Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013130 | Lactobacillus paraplantarum strain L-ZS9 chromosome, complete genome | 7 crisprs | csn2,cas2,cas1,cas9,cas3,WYL,csa3,DinG,DEDDh,cas8e,cse2gr11,cas7,cas5,cas6e | 1 | 12 | 7 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013130_1 | 302453-303280 | TypeII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013130_1
|
12 spacers
spacers of NZ_CP013130_1
>1.1|302489|30|NZ_CP013130|CRT AGTACTTATAAAGCAATTAACCATGCTACT >1.2|302555|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder CCTGGCTCATAGATGAGTGCAGGAAAAAAT >1.3|302621|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder ACGTTCTCGACACTATCTGGCACCTTCCTT >1.4|302687|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder TCATAAACGACTTGGTACCCATTAGAACGT >1.5|302753|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder TGTAGGCGCCGTGCAATGCTAAGAACTCAT >1.6|302819|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR TAATATTAATTGTTAGCTTCAGCTCAAAAA >1.7|302885|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR AGGTCGGTCATTTTCCTATTGAGTTGCATA >1.8|302951|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR CGGAGGTGTGGTGGTATGTAATGGCAAAAG >1.9|303017|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR GTGAAGCACCCTATCAAGCAACTTTGTAAA >1.10|303083|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR CTGGCGACCAAAATCAAAATCTGCCTTCAT >1.11|303149|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR TGAGTTGTTAACTCAATTTGGCATGCCATT >1.12|303215|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR ATAACTTTAAGAGCACTCGTGAAGACATGA >1.13|302555|29|NZ_CP013130|PILER-CR CCTGGCTCATAGATGAGTGCAGGAAAAAA >1.14|302621|29|NZ_CP013130|PILER-CR ACGTTCTCGACACTATCTGGCACCTTCCT |
csn2,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013130_1
The CRISPR arrays of NZ_CP013130_1 >merge|NZ_CP013130|1|302453-303280|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder,PILER-CR AAGGCATAATCATATTAATCAATGTCCTTCTGAAACAGTACTTATAAAGCAATTAACCATGCTACTGGTCTTGATCTTATTGATTTGATGTCCTTCTGAAGCCCTGGCTCATAGATGAGTGCAGGAAAAAATGGTCTTGACCTTATTGATTTAATATCCTTCTGAAACACGTTCTCGACACTATCTGGCACCTTCCTTGGTCTTGACCTTATTGATTTGATGTCCTTCTGAAACTCATAAACGACTTGGTACCCATTAGAACGTGGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAACTGTAGGCGCCGTGCAATGCTAAGAACTCATGGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAACTAATATTAATTGTTAGCTTCAGCTCAAAAAGGTCTTGACCTTATTGATTTAACGTCCTTCTGAAACAGGTCGGTCATTTTCCTATTGAGTTGCATAGGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAACCGGAGGTGTGGTGGTATGTAATGGCAAAAGGGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAACGTGAAGCACCCTATCAAGCAACTTTGTAAAGGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAACCTGGCGACCAAAATCAAAATCTGCCTTCATGGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAACTGAGTTGTTAACTCAATTTGGCATGCCATTGGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAACATAACTTTAAGAGCACTCGTGAAGACATGAGGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAAC >NZ_CP013130|1|1|302453-303280|CRT AAGGCATAATCATATTAATCAATGTCCTTCTGAAAC AGTACTTATAAAGCAATTAACCATGCTACT GGTCTTGATCTTATTGATTTGATGTCCTTCTGAAGC CCTGGCTCATAGATGAGTGCAGGAAAAAAT GGTCTTGACCTTATTGATTTAATATCCTTCTGAAAC ACGTTCTCGACACTATCTGGCACCTTCCTT GGTCTTGACCTTATTGATTTGATGTCCTTCTGAAAC TCATAAACGACTTGGTACCCATTAGAACGT GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAAC TGTAGGCGCCGTGCAATGCTAAGAACTCAT GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAAC TAATATTAATTGTTAGCTTCAGCTCAAAAA GGTCTTGACCTTATTGATTTAACGTCCTTCTGAAAC AGGTCGGTCATTTTCCTATTGAGTTGCATA GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAAC CGGAGGTGTGGTGGTATGTAATGGCAAAAG GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAAC GTGAAGCACCCTATCAAGCAACTTTGTAAA GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAAC CTGGCGACCAAAATCAAAATCTGCCTTCAT GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAAC TGAGTTGTTAACTCAATTTGGCATGCCATT GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAAC ATAACTTTAAGAGCACTCGTGAAGACATGA GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAAC >NZ_CP013130|1|1|302518-302686|PILER-CR TGGTCTTGATCTTATTGATTTGATGTCCTTCTGAAGC CCTGGCTCATAGATGAGTGCAGGAAAAAA TGGTCTTGACCTTATTGATTTAATATCCTTCTGAAAC ACGTTCTCGACACTATCTGGCACCTTCCT TGGTCTTGACCTTATTGATTTGATGTCCTTCTGAAACTCATAAACGACTTGGTACCCATTAGAACGTGGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAACTGTAGGCGCCGTGCAATGCTAAGAACTCATGGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAAC TAATATTAATTGTTAGCTTCAGCTCAAAAA GGTCTTGACCTTATTGATTTAACGTCCTTCTGAAAC AGGTCGGTCATTTTCCTATTGAGTTGCATA GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAAC CGGAGGTGTGGTGGTATGTAATGGCAAAAG GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAAC GTGAAGCACCCTATCAAGCAACTTTGTAAA GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAAC CTGGCGACCAAAATCAAAATCTGCCTTCAT GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAAC TGAGTTGTTAACTCAATTTGGCATGCCATT GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAAC ATAACTTTAAGAGCACTCGTGAAGACATGA >NZ_CP013130|1|1|302519-303280|CRISPRCasFinder GGTCTTGATCTTATTGATTTGATGTCCTTCTGAAGC CCTGGCTCATAGATGAGTGCAGGAAAAAAT GGTCTTGACCTTATTGATTTAATATCCTTCTGAAAC ACGTTCTCGACACTATCTGGCACCTTCCTT GGTCTTGACCTTATTGATTTGATGTCCTTCTGAAAC TCATAAACGACTTGGTACCCATTAGAACGT GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAAC TGTAGGCGCCGTGCAATGCTAAGAACTCAT GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAAC TAATATTAATTGTTAGCTTCAGCTCAAAAA GGTCTTGACCTTATTGATTTAACGTCCTTCTGAAAC AGGTCGGTCATTTTCCTATTGAGTTGCATA GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAAC CGGAGGTGTGGTGGTATGTAATGGCAAAAG GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAAC GTGAAGCACCCTATCAAGCAACTTTGTAAA GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAAC CTGGCGACCAAAATCAAAATCTGCCTTCAT GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAAC TGAGTTGTTAACTCAATTTGGCATGCCATT GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAAC ATAACTTTAAGAGCACTCGTGAAGACATGA GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAAC >NZ_CP013130|1|2|302783-303280|PILER-CR CCTGGCTCATAGATGAGTGCAGGAAAAAA TGGTCTTGACCTTATTGATTTAATATCCTTCTGAAAC ACGTTCTCGACACTATCTGGCACCTTCCT TGGTCTTGACCTTATTGATTTGATGTCCTTCTGAAACTCATAAACGACTTGGTACCCATTAGAACGTGGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAACTGTAGGCGCCGTGCAATGCTAAGAACTCATGGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAAC TAATATTAATTGTTAGCTTCAGCTCAAAAA GGTCTTGACCTTATTGATTTAACGTCCTTCTGAAAC AGGTCGGTCATTTTCCTATTGAGTTGCATA GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAAC CGGAGGTGTGGTGGTATGTAATGGCAAAAG GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAAC GTGAAGCACCCTATCAAGCAACTTTGTAAA GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAAC CTGGCGACCAAAATCAAAATCTGCCTTCAT GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAAC TGAGTTGTTAACTCAATTTGGCATGCCATT GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAAC ATAACTTTAAGAGCACTCGTGAAGACATGA GGTCTTGACCTTATTGATTTAATGTCCTTCTGAAAC
>NZ_CP013130.1|WP_033611319.1|301857_302382_+|histidine-phosphatase-family-protein MKIYLIRHGEPDYGPVTNAGYTGFGRDLSPLTKQGVLQAQHCAEQPIFNEVQLILASPYTRALQTATEIIRRHNRPLQVELGLHEWYPDKSGWQIKSGRQAMAAYDEYTANHGQASDSQVWDYETSADIRHRVQAVFDKYQHYQCIACVTHSEVMRQFGDWQRIGYCEVKVIIL >NZ_CP013130.1|WP_033611320.1|301313_301844_+|histidine-phosphatase-family-protein MQVYLIRHSEPTYQQVTSAGLTGFGRELGGLTDRGIILAQQCAQQPLFAQVQLILSSPYTRALQTALEIVRFNDVPLKVELGLHEWLPDQTGTRTDTDEQAGQAYKLYRQHMGERTAASPLPYESAAEIKAQVLATFSKYAASYDCIACVTHGEVMRQFGDHNDVDYCGVRVITVD >NZ_CP013130.1|WP_081939550.1|296596_301189_+|MucBP-domain-containing-protein MKSITFNNLTKHQQSRWLVTSATTMILTALTIGSHTAYADENTATSTTNQQTSSQVMPAAESQSTATTIKTAATPAKESSNNTNSSRPVATTMADQTTAKTVTSTVTATNTVVSVQGSAPAKTDATDTVMTTPNTTTSTTSSNDNTSTNATSPDTIVTTPSATNSTNITDKSSVQSATAVSTKTSTTNQPGKTQSMVKANSDTDQTQVGAAQAHLSQESVKSRATQPITISATQRAVQEDINQWMPNKLLQQEVLRQLRAQNPGRTWNSADDITKDDMLLLTTYYGKDTYIDGKTSYSLEGLQYATNLTTVWLNNNLNAPSGSYYSDVTDISQLADLQKLQVVNIQQNRITDISPLANLKNLTTVDAAYNHISDFSPLKGFKNLKGTFSNQFITLPPAYISADNNIATLAVDCYLPDGTKTQLKPNGGVGETVFYKNGQTYARWYINGAGGGNYDSNGHIYYTNMKSQQPGIAGPTFNGTTVIPMDDYYFMTAASDGNNFVVVRPYVLAATAAPITVKYVDALTGKSLVTTDLTLNGIVGQPYTTQRIDNDLPNYDFTNIIGNASGVFTADAQTVTYYYTRKDAGDITIHMVDTNGNLIHDSATLTGKNNLGNAYDLAAPTFNHFKLQDTVGNAAGVFTTDPQSVTFIYVRLDAGNITVKYQDKNGQQLKPTKTIAGSQSLGQTYQTEPLDIENYTLTTTPANATGTFTDQEQTVIYVYVRRDAGQIVVKYQDSAGNQLAPDKILDGKAQLGSVYQTEAILVPNFYLVATPENATGAFATDTQTVIYQYARSDAGNITVKYQDASGTALAPDDVLTGNHQLGRPYQTSAKTIENYRLIQTPANATGQFSDQAQTVIYVYTRADAGNITVQYLDENGKQLAADSVLSGQGQLGRPYETSPLNINGYTITSTQGNTTGTYTTQPQRVVYIYERTAGQPVTAKYQDAHGKTIHPDVVHTGYFGESYSTEQLVIDGYTFKAVQGDVSGTFGNAAKTVTYIYERTTGQPVTAKYQDEHGKTIHPDVVHNGYLGDSYSTEQLTIDSYIFKTVQGDVSGTFGNAAKTVTYIYERTAGQPVTAKYQDEYGKTIHPDVIHTGYFGESYSTEQLTIDGYTFKAVQGDVSGTFGNAAKTVTYIYERTAGQPVTAKYQDAHGKTIHPDVIHTGYFGDSYSTEQLAIDGYTFKAVQGDVSGTFGNAAKTVTYIYERTAGQPVTAKYQDEYGKTIHPDVIHTGYFGDSYSTEQLAIDGYTFKAVQGDVSGTFGNAAKTVTYIYERTTGQPVTAKYQDEYGKIIHPDVIHTGYLGDSYSTEQLTIDSYIFKTVQGDVSGTFGTDAKTVTYIYTKNTPTIPESKGTVTVHYVTKDGITLNAPTVLSGKTGTSYQTKALTFTNYELVGQPENTTGLFTTDNVDVTYVYQATNTTGTGDIIDPEEPEQPTKPVEPTTPKTPSEPGTTSTQPDNIKPAQPTATVKPAATVKPTLKPAAAHANLVKTTSPATEQSDQLPQTDEQTGKLTVILGLLLSVVTLGFYGKHRQS >NZ_CP013130.1|WP_003645748.1|296253_296373_-|putative-metal-homeostasis-protein MEKQDLASARRRLRGTNLKSRKRALKILHDARRNASKAK >NZ_CP013130.1|WP_033611321.1|294841_295600_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MLLAALLKTRRCQHGLTQAQLAAKLFVTTQAVSKWERGKAVPSIDNLLALSDLYNVSLDELVRGSAFFSKPYIVGRRLSFGRLLGLGLFWLVVCLIFTGFGYQPWWLFGLLYAGGLIVVVPVGINDFWVIQPAAIELHTYAASTLTKFRQIVFNRPQCQLIHYADLQRVTISYRRRQRLSPFDFNPDYFQLILTTNEQTYPLECAMKASDYLPQFVSYLQRQGVKVDDPQQIVGLLVKGESLYQHFHAGVQS >NZ_CP013130.1|WP_033611322.1|294193_294748_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MKIVIGTKIKQQRQRREWSQQTVAERLHVSRQTISKWELGKSYPDLESLVALSKLFAVSTDELLGLQRVSARRPWWQLLWRKRGRTEMTTIKWYSGGQERAQIAVGLISDLVANLNTTTAQPLRELLASYYTELLELRTGSALGVFDRMNLDISKCLRQQQITLSPANEQLMQQLMGLNMIHYR >NZ_CP013130.1|WP_033611323.1|293195_294122_+|LysR-family-transcriptional-regulator MENKLLVFLEAIQQHNSMTKAAQSLFISQPYISRTIKSAETHFGTPLIDRGHHPLELTYAGKRLLTYLQSDARLHQRMNTELKEISQNKYQSMTIGITPPMANAWFSQTLPAFYQRFPNIRTKILEITTSKAETLLASHQLDFFIGKTIHQTNVKTIPLQTISLSLVIPKTAGIYQSNQFWRPFTPTILTGMTGEPVIRAVGEARFQELVDHYFADKGIQTIPLIEVDNSRFALSLTLQGLGSIVLATAMLARLATEPAKYPINAFKLPTSELSLDFSIAYLPSHVLAKPIAYLAEQACQTFNPAIDF >NZ_CP013130.1|WP_033611324.1|291131_293009_-|FAD-binding-protein MDFERVVSMLKKMNQVKWDYQYDTVVIGFGGAGATAARFAADAHAKVLLTDAAPNGHEGGNTRYSAQLLGTVDSFDEGKKYYQNLTAPVQLDDSMVDTFVAGMANMRDYVQKYLNVDPVSVKNDFTAADSPISLDSAVHEFPEFDGVQSYDFTTVHHGIFDAALWKILRQKVLDRQQQIDVWLSAPAQHLIQDPTTNTIIGVQIERQHRLVNVRATNGVVLACGGFENNQQAIQDYLGAEHLAPLGTLFNKGAGIKMAQEVGADFWHMQNYESLGFLHGLSIDVPQGERGRLILGWPEVNHGSVITVADDGSRYFDESEANRHGHIYDHGMWRVPRTNVHPYLVFDETQYQQMLASQYTPINNLTDLVVKATTLNDLARVMEVDGTVLTKTVHDFNYFVESGTDYAFNRQVDTMRAFDDGPYYALKLTNNVLNTQGGPRRNDRAEILDSNQQPIPHLYGAGELGGICANQYQGGGNLAECLIFGKIAGENAAKPKEETTQLVDEKAVAKPDANTSASVHQTSANDLLAEASPDITVGEHQYLGRSDDGIGGQVVVRITYVDQQLTNVEVVEQHETGEVGGQAVAELPAKMVAANTYDVDAVSGASVSSRAVKAALSQAEQTVSND >NZ_CP013130.1|WP_003641193.1|290377_290851_+|MarR-family-transcriptional-regulator MSISTEQTILTQLKTIRTKRASTTGEQKWLQQHITEANLRRLLPDISIVGLHLLSELEAGPQTGIDLATNLGVTRGGVTRAAKRLVTQGLIGSFQQPDDHKKIFYRLTPSGRKLARYHDKMHATRNHQAITLLHEHYSPAELAVIQRFLADLTDYEA >NZ_CP013130.1|WP_033611325.1|289639_290269_+|FMN-dependent-NADH-azoreductase MTKLLMINAHPHTTVPSASLTVAASFKTAYQQTHPNDEITTRDLYQDGVPALNDTTFEAWRKQKYGEELTSTEAELLSRHAAWLAEFLAADKIVFVNPMYNHFLPAELKQYLDLTAVARKTFKYTVNGPVGLLPAKHVLHIQAAGGYYHQPDQHNQVEAGDPYLRGMMQLYGIQDYRTIFIEGLDQFPEQREQAITAAQVAAEKLAGEF >NZ_CP013130.1|WP_033611318.1|303311_303980_-|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2 MKFSYASHKEIQLNPGKITTLGTYSSVVYTELIQGMQGLNEQIRVFDDEYNECPLNKSIDWCGDIGCRTIEVNQYLTKLERLISESLTDEDRNQIHDCLSKLYSAVEQQLFLTDLPLEVTYDFDMKHLLKFAKIHFDEKWQTNPYDIIESILKVHQECDIESCVVLTNVTHYLTASQMHELEDSVVATGQSLLLLEFCKMDQRDYYDVGSFNFIDEDFVDWY >NZ_CP013130.1|WP_033611317.1|303976_304282_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MRLMIMFDLPVETAKQRKAYRQFRKSLINEGFLMIQYSVYVRVCVNRKSATFMEQRLKRVIPAEGLIQSLIVTEKQYSEMHFLVGHSVDDVRNTSDRTVIL >NZ_CP013130.1|WP_033611316.1|304259_305165_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGWRSVIITQHAKLSYSAHTMVVQTRDGINQIPLSDISLVVVSTVQAVITSALISELSRQNTKIIFTDKDHRPVSETTCYYPNNRSEALIRGQVNWDTQRQQVLWTKVVAAKIINQIMVLERMSIESDELRTALDELEVNDVSNREAVIARKYFPLLFDRKFTRRDGSTINAALDYGYSILLSTVNQEVVANGYLTYLGIHHSSEQNDFNLSSDLMEPFRPVVDYWIANQRFNEFTPDVKYGLVQLLSLELKFNGQKMLLKNAIASHVRHCLKYLSGEAEQVKIEVVFLDEVPSHAINDNV >NZ_CP013130.1|WP_052048889.1|305396_308045_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MKRREAGEITPWNFNQKVDIKETANRFIKRLTTKDTYLMAEDVLPKESLIYQRFEVLNELNAIRINGRRLSIENKQLAFQQLFVAGKQKSVSIKQFSNFVNSMLKLPNKPKITGFAGQHHFLAKLSTYHDFKQIFGAKADQTNLQSDFEKIVEWSTIFEDRHIYREKLNEIQWLSAAQIDQLVLIRNRGWGRLSRRLLTGLRDEDGQTVLDCLWTTTDNFMGVISKSAFAQAIEDENRTQIKAHGLEDILDQAFMSPQNKKAIRQVLKVVDDIEQTLGCPPQKIMIEFTRNPDKKKQRTTTRLDKVKQAYKAVAEQLAGQSIVTELSQYAQHHSTLSDAYYLYFMQLGRDLYNGEPLNIDSPTLDIDHILPQAFLKDDSLDNRALTEKPINNTKSAVFPAERFGQQKKVTDFWKLLKRCGLMSGVKEKHLYLEPTSVDKWTRSGFIRRQLVETSQVVKVVANLLKDQYQQNQTEIIEVPARLGTQLRRHFDWYKVRVVNDYHHAFDAYLAAFIGNYLYQRYPKLQAYFVYGNFAKIPQSQVMKVEQFNFLHDITENDHIVTDIETGAVLWDDTIRQQMQRVYEYKFMLTSHEAFMKRRALFGQTIYPRRDFKPGTLTPIKQDRSQEMYGGYKNLTAAYMCIVKVQRKQKKPAEYRVVRVTNESLLALQNARSMGIEAYDRCLKQVLVKTNQILRKTKDPNSDPLEFKVLLDHVRYHQLIISAGQKFMLGGYEYKADCMQLVLSNASMKALSTRVVALKEAKDEPLVQVYREILEVVNKYFNLFDDKNFRANLNNFYEEFKELPVTNVYSDTGNKIIQRGQRETLTAILRGLHANMDAVKYTDKGTPFGKFQTLNGIQLAEDSVIQYTSPAGLKVRTVKLRDL >NZ_CP013130.1|WP_081939549.1|308078_309335_-|hypothetical-protein MGRRRWRLGYLNRFFDNEIAKVDENFLPRLKASNRAHRDEKRLFRGALLFPETGDDAYYHEYPTIYHLRYALITRKKQFDIRLIYLALHHMIKYRGNFLDTTPVSAFDAKAIDLTNQFVALNSCYSQLEMDFDFQFDLDHIEQIQKLLLDKQSKKDRANDLNAQLPKLMGNRVADEKRKVITKEFVKALVGNKLDLAKILNLSVSDAKSWQFYMTDEDVDETIANLVDELDENRKQIAQLIQMTYSQVMMYRLLHGNQLLSGAMVERYDQHAKHWASLKKLLPALDESQRAAIIHAYTAYTGHSRTDHVLPADEFGKKVKAILSKYKALDGVTEILQLIDNGEFMPKQRDAVNGVIPHQLHQRELELIIQNQQQYYPFLATKANPRDKETMIEQLLSFRVPYYAGPLIDRDFVKMANR >NZ_CP013130.1|WP_012490951.1|309496_310495_+|IS30-family-transposase MSPYTHLTLKDRECILLGVTLHHTYQVIADQIGCSKATVSREIKRNGGRGAYSAVKAQQNYQQRRLKSRRLRVLENLKLRDFVLHCILQRQWSPEQIAGRLSLENSNWHISYNTIYRGIERNNLGVKRKSHGARGFARKLRHRGKTRKVKGTVNERRGRFNNVPSVHERPVSCENRTRFGHWEGDTVRGKIGRSGLVSLVDRKSRYLLSERVPKVNAKNVTQAMIDLLHTVTPKRVRTLTPDRGTEFAGYREVGKELGISVYFPDPHAPQQRGTNENTNGLIREYFPKGTDLDELTDQDIAKFVRDLNNRPRKVLVWKTPSEVFFGKKLHLI >NZ_CP013130.1|WP_033610470.1|310897_312952_-|hypothetical-protein MGKLKYWGFLLGLLVWGMSVATTTVRADALDEVPAKALNLDGLFEVGQFDKNSASKIAVTNSNGEQAHVFELNHDNNQVGAIWSTPVNRFNMNVDNKITMWVNLAASEGLALVLQNDPRKTAAISRFGTKNIIGENLGVYGTDTYHRKTAPATIAKTAIQKSWALEIDTKVNNGGFLGFYQRGNSFDEKMHKNHLASIYPAAPETYTQRGGLTTAYHFEQNHQAAQERLKVNSGQWYPVKLTWSAKNKTMSYSFDGGPVKIFQIDTQVFGKSFRNLTWGVTSTATANNARALVAFETLPHPIEVESDLNVRNLTQALPVYEGSWVHGGDELEYEYVLSYLSGDNDWQRVEANLALPAHVAFSEANIRYEDGHEEVVGLPEDGEKAAERIQHSLSQALSVNNRHAYITLKGETERVTQDTKVADDISYFVGHEKQSDTPTPYFTITTGKSVGLTVEPIKPVKKGEGATVKGQIRLNDESDFDNEGMRVEVKLNGERLEDYLLDPDEAAGYVELDFDPEELNEGENELVLRARSKDNAVSDPVTVTVLVLNGELRIKSYSENSTFETVKLSGATQISRPQDMQLVIVDETGSNNKWRLDVAATEFKTAQGAKLAGGLYYHDGEQMKPVTENNAQVVVEKRTNVGEDYHVTKDWSAQQGLMIQTSPEAIPGQYQSTIKWTLNSVPGK >NZ_CP013130.1|WP_080474943.1|313162_313726_-|DNA-3-methyladenine-glycosylase-I MERCAWANSSLAMQAYHDNEWGHPQHDSQRLFELLCLETYQAGLSWQTVLNKRAAFDEDFADYNIERVAAMTSADVDRLLTDARIIRHRQKLMATINNARVIRDWPAGDNFADWLWSFVDGHPIRQAWSSIDELPATNALAQRVSKEMKRRGFKFVGPTTIYSYLQATGIINDHVIDCPWAPENRSV >NZ_CP013130.1|WP_033610468.1|313815_317769_-|MMPL-family-transporter MKGSRRRFTIQAIVWLVVMVAAIIFLPNISSLVRDKGQTKLPSSAKSQVAQVIQNHWGRNQNNTRQVVVVFNNGDSPLTSDQKQAIDGTIQRFKVQKSKYHVKSMTAASDNAAAKKQLISKDKSTELLQLMVGKNQTVANMTKNITAGAKTTGVKTYVTGSDILNDDFTQETEAGIQKTEIITVIFIFIVLTLVFRSPIAPLVSLLSVGVSFIISLSVVMNLVDKFNFPLSNFTQVFMVVVLFGIGTDYNILLFDQFKEELSHGDSPVAATGRALKIAGRTILYSGSSLLIGFSALGLANFSIYKSAVGVAIAVAILLVVLLTLNPFFMAILGPRLFWPTKKFAGGSTSKMWHGIAASSVRYPIIALVVVLGVSLPFILTYNNELNYDTLAELNDTIPAKKGFQVVQDHFSKGTAEPSTLYIKTDHALNNEKDLKVIDSLTKQLQKVKGVKTVASVTQPGGSQIDQLYVSDQLSTVTSGMKSASKGLTKIGSGLDSANSKLKSADMDGSAKSAKKLADGADEVSSGLNTLNGKTGTLSSGASQLASGSSSLASGLVTYTNGVYTVNNGLNQLNSKTGTLASGVNQLTTGANSLFSGTNTLSSGLDTLNGYKTKISSGTGTLTSGVSQLQTGATTLTAGLQKMQTSVNSSVSDATSTANTQKLIVLQKGLKELNEAMTPLLSYDSNSLPDVSGITTTATTLEKNSTVVQNDASNLQTALTNLEKVASSNGNVSLSEADIQTVVNAVNKNGGTALTTQQTAALTAALTAVGKQITQKVDSASSSMSSSISSTQTSAQQLKTDLVTMNKTGATLTDDLNELSTLSSELKQLSDLKQLATKSIEANNGSLEVISKLQSAISGMQQIQSGLNGTNGLVDGSQQITTGLNQLQSGASSLASQLNTYTNGVSTAATGATKVNNGASQVSTGLTSLQGQIPTLTSAISALDSGTNQLAANSSTLNSGASQLASGTASLNSQVPTLVSGVSKLNSGASQVASGNEQMYTSIQGLVGQMKTLQDGLKTASDGTTTINKGVGSANSYLTGLKDSAAAKTYYVPKSTLKGKTYKSALKAYMSGNNHATKLTIVLNENPSSKSAMNKVTAIQKQATNTLKGTALDGATIAIGGQTSETNDTQAIASSDFIRTAAIMLVGILIALMVITRSVLQPFYILGTLLLAYIMSLSITRMLSNWFLGQSMLTWNTPFFGFIMLIALGVDYSIFLMMKYREFDNSAATPSTRIVRASAVIGAVVLSAALILSGTFAALMPSGVLTLIQVAMVVIIGLIILVFAIPTIIPSLIRLTYPLTDRMEDESTADKQTKRNRQ >NZ_CP013130.1|WP_021730569.1|317949_318522_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator-C-terminal-domain-containing-protein MVGTKNNRRSQMTERLIQDSLINLLQRQSLDEITVTAVCKAADINRGTFYAHYEDVKDCMEKMEQDATEELLAVIDKHLNPDSLQAILTGIFEVVKKRHAVTSFILTTDQDFLMSFIATTKREILAHNQAPVDGIGNREKEYMFEYYLNGIVGVVRYWLKTGLHESPEELARFINDWWYRGKPVKELADH |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013130_2 | 1292066-1292469 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013130_2
|
4 spacers
spacers of NZ_CP013130_2
>2.1|1292096|66|NZ_CP013130|PILER-CR TGAATTAGCACGTTCAGCGGCTGCAATTAATACGCGGCCAGTCGATAATTCAGCGGTATCAACGGC >2.2|1292192|63|NZ_CP013130|PILER-CR AGCTCTAGCAGCATCTGCAGTGGCCGTTAATGCGCCAAAGGCAGTTAGTTTGGCATCGGCAGG >2.3|1292285|63|NZ_CP013130|PILER-CR AACTCTAGCAGCATCTGCAGCGGCCGTTAATGCGCCCAAAGCAGTTAGTCTGGCATCGGTAGG >2.4|1292378|63|NZ_CP013130|PILER-CR GAGTCTAGCAGTATCTGCGGCGGCTGTTAATGCGCCCAAAGCAGTTAGTCTGGCATCGGTAGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013130_2
The CRISPR arrays of NZ_CP013130_2 >merge|NZ_CP013130|2|1292066-1292469|PILER-CR CCGACGGAAGTGTTTGAACCGACTGATCCTGAATTAGCACGTTCAGCGGCTGCAATTAATACGCGGCCAGTCGATAATTCAGCGGTATCAACGGCTCCTACAGAAGTATTTGAACCGACTGATCCAGCTCTAGCAGCATCTGCAGTGGCCGTTAATGCGCCAAAGGCAGTTAGTTTGGCATCGGCAGGTCCTACAGAAATATTTGAACCGACTGATCCAACTCTAGCAGCATCTGCAGCGGCCGTTAATGCGCCCAAAGCAGTTAGTCTGGCATCGGTAGGTCCTACAGAAGTATTTGAACCGACTGATCCGAGTCTAGCAGTATCTGCGGCGGCTGTTAATGCGCCCAAAGCAGTTAGTCTGGCATCGGTAGGTCCTACAGAAGTATTTGAACCGACTGATCC >NZ_CP013130|2|3|1292066-1292469|PILER-CR CCGACGGAAGTGTTTGAACCGACTGATCCT GAATTAGCACGTTCAGCGGCTGCAATTAATACGCGGCCAGTCGATAATTCAGCGGTATCAACGGCT CCTACAGAAGTATTTGAACCGACTGATCCA GCTCTAGCAGCATCTGCAGTGGCCGTTAATGCGCCAAAGGCAGTTAGTTTGGCATCGGCAGGT CCTACAGAAATATTTGAACCGACTGATCCA ACTCTAGCAGCATCTGCAGCGGCCGTTAATGCGCCCAAAGCAGTTAGTCTGGCATCGGTAGGT CCTACAGAAGTATTTGAACCGACTGATCCG AGTCTAGCAGTATCTGCGGCGGCTGTTAATGCGCCCAAAGCAGTTAGTCTGGCATCGGTAGGT CCTACAGAAGTATTTGAACCGACTGATCC
>NZ_CP013130.1|WP_021731773.1|1290731_1291373_+|DUF4479-and-tRNA-binding-domain-containing-protein MLITSYNPSELGDTLITILRPDTATQTIETHANVTRISDADSGETLGYNFFDVSKTLGDLNANGQVHLTTEQVEQLNNLLKTNDFEPELVLDTDPKFVVGYVESAEAHPKSDHLQITKTNIGSDQPLQIVSGSPNMQADILVVVAKVGAMMPSGLIIWPGELRGVKSDGMIVSGRELHLPNAPQRPGALILPADYQPVGAAFDFKRAQTLFTA >NZ_CP013130.1|WP_003640256.1|1290239_1290563_-|PepSY-domain-containing-protein MNKQLQYGGLLAVGMAGIAGGFSVGGLFKRLRRPTPNQILSQVKRAFLKEAPIEGSWIEMKKSPLQKFALRTDVYYGGITRYEDGQLVQYEFLADANTGSILDIYRL >NZ_CP013130.1|WP_033610649.1|1289461_1290106_+|tRNA-(guanosine(46)-N7)-methyltransferase-TrmB MRVRNKPWAPKLIAAHPELITEDPTQFKGRWQSRFAKSQPLQIEVGSGKGQFIIEMAKRHPEINYVAIEIQTSVIAIILKKLVEAPLPNLQLAHADGQAVTAFFEPHEVDRLYLNFSDPWPKSRHEKRRLTYKSFLSSYREVLKTNGQIEFKTDNRGLFEFSLTSMNNFGMRFEQVWLDLHAVATPEDNVETEYEQKFSVAGPIYKIIATFPAE >NZ_CP013130.1|WP_021731775.1|1288592_1289378_+|phosphotransferase-family-protein MDFELDDGWDVYPIYGNTNKAFMGKKNHQRLFLKRNASPFLAALSMEEITPRLIWTKRISSGDTLTAQEWLNGQTLTKQQMRLPEVAHLLARVHNSELLHRMLRKVGGQSARPQDFIQQYLQDLPDDLRQHPLMARVLSELKGTAPTLPVTDYRVCHGDLNHKNWLLSDRQQLYLVDWDSARFADPASDISMLLCEYVPLKDWQQWFSEYGETMTTALRTRVVWYAKINLLLNIKDNYYRNQYHQMNHEIIFLEELSQYEV >NZ_CP013130.1|WP_033610648.1|1287268_1288474_+|ABC-transporter-permease MNELFQTRLQRHLRRMLRYLRLVFNDHFVIALMFFVGGLGLAYSNWLKSLGPQQTWIIVLLGLLLWIGLSVSHIATLLEPADAVFLLPRERDVHAYFVKAWRYSWWLAQVVQVIFVGLTVPLLMIVDQMTGWSLLALLITQSALKDAQLTLSVTSLYQVSPTIKRWLRPLYWLVALVTLALGLMVTPWLSALIAIVVAIGQRYLHQRIWPTTVVAWRDDINAEANRMLGIYRFFNLFTDVPMVQGSVKRRRYLDWLLRWLPKDQQHAFGYLYTRGMLRGTEFSGLVVRLTLIGAVLLYFSGHGWLAIALDALFIYLIGFQLLPFYKQYDNIVFTHIYPLTTQQRLQNFQRLLRNVLSVTGVVFLIAFWLSNASLAQVGILLVVNVIEIYLLVTWYLKLRLA >NZ_CP013130.1|WP_033610647.1|1286538_1287276_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MALAVQHLIGGYSQIPVLKDISFQVEPGELVGLIGLNGAGKSTTINHIIGLLTPMKGTIALNGVTLAQDPQSYKSQIAYIPETPILYEELTLKEHLEMTMLAYGLDQDQAWRRAHDLLKTFRLDNKLDWFPANFSKGMKQKVMIVCAFITNAKLFIIDEPFLGLDPLAVHDLLALIATVKAQGAAVLMSTHVLDTAEKACDKFVLLHAGEVQTQGTFAEIKTNYPDAGESLNDIYLSLTGVTRDE >NZ_CP013130.1|WP_021731778.1|1285889_1286342_-|HIT-family-protein MTAFEPKLDDDCIFCKIIKGDIPSYTVYEDDMVKAFLDISQGTPGHTLVVPKTHVADIFGYDRDLASIVFARIPEIARAIKASDDNIIGMNIVNNNGAVAYQSVFHSHFHLIPRYSDKDDFRMIFKDNAKKYDETDYTRLQNAIKTELAH >NZ_CP013130.1|WP_021731779.1|1285537_1285879_-|hypothetical-protein MAKFIRNGLIGLGLSATAYMLINQKTPKALYTDIKSYVQEVLDAADDLQDAREEFSDAQRNLSVQMAHAAEVFDDIQTELDKFQFKIEPHMAIMKTRADHLQATLDHLTNTPD >NZ_CP013130.1|WP_033610646.1|1284406_1285303_-|peptidylprolyl-isomerase MKKWLIALAGVLLTFTLAGCGSKTVASTSGGKITESQYYSSMKGTSSGKQVLQQMILNKVLEKDYGSKVSTKQVTKQYNTYKSQYGSSFSTVLSQNGLTTKTFKEQLRSNLLLKEAVKDKVKITDKALKKQWKSYEPKVTVQHILVAKSATADKVLDALKKDSSQANFAKLAKKYSTDTTTKNDGGKLSAFDNTDTTHTSKFLTAAFKLKNGEYTTSAVKTSDGYEIIRMIKNPGKGKMSDHTADLKKQIWDNDMSDSTVLQSVVSKVLKGGNVSIKDSDLKDILSSYLSTSSSSSSN >NZ_CP013130.1|WP_033610645.1|1282984_1283689_-|WxL-domain-containing-protein MKKTVITATMLLSLLGMPAVMATADSIARTDTNLELTENTGPTVPVDPTNPANPQDPADPDNPATGNMGALTLDVAPKTFNFGSVQTYAAEHTYEATTTDSGHQYLQVTDNRGTDEQGWAVTVEQDQDLTETAESGTHVLTGTTIHVPTGIARNSLASSSVDPDTNLDVKTADVTNTSGAVTVFSTTTTPSAGKGTSVKAWNPTDVTLTIPQNTAKPGTYTNTLTWTLTAATTS >NZ_CP013130.1|WP_021731771.1|1294454_1295765_+|UDP-N-acetylmuramate--L-alanine-ligase MDKATVYYFVGIKGSGMSSLALILHDKGYQVEGSDIEQYTFTQKGLAAAGIKMLPFSEANIREGLTVIAGNSFTDDHPEIKKAREMGLPVYRYHEFLGKLMEGFTSIGVAGTHGKTSTTGLLSHVLSHIAPTSYLIGDGTGKGTPDARFFVFEADEYRRHFVAYHPDYAIMTNVDFDHPDYYKDLADVQAAFQQFGNQVKKGIFAWGDDESLRNLDVDTPIYYYGTNDRDDFQAVNIKRTTKGSSFEVKYHDESLGEFEIPLFGEHNVLNSTAVIAVSYFEKVNLDEIRRELLDFSGVKRRFSEQQVGDMVMIDDYAHHPSEIKATLDAARQKYPDKEILAVFQPHTFSRTKALMDGFAASLSKADHVFLTNIFSSAREKSGDVSSKDLAAKLPNGGEIITTDDMSALTAYHNAVAVFMGAGDIQKYEKIYKDQMK >NZ_CP013130.1|WP_011101416.1|1295953_1296118_-|FeoB-associated-Cys-rich-membrane-protein MALFINFLIIALIIGAAGYQIYRVVKRAKKGKCAACDYDCEAKKMLNKAQKQQN >NZ_CP013130.1|WP_033610652.1|1296134_1298123_-|ferrous-iron-transport-protein-B MTTVALLGNPNTGKTTLFNELTDKYAYVGNWTGVTVEKKMGRIRHSEVEMVDLPGVYSLNPITKDEAVVTNYLLHNHPDLILNVTNASQLKRNLLLSIEVLEFGAPVIIALNMIDDLKRTGHYYDFDTLAEQLGCQIKATNARNKEGLNQLREDLLAGPHPAATPLKLNYPFMIEQAIRQASQQLIKKFDLTADFARWLTIQFINQNKPIRAYAKHMGLTPLTSQAAYYDAQKFDEQIFQTRLDFIEQTLASASQNLASSSHVEMTAKIDKWVTNPFLGLPVFVGIFYLMFKLSFDWVGTPLSDLLDSFVSGPLSSTVSHWLTMAGAIPVLRSLIVNGLIAGVGGVLVFIPQIFVLFACISILEDSGYMARAALVTDRLMQMIGLNGKAFIPLIIGFGCNVTGIMAARTIEQPKERLITTLISPFMSCSARLPIYSLFVAAFFPKNQALIVLSIYFLGIAVALGMAKFYQLIFNVDDSSVFIVELPQYHIPRVDIIWRGTWDKGKGFIKKAGTIIFAGTVLIWLLSSFGTSGLVSDIDNSFAATLGKTLLPLFAPLGVTAWQVISALFTGILAKEVISSSMMVMFHSANQAGLIAMMGRFFTPLSAYAMLVFILLYVPCFATIGTIKSETGSTKWAVYAVFSSLVIAYTLAFVIYQVGQLFI >NZ_CP013130.1|WP_021731769.1|1298124_1298349_-|ferrous-iron-transport-protein-A MLSQSVTNTSQLHIQQFTGLDNQTVQRLHSLGLHVGSPLAVIRYYPFHGPVIVQIDQQRIGIRYTVFQTLIGGH >NZ_CP013130.1|WP_033610653.1|1298604_1299402_+|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC MATLEVKDLHVEVTDDEQQKSREILKGVNLSMKTGEIHAIMGPNGTGKSTLSQTIMGQPAYHVTQGDILLNGESIVNMPVDERARKGLFLGMQYPAEIQGVTNAEFLRAAMNARRPADDQISVMAFLKELDKNLALLNMSESMTERYLNEGFSGGEKKRNEILQLLMIKPSFALLDEIDSGLDIDALQVVSKGVNSMRGDNFGSLIITHYQRLLNYIVPDVVHVMMGGRIVKTGNADLAKTLEKEGYAGLRDDLNIDVKLVDDED >NZ_CP013130.1|WP_033610654.1|1299413_1300715_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD MEATADYETIKTTLAAAANEHGEPHWLVERRLAALDAMQGLTVPKADRFSIRDWPLTPTDQPLKFSRSDRTLATDVTAEAGHIQIVQVGQTTVTVNLPDELDEQGVILTDMFTAFREHPQLTEKHFMGKVVKTDEDRLTSYHTAFLNAGVFLYVPKGVTVKEPIEITTIQDSTRVQPLISHVLIVAEQDSHFAVTQHLTTKGDVDNIANCVVEILARADSEVHFSAFDELGANTTAYLNRRAAISRGAKVDWAIGMMNNGNTFGDFDSELIGEGAKSDAKVITVTTKAQDVCVNTRVTNRGKKTDGNIVQRGVIMEKSNLIFNGIGHIIHGASGAHAEQENRVLMMSDDAHGDANPILLIDENDVLAGHAASVGQIDQNQMYYLMSRGIDKPQAQRLVIRGFLSTVIGAIPSKTVRTRLTNTIERKLEDGIQF >NZ_CP013130.1|WP_033610655.1|1300698_1301937_+|cysteine-desulfurase MASNFETLRSDFPILDQQVNDERLVYLDNAATAQRPNQVVDALVHFYQHDNANVHRGVHTLAERATSQYEAARAKVQRFINAAKTDEIVFTKGTTDSLNLIASTYGEANIQAGDEIVISIMEHHSNLIPWQQLALRKHATLKYIELTATGELDIADAANKITDRTKIVSVTHASNVLGTVNPIKALARLAHQHGAVMIADGAQAAPHMPVDVQALDVDFYAFSGHKMLGPTGIGVLYGRENLLATMPPYQFGGEMIGFVHRNDSTWAELPWKFEAGTQNIAGAIGLGAAVDYLTQLGMDQVQQHEQQLVNYLLPKLIAMPGVTVYGPQDPQHHTGVIAFNIDGLHPHDAATALDMEGVAVRAGHHCAQPLMAALGLVATARASFYIYNTQADADQLLTSLQATKEFFEHGTV >NZ_CP013130.1|WP_033610656.1|1301923_1302391_+|SUF-system-NifU-family-Fe-S-cluster-assembly-protein MGLSKLSGLYREVILDHGDHPHHKNALPNATHAITLKNPTCGDVINLAIQLDEHDQIEDIGFTGEGCTISQASASMMTDAVMGKSKEQALAMAKTFSDMAIGKQHPQADMDALEDAAILSNIMQFPARIKCATLAWWALQRALLAENGNEEESEV >NZ_CP013130.1|WP_033610657.1|1302387_1303794_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufB MSEVPDVVKNDRDYEYGFHDDVKPAYSTGRGLTEATVREISAAKHEPQWMLDYRLNAYHEYLKMPLPKFGPDLTKLDLKNMLYYQKMTDKKFRDWKEVPADLKRTFDRLGVPEAERKYLAGSSAQYESEVVYHNMRKDFEKLGIIFTDTDTALHDYPELFKKWFGKLVKPTDNKFAALNAAVWSGGSFIYVPKGVQTKTPIQSYFRLNAENSGQFERTLIIVEDGASVDYVEGCTAPNYSSDSLHAAVVEVNVEPDAYCRYTTIQNWSDNVYSLETKRAAAAENATMEWVDGNLGSKVTMKYPSVYLNGEGARGTMLSIAVASNGIHQDSGARMIHNAKNTSSSIVSKSIAKTGGATDYRGTVRFAKHSDGSKAHVECDTIIMDDQSSSNTIPYNEIDSANVAMEHEAKVSKISEEQLYYLMSRGISEAKATEMIIMGFVEPFTKQLPMEYAVELNRLISFEMEGSIG >NZ_CP013130.1|WP_033610658.1|1303810_1304881_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKTRRILLGLALIIGLSVGAGCRSTASKSKTTNASQSATTRMVTDMADTKVNVPTKVTRVADLWHANNQVVLLLGGQKKLVATTQMIKQSPWFKTIDPGISKVTAPFAGDDLQTEELLKAKPDVVIAADAAQVKQARKAKIPTVNAMYQTFAGLRQSVNLTAQVLGGTAPKIAKAYQKTLTNNLNDVKTRLKGVTSKPKVLHFVNATNLNQVDGTGTIVNEWIKAAGGQNALTQKGNMISVTTETLAKSNPDVIIVGSATTAEARAALKKNAVLSKLTAVKKNRVYGNPQGTFPWDRYSAEEALQVLWAAKKLHPDQFQDLNMVAKTKAFYQQFYHYQLSTAQANRLLNGASSPK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013130_3 | 1344198-1344530 | TypeI-E |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013130_3
|
5 spacers
spacers of NZ_CP013130_3
>3.1|1344226|33|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT TCTGCCTCCAATAGATCCGGGTTCTCGTGCACG >3.2|1344287|33|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAAAGTCAACCGACGGGACTGGGACTTTCAACA >3.3|1344348|33|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTGAGTTTAAGACTGTGTCTCTATTTCTTCGTA >3.4|1344409|33|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGGACAAGGCGCTGGCTGATGCGTATGGCGTCA >3.5|1344470|33|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTGTCGACACGATTCTTAACCTCAGCCAGCAAG |
cas1,DEDDh,cas3,cas8e,cse2gr11,cas7 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013130_3
The CRISPR arrays of NZ_CP013130_3 >merge|NZ_CP013130|3|1344198-1344530|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAATCACCCCCGCATATACGGGGAACAGTCTGCCTCCAATAGATCCGGGTTCTCGTGCACGGGATCACCCCCGCATACACGGGGAACAGTAAAGTCAACCGACGGGACTGGGACTTTCAACAGGATCACCCCCGCATACACGGGGAACAGGTGAGTTTAAGACTGTGTCTCTATTTCTTCGTAGGATCACCCCCGCATACACGGGGAACAGCGGACAAGGCGCTGGCTGATGCGTATGGCGTCAGGATCACCCCCGCATACACGGGGAACAGCTGTCGACACGATTCTTAACCTCAGCCAGCAAGGGATCACCCCCGCATACACGGGGAACAG >NZ_CP013130|3|2|1344198-1344530|CRISPRCasFinder GAATCACCCCCGCATATACGGGGAACAG TCTGCCTCCAATAGATCCGGGTTCTCGTGCACG GGATCACCCCCGCATACACGGGGAACAG TAAAGTCAACCGACGGGACTGGGACTTTCAACA GGATCACCCCCGCATACACGGGGAACAG GTGAGTTTAAGACTGTGTCTCTATTTCTTCGTA GGATCACCCCCGCATACACGGGGAACAG CGGACAAGGCGCTGGCTGATGCGTATGGCGTCA GGATCACCCCCGCATACACGGGGAACAG CTGTCGACACGATTCTTAACCTCAGCCAGCAAG GGATCACCCCCGCATACACGGGGAACAG >NZ_CP013130|3|2|1344198-1344530|CRT GAATCACCCCCGCATATACGGGGAACAG TCTGCCTCCAATAGATCCGGGTTCTCGTGCACG GGATCACCCCCGCATACACGGGGAACAG TAAAGTCAACCGACGGGACTGGGACTTTCAACA GGATCACCCCCGCATACACGGGGAACAG GTGAGTTTAAGACTGTGTCTCTATTTCTTCGTA GGATCACCCCCGCATACACGGGGAACAG CGGACAAGGCGCTGGCTGATGCGTATGGCGTCA GGATCACCCCCGCATACACGGGGAACAG CTGTCGACACGATTCTTAACCTCAGCCAGCAAG GGATCACCCCCGCATACACGGGGAACAG >NZ_CP013130|3|4|1344259-1344530|PILER-CR GGATCACCCCCGCATACACGGGGAACAG TAAAGTCAACCGACGGGACTGGGACTTTCAACA GGATCACCCCCGCATACACGGGGAACAG GTGAGTTTAAGACTGTGTCTCTATTTCTTCGTA GGATCACCCCCGCATACACGGGGAACAG CGGACAAGGCGCTGGCTGATGCGTATGGCGTCA GGATCACCCCCGCATACACGGGGAACAG CTGTCGACACGATTCTTAACCTCAGCCAGCAAG GGATCACCCCCGCATACACGGGGAACAG
>NZ_CP013130.1|WP_033610695.1|1342665_1343928_-|replication-associated-recombination-protein-A MAFKTPLADQMRPQSLDQMVGQQDLLKSGQPLRQIIDQHVNIPLILWGPPGTGKTSLAQIIASQDDYPFVAFNASTENKAQLTKAIAQYPNQSFVLLIDEIHRMTKTLQDFLLPYLENGHVMLIGSTTENPIMSIVPAIRSRCQIFEFQPLSDTDIEIALRRAVTDIYELTDDQVDTQALNLIAISAEGDLRIALNILETLHAIDQHQITVAAVQNFAKQQHFSYDRKATKHYDYLSAYSDSMAGSDTDAALYYLTILLKNDDLPSVVRRLREIPYTYIGLANPEQVTQIVVAANQAEKIGMPKAKYPLMFATMLMCISPKSGSFDQSWEKLDQDTQNPSQHPMPRGLRDMHYKHSEEITGGGLIDNPFQMPHQIAQQNYMPKGLAGRRYYSPKDNENERKLGAQYLKLHRFIYDEDYHE >NZ_CP013130.1|WP_033610694.1|1342188_1342500_+|hypothetical-protein MATVLPKAVRVWMGANILQIEFDNGEFRYLRTHFIDDYISAWSPKKGKGKRRNLWLMPSWEWLGANARIEPDGTVVLFEKDVYTAQELWHNSVTRIDLVSGVH >NZ_CP013130.1|WP_021731729.1|1341581_1341938_+|50S-ribosomal-protein-L20 MARVKGGTVTRKRRKRILKLAKGYRGAKHIQFKVAKDQVMKSYEYAFRDRRRRKSDFRRLWIARINAAARINDISYSQLMHGLKLANVDVNRKMLADLAVNDADAFKALVDTAKKALA >NZ_CP013130.1|WP_003638526.1|1341350_1341545_+|50S-ribosomal-protein-L35 MPKQKTNRAAAKRFKVTAKGKIKSANAFTSHRFHGKTKKQRRQLRGTAIIEKPMVKTYHKLLQK >NZ_CP013130.1|WP_003640278.1|1340828_1341329_+|translation-initiation-factor-IF-3 MVNDGIRAREVRLIASDGEQLGVKSRQEAMQIAEDASLDLVLVAPKAKPPVARIMDYGKYRFEQQKKDREARKKQKVVSIKEVRLSPAIDTNDFNTKLKHAEKFLSKGDKVRVSIRFKGRAITHKDIGRQVLNRMIEATKEFSTVEAYPKMDGRSMFLVLAPKTDK >NZ_CP013130.1|WP_033610693.1|1338620_1340585_+|threonine--tRNA-ligase MASINVKFPDGAEKQFDAGVTTEAIAKSISPSLAKRSVAGKFNDQIVDYRQPLTTDGSIEIIAADSEDGLNVLRQTAAQVLANAVKQLFPNIHFGSGEGNANGFFFDTDNPDEDGKQVSEDDLEAISDKMAAIIKQDLPIEREVLSKADALALVGDNPYQQDLVNERAAANNDQVVVYKQGDFVDLSDGAQLASTGKVKVFKLLSVAGAYWQGKSSNPMLQRIYGTAFLKQKDLDADLKRRQEARERDHRVIGNELDLFFVDPKVGNGLPYWMPNGATIRRQIERYIIDKEVANGYQHVYTPVLANLDVYKQSGHWDHYREDMFPPMDMGDGEQLELRPMNCPSHIQIYNHHIRSYRELPLRIAELGMMHRYEKSGALTGLSRVREMTLNDGHTFVAMDQIEEEFKKILSLMVEVYEDFDISDYRFRLSYRDPENKEKYFDDDAMWERSQKMLKSAMDDMGLDYFEAEGEAAFYGPKLDVQTKTALGGEETLSTIQLDFLLPERFDLKYVGADGEEHRPVMIHRGLVSTMERFVAYLTEIYKGAFPTWLAPKQVTIIPVNNGAHGAYAETVRRRLAAEGVRVSIDDRNEKMGYKIRESQTKKVPYLLVVGDQEVANGSVSVRKYGEERTESEAVDMFIGAITQEIKHYSRGASK >NZ_CP013130.1|WP_033610692.1|1337352_1338288_+|primosomal-protein-DnaI MENISETLRTLMNRKNLNHRYEALMTAVYQDPDVRQFLAAHQNELSSDALERSAAKLYEFCEEKRKIARHEPTQAPGYQPALVMSNHLIDIAYQPTPQLQEQQAAHELQQRVRSISMPKNIQTADLKTYDQDGDRATALMAALDFIDAYTQAPKRFHRGLYLYGSFGVGKTYLLGGMANALAAKGFNTTLIHFPSFAVEMKRSISNNTSADKVDAIKRAPILMIDDIGADSSSTWIRDDVLGVILEYRMQEELPTCFSSNFSMQELQDGYLTLSQKGDEEPVKAQRIMQRVRYLASEIEMVGRNRRLNPDA >NZ_CP013130.1|WP_033610691.1|1335945_1337349_+|DnaD-domain-protein MPNDEPLTPKTGLVVPQAPALSAAQQAVLAELYLPLMGPLAYSLYAALRSLQSSENELSNRRSHAELLGILNVDLPTVLAARRKLEATGLLRSYYQQDELGVVYIYQLQAPLLALQFFADDLLSVLLLDTVGELRYQQLASDFSAQPIDLTAAKDVTANILDVFHVDSQKVTTPPLSVQKVRAQLAANEPAEDHSPVLSDDDFDWQLLGQILKQNYVDLKQVASSRQLIITESRVYGISEIEMAKLISEVASLTTGQFDENQLKLLIARRYERPAVSSQQVATEAPVATTATKDTKTSAQLSTAEQQLVTYAKQAAPYEFLTALKQEKHGFVTSGENRLVHDLIGRGVLPNAVINMVIYYLLQNRELAALNRNLLETVANDWQQHGITTPEAALIYLRQRKQPKSTPTRRKNNRPTRKEIMPKWAQQQQQTERGKQPAQTGKQITAAQRKQLADRLAKLETNSEKED >NZ_CP013130.1|WP_033610690.1|1335408_1335924_+|transcriptional-repressor-NrdR MQCPHCHHNGSRVVDSRPTDDGRVIRRRRECENCGFRFTTFERVEATPLLVIKKNGAREEFNREKVLRGIIRSAEKRPVSMETMTGVVDDVENKVRSLGENEISSQVIGEYVMEQLADIDEISYIRFASVYRQFKDMHVFLNELQDMMERDKVKLAKPSAKTAHAPKRKKD >NZ_CP013130.1|WP_033610689.1|1334773_1335367_+|dephospho-CoA-kinase MTKLIGLTGGIATGKSTVSKLLAAKLPIVDADKIAWQVEGPGQPTTQKIAAYFGQQAVLADGQLNRPWLGQLVFNDPQALQALTAITRLPIQYAMFEAIVAANQHQPAAIILDIPLLFESGWQHICDQVLVVTAPPTVVLQRLMARNHLSQQAAQARIDSQMPLAQKVAQADVVIDNRANIDKTKAAVLKWLKTITN >NZ_CP013130.1|WP_033610696.1|1344749_1345781_-|zinc-binding-alcohol-dehydrogenase-family-protein MHAIGFTDHLPIENPASLQDVTITKPTPHGHDILVQIQAVAVNPVDVGVRKTGHEHLTRPKILGWDATGIVTAVGKAVTLFQPGDRVFYAGSFNRPGCDSAYHLVDERLVGHAPKTLTPAACAAMPLTSLTAYEALFEQLHISFDPAKPNFQKRNQTILIINGAGGVGSIATQLAKLAGLTVISSASRPESITWTQQHGADLVVNHRHDLVREVHALGIKDVDYILGLSDLDSHWDEMCALIKPGGHIASITENRRPIDLKKLTKKRGTFAWEWMYSKSYYHTADMISQHYILDTIANLLDHDLLKSTLSQTLQPINALNLRQAHQLIEQHHMIGKVVIEGWE >NZ_CP013130.1|WP_033610697.1|1345943_1346291_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MQRQIYDCAAGCPVESTLQVIAGKWKSVILYHLLTTGTCRFSTLKKRLSGCSRRMLARQLQEMLQDGVIAKRVYPVVPPKTEYWVTPFGQTLKPVIMAMEAWGRQYNSVNGNIIS >NZ_CP013130.1|WP_033610698.1|1346686_1347436_+|aspartate/glutamate-racemase-family-protein MENCFGIIGGMGTMATEDFVHTVNRLTVTHRDQDYLNYVVLNDAQIPDRTAYILDHNCTNPLPSLKTDVQLLNRLGAKFIVMTCNTAHYFIPALTAITNVPILNMPALAVEAACQLQQPRPLRIGILATTGTLKSQLYQQLIRANGHMPVVPTGQQQAQVMALIYEDIKQHDYVDRVKFHGLIDQLLNAADCDVVILGCTELSVAQDAAPYGSERVIDAQYELARVTVQCAQAAKPTMILQRQQSMNGY >NZ_CP013130.1|WP_033609918.1|1347974_1348940_-|IS30-family-transposase MTYTHLTIDELATIYSFWKLGKKAYLVAPALHRSAETVYRIYRFLDAGGTIIDYQCHYRKHKQHCGRKPIQLRPDELAYIQAKTQAGWQPDTIINRQERAFSCGVRTLYRLFKRGVLGLSTKDLPMHGKRHPNGYIERRGKAGQLGRDLKNRYQDYPNFNQEFGHLEGDTVQGKNHQGAVTTLVERQTKVAIVLNSHTKSAHDVNRSLAGWLSKLPRHLFKSITFDNGKEFAGWRTIANQFDLNIYFAAVGAPNQRGLNENTNGLLRKDGLRHNLIMDQLSDRFVQAVASRRNHIPRKSLGYQTPLEAFISQITDEQLKNF >NZ_CP013130.1|WP_033611678.1|1349753_1350704_+|type-I-E-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKSGAKKPELSELSRIHDRLTFLYLEHAKLDRQDSAIRVSDARGVVFVPAAIISVLMLGPGVDVTHRAMELMGDAGMAVVWVGERGVRQYAHGRALNHSSRLLEAQARLFSNQRSRLTVARKMYQMRFPNDDVTTLSMQKLRGKEGARVRQVYRLESERTGVSWTRREYNPDNFEASSPINQALTAAHQALYGLSYSVIMAMGASAGLGFVHTGHDLSFVYDFADLYKAETSIPVAFDIVAASTADEDIARSTRLAMRDVFVDGKLLRRMVSDLKSILGVSDTTTEVSNLSLWDDRLGLQEFGVQYHETEVGGIK >NZ_CP013130.1|WP_033611680.1|1350700_1351591_+|type-I-E-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas2 MIVITLTKVPNALRGDLTKWYQEIQTGVYVGNVSARVRDSLWLRIVENIGRGEATMVYNANNELGYQFKTTRHDHQVVDFDGIPLMMHLVAGQSVEKHGYSNAAKFHKARMMTRKVQRQQSHYSDEPVVAVDIETTGLDPSKDVIISIAAVKSIPDGQTSEFSRLIKIDRLLPQKIVELTGITRDMLNEEGVSIVMALSEMKVFIGNSVIVGYNFHFDEMFLKQALIEKDIEGLTNQTTDLMPIVKRTNIFLDNYRLSTVLAAYQIVNLRPHNALSDAKATLALAHKLIKDGSLNI >NZ_CP013130.1|WP_033611681.1|1352777_1355525_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MTEFSRLAQSLWAKKCSDDGQRRWLPLIVHLKDCENTINWLFNHWLSDGQRQQLSEVTSEEDVQRLVKFLGFTHDIGKATPAFQTKPAYNGDHQLDQLLIEQLMQNGFQDLASLNLSSARESPHALAGEAILESFGVNPTVGAIIGGHHGKTASASPKRQIKDYTANYYQNDNQPGLQIAWQQVQRELVAYGLHTAGYQTTAEIPTLNQPEAVILTGLLIMADWLASSEYLNENPDKPLFPLVTTMQSVTDIDLQARFRDAITTWQSDDEWVPAPLAHDRDPYQVRFGFHARPVQAAITNALGATSDPGMAIVEAPMGLGKTEIALIAVEQLARMTGRDGVYMGLPTQATTNAMFARVNDWLERVADEQSARLSIKLMHGKAQFNQMYKRLPNASNVNSTDEHDGAVTVNSWFGGKKSILTKFTVGTIDNLLLMGLKQKHLFLRHLGFSGKVVVIDEVHAYDAYMNKYLLRAIEWLGAYHVPVVILSATLPKTKRNQLLKAYLKGKYGRRYHQILKVAPTGWEDTQAYPLLSILDGPDIKQLTNFEGQSDQTALTLEVQRNNQDDQELIMTLLKQLSQGGIAGIIVNTVKRAQDLAALISAEVPLMVLHSAFLAPDRAQQEMKLQAAIGKHGERPAKLVVIGTQVLEQSLDIDFDILYTDIAPMDLILQRAGRLHRHQMIQRPHNFQQPQLKIMGIKGFGDYGAGNEAVYGKYLLMKTDYFLKNQIKLPDDISTLVQQVYDSATDTQVPEITTAAEDFATDLKAEQQKAQVFQISAPQLKHGKSIHGWLDRNHRDIVTDQQASAAVRDIQETLEVILIQHMNQDDFLLDGRKLDEVASTEIAQQTLRLPVAVTPNITKAINQLEDLTRPYHARWQDDIWLRGVLVLPLDQKLTAEFGKWRLSYSSQLGLSYSKEE >NZ_CP013130.1|WP_191980459.1|1355530_1357261_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse1/CasA MTMQTFNLTTDPWIVVIDARTNQEVTVSLIELFQNAQYYRQLAGDMRAQDLAILRLLLAILTTIYTRYNADNQAYEWLTVDDMAKVEHVDEDYEIDEIHDDLKQTWADLFASGHFSTIVTDYLQGHAGQFDLFGDQPFYQVTASAYDEFVPETKSVARSKRTGKPTGQVAVRQMNRRISESGNSVALFAPKVNETKNDLTLAELVRWLIMYQNYTGVTDKTKINSDEKFSNGAGWLYRLNPVYASGRSLFEILMLNLILIPTASDGQYIVQQPVWEHATLTAYLQERQRQQVPDNLAALYTTWSRLLHLEWDDQQRPTIYSAGIPMFDTEDALIEPMTLWRQDKKTSRFRPAVNGIKYMGKAMWRNFGQYVNVNHSDDIHEAGIVAWLHYLKTEGLVADDQQLWLASTALISDGNMSSQMPATEVYDDMQIQADVLFDEATADYWPVRIEDIIELTQKIGDGYYHFAATVGQIRNIDAKQFAQRHSVQFYAGLNRPFKEWLASLTGDDDRDAKIDEWRQTLQQITLQAASAIMATSSSRDVRGIVERDKNNVLRQVNIFTANNQLRRLVFTQLSGK >NZ_CP013130.1|WP_033611682.1|1357274_1357880_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse2/CasB MESKIQSATISIIRQLYNNGNLNKGVLANVRHATALTSPQAQTLWPVMMAHLERNMLSQDGQPTKAEVAVYTAIRFYAIQQQGTESLVYGPANPHADVKDQGMPLFRALASLRRNEETRVALDRRMQPLLATTNVASIINALTHLVSMLKANNQLQKIDYARLAQDLYWFQQDYEHASQVRLQWGQQYYRPLTATTEGKKN >NZ_CP013130.1|WP_033611683.1|1357879_1358959_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cse4/CasC MTTNNLYLDIHVIQTVPSSNINRDDTGAPKTALYGGVTRARVSSQSWKRAVRQSFKDDTVTVGFRTKAAAQLLKQALQKLTSELDDDDAWEQVNAVFKLAGVKLDKDEETSALLLVSPGQIDQLAQYVTDNADGELDKKAIKAVLKGNQSIDLALFGRMVADNPELNVDAAAQVAHAISTHEVVPEFDYFTALDDLQPEDSTGAAMLGTLEFNSATLYRYANVNVNELIANLGETAAIDGIREFVKAFVLSMPTGKQNTFANKTLPNYVMVTLRPDTPVNLVSGFEDPVSSKTGYVKQSIQQLTAAYQAALSFVEKPLLNVDLGANESQVATSADNLTDLLEQLATELTKVVKDENGND |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013130_4 | 1349145-1349418 | TypeI-E |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013130_4
|
4 spacers
spacers of NZ_CP013130_4
>4.1|1349173|33|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT ACAAACGAAATCCGCGAGTTGAGGTAGAGGAAG >4.2|1349234|33|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT GCGATTAGCCATGACACTTATGAAACATTGTAA >4.3|1349295|33|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT TCAACGATAATAAGCCGTGGGTCTGGCAACGTG >4.4|1349356|33|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT GCTGATGCCGTTAGCGCGTTCCTTGATATCACA >4.5|1349236|31|NZ_CP013130|PILER-CR GATTAGCCATGACACTTATGAAACATTGTAA >4.6|1349297|31|NZ_CP013130|PILER-CR AACGATAATAAGCCGTGGGTCTGGCAACGTG >4.7|1349358|31|NZ_CP013130|PILER-CR TGATGCCGTTAGCGCGTTCCTTGATATCACA |
cas1,DEDDh,cas3,cas8e,cse2gr11,cas7,cas5,cas6e |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013130_4
The CRISPR arrays of NZ_CP013130_4 >merge|NZ_CP013130|4|1349145-1349418|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATGGATCGCCCGTGTACACGGGGAATAGACAAACGAAATCCGCGAGTTGAGGTAGAGGAAGGGATCACCCCCGTATGCACGGGGAATAGGCGATTAGCCATGACACTTATGAAACATTGTAAGGATCACCCCCGTATGCACGGGGAATAGTCAACGATAATAAGCCGTGGGTCTGGCAACGTGGGATCACCCCCGTATGCACGGGGAATAGGCTGATGCCGTTAGCGCGTTCCTTGATATCACAGGATCACCCCCGTATGCACGGGGAATAGAC >NZ_CP013130|4|3|1349145-1349416|CRISPRCasFinder ATGGATCGCCCGTGTACACGGGGAATAG ACAAACGAAATCCGCGAGTTGAGGTAGAGGAAG GGATCACCCCCGTATGCACGGGGAATAG GCGATTAGCCATGACACTTATGAAACATTGTAA GGATCACCCCCGTATGCACGGGGAATAG TCAACGATAATAAGCCGTGGGTCTGGCAACGTG GGATCACCCCCGTATGCACGGGGAATAG GCTGATGCCGTTAGCGCGTTCCTTGATATCACA GGATCACCCCCGTATGCACGGGGAATAG >NZ_CP013130|4|3|1349145-1349416|CRT ATGGATCGCCCGTGTACACGGGGAATAG ACAAACGAAATCCGCGAGTTGAGGTAGAGGAAG GGATCACCCCCGTATGCACGGGGAATAG GCGATTAGCCATGACACTTATGAAACATTGTAA GGATCACCCCCGTATGCACGGGGAATAG TCAACGATAATAAGCCGTGGGTCTGGCAACGTG GGATCACCCCCGTATGCACGGGGAATAG GCTGATGCCGTTAGCGCGTTCCTTGATATCACA GGATCACCCCCGTATGCACGGGGAATAG >NZ_CP013130|4|5|1349206-1349418|PILER-CR GGATCACCCCCGTATGCACGGGGAATAGGC GATTAGCCATGACACTTATGAAACATTGTAA GGATCACCCCCGTATGCACGGGGAATAGTC AACGATAATAAGCCGTGGGTCTGGCAACGTG GGATCACCCCCGTATGCACGGGGAATAGGC TGATGCCGTTAGCGCGTTCCTTGATATCACA GGATCACCCCCGTATGCACGGGGAATAGAC
>NZ_CP013130.1|WP_033609918.1|1347974_1348940_-|IS30-family-transposase MTYTHLTIDELATIYSFWKLGKKAYLVAPALHRSAETVYRIYRFLDAGGTIIDYQCHYRKHKQHCGRKPIQLRPDELAYIQAKTQAGWQPDTIINRQERAFSCGVRTLYRLFKRGVLGLSTKDLPMHGKRHPNGYIERRGKAGQLGRDLKNRYQDYPNFNQEFGHLEGDTVQGKNHQGAVTTLVERQTKVAIVLNSHTKSAHDVNRSLAGWLSKLPRHLFKSITFDNGKEFAGWRTIANQFDLNIYFAAVGAPNQRGLNENTNGLLRKDGLRHNLIMDQLSDRFVQAVASRRNHIPRKSLGYQTPLEAFISQITDEQLKNF >NZ_CP013130.1|WP_033610698.1|1346686_1347436_+|aspartate/glutamate-racemase-family-protein MENCFGIIGGMGTMATEDFVHTVNRLTVTHRDQDYLNYVVLNDAQIPDRTAYILDHNCTNPLPSLKTDVQLLNRLGAKFIVMTCNTAHYFIPALTAITNVPILNMPALAVEAACQLQQPRPLRIGILATTGTLKSQLYQQLIRANGHMPVVPTGQQQAQVMALIYEDIKQHDYVDRVKFHGLIDQLLNAADCDVVILGCTELSVAQDAAPYGSERVIDAQYELARVTVQCAQAAKPTMILQRQQSMNGY >NZ_CP013130.1|WP_033610697.1|1345943_1346291_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MQRQIYDCAAGCPVESTLQVIAGKWKSVILYHLLTTGTCRFSTLKKRLSGCSRRMLARQLQEMLQDGVIAKRVYPVVPPKTEYWVTPFGQTLKPVIMAMEAWGRQYNSVNGNIIS >NZ_CP013130.1|WP_033610696.1|1344749_1345781_-|zinc-binding-alcohol-dehydrogenase-family-protein MHAIGFTDHLPIENPASLQDVTITKPTPHGHDILVQIQAVAVNPVDVGVRKTGHEHLTRPKILGWDATGIVTAVGKAVTLFQPGDRVFYAGSFNRPGCDSAYHLVDERLVGHAPKTLTPAACAAMPLTSLTAYEALFEQLHISFDPAKPNFQKRNQTILIINGAGGVGSIATQLAKLAGLTVISSASRPESITWTQQHGADLVVNHRHDLVREVHALGIKDVDYILGLSDLDSHWDEMCALIKPGGHIASITENRRPIDLKKLTKKRGTFAWEWMYSKSYYHTADMISQHYILDTIANLLDHDLLKSTLSQTLQPINALNLRQAHQLIEQHHMIGKVVIEGWE >NZ_CP013130.1|WP_033610695.1|1342665_1343928_-|replication-associated-recombination-protein-A MAFKTPLADQMRPQSLDQMVGQQDLLKSGQPLRQIIDQHVNIPLILWGPPGTGKTSLAQIIASQDDYPFVAFNASTENKAQLTKAIAQYPNQSFVLLIDEIHRMTKTLQDFLLPYLENGHVMLIGSTTENPIMSIVPAIRSRCQIFEFQPLSDTDIEIALRRAVTDIYELTDDQVDTQALNLIAISAEGDLRIALNILETLHAIDQHQITVAAVQNFAKQQHFSYDRKATKHYDYLSAYSDSMAGSDTDAALYYLTILLKNDDLPSVVRRLREIPYTYIGLANPEQVTQIVVAANQAEKIGMPKAKYPLMFATMLMCISPKSGSFDQSWEKLDQDTQNPSQHPMPRGLRDMHYKHSEEITGGGLIDNPFQMPHQIAQQNYMPKGLAGRRYYSPKDNENERKLGAQYLKLHRFIYDEDYHE >NZ_CP013130.1|WP_033610694.1|1342188_1342500_+|hypothetical-protein MATVLPKAVRVWMGANILQIEFDNGEFRYLRTHFIDDYISAWSPKKGKGKRRNLWLMPSWEWLGANARIEPDGTVVLFEKDVYTAQELWHNSVTRIDLVSGVH >NZ_CP013130.1|WP_021731729.1|1341581_1341938_+|50S-ribosomal-protein-L20 MARVKGGTVTRKRRKRILKLAKGYRGAKHIQFKVAKDQVMKSYEYAFRDRRRRKSDFRRLWIARINAAARINDISYSQLMHGLKLANVDVNRKMLADLAVNDADAFKALVDTAKKALA >NZ_CP013130.1|WP_003638526.1|1341350_1341545_+|50S-ribosomal-protein-L35 MPKQKTNRAAAKRFKVTAKGKIKSANAFTSHRFHGKTKKQRRQLRGTAIIEKPMVKTYHKLLQK >NZ_CP013130.1|WP_003640278.1|1340828_1341329_+|translation-initiation-factor-IF-3 MVNDGIRAREVRLIASDGEQLGVKSRQEAMQIAEDASLDLVLVAPKAKPPVARIMDYGKYRFEQQKKDREARKKQKVVSIKEVRLSPAIDTNDFNTKLKHAEKFLSKGDKVRVSIRFKGRAITHKDIGRQVLNRMIEATKEFSTVEAYPKMDGRSMFLVLAPKTDK >NZ_CP013130.1|WP_033610693.1|1338620_1340585_+|threonine--tRNA-ligase MASINVKFPDGAEKQFDAGVTTEAIAKSISPSLAKRSVAGKFNDQIVDYRQPLTTDGSIEIIAADSEDGLNVLRQTAAQVLANAVKQLFPNIHFGSGEGNANGFFFDTDNPDEDGKQVSEDDLEAISDKMAAIIKQDLPIEREVLSKADALALVGDNPYQQDLVNERAAANNDQVVVYKQGDFVDLSDGAQLASTGKVKVFKLLSVAGAYWQGKSSNPMLQRIYGTAFLKQKDLDADLKRRQEARERDHRVIGNELDLFFVDPKVGNGLPYWMPNGATIRRQIERYIIDKEVANGYQHVYTPVLANLDVYKQSGHWDHYREDMFPPMDMGDGEQLELRPMNCPSHIQIYNHHIRSYRELPLRIAELGMMHRYEKSGALTGLSRVREMTLNDGHTFVAMDQIEEEFKKILSLMVEVYEDFDISDYRFRLSYRDPENKEKYFDDDAMWERSQKMLKSAMDDMGLDYFEAEGEAAFYGPKLDVQTKTALGGEETLSTIQLDFLLPERFDLKYVGADGEEHRPVMIHRGLVSTMERFVAYLTEIYKGAFPTWLAPKQVTIIPVNNGAHGAYAETVRRRLAAEGVRVSIDDRNEKMGYKIRESQTKKVPYLLVVGDQEVANGSVSVRKYGEERTESEAVDMFIGAITQEIKHYSRGASK >NZ_CP013130.1|WP_033611678.1|1349753_1350704_+|type-I-E-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKSGAKKPELSELSRIHDRLTFLYLEHAKLDRQDSAIRVSDARGVVFVPAAIISVLMLGPGVDVTHRAMELMGDAGMAVVWVGERGVRQYAHGRALNHSSRLLEAQARLFSNQRSRLTVARKMYQMRFPNDDVTTLSMQKLRGKEGARVRQVYRLESERTGVSWTRREYNPDNFEASSPINQALTAAHQALYGLSYSVIMAMGASAGLGFVHTGHDLSFVYDFADLYKAETSIPVAFDIVAASTADEDIARSTRLAMRDVFVDGKLLRRMVSDLKSILGVSDTTTEVSNLSLWDDRLGLQEFGVQYHETEVGGIK >NZ_CP013130.1|WP_033611680.1|1350700_1351591_+|type-I-E-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas2 MIVITLTKVPNALRGDLTKWYQEIQTGVYVGNVSARVRDSLWLRIVENIGRGEATMVYNANNELGYQFKTTRHDHQVVDFDGIPLMMHLVAGQSVEKHGYSNAAKFHKARMMTRKVQRQQSHYSDEPVVAVDIETTGLDPSKDVIISIAAVKSIPDGQTSEFSRLIKIDRLLPQKIVELTGITRDMLNEEGVSIVMALSEMKVFIGNSVIVGYNFHFDEMFLKQALIEKDIEGLTNQTTDLMPIVKRTNIFLDNYRLSTVLAAYQIVNLRPHNALSDAKATLALAHKLIKDGSLNI >NZ_CP013130.1|WP_033611681.1|1352777_1355525_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MTEFSRLAQSLWAKKCSDDGQRRWLPLIVHLKDCENTINWLFNHWLSDGQRQQLSEVTSEEDVQRLVKFLGFTHDIGKATPAFQTKPAYNGDHQLDQLLIEQLMQNGFQDLASLNLSSARESPHALAGEAILESFGVNPTVGAIIGGHHGKTASASPKRQIKDYTANYYQNDNQPGLQIAWQQVQRELVAYGLHTAGYQTTAEIPTLNQPEAVILTGLLIMADWLASSEYLNENPDKPLFPLVTTMQSVTDIDLQARFRDAITTWQSDDEWVPAPLAHDRDPYQVRFGFHARPVQAAITNALGATSDPGMAIVEAPMGLGKTEIALIAVEQLARMTGRDGVYMGLPTQATTNAMFARVNDWLERVADEQSARLSIKLMHGKAQFNQMYKRLPNASNVNSTDEHDGAVTVNSWFGGKKSILTKFTVGTIDNLLLMGLKQKHLFLRHLGFSGKVVVIDEVHAYDAYMNKYLLRAIEWLGAYHVPVVILSATLPKTKRNQLLKAYLKGKYGRRYHQILKVAPTGWEDTQAYPLLSILDGPDIKQLTNFEGQSDQTALTLEVQRNNQDDQELIMTLLKQLSQGGIAGIIVNTVKRAQDLAALISAEVPLMVLHSAFLAPDRAQQEMKLQAAIGKHGERPAKLVVIGTQVLEQSLDIDFDILYTDIAPMDLILQRAGRLHRHQMIQRPHNFQQPQLKIMGIKGFGDYGAGNEAVYGKYLLMKTDYFLKNQIKLPDDISTLVQQVYDSATDTQVPEITTAAEDFATDLKAEQQKAQVFQISAPQLKHGKSIHGWLDRNHRDIVTDQQASAAVRDIQETLEVILIQHMNQDDFLLDGRKLDEVASTEIAQQTLRLPVAVTPNITKAINQLEDLTRPYHARWQDDIWLRGVLVLPLDQKLTAEFGKWRLSYSSQLGLSYSKEE >NZ_CP013130.1|WP_191980459.1|1355530_1357261_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse1/CasA MTMQTFNLTTDPWIVVIDARTNQEVTVSLIELFQNAQYYRQLAGDMRAQDLAILRLLLAILTTIYTRYNADNQAYEWLTVDDMAKVEHVDEDYEIDEIHDDLKQTWADLFASGHFSTIVTDYLQGHAGQFDLFGDQPFYQVTASAYDEFVPETKSVARSKRTGKPTGQVAVRQMNRRISESGNSVALFAPKVNETKNDLTLAELVRWLIMYQNYTGVTDKTKINSDEKFSNGAGWLYRLNPVYASGRSLFEILMLNLILIPTASDGQYIVQQPVWEHATLTAYLQERQRQQVPDNLAALYTTWSRLLHLEWDDQQRPTIYSAGIPMFDTEDALIEPMTLWRQDKKTSRFRPAVNGIKYMGKAMWRNFGQYVNVNHSDDIHEAGIVAWLHYLKTEGLVADDQQLWLASTALISDGNMSSQMPATEVYDDMQIQADVLFDEATADYWPVRIEDIIELTQKIGDGYYHFAATVGQIRNIDAKQFAQRHSVQFYAGLNRPFKEWLASLTGDDDRDAKIDEWRQTLQQITLQAASAIMATSSSRDVRGIVERDKNNVLRQVNIFTANNQLRRLVFTQLSGK >NZ_CP013130.1|WP_033611682.1|1357274_1357880_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse2/CasB MESKIQSATISIIRQLYNNGNLNKGVLANVRHATALTSPQAQTLWPVMMAHLERNMLSQDGQPTKAEVAVYTAIRFYAIQQQGTESLVYGPANPHADVKDQGMPLFRALASLRRNEETRVALDRRMQPLLATTNVASIINALTHLVSMLKANNQLQKIDYARLAQDLYWFQQDYEHASQVRLQWGQQYYRPLTATTEGKKN >NZ_CP013130.1|WP_033611683.1|1357879_1358959_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cse4/CasC MTTNNLYLDIHVIQTVPSSNINRDDTGAPKTALYGGVTRARVSSQSWKRAVRQSFKDDTVTVGFRTKAAAQLLKQALQKLTSELDDDDAWEQVNAVFKLAGVKLDKDEETSALLLVSPGQIDQLAQYVTDNADGELDKKAIKAVLKGNQSIDLALFGRMVADNPELNVDAAAQVAHAISTHEVVPEFDYFTALDDLQPEDSTGAAMLGTLEFNSATLYRYANVNVNELIANLGETAAIDGIREFVKAFVLSMPTGKQNTFANKTLPNYVMVTLRPDTPVNLVSGFEDPVSSKTGYVKQSIQQLTAAYQAALSFVEKPLLNVDLGANESQVATSADNLTDLLEQLATELTKVVKDENGND >NZ_CP013130.1|WP_033611684.1|1358939_1359647_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas5/CasD MKTVTIRLTAPLQSYGNEANFDRRTSYDYPSKSAVIGLIAAALGYPRRDSRIQTLNQLAYAVRVDQPAEPLTDFQIVEWKHGRRKLTYRDYLQDAVFMVAVGSEDDALIDQIDWALHHPHFQLALGRRANVLAGAIMTEISLNSNPVQTLQTLSWHAARFYMKKTRRSTFVAELIADAELLPDRPNSMVKDMAVSFDQRHRQYGFRAIAVDRVPLENPYFKANNADTNHDMMNYL >NZ_CP013130.1|WP_033611685.1|1359660_1360329_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas6/Cse3/CasE MYLSRVEIDTNNRYKIKDLSHLGAYHNWVEQSFPEEIDSSQRNRHLWRIDRLNGKNYLLLLSAERPVLEQLEQYGVAKTAVTKSYDAWLDHIKVGMVLRFRLTANPTHSIIDPKHPKGRVVPHVTIEQQKQWLEDRALRAGFELVSRTESLPDMDHQSAFDVVDHDWPMLHRRKGRGVRLSRVTFEGVLRVLDVATFRQTLTRGLGREKAFGMGLMTVIPEA >NZ_CP013130.1|WP_033611686.1|1361289_1362603_-|glycosyltransferase MEIMQTLKPFESIWNFVLLLLVSYPILGAFAWFVGVLCYQLIYRHRHTDDVEFKELAPAEQPLITIMIPAHNEEVMIEHTIDYLMTSLNYTNYEVLVTDDGSTDKTPEILARLQDKYAKLRVVTIRKNQGKAHAFNVGVGFARGEFILSNDADSIPEPDALWKYMSYFMGEEHANTAAVTANMDVQNRSTIIAKSQTVEFSSIVGVIKRSQVSALGNMYAYSGANTMYRRDALIDVGLFRQDRATEDISIAWDHQLNGWTTVFSPDILFYMNVPETLKALYHQRKRWAKGGTEVLLTNFKRVMSHPGKYLKQWAFITDQTLSIIWSLFFFVSTLIFLISLVSFFFTGNYERVYHMFCMAFIFVTFEMFAGLLQLLSALIVDDRGKKFKYLIFMPLYMLVYWQVNALALVMTLIPAVKTILGYGSGTWVSPVRKHHME >NZ_CP013130.1|WP_033609485.1|1362606_1363071_-|hypothetical-protein MQQYVTDKYFTKGHWWTKIWQTLVAIIGWICVAIPVYWTISSTLLANNPRFIHAWKYEEGKTLFYFFDRFFIFAFILIAIIVIISTIHNNHRVKQHISKERQYDEEQLAIRKRRLNNFYTTRFGQETFRQHVKHYTVDPEQNLDVHEIHKLYED |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013130_5 | 1351689-1352203 | TypeI-E |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013130_5
|
8 spacers
spacers of NZ_CP013130_5
>5.1|1351717|32|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT AGCAAAAAATCGCTAACCGCTTGCGTGGACTG >5.2|1351777|33|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT ACGAGCGACTTAGATCTGTTCCGCTGCATGCAA >5.3|1351838|33|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT TCACTGCCACCCCTTGTTTTTACTGTGCTATAA >5.4|1351899|33|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT AACTTTTCCCGCAATGTTACGATCGATCATTTG >5.5|1351960|33|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT CAAGAAGCAGATTCCTTTCTTGTGGAAATTCTA >5.6|1352021|33|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT TTGCATGGAAAAAGTGTCAGAGTTGTGATGATG >5.7|1352082|33|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT TTAAGACGGCCGAACCCGGAACGCGGAACAATA >5.8|1352143|33|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT CGCTACATTGCCGTTCGTGAAAACGGGGTACCG >5.9|1351778|33|NZ_CP013130|PILER-CR ACGAGCGACTTAGATCTGTTCCGCTGCATGCAA >5.10|1351839|33|NZ_CP013130|PILER-CR TCACTGCCACCCCTTGTTTTTACTGTGCTATAA >5.11|1351900|33|NZ_CP013130|PILER-CR AACTTTTCCCGCAATGTTACGATCGATCATTTG >5.12|1351961|33|NZ_CP013130|PILER-CR CAAGAAGCAGATTCCTTTCTTGTGGAAATTCTA >5.13|1352022|33|NZ_CP013130|PILER-CR TTGCATGGAAAAAGTGTCAGAGTTGTGATGATG >5.14|1352083|33|NZ_CP013130|PILER-CR TTAAGACGGCCGAACCCGGAACGCGGAACAATA >5.15|1352144|33|NZ_CP013130|PILER-CR CGCTACATTGCCGTTCGTGAAAACGGGGTACCG |
DEDDh,cas1,cas3,cas8e,cse2gr11,cas7,cas5,cas6e |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013130_5
The CRISPR arrays of NZ_CP013130_5 >merge|NZ_CP013130|5|1351689-1352203|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGGTTACCCCCGTGTAAACGGGGAATAGAGCAAAAAATCGCTAACCGCTTGCGTGGACTGGGGATCACCCCCGATACACGGGGAATAGACGAGCGACTTAGATCTGTTCCGCTGCATGCAAGGATCACCCCCGTATACACGGGGAATAGTCACTGCCACCCCTTGTTTTTACTGTGCTATAAGGATCACCCCCGTATACACGGGGAATAGAACTTTTCCCGCAATGTTACGATCGATCATTTGGGATCACCCCCGTATACACGGGGAATAGCAAGAAGCAGATTCCTTTCTTGTGGAAATTCTAGGATCACCCCCGTATACACGGGGAATAGTTGCATGGAAAAAGTGTCAGAGTTGTGATGATGGGATCACCCCCGTATACACGGGGAATAGTTAAGACGGCCGAACCCGGAACGCGGAACAATAGGATCACCCCCGTATACACGGGGAATAGCGCTACATTGCCGTTCGTGAAAACGGGGTACCGGGATCACCCCCGTATACACGGGGAATAG >NZ_CP013130|5|4|1351689-1352203|CRISPRCasFinder GGGTTACCCCCGTGTAAACGGGGAATAG AGCAAAAAATCGCTAACCGCTTGCGTGGACTG GGGATCACCCCCGATACACGGGGAATAG ACGAGCGACTTAGATCTGTTCCGCTGCATGCAA GGATCACCCCCGTATACACGGGGAATAG TCACTGCCACCCCTTGTTTTTACTGTGCTATAA GGATCACCCCCGTATACACGGGGAATAG AACTTTTCCCGCAATGTTACGATCGATCATTTG GGATCACCCCCGTATACACGGGGAATAG CAAGAAGCAGATTCCTTTCTTGTGGAAATTCTA GGATCACCCCCGTATACACGGGGAATAG TTGCATGGAAAAAGTGTCAGAGTTGTGATGATG GGATCACCCCCGTATACACGGGGAATAG TTAAGACGGCCGAACCCGGAACGCGGAACAATA GGATCACCCCCGTATACACGGGGAATAG CGCTACATTGCCGTTCGTGAAAACGGGGTACCG GGATCACCCCCGTATACACGGGGAATAG >NZ_CP013130|5|4|1351689-1352203|CRT GGGTTACCCCCGTGTAAACGGGGAATAG AGCAAAAAATCGCTAACCGCTTGCGTGGACTG GGGATCACCCCCGATACACGGGGAATAG ACGAGCGACTTAGATCTGTTCCGCTGCATGCAA GGATCACCCCCGTATACACGGGGAATAG TCACTGCCACCCCTTGTTTTTACTGTGCTATAA GGATCACCCCCGTATACACGGGGAATAG AACTTTTCCCGCAATGTTACGATCGATCATTTG GGATCACCCCCGTATACACGGGGAATAG CAAGAAGCAGATTCCTTTCTTGTGGAAATTCTA GGATCACCCCCGTATACACGGGGAATAG TTGCATGGAAAAAGTGTCAGAGTTGTGATGATG GGATCACCCCCGTATACACGGGGAATAG TTAAGACGGCCGAACCCGGAACGCGGAACAATA GGATCACCCCCGTATACACGGGGAATAG CGCTACATTGCCGTTCGTGAAAACGGGGTACCG GGATCACCCCCGTATACACGGGGAATAG >NZ_CP013130|5|6|1351750-1352203|PILER-CR GGATCACCCCCGATACACGGGGAATAGA CGAGCGACTTAGATCTGTTCCGCTGCATGCAAG GATCACCCCCGTATACACGGGGAATAGT CACTGCCACCCCTTGTTTTTACTGTGCTATAAG GATCACCCCCGTATACACGGGGAATAGA ACTTTTCCCGCAATGTTACGATCGATCATTTGG GATCACCCCCGTATACACGGGGAATAGC AAGAAGCAGATTCCTTTCTTGTGGAAATTCTAG GATCACCCCCGTATACACGGGGAATAGT TGCATGGAAAAAGTGTCAGAGTTGTGATGATGG GATCACCCCCGTATACACGGGGAATAGT TAAGACGGCCGAACCCGGAACGCGGAACAATAG GATCACCCCCGTATACACGGGGAATAGC GCTACATTGCCGTTCGTGAAAACGGGGTACCGG GATCACCCCCGTATACACGGGGAATAG
>NZ_CP013130.1|WP_033611680.1|1350700_1351591_+|type-I-E-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas2 MIVITLTKVPNALRGDLTKWYQEIQTGVYVGNVSARVRDSLWLRIVENIGRGEATMVYNANNELGYQFKTTRHDHQVVDFDGIPLMMHLVAGQSVEKHGYSNAAKFHKARMMTRKVQRQQSHYSDEPVVAVDIETTGLDPSKDVIISIAAVKSIPDGQTSEFSRLIKIDRLLPQKIVELTGITRDMLNEEGVSIVMALSEMKVFIGNSVIVGYNFHFDEMFLKQALIEKDIEGLTNQTTDLMPIVKRTNIFLDNYRLSTVLAAYQIVNLRPHNALSDAKATLALAHKLIKDGSLNI >NZ_CP013130.1|WP_033611678.1|1349753_1350704_+|type-I-E-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKSGAKKPELSELSRIHDRLTFLYLEHAKLDRQDSAIRVSDARGVVFVPAAIISVLMLGPGVDVTHRAMELMGDAGMAVVWVGERGVRQYAHGRALNHSSRLLEAQARLFSNQRSRLTVARKMYQMRFPNDDVTTLSMQKLRGKEGARVRQVYRLESERTGVSWTRREYNPDNFEASSPINQALTAAHQALYGLSYSVIMAMGASAGLGFVHTGHDLSFVYDFADLYKAETSIPVAFDIVAASTADEDIARSTRLAMRDVFVDGKLLRRMVSDLKSILGVSDTTTEVSNLSLWDDRLGLQEFGVQYHETEVGGIK >NZ_CP013130.1|WP_033609918.1|1347974_1348940_-|IS30-family-transposase MTYTHLTIDELATIYSFWKLGKKAYLVAPALHRSAETVYRIYRFLDAGGTIIDYQCHYRKHKQHCGRKPIQLRPDELAYIQAKTQAGWQPDTIINRQERAFSCGVRTLYRLFKRGVLGLSTKDLPMHGKRHPNGYIERRGKAGQLGRDLKNRYQDYPNFNQEFGHLEGDTVQGKNHQGAVTTLVERQTKVAIVLNSHTKSAHDVNRSLAGWLSKLPRHLFKSITFDNGKEFAGWRTIANQFDLNIYFAAVGAPNQRGLNENTNGLLRKDGLRHNLIMDQLSDRFVQAVASRRNHIPRKSLGYQTPLEAFISQITDEQLKNF >NZ_CP013130.1|WP_033610698.1|1346686_1347436_+|aspartate/glutamate-racemase-family-protein MENCFGIIGGMGTMATEDFVHTVNRLTVTHRDQDYLNYVVLNDAQIPDRTAYILDHNCTNPLPSLKTDVQLLNRLGAKFIVMTCNTAHYFIPALTAITNVPILNMPALAVEAACQLQQPRPLRIGILATTGTLKSQLYQQLIRANGHMPVVPTGQQQAQVMALIYEDIKQHDYVDRVKFHGLIDQLLNAADCDVVILGCTELSVAQDAAPYGSERVIDAQYELARVTVQCAQAAKPTMILQRQQSMNGY >NZ_CP013130.1|WP_033610697.1|1345943_1346291_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MQRQIYDCAAGCPVESTLQVIAGKWKSVILYHLLTTGTCRFSTLKKRLSGCSRRMLARQLQEMLQDGVIAKRVYPVVPPKTEYWVTPFGQTLKPVIMAMEAWGRQYNSVNGNIIS >NZ_CP013130.1|WP_033610696.1|1344749_1345781_-|zinc-binding-alcohol-dehydrogenase-family-protein MHAIGFTDHLPIENPASLQDVTITKPTPHGHDILVQIQAVAVNPVDVGVRKTGHEHLTRPKILGWDATGIVTAVGKAVTLFQPGDRVFYAGSFNRPGCDSAYHLVDERLVGHAPKTLTPAACAAMPLTSLTAYEALFEQLHISFDPAKPNFQKRNQTILIINGAGGVGSIATQLAKLAGLTVISSASRPESITWTQQHGADLVVNHRHDLVREVHALGIKDVDYILGLSDLDSHWDEMCALIKPGGHIASITENRRPIDLKKLTKKRGTFAWEWMYSKSYYHTADMISQHYILDTIANLLDHDLLKSTLSQTLQPINALNLRQAHQLIEQHHMIGKVVIEGWE >NZ_CP013130.1|WP_033610695.1|1342665_1343928_-|replication-associated-recombination-protein-A MAFKTPLADQMRPQSLDQMVGQQDLLKSGQPLRQIIDQHVNIPLILWGPPGTGKTSLAQIIASQDDYPFVAFNASTENKAQLTKAIAQYPNQSFVLLIDEIHRMTKTLQDFLLPYLENGHVMLIGSTTENPIMSIVPAIRSRCQIFEFQPLSDTDIEIALRRAVTDIYELTDDQVDTQALNLIAISAEGDLRIALNILETLHAIDQHQITVAAVQNFAKQQHFSYDRKATKHYDYLSAYSDSMAGSDTDAALYYLTILLKNDDLPSVVRRLREIPYTYIGLANPEQVTQIVVAANQAEKIGMPKAKYPLMFATMLMCISPKSGSFDQSWEKLDQDTQNPSQHPMPRGLRDMHYKHSEEITGGGLIDNPFQMPHQIAQQNYMPKGLAGRRYYSPKDNENERKLGAQYLKLHRFIYDEDYHE >NZ_CP013130.1|WP_033610694.1|1342188_1342500_+|hypothetical-protein MATVLPKAVRVWMGANILQIEFDNGEFRYLRTHFIDDYISAWSPKKGKGKRRNLWLMPSWEWLGANARIEPDGTVVLFEKDVYTAQELWHNSVTRIDLVSGVH >NZ_CP013130.1|WP_021731729.1|1341581_1341938_+|50S-ribosomal-protein-L20 MARVKGGTVTRKRRKRILKLAKGYRGAKHIQFKVAKDQVMKSYEYAFRDRRRRKSDFRRLWIARINAAARINDISYSQLMHGLKLANVDVNRKMLADLAVNDADAFKALVDTAKKALA >NZ_CP013130.1|WP_003638526.1|1341350_1341545_+|50S-ribosomal-protein-L35 MPKQKTNRAAAKRFKVTAKGKIKSANAFTSHRFHGKTKKQRRQLRGTAIIEKPMVKTYHKLLQK >NZ_CP013130.1|WP_033611681.1|1352777_1355525_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MTEFSRLAQSLWAKKCSDDGQRRWLPLIVHLKDCENTINWLFNHWLSDGQRQQLSEVTSEEDVQRLVKFLGFTHDIGKATPAFQTKPAYNGDHQLDQLLIEQLMQNGFQDLASLNLSSARESPHALAGEAILESFGVNPTVGAIIGGHHGKTASASPKRQIKDYTANYYQNDNQPGLQIAWQQVQRELVAYGLHTAGYQTTAEIPTLNQPEAVILTGLLIMADWLASSEYLNENPDKPLFPLVTTMQSVTDIDLQARFRDAITTWQSDDEWVPAPLAHDRDPYQVRFGFHARPVQAAITNALGATSDPGMAIVEAPMGLGKTEIALIAVEQLARMTGRDGVYMGLPTQATTNAMFARVNDWLERVADEQSARLSIKLMHGKAQFNQMYKRLPNASNVNSTDEHDGAVTVNSWFGGKKSILTKFTVGTIDNLLLMGLKQKHLFLRHLGFSGKVVVIDEVHAYDAYMNKYLLRAIEWLGAYHVPVVILSATLPKTKRNQLLKAYLKGKYGRRYHQILKVAPTGWEDTQAYPLLSILDGPDIKQLTNFEGQSDQTALTLEVQRNNQDDQELIMTLLKQLSQGGIAGIIVNTVKRAQDLAALISAEVPLMVLHSAFLAPDRAQQEMKLQAAIGKHGERPAKLVVIGTQVLEQSLDIDFDILYTDIAPMDLILQRAGRLHRHQMIQRPHNFQQPQLKIMGIKGFGDYGAGNEAVYGKYLLMKTDYFLKNQIKLPDDISTLVQQVYDSATDTQVPEITTAAEDFATDLKAEQQKAQVFQISAPQLKHGKSIHGWLDRNHRDIVTDQQASAAVRDIQETLEVILIQHMNQDDFLLDGRKLDEVASTEIAQQTLRLPVAVTPNITKAINQLEDLTRPYHARWQDDIWLRGVLVLPLDQKLTAEFGKWRLSYSSQLGLSYSKEE >NZ_CP013130.1|WP_191980459.1|1355530_1357261_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse1/CasA MTMQTFNLTTDPWIVVIDARTNQEVTVSLIELFQNAQYYRQLAGDMRAQDLAILRLLLAILTTIYTRYNADNQAYEWLTVDDMAKVEHVDEDYEIDEIHDDLKQTWADLFASGHFSTIVTDYLQGHAGQFDLFGDQPFYQVTASAYDEFVPETKSVARSKRTGKPTGQVAVRQMNRRISESGNSVALFAPKVNETKNDLTLAELVRWLIMYQNYTGVTDKTKINSDEKFSNGAGWLYRLNPVYASGRSLFEILMLNLILIPTASDGQYIVQQPVWEHATLTAYLQERQRQQVPDNLAALYTTWSRLLHLEWDDQQRPTIYSAGIPMFDTEDALIEPMTLWRQDKKTSRFRPAVNGIKYMGKAMWRNFGQYVNVNHSDDIHEAGIVAWLHYLKTEGLVADDQQLWLASTALISDGNMSSQMPATEVYDDMQIQADVLFDEATADYWPVRIEDIIELTQKIGDGYYHFAATVGQIRNIDAKQFAQRHSVQFYAGLNRPFKEWLASLTGDDDRDAKIDEWRQTLQQITLQAASAIMATSSSRDVRGIVERDKNNVLRQVNIFTANNQLRRLVFTQLSGK >NZ_CP013130.1|WP_033611682.1|1357274_1357880_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse2/CasB MESKIQSATISIIRQLYNNGNLNKGVLANVRHATALTSPQAQTLWPVMMAHLERNMLSQDGQPTKAEVAVYTAIRFYAIQQQGTESLVYGPANPHADVKDQGMPLFRALASLRRNEETRVALDRRMQPLLATTNVASIINALTHLVSMLKANNQLQKIDYARLAQDLYWFQQDYEHASQVRLQWGQQYYRPLTATTEGKKN >NZ_CP013130.1|WP_033611683.1|1357879_1358959_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cse4/CasC MTTNNLYLDIHVIQTVPSSNINRDDTGAPKTALYGGVTRARVSSQSWKRAVRQSFKDDTVTVGFRTKAAAQLLKQALQKLTSELDDDDAWEQVNAVFKLAGVKLDKDEETSALLLVSPGQIDQLAQYVTDNADGELDKKAIKAVLKGNQSIDLALFGRMVADNPELNVDAAAQVAHAISTHEVVPEFDYFTALDDLQPEDSTGAAMLGTLEFNSATLYRYANVNVNELIANLGETAAIDGIREFVKAFVLSMPTGKQNTFANKTLPNYVMVTLRPDTPVNLVSGFEDPVSSKTGYVKQSIQQLTAAYQAALSFVEKPLLNVDLGANESQVATSADNLTDLLEQLATELTKVVKDENGND >NZ_CP013130.1|WP_033611684.1|1358939_1359647_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas5/CasD MKTVTIRLTAPLQSYGNEANFDRRTSYDYPSKSAVIGLIAAALGYPRRDSRIQTLNQLAYAVRVDQPAEPLTDFQIVEWKHGRRKLTYRDYLQDAVFMVAVGSEDDALIDQIDWALHHPHFQLALGRRANVLAGAIMTEISLNSNPVQTLQTLSWHAARFYMKKTRRSTFVAELIADAELLPDRPNSMVKDMAVSFDQRHRQYGFRAIAVDRVPLENPYFKANNADTNHDMMNYL >NZ_CP013130.1|WP_033611685.1|1359660_1360329_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas6/Cse3/CasE MYLSRVEIDTNNRYKIKDLSHLGAYHNWVEQSFPEEIDSSQRNRHLWRIDRLNGKNYLLLLSAERPVLEQLEQYGVAKTAVTKSYDAWLDHIKVGMVLRFRLTANPTHSIIDPKHPKGRVVPHVTIEQQKQWLEDRALRAGFELVSRTESLPDMDHQSAFDVVDHDWPMLHRRKGRGVRLSRVTFEGVLRVLDVATFRQTLTRGLGREKAFGMGLMTVIPEA >NZ_CP013130.1|WP_033611686.1|1361289_1362603_-|glycosyltransferase MEIMQTLKPFESIWNFVLLLLVSYPILGAFAWFVGVLCYQLIYRHRHTDDVEFKELAPAEQPLITIMIPAHNEEVMIEHTIDYLMTSLNYTNYEVLVTDDGSTDKTPEILARLQDKYAKLRVVTIRKNQGKAHAFNVGVGFARGEFILSNDADSIPEPDALWKYMSYFMGEEHANTAAVTANMDVQNRSTIIAKSQTVEFSSIVGVIKRSQVSALGNMYAYSGANTMYRRDALIDVGLFRQDRATEDISIAWDHQLNGWTTVFSPDILFYMNVPETLKALYHQRKRWAKGGTEVLLTNFKRVMSHPGKYLKQWAFITDQTLSIIWSLFFFVSTLIFLISLVSFFFTGNYERVYHMFCMAFIFVTFEMFAGLLQLLSALIVDDRGKKFKYLIFMPLYMLVYWQVNALALVMTLIPAVKTILGYGSGTWVSPVRKHHME >NZ_CP013130.1|WP_033609485.1|1362606_1363071_-|hypothetical-protein MQQYVTDKYFTKGHWWTKIWQTLVAIIGWICVAIPVYWTISSTLLANNPRFIHAWKYEEGKTLFYFFDRFFIFAFILIAIIVIISTIHNNHRVKQHISKERQYDEEQLAIRKRRLNNFYTTRFGQETFRQHVKHYTVDPEQNLDVHEIHKLYED >NZ_CP013130.1|WP_033611687.1|1363665_1364196_+|YqeG-family-HAD-IIIA-type-phosphatase MIKQFKPTWMIPAIYNVTPAQLRAQGIKAVFTDLDNTLIAWNNPDGTPELKKWLHALQDAGIPLVVVSNNSEDRIAKALTSLELPFVSRSLKPLPIGITKARRDLGLQPNEVVMVGDQYITDMWAAHLAGVPSILVKPIVTTDAWNTRINRFFERFIKLRLAHVYPEMHFQEDLNK >NZ_CP013130.1|WP_033611688.1|1364192_1365329_+|ribosome-biogenesis-GTPase-YqeH MSETSEETLYCIGCGAAIQTTDPKAAGYTPNSALQKSLASDAQDLYCQRCFRLRHYNEIVPVGLTDDDFRHLLATIRDANALVVYVVDIFDLNGSIIPGLQRFVGDNPVLLVGNKEDVLPRQLRRTKLREWMNQQVRAQGIKPVDVALTSAKKGHSIDELLAMIEKYRRGRDVYVVGVTNVGKSTLINRIIANNTGLKDLITTSRFPGTTLDKIEIPLDDGHMMVDTPGIIHPEQMAHVLSGDDLKLVSPQREIRPKGFQLGNGQTLFLGGVARLDIVDTMKPTGTVYVDNNLTLHRTRTENADNFYTKHVGELITPPTGDAVADFPALVRHEFKVTEISDIVFEGLGWVTVAADTRVAAWAPQGVAVLTRPAMINKR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP013130_6 | 2311340-2311521 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013130_6
|
2 spacers
spacers of NZ_CP013130_6
>6.1|2311366|52|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder CAAGGACGTTACCTTTTTCAACCGTTGAAACGTACACCGCATGGTCGTCACA >6.2|2311444|52|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder TAATGCCGCTAACACCGAGCAGTTGGCAAAAGCGTAACTAATATCCGTCATT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013130_6
The CRISPR arrays of NZ_CP013130_6 >merge|NZ_CP013130|6|2311340-2311521|CRISPRCasFinder TTACTCGTATCCCAAGCGCTCACATCCAAGGACGTTACCTTTTTCAACCGTTGAAACGTACACCGCATGGTCGTCACATTACTGGTATCCCATTTAGCGACATCTAATGCCGCTAACACCGAGCAGTTGGCAAAAGCGTAACTAATATCCGTCATTTTACTCGTATCCCATTTAGCGACATC >NZ_CP013130|6|5|2311340-2311521|CRISPRCasFinder TTACTCGTATCCCAAGCGCTCACATC CAAGGACGTTACCTTTTTCAACCGTTGAAACGTACACCGCATGGTCGTCACA TTACTGGTATCCCATTTAGCGACATC TAATGCCGCTAACACCGAGCAGTTGGCAAAAGCGTAACTAATATCCGTCATT TTACTCGTATCCCATTTAGCGACATC
>NZ_CP013130.1|WP_033612033.1|2309627_2310182_-|sugar-O-acetyltransferase MSELAKLTAGEWYQFKDAEVAAQKARAARLCQEFNQIDATDPDAQTVKMQAILGSYGRNLSVQANFNCDNGRNIHVGDNFLSNYNLTILDIAPVYIGDNVMIGPNVDIYTVNHPLTARGRRDNLAQGHPVTIGDDVWIGGRVVITPGVTIGNNVVVAAGAVVTHDVPDNVLVAGVPAKVIRTLE >NZ_CP013130.1|WP_033612032.1|2308670_2309444_-|TerC-family-protein MLHLIEQLYGPFFSATNWGNVITSANDWLIILSLAIIECLLSVDNAVVLAAQTQSLDNLQEREKSLFYGLWGAYVFRFLIIGIGTYLISFWEIKVLGAAYLVYLVYRYFSQPKNGATVAQKPKKQRRFFGLSNFWSVVIQIEMMDIIFSIDSVLASLAISDNPVIVLIGGMIGIACMRGIAEVIMRLMRKIPELETMAYCLIVLIAIKLFISIPAIGWDIPATAFGGIVLVAFMITLLIHFWRRRRNEQRVEGKVRK >NZ_CP013130.1|WP_033612031.1|2307813_2308674_-|NAD(P)-dependent-oxidoreductase MMKLGWIGTGVMGAAIVRNLMAAGYDVTVYNRTKSKADALVAAGATWADTPAAVAQMSDVVFTMVGFPQDVDQVYFGDHGIFSGLAAEKTVIDMTTSQPKLAVKIATYAREHGMHALDAPVSGGDIGAQNATLTVMVGGDTATYETMLPLFNVLGHKVNHFGDAGTGQHAKMANQIMIAGTMTGLTEMLLYTKAAGLDPEKVLATLSSGGADNWSMDNYVPRILKDDYTPGFFARHFLKDLRIALSEADAMGLNLVATAQAKRLYEVMVDVKGLGDQGTQGLINIY >NZ_CP013130.1|WP_033612030.1|2305381_2306737_+|FAD-dependent-oxidoreductase MKVIVVGSSHGGYETVRGILAAQPDTEIQWYEKGDFLSFLSCGMQLYLEGAVKDVNAVSYATPAGMQAQGVHVFVNSEISKVDPASHSVHVIDHATGDERDEAYDKLVLSVGAVPFDLPVPGHDLANIYAMRGRDWAIKLKAKTVDPSVKNVVVIGSGYIGIEAAEVFAKAGMHVTVIDLLPRLLSLYLDQEFTDILTKTMADHGIYAAVGQGIKSYEGVDGHVTKVVTDQGEYPADLVVTAAGIRPATGFLKGVVDLDDHGLIKINDHLQTSDTDIYAVGDATLVPFAPTGKDNRIALATNARRQGRIAAKNLLGENVPMPAVSGSSALSVFDYHFASTGIKEGTADKLGVKTASVLVTDTIRPKFVSEDAGNTKVWFKLTFDPIDGRVLGAQIMSKYDVTANINAISVAIQAKLTVADLAYTDFFFQPGFDRPWNIINIAAQKAAATLN >NZ_CP013130.1|WP_021732698.1|2304327_2305110_+|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MTNNNAPLLSLKNIVTKVNPGTPNEVKILRGLNLDVYDGDFITVLGSNGAGKSTLFNTISGELPVDSGTIQLRDHDITRLSVEKRTAFLARVFQDPKMGTAPRMTVAENLLLASQRGKRRTLKLRQLKKHLPHFQALTETMDGNGLSERLNTATENLSGGQRQALSFLMATEQRPDLLLLDEHTAALDPKTSAQLMTQTNQRVTEEKLTCLMITHHLDDALKYGNRLIVLDQGQIKYDVRDAEKAQLTKEKLLSFFDIIE >NZ_CP013130.1|WP_033612029.1|2303432_2304341_+|branched-chain-amino-acid-ABC-transporter-permease MSMIVSSIGQGLLWATLGVALFLTFRILGFPDMTVEGTFPLGAATAVMAISHGMGPITASLLAFVAGAITGLVTGLLYTKGKVPILLAGILVMTACLSINLRIMGGSSNVSLLGKQTIFSNHFLESLPKYFDSVFVGLVVISIITVLLIVFLQTNLGQAFIVTGDNREMARSIGINTDNMTIMGLMVSNGIIGLGGALIAQNNGYADVSMGIGIIVIALASIIIGEVVFGELTLNQRLVAVTLGSILYQFVRLLVLQLGFNTNDMNLLSALILAICLMLPQFNKVLHLSHVLKKGVARYDEQ >NZ_CP013130.1|WP_033612169.1|2302437_2303436_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MIAFISALIVFLGVAFVMTGKTTATKTTSTKKVPTVGILQLQTHPALDAIHRGVVAGLKEYGYIDGKTVKIDYQNSQGDQSNLKTMSQKFMNENAALTVGIATPAAQALASAANKQTPVMLAGITDPSGSGLIKSDQHPGANITGTSGESPLKSHLDLLRKLVPSAKTIGIIYTTSDHGGEYNAKKFARICKQEGVKYKLYTIANTNDMQQVAETMAANVDAVYAPQDNGVASAMKTLVSVTNKAKIPVIPAVDTMVKAGGLATLSVDQYQLGKLTGEMAAKVLKGKATSDYPIKVITKGKMTINLSEAKKLGIKFPASVIKEAKTKGVIYK >NZ_CP013130.1|WP_033612028.1|2300460_2301336_-|homoserine-O-succinyltransferase MTVTANNGLLAARGEWENADKQVNYQSKQILILNLMPTKLTTERQFLKRFAAGTTDVTVTFMYPASHQFKNLPQAVIAAHYVTLADIRDQYFDGLIVTGAPVETLPFERVDYWQELLVIIDWAQRHVSQTLFECWAAQAGLYAQFGIAKRLVAHKIFGIYSATNTDVKSPLINGLSAGGLLKMPQSRHTALVMPEQLPNGLQVVADNPQVGPLVLTAPKQHAVYVTGHPEYERQTLADEYFRDRRKHLPIQLPEHYFATERLTTVDYSWQTASDRLYQNWLATLNLTKVGY >NZ_CP013130.1|WP_033612027.1|2299171_2300458_-|O-acetylhomoserine-aminocarboxypropyltransferase/cysteine-synthase MTTTNPENYHFETLQVHAGQTVDETGARAVPIYQTTSYVFKDAKQAAGRFALTDAGNIYTRLTNPTTDVVDKRVAALEHGTAGVTLATGSAAITAAILNIAQQGDEIVAANTLYGGTYDLFSVTLNKLGITTHFVDPDDPANFENAINEHTKALYVESIGNPGINLVDFEAIGKIAHDHGIIFIVDNTFGTPYLVRPLEHGADVVVHSATKFIGGHGTTMGGVIVEGGQFDWRASGKYPDFTAPDPQYNGLVFADLGGAAFTTKVRAETLRDTGATISPFNSFLLLQGLESLSLRVERHVANTRKIVAFLKAHTKVAWINYPELEDSPYHDLAAKYFPHGVGSIFTLGLTGGEAAGKALIEHLQLFSLLANVADAKSLIIHPASTTHAQLNEQELLAAGVTPDLIRISVGVENAEDLIADLEQALAQI >NZ_CP013130.1|WP_033612026.1|2297839_2299120_-|homoserine-dehydrogenase MTTTIEVGMLGLGTVGSGVVERLTRSATKIEQTQGIRLHLAAVAVNHLNAHRSVQLPIGTRLTDSLTNVVCDQQIQLIIEVMGTVATAKAAIVAALNQGKAVVTANKDLIATAGPELAALAKKRGCDLFYEASVAGGIPILRTLTDSYATDNVQSVSGIINGTANYILSAMTAGQSYEQALAAAQTAGYAEADPTNDVAGVDAAYKLMILSRFAFGQELTLSQIRPVGITSLPAADCQLAAENGWGVKLLAQIQQHVTGLYCRVAPVAIPTNQSLSQINGVQNAIVIQSEAIGTGLYTGPGAGSTATANSVLNDVLVAAKHLISDHQAVRNPEPAAPLTVARLDQLTQTYLGFSTVSQKELKRRANEADFSVEFITANCYRIAALSAVQRDKLRAELPINLIPIANTTVWPQTSENTITTPVNVAI >NZ_CP013130.1|WP_033612034.1|2313109_2314180_-|histidinol-phosphate-transaminase MKASIKRLKPYVPEKPLATLQAELGVAKLVRLSANENPYGTSPAVAEAVKNWDFAQSNRYPDAEAAVLRQAVAAQQQIDPASIVFSVGLDEMIVMLSRTFLAPDDQVLVSTPTFSEYGLHAEIEGAKLVSVPTLSNDHVDFTSLLRAITPQVKMVWLCNPNNPTGTVESLASIEAFIQQVPTDTMVLIDEAYIDFVPAASQVTAMQLPAKYANVTVMRTFSKAYGLANFRVGYAVFNLQYASTMQTIRLPYNVNSLAQVAALAAINDADFVQTIVQKNATERTKWLTFLDEQGLTYDQSGANFIFFNYPEADRLADYLRQHGYLIRTGLRPGWLRVTIGTADDNRQVQQLMREFKA >NZ_CP013130.1|WP_033612035.1|2314191_2314512_-|phosphoribosyl-ATP-diphosphatase MQNMEELYELIKQRKATPKKGSYTDYLFTKGLDKILKKVGEEATEVIVAAKNPGDDELTYETADLLYHVLVLLVERGVSFDQIKQELAKREGKMSDYKDRPEINNL >NZ_CP013130.1|WP_033612036.1|2314651_2314978_-|phosphoribosyl-AMP-cyclohydrolase MTPDFEKGDGLLTTVVTDADTKDVLMVAWMNAESYQRTVTSGQTWFWSRSRQELWHKGATSGNLQDVVSMTLDCDQDTLLVTVHPHGPACHTGHTSCFFNPVELEQGA >NZ_CP013130.1|WP_033612037.1|2314974_2315733_-|imidazole-glycerol-phosphate-synthase-subunit-HisF MLAKRIIPCLDVADGRVKKGVNFVNLTDVGDPVAIAAAYQQQGADELVFLDIAATNEHRETMATMVEQVSAQVFMPLTIGGGISSVADMQRILRAGADKTAINSAAVANPELIRAGAEKFGNQCIVVAIDAAWDSSTQQYRVYTHGGQQATDLDAIAWAKQAVALGAGELLVTSMDRDGTKAGFDTKLYQALGAAVNVPIIASGGAGNLQDFVDVFEATPVDGALAASVFHFGELTIADVKARLRERGVVVR >NZ_CP013130.1|WP_033612038.1|2315726_2316446_-|1-(5-phosphoribosyl)-5-[(5--phosphoribosylamino)methylideneamino]imidazole-4--carboxamide-isomerase MIFPAIDLRAGQSVRLYQGDFKQATLINSDPVVQAQQINAAGLQQLHMVDLDGAKSGRPENLATITAIRQAFTGTIELGGGIRTYELATGYLKLGIDRLILGSVALTDPQLVKQLLSEFGGERIVIGLDGTNGYVAINGWLEQSQTKMSTLMKTMTASGAKHFIVTDVARDGTMQGPNLALYQELQAQVPTANLIASGGVRNLTDVQVLQASGFKDVIIGKALAEGGVTLAELAGVTKC >NZ_CP013130.1|WP_033612039.1|2316426_2317053_-|imidazole-glycerol-phosphate-synthase-subunit-HisH MFAIVDYDTGNTRNLKKAFDYLQVPTVLTADPQQLAVADAIILPGVGAFAAAMAALKERRLVSVLQTLAQNGKPVLGICLGMQLLFESSSEYGEHSGLGLLSGHVTALPTDLNVKVPQMGWNQNELQRSDGPFASIDAAYTYFVHSYYAVCPVAEIVATVQHGVQVPSIVQRQNVIGMQFHPEKSGQVGLKQLAAFKEMVSANDFSSN >NZ_CP013130.1|WP_033612040.1|2317053_2317638_-|imidazoleglycerol-phosphate-dehydratase-HisB MRQATIKRETKETQIEISLNLDEQSGIEIDTGIGFLNHMLNLFAKHGRFGLVAKCDGDLDVDPHHTTEDTGIVLGECFKQALGDKQGIERYGTEFVPMDETLGQVSVDLSGRSYLVFDAELTNPRLGGLDTETVEDFFQAVAFAAEMNLHARILYGRNTHHKVESLFKAFGRAMRAAVTINPDIQGVNSTKGVI >NZ_CP013130.1|WP_033612041.1|2317710_2318997_-|histidinol-dehydrogenase MKIINKDLASLKRLVQTKTQQLTDLKVESAVRDIIANVIEKGDAAVKAYEAQFDNVDVTDFKLSQAVIDDAYANLDPQVKDALLLAKRNITSFHEKEKATGFIDAEQPGVLRGQKLLPLKRVGLYVPGGTAAYPSTLLMSALPAKIAGVSEVIMVTPPQVDGINPAVLAAAKIAGVDAIYQVGGAQAIAALAYGTESIPAVDKIIGPGNVFVATAKKQVFGQVAIDMVAGPSEIGILADDSADPRQLAADLLSQAEHDQRARPILITDSADLAQAVSDNVTSQLTVLPREAIATEAVNEKGFIAVVAKVEEMFDLMNTVAPEHLEVQLKNPTQYLNLIKNAGSVFLGRYASEPLGDYVAGPNHILPTSGTARFSSPLGVYDFVKRTSFIQYTKDALAKEAPAITTLARVEGLEGHARAIESRFDTYYD >NZ_CP013130.1|WP_033612043.1|2318996_2319653_-|ATP-phosphoribosyltransferase MTETRLKIALTKGRVEQQVLPLLEQAGLDCTQVRNKQRRLIFDSETQPYEFILAKGPDVTTFLERGAADIGIVGSDILTEHESTQYELLDLGVGQCQFVLASTADFDPVAPRRKIIGTKYPLITQRYFDRLGQDVEIVKIEGSVELAPLTGLADAIVDITETGTTIRENHLQIYDYLQPVSTRLVVNRLALKQQQTAIFDLVDRLAAVVNMNNPKEFV >NZ_CP013130.1|WP_033612044.1|2319645_2320797_-|ATP-phosphoribosyltransferase-regulatory-subunit MLKHLLPLGTRDEFGRRARTKQHLIAVIQAHFKQRGLAPIATPLLENEAVFEPYQMGRYQLYRLFSNNGRTLVLRPDMTLPVARFISATNVPLPQKFGYVGDIFRVSRQLSGSYNQITQAGVELVGYASLKAEFECLTIANQLSSELIADAVEIELGDAQFAQRVVASLTDDATEQQAILTALFDKQVPRYTSLIGKYRTQPLYGFLQAWPRLFGRPERIFQELAAAPLPATVQPSLKRLQTVVTWMQQTMPEQAISVDLSSQAPQKYYTGLTFRGYSQAGAGYLFSGGRYDKLLTNFQAEAEPAVGMGLNVDLLTTLATNQQTAYAEQLIYFEPAQWAQAEAYLAKQSHAILSLADDLAGARIEAQRLNAQLIDLTGGVTND |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP013130_7 | 2726056-2726234 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013130_7
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2 spacers
spacers of NZ_CP013130_7
>7.1|2726079|55|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder GGTATTGGCTAGGGTAGTGACGTCAGTCGTATCCCAACCACTAAGATTCAGTGTT >7.2|2726157|55|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder GGTGCTGGCTAAACTAGTAATTACTGGAACAGTCCAATTACTAACATCTAAGGTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013130_7
The CRISPR arrays of NZ_CP013130_7 >merge|NZ_CP013130|7|2726056-2726234|CRISPRCasFinder ATGAGACTTGAACAACTCTGAAAGGTATTGGCTAGGGTAGTGACGTCAGTCGTATCCCAACCACTAAGATTCAGTGTTGTCACCTTAGAACAATTCTGAAAGGTGCTGGCTAAACTAGTAATTACTGGAACAGTCCAATTACTAACATCTAAGGTCGTCACCTTAGAACAATTTTGAAA >NZ_CP013130|7|6|2726056-2726234|CRISPRCasFinder ATGAGACTTGAACAACTCTGAAA GGTATTGGCTAGGGTAGTGACGTCAGTCGTATCCCAACCACTAAGATTCAGTGTT GTCACCTTAGAACAATTCTGAAA GGTGCTGGCTAAACTAGTAATTACTGGAACAGTCCAATTACTAACATCTAAGGTC GTCACCTTAGAACAATTTTGAAA
>NZ_CP013130.1|WP_033610550.1|2724238_2724802_-|WxL-domain-containing-protein MKKFVFGLMISAGLLGATTVVANADTSTGDVTFTGGTLSMSVDATNLAFGSNAITSSNATLDASTTPTVTVSDLRGTSAGWTLTVAQGQQFNTATDGTGSALTNAALTVAGTESDSAVTNGSTTLAPGTTEAAGAAGTVASAKNGTGNGDSTVTFSDSKLAVPGATTKLATGYTTTLTWNLSDTPGN >NZ_CP013130.1|WP_033610551.1|2723117_2724164_-|DUF916-and-DUF3324-domain-containing-protein MQKRLQCILGILLAGVVSLLMMGQTAAADQGVGFEITPVQSSSQVDKSLSYFDLKLKPRQIQTIAVKIHNTASTPITINIGIAKATTNINGVVEYKHTNNRSANLPYDISKLVTTDESQVKLAKGQVKTVKFQIKMPAKSYQGILAGGITFLKKVSATDTKKAVAVNNQYAYTEAVILHGSKDLTTNQLTMNKIAVKQINGRNVINFPLVNHTAAYLNKVQTNIKIYHRGGSKVVYHQKLANGQMAPNSIYKLPLRTGEKALAAGKYTAVVKVTSKKQHWQFKQNFVITQGQADTLNKTAVLKQGPNWWLYIGIGLLLLLLIVLVIWYIRRKQKKIKALEKQLAEKDK >NZ_CP013130.1|WP_033610552.1|2716700_2722679_-|KxYKxGKxW-signal-peptide-domain-containing-protein MQKRRLQQARLVEKRTYKMYKKGRLWLVAGLSTLTIGTGLAQLQVKADTTSTATSQTETTEVTGTSATLTTKATVSTSTASTESDTATEQNDSSDGTQTTSTDSNNNVATTSANSVSVAAEGDASSTTSSSTKTSGVATSETNPDTTATLIKTRTKTNVAETVSVASFSAAIASPSSTSRAAVTTVATVNSATKTYDGKTDTPNRYTVTLADGTKAPADWAATSTANIYTVTDLSDVDTAKFSSEIGTYTIALSTTGITKLSEANNSADITAANVVTGTLTIEQAPVPSAIITIGSASINYGDATPSAYTITVPSQYKVPSAWTLASSATDGTTNTYMIASDSGDIVVPTATESGTYQLTLSNQGLVALQQANPNDAITADAIITGQLVIAAHDLITMGATTVMVNKTLSVVQATVNSRAIVVPADWTISYDDTQTDAIVYNVPIAYTTYSEVVNSGVVGKYTITLTDAAMTTLSDLNNTTFDSTTVGDGVVLVKTSTAVILSPANYGAQASVETPISVLTISHARTRGIDLSYGQALYLILPLLNISQSETAVNNLTEYIIVPSGFKVATTASDGAVQVATDPVSTLTAAIETMMTQNNVTYQGLVVTQLTDYNDRQTFQIHFDQTSVYNGGSFSTLKYTLLPVIAVQSSGVTSGLIGNQVSSPDSAVVYVTDDPNETDGSYSLTLQNYTNIDRVADALGIADAVTIGSGFTDYLYHYTLSAKTITDTYQLVGNDGAALGTVTYTGDSGATYVPMTKLPTTITQDGVTYYLNTNTVASTQNYSGDENTVYTVTYQRYVTTSTDATARITIAPASKVYDNDATTDPSSYTVYLPTEYGAPSNWTIDDTAVVVSGTTAYHVSTNYLDITTIDQNVGTYAVTLNAAGMAALAAANPNLLIAGNVNVGGTLTITKRPVTIALPDTILWANGQEQNIIPVITGVVAGQTIGYTLTSGLTDPGTKMITVTLTSAAVNNNYEITNPASGELTVGAVTVVYNYGYQAADGTFKLTSTISGTVTHGVNINATDYLNYTTSDTAAAHNKIGYTLQPGSTGYQADGTLTDVGGQVVYTYLANTEKITVVYVDQDQNNATLKRVPLSGSFSTSVNYTTANDIEAYEELGYVLVSDQVPTSIRFDQDTEQTYYVYLTHGTTTVTVDHPGRLTVSDLTTTSQRIINYVYADQTPTGLDNVIQTVGYTRTAIVDAVDGTLLSYGNWTTSATGGYPVVVSPIITGYTADTATVAAAMPASVGEVVTKTVIYTVNPETIKIQFIDETTGNQVLATVELRGNYGDSANYTATADIAKYEKLGYELASSDLPNQLTYNQDDPTYRITLVHRRVTVSVDHPGQPGQPIDTNYPGGPKYPADTGRDSLQQTVTRTIMYQYATGKLAAATVNQSVTFERTATFDMVTGKQLIYSDWVVAPGQTASLAVVTSPTITGYQASAAEVGAITVTSQSELQPVVITYTAKPEVASIVFVDVTSGDTLATRLVTGDYDTVSDYSPASQIAAYKRLGYQLTSNNVPITGISFDQDDVMKVYTVKLTHQLTTVTPTKPGEPGQPIDPTNPDGPKYPVGTGIEDLTTRSKRIINYVYGDGQNVAPTVAQTVIFHRTATFDQVTKKVTYTDWDTAEATVTGAYATIDSPVITGYTPSAVRVDGITVKAGDADVQQTVVYQANIETAMVTYIDVTVGHQLGASVTLTGLFGTQADYQPASVIAQYVKAGYVLMSNDYPSMGAVFNQDGVVQRYTVYLAHNKLAITDQDQLTKTVTQTVHYQDQSGQMLQTDTIRALTFTRSGIEDAVTGVATYRDWEPTVLNFTALTAPTIAKYHVLTVTTQAVTITADSVDDVQTLTYVLDNLTPTEPTKPIEPTKPVEPTGNDDLLKPAQSTTPAKSVHLLQPTKSTTIVKADHVTTSNQLSVLEPSQTAIPSRANAVKATPIIKTASEATVQTNKTRAATSRQLPQTSESRRSELMTEILGVTLATLLLGFGELKRKHYEK >NZ_CP013130.1|WP_033610612.1|2716226_2716607_+|MerR-family-transcriptional-regulator MLTFKIPEQQAYFTSKEVTTITGMTKDALRYYEHLGILPDVQRDQHNYRQYSYKNLEALQLIKIFRTLDLDLSLLTPANLAMDNQAKAAAFKQYQQVIHGRLQHLKAIDQLLATKIDYFENHSTNV >NZ_CP013130.1|WP_033610553.1|2715379_2716216_+|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase MQSQLAVIIGGTSGVGKHTAIDLANQNYHVIIVGSKASKGQQARADISRATGNQAVQLVLADLSTKVGVQQLADQLTSMTDHIDILLNSIGVMLPERHLSADGYDLNLVLNYLTHFWTIQALLPLLKHSDQARILLVGALPFVINHAKVSLPDFDAPTTSKYNAMSVTAHATAARVLLTLTLSERLAATNVTINIFHPGYVPDSNFGAGGSWMSRLAGRILGESFSRKNSPIGAWLATAPELTHISGHFYDDRLHQVRLSKQYSHSKANDLWRISSQY >NZ_CP013130.1|WP_033610554.1|2714097_2715060_-|LacI-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MATIFDVAKLAQTSKSTVSRVVSGHGYVSAPVRKRVLAAMHQVNYVPNQLARQLKAQRTKTIGFLVNEYAPVMGDLINYFTQIAQSDGYRVNMYQTINAADELHVLNQLMTHELDAVYIAVRHNHWDKIEPYTKYGPIATWQRIDSNEIYSSYIDHYPLYLQILTYLVNQGYTRIGHVLNDKRASNTQARLHAIAAFKRKYPQIDQEWQQAHQHQQHAGEQAALTWLQTPNPPQVVVLYADYVAAEFIATLRLHGKRVPEDCRVFGFDNSEFGRLMAITTVDAQLQGQAQNAYTYLINRIQQTSRPYQQLTPRLIFRSSC >NZ_CP013130.1|WP_033610555.1|2712610_2714017_-|6-phospho-beta-glucosidase MSHDALKLVTIGGGSSYTPELIEGYIKRREQLPIKEIWLVDIEAGMEKLKIVGAMARRMVKAAGLDWEVHLTLDRQAALKDADFVSTQFRVGRLPARIKDERIPNYYGLIGQETNGAGGIFKAFRTVPVILDIVADMQRLCPQAWLINFTNPSGMITEAIRTYGHWDRVIGLCNVPVMAMLSEPELIGKTLDQLTYKFAGIDHFHWHRVWDESGQEVTMAIIDKLFGDDDAGLPTNIFDVPFFKDQLAAMRMIPCGYHRYYYRQEEMTAHGLAEYRENKTRAQQVTQIEEELFELYRDPELDYKPKQLAERGGAHYSDAACEAIASIYRDKKTHMVVSTLNQGSVPDLPSDHVVEVSAQIGAAGAVPMAFGHFQPAERGWLQLMKNMELVIVEAAVTGDYGLALQAFTMNPLIPSGATAKRVLDELLIAHQAYLPQFADKIQALIAAGIMVQDTVAAELSEVTQAVSD >NZ_CP013130.1|WP_080474929.1|2711835_2712381_-|acetyltransferase MREGDIIKPKYLDQAYLQAIQPIVDANQQRIQQLNATHQPSKIRQLLAAITDQPIDDSVEVRVPLWTDYGRNLKIGNRVFINDNVQITDLGGIELADDVLIGPGAMLLSVNHPLDPAKRHAVEVQPIHIGRNAWIGAGAKVLAGVTVGENAVVGAGAVVTKSVPANTVVAGVPAKVIKKID >NZ_CP013130.1|WP_033610556.1|2711063_2711810_-|SDR-family-oxidoreductase MSIENKVVVITGASSGIGAATAKLLAAKGAKVVLGARREDRLQALSQAIGDNAVYQVTDVTDRQQVRALIDLAVAKFGRVDVLYNNAGTMPQGNLSDRDYDKWQMMLNVNIMGVLNGIGEVLPIMQKQHDGLIIATDSVAGHVVYPTSAVYNGTKYAVRAIMEGLRQEEKGHGIRSTIVSPGAVRTELVNTIGNTQIQAGISELMNADDSQGLALNPEDIANAVLFAIDQPKHVAISEVLVRPAQQEV >NZ_CP013130.1|WP_033610557.1|2709829_2710825_+|iron-ABC-transporter-permease MTIHRRVCTWSVCLAGCILVLALINLSTGTMAIGLPALFQIISGHGTATDMLVLFNFRLPRIILALVVGWALALAGNVLQTITNNPMADPSLLGINNGAGLAVMLLIISAGTNAALTFSLPIVALLGAWLSTALIFLLANQPQRGISSKRLLLVGVALSGCFSALMVLMTLKLSPDNYQFVMNWLAGSLWGTDWAYIGWALPWLVIGSIILLIQLPVLDAFTLGTTTAQTLGLNLKHQQLGLISVAAMLAGVSVAISGGISFIGLITPNLARRIVGSRQRYQLPLAGLLGSTLLLAADTLGKLITTTTELPAGVLVALIGAPYFIYLLVRG >NZ_CP013130.1|WP_033610549.1|2727367_2727757_-|hypothetical-protein MIGAICVIVTPTMIARANDTSTAQVTFQQATTSSSTTNTQTMIKHHDTITKATKQSDNRKIPTRTSRDYRKNDRQTNQGSSWRGYLPQTDEQACRWLLVIMGLLLLILLLMAAYYGNKCERYQHSVLHE >NZ_CP013130.1|WP_033610548.1|2728253_2729102_-|alpha/beta-fold-hydrolase MKFATVKVQGLEMFYREAGSPDKPVFLLLHGFPTASHLFRNLMPMLAKDFHVIAPDFIGFGQSAAPAHDAFDYTFENLTNYVEDFLTVMNIDKFYMYVFDYGAPIGFGIAVKYPERILGIVSQNGNIYQEGLGAKWADREAYWQHPTPALRKSYQAAFKPATIIGQYKGGEQPNSVSPDGYSLDIFYTSLPDYAERQSDLIFDYQNNVKNYPVFQKYVRTYQPEIIAAWGKNDPSFVYQGAQAFAKDDPNVDVHLLNGGHFVLETHWQEIGQLILDKWGHKD >NZ_CP013130.1|WP_052048863.1|2729220_2730075_+|LysR-family-transcriptional-regulator MNTDTLKMFITIAQAGSISAAAQQLGYAQSNVSTKLQQLERDLNTRLFYRNNRGIVLTATGQQLLQRASQIVQLTDRTITDIQHPNDVRGKLRLGTLQTAASTFLPPILSHYHQHYPKVTLTIQTGTTLANTQAVLNYQVDGAIIGGAVNDDTLISIPLMQEPLCLITATSSMADIHHTPILVFPVGCAYRNTLERWLDSQQITLHYPVEFDYLNAIIASVSAGLGMSILPTRVVQPYVDAGVLNAVTLPAPFATLPVTFIYRQDTVMSAPFDHFITAIRHYHD >NZ_CP013130.1|WP_033610547.1|2730296_2731901_-|cation:proton-antiporter MALLISTAVLVVAALVSIVTNRQLLPRLSVNYVSMLIGALIAVVPFLNGLVEQFNSEVFIGLIVAPLLYFEGQNTRLNLVGRHVREIISLTVGMVVLCAVVAGIGTQLLAGVGLPLAFILAAISTPTDATATESVTMGRILPRREQTSLKLESLFNDASGIILLNMATLWYVNGYINYSQTLWDFVYAAGGGIVFGGVISGLIVYVRQKMLRSRLNFINNTYNNGTPLKIIYVMTPFVLYFGAEALGVSGIIAVVVAGLVHNAEGERSSLANPQLASDIHQLVGLMSDILNSIVFIVLGIMLLRTALDRSVSYNGSLIWIVIGVALYLANLFARYGYVRLVHHLARREAWIFALGGIHGAVTFALAFTVAETQVKTADFNLVLMSESLLIILSLLVPTIIFRWLLPSIPTDPTATVRIAGIRQQMIDAGVGQVQQMTISQEFKDAVAFDLRSQNGHTSMRQFIAEWRRMVQHPEYTANQMRELMVIYRQVFQTERDYLQQQYDETHAISEDLFNQLYHEITMAEMVVLEYGVKD >NZ_CP013130.1|WP_033610546.1|2732242_2733067_-|NAD(+)-diphosphatase MFQDIQPHVLKNQNDQQRSPRPGDYVLIGRQQQVLLINGTLPKYEAVAADWAFAPEQYQYLLAVDQAAFFWVDVEAEAMDQYTVGTTRDFRNLTPAWLAFSSATAAHLAWWYDTKRFCGHCGQPLHPGATERSLVCAACGQTIYPTIMPAIIVGVTNGDKILMTKFLSGYNHFSLISGYTEIGETFEDTVRREVFEEVGLEVHNIRYFGSQPWAPSHSLLAGYFADLNENVAIELETDELAKAQWFQRNQIPHNDTNTSLTWTMIEAFRHHQEK >NZ_CP013130.1|WP_033610845.1|2735990_2736716_-|hypothetical-protein MTIDKYIITNHLQEILDDKQIPLETFVKYATAYGLSRAVVYKIAANSQYSMKETVSHKLGLLLEVPHDELIAWSPNMKTYLDDDLRGFSQSRLKVLSDEMSSAGVDLQYQVYSQNDAMNVTTSYAQNRRMYLDGNFRIDTNGLPELWLINFEVINNRIDTTLTELRNFQCQLLRRIVNFSKKVGIYRINYFVTRTDNVQHKNMCVSAEENMQICKELGFKESTRCGSDRFQLHFVKTLLSC >NZ_CP013130.1|WP_033610844.1|2737156_2737408_-|hypothetical-protein MSEKTAANEVTQREMIRIIGLFRKQGFKGNYLSFQHVVDEGATYFVVMGDENNGNQGLFKANLLTDEVAFQYMLDEDHVVSSK >NZ_CP013130.1|WP_033610842.1|2737440_2738160_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MNIKRYGVDAPFALLIYAVFGVGLLWHAYVNRLNYPIGIVLVLGALIFLHTTTRGKYKIFDDAIKHLNLKSDSQVLDLGCGRGALLTRIAKQLGAAGKVTGLDLWLSRDQSHNKMSITQKNVDDLGLTDRVNLVTDDMTKLDFPDESFDVVTSSFAIHNIKNEQVRIHAVKEAIRVLKPGGHLMIIDTGRNIKEYSQIFQDSGLQIAQSRGLGFNGWWATPLTNSYVVAGNKPATKTAK >NZ_CP013130.1|WP_033610841.1|2738408_2738624_-|hypothetical-protein MYDEAELLEAKRQIDSTVHKIQEVIKTFEAKEEPDRYKSQLTLAKRRLKAFGIATQLIDDQLVRVRAENSY >NZ_CP013130.1|WP_003642405.1|2738801_2739494_-|2,3-diphosphoglycerate-dependent-phosphoglycerate-mutase MAKLVLIRHGQSEWNLSNQFTGWVDVDLSEKGVEEAKAAGQKVKEAGLEFDYAFTSVLTRAIKTLHYVLEESDQLWIPETKTWRLNERHYGALQGLNKKETAEKYGDDQVHIWRRSYDVLPPLLSADDEGSAVNDRRYADLDPNIVPGGENLKVTLERVMPFWEDQIAPKLLDGKNVIIAAHGNSLRALSKYIEQISDDDIMDLEMATGEPVVYDFDEKLKVLGKEKLGK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013130_1 | 1.11|303149|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 303149-303178 | 30 | NZ_CP013130.1 | 214307-214336 | 0 | 1.0 |
1. spacer 1.11|303149|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to position: 214307-214336, mismatch: 0, identity: 1.0
tgagttgttaactcaatttggcatgccatt CRISPR spacer tgagttgttaactcaatttggcatgccatt Protospacer ******************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013130_3 | 3.1|1344226|33|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT | 1344226-1344258 | 33 | KU052488 | Lactobacillus phage SA-C12, complete genome | 34540-34572 | 1 | 0.97 |
NZ_CP013130_3 | 3.1|1344226|33|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT | 1344226-1344258 | 33 | MG788324 | Lactobacillus phage PM411, complete genome | 23915-23947 | 2 | 0.939 |
NZ_CP013130_4 | 4.1|1349173|33|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT | 1349173-1349205 | 33 | NC_004305 | Lactobacillus phage phig1e, complete genome | 35000-35032 | 2 | 0.939 |
NZ_CP013130_4 | 4.1|1349173|33|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT | 1349173-1349205 | 33 | X98106 | Lactobacillus bacteriophage phig1e complete genomic DNA | 35000-35032 | 2 | 0.939 |
NZ_CP013130_1 | 1.4|302687|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder | 302687-302716 | 30 | NC_004305 | Lactobacillus phage phig1e, complete genome | 20188-20217 | 3 | 0.9 |
NZ_CP013130_1 | 1.4|302687|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder | 302687-302716 | 30 | X98106 | Lactobacillus bacteriophage phig1e complete genomic DNA | 20188-20217 | 3 | 0.9 |
NZ_CP013130_4 | 4.3|1349295|33|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT | 1349295-1349327 | 33 | JX486087 | Lactobacillus phage ATCC 8014-B1, complete genome | 28003-28035 | 3 | 0.909 |
NZ_CP013130_4 | 4.3|1349295|33|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT | 1349295-1349327 | 33 | JN051154 | Pediococcus phage clP1, complete genome | 17276-17308 | 3 | 0.909 |
NZ_CP013130_4 | 4.6|1349297|31|NZ_CP013130|PILER-CR | 1349297-1349327 | 31 | JX486087 | Lactobacillus phage ATCC 8014-B1, complete genome | 28003-28033 | 3 | 0.903 |
NZ_CP013130_4 | 4.6|1349297|31|NZ_CP013130|PILER-CR | 1349297-1349327 | 31 | JN051154 | Pediococcus phage clP1, complete genome | 17278-17308 | 3 | 0.903 |
NZ_CP013130_1 | 1.8|302951|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 302951-302980 | 30 | NC_004305 | Lactobacillus phage phig1e, complete genome | 30127-30156 | 5 | 0.833 |
NZ_CP013130_1 | 1.8|302951|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 302951-302980 | 30 | X98106 | Lactobacillus bacteriophage phig1e complete genomic DNA | 30127-30156 | 5 | 0.833 |
NZ_CP013130_1 | 1.8|302951|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 302951-302980 | 30 | NC_047983 | Lactobacillus phage Lb, complete genome | 20360-20389 | 5 | 0.833 |
NZ_CP013130_1 | 1.8|302951|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 302951-302980 | 30 | NZ_CP018326 | Lactobacillus plantarum subsp. plantarum strain TS12 plasmid pLP12-2, complete sequence | 16812-16841 | 5 | 0.833 |
NZ_CP013130_1 | 1.8|302951|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 302951-302980 | 30 | NZ_CP014917 | Lactobacillus paracollinoides strain TMW 1.1994 plasmid pL11994-2, complete sequence | 21462-21491 | 6 | 0.8 |
NZ_CP013130_1 | 1.8|302951|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 302951-302980 | 30 | NZ_CP019739 | Lactobacillus brevis strain TMW 1.2108 plasmid pl12108-5, complete sequence | 39301-39330 | 6 | 0.8 |
NZ_CP013130_1 | 1.8|302951|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 302951-302980 | 30 | NC_028835 | Lactobacillus phage CL2, complete genome | 14-43 | 7 | 0.767 |
NZ_CP013130_1 | 1.8|302951|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 302951-302980 | 30 | KR905066 | Lactobacillus phage CL1, complete genome | 14-43 | 7 | 0.767 |
NZ_CP013130_1 | 1.10|303083|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 303083-303112 | 30 | NZ_CP016179 | Vibrio breoganii strain FF50 plasmid unnamed1, complete sequence | 300365-300394 | 7 | 0.767 |
NZ_CP013130_5 | 5.1|1351717|32|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT | 1351717-1351748 | 32 | NZ_CP032091 | Pseudoalteromonas donghaensis strain HJ51 plasmid unnamed1, complete sequence | 637477-637508 | 7 | 0.781 |
NZ_CP013130_1 | 1.1|302489|30|NZ_CP013130|CRT | 302489-302518 | 30 | NZ_CP013139 | Pseudoalteromonas sp. Bsw20308 plasmid pPBSW1, complete sequence | 584013-584042 | 8 | 0.733 |
NZ_CP013130_1 | 1.6|302819|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 302819-302848 | 30 | KF010834 | Paenibacillus phage phiIBB_Pl23, complete genome | 18134-18163 | 8 | 0.733 |
NZ_CP013130_1 | 1.6|302819|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 302819-302848 | 30 | KT361653 | Paenibacillus phage Paisley, complete genome | 19322-19351 | 8 | 0.733 |
NZ_CP013130_1 | 1.6|302819|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 302819-302848 | 30 | NC_048714 | Paenibacillus phage Yerffej, complete genome | 19601-19630 | 8 | 0.733 |
NZ_CP013130_1 | 1.6|302819|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 302819-302848 | 30 | NC_028746 | Paenibacillus phage Harrison, complete genome | 19324-19353 | 8 | 0.733 |
NZ_CP013130_1 | 1.8|302951|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 302951-302980 | 30 | MN855786 | Bacteriophage sp. isolate 70, complete genome | 25097-25126 | 8 | 0.733 |
NZ_CP013130_1 | 1.8|302951|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 302951-302980 | 30 | KR905069 | Lactobacillus phage iLp84, complete genome | 11-40 | 8 | 0.733 |
NZ_CP013130_3 | 3.1|1344226|33|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT | 1344226-1344258 | 33 | MK448665 | Streptococcus phage Javan1, complete genome | 15090-15122 | 8 | 0.758 |
NZ_CP013130_1 | 1.6|302819|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 302819-302848 | 30 | NZ_CP024793 | Nostoc flagelliforme CCNUN1 plasmid pNFSY08, complete sequence | 671086-671115 | 9 | 0.7 |
NZ_CP013130_1 | 1.6|302819|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 302819-302848 | 30 | NZ_CP013332 | Fusobacterium hwasookii ChDC F174 plasmid unnamed1, complete sequence | 28055-28084 | 9 | 0.7 |
NZ_CP013130_1 | 1.7|302885|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 302885-302914 | 30 | MG592505 | Vibrio phage 1.134.O._10N.222.52.B8, partial genome | 6929-6958 | 9 | 0.7 |
NZ_CP013130_1 | 1.7|302885|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 302885-302914 | 30 | MG592457 | Vibrio phage 1.082.O._10N.261.49.E4, partial genome | 8255-8284 | 9 | 0.7 |
NZ_CP013130_1 | 1.7|302885|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 302885-302914 | 30 | MG592606 | Vibrio phage 1.240.O._10N.261.52.F8, partial genome | 7440-7469 | 9 | 0.7 |
NZ_CP013130_1 | 1.7|302885|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 302885-302914 | 30 | MG592483 | Vibrio phage 1.110.O._10N.261.52.C1, partial genome | 7172-7201 | 9 | 0.7 |
NZ_CP013130_1 | 1.7|302885|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 302885-302914 | 30 | MG592593 | Vibrio phage 1.226.O._10N.261.48.E5, partial genome | 8855-8884 | 9 | 0.7 |
NZ_CP013130_1 | 1.7|302885|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 302885-302914 | 30 | MG592488 | Vibrio phage 1.115.A._10N.222.49.B11, partial genome | 8605-8634 | 9 | 0.7 |
NZ_CP013130_1 | 1.7|302885|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 302885-302914 | 30 | MG592489 | Vibrio phage 1.115.B._10N.222.49.B11, partial genome | 8604-8633 | 9 | 0.7 |
NZ_CP013130_1 | 1.7|302885|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 302885-302914 | 30 | MG592543 | Vibrio phage 1.176.O._10N.261.55.F5, partial genome | 6930-6959 | 9 | 0.7 |
NZ_CP013130_1 | 1.7|302885|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 302885-302914 | 30 | MG592517 | Vibrio phage 1.148.O._10N.286.54.A10, partial genome | 7231-7260 | 9 | 0.7 |
NZ_CP013130_1 | 1.7|302885|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 302885-302914 | 30 | MG592490 | Vibrio phage 1.116.O._10N.222.52.C10, partial genome | 6929-6958 | 9 | 0.7 |
NZ_CP013130_1 | 1.7|302885|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 302885-302914 | 30 | MG592539 | Vibrio phage 1.172.O._10N.261.52.F5, partial genome | 6930-6959 | 9 | 0.7 |
NZ_CP013130_1 | 1.10|303083|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 303083-303112 | 30 | AP022644 | Bacillus wiedmannii PL1 plasmid pBwiPL1-1 DNA, complete sequence | 351577-351606 | 9 | 0.7 |
NZ_CP013130_4 | 4.7|1349358|31|NZ_CP013130|PILER-CR | 1349358-1349388 | 31 | NZ_AP014579 | Burkholderia sp. RPE67 plasmid p1, complete sequence | 1241635-1241665 | 9 | 0.71 |
NZ_CP013130_4 | 4.7|1349358|31|NZ_CP013130|PILER-CR | 1349358-1349388 | 31 | NC_016626 | Burkholderia sp. YI23 plasmid byi_1p, complete sequence | 1093440-1093470 | 9 | 0.71 |
NZ_CP013130_1 | 1.1|302489|30|NZ_CP013130|CRT | 302489-302518 | 30 | KY971610 | Pseudomonas phage PspYZU05, complete genome | 60876-60905 | 10 | 0.667 |
1. spacer 3.1|1344226|33|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT matches to KU052488 (Lactobacillus phage SA-C12, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
tctgcctccaatagatccgggttctcgtgcacg CRISPR spacer tcttcctccaatagatccgggttctcgtgcacg Protospacer *** *****************************
2. spacer 3.1|1344226|33|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT matches to MG788324 (Lactobacillus phage PM411, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tctgcctccaatagatccgggttctcgtgcacg CRISPR spacer tccgcctccaatagttccgggttctcgtgcacg Protospacer **.*********** ******************
3. spacer 4.1|1349173|33|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004305 (Lactobacillus phage phig1e, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
acaaacgaaatccgcgagttgaggtagaggaag CRISPR spacer acaaacgaaatccgcgagtagagatagaggaag Protospacer ******************* ***.*********
4. spacer 4.1|1349173|33|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT matches to X98106 (Lactobacillus bacteriophage phig1e complete genomic DNA) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
acaaacgaaatccgcgagttgaggtagaggaag CRISPR spacer acaaacgaaatccgcgagtagagatagaggaag Protospacer ******************* ***.*********
5. spacer 1.4|302687|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder matches to NC_004305 (Lactobacillus phage phig1e, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
tcataaacgacttggtacccattagaacgt CRISPR spacer tcataaacgacttggtacccattaacacat Protospacer ************************. **.*
6. spacer 1.4|302687|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder matches to X98106 (Lactobacillus bacteriophage phig1e complete genomic DNA) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
tcataaacgacttggtacccattagaacgt CRISPR spacer tcataaacgacttggtacccattaacacat Protospacer ************************. **.*
7. spacer 4.3|1349295|33|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT matches to JX486087 (Lactobacillus phage ATCC 8014-B1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.909
tcaacgataataagccgtgggtctggcaacgtg CRISPR spacer tcaacgataatcagccgcgggtctggcaacgta Protospacer *********** *****.**************.
8. spacer 4.3|1349295|33|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT matches to JN051154 (Pediococcus phage clP1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.909
tcaacgataataagccgtgggtctggcaacgtg CRISPR spacer tcaacgataatcagccgcgggtctggcaacgta Protospacer *********** *****.**************.
9. spacer 4.6|1349297|31|NZ_CP013130|PILER-CR matches to JX486087 (Lactobacillus phage ATCC 8014-B1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.903
aacgataataagccgtgggtctggcaacgtg CRISPR spacer aacgataatcagccgcgggtctggcaacgta Protospacer ********* *****.**************.
10. spacer 4.6|1349297|31|NZ_CP013130|PILER-CR matches to JN051154 (Pediococcus phage clP1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.903
aacgataataagccgtgggtctggcaacgtg CRISPR spacer aacgataatcagccgcgggtctggcaacgta Protospacer ********* *****.**************.
11. spacer 1.8|302951|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_004305 (Lactobacillus phage phig1e, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
cggaggtgtggtggtatgtaatggcaaaag CRISPR spacer cggaggtgtggtggtatgtaatgaaacgaa Protospacer ***********************. * .*.
12. spacer 1.8|302951|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to X98106 (Lactobacillus bacteriophage phig1e complete genomic DNA) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
cggaggtgtggtggtatgtaatggcaaaag CRISPR spacer cggaggtgtggtggtatgtaatgaaacgaa Protospacer ***********************. * .*.
13. spacer 1.8|302951|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_047983 (Lactobacillus phage Lb, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
cggaggtgtggtggtatgtaatggcaaaag CRISPR spacer cggaggtgtggtggtatgtaatgaaacgaa Protospacer ***********************. * .*.
14. spacer 1.8|302951|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP018326 (Lactobacillus plantarum subsp. plantarum strain TS12 plasmid pLP12-2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
cggaggtgtggtggtatgtaatggcaaaag CRISPR spacer cggaggtgtggtggtatgtaatgaaatccg Protospacer ***********************. * *
15. spacer 1.8|302951|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP014917 (Lactobacillus paracollinoides strain TMW 1.1994 plasmid pL11994-2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
cggaggtgtggtggtatgtaatggcaaaag CRISPR spacer tggaggtgtggtggtatgtaatgaaactaa Protospacer .**********************. * *.
16. spacer 1.8|302951|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP019739 (Lactobacillus brevis strain TMW 1.2108 plasmid pl12108-5, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
cggaggtgtggtggtatgtaatggcaaaag CRISPR spacer cggaggcgtggtggtatgtaatgacacgta Protospacer ******.****************.** . .
17. spacer 1.8|302951|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_028835 (Lactobacillus phage CL2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cggaggtgtggtggtatgtaatggcaaaag CRISPR spacer gggaggtgtggtgatatgtgatggttgaaa Protospacer ************.*****.****. .**.
18. spacer 1.8|302951|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KR905066 (Lactobacillus phage CL1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cggaggtgtggtggtatgtaatggcaaaag CRISPR spacer gggaggtgtggtgatatgtgatggttgaaa Protospacer ************.*****.****. .**.
19. spacer 1.10|303083|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP016179 (Vibrio breoganii strain FF50 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ctggcgaccaaaatcaaaatctgccttcat CRISPR spacer ttcttggccaaaatctaaatctgccttgat Protospacer .* .*.******** *********** **
20. spacer 5.1|1351717|32|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032091 (Pseudoalteromonas donghaensis strain HJ51 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
agcaaaaaatcgctaaccgcttgcgt-ggactg CRISPR spacer agccaaaaatcgctaaccgtttgtttcatact- Protospacer *** ***************.***. * . ***
21. spacer 1.1|302489|30|NZ_CP013130|CRT matches to NZ_CP013139 (Pseudoalteromonas sp. Bsw20308 plasmid pPBSW1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
agtacttataaagcaattaaccatgctact CRISPR spacer caaggtgataaagcaattaaccctgctatt Protospacer . . * *************** *****.*
22. spacer 1.6|302819|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KF010834 (Paenibacillus phage phiIBB_Pl23, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
taatattaattgttagcttcagctcaaaaa----- CRISPR spacer aaatatcaattgttagcttcatct-----attcct Protospacer *****.************** ** *
23. spacer 1.6|302819|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KT361653 (Paenibacillus phage Paisley, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
taatattaattgttagcttcagctcaaaaa----- CRISPR spacer aaatatcaattgttagcttcatct-----attcct Protospacer *****.************** ** *
24. spacer 1.6|302819|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_048714 (Paenibacillus phage Yerffej, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
taatattaattgttagcttcagctcaaaaa----- CRISPR spacer aaatatcaattgttagcttcatct-----attcct Protospacer *****.************** ** *
25. spacer 1.6|302819|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_028746 (Paenibacillus phage Harrison, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
taatattaattgttagcttcagctcaaaaa----- CRISPR spacer aaatatcaattgttagcttcatct-----attcct Protospacer *****.************** ** *
26. spacer 1.8|302951|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MN855786 (Bacteriophage sp. isolate 70, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
cggaggtgtggtggtatgtaatggcaaaag CRISPR spacer aggaggtgtggtgatatgtaatgaattttg Protospacer ************.*********. *
27. spacer 1.8|302951|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KR905069 (Lactobacillus phage iLp84, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
cggaggtgtggtggtatgtaatggcaaaag CRISPR spacer gggaggtgtggtgatatgtaatgcgactga Protospacer ************.********* * ..
28. spacer 3.1|1344226|33|NZ_CP013130|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448665 (Streptococcus phage Javan1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
tctgcctccaatagatccgggttctcgtgcacg CRISPR spacer ccaacctccaatagatctgggttttcgtagatg Protospacer .* .*************.*****.****. *.*
29. spacer 1.6|302819|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP024793 (Nostoc flagelliforme CCNUN1 plasmid pNFSY08, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
taatattaattgttagcttcagctcaaaaa CRISPR spacer acgccataatttttagcttcagctcaaatt Protospacer .. ***** ****************
30. spacer 1.6|302819|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP013332 (Fusobacterium hwasookii ChDC F174 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
taatattaattgttagcttca-----gctcaaaaa CRISPR spacer taatatttattgttagcttcatagtcattt----- Protospacer ******* ************* ..*.
31. spacer 1.7|302885|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MG592505 (Vibrio phage 1.134.O._10N.222.52.B8, partial genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aggtcggtcattttcctattgagttgcata CRISPR spacer ctagcgatcagtttcctattgagttgctac Protospacer . **.*** ****************
32. spacer 1.7|302885|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MG592457 (Vibrio phage 1.082.O._10N.261.49.E4, partial genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aggtcggtcattttcctattgagttgcata CRISPR spacer ctagcgatcagtttcctattgagttgctac Protospacer . **.*** ****************
33. spacer 1.7|302885|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MG592606 (Vibrio phage 1.240.O._10N.261.52.F8, partial genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aggtcggtcattttcctattgagttgcata CRISPR spacer ctagcgatcagtttcctattgagttgctac Protospacer . **.*** ****************
34. spacer 1.7|302885|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MG592483 (Vibrio phage 1.110.O._10N.261.52.C1, partial genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aggtcggtcattttcctattgagttgcata CRISPR spacer ctagcgatcagtttcctattgagttgctac Protospacer . **.*** ****************
35. spacer 1.7|302885|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MG592593 (Vibrio phage 1.226.O._10N.261.48.E5, partial genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aggtcggtcattttcctattgagttgcata CRISPR spacer ctagcgatcagtttcctattgagttgctac Protospacer . **.*** ****************
36. spacer 1.7|302885|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MG592488 (Vibrio phage 1.115.A._10N.222.49.B11, partial genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aggtcggtcattttcctattgagttgcata CRISPR spacer ctagcgatcagtttcctattgagttgctac Protospacer . **.*** ****************
37. spacer 1.7|302885|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MG592489 (Vibrio phage 1.115.B._10N.222.49.B11, partial genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aggtcggtcattttcctattgagttgcata CRISPR spacer ctagcgatcagtttcctattgagttgctac Protospacer . **.*** ****************
38. spacer 1.7|302885|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MG592543 (Vibrio phage 1.176.O._10N.261.55.F5, partial genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aggtcggtcattttcctattgagttgcata CRISPR spacer ctagcgatcagtttcctattgagttgctac Protospacer . **.*** ****************
39. spacer 1.7|302885|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MG592517 (Vibrio phage 1.148.O._10N.286.54.A10, partial genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aggtcggtcattttcctattgagttgcata CRISPR spacer ctagcgatcagtttcctattgagttgctac Protospacer . **.*** ****************
40. spacer 1.7|302885|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MG592490 (Vibrio phage 1.116.O._10N.222.52.C10, partial genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aggtcggtcattttcctattgagttgcata CRISPR spacer ctagcgatcagtttcctattgagttgctac Protospacer . **.*** ****************
41. spacer 1.7|302885|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MG592539 (Vibrio phage 1.172.O._10N.261.52.F5, partial genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aggtcggtcattttcctattgagttgcata CRISPR spacer ctagcgatcagtttcctattgagttgctac Protospacer . **.*** ****************
42. spacer 1.10|303083|30|NZ_CP013130|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to AP022644 (Bacillus wiedmannii PL1 plasmid pBwiPL1-1 DNA, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ctggcgaccaaaatcaaaatctgccttcat CRISPR spacer tcttagctgaaaatgaaaatctgccttcat Protospacer .. * . ***** ***************
43. spacer 4.7|1349358|31|NZ_CP013130|PILER-CR matches to NZ_AP014579 (Burkholderia sp. RPE67 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
tgatgccgttagcgcgttccttgatatcaca CRISPR spacer ggatgccattggcgcgttccttgagcaagct Protospacer ******.**.************* .*
44. spacer 4.7|1349358|31|NZ_CP013130|PILER-CR matches to NC_016626 (Burkholderia sp. YI23 plasmid byi_1p, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
tgatgccgttagcgcgttccttgatatcaca CRISPR spacer ggatgccattggcgcgttccttgagcaagct Protospacer ******.**.************* .*
45. spacer 1.1|302489|30|NZ_CP013130|CRT matches to KY971610 (Pseudomonas phage PspYZU05, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.667
agtacttataaagcaattaaccatgctact CRISPR spacer gacgtacgtaaagcaattacccatgctaca Protospacer ..... ..*********** *********
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
38158 : 50996
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013130|38158:50996|DBSCAN-SWA TTTAAAAGCCTAAATAATTGGCTAACTTGTTGGCCGCCTGTTGATTTTGGCCCTTAGTGACGTGTGTGTAAACATTTAAGGTTGTTGCAACGTCCTCATGGCCTAATCGGGTTTGTACTTCTTTAATGGTGGCACCAGCGGCAAACAAAGCGGAGGCGTGACTGTGTCGAAAGCCATGCACGGTAATACTAGGGGTTAGGTGGTAGTCAGTGATGATCCGCTTTAACCACTTACCCGGAGTATTAAGCGATTTAAAACCGTTCTTAGTGTTAGCAAAAACTAACTGATCCGGTTGTAACGTATTAAAACCTAAAAACAAATAATATTCACGTTGCTGTTTATGCCAGCGTTGTAATATTTCTACCGTCGTATTGTCCAAGCTGACAGTGCGGCGGCCTTTTTTTGTCTTAGGGGCTTGAATAATCTGCTTGCCGCGTTTCCCTTGGGTGAGTGTTTTATTAACCCGCAAGGTCTTATGGACAAAGTCAATATCTTGCCATGTCAGGGCTAAACACTCGCCGCGTCGTACGCCTGCAAACGCCAGTACCCGGAAGAGACAATACTTTTCGGTCTCTTTTTGCTGGTCAATGCACTTGAAGAACGTCTTTAGTTGATCGCGATCCCAGAAGTTGTCGGGCTTATCACCCCAACTATCAGGCTTAACTGGCATTGTAATCATTCTAGCTGGATTATGTGTGATATAGCCGTGTTTTAAGCCGTATTCAAAGACTGCTACCAGATAATTGTACCAACGCTTGTAATTGTACGTGACTTCTTTAAACCACAGATTAACAGCACGCTGGCACTGGTTGACGGTGATGGTTCGCAACCGCTTGTTACCAAACAACGGCAAGATGTGATTATCGAACATGCCAGCAGTCCGTGCCCAAGTGCTTTCACGAACGGTATTAATATACTGGTCGTACCATTCGTGATAAACGTCAACGAAAAGAATATTATTATCAACTGGTAAAACGGGTTCTTGCTGTAACTCTACTTCAATTCTGGATAAAGCAATACGGGCAGCGCTTTTTGATTTAAAACCCCGCCGCCGGGTTGACTTCTTTTTACCAGTTTGAGGATCAACACCTAAATAAACTTGAAACTGATAACGGGTATTCCCGTCCTTGTCCTGATACTTCTTGATTGTTGCCATTTATAATTTCCTCCATAACGTACCTTGAGCGGGGCAGTGTTATGTAAGAAAAAATAGTAGCTATTAGAAATATTCCTCTATGCTTTCATTGAGTGTTTTTTCATAATCGTAAAATTCTTCTTTTGTTATGTCTCGTTTCATTAATAAGCTAATTCCAGAAATAAAAAACGACAAATCACCGAGGAAACGTTTATCTACTTTACTACTAGAATAGTTTTTTAAATAGATTAAAATATTACTCAAAAAAATTCGCTGTTCAGGGGGCAGTTTGTCAAAATAGCTACTTTTAAAGGCATCCTTTGCAAATGATGTTTCCATATCAATTGCTCGATCTATAGAATTTTGCATAGTTAGATTAATCTCATTGACTTTTTTCTTTTCCTGCTGATTCAAAGATTTTTTACCAGAAATAGAGTCACTAAATTGATTGATTTCTTCTAAGCTTAATTTAGATCCATTAAGCATGAACTCTGTTGTAACACCACCAAGTTTAGCTATTGATTGTAATCTTTCTTGACTAGGAACATTAAGCCCTCTTTCCCACCTTGAGACATTACTTGCTGAAGCAGATGGTATTACCTTTTTTCCAAATTCAGCTTGATCCAATTGAAGATTCTGCCGAATGGATTTTATACGTATACCGAGACTTGTTTTTTTATTATCTGAAAATCTAGCCATGAGTGTACCTCCTTTACTTAGATATTTTACCATTGACGCAAAAATTGCACAAACCTATTGACAATTAAAATAAAGCGGTGTAAATTGAAAATACTAAAAAGACGCAAAAATGACGTCCTTAGAGAGGGGAAAGTAATAATGAACACAAATTTGCCAAAACAAATGAATTATAAGCAGGCGTTAAAGTTCTTCAACATTGGTTCCTATAACACGTTGTATTCCTACATCAAAGAGGGACTTAAAGTTACACAAGTAGGCAGTGTCAAGCGAATTGATCAAGATGATGCAAACAAATTCTTAGAAGCACATAAAATTTAATGCCTTGAGCGGGGCAGAATAAACTTAAGGAGGTGATTTCATGATAGCAACAGCAATCTTATGGGCAATCAAGTTTATGATTGTGTCGTTTGTTGGCAACGTGGTGGCTAAGTTAATCAAGAACCCGCGTCGGTATTTTGGAATGTGAGGTCAGTCGCATGGGAAAGCATACAAAAAAGGCCTACTTTACTTTGGCGAGTAGTAGGTCGAAGAGATAATCAAAAATATGCTTTCCCTTATTTTAACACGAATAAGGAGAATGGAAAATGACAAATAGTGAATTAGTGGAACAAGCTAAGAAGTTATCAGTGGCACGTGACAATCTGAAAATGGCAATTGATTACTTAGATATGGTATCTGCGTCAGTTAGTGGTGGGGACACATGGGCAGGACAATTATTTTTCTCAAACCACCGCGCTGGAAATGTTGTTGAAAACATGCAAAATGTTGCTGATTCGATTATGGCAGTTAGCAATGACATTTGTCCCGAAGATTAGGTGGTTATATGAAAGGAATTTGTAATGAAGAAAACTAAAGATTTAGATGAATTAGAGTTTGAGGCTGGATCACTCGTAACTTCAATAGATGCTTTAGATGATTTTGTCTTTGACTACTTCGTTAATAAAAATATTGATCATTCTGAAAAATTGAGTGGACTAATCACTGTCATAAAGCAATATGCAGAAAATCACTATGCAGATATTTCTGAGTTTAATACGTTTGGCGGTGATGAACAATGAAAGAGTTCGCAACGCTAGATAAAGCCATTGAGCTGGCGCAGCGAGGCTATGCGGTTTACCCACTGATTGAAAACACGAAGAAGCCACCTAAAGGGGTGGCGGGCTACCAAGCCGCAACTAGTGACCAGAACACCATCTTCGCATGGTTTAAAAAGCACCCCACTTACAGCTTAGGCTTGCGGCTAGATTTATCGGATTTATTGGTTGTTGATATTGATATGCACGAGCCAACTAAAAATGGTCGGGCTAGCTTGGCACAACTATTTAAGCAAGGACAGACGTTGCCGAATGATACCTACATTGAACGGACGGCTAACGGTGGCGTACATTACTTTTTGAAATATGCGGGTGCTAAGGTTCGCAAGATTGACGTTTGGCCCGGTATTGACTTGTTAAGTGACTTCACGGTGATTGCACCAAGTGAAATTAACGGCAAACCATATACTCCATTAGATGGCCGAACCTTGGCTGATATTAAGCCAGCTCCTCAATGGTTAGTCGATAAGTTGGCGGGGCAAAAAGTGAACTGGACGTCAGAACACGCCTATGCCACACGCCAAAAGAAGTATACCGGTCGCTTGTTAGATGAAATGGTAACCGGGACAACCCAAGGCAATCGCAACGCTTGGTTAACTAAAATTGCCGGTCGTATGTTTGGCGTCGGTGCTGCTCCCAAGACAGTCTATAACATGCTGTCAGTGATCAATGATTCGTTCGTTGATCCGGCACTACCAAGCAAGGAAGTTAATGTGATTTTTCAATCCATTTTAAAACGAGAGAGTAAGGGGGTTCATTAATGGGCAAAGCAATGGATTTACCAGCAGAGACCCGAGAAGCGGCCAACAATGTTATCAAAATGCAACGTGACGCTGATTGGCAGAACGATTTCAAGAAGAATTCGGACGATGGAATTAAAACACAGTCTCTTTACAATATCCGCTTAATTATGGAACATGATGAAATGCTGAAAGGGCTAGTTGTCTTTGACGAGTTCTCGGAACAAATCGTTAAAACACCACAAGCAGAAAATTCACCGTTCAAAAAAGGTTTTTGGAATGATAGTGATGACACGTTATTGAGAAGTTATATTGAGGATCATTACAACTTGTTATTCAGCAAGGAAAACATTACCGACGCGGTAGTTACAGAGGCACGCCGCAAGACAATCAATCCGGTTAAGGCTCGTATTGAAGCGGTAGAATGGGACGGCCAGCCACGTGCTGAACGTTATTTCATTGATTGCTTAGGTGCCGAAGACAATCATTACACCCGCACCATCACTAAGAAATGGCTAACTGGTCTTATTGCCCGGGCCTATGTTCCCGGAGTTAAGTTTGAAATTGTTCCTATCTTAGAGGGAAGCCAAGGACTTGGCAAGAGTACGGCTGGTAAAAATCTATACCCGGATAAATTCAATGATTTGTTGAAAGGAATGGGTAAGCAGAAAGACGATTATCAACAGTTGCAAGGTAGTTGGATTATTGAAGTTGCCGAGCTTTCCGCCATGAAGAAGACGGATATTGAGGGAATTAAAAATTTTATTAGTGCACAAACCGACACATATCGGAATAGTTACGGCCGCTATGCGTTACCGCACCCACGTAAATGCGTATTTATTGGCACAACTAACCAAACTGACTATTTAAAGGACGCGACCGGTGAACGGCGCTTCTATCCAATTAAATGTGGGGTCAACAAGGCCAAATTAGATGTATGGCACCCGGACGAGAATTACACGCTTCAAGTATTGGCGGAGGCCGCGTACTGGTTTAGGAATGGTGAACTGCTATATCTGGATCAGGACACTATGAAAGAGGCTAAGGCGTATCAGATGGCTGCGGAAGCTGTCAACCCTATGCGAGATGCCATCGAAGCGTTTTTAGCAATGGAAGTTCCCACAGATTGGGAAAATATGAGTACCGGCTTAAAGCAAAGCTATGTCAGTGACTACGGCCATCATTCTAAGTGGCTAAAAGATCAAGTCAGTAATGAACGGAAACTACTCAACCAAACAACAACTCTGGAAATCATGGAAGTTGTCTTCCATAAAACAGTCGATCGTTTTTTAACCGGGCAAACAAACTCGGAAGCTAAGCGAATCAAGCTAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013130|38158:50996|45832_47536_+|WP_033611504.1|terminase|DBSCAN-SWA MIEYVDQVLSGQVLAGQKIKWACERFKRDLSRSKDDSFPFYYDEAKAAQAVKFIELMPKTDGSQLTMQPFQKWLISELYGWREKTTGNRRYDRAFISMARKNGKTYLASGMAANGLLRERQPARNRQVLFVSNALKQAKLGYDMLSSGLRQVRKQSKYMRQRIKVQKQAITDLETDSQALALASDTSTLDGYAGTTVILDEFHEAKDRKIYNVLKSGQAQEDNSLLAVVSTSGLNLNVPMHAEYEMLTDVLKGKIEADRYFVAIWELDDREEVYDQANWIKANPLFSEPHVKQRMTEKIQADVDLAIKQNNLIPILVKNFNMWLQASEDSYISADDWAAGKLAKVPDLHNRDAYIGIDLSKSNDLTAVSWLVPIGNGQFYCDSHSFVGTKYGLDSKIKRDGIDYRSMERAGECSITRLDSGIIDYDDLFDFVQKLVGKYNWKVKAIAYDPYNAQTLITKFEKLSYPLFEVRQGTKTLNIPTRNFRDQLYDDKIKHNGNKILAYAVNNAILKVLNNGWQLDKARNSNRIDPIAALINAFVAGMDYYQESEDQQHAEDYYKTATAADLF >NZ_CP013130|38158:50996|40830_41049_+|WP_033611511.1|DBSCAN-SWA MKKTKDLDELEFEAGSLVTSIDALDDFVFDYFVNKNIDHSEKLSGLITVIKQYAENHYADISEFNTFGGDEQ >NZ_CP013130|38158:50996|50726_50996_+|WP_033611500.1|head,tail|DBSCAN-SWA MAVTVDDIKLSLRIDVTEDDPMIQSYLDAAKDYVQTAVSKNEDLTVYKQYDFAVSLLTQFWYQNRVTDMTKTPYQVVSMIQQLRGLVTG >NZ_CP013130|38158:50996|40575_40806_+|WP_033611512.1|DBSCAN-SWA MTNSELVEQAKKLSVARDNLKMAIDYLDMVSASVSGGDTWAGQLFFSNHRAGNVVENMQNVADSIMAVSNDICPED >NZ_CP013130|38158:50996|45362_45836_+|WP_033611505.1|terminase|DBSCAN-SWA MSQKVKALASMKKHLTNDERDQRKDAEKALFDYPVLDLTPPDWLHDRALTEWQRVAPYLKANTPISELDRAMLASYCRAYATVQTCENDIRKNGLVQTNQETGVRKPNPYVALQSQAMKDLKSLANDLGMSLSSRARMELNKQKDETPEDTFEAMLS >NZ_CP013130|38158:50996|38158_39313_-|WP_033611514.1|integrase|DBSCAN-SWA MATIKKYQDKDGNTRYQFQVYLGVDPQTGKKKSTRRRGFKSKSAARIALSRIEVELQQEPVLPVDNNILFVDVYHEWYDQYINTVRESTWARTAGMFDNHILPLFGNKRLRTITVNQCQRAVNLWFKEVTYNYKRWYNYLVAVFEYGLKHGYITHNPARMITMPVKPDSWGDKPDNFWDRDQLKTFFKCIDQQKETEKYCLFRVLAFAGVRRGECLALTWQDIDFVHKTLRVNKTLTQGKRGKQIIQAPKTKKGRRTVSLDNTTVEILQRWHKQQREYYLFLGFNTLQPDQLVFANTKNGFKSLNTPGKWLKRIITDYHLTPSITVHGFRHSHASALFAAGATIKEVQTRLGHEDVATTLNVYTHVTKGQNQQAANKLANYLGF >NZ_CP013130|38158:50996|43875_44067_+|WP_027821889.1|DBSCAN-SWA MKIKMVHADNMEELFAQVSEVDKAQDIDDELIGTSIDFIKVSDSKMIYCEALVYRTGDDDEEL >NZ_CP013130|38158:50996|40129_40309_+|WP_033611513.1|DBSCAN-SWA MNTNLPKQMNYKQALKFFNIGSYNTLYSYIKEGLKVTQVGSVKRIDQDDANKFLEAHKI >NZ_CP013130|38158:50996|41845_43240_+|WP_033611509.1|DBSCAN-SWA MGKAMDLPAETREAANNVIKMQRDADWQNDFKKNSDDGIKTQSLYNIRLIMEHDEMLKGLVVFDEFSEQIVKTPQAENSPFKKGFWNDSDDTLLRSYIEDHYNLLFSKENITDAVVTEARRKTINPVKARIEAVEWDGQPRAERYFIDCLGAEDNHYTRTITKKWLTGLIARAYVPGVKFEIVPILEGSQGLGKSTAGKNLYPDKFNDLLKGMGKQKDDYQQLQGSWIIEVAELSAMKKTDIEGIKNFISAQTDTYRNSYGRYALPHPRKCVFIGTTNQTDYLKDATGERRFYPIKCGVNKAKLDVWHPDENYTLQVLAEAAYWFRNGELLYLDQDTMKEAKAYQMAAEAVNPMRDAIEAFLAMEVPTDWENMSTGLKQSYVSDYGHHSKWLKDQVSNERKLLNQTTTLEIMEVVFHKTVDRFLTGQTNSEAKRIKLLMDNMDGWEAKRIRINGKQPHGYVRVQ >NZ_CP013130|38158:50996|48787_50317_+|WP_033611501.1|capsid|DBSCAN-SWA MKQDRRLTIDAELRAQTPQSETPEDGPAENSADPQPKDSQTSKGKTISGYAIVWNSPSKDLGGFTEVVTPKALDGVDLSNVLMLNNHDYTQVLASAKAGTLTLETDDKGLHFTAQLPNTSFANDVYEEVQSGNVDSCSFGFDSDDDTDEWTKDDGGNITRTINQVKSLFDVSVVAVPAYDDTNVQVDTRSYEKFINQEKEPDNMAKQTIIDPNGNENKTGIPAFEQYVRTHGETRDGLKTDGVSAVIPKELITPVFQLKQSNYNLAQYATVKQVSSGSGTYPIATSRQSAVLATKEELADIADVNANMFTEVPFDVKTRAGKIALSNEVVEDAEVDIVSEVKTQLQQLVDNTDNTQIMGLLTGTSFTKATATNIDDLKKIFNVTLDPALSKMWLVNQSGFNYLDTLKDSDGRYLLQPNPTAPSGFTLLGAPVVMISDKLLANNADGTFPMIVGDLSQAVAVFRRNQVTAQWDKFDQFSQGLSVIVRNDYEVIDKTAVINVALGTATAGK >NZ_CP013130|38158:50996|41045_41846_+|WP_033611510.1|DBSCAN-SWA MKEFATLDKAIELAQRGYAVYPLIENTKKPPKGVAGYQAATSDQNTIFAWFKKHPTYSLGLRLDLSDLLVVDIDMHEPTKNGRASLAQLFKQGQTLPNDTYIERTANGGVHYFLKYAGAKVRKIDVWPGIDLLSDFTVIAPSEINGKPYTPLDGRTLADIKPAPQWLVDKLAGQKVNWTSEHAYATRQKKYTGRLLDEMVTGTTQGNRNAWLTKIAGRMFGVGAAPKTVYNMLSVINDSFVDPALPSKEVNVIFQSILKRESKGVH >NZ_CP013130|38158:50996|47690_48791_+|WP_033611502.1|portal|DBSCAN-SWA MSFFVKSSTTSGTHDPVADALVSLSSNDPYTFVSAAVLRNSDIYAAINIIASDIASNPIMCDTAIFNTMINQTPNSQMDGYHFKYALAANLLLNGNSFAEILPNHTLKLIANNQLTVEQDDVSGALTYTYTPTGGNSRQIAPNNILHFKYFTKDGVSGISPLYALKDERQIQSAGNKLLTGFFTAGVHGTTVIKVHQSDLGPEAKDNIRKQFDEANTGDNAVNTIVTDDTMDISNLSLNTDVLKLVNSNDWTTRQIAKAFGLPPERLGVENNHSNQEQSGVQYLQGTLQHYFDSFTSELSFKFGHDFTFNTDKLLSLDPQTQQAQAVAGFTGGVMSRNEARAKIGLPPTDDGNIFLNLQKNGVTNS >NZ_CP013130|38158:50996|43380_43860_+|WP_033611508.1|DBSCAN-SWA MKWQEMQLLRDTKYSSSENLKKFEDVFKFDKCAVYERPHSLEKLLAGERSYNAGKKYDTPPYLGEWLDHAELQKVSGTTRVVAIAHDYGPANSVHSKIAEHVLSLDLVGVIFDSKVDWYYPGQSSLVMIMSKETYNYYYYDLLANHHVVDVVKKQYFRE >NZ_CP013130|38158:50996|44384_44774_+|WP_033611506.1|DBSCAN-SWA MAKPMKECEHPGCRTLVAYDVRYCEKHKKATNKLRYHKRIYNSDESKYQQFYKSSAWRKLSRRFLESNPVCVKCYQDGVIRKADVVDHVIEIKDDWSRRLDESNLQPLCYRHHNRKTGLVREQRKKQTK >NZ_CP013130|38158:50996|47489_47690_+|WP_033611503.1|DBSCAN-SWA MQKITTKQRLRQICSDYVQTILLVIGLICLVIGFGCWISWQAGLILAGIAMILLALLINYEKQRGD >NZ_CP013130|38158:50996|44053_44392_+|WP_033611507.1|head|DBSCAN-SWA MKNYNLNRLNKRVQFGTVKSVQNPINGTTKQQFVTLFTVWYGEYTLTISNTISLTGTTATTNQLIAVRHDERITTALLALLDGVEYKVAGVSSDSELNAYDVVTLTKVNGHG >NZ_CP013130|38158:50996|39376_39991_-|WP_052048901.1|DBSCAN-SWA MARFSDNKKTSLGIRIKSIRQNLQLDQAEFGKKVIPSASASNVSRWERGLNVPSQERLQSIAKLGGVTTEFMLNGSKLSLEEINQFSDSISGKKSLNQQEKKKVNEINLTMQNSIDRAIDMETSFAKDAFKSSYFDKLPPEQRIFLSNILIYLKNYSSSKVDKRFLGDLSFFISGISLLMKRDITKEEFYDYEKTLNESIEEYF |
17 | Staphylococcus_phage(28.57%) | head,capsid,integrase,portal,tail,terminase | attL 34060:34074|attR 46429:46443 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
388793 : 434003
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013130|388793:434003|DBSCAN-SWA 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42 | Staphylococcus_virus(20.0%) | protease,transposase,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
437420 : 492880
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP013130|437420:492880|DBSCAN-SWA 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52 | Tupanvirus(22.22%) | tRNA,protease,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
902951 : 911662
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP013130|902951:911662|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP013130|902951:911662|910666_911662_+|WP_033611025.1|DBSCAN-SWA MSILVLGGAGYIGSHMVDRLVEHGTDVVVVDNLITGHRAAVNSAAKFYQGDLRDADFLNHVFDTEDIEAVVHFAAFSIVPESMSKPLKYFDNNTGGMITLLETMQAHDVKQIVFSSTAATYGTPKQIPIKETDPQLPINPYGASKLMMEQIMHWADAAYGIKFVALRYFNVAGAKPDGSIGEDHGPETHLVPIILQVAQGKRDELKIFGDDYNTPDGTNVRDYVHVIDLADAHILALKYLAAGNDSNAFNLGSSTGFSNKQMLAAAREVTGQPIPAKLAPRRPGDPDSLVAASDKARDVLGWQPNYDNVNDIIETAWAWTQKHPNGYDDRD >NZ_CP013130|902951:911662|908847_909744_+|WP_033611022.1|DBSCAN-SWA METQQSFADHMGVGTLYLVPTPIGNLQDMTYRAVATLKAVDLIAAEDTRNTQKLLNHFEITTKQISFHEHNTQERIPQLIEKLQAGVNLAQVSDAGMPSISDPGKELVAACIKVNIPVVPLPGANAGLTALIASGLVPQPFYFYGFLPRKKNEQKADLAKLAQRHETVVLYESPFRVAKTLALLATVCEGTRPIVACRELTKRYEEFARGTLTEMVAWAQDHQLKGEFVLLIGGNPDTDEPETTDELAQLPLKAQVEALIAAGDKPNVAIKTIAKRRNIPRQSVYNQFHELNTNDEES >NZ_CP013130|902951:911662|907356_908376_+|WP_033611020.1|DBSCAN-SWA MATIESFAQTLAAKQPRLLAAFKHIIAQNHLAHAYLLAGMEGAGQPELAHWIAQRLFCLHVKDGEPDGTCEECVRIANGSHPDIVTVAPEGQRIHVDQVRYLKAEFSKSAVEGNRKLFIINDAEKMTASAANSLLKFIEEPSGNVTALLLTTNKQLMLPTIISRTQVIEFPPLNAQALQQTFEQAGIAPNQAQMLRGLTNSVTQAQALLVDDWLPQAAQALWRWFDQAVKGDPRSFVAVQVNLVGLAKDADHQLVMLDLIAALFQDLLQLHFEVAATALTFGQYQKELAGLTAEVSDEQLIAATELALTAKRQLASNISFQNVLEGLTLKLWPIFQTNA >NZ_CP013130|902951:911662|906348_907014_+|WP_033611019.1|DBSCAN-SWA MLTGKLVTFEGPDGAGKTSALNAIVAKLQPQLGDRLVVTREPGGNQISESIRKIILDRHNTAMDDRTEALLYAAARRQHIVQTIQPALQNDQLVLCDRYIDSSVAYQGAGRGIGEQAVYDMNQFATAGLTADLTLYFDVDAAVGLNRIQKHRQNEINRLDVEALSFHHRVQAAYLKLLAEHPDRIKRVDASQPLDQVVAQALEIMAAQLPTYVASKGGEDQ >NZ_CP013130|902951:911662|904994_905594_+|WP_003637790.1|DBSCAN-SWA MQYPEPIAKLIDSYMKLPGIGGKTATRLAFYTIDMNGDDVTEFAKSLIAAKRDLHFCSICGNITEDDPCVICKDKSRDQSTVLVVEEAKDVMAMEKIKEYNGLYHVLHGVLSPIDGKGPEDINIASLLKRLQQNEAIKEVIIATNATPEGEATAMYISRLVKPAGIKVTRLAHGLSVGSDIQYADEMTLFKAVEGRQEM >NZ_CP013130|902951:911662|907010_907340_+|WP_003640965.1|DBSCAN-SWA MKLIIAIVQDKDSNRLSSQFIEANVRATKLSTTGGFLRSGNTTFMIGIDDDRVDEVLAMIKETSHAREQFMTPPVNLDVTMDGAAAYPVEVQVGGATVFVLPIEQFHQF >NZ_CP013130|902951:911662|904670_904979_+|WP_003640956.1|DBSCAN-SWA MMRGMGNMQSMMKQMKKMQAQMTAEQAALNEQTFTGAAPDDMVKVTFTGDKKMKDITINPDAVDPDDVDMLQDLVVAAVNDALTKVDEQTQSTMGKYTKGLQ >NZ_CP013130|902951:911662|902951_904649_+|WP_021731236.1|DBSCAN-SWA MYRALYRVWRPQRFDEIVGQQMITQTLKNAIMTHQTSHAYLFTGPRGTGKTSAAKIFAKAINCHHLVDGEPCNECETCTAITKGQLNDVIEIDAASNNGVEEIRDIRDKAKYAPTQADYKVYIIDEVHMLSTGAFNALLKTLEEPPANVIFILATTEPHKIPLTIISRTQRFDFRRITAKDSYDRMVYILNEKDVTYDEKALRVIAAAAEGGMRDALSILDQVISFGDNTVTLDDALMVTGSVTKQLLANYVSEVTDHDTKPALETMRQILQEGKDANRFIEDLISYTRDVLLYQQAPEMVDSVAMGEDDQQFEAFAKQIDAEVLYQMVKTLNDIQQQMRFTTHPDVYLEVLTVKLAQLDGQAAAQPVAAATVNPEDPTVHKLAQQVEQLQSEVKTLRSQGGSVAKPAPAKPRSSNGPVVKKVNVSQIYPILGAATKNDLIKVRDVWTDLMNILSVTQRALMHVAQPVAASSEGVVVAFDYAFVYQKAIDDQTLIDALGNGLDRLMGQAPKIICVPKEQWPQIRKDYLATHQPGGATPEQQAPAKEPVVEEAKNMFGDLVEVQPD >NZ_CP013130|902951:911662|908400_908748_+|WP_033611021.1|DBSCAN-SWA MDKRDLYDSFGEMEQQMQQMLDKMAKLRADMTTVLEKSAELVIENEHLREHMVEIENELPKKPTSTTTLSKSRQNLEKLYDEGFHVCNQFYGKRRDDDESCVFCLEVIYGERERA >NZ_CP013130|902951:911662|909747_910533_+|WP_033611024.1|DBSCAN-SWA MATLGANASLYSEQHRITYYECDRTGRATLTTLIDIAVLASEDQSDALGLTTAMVQSHGVGWVVTQYAIDITRMPRQDEVVTIAVRGSAYNPYFAYREFWIRDANGQQLAYITSIWVMMSQTTRRIVKILPELVAPYQSEAVKRIPRLPRPINFEATNTTITKPYHVRFFDIDPNRHVNNAHYFDWLVDTLPATFLLQHDLVHVDVRYENEVKYGQTVTAHANILPSEVADQVTTSHLIEVDGEKCCEVTIQWRTLAEPIQ >NZ_CP013130|902951:911662|905608_905860_+|WP_021731234.1|DBSCAN-SWA MFKRKQKIKHPKELYDEKLLATLNAAKLDWDRAKQNQEAVYDNNTSELVTQTALARAKYLYLYREARLRQVHGQTIQRSVIDK |
11 | Streptococcus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1235257 : 1243078
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP013130|1235257:1243078|DBSCAN-SWA TTTATGAAATTGTTGATGATTGTGCCAGATCGGCTTCTAACTGGGTTAAGAAGATCGTCACCAAGTCTTTTTCTACCTTATTCAGTGAATGCTCAGCTGGAAACGTAATGAAGTAATTCAGCGACATTAGCGCTTGGGGCAGGGGTAAGATGTTATAACGCTCCGGATCTGGTGGTGTATGGACACTGTCTGGTAAAAAGGTAACACCCAGTCCAGCGGTGGCGAGTTTGGTGATGGTGGCGGTATTCGTGCTCTCAATCACGATATTCGGTGTCACGTTGTGCTTTTGTAATAAATAGTCAACTTGGCGTCGAATCGATGACCCGTGGGGCGATAAGACTAGCGGTGCCTGTAGCAGGTCGTTAAGCAGTAACGCCCCCGGGTTAATGAAGGGCTGATGGGGTTGGTACCATTTAACGGTGTTCGGAATAATCGCGTAGTAACCGTCACGCCCACGATCATAGCTTTCAAGGCCCGGCGCGATGGTTTCAGGATTCTGACCAATCCAAAAGTCCAGCTCACCGTGTAGCACCCGTTGTTCATTGCGAGCTGCGATATCTTCCATTAATTCGATTTTGGTGGTTGGGTGAGCCTTCAAAAAAGCAGGTAAGAATAAGGGTAATAAGTAATAGCCGAGACTAGATAAGACGCCCAGCCGAATCACTTGTTGGTTGGCATGCGTGTATTGCCTAATTTGTTTATTAAAGTGATCCTTCTCGTTTTCAAGTGCCGTCAAATATTGATAATAAGTGCGTCCAGCCGTGGTCAGGCGCAGCGGGGTAACCTCACGATTGATAATGGTGATGCCCAGTTCCTTTTCAACGTTGCGAATGCTTTGGGTGAGGTAGGGTTGTGAAATGTAGAGATCTTTGGCCGCTCGGGTAAAGTTGCCATGTTTGAGCAACACATCTAAGAACCGTCGCATTTCGCTGGAATCTGATTTTGGCATGAAGAACCTTCCTCTCGCATTGTCATTAAGTGGTCGTTTGTTTGAACGTTGCGTTGTGCTAGTTAAGTAGTCATTGATCATGATAATGCCTAAATAATAAGTAGCATGTCACCCTCAAACTTGCTTAATTTTAACGCGAATCGTCGACATAGTAAATTTGTTATCAAGGTATAGATAAATAAATACTTCACAAGCAGAACGCTTTCACTTACACTAATCAGTATTAAGAGTGGCCAATCATTCAGTAGCTACTCGTCGAAAACAAGTGTTTAAATCATCCTGAAAGGACCTGAAATTATGAAATTTATTGGGATTGTTGGGACTAATGCGACCAAGTCCACTAACCGGCAGTTATTGCAATATATGCAACGGCATTTTCAACAACAAGCCACTGTGGAAATTTGTGAAATAAAAGATTTACCAGCTTTTAATGAACCGGAGGACCGGACGGCACCGGTTGCGATTCAACAGCTTAGCGATAAAATCGTCGCAGCTGACGGGGTGATTTTTGCCACACCAGAATATGATCATTCAATTCCGGCGGCACTGAAAAGTGCAATCGAATGGCTGTCTTATACCACGCGGCCGTTAATCAATAAACCCGTCATGATTGTTGGGGCCTCCAATGGTTCGCTAGGAACGTCGCGAGCACAGGCGCACTTACGCCAGATTTTAGAGGCACCGGAATTAAAAGCACTGGTGATGCCAAATATTGAATACTTACTAGGCCGCTCACTACAAGCTTTTGATGATCAGGGTGACCTGACCTATCCGGATAAGGTTCAGGAATTAGACAATGCGTTTGGCGAATTCGTCGATTTTGTGGATTTGACAAATAAGATCATGCCATCGAGTCAGTTCTTCGAAAAAAGTAAGCAGTTCTCATGGCGACAAGTGACTGGGGAGGAATAGACATGAAATTTGTTGGAATTGTTGGCACGAACGCACGCCATTCTTATAATCGGATGTTACTGGAATTTATGCAACGCCACTTTGCGACGCAGGCTGAAATCGAAATTTTAGAATTGACTGATGTCCCAATGTTTGATGAATCGAACGATCAAACTGACAGTACCGTCATTCAAAACTTTGCCACCAAAATTGCGGCCGCTGACGGGGTTATCATTGCCTCACCGGAACACAATCATTCCGTACCATCTGCATTAAAAAGCATTATTGAGTGGTTATCATTCAAAATTCACCCATTAGATGGTCAAGCGGTGATGATTGTTGGCGCTTCATACAGCGTTCAAGGCTCATCGCGCGCGCAACTACACCTGCGCCAGATTTTAGACGCTCCCGGCGTTAACGCCAGTGTTATGCCTGGTTCGGAATTCCTATTAGGTCGGGCCCAAACGGCTTTTGATGACCAGGGTAACTTAAAGGTTCAGGGCACTGTCGATTTCCTTGACAGTTGTTTTGCAAAATTTCAGAAATTTGCAACTATTGTGGCCGAGATGCGCGCACCAGAAGCCTTAAGCTTTGCCCCTGGAACGTATCAAGTGACGGCCACTGGTCATAATGGTGAATTGCCAATGCGGGTGACCCTCTCCGCTGACCGGATTGAAAATATCGAAATTGATACCAGTAGTGAAACGCAGGGGATTGCCGATGTTGCCTTTGAACGTATTCCTAAGGAAATTATCGCGGGGCAAACGCTCGCCGTTGATGCGATTTCTGGGGCATCAATTACTAGTCATGGGGTTATCGACGGGGTCGCCCGTGCGGTTAAAGAAGCCGGTGCCAATCCCGATGATTTGAAGAAACGGCGTGCGACTAAGCAAGCAGTCCAATCAGCGGTCAAAGAAGTGACAACTGATGTCGTGGTAGTTGGTGCTGGTGGTGCTGGTTTGACGGCGGCCAAAGTATTACAGGCTAGTCATCAAGTCGTTGTCTTAGAAAAGTTCCCAGCCGTGGGCGGTAATACCGTTCGCGCTGGGGGCCCCATGAACGCAGCTGACCCGGATTGGCAACGACAGTTTGCAGCCTTGCCGGGTGAAAAGCAAACGTTGAAGGAGCTGAGTGAGCGTGATGAAAGCACGATTGCTCCTGAATATCGGGCTGATTTTCGTGAATTGAAGCAGCAGATTAAAGCTTACCTGACTGCCAACACCGATCAGCAGGGCACCTTATTCGATTCAACCTTGTTACACCGGATTCAAACGTATTTAGGTGGTCAACGGACCGATTTGAATGGTCAAGAGATTCATGGTCAGTATGATTTGGTGAAAGAATTGACTGATAGCGCCCTGGATTCAGTCAAGTGGTTACAATCGATTGGCGTGAAATTTGATGAAAGTCAAGTGACGATGCCGGTTGGTGCGATCTGGCGCCGTGGGCATAAACCAATGGGCGATTTAGGTTTTGCTTACATTAAGACGTTACGTGCCTTTGTTGAACAACAGGGTGGCACGATTATGACGGAAACGCCAGTGCAAGAATTATTGGTGACGGATGGGCAAGTTCGCGGCGTCATTGCGACTAATGCGGCTCATGAAAAAGTTATTATCCATGCTGATGCAGTGATTTTAGCTTCGGGTGGTTTCGCTGCGAATACTAAAATGTTACAAAAGTACAATACGTACTGGACGGCCATTGACGATGATGTCAAGACGACTAATTCACCGGCGATGACTGGTGATGGAATTCGGCTAGGAACTAGCGTTGGTGCGGCATTAGTTGGGATGGGCTTTTCACAGATGATGCCAGTATCTGATCCGGAGACTGGTGAATTATTCAGTGGGCTACAGGTGCCACCGGCTAACTTCGTGATGGTGAACCAGCAAGGGAAGCGATTTGTCAACGAGTACGGCAGTCGTGATGAGTTAACTCAGGCGGCCATTGATAATGGGAGTCTCTTCTATCTAATTGCCGATAATGAAATCAAAAAGACGGCCTACAACACGACACAAGCTAAAATTGACCAGCAGGTGGCGAATGGCACCTTGTTCCGTGCTGATACTTTGACAGATTTAGCGCAACAAATTGACATGGACCCGGCAGCCCTGACAAAGACGATTGCGGACTACAATCGTTACGTTGATGCTGGTGAGGATCCTGAATTTCATAAGACGGCCTTTGATTTGAAAGTTGCCGTGGCACCATTTTACGCAACGCCGCGTAAACCAGCTACCCACCACACGATGGGTGGCTTGAAGATTGATACTGATGCTCACGTTTTAAATACGGACGGTCAGATTATCGACGGTCTATACGCGGCGGGGGAAGTAGCCGGCGGCATTCACGCGGGTAACCGGCTAGGTGGTAACTCGCTTAGTGATATCTTTACGTTCGGTCGAATCGCGGCTGCTCAGGCCGTCGCTGAGCACGTTGATTCGGTGACAGCCTAAGGTAATTGCTAAGTCACTGCGTTGGTTCAGTTGTGTTAGTGTATAATCGACCGTAGAGAGAAGCAGATCGACAAGGGAGATTATTACATGCAAAAACCAATGCCAGTCGCGGTGACGAACATTGCGGACAATATTACGCACCAACCAGCTTATATGACGATTGTTTTAAATGATCACAAGTATTCGATCGCGCGTAAAAAGACGCCGTTTATCTTGAAAGCTTTAAATGAGGGTGCGGCTGCGCATGGGCGTTTGACGATCACGCCTAGTCGACTGAGTTTGGCTGATGAGCGCGGCCAAGTCCTTCAAACCTTGGCACCAACCCCCACGGTTATCACGGATGTTCAACTGGGCTTATATCGGTCGATTGTGCGGCAACTGGGTAATGGCGTACGAATGAAGGCCCGCTATACGTTGGCGGTGACGTTAACCAGTGATACTGCCGCCTATCAAATGTTAAATACTGATTTGGCTGTTCTTAAACCGCTGTTAGCTTGGAGTGCAGACTTTCATCTGCACTTAACCGATTCGTTACAATTGGCAACCAGTGACCTCGACTGGCTCAATTTGACAGCTGATCAATTTGAAGCATTGACAAAGGGCACCCCGTACTTTGCTTGGCAACAAACGATTGGGGCCCACTGGTCAAAAAGTTAAAAATCAAAAAAATGAAGCCAGACTTTCGAAAATCTGGCTTCGTTTTTTATTATAAAATTTCTCCGACAAAGTCGCCTTGGGGCAATTGTGTGAAATCGTAAGTTTTAAAATCACGCACTTGTTTCGTATACCAATGCAAACTTTCAGTAATCATCAGGTTAACGGCCTCATCCTTTTCTTGCAAGGCCAGGATGGGCAAGTCGCGCATGGTGGCCACGCCCAGTTCGTAGGCAGTGCCGGAATCCAAGTTTTTGGCCTCGAAGTCTAAGATGGTCACGATGACTTGGGCGGCTGCAATCTGAGCCATATCACGATGAAAAATTTCCGTGGCCCAAGTCTTGGTAAACTGTTCGGCTTGAGCGTCTTGGTGTAGACGTGGCGAATAAAAATCAGTGACCGTTGGATTTTGGGCGAGGGCTTCCTCAAGTTGAGTGACCCGCGTCACTTGTTCAGGACTGAAAAATGGACTAGCAATATAGATTTGTGCCATGAAAATACCCCTTAAAGTTAATTTAGTAAAAAAGACTAATGGCTTAATTTTAGAGATTTTGAGAGCTAACGTCAATTCATTTTTAACTACTGATCTAAGTTGCGTTGCAAATACTTATCATCGCTAGCAGCCGAAAATGGTTAGCACCGATGTCTTAACATTAAGTGAAAATGTGCTGTACCAAAGTTAGTGACTACGATCTGCTGGGCCCACAACCAAGTTAAGGCGGAGTGGCTATCTGGTCAATAGCCATTCGTTTGTAAATTAACCGATGACAACTTATTAATAACACCAATGAAAAAGATGGGCTTAATATGAAGTGATAATAGAACGATTAAAACTTTTAATTAACGTTCTAATTATCAATGTTGGTTGTGTTTGGAAGAGAGTGGAGGCGGTTTTATGCGAGTTAAATTGTTTTCAGTCCTACTAGGTCTGTTAACAGTTTTAGCAACAGTCTTAGTGTTAGGACGTACCGTGAAAGCAGATGTGATTCCGGCGACTGGTTTGACCGGGAGCGCGGCCGTAGTTACTGATCGTGATGGTAAGGTGATCACGGATGCAAGTACGTTGAGTAAATGGGAGGATTATACCGTTAAGTATGATTGGTCCGTGCGTGATGGTCAGCCGATTGCAGCGGGTGATACGGCGATTGTTGAATTACCTGCTGGTACGGTGGCACCTGTCGATCTGAGTTTTCCATTGAAAGATGACAACGGTCGAGTCGTTGGTAATTTTACGATTAAAGCGGGCGAAACGTCCGGGGTGATTACTTTCAATGATGCTTTGGCACAAACGGGGACGAACCGTGCCGGCGTCTTACAATTTTATGCAAAGGGGACCGCTGATTCTGACGTTCATTTTGATTGGAAACTCAATAAAATTGGCTGGATTGGGAGTTACGATGATCAAGGGTTGCCCGCAACTCTAACGTGGAACATCGCCTTTAATCCGACTGGTCAAAATGTTGGAACGGTGGTTGTTAATGACACGCTGGGACCTAATCAAAGTTATATTCCAGGTTCAGTGGTTGCCCAGACCGGATCATATAATAATGCTGGGAATTTTGTGCAATCGGGTACCATTGTGCCACAAGTTGTCGTTAATGGTAATCAATTGACTTTTACTTTCAGCAACGTCACAACTGCAGTTAACATGGTTTATAACAGTAAGCTGACTAAGGTTACTGAAGGAAGTAATAATTGGAATAACTCGGCATCCATGAACGGGACAACCGTCAGTGGCAATGTCAGTTATGGTGGCAACGGAACTGGTAATGGCGATAATCAGCTTGGTAGCGTAACGCTGACCAAGCAAGATGCAACGACTAAAGCGGCCTTAAGTGGTGCTGAATACCAGTTAATGGATAGTACTGGTGAAGTGATTCAATCTGGTTTGACTACTGATGAGAATGGTGATATTAATATTACCGATTTAATCCCTGGTCACTATCAATTCGTAGAGACTAAAGCACCCACGGGCTATACGTTGAATTCAACGCCTATTGATTTTACGATCGATGCTGATACGGTCGCAACGCCGGTTAAAGTTGCGCAGTTTGATGAAAAAGCGGTGGTTACTGGTTCAGTTATTTTAACTAAAACGGCTGCCAACGATGGTCAAGCATTGGCTGGGGCAACTTATGATTTGAAAGATGCCGCGGGACAGATGATTCGGCATGGGTTAGTGACTAACACGCTGGGGCAAATTCAGGTAGATGAACTAGCCCCCGGTCGTTATCAATTTATTGAAACTAAGGCACCAGCAGGTTATGAGCTGAATCAGGCACCGCTGGATTTTACCATTGTTAATGGTCAGACGGCAGCAGTGACAGTGAAGGCTACCGATCAGCAAGCACAGCCGGGAACGACAGCGCCGGAGCAGCCGGGAACAACAGCGCCAGAGCAACCGGGAACGACGGAGCCAGAACAGCCAGGAACGACGGAGCCAGAACAACCGGGAACAACGGCACCAGAGCAACCGGGAACGACAGCGCCGGAGCAGCCAGGAACGACAGCACCGGAACAGCCGGGAACGACAACGCCGGAGCAGCCAGGAACGACAGCACCGGAGCAGCCGGGAACAACAGCACCGGAACAACCGGGAACGACAGTACCGGAACAACCGGGAACAACTACTGGCCAACCGGCAGGCCCTGATAACGGCGCTAGTGATGCAAGTACAAGCATACCAAATGGTCATAATCAAGTGAGTTCAAACGGACATGGCACATTAGGGCTGCCAGCGGACCAAGCCGGTCAAACTTCACAGGCAACCACGTTACCACAGACGAATGAGAGTCATCAGAGCTTAATCATTGCAGTATTGGGACTTGCCTTATTGTTACTAATGATTGTATGGGTACCTTTTAAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP013130|1235257:1243078|1239642_1240212_+|WP_033610330.1|DBSCAN-SWA MQKPMPVAVTNIADNITHQPAYMTIVLNDHKYSIARKKTPFILKALNEGAAAHGRLTITPSRLSLADERGQVLQTLAPTPTVITDVQLGLYRSIVRQLGNGVRMKARYTLAVTLTSDTAAYQMLNTDLAVLKPLLAWSADFHLHLTDSLQLATSDLDWLNLTADQFEALTKGTPYFAWQQTIGAHWSKS >NZ_CP013130|1235257:1243078|1241104_1243078_+|WP_033610328.1|DBSCAN-SWA MRVKLFSVLLGLLTVLATVLVLGRTVKADVIPATGLTGSAAVVTDRDGKVITDASTLSKWEDYTVKYDWSVRDGQPIAAGDTAIVELPAGTVAPVDLSFPLKDDNGRVVGNFTIKAGETSGVITFNDALAQTGTNRAGVLQFYAKGTADSDVHFDWKLNKIGWIGSYDDQGLPATLTWNIAFNPTGQNVGTVVVNDTLGPNQSYIPGSVVAQTGSYNNAGNFVQSGTIVPQVVVNGNQLTFTFSNVTTAVNMVYNSKLTKVTEGSNNWNNSASMNGTTVSGNVSYGGNGTGNGDNQLGSVTLTKQDATTKAALSGAEYQLMDSTGEVIQSGLTTDENGDINITDLIPGHYQFVETKAPTGYTLNSTPIDFTIDADTVATPVKVAQFDEKAVVTGSVILTKTAANDGQALAGATYDLKDAAGQMIRHGLVTNTLGQIQVDELAPGRYQFIETKAPAGYELNQAPLDFTIVNGQTAAVTVKATDQQAQPGTTAPEQPGTTAPEQPGTTEPEQPGTTEPEQPGTTAPEQPGTTAPEQPGTTAPEQPGTTTPEQPGTTAPEQPGTTAPEQPGTTVPEQPGTTTGQPAGPDNGASDASTSIPNGHNQVSSNGHGTLGLPADQAGQTSQATTLPQTNESHQSLIIAVLGLALLLLMIVWVPFK >NZ_CP013130|1235257:1243078|1236502_1237117_+|WP_033610332.1|DBSCAN-SWA MKFIGIVGTNATKSTNRQLLQYMQRHFQQQATVEICEIKDLPAFNEPEDRTAPVAIQQLSDKIVAADGVIFATPEYDHSIPAALKSAIEWLSYTTRPLINKPVMIVGASNGSLGTSRAQAHLRQILEAPELKALVMPNIEYLLGRSLQAFDDQGDLTYPDKVQELDNAFGEFVDFVDLTNKIMPSSQFFEKSKQFSWRQVTGEE >NZ_CP013130|1235257:1243078|1235257_1236205_-|WP_033610333.1|DBSCAN-SWA MPKSDSSEMRRFLDVLLKHGNFTRAAKDLYISQPYLTQSIRNVEKELGITIINREVTPLRLTTAGRTYYQYLTALENEKDHFNKQIRQYTHANQQVIRLGVLSSLGYYLLPLFLPAFLKAHPTTKIELMEDIAARNEQRVLHGELDFWIGQNPETIAPGLESYDRGRDGYYAIIPNTVKWYQPHQPFINPGALLLNDLLQAPLVLSPHGSSIRRQVDYLLQKHNVTPNIVIESTNTATITKLATAGLGVTFLPDSVHTPPDPERYNILPLPQALMSLNYFITFPAEHSLNKVEKDLVTIFLTQLEADLAQSSTIS >NZ_CP013130|1235257:1243078|1240261_1240702_-|WP_033610329.1|DBSCAN-SWA MAQIYIASPFFSPEQVTRVTQLEEALAQNPTVTDFYSPRLHQDAQAEQFTKTWATEIFHRDMAQIAAAQVIVTILDFEAKNLDSGTAYELGVATMRDLPILALQEKDEAVNLMITESLHWYTKQVRDFKTYDFTQLPQGDFVGEIL >NZ_CP013130|1235257:1243078|1237119_1239555_+|WP_033610331.1|DBSCAN-SWA MKFVGIVGTNARHSYNRMLLEFMQRHFATQAEIEILELTDVPMFDESNDQTDSTVIQNFATKIAAADGVIIASPEHNHSVPSALKSIIEWLSFKIHPLDGQAVMIVGASYSVQGSSRAQLHLRQILDAPGVNASVMPGSEFLLGRAQTAFDDQGNLKVQGTVDFLDSCFAKFQKFATIVAEMRAPEALSFAPGTYQVTATGHNGELPMRVTLSADRIENIEIDTSSETQGIADVAFERIPKEIIAGQTLAVDAISGASITSHGVIDGVARAVKEAGANPDDLKKRRATKQAVQSAVKEVTTDVVVVGAGGAGLTAAKVLQASHQVVVLEKFPAVGGNTVRAGGPMNAADPDWQRQFAALPGEKQTLKELSERDESTIAPEYRADFRELKQQIKAYLTANTDQQGTLFDSTLLHRIQTYLGGQRTDLNGQEIHGQYDLVKELTDSALDSVKWLQSIGVKFDESQVTMPVGAIWRRGHKPMGDLGFAYIKTLRAFVEQQGGTIMTETPVQELLVTDGQVRGVIATNAAHEKVIIHADAVILASGGFAANTKMLQKYNTYWTAIDDDVKTTNSPAMTGDGIRLGTSVGAALVGMGFSQMMPVSDPETGELFSGLQVPPANFVMVNQQGKRFVNEYGSRDELTQAAIDNGSLFYLIADNEIKKTAYNTTQAKIDQQVANGTLFRADTLTDLAQQIDMDPAALTKTIADYNRYVDAGEDPEFHKTAFDLKVAVAPFYATPRKPATHHTMGGLKIDTDAHVLNTDGQIIDGLYAAGEVAGGIHAGNRLGGNSLSDIFTFGRIAAAQAVAEHVDSVTA |
6 | Lactobacillus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2210311 : 2247609
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP013130|2210311:2247609|DBSCAN-SWA ATTATACTACTTTTTCTCCTGATTGTGAGGCGGATTCTGACGTCGTTTCAGTGTTAGATGATGCAGAACTATTCACTACAGCGACTGTGGACGTTGGTGTTTGCGCTTCGTCAGCAACTTTATTAGCTGTCGCTTCAACTTGGCTTTCCTCGTCACTTTTAACTGTTGGTACTGTCACTGTTTGAACGTCAGTAATAACGCCCAGCATACCGAGGATCGTTAATACGGTATTCAATACTGCGATAATTGCTGACCAGTCACCAGTAAACTTAATGCCAAACATGGCAAAGATTTGTTGAACCAAAACGATCAGTAACGAAATAATTCCAGCGATCAATTTACCATTCAAGCTTCCATCAGCATTCTTAAAACTAATTTTTCTCATTTCTTTTGGTTTCCTTTTCATATAGATGTTTAAATTCCATGTCATGACCATCTAGCCGGCCTTCTACCTTAATGACCCGATTTTCAATCGCATTCATTGCTTCAGCATTTTGCTGCCTCACTTTTAAACTTTCATCGGTAAAATGGCTCAGCCGCTTGCCTAAATCGTTAAGCGGGATACGGACCGTCTTATTTAGAATCCAATTAGCTAGTACACAAATACTAGCGACAATGGCAACAATTGATCCCCATTCATCCCAGCCTAATCCTAATAGTGTATGCAATTACCGCACCACCAATCGCTGGCCAGGATAGATAGTGGTGTAAATCGTCTTGCCGTTCTGACTAGCTAATGTAGTCATATTTAGGCCGTTGCGTTGTGCGATTGCCCACCAGCTGTCGCCAGACTTGACTGTGTAATACGTGTGAGTTGCACCACTCTTTACATATTCCAGCGTATTACTTGCCGGGCCAGTTGCTAGATAACCATACCCATGTGAACGTGGTTGACGCACCCAACGATAGCCACCTTGAATAATGGCCTGGTCCGTCTTAACCGTGGTTCCAGCTGGCAAAATAGTGATCGCATTTGATGACGTTGACGCGCCTGTGCGCAGCTTAACCGCAGTCTTGAGTGTGTAGGTCTTCGCTTCCTTGACCCACTTGGCTGACGTAGATGGCTTGGAAGTGTTTTTGTTGGCTCCCTGGTTGTTGGCCTTAACCGCATCCTTATTGGTCGGTTTGACCGTTGATTTTTGACCAGCTGTGTAGTAATCAGTATAAAGTTGACTAACGTCAAACCCACCGTAACTAATCCGGAAATGGGCTGACCCAGACCATTGCCAGGCATTGTTATTCGTATACCATTTCTGACCAGACATGACATAGGGGTAGCCAGCAACCCACCCTGTTTTGCCCTTGATGGTCATCTTGTTGTTAGCCCATGATCCAGACGTGTAAATGTCGGCCCGATAACCAAACTTCTGAATCTCTTTCATGAAGGCGGCATTGTTGCGGTCATTGGTTGCTTGTGACAAGATTCCTTGTTCTTCAGCCGATTCTACGTCCGTTGCCAATACTGCGCCCACCGGTAACCCGGCCGCTTTGGCTGCCTGACCAGCATAATCAGCTTCGGCAATCGCTTGGGCCTTAGTTTTATAATGGGCAAAATGATAGCCGTTGACGTATAAGCCAGCCGCTTGACCATTAGCGATATTGCTAGCAGCATAGCCATCTTTGAAGGTTGTGCCTTCACTAATCTTAACGGTGAGGGCCTTAACACCAAACTCGTTACGCATCGAAACATACTCAGCGGTACTCATATAGCCGTTGTTATTCGACACATCCACCATATCCATGCGAGCAGCCTGACTGGTAACATTGACCATTAAAAAGGCCATAAAAATGGCGCCCACCGTTAAGATGAGTGCCTTTAACTTGTGCTTATTCAATTGTCTACCTCCTATTTGTCATTCCTGATTGAACGGTCAAAAGCGTCCTAAAATACACTGGCCTAGTCGTTTTAACTTATTAATTTTCAATTCACCATCTCTTCAAAGTTCATCTTTCACTTAATACTTATGATGTTGGCAATTCATTCTTAAGAATGGATTGCAGCACACTCTGCGCCTCCGACATCGTAACATCGTCTAACTTCTTATCTGAAAAATCTGATTCAGTGGCAGTAACATTCGCATTCACATATGTGCCAGTTTCAGACTGATTAAATTGAGTGGATACCGATGAAATCTTGCCAGCAGTAAAACTCCACCCACCATTAACTGCAATTAGAGAGTCAATTACTGATGGAATCTTATCCACCGCACGTTTGGATAATTCTTTTTTGGTTAGATCATCGAAAGTTTCATCTTTAGCTAAGTCTGTCGGATAAATAGTGACATTTGCCGTAATAGTTACTCGACCTTCTACTTCGCCACGAAGACCTGCAATTACAGAACTCGTATTACCAGTTCCATCTATATTATAAGAGATGCTAGTGTTTAATAATTCCATTATTATTCCCCTTTTCCGTATGCTTTATCGAACTGATCAAATACTAATGCGTATACTAGAGCTGTTTGCCCTTCCAGCTCATATGGATAGTCCTCAAGTGCATTAAATAAAGCTTTCATTCGTGCAGAATATGAGCTGATTTCAATACTTACTGGTTCGTCTACCAATTGATCAAACTCTTTTTGAGCTTCATCCATGGTGTACCCGTCTTTCAAAATTAGAGTCTTTTTGTCTTTCTTATAAACAAAATCCCCATCTTTATCCGTTTTAAAAAAGTTCTTTTGGGTTGCTAATTGGTCAGCGTTAAACTGCTTGTTTAGCTCCTCAAGATGCTTAATCAACCACGTACGCCCAAGCGAAGCTCGACCTTTAAGCTTGAACTCTGCTAAAGTATTTCCAATGGTCACCAGTTGTCCATTTGTGAACGTTAATGTTTCTTTTCTTGCTGTCATAGTTACCTATACCTCTTTCATTTGTTTGACTTTGTTTTCTAATTCAGTTATACGATCCCGATAGTTACGAACGATTGGGATAATAGTCAATGCAACACGGTCATACATGATCCCTTCTACTTCGCCTTTTTCATCGTATTCTACTAATTCAGTTAATCCAGCATCGTCTAAATCATCAGCAATCATACCGAAATAGCGGCGAGGATCTGGAGCTTGAGGGTCTAATGTTTTTTTACGAACTTCTGCTTTGTCAAACCAATGTGCCGTTGGAATTTCTAAGATGCGTTCGCCCATCCCAGTATCGAATGATCGTTCGATATTTGTTTTATACTTAGAAGCCGAACTAGCTCTAACAATGGCACCATCATCAGCAACATAAACGTTAGCCGCATGACTGCTGGTTTGCACCCATGTGCTAAAATTATACAAGTAGTTACAATCCATAATAATGTTTGGCCCATTCATACCTCCAGAATGAGTGCTAGTACTTGTAGCACCAACCATAATTGAAGGACTGGCTGACCAGTATCGATTGTACGATGTGGCTTTACCTCCAGATATAACCACACCGCGCTCGGCTCCACCAACTTTGGTCATGTGCCATCCCGAATTCAAATAGCCAGTACCATACCCAGTTGCAATACCACTAAATTTTTCTGTTCCAAGTCCTATGTCAAACATTTCGTTTCCAGTTGCATTACTCGAATTTGTCAATACTGCGTATCTACGACCAATAAAAGCGGCGCCTTCAGCTGACTGCCCACCAAACGTATTTGAAATACGTAGATAGGGATTGCTAGATGTGTCGTAAGTTGTTGGTTCTACAAATTGCATTTCACCATTTTTTAACATTACACGATTAACGTCATTAGCAACTGAAATGTACCTATTATTGATGTTAATATCAATTGTATTATCAGACGAATGGATACGTCCTGCCTGGAACTCAATATTACCAGTATTCAAATTAATCGATAAGTTACTACCTTTAATCGTACCGGTTGTTATATTGTTCGCATTCAGATTAATCACATTTATATGCGCAGCATTGATGGTACCTGCAGTAAGCTTATTAGCACTTAGGTTCTCAATCATGGCGTCCTTAATGACTGCATTATCAATGTAGGTAGCAGCAGTAATGCGAAGTTTATTACCGTATATTGTTGTTCCTTCAGGAGAGACGTTAATCGCATTTACAACACCATCTTTGGAAACCTTAAGATTGATATTATTATTCATTAAAGCTATTTCCGCCGATCCCACAGTATCAGCTTGATATTGCCCAACAGTATCACCAATGACAAGCATGGGATGCTTAAAACGAACGTAGGCTATTCCTCTTATACGTAGTGACATTCTAACGTACTTTGCGTTTGCATCTGGCGAACTTCCGTTTAGCTGAACCGTATATGATTTGTTTGCAGGTATTGTATTGTTGGCATCAGAGTCAGCACGGATGCCAATATCATAACTCTTGTACGAACTACGAGTACCACTTTCATTTAAATACTCAATCATAACCTGCGCGTACGAATAGCTATCATTAGACGTACTTGATATGATGACATCACATGAAGCACTATACTGCGTATTGCTATTTGTCAGTACTGGAATTTTTTTCGACAGCAACGCATACCATTGATCACCACCGGTTATTGTATGAATCCCCATGCCACCTGTGGTATGGTCAGACCATATGCCTGAAGTAACATAGAAATTAGCTGCCTTAGACCAGCCTTCAGCATTTTGTGTAAACTCACTATTATAAATAATATTAGTTTGGCCCAAATTATTGACCTGACCTACAATAGAAGTTATCTGATTACTCAATTGGGTTAGCTTGGACTGGTACACATCATTATCGACTTTTCCACGAACAGTCGTTTGAATTGAATCCACAGTTTGAGAAATACTTGAAACGGCGTCAACGGTTGCATTGTCGGACGGATTTTCAGAATAATCAGTTGCGTTTGAACCTAACTCTAGTTTCATATTGGAGAATGTAATAGTGGCTGTCGAAGGCACATTATCAAGGCGGAGATAAACACCTTGTTGCGAAAACCCATTCAGCTTGATGGTTGCCACATAATGTTTCTTTGTGGTGCCAACAGTACTATCAATATACCCCATCCAAGTTCCACCGTCTGAGTT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48 | Oenococcus_phage(38.24%) | protease,capsid,terminase,holin,portal,tail,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2448500 : 2457011
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP013130|2448500:2457011|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP013130|2448500:2457011|2451532_2453752_-|WP_033612131.1|DBSCAN-SWA MLRKQPLSPTDVRDSKVYRDWGLTDAEYQLLTDEVLERLPNETETGLFSGMWSEHCSYKNSKPVLKKFWTQGEQVLEGPGEGAGIIDIGDGQAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALLDSLRFGEPTDAHTKYLISQVVAGIGGYGNCIGIPTIGGDTVFDASYQKNPLVNAMCVGILDQADIQKGQATGIGNAVIYVGAKTGRDGINGASFASAEFNDANETQRSAVQVGDPFMEKLLMEACLEVIHDHRDILIGIQDMGAAGLVSSSAEMASKAGSGLSLNLDLVPQRETGMTPFELMLSESQERMLLCVKAGAEAEIYQVFEKYGLDAVTIGKVTAGHQYQLFHHGKLVADVPVDALATKAPVYEREKKRPTRLNHQSHHQFMPRLVDATGTLKKMLQQPTIASKASLYGTYDSQVQTNTVVKPGSDAGVIRIRHTDKALAVTTDVNGRYLYLNPRIGGEIAVAEAARNIVASGGQPLGITDCLNYGNPEKPEQFYDLDESAMGIARACQLFNTPVISGNVSLNNESNGEAIYPTPMIGMVGLIKHQKDITTSDFKHAGDAVYVLGTTAADFNGSELQKMLTGTISGELFDFDLVTENRNQRLLLTAIQKGLVASAHDVSEGGLITTIAEACFPQSIGVELVSDLSATNFFAETQSRFVISVTPEHQAAFESLMEPYVTYLGQTTAKDRLHVQTADQAFDIKVSFAKQLWEGALPCLLK >NZ_CP013130|2448500:2457011|2454424_2454679_-|WP_021730779.1|DBSCAN-SWA MYLVKIYVTYKQSILDPKGEAIHDALHRLGYTNVDAVELGKYFEVKIHADDRPVAAEIDEMCDQLLANVNMETYRYEITEMEAL >NZ_CP013130|2448500:2457011|2454680_2455412_-|WP_033612132.1|DBSCAN-SWA MTTPIEKKALLYTGKAKAMYTTNDPEILWVEYLDQATALNGKRKVPIEQKGRLNNQIASLIFKDLAAHGIVNHFIDQPSDYVQLVRRVTMIPLETVVRNAASGSFERKFAVPHLTKFTEPVLEFFYKSDQLDDPFINESQIQALNVTTPATVAEIKRQALQVNQRLTAIFAAMGVQLVDFKIEFGLTTTGKVLLADEISPDSCRLVDSKTGASLDKDVFRKNLGNLTSVYQEVLARLATVEEA >NZ_CP013130|2448500:2457011|2448500_2449079_-|WP_021730774.1|DBSCAN-SWA MVKKIAVFASGNGTNFDALQQAIKVRQLPVVLGLLVCDQPDAPVIAKARAVNVPILIVDFHEYANKAAAEAIILTALQARQIDVVLLAGYMRIIGPTLLNAYAHKIINIHPALLPDFPGRHGIEDAFAAGVTETGVTIHYIDAGIDTGQIIAQRVVPVAPDDTLSTLATRIHICEHQFYPDVLQTLINEGAI >NZ_CP013130|2448500:2457011|2450093_2451548_-|WP_033612130.1|DBSCAN-SWA MPTEVSSLNEECGVFGVWGSPDAAQLTYFGLHALQHRGQEGAGITANNHGKLQTERGLGLLADVFRDPRRLAHLTGQAAVGHVRYATAGNHGLENIQPLSFNFSDAQFALAHNGNLTNAVTLRQRLEQHGAIFHASSDSEILMHLIRRSPAATLTEQVKDALRQVHGGFAYLLLTNECLIAALDPNGLRPLVVGQLPTGGYVVCSETCALDTIGATFVQDVQPGELLIIDDHGLTIDHYTTDTQLAICSMEFIYFARPDSDIHGVNVHSARKRMGAQLAIEQPVDADIVVGVPNSSLSAATGYAEASGLPYEMGLIKNQYSSRTFIQPTQALREQGVRMKLSAVKGVVAGKRVVLIDDSIVRGTTSRRIVKLLKDAGAKSVHLRIASPPLRYPCFYGIDIQSTNELIAAQQTIPEMCQTFGADSLGFLSEQGVIDAVGLQTSEPYGGLCMAYFNGDYPTALYDYQAEYDAEIAQLHANHEGVIK >NZ_CP013130|2448500:2457011|2449071_2450097_-|WP_033612129.1|DBSCAN-SWA MSDAYKRAGVDINAGYDVLKTVKQMSGNQQLGAFGGAFPLGPDVTTNNPVLVAGTDGVGTKLLVAIEADQHTTIGIDLVAMCVNDILAQGATPQFFLDYLGLGHTDQDRVKAILTGVVAGCQQAHTTLIGGETAEMPDMYGQNHYDLAGFAVGIANRADLLSPANVTAGDVLIGLPSNGLHSNGFSLVRDILFKQHDYQLTTVFKELGHDLQTELLRPTTIYVDAVQPLLQQKLVTSIAHITGGGLIENVARALPAGLSAHLELGQWPVPPIMPLLAELGDLTATDLRSTFNLGLGMVLIVHPDQVATVIAKLTANQQPYYQVGTVQAGSTPVVFEEAQHG >NZ_CP013130|2448500:2457011|2453744_2454425_-|WP_080474886.1|DBSCAN-SWA MLRFAVPVFPGSNCDHDMVNALRDVLHVSADLIPATATSLAGYDAVILPGGFSYGDYLRSGAIARFAPIMPAVIAFANAGKPVIGICNGFQVLTEAGLLPGALQSNRSAKFICQDSRLRIVNHGTAFTSAYGSTDQISLPIAHGEGNYYCDEATLAELRANHQIIFEYVDNPNGSTENIAGIMNRAGNVLGMMPHPERAVEMILGSTDGLGIFQSVIANQEEATHA >NZ_CP013130|2448500:2457011|2455414_2456545_-|WP_033612133.1|DBSCAN-SWA MNVNFKNAILPPATIGIVGGGQLGQMMTLSAKAMGYHVGVLDPMPKAPAAQVADFQIVAAYDDQAALLDLARRSDVLTYEFENVDEAALVAAQAYAQLPQGTALLHITGDRLNEKQFLHDHGIPVTPFAPVTDLQSLNYALNRVGTPAILKTAAGGYDGHGQTDLATTTVTDAANALLAQPCILEARQEFRTEVSMMVTRSAAGVVTPFPLVENQHQHHILHTTIAPANVRPSVHAAARKIAVSIAEALQLRGVLGIEFFVLPDDTLLVNELAPRPHNSGHYTIEACNISQFEAHIRSICGLPIPAITQTSPAVMRNLLGADLTLARQQLINHPEWHFHDYGKADIKPQRKMGHVTVLNHDIDVALAALASLKGEQ >NZ_CP013130|2448500:2457011|2456528_2457011_-|WP_033612134.1|DBSCAN-SWA MAKVGLIMGSISDWPTMQLAAEQLTALGVSYERHIISAHRMPQTLQSYGEQAAARGIQVIIAGAGGAAHLPGMLAANTLLPVIGVPIKTHTLNGVDSLLSIVQMPAGVPVATMAIGEAGAKNAALMAAQIIGLREPEVQRAIGDFRMRQRQEAEQSERQF |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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