCAN-SWA MKSQTSKVADLQGGIYHAFDIEVIKNFREADFSFKTEIYRIHLWQGMAAEVMSFRKIDDNIAVHGRIEKRGNDLMLIAENLEYLA |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1391160 : 1461133
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP013213|1391160:1461133|DBSCAN-SWA 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72 | Erysipelothrix_phage(79.17%) | transposase,capsid,integrase,head,portal,terminase,holin,tail,protease | attL 1374429:1374446|attR 1451365:1451382 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2045441 : 2091992
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP013213|2045441:2091992|DBSCAN-SWA 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52 | Enterococcus_phage(20.0%) | transposase,capsid,head,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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