Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012373 | Beggiatoa leptomitoformis strain D-402 chromosome, complete genome | 7 crisprs | DEDDh,cas3,cas10,csa3,RT | 0 | 15 | 9 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP012373_1 | 552059-552295 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012373_1
|
3 spacers
spacers of NZ_CP012373_1
>1.1|552095|30|NZ_CP012373|CRT TACCCATCATTGATTGAAGACTTGGGGGGC >1.2|552161|32|NZ_CP012373|CRT ATGGAACAATTCCTTGAAGAACAAAACACCAT >1.3|552229|31|NZ_CP012373|CRT AAGATGCTGATGTAGTGGGTTTTGTATATCG >1.4|552096|30|NZ_CP012373|PILER-CR TACCCATCATTGATTGAAGACTTGGGGGGC >1.5|552162|32|NZ_CP012373|PILER-CR ATGGAACAATTCCTTGAAGAACAAAACACCAT >1.6|552230|31|NZ_CP012373|PILER-CR AAGATGCTGATGTAGTGGGTTTTGTATATCG >1.7|552095|31|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder TACCCATCATTGATTGAAGACTTGGGGGGCG >1.8|552161|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder ATGGAACAATTCCTTGAAGAACAAAACACCATG >1.9|552229|32|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder AAGATGCTGATGTAGTGGGTTTTGTATATCGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012373_1
The CRISPR arrays of NZ_CP012373_1 >merge|NZ_CP012373|1|552059-552295|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAACTACCCATCATTGATTGAAGACTTGGGGGGCGTTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAACATGGAACAATTCCTTGAAGAACAAAACACCATGTTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAACAAGATGCTGATGTAGTGGGTTTTGTATATCGGTTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAAC >NZ_CP012373|1|1|552059-552295|CRT ATTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAAC TACCCATCATTGATTGAAGACTTGGGGGGC GTTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAAC ATGGAACAATTCCTTGAAGAACAAAACACCAT GTTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAAC AAGATGCTGATGTAGTGGGTTTTGTATATCG GTTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAAC >NZ_CP012373|1|1|552060-552295|PILER-CR TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAACT ACCCATCATTGATTGAAGACTTGGGGGGCG TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAACA TGGAACAATTCCTTGAAGAACAAAACACCATG TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAACA AGATGCTGATGTAGTGGGTTTTGTATATCGG TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAAC >NZ_CP012373|1|1|552060-552295|CRISPRCasFinder TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAAC TACCCATCATTGATTGAAGACTTGGGGGGCG TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAAC ATGGAACAATTCCTTGAAGAACAAAACACCATG TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAAC AAGATGCTGATGTAGTGGGTTTTGTATATCGG TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAAC
>NZ_CP012373.2|WP_062148489.1|551548_551767_-|hypothetical-protein MLGTIRDASSLDIPNIVPGECSLLPKFSIPLGSSTYTPDFSEQSYCDFFTALASFFIFMVVLSAIFITLTKG >NZ_CP012373.2|WP_062148485.1|550732_550951_+|type-II-toxin-antitoxin-system-HicA-family-toxin MPPVPALSASEVIKKFQRLGWIIRRQTGSHIMMNKEGHPALLVVPNHPEVARGTLRGLIRVADITVDEFIKA >NZ_CP012373.2|WP_062148482.1|550529_550733_+|type-II-toxin-antitoxin-system-HicB-family-antitoxin MYYTVVFEPDEDGIWVAECLELLGCFSQGKTQEEALNNIKDAIKLYLEVKQELNMHSQRKVCQVEVA >NZ_CP012373.2|WP_062148479.1|550135_550495_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MSDTTEVLERLYQLHNVKNDAELARKLNIGTSTISNWRTRDTVPYKICVEISKRDNVSLDWLLTGKELTNVNKPKTQAIIEMIENLDDSQKQKVYAVIEDEKRFAEMKKRIDQLERKTA >NZ_CP012373.2|WP_062148476.1|549655_549892_-|hypothetical-protein MNKESMLEQLRDEFGTIQEAAEYFHTSRVLLYQSIDGKGARAVRVALAKYFNAYPSDIWQDGTDTRVLDDYQMTETRQ >NZ_CP012373.2|WP_101539114.1|548830_549579_-|IS5-family-transposase MSRRYALTDEQWSKLEPLLPGRKGHVGMTAKDNRLFIDAVLFRYRSGIPWRDLPERFGDFRVVHTRFSRWSQKGVWERVFKILSADADNEYAMIDSTIVRAHQHSSGGGADEAIGRSAGGLSTKINSVVDALGNPTPFFLTAGQASDLEGADALIPQIKANALLADKAYDADERVRDVLKQKSIEPVIPYRKNRLNPPDYDKALYKARYLIEHFFGKLKQYRAIATRYDKRARNFLSGVYLASTLILLA >NZ_CP012373.2|WP_062148474.1|548300_548777_-|hypothetical-protein MFNPQTGEIVADGQYLLGELRKVIAKEDFTDRETKEVRPGGYEIEILCEVPNARDLLIIAKCPNPEDFTPLLKRRVLVSVKASAFQFGDRDAQVSYTVQASVKPIALDTLIGSSIHAHQHATPAVVPEKIPTVTEKPVETTEKVDSVVPKKTFMGSTV >NZ_CP012373.2|WP_062148470.1|548086_548272_-|hypothetical-protein MTYSTDFRKKVLLVTKLCLVMPIRQALLGGYLNAPRLSPLVLGKRSLQGRHYQAELGNEQI >NZ_CP012373.2|WP_062148467.1|547420_547903_-|hypothetical-protein MATDANANTAPMTYAQGEAIIGGVKGVGDAVKGVSDGIKGVGDAIKGVSDGIKDVGDKLDGIGNKLSANAPAINLKIPEGNPRQELTDLLGTIRNASSLDIPNIVPGQCSLLPKFSIPLGSSTYTLDFSEQTYCDFFTVLASFFIFMVVLSAIFITLTKG >NZ_CP012373.2|WP_062148464.1|547126_547417_-|hypothetical-protein MQELIDFLYAGLVAIFAGIGDLLLYVYFSLMLFLVDIFWKMGQDIIAFYDVMGKIDTLFSNLNPGLVNAFAFFKVKECVHLLATARITRYLFSFIS >NZ_CP012373.2|WP_101539228.1|553083_554289_+|glycerophosphodiester-phosphodiesterase MQNLTDLNFTVTNATLLSETAPRNIQVGVRPFYLIEDMEASALKIKLQQCNETPLKKTEFSIGHRGAAMQFPEHTKESYVAAARMGAGIIECDATFTKDKQLVCRHSQCDLHTTTNILATPLAAKCSVPFTPADVANGTPASATCCTSDITLEEFKSLCGKMDASNPKATTVAEYLGGTPDWRTDSYATCGTVMTHAESIALFKQLGVKMTPELKSASVTMPFEGTYTQSQYAQQLIDEYKAAGVPASQVFPQSFNLADILYWIKNEPDFGQQAVFLDELETMDGVDASTARLPELVAQGVKIVAPPTWMLVTTDSNQQIIPSDYAKKAKALGLDIITWTLERSGPLKTGGGWYYQSINNVINNDGDMMVFLDVLAKQVGIRGIFSDWPATVTYYANCMGL >NZ_CP012373.2|WP_062148493.1|554486_555638_+|lipid-A-disaccharide-synthase MRIAMVAGEMSGDILGAGLIRALQVHYPDAQFEGIGGEQMISAGLHSYFPLETLSVMGLVEVLKHYRSIKRCYNQLRETWLNNPPDVFIGIDAPDFNLRLEYDLKQARIPTVHYVSPTVWAWRRYRVKKVIKSCDLVLSIFPFEVDFYRPYPVNVQFVGHPLADEMPLKVNQQAAREWLKLPKASAYIALLPGSRQGEVQKLGTIFLQTAQWLQQYYPDLHFILPIANAHLQQLVMTQITQTAPHLSITLIDGNAREAMAAADVVLTASGTATLETLLSKRPMVVAYKVAFLTYFLFKPLVKVPYFAMANLLADEALAPEFLQYAVTPANLGQAVSGWLEHPAEVYALQQRYTQIHQQLRCNASEQAAQAIVNLLCNLYVNET >NZ_CP012373.2|WP_062148496.1|555621_556179_+|flavoprotein MSTKPEKPRFAWAFTGSGHYLTECLTLANQLQNVDFFFSKAAYEVFRIYELEHHIHAWQEQQGVRIFRDTAASAPPVGLFYRGDYHTLIIAPATSNTVAKCVVGISDTLVTNIFAQAGKCLIPSIVFACDTEPVMETPAPDRIVKVYPRKIDLENTERLCEFERTTVVKSLADLERVIKVREGEL >NZ_CP012373.2|WP_062148505.1|556260_556608_-|hypothetical-protein MLAERVAIWYEEGVQKGMQAGMQAGMQEGLLKGIQQGREEGREQGREQGLMEGQATGIKNAMLAVLTMRFGKVSPVLQQAINDIHEITQLEDLMRQAVIIDSLTTFQQLIHSTNH >NZ_CP012373.2|WP_062148508.1|556664_557732_-|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MPDHDPSYKRFFSHPEMVKDLLQGFVHETWVAELDFTTLEKVSGQFISDDLRSRDNDVIWRIRWQNKWLYVYILLEFQSSVDNYMAIRLMVYIGLLYQDLIKAGLTTDKLPPVLPIVLYNGNRRWTAPVNVQDLIEPSPLQNYQPQLHYLLIDEGAYSTTELSRLHNLVAALFRIEKARNKEEVIAVLEALLQWLKEPEQMGIRQAFAVWLNRVYLPHHLPNTELPKLIDLQEINVMLAERVAIWYEEGVQKGMQAGMQEGLLKGIQQGREEGREQGREEGREQGREQGLMEGQATGIKNAMLAVLTMRFGKVSPVLQQAINDVHEITQLEDLMRQAVIIDSLTTFQQLIHSTNH >NZ_CP012373.2|WP_062148511.1|557799_558270_-|6,7-dimethyl-8-ribityllumazine-synthase MTAYTLLEGDFTACNARYAIAVGRFNAFIVDSLLEGALDVLKRHGVDATNITVAKVPGAYEIPLIVQRLAASKKYDAIIALGAVIRGGTPHFDYVAGECTKGIATVALQHDIPIAFGVLTVDSIEQAIERAGTKAGNKGAEAALSALEMVSLLKQL >NZ_CP012373.2|WP_062148514.1|558266_559394_-|bifunctional-3,4-dihydroxy-2-butanone-4-phosphate-synthase/GTP-cyclohydrolase-II MSLNTIEELIDDIRQGKMVILMDDEDRENEGDLIMAAEKVRAEDINFMARYGRGLICLPLTEERCKQLQLPLMVSDNRTPHGTNFTVSIEAAHGVTTGISAADRAVTIQAAVAPHATPTDLVQPGHIFPLMAQPGGVLRRAGHTEAGCDLARLAGLEPASVLVEILNEDGSMARRPDLELFAKQHNLKIGTVAALIQFRLANEKTVEKVAHCRLPTEFGEFQLEAYQDSIDGTLHFALVKGTPKAEEPTLVRVHITNILCDLTFSTQKECGWPLRDALQRIAAEETGIVVILQQTTNAKSIIKAIQDNHKRELGENLPAQPSTDDLRTYGLGAQILADLGVRKMRVLSAPKKMHGISGFGLQIVDYINQEGTSHS >NZ_CP012373.2|WP_062148520.1|559767_562815_+|PAS-domain-S-box-protein MPNKEFHHANFFTTCKTLLCVIGFDGGLRQFNLAWETELHYSTKELSEFLYLDLIHPEDKSITKNYIDKLITGAESAVFTNRILQKSGYYRAYLWHITACLKEFSFYAVGIETTEEVARQEIAQPMSATNTIDNQYASLFDVAPLLIVHKDKENRIIRANQQAARFWKTTTDKLSGISMDTLMPEDVDHHHADDLDIVVSGQAKRGILQETLNGTLQIDKFPYRNANGNIDGVVWFAVDITERLKVEQALRENQSLLTAIFEVAEIGIGLTDKNGRFVRVNPAYCEMFGYHPNELLGQSLLAVFPNSLHKEVQKLYQDAVSGSQFLAHDEWEGRHKDGHHFDMEITVSRLTQYNKPFVVTLTSDITQRKQMVRSLQNSEAHLRMIVENLPIMVDAMDEKYNFVLWNRECERITGYTANEMLHNPQALEKIYPNVDDRQKLVEALSNVLHTNPGYRRREWQMTCKDGTQKIIAWSINSKIKIPGFAVWGIGEDVTEREKALQQLQRSEESLRESEAHLKFVIENLPIMVNAVNAENQFVLWNRECERITGYSAAEIIGNPDALTLLYPDADYRQKMLAHFQFILEQNPGIHYSEWTVVCHDGIQKTISWAVNSKIKIPGFAVWSIGEDVSEREEALHILKTSEERLKQSEVHLKFVIEHLPTMVDALDTKGNFLLWNQECEQVTGYSAKEMIGNARGLEKLYPDPQYRQKMLDAVQRVAKEDPGYRRGEWVVRCKDGSDKNIVWSVNSKIKIPGFPVWGTGEDVTERQKILKQLADNESRLRSLVENIPIMLMAFDEKGQIVLWNRQCEQVTGFPAEDIVGNPSALAMLYPQPEYRSYRTKPLQYISPYWQNDMTCKDSKLKTIAWKDVSNQFPMSGWAKWITGEDVTFRKKIEQSMGINDGLLIAALNSIDSAVCATNSLEKIVYVNQGFCDLFGYTTEELLKMSIKQIMPSDSRGSFVARHYFSFYTGAHGSFYEETHHAFHHDGHIFKVKLNAHRVKQEKEVHILWIVNYLDG >NZ_CP012373.2|WP_062148523.1|562870_563527_+|thiopurine-S-methyltransferase MNAEFWHKRWERNQIGFHQTEINTHLQTYWQALNLPKGASVFVPLCGKSLDMLWLLEQGYRVLGIELSKVAVRDFFTENNLTPTVTTYKTFNRWAMDEIEILCGDFFHLTPTELQTCTAIYDRASLVALPPEMRNDYAQQLATLFPTNTQILLVTFEYSQAEMQGPPFAVHADEVTQLYQQHFTIEQVAHTDILNENPRFQKLGVTQMQESVYLLRKK >NZ_CP012373.2|WP_062148526.1|563690_564074_+|Co2+/Mg2+-efflux-protein-ApaG MLTSQLHNIIIDVETHYIDEQSDPEIARYVFAYTVTIRNMGKVPARLVTRHWVITDANGKVQDVRGEGVVGEQPYLRPGEGFRYTSAAMIETPVGSMEGSYQMVADSGEQFDAPINPFSLAQPRTLH |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP012373_2 | 945619-945987 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012373_2
|
5 spacers
spacers of NZ_CP012373_2
>2.1|945643|45|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder AATAGTTGACGGTCAACGCACAGGCAGAGGCATTTATACATGGAA >2.2|945712|45|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder CTTCACCAATGGTATTCGTGAAGGAGAAGGCATTTACCTCTGGAA >2.3|945781|45|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder TTTTGCAGCTAACCGTCGCGAAGGTAAAGGCACTTACCTGTGGAC >2.4|945850|45|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder CTTTATTAACGGCACACGTCATGGCAAAGGCATTTTAACTTGGGC >2.5|945919|45|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder ATTTTCCAAAGGAAAGCGCACAGGACAAGGCATTTACACCTCATC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012373_2
The CRISPR arrays of NZ_CP012373_2 >merge|NZ_CP012373|2|945619-945987|CRISPRCasFinder CAATGGCGACAGCTACGAAGGTGAAATAGTTGACGGTCAACGCACAGGCAGAGGCATTTATACATGGAAAAACGGAGATAGCTATCAAGGCGACTTCACCAATGGTATTCGTGAAGGAGAAGGCATTTACCTCTGGAAAAATGGCGACCGCTACGAAGGCGATTTTGCAGCTAACCGTCGCGAAGGTAAAGGCACTTACCTGTGGACAAACGGCGACCGCTACGAAGGCGACTTTATTAACGGCACACGTCATGGCAAAGGCATTTTAACTTGGGCAGATGGCGACCGCTATGAAGGCGAATTTTCCAAAGGAAAGCGCACAGGACAAGGCATTTACACCTCATCAACAGGTGACCGTTATGAAGGGGG >NZ_CP012373|2|2|945619-945987|CRISPRCasFinder CAATGGCGACAGCTACGAAGGTGA AATAGTTGACGGTCAACGCACAGGCAGAGGCATTTATACATGGAA AAACGGAGATAGCTATCAAGGCGA CTTCACCAATGGTATTCGTGAAGGAGAAGGCATTTACCTCTGGAA AAATGGCGACCGCTACGAAGGCGA TTTTGCAGCTAACCGTCGCGAAGGTAAAGGCACTTACCTGTGGAC AAACGGCGACCGCTACGAAGGCGA CTTTATTAACGGCACACGTCATGGCAAAGGCATTTTAACTTGGGC AGATGGCGACCGCTATGAAGGCGA ATTTTCCAAAGGAAAGCGCACAGGACAAGGCATTTACACCTCATC AACAGGTGACCGTTATGAAGGGGG
>NZ_CP012373.2|WP_062149369.1|944247_944868_+|phosphoserine-phosphatase-SerB MKLCVFDFDSTLMDGETIDEIAAACGKKNAVAHITEQAMQGKLDFFEALTQRVAMLAGTSYTKVIDVCQHLPLMNGALETVQGLQQQGYKVVILSGGFHEATAYLGKQLGVDGEFANFLHHKENVLTGKVGGEMMQSTSKGDMLARLQKLLGAEKANTIVVGDGANDASMFPYADKKVAFCAKPILKQQANIIIDHKDLRELLQHI >NZ_CP012373.2|WP_062149366.1|943401_944163_+|adenine-nucleotide-alpha-hydrolase MNQLIKPPKSLLRCVGRAIGDYAMIKANDRVLLGLSGGKDSLSLLHILAHLKRHAPIHFNLGVITVDPLISGFDPSPLKTYLADLNIPYFYQQQPIMEEALRHIRGDSFCAYCSRMKRGIMYSTARKEGYNVLALAQHLDDLAESFLMSAFHGGRLQTMKAHYTNDAGDIRVIRPLIYARERQTADFAKATQLPVIFDNCPACFSKPTQRHHIKQLLATEELAYKQIFRNLLHAMRPLMQGNQPALQETDDDS >NZ_CP012373.2|WP_062155336.1|942197_943094_-|SPFH/Band-7/PHB-domain-protein MSIKSVPQGSNWTVERFGKYIRTLSPGLNFIIPIIENVSKKLSMMEQVMDVPSQEIITKDNAMVRVDGVAFFQIMNASEAAYQVQNLMDAILNLTMTNIRTVMGSMDLDELLSKRDEINHQLLRVVDEATTPWGIKILRIEIKDIAPPKDLIDSMARQMKAERDKRASILEAEGERQADILKAEGEKQSIILAAEGRKEAAFRDAEAREREAEAEAKATMMLSQAISKGNVQAINYFIAQDYVKALGQIASADNQKVIMMPLEAASVIGSIAGIGELAKEAISKRNPSPTIPPAGTSS >NZ_CP012373.2|WP_062149363.1|941738_942194_-|NfeD-family-protein MMSSLYVNFWYWWILAILLSIIELVVPTTLFIWSAAAAVVTGFVVLVFPQMGIEIQLILFSLLSIFIVWLGRSLQAKYPTKTDQPLLNQRGSEYIGRIFSVTEAINDGVGKVRIGDGYWRVEGSDCPVGTKVKVISVDGVRLKVEPLVEEN >NZ_CP012373.2|WP_062149360.1|941113_941554_-|rhodanese-like-domain-containing-protein MTEIVHSIAPREAWRLLEENPKAILIDVRAEMEYLWIGHPKGAIHIPWIDEPDWTVNPHFAAEVRKLLLGGVITDHDDVEHPIDSIPILLICRSGNRSLEAGKELVRKGFSNVYNVIEGFEGPLDHEHHRSTISGWRFHGLPWEQI >NZ_CP012373.2|WP_062149357.1|939817_940825_-|porphobilinogen-synthase MPLTNAPFPALRMRRMRRDEFSRRLMREHHLTTDDLIYPLFIMEGQQQRVAIPSMPEQYRLSIDELLKEAEQLVQLNIPAIALFPVITPDKKSLNAAESYNPDGLVPRAVRCLKQAFPQLGIITDIALDPYTTHGQDGLIDASGYVMNDETTHVLIQQALSHAEAGVDIVAPSDMMDGRIGEIRYAFESSEFKHTRIMAYSAKYASSFYGPFRDAVGSSGALGKGNKHTYQMDIANSDEALREVALDIQEGADMVMVKPAMPYLDIVRRVKTELRVPTFAYQVSGEYAMLKAAAQNGWLDEQSVMLESLIACKRAGADGILTYFAKQAALYLQQK >NZ_CP012373.2|WP_062149354.1|938995_939694_-|Crp/Fnr-family-transcriptional-regulator MLATQEIMLREHALFRHLNKKLVERILSISSIRHLKKGEVLFVKDEAGDALYGVLAGRIRISNRSLEGQELILKIMEKSDIFGEIALLDGSPRTADAVASEDSQLLMIRHRDFTLLLQQEPMLALQMIRLLCERVRQSNEYIEDLTFLDISRRLAKHLLNASREGEKMDEGIRLPLLSHDELAQRLGTTRTEVTKQLHYWRDNGWLLLEKGQITLCDARALQKFINSRADMW >NZ_CP012373.2|WP_062149351.1|937468_938695_+|exo-alpha-sialidase MLRFGVKYLISSYCLCFSLIVSAECLFTTTTGVTVDGHYPRFAELSDGSVLMSADRYIVNEQGQGGQAIVIFRGDKNLLVWEEVVIAAYNPPANFSNAYLTVLKAKGSRPETILLALRAWEGINSHIDVIQSTDKGKTWQFRSQAFGENMGNLTNGESDDGSTVSDVGVYEPSLWVSHDGYNASGNETLFITYASEVSATADHAYENEQVILLQRSDDLGLSWSAPVVVTENEPYQRFGMPAIIAVDNLMAVFYEQVDLTPERVYSWWDFKTRPAWKWSIRSALSVDGGHSWNSGYMMFDSRLGYVDNEGKSINYSGAPVVRFLRFPNSSVDTIGLIFQVANIPTYADRNTAKVSPYYIGLTKEGIEFYRGPLPEPLSAWWASSFQHSISGKIILAGDKEGCMQAGFY >NZ_CP012373.2|WP_062149348.1|936714_937200_-|hypothetical-protein MQRLIQTFNDGSTVAFDSGRFDDWCVYLHRPAQRRYAPSDTYYFARLQILGKLYGFQSLYDDYIAIYEKTNAQINPDVLSLILQLTEKYQVDSLEIAIWFTVIYAGMVAEENKQGAILKKRIKRLGMHQTLIEQIAPNIAANYSRGKKWRELDVLCKEKGF >NZ_CP012373.2|WP_062149345.1|935774_936713_-|hypothetical-protein MIDITQLRFFTTCLLLAILSVAKASEISIDDTYTEIYNVQQELNIIKQYLKIDKEIIPPQVTLQVVPRLTWQKTYQILFKLDHIHEKYNLPRLNIPSREPEKDVSTAVIYEQVCRIRTELFLLKRVFDIKTEIPPPPVFTKKTQLDNYNALNQILYELDAFTGTSFLPSHVFGQAMRIHYDIDALLYALELTDSTLPPPKKDNVLPVDVFNAGLTLIKEMQEIQTHLNINKINLNINVYQRNSIQQITPTETFGMTGFVLAELQVIKAYLGLTNVITPVAQIYQGKIPADTLQILEWNIARIRLISKAIKQL >NZ_CP012373.2|WP_062149375.1|946100_947048_+|4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl-diphosphate-reductase MNVILAQPRGFCAGVVRAIEIVEQALMVYPSPVYVLHEIVHNRYVVDDLRQRGAVFVETLDEVPLGAVCIFSAHGVAQAVVKNAELRQLEVIDATCPLVTKVHQQAQRYVQQGAEIVIIGHAGHPEVEGTRGRIDGIVHILSTVAEAQALQVRDPEKLAYVTQTTLSVDDTKDVIAVLSQRFPTIQGPQLSDICYATQNRQNAVRELATKVNLLLVVGAQNSSNSNRLREAGEQAGVTSYLIQDAHDLNPEWFTGDQQIGVTAGASAPEILIQGVLDRLKTFGVQTISIMDGQPENTTFKLPLALLEKVKQKEVV >NZ_CP012373.2|WP_062149378.1|947354_952349_+|NAD-nucleotidase MTQGIMRKQAWQWLITSGLLAFAPVSLAEMTITEVGRYQSNLFAQGGAEIVAFDSVNKQVFVVNSGLAQIDVLSLNTIATPQKISTIDAKALGAGANSVAVKNGIVAVAIENVDKQANGLVAFYDSTTLKLLKTVTVGALPDMVTFSPDGKTVLVANEGEPNADYTVDPEGSVSIIDISHGVENAVAKIADFSAFNTQKQRLLNKGVRIFGKGANVAQDLEPEYITVTADSKTAYVSLQEANALAIIDIANAKVLDVVPLGYKDHNQGAPSLQTFNFPEMPDLNTSAMGETVKLGGFSGLHFEGVDSATGNYKFVTIPDRGPDAGLVDVDGDGVQERIFTIPQYQIRVVRFEVNPQTGVVQITQQIPLTRQDGTTPITGLPNIAGADESPAEQVPSNGQFTIEGKQYNKLDYDIFGADLEGIVINPVDNSFWMVDEQRPAIYHFLADGKLANRFVPQGTDPEGQARYGAETLPAVYRKRVNNRGFEAVALDTEQNILYAFIQTPLANPNMAASNASTVIRMLGINPDTGETVAEYVYLLEKPVVRGSVVDKIGDATYAGNGQFYVVERDSDLTANSIKPVYKIDLKGATNLLTSNINLLPDLTLEQHTPDQLSSVGIQAVHKRKILNLPSIGYLPSDKSEGLTVLPDGKLAVLSDNDFAANPETAQIQMGLISFGTNYGLDASDKDGMINIRNWPVLGSYMPDSLANIVINGNTYIVTANEGDSRDYAGFSEEVRIGSSKVVLDPIVFPNASDLKTDEQLGRLKITNTQGDIDGDGDYDELYAFGARSFSVWDNRGNLVYDSGDQFERFTAELLPDFFNTSHDNNKFDDRSDDKGVEPEAIAVGEVNGQPYAFIGFERLGGVAVYNLSNPHAPQFVDYVNNRHFAVTPEAGADTGDLGPEGFSFVHASQSPTGQALLIIGNEISGSTTLYQLGDSATAVTLPNLNTGVATDAQGQHVDKQTSFAGGISVKQTAFDKAVGQKLADKATVRGRIYVDPADVGKVADIVVYAAYKPILAANSPTVPANYFMLNAQNQIVTWDGKLSTLSAYQTNLTLSAQQDVLLYDANWLVSGYLELSFGYRLQDGTLVLSGTPITTTINDTPVVALRTSLIHINDSHSHLTEETIDLNLNGKTTRVNMGGFARVATKINALRKTAENPLVLHIGDAVVGTLYYSLFKGAADAAALNTIKFDALTLGNHEFDDGNANLAQFLKQLDNIPALSANIDVSQSADLKDLVKPYLIKEINGQKVALVGITTLKTLVSSSPGADITFSNEVEAAKQVVAELEGMGINKIIFMTHYGYTQDIELAKQVSGIDVILGGDSHTLLGNFSNIGLSSEGAYPTIARTPAGEKVCIGQAWQYAYVVGFMTVDFDDAGNVLYCDGNPTLLLGDNFLQADAAGTFVAVSDAMKTQLSQLINTQYTAEIVPENSDMAGVLSLFSEQVNVLKQSVIGKATDSLLHIRIPGKHTSGVELSHGSMIAPVVAEGFYQQLKTRNYNPDLILQNAGGVRVDLPQGDITVATAYTLLPFGNTIYVLDMTGAEVKQAIEDGLSNYFDNAGSSGSFPYAYGIHYTVDMNKANGERVTSLEVMSKTDGTYSVINPESLYRVGVNSFMATGGDGYTTLKKVAADRRTDTYFDYAESFVNYMKAVGTISAPTSYNLTYIPKQ >NZ_CP012373.2|WP_062149381.1|952484_953831_-|glutamine-synthetase MSFDYLKEWLETRHITEVECLVPDISGVARGKIIPASKFCKEEGMRLPEIIFIQTITGDYPEDESAIDPAEIDMILQPDPSTIRLVPWATEPTAQVIHDCFYRDGSEVDLAPRTVLKRVLKRYDEQGWKPIIAPELEFFLVKKNIDPDYSLEPPIGRSGRPERARQAYGIDAVNEFDPLFEEIYDFCEAQELNIDTLIHEAGAAQMEINFLHGDPLELADQVFLFKRTVREAAMRHDIYATFMAKPMEKEAGSAMHIHQSLVDKETGVNLFSNDKPEMTDLFLSHIAGLQTYLPSAMSFLAPNVNSYRRIARYNSAPINVQWGYDNRTVGLRVPYSDPKSRRIENRVAGADTNPYIVFAASLACGYLGMMQGLKPRPAIEGSAYDMPYELPRNLEESLRFLSEPESIPLREILGERFVKAYRAIKLKEYETFLAVISSWERDFLLLNV >NZ_CP012373.2|WP_062149384.1|954158_954524_+|hypothetical-protein MSQSVAQRLSDILITLPEAEQKNVLAFAEFLHARVRAEHPLTLPLPELLEPPQGESVVAAIKRLSRSYAMLDKTKMLGQTAELMTQHVVYGRTAEEIIPLLETLFMQHYQSFVEHYNKQIG >NZ_CP012373.2|WP_062149386.1|954528_955617_+|AI-2E-family-transporter MVQVLSRWFHRYFSDPQAVFLAILLVGSLTVLMTMGEILAPLLASIVIAYLLEGLVKNLQQWRVARLPAVIIVYSCFLAFLIFVLVILLPLLSNQLSQLFQELPNKLTKWQELLMALPQRYPGFISNEQVDSLLNSIRVGLRSIGQIALSYSIASLGVVIMLMVYSVLVPFLVFFLLKDKEVIIRWALSFLPQNRHAASQLWVEMDAQIGNYVRGKVYEIFIVGIATYIPLAILGMNYASLLAVLVGLSVIVPYIGAVVVTIPVVMVAYIQWGFNSDFIWAMSAYTVIQFIDGNIIVPLLFSEAVNLHPVAIIVSVLVFGGLWGFWGVFFAIPLATLVKALLVAWPRMPDHDMEKRQMDSLY >NZ_CP012373.2|WP_062149388.1|955641_956415_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKVFSAVCLILCLLGTQASYAEKLRFGVEGAYPPFSLIDTQGELQGFDIDIAKALCHAINVECVLVQNDFDGLIPALLAKKFDAIIASVSITEERKKSVDFTKKYYNTPARFVRKKDSGIEATAEGIKGKVVGVQRATTHDKYLTDNYDTTIDIKRYVTLDDAYLDLQAGRIDLLLADSIPLADGFLNKPDGKAYEFTGEPITDPKWFGEGVGIAVRKGDNELREKLNQAIAKIRADGTYKTIQDKYFQFDVYGDE >NZ_CP012373.2|WP_062155338.1|956628_957996_+|UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine--D-glutamate-ligase MSNPTSSIPTQTNSYTAIMGMGKTGVSCVHFLVKQGIQLYIMDNRAEPPYFNTLQQTYPQLTYLTGHFDPDILANAQEIIISPGISLENEALQLARQAGVPIIGDIELFARHVTAPVVGITGSNGKSTVTTMLGEMAKQAGRAVQVGGNLGQPALDLLSTAADLYVLELSSFQLETTHSLRPKVAVVLNVCADHLDRYADMQAYAVAKQRIYQYAETCVLNADDPIVMAMAPTDKPIITFSLQADKGDFRVATYQGQAHLVRVKQGQIIPLIATAELALKSAFMRANALAALALGEVLGLPLDSMILILKTFKGLHHRCELVTTINQVEWFNDSKGTNIGASIAAIQGLENPKKIILIAGGDGKGADFSPLAAVAHEHLKACVLIGRDAPLIEIALQGIIPLSHAHSLEAAVKQCAELADAGDIVLLSPACASLDMFKNYEHRGQVFTDAVHGLV >NZ_CP012373.2|WP_062149391.1|958182_963249_-|hypothetical-protein MQWLCKFIFIFLYFSLLPIQIAIPLGLITFFWQSSTKSGVNEKPKTAPERRELFDLLTFYFELRSNHKQWRVTPAEYQDLLTKIEARCKSLVHYHYIDEIEKNRRLTDAWQLLRPQQTPCWEQQATLETESPQTNTQHIDDLIKELDNTLAPVTLPPAVTLPASVVIPKPRVNPVVIKQTVATVKPRIVKPLPSPKTTPTTPSLINRLQVFTRQILLPFIWQNIGWFVGGFCFVSGSGLLVAYTDGFANGLAVLFCLALYTLLILWGAYQIRRQRPELLISHQVLNFLGIFLIPLNFAAAVRLFMTSDGNFALLAVATLCAVGLWGGFLFALKIASGSLERQSLKEYPRLFLFLAGLQFALPLVSSMNSWYFLAVLHILLLAGLSYAFLRFTQGWLKALFLDADLLTYFTVGSLLYAALISFVHLTVSSGLTLPVGYAGGLLMLVCVLLFYVDSCANRDEFKQTIINYFTFLIYALSVTAIVLSYSSAWFIPTLSLAIGLYAAMVWRYLTLSPLYLLLAASVVWYWQVVLVHFTPDEHFLASVPLFVALWQLYRLACRRESPRFIVITYRTLLVLLFSVLAWSLYYAHPSVIGLITSLSASLLIFLLSKGRNTSPYMKTLGFIGAVTLNGIYFPLLPTLTVSVQFTLLFLLLSLIWTVISLSKWLKPAYAPVWFMQAGILSGLISIFISLNTHDILLSLAVTSGFASLLLSIGWIVRVRAFFYSGLLFITGVVVVSKLLFFPQTNLLALLLVTLVLWWVTWGLQRLQQRLLVHDIHLEPLLFLGMPLARTADRFTLLIPPCQISTIILWGVGIFGLLHYLLLPLSILSTGSLLLVLEAVITLLMAGQTRQLWLLPAVLFWLGLVLVPIFSDVQPLVFCFFLACYALGAWLTALIGLQFFHPRLTQLLCWQGGYGQRGGYTRAMQWVFYSTLFLLIGVQGASLSYALLFPHLGDGVLTAIFILSTLYFVILGRYYRYIALSYAALLTITISLLSFIGLPTLFALDLAQVLTILLGIAVALVGVTYPLRLSPVFSDLYYKPLYYTATLLYAYVLLHALSLLVWQFPMTSIWLAYVFGGLVVAQLPIFQWLAKDALHWRGIFLPLQLLAIVLVLFPQGNEFAWLILPFVLLGLAYYGLPWFNRLFALWAIDPTITFMLSFFVLFALPVVNFLQTGQIAWQIMLTVAAYFWLLQQQSHAENNRSLFTHLLFLALFGTFYSLSVTLFVLTAPSIFALWALLLFGLLQLGYRIKECEVWLFLTLIMAIISLFLLAVSLPQQLITFSIISGIALTIGGQQRDTTWFNVGILGGLVALHLLWFFLPATTLWAVLPYYALQNAVLLCVLLTLFPMLKATEDNWFNQLKLEWLIPFITASTLVLWAVGLVANLLVNQPLFGVVDSGILFLTGGIFIALWQAYRVEPTEKFIGIVFLITILAIYSRMSLFGFSSLTLWDSVALMLAAYGSLFSRYFIQLKVLDRLNLLLPCIALVPLLTVSDSTAITLLLFTGAVYYFFLQNQMKTVLPLYLAMILLNIALYLWIPALAQQQHLVQLYVLPAAITVLIMTYIHTQELRTTINHNLRLLALTVLYTSATTDVFLRPELSFFILALGLSMGGIILGIALRTRAFLYAGIVFLMINVLGQLVQFYPEDRLSKAIILILLGGGITVSMIFFNLKREMLLQKIRIMRADLAEWR >NZ_CP012373.2|WP_062149394.1|963458_964133_-|PspA/IM30-family-protein MFSIFRRVNDILNANVNDLLDKVEDPERMIKQLIREMEEQIASAKDGVVHAIASEKQLLRELEQQKAQSAEWQNKAETALRAYKEDLARSALQRKTEIDNVIRNLEPAWQTAKTTSERLKNQLRQLENKVEETKRKQGALVARQRAAQARQQMGKTLDRFQQGLDTQSRFDRLEDRIGEMEAYSEAMAEVDDTQSELDKEFAKLESTQEVDTLMAELKIKIQQK >NZ_CP012373.2|WP_062149397.1|964598_965537_+|nucleoside-recognition-family-protein MEEIAALILKSGRAGVELALFVLLPVMVVMLTLMRLLEAENILDRIVNWITPIFRPLGIPGLGIFALIQTLFVSFAAPLATLAMMDKSGTSRRHIAATLAMVFTVAQANVTFPMATLGLHVGTTILVSLIAGLLSATVTYHVFARHLPNESEPPEPALNHPQAANVKGVLHVINRAGREAFEIAIASIPMLILALLLVNSLQAIGIMGWLETLLAPVFAWFNYPSASVLLIITKYIAGGTAMMGVSADALQHGTITIVEFNRMAGLLISPFDVAGVAILISAGPHVASVLKPAAYGAIVGTLIKMILHGLLF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012373_3 | 1966232-1966414 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012373_3
|
2 spacers
spacers of NZ_CP012373_3
>3.1|1966270|30|NZ_CP012373|PILER-CR GTACACTCGGTATATTCAGCGTCTGCTGGA >3.2|1966338|39|NZ_CP012373|PILER-CR AAACCATATGGGAGTTTGAACAACGGACTGGTTACACGC >3.3|1966270|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder GTACACTCGGTATATTCAGCGTCTGCTGGAGGG >3.4|1966338|42|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder AAACCATATGGGAGTTTGAACAACGGACTGGTTACACGCTTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012373_3
The CRISPR arrays of NZ_CP012373_3 >merge|NZ_CP012373|3|1966232-1966414|PILER-CR,CRISPRCasFinder TCATTTCAATCGCCTGCATTGGCGAACCGGCTGTTAACGTACACTCGGTATATTCAGCGTCTGCTGGAGGGTTTCAATCGCCTGCATTGGCGAACCGGCTGTTAACAAACCATATGGGAGTTTGAACAACGGACTGGTTACACGCTTGTTTCAATCGCCTGCATTGGCGAACCGGCTGTTAAC >NZ_CP012373|3|2|1966232-1966414|PILER-CR TCATTTCAATCGCCTGCATTGGCGAACCGGCTGTTAAC GTACACTCGGTATATTCAGCGTCTGCTGGA GGGTTTCAATCGCCTGCATTGGCGAACCGGCTGTTAAC AAACCATATGGGAGTTTGAACAACGGACTGGTTACACGC TTGTTTCAATCGCCTGCATTGGCGAACCGGCTGTTAAC >NZ_CP012373|3|3|1966235-1966414|CRISPRCasFinder TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAACCGGCTGTTAAC GTACACTCGGTATATTCAGCGTCTGCTGGAGGG TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAACCGGCTGTTAAC AAACCATATGGGAGTTTGAACAACGGACTGGTTACACGCTTG TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAACCGGCTGTTAAC
>NZ_CP012373.2|WP_062151614.1|1964790_1966098_+|DUF58-domain-containing-protein MRPAPLLLWLLFGWLLFAICTSIFPRLLMLWAIMGGMLLIIALYDLLQLWMQTFPHVTRKAAGSLALGVWCDVELTIFSRYKADQQIEIIDDYPPQADIENLPQTLYLQANTGVATQYQFCPQQRGNLHFNGVHLLLHSSLHLWKRYYYQAIPQAIKVYPNFAAVTKYALFAIENRLGQLGIRKRPRRGEGLEFHQLREYRAGDSLRQINWNATSRLKKLISKEYQDERDQQIIFLIDCGRRMATQDGALSHFDHTLNAVLLLSYVALRQGDALGLLTFSGTESRWIAPRKGMNTVNLVLNTLYDLQPTLRTSDYLNAVEQLLKHHQKRALIILISNLRDEDNEELTIALKLLRAKHLVLLASLREKILNEVLDAPVMQFNDALRYAAIHEYLGHRSQSQENFKNKGVIFVDTEPEQLAIHIVNRYLDIKRGGIL >NZ_CP012373.2|WP_062151612.1|1964079_1964787_+|DUF3108-domain-containing-protein MFRFFILVLHLGCIAPLWADDAFPPPFTAHYTVYAKGVTVGEGTRRLYRQADGRYVFEAKSNTVGVAALFRDDVIEEKSIFDLINNNARPLEYIYSQQGSKKQKFIHIIFDWEKHTAQNIAPEKPWDIHIEDGVVDMMLYQIILMQELQAGKRDLQYAIVDKGEVKTYIPKYLGDDIIDTGLGELNALKYERLSENGKRKTTIWSAPKLHYLPVRVEHEERGDTFSLVLESVEGL >NZ_CP012373.2|WP_062151610.1|1962911_1963943_-|RNA-3'-terminal-phosphate-cyclase MLQTRYLSIDGSQGEGGGQVLRSSLALSIYTQQAFHIHHIRAKRKNPGLQAQHLTAVRAAKMVSNAHVEGDVIGSGELWFTPNLAQGGRYRFNIGTAGSTTLVLQTVLYPLLLAEHPSHLVLSGGTHNTAAPPFEYLTTVLFPLLQKMGCQVTATLDNYGFYPKGGGQITVDIQPTRVLQGLTLLQRGELLQQEAQALITGIPAHVAERELAQVKKKLRWADSCLKFMPVASGYGTGNILLLFLHYAQVSELFSGVAQRGLKAEAVAEHAIVALQAYQAADVPVGEHLADQLLLPLAFAGKGQFLTVAPSQHTLTHCEIIQQFLGLKIQIEQVTSSQYLITVG >NZ_CP012373.2|WP_062151607.1|1956367_1962835_+|ExeM/NucH-family-extracellular-endonuclease MRRTQYPDSWVIKIRQYITSFSIYTLIIFGFLAQSAMAAPKLLISGYLANPQSTDSPYEYVQLIAVENIDFSVTPHAVVFTNNGTATSNGWVAGGALTYGFNLTTGTLNAGDIVYVGGSGKLINGSGSTDISSATWLNAINTATTAGNSFGTAASSGVLGNGGGNADGIAIFDVAVSSITASTVPVDAVFFGTGVGSAKPATGGYTLPTNDLYDNAQGTFGNGTNTFIFSDPAGSGFTKLTGVYNTNTATWTTARTGSSITLSTSSVLSDITTAITLATTDTAPTVISSVPSDSATNVATSSTITLNFDEPVDLTAAAVTVECPTATAQSFTGLPANNVSTVILTPSTTLPNTTSCTVTVIAGQVTDKDGTADNMATNQIISFTTIAAPVGTAPSISFGTNTDDYIDGGVSIAPASPFAITAALNDSTDAVKNAGIDFIIADSDGIATTSVTASSSNSSVVPNTNLTIAGSGTAAVNVKINPVGVGYSTITVTVSDGTNMADYVLNYAVSAASTTPTTTRFHSGKADASSAIAIDTDYMLVADDEDQTIRLYNRANSGLPVASFDFTSSLGLSGSSEVDIEASTRVGNSLYWLGSHSNNSSGNDKPNRERLFTTTLSGTGTTATLTFEHYYKYLEDDLIAWDSSNAHGLGANFFGLSASAAAGVIPETTGGFNIEGFSIAPNSTDTVYLAFRAPIVPTNTRTKALIIPVTNFTTLGDASGGVSGSATFGAPIQLELGGRGIRSMECNTAGCLLIAGSADGTGNFKLYTWSGNALDTPDERSTNLPIITDGSYETIVALPTGATLTAWDNQDVQFLIDTGDMIYYADGTIAKDLPNSNHKKFRSEIVNLGTPPVISKIHTLQGNGAATSLTGTQVIEGIVVGDFQGSTEGKGFYVQEEDADIDADVTTSEGIFVYCNTCTTAVSVGDKVRVTGTISEYSNQTQLGGTLSINVLSTGNSLPSASTVTLPVPSAIAGVDYLERFEGMLVIFSQTLYVSSNYTLGRYGEILLSANGRLSQPTNVTTPGVNASTLQAQNLLNQITLDDGLTSQNPDPAPHGLSASHSIRGGDTVTGLSGILNYNYNLYRVQPTASVSFIASNPRTATPTSVGGTVKVASFNVLNYFNTFTACTLGVGGTANNDNCRGATDATEFARQRAKTIAAIQAINADIVGIMEMENDGYDASSALQDLVNGLNSAMGADTYSFIDPDTALSTVNVMGTDAIKVALIYKSAVVTPAGAAMTSTDAIFDRRPLAQTFQVGIEKFTVIVNHFKSKGSCPTTGTDTANEDSGDGQSCWNAKRQTQATTLLNFIDNTVKVNSGDDDILIIGDLNSYAEEDPITLIKAAGYTNLVTEHSGVNAYGYQYDGLWGYLDHALSSASLTPQINGVTDWHINADEPISLDYNTEYKSAGQLTSLYAADGYRSSDHDPVVIGLTPTVAYQLSLTTTGTGTGTISSSGTPAGTSCGTNCLTYVSTSTVNLQATPTGGASFSGWSCTPTFVSGNTLTANTICAATFTAAVVTPVTPPTSGDYSLAIKVVGTGSGTISGTSAGNYPSGTRISLTALANADSDFIGWSPSTCAATFVLDVNTTCTATFDLKVIPQQYTLSLTTTGTGSGVISGANAGTYPSGTLINLSAIANSDSQFIAWNNALCASPFNLTADTVCIAQFESNPVTPPPPTTLSYTLYLQTTGTGTGMINGTGAGMYPNETLINLNAIANSDSQFITWNNALCASPFTLTADTNCIAQFDKLLPTTPLTYTLTVTPSPFGTVQMASVTCPDDCSVIVDSGTILSLNAIANTGYQFIHWTGDASCGQTVNMTTNIHCEAVFMPITTTTATTPLCPLTGTVNTLCNAQLREITQALTVLPQGNISNLVIATTVLNQGWLSNILVKTTGRITGGILTGYVHNQGILTDIDFKGGYLQGGILAGVILNSSLVDGYIANVRFMENATLTGGILQGRIYGNPNAPAMLNNVRIKTGSHLSGVILGENVIVEDNVIIDKNIILPRLDTLTAYDATGKVITVDSQFVGGISVLNQAYVIKTTQKLADTVNIRGRIFVAPEHVGKTADLFVYSPYWYADNRFISYFMTDSKGQIFAWDEKPLNLIPFKQSVVLEPIQEMDLYTGHFVAIGTLKVVFGYRLSDGTLVMHNEPSTIHIEIQP >NZ_CP012373.2|WP_083991470.1|1955537_1956161_+|GTP-cyclohydrolase-I-FolE MSQETPENKKSQYIVGENAVENLTTMYRNIIVNVGENVERDGLLKTPERAAKAILRLTSGYQQNLNAIVNDALFESDSDQVVLVRDIEFYSLCEHHLLPFFGKCHVGYLPCGKVLGLSKVARIVDMFSRRLQIQEQLTHQVALAIQECTGAYGVGVVMDARHMCMIMRGVEKQSSSTTTSAMLGTFRQNPAARAEFLSLIASSNSSL >NZ_CP012373.2|WP_062151604.1|1954729_1955344_+|phosphoribosylglycinamide-formyltransferase MEKLAIVVLISGRGSNLQAIIDAADPLVDIRAVISNRPHAQGLHIATQAGIPCEIIDHTQFANRDTFDTALQNCIDHYQAQLVVLAGFMRILTPDFIQHYAGRLINIHPSLLPAFKGLHTHRQALQAGVTEHGATVHFVTPELDSGAPILQGRVPVYPDDTEEQLAQRVLDIEHQIYPQVIHWFAEQRLYLQAQTAYLDNKPIN >NZ_CP012373.2|WP_062151601.1|1953686_1954730_+|phosphoribosylformylglycinamidine-cyclo-ligase MKNQTSLTYRDAGVDIDNGDALVERIKPIARRTHRPEMLGGLGGFGALFEIPLDRYRQPVLVSGTDGVGTKLKLAMQLGKHDTIGIDLVAMCVNDVLTSGAEPLFFLDYYATGALDVETATHVISGIGKGCELAGAALVGGETAEMPGMYHGEDYDLAGFCVAVVEKAKIIDGSQVQAGDALIGLASSGVHSNGYSLVRKLLALSNADVHQDFYGRTLGATLLEPTRIYVKPLLQLIRTLPVHALAHITGGGLTGNVPRVIPEGLCARINTNSWHRPPIFDWLQTQGNITDEEMYRTFNCGIGMIVCVAQTDLDATMQCLHDAGETVWHIGEIVTDPQQTIVLHAGT >NZ_CP012373.2|WP_062151598.1|1951842_1953162_-|hypothetical-protein MTHKKHSAVLSIAGILLFSMICLSTIHGLTGFVSPLGAGICAWLAGILLFKRVSRQQKYQVWIILTIGFICMFFSLSQGKTAVLVAAVSINQAVLAMLAAVGFLRLVTQPRLHKHETLPTGKAALLRTLYGVHLFGFFINMSVLVIMGDRLAAHQTGLSRQQAIILSRAFAMAVLWSPFFAAMAVIYLYIPHINFLLLMAMGLPLALCGLWLTGHELVSEAESQHFVGYPMHFASLWVPSLLAVCVVLVHFLFPQLPVLTLITLLPIVLVVIVLSLQQGLPATFHQIFMHITHNLPTMSGELLLFLAAGVMAAGISSVLQITMIQLPLSHFGLLEATLLLFVILLIALIGVHPLISITTLSSLFLPIPHDPNLLGMTFLMGWGLGVSGTPFSAMHLMMQGRFHLSSYLITRWNIRFTLKMIALSLVVLYCYDLVSYYFI >NZ_CP012373.2|WP_062151595.1|1950899_1951820_+|hydroxymethylglutaryl-CoA-lyase MSLPTFVKLVEVGARDGLQNESQFVPTAQKIEFINRLSATGLSVIEVTSFVSPKWVPQMRDNTAVLTGITHQQGISYPVLTPNLQGFDMAVAAGATDVAIFAAASESFSQKNINCSIQESLARFNPLCQRAQQENIRVRGYVSCVLGCPYEGTISPQAVAEVATRLYDMGCYEISLGDTIGTGTPTKACQMLEAVATQIPLSQLAAHFHDTYGQALANLYAALTMGISVIDSSVAGLGGCPYAKGASGNVATEDVLYMLNGLGIETGVNLTALCQAGQFISHYLQRPSRAKVATALCITDYPNQNA >NZ_CP012373.2|WP_062151592.1|1947100_1950889_+|PAS-domain-S-box-protein MSFFTVFTSPPTRRHLLAFQTLLFLLLSTSWLLSFIHWEQPYQWLMITCLSSVIALHLLLGYWIRQEHGNTHILKLIQQDTLDTLFESENRFQAIFENAPIGVTLVDNKTHHFLQANNAICQMLGYSREELLSKTIFDITHPEDIELNRQLFETISPPHPIIIGEKRYLHKTGHTIWAAISSSLPPNSSYRITHIQDITERKQAEVALRESENRFRKAFENAPIGMTLTGLDRLIQQANNSFCMMLGYPANRVIGKNEADFTHAEDNNGGQQWVMQVLEYSISPHPLEKRYVHRDGHIVWAAISSTLQRDINGKPVYLITQVVNITEQKKAEAEIKRLNIELEQRVARRTAELSLISQILSLFIRSNESPLVFETMLQRILELTESEFGFIADVVYDTIGQPYLKCHAIGYLIKQNELSAHFQPLALAGHQIRKLDNPLGLVIQQGERMIINEYATEADEFPRHYPPVHNFLGLPLYRGEHLIGMLGLHNRITNYSEELADSLEPIISTFSQLIEAFHNEQKRQRAEEALRKNQQFLQTLIDSLPVAVFVRDIRDCGFEFVAWNKACEQFFGFNAETVLGKMAHDCMPITLANKLTQSDEIVLDYGQALEIAETQIDSPNLGHRILQPVKVPIFDEQHNPLYILCIAEDITIRKHAEESIAQKTAILEATLENMGQGILMVDKQWRLVAYNQRVIELLKFPAEFLKHRPNFAEIVRNWNEHHGIKEHLLQDTELNTQQMDSFTIEMPIIGDRVIEMGHFPIVDGGFVRTFTDITEHKQIEESLRQAKNQAEAANRAKSAFLANMSHELRTPMNAILGFSQLMQRDPHITPNLQENLEIINRSGEHLLALINDVLAMSKIEAGRMMLNEQNFDLYHLLDGLHDLFHLQAINKDLNVIFQIADNIPHYIRTDENKLRQVLINLLGNAIKFTNQGDITLTVSHVNAPATNNKARLHFQVKDTGPGIAKHEITHLFKAFGQTSTGQQAQEGTGLGLRISQEFVRLMEGEITVESWLGQGTIFSFEINVTLIDASDVPFKETTRRIIGLAPEQPVYRLLVVEDRWENRELICRLLEPLGFAVQKAANGQEAVAIWAKWQPHLIWMDIRMPVMDGVAATRSIKARKTAQQTIIIALTAGAFEEERAAMLEAGCDDFVTKPFREEIIFEKLAQYLGVKYRYAEQGVTPSRDNQATTAQLGTLYDLPVMMQAALQDALYSVDLDQLDTLLTTLNDTHPQLSTVLRECIDNFEYERVLAVLKTPLPDSLPR >NZ_CP012373.2|WP_062151616.1|1966847_1968143_-|adenylosuccinate-synthase MGKNVVVIGTQWGDEGKGKIVDLLTDRAAAVIRFQGGHNAGHTLVIDGKKTVLHLIPSGILRDKVLCLIGNGVVLSLQALMEEVEFLEKSGIPVRERLRISDAAPLLMPYHVALDQAREKARGESKIGTTGRGIGPAYEDKVARRALRVSDLFHRERFAAKLGEVLDYHNFALQHYYKVPVIDFQKTLDETLALADKIAPMVMDVTSLVGQLQKDGKNIMLEGAQGTMLDIDQGTYPFVTSSNTTAGGAATGSGIGPKDLHYILGITKAYSTRVGAGPFPTELFDEIGEYLTKQGNEFGATTGRRRRCGWFDATALRRAKLINSLTGVCITKLDVLDGLDSVRIGIGYRCNGQELYLAPTGADAIANCEPIYIDMPGWKESTIGIRRYEDLPANAKAYLEKLEELIEVPIAMISTGAERNDTIIKQHPFDL >NZ_CP012373.2|WP_062151618.1|1968340_1969513_-|ATP-phosphoribosyltransferase-regulatory-subunit MNHQDRWLLPAGITDALPEEAAHLEHLRRTLLDLYTTWGYELIIPPMIEYLDSLLVGAGHDLDLQTFKLIDQLNGRLMGIRADMTPQAARIDAHRLKREIPSRLCYLGTVLHTRPTGFTGTRSLLQVGVELYGHAGIESDAEILSLLLTTLKTTGVQAFHVDVGHVGIYRALVEQAHLNSEQESQLFAAIQRKSRTEIHDLLTIWQVSPLLQQQLTALIELNGDVSILAEARQALAPAPAEVLEALNSLEQLNKHLSNFTLHFDLAELRGYNYYTGLVFAAYVPEHGQAIALGGRYDNIGKAFGNARPATGFSTDLRILAELTTIPPIRKTAIFAPAGLDAALQTHIQQLRQVGENVIQALPNQQGDALAMGCNRELCWQAGQWQVRNID >NZ_CP012373.2|WP_062155421.1|1969512_1969698_-|DUF2065-domain-containing-protein MWTEFGIAFALLMVIEGMTPFLNPSRFRQTLRAVAELNDKTLRMMGFVSMLFGLLLLYLIH >NZ_CP012373.2|WP_062151620.1|1969831_1970716_-|protease-modulator-HflC MLQNKMVLGVISIVVLLIMMMSLFYVQETEKALKLQFGRVVKADYSPGLHFKIPFFQTIRKFDGRIQSFDSNPQHFLTGEQKNLIVDSFIKWRITDTEAYLKSVGGNPINAGRRLSEFIADGLRSEFGKRTIQEVVSGDRAKIMDIITAEANRRGSEFGIEVVDVRIKQINLPDDVSTSVYQRMDAAREQVAKELRSRGEAAAVRIRAEADRENMEIISKAERDAEQIRGEGDATATEIYARAFNRNVDFYTLTRSLNAYREVFNSKDDVLVIEPNSDFFKFFKGLDPIIAPKE >NZ_CP012373.2|WP_062151621.1|1970715_1971918_-|FtsH-protease-activity-modulator-HflK MAWNEPGNNGNKDPWGHRKNEQGPPDLDEILKKIQDKLNSLFGGGSGGSGMGNMGDMGKGLSWSLLAMIAVGLLFLWSMFGWYVVQPAEQGVETRFGRYINTTTQGLNWHFPYPIESVQKVNVEQVRAITHRALMLTQDENIVDIELVVQYRVANARDYLFNVNDPDGTLQQATESSLREVVGTSEMEKVLTSERDKVTLKTKDLIQVIIDRYKTGLVVISVNMQNAQPPTAVQAAFADVIKAREDEERDKNRAQAYANGVLQRATGQSELLRQEAQAYKAVVIARAEGQTQRFLSILTEYEKAPEITRKRLYIETIESVLSNSTKVMVDVKGGNNVMLLPLDKLFAGRTVTTVPTDTTQPAVPSATALPPFTVFPQSSTLQPIERPSRDDNRTTTRGNP >NZ_CP012373.2|WP_145917075.1|1972069_1972375_-|hypothetical-protein MGRFRKAINTIFGIAILGGISYYTYNFASAESRIRAVCAEIQQGMTTKELQAFALTHGLSSFKLKESGINYVVETKTYGRFGCKVITESGFIKESEYNFAD >NZ_CP012373.2|WP_062151631.1|1972488_1972704_-|hypothetical-protein MKDKYDFSNAEQGKFYRPLEELDIPIYLDNEVKAFFIQKLRARAKDQSFSLNEMINALLKKDIEISIQLIS >NZ_CP012373.2|WP_062151634.1|1973032_1974337_-|GTPase-HflX MFERPRTGERALLVHITIHQFTEQASLEEFTELASSAGAIPILQITGTRPMPDPALFVGKGKLQEILDAIKANDIEIVLFNHSLSPIQERNLEKALQCRVLDRTGLILDIFAQRARSFEGKLQVELAQLQHLSTRLIRGWTHLERQKGGIGLRGPGETQLELDRRLIAGRIKNIHKRLEKVNQQREISRRARQRAEIPVISLVGYTNAGKSTLFNRLTNANVYAANQLFATLDATLRRIDLPDKTPLILADTVGFIQQLPHDLVAAFRATLDETRLATLLLHVVDASDPERQDRISQVNQVLTDIEARHVSQILVYNKVDKLGDEQPHVERDESGRICKVWLSAVTGAGIDLLFMALSEQLHEINIQQWVCVPANNGQLRSRLYQISTVLEEEHAENGDSLLKIQLLPKTLTQLLESEKDLQVVDEPTGLPKAS >NZ_CP012373.2|WP_002683997.1|1974423_1974669_-|RNA-chaperone-Hfq MSKGQSLQDPFLNALRKERVPVSIYLVNGIKLQGQIESFDQFVVLLKNAVSQMVYKHAISTIVPARNVKIPHEDLMQDENG >NZ_CP012373.2|WP_062151637.1|1974741_1975701_-|tRNA-(adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase-MiaA MNEIPCIFLMGPTAAGKTDLAVAIIQQFPCEIISVDSALVYRGMDIGTAKPTADILSIAPHHLIDICDPLEAYSTARFCKEALAHIQHIQAKGKIPLLVGGTGLYFRSLQQGLSDLPPADACVRERLNQELETFGLAALHARLAQVDPVAAQRIHPNDPQRIQRALEVYEISGVSMTEWYANTEKAWSLPHVLKFVIAPAQREVLHAKIAKRFKLMLEQGLVNEVETLFKRGDLHLSLPAMRAVGYRQVWQYLAGELDYAGMVEQSITATRQLAKRQLTWLRAEADATWFDSQQTDMTEHVLKRLVKIPMLSQSTSIIK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP012373_4 | 2230966-2231121 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012373_4
|
2 spacers
spacers of NZ_CP012373_4
>4.1|2230996|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder GACAAGGTCAGCTTGGGCAATGGCAAGGTCTGC >4.2|2231059|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder AGTTAGTTCGGCTTGAACAGTAGTCAATTCGGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012373_4
The CRISPR arrays of NZ_CP012373_4 >merge|NZ_CP012373|4|2230966-2231121|CRISPRCasFinder TTGAGCGGTTGTTAGTTCGGCTTGAACAGTGACAAGGTCAGCTTGGGCAATGGCAAGGTCTGCCTGAGCCGTTGCAAGGTCTGCTTGAGCGGTAGTTAGTTCGGCTTGAACAGTAGTCAATTCGGCTTGGACTGTTGCGAGTTCCGCTTGAACCGT >NZ_CP012373|4|4|2230966-2231121|CRISPRCasFinder TTGAGCGGTTGTTAGTTCGGCTTGAACAGT GACAAGGTCAGCTTGGGCAATGGCAAGGTCTGC CTGAGCCGTTGCAAGGTCTGCTTGAGCGGT AGTTAGTTCGGCTTGAACAGTAGTCAATTCGGC TTGGACTGTTGCGAGTTCCGCTTGAACCGT
>NZ_CP012373.2|WP_062152166.1|2229889_2230555_-|formylglycine-generating-enzyme-family-protein MGKFLAGDLLGGGDPDEKPVHSVTITSDFYMSQYEITFAQYDLFCDATGREKPSDEGWGRDNRPVINVSWQDATDYSRWLSELTGKRYRLPTEAEWEYAARGGTKTAYWWGDEVKPNMANCIDCGDEFVNQTAPVGSFPANPYGLYDMTGNVWEWTRDWYASYSREPKTDPYGPIIGSHRVIRGNSWEDNARRSRSSFRGYHEPEKKTAYLGFRLIIEMEQ >NZ_CP012373.2|WP_062152164.1|2229175_2229718_+|ATP-dependent-protease-subunit-HslV MEQFDGTTILSVRRNGQVVIGGDGQVTFGNTKLKGNARKVRRLYQNKIIAGFAGGTADAFTLFERFEAKLEKHQGNLTRSAVELAKDWRTDRMLRRLEAMLAVADHTASLIISGNGDVVEPEMGLMSIGSGSMFAQSAARALLENTELSAAEIVEKSLHIAADICIYTNHNLTIEILNAV >NZ_CP012373.2|WP_062152162.1|2227205_2229113_+|M48-family-metallopeptidase MLKVDFFGQQDQAQQKTRWLILYFIIALFVIIGFINLTFFLVGKFISLHHYQLSQWLQSPASHWVIGITLMVILGGTIRRLYQLREGGEALAIMIGATPIEPDTYREEERRLMNVVEEMAIAAGIPVPALYVLQMEHGINSFVAGYHASDVTLVVTRGALEQLDRRELQGVIGHEFSHILQGDMRLNLHLIGILAGILAIGQMGFYLLTGGTYQYEDRLNRNLRDLNIFPFALPFSILLISLGYIGLFCGRVIKSAISRQREFLADAAAVQYTRDPACLVGALLKIKGHRIGSKLYNYRAEEVSHLCFGSAFNLSRLLATHPTLDERITRIDRAYPYRLKYGKLGEQTASQQTAPLSEEYLSFQSTPTVRPPTTKTTVVASIGNPTPEHLAYATKIYQQIPKNILTLVHQQTGAKIITYALLFQGKVADKQAREIVLNTAESTEITQQVIALRQQLDTLGNQVRVPLLDLALPALKKLPYVERTTYLTIINDLIKADGKVSLFEYVLETILRHHLDTHTMRTSTVSYKNLAEALPDISLILSLLAHVGSGQSAYTIALKTLTTQPLPFASIVACKPEKLNGAINRLKYLTPQLKKSVIDACVTCVLADKQVETAELEVLRAVVESLDCPMPPLIG >NZ_CP012373.2|WP_062152160.1|2224383_2227002_+|hypothetical-protein MCVFKQHSNSCVWTDYAFYLLFFIGLSFTFPAQAADTTLPQLEGASGLDTTGESFSPNVIFSGGNAVAGQSYQTTVTQSLNAVADVKATIQVDPTHIGEKADIFVFAVTTLSVSTDVYYFMLGEGLYIDLWDQYTNTIVPFIPNVTLTATQSLSLYQGKFFYPGKLDIYFGYRLLDGTFIYNYQPISITITDTTTEPTPDPDPSTDAINGIPALTSYAFKSEQSKTIQGTSTENATGFNCSGTIKATDQIGRLALVSLFYQNGCYTDGTYNNNNYLVEKGTLNSSTQQQFEAYQIHEPSSKAQAFLASEHAIYYQFPTQEDYTVYSFNNNGLVKVADIAASAITLNEFTPIKSLTVSKVSGSVIYVFIPATQRISPFTALSTNVEAAHLTTTALGTPFKYRYNVNGLPFDTKQGFPYSPSDHANIYAQPRQFFFVRKTNGQIGIVWQNQADHSIQLTWLSNDLQSYTTITLNNNGMDLAVATGDDEGFIYYLTIQSGNGAQTDSSRVATLYKSNENGVLSTSLALDTAKTGLNIVSFDTDNVASLRYAQGKLGLIIGRLMHTSNDGLNHQGAIAVTFDANTLALLKNFGQTSGHSFENILTTNSQNEFVGVDLGDNYPRGINLHKFTDSRIDSRVIYTFKTQHGTTATSPAGKSYPLYSEISDSSHTYYKWSNDNNTYSELGGVIEGQQGYTVIFAGEKSPTGVSLDNSRVGSYLNDPRNLGIVQVIHDFASITPNTDNEVPEGLILTDGLTETGGFYTFNGTWSPQRNTGVVWLTNYQDKTQANVSRLKSVKLNDGNILLLWELWTDSQYVNTYMLKISEQGQKRSDIIALGTEVRLNRTDDILVNDNTVYIVNGNKSEKKLELIALPLTN >NZ_CP012373.2|WP_062152158.1|2221273_2223985_-|response-regulator MSNIIHFAQQTTNRILAVFPLRVVLIVPFLAQLIITVGLVAWLSFANGQKAVQELSQALRSEITQKIQQNLADYLSVPFYVVKNNLALLNQHFLTASDLTKWEKLFREQIYTYKTINSIALANEQKEFVAIRRIEASKLSFALSNEKTNFNLINYDYYTNQEIARSDNFDPRSRSWYKNPVKYNGLRWSDIFIALDTTALQLTVGVPITNVQAQLSGVIASTLRLTYISDFLKNLKIGKTGQTFIIERNGMLVASSTGENLFKKEDNTTKRMAVTESTNALTRYIADVLLQRFTQLSTIQTEQQIDFVWSDARYFLQVTPYQDDYGLDWLIVVLIPEADFMAQIHTNTRVTFVLSLLALIIAIFVGLLTARWVIKPILELNHAAQNLANGQWQAQSLLQTQRQDELGQLANSFQRMADQLYISFKNLENEVVARTQAQASAEAANRAKSTFLATMSHELRTPLNGILGYTQILEDDENLTLEQQEGIKTIQRSGEYLLTLINDILDLTKIEANRLELYPSSFKLKQFLEELVIFFKTNAQQKNVTFLYEALTLLPRFICTDEKRLRQVLINLLSNAVKFTARGGITFRVSYLDEKLCFQIEDTGVGISPEDLIHICESFKQVGDPKYRPDGTGLGLSITKRLLALLGGELLINSELGKGSCFSFCLHLSEIVELEKPTETPLAIGYTGTPRKILVIDDHWENRALLNSLLKPLGFEMIEAVNGADGLEKAKYYIPDLIVTDFVMPVMDGFEVVRQLRKIPALKNIPIIADSMSLLDYPQNTVSNIEINAFLPKPIKIEILLAILEKQLALTWIYKKPQGILSENVEQNATQYIDKTIILPSPTMLRSLHELATMGHINGIFKQLNHLETMDKQFSPFVKQIHVLAKGFQLDEICALIEQYLQQ >NZ_CP012373.2|WP_062152156.1|2220378_2221194_-|hypothetical-protein MQVERKKSFVEKLLTFLSRLKGYKSPLFIVYQPHSFLIKGKDTQEVMHLIKPGDILLRTYNNYLDKYFVKGTFTHAGLYLGEVTENHLRQIAKVDKPERYATGTQMVIHALADTVILEDLIQFCRCDALAILRFPQQLVLQKGRIPPDTVLNYLTEYAKVEAKSHQAAVLKAEIDIMTRLAQGDSLHFDTLFKIIYRVALSELITPHPADFGFDNFSPLSCTELIYFATKSICWNYDIEPTKQKIFFQQRRVIEADTFTNTDLEEVWKKVG >NZ_CP012373.2|WP_062152154.1|2219562_2220375_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MTETANDSLVKVRGLRFSRGKHLIFDNVDMDIPRGKITAIMGPSGTGKTTLLSLIGRQLRPQAGTIEVNGLDINKLSLNELYKIRKQMGMLFQSGALLTDLTVFENVAFPLREHTQLSEALIRNLVLMKLQAVGLRNARALMPSQLSGGMARRVALARALVLDPTMIMYDEPFTGQDPISMGVLVRLISSINKSLGVTSLIVSHDIHETASIADKIYIIANGKVVGEGHPDELRQSSSAWVRQFINAEPDGPVPFHYQGMDYETDLLGDK >NZ_CP012373.2|WP_062152152.1|2218762_2219545_-|lipid-asymmetry-maintenance-ABC-transporter-permease-subunit-MlaE MLDQFQQIGSQTLALFERLGRSVLFMLHLLSGLPSLLLRPRLVVMQLYSVGVLSLSLILVSGLFVGMVLGLQGYNILVNFNATEMLGVMVSLSLLRELGSVLTAILFAGRAGSALTAEIGLMKATEQLAAMEMMAVNPYHRVMAPRFVAGVLAMPLLAAMFNMIGIFGGHLVVVNLLGVDSGSYWSQMQSTVELYDDIFNGLLKSFVFGIAVTWIAVFEGYDCLPTSEGVSRATTRTVVYSALATLALDFMLTAIMFSDV >NZ_CP012373.2|WP_062152148.1|2218370_2218763_-|SEC-C-domain-containing-protein MAKKTIITTCPCGSGQVLQRCCEPYLQRQDYPLTAEALMRSRYTAYVLGNVDYLQTTWHPNTRPATLILDDSCRWVALEVVKTQAGKATDIQGTVHFRAYYKLATGRGGRLEEISQFERIDQQWFYLMGE >NZ_CP012373.2|WP_062152146.1|2214480_2218161_-|PAS-domain-S-box-protein MAVNNPRHSRFFWRSSAMFGILDMECQFKEVNAAWEKTLGLSTGQLLAKTFFAFVHQEDQPSTKYYFEQLEKGMASVSFACRFRHHDGTYRQILWEINGAASQEYAYHAVGMDITGREQPMIADEILSVLQEGVVLQYANGTIGACNPSAEQIIGLPAEQMMGWTLIDPDWRAIHEDGSPFPTETHPAICTLRTGQAYSDVVMGVVKSDESIFWLRVNSYPLWRDDVTTPYAVVISFSDISHYKENELTIRKEIQKRSSSPETVTDNNYELWDWNLDSNEVYFSSRWKKMLGFEEAELPNHIDTWHQRIHPSDYKKVMADIQNHLEGVTPVCENTHRLQHKDGSYRWILSRAVLVRDANGKPQRMVGTHIDVTETRRVEEELQETEKKYRQLLEVENNAVFMIDAESTGILELNKAAVQMYGYGRNDLLKMKTLDLSAQPEKTAKSIKKGLKYTSQQYHKKEDGTVFPVEVTANPFIWRGKQVLMLIVHDISERQKIETALWESESKYRQLFEASSNPTIVFDANTQQIFDVNHAAVDLYGFSKEDWLRLKTEEVSAESMKQRSAFGGGTTKKVQTIPLRWHRKKDGTVFPVEISTGNTYLFQGRSLICATVRDITERKAAEEALRKERDFINMLVQASPAFFFALEPDGKIRLMNKAMLNALGYVLDEVAGKEYLTFVPESERGIVATEFDTLRKSMQPSLLESHVISKSGVPLLVEWHSRAIVKANGALDYIFGVGIDVTERKKAQGHLRLFKSIIESSAEAIFVSNPEGQVVYVNPAHEKLLGYSTKDSRQMNYRTYYSDSSLMVWESDVVPALEEGGSWEGELEVHTQEGQLFPVWERVDAVRDTGGNILFSFGLLHDISEQQRTRDTLYKQAEENHVILNTIPAFIWYRDRENQLVRQNLLADTTFGTGNPLVMQLTDGKDVLRNGLAQFGIIQTYPTKTGDAVRLKIDKLPYHDGLGRVSGVIVYAIQLQDNMSLSANKPTDESVYEALQKLPFMLMAFDKERTLMVWNEMCTTITGYSGEEMVGDPAALKQLYPSIDQLEDILFSTSNQASFHWESLLTAKDGQLKNVVWYDLAKYFALPKWFTWYLGYEIPLDSYDDDALHDDDVMLSAVFDASKLGLCLTDDRGRFLRVNRTYAEFYGYRQDELLGQPFTLVLPSNTHSEAVREYYSLLMTNEQAIMYRQRNEQHRTGAIFETNVMASRVILNDKRRLLLSVVNKVI >NZ_CP012373.2|WP_062152170.1|2232077_2233799_-|hypothetical-protein MSITPAPPTNSSVNNAYYWHFTSDGEMVEAVSLPLFLSLTTTPTGYALSGTPYQVGSHVIELLVGGIAYSYTLLVEMPSSEQALVTIPATDTAVLLVQLNYFNPQTSVVERHFIATAPYISKPTDARANTSFYECIVNKPTVSRELSGAFDGIIKTNTDALTVKNFANERDDWLMQSFGMRRYRMWVGSKNQALDTLTQIAYGYIAREGITTSGETQLSIPFRDATEILDNPLQTNTYTQTHIKNQIYPDVFGTVFNIEPICIDTALLIYQFHSGSSNALTAVRDGGIGLTLGIDYTDVDLQNSTFRLIQPVKYRLTCDVQGATWNGQFVQTVGDIINYVLVNRLPELELVNLAEFNYLCPQPVGIYIKEKMTFKTLFNKLLSSIGAFAITDNEGRLSLKRFGDVTGNPVINIPKNDIVQGSMELAKRIPPVASLRLGYKKNYTVQADSFAEDLTEAERQPFKQEWLIAQTSNTGIEEQWREATLLESTGDITETCLVNELDAFAEASRRTVMYSRMRDVFKFKVYFNASLLPIGSEITIAYNRFGLAVATNVIVLSISAPLIGGSSEIGVLR >NZ_CP012373.2|WP_062152172.1|2233800_2234709_-|hypothetical-protein MRTKYTYSASATLAHVHADIIAILTGETDVNNLSASCNKASSSILTTISTAGWSVHDSSTGTTNKTIIKAPHADNASNYKYVEIYSQTSSLTVTLWEAWNETTNAGTNQSTAVTQPLNLTSGGSVYIWANPRYLVMASEIGASWGNSQNSGVVPIFELSRGQPWNTTSYPSFCLVNFYYTIYSNTAATYIPKAVDNNGNTVTGTNANCYIGSIAALIYLNVPSGATARVPDGSGGFTTPFYPLYLHNPSKYAAPVGQITSICDIWLAPSSLFSNLATIDKEGVTYEAVLIYSTGYHLLIPKG >NZ_CP012373.2|WP_062152174.1|2234708_2235500_-|hypothetical-protein MYLSLSLSSTATNATVLDAIRLALTGTTTLIGLGSACDMANSELLTDVSAGWTLVDSGTGFIVLSAPQETGTAIKFVRIRLISNSLSIDGMEAWNSTTVSGTNVTTAASISLAMPTVNQLNKLVLFSSNRFVAMQSTQNGVVSTLIYACEYTPIYPASLDKVRLLVSGRCVTQFNQDTQILLYNYSATVQTLDADFATTSTGQDTSGNLYAPAYPQFVNPASGGFVLGKLFGLLKTIALSQMEVTLNADSYAVIDTTTLIRKG >NZ_CP012373.2|WP_062152176.1|2235499_2243935_-|tape-measure-protein MSTVTVTVKILADGSALVGTTRLTREELAKLSGGMDYAKTAAGSLDNSFSRLANTLKGVVAAAVGLSVIKQVGSDFVQTIAETQQLNSRLLSLTGTLEGLAEAQDYASNAANKLNTDLQAFKASYASTLVLQQAGLMTTREARALIEGISQVAANIGASSDQVKTAMYGIAQSLGSGVLQMQELMQVAEPLPGILNSVARAAGVTVGQFRQMVSDGKITSEMYKNYLLKAVKEYDGAAQASAKNLIPAYTRLNNAYTEFKNAFEKPISDTLTPLMQNATSALKTMTGYAPQIIGAFSPVVNILGVGGGLYLGMKGLPVVVGGATTAFTTLSRAMYVLTVATSTAIVPTSRLDMALLALRANLAAQTTLLGKTSVLWGTLNTSLYGTAVAAQFASGWMGKLQVAGGLLFAAYAGWEIGSYLYEQFDIAKTGGMFFVSTTLQGWEYLKQGGDNLVGRLSKGWGIMGEAFKSPIQAIQTMFFTTIGAMTDTFIGFIQTVVSIGEYIPAVGDQFTQLNGYLESIKTSSNTTFAELSTTDFATNITKNNAEIDASLADLNKGYADNITQIQKLADEQAVSVVVGNQKVTQLDEEKRNLAEITKMETERTEGHKKQLEAIKTSMAEQLRLSTLNEKQAGAEQTVTELLKNQKFQATEEEKQSLISLQLQIEGNKETRKKAAQVEEQAIKQQADTLKKYVDTAKEAYAEIAQAGLNAQQKTQYEATDKYGNDLGLLVSQAQQAGEAITLLRDKRLELQKVGLSETQQKELDLTQQYNSELAKQVIEIDRLVVSQTALIEAQQGYDASGLTKQAREYLDLMKQVGEETAKQVITLNNQATAKSTGVDRIASLQEEITLLQLTEKERAQYNALVDIAPDQRDAVKSLLEQKAVLENTQKQWETMTNSAADYAEKVATGELKIGDAVKGFIVDINKQNIKDQLTKLKEQITSFFNGDSGKVTLEGALGIADAQTAKDVSAASKIFETYQESLKTGTDDSVKRMIDGVNTGIANLQKGIEESLLKVNIGLNDATANLTKAVEKSNVVSASNTSQTYTAKGNNQSIEAIIQAAVKNGISQTDFLKFASIETGGKFNADAYNSGSGASGLFQFVKSTAKQYGLDSSNVFDPFANANAAAKLYIDNLKQIQKYTNDISATDMYLAHQQGMGGYASIKSAQDTGSFTRSDTRKNILSNVSSADIKKILGIDLNQFKSLNDKEMAENFEKYWKTKVDAIDISKFVTANNTLTQAQQQQAQALTQSTVQKTVTDQQQIVAGQTLATANMQQVDALGLAGQGVQGFANATALSAQAIVDTAKGFASGAGDLVKQVANKIQTTQPSTSKESDKGLLSSITGIFDSDGMLSGVGDLFKTGGALESVGSAVSGLTDKLGKAGGSLGGFSTSIMSLFSGDIKGALTSGISAGLSVALPGVGTALGFAVTPVMNKLFGSWEVESQHLTASFKDLSASFAVKTVEVNKGLIGGGKKTTYSEVDSETNQQLQESIDATVKLIEDAGQKIGKALTDNFNFKSVIDMVHEGTDDFETQFARMQSIMVKNAFTEANIAGVDTSITAVMADKVQNVLKQASDGLYDKATQEFMWKPDTQKYAVQITGTVQDGLNSLIASTDWSGLTFDESQSKLQTYLTDAFNAIGVDVPQETFINMANDFATQIQDGMSWLNDTQDIVDPDAQFFKNMREIVNNFNEWDAQPEEVSAFINSLLGLKDAFKLVGYDAGLISQSLIDASGDIGTLSSNLDTFYSNFLSEEEQRTNKMTVLNDSLTSSFTQLGLEMPKSKDAFRALIDGMASDMSDPALFADAIALSEQVAEYFNLQAESVNDGITNVANGFDILIEQIDALATSLTAQDVGGWLKDSVLNATNAEDAGLRFSNAFANAFQEQMLSTVLSTVSNMVYTGLVEPMLQASSISASNTVSASTLSANQDITASNNSAVSLTAGGSTAATALAAGGQIAAEYIAGVVSEVKNVIAVMTTVMQDESIKAMLADLQPALQDIGSATFSAVSTPTSITAPYVQSQQASAVSDKADTATSNTTQEVEKEVESLDSLRQSLREFGTGLDDTDLKLYQLSDVFKNADLSMINFSGSAEDIANSINGLDDTQLRKIASETGISIDELEGYAVDYLSILREQATAEKERLAEFTAWQTGLLDYTANGSQVAQVTQWLTDSVNRLGMNADSAVGFLQGLNQADIAGYAQDLGITDDELQELIPDVISGLNDFAKSIESFHTSLNDFLTLSDPLNEFAKQTLELGVGSAQAAEWAKSQNPETLAKWAEELGISTDELMQNAVKVVTYMQTAETDARAMADGWISVFTELMDSLDSLNQGIGDDINSLNGLSVDSVARLKEQVYGDYTGNADSILQDPDELKKRISLAGDLRQAIMTQYEEQKSLLEEKHQTELDNANELLDIAQSLKDRVMSIQLNKTYFSAQDRFSTAQTQYQDLLGKAQGGDAEAAKKVGEAFSSYLDVASEMYASSAQFKAIRDAGLKDLTSLGVDLTTKGNSVSQSFQDSTYAGELKGLQESALSELQTLSNVVETTQAQGTNQLVASLKDLGTQFGIDINNVGQVIKDLFPQLGTRTDSVANAVTTPAVSDKQIADYVSQAVQASGGVNQQSVSQIVNTASQYGIAPDRLAGAIGVDKQTVSQTAAQYGQTYNAVSKKDITDYVGAVVAQKGITQESMTEIYNMAKQSGVTSGQLADALGYTREDVLAIAAQYGLPAFAEGGIVTKPTIGLIGEAGREAIIPLNQLPQMTQQGASPELLALIARLIEAQQRTQAILEQLLSSSDRVSSTVKETGDKQAKALEKAGSNGRFS >NZ_CP012373.2|WP_145917083.1|2243941_2244301_-|DUF1799-domain-containing-protein MDKNLSNIGEHWAMLQTRPRAVNIRKDYGYLPDEVIEALEGEQIQTDNVVCQVYACNVPAFNLFLDVCHLWRYLPMGGLIGLDWVQVQAWLALTQQVISPIVIRAVQVIESSAVRTLNK >NZ_CP012373.2|WP_062152180.1|2244281_2244605_-|hypothetical-protein MSFDIAEKIIIPTDVNVITADPKKPIKLRVHYAIVPQDEIDEAVETDGDKGFISAVVEKVEGIVKSGVAVDPVEAVQLIANHPLLSTAVMGAYAELRNRNFRGQKSK >NZ_CP012373.2|WP_062152183.1|2244639_2245788_-|hypothetical-protein MAYEIKFTKRAVVEAALEATAGVNPNSGFTAILANVGAKVDKNSTPIDRNVLDREFGAFGSAITASMFKESIEVEMKALGREAGNILVPEWTVPLQACATVKNDAYVLALSGVTGTFEVGEEVSVTSTVVGVIIDIAGTTLYVRKVGLTTVTPSDVVDGESSSASGTVSTVTTGLLFEPTSDESLMKSMTARFNQDGILKISTYMRGTAVITGAAKALPKIAFDLTGIYNAPTDTAMPDVTTSGVKPIPFQNVTLTWGDLDVSKIMFSEFSLDLGNVVVESEDSKKANSIGGVFITDGLPKLKLIFSQSTLAEYNPFAEHETPVERDFAVTYGVTDKFIRVGARKVQITTIAEQEKNNINFYTLDCTCNKGGLTPKWYIAIY >NZ_CP012373.2|WP_062152185.1|2245790_2246681_-|hypothetical-protein MNNCSRLNLPRQALFPTTFESGFQPAAHNFWFGLPRLRGDIALVGSVTTQDTTALVDSGIVALVGSVTAEQTNLVFTGNIQLVGDVTPTAVIAEQIDAGIVRLVGSVTLIEPTYVDSGVIALTGSVSTQDTTALVDSGAVALVGGVTTGSIIAEDSIVRQQIVLKLKEITDFLEVSGVANLKAGADNVDNMPSAYVFESGVTATDNQAATGVLQTVSTLFVIILMIENNTDDFGSDSSDQMNQLRAQVMSKLLGFKPIGQVQRLEYRGGRVYDFTDDILVWQEHYLLPYTVISDRS >NZ_CP012373.2|WP_062152187.1|2246649_2247003_-|hypothetical-protein MHLLLLIIPFLLLGCAEHPTRLSNGFGLIIHQVDEDRVPTDCATLTGVSYPYVGCTRIFNEENLCIVVAPTDAFPYFNQREQAIVDHEIRHCTEGNYHEPDLRDEQLYEQLLPIKPT >NZ_CP012373.2|WP_062152189.1|2247006_2247804_-|hypothetical-protein MIQNWDSVIAACNAQQVLNFYAPSTTTKGAGTFFNYWGTTWTYGAGVTPSTGAGQTFNKDSVGAIRFTAPPSGEKLYLGKWFMSSSVASSFFLYDFLWGNSGLVGNSLTLQAINSVALPTRASNGEGVQLWVNFYQGTDNAAPSITIKYTNSEGVANRTATATIPATNPVVGQAFPVLLQAGDKGVQSIQSFQMATVTPSAGDIGLMLVKQVSEMSLQQANVAESRDPIALLLPQIDENAAISIMQMCTTTVSGIQQGTFRLLAG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012373_5 | 3241978-3242161 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012373_5
|
2 spacers
spacers of NZ_CP012373_5
>5.1|3242003|53|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder TAGTTATAGCGGACAAACTTATGCACAGGGAATGGGATTATGGGGTTATGGTT >5.2|3242081|56|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder GCATTATAACGCGACTTTGTACGGGCAGGGCGTTGGGGGTGCAAAAGGCTTAGGTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012373_5
The CRISPR arrays of NZ_CP012373_5 >merge|NZ_CP012373|5|3241978-3242161|CRISPRCasFinder TATTATTAGATTTACAAGGAAATGATAGTTATAGCGGACAAACTTATGCACAGGGAATGGGATTATGGGGTTATGGTTTATTATTTGATTTACAAGGAAATGAGCATTATAACGCGACTTTGTACGGGCAGGGCGTTGGGGGTGCAAAAGGCTTAGGTTTGTTGTTGGACATGCAGGGTAATGA >NZ_CP012373|5|5|3241978-3242161|CRISPRCasFinder TATTATTAGATTTACAAGGAAATGA TAGTTATAGCGGACAAACTTATGCACAGGGAATGGGATTATGGGGTTATGGTT TATTATTTGATTTACAAGGAAATGA GCATTATAACGCGACTTTGTACGGGCAGGGCGTTGGGGGTGCAAAAGGCTTAGGTT TGTTGTTGGACATGCAGGGTAATGA
>NZ_CP012373.2|WP_145917111.1|3239178_3240405_+|hypothetical-protein MPSHLNWTLIDQAMVSLVNFLTGVLVARLLGLDAFGFFALLWTILFFFSGLQIAFILSPLLSLGTQQTPEQADSYYSIVLIQQLIFAGLSSVFILLGLYLSDIFFPTWHTAPYALLLALTSFTYQLQDFIRRYFFTTGNTHSAFTNDVISYLGQLAGLLGLFYWQIISISAVLWVTMLSSLFAVGVGLCQFRWRAWNKTFFYQITQRHWQYARWLFASVLLERLHDAIMKAVITAVLGVQAVGVFRACQNVIGMSHVLLLALENFAPPQAGREYLQHGIVGLRRYLSRITFNGGVVMAGIALLLGCFPTTWLYLFYGDEFSDYGYVLTSYVVVYFIVFFLSPVKIGLRVLEKTRPLFHALLWAVLISLVVIYPFTVWFGLQGTLLQLMLFNLIQVVYLFWVLRLQLRH >NZ_CP012373.2|WP_062153681.1|3234337_3239149_+|tetratricopeptide-repeat-protein MNITLITITEKSFINNGFSAELAFNHQRRYQITITPPFDEKQEHNLAWYFEKYLAFPFTDNVRFNETALSIKTYGEQLFKQVFHEPDAYSDYRDALKTGFTLEIIGSPAFHALHWESLHDEKRPAPFALQFEIVRKPLHFNSPYQAITPQVSPTLNVLLVVARPNGRNDVAYRTISRPLVEMVRNSADLHVHFDILRPATFQALTQHLEDVKKKKGAGFYQIVHFDVHGAVLDYTTAQTAETAGRISFDYGRGELQPFEGKKAFIFLNHEQTGKAAPISAESLTDLLFQHGVPVVLLNACQSAKQENTSTETSLASYLMQAGTQAVVGMAYSVTVSAATLFMQTLYEQLFEGASLAVAIQRGRFELDKQKERQVYYNQLIKLEDWLLPVVYQNVPQVQFALRAFSVEEERTFYEQDALRFSEPKTAYGFFGRDLDILEIETAVLKRNSLLIQGMGGAGKTTLLKHLGAWWQTTHFVDKVFYFGYDEKAWTRQQIMRDIAIQLWGKLEYEQRFQAFSEDAQQKKLAKALRSERHLLILDNLESVTGSALAIQHVLTVTERENLQHFLQELVGGASLVLLGSRGAETWLKTGTFEINQFILNGLDSEAASQLVNEILNRHQIKTEYKQQDDFKKLLKLLAGYPLALQVVLQNLTTKTPTDILTALTAGDSAIDLNSTDKTQSILRCIEYSHSNLSPDAQQLLLCLAPFVGVINTNGLAVYTELLKQQPALAHLPFEKWETVLQEAKNWGLLGQHESHIYLTIQPTLPYFLQTQLQNKVEVKTAIETAFRLYYEKMAAGIYQLQKSKDPKQKQLGQLFASIEFENLQQSVQFALTAQVSIFYPYIALSNYFDATQNLQQGLVFGQQVLTQLEQYSPEKLAGQLGAELVGVIDNIANCFLQSQEYALAEQTYQKALKIWKNLTFFEKTERAKLNANTYHQLGMVAQAQRQWSQAQDYYQQALAILIEFNDRYSQASTYNQLGMVVEEQRQWSQAQDYYQQALAIWIEFNDRYAQAGTYHQLGNVAYEQRQWSQAQDYYQQALAILIEFNDRYSQASTYNQLGMVVEEQRQWSQAQDYYQQALAIWIEFNDRYAQAGTYHQLGNVAYEQRQWSQAQDYYQQALAILIEFNDRYSQASTYNQLGRVAEEQRQWVQAQDYYQQALAIWIEFNDRYSQAGTYHQLGRVAEEQRQWSQAEDYYQQALAIWIEFNDRYSQARTYHQLGRVAQEQRQWSQAEDYYQQALAIKIEFNDRYSQAYTYHQLGRVAQEQRQWSQAEDYYQQALAIKIEFNDRYSQASTYHQLGMVAQEQRQWSQAEDYYQQALAIFIEFNDRYSQASTYHQLGMVAQEQRQWSQAQDYYQQALAIKIEFNDRYSQASTYHNLGMVAQEQRQWSQAEDYYQQALAIKIEFNDRYSQASTYHSFGSVAQEQRQWSEAQDYYQQALAIYIEFNDRYSQARTYHSFGSVAQEQRQWSQAQDYYQQALAIYIEFNDSYSQAGTYHQLGRVAEEQRQWSQAKDYYQQALAIWIKFNDSYSQASTYHQLGLLAEAQEDWEQAIEYLLQAYIIFAEYQDEHNLQITLENLARIYQQHPNLVEQKYKALGISMNGNS >NZ_CP012373.2|WP_062153679.1|3233979_3234327_+|hypothetical-protein MTEYTVIFSPELDIQPAEFATFWNAQSQLQQQAVAQVQDAQKTAHYEMDGLTMMALIFIGNFALDIFKDVTKDAIKDFLKKRWLNKPEQKATEFDLIEKKTEDGKTLIIVLPKQN >NZ_CP012373.2|WP_062153677.1|3232792_3233938_+|OpgC-domain-containing-protein MSLISTSSPHSTITQRELKLDFFRGLALCIIFVAHIPDNWLANYTHGRFGFSDSAELFIFVSGYTAARAFGRTFSQLGFWVGTVRVLHRCWQLYIAHLALFFLLAAICAAGNKLQYIDYIGRLNIYFFFEHTPEAIVGLFSLSYVPNYFDILPMYIAILASVPLIMLLARVRPVLVPIACLGIYLGMWWFNLALPAEIDSDRPWFFNPFGWQLLFFTGFMLGAGWIKSPHLTSVLAFVCLLFILLSIPLSNYPIYSQSEWLNQLRTNIDPLVIKTNFGILRWIHFLALTGLTLYLLKYWKNFFYTLFAQCLIKIGQQGLALFLCSMILSYLAGMLMDYTGRHIIDTVVINGIGIGGLIGIAYMVAWFKTVPWKNKAVMCFG >NZ_CP012373.2|WP_062153675.1|3230476_3232276_-|aspartate--tRNA-ligase MRSHYCGQINEAFIDQIVTLCGWVHRRRDHGGVIFIDLRDREGLVQIVFDPDTQDAFNIAERLRNEFVVQIQGLVRRRPEGTENPDLSTGHIEILGRQVEILNASEALPFQMDENNVNEETRLRYRYLDLRRPIMQERMKLRTRVSRLVRNYMDSNGFMDIETPFLTKATPEGARDYLVPSRTHNGEFFALPQSPQLFKQLLMMSGMDRYYQIVRCFRDEDLRADRQPEFTQIDVEMSFVDETIVRDTMEKMIRGIFKEELNVEFPEPLQCMTYHEAVSRFGSDRPDLRNPLELVDVGDLMQGVEFKVFAQPAKDPNGRVAALLVPGGGHELSRGQIDGYTDFVTIYGAKGLAYIKVNDIMTGRDGLQSPILKFLPDDVVKQLLERTKANTGDLIFFGADKAKIVNESLGALRLKIGDDLKLTQQAWKALWVVDFPMFEWDDKENRWMSLHHPFTAPKVNDIAEMEANPGACLSRAYDLVLNGSEIGGGSIRIHRPDLQSAVFRLLGIGEEEARAKFGFLLDALKFGCPPHGGLAFGLDRLVMLMTGASSIRDVIAFPKTQTASCPLTSAPSPASEMQLRELHIRLRTPATKETVVAKD >NZ_CP012373.2|WP_062153673.1|3230089_3230347_-|hypothetical-protein MPTYDYHCSANGQTLEAKHSMNEELNTWGELCANTGLALGATPADAPIMRLITGGQIVSSRALKNPEMPACASGGCGGGMCGLMN >NZ_CP012373.2|WP_062153671.1|3229323_3230046_+|glutamine-amidotransferase MKKLFLVKTGKTFPALIKRRGDFDQWFIQCLGFSPDHIEIVEVFEGEPLPDELDDVAGVLVTGSPAMVTDRERWSELTAKWLCQVHQSSIPLLGICYGHQLIAHALGGKVANNPNGFEAGIVEIHLNEACDTDILLKELPKTLSVHAMHRQVVVTLPPETVILASNPHTDYQAYKIGETTWGLQFHPEFDADIMRTYLAEREAVFIKEGIDVETARQNAADTPYGDMLLKRFATLVQTRI >NZ_CP012373.2|WP_062153669.1|3228413_3229199_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MNTSSTIVRGVYDKQKCYVSITTDKTEVRQAQALRYQVFSEEMGATLNTSLSGYDIDIFDDYCQHVLVRESDTHQVVGCTRILTSEQARLAGGFYSESEFDLSRVLQREGRFMEIGRTCVHPDYRTGGVITLLWSGLARFMVEEGFDYLMGCASIPMPTADHHSLFDRFRERYFSDDQLRVTPKIPLRKTVEDTFNLDIPSLLKAYLRLGAQICGEPYWDADFKVADVFIFLDLDNLQDRYMKHFVDRARPTPHTLHSVAA >NZ_CP012373.2|WP_062153667.1|3226860_3228162_+|CHRD-domain-containing-protein MKKVIHSFLLLTTSLFLWTSAVFSQQAVFGVNTFTEYEAFLSAEQELGEENNSPAQGYGRLSFADDLSTAKLDVFIKDVDVNQITAFHIHCGSPNVLGPIIADLSVFGNFTDTIVNGHFAATLTNEHIVFVTMPPPAPNAGESFTLPLPEGCPNDYGQLGQVYTIAGLEALAKKGLLYFNLHTVTNPFYGEMRGQLYPLTQYKSAPTASSISFGTDSFTHYTANLSPKQELGEANGSQASGQGTVSFVQNLSYAQVELTINNLDASQLTAIHIHCGSPNVLGPYIIHFGDVATKVVNGKLSMKLTNKDIVFVTQAPPPPELGQSFTLPLPEGCPNDIGQVGQVYTIAGLEALARKGLLYFNVHTVTNAFYGEIRGQLGSEHPRADRAVYDNNYLMIPAVDVLDQDGKTVTYKADMMRLNTDNWLFELTSATEK >NZ_CP012373.2|WP_062153665.1|3225731_3226709_+|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MSFFLSPISEEVKSSSLFNPYLYTFAFASLYLLYCLLYIWLSSEIASHFAFSIQELTSIEQWKGTVFVFVTTLFISVILLLTLKRIEEYQNQILHQQNLLIQSERRATAGIFAASVAHDMNNYLFSMSGAIELIKESPSLNITDKQQQLLNSVEVGLQALMNLSTSLVSVEQETLQRDVTLIDINNFIEEIIGLTKHHQRVKKCTVRLEPMQLPQVLVDVNLIKQALINLIINAADAIQHPEGVILFKTALTHQQLLIEVHDNGTGIPENLRQKVFEPFFTTKNNGSGLGLLSVKVCMDKHHGNIKITNSASLGGCCIQLAFPLN >NZ_CP012373.2|WP_062153686.1|3242921_3244886_-|SurA-N-terminal-domain-containing-protein MLQGMRAGIQGWLGWALIILISIPFALWGIQEYLSPSRGVAVAEVNGVEISSLNFEQAVDQQKRQLRSMTQQADLSFMEAQIRKETLNRLIEQEVLMQTAINHGMRIGDMMLAKQIHQFPMFQQGGMFSQPIYEQALRSQGMNPSGFEVEMRRSLLVSQLQDGITNSAFISSAELTQRTQLEKQQRSVSYLTIPANRFTAQVVVDDAEINKYYQDHPDAFKTPEKVSLEYIEFSQEELAAAQAITEEHLKEQYKERLASFTTPGQWQAKHILIEVPQDASPEKLADAEKQANDILAKIKAQEKTFDESAKAFSADTSNKDKGGDLGWFGEGFMVKPFEEAIKSMKVGDISDKPVKTQFGFHIIQLVDAKPTITKPFESVRDELLKKVQTEEAEQAFYTHAEQMADLAFENPNSLQAIADTLKHPIKTTALFAKTETGEKDTFLSNRKVIESAFSEQVLENRYNSEVLELDKPQHVAVIRLKEHQPAQLRPLADVKEEIIAKLKQEKSTAEAEKLGKTLLADLQKGEAPDALFKKQDLQPQPAQWIERQNSRLGYPEIVREAFKMGHPTETKALYQGVSLNNGDYAIVILLAVKAGEIPAVVVENGKETANPEADRSKTQIKRALGDAGFKQIVAEMKVGTDVMVYQDRITDKVQ >NZ_CP012373.2|WP_062153687.1|3244912_3245551_-|Vat-family-streptogramin-A-O-acetyltransferase MLGPDKNAIYPLKNYNRLCFLKNIITNPNILIGDYTYYDDFEDIHNFEKNVKYHFDFIGDKLIIGKFCMIASGATFIMGGANHRMDGITTYPFTIFGHGWETITPTLNDLSLKGDTIIGNDVWIGTNATIMPGVHIGDGAIIATNATVTKHVEPYAIVGGNPAREIRKRFSTQQIKELLEIQWWNWDIEKITANLHHLVNNNIDKLKTNSSV >NZ_CP012373.2|WP_062153688.1|3245931_3246204_-|HU-family-DNA-binding-protein MNKSELVQAVAESIDIPKTTAAKAVDAVLDSIKKALTEDDTVTLIGFGTFTVRERAARTGRNPRTGKPLDIKAAKVPVFKPGKALKDSVN >NZ_CP012373.2|WP_062153689.1|3246346_3248791_-|endopeptidase-La MAYDDKTSEVIEDTRLVLPVLPLRDVVVYPHMVIPLFVGRAKSIHALEQAMTTDKQILLVAQKNAAEDEPNIEDIYRIGTVSNILQLLKLPDGTIKVLVEGGQRAKIINFLSVDDMFSAQVMPLASSDGEEREVEVLSRSVTSHFDQYIKLNKKVPPEILSSLSSIEEPSRLADTIAAHMAIKIEEKQKILEITSIRDRLEHLIALMESEIDLLQIEKRIRKRVKGQMEKSQREYYLNEQMKAIQKELGELEEVPSEIDELTRKIEEAGMPKEAKAKAYSELNKLKLMSPMSAEATVVRNYIDVLVNVPWRKRSKISRDIAKAEQVLEADHYGLEKVKERILEYLAVQQRVNKLKGPILCLVGPPGVGKTSLGQSIARATNRKFIRMALGGVRDEAEIRGHRRTYIGSMPGKIIQNLVKVSTRNPLFLLDEVDKMAMDFRGDPASALLEVLDPEQNHTFNDHYLEIDYDLSDIMFVATANTMNIPAALLDRMEVIRLSGYTEEEKVNIAINYLVSKQIKSNGLKKEEININEAAIRDIVRFYTREAGVRNLEREIAKLCRKVVKEILLKPSLKKITITPRNLEKYLGVQRFRYGRAEEQDRIGQVTGLAWTEVGGDLLTIETAMMIGKGKLTYTGQLGDVMQESIQAAMSVVRSRASSLGITSDFYQKYDLHIHVPEGATPKDGPSAGISMCTAIASVLTNIPVRADVAMTGEITLRGEVLPIGGLKEKLLAALRGGIRTVIIPDENKRDLQEIPDNIKKSLSIRPVKWIDEVLEIALQHMPTPLEAREEAVGEEQTVVDQAANVQKKQSVQTH >NZ_CP012373.2|WP_062153690.1|3248921_3250205_-|ATP-dependent-Clp-protease-ATP-binding-subunit-ClpX 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP012373_6 | 3500145-3500724 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012373_6
|
8 spacers
spacers of NZ_CP012373_6
>6.1|3500181|32|NZ_CP012373|PILER-CR,CRT ACCATAATCCCTAGGTGGACTTTGACATACGT >6.2|3500249|30|NZ_CP012373|PILER-CR,CRT AGAAGCGACTTGATAACGCTACGAATTCTG >6.3|3500315|31|NZ_CP012373|PILER-CR,CRT TTCATCAAATGTGTCTCGCCCGTCGATTCAT >6.4|3500382|30|NZ_CP012373|PILER-CR,CRT CACAATGGAATTGATGAGTATTTGCTCCCC >6.5|3500448|36|NZ_CP012373|PILER-CR GACCGTGCATTTCTCGCGCTGTTAAAATCAAGAGTT >6.6|3500520|34|NZ_CP012373|PILER-CR ATAATCAACGATGGCGATGTTGCGTAGTGTTGAC >6.7|3500590|34|NZ_CP012373|PILER-CR TCATCTATAAAAATCTATTAAGCACTTACCGTTT >6.8|3500660|32|NZ_CP012373|PILER-CR TTGTCAGTCTCTCCACCATACTGCATTAGTTC >6.9|3500448|33|NZ_CP012373|CRT CGTGCATTTCTCGCGCTGTTAAAATCAAGAGTT >6.10|3500517|34|NZ_CP012373|CRT ATAATCAACGATGGCGATGTTGCGTAGTGTTGAC >6.11|3500587|34|NZ_CP012373|CRT TCATCTATAAAAATCTATTAAGCACTTACCGTTT >6.12|3500657|32|NZ_CP012373|CRT TTGTCAGTCTCTCCACCATACTGCATTAGTTC >6.13|3500181|45|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder ACCATAATCCCTAGGTGGACTTTGACATACGTGTTGCAGCCTTAC >6.14|3500249|43|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder AGAAGCGACTTGATAACGCTACGAATTCTGGTTGCAGCTTTAT >6.15|3500315|44|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder TTCATCAAATGTGTCTCGCCCGTCGATTCATGTTGCAACCTTAC >6.16|3500382|43|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder CACAATGGAATTGATGAGTATTTGCTCCCCGTTGCAGCCTTAC >6.17|3500448|46|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder CGTGCATTTCTCGCGCTGTTAAAATCAAGAGTTGTTGCAGCCTTAC >6.18|3500517|47|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder ATAATCAACGATGGCGATGTTGCGTAGTGTTGACGTTGCAGCTTTAT >6.19|3500587|47|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder TCATCTATAAAAATCTATTAAGCACTTACCGTTTGTTGCAGCCTTAC >6.20|3500657|45|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder TTGTCAGTCTCTCCACCATACTGCATTAGTTCGTTGCAGCCTTAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012373_6
The CRISPR arrays of NZ_CP012373_6 >merge|NZ_CP012373|6|3500145-3500724|PILER-CR,CRT,CRISPRCasFinder GTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAACACCATAATCCCTAGGTGGACTTTGACATACGTGTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAACAGAAGCGACTTGATAACGCTACGAATTCTGGTTGCAGCTTTATACGCCAATGCAGGCGATTGAAACTTCATCAAATGTGTCTCGCCCGTCGATTCATGTTGCAACCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAACCACAATGGAATTGATGAGTATTTGCTCCCCGTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGGTTGAGACCGTGCATTTCTCGCGCTGTTAAAATCAAGAGTTGTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAACATAATCAACGATGGCGATGTTGCGTAGTGTTGACGTTGCAGCTTTATACGCCAATGCAGGCGATTGAAACTCATCTATAAAAATCTATTAAGCACTTACCGTTTGTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAACTTGTCAGTCTCTCCACCATACTGCATTAGTTCGTTGCAGCCTTACTCGCCAATGCAGGCGATTGAAAC >NZ_CP012373|6|3|3500145-3500724|PILER-CR GTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC ACCATAATCCCTAGGTGGACTTTGACATACGT GTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC AGAAGCGACTTGATAACGCTACGAATTCTG GTTGCAGCTTTATACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC TTCATCAAATGTGTCTCGCCCGTCGATTCAT GTTGCAACCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC CACAATGGAATTGATGAGTATTTGCTCCCC GTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGGTTGAGAC CGTGCATTTCTCGCGCTGTTAAAATCAAGAGTTGTT GCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAACATA ATCAACGATGGCGATGTTGCGTAGTGTTGACGTT GCAGCTTTATACGCCAATGCAGGCGATTGAAACTCA TCTATAAAAATCTATTAAGCACTTACCGTTTGTT GCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAACTTG TCAGTCTCTCCACCATACTGCATTAGTTCGTT GCAGCCTTACTCGCCAATGCAGGCGATTGAAAC >NZ_CP012373|6|2|3500145-3500724|CRT GTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC ACCATAATCCCTAGGTGGACTTTGACATACGT GTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC AGAAGCGACTTGATAACGCTACGAATTCTG GTTGCAGCTTTATACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC TTCATCAAATGTGTCTCGCCCGTCGATTCAT GTTGCAACCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC CACAATGGAATTGATGAGTATTTGCTCCCC GTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGGTTGAGAC CGTGCATTTCTCGCGCTGTTAAAATCAAGAGTT GTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC ATAATCAACGATGGCGATGTTGCGTAGTGTTGAC GTTGCAGCTTTATACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC TCATCTATAAAAATCTATTAAGCACTTACCGTTT GTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC TTGTCAGTCTCTCCACCATACTGCATTAGTTC GTTGCAGCCTTACTCGCCAATGCAGGCGATTGAAAC >NZ_CP012373|6|6|3500158-3500724|CRISPRCasFinder ACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC ACCATAATCCCTAGGTGGACTTTGACATACGTGTTGCAGCCTTAC ACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC AGAAGCGACTTGATAACGCTACGAATTCTGGTTGCAGCTTTAT ACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC TTCATCAAATGTGTCTCGCCCGTCGATTCATGTTGCAACCTTAC ACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC CACAATGGAATTGATGAGTATTTGCTCCCCGTTGCAGCCTTAC ACGCCAATGCAGGCGGTTGAGAC CGTGCATTTCTCGCGCTGTTAAAATCAAGAGTTGTTGCAGCCTTAC ACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC ATAATCAACGATGGCGATGTTGCGTAGTGTTGACGTTGCAGCTTTAT ACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC TCATCTATAAAAATCTATTAAGCACTTACCGTTTGTTGCAGCCTTAC ACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC TTGTCAGTCTCTCCACCATACTGCATTAGTTCGTTGCAGCCTTAC TCGCCAATGCAGGCGATTGAAAC
>NZ_CP012373.2|WP_062154083.1|3496574_3499850_+|methylmalonyl-CoA-mutase-family-protein 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MSEIEGKYQKIKYLSLRWKFSIPLIALGLLGIISFTWLFSLFFINKIEMQVLKQTKQTMQIISYATERVFINTEQLQGFISLIANDDDIQDVLILSGEPLRVIATTNRQFIHKPLDAVFHDTLLYTHLVDAIKDNRPYYDQINQQELRFIMPLRFYEDFQSAEPISSNSAMLLIVNTSDIYTVQSETLWHIFSFSLGFVVLIGTAIYLLLNRLVLHPAKIIRDAISRQTNNNKIILMPRLAMDEIGLIAQTFNTMLLEQERNQNEIRKLALVVERTNNAVIITDAQQRIEWVNQGFTRMTGYRLHEVIGRVPGHFLQGVETDPNTVQYMRQKLAEGNAFQVELVNYSKIGRRYEVAIETQPVCDEQGRIVQFMAIESDITARKAAELEIRQTKDFLNTIVSHLPLALFAKEPENLRFILWNKYCEQLFGLNEADVLGKTDYDFFPVKEASLYQTYDRQVLNNGSLVDIPEEIIHSKTLGERIAHTRKVAVLGQDKKVVMLLVILEDITEQKNAAQALQASEERFRTLVEASSDWVWETNTHFINVYSSPKVADLLGYTPEEIQGRSLYSFMSSKETEQAIQTINPYLQTQKPFRFVQNQWLHKDGHLVILEMNGVPMLDTQGKYIGYRGIGRDVTARYEMEMAVRQQAQELSLLNQELLRASRLKDEFLANMSHELRTPLNSILALIEILQEQVYGVVNAQQQKYLSNIDTSGRHLLALINDILDLSKIAAGKMELEIQSTILEGVCQASMNFIREQALRKKIRVTTHYDHNVNKIEADERRLKQILINLLTNAVKFTPEKGEIGLEYKGIPDKKTLEIHIWDTGIGIDKNELSNLFKPFTQLNTTQHEGTGLGLALVRRLTALHGGDVQVNSEMGKGSRFIITLPWRPNDIDNTAPTTAPTAETATIELHKPDDNPLILIVDDNDANILSISDYLTLKGYRTTIAHNGIEAIESANKLHPDLILMDIQMPVMNGLDAITHLRADKTFKTVPIIAVTALAMSGDRERCLNVGANEYLAKPIGLRHLVSVIERLRQQVLDNSIIS >NZ_CP012373.2|WP_062154087.1|3504456_3505560_+|cell-division-protein-ZapE MPTPLARYQRDLQRPDFVSDEAQKRAVQHTQQLYEALIHANTPPTDSLLSVLRAKLSKRKKEPVKGLYFWGGVGRGKTYLIDNFYDCLPFSEKMRIHFHRFMRQVHEDLQKFKALQNPLTHVARHLAQQTQVLCLDEFHVADITDAMLLTGLLKALFDNGVTLVSTSNVAPDLLYKGGLQRDRFLPAIALLKQYTQVLNVDGGVDYRLRTLEQAEIYHYPLDAQADINMLNSFMALSPEEGFNNQALEINGRSIQTKRCADGIVWFDFEVLCNVPRAVSDYIEIAQCFNTVFLSNIPVLDVYKDDHALRLINLVDEFYDRNVKLIVSAATSVDKLYTGQRQAFQFQRTISRLLEMQSHDYLQRPHLP >NZ_CP012373.2|WP_062154088.1|3505675_3509773_+|PAS-domain-S-box-protein MSYLIILECLKIGMLAVVLASLSVINQQLKNTRKTGWYLLFGGFCLISLEKSFYLSAEIPLHSTDFIVTELISLCGFIGYLLFVSGIFYVLPYGSKLSRMVHRYLLKKQKKQVNIKANSELLAQETLARLNELIKTSPLAVMEWDEKGIIHRWSLSAEKIFGYSEAEILGRNIFEVNFIYEEDSEHVLKVKDRLLMGIEQNNICVNRNYSKDKRIIFCEWHNSVQPATDNYPLSVLSFAQDITEREEHHQALHNSEEKFRQVTEHLNEVCYVVDLQSQRIIYVNAAFEQVWGIPVQQLLTNPHVWLDAVHPEDKKYVKTLFFNDFFQEKNLTYHQAEYRLLKANGDIYWVRDKCYPVIDRNGHVYRLVGIAEDVTYYKNTENTLREQQELLSQRNIELSKTYENLQFHIDNSPFAIVEWDAEGQISYWSTTAEKMFGWYASEMLGKSLFEVDWVHQADIRVIKILIKRLICREMSTIMHISRHYTKEKQLLFCEWHVSVRLDEQGQILSLLSFALDVTLREQLRLTLQYSEEQFRQLAEHIEEVFYIFDIEQNKLLYISPSHEKIWGQSTKDLLQNPALWAEIIHPDDRNMVEKAFRRFQQGGEFIQEYRIIRVEDKEIRWIRDRSYPIYNATGQLYRVVGIAEDVSDYKYAEIALKQSKVELQQRNFEIRELYEFTQQLNYRLNMDEVLRIFYEYLYRLIPAITCSCFISNDTNSYQLFIASREKLSPTLIQNIREEVFATLTSLNPHHGITAEEIPIVWLKQYSLQNTFNNTTLLSSRLNIPLEKTTPTLQNKAKPSSILWLGTVMKDAFTHNQLRLCYIFINHLANTFKRIQEVFIKEQRDLQSIVMYLPIGVVLFDKKAKILFVNQQAQQYFPFLIDDNKDYLAEKIFNPLLYNTNSEQNYLNRQYINIENLFLELTTRQLDYGSYSTHYLMVIQDITEQKKIESALKAERVLLAQQVEKRTAALSDANLELAKANRLKDEFLASMSHELRTPLNAILGMSEALNEEVYGKLNEKQHKFLHHIHESGQHLLALINDILDLSKIEAGKVQLMLDTTNIAELCQSCLTLIKQQAENKKLHVHFHLDGQAQVIYADQRRLKQILLNLLSNAVKFTAEGGDIGLEVEHDAEKQAIHFIIWDKGIGIDNENMQQLFKPFTQLDSRLSRQYEGTGLGLVLVHRLTELHGGSIKVESQAGQGSRFTVSLPAVSEKWRAYIQSEDPQIVLKPPSTINATIAQQAPLILIAEDHLNNILVLIDYLMAHGYRVNTARTGTEALEQLHEETPHLILMDVQMPGMDGIEATRQIRLNAQFASLPIIAMTALTMPGDREQCLAAGMNDYISKPFALKQLLNLIQQYLGVKTEKT >NZ_CP012373.2|WP_062154090.1|3509892_3510540_+|cytochrome-c4 MKKLTLALYILLGSPFVYATEQATGNGAIVGTAEAGKAKATTVCVACHGADGNSINPEWPSLAGQHASYIEQQLHDFKAGVRENALMSSQAANLTEQEIADLAAYFADQTKKQGAASSAELATQGERIYRGGNQSTGLPACAGCHGPKGSGNGGAKYPALSGQHAKYVQKQLADYKSGARGSKSDQATKLMMRQIAQKLSTEEIAAVAEYISGLH >NZ_CP012373.2|WP_062154092.1|3510738_3511104_+|transposase MTYSIDFRKKVLKVKQEENLTLAAVAKRFQIAIASVVRWSKVLEAKGTRNRPTKIDMEALKQDVALYPDAYHYERAARFGITEGGIRHALKRLGISRKKNPQTSQSQPRSTASLSKQNEPL >NZ_CP012373.2|WP_106405021.1|3511090_3511561_+|IS630-family-transposase MNRYKQSDRQIVFIDESGFAHDMPRRFGYAPIGKRCSGTQDWNAKGRTNVIGALLNFCLLTVSLVSGAINSDVFFAWITQDLLPKLPQNSVIVMDNATFHKRSDIQQAILDAGHLLEYLPPYSPDLNPIEHKWAQAKTLRKQQHCSIDELFLLNSI >NZ_CP012373.2|WP_062154094.1|3511648_3514459_-|phosphoenolpyruvate-carboxylase MKNLVKDKPLRRRVKLFGKLVGKVLRARAHGQVYATVEELRKGYIQLRKTPDSVKQHKLERMITLLSPEVLSEVIRAFNIYFSLTNIADELFKHQSRREQVHKGGALWEESFDATFREFIKAGLSPQDIQSLFDNLLYTPVFTAHPTELRRRTLMLALRRVFLATEKLDQRGLSWVEHAELEAALEAELHILWKTDEVRLRQMHVEDEISNGLNYFRESLFTAVPLAYRAAERTIKRLYNDTNQTPVVVPSFLRFGSWIGGDRDGNPFVKPATTVKALRLQKVEILREYERQLYDLSDIITHSKSFCQPSQALLESIEQDAGLLARNNLYTYSEHIFEIYRRKLSMMRIRIKNNLEATEARLNNALTGMVIADKERIGYTNEAEFLADLQLIYQSLLSHDDQAVADGALKDLIRSVETFGFYLMKLDIRQESTRHTEAVTELLTAQNIDYNSLSENARLALLIQLLQTEQALLTNNTRWSELTAETLEVFQIVHDMRQEISPDAFGSYVISMTHSASHVLEVLLLAQQYKLVDKNGGYCYIGVSPLFETIDDLNHIEHVLSTLFTQPFYRQLLRASGNTQEVMLGYSDSCKDGGIITSSWLLHEAQKKITALAEANQLACRLFHGRGGAVGRGGGPTYEAIISQPAGTVHGQIKFTEQGEVLAYKYSNPETAMYELTVGAAGLLKASSVLMHKHKSVDSRYIEIMNYLAKQGEKQYRLLTDHTEGFMPFFYDATPVAEIGLMNIGSRPARRRSDNPSKYSIRAIPWVFGWSQARYTLPAWFGLGTALEKFCDKDVDNLAKLQKMYVEFPFFKSLLSNIQMSLFKTEMDIARRYADLCSDKRQAEKIFAMIEAEYVRSEQYLLQVANISELVADNPSLQLSIERRLPYIDPLNAIQVYLLGQYRQTTASGNAEEAKRWFDPLIRSINAISAGMRNTG >NZ_CP012373.2|WP_062154096.1|3514748_3515336_+|rhomboid-family-intramembrane-serine-protease MFDTFTPKSSQTYNGVFTLIIINLVMYVLDHILQLPLERLYLNHHNPALYQFVTSLFCHASWQHLSGNLFFLYLFGKLVEEEEGASGVIISYLVCGIGANLMSWLLQSGYFSSLGASGAVFGLFSVSVLIRLSWDWRRLLEVLILGQFVIMQVIQETQQLGQADGVNRIAHLGGAFVGVVFILGLLRLAKSKKTS >NZ_CP012373.2|WP_062154099.1|3515597_3517208_+|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-C MRRFDWLAELLARFEDQTIQVGNGSKTTLQPAHLLHIPAPEWGRALAEVAQFACRFSALWVTETLPTAKDEYYGFFILSCCVEKRGDYVVFRTEIASDTPEIASITPFYPAANRVERHIQDLFGIRFIDHPDKRRWIRHQAWQEHEYPLRKAFSAQGAPPHLTPPDSDYPFLQAQGIGVYEIPVGPVHAGIIEPGHFRFQAVGEKILNLEEHLGYIHKGTEKIAEGRDPIALAKLAGRVSGDSTVAHTWAACMAMERAAQVTIPPRAQFLRAILCERERVANHLGDVGAICNDVAFSFAFYQFARLREEWQRLNVASFGHRFLMDCIIPCGVKTDLAANLIPEHKAQLHVFQQEVEELAGIIDRHTGIEDRLETTGILSLETASRLGCLGYVGRASGLTYDVRRACPYPPYDEIVVEVPVFKKGDVKARLQIRLAEIQATLTLLNQLLSFLPTGDIVGQWQIPLENAEGLGIIEGWRGEIVSYIRFGKAGLIDRFYPRDPSWLTWSALELMIRNDIVPDFPVCNKSVNGSYSGVDL >NZ_CP012373.2|WP_062154101.1|3517226_3518333_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MQKYHFIFLIFSYLLSNVTVTLAESPAKTLTVVSWGGKYTDSQIAAYYKPFADKFGVAIQANTYNGGLGQIRSQVKTHNIKWDVVDLSLADAVKGCNDGLLEPIDLTSFPPSSNGISPLNDFYDITILTSCAAPLVVWSTVVAYNETAFAKAKKKPNKIADLFDIETFAGKRGFRKTPQVTFEWALMADGVPSTEVYNVLATAEGVERVFTMLDKIKKQIIWWDTGAQALQLLNNNEVVMTTIYNGWVADAIVNNAKPYKIIWDGQLFDLDVLSIVKGTKQLDLAIEFIKFASDTQALAEQTRYIAYSPARKSALKYLPTIAQLGYDIRPLLPMTPANFTNAIRYDFTWWAKHQEVLTDKFNAWLARN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012373_7 | 3708860-3708954 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012373_7
|
1 spacers
spacers of NZ_CP012373_7
>7.1|3708883|49|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder GGGAGAAGAGCGCGGCGTTGAAAAGGGTTTACAACTTGGAGAAGAGCGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012373_7
The CRISPR arrays of NZ_CP012373_7 >merge|NZ_CP012373|7|3708860-3708954|CRISPRCasFinder GGATTGGAAAAAGGCTTGCAAATGGGAGAAGAGCGCGGCGTTGAAAAGGGTTTACAACTTGGAGAAGAGCGCGGCGTTGAAAAAGGTTTACAACT >NZ_CP012373|7|7|3708860-3708954|CRISPRCasFinder GGATTGGAAAAAGGCTTGCAAAT GGGAGAAGAGCGCGGCGTTGAAAAGGGTTTACAACTTGGAGAAGAGCGC GGCGTTGAAAAAGGTTTACAACT
>NZ_CP012373.2|WP_062154420.1|3707619_3708141_+|co-chaperone-HscB MTSPNYFELFGLPVCFTIDSEVLAACYRDLQKMIHPDKFVDAPERERRLAMEKATLINEAFQTLKQPVNRARYLLELQGVSLNNDSDTFMDATFLMAQMELRETLAEIKNQINPLAALSQFLTTLNKQSQTLIDKLNQQFTQQDWQAARNSVRQLQFFNRLQEETLQLEETLL >NZ_CP012373.2|WP_062154418.1|3707292_3707616_+|iron-sulfur-cluster-assembly-protein-IscA MMISLTPKAATHIQKSIDKRGKGVGLRLGVRTSGCSGMAYIMEFADQVEEQDQIFESQGVKVIVDPKSLSYIDGTELDYVREGLNEGFKFNNPNIKDECGCGESFNV >NZ_CP012373.2|WP_101539113.1|3706052_3706801_-|IS5-family-transposase MSRRYALTDEQWSKLEPLLPGRKGHVGMTAKDNRLFIDAVLFRYRSGIPWRDLPERFGDFRVVHTRFSRWSKKGVWERVFKILSADADNEYAMIDSTIVRAHQHSSGGGADEAIGRSAGGLSTKINSVVDALGNPTPFFLTAGQASDLEGADALIPQIKANALLADKAYDADERVRDVLKQQGIEPVIPFRKNRLNPPYYDKVLYKARYLIEHFFGKLKQYRAIATRYDKRARNFLSGVYLASTLILLA >NZ_CP012373.2|WP_161575471.1|3704783_3706013_-|type-II-secretion-system-protein-GspL MRYFLLCRLGTDVDALISWVLYDHAGKRIDSANAVSLATLPPPASHVLSVLVPSTACLLTTAHVPTTQRQRLLQAVPYALEELFAEDVEALHFALGERLVSEQVAVAVTTHQKMQQWLALFTERGYKPQTIMPDVLAVPRPENTWGILFYNQVVLVRTGDYSGFGIELETLQTALQLALHQQAAPARLVVYYARVAPPSLTVLRGLGIPIEEQAHTEDSLGWLLQGITQKNKTINLLQGEYRPQDKIQTLWKPWRLTIGLLLVWGVILFIQQIVEYQDLSQQRTALNTEIEALYRQTFPDAKRIVNARVQMEQQLNTLKNQQSNPLKGESYLTTLAQLSPILKQAAGLHLKRLDYRQGRFDLELELANLQALEQIKQSLSQMGFTVELQSASSRDNVVEARLRLQKNPI >NZ_CP012373.2|WP_062154414.1|3704043_3704697_-|hypothetical-protein MGKEIDRISSDIACLNIEHFPATLVSTTGSHCEVWQAFRTSFDNAEKTTLNFVVKRHYQPCEFREVRNLCRDYYILKEKLTDIIPNALFVQTSIDNRANLIVIAETNTPWFNLANPINETEAIPTLRQNPKALSQLKRFLQAAKQWHDEKGWVIDLYGLDNLILNKNSEVRYIDSFSVFFYEDMLKFVTDDDSLQEKIDLSLKRRSYLEYIYAQATP >NZ_CP012373.2|WP_062154412.1|3703670_3704039_+|DUF1992-domain-containing-protein MVNIDKIAEAYILEAIEKGELDNLAGMGKPLELEDLSHVPEELRMAYKILKNAGCVPEEVQLRKDIMQLQTLLQTVDDEKTRTQAVKRLNLLFAKLGNQRAGSLQAMDTQYYQKTVDKLLSE >NZ_CP012373.2|WP_062154410.1|3702546_3703524_+|quinone-oxidoreductase MTVNAIQIHQTGGIDVLRWEKIEIGEPAAHQIRIRHTAIGLNYIDVYFRMGLYKPAAYPFIPGMEAAGVVEAVGAAVTDLHVGDRVAYGATLGAYTEARVIDAERVVKIPDGISDQTAAAMMLKGMTAQYLLRQTYPVKAGDTILFHAIAGGVGLIACQWAKKLGVTVIGTVGSAEKAELAKAYGCDYPIIYTKENFVTRVKELTNGKGVPVVYDSVGQDTFMQSLDCLQPMGTIVSFGQSSGSVPPLDIGILSAKGSLFLTRPTLMSYTASRQQLLTCTDDLFAVVQSGDVKIDVNQIFSLKDAGKAHAALETRQTTGSTVLLP >NZ_CP012373.2|WP_062154406.1|3701719_3702490_+|5'/3'-nucleotidase-SurE MKILVSNDDGYRAAGIVCLVNKLKTFADITVVAPDRNRSGASNSLTLEYPLRAHTADNGFLYVDGTPTDCVHLAITGLLEELPDIVVSGINEGANLGDDVIYSGTVAAAMEGRFLGLPAIAVSLAGYPNPTHYDTAARIVEILLNHLHEGNLPLPVDTILNVNVPNVPFAALQGIQVTRLGSRHRAAPVVKDQDPRGRDIYWVGAPGKEQDAGVGTDFHAIRNGFVSVTPLHVDLTRYSAMDVTRTWLKAFETLKP >NZ_CP012373.2|WP_062154404.1|3700918_3701572_+|endonuclease-III MNAAHRHALFARLQAQNPNPKTELVYHSTFELLISVILSAQATDISVNKATVKLYSVANTPQAILNLGADGLKGYIKTIGLYNAKAKNILQTCQVLVDKYNGEVPHERAALEALAGVGRKTANVVLNTAFGEATIAVDTHIFRVANRTGLASGKTVRAVEDNLLKAVPPEYQQHAHHWLILHGRYTCTARNPKCASCVIAEFCEFKEKNLVMPNKAG >NZ_CP012373.2|WP_145917119.1|3698351_3700565_-|LPS-assembly-protein-LptD MPKRHKLILFITLLITLPTNSHALEWGMCQAIAEITPLPPQLPPPPENNAVRLYADDGEMSEKEGKVTANGNVILQRGEQVLKTDLAIYLRDQETVDAEGNFTFWDKQFIVSGNRAKLLPNHQGEMHDVHYWLLNRRGRGQATFLQRESENNASLQQTTYTTCDPSAEVWRLDAANVHLNQETGRGTANNVFINVLNIPVFYSPYLSFPIDERRLSGFLAPSMGSSDEVGVEFSIPYYLNLAPNYDATITPRFMSKRGLLLGTEFRYLLANSGGKIEWEYLPSDRVADINRSLLKVRHSGMVVPSLYTDIVYDEVSDDLYFRELGDNLTVSSTTHLEQRGDLRYFGHGWNVLGRLQRYQSLDANPATRPYERLPQIILSSDVPERNKKINVQGQVELVNFERSYDEAPVGNRYDFKSTISFPWRTASGFFVPSAILRHTRYDLSQIPIAEADRFSETPTRSTYTLMADSGLFFDRELSLFNRNLLHTLEPRLFYRYTPYENQDDIPIFDTAEYDLSFGQLFRENRFIGADRVDDSNQLTAALTTRFIDQATGLENLRVSVGQIYYFADREVVLPSELFETNSSSNIVAEISSQFNSRLSGSATVLWNPYDSKAELSIWRLRYRPNPESLYNFAYRLRENRLEQTDVSWRFPLSSQWRTLGRWNYSLDEHKDLEVFLGLEYESCCWAMRGVARRYLNTVDGAYLNGFFFEVELKGLGGVGKKASAFLEDSIVGYDDRF >NZ_CP012373.2|WP_062154423.1|3709167_3711051_+|Fe-S-protein-assembly-chaperone-HscA MPLLQISEPGQSTAPHQHRLAAGIDLGTTNSLIATVRSGIAETLPDQQARHLLPSVVHYATDTQTVIGYEALAFASSDPLNTIASVKRLMGRGLHEVKTLGTQLPYDFIDQQGMPLLRTVKGELSPVQISADILRSLKQRAEATLGGELSGVVITVPAYFDDAQRQATKDAATLAGLQLLRLLNEPTAAAVAYGLDKKAEGIHAIYDLGGGTFDISILRLHKGVFEVMATAGDSALGGDDLDREIARWIMTQAGIADNSTQGHIRYLLDSAKTAKEALTIQDSVMLNLTLSNGQPWTGVLNRETLHSLVDTYIQKTLLPCRRALRDAGITIEDIHEVVMVGGSTRMPRIREKVADFFQRQPHVDIDPDKVVAIGAAIQADILVGNKPDDDMLLLDVIPLSLGLETMGGLVEKVIPRNTTLPVARAQEFTTFKDGQTAMAVHVVQGERDLVSDCRSLARFELRGIPPMVAGAARIRVTFQVDADGLLSVSAQEQTTKIKSEINVKPSYGLQDADIERMLKEAISYADLDAKKRTLREQQVEADRVINALRAALQADGQTLLKHQEFLAINVALDELLTVAQGNEPMVIKQAIEKLDNLTQEFAARRMDQAIKHAMQGHKINEFMEENK >NZ_CP012373.2|WP_062154424.1|3711050_3711389_+|ISC-system-2Fe-2S-type-ferredoxin MPKITFLPHPELCPDGITIEVSTGTSVLDAALDNHVALEHACDKSCACTTCHIIIREGFDSLTPATDEEEDLLDKAWGLESESRLGCQATIKMDDLVVEIPKYTINYARENH >NZ_CP012373.2|WP_062155576.1|3711411_3712398_-|NAD(P)H-quinone-oxidoreductase MNYIKLNPIDTPDALVLAHETIPAPKAGEVLIKVAAAGVNRPDVLQRQGLYPPPAGASTVLGLEVAGTIVAVGETVDENLLNQPVCALVNGGGYAEYCIADVELCLPIPQGLDFISAAAIPETYFTVWTNIFERAKLQAGETFLVHGGTSGIGTTAIQLAKAFGATVIATAGNEAKCQVCRELGAHHVINYHTHDFVEVVKKLTAGQGVNVVLDMVGGDYIAQNIKVLALEGRLVQIAFLTGSKVTLDFMPIMLKRLTLTGSTLRARSVAQKAQIAQALLQNVWTLLEKGQVKPVIYKTFPLSHAADAHRLMESNQHIGKIVLVMEGA >NZ_CP012373.2|WP_083991626.1|3713032_3714076_+|diguanylate-cyclase MLADANSQFKHINTLVEQILDYKSYLKTPRLSSHPNALNFHHNSQAVLGTDFFQGYKSNTQQAYPLTHQPLLRALQGERVYIDDLEIQLENSILPLEVWATPIFNEKQEVLYAIAVFQDISQRKQAEAERIRLAQEREAKDAALRMNALLAQEIQERRRAEAELAKANQELQRLASLDGLTQLANRRRFDEYLDQEWRRAVREDVPLSLILCDVDFFKRYNDTYGHQAGDDCLRQVAMAMSQAVKRPADLVARYGGEEFAVILPNTHTDGAKTVAQNIADAVKALCLEHRASTVQPIVTLSVGVAGIYPSRGQSSIFLIKTADEALYLAKNAGRNQVFTRAIQLENS >NZ_CP012373.2|WP_062154426.1|3714072_3715029_-|MoxR-family-ATPase MDVSVFNTLRQSLEQQIIGQHHLVNSMLIALLSDGHILVEGMPGLAKTTAVKSLATAIEGEFHRIQFTPDLLPADLVGTDIYQQETGEFTFRPGPLFHNVLLADEINRAPPKVQSALLEAMAERQITVGQTTYRLPNLFMVLATQNPVEHEGTYTLPEAQLDRFLLYVKVSYPSRAEELAIIELHEQNAPTTRSTPAYHLSQADVFAARDAVMQVYIDPRLKEYIVDIVRASREPLAYDKDLHRWQRFGASPRASIALVHCARACAWLAGEKYVTPAHIQTVLPDILRHRLLLSFEAEADAISTDMFIERLLRVVGVP >NZ_CP012373.2|WP_062154427.1|3715181_3715712_-|hypothetical-protein MQLKLLISSLLLAISTVAMAAKPITEEEVLAAQKTWGEAIVAIGKAYVAKEDYKAVATKTVETLYGYHEGEVLFKPTKASQQQFRLTKEEAISYFISGVIPEDHGFAIQPWTNVRFENKDIIIDSDSAIAMGNYYFTDAKTDKEAKVEFTFGYKRGVDDNLLINLHHSSFPYTPTY >NZ_CP012373.2|WP_062154429.1|3715922_3717551_+|VWA-domain-containing-protein MIKNLFFVLLGSLLLTACNQSTSSNNEISHIETAPKVGSVSVTESFNRGQPQPASIPADYRPPLEDREKYAHVSDNPIKSAKEQPVSTFSIDVDTGSYSNIRRFLNQGSLPNPDAVRVEEMLNYFTYNYPYPVSTTPPFKVTTEFAPAAWNPKTHILLIGIQGYDVPRAQLPPANLVFLIDVSGSMNSPDKLGLLKSALQLLAESLTAKDRVSIVVYAGASGVVLEPTAGNETATINAALQRLVAGGSTNGGEGIQLAYAMAQQAYIPNGINRILLATDGDFNVGTTDFEALKSLVSEKRKSGIALTTLGFGTGNYNDQLMEQLADAGNGHYAYIDTLNEARKVLVDEVSSTLQIIAKDVKIQIEFNPAQVAEYRLIGYENRVLAREDFSNDKVDAGEIGAGHRVTALYEVTLQGSGGERLESLRYNETKSQGAMSNAEIAFLRLRYKMPNAEKSELLEFPISSTLLNKNVSNTSENFRFASAVVAFGQLLRGGKYTEHFGYDDVLALAQAAKGLDEFGYRNEFINLVKLAKSLSTRSLEKE >NZ_CP012373.2|WP_062154431.1|3717671_3718712_+|glycosyltransferase-family-4-protein MVLVLMLLAFFVALVLTRQFTHPDTFLYVVNVPNQRSLHTRPTPITGGVAFLSGFAVAMFITYFFYTEISTDLLWIYFGALLIAFISFLDDCYELSALKRLIIHIIATILLLSQGGYWLTHLLLPNVAWLLPKSLQVVVSLFFVVWMINLYNFMDGMDGFAGGMAIVGFGAFAILGGLKGDMVFMLVNLLLISAIAGFLVFNFPPAKIFMGDTGSSTLGFLVAALSLWGQRYGIFPLWIAVLIFSPFIVDATVTLFKRLFRGEKIWQAHKSHYYQKLVQLGWGHKRTVLTEYGLMSACSISALIALYFPPTTQWILIIAWCVIYIFLMYLVFLLEKQAALKKLTGF >NZ_CP012373.2|WP_062154433.1|3718697_3719468_-|ParA-family-protein MLRVIFNQKGGVGKSTITCNLAAISATKGYRTLVIDLDAQANSSYYLLGKQLTEETQGITTFFEQLLTFTFQEKKITAFIHPTPYENLSVLPANANLSYLESKLESRHKIYKLRDALKTLLQEYDQIFIDTPPALNFYTQSALIAADRCLIPFDCDDFSRRALYSLSDNVREIQQDHNDRLRIEGIIVNQFQPRAKLPTQLVDELISEGQPVLNTRLISSVKVRESHQAAMPLIHFAHDHKITEAFKQLFAELETR >NZ_CP012373.2|WP_062154435.1|3719602_3719986_+|zinc-ribbon-domain-containing-protein MKSNKQRRLEIKANRLKQAKKQQKKLIAIPVPLPKGAILANPQALAHNHTYGILPTYYLDRPFTCRDCGVVEVWTAKQQRWWYEIAKGNINSRAVRCSACRHKIREQKRLQREHMDEKSSNIKKQNC |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012373_1 | 1.2|552161|32|NZ_CP012373|CRT | 552161-552192 | 32 | MK387337 | Vibrio phage ValB1MD, complete genome | 28579-28610 | 5 | 0.844 |
NZ_CP012373_1 | 1.5|552162|32|NZ_CP012373|PILER-CR | 552162-552193 | 32 | MK387337 | Vibrio phage ValB1MD, complete genome | 28579-28610 | 5 | 0.844 |
NZ_CP012373_1 | 1.8|552161|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder | 552161-552193 | 33 | MK387337 | Vibrio phage ValB1MD, complete genome | 28579-28611 | 5 | 0.848 |
NZ_CP012373_1 | 1.2|552161|32|NZ_CP012373|CRT | 552161-552192 | 32 | NZ_CP054613 | Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence | 2374100-2374131 | 6 | 0.812 |
NZ_CP012373_1 | 1.5|552162|32|NZ_CP012373|PILER-CR | 552162-552193 | 32 | NZ_CP054613 | Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence | 2374100-2374131 | 6 | 0.812 |
NZ_CP012373_1 | 1.3|552229|31|NZ_CP012373|CRT | 552229-552259 | 31 | NZ_CP033050 | Virgibacillus halodenitrificans strain Bac324 plasmid unnamed, complete sequence | 179798-179828 | 7 | 0.774 |
NZ_CP012373_1 | 1.6|552230|31|NZ_CP012373|PILER-CR | 552230-552260 | 31 | NZ_CP033050 | Virgibacillus halodenitrificans strain Bac324 plasmid unnamed, complete sequence | 179798-179828 | 7 | 0.774 |
NZ_CP012373_3 | 3.1|1966270|30|NZ_CP012373|PILER-CR | 1966270-1966299 | 30 | NC_022050 | Paracoccus aminophilus JCM 7686 plasmid pAMI8, complete sequence | 40999-41028 | 7 | 0.767 |
NZ_CP012373_3 | 3.1|1966270|30|NZ_CP012373|PILER-CR | 1966270-1966299 | 30 | NZ_CP050093 | Rhizobium leguminosarum bv. trifolii strain 22B plasmid pRL22b5, complete sequence | 147618-147647 | 7 | 0.767 |
NZ_CP012373_1 | 1.2|552161|32|NZ_CP012373|CRT | 552161-552192 | 32 | NZ_CP007767 | Campylobacter peloridis LMG 23910 plasmid pPEL1, complete sequence | 32674-32705 | 8 | 0.75 |
NZ_CP012373_1 | 1.2|552161|32|NZ_CP012373|CRT | 552161-552192 | 32 | NZ_CP044261 | Campylobacter armoricus strain CA639 plasmid pCA639-1, complete sequence | 31359-31390 | 8 | 0.75 |
NZ_CP012373_1 | 1.2|552161|32|NZ_CP012373|CRT | 552161-552192 | 32 | NZ_LR134403 | Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence | 331988-332019 | 8 | 0.75 |
NZ_CP012373_1 | 1.5|552162|32|NZ_CP012373|PILER-CR | 552162-552193 | 32 | NZ_CP007767 | Campylobacter peloridis LMG 23910 plasmid pPEL1, complete sequence | 32674-32705 | 8 | 0.75 |
NZ_CP012373_1 | 1.5|552162|32|NZ_CP012373|PILER-CR | 552162-552193 | 32 | NZ_CP044261 | Campylobacter armoricus strain CA639 plasmid pCA639-1, complete sequence | 31359-31390 | 8 | 0.75 |
NZ_CP012373_1 | 1.5|552162|32|NZ_CP012373|PILER-CR | 552162-552193 | 32 | NZ_LR134403 | Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence | 331988-332019 | 8 | 0.75 |
NZ_CP012373_1 | 1.9|552229|32|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder | 552229-552260 | 32 | NZ_CP033050 | Virgibacillus halodenitrificans strain Bac324 plasmid unnamed, complete sequence | 179798-179829 | 8 | 0.75 |
NZ_CP012373_6 | 6.1|3500181|32|NZ_CP012373|PILER-CR,CRT | 3500181-3500212 | 32 | MN417334 | Clostridium phage CPAS-15, complete genome | 23071-23102 | 8 | 0.75 |
NZ_CP012373_6 | 6.1|3500181|32|NZ_CP012373|PILER-CR,CRT | 3500181-3500212 | 32 | MF001357 | Clostridium phage CP3, partial genome | 641-672 | 8 | 0.75 |
NZ_CP012373_6 | 6.2|3500249|30|NZ_CP012373|PILER-CR,CRT | 3500249-3500278 | 30 | MN692957 | Marine virus AFVG_117M60, complete genome | 36488-36517 | 8 | 0.733 |
NZ_CP012373_6 | 6.4|3500382|30|NZ_CP012373|PILER-CR,CRT | 3500382-3500411 | 30 | NZ_CP013238 | Clostridium butyricum strain CDC_51208 plasmid pNPD4_2, complete sequence | 20042-20071 | 8 | 0.733 |
NZ_CP012373_6 | 6.4|3500382|30|NZ_CP012373|PILER-CR,CRT | 3500382-3500411 | 30 | JQ680349 | Unidentified phage clone 1013_scaffold24 genomic sequence | 29804-29833 | 8 | 0.733 |
NZ_CP012373_1 | 1.1|552095|30|NZ_CP012373|CRT | 552095-552124 | 30 | AP014207 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C8-MedDCM-OCT-S26-C6, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 2322-2351 | 9 | 0.7 |
NZ_CP012373_1 | 1.3|552229|31|NZ_CP012373|CRT | 552229-552259 | 31 | MN871444 | UNVERIFIED: Serratia phage KpGz_1, complete genome | 49553-49583 | 9 | 0.71 |
NZ_CP012373_1 | 1.4|552096|30|NZ_CP012373|PILER-CR | 552096-552125 | 30 | AP014207 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C8-MedDCM-OCT-S26-C6, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 2322-2351 | 9 | 0.7 |
NZ_CP012373_1 | 1.6|552230|31|NZ_CP012373|PILER-CR | 552230-552260 | 31 | MN871444 | UNVERIFIED: Serratia phage KpGz_1, complete genome | 49553-49583 | 9 | 0.71 |
NZ_CP012373_1 | 1.8|552161|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder | 552161-552193 | 33 | NZ_CP007767 | Campylobacter peloridis LMG 23910 plasmid pPEL1, complete sequence | 32673-32705 | 9 | 0.727 |
NZ_CP012373_1 | 1.8|552161|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder | 552161-552193 | 33 | NZ_CP044261 | Campylobacter armoricus strain CA639 plasmid pCA639-1, complete sequence | 31358-31390 | 9 | 0.727 |
NZ_CP012373_1 | 1.8|552161|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder | 552161-552193 | 33 | NZ_LR134403 | Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence | 331988-332020 | 9 | 0.727 |
NZ_CP012373_1 | 1.2|552161|32|NZ_CP012373|CRT | 552161-552192 | 32 | MN693402 | Marine virus AFVG_25M260, complete genome | 22109-22140 | 10 | 0.688 |
NZ_CP012373_1 | 1.5|552162|32|NZ_CP012373|PILER-CR | 552162-552193 | 32 | MN693402 | Marine virus AFVG_25M260, complete genome | 22109-22140 | 10 | 0.688 |
NZ_CP012373_4 | 4.1|2230996|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder | 2230996-2231028 | 33 | AP013497 | Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G19, isolate: uvMED-CGR-C68A-MedDCM-OCT-S35-C79 | 4324-4356 | 10 | 0.697 |
NZ_CP012373_4 | 4.1|2230996|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder | 2230996-2231028 | 33 | AP013775 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C68A-MedDCM-OCT-S26-C73, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 8948-8980 | 10 | 0.697 |
NZ_CP012373_4 | 4.1|2230996|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder | 2230996-2231028 | 33 | AP013498 | Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G19, isolate: uvMED-CGR-C68A-MedDCM-OCT-S38-C76 | 24489-24521 | 10 | 0.697 |
NZ_CP012373_6 | 6.8|3500660|32|NZ_CP012373|PILER-CR | 3500660-3500691 | 32 | MN694562 | Marine virus AFVG_250M829, complete genome | 31480-31511 | 11 | 0.656 |
NZ_CP012373_6 | 6.12|3500657|32|NZ_CP012373|CRT | 3500657-3500688 | 32 | MN694562 | Marine virus AFVG_250M829, complete genome | 31480-31511 | 11 | 0.656 |
1. spacer 1.2|552161|32|NZ_CP012373|CRT matches to MK387337 (Vibrio phage ValB1MD, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
atggaacaattccttgaagaacaaaac-accat CRISPR spacer gtcgaacaattcgttgaagaacaaaactatca- Protospacer .* ********* ************** *.**
2. spacer 1.5|552162|32|NZ_CP012373|PILER-CR matches to MK387337 (Vibrio phage ValB1MD, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
atggaacaattccttgaagaacaaaac-accat CRISPR spacer gtcgaacaattcgttgaagaacaaaactatca- Protospacer .* ********* ************** *.**
3. spacer 1.8|552161|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder matches to MK387337 (Vibrio phage ValB1MD, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.848
atggaacaattccttgaagaacaaaac-accatg CRISPR spacer gtcgaacaattcgttgaagaacaaaactatcat- Protospacer .* ********* ************** *.***
4. spacer 1.2|552161|32|NZ_CP012373|CRT matches to NZ_CP054613 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
atggaacaattccttgaagaaca-aaacaccat CRISPR spacer atggaacatttccttgaagcacacgaacaata- Protospacer ******** ********** *** .**** .*
5. spacer 1.5|552162|32|NZ_CP012373|PILER-CR matches to NZ_CP054613 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
atggaacaattccttgaagaaca-aaacaccat CRISPR spacer atggaacatttccttgaagcacacgaacaata- Protospacer ******** ********** *** .**** .*
6. spacer 1.3|552229|31|NZ_CP012373|CRT matches to NZ_CP033050 (Virgibacillus halodenitrificans strain Bac324 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
aagatgctgatgtagtgggttttgtatatcg CRISPR spacer accatgctaatgtagcgggttttgtagttgg Protospacer * *****.******.********** * *
7. spacer 1.6|552230|31|NZ_CP012373|PILER-CR matches to NZ_CP033050 (Virgibacillus halodenitrificans strain Bac324 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
aagatgctgatgtagtgggttttgtatatcg CRISPR spacer accatgctaatgtagcgggttttgtagttgg Protospacer * *****.******.********** * *
8. spacer 3.1|1966270|30|NZ_CP012373|PILER-CR matches to NC_022050 (Paracoccus aminophilus JCM 7686 plasmid pAMI8, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gtacactcggtatattcagcgtctgctgga CRISPR spacer aagcgctcggtatattcagcgtctgcaaca Protospacer . .*.********************* . *
9. spacer 3.1|1966270|30|NZ_CP012373|PILER-CR matches to NZ_CP050093 (Rhizobium leguminosarum bv. trifolii strain 22B plasmid pRL22b5, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gtacactcggtatattcagcgtctgctgga CRISPR spacer cgacactcggtatatgcagcgtcaccgcga Protospacer ************* ******* * **
10. spacer 1.2|552161|32|NZ_CP012373|CRT matches to NZ_CP007767 (Campylobacter peloridis LMG 23910 plasmid pPEL1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccat CRISPR spacer aaagaaccattccttgaagatcaaaacaaaga Protospacer * .**** ************ ******* .
11. spacer 1.2|552161|32|NZ_CP012373|CRT matches to NZ_CP044261 (Campylobacter armoricus strain CA639 plasmid pCA639-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccat CRISPR spacer aaagaaccattccttgaagatcaaaacaaaga Protospacer * .**** ************ ******* .
12. spacer 1.2|552161|32|NZ_CP012373|CRT matches to NZ_LR134403 (Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccat CRISPR spacer gtacaacaataccttcaagaacaaaacaaaaa Protospacer .*. ****** **** ************ *
13. spacer 1.5|552162|32|NZ_CP012373|PILER-CR matches to NZ_CP007767 (Campylobacter peloridis LMG 23910 plasmid pPEL1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccat CRISPR spacer aaagaaccattccttgaagatcaaaacaaaga Protospacer * .**** ************ ******* .
14. spacer 1.5|552162|32|NZ_CP012373|PILER-CR matches to NZ_CP044261 (Campylobacter armoricus strain CA639 plasmid pCA639-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccat CRISPR spacer aaagaaccattccttgaagatcaaaacaaaga Protospacer * .**** ************ ******* .
15. spacer 1.5|552162|32|NZ_CP012373|PILER-CR matches to NZ_LR134403 (Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccat CRISPR spacer gtacaacaataccttcaagaacaaaacaaaaa Protospacer .*. ****** **** ************ *
16. spacer 1.9|552229|32|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033050 (Virgibacillus halodenitrificans strain Bac324 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aagatgctgatgtagtgggttttgtatatcgg CRISPR spacer accatgctaatgtagcgggttttgtagttgga Protospacer * *****.******.********** * *.
17. spacer 6.1|3500181|32|NZ_CP012373|PILER-CR,CRT matches to MN417334 (Clostridium phage CPAS-15, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
accataatccctaggtggactttgacatacgt CRISPR spacer actgatatgcctatgtggactttgacatattt Protospacer **.. ** **** ***************. *
18. spacer 6.1|3500181|32|NZ_CP012373|PILER-CR,CRT matches to MF001357 (Clostridium phage CP3, partial genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
accataatccctaggtggactttgacatacgt CRISPR spacer actgatatgcctatgtggactttgacatattt Protospacer **.. ** **** ***************. *
19. spacer 6.2|3500249|30|NZ_CP012373|PILER-CR,CRT matches to MN692957 (Marine virus AFVG_117M60, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
agaagcgacttgataacgctacgaattctg CRISPR spacer acgttgtacttgataacgctactcattctg Protospacer * . *************** ******
20. spacer 6.4|3500382|30|NZ_CP012373|PILER-CR,CRT matches to NZ_CP013238 (Clostridium butyricum strain CDC_51208 plasmid pNPD4_2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
cacaatggaattgatgagtatttgctcccc CRISPR spacer aacaatggaattgatgtgtatatgtcagct Protospacer *************** **** **.. *.
21. spacer 6.4|3500382|30|NZ_CP012373|PILER-CR,CRT matches to JQ680349 (Unidentified phage clone 1013_scaffold24 genomic sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
cacaatggaattgatgagtatttgctcccc CRISPR spacer cttcatggaattgatgagtattggcatatc Protospacer * . ****************** ** . .*
22. spacer 1.1|552095|30|NZ_CP012373|CRT matches to AP014207 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C8-MedDCM-OCT-S26-C6, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tacccatcattgattgaagacttggggggc CRISPR spacer acgctctcattgattgaagtcttggggaaa Protospacer *. ************* *******..
23. spacer 1.3|552229|31|NZ_CP012373|CRT matches to MN871444 (UNVERIFIED: Serratia phage KpGz_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
aagatgctgatgtagtgggttttgtatatcg CRISPR spacer ctctacctgatgtagttggttttgtagattg Protospacer ********** ********* **.*
24. spacer 1.4|552096|30|NZ_CP012373|PILER-CR matches to AP014207 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C8-MedDCM-OCT-S26-C6, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tacccatcattgattgaagacttggggggc CRISPR spacer acgctctcattgattgaagtcttggggaaa Protospacer *. ************* *******..
25. spacer 1.6|552230|31|NZ_CP012373|PILER-CR matches to MN871444 (UNVERIFIED: Serratia phage KpGz_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
aagatgctgatgtagtgggttttgtatatcg CRISPR spacer ctctacctgatgtagttggttttgtagattg Protospacer ********** ********* **.*
26. spacer 1.8|552161|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP007767 (Campylobacter peloridis LMG 23910 plasmid pPEL1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccatg CRISPR spacer aaagaaccattccttgaagatcaaaacaaagat Protospacer * .**** ************ ******* .
27. spacer 1.8|552161|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044261 (Campylobacter armoricus strain CA639 plasmid pCA639-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccatg CRISPR spacer aaagaaccattccttgaagatcaaaacaaagat Protospacer * .**** ************ ******* .
28. spacer 1.8|552161|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR134403 (Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccatg CRISPR spacer gtacaacaataccttcaagaacaaaacaaaaaa Protospacer .*. ****** **** ************ * .
29. spacer 1.2|552161|32|NZ_CP012373|CRT matches to MN693402 (Marine virus AFVG_25M260, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccat CRISPR spacer gctcaacaattacttgaagaacaaaacctttc Protospacer .. ******* *************** .. .
30. spacer 1.5|552162|32|NZ_CP012373|PILER-CR matches to MN693402 (Marine virus AFVG_25M260, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccat CRISPR spacer gctcaacaattacttgaagaacaaaacctttc Protospacer .. ******* *************** .. .
31. spacer 4.1|2230996|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder matches to AP013497 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G19, isolate: uvMED-CGR-C68A-MedDCM-OCT-S35-C79) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
gacaaggtcagcttgggcaatggcaaggtctgc CRISPR spacer accaatgtcagcatgggcaatggcaagagtaaa Protospacer . *** ****** **************. . .
32. spacer 4.1|2230996|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder matches to AP013775 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C68A-MedDCM-OCT-S26-C73, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
gacaaggtcagcttgggcaatggcaaggtctgc CRISPR spacer accaatgtcagcatgggcaatggcaagagtaaa Protospacer . *** ****** **************. . .
33. spacer 4.1|2230996|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder matches to AP013498 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G19, isolate: uvMED-CGR-C68A-MedDCM-OCT-S38-C76) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
gacaaggtcagcttgggcaatggcaaggtctgc CRISPR spacer accaatgtcagcatgggcaatggcaagagtaaa Protospacer . *** ****** **************. . .
34. spacer 6.8|3500660|32|NZ_CP012373|PILER-CR matches to MN694562 (Marine virus AFVG_250M829, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
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35. spacer 6.12|3500657|32|NZ_CP012373|CRT matches to MN694562 (Marine virus AFVG_250M829, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
ttgtcagtctctccaccatactgcattagttc CRISPR spacer agtacagtctctccaccttcctgcatttcccg Protospacer ************* * ******* ..
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1442180 : 1498955
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012373|1442180:1498955|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012373|1442180:1498955|1475328_1475649_+|WP_062150452.1|DBSCAN-SWA MDDKAIAGLEALLAKGQDNALLRLSLGNAYLQKQQVEIALIHYAQATQLDPSYSAAWKGYGKALAENQQIEEAIQAYTTGITVAEQKGDKQTMKEMQVFLKRLQKL >NZ_CP012373|1442180:1498955|1477642_1478677_+|WP_062150464.1|DBSCAN-SWA MTATTARIPTHLITGFLGAGKTTAILNLLANQTTGEKWAVLVNEFGEVGIDGAILQNGGVAVREVTGGCVCCTVGVNMQVALTQLIREVRPQRLFIEPTGIGNPVNILKILQNEWLEPYLAVQAVVCLIDPRQFNETLLDRSPVYWDQLQFADVLVINKCDLASPADIDRFNQFAQTLHPPKSLIVKTEQAQLTLDWLIRPHHRDIPLTPHDTHNHIPPQTTTPIITLFPKELPPTDTLRRYESEGFNRVACGWIFPINDYFSEEKLTKLFSQLSKHPAFSMIERAKGIFRITEAEWQLFNRANTGLEMRLLTMQHDSRIELIAQEGEKPDWLVIEEILRGLKK >NZ_CP012373|1442180:1498955|1472855_1473242_+|WP_062150439.1|DBSCAN-SWA MQRISQRVIGVPYGKTKDEIGQLLLRNWQNAIIEQTKNLPKIKGVCVLKLNFLLPADKFPTRFPYGPDLEGLIGRVMDSLNSTVFSEVAGGHSCVMSLNVKKTKVLSDKDAGVSIEILTLDTKAGAKT >NZ_CP012373|1442180:1498955|1449310_1452208_-|WP_062150396.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP012373|1442180:1498955|1474837_1475329_+|WP_062150448.1|DBSCAN-SWA MANRYLHIHLPTQSLHHLTDTGESCFSTSISSARNGAGEVRNSGCTPRGWLVIKAKVGANCAINSVFIGRRFTGEIYTPELAQLYPQRDWILSRILWLGGLEPNKNRYGQVDTLRRFIYIHGTPDDKPMGIADSCGCIRMRNHDIITLFDQVNVGTRVFVEAE >NZ_CP012373|1442180:1498955|1478837_1479386_-|WP_062150467.1|DBSCAN-SWA MENLVKGKLQRWDDEKGFGFILPEVGSKLVFMHVSAMKNSSRRPKVGDIVSYELFTTRDGKLRAINARIEGVTLKNRSKSSWKKTFLMLLKTAIYIGLAVIFVKMLLNNFDHRKQEAIAIDDMGFQTGAKPKSNNTYSCDGRIHCSQMKSCEEAVFFLRNCPNTQMDGNNDGVPCERQLCGR >NZ_CP012373|1442180:1498955|1453712_1454174_-|WP_062150404.1|DBSCAN-SWA MEKILCQYAIVRFMPTIETEEFINVGIVLLATQHHFFGFKLTNKRYGRITHFFHKEARDAYLFAKENILEKELIRIQKLLDKYQLENHSKKEYSDFARTIFNELIRPRETAIRFSEQKVLLSNNVENTLEDLFASYVNRYFVSKPIAKRISEK >NZ_CP012373|1442180:1498955|1443944_1445228_+|WP_062150391.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP012373|1442180:1498955|1458570_1459110_-|WP_062150411.1|DBSCAN-SWA MLRTLLITMLLLAQPLFAETNCHCPQGENVALDQQCPNPFTTEQALTELNHLLPSRGTGSIADEFYQAEQQRVQNGVLQQLSCGELEIRRQLLPDIANQNHNRANVAIKSLESLYQSHNALSESAQTTYRRKHTPDVMMLDRYNHFYDDYEPTYASPYYNHHLVPHLYYRHKNIYWSDR >NZ_CP012373|1442180:1498955|1445363_1446779_+|WP_062150392.1|DBSCAN-SWA MTPNKLIFLTLLLNPAFTLATTIDFSKSEPNEALSGGATTVFNATVNAFSLPAANMPISRRDNFSIGNAFFRQPWVTAPSTTTARDGLGALFITNACQNCHIKDGRGSPPAKADDDFVSILLRLSLPAITDAQKAQIKQSGVIAEPTYGDQLQNFSVQGVPAEGKPTVTYTEIPITFADGEVLTLRQPKYEIKNLQYGELHKEVLISPRVAQPMIGLGLVDAIPEASILANADPEDKNGDGISGRPNHVWDVEKKQTVMGRIGWKANMPHIRQQTAGAFNGDIGITSVLFPTSSCTDSQTACKNAPNGGEPEISTELLDFVTFYARTLAVPARRNVDDPIVLKGKAVFYTANCTGCHTPTFQTGEFAGLPEVSKQAIRPYSDFLLHDMGDGLADARPDFEATGNEWRTQPLWGIGLTETVNGHTQFLHDGRARNLMEAVLWHGGEAEQAKQAVLKLAKPEREALIKFLESL >NZ_CP012373|1442180:1498955|1452714_1453659_-|WP_062150401.1|DBSCAN-SWA 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52 | Rhodococcus_phage(20.0%) | integrase,tail,transposase,tRNA | attL 1472992:1473007|attR 1497631:1497646 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
2166079 : 2173584
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP012373|2166079:2173584|DBSCAN-SWA GTTATGTAAATGTTTGTTCTATGGTTGGAAATGCTTTACTTTTAACTGCTTGCGTGTAGGCTTGAACAGCCGCTTGGATGGAATACTGTTCTGTCAGAAAGTTTTTAGAAAATGAAGGGGGTTTTACCGTTAAACCCAACATGTCATATAACACCAGAATTTGTCCGTCACATTCAGCACCCGCTCCAATACCGATGACAGGTATGTGTAAGGCTTGGGTGATTTCTGCTGCTAATTTACCCGGTATGCACTCTACCAATAACATTGATGCCCCTGCTGCTTGTAAGGCGAGAGCATCTTGACGCAATCGTTCTGCATCGCTGTTGGCGCGACCTTGTACCACATAACCACCCAGTTGATGAACGGATTGGGGCATGAGTCCTAAATGAGCGCATACAGGAATTCCTCGTTCTGTGAGGAGTTTAACCGTATCAACTAGCCAATTTCCCCCTTCCAGTTTTACCACTTGGGCATAGCCTTCGCGCATTAAGCGTGCTGCATTGTGTAAGGCTGTATCGGGTGTTGCGTAACTCATAAATGGCATGTCGACCATTAAGAGCATGTTGTCACTACCACGATGTACTTGTTGAGCATGATAAATCATTTCTTCAATAGAAACAGGGAGTGTGCTTTCATGCCCTTGAATCACCATTCCCAAAGAATCGCCAACCAATACCAATTCAATGCCCGCTTCTTCTATCAGATGGGCAAAGCTCGCATCATAAGCGGTTAGAGAAGCAAACTTTTCGCCTTGGCGTTTAAGTTTGCGAAAGTGATTAAGTGATAAACGTGGCATCAGTTTTCTATCCTATATAAGCCATCCATCGGACAGTGTTGTAGTAATATTTCTAGGGGTGTTCCATCGGGTAATATTAATGCGGGTTCGCATTCATACAAGGGGTATAGTACAAATGCCCGTTGTGTCAGTCCGATATGTGGCAAACACAAACGCGGGTCTGTGGATTGTAGTGCGTCATAAAGAAGGATGTCTAAATCCAACGTGCGTGCGCCCCATCGCTCCCCTCTCACTCGTCCTTGTTGATTTTCTATCGCTTGCAAGTGTTCTAGGAGAATATATGGGGGGAGTTGTGTCTCTAAAACGGCTACGGCGTTAATATAATCGGGTTGTAGCATATTAGCGAGCGGTTTGCTTTGATACAGTCCAGATTGTTTACGCAATTGTGTTTGCGGTAACGTAGCGAGAGATTGAAAGGCCTGATGTATTTGTTTAACTGGTTCGGCAAGATTACTGCCTAACCCGATATAAGCGATACTATTCACCATAATGACCCACTAGGATTCGCTTTGCGATGCGTCGTTTCTACGCCGATAAGGACGACGTTTCCTGCGATTATGATGCGGTTGTTTATGAATGGCGGGATGCGTCGGTGGTGTTGATATTATTAATGTTTCTTCTATTTCAGCAATAACGGGTGTATTCTCTTCAGGCACACGCGCCACAACTTCTGTGGTCAATGCCTGCGTCCACCATTCTGCCCCTTCACGCGCTTCCGCGTCTAAAAATGCCCGCAATAAGAGGAAATCATAAGCGGCCCGAAAACGGGGATGTTCCATTAATAATAGGCGTTTACGCTTATTTTTTCGTTGTAACAAACGTGGTTGCATTAACCAAATTTCTTGCATAATCACACTAATACGTTTAGGAATAGCAACTTGTTTAACTTGTTTATTCATCACTCGTTGCATTGCATTAATCAGACAATCTTGTTCACTCGCCCCTTCTTCACGGTGAAAAGGTAAGACTTTGAGAATAGGCGACCAGAGCAACGCGGCGAATAAAAAGGCAGGATTAACGGATTGCTGTTTAGCAACTCGCTCATCTGTATTTTTTAATACTTGTTCGACCATCGTCAAGACATTGGGATTTTCTAGAATGCACTCATGTGTTTGACGAAATAAATGTTCAAATAAACCGTATTGTCGTAAATAGCGGAAAGATTTTAAACCATGTCCACTTAAAAACAGTTTTAAAACTTCATCATGCAAACGTGCAGAAGGTACATCGGCTAATAAACCACCCAGTTGTGGAATGGGTTCAGCCGTATAGTTTTCAATCGTAAAACCCAATTTTGCCGCAAACCGCACCGCCCGCAACATACGCACAGGGTCTTCTTGATAACGTAACATCGGGTCGCCGATTAAACGCACAATACCCGCTTGTAAATCTGCCATGCCATTGGCGTAGTCTAAAATGGCAAAATCATTTATGTCATAATACAAAGCGTTAAAAGTAAAATCTCGACGATTCGCGTCTTCATCAACGGTTGTACCATACACATTATCACGCACAATTCTTCCGTCTTCTATCACCCGTTCATTGCCATTCACTTTGCCACCATGGCTTGCTCTAAAGGTAGCGACTTCAACAATTTCTTGTCCAAAATACACATGCGCGAGTACAAAGCGACGACCAATTAAACGGCAATTGCGAAAAACGTTTTTAACTTGTTCAGGTAAGGCATTAGTAACAATATCAAAATCTTTTGGTTGTTTACCTAAAAGAACATCACGAACACCACCACCCACAATATAAGCCTGAAAACCAGCACTTTGTAATTGATACAACACTTTTAGGGCAGATTTACTAATATTTTTACGAGAAAGGGCGTGTTCTGCACGTGAAATACGTAAAGGAACAGGCTTTTGCGTATCTATAATAGATGACAACGCCGTCTGCGGTTGCACCTCAGAAGGTTCAAAAGATTTTAATATTTTTTTTATGCCATCAACCAAGCGTTTATAAGGAGTCATCGTTTTCCTTGATGAGAATTAAGCACTACTATTTTACATTAATACCATTACCTAAAACATTATATGCTTTTGTGGACGGTTTGAAAGGTGGAAATGACGTAACTCGTCAGTCTTACGCACATCTTGATATTGGTAATACTACATTTATATGAATGAATTTACACTAATTTTATGGCAAGCTTACAACTCTACGCACTTATCCCCCAAACCCATGTTTTAGGCCCTTTCACCCGTTTTGCCTTATGGGTACAAGGCTGTCCATTCCGTTGTCATGACTGCATGACACCTGATGCGTTGCGTGTGGATGGCGGAACATCTGTGGAAATTACAGAATTAGCTCAACAAATTCTAAACACTCCCACGATTGAAGGGATTACTCTATCAGGTGGTGAACCCTTTGCACAAAGTGCTGAGTTACTAGAATTAATTCATCAAATTAAACGGGTTAAGTCATTAGGAATTATTGTTTATTCAGGCTATACCCTAGAACAATTACAAAAAATGGCTAAAAAACATCCCGCTGTTGCAGGCTTATTAGACCAAATAGATGTATTAATTGATGGTTTATATATTGCAGAACAAAACGATGGCTTGAGTTTGCGGGGTTCAAAAAACCAACAAATCCACGCACTGACTCCACGATATGCGGCACTCATTGCTGAATATTATGCGCAATCTCAACGCGCTGTTGAAATGCACTTATTAGCCGATACCGTTATGCTGGTTGGTATTCCGGGAATAAATTTATTATCAACATGGCAAACACAGATTAAAAAACAATCTTAGCTTTTATTAACAAATAATTGCACATACTGCTTTGCAACTTGTTCCCATGAAAAATGTTCCATAACCCATTGTCTGCCTGCATCCCCTAATACCTTTGTTTGCTGTCGATTTGTTATGAGATATTTAAGCGTTGTTTGTATCTCATCATTATTTTGCAATGCCAACAAATACCCTGTTTCCCCATGACGTACAACCGACTCATGTCCTGTTACTTGACTAGCAACAATTGCAAGCCCTGATGCCATTGCCTCCAACAACACATTAGGCATTCCTTCATATAAAGAAAAACTTAATAAGCAATCTGCCTGTTGATAACAAGCACGTAATATTGTCTTATCTAACCAACCATGCCAAATTAACACATCATCAAGTTGCAACTGTTGTGCATAGGCTTGTAATGCTGTCTTCTGGTATCCATCACCAACTAAATGACAACAAAAGGCTAATGTCGTCGTATCGCGTAATTTTTTTAACTGCTTTAATAAAAAGAATAAATTTTTCTGTTCCTGAAAACGTCCAACGAATAAAAATTGAAAAATTGGGTTTTCATGCGGAATAGGGAAAAAAAAGTGGGTATCTACACCATTAGCTATTATTTGGGTCTGGAAGGGGTCAGCTTTTTGCGCGACTTGTTGTAAGCCAATAGAGTTAGCAACAATGGCTATTGCTTGTTTTAAAATTACACGGCGTAACGGTTGCAATATGCGGTGTATCCACATAATACGCGGCTCTAAACCGGGAACATCGCCCCCCCGTAATGACACAATGTAAGGTGTTTTATACAAAAGCTTAGCCCATAGACCCAATGGGCCACAAGGAATTGAAAAATAAACAATAATTCCTTGAATATTCTGTTTCTTTAACAAACGGGGCAAAACCATCATTGCGGATAAAACAAAAGAAAATTGCTCAAACAAACTAGAACGACTGACTTGATGACGGAAAGCTAAACAACGATAAATAAATACACCCTGTTCTTCTGACCAACCACGTAATTCTTGGAAACAACTGGTTAAAACAGTAACCTGATGCCCTTGCTTAGCCAACTCATGGGCGGTATTCCACGTTGCAGTTGCCGCTCCACCGCCAATAGGCGGAAACTCGTAATTTATCAATAGTAAATTCATATTTTCTAAAAAGACTTAGATTCACTCCAACGACTTAATAACGATAGATTCCATAAAAACGCCCGATTATCAACCGTATTGCATCTATGTTCATGAATTTTTTCTTGAATAAAAGGACTATGTAACAGGGGAAATGTTGTCGGTATTGTTAGTTTCCCTTGTGCTAACCATTTCCCAATGGGTACACCAAAACCTTTTTTACTGCGATATAAAATCTCGTTGGGCAATATACCTTCCAATGCCTTTTTTAATAAGTATTTCGTCTGTCCATGACGGAATTTATAATCACTGGGAATTTGACGGATAAAATTAACCAAATCAATATCTAAAAATGGACAGCGTCCTTCTAAAGAAACCATCATGCTAGCGCGATCTAGCTTTACGAGAATATCATCTTGTAAATATAACTTTGTATAAAACTGCAATGTTTTATCAACTAAATTATCCTGTTGACATGCATCCCACTGTATTATTGCTTCAGAATATAAATTTTCTAAATCAATCGGTTCTTGAAATAAATCGTTGAGTTCTTGAGGGTCTAATGTTGCCATCCACACAGGCGACCAGAGCGATGGGGGATAGCTTAAACCGCGTAATGTCCGCTTAATTTTAAAATCTACGCTCATATTACGGTGAGAAACAGGCAACCGCGCGAAAAGCAAACGAATTCCCTGATGAAGCGGTTTAGGGATAAACTTTTGATAAAGTGTTGCCCAGCGTAACGCACGAAAGGGGTCATAACCTGCAAAAAGTTCGTCGCTACCATCGCCCCCCAATGCGACCGTCACCGTTTGCCGTGCGAAACGACAAAGCAAATAAGTTGGCAATAATGAGCTATCCCCCATCGGTTCATCTAACTTATCGATAATACTGGGTAATAAAGTTTGCGCTTTATCCAACGATAGCACATCTAAATGATGTTGCGTGCCTAAATAACTTGCAACTTGTTGTGCATACTTAGATTCATCAAAATCTGCTTCTGTAAATCCAATGCTGAACGTATTGAGTTTATCGCGGTCAACATGCCGACGTGCAAAAGCCGCAACCGCAGAGGAATCCACCCCGCCACTGAGAAAAATCCCCAACGGAACATCTGCCATTAAACGTATTTTAACAGCATTATCCAGCAATTCGCGCAACTGTTCTGCCCATACAATGTCGGGGTTAGAAGGAATAGTTGTAAAGGGTTCTAGCACAAAATCCCAATATTTTTGAATGTTACAATGCTGTGTTTGCAGGTTATAAATGAGGGAATGCCCAGCAGGCAGCTTATAAATATTTTTATAAAGTGTGTGTGGTGCAGGAATATAACCGTAGGCAAAATATTTTTGTAATGCTAAGGGAAAAAGAGTAGGAGTTACTGCGGGATGTGCTGTAATTGCTTGTAATTCTGAAGCAAATACAAATAAATCTTTTTGACAGGTATAAAAAAACGGTTTTTCCCCGAAACGGTCACGACTGCAAAAAATCACTTGTTGTTTACGGTCATACAATACAAACGACCACATCCCATTTAACTTGTTTGGTAGTTCCGTACCCCATTCTCGATAACCATGTAATAACACCTCGGTATCTGAATGGTCGGTAACAAAAACGTGTCCTTTACATTGCAGTTGTTGGCGTAGGGCAATATGGTTATAAATTTCCCCATTAAAAACAATTACTAAATCTTTATCGCTAGTCAACATGGGTTGTTGCCCTCCTGAGAGGTCAACTATAGCCAATCGTCGATGTCCTAAAAAAACCGTCTGTTCATGCCATAACCCTTCAGCATCGGGTCCACGATGTTGCAATCGATGGGTTAAACTGCGTAAATCTGCAATTGTCCCCGTACCAATAAAACCTGCTATGCCACACATAATTATGGTTTATCTGCTGTAATGTTGAAGCGGGTTCTAATACTATATGTTGGTTTATCTTGCGATTCATAATAAGTACGCATTAATAATTCACCAATTAATCCAAAAAAGATAGATTGCACACCAACGATGAAAAACATGGCAGACATTAACAATAAGGGACTGGTTACTAAGGACTGTGCATAAAAAAACTTATCTAGTAACAGATAGATAAGTAGCAAAAAACTGCCAACAATAAATCCTGCCCCAATACTGCCAAATAGATAAATGGGTTTTTGCCCATATTTGCTTAAAAATTTAACTGTAAATAAATCTAAAATAACCTTAAAAATTCGTTCTAAACCATATTTAGACTGTCCAAAGCGACGCGGATTATGATTAACTGGTATTTCCGCAATGCGTGCGCCAACTTGTGCAGCATAAGCAGGCAAAAAGCGGTGCATTTCACCATACAAGCGATAACCCTGTAAAACCTCTTTACGATAGGCTTTTAAGGTACAACCATAGTCATGCAACCGTACACCCGTTACTTTGGAAATTAGCCAATTTGCCATGTTTGAAGGTAATGTCCGTGTCAACCATGCGTCTTGCCGATTCGCACGCCACCCACTGACCAAATCATAGCCTTCATCTAATTTGTTTAATATCATTGGAATATCAGCAGGATCGTTTTGTAAATCAGCATCCATAAAAATAATCACATCACCCGTCGCATGGTCAATACCCGCAGCAATTGCGGCAGTTTGCCCATGATTACATGTAAATTGAATGACTTTTATGAATGCGTTGTTCTGTGCAAGAGCGGTTAAAACCGCAAAACTTTGGTCTTGGCTACCATCATCAACATAAATAATTTCATAAGGATAAGAAAGTTGAGCAAGCGTTTTCGCAATTTTTTCTTGAAGTAATGGGATATTTTCGGCTTCGTTATAAACAGGAATGATAAGAGAAAGTGAGTGCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP012373|2166079:2173584|2170768_2172622_-|WP_062152034.1|DBSCAN-SWA MCGIAGFIGTGTIADLRSLTHRLQHRGPDAEGLWHEQTVFLGHRRLAIVDLSGGQQPMLTSDKDLVIVFNGEIYNHIALRQQLQCKGHVFVTDHSDTEVLLHGYREWGTELPNKLNGMWSFVLYDRKQQVIFCSRDRFGEKPFFYTCQKDLFVFASELQAITAHPAVTPTLFPLALQKYFAYGYIPAPHTLYKNIYKLPAGHSLIYNLQTQHCNIQKYWDFVLEPFTTIPSNPDIVWAEQLRELLDNAVKIRLMADVPLGIFLSGGVDSSAVAAFARRHVDRDKLNTFSIGFTEADFDESKYAQQVASYLGTQHHLDVLSLDKAQTLLPSIIDKLDEPMGDSSLLPTYLLCRFARQTVTVALGGDGSDELFAGYDPFRALRWATLYQKFIPKPLHQGIRLLFARLPVSHRNMSVDFKIKRTLRGLSYPPSLWSPVWMATLDPQELNDLFQEPIDLENLYSEAIIQWDACQQDNLVDKTLQFYTKLYLQDDILVKLDRASMMVSLEGRCPFLDIDLVNFIRQIPSDYKFRHGQTKYLLKKALEGILPNEILYRSKKGFGVPIGKWLAQGKLTIPTTFPLLHSPFIQEKIHEHRCNTVDNRAFLWNLSLLSRWSESKSF >NZ_CP012373|2166079:2173584|2172624_2173584_-|WP_062152037.1|DBSCAN-SWA MHSLSLIIPVYNEAENIPLLQEKIAKTLAQLSYPYEIIYVDDGSQDQSFAVLTALAQNNAFIKVIQFTCNHGQTAAIAAGIDHATGDVIIFMDADLQNDPADIPMILNKLDEGYDLVSGWRANRQDAWLTRTLPSNMANWLISKVTGVRLHDYGCTLKAYRKEVLQGYRLYGEMHRFLPAYAAQVGARIAEIPVNHNPRRFGQSKYGLERIFKVILDLFTVKFLSKYGQKPIYLFGSIGAGFIVGSFLLLIYLLLDKFFYAQSLVTSPLLLMSAMFFIVGVQSIFFGLIGELLMRTYYESQDKPTYSIRTRFNITADKP >NZ_CP012373|2166079:2173584|2169021_2169636_+|WP_062152029.1|DBSCAN-SWA MASLQLYALIPQTHVLGPFTRFALWVQGCPFRCHDCMTPDALRVDGGTSVEITELAQQILNTPTIEGITLSGGEPFAQSAELLELIHQIKRVKSLGIIVYSGYTLEQLQKMAKKHPAVAGLLDQIDVLIDGLYIAEQNDGLSLRGSKNQQIHALTPRYAALIAEYYAQSQRAVEMHLLADTVMLVGIPGINLLSTWQTQIKKQS >NZ_CP012373|2166079:2173584|2166079_2166874_-|WP_062152021.1|DBSCAN-SWA MPRLSLNHFRKLKRQGEKFASLTAYDASFAHLIEEAGIELVLVGDSLGMVIQGHESTLPVSIEEMIYHAQQVHRGSDNMLLMVDMPFMSYATPDTALHNAARLMREGYAQVVKLEGGNWLVDTVKLLTERGIPVCAHLGLMPQSVHQLGGYVVQGRANSDAERLRQDALALQAAGASMLLVECIPGKLAAEITQALHIPVIGIGAGAECDGQILVLYDMLGLTVKPPSFSKNFLTEQYSIQAAVQAYTQAVKSKAFPTIEQTFT >NZ_CP012373|2166079:2173584|2169632_2170763_-|WP_062152032.1|DBSCAN-SWA MNLLLINYEFPPIGGGAATATWNTAHELAKQGHQVTVLTSCFQELRGWSEEQGVFIYRCLAFRHQVSRSSLFEQFSFVLSAMMVLPRLLKKQNIQGIIVYFSIPCGPLGLWAKLLYKTPYIVSLRGGDVPGLEPRIMWIHRILQPLRRVILKQAIAIVANSIGLQQVAQKADPFQTQIIANGVDTHFFFPIPHENPIFQFLFVGRFQEQKNLFFLLKQLKKLRDTTTLAFCCHLVGDGYQKTALQAYAQQLQLDDVLIWHGWLDKTILRACYQQADCLLSFSLYEGMPNVLLEAMASGLAIVASQVTGHESVVRHGETGYLLALQNNDEIQTTLKYLITNRQQTKVLGDAGRQWVMEHFSWEQVAKQYVQLFVNKS >NZ_CP012373|2166079:2173584|2167371_2168850_-|WP_062152026.1|DBSCAN-SWA MTPYKRLVDGIKKILKSFEPSEVQPQTALSSIIDTQKPVPLRISRAEHALSRKNISKSALKVLYQLQSAGFQAYIVGGGVRDVLLGKQPKDFDIVTNALPEQVKNVFRNCRLIGRRFVLAHVYFGQEIVEVATFRASHGGKVNGNERVIEDGRIVRDNVYGTTVDEDANRRDFTFNALYYDINDFAILDYANGMADLQAGIVRLIGDPMLRYQEDPVRMLRAVRFAAKLGFTIENYTAEPIPQLGGLLADVPSARLHDEVLKLFLSGHGLKSFRYLRQYGLFEHLFRQTHECILENPNVLTMVEQVLKNTDERVAKQQSVNPAFLFAALLWSPILKVLPFHREEGASEQDCLINAMQRVMNKQVKQVAIPKRISVIMQEIWLMQPRLLQRKNKRKRLLLMEHPRFRAAYDFLLLRAFLDAEAREGAEWWTQALTTEVVARVPEENTPVIAEIEETLIISTPPTHPAIHKQPHHNRRKRRPYRRRNDASQSES >NZ_CP012373|2166079:2173584|2166873_2167362_-|WP_062152023.1|DBSCAN-SWA MVNSIAYIGLGSNLAEPVKQIHQAFQSLATLPQTQLRKQSGLYQSKPLANMLQPDYINAVAVLETQLPPYILLEHLQAIENQQGRVRGERWGARTLDLDILLYDALQSTDPRLCLPHIGLTQRAFVLYPLYECEPALILPDGTPLEILLQHCPMDGLYRIEN |
7 | Ostreococcus_lucimarinus_virus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
3030146 : 3096086
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP012373|3030146:3096086|DBSCAN-SWA GCTACTCCAAATTATTCAGTTGTTCATGCGTTAAACCTGTGATTTGTGCAATCATCTCTAAGCTCATACCTTGCGCTTTTAAATGTTTAGCAATTTCTAAGTTTCGGCGTTCTACACCCTGTTCCACACCCAGTTGTATTCCCTTTTCAATTCCAACTTTGACACCAACATGAAACTCCTCAGTTTTTTCTTTCAGCATCAACTCTTCTAGCGAATACTCATCTTTCATTCTGGCGCGGTCTTGTGGCGTTAATCCATCAGTTTTAATAAGGTTAAGAACCTTTAGAATCTCACTTTTATGATAAGCCGATTCGTCTATCTGCTCATCTAAACTGTCTTGTATCATCAATAACCATTCACGACATGGTTCGCGAGTTTTATCCGTAATTTGTTTCGGAGAAAGGTACAGAATACGGTGATGAATTCTATTGAGCCGTTGATTGGTTTCTATATCCACAGGGTCAAAGTTAATTTCAGCTATTGCACAATCTTCTTTTGTACCTGAGGTTAAAACCACAATTGTAAATACAGTTAATGCAGGGCTATAACTTTTTGCGTTGCTGATTTGTTCTAGTAATGCAGCACAATGATAATGTAGAAATCTATCGTAATAGTCTTTGTAACGACGGTGTTGAATATCGACGATAACGCGGTTTTTCTTATCTTCTGCATATAAATCAAAGCGTGAATCAACCCCGCCAATTGGGGGGTCAAAAGATTTTTCAGTTTCTACTTTGTCTATTTCTAAGGTAAAACCGAGAAAATCACGCACAAATGCGGTGAAGACTTCAACATCACAAAAGGCTTTTTTAAAGATAACGCCGTAACGTAGGGAGGCAACTTGTTGCATGGTCAGCTACTCCGAATTATTCAGTTGTTCATGCGTTAAACCAGTGATTTGTGCAATCATTTCTAAGCTCATGCCTTGTGCTTTTAAATGTTTAGCAATTGCTAAGTTTTGGCGTTCCACACCCAGTTGTATTCCCTTTTCAATTCCAACTTTGACACCAACATGAAACTCCTCAGTTTTTTCTTTCAGCATCAACTCTTCTAATGAATACTCATCTTTCATTCGTGCACGGTCTTGTGGTGTTAATCCATCGGTTTTAATGAGGTTAAGAACCTTTAGAATCTCACTTTTATGATAAGCCGATTCGTCTATTTGTTCGTCTAAACTGTCTTGTATCATCAATAACCATTCACGACATGGTTCGCGGGTTTTATCCGTAATTTGTTTTGGAGAAAGGTACAGAATACGGTGATGAATTCTATTGAGCCGTTGATTGGTTTCTATATCCACAGGGTCAAAGTTAATTTCAGCGATTGCACAATCTTCTTTTGTACCTGAGGTTAAAACCACAATTGTAAATACGGTTAATGCAGGGCTATAACTTTTTGCATTGCTGATTTGTTCTAGTAGTGCAGCACAATGATAATGTAGAAATCTATCGTAATAGTCTTTGTAACGACGGTGTTGAATATCGACGATAACGCGGTTTTTCTTGTCTTCTGCATATAAATCAAAGCGTGAATCAACCCCGCCAATCGGGGGGTCAAAAGATTTTTCAGTTTCTACTTTGTCTATTTCTAAGGTAAAACCGAGAAAATCACGCACAAATGCGGTGAAGACTTCAACATCACAAAAGGCTTTTTTAAAGATAACGCCATAACGTAGGGAGGCAACTTGTTGCATGGTCAGAACTCTTTGCGAGATGAGAGGCACTATAAGTGCGAATTTATTCGCACCTATCCATAAATTAAGCAATTAAATTCTATTTTCGTAACCGATGTATCCCCAACATCACCCCTACAGCAACGCCCCCCACGATAAGCCCAACAAAAAACTCAGCAATAATCGTAGGTAAAAATTCAAATAAATGATGGATAACCGCAATGTTATGTACAAACATACCGCCACCGACTAATAACATCGCTATCGTACCGATAATTGATAAGGCTTTAATAATACGTGGCATTAGGTTTACCAAGCCCTGCCCCAATACAGCCAGTGTATGATTATTATTCGTCGTTGACTGTTTGATAAGCCAAAAACCGACATCATCCATGCGGACAATTAACGCGACAAAACCATACACGCCAACCGTTGCAATGAGTGCTATTAAAGAAACAACGATGAGTTGCAACGTCAGACTTTTATCCATTACTGACCCTAATGCAATAATGATAATTTCTATCGATAAAATAAAATCGGTGAGAATGGCACTTTGAATTTTTTTCTTTTCTACATCGACAATAGTCGCAGCACTGGATTGCAAGACTTCTACTTTTTCTTCTTCACGAGAATGTGGATGAATCCATTCTAAAATTTTTTCTGTTCCTTCATAACTTAAATAGATGCCACCTATCAGTAAAATAGGTACAATCAGCCAAGGCAAAAACGCACTGAGTAAAAAAGCAAAAGGTAAGATGATAATTTTATTCAGCACAGACCCTTTAGTGATTGCCCATAAAACAGGCAACTCTCGGCTGGCGTGAAAACCTGATGCTTTTTCTGCATTTACGGCTAAATCGTCGCCTAAAACACCCGCCGTTTTTTTAGCCGCCACTTTGGTCATCGCTGCTGTATCGTCTAACAGCATGGCAATATCATCTAAAATCGCAAACAATCCGCTTGCCATCGTGTATTATCCTCATGTGTGTAAAAAGTAACTGTTTTGCTGTTTATCAGATTTAATTTTAAATTACTTCATAATGAAGAACTAACAAACGCAATTACATTGTATCTTACTGAAATTACTAAATGCTAAAATGATGTGCATTAATTTATCATAACATTGTGAAAACCTTTCCTCCCTACTATCTCATCACGCCTGAACCCACAGACCCGACACGCTTTTTTCAGTCTTTATCTCATGTTTTAGCGTCAGGTATTCGCTTGATACAATTTCGTGCAAAATCACTCAGTGATGAAATTTATCAAGATTATGCAAGACAAGTATTAGACTTATGTCAAGAGGCGGGCGTAATCTGCTTATTAAATTGCGCGCCAACCGTTGCACGACAATTAGGCAGTCAGGGCATTCATTTAAATAGTTCACGATTGCATGAACAACAAAAGCCTTTACAAGGATTTACTCAGGTTTCTGCCGCTTGTCATACCATAGCGGATTTACAACAAGCAGCGCGCATTCAAACGGATTTTGTCGTATTAGGTCCAGTCTTAGTTACTGCATCACATCCTGATACATTGCCGATGGGCTGGGCGACATTTACACAATTAATACAACAAACCCACTGCCCTGTGTATGCCCTAGGGGGTTTACAGAAAACCGATTTAACCACAGCACAGCAAGCGGGTGCGGTTGGTATTGCCGCCATTCGTAGCTTGTGGCAATTATAATATTATTTAGGAATAACAATTGAATACTGAAAAAACAGCACAAGTCTCGCATGTAGAAATTTCTGAAGACCATGCAGGACAACGGATTGATAATTTTCTGCTCACCCATTTAAAAGGCGTGCCAAAAAGTCATATTTACCGCATCTTGCGCAGTGGTGAAGTGCGCGTCAATAAAGGGCGGATAAAACCCGATTATCGGCTACAAGCAGGCGATTTATTGCGTTTACCCCCCGTACAAACCGCAACACGAACCGAAGTAACGCCACATCAATCCGTTTTAAAAGCCTTACAAGCCTCTATTTTATATGAAGACGCTAAACTACTAGTCATTAACAAACCATCAGGGCTTGCTGTACATGGCGGGAGCGGGGTGCAATATGGCGTAATTGAAGGACTACGCGCGCTATATCCGCAGGCAAACTTTTTAGAACTCGTGCATCGTTTAGACAGAGAAACATCGGGCTGTTTAATGATAGCCAAAAAATCCAGCGTATTACGTCAATTACATGCGTATTTACGCGATGCGGACATGAATAAGCAATATTTAGCATTAGTACAAGGAAAATGGTCAGCGCGCGTAAAGCAAGTAAACGCACCATTACGGAAAAATATTTTACAATCAGGTGAACGTGTTGTACGGGTTAATGACGATGGCAAACCATCATTAAGTGAATTTCGCATTGTAGAACTGTTTAAACAAGCGACACTCATGCGTGTACATCCTGTTACAGGGCGGACACATCAAATCAGGGTTCATGCAACCCATACAGGACACCCCATCGCAGGCGATGAAAAGTATGGCGATGACAATTTTAATCGTGCATTACGTCAGCAAGGGCTAAACCGTTTATTTTTACACGCGGCAGAATTAACCATTCAATTACCTGAACAAAAACCCTTAACAGTAAAAGCCCCATTACCCGAACCATTAGAAGCCGTTTTAGCACAATTACGCCGTTAATTTATCTAAACACCGATTCAAACAAAAACGGATACATAACCTCTCAGTAAGATAAGACCTCCCCCATTTACGGGGGAACGTTTTAATCCTGACAAGATAATTCAACACGACTATTAATACCTGTCGCGCGTAACGCATTACGCACCAGCGTTCCGCAATAGAGAAATTCCGTATTGATACCAGATAATTCCCCCGTCAACGTTGCGTCAGTGGTTAAATGTGTGAGGGATTTTTGAGAAAATTGAGGTTTCTTGAAATTTTTGAGGGGGTTTGCGGTATACAGTCTTCTGTTTATTTTAAACTTTTTAACAATGTCCGTAACGTAAACGGTAGTAATTCCAAAGCGGCTAATAAATAATCCACCATGACCTCATCCGTCCAAGAGGTGGTTTTATCTTCTCTGCACAAATCATAGAGATATGAAAGTAGTCGATGTTGCAATTCATTGTAACAGCGTAGCATTTTCGGATGATCTAAATCATCTGTTCCTACACGGTAACTACCACGTGCATCAATCGTTAATGCATGAGCGACTCTACTCCAATAACATCGCCGTTGTGCATCGTCCAATGACGCGAGTTGTTTTTTCAGTATTTGAATAGCTTCTTCTTTTGTCACTTTTTCCACCTATAAAACTCAGCTACAAAAATATTGGTATATCTAAATCTGGGAGACCTT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57 | Mycobacterium_phage(25.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
3107520 : 3173279
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP012373|3107520:3173279|DBSCAN-SWA 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53 | Paramecium_bursaria_Chlorella_virus(20.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
3351400 : 3419004
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP012373|3351400:3419004|DBSCAN-SWA 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50 | Wolbachia_phage(30.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
3434710 : 3511561
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP012373|3434710:3511561|DBSCAN-SWA 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56 | Tupanvirus(25.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
3774717 : 3832549
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP012373|3774717:3832549|DBSCAN-SWA AATGCTAACTTGCCCTAGTTGTAAAGTGACACATATCGTGAAATATGGAAAACCCCACACAGGGACACAAAACTACAAATGTCGCGAATGCGGACGGAGATTTGTATAGTAACCGTCATTTGTGAAATACGATAAAAATTAATATTTTTTAATCAAAAGATTGGAAAATATAGTTGAAATATAGACAGGATAATACAGAAGGGAAGAGAAACAACGCGGTTTAAGGTGGGGGAAAATCAGCGATGTGGAGGAAGACATCGCTGAGTATTGTATGGCGGGATATAGCGGGCGGGAAATATTCGGGGTAAATTCATTACTTGTAAAAACAACATCATTATTCGTATTCTCCTTTTAACCAATCACATAAGGTGCGTTTTAACGATTGTTTATCGCTCATCCGTTTACCTGTTTTGGATTGTTCGTGTACGCCACCTTTACGCAAAATGGGGGCGCGAGCAATGGGGTTGTGGACAACTTGCCGTTGTTTGGACGGCATGGCTTTGTAATTGGGCATAGCTATTTTCCTTGTAAAAATAATACCATCGATAATCCAGTGTGTGCGTGTATGGTGATGACATAAAAACCTCCATTATAAAAAAAATGTTAAACATGACTTCCCGCTTGTCGTGTGACAACAAGCAGGAAGAGGACTCACTAGACTTATTTAATTCTTGCTTTCAGAGATACCAACTTCTTTTGCGAATTCCAATACCTTACCATCAGGTTTATCGGAGCAGGCTTTTGCCAAGTTGTTGACAAACTCACCTAATGACGCAGGGTCAAAAGAAGTGTCGTCTGTTACCCCTGATAAATAACCATCTAACCAAAACAACATCATAGATGCCGTTTCTTTATCCATGCCATCTAAATCCTTACAAGTCATGTTTTTTAAGTCCACTGCACCAGCGGCATTGACTAAAGGTGTTGCGCCTAAGCAAGCCAATAAAGCAATTGCACCGAACAACTTTTTCATAAACGACTCCGTTAAGATGGTAAATTAAGCATAAGTGATAAACAGATAACATGCCGTTATCCGTGCATTTACTCTAGCATAAAAAATGCCGAGTAATAGCGGTGTCCTCATAATTTTTAGTGGTGAACTATTAGCGATAACATTATGTATTTTGAATCTGAGATGTTTTTCACTCATAAGCACGTTAAAATCTATGGTAGTGAAAAGATTCCTTCGCAATTTCCTTGTTTACGTGCTTCTCTTTGCTGATAGAAAGGGGTGAAGAAGGAAAAATTCAGCCATTATTTAGCATTACTCAATCAATCTATTCTTTCATAACGCTTTAGGATTCATGGAATGCACTTGCTTTCGCGTTGGTATGTTCAAGTTTTTTTAATAATAATTGCCGTTATTGCTGTTTATGCGCAAACCGTAGATGTTCCGTTTTATTTAGATGATTTTTCATCGATTCAAGAAAACCCCGTTATTTATCAGTGGAAAGGCACGCTTGCTGAGTTATGGAATTTTTCGGCACTGCGTATTTTGGGGTATTACACCTTTGCCTTAAACTTTCAAACTCATCAGTTTGAACTTTTTGGCTATCATCTGGTCAATATTACGATACACGCATTAGCGGGCGTGGCTGTTTTCGCGTTTGTTCGCAGTTTGATGCAGACACCCACCATGCGCCATCATTTATCCGAACAAAGTATATTATGGTTACCCATTCTTGTTGCCTTGTTGTTTGTGTTACACCCGCTACAAACGCAAGCGGTTACTTATATTGTTCAACGTCTAGCGTCGCTCGCTGCGTTGTTTTATATCGCCGCATTAGCCTGTTATTTACAAACCCGTTTAGCAACAACCGTTACCAAACGAACAATATGGTTAATAGCTTGTTTAATCTTATGTGTTTGCGCTTTTTTTACCAAACAAAACACGGCAACGCTTCCCTTAGCCTTTCTCTTATTAGAATTACTCTGTTTCCCCTTACATATAAAACGCTTAAAAATAGCCGCAGGGGTTATGGTACTTGGATTAATAGCAGGGGCGGTGTTGATAACCATTATCTTGGGATACAACCCTTTTTCTTTAGAGGCAATGCAAGCACTTACCCAAGAAACACAAGAAATTTCGCGTCTAATTTATTTAGCAACACAATTCAGTGTGTTATGGGCGTATATCGGATTATTTTTCTTTCCTGTTGGACAACACATTGATTATTTTTATCCACTAGCCACCAGTTTTTGGAATGGACAAGTTTTGTTTGCTTTAGCAGGACATTTAATGGTAATCGGTTTTGCACTTTCTCAAGTAAGACGTTTACCCTTATTAGTTTTAGGCATTTTATTTTATTACCTTGCTCATCTGGTTGAATCTAGTGTTATACCCATTACCGACGTTGTTTTTGAACACCGCACATATTTGCCCAATTTAGGGCTATGTTTACTGAGTGGATGGTTTTTATTAGAAGTGGTCTTTCAATGGTTTGACCAACGACATACCGTTATTCTTATTAGTATCATACTAATAACATTAGGTATTACCACATGGCAACGTAATCAATTATGGCGTGACCCCATTGCATTATGGCAAGACAACACCACAAAATCGCCCAAAAAAGAACGGGGTTGGGTTATTTTGGGTAAACACCTTATTCAAGCAAATCGCCCAACCGAAGGATTACAAGCCTTACAAAATTCAGTAACACGGATTACCAACAGTGACGGCACCCAATCTGTGCGTATCACTGTAGAAACCATGCTGAATATGGTTGTAGCGCATCGCATGTTAAAACAATACGACCAAGCGAATAACTTAATCAATCAAGCCCTCAGTTCGCCGAGCTTGCGCCCATTTGACCGCGCTAAATTTCTTGTTAATCAAGGAAATATTTTTTACGAACAGCACTTATATGCAGAAACAGAAGCTGCTTATCGTCAAGCGATTGAATATTATCCTGAAGGCTTAACCGCGCGAGCCAATTTAGCCAGTATTTTGGCAGCAACTGGTCGCGAGGCAGAAGCGATTAAGATATATGAGGAAATTCTAAAAATAGACCCAAATAATGCGATTGTGTTGGAAAATCTCAAAACAATCCAATCGGAACAATACTCATCGGTAGGTACTACAAAATAACCGTAATACCTTGAGACTGAAAGAATATGGATAACACCGCTAGAGGCGATGATATCCGTATTCGCGGTAGGGTGGGTGTTGCCCTGCCACGTCTTTATTTAATAGTATTAAAATCATGTACTTAAGCTATTTTATAGCGACAAGCCAATTAATGAAATCCCAGAAAAATTAACGCAATTGTTTTTGCGTAATCCCACATGTTCCTAATCACCGCGCAATCCGCCCGACAAGGCTTTATATTTTTGATGTAATAGAGAGGAAATATAGAGCCTGTCATCAAATAAGAAGGGTTAAAGGTTCAAGCTAAAAGAATCAAGGTAGAAGCCAAATAGACCCCACTTAAGAAATTCCTAGCGCGTTTATCATATCGAGTAGCTATTGCACGGTATTGCTTTAATTTACCAAAGAAATGCTCGATTAAATAACGTGCCTTATAAAGGACTTTATCATAATAAGGTGGATTTAAACGATTTCTCTTGAACGGAATCACAGGTTCTATGCCTTGCTGTTTTAATACACTTCTAACTCGTTCATCTGCATCATAAGCCTTATCAGCCAATAAAGCGTTTGCCTTTATCTGTGGAATAAGGACATCAGCCCCTTCAAGGTCGCTTGCCTGTCCCGCAGTCAAAAAAAAAGGGTCGGATTGCCCAGTGCGTCAACAACGGAGTTAATCTTGGTACTTAACCCCCCTGCACTACGCCCAATGGCTTCATCCGCGCCACCGCCACTATAGTGCTGTCTATCATGGCATATTCGTTATCAGCATCGGCACTTAGTATCTTGAAAACACGTTCCCAGACACCTTTCTGAGACCAACGACTGAAGCGGGTATGGACAACACGGAAATCACCAAAGCGTTCGGGAAGGTCGCGCCAAGGAATGCCACTGCGATAACGGAATAGAACAGCATCAATAAACAAGCGGTTATCTTTAGCTGTCATTCCAACATGTCCTTTACGTCCAGGGAGTAGCGGTTCTAGTTTTGACCATTGTTCATCTGTTAAGGCATAACGACGACTCATTGTTTTATCCTTGGTGATATCTGGATATATACTTATAATATAACATTTTTTACTATTTAATGACACGCCCTAACTGTTGAAGGTATTAATATGACCGCTTGTGAGAGAATAATTGACGGTGTAGCCAAACTTTCAACTGTATTTACTCCCTAAAATAAATGATGGAGGTGCTTTCTTGAATATCGGTGAATTATCTAAATTAGAACATCATATTATGTTTCATATTTTAAGTAGTCATTTTGGTGAAACAATGGCAAATGTTGTACTTCACCAACTCATTGTTAAGGAACGCACATTTACTACTTCGTCCATAATGCCAAGTCTTTGTTCGGGTTCATTTACAGATTTTGAACCATTTGATAACTCACGTTTGGGAAAATTAGACTGCACATATTATGCTGATGCCGAACATCCCTTACTTCCAGGAACAGGTTGTAGCATTGTTTTATTTGCAACGGAAGATAGAACCTCATTTAATTTTTTAGAACTTAGTTTTTATGGGGAATCTTTACCTATTGATTTGGTAACTGCTGAGTTACATGGTTTTACAATAATTACTTATGACCCCCTGATTAGTCGGGATTTGTAACCCTAACTAACATTAACGCACCATAATACACAGATTTTTAAGTTATTTAAGCGTTTTTTAACCGCCTTTTTGGCGAACTAAGCGCGGAAACCGCACTTTGTGCCAATAATCCCCTGTATCAGGTTTATTACACTCGCGATAAAGCAGGACGAATTACCCAGAAATTAGAAACGATAGAAGGCATTACCCACAGTATTGATTACAGTTACGACCTCGCAGGACGCTTAATTGAAGTCAAACAAGACGGCACAGTCACAGAAACCTATCAATACGATGCCAATGGAAACCGCCTCAA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50 | Morganella_phage(58.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
3875646 : 3931915
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP012373|3875646:3931915|DBSCAN-SWA 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45 | Hokovirus(20.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
4202829 : 4252878
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP012373|4202829:4252878|DBSCAN-SWA 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43 | Streptococcus_phage(12.5%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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