Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
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NZ_CP009620 | Vibrio coralliilyticus strain RE98 plasmid p319, complete sequence | 0 crisprs | csa3,WYL | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP009619 | Vibrio coralliilyticus strain RE98 plasmid p380, complete sequence | 0 crisprs | DEDDh | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP009618 | Vibrio coralliilyticus strain RE98 chromosome 2, complete sequence | 0 crisprs | cas3,csa3,RT,DEDDh,WYL | 0 | 0 | 2 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
472160 : 481478
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP009617|472160:481478|DBSCAN-SWA AATGAAACTGCCTATTTATCTAGATTACTCAGCGACTTGTCCTGTTGACCCTCGTGTGGCTGAAAAAATGGTTCAGTACATGACAATGGACGGTACGTTTGGCAACCCAGCATCGCGTTCACATCGATATGGTTGGCAGGCAGAAGAAGCAGTAGACACTGCTCGTGAACAAATTGCTGATCTACTGAACGCAGACCCTCGCGAAATCGTCTTCACCTCTGGCGCGACAGAATCAGATAACCTAGCTATTAAAGGCGCAGCTCATTTCTATTCTAAGAAAGGTAAACACGTAATTACGTGTAAAACTGAGCACAAAGCGGTTCTGGATCCATGTCGCCAACTAGAGCGCGAAGGTTTTGAGGTAACTTACCTTGAGCCTGAGTCTAACGGTTTGATTGATCTTAAGAAGCTTGAAGCCGCAATGCGTGAAGATACTGTATTGGTTTCTATCATGCACGTGAACAACGAAATTGGTGTGATTCAGGATATCTCTTCTATTGGTGAACTTTGCCGCGAACGTAAAGTTGTTTTCCACGTTGATGCCGCGCAGTCTGCGGGTAAGTTACCAATCGATGTGAAGGAAATGAAAGTAGACCTTATCTCACTGTCTGCTCATAAAGCGTATGGCCCTAAAGGTATCGGTGCACTATACGTTCGTCGTAAGCCACGTATTCGCCTAGAAGCACAAATGCACGGTGGTGGTCACGAGCGTGGTTTCCGTTCAGGAACACTAGCTACTCACCAAATTGTTGGTATGGGTGAAGCGTTCCGTATTGCTAAAGAAGATATGCAAAAAGATTTCGACCATGCTCTTGCACTTCGCAACCGACTATTTGATGGTGTTAAAGATTTAGAAGCTGTAACAGTTAACGGTGACTTTGAGCAACGTGTTCCTCACAACTTGAACGTTAGCTTTGCCTTTGTTGAAGGTGAATCTCTACTGATGTCGCTTAAAGATCTAGCGGTATCTTCAGGTAGTGCATGTACATCGGCAAGTCTAGAGCCTTCATACGTACTGCGTGCTCTTGGTCTAAACGATGAATTGGCACATAGCTCTGTTCGTTTCTCTTTCGGTCGCTTTACGACTGAAGAAGAAATTGATTACGCAATTGAACAAATTCGTACCGCAGTAACTAAACTGCGTGACATGTCTCCTCTATGGGATATGTACAAGGAAGGAATTGACCTAGATACAGTTGAGTGGGCTCACCACTAATTTCAATCAGGTTATTCCAAGTCAGTTAATAGAGGATTCGAGGTAAATATCATGGCATATAGCGAAAAAGTAATTGATCACTACGAGAACCCACGTAACGTTGGTTCATTTGATAAAGAAGACCCAGCGGTAGGTAGCGGCATGGTTGGCGCACCAGCTTGTGGTGACGTAATGAAGCTTCAAATTAAAGTAACACCTGAAGGTATTATTGAAGATGCGAAGTTCAAAACATACGGTTGTGGTAGTGCAATCGCATCTAGCTCACTGGTTACTGAGTGGGTAAAAGGCAAGAGCATTGATGAAGCAGCAGCAATCAAGAATGCTGAGATTGCTGAAGAACTTGAGCTGCCTCCAGTTAAAGTACACTGCTCAATTCTTGCTGAAGATGCAATCAAAGCAGCGGTTGCTGACTACAAGAAAAAACACCAAGAATAAGTAATCTGTATATAATGGGAGCCTAAAGCTCCCATTCCGTTCGCCAATCAATAAACTAAGGTGCAGTATGGCCATCACAATGACAGAAACCGCGGCAAGTCGCGTTAGAACATTCCTAGAAAACCGAGGTAAAGGGATCGGTTTACGTTTGGGTGTGAAAACGACAGGCTGTTCTGGTATGGCTTATGTTCTTGAGTTTGTTGACGAGCTTAACGAAGAAGATTCAGTATTCGAGCATTCAGGCGTTAAGGTCATTATTGACCAAAAGAGCCTAGCGTATTTAGATGGTACTGAGCTTGACTACGTTAAAGAAGGGTTGAATGAAGGCTTCGAATTCAACAACCCGAATGCTAAAAGTGAATGTGGTTGTGGTGAAAGCTTCAACGTATAATTGATAGCGCCTGCAGGTATTGCTTGCAGGTAGATTACCAAGGACCGAATTCTCCATGAATTACTTTGAATTATTTGGGCTACCAAGTCAGTTTCAGCTGGATGGTAGCCTTCTTTCTTCACAATTCCGTGAACTTCAAAAACGCTTCCATCCAGATAACTTTGCCAGTGCTTCAGAGCGAGACCGTCTTATGGCGGTTCAGAAAGCATCGGAAATCAACGATGCCTATCAAGTATTAAAGAGCCCTCTGTCTCGCGCAGAGTATCTTCTGGCAGAAAACGGTGTTGATATTCGTGGTGAGCAACAAACCATGAGTGATCCTATGTTCCTAATGGAACAGATGGAATTACGTGAAGAGCTTGAGGATATTCCATTTAGTTCAGAACCAGAAGACGCACTATTCGATTTTGACAACAAGGTGAGCAAAATGTACAAGCAGCACCTGAAATCGGTAGAGCAGGAACTGAATGATGGCCTTTGGCAACAAGCCGCTGAGCGTGTACGTAAACTCAAATTTATCGCCAAATTAAAAAATGAAATCGAGCTAGTGGAAGAGAAACTCCTCGGCTAGTTAAAGATAAGGACCAACCATGGCACTACTTCAAATTGCAGAACCGGGTCAAAGCTCTGCACCCCATGAGCATAAACTGGCAGCTGGTATCGATCTCGGTACGACGAACTCATTGGTAGCTTCTGTTCGCAGCGGAGATGCAGCGACATTGAAAGACGATCAAGGACGCAGTATCTTGCCATCGATAGTCAATTATGCCGGTGAACAACCTGAAGTAGGTTATGAAGCTAAAGCACTGGCGGAAACTGATCCGCAAAACACCATTATTTCAGTGAAACGACTAATTGGCCGTTCATTGAGTGACATTCAGACTCGTTACCCAAATCTACCTTATCAATTTAAAGCGAGCGATAATGGTTTGCCGGTACTTCAAACAGCAGCTGGTGACAAAAACCCGATTGAAGTATCAGCAGAGATTCTCAAATCATTAGGTAAGCGTGCTGAACAAACGCTTGGCGGAGAGTTAGCTGGTGTTGTGATTACCGTGCCTGCTTACTTTGATGATGCTCAGCGAGCTGGTACAAAAGATGCGGCTAAACTGGCAGGTCTTCATGTTCTGCGCTTATTAAATGAGCCAACTGCAGCAGCGATTGCTTACGGCCTAGACTCAGGCCAAGAAGGCACTATCGCGGTTTACGATCTGGGTGGTGGTACATTCGACATCTCTATTCTGCGATTATCCAAAGGTGTCTTCGAAGTTCTGGCGACTGGTGGTGATTCCGCATTAGGCGGAGATGACTTTGACCACCTTCTTGCTGAGTTCTTGATTGAAAAAGCAGGGCTCCAAACGGAGCTAACTGCGGAGCAGAACCGCATTGTTTTAAATGTTGCTACAGAGACCAAAATTGCATTTTCACAGCAAGAGAATGTAGATGTTGAGGTGCTTGGTTGGACTGGTTTTGTATCCCGTGATGAATTTGAATCTTTGATTCGTCCACTAGTGAAAAAGACGCTGATGTCTTGTCGCCGCGCACTAAAAGATGCTGAAGTAGACACAGATGATGTACTAGAAGTAGTGATGGTTGGAGGCTCGACTCGTACACTGCTGGTACGTGAAATGGTCGGTGAATTTTTTGGTCGTACGCCACTAACAAGCATTAACCCTGATGAGGTTGTTGCGATCGGTGCGGGCATTCAGGCTGATATTCTCGCTGGTAACAAGCCAGACTCCGAAATGCTGCTTCTTGATGTGATTCCACTGTCTCTAGGTATTGAAACCATGGGTGGACTGGTCGAGAAAATTGTTCCACGCAATACCACGATTCCGGTTGCCCGAGCGCAAGAATTTACGACATTTAAAGATGGTCAGACTGCAATGAGTGTTCACGTTGTTCAAGGCGAGCGTGAAATGGTCGATGACTGCCGTTCGTTGGCGCGTTTCTCATTGAAAGGCATTCCTCCAATGGCCGCTGGTGCTGCTCATATTCGAGTGACTTACCAAGTTGACGCTGATGGCCTTCTTTCGGTCACCGCAATGGAAAAGAGCACAGGGGTTCAGTCTGAAATACAAGTTAAACCGTCTTATGGTTTGAGTGACGACGAAGTGGCAAATATGCTGCGTGACTCAATGACGTATGCGAAAGACGACATGATGGCTCGTGCACTGGCTGAGCAGCGAGTGGAAGCTGATCGTGTCATTGAAGGGTTACTTGCTGCAATGCAAGCAGACGGTGATGACTTACTGTCTGAAGCGGAAAGAGAAGCCCTGATTAAATCGATTGAATCATTGATTGAACTGCGCAATGGCGACAGTGCGGATGCCATTGAACAGGGAATCAAAGACACTGATAAAGCGAGCCAGGATTTTGCTTCGCGCCGTATGGATAAATCGATTCGAGCTGCACTGTCAGGTCAATCGGTAGATGATATTTAAGAGATAAGAAGTTATGCCTAAGATTATAGTATTACCACACGAAGATTTATGCCCAGAAGGTGCGGTACTAGAAGCAGATACTGGTGAAACTGTACTGGACGTGGCGCTGAAAAATGGTATCGGTATCGAGCATGCGTGTGAAAAATCATGTGCGTGTACTACCTGTCACATTGTGGTTCGTGAAGGCTTTGACTCTTTGGAAGAGAGTGACGAGTTGGAAGACGACATGCTGGATAAAGCATGGGGCTTAGAGCCTGAATCACGATTGGGTTGTCAGGCTAAAGTTACCGACGAAGACTTGGTGGTTGAGATTCCTAAGTACACATTGAATCACGCGTCAGAAGATCACTAATCTCTCATATAGGAAGTGTAATCATGAAATGGACAGACTCACGAGACATTGCGATTGAGCTTTGTGACAAATTCCCAGAAGTGGATCCAAAGACAGTACGTTTCACCGATCTTCATCAGTGGATTCTAGAGCTGGAAGATTTTGAAGACGAACCTAACCGTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP009617|472160:481478|478734_479163_+|WP_006959823.1|DBSCAN-SWA MALERTFSIIKPDAVERNLIGEIYHRIEKAGLQIIAAKMVQLTEEQASGFYAEHEGKPFFPALKEFMTSGPIMVQVLEGEDAISRYRELMGKTNPEEAACGTIRADYALSMRHNSVHGSDSPESAAREIEFFFPQAEICPRT >NZ_CP009617|472160:481478|477377_478676_+|WP_043006942.1|DBSCAN-SWA MSTQMSVFLSQEAAAPHWGEKAILSFSESCATIHLGEGHDLGAVQRAARKLDSQGVASVSLEGAGWDLESVWAFHQGYRGPKKKNTLALPELVEAAQAELEARIKATEFTRDIINKPAEEVAPRQLATMAAEFIKSVAPEGTVKARIVKDKDLLAEGWEGIFAVGRGSERTSAMLQLDYNPTGDENAPVWACLVGKGITFDSGGYSIKPSGFMAAMKADMGGSGTITGGLGLAIMRGLNKRVKLILCCAENMISGRALKLGDVITYKNGKTVEILNTDAEGRLVLADGLLYASEQNPELIIDCATLTGAAKNALGNDYHALMSFDEELSQQALSVAKEEKEGLWPLPLADFHRGMLPSNFADLSNISSGDYSPGASTAAAFLSYFVEDYKKGWLHFDCAATYRKSATDKWAAGATGVGVRTLAGLLIQQANK >NZ_CP009617|472160:481478|479390_481478_+|WP_019274079.1|DBSCAN-SWA MADLSKYRNIGIFAHVDAGKTTTTERILKLTGKIHKTGEVHDGESTTDFMEQEAERGITIQSAAVTCEWNGHRLNVIDTPGHVDFTVEVYRSLKVLDGGIGVFCGSGGVEPQSETNWRYANDSEVARLIFVNKLDRMGADFFNVVDQVKNVLGANPLVMTLPIGREDDFVGVVDVLNRKAYVWDETGLPENYEVQDIPADMVDDVEQYREELVETAVEQDDDLMEAYMEGEEPSIEQLKACIRKGTRDLAFFPTFCGSAFKNKGMQLILDAVVDYLPAPAEVDPQPLTDPETGEPTGEVATVSPDEPLKALAFKIMDDRFGALTFVRIYSGRLKKGDTILNSATGKTERIGRMCEMQADERNELTEAQAGDIIAIVGMKNVQTGHTLCDPKHECTLEAMIFPEPVISIAVTPKDKGGSEKMGIAIGKMVAEDPSFQVETDEESGETILKGMGELHLDIKVDILKRTYGVELEVGAPQVAYRETITQAVEDSYTHKKQSGGSGQFGKIDYRIRPGEPNSGFTFSSTVVGGNVPKEFWPAVEKGFASMMETGVLAGFPTLDVEVELFDGGFHAVDSSAIAYEIAAKGAFRQSMPKAGAQLLEPIMNVDVFTPEDNVGDVIGDLNRRRGMIKDQQAGTTGVRIKADVPLSEMFGYIGHLRTITSGRGQFSMEFGQYAPCPANVAEQVIAEVKERNEKK >NZ_CP009617|472160:481478|474256_474772_+|WP_043006939.1|DBSCAN-SWA MNYFELFGLPSQFQLDGSLLSSQFRELQKRFHPDNFASASERDRLMAVQKASEINDAYQVLKSPLSRAEYLLAENGVDIRGEQQTMSDPMFLMEQMELREELEDIPFSSEPEDALFDFDNKVSKMYKQHLKSVEQELNDGLWQQAAERVRKLKFIAKLKNEIELVEEKLLG >NZ_CP009617|472160:481478|474791_476645_+|WP_043006941.1|DBSCAN-SWA MALLQIAEPGQSSAPHEHKLAAGIDLGTTNSLVASVRSGDAATLKDDQGRSILPSIVNYAGEQPEVGYEAKALAETDPQNTIISVKRLIGRSLSDIQTRYPNLPYQFKASDNGLPVLQTAAGDKNPIEVSAEILKSLGKRAEQTLGGELAGVVITVPAYFDDAQRAGTKDAAKLAGLHVLRLLNEPTAAAIAYGLDSGQEGTIAVYDLGGGTFDISILRLSKGVFEVLATGGDSALGGDDFDHLLAEFLIEKAGLQTELTAEQNRIVLNVATETKIAFSQQENVDVEVLGWTGFVSRDEFESLIRPLVKKTLMSCRRALKDAEVDTDDVLEVVMVGGSTRTLLVREMVGEFFGRTPLTSINPDEVVAIGAGIQADILAGNKPDSEMLLLDVIPLSLGIETMGGLVEKIVPRNTTIPVARAQEFTTFKDGQTAMSVHVVQGEREMVDDCRSLARFSLKGIPPMAAGAAHIRVTYQVDADGLLSVTAMEKSTGVQSEIQVKPSYGLSDDEVANMLRDSMTYAKDDMMARALAEQRVEADRVIEGLLAAMQADGDDLLSEAEREALIKSIESLIELRNGDSADAIEQGIKDTDKASQDFASRRMDKSIRAALSGQSVDDI >NZ_CP009617|472160:481478|472160_473375_+|WP_006959830.1|DBSCAN-SWA MKLPIYLDYSATCPVDPRVAEKMVQYMTMDGTFGNPASRSHRYGWQAEEAVDTAREQIADLLNADPREIVFTSGATESDNLAIKGAAHFYSKKGKHVITCKTEHKAVLDPCRQLEREGFEVTYLEPESNGLIDLKKLEAAMREDTVLVSIMHVNNEIGVIQDISSIGELCRERKVVFHVDAAQSAGKLPIDVKEMKVDLISLSAHKAYGPKGIGALYVRRKPRIRLEAQMHGGGHERGFRSGTLATHQIVGMGEAFRIAKEDMQKDFDHALALRNRLFDGVKDLEAVTVNGDFEQRVPHNLNVSFAFVEGESLLMSLKDLAVSSGSACTSASLEPSYVLRALGLNDELAHSSVRFSFGRFTTEEEIDYAIEQIRTAVTKLRDMSPLWDMYKEGIDLDTVEWAHH >NZ_CP009617|472160:481478|476658_476997_+|WP_006959826.1|DBSCAN-SWA MPKIIVLPHEDLCPEGAVLEADTGETVLDVALKNGIGIEHACEKSCACTTCHIVVREGFDSLEESDELEDDMLDKAWGLEPESRLGCQAKVTDEDLVVEIPKYTLNHASEDH >NZ_CP009617|472160:481478|473426_473810_+|WP_004412993.1|DBSCAN-SWA MAYSEKVIDHYENPRNVGSFDKEDPAVGSGMVGAPACGDVMKLQIKVTPEGIIEDAKFKTYGCGSAIASSSLVTEWVKGKSIDEAAAIKNAEIAEELELPPVKVHCSILAEDAIKAAVADYKKKHQE >NZ_CP009617|472160:481478|473877_474201_+|WP_006959829.1|DBSCAN-SWA MAITMTETAASRVRTFLENRGKGIGLRLGVKTTGCSGMAYVLEFVDELNEEDSVFEHSGVKVIIDQKSLAYLDGTELDYVKEGLNEGFEFNNPNAKSECGCGESFNV >NZ_CP009617|472160:481478|477020_477215_+|WP_006959825.1|DBSCAN-SWA MKWTDSRDIAIELCDKFPEVDPKTVRFTDLHQWILELEDFEDEPNRSNEKILEAVILCWMDEMD |
10 | Faustovirus(14.29%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1406793 : 1449920
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP009617|1406793:1449920|DBSCAN-SWA 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37 | Vibrio_phage(33.33%) | capsid,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2573659 : 2580343
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP009617|2573659:2580343|DBSCAN-SWA ATTAGGAATCGATTTCAGATAGAACGTTAATCATTTCAAGTGCGCTTAGTGCAGCCTCTGCACCTTTATTACCAGCCTTGGTTCCTGCGCGCTCGATAGCTTGGTCAATTGTATCAACGGTCAATACACCAAACGCCACTGGAAGACTGTACTCCAGAGACACCTGTGCAAGGCCTTTGTTACATTCACTACAAACATAGTCAAAGTGAGGTGTGCCGCCACGAATAACAGTACCTAGTGATACGATCGCATCAAACTTGCCTGTTTTTGCTACGCGCTGAGCTACCAATGGAAGTTCAACCGCACCCGGACAACGAACTACGGTGATGTTATCTTCGCTGATTTGTCCATGACGCTTTAAAGTATCGATTGCACCAGACAATAGACTTTCGTTAATAAAACTGTTGAAACGAGAAATAACGATAGCAATTTTTGCGTTTGGCGCTGGGAAGCCACCCTCGATCACTTTCATAAGCCTTCCTTTAACTATGTTCATCAAGTGAGAATCGCCGGATTCTAGCACAAATCTGTGAGCAATATCTAATGGAAATTTAGCATTACTTAATTAGCAGAACGGCGTTAAAAACAAAGAAGGCAATTGGTTCATCACCCTTTGCCTTCATATACAATCTAGTCGTTTTCTATCTGCTTATTCGCAAACATATTCAACCACATTAAGACCAAACCCACCCAAGGCGTGGTATTTCTTATTGGTTGAAGAAAGTAGACGCATGTCATGCACACCCAAATCCGCCAAAATCTGCGAACCGACACCAACACGTCGTGATGTTCCTTGCTTCTTCGCCAAGGTTGGCGCTTCGCCTTTATCTTGGGCTTCAAACATTTTCACGCGGTGGATAAGCAAGTCAGTTGACTCTTCATTACCAAGAATTACCAAGACTCCACCTTCTTCACCAATGCGCTTCATTGCTTTATCTAGCGTCCAGCTTCGTTCAGCATTGCGATCGCTACGCAGTAGGTCGGTAAACGTATCCTGAAGGTGAACTCGAACCAATGGTGCGTTCTCTTGCACGTTGCCTTTGCATAGCGCGTAGTGAACCTGATTGTCGATAGTATCGCGGAAGGTCACCAGTTCAAACTCACCGTATTCTGTCGGCAATTTGCACTCTGCAACACGCTCGATAGTCGTTTCTGTGTTGTTGCGGTATTCGATCAAATCAGCAATCGTACCTAACTTGATACCATGTTTCTCAGCGAAGATTTCTAGATCTGGGCGACGAGCCATTGTGCCGTCGTCATTGAGGATTTCAACAATCACACCGGAAGGCTCAAAACCAGCCAAACGCGCCAAGTCACAACCTGCTTCAGTGTGGCCAGCACGAGTCAGAACACCACCGTCTTGTGCGGCAAGTGGGAAGATATGCCCTGGTTGAACCAAGTCCGCCGCTTTGGCGTCTTTTGCAACTGCAGCTTGCACGGTGCGCGCACGATCTGCTGCTGAAATACCTGTTGTCACGCCTTCCGCCGCTTCAATAGAAACAGTGAAGTTAGTCGTGTACTGCGCGTTGTTGTCCTGAACCATAGGTGGCAAGCCTAAACGCTCACAACGCTCTTTAGTCATCGTCAAGCAGATCAGGCCGCGGCCGTGAGTTGCCATGAAGTTGATCGCTTCTGGAGTCACATGTTCGGCCGCCATGATCAGATCGCCTTCATTTTCACGATCTTCGTCATCCATCAGGATGACCATTTTACCTAAGCGAATGTCTTCGATGATTTCTTGAGGCGTACTAATTGGCATTTCTCTGTTCCTGTTATCTGGGCACTTGGCGACTTTATTCTGTGTCAACGCCCAGCGTTCTAGGCTGGGCGTCGGTTAATTTATGCAAAACCGTTTTGCTGGAGAAACTCCATGGTCAAACGCGATTCTGGCTGCTCTTTTTGGCTGGTCAGTAAACGTTCCATGTAACGTGCTAATACGTCCACTTCCAAATTCACTTTTCGTCCAACATGGAAATCTGCGATGGTCGTTTCTTCGCCAGTGTGTGGCACTATCGTAAGTTTGAAGGCATTTTTGCGCAGAGCATTCACCGTCAGGCTGATACCATCCACAGTAACAGAGCCTTTCTCAGCAACATATTTGGATAGTTCTTCAGGGATGGAAACCCAAAACTCAATCGCTCTCCCCACCTGACTACGTTCAGTAATTTCACCAACACCATCCACATGACCAGAAACAATATGACCACCAAAACGTGTGGTTGGCAGCATGGCTTTTTCGAGATTGACCTTGCCACCCACTTGGTAATCCGTGAACCCAGTTTTGTTCAATGTTTCTAACGACAAATCGGCGCTATAGCTGGTTGAATTGAAATCCACAACCGTCAAACACACGCCATTCGTTGCTATGCTATCGCCGAGTTTGACGTCTGACATATCCAGCTTACCCACTTCAACGGTGACACTAATATCTTCACCTTTCGGAGTAATTGCTGTTAGCGTACCAACAGCTTCAATAATTCCTGTAAACATATTTACGCTTCTTTGTTCTTAAGTCGGGCTACAAGGCGAATGTCTTGGCCAACTTGTCTGATATCTTGAATATCGAGTTCAATGACCTCTGCCATCGACTCTAGGCCAAGTACACCGAATAAGCCTCGGCCGTCACTGCCCATAATTTTAGGCGCTAGATACAATACTAACTCATCCACCAAACCTTCTTTAATCAGACTACTTGCCAAAGTGGCGCCCGCTTCAACCCAGAGATGATTAATATTGTGTTGAGAGACCAAATTTGCAAATGTTGATTTCAAATCGATTTGCTCTGAGTCATTAAGTAAGGGAGCCACATCGCCTTGTGCAGAGACAACTATACGCTCACCGTCAGTCGAATAGAATTTGAGTTCAGAAGATAGCTGCTGCTGGCGATCCAACACCACTCTGACAGGTTGGCGCACTTCACTTTCAGGCAGCTTAGTCTGCACAGACTCAGGTAGCTCAGACCAACGGACATTCAACGATGCATTGTCCTCAATCACCGTTTTACTTGTCGATAAGATAGCGCCGGCTTGAGCACGATAGTTTTGTACATCCTGCCTTGCCTGAGGAGACGTAATCCACTGGCTTTGACCATTACTCAGCGCGGTTTGGCCATCGAGACTTGCGGCCATTTTCAGCTGCACAAACGGCATTCCGGTTTTCATACGTTTGATGAAAGCAGAATTCAGATCCATCGCATCGCTTTCTAGCAATCCAACCTGAACTTCAATACCCGCATCTCGCAGCATTTTAATGCCACGCCCCGCCACCTGTGGATTTGGGTCTTCCATGGCACAAATCACTTTCGCAACCTTGGCTTTAATCAAACCTTCAGCGCATGGAGGGGTACGGCCATAATGAGAACAAGGCTCGAGGGTAACATAAGCGGTCGCCCCGACAGACTTGTCGCCTGCCATTCTTAATGCATGTACTTCAGCATGAGGTTCGCCAGCACGATAGTGAAAGCCTTCACCCACGATGTCGTCATCAAGGGTAATAACACAACCAACATTCGGATTTGGTGCCGTGGTGTAGATGCCGCCTTTAGCTAATTCAATCGCACGCGACATCATTTGATAATCTTGAGGGGTGAATTCAGACATGTTTACGTTAATCTTCTAATCGGGCAATTTCTTCGCCAAACTCACGAATATCTTCAAAGCTACGGTAAACGGATGCAAAGCGAATGTAAGCGACTTTATCCAGCTCTTTAAGCTGATCCATAACCAAATTACCGATCATTTCACTAGGCACTTCACGCTCTCCGGTCGCTCGTAGCTGAGACTTGATCATGCTGATCGCCAGCTCAACAGAGTCCGCACTCACTGGGCGCTTTTCCAACGCTCGCTGCAAACCACCGACCATTTTATCTTCATTGAATGGTTCGCGATTTCCATTTGATTTAATCACGCGAGGCATCACAAGTTCAGCAGTTTCGAATGTGGTAAAGCGTTCGCTACAAGCTAGACACTGCCTGCGACGGCGAACCTGATGACCGTCGGCCACCAGACGAGAATCGATCACTTTCGTATCATTCTCAGAGCAAAAAGGACAATGCATATCACCTCCATAATATACTCAAGCAACCTCTGCGCTTAGCGCACATTGATAGAATCAATAAAGGGACTTTGTTCAATGCAAACCTCAACGAGAATCCCTTTTAGGATAAGTTGTTAACGCGCAAACGAAGTCACTTGAGTATATCGCAGCTAGTGTAGCGGATTTGGTAAAGTGAAGAAAAGCAAAAGGGGCGAAATCGCCCCTTTTTCATATCGGAATACTGAGTTTTGTTAACTACGCGGTAGGTAGTTAGCCTTTCCTACCCATTTATAGCTGGTAAGCTCTTCTAACCCCATTGGCCCACGAGCATGCAGCTTCTGTGTCGACACCGCAACCTCAGCACCTAAGCCAAACTGCGCACCATCGGTAAATCGAGTAGAAGCGTTAACATACACAGCAGCAGAACCCACTGAATTGATGAACAACTCCGAGTTTTCCAAGCTGTTCGTCATAATTGCATCAGAGTGGCTGGCATTATGGACTCGCATATGATCGATAGCTTGTTTGACATCCTTAACTACTTTGACACCTAGCGTATAGCTGAGCCATTCTGTATCAAAGTCCCCTTCGCCACTATCACGTATCAGCTTAGCGGTCGCCATCAAAGCCTTTGCTTGAGGCTCTGCAACAAATGTGACTTTCTCTTCCATACGTGCTTTCAACATTGGCAGAAACTCGGCTGCGACAGCTTCATGAACCAATAAAGTATCCAGAGCATTACAAGCCGAAGGACGCTGCACTTTCGCGTTTTCAACGACTTCTAGAGATTTCTGGAGATCAGCACTCTCATCGACGAATACATGGCTGATACCAAAGCCGCCGATAATGACAGGGATCGTACTGTTTTCTTTACACATTTTGTGAAGACCAGCGCCACCACGTGGAATGATCATGTCAACGTAATCATCGAGCTTAAGCAGCTGAGAAACCAACTCTCGATCCGGCTTCTCAATATACTGAACCGATGCTGCAGGCAGCTCGGCTTTAGCAAGCGCCGACTGAATAACTTTGACCAGCTCCATATTGGAGAAAAACGTCTCTTTACCACCACGAAGGATGCTTGCGTTACCCGTTTTCAAACACAGGGCAGCAATATCAATGGTCACGTTCGGGCGCGCTTCGTAGATGACGCCAACAACCCCTAATGGCACTCGACGGCGAGAGAGAGACATGCCGTTTTCTAGGACTTTGCTATCAATTTCACTGCCGACGGGATCATTAAGGCTAATCACGTTACGTACGTCATTAGCGATCCCCGCTAAACGATCTTCGTTAAGCAGCAGGCGATCAAGTAACGCCTCTGTCAGGCCAGCTTCACGACCCAGTTCAATATCTTTCGCATTTGCCGCCAAAATCGTGTCTGCGTTGGCTTCAAGCTCATCTGCAATGATCGCTAGTGCTTGGTTTTTTTGCGCCGTTGATGCTGTTGCCAGTTGGAAAGCTGCGTCTTTGGCAGCTTGACCCATAGAAATCAGTTCCACTATCTTTCCCTCAATTATTCCTGAATAACGACCATATCGTCACGGTGCAGCACTTCGCTGCCATAGTCGTAACCCAAAATTCCTAAAATATCTTTACTGTGCTTACCAATTATCTTGGTCATGTCTTGGCTGGAGTAGCTGGAAATCCCACGCGCAACCAATGCACCGCTCTGATCAGTCACACGCACCACCTCACCGCGGGCAAATTCGCCACTCACGTGAGTCACTCCCTTAGCCAGCAGACTACTGCCTTTATCGATGACTGCTTTCACCGCTCCGTCATCAATGACAATATCACCTGACGCGGCTGGCCCAGCCAGAATCCAGCGTTTGCGACTTTCGAGCGCTTCTTCAATTGGCAGAAAGCGGGTACCTTGCGGTTCTTCACCTAATGAGTCAAATACCACATTAGGTGCGCTACCAGCTGCGATGATCACTTCAATCCCAGCTCTTCGAGCAATATCCGCCGCCTGAAGTTTGGTTGCCATCCCGCCAGTACCAAGCGTTGTGCCACTGCCTCCGGCGATTTTGCGCAGAGTGTCATCAATGGTTTTCACTTCTTTGATCAATTCAGCATTTGGGTCTTTGCGCGGATCAGCGGTAAATAGCCCTTTCTGATCTGTCAGTAGGAGCAATTTGTCTGCCCCACAAAGAATACCGACTAAAGCTGACAAGTTATCGTTATCACCCACTTTGATTTCACTGGTCGCTACCGCGTCATTTTCATTTACGATAGGAATGATGTCATTGTCGACTAAAGCATTGATGGTATCGCGGGCATTCAGAAAGCGTTCTCGGTCTTCCATGTCTGCACGAGTCAGCAGCATCTGACCAATTTTAATTCCGTAGATGCCGAACAAGGCTTCCCAAGTTTGAATCAATTGGCTCTGCCCCACCGCAGCCAATAACTGTTTATTTGCCATCGAGTTGGGCAGTGCGGGGTAACCTAGGTGCTCTCGGCCGGCCGCAATTGCGCCAGACGATACCATGACCACAGAGTGGCCCAGTTTCTTCAGCTCAGCACACTGGCGCGCCAACTCAACCATGTGAGCGCGATCTAACGCCAATGTCCCACCAGTTAATACACTGGTACCCAGTTTCACAACCACAGTTTGGCGCTGTGTTGTGTTTCCGCATTCTTGATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP009617|2573659:2580343|2574307_2575417_-|WP_006957920.1|DBSCAN-SWA MPISTPQEIIEDIRLGKMVILMDDEDRENEGDLIMAAEHVTPEAINFMATHGRGLICLTMTKERCERLGLPPMVQDNNAQYTTNFTVSIEAAEGVTTGISAADRARTVQAAVAKDAKAADLVQPGHIFPLAAQDGGVLTRAGHTEAGCDLARLAGFEPSGVIVEILNDDGTMARRPDLEIFAEKHGIKLGTIADLIEYRNNTETTIERVAECKLPTEYGEFELVTFRDTIDNQVHYALCKGNVQENAPLVRVHLQDTFTDLLRSDRNAERSWTLDKAMKRIGEEGGVLVILGNEESTDLLIHRVKMFEAQDKGEAPTLAKKQGTSRRVGVGSQILADLGVHDMRLLSSTNKKYHALGGFGLNVVEYVCE >NZ_CP009617|2573659:2580343|2577264_2577714_-|WP_006957923.1|DBSCAN-SWA MHCPFCSENDTKVIDSRLVADGHQVRRRRQCLACSERFTTFETAELVMPRVIKSNGNREPFNEDKMVGGLQRALEKRPVSADSVELAISMIKSQLRATGEREVPSEMIGNLVMDQLKELDKVAYIRFASVYRSFEDIREFGEEIARLED >NZ_CP009617|2573659:2580343|2579209_2580343_-|WP_019277477.1|DBSCAN-SWA MNQECGNTTQRQTVVVKLGTSVLTGGTLALDRAHMVELARQCAELKKLGHSVVMVSSGAIAAGREHLGYPALPNSMANKQLLAAVGQSQLIQTWEALFGIYGIKIGQMLLTRADMEDRERFLNARDTINALVDNDIIPIVNENDAVATSEIKVGDNDNLSALVGILCGADKLLLLTDQKGLFTADPRKDPNAELIKEVKTIDDTLRKIAGGSGTTLGTGGMATKLQAADIARRAGIEVIIAAGSAPNVVFDSLGEEPQGTRFLPIEEALESRKRWILAGPAASGDIVIDDGAVKAVIDKGSSLLAKGVTHVSGEFARGEVVRVTDQSGALVARGISSYSSQDMTKIIGKHSKDILGILGYDYGSEVLHRDDMVVIQE >NZ_CP009617|2573659:2580343|2573659_2574130_-|WP_006957919.1|DBSCAN-SWA MKVIEGGFPAPNAKIAIVISRFNSFINESLLSGAIDTLKRHGQISEDNITVVRCPGAVELPLVAQRVAKTGKFDAIVSLGTVIRGGTPHFDYVCSECNKGLAQVSLEYSLPVAFGVLTVDTIDQAIERAGTKAGNKGAEAALSALEMINVLSEIDS >NZ_CP009617|2573659:2580343|2576150_2577257_-|WP_043009025.1|DBSCAN-SWA MSEFTPQDYQMMSRAIELAKGGIYTTAPNPNVGCVITLDDDIVGEGFHYRAGEPHAEVHALRMAGDKSVGATAYVTLEPCSHYGRTPPCAEGLIKAKVAKVICAMEDPNPQVAGRGIKMLRDAGIEVQVGLLESDAMDLNSAFIKRMKTGMPFVQLKMAASLDGQTALSNGQSQWITSPQARQDVQNYRAQAGAILSTSKTVIEDNASLNVRWSELPESVQTKLPESEVRQPVRVVLDRQQQLSSELKFYSTDGERIVVSAQGDVAPLLNDSEQIDLKSTFANLVSQHNINHLWVEAGATLASSLIKEGLVDELVLYLAPKIMGSDGRGLFGVLGLESMAEVIELDIQDIRQVGQDIRLVARLKNKEA >NZ_CP009617|2573659:2580343|2577944_2579195_-|WP_043009026.1|DBSCAN-SWA MELISMGQAAKDAAFQLATASTAQKNQALAIIADELEANADTILAANAKDIELGREAGLTEALLDRLLLNEDRLAGIANDVRNVISLNDPVGSEIDSKVLENGMSLSRRRVPLGVVGVIYEARPNVTIDIAALCLKTGNASILRGGKETFFSNMELVKVIQSALAKAELPAASVQYIEKPDRELVSQLLKLDDYVDMIIPRGGAGLHKMCKENSTIPVIIGGFGISHVFVDESADLQKSLEVVENAKVQRPSACNALDTLLVHEAVAAEFLPMLKARMEEKVTFVAEPQAKALMATAKLIRDSGEGDFDTEWLSYTLGVKVVKDVKQAIDHMRVHNASHSDAIMTNSLENSELFINSVGSAAVYVNASTRFTDGAQFGLGAEVAVSTQKLHARGPMGLEELTSYKWVGKANYLPRS >NZ_CP009617|2573659:2580343|2575497_2576148_-|WP_043009024.1|DBSCAN-SWA MFTGIIEAVGTLTAITPKGEDISVTVEVGKLDMSDVKLGDSIATNGVCLTVVDFNSTSYSADLSLETLNKTGFTDYQVGGKVNLEKAMLPTTRFGGHIVSGHVDGVGEITERSQVGRAIEFWVSIPEELSKYVAEKGSVTVDGISLTVNALRKNAFKLTIVPHTGEETTIADFHVGRKVNLEVDVLARYMERLLTSQKEQPESRLTMEFLQQNGFA |
7 | Staphylococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
653417 : 703841
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP009618|653417:703841|DBSCAN-SWA ACTACAAGTGAGCGAGTGGGTTATGAGTAATTGCTTCTGATAGGTGATCTGGGGCGAAGTGAGCGTAGCGCATGGTCATACTAATATCTGCATGGCCAAGGATGTCTCGCAGTACCAAAATGTTGCCGCCGTTCATCATAAAGTGGCTGGCGAATGAATGGCGAAGAACGTGCGAGGCTTGGCCAGAGGGTAGAGTAATACCGAGTTTGTTCTTAAGGATGTAGCAAAAGGGTGTGTAGCACTCTTCGAACAACTTACCTGAGGTTGGTTTATAGATCTCATGAAAAAGCTCTTCAGAGATGGGTACAGAGCGATTCTTCTTAGTTTTAGTGTTGGTATAGGTGACTTTGTATTTGCTGAGCTGAGAGCCGTTAAGTTGCGCAGCCTCATTCCAACGCGCACCGGTAGCAAGGCAAAGCTTAACTATCTTGAGCATATCCTCTCTAGTGTGTAGAGCGACTAATTCCAACAGAAGGGAAATTTGCTCTTTATGTAAGAAAGCCATGCTGCGCTCGTGATCTTTAAAAGGCTTAACATCCTCAATAGGGTTGGGGAGTTTCCATTCTCCCAGTTCCTTCAACTTGCTGAAAACAGCTTTAAATCTAGCGAGCTCAGAATTTAGCGTAGCAATACTCGGTGCACCTTTTTGCCACCGGTCATCAACAAAGCTAACTTGCCCATGCATGCGCTGACTGCGAAAATCTGAATACAACTTAGCATTGAGAAGGGTAGCAATTGGGTTACCCATAGCATCACACATCTTTTGCAGCTTGCTATAAATAACGGCTCCGTTAGCGAGCGTTGCACCATAGCGCGTAAACCAAATGTCCATAAGCTCAATTAGCCTTCTGTGTTCAGGCTTATCACCTTCCCAAGGCTTGTTCTCAACTTCACGCATGACAAAGCGCTCGTAGGCGGCAGCCTCACCTTTGGTGGCGAATCGCTTTCTTACTCGCTTTCCAGAGCGGCCATTTGGGTAGCATTCACATAGCCAAGGCTTAGGTGAGCTATCTTTTAGGTTTCTTACGGACATTATCACTGCCTACTTTTACTGTCTTTATATACAGTTTATTTAGAGGTTATTTCATACACAATGTTCAATGATCCGTTTTGAGCACAAATTTAAAAAGCGACATAAACGGCCATAAAGTCCGATGAATTAACATATAAAGCATACATTTATTTTATTTATGATTTCTGTCACATGTGGTGGAATTTTTTATGTGATCAGTTTCAATGCTACTAGTGTAGTTATTGTGTAAAAATAAGACAAACAGCAGTGGTAAGTTTTTGGTTTTAAGTTCTATAACGTATAATTTGAACAAGTTGAACAATCTTTAAGTAGTCATGACCGAATTAACCAAGTTGAGAAGTATAGCTAGCCTGTTCTCAACATCTGCCATTAAAAGACTTATATCCGAAGGAACGCAAAGCTTTATTGATTCCTCTGGAAAGCTCGATGTTAATGGTTGTAGTTCTGTAGGTTCTATTTTTGATTCAGCTTATTCAGAGCTTTTGGGTTCATATCGGAATGAGTACGTTTATAAAAATGCTATCGCCGAAAAGTTGATTCGAGGCACTCATCGGTTTTCGAGAAATTGCTATTTCTCGACAGAGTTTCGTGTTGGTAATTCCTTAGCTGATGTTGTCGTAGCAAACGGCACGACAACGGTTTATGAGATCAAAACTGAGTTTGACTCTTTTGAACGGCTGGAAGGGCAAATATGCGACTACTCAAAAGCCTTTGAGTATATACATGTAGTTATCCCAGAAAAAAAACTTTCAGATTGGGAGCTAAAAATCCCTAAGAATGTGGGCATCACGGTCCTTTCAAATGAGTATACTCTCAGAGAACGCAGGCCAGCCGCATCTAACATTGAACACTTCGATCTCGAAACAATGTTTGCCTGTTTCAGGCGCATGGAGTTTATTGCTGCTGTTGAGAATCAGTTTGATTACATTCCAGAGTGTAAGCCTGTAGAACTAAAAGCTAGATGTAGAGAGCTATTTCTTACGCTAGATCCTCTTGTTGCTCATGAAGAATTTTTAGCGGCTTTGAAGTGCAGGCAAATGCGATGTGAAAAAATCGAGCTATTGAAAAATGCGCCTTCATCACTCACTTCGGCACTTATTTCAGCGAACCTATCACTGAAAGAGATAGCTCGACTAAACGAAGTCTTGGGGGAAGGCGTTTAAACTCATTTAGTAGGAGTGAAAATGTACTTTCCGTTTTTTAGAGCCCGCCAATACGAGCTGCTTGCGCTTCGAGATACTATTATCAAGGAGCATATAAGCAAACAAAATGTTAAACCAATAATTGAACCTGTTATTGAAGGGACTCGAGACATATTCCGGTTTTGTGATGAGCTTGAAAAAGTTAATATGGGATTCATTTTTGTGGTTAATCCTTCTAAGGGATACTACGTCAAAAACCAGAAAAAAATTTTAAAACTCGCTGGAGAGTGTATCAACCGAAACACGAATATCGAGTTTGCATTCCGAGTCGATGATGGCACTCCGATAAAGTCCATAGCTCAATTTGTTCAAGACTTCGCTGAGTTTCGCGTGTCTTTAATCCATCAGAGCAGTATTAAAGAGATCACTGAGCTTAAAGATGCAATCAACACCGATAACTTTGCCTACAATGTGTTCTTAAAAGAGGGTACTAGTAAAAAATATCGTTCAAAGTTTGCAGAGTATGAAAATGTAATTCTTGAAGACTCTTTCAACAAGGTGGAGCCTAATTCTGCGTATGAAGGAGAAGAGTTTTTTAACGATACAGTATTCACATATGAAGAACGTGGCTACTTTGGGTTCGGTGACTATTCAATTGTAGGTGACCATTTTTCTGTTGGTGGTGGGCAAGCGAGAACTTGTGCTATCCATATAACCTACGAAGAAGATGATGAAGAAATCTGGGTTAAGCATTTCCTTTCTGAACCAAGAGAAAATGTAGATGATGGCTCAACTTTAGCTGCGGAAGCAATTGAAGCATTAGTATCTTTCGTAGAAGAAAATTGGACCGAAGAGCAGTATACTAACGCCATCAAAGAATTCGTTGAACTGCAAGAATCTGGTCGACAAACTAGCTTGGCATTTGTGAAAAAGCTGTCGATGCGTCACCATCTTGAGTTAATTGATGGTATTTTAGGCTAATTATCACTATCTGATAAAGCCCTATAAAACAGGGCTTTATCAGAAACCATAAAGCTCTCTGTGCTTACCAAGATAAAAAGCATGTTCTTTCGTAAGACCGGAAACTTTTGTGTTCTCTTTAATCCCCATTGAGTTGAGAGTAACAACGGGAAGTGACTTACTCCGTAAAAGAACTCCATCATCTGTGAATGAAATCAAACCTTTATCGAAAAGTTTGTCAACGTTTGGAGCTAAAGGAAGTCCGTTGTAGCCATCTATTTTTTCGTCATCTTCACTCATGATCCATGGGACAATGTGAGAAGCTATCAAAAGGCTTGGGATGTTGACTTTTGTAACAGGGCAGGTGTAGTTCCACATTTCAAGAACTTCATCTCTAAACGCGCCTTGGCCAACTCGAGCATTCACTTTAGCTTTCCTAACCCCTCCCTTGGTCGCTTTTCGCATTTTTCGAGCTTTTCCCTTACTCGAATTTCGCTTAATCGGCGGCACTTTGAATTCAATCAACTGACTTTTGTCCAAACTTGAGAGGACAATAGCGGCAACTTCGTCAGGGATTGCGACCATATAGTTCTGAGTAGCATTTGCCTCTACATTAAACAAAAGTGGGTCACATTTACTGTTAAGCCTTTCAATGATCCGGTGTTTGAACAGTTCGTTGGGAACTGGTGTATCGAGAATCGTCAGGTCGACTTCTATCTTGTAACCGTCTTTCTTCCATTCATCAAATGTTCGGCTTTCTGGCCTAGGAGCAGGATAAGCATTTTTTGTTGCTTGAGCGATATAAATCACTCGCTTGTTTTCATGGCAGATAACAACATCACCACGCTTTACATGCGGCACGTGCTTCCAGCCAGGTTTGACTGTTTTTTCACCTTTTTCGGTATAGGTATGAGATGGAGCCCATAAAAAGTTGTGATCTCGTACTTCTTTATAAGATACGCCTAAATTTACCCAGTAGTAAGCCATTTTTTCCTCTTGGTATAAACCTATAAGATAATTGATTTTCTTTTATTGGTTTTTAAGTAGTGTTTTTTTATCTCTTGGAATTCATCTAGCTGAAGTATTGGGGAATGATTTTTCTTCGATCGGTAGCTATTTTCAATGTGCCGAATGATTCTATACGCTTTTCTTTTGGCTCCTACTTTGAATAAAGCATAAGCTCTATTGAGAAGAATGACTGAATAGTAGTCAAATAGAATTTTCTTTGTTTCATTATTAACTAAACTTTTAACCTCTTCGAATTCAGACAAAAGTGCAGGCCAATTCCTGACAACAAAATAGTGATGTGTAATATTAATGTATGATGTAAGAACTTGGGCTGGACTCGTAGACGTTGATACTAATTGCTCTTTTTCTATTGTTTTTGATTTTTTGTATTCTGTATTATTTTTACTGTTGAGTTCTAGAAGGTCATGATGGATGGAAGAGTTTTCATCATAAGTAGAGTTAACCTTCGCAAGGCTTTCTTGAAAAAGACTTTTATCAAATTCGTCTATGCATCTGAGGAGTTTGGCCATACCATTATATTCAAATTTATTTTCTAATATTATCGTCAATAGAAAATTAAATAACTCTCGCGCCTGATCGTAATGATTAGACCTGTACAAGCTATAGACAATACAGTGCGTTGTATATGTAGTATTTACAAGCCGTTCTAGTTTAATTAAATTATCTTTGTTTAAAAATATGTCTAGGTTTGTTAGGTATATTTTACTAACAGTAGAGTAATGGCCCACTTTTGCGTAGCAGAAAATTTGATAGTGTATTAATGCAAGCCGTTGTTCATCCTCAAAAGAGTCAATGTGTACGGATTTTGCAACTTTGTATGCCATCCAATCTGCCTG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59 | Vibrio_phage(35.0%) | plate,integrase,portal,head,holin,capsid,tail | attL 647736:647750|attR 678479:678493 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
918357 : 963040
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP009618|918357:963040|DBSCAN-SWA 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53 | Vibrio_phage(68.18%) | plate,integrase,portal,protease,capsid,terminase,tail | attL 918943:918958|attR 965224:965239 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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