Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP006777 | Clostridium beijerinckii ATCC 35702 strain SA-1 chromosome, complete genome | 6 crisprs | DEDDh,cas3,csa3,DinG,WYL | 0 | 3 | 10 | 0 |
1. NZ_CP006777
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP006777_1 | 1015037-1015137 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP006777_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP006777_1
>1.1|1015061|53|NZ_CP006777|CRISPRCasFinder TCAATTCACATATGAAAAAGTGTGAAGCACAATTAAGAACAATTCATATATGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP006777_1
The CRISPR arrays of NZ_CP006777_1 >merge|NZ_CP006777|1|1015037-1015137|CRISPRCasFinder AAAAAGTGCGAAGCACAATTAAGATCAATTCACATATGAAAAAGTGTGAAGCACAATTAAGAACAATTCATATATGAAAAAAGTGCAAAGCACAATTAAGA >NZ_CP006777|1|1|1015037-1015137|CRISPRCasFinder AAAAAGTGCGAAGCACAATTAAGA TCAATTCACATATGAAAAAGTGTGAAGCACAATTAAGAACAATTCATATATGA AAAAAGTGCAAAGCACAATTAAGA
>NZ_CP006777.1|WP_011968177.1|1014158_1014818_+|tRNA-(guanosine(46)-N7)-methyltransferase-TrmB MRMRKKPWARPELEGCDFFVINPKEYKGKWKEFFGNDKPIYLELGCGKGTFMAVHASENPDINYIAIDIKDEVLGLAKRNIEKAYEEKNRKTDNVKLMAQEIGLISEILSEEDVVSRIYINFCNPWPKEKHKKRRLTHMRQLEQYKTFLKSEGEIYFKTDDDELFEESLEYFNEAGFRIKYITYDLHNSDVEGNVQTEHEKMFSEQGIKIKFLIAMKDN >NZ_CP006777.1|WP_011968176.1|1012186_1013737_+|nitrite/sulfite-reductase MKELKEKLLIEIEEFRELGNKFLSGEVSIMDFKKVSGGMGVYSERNKKEFMIRLRIPSGISSFENMNWLCDIADKYNLDKFHLTTREAVQYHNLTIDQVCGIMKDGIDNDIYSRGGGGNFPRNVAMSPLSGVDKDEAFDVTPYALTVNKHFLNKITSYKFPRKFKVSFSSSDSDQGHCNVADLGFLATIKDNEKYFRVFMGGGIGRNPQVAVEYDELIKPSDVLYHVEAMTSLFIKEGNYEDRNKARIRYILERMGKEKFIETYKEHLKYVLDNNALDLFVESKEITKEGKEIELKHSRLYSQKQKGLYSVYFHPIGGQISVKTLREILDKLKVVKDLEIRLTMTEGLYFRNLNGDEAKEILDLTQNIGGETALQQSVSCIGVPICQVGILESQKMLNNIINYFAEKGYNKDILPRVHISGCGNSCAVHEVVGIGLTGKRKKVVDVVEDVFELHINGSFETGSARLGKVYGDLLASEIPEFLYELSLYIENKNMNFYEFVENNEEELLKIIEKYKK >NZ_CP006777.1|WP_011968175.1|1010892_1012026_+|molecular-chaperone-DnaJ MANKDYYELLGLQKGASDDEIKRAFRKLAVKYHPDRNQGNAEAEEKFKEINEAYQVLSDPEKKAKYDQFGSAAFDGSGGFGGGGFGGFDGFDMGGFGDIFESFFGGGGSNSRRRNGPVRGNDIEYTITLTFEEAVFGVEKEISVTRNENCEHCHGSGAEPGTNAKTCPTCSGSGQVRVQRQTPLGSFVSTSTCDTCRGTGKIIEKPCSECRGKGSVRKTRKIKVNIPAGVDTGNVMPLRGQGEHGLRGGSPGDLYVRINVTPSKVFTRKGNDVYIDAHISMPKAALGTEITVATVDGNVKYTVPPGTQSGTMFRLKGKGIQRVNSNGKGDQYVKVIVDIPKTLNKEQKEALYDFMRASGEEFDEANVPKKKLFGKNK >NZ_CP006777.1|WP_011968174.1|1008937_1010782_+|molecular-chaperone-DnaK MGKIIGIDLGTTNSCVAVMEGGEPTVIANSEGARTTPSVVSFQANGERLVGQVAKRQAITNPDKTVISIKRHMGTGYKVDIDGKQYSPQEISAMVLQKIKADAESYLGETVTQAVITVPAYFNDSQRQATKDAGKIAGLEVLRIINEPTAASLAYGLDKTDSAHKILVYDLGGGTFDVSILDLGDGVFEVLSTNGDTKLGGDDFDEKIMKYIADEFKASNGIDLMQDKMAVQRLKEASEKAKIELSASQQTNINLPFITADATGPKHIDLTLSRAKFNEITHDLVERSIEPMRKALADAKLSLNDIDKIILVGGSTRIPAVVEAVKNFTGKEPSKGVNPDECVAVGAAIQAGVLTGEVKDVVLLDVTPLTLGIETAGGIATPLIERNTTIPTKKSQVFSTAADNQTSVEINVVQGERQMAMDNKSLGQFTLSGIAPAPRGIPQIEVTFDIDANGIVKVSALDKGTGKEANITITASTNLSDDEVDKAVKEAEKFAEEDKKRKEKVEAVNNADQTIYQIEKTLNEVGDKATEDEKAAVRAKIEDLKKVKDGDDVEATKAAIEAVNQSFYPIATKMYQQAGGAEGAADPNAAAGGAQSAPHDDNVVDADFKVDEDK >NZ_CP006777.1|WP_011968173.1|1008208_1008832_+|nucleotide-exchange-factor-GrpE MEENRDVKNEELEKEEIADEVAEKDNETQESNDAAETNEASKEASENIEAAEEDQEDLVKNQEEENKKLREELDATKDRLLRLTAEYDNYRKRTAKEKEGIYSDAYVDVLKEIVPILDNLERAVAADGSIEDLKKGIEMTIKGCKDSFAKLGVEEIDATGEFDPNLHNAVMHIEDEELGKNVVAEVFQKGYKKDDKIIRHTMVKVAN >NZ_CP006777.1|WP_011968172.1|1007142_1008171_+|heat-inducible-transcriptional-repressor-HrcA MSIDDRKIRILQAIINDYIRTGDPVGSRTIAKNYNLGIGSATIRNEMADLEDMGYLEQPHASAGRIPSSKGYRLYVDQLMDNQMLTVEEDLRIKQYIIDSAMLEVDKIVKQTSALLSELTKLTCVIETPSVKRSFIKSIQLIKVDDHNLVSVFLTDTGVIKNHIMKLNNRVPEVETLTRINEVINNRLVNLSIQEINLEVINNLKKDLGAYEEIFNALLPILYETLNSADSTEVFMEGTTNIFNYPEYNDIDKAKEMLSLLNDKEALMELFNPQDNITVSIGDENYKPQARDCSIISAEYSFKDRPIGKIGLIGPRRINYSKVIMIMSEVIKELNNILSNPK >NZ_CP006777.1|WP_011968171.1|1005776_1006904_+|oxygen-independent-coproporphyrinogen-III-oxidase MRDISLYIHIPFCKQKCFYCDFPSYSGKEGLMNEYIEALSNEILQKGKEYRISSIFIGGGTPSYLNDLSLEKLLGTLNKLNLKDDLEFTVECNPGTLNEKNLNIMKEHNVNRISMGLQSTKNSLLKDIGRIHSYEEFEENYFLARKLGFNNINVDLMFGLPNQTIEDWECSLRKAAELELDHISAYSLIIEEGTRFYNLYEEDKLNLPEEDKERIMYLTTKDILNGYGYHQYEISNYSKKSKECFHNKVYWKCDEYLGMGVSASSFIDKKRSKNIDNIKEYIKRINNKESVIEEIHLNDIKDDMEEFLFMGLRMIEGIKVEKFKERFNKDIYEVYGEIIEKNIKKGLLINNSGNLYLTSHGIEISNYVMSDFILS >NZ_CP006777.1|WP_011968170.1|1005120_1005561_+|hypothetical-protein MFLNELKKNEGIAFMQLVRILANSDNVFAKEEKNLYNDYLKELSINESEISESDLNSVCENLKGSSNRCKNIIYFELIGLALIDGEYNEEEVELLEKLGEALGITRSKRIAFANYFYNFVDVYGFSVVDAESKIALLKEQAEKLLV >NZ_CP006777.1|WP_038458213.1|1003134_1004940_+|elongation-factor-4 MKSERQKHIRNFSIVAHIDHGKSTLADRLLETTGTLTKREMEEQVLDNMEIEKERGITIKSQAARLVYRRDDGEEYILNLIDTPGHVDFNYEVSRSLAACEGAILVVDATQGIQAQTLANCYLALDNDLEIAPVINKVDLPSARPDEVKKEIEDVIGIPAEEAPTISAKTGLNIGDVLECVVKTIPSPDGDEEAPLKALIFDSYYDSYKGVVCIVRVMDGRVKIGTKIKLMATNKVYDVTEVGVFTPGVLPISELSAGDVGYVTASIKNVRDARVGDTITEANRPTETALPGYKPAIPMVYSGIYPVDGAKYDELREALEKLQINDAALSFEPETSIALGFGFRCGFLGLLHMEIIQERVEREFNLDIITTAPSVIYKVIKTDGEILEITNPTNLPPLTEVDYMEEPVVKASIITPKDYVGAVMELCQDRRGIYIDMQYIEETRAVVNYDIPLNEIIYDFFDTLKSRTRGYASLDYEFKGYIRTKLVKLDILLNGDVVDALSMIVPEERAYHKGRGIAEKLKEIIPRQLFEIPIQAAVGSKIIARETVKAMRKDVLAKCYGGDISRKKKLLEKQKEGKKRMRQVGSVEVPQEAFMAVLKVD >NZ_CP006777.1|WP_011968168.1|1002633_1002963_+|hypothetical-protein MKKIIKSNILRRISPMIFILFIIFIGIIKIDMINTKALSPLGNTNENYKLVSNEFGEDFSNFIKDNSFLKIYKESEKDVLVKIGSNDFRINNQSSFIKKIEDIIERIKP >NZ_CP006777.1|WP_011968178.1|1015517_1016462_+|50S-ribosomal-protein-L11-methyltransferase MDGIWIEVSVITKSEALEPISGIFYGLNCPNVAIEDPEDLLSRDQGPLTWDFADINILEHKGNAAVVKAYFSQDDKVEEIVEYVKEKLSEIKEFGIDIGEGTVEAKKMHEEDWANNWKQYYKPVKITDKIVVKPIWEEYEKNDEELIIELDPGMAFGTGTHETTRMCIQALDKYVKPDTTVFDVGCGSGILAIAAAKLGAKHVVGVDLDPVAVDSSKENISFNNLNNIEVLEGNLLDVVDGKADIVVANIIAEIICVLTEDVKKALNEGGLFITSGIIHDRVDMVTEKFAECGFEVIEINKDGEWNCIVAKAIN >NZ_CP006777.1|WP_011968179.1|1016668_1017436_+|16S-rRNA-(uracil(1498)-N(3))-methyltransferase MHKFFTEPHNISETEGKILGDDVKHIYKVLRLSEGEEVVLNNCEGIEYLGEIETITKSEVIVKIIKRLDINNESKVKVHLFQGLPKGQKMDLIVQKGTELGVSEFIPVTTARVDVKLKGEFKKLDRLNRIALEACKQSKRSVIPQVKEVIDFNEAINELKKMDLIIVPYENAEDFGIKTLVRKLERDSVDLDTINNVGILIGPEGGFEESEIDDLKEQGAYIVTLGNRILRTETAGFTATALIQYELGDLGGKLS >NZ_CP006777.1|WP_038457176.1|1017435_1018839_+|tRNA-(N(6)-L-threonylcarbamoyladenosine(37)-C(2))--methylthiotransferase-MtaB MGENQMKLVRAGSDKTKLKKLSNKEPIKNTEGKSLVAFATLGCRVNHYETEAMAEKFIREGYEVTDFEGFADVYVINTCSVTNMSDKKSRQIISRARRRNENAIIAAVGCYSQVAPEEVSKIQGVDVVLGTRNKGDIVYYVNKAKDEQKPQLMVGEVLKNKQFEELNIEEYQDKTRAFLKIQDGCNRFCAYCLIPYTRGTTCSKDPQKVLDEIKNLSEHGFKEIILSGIHTASYGVDLDGNVTLITLLEEIEKLDGIERVRIGSIEPSFFTDEVIEKMKKMKKLCPQFHLSLQSGCDATLKRMNRRYTAKEYEDAVNRIRENLKDASITTDVIVGFPGETDEEFNETYEYLKRIKLTKTHIFKFSPRKGTKASDMPNQIDGNVKDKRSKALIELNAKNEGDFSKSLVGRELDVLVEQEVSNKPGVFEGYTRNYVKVEIPNGSRDMIGKIILCKIMASDAEYVVGKII >NZ_CP006777.1|WP_011968181.1|1018988_1019333_+|histidine-triad-nucleotide-binding-protein MEGCIFCKIISGDIPSKKIYEDDKVYAFYDINPEAPTHFLVIPKEHIESANTLDDSNIDIVSHIFKVIGKLVVDLGISDKGYRVVNNCGEDAGQTVKHIHFHVLGGRSLQWPPG >NZ_CP006777.1|WP_008429643.1|1019475_1019652_+|30S-ribosomal-protein-S21 MSEIKVGENETLESALRRFKRKCARAGVLSEVRKREHYEKPSVKKKKKSEAARKRKFK >NZ_CP006777.1|WP_011968182.1|1019682_1020135_+|GatB/YqeY-domain-containing-protein MSSIKDRLQDDWKIALKAKDKFTSSVISTAKAAVLLVEKTDNRKLEDDEVITILAKEIKQRREAMLEFEKGNRQDLIDQSKAEIEILLKYLPQQLSEEEIKQLVKESAEEVGANSIKDMGKVMSAVKPKVVGKADGKLVSQLVKEYLNNK >NZ_CP006777.1|WP_011968183.1|1020423_1020702_+|sporulation-protein-YqfC MEEKFQRGKEKILSKLDFPSDISLDLPKIIVVGNREITIENHKGIIFFETNMVKINSRIGAIIIEGKEFEILFIAETSITISGIFKGISYER >NZ_CP006777.1|WP_011968184.1|1020708_1021836_+|sporulation-protein-YqfD MFSSLKSGQVTIEINALVPEKILNAFWNSQIYTCNIVKVSLTTVRVTIYYRDYKDAEILIKKYKGKVKIVRTSGIIVLLMKMRRKISLVIGMGLFFAVIYILSNYIWAIDIETQRNLSPFEVRQQLSSIGIKPGLNKSQVNVYQIEKKMEDLNSQIMWIRVRIEGSTLKLVIKEKVNPPSTEKTLYNQVVAKMDGEVKRVYTNSGNPAVVPGDIVKKGDDLILPIQGREGFQMEVKPSGTVIANTFYDKFMEVQISGEKLERTGNKNSDIYLNFFGKKVYLKKAINQFEYYDKIEEKDGFFNKITYFEKKGINVNLDKESTVKEATEKLEGSLRKTLSNDAKIIDKKTAVEDIEGGKILINVKFTVEQDIAKNVS >NZ_CP006777.1|WP_011968185.1|1021896_1023981_+|HD-family-phosphohydrolase MDIKQNNKWKNNRIQRIVLFILVFSIGYLLLVTAITPKQYSLKEGDIPRVDIKAPRDIVDEKATKEKEDQAAEKVGKQYTSKPEVKKEAEDNVRALFDKLVSLSNMASSTVADKQTELKKLTIFQLTDEQCKALIGISKDTLPGIEDKIVNIIDSAYEKNIQEKDEGALKEAKGAVSTQIDNLNLDKDVSSALKQIAQTQINPNVFFDEEKTQEKIQEVKKNVSKVIIKQNQIIVKEGEPVTQDQIDILSDLGMLNDENVTAYVYIYLALAIFWMIILFLQYGYVRINYGEIYKNNKKLILISTINLISLVLARTVGVISPFLIPFACAPMMLTLLLNYKISFVLSALNAIVIGALNGFDVQIIILGIVSSVLGAAFLKKMQQRNELLYSTLYTAVVTVILTLSTGILISSNFGDVLVKGGITFIGGLLSGIFALGILPFLEGTFNEVTTLKLLELSNPNTPLLKKLLMEAPGTYHHSMLVANLSEMAAEEVGANSVITRIGSYYHDIGKTERPYFFGENQMGIDNPHENIPPNLSAMIIKSHVKDGLELAKKYKLPKVIQDIILEHHGKTLVKYFYYTMKNSAENPEEIKEEDYRYEGPIPSSKEAGIVMLSDSVEAAVRSIKKPTKDAINQMVNCIIDDKLSSGQLNDCDLTLKDIEKIRVCFLTSLNSIYHQRIEYPKEKMKDFNGESNKG >NZ_CP006777.1|WP_011968186.1|1024007_1024511_+|rRNA-maturation-RNase-YbeY MIYVDNRQNKVEASEKLIERLTEVIEFALKEEEVNMKCEISLLFVDNNEIKEINNETRGINRETDVLSFPMLEYEDKKVFKDMYKDYKFSQSDFDGDELVLGDIVLSLEKALEQSKEFNHSYEREASYLVVHSVLHLLGYDHMEDDDKIIMRSREEDILNKLNIIRG |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NZ_CP006777_2 | 1516090-1516168 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP006777_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP006777_2
>2.1|1516114|31|NZ_CP006777|CRISPRCasFinder AGGAACTTGCTAAGCGCAACCAAGATCTTAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP006777_2
The CRISPR arrays of NZ_CP006777_2 >merge|NZ_CP006777|2|1516090-1516168|CRISPRCasFinder ATGAAAAGAGTGCGGAGCACAATTAGGAACTTGCTAAGCGCAACCAAGATCTTAGATGAAAAGAGTGCGAAGCACAATT >NZ_CP006777|2|2|1516090-1516168|CRISPRCasFinder ATGAAAAGAGTGCGGAGCACAATT AGGAACTTGCTAAGCGCAACCAAGATCTTAG ATGAAAAGAGTGCGAAGCACAATT
>NZ_CP006777.1|WP_011968616.1|1515288_1515930_-|undecaprenyl-diphosphate-synthase-family-protein MRIPKHIGIIPDGNRRWALSNSLGKDKGYDHGINPGLEVFKLCQKENIQEVTFYGFTIDNTKRPSDQKIAFTKACIDSVMLLTKEDCEILVLGNTESSCFPKELLPFTKRKKFGSGGIKANFLINYGWEWDLNLLKNADISKKHIQPHLQSKDISRIDLIIRWGGRRRLSGLLPVQSVYSDFYILDNYWPDFKKEDFYNALSWYNEQDVTLGG >NZ_CP006777.1|WP_011968615.1|1514876_1515152_-|DUF1294-domain-containing-protein MKFMLKVVFTYLLIINLLGFLIMFIDKQRAIHKEWRIPEKTLIGISIFGGSIGMLIGMSSFRHKTKHKKFTIGVPFILLMQIFIAILYLNY >NZ_CP006777.1|WP_011968614.1|1514229_1514838_+|DUF2238-domain-containing-protein MKEKNFHLILLISIFAILVASGINPHDRFTWVLEVIPAVIGVMVLITTYNKFVFTNLTYILIWFHAVILIVGGHYTYAEMPLFNWLRDTFDLSRNYYDRLGHFAQGFVPAIIIREIFIRNKIVKNIAWTNFITISICLAISASYEIIEFIVALITGESATAFLGTQGDIWDTQWDMIFALLGSMVSVLTVGKYHENLLKTKQ >NZ_CP006777.1|WP_011968613.1|1513229_1514144_+|homoserine-O-succinyltransferase MPIKIPIELPAFQVLSDENIFVMNNERANTQDIRPLKIAILNLMPKKIVTENQLLRYLSNTPLQVEVSLIQTKSYTSHNTPPEHLNKFYSYFDDIKQEKFDGLIITGAPVEQMAFEEVTYWKELTEIMEWSKTHVFSTFYICWGAQAGLYYHYDIPKYDLDEKMFGVFSHWVNDEKADLTRGLDDVFYAPHSRHTEVKREDIEKVSNLEILSESEEAGVFIVATKDRRNVFVTGHMEYDRNTLMDEYIRDKEKGDEIALPKNYFRNDDINQKPLYTWRGPASIVFGNWLNYCVYQNTPFDLNTL >NZ_CP006777.1|WP_011968612.1|1511581_1512640_-|lactonase-family-protein MVLKENISVGFIGTYTKNESKGIYRINFDTISGNIENINLAYNIENPTYLTLDRERHILYSTCKINEKAGVSSFKYWKEDNKLHLINSNLSEEKPPCHVSLNNSHEILISSNYHENKMFVYKTLDGLILNSPMLGSHSGSSVNQLRQEKPHIHCSMFTDDDKYILSIDLGIDKMIVSSIKDGKLYQNENLSYTFPAGTGPRHITYANGKHYYYVLSELTSEIFVFDYKAKSNIVFENIQTLSSLSKDYKGTKSGSAIRIHKNNKFLYTSDRGNNSLSLFHINSDNGKLKYIDTISCNGDSPRDFQLDPSGKFLLCANENSDNISIFSINSITGELTFIKSENIPTPTCIEFI >NZ_CP006777.1|WP_011968611.1|1509554_1511324_-|adenine-deaminase MNKDTLINHIKASNRSVKCDLVIKNVTIIDVFNKNRFVDTIGIKDGYIVGIGDYDGYEIVDGTNKYICPGLIDSHCHIESSLVTPTEYSKLALLNGITSVIADPHEISNVMGADGINFMLNSSQNIPFDIYFMLPSCVPGTSFESSGATLLSKDLKDFYKNDKVLGLAEVMDYPSVSECDDKIIDKICDSITNNKVIDGHGAGFTSMMTNTYRAANILTDHECNNAEEALDKIRRGMYILIREGTVAKNLKELLPAVNESNSNRFCFCTDDKHIDDIAANGSINSSIIYTINNSNLNPETAIQMATLNPSLLYKLNNKGAIAPGYIADFILLDDLERFKISQVYKEGKLVVNNNELVNFDTDLVKNANNNAFYNSINLPPLSEDSFKINIPNKDVKILNAIEIIPNKLESIHLRLNISDINSIKDSDYKFFTSSTEEDLLKIAVIERHKASGNLGLGILKGLEISAGAIGTTIAHDSHNLIIAGTNDKDMLFAAKELERMGGGIIVVKDKNILAHIKLEIGGLMTNRTYGEIEFDLKNLHSAIKIIAPQIDFNPFLTLSFLSLPVIPDLKITDKGLFDVINFKFIDIFE >NZ_CP006777.1|WP_011968610.1|1508402_1509509_+|HD-GYP-domain-containing-protein MRLVPIENVKPNTVLGKSLYDINGRILLRAGVVLRENTIAKIKEINILSIYIVDKYSNEEIEDIIKPELRQKAIITIKEAFSNIGRLNNNSVRNKESDYTWQEQSYFYNIGKMAVDLIEDIVNRRDVMLALVDIRSMNNYMYSHSVNVAVISLTIGIALQLSKKKLEALCIGALIHDIGKSLVPREIFDKQGSLSEEEKEILKQHPRLGYKYLSTTYNINSLSKLIVLQHHERPDGNGYPDGLTKDNIIELSNIVSIANVYDNLSTDLPNKRAMFPSDVLEYLMSNAGTMFDYNIVNIFCRIVIPYPKGTIVELSTEEVAVVEETIPGFPLRPTVRVIESPRVSRISMKIDLIKEISIVITGVKYEID >NZ_CP006777.1|WP_011968609.1|1507130_1507943_+|sugar-phosphatase MYKLLALDMDGTLLTTDKKVSKNTEAAIKAAEEKGVKIVLASGRPLDGLNRYLEELDLKKGEDYVLSFNGGLVQNTRGKIVSKVCLKGSDLKYIYEISKRLNVNVHAFSAKDGLIAPKTSQYTEYEAAMNGIDITIKDFNEVDDNEDIIKVMMIDPQEILDPAIKELPSEIYEKYSVFKSAPYFLEFTHKEVDKGLGLKKLGEYLGIKQEEIIACGDAGNDLSMVKYAGLGVAMGNATEEIKQAANFITDSNDEDGIVKVIKKFILSESK >NZ_CP006777.1|WP_011968608.1|1506193_1506820_-|sporulation-membrane-protein-YtaF MLESLLLVSSLCIDSFVASIAYGTSKIRIPPICAVVINLVCTITLACSLLIGSIVKSILPSNLPAILGFVLLMLLGIYRLFEYIFKSYISKCSKSDSPLTFKIFDFQFVLQVYADEIKADFDNSKCLNIKESFYLGLALSLDSLAVGIGSSLCNINYTEVLVLCFIIGVSLVSLGVVIGRKFAQKVHLELSWLSGALLILLAILRVLK >NZ_CP006777.1|WP_011968607.1|1505482_1505998_+|hypothetical-protein MLTATEERLLEYIEERARANVKGKTFYKMTDILEQAFWISEEKAYEVLKNIIARKNIGNSKDAIIDEYIDMLKKGYGSIQEQVDLFGGDKYTSVMYAAERRLKQYEGGTFFDLLREVYKVPDEEIMEVTEKYLKFLNSPIFSYRLEKETFHKFLQSDLEELDKQFNRFVNL >NZ_CP006777.1|WP_011968617.1|1517015_1518221_+|glutamyl-tRNA-reductase MIGLIGIRKNTPLEIREKFIVKSKKYNEYFGELLKELNEVVILATCNRTEIYFNASLNEEELLKKIFDIFNWDYEYKKYVFITNNKDAYRHLFEVCSGFHSKILGEDQILGQVKDAYEEALEFKAVSLELHRLFQEAITCGKRFRKEAKLFEIPVSSSSIVVSEAIKRECTKFMVLGYGEVGQLVMKYLLSHKIQTVYLVVRNPKIKDEIQDERVKVITFEEKNKYINSIECIISCTSAPHPVVKTEDISESGSRLVIYDLSVPRDVEKEVALLSRTEVYNIDTISRIDDENKKLRKDKMEDNRHIMNKYLKEYDEWLKLRSISHVIKNLKTVGNDVYEKRVQTFSHKSKDKNDIALAHKLIKSTSDFYINRAIEVIKEETLKGCGEEWIGIIEKIFMTKE >NZ_CP006777.1|WP_011968618.1|1518178_1518859_+|NAD(P)-dependent-oxidoreductase MDRDNRENIYDEGIEYSYISLISKKLRVGIVGGGKAGTIKARHFVKNKCCVEVISKTFDGELIELSKEFSEILTLKNEDLSYEFLSDKHLIIIALDDENLKNIVKKYCEENYKIYIDSSDFISGMGVVPIQRSTENVVFALNTNYGNPKGAVLLSNKVENTIKEYDEFIRYIGLIRNKAKSFPELKIQITSFIGNDEFKKSFDKGEAEKALRSRFSKEIVDYLINF >NZ_CP006777.1|WP_011968619.1|1518902_1519778_+|hydroxymethylbilane-synthase MNKLTIATRKSKLAQTQTEIIMKSLKDKFNIDSEKMLIVTEGDRKLDVSLAKIGGKGLFVKDIEIALLEKRADGAVHSMKDVPYELSHEFEIAAITEREDIRDVLISKDNIPFKELRKGAIIGTSSIRRACQLKLMRNDLDIVPIRGNVQTRLEKMKEQNLDGIILASAGLKRLNEEDIITEYFDPKVFIPAVAQGALGIECLKTSSAKKYFEKMEDSNAKLTVEAERSFMRMLNGDCHSLIGAYSEIQGNDLYMIGIYDIGGRIVKKDILGDKNDHIELGRKLANKILEI >NZ_CP006777.1|WP_011968620.1|1519790_1521254_+|uroporphyrinogen-III-C-methyltransferase MSKVYIIGTGPGDEELLTLKAVKVLKRCTAVLYDRLVSNNVLNYLEPNCEIYYCGKEPGAHSKTQEEINELLVKLAKEGHTVGRIKGGDPYVFGRGGEEVLALVDENIEFEVIPGVTSPIAVLNYAGIPITHRKIAQSFHVITGKSAQDLNVNFKALAKEEGTLVFMMGLGNLDNIVEELINNGKEPIFPCAVVMRGTSAKQKKVVGTLENISQKVKDAKLQSPCIIVVGEVVNLNKDLNWYENKPLFGKNICITRSRRQSEKLKNKLVDLGAEVTSFNSIKIESSAENLNDYIEKIENYDHMVFTSVNSVEIFFDYLIEKDYDIRRIKAKISAIGAATANSLKQRGIICFAKAREFVGEGLVSILKPHLKDNQTLLLPCSAKSRKYIYEELTNCGASVDKVYIYDTVCGSVVNKRSFDEVDIVFFTSPSTVENMIDMLGIEEIKKKQVIAIGPKTNEPLEKYGIKAYVCKEHSEEGFLKEIENLLQ >NZ_CP006777.1|WP_011968621.1|1521352_1522318_+|porphobilinogen-synthase MIKRGRRLRVNAAIRDMVRETSLDSKDFIYPIFVVEGDNIKNEISSLPDVYHYSVDRLYEVVEEVREANISGVLLFGIPNHKDECGSESYNDNGIVQQAIREIKKLDKELLVITDVCMCEYTSHGHCGIIHDEYVDNDETLEYLSKIAVSHAKAGADIIAPSDMMDGRIGSLRSALDENNFKNVSIMSYSAKYCSAFYGPFRDAANSAPQFGDRKTYQMDPGNRMEAIRETQMDVEEGADFIMVKPALSYLDIIRDCKENFNLPLVAYNVSGEYAMIKAAGKLGVIDEERVMMETLTSIKRAGADIIITYHALEAAKVLRR >NZ_CP006777.1|WP_011968622.1|1522555_1523851_+|glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase MKNVDIFKESEEYMPGGVNSPVRAFKGVNLNPPIIKSGKGVIIKDEEDNEYIDFVLAWGPLILGHCDDDVVEAIKEVSSMALAFGAPTKLELDLAKFICTNLDNVEMIRMVNSGTEATMSAVKLARGYTKRKRIVKFAGCYHGHFDGFLIEAGSGVMTGGIPGSLGVPNESIENTLIGIYNDKEQITELFKKYGNEIAGVIIEPVAGNMGVIKSENDFMETLRDLCNQYGSLLIFDEVMSGFRVAFKGAQSLFNVKPDLVTYAKIMGGGLPCGAYGGRKEIMKNLSPLGGVYQAGTMSGNPIVMAAGIATLNKLKNNQNYYDHIENIGARLEEGIINISKKYDLPVVMNRVGGMMTLFFNDLKEVRTYDDVKKCDVNRFNRYFEHMLKSGFNLPPSQFEALFLSVQHKESHIDAFLKAFEEFALNENKMSL >NZ_CP006777.1|WP_011968623.1|1523893_1524535_+|epoxyqueuosine-reductase-QueH MNKINYQKELDSLIENLVKNEEVPTLLLHSCCAPCSSYVLEYLSQYFKITIFFYNPNIYPMEEYTRRVAEQKGLISEMKVKNEIRFIEGKYDTESFYKLTKGLEEEKEGGVRCFNCYELRLNEAAIMAKEKGYDYFTTTLSISPHKNSAKLNEIGKSLSEEHDVKYLYSDFKKKEGYKRSIELSKQYKLYRQDYCGCVFSKNERMNDGNEKNK >NZ_CP006777.1|WP_011968624.1|1524618_1525176_+|DUF3867-domain-containing-protein MSDKIIDFNELKNKVKDKDIDKFEEYIYSMYYKLAEGKMNMSDFSKNILAYMEENNISQDKLINIQKKFLERYGVDPSLIQGQFKIPGFDTGGSNLDYQTIKKTMGFQEKYKSRISNKTMSEYFIKNEKNDLKVLLENLDVILVSEKSIDLNDNELNEFLCSYKKVIEDKKINIVICENVKNYEY >NZ_CP006777.1|WP_038457281.1|1525582_1526557_-|alpha/beta-hydrolase MKKFFKRFFLILFIVLFVFSLFFYKRIMLSYRIADKYISLKNHVWTIQEFNTQKSSSSMNYKDVIYKNTNGVPLKLDIYGPINQVYKSSPVLVYVHGGSWAYGDKNIPDALSPVLDTFREQGYTIISTSYELMKEKENFNKQISDVKDTIRWINKNQYSYNLNTSEIGIIGVSSGAHLSLMASYSGDDEFIDDNELSNYSSKVKYLIDFAGPTDLSLLNTQNLNYDLSKIFASISNKEDVIKKYNPITYVNKATPNTLIIHSNSDNMVPYESSKELYDKCVQEHSKAKLITLNSSAHDLSDISKDDVIDISEGLLKFVIFNSPL >NZ_CP006777.1|WP_011968626.1|1526930_1527869_+|hypothetical-protein MSNPFGILVYLDEILVRNLSSLVLTGFIETITRTQAFDRTLSAGFHEGDRIENSNQGSVTRIERKGFKDKNELDANNNFEHHHIDKEIDARQCVREERQVKTTYTTFVLNGSLINYFNENKQLQHKNEKDIENNNIYPGDLIEIEGTITNKSIMSYIETLINLITIFGAEYLDDLTKECNVKINFSMCLKMLTYMKSILENNNTTDLIMKCGNGTIILNVNKDNFMNNKFNIFDNINCPCRVIGKVIKTCTEEQDSISLLRKTGQEQFYEKFFEQFTPLIECLEKNNIFVPECPDLRINDCAIQIMPLNIYM |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP006777_3 | 1588985-1589124 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP006777_3
|
2 spacers
spacers of NZ_CP006777_3
>3.1|1589012|29|NZ_CP006777|PILER-CR TTATATTGTTTGTAATCTGCTAATTATAA >3.2|1589068|34|NZ_CP006777|PILER-CR TTTGGTGTGAATATTACATATTTAGATGATTTGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP006777_3
The CRISPR arrays of NZ_CP006777_3 >merge|NZ_CP006777|3|1588985-1589124|PILER-CR TATATAAACAATTTAAAATAAAATTATATTGTTTGTAATCTGCTAATTATAAAACCTATATAAACAATTTAAAATAAAGTTTGGTGTGAATATTACATATTTAGATGATTTGTAATCTATATCAACAATTTAAAATAAAA >NZ_CP006777|3|1|1588985-1589124|PILER-CR TATATAAACAATTTAAAATAAAATTAT ATTGTTTGTAATCTGCTAATTATAAAACC TATATAAACAATTTAAAATAAAGTTTG GTGTGAATATTACATATTTAGATGATTTGTAATC TATATCAACAATTTAAAATAAAA
>NZ_CP006777.1|WP_011968684.1|1587934_1588891_+|hypothetical-protein MYEFLGEDTTLDKLDEFQKNKVQWLQDNVQYSETTKRTYWEIININFHDYEKERKRDLYDFGKDEIISVINSIIYTSIKTNISLISIVSSYINWAIEHEYKKGENPCRDIDKTEIMKNRAEIVKRKYITLREFFKLLNNLKCSDIDKMLLVLARYGVKSQSVGTIKWNQVDRDNMILNLENNAKLPIDDRFLTYLDRAYKCEMYDYKTSTLNYVDYGYILKVSDKTDSDKLGRDTIYTRVNAIFRNNGMQKISLTDLYHSRQYDFLFDILRKNKDVTYNDVRNVLMMFFGESTPARAQYLKERFTLMSDYLPDLINNT >NZ_CP006777.1|WP_011968683.1|1587492_1587846_+|hypothetical-protein MGKRSINELSDVAKKRKEHRWDDLTSLIVIYGIEWEEDMAFCKLEDYKSGEAFDEENATKILYGFNEDEIWNNLFKVSNTNDYDDLHSRFKNAKWCTHENLMIFELLDGAKFCAMRL >NZ_CP006777.1|WP_158380889.1|1587306_1587468_+|hypothetical-protein MSLNLYSLIIKAANDNNINITLEDIGRINNTINNLISRKTNIQWIKNNIEVLL >NZ_CP006777.1|WP_038457294.1|1587019_1587217_+|hypothetical-protein MDKIRSFRGITAEKLIEVLKQVPSDTKICIELLGDNFPIKQVEECTYFDWSNGEKKQEHKGILIK >NZ_CP006777.1|WP_011968682.1|1586341_1586995_+|hypothetical-protein MNTSKDFIKFRQYVRSLSLSVNEQYMLEYLFEYTNVQYMYAYPKFSDLLLAFSTTSKNRISSTIKKLEKKKLLFVDRSFTNNRYHVVNAELFIHQGKHNDKNGTEAPLNGQVEFELTQEEKEVIDATNFTRNQAKSLLQLCNNKVDKLISMIKYVSNKANISNKFGYIKALLERGINIEDTKGNYPKKSISFVDNCSSRNYTEEWYQNIENRLLYGL >NZ_CP006777.1|WP_011968681.1|1585988_1586189_-|ribbon-helix-helix-domain-containing-protein MEEKSKYRRVVNREPFSTTVNLNYNNLLSELSEKTRIAKSKLTDEALELLFEKYNIDYKNESTEKK >NZ_CP006777.1|WP_077836901.1|1585271_1585685_+|SHOCT-domain-containing-protein MALRQACQNLDGFNINDFDETLKILYLKAGVSLFSWGENITVTVASCDNGNSEISILSTPKTGVMFGGTVDMGKNRKNINTIMSALSEELKNYVQVTKKSTSTESVADEIRKLAELKEQGILTEDEFSSKKKQLLGL >NZ_CP006777.1|WP_011968679.1|1584490_1584790_+|hypothetical-protein MINSDYLIRKNGKYSGDIKCPICEEIIEWKENENAEVRVVLKDCAIEEHMTSGLNIGRNYIIPAKISKTGEVTFKVYVVAECPKCNHKIEFYERAKYTR >NZ_CP006777.1|WP_011968678.1|1583733_1584459_+|hypothetical-protein MSGNPWSSDISEEKVCLSPDEFSINNSDDWTCALEKNYDKGSKFSTFRCDNKEKLLEITKDYWCFLKLILDERNKYEKCLGILEYRNGYPFVNNKEASNYNNYKVENYVFIRENRDVKSTMKLIFNCFRDNLQEEGIVLNILNKDNMELRAEHFKNKVEGQLENIPLRPIMIKEVETGIYELETYIPIDKYTEFQNIVGKEIDFEIYQYIKNIKIKVIERGTGGGTSDKWDSVSIKFKKVN >NZ_CP006777.1|WP_139355891.1|1583459_1583636_+|YegP-family-protein MARFEIKKSSNDQYYFVLKANNGQVILQSETYTSKQNCNNCIKSIKENAPDAEVADLT >NZ_CP006777.1|WP_011968685.1|1589371_1589785_+|hypothetical-protein MAWNRRVYITLNSDKEKDIIIEKFLSQSYSEADCIKEVLYRMATQGDNLKLININSTDKVQKITNSNKKVKNYTKPKGNNKVLKGADNDKELLKDDNILVNNMEQIETDNTKKVQINDNSDNEELNKNILEGLDRYF >NZ_CP006777.1|WP_038457297.1|1589893_1590091_+|hypothetical-protein MENVPLVKFVRTQKLAGYLMLQGFKFLRDDIDRNNPNYKIYIFKNQDGIETAIDNYKKEFGRKGN >NZ_CP006777.1|WP_011968686.1|1590093_1591941_+|hypothetical-protein MEELAVKKLSLQECLEDLQNEIRHGKNRDFFRVYSIETSGGKTYNTIKAIKDHYIFVRDNPFIKDKKRRFIFVTKFIEEGIEVAKEINKDEEEKIAMFYTPDKAIKNENCSSNFFECAKANTLILTHAMYSILCNPKKQEHKEYRKIFLKYKTLIIDEEINPVKDSLFTFSQGDTYWLTTLDSFTEQNLSKKLYQLMKPLLTLLKEDYKPENQLHRVECDYDRKEVDKLYEELMQGVQNIRNELFEDKYKCGETKCQKENLFKLLNGILLTYDSIDDNICLINPKRQIFSYNYKFDYLMLNNNIWLDASANFNKMYENGLFKVIDCPREIDHTNSKLIFHKIKTTTSSKNTDENFRRDISKYLIKEYSDQEILILSKDVECKQLAEKEEYLKNYPNFKYSNFEAMRGKNDWKDFKVCCYIHTYRWTSAYYIFLYEYFNDVILPDNDLITSNRKFVFKSKKSKSEWGFEKEELNEIMLSDMSSSMYQGLKRVQRNKQPKAIFDVFTDSINTIMTVKKQLYGIETKKNFIIADKGKQTDADKLKEYIKEHFEENEDKWIKVKSSDVMEQLEIGKSNWSKLWSKDELFKQYSKDKRLKQSQLKNDDGSNKKINWIIKY >NZ_CP006777.1|WP_011968687.1|1592450_1595918_+|hypothetical-protein MNYRMTKLKLSDFKIETEKTGKIIETENGEKALEIVHIKNEKGTSVPKLIYTWSNYPKIRSALNSKLNAMKIELQKSIEEIDTNLTEEERKELIKSKKKEFNNNLRNAFENCKEKNHNSYKVIVRDTELIRIIRALNLKNNDTEENGYTYIKDLICVSVSVPMYKQIEKDGVIKVNHVRFKRILASSGNVRNKKVIFINEKLYDSAMTILLCGLPKDMEHEQVSKYNAYIGLVNSDTIPVSTPRMIVIDDFTTKIPETFDVVIKDKNKKFSVIPDQEKEFKLMPFDGAGIVDLEVAKIWSKELNDILRKETNRNKVNYIPSSFQFRAIIGVKGNLYTFDLKKYALSLDEDKRYIKDVWGKEHKILDDKDNLLIDAILTKSQFKFKKKYDSFDKWQTEFDKEVELKDLDNNDIKYKRTFNIAKWGNKKNKDKALLSYQPIQSLELTQEQIEILCKPTVEIIKNISTDVDEFLKYRGLLEETYDENGELVLKETDMDRVPKYYEALKKNKNLFYDSYIQKKVQKDINRFKENAMKGMVFVDGNFQTMSPDIIAFMEYATGQSVKGVVPKNNIYSNYWRNKEYISYEKNEAGEEVKKIEKVTAVDIIRFPHVSNEHIFATVMQNEIEEFQYIQDGIIMSIYDTSLERLGNGDEDGDRILTIPNVGAENKIIVDNAKEQQTNTIYFINEYEKDKKEKEEKLIAEGKMERPKPIKINQIDELIKCDANGMEASIGKVVNKISILWSLPKTKERDNYIKIMSVIGSLTIDYVKTGVLEPIPKEIEEFLENKKEVDGKEFKDSYKKPIFLKVKYKKLERDEKRINKNHKLFDDNITEELFSDTDCTMNRLYHHIESELNKINLDKPKGDFDFTTLIKDKANVRNETYPKVKEKLIELKKEHDDLTQENSIDIENYSYDSDKKVEQYDRFKYFYRYCKNELASINKETQKKDKLIDYLVYAFYCDKDFALKNEAKDLLWNVFGAELNTRINNKSYNDKEFDVIELEDKRKELLIEKKEKAKNNAKKIKIEGIDTLEDKDKKKIEFHKQNTFKNIDEMGLSKQANKVLKVLIMLDLLFNQYNKKLLIGQSSKKTITRATISKFTGINGIKIDEYLKELISKELIELTTKSDKITLECNINVSVSNTGNAVKLRDSESILKQLKK >NZ_CP006777.1|WP_038457299.1|1596121_1596301_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKQDIIREDLKSYLKENGIKAKFIAEKIGISPAMISYFINHKKKLSSASLILISNIIYN >NZ_CP006777.1|WP_011968688.1|1596630_1597266_+|hypothetical-protein MMETNKALTKRDYIIIKKYLLENEFNIDTFKREYPDIKVPNIRAGEFQNIIFVNGYLFPIEFYYNRNFFQISDTKTFKLDLEKKQFIKVTQFSEIYIDFINAIEKNAIEFSKIDEDKSLEDLEDLLDEKLHMTLLIDRKDKVSELVEGFSKALKSSELEEIHEDMKKTIKNLKPFLDKFYYYAVDMENSRLGQGYIIVDSKNNFIEFIRTI >NZ_CP006777.1|WP_011968689.1|1597839_1598394_+|hypothetical-protein MELSELNLNEEQLTGVNEYLESQIQAKLQSEGDKIRTKYNNKIKEYETKIGEYDITIKDLQSKVPVEKSPEQIENDKRIKALEDKAKEVDKKEKMLDLQEKLSSKGLNKQLHKFLNVEGVEDFETYLGELVEAIGKQSTSTYQPKKHVDTANSNITKADFQKMNYQQRTELYSSNPDLYKLLSK >NZ_CP006777.1|WP_011968690.1|1598404_1598710_+|hypothetical-protein MQRYNGQLFADAQFTNVNLDVEFGEDETEIDVMPLLLKNGFDYLWKVRVMSYGSVKYLINGIEYERNGCLYLDEVLVETFKILKLEGATNNKVTLNLEYCL >NZ_CP006777.1|WP_011968691.1|1598780_1599620_+|hypothetical-protein MAQVTIVPDVYSTMVTEKVKGMIKISTLAKDLGDLSGNVGDTLQFPMFKALSDAELMKKGVAITPEELSQTSSGKKIVQYGKGVRVYDMDSLTALGNFVENGISQQARIMAHAQDNEMVKDIDANAILKVATAQPKAITDDELMAGFQMFGDEQDNVDFAGIVVNSLLAPSFYKMESFVKSTSTTATAQNGRVVNGCIGFYRGTIPVMLSDVNTFDSTLGECKSYIIKNDALGIMPKRDILVEPDRKPDFKATDVYADYIFACGLIMKDGVCILRKTIA >NZ_CP006777.1|WP_139355892.1|1599758_1600010_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MRERIRMTRAIYNITQKDVADYLGLSKQYITQIETNKLTATDERMEQILNAVYSVGELKKQGRLKEVLEELKKANENNKTKTE |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP006777_4 | 4694164-4694260 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP006777_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP006777_4
>4.1|4694189|47|NZ_CP006777|CRISPRCasFinder ATATTTTATCATAAGTATTTTAAAAAATCTATTATCAATCCATACTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP006777_4
The CRISPR arrays of NZ_CP006777_4 >merge|NZ_CP006777|4|4694164-4694260|CRISPRCasFinder CCATACTTGTATGGTAGTTATATTTATATTTTATCATAAGTATTTTAAAAAATCTATTATCAATCCATACTGCCATACTTGTATGGTAGTTATGTTT >NZ_CP006777|4|3|4694164-4694260|CRISPRCasFinder CCATACTTGTATGGTAGTTATATTT ATATTTTATCATAAGTATTTTAAAAAATCTATTATCAATCCATACTG CCATACTTGTATGGTAGTTATGTTT
>NZ_CP006777.1|WP_012060242.1|4693461_4694133_-|GntR-family-transcriptional-regulator MALEVNKNTTSKTIYYKLRDEIINLYLEPGTSISEKELSEKYSVSRTPVREALVRLAQEGLVNIYPQKGTVVSLIDLSAVEEGRFLREHLERAVVKEACKEFSQENVLALEMNLKLQKMYIENNDYKKLFEADEEFHKIIFEGSNKKRVWNSINDGSTEFQRIRMLRLVTNSSWDNIYLQHKEIFNAIKNKSPEIAEDFMKEHLNMVTFDKNKIKEKYPNYFK >NZ_CP006777.1|WP_012060241.1|4692209_4693271_-|mannonate-dehydratase MKMGFRWYGEGNDTVTLEQIKQIPGVGGIVWALHDMAAGEEWPMEKILEVKKSADKYGFNMDVVESVNVHEDIKLGLPTRDKYIENYKKTIEKLAKVGVKVICYNFMPVFDWLRTDLFKKAEDGSTALFYEKAKIKDIDPMELVNKIASNPDLTMPGWEPERLKNLSQLFEAYKNVTEEDLWNNLKYFLEQIISVAEINDIKMAVHPDDPPWPIFGLPRIVKNRDDLARLLRLVDNPYNCLTLCSGAIGSDPNNNVPAMIREFGNRIAFAHIRNVKIYENGDFIETSHRTCDGSLDICDIVKAYHEVGFTGYVRPDHGRHIWNEQCRPGYGLYDRALGIMYLWGIWDSLERNK >NZ_CP006777.1|WP_012060240.1|4690482_4692096_-|mannitol-dehydrogenase-family-protein MNNAKIVLSKESIKNSDLWEKAGIEIPKFDYDKMSASTKENPTWVHFGAGNIFRGFIAILQQELLNTGKAKSGIVAVEGYDYEIIDEIYSPYDNLSLLVIMKPDGSLDKKVVGSIGESLAGDYSREEDWNRLKEIFSNPSLQIASFTITEKGYSVKNLSQQDTTDGLEHPVSIIAKVASLAYVRYQNGQLPIAFVSMDNCSKNGEKLHNAMEIMIKNWVENGLVDKGFLEYINDTKKVSFPWSMIDKITPRPSQSVKNTLEAVGFDSTKIVTTSKNTYIAPFVNAEGPQYLVIEDNFPNGRMPLEEAGVFLTNRETVERVETMKVTTCLNPLHTSLAVFGCLLGFDLIADEMKDPALKKLVEKIGYEEGMPVVVNPGILNPEDFIKEVVEVRLPNPYIPDTPQRIASDTSQKVGIRFGETIKAYSKREDLDAKELKYIPLVIAGWCRYLMGLDDNGNVMELSPDPLLDELKKYVADIKLGSKESVESSLKSILINEEIFGVNLYTIGLGEKIEGYFNELISGAGAVRATLEKYLDCK >NZ_CP006777.1|WP_012060239.1|4688657_4690070_-|glucuronate-isomerase MKNFMDENFLLSNQTAIDLYHNYAKNLPIIDYHCHIDPKEIYENKKFSNITEAWLYGDHYKWRAMRSNGIDEKCITGDGSDYDKFLAWSQTIPMAIGNPLYHWTHLELQRFFGIYEPLDEDTAPEIWKRANELLNGEGFNVRDLIIKSNVETICTTDDPIDTLEYHIKIKEDASFNVNVLPTLRPDKGIEINLDGFVSWVKDLEKVSEVSINNYDEFLKALDSRIRFFHSVGCRIADHGIDGVVVYADSSKEEAEAIFAKALEGKSISIDEEKKYKTYTLRHVFKLYHELGWTMQLHIAALRSNNTKMLEKIGVNTGFDSINDESIAYPLSRLLDSVDRENSLPKTILYTLNPKDNYVLGTMIGNFQGDGIPGKMQFGAAWWFNDNKDGMIEQMKALGNLGLLGRFVGMLTDSRSFLSYTRHEYFRRIACNLIGEWVENGEVPKNDKLLKRIVQGICYSNAKEYFGFDEK >NZ_CP006777.1|WP_012060238.1|4687113_4688619_-|MFS-transporter MSNNNRKITIARGVGYGLVDLMGGGAFTIIGAFLLFFYTTFAGLTPIEGASIIAIARIVDAVASLFIGSISDNFYKTKLGKLFGRRRFFLLIGAPLMADYVLLWVTGRSYAFYLVTYLLFEIIAAMVLIPWETLPAEMTKDFTDRTKLSASRMFISATGTFLATFVPGRLIAFFGDKSPQAYFINGLVFAIIYAICILISHKVTWERDLTPEMEQELLNGSTSKSFGEQLMTIVKVAGDYVSTFKIRAFRQHLAIYICSFTAKDLFNSVFIYFCVFNLGVSSTTAANVLSLSIIGIPVTILGGFLMIKVGPGNLYKMAYSIMIVCLLAFYGLYVGNLGSNIVLLFVIGTIYQVGRSLLEFTPWNVFPFIPDVDEMVTRQRREGLFAAVMTFTRKSSVAIATFVIGVVLQESGFVKGQATQSPQVVSTIATLLAVGCISLLVIALICAATFKLNKRTHGILVDEVERLKNNGSKEEVTPETKTIVENLTGYKYENVWKETVV >NZ_CP006777.1|WP_012060237.1|4686406_4686829_-|HIT-family-protein MSNKNNCLYCDKDEKLDNLMIEICKLEVSTLYLFKEQSHKGRCIVAYDKHVKELFELDDKELELYMKDVTRAAAMIKKTFSPDKINYGAYSDTLPHLHFHLVPKYKDGYSWGGVFEMNPQKKYLSDEEYVKRINLIKENL >NZ_CP006777.1|WP_012060236.1|4684961_4685519_-|methyltransferase-domain-containing-protein MWIKFLMEYFKSPRTVGAVAPSSKKLAEKMAHDIDFDHAKCIVEYGPGTGVFTDRLMKKIKDHTMLMLVEYNEEFCRELEEKYGEYNNVVIVNDSAENVDKYLKEYNIKEVDYVVSGLPFASLPKNMSNSILKKTKDILKKNGLFITFQYTLLKKGYIGSYFEDISLERVVLNIPPAYVLKCQNT >NZ_CP006777.1|WP_012060235.1|4682920_4684384_-|sugar-ABC-transporter-substrate-binding-protein MEILNFRLRKLSCIVLIILVGSILSACSQVGKVIVDKEPKEDRQKDYIEEVPTQTVTNEKSVNLAPLYDQVRNLKGQEALDFFESLKSKGLSDRDILEFFINLPLSDANKEITDIYKNEKFETYMSTYPTGKPFGNYKWTNGDGTKIKGAFSELDLKLPFSNYVALKSGPVGDLNKKYRIGVAIHGFDQPWNVSLADAAQWEAERHPNVEVDVKDAQWDNDRMADIIDSFVLQKVDGILTWPMVESETTIAPVKRAIEAGIPVVSVDRMTGLEETTSRVTGNFPANGAQCGMYLIWKLAKEGSLNANVVLLRKPSGSTADANRTGHFLKVLSYFPDIHILKSYHDDDNTAEALANMQLALNEYPSIDVVFGTGDHEAIAAYDASKNANRLNSRKDDKKMMFLSIDDSKKAITSVKDGLFEVNTPYTPLISDIGMRTLLNIITKNGSMPHDIITPNIPMVTKDGDTIFGLKTQTPDQWYEYTFGAPIK >NZ_CP006777.1|WP_012060234.1|4681140_4682838_-|HAMP-domain-containing-protein MKKISSVPGRIPLTIKSKLIISFSLIVFLISAVGITSYMTMRSYLVQENIMIEKNVMANDIIILINSIPQDISKYILNPTAENKKIIDDKFININKNQEFIKDNVSGEKALKSFDAVSRMLESYSEENIKLFESKNATEMVEKNKLMNRFSKLIQNSMQEYMSVELDQQNKARADLAKKSNFTGVLIIVFIVSIGFFSIIFAIFFSIKLGKSLNKIVLLADDIANGNLQVEEYKVNSNDEVSLLASSFNEMTKNLRTMIKGIINNSKDLYESSTMIKDRAKESVKAVNQIAVSTQDAVDGSQYQFSEAKRTEEAVNRLIKMNSTIKEKSNNVLSLANKSLKIAEGGNEKVRSMLNQMNTIKEQVMNIQSVTGILKENSSQIETILDTISKITASTELLALNAAIEAARAGEYGKGFAVVSDEIRKLATSSATSTVEISKILTQIQNYINVLIKSMSIAVSEVMSGSEKVLEVEGAFKNIVESNNDVDGEIKNISDEILVMVNEINAIEKISKNICEISNKSLEGSTDISAIVEEQLATQEEFFASATTLANISSELANVVSKFRV >NZ_CP006777.1|WP_012060233.1|4680075_4680975_-|ribokinase MKSLCVIGSLNMDLVTTVENFPAAGQTVMGKEFNTFPGGKGGNQAIALGRLGSDVLMVGKIGEDIYGKRYLEVLRSNNVKSHGVSIEKGISSGVAVIQVSNKGENNIIVVPGANAEVDINYIESKWSLIERADIFLFQLEIPLETAIATMKKLKKQGKTVILDPAPALDLPDEIFKYVDYLTPNETELETLIGRNINSEENLVEAAKTLFDKGVKVIVAKLGSDGAAIIKKDKCIRVPGFIIDPIDTTAAGDSFALAKEKELKECVIFGNAVGAISTTALGAQEAMPTFERVDKFIRDR >NZ_CP006777.1|WP_012060243.1|4694479_4696159_+|methyl-accepting-chemotaxis-protein MLKNIKIINSIILMVILSTVVSLSIAIIGYNNMKTINLNSSSMYTIALTRIIKTEEIRQTFLNIRLNVNRISISEFNDDDVAAIDNDYSAINKMVEDYENLSLSTIETNNLSEFKKDSSAYYEQIKNLEKGNKLYGIDLEKFNQLGVEMQLFLDNLVTYSSNTANTLHNDNMSLYIRSTKIFFTTFFIGFILQILVSSSIILVIRKSIKEIMSDLDNVAQGDFSFEISTNLKNEFGRMKKSLKVTTSNISSMLEEVQNSANVVNIQATNLLGASDEMSSSAQEINAAVQEVANAATEQSSDLMNVKTSLDSFADSLDQITSSINDVNSNIHNISSMAEDSNSKLEFLFNSIKDVNESFDTVRNKVVQLDNHVEQVNNITTIINSIADQTDLLALNAAIESARAGEVGRGFSVVAEEIRKLAEQSKVSASNISDLITNINNEAQIAVKTTDLGKDSLNNQSVLIEDSIKSFALIFKAINTILPRVDNINKSIENINIEKDLIISKTLDISGVSEENAASSEEIAASVQQINSSFNDVATSAQTLSNLTTSMMNEVSKFKL >NZ_CP006777.1|WP_012060244.1|4696240_4697416_+|extracellular-solute-binding-protein MKNFKFLNVTLVIVFMTTILTGCGSKNVSKAMQPITLNIIDVSGSMQLVGDSIDQFKAANPDLIGDVVVKKSTALEVPSLLKAQILSEDMQTNLIFTGIDGLSTCIDRDVIENIMTAYSSRFPDLESNYSSGAKATYDLVKGYGITYVYSPSGPFFTYNPDTVQNIPKTPDELLAFAKANPGKFTYARPAGSGPGRIFLQGLPYILGDKDPKDPKTWDKTWAYLKELNQYIDYYPAKTGTTFTELKDGKRSIIASQLGWDMNQRIIGGIPQTYQGFILNNTTLVADAQYMAIPKGLSDEQKNVVLKLMAWLMTPKMQAITYDSGYFYPGPSVKNVSLDMAPKESQDKIKPAIRQSYEDSINTLPNSTQLDTTKFMDALNMWDQLFGTKVKR >NZ_CP006777.1|WP_012060245.1|4697495_4699358_-|APC-family-permease MLTKFLDVLLGEPLSNEQGCNEKYNIPFGLAIMASDAISSVAYAAQEILFVLIVLGVAAYQWLTWTSFMIIGLLIILTISYIQIIRAYPQGGGAYKVANENIGKKSGLAAGAGLIISYILTVAVSASAGADAIISAFSNLTEYKVMFVLIIIIVLTILNLRGISESSKIFAIPTYIFIFSMAFMILYGLFKYFILNIHPEPMYSIPANTTENVSIFLILRAFSSGCSALTGVEAVSNSVPNFQEPSQKSAKTVMILLAALIFFIFGGTSVLAIFYTAVPIANGPTVVSQIAFAIFGNGIMYYIIQFSTAVILLMACNTAYTGFPMLMYIVGKDGFAPRQFTIRGKRLSFSFGIVALSCIACILVIVFKADTHRLIPLYAIGVFISFTLGQFGMVNHWRKEKGKGWVKRAIINGIGSVVTLLTTIIILIEKFSEGAFIVAILIPIIIVIQLRIKKHYDKVACGLSISQLNLKKVNLRKKYTHIVIVPIASLNKATIGALQYAQSVSDNVIALNISPDKEAMEKLKSRWSELDTDILLVAKYSPYRAVVTPLLKNIELIANSTAKDEKITVIVPQFVTNERFGEVLHNHTSFFIRETLLKNDNIIVSTYPYHLLDEDVKQSK >NZ_CP006777.1|WP_012060246.1|4699929_4700226_+|hypothetical-protein MAQNHICELCNRNVSSITKHHLIPLEKGGEKFKTLSLCSTCHRQIHALFTNRELATHYRSLESLKKDIKIVKFLKFIQNIPGDSYLDIKKSRHVRKSC >NZ_CP006777.1|WP_012060247.1|4700363_4700807_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MNNITYEFINYKSKEFKEVSELRFKILFKPYNLIHKYDYDELDYSSIHLVALDEGAVVAYSRMTNYNMNGKMTNIVVSQEYVGKGIGIEMLKTHKIKAKELGIICLYLNARLDTINFYKKAGFQCKGNIFLSEKSGLALQPMYFKIS >NZ_CP006777.1|WP_012060249.1|4701403_4702465_-|iron-containing-alcohol-dehydrogenase-family-protein MKTSTHRIAIPSILEVGKGNINNVGNLIKKAMFKNVLICFGEGLEELFGESIRNSLKEANIGISRIETISDINFEKISVKAFEISNDVEALIGVGGGKAIDAVKYMSFLRKLPFVSIPTSTSNDGFSSAGASLLVNGRRMSLPAKTPYGIIVDIDVIKSAPEKFIYSGIGDLVSNITALYDWKFEEENGRIIIDDFATMISKKAVNSFIRTEFKNIKDDLFLKELVDSLILNGISMEIAGNSSPASGSEHLISHALDKFLEMPQLHGIQVGIATYIMAKVQDHRFERISKILKETNFFEHAKTLKMKRKDYKNAIDIAPSIKPNRYTYIHVDENRILAKKIIDEDEILNYILI >NZ_CP006777.1|WP_012060250.1|4702560_4702872_-|hypothetical-protein MDKVNSLIKNTPIHLTTNTIVLIIVAIIALYILIKAIAGIIRIAALIGVCWFILMSIQSTNLINIPIIREAYTTVEKIIPSKELWTEALDKADKINKVVNDLK >NZ_CP006777.1|WP_012060251.1|4702955_4703147_-|PspC-domain-containing-protein MEKRLYLAATDKKLAGVCGGIAEYFGLDSTLVRIGWAILIVCAGSGLLLYIICALIIPKQPLL >NZ_CP006777.1|WP_012060252.1|4703551_4705267_-|dihydroxy-acid-dehydratase MISQEVRKIAPEMDPLRRGMGWTTEDLSKPQIIVESTFGDSHPGSAHLLKFANKAVEGITQSGGKGARYFATDICDGMSQGHDGINYSLASRDTLTSLIEIHANATPFDGGVFISSCDKAVPSHLMSIGRLNIPSIIVTGGVMEAGPDLLTLEQIGAYSAMCQRGEISEEKLTFYKENACPSCGACSFMGTAATMQVMAEALGLMLPGSSLMPATCEDLEEVALKAGRQAVELAKMNLRPKDIVTIKSFENAILVHAAISGSTNSLLHLPAIAHEFGLYIDEETFDRIHKDAHYLLNIRPAGKWPAQYFYYAGGVPAIMEELKHLLHLDVMTVTGKTLGENLEELKTNGYYEKCNEYLEKVGLKKEDVIRPFNNAIGTNGSVSILKGNIAPEGAVVKHSAVPKEMHEAILKAKPFDSEEEAIDAVLRKIIRPGDAVIIRYEGPKGSGMPEMFYTTEAIASDEELAASIALITDGRFSGASKGPAIGHVSPEAAVGGPIALIEEDDLIEISIPNRVLQIVGIKGKKCSKEEVEKVFEERRKNWKPRKSKYESGILKIFSEHAVSPMKGGYMK >NZ_CP006777.1|WP_012060253.1|4705497_4706226_-|FadR-family-transcriptional-regulator MSDIRELSFNDTNSSTKSLGEQTSERIVRLIIDNDWKSGDKLPNEYDLASSLNVGRSTIREAIKALVSRNVLEIRRGAGTFISDKCGIADDPLGLTFVKDKYKLALDLLEVRFMIEPSIASIAATKATDEEIEQMSSLCDEIESLILKNEPYLEKDIEFHTAIAKSSKNLVMVNLIPIINRSITIFIDITNRKLRNETIETHREILNSIKEHNANGAHDAMLLHLVYNRRNIASIIAKEKNY |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP006777_5 | 5489851-5490056 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP006777_5
|
3 spacers
spacers of NZ_CP006777_5
>5.1|5489877|34|NZ_CP006777|CRISPRCasFinder CTATATTAAAGCAGATGGCATCATGGCTACTGGC >5.2|5489937|34|NZ_CP006777|CRISPRCasFinder TTTCTTAACTGGCTCAGGTGCCATGAAAACTGGC >5.3|5489997|34|NZ_CP006777|CRISPRCasFinder TTACTTACAATCATCAGGTGCTATGAAGACTGGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP006777_5
The CRISPR arrays of NZ_CP006777_5 >merge|NZ_CP006777|5|5489851-5490056|CRISPRCasFinder TGGGTTAATGATTCCGGAACTTGGTACTATATTAAAGCAGATGGCATCATGGCTACTGGCTGGATCAAGGATGGATCAACTTGGTATTTCTTAACTGGCTCAGGTGCCATGAAAACTGGCTGGTTGAATGATAATGGAACTTGGTATTACTTACAATCATCAGGTGCTATGAAGACTGGTTGGTTAAATGATAATGGAACTTGGTA >NZ_CP006777|5|4|5489851-5490056|CRISPRCasFinder TGGGTTAATGATTCCGGAACTTGGTA CTATATTAAAGCAGATGGCATCATGGCTACTGGC TGGATCAAGGATGGATCAACTTGGTA TTTCTTAACTGGCTCAGGTGCCATGAAAACTGGC TGGTTGAATGATAATGGAACTTGGTA TTACTTACAATCATCAGGTGCTATGAAGACTGGT TGGTTAAATGATAATGGAACTTGGTA
>NZ_CP006777.1|WP_012060871.1|5485936_5487820_+|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase-family-protein MFKRANKITSLLVAAASVMSLVPAYAADVKKIDSDDGTVYNAVAYKDGKFFVDGEINDDEEAYYVSDGKFNKLEDIDSGDDADLFGEKYLDINDGDYTVDLDKGSITDDDTKGDTADDASADLRKKIKDDTDDRYDEDFADNIIDENKDDTEDLTKLNIIPGAKYKTPWYYTQYKAADKAVNDNVNGLKEITDQNKRVFNVYTDTKGGYIDADYNLGKVKVTTTADGASTKTETIENTNDKYDAAGKDDALTASVSQDKILTQDDDYIYRLATIKVNVTTDAGAKVRISEINGVELNPKNANDKPQIFKVENDGGTVSFKAIQKISKAQDSDDVDGAKYAKTVTTYALSDEDGKNLDAKDLFLNTDGTINEDTKFTVANGKLIAYNTEMNEYKKVVVRAYSLKTKGGYYYADEEDESKEDCEVSSQDDKTSAVQTDVDGNLWRLDGGYIYKFDNTDDWDKVYKVDGSFDELSVYDKDNIAAWSEDDDVYSLIGGKSSDDNNTNPPTTTAGWVQAADGTWTYNKEDGTKATGWLNLNGVWYYLNTDGVMATGWLNLNGVWYYLNPSGAMATSWLNLNGTWYYLNSSGAMATGWLNDNGTWYYLNSSGAMLYNTTVDGYVLGSNGAWIR >NZ_CP006777.1|WP_012060870.1|5483812_5485408_-|peptide-chain-release-factor-3 MADYIKEIEKRRTFAIISHPDAGKTTLTEKFLLYGGAIRLAGSVKARKASKHAVSDWMEIEKQRGISVTSSVMQFNYNNHCINILDTPGHQDFSEDTYRTLMAADSAVMVVDAAKGIEDQTRKLFHVASLREMPIFTFINKMDREAKDPFQLLDDIENELGIKTYPMNWPIGSGKEFKGVYERDNNRIIAFNGGNHGQNEVEAIEGSPDDPKFREILGDALHDKLMEDIELLDIAGDELDLDVVRRGELTPVFFGSALTNFGVEPFLEHFLEMTTSPLARNSSGGTIDPFDDKFSAFVFKIQANMNKAHRDRIAFMRICSGKFNKGEDVYHMQGGKKIKLAQPQQFMAQDREIVEEAYAGDIIGVFDPGIFSIGDTLCAPSKKFKFEGIPTFAPEHFARVRPVDTMKRKQFIKGVSQIAQEGAIQVFKEIHIGMEEIIVGVVGVLQFEVLEYRLNSEYNVDVKMDRLDYRYVRWIENKDVNMDSLNLTSDTKKVKDFKDRNLLIFQNDWGISWALEHNKGLILSGVGKSED >NZ_CP006777.1|WP_012060869.1|5482701_5483661_+|DNRLRE-domain-containing-protein MNSITIPAIKSLSITNKYSDKSLNEDKIIVGADGNYNYYSYLFWDISSIPTNATVHNAKLTLFKTDNFYYDTSKKFSISPLYEYFSTYTTYNNSPNYDHYTVINFYPLTDNISVTIDITTIVSSWVKNSLKNKGIILYGRNEDILTSFGSVKSSDNYLMPFIIVNYDPYSPNKCLKKECTNKYSKDCCKKKYNDEYFKDDCCEKYIKICKEELESILFKVCKEACGGNCNPFPSNTSITRTVRVTGTVAPTSVYYIVVDLQVTRASSGQVNHYYVSDEYDNSLNNTPLPIDKTYNIAVSPPIQSGDAEDVILYGSYKGF >NZ_CP006777.1|WP_012060868.1|5482003_5482288_+|hypothetical-protein MASFDTPQNSTIQTIYATGTIPAHNDAGFIEIQAVASRNGGHETFYKTFQVAASATRATAEVWAGAGNYQIIITPKLFGTQSVSSTTVINSFKH >NZ_CP006777.1|WP_012060867.1|5479128_5481639_-|glycosyltransferase MKDNLVNIVMQSKDELINDTENLKEDISCVVKDKMKLAFFVRLGLDSFLGDIIEGLSQEYEIKKIIVTEYKQIEDGMQWADICWFEWCDELIAYGSKLELAREKKVICRLHSYEAFTDYINNVTWNSIDKLIVVGAHIKDFIVQNFNIDEKIISVIPNGIDEKKWTYKERENGFNIAYVGYINYKKGPMLLLHTFKAIYDEDNRYKLYIAGVFQDNRDVLYYNQMVRELGLENNVIYEGWQNDLDKWLEDKNCILCTSVLESQNISVMQAMCKGIKPIIHNFVGARVIYPSQYVWNTITEAVEMISDKNYTSKVYRAFIKERYSLNDQLIKIKDLLISSSEKGSKENLNYINPDHLRKSSDQVDLMKTKFMVNSDDMTNTEALFDYLLSINDEESYMKYLSEWFIRSKYELTFKFNYYYGNMYRRFTSYSRFKYMQQNVYEEMDKIGERILDENYLTYFNNKKMSLKENKRKILFILNGLDIHQSVTQFFINYLESSENAKDRYSVLSLLNKNEFNNSKESIEYFNKLNVNLFVPISNCIEDKIKEFYTYISEENFDYVVYQSLYFAPIGILLYPLLKKACEIIGKIQFQQPEDYFDKKLDFCYTYIKKDNCCENIFELISPINTELVDKNLDIRTLFNIDKKKKVVISIGRSIKYKNNEFWNFVIKLINEIDDICLVVFGGNYSEFEQYVPNKLIQECNVIFAGFNLEASSYLKSCDFYLNSYPGGGYSLEEAYYAELPIITFYKEENNEAFDVINASYMAPAYLYNNAKTIFPKTGDFDKLLSYSKKLIQDNSFRNTVKMNRKIESNNLKFEYFVKEFEKYMDNIANNNGRNNK >NZ_CP006777.1|WP_012060866.1|5478169_5479132_-|NAD-dependent-epimerase/dehydratase-family-protein MIKSKKIFLTGGAGFIGTKLCEKLSSNNELLIYDNLKRNSIKNTKLLNKDNIKLVKGDILNFNFLKHVIDEFKPNIVIHLAAIAGIDTVIKNPVSTMKVNMIGTYNILEALKNQKIEIFIDFSTSEIFGSYAYKVDEAHTTNLAPVGEARWTYSVSKLAGEHLAYSFYKEYGLPIVTIRPFNIYGDGQVGEGAIHQFVVRAIKNEQIQIHGEGNQIRSWCYIDDFITGVMLCLDNEKAIGQAFNIGNPRGTITIAMLAKLIKRIAKSKSEIVYVPKNYVDIELRSPSIEKAKEILKFVPKYDLDEGLERTIKWYRGVLND >NZ_CP006777.1|WP_012060865.1|5477073_5478177_-|DegT/DnrJ/EryC1/StrS-family-aminotransferase MIKLASPDIGQEELDEIKKVFDSKYLVQGDKVEEFENQLKEYLNAKYCFAVSSGTAALHLALLAIGIKADDEVIVPDFTFPATANVVEIVGAITKFVDIKLDSLCIDTDKIENAITDKAKAIIPVHEFGQSADMDKIVTIAKKYNLKIIEDAACALGAEYKGKKVGTIGDIGCFSLHPRKAITTGEGGIVVTNNSKLAENIRILRNHGLNYKNGKISFVEAGLNYRMTNIQGAIGTVQMKKLELINERRIELANKYNNLLKNVKFITLPEEKSYEKHVWQTYHILLDKRIDRDKLIIELKDKGIETNFGAYAVHEEPYYKEKYGYENCQFYNSVYAHKHGIALPLHNNILSKEIIYIVSELEKILNE >NZ_CP006777.1|WP_012060864.1|5476043_5477081_-|hypothetical-protein MNNNIIMYFKENGMINPKRSINLICKAIKFTKLDLSGLIVFTEAACGEFIYTPIIAAMAGAKKVYAITKDSKYASKDEVKKKTMLFAELCDVVDKIEIVFDKRNINQADIVTNLGFVRPIDKETIDMMKENAVIPYMCETWELRNEDIDIEYCKQKAINVMGTNENYPGLDTFKFSGPLAVKMLFDVGIEIYKSKIVIVSNDNFGQIIYTTLSKLSSDVVVIKNLLEENHDLLINTDALIVADYTSEKCFIGMNNSDITSKKLKSLSSFITVIQYSGIVDIDDLKENCINFYPDYKVGNYRMGKTLAYLGPKPIIDLHCAGLKVGEIMYKNSKKHIRNKLCQEFL >NZ_CP006777.1|WP_012060863.1|5475134_5476025_-|UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)glucosamine-N-acyltransferase MKLSELVNKIENISIYNDGEFDNLDYSNSKTRSRILTFINDEKYIHTLSESVTCIICDAKIAKILPNKYGICLSENPRLSFYLIHNCLCRDINLYNKEEFETIIGDNCIIRDRKGISRKNVIIGNDVTIEENVIIRENVKILDNSVIRSGVILGGEGFQFNKEGRIFFIEHCGGVEIGRNVEVQYNTCIDKAMFPWDNTVIGEETKIDNLVHVGHGAKIGKRCLIAANALIGGSSIIGNDCWIGVSVTISNGLIVGNNVSIKIGAVVTTNIADGSAVSGNFAIEHSKFIKFIKSIR >NZ_CP006777.1|WP_012060862.1|5473485_5474802_-|nucleotide-sugar-dehydrogenase MLDKDNLIYKINNKTATIGIVGLGYVGLPLAVEFAKSGYKVLGFDIQEKKVNMINNGENYISDVMTEELKFAIKNRRLKASNEIKFLKDTDVILICVPTPLDKYQQPDISYVKESTESVGKYLHEGMLVILESTTYPGTTEELVLPTLEKMSGLKCEKDFYLAFSPERVDPGNSIYNTANTAKVVGGVGRDSTEIAAELYRKVLNSEIFEVSTPRVAEMEKILENTYRNINIGLINEMAVICNKMNINIWEVIEAAKTKPYGFQAFYPGPGLGGHCIPLDPYYLTWKAREYDYHTRLIETSGEINNFMPQYIVQRSATILNKFNKALNKANILILGIAYKSDIGDYRESPALKIIENFQKQGSEVKFYDPYISSYMYKGEEHYGIKLTQEVLRNADLVIITTAHKKYNYSFIQENSIFIFDTRNATKNVQNKDNIELL >NZ_CP006777.1|WP_012060873.1|5490456_5492406_+|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase-family-protein MIRGMGKVTSLLVAAATVASLVPFSGANAAEVKRISSDDGTIYNAIAYKDGKAYIDGEINDDEEAYYLSNGKFNKLDDVDSGDSAALFGEKYLDISDGDYTVDLDKGSVTDDDIKGDTEDDAAAALRKKIKDDTDDRYNETEANTIKDSNHGDLFDLIPGAKYNKVWYYTQYKAAQKSIDKNVNGLNGLDSAHQIFNVFTDDKGNYIDADYNLGKVKVTTTASSASGTTLTKTDTIENTNDAYDAADGIINGTSVSGSDKLSASVVQDRVLTQDKDYIYRLATVKITITTGAAATISEINGVKVDPNNSNDIFKVENNGQVVSFKAIQKISKTQASGDIDDAKYAKTVTTYALSDKDGKKLDAEDLFINTSGNVVTTTNYTVGSGKLIAYNSEINNNDKVTVRAYTLKSSSGFYYADEEDQSKEDCENSKNQGAAVQTDVDGNLWRLDGGYIYKFDNTDDWDKVYRVDGSFDEFSVYDKDNIVAWSEDDDVYSLIGGKQSNTDPDDTPVVKTGWVQASDGTWSYIKADGNKATGWVQDGSTWYYFKADGSMATGWVQDGSTWYYFQSWGGMQTGWLNNNGTWYYLQSWGGMKTGWLNDNGNWYYLQSWGGMQTGWFNDNGTWYYLYSNGVMAANTVVNGYNLSASGAWV >NZ_CP006777.1|WP_012060874.1|5492679_5493552_-|glycerophosphodiester-phosphodiesterase MKILNIAHRGYSGKFDENTMLAFKKAIEYNADGIEADVQLSKDGVPIILHDETLDRTTNGHGFVKDYTLDELKIFRTKSVPEIQLLKNDSLQEMAHLKLNMATERNYEEGKQAGSYKVGKYTMEEVEYFQNRGGEEIPTLRELLELVADSDLKVLNLELKNSVIEYKGLEKKVLSMIDEYNLRDKVIISSFNHTSLVKVRKLENNKKITLGALTETILVNVPKYLKAISVDCYHPHFSSILNEEYIKEIKDAGIKVNPYTVNSLVDMKKVIMVGVDSIITNEVELLNTLL >NZ_CP006777.1|WP_012060875.1|5493843_5494911_-|cell-wall-binding-protein MKYEYLRKSIAVSLAISSLITVAPVKSLAAWIENYDGSWSYADIYGYANGGWKQINGIWYYFDSYGLMRTGWILDNGEWYYTDLSGVMQTGVIQIEGKIYIFSENGAMQKGTSIINGRIYNLDDSGACIGSDYPIPTKSFDYYGNNTLPYVPNQIIDEDSKMSKDIPTDPSKEVKKQYKVKFKDPEAEDDDDELLRTKTVDEDTMLTLYKPVKNGYTFIEWNTKSDGDGSSYEYDDRIKITKDITLYAQWRKNEDTGGETTIKVENIVVLGPISGTTEISSITTKGGSLQMSKKVYPTNSDNQKVKWLVVNEDGSATISDTGKLTAISNGKVIVKAIATDGSGVIGTKEIKISGQ >NZ_CP006777.1|WP_012060876.1|5495002_5498320_-|cell-wall/surface-repeat-containing-protein MKWKFINKIISAITVSMTLFTLIPLRASAEWVNDYQGNFYYMQDNQKVTGWKRIDGQIYYFDGNGKMQTGWIKAGSSWYFLQNDGALKTGWINYNKKWYYADSSGVIQTGIVNISGKVYIFDDNGAIKTNNTVINGEFYTIGSDGEVVGTKMPTPEKEYDDSGNCIQVLKNTDNKVITSPTDSKFNEVIEDKTGSDDNPNEGRTFKVLLKDSDGSELKTKTVKYGKSFDLYKPTKDGRVFAGWNAKSNGSGKSYDADDSIKVEEDIILYAQWKEDTSVYVEDINIKGNSNVTVNKSVTMTAEVSPSNVTNADVTWSVSDETGKATIDSNGVLTGVSAGTVMVKATAKDGSDVSGTKEVTVTNTDVVVPVSKVTVSGQSGESTITAENGTLQMKATILPEDATNQAVTWEVQNNTGSASIDSSTGLLKAISNGTVTVKATASNNVVGSMTVTISGQSTKILVTRMDITTTKTDFAITEDGGTLQLNLNITPTTATNKSVKWSIKSGQDKATINSSTGLLKAVTNTNGTPVTVQAEALDGSGVVATKDVTISGQKIKVSKITIDGPDSVTGTGKVTMDKTVLPKDATNGAVVWSVENNTGSATIDTNTGELTPKSNGKVTVKATATDGTGISDTKEVTISGIDNNIPATKINIATKDGAALSITEDDGTLGLIASLLPSYSTTTSEAVNWEVISGSDGGSAKIEGGTVGSSINIKGVTNGTVTVKASVVNADGTTAIGSATVRIAGQITNVTDITISPDEAPEVVVGGTLQMSASVDPNNATYKIVNWSVSNGTGTATITSSGVLTGVSSGDVKVIATADNGKGISKYITVKVIPQVKVTKVTVNAPDGSGNEITDGGALQMTASFEPTGATSKSVTWSVTPGTGKATVDSNGLLSAVSNGTVTVNATATDGSKVVGSLPITISGKVGTITVTGTGNISTIVIPNGTLQMLATVGPTDAVNKAITWSVTPVTGKATIDSNGILTAVSNGTVTVNAAATDGSGIVGQSVVTINSASGITINQSSNTVAVGNTVKLTSVISPTSVTGKKVIWSISNIDGTNTDLATINSTGDLTADLTALKQGSVNIKATLDDGSGISVTKTIIINPNS >NZ_CP006777.1|WP_012060877.1|5498635_5500738_-|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase-family-protein MIRRINKILALILIGTSIIATIPNSVFSTPVKAETNDISKIILNPQTNNIALSGIDIGSMVPDGDTLIGMAENTTINPQLENGVKLMFSSKGAKSIDNEECGKLSYNLSGSLVDEISAQVYEVLKDPITNAVVSKAESATGGTIPEETLKNVIEPIVEKNLQAALPSAIKSRFQNIPIYQYTGKNNSGDVIAQAFVVKGLVGSIVNTVVGNGAYCINTYSANVRNASYSSLDIVPSLTFDPAVGTTAYSKVINLDNGSKVIGDGMSINVIDSINNKVYVINNPIYNMLKAKQGQSDKINRDLNIIDFNGVTNLSGSLSFPLDIDGTKFSILSLSLTKNGDITANKSYKYAVVVGDYEKNLLDNMIDGVNLGNVGDKIKVMIKSGTYNMIPDINTQIGGLIDKGKNEFDKTIDGISDGINDINDSLDDLTDALKDKNNDVDDAWDKVFDRYDNDKGWGKHDGYIYYYDKDGVSLKGIQKINGKIYYFNRIDGAMETGWQIVDGKKCYFDKKKGYELFNQWVQDDDWYYVGEDGAVKKMEWVNYNGKYYYLKADGKMVKDWFKVDEYWYYFNNDGSMSASIWKSSNGKWYYLKDNGQAAGDWLNLGSNWYYFKNTSGEMQTGWFRANGNWYYSNDDGSMKTGWIYSKNNWYYLDEGTGVMKKNEWVVIDGKNYYFNINGEMVTGSRYIDGTKYMFGSDGTLY >NZ_CP006777.1|WP_012060878.1|5501010_5502318_-|methyl-accepting-chemotaxis-protein MNKEKKNVSLKVKLQVSYVIMSILVFISGIVNFKQLSDIKNGIANGDTLARDITTTVVVCIISIIAAIFAGFYMHKNIISRLNSLQKFAMKLASYDFSEGIEITKDDEIGATGRELNVAQENVKNLISTILNEACNMSGLSQELSANVEEVSAKLDEVDNSSKNINVTMTETSATAEEIAASIEEVNSSMESLANKAADGSTNAEKIQRRAEKVKEDSKIAIANTTQIREQKEKDIIKAIEDARVVEEVKVMAGAIADIAEQTNLLALNAAIEAARAGESGKGFAVVAEEIRKLAEESSQTVFTIQDTISKIQDAVKNLSDNSNDILNFMSSEVNKQLQDYAKIGEKYSNDGDFVSSMSEELVSMAQEVEATVEQINEALQSTAADVQKSSVNSEKIQSEIETSSSAISQVANAATQQAQIAMHLTELVQKFKLK >NZ_CP006777.1|WP_012060879.1|5502587_5504822_-|cell-wall-binding-protein MSAKKINLNKITSYLLIFTVFFTLMQTVNLQKASATDETQVKGLQFHIGDVNGKTKNIDGNEKDGYLCEFLPIGENFTLVADSGYSIVGVQSSNSSFMNVKGIPNSSGGKDYVVNTITDYSDFTLTVTMKDSSGKQFIYPIKMKFESDSSLSFGTLRVTLDGKATYDLLFTQTDANGNYNIPDVNSDVKMAKVQLFDNNKTPMNFSANGGSSAAEATVNLTGGDNVISIAVTNQNISRQYKLIITKKGEAKLQSLVPSTGTLSPAFNSSTYDYTLQVPTAQTTIAFTPTAVDNSSTIKVNGVTVKSGSRSQNIKLDEGENDVEVIVTTKDGDTNTYNIKVTRTALFRSSQLIGLTLTSGTLTPAFNKGIYEYSGTVDNSVTSIGVTPTAEDVNATITVNGKKVPSGATSPYISLDEGGNTINVKVTDSKGNSNTYVLNITRRYPKDNVNLASLSVTDGTMSPKFDPETYLYSVKVARNIEKVRVMYTSQNDKAKIKINGKEYTNGQSDYIKLDIGANLVVVEVTAEDGKTTTTYKLSVIRGDIEGTNQWVLVGGNWTFYNAAGMQIKNQWVKYDNQWYFLDINGYMQTGWIQDSGNWYYLNKDGIMQTGWFYDKGYWYYLEANGAMRVNTWATYDGKWYYFNNFGEMQTAWAQYKGKWYLMDDHGVMQKGWVTYDRNKYYLNDDGSMRTGWLYNGKSWYYLDDSGIMITGWKNINGKNYYFDAGGVMKTGMLFLDGQWINLNNA >NZ_CP006777.1|WP_012060880.1|5505144_5506566_-|cell-wall-binding-protein MSKMVRRIISTFFIIYSVSFLQTSSLNLLMTKVYAEQDNPSLKDIYLSDGGNLDFSEDKYSYVTDVGNDIDQVLIKAKPYDLLDTVKVDGEIVTRDDSYRKVVPLVKGKNKVEIEVLDNRSDATSTYNVYIYKGGKDAVYLKDININDSNIGFDKNTNFYNIELDEGTNMMELEATPEDGNYSMTANGKQLSNDSIKVKFNGIGKYTINLGVKDDDTQRIGNYTLNMYLGIPVTPNVQDTINSIIKPNQWVIVNGRWRYNDTAGKCLKNTWYYDNKYKSYFYFNARGNMQTGWMEDDDKWYYLEANGEMQAGWLYYKNEWYFLDNNGVMKTGWIKDNDKWYFLKDDGTMATGWITSNGTWYFMERNGSMRTGWIYYGKQWYYLEQSGAMNTGWVNENNQWYFLNADGSMKAGEWVYWKNNWYYLNYAGNMRCGWLYKDDKYYYFNEDGAMRTSPVEIDGYIYNFNNDGSVNFG >NZ_CP006777.1|WP_012060881.1|5506998_5508780_-|cell-wall-binding-protein MIKRMTKATSLLVAAAAIISIVPAHAADYTKIDSQEGTIYDAVAYKDGKFYVDGEVNDKDEAAYYLADGKYNNLSDIDSGADTDIYGSKYLEVQDGDYFVDLDNGSVTDESIKENAEDDAASALRKNLKKDNDKRYASSEAETIQDLAGAEIAGNKFSAPWYKFEYTKDNATNGSVAKLNVYTDAQGNYIDADYNLGSIKVTTTASSTTSKTVTIANTDDSYDADGTSDATGKEKVSASVDTSAGKVIGQDANYIYRTAKVTVNAANGATITKINGMDVTVDGGHTFTVSNGTLGSSASTVGFNVIQKISKAQASGNVDGAKYAKSVTTYIVSDEDGKNEAFAYDNYTVANGKIVGYTANGTNVKTATGTLSSKNGYYYVDLGDEASEDVKENGTKSAVDTDVDGNLWRLDAGYIYKWDNDEDWTKVYKVDGSFDQMSVYNQDNIVAWSKEDDVYSVIGGKGTTTPTDPTPVVNKGWVKTDAGWTFYNTDGTQVKGQWVNDGGVWYYIKADGTMATGWIQDGSTWYYLQSSGAMKTGWLNDNGTWYYLQSSGAMSTGWLNDNGTWYFLNSSGAMLANTTVDGYKLGASGAWIK >NZ_CP006777.1|WP_012060882.1|5509808_5511776_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein/permease MALLELRSINKYYRLKDNDKFHVLNNINLSFNAGELVSIIGESGSGKSTLMNLIGGLDSDFSGELLVNEKDIKKLRRKELDKYRKNEVGFIFQSFNLIGHLSVLDNVTIAMTLSNVRKKKRLKRAKEILRDLGLENHINKKPSQLSGGQKQRVAIARALINNPKIIIADEPTGSLDSKTTIQVLEIMKDISRKGKLVIMVTHSERVASASSRIIKISDGEIIDDNKVIELDNEVNIEKQDNIRKQKQNLSLISSAKLALVNMKEKLPRNILVSVGGSIGIMSIILMLSLGNGVKSYFNKTMNNYVNPLVIEVNMPSEEDENINLDVTTVQKPDVNATKPFEESDIDTLSKIENVSSVERGYSIISLGANSLVYNNKTNNLMNVSTISSNITTSNVETGTLPKAGEVLINKALSDNLGKDIIGQKVNLRILANQKILNRDFIVSGVYTTTSGDLTANMKSAFLNYADLEKLYSDNGYKLKPNVIYVNTTNSKYTSQIKQKVNELGYSQSSQEQMASMFNQMIDILTYVLSGIAAISLIVSAIMIIVVMYISVVERTKEIGIIKAIGARAKDIRRIFVSEAFLIGFFSGAIGLVGAYLIMRGINLMSNKLFGVSVVLIKREYAILGVIVSIVISTLAGLLPANKAARLDPVESLRRE |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP006777_6 | 5550943-5551089 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP006777_6
|
2 spacers
spacers of NZ_CP006777_6
>6.1|5550970|33|NZ_CP006777|CRISPRCasFinder GAAAGTTCCGTTATCATTTAACCAACCAGTTTG >6.2|5551030|33|NZ_CP006777|CRISPRCasFinder CCAAGTTGCTCCATCTTGAATCCAACCTGTAGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP006777_6
The CRISPR arrays of NZ_CP006777_6 >merge|NZ_CP006777|6|5550943-5551089|CRISPRCasFinder CATAGCACCTGATCCATTTAAGTAGTAGAAAGTTCCGTTATCATTTAACCAACCAGTTTGCATAGCACCTGATCCGTTTAAGTAGTACCAAGTTGCTCCATCTTGAATCCAACCTGTAGCCATTGTACCATCAGCTTTTAAGTAGTA >NZ_CP006777|6|5|5550943-5551089|CRISPRCasFinder CATAGCACCTGATCCATTTAAGTAGTA GAAAGTTCCGTTATCATTTAACCAACCAGTTTG CATAGCACCTGATCCGTTTAAGTAGTA CCAAGTTGCTCCATCTTGAATCCAACCTGTAGC CATTGTACCATCAGCTTTTAAGTAGTA
>NZ_CP006777.1|WP_012060912.1|5547775_5549608_+|O-antigen-ligase-family-protein MTNSRNNSNEKSFNFFLPIAFILSIVPLIVRMAAVKLDENLIKIWGTTVKTDLFSQRKALLLIIFSVILIITCVIFFKKIFSRKDKLVNYILIACGVFTLFTFLSAIFSKYKQVSFWGMFDRAEGFIIIACYIVLFLYSLYTFKTTNNYKYIITPLLILVFINAFLGLFQYIGQDLIKTSLGASIAGASSNSGIDLLNEKGTIYGTLASYNYMGSFVSIALPILFCYTIFEDEVMYKILSFIGTLLSFWLLFGSTARSGIIGVLGALIFGIIIFYKPLIKRWKGILIGVITLIILFVGANFASKGSLFKRIPSLASDAFSIFKDTSDLDYTNYTPVKDIKYIDSTTEVVLPNDTLKITYESGNPVFKDSNGEVVPYALNGKVLSTNIETFKNITFAFGKLDKKSVISDSLLLNINNQPTFLFKLNDNKIFHLIDMSTKNYIDLQTPETFGFKGKEKLGSSRGYIWSRSLPLIKNTMILGTGPDTFVFDFPQGDLIGKYYAYDTPNIVVDKAHNLYLQIAINYGVIALVGFIAMLLIYIIDSIKLYALKNNFEDRNQALGAITCLGIIGYLFAGIFNDSVVGVAPIFWIIFGVGIAINFMNRENIRKKSNK >NZ_CP006777.1|WP_012060911.1|5546697_5547567_+|glycosyltransferase-family-2-protein MKLSIIIVNYNTYDLTKQTIESVIKEHHNFNYEVILVDNASSDGSINKLQDKFRNIVTTKKLHIIINKDNLGFAKANNIGIKFARGKYILLLNSDTVLKENCLEKCIAKMEKDKNIGALGCKVVLANGDLDHACKRGFPTPKASLYYFLKLHEKNPSKYGQYNALHLREDDIGEVDCLTGAFMLMPKLIFDKVGGLDEDFFMYGEDIDLCYKIKELGYKILYYPEAQIIHYKGGSSKKKRSKVIYDFHQAMWIFYKKHYYKKYNFAVTFLVFIGIGLKYLVQIIKNAFK >NZ_CP006777.1|WP_012060910.1|5545203_5546622_+|undecaprenyl-phosphate-glucose-phosphotransferase MIKENQNLLNKFNAISDIIILFISITLAYLIRFYIFSPDTYYITLTTYIEFSVIIIPINLILFNFFNLYHSFRTRSFVKECSAIIKSNTILTAVLLSLLFVLKLVHISRLVIIIFYFVNIMLIMAKRLILRKILSRMRTKGLNLKHVVIVGAGEVANEYLDVLKNNKSFGYNYSGYVSDASNFQGRKLGNYSDLYNVLNEYKPDEVVCALDLSDAKYLENIVSDCEKSGTKISIIPFCYKYIPSQPYIDQLGSIPLINIRRIPLDNLGNAFIKRSLDILGSLFLILCTSPIMIITAVIIKFTSNGPIIFKQKRVGLNKNLFVMYKFRSMKINSQEETGWSTDNDPRKTKFGSFIRKFSIDELPQFFNVLKGDMSLVGPRPELPHFVENFKNEIPLYMVKHQVKPGITGLAQVNGYRGDTSIKKRIEFDIHYIENWNILMDMSILFKTAFKGFKNNEKIRINSTKSTNNEVNL >NZ_CP006777.1|WP_038458054.1|5543894_5544776_-|glucose-1-phosphate-thymidylyltransferase-RfbA MTKGIILAGGSGTRLYPLTMVTSKQLLPVYDKPMIYYPLSTLMLAGIKDILIISTPNDLPNFEKLLGDGSRYGINLSYKVQPSPDGLAQAFILGEEFIGNDNCAMILGDNIFHGNGLKNHLKKAVENKGRATVFGYYVEDPERFGVVEFDVNGKAVSLEEKPENPKSNYAVTGLYFYDNKVCEYAKRLKPSQRGELEITDLNKIYLEQGNLDVITLGRGYGWLDTGTVDSLTEASEYVKVIETRQGLKIACLEEISYKNGWIDKKTLLESAEQYGKSPYGQHLKNVAEGKVIY >NZ_CP006777.1|WP_012060908.1|5543308_5543860_-|dTDP-4-dehydrorhamnose-3,5-epimerase MNLIKTKLEGVYIVEPQVFGDERGWFMETYSRIKTPEIACDFCQDNQSYSKGKGILRGIHFQNGENAQAKLVRCVKGAVLDVAVDLRKGSPTYKEWVAVELSAENKKQLFIPRGFGHGFLTLTDDVEFVYKTDNYYNYESDRSIKFDDPEIGVEWGIENPILSEKDKKAPLLKDSDCTFIYNK >NZ_CP006777.1|WP_012060907.1|5542123_5543143_-|dTDP-glucose-4,6-dehydratase MKIVVTGGAGFIGGNFVHYMLNKYKDYKIICVDALTYAGNMETLVSVKDNSNFSFYKIDIADRDAVYDMFEKEHPDMIVNFAAESHVDRSIENPEIFLKTNIIGTAVLMDACRKYGIKRYHQVSTDEVYGDLPIDRPDLFFTEETPIHTSSPYSSSKASADLLVGAYHRTYELPVTISRCSNNYGPYHFPEKLIPLMIANALNNKELPVYGTGENVRDWLYVEDHCRAIDLIIHEGKVGEVYNIGGHNERTNLQVVKTVLHELGKPETLIKYVTDRKGHDMRYAIDPAKIHNELGWLPTTTFDEGIKKTIEWYLDNKTWWENIISGEYQNYYDKMYGSR >NZ_CP006777.1|WP_012060906.1|5541168_5542137_-|glycosyltransferase-family-2-protein MEVDKPLVSILLAVYKPNENWFIEQLISLNEQTYNNLELFVYDDCPDFPTSEDFLKKCITNFNYTVIRGKTNEGSNKAFEELTKIGNGEFFAYCDQDDIWEKDKISIIMDGFKEDDVTLVCSDLSIIDENGTKTANSITEIRKRIIYKSGYDLTEGLLERNFVTGCAMIVRSNIAKKAIPFVDSLVHDNWIAIIASINGKIEFVNKPLVRYRQHNSNQTGILKGIYDKNTYCKFKIEDVLERYISLKNRLGYIGELQGHLNYCITSLRARRSYFLKPSLKELKIIIKYSKYYKASIVLEIFLPIMPEFVFKYIIRLTKKGIL >NZ_CP006777.1|WP_012060905.1|5540314_5541154_-|dTDP-4-dehydrorhamnose-reductase MILVTGVNGQLGYDVVKELNRRNIECLGIDRAELDITDKNAVKDCIGKLKPDCVIHCAAYTAVDRAEDEEEVCAKVNVYGTDNIAKACKEIGAKMIYISTDYVFDGKGNTPFEVEDKIEPHSVYGKTKYEGELKVKEVLDKYFIVRISWVFGVNGNNFIKTMLRLGSEKESLNVVCDQIGSPTYTADLAPLLCDMAVSEKYGVYHATNEGFCSWAEFAGEIMKKAGLSCKVNPIPTSEYPAKAQRPFNSRLSKKSLVDNGFGLLPNWENALDRYLIELK >NZ_CP006777.1|WP_012060904.1|5538922_5540299_-|ABC-transporter-permease MNKRKFIKLTILVSLIFITNILIFKFCNIDDKNITLSYKIVSNEEDSYQVFYGTDMLWSEEQSQINSYTNINRQETLKFSIPKDITNLRFDFGEHPANINVSEIKLSCWGKSINIDLNEILNENNENQIGEVQEINNSLNIQTIGNDPYVVYKMDSTLISGLIEYEDSINNAIKLGSCILIDILAAIVLRKSRSVLILIQELKNNKTLIWSLSKNDFKTKYAGSYLGIIWAFIQPIVTILVYWFVFEYGLKSGSPIKGVPFIVWFMSGLVPWFFFQEALLNATNCMLEYTYLVKKVVFKISILPIVKILSALFVHLVFIVFLFFVAAIYRFYPSLYTTQLIYYSFCTFCIVLGISYTTSAIVIFFKDLGQIINIFLQVGMWLTPIMWSYTMVPQQYQWILKLSPMYYIVEGYRDTFINHVWFYERYFQTIYFWVVTLGVFAIGAVVFKKLKPHFADVL >NZ_CP006777.1|WP_012060903.1|5537647_5538910_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNDIAINVEHLSKIYKLYDKPIDRLKESLFFTRKVLYHEHYALNDINFEIKKGETLGIIGTNGSGKSTILKIITGVLNPTLGRVEVNGRISALLELGAGFNQEYTGIQNIYLNGTMMGFTKEEIDRKVNNIIEFADIGGFINQPVKTYSSGMFVRLAFAVAINIEPEILIVDEALSVGDVFFQNKCYRKFEEFKSEGKTILFVSHDLGSISKYCDRVILLNRGRKICEGNPKESIDMYKKVLVNQQDDSYDINHISQNKYIEKGQWKRSLTVNPDTLEYGNKFAEIIDFGIVDNTGIITNNITKGTIFMIKMKVLFNKKIQNPIFAFTIKDLKGTEITGTNTMIEKEDISVIEQGDIKEISFTQNMNIQGGQYLLSLGCTGYRDGDFTVYHRLYDVCNITVVSHKNSIGYYDMNSEVKIK >NZ_CP006777.1|WP_038458057.1|5553496_5554714_-|cell-wall-binding-protein MNKNLKKIIAIILAVNTVSTIAPVANLGLLTTKAYAANKITNLTVEDSNGDNMSLYSESDCTDKHRVDSDDVQPGKTYYTRKTSADEINIDADGVDSDNIRVFEETSSDTEGKDVGEDVDLSSGTNIITVRVYNGDPGTVKYSDNSYVNEYKIRVKYSGSNDDDDEDSDNVYLSSITLMGGNIDFSKKVYTYDVQVPEDLSKITIRARPDCDSGKYDDYKVKINGVKVDKDDKFKDDVSLNKGKNVIDIKVEDDDDNERVYTLNITRGKDNSNNNSKSSEQAEVTKTSQWVQVDGKWQYKDSTGNSVKNTWVQNYFVQADGNMATGWLNNNGKWYYLGDDGARKTGWQLVNGNWYYLDSQGTMQVGWIKDISNGKYYYLNNDGSMAYNTTIGEYKLGSDGAWYNR >NZ_CP006777.1|WP_012060915.1|5554844_5556089_-|cell-wall-binding-protein MNKNIKRVIAIVLAIGIISAATPNSKINLLTTRAYASTTNDESTLDSLSLDDSDGNNVKLYDDNDYKNRVKENDVHEDETYYAKTSSKTVSVDISGPDDNFVRVFRDSSDSTKGKEVGDDIQLTDKSVVTDLIIKVYGKDLDGETVRNNEHDDDEYDLLNTYEVKVRHVDEDDSDKTDFDDIYLERLSIAGSTINLSNSITKYTYNVDSNVNTVVIKATPENDNYDVTIDGEDADYDDNYKRTVNLEKGQNIIKVEIEHNNKDRVYTLIINRGNVSSSNTNNGSTNTDTNTGSKDVKANQWVQTNGIWQYNDAEGKVVKNSWIQNYYLNSDGNMVTGWLNLNGTWYYFGTDGAKKVGWQQSSGKWYYLDSEGRMQTGWVKDRNGKYYYLNSDGSMAYNTKIGVYRLGADGAWIK >NZ_CP006777.1|WP_012060916.1|5556139_5557681_-|cell-wall-binding-repeat-containing-protein MKKNMIKIVSIALALGIVSAAAPATNINVLTTKAYAATDNDDDYLDRLELNDEDGNNIKLYSDSDYDSKVNASDVEEGETYYAKTSSDTVSIDIDGPDEKYVRVFNGTSSSSKGKEMGEDVDLSDDSSTTTLTIKVYGKEPDDDMRYKDNDDYNVLSTYRIKVENPNYNQNNDNDNIYLERLSVNNNKVQLSKSELTYTYNVASDVKRVTIKATPEDDDYDVTIDNKNVQSADNYKKEVDLDEGTNEFEIELEDGDKDRVYTLIINRGNPSSNGTSSQDTAETEHQDSIYLDKLSIDGRLFSLSQSQVNYSSNVPSDVNKVTIKAEPEKDFYTVKVNGDEVFEDDDYKATVNLKDGENKIKVDVKNENSDEERVYTLTVIRGSVTSTQNNNGSSAANQWVQVNGIWKYNDASGNFVKNTWVGNYYLLDSGNMATGWLNYNGSWYYLGSDGARKTGWQLVDGAWYYLDSQGKIQTGWIKDSNGKYYYLNSNGAMAYNTTVGGYKLGYDGAWIQK >NZ_CP006777.1|WP_012060917.1|5557911_5559177_-|cell-wall-binding-protein MNKNLKKIVAIALAIGTISAVAPATNINFLTTKAYASSDNDETELESLQLLTESGSKIKLYESSSYDSDDKVDADQVEAGEKYFAKTSADTISIDIDGPSSKYVRVFKGTSDSTKGKKISSDISLDKDSTTTLTVRVYDEEPDDDVRYEDDDYSSEYTIKVKCTADSSDSDDEDSSDSSDDYDDIYLDRLSVDGQSISLSKSKVEYTYNVSSDTDEVTIKATPEDEDYDVTIDGDSVDDDDKYKSDVDLKKGENKIKIELEDGDDERVYTLIINRGGTSSTTGSTTNTASGSPSSATDVVATVTNKWVQVGGNWQYKDATGNTVKNTWVQNYFVQADGNMATGWLNYSGKWYYLGSDGARKTGWQQAGGKWYYLDSEGAMQTGWVRDLGSGKYYYLNSDGSMAYNTMIGKYKLGSDGAWIN >NZ_CP006777.1|WP_012060918.1|5559341_5560643_-|cell-wall-binding-protein MHKKIKYIIAATLVVAAVSGFAPSNNFLLGSVEAYASTYNDASNGELKSLDLTWGSGSKIKLLDSYSGDEVDLSSDTDYYVQLKGVSDFNVAAEVKGSGYVVKMFTSSSRSEKGEDVGQDVNIGSGYKDIYLRTYKSEEAYKEAYNDGDVSDCEKTYIIHARKESSTSEAEEDREYAYLDGIYLSDGSVDFSKNKTSYDVNVGEDVDKLTVRANPDDDDDYIEINGNSVYEDDNFEKTVNLDKGNNTITIYVEHEDEDTTYTLNVYRGKSANKTDSSNGQNFAIQTQEGSLNAWQRVDGKWRYVDGTGSVLKNKWWFDKDTGKNYYLGQDGFRTTGWFSDNNNWYYFNENGEMQTGWVNTNKNWYYLNKSGAMQMGWLEDSTGNWYYLDGSGAMETGWIEDSNGKWYYLDSTGKMIKDSAIGAYKLGTDGELE >NZ_CP006777.1|WP_012060919.1|5561110_5562838_-|cell-wall-binding-protein MNKNIKRIIAITVAVNTISTISPTTLNTYFVGAKPVYASSYSPDDEQLKTLKIKSLDGETLDLRDGYNGDTVKLSDETEYYTKLTDDSDGIKITAEAEDDDYVVKIFTSDAENATAYDPGDEILLGKGDTTLYIRTYKSKSEFNKVKNNVSNCKEEYTLNVRKTKESSYEDDSQDSIYLDKIDLSKGNIDFLKGKTSYDIKVDENVDSMWIKAIPESNSDRVRVDGSLVDSSDNYKETVSLNKGKNEIKIKVTDSKDNQRTYTLNVTRGDDSDNEDDIYLDNITLSEGDIDFSKDDNSYNVDLDESVSKITIGAEPEDSDYSVTIDGDEVRSSDDYEKKVSLDKGENVIKVNVEDELNDKKRTYTLTINRGKETDDSKDNNTEDTSDKKSQWVQTNDGWKYYDENGKVLKSSWLYDKDQKVYCYLDKDGLRVTGWHKDNEKWYLLDSKGAMLTGWQKDNEKWYLLGSDGAMLTGWHKETVDDQNKNTDTSTNSGDNDTKKVDNWYYLNQDGSMRTGWLSDGGKWYFFNADGTMQKGWLIDYNSKYYLTEDGSMATGTRTINGKEYKFNNSGALIL >NZ_CP006777.1|WP_012060920.1|5563071_5563329_+|hypothetical-protein MSKERTPYNPTPGDYDVEKLSGTRPESSNRQGGRDNIAPTRSLNPLSTDGPNKNITSSTSSKPHPVTGSVSMNHEDAFEYKNHNI >NZ_CP006777.1|WP_012060921.1|5563349_5563571_+|hypothetical-protein MSKEKMSSNENEKYYSEEELTDSHPSDPNDSELKKIKSMYLPDSKADHAPSEKSIEDANGLEHPEPVKPKSLI >NZ_CP006777.1|WP_012060922.1|5563669_5563921_+|hypothetical-protein MSQSKIPFSINPGDDYPMEEYSKESSPKSKASDSENVGKTTASGERNAKSLNNANISRTNLDTELIDLNADGDSDESKYSDLI >NZ_CP006777.1|WP_158380906.1|5563966_5564110_+|hypothetical-protein MSKGKYPYVPTPEDVPAPDLSYIFSPESKNSSNKNDNKNTDSHKRNS |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP006777_3 | 3.1|1589012|29|NZ_CP006777|PILER-CR | 1589012-1589040 | 29 | MN856024 | Bacteriophage sp. isolate 154, complete genome | 5002-5030 | 5 | 0.828 |
| NZ_CP006777_6 | 6.1|5550970|33|NZ_CP006777|CRISPRCasFinder | 5550970-5551002 | 33 | MT446411 | UNVERIFIED: Escherichia virus TH40, complete genome | 28967-28999 | 7 | 0.788 |
| NZ_CP006777_6 | 6.1|5550970|33|NZ_CP006777|CRISPRCasFinder | 5550970-5551002 | 33 | MT446412 | UNVERIFIED: Escherichia virus TH41, complete genome | 156610-156642 | 7 | 0.788 |
| NZ_CP006777_6 | 6.1|5550970|33|NZ_CP006777|CRISPRCasFinder | 5550970-5551002 | 33 | MT446392 | UNVERIFIED: Escherichia virus TH15, complete genome | 21954-21986 | 7 | 0.788 |
| NZ_CP006777_5 | 5.3|5489997|34|NZ_CP006777|CRISPRCasFinder | 5489997-5490030 | 34 | GU075905 | Prochlorococcus phage P-HM2, complete genome | 11901-11934 | 10 | 0.706 |
1. spacer 3.1|1589012|29|NZ_CP006777|PILER-CR matches to MN856024 (Bacteriophage sp. isolate 154, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
ttatattgtttgtaatctgctaattataa- CRISPR spacer ttatattgtttgttatctgataa-cacaac Protospacer ************* ***** *** .*.**
2. spacer 6.1|5550970|33|NZ_CP006777|CRISPRCasFinder matches to MT446411 (UNVERIFIED: Escherichia virus TH40, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
gaaagttccgttatcatttaaccaaccagtttg CRISPR spacer aaaagttccgttttcagttaaccaaccagaagc Protospacer .*********** *** ************
3. spacer 6.1|5550970|33|NZ_CP006777|CRISPRCasFinder matches to MT446412 (UNVERIFIED: Escherichia virus TH41, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
gaaagttccgttatcatttaaccaaccagtttg CRISPR spacer aaaagttccgttttcagttaaccaaccagaagc Protospacer .*********** *** ************
4. spacer 6.1|5550970|33|NZ_CP006777|CRISPRCasFinder matches to MT446392 (UNVERIFIED: Escherichia virus TH15, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
gaaagttccgttatcatttaaccaaccagtttg CRISPR spacer aaaagttccgttttcagttaaccaaccagaggc Protospacer .*********** *** ************
5. spacer 5.3|5489997|34|NZ_CP006777|CRISPRCasFinder matches to GU075905 (Prochlorococcus phage P-HM2, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttacttacaatcatcaggtgctatgaagactggt CRISPR spacer agaaacaaaatcatcaggtgctgttaagactgca Protospacer * .* **************.* *******
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
461760 : 514831
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP006777|461760:514831|DBSCAN-SWA 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51 | Clostridium_phage(16.67%) | coat,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
1031676 : 1097835
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP006777|1031676:1097835|DBSCAN-SWA 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65 | Clostridium_phage(56.67%) | terminase,coat,head,integrase,protease,capsid,portal | attL 1022932:1022950|attR 1107493:1107511 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1103552 : 1112931
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP006777|1103552:1112931|DBSCAN-SWA AATGAGCGATAGCAGAGCTGTTATACAAGCTAGATTACTTAGCAATATAAGTGATGAATATAACAAAAGCGAAGGCGAGTTCATGTATGATGCTGAGAAACCAGTTGCTATTGAATTAGAAAATGCATATACAGAAATTGAAGGCGTATTAGATAAGAGATTTGCAGAAACAGCAGCTGGAAAGGATCTTGATAAAGTAGTAAAAGATGTTGGATTAACACGTAAATTAACAACTCAATCTATCGGGAAAGTTACAATTACTGGAGTAGTCGGCTCTCCTATAAATAAAGGTGAACTCGTAGCTAGTGATAGTGTTAGTTTTGAATTTACAGAAACATTGGTTATACCTGAAAGTGGGATTATAGATGTTTCAGTAAAATGTGTGAAGTACGGTGAAGTAGGTAATATACCAGTTGGAACTATTAAATATTTTCCAAAGACACTTTCAGGACTACAAAAAGTAATTAATAAAGAAGCTATTTCTAATGGATATAATGAAGAGACAGATGAAGAGTTAAGAAAAAGATATTATGCCAAAATTCAGACTCCTGCAACGTCTGGGAATAAATATCATTATAGAAATTGGGCATTAGAGGTAACAGGCGTTGGAGATGCAAGAGTTGTACCACTTTGGGCAGGAAACGGAACTGTAAAAGTTGTTATTATAAATGCTAATAAGACTGGAGCTGATAAAACATTAGTGGATAGTGTTAAAAAGTATATCGATCCAGTTGATGGAATGGGTGAAGGACAAGCACCAATTGGGGCAACTGTAACAGTTGTTTCAGCGATTGAAAAAGCAATAAATATAACTGCAAATGTGAGTATAACTAATGGATTTAATCTTGGAATAATACAAACAACTTTTAAGACATTGGTACTAGAGCATTTACAAAGTATTTCATTCAATGCTTCATATATAAGTATAGCAAAGATAGGAAAAATATTATTAAGCACTGAAGGCGTTATGGATTATTCTGATTTAAAAATTAATGGTGCAATATCAAATATTAATTTAGCTGATGAAGAAATTGCAGTAATGGGAAATGTAAATTTGGGGGTGATGTGATTTGAATGTAACTCAATTCCATGAGAAGCTCAATAAACTTGAAAATAATATATATGTAATTGAGGAAGTTGTCAAAGTATTAAATGGCGTTTATGAATCAGAGCTACAACATGATAATGTAAATCTAAAGACATTGAATGTTTATACAGGAAGTAAACTTACAGGAAATAAGATTGAAGCATATTTTACATCAACTCCATCATTAACTCCATGGAAAACAATAATTAAAATTTACTCTAATGTAAGCCCTATTTATATAAGCTATGAAACATTAGGAGATCAAGTTGAGGCAGAAGATGTTAATAAACTTCAGGATGCAGTCGTTGAGACTCAAGAAAATCTTAATAGTGAAATTAATAGAGCTACTGGGGCTGAAAAAGTTCTAACTGATAATTTAAATACAGAAATATCAAGAGCAAAGAGTTCAGAAAATACGTTAACAATTAACCTGAATTCTGAGATTACTAGAGCAAAAAGCGCAGAGTCTATTTTAACAACAAATCTAGATTTTGAGATAAATAGAGCTAAAACTAAAGAAAGTTCTATAGATGCAGAATTATCTAATAGATATACAAAGGATAAAGTTTATACAAAGGATGAAGTATTACAAAAGATATCAGAATTAATAAATAACGCGCCTAATGTTTTAGATACATTTAAAGAAATTGCAGATGCACTTGGAAATGATCCTAATTTTGCTACGACTATGACTACAATGTTAGCTGGCAAAGTTGATAAAGTTTCAGGAAAGGGACTTAGCACCAATGATTATACAGATACAGAAAAAGCAAATTTAGCAGATACAAATAATAAGAAGCATGAACATGGAAATAAATCTGTAATAGATGGGATAACAGCCACATTAATTGGATATTGGAATGCTGCTTACACTCATATTAGTGATAGTGTTAAACATATTACAAGTGATGAGAGATCCTTATGGAATACCGTAAGTAATAAGGTAGATAAAATAACGGGAAAAAGTTTATCTACAAATGACTTTGATAATAACTATAAAGGTAAAATTGATGGGATTAGCAGTAATGCTAACAAAGTTGAAGTAAGTACAACTAATGGGAACATAAAGATAGATGGTGCTGAAAAAACAGTTTACACACATCCAAGTGGAACTAATCCACATGGCACAACTAAAACTGATGTTGGATTGGGGAATGTAACTAACGACCCTCAAGTAAAAAGAAGTGAAATGGGAGCTGCTAGTGGAGTGGCCACTCTTGATAGTTCTGGTGTAAATAGTCAAGCTCCAAAACCTCATACTCATGATGATAGATATTATACAGAATCAGAAGCAAATTCAAAATTTGCAACTAAAGACGAAATATCTAATGCTGGATATGGTGATATGCTTAAAAGCATATATGATACTAATAGCGATGGGATTATAGATAATGCAGATAAATTAGATGGAAAACATGCTAGTGATTTTGCACCTAGTGGATATGGATTAGGAGGAAAAGGTCAAAGACTAAATACAAGTACTGATTTGAATAATATAGTAGCTAATGGATGGTATGATGTACAAAATCCTGTAAATGGACCTTATTCGAGTGGGTGGTTTAATTTTATGGTTATATGTAGCGGTGATCAAAGCTATTTAACACAATTAGGTTTTGGAATGACAGTAAATGTAGGTCATGTTTATATACGAACTAAAAGTGGAAGTTCGTGGTCAACATGGATAGAACTATACTCTAACTCAGTGAAGCCAACTCCATTTGATATTGGAGCAAGTCCAAGTACACATAATCATGATTCAGTCTATCTAAAAAAAGGATTGTCATGGAATGATTTAGAGGGGGTATAGCATGAATTATGGTACAACCAAATATGGAATTAATGAAGAAGATAACATAGATGAAATAAAACTAATATCTCCTGATCTTATGCGATATATGCCTGATTATTATATTACATCTAAAGTTATGAAGGAATTAGAACATTCTAATTCGCTGGAGCTTGGAAGATTAAATTATAAAATTAAGGATATAAAGAATCAACTTTGGATAGATACTGCAACATGGGGGCTTACCTATTGGGAAAATGAATATGGAATTGAAACTAATTTATCTTTAGGGTATGAACAAAGACGAGAAGTACTTAAAGCTAAAAAAAGAGGGCAAGGTACAACAACTAAACAGATGATTAAAAATGTAGCTGAAACTTTTTCTGGTGGAGAAGTAAACATAATACAAGATAATCCTAATTATGCTTTTGTAGTCCAATTTGTTGGAGTTAAGGGGATACCAAAAAACATGCAGTTATTTAAAGATATGCTGGAAAATATTAAACCTGCACATCTAGGATACACGATTAAATATACTTATACCGTTTGGAATGTATTAAAAGAAAATAAATTGACGTGTAACAATGCAAAATTGAAGACATGGGATGAGTTAAAAGTTTATGAATAGAAAGGGCTGATTAAATGTTAACAACAACAAATTATGGATTGAAAAAGCCAGAAGGAACTGATGTTGTAAATATAGATGATTTTAATGGTAATGCTGATATTATAGATACAAAGCTAAAAGAAATTAACTCAGCATTACCTCTTAAAGCTCCGCTAGATTCTCCGGGGTTAACAGGAGCACCAACAGCGCCAACTCAAACTGCAGGAGATAATAGTACTAAAATTGCTAATACTGCTTTTGTAACTGCAGCGGTAGCGAATAAAACAAGTATAAGTGGGAATGCAGGAACAGCAACTAAGATACAGACACCTAGGAATATAGCATTAGCTGGAGATGTTACTGGTTCAGCCGACTTCGATGGCTCAAGAAATATATCGATAACAACTACCGTAGCAGATGATAGTCATAATCACATTATAGCTAATGTAGATGGATTACAAAGCGCTTTAAATGCAATAGATACGCAATTGTTAGATATGGTGTATCAAACAGCAGGCGGATCAGCCACAGCCATAACACTTACAATTAAAGGAACGTTAGTAAATGGATATCCAATAACTTTTATAGCAAGTGCAAACAATGGGGGAGCTGCAATCACTATAAATGGAAAAAAATTATATAAACCAGGAACAACAACATCACCAAATTTAATAGCAGGAAAGGCGTATACAGTTTGGTATAACTCAACTGGTGACTGTTTTTTTATCAAAGCTAGTGCGGAAGGAACTGCACTAGCGAAAGATGTGCGTAGGAATACGACCTTTAGTAATGATAATGATACTGGTATAACTGGAGGTCTTGATTTATCTTTGTTAGTTCCGGGAAATATAAGAGCTGGTATTACTATAGATGGCGTTACAGGTAAATCTTCCGTTGTAGATACAGCAGATGCATTATTAGATCCTCAATATTTGCTAAAAGGATATAGTGGATATGATGATGGAGTTAAAAAGTTTGGAACTCTTGAAAATATGACAAGTGCAATTAATATGGGAGGAGCAGATTCGGGTGACTTTTACAACAGTTCTGGAATTTGTGGTGGTGTTGCCACTAATGAATATGTAGGTGCATTTGATCTTTATATTCCAAAGGGGTACTATTCAGGTACCGGTACAAACAGACTACATATTCCGAATTTAATGCCGTGGAATATAGTTAATGGTGTAAATATTGGTTGGAATGGTAAGAGTATTGTTGGAACAGCATCAACTTATCAACATGTATCTGGTGCATTGGATTACACAATACCGAGATATTCAGGAACTAGTTCAAATCACACTTCTTATAGCTATAATATATCTTTAAATTTCGTACCAGATTTAATACTTTGGTTACAAGCTTCACCAAAAGGGGCTTATGTAATTTTCCCAGGATTTAGTTCAAGCCCAGACAATTTTTGGTTTTATATAAGCAATCAGGTAATATACTGGTACAATGATTCGGCCAGTAGTTTTAAATTATCAGGTAGTTGGCATGCATGGAAATTTAGTTAGCATTAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP006777|1103552:1112931|1106446_1107052_+|WP_011968268.1|DBSCAN-SWA MNYGTTKYGINEEDNIDEIKLISPDLMRYMPDYYITSKVMKELEHSNSLELGRLNYKIKDIKNQLWIDTATWGLTYWENEYGIETNLSLGYEQRREVLKAKKRGQGTTTKQMIKNVAETFSGGEVNIIQDNPNYAFVVQFVGVKGIPKNMQLFKDMLENIKPAHLGYTIKYTYTVWNVLKENKLTCNNAKLKTWDELKVYE >NZ_CP006777|1103552:1112931|1109948_1110737_+|WP_011968274.1|DBSCAN-SWA MFKGIDISNHNGNINFNQVKTAGVEVVYIKATEGTTFKDSYLDTNYSNAHYAGLKTGFYHFLVGTSEPESQANNFYNAIKDKTSDLIPMLDVETNFDGLMDYILRFIAKFKELSNMQIGIYTYTSFMDNLDNRIADYPLWEANYNNDPWRLNSNFFTNRVGHQYSETGSVSGINTECDMNEFNDGILNKTTGYVVTNYLPNGYQGDNSFNGVDADYVLQYFKGVRCYFRGNEKGVWIETQNLSMSKCLELKETLGSWFYDIK >NZ_CP006777|1103552:1112931|1104621_1106445_+|WP_011968267.1|DBSCAN-SWA MNVTQFHEKLNKLENNIYVIEEVVKVLNGVYESELQHDNVNLKTLNVYTGSKLTGNKIEAYFTSTPSLTPWKTIIKIYSNVSPIYISYETLGDQVEAEDVNKLQDAVVETQENLNSEINRATGAEKVLTDNLNTEISRAKSSENTLTINLNSEITRAKSAESILTTNLDFEINRAKTKESSIDAELSNRYTKDKVYTKDEVLQKISELINNAPNVLDTFKEIADALGNDPNFATTMTTMLAGKVDKVSGKGLSTNDYTDTEKANLADTNNKKHEHGNKSVIDGITATLIGYWNAAYTHISDSVKHITSDERSLWNTVSNKVDKITGKSLSTNDFDNNYKGKIDGISSNANKVEVSTTNGNIKIDGAEKTVYTHPSGTNPHGTTKTDVGLGNVTNDPQVKRSEMGAASGVATLDSSGVNSQAPKPHTHDDRYYTESEANSKFATKDEISNAGYGDMLKSIYDTNSDGIIDNADKLDGKHASDFAPSGYGLGGKGQRLNTSTDLNNIVANGWYDVQNPVNGPYSSGWFNFMVICSGDQSYLTQLGFGMTVNVGHVYIRTKSGSSWSTWIELYSNSVKPTPFDIGASPSTHNHDSVYLKKGLSWNDLEGV >NZ_CP006777|1103552:1112931|1111202_1111625_-|WP_049767631.1|DBSCAN-SWA MRIDLKDEFKDLPANTIAENLIRLRKLNNLTQKELSLTIGISKSSISKYERGELFPTKEQSIKLASYFNINSKYFYDPYLESMDNFHQYLSTVLNKNIHINKDKLCKSLDISKRTLYRYCYQNNVPSRNIFDRMESYLNT >NZ_CP006777|1103552:1112931|1111652_1112129_+|WP_011968276.1|DBSCAN-SWA MYRAFKGGTGDYVALFEPTASAIQKEGTGYILASVGEESGLIPYTCYFTTKSYMDKNPQVIQGFTNAIYKGQQWFFSHSTEEVADSIIDYFPGTDKDTIMTVIDNYKKIDAIAHTPEIKEENLNRLMDIITDYDSSLMPQRPEFSKIVDNSFAEKAAK >NZ_CP006777|1103552:1112931|1109230_1109467_+|WP_011968272.1|DBSCAN-SWA MNEELVKDKIETHERRLNNHGDRIDKLEQDGRELKTELKNLCENLKNLTSMMKWFITAMGGALISFFFYAVQTGIFNK >NZ_CP006777|1103552:1112931|1108572_1108845_+|WP_011968270.1|DBSCAN-SWA MKTLAIYNKNTGEILFTQSGGTELEDNILTNLSCEVPDGKITKSVNIETKEAIFEDIPKTELELLKEKVNDLAQANAELTSIVAMGKSNA >NZ_CP006777|1103552:1112931|1109482_1109878_+|WP_011968273.1|DBSCAN-SWA MIKQILGLVISILKNKTYMTAAREVWSIVDENFRITEKIEDTFKSKTEEFDKLLLAKFPELTKEDVIYFRQAVAGSVNVGKEAVLDNSVIMKELQESNTKLQAENASLKDQLSKFQSLAAATVNVDVQQTV >NZ_CP006777|1103552:1112931|1103552_1104620_+|WP_011968266.1|plate|DBSCAN-SWA MSDSRAVIQARLLSNISDEYNKSEGEFMYDAEKPVAIELENAYTEIEGVLDKRFAETAAGKDLDKVVKDVGLTRKLTTQSIGKVTITGVVGSPINKGELVASDSVSFEFTETLVIPESGIIDVSVKCVKYGEVGNIPVGTIKYFPKTLSGLQKVINKEAISNGYNEETDEELRKRYYAKIQTPATSGNKYHYRNWALEVTGVGDARVVPLWAGNGTVKVVIINANKTGADKTLVDSVKKYIDPVDGMGEGQAPIGATVTVVSAIEKAINITANVSITNGFNLGIIQTTFKTLVLEHLQSISFNASYISIAKIGKILLSTEGVMDYSDLKINGAISNINLADEEIAVMGNVNLGVM >NZ_CP006777|1103552:1112931|1112163_1112931_+|WP_011968277.1|DBSCAN-SWA MSLLEISNISMNYHSIKGETQALNNVNFQVDDGKFISILGPSGCGKSTLLNIMSGLLEPSNGSVLYKGEDVKKNLDKIGYMFQKDHLFEWNTVWENVILGLKIKKQLNSESKERVSGLLDAYGLTRFKNHHPSELSGGMRQRVALIRTLALNPEILFLDEPFSALDYQSRLLVCDDVYKIIKTEKKTAIMVTHDIAEAISLSEKVIVLSKRPSSVKAEIPIHFSDEELTPFQKRRAPEFSDYFNMLWKELNDGNG >NZ_CP006777|1103552:1112931|1108837_1109053_+|WP_011968271.1|DBSCAN-SWA MLSIINLILRRVFRMQFNKNSGCVKVWVTLIVGGTYEYKDVPKLLNLQEQVKLVLVDMGAIEDITTESTAS |
11 | Clostridium_phage(75.0%) | plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1260530 : 1270721
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP006777|1260530:1270721|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP006777|1260530:1270721|1268587_1269199_+|WP_011968401.1|DBSCAN-SWA MFKIAVLVSGGGTGLQSVIDAVESNYMNVKIEMVIGSRDNIYALERAKKHNIDTFVVNRREYGEESSNKILELTTGKVDLIVLAGFLAILDGEILKEFDNRIINIHPSLIPSFCGPGMYGLKVHEAVIKSGVRFSGCTVHFVNSEVDGGAILLQEVVPVYFEDDAETLQKRILEKEHEILPKAIKLISENKIRVIDGRVKIEE >NZ_CP006777|1260530:1270721|1266113_1267529_+|WP_011968399.1|DBSCAN-SWA MSNPNFELIMDPSNDKFKDECGVFGVYTNKPIDVASMTYYGLYALQHRGQESAGIAVADGEKIDIHKGLGLITEAFKQEDLQKLKGHIAIGHVRYSTAGGKGIENAQPILVSSKMGPIAMAHNGTLVNADVIKELLEDGGQIFHTTTDSEVIACLIARSAKKGFAKAVVDAMSAVRGSFALTIMSKDRLIGARDPHGIRPLSLGKIEEGYILTSESCALDAIGAEFVRDIEPGEIVIIDSEGIQSYRYSENTKCQTCAFEYIYFARPDSRIDGLEVHTTRVKAGEQLYKEHPLDADVVIAVPDSGIPAAIGYAKASGIPYDTGFIKNRYVGRTFISPSQEIRERAVAVKLNPLKSNLEGKRVILIDDSVVRGTTSKHLVESLRRVGVKEVSFLLASPSVKYPCYFGIDTPYRSELVAANNTIEEIRDMIGADYLGYLSEEGVYKSCGDREEFCMGCFNGVYPVATPVEKEI >NZ_CP006777|1260530:1270721|1264671_1265151_+|WP_011968397.1|DBSCAN-SWA MQVAIFFGSKSDTEVMRGAANALKEFGVGYKAFILSAHRVPEKLEETLEEIQAQGCQVIIAGAGLAAHLPGVIASKTILPVIGVPVKAALEGVDALYSIVQMPKSIPVATVGINNSYNAGMLAVQMLSVNNDELKNKLKEFRLNMKKKFIEENAEGVEL >NZ_CP006777|1260530:1270721|1260530_1264274_+|WP_011968396.1|DBSCAN-SWA MLNIRSVFVEKKKGFNVEAQSLLNDFRDNLGVTGLEDVRLVNKYIISDIPEEYYNKALHTIFSEATVDVVYESELPMNEGEVAFGVEYLPGQYDQRADSASECLALLTAEDRVEIKSAKVVLLKGNLSKDDIEKIKKYYINPVDSREVDINSKDLSSLSNIPKDVQILDGFTSKTLDQLKEFHSGQGLAMSIDDLLMIQDYFKGEKRDPSITEIKVIDTYWSDHCRHTTFSTILEDIQIEDNKYTAPIKASYESYIKSRSYVYGEKEKNKTLMDMAVIAMKELRKRGKLEDLDISEEINACSINVKIETDKGMEDYLVMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCLGGAIRDPLSGRTYVYQAMRVTGAADPTVAIEDTLEGKLPQRKITLGAAHGYSSYGNQIGLATGQVEEVYHPNYAAKRMEVGAVIAAAPKENVVREEPALGDVIILLGGRTGRDGVGGATGSSKEHTVDSLNECGAEVQKGNAPTERKLQRLFRNSKAAKMIKRCNDFGAGGVSVAIGELCRGLDIDLDKVPKKYEGLDGTELAVSESQERMAVVVTKEDADEFIRLSNDENLEANLVAHVTDADRLRLFWRGKNIVDLKRTFLDTNGATQKTNVTVKAPVDYPYTVADIDVKEEWINNLRKLNVSSKQGLSERFDATIGHGTVLMPFGGKYAKTPAEGMAAKIPVLDGESSDATLMTFGFNPELGTWSPYHMAYYAVIESMSKLAAMGGDYRKARLTFQEYFERLGIEASRWGKPFAALLGAYEAQMAFETAAIGGKDSMSGSFGDLDVPPTLVSFAVGVEKARNIISPEFKEAGSSLVLLQTEKLEDGTINVEKLKKNLDVLYNLIQSGKVISASAVKYGGVSETVTKMTLGNRIGAEIENLTKDELFGFNYGTIVLEVKNGVNVEEFKECLYKEVGKTISSAVIISKEYDLNLDIEALEKTYEEKLSSVFKIKTEDVEGKVETVLYDKKSTLSPAIKVAKPKVVIPVFPGNNCEYDCARAFEKEGAEVTQVVFRNITKEALNESIERLAKEISTAQILMIPGGFSAGDEPDGSGKFIANALRNEKISNSVMELLKNRDGLALGICNGFQALIKLGLVPYGEIVDIKEDMATLTYNNINRHMSSIISTKVVSNKSPWFSEVNVGDIHSVAISHGEGRFVAPESLIKELIANGQVATQYVDFDGNVSLNMPFNPNGSMYGIEGITSPDGRVLGKMAHSERIGTDLYRNIPGDFDQKIFKAGVEYFK >NZ_CP006777|1260530:1270721|1265150_1265858_+|WP_011968398.1|DBSCAN-SWA MEKLEMLYEGKAKKIYATDKADEVIVYYKDDATAFNGEKKGQIEDKGIMNNAITSVLFEILEKAGVKTHFIEKLNDREQLCKKVEIVPLEVIVRNVAAGSMAKRLGLEEGFKLKTTVFELSYKDDSLGDPLINDYHAVGIGATTFEELKVIYDMTAKINDTLKAVFKEQNINLIDFKVEFGRCADGTIVLADEISPDTCRFWDATTGEKLDKDRFRRDLGNVKDAYVEILKRISK >NZ_CP006777|1260530:1270721|1269212_1270721_+|WP_011968402.1|DBSCAN-SWA MKKRALISVFDKEGVLDFAKFLVSKDVEIVSTGGTYKYLKENGLNVIEINEVTDFPEMLDGRVKTLHPLVHAGILAIRDNEEHMNTLKGRNIHTIDYVVVNLYPFFEKVKEDLEFEEKVEFIDIGGPTMLRAAAKNFQDVVVISDKNDYKVVMEEIEANGETSYKTKKKLAGKVFNLMSAYDGAISNFLLADEEEEYPEYLSVSYKKMQSLRYGENSHQTAAVYASTMLDGAMNTFETLNGKELSYNNFKDVDIAWKCANEFDEPACCALKHNTPCGVAIGKDSYEAYMKAYEVDPTSIFGGIIGFNRKVDKKTAEEMVKIFLEVIAAPEYDEDALEVLKTKKNLRVLKFHNTPKADKYMVTVDGAMLVQEEDNKLVEEIKVVTEKKPTDEEMKDLLFGMKVVKYVKSNAIVVAHNGIALGIGGGQVNRIWPTEDALKRGKGATILASDAYFPFGDVAETAAKAGIKAIIQPGGSIRDQESIDVCNKYGISMVFTGYRHFKH >NZ_CP006777|1260530:1270721|1267598_1268600_+|WP_011968400.1|DBSCAN-SWA MITYKEAGVNIEEGYKSVKLIKEYAARTMSQYVLNGLGSFAGMVELPSGYEKPVLVSGTDGVGTKLEIAFKNKKYDTVGIDCVAMCVNDILCHGAKPLFFLDYIACGKLEAEVAADLVKGISDGCVDSDCALIGGETAEMPGFYSDGEYDMAGFAVGIADKDKIINGSNIKDGDKLIGIASSGIHSNGYSLIRKVFPDLNEEFNGEEVWKTLITPTKIYVKPVLKLLESYEIKGMAHVTGGGFIENVPRMFNGGDFTAVINKDSYPLPAIFERIIEKGVDKEHMYNTFNMGIGFVLAVKDEDVEPIIKALVEMGEKAYEIGYVTSGGEGICLK |
7 | Cyanophage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
1564516 : 1616656
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP006777|1564516:1616656|DBSCAN-SWA 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|
52 | Bacillus_virus(22.22%) | portal,protease,integrase,tail | attL 1575751:1575768|attR 1618539:1618556 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
1901496 : 1945448
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP006777|1901496:1945448|DBSCAN-SWA 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53 | Clostridium_phage(50.0%) | terminase,plate,tail,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
2580442 : 2586966
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP006777|2580442:2586966|DBSCAN-SWA TTCATTTTTTCCCTTTTCTACTGATCATTATAGATGTTATTACACTTATTACAAGAATTAGTAAAATAACTGAAATAGAAATCACTATAGATATATGATACTTAAATGATATTCCAAGCTTTATACCAGTAAATATAAGTATTAAGGCTACTCCGTATTTAACATATTCGAAGGTGCTGTGTAGTTTTTCTAAAATAAAATATAAATTTCTAAGACCTAATATTGCAAAAATATTTGATGTGTATACAATGAAAGCATTAGTCGTTATTGCAAATATTGCAGGTATTGAATCAATAGCAAATAGTAAATCTGATCCTTCAATTAAAAATAATATTGCAAATAACGGTGTTGCATGAAGAACATTGTTTATTCTTATAAAAAACTTTTCATCATGAAGCTCTTTAGTTACAGGTATCATTTTTTTTAGAAGTTTAATTAATTTACTGTTCTCAAATGATACATCATCTTCTTTGTTAATCATCATTTTTATACCACTTATAATAAGAAGTATACCAAATATATATATAATCCATTTAAATGCATTAATAATTGCAATTCCTAATAAAACAAATATAAATCTTAGAATAATCGCACCAAAAATTCCATAAGTTAAAATTCTTTTTTGATGTTTAGCAGTAATTCCAAAGCTTGAGAAAATTAATAAAAAGAGAAAAAGATTATCGACACTAAGACTTAATTCAATAATATATCCTCCGAGAAATTCTAAAGCTCTTTCAGAACCCATGTAATACCATATAGCTAAATTAAATATAGCAGCTATAAATGTAATTAATAAAAACTTAAATAAATGTTTTCTAGTAGACATTTTTGTAGCTCCTTTCAGATAAATTTGTATTTAAATTGTATATATTTTTTTAATATATTCGAAATTTTATGTAAAAACAATATTAATATAAGTTTTGTTTTTTTGCGTAAATTATAATAATTTTAAAAAGTAATTAAAAAACTCATTTAAAATAATATAACAATTATGTAAGAATAAATCAATAAAAGTTTATCATGTTAAGATTTTTATAATATTGACAAGTTTTTTATTTAATAGTAATATTGTTAATAACAATATTAAAAAGACAGTGATAATCTCATTTATAGGGGGAGTAACTGCCTGTTAATTATAACAGGATTCAAAGTCGTCATTACGGAGAGATCCCGGCTTTGAAAGCAAAAAATGCTTAGTGAGACTCTATAGTTAGAACGTGTTCTAGCTATAGAGTTTTTTTGTTACATAAATTTCTGAATTGAGAAAAAATTGTCAAAATATTTTAGTGATTAAGTAAAAGGAGGAAAACAAAATGAGTAGTTTTGGAAATCAAATTAAAACTTTACTCTTGATGAGTGTCCTGACGATATTAGTAGTATTAATAGGCAGAGGTATTGGAGGGCAATCAGGGATGCTGATGGCTTTGGTGCTTGCATTAGTTATGAATGGAGGAAGTTATTGGTTTAGTGATAAAATTGCACTATCTATAACTGGAGCTAAGCCATTAACAAGAAATGATAATATTGAAATTTATAATATGGTGGAAAGATTGACAGCAAATGCAGGAATACCAATGCCAAGGCTTTATATTACAGCTTCTACGCAGCCTAATGCGTTTGCAACAGGAAGAAATCCTAAGCATTCAGCTGTTGCTGTTACACAAGGATTATTGAATATACTAAATTATGAAGAATTAGAAGGTGTTATTGCTCATGAACTGGCACATATTAAGAATAGGGACGTGCTTATAAGTACTATTGCAGCTGTAATGGCAGGAGTAATCACAACAATGGCTAATTGGGCGCAATGGGCGTTAATGTTTGGCATGGGTAACAGTGATGAAGAAGAAGGCTCAGGATTCCTAGCAGCTTTACCATTAATTATTTTAGGACCTATTGCAGCTATGTTAGTACAGATGGCAGTATCGAGATCTAGAGAATATCTTGCTGACAGTACAGGAGCGAGGATTGCAGGACATAGCAGAGGACTCTCTAATGCATTACTTAAGTTAGATCAGGCTTCAAGAGTGGTTCCTATGGACGTAAATCCTGCAGTAAGCCATATGTTTATAGTCAATCCTCTAAGTGCGCAAAGATTAATGAATCTATTTAGCACTCATCCAACGATAGAAGATAGAGTACGTAGACTTCAAAATTCAAATTTATAGTCTTATTTAAAATTAGGAAACTAACTTGCTATTTTTTTGAATGAGCCTTAATAAAATATGAAAAGATCGTACTATACAAAGGAATAAAGTTTATTCAAGTGAAATAGCAGGAAGTCTAAAAATCATACCCAGATAAATTCGTTAAATTTCAAATTGTAGAATTCCATGAAGATGAGAAGTTCAAATATCTTGATGAAGTTGGCATAACAACAGCCATAAAATATAGAAGAGAAATTATTATAGAATTTACAAAATATAAAAATGGTCAGTTAGTTGCAGCAATGAAAATGAAGTATGAGAATAGAAAAGATCCAATATTTTTGTATTTGAGGAGGGGGGAATTAAAAGCAACTTGAAATTTAAATATAGCTTAAAGCAAGAAATTAAAGTGCTGTATTATTCTAGAGTGAATTATACAGCATTATTAATTATATATGAAAATTAATAATTAAAAGGTTGTATATCAGTGATATAGCTATTGGTGCAATTAATTAGAAGTGTTGTAATTTAATTTGGGTATTTAATTTTAATTTATTTTTATCAAATAACGTCCCCATTATAGACAATAAATTAAAAGATTCTATCTTGATTATTAAGTTGTGAGCAACGATTAAATTCCATTTCTAATACCGTGTTTACTGTATGTTTACCTAGATTATCTAAAGAATTATATTTTTTTAATAAACATTCTAATTCTTCTGATAGTTGTAAACGTGTTTTTATTTTGTTTTCATCCCATCCCATTAAAATAGATGGAGTTGTTTCTAATATTACTGCAAGTTTTTCGATTTTGTCAGAAGGTATATTAGAGATTACACCGCTTTCATATCTTTGAAGTGTTGGCTTACTAATAGATAATCTTTTAGAAACATCTTCTAATGTGAGATTCAATTCTAATCGTCTATTTTTGATATTTTCTTTCAAACCCATTTTATATCACCTCTTAGTTCTATATTAAAAGTAAGTAAATTATAGATTATCAATTAATATAATTTATTGATAATCTATAATAAAATCGAAGCGTCCTAATAAAACTTAATAACTTTTTATTTAGTTTGTTTACTGCAGTTAGGCAAATTAAAAAAATCATTCTAATTTGGAGACTATTAATATAATTTATTATAACATCTGTTTCCGGATATGCAACAATTATTTTCCATTATATAGAAAAAGTTACGTAGGAAGTATTGACAATAATAGCCATAATATATAAAATATTACTTAACGAGTAACGAAAGGAGAGCATTTATGATATTAGTTAATGAGTTAAAAGGAAAGATAAAAGCAAAAGGATATACTCAGGAAAAGCTGGCAAGGGAATTAGGAATGTCTCCAAAAACCTTAGGTAATAAACTTAATAAAGGAATATTTGGTTCTAATGAAATCGATAAGATGATAAAACTGTTAGATATAAGTAATCCAATAGAGATTTTTTTTAATAAATAAATTACTTGAAAAGTAAATTGTATTAACTTTATATATAGTGTTAGAAATCAAAAATTAATTATATATATTGCAAAAATAATTCTTCATCACAATTCTAAAAATATTGCAAGAATTTTATACGTAATTGTGAAATGTGCATTGGGAATTGCAACGTATATATTGTAATGTAAGAGCATTATGTTGAGCTGATAATTATTTTTATAGAAGGACAAGCTATGGAAGAATCATTAAAAGAAATTTTAATTGAATTAAGAAAATAGTAGTCTTAAATTAAAAAATAAATGCAAATTTATTTTAATACATCTTTAGCTAGAATGTATCAGGGATACAACTTTTGATAGAAATGTATAAAAAGAAAGTGAGGACTTACAAATGAATTTTAGGATTTTTAAATGTTATATAGATGTTTGTAAGTTAATTGAGTTAAACCCATCATGGAATGGTCTCAAAAGATTTAGGCAATTTTATTTATGGGAGCGTGAAAATAATGGCAGATATTAAATGGATTAAATTAGCTACTAATATGCATGATGATGAAAAGATGAAGTTAATAGATGCAATGCCTAACAGGGATACAATTCATTATGTTTGGATAAGAATACTTTTACTTGGTGGAAAACTTAATGCTAATGGAAAGGTTTTCTTATCAGAAGGGAAACCTCTCACTGCCAAAATGTTAGCTGTATTATTTTCTAGGCCTTTAGAGGATATTAAGATTACATTAAAAGTATTATCTAACTTTGGCATGATTGAAATAGCTTCTGATAAAGTAATTAGAATTGTGAACTGGGATAAGCATCAGAACATAGAGGGAATGGAAAGGGTTCGTGAACAAAACAGAAAAAGAGTTGAAAATCATAGAGAAAAGAAGAAAGAAGAGAAGAATGCAGCTAAAAGTAATAAGGAAGAAACTCAGGAAGATAAAGTCTTAGAAGAATTTATAGATTTAGAAGAAAATCAAGATCTGGATGAAAGTGTAGAATTAGAAAAAACTAATGAATTAGAACGAAAGAAAGATTACTCTAAGAATTCTACTATAGAAGAAAACAAAGCTCTAGGTAAAATTGATATATTAGAAAATTTGGAAACTAATGAAGATATCAGTAATAACATTTTAGAAACTGCTGATGATAATTGTATTGTCACTAAAAATAATAGTAACGTTACACGAAATAGAAGTAACGTTACAGTAACGCAGCAGAATAAGAAAAAGATAGATAATAAGAAGAAGAATAAGAAAGAGAAAAAAGAGATAGATAAAGATAAAAACATAGAGGGTAAAAAGAATAATGGTTTTGATATAAATAATAAAGGCTCAGCTTGTGATGATGAAGTTAGCCAGTCGAATCTATCTAAGAAACACAATAATACTAAAAGTGAATCCGGGGAAGAGGAGGACATAAATCTTAAAGCTTTAGAGCTTATGCATTATCATGAAAAAATAACAGGGAAGCCAGGAGGATGCGACTATGTTGCTCTTAGATCGGCTATTGATATCCATGGAGAAAAAATGGTTAAGATGGCCATGGATGTTGGGTTTGAGAAGAATTGTCCTGACATAAAGTATGCAATTGGGGTATTAAAAAACTGGAGGAGAGATGGGTATCCAGAAGATCATATGGAGGTAAAGAAAAATGGGGTTAGAAGCAATGGAAAGAGTGACAGAGCAGATAAAAATGAATTTGCTGGATTCAAGCCAAAGGAACCGCGAAAACTTACAGAAGCTGAGCGAAAGAGGATTGAAGAAAACCTCATATAAATGCGATAAATGCTGCGATACTGGATGGATACTTATCCCCCAGGAACATATGCAGCCTCTTGCTGTAGCCTGTGAATGCAGAAAAATAGAAAAACTAAAGAATGAGTGGAAGTATTCGGGAATCAATGTTGAACAAAGTAAACTTACTTTTTCTAGTTTTGAAGTTTGGAATAATGCGTCACAAAGGATGAAGGACACTGCAGCAGCATATTGTACTGATTTTGATGAAATAAAAGATAATAGGCGAAATAGTATTCTATTATGTGGACAGGTTGGCAGCGGTAAAACGCACTGCAGTATTGCTGTTGCATTAAATTTTTTAAAACAAAGAATCAAAGTGGTGTACATGCCTTATCGTGATGTAATCACAAAGGTAAAACAAAATATGATTGATGAAGAATATTATACTAGGACCATTTCAAAGTATCAATTATGTGAGGTTCTACTTATTGATGATCTCTTTAAGGGAAAAATCAATGAAACAGATACAAATATTATGTTTGAAATTATTAATTACAGGTATCTTAATTTTCTGCCTATCATAGTCAGCAGCGAATTCTCTATTGACAGATTACTGACATTTGATGAAGGGGTCGCTTCAAGAATATATGAAATGTCAAAAGATTATGTTGTAGAAATTGAGAAGGATATTAGTAATAATTATAGGCTTAAGTAAGAGCCCAAAAAGTGAGAGTCCAAATTTTATATTTGGTTACTCGAACTTTCTCTGTGAGATTTCATATTTGGCTGCTCGCACTTACTCCTATGAACGAATGTGAGTAGGAGTTTCATAGATTGTGCCTAAGCTAGGTTATGAAAATGTGATTTTAGAAAAGAAAATAGAGATATTAGAGGAAAAGACAAGAGTAATTCAATGCAAGAAATAATTTATATGAGGAGAATGTAAAGATGAAATCGTCAGGAATAGTAAGAAAGCTCGACCCACTTGGAAGGATTGTAATACCAAAAGAAATAAGAAAGGTACTAGAAATTTACGAGGGAGATTCCATGGAAATAATTAAGGTTGATAATGGGGTGGTTGTTAAAAAATATATTAAAGGATGCATTTTTTGTGGAAGTGATAAAGATGTTGTTGAATTTAATGGAGCAGTTGTTTGCGATGGATGCAGAAAGGCTTTAGGGCAGGATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP006777|2580442:2586966|2585863_2586490_+|WP_012058443.1|DBSCAN-SWA MQPLAVACECRKIEKLKNEWKYSGINVEQSKLTFSSFEVWNNASQRMKDTAAAYCTDFDEIKDNRRNSILLCGQVGSGKTHCSIAVALNFLKQRIKVVYMPYRDVITKVKQNMIDEEYYTRTISKYQLCEVLLIDDLFKGKINETDTNIMFEIINYRYLNFLPIIVSSEFSIDRLLTFDEGVASRIYEMSKDYVVEIEKDISNNYRLK >NZ_CP006777|2580442:2586966|2580442_2581267_-|WP_012058438.1|DBSCAN-SWA MSTRKHLFKFLLITFIAAIFNLAIWYYMGSERALEFLGGYIIELSLSVDNLFLFLLIFSSFGITAKHQKRILTYGIFGAIILRFIFVLLGIAIINAFKWIIYIFGILLIISGIKMMINKEDDVSFENSKLIKLLKKMIPVTKELHDEKFFIRINNVLHATPLFAILFLIEGSDLLFAIDSIPAIFAITTNAFIVYTSNIFAILGLRNLYFILEKLHSTFEYVKYGVALILIFTGIKLGISFKYHISIVISISVILLILVISVITSIMISRKGKK >NZ_CP006777|2580442:2586966|2581754_2582609_+|WP_012058439.1|protease|DBSCAN-SWA MSSFGNQIKTLLLMSVLTILVVLIGRGIGGQSGMLMALVLALVMNGGSYWFSDKIALSITGAKPLTRNDNIEIYNMVERLTANAGIPMPRLYITASTQPNAFATGRNPKHSAVAVTQGLLNILNYEELEGVIAHELAHIKNRDVLISTIAAVMAGVITTMANWAQWALMFGMGNSDEEEGSGFLAALPLIILGPIAAMLVQMAVSRSREYLADSTGARIAGHSRGLSNALLKLDQASRVVPMDVNPAVSHMFIVNPLSAQRLMNLFSTHPTIEDRVRRLQNSNL >NZ_CP006777|2580442:2586966|2584542_2585814_+|WP_012058442.1|DBSCAN-SWA MADIKWIKLATNMHDDEKMKLIDAMPNRDTIHYVWIRILLLGGKLNANGKVFLSEGKPLTAKMLAVLFSRPLEDIKITLKVLSNFGMIEIASDKVIRIVNWDKHQNIEGMERVREQNRKRVENHREKKKEEKNAAKSNKEETQEDKVLEEFIDLEENQDLDESVELEKTNELERKKDYSKNSTIEENKALGKIDILENLETNEDISNNILETADDNCIVTKNNSNVTRNRSNVTVTQQNKKKIDNKKKNKKEKKEIDKDKNIEGKKNNGFDINNKGSACDDEVSQSNLSKKHNNTKSESGEEEDINLKALELMHYHEKITGKPGGCDYVALRSAIDIHGEKMVKMAMDVGFEKNCPDIKYAIGVLKNWRRDGYPEDHMEVKKNGVRSNGKSDRADKNEFAGFKPKEPRKLTEAERKRIEENLI >NZ_CP006777|2580442:2586966|2583179_2583539_-|WP_012058440.1|DBSCAN-SWA MGLKENIKNRRLELNLTLEDVSKRLSISKPTLQRYESGVISNIPSDKIEKLAVILETTPSILMGWDENKIKTRLQLSEELECLLKKYNSLDNLGKHTVNTVLEMEFNRCSQLNNQDRIF >NZ_CP006777|2580442:2586966|2583857_2584055_+|WP_012058441.1|DBSCAN-SWA MILVNELKGKIKAKGYTQEKLARELGMSPKTLGNKLNKGIFGSNEIDKMIKLLDISNPIEIFFNK >NZ_CP006777|2580442:2586966|2586723_2586966_+|WP_012058444.1|DBSCAN-SWA MKSSGIVRKLDPLGRIVIPKEIRKVLEIYEGDSMEIIKVDNGVVVKKYIKGCIFCGSDKDVVEFNGAVVCDGCRKALGQD |
7 | Escherichia_phage(16.67%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
2629158 : 2635879
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP006777|2629158:2635879|DBSCAN-SWA ATTAAAAGCTTTTATCCTGATTATTAAGTTGTGAACAACGATTAAATTCCATTTCTAATACTGTGTTTACCGTATGTTTACCTAGATGATCTAAAGAATTATATTTTTTTAATAAACATTCTAATTCTTCTGATAGTTGTAAATGTGTTTTTATTTTGTTTTCATCCCATCCCATTAAAATAGATGGAGTTGTTTCTAATATTGCTGCAAGTTTTTCGATTTTGTCAGAAGGTATATTAGAGATTACGCCACTTTCATATCTTTGAAGTGTTGGCTTACTAATAGATAATCTTTTAGAAACATCTTCTAATGTGAGATTCAATTCTAATCGTCTATTTTTGATATTTTCTTTCAAACCCATTTTATGTTTCCTCCTTATAGCATATTAAAAGTAAGTAAATTATCCAATATTTATTAATTTAATTTATTGAATTGCAGTAAATTAATTAAAATTATTCTGATAAAGTATAATATCTGCCTATATAATTTACAGATTAAAAACAGTAAACTAAATAAATGATAGTGTACTTTGACATTAATTGTAATTAACTAATCTTAGATTTTAATAGATTATATTGATTATGTATATATTTTATCTGCTATTGTTAATAAATAAAATATATAATAATATTCATTTACCATTTAATTTGTTCAGTATAGTAAATAAATTAAATTATCATTTTTAATTTATTATAACATCTGTTTCTGGATATGCAACAATTATTTTCCATTATATAGAAAAAATTACGTGAGAGGTATTGACAATAATAGCCATAATATATAAAATATTACTTAACAAGTAACGAAAGGGGAGCATTTATGATATTAATTAATGAGTTAAAAGGAAAGATGAGAGCAAAGGGATATACTCAGGAAAAGCTGGCAAGGGAATTAGGAATGTCTCCAAAAACTTTAGGTAATAAACTTAATAAAGGCATATTTGGTTCTAATGAAATCGATAAGATGATAAAACTATTAGATATAAAGAATCCAATAGAGATATTTTTTTATGAATAAATTACTTAAAAAGTAAATTGTAATAACTTTATATATATTGTTTAGAAATCTAAAATTAATTATTCCAATTTAAAAGTATTATGTTACGCTAATAGTTATTGTTACGGGAGGACAAGCTATGGAGGAATTATTAAAAGAAATTTTAGTTGAATTAAGAAAAAATAGTGAAAAAGAGAATGCTGGAGATAAACTTACTTATACCCTTAAAGAGTGTTCTTATATATCAGGTATTGGTCTCAATACGTTACAAGAAGAGATTTCAAAGCAGAATTCAGATTTTCCATTCTTTAAAATAGGAAAGAAGGTGATGGTAGATAAAAAACTATTTCATCAATGGCTTGAAAATATTTCTATGGTTCACCAAGAATTAAGAAAATAGTAATCTTAAATTAAAAACATAAATGTAAAATTATTTTCATACACCTTGATTTAGAATGTATGGGGATTCAACTTTTAATAAAAATGTATAAAAAGAAAGTGAGGACTTACAAATGAATTTTAGGATTTTTAAATGTTATATACATGTTTGTAAGTTAATTGAGTTAAACCCATCATGGAATGGTCTCGAAAGGTTTAGGCAATTTTATTTATGGGAGCGTGGAAATAATGGCAGATATTAAATGGATTAAATTAGCTACTAATATGCATGATGATGAAAAAATGAAGTTAATAGATTCAATGCCTAAGAGGGATACAATTCATTACGTGTGGATAAGAATACTCTTACTTGGTGGAAAACTTAATGCTAATGGAAAGGTTTTCTTATCAGAAGGAAAACCTCTTACTGCCAAAATGTTAGCTGTATTATTTTCTAGGCCTTTAGAGGATATTAAGATTGCATTAAAAGTATTATCTAACTTTGGCATGATTGAAATAGCTTCTGATAAAGTAATTAGAATTGTGAACTGGGATAAGCATCAGAACATAGAGGGAATGGAAAGGGTCCGTGAACAAAATAGAAAAAGAGTTGAGAATCATAGAGAAAAGAAAAAAGAAGAGAATAATTTAGCTAAAAGTAATAAGGAAGAAACTCAGGAAGATGAAGCCTTAGAAGAATTTATAGATTTAGAAGAAAATCAAGATTTGAATGAAAATGTAGAATTAAAAAAAACTAATAATTTAGAACGAAAGAAAGATTACGCTGAGAATTATACTATAGAAGAAAACAGAGATCTAGGTAAAAATGATATACTAGGAAATTTAGAAACTAGTGAAGAAGATTCTACAAATACTGATATTAATGATAAAACTAATACTGATACTAATGAAGCAGCTAGTGATATAAGTGCAGAAAGAGCTAATAGTAATGAAGATATCAGTAACAATATTATAGGAAGTGATGATAATAATTGTATTGTTACTAAAAATATCAGTAACGTTACACGAAATAAAAGTAACGTTACAGTAACGGTACAGAATAAGAAAGAGATAGAGAATAAGAAAAAGAAAAAAGAGATAGATAAAAACATAGAGAGTAAAAAGAATAATGGTTTTGATATAAATAATAAAAGTTCAACTTGTGATGAAGATGTAAGTCAGTCAAGTCTCTTTGAGCAACATAATAATACTAAAAGTGAATCTGTAGCAGAGGATGATATAAATCTTAAAGCAATTGAGCTTATGCAGTATCATGAAAAAATAACAGGAAAACCAGGTAGTTGTGAGTATGTTGCGCTTAGATCAGCTATTGATCTTTACGGAGAAAAGTGGGTTAAGAAGGCTATGGATGTTGGGTTTCAAAAAAATTGTCCAGACATAAATTATGCAATTGGAATATTAAAAAACTGGAAGAGAGATGGATGTTCAGAAGATAATGTGGAGGTGAAGAAAAATGGCTTTAGAGGCACTAGAAAGAGTAACACAGCAGATAAAAATGAATTTGCAGGATTCAAGCCAAAGGAACCACGAAAGCTTACAGAAGCTGAAAGAAAGAGGATTGAAGCAAACCTCATATAGGTGTGACAAATGCTGCGACACCGGATGGATACTTATTAAGCAGGAGCATATGCAACCTCTTGCTGTAGCTTGTGAATGCAGGAAAATAGAAAAGCTAAAAAGTGAATGGAAGTATTCAGGAATCAATGTTGAGCAAAGTAAACTTACTTTCTCTAGTTTTGAAATTTGGAATGAAGCGTCAAGCAAAATTAAGGATACTGCTGCAGCTTATTGTACTGAGTTTGATGAAATTAGAAACAATAGGCGCAATAGCATTTTATTATGCGGACAGGTTGGCAGCGGTAAAACGCACTGCAGCATTGCTGTTGCATTAAACTTTTTAAAACAAAGAATTAAAGTAGTGTACATGCCTTATCGTGATGTGATCACAAAGATAAAACAAAACATGATTGATGAAGAATATTATACTAGGACAATTTCAAAGTATCAATTATGCGAGGTCCTTTTGATTGATGACCTCTTTAAAGGAAAGGTCAATGAAACCGACGTGAATATTATGTTTGAAATCATTAATTATAGGTACCTTAATTTTCTGCCTATAATAGTCAGCAGCGAATTTTCTATTGATAGATTATTAGCATTTGATGAAGGGGTAGCTTCAAGAATATATGAAATGTCAAAAGATTATGTAGTAGAAATTGAGAAGGATATTAGGAATAATTATAGGCTTAAGTAAATTTACAATGCACACAGCACAATTCACAATAAACAATTACAGAGTGAAAATTCGCATTAAAATGAATTTTTTTGAGAATTAATCAAAATTAAGTTATGAAGGGAAGTTATTTAAATGAAAGCATCAGGGATAGTAAGAAATCTTGATAATTTAGGGAGAGTTGTAATACCAAAGGAAATAAGAAAGGTATTAGGAATTAATGAAGGGGATTCAATCGAAATAACTAAGGTTAATAATGATATAGTTTTGAGGAAATACAGTAAAGGATGCATCTTTTGTGGAAGTGATAAAGATATAAGTGAATTTAATAATGTGCTTGTTTGTAGTGGCTGCAGAAAGATTTTAGGACAGAATTAGAATGAACAGGCCGAAAGATTTACCTAACCGCCTGGAATGCGCATACTGCAAGAGGAATTATAAACATGGTGGAGAATGTCAGGGAAAAAGCACAAATAGAAATGAAGATGGCTGTCTTTATTTTAGCATGGATGAAAAAGGATGTATAAGAAATATAGATCAAAGTATACCTTTTAATCTATATAGTGATATTCCACCAGTTGGTATGTGGAGAGATGGATGGACAATATATAATCAAGATACAAAAATCAGAATAAATAAGATATATGCTTTAAGCTGGAATGAAAGAAAAGGTTTGTTGTATGTTAAATGTAACTTTGATTATTTTATTAATGAGTTTAGTGAGAATTATAAAAAAGAAACTAATAAACCAAATCTAAAGGTTATTAAATGAGTCACATGAAGAAATGAATATTTTGAATTATTGATTAAGGATTAAAAGGATAAAATTTTAAAAAAGGGGATAATCAAAATGGGAGGTTTACTAATTTTCAAGAATGAAAGATTTGGAGAAATAAGATGGGTAAAAATTAATAATAAAGATTATGCTGTTGGGATTGATATAGCAAAAGCTTTAGGATATAAAAAGCCTAATGATGCAATTTCAAGACACTGTAGAGGGTCCGTGAAACACGGAGTAGGGGTAGTAACGGGGAAAAGAAAAGATGGAACTGATGCTATCCAAAATGTAGAAATGAGTGTAATTCCTGAAGGAGATATATATCGCTTAGTCGCTAAATCTGAATTACCAGGTGCAGAGAAATTTGAAGCCTGGATTTTTGATGAGGTGTTACCTTGCATAAGGAAAACAGGGATGTATGCTACAGATGAATTATTAGATAATCCAGATTTACTTATTGCTGCAGCTACTAAGTTAAAAGAAGAGAGAAAAGCAAGGTTGGAAGCCGAAAATAAAGTAAAATTACTAGAACCTAAAGGGGAATTTTATGATGATGTTGCAGGCTCTAAAGATTCTATTGAAATGGGCCATGTTGCAAAGGTTCTTGGCATTAAAAGAATGGGAAGAAATAGACTATTTTCATTATTAAGAGAAAAGAAAGTCTTGGATAAAAATAATATTCCTTATCAGCAGTTTGTAGACATGAGGTATTTTCGAGTATTAGAGCAAAAATATACAGTACCAAATGGAGAGACTAAAATCAATATAAAAACAATGGTATTTCAAAAAGGAATAGAATTTATAAGGAAAAAGATTAATGAGCCATGAGTCAAGTTACTTAATGAAGAAAGTACAAAAAATAGAAGCTTATCATATAAAGACAAGCTTCTATAATGTTACTCAAAACTAAGCTACATCAAATTTAGTAACTTGTCGTTGAGTAACTTGAGCACCAGATTTCTTAACTAAATCACCAGAATTAGTTTTGAAAACATTCTTAGCAATTACAGTATCCATAAGTGCGTTAACCTCATCTTTTGTAAGAGTAGGTTTAACACCAGAAACACTTAAAGTACTTTTTTCACCAGCTACAGTTAAAAAAGTCATAGATAAAGAATATTCCATTTAATTTCCCCCCAATCTTAAGTAGAGAACTCGAATCTATGATTCGGTGTGAATCACTTACTCAGCGAACGAATGTGAGTCGAGTTTCCTACAATATTTTTTTTAGAATAAGATCCTAAGCATTTGCTAAGCTAGAAGATTCATTAATAAAATAATCTCTAGTATTAGCTTCCATAACACCTTTAATTGCATCTGCGACAGCATAGACATTCTCAGGTGTAGCATCTGTTTTTATACCTGAGAAAGTTTTCTTGGTATAAATTGGGTCCCCAGCTTTATCTAAAGCTTTTTGAACCTCGATACTAAGAGAAACTGAGTCGATAGTTTTAGTTACAGCCATAGTTTTAACCTCCTTCATTTTGTTTTCATAAATGATATATGGATAAATGCTTAACATTACATAAATAGATAAAATTTATTTGTTTTTTATGAACAAAAGAACTAAAACAGATTAAAGATATTGAAAGGATGAATATGAAAAGTGAATGTTTCATCGAAGGACAAATTAGTATATTTGATTTACCTGCTATAGAAGTTATAAAACCCAAGAAAATTATTATTAAAGAAGAAACTAAAGAAGTGGATAAGTTTTATGCAATCACTAGATTATATTCACAAAGTTGTAGCAGAATAGTTAAGACACTGAGTGGCGCAGTGTTAGTTGAATTAGACGATAAAACTTTGTATTTTAATGCAAGTGGCATAAATGAGTTTAGTCTACCTAAAGATGTGGGAATCATGCCTGGAGAAGAAATACTTATTGCGAATAGTGATAAGAAAATAAATGAAACACAAAAACAAAAGTTAGAGGCTCTTAAGCCTAAACAATATATCAAAAGAAAAGGTGATGCTAATTTAATAATACCTGGAGAAAAAACTATAGTGATAAATCCAAAAGGATGGATATTAGAATATAATCAAAAGCCAAGTTATCATTCAAATGAACTAATTAATACGGAATTTAATCTTGAAATTAATGAGGTGGATGATAAAAAGAATAAAATAGATCTTGAAACGAATGATATAGAATTTAAGATTGACGATGAGGTTAATATTGAATATCAAGGCATAAAGACCGTTGGGAAGGTTGTTAGGGTATATAATAATGGAGAAACCGTGAATGTGAAATGGGATGGAAAACAAACAGCTTTTTATTATAAGAATGTAAGTAAGATAAATAATCCTAAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP006777|2629158:2635879|2633164_2633557_+|WP_012058490.1|DBSCAN-SWA MNRPKDLPNRLECAYCKRNYKHGGECQGKSTNRNEDGCLYFSMDEKGCIRNIDQSIPFNLYSDIPPVGMWRDGWTIYNQDTKIRINKIYALSWNERKGLLYVKCNFDYFINEFSENYKKETNKPNLKVIK >NZ_CP006777|2629158:2635879|2629976_2630174_+|WP_012058486.1|DBSCAN-SWA MILINELKGKMRAKGYTQEKLARELGMSPKTLGNKLNKGIFGSNEIDKMIKLLDIKNPIEIFFYE >NZ_CP006777|2629158:2635879|2632179_2632806_+|WP_012058489.1|DBSCAN-SWA MQPLAVACECRKIEKLKSEWKYSGINVEQSKLTFSSFEIWNEASSKIKDTAAAYCTEFDEIRNNRRNSILLCGQVGSGKTHCSIAVALNFLKQRIKVVYMPYRDVITKIKQNMIDEEYYTRTISKYQLCEVLLIDDLFKGKVNETDVNIMFEIINYRYLNFLPIIVSSEFSIDRLLAFDEGVASRIYEMSKDYVVEIEKDIRNNYRLK >NZ_CP006777|2629158:2635879|2634803_2635028_-|WP_012058448.1|DBSCAN-SWA MAVTKTIDSVSLSIEVQKALDKAGDPIYTKKTFSGIKTDATPENVYAVADAIKGVMEANTRDYFINESSSLANA >NZ_CP006777|2629158:2635879|2632920_2633163_+|WP_009168788.1|DBSCAN-SWA MKASGIVRNLDNLGRVVIPKEIRKVLGINEGDSIEITKVNNDIVLRKYSKGCIFCGSDKDISEFNNVLVCSGCRKILGQN >NZ_CP006777|2629158:2635879|2634469_2634688_-|WP_009168791.1|DBSCAN-SWA MEYSLSMTFLTVAGEKSTLSVSGVKPTLTKDEVNALMDTVIAKNVFKTNSGDLVKKSGAQVTQRQVTKFDVA >NZ_CP006777|2629158:2635879|2635162_2635879_+|WP_012058492.1|DBSCAN-SWA MKSECFIEGQISIFDLPAIEVIKPKKIIIKEETKEVDKFYAITRLYSQSCSRIVKTLSGAVLVELDDKTLYFNASGINEFSLPKDVGIMPGEEILIANSDKKINETQKQKLEALKPKQYIKRKGDANLIIPGEKTIVINPKGWILEYNQKPSYHSNELINTEFNLEINEVDDKKNKIDLETNDIEFKIDDEVNIEYQGIKTVGKVVRVYNNGETVNVKWDGKQTAFYYKNVSKINNPK >NZ_CP006777|2629158:2635879|2633635_2634391_+|WP_012058491.1|DBSCAN-SWA MGGLLIFKNERFGEIRWVKINNKDYAVGIDIAKALGYKKPNDAISRHCRGSVKHGVGVVTGKRKDGTDAIQNVEMSVIPEGDIYRLVAKSELPGAEKFEAWIFDEVLPCIRKTGMYATDELLDNPDLLIAAATKLKEERKARLEAENKVKLLEPKGEFYDDVAGSKDSIEMGHVAKVLGIKRMGRNRLFSLLREKKVLDKNNIPYQQFVDMRYFRVLEQKYTVPNGETKINIKTMVFQKGIEFIRKKINEP >NZ_CP006777|2629158:2635879|2630292_2630553_+|WP_012058487.1|DBSCAN-SWA MEELLKEILVELRKNSEKENAGDKLTYTLKECSYISGIGLNTLQEEISKQNSDFPFFKIGKKVMVDKKLFHQWLENISMVHQELRK >NZ_CP006777|2629158:2635879|2629158_2629518_-|WP_012058485.1|DBSCAN-SWA MGLKENIKNRRLELNLTLEDVSKRLSISKPTLQRYESGVISNIPSDKIEKLAAILETTPSILMGWDENKIKTHLQLSEELECLLKKYNSLDHLGKHTVNTVLEMEFNRCSQLNNQDKSF >NZ_CP006777|2629158:2635879|2630780_2632130_+|WP_012058488.1|DBSCAN-SWA MADIKWIKLATNMHDDEKMKLIDSMPKRDTIHYVWIRILLLGGKLNANGKVFLSEGKPLTAKMLAVLFSRPLEDIKIALKVLSNFGMIEIASDKVIRIVNWDKHQNIEGMERVREQNRKRVENHREKKKEENNLAKSNKEETQEDEALEEFIDLEENQDLNENVELKKTNNLERKKDYAENYTIEENRDLGKNDILGNLETSEEDSTNTDINDKTNTDTNEAASDISAERANSNEDISNNIIGSDDNNCIVTKNISNVTRNKSNVTVTVQNKKEIENKKKKKEIDKNIESKKNNGFDINNKSSTCDEDVSQSSLFEQHNNTKSESVAEDDINLKAIELMQYHEKITGKPGSCEYVALRSAIDLYGEKWVKKAMDVGFQKNCPDINYAIGILKNWKRDGCSEDNVEVKKNGFRGTRKSNTADKNEFAGFKPKEPRKLTEAERKRIEANLI |
11 | Clostridium_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
3729937 : 3740965
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP006777|3729937:3740965|DBSCAN-SWA CTTATTGATTTATCTTATCTCGTTTTAATTTTAAAATTTCTTCAACTGCTTTCTTATAGCCTCCAGATTCTTTGAAAGAATTACTTATTTTTCTAATATTTTCAAGATAACTTGAATCAGTTAAAACTTTCTCAACAGATTCCCTTAAAATCTCTGGATTAATATTATCCTTATCAAGAGAAATAGTTGCACCTAACTCTTCAGCTCTTTTTGCCATATATGGTTGATCTGCACCTATAGGTATTGCTACAAAAGGCACATTGTTATACAATAAGTCACTAGTACTATTCATCCCAGCATGAGTTATTGCTACATCAGTATACTTTAAAACCTCTGATTGTGGAACATAATTTCTTACAATAAAGTTATTAGGTATATCAAATTTAGATAAGTCTATATTATATGCTGCCATTACAACAACTTCATCAGTATTACCAAATGTTTTAAAGAATATATCATATAGATTGCTATCAGTATTATTAAACACTGTACCTAGTGAAATATAAACAACTTTCTTTCCCTCTAATTTTTCAAAAGGAAAATCTAAATTTTCTTTTCTATCATATATTGGTTGGCCTATAAATTTAAAGCTCTCATCATAATATTCTGGATGTGCAACAAAATATTTAGATGTATATGCAATATTTATATCACCCTTATTAAAAAATAAATCAAAGATATTATGGGACATTTCCACATTAAATTCTTCTTTTAATTGTCTTGAAACTTTTTTATAAGTCTCTATAACTGGATGATTTTTTATTAAATTTTCATTCATTAATTCTTTGTGCTGCGACCTTAATTCTTTAGGAGTTGCAAACACTGCAAAGGAAGAAACTGAAGGTATTTTCAGTATTTGAGCAATGATACTTCCAAAAGGAAACATGGCCGTGTACATAATATAATCGAATTTTTTGCCTTCAATTTGATTTAAAATATCTTTTATAATTTTATCACTTGATTTAAGCGTTTCATTTATATAATCAAGAAGTTTATCTGGCCCCATATCATTAGAAGTCTTATGTTTTCTTTTAAAAAGGCTCAGTTCCACTCTATAACTTTTAAATTTGGCACCTGTTTTTTCAATTTTTTCTTTAAAATCTTCTGAGCAGAAATACGTAATTTCTTCTCCTTGTTTTACTAATTCATTTACTAATCCCAATGTAGGATTTATATGACCATGCGCAGGTATACTTAAAAAAAGTACTTTTGACATAAATCAACTTCACTTCCATTCTTTATATTTACACTTACATATTCTCATAATACTCATAGTAATTAAATAGCATTTTCTCTAAACGTCCAAATCCACACATTAAATGTAAATTCCTCGGTATTAAGTTTAGATTTTTTAACCAGAATATATTAATTAATATATTCTGCATTTTTTCCCATGCATATTATTTTTTTTGCATGAATAAGCAAAAATTATTATCACCTTTCATATTTATCTTTTAATATAAAAAGCAGTAGTTAAAGACCTCCTAACTACTGCTTTTAAAATTTAAAATATGATTTATATTAATAAATTCCATGGTGCTTTATATTAAATATACGTAAATATCTAGCCTTTATATTTGCATATCCCAAAATAAGGAGAATGAGTTTATCACTCCCCAATTTTCCTTCTTATAAACTCTATTCCCTTTTGAAATACCATTGTCTTAATGTTTATCTTTGTTTCACCACTAGGAACTGTGTATTTCTGCTCCAATACTCTAAAGTATCCTAAGTCTACAAACTGTTGATAAGGAATATTGTTTTTATCTAAAACTTTCTTTTCTCTTAAAAGTGAGAATAAATTATTTCTGCCAATTCCTCTTATAGCAAGAACCTTTGCAACATGTCCCACTTCAATGCTATCTTTAGATCCTGCAACATCGTCATAAAATTGTCCTTTAGGCTCTAATAGCTTTACCTTATTTTCAGCTTCAAGCCTTGCTTTTCTCTCTTCTTTTAACTTAGTAGCTGCAGCAATAAGTAAATCTGGATTATCTAATAATTCATCTGTAGCATACATTCCTGTTTTCCGTATGCTAGGCAATACCTCATCAAAAATCCATGCTTCAAATTTCTCTGCTCCAGGTAATTCTGATTTGGCTGCTAACCTGTAAATATCTCCTTCAGGAATTACACTCATTTCTATATTTTGAATAACCTCTGTTCCATCTCTCCTCTTTCCAGTAACTACCCCTATGTCGTGTTTCACGACACCCTTGCAATGCCTTAAAATTGCATCTCTTGGGTTTTTATATCCCAAAGCTTTTGCTATATCAATCCCAACAGCATAATCTTTATTATTAATTTTTAACCATCTTATTTCTCCAAATCTTTCATCTTTAAAAATTCGTAAACTCTCCATTTTTGTTTATCCCCTTTTTATAGATTTACTCTTGACCTAACGCCTTTTTGCACTCACCACAGACAAGTGCATCTCTAAACTTTGAAATACCTTTATCACTCCCACAAAAGATGCAGCCTTTAATATATTTCCTAACAACTACCTCATTATCAACCTTAATTATTTCCATAGAATCTCCATCATTAATTCCAAGTACCTTTCTTATTTCTTTTGGTATTACAATCCTTCCAAGTGGATCGAGCTTTCTCACTATTCCTGATGCTTTCATTTTTACATTCTCCTCTGCAAAATTATTTTCTTTTATATGATTAAATCATTTCTTGTATATCTCAAATTTTATATATTTACTAAGCCATCATAACCACAATATACTGAGATGATTTCTTGCCTTGAATTACTCTTGTCTTTTCTTATAATATCTTTATTATCTTTTCTAAAATTAGATTTATAGGCACATGAGAGAAAATAATAAATCCAAAATGCCATGATTATTTTTTTGAATGTGCCTTATAACCGAGCTTAATGTTCTCTCCAGTAAGCTTTATATTTTCATTAATAATTTCCTCAATAGCTTTTTTATCCATATCCTAAACACTCCTTAAATCTTCTTAACTTCTACTCAAAATTTTGAACTATTTAACCTCATAATTGTTATTTAAGAACTCAACTTATTAGATGAACATATTTACAAAGTTGAAAAAACTTTAAGTTCATCTCTTCACTAGAAATCATAAATATATTTGTGGAGAAAACATTTGAAAATGAGCTGTTAAAGGTTCTTAGCTGTAGGTTGTTCTATTTTAGCTTGTCAAACTGAAAGTTGGAGCATGCTAAAGTGGATACAACCTGCTGCTTAGAACCTTCAGCGATATTTTCATAGCTTTTCGGAATCAAAATATTTATGATTTCGGTAAGTTTCCACTTAAATTTAGTTTTAAAGTGGGATATCTATATTTTGTTCTGAACTTATTTTAATCTAAAGTTATTGTGTATGTCTTTCTCAATTTCCACCACATAATCCTTACTCATCTCATAAATTCTTGAGCCAACAGCTTCATCAAAATTCAGTAATCTTTCAATGCTAAATTCACTGCTGACTATGATTGGCAGAAAGTTTAAATATCTATAATTAATGATTTCAAAGACTATATTTATATCACTTTCATTGATTTTACCCTTAAAGAGATCATCAATAAGTAAAACCTCACATAGCTTATATTTTGAGATGGTCTTAACGTAATATTCTTGGTCAAGGATGTTTTGCTTTATATTAGTAATTACATCTCTATAAGGCATGTACACAACTTTAATCTTCTGCTTTAACAAATTTAATCCAATGGCAACACTGAGATGCGTTTTGCCACTGCCTACTTGGCCACAAAGTAGAATGCTATTTCTTCTGCTATTTCTAATTTCATCAAAATCAGTGCAATAAGCTGCTGATGTATCCTTTGCTCTTTGCGATGCTCTATTCCACACTTTATAATTAGCAAAAGTATGCTTTGTCATTTCAACATTAATTCCTGAATGCTTCCATTCATTTTTTACCTTCTCAATTTCTCTACACTCACAGCTAACTGCAAGGGGCTGCCTATTTTCTTGTGGAATAAGTACCCACCCAGTATCACAGCATTTATCACACTTATATGAGGCTTTTTTCAGCTTTTTTTCGCTGCTCATCTGTAAGGTTTCGTGGTTCCTTTGGTTTGAATCCTGCAAATTTGTTTTTATCTGGGTTACTATTATTTCCATAGCTTTTATTGACATTTTTCTTTACCTCCTTATCATCTGGATATCCTTCTCTTCTCCAATTTTTCAGTATGCCATCAATGTAGGTCATATTAGGTTTATTAGCTTTTAATGCTATATCTATAGCCATCTTTACATATTCTTGACCATGCATTCCTATAGCTAACTTAAGTGCGCCTAAATTAAGAACATTAGCTATTCCAGCTATTAGTTCACAATACTTAGCAAGTTCAATAGATTTAGAATTTATATCATCTTCTTTCTTTATCTCTCTATCTTTATTATTCTCATTCTTAATCTTGTTCTTATTCTCTCTCTTATTCTGCACCGTTACAGTAACGTTACTTTTATCATCCGTAACGTTACAAGATTTTTTTGTAATGTCACAAATATCATTTGTAACTTCAATGCTATATTCTTTACTTTCAGCACAGCTATGTTCTTCAATTTCAACATTAGTTTCTTCACTTTCATTAACTACAGCTTCAAGTTGTTTTTTCTTTTCTCTATGGTTTTGAACTCTTTTTCTATTTTGATCTCTAACTCTGTCCATTCCCTCAACATTTTGATGTCTCTCCCAATTCACTATTCTGATTACATTATTTTCAGCTATCTCAATCATTTGAAAATCTGATAATACTTTAAGTGCAAGTCTTATAGAAGCTAGAGGCCTTGAGAATATTGTAGATAACATTTCATCAGTATATGGGATATTCTCATTTAGATATATAAGTCCATTAGCATTAGTTTTTCCAGCTTGTATAAGTAATCTTATCCATAAATAATGAATAGTATCTCTCTCTGGCATTGCATCCACTAATTTCATCTTTTCATCATCATGCATGTTAGTAGATAACTTAATCCATTTAATATCTGACATGTTTCTCACTCTCCTTTAAAAGAAATACTTTAAACCTTTCCAATTTTTCCATGAGGGCATCAATCTCACGGAAGTACATACATCCGTCTAATGCCTAGACATTCTAATACTCCAATCACTTCCGATAGCAGTTAAAAACTTACACTCTTAGATATTTTACCTTGTGGCTACATTGTGGCCCTTGGGGTATAAGTTCAACTAAATCCATCTTAAATACAAAATTTAACATGAAAATTTTTACTTTATATATACTCTAAGTATTTTAAGGTCCAAACTGTAAACCTATCTTTCAAAATTATTACAAATAAAAATTATATTTTTCTTTTTTAATAGCTATTAACTCATAAAAATGTATTCTAAAATTGCCTTAATCCTCTTCATAATTTAATTCTCATTAATAAAGATTAATATCTATTAGGGGCATATATATGAATAGTCAATCATAGCTTTAAATTTAGGTAAAAATGAATTGTTGAAGAAATGGGAGATTACTTATATACTCATTATTAATAACATTATTGATAGAAAGATTGATATTGAAATACATATCATAAAATGAGGTGAATACATGAACAGTATTAAAGATCACATATTACAATTAGAACAGGAGTTATTAAAATCAGAAGTTAGAAAGTCAGCTGATAAAATAAATGGCATGCTATCAAATGACTTTATTGAGTTTACTAGCTCAGGAAGTGAATATCATTACAAAAATGGTGATGTATTTCAAGAACAGAATAATCCTCAAACATTATATGGAGAAATCTCAGATTTTAAAATAAAGGAACTGTCCGATGATTGCATATTAGCAATGTATAAAATAATAAAGCTCAATGAGTTGAACGAAAATAAAAAATATTCATTACGCAGCTCCATATGGAAATGCTTTGATGGTAAATGGAAAATGATTTTCCATCAAGGAACTTTATCATCTAACTCTGAAATAATATAGATAAGCATTATATTAGAAAGCAAAAATATTTTTATCTCTGCTTTTTAATATAATATTTATTACAAAATACATTATAGTTCTCTAATGACTATTTATTATAAAATCCAGATTTAATCATAACTGCATTTATATAATTACAAAAACTAATCTCAATATGAATATCACAAACTCTTTCCGCGAATAATAAATAAAAAGTAAGGTGGTGATATAAAATGGGATCTTCTCAATACAATAGAAATAAGAATGATAAGAGCAATGTTGATAAGATGAAAGGCAAGAATAATCGTGATAAAGGCAACAATCAAGTTGGCTCAACAGATAATGGAAAATAATCTATTTTACTTAAATATATTATAACTAAGTTAACAGCAAATATATAATTAAAAAACACAGCCTACATCAATACTCAGTAGGCTGTGTTTTTTCATATTATTTTTTATATAAATTTTTAAGTTCAAATTTTAAAATACTAATAAAATAAAAGTAGAAATTCACCAAAAAATCTAAATTCCACTTATAATTTAGACCATACTAGAAAGAGAGAGTACTCTTTTTTGTAGCATTGCATTGAGAATAAAGATGTAAGATTTCTTCATTAGAAGTTGTTCAATTATTGTTTGTCACAATTTTATATTGGGAACAAACAGTAATTGGTACAACTTCTAATGTTAGAAATCATCAGCTTTTATTCTCTAGCAATCGAAAAACAGAGTATTCTCTCTTTCGGTTGAGTATGAATTATAATTTATACTGCGTCAAAGAAGCTCATTTGATCACTTTCTGGAAGGCCATTTAAACAATCAAATTTTCTAAGAAGCTCTATGGCAGCATTACCAATCTTTGAACGTTTCTTTACATCATCTACTGAATTAAATTCCTTTTCCTTTGCTGCACTTGCTATACCTTCTGCCGCTACATTTCCCATACCTGCTATACTGTTTAATGGCGGTCTTATTCCATCTTCTTCTAGCTGGAATTTTGTAGCACTAGATTTATATAAATCAATTGGAAGGAATTTAAATCCTCTTTCATACATTTCCAAAACTATTTCAAGGTCATCATACATATCCTTATCCTTAGGACCAGCCTCATTTCCAAGAGCCTGAATTTCCTGCATCTTTGCTTTAACCTTTTCTTTTCCAAAGATCATAAATTCTGCATCAAAGGCTTTTGCTCTTATAGTAAAGTATGTTGCATAATAAGCCTGAGGTATATGAACTTTAAACCATGCTATTCTAAATGCCATCATTACATAAGCTGCTGCATGGGCTTTAGGGAACATGTATTTTATCTTTTTACAAGACTCTATATACCATTCTGGTACATCATGTTCTCTCATCATAGCTTCATATTCTGGAAATTTAGGTTCTTTTAAGGCTTTACCTTTACGAACAGTTTCCATTATTTTAAACGCGGTATTAGGTGGAAGTCCTTTTCTAATTAAGTAAACCATTATATCATCTCTGGTACATACCGCATCACTTATGCTGGTAATTACTCCATTATCAATTAAGTCCTTAGCATTTCCAAGCCATACATCTGTACCATGTGAAAGTCCTGATATACATAATAAGTCTGAGAAAGTTTTTGGTTTTGTATCTACAAGCATTCCTCTTACGAACTTAGTACCAAACTCAGGAATTCCAAAGGTTCCTACCTCTGAATTTATCTGATTTGGAGTTACCCCAAGAGCCTTTGTTGAGAAGAATAAGGACATAGTATCCTTGTCATCCATAGGAATCTCATGTGGGTCAACCCCTGTTATATCTTGAAGCATTCTTATAACTGTCGGATCATCGTGCCCTAGTATATCAAGCTTCAATAGATTTTGGTCAATAGAGTGATAATCAAAATGTGTTGTTATAATATCTGAGTTAGGGTCATCTGCGGGATGCTGCACAGGGCAGAATTCAAATATTTCTCTTCCCTTTGGTACAACTATAATTCCTCCTGGATGCTGACCTGTAGTTCTCTTTATACCAGTACACCCTACTGAAATTCTTATTGTTTCAGCTTTGTTTATTGTAATATTTTTTTCTTCATAATATTTTTTAACATAACCAAACGCTGTTTTTTCTGCTATAGTACCAATAGTCCCTGCTTTAAATGTTGTTCCCTTTCCAAAGATAACTTCTGTATATCTATGGGCCTTTGCCTGATATTCCCCTGAGAAGTTTAAATCTATATCCGGCTCTTTATCTCCATTAAAGCCCAGGAATGTTTCAAACGGAATATCTATACCATCTTTATACAGATTTTCTCCACAAACAGGACATACTTTATCTGGTAAGTCAAAGCCATTTAGAACGCCATAATCCTCAAAATCAGAATACTTACATTTAGGACATCTATAATGAGGTGGAAGCGCATTTACTTCTGTTATACCAGTCATATTTGCAACGAAGGATGAACCAACAGATCCTCTGGAACCTACTAAGTATCCATCTTCATTTGATTTCCATACCAGCTTCTGAGCAATAATATACATTACTGAGAATCCATTTTTTATAATAGAATCCAACTCTTTATCAAGTCTTGCCTGAACTATTTCTGGAAGTGGATCTCCATAAAGTTCATGGGCTTTTTCATAAGCTATATCTTTTATTGTCTGCTCACAGCCTTCTATATGTGGTGGACATTTTTCAGGAGAAATAGGGCTTATTTGCTCACACATATCTGCTACTATATTAGTATTTGTAACTACAACCTCATAAGCTTTTGTTCTTCCTAAATAAGAGAATTCATCGAGCATTTCTTCAGTAGTTCTTAAATATAATGGAGCTTGATTATCTGCATCCTTAAATCCCTGTCCTGCTTCTAATATACGTCTGTATATTTCATCTTCAGGATCTAGGAAGTGAACATCTCCAGTAGCTACTACAGGCTTACCTAATCTTTCTGCAAGTTCTACAATCTTTTTATTAATTTCTTTTAAATATTCTTTACTTGGAACTTGCTCCTGTCTTACTAAGTAATCATTATTTCCTAAAGGCTGAATTTCTAAGTAATCATAGAAATTAGCAATTTCCTCAATTTGTTCTTCTGGTTTTCCAAGAAGTATCGCTTGATATAATTCCCCTTCACTACAAGCACTTCCAATAATTAAACCTTCAGAATATTTCTTAAACATGCTCTTTAATATACGTGGCTTTTTATAAAAATAATCTAAATGAGAATATGATACCAATTTATATAAATTCTTTAATCCCACGTAATTTTTTGCTAGTATTATTGCATGGTGAGTTTTAACCTTTTTATATGCCACTTTCTTAGCTTCTTCATCGGCTGCATATAAATCTATATCTGATAGAGTTTGTGCGCCTCTTTCTTTTAGCTTTTCAATGATTATGTTAAATACCTTAACAGTTGTATCAACATCATCTAAAGCTCTATGTGCAACTTCAACCTTTATTCCAAGATTCTTAGCAATTCTTCCTAGCTTATAAGATTTATAATCAGGGAATACATCTTGCGCTAATCCTAAAGTATCTATATAGGTAAAATCAAACTCATAGCCTAAAACTTTCGCATTATGCTTTAAAAATCCAATATCAAAGTCGGCATTATGCGCAACTAAAACACTTCCTTCAATAAATTCAAGCAATTTAGGGAAAACTTTATCAATAGTTTCTGCATTTTTCACCATATCATCAGTTATCTTTGTAACCTCTACAACTCTCATAGGAATTGACTTTTGAGGGTTTACAAAAGTACTGAACTTATCTATAACCTTGCCATCCTTAATTTTCATTACTCCTATTTCAGTAATCTTTTCTGTCTGAGGAGAAAAACCTGTAGTTTCTAAATCAAGAACACAGTATACCGTATCAATACTTTCTTCCCTAACATTTGTTACAGATGGCTTTTTATCAGGTGCTAGGTAAGCTTCAACTCCATATATAACTTTCATATCTGGATTATCTCTTCCAAGCAATTTGTGCGCTTCTGGAAATGACTGAACTACTCCATGATCAGTTATAGCAATAGACTTCATTCCCCAGCTCATAGCTCTCTTAATTAAATCACTAGCACTAGACATGGCATCCATCTGGCTCAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP006777|3729937:3740965|3732323_3732566_-|WP_012059380.1|DBSCAN-SWA MKASGIVRKLDPLGRIVIPKEIRKVLGINDGDSMEIIKVDNEVVVRKYIKGCIFCGSDKGISKFRDALVCGECKKALGQE >NZ_CP006777|3729937:3740965|3729937_3731152_-|WP_012059378.1|DBSCAN-SWA MSKVLFLSIPAHGHINPTLGLVNELVKQGEEITYFCSEDFKEKIEKTGAKFKSYRVELSLFKRKHKTSNDMGPDKLLDYINETLKSSDKIIKDILNQIEGKKFDYIMYTAMFPFGSIIAQILKIPSVSSFAVFATPKELRSQHKELMNENLIKNHPVIETYKKVSRQLKEEFNVEMSHNIFDLFFNKGDINIAYTSKYFVAHPEYYDESFKFIGQPIYDRKENLDFPFEKLEGKKVVYISLGTVFNNTDSNLYDIFFKTFGNTDEVVVMAAYNIDLSKFDIPNNFIVRNYVPQSEVLKYTDVAITHAGMNSTSDLLYNNVPFVAIPIGADQPYMAKRAEELGATISLDKDNINPEILRESVEKVLTDSSYLENIRKISNSFKESGGYKKAVEEILKLKRDKINQ >NZ_CP006777|3729937:3740965|3736624_3740965_-|WP_012059384.1|DBSCAN-SWA MKRINEAFSDYESTGSINTAVIQSVVLRKKTKVLEMEISSDNYIELGEIESFNSFIKDKFGLNDSKIIVKYSDEVEIRPIEKELKNIVYSLSTKYPALKAAVNNSDYEIEGNTINFNFKIPVSGFLKTMEYDKQINKAIKHMYGKHYNINFIDQIDSEELVKIVEDKRANEMKVIKEIKINQSNNPPEVPKAEEGKPEVKAEGDGKKASNPFLILGRNANIKENIIKINDITPDEGRVALEGEISNLEAKELRSGKMLISFDLYDGSNSMTCKIFAKPNEYDEVFSRIKKAKGLRLAGNAGYSNFSHEVELIANTVIETNGIKKYKRQDNSEVKRVELHMHTQMSQMDAMSSASDLIKRAMSWGMKSIAITDHGVVQSFPEAHKLLGRDNPDMKVIYGVEAYLAPDKKPSVTNVREESIDTVYCVLDLETTGFSPQTEKITEIGVMKIKDGKVIDKFSTFVNPQKSIPMRVVEVTKITDDMVKNAETIDKVFPKLLEFIEGSVLVAHNADFDIGFLKHNAKVLGYEFDFTYIDTLGLAQDVFPDYKSYKLGRIAKNLGIKVEVAHRALDDVDTTVKVFNIIIEKLKERGAQTLSDIDLYAADEEAKKVAYKKVKTHHAIILAKNYVGLKNLYKLVSYSHLDYFYKKPRILKSMFKKYSEGLIIGSACSEGELYQAILLGKPEEQIEEIANFYDYLEIQPLGNNDYLVRQEQVPSKEYLKEINKKIVELAERLGKPVVATGDVHFLDPEDEIYRRILEAGQGFKDADNQAPLYLRTTEEMLDEFSYLGRTKAYEVVVTNTNIVADMCEQISPISPEKCPPHIEGCEQTIKDIAYEKAHELYGDPLPEIVQARLDKELDSIIKNGFSVMYIIAQKLVWKSNEDGYLVGSRGSVGSSFVANMTGITEVNALPPHYRCPKCKYSDFEDYGVLNGFDLPDKVCPVCGENLYKDGIDIPFETFLGFNGDKEPDIDLNFSGEYQAKAHRYTEVIFGKGTTFKAGTIGTIAEKTAFGYVKKYYEEKNITINKAETIRISVGCTGIKRTTGQHPGGIIVVPKGREIFEFCPVQHPADDPNSDIITTHFDYHSIDQNLLKLDILGHDDPTVIRMLQDITGVDPHEIPMDDKDTMSLFFSTKALGVTPNQINSEVGTFGIPEFGTKFVRGMLVDTKPKTFSDLLCISGLSHGTDVWLGNAKDLIDNGVITSISDAVCTRDDIMVYLIRKGLPPNTAFKIMETVRKGKALKEPKFPEYEAMMREHDVPEWYIESCKKIKYMFPKAHAAAYVMMAFRIAWFKVHIPQAYYATYFTIRAKAFDAEFMIFGKEKVKAKMQEIQALGNEAGPKDKDMYDDLEIVLEMYERGFKFLPIDLYKSSATKFQLEEDGIRPPLNSIAGMGNVAAEGIASAAKEKEFNSVDDVKKRSKIGNAAIELLRKFDCLNGLPESDQMSFFDAV >NZ_CP006777|3729937:3740965|3735495_3735879_+|WP_012059383.1|DBSCAN-SWA MNSIKDHILQLEQELLKSEVRKSADKINGMLSNDFIEFTSSGSEYHYKNGDVFQEQNNPQTLYGEISDFKIKELSDDCILAMYKIIKLNELNENKKYSLRSSIWKCFDGKWKMIFHQGTLSSNSEII >NZ_CP006777|3729937:3740965|3731545_3732298_-|WP_012059379.1|DBSCAN-SWA MESLRIFKDERFGEIRWLKINNKDYAVGIDIAKALGYKNPRDAILRHCKGVVKHDIGVVTGKRRDGTEVIQNIEMSVIPEGDIYRLAAKSELPGAEKFEAWIFDEVLPSIRKTGMYATDELLDNPDLLIAAATKLKEERKARLEAENKVKLLEPKGQFYDDVAGSKDSIEVGHVAKVLAIRGIGRNNLFSLLREKKVLDKNNIPYQQFVDLGYFRVLEQKYTVPSGETKINIKTMVFQKGIEFIRRKIGE >NZ_CP006777|3729937:3740965|3733264_3733978_-|WP_012059381.1|DBSCAN-SWA MSSEKKLKKASYKCDKCCDTGWVLIPQENRQPLAVSCECREIEKVKNEWKHSGINVEMTKHTFANYKVWNRASQRAKDTSAAYCTDFDEIRNSRRNSILLCGQVGSGKTHLSVAIGLNLLKQKIKVVYMPYRDVITNIKQNILDQEYYVKTISKYKLCEVLLIDDLFKGKINESDINIVFEIINYRYLNFLPIIVSSEFSIERLLNFDEAVGSRIYEMSKDYVVEIEKDIHNNFRLK >NZ_CP006777|3729937:3740965|3733940_3734927_-|WP_012059382.1|DBSCAN-SWA MSDIKWIKLSTNMHDDEKMKLVDAMPERDTIHYLWIRLLIQAGKTNANGLIYLNENIPYTDEMLSTIFSRPLASIRLALKVLSDFQMIEIAENNVIRIVNWERHQNVEGMDRVRDQNRKRVQNHREKKKQLEAVVNESEETNVEIEEHSCAESKEYSIEVTNDICDITKKSCNVTDDKSNVTVTVQNKRENKNKIKNENNKDREIKKEDDINSKSIELAKYCELIAGIANVLNLGALKLAIGMHGQEYVKMAIDIALKANKPNMTYIDGILKNWRREGYPDDKEVKKNVNKSYGNNSNPDKNKFAGFKPKEPRNLTDEQRKKAEKSLI |
7 | Plutella_xylostella_granulovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_10 |
3930438 : 3989488
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP006777|3930438:3989488|DBSCAN-SWA 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60 | Clostridium_phage(72.22%) | terminase,plate,transposase,tRNA,holin,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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