Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP013337 | Fusobacterium hwasookii ChDC F206 plasmid unnamed, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
| NZ_CP013336 | Fusobacterium hwasookii ChDC F206 chromosome, complete genome | 5 crisprs | WYL,cas3,cas14j,cas14k,cas4,cas10,csm2gr11,csm3gr7,csm4gr5,csm5gr7,cas6,csm6,cas1,cas2,csa3,DinG,DEDDh | 0 | 1 | 4 | 0 |
1. NZ_CP013336
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP013336_1 | 237092-237180 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013336_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP013336_1
>1.1|237115|43|NZ_CP013336|CRISPRCasFinder AAATTCCATAGTTTCCATTTCCTGTTGAATTTAGAACTGATGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013336_1
The CRISPR arrays of NZ_CP013336_1 >merge|NZ_CP013336|1|237092-237180|CRISPRCasFinder ATTTGTTACAGAACCTGCACTATAAATTCCATAGTTTCCATTTCCTGTTGAATTTAGAACTGATGAATTTGTTACAGAACCTGCTCTAT >NZ_CP013336|1|1|237092-237180|CRISPRCasFinder ATTTGTTACAGAACCTGCACTAT AAATTCCATAGTTTCCATTTCCTGTTGAATTTAGAACTGATGA ATTTGTTACAGAACCTGCTCTAT
>NZ_CP013336.1|WP_029490855.1|234290_234878_+|YigZ-family-protein MEKIKTVKKECKIEFEEKKSKFIGYVKPVFSKEEAEEYIRHIKNLHSDATHNCSAYKINNNGLEFFKVDDDGEPSGTAGKPMGDIINYMEVTNLVVIATRYFGGIKLGAGGLVRNYAKTAKLAITEAEIIDFIDKIDLIFEIPYERLSEVEKLLKDYEAEVIDKSFLEKIVFKVRINKDFYDNLENYPFINLLDI >NZ_CP013336.1|WP_029490854.1|232778_234215_+|leucyl-aminopeptidase MSFQCVKKYEDSYDKYVLLATSGKVVLPDYLDKESQKLAETIIKKNKFTAKASEKISMTLVNKKKVIDFTIVGLGEKKKLDSKNIRQYLFDGLKNITGKTFVSFNDKDLDNMDVVAEVVEHINYKFDKYFSKKKEEFLEVSYLTDKKVPKLIEGYELAKISNIVKDLVNEQAEVLNPKELADRTVKLGKNFGFEVEILDEKKAQKLGMTAYLAVARAAHHRPYVIVMRYKGDAKSKYTYGLVGKGLTYDTGGLSLKPTESMLTMRCDMGGAATMIGAMCSIAKMKLKKNVTCVVAACENSIGPNAYRPGDILTAMNGKTIEVTNTDAEGRLTLADALTYIVRKEKVNEVIDAATLTGAVMVALGEDVTGVFTNNDKMARKIIDSSENWNEYFWQMPMFDIFKKNLKSPYADMQNTGVRWGGSTNAAKFLEEFIDDTKWVHLDIAGTAWASGANPYYCQKGATGQVFRTVYSYIKDSKN >NZ_CP013336.1|WP_029495085.1|227975_232520_-|hypothetical-protein MFKNKYLFVLALLVTTTSYSENYIVTQENKKEAKEVLKHEKEDSGRIGEFAVSGNVIIFKGNGFLINDGVLKGSIKAVGEDTKNEKSKKGEIIVTAQGNGVSGVGYSPYSNKRDVDKKINSIKNSGYISGEANLTGGNAVTHGALEEVYSVANGISGLTLADFGDTATGGSGDSGIVDGAGGASRSGRSKSVSLLSTKVLASKTVEKISENKIGEIKKTDPADFHGKNNKFTLEDIVNTGNISGKAILRTKEGYIKPDSEAFAGNKAMSPQWRTINATSTANGIANMAYLTTIDKYTYSEDKVNGSYIRNINNFGNISGEADAKTGSLATLNNIRAYATANGISSVAYSNNFVKSLTEATIDKVNNSGNISGKLKAEVGHNTSRGIHEYSQALVTGSANGISVYSRSSNGQMKNSRAVLGELSNTGSISGDLYARGGSGYGEARADIKSSGNGVAVYTESSVKKETKIGSVNNQGMITGKAVVYGGKDKRAMNDKELKDKIFHVPLTNNISGFSLPEEDVEDDKAAVAEMRKYEKEKANELENNIAKYQKLVGDKEKEILAKSPKSPQLSEQDKINRDNIFKKYINDEIKEQQDLIWSGINNETVTKARKRKAELEELKSAATDEQKNQFLEEYKNELEKRLLIPRLQLYVKNKINDKLKKINEILEKNKNKNIPDSPEILALKEEKKKLEGDLANLLKEKKDIENDHVAANVNTVTGMEASGNGISINDGSQTGVELGSFKNSGVISGETEIHHGNSQRKYTRIAHKNSGAGVAVGGDVLSKIENTGIISGTEFALLAKGSRSDAYGLKKEDIVYKSGFKGGVDNYGILAGRIIIGGYQVAHTGTHGEWGAIEEDYAYFETIYKDEKHYNNKGIFLVLDRNGEVKKVIGKNEDATYNGRTVKNVLDKDSTYQGDTTNKIINGVGKDGVVIAKENQDRNIDNSIVNGFKTAVKVEDRGVARISNSTINANGFGNSYAILGDEGANEVEITNKSIINGKIDLGAGDDRLTLSGNYRLNREVDLGKGNNTLAFGKKENTTISTLSYSTFGTSSTNTSVFNGTVNNANKVEVNENTAFSSSSRINGVNELNLANGKTLDYYFVDKENQAFAELAKNNRNLKVNGSGKVNLVPIGNKVQIGYEKDLLGFSFGNNLLKPNSNGGNNNSSNNNPGNNGNNGNNNNPGNNVPGNNGNFFIDPRLTPFEKYSKGAFDAYIADYKSTGIDFLKDYKSSQEVFKNYLYNLTNNNPVGYLKDSAIDTMLAYHKVNTNNFTKKGQLAVSGETFNIRNKYYENNKVVSNGALAEISYGTSDNTNIGLNIGGGQSKVKTSDENLKSEVLVLGVNAEYKVKNFSWQNEVSYGRIKPKKYSTLDTYSLYSQLGYNIPLSETWNLIPKVSVFLSKVKQKEMTVDNIKVTKDDDTFVETTVGTELNKKFMFGNNGINFGLGVDYSMVKDLDDSKAHFIGGSTEFDLRNYDRKNRATAEIKFGYEHISGITATFRIRKNKDITSSGFGLGYKF >NZ_CP013336.1|WP_187099974.1|227557_227926_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MSKMDKNKKYNCFFEFTLDIVGGKWKPIILYYININSVARHSELKRFIPSINERMLTRQLRELEEDNLIERKVYPIVPPKVEYTLTEYGKSLIPILKSLVLWGKDYAKAIRFDNFKMEFPEE >NZ_CP013336.1|WP_029495087.1|224964_227394_-|CoA-disulfide-reductase MEKVLIVGGVAGGASTATRLRRLDENLEIVIFEKGEYVSFANCGLPYYIGDIIQNRESLLVQTPESLKARFNLDVRVNSEVVGVNGKDKKVKVKTKNGEEYEEIFDFLVLAPGAKPIFPAIKGIENKKIFTLRNINDMDKIKSEIKNNSIKKAVVVGGGYVGIETAENLKHLGIDVTLIEAAPHILAPFDSEISNILEYELVNNGIELMTSEKVVEFQEDANKIIIKLESGKIVTTDMVILSIGVSPDTKFLQGSGINLGERGHILVNENLETNIDGVYALGDSILVKNYITNQNVGIPLAGPANRQGRIVAGNIVGRNEKYKGSLGTAIIKIFELTGASTGLNERSLKQLNISYEKIYLHPNNHAAYYPGASPISIKALYNKENKQILGAQAVGISGVDKFIDVMATSIKFKATIDDLAELELAYAPPFLSAKSPANMVGFIGQNIEDDLLEQVFMEDLKKYDEKKTIILDIREELELIGGKFDNSINIPLSELRKRYTELPKDKEIWTYCAVGLRGYIATRFLSQKGYRVKNLAGGIKSEEKVIVNTQKESSLTKEGNSNIEKEEDYLDLSGLSCPGPLVKIKEKIDKLGEDEKLKVKVSDPGFYNDIQAWSKVTKNPLLSLDKKDGLTYATLQKGQTSKVIEKNQENVIIEDNSNMTMVVFSGDLDKAIAAFIIANGALTMGKKVTMFFTFWGLSILKKKNLVKKSFIEKMFAMMLPKNSQDLPVSKMNFFGIGAKMIRSVMKKKNIMSLEELIKKAIDSGVNITACTMSMDVMGISEEELIDGINYGGVGQYLGEAEKSNNNLFI >NZ_CP013336.1|WP_029490850.1|224350_224836_-|cytidine/deoxycytidylate-deaminase-family-protein MRENYINWDSYFMGIAILSSMRSKDPNTQVGACIVNDEKRIVGVGYNGLPKGCDDKEFPWERDGEFLNTKYPYVCHAELNAILNSIKSLKDCIIYVALFPCHECTKAIIQSGIKEIVYLSDKYTNTDSNRASKKMLDAAGVKYRRFEPDIEKLEINFANIE >NZ_CP013336.1|WP_029495088.1|223687_224341_-|Crp/Fnr-family-transcriptional-regulator MIETLRETVIFNGIDEKTIKNILEKTKYEIKKYSPDESIAFRGDEVKGLYIILKGTLTTEMLTEEGNVIKIEELGSSDVIASAFIFGKKNSFPVDLIAKDEVEILFVERKEFLKILFSKEKILENFLNEVSNKTQLLTSKIWNSFNNKTIKKKFCDYVKKNQKNDLFSIQSLGALAEYFGVERPSLSRVLSDLVKDEKLERIGRNKYKILDKEFFEI >NZ_CP013336.1|WP_029495089.1|222457_223450_+|PTS-transporter-subunit-IIC MKNFFIKSLNGMAFGLFSSLIVGLILKQIGTLFNIEFLTYLGGFSQLLMGAGIGVGVAYALETHVLILIASAITGMYGAGSINFVDGQAILKVGEPMGAYFSVIFGLLISKQIAGKTKFDIILLPMTTIVFGCLLGKFFSPYISAVISEIGVIVNKTTELRPILMGLTMSVIMGIILTLPISSAAIGISLGLSGLAAGASLTGCCCQMIGFAVMSYDDNDLGTVFSIGFGTSMIQIPNIIKNPIIWIPPIASSAILGVLSTTVFNLSSNSIASGMGTSGLVGQIASFSVNGMSYLPTMIILHFILPAILTFIIYKVLKKKGLIKAGDLKI >NZ_CP013336.1|WP_005916053.1|220877_222131_-|DUF3798-domain-containing-protein MKMKKILFSLLAIFMLVVAVACGKKEAPTEDANAQQQGATTEATQNYHIGIVTTSVSQSEDNFRGAEAVAKKYGLSNEGGKITIVTVPDNFMQEQETTISQMVSLADDPEMKAIVVAEGIPGTYPAFKAIREKRPDILLIVNNTHEDPVQVSTVADVVVNSDSVARGYLIVKTAHDLGATKFMHISFPRHLSYETISRRRAIMEQTAKDLGMEYIEMSAPDPVSDVGVPGAQQFILEQVPNWIAKYGKDTAFFATNDAQTEPLLKQIAAHGGYFIEADLPSPTMGYPGALGIEFSDDEKGNWPKILEKVEKVVVEAGGSGRMGTWAYSYNFSGLEGLTDLAVKSIETGDKDFTLDKVLASLDTVTPGSKWNGSLMKNNNGVEIPNSFFVYQDTYIFGKGYMGVTSVEVPEKYGKIGK >NZ_CP013336.1|WP_005916050.1|219189_220773_-|sugar-ABC-transporter-ATP-binding-protein MSDTILKIENLSKSFGDNTVLKDINLELKAGEILGLVGENGAGKSTLMKIIFGMDVIRETGGYNGKISFDGKEVNFASPFDALNAGIGMVHQEFSLIPGFKVSENIVLNRESTKNNLMTHLFGQGISKIDQKNNTKRAQEAISKLGVSLTGQEQINEMAVAYKQFTEIAREIEREHTKLLVLDEPTAVLTEDEAEILLETMKKLSNKGITIIFITHRLNEIMAVSDKVTVLRDGQLINTVPTKSTNVNEITEWMIGRKVSSSSEGKNIDNSKLESLMEIKDLWVDMPGEMLKGLDLDIKKGEILGLGGMAGQGKIAVANGVMGLFKSKGNVKYKGEDLVLNKATYPLEKGIFFVSEDRKGVGLLLDESIERNIAFPAMEIKGQFLKKYLGLINVVDDKAVTDNAKKYIEKLEIKSMGEKQKVAELSGGNQQKVCMAKAFTMEPDLLFVSEPTRGIDVGAKQLVLETLKEYNRERNTTIVVTSSEIEELRSICDRIAIINEGKVAGILPATASILDFGKLMSGIKEGE >NZ_CP013336.1|WP_187099983.1|241187_241337_-|hypothetical-protein MKKLAILALGVLSLVACTDQKVVNYNTARSWFSNFIFNVGNKCIFRRSK >NZ_CP013336.1|WP_058118815.1|241353_241779_-|hypothetical-protein MKNRILFGTMLALLLVGSVSFADDDADKKRLLEEYDKMQAEKAKEAERLAKEQPQEAAPAEATEVVGENGEVVVTEGEEVAQAPKKAEKDMTESERMDVEVQRIKKRMLEINDKIENYNKTNEMIDNLEKNVEELERKVNY >NZ_CP013336.1|WP_060555387.1|241810_242368_-|hypothetical-protein MKKFLKVALFLCALSSLAYAEETTSVVAEANTTMSAEDQKDAMDILERMRAKIEKEEAEKAKLAAEARELGMSPSEVASMDNVEEMIEAKRTEEAKPKTEAEKLELTRKKALNKLDFYERVVRSVAREENEVSDYYGVMGEEKQRSTVNLGTAAEVAPAEQQTAEQQVEQSVAPAEIQPPVEQTK >NZ_CP013336.1|WP_060555389.1|242381_242777_-|adhesion-protein-FadA MKAKILLCSMLILGSLSYAAETDSVAQEVMSEIKNIEAEYQALMQKEMERKEEFRQEKETLEKEVQELKERQLGREELYAKLKEDSKVRWHRDEYKKLLKRFDEYYNKLEQKIADKEQQIVELTKLLEVLN >NZ_CP013336.1|WP_029495588.1|243081_244269_-|dicarboxylate/amino-acid:cation-symporter MATKKLGLVPRLIIAIIVGILIGQFLPLWIVRIFKTFSTFFGLFLSFFIPLMIVGYVVSGIAKLTEGAGKLLGFTAVVSYISTIVAGTFSYTVAANLYPKLISGISSGINFEGKDVAPYFTIPLKPPIDVTAAIVFAFMMGITISIMRSQKKGEITFKLFEEYEEIITKVLAGFVIPLLPFHILGIFSEMAYSGIVFKVLGVFSAIYLCIFAMHYIYMLVMFSIAGGVSKKNPFTLMKNQIPAYFTAVGTQSSAATIPVNVQCGLKNGTSPEIVDFVVPLCATIHLSGSMITLTSCIMGILLLNGMPHSIGMMFPFLCMLGIAMVAAPGAPGGAVMSALPFLFLIGIDAQGPLGSLLIALYITQDSFGTAINVSGDNAIAIYVDEFYKKYIKKSA >NZ_CP013336.1|WP_029495587.1|244450_245797_+|glucose-6-phosphate-isomerase MKKISLDYSKIFKFINEDELSQMKVLVDGVSTKLHNKSGAGNDFLGWLDLPINYDKEEFSRIKKASEKIKFDSEVLIVIGIGGSYLGARAVIECLSHSFFNSLSKEKRNAPEIYFAGQNISGKYLKDLIEIIGDRDFSVNVISKSGTTTEPAIAFRVFKELLENKYGEKAKDRIYVTTDKNKGALKKLADEKGYEEFVIPDDVGGRFSVLTAVGLLPIAVSGINIDDLMNGAKTAREDYSKDFVDNDCYKYAAIRNILYKKNYNIEILANYEPRFHYISEWWKQLYGESEGKDKKGIFPASVDLTTDLHSMGQYIQDGRRNLFETILNVETSDKDIIIKKEAEDLDGLNYLEGKGLSFVNNKAFEGTLLAHIDGGVPNLVINIPEVTAFNIGYLIYFFEKACAISGYLLEVNPFDQPGVESYKKNMFALLGKKGYEELSKELNERLKK >NZ_CP013336.1|WP_060555390.1|253442_253994_-|OmpA-family-protein MGKRKNSTTIIMTVLFLVVFSLPSLAALTTTQIRENSIRINALELKNLDILNSEAPKEMTIVLDERSLNFDFDKSNVKPEYYDLLTNIKEFVEQNNYEITIVGHTDSVGSNAYNFKLSRRRAESVKAKLLEFGLTEDRIVGIEAMGEEQPIATNETKEGRAQNRRVEFKLVQRESTPVTGENK >NZ_CP013336.1|WP_032889980.1|253963_254212_-|hypothetical-protein MKKLAILALGVLSLVACTDQKVVNYNTARLDVIEDYLRNHKYVKPSENFDKLVEEGKIEYAEEYVSLEKEAKQWEREKTQQQ >NZ_CP013336.1|WP_060555392.1|254228_254645_-|hypothetical-protein MKNKILFGTMLALLLVGSVSFADDDADKKRLLEEYDKMQAEKAKEAERLAKEQPQAAEATEVVGENGEVVVTEGEEVAQAPKKAEKDMTESERMDVEVQRIKKRMLEINDKIENYNKTNEMIDNLEKNVGELERKVNY >NZ_CP013336.1|WP_060555395.1|254675_255200_-|hypothetical-protein MKKFLKVALFLCALSSLAYAEETTPVVAEANTTMSAEEQKDAMDILERMRAKIEKEEAEKAKLAAEARELGMSPSEVASMDNVEEMIEAKRTEEAKPKTEAEKLELTRKKALNKLDFYERVVRSVAREEAEVAGYYEIMGEEKAIPSIMDEQNQAPAETTTEVSTQEATEAEVK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP013336_2 | 605656-605744 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013336_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP013336_2
>2.1|605679|43|NZ_CP013336|CRISPRCasFinder TCATCAGTTCTAAATTCAACAGGAAATGGAAACTATGGAATTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013336_2
The CRISPR arrays of NZ_CP013336_2 >merge|NZ_CP013336|2|605656-605744|CRISPRCasFinder ATAGAGCAGGTTCTGTAACAAATTCATCAGTTCTAAATTCAACAGGAAATGGAAACTATGGAATTTATAGTGCAGGTTCTGTAACAAAT >NZ_CP013336|2|2|605656-605744|CRISPRCasFinder ATAGAGCAGGTTCTGTAACAAAT TCATCAGTTCTAAATTCAACAGGAAATGGAAACTATGGAATTT ATAGTGCAGGTTCTGTAACAAAT
>NZ_CP013336.1|WP_060555419.1|600952_601504_+|OmpA-family-protein MGKRKNSTTIIMTVLFLIVFSLPSLAALTTTQIRENSIRINALELKNLDILNSEAPKEMTIVLDERSLNFDFDKSNVKPEYYDLLTNIKEFVEQNNYEITIVGHTDSVGSNAYNFKLSRRRAESVKAKLLEFGLTEDRIVGIEAMGEEQPIATNETKEGRAQNRRVEFKLVQRESTPVASENK >NZ_CP013336.1|WP_032889980.1|600734_600983_+|hypothetical-protein MKKLAILALGVLSLVACTDQKVVNYNTARLDVIEDYLRNHKYVKPSENFDKLVEEGKIEYAEEYVSLEKEAKQWEREKTQQQ >NZ_CP013336.1|WP_060555416.1|600301_600718_+|hypothetical-protein MKNRILFGTMLALLLVGSVSFADDDADKKRLLEEYDKMQAEKAKEAERLAKEQPQAAEAAEVVGENGEVVVTEGEEVAQAPKKAEKDMTESERMDVEVQRIKKRMLEINDKIENYNKTNEMIDNLEKNVEELERKVNY >NZ_CP013336.1|WP_060555415.1|599727_600270_+|hypothetical-protein MKKFFKVALFLCALSLLAYAEETTPVVAEANTTMSTEEQKEAMDILERMRAKIEKEEAEKAKLAAEARELGMSPSEVASMDNVEEMIEAKRAEEAKPKTEAEKLELTRKKALNKLDFYERVVRSVAREEAEVAGYYEIMGEEKARPSIMDEQKAEATEQASPAEVPQEAVPAEATVEQAK >NZ_CP013336.1|WP_060555413.1|599318_599714_+|adhesion-protein-FadA MKAKILLCSMLILGSLSYAAEADSVAQEVMSEVKNIEAEYQALMQKEMERKEEFKQEKETLEKEVQELKERQLGREELYAKLKEDSKVRWHRDEYKKLLKRFDEYYNKLEQKIADKEQQIVELTKLLEVLN >NZ_CP013336.1|WP_029491940.1|598594_599065_+|DUF523-domain-containing-protein MKKKIKVLISACLLGDNVKYSGGNNLTPELVTLLEKYNVDIVKVCPECFAGLPIPRLPSEIKEGKVYSKDGMDITEEFLDGAEKTYEVAERKQADFAILKERSPSCGSSYIYDGSFSGKVIEGQGFTTKRLNEENIIVFSEENLEEIEKYLQELNK >NZ_CP013336.1|WP_029495303.1|596427_598611_+|metallophosphoesterase MRTLLLLRGIQASGKSTWIKENNLEAYTLSADNIRLNIANPVLLEDGSYEISQKYNKVTWELLYKYLEMRMQNGDFTIIDATHSDIKLMNKYRDLANTYKYTMYCLEFDIPLEEALKRNKERDNYKYVPERVIERTYETIKNNEKLPSGLKKIESIDEIINFYTADVNQYKKVVIIGDIHSCAEPLKEVLKDFNEETLYVFVGDYFDRGIQPVEIFNIMLDLLEKPNVILIEGNHEEKSMKKFIYDEEKYTKSFEETTLLPLLKEYDIDYVRASLKKIYKKLRQCFAFEFRGEKFLCTHGGLPLVPKLTLVSAKEMIHGVGKYETEIGEIYSENYKKGLCQDFIQVHGHRGINDGEYSYCLEARVEFGGELKVLTIDNEGNIEKYGIKNDVYNRGLKLPMSGAREKVEFNTTNELINEMIGHKFITVKECDYNLISLNFNREAFNKKKWNDLTIKARGLFVDKDSGEVKIRSYNKFFNFGERHVNLGYLNKYATYPIRVFKKYNGFLGLASIVNNEVVLTSKSVTSGKYKDIFQNIWDKVEDEVRELLKKTMIENNCTAVFEVVSPEYDPHIIKYDKEHLYLLDFIENKLDLDTHNIDLGFSENLMKKVEFSSNLLTKKEELTRLENYDELYNFLHEKTMSLEEFEGYVLCDNSGFMFKFKLPYYNLWKERRGWLERYRSALAKGKKVEVTEKDEHRHFKKFLLKLGKDKLEGLSIIDVRELYEKEN >NZ_CP013336.1|WP_029495304.1|594909_596187_+|adenylosuccinate-synthase MAGYVVVGTQWGDEGKGKIIDVLSEKADYVVRFQGGNNAGHTVVVNGEKFILQLLPSGVLQAGTCVIGPGIVVDPKVFLEEIDRIEKRGAKTDHVIISDRAHVIMPYHIEMDKIRESVEDRIKIGTTKKGIGPCYADKIARDGIRMSDLLDLKQFEEKLRANLKEKNEIFTKIYGLEPLDFDKIFEEYKGYIEKIKHRIVDTIPIVNKALDENKLVLFEGAQAMMLDINYGTYPYVTSSSPTLGGVTTGAGVSPRKIDKGIGVMKAYTTRVGEGPFVTEIKGEFGDKIRGIGGEYGAVTGRPRRCGWLDLVVGRYATEINGLTDIVMTKIDVLSGLGKLKICTAYEIDGKIYDYVPADTKSLDRAIPIYEELDGWDEDITQIKKYEDLPVNCRKYLERVQEILVCPISVVSVGPDRSQNIHIREI >NZ_CP013336.1|WP_029495306.1|592728_594651_+|tRNA-(guanosine(46)-N7)-methyltransferase-TrmB MYNLLRKIALTLYKPFMKEKMKTFINKRLSQDFSDLKDEEYIWIHCSSVGEVNLSEDLVKKFYSISRKNILISVFTDTGYENAVKKYSDKKKIKVIYFPVDDKKKINEILNKIKLKLLVLVETELWPNLINETKKKQSRIIIVNGRISDRSYPRYKKLKFLLKSMLQKIDFFYMQSEIDKERIISLGADENKTENVGNLKFSISLEKYSDNEKEEYRKFLNIGDRKVFVAGSTRTGEDEIILDVFKKIKNYVLIIVPRHLDRLAKIENLIKENNLTYVKYSELENKVSTGKEDIILVDKMGVLRKLYSISNIAFVGGTLVNIGGHNLLEPLFYRKAVIFGKYTQNVVDIAKEILRRKIGFQVENVEEFVKAIETIENEKNSDEEINSFFEENRLIALNIVKKENLIMNNIKEEAKDLWKHFFHSEKSNYNIYMYKLLDYPEYIMYDNDVMKEKKSKWSEYFGNSNPIAVEIGTGSGNFMYQLAERNPNKNFIGLELRFKRLVLATQKCKKRNLKNVAFLRKRGEELEDFLADNEISEMYINFPDPWEGTEKNRIIQERLFKTLDKIMKKDGMLYFKTDHDMYYSDVLELVKTLKNYEVIYHTSDLHNSEKAENNIKTEFEQLFLHKHNKNINYIEIKKLV >NZ_CP013336.1|WP_029491936.1|592043_592700_+|(d)CMP-kinase MNNIIVAIDGPAGSGKSTIAKIIAKKFNFTYIDTGAMYRMITLYLLENNIDFDNLKEIEKVLNTVNLDMQGDKFYLNNVDVTTKIREKRINENVSKVASIKIVRSNLVDLQRKVSNNKNVILDGRDVGTVIFPNAQVKIFLIASPEERARRRYNEFLEKKTEITYDEVLKSIKERDHIDSTRDESPFVKADDAIELDSTNLTIDDVVNFISKEIEKVK >NZ_CP013336.1|WP_147373394.1|606190_606970_+|autotransporter-domain-containing-protein MNYKNNAYGVAYVHENEDIKLGKGIGWYAGIVHNTFRFKDIGRSREHMLQGKVGLLKSVPFDDNNSLNWTISGDIFVGRNRMHRKFLVVDEIFNAKSKYYTYGIGVRNEIGKEFRLSEGFTLRPYAALKLEYGRLSKIREKSGEIKLEVKQNQYFSVRPELGAELGFKHYFGMKALRTTLGVAYENELGRVANGKNKARVVDTTADWFNIRGEKEDRRGNVKVDLNVGVDNTRVGVTANVGYDTKGENLRGGLGLRVIF >NZ_CP013336.1|WP_081038423.1|607241_608528_+|ISL3-family-transposase MISLSLSNFIKTILNIQDDNISFPEEEYYQVIQKGDHLIKLFKGFLKSDYCACPHCNSKNIVKNGSRIRKIKYIPIQNYNIELELNVQRHICKECKKTFSASTNIVSDNSSISNNLKYTIALELQKNISLTSIAKRYNISISSVQRIIDNCYSDFKVNKEHLPEAICIDEFKSVKNIDGAMSFVFADYRTKSIVDIVEDRKLNSLTEYFSRFSLEARNNVKYICMDMYTPYISLVNSIFPNTKIVIDKFHIVNLVNRAFNQTRISIMNSIQDDSLKRKFKLFWKSLLKYYPDLCQVNYYCQSFKRKLSSKDKVDYLLEKSPELEANFNVYQDIIQAIKHNNFKRFESIVKKYLANKEKISKKIIIALRTLKKYMKYIENMFESNITNGVIEGLNNKIKSIKRTAFGYSNFSNFKKRILIQAGIISISA >NZ_CP013336.1|WP_029491880.1|608745_608997_-|GlsB/YeaQ/YmgE-family-stress-response-membrane-protein MGIIAWIILGALSGWIASIIMDKNASMGAIANIVTGIIGAFIGGIVFNFLGAQKVTGLNLHSILVSVVGACILIWLLGLIKRK >NZ_CP013336.1|WP_005917734.1|609027_609522_-|hypothetical-protein MVTINLDLIIKILLSTALTIFFILLFVTLIKIISFFSKINSLLKKNKEQLEKSITEIPNLVRNSEKILENTNSNLEKINILVEDITSILKVSRKNIVDSSSNVSTTLENIKNVSSNVAESSKFITQNFIDKTTGAKKNIGGFIGALDTALDCWDIFKTIFKKKK >NZ_CP013336.1|WP_005917738.1|609542_609938_-|YtxH-domain-containing-protein MGLIRYIEEKRLERERAIRNEKLIGTMKVLASVGAGFTLGILFAPKSGKETRKDIANATKEGLNFVSENLNNAKNYVKDKAANIKEAVAEKYDELRNETIPEKIEDFEEDVEDTADIIEEKAEVVKEKVKK >NZ_CP013336.1|WP_029491879.1|610245_610695_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MEIVHIKNPNFEMMKKIVEIEQEAFEGNGNVDLWIIKALIRYGLVFVIKENDKIVCIVEYMQVFNKKSLFLYGISTLKKYRHKGYANCILNETEKILRNLSYEEIELTVAPENEIAINLYKKHGYLKEKLLEDEYGKGIHRYVMRKKLI >NZ_CP013336.1|WP_029491878.1|610803_611232_+|transcriptional-repressor MELQLHTGDIGNYLKKHDIKPSYQRMKIFQYLLDNHNHPTVDTIYKALCTEIPTLSKTTVYNTLNLFIEKKLVYVIVIEENETRYDLLTHTHGHFKCTCCGALFDVELNIDYSKNQELLGCDIEEKHIYFKGICRNCKDRSN >NZ_CP013336.1|WP_005917747.1|611268_611862_+|hypothetical-protein MRKYLFLMVLLFTVLSSFSYSNYPRPNYKYYIVKEPMVVKNLELPVGTEIVYFDTSLFGDGESSRPLREKNIYQIFFPDDKPLIWGGVPVSLIERFFNRDMKGFTVYPELGNSLQSDENKRKLMEKNEFIKLWFMWAKNMDVHIKDEKDWSFNPDNMVLGGEADSRYIDYGNLEYFNGKDSMVEHLRKLNEAAKNVK >NZ_CP013336.1|WP_005904076.1|612132_612285_+|50S-ribosomal-protein-L33 MRVQVILECTETKLRHYTTTKNKKTHPERLEMMKYNPVLKKHTLYKETKK >NZ_CP013336.1|WP_005894938.1|612410_612587_+|preprotein-translocase-subunit-SecE MNLFQKVKMEYSKVEWPSRTEVIHSTIWVVTMTVIISIYLGVFDILAVRALNFLEALI |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP013336_3 | 932371-932497 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013336_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP013336_3
>3.1|932412|45|NZ_CP013336|CRISPRCasFinder GATTTTTCAATAAAAAATTAACTAGTAACTTTCTAGTATTTTCTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013336_3
The CRISPR arrays of NZ_CP013336_3 >merge|NZ_CP013336|3|932371-932497|CRISPRCasFinder GTAACTTTCTAGTAACAAAAGAAAGTAATTGAAATACAAAGGATTTTTCAATAAAAAATTAACTAGTAACTTTCTAGTATTTTCTGGTAACTTTCTAGTAACAAAAGAAAGTAATTGAAATATAAAG >NZ_CP013336|3|3|932371-932497|CRISPRCasFinder GTAACTTTCTAGTAACAAAAGAAAGTAATTGAAATACAAAG GATTTTTCAATAAAAAATTAACTAGTAACTTTCTAGTATTTTCTG GTAACTTTCTAGTAACAAAAGAAAGTAATTGAAATATAAAG
>NZ_CP013336.1|WP_029494140.1|930888_932319_+|putative-DNA-binding-domain-containing-protein MDNKIKPFISSPENQYLERKSARVEPLDILKHLVAFANADGGSLVIGVEDNGEITGFSNSKAHKIDEFKNMTVTKLRDTPILPKYEIFDVKNKKGEEDKILVISVEPAYDRVIKSYDNNVYLRQFDKTEKLNHEQITQLEYDRGQRYFEDEVVEDSSIEDIDLELVESYRKNMNLTNSNLEDILKARNFIKKGLLTNACVLLFAKEPTKYLPQARLKFIRYDGVKANVGTEINIIKEKTFDKAIPKIITEVKEFIKIQLREFQYLDGEEGNFKSMPEYPEFAWFEGIVNALTHRNYSIRGEYIRFIMFDDRIEIHSPGKLPNIVTIENILTQRYSRNPRIARILSEFGWVKEMNEGVKRIYSEMEKFFLRKPVYLEPGNNVLLVLENNILNRNIRIDDNLKKLIDEDVYEELNFIEKEIIKFSFMNKKITVADLSKNINKTTVTTRMYLKKLVTLGLLEWHGTNPKDPTQFYSLKK >NZ_CP013336.1|WP_029494141.1|929315_930878_+|type-I-restriction-modification-system-subunit-M MDNKKEQERAELHRTIWGIANALRGSVDGWDFKQYVLGILFYRYISENLTNYINKGEVEAGNTDFDYSLLNDEDAIVAKEDLIRTKGFFILPSELFVNVRKRAAKDENLNVTLHTIFNNIENSASGTESESDLKGLFDDIDVNSNKLGGTVAKRNENLVNLINGVGDMKLGDYQENTIDAFGDAYEYLMGMYASNAGKSGGEYYTPQEVSELLTKLTLVGKTEVNKVYDPACGSGSLLLKFAKILGKNNVRNGFYGQEINITTYNLCRINMFLHDIDFDKFDIAHGDTLTDPAHWDDEPFEAIVSNPPYSIKWEGDGSQILINDSRFSPAGVLAPKSKADLAFIMHSLSWLASNGTAAIVCFPGVMYRSGAEQKIRKYLIDNNYIDCIIQLPDNLFYGTSIATCIMVLKKSKVDNKVLFIDASKEFVKVTNSNKMTEKHIDDIVEKFTKRENIEYIANLVEYEKIVEENYNLSVSTYVEKEDTSEKIDIVELNKEIQRIVAREEELRKEIDKIIAEIEIK >NZ_CP013336.1|WP_005919026.1|927914_929060_-|cyclically-permuted-mutarotase-family-protein MSKKIFYLLFFIFLSSFGYASKTLSIENKRLVWDYAGSLPAQKGFDKNIGTAGLLQGVIGDYIVVGGGANFPEALEKGGKKVTHKDLYLLKDVNGKLKTIEQVQLDYPIGYGASVSVKEENAIYYLGGSPDSEHMRDVLKVTLKNGKLKTEIYAKLPLGFENGVAQYKDGKIYYGVGKIENSEGKNVNSNRFYAFDLKTKETKELASFPGEARQQTVGQILNNKFYVFSGGSNVSYVDGYAYNFKTNTWEKVADVNIDNEKILLLGANSIKIANDKMLVIGGFNYDLWNEANDKLSNLKDEELKNYKAAYFGAEPNSYNWNRKILVFDATKNSWKSIGEVPFDAPCGAALLMKNDSIYSINGEIKPGVRTERMYKAYIISK >NZ_CP013336.1|WP_005919030.1|926896_927898_-|LacI-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MITQKELAARLGLSRTTIARAINNSSNIKPETKEKILKLVKELGYEKNYVGSLLASKKKIVYSFIVESKNSYYTEQIKLGIKGAKKEYKHYNLEIIEIVTDINKPMEQVLELQKLLNSDKQIDGIIIIPLDKVKIMDLINPYLEKIKFISLSVFLSKKIAYVGTDYEKCGRLAAEFLGKTLNSDDKVLVIDNGDDNISSKYYLNGFLDRANKDKINIVGPIKKNGVEDSLIYLEDTFKEKNIKSIFINRYAQDILLELPDNILKKQKNITTGIGNRIRKLIIEKKILATVADDVYNTGYKACQLMVDMLYKEIGKKVKNIILEPQILLIENLK >NZ_CP013336.1|WP_029490731.1|925892_926876_-|sialic-acid-TRAP-transporter-substrate-binding-protein-SiaP MKKTGLLKMAILFGVMTTSAFAAKYNLKMGMTAGTSQNEYKAAEVFAKELKKRSNGEIELKLYPNAQLGKDDLAMMQQLEGGALDFTFSETGRFSTFFPEAEVFTLPYMIKDFNHMKKAVNTKFGKDLFKKVHDKKGMTVLAQAYNGTRQTTSNKAIKSLADMKGMKLRVPSAAANLAYAKYTGAAPTPMAFSEVYLALQTNAVDGQENPLSTIKAQKFYEVQKYLAITNHILNDQLYLVSNITMEELPPNLQKVVKESAEVAAEYHTKLFMDEEKSLRDFFKGKGVTITEPNLEEFKKAMKPFYNEYTKKNGKVGEDAIKAIDAVR >NZ_CP013336.1|WP_029490730.1|924015_925869_-|TRAP-transporter-large-permease-subunit MKIFNKLEEWIGGGLFIGLFLILVVQIFARQVFDSPLIWSEELSRLMFVYVGLLGVSMGIRSQQHIMIDFLYAKFPKSMQKIVFTIIQILILGCLVFFLYFGYDLFIKKEELEIVSLGISMKWMYLALPLITLLMLVRFYQAYSENYTEGKVSIKPVFILALMIILVLVAFIKPELFQVLKLSNYFDLGEMTVYYVLLAWLVMIFFGVPVGWSLLVACILYFALTRWKVVYFASDKLVYSLDSFSLLSVPFFILTGILMNGAGITERIFNFAKAMLGHYTGGMGHVNVAASLIFSGMSGSAIADAGGLGQLEIKAMRDEGYDDDICGGLTAASCIIGPLVPPSISMIIYGVIANQSIAKLFLSGFVPGFLTTIALMIMNYFVCKKRGYKKAAKATPQERWIAFKRSFWALLTPVLIIGGIFSGIFTPTEAAVIATFYSIILGGFIYKELTIKSFFNHCVEAVAISGVTVLMIMTVTFFGDIIAREQVAMRVAEIFIKYATSPIMVLVMINLLLLFLGMFIDALALQFLVLPMLIPIAEQVGIDLVFFGVMTTLNMMIGILTPPMGMALFVVAQVGKMSVSTVTKGVLPFLLPIFITLVIITMFPQLVLFLPNLIMGG >NZ_CP013336.1|WP_005919037.1|923136_924012_-|ROK-family-protein MNILAIDIGGTMIKYGLISSDGKILSTDKVKTEAGKGLDNILEKIDNIFKKYKEHKPVGIAVSGTGQINGMIGKVIGGSPIIPNWIGCNLVEILEENYSLPAILENDVNCMALGEKWLGAGKNLSNFICLTIGTGIGGGIILNNELFRGENFVAGEFGHILIKKGEFQDFASTTALIRLTKEKTGKALNGEEIFNLEKKGVIEYKNIISEWIENLTDGLSSLIYCFNPKDIILGGGVLEQGDYLIRKIEDSLSKKIGPRFQENLNIKQAKLGNNAGMIGAAYLLLEKINKK >NZ_CP013336.1|WP_185161676.1|922244_923126_-|N-acetylneuraminate-lyase MGIMKGIYSALMVPYNEDGSINEKGLREIVRYNIDKMKVDGLYVGGSTGENFMISTEEKKRVFEIAIDEAKDAVHLIAQVGSINLHEAVELGKYVTKLGYKCLSAVTPFYYKFDFSEIKDYYETIVRETGNYMVIYSIPFLTGVNMSLSQFGELFKNEKIIGVKFTAGDFYLLERVRKAFPDKLIFAGFDEMLLPATVLGVDGAIGSTYNVNGIRAKQIFELAKNSKIAEALEIQHTTNDLIEGILSNGLYQTIKEILKLEGVDAGYCRKPMKKISQEQVEFAKELHKKFFKN >NZ_CP013336.1|WP_029493734.1|921548_922229_-|N-acetylmannosamine-6-phosphate-2-epimerase MNKILESIKGKLIVSCQALEDEPLHSSFIMGRMAYAAHVGGAGGIRANTVEDIREIKKNVSLPIIGIIKKVYDNCNVYITPTMKEVKSLIDEGVQIIAIDATKRERPDKRELKDLITEIKEKYPNQLIMADVSSVDEALYAEKIGFDIVGTTLVGYTEYTKNYKALEELEKVLKVIKIPVIAEGNIDTPLKAKKALELGAFAVVVGGAITRPQQITKKFVDEMEKI >NZ_CP013336.1|WP_029494701.1|921103_921523_+|hypothetical-protein MKKGIFAVLILAASMAMVACTNNSSATEGATGENDAFKALEKRREYYKAQDKERAKLEAEAKKAEEKAMKEAVNKVETTTEQVVTEEAVTEEAVTEEAVTVDEAEARKAEEKAMEEAAKAKAAAEKEALKILEKKRKSN >NZ_CP013336.1|WP_081038425.1|932562_933948_+|restriction-endonuclease-subunit-S MSKLDELIKELCPNGVEFKKLGELGTIYNGLTGKNKNDFLEGNKRYITYVNVFNNISIDIGSQDKVKIDENEKQNKVEYGDIIFTASSENIEDVGMTSVLTSIIEEDLYLNSFCFGFRFKNNIMSPSFSKYLFRSENLRKQIRKTANGVTRFNISKEKIKEILIPILPLKIQEEIVRILDDYTKSVEELKEKLNSEFIAREKQYEFYRNLLLTFETENNSLSKTRQDKTRQDINKLFMCNFRNIKLELAEVFELKNGYTPSKSISEYWKNGDINWFKIEDINTNGRVLNNSIEKVNKKGIKGKLFPKNTLIISTSATIGEYALITKEFLCNQRFTCLITKEEYKDVVLPMFLKHYAYILSKKCRENIKVGNFPSVDMNKFKKIPILLPPLEVQKRIVEVLDNFEKICNDLNIDLPAEIEARQKQYEFYRNFLLTFKEDSVNSLRQDKTRQDKTRQDKIRYI >NZ_CP013336.1|WP_032881610.1|933940_934492_+|restriction-endonuclease-subunit-S MYRLLTYIFGYINLELGEILKIKNGSDYKKFNTGNIPVYGLGGIINYTDTYIYDKESVLIPRKGSIGNLFYVDKPFWTVDTIFYTVIDKDIVIPKYIYYYLSKVNLEKLNTAGGVPSLTQTVLNKILIPLPPLEKQQRIVNILDRFDKLCNDISEGLSAEIEARQKQYEYFREKLLTFKNIND >NZ_CP013336.1|WP_029494138.1|934509_937551_+|type-I-restriction-endonuclease-subunit-R MSSVDYNMLISTLESTVVTEYVKEDTPVYTYQSEADLEREFIKNLQNQGYEYLSIHNEKELIANLKGKLEKLNNIVFSENEWERFFKEKIANKNESIIEKTRTIQEDYIKSFTRDNGTLINICLIDKKNIHNNFLQVINQYEEENGNHNTRYDVSILVNGLPLIHIELKRRGVAIREAFNQINRYQRDSFWAGSGLFEYVQIFVISNGTNTKYYSNTTRARHIKEMSFNRRKVKKSSNSFEFTSYWADANNRAITDLVDFTKTFFAKHTILNILTKYCIFDTSDTLLVMRPYQISATERILSKIQLANNYKWVGKIDAGGYIWHTTGSGKTLTSFKTAQLASQLDYIDKVLFVVDRKDLDSQTQKEYDRFSKGSANGNTSTKILKAQLEDKYENKSKIIITTIQKLGHFIKQNKNHEVFKKNIVLIFDECHRSQFGELHLAIAKTFKNYFMFGFTGTPIFPKNSNGSSKTLFKTTEQTFGDKLHTYTIVNAINDGNVLPFRIDYINTIKEKENIQDKKVNAIDIEKAMSDPNRIREIVSYIVEHFEQKTMRNKHYELKDQRLSGFNSIFAVSSIPVAKKYYLEFKKQLEEKNKNLAIATIFSYSANEEENTDNLDDESFDTENLDLGSREFLEEAISDYNKKFGTNFDTSSDGFQLYYEDLSKRTKNKEIDILIVVNMFLTGFDATTLNTLWVDKNLRMHGLIQAFSRTNRILNSIKTFGNIICFRDLQNETDEAIALFGNKEAGGIVLLKTYEEYYNGYEDDKGREKEGYSQLIEELQNKFPIDEQIIGEQNKKEFIILFGNILKIKNILSAFDKFAGNEILSEREYQDYQSIYIDLYEEIKKTKNTDKESINDDIIFEIELIKQVEINIDYILMKVAEYYKSNKKDKEILIDIKKAIDSSIELRSKKELIEGFIDRVNSSKNVTDDFKKFVKEEKEKDLEKVIEEEKLKPEETKKFIDNSLRDGTLKTTGTDIDKLLPPVSRFGGGNRIEKKLGVIEKLKGFFDKYLGLTI >NZ_CP013336.1|WP_029494137.1|937653_938058_+|YbgA-family-protein MKPKNIKKDCEELWAKNKYYVLSKSQKVYLEIREYLKEKDVDILFLNEKIQRARNIEESKKDFNNAILHVWGYFKKEATEIEKQGLCNLLQEYMIGKNNQKSVIEYINILLKKYPNEYLQKSTLLTGEQDETVA >NZ_CP013336.1|WP_005919006.1|938041_938416_+|hypothetical-protein MRLWHEEIIHLLPRNQLLGQHRECCALRGNGWGKKHKTVDYVFLYSPYHLFVYHSLVMDEMEKRGYKVSIEWRDKNYRGKEAEKYDDLEEKTIDKPIYKEHNAEYMIECIENLQKKGIEIELEL >NZ_CP013336.1|WP_029490740.1|938845_940348_-|flotillin MFSSNLFVIGLIAIGVIFIVCFFSYVRVPVNKIAFISGIGKNRVAKGKLVIYLRFFERVDYLDLSVFSVDVNTAVAVPTNDFINIKVDAVVNLQVDETAGILEIAAKNFLNRKSSDIAISVKDVLEGNLREIVGQMQLKEIVQNRKNFNEKVQENVAPDLREMGLKVISFNVQNFQEDKQVIENLGAENISKISKEASIARAEADKEIEIAKANANKEAMDIKLKTEQDIAEKENALAIKKAELKVKADTEKAKADVTYELEKERKRKEIEEVTGLSNLVREQKAIETNKAKYEAETIVPKQADAEARKVEKTKEAEAKKIEEQEAAEAKLYKEQREAEAIKLRALAEAEAIREKALAEAEATRQKGLAEAESKKALLLAEAEGVREKGLAEAEALDKKAEAMAKYGDAAKLEMYYNALPLVAKNLAEPLSKIGNITMYGEGNTTKFMSEMTQNLDKVLKAATDGLGIDAKALLTSYLGGKIAQNKDNNSKAEVIENEEK >NZ_CP013336.1|WP_029494136.1|940470_941793_+|MATE-family-efflux-transporter MFKKTIFKTIFKYAIPNVISMWIFTLYTMIDGVFISRFVGSTALAGVNLALPLINFIFSISIMIGVGSSTLIAIKFGENKYDEGNRIFTLATFLNLFLGVFISAMILFNIDRVINILGAEKSQEVYKYVKEYLTIIVFFSIFYMSGYAFEIYIKIDGKPSYPAICVLVGGFTNLILDYVFVVIFHYGVTGAAIATGISQVISCTMLFLYIVLKAKYIKFKKLTKISFNKIAKIFKTGFSEFLTEISSGILILIYNLVILKKIGVLGVSIFGTVSYITSFITMTMIGFSQGIQPVISYNLGKRNHKNLKDILKISIIFLGVLGIFCSFFISLFSEYIGKIFFREQDMILYVKRVLRIYSLSYVVIGINIFVSAYFTAIKKVIYSALITFPRGILFNSILLLILPNIFGNKVIWIVSFLSEVLTIFICIYLLKKIKREGILS >NZ_CP013336.1|WP_029494135.1|941794_942388_+|flavin-reductase-family-protein MKKRNLKGSVVLNPVPVVLVTCKNLEGKDNVFTVAWVGTVCSKPPMLSISIRPERLSYDYIKETMEFTINLPTKKQTKEVDFCGVRSGRQIDKIKESSFTLQEGEKVKSSYIKECPVNIECKVKDIIKLGSHDMFIAEVLCSHIDEDLFDEKDKIHFEKANLISYSHGEYFSLSKEAIGKFGYSVMKKKKKTKISKK >NZ_CP013336.1|WP_029494134.1|942427_942976_-|hypothetical-protein MLKIRKKIFTFNKDEEVYMGHLSIWNKETEVHFWGKINQNYEKNLEEKLVWLEENRVSIIDKFIQEDNALNSINQLILNKELEIDHQKILDKISEDDFKNSFYIKIINFEFSENAITIDLYMGTEPDYLMGHFINIKISNDFNINVHYTYVLPTLIRQAIQRNLRKPWKTDDKILIFPYVEK >NZ_CP013336.1|WP_029494133.1|943119_943635_+|flavodoxin MGKRLVVYFSHKGENYSKGRIVNLEKGNTEVAAEMISNIADADIFEIVADKKYPFKYDDCIEIAKKELRDNSRPKLKDDIDIKEYDTIFVGYPNWWGTMPMLVWTFLEGKDFRNKRILPFCTHEGSGLGKSEIDIKKIVSDVEILKGLAINGLEVNNSEKQIKKWLEDSLR |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP013336_4 | 1298702-1301164 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013336_4
|
33 spacers
spacers of NZ_CP013336_4
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cas2,cas1,csm6,cas6,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,csm2gr11,cas10 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013336_4
The CRISPR arrays of NZ_CP013336_4 >merge|NZ_CP013336|4|1298702-1301164|PILER-CR,CRT,PILER-CR 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>NZ_CP013336.1|WP_029491192.1|1298239_1298563_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MDNWDFLDEDFEKEVFEDNFTVIIIYDIISNKRRTQLSKLLSAFGFRIQKSAFECLLTREKYKLLIEKIDRYAKPEDLIRIYRLNQNVVTQIYGEKLEIENEMYYFF >NZ_CP013336.1|WP_029495211.1|1297226_1298234_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MSNLYIYEQGIVLRYKENRLLITYTNGDYKSIPIENIDNVVIFGGIQLSTACMHNLLTKGIHVTFLSKNGAYFGRLESTSNINIDRQREQFRRSDDKEFCLEIAKKFIKGKATNQRTIIIRANKDLKSGILSSTITSMFGIIKDINDSKTIEELMGVEGYLAKLYFNALNHIIDKKYSFKTRTKRPPKDPFNAIISFGYTLLHYEIFTTLVTKGLNPYAAFLHSDRHKHPALCSDLMEEWRAILVDSLAIALLNNNKIIYEDFDFDEKSGGVFLNKKACEKFVEQFEKRLRQEVSYITEVPYKMSFRRIIEYQVMLLIKAIEANDANIYKSVLIR >NZ_CP013336.1|WP_029495214.1|1295818_1297213_+|CRISPR-associated-protein MSKKILLTFAGNTDPTRGEHDGPIIHICRYYKPDNIYLILTKEMEERDEEPHNIYERAIKENLKNYNPEIIRIKTGIKDAHHFDIYFSWIYETFEIIKKENKDAEIYLNMTSGTSQMTTNLLMYYIDSLDLNLIPIQVETYKKQSNQSEENNKTVDKNYDVEAEAICNLDNEEKTRTYRIVEPDLKKYSRILTKNQIEKLLEQYKYEAISELLKRNIFDKNLELNTLVNFAIERTNLKGLDCNKKLNSLNNKDYNKLYYFTKDKNITRIPDWYQIVDFFSLANIKQKTEDISTYTLMLEPIIVKIYLSILKDLMGKNLDELFKRDSNGYKIELRRLENGLKEMIKEDLNKDSLKDNVYISAQILVSTIKYYLKNNINLANYINVEYFNNLAETLAKMKTVRNTLAHELKSISREDFNKESETTVEQINSKILEFFNKFYTSLGYKKEMVEIYDNINKEIVKLLK >NZ_CP013336.1|WP_029491189.1|1295103_1295826_+|CRISPR-system-precrRNA-processing-endoribonuclease-RAMP-protein-Cas6 MLAQINIELEANGLSTNMGSLFHGYLMENIDSAYADYFHYNTTNPFTSCIFKDMKTDKFFWRITTFNQKAYDMLMTCFSNNIPETIYLKNKDLEINVKSFSIQKKSYDNLFLECTERKRIRLISPTSFKSNGVTHIFPNISTLISGVIEKINQHSDSAELADKKIIDELLEKVYIKDYNLRTKIFHLESIKIKGFIGTMDLAIKGEDTTLANILNFLILMSEYTGLGIKTSLGMGGVKVE >NZ_CP013336.1|WP_029491188.1|1293950_1295120_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm5 MSNIIKYKMKLEVLTPLHIGGADYKSKLDKKEYVFDKDKGTLTLIDSEKFISFLIKKNLFDDYIFYIQKNLNLKKHEQDKNIKLIDFLKSRDIYKNIEEFRKKAPIKIDPEIEEMNDIKLILRNLQGKPYIPGSSIKGAIINFLLVNYIINHRDKFKIERNKILEIAKKTNNDNDIKKAKNDIKRIVNEIEKSIIYGDNKELEKSKRFGISVSDTYSYSNTRTYFYRDIDEKRDKSKEEKEQAMPVYREYIMANSIFDFDVTLDIDLMEKSKFKIKNISNLTEAIENTSNYLINDILKDENSPQIENLVLGANTGFLQKTIIYSLFEKEEERLEVIKKLLHLKKGDKIKDHLKDKFSPRVLNRIKINGKNHLTGLVKITKVEEKNVGTN >NZ_CP013336.1|WP_029491187.1|1292949_1293954_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm4 MSYLLYKLRFPNGIHIGTASGNTLEETMISVYSDTFYSALYNEYMKIYNNDELYKISKSGDFLVSDLLPFKEKEDISTDFYLPKPFISIQRDEKEKNDEEVVDRKKVKATNFIPADKLEEYFSFLKTGKNFPEIDDNFGRKQLYTKIKVSLENEDTQLYNIEIFKFNKQSGLYFLVKLPEDEKWEGIFENILESLSLTGIGGKKNSGFGQFIFEDPMFFDGDDFSSIESESDAYINKALYSDEEKFLSLSSYSPKMEEIEKIKESENYYQLIKRSGFVNSSLYSEQAEKRKQVYMLSSGSVLSFKPEGKMLDLNLHGKHSIYRMGKPIVLGVKI >NZ_CP013336.1|WP_029491186.1|1292242_1292950_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm3 MYTLKGKLLIKGTIKLITGLHIGTSGDFSAIGAVDTIVIRDSVTNKPMIPGSSLKGKMRYLLSRTKYNSSLELVDIKKEDDCIKRLFGSSEPITISRLQFQDILLSDKSIEDFKEFEFDLPYTEIKYENTIDRTKGVANPRQLERVPAGSEFDFKVVYNVEKIEDFKEDMKNILLMMDVLEDDYLGGHGTRGYGRIKFKNLSLELKTYTEENKKELTTIEEEINNFRKELESKVE >NZ_CP013336.1|WP_029491185.1|1291837_1292206_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm2 MNNLNVQEKIEKYQEDKKNRVTTTQLRLLLSNAVIIKNKIQVETRAKKGDEISEKLENEIKYLLVKHIYQCGREANVKRFDNEFHISGKIKGIGKSAKKFNEFYRYLEEIVAYMKYYESDNK >NZ_CP013336.1|WP_029491184.1|1289302_1291834_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 MDEKLICLQLGALLHDIGKIVRRAGLDSKEHSEAGSNYLKNNNLLDDKYKYVYDMIEYHHAKYLSSADLKEDSLAYIVYEADNIASGIDRVKYENEKIRGNEMDSLNSIFNVIKVEKNNLKKTFKLFDFDKNGFNMPTSNNIKLANSDYKKIIDYIKDNLNSFKENINPEKLAIVLEACCSYFPSSSYVDAPDVSYYDHVKLTAAVSACFYLYDIENNIKDFKKEYFLNIDRNKKKFLLVSGEFSGIQNFIYTISSKMAMKSLRGRSFYLELFAEHIIDEILSILELSRINLLYSGGSHFYLLLPNTEKTKEILDSYKEKINSFILEKMGTTIYFEMVYTETSAEELGNGLSEKIKKENRVGELFRKTSNKVSKAKLSKYSLGQLKELFDENSSINKIHSYTKECKICKKAEDEKILENNARDFGDEDGIELCDSCKGYINLGKDISKLYHTNDEFIIEENCEKNKNTLTFPKYQEGYVNILIKNKDYILKNIDKMHRYYAINSNYVGDKLCKNIWIGNYNIIAKDENENLIEFKNLVKKSKGIERLAVFRADVDNLGTLFQSGFEDKTSKEPYKNVTLSKSVVLSRYLSDFFKRKINLILEKKEAAKDSNEIFKKYCDIICENNSNPRDIVIVYSGGDDVFAIGTWNDIIEFSIDLRTAFKEFTNDKITLSAGIGFFSKNYPIHQMAEKTGNLESLAKANEDNSGKIIKNSVALFGEIDEKLNHIYTWDIFIDKVLREKYKFIKSITILKEEDKGKYKDRIVIGKSKWYKIMDLIINRLTKDDNKLDIARFAYVLGRINFTSENKDNFYEFKKNLLLWLKDKEEAKQLLTAINILIYQERGE >NZ_CP013336.1|WP_005915516.1|1288072_1289098_+|tRNA-(adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase-complex-transferase-subunit-TsaD MIILGIESSCDETSIAVIKDGKEILSNNISSQIEIHKEYGGVVPEIASRQHIKNIATVLEESLEEAKITLDDVDYIAVTYAPGLIGALLVGISFAKGLSYAKNIPIIPVHHIKGHMYANFLEHDVELPCISLVVSGGHTNIIYIDENHNFINIGETLDDAVGESCDKVARVLGLGYPGGPVIDKMYYKGDRDFLKITKPKVSRFDFSFSGIKTAIINFDNNMKMKNQEYKKEDLAASFLGTVVDILCDKTLDAAVEKNVKTIMLAGGVAANSLLRSQLTEKAAEKGIKVIYPSMKLCTDNAAMIAEAAYYKLKNAKNEKDCFAGLDLNGVASLMVSDEKVI >NZ_CP013336.1|WP_029495208.1|1301522_1301990_+|cupin-domain-containing-protein MKKLLFLTLFVGICITGVASTKEKNPILMKQVFKKEELIILDKENAAGGKGTLKGKFAFTRDMATEDEAIKEIGWMTLNKGESVGVHPHKNNEDTYIIISGEGIFTDGSGKETVVKAGDVTIARPNQSHGLRNEKDEPLVFLDIIAQNHALKTEK >NZ_CP013336.1|WP_029495206.1|1302125_1302455_-|hypothetical-protein MSNLDFTLICIVKFFSKKRKTPPNLSNGKYYPHLVIKGDTEYLGVCFIDGEEVIFDKEIIASALPLYDGVDYSGLTEGTEFMIMEGGNKVGEGVIDEIFQHIPAKEFKK >NZ_CP013336.1|WP_029495205.1|1302500_1303862_-|glutamate:sodium-symporter MTSKIFMDLLNSLGLLGLFLILGTFLRAKIKFFQTTFIPASVIGGFLLLILGPICFNVIKIPEEWLKIFSLTPGILIVPIVASVPLGLKSSSEKKSMKNILPLAFIGIAIAMLQFGFGFSAQYIFPNYDFYKTFGWELGIGFVGGHGTAGLLGNMLQSANLDFWEIAQGVATTTATFGLVGGILIGMLLINIASRKNFTAILKKPGDIPESFKIGFVKDIENQPKLGRETTLTSSVDTLAFHAAIIFGVCLISSQLQNLIKEYKIPILDKISIWAYAMIIMFIVWKLFNKFKIDFLIDSNTKSRISGSLTEFAVTAAIASLPIKAVFSYLIPILFIVIIGFIVTTLFLFYMCKFFTKDYWFEHMIATFGMATGVFLTGILLLRICDPDFKSPVLANYSLSYTITSVVYFVFLNVILTLLLTKGLFFGMSFTFIVGILFTLAAIISSKILLKDR >NZ_CP013336.1|WP_187099956.1|1303897_1305094_-|amidohydrolase MEVTMDFKEIEKMIDKYIDEIIDFRRDIHSHPELSGNEKRTSEKVIEKLNKLPVEIIKNVNGYGVIGNLKGNSNKKTILLRGDMDALPINEINDLPFISKNKNIMHACGHDMHTSILLGTSFVLSSFKDKLNGNVKFMFQPSEEASPIGGSKGMIAEGLLENPKVDEAYALHVFGIPTGSVAIKPGVATSRSDRIDIEIFGKSSHASIPSEGRDAIVAAGNIITSIQSIISRNMPPNQTAVITIGKMEGGSRYNVLADYVKLEGTVRTFSTENADMIKERLQKIVENIASAYGCSAKLNYQNGYDFVYNDPDLSEAAIKSLNEILGRENVLVQSNPLPAGEDFSFITKKVPSVFMWLGTESDFNKGKCTLHSPEFIADETSLKIGIKTLCKLVFDRLN >NZ_CP013336.1|WP_029495201.1|1305260_1306460_+|HTH-domain-containing-protein MIKLAILTPRNSYENIKKYLKDIECEIKYIFYDNLYDLESLYLKNAQEYDGIITSGPIGYEIIKNSVELFTPLYHFDISKGDLYKYLFNILKENPKIDFSRVYIDFISPEKKEYWFQDIFKKEEEPIFYQINFSNKNLYETLKSNYINLKKENRIDMVLTRISNMVKFLKNEKISFDFLFPSEENIKNTVLEVIKDIKILKSEKKQIIFGKLLLDEISIDIEEEIHSISKNCIVKILGKNIEIMMIYEDFINSNIALNLKKKLKEKFYSGWGKGNNINEARYNAEKSYKKNVDLNSEVIYLVSTNSEIILSEIDAEKKKNIEIIEKLKELNITKQNSKKLIELFKSKEKVSCASLANYMDISERTANRLLLKLEENNLAISDLVKINRGRPKKLYKFSF >NZ_CP013336.1|WP_005915510.1|1306509_1307130_-|hypothetical-protein MKKIFILLIVLLGILVIGCGKKWDYQVTKKESIQIGNDITFYLLTLKDKENGNEIEPLQITKEGFDKYNVEDKLTKEELDSIKISEDSLVNSDLTLKGNYCIVENTSSTDLKFIPENSEFSILNIGKQEDVTPTIPTMILIDKEHKLFYVIILKNQWDAEEFEYTINKDDLKNIEARHMATGNYDENDLSSIENFKNDIHFVEEEK >NZ_CP013336.1|WP_029495199.1|1307377_1307773_+|hypothetical-protein MKKFVEQYDIRMLPDRIGMATQFRKEHLREFYKYKVTAIERYLLARLEEEKYNNNFDKASKIDKILSSIIGIADSTDFIKIEESIAYDNEREFQRVVFEINTTNIELARFGIDLENDTFNIIKIIENQINE >NZ_CP013336.1|WP_032886650.1|1307803_1308286_-|phage-holin-family-protein MEDFFINAKNGIAMIWTSWISVLVWALGGFDLSVKVLVFLMLVDYITGLWVGYITKTVNSTRAYKGISKKVFILIIVSCSTVIEQLVPNVGIRNLVIIFYVATEILSVIENASKLGVPIPEKLKIALEQCKGDKCNSKCADDKNIKPEKLKDEDFNNEIK >NZ_CP013336.1|WP_029491989.1|1308286_1308646_-|DUF1353-domain-containing-protein MEISKLKTMPIDDKYWEVMEDYFYQTSRGVIVVPKGFRTDYASVPRIFRNIINSYGKHGRGAVVHDWLYSSQCKTDITRQEADKIFLEIMAECGVNKIKRNLMYRMVRMFGASHFRRGE >NZ_CP013336.1|WP_029495198.1|1308657_1309158_-|M15-family-metallopeptidase MFSLSNSSLEKLNGVHPNVVNFMKELIKESPYDFKVTCGIRTAEEQNHEYQKGRTILFDENGKKQPKVSWCDGYNLKSKHQVKVDGYGYAVDIAVLEKEKYIDKKTGEEKEKTVARWDYKYYKAIYDIAKSKGLIDKYGIVWGGNWKQKDSVHFQLGTADNVQFKR |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP013336_5 | 2416531-2416610 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013336_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP013336_5
>5.1|2416554|34|NZ_CP013336|CRISPRCasFinder TTAGATTGTGCTCACTGTGCAACTAAAATTGAAG |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013336_5
The CRISPR arrays of NZ_CP013336_5 >merge|NZ_CP013336|5|2416531-2416610|CRISPRCasFinder AAAAAGTTTTTAAATTAGAAGGTTTAGATTGTGCTCACTGTGCAACTAAAATTGAAGAAAAAGTTTCTAAATTAGAAGGT >NZ_CP013336|5|4|2416531-2416610|CRISPRCasFinder AAAAAGTTTTTAAATTAGAAGGT TTAGATTGTGCTCACTGTGCAACTAAAATTGAAG AAAAAGTTTCTAAATTAGAAGGT
>NZ_CP013336.1|WP_005917816.1|2416144_2416525_+|winged-helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKTTKTVNSCDCDSVNQELVDKVKKKFPDDELLGDLSDFFKVIGDGTRIRILWALDVSEMCVCDIANVLNMTKSAVSHQLRALREADLVKFRRSGKEVLYSLSDNHVKEIFEQGLIHIQEDKKGDE >NZ_CP013336.1|WP_005917819.1|2415265_2415997_+|pyruvate-formate-lyase-activating-protein MQGYINSFESFGTKDGPGIRFVVFMQGCPLRCLYCHNVDTWELKDKNYIYTPEEILAELNKVRAFLTGGITASGGEPLFQASFILELFKLCKENGIHTALDTSGYIFNEQAKKVLEYTDLVLLDIKHIDKEMYKKLTSVDLEPTLNFIKYLQEINKPVWIRYVLVPGYTDDIKDLNDWAKFVSQFDVVKRVDILPFHQMAIYKWEKTNREYKLKDTLTPNKEQIQKAEEIFRKYNLPLYKERS >NZ_CP013336.1|WP_029495078.1|2412973_2415205_+|formate-C-acetyltransferase MEAWRGFKSGEWQDSINVSNFIKHNYTEYLGDESFLEGPTDNTKKLWNILSGMLKIEREKGIYDAETKIPSKIDAYGAGYISKDLETIVGLQTDAPLKRAIFPNGGLRMVENSLEAFGYKLDPITKEIYEKYRKSHNAGVFSAYTPAIKAARHTGIITGLPDAYGRGRIIGDYRRVALYGVDRLIAERKREFDAYDPEEMTEDVIRDREEMFEQLEALKALKRMAAAYGFDIGRPAETAQEAIQWTYFAYLGAIKDQNGAAMSLGKTAGFLDVYIERDLKEGRITERDAQEFIDHFIMKLRIVRFLRTPEYDQLFSGDPVWVTESIGGMNNDGKSWVTKNAYRYLNTLYNLGTAPEPNLTILWSERLPENWKRFCSKVSIDTSSLQYENDDIMRPQFGEDYGIACCVSPMAIGKQMQFFGARANLPKALLYAINGGKDELKKEQVTPAGQFEKITSDYLEFDEVWEKYDKMLTWLASTYVKALNIIHFMHDKYSYEALEMALHSLDIKRTEACGIAGLSIVADSLAAIKYGKVRVIRDEDGDAVDYVVEQPYVPFGNNDDRTDELAIKVVRTFMNKIRSHKMYRNAEPTQSVLTITSNVVYGKKTGNTPDGRRAGAPFGPGANPMHGRDTKGAVASLASVAKLPFEDANDGISYTFAITPETLGKTDDEKKNNLVGLLDGYFKQTGHHLNVNVFGRELLEDAMEHPENYPQLTIRVSGYAVNFIKLTREQQLDVINRTISSKM >NZ_CP013336.1|WP_029492063.1|2411973_2412657_-|peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase MEEDKILHAILLKKAKEAQYTNYEIEQINLQSESLFIRYYLEREAAKIVENTNIEEEVLKKIYEENQTLYKYPEKVKIDTIFVKDLEKAEEILKEVTLENFNELKEKNDEKGKDVKESLDEFLFVTEIHPTIAQEVLQESEKNVIIKKAIPVQEGFHIIYLKDIEESRQAIFDEAKEAILADVKRNIFGQVYNQLIQDIANETVKIEEPTKNEKSKESKSTKVGAKG >NZ_CP013336.1|WP_029495077.1|2411481_2411871_-|adhesion-protein-FadA MKKFLLLAVLAVSASAFAATDAASLVGELQALDAEYQNLANQEEARFNEEKAQADAARQALAQNEQVYNELSQRAQRLQAEANTRFYKSQYQDLASKYEEALKKLEAEMEQQKAIISDFEKIQALRAGN >NZ_CP013336.1|WP_029492061.1|2410401_2411331_-|ABC-transporter-permease MYKLFGYGLKGIPYINRLKRRVFYAVVITVVSLNVFISFSLNLRSLTNEKIFNSFIVVDLQNNLNQDKKNEIEKYILGIEGVRSVRFMDKFESFKNLQNELNISIPESSNPLTDSLVISVKDPTLLGKIQETIETREEVKEVYKDESYLKQSKEQGFITSIAQIGSGVFSFFIAVITIIIFNFGVAIEFLNNANTGLDYAENIRKSKIRNLLSFTMSTVIGTLIFFNIYVLFRRYVSNAKFDSSMLSLKEIVLWHLGAIAVLNLLVWLIPANIGRIEYAEEDDEDELDDEFYEDDEDGDSDDEFEDDED >NZ_CP013336.1|WP_029492060.1|2409191_2410427_-|murein-hydrolase-activator-EnvC MSSKMMKTKIFLTFFLLSASIYPASNSVKDMNKRLKNIDKEIEKKNTRIKAIDTETSKLEKMIKELEEEIKKLEHERKEIEDEITVVKKNIDYSKKNLEISEVEHGRKESEFVAKIIAWDKYSKIHGKDIDEKVLLTKNYREMLHGDLQRMGYIEKVTGNIKEVKEKIEAEKRKLDRLEAELRENLRKSDVKKEEQKKLKEQLQVEKKGHQSSIEKLKKEKQRISREIERIIRENARRAAEKAAREKAAREAAKNKGKSTGKGKGSDGTKVTTTTVDMPKISNPEAYKRIGKTIKPLNGQVVVYFGQKKAGVVESNGIEIKGKLGNPVVASKAGTVIYADAFQGLGKVVMIDYGGGIIGVYGNLLAIKVNINSKVSSGQTIGVLGLSSDKEPNLYYELRANLRPIDPMPTF >NZ_CP013336.1|WP_029492059.1|2408370_2409174_-|NAD(+)/NADH-kinase MIKLSIIYNTDKEDAIKIYKELLKYLKSKKEFEVLDDKNISQAEYIVVIGGDGTLLRGFKKIKNKEVRIIAINSGTLGYLTEIRKDGYKEIFENILKGKVNIEERYFFTVKIGKKKYNALNEVFLTKDNIKRNIVSSEIYVDDKFLGKFKGDGVIISTPTGSTAYSLSAGGPVVTPELKLFLITPIAPHNLNTRPIILSGDVKIVLTLSGPSEFGIVNVDGHTHNKINLEDEVEISYSKESLKIVLPDNRNYYNVLREKLKWGENLC >NZ_CP013336.1|WP_029492058.1|2406715_2408392_-|DNA-repair-protein-RecN MGRKLMLRELKIENLAIIDELDIEFDKGFIVLTGETGAGKSIILSGINLLIGEKASVDMIRDGEENLVAQGVFDVDEEQKKALEAMGIDTDGDEIIIRRSYSRSGKARAFVNNVRISLTDLKEIASTLVDIVGQHSHQMLLNKNNHIKLLDSFLNKDEKDLKENLINLLSQYREIDTKIENIERERKETLEKKEFYEYQLEEIEKLKLKDGEDELLEAEYKRVFNAEKIREKVYESLEYLKDDEDSALSLITNSIRNIEYLGKYDERYIELAKRMENAYYELEDCANEIENISKGIDVTESDLDKIAGRMNTLKRIKEKYKRSLPELIAYREDLKEKLSDIDSGDFKTKELKKELNKIKTEYDKIAEKLTISRKEIAVKIENELLNELKFLNMEDAKLKVQINKLERMTSEGYDDVEFFISTNVGQDLKPLNKIASGGEVSRVMLALKVIFSKVDNIPILIFDEIDTGIGGETVRKIALKLKEIGDNTQIISITHSPVIASKASQQFYIEKYVENSKTISRVKKLSAEERIKEIGRMLVGEKINNEVLEIANKMLNEV >NZ_CP013336.1|WP_029492057.1|2405955_2406714_-|site-specific-integrase MNILEKYIENLVVKKNLLQTTVDAYKLDINEYLEFLTKKDIDILDTNEKIFNEYFSDVEKNYKKATFSRKYSTIRGLYKFLLKNRYIEKIFEYKLSVNKSDNEVTTKKNNIIFKQKEYEEFINSLSDNFNEMRLKLISKMIVEYKINLVNIFEIQIKDLLKYDFQKIIIVRNNKIISYDINKIMEEDLKNYYKKYAFEKRFLFGAYGKSTFISDLKRYNLDFKTLKNCMQEDEKDLIENIRKMYFEIGIGDN >NZ_CP013336.1|WP_029495079.1|2416954_2418799_+|cadmium-translocating-P-type-ATPase MKKKKEVIIIISAVLFAIALFVRMTQNLQLILMLVVYILLGKDTVLKAVKNVEKGDFFDENFLMTVATLGAIMIGEYPEAVAVMLFYEVGELFQGYAINKSRKSIADMMDIKPEYANVIRDNKSIKVDPDEVQIDETIEIKPGERVPLDAIIIKGETTLDTSALTGESLPVEVREGATILSGCININSLILAKVTKEYFDSTVNKVLDLVENAAAKKSTSERLITRFAKIYTPIVISLAVLLAILPPIISGEYNFRLWIFRALSFLVVSCPCAFVISVPLSFFSGIGAASRAGILIKGGNYLEILSKVDTVVFDKTGTLTKGVFNVQKVVVIDKSIKEDEFISLVAMAESGSNHPISKSIQKYYNREIDKTSINSIKEISGKGIEALINNMKILIGNEKLVNVPSDLIIDDIGTILYVEIDNKFTGYIVISDEIKKDASKAIKGLKDVGVKKSIMLTGDIEKVGKKVGEELGLDEIYTNLLPQDKVSKFEEIIENKKSKGNVAFVGDGINDAPVLARADVGIAMGAMGSDAAIEAADVVIMTDEPSKIVTAIKSSKKTMKIAMQNIALAFGVKAIALILSALGIADMWMAVFADTGVTILAVLNSFRALKIENN >NZ_CP013336.1|WP_023038106.1|2419035_2419815_+|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKILLHCFTWLLISANIFAGTLKVGATPVPHAELLNYLKSDLKKEGVDLKIVEFTDFVTINEALIDGELDANYWQHLPHLTLIMQKEKKTDLVAVTKVHVETIGLYSTKIKSIKDLKVGAKIAIPSDSTNEGRALILLHNNGIIKLKDPKNLLATPVDIVSNPKKLKFQELDAALLPRTLDSVDGAIITANYALQAGFVPSKDAILLEDKNSPYVNVLVTRKKNQNNEDIKKLAKALNSEKARKFINEKYNGAVVPAF >NZ_CP013336.1|WP_032881823.1|2419837_2421121_+|O-acetylhomoserine-aminocarboxypropyltransferase/cysteine-synthase MIDKKNLEIETQLVQSLEEFEEGESRTVPLVQSTTFNYTNPDTLAELFDLKKLGYFYSRLSNPTVAAFENKMAILEKGVGALAFASGQAANTAAILTICKAGDHIVAVSTLYGGTITLLASTLKNYGIETTFVNPEASEEEFKAAFRENTKILFGETLGNPEMNTLNFEKIVKIAKEKDVPTIIDNTLATPYLCNPISHGINIVVHSATKYIDGQGSVLGGVIVDGGNYNWDNGKFPMLVEPDVSYHNMSYYKTFGNLAYIIKARANILRDMGAALSPFNAFILLRGLETLHLRMERHSENALALATALEKNPNISWVKYSKLPSHYAYKNAEKYLPKGGSGVILVGVKGGREGAEKFIKGLEWIRAVVHVGDSRTCLLHPASTTHRQLSEEDLIKCGVLPEAVRINVGIENINDIIADIEQALAKL >NZ_CP013336.1|WP_029492069.1|2421214_2422726_-|YfcC-family-protein MKRKNFEFPTAYTVLFLILILVTVLTHVIPAGKYNRLSYEESTNEFVVETYGNGNINLEATQKNLDKLEIKIDVNKFIDGTIKKPMAIPNTYVKLDGKAQGFKELIIAPISGIAESIDIIIFVLILGGIVGIVNKTGTFNIAMKAISQKTKGKEFSLVIISFIFFAAGGTIFGFWEETIPFYSILMPLFLINNFDPLVPMATIFLGSAVGCMFSTVNPFSTIIASNAAGISFNEGLKFRFVALIVFSIISLLYINRYIKKVKKDSDNSLVIEEQEEIKEKFLKDYSQETNIKFDWRKKIILFLFIFQFIIMIWGVSSLGWWFQEAAAMFFGIAIIIMLLSGLSEKEAVNGFISGASEVVGVTLIIGLARAINIIMENGMISDTLLFYSSNVVAEMGKGLFSIAMLLIFAFLGIFIPSTSGLAVLSMPILAPLADTVGLSRAVVVDAFSWGQGVILFITPTGLIFVVLQIVGIPYNKWLKFVMPLMVIIIILIISILYVRSVFF >NZ_CP013336.1|WP_060555499.1|2422880_2423129_-|autotransporter-domain-containing-protein MTLGVAYENELGRVANGKNKARVADTTADWFNIRSEKEDRRGNVKFDLNLGLDNQRFGVTGNVGYDTKGQNVRGGLGLRVIF >NZ_CP013336.1|WP_029495533.1|2423538_2424468_-|toxin-antitoxin-system-YwqK-family-antitoxin MKKGIILLTALIFTACINLEDIAGNSGGEVKEIKTVDTNIKINKNYEKRNGILYVENVLANGKQEYKEKNGVIIKGNYREGLPDGIQEKYYPSGKIFGKINIINNKTEGTESNYYENGKTLSQLDYTQGKLISGKIYYENGDLLSKIEGKKITIFYSSGKKLFTMDKSDIAIYHENGKEVFSNSDDGIKINGEVAEKSLLDMFSKDNLLKTALYLLTSNTIQAEYKNGKPSVQLQGTTVVMYYPSGKILLELSLSLDGTVNSKIYYENGQLMQVEDRNKSGRNVKNYDKAGNLIADTTYSKEHEIRQIF |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP013336_4 | 4.58|1301094|34|NZ_CP013336|CRT | 1301094-1301127 | 34 | NZ_CP010111 | Bacillus thuringiensis serovar indiana strain HD521 plasmid pBTHD521-5, complete sequence | 156994-157027 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP013336_4 | 4.58|1301094|34|NZ_CP013336|CRT | 1301094-1301127 | 34 | NZ_CP017574 | Bacillus thuringiensis strain SCG04-02 plasmid PSCG364, complete sequence | 343715-343748 | 10 | 0.706 |
1. spacer 4.58|1301094|34|NZ_CP013336|CRT matches to NZ_CP010111 (Bacillus thuringiensis serovar indiana strain HD521 plasmid pBTHD521-5, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ttcaaataattttacatcagacatttttaatacc CRISPR spacer cacttataatttaacatcagacatttttagttgt Protospacer . * ******* ****************.* .
2. spacer 4.58|1301094|34|NZ_CP013336|CRT matches to NZ_CP017574 (Bacillus thuringiensis strain SCG04-02 plasmid PSCG364, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttcaaataattttacatcagacatttttaatacc CRISPR spacer cacttataatttaacatcagacacttttagtttt Protospacer . * ******* **********.*****.* ..
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
1307377 : 1343766
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013336|1307377:1343766|DBSCAN-SWA AATGAAAAAATTTGTTGAACAATATGATATTCGTATGTTACCAGATAGAATTGGAATGGCAACACAATTTAGAAAGGAGCATTTAAGAGAATTTTACAAGTATAAAGTAACAGCTATCGAGAGATATTTATTAGCAAGACTTGAAGAGGAAAAATACAATAATAACTTTGATAAAGCTTCTAAAATAGATAAAATTTTAAGTTCTATAATTGGTATTGCTGATTCAACTGACTTTATAAAAATAGAAGAATCAATAGCATATGATAATGAAAGAGAATTTCAAAGAGTAGTTTTTGAAATAAATACAACAAATATAGAACTTGCAAGATTTGGAATAGACTTAGAAAATGATACATTTAACATTATAAAAATAATAGAAAATCAAATAAATGAATAAAAGCCCAGCTAATAACTGGACTTTTTTTAATTATTTTATTTCATTGTTAAAATCTTCATCTTTTAATTTTTCTGGCTTTATATTCTTATCATCAGCACACTTAGAATTGCACTTATCTCCTTTGCATTGCTCAAGTGCTATTTTAAGCTTTTCAGGGATAGGTACTCCTAATTTACTTGCATTCTCTATAACTGATAATATTTCTGTGGCCACATAAAAAATTATAACTAAATTCCTTATACCAACATTAGGCACTAACTGCTCAATAACTGTGGAACAAGATACTATTATAAGTATAAAGACTTTTTTACTTATTCCTTTATATGCTCTTGTACTATTAACTGTCTTAGTTATATAACCAACCCATAAGCCAGTAATATAATCTACAAGCATAAGAAAAACTAAAACTTTTACAGATAAGTCAAATCCACCTAAAGCCCAAACAAGAACTGATATCCAGCTAGTCCATATCATAGCAATACCGTTTTTTGCATTAATAAAAAAATCTTCCATTTACTCACCCCTTCTGAAATGGCTAGCTCCAAACATTCTAACCATTCTATACATTAAATTTCTTTTGATTTTATTTACTCCACATTCTGCCATAATTTCTAAGAATATTTTATCTGCTTCTTGTCTTGTAATGTCAGTTTTACATTGACTTGAATATAGCCAATCATGAACAACTGCACCTCTGCCATGTTTACCATATGAATTTATAATATTTCTGAAAATTCTAGGTACAGAAGCATAATCTGTCCTAAAACCTTTTGGAACAACTATAACTCCTCTTGATGTTTGATAAAAATAATCCTCCATAACTTCCCAATATTTATCATCTATTGGCATTGTTTTAAGTTTAGATATTTCCATTTTATCCCTCCTTATCTTTTAAATTGAACATTATCTGCTGTTCCTAATTGAAAATGTACAGAGTCTTTTTGCTTCCAATTTCCTCCCCATACTATTCCATATTTATCAATAAGTCCTTTACTTTTTGCAATATCATAAATAGCTTTATAATATTTATAATCCCATCTAGCAACAGTTTTTTCCTTTTCCTCTCCAGTTTTCTTATCTATGTATTTTTCTTTTTCCAAGACTGCTATATCAACAGCATATCCATAGCCATCAACTTTTACTTGATGTTTTGATTTTAAATTATAACCATCACACCAACTGACTTTTGGTTGTTTTTTCCCATTCTCATCAAACAAAATTGTTCTACCTTTTTGGTACTCGTGATTTTGTTCTTCTGCAGTTCTAATTCCACATGTAACCTTAAAATCATATGGTGACTCTTTTATAAGTTCTTTCATAAAATTTACTACATTAGGATGAACACCATTTAATTTTTCTAAACTTGAATTTGATAAACTAAACATATAACCTCCTTATATATAAAAAAACATATTTTTATATCTAAAATTAAAATTTACTATCTCTTAAATATAAAATCTTTAAAATTTATATTTAATAAAATCTATTTAAAAAAATGACCTTGTAATATCAATTTTAAAGAGTTTTATCAAAGGTAGCTATATAAAACTACCTTTGATAATAGAAACTCTTAAAATTAGCCTTTTGCTAGTGCATTATGTATCTCTTTTCTTTTTTTCTCAAATTCATCTTTTGAGAGGTCTTTTGGATTAACTTTTGTCTTGAAGTAATTTTCAGTATCATAAACAGATTGAATAAATGTACTTCCAAAAAACATTAATTGAATAAAGCCCATTAAATCTAAACTAACTCCGAAATTATCCTCAAAATACCAAGTTTTTTTTATTTCTTTATTCATAAAAGTTTTAACTAAAAATAATAATAGAGCCGACATTGCTATAAATATGATATCTTTGTCTCTACATCTTTGGCGATGTTCTTTTTCTCCAACTTTATAATCAAATCCATAGTCTAATACCTCAGCTTTTAAGCTATCTATAGTATTAAAATAATCTTTTCTTTGTGCTTCTGTATCTAATATCCATAAGTGTTTATCTTTATCCCAATTTAAGTATTTATCGTTTCCTTGTGGTTTAGGTACTTTTATAAGTTTTTTATTTTCTATAAATTCGCCAACTTCAAGAGTTATCTCAATATCATTTGCGACTTTTTCTTCTCTTGTCATTTCTCTAATTGTGTTATTATCAAAAATTGGATAGTTGAATGGTATATCTCTTTCAATTATCGTTGAATTGTCTTTTTGAATGTTAGGATAATATCCAAAAATAACATCCCAACCTCCATATAATTTAACCTCATCAGATGTTAAGTTTACATCAAATAACAGTTTTGGTAATTTTTCTTTTGAATATATATAATACATAATTTACTCCTTTCAAAAAATAGTATTTTAGGTTATCTGTTCCATCACAGATAGATTTTTAAAATGTGAATAGATTGGAAAATTTATCTAGTTCTGGTGCAAAAAGGATAGATTTAAATATTCCTAACTCTAGTCATTCTTATGCTTATAGAATAGGAGACATTTGTATTCTAAATATTGACTCTGGTGGTGCTTTTATTGGGAAAAAAGCAGATGACATATTATTTAAGTTACCATCTAATTTATTACCAAAAAGTAGAACGATTGCTACTTTAGGTTCTTTTGTACCAAGCCTAAGTAGAGAAATTGTGGTATATATAGAACCAAATGGAAATTGTATTCTAAAATCTCAAAATGTTACATGCCAAACAGCATATTATGGCAATATTAGCTATATAATTCAAAATTTATTTTAAAAAAGTTGTTAACTGTCCCATAAATGTATTTGTAAGAGGATTTCTAACATCTGTAGAAGAAACCATTAAAACATTATTAACTAAAGATAAATGTCCACAAGTTCCATTATTTCCTGTGATTGCTGCTGCAGTATTATGACATCTGTAAGGTAAATTACATTTATATGTGATTCCATAATTTACTTTTTCTATACTATATGTGTAAGCAGCTACAAGAATTAAATTACCGCACTGAAATATAGTAAATTTTATCCCACTTGGAGTTGAATATAATTCTTGAACTTTAAATCTTGATAAATTTTCCAATCTATTAAGATTTTCTAATATACTCATATCTATAAAATTTCCGTTTGGCATTGGAGCAGGGCCGCCAACTTTACATTTATAATATTTTTTTGTTAGTTCAGAATAATAGACATTTCCAACCACTGCATTTGCTACAGGAAAATCTCCATCATGTTTTCCAACTGCCGAAACAAGTCTATCATTTAAGCCTTTTGAATTCTTTTCTGTATCTCCCTTTAGTTTAAGTATGTAATCCTCTATTTTATCCCATAACTCATTCCAAAAGTCTCTAAATTTACCCTTGTGATTTGCTTTCCATACAGGTAATTTTAATTCTTTTGTAACCTTTTCTATTTCTTCTCTACCTTGTGGGTCATTAATCCATTCAGCCATTTTTTACCTCCTTGAAATTTTAATTTTTTCTATTTCTTCTAAATTCATTTGTTCTAGTTCTGATAAACTGTACATTTCAATATAATACTCATCTCTAGCTAGTGTAATCTTTTCAATTTCTTCTAATGTCATTTCATGCAGTTCTGATATTAAGTAGTCTTCTACATAAATTCCATTAATAACTTCAAGCCCTACACCTGCACCTTTTATTTTTTTAACTAAGTTAAATACTTGTTGCTTTTCTAATTTTTCAGGGATAGAAATAAGTATTTTCCCTGATAATTCTATAATTCTAAACTCTGTTTGATTTAATTTGAAATATTCTGATAGTATTCTAATTATTTCTTTAGGACTTCCTAAAAACTGTAATAATGCTATTTCAAACTTCAATAGTTTTCTGTACTCTATATCATTAAGTTCATTTCTTGGGATTTTAAAGTTTCCACCTAAAACATCTAATAAATAGCCTTCTGATTTATCAATATCATTAAAATTAGAAAACAAATTATAAATATTTCTTATTCTTAAATGCTTAGTTTCTGCTATTTCAAACATTTTTTTTGAATACACTGTATCATGATAAATATGAGGTACTCTGCTTAGTATCATAGATTCACCTCGATAGTTATATCATCAGCATTAGCAACTGCAACTTCTTTAGTAGTAAGTTTATAATCTTGCTCTCTTTCATTGTACTTAACATCACCTAACTTAATTTTTAAAGTTTTTATTCCACTTACATTTTTATATATTTCACCTATAATTTTATATAAGTAAATAGTGCTATTTGGCTCAACTTCATCAATATATTTTAAGTAAATATCTTTTATAGTTTTCTTGAATTCATCTTTCCAAACTTCTTTTATACCTTGTATTTCAACTTTTAAGAATACAGTTTTTTCTGTTGGTCTAGTAAAGCCTACACTAATTTCATCAAAATTCTTTGTAATTGCTCCAACTGTTCTAATCCCTGCAATTTTATACTCGTACAATGCTTTTAAGATGTTATTGTTAGTATCTCCATAACATATACATTCATAACTATGTGCTAATCTCCCATCACTATCAAAAGTATCTGTATCATTTTCTATAACTTGACATTTCTTAACATTAGTATTCTGTAATATATAGTTTTTAATCCCTTCTGTTGTAAAAGAACTTTTTCTATCTAGTCTTTTTAAATATC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53 | Fusobacterium_phage(86.49%) | terminase,transposase,capsid,holin,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
1771100 : 1777184
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013336|1771100:1777184|DBSCAN-SWA 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ATATAGTGTTATTTATTTTAGTTCCTTCTTTTATTCCAACTCTTTTAGCCATAGAGCCAGCTATTATATTTCTAACTATAACTTCAAGAGGAAATATACTTACTCTTTGACATAATTGATCTCTATCATTTAATTTTTTAACAAAGTGAGTTTTTATTCCATGTTCTTCTAACATATTAAATATTAAAGCTGTTATTTCATTATTCATTATACCTTTATTGTGAATAGTTCCTTTTTTTGCTCCATTTCCAGCAGTTGCATCATCTTTATAGTGAACAATAACTAAATCCTTATCATCAGTTTCATATAGTTGTTTTGCCTTTCCTTCATAAATAAATTTTCCTTTTTCCATCTTTATTCCCTCCTAATTTTAAATAAAATATTCATTTTGATTGATTATATAAAGAAAATAAATGAGTTACGATTGTAGATTTTAGATAAAAAATCAAATAGAATGAGCCAAGCAAATCTCGCTATGTTTGAACGAAGTGAGTTTGCTGAATTTCTTAGAAACACTTAGCAATTTATTGCTTAGAGTTTCTTAGATGCGAATTCTTGATTTTTTATCGTTAAGAAATCTACTTAGTAACGAATTATTTTCTTTATTTCCATTATAATTCTACATGTATATTTTTTTTGAAATCTTCTTTCATTTCTTTTCTAAATTCTAAAAGTTTTTCTCTTAATTCTTTATTTCCAACTGCTAATATTTCTACTGCTAACATTCCAGCATTATATGAATTATTTATTGCTACGGTTGCAACTGGAATTGATTTAGGCATTTGTACTATTGAGAATAGTGCATCTAAACCTTCTACTGCTGCTTTTATAGGTACTCCAATTACAGGTAAAACAGTTTTTGAAGCAATAACCCCTGGTAAATGTGCAGCAAGTCCTGCTCCTGCAATAATAACTCCATAGCCTTCTTTCTCAAATTTTTCTAAAGTTTCTTCTAAAAGTTCTGGAACTCTATGTGCTGATAGAACATGTGCAGAATATTCTATTCCAAACTTTTTTAAACAGTCTGCTGCTCCTCTCATTACATCAACATCTGATTTACTTCCAAATATAATTCCTACTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013336|1771100:1777184|1772655_1773240_-|WP_005916671.1|DBSCAN-SWA MSEINKKKIAVLVSGSGSNLQSIIDNVENGNLNCEITYVIADRECYALQRAEKHGIETLLLDRKIIDDKSVNEIIDSTLEGCKTDYIILAGYLSILNEKFIKKWDKRVINIHPSLLPKFGGKGMYGIKVHEAVIKAGEKESGCTVHFVNNEIDAGEIITNVKVPVLEDDTPETLQKRVLEQEHKLLIKGIKKIL >NZ_CP013336|1771100:1777184|1776710_1777184_-|WP_029494806.1|DBSCAN-SWA MKVGIIFGSKSDVDVMRGAADCLKKFGIEYSAHVLSAHRVPELLEETLEKFEKEGYGVIIAGAGLAAHLPGVIASKTVLPVIGVPIKAAVEGLDALFSIVQMPKSIPVATVAINNSYNAGMLAVEILAVGNKELREKLLEFRKEMKEDFKKNIHVEL >NZ_CP013336|1771100:1777184|1774342_1775692_-|WP_029494807.1|DBSCAN-SWA MGILALHSKKVRKDLVGIAYYGMYSLQHRGQEGAGYTICDSITNGEVRIKTVKNVGLVSDVFLVEDFQRYTGNILIAHTRYGSKNTMSIRNCQPIGGESAMGYISLVHNGDLSNKIELKQELLDDGSLFQTGIDTEIILKFLSIYGKYGYKEAVLKTIEKLKGCFALAMIINDKLIAVRDPEGLRPLCLGKIIEDDMYVIASESCALDAIGAEFVRDIEAGEMIVIDDNRVESIKYKESTKKASSFEYIYFGRPDSVIDGVSVYDFRHQTGRYLYEQNPIEADIVIGVPDSGVPAGIGYSEASGIPYSAALLKNKYIGRTFIAPMQELRERAVKVKLNPIKELIKGKRVVVIDDSIVRGTTSKKLIDVLFEAGAKEVHFRSASPVVIEESYFGVNIDPNNKLMGSYMSVEEIRKAIGATTLDYLSLKNLKKILNGGEDFYTGCFKEDEE >NZ_CP013336|1771100:1777184|1775737_1776451_-|WP_005916677.1|DBSCAN-SWA MEKGKFIYEGKAKQLYETDDKDLVIVHYKDDATAGNGAKKGTIHNKGIMNNEITALIFNMLEEHGIKTHFVKKLNDRDQLCQRVSIFPLEVIVRNIIAGSMAKRVGIKEGTKINNTIFEICYKNDEYGDPLINDHHAVAMGLATYDELKEIYDITGKINNLLKEKFDNIGITLVDFKIEFGKNSKGEILLADEITPDTCRLWDKETGEKLDKDRFRRDLGNIEEAYIEVVKRLTEKK >NZ_CP013336|1771100:1777184|1773227_1774247_-|WP_029493880.1|DBSCAN-SWA MINSYKDSGVDKEEGYKAVELMKKNVLKTHNKSVLTNLGSFGAMYELGQYKNPVLISGTDGVGTKLEIAMKQKKYDTVGIDCVAMCVNDVLCHGAKPLFFLDYLACGKLDAEIAAQLVSGVTEGCLQSYAALVGGETAEMPGFYKEGDYDIAGFCVGIVEKDNLIDGSKVKEGNKIIAVASSGFHSNGYSLVRKVFTDYNEKISLKEYGENVTMGDVLLTPTKIYVKPILKVLEKFNVNGMAHITGGGLYENLPRCMGKELSPVVFRDKVRVPEIFKLIAERSKIKEEELFGTFNMGVGFTLVVEEKDVEPIIELLTSLGETAYEIGHIEKGDHNLCLK >NZ_CP013336|1771100:1777184|1771100_1772615_-|WP_029494808.1|DBSCAN-SWA MKKRALISVYDKTGILDFAKFLISKGVEIISTGGTYKYLKENKIEVIEVSKITNFEEMLDGRVKTLHPNIHGGILALRDNEEHMRTLKERNIDTIDYVIVNLYPFFEKVKEDLSFEEKIEFIDIGGPTMLRSAAKSFKDVVVISDVKDYESVKEEINKSNDVSYETRKKLAGKVFNLTSAYDAAISQFLLEEDFPEYLNVSYKKSMEMRYGENSHQKAAYYTDNMSDGAMKDFKQLNGKELSYNNIRDMDLAWKVVSEFDEICCCAVKHSTPCGVALGDNVEEAYKKAYETDPVSIFGGIVAFNKEVDEATAKLLNEIFLEIIIAPSFSKSALEILSKKKNIRLIECKNMPSDKKELIKVDGGILVQDTNNRLYEDLEVVTKAKPTSQEEKDLIFALKVVKFVKSNAIVVAKNLQTLGIGGGEVSRIWAAEKALERAKERFNATDVVLSSDAFFPFKDVVKLAAKNGVKAIIQPSGSVNDKDSIEECDKNNISMIFSKLRHFKH |
6 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
2014942 : 2062146
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP013336|2014942:2062146|DBSCAN-SWA 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68 | Fusobacterium_phage(88.89%) | terminase,integrase,tail,protease,portal,capsid,holin,plate | attL 2012728:2012743|attR 2064086:2064101 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
2071015 : 2093868
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP013336|2071015:2093868|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP013336|2071015:2093868|2085707_2087567_-|WP_029495642.1|transposase|DBSCAN-SWA MTKEYLLEDLQRLFEKTRTQALRFAQVQGWTVEKKKIGKVYKNVYKASEIDAYISSLVEVKEEKEKKVATRTVVKKEATAIDELPSWNQRIANARFIICMKLEEKYEEGGDSKEEIIKKFVNDVNRNYPQQMEILKKLTVPTLRRWWGIYLKNKHNPLALASGHGTTKGIRRVEKEVLEFAKMLYFSKNKPKISFVFERVVAMFGVKAISYGTLRNYLNKDINLIEKDKARMGNKEFKDTYTPFIERSYEDIKAGEVWMSDGHDLEMMCYQGDKKKANGDRYFGSPKLIVWIDVKSRFIVGWSLAWSETTEAIAIALKRGIEKYGVPQHLYTDNGKAYKSKVLKGTDELDGIYASLGINVDHARAYNAQAKHIERWFVDFKESFTKQFATYKGGNIIERPEHLRSFAMQKLDKGEILEQWELEELIEKFIETKNHNYYALRRAAGLKAHRGRGMNNRTPLEVFQEENPLANRKMLSDQELRLLFLYEEIRTIKQNGIEFMGNTYVNEYLYYHQTEKCKIKYDPHDLSYIFVYQETGEFLCKAEQLGLAGWKDVTAIKTHKKRLQKISKLSKEIMGIREDIRDNLDLIDATIVEDTKAIENKKKNEKERILIGEGIYLED >NZ_CP013336|2071015:2093868|2077472_2077658_-|WP_029495628.1|DBSCAN-SWA MIKNIRGGKREGAGRKALGKDKRISRSITIKKELLDEIKIKYNQKTLSYVIEDALIEYLKK >NZ_CP013336|2071015:2093868|2078339_2078567_-|WP_008693769.1|DBSCAN-SWA 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33 | Bacillus_phage(14.29%) | terminase,integrase,transposase,capsid,portal | attL 2083905:2083921|attR 2089795:2089811 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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