Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012512 | Piscirickettsia salmonis strain PM32597B1 plasmid pPSB1-4, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP012509 | Piscirickettsia salmonis strain PM32597B1 plasmid pPSB1-1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP012510 | Piscirickettsia salmonis strain PM32597B1 plasmid pPSB1-2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP012508 | Piscirickettsia salmonis strain PM32597B1 chromosome, complete genome | 2 crisprs | DEDDh,cas3,DinG,csa3 | 0 | 0 | 32 | 0 |
NZ_CP012511 | Piscirickettsia salmonis strain PM32597B1 plasmid pPSB1-3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 2 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
26126 : 37376
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012510|26126:37376|DBSCAN-SWA 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TACCGGATTAGAGGCGTTTTTATGGTATCACCCCGGAGAAAAACGTTATTTTCAAATCATTTGTTCTGAGTGGCAAGCCAATTTACAGCACAACTATTGGACGGTGATTTTACGTTTTGAGGAGGATTTTAACCCACTATGAGTTTAATCGAGTCCGCCAAGATTTATTTATTTACCCTTGATTTAACGCCCTTGCAATCATCAATTAAATATCACTTTTGTCATAGTCCCGATGGTAATCAAGCGGTGAGCTTTGGCGGGGTCGAGTATCAGCCGATTCCGTTAAAAACGGATGGGTTTGAACGCACAACGATCCATCAACCGACGCCCTCAATCGTATTAGGCAATGTAAAACCCTTATTACTGCCATTATTAAAAGCGCATGATAATCTGCGCGGTGCGTTAATTCGCCGCGTGATGACTTACGTTAAACACTTGGATGGCCATAGCGACCCCGACGCCAGTGCCACCTTGCCCGAGCAAGTCTATGTGATTGAACGTAAATCACAGCATAACAATCTAACGATTACCTTTGAATTGGGCAGTAAATTACCGAGTGATTTAAAACTACCCAGACGCACACAGCTCGCCTCATGTTCAAAAATATATCGCCAATGGGATGAAGAACAACAAGTGTGGATCGCCGGCAGCTGCCCTTATGCCGCAGCTCAGTATTACAACGAGTTTGGACAACAAACGACTGATAAAACAAAGGATCAATGTGGTAAAAAACTCGCAAATTGCATGGCGCGCTTCGGCAACGGACACGCTCTGCCCTTTGAAGGATTCGAGGGCATTAAACCTTTTTAAAGCCTATGCCCTAGAGCAATACCCCAAGGAAGCCGTCGGGCTGATTTTACCCGCAGATCATTTTATGCCCTGCCCTAATTTATCAACGACGCCAGAAGAGAATTTTTGCATTGATCCTACTCAACTCATTGATACCCCGAGCGGTACGCTACTGATACATTCCCATCCTGACGGCACGGTTGAACCCTCATTAGCGGATATGGTCGGTCAACGCGATACAGGGTTATTGTGGGGGATTGTTGCACTCAATCAACACGCAATCACGGATGTCATTGTTTTTGGTGAGCAGTTATTCACCCAGCAATTACTCGAACGACCGTTTTTGCATGGTATTTTTGATTGTTATTCGTTGATTCGTGATTTTTATGCCGTTGAAAAAAAGATTTTTTTGCCTGATTTTCCGCGTCAACGTTCGTGGTGGGAAATCGAAAAATATAATTTATATGAGCGGTATTTTACCGACGCCAGTTTTATCGAAGTGGATAAAGCCAGTCCATTGCACCGCGGTGATGTGTTATTGATGCGCGTTGGCCGCACCACCTGCATTAATCATGGCGCCATTTATTTAGGTGAAGATTGCCGACTCAAAGAAGATCGTAATGCTGTCAGCTTGCCCGGGATGATTTTACACCATGTCTGTGACAACTTAAGCCGCCGTGAAATGTTGAGCGAGTGGCAAAAACGCATTGCAAAGGTGGTTCGTTATGAAAACTAAAATTTACCTGCATGGACGTTTAGGCCGCATTTGCGGCTCTTTTTTTGAGCTTAAAATCAATCACGCTCGTGAGGCGATTTATGCTTTATCAACACAGTTGCCTGAGTTTAAAAAAATCATTCAATCCGGTGAGTGGGCAATTTTTCGAAAGCGCAAATCACTGAACTTAGAACAGTTAGAGTTAAATTGTGCCGGCGGTGAATTACATATTGTGCCTAAGCCGAAGGGGGCGAAGAATTCAGGGTTTGTCCAAGTTTTAATCGGTGCGGCTTTAATTACTGCCGGTTACTTTTCGGTCGGGACGGCATTGGCGCCGATTGCTGGAGGGCTCAGTGCCGCAGGTACAGGTCTTGTGATCAGTGGGGCGTTGACGATGCTCTCCCCTCAGCCGAGTTATGATAATGATTACAGTACCACCGACCCGAATGCCTCCACCTTATTTAGCGGTGTCGATAATGTTGCCGCGCCCGGAGCGCCGGTGCCCTTAGTTTATGGTGAGCACTTGGTGGGTAGTTCAGTGGTGTCGAGTCAGTATAAAACCTTATGAAAAAGACAATTCATGGCGCCGGTGGTGGTGGCGGTAAAGGTGGCGGTAGTACTCATACCCCCACCGAAGCCCCTAACACCCTCTCTACCAATGCCGTTGTAACTCTCGTCGATTTACTTGGCGAGGGTGAAATTGAGGGTTTAGTGAATGGCGCCCAGTCGGTGTATTTTGATGATACCCCGCTGCAAAATCCTGATGGTTCGTATAACTTTGAAGGAGTAACGCTTAAAAGCAATCACGGCACACCTTCACAAGATTATTTACCCGGTTTTGCTGAGTCAGCCAGTGAAGAAGCCTTTAATGTAAAAGTCACCCATGAACAGCCGGTGATTCGTACCGTTGGCCGCCAAGAGACCAATGAACTTCGCGTTAAAATCGGCTTGGATGCGCTCACCGAATATGCAACTAACGGCGACATTAACGGCTCTAGCGTGCATATTCGCCTGTATTTAAATAATGTACTGGTGGTGAATCATGAAATTACCGGCAAAACGACAAGTAAGCTTGAACAGACCTTTATTATTAAAGTCTCTCCTGGGTATTATATTGCAGACATCGAAACCTCTGATGTTGTTCTTGATAACCTTGATGAGTACTTTAGTTGGAAGCGCGCCGGTGCACATGCAATCACCAATAATTATTATAAACCCACCCACTTTGCCTATCCCTACACCTTAAAAGTTGAACGGGTCACTGAAGATACCGATTCGAGTCGGGTGCAAAATAGTATTTATTTAACCAGCATCACCGATGTCATTGATACAAAGCTTAGCTATCCCAACAGTGCGGTGGTGGGCTTGGAGTTTAGCGCCGCGCAATTTGGTAATCAATTGCCCAAACGCAGTTATTTAATCCGTGGCTTAAAAATTCAAATCCCGACTAATTACGACCCCAGTACACGAATTTATAGCGGAATTTGGGACGGCAGCTTTAAAACAGAATATTCGAATAATCCAGCCTGGGTATTTTATGACTTACTCATCAATGAGCGTTATGGTGCCGGTCATTATCTTGTAGATGCTGATGTAGACAAATGGGAACTCTATAGCATCGCCCAGTATTGTGATGAATTGGTGCCGGATGGGCGTGGCGGCAAGCAACCGCGGTTTTGCTGTAATTTAGCAATTAACAATCAAAACCAAGCGCTCAACATGATTACTCAGCTGACCTCGATTTTTCGGGGGATGGCTTATGATGCGGCGGGGACCATTCAATTTAGTCAAGACCGCCCACGCGAGCCGTCGATGCTGATTACTCAAACCGATGTAGTGAACGGCCAATTTGATTATCAGACGAGCAGCATTAAAGAATTGCATTCGGTCTGTGTGGTCGCCTTTAGAAATCCAGATTTAAACTATGCCATTGATCAAGAAGTCGTGGAGGATGCCAGCCGCTTAGCGCGCTTAGGTGAGCGCCGCTTGGAAATTACTGCGGTCGGTTGCACCTCCCGATCTCAAGCGATGCGCCAAGGGCTTTGGGCACTGCAATCGGAGGCACAGAGTGAGATGATAAGCTACAAAGCCACGCAAGACCACATTCATTCACTGCCGAGCGATATTGTTAAAATCTTTGATCCGGATATGGATCAAGAACAAGGGGTGGCCGGTGTCATTACCGCGGTGGCTGATCATGTGATTACTTTAGATCGTGAGGTCAGTTTATCCAGTCAAAACACTCTGATGATCTTTTCAACAGAGCAAGGGATTGAAGAATATACAGTGATTGGTGCGCCCGGGTCTAGAAGGCTGGAGGTAGACCGCACCATCATCGCTGATGTAGGCGCACGCTGGGTAGTATATCACTCTACACCACCGAAGCAATGGCGCATTACGGCCATTACGGAAGAAGACGACGGCACCTATACCGTCAATGCAATTGCCCATGACCCAGATAAATATCAAAAAATCGATGAAGAGCGAGCGCTAGGGGTCAGCAAAGAAAACACTCCAATTCCAAGCTTAAAAGCACCGAGTAATTACCGTGTTGAACAGAGCCTCAGCTATCACGGCGGCATGGTCGAAGCGGTTTTAATTGTTGCGTTTGATGGCGACCCGAATGCGGCCTATTACGAGTATCAAGTCCGCAGCAATGACGGGAATTATTCAGACGTTAAAACCACGCATTTAAATCACATTGAATTGAATAGCACAGGTGCAACATACACCTTTCGAGTGCGTGCGATGGGTTGGTTTGGGCAACGTAGCGGCTATTCAACATATCGCTGTAGCGCATCGCTGGAGCAGCAGATTCCTGACAATGTCAGCCGTTTTGTGTCCTCGTATAGCGATAAAATCGCCGTTTTAGAATGGGCTAAAAATCCAGAGTTGTATGTTAAACACTATGAAATCAGGCAGGGTACCGCCTGGGAAAACTCAATTCTCATTGCAGAACTTAATAGCACCACACTGCATCTAACTCATGCCAGACCTGGCTTTTATTTGATTAAAGCGGTGAGTCAGTGGGGGATTAAATCAGCTGAAGCGAGTGCGTTAGAGCTGACCGACTTAACCCCTTTAAACATTATTCAAGAATACGATTATGCCGCTAATGATTGGCCGGGCGAATTTCATCATACCGCTGTTAATAATAATAACCATATTCGCTTATTTTCATACTACTCTTGGGGCGGTATGACTCAATCCTGGGAGGATTACGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATTCATACAGATAAACTCTCTAGTTCTCCTTTTGACTTAGAGGGTAGAGATGATTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGCGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGACAAGCTTTTCAACAAATTTCAGAAGAGGAAAAAATGTTGATTCATCAGCGGTTAAGCACTCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAAGAACTTATACGTGAGCATAATATTCAGGTGAGTGAGAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCAGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCAGGCGTTGTTGCGTAACCTCTGGTCCCATATTCCAGGCACAATTCAGCTGCGTCTAAAACTATCCGGCATGCCGAGACTGGTCATCTTATTTAAAATACCCGCGCCAATTAGTCCTTCATTTTTCTGACGCGATATCTCTCTGGACTGCATCGTGTTGCCCAAAATGCGTTTGTAACGCTGAATCGCCAACTCAGAATAATTACGCTTGCCGTATTGTCGTGTCTTTTGCCAGTGCATTCTACCATGATCTTTAATCTCATTAAAATTTATGTTTCTAATCGCGTGGTTATTTTCATCAAATACGGCATTTTTAGGAGGAGGGATAACAACATCAGCATTAGGTGAGTGGTTTAAAACGGAATCGTAAACATCATGGCTATCGTAGGCTCCGTCTGCAGTGAAGCGATCAAACGGCTCATCAATTTGCTCCAGTAGCTCATCCACAACCTCCTCATCTGCTTCATAGCGATCGGTGATGAGTGCGGCTTGAATATAGTGATCATCATCAACGGCCACATGAAGTTTACGCCAGCTGCGCTTTGCTGATATCTTGTATTTTTCTTGGTGCCACTCGTCACGGCCAAAACGCTTAAGGCCTGTAGAATCAATGGCTATTCCCGCAATATCATCATCTGGCTTATCTGTTTTGCGATAGCGTGGGACCTTAATATCGAGCTCCGCTAACCTTTTTGATAACACCGTATAGTCAGGGCATTTGATCGGCAGTCCTTGGGATTCAAAGAAGGAATCAATTAGGCCCTGAGTCTGGCGTAATGGCTGTTTAAACACTTTACGAATTTCATGACAGGTGATGATCGCCAGGTCTGAGTATAGAAACGGCGTGCCTGTACCATCATAAACTCGGTCTTTTTTGTACCAACCTTCAATGGCTTTCTCTGAAATCCAAACATCAATACGGCCACGATTACGCAGGCTATCGGTGTACTTTGCCCAGTTTGTAACGCCATATTTTTGTTTAGGGATATCCCACCCTTTTCCTTTTGGATATTTATATGGCAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012510|26126:37376|32639_33197_+|WP_017375789.1|tail|DBSCAN-SWA MKTKIYLHGRLGRICGSFFELKINHAREAIYALSTQLPEFKKIIQSGEWAIFRKRKSLNLEQLELNCAGGELHIVPKPKGAKNSGFVQVLIGAALITAGYFSVGTALAPIAGGLSAAGTGLVISGALTMLSPQPSYDNDYSTTDPNASTLFSGVDNVAAPGAPVPLVYGEHLVGSSVVSSQYKTL >NZ_CP012510|26126:37376|30925_31267_+|WP_017375786.1|tail|DBSCAN-SWA MLNFPSLLPTKIDADKVKPRLRITPLGDGYMQREADGLNTLRHYFTVSFIGLSEIEKDSLINFVTERTGLEAFLWYHPGEKRYFQIICSEWQANLQHNYWTVILRFEEDFNPL >NZ_CP012510|26126:37376|28204_28528_+|WP_017375783.1|DBSCAN-SWA MALRNALFNLAFKTAPVTLGELELQVKELSIAEQQYYQQQHADLSETEASLLLICLSLCDLQGAKVFDVSEYKKLAELPLGIIKQITDAIVEVNGFNESAAHDLKKN >NZ_CP012510|26126:37376|31864_32650_+|WP_144420832.1|DBSCAN-SWA MAWRASATDTLCPLKDSRALNLFKAYALEQYPKEAVGLILPADHFMPCPNLSTTPEENFCIDPTQLIDTPSGTLLIHSHPDGTVEPSLADMVGQRDTGLLWGIVALNQHAITDVIVFGEQLFTQQLLERPFLHGIFDCYSLIRDFYAVEKKIFLPDFPRQRSWWEIEKYNLYERYFTDASFIEVDKASPLHRGDVLLMRVGRTTCINHGAIYLGEDCRLKEDRNAVSLPGMILHHVCDNLSRREMLSEWQKRIAKVVRYEN >NZ_CP012510|26126:37376|27038_27434_+|WP_017375780.1|DBSCAN-SWA MPKMSFSVEGLRELEKQLKQLAPKKIRNLNRRALRKAAEPVETQMKANAPQKSGALVESIKRRSKKGKGRRTVVNVTVGPARKIQYAIEQEYGSSHQPARPFIRPALNDNAQKSIDIFKNALTLALKKQKL >NZ_CP012510|26126:37376|36398_37376_-|WP_036771347.1|transposase|DBSCAN-SWA MPYKYPKGKGWDIPKQKYGVTNWAKYTDSLRNRGRIDVWISEKAIEGWYKKDRVYDGTGTPFLYSDLAIITCHEIRKVFKQPLRQTQGLIDSFFESQGLPIKCPDYTVLSKRLAELDIKVPRYRKTDKPDDDIAGIAIDSTGLKRFGRDEWHQEKYKISAKRSWRKLHVAVDDDHYIQAALITDRYEADEEVVDELLEQIDEPFDRFTADGAYDSHDVYDSVLNHSPNADVVIPPPKNAVFDENNHAIRNINFNEIKDHGRMHWQKTRQYGKRNYSELAIQRYKRILGNTMQSREISRQKNEGLIGAGILNKMTSLGMPDSFRRS >NZ_CP012510|26126:37376|27430_27781_+|WP_017375781.1|DBSCAN-SWA MIEDIYFALLGTGWPVFPMVLPKNQILPAVTYQVIGGDRRYSLDAQAHLQKKTIQISCIAKTYQECKLMQDNITEQLNGYHNENIQLITFESELDQYEQDTKTYRTNLTFHLTGVV >NZ_CP012510|26126:37376|26126_26438_+|WP_017375778.1|head,tail|DBSCAN-SWA MIDLTRLKSHLRIEDHSEDDYLEFILAAALQAAEDYLDRVIVNNTDDLEAIENSVLINKSIEIAILMSAGHFYENRESTSTLTVKEVPMSTHFLLNPHRYLSV >NZ_CP012510|26126:37376|28854_30933_+|WP_036771950.1|tail|DBSCAN-SWA MATIGSLVVNLSANSAELVKSLSKAELASKNFSKKVQRNLKKTTLAFAAVSTAATGAVAVMISKSSDSIDLLAKTSDKLGVTTEALASLRHAAELTGVSQTKLDMGLQRMTRRLSEAAAGTGEARKALVELGLDAEHLNQLSPDAAFKEVARAMENVEGQSDKVRLAFKLFDSEGVSLVNTLALGAEGLDQAAGEAARLGIAINRIDAAKVEAANDAAYKMRQLFVGVSHQLAITFAPIIEDLTTRFTNAGTAASSFSSNVLSGFCVVAKSFAIVGDGVHYINIGLDIISAGFAVMKNMAIQSLTAIAKGLSWLYQKMGEGINFVLSQYQKIADAGATLPIVGNKFERLGQSIARMKASVSERFTLDTSGLKIAEESANNVNQKLAQLYQTLFSKRPTESVDAYFDDIAKKAAALDEKIRTSQPEKSALMGASLHVQDNQKQLDSLKERLLSEEEAIQHSYDKQKRIILDATREGSEERAKLLEKIEVQKNTKLKNLAQKQAKELNGIGHQAKELAGNMEGSFSNAFAGVVKGTATVSDAFSSMLNDMAAEALSMASKGIFKSILGGVISSVGGSSFASWFGGGSTAAGAKASGGTVAAGQLYRVNEQGAEIFSSGGKDYLMTGKKSGFVTPNHQLGQTVISNQVQNNITIAPTINASGADGEQVSADVVTTIKHIVNDQIFKLKKQKLLNA >NZ_CP012510|26126:37376|28584_28851_+|WP_017375784.1|DBSCAN-SWA MNQLSQELSLSEFNEWLAYYALEPFGVEKDDHRTALLVSAVVNGPLQRKDKTLFTPDDFMPNYSAGDEKKAQSATDMAAILSAIAKRK >NZ_CP012510|26126:37376|35942_36371_+|WP_017375652.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGVVA >NZ_CP012510|26126:37376|33193_35884_+|WP_027242568.1|DBSCAN-SWA MKKTIHGAGGGGGKGGGSTHTPTEAPNTLSTNAVVTLVDLLGEGEIEGLVNGAQSVYFDDTPLQNPDGSYNFEGVTLKSNHGTPSQDYLPGFAESASEEAFNVKVTHEQPVIRTVGRQETNELRVKIGLDALTEYATNGDINGSSVHIRLYLNNVLVVNHEITGKTTSKLEQTFIIKVSPGYYIADIETSDVVLDNLDEYFSWKRAGAHAITNNYYKPTHFAYPYTLKVERVTEDTDSSRVQNSIYLTSITDVIDTKLSYPNSAVVGLEFSAAQFGNQLPKRSYLIRGLKIQIPTNYDPSTRIYSGIWDGSFKTEYSNNPAWVFYDLLINERYGAGHYLVDADVDKWELYSIAQYCDELVPDGRGGKQPRFCCNLAINNQNQALNMITQLTSIFRGMAYDAAGTIQFSQDRPREPSMLITQTDVVNGQFDYQTSSIKELHSVCVVAFRNPDLNYAIDQEVVEDASRLARLGERRLEITAVGCTSRSQAMRQGLWALQSEAQSEMISYKATQDHIHSLPSDIVKIFDPDMDQEQGVAGVITAVADHVITLDREVSLSSQNTLMIFSTEQGIEEYTVIGAPGSRRLEVDRTIIADVGARWVVYHSTPPKQWRITAITEEDDGTYTVNAIAHDPDKYQKIDEERALGVSKENTPIPSLKAPSNYRVEQSLSYHGGMVEAVLIVAFDGDPNAAYYEYQVRSNDGNYSDVKTTHLNHIELNSTGATYTFRVRAMGWFGQRSGYSTYRCSASLEQQIPDNVSRFVSSYSDKIAVLEWAKNPELYVKHYEIRQGTAWENSILIAELNSTTLHLTHARPGFYLIKAVSQWGIKSAEASALELTDLTPLNIIQEYDYAANDWPGEFHHTAVNNNNHIRLFSYYSWGGMTQSWEDYALRHLKCNTQ >NZ_CP012510|26126:37376|31263_31935_+|WP_017375787.1|tail|DBSCAN-SWA MSLIESAKIYLFTLDLTPLQSSIKYHFCHSPDGNQAVSFGGVEYQPIPLKTDGFERTTIHQPTPSIVLGNVKPLLLPLLKAHDNLRGALIRRVMTYVKHLDGHSDPDASATLPEQVYVIERKSQHNNLTITFELGSKLPSDLKLPRRTQLASCSKIYRQWDEEQQVWIAGSCPYAAAQYYNEFGQQTTDKTKDQCGKKLANCMARFGNGHALPFEGFEGIKPF >NZ_CP012510|26126:37376|27780_28203_+|WP_017375782.1|DBSCAN-SWA MSESIGALSEIYRDSDNGGNYVKLANITNIGEISSSRDKVDVTEYGSTQKKYKLGLKDHDEIQLDMNVAQDNSELKNLISDHDAGVERQFKIILATQPKRQIYEFTALITNHKIIAPLTEAISMSVSLQPTSVIVQSDEV |
14 | Moraxella_phage(25.0%) | tail,transposase,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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DBSCAN-SWA_1 |
0 : 130296
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012511|0:130296|DBSCAN-SWA
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120 | Streptococcus_phage(44.23%) | integrase,transposase,portal | attL 18329:18388|attR 70723:71237 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
166313 : 171244
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP012511|166313:171244|DBSCAN-SWA ATTGCCTAGACGTGCGAAACAGATTTGCTGTTATGCCGGATGTCATAACACAACCTATGCACGCTACTGCGAATACCACGAACAACACGGCAATCGATACCATGCCCCACGTAAGACAACAGCCCAGCGTGGCTATGGGGGGCGGTGGCAACGTGAACGTAAGATATTTTTACAAGATCATCCACTGTGCAAGCAGTGCTTACAAGATGACAAATTAATCCCAGTGACTGAAGTGGATCACATTAAACCGCATGATGGTGATCATGATTTAATGTGGAACCAACGCAATTGGCAAGCGCTGTGTAAGCCCTGTCACTCACGTAAAACAGTGAATGATGATGGTGGCTTCGGTCGTAAAAGATCACCCCAGGGGAGGGGTATATAAAATGTCTATGACCTTTATTTCCTGACCACCCGCCTAGTCGAATTTTTACGCATGCGAAATTAGAACTAAAAACTTGGAGGTTTTTGATGTCGAGAATGAGAGGTCAAGGCAGAAAGCCAAAACCAACAAAAATTAAGAAAATTACAGGGAATCCTGGATGTAGAAAACTAAATGAGCATGAGCCAAAACCACAGGATGGGGTTGCCATTTGTCCAGGTTATTTTGATGAAATAGCAAAAGGAGCCTTTGATTCAGCCGTCTCTGATCTTGAATATATGCACATCAAAACAGCCTCTTTTCAAAAACAACTAGAAATTTATGCGAGTGCTTATTCTGACTGGCGGCAGCTATCCGCTGTCATAGAACAAAAGGGCCGTACGTTTGAAACGACGACGCAAGCCGGGGATACCATGTACCGCAGCCGCCCCGAAGTGGCTCAACGCAATGAAGCCTGGAAACAAGTCAAAGCCTCATTAAGTGAGCTTGGATTAACACCAACCGCGATTAGTCGGCTCAATGCTCAAGTATCTAGTGCTATTGAGTCAGAGATAGATAAAATTTTGGATTAACTATGATTAAAAGCGACCCGGTAAAAACCGCCCTCACCTACTGCGATAATGTACTAAGCGGCCGCGTCATTGCCTGTGATTATGTAAAAAAAGCCTGTCAGCGTCATTTAAACGATTTAAAGTATGCTGGTGATCCCGGTTTTTACTTTGATAAAGAAGCGGCCTGTAAAGTCGTTAGATTTTTTAGTTACTGCAAACACAGCAAAGGTGAGTGGTATGGGAAGAAAATTACTTTAGAGCCTTGGCAACTATTTATTATTACTACCGTGTTTGGTTGGAGGCGTGAAGTTGATGGTATGCGGCGTTTTCGTACCGTTTATGAGGAAGTCGCACGTAAAAATGGCAAGAGTACGAAATTATCAGGCACTGGCTTGTATTTATTTTGTGCTGATGAAGAGCCGGGTGCAGAAGTCTATGCCGCGGCAACCAAACGCGATCAAGCAAAAATCGTTTTTGATGATGCGGTCAAAATGGTTAGAGCCTCTAAAGCCTTAGCTTCTCGCATCGGTATTTATAAAAATAATATGCATTATCCCAAGGATTTACCGAATAATAAGTTTGAACCGTTATCGAGCGATAGCCAGACACAAGATGGCTTAAATGTGCATAGTAGTATTGTAGATGAGTTGCATGCCCATAAAACCGGCGATTTGTGGCGGGTATTAGAGACGGGCACCGGCTCCAGGCGTCAACCGTTGCTGTATGCGATTACAACCGCCGGCTTTGATCAGACGGGGATTTGTTATAGTTTGCGTGATTATGCGGTTAAAGTGCTGGAAAATATCATTGAAGATGATACCTTTTTCGGCATTATTTACACCCTCGATAAAGAGGACGATTGGACAGACGAGCGTGTTTGGATCAAAGCCAATCCAAATTTAGGCATTAGTAAAAAGCTTGATGACATGCAACGCCAGTGCGTAAAAGCTCAACAAATGAAGGGTGAACGCAATGGCTTTTTATGTAAGCATTTAAATATCTGGACGAATGCCGAAACCGCTTGGTTAGATTTAGAACGCTGGAAAACTTGCGCTGAATATACCTTTAAACGTGAATCACTGGAAAATCGGCCCTGTTATATAGGTCTGGACTTAGCCAGTACCAACGATATCGCCGCCTTAGTTGCGGCTTTTTTAATGCCAGATGATTCAGTACGTTTATTTTGTCGCTTTTACTTACCTAAAGAAACCGTAATGACTCGAGCCAAGCAATCCCCCGTGCCCTATCAGCTATGGTCAGATGAGGGCTATTTAACCCTCACTGAGGGTAATGTGATCGATTACAACCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACATATATCAAAGACGATATTTACCAGCTCAATAAAGAATTTGATGTGAAAGAGATTACTTATGACCCGTGGAATGCCACCCAGCTGGCCAATGATTTACTCGAAGAAGGCGCGAATATGGTGGAGTTTCGCCAAGATTTTAAGTCCATGACCCCAGCATTAAAAGAACTTGAGCGCTTGGTAATTTCAACAAAGCTCCATCATAACAATAACCCCGTGTTGAACTGGATGGCCTCGAATTTAGTCGTTGTTGAAGATGATGCGGGGAATATGAAACCTTCTAAGCGTAAATCCACAGAGAAGATTGACGGTATGGTGGCCATTGCGATGGCCGTCGGGCGTTTAATTGCTGGGGAAGATCATAATTCGATTTATAACGAGAGAGAACTGCTCATTTTATGAAGTTATTTAAACGCTGGTTTGGTGCGGCAACGGAGCTTGAGCCAAGTAGCGAATATGGTGGTTATGAGCTTTTAGATACTGCGCCCATGAGTGCCAGCGGTCAAAGCATCCACCCCGATAATGCCATGCGCTTAGCAACGGTTTATGCCTGCATTCGTGTATTAGCCGAATCGATTGCGGCTTTGCCTTTGCATGTGTATCGCTATGAAACAGATGGTGGTAAAGCCTTGGCTACAGATCACCCGTTATATTCTGTCTTGCATGATCTGCCGAATGGTGAAGTGACTAGTTTTGATTTACGTGAAAACCTCGTCGGCCATTTATGTTTACGTGGTAATGCCTATTGTCAGATTATTCGCGATGGTGCAGGGCGGGTACGTGAATTAATCCAACTGCCCACTGATAACACCAGCGTCCGCCGTGATGAAAAAACTAAAAAGCTCATTTATAGGCACTGTTGCGAAAAGTTATAGGGAGCTTCAGAAAGGTTATTTTCTTGTGTTCGCGGCCTTAGAATGAAGCCGCCAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGGTTTTGGGCACAGATATCCTGTTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAACCATGCGCATCGCTTCCATCACATCAATGGTAGATCGGGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGGAAACGGGATTTGCGCTTTACTGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAATTGTTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACATCGCCTAGAAAAGACACCTTCATCTTTGGCTTTTTGATGAGCCGGTGGAAATGAAGCATGTTTATCGACATTCACAATACGTGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCGATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCATCGCCGCTTTGGCATTTTGATGTCGACTGAGCATCCAGTCCAAAGTATTGCCATATTTATCAATGGCTCGATAAAGGTAATACCAGCGCCCTTTAATTTTCACCAACGTTTCATCTAACCGCCAAGAGGCACACGTTTGACGAAAGTGGGGCCTCAGCCGTTTGGCGATCTGCGAGCCATACTCGTGCACCCAACGACAAATGGTTGAACGCTCAATCTCAAGACCTCTTTCAGCTGCTATTTCTTTGAGATCACGGTAAGATAAGGCATAGCGGCCATACCAACGCACCAGCCAAAGAATGATCTCACCGGAATAATGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATCGTTTACGTTTTACCACAGCAATTCACTCTTAACTTCCGTTGATTGCTACACCCTACTCAAATCTAAATTTTTTGCAACAGTGCCGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTCTTTAACCGCTGATGAATTAACATTTTTGCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCCTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAATCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP012511|166313:171244|169749_170484_-|WP_036771649.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRHQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRIVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSRRCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARSTIDVMEAMRMVQKGQLRYIKKQDICAQNQLIDKLFGLAASF >NZ_CP012511|166313:171244|169325_169712_+|WP_087910668.1|portal|DBSCAN-SWA MSASGQSIHPDNAMRLATVYACIRVLAESIAALPLHVYRYETDGGKALATDHPLYSVLHDLPNGEVTSFDLRENLVGHLCLRGNAYCQIIRDGAGRVRELIQLPTDNTSVRRDEKTKKLIYRHCCEKL >NZ_CP012511|166313:171244|168882_169239_+|WP_157894751.1|DBSCAN-SWA MKEITYDPWNATQLANDLLEEGANMVEFRQDFKSMTPALKELERLVISTKLHHNNNPVLNWMASNLVVVEDDAGNMKPSKRKSTEKIDGMVAIAMAVGRLIAGEDHNSIYNERELLIL >NZ_CP012511|166313:171244|167268_168600_+|WP_048876205.1|terminase|DBSCAN-SWA MIKSDPVKTALTYCDNVLSGRVIACDYVKKACQRHLNDLKYAGDPGFYFDKEAACKVVRFFSYCKHSKGEWYGKKITLEPWQLFIITTVFGWRREVDGMRRFRTVYEEVARKNGKSTKLSGTGLYLFCADEEPGAEVYAAATKRDQAKIVFDDAVKMVRASKALASRIGIYKNNMHYPKDLPNNKFEPLSSDSQTQDGLNVHSSIVDELHAHKTGDLWRVLETGTGSRRQPLLYAITTAGFDQTGICYSLRDYAVKVLENIIEDDTFFGIIYTLDKEDDWTDERVWIKANPNLGISKKLDDMQRQCVKAQQMKGERNGFLCKHLNIWTNAETAWLDLERWKTCAEYTFKRESLENRPCYIGLDLASTNDIAALVAAFLMPDDSVRLFCRFYLPKETVMTRAKQSPVPYQLWSDEGYLTLTEGNVIDYNRCEPWSAKHGVSRPR >NZ_CP012511|166313:171244|166783_167266_+|WP_075278733.1|terminase|DBSCAN-SWA MSRMRGQGRKPKPTKIKKITGNPGCRKLNEHEPKPQDGVAICPGYFDEIAKGAFDSAVSDLEYMHIKTASFQKQLEIYASAYSDWRQLSAVIEQKGRTFETTTQAGDTMYRSRPEVAQRNEAWKQVKASLSELGLTPTAISRLNAQVSSAIESEIDKILD >NZ_CP012511|166313:171244|170530_171244_-|WP_048876202.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRAKAKQGQAFQQISEEAKMLIHQRLKTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTALLQKI >NZ_CP012511|166313:171244|166313_166697_+|WP_027242929.1|DBSCAN-SWA MPRRAKQICCYAGCHNTTYARYCEYHEQHGNRYHAPRKTTAQRGYGGRWQRERKIFLQDHPLCKQCLQDDKLIPVTEVDHIKPHDGDHDLMWNQRNWQALCKPCHSRKTVNDDGGFGRKRSPQGRGI |
7 | Streptococcus_phage(42.86%) | portal,transposase,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012508_1 | 1098271-1098366 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012508_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP012508_1
>1.1|1098295|48|NZ_CP012508|CRISPRCasFinder ATTGGGATTGAAAACCACCTACAGTACCAAAAATTTCTTCTTCTTGTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012508_1
The CRISPR arrays of NZ_CP012508_1 >merge|NZ_CP012508|1|1098271-1098366|CRISPRCasFinder CAGAGTGTCCTGAAGCCCCTTGAGATTGGGATTGAAAACCACCTACAGTACCAAAAATTTCTTCTTCTTGTCCAGAGTGCCCTGAAGCCCCTTGAG >NZ_CP012508|1|1|1098271-1098366|CRISPRCasFinder CAGAGTGTCCTGAAGCCCCTTGAG ATTGGGATTGAAAACCACCTACAGTACCAAAAATTTCTTCTTCTTGTC CAGAGTGCCCTGAAGCCCCTTGAG
>NZ_CP012508.1|WP_017378009.1|1095865_1097611_-|hypothetical-protein MPITKQTKATTIQISIRALLSSTMEPCGQTIISSIDSSHQEIIRWLEFVKELPQIKESGGGVSFILESNTPLPEGFQQDLKDQCERLIANSKIFFNISSIAAKHHAAEKNSIEISEEIYEEIDSKHYATSPRQSVTEHSLSNHTDDDKDSSTHAHPIANTTQNNDFPPPPPNAADSSATASNLPFEQIQTQPASETVKNLGGSITYDQLLNLLKQEIQKAVAIIDKKIKNAKLPFSISTPFEDTKGRKKSILVLEEFIKDILTYPDQGNPDQPLTQELGMLVHTRLKDFYEDDGKMKGRRKTKTISMLFSEIKLMFQNITYANTAVSDDNGSPFPPPPPPLLEQDLLSLELTQFNDSELPLPPPPPPSPILLEDQQQLELNAAQPDLSADSHKAHMAVLGAKLRERQLSLGNETQSNSNSQPAPPPLPPKPVFSVGDLAPPNSGNTKPPLPPKPPLVVDDLTSSESTHAQCASDLTADKTVTFLEEIQQRKQQGLRSIKHSHPLQGPAPLDLNAQILKRRQNMQQTGTSDGKPINLAAALLFQCSQMNTQHSQSNNSNATNDNNDNWSDDWSDSASSPPSP >NZ_CP012508.1|WP_144420648.1|1093990_1095463_-|hypothetical-protein MPTTMIKVIKENEGAIVTKGQETILLTGSIYDGSNLGKSPAIIALSELGSGLFCAKATLQSENSCLSWLQELKETLGNEITFHLTGKQSKEDLAELQILCQQAEIEAQFPIPEKQPLLYSLATGVNANGIIEKEDLYEKTGGFSFSLTLTKEIEQAISELEKKIKDSWFTINTKGRTDSIILLKELKQNLEQLGESYIGPVNSESDLKFPKSLKEAIKDYSGSEAKNGRQQTTTVGGLLKTLDFHFTRYTVLTTKFTQVPVLTATWHTSEPSADTDSASATPMPDINESKSTPPPPPPAELKAGAKARREEEAAVTVLTNAMEFADDNAEDLPPPPPPSNPDLQQPLPDFNDSDFPPPPPPPPPSDEEQMPLADFDDIELPPPPPMDFETGPETQVSPIEEVNSGATPTDGTGPDTTEKKDSANITAEMQSIMARRGAIGGPDSETEAGEDDSWSDQEDNSGPNQSPSTLFQRQQSQSQEADNSNPLQYN >NZ_CP012508.1|WP_053093668.1|1093208_1093808_-|hypothetical-protein MRIITKPTTAKCNIQAYIRYLLSEPVRTSCTGLSDVLLNISHDSVNRFLLRENYRPEDLWTEVSEKIDLNNGVLSVDDMVIDKPYSNAEKTDLIGFFYSGKHHCVVKGVNVITLYYTDQHDVSVPINFRIIDPDEGKTKNEHFREMLQQVLSWGLQPSWVTRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP012508.1|WP_144420647.1|1092873_1093071_+|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVSEDIIRLFSIANSMPRLYFLINFRFSMLEYQQSPAASHGVLSTG >NZ_CP012508.1|WP_155046604.1|1092532_1092673_-|hypothetical-protein MLSTPWLAAGAVAVRFKQSIVGMKVVYKSNGTTLRARSEQKRTLAQ >NZ_CP012508.1|WP_048875964.1|1091685_1092465_-|hypothetical-protein MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFKSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSHVSVATSVGILHIQ >NZ_CP012508.1|WP_017376708.1|1090719_1091121_-|transposase MGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKERKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP012508.1|WP_017375625.1|1090197_1090425_-|hypothetical-protein MSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP >NZ_CP012508.1|WP_017376710.1|1090022_1090193_-|hypothetical-protein MPLGFRVVCQAAINYRKYRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP012508.1|WP_027242834.1|1088430_1089738_+|hypothetical-protein MKFIYPGINAPLDTEKSLYAETTQGYFSHKESGKALDFNFIKKQESYFSQWDKRTAFTCEEYKALTHQQRLQLYRLHTTRWNYTLSLLLKDPGAGPDSPLYAEKQFLQNLNENEEMRKLYAGWFIDYVESREGETSKAVEALFKKEMQLKPECDLSKEKQIAVKVRGFRDEITELQAWLMNGSSAERIAIEKYDTKAVNQFIKYQLGQVSKSEFNKTFERAQSKCNKVLKNALHLTTSAASILTEKKIDLNSSVEWERLKNSQHLQKAVLILHKSNINLADSWDTLKDNSHLQKAVLTLHHESSINLTEHWDKVKNNSPLQKALAASYDYLNAERSSWSKMHHNHGIRQTHKFIRHLMASENQTLSGIQAEMQQWLHGYGHFSRASGSASNSRMSFALQSGLCPQADTPPTLLFNTSLQATEVEQEVTNQVTLSS >NZ_CP012508.1|WP_017378007.1|1099424_1101368_-|CHASE-domain-containing-protein MKNNIYLNKLPSFLILITGITISLFLFYSLNKSHNLEASSHFEELATDTQQAIQNNINKNIAALNILKSFYESSDFINFNEFTTFTNSLLERDLAIQALEWIPNIPHSKRHDYVKKANQFFKNFNIKEKTAQGKMLIAKTKTNYFPVYYVNPVRGNEKAIGFDISSSPMRNKSLEKAALTGRNVATHKITLIQEEKGNSYGFLLFNPVYHSSSPQDISPKSLKGFVLGVYRINDILGHALNFSAKNNLIIFVKERINNNTLSPIFQNNGKQEINSHLSYQSTFTVADKKWPITIYPSHDFIKEHKNHLPMIILFAGVIISLILAAYLWLLVNREVRVKNLVEERTEQLNELNSKLTVLNEELDQKVMERTQKLKENQEQLIQSEKLASIGQLAAGVAHEINNPIGYIMNNIEIMGEYLDSIKAITQQAEACSKTLTSNDIQIKNDQLQQLKNTLEQEDINYVIDDTEKIIQQSLEGAEKVKNIVLSLKSFAHSDTDNKEEFDLNHCIEQALTITQNELKYKCKIIKNLSPLNPLLGYSSQIGQVIMNLLINAAHAIKESGTITITTQQIAGFNKLTIEDDGYGIHKDHLAKLFDPFFTTKSVGEGTGLGLSISYGIIKKHQGSINVESTVGQGTVFTIQLPNHSHHS >NZ_CP012508.1|WP_048875961.1|1101513_1102917_-|IS4-family-transposase MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFKSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSQRKYDFRKGRKLGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKEIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP >NZ_CP012508.1|WP_017378006.1|1103036_1103666_-|response-regulator MPSLLLVDDEPHIIDALKRLFRREKYTLHCAYSAKEGLDILAQQHIDIILSDQRMPSMLGSEFLAKAQAQSPQTLRIILSGYADTKEIINGILNNHIHQFLEKPWRANELREHLRHLINLMDKNQYTQKNQSDNHYTRTAALSFNKNGAIKSINLYFCALLGQKPEHILSAPLTSVINYNQKQLKEILSYVNNHGHWQGKVTLANSTQD >NZ_CP012508.1|WP_017378005.1|1103904_1104624_-|sulfate-transporter-CysZ MSGFHYFLNGLNFILTPKMRRYLYLPILLNIILLLVLSYLGVHGIEVITNHVSTSLPHGLHFLRPIATIILSLALITLLVFSFTTLASIIGAPFYSLLCEAVLQKKDHQLPQDNITALIKDMPRLIGRELIKLRYFIIRVMILMILLFIPGINLIVSLLWFIFNCWMQAIQYIDYPMDVLKHPFKQTLKATRQTPLTAMSFGLVCFVCTLIPLLNLIAIPAAVAGGTLLWSERIQPLLK >NZ_CP012508.1|WP_017378004.1|1104737_1108277_+|chromosome-segregation-protein-SMC MRLKKIKLAGFKSFVDPMTVELPSQLAAIVGPNGCGKSNIIDAVRWVMGESSAKNLRGESITDVIFSGSSARKPVSQATIELIFDNSQGKLVGPYVSYSEISIKRIVNREAQSSYFLNGTKCRKRDIADVFLGTGLGPRSYSIIEQGMISRVIEAKPEELRVHLEEAAGISKYKERRKETERRIRHTRENLERLGDIREELGKQLSRLHQQAQAAEKYQNFKKEEREVKGQLYIQRWKSLQTQHGQEQKKIQEHEVIVEKQRAGQQHIDASLEKERLALSEASEKLHACQADYYQAGNEVSRLEQQIEHATTRIRETGQEMARLNTSLEKARSELAADEQQKVLLSAQEEALEPETELLQNAVDEAALSAEEAEVSYRQLEKERESLLQQVALCRQEAEVEQTRIRHMEEQGQRLQQRLERLRAETHNSDLISLEVGLEDVQGQQRELEEKEQELQLGAEEQQQRLIQQRQLIEQQRKGLEQQRGELHPLKGRLASLEALQQAALFDVNADSASSVKTWLETQGLIASKQLAQSLRVQEGWETAVETVLGDNLQALYTPGYQVNACVAELEMSLICIDQPLALNVNTQVAQGHENQAGILKLTDVIEPGESLPSQLQHVYLAEDLLAALRIRSELKSYESVVTVDGLWLGVNWLKVTKRDDSQSGVIAREKELMTLRQQELALEESICLHEEQLSQSQEVLMQVEAQVKSVQQQAQALQRELAEVKARVSGRLAHIEQVRARLAVVEHELSEALELFNEEQEEIKIARQRLEIAVEKMAELELQRQALESGRVEASRTTQEARQQLESLKSQYQQKQMQLQRVQSEQAGIKAALQRLEELLGRDKVRLVELEQSRIGLEEPLEEQRMLLDEQLERQLSFEDRLKTVKDQAQAHENQVRTFEKQLHEQMNQVAHAREALEQGRMQAQELFIRRQSVEEQLVEAGFQLRGLLEIYQEGCDVKELETALEDIGRRIQRLGVINLAAIDEYAGQSERKVYLDAQHDDLTEALDMLEAAIRKIDKETRTRFKETFDEVNGHFKLLFPKLFGGGSATLELIGEDLLEAGVALMAHPPGKRNSTIHLLSGGEKALTAAALVFAIFQLNPAPFCMLDEVDAPLDDANVGRFCRLVEEMSESVQFIFISHNKIAMEMADQLVGVTMREPGVSRLVAVDIEKALEMAEE >NZ_CP012508.1|WP_017378003.1|1108343_1109174_+|hypothetical-protein METFLKVLVLLVGILLVWVFIWEGLRRLKVWRIRKWGVKRPLQMRSGDPLAEDDIVDDVTDRQNTEDNQQNQSQHDRQADTVSARAPEPNHIILNIYIESKSTGFLAYALFSLLKRSGLIFNDELQVFEAKNEQGEVDFYITSAVAPGVFDIKNAMVSIPAVSVFARPDLQTNPRMSFFKLLESTHTIASELDGRVLNMRREILSEASVSADYLSVVNTYAVAESTAAALSASNSTSIVVDESMQDDNHVYQENESHVIADTRVDADSNKDQHVAG >NZ_CP012508.1|WP_027243144.1|1109190_1111200_+|NAD-dependent-DNA-ligase-LigA MSDARVDELVKQLNLYSEAYYSEDDPLVPDSEYDRLFNELQQLEADYPELKQVDSPTLRVGGTILAEFTEVQHQSPMLSLSNGFNDQDIYDFIKRLKVDEDACFFCEPKLDGLAISLHYQRGRLVLAATRGDGTTGEDVTENVKTIRSIPLRLHSNNPPEFLEVRGEVFMMKSGFNKLNDQLRETNQKTFANPRNAAAGSLRQLNSKVAASRPLSFYAYSLTHMVGIELAQSHHERLALLASWGIPVNGDARCAAGTKGCLVFYQSILKVRDQLNYDIDGVVYKLDDIAAQEKLGFTARAPRWALAHKLPAEEEITIVKAIEFQVGRTGALTPVARLEPVHVGGVVVSNATLHNMDEVERKDVRIGDSVIVRRAGDVIPEIVKTIIENDTQSKAHAARPKLVMPDKCPVCDSAVERLAGEAVSRCMGGWRCKAQRKEALKHFISRKALNVDGLGEKLIEQLVDLELVQDAADLYQLTLEQLAGLERMAEKSANNVLEALEKSKVTTFGRLLYALGIRNVGQATAQVLAQRFGNLAALLAANTEELHAVDDVGPVTSQFILQFFSQQENQQLIERLQALGVCWPEQDKPLLAVRALQGEVIVLTGTLHGFSRDEVKEKLEQLGAKVTSSVSKKTTLLIAGENAGSKLDKAQALGVPVKNENDLKVLLGSN >NZ_CP012508.1|WP_027243145.1|1111215_1112271_+|protease-SohB MITQLLADYGLFLIKTATLVAAILIVFSGLLALAMKNRLAKQKGSLEVEKLNDHYDDLKETIEIEVLDKKELKALEKERRKEEKQERKDKKKNKSKETETDDEDAASAARIFVLDFDGDIEASAVHALREEVDALLTFINEKDEVVVRLESPGGMVSPYGLAASQLARFRSKGVKLTIAVDQVAASGGYLMACVADRVIAAPFAVLGSIGVVFQMPNFHRVLKKHDVEYEQLTAGDYKRTLTMFGKNTKEGREKLQEELEDIHYLFKNFVGEYRPQLDIDKVATGEHWFGQRALELNLVDELITSDDYLLSRADEHDIYSVNYMEKQTLADRLGIMARALLGKLATAGVKR >NZ_CP012508.1|WP_017377998.1|1112281_1112812_+|7-cyano-7-deazaguanine-synthase MQRKAIVLLSGGGYSSLCLYLARSQGYLPYALSLDIPKRHFQLDSAQQFARDVGVAEHQVIAMNENSLSDSKALTYYSSLLSFAVNWAQELSAQDIFIGLHPSAEHTLEYMVEWLQSYQELINLSSTTAIRIQTPLLFMSDKKREQTAEQFNLKLPEPVSKLKSKKKKFIQRIFSE >NZ_CP012508.1|WP_048875965.1|1114969_1115890_-|hypothetical-protein MLSTPWLAALDFDGCLYNVNIDNVRRAFHSPGKPKEELTLAHLITINQKLIDHLNNQAEKFSSSTVFLGSDRQDYKKERDNSAGPNREGQYCYPLISDFAKKIGAEFDPLLMADIYNNLPLGESFRQALQDYHTPEKHDQDPHTQPDSSKLTLLYAQMHKAATENPDDIVTYEFYDDRKDILLSLQEIFESDPHMIPKNITLYLNHYDGVNLQNLLIIQGQGNPDSQYQHTLKNPAYRKASANPAEAQTDYSISELIKEKFPKISKSFLEIKQKLQQLNLPKLKKSLIREATSVSVATSVGILHIQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP012508_2 | 1656178-1656287 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012508_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP012508_2
>2.1|1656204|58|NZ_CP012508|CRISPRCasFinder CGAGCTAATTTGATATCGGAACGATAAAGGGCGATAATGGCTGTTTGAAGGATAGAGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012508_2
The CRISPR arrays of NZ_CP012508_2 >merge|NZ_CP012508|2|1656178-1656287|CRISPRCasFinder TATCTTTAAGTTGCTCCCAATCTCCTCGAGCTAATTTGATATCGGAACGATAAAGGGCGATAATGGCTGTTTGAAGGATAGAGCTATCTTTAAGTTGCTCCCAATCATCC >NZ_CP012508|2|2|1656178-1656287|CRISPRCasFinder TATCTTTAAGTTGCTCCCAATCTCCT CGAGCTAATTTGATATCGGAACGATAAAGGGCGATAATGGCTGTTTGAAGGATAGAGC TATCTTTAAGTTGCTCCCAATCATCC
>NZ_CP012508.1|WP_017376785.1|1654672_1655578_-|LysR-family-transcriptional-regulator MSVKITLRQLEIFVAISQHGHVTQAANSLYLSQSAVSMALAELERQLGKTLFDRAHKNLQLTNEGRLLLDKAVSLMQQAREVEQLFESDVQGELVVGASSTVGNYMLAGLMSEYLQKYPQLRLRLEISNTRRSQEKLLDYQFDCAFVEGEVTHADIKRQLWCMDEMLLIVAPTHPLAYKGLVEASDLSKAVWVLREQGSGTREFFNRRVLPELTYAQVCLELSDSTAIVQSVETGVGVSCLSRHVVECALREKRLAKLPYERKLERAFYLLIHKKKHIPALVHHFIDFCYQYIGKNNNYSL >NZ_CP012508.1|WP_027242578.1|1653673_1654210_+|DUF2062-domain-containing-protein MFNWFKKKIPTRESLQDHKILAKLYHLLHYHYLWHFNRHSVSKAIAIGSFFAFIPVPFQMIPAALCALVFRANVGISIATVWISNPITIPPMIYAAYKLGSWMIGHPGFIISLEQPHDIIHLLSQSWPPFLLGCITLSITFSLVNYIIARLFYRLWIIHKWHKNREKHKQANTTKKER >NZ_CP012508.1|WP_162038665.1|1652354_1653566_-|ComEC/Rec2-family-competence-protein MCYFIKSKHKAKLLCCLGLGGLWAIIIIFWQDYLHLDDFVLNQVVVITGNVVSIPEHDTRKVCFLFLIESINHQPLWPARQVRLNWYRFKQKKQQVLKAGESWQFQVKLRAPFGLENFIGFNYRRWLYQHSIQATGLVIDRYGKKGINRKLSSSHVFNLQQYRQKIAWFLERIDLHNTALIKALVLGERAEVKRSVRNLLQQTGTAHLLAVSGLHIGLIVTFTFFLIRGVLLWAPGMSRKYKSSGYALFIAAIVSLLVALCYSALAGFSVATLRACLMTVCVLLAFLCRRVVPIWALYQYALVGVVILFPLSVLSIGFWLSFLSVGVLIFVCAGRLTQTKLQKYLKPQWALLIALAPLSLAYFFNMPLIGLLANLVAIPWVGFLVLPLLLFALRHLKCNTTLY >NZ_CP012508.1|WP_048876008.1|1651383_1652358_+|IS30-family-transposase MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKSITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP012508.1|WP_144420681.1|1651154_1651340_-|hypothetical-protein MNMNSLLSVALQMTEGVLGLIFIPLSNELSWVLFHCADLQITWLINRCEPWSAKHGVSRPR >NZ_CP012508.1|WP_155046590.1|1650810_1650975_-|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYGITLFRPLAALYTTLLWCANINFIGFFFFNVSSI >NZ_CP012508.1|WP_036774017.1|1649933_1650809_+|IS982-family-transposase MDLTLISLFCVIDDFCQELLPQWNAILLEDTNKKRNKPSQMSTSEIMTIMIYFHKSNYRNFKMYYLHVIKGSMVKYFPNSVSYNRFVELMPSILLPLCFFIAAQGKTATGIYFVDSTILRVCHEKRASQNRAFKGLAKKSKSTMRWYYGFKLHIIVNDMGELMAFKMSKATTDDRVVLPKMAENLTGKIIGDKGYISQKLFDQLYEKGLQLITKIRKNMKNKLVLMIDKILLRKRGIIESVFDQLKNISQIEHSRHRSADNFMVNIVAGLAAYCLQEKKPSLGIKYNLLNG >NZ_CP012508.1|WP_162038664.1|1649424_1649643_-|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVLLMSNSRFFRYVNLINAAWFPWAVVRACDDVGSLGLRTKTCYAGSCICAST >NZ_CP012508.1|WP_162038663.1|1648697_1649498_-|DNA-internalization-related-competence-protein-ComEC/Rec2 MTMLVPWVYALRPVTPDHAFVRVLDVGQGLAVIVKTHHHNLVYDVGNKTKSGFDLGQMVVVPNLYALGIQHIDKLVISHIDSDHSAGLASVLAAYPKTPIVSSSPLLPYTKIQACVAGDRWLWDGVTFEFLSPAYPFPYGRNNQSCVLKVSINEEGSSMLLTGDIEKRQEKKLLLQAPLSLKSDILFAPHHGSNSSSTSPFIKAVSPHTVIISAGRYNAYRLPHVKVLHRYQSQHIAILNTGQVGAIDFQLSGNKEPLFTFAGAGV >NZ_CP012508.1|WP_017375696.1|1648298_1648682_+|hypothetical-protein MTINKRDFFDAINYADTAVKIHEYLLNTLEKQQKDFAESCNNDNSSEKSKALASISDVELRFAQLDMLSAIYRKVLLNTLNEIEGCNDQELKTIKNGLLHMVATTLEACVNDFTIEAKITIDIKEEQ >NZ_CP012508.1|WP_171824204.1|1656969_1657146_+|hypothetical-protein MRIFSVYHFQIDNQINQFLNRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP012508.1|WP_155046588.1|1657680_1657890_-|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYEINNILILFSYLFGAILKLTFPSYYNFLAKLRSHTICQELYGIQKSKEP >NZ_CP012508.1|WP_027243099.1|1659005_1660319_-|DEAD/DEAH-box-helicase MSFSSLGLSAPLLDAITEQNYKEPSAIQAQAIPAVLSGRDVMAAAQTGTGKTASFTLPLLERLSKGEQVRANQARALVLTPTRELAIQVAESVAVYGKNMPLRSTAVFGGVKINPQMMRLRRGVDILVATPGRLLDLYSQNAIKFKQLEVLVLDEADRMLDMGFIHDLRKIMALLPKQRQNLLFSATFSKEIRALAKTFVHQPLEISVTPRNTTAKTVKQWICPVDKKQKSALLMHLISHHQWQQALVFSKTKHGANRLARYLDDQGVTAAAIHGNKSQGARTKALADFKQGEVRILVATDIAARGLDIDQLPQVVNFDLPNVPEDYVHRIGRTGRAGACGQAVSLVSADEIKQLSDIEHLIGQLLARKLVDGFEPVHDVPVSSLDRRSKAPKKPEIEHQGGQRLGGSMQGKRREDHRNSQQQPGRKRRRPQLCRSK >NZ_CP012508.1|WP_027243098.1|1660554_1661700_+|carboxypeptidase-family-protein MRISSQFDAGNIEVISAEAVNNIQLKIRKDNQSDFLQWFHFRLHGAKNQACTLKILNASACSYPQGWQNYNIVASYDKEHWFRIPSHYDGKTLIVEHTPEANSIYYAYFTPYSYERHQELIGHAQQHSQCEVSLLGQTVDGRDLDLLTLGQLDQSNSDHHHKKKIWLIARQHPGETMAEWFIEGFLGALLDESNALARVLLSKAVFYVVPNMNPDGSVRGNLRTNAAGANLNREWQTPSMTKSPEVYYVKEKMQNTGVDLFLDIHGDEALPYNFVVGTEGNPLYSARIHSLEKQFKDAFKQTNPDFQDQYGYDKDQPGQANLTVACNNIGQTFDCLAFTIEMPFKDNADLPCKEFGWSAERSEQLGASVLQPIYNVIDQLR >NZ_CP012508.1|WP_155049745.1|1661774_1661951_+|DUF1508-domain-containing-protein MSELSRPENKWDIFKNSKGQWQWSCSDPNGRFLGASTETFDNEESCVANAREQGYSSE >NZ_CP012508.1|WP_027243096.1|1661986_1662619_-|MarC-family-protein MHELITFFITLLALTNPFGNLAIFIGLVEGRDVKEQRGIAFKAGIAVAIILMIVTLFGQNILDFFGISIGAFEVAGGLVILLLGLSMLNMKTEHQPHTKSEHTLAEEKPAIAVVPLAMPIIAGPGALAAVIIHTQSHVADRLFAKLPYVGVDIVIAVVVTAVLLFAPFFHKLLGVAGLKIVERIMGLILMAMAVTMMASGVHSLFPVPAA >NZ_CP012508.1|WP_144420683.1|1662795_1663452_+|hypothetical-protein MLKACSVPTMQLHADYDTETKKSHYSPLGDLRIQRFFDGRPNIQKTALKRYFKKKLPSGIFSGKTQPELSTYLQTTMRTIGQENGSNAPHSTQHYVITGIIQSIQVSKKPGVAKELMNPNAQYTPYIGASHYHAQVKFKAELRQAGLIILTVPVSINLFEITASHLTVQQDSDKMAYLLKKAINQAIKTMYKKLHQQLPQQSTMTSIKKLSQINRLHP >NZ_CP012508.1|WP_027243095.1|1663440_1665726_-|hypothetical-protein MPYTVELEEIYQGKRFESERKRYQECFNAADALADSVYLSESMLGYFEDVSGDELDFNNDATYSSSLSLFVLLGIFGVFKARAHFDKNENIDKYYKKLRTALSGLKNGRHALVNISSLVSILSHHAVASSVVSPVGALGFAIGILLAANNLYKLKLEEKRNSNLKAIEQYFLNFDRPEFDQDFKRIVPPNVKSNRKLIYTNIIDGFTDGLYLVGNAFMLLGLCGATSMVPTVAIGLCVAYGVYTLGSIINKYFKEKEEQLKEEFIYLKFLENLENQGKLVEYHDQFKSDPNYKKYIGDLSESDGAEEIRNKLGVALKIKEKELNAKKETLQSNTFYKVYKMISKSFSTVRSYVNTIKNSLATVTGIDILASQHPLAQAAVSLGCIITGCAVAVPFLVYKTYCSFRPTYQLRCRQGLDYPDLLYFFNEYAKSGFLKKHNHKGLIDRLTDDYQDYRENYLHILCTVNEYIADHYRNMNQKGELFLRYQAAKDYILCKHKYFSSMIKQLYKEYHYYSSLNINSDSDDIFIKNTRCLLKLYPATTKKEVVESLAIFSWDRQIAIITALPEFIDDHQVIMDLKGFLSAIKKPLREKNNFWLDKAHKKAQQDFFNAMLQNYLDNGVVNRSECAALVMNINKLLNSELLYPMPVKTINFYLHKAAVNYLAASASKILKNENLSIQQKIALYQSQHDELLRLLPNMMKSYAQRDSHDSLKVDESQFEEFLARAKNHRSNSNSCFTNMMFYHGQVDTMEPASSHRLVLGV >NZ_CP012508.1|WP_017376797.1|1665999_1666359_-|hypothetical-protein MFTRQKKSLAKFAAESAGTVEAVEAFHREPVCELVFSVCDQEISQCIDLLYDAGHNIHNLKKYAPIEFRNYIYEEFLMRLESPAADVQRELAREVFMDYLETRLKFDMDIAREIIKMPG >NZ_CP012508.1|WP_017376798.1|1666640_1667276_+|LysE-family-translocator MTFGIWLSLFAVCILGAMSPGPSLAIVTKHSLTNGRWHGIATSWSHALGVGLYATLTLLGLAVLLKRSPILFAIISYAGAGYLIYLGINALRSKGGIDSKLNLGQPAPLKDSCREGFMISLLNPKLALFFLALFSQFISVGHQLSSQVIIVATPTLVDGLWYTLIAFILSNPKVLSILKNKAQLIDRLSGIVLLLLASVFIISTISHSIFN |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
3091 : 61662
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012508|3091:61662|DBSCAN-SWA GATGTCTGCCGTAGAGACAATTGCCGCGCAAGCGACGCCTAGTGGCCGTGGCGGCGTTGGTATTGTGCGTATTTCCGGGCCGAAAGTAGTCGCTCTTGCCACGCTACTACTCGGGCGAGTCCCTAAAGCACGTTATGCACACTACGGACCATTTTTAGGTGAACAAGGTGAGATTCTAGACTTTGGCATTAGCTTATATTTTAAAGGCCCACACTCATTTACTGGAGAAGATATACTCGAGTTGCAAGGACATGGCGGTTCTGTTGTTATGGATAACTTGCTACAGTACATTTTGATGCAGGATGGCGTCAGAATGGCGCGTCCTGGTGAGTTTTCCGAACGGGCATTTTTAAACGATAAACTGGATTTAGCTCAGGCAGAAGCCGTTGCTGATCTGATTGATGCCTCATCAACACAGGCCGCACGCTCTGCTTTGCGCTCTTTGCAGGGTGAGTTTTCTAAAGAGGTTCATGCCCTTGTTGATCAGGTAATCTATTTGCGTACTTATGTTGAAGCGGCAATAGACTTCCCTGAGGAGGAAGTAGACTTTCTTTCTGATGGAATTGTTGAGACTAAGTTACATGATATTCGCGGACACTTAGAGCGCATTCGTTCACAGGCACGACAAGGTGCCTTATTACGTGAGGGGATGACGGTTGTTTTAGCAGGTCGGCCAAATGCAGGAAAATCAAGTTTATTGAATGCATTGACGGGTAAAGAGTCGGCGATAGTGACTGATGTTGCAGGGACGACACGCGATTTATTACGAGAGTATATTCATATTGATGGCATGCCTTTACATATCATTGATACTGCGGGTTTAAGGCAAACAGATGACGTGGTTGAGCGCCAAGGTGTTGAACGTGCTTTGAATGAAATTCGTGAGGCTGATCAATTATTATTATTAGTGGATAGTCATGAAACTCCTGCGACAGGGTTAACTGAAGTGTGGCCCAGCCAACTAGATGGTTTAATGGGTGAATTAGATGTGACGGTTGTTCGCAACAAGATCGATATGCATGGCCATGATCGTGATCGCTTGCAGGTGGAGCAGTTTGAAAGAGAGGGTGTTACTTGGATTAATTTATCGGCGAAAACTGGTGAAGGAGTCTCATTATTAACCCAGCACCTCAAGTCGGTTATGGGCTTTAATAGCCAGGCTGAGGGACGTTTTTCAGCACGTCGACGTCACTTAGACGCCTTGGAGCGGGCAGAGCGCAGTTTAAATGAAGGCTATGAACAATTTTTAGTTTTAAATGCTGGCGAATTATTAGCCGAAGATTTGCGCCATGTTCAGGGTTATTTGTCAGAGATCACCGGTGAGTTTAGTTCGGATGATTTGCTTGGGCAGATCTTTACAAGTTTCTGTATAGGTAAATAGGTGTGTATAACTTTGTGGGTTATACACAGGATATGCCCTGTAATTAACAGTTTATCCACAGATTAATTAGTGTTAATTCTGTTTTGTTAAGTATTTTAAAGTTAGGTTGATATGATGTTTTTTGATGAGCACTTTGATGTCATTGTTGTTGGTGGTGGCCATGCAGGTGTCGAGGCCGCACTGGCTGCTGCACGCAGTGGTGTAAGTACATTATTGCTCACTCATAATATTGAAACGATTGGTCAAATGTCGTGTAATCCGGCCATCGGTGGGGTGGGCAAAGGTCATTTAGTCAAAGAAATTGATGCTTTAGGTGGGTCAATGGCTTTAGCTGCTGATTACGGTGGTATTCAGTTTCGGACTTTAAATGCACGTAAAGGTCCTGCGGTACGAGCAACACGTGCACAAGCAGATCGTATGCTTTATAAGTCTGCAATTCGTGAGATTGTTGAAAATCAGCTGAATCTGAAAATTTTTCAGCAATCTGTTGATGATCTAATTGTTGAGGGTGATCGTGTCAGCGGTGTTGTGACACAAATGGGCTTAAAGTTTCGAGCAAAAGCTGTGGTTTTGACAGTAGGAACTTTTTTAGGTGGAGTGATTCATATTGGTTTGGAGAATCACTCAGGTGGCCGGGCCGGTGATCCTGCAGCGAATGCGCTAGCTCGACGATTAAGGGAGTTGCCGTTTACGGTAGGGCGCCTGAAAACAGGTACACCACCGCGTATTGATGCGAGAACGATTGATTTTTCTGACTTGCAAGAGCAACCGGGTGATACACCGTGCCCAGTGTTTTCATTTATGGGCTCGCTTGACTTGCATCCGCAGCAAATCTCATGCTATATCACGCATACCAATGAAAAAACACATGATATTATCCGCGCAGGTCTTGATCGCTCACCGATGTATTCAGGTGTGATTGAAGGGGTTGGCCCGCGTTATTGTCCATCGATTGAAGATAAAATCACCCGTTTTGCTGATAAATCATCGCATCAAATCTTTATTGAGCCGGAAGGCTTAACGACTCATGAGATTTACCCTAATGGCATCTCGACAAGTTTACCTTTTGATATACAGGTACAACTGGTACGCTCAATGAAAGGGTTTGAACAAGCTCATATTCTAAGACCTGGTTATGCAATTGAATATGATTATTTTGATCCGCGTGGTTTAAAGCCGAGTTTAGAGACGAAATATATCAGCGGTCTATTTTTTGCTGGACAAATTAATGGTACCACTGGTTATGAGGAAGCCGGAGCGCAGGGGCTATTAGCAGGAATAAACGCGGCATTAGGCGCACAAGAAAAAGAGAGTGTTCATTTTCGTCGTGATGAGTCTTATCTTGGTGTGCTCGTCGATGATTTAATTACTTTAGGAACACAAGAACCTTATCGAATGTTTACTTCACGTGCTGAATATCGTTTATTATTGCGTGAAGATAATGCTGATTTACGCTTAACAGCAAAAGGGCGTGAATTCGGTCTGATTGACGATAAGCGTTGGCGAGCATTTGCAGAAAAATGTGAAGCCATTGAGTTGGAAAAACAGCGATTAAAATCAACGTGGTTGCAACCTGAATCAGCCCAGGCTCTACTGTTAAAAGAGCAGTTTGGAGTGACACTGGGGCGTGAGCATAGCTTAGAGAGCTTATTGCGTCGTCCTGAAGTTAAGTATCAAGATCTAGCAATAGTTGCACCAGCAGAATTAAGTTGTACAGATGATGTTGCCGAGCAAGTTGAAGTGCAGATTAAATATGCAGGCTATATTGAGCGCCAGCGTGATGAAATTGCTAAACAACGTCGTCATGAAGAAACAAAAGTACCGTCTGAATTTGATTATGATGCAGTCAGTGGTTTATCTAATGAGGTAACAGCAAAGTTAAAATTAGCACGCCCTGAGACGGTCGGTCAAGCCTCGCGCATATCCGGAGTAACCCCGGCGGCTATATCATTGCTCTTAGTTTATCTTAAAAAACAGCGTTACATTAATGATGAAAATCTGGCCTGATTTAATTTAGGCATAAATTAAAATAAGTTGAAGTTGTTAGCGATAAAATGTTAAAAGAAAAGTTAATCCAAGGTATTAATCAATTAAATTTATCACTCGGTGATGATCAAGTTAATTTATTGATTGATTATGTACAGTTATTAAATAAATGGAATAAAACCTATAATTTAACTGCAATTCGAGATATTAACGAGATGATCAGTTTGCATCTCTTAGATAGTTTAGCTGTGGCGCCTTATTTACAGGGGCATGATATTCTTGATGTGGGCACGGGAGCCGGGGTGCCGGGAATTCCCTTGGCAATTTGCTTTCCAGAGTATAACTTTACGTTATTGGATAGTAACGGTAAAAAAACACGTTTTGTGCAACAAGCGGTTTTAACTTTAGGCTTGAAAAATATTAACGTGGTACAAAGCCGGATAGAGCACTTTGTGAGCCACGATAAGTTTACGACCATCATCAGTCGTGCCTTTGCTGCAATCGATGATATGCTAAAAGGGGCTGCTCATTTGTGCCGGCATCAGGGAGAATTTTTAGCAATGAAGGGAATAGATCCAGAAAAAGAGTGGCAAGCGGTCGCCGCAGATTATCATCTGCTTGAGACCATCAAATTATCTGTACCTTTTATTGATGGTGATCGCCACTTAGTGCGTATACGTTTAAAAAATAAGTAAGCATGTTGGGGGAGTTATTGTGGGGAAAGTGATTGCGCTAGCAAATCAAAAGGGAGGTGTGGGAAAAACCACCAGTTGCATCAACCTGGCAGCTTCTTTAGCTTCATTGAAAAAGAAAGTCTTACTTATTGATATTGACCCTCAAGGCAACGCCACCATGGGTAGTGGGGTGAATAAACATGAGGTTGAGTTTAGTATTAATGATGTACTCATTACTGAAATATCCATACAACAAGCACGGATTGATGCTAGTTTAGCGGGTTATGATTTGATTGCTGGCAATGCTAATACGACAGAAGCCGAAATTCAATTGTTTCAATTTGAACAACGTGAACAAAGATTAGCACAGGCTCTTGCGCCTATTAAAGAAGACTATGATTTTATTTTAATTGATTGTCCTCCTTCTTTAAATATGCTGACTTTAAATGCGTTAACTGCAGCAAACTCGGTATTTATTCCGATTCAATGTGAGTATTTTGCTCTAGAGGGCTTATCTTCACTGCTTGAAACGGTCGAGCAAATTAGAGAGTCTTTAAATAGCGAGTTACAGGTAGAAGGCGTGCTTAGAACCATGTATGATGCGCGCAATCGCTTAACAATGGATGTTTCAGATCAGTTGGTACAATACTTTGGTAAGCAAGTATATAAGGCAATTATTCCACGTAATGTGCGTTTGGCGGAAGCGCCTAGCCATGGATTGCCGATTATTAAATATGATAAATATTCAAAAGGGTCGTTGGCCTACCTTGCTTTGGCAAAAGAGTTTATTCGTAAAAATAAAGCGGTTCAGAAAGTAGCTCAACTTACGTCAAAATCAAAACCAAAACTCAGTGCAGTAAAAACGCAAGCTAAATCTAAATCAGCGAAATCTAGGTCCAATAAATCTAAAGTGAAAATGGCGTAATCTACAGTATCTAAGGTAAGGGTGGTAAGGTGAT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54 | Escherichia_phage(28.57%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
191889 : 322697
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP012508|191889:322697|DBSCAN-SWA 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113 | Acinetobacter_phage(11.76%) | tail,transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
330663 : 384077
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP012508|330663:384077|DBSCAN-SWA 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49 | Staphylococcus_phage(57.14%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
441074 : 563458
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP012508|441074:563458|DBSCAN-SWA 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108 | Staphylococcus_phage(24.14%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
571955 : 679071
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP012508|571955:679071|DBSCAN-SWA 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111 | Acinetobacter_phage(19.35%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
686427 : 758657
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP012508|686427:758657|DBSCAN-SWA 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53 | Staphylococcus_phage(44.44%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
771130 : 831354
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP012508|771130:831354|DBSCAN-SWA 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51 | Acinetobacter_phage(27.27%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
845017 : 893343
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP012508|845017:893343|DBSCAN-SWA 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40 | Bacillus_virus(16.67%) | transposase,protease,integrase | attL 871096:871155|attR 887253:887749 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
902829 : 1045434
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP012508|902829:1045434|DBSCAN-SWA 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118 | Staphylococcus_phage(19.23%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1050646 : 1112271
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP012508|1050646:1112271|DBSCAN-SWA 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55 | Bacillus_phage(22.22%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1119135 : 1153277
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP012508|1119135:1153277|DBSCAN-SWA 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30 | Acinetobacter_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1193753 : 1242139
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP012508|1193753:1242139|DBSCAN-SWA 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41 | uncultured_Mediterranean_phage(28.57%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1253036 : 1299666
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP012508|1253036:1299666|DBSCAN-SWA 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38 | uncultured_Caudovirales_phage(12.5%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1361899 : 1402305
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP012508|1361899:1402305|DBSCAN-SWA 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38 | Tupanvirus(22.22%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1568534 : 1584105
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP012508|1568534:1584105|DBSCAN-SWA 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14 | unidentified_phage(25.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
1599092 : 1652358
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_CP012508|1599092:1652358|DBSCAN-SWA 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54 | Staphylococcus_phage(33.33%) | transposase,protease,integrase | attL 1600160:1600219|attR 1658726:1659266 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
1674718 : 1793213
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NZ_CP012508|1674718:1793213|DBSCAN-SWA 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100 | Acinetobacter_phage(14.81%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_18 |
1799630 : 1846356
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >NZ_CP012508|1799630:1846356|DBSCAN-SWA 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39 | Acinetobacter_phage(50.0%) | plate,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_19 |
1876111 : 1989612
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >NZ_CP012508|1876111:1989612|DBSCAN-SWA 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97 | Staphylococcus_phage(28.57%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_20 |
2007114 : 2074403
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >NZ_CP012508|2007114:2074403|DBSCAN-SWA 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49 | Acinetobacter_phage(22.22%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_21 |
2084510 : 2135609
Sequences of DBSCAN-SWA_21
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21 >NZ_CP012508|2084510:2135609|DBSCAN-SWA 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48 | Acinetobacter_phage(27.27%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_22 |
2150772 : 2212557
Sequences of DBSCAN-SWA_22
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22 >NZ_CP012508|2150772:2212557|DBSCAN-SWA 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56 | Acinetobacter_phage(20.0%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_23 |
2236522 : 2280803
Sequences of DBSCAN-SWA_23
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23 >NZ_CP012508|2236522:2280803|DBSCAN-SWA 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41 | Staphylococcus_phage(45.45%) | transposase,integrase | attL 2237956:2238015|attR 2280759:2282300 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_24 |
2335721 : 2388301
Sequences of DBSCAN-SWA_24
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24 >NZ_CP012508|2335721:2388301|DBSCAN-SWA AATGGACTTAACATTGATTTCTCTCTTTTGTGTAATAGATGATTTCTGCCAAGAGTTATTACCTCAATGGAATGCTATTTTGCTAGAAGATACGAATAAAAAACGTAATAAGCCTTCACAAATGTCAACAAGTGAAATAATGACAATTATGATTTATTTTCACAAATCTAATTACCGAAATTTTAAGATGTATTATCTTCATGTAATAAAAGGTAGCATGGTAAAATACTTTCCAAACAGCGTTAGCTACAACAGATTCGTTGAACTCATGCCGAGCATCTTATTGCCTCTGTGTTTTTTCATTGCGGCCCAAGGTAAAACAGCAACAGGGATTTATTTTGTTGATTCGACAATACTCCGTGTTTGTCATGAAAAACGTGCGTCTCAAAATAGAGTTTTCAAGGGATTAGCTAAAAAATCTAAGTCAACGATGGGGTGGTACTACGGCTTTAAGCTCCACATTATTGTGAATGATATGGGAGAGTTAATGGCCTTTAAAATGAGTAAAGCTACTACAGATGACCGTGTCGTATTACCTAAAATGGCCGAGAACTTAACAGGTAAAATTATTGGTGATAAAGGCTATATTTCACAAAAATTATTTGATCAATTGTATGAAAAAGGACTTCAACTTATCACAAAGATTCGTAAAAACATGAAAAATAAGCTGGTTTTAATGCGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTACGTGCCTTGAAGCGGCACACTCCACTACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGCCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGATTGTTGCTGGCTTAGCAGCCTACTGTTTACAGGAAAAGAAGCCTTCTCTTGGCATAAAATATAACCTGCTAAATGGTTGAGTTATATCGAACTCACGTTAAATATAGCAACTTTTTATCAAACTGCGCTTTTGCTTTGGGACAAGCCACCTCTTGCTCTTGACCTTGATCTTGCTAAACCTTCTATTGCCAATACCACTAACGCTAACCAAATAAAAACAAACGTGATGATCGATGGCAAAGTCAACTTTTCACCATACAGCGTCACAGCAATAATAAATAAGATCGTCGGCGTTAAATACTGAAAGAAGCTCAGAATAGAAAACTTAAGACGTGTTGCCGCCGCAGTAAACCCTAATAAGGGAATCACCGTTACCACACCAGCAAGCATCAATAATAAATTCATCGATGTCCTATTTTCAATGAAATTTGCAGTTGCACTATAGTCAAAAAAATGCAGATAAATCAGAGCAAAAGGAGTAAGCAAGGCTGTCTCGCACAACAGCCCCGTCACAGCAGCTAAGCCTAATTTTTTGCGCAGCATACCATAACAACCAAAGGTAAACGCTAAACCTAAAGACACCCAAGGCAATGAGCCATAATGAATAATTTGAATGAGCACACCCATAACAACTAATGCAACAGCAAACCATTGCCATACACGCAAGCGCTCTTTTAATATAACCATCGCCAAAATAATATTAAGAATCGGATTAACGTAATAACCTAAACTGGTTTCAAGCACATGGTCATTATTCACCGCCCAAATATAAATAAGCCAGTTGCATGCTAAAAATAACGTTGAAAAAAACAGAAAAATTACTTTATTTTTTTGGGTTAATACCTTTCTAACCTCAGTTAATTGTTTTAACAATAAACTGATAATGGCTAATAAAACACAAGACCAAATAATCCGGTTAGCTAAAATTTCAAGCGCAGGAATTTGCATAATTTGCTTGTAATAAATAGGCGATAGTCCCCATAAAGCATAGCCTAAAATTGCATAAATAATACCCTGCTTTGTCTTGACATCAGTACTCATCACTCACTCAACTCTGCCATAAAAGATTCATTCTACTTGTATCAGGATACAGATTAAAGCGATAATCTATCTTTAGGCTCTCGAATAATTTATCTAAAAATAAAAATTAGCAGGACCTAAGCGCTAATAACACCCCAAGCATTACATATTTTCATCATTTTACTTGTTTGACTAACAAATAACTGCTCTGCTGACGCTAAACTAAAACCAAAATTAATTTGATAATTTAATGGTGATTACATCAGAACAGTTAAGAACATAATAGCGCTACTCTGGCATAAAACTAATAGTTTCCTTGCCGGCATCTGGTGCTATAGCAGAACGCGTCATTTCCTCTAAAAATAACAAGGCTGCTTCTTCACTAATTTTCTCAGCAAGCTCATATTTAAAGTCAAAGCTTAAGGGTAAGATATTGACTTGTTTGTCTTCACTCGTACTATTATCGGTTAGGGTATGTAGTTCCATGCCATCTCTTGTCGGATAGATATAATCCGATCTTCGAATAGGGTCGGCTCCAATTGTGCCTTCAGGTAGAGAATCGGGTAAAGCTATTTTCTTCATTGCAATTAATATCCTTGTTTTTATTTTTCATAGAAACTAAGTTTCATTGACATTGCACTAACCATAAGATGGTGCTTGCACGGACGTGAGAAGAGTATCTCAAACGCTTTTGATAAACAAGCGGCATTTACTTCTAAGCGATCAATCATACCTATAACGATTAATCTCTCGCCTAGCAGGCCTATACTTGCATGAGTTAGAAACAGGACTTACGCATTGACAACAAAATCTAGTTATGCACCCACAAAAAATTGGTATTTTCAGTACATTTTTTTCATAACTTGTATGAACTCTTGTCATAAACTCATACTTTTGCTCTCTTCAGAGAGTTTGTAAAAAAGTGATTAAAAGGCTAGATCTATTGATGTCACTAGCTTTCATGTTTTAAAACAGCTGTCAATGCGTAAGTCCTGAGAAACTATTTAGATAGGTGAGTGTAAATATTTATGCGACTAATTTACACTCAATATTTAACATATAAAGCAATGCATTTGTTAAGAAGCAGAAAAACCGTATAAACGGTGTAAATAGATTAGTCTCTATTTAAATTTAACGGAATACCTTAGAAAAAACATCTGACTTACATATAAATACAGTTTTTTAATTTAAATAAATTAATTTTTTTTAAATTAAATTTAACATGATAAAAATAAAATATATTCATTATATTTATTATAAAAACTCCTATTAATATTTTTTAATAATTATTAAATCTTAATCATACATTACTTATATTTTATTTTAAATTTAAAGTTTATTTAAAAGAATGCAATATGCCAATTAATTTCTCATTAATTATAAAACAAATAAATATATTCATTTACTTTCATTGGCATAAAAATAATTACAATAAAATACCTGTTTAGACGTAATTTTATAAAATAAATAGCTATATTGTTATTATGATGACATAGACAGCAATTTGTTTAAGTTAAGAACTCACCTTATTAATTAGCAGATAGTTTCTATATAAAAATAGAGATAAACTCTAAATGCACTATTAATGTTCGTGATGATTTTCAGTTTAAATTATCAACATTAATTTAATTCTATTAGTAAATATGCTTAAGATATTGAAGTATCACAACATGCTATTAAATTGTAATTTATTGTCTACATCCTTGAATTGATTAATATTAATTTCAAGATATCTACATACTTTATCTAAAACTTATTAACACATTTATACTTTGGAGTTATATATGACTAAATATACATTTGTTCCATTTGAAGGTGAAGATAAATCAATGCCAGTTCTTGCTCGTAGCTGGCGCCGTGGTCAGTATACAATAAAAGAGCATAGTGAGGGTGATTGGCCTGAGGTACGCACATATGATAAAACGTCGGATCAACTATCCGATATTGGTCCAGATGATAAATTATATATTTATGCTCATGGGTTGATAGGTACTGGGCAAGTACGTAGTACCCGGCATAGAGTAGCAGAGTCTGAGTGTCTCACACCTGAAGAATTAGCTGATCGGCTTATTGCAAGTGGCTTAAGACGAGATATTCAACAAATTAATTTATTTATGTGTGAGAGTGGCGGTACTTACATTGGTAAAGGACATCCTGAATTAGAGGGAACGTCAATTGCCGGAAGATTTGCTGCCAGGCTTTCACAACAAGGTTTTCGTAATGTAACCGTAATCGGTTATACCCAACCATTAGACCCAGTCATAGGTTATGCAGCAACATTATCTGGAACAACTAGGCCTTGCTCAAGATACAAGGAGATACGCAGGACAGTTGATGATTCAGAGTTAGTGGGGCCCTTGAGAAGAGCAAAAGAAGTACAAAGAAGATACACCATAGACGGGCATGGCCATGTAATGGACTCTAGCACAGGTGAGCATTCATACAGAAATAATGGCCCCACCAGATTGCCACCACACTTATTTAGTAGCATTTTTGCTAGTAGTCCAGCCAGTGGTGGTGGCTCTAGTCTTTATGACAGTGCGCTTAGAGCAGCTAACACACCATTAGAAAAGCAAATTGATGATACACCAGAGCCAACTAGATCATCAACATTGATATTTGACCACGCTACAGCCAGTGATTCTGGTCTTTATGCCAGTGCTTTTGAAGCAGTTACAACACCATTAGAAGAACAAATTGAAATGTAAATGAGTGTAACTCCTTGCCCACGGAGAGGGCCTCATATTGTAATTGGATAAATAATACGTCCAGTATCTCTCACCAAAGCTCTTCAGTAATTAAACCCCTTATGAATTTAAATAAGTCACAAGGGTAAAAATTACCTATTTAACGCCTAACTCTTTTAGACGCTCATCCAAATAGCTTTTTGCCGTATGGCGCTCTGATAGCACAACCTCTGAGCGAGGATGTAAAAATAGTGGTGCTGTTAAGCGTGAATTTGCCGAACGCACACCTGTTGGGTTAATCACCCGGTGTAACGTCGATGGATAA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45 | Synechococcus_phage(14.29%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_25 |
2405923 : 2424403
Sequences of DBSCAN-SWA_25
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25 >NZ_CP012508|2405923:2424403|DBSCAN-SWA 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15 | Staphylococcus_phage(28.57%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_26 |
2457885 : 2505300
Sequences of DBSCAN-SWA_26
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26 >NZ_CP012508|2457885:2505300|DBSCAN-SWA 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44 | Staphylococcus_phage(40.0%) | plate,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_27 |
2530600 : 2575168
Sequences of DBSCAN-SWA_27
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27 >NZ_CP012508|2530600:2575168|DBSCAN-SWA TATGAGTTCTGCACGATTAAACAAGGTCAAACGCGTCTTAGCCGCGCGTCAAGATAATTTAGCCGTCTTAATGGACCATGTCCACAAACCACATAATTTATCTGCCATCGCCAGAACCTGTGATGCTGTGGGTGTTGCCAATCTACATGCCGTTCACCCAGAGTTTACAGACATCGGCATTCATCATCATACCGCCGCAGGTAGCAAAGACTGGGTTCATATTATGCGTCATGAATCCATTGATACCGCCTATCAACACTTGCGTACAAAAACTCCCAACGTGCAGATTCTAGCCACGCATTTATCTGATAAGGCCATAGACTTTCGTGAGGTAGATTATACTCAGCCAACCGTGATAGTACTCGGCAATGAGCTTGACGGTGCCAGTACTGAAGCCTGCGCTGGTGCGGATGAGCATATTATCATTCCTATGGTCGGCATGGTGCAATCGCTGAATGTTTCTGTCGCAGCAGCCACTATTTTATTTGAAGCACAACGCCAACGCCAACTGGCAGGGCTGTATAAGAGTTATGAGAGTATCGAAAAACCAGATACAATAGACAAAAATAAAGTATTTGAGTGGATGCACCCCAAAATTGCCAAACTCTATCAAGCTCGTAATCAAGCCTATCCAGATCTTGATGAGGATGGGGACATCCTGCCGCAATCAATTTAAAATCTAACACTTAAAAATGGAGGCAGTGATGAAGCGACGTAATATCTCTTCAGGTTCTGACTGGGAAAAACAAATCGGCTTCTCTCAAGCGGTTTGTGTGGGCCCGTTTATTCAAATCTCAGCACTCACCCCAGTTGATGCAGAAGGTAAAGTCATCGGCATACGTGATGCCTATGAACAAACTAAACAAATTCTAACCAACCTCCAAGCAACCCTCGAGCATGCCGGTGCTGAAATGGCCGATGTTGTGCGCACGCGTATTTATGTTAAAGACCTACGCCTCTGGCAAGAGATTGGCCGCGCCCATGGTGAAGCCTTTCAAGATATCAAACCAGCAACATCCATGCTTGAAGTCTCACGCATGACCGGCCCTGACTTTTTAGTTTCTATAGAAGCTGATGCAATCATTGACGAATCCGCTGAGCGTGTTTAACACGCTCTGAATCAATACAAATAATTATTCACTCTTTTTTCCAGCAAGCGTAGCGTTTTTTATCATTGATAAGTTAGTAACAATTTTTTCTAATAAACGGCTTAACTCAACTTGTTCTGTAGCTATTAATTCATTAACCACCTGATTTTTTATCATTACAGACATAAAATCGATACTTTCTTCTATTTTTTTCCCCTTTGCAGTCAAATAAATGAACATGCCTTCTTCATTATCACTGGCAGATGTACTAGAGCTAGGGGGAGTCGACTCTATACGCACTAGGCCATCAGCAAATAAGTTTACCAGTGCTGTCATCGCTGTTTTATCATCCACCTTTAGCGCTTTAGTAAACATGCTCGTGCTTATGCCATCAGCACGCCATAACAGACTTAAAAACTTGGGACTATAAGCGGGTACCGCATGTTTTTTCATCAAGAAAATTTCACTTTGCGTTAAATGATAAGCCACTTCTTTAATTAAACTTACGATAGCACTGGCCTTGGCTAAATGATCTGAATCATGAGCACTCCCCTCTGCAGAAGCCATCTGCTCATCTGTACCTGCACTGGCAGGAGCTATGATTTGTTTACTTTCTTGGTAATCTTTAGCGCACTGATTCAAAATTTCTACAATCTGCTCCTGAGTCCAGGGTTTAGCCAAAATATAATTAATATCATCATTAGCAATCGCAGCAATTATGCCTTCATCATTAGGGTAACCCGTCAACAGTACCCGCACTGTATCCGCGTGTATGCCATGAGCATGCGCCAACACCTCAAGACCATTAATATTAGCCATTTTATAATCTGTCATAATCAGACCAAAAGAAGGTCCTTCACTGATCAAGCTCATTGCTTCTTCTCCAGATTCGGCGAGCGTCAGCTTTGACTCTGGAAATTTGAGCAAGATTAACCTTTTTAATGAATGCAAAACATTTTTTCTATCATCAACAATGAGTATATTCATACGCAATTTATAGTACATACCAAAGTGAATACAAGTTAATTATAAGTATAGCTTGAGGAATATCACTCTCCCCAACTGAACGCCTTTTAAGTAATATTTTTAAACCTATCTAAATATATACAGCTAGCTAGAATACGCCTCTTAAACCTATCAGCTATATAAATGACTGTGTTTTAACTCTGACAATGACATCAAACCAAGCGAACAAACACCGAGTACCGCAAGAATAATCATCAAATACCACAAGGCATGAAAACCAAAATGATCAATATAGCCTCCCATTATCACCGGGCTGAAGTAGTTTGCTGAATTAATCACCGCAGGCAAAATACCGGTAATTCTTCCCCTGTGGCTGCTCGGTGAATGATTGGCAATAAATACACTGCTTTTTGTAACAATTAATACCTCAGCTACCGTCATAAAAAAAACAGCCAGAAATATCACTATTAAACTCTGATTTAATAACAACGTGCTATAGCATAAACCAAGAAAAATCGCAGCAATCATCGTTCCAATCAATGCACTATAACGACGAGTTAATACCGTTAAAATAGGGGTAAAAATAACAACAATCACCGCATTCGCCGTCATGATTTGACCATAATATTGAGCGCCTTGCGCATTAAATAACGCGGCTAAATACAACGGAAATGCAAAAATCAGCTGAGCCATGGTTAAAGAAAGTACTGTACATATCAAAGTATAACTAACCAGTTGAGGGCGTCGTTTTAAAACCAGCCAAACAGAGCCAGCAACCGCCTGCTCCAAATGACTGTTCGCCTCAACAGTGTGTCCCTCAGTTAAGTAAAAAATAATAAGCAGCAAGCTAACAAAGGCTGTCAACGCATCGAGCCAAAATAACCAATGCGTATAATGAGTAAATAAAAAGCCAGCCAACAACAATCCAGCCCCAAAACCAAGATTAAAAACCAAATAACTAAAAGACTATAATGCTCCCGAGTTTTCAGACAGGATAATTTAACGATTTATTCCTGAAAGGTTAAAATGATGCTTAACATTTTAGGAGCTATGAGATGAGTCAAAAAAGAAAGAAGCCAAGCGCTGAATTTAAAACTAAAGTTGTCTTAGAGGTCATTGAAGGAGATCAGACGCTCAACCAAATATGCTCGAAATATGAGCTAGTCCCTAAAACTGTTCAAAACTGGAAAAAGGTGTTTTTAGCGAATGCAAGCCTGGCTTTTAATATCGATAACGCTGTGGCGGAGTTTAAGGATGAAATTAAAACCAAAGAAAAAGAAGTGAATGAACTTCACCGTCAACTGGGCAAACGCACAGCGGAGTTGGAGTGGGCGGCAAAAAAGTTGAAGAGCTTGGACTATGAAACAAGAAAGTGCCTTATTGAGTCTGAGCCGAAAAATATTCCAGTTACAAGGCAATGTGAATTAATAAATTTTAATCGCAGCAATTGTTATTATAAGTCTGTACGGTGTACCAAAGATAAAATGGAGCTGTTAAGAGCTATTGATCGAATTTATACCGAAACACCGTTCTATGGTTATCGCAAGGTTCATCAGCAGCTAATAGAGGGAGGTTATAGCGTAGGATTGAACCGTGTTAGAAATTATATGAATGAATTAGGACTTAAAGTCATTTATCCAACGAAGAAAGTTTGTACTACTCTTGCTCACCCCGAGCATAAAAAATATCCGTATTTACTTAGAGACTTGGAAGTTTACAAGCCAAATCAAGTGTGGAGCACAGATATTACCTATATTAGGCTGGATGGTGGCTTTGTTTATCTAGCAGCTGTAATTGATTGGCATTCTAAGGCTATCCTATCACATAAGATTTCCACTACAATGGATTCAAGTTTAGTCATTAATGTCCTCAAACAAGCATTAGAGCGATACGGGACACGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTACGTGCCTTGAAGCGGCACACTCCACTACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGCCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGCCTGAAATATTTAATACAGATCAGGGCAGTCAGTACACCTCTCATGACCACACACAGCTATTAATTGATCGTGGTATCAAAATTTCTATGGATGGCAAAGGTCGAGCAACAGACAATATTGCTATTGAACGTTTCTGGCGAAGTGCTAAATATGAAAATATTTACTTATCTGAATACACGAACATTAAGGAATTAAAAGCAGGAGTGACGGAGTATATCGAGTTTTATAATAACAAAAGGTTCCATCAAACCCTTGACTACAAAAAACCGATGGATGTTTACTGTAATTTACAGCCTCAGTTACTTTTGGAGGCAGCATAAAAGGAATTAATCAGTTAAAAGATTTGTCTTGACTAACAGTGGCACTATATAATAAGCTTAAAAAAGGAAAAACAAAACGGCCTAAAGCCAAGACAAACTCTGTCAAAGCGATAATATAAATATCTCTAGGCAAGCCAAAGTAAAGTGCCATCATTTTATCCCGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTACGTGCCTTGAAGCGGCACACTCCACTACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGCCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATG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37 | Escherichia_phage(12.5%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_28 |
2634725 : 2687818
Sequences of DBSCAN-SWA_28
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28 >NZ_CP012508|2634725:2687818|DBSCAN-SWA 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49 | Staphylococcus_phage(22.22%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_29 |
2730778 : 2790902
Sequences of DBSCAN-SWA_29
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29 >NZ_CP012508|2730778:2790902|DBSCAN-SWA 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56 | Staphylococcus_phage(18.18%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_30 |
2794555 : 2833887
Sequences of DBSCAN-SWA_30
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30 >NZ_CP012508|2794555:2833887|DBSCAN-SWA 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43 | Staphylococcus_phage(33.33%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_31 |
2917548 : 3028386
Sequences of DBSCAN-SWA_31
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_31 >NZ_CP012508|2917548:3028386|DBSCAN-SWA 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102 | Staphylococcus_phage(13.33%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_32 |
3061380 : 3122848
Sequences of DBSCAN-SWA_32
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_32 >NZ_CP012508|3061380:3122848|DBSCAN-SWA 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56 | Acinetobacter_phage(33.33%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
21561 : 31760
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012512|21561:31760|DBSCAN-SWA CTTACGTATTTGCATATTCAGTGAGGGCATCTAAGCCGATTTTTACACGCAGTTCATTCGTCTCTTGGCGGCCAACCGTGCGAATCACCGGCTGTTCATGAATGACTTTTACATTAAACGCCTCTTCACTGGCCGACTCAGCAAACCCGGGTAAATAATCTTGTGAGGGTGTACCGTTATTACTTTTAAGGGTCACCCCTTCAAAGTTATACGAACCATCCGCATTTTGTAGCGGCGTATCATCAAAATACACCGATTGGGCGCCATTCACTAAACCTTCAATCTCGCCTTCACCGAGTAGATCCACTAAGGTAACGACAGCATTAGTTGAGAGCGTATTAGGGGCTTCGGTGGGTGTATGAACACTACCGCCGCCTTTACCGCCACCACCGCCGGTGCCGTGAATGGTTTTTTTCATAAGGTTTTATACTGACTCGACACGACTGAACTACCCACTAAGTGCTCACCATAAATGAGTGGCACCGGTGCCCCGGGCGCGGCAACATTATCGACGCCACTAAATAAAGTCGATGCATTCGGGTCGGTGGTACTGTAATCATTATCATAACTCGGTTGAGGGGAGAGCATCGTCAACGCCCCACTAATGACAAGACCTGTACCTGCGGCGCTGAGCCCTCCGGCAATCGGCGCCAATGCCGTCCCGACTGAAAAGTAACCGGCGGTAATTAAAGCCGCACCGATTAAAACTTGGACAAATCCTGAATTTTTAGCGCCCTTCGGCTTGGGCACAATATGTAATTCACCACCGGCACAATTTAATTCTAATTGTTCTAAGTTCAGTGATTGACGCTTTCGAAAAATCGCCCACTCACCGGCTTGAATGATTTTTTTAAACTCGGGTAATTGTGTTGATAAGGCATAGAGTGCTTCGCGGGCGTGATGAATATTTAGCTCAAAAAAAGGGCCGCAAATGCGGCCCAAACGTCCATGGAGATAAATTTTAGTTTTCATGTATTACTCAGCTTTTGCTTCGTGAGCAACTTCTGTTTGAAGTGCAATTTGTCTGTTTAAGATGAATTACAACATATTAATTAATTTCTATTATTTGTTAATGAATTAGATCTACTAGTTAGATATTTTTTTTGACATATTAACTTCTCTTAATATTTTGCGGAGTACAGCTCGCAATTTCGTAGGGACTGAGCTAAATATCCAGCTCTCCCCTCAATTGTAATTAGAAAATAAGTGGTGTTCTTGTTAGATAAAGCTCTTAAAAATGATCTCTTAGACTAACAATAGTTTCTAGGTTCTTAATGCGAACTATCCAAAACCCAACTTTAAAAATAAAGGTGAGCTATGTTTAAAACATTAAAAAGATCAGTTTTAGTTTGTGTTATTCCAGTATTATCTTCGAGCCTTCTTATTACATCTGCGTATGCTACATGTTATGTAGACTATAAAAACAGTTCAGAAAACACATGGAACATAACACTTAAAAATTTAGAGGGTGATACTGCACATATTTATTGCCCTAATAAGACCTTAGGTTATAAAGAAAGCTGTACATTTCCTGTCAATCCAGGAGATTCAGTGTCAGTTGGTTTTTCGCATACCGCTGGCATGATTAAAGCATATATTTCATTCTCAAGCACAATAAATGGCCACTCAGAGAGCTTGAATGATTTGCTTGTAGAGGCTATTGATGATCATTGTCCAGAGATTTATTATAATGACAGTGTACCATACGGTATAACGCTAAATAAACCTAGTATAGGTAATGTCATCTTCGCACCTTATAGTGAAAACGAATCAACTCTCAATAAATTCTCTAAAATTAATTTTGAGGCTGACACTAATAAAAAGTTCAGCTGATTCTCCGCTCCAAAACACAATTCAAGGCTCATAACGAACCACCTTGGCAATACGTTTTTGCCACTGGCTCAACATTTCGCGGCGGCTTAAGTTGTCACACACATGATGCAAGATCATCCCGGGCAGGTTGACGGTATTACGATCTTCTTGCAGTCGGCAATCTTCACCGAGATAAATCGCCCCATGATTAATGCAGGTGGTGCGACCAACGCGCATCAATAACACATCACCGCGGCAAAGTGGTGTGGCTTTATCCACTTCGATAAAACCGGCCTCGGTAAAATACCGCTCATATAAATTATATTTTTCAATTTCCCACCACGACCGTTGGCGCGGAAAATCAGGCAAAAAAATCTTTTTTTCAACGGCATAAAAATCACGAATCAACGAATAGCAATCAAAAATACCATGCAAAAACGGCCGCTCGAGTAATTGCTGGGTGAATAACTGCTCACCAAAAACAATGGCATCCGTCACAGCGTGTTGATTGAGTGCAACAATCCCCATAATAATCCAGTATCGCGTTGACCCACCATATCCGCGAGTGACGGCTCAACCGTGCCATCAGGGTGAGAATGTATCAGTATCGTACCGGTCGGCGTATCAATAAGCTGAGTAGGATCAATGCAAACGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGCTTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGATAATCTTCGGCAGCTTGCAGGGCAGCGGCAAGAATAAATTCTAAATACTCATCTTCGTTATTATCGTCGATGCGCAAATGGCTTTCGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACCGAGTAGAGAGTTCATATCCATACAGATAAACTCTCTAGTTTGCCTTATGAGGGTAGAGATGATTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGCGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGACAAGCTTTTCAACAAATTTCAGAAGAGGAAAAAATGTTGATTCATCAGCGGTTAAGCACTCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAAGAACTTATACGTGAGCATAATATTCAGGTGAGTGAGAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCGGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCAGGAAAACCTTATAAGAAGAAGGTGAGTCGTGGTGATCAAACAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACAACGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGTGACCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACTTCTGACAACGGAACAGAGTTTGCCGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAACACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACGGATTTTAATGAAGTTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATCGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGTTTTTAAGCGTGTTAAATCGATCATTTTGATTTTTTCTTCGACGTTTTAATGTTAACCGCTTCAGCATCACCGTGCTTAATCATGGCTTTTGCAGTTTTATCGGGTAAATCAACAATATCGCCGATATTATAAGCAATATTAATCCCAGCCCTTGGCACTAAGATTTTAACTTTCATAAAGTCCCTTTTCGGTTTGATTTAAATGTGAATTAAGGTGATTTACACAAAAATAACATTAATTTTTGATTCCGCATATTCATGCTTATGATATTTTATTTTTTTATCTGGTATTTTACTCTCTAAATTAAATGAAAGTTCAATACAACGTTAAAGGTTTAAATATAATGCCTACACAGAAACATATGGAAAAAATAACGAACCTTATTGATGATCTCCAGAAGAGAATTACTAAGTTGGACGGTCAGATAGAAGCAGAGGCTAAAAGCTCATTTATTTCTTCTGGGCTATTAGAAAGAGAAAAGAGCAAAGGCTCACGACCTGTCGAATATTACCATAATGTAAGAGAGTTTAGTCGGAAACTTTTACCTAAAATCGCATCATGGGCTCGTAAGGCTCTTCTATTATGTGAATGCAAAAACTTTTTAGAAGAAATGACAAAAGATGACTCTAAAGCTCTAGAGCACGCAACTCATTTAAATGAAACCTATCTTAGACATTCCAATCTTGCAGTGTTTGAGGCTAGGTTTAGAAGCATGACAAAAAGCTTATGTTCAAAGACTTACAAGATTTTAAAAAGTATCGCGAAAGAAAATCAACAATCTGCCGTTGCAGCGACTAACTGGGGTGGAGGCGCATATGCAGTAGCTGATATTGTAAATCGACACCAGTCAAGCGGACTTACCTCAGTTGAAGAAGGTTTACAAGTAGTAGAGTTACCTCAAACGCAGCCAGCCATGCAGGGCTAAGCACAGAGTGAATAGTTTGCTGCTGAGAATTATTATTAAGCGGCAGCGGTTTTAAGTTGCTTAATGGCGTCTGTTTCAAGCAATAGCGCATCCACACGCAACCACATTAAATAACCGACCTCACCGGTTGCAGCATAAAGCTCATTGAGGCGACGCAGCGAAATACCCCCACGATCAGCAATAATAAAATTAGAAAAATCACCGAACAAGGCGGCACATTTCCCGGCGGCGAGGGTGTCCATAAAATCCGAGGTATTCACACGTTTACCACGTAATAAATCACCTTCACCGCTTTTAAAGTCAGGCTGGATAATATACTGGCCATTACCATCTTTCATTTTTAACAATGAGCCATAAGTGGAGTCGTGCATAAGATAGGAGGCTTTACGGCGATAAGCAGCTTTGACCGAACTACGTAAATCTAAAATATTACGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATTCATACAGATAAACTCTCTAGTTCTCCTTTTGACTTAGAGGGTAGAGATGATTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGACACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGCGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGACAAGCTTTTCAACAAATTTCAGAAGAGGAAAAAATGTTGATTCATCAGCGGTTAAGCACTCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAAGAACTTATACGTGAGCATAATATTCAGGTGAGTGAGAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCGAGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCAGGAAAACCTTATAAGAAGAAGGTGAGTCGTGGTGATCAAACAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACAACGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGTGACCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACTTCTGACAACGGAACAGAGTTTGCCGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAACACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACGGATTTTAATGAAGTTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAATACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATCGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGCTTTGCACGCGGCTTCTTTATCAAAGTAAAAACCGCGGTCACGGGCATATTTTAAATCGTTTAAATGACGCTGACAGGCTTTTTTTACATAATCACAGGCAATGACGCGGCCGCTTAGTACATTATCGCAGTAGGTGAGGGCGGTTTTTACCGGGTCGCTTTTAATCATAGTTAATCCAAAATTTTATCTATCTCTGATTCTATCGTGTTGGATACTTGAGCATTGAGGCGACTAATTGCTGTTGGTGTTAATCCAAGCTCACTTAATGAGGTTTTGACTTGTTTCCAGGCTTCATTACGTTGAGCCACTTCGGGACGGCTGCGGTACATGGTATCCCCTGCTTGAGTCGTCGTTTCAAATGTACGGCCCTTTTGTTCTATGACAGTTGATAGCTGCCGCCAGTCAGAATAAGCACTAGCATAAATTTCTAGTTGTTTTTGAAAAGAGGCTGTTTTGATGTGCATATATTCAAGATCAGAGACGGCTGACTCAAAGGCTCCTTTTGCTATTTCATCAAAATAATCTGGACAAATGGCAACCCTGTCCTGTGGTTTTTGGCTCATGCTCATTTAGTTTTCTACATCCAGGATTCCCTGTAATTTTCTTAATTTTTGTTGGTTTTGGCTTTCTACCTTGCCCTTTTGCTCTAGACATCAAAAACCTCCAAGTTTTTAGTTCTAATTTCGCATGCGTAAAAATTCGACTAGGCGGGTGGTCAGGAAATAAAGGTCATAGACATTTTATACACCCCTCCCCTGGGGTGATTTTTTACGGCCAAAGCCACCATCTTCATTCACTGTTTTACGTGAGTGACAGGGCTTACACAGCGCTTGCCAATTGTGTTGGTTCCACATTAATTCATAGTCACCATCATGCGGTTTAATATGATCTACTTCAATCGCTGGGATTAATTTGTCATCTTTTAAGCACTGCTTACACAGCGGATGATCTTGTAAAAATATCTTACGTTCACGTTGCCACCGCCCCCCGTAACCACGCTGGGCAGTTGTCTTGCGTGGGGCATGGTATCGATTACCGTGTTGTTCGTGGTATTCGCAATAACGTGCATACGTTGTGTTATGACATCCGGCATAACAACAAATCTGTTTCGCACGTCTAGGCAATGTGTAATCTCACAAAAATAATAAATAAAAAAAAAGACCTAAACAGGTCTTAATGGAATTAAATGTCATTAGCTAGACATGAAAATAACTAGCTTACCTAAACTCTACAGTTTTTACCCGGGTAAAACAAGGATTTAGAATAGCACAATGGCGCGCAGCATGTGTTCTAATCATCAAAGGCTGATAGAGCTGTGATACAGCGAACAATATGTTTAGCCGCAATAATACAGCGCTGCCTCTTCTCCCTCAGGTTCAGGTTCTTCATGCGCAGACAAAAAAGGAAATTGAAAACGATCTTTCCAAGGCCCAGCTGTGTGGTGAATTGAATTGTTCAATACAAAGTCAGGATTACCTTGCTTAAACTCTGTTACTAATTCACGTTCTTTTTTAGTAATAAGATGAATATCAATGTCTCGTGAATCAACCGTTCCTAAATCTGCACTCGCTAAGCCAAGATAACTTCTTTCATCGTAAGCATCCATAAATTCTGCATTATTTCCTTTCAATGCCTTTTTAAGGCTGACACATTCAACCAGATATGGATCAACTAAATAATTATCTCCAGGATTTCTCTCAAATACAGATAAAAGTTCTTGCCGCGCTTGATTTACCCTAGCAACCTGAGTTTTAAAGTCGAACCCTTGCAACTGCGCAGAAGGATCATTGGCAGAAAGCATTAAAAAGCAATGATTGTTTTTATTTTCAGGTACCTTTGGATCTTGAACGTTAAAGAAAATAACTGTCATATAAGGCAACAGCTCAGCAGCTTCACTTTGTATATGTACTTTCATAAAACTAGTTAGGCTTTCTTCACATCGAGCCAGACCTGATAAAGCAGCTCGAGCTGAACTATGTGCAATAAAGTCATGAATATCTCTCGTTCTTTCCGCTTCAGATTGAGGCATACGAGATGAAAGCGCACTCAATTTTGCTTTATGATTACTGTACTCTACAGTATGGTGAGCTACTGGAATCATTTCAACCGGAGTATTGCCACTTCTTAATGCATCTACGTCTTTATATAATCTGCGACTACTCTGCTCTATTTCTTTTTGAATCATTTGATCATATTTTGGCATATCATTATCTCCCTTTCCTTGCAAAAGGAAATATCATTCAATTCCACAGTAAAAAAGTAAATATAGCAAATTTCTATAATTTACTAGAGTTAGTTAATTTATACTGATAAATTGCTCAAAAAATGATCATTAACCAATTAGATGACAGAGGGTGTATGGAAGCACGTAAACTCAGGTAGCTGGAAAATAGCTTGCCATCAAGGAACAGTCGTTGAGAACTTAGAGTAACTTTCTCAAACCTCGTCTAATGCCTTTGTACTTTCGCCGTGCTTTAATTCGTAAGCGTCGCTACCTCGGTAGGTATTTTGCACATCCAATGATGCAAAATCGCCGAGCAAAACGCGACGACTATAAACCCTCGGCTGTCCGCGTCACACAGCGTTACGTGCCTTGAAGCGGCACACTCCACTACTGTGCTCTCACATGACTCTACGGTTCGTATAGATTTTTAGACACTCGTTACGCTTGCTACAGACCTAACGGCCTTTCGCAACTCCGCTCTGCTAAAAACCCGAACCTACCTCGGCCTACTCACCCCGTGCTTAGCACTCCATGGCTCGCAGCGACTGAATAGTTTTGCCCAGTACATCGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTACTCTATACTAAGCCGCCATCAAATACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCGATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTATTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAACTTCATTAAAATCCGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGTTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCGGCAAACTCTGTTCCGTTGTCAGAAGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCTCGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTGCTTAACCGCTGATGAATCAACATTTTTTCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAATCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012512|21561:31760|21974_22532_-|WP_027242944.1|tail|DBSCAN-SWA MKTKIYLHGRLGRICGPFFELNIHHAREALYALSTQLPEFKKIIQAGEWAIFRKRQSLNLEQLELNCAGGELHIVPKPKGAKNSGFVQVLIGAALITAGYFSVGTALAPIAGGLSAAGTGLVISGALTMLSPQPSYDNDYSTTDPNASTLFSGVDNVAAPGAPVPLIYGEHLVGSSVVSSQYKTL >NZ_CP012512|21561:31760|25839_26421_+|WP_027242946.1|DBSCAN-SWA MPTQKHMEKITNLIDDLQKRITKLDGQIEAEAKSSFISSGLLEREKSKGSRPVEYYHNVREFSRKLLPKIASWARKALLLCECKNFLEEMTKDDSKALEHATHLNETYLRHSNLAVFEARFRSMTKSLCSKTYKILKSIAKENQQSAVAATNWGGGAYAVADIVNRHQSSGLTSVEEGLQVVELPQTQPAMQG >NZ_CP012512|21561:31760|21561_21978_-|WP_027242943.1|DBSCAN-SWA MKKTIHGTGGGGGKGGGSVHTPTEAPNTLSTNAVVTLVDLLGEGEIEGLVNGAQSVYFDDTPLQNADGSYNFEGVTLKSNNGTPSQDYLPGFAESASEEAFNVKVIHEQPVIRTVGRQETNELRVKIGLDALTEYANT >NZ_CP012512|21561:31760|27939_28125_-|WP_027242948.1|DBSCAN-SWA MIKSDPVKTALTYCDNVLSGRVIACDYVKKACQRHLNDLKYARDRGFYFDKEAACKAPSVI >NZ_CP012512|21561:31760|30407_30554_+|WP_169834793.1|DBSCAN-SWA MPLYFRRALIRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP012512|21561:31760|28127_28520_-|WP_053856795.1|terminase|DBSCAN-SWA MSQKPQDRVAICPDYFDEIAKGAFESAVSDLEYMHIKTASFQKQLEIYASAYSDWRQLSTVIEQKGRTFETTTQAGDTMYRSRPEVAQRNEAWKQVKTSLSELGLTPTAISRLNAQVSNTIESEIDKILD >NZ_CP012512|21561:31760|22877_23393_+|WP_027242945.1|DBSCAN-SWA MFKTLKRSVLVCVIPVLSSSLLITSAYATCYVDYKNSSENTWNITLKNLEGDTAHIYCPNKTLGYKESCTFPVNPGDSVSVGFSHTAGMIKAYISFSSTINGHSESLNDLLVEAIDDHCPEIYYNDSVPYGITLNKPSIGNVIFAPYSENESTLNKFSKINFEADTNKKFS >NZ_CP012512|21561:31760|26456_26849_-|WP_075275490.1|capsid|DBSCAN-SWA MLDLRSSVKAAYRRKASYLMHDSTYGSLLKMKDGNGQYIIQPDFKSGEGDLLRGKRVNTSDFMDTLAAGKCAALFGDFSNFIIADRGGISLRRLNELYAATGEVGYLMWLRVDALLLETDAIKQLKTAAA >NZ_CP012512|21561:31760|25516_25672_-|WP_168183246.1|DBSCAN-SWA MKVKILVPRAGINIAYNIGDIVDLPDKTAKAMIKHGDAEAVNIKTSKKKSK >NZ_CP012512|21561:31760|24484_25459_+|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP012512|21561:31760|24195_24441_-|WP_171824220.1|head,tail|DBSCAN-SWA MNSLLGVALQMTEGESHLRIDDNNEDEYLEFILAAALQAAEDYRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP012512|21561:31760|26945_27920_+|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP012512|21561:31760|29293_30160_-|WP_027242951.1|DBSCAN-SWA MPKYDQMIQKEIEQSSRRLYKDVDALRSGNTPVEMIPVAHHTVEYSNHKAKLSALSSRMPQSEAERTRDIHDFIAHSSARAALSGLARCEESLTSFMKVHIQSEAAELLPYMTVIFFNVQDPKVPENKNNHCFLMLSANDPSAQLQGFDFKTQVARVNQARQELLSVFERNPGDNYLVDPYLVECVSLKKALKGNNAEFMDAYDERSYLGLASADLGTVDSRDIDIHLITKKERELVTEFKQGNPDFVLNNSIHHTAGPWKDRFQFPFLSAHEEPEPEGEEAALYYCG >NZ_CP012512|21561:31760|28697_29081_-|WP_027242950.1|DBSCAN-SWA MPRRAKQICCYAGCHNTTYARYCEYHEQHGNRYHAPRKTTAQRGYGGRWQRERKIFLQDHPLCKQCLKDDKLIPAIEVDHIKPHDGDYELMWNQHNWQALCKPCHSRKTVNEDGGFGRKKSPQGRGV >NZ_CP012512|21561:31760|30785_31760_-|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA |
15 | unidentified_phage(37.5%) | head,transposase,tail,capsid,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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