Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_022777 | Clostridium tetani 12124569, complete genome | 8 crisprs | csa3,WYL,cas3,DEDDh,cas2,cas1,cas4,cas5,cas7,cas8b2,cas6,cas7b,cas8b1,RT | 0 | 33 | 3 | 0 |
NC_022778 | Clostridium tetani 12124569 plasmid p12124569, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_022777_1 | 1469658-1471149 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NC_022777_1
|
22 spacers
spacers of NC_022777_1
>1.1|1469689|36|NC_022777|CRISPRCasFinder TGACTTTTAACTTCTCCTTATCACTCAGCCTCACAG >1.2|1469756|34|NC_022777|CRISPRCasFinder TTTGCTTTATCCTCTACTAATTTACGGCGTGCTT >1.3|1469821|36|NC_022777|CRISPRCasFinder ATATAACTTGTAAAAAATGTGAAAATTCTCTTACAT >1.4|1469888|36|NC_022777|CRISPRCasFinder TTAATTGTAACTCTTCTAATAGTTTCTCCTTCTCTT >1.5|1469955|36|NC_022777|CRISPRCasFinder TAGAAACACATACTAAATTAATGATAAATAGATTAA >1.6|1470022|36|NC_022777|CRISPRCasFinder TAAGCTTGATTTTCTGAAACTTTTTCTTCTACAAAT >1.7|1470089|36|NC_022777|CRISPRCasFinder GGATACGAACAACAAGTATTAAATATATCTAAATCA >1.8|1470156|35|NC_022777|CRISPRCasFinder CCCCATATACCCTACATATATCATCTACTGTTCTT >1.9|1470222|35|NC_022777|CRISPRCasFinder TTTTTCTGGATTTAAAAGAAGTACTCCAGCACTTT >1.10|1470288|35|NC_022777|CRISPRCasFinder TACTTATTGTAGGTGCTTTTTCTTATTATCTAAGA >1.11|1470354|36|NC_022777|CRISPRCasFinder CATTCCCATGCTCCCCCTTTTTTTTATTTGATCAAA >1.12|1470421|35|NC_022777|CRISPRCasFinder TTTATTAGTACTTAGTAGTGTCTGATTATCCGTTT >1.13|1470487|36|NC_022777|CRISPRCasFinder TGCATTACAAGTTCTTTTATGTTATTATAAATTTAA >1.14|1470554|36|NC_022777|CRISPRCasFinder GTCCATTTTCTAATATTTTATATTCCTTTGTAAAAC >1.15|1470621|36|NC_022777|CRISPRCasFinder TCATCAAACAGTTTATAAATTGCATCATAAACTTTA >1.16|1470688|36|NC_022777|CRISPRCasFinder TAAAGGCAGGTGAAAAAAATGATACCACTAGATGAA >1.17|1470755|35|NC_022777|CRISPRCasFinder AGTTGCAAAGATAGCTTCAAAAGAAGATATAAAGA >1.18|1470821|35|NC_022777|CRISPRCasFinder GATTCAAAAGACTATGGCTGAATCATTTAAAGCTG >1.19|1470887|35|NC_022777|CRISPRCasFinder GTTATAGGAAGAATTCTTTCTTCCAATAAAGTACC >1.20|1470953|34|NC_022777|CRISPRCasFinder GTTGAGAAACGATATAAAAAATCAATAGTAGCCA >1.21|1471018|35|NC_022777|CRISPRCasFinder TGAAATATTCCTGTATCGGGTTCATATGGTGCATC >1.22|1471084|35|NC_022777|CRISPRCasFinder CATCTATAAGAGTAGAAAGTTCCCTAACTGGGATA >1.23|1469689|37|NC_022777|PILER-CR,CRT TGACTTTTAACTTCTCCTTATCACTCAGCCTCACAGG >1.24|1469756|35|NC_022777|PILER-CR,CRT TTTGCTTTATCCTCTACTAATTTACGGCGTGCTTC >1.25|1469821|37|NC_022777|PILER-CR,CRT ATATAACTTGTAAAAAATGTGAAAATTCTCTTACATA >1.26|1469888|37|NC_022777|PILER-CR,CRT TTAATTGTAACTCTTCTAATAGTTTCTCCTTCTCTTG >1.27|1469955|37|NC_022777|PILER-CR,CRT TAGAAACACATACTAAATTAATGATAAATAGATTAAA >1.28|1470022|37|NC_022777|PILER-CR,CRT TAAGCTTGATTTTCTGAAACTTTTTCTTCTACAAATA >1.29|1470089|37|NC_022777|PILER-CR,CRT GGATACGAACAACAAGTATTAAATATATCTAAATCAA >1.30|1470156|36|NC_022777|PILER-CR,CRT CCCCATATACCCTACATATATCATCTACTGTTCTTA >1.31|1470222|36|NC_022777|PILER-CR,CRT TTTTTCTGGATTTAAAAGAAGTACTCCAGCACTTTG >1.32|1470288|36|NC_022777|PILER-CR,CRT TACTTATTGTAGGTGCTTTTTCTTATTATCTAAGAA >1.33|1470354|37|NC_022777|PILER-CR,CRT CATTCCCATGCTCCCCCTTTTTTTTATTTGATCAAAA >1.34|1470421|36|NC_022777|PILER-CR,CRT TTTATTAGTACTTAGTAGTGTCTGATTATCCGTTTT >1.35|1470487|37|NC_022777|PILER-CR,CRT TGCATTACAAGTTCTTTTATGTTATTATAAATTTAAC >1.36|1470554|37|NC_022777|PILER-CR,CRT GTCCATTTTCTAATATTTTATATTCCTTTGTAAAACG >1.37|1470621|37|NC_022777|PILER-CR,CRT TCATCAAACAGTTTATAAATTGCATCATAAACTTTAA >1.38|1470688|37|NC_022777|PILER-CR,CRT TAAAGGCAGGTGAAAAAAATGATACCACTAGATGAAA >1.39|1470755|36|NC_022777|PILER-CR,CRT AGTTGCAAAGATAGCTTCAAAAGAAGATATAAAGAT >1.40|1470821|36|NC_022777|PILER-CR,CRT GATTCAAAAGACTATGGCTGAATCATTTAAAGCTGA >1.41|1470887|36|NC_022777|PILER-CR,CRT GTTATAGGAAGAATTCTTTCTTCCAATAAAGTACCA >1.42|1470953|35|NC_022777|PILER-CR,CRT GTTGAGAAACGATATAAAAAATCAATAGTAGCCAA >1.43|1471018|36|NC_022777|PILER-CR,CRT TGAAATATTCCTGTATCGGGTTCATATGGTGCATCA >1.44|1471084|36|NC_022777|PILER-CR,CRT CATCTATAAGAGTAGAAAGTTCCCTAACTGGGATAA |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_022777_1
The CRISPR arrays of NC_022777_1 >merge|NC_022777|1|1469658-1471149|CRISPRCasFinder,PILER-CR,CRT TATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACTGACTTTTAACTTCTCCTTATCACTCAGCCTCACAGGATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACTTTGCTTTATCCTCTACTAATTTACGGCGTGCTTCATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACATATAACTTGTAAAAAATGTGAAAATTCTCTTACATAATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACTTAATTGTAACTCTTCTAATAGTTTCTCCTTCTCTTGATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACTAGAAACACATACTAAATTAATGATAAATAGATTAAAATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACTAAGCTTGATTTTCTGAAACTTTTTCTTCTACAAATAATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACGGATACGAACAACAAGTATTAAATATATCTAAATCAAATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACCCCCATATACCCTACATATATCATCTACTGTTCTTAATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACTTTTTCTGGATTTAAAAGAAGTACTCCAGCACTTTGATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACTACTTATTGTAGGTGCTTTTTCTTATTATCTAAGAAATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACCATTCCCATGCTCCCCCTTTTTTTTATTTGATCAAAAATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACTTTATTAGTACTTAGTAGTGTCTGATTATCCGTTTTATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACTGCATTACAAGTTCTTTTATGTTATTATAAATTTAACATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACGTCCATTTTCTAATATTTTATATTCCTTTGTAAAACGATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACTCATCAAACAGTTTATAAATTGCATCATAAACTTTAAATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACTAAAGGCAGGTGAAAAAAATGATACCACTAGATGAAAATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATGCAGTTGCAAAGATAGCTTCAAAAGAAGATATAAAGATATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACGATTCAAAAGACTATGGCTGAATCATTTAAAGCTGAATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACGTTATAGGAAGAATTCTTTCTTCCAATAAAGTACCAATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACGTTGAGAAACGATATAAAAAATCAATAGTAGCCAAATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACTGAAATATTCCTGTATCGGGTTCATATGGTGCATCAATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATACCATCTATAAGAGTAGAAAGTTCCCTAACTGGGATAAATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC >NC_022777|1|1|1469658-1471149|CRISPRCasFinder TATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC TGACTTTTAACTTCTCCTTATCACTCAGCCTCACAG GATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC TTTGCTTTATCCTCTACTAATTTACGGCGTGCTT CATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC ATATAACTTGTAAAAAATGTGAAAATTCTCTTACAT AATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC TTAATTGTAACTCTTCTAATAGTTTCTCCTTCTCTT GATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC TAGAAACACATACTAAATTAATGATAAATAGATTAA AATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC TAAGCTTGATTTTCTGAAACTTTTTCTTCTACAAAT AATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC GGATACGAACAACAAGTATTAAATATATCTAAATCA AATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC CCCCATATACCCTACATATATCATCTACTGTTCTT AATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC TTTTTCTGGATTTAAAAGAAGTACTCCAGCACTTT GATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC TACTTATTGTAGGTGCTTTTTCTTATTATCTAAGA AATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC CATTCCCATGCTCCCCCTTTTTTTTATTTGATCAAA AATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC TTTATTAGTACTTAGTAGTGTCTGATTATCCGTTT TATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC TGCATTACAAGTTCTTTTATGTTATTATAAATTTAA CATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC GTCCATTTTCTAATATTTTATATTCCTTTGTAAAAC GATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC TCATCAAACAGTTTATAAATTGCATCATAAACTTTA AATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC TAAAGGCAGGTGAAAAAAATGATACCACTAGATGAA AATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATGC AGTTGCAAAGATAGCTTCAAAAGAAGATATAAAGA TATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC GATTCAAAAGACTATGGCTGAATCATTTAAAGCTG AATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC GTTATAGGAAGAATTCTTTCTTCCAATAAAGTACC AATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC GTTGAGAAACGATATAAAAAATCAATAGTAGCCA AATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC TGAAATATTCCTGTATCGGGTTCATATGGTGCATC AATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC CATCTATAAGAGTAGAAAGTTCCCTAACTGGGATA AATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC >NC_022777|1|1|1469659-1471149|PILER-CR ATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC TGACTTTTAACTTCTCCTTATCACTCAGCCTCACAGG ATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC TTTGCTTTATCCTCTACTAATTTACGGCGTGCTTC ATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC ATATAACTTGTAAAAAATGTGAAAATTCTCTTACATA ATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC TTAATTGTAACTCTTCTAATAGTTTCTCCTTCTCTTG ATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC TAGAAACACATACTAAATTAATGATAAATAGATTAAA ATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC TAAGCTTGATTTTCTGAAACTTTTTCTTCTACAAATA ATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC GGATACGAACAACAAGTATTAAATATATCTAAATCAA ATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC CCCCATATACCCTACATATATCATCTACTGTTCTTA ATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC TTTTTCTGGATTTAAAAGAAGTACTCCAGCACTTTG ATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC TACTTATTGTAGGTGCTTTTTCTTATTATCTAAGAA ATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC CATTCCCATGCTCCCCCTTTTTTTTATTTGATCAAAA ATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC TTTATTAGTACTTAGTAGTGTCTGATTATCCGTTTT ATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC TGCATTACAAGTTCTTTTATGTTATTATAAATTTAAC ATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC GTCCATTTTCTAATATTTTATATTCCTTTGTAAAACG ATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC TCATCAAACAGTTTATAAATTGCATCATAAACTTTAA ATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC TAAAGGCAGGTGAAAAAAATGATACCACTAGATGAAA ATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATGC AGTTGCAAAGATAGCTTCAAAAGAAGATATAAAGAT ATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC GATTCAAAAGACTATGGCTGAATCATTTAAAGCTGA ATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC GTTATAGGAAGAATTCTTTCTTCCAATAAAGTACCA ATTTACATTCCAATATGGTGCTACTAATAC 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>NC_022777.1|WP_023438288.1|1467869_1469147_+|FAD-dependent-oxidoreductase MKVIVIGGGWAGASAAITAKKAGAQVILYEKTDMLIGLGNVGGIMRNNGRYTAAEELINLGAGDLIKITDKNTRHKNIDFPGHNHAWLYDVNKIEPDVRDYLTSLGIEINFMNRVVDIEKEDKTIRGIYLSDGTYVKGDVFIEATGSTGPMGNCLRYGNGCSMCILRCPSFGPRVSISARAGVEDLQGEREDDVYGAFSGSCKLCKESLSEDLLKEIEEKGSVVLKVPPEDVNLDKLKLKVCQQYALKEFAENIVLLDTGHIKLMSSYYPLDKLRKIKGLEKAKYIDPYAGGKANSIRYLSVAPRRDSMKVKGIDNLFCAGEKSGLFVGHTEAMCTGALAGHNAVRHLLGMPLLILPKTLAIGDLISYANFKMATKEGRRKRYTFAGAEYFERMKNTGLYSTDNQEIVKRVEKLNLLGIMEGKMV >NC_022777.1|WP_023438287.1|1466886_1467873_+|sulfide/dihydroorotate-dehydrogenase-like-FAD/NAD-binding-protein MNYEIKDCIDAGTEYCPCHLAEANECILCSQLRDKDFCDCINWKGVCIYQEFVWNGKKPKEGRKEIECTLLEKEYLYEDLAILKIDVPHKLAKELTSPGSFVFLRNFCEGQFFSAPISVMESNVEENIITLALEIKGIKTKKINKVNAGEKILVKGPFWNGIFGLKNINKSKDKTSIVIARGIGQAPIVPLIKKLYSNGNKIYTLLDEKPFNKSFIDKYLEQYNCHVINTTLIGDKGELTSEFKNILLSIIREDDVNLVHSSAADIINYNVLNLIGETIDFSCCNNAKMCCGEGICGSCSVKNKYFDIERSCKLQIDPRNILEGRKLL >NC_022777.1|WP_023438285.1|1465541_1466678_-|VanZ-family-protein MYAYVFPIKIALLTVIFLIYLAFIPYCIIQYRKHGFLSKYRSFMHIAFVFYIISAFYLVILPLPDRNFVPKHIIHPQLIPFNFIGDFFKEYSNLVARGFSTPSSILKNRGLWQVFFNVLLLTPLGFFLRYFYNINFKKALAISFLTSLFFEVTQLTGIFGIYKYAYRLFDVDDLMLNTIGGVIGYYLVPISKKILPNIDEIDLRYNYDESKVGYIRRGIAFAADLLIVSFIPLINRKNDITSIWFILYIILLPYITNGYTLGKKLVKIRIVNESNTKLKLIELIKRYFWLIVISVLRIIFGLNLLSNFHTTVISIINIIYLIIILIIGFKLFIGLFNKNKTMFYEEFSRTHIANSFKLKSNKNDINRDDGNKEHINKH >NC_022777.1|WP_023438284.1|1465290_1465485_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKNMKLKLARVEKELSQEDLAKIVGVTRQTIGLIESGKYNPTLSLCIAICKVLSRTLDDLFWEE >NC_022777.1|WP_023438283.1|1464760_1465267_+|hypothetical-protein MKLFKKNNHIVDERIENIKNKIYKEISILVMLVCTISIIVKYSMYGQNIKLVATELLIMFSTSVYYVVRIVYLGIYSDEVEMHDRTSKISMNTKNIIIGLVIGISIAIFFGFRSALLYGTTPSIRVQYFSIVFIVSILIYLPFFIIFLTFQHSIANKISKKQSLKRIN >NC_022777.1|WP_023438282.1|1462580_1464140_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein 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MKSKINFKMVFFIFIILVMVIGKICTPYDPNLVDMSISLQPPSSQHLFGTDNLGRDVFSRVLSGAWTTVGTGIIILILSLLIGVPIGLFSGYVGGKVDWVIMRFIDSFIAFPDYIVAIVLSGILGSGTFNLILAIVAVKWVRYARLVRSTVQSEKTKDYILIAKLNGLNTISILNKHLIPHIVGNITAVATMDMGKIILMIASLSYIGLGVQPPNPEWGSMLNEGRTFFQSAPHLMIAPGLAIMIVVLAVNLFGDSISKQYSTRK >NC_022777.1|WP_023438279.1|1460013_1460829_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSVVNINNLIIHANKRPVVDNVSFSINEGEWLALIGESGSGKSVTASSIGLLIHKNLNLVSGDINLNGIDIRSLNEEELRKIRGKEVAYIFQDYQNAFTPFIKIGKQIEEMIKCHIDISDKERKKRILKSLNEVGLDEKRVFNSYPFQLSGGQLQRAAIAQAVILKPKLLIADEPTTALDALTNSKVLELLLDIKEKTKCALLFITHDLRCAKNYANKIAIMHNGKIVEMGSRDKIVNNPEHIYTKNLFASIPPMRHVPKRLYITGEYKII >NC_022777.1|WP_023438278.1|1459181_1459988_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MDSISIPEEDIKDNLLVVDKVVKKYSNGHLALKDASFSMKKGECLGLVGESGSGKSTLARCILMFERIDKGEIWLNGEAIHNMKKTEFRKKQRNMQAVFQNPTASLNSKLKIIDSLMEPLDYQPDVIPSFLKDIRSNRRKSAKALLNMVELPSRYLDSYPCELSGGQKQRVIIARAISVEPSLIILDEPTASLDVSIQARVLNLLKDLQENLGLSYFFISHDLSAVNFMCQRMMVMKEGVIVDRCNRKGLFDKERHSYTKDLLKVFEA >NC_022777.1|WP_023438289.1|1471327_1471606_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYVILVYDIKSDEDGQRVLNRTFKTCKKYLSHIQNSVFEGELAESQIIKLKYELDSIIRKDKDSVILFKSRSKKWLNKDMWGKKEDRTSNFI >NC_022777.1|WP_023438290.1|1471619_1472612_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKRSYYIYNNGALKRKDNSIAFIDELGERRYIPIETVNEIYVMSEMDFNTSLINYLSQYDVIIHFFNYYSFYTGSFQPRKKLVSGNLLVNQVNHYSDNNKRLEIAKKFVDGASYNIYRNLRYYNGRGKDVQTYMDKIEALRKQIYVSANINELMGYEGNIRKIYYEAWNIIIDQKIDFTKRVKNPPDNMINTLISFINTLVYTKILGAIYHTQLNPTVSYLHEPGIRRFSLSLDIAEIFKPILADRLIFSLLNKKQITKKSFTKELNYLHLTKDASKIIVGELDQKLQTTIKHKDLNKNVSYEYLMRLECYKLIKHLLGEKEYEPFKIWW >NC_022777.1|WP_045923686.1|1472629_1473124_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKKEITGVMIYYYKVCKRKLWYFYNEIQMEQGNQSVEIGKAIDEETYRRDKKHINIDNIINIDFIRSKGILHEVKKSNKIEEASILQVKYYLYFLNKRGIENIKGKIDYPLLKQNIDVELTREDVTMIEEILDDIQNIVKASNPPNLEKKRICKSCAYYDLCFI >NC_022777.1|WP_082208650.1|1473152_1475483_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MKGSRKPSCCFIIRRRIMEGKLKILDNDTLKLIEEKKAKPDKTIKEHTLELIEVLNLLRDLGYIKNDKIYELVEKACIYHDLGKLNKEFQKRVNGKNIKFNETKEVVHNILSLYFINSKNFENQEDYLKVAHSVLNHHNYCNNFDEMSEKEDLIQNLIDGFKTYKVKRSVKSKLASIVSDIDSIKIKGYLHKCDYSASSGNVAEYPNKFLENGLKDLLMKWRKGNKEATWNELQNFCIKNKDENIIAVAQTGMGKTEAGLLWIGDTKGFFVLPIRTAINAIYDRVRKDILNNKGIDEKIAILHSSSLEYYIRNITGDTNEKEEIDLMNYHKIGKQLSIPINISTMDQIFDFVYKYPGYELKLTTLSYSKIVIDEIQAYGPDLLAYLICGLEKIAELGGRIAILTATLPPYIKDLLQKNIKFIENSTAFTNDMKRHNLKIIDERINSKDIYNKYVENKELNKNNKILVVCNRIKEAQKLYEELKELINNEELHILHSKFIRKDRLKKESEIIEFGKTYDENKNIDKKNGIWISTSIVEASLDIDFDYLFTELQDLNSLFQRLGRCNRKGKKDSSDYNCYIYAEIDTANLINGDKGFIDKRLFDLSKEAIISYDGQISEKQKVSLIDSYLTTENLKGSDYMRKYKEIYNFIKDIPPYEFDLNQIDLRNILSEEIIPSPVYEEFLEEIKEIECKLANENISYYEKIILKDEIRKYTVSVHPNDIRNYERAKQRGEAINYNRVLLSKHKNDYIKVIECEYDKAGYKRIKYNETTRGSNIW >NC_022777.1|WP_023438293.1|1475482_1476565_-|CRISPR-associated-protein-Cas5 MKVLRIVLTQSSANYKKEETIDNKMTYPLPPISTIIGAIHNACGYKDYHSMDISVQGKFESMHKEPYTDYCFLNSVMDDRGILLKMRNGSLLSNAFDKVASAKKSQGNSFRKGITIQVYNEELLKEYRDLKDLNDKIAHYKKNEFKEKLDSIKAEKTKLAEDKKKLDKKSKEFEDIVKKEKEVKLKEKEFKEKVKEFELEKYIKPISKFRSLTTSLKYYEILNNVELVIHVRSDEKTLNEIEENIYNLKSIGRSEDFVNIIEAKIVTLKENDDCEIRSNYSAYLNYNDVKNKKVWFENVRADQEVSGTKYYINKNYIIKDGKRFFEKKKVIYASQYSIEETSKNIFIDNEDNKEYIVNFI >NC_022777.1|WP_023438294.1|1476592_1477492_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MKYKKALTLTVVANMTSNYSEGLGNIASVQKVFKNRKVYTIRSRESLKNAIMVQSGMYDDLQTEVDGATQKLVNEELNASNCRALEGGYMSTKGTTNIRKSSFYLTDAISCESFVNETRFHNNLYLANNLAKAKNINVQESPKAAGLMPYQYEYDKSLKIYSITIDLEMIGKDENFEQEENYREADNKEKAGRVNAILNAIENLSLTVKGNLDNAEPVFVVGGLSHRKTHYFENVVKVEEEKLIISGDLKDKIEKGYHVGLLEGKTLQNEREIKEQLNPISITKFFDEVRHEVNTYFGV >NC_022777.1|WP_023438295.1|1477507_1478851_-|type-I-CRISPR-associated-protein-Cas8a1/Csx8 MKTSIQNEKYDTMLEPSDWRFSAAIVGLLQYLNYHYLDYKMEEDYILYNSSGINEERYLDFVEYKYGDELHHRLVENILSNEEITEEQLKLINEKLVANTIMKKTFGKIKFDNTNKKEILDIINKNRYELIRETFRSKSDMYANYANTNQLFNDSQDYCRLVGYCIDTGKKGKSTGFNFTMNTFVGSDILEFDFIPFAFEGSREAFFINDNYTIQRLKMSNEILSKKIESDLEGESKRKDARQALFKAIMEASDFIKRDVEVILKDISEDYFETLYIRKESIDIFKELINEKIEYKSFCFSHKITDKYYINIQKRVTESILNNVLLDELIEIFLKEKNRSYLVLQLIKINVLIRRDKTMKDRLKGAFACAKQVSKAIESNKLDSYKQKLTSSIIFKDYDRVCQILLQLSNYSGIEFGFVYDLYDDFEENKDLAYTFINALSKKSENN >NC_022777.1|WP_023438296.1|1478865_1479609_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRFCLTLHLKEKIFPIEYRKVILSYIKNAISKCNNGKYYECFFKDTKQKDYCFSVILPNPAFTKNEIILNGNEIKVLFSTNNNSKIGFILFSAFIAQKNKPYPLPNNNSMILKNINNKKQEEIFNSKAIFKTTLGSGLCVRDHDKEENKDTYYVYTDEKFREKLKVVLVKQILKAGFTEEEAKGIKVNPIQCKKVVVKHYRRYIDTTTGLFEIQANNKILQHFYDAGIGSRKSMGFGMIDLVTQDLL >NC_022777.1|WP_045923593.1|1479938_1480319_-|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_022777_2 | 1555216-1555440 | Orphan |
III-B
Consensus repeat of NC_022777_2
|
3 spacers
spacers of NC_022777_2
>2.1|1555246|35|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT GTTACTGTGTATATTGGTACAAAAAGAATAAAAAC >2.2|1555311|35|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGCTTTATACTTATACAGATGGAGGATGTAGGAAA >2.3|1555376|35|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGTTGTGGAGATTATAGAGATATGCAACATACTGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_022777_2
The CRISPR arrays of NC_022777_2 >merge|NC_022777|2|1555216-1555440|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGAGGTATACATCCTATGTTAAGGTTCAACGTTACTGTGTATATTGGTACAAAAAGAATAAAAACATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACGGCTTTATACTTATACAGATGGAGGATGTAGGAAAATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACAGTTGTGGAGATTATAGAGATATGCAACATACTGCATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC >NC_022777|2|2|1555216-1555440|CRISPRCasFinder TGAGGTATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC GTTACTGTGTATATTGGTACAAAAAGAATAAAAAC ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC GGCTTTATACTTATACAGATGGAGGATGTAGGAAA ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC AGTTGTGGAGATTATAGAGATATGCAACATACTGC ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC >NC_022777|2|2|1555216-1555440|CRT TGAGGTATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC GTTACTGTGTATATTGGTACAAAAAGAATAAAAAC ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC GGCTTTATACTTATACAGATGGAGGATGTAGGAAA ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC AGTTGTGGAGATTATAGAGATATGCAACATACTGC ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC >NC_022777|2|2|1555281-1555440|PILER-CR ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC GGCTTTATACTTATACAGATGGAGGATGTAGGAAA ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC AGTTGTGGAGATTATAGAGATATGCAACATACTGC ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
>NC_022777.1|WP_023438375.1|1553634_1554999_-|MBL-fold-metallo-hydrolase MKALTKIGKILVILIILSVIIAISPKLGSIVFTIVPIIYLIYLFKKGPKFKNYNFLLKGLISFFLILVSTTGIGGVFSEFGEEDNKWKQVATVKTDNVDKNNIKENIDSATPINKEVKDNKETKEIKNNEVAGNLKVHYIDVNQGDSILIQQDGHNMLIDAGINATETSVVSYLKNQGVTKLDYVIGTHPHEDHIGGLEKVIDTFQVDKVFMPEINHTTQTFKNVVTSIKNKGLKISTPKVGNSYGLGNARWQILAPVSASYDNLNNYSIVTKLKFGNNSFIFTGDAESLSEGEILQKQLDISSDVINIGHHGSRTSTTQNFLDKINPKYAVISCGKGNKYGHPTQETLNKLKDKGIKVYRTDECSNVIATSDGNNITFNTKPGSYKGVDNTKSTRKPTSKVQPKPVPKATPKPTAKPQPTLPVVKSQPNSKTVHITNTGKKYHRNGCRSLRKK >NC_022777.1|WP_023438374.1|1552714_1553257_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MDKFKLGKNIKNLRKAKGLTQKKLSEELGLSLQSIIKYESGEREPNFETLNKMANIFNVELSILLLDKEESTSTENKIKNECSSIQKKMEDEISNAVKSWLDGSSEEFELEQKKLYEKYFFSLLRWKLKNISTPEEFFTFMFSCCTLDNFPYLSSKDINDLITTFSQLYKMKIYENYIGK >NC_022777.1|WP_023438373.1|1551647_1552514_-|hypothetical-protein MEGWIKLHRKLLEKAIWRNCTPSQCKVLITILLMCNYEEQQWIWKGKKFMVKPGEMVTSLNNIARNCGEGITPKIVRNSLDKFQQYGFLKSIGSERGRLITINNWEFYQSIGESVEQNKNSEYYEENERHRAKLGQGVSHWNMEDEKKWVLMEGQSEGKVRATNKKDKNIRINIYSAIFSYWNQKGIIKHRQLTKKIESAMDKALKEYSQDEILEAIDRYSTVYFDKDFYYKHSWTLEKFLRQGNGISNYSDEGIIWINYKRHKEKVETKKNCEGCNIHEQREKYILC >NC_022777.1|WP_023438372.1|1550282_1551635_-|AAA-family-ATPase MDILSKMRNIELEQIILGSIILKNSLWIHIEEENIEKDHFYENRHKELFAIMEKLIKDNEVIDMVTLNNYILKKGIENKISISFLSILITNVISTSNFQTYLKELKKYKEKRDIKDIMIYIQSNFHKESEELKEELTKRILNITKEDKKDSGSIREGMDKLLDDLEFRITNGGQDKISGFSTGLRALDLTIDGFEKGDLITVVARSGIGKTTFATSLILNMLRKDYKVAMFSMEMPKEHILKKMAFNHCRVEGDKYKRGELRDEEIQNIVEFVNWIGGKENFFIYNDSNFNSIVWKIKSQLLKKKVDIVFIDYLNKIQGLKENTRDIELNRVTSTLKDIALENNICIVSLTQANRQVDRQQDKRIDLADIKESSSIEQNSDKVISLYRNKKLDNPLYKEKLFNEGKLNYKKPNADYNPDCIEVDVLKCRMGDCKTIACRWSGKHSKISNW >NC_022777.1|WP_023438371.1|1550015_1550255_-|DnaD-domain-protein MLKCNKKQEEEVKKICEVFEKNVRPITIIEYEKILNWMKQSSSDLIILAIEEVSKRNIKNTMYIDTYLKLVKDIKMERC >NC_022777.1|WP_045923688.1|1549448_1549991_-|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MGELYKRYKKGDNDAILEIIDNFKPLIFKESRKWKIKCYDYEDLVQHGYLSIIKALNIFKGEPEKFVGYCIKAIKMNYRALLKGEIKHHREIPDEYILDKADNDYLFTLEDEVIAYEKTKELYNALDKLSKSEKHIIKEAYFNNNSVNKIALDSNLTYNKVRYKKFKALKKLQKELKVHI >NC_022777.1|WP_035109724.1|1549058_1549238_-|YvrJ-family-protein MFDEIVMLISNVGFPVAVTTYLLVRLDQRLEELTKDFIDLTRVIEAALEHQEREENFKK >NC_022777.1|WP_023438368.1|1548703_1549048_+|hypothetical-protein MNIEKLIEELGKSIGKTILNKKEESSKKINIDQMSSTDIFKIIFNKLFREGNYNKAEDLLFDELEKNNSSEVYEIAIEFYNSLLKKTDEELNKRNFSREEIYKGLEDIQKFKVN >NC_022777.1|WP_023438363.1|1544753_1545440_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIILETKNLKKFYGVEPNIVKALDGINLTVEKGDFLSIVGTSGSGKSTLLNMLGGLDTPTSGNVIVRGKELNKLKEEQLTIFRRRNIGFIFQSYNLVPTLNVHENIVLPVDLDGEKVDKPYFNEIINMLALERKLNSLPSQLSGGQQQRVAIARALITKPAIILADEPTGNLDSKTSEDVLALLKRTSEKFNQTIVMITHNNGIAQLADRIVRIEDGKIVGRDLHVSK >NC_022777.1|WP_023438362.1|1543580_1544597_+|two-component-sensor-histidine-kinase MKNNMNKETLFLVVITLLYNLFLLLYFKIFLLLILSILMCVIYIFYCYLSIKKVENEVYAFTESINKSFNELINKEYANIFSLNTMDETLIAKINQKMIRLAEISEHESVKGMKGKKELQVLISDISHQVKTPLTNLKMLQCTLLEKELPKEKRIELLLSVGRQLNKLDFLLNSMIKTSRLETGLIQLNKLEENLFETIAEALSGITILAEKKNMNILVKSSEEFLLKHDRKWTAEALFNVLENAVKYSPKGTVIEIQVSRWEISTKIDIIDQGKGIPEEHHGKIFQRFYREEYNNDEEGIGIGLYLTREIIQKQGGYIKVSSTVSKGSTFSIFLPNN >NC_022777.1|WP_011099656.1|1556095_1556683_-|HDIG-domain-containing-protein MITRKEAWDLLNEYNKEAFHIQHALTVEGTMKYFAEKLGYEDEVEFWSMVGLLHDLDFEIYPEEHCIKTQEIMRQRGLDEKLIRAAASHGYGLCQGELPKPEHQMEKVLFAVDELTGLIGAAARMRPSKSVMDMEISSLKKKFKDKKFAAGCSRDVIKKGAEMLGWELNKLFEETILAMRSCEAYINDEMEVYNN >NC_022777.1|WP_023438376.1|1556918_1557470_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MNINSIIAENLKTLRTERNLSLGQLAELSGISKVMLSQIEKGDTNPTINTLWKIAKGLKVPYTSLLEQKKHDTYVIKKRNIEAQFTEEGHYRVYCYYTSTPYRNFELFQIEIDEGCSYKSIGHSKKCQEYIMVLEGELTLEINNKIYKLTSDDSISFSASSQHIYINSGNGTLKATITNFYPA >NC_022777.1|WP_023438379.1|1558368_1558659_-|ethanolamine-utilization-microcompartment-protein-EutM MKYDALGMIETKGLVGSIEAADAMVKAANVYLIGKEYVGGGLVTVMVRGDVGAVKAATDAGAAAAQRVGELVSVHVIPRPHSEVEVILPSAKETAK >NC_022777.1|WP_011099658.1|1558726_1559377_-|phosphate-propanoyltransferase MDNCEELLKLLLEAVKSQGLNTEVNKNSSEIPVGISNRHIHLSQRDLDILFGNGYELVKIKDLSQPGQYACNETVTICGPKGAIEKVRILGPVRGKTQVEVLTGDCIKLGVVPHVRLSGDLKDTSRITIVGPKGSIQVEEGLIVAQRHIHMTPEDAKYLGVHDGEIVSIKFEDLRGGIYNNVAIRANNTSKLECHIDIEEANAMGITSKSKVTIVK >NC_022777.1|WP_023438380.1|1559376_1560975_-|acetaldehyde-dehydrogenase-(acetylating) MEKYDKDLYSIQQARNLARLGKVAANKIANYTEEQIDKILRNMVRVAEENAVSLAQMAVEETGFGKVEDKTYKNHLAATILYNSIKDMKTIGVISEDKVNKMIEIAEPVGLIMGIVPSTNPTSTAIFKSIIAIKSRNAIVFSPHPAAAKCTIRAVELMRDAAIEAGAPEDIIASLTNLTMEATNELMKNENVSLIIATGGPGMVKAAYSSGKPAIGVGAGNSPAYIERTANVEKAIRDIISSKSFDYGTICASEQSIICEECNHDAVVEELKKQGGYFMTAEETERVCKLLFKNGHTMNAKFVGRSPQVIANAAGFTVSEDIKVLIGKQNGVGNGNPLSFEKLTTVLAFYTVKDWHEACELSIELLQNGIGHTMSIHTQNDDIVMEFAKKPASRILVNTGGSQGGTGASTGLKPAFTLGCGTWGGSSVSENVTPEYLINKKRVAYGLKDCATLVQNDPTFNCIKTASNCRGVQNQFMNMSPAQIAAAAEVLNKCNDYAKNTGCSNESKEKDANNEELLSLVNQIVAAMKGAN >NC_022777.1|WP_023438381.1|1561009_1561699_-|BMC-domain-containing-protein MQALGLIETKGLLAAVEAADVMVKSADVSIIEKTYVGGGLVTISVTGDVGAVKASIEAGAAAVKNLNEEFLVSEHVIPRPHEELESIIGSNNLQEDSSSNEDTSSVENVEKAEVVETTEALEEEQIVEDIYDSKNLKDVDTENKIKENQEKLDEDLDKVNLEKLHKNNVDNLVSKNGLEKIISILNKLKVAKLRSLAGEYKDFGIKVSEISKADKNLLIKKFKLYYEKN >NC_022777.1|WP_023438382.1|1561729_1562380_-|cupin-domain-containing-protein MKKLICAKDVEELILKGEKIFYIDGTEIITPSARDLVKNNGIEFTTKPCEIKVQSLENNKALNMDEFDSEMMINFFKKMMDKGILEEILKCLKQKSLPFEAECDPSGLKVIRGNTVKMDVFDTGNPDAKVYFQELFSKKGSKIGAGFLTIEDSKFHLKLNCEEMNYVIEGTLTVEINGKTYTAHAGDVLFLPKDSTVLLKSFAKTKVFYVKYPESL >NC_022777.1|WP_023438383.1|1562414_1562678_-|EutN/CcmL-family-microcompartment-protein MILAKLIDTVWATRKAESLSGLKFMLAEEASGTYKGRRFIVADTIGAGIGDRVIVSTGSGARRMLGDDNIPIDAVVIGIIDSDCNLS >NC_022777.1|WP_023438384.1|1562674_1562977_-|BMC-domain-containing-protein MDFRIIKSPSNSTKDILKKRMSKNSITDLENADAIGLVQGKFIDMIYASDIAEKAVGVTVEDIRGTCPQHMVLISVLGDTSSVEAALNEIKLKMKEVGAI >NC_022777.1|WP_023438386.1|1562992_1563841_-|ethanolamine-utilization-protein-EutJ MSKGNLTFEYCDNMVQKFEEVIKKPILNESSVYYTGVDLGTACVVLAVLDENYEPVAGAFRYADVVRDGMIVDYIGAVKIVRELKEEIEEKLNTELIYAAAAIPPGTDELDSGAIKNVVQAAGFELTRILDEPTAANALLKIQNGAVVDIGGGTTGISILKDGKVVYVVDEATGGTHFSLVISGAYGMSFKEADKFKRDSKNHKEILPILKPVIEKVSSIINNYIKNHDVCEISLVGGTCCLTGIEEIIEKQTKIYTHKPKNPMFVTPLGIALSCTQDIIEE |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_022777_3 | 1573835-1574124 | TypeI-B |
III-B
Consensus repeat of NC_022777_3
|
4 spacers
spacers of NC_022777_3
>3.1|1573865|36|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT AGATAAATGAATTGTTTAGTTACTTAGAGGAAGGCA >3.2|1573931|34|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT GCTTAGGCTAGGAGCTACCTCTTTTTTTATTTTT >3.3|1573995|34|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT GTTTTGCAGAGGTTCGAGAAAAACTTAAATATTA >3.4|1574059|36|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT TGGTGCTAAATTAACAACTGTTAATCCAAATATAAA >3.5|1573867|36|NC_022777|PILER-CR AGATAAATGAATTGTTTAGTTACTTAGAGGAAGGCA >3.6|1573933|34|NC_022777|PILER-CR GCTTAGGCTAGGAGCTACCTCTTTTTTTATTTTT >3.7|1573997|34|NC_022777|PILER-CR GTTTTGCAGAGGTTCGAGAAAAACTTAAATATTA >3.8|1574061|36|NC_022777|PILER-CR TGGTGCTAAATTAACAACTGTTAATCCAAATATAAA |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7b |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_022777_3
The CRISPR arrays of NC_022777_3 >merge|NC_022777|3|1573835-1574124|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATTAAATACAACTCTTATTATTGTTCAACAGATAAATGAATTGTTTAGTTACTTAGAGGAAGGCAATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACGCTTAGGCTAGGAGCTACCTCTTTTTTTATTTTTATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACGTTTTGCAGAGGTTCGAGAAAAACTTAAATATTAATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACTGGTGCTAAATTAACAACTGTTAATCCAAATATAAAATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC >NC_022777|3|3|1573835-1574124|CRISPRCasFinder TATTAAATACAACTCTTATTATTGTTCAAC AGATAAATGAATTGTTTAGTTACTTAGAGGAAGGCA ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC GCTTAGGCTAGGAGCTACCTCTTTTTTTATTTTT ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC GTTTTGCAGAGGTTCGAGAAAAACTTAAATATTA ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC TGGTGCTAAATTAACAACTGTTAATCCAAATATAAA ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC >NC_022777|3|3|1573835-1574124|CRT TATTAAATACAACTCTTATTATTGTTCAAC AGATAAATGAATTGTTTAGTTACTTAGAGGAAGGCA ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC GCTTAGGCTAGGAGCTACCTCTTTTTTTATTTTT ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC GTTTTGCAGAGGTTCGAGAAAAACTTAAATATTA ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC TGGTGCTAAATTAACAACTGTTAATCCAAATATAAA ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC >NC_022777|3|3|1573837-1574124|PILER-CR TTAAATACAACTCTTATTATTGTTCAACAG ATAAATGAATTGTTTAGTTACTTAGAGGAAGGCAAT TTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACGC TTAGGCTAGGAGCTACCTCTTTTTTTATTTTTAT TTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACGT TTTGCAGAGGTTCGAGAAAAACTTAAATATTAAT TTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACTG GTGCTAAATTAACAACTGTTAATCCAAATATAAAAT TTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC
>NC_022777.1|WP_023438394.1|1572442_1573585_-|iron-containing-alcohol-dehydrogenase MKEFSINTDVYFGEGSLDRLNEIKNKRVLIVCDKFMETSGMVTKVQQKLTDCEVTIYSDIVPDPSVEVIASGIQKLQSCNAQIIIALGGGSSIDGAKAIKEYSKKVTGKTINIEEFYAIPTTSGTGSEVTEYAVITNKQEGLKYAITDKSLLPTVAILDPQLVKSVPKAITADTGMDVITHALEAYVSKNATDFSDALAEKAFTLAFRFLPQAYADGEDIIAREKLHNASCLAGMAFNAAGLGITHSLAHAVGGKLHISHGRSNAIILPYVVEYNANLNKESFNAEYSIAAKKYQRLAKLLKLHAPNVTIGVNNLIKSIVKLQNTLMIPQTLKQQREDINLDETSKEEIINAALRDVCTTSNPRETKKEDFLKILDKVLG >NC_022777.1|WP_023438393.1|1571529_1572360_-|MerR-family-transcriptional-regulator MKEELYSIGKVGEICKITKKALRYYDKMDILSPDKVSDESGYRYYSKKTLLSVPMIKYYKQSGFKLEEMKVFLEGETYDFFHKSFRNKIDELKELEKEINLKIRSVKDWDDLIVEAQNVIENNVCDVAIKYIDNKTLTFLDQEFKYDYMDSIINIEFTNYIDSIENAITGPVIIRFPCHEDKMNGKCTKMRIMQETILKCKEELSVEFGGWMAAACYHIGPHETISDTYKKIKEWTKEHGYICFEECYERYVTDYWTTKNTDKFVTEILIKISRER >NC_022777.1|WP_011099669.1|1569970_1571086_-|membrane-protein 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_022777_4 | 1578188-1578348 | TypeI-B |
III-B
Consensus repeat of NC_022777_4
|
2 spacers
spacers of NC_022777_4
>4.1|1578219|33|NC_022777|PILER-CR AAAAGCTGTTAGAAGTATAGCTTGTTCACCATC >4.2|1578283|35|NC_022777|PILER-CR CTTATGCGTAGTTTCTATATTCCAGTTCTTTTCTT >4.3|1578218|34|NC_022777|CRISPRCasFinder AAAAAGCTGTTAGAAGTATAGCTTGTTCACCATC >4.4|1578282|36|NC_022777|CRISPRCasFinder ACTTATGCGTAGTTTCTATATTCCAGTTCTTTTCTT |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7b,cas8b1,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_022777_4
The CRISPR arrays of NC_022777_4 >merge|NC_022777|4|1578188-1578348|PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACAAAAAGCTGTTAGAAGTATAGCTTGTTCACCATCATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACACTTATGCGTAGTTTCTATATTCCAGTTCTTTTCTTATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACC >NC_022777|4|4|1578188-1578348|PILER-CR ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACA AAAAGCTGTTAGAAGTATAGCTTGTTCACCATC ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACA CTTATGCGTAGTTTCTATATTCCAGTTCTTTTCTT ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACC >NC_022777|4|4|1578188-1578347|CRISPRCasFinder ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC AAAAAGCTGTTAGAAGTATAGCTTGTTCACCATC ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC ACTTATGCGTAGTTTCTATATTCCAGTTCTTTTCTT ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
>NC_022777.1|WP_023438397.1|1576958_1577771_+|hypothetical-protein MFKSLSKKVIISVVILIVVLLGVLGMKNYNKSKDYKNLVTTANEYMNEKDYDKAMDKFKESLDYKKDQKAEEKLEECKNELINLSKEALKNKEYEKADNYLNVLLKHDGKNEEAIKMKNTIKDEIQKSKEEEEIKKAIEKEKREQELKKQMDKEEQAKKKTGITEQNKKKEVKENNKITKEKAESLVQPLKNKNEEIRYLGTRQVPEIPAKSTPYKKFPKEIENKKVYIFDIAVVYNSDSKATIGRYYVDFSGNIYKDTYPSNLECVKVK >NC_022777.1|WP_023438396.1|1575446_1576583_-|cysteine-desulfurase MKKNIYMDYAATTYIKKEVIEAMMPYLTEYYANPSSVYNMSNNLKIVIDEAKEEIADFIGATPEEVFFTSGGTEGNNWAIKGIAYANEEKGKHIITSSIEHPAVLNSCKYLKEKGFEITFLPVDSYGKVDLEKLEKSIRNDTILVSIMAANNEIGTIQHIKSIGEICKRHKVLFHTDAVQALGQISINAEEMDIDLMTITAHKIYGPKGIGALYIKKGTKIENILHGGSQERGKRPGTENTAAIVGFKKAVSLLKENGLEESKRIEKLRDKFIKGLLQIENTKINGAMGKERLKGNVNVSFKNIDGELLLMLLDREGIYASAGSACSAGSIDASHVLVALGLEDEFLKGTIRFTLGARNTEEEVDFVLEKLNQLIKKI >NC_022777.1|WP_172645108.1|1574336_1575413_-|tRNA-2-thiouridine(34)-synthase-MnmA 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MRYYGDEALGLVETIGLVPALEAADKMLKAANVELISYENIGSTLVTIMVKGDVAAVKASVEAGAKAAAAIGKLTAHNVMPRPIREVGDIVSVHDIDL >NC_022777.1|WP_023438390.1|1568984_1569293_-|BMC-domain-containing-protein MARYRALGLIETFGLVFALEAADAMCKAANVELIGYENVASGYISVLVSGDVGACRSAVDAGVAAVNGMEGGNLYSSIVIPSPHEDLEKIIKRYSITTLIPE >NC_022777.1|WP_023438389.1|1566305_1568846_-|choline-trimethylamine-lyase MDIREFSNMLMEATKNMSDEERNGLMNMFQSISKEIRKEEKVTPNVVFNNNGEIPDGMTERLIKLKENYMKQVPSITTHRARAITKIAKENPGVPKSVLRGKCFKYCCETAPLVIQDNELIVGAPNGKPRAGAFSPDIAWRWMEDEIDTIANRPQDPFYISEEDKKIMREELFPYWKGKSVDEYCEDQYREAGVWELSGESFVSDCSYHAVNGGGDSNPGYDVILMKKGMLDIKREAEEKLASLSYERPEDIEKIYFYKSIIDTAEGVMIYAKRMSDYAAELAAKETDPKRKAELQKISEVNARVPAHKPSTFWEAIQAVWTIESLLVVEENQTGMSIGRVDQYMYPFYKSDIESGRMTDFEAFELAGCMLIKMSEMMWITSEGGSKFFAGYQPFVNMCVGGVTREGRDATNELTYLLMDAVRHVKIYQPSLACRIHKGSPQKYLKKIVDVIRAGMGFPACHFDDVHIKMMLAKGVSIEDARDYCLMGCVEPQKAGRLYQWTSTGYTQWPICIELVLNHGVPLWYGKQVCPDMGDLSQFKTYEQFEGAVREQIKYITKWTAVATTISQRVHRELAPKPLMSMMYEGCMEKGRGVEAGGAMYNFGPGVVWSGLATYTDSMAAIKKLVFEEKKYTLEELSEALKADFVGYERLRKDCLEAPKYGNDDDYADYIAADLVNFTEQEHRKYKTLYSVLSHGTLSISNNTPFGQMTGATANGRRAWMPLSDGISPSQGSDFKGPTSIIKSVSKISCEDMNIGMVHNFKLMSGLLDTPEGEQGIIALLRSACALQLGEIQFNYLDNETLIEAQKHPEQYRDLIVRVAGYSAFFVELCKDVQDEIISRTMLTHF >NC_022777.1|WP_011099679.1|1578782_1580366_-|AAA-family-ATPase MKKRFNVTGTCIPERHYMVDISNKLDSILKLVNNEEYFIINRPRQYGKTTTLYMLERYLNKFKDYLVISISFEGIGDLIFQDEKVFSKEFLQIMSDSLLLNSQALSECLEEQKPHVENFIDLSRVITKFIVKAKRKVVLMIDEVDKSSNNQLFLSFLGLLRNKYLLRNVGKDYTFHNVILAGVHDVKSLKLKIRPDEEHKYNSPWNIASDFDVDMSFSIDEIKTMLDDYVENKEVNLDKEYFAEKIYFYTSGYPFLVSKLCKIVDEKIMVKDELKWEKEYLQIAVKELLKESNTNFDSLIKNIENNKDLQELVRKIILDGYEITYNEDNPLITMGVTYGIFKNSHGKVKIHNRIYEQRIYNYMISLIETKINLGFYTERERYLKPNGDLDIKKVLKKFQEFMKHEYSQKREGFLEEDGRLVFLAFLSPIINGAGFAFKEVQGGEEKRFDIVITYNKKMYILELKIWRGEEYHKKGLKQLVEYLNQYGLEEGYLLIFDFRKATNLIGQVEETHINAEDNIKKIIGVYC >NC_022777.1|WP_023438399.1|1580943_1581234_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MSKNFNYNYAFVFYDVNEKRVNRVFKTCKKYLSHFQKSVFRGELTPANFILLKKDLNKVINEDEDFICIIKLMNNKVYDEEILGNPHSCTGEDLIL >NC_022777.1|WP_023438400.1|1581234_1582233_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGSTRYITSVGELKRKDNSLCFRKNNKNVYIPVENTKEIYCMSEVNINSKLLDFLSQNNIIMHFFNYYEGYSGTFYPREHYNSGKLLVKQVETYENRRLEVAKSIVEAIGDNIYELLYHYYKHDKKEVKETLDWIKNHSKTNLKKANDIKQIMQVEGETWQRFYGEFKNILPEEFVMNKRVKRPPDNPINALISFGNTLLYGKTITAIYNTHLDQRISFLHEPSEGRFSLSLDISEAFKPVIVFKTIFDLVNNKRIQVSKHFDKKLNYCLLNDEGRNIFITAFEERMESIFLNEKLKRKISYKTAIKLDCYKLIKFILENKEFKPFSLKERM >NC_022777.1|WP_023438402.1|1582242_1582734_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKVNGTLINYYFHCKRQCWLHGNRINLEDNSQDVKIGKAIHEVKKEKGKQTEISIDNIKIDKITKDYLTEVKKSDSDIEAAKWQLLLYLKVLKDKGIERKGKLEFIEKNKSKSTIIIELDENNLSELEDVIKNIENLLIQENPPEVINESKCKKCAYFEYCYI >NC_022777.1|WP_023438403.1|1582742_1585349_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MYFKNIEKVNLKDVINKSDKIYAHIGNGKKETLKEHLDLSIKYLCKIYESKSLYNVFLKIENNFLEKFSIEGKEFYRKMLLNTIYMHDLGKINCNFQYRKMGNKEFENEEGLKFNNSNHSMLSSIIYINYFFREMGNLKHKEDREFLIVFLLLNSYIISKHHGSLDSFSEFRKRLVENGEEGKRLYTEQMPIFNKIYKEKIFFNENKLNRIFEKYKLILEDETEKNKGFSIELYIYERFLASLLLSCDYYSTSEFKNQKEVEEFGEIKDIEKFYQSFKNTEVYNWIRKYEKNDYGKTDDFSNIDDINVLRNELFLDAEKTMVSNIDKDIFYLEAPTGSGKSNVSFNLSFKMVERFKEINKIFYVYPFNTLVEQNIKTLEKIFKNNEIMKDIAIINSVVPIKIKSSKDNKIKEIDTNEESDILNEDYERALLDRQFLHYPIVLTTHVSIFNYLFGTSKDNLFPLCQIANSIIVLDEIQSYKNRIWKEIITFLACYSRLLNIKIIIMSATLPNLNKLVDGEIKTVNLIENRKKYFENPIFKNRVMVDFSLLEEKENIKEVLFNNVIKNTKAPNKNILVEFITKESAMDFYEKLKDYNKYLQESEKREIELITGDDNRVDRNRIIDKIKSQKNIILVATQVIEAGVDIDMDIGYKDISMLDSEEQFLGRINRSCKNDAQGIVYFFDLDSASNIYKSDIRKEKNINLNFPKIREILINKNFEEFYDYVIKELNKKAGEHNDSSFQTFFLDKIKTLNFKGIEERMKLIDELYKNSVFLNRNITLENEEELCGEDVWNEYIAILKNNKLDYAEKKIKLSQVTANLNYFIYQVPSNDFIYEDRIGDIYYIGDGEKYFEDGKFDRKKFKSIIVDFI >NC_022777.1|WP_023438404.1|1585410_1586172_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MDALKFSLSGRTAFFKKPDVNSFYYFTYGNIHKVALLGILGAICGYGGYNRQCLNKEQIYPEFYGKLKDINIGIVPKNEKGYIDKKIQVFNNSVGYASKELGGNLIVKEQWLENPKWDIYILMDENVPKDLEDRLLNFKFKYIPYLGKNDHMANITDVEYLENIEKLDNTNKLDSIFIKDKYEIQKLDNDLFDMLNDSYKDVCEYKYEEMLPVSLDETTNKYNLETFIYTNSKLKSLTESKTYQCDSKNIFFF >NC_022777.1|WP_023438405.1|1586175_1587135_-|type-I-CRISPR-associated-protein-Cas7 MGMNKRVYGVLGIVSRMSNWNADFTGYPKTTSSGDVFGSDKAFKYPMKKMWENGGEKVLYIKSIKFQENKKKERELIPRTLKERYEYIFDVEDLKKNKDSEEVLKNLFTAIDVKNFGATFAEEGNNISITGAVQIGQGFNKYKETYAEEQQILSPFRDPNQKEKSKDGEEAKSSTLGTKIVSNEAHYFYPFVVNPSSYNQFEEIGVTNGYTEEDYKKFKEASMIAATSFNTNSKIGCENEFALFVETKEDLYLPDLSQYVDFEKVEDKNIITLSCSELLNSFEDEIENIEIYYNPYTTEIKLDEIKKAKKFNIFTKKEV >NC_022777.1|WP_023438406.1|1587140_1588880_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b/Csh1 MLKDVISIFKREYEKIGDRYVTESYIPSDGEYIIVDTFENDFKILDKVIIKKDRKTQKIDDSNQYFPFIREADYLSRLLDMNKPIDHKKIIHSNNYLSFFIKKENVNNGKLSDEIIDRYYEILKDPLIKYKNTKAEKLYEEVEEEHGKVNEKLIDEIKNWIKEKIHDFVDKGSKEKEYLKIFFKYDLDKYRKESEKYISPNLYNSNDYNVKIKEEIYGLPNDNMGLNSKKPYLENKTRKSKVPYLISKEEVLIQKKFFDYLMNQVAIGKSNIYINEKGIKGISNKETLGEDFTGYYLRIQKGKEVEIHNFDTIVNYRAKIEPFKLENVLELEKSELNYNVFIYEIGKLKDLIDNVFFYKFLSGNFFTEAKDLNINDATLKRSILLSRDTLFTWFYKGIDNNVWKNLNISSLNLIKGSINKGYLLKAGEQFNLRSSLKNYFEGGISMADVLLEIKNSLREKINKTSKENKNNEDVTLDNDKEYYFAVGQLAYYLISLSKSKNKNHSLVNPIINAKTNERIKDEIRRLYTRYNYRIEFGSKRVERLYSMISSYIPKGKINEDLIIAGFLKNNLIYEKSEEE >NC_022777.1|WP_023438407.1|1588892_1589585_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MKIYELTLKVFLLKDIKSDESLEKISNLIDKSLSKDGKLLDFHERNTYKNYTFNSLYPIEKDKIYNEGKIYSVQIRTVDESLIQYFKKNLTNEYTEYIKALTLECRVIPQRYIEKIYSITPVIIKTEKGYWKGNLSLGEFEERIKNNLIKKYNSFFNTKIDERFTLFRAINLINNKPISCSYKDINILGDKITLIIDENEMAQKLACFSLGSGVGEMNARGYGFVNYKWL >NC_022777.1|WP_023438408.1|1589704_1589851_-|hypothetical-protein MKKKLKFSISATYEDLKEKERIEIDDIIYIIELVSVITLILKIFQFKN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_022777_5 | 1580469-1580758 | TypeI-B |
III-B
Consensus repeat of NC_022777_5
|
4 spacers
spacers of NC_022777_5
>5.1|1580499|36|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT AACTGTATATATTCTTCGATTGCTACAGAATTTTGA >5.2|1580565|34|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT ATATTTCTTTTTTACTCCAATAAGCTCCAATGAG >5.3|1580629|36|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT TATTAATTTTATATTAAACAAAAATCATAAATTCAA >5.4|1580695|34|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT TTACGGCTGGATCCCTACTATAGTTTTCTAGCTG >5.5|1580499|37|NC_022777|PILER-CR AACTGTATATATTCTTCGATTGCTACAGAATTTTGAA >5.6|1580565|35|NC_022777|PILER-CR ATATTTCTTTTTTACTCCAATAAGCTCCAATGAGA >5.7|1580629|37|NC_022777|PILER-CR TATTAATTTTATATTAAACAAAAATCATAAATTCAAA >5.8|1580695|35|NC_022777|PILER-CR TTACGGCTGGATCCCTACTATAGTTTTCTAGCTGA |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7b,cas8b1,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_022777_5
The CRISPR arrays of NC_022777_5 >merge|NC_022777|5|1580469-1580758|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACAACTGTATATATTCTTCGATTGCTACAGAATTTTGAATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACATATTTCTTTTTTACTCCAATAAGCTCCAATGAGATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACTATTAATTTTATATTAAACAAAAATCATAAATTCAAATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACTTACGGCTGGATCCCTACTATAGTTTTCTAGCTGATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC >NC_022777|5|5|1580469-1580758|CRISPRCasFinder TTTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC AACTGTATATATTCTTCGATTGCTACAGAATTTTGA ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC ATATTTCTTTTTTACTCCAATAAGCTCCAATGAG ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC TATTAATTTTATATTAAACAAAAATCATAAATTCAA ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC TTACGGCTGGATCCCTACTATAGTTTTCTAGCTG ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC >NC_022777|5|4|1580469-1580758|CRT TTTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC AACTGTATATATTCTTCGATTGCTACAGAATTTTGA ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC ATATTTCTTTTTTACTCCAATAAGCTCCAATGAG ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC TATTAATTTTATATTAAACAAAAATCATAAATTCAA ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC TTACGGCTGGATCCCTACTATAGTTTTCTAGCTG ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC >NC_022777|5|5|1580470-1580758|PILER-CR TTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC AACTGTATATATTCTTCGATTGCTACAGAATTTTGAA TTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC ATATTTCTTTTTTACTCCAATAAGCTCCAATGAGA TTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC TATTAATTTTATATTAAACAAAAATCATAAATTCAAA TTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC TTACGGCTGGATCCCTACTATAGTTTTCTAGCTGA TTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC
>NC_022777.1|WP_011099679.1|1578782_1580366_-|AAA-family-ATPase MKKRFNVTGTCIPERHYMVDISNKLDSILKLVNNEEYFIINRPRQYGKTTTLYMLERYLNKFKDYLVISISFEGIGDLIFQDEKVFSKEFLQIMSDSLLLNSQALSECLEEQKPHVENFIDLSRVITKFIVKAKRKVVLMIDEVDKSSNNQLFLSFLGLLRNKYLLRNVGKDYTFHNVILAGVHDVKSLKLKIRPDEEHKYNSPWNIASDFDVDMSFSIDEIKTMLDDYVENKEVNLDKEYFAEKIYFYTSGYPFLVSKLCKIVDEKIMVKDELKWEKEYLQIAVKELLKESNTNFDSLIKNIENNKDLQELVRKIILDGYEITYNEDNPLITMGVTYGIFKNSHGKVKIHNRIYEQRIYNYMISLIETKINLGFYTERERYLKPNGDLDIKKVLKKFQEFMKHEYSQKREGFLEEDGRLVFLAFLSPIINGAGFAFKEVQGGEEKRFDIVITYNKKMYILELKIWRGEEYHKKGLKQLVEYLNQYGLEEGYLLIFDFRKATNLIGQVEETHINAEDNIKKIIGVYC >NC_022777.1|WP_023438397.1|1576958_1577771_+|hypothetical-protein MFKSLSKKVIISVVILIVVLLGVLGMKNYNKSKDYKNLVTTANEYMNEKDYDKAMDKFKESLDYKKDQKAEEKLEECKNELINLSKEALKNKEYEKADNYLNVLLKHDGKNEEAIKMKNTIKDEIQKSKEEEEIKKAIEKEKREQELKKQMDKEEQAKKKTGITEQNKKKEVKENNKITKEKAESLVQPLKNKNEEIRYLGTRQVPEIPAKSTPYKKFPKEIENKKVYIFDIAVVYNSDSKATIGRYYVDFSGNIYKDTYPSNLECVKVK >NC_022777.1|WP_023438396.1|1575446_1576583_-|cysteine-desulfurase MKKNIYMDYAATTYIKKEVIEAMMPYLTEYYANPSSVYNMSNNLKIVIDEAKEEIADFIGATPEEVFFTSGGTEGNNWAIKGIAYANEEKGKHIITSSIEHPAVLNSCKYLKEKGFEITFLPVDSYGKVDLEKLEKSIRNDTILVSIMAANNEIGTIQHIKSIGEICKRHKVLFHTDAVQALGQISINAEEMDIDLMTITAHKIYGPKGIGALYIKKGTKIENILHGGSQERGKRPGTENTAAIVGFKKAVSLLKENGLEESKRIEKLRDKFIKGLLQIENTKINGAMGKERLKGNVNVSFKNIDGELLLMLLDREGIYASAGSACSAGSIDASHVLVALGLEDEFLKGTIRFTLGARNTEEEVDFVLEKLNQLIKKI >NC_022777.1|WP_172645108.1|1574336_1575413_-|tRNA-2-thiouridine(34)-synthase-MnmA MNILKKKVLVGMSGGVDSSVAAYLLKEQGYEVIGATMQIWQDDKEFIEREGGCCSLSAVADARRVANKIGIPFYVMNFKDAFKKNVIDYFVDEYMEGRTPNPCVACNKFIKFSSFLDKAMNLGIDYVATGHYAIIEKQNNRYIIRKSEDDKKDQTYALYNLTQFQLERTLMPCGRYKKSEIREIAKKIGLRVHNKKDSQEICFIPDNDHGKYIKNRFPSKVRQGNFVDKSGNVLGTHKGIVYYTIGQRKGLDIALGKPMYVVDINPFRNEVVLGNLDDLLNTELIAKDVNYIPFDNLKEPMEVEAKIRYSQIPSKAVITPMEDGRVKVNFNEKQRAITKGQSVVFYKGDLLIGGGIIE >NC_022777.1|WP_023438394.1|1572442_1573585_-|iron-containing-alcohol-dehydrogenase MKEFSINTDVYFGEGSLDRLNEIKNKRVLIVCDKFMETSGMVTKVQQKLTDCEVTIYSDIVPDPSVEVIASGIQKLQSCNAQIIIALGGGSSIDGAKAIKEYSKKVTGKTINIEEFYAIPTTSGTGSEVTEYAVITNKQEGLKYAITDKSLLPTVAILDPQLVKSVPKAITADTGMDVITHALEAYVSKNATDFSDALAEKAFTLAFRFLPQAYADGEDIIAREKLHNASCLAGMAFNAAGLGITHSLAHAVGGKLHISHGRSNAIILPYVVEYNANLNKESFNAEYSIAAKKYQRLAKLLKLHAPNVTIGVNNLIKSIVKLQNTLMIPQTLKQQREDINLDETSKEEIINAALRDVCTTSNPRETKKEDFLKILDKVLG >NC_022777.1|WP_023438393.1|1571529_1572360_-|MerR-family-transcriptional-regulator MKEELYSIGKVGEICKITKKALRYYDKMDILSPDKVSDESGYRYYSKKTLLSVPMIKYYKQSGFKLEEMKVFLEGETYDFFHKSFRNKIDELKELEKEINLKIRSVKDWDDLIVEAQNVIENNVCDVAIKYIDNKTLTFLDQEFKYDYMDSIINIEFTNYIDSIENAITGPVIIRFPCHEDKMNGKCTKMRIMQETILKCKEELSVEFGGWMAAACYHIGPHETISDTYKKIKEWTKEHGYICFEECYERYVTDYWTTKNTDKFVTEILIKISRER >NC_022777.1|WP_011099669.1|1569970_1571086_-|membrane-protein MSENSKTVSLEAIAAKKKLSSDFFKKGISLALFSGLAYGLYTAFLTMGMTKGVWGDWYGDNTAGLSVFVIAYLLAALGNAINDTCSAIWSLLYAVVKGKFGDFLRCINTKPGRIMILAALIGGPIASTAYVIALQMAGSIVVPISALCPAIAAILGKVLYKQELNKRMAFGIVICVCASFLIGSTGFTSDGISRNTLLGLLIAIIAALGWGFEGCVAGYGTAMIDPEIGICIRQVTAGIADLCILLPVLGMMAGGINISVDLTMQAFTSAPAMIWFTLSGLLTFMTFMTWYAGNSMCGAGLGTACNGTYSFFGPLFCLLVLGVYGGMDGWALPTVAWIGAVVMIIGILIISMNPLDLFKRKKMEVDVDETA >NC_022777.1|WP_023438392.1|1569717_1569984_-|hypothetical-protein MKPLNYAILKHFTKVPEACVDDVIEALKGEYGHFKALNRKAVTNALMTAEANGLIEEVRFDLDENKQLRVYYHAHKEGADTINKYIPD >NC_022777.1|WP_023438391.1|1569314_1569611_-|BMC-domain-containing-protein MRYYGDEALGLVETIGLVPALEAADKMLKAANVELISYENIGSTLVTIMVKGDVAAVKASVEAGAKAAAAIGKLTAHNVMPRPIREVGDIVSVHDIDL >NC_022777.1|WP_023438390.1|1568984_1569293_-|BMC-domain-containing-protein MARYRALGLIETFGLVFALEAADAMCKAANVELIGYENVASGYISVLVSGDVGACRSAVDAGVAAVNGMEGGNLYSSIVIPSPHEDLEKIIKRYSITTLIPE >NC_022777.1|WP_023438399.1|1580943_1581234_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MSKNFNYNYAFVFYDVNEKRVNRVFKTCKKYLSHFQKSVFRGELTPANFILLKKDLNKVINEDEDFICIIKLMNNKVYDEEILGNPHSCTGEDLIL >NC_022777.1|WP_023438400.1|1581234_1582233_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGSTRYITSVGELKRKDNSLCFRKNNKNVYIPVENTKEIYCMSEVNINSKLLDFLSQNNIIMHFFNYYEGYSGTFYPREHYNSGKLLVKQVETYENRRLEVAKSIVEAIGDNIYELLYHYYKHDKKEVKETLDWIKNHSKTNLKKANDIKQIMQVEGETWQRFYGEFKNILPEEFVMNKRVKRPPDNPINALISFGNTLLYGKTITAIYNTHLDQRISFLHEPSEGRFSLSLDISEAFKPVIVFKTIFDLVNNKRIQVSKHFDKKLNYCLLNDEGRNIFITAFEERMESIFLNEKLKRKISYKTAIKLDCYKLIKFILENKEFKPFSLKERM >NC_022777.1|WP_023438402.1|1582242_1582734_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKVNGTLINYYFHCKRQCWLHGNRINLEDNSQDVKIGKAIHEVKKEKGKQTEISIDNIKIDKITKDYLTEVKKSDSDIEAAKWQLLLYLKVLKDKGIERKGKLEFIEKNKSKSTIIIELDENNLSELEDVIKNIENLLIQENPPEVINESKCKKCAYFEYCYI >NC_022777.1|WP_023438403.1|1582742_1585349_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MYFKNIEKVNLKDVINKSDKIYAHIGNGKKETLKEHLDLSIKYLCKIYESKSLYNVFLKIENNFLEKFSIEGKEFYRKMLLNTIYMHDLGKINCNFQYRKMGNKEFENEEGLKFNNSNHSMLSSIIYINYFFREMGNLKHKEDREFLIVFLLLNSYIISKHHGSLDSFSEFRKRLVENGEEGKRLYTEQMPIFNKIYKEKIFFNENKLNRIFEKYKLILEDETEKNKGFSIELYIYERFLASLLLSCDYYSTSEFKNQKEVEEFGEIKDIEKFYQSFKNTEVYNWIRKYEKNDYGKTDDFSNIDDINVLRNELFLDAEKTMVSNIDKDIFYLEAPTGSGKSNVSFNLSFKMVERFKEINKIFYVYPFNTLVEQNIKTLEKIFKNNEIMKDIAIINSVVPIKIKSSKDNKIKEIDTNEESDILNEDYERALLDRQFLHYPIVLTTHVSIFNYLFGTSKDNLFPLCQIANSIIVLDEIQSYKNRIWKEIITFLACYSRLLNIKIIIMSATLPNLNKLVDGEIKTVNLIENRKKYFENPIFKNRVMVDFSLLEEKENIKEVLFNNVIKNTKAPNKNILVEFITKESAMDFYEKLKDYNKYLQESEKREIELITGDDNRVDRNRIIDKIKSQKNIILVATQVIEAGVDIDMDIGYKDISMLDSEEQFLGRINRSCKNDAQGIVYFFDLDSASNIYKSDIRKEKNINLNFPKIREILINKNFEEFYDYVIKELNKKAGEHNDSSFQTFFLDKIKTLNFKGIEERMKLIDELYKNSVFLNRNITLENEEELCGEDVWNEYIAILKNNKLDYAEKKIKLSQVTANLNYFIYQVPSNDFIYEDRIGDIYYIGDGEKYFEDGKFDRKKFKSIIVDFI >NC_022777.1|WP_023438404.1|1585410_1586172_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MDALKFSLSGRTAFFKKPDVNSFYYFTYGNIHKVALLGILGAICGYGGYNRQCLNKEQIYPEFYGKLKDINIGIVPKNEKGYIDKKIQVFNNSVGYASKELGGNLIVKEQWLENPKWDIYILMDENVPKDLEDRLLNFKFKYIPYLGKNDHMANITDVEYLENIEKLDNTNKLDSIFIKDKYEIQKLDNDLFDMLNDSYKDVCEYKYEEMLPVSLDETTNKYNLETFIYTNSKLKSLTESKTYQCDSKNIFFF >NC_022777.1|WP_023438405.1|1586175_1587135_-|type-I-CRISPR-associated-protein-Cas7 MGMNKRVYGVLGIVSRMSNWNADFTGYPKTTSSGDVFGSDKAFKYPMKKMWENGGEKVLYIKSIKFQENKKKERELIPRTLKERYEYIFDVEDLKKNKDSEEVLKNLFTAIDVKNFGATFAEEGNNISITGAVQIGQGFNKYKETYAEEQQILSPFRDPNQKEKSKDGEEAKSSTLGTKIVSNEAHYFYPFVVNPSSYNQFEEIGVTNGYTEEDYKKFKEASMIAATSFNTNSKIGCENEFALFVETKEDLYLPDLSQYVDFEKVEDKNIITLSCSELLNSFEDEIENIEIYYNPYTTEIKLDEIKKAKKFNIFTKKEV >NC_022777.1|WP_023438406.1|1587140_1588880_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b/Csh1 MLKDVISIFKREYEKIGDRYVTESYIPSDGEYIIVDTFENDFKILDKVIIKKDRKTQKIDDSNQYFPFIREADYLSRLLDMNKPIDHKKIIHSNNYLSFFIKKENVNNGKLSDEIIDRYYEILKDPLIKYKNTKAEKLYEEVEEEHGKVNEKLIDEIKNWIKEKIHDFVDKGSKEKEYLKIFFKYDLDKYRKESEKYISPNLYNSNDYNVKIKEEIYGLPNDNMGLNSKKPYLENKTRKSKVPYLISKEEVLIQKKFFDYLMNQVAIGKSNIYINEKGIKGISNKETLGEDFTGYYLRIQKGKEVEIHNFDTIVNYRAKIEPFKLENVLELEKSELNYNVFIYEIGKLKDLIDNVFFYKFLSGNFFTEAKDLNINDATLKRSILLSRDTLFTWFYKGIDNNVWKNLNISSLNLIKGSINKGYLLKAGEQFNLRSSLKNYFEGGISMADVLLEIKNSLREKINKTSKENKNNEDVTLDNDKEYYFAVGQLAYYLISLSKSKNKNHSLVNPIINAKTNERIKDEIRRLYTRYNYRIEFGSKRVERLYSMISSYIPKGKINEDLIIAGFLKNNLIYEKSEEE >NC_022777.1|WP_023438407.1|1588892_1589585_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MKIYELTLKVFLLKDIKSDESLEKISNLIDKSLSKDGKLLDFHERNTYKNYTFNSLYPIEKDKIYNEGKIYSVQIRTVDESLIQYFKKNLTNEYTEYIKALTLECRVIPQRYIEKIYSITPVIIKTEKGYWKGNLSLGEFEERIKNNLIKKYNSFFNTKIDERFTLFRAINLINNKPISCSYKDINILGDKITLIIDENEMAQKLACFSLGSGVGEMNARGYGFVNYKWL >NC_022777.1|WP_023438408.1|1589704_1589851_-|hypothetical-protein MKKKLKFSISATYEDLKEKERIEIDDIIYIIELVSVITLILKIFQFKN >NC_022777.1|WP_023438413.1|1594021_1595170_-|polysaccharide-deacetylase MRRKNKFGVILFLMIIITALSIILSDSRGSRQFIKSQKSENMASKNEKNKKKIKSEKYNGEMEFYNGEIEHLFFHPLILDKKAAFTGPKWHTDNMDNWLVTVEESKKVINSLYSKGYILIDPNSLYEEYESDGKKLFRKKPLKVPKGKKPLILSIDDLSYNEGMRKATALKLILDENGNLATYRKDQNGKEIIGYDEIVMILDRFVKEHPDFSLNGAKGVIALTGYEGVFGYRTNLDSKNREEEAKKAKVIANKLKENGWKFASHSYGHLDNAKIPFQTLKRDADKWEQLVKPIIGHTSIYVYPHGTAIKTNSEKFKYLQSKGFKIFYSVDSYLGERISENDLVVEGGRMPIDGLSMRNRREAFLKFFDAKEVLDLESRPKR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_022777_6 | 1590062-1590420 | TypeI-B |
III-B
Consensus repeat of NC_022777_6
|
5 spacers
spacers of NC_022777_6
>6.1|1590092|37|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT GATATCTCCTATTATAACTAGTATTGCCAATAATCCT >6.2|1590159|36|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAGTAGCTATATCTATACTTATTGCTATAGCTATAA >6.3|1590225|37|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCAAAGAACAAGTATTAGAGTACGTAAATAGGTTTGG >6.4|1590292|35|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAAGCCAATCAAAATCTATTTTATATTTAGATTT >6.5|1590357|34|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGCAGAGAAATCGCAAGAATAACAGCTAAACCAA |
cas6,cas8b1,cas7b,cas5,cas3,cas4,cas1,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_022777_6
The CRISPR arrays of NC_022777_6 >merge|NC_022777|6|1590062-1590420|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTAAATACACATAATGTTAAGGTTTAACGATATCTCCTATTATAACTAGTATTGCCAATAATCCTATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACTAGTAGCTATATCTATACTTATTGCTATAGCTATAAATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACGCAAAGAACAAGTATTAGAGTACGTAAATAGGTTTGGATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACAAAAGCCAATCAAAATCTATTTTATATTTAGATTTATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAACGGCAGAGAAATCGCAAGAATAACAGCTAAACCAAATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC >NC_022777|6|6|1590062-1590420|CRISPRCasFinder TTTTAAATACACATAATGTTAAGGTTTAAC GATATCTCCTATTATAACTAGTATTGCCAATAATCCT ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC TAGTAGCTATATCTATACTTATTGCTATAGCTATAA ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC GCAAAGAACAAGTATTAGAGTACGTAAATAGGTTTGG ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC AAAAGCCAATCAAAATCTATTTTATATTTAGATTT ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC GGCAGAGAAATCGCAAGAATAACAGCTAAACCAA ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC >NC_022777|6|5|1590062-1590420|CRT TTTTAAATACACATAATGTTAAGGTTTAAC GATATCTCCTATTATAACTAGTATTGCCAATAATCCT ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC TAGTAGCTATATCTATACTTATTGCTATAGCTATAA ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC GCAAAGAACAAGTATTAGAGTACGTAAATAGGTTTGG ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC AAAAGCCAATCAAAATCTATTTTATATTTAGATTT ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC GGCAGAGAAATCGCAAGAATAACAGCTAAACCAA ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC >NC_022777|6|6|1590129-1590420|PILER-CR ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC TAGTAGCTATATCTATACTTATTGCTATAGCTATAA ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC GCAAAGAACAAGTATTAGAGTACGTAAATAGGTTTGG ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC AAAAGCCAATCAAAATCTATTTTATATTTAGATTT ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC GGCAGAGAAATCGCAAGAATAACAGCTAAACCAA ATTTAAATACATCCTATGTTAAGGTTCAAC
>NC_022777.1|WP_023438408.1|1589704_1589851_-|hypothetical-protein MKKKLKFSISATYEDLKEKERIEIDDIIYIIELVSVITLILKIFQFKN >NC_022777.1|WP_023438407.1|1588892_1589585_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MKIYELTLKVFLLKDIKSDESLEKISNLIDKSLSKDGKLLDFHERNTYKNYTFNSLYPIEKDKIYNEGKIYSVQIRTVDESLIQYFKKNLTNEYTEYIKALTLECRVIPQRYIEKIYSITPVIIKTEKGYWKGNLSLGEFEERIKNNLIKKYNSFFNTKIDERFTLFRAINLINNKPISCSYKDINILGDKITLIIDENEMAQKLACFSLGSGVGEMNARGYGFVNYKWL >NC_022777.1|WP_023438406.1|1587140_1588880_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b/Csh1 MLKDVISIFKREYEKIGDRYVTESYIPSDGEYIIVDTFENDFKILDKVIIKKDRKTQKIDDSNQYFPFIREADYLSRLLDMNKPIDHKKIIHSNNYLSFFIKKENVNNGKLSDEIIDRYYEILKDPLIKYKNTKAEKLYEEVEEEHGKVNEKLIDEIKNWIKEKIHDFVDKGSKEKEYLKIFFKYDLDKYRKESEKYISPNLYNSNDYNVKIKEEIYGLPNDNMGLNSKKPYLENKTRKSKVPYLISKEEVLIQKKFFDYLMNQVAIGKSNIYINEKGIKGISNKETLGEDFTGYYLRIQKGKEVEIHNFDTIVNYRAKIEPFKLENVLELEKSELNYNVFIYEIGKLKDLIDNVFFYKFLSGNFFTEAKDLNINDATLKRSILLSRDTLFTWFYKGIDNNVWKNLNISSLNLIKGSINKGYLLKAGEQFNLRSSLKNYFEGGISMADVLLEIKNSLREKINKTSKENKNNEDVTLDNDKEYYFAVGQLAYYLISLSKSKNKNHSLVNPIINAKTNERIKDEIRRLYTRYNYRIEFGSKRVERLYSMISSYIPKGKINEDLIIAGFLKNNLIYEKSEEE >NC_022777.1|WP_023438405.1|1586175_1587135_-|type-I-CRISPR-associated-protein-Cas7 MGMNKRVYGVLGIVSRMSNWNADFTGYPKTTSSGDVFGSDKAFKYPMKKMWENGGEKVLYIKSIKFQENKKKERELIPRTLKERYEYIFDVEDLKKNKDSEEVLKNLFTAIDVKNFGATFAEEGNNISITGAVQIGQGFNKYKETYAEEQQILSPFRDPNQKEKSKDGEEAKSSTLGTKIVSNEAHYFYPFVVNPSSYNQFEEIGVTNGYTEEDYKKFKEASMIAATSFNTNSKIGCENEFALFVETKEDLYLPDLSQYVDFEKVEDKNIITLSCSELLNSFEDEIENIEIYYNPYTTEIKLDEIKKAKKFNIFTKKEV >NC_022777.1|WP_023438404.1|1585410_1586172_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MDALKFSLSGRTAFFKKPDVNSFYYFTYGNIHKVALLGILGAICGYGGYNRQCLNKEQIYPEFYGKLKDINIGIVPKNEKGYIDKKIQVFNNSVGYASKELGGNLIVKEQWLENPKWDIYILMDENVPKDLEDRLLNFKFKYIPYLGKNDHMANITDVEYLENIEKLDNTNKLDSIFIKDKYEIQKLDNDLFDMLNDSYKDVCEYKYEEMLPVSLDETTNKYNLETFIYTNSKLKSLTESKTYQCDSKNIFFF >NC_022777.1|WP_023438403.1|1582742_1585349_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MYFKNIEKVNLKDVINKSDKIYAHIGNGKKETLKEHLDLSIKYLCKIYESKSLYNVFLKIENNFLEKFSIEGKEFYRKMLLNTIYMHDLGKINCNFQYRKMGNKEFENEEGLKFNNSNHSMLSSIIYINYFFREMGNLKHKEDREFLIVFLLLNSYIISKHHGSLDSFSEFRKRLVENGEEGKRLYTEQMPIFNKIYKEKIFFNENKLNRIFEKYKLILEDETEKNKGFSIELYIYERFLASLLLSCDYYSTSEFKNQKEVEEFGEIKDIEKFYQSFKNTEVYNWIRKYEKNDYGKTDDFSNIDDINVLRNELFLDAEKTMVSNIDKDIFYLEAPTGSGKSNVSFNLSFKMVERFKEINKIFYVYPFNTLVEQNIKTLEKIFKNNEIMKDIAIINSVVPIKIKSSKDNKIKEIDTNEESDILNEDYERALLDRQFLHYPIVLTTHVSIFNYLFGTSKDNLFPLCQIANSIIVLDEIQSYKNRIWKEIITFLACYSRLLNIKIIIMSATLPNLNKLVDGEIKTVNLIENRKKYFENPIFKNRVMVDFSLLEEKENIKEVLFNNVIKNTKAPNKNILVEFITKESAMDFYEKLKDYNKYLQESEKREIELITGDDNRVDRNRIIDKIKSQKNIILVATQVIEAGVDIDMDIGYKDISMLDSEEQFLGRINRSCKNDAQGIVYFFDLDSASNIYKSDIRKEKNINLNFPKIREILINKNFEEFYDYVIKELNKKAGEHNDSSFQTFFLDKIKTLNFKGIEERMKLIDELYKNSVFLNRNITLENEEELCGEDVWNEYIAILKNNKLDYAEKKIKLSQVTANLNYFIYQVPSNDFIYEDRIGDIYYIGDGEKYFEDGKFDRKKFKSIIVDFI >NC_022777.1|WP_023438402.1|1582242_1582734_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKVNGTLINYYFHCKRQCWLHGNRINLEDNSQDVKIGKAIHEVKKEKGKQTEISIDNIKIDKITKDYLTEVKKSDSDIEAAKWQLLLYLKVLKDKGIERKGKLEFIEKNKSKSTIIIELDENNLSELEDVIKNIENLLIQENPPEVINESKCKKCAYFEYCYI >NC_022777.1|WP_023438400.1|1581234_1582233_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGSTRYITSVGELKRKDNSLCFRKNNKNVYIPVENTKEIYCMSEVNINSKLLDFLSQNNIIMHFFNYYEGYSGTFYPREHYNSGKLLVKQVETYENRRLEVAKSIVEAIGDNIYELLYHYYKHDKKEVKETLDWIKNHSKTNLKKANDIKQIMQVEGETWQRFYGEFKNILPEEFVMNKRVKRPPDNPINALISFGNTLLYGKTITAIYNTHLDQRISFLHEPSEGRFSLSLDISEAFKPVIVFKTIFDLVNNKRIQVSKHFDKKLNYCLLNDEGRNIFITAFEERMESIFLNEKLKRKISYKTAIKLDCYKLIKFILENKEFKPFSLKERM >NC_022777.1|WP_023438399.1|1580943_1581234_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MSKNFNYNYAFVFYDVNEKRVNRVFKTCKKYLSHFQKSVFRGELTPANFILLKKDLNKVINEDEDFICIIKLMNNKVYDEEILGNPHSCTGEDLIL >NC_022777.1|WP_011099679.1|1578782_1580366_-|AAA-family-ATPase 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>NC_022777.1|WP_023438414.1|1596183_1596507_-|hypothetical-protein MFNTDDSEISEIITAAIHDSSGIGLEDTSSLKFMILEGDWNNKEIPQCFEGIKSAGESGKIQVLSRGKNLFNKDSIYYLNVVTGKTIRNLSKFGSSFIVVKPNTSYM >NC_022777.1|WP_155276578.1|1597726_1597885_+|hypothetical-protein MKLNIKIINAKYIFTFNIAFRIPRTNDIAGYAKNIKSIINPLKVSLPYLKII >NC_022777.1|WP_023438418.1|1598095_1599184_-|amidase-domain-containing-protein MKKKLMELKSKLDYGSLKNAYIIKGDEITNEDIKALIDNYFNWTYENLINNTIGELQNIVGNNKLVEFKKSKLKWLVNWYGKNEEEIKDYKIYTEINDVDINGNIIYINVIYGEDLILKSNSDIVQKIRNQEHKILAKNVGSKLVIIHDYYNDELADEMFLVSDREFKTNKKVKSINKKLEKKTLEINKNIKKIDKLVKQYKRNLHNTLQINNIQERKYPGYDGIAAAKYAVKYAINYNPEYQDYNGRGGDCTNFISQCIYAGGIPTDNVWYKDSHAWIRVVELRSWLLKKGYARELTVQDNAKKGDLIQLRNSGGYWYHSLIVTYKNSSNGELFVSCHTGDYVNRALSTYTTDRRYLILTS >NC_022777.1|WP_011099692.1|1599348_1599906_+|hypothetical-protein MIKTKKKVFANVSFTVLLLVLINTSVFAAYPSKATMDNTWGFEKGDSTEKQLIYHQHGDLDWKGHVDFAMNEININPADISCYYGTSEDLANIVVTSNYWPDATWSGSTYAPIGLEPKTIELNSSAELTDWQRDAVTTHEFVHIWGINDSRNKNSISYGFTPVNYRTITDDVTTLLKNRYNEEVK 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_022777_7 | 1592328-1593005 | TypeI-B |
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Consensus repeat of NC_022777_7
|
10 spacers
spacers of NC_022777_7
>7.1|1592358|35|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT GTGCTGCACTTCTAGAACTTAAATTACATTCCTTT >7.2|1592423|35|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT CGATTCCATGGTCTAAAAAAAGAAGATATAAATGA >7.3|1592488|35|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT ATTAACCTTAGTAGATAAAAATATAGAAAACAGAA >7.4|1592553|34|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT TATTAGAAATACTTAGATTTTTAGGTACAGGGAC >7.5|1592617|35|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT AGGCTATGGATTATTAAAGAGTTTAATTTAGATAA >7.6|1592682|34|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT TTTTATCATCTAGTCCTTTAAAAATTAAAGTTAG >7.7|1592746|36|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT TTTATTTCTTCCTCGGTATCTGCTATAGCAACTATG >7.8|1592812|35|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT AAAGATAAGAGAGAAGGATTACTTCCAGAAGTAGC >7.9|1592877|34|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT CTAATAGTAGGATAATAATTCAATTCATTTAACA >7.10|1592941|35|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT CATTGCTTCTATTTGTACTGCCCTGGTCGATTCAC >7.11|1592359|35|NC_022777|PILER-CR GTGCTGCACTTCTAGAACTTAAATTACATTCCTTT >7.12|1592424|35|NC_022777|PILER-CR CGATTCCATGGTCTAAAAAAAGAAGATATAAATGA >7.13|1592489|35|NC_022777|PILER-CR ATTAACCTTAGTAGATAAAAATATAGAAAACAGAA >7.14|1592554|34|NC_022777|PILER-CR TATTAGAAATACTTAGATTTTTAGGTACAGGGAC >7.15|1592618|35|NC_022777|PILER-CR AGGCTATGGATTATTAAAGAGTTTAATTTAGATAA >7.16|1592683|34|NC_022777|PILER-CR TTTTATCATCTAGTCCTTTAAAAATTAAAGTTAG >7.17|1592747|36|NC_022777|PILER-CR TTTATTTCTTCCTCGGTATCTGCTATAGCAACTATG >7.18|1592813|35|NC_022777|PILER-CR AAAGATAAGAGAGAAGGATTACTTCCAGAAGTAGC >7.19|1592878|34|NC_022777|PILER-CR CTAATAGTAGGATAATAATTCAATTCATTTAACA >7.20|1592942|35|NC_022777|PILER-CR CATTGCTTCTATTTGTACTGCCCTGGTCGATTCAC |
cas6,cas8b1,cas7b,cas5,cas3,cas4,cas1,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_022777_7
The CRISPR arrays of NC_022777_7 >merge|NC_022777|7|1592328-1593005|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACGTGCTGCACTTCTAGAACTTAAATTACATTCCTTTATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACCGATTCCATGGTCTAAAAAAAGAAGATATAAATGAATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACATTAACCTTAGTAGATAAAAATATAGAAAACAGAAATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACTATTAGAAATACTTAGATTTTTAGGTACAGGGACATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACAGGCTATGGATTATTAAAGAGTTTAATTTAGATAAATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACTTTTATCATCTAGTCCTTTAAAAATTAAAGTTAGATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACTTTATTTCTTCCTCGGTATCTGCTATAGCAACTATGATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACAAAGATAAGAGAGAAGGATTACTTCCAGAAGTAGCATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACCTAATAGTAGGATAATAATTCAATTCATTTAACAATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACCATTGCTTCTATTTGTACTGCCCTGGTCGATTCACATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC >NC_022777|7|7|1592328-1593005|CRISPRCasFinder TTTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC GTGCTGCACTTCTAGAACTTAAATTACATTCCTTT ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC CGATTCCATGGTCTAAAAAAAGAAGATATAAATGA ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC ATTAACCTTAGTAGATAAAAATATAGAAAACAGAA ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC TATTAGAAATACTTAGATTTTTAGGTACAGGGAC ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC AGGCTATGGATTATTAAAGAGTTTAATTTAGATAA ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC TTTTATCATCTAGTCCTTTAAAAATTAAAGTTAG ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC TTTATTTCTTCCTCGGTATCTGCTATAGCAACTATG ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC AAAGATAAGAGAGAAGGATTACTTCCAGAAGTAGC ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC CTAATAGTAGGATAATAATTCAATTCATTTAACA ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC CATTGCTTCTATTTGTACTGCCCTGGTCGATTCAC ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC >NC_022777|7|6|1592328-1593005|CRT TTTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC GTGCTGCACTTCTAGAACTTAAATTACATTCCTTT ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC CGATTCCATGGTCTAAAAAAAGAAGATATAAATGA ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC ATTAACCTTAGTAGATAAAAATATAGAAAACAGAA ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC TATTAGAAATACTTAGATTTTTAGGTACAGGGAC ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC AGGCTATGGATTATTAAAGAGTTTAATTTAGATAA ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC TTTTATCATCTAGTCCTTTAAAAATTAAAGTTAG ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC TTTATTTCTTCCTCGGTATCTGCTATAGCAACTATG ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC AAAGATAAGAGAGAAGGATTACTTCCAGAAGTAGC ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC CTAATAGTAGGATAATAATTCAATTCATTTAACA ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC CATTGCTTCTATTTGTACTGCCCTGGTCGATTCAC ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC >NC_022777|7|7|1592329-1593005|PILER-CR TTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACG TGCTGCACTTCTAGAACTTAAATTACATTCCTTTA TTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACC GATTCCATGGTCTAAAAAAAGAAGATATAAATGAA TTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACA TTAACCTTAGTAGATAAAAATATAGAAAACAGAAA TTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACT ATTAGAAATACTTAGATTTTTAGGTACAGGGACA TTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACA GGCTATGGATTATTAAAGAGTTTAATTTAGATAAA TTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACT TTTATCATCTAGTCCTTTAAAAATTAAAGTTAGA TTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACT TTATTTCTTCCTCGGTATCTGCTATAGCAACTATGA TTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACA AAGATAAGAGAGAAGGATTACTTCCAGAAGTAGCA TTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACC TAATAGTAGGATAATAATTCAATTCATTTAACAA TTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACC ATTGCTTCTATTTGTACTGCCCTGGTCGATTCACA TTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC
>NC_022777.1|WP_023438408.1|1589704_1589851_-|hypothetical-protein MKKKLKFSISATYEDLKEKERIEIDDIIYIIELVSVITLILKIFQFKN >NC_022777.1|WP_023438407.1|1588892_1589585_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MKIYELTLKVFLLKDIKSDESLEKISNLIDKSLSKDGKLLDFHERNTYKNYTFNSLYPIEKDKIYNEGKIYSVQIRTVDESLIQYFKKNLTNEYTEYIKALTLECRVIPQRYIEKIYSITPVIIKTEKGYWKGNLSLGEFEERIKNNLIKKYNSFFNTKIDERFTLFRAINLINNKPISCSYKDINILGDKITLIIDENEMAQKLACFSLGSGVGEMNARGYGFVNYKWL >NC_022777.1|WP_023438406.1|1587140_1588880_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b/Csh1 MLKDVISIFKREYEKIGDRYVTESYIPSDGEYIIVDTFENDFKILDKVIIKKDRKTQKIDDSNQYFPFIREADYLSRLLDMNKPIDHKKIIHSNNYLSFFIKKENVNNGKLSDEIIDRYYEILKDPLIKYKNTKAEKLYEEVEEEHGKVNEKLIDEIKNWIKEKIHDFVDKGSKEKEYLKIFFKYDLDKYRKESEKYISPNLYNSNDYNVKIKEEIYGLPNDNMGLNSKKPYLENKTRKSKVPYLISKEEVLIQKKFFDYLMNQVAIGKSNIYINEKGIKGISNKETLGEDFTGYYLRIQKGKEVEIHNFDTIVNYRAKIEPFKLENVLELEKSELNYNVFIYEIGKLKDLIDNVFFYKFLSGNFFTEAKDLNINDATLKRSILLSRDTLFTWFYKGIDNNVWKNLNISSLNLIKGSINKGYLLKAGEQFNLRSSLKNYFEGGISMADVLLEIKNSLREKINKTSKENKNNEDVTLDNDKEYYFAVGQLAYYLISLSKSKNKNHSLVNPIINAKTNERIKDEIRRLYTRYNYRIEFGSKRVERLYSMISSYIPKGKINEDLIIAGFLKNNLIYEKSEEE >NC_022777.1|WP_023438405.1|1586175_1587135_-|type-I-CRISPR-associated-protein-Cas7 MGMNKRVYGVLGIVSRMSNWNADFTGYPKTTSSGDVFGSDKAFKYPMKKMWENGGEKVLYIKSIKFQENKKKERELIPRTLKERYEYIFDVEDLKKNKDSEEVLKNLFTAIDVKNFGATFAEEGNNISITGAVQIGQGFNKYKETYAEEQQILSPFRDPNQKEKSKDGEEAKSSTLGTKIVSNEAHYFYPFVVNPSSYNQFEEIGVTNGYTEEDYKKFKEASMIAATSFNTNSKIGCENEFALFVETKEDLYLPDLSQYVDFEKVEDKNIITLSCSELLNSFEDEIENIEIYYNPYTTEIKLDEIKKAKKFNIFTKKEV >NC_022777.1|WP_023438404.1|1585410_1586172_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MDALKFSLSGRTAFFKKPDVNSFYYFTYGNIHKVALLGILGAICGYGGYNRQCLNKEQIYPEFYGKLKDINIGIVPKNEKGYIDKKIQVFNNSVGYASKELGGNLIVKEQWLENPKWDIYILMDENVPKDLEDRLLNFKFKYIPYLGKNDHMANITDVEYLENIEKLDNTNKLDSIFIKDKYEIQKLDNDLFDMLNDSYKDVCEYKYEEMLPVSLDETTNKYNLETFIYTNSKLKSLTESKTYQCDSKNIFFF >NC_022777.1|WP_023438403.1|1582742_1585349_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MYFKNIEKVNLKDVINKSDKIYAHIGNGKKETLKEHLDLSIKYLCKIYESKSLYNVFLKIENNFLEKFSIEGKEFYRKMLLNTIYMHDLGKINCNFQYRKMGNKEFENEEGLKFNNSNHSMLSSIIYINYFFREMGNLKHKEDREFLIVFLLLNSYIISKHHGSLDSFSEFRKRLVENGEEGKRLYTEQMPIFNKIYKEKIFFNENKLNRIFEKYKLILEDETEKNKGFSIELYIYERFLASLLLSCDYYSTSEFKNQKEVEEFGEIKDIEKFYQSFKNTEVYNWIRKYEKNDYGKTDDFSNIDDINVLRNELFLDAEKTMVSNIDKDIFYLEAPTGSGKSNVSFNLSFKMVERFKEINKIFYVYPFNTLVEQNIKTLEKIFKNNEIMKDIAIINSVVPIKIKSSKDNKIKEIDTNEESDILNEDYERALLDRQFLHYPIVLTTHVSIFNYLFGTSKDNLFPLCQIANSIIVLDEIQSYKNRIWKEIITFLACYSRLLNIKIIIMSATLPNLNKLVDGEIKTVNLIENRKKYFENPIFKNRVMVDFSLLEEKENIKEVLFNNVIKNTKAPNKNILVEFITKESAMDFYEKLKDYNKYLQESEKREIELITGDDNRVDRNRIIDKIKSQKNIILVATQVIEAGVDIDMDIGYKDISMLDSEEQFLGRINRSCKNDAQGIVYFFDLDSASNIYKSDIRKEKNINLNFPKIREILINKNFEEFYDYVIKELNKKAGEHNDSSFQTFFLDKIKTLNFKGIEERMKLIDELYKNSVFLNRNITLENEEELCGEDVWNEYIAILKNNKLDYAEKKIKLSQVTANLNYFIYQVPSNDFIYEDRIGDIYYIGDGEKYFEDGKFDRKKFKSIIVDFI >NC_022777.1|WP_023438402.1|1582242_1582734_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKVNGTLINYYFHCKRQCWLHGNRINLEDNSQDVKIGKAIHEVKKEKGKQTEISIDNIKIDKITKDYLTEVKKSDSDIEAAKWQLLLYLKVLKDKGIERKGKLEFIEKNKSKSTIIIELDENNLSELEDVIKNIENLLIQENPPEVINESKCKKCAYFEYCYI >NC_022777.1|WP_023438400.1|1581234_1582233_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGSTRYITSVGELKRKDNSLCFRKNNKNVYIPVENTKEIYCMSEVNINSKLLDFLSQNNIIMHFFNYYEGYSGTFYPREHYNSGKLLVKQVETYENRRLEVAKSIVEAIGDNIYELLYHYYKHDKKEVKETLDWIKNHSKTNLKKANDIKQIMQVEGETWQRFYGEFKNILPEEFVMNKRVKRPPDNPINALISFGNTLLYGKTITAIYNTHLDQRISFLHEPSEGRFSLSLDISEAFKPVIVFKTIFDLVNNKRIQVSKHFDKKLNYCLLNDEGRNIFITAFEERMESIFLNEKLKRKISYKTAIKLDCYKLIKFILENKEFKPFSLKERM >NC_022777.1|WP_023438399.1|1580943_1581234_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MSKNFNYNYAFVFYDVNEKRVNRVFKTCKKYLSHFQKSVFRGELTPANFILLKKDLNKVINEDEDFICIIKLMNNKVYDEEILGNPHSCTGEDLIL >NC_022777.1|WP_011099679.1|1578782_1580366_-|AAA-family-ATPase MKKRFNVTGTCIPERHYMVDISNKLDSILKLVNNEEYFIINRPRQYGKTTTLYMLERYLNKFKDYLVISISFEGIGDLIFQDEKVFSKEFLQIMSDSLLLNSQALSECLEEQKPHVENFIDLSRVITKFIVKAKRKVVLMIDEVDKSSNNQLFLSFLGLLRNKYLLRNVGKDYTFHNVILAGVHDVKSLKLKIRPDEEHKYNSPWNIASDFDVDMSFSIDEIKTMLDDYVENKEVNLDKEYFAEKIYFYTSGYPFLVSKLCKIVDEKIMVKDELKWEKEYLQIAVKELLKESNTNFDSLIKNIENNKDLQELVRKIILDGYEITYNEDNPLITMGVTYGIFKNSHGKVKIHNRIYEQRIYNYMISLIETKINLGFYTERERYLKPNGDLDIKKVLKKFQEFMKHEYSQKREGFLEEDGRLVFLAFLSPIINGAGFAFKEVQGGEEKRFDIVITYNKKMYILELKIWRGEEYHKKGLKQLVEYLNQYGLEEGYLLIFDFRKATNLIGQVEETHINAEDNIKKIIGVYC >NC_022777.1|WP_023438413.1|1594021_1595170_-|polysaccharide-deacetylase MRRKNKFGVILFLMIIITALSIILSDSRGSRQFIKSQKSENMASKNEKNKKKIKSEKYNGEMEFYNGEIEHLFFHPLILDKKAAFTGPKWHTDNMDNWLVTVEESKKVINSLYSKGYILIDPNSLYEEYESDGKKLFRKKPLKVPKGKKPLILSIDDLSYNEGMRKATALKLILDENGNLATYRKDQNGKEIIGYDEIVMILDRFVKEHPDFSLNGAKGVIALTGYEGVFGYRTNLDSKNREEEAKKAKVIANKLKENGWKFASHSYGHLDNAKIPFQTLKRDADKWEQLVKPIIGHTSIYVYPHGTAIKTNSEKFKYLQSKGFKIFYSVDSYLGERISENDLVVEGGRMPIDGLSMRNRREAFLKFFDAKEVLDLESRPKR >NC_022777.1|WP_023438414.1|1596183_1596507_-|hypothetical-protein MFNTDDSEISEIITAAIHDSSGIGLEDTSSLKFMILEGDWNNKEIPQCFEGIKSAGESGKIQVLSRGKNLFNKDSIYYLNVVTGKTIRNLSKFGSSFIVVKPNTSYM >NC_022777.1|WP_155276578.1|1597726_1597885_+|hypothetical-protein MKLNIKIINAKYIFTFNIAFRIPRTNDIAGYAKNIKSIINPLKVSLPYLKII >NC_022777.1|WP_023438418.1|1598095_1599184_-|amidase-domain-containing-protein MKKKLMELKSKLDYGSLKNAYIIKGDEITNEDIKALIDNYFNWTYENLINNTIGELQNIVGNNKLVEFKKSKLKWLVNWYGKNEEEIKDYKIYTEINDVDINGNIIYINVIYGEDLILKSNSDIVQKIRNQEHKILAKNVGSKLVIIHDYYNDELADEMFLVSDREFKTNKKVKSINKKLEKKTLEINKNIKKIDKLVKQYKRNLHNTLQINNIQERKYPGYDGIAAAKYAVKYAINYNPEYQDYNGRGGDCTNFISQCIYAGGIPTDNVWYKDSHAWIRVVELRSWLLKKGYARELTVQDNAKKGDLIQLRNSGGYWYHSLIVTYKNSSNGELFVSCHTGDYVNRALSTYTTDRRYLILTS >NC_022777.1|WP_011099692.1|1599348_1599906_+|hypothetical-protein MIKTKKKVFANVSFTVLLLVLINTSVFAAYPSKATMDNTWGFEKGDSTEKQLIYHQHGDLDWKGHVDFAMNEININPADISCYYGTSEDLANIVVTSNYWPDATWSGSTYAPIGLEPKTIELNSSAELTDWQRDAVTTHEFVHIWGINDSRNKNSISYGFTPVNYRTITDDVTTLLKNRYNEEVK >NC_022777.1|WP_011099693.1|1599906_1600500_+|hypothetical-protein MIKKISVILALTGVINTNSALSTPPSKVNEPIKPKASASYMEIDGLKELKAKSDIIVEVEGTDKFELIDYKGIKMRKTTVKILDVMKGNPTLKEITVVQTEGLESEEPPMKNEKLLMFLRKGIDITDSYVPIGGNQGIYKIITKKTKKNSMTPKKLPHLNAPKDDAIKIVTPTSLINNKILRDLNGNYDDIKKKLIE >NC_022777.1|WP_080744613.1|1600510_1601818_-|S41-family-peptidase MKMKRFKKITILAVVLIILILSKSFIGKAYYKKNAPEHIKNFSKKEALEDYDYMWNVLERNYPCFNVIERKHGVTIKDIKNGYRKRIENRENVDFKYFNMILNKSINKFSDVGHLYVMDFNFYIMLRGTFDAISKNEIGGIVKNNFEMAINKKTEETYKHIYNISYGKKILKNLNFTNISNKLYDNKNLSFKEIDKDTAYIKINNFYHYNIANDKDKLINFYRKNSDKKNLVIDLTENRGGSDSYWMTNIVAPNIDKELKLYNQYALYKNGDIVNDQWVKKHGNNEYREITKDFSEVLKLSKIRKEDLKDLKYLEISKSIPYNVKPSSKKKLFKGKIYVLVSEQVQSSGEDFVEYCKNTKFATLIGTNTGGNSPAMSPVYDVLPNSGLLLMYQIDYKLNPDGTCNTEFGLPPDIVSKENEEPLDTFKRVILEKKL >NC_022777.1|WP_023438420.1|1601929_1602112_+|hypothetical-protein MILLLISMLSSKIFDIIFFNLLGETTGTLGSIIGFVLPYSIALEIILKKLFFEPSSKDSK >NC_022777.1|WP_023438421.1|1602272_1604000_+|histidine-decarboxylase MKNPMTQPTKDPNTVYPKVPGIDYDKFKLSEDKMTSKQINDALEELHNYISNQQTNFLGYQINQSFNYMKDLKEYLNVHMNNIGDPFVSGNFTVNTKFLERAVLDYFASLWNAQWPHESKGDSNTNDWKNSYWGYVVSMGSTEANFFGIWNARDYLSGKALLLDTSTHKRAKSASVNGNPQSVEPRVLNYQAKSLEDNPNMYTPIAFYSQDTHYSIIKGMRILNFTTFNEAGSGKFECPLKYPEDYPKGFSINYLDENGWPFEVPSNNDGSVFIPALKKLVEAFASKGYPIFVNFNYGTTFKGSYDNVEKAINELVPILKKYNLYEREIIFDKNNKNSDTRTGFWFHVDGALGAAYMPFLEMTTDNEDFPVFDFRLKDVHSISMSGHKWIGVPWPCGIYMSKIKYQLLPPDNPNYIGSPDSTFAGSRNAFSALILWYYIATHSYEDCKNMILDCQDTAKYTVEKLNELSKKLGINLWVEYSSKSLTIRFKEANPDIVFKYSLSGEILYVNGEKRAYSHIYIMPHVTKDLIDKFIEDLSKPGAFPEQVSHLEKDGVNFNSNSHKGIYVPQTGRGFK >NC_022777.1|WP_023438422.1|1604123_1604705_-|TlpA-family-protein-disulfide-reductase MKKRMKKIILLAVFVITIISLVGCSSDKKDNTSQNSKSIQSTSNAKVFPKFQGEDFEGNTVDEKVFSKHPVTVVNLWFAGCKACVDEMPDLEKMSAEFQKKNVKMLGIDIDSTDDKEEVKKLLKAKGVTYQNLMLKSDKEIDEFLSKISAFPTTFLINRKGEIVGEAIEGAINSPKRIEEINRKIDEIIGQDK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_022777_8 | 1596528-1596755 | TypeI-B |
III-B
Consensus repeat of NC_022777_8
|
3 spacers
spacers of NC_022777_8
>8.1|1596558|37|NC_022777|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGCAAAACAATATGGGAATGGAAAACCTAAAGACAA >8.2|1596625|34|NC_022777|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAATCTTCTATTACTCCATACCCCCATACTGAC >8.3|1596689|37|NC_022777|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTTGTTTCTGGATTCAAACAGATCCAGATCAATCCA |
cas6,cas8b1,cas7b,cas5,cas3,cas4,cas1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_022777_8
The CRISPR arrays of NC_022777_8 >merge|NC_022777|8|1596528-1596755|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACTTGCAAAACAATATGGGAATGGAAAACCTAAAGACAAATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACAAAATCTTCTATTACTCCATACCCCCATACTGACATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAACGCTTGTTTCTGGATTCAAACAGATCCAGATCAATCCAATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC >NC_022777|8|8|1596528-1596755|PILER-CR ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC TTGCAAAACAATATGGGAATGGAAAACCTAAAGACAA ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC AAAATCTTCTATTACTCCATACCCCCATACTGAC ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC GCTTGTTTCTGGATTCAAACAGATCCAGATCAATCCA ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC >NC_022777|8|8|1596528-1596755|CRISPRCasFinder ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC TTGCAAAACAATATGGGAATGGAAAACCTAAAGACAA ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC AAAATCTTCTATTACTCCATACCCCCATACTGAC ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC GCTTGTTTCTGGATTCAAACAGATCCAGATCAATCCA ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC >NC_022777|8|7|1596528-1596755|CRT ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC TTGCAAAACAATATGGGAATGGAAAACCTAAAGACAA ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC AAAATCTTCTATTACTCCATACCCCCATACTGAC ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC GCTTGTTTCTGGATTCAAACAGATCCAGATCAATCCA ATTTAAATACAACTCTTGTTATTGTTCAAC
>NC_022777.1|WP_023438414.1|1596183_1596507_-|hypothetical-protein MFNTDDSEISEIITAAIHDSSGIGLEDTSSLKFMILEGDWNNKEIPQCFEGIKSAGESGKIQVLSRGKNLFNKDSIYYLNVVTGKTIRNLSKFGSSFIVVKPNTSYM >NC_022777.1|WP_023438413.1|1594021_1595170_-|polysaccharide-deacetylase MRRKNKFGVILFLMIIITALSIILSDSRGSRQFIKSQKSENMASKNEKNKKKIKSEKYNGEMEFYNGEIEHLFFHPLILDKKAAFTGPKWHTDNMDNWLVTVEESKKVINSLYSKGYILIDPNSLYEEYESDGKKLFRKKPLKVPKGKKPLILSIDDLSYNEGMRKATALKLILDENGNLATYRKDQNGKEIIGYDEIVMILDRFVKEHPDFSLNGAKGVIALTGYEGVFGYRTNLDSKNREEEAKKAKVIANKLKENGWKFASHSYGHLDNAKIPFQTLKRDADKWEQLVKPIIGHTSIYVYPHGTAIKTNSEKFKYLQSKGFKIFYSVDSYLGERISENDLVVEGGRMPIDGLSMRNRREAFLKFFDAKEVLDLESRPKR >NC_022777.1|WP_023438408.1|1589704_1589851_-|hypothetical-protein MKKKLKFSISATYEDLKEKERIEIDDIIYIIELVSVITLILKIFQFKN >NC_022777.1|WP_023438407.1|1588892_1589585_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MKIYELTLKVFLLKDIKSDESLEKISNLIDKSLSKDGKLLDFHERNTYKNYTFNSLYPIEKDKIYNEGKIYSVQIRTVDESLIQYFKKNLTNEYTEYIKALTLECRVIPQRYIEKIYSITPVIIKTEKGYWKGNLSLGEFEERIKNNLIKKYNSFFNTKIDERFTLFRAINLINNKPISCSYKDINILGDKITLIIDENEMAQKLACFSLGSGVGEMNARGYGFVNYKWL >NC_022777.1|WP_023438406.1|1587140_1588880_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b/Csh1 MLKDVISIFKREYEKIGDRYVTESYIPSDGEYIIVDTFENDFKILDKVIIKKDRKTQKIDDSNQYFPFIREADYLSRLLDMNKPIDHKKIIHSNNYLSFFIKKENVNNGKLSDEIIDRYYEILKDPLIKYKNTKAEKLYEEVEEEHGKVNEKLIDEIKNWIKEKIHDFVDKGSKEKEYLKIFFKYDLDKYRKESEKYISPNLYNSNDYNVKIKEEIYGLPNDNMGLNSKKPYLENKTRKSKVPYLISKEEVLIQKKFFDYLMNQVAIGKSNIYINEKGIKGISNKETLGEDFTGYYLRIQKGKEVEIHNFDTIVNYRAKIEPFKLENVLELEKSELNYNVFIYEIGKLKDLIDNVFFYKFLSGNFFTEAKDLNINDATLKRSILLSRDTLFTWFYKGIDNNVWKNLNISSLNLIKGSINKGYLLKAGEQFNLRSSLKNYFEGGISMADVLLEIKNSLREKINKTSKENKNNEDVTLDNDKEYYFAVGQLAYYLISLSKSKNKNHSLVNPIINAKTNERIKDEIRRLYTRYNYRIEFGSKRVERLYSMISSYIPKGKINEDLIIAGFLKNNLIYEKSEEE >NC_022777.1|WP_023438405.1|1586175_1587135_-|type-I-CRISPR-associated-protein-Cas7 MGMNKRVYGVLGIVSRMSNWNADFTGYPKTTSSGDVFGSDKAFKYPMKKMWENGGEKVLYIKSIKFQENKKKERELIPRTLKERYEYIFDVEDLKKNKDSEEVLKNLFTAIDVKNFGATFAEEGNNISITGAVQIGQGFNKYKETYAEEQQILSPFRDPNQKEKSKDGEEAKSSTLGTKIVSNEAHYFYPFVVNPSSYNQFEEIGVTNGYTEEDYKKFKEASMIAATSFNTNSKIGCENEFALFVETKEDLYLPDLSQYVDFEKVEDKNIITLSCSELLNSFEDEIENIEIYYNPYTTEIKLDEIKKAKKFNIFTKKEV >NC_022777.1|WP_023438404.1|1585410_1586172_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MDALKFSLSGRTAFFKKPDVNSFYYFTYGNIHKVALLGILGAICGYGGYNRQCLNKEQIYPEFYGKLKDINIGIVPKNEKGYIDKKIQVFNNSVGYASKELGGNLIVKEQWLENPKWDIYILMDENVPKDLEDRLLNFKFKYIPYLGKNDHMANITDVEYLENIEKLDNTNKLDSIFIKDKYEIQKLDNDLFDMLNDSYKDVCEYKYEEMLPVSLDETTNKYNLETFIYTNSKLKSLTESKTYQCDSKNIFFF >NC_022777.1|WP_023438403.1|1582742_1585349_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MYFKNIEKVNLKDVINKSDKIYAHIGNGKKETLKEHLDLSIKYLCKIYESKSLYNVFLKIENNFLEKFSIEGKEFYRKMLLNTIYMHDLGKINCNFQYRKMGNKEFENEEGLKFNNSNHSMLSSIIYINYFFREMGNLKHKEDREFLIVFLLLNSYIISKHHGSLDSFSEFRKRLVENGEEGKRLYTEQMPIFNKIYKEKIFFNENKLNRIFEKYKLILEDETEKNKGFSIELYIYERFLASLLLSCDYYSTSEFKNQKEVEEFGEIKDIEKFYQSFKNTEVYNWIRKYEKNDYGKTDDFSNIDDINVLRNELFLDAEKTMVSNIDKDIFYLEAPTGSGKSNVSFNLSFKMVERFKEINKIFYVYPFNTLVEQNIKTLEKIFKNNEIMKDIAIINSVVPIKIKSSKDNKIKEIDTNEESDILNEDYERALLDRQFLHYPIVLTTHVSIFNYLFGTSKDNLFPLCQIANSIIVLDEIQSYKNRIWKEIITFLACYSRLLNIKIIIMSATLPNLNKLVDGEIKTVNLIENRKKYFENPIFKNRVMVDFSLLEEKENIKEVLFNNVIKNTKAPNKNILVEFITKESAMDFYEKLKDYNKYLQESEKREIELITGDDNRVDRNRIIDKIKSQKNIILVATQVIEAGVDIDMDIGYKDISMLDSEEQFLGRINRSCKNDAQGIVYFFDLDSASNIYKSDIRKEKNINLNFPKIREILINKNFEEFYDYVIKELNKKAGEHNDSSFQTFFLDKIKTLNFKGIEERMKLIDELYKNSVFLNRNITLENEEELCGEDVWNEYIAILKNNKLDYAEKKIKLSQVTANLNYFIYQVPSNDFIYEDRIGDIYYIGDGEKYFEDGKFDRKKFKSIIVDFI >NC_022777.1|WP_023438402.1|1582242_1582734_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKVNGTLINYYFHCKRQCWLHGNRINLEDNSQDVKIGKAIHEVKKEKGKQTEISIDNIKIDKITKDYLTEVKKSDSDIEAAKWQLLLYLKVLKDKGIERKGKLEFIEKNKSKSTIIIELDENNLSELEDVIKNIENLLIQENPPEVINESKCKKCAYFEYCYI >NC_022777.1|WP_023438400.1|1581234_1582233_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGSTRYITSVGELKRKDNSLCFRKNNKNVYIPVENTKEIYCMSEVNINSKLLDFLSQNNIIMHFFNYYEGYSGTFYPREHYNSGKLLVKQVETYENRRLEVAKSIVEAIGDNIYELLYHYYKHDKKEVKETLDWIKNHSKTNLKKANDIKQIMQVEGETWQRFYGEFKNILPEEFVMNKRVKRPPDNPINALISFGNTLLYGKTITAIYNTHLDQRISFLHEPSEGRFSLSLDISEAFKPVIVFKTIFDLVNNKRIQVSKHFDKKLNYCLLNDEGRNIFITAFEERMESIFLNEKLKRKISYKTAIKLDCYKLIKFILENKEFKPFSLKERM >NC_022777.1|WP_155276578.1|1597726_1597885_+|hypothetical-protein MKLNIKIINAKYIFTFNIAFRIPRTNDIAGYAKNIKSIINPLKVSLPYLKII >NC_022777.1|WP_023438418.1|1598095_1599184_-|amidase-domain-containing-protein MKKKLMELKSKLDYGSLKNAYIIKGDEITNEDIKALIDNYFNWTYENLINNTIGELQNIVGNNKLVEFKKSKLKWLVNWYGKNEEEIKDYKIYTEINDVDINGNIIYINVIYGEDLILKSNSDIVQKIRNQEHKILAKNVGSKLVIIHDYYNDELADEMFLVSDREFKTNKKVKSINKKLEKKTLEINKNIKKIDKLVKQYKRNLHNTLQINNIQERKYPGYDGIAAAKYAVKYAINYNPEYQDYNGRGGDCTNFISQCIYAGGIPTDNVWYKDSHAWIRVVELRSWLLKKGYARELTVQDNAKKGDLIQLRNSGGYWYHSLIVTYKNSSNGELFVSCHTGDYVNRALSTYTTDRRYLILTS >NC_022777.1|WP_011099692.1|1599348_1599906_+|hypothetical-protein MIKTKKKVFANVSFTVLLLVLINTSVFAAYPSKATMDNTWGFEKGDSTEKQLIYHQHGDLDWKGHVDFAMNEININPADISCYYGTSEDLANIVVTSNYWPDATWSGSTYAPIGLEPKTIELNSSAELTDWQRDAVTTHEFVHIWGINDSRNKNSISYGFTPVNYRTITDDVTTLLKNRYNEEVK >NC_022777.1|WP_011099693.1|1599906_1600500_+|hypothetical-protein MIKKISVILALTGVINTNSALSTPPSKVNEPIKPKASASYMEIDGLKELKAKSDIIVEVEGTDKFELIDYKGIKMRKTTVKILDVMKGNPTLKEITVVQTEGLESEEPPMKNEKLLMFLRKGIDITDSYVPIGGNQGIYKIITKKTKKNSMTPKKLPHLNAPKDDAIKIVTPTSLINNKILRDLNGNYDDIKKKLIE >NC_022777.1|WP_080744613.1|1600510_1601818_-|S41-family-peptidase MKMKRFKKITILAVVLIILILSKSFIGKAYYKKNAPEHIKNFSKKEALEDYDYMWNVLERNYPCFNVIERKHGVTIKDIKNGYRKRIENRENVDFKYFNMILNKSINKFSDVGHLYVMDFNFYIMLRGTFDAISKNEIGGIVKNNFEMAINKKTEETYKHIYNISYGKKILKNLNFTNISNKLYDNKNLSFKEIDKDTAYIKINNFYHYNIANDKDKLINFYRKNSDKKNLVIDLTENRGGSDSYWMTNIVAPNIDKELKLYNQYALYKNGDIVNDQWVKKHGNNEYREITKDFSEVLKLSKIRKEDLKDLKYLEISKSIPYNVKPSSKKKLFKGKIYVLVSEQVQSSGEDFVEYCKNTKFATLIGTNTGGNSPAMSPVYDVLPNSGLLLMYQIDYKLNPDGTCNTEFGLPPDIVSKENEEPLDTFKRVILEKKL >NC_022777.1|WP_023438420.1|1601929_1602112_+|hypothetical-protein MILLLISMLSSKIFDIIFFNLLGETTGTLGSIIGFVLPYSIALEIILKKLFFEPSSKDSK >NC_022777.1|WP_023438421.1|1602272_1604000_+|histidine-decarboxylase MKNPMTQPTKDPNTVYPKVPGIDYDKFKLSEDKMTSKQINDALEELHNYISNQQTNFLGYQINQSFNYMKDLKEYLNVHMNNIGDPFVSGNFTVNTKFLERAVLDYFASLWNAQWPHESKGDSNTNDWKNSYWGYVVSMGSTEANFFGIWNARDYLSGKALLLDTSTHKRAKSASVNGNPQSVEPRVLNYQAKSLEDNPNMYTPIAFYSQDTHYSIIKGMRILNFTTFNEAGSGKFECPLKYPEDYPKGFSINYLDENGWPFEVPSNNDGSVFIPALKKLVEAFASKGYPIFVNFNYGTTFKGSYDNVEKAINELVPILKKYNLYEREIIFDKNNKNSDTRTGFWFHVDGALGAAYMPFLEMTTDNEDFPVFDFRLKDVHSISMSGHKWIGVPWPCGIYMSKIKYQLLPPDNPNYIGSPDSTFAGSRNAFSALILWYYIATHSYEDCKNMILDCQDTAKYTVEKLNELSKKLGINLWVEYSSKSLTIRFKEANPDIVFKYSLSGEILYVNGEKRAYSHIYIMPHVTKDLIDKFIEDLSKPGAFPEQVSHLEKDGVNFNSNSHKGIYVPQTGRGFK >NC_022777.1|WP_023438422.1|1604123_1604705_-|TlpA-family-protein-disulfide-reductase MKKRMKKIILLAVFVITIISLVGCSSDKKDNTSQNSKSIQSTSNAKVFPKFQGEDFEGNTVDEKVFSKHPVTVVNLWFAGCKACVDEMPDLEKMSAEFQKKNVKMLGIDIDSTDDKEEVKKLLKAKGVTYQNLMLKSDKEIDEFLSKISAFPTTFLINRKGEIVGEAIEGAINSPKRIEEINRKIDEIIGQDK >NC_022777.1|WP_045923598.1|1604769_1605684_-|4Fe-4S-binding-protein MQKPLDCVWSVLELDRKRNIIQAFSTFITNIHFPNFLKGVLYNGQIKRVCVPGLNCYSCPAATGACPIGSFQAVVGSSKFSFSYYITGILILFGVLLGRFICGFLCPFGWFQDLLYKIPFKKFSTKKLKLLTYLKYLMLFVVVGLLPILITNNVGMGSPFFCKYVCPQGILEGGIPLSIANKGIRSSLGALFALKSVILVMVILLSLMFYRPFCKWICPLGAFYSFFNKISLYSYDFNKDKCVNCGKCRRVCKMDVDITKSTTHNECIRCGECIKVCPTKAISTFWGYEKRNSSTKIIGKYKNI >NC_022777.1|WP_023438424.1|1605637_1605787_-|hypothetical-protein MIITKNKKIITPSALLVAITFIIIGVHRGEVNTVFAKAIRLCLECVGIG |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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NC_022777_1 | 1.7|1470089|36|NC_022777|CRISPRCasFinder | 1470089-1470124 | 36 | KM983331 | Clostridium phage phiCT19406B, complete genome | 24358-24393 | 0 | 1.0 |
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NC_022777_1 | 1.10|1470288|35|NC_022777|CRISPRCasFinder | 1470288-1470322 | 35 | KM983331 | Clostridium phage phiCT19406B, complete genome | 24028-24062 | 0 | 1.0 |
NC_022777_1 | 1.25|1469821|37|NC_022777|PILER-CR,CRT | 1469821-1469857 | 37 | NZ_CP013844 | Clostridium botulinum strain A634 plasmid pRSJ19_2, complete sequence | 19777-19813 | 0 | 1.0 |
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NC_022777_1 | 1.32|1470288|36|NC_022777|PILER-CR,CRT | 1470288-1470323 | 36 | KM983331 | Clostridium phage phiCT19406B, complete genome | 24028-24063 | 0 | 1.0 |
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NC_022777_6 | 6.5|1590357|34|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1590357-1590390 | 34 | NC_029006 | Clostridium phage phiCT19406C, complete genome | 26005-26038 | 0 | 1.0 |
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NC_022777_3 | 3.7|1573997|34|NC_022777|PILER-CR | 1573997-1574030 | 34 | NC_010418 | Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence | 196160-196193 | 3 | 0.912 |
NC_022777_7 | 7.9|1592877|34|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT | 1592877-1592910 | 34 | MN693465 | Marine virus AFVG_25M405, complete genome | 25756-25789 | 7 | 0.794 |
NC_022777_7 | 7.19|1592878|34|NC_022777|PILER-CR | 1592878-1592911 | 34 | MN693465 | Marine virus AFVG_25M405, complete genome | 25756-25789 | 7 | 0.794 |
NC_022777_3 | 3.2|1573931|34|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT | 1573931-1573964 | 34 | NC_028838 | Clostridium phage phiCD506, complete genome | 19424-19457 | 8 | 0.765 |
NC_022777_3 | 3.6|1573933|34|NC_022777|PILER-CR | 1573933-1573966 | 34 | NC_028838 | Clostridium phage phiCD506, complete genome | 19424-19457 | 8 | 0.765 |
NC_022777_7 | 7.1|1592358|35|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT | 1592358-1592392 | 35 | NZ_CP026601 | Clostridiaceae bacterium 14S0207 plasmid unnamed1, complete sequence | 34147-34181 | 8 | 0.771 |
NC_022777_7 | 7.9|1592877|34|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT | 1592877-1592910 | 34 | MN693512 | Marine virus AFVG_25M128, complete genome | 13186-13219 | 8 | 0.765 |
NC_022777_7 | 7.11|1592359|35|NC_022777|PILER-CR | 1592359-1592393 | 35 | NZ_CP026601 | Clostridiaceae bacterium 14S0207 plasmid unnamed1, complete sequence | 34147-34181 | 8 | 0.771 |
NC_022777_7 | 7.19|1592878|34|NC_022777|PILER-CR | 1592878-1592911 | 34 | MN693512 | Marine virus AFVG_25M128, complete genome | 13186-13219 | 8 | 0.765 |
NC_022777_1 | 1.6|1470022|36|NC_022777|CRISPRCasFinder | 1470022-1470057 | 36 | MN693340 | Marine virus AFVG_25M356, complete genome | 21497-21532 | 9 | 0.75 |
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NC_022777_1 | 1.17|1470755|35|NC_022777|CRISPRCasFinder | 1470755-1470789 | 35 | NZ_CP027182 | Acinetobacter baumannii strain AR_0070 plasmid unnamed4, complete sequence | 11218-11252 | 9 | 0.743 |
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NC_022777_1 | 1.20|1470953|34|NC_022777|CRISPRCasFinder | 1470953-1470986 | 34 | NZ_CP009606 | Bacillus cereus strain S2-8 plasmid pBFR_2, complete sequence | 221586-221619 | 9 | 0.735 |
NC_022777_1 | 1.20|1470953|34|NC_022777|CRISPRCasFinder | 1470953-1470986 | 34 | NZ_CP053994 | Bacillus cereus strain FDAARGOS_780 plasmid unnamed1, complete sequence | 295357-295390 | 9 | 0.735 |
NC_022777_1 | 1.20|1470953|34|NC_022777|CRISPRCasFinder | 1470953-1470986 | 34 | NZ_CP053992 | Bacillus cereus strain FDAARGOS_781 plasmid unnamed2, complete sequence | 278373-278406 | 9 | 0.735 |
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NC_022777_5 | 5.3|1580629|36|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT | 1580629-1580664 | 36 | NZ_CP013684 | Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence | 133627-133662 | 9 | 0.75 |
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NC_022777_1 | 1.28|1470022|37|NC_022777|PILER-CR,CRT | 1470022-1470058 | 37 | MN693340 | Marine virus AFVG_25M356, complete genome | 21496-21532 | 10 | 0.73 |
NC_022777_1 | 1.39|1470755|36|NC_022777|PILER-CR,CRT | 1470755-1470790 | 36 | NZ_CP027185 | Acinetobacter baumannii strain AR_0052 plasmid unnamed1, complete sequence | 9854-9889 | 10 | 0.722 |
NC_022777_1 | 1.39|1470755|36|NC_022777|PILER-CR,CRT | 1470755-1470790 | 36 | NZ_CP027182 | Acinetobacter baumannii strain AR_0070 plasmid unnamed4, complete sequence | 11217-11252 | 10 | 0.722 |
NC_022777_1 | 1.42|1470953|35|NC_022777|PILER-CR,CRT | 1470953-1470987 | 35 | NZ_CP009595 | Bacillus cereus strain 3a plasmid pBFC_3, complete sequence | 42873-42907 | 10 | 0.714 |
NC_022777_1 | 1.42|1470953|35|NC_022777|PILER-CR,CRT | 1470953-1470987 | 35 | NZ_CP009606 | Bacillus cereus strain S2-8 plasmid pBFR_2, complete sequence | 221586-221620 | 10 | 0.714 |
NC_022777_1 | 1.42|1470953|35|NC_022777|PILER-CR,CRT | 1470953-1470987 | 35 | NZ_CP053994 | Bacillus cereus strain FDAARGOS_780 plasmid unnamed1, complete sequence | 295357-295391 | 10 | 0.714 |
NC_022777_1 | 1.42|1470953|35|NC_022777|PILER-CR,CRT | 1470953-1470987 | 35 | NZ_CP053992 | Bacillus cereus strain FDAARGOS_781 plasmid unnamed2, complete sequence | 278373-278407 | 10 | 0.714 |
NC_022777_5 | 5.7|1580629|37|NC_022777|PILER-CR | 1580629-1580665 | 37 | NC_010418 | Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence | 25728-25764 | 10 | 0.73 |
NC_022777_5 | 5.7|1580629|37|NC_022777|PILER-CR | 1580629-1580665 | 37 | NZ_CP013684 | Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence | 133626-133662 | 10 | 0.73 |
NC_022777_7 | 7.4|1592553|34|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT | 1592553-1592586 | 34 | KC821607 | Cellulophaga phage phi19:1, complete genome | 55333-55366 | 10 | 0.706 |
NC_022777_7 | 7.5|1592617|35|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT | 1592617-1592651 | 35 | KU878088 | Bacillus phage AR9, complete genome | 141013-141047 | 10 | 0.714 |
NC_022777_7 | 7.5|1592617|35|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT | 1592617-1592651 | 35 | MF360957 | Bacillus virus PBS1, complete genome | 51144-51178 | 10 | 0.714 |
NC_022777_7 | 7.6|1592682|34|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT | 1592682-1592715 | 34 | NZ_CP009218 | Rickettsiales bacterium Ac37b plasmid 1, complete sequence | 21090-21123 | 10 | 0.706 |
NC_022777_7 | 7.14|1592554|34|NC_022777|PILER-CR | 1592554-1592587 | 34 | KC821607 | Cellulophaga phage phi19:1, complete genome | 55333-55366 | 10 | 0.706 |
NC_022777_7 | 7.15|1592618|35|NC_022777|PILER-CR | 1592618-1592652 | 35 | KU878088 | Bacillus phage AR9, complete genome | 141013-141047 | 10 | 0.714 |
NC_022777_7 | 7.15|1592618|35|NC_022777|PILER-CR | 1592618-1592652 | 35 | MF360957 | Bacillus virus PBS1, complete genome | 51144-51178 | 10 | 0.714 |
NC_022777_7 | 7.16|1592683|34|NC_022777|PILER-CR | 1592683-1592716 | 34 | NZ_CP009218 | Rickettsiales bacterium Ac37b plasmid 1, complete sequence | 21090-21123 | 10 | 0.706 |
NC_022777_1 | 1.2|1469756|34|NC_022777|CRISPRCasFinder | 1469756-1469789 | 34 | NC_017804 | Borreliella garinii BgVir plasmid lp54, complete sequence | 971-1004 | 11 | 0.676 |
NC_022777_1 | 1.2|1469756|34|NC_022777|CRISPRCasFinder | 1469756-1469789 | 34 | NC_006129 | Borreliella bavariensis PBi plasmid lp54, complete sequence | 55012-55045 | 11 | 0.676 |
NC_022777_1 | 1.29|1470089|37|NC_022777|PILER-CR,CRT | 1470089-1470125 | 37 | NC_011668 | Shewanella baltica OS223 plasmid pS22302, complete sequence | 48758-48794 | 11 | 0.703 |
NC_022777_7 | 7.4|1592553|34|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT | 1592553-1592586 | 34 | MN693186 | Marine virus AFVG_25M505, complete genome | 15029-15062 | 11 | 0.676 |
NC_022777_7 | 7.14|1592554|34|NC_022777|PILER-CR | 1592554-1592587 | 34 | MN693186 | Marine virus AFVG_25M505, complete genome | 15029-15062 | 11 | 0.676 |
1. spacer 1.3|1469821|36|NC_022777|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013844 (Clostridium botulinum strain A634 plasmid pRSJ19_2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atataacttgtaaaaaatgtgaaaattctcttacat CRISPR spacer atataacttgtaaaaaatgtgaaaattctcttacat Protospacer ************************************
2. spacer 1.7|1470089|36|NC_022777|CRISPRCasFinder matches to KM983334 (Clostridium phage phiCTC2B, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ggatacgaacaacaagtattaaatatatctaaatca CRISPR spacer ggatacgaacaacaagtattaaatatatctaaatca Protospacer ************************************
3. spacer 1.7|1470089|36|NC_022777|CRISPRCasFinder matches to KM983331 (Clostridium phage phiCT19406B, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ggatacgaacaacaagtattaaatatatctaaatca CRISPR spacer ggatacgaacaacaagtattaaatatatctaaatca Protospacer ************************************
4. spacer 1.10|1470288|35|NC_022777|CRISPRCasFinder matches to KM983334 (Clostridium phage phiCTC2B, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tacttattgtaggtgctttttcttattatctaaga CRISPR spacer tacttattgtaggtgctttttcttattatctaaga Protospacer ***********************************
5. spacer 1.10|1470288|35|NC_022777|CRISPRCasFinder matches to KM983331 (Clostridium phage phiCT19406B, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tacttattgtaggtgctttttcttattatctaaga CRISPR spacer tacttattgtaggtgctttttcttattatctaaga Protospacer ***********************************
6. spacer 1.25|1469821|37|NC_022777|PILER-CR,CRT matches to NZ_CP013844 (Clostridium botulinum strain A634 plasmid pRSJ19_2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atataacttgtaaaaaatgtgaaaattctcttacata CRISPR spacer atataacttgtaaaaaatgtgaaaattctcttacata Protospacer *************************************
7. spacer 1.29|1470089|37|NC_022777|PILER-CR,CRT matches to KM983334 (Clostridium phage phiCTC2B, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ggatacgaacaacaagtattaaatatatctaaatcaa CRISPR spacer ggatacgaacaacaagtattaaatatatctaaatcaa Protospacer *************************************
8. spacer 1.29|1470089|37|NC_022777|PILER-CR,CRT matches to KM983331 (Clostridium phage phiCT19406B, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ggatacgaacaacaagtattaaatatatctaaatcaa CRISPR spacer ggatacgaacaacaagtattaaatatatctaaatcaa Protospacer *************************************
9. spacer 1.32|1470288|36|NC_022777|PILER-CR,CRT matches to KM983334 (Clostridium phage phiCTC2B, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tacttattgtaggtgctttttcttattatctaagaa CRISPR spacer tacttattgtaggtgctttttcttattatctaagaa Protospacer ************************************
10. spacer 1.32|1470288|36|NC_022777|PILER-CR,CRT matches to KM983331 (Clostridium phage phiCT19406B, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tacttattgtaggtgctttttcttattatctaagaa CRISPR spacer tacttattgtaggtgctttttcttattatctaagaa Protospacer ************************************
11. spacer 6.4|1590292|35|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_029006 (Clostridium phage phiCT19406C, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaaagccaatcaaaatctattttatatttagattt CRISPR spacer aaaagccaatcaaaatctattttatatttagattt Protospacer ***********************************
12. spacer 6.5|1590357|34|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_029006 (Clostridium phage phiCT19406C, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ggcagagaaatcgcaagaataacagctaaaccaa CRISPR spacer ggcagagaaatcgcaagaataacagctaaaccaa Protospacer **********************************
13. spacer 3.3|1573995|34|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010418 (Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
gttttgcagaggttcgagaaaaacttaaatatta CRISPR spacer ggtttgcagaggttagagaaaaactaaaatatta Protospacer * ************ ********** ********
14. spacer 3.7|1573997|34|NC_022777|PILER-CR matches to NC_010418 (Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
gttttgcagaggttcgagaaaaacttaaatatta CRISPR spacer ggtttgcagaggttagagaaaaactaaaatatta Protospacer * ************ ********** ********
15. spacer 7.9|1592877|34|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693465 (Marine virus AFVG_25M405, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
ctaatagtag-gataataattcaattcatttaaca CRISPR spacer -tacaggtaatgataataattcaaataatttaaca Protospacer ** .***. ************* * ********
16. spacer 7.19|1592878|34|NC_022777|PILER-CR matches to MN693465 (Marine virus AFVG_25M405, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
ctaatagtag-gataataattcaattcatttaaca CRISPR spacer -tacaggtaatgataataattcaaataatttaaca Protospacer ** .***. ************* * ********
17. spacer 3.2|1573931|34|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028838 (Clostridium phage phiCD506, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
gcttaggctaggagctacctctttttttattttt CRISPR spacer taatttgctagttgctacctctttttttatttta Protospacer * ***** ********************
18. spacer 3.6|1573933|34|NC_022777|PILER-CR matches to NC_028838 (Clostridium phage phiCD506, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
gcttaggctaggagctacctctttttttattttt CRISPR spacer taatttgctagttgctacctctttttttatttta Protospacer * ***** ********************
19. spacer 7.1|1592358|35|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026601 (Clostridiaceae bacterium 14S0207 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
gtgctgcacttctagaacttaaattacattccttt CRISPR spacer gtgctgcacttcttgaacttaatttatttttaatc Protospacer ************* ******** ***. **. *.
20. spacer 7.9|1592877|34|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693512 (Marine virus AFVG_25M128, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
ctaatagtag-gataataattcaattcatttaaca CRISPR spacer -tacaggcaatgataataattcaaataatttaaca Protospacer ** .*.*. ************* * ********
21. spacer 7.11|1592359|35|NC_022777|PILER-CR matches to NZ_CP026601 (Clostridiaceae bacterium 14S0207 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
gtgctgcacttctagaacttaaattacattccttt CRISPR spacer gtgctgcacttcttgaacttaatttatttttaatc Protospacer ************* ******** ***. **. *.
22. spacer 7.19|1592878|34|NC_022777|PILER-CR matches to MN693512 (Marine virus AFVG_25M128, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
ctaatagtag-gataataattcaattcatttaaca CRISPR spacer -tacaggcaatgataataattcaaataatttaaca Protospacer ** .*.*. ************* * ********
23. spacer 1.6|1470022|36|NC_022777|CRISPRCasFinder matches to MN693340 (Marine virus AFVG_25M356, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
taagcttgattttctgaaactttttcttctacaaat CRISPR spacer ttaaaatgatcttctgaaacttttttttctactata Protospacer * *. ****.**************.****** *
24. spacer 1.17|1470755|35|NC_022777|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP027185 (Acinetobacter baumannii strain AR_0052 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
agttgcaaagatagcttcaaaagaagatataaaga CRISPR spacer gagggaaaagatggcttcaaaagatgatataaatt Protospacer .. * ******.*********** ********
25. spacer 1.17|1470755|35|NC_022777|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP027182 (Acinetobacter baumannii strain AR_0070 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
agttgcaaagatagcttcaaaagaagatataaaga CRISPR spacer gagggaaaagatggcttcaaaagatgatataaatt Protospacer .. * ******.*********** ********
26. spacer 1.20|1470953|34|NC_022777|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009595 (Bacillus cereus strain 3a plasmid pBFC_3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gttgagaaacgatataaaaaatcaatagtagcca CRISPR spacer attgagaaattatataaaaaatcaatgttgctta Protospacer .********. ***************. *. ..*
27. spacer 1.20|1470953|34|NC_022777|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009606 (Bacillus cereus strain S2-8 plasmid pBFR_2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gttgagaaacgatataaaaaatcaatagtagcca CRISPR spacer attgagaaattatataaaaaatcaatgttgctta Protospacer .********. ***************. *. ..*
28. spacer 1.20|1470953|34|NC_022777|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053994 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_780 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gttgagaaacgatataaaaaatcaatagtagcca CRISPR spacer attgagaaattatataaaaaatcaatgttgctta Protospacer .********. ***************. *. ..*
29. spacer 1.20|1470953|34|NC_022777|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053992 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_781 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gttgagaaacgatataaaaaatcaatagtagcca CRISPR spacer attgagaaattatataaaaaatcaatgttgctta Protospacer .********. ***************. *. ..*
30. spacer 4.2|1578283|35|NC_022777|PILER-CR matches to MN694698 (Marine virus AFVG_250M1036, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
cttatgcgtagtttctatattccagttcttttctt CRISPR spacer taattccgtagtttctatattctaggtcttttgtc Protospacer . * ****************.** ****** *.
31. spacer 4.4|1578282|36|NC_022777|CRISPRCasFinder matches to MN694698 (Marine virus AFVG_250M1036, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
acttatgcgtagtttctatattccagttcttttctt CRISPR spacer ataattccgtagtttctatattctaggtcttttgtc Protospacer *. * ****************.** ****** *.
32. spacer 5.3|1580629|36|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010418 (Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tattaattttatattaaacaaaaatcataaattcaa CRISPR spacer tcatcatttaaaattaaacaaaaatcataaaatagg Protospacer * * **** * ******************* * ..
33. spacer 5.3|1580629|36|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013684 (Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tattaattttatattaaacaaaaatcataaattcaa CRISPR spacer tcatcatttaaaattaaacaaaaatcataaaatagg Protospacer * * **** * ******************* * ..
34. spacer 7.4|1592553|34|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028924 (Polaribacter phage P12002L, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tattagaaatacttagatttttaggtacagggac CRISPR spacer aattagaattacttagatatttaggaagtaaaac Protospacer ******* ********* ****** * ...**
35. spacer 7.4|1592553|34|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028763 (Polaribacter phage P12002S, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tattagaaatacttagatttttaggtacagggac CRISPR spacer aattagaattacttagatatttaggaagtaaaac Protospacer ******* ********* ****** * ...**
36. spacer 7.14|1592554|34|NC_022777|PILER-CR matches to NC_028924 (Polaribacter phage P12002L, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tattagaaatacttagatttttaggtacagggac CRISPR spacer aattagaattacttagatatttaggaagtaaaac Protospacer ******* ********* ****** * ...**
37. spacer 7.14|1592554|34|NC_022777|PILER-CR matches to NC_028763 (Polaribacter phage P12002S, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tattagaaatacttagatttttaggtacagggac CRISPR spacer aattagaattacttagatatttaggaagtaaaac Protospacer ******* ********* ****** * ...**
38. spacer 1.7|1470089|36|NC_022777|CRISPRCasFinder matches to NC_011668 (Shewanella baltica OS223 plasmid pS22302, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
ggatacgaacaacaagtattaaatatatctaaatca CRISPR spacer agtgcagaacaacaaggattaaatatatcgaaagag Protospacer .* ********** ************ *** .
39. spacer 1.28|1470022|37|NC_022777|PILER-CR,CRT matches to MN693340 (Marine virus AFVG_25M356, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
taagcttgattttctgaaactttttcttctacaaata CRISPR spacer ttaaaatgatcttctgaaacttttttttctactatat Protospacer * *. ****.**************.****** *
40. spacer 1.39|1470755|36|NC_022777|PILER-CR,CRT matches to NZ_CP027185 (Acinetobacter baumannii strain AR_0052 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
agttgcaaagatagcttcaaaagaagatataaagat CRISPR spacer gagggaaaagatggcttcaaaagatgatataaatta Protospacer .. * ******.*********** ********
41. spacer 1.39|1470755|36|NC_022777|PILER-CR,CRT matches to NZ_CP027182 (Acinetobacter baumannii strain AR_0070 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
agttgcaaagatagcttcaaaagaagatataaagat CRISPR spacer gagggaaaagatggcttcaaaagatgatataaatta Protospacer .. * ******.*********** ********
42. spacer 1.42|1470953|35|NC_022777|PILER-CR,CRT matches to NZ_CP009595 (Bacillus cereus strain 3a plasmid pBFC_3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
gttgagaaacgatataaaaaatcaatagtagccaa CRISPR spacer attgagaaattatataaaaaatcaatgttgcttat Protospacer .********. ***************. *. ..*
43. spacer 1.42|1470953|35|NC_022777|PILER-CR,CRT matches to NZ_CP009606 (Bacillus cereus strain S2-8 plasmid pBFR_2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
gttgagaaacgatataaaaaatcaatagtagccaa CRISPR spacer attgagaaattatataaaaaatcaatgttgcttat Protospacer .********. ***************. *. ..*
44. spacer 1.42|1470953|35|NC_022777|PILER-CR,CRT matches to NZ_CP053994 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_780 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
gttgagaaacgatataaaaaatcaatagtagccaa CRISPR spacer attgagaaattatataaaaaatcaatgttgcttat Protospacer .********. ***************. *. ..*
45. spacer 1.42|1470953|35|NC_022777|PILER-CR,CRT matches to NZ_CP053992 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_781 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
gttgagaaacgatataaaaaatcaatagtagccaa CRISPR spacer attgagaaattatataaaaaatcaatgttgcttat Protospacer .********. ***************. *. ..*
46. spacer 5.7|1580629|37|NC_022777|PILER-CR matches to NC_010418 (Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tattaattttatattaaacaaaaatcataaattcaaa CRISPR spacer tcatcatttaaaattaaacaaaaatcataaaataggc Protospacer * * **** * ******************* * ..
47. spacer 5.7|1580629|37|NC_022777|PILER-CR matches to NZ_CP013684 (Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tattaattttatattaaacaaaaatcataaattcaaa CRISPR spacer tcatcatttaaaattaaacaaaaatcataaaataggc Protospacer * * **** * ******************* * ..
48. spacer 7.4|1592553|34|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT matches to KC821607 (Cellulophaga phage phi19:1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
tattagaaatacttagatttttaggtacagggac CRISPR spacer aattagaaatacttagatatttaggaatcaaaga Protospacer ***************** ****** *. ....
49. spacer 7.5|1592617|35|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT matches to KU878088 (Bacillus phage AR9, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
aggctatggattattaaagagtttaatttagataa CRISPR spacer ttaatgtggattagtaaagaatttaatttagtaga Protospacer . *.******* ******.********** .*
50. spacer 7.5|1592617|35|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT matches to MF360957 (Bacillus virus PBS1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
aggctatggattattaaagagtttaatttagataa CRISPR spacer ttaatgtggattagtaaagaatttaatttagtaga Protospacer . *.******* ******.********** .*
51. spacer 7.6|1592682|34|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009218 (Rickettsiales bacterium Ac37b plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttttatcatctagtcctttaaaaattaaagttag CRISPR spacer tattctcatctaatcctttaaaaattccatcccc Protospacer * ** *******.************* * ..
52. spacer 7.14|1592554|34|NC_022777|PILER-CR matches to KC821607 (Cellulophaga phage phi19:1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
tattagaaatacttagatttttaggtacagggac CRISPR spacer aattagaaatacttagatatttaggaatcaaaga Protospacer ***************** ****** *. ....
53. spacer 7.15|1592618|35|NC_022777|PILER-CR matches to KU878088 (Bacillus phage AR9, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
aggctatggattattaaagagtttaatttagataa CRISPR spacer ttaatgtggattagtaaagaatttaatttagtaga Protospacer . *.******* ******.********** .*
54. spacer 7.15|1592618|35|NC_022777|PILER-CR matches to MF360957 (Bacillus virus PBS1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
aggctatggattattaaagagtttaatttagataa CRISPR spacer ttaatgtggattagtaaagaatttaatttagtaga Protospacer . *.******* ******.********** .*
55. spacer 7.16|1592683|34|NC_022777|PILER-CR matches to NZ_CP009218 (Rickettsiales bacterium Ac37b plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttttatcatctagtcctttaaaaattaaagttag CRISPR spacer tattctcatctaatcctttaaaaattccatcccc Protospacer * ** *******.************* * ..
56. spacer 1.2|1469756|34|NC_022777|CRISPRCasFinder matches to NC_017804 (Borreliella garinii BgVir plasmid lp54, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
tttgctttatcctctactaatttacggcgtgctt CRISPR spacer tttgctttatcctctaatcatttataaatctgta Protospacer **************** * *****... . *
57. spacer 1.2|1469756|34|NC_022777|CRISPRCasFinder matches to NC_006129 (Borreliella bavariensis PBi plasmid lp54, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
tttgctttatcctctactaatttacggcgtgctt CRISPR spacer tttgctttatcctctaatcatttataaatctata Protospacer **************** * *****... . *
58. spacer 1.29|1470089|37|NC_022777|PILER-CR,CRT matches to NC_011668 (Shewanella baltica OS223 plasmid pS22302, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
ggatacgaacaacaagtattaaatatatctaaatcaa CRISPR spacer agtgcagaacaacaaggattaaatatatcgaaagagg Protospacer .* ********** ************ *** ..
59. spacer 7.4|1592553|34|NC_022777|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693186 (Marine virus AFVG_25M505, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
tattagaaatacttagatttttaggtacagggac CRISPR spacer cagatcgaatacttagatttttacgaacaggtca Protospacer .* .**************** * *****
60. spacer 7.14|1592554|34|NC_022777|PILER-CR matches to MN693186 (Marine virus AFVG_25M505, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
tattagaaatacttagatttttaggtacagggac CRISPR spacer cagatcgaatacttagatttttacgaacaggtca Protospacer .* .**************** * *****
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
459142 : 532262
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_022777|459142:532262|DBSCAN-SWA TGTGGACCAAGCGAAATCCTATATATTTAGGATAGTGAGGGATAGCAAAAATGATGAAAATTATGTTGTAAGTAATATAAAAGCTGATAATCCAGAAGATTTAAATAGAATTTTAAAAGCAGAAATGGAGAATTATCCAAATGCTATAGAATTTAAAGTTAAAACTGAAAAGATACAAGAAACATTTAATAGTTTAGAATCAGCATATGATGATTATTTTAAAGAAAATAGAACAAAATATCCTAATATTAAGTATGGGATAAAATTAAAAAGTCCAGATGGTAAATATAATCCAACAGATGAATATGTAGATGTAATATTTGAAGCTAAATATGTAGTTTATGGAACAGAAGAAGAAATTCCAGCAGAAAAACTTAGGAGCTATGAAGAAGAAGCAGAAAAAATAGCGAAGGACTTTGTAAATAAAGAAATAGGAGGTAAAAATTTATCTGATGCAGAAAAGGCTTTAAAGATAAATGATTATTTAGTAAAAAGAGCAGCATACCATCATGAAGGTGTAAATACATACTATGTAGAAGACCATATCGCATATGGAGTTTTAAGTGATCGAAAAAAAGGTGTTTGTGAATCCTATGCAAAAGCATTCCAATTACTTGCAGAGAAATCAGGATTAACAAGTATTTATGTTACAGGACAAGGAAAGAACCCTAATAAAGATAAAGGAGAAGCTCATGCATGGAATATGGTGAAAATAGATGGTCAGTGGTATAGTATAGATACTACCTGGAACGATATTGGGGAAGGAAGTAGATATGATTACTTCTTAAAGTCAGATGATGATATGAAAGCTACTCACACAAGATCAACAGATTTTAATTATCCTACAGGAAATGGAACAAAAGATTTTGTTGCAGAATTAAAATTAAAATAAAAGTAAGCAAGCTCAGTTTCTTTCGCAAGGATTCCAAGAATCATGAACAAATTATAAACAAAATATTAATTAGTAAAGCTTAAAAGGATAGTCTGTTTTGACTATCCTTTTTTAGATTTCATTATAAAGTAAAAAAACTTTTTGTAAAAAATAAATATTTAGACTAAAGATTTTCTAATAAATACGATAATTATAGTAGAAGAGATATTAAATGATTCAATTTCAGATATACCTAATGAAGTTTTATATGATTATTATAAAATAAAGAAAAAAGGACAGTCCGTTAAGACCATCCTTTCGTGAGTTTTATTATAATGACATTTAAAGGCTAAGAAGAATTTAAAATATCCATATATAATAAATCACTCATTACCATTAATTCTAAGTTAATGGTATAACATAGGAAATCAATCCATGAGGGGGATGAATTCCTACTAATTATATTATAAATGAAATATCCATAAAAGTCATTATAAAATTGAAGGAATTTGAGGAATAGTAATACATATATTATTTAATTAGGTTTATATGGAAGCAAGATGAAAGTAAAAAATATATTCATTGAATGCAAAAATTGCTATATCAAAATAAAATTTTGATATAGCAATAGCAGAGGATTAGCAGATAGTGGTAAACATGAAATTCAATCCACTGTATACAATTTATATAAAGTAAATTCTAATAATTACGATATATATAATAATTTATAATTAAAATTTCAATCATATTGTACGTTCATTAAAATCCGTATAAAACCATATATTTAGTTTATATTATCGATAGAACGCCTTATGCGGTGAAAGTCGCACGTAGGGTGTGGACCAAGCGAAATCCTATGTATTTAGGATAGTAAGGGATAGCAAAGAAACAGAAGAGAAAGAAAAACAAGAACAAGCTGAAAAGGAAAGACAAAAAAAATTAGCCGATGCTCAATCAGTGCAAAAAGCAAAGGATAATTTAAATTTAACTAATTTAAATAATGTAAGTTCTAACATTAATTTACCAAAGGATATTGACGGAGTTTCAATTACTTGGAAATCTAATAACACTAGTGTACTTGATGAAAAAGGAAATGTTACAAGACCATCAGCAACAAAGGGAGATACTTTAGTAACTCTAACAGCTACATTAACAAAGGATGAAGCTAAAGATACTAAAGATTTTATAGTAACTGTTAAAGCTAAAGATTTTACAGATGAAGAACTTGTAGATATGGCTCTTGGCAATTTACAACCGGAAGGAAAACTTGACTCTGTAGTAGATAATTTAAAGTTACCAACTAAAGATGATAAAAATGCTGTGGATATAACTTGGAATTCAAGTAATGAATCAGTAGTTTCAAATGCCGGTGTAGTTACAAGAACGGATAAAGACGAAAATATTACATTAATAGCTACATTAAAAAAAGGCTCTATTACAAAAACTAAAGAATTTAATATAGTAGTTAAAGCAAAAGAAAAAGATACACAAGAAGCTTTAAAACTAATTGCAAATTCCTTAGAAATAAGCAATAAAGGCAGTATAGAAAAAGACATTAATTTACCAACTTCTTTAGATGGAGCAACTGTAATATGGAAGTCAAATAATGAAGCTGTAATAAGTAATACAGGAAAAGTAACAAGACCTAAAATAGGGAAATCAGATGAAAAAGTAACATTAACTGCTACTATAACTAAAGATGGTAAAAATGAAACTAAAGATTTTACAGTAACTGTTAAAGCTGAAAAACAATTAGTAGCTAATAATAAACAAGAATTTAATGAAATTTTAAAACAAGCAATAATAGACTGTGAACCTACGGTAGACATCAGCTTACCAAATTTTGACACTAATAATAATGTATATAAATTTGATGATTATCAAAATCTACTCATTGAAATTGGAGAAATGGATTTTGGAAAGCCAGGAGTAGAAGGTAATTATAAAAATGATGGAAAAGGTTGGATAATGACAGTAGAATTTAAATATAGAAAAGATGCCGCTGAAATTAAAAGACAAAAAGAAGCTACAATAAAGAAAGCTAAAGAGGTTGTAAAAGATGTTATAAAACCAGGTATGAAGCATTATGAAAAAGAATTAGCATTACATGATTATATAGTAAAAACTGCTGATTATAATGTAGAAAACTATAATAAAGGTAAGACTACTTTAGAAGATCATACTGCTTATGGTGTATTAGTAGACCGTATTGGTGTTTGCGAAAGCTATGCTAAAGCTATGAATTTACTTTTAAAAGAAGTTGGAATTGATTGTAAGTATGTTACAGGGTTCTCAAAGCATAATGGAGTTAAAGGCGGAGGACATGCATGGAACATGGTTCAGTTGGATGGAGAATGGTATAACTTAGATGCTACATGGAATGATCCAGTTTCTGATAGAAATGGTGCTGAAAGTGTAAACAAAGACAATACTTCACCAGCAACAGTTAATCATACTTATTTTAATCTTCCAGATGATATTTTTAACAATGATCACATAAGAGGAGATTTTGAAGAAAAGAATTATCCAAAATGTACAGCTACAAAATACTCATACCACAATATGGATGTAGATGAATACACAGCTGATGGAAAATTAATTGAAAAAGTTACAACTAAAGATGAATTAGATGCAAAAATATTAGAAGCTATAAAAAATAAAGAAAAAACTTTAAGTTTAAGAATTAAAGGCTTTAAAATGACCCAAAAGGAGTTAAGTGATGAATTTAAAGCAGTTGCAGAAAAGAATAGAGTGGGTGGATGTAGCTGGAGTACAAGTGCACCAGATGATTACCATGTTAACTATACTATAAAGTGGTAATTTGAAATTTATTTAATACTAATTTAATCAAATAATCAATGTAGAATTGCTATATCGAAATTTTATTTTGGTATAGCAATTTTTTAAAAAATTATATAAAGTCATATTTAACAATTACGATATATATAGTAATTTATATTAAAAATACTTATAAAATAAAATCTTATATTAGTATCTATTGTCGATGGAACGCCCTATGCGGTGAAAATCGCACGTAGGGTGTGGACCAAACGAAATCCTATGTATTTAGGATAGTGAGGGATAGCAGTGAATCAGCAGACAGTGGTGAGCATAAAATAGAATCCACAAAAATAGGAATATTAGAAGGAACAACACTTAAAGATATTCCAACGGGTACAACTATAGAACAATTAAAAAAAGCATTAACAGTATCAAAAGGAGCTAATATTCATTTTGTAAAAAAGAATGAACAAAATACTCCAGAAATAAAAGACCTAACAGAATTAGTAACTGATGAAATGGAAATAGTAGTGGAATCAGGAACACAAACAGTATATACAATAGAAATAATTTAATAGAATGATCGGAAACATTTCAAACTTAATTCACATCAAAACAATTTAAATTCATAAAATATCCAGGACACATCACTGGCTGAAAAATTAAATACATTTCATAAAAGACCAATCCTTTTGGGGTTGGTCTTTTTTTACTGCAAGTGCTCTAGTATGATGAAAACTTGTATGTAAAAAGGATATTTATATTGTAGAACTATAAATAGTTAAGTTTATTACCTAATATTCATTATTGACAAAATCATGAAATTAAAGTAATATGTATATACAACAGTTTAATACCATATAAATATAATATTTTAAGAGGAAATTTTGAACTATATACTTATTTGGGCACTTTGTATATAGGGAGTTAGTAGTGCAACCGACCTTGATTAATCAGGGTCGGTTTTTATTTTTAAATAAAGCAAGAAATAACTAGGAGGGGGTATATTGAAAACCTTTGACAAAATAATTAAAGGCAGAAAAAATATCATAATTATTTTGACATTTTTATTTCAGATATTATTATGCTCAAAAACTGTATTAGCAGCAAATGTAGATGTTATAGATAATGTTAAAATAACTAATGAAAAGGGGGTAGTGCAAGGTGGTTATAGACCAGGTGATAGAATAAGAATTGATGTAGATTGGTCTATTAAATCAGAAACAAAAGCTGGAGATACCTTTAGTTTAAAGATACCCAAAGAATTACGAGGGTTTAATGGTACAATTCAGTTAAGGGATAAGGAAGGACGTAATTTTGGTACAGGAGTAGGAAAAGGTGATGTAAT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57 | Planktothrix_phage(50.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1119025 : 1169373
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_022777|1119025:1169373|DBSCAN-SWA 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62 | Clostridium_phage(92.59%) | holin,portal,tail,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_3 |
1652559 : 1659595
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_022777|1652559:1659595|DBSCAN-SWA 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AAAAAAATAGATTATCTCATAAAAATAAGATAATCTATTCCCAGTTAACAGTTAGTAGCTAATAGTGAACAATTATGGATAACTTTTCTGCATTTCATTACGACAAATTTTTAATTATATAAAATCCTGATGTTTAGCTTTGCTGGACAAGCTATTCCATAGAGTATAATTAAAATAGCGATGTTTAGCTTTAGCTTAACGAGCCTTCCTAAATAAAATTAAAATTTTTTAGATCAAATCCAAGAAAAATCTCCTTAGTTATTCATTATTCATTGTTAGTTGTTCATTAATTAAATTCTTTCTATTATAGTTCCTACAAGATTTATAAAGGTATTTTTAACCTTGTTTGAAGTTTCTATAACTTCTTTATGATTTAAAGGTTGATCTAGAATTCCCGCTGCCATATTAGTTATACAAGATATACCTAAAACTTTCATATCACAATGTTTTGCTGTTATTGCATCTGGTACTGTAGACATACCTACAGCATCTCCACCTAATATTCTTACCATCTTAACTTCTGCTGGAGTTTCATAAGTTGGTCCTGTCATCATACAGTAAACTCCTTTTTCTATGCCCACATTTATATCCTTTGCAGTGTTTTCTGCTAGTTCCACTAAATCCTTATCATATACATTACTCATATCAGGAAATCTTGATCCTATTTTTTCGTTGTTTTCACCTATTAATGGATTATTGAAAGCTAGATTTATATGATCTGTTATAATCATAAGATCCCCTGGGTTAAAGCTCTCATTCACACCGCCTGCTGCATTTGTTACCAATAAAATCTTTGCTCCTAAGTATTTCATTATGTGAATAGGTAAAGATAAAATCCCCATAGGATGTCCTTCATAATAATGAATTCTTCCTTGCATCATTACTACATTTTTCCCCTTATATTTTCCAAAAACATATTGTCCTTTATGACCACATACTGTTGATTTTGGCATATTAGGTATATCTTCATATTTTACAATTACTTTATCTTGGATTTCTTCAGCTAAATCTCCTAATCCTGAACCTAATATTACTCCTATTTCTGGTACAATATTTATTTTACTTTTTACAAACTCCACACTCTCTAATATTTTTTCTAAATTCATGTTATTTCCTCCTCTGTTATAACTAGTATACTTAAGCTCTAGGATGAGCTTTTTTATAAACCTCAGCTATCTTACTTTTATTAGATATAGTTGAATAGATTTGAGTGGCTGCTAAATCACTATGTCCTAAAAGTTCTTGCACTGATTTCATATCTGCTCCATTTTGCAAAAGATGTACTGCAAAAGAATGTCTTAAAGTATACGAGTTTATAGACTTTTTTATACCTGATATTTTAGCATATTTTTTAACTATTTTCCAAAAACCTTGTCTTGTCATTTGAGTACCTTTTAAATTTAAAAACAGATAATCTAAATTATATATATTAATGTTTGGTCTAATACTTAAATAATCATCTAAACAGTTCACTGCATATGTCCCAATAGGAATAATTCTTTCTTTATTTTTGGATCCTCTGCATTTTATATAGGAAAGTTTTAAACTCACATCAAATACTGTCATATTTAAAAGTTCAGTAACTTTAACCCCTGTAGCATACATAACCTCTAGCATTGCCTTATCTCTTATACCTTTTTCTTCAGAAATATTTGGAGCATTTAATAAAATATCTACCTCTTCTACTGTTAGTACCTTAGGTATGTTTCTTTTAACTTTGGGCAGTTCATAATTTATAACTGGATCCTCATCTATATAACCTTTTTTGTATAAAAATTTATAGAAATTTCTAATAGACACTATATTTCTCACAATTGAGGAGTTAGCTTTTCTACTCTTTTGAAGAGACTGAACATATGCCATTATTGTAACTTCTTCTACATCTAATATATCTTCTTTTCTTTCTTTTAAAAAGTCTAAAAATCTATTTACATCTCTTATATAAGCATCTAAAGTATTTTTGCTTAAGCCTTTGTCCATAAGGCGGCTTATATACTTGTTAATTAGTTCATCTCTAGTTCTTATATTCAATTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_022777|1652559:1659595|1658695_1659595_-|WP_023438476.1|DBSCAN-SWA MKLNIRTRDELINKYISRLMDKGLSKNTLDAYIRDVNRFLDFLKERKEDILDVEEVTIMAYVQSLQKSRKANSSIVRNIVSIRNFYKFLYKKGYIDEDPVINYELPKVKRNIPKVLTVEEVDILLNAPNISEEKGIRDKAMLEVMYATGVKVTELLNMTVFDVSLKLSYIKCRGSKNKERIIPIGTYAVNCLDDYLSIRPNINIYNLDYLFLNLKGTQMTRQGFWKIVKKYAKISGIKKSINSYTLRHSFAVHLLQNGADMKSVQELLGHSDLAATQIYSTISNKSKIAEVYKKAHPRA >NC_022777|1652559:1659595|1655463_1656228_-|WP_023438472.1|DBSCAN-SWA MELQIKIQNFQGPFDLLLHLIKKNQLDIYNINISEITGQYMEYIESLKEMDLEVTSEFIVIAATLLQIKSRELLPKTQDEEEEEISEETSEKILLDKLIEYKKFKNVANYLKGRLEKGFTVFSKKPEIIEKKEEEDKDIFIDVTILELYNLYNELITKYKDKINLSNTIPEEIELEEFKIGDKMDYLKSKIIENKNLSFSKISKECSCKGEVIVTFLALLELIRIKIVKVVQEGNFKEIYLERMKEDEADELYY >NC_022777|1652559:1659595|1652559_1653684_-|WP_011099736.1|DBSCAN-SWA MKIKKILLYFICFIITININTYSVLANQHLNKKENKLNVNARAYIALDANSKVVLAGRNSEVIMPMASTTKILTALVTLKYGDLDKMVEISPKASSIRGSVAGYKKGEEISLKELLFGLMLRSGNDAAIAIAEGVAGSEEEFVRLMNEYAASLGLIDSHFCSPHGLDSAEHYSTVYDLAILTAESKKHPLFHEIVSTKDITKDKYSFSRDYHNINKILWQLPNATGVKTGYTGGAGKCLVSSVDISGREVIIVVLDCPGRWKETTKVNNYVKKNYEYKKLHSKGEVVAKAPKDKKNIDLVCKEDIIIPTEKGTDYSVKINVPNEINHNIYEGDKVGSINVFKEDKLIFTESLVAKNSYKAPIIKKFPFKSIFKK >NC_022777|1652559:1659595|1656306_1657494_-|WP_023438473.1|DBSCAN-SWA MIKNKKTFIFTILLIFIFQCTVVPVRVSAEGEDKGEIQVEASSALLMEPNSGKIIYEKNANEKLPPASVTKIMTMLIAMEAVDSGKIKLTDKITVSENAKKNGQGGNSSMLLDTGEIRTVEEILKGIAIASGNDAATAMAEYLEGSEEAFVKTMNDRAKALSMKNTNFKNCSGLPEEGHVTTAYDIALMSKELLKHPTILKYTGTYMETISEGRKSPIGLVNHNKLVRFFKGCDGLKTGYTSEAKYCISATAVRDGVRVLTVIMGAPNYKIRNKEASNLMNYGLSKFENKNIIKKDSEVEKVKLGKSEDKFFIAKALEDLDVVVERGSKEKITKKPIVNLDKKYYNKGEVVGHCEVYVGDKLIGKVKLYSDRDIKKSGLLDNILHNFRNIFDNAV >NC_022777|1652559:1659595|1654339_1654756_+|WP_011099738.1|DBSCAN-SWA MENHPIENLMQSTMENIKNMVDVNTIVGNTILTPDGASIIPISKVSFGFASGGSEYNSSISSDLGKYPFGGGSGAGVSLKPVAFLFIKSDSVRLLPVDQTTPYDRVIDTVPQLVDMFKDMSKSKTSSNNANKSSTVNE >NC_022777|1652559:1659595|1654919_1655489_-|WP_045923601.1|DBSCAN-SWA MKQMNYIINEENELRFFSIIESLLFASGEPLSLKDISEIIELNTLDTKEILQKMIREYEIEKRGIKLIEIEKKYQLVTKEENSCFIEQLLKTNSSQSISQAALETLSIVAYKQPVTRVDVDEIRGVKSDRALQTLLQKSLIKETGRLDVPGRPILYSTTEEFLKHFGLESIKELPSLEELLEEFQEEDL >NC_022777|1652559:1659595|1657848_1658664_-|WP_023438475.1|DBSCAN-SWA MNLEKILESVEFVKSKINIVPEIGVILGSGLGDLAEEIQDKVIVKYEDIPNMPKSTVCGHKGQYVFGKYKGKNVVMMQGRIHYYEGHPMGILSLPIHIMKYLGAKILLVTNAAGGVNESFNPGDLMIITDHINLAFNNPLIGENNEKIGSRFPDMSNVYDKDLVELAENTAKDINVGIEKGVYCMMTGPTYETPAEVKMVRILGGDAVGMSTVPDAITAKHCDMKVLGISCITNMAAGILDQPLNHKEVIETSNKVKNTFINLVGTIIERI >NC_022777|1652559:1659595|1653815_1654322_+|WP_023438470.1|DBSCAN-SWA MYITLILLLSLIILLFIPIPIKIYIIYNENTLSLKLGNKVFSLDRLKFENINKTSPIEKISKKENNQKLSFKSVLGYLKITPSKPKLKISIYLNYGFEDAYITAIFYGIFYSIYPFILGLINSCFTIKKERLHIEPHFNKNIFNFEIKSIFFMSIAKIMYIYIYLLIK |
8 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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