Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP011386 | Lactobacillus helveticus strain MB2-1, complete genome | 5 crisprs | cas14j,cas3,Cas14u_CAS-V,cas14k,DinG,DEDDh,cas2,cas1,cas4,cas5,cas7,cas8b2,cas6,csa3 | 3 | 8 | 13 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP011386_1 | 372695-372830 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP011386_1
|
2 spacers
spacers of NZ_CP011386_1
>1.1|372719|27|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder TGAAGCGTCTAAAACCATTAGAAAACC >1.2|372770|37|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder TTAGCTCAGCGCAAAATTACGCTCAGTACAAAAGTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP011386_1
The CRISPR arrays of NZ_CP011386_1 >merge|NZ_CP011386|1|372695-372830|CRISPRCasFinder TATCCCGTCTAGCTAGGGATGAAATGAAGCGTCTAAAACCATTAGAAAACCTATCCCGTCTCATTAGGAATGAAATTAGCTCAGCGCAAAATTACGCTCAGTACAAAAGTATTATCCCGTCTCATTAGGGATGAAA >NZ_CP011386|1|1|372695-372830|CRISPRCasFinder TATCCCGTCTAGCTAGGGATGAAA TGAAGCGTCTAAAACCATTAGAAAACC TATCCCGTCTCATTAGGAATGAAA TTAGCTCAGCGCAAAATTACGCTCAGTACAAAAGTAT TATCCCGTCTCATTAGGGATGAAA
>NZ_CP011386.1|WP_146042801.1|372573_372675_-|hypothetical-protein MSRCYKPPVRGMHPHCRKFGSDSAVKNMYKPPV >NZ_CP011386.1|WP_046813869.1|371433_371652_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKLTDQQVTAIKRKRGELDLSITSLANATGVSKWTLIYIFKHDHRNVNSATFKKLNDWLVNQYNHDLVKEVN >NZ_CP011386.1|WP_046813868.1|371010_371433_-|hypothetical-protein MSETMQSNKSKVSAQMTLNLDGLTFPSRDAKLTSIEKRVYNLLSTGKENARPSSYFTEILGISRRNLSDVVKRLKLKSLDVGSTRDDGYYKFKDVQEYLDFMSRDAHELAERNKVHDAMRSTPLGRKLFADMNQESKEEN >NZ_CP011386.1|WP_046813867.1|370705_371008_-|hypothetical-protein MKQSKDKEITINDAIIGLKQLDDPVFGSISYRNPCTTVTIRTHDRVIKTTLEQIRIAVFKFNAETFGFIFKNQWFCNQKEFDKWNAKTKRLASHELKANF >NZ_CP011386.1|WP_080948189.1|370110_370686_-|hypothetical-protein MTKYLINNDDVIRIGQKLYQLSSNSPETDFLKCKDASKDYEERLIENDINAEIFHDGNDQNTTALMQGDLVQSKQESDLKFILISTRLMPLQEAKYALDAYSKNQRPNVVKIPNPKPTLKASKQYDKRDHRMTKDIDTLKALVDNAENQGWETIDGVNYGASHTWREVAQLALDLADQQEWFDRYDNKYFN >NZ_CP011386.1|WP_118953649.1|369774_370035_-|DNA-binding-protein MKDGLKQATNTRPYLNRKEIAKYFGVAESTITFWASLGMPVAVIDGRKLYGKQSITAWLKAHEMPSQKAMEQTKKPLTIGVVKDVQ >NZ_CP011386.1|WP_046813865.1|368196_369690_-|HTH-domain-containing-protein MFLFRKAVKHEMNNVKSEKTNINPNLHIPTALIKNYSLSGLALLVYGELNGLYSKHKQCFITDKALSERLNRSIASIQRAIRDLKNLGLITSKQKPHFKGRLVTVPPLNAKKFLLIPVAIVRNHDLSIGAMLLYGSLYSRQKKLIKINTDKYQEDAPLIICVTKSELADEFRKTSRAIGYQLKELEKNKYINLISNKGINVEITLVPLKMTSILSGSDKKGENDIYTAIKFGQKVRSSTGTTDDYSPNNLGKKRASTYEKYVVPPRKKMSIDLGKKRETNRTLIKINKGENYSFSSSNKDQRGAVDPFDPFEVGEPLKEPVYYDSIPNANDAPPIQQENESLEDIAKLEADLNELDQRSAQRVKATKTGKGGSEVGTKDKQQDQPSTQQAKATGTGNTTSSNNASKPKQQKSQYEPYDGINLEYQVKELQEMLRCKTNRRYIITSQQKPLIQQRLKEGFTLYDFEKAIDYLIQQKQSISAKELVINISNYLNKINSN >NZ_CP011386.1|WP_046814581.1|367949_368144_+|hypothetical-protein MDNLASFLSSLTYWQTINLYITLLQARSNISFNDAKKQAIVNYSNASNLKKMLNESLNSPSPKE >NZ_CP011386.1|WP_046813864.1|366094_366628_+|hypothetical-protein MIRMKKKKNETLKITWIMTAVYWVVGLLCMFWGKLDHVFSGQLKDINNVYALTLLIVLILPLLFSILLSMKVKPPRLICNPLVTVIYLLVVIAAGMAYYFQNIIGYFFPIILFVLMAFLAIFYALFKTFRNKKKGKYYFIDGKDREECRNFWDAYKQYYAMGLTSGIIEGLLSAVFK >NZ_CP011386.1|WP_080948188.1|365705_365798_-|putative-holin-like-toxin MSVYDCISLILLFGMFVLALLTYIDHHDKK >NZ_CP011386.1|WP_046813870.1|372945_374097_+|site-specific-integrase MNNDIKEYTTPSGKKRYKFAIYVGKSEVTGKSIQARKRGFKSYEDALKCYALISSKIADNTYTGLEIKNHKVSDVYRVWLESYKDTVKTSTLVNVKQFFKNHILKDLGSYYIERLTPFKCQRVAQKWALELPKTFNALIIYSNKLLDYAVRFDYIRKNPMRMIIKPKKQAEHKEFTDFYTKQELNAFLKASKNENIKIYTFFRLLAYSGMRKGEALALKWSDIDFTSNTISINKTVSIGNKHRVVVNNTTKTKRNRAISMDARTMQLLKEWRFQQRQDLLRLGFNPFDKEQVVFQNFDNEVVRPNLVAVWNKRICDKNGLRRIKIHGFRHTHASLLFDAGVPMEDVKQRLGHASIQTTMDIYTHVTKDKQDKTALSFAQYMEN >NZ_CP011386.1|WP_003627770.1|374333_374618_+|co-chaperone-GroES MLQPIGDRVIVKVKDEEEKTVGGIVLASNAKKKPTEGEVVAVGEGAYASNGEKIPMSVKKGDVVLYDRYSGTNVEYEGEKYLVLHEKDILAIAK >NZ_CP011386.1|WP_003627769.1|374671_376294_+|chaperonin-GroEL MAKDIKFSENARRSLLKGVDKLADTVKTTIGPKGRNVVLEQSYGNPDITNDGVTIAKSIELKDRYENMGAKLVAEAAQKTNDIAGDGTTTATVLTQAIAREGMKNVTAGANPVGIRRGIEKATKAAVDELHKISHKVESKDQIANVAAVSSASKEIGALIADAMEKVGHDGVITIEDSRGINTELSVVEGMQFDRGYLSQYMVTDNDKMEADLDNPYILITDKKISNIQDILPLLQEIVQQGKSLLIIADDITGEALPTLVLNKIRGTFNVVAVKAPGFGDRRKAQLQDIAALTGGTVITEDLGLELKDTKIDQLGQARRITVTKDSTTIVGGAGSKEAIDERVDTIRKQIEDSTSDFDKKKLQERLAKLTGGVAVIHVGAATETELKERRYRIEDALNSTRAAVDEGYVAGGGTALVNVEKAVREVKGETTDEQTGINIVLRALSAPVRQIAENAGKDGSVILDKLEHQENEIGYNAATDKWENMVDAGIIDPTKVTRTALQNAASIAALLLTTEAVVAEIPEPKQAAPQGGAGAPMGM >NZ_CP011386.1|WP_153245832.1|376475_379052_+|DNA-mismatch-repair-protein-MutS MMEQYYEIKKQYPDAFLFYRVGDFYELFEDDAVKGAQILELTLTHRSNKTKNPIPMAGVPHMAVDTYVNTLVEKGYKVALCEQLEDPKKAKGMVKRGIIQLVTPGTMMNEGPNDAKDSNYLTSVVTTKSGFGLAYSDLSTGEIYSTHLKSFAAVSNELLSLRTREVVYSGPLTEQNKDFLHKANITVSAPTPIEGEHAEISYVEQNLTNGAEKSATRQLVGYLLSTQKRSLAHLQIAKSYEVNQYLQMSHTVQNNLELVASAKTGKKMGSLFWVLDKTHTAMGGRLLKQWLARPLLNVDIINHREKMVQALLDGYFTRENIIDALKGVYDLERLTGRIAFGNVNARELLQLSRSLQAVPVILDALNQSDSDVLIDFAKKIDPLKGVAELISTTLVKDPPLLTTEGGLIRDGVDKQLDRYRDAMNNGKKWLVQMETDERQKTGIENLKVGFNKVFGYYIQVSNGNKSKVPLDRYTRKQTLTNAERYITPELKEHENLILEAQTRSTDLEYDLFVQLRDEVKKYIPALQKLGNQLAALDVYCSFATVAEQNNYCRPSFHTDSQDIDVVNGRHPVVEKVMTAGSYIPNDVKMDSATNIFLITGPNMSGKSTYMRQMALIAIMAQVGSFVPADSAALPIFDQIFTRIGAADDLISGQSTFMVEMSEANDALQYATKRSLVLFDEIGRGTATYDGMALAGAIVKYLHDKVGAKALFATHYHELTSLDETLDYLKNIHVGATEENGKLIFLHKILPGPADQSYGIHVAQLAGLPRTVLREATKLLKRLEAQGSELAPVSQQLDLFAQPEAASDEVDDNDSENSPMTDAEQEVLDDISNLYLADKTPLQIMQMVANWQKDLKDDK >NZ_CP011386.1|WP_046813872.1|379051_380962_+|DNA-mismatch-repair-endonuclease-MutL MAKIHELSENLTNQIAAGEVIERPASVVKELVENSLDAGATRIRVDFIDAGLKQIVVQDNGTGIARDQVDLAFTRHATSKISNEHDLFKVSTLGFRGEALASISAVSHVEIVTATENAIGIKADFSGGSKKGQEDAASQKGTKITVQDLFFNTPARLKYLRSPRTEIMKIVDIINRLSLGYPHVSFTLSNTGKVLFRTTGNGNLKQTVANVYGRHIAEKMESFEAKDSDFKITGLMSKPELTRSTRNFISILLNGRYIKNFQLSNAIMDGYGSKLAARHYPIVVIAIHVDPLLVDVNVHPTKQEVRLSKEKELSRLITGAISDALLDKTEQSSGFANLENKRETLVDQLEFNLNQDVVNTTRKMPEVHEEAEKPEFLVKQEAKNSEEPKNETEHNYVDINIPREDDQYIITKTWDKNVALQQKLMPFSNKKVDQEVISTGDETLANNLPRLAYVGKIDTYLLAENDGDLYLIDQVAARRRLQFEQIYQTITSKKIVQQGLLTPIVLEFGNLDFLQIKDKIYQIKQLGIYLDEFGQNSFIVRSYPTWIHDHVEESIREILDNYLNLDKGKTQNLFKRVAALEAKRSVKGKINLSAAEGTQIITDLRKTSDPYHDADGRLILVRISQNELRKMFKKGE >NZ_CP011386.1|WP_003627766.1|380962_381553_+|Holliday-junction-branch-migration-protein-RuvA MYEYFEGIVTVITPSYIVVDVNGVGYKVYSPTPFAYQKGDKAKIFIEQVVRDTGITLYGFQSEDDKELFLKLLSVSGIGPKSALAIMAAEDANSLAEAIEQGEVKYLTRFPGVGKKTASQIVLDLKGKLRDYVARLDRQDEEQGNIPPALNDALLALIALGYTQKELDRITPKLEEVNADTADQYIKKGLALLLKK >NZ_CP011386.1|WP_003627765.1|381601_382618_+|Holliday-junction-branch-migration-DNA-helicase-RuvB MVENEDAVTSGEVENSEEEAMELSLRPQTLDQYLGQKRVKKEMSIYIKAAKQRDEALDHVLLYGPPGLGKTTLAFVIANELGVHLKSTSGPAIEKAGDLVALLSDLDPGDVLFIDEIHRLAKPVEEVLYSAMEDYYIDIVIGEGQTTHAVHVPLPPFTLIGATTLAGQLSAPLRDRFGIVEHMQYYTIDELEKIVQRSSDVFHTSIAPEAAHELARRSRGTPRVANRFLKRVRDFAEVKGEKTISLATTEGALKQLQVDDEGLDQTDRRLLRTMIEGYNGGPVGIRTLAANVGEDMETIESLYEPYLLQHGFILLGPRGRMVTDKAYLQLGLPVPGDK >NZ_CP011386.1|WP_153245667.1|382667_383102_+|preprotein-translocase-subunit-YajC MKDLNTLFLANAGAAGGSNMMMIILFIVLIGFTYFGMIRPQKKQQQQRLQMMDKLKKGDGVVLVDGLHAKVDKINSDKTIVVDADGIYLTFERMAVRRVIPAVASVEENDAPAADKTEDTASKEDTSATDTKTTDASDETKEDK >NZ_CP011386.1|WP_046813874.1|383235_384687_+|glucose-6-phosphate-dehydrogenase MRNIPVVMIIFGGSGDLAHRKLYPALFNLYQRGLIHDNFAVIGTARRPWSHEYLREQVSDAVHETHDEVDENSLKHFASHFYYQSHDVTNVEHYETLKKLAQELDDRYCAHGNRLFYMAMAPRFFGTIATHINDQCLTGSGFNRIVLEKPFGHDLASAEKLNKEITASFNEEDIFRIDHYLGKEMVQNIMPMRFTNPLIKNIWSADYIKNIQVTLAERLGVEARGGYYDTSGALRDMVQNHIFQIITLLAMPEPKDLTSAGVHKAKQALLESMIIPSPEEVKKDFVRGQYLGSDTTLAYRQEPNVDENSTTETFVAGKVKFKEGPVAGVPIYFRTGKEFKEKKNRIDIVLKHINNPYGQAYSNKITIEIDPTSKIYITINGKKIDQPGIRRENLTYEFSKSEMAKVPDGYERLLQDVFVNDLTNFTHWSELKRYWEFIDSVEADWQKENETGDAKIAQYLPYRMGPKEANDIFETPTEHWIYE >NZ_CP011386.1|WP_046813875.1|384679_385801_+|DNA-polymerase-IV MNKQNLLPQNDIHRRIIHLDMDAFYASVETQRNPELKNKALVIGQDPRNNGGHGVVATCNYVARKYGVHSAMPAIKAVKLIPKSELVFVRPDFKKYRSVSAKIHSFMHEITDKVESIALDEAYLDVTHNKLGQNLAVQLAIGLQRRIRTELGLNSSFGVSYNKFLAKMGSEYAKPFGRTVILPYEAKQFLGMQKIEKFPGVGPKTQEQLHEMGIYTGADLQKVADFVLIKKFKKMGYFLAQHAHGIDLRPVIADSDTNRKSIGMERTYEPAIYTRDEALTHIRHYCKHLEDELKKRNFFAQTVVIKVRDNDFDTVTKRRKLTKPSNSQYDYYESARELFDKTSSFLEKGIRLIGVTVTDFKKDEYQTINLFDY |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP011386_2 | 531455-531637 | TypeV |
NA
Consensus repeat of NZ_CP011386_2
|
2 spacers
spacers of NZ_CP011386_2
>2.1|531479|60|NZ_CP011386|PILER-CR CCTCCTCTGATTGGTCCATTGGAGCAGTGGTTTATCTCGCCTCCCTGTCACGGAGGAGAT >2.2|531563|55|NZ_CP011386|PILER-CR GGACCGTTTATGGCGGAATTGGTGAAGGGGTTAACACACTGGTTTGTGGATCCAG |
cas14k |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP011386_2
The CRISPR arrays of NZ_CP011386_2 >merge|NZ_CP011386|2|531455-531637|PILER-CR CGCGCGTGGGTTCAAATCCCACATCCTCCTCTGATTGGTCCATTGGAGCAGTGGTTTATCTCGCCTCCCTGTCACGGAGGAGATCGTGGGTTCAAATCCCACATGGACCGTTTATGGCGGAATTGGTGAAGGGGTTAACACACTGGTTTGTGGATCCAGCATGCGTGGGTTCGAATCCCACAT >NZ_CP011386|2|1|531455-531637|PILER-CR CGCGCGTGGGTTCAAATCCCACAT CCTCCTCTGATTGGTCCATTGGAGCAGTGGTTTATCTCGCCTCCCTGTCACGGAGGAGAT CGTGGGTTCAAATCCCACATGGAC CGTTTATGGCGGAATTGGTGAAGGGGTTAACACACTGGTTTGTGGATCCAGCATG CGTGGGTTCGAATCCCACAT
>NZ_CP011386.1|WP_046813929.1|529740_531057_+|IS200/IS605-family-element-transposase-accessory-protein-TnpB MRKKVVPRNKAKYEHLASEYLVAGNSKLDQCSHDLYNRALYDLRQGFFKRNYVKGYCDLDQRFKKRYSARESMLYHSLFYVQSAQQTLKEVNTIWSAWLKAIKAYQANPGKFTGRPRMPKYLAKGQRHVFFVTNQNAKVKDDYLIIPKLGFKLKLTPHLKAIQRVAFKPVYGGYKAIVQYKTNRDIDYLPDNGRYMGIDPGVDNAFACVANIQKAPLLVNGRAIKSVNQYYNKERSRLKALQARYHQLESIVDTQQGKKPVYRETKAMRRITAWRNRKIRQFAHKASKRIVDYALSCGANTIVIGNNKSWKRSSDMGRKNNQNFIGIPHKVMIDMIQYKANLAGISVIRTNESYTSQTSALDHEKPCWENGSQSRKRQGKTPINRRIHRGLFQSNNGRLVNADITGALQIIRKVFPKFSLDEGIEDAVLHPVKWSPLI >NZ_CP011386.1|WP_003627960.1|529102_529711_+|IS607-family-transposase MKAGKVMDLLQISRSTLKRYREKGILEAKKLPTGQYDFDDDSVFLLKNKHSKRLTVLYGRVSTYKQKADLANQMQELSDFAQSKGFQANDSFQDIASGISFKNRKQFFKMLDLILAGKVKRVIITRKDRLSRVGFELFEYLFQNYGTEIDVISDEMNPKTDEQELFEEIISLLHCFSMREYSHRRAERKLFEATLNQKEKTK >NZ_CP011386.1|WP_046813928.1|528499_529000_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MIIKPLISEDEAKETSRLFQKCWQNTYKDILPDVFLDNIPENAWVKRLNESGRHNLIFIDDDNKIRAAVSYGRPRDTRMLGCGELMALYVEPDFQGFNIGKTLLNAAENELKRMGYGKIYLWCIDGDENARQFFEHFGWVNNATEKFVEIAGKEYKYLLYSHKLLV >NZ_CP011386.1|WP_046813927.1|526711_527158_+|hypothetical-protein MINNWVSSSKELQLLVDDYLLTVNYRSVIENDLVNYTQGIESYFRNERLTLRDKINKFIEELPESYRELLSEHVGNTDDWIGKLVSTRVFLTHGDRENMAVSNPYKLVQMTKIFGFMVRIFILQKLGITIDKPKILNKFKNVLTAHYY >NZ_CP011386.1|WP_003626883.1|526149_526353_-|cold-shock-protein MQTGTVKWFNADKGFGFITGSSDNKDVFVHFSAIKTDGFKSLEEGQKVSYDVEQGSRGPQATNVVPQ >NZ_CP011386.1|WP_003626886.1|523309_524101_-|carbon-nitrogen-family-hydrolase MQMKIKVALAQFNIQFADPDKNQQRVAELTSIAAKAGADVIVFPEMWNIGYALNQLDRLADDGGRTTTKLFYRLARQYQISIVGGSVAVKEGGHFYNRTLIVDPLGQVVGKYDKVHLFRLMNEHRYLTAGNQENYFRLAGVPSASFICYDLRFPEWIRTVARHGSAVLYFPAEWPAVRIPQWTTMLKARAIENQAFVVAVNRVGDDPDNHYNGHSLAIDPLGNVIADAGENDGITYAELDLTQLATVRGAIPVFVDRRPDLYK >NZ_CP011386.1|WP_046813926.1|522110_523289_-|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase MEFQQSKLLGRLPKQFFASLVAKVNHKIESGVDVINLGQGNPDKPTPEYIVKATQKWVADPATHKYSPFQGLPEFKQAAADFYAEKYGAHFDPEKEVAILGGSKIGLVELPWALMNPGDTYLLPDPGYPDYFSGAALGGVKFETVPLLAKNNFLPDLKAIPEAVAQRAKFFYLNYPNNPTGAVATKKFYEELVSWAKKYHVGIISDFAYGALGFDGQAPRSFMQTPGAKDVGIEFYTFSKTFNMAGWRIAFAVGNQDIIGALNLIQDHLFVSLFPALQRAAIDALQGSQRDAEIAKIVGRYEERRNAFVDAAEKIGWHAFVPKGTFYAWMPVPAGYTSESFADLLLDKAGVAVAPGNGFGKHGEGYVRIGLLIEPARLKEAVARIAKLHLFD >NZ_CP011386.1|WP_046813925.1|521129_522092_-|2-dehydropantoate-2-reductase MTLKYTVLGAGAMGLRFGVLLQELAGAKVDFVDNWAPEVKTIQQQGGVYVSRDHEDRHLVPIKIYSPEDYHGDPDVFIVFAKQMTLADLLKRSAHFFHPDHQYVFSGMNGMGHIEKINQYFPKEHVVAGTCLIGTVLNKAGDVDFIGKSGAGSINMAAQTEKADDRVKQIVADFTAANINPHLNNNFLGTLLTKVVFNSVINTICTLFEIQMGQFIDYDGSEKLGKQLINEAYDVAERAGIQLLSTREEEWQTIKYVSSVTNPLHYPSMYQDMSKDRPTEVDYINGYIYQLGKKYNYEASTHDFLRNLVHLAENTRKFRK >NZ_CP011386.1|WP_046813924.1|518339_519692_+|23S-rRNA-(uracil(1939)-C(5))-methyltransferase-RlmD MEKNQIIDLEITDLSYEAMGVAHYNGMTVFVTNALPGEVVSAKILKVKKNFAFAKIEKIKKESPDRVNVKLNQGVQSGLASLAHIKYDKQLDFKRNQVVNLLKKAHLENIEVGETLASPEEVGYRNKAQVPVREVNGQLEIGFFRRHSHDLMPLTHFFTTDSEIDRVLVAVRDILRKYKVPAYDEINNNGEVRYLEVRRSKSTGEMMVILVCLHKDFMQLPNVAAEVSQIPGVSGLILNHNPKKTNVILGPKDYLVFGNDQITDQIGDLKFRISPQSFFQINSLQTPRLYNLAIKQADLKPDDVVIDAYSGIGTIGLSVAKHVKAVRGIEVVRDAIKDAKDNAKLNDITNAKYYLGKAEEIMPRWAKSGLKTDVVFVDPPRKGLTPEFIDAAVKTGPKKIVYISCNPATLVRDLQLFQEKSYEFNRIDPVDMFPQTPHVESVTVLERTEK >NZ_CP011386.1|WP_046813923.1|516598_517975_-|Na+/H+-antiporter-NhaC MKKEKVSFTESIIILIALLAILGISVIKFGLSPEVPVLFTVLLLTFWARFRGFTWKDVQDGIKEGIGVAIIPIFIFILIGALIGLWIKAGIIPSIMVLGFHLISGSFFVPSVFIACAIVGVAIGSGFTTISTVGIALFGIGASMNANLALVAGAIISGAVFGDKMSPLSDSTNLSSAVAESELFAHIKNMMWSTIPSFIVSLILFWILGNSGHMDPTKIERTSHVLQTNFSISWWAVVPIVFMLLCAWRKVPAIPTLFINIAATVIMIFVQNPHESVQSLNNLIMNGFVAKTSDASVNALLTRGGISSMMATVALIISTLSLGGMLMKFNVVQSAMEPLVKHLRKPGRLITVTILSGICINLFVGEQYLSVILPGRAFKPAFDKIKLSPLALSRVLEDGGSVINYLIPWGVAGSFAATTLGVPVLQFLPFVFFSLLSPVFSIISGFTGIGLKWAKDKK >NZ_CP011386.1|WP_046813930.1|534850_536179_-|uracil-permease MSKKENFRNPDAILDVYEKPEFGQGVLLSLQHTFAMFGSTVLVPILIGINPSIALLSSGIGTLVHMILTHFKIPAYLGSSFAFVATMQALMKADGYPAVAQGAIASGLVYVIVALIIAKVGSGWVNKVLPPIVVGPIIIVIGLSLATTAANDAMMNNQKYDLTYFGVAIFTLVMTLVFQMCFKGFTSLVSIMLGIICGYVLACLLGIVDFSGVEKAAWFSIPSLDVMGISYHFKWYPAAILAMAPIAFVTMTEHMGHIMVLNSLTKRNFFKNPGLHKTMMGDGISTIIAGFIGGPPTTSYGENIGVLAMTKVHSVWVLAGAAVCAIIFSFVGKLAALIESIPMPVIGGISFLLFGTIASNGLKILVDDKVDFGEKRNMLIASVILVIGIGGAYLQLGNFQLTSVALSTIIGMILNWVLPKKAASEKALEEKNKQKQDGKIYQ >NZ_CP011386.1|WP_020829065.1|536191_536722_-|bifunctional-pyr-operon-transcriptional-regulator/uracil-phosphoribosyltransferase-PyrR MAKEIIDAIGMKRALMRMTYEIVERNKGTENLVLVGIKTRGLYLAQRIAANLKKLEDVEISVGAIDVLQYRDDLPESKKEKMIHNQQLDFDITDKNVVLVDDVLFTGRTIRAALDALMDQGRPAKINLAVLVDRGHRELPIRPDFIGKNIPTAMNEEVKVSMTEVDDKDSIELINK >NZ_CP011386.1|WP_046813931.1|537012_538482_+|MFS-transporter MNKKQLFMVTLALLLANIMSGLDATIINTAIPAIVSDLHGIQYMGWIVACFLLGMSVSVPIWGKLGERMGNKFAFELSLALFILGSLLEGIAPDIYFFLIARILMGVGAGGMGSLPYVIVGYIYPNIKRRTVILGYIAASFSAASIAGPLVGGWIVDTLSWHWVFYINVPLGLIAIILSFVYYKGIRKPNKNTQFDKLGAFTLIAGLTSFLIGIQLLGMVSLPVVLGFIILGILLLVVFIRAERKAKSPVVPLSVFTNKALVGDFLIFALAWGSYIAVNTYLPMWAQAILGASALVGGMTLIPNSIVDIVGSQTAPYFLRHVNNYHLLIANLTIMAITAVGLILAPISTPYQILALIAAFSGFGVGSIFVILQIKVQVDASEKDMAPATSLSFLIRILALTIMAAIYGVIMNLALGRGIAGHPGITMTMMNKLIDAESAKSLPVQLLPTMRKIFYGGIREIMIVSLVLLVAAYVVNYLYNRHEEKIMAE >NZ_CP011386.1|WP_046813932.1|538435_540172_-|IS1182-family-transposase MYQNYTTGQTALTLNLDFTIPNNHLANTISCFVDSIPEDVLLGDTAKTGRPAYHPAMMLKILLFAYSRRVFSGRKIELMLEENLPMMVLAEKQKISYHTINNFRSGDHANELVKKSFLYFTNLLEAEGLINEGAIFIDGTKIEADANRYTFVWRKAAEKFHEKLKGQAVELYDELIAKEVVKAMAQEKVQTSQGLEELAQETEDEIEKLTKEIEQEPKAIPGGSLRKARRRGLKKLLHRLKKDYVPRMKKYEEAEEIFAGRNSYSKTDHDATFMHMKEDHMKNGQLKPGYNIQAATTDQYVVGFALYPNPTDFKTLEPFLKQMPILDKFDKIVADAGYGSEYNYSMLEKEYPDKKYYIPYTMYEKEKTRKYRNDPTKLANWFYDEKDDYYLDQNGVRFNFKYYSQRKDRSTGQVRDFKVYEADEFQLTPELERLAKTKSGRQRQVRYNPNWQYLKEKAKEVLQSPEGRHIYSMRKYDVEPIFGHLKNVFGMRRTHLRGKKKVETDVGIAFMMMNLSKYWNRRWSKDQFSLFKNKNREKKRPIKLKLRVELIVFRYLRVGYFPDTILPLFFLHGGYKDN >NZ_CP011386.1|WP_046813933.1|540317_541523_-|multidrug-efflux-MFS-transporter MKEKPIWKKNLFVLSIAVFIAGIAFSEVMPFLPLYIDTLGKFSHQQLNFWSGFIYSGTYLVSALISPWWGKLADKKGRKPMTLRASLGMAIVIGCMGLVTNVYQLFILRMLQGVFAGFVSNSNALIATETPKEKSGQALGTMASSFTAGNLLGPFIGGALASIFSYRVTFFITGGLLLISFFLSLFFVHETDFKQVTEKKLATASGIIKELRSPQLIFGLLLTTLIIQAANNLINPIVSLYVKQLMANHGNVVFISGVIAALPGIATFLAASRFGALGDRIGTHKIIVGGFIGATILFFLTAFVQNTVELGILRFLVGFTDACLFPQVQTLLTKNTPAKITGRIFSWNQSAMYVGNIFGPLLGSTISGLTSYSMVFIVTAIIVVFNLILFKFNVINNLRQK >NZ_CP011386.1|WP_003633113.1|541649_542732_+|M42-family-peptidase MQKEQEIQMLKEFSDANSTSGFEEEFVKLFTSYAEKTANIEVDGMLNVYASKKENKGDRPVIQLDAHSDAVGFITQAVRPNGLIKFVPLGGWVKYNIPALKVKVRNRDGEYIPGVVATKPPHFMTAAERNNVPDVVDMSIDVGSSSREETIKDYKIDTGCPIFVDVKCEYHEKSGLFFGKDFDDRFGAGAMIDVLDNLKGEETNFDVVAALSSQEEVGLRGAYVTARKVKPDLCLVLESCPADDTFTPDWLSQTGLKRGPMLRDMDTTFLPNPKFQQYACDLADKNNIPYTRSVRTGGGQDGAAIYYENGAPTIVIGIPVRYEHSPYCFSSYKDFKASVDLATAIIRDITQEKLDSFKKF >NZ_CP011386.1|WP_046813934.1|542836_544459_+|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MITVSDLSLKFGGRTLYEDVNLKFTPGNCYGVIGANGAGKSTFLKLLEGKLEPTTGSISIDPNERMSSLNQDHFAFEDFTVMDTVIQGHKELYQVMKEKDALYAKPDFGDEDGVKAAELESKFAELDGWNAEANASKLLQSLDIPESEHQMLMKELPESEKVKVLLAQALFGNPDILLLDEPTNGLDVHTVEWLENFLADYPNIVIVVSHDRHFLNQVCTEMCDVDRGKIQLYVGNYDFWYESSKLANELVANQNAKKEEKIKQLQEFIARFSANASKSRQATSRKKQLDKITLDDIKPSSRKYPFVKFEMHRDLGNDLVKVENVSYSVDGEKILDNVSFIVRPGDKVAFLSRNALATTALLDIIAGKIKPDTGTVTWGQTTAFNYMSRDLNANFNNDDLTILDWLRQYATKEQDDNTFLRGFLGRMLFSGEEIEKKIKVLSGGEKVRCQLSRMMLESANVLIMDDPTNHLDLESITALNDALVAYPGSILFTSHDHEFIQTIANHIIEVGPKGIVSRQDTTYDEFLDKESIQDQVEKIY >NZ_CP011386.1|WP_046813935.1|544735_545407_+|hypothetical-protein MDNLPFSSVTGKLDNIPFNYDHAGTKEVVVNNVIGDYFNPVTKKYEISDHTFVVGHIKDSNLDQDIAIEQMQQAAMNIINELNKRQMPPHMVMSHLLTDVEKAKQVVTDDDVKISQLSKETGISEEILSDYRENPATLKKASNSTIERLITKYYEKYFNRNEIEKFRFMLIKTVMAYLKENKKDEIDYDPVYELYKLCQQADWHRLARMEEIWRAFYTVDNQH >NZ_CP011386.1|WP_046813936.1|546129_546948_-|transporter-substrate-binding-domain-containing-protein MKKRFFLSTLLIGIALFTLSACSQNKKQNVYQTVKSTKTINWGVKADTPLFGSMNIKTGKINGFEIDLAKALTKEMLGKNAKANFVTTTANTKIQLLKNRNVDAVIAAMTITPEREKQVDFSKPYFPAGQSIMVAKNNKIKNVKDLNNKKVLVVKGTTAADAVKKFAPKAEILQFDDYGQAFTALKADQGDAFVTDNGILVGILRDSSGYKLVGGNFTNQPYGIAVNKGQTEMDKQINLALTKLEKDGTYNRLLKKWFGNIPGFNVKTAEKY >NZ_CP011386.1|WP_012211536.1|547089_547551_+|MarR-family-transcriptional-regulator MKISESEKLNMAIVHGNRAYQQWDQDHELSDYLSVILYELLLRKKLTQKQLVGLTDLPKQSINKGIKILHDSGYLAMSVDPHDKRVRFCELTAAGNKYAKQKMQSLFRLEEQTAQKLGSEKMQLLTDLLTEWSNTFWDFLNEERSKECKHSKS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP011386_3 | 741665-741768 | TypeV |
NA
Consensus repeat of NZ_CP011386_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP011386_3
>3.1|741700|34|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder ATAAAAAGGGTGAACGAATCGTTACCCCCTCTGG |
cas14j |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP011386_3
The CRISPR arrays of NZ_CP011386_3 >merge|NZ_CP011386|3|741665-741768|CRISPRCasFinder GTTTAAACTGGCTTGCTTATTTTAGTAATTAATACATAAAAAGGGTGAACGAATCGTTACCCCCTCTGGGTTTAAACTGGCTTGCTTATTATTAGTAATTAATA >NZ_CP011386|3|2|741665-741768|CRISPRCasFinder GTTTAAACTGGCTTGCTTATTTTAGTAATTAATAC ATAAAAAGGGTGAACGAATCGTTACCCCCTCTGG GTTTAAACTGGCTTGCTTATTATTAGTAATTAATA
>NZ_CP011386.1|WP_080948258.1|739048_740644_-|DNA-primase MRPKWDKKDGASTYGQRTIDKAITGTTETFNSSRDATAKDVYGFNHDTKTINQLKATLKQQGLEQRQLIKEQNIADGHPQKKAILNFRRVTSILEKYILWAVVGNNQDDWQKSALYFYNPESGIYEKNNLLIEELINTVEPQITEKNIKEVKSKLRIEGKRKYLTNNPNLYVLGNGIFDAKKHQLLDYSPKFVFTSKIAVNYNPNAQEPKFDNWSFSKWINEDIAQGKEDKIKLIWQTFKAVVNSNYSYHSAVFLLDAKHGSAGKGTFEQLLENIAGEGNYASIKLNEFEKDAILATIVNKPLVIGDDNDPNKPIDSSERFKSASTGDSITINDKYEKAYSYKPTCLIVQSLNDLPKFKDNSDATYRRIRVIKFNKHYTENASNRKIKDEYIYNKDLLEWIVKTAIDVKIDGVMVHTEESNAILKENKIDSEPFLQFVNDIVIPNENGYRFQDTTYQAYRTWYKNTGHNIIYLESFRDFNKKMREHGFKQRRKTRDNHKLQVWLNIQLNTDSMNLTYMDLKDIKDTKDTKY >NZ_CP011386.1|WP_003628016.1|735580_736594_-|serine-hydrolase MIDYNKTQHLIESMVLERVVPGVNYTFIKDKQIFTSTTGFASIYPTVTQLSPFAEYDLASLTKVLATENVLLKLYDQGKLNFTEPLQEFIPEFKDSRIRLYHLLTHTSGIRGWIPHRDELNHDELLKAIINLPVTGEFEHKMRYADTNFILLGLVIKKIFNRPVQEVATTEVFNQMPLAHTTFSPKKEACVPTAIVNGHVLQGVPHDPKARQLRADCGSAGLFSTMQDLITFSQGYLGLKKDVLPYSQKTVSLLFDNKNPAGVKPRSWGWDLRFDPKNHYPIILHTGFTGTLMILDRIKRSGLILLTNRIHPTGHNTIFLAMREKIIRSFLKENSKA >NZ_CP011386.1|WP_080948199.1|734081_735311_+|IS110-family-transposase MMKQNIIFGIDVSSKSSTVCVVIDRIKQGETFKITNDSFGYQDLLDRLNQYLITPLVVFEATGVYSLSLQAFLEDYHIKYLKLNPLKAKKLMDNNLRHNKTDKVDAYRLALIQFNAPQKLRAPQPKEYHELQNASRYYEELTQALIINKNQLHRNLQSTFPQIESIFSTSSGRVYWTIVSLFPHAQYVLNHNESQVFQSLLAISGIGRQRAHYLTTRLYALARQAYPYDNESSITIRAIQRNIANLFSLSAERDNVINYMEKLAMQANARSLTIYESIPGIAKTTAVRLVAELGDLRRFDTSAQIDAFVGIDPGRYQSGEKNSHLGITKHGNHLARKILYRTITQMETVKATQLCHITDYYDKKKRSSNSRGYKKIAIASVHKLIRTMFALIKHDQLYDYNVATHNQRL >NZ_CP011386.1|WP_003626134.1|729562_730903_+|glucose-6-phosphate-isomerase MSLINFDSSKLTPFVHENELGEMQAMVNAANTELRDGTGAGSDFRGWLDLPVDYDKDEFARIKKAAKKIQGDSEVLICIGIGGSYLGAQAAIELLNSNFYGKEKTDMPIVVFCGNSLSGSYLYDLIEWLGDKDFSINVISKSGTTTEPSVAFRIFKDKLIKKYGKEEAAKRIYATTDRQKGALKTEADAEGYEEFVVPDDIGGRYSVLTAVGLLPIAAAGADIDALMKGAADARADYTDTDVHKNSPYQYAALRNILYRKGYTTEIVENYEPSLRMFGEWCKQLMGESEGKDNKGIWPSSANFTTDLHSLGQYIQEGLRNLFETVIRVENPRHDVKIPGDEKNLDQLNFLEGKSLNYVNDRAYEGVVLAHTDGGVPVMTVNIPDQTEHTLGYMIYFFELAIAISGYLNGINPFNQPGVEEYKRNMFGLLNKPGYENLHDDLTKRLK >NZ_CP011386.1|WP_003626132.1|728872_729487_+|VanZ-family-protein MLFFGPLYNLLAERYATSINHFALVKLTFLALDKTFFYFLIFAVLRLIWLLFVRRRRSIKSEISVWIFAFYLILILMLTTFRDTYFPWQLAFNFNRPLSDVNLVFMKETWKLVYAPSRLDFFYNSFGNIMCFVPFGILFPIVFSKKQSFFKTIVIGMLFSIFIETLQFLLATGVSDIDDVFFNTCGAILGYLIYLFFKKLCMRL >NZ_CP011386.1|WP_046813993.1|726576_728748_-|LTA-synthase-family-protein MLKEKNMKKKISNFIQTRTGFLVLLVFCFWIKYIFAAYFDFNLGLSDPYQHIIMWLSPIGTAVILISIGFYIPKPIISYIAMLIIDFANTALLFANIIYYRQFTDFLTIKTMTNAGKVSQGLGKSTVALLHPSDILIWIDLIVIIILLVIHKIRIDQKSYGLSMPIAITSVGALITTLNIFLAETSRPRLLRNTFDRSYVVKYLGIDAFTAYDGFKSAKNVQVTKNANASDLNDILNFTKKIYAAPSSADFGVEKNKNVIVIHLESFQQFLINLKVNGKEVTPFLNSLYRNKHTLSFDNFYHQVGLGRTSDAENMLETSTYGITDGSLFTSLGSENTFQAAPQILRQDGYTSAVFHGNVGTFWNRNDVYKNMGYNYFFDKNYYSSQTKDSSGYGLKDKLLFAESIKYLEQIQQPFYAKFITVTNHIPFELDKEDRDPNFQTTKTRDQTINNYFETAHYLDEAVHEFFNYLKASGLYKNSMIVIYGDHYGLSNSENETLAPIINESADTWNTYNNVQMQRVPFMIHANNLKGKISHEIAGEIDVLPTLLHLLGINNKGYVQFGNDMLSPHRQNWIVLRNGTIISSKYIIVGDKGIKGTVYNRINGRQIIDFSPQEKKEITTLAKKAKDSLHYSDLLNNHNLLRFYTPAGFVPVDPTQFNYSDNYQKMIAIRQDLADSSTSLYSRNHNRSTTKLYKTDASKLHNREKDITKVPEEVLKKPVNRSR >NZ_CP011386.1|WP_046813992.1|725170_726361_-|IS200/IS605-family-element-transposase-accessory-protein-TnpB MLKGIKLRLYPNRTQQNQLEQMFGNDRFVWNQMLAMMNERYQNNKDLPFLGKFKLNYLLKPLKKEYPFLKNSDSSSLQVVNEFLTQSWKNFFQDKTGQIGKPRFHSRKYLKKSYTGKSIIKTAGKRYLKIPKLGYVKTSKTGVLQNTKIKRYTVLLEPTGKYYLSLQVEISEPEKYSLTGKRVGIDVGVADFAILSNGLKYPSFNSSYFEKKAKVWQRKYARRRHLVKLLVLQDRNKRVLCPRSLESFTNWQKAQKSKAKCQAKAANQRRDYLHKLTTHLVKQYDVIAIEDLKTKNLQKNHHLAKSIANASWRMFRQMLEYKCEWYGKKLIAVDPKNTSRICSKCGYNSGAKPLEIREWTCSKCQTKHDRDINAAVNILHKGSTKPTGQGLAMVTS >NZ_CP011386.1|WP_003626128.1|723620_725078_+|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MKLIYQNMLGFLLIIVTTISIIGYSEIGYARNQAYMQNYQRMESYANSLGELAETDEKNGTALLNDNFLNQLEFVLRGDDVHLRIFNDQNMQIYPRVNAKVQLSDKIFSTLKNGQEIRIQNNHAEHSPIGSTKDAYTGVLVPWRNGKNLVGVAWISSKVTHVERPIYMSKRNLLRALLVTVAVGLILSFIISYYSTKRIKRLSRATQKVALGNFNVQIAHKDSDEIDQLAENFNKMVKALKQSNEEVRAQENRRDQFMADAAHEMRTPLTTINGILEGLQYDAIPEESKPKSIDLMQRETKRLVRLVNENLDYEKIRNNQIMLIKTDFDAMPILRDLKSQLKQNAGKANDEISVTGPEKLPIYADRDRFTQVMVNLVQNAIQFTHDGQIEISGKRLEHASEIFVKDNGIGMSKDQTKYIFERFFKADPSRARMGTGESGLGLAIVSSLIKQHGGKVKVDSEPGKGSTFTIIFYDKGYEQFISKDQ >NZ_CP011386.1|WP_012211656.1|722898_723621_+|response-regulator-transcription-factor MSLRILMVEDDNSVAEMMGMFFKKEGWQQDIAVDGVEAVDMFKENADKYDLITLDLNLPKKDGIQVAKEVRAISPTVPIIMLTARGSESDQVLGLGIGADEYVTKPFSPIALIARIKALHRRVMMEEDVQTQENNNQEYEIQTAHLKISKDRREVLFDDQLVVDLTPKEFDLLYTMAQKPKQVFSRDQLLDLVWGYEYYGEERTVDAHIKKLRQKLEKVGAKVIQTVWGVGYKFDDSQVK >NZ_CP011386.1|WP_003633551.1|722506_722896_+|SdpI-family-protein MIYVACGSIMAVIGIIWLISPAKKPNRIYGYLSYLAQVNKASFKFAQRRASLYCILFGLIQVAIGVIIHYLNWDRYFLIWLLTFYLFILLPIVFTEKSLKSFLSELHELPHDYVDPDQVKRQRTKGFRD >NZ_CP011386.1|WP_003631016.1|741811_742087_-|hypothetical-protein MEFKLDQQQETEIKTYVLDVVKDAIKQATTANKPYLNRKEIAKYFGVAESTISYWASLGMPVAVIDGRKLYGKQSITNWLKSHEMPSIKAK >NZ_CP011386.1|WP_003631017.1|742089_742317_-|hypothetical-protein METTQQKLSSAIYEMNRIAEQLFVSYGLLSKLIDDVPEDDPFDPISTKKMLQHVANELADYSTDLSDSAKSNKER >NZ_CP011386.1|WP_003631018.1|742320_742539_-|hypothetical-protein MTNYSADGSNVVNRWYKDGYLYCAFVDGTIMEYGRNKIPERYIEVMRNELAQTIQELQSNEYDFDELEPMEA >NZ_CP011386.1|WP_046813997.1|742531_742738_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MSKEYLTFKEAMSYMGFTTYDSLRKTIKQGLPVIKFGNSKRISKTAIDEFMQAHTVQAHPSKAVVNHD >NZ_CP011386.1|WP_052747885.1|742886_743588_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MNRIKELREKRSLSQRQFVTDFNKYISTNEEQYKNKRGVKKITFGTASRWENSLNKPTEYMWQALADFFNVSVAYLKGAYSKKEIAQITQETYKKNYYQQSNDILIRVFSSICDDYFVSIGAVPINIKKEWRLIPPEKVESLEFWKNILEELYIPYVAIRWLIEKPSLDASKKDVIDAVKGAMSAYSYSSSRYNERCIFIAKHTFYRKQVKKDQAPEYLDFNREHPLDNQIYY >NZ_CP011386.1|WP_046813998.1|743730_744888_+|site-specific-integrase MNNDIKEYTTPSGKKRYRFNLYVGVDETTGHSIQIRKQGYKSKKEAQEAYLNYQLKVIKGEYIPESKGHITFNKLYEMWLKIYRETVKTSTYATTTRYFDDHILKQLGSKYIDKLTVLDCQKAVNIWFNDAPKTYKRFMRYTNNVLNYGINNLELISKNPMNKVIPPKAKNKPKPFTDFYSKDELNIFLRDAKEYNFKYFVFFRLLAYSGMRKGEALALKWSDINFKDNTISINKDVTVGLNNELYEDTPKTENSFRTLDMDAATMEYLKEWRLMQQKTMLKLGYNFLNSDNLLFSTINNGYLSMSKPRQWNVAICKKYDLRRIKIHGFRHTHASLLFEAGASMNEVKARLGHADINTTMNIYTHVTDDQKKDTANKLVRLLEGK >NZ_CP011386.1|WP_023191663.1|745065_746418_-|Mur-ligase-family-protein MSFKSGIAKVAGKSSYWFLHNVLKGGTSFPGKFAMKIDPNVLNSLAQGYETVIVTGTNGKTMTTALIVEALKKKYGDVLTNPSGSNMQQGIVTAFLAHKHKRVKRKIAVLEVDEANVKMVTKLLHPSVFVLTNIFRDQMDRYGEIYTTYDKIVDGIKLAPDATIIANGDASIFSSVELPNKKIFYGFKLPNDKPENDFKAPVNTDGVLCPKCDHILHYHSRIYANLGDFFCPNCGYHRPDLTFTVNNILEQTPNSLKFQMGNKDYSINIGGTYNIYNALAAYSVARHFGLTEAEVAQAFAENKRIFGRQELIHYGNRDIDLILVKNPVGLDEVLHMLNTEKDDYSLVALLNANHADGIDTSWIWDADFEGLNKDKIKKILVGGQRWHDMGFRLEIAGFDPGTMSTNPDYDSLIEEIKKLPTKKVYILSTYTAMLALRRKMAEKKIIKAGM >NZ_CP011386.1|WP_046813999.1|746567_747167_+|thymidine-kinase MSQLFFRYGAMSSGKTIEILKVAHNYEAQGRKIALMTSGLDNRSGVGTVASRIGLHRKAIPITADMNLYTYIEKMNSYDLADGKGKLACVLIDEAQFLKRHHVLECAKIVDEFNIPVMAFGLKNDFQNHLFEGSENLLIFADKIEEMKTICHYCGHKATMNLRVNNGKPVYEGEQVQIGGDESYYPVCRYHYFHPGIQR >NZ_CP011386.1|WP_003626148.1|747183_748272_+|peptide-chain-release-factor-1 MDKVMAQLEGLVAHYEELQEMMADPEVINDTKRYMEISKEEADLREVVQKYKKYKEDKKEIADNKEIIANETDSDLIEMAKEENAEIEKEIPELEDQIKILMLPKDPNDDKDIIMEIRGAAGGDEASLFAGDLLRMYEKYAERQNWKVSMIDSEPTEVGGYKRVAIMITGDKVYSKLKYENGAHRVQRIPVTESQGRVHTSTATVAVMPEYEQVDIDIDPKDIRVDVYRSSGAGGQHINKTSSAVRMTHLPTGIVVAMQDQRSQQQNREKAMQILKSRVYDYYESQNQAKYDAKRKNAIGTGDRSERIRTYNYPQNRVTDHRIGLTINKLDRVMNGELDEIIDALILYNQTKQLEELADQNA >NZ_CP011386.1|WP_046814000.1|748264_749107_+|peptide-chain-release-factor-N(5)-glutamine-methyltransferase MPKTLKEIRIKAGETAENACPEDIDYVLAERLNLTPSEFELKQDMVLSDDQLKQANKDIKKLAKGVSPQYILGYAWFFGYKIMVQRGVLIPRFETEELVEWTLKSLKSGDKVLDLGTGSGCITVALAKEAEKKGIKDLTLYASDITDAALRTSEENFLTYDLDVVTRKANVLIGLEKFDKIISNPPYIKTTEKKEMDANVLQNEPKEALFAGSDGLDFYKKFAKQVRDHLNSHGEFFLEFGFSEEDQLKELFAKELPDFDIEFRKDMAGKPRMVHGRWQK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP011386_4 | 1524688-1524776 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP011386_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP011386_4
>4.1|1524716|33|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder CAGATCAGAGAAAGGAGAGGATTAAGTGGAAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP011386_4
The CRISPR arrays of NZ_CP011386_4 >merge|NZ_CP011386|4|1524688-1524776|CRISPRCasFinder GACTATGCCATTGCCGCAGGGATTTTAGCAGATCAGAGAAAGGAGAGGATTAAGTGGAAGAGACTATGCCATTGCCGCAGGGATTTTAG >NZ_CP011386|4|3|1524688-1524776|CRISPRCasFinder GACTATGCCATTGCCGCAGGGATTTTAG CAGATCAGAGAAAGGAGAGGATTAAGTGGAAGA GACTATGCCATTGCCGCAGGGATTTTAG
>NZ_CP011386.1|WP_023192717.1|1524106_1524400_-|hypothetical-protein MNKEKDELKRNLEKVAEEQGGQQAVSYQDLFNPRFMQKNTHFTTIDVFVRELGAKSFPDIEQLGQKVVDNFVKKETNFNSWEEMQQRAVSEYMSSLF >NZ_CP011386.1|WP_046814365.1|1522506_1523556_+|IS30-family-transposase MDSLHSTMNQHIKGKHLSFEERVIIQLRLKDGYSLRAIARELNCSPSTISYEVKRGTVDLYHGKVKRYKATQGHDAYQAHRKNCGRKSDFLRKTQFMRYVHKHFFKDGWSLDVCSNRATAVGAFSSRDVVCTKTLYKYVDQGLLDIHNYDLPEKLKRNTKLHRIRKNKKKLGRSIEERPKEINKRNEFGHWECDLVLGHKSKDDEVLLALSERMSREFLILRIPDKTSVSVMQAFKELQRQYSEHWNDIFKTITTDNGSEFADLSNLEKASNTLVYYAHPYTSCDKGTVERHNGLIRRFIPKGEAIANYSLQDIINIETWCNSLPRKILAYHTPDEIFERELDLIYQAA >NZ_CP011386.1|WP_003628066.1|1521768_1522398_+|histidine-phosphatase-family-protein MTDFYFVRHGQTTANVAGLKQGTINTKITFLTETGKKQAQTVHKHFDISFADRIVASPLQRTKDTADILNQSAHLPITYDKLLLEISYGNWDGSKNADLEAKYPQVFDHVLNDVLPSYAPLAHGETFTHVIDRADHFMSVTAQRYPDEKIIVVTHGFTIKAAVLAALGRPDNPMVVEEPDNLSITRITRKASSDNYYLRYYNRVVDSKF >NZ_CP011386.1|WP_003628067.1|1520266_1521367_-|3-phosphoserine/phosphohydroxythreonine-transaminase MTVYNFAAGPATLPDPVIKQIQEELPSLQGSGMSILEISHRSQMFDKIIDTAKQDIKDLMHVPDNYHILFFQGGGTGQFAAVPMNLATKHKRIALLDSGHWATRAGDEAANLGVTVDVLDSTKDKHYQELPHMPHAISASDYDYLHITTNNTIEGTAYHTLPEHGDVTLVGDLSSNFMAEEYQVSDFGLIFGGVQKNLGPAGVTVVIVRDDLVNHVDHIPSILNYELFVKKNSMFNTPPVFAIYATGLVLKWLKQQGGIAGIEALNKKKSALLYDFLDQSTLFHNDIKKTDRSLTNIPFKTNDPVLDKQVIAEADQAGLKNLKGHRSVGGLRASLYNAMPLAGVQALVDFLYNFEKQHYGEKICIK >NZ_CP011386.1|WP_003628068.1|1519112_1520279_-|phosphoglycerate-dehydrogenase MYQVKTYNAIAQAGLDQFTDNYQINQTDNADAYLIRSVDLHDETFPESLKIIVRAGAGFNNIPLDRATQNGIAVFNTPGSNANAVKELIISLLVASSRNLFDAADYSAHNSGADISLRTEHDKTKFKGTELTGKTLAVIGVGHVGSLVANAASALGMNVIGYDPYLSSDAAWHISTSITRARTLDEALKCADYVTVHVPKNEETTGLIGKEQLAVMKDGVHLFNYSRGGIVDNQAAVEALDAHHLQTYMTDFGEDILLNRDDVVVTPHIGGSTDEAEVNGATQGAHTIMTYLETGNIQNSVNLPNLQVPFQAPYRITLIHKNIPNMVGQIATALANAGINIKSMSNAARKDIAYTMIDLDNLKNEEDNKLIEKLGKIDAVFRVRVLKH >NZ_CP011386.1|WP_080948227.1|1515690_1516860_-|MFS-transporter MIGFGLLVNTIGLFFGPISQEFNVGRANVALMMTFQNAAAAIALLFAGKIMEKVNLRWLLTACFALIAVSMLSLTFANSLVHFYLAWTIIGICQPIAITLSIPVLLSKWFNQKLGTVMGISLAFSALGGTIFNPIIAEVIKQFGWRGGFVREAMLIGLILVPLAISINPEPTTQYPAYGKAMQSSKKVALTGLSLKQALKMPVFYAVAFAMLALQFVSGSIYHISGHITNIGISPITAATVVSGVMIGSAIGKISIGYFLDKFNAKLVLAVYSLFGVIGWGGQAMLRESNLLILAAVILGSGQAVCVVALPYLIRQIFGEKDYSNILSVINMIGAFAMSASVYLIGLFFDQTGSYNLGWMINVSAVTLSFIVIMITLGKKESANSDFRK >NZ_CP011386.1|WP_133174219.1|1515172_1515442_-|hypothetical-protein MMINLYDLGQVYIVCGRTDMRRGIDGLAAIVKDEFDLDPFSGRVFIFCGGKATVTRNQKIKYAGKLTETSRELYYYVGSGAYVKAKDVS >NZ_CP011386.1|WP_046814362.1|1514806_1515154_-|hypothetical-protein MFLKTNTYVYNKKCQRIKKQGTLRQGTLVTYSGSVKAASSSDDFFFYPSESSNKDPQALKQYKIKGKVYYALGGGRYVKAVNVSKINGQYVFTKQPTYVIPRADMYILNKDLKET >NZ_CP011386.1|WP_041808687.1|1514233_1514767_-|hypothetical-protein MIDTDYTDPQLYVRIAGTKDQFLYWTDAGDYPDEDEGNFSFRFFMDDNHNFAESTQSLVTFKQGLEKTTPLYNDQGQLVDLGGKYLEKAARGNFLPENNYQVDYARYIWVPSEKKAELFYHLIGTTFSMRDPHSKYQYTWVKQNVGSVYVKASDVIFKGLKVKTQNTAEEATKLAEK >NZ_CP011386.1|WP_014918530.1|1512164_1513910_-|oligopeptide-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKAIKFISTTGLLIGAALSLAACGQNNKNAAKTAKKFPEQTPQKTAKQGGTLTYAIETDTPFKGIFDSQLSVDQVDSDVMQFGNEALFDTDNQYKITNKGPATFKLDKKAKTVTITVKKGVKWSDGKQVIAKDLEYPYEMTTNKATNSLLYSDSLANIVGMKAYHNGKAKTISGITYPDGENGRTIVIHFLAMKPGMLQSGNDYFIETAAPYHHLKDVPFSKLVSSDQIRKDPLFFGPYKVSKVVRGQSVTWVPNKYYWRGKPKLNKIVAQVVSTKTASQAIKSHKFDIADVVNSDWQAVKTAKDVKFIEKIPLAYSYLGFKVGKWENGKNVMDKNAKMNNKSLRQAIAYAMNINQVEKRYTQGLTFRVPTLIPAQFGDYFDKNAKGFPYNLKKANQLLDKAGYKKKGKWRVQPNGKPLSIHLAAMTGSAVQEPIIQNYIQQWHKIGLHVSLTGGRLIEFNSFYDKLDHDDKNVDMFMAAWSLSSEPSPRGIYSETNPMNDSRFATKENNKLLNEIDSTKAFNHKYRVAAFHRWQQYMNDEAYIVPMTNSYSIQAVNNKIVNYSLKPAAANSVWYKVGYAK >NZ_CP011386.1|WP_025283733.1|1526052_1526379_+|metal-sulfur-cluster-assembly-factor MRDGETIKNDIINQLATVIDPELNVDVVNLGLIYEIDLDKDGICLINMTLTTPTCPLTGYLIDSITQAVKKVLEVKNVDVEFVWYPVWTPDRMSDAAKKYFNIDEKQD >NZ_CP011386.1|WP_052747907.1|1526666_1527206_-|hypothetical-protein MNKIIKKLALVGACSMLMSSVVATVPSQTVDAVSSKTFSKYSKKFNRVIVTDPIWVYKIYPRYPMYKTKYVKAYKLKPGDTPIVRHRGVDWGWTVGKSYRYCILKDSFSWFDGYSKYKWVDQGLLDGSMKDEHFAYKFTWKQYCQLIKAGIYTTVHPKKLWNSKIKKMIERWKPETDNS >NZ_CP011386.1|WP_046814366.1|1527217_1527580_-|hypothetical-protein MSHLFRRRSITKSITARTSAKYKRQIKKKILPGYGKKGAGVIKDPKKSMYNAIYNRTTIDTRKIGKSKQAKNDESDNKLGCGCATTLIFFGAIVGQMIGGNIGGTIGVILMLIIAIFGMI >NZ_CP011386.1|WP_153245682.1|1527908_1528046_+|hypothetical-protein MLKKTKWNTAIVAVLLGAGIISTNHVQADAVSNAQSNTQVVQNSN >NZ_CP011386.1|WP_046814643.1|1529397_1530018_+|hypothetical-protein MLKDVRKIPHTKHYSYFDQLGRRRMKNTSTKKAYYWINKKGQITGIKNNAKVICQRPQMPTGCEITAVTMMLNFAGKKVSKYQAAKVMPRSSNPNKGFVGSPYKKFPLGFWVAPGGVKPVVQHYLGKSKIMTNCSINAIKQKLLRSHLVVVWVGMFDGISNHAITLTGYHGNTLYYNDPWTGTKRKISVTKFKIHWALDGHRAISY >NZ_CP011386.1|WP_054607281.1|1530130_1530364_+|hypothetical-protein MYIYYQIGIFVGLVFVALAINIFRQARKSGYPSNLVNCIFSITISTAGICIIVASLAAIQPHNWYTSSLLWKILIAG >NZ_CP011386.1|WP_025283744.1|1530998_1532450_-|zinc-ribbon-domain-containing-protein MKKICPNCGKEVDPEEKYCPFCHFNLVNNDETMVTVNIGLLGLKNNESTKKDEEKIQSEKKESDAKPEKKKQPEKAVSKSNEDKKQKIEKNEIIPSPLPPKKKPTPLPKSKKKKFHFKWSILIEIVVAVIAILVMVGMNYYSCKAQIGRIETGLKNGEVNNVVTNGKVPLTAKNLTPLKEYYKNNPAAYKKLKKSLMGKNNLPIKLIKQGHYFLFFPRYVVQLPTYELNVVNDYHHSTVTVNGMKFVKKQKVFPGAYNIEAKSSYLGQTAKFKKTVNVWKDQTAEVNLNAKTIKVQGMPNGKLYLNNHNIGKLDKKGNLVLEDVPLTKPFSMYVAKKQKGKLVKTKQVRDVPAVIKGSKNVAVLKLDWQQSKNVGKLLEDNFNYPNSKDFIGGSKNKSYVELRTLVSNWRNSPNITKYHANITVNNKSLNDIRYSVEFNFAFNKNGKRYKRVQVMKFRSASARSTSKGLKIKTIGGGRIVSSK >NZ_CP011386.1|WP_046814368.1|1532631_1533138_+|hypothetical-protein MKNYTIDHDIYLMNHKNGDVLKVTVNKEDSVKILQLYRQDGLGNYYIDKNSLLKKQDNLTTKEDIVKASKKIGGHNTHHIDKWHHQVVPIYNAQHQITGFKPKLVLEHRTRIQNAKRYLRHLDHHHAIYLSTTSRNTLLKPINHLKDAIYADRNKEMVLAHKIHKLSR >NZ_CP011386.1|WP_079227881.1|1533300_1534566_-|IS3-family-transposase MERYGVKVLDKPYENYATEFKEKAIKRVLFAHESARRVSLELGLSNGGQIHNWIRKYKEDGYNVINHKKGRPTHEEQRQADRGASKADKRPKTEELKTYCRERVCKKIERLSLPKNQKPTAQEIATTVTQLRQELHVTVKFVLDTINANPDLPHLSRSNYYYTLTKDDKNLKNEKVMKRIKEIFEEHRHRYGYRRITAQLHREGMRVNHKRVKRLMVKMHLYAITIRRRFKYSSYKGTIGKIKSNLIKRHFAAIIPDRHWYSDITEFHLNGEKLYLSPVMDGCSQEIVAYTLSRHPVLKQVMDMLDLAYKKHPALNGLIFHTDQGWQYQHAAFQAWLKNHGVSQSMSRKGNSLDDGLMEGFFGILKREMFYGFEKTFKTMDELEQAIKEYIHYYNHDRIKTVLKNHTPIEYRNMVLNKAVQ >NZ_CP011386.1|WP_153245681.1|1534737_1535472_-|hypothetical-protein MGKSKYYFVWIDGHKAGWLNQRVFLRNKISVVKKISLVNNPYYSFPTKDAINLATDSIGTVVNPNKVKASQDEVLSNSASEHKITLTYGKAHAHTVVEVRGDAQEGVGVADKPEHTGKSASNWFKHYRTSGNWGKGASYAPETKPHVLKSGSFKLKTYFYQPATLSQGRSQTGMVGPVPEGMTISNGSMYATMYKSSHNTRAHIVAYKLKNVPNRYIMQKLPWLPWGQFTRLASKIKISPYIKL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP011386_5 | 1644308-1647001 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP011386_5
|
40 spacers
spacers of NZ_CP011386_5
>5.1|1644338|36|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder AGCATATTTAGTAAAGTTGGTGTAAAATTCGGCTTT >5.2|1644404|38|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT CTACCAACTACTAAAACTTTTAGATTAAACTTTCAAAA >5.3|1644472|36|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT TCACTCAAAAAGAGGTACTATAGATCATTCAAGTTT >5.4|1644538|35|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT CAATGGGTTCAAGCATTCCGTTACCACCTGAATTA >5.5|1644603|36|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT GGTGTGGTTTTCTCATGAATGTATGTAAAAATTTGT >5.6|1644669|36|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT AACGGCATAAACCATTGAGTCGACATTGTCATCGTG >5.7|1644735|36|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT AAGCTCCATTAATGCTGACTTAATCCCCCATGCAGT >5.8|1644801|35|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT AAAGTCCAACGACCAAAAGAAAGGATATAGATAGA >5.9|1644866|37|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT CGTCCTTATCATCACCTTGAGTCAAGCTTAAATCACT >5.10|1644933|37|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT TAAAGCAAAGCAAAATAAGTTTTACCACTCAAAGCAA >5.11|1645000|35|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT GATGATCTAAATAAACATACTTATACTGCTAAGCA >5.12|1645065|35|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT TGATTGATCACCATTTCCTGCATTGTTGAATTTAA >5.13|1645130|63|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT ACTTCTTTTTACCGTTTTTAAGATTATATGACTTATTACCGTTTTTAAGATTATATGACTTAA >5.14|1645223|36|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT TGATTAGATTGTAAGGAATTGTAGTCAGCTACTAAT >5.15|1645289|36|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCAAAACCGTTCACAGCGCCGGATAGGTACTAAGAG >5.16|1645355|35|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCAGCTAAATCAGCATAAGTCTGCTTTAGTTCATC >5.17|1645420|36|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTGCTACACACGGCATGAAAGTAGGTGCTTAGATA >5.18|1645486|36|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATCTAGTTCAGTTGATTGGGCTACACGTCAGATAGC >5.19|1645552|37|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAGTTTGCCTTGTTGTGTTCGCTAGCAGATAGGTTAA >5.20|1645619|36|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTTTTCCGTGTGCCCTTTACCTTGCACATATAGCA >5.21|1645685|35|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GATGATCTAAATAAACATACTTATACTGCTAAGCA >5.22|1645750|35|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGCAAGCTCTTTGTAGTTTTCTACTTTTTTTGAAA >5.23|1645815|36|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTTTTCCGTGTGCCCTTTACCTTGCACATATAGCA >5.24|1645881|36|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCAATTCAAGATACTTTTCAACTAGCTTTTCATCTT >5.25|1645947|37|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAAGCGAGAAATGGCTTAAAAATCACAACTTATATTA >5.26|1646014|36|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTAAGTGAGTTAAGTTATTGAGTGAGTGAGTTGTG >5.27|1646080|37|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCTTAAAATTGTAAATTAGCGTATATAAGCGTTATAT >5.28|1646147|37|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGTATGGAGTTATGTGGTTATTCTGCTGTTGTTCGA >5.29|1646214|35|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTGAGCTTTGCGCCCTTAACATTTCGGGCAATATC >5.30|1646279|36|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCAGATATTGATTATGAGATGATCGAAGGCTTAGCA >5.31|1646345|37|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAAACATAAAAGCAATGCGTTTCTCAAACTCAAACTT >5.32|1646412|35|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGTGATAAATCACATGATCACGCTGTTTGCTTACA >5.33|1646477|36|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACGTTAGGATATTAATCGCATATATTGATGAGCAAA >5.34|1646543|35|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCAGGAATTGACCAATTGATAGCAGCACCTTTGCT >5.35|1646608|35|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TACTTATAGTTGCCAAAGTCGTTCCATTGGTTCTT >5.36|1646673|36|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATACCTTGTCAATTCCACTAATACCATTGTTGACT >5.37|1646739|34|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGTGCCCTATACATAACGTTCACTTAGTTTCAGT >5.38|1646803|37|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAGTGAATGAATTGAATTGATCTGTATAAAAGCCGAG >5.39|1646870|35|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCGGCATATTCCAATCACTGCCCTTTCTATTGATC >5.40|1646935|37|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGTTTTTAGGATTTTTGTATGAAAATTCTGACATTG >5.41|1644473|36|NZ_CP011386|PILER-CR TCACTCAAAAAGAGGTACTATAGATCATTCAAGTTT >5.42|1644539|35|NZ_CP011386|PILER-CR CAATGGGTTCAAGCATTCCGTTACCACCTGAATTA >5.43|1644604|36|NZ_CP011386|PILER-CR GGTGTGGTTTTCTCATGAATGTATGTAAAAATTTGT >5.44|1644670|36|NZ_CP011386|PILER-CR AACGGCATAAACCATTGAGTCGACATTGTCATCGTG >5.45|1644736|36|NZ_CP011386|PILER-CR AAGCTCCATTAATGCTGACTTAATCCCCCATGCAGT >5.46|1644802|35|NZ_CP011386|PILER-CR AAAGTCCAACGACCAAAAGAAAGGATATAGATAGA >5.47|1644867|37|NZ_CP011386|PILER-CR CGTCCTTATCATCACCTTGAGTCAAGCTTAAATCACT >5.48|1644934|37|NZ_CP011386|PILER-CR TAAAGCAAAGCAAAATAAGTTTTACCACTCAAAGCAA >5.49|1645001|35|NZ_CP011386|PILER-CR GATGATCTAAATAAACATACTTATACTGCTAAGCA |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP011386_5
The CRISPR arrays of NZ_CP011386_5 >merge|NZ_CP011386|5|1644308-1647001|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR,PILER-CR 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MKAGKVMDLLQISRSTLKRYREKGILEAKKLPTGQYDFDDDSVFLLKNKHSKRLTVLYGRVSTYKQKADLANQMQELSDFAQSKGFQANDSFQDIASGISFKNRKQFFKMLDLILAGKVKRVIITRKDRLSRVGFELFEYLFQNYGTEIDVISDEMNPKTDEQELFEEIISLLHCFSMREYSHRRAERKLFEATLNQKGKTK >NZ_CP011386.1|WP_012212124.1|1630070_1630364_-|ACT-domain-containing-protein MIFIFFAKTDEELSLVCETKNAPSKTINREDGWRAFKIEGQLDFLLIGILAKIAQLLANNGISIFAVSTFNTDYILVKDNNFDSAIKILSENNYEIK >NZ_CP011386.1|WP_023192833.1|1647185_1647467_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYVILVYDIVMDKQGAKVSRHVFKICKKYLTHVQNSVFEGELTKSQLESLKNELDRWIRQNVDSVIIFKNRNKDWLDKEFMGQDLTDLTSDIF >NZ_CP011386.1|WP_023192832.1|1647472_1648462_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MEDYYLFSSGELERKDNTVRLTRSDGKYKDLKIEVTRDIYLFGEVSTNTKCLNYLAQMKIPVHFFNYYGFYTGSFYPKEQNVSGTLLIQQVQAYTDPKRRLYYAKKFVLGAAKNLLRNLKYYQRRGRNLDDSIKEITSLIRQIDQVHDVEELMGVEGTIHRRYYASWQSVFIPDVDFSKRVRRPPDNMVNTLISFLNGLMYTTCLSEIYVTQLNPTISYLHSPMDRRFSLCLDISEIFKPMIVDRLIFSLINKNMISEEDFNKESNYCYLSEKSKRIIVSEYDKYMKQKVRYKTLHRDVSYRHLIRLECYKLVRSLVEGETYEPYVMGW >NZ_CP011386.1|WP_025283809.1|1648471_1648963_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MRVTGNMVNYFFVCKRKLWLFQHQIGFEQTSERVQLGSLLDRTSYQGHGTHHVMIDNLINIDMVENWQLIHEVKRSDAIEPAAIWQLKYYIYYLRKKGVNISKGLLDYPRLKKCVKVDYTDEDEKQMEKYISEIEQICEQVTPPKPQFKPICKSCAFYEYCFS >NZ_CP011386.1|WP_046814409.1|1648978_1651408_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MNEYLAKSLDQSEGNHCETIVEHTNNLLKQYSLLKQAYPDIFQNFWLSQDRFNDMTKQVDIRSKDDWRLLEIACSYHDLGKMNLRFQKKVKAGQSFCKGEIPHALLSITMLPIDELQKHYTKDQIIALIFAIKWHHERNFSEIDEKHYEDEIEALKKEFASFDYSKLSFPIPPQEPAKVDSKYLTGNLSHRLSPNYEPKIYDEFVILKGLLNRIDYAASGHYEIESKSRVCLSQNILQEWHKKNPVADWNELQKYTYDHRNESIVVVGQTGLGKTESALRWLDNSKSFFVLPLKSAINSIYDRISGIVFQNKSHENLALLHSDMMAKALSEKFDDEDNFEEFVNEERSWSKQLSVATLDQIFNFVYHYKNYEPKLATLAYAKVVIDEIQMYSPDLLGYLIYGLGEIQKFGGKFDIMTATLPPFLIDLLESNGLEFKQAPHPFLDPKVNHRHKVKVLHKQINSDDIINLDRHQKTLVVCNTVKSATELYSELKQKGVSDVHLIHSRFIRKDRNEREKEILEFGQKENHSSGIWIGTQVVEASLDIDFDMLITELSELCGLFQRMGRCYRKRNYEGKEPNVYVFDGGDKLTSGIHESKQEYDDKRYHSVVDYHLFEISKRALAQVDGYLTESDKLKLIDENYTTDKLLDENCQLIDKVNDCIDYLNDLTFLDNLKTKEEVVNTFRNINTIDIIPEQVFLENKDKLEVAAKALNNYIRREDFLDQTEYKKQHQILVKEKIKAREVINNYLVGIPLYIINKVSKQDRWIKDKALNEVGYNILPADFNYDSMTGLSYNDNKNKNAEIDDDDNIF >NZ_CP011386.1|WP_003627156.1|1651550_1652264_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKVIRVKLHQETANYRVPASHGFRESYPLPPISTVIGMVHYLCDFHEYHPMKVSVQGSYVSTTSDFFTRYEFKNGLKFDPGRHQLNAEGYGISRGIGHVQLLYDVNLILHIKPDDENELEDIYNALKYPREFPNLGRREDLVNFEEVKIVDVEKKDEDLTVNHGAYIPVEMSENIGLENEGIGYKGTHYYLNKDYKLVTIKKGQTQRRWNKVEVIYASGFTVYKSYVDEDNNVVFLV >NZ_CP011386.1|WP_023192831.1|1652250_1653153_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MTQDKMGLTATIVFQASSANYGESLGNVASLKKLTRGDGQQYSYISRQAIRYDIVQQLGEKETNLEAEGSGDKKVIQFAKDASIKDFPEIDFFGYMKTEKGNNSSIRSAKVRLSNAISQEPYEGDTDFLTNMSLAQRIRKATGDNKIRNSIAQSEIQQSYYVYTLTVDLDQIGVDDNDGTNLNANEKNRRVAKLLDTIQYLYRDIRGRREDLKPLFAIGGVYDIKNPIFENAVKVRNSNIDIESIQSILDDPRVKENTSVGFVDGAFNNSQEIKDKLDAVTVAKFMTDLKKKVADYYEGN >NZ_CP011386.1|WP_046814410.1|1653171_1654929_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MGETSTVTIDFRINSWLENAGIVGLTRILKANPRYRGSYKEKENTLEVDPKVFDNFSDLYFNFFIKNYGQATRYWRIVSEENFLKSLKENGFKDFDNKKLKELTDWFDNVLKYSVNSASYKKVIKFINSDYDIKAEVKDCNKKIRTLNKKNFLTESPEEAKEILQELINQLLKAIEYFSTDPARKYFPAKTLSYTVINKAWNGVSFLNPQAKNLDFYDDYQNYFVAPVQKYLQEDHSKDKYICSTCGRPIKRLEYSYGFLNDMGYDLNRKTSNAWNFKNDLYICPVCQFLYSLVPAGFTYNMASQGIFINENSSIRNLQGKNDATFNSMMRDIRSNTQTSPYRAFSAAFKDAEASGQNAALANIQLITYNNDHYNFQIIPIVASKVLIKVVEKKYTVKQTGEVKSYLANLYNAGISNFRGAGYYSILENVLNCLFNNTNLFSIIQELELLKVGNTAGCYYNTFQIMTVIRMNGWFLNELHKYRRSENAMKVEEDKLTKARGCGMHVRMGYDNENKAKTLAYKMLEAIRANSTDRFMELLLNAYLYLDKTVPKIFIETQSNTEVFKEYAFAFIAGLIGSSNAEQDK >NZ_CP011386.1|WP_003627162.1|1654946_1655702_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRFGIPIHLLPKNSEEKEIKINIDYDAYILSLIKTGLSTENPALFKELFGKPTQKNYSTSVFFPNATFTKDNIVLDKNGEMKLYFSTANTNLAINFYNSFVYLDHLDAEKLPFGHSYLADVKKLYTIELPKITKDRVIFKTMSTIVIRNDEGRFISCPNDSTEEGLAEFNDALRRNTFNKLRDNESLASTVKGLKFKPIKMRKTVRKSFGLNIECTKGIFELEGNPTLLNFIQESGLGEKTGTFSGMISLA >NZ_CP011386.1|WP_003629695.1|1658180_1658834_-|flavodoxin MFGRTYSDLGPVVGQINGEDIRANQLERRGYDWENGYGTPSDGQDTNRDGQPVRKLTKDAKSIIIFWSCSGSTKLLASKIARETGADILEITLRNPYPANYRKTLNRANCERIQNDPPELEMLSQYDTIYLGYQTWAMTLSQPMRAFLLEYGGEFSNKKIAPFLSEGGYGSGDSTELIREFIARDGGKNNTYTSALVVDGNRVDESDVEVKRWLKTI >NZ_CP011386.1|WP_003627167.1|1658978_1659860_-|SPFH-domain-containing-protein MMARIIIGIIVVLVIVYVCCGFKIVPQNNEGLVETLGKYSKTVKAGFIFVWPLFQRIRKVPLALQPLEISKYSIITKDNAEISTSLTLNYLVTDSYRYFYNNTDSVESMVQLIRGHLRDIIGRMDLNAALGSTKEINDQLFTATGDLTDIYGIKVVRVNVDELLPSAEIQHAMDKQLTADREKTAAIAKAEGEARTIGMTTKAKNDALVATAKANAEAVKTQADADAYRVQKMQEALSKAGEGYFRNQSLDSFNQLAQGPNNLIVVGKDEMTDLGKVPALRKVWDASDDKKDK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP011386_5 | 5.30|1646279|36|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1646279-1646314 | 36 | NZ_CP011386.1 | 2079068-2079103 | 0 | 1.0 |
NZ_CP011386_5 | 5.40|1646935|37|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1646935-1646971 | 37 | NZ_CP011386.1 | 826561-826597 | 0 | 1.0 |
NZ_CP011386_5 | 5.14|1645223|36|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT | 1645223-1645258 | 36 | NZ_CP011386.1 | 930490-930525 | 1 | 0.972 |
1. spacer 5.30|1646279|36|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to position: 2079068-2079103, mismatch: 0, identity: 1.0
gcagatattgattatgagatgatcgaaggcttagca CRISPR spacer gcagatattgattatgagatgatcgaaggcttagca Protospacer ************************************
2. spacer 5.40|1646935|37|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to position: 826561-826597, mismatch: 0, identity: 1.0
aagtttttaggatttttgtatgaaaattctgacattg CRISPR spacer aagtttttaggatttttgtatgaaaattctgacattg Protospacer *************************************
3. spacer 5.14|1645223|36|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 930490-930525, mismatch: 1, identity: 0.972
tgattagattgtaaggaattgtagtcagctactaat CRISPR spacer tgattcgattgtaaggaattgtagtcagctactaat Protospacer ***** ******************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP011386_3 | 3.1|741700|34|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder | 741700-741733 | 34 | NC_005355 | Lactobacillus prophage Lj965, complete genome | 10514-10547 | 3 | 0.912 |
NZ_CP011386_3 | 3.1|741700|34|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder | 741700-741733 | 34 | AY459535 | Lactobacillus johnsonii prophage Lj965, complete genome | 10514-10547 | 3 | 0.912 |
NZ_CP011386_5 | 5.36|1646673|36|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1646673-1646708 | 36 | MN855636 | Bacteriophage sp. isolate 140, complete genome | 936-971 | 7 | 0.806 |
NZ_CP011386_5 | 5.8|1644801|35|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT | 1644801-1644835 | 35 | NZ_CP038863 | Campylobacter jejuni strain SCJK2 plasmid unnamed1, complete sequence | 35302-35336 | 9 | 0.743 |
NZ_CP011386_5 | 5.22|1645750|35|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1645750-1645784 | 35 | NZ_CP019991 | Enterococcus faecium isolate 2014-VREF-63 plasmid p63-3 | 15682-15716 | 9 | 0.743 |
NZ_CP011386_5 | 5.46|1644802|35|NZ_CP011386|PILER-CR | 1644802-1644836 | 35 | NZ_CP038863 | Campylobacter jejuni strain SCJK2 plasmid unnamed1, complete sequence | 35302-35336 | 9 | 0.743 |
NZ_CP011386_5 | 5.11|1645000|35|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT | 1645000-1645034 | 35 | MN694447 | Marine virus AFVG_250M387, complete genome | 11213-11247 | 10 | 0.714 |
NZ_CP011386_5 | 5.21|1645685|35|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1645685-1645719 | 35 | MN694447 | Marine virus AFVG_250M387, complete genome | 11213-11247 | 10 | 0.714 |
NZ_CP011386_5 | 5.49|1645001|35|NZ_CP011386|PILER-CR | 1645001-1645035 | 35 | MN694447 | Marine virus AFVG_250M387, complete genome | 11213-11247 | 10 | 0.714 |
1. spacer 3.1|741700|34|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder matches to NC_005355 (Lactobacillus prophage Lj965, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
ataaaaagggtgaacgaatcgttaccccctctgg CRISPR spacer atttaaggggtgaacgaatcgttaccccctctgg Protospacer ** **.***************************
2. spacer 3.1|741700|34|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder matches to AY459535 (Lactobacillus johnsonii prophage Lj965, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
ataaaaagggtgaacgaatcgttaccccctctgg CRISPR spacer atttaaggggtgaacgaatcgttaccccctctgg Protospacer ** **.***************************
3. spacer 5.36|1646673|36|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN855636 (Bacteriophage sp. isolate 140, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aataccttgtcaattccactaataccattgttgact CRISPR spacer aataccttgtcaattccagtaataccacgattaatc Protospacer ****************** ********. .**.*..
4. spacer 5.8|1644801|35|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP038863 (Campylobacter jejuni strain SCJK2 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
aaagtccaacgaccaaaagaaaggatatagataga CRISPR spacer ttcattaaacgattaaaagaaaggatatagataaa Protospacer .*. *****..*******************.*
5. spacer 5.22|1645750|35|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP019991 (Enterococcus faecium isolate 2014-VREF-63 plasmid p63-3) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
agcaagctctttgtagttttctactt----tttttgaaa CRISPR spacer gttaagctctttgtagtgttcttcttttgcttttt---- Protospacer . .************** **** *** *****
6. spacer 5.46|1644802|35|NZ_CP011386|PILER-CR matches to NZ_CP038863 (Campylobacter jejuni strain SCJK2 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
aaagtccaacgaccaaaagaaaggatatagataga CRISPR spacer ttcattaaacgattaaaagaaaggatatagataaa Protospacer .*. *****..*******************.*
7. spacer 5.11|1645000|35|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694447 (Marine virus AFVG_250M387, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
gatgatctaaataaacatacttatactgctaagca CRISPR spacer acacaagtaaataaaaatacttatattgctaagac Protospacer . * ******** *********.*******
8. spacer 5.21|1645685|35|NZ_CP011386|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN694447 (Marine virus AFVG_250M387, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
gatgatctaaataaacatacttatactgctaagca CRISPR spacer acacaagtaaataaaaatacttatattgctaagac Protospacer . * ******** *********.*******
9. spacer 5.49|1645001|35|NZ_CP011386|PILER-CR matches to MN694447 (Marine virus AFVG_250M387, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
gatgatctaaataaacatacttatactgctaagca CRISPR spacer acacaagtaaataaaaatacttatattgctaagac Protospacer . * ******** *********.*******
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
372945 : 382618
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP011386|372945:382618|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP011386|372945:382618|374671_376294_+|WP_003627769.1|DBSCAN-SWA MAKDIKFSENARRSLLKGVDKLADTVKTTIGPKGRNVVLEQSYGNPDITNDGVTIAKSIELKDRYENMGAKLVAEAAQKTNDIAGDGTTTATVLTQAIAREGMKNVTAGANPVGIRRGIEKATKAAVDELHKISHKVESKDQIANVAAVSSASKEIGALIADAMEKVGHDGVITIEDSRGINTELSVVEGMQFDRGYLSQYMVTDNDKMEADLDNPYILITDKKISNIQDILPLLQEIVQQGKSLLIIADDITGEALPTLVLNKIRGTFNVVAVKAPGFGDRRKAQLQDIAALTGGTVITEDLGLELKDTKIDQLGQARRITVTKDSTTIVGGAGSKEAIDERVDTIRKQIEDSTSDFDKKKLQERLAKLTGGVAVIHVGAATETELKERRYRIEDALNSTRAAVDEGYVAGGGTALVNVEKAVREVKGETTDEQTGINIVLRALSAPVRQIAENAGKDGSVILDKLEHQENEIGYNAATDKWENMVDAGIIDPTKVTRTALQNAASIAALLLTTEAVVAEIPEPKQAAPQGGAGAPMGM >NZ_CP011386|372945:382618|372945_374097_+|WP_046813870.1|integrase|DBSCAN-SWA MNNDIKEYTTPSGKKRYKFAIYVGKSEVTGKSIQARKRGFKSYEDALKCYALISSKIADNTYTGLEIKNHKVSDVYRVWLESYKDTVKTSTLVNVKQFFKNHILKDLGSYYIERLTPFKCQRVAQKWALELPKTFNALIIYSNKLLDYAVRFDYIRKNPMRMIIKPKKQAEHKEFTDFYTKQELNAFLKASKNENIKIYTFFRLLAYSGMRKGEALALKWSDIDFTSNTISINKTVSIGNKHRVVVNNTTKTKRNRAISMDARTMQLLKEWRFQQRQDLLRLGFNPFDKEQVVFQNFDNEVVRPNLVAVWNKRICDKNGLRRIKIHGFRHTHASLLFDAGVPMEDVKQRLGHASIQTTMDIYTHVTKDKQDKTALSFAQYMEN >NZ_CP011386|372945:382618|379051_380962_+|WP_046813872.1|DBSCAN-SWA MAKIHELSENLTNQIAAGEVIERPASVVKELVENSLDAGATRIRVDFIDAGLKQIVVQDNGTGIARDQVDLAFTRHATSKISNEHDLFKVSTLGFRGEALASISAVSHVEIVTATENAIGIKADFSGGSKKGQEDAASQKGTKITVQDLFFNTPARLKYLRSPRTEIMKIVDIINRLSLGYPHVSFTLSNTGKVLFRTTGNGNLKQTVANVYGRHIAEKMESFEAKDSDFKITGLMSKPELTRSTRNFISILLNGRYIKNFQLSNAIMDGYGSKLAARHYPIVVIAIHVDPLLVDVNVHPTKQEVRLSKEKELSRLITGAISDALLDKTEQSSGFANLENKRETLVDQLEFNLNQDVVNTTRKMPEVHEEAEKPEFLVKQEAKNSEEPKNETEHNYVDINIPREDDQYIITKTWDKNVALQQKLMPFSNKKVDQEVISTGDETLANNLPRLAYVGKIDTYLLAENDGDLYLIDQVAARRRLQFEQIYQTITSKKIVQQGLLTPIVLEFGNLDFLQIKDKIYQIKQLGIYLDEFGQNSFIVRSYPTWIHDHVEESIREILDNYLNLDKGKTQNLFKRVAALEAKRSVKGKINLSAAEGTQIITDLRKTSDPYHDADGRLILVRISQNELRKMFKKGE >NZ_CP011386|372945:382618|381601_382618_+|WP_003627765.1|DBSCAN-SWA MVENEDAVTSGEVENSEEEAMELSLRPQTLDQYLGQKRVKKEMSIYIKAAKQRDEALDHVLLYGPPGLGKTTLAFVIANELGVHLKSTSGPAIEKAGDLVALLSDLDPGDVLFIDEIHRLAKPVEEVLYSAMEDYYIDIVIGEGQTTHAVHVPLPPFTLIGATTLAGQLSAPLRDRFGIVEHMQYYTIDELEKIVQRSSDVFHTSIAPEAAHELARRSRGTPRVANRFLKRVRDFAEVKGEKTISLATTEGALKQLQVDDEGLDQTDRRLLRTMIEGYNGGPVGIRTLAANVGEDMETIESLYEPYLLQHGFILLGPRGRMVTDKAYLQLGLPVPGDK >NZ_CP011386|372945:382618|374333_374618_+|WP_003627770.1|DBSCAN-SWA MLQPIGDRVIVKVKDEEEKTVGGIVLASNAKKKPTEGEVVAVGEGAYASNGEKIPMSVKKGDVVLYDRYSGTNVEYEGEKYLVLHEKDILAIAK >NZ_CP011386|372945:382618|380962_381553_+|WP_003627766.1|DBSCAN-SWA MYEYFEGIVTVITPSYIVVDVNGVGYKVYSPTPFAYQKGDKAKIFIEQVVRDTGITLYGFQSEDDKELFLKLLSVSGIGPKSALAIMAAEDANSLAEAIEQGEVKYLTRFPGVGKKTASQIVLDLKGKLRDYVARLDRQDEEQGNIPPALNDALLALIALGYTQKELDRITPKLEEVNADTADQYIKKGLALLLKK >NZ_CP011386|372945:382618|376475_379052_+|WP_153245832.1|DBSCAN-SWA MMEQYYEIKKQYPDAFLFYRVGDFYELFEDDAVKGAQILELTLTHRSNKTKNPIPMAGVPHMAVDTYVNTLVEKGYKVALCEQLEDPKKAKGMVKRGIIQLVTPGTMMNEGPNDAKDSNYLTSVVTTKSGFGLAYSDLSTGEIYSTHLKSFAAVSNELLSLRTREVVYSGPLTEQNKDFLHKANITVSAPTPIEGEHAEISYVEQNLTNGAEKSATRQLVGYLLSTQKRSLAHLQIAKSYEVNQYLQMSHTVQNNLELVASAKTGKKMGSLFWVLDKTHTAMGGRLLKQWLARPLLNVDIINHREKMVQALLDGYFTRENIIDALKGVYDLERLTGRIAFGNVNARELLQLSRSLQAVPVILDALNQSDSDVLIDFAKKIDPLKGVAELISTTLVKDPPLLTTEGGLIRDGVDKQLDRYRDAMNNGKKWLVQMETDERQKTGIENLKVGFNKVFGYYIQVSNGNKSKVPLDRYTRKQTLTNAERYITPELKEHENLILEAQTRSTDLEYDLFVQLRDEVKKYIPALQKLGNQLAALDVYCSFATVAEQNNYCRPSFHTDSQDIDVVNGRHPVVEKVMTAGSYIPNDVKMDSATNIFLITGPNMSGKSTYMRQMALIAIMAQVGSFVPADSAALPIFDQIFTRIGAADDLISGQSTFMVEMSEANDALQYATKRSLVLFDEIGRGTATYDGMALAGAIVKYLHDKVGAKALFATHYHELTSLDETLDYLKNIHVGATEENGKLIFLHKILPGPADQSYGIHVAQLAGLPRTVLREATKLLKRLEAQGSELAPVSQQLDLFAQPEAASDEVDDNDSENSPMTDAEQEVLDDISNLYLADKTPLQIMQMVANWQKDLKDDK |
7 | uncultured_virus(50.0%) | integrase | attL 366675:366703|attR 374169:374197 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
449852 : 484012
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP011386|449852:484012|DBSCAN-SWA 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31 | Lactobacillus_virus(20.0%) | integrase,transposase,holin | attL 478256:478315|attR 486253:486327 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
492297 : 575061
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP011386|492297:575061|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP011386|492297:575061|522110_523289_-|WP_046813926.1|DBSCAN-SWA MEFQQSKLLGRLPKQFFASLVAKVNHKIESGVDVINLGQGNPDKPTPEYIVKATQKWVADPATHKYSPFQGLPEFKQAAADFYAEKYGAHFDPEKEVAILGGSKIGLVELPWALMNPGDTYLLPDPGYPDYFSGAALGGVKFETVPLLAKNNFLPDLKAIPEAVAQRAKFFYLNYPNNPTGAVATKKFYEELVSWAKKYHVGIISDFAYGALGFDGQAPRSFMQTPGAKDVGIEFYTFSKTFNMAGWRIAFAVGNQDIIGALNLIQDHLFVSLFPALQRAAIDALQGSQRDAEIAKIVGRYEERRNAFVDAAEKIGWHAFVPKGTFYAWMPVPAGYTSESFADLLLDKAGVAVAPGNGFGKHGEGYVRIGLLIEPARLKEAVARIAKLHLFD |
58 | Bacillus_phage(18.18%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
852554 : 913504
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP011386|852554:913504|DBSCAN-SWA 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47 | Lactobacillus_phage(30.43%) | terminase,protease,head,integrase,transposase | attL 864567:864584|attR 906108:906125 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1274821 : 1332961
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP011386|1274821:1332961|DBSCAN-SWA 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MADKLKVWLKHDPKASTNTDVLILSGIDAHDFKYILEDPDNSGECWYRFGNAVIRIDHVEKYEEINDGL >NZ_CP011386|1274821:1332961|1291564_1291747_-|WP_046814239.1|DBSCAN-SWA MRSYCKQITKHGQETMMFKCDQCGHEVAIDAYDMFIADLNVFCPVCGASPEHLNYKEFEK |
66 | Lactobacillus_phage(50.0%) | integrase,transposase,terminase | attL 1304349:1304365|attR 1317989:1318005 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1349769 : 1452413
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP011386|1349769:1452413|DBSCAN-SWA 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109 | Lactobacillus_phage(55.32%) | tRNA,capsid,protease,head,terminase,integrase,transposase,holin,portal,tail | attL 1404686:1404702|attR 1450883:1450899 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1471408 : 1541541
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP011386|1471408:1541541|DBSCAN-SWA 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53 | Streptococcus_phage(33.33%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1562941 : 1573238
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP011386|1562941:1573238|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP011386|1562941:1573238|1565073_1566123_-|WP_003627023.1|DBSCAN-SWA MNRYKDAGVDVEAGYDLVKRIKKDIAATSRPETSGTIGSFGGMFDLEKLGYQHPVLVSGTDGVGTKLMIAQEMGINDTIGIDCVAMCVNDVLAQGAEPLFFLDYIATGHNDPAKLAQVVHGVAEGCRQSGSALIGGETAEMPDMYPKNEYDLAGFSTGIANKEDILTQDLAKEGDILIGLPSSGVHSNGFSLIRQVLFKDHHLKVTDRPEALEGKSIGEILLTPTKIYVQAVLSLVKRHLLHGIAHITGGGLIENLPRTYNDDLQAEVNLGAWPVQAIFRYLQNKGQLKEQDCLNTFNMGIGLVLLVPKANVLQVKEQLKQKNEQYYEIGKLRKRPIGEKKIVFNGSFK >NZ_CP011386|1562941:1573238|1572749_1573238_-|WP_003627031.1|DBSCAN-SWA MTVKIAVIMGSKSDWPTMKHACDLLDQFNVGYEKHVISAHRMPTEMYDFAQKAEERGIRVIIAGAGMAAHLPGMTAANTVLPVIGVPGQTKALGGMDSLLSIVQMPTGIPVATTAIGNAGASNAALLALEILGTNDEKLRGRLKNYRQKLHDLAKESSGELE >NZ_CP011386|1562941:1573238|1570456_1570708_-|WP_003627027.1|DBSCAN-SWA MTTIRIYVTYKPSVFDPQGAAITDSVNSLGHQEVKNIVVGKFFDIKLDEDDQDKAKQDVKEIAEALLVNFNMETYRLKVLEEN >NZ_CP011386|1562941:1573238|1567557_1569789_-|WP_012212086.1|DBSCAN-SWA MKQAMTPEEIKEKKPYLDWSLTEHEYDYICDKLLKRLPNYTEIGLFSAMWSEHCSYKKSKPVLRLFPTKGKRVVQGPGEGAGVVDIDDGQAVVFKAESHNHPTTVEPYQGAATGVGGILRDVFSMGARPVAILDSLHFGELKNNPTMRYKMEETIRGVGDYGNCIGIPNLGGETTFDSCYNGNILLNAMCVGLMNIKDMEHGKAVGLGNSIMYVGAKTGRDGIHGATFASADFSKEHETQRSAVQVGDPFMEKLLMEACLELILKHRDWLVGIQDMGAAGIVSSSAEMATEGNAGMELNLDLVPQREPNMSAYEIMLSESQERMLLCVKKGHEEDVKKIFKDYNLDAVTIGRVIEGENYVLYHEGEKVCDIPVRSLTEDVLEEPSKEIKPQYIIDAEKMPAWRPSFESSGEILKRLLNQPTIANDQFITQQYDSQVRSNTIVKPGSDAGVLRIRHTKKAIAMCTDTNGRFVYLNPKIGGQRSVIESVCNIVASGAKPLAITDCLNYGDPNDPEIFWSLRESCQGIADACRIFETPVVSGNVSLYNENDGQAIYPSPMIGMVGLIKNTDYVIPMHVQEADDIVYLVGKTTADFAGSEVQKMLQGKISGLPEAPNLELIHDYLKNLHKAMTQGLVTSAHDLSEGGLAVSLAESVFDTEFGLNINLSEFDKTLLFSETPGRLIVSVKPENKSAFESLLGSAVQEIGRVTDQRKLSIKLANDELNTDVASLEKIWKESIPCLMKSKA >NZ_CP011386|1562941:1573238|1570707_1571424_-|WP_003627029.1|DBSCAN-SWA MEKLLYSGKVKQMWSTNDPEVLRVVYTDQATAGNGEKKDNFKDKAELNNQISTLIFQYLEKNGVPTHFIKKISDKEELVKKCEMFPLEVVTRNIAAGHFSSRYGLDEGMRFAIPVEELFFKSDELDDPILNSSDAVALNVATKSEQEQMWSLSRQVNQLLINLFDEAGMDLVDFKLEFGKLHNGQIVLADEFSPDNCRLWDKKTKSHMDKDVYRRDIGDLTAVYKKVLARIEEVLEED >NZ_CP011386|1562941:1573238|1562941_1565077_-|WP_080680620.1|DBSCAN-SWA MKIAILASGNGTNFEVLTKKFQAGEIPGTEALMFCNHPNAPVIKRAQRLGIPYETFSVKECGSKQAYESRLLKVLKEYKIDFIILSGYLRVVGSTILNEYPDSIVNLHPALLPKYPGLNSIARAFADYQKGLIDKTGVTVHFIDARLDHGPIIAQKAVPIYPDDTEETLETRVHETEHELFPMAVSEVIQTRMKRGNKVKRALVSVSDKTNLVPFVKGLVENHYEIISTGGTKKKLDEAGIKTISVEEITGFPEILDGRVKTLNPYIHGGLLAERDKPEHMKTLEKLNIHTIDLVCVNLYPFKQTIEKPNVELADAIENIDIGGPSLLRAASKNYASVTVVTDQADYDRVLKEITENGDTNLKTRAELAAKVFRTTAAYDALIAEYLTKQTGLEDPEKLTLTYDLKQKMRYGENSHQKAWLYEDALPKKFSILQAEQLHGKKLSYNNIKDADEALRAIREFQAEPTVVAMKHMNPCGIGRGKTLEEAWDRAYEADSISIFGGVIALNRKVDLATAKKMHKIFLEIVIAPGFDDDALAVLEKKKNIRLLQLDFSHENEPVRYETVSVMGGLLMQEQDVLNENVADWKCVTDVKPTEQQLKTMMFALKAVKHTKSNAIVVANNERTLGVGAGQPNRIDSAKIAVKHAGEAIDNTAVMSSDAFFPFGDCVEYAGKHGIKAIVQPGGSVRDQESIEAANKYGIAMVFTGYRHFRH >NZ_CP011386|1562941:1573238|1569785_1570457_-|WP_003627026.1|DBSCAN-SWA MKIAIVVFPGSNCDIDMYEALNTVCHAEAEYVSYRTKKLDGFDAVILPGGFSYGDYLRAGAIARFAPVIPAIRKMAQDGKLVLGVCNGFQILTEMGLLPGALKRNNSLQFICETVKLQVKNNQIPFTTEYDQDQIIDIPIAHGEGNYYADDATLAELEKNNQIVFEYYQHNPNGSVKNIAGICNKEGNVLGMMPHPERAVEEVLGGTDGLPLFKSFLKLGVLA >NZ_CP011386|1562941:1573238|1566148_1567600_-|WP_095662284.1|DBSCAN-SWA MEGEYSLFNEIKSLNEECGIFGIYNSENASQLTYLGLHNLQHRGQEGAGIVSSDGRQLYQHRDRGLLSEAFADPNDLKKLIGDSAIGHVRYSTTGRNSIQNVQPFLYHFLDGDVALAHNGNLVNASSLRNRLEKHGAIFQSDSDTEILIHLIRNHIEDGFIPALKKSLNEVHGGFAFLLLQKDRMIAALDPNGIRPLCIGRLTNGAYVVASETCALDIVQAEFVRDVQPGELIIFDQEGMHIDHFTTQTQLAVCSMEYVYFARPDSIIHGVTVHNARKRMGKLLAQEQPADVDIVIGVPNSSLSAASGYAEELGLPYEMGLVKNQYVARTFIEPTKELRENAVKLKLSAVRGVVQGKKIAVVDDSIVRGTTSKQICRMLKKAGAKEIHLRIASPAFRFPCFYGIDISTRTELIAAHHSVEEMQKILGVDSLRFLSVESLIKAIDIPDAGESPYGGLTVAYFNGQYPTKLDDYEQGYLASLNEQ >NZ_CP011386|1562941:1573238|1571620_1572739_-|WP_103658193.1|DBSCAN-SWA MGQGKTIGIIGGGQLGQMMAISAKYSGMKVITLDPTPNCPCGQVADDQIVANYSDISAIEELAERSDVLTYEFENVDLKALEDVKDKVAIPQGTKLLYITKHRIREKNFLRSAGCQTAPYIPVKNKSDLQAAVKTIGYNCVLKTCEGGYDGHGQEVLHSDADLTNDHVKQILSTGDCILEGWVPFKVEASVMVARNAMGEVSVFPVSENYNKDEILHMSIVPARISPDVYQKAQKIAVQIAEAIDLRGILGVEMFVLNNGEIYINELAPRPHNSGHYSIEACNFSQFDLHDRAICNWPLPKIKLMSKVVMVNVLGQHVAGIHKIIAEKRGWHFHDYGKAEIHHNRKMGHVTILTDNIAKTISDINATHIWDR |
9 | Prochlorococcus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1677621 : 1728343
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP011386|1677621:1728343|DBSCAN-SWA 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54 | Aureococcus_anophage(22.22%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1741576 : 1824368
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP011386|1741576:1824368|DBSCAN-SWA 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57 | Staphylococcus_phage(12.5%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1832784 : 1882435
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP011386|1832784:1882435|DBSCAN-SWA 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47 | Clostridioides_phage(15.38%) | bacteriocin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1921858 : 1984690
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP011386|1921858:1984690|DBSCAN-SWA 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50 | Lactococcus_phage(18.18%) | bacteriocin,transposase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1989069 : 2051235
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP011386|1989069:2051235|DBSCAN-SWA ATTATTGGACTGCTTTATTTAAGACCATATTTCGATATTCTATCGGAGTATGGTTTTTTAGTACCGTTTTGATTCTATCATGATTGTAGTAATGAATGTATTCTTTGATTGCTTGCTCTAATTCATCCATGGTTTTGAATGTTTTTTCAAAGCCATAGAACATCTCACGCTTAAGAATACCAAAAAAACCTTCCATTAAGCCATCATCTAAAGAATTGCCTTTGCGTGACATAGATTGAGAAACACCATGATTTTTAAGCCAAGCTTGGAATGCAGCGTGCTGATATTGCCAGCCTTGATCAGTATGAAAAATTAGGCCATTAAGAGCTGGATGTTTCTTATAAGCTAAATCCAGCATATCCATAACTTGTTTCAATACTGGATGACGGCTTAATGTATAAGCAACAATCTCTTGACTGCAGCCATCCATCACAGGCGATAGATAAAGCTTTTCTCCATTAAGGTGAAATTCAGTAATATCTGAGTACCAATGCCTATCTGGGATAATCGCCGCAAAATGACGTTTAATTAAATTGGACTTGATTTTTCCAATAGTTCCTTTATAGCTTGAATATTTAAATCTACGTCTGATGGTAACGGCATATAAATGCATTTTGACCATTAATCGCTTGACGCGCTTATGATTCACTCTCATACCTTCTCGATGCAATTGAGCAGTAATTCTGCGGTAACCATACCGGTGTCTGTGCTCTTCGAATATTTCTTTAATCCGCTTCATAACTTTTTCGTTTTTTAAATTTTTGTCATCTTTAGTCAAAGTGTAGTAATAATTACTGCGCGACAGATGTGGCAGATCAGGATTGGCATTGATCGTATCAAGCACAAACTTAACGGTTACGTGAAGTTCCTGCCTTAGCTGAGTAACCGTAGTAGCTATTTCTTGTGCTGTTGGTTTTTGGTTCTTTGGGAGACTAAGGCGTTCAATTTTTTTACAAACTCGTTCTCGACAGTAAGTCTTAAGTTCTTCTGTTTTAGGTCTTTTATCTGCCTTTGAAGCTCCTCTATCTGCTTGTCTTTGTTCTTCATGGGTAGGTCTGCCTTTCTTGTGATTAATGACATTATACCCATCTTCTTTATATTTGCGAATCCAATTATGAATTTGTCCACCATTGGATAAACCTAGCTCTAATGATACTCGGCGAGCTGATTCATGAGCAAAAAGGACTCTTTTAATGGCTTTTTCTTTGAACTCTGTTGCATAATTTTCGTATGGCTTATCTAGAACTTTTACTCCATAACGCTCCATTAAGCTTAATACATATCTTAAATTACCAGAAGTAACATTGTATTCTCTACCTAATTGCTCAACTGATTTACCATAATTTTTCCAGCTATTGTAAATATCAATTTTGTCTTGTTTAGATAATTTGGACATAACAAAAACCCCGAAATTCTTGTCCGAATTTCGGGGTTCATATCATATTTTGCAGATTGAGCTTTTTAATTTCTATTCTTAATAATTATAAAACACGTTTAGCAACTGATGGGTAAAAGTACATGCTAATAGCTTGCTTTTTAATACCTTGACCTGGCGTTGCGGCATGAACATACTTGCCATCACCAACATAAATACCTACGTGGTAAGGAGATGAAGTTGAACCCCAGAATAATAAGTCACCTTTTTTAAGATGGTTTAAGGATACGCGCTTACCTTTGTTTACCTGACTATATGTAGTTCTAGGCAAGGTCTTATTGGCAGCTTTTTTATAAACGTATTGAGCTAAGCCTGAGCAGTCAAATGCGGAAGGACCAGTTGCACCGTAAACATATGGCTTACTTACTTGCTTCTTAGCAAGTTTAGCAACTGCGTTACGCTTTCCCTTTTTGCTTGCTGCTTGTACAGTTTGTGATTGATTCAAATTAGGCACATTGATTAAAGATACGCCTGTAAAGAATAATGATAAAACTGCAACTAACTTAACTAAACTACGCTTAAATTCCAATGTATTTCTCCTTAATATTATTTCTTAGGTCAAATGATTCGTTTAATCACTCAACGGTTTATATATTACCCAAGAAATATTACAAAGAGATGTTAAAAAGACTACTATCGAATTAAGCAATTTGACAAAGCTAGTAAAATTTTGTAATTGAGTAATAATTATTTACTTAACTTATTTTGTCCAATCTTATTGCTACGCTTTTTAGGGATGATATTAAGAGCCATGGCAGCTACTACGACAAGGACTGCTCCTACCCAATCCATTGGCATCATAATTAACCCAAAGACAAGTACAGAGCCAATCGTTGCAGAAAATGGTTCGAATGCATCAAGCAGACTAGCAGTTGAAGGGACAACATAGCGCAAGGCATTAGCCATAATTTGGAATGGAATGATGGTACCAATTATTACAACCGCTGCTGTATATAGCCAAACCTCAGACTTATTAGGAATTGCTTGAAATTGTGGCTGAATAATTACTAGGCTAAGTCCGGCAAATAGCATCCCCCAACCAGTCACTACCATACTGGATTCTTTTTTAACAATATTAACAGGAATTAAAGTATAAGCTGCTTCACCTACGGCTGAAAGCAAGCCCCAAAAAAGAGACGCTGGTGTAATTGCCAAATGATCAAACTGACCATGCGTCGACAAAAGAAAAACACCCAAGAAAGCACAAATTGCGGCAATGATATCCAATCTACGCATAACTTGTTTGTGCGTGATAGTCAGGTAAGCCCAAAACAGGACCGATAAATTGTAAAATTGTTGCAATTGATGCATTAGCAACTTTGATACACATAAAATAGAATAATTGCACGGGTAATAATCCAAATACACCATAAGCAATAATCACCCAAGCATCGTGCTTATTTTTTATTGTAGCAATTGGTTTCTGTTTCAAAATTCCAGCTACAATTAACAAAATAATTCCTGAAGTAACCATTCTTCTTTTCCCAATTCTAAACTAGCACCTTCTATACATAGCAAAAAGAAACTAGCAGGGAAATTGGTTTTTGCACAAAAATATCCGCCCAAAGGCGACCACTTCTAAAGTTGATTTAAATGATACAAAGTATAACCAACCGCACCAATTACCAAGCCGATTATATACATCCACCAAAGAACTGGATGGAAGGCTAAAAGGATCAATGAAACAAACATTGTAGCTACGCTTGAATTTCTTGTTAGACGTTTTTTACCAAAAAGCAGACCAAACATAATTCCAGCTGTGGTAAAAACGTAGAATGTATCAGCACTCATCAATATATTTTCAATGATTGCCAATTGTCCTGCTTGAGGTTTACCTGCAATATCTACAAAAATTTCGTAACAAGAAAAAGCCGCAATTGCAAAAGAAAGAATGACAGTGATTAAGCTAATTGTGCGAAAAATAGCTTTTTGCTTTTGAACGGGCGTCTCTTCCATAAATGTTTTCAGGAAGAAAGAACGATCTTTTTTAACGGCTACGACCTTACCAGTCTTCTTGTCATGCCAATTATATGCCCAGCTAATTACAAAGAAAGCCAAAATTAACACGAACTGAATAATCATTAAACGCCAGAAAATTTGAATAGCGAAAACTACTGTAGTCAAAAGTAAAAGAGCATAAATCAGTTCAGCGTAAAGTACATATCTGATACGTTTTTTATCTTTAAATAAGCGTGTAAAAGTTTCAGAATTTGGATCCATCATTACTATTTTCCCCTTCTTTAGAGCTTAGCTCGGTAGGAAAACCATATTCCGATTAAGCTAACTAACATCCCTAATATATTAGTAATCAACAATGGAGATTTTGCCAATAATAAAACAATTGCTAAAAATATAGTGATAACACTGGCTACCCTAATGAATCTCTTATTAGCTGCTAAAATACCGATAGCTAATCCAACCATGATCAGAACATATGCAAAATCCCCATATAACATAATGTTCATGGCTGTGTCACTAAGTTTAAATTTAAATGGCATTTCAAAAAGAATATTCCAGAGTTGATGAGAAAATCTAATGGCACTGCCCAGCGCGATGAAGAAAATTAGGCCTTCAAATAAGCGCAAGAAAAACAACTTAGTGAGCCTAATACTTGTAATGGTCTCCCACAGCGTATCACGCTTTCTCATACGAATAATTGGATCTCCTCGATCAAAGATCCAACCAACTACTAAATATAATGAAATTACGATGCCTTGAACTAAAAGCAAGTGCATGAACATTGAAAAATCATAGAGCAAACTTAGCAATAAAAGAATTACATAAAATAGCTCAAGATAAGCCAGTACTTTGTCAACTTTACGCCGCTTTAACCATGGCTTTAAATCATCTCATCCATGTGGTCGTTCACGATCTCACCTACTTTTAATTTTAATCTAATTATCCATGATTATATTCTAATTTTTTAAAAAATACCAGAAGTTTTCAAAAAATTAAAAATTGCAAAATAAGCACCCATGATTTTTATTCACCTTACTTCATTTCACCTGTATAATTGATTAAAAATATATCCTATCCGATTTTAATTACATTTTAATATTTATAGTATTTTTAGGATATTTTATTTTGATATTGACGCATGAGCGACGGTCGCTTAAATCCGGTTTTATGTCTGTCTTAACACTTTTCAGTCTTGCACTTTTTGCGGCAACTGTACTAGTTAACATTGCAGACCTTGATCCCCATTATAAAGATTGGATTTTGCCGCTTCTTGTATTTGGCTTAGCAGCGGTCGCTTTAGGAGTCACCGTTTTTGCTTTTACTCTGATTATTATGTTTTTATATGATGGCATAAAAATTATTCGTAAAGAAGGCAATCGTTGGACAAATTATTTGTCACTAGCCATGGGAATTGTCATTATTTTCTTTTTGTTCTTCTACCCACAATTAGGCAAATTCAGTCACGATTCATGGCTTGTTTATCCTTATGGATTTTTGTGGCTCGTTATCATCTACTTAGTAACTATTATGATGATGTACACGTTAACCGCCTGGATCAATTTAATCAACTGGCATGTTCCTCATCTTGATTACGTCGTTGTACTTG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53 | Lactobacillus_virus(11.76%) | protease,transposase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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