Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP010474 | Campylobacter jejuni strain CJ677CC536, complete genome | 0 crisprs | DEDDh,cas2,csa3 | 0 | 0 | 2 | 0 |
1. NZ_CP010474
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
79351 : 166296
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP010474|79351:166296|DBSCAN-SWA TATGGAAAAAGAAGTTATTGCGTATTTGGATAATGAGACAATAATTGACTCTCAAAGTGTGAAAGATACAAATTTAAAAGAAATTTATTTTGATAATTCTAAAGAAAGTTTAGAAGTAATCCGCCATTCTTGTGCACACTTAATGGCACAGGCGATTAAGAACTTGTATCCTGAAGCTAAATTTTTCGTTGGTCCTGTTATAGAAGATGGATTTTATTATGATTTTCGTGTAGAAAGTAAGATCGGCGAAGAAGATTTAGTAAAAATTGAAAAAAAGATGAAAGAACTTGCTGAAGCAAAGATTGAAATTTCAAAATATGAAATCACAAAAAGCGAAGCTTTGGCTAAATTTCAAAATGATGATTTAAAACAAGAAGTTTTATTGCGTATTCCTGATGGAGCTGTAAGTATTTATAAACAAGGTGAATTTGAAGATTTGTGTCGTGGTCCTCATGTGCCAAATACGAAATTTTTACGCTTTTTTAAACTCACTCGTGTTGCAGGAGCGTATTTGGGTGGCGATGAAAAAAGAGAAATGCTTACTCGAATTTATGGTACTGCTTTTGCAGATAAGGAAAGTTTAAAAGAGTATTTAACTATTATTGAAGAAGCTAAAAAACGCGATCATAGAAAGCTTGGAACAGAGCTTAAGCTTTTTACTTTTGATGATGAGATTGGAGGGGGTCTTCCTATCTGGTTAAGTAATGGTGCAAGACTTAGATCTAAACTTGAACACATGCTTTATAAGATCCATCGTTTGCGTGGTTATGAACCTGTGCGTGGGCCTGAACTTTTAAAAGCAGATGCATGGAAAATCAGTGGGCATTATGCAAACTATAAAGAAAATATGTATTTTACACAAATTGATGAACAAGAATATGGTATTAAGCCTATGAACTGTGTGGGGCATATTAAAATTTATCAAAGTGATGTAAGAAGTTATCGTGATTTGCCTTTGAAATTTTTTGAATATGGCGTAGTGCATCGTCATGAAAAAAGTGGGGTTTTGCATGGACTTTTTAGGGTGAGAGAATTCACTCAAGATGATGCACATATTTTTTGTATGCCAAGTCAGATTAAAGATCAGGTTTTAGAAATTTTAGCTTTTGTGGATAATTTGATGAAATTATTTGATTTTAGCTATGAAATGGAAATTTCAACTAAACCTGAAAAAGCCATAGGCGATGATGAAATTTGGGAAGTAGCGACTAAGGCTTTAAAAGAAGCTTTAGATGAACAAGGTTTAAAATACGGTATTGACGAAGGTGGAGGGGCTTTTTATGGGCCAAAGATTGATATTAAAATCACCGATGCTTTAAAAAGAAAGTGGCAATGTGGAACCATACAAGTAGATTTTAACCTGCCAAGTCGTTTTAAACTTGAATACACTGATAGTGATAATGAAAAAAAACAACCTGTAATGTTGCATCGTGCGATTTTAGGTTCTTTTGAAAGATTTATAGGAATTTTAACCGAGCATTGTGCGGGTGAGTTTCCATTTTTTATCGCACCAACTGCGGTGGGTATAGTGCCAATAGGCGAAGCACATATTGCTTACGCAAAAGAAATTCAAAAAGAATTATTAGAGCTTAATATCGATAGCGAGGTGTATGAAAAAAATGAGAGTTTAAGTAAGAAAATACGCACAGCTGAAAAACAAAAATTACCTATGATTTTAGTTTTAGGCGATGATGAGGTGGCAAAGCGTAGCGTTGCTTTAAGAGATAGAAGAGCTAAAGAACAAAAAAATCTTAGCTTAGATGAATTTATTAAATTAGTTAAGGAGAAAATGAGTGAGGTACACTTTTGAGTAAAGAAAAAGAAGTATTGCTCAATGAAGAAATAAGAGCGGATGAAATCAGATGTGTTGGCGATGATGGCAAGGTTTATGGTATTATTAGTAGTGATGAAGCTTTAGAAATTGCAAATCGTTTAGGACTTGATCTTGTAATGATAGCTGCAGATGCTAAGCCACCTGTTTGCAAGATTATGGACTATGGTAAATTCCGTTATCAACAAGAGAAAAAACAAAAAGAAGCAAAGAAAAAACAAAAAGTGATTGATATAAAAGAAATCAAACTTTCTGTAAAAATTGCTCAAAATGATATTAATTACAAGGTAAAACATGCTTTAGAATTTTTAGAACAAGGTAAGCATGTGAGATTTCGTGTGTTCTTAAAAGGACGTGAAATGGCAACTCCTGAAGCAGGTGTAGCTTTGCTTGAAAAAATTTGGACTATGATAGAAAATGAAGCTAATCGTGACAAAGAGCCAAATTTTGAAGGTCGTTATGTAAATATGCTTGTAACTCCAAAAAAAGCTTAATCCACTTTTGTGGATAAGGCTTTTAAAGGTTTTAAATTTTGAAAGAAAATCCTTCTTTTTTAAAAGAGCAAATTATAACTTATCTTGGAAATAAAAGAGCGCTTTTAAGTTTTTTAAATAAGGGCTTTAAGGTAGCTAAAAAAGAACTTGGTAAAGATAAATTTAGTTTTTGTGATATATTTAGTGGCTCAGGTGTTGTAAGTCGTTTTGCAAAAGCACACTCAAATTATATTTTAGCCAATGATTTAGAGGATTATTCAAAACTCATCAATGAGTGTTATCTTGCCAATAAAGACAAAGATTTACTTCAAAATATAAAAAAGCATTATAAAAATTTAATCCAAAATTTAGATTTTCAAAAAGGTTTTATCAGTGAGCTTTATGCTCCAAAAGATGATGATGATATTAAAAAAAATGAAAGGGTTTTTTATACTTTTAAAAATGCTTTATATCTTGATACTATAAGGCAAAAAATCGAAAATGAAATTCCAAAAGAATTGAGGCATTTCTTTATAGCTCCTTTGATTTATGAAGCCAGTGTTCATTCAAATACTAGTGGAGTTTTTAAAGGTTTTTATAAGGGTAAGGATGGCATCGGAAAATTTGGTGGCGAAGGACAAAATGCACTTAAACGAATTAAAGGAGAAATAGAGCTTAAAATGCCTATTTTTTCAAATTTTTCTTGTGAATTTGAAGTGATGCAAAAGGATGCAAGTATGCTTGCAAAAGAACTTGATTTTTTTGATGTAGTGTATCTTGATCCCCCTTATAATCAGCACCCTTATAGTTCTAATTATTTTATGCTAAATTTAATCGCAAATTATAAAAAACCTGAAGAAATTTCTAAAATCAGTGGCATTCCAAAAGATTGGAACCGTAGCACTTTTAATAAGCCAAAATTTGCCCAAGATGCTTTATTTGAACTTATTAATGATTTAAAAGCAAGAGTGATTTTACTTTCTTATAATTGTGAAGGTTTTGTAAAAAAAGAAATTTTTTTAAAGCGTTTAAGTACTCTTGGAAAATGTCGGATTTTAGAACAAAAATATAATACTTTTAGAGCTTCTCGCAATCTTAAAAATCGTAATATCCATCTTCATGAACAACTTTATATTTTAGTTAAAAATTAAATTTTGTGCTAAAATTATATTTATAAAAAGGAGGGATTTATGAAACTAAAATTATCTTTTTGTGCATTAATGGCATTTGGTTTTTCTAATTATCTTTTTGCTTCGGCCATTGATCCAAAGTTTTATTTTCAAGAATATCTTGATTTTGCTAGCAATAAGGGTAAATTTCAAGTAGGTCAAATTGGCTTTGAAATTTTAGCAAAAAATCCTAATCAAAACATCTCTTTCAATGTACCTATGATTGATTTTTCTACTTCAAATCGTGGAGGAAAATTCCAAGGAGAATTTACCAATATAGGACAATCTTATATAGTCAGTGCTTTTCATATGAGTACAAGTTCAAATACTGGGGAAGTAAATAAAGGCTATGTGAAACAAGGTAGTGTTTTACACTTTGGAGGTGTAGCAAATAGAATCGTAAGCTCAAGTGATAATTTTACTTATAAGAAAGAAAATGTGGATTTTGCTGTTTTAAAAATGAGTAAGATCAATCTCAATAAAAGTGCAAATTTGAGTAAAGATTTCAATTTTATTGAAAAAGATTCTGGCGATGGTGGAGATATTTATGAATACAAGGATCCTTTTTGGGATAGTTGTCAAAGTGGAAAATGTGATTATTCTAAAGGCAAAGGCAAGCTTTTTGATAGTTCGCGTTATGAGTACTTTGTAAGAGAGGGAAGTGGTATTGTAGCTTTAGGTTTTGAAGATACAAATAAAGTACCCATTAAGATTTTTGATTCTAATGAAATTAATTTAGGAGGTTTTGTCAGTTTAGCTCCTAAAAATACTGAAGATAAGCGTTTTAAGTTGCAATTTCTTAATTATACCAATGATAAAAGAAATCCTTTTGCAAGTTCTTCAACACCTGGGGATTCTGGAAGTGGAGTTTATGTTTATGATAAGATTGATAAAAAATGGTATTTAGTAGGTGTAGTAAGTACGAGTAATTGTAATGCCCATTTTACTGATGGATATACTTGTTCACAGGTTGATTATGCTTTGATCAATCAAGCAAAGATCAATGAATTTCAAAATACTCATAAAGTAGCCATAGGATCTGGAACTTATGCACTTAGTAGTGATGGTTTGATGAAAGATGGTAAAAAAATAGAAAATGTAAGTTTGATTTCTGGGACTAATGCGGGTTATGTAAGCTATAAAAATTCTTTTGATGATAAGACTAAATATGATAAGAGAATTGAAGAAATGCAAAATAGCAAGGATTTGTATTTTTCTCAAAATGGAAGTATAAATTTAAATAGCGATGTGGATTTAGGCGCTAGTGTTTTAAATTTTGAACAAAATTCAAATTGGCAAATAACAGGCGACAAATGGCTTATACATGGAGGAATTTACGCTGATAAGGGTTCAAGTATAGAATATAATGTTAAAACCAAAAAAGATGATTTTCTTTATAAAATGGGCGAAGGGGAGCTTATTGTCAAAAGTCAAAGTGTGGATGCAGGACTTAGAATGGGTGAGGGCAAGGTAAGTCTTGAGGGTGAAGGTTTGAGTTTTGGCGAAATTTATATGAATGGTGGAACT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97 | Campylobacter_phage(27.59%) | protease,tRNA,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
1288766 : 1302072
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP010474|1288766:1302072|DBSCAN-SWA 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16 | Synechococcus_phage(38.46%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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