Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP009158 | Glaesserella parasuis strain SH03 chromosome, complete genome | 7 crisprs | PD-DExK,DEDDh,WYL,cas3,cas2 | 6 | 3 | 15 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP009158_1 | 196288-196386 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009158_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP009158_1
>1.1|196318|39|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder ACCCAATGTCACTAATGAACATTCCCCAATGGCGGAAAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009158_1
The CRISPR arrays of NZ_CP009158_1 >merge|NZ_CP009158|1|196288-196386|CRISPRCasFinder CGACATTCGGGAAGAAGCAAAACCGCCATTACCCAATGTCACTAATGAACATTCCCCAATGGCGGAAAGCGACATTCGGGAAGAAGCAAAACCGCCATT >NZ_CP009158|1|1|196288-196386|CRISPRCasFinder CGACATTCGGGAAGAAGCAAAACCGCCATT ACCCAATGTCACTAATGAACATTCCCCAATGGCGGAAAG CGACATTCGGGAAGAAGCAAAACCGCCATT
>NZ_CP009158.1|WP_016527921.1|195251_195977_+|Rha-family-transcriptional-regulator MKTELLSTNQRENATLTMSSREIARITESRHRDVCLSIRNLMNKGVIGGYAESPYTHEQNGQVYYEYHINKRDTYVIVAQFSPEFTARLVDRWQELEQKQVQQLPSYSEALRQLADKIEESEQKSLQIASMESYFRNGISPFEFVKGLNGVNALKIGAFLVDKNWLYQDGNHKRVKSYARDQYLTEETTEISQHGKDPFVAYKPVLLKKGAAKLYEWYTKRELPMKANWNGVFTQDKVVGL >NZ_CP009158.1|WP_016527920.1|194704_194911_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MNNLAKVRESVGITQKQLADQLGFGQPRIANYETGNRTPSLADARRIVSALNKFGATTSLDDVFPVGS >NZ_CP009158.1|WP_038513492.1|193915_194572_-|LexA-family-transcriptional-regulator MKIGERIKAFRAKTGMNQKDFAEAVSKIDTRERSKWGQSRIANYETNVRMPDLDDIEVIAKVIGIDPAKLAFGDPNVEPVIVKNSYSYPLISSIQAGVWPEVFDYRDTEGYDYIDTEIDAGPDAFFLRVSGMSMEPKFSEGDLVLIDVRKRPHPGDFVAAVNGNGEATLKRYRELGELSPSGNPHFELVPLNQDFPTLSSMKQDIRIIGVAVEHRSYL >NZ_CP009158.1|WP_021114968.1|193438_193852_-|hypothetical-protein MRKIKLPNSDLADTFRKEETSALKAAKNMLLQEQKGDFDKDKLIDEIIMGRNPLLTADNIASRLGIPIEVFHQWVKNADPKYQIPTNSLFGELGRAMFNSSLERTEHYKFAKPDVYIGSYPRWTTETLRSWLRANLK >NZ_CP009158.1|WP_038513487.1|192562_192841_-|hypothetical-protein MKIVCQCLEVDVEKRYNNVRDILNDLSKIDYNGLDWQCTESDTSHEWNFTDEKGLTYQVTRQKGEKAYTVVKNNRKTTPKSDTLRDYLLTLK >NZ_CP009158.1|WP_157686076.1|192398_192566_-|hypothetical-protein MKIAIKAERHTFKTRTSLVAPKKNEPTAESQQKAQKIIGYQQEGHYFVAIVKEKK >NZ_CP009158.1|WP_021112693.1|191868_192015_+|hypothetical-protein MVLSPLSVPLTGKLGDSGLVVTSMVLLPICRHGSFSHKTKRSISQRGF >NZ_CP009158.1|WP_035491943.1|191415_191679_-|hypothetical-protein MTSMYAQISITVNGITMNRGITFTPPQNDHINMQKTAIQHQIEKLLEPIDAIERMQINAEKHFELKKWLTQAFQNELDVAQQDRSPT >NZ_CP009158.1|WP_131382560.1|191165_191474_+|hypothetical-protein MATVIFTLATVSKFLIVSHNIKEYNSISHNINRDLIMSNSEFTFANAVQVAAILLRNDIEIYDKDGTHISENVEAQSDLACRLFMLASGLVEQHQARFGKPE >NZ_CP009158.1|WP_038513483.1|190320_190962_-|DUF3560-domain-containing-protein MNTYAKFCPNVFLAKCQEQHEKNEIITVTSKYGNETEVEIHNLVKQQGGFYFYSFVRCDGLDSQARATAKAERYQEYADNAAKRSNQYCEAANEGRDFLSLAEPIKIGHHSEKQHRALIERNAKRMDKAVEEMKKAESYADKIAYWESMAEKIDLSMPESLEYFKHKLKEAEDKHSDLKKFPEKREHSYSLTYAKKAVNEFKEKVRLAELLWA >NZ_CP009158.1|WP_052157555.1|196803_197475_+|hypothetical-protein MQNVASMNLKSLVGQEPNYQVPAKATAIPDGAIRTVNQLFIQLRAIFPAWKNSFPDADSYREAKRIWLETLVNEKITTIEQLQNGIERAKKSKNPFWPSVGEFVEWCKAVDYEALGLPDEDKLYKRLQAFMAFGMEEIQKFKFVSTAEYYLITDLYVRCRTGEWSDKQLKDEIKKSLVKMSKRLKTREVLPEPKLALPQEVKAVDREKVRAFWGGLLKQVRGF >NZ_CP009158.1|WP_080716923.1|197709_198159_+|recombination-protein-NinB MEQRLVGMEHKQKYFLRTEQIKNNALEFVKALPIDEKKPLVIDVKPITRNLEQNAKFHAMCGDIARQVQFNGEWLPPETWKVILISAHAEATKEGSFLVTGLEGELVNIRESTAQMSVKRMASLIEYATSWGVSNGVHFNDRWNFWGVK >NZ_CP009158.1|WP_038513497.1|198155_198506_+|hypothetical-protein MMEIKSFSFGKLIADLAIVGGFVYSHLYLTDGAVNVYIWAFWAFSILTLMSAFIKPTKFLFTENRAKQMIISELTISLVLVYFGYPVLATVGFISTLAYAGCRTVKNNKKTGKHNE >NZ_CP009158.1|WP_038513501.1|198649_199219_+|NinG-recombination-protein MIKPKVKKRKCKCCGGEFKSADSFRKWCSAECGVKLAKIAQEKARQKAIEKRNREERAKIKATRERLKSRSEWLKDAQAVFNEYIRLRDKDEPCISCQRFHQGQYHAGHYRTVKAMPELRFNEDNVHKQCSACNNHLSGNITEYRINLVRKIGAERVEALESYHPPVKWSVEDCKEIIQTYKAKIKELK >NZ_CP009158.1|WP_038513503.1|199215_199593_+|antitermination-protein MIRLHISIDDILLVWVRRWASHRGCRGYPSLQSFMREATAQITKYSIDKLSEEQYLKLDEAVMTLHDLNLEAYQVLMAVFLQGQDKKNICLEMQISPTTFDNRLRTARDFMEGAVFGSGLIRLKF >NZ_CP009158.1|WP_021116919.1|199601_199787_-|hypothetical-protein MALTKKEIQEKSDKKRGVRMVGFKLHEEVIALLTELSEQSGLSKTQIVTQGIKLFAEQNKA >NZ_CP009158.1|WP_038513510.1|201610_202174_-|hypothetical-protein MYFREGYTKFPYRPSNGSEDCQNPTPNAGGIDLVNHPEKIDEILEIAQLPELKTTLIELNKPDSPFITLGCSHWIGKYDNSHFSYIEFTFKDAKIANNFNFLVQLEKDLHLFFIEKLTTGFTKEQRDSYATYLKDQVQVYFRKIQYQDDLELRNLLGLEFHFQDRQMVDFHHKALRHFLTQHLVLPL >NZ_CP009158.1|WP_038513512.1|202562_203108_+|lysozyme MRKLRKLGKVGGGVCFVSAIIAVLNTDFHGQFRTSKQGLEIIGDAEGCKREPYLCPANVLTVGIGSTEASSGKIERKVYTDKEIAQRWLVDIQHAEKCVKRYANGWNIPQSVFDVATSLTFNAGCGTVSKSTFFRKIKSGDYVGACNELPKWVYSGGKKLRGLEIRREKEKALCLAGLIKS >NZ_CP009158.1|WP_080716950.1|203107_203425_+|DUF2570-domain-containing-protein MALILGLCAWLWGQSRRIDSLTAENQTQAQTIEQQQKANNKLTMQLQQERQAVEYQQNVANKLRKQVEQSNEQIKAILQKEPCSVTALPRPVVDELKRLHSKDKD >NZ_CP009158.1|WP_080716925.1|203387_203591_+|hypothetical-protein MSLSGCTAKTKIEYLYPPQAFLVQCERSEFGGTTYGDAIEYLVKVMGERDLCAGQIDSIREWYNKYK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP009158_3 | 487252-487392 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009158_3
|
2 spacers
spacers of NZ_CP009158_3
>3.1|487276|39|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder GTGAACCGGGTCCTAAAGGTGAACAAGGTATTCCAGGCC >3.2|487339|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder GTCCTGCGGGTCCAGCAGGACCACAAGGCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009158_3
The CRISPR arrays of NZ_CP009158_3 >merge|NZ_CP009158|3|487252-487392|CRISPRCasFinder CTGCGGGTCCAGCGGGACCAAAGGGTGAACCGGGTCCTAAAGGTGAACAAGGTATTCCAGGCCCTGCGGGTCCAGCGGGACCACAAGGTCCTGCGGGTCCAGCAGGACCACAAGGCCCTGCGGGTCCAACGGGATCACAAG >NZ_CP009158|3|3|487252-487392|CRISPRCasFinder CTGCGGGTCCAGCGGGACCAAAGG GTGAACCGGGTCCTAAAGGTGAACAAGGTATTCCAGGCC CTGCGGGTCCAGCGGGACCACAAG GTCCTGCGGGTCCAGCAGGACCACAAGGCC CTGCGGGTCCAACGGGATCACAAG
>NZ_CP009158.1|WP_038513750.1|485113_487243_+|hypothetical-protein MNKIFRVIWSHTQQAWVVVSELVKSHTKTSACTDKRAQVCTSDYFLDKQQDKFKLSLLSLVLLSIFFSPVAVGVDRHKGSPYLQDGATKSNLGTDDGTIGIGKSSKAGYGAIAIGQYSKAEARHNVAIGYDSNAGTGTNSITIGYNTQVTGEEGIAIGKQSKAGGRSVVLGGQADAANIEQAVVIGNLAKASKAQSIAIGANTKAEGYGSISIGGDDLKTTKYQTGNQGQSKTTTAKGKASVAIGGMSLAGGEGSIVLGPVASASHVEGIAIGARSKSTAEYGIAVGGGATAGKNAVAVGRDSKGAGEDSIAIGNSAKTTGADSVVVGANINVTDGQLVAIGYQASAKSHSTALGYKASAGGMHSVAVGDNAVTNDGAARATALGNNTVVTVGGGVALGYGSNASTAGGVEGLKQNHSVTTGTSTEANGFKSTEKVDGNNKIGAVSVGNNLIKRQIVNVAAGTQDTDAVNVAQLKSLTMQTGGDNNSSGKVGIWNGTLKVVGTSGEIKTSASNDTITLKLDETLKNKIDKIDNLGWKLAITQGSGGQATPLNSPHLIKMDQTVTFTAGNNIKLEQVGGNITISTIIGKLITKTESLADGGLKITYTDNSHDIIKKGEKGDRGEKGPKGDRGETGPAGPAGPRGEPGPVGPAGPQGTPGPAGPRGPQGTAGAQGPKGDKGEPGEAGPAGPRGPAGPKGDAGPKGDTGQER >NZ_CP009158.1|WP_005714548.1|483736_484345_+|SH3-domain-containing-protein MQKHISLFCSTLLLAISLPSFAQTQYVTENLNTYLRKGPGDQFKIFGSIQAGEKVTLIETKDRYSLIRDSKNREAWILNSELTSTPSSKELTPLLQQQVQELTTKLNNIDRDWQQRTAEMQRRVQQSALQSSELLEQNALLKRELEIIKNKNRDLEAIQDVASREIMIQYFIYGGAVLGLGLIFGLLIPALLPRRKSNYRWN >NZ_CP009158.1|WP_026916902.1|482400_483663_+|inorganic-phosphate-transporter MELIQEYGSMIVFITAVFGFFMAFGIGANDVSNAMGTSVGSGTITAKQAILVAMVFEFAGAYLAGGEVTETIKSGIIDIHHFSGRPDTLVLGMMSALFAAGTWLLLASKMGWPVSTTHSIIGAIIGFALVTVGAEAVHWGDLSGIVGSWFVTPVVSGIIAYAIFTSTQKLIFDTDNPMKNAQKYGPFYMGLTTFILSIVTMTKGLKHVGLQLTMTETLVISSAISITSIITCFFYFRSQSFANRVQGGAFGGVEKVFSILMLLTACSMAFAHGSNDVANAIGPLSAVVSIVENGGVIEAKSILAPWILPLGATGIVAGLAVMGYKVMGTIGTGITDLTPSRGFSAEFATAMTVVVASGTGLPISTTQTLVGAVLGVGFARGIAALNLTVIRNIVASWVVTLPAGAFFSILIFYILNAIFY >NZ_CP009158.1|WP_005714552.1|481700_482381_+|TIGR00153-family-protein MAKNNILGLFAQSPLKPLQKHSKKVTECCGLLIPFFEASFQKNWEVAEDIRRQVIDLENRADTLKREIRLKSPRGLFMPVERTDLLELVTQLDKLANYAKDISGRAIGRQLNIPEEIQPIFQQFLTRSLDATVHVDKVINEMDHLLETGFRGRELNFVNNMILELDVIEDDTDQLQIVLRRAMLAIEQQYNPIDIMFLYKIIEWVGVLADQAQRIGSRIELMLARS >NZ_CP009158.1|WP_005714554.1|480407_481391_-|phenylalanine--tRNA-ligase-subunit-alpha MQNLENIVAEALQAVEKASDVASLEALRVEYFGKKGHFTLLMQGLRDVPADERPAVGAKINEAKQKAQDALNGKKEQLETEELNAKLASESIDVSLPGCKTELGGLHPVSITIERVVKFFSELGFSVEKGPEIETDYYNFDALNIPAHHPARADHDTFWFDAERLLRTQTSGVQIRTMEKMQPPIRIMAPGRVYRNDYDQTHTPMFHQIELLYVDKKANFTELKGLLHDFLRAFFEEDLQVRFRPSYFPFTEPSAEVDVMGKNGKWLEVLGCGMVHPNVLRNVGIDPDEYTGFAVGMGVERLTMLRYNVTDLRSFFENDLRFLKQFK >NZ_CP009158.1|WP_038513747.1|477864_480252_-|phenylalanine--tRNA-ligase-subunit-beta MKFSESWLREWVNPAITIEQLCDQITMLGLEVDAVEAVAGEFNGVVIGEVVECAQHPDADKLRVTKVNVGGERLLDIVCGAPNCRQGLKVACATDGAVLPGDFKIKKTKLRGQPSEGMLCSFSELGIKEDHSGIIELPADAPVGIDFRDYLKLNDRAIEISLTPNRADCLSIAGIAREVGVVNQLAVNAPEIQAVPATIADKVTIELQAPEACPRYLGRVVKNVNVKAQSPLWLQEKLRRCGIRSIDPIVDITNLSLLELGQPMHAFDAAKINGTIQVRMAKEGEELILLDGTTAKLQPNTLLIADQNGPLAMAGIFGGEASGVSAETKDVVLEAAFFAPLAITGRARQYGLHTDASHRFERGVDPELTRKAMERATALLLEICGGEAGEIVEAVSSAHLPTSKQVVLRRSKLDSLLGHHIETETVTDILARLGLNPSYADESWTVQSPSWRFDIEIEEDLVEEVARIYGYNSIPNNAPLAHLQMKGFPEKILEAIRVRTALVDSDYQEVITYSFVDPKVQELLHPSQEALILPNPISSEMSAMRVSLLTGLLETVAYNQNRQQNRVRIFESGLRFIPDTNAENGIRQEFVLGAVIVGDKRPAHWEHKAENVDFFDLKGDLERVLSLTNAGNRLRFVAKSYPAFHPGQSAAILLDDQEIGYIGTIHPKVVQKLGLSGKPVAFELLWSAIAERSVPNAKEISRFPANKRDIAVVVDSNLPAGDLLDVARQAGGAKLVAVNLFDVYQGTNLPEGKKSLAISLTIQDTEKTLEEEEINAVLQAVLETLAQRFNAYLRD >NZ_CP009158.1|WP_005710633.1|477551_477848_-|integration-host-factor-subunit-alpha MALTKIEIAENLVERCGLDKRIAKQFVEDFFEEIRRSLESGEEVKLSGFGNFTVRDKKARPGRNPKTGEDVAVSARRVVVFKAGQKLRERVENAKVKA >NZ_CP009158.1|WP_038513743.1|476986_477499_-|endopeptidase MFSQLIKKHFSLYTMLFCAFLLSACVSKITTVQDKSGNKHKGQLSDSIFVISSLSEHQREWKGTRYRLGGITKSGIDCSGFVQLTFRELFGIDLPRITVDQAKAGIQISKSELRTGDLVFFKTGRGPNGRHVGIYVKNGQFLHASTKGGVIYSDINSPYWSRSFWQARRL >NZ_CP009158.1|WP_010786629.1|476143_476797_-|uridine-kinase MSNTTQKESCIVIAIAGASASGKSLIASTIYKELQAELGQDDIGIISEDAYYRDQSHLAMEERVKTNYDHPNSMDHELLVTHLKSLKQGQAVDIPEYDYAEHNRKETVTHFTPKKIIILEGILLLTDEKIRDEINVSIFVDAPLDICFIRRLQRDMEERGRTMESIVNQYRKTVRPMFLQFVEPSKQYADIIIPKGGKNRIAINILKAQIKQLLGHS >NZ_CP009158.1|WP_005710639.1|475542_476127_-|dCTP-deaminase MRLCDKDIERYLDEGIISLTPRPSNEKISGATIDVRLGNSFRVFREHSTPYIDLSGPREEMTAQLNRVMSDEILIADDEAFFLHPGELALATTLESVKLPANIVGWLDGRSSLARLGLMVHVTAHRIDPGWEGKIVLEFFNAGKLPLALRPNMAIGALSFEILSGYAEHPYNARKDAKYKNQQSAVFSRIDKDE >NZ_CP009158.1|WP_005712327.1|488397_489033_-|endonuclease-III MNKEKRIEILTRLRNENPHPTTELNYSNPFELLIAVILSAQATDVGVNKATAKLYPVANTPQAILDLGLDGLKEYIKTIGLYNSKAENIIKTCRDLIEKHNGEVPQTREELEALAGVGRKTANVVLNTAFGQPTIAVDTHIFRVSNRTNFAPGKDVVKVEEKLLKVVPDEFKVDVHHWLILHGRYTCIARKPRCGSCIIEDLCEYKEKTEI >NZ_CP009158.1|WP_038513754.1|489036_489810_-|TSUP-family-transporter MELGLDVAIILFVAAFVAGFIDAIAGGGGLITIPALLAVGIPPTVALGTNKLQACGGSFSASLYFVRKKVVDLKQIWLLILLTFIGGSIGTILVQMIDVNALKVALPFLILIIGCYFLFSPSLGDEQRRQRMSFPMFACTAAMGIGFYDGLFGPATGSFFTLAFVLLLGFNLTQSVAHSKVLNFTSNLASLIFFIIGGAILWKIGFLMMIGQFIGASLGARMVVTKGKQIIRPLIVMISFIMVVKMLWDQSYFAFIG >NZ_CP009158.1|WP_038513756.1|489832_490933_-|glutamate-5-kinase MAKTIVVKLGTSTLTHGTKSLSRPHMLEIVKQIAQLHEQGYRVILVTSGAVAAGRDYLGHRELPKTLATKQLLAAVGQSQLIQVWESLFSIYNIKIGQMLLTRADIENKDHFLNARDTLTALLDQQIIPIINENDAVATAEFRIGDNDNLSALVAILAQAELLILLTDQEGLYDSDPRSNQNAKRIPVVEKITPEIRQMAGGSGTTLGTGGMSTKITAADIATRSGVETAIASGERPNVIFEVAQGAEIGTRFLAQHDKIEGRKQWLFGAPPAGTIYIDQGAENALVEQHKSLLPTGIAKIEGQFARGEVAKICNLNGKVLALGISRYNSDALALIKGKKSSEIETILGYEFGSVVFHRDEMVVHY >NZ_CP009158.1|WP_038515126.1|491012_491510_+|type-3-dihydrofolate-reductase MQISLIVARTLNKVIGKDNTMPWHLPVDLAWFRANTLGKPVIMGRKTYESIGRLLPKRPNIILSRSDFAIDGAYSATSLEQAVELAKNFANSDEIMIIGGGELYKQAMPFADKLYLTEIQANIEGDTFFEFDETQWQQVAEKWSEVDEQNSYRCRFMILDRLKND >NZ_CP009158.1|WP_005712334.1|491698_493294_+|L-lactate-permease MALFLSIFPIVLLIYLMVKRNALPSYVALPWIAVVVLIIQLIYFGTDIQTVSANIASALIAVQTPITVIFGAVLFNRFSEVSGATDVLRKWLSNINPNPVAQLMIIGWAFAFMIEGASGFGTPAAIAAPILVGIGFHPLKVAMLALVMNSVPVSFGAVGTPTWFGMGALQLGEEQILEIGSITAFIHSIAAFIIPVMALRLIVSWSEIRKNIVFIYISIFACVIPYFLIAQLNYEFPSLVGGAIGMVISVLVANKGIGLAKVDNTVDSNAVTTAQVVKALFPTGLLIAILIVTRIKQLPLKAMMNDATSWFSVKLGSLGVFDISHGLIFSLKEIFGTTISSNYKLLYVPALIPFVITVLIAIPVFAVSAKNTKEIFATSLKQTKNPFFALVGALIMVNLMLVGGDGSMVKIIGQSFAQATGEYWTIFASYLGAVGAFFSGSNTVSNLTFGSVQLSTAMETGLSVSLILAAQSVGGAMGNMVCINNIVAVCSVLNINNKEGEIIKRTVMPMFVYGVITALSALFIVPLFYNV >NZ_CP009158.1|WP_005712335.1|493662_494394_+|(Fe-S)-binding-protein MNVNFYVTCIADIVKAGVAKNSVLLLEKLGCKITFLEKQGCCGQPAINSGYTKQALEGMKKLVETFEVNDYPIVAPAGSCVYAIKTYPDHFERFGEPEWAARAKKVADRFHDLTDFIVNKLGVTNVGATLTGKAVYHPSCSLSRKLGIVNEPITLLQNVKGLELLPIQNQQTCCGFGGTFSVKMAEISGEMVKEKVEHIADVEPEYLIGADVSCLMNIGGRLSREGKNIKVMHIAEVLMQEGK >NZ_CP009158.1|WP_005712336.1|494395_495802_+|iron-sulfur-cluster-binding-protein MSLKTSNLAFKKRVDDQIHNAMMRKAVVKAQETIGANRQRMVDELGHWEEWRDAAKQIRNHVLANLDAYLYQLSEKVQQNGGKVFFAETAEEATAYIRQIALEKNAKKIVKSKSMVTEEIGLNHVLENEGIKVVETDLGEYLLQIVGDKPSHIVVPAIHKDRYKIRQELHEQLGYNGSETPEEMTAFVRQVIRKDFLEADIGISGCNFAVAETGSVCLVTNEGNLRLATTVPKTHIAVMGMERLAPTFQEVDVLITMLARSAVGAKLTAYNTWLTGPRLEGETDGPEEFHLVIVDNGRSKILESEFKEVLRCIRCGACLNTCPAYRQIGGHGYGSIYPGPIGSVISPLLGGYEEFKELPYACSLCTACNSVCPVKIPLAQLILKHREHIAQNGMTPAAERLSIFGFNFANSHPTLWKVGVNIGAKVAGKFIKNGKAPIQVGALAEWTKARDLPSAEGESFREWFNNRG >NZ_CP009158.1|WP_005712337.1|495806_496508_+|lactate-utilization-protein-C MDLQNRENFLNKLAERMGRPRQLVPEPMPKLVNDYPTTRLTDRTQAQLVEEFVSFAKVMMTDVAVVKEENLIAEVTALCDKYGGGSVIINNDSRLVDLGITPALQAKYDSYVWDHNADGSVNIDKAEKANIGVVYGEYGLTESGGIVLFSDKEFGRSVSLLPEKSIVVLRASTVLPRVAQLAKILHDKAQQGERMPSCVNIISGPSATADIELIKVVGVHGPVNKVYVVIDDL >NZ_CP009158.1|WP_010786694.1|496619_497924_+|acetyl-CoA-C-acyltransferase MAKQNLLTAQGERVAIVAGLRTPFVHRDTGFKSSYATDLGTMVTNELLSRTAVDHQHIEQLVFGQVIQQPDIPNPSREIALALNMPYVQAYTLSSSCLSGLQALVNVAGSIISGSISAGIAGGTDSISNAPFSISPRVIHKLKAIFNAPTLDDKYRLFREFSWKELKPHGVNLKDYMTQMSVAEISEQMAQQFHISREAQDEYALNSHIKAQNAWKLGLLKDEVMPSFPRPYTDFVVSDSLISSATKAAYYEKFSPLMNKSYATVTEANMPRTVDGAAAVLLMRENKAKELGLEPLGYIRSYAIAGNDIWQNMFMGATVASHLALERANVSLSDLDFVDIHETSASQMLVNMKLFASDEFAKKQLNRSACIGEIDPEKLNHLGGSIAFGNPRAATSLRILVQSLKALKRKGGGLSLIASSGLGGLGSAMILESE >NZ_CP009158.1|WP_035490137.1|497928_500049_+|fatty-acid-oxidation-protein-subunit-alpha MTTQAQYISPFHVEIDDNRIAIVRIDVKGKSQNWLPEQFIEDLRDVIGSVIYQQARGVIFVSGKEKGFIQGYDPDHLRGKNDEQLKTLSHNAQLVMREINTLKMPAVAVIDGGCYGVGLELALACDYRIASEEGYTKFAMPQIRSGILPFAGGTQRLPRLVGLQNAVTMLLSGQKIGVEKALKIGLVDKLIPASNLFETAYQLLLNHKVQKVDHKNPLDKVKKWRKQLEGNKFIREKYLAHIENRVWDKAFGNYPAVTEMLALLKEPHFKAGLALEQNALVNLMHTEQAQVLMNLKQTERAMKEQYQHLAQVRDVQQVTVLGSGYMGAGIAYLTANNAQIPVRIKDIHPSEIQKALQTCYGLMQKAVDKKQLSHGEMIQRMNLITGGERLVAAKSTDFIVEAVYEKLELKQQMVQESENYYEENAIFATNTSTFAIRDIASVAKRPENVIGFHYFSPVTKRPMVEIIPHEKTCQRAVSTAIHFAIQQGKIPMLVADKEGFFINRILTPFLLEAIECLSEGEGIEFIDRALQEFGFKIGPLAMIDEIGLDIIVKSNPAMVSELGKRFALPTTIERLTGDDRKGRKNKRGFYLYDTRGKRTQEDKSVYHTMETIMQNEMEAEDIARRCVLRMLNEACWCLQDQVIRSTDEGNVASVFGVDFPDFRGGVYAYIDKIGAKELVRQLRKHTQQYGERFTPCEWLVERAEKA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP009158_2 | 487017-487185 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009158_2
|
2 spacers
spacers of NZ_CP009158_2
>2.1|487041|39|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder GTGAACCGGGTCCAGTGGGGCCAGCTGGACCACAAGGTA >2.2|487104|57|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder GACCGCAGGGAACAGCGGGTGCTCAGGGACCTAAGGGGGATAAAGGCGAACCAGGAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009158_2
The CRISPR arrays of NZ_CP009158_2 >merge|NZ_CP009158|2|487017-487185|CRISPRCasFinder CTGCGGGTCCAGCGGGGCCTAGGGGTGAACCGGGTCCAGTGGGGCCAGCTGGACCACAAGGTACACCTGGTCCAGCAGGACCACGAGGACCGCAGGGAACAGCGGGTGCTCAGGGACCTAAGGGGGATAAAGGCGAACCAGGAGAAGCGGGTCCAGCAGGACCACGAGG >NZ_CP009158|2|2|487017-487185|CRISPRCasFinder CTGCGGGTCCAGCGGGGCCTAGGG GTGAACCGGGTCCAGTGGGGCCAGCTGGACCACAAGGTA CACCTGGTCCAGCAGGACCACGAG GACCGCAGGGAACAGCGGGTGCTCAGGGACCTAAGGGGGATAAAGGCGAACCAGGAG AAGCGGGTCCAGCAGGACCACGAGG
>NZ_CP009158.1|WP_005714548.1|483736_484345_+|SH3-domain-containing-protein MQKHISLFCSTLLLAISLPSFAQTQYVTENLNTYLRKGPGDQFKIFGSIQAGEKVTLIETKDRYSLIRDSKNREAWILNSELTSTPSSKELTPLLQQQVQELTTKLNNIDRDWQQRTAEMQRRVQQSALQSSELLEQNALLKRELEIIKNKNRDLEAIQDVASREIMIQYFIYGGAVLGLGLIFGLLIPALLPRRKSNYRWN >NZ_CP009158.1|WP_026916902.1|482400_483663_+|inorganic-phosphate-transporter MELIQEYGSMIVFITAVFGFFMAFGIGANDVSNAMGTSVGSGTITAKQAILVAMVFEFAGAYLAGGEVTETIKSGIIDIHHFSGRPDTLVLGMMSALFAAGTWLLLASKMGWPVSTTHSIIGAIIGFALVTVGAEAVHWGDLSGIVGSWFVTPVVSGIIAYAIFTSTQKLIFDTDNPMKNAQKYGPFYMGLTTFILSIVTMTKGLKHVGLQLTMTETLVISSAISITSIITCFFYFRSQSFANRVQGGAFGGVEKVFSILMLLTACSMAFAHGSNDVANAIGPLSAVVSIVENGGVIEAKSILAPWILPLGATGIVAGLAVMGYKVMGTIGTGITDLTPSRGFSAEFATAMTVVVASGTGLPISTTQTLVGAVLGVGFARGIAALNLTVIRNIVASWVVTLPAGAFFSILIFYILNAIFY >NZ_CP009158.1|WP_005714552.1|481700_482381_+|TIGR00153-family-protein MAKNNILGLFAQSPLKPLQKHSKKVTECCGLLIPFFEASFQKNWEVAEDIRRQVIDLENRADTLKREIRLKSPRGLFMPVERTDLLELVTQLDKLANYAKDISGRAIGRQLNIPEEIQPIFQQFLTRSLDATVHVDKVINEMDHLLETGFRGRELNFVNNMILELDVIEDDTDQLQIVLRRAMLAIEQQYNPIDIMFLYKIIEWVGVLADQAQRIGSRIELMLARS >NZ_CP009158.1|WP_005714554.1|480407_481391_-|phenylalanine--tRNA-ligase-subunit-alpha MQNLENIVAEALQAVEKASDVASLEALRVEYFGKKGHFTLLMQGLRDVPADERPAVGAKINEAKQKAQDALNGKKEQLETEELNAKLASESIDVSLPGCKTELGGLHPVSITIERVVKFFSELGFSVEKGPEIETDYYNFDALNIPAHHPARADHDTFWFDAERLLRTQTSGVQIRTMEKMQPPIRIMAPGRVYRNDYDQTHTPMFHQIELLYVDKKANFTELKGLLHDFLRAFFEEDLQVRFRPSYFPFTEPSAEVDVMGKNGKWLEVLGCGMVHPNVLRNVGIDPDEYTGFAVGMGVERLTMLRYNVTDLRSFFENDLRFLKQFK >NZ_CP009158.1|WP_038513747.1|477864_480252_-|phenylalanine--tRNA-ligase-subunit-beta MKFSESWLREWVNPAITIEQLCDQITMLGLEVDAVEAVAGEFNGVVIGEVVECAQHPDADKLRVTKVNVGGERLLDIVCGAPNCRQGLKVACATDGAVLPGDFKIKKTKLRGQPSEGMLCSFSELGIKEDHSGIIELPADAPVGIDFRDYLKLNDRAIEISLTPNRADCLSIAGIAREVGVVNQLAVNAPEIQAVPATIADKVTIELQAPEACPRYLGRVVKNVNVKAQSPLWLQEKLRRCGIRSIDPIVDITNLSLLELGQPMHAFDAAKINGTIQVRMAKEGEELILLDGTTAKLQPNTLLIADQNGPLAMAGIFGGEASGVSAETKDVVLEAAFFAPLAITGRARQYGLHTDASHRFERGVDPELTRKAMERATALLLEICGGEAGEIVEAVSSAHLPTSKQVVLRRSKLDSLLGHHIETETVTDILARLGLNPSYADESWTVQSPSWRFDIEIEEDLVEEVARIYGYNSIPNNAPLAHLQMKGFPEKILEAIRVRTALVDSDYQEVITYSFVDPKVQELLHPSQEALILPNPISSEMSAMRVSLLTGLLETVAYNQNRQQNRVRIFESGLRFIPDTNAENGIRQEFVLGAVIVGDKRPAHWEHKAENVDFFDLKGDLERVLSLTNAGNRLRFVAKSYPAFHPGQSAAILLDDQEIGYIGTIHPKVVQKLGLSGKPVAFELLWSAIAERSVPNAKEISRFPANKRDIAVVVDSNLPAGDLLDVARQAGGAKLVAVNLFDVYQGTNLPEGKKSLAISLTIQDTEKTLEEEEINAVLQAVLETLAQRFNAYLRD >NZ_CP009158.1|WP_005710633.1|477551_477848_-|integration-host-factor-subunit-alpha MALTKIEIAENLVERCGLDKRIAKQFVEDFFEEIRRSLESGEEVKLSGFGNFTVRDKKARPGRNPKTGEDVAVSARRVVVFKAGQKLRERVENAKVKA >NZ_CP009158.1|WP_038513743.1|476986_477499_-|endopeptidase MFSQLIKKHFSLYTMLFCAFLLSACVSKITTVQDKSGNKHKGQLSDSIFVISSLSEHQREWKGTRYRLGGITKSGIDCSGFVQLTFRELFGIDLPRITVDQAKAGIQISKSELRTGDLVFFKTGRGPNGRHVGIYVKNGQFLHASTKGGVIYSDINSPYWSRSFWQARRL >NZ_CP009158.1|WP_010786629.1|476143_476797_-|uridine-kinase MSNTTQKESCIVIAIAGASASGKSLIASTIYKELQAELGQDDIGIISEDAYYRDQSHLAMEERVKTNYDHPNSMDHELLVTHLKSLKQGQAVDIPEYDYAEHNRKETVTHFTPKKIIILEGILLLTDEKIRDEINVSIFVDAPLDICFIRRLQRDMEERGRTMESIVNQYRKTVRPMFLQFVEPSKQYADIIIPKGGKNRIAINILKAQIKQLLGHS >NZ_CP009158.1|WP_005710639.1|475542_476127_-|dCTP-deaminase MRLCDKDIERYLDEGIISLTPRPSNEKISGATIDVRLGNSFRVFREHSTPYIDLSGPREEMTAQLNRVMSDEILIADDEAFFLHPGELALATTLESVKLPANIVGWLDGRSSLARLGLMVHVTAHRIDPGWEGKIVLEFFNAGKLPLALRPNMAIGALSFEILSGYAEHPYNARKDAKYKNQQSAVFSRIDKDE >NZ_CP009158.1|WP_010786632.1|473897_475412_+|amidophosphoribosyltransferase MCGIVGIIGQTPVNQALYDGLTLLQHRGQDAAGIVTIDDENRFRLRKANGLVSDVFRQEHMLRLQGNVGIGHVRYPTAGSSSVSEAQPFYVNSPYGLTLVHNGNLTNNAELKRLLFNLAKRHVNTNSDSESLLNIFAYYLDQYPHEPLTPENIFESVRKTNQVIRGAYACLAMIIGHGMVAFRDPLGIRPLVLGKREIDGKTEYMFASESVALDVVGFEYVRDVQAGEAIYITFDGQFYSAICADNPKLNPCIFEYVYFARPDSVIDGVSVYAARVHMGKFLGEKIAKEWTDILADIDVVIPIPETSTDIALQIATVLKKTYRQGFVKNRYVARTFIMPGQAQRKNSVRRKLNAIASEFKGKNVLLVDDSIVRGTTSEQIVEMARQAGANKVYFASAAPEVRYPNVYGIDMPTCEELVAYNRSVEQVAEMIGVDRLIFQDLSALFKSVQLENPDIHNFDASVFTGEYITGDVSCEYLNAIAQARNDKAKTAQAKQAGNLEIHNE >NZ_CP009158.1|WP_038513752.1|487205_488159_+|hypothetical-protein MQVQKVIQVRRGETGSAGPAGPKGEPGPKGEQGIPGPAGPAGPQGPAGPAGPQGPAGPTGSQDPAGPTGNSELKGITSIANGNDATKANGAKITLSAGSTDKTVNVNDAKITNVAAGTADTDAVNVSQLNTKAAAARTEVEAGKNVKVTSKTGANGQNIYNVSVSGDLSDITSISNGDTKVSLGKDKQGNPVVNMNGARITNVGDGSAEGDIVNVRQLNKVVSSVNTGFNQLSRDIGRVDVNARAGIASAGAMANLPQISLPGKSAISVSNAQYRGQSAYAIGYSRISDNGKWLIRASVSSNTQRDTMIGGGVGFVW >NZ_CP009158.1|WP_005712327.1|488397_489033_-|endonuclease-III MNKEKRIEILTRLRNENPHPTTELNYSNPFELLIAVILSAQATDVGVNKATAKLYPVANTPQAILDLGLDGLKEYIKTIGLYNSKAENIIKTCRDLIEKHNGEVPQTREELEALAGVGRKTANVVLNTAFGQPTIAVDTHIFRVSNRTNFAPGKDVVKVEEKLLKVVPDEFKVDVHHWLILHGRYTCIARKPRCGSCIIEDLCEYKEKTEI >NZ_CP009158.1|WP_038513754.1|489036_489810_-|TSUP-family-transporter MELGLDVAIILFVAAFVAGFIDAIAGGGGLITIPALLAVGIPPTVALGTNKLQACGGSFSASLYFVRKKVVDLKQIWLLILLTFIGGSIGTILVQMIDVNALKVALPFLILIIGCYFLFSPSLGDEQRRQRMSFPMFACTAAMGIGFYDGLFGPATGSFFTLAFVLLLGFNLTQSVAHSKVLNFTSNLASLIFFIIGGAILWKIGFLMMIGQFIGASLGARMVVTKGKQIIRPLIVMISFIMVVKMLWDQSYFAFIG >NZ_CP009158.1|WP_038513756.1|489832_490933_-|glutamate-5-kinase MAKTIVVKLGTSTLTHGTKSLSRPHMLEIVKQIAQLHEQGYRVILVTSGAVAAGRDYLGHRELPKTLATKQLLAAVGQSQLIQVWESLFSIYNIKIGQMLLTRADIENKDHFLNARDTLTALLDQQIIPIINENDAVATAEFRIGDNDNLSALVAILAQAELLILLTDQEGLYDSDPRSNQNAKRIPVVEKITPEIRQMAGGSGTTLGTGGMSTKITAADIATRSGVETAIASGERPNVIFEVAQGAEIGTRFLAQHDKIEGRKQWLFGAPPAGTIYIDQGAENALVEQHKSLLPTGIAKIEGQFARGEVAKICNLNGKVLALGISRYNSDALALIKGKKSSEIETILGYEFGSVVFHRDEMVVHY >NZ_CP009158.1|WP_038515126.1|491012_491510_+|type-3-dihydrofolate-reductase MQISLIVARTLNKVIGKDNTMPWHLPVDLAWFRANTLGKPVIMGRKTYESIGRLLPKRPNIILSRSDFAIDGAYSATSLEQAVELAKNFANSDEIMIIGGGELYKQAMPFADKLYLTEIQANIEGDTFFEFDETQWQQVAEKWSEVDEQNSYRCRFMILDRLKND >NZ_CP009158.1|WP_005712334.1|491698_493294_+|L-lactate-permease MALFLSIFPIVLLIYLMVKRNALPSYVALPWIAVVVLIIQLIYFGTDIQTVSANIASALIAVQTPITVIFGAVLFNRFSEVSGATDVLRKWLSNINPNPVAQLMIIGWAFAFMIEGASGFGTPAAIAAPILVGIGFHPLKVAMLALVMNSVPVSFGAVGTPTWFGMGALQLGEEQILEIGSITAFIHSIAAFIIPVMALRLIVSWSEIRKNIVFIYISIFACVIPYFLIAQLNYEFPSLVGGAIGMVISVLVANKGIGLAKVDNTVDSNAVTTAQVVKALFPTGLLIAILIVTRIKQLPLKAMMNDATSWFSVKLGSLGVFDISHGLIFSLKEIFGTTISSNYKLLYVPALIPFVITVLIAIPVFAVSAKNTKEIFATSLKQTKNPFFALVGALIMVNLMLVGGDGSMVKIIGQSFAQATGEYWTIFASYLGAVGAFFSGSNTVSNLTFGSVQLSTAMETGLSVSLILAAQSVGGAMGNMVCINNIVAVCSVLNINNKEGEIIKRTVMPMFVYGVITALSALFIVPLFYNV >NZ_CP009158.1|WP_005712335.1|493662_494394_+|(Fe-S)-binding-protein MNVNFYVTCIADIVKAGVAKNSVLLLEKLGCKITFLEKQGCCGQPAINSGYTKQALEGMKKLVETFEVNDYPIVAPAGSCVYAIKTYPDHFERFGEPEWAARAKKVADRFHDLTDFIVNKLGVTNVGATLTGKAVYHPSCSLSRKLGIVNEPITLLQNVKGLELLPIQNQQTCCGFGGTFSVKMAEISGEMVKEKVEHIADVEPEYLIGADVSCLMNIGGRLSREGKNIKVMHIAEVLMQEGK >NZ_CP009158.1|WP_005712336.1|494395_495802_+|iron-sulfur-cluster-binding-protein MSLKTSNLAFKKRVDDQIHNAMMRKAVVKAQETIGANRQRMVDELGHWEEWRDAAKQIRNHVLANLDAYLYQLSEKVQQNGGKVFFAETAEEATAYIRQIALEKNAKKIVKSKSMVTEEIGLNHVLENEGIKVVETDLGEYLLQIVGDKPSHIVVPAIHKDRYKIRQELHEQLGYNGSETPEEMTAFVRQVIRKDFLEADIGISGCNFAVAETGSVCLVTNEGNLRLATTVPKTHIAVMGMERLAPTFQEVDVLITMLARSAVGAKLTAYNTWLTGPRLEGETDGPEEFHLVIVDNGRSKILESEFKEVLRCIRCGACLNTCPAYRQIGGHGYGSIYPGPIGSVISPLLGGYEEFKELPYACSLCTACNSVCPVKIPLAQLILKHREHIAQNGMTPAAERLSIFGFNFANSHPTLWKVGVNIGAKVAGKFIKNGKAPIQVGALAEWTKARDLPSAEGESFREWFNNRG >NZ_CP009158.1|WP_005712337.1|495806_496508_+|lactate-utilization-protein-C MDLQNRENFLNKLAERMGRPRQLVPEPMPKLVNDYPTTRLTDRTQAQLVEEFVSFAKVMMTDVAVVKEENLIAEVTALCDKYGGGSVIINNDSRLVDLGITPALQAKYDSYVWDHNADGSVNIDKAEKANIGVVYGEYGLTESGGIVLFSDKEFGRSVSLLPEKSIVVLRASTVLPRVAQLAKILHDKAQQGERMPSCVNIISGPSATADIELIKVVGVHGPVNKVYVVIDDL >NZ_CP009158.1|WP_010786694.1|496619_497924_+|acetyl-CoA-C-acyltransferase MAKQNLLTAQGERVAIVAGLRTPFVHRDTGFKSSYATDLGTMVTNELLSRTAVDHQHIEQLVFGQVIQQPDIPNPSREIALALNMPYVQAYTLSSSCLSGLQALVNVAGSIISGSISAGIAGGTDSISNAPFSISPRVIHKLKAIFNAPTLDDKYRLFREFSWKELKPHGVNLKDYMTQMSVAEISEQMAQQFHISREAQDEYALNSHIKAQNAWKLGLLKDEVMPSFPRPYTDFVVSDSLISSATKAAYYEKFSPLMNKSYATVTEANMPRTVDGAAAVLLMRENKAKELGLEPLGYIRSYAIAGNDIWQNMFMGATVASHLALERANVSLSDLDFVDIHETSASQMLVNMKLFASDEFAKKQLNRSACIGEIDPEKLNHLGGSIAFGNPRAATSLRILVQSLKALKRKGGGLSLIASSGLGGLGSAMILESE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP009158_4 | 576642-576996 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009158_4
|
4 spacers
spacers of NZ_CP009158_4
>4.1|576673|41|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder CAGCGGGTCCTATGGGTCCAGCAGGGGCTGCTGGTCTAGTA >4.2|576745|68|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder CACCTGGTCCTGTGGGTCCAGCAGGGGCTGCTGGTCCTAAGGGGGATAAAGGCGAACCAGGACAAGCG >4.3|576844|50|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder CTAAAGGAGATAGAGGTCCAAAAGGTGATACAGGTGAGAGAGGTGCAACT >4.4|576925|41|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder ACAAAGGTGATACGGGTCCAGCAGGACCACGAGGCCCTGCG |
WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009158_4
The CRISPR arrays of NZ_CP009158_4 >merge|NZ_CP009158|4|576642-576996|CRISPRCasFinder GGTCAGAGAGGTGCAGCTGGCCCTGCGGGTCCAGCGGGTCCTATGGGTCCAGCAGGGGCTGCTGGTCTAGTAGGGCCAATGGGCCCTCAAGGTCCTGCGGGTCCACCTGGTCCTGTGGGTCCAGCAGGGGCTGCTGGTCCTAAGGGGGATAAAGGCGAACCAGGACAAGCGGGTCCAGCGGGACCACGAGGACCTGCGGGTCCTAAAGGAGATAGAGGTCCAAAAGGTGATACAGGTGAGAGAGGTGCAACTGGCCCTGCGGGTCCAGCGGGACCTAAGGGTGACAAAGGTGATACGGGTCCAGCAGGACCACGAGGCCCTGCGGGTCCAACGGGACCACAAGGACCTACGGGTC >NZ_CP009158|4|4|576642-576996|CRISPRCasFinder GGTCAGAGAGGTGCAGCTGGCCCTGCGGGTC CAGCGGGTCCTATGGGTCCAGCAGGGGCTGCTGGTCTAGTA GGGCCAATGGGCCCTCAAGGTCCTGCGGGTC CACCTGGTCCTGTGGGTCCAGCAGGGGCTGCTGGTCCTAAGGGGGATAAAGGCGAACCAGGACAAGCG GGTCCAGCGGGACCACGAGGACCTGCGGGTC CTAAAGGAGATAGAGGTCCAAAAGGTGATACAGGTGAGAGAGGTGCAACT GGCCCTGCGGGTCCAGCGGGACCTAAGGGTG ACAAAGGTGATACGGGTCCAGCAGGACCACGAGGCCCTGCG GGTCCAACGGGACCACAAGGACCTACGGGTC
>NZ_CP009158.1|WP_005714340.1|573502_574099_+|DedA-family-protein MELLIEFFSSYGYWAVFLVLLACGFGLPIPEDITLVSGGVISGLGYTNVHWMLFVSMLGVLVGDSTMYWLGRIYGEKILQFPLIRRIATPERFATVQERFEKQGWKLLFVARFLPGLRAVVYLVSGITRRVTFTRFVLVDFFAAIISVPIWVYLGDFGAKNLDWLHQQIQKGQMAIWLMLLIGVAIVFWKWKKSHKVN >NZ_CP009158.1|WP_038513831.1|572469_573492_+|HTH-type-transcriptional-repressor-PurR MATIKDVAKLAGVSTTTVSHVINKTRFVAEDTTKAVWDAIASLNYSPSAVARSLKVNTTKSIGMIITTSEAPYFAEIVLAVEEYCYRQGYSLFLCNTQNDAEKVQNHLDMLIKKRVDGILVMCSEYTENSLALFNGTNVPMVVMDWGPNDGKSDRIIDHSLDGGYMATKHLIDNGHCDIAIIAGYLYKTTAKARYDGFVKAMTEAGLLIRKEWIFENDFQPEGGYESMNNLLKQDKLPTAVICGCDAMALGVISAITEKRLSVPQDISVIGYDNIHSSRFYAPPLTTIHQSKTRLGQMAIDTLLERIQQHNEQPSEPVTPKVLEFYPELVVRSSVRNLNQ >NZ_CP009158.1|WP_038513828.1|571410_572355_+|50S-ribosomal-protein-L3-N(5)-glutamine-methyltransferase MYEHNLELLDEIASSPVADDLATILDMMRWAYSYFNASDLYYGHGHDNAWDEANQLVLTALALPMDVPETLYASRLTCVEKERIIEMVEQRLGLRKPVAYLTNSAWFSGLEFYVDERVIVPRSPIGELIQQGFTGILRAEPKRILDMCTGSGCIAIACADKFPNAEIDAVDLSVDALNVAEINIERHNMAHRVFPFQSDLFDDLPQDRYDLIVTNPPYVDQEDLDDMPEEFHHEPEMALGSGVDGLDITKRILAQAADFLSDNGVLVCEVGNSMVHLIEQFPSVPFHWLEFKNGGLGVFSLTREQLVANRHLFF >NZ_CP009158.1|WP_005714346.1|570793_571324_-|endonuclease-SmrB MLENDELALFREAIKGTKKIKQDTFVPKVEPRKKINEIRELKEKADTLFYFSDEYEPLLTEENDKVKYRREDVDPYILKQLRRGDFHPELFLDLHGLTKENAKKELASLILACEREGIYCASIMTGYGTRALKYQIPRWLVQHPKVIALHQAPREWGGNSAILILIEQPEKLDKKR >NZ_CP009158.1|WP_038513825.1|569434_570652_+|tyrosine-transporter MKNKILGSALMIAGTTIGAGMLAMPLTSAGMGFGMTLVLLVGLWLLLTYTGLLFMEVYQTAAQQDVGVATLAEQYFGMPGRVLATVSLLVLLYALLAAYITGGGSLVSGLLPEMGEGDTTLKVSILLFTFILGAFVVVGIKGVDGLTRVLFIGKIVAFVFVLLMMFPKAKLENLTAVPLDNLLVISAIPIFFTSYGFHVIMGSINSYLDADIRKIRIAVIIGTVIPLGAYLLWQLATHGVLSQGEFVTLLNQDPTLNGLVKATSQITGSTILGEMVRIFSALALITSFLGVAMGIFEGVGDLLKRVNLPANRAILTPLTFIPPLAFALFYPNGFIAALGYAGLLFAFYGLILPIGLAWKVRQAHPNLPYRVAGGSIGLILAFIMGIVIIVIPFLMQNGILPTVAG >NZ_CP009158.1|WP_021115778.1|568072_569287_+|amino-acid-permease MKNKTLGSTLIVAGTTIGAGMLAMPLTSAGIGFGFTFLLLVALWLLLCFSALLFVEVYQTVDSDAGLGTLAEKYYGPFGRIVSTTVLIVFLYAILSAYVSGGSSLLAAFLPTIIDAETTTRISGVIFTVVFGIFIILGTTSVDAVNRLLFTTKILAFILVLFLLLPKVSIDNLMAMPIDNALLISASPIFFTAFGFHGSIPSLNKYLEGNVKALRISIVVGTSIPLVAYILWQLATHGVLTQTEFLQILEKDPTLNGLAEAARQITGSSIIGAMVRIFSVLALITSFLGVALGLFEALEDLLKRVNINAGRVSLGALTFIPPMLFAFFYPQGFIAALGYAGQMFAFYAIVLPIAMVWKLRRQNLNLPYQVKGGSISLLLALVIGVFIVMVPFLIESGWLPKVVG >NZ_CP009158.1|WP_010786761.1|566795_567275_+|redoxin-family-protein MKKIMGLLLMLFSFNAFAEENKNLADIQFKDLDNNIVSLEKYKGKNVYVKMWASWCPICLAGLAEIDDLSADQNKNFEVITIVSPDKKGEKSTEKFIEWYKGLDYKNVVVLLDEQGEVLKRAKVRGYPSNVFLDSELNVKKVVPGHLSTTQITESINSK >NZ_CP009158.1|WP_035491394.1|566127_566778_+|cytochrome-c-biogenesis-protein-CcdA MFDQNLLISSVFLAGLASFLSPCIFPIVPIYFGILSKGGKKVLNTLLFIMGLSLTFVSLGFSFGFLGDLLLNDTTRVIAGIIVIILGIHQLGIIKINFLEQTKLVEIKTNGKSASVEAFVLGLTFSLGWTPCIGPILASVLALSGDEGSALYGGAMMFVYVLGLALPFIIFSFFSDELLKRAKSLNKHLDKFKIIGGTLIILMGLLLITNNLHSFM >NZ_CP009158.1|WP_035491391.1|565055_566126_+|peptide-methionine-(R)-S-oxide-reductase-MsrB MKSHKTVLFTLIMSAISNNSLAINHTNNSSKEMSKMTQTQNENIREIYLAGGCFWGIEAYMERIYGVKNATSGYANGKTDKTHYHIIGKTDHAETVHITYDANKISLEKLLKYYFQVIDPTSLNKQGNDRGRQYRTGIYYQNEQDKAIILKEIEALQTKYKDKIQVEVEPLKHYILAEEYHQDYLKKNPNGYCHIDLEQANNIIIDPKDYPKPSDEELKAKLTPLQYSVTQKKNTERSFSNEYWDNKKDGLYVDITTGEPLFSSRDKYDSGCGWPSFTKPIDKNVVTYQKDTSFNMIRTEVLSRSGKAHLGHVFDDGPKDKGGLRYCINSAAVKFIPLEQMEKENYGYLINLIKGK >NZ_CP009158.1|WP_038513818.1|564655_564952_+|hypothetical-protein MKTLLKVLMTTSLVSIATINTANAEMMDDCKNKMRADCQTMENMKHSEMKKNHMMKSDDMKKDGMMKSDDMKKDGMMKSDDMKKDHMMKSDKMKKEKM >NZ_CP009158.1|WP_005714201.1|578114_579206_-|murein-transglycosylase-A MFYKTYSKIILLSTLTLFTACSTKISEQPNTEITKLGAKFHQRKFIPSNVPLVNISDIQINNNIVNQKDFLQQLAHIQNHSTNLMKHHVKTYNKLFTWLSHGGKIKDLKHYGVQIQQMRGQDGYQNVLMTGYYIPVIPARIRPEGEFHHPLYAIPKGNKKYSRAQIYRGALAGKGLELAYTNSMLENFLMEVQGSGFVDIGGGRLHHLAYGDKNGYAYTSIGRLLVEDGEIAKENISIQAIRKWSKENPHRLQSLLERNNSFVYFRRDPTLEVKGSARVPLVPLASVASDKRLIPTGSVLLIEMPILDHNGNWNGRHEFRLMVALDVGGAVKGQHFDLYQGIGHQAGQKAGHMKHYGRAWLLN >NZ_CP009158.1|WP_038513834.1|579316_581296_-|exoribonuclease-II MFQNNPLLAQLKQQIEASKEYVEGVVKTSDKSYGFLECEKNSYFIPPVEMKKVMHGDKVKAVVKRDGDKEQVEIDSLLEPMLERFIAQVRFNKDGKLQLAVDHPSINNFIPANTQKKVTETLENGDWVVAQLKTHPLRDDRFFFAQVTQFICKADDNFAPWWVTLARHEQPREPVANEKSYELQDQVEREDLTHLYFTTIDSASTKDMDDALYVEPITENGTQTGWRLVVAIADPTAYIPEQSAIEKAARQRCFTNYLPGFNIPMLPRELSDDLCSLVPNEKRPALVGYIETDLSGNVVGEARFVSAWVQSKARLVYDEVSDYLEKVENHWTPDYAETAQQIDWLYQFTLARIDWRSKNALLFKEQGDYSFELAEDGAVKAIHIEYRRIANQMIEEAMIIANICAAQFLDKYAHTGVFNTHSGFDSKNLEPARKFLLDTLSNDENRESLSERYSPERLSTLEGYCEMRRDIEQFPENFLEMWLRRYLTFAEFKATSAPHLGLGISHYATWTSPIRKYGDMVNHRLIKQVLANQTAKPVEETVLARLQEARKQNRMVERDIADWLYARYLAPMVEQNVEFDGEIHDVSRGGLRVKVIENGASVFVPFSTLHNNKEEMLFSPEEIALYIKGEKAYQIGQAVKVKLKEVRVETRSVVGDVLI >NZ_CP009158.1|WP_005714197.1|581510_581855_+|hypothetical-protein METEEYLTFIETKVFEEDRKALMSDDEYQKFQAYLLESHELGDFIQNTGGCQKIRWKLESNNKGKSGGVRVIYYVVTKQGKLLLMMMYAKSKQDNMSDKQKAMLKAVVSQLSEE >NZ_CP009158.1|WP_016527809.1|581857_582154_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MEKELFERLMESAREMVAIEKGEIEVPPHRIHIHKIPNVKAIRTQHQMKQAEFASLLGVSQNLVQSWEIGRRTPNGAARKLLAIIEQQPELIPVLQGL >NZ_CP009158.1|WP_038513837.1|582210_583173_+|WYL-domain-containing-protein MPKRPSGIDSTLFLLEILRRIPKKPYRLTTSEIFESMKKAGFEKDKRSIQRALKTLSEHFDDLECDDRDNEYAYCWLERSVGISVPMLNEQQALILKLAEQQLKYLLPANIMSSMEPFFKQAEKIVGAGTSNPEHQWLGKICSVPTSQPLIPAKVKEDVFTAVSTALFQNKLLHIEYQNQAGKKHKAQIMPLAIAQQGASTYLVARYDGFDDNRLLALHRIKKAELSTFSFERPKDFNLKQYQDEGNLGFGSGGKVKLTFSIARWAGFHLTETPLSKDQITLEESEEHYRFQATVADTDMLQWWIRRFGEDIWDIQKESV >NZ_CP009158.1|WP_035519505.1|583248_584022_+|PD-(D/E)XK-nuclease-family-protein MHLSVNFNQDKDKTLDIAQLATFFKMWKEGVFLEPSEEKKELVIPDREKLQYFFNEYKEARVPMEEEKALGMKVNVWKTANLGRYEVRNSKVLRWFLDMHEDHGQGSFFLKALYDSLGWDKSSFPFPSVYRATEECCPLGDESERVDIEIESDEVLLFIEVKIDALEGKEQLKRYHDVAKIKAGSREWKIIYLTKDGIVKYDQEDKQSLSDKEKIIGLSWTHFAKVLQKQIRQELRKNPNNRSLWLAEQFVEHILTF >NZ_CP009158.1|WP_016527812.1|584038_584686_+|hypothetical-protein MSRQAAFKLIIENIQMFDEASHLINDDFDSELFNAVDNVIKEFEFDFECKGKFNSAENRFSTFYPSYWLANSSDDTDANNCYAHYYFGFECDETGKKIHYWGITSLFSKVEGMVLGFYSWKKQFPKCGNKDWKEFMIEQNKKYPELGKLGFKFNTKGYDFYLPIKSLDPKLVIENYPDSLEDAMEPIRDALKTLKEAHPIFNEIVEAAKKKFGTN >NZ_CP009158.1|WP_035519506.1|584964_585681_+|hypothetical-protein MSKKVQFTGIGLQGNEFVKNHENSPLVTSFHYIEQLTEVMAVDTEAFSLLFVENNERDLQLCYQFAKSFQFDCLSVVVLPTRRESLHSNCHKWLLDLEKRIDILIALNKPLPVDCMLLKETDLFDAITVIIDLISENNLINVDVEDIKTVSYGAKEIDFYSFEIERKGETISADDVITHLLSKSHKKIKEINGAVISITSDENLLLDEYHMIMESISSLISEDCTIIASTNEPLPQFV >NZ_CP009158.1|WP_038513840.1|586903_588961_+|AAA-family-ATPase MSNQYQLNPPTVSVYAEHLMLKLLFEHKGFPEIFRENGWRDDDIATALGLPPEMENIDNVRSVVKELLQARYKETNFSEDVSERWKMAYQNIEKLSEIVELNEAEKNIFRFVFHLRAEKQMKDLMCYLPHINLSQAIEIVADILSLSKDDVRKVFSKKQKLFAYGLMEFSHSPDRLEEYLGWGDTLDFDDFLTQPLTEEMLLARCTLPTEKPSLSLSHFEHIKSTYELMLSHLKFSIDNAKKGTNILIYGSPGTGKTELAGLLSEALNVSSYTMAYMDEDDDVLGGKRRLENCRLAQRLLRDKSTVIIFDEIEDVFASSFMERSVAQENKAWVNQFLENNDVPMIWLSNSVSCIDNAYLRRFDLVFEMPDLPFSHKEKLIRSIVNEQLSHDYIRHFSQVKALSPAIITRGLTVMKQAYSDCSQQDFAEKTLNWFNQMLKSQGFKKIEPLVEGKISYNLDWVACNDDIYKITEGLKRTKRGRICCYGPPGTGKTAWANWLGQELGMSVLICQGSDLLDKYVGGTEKKIAQAFAQAKENNMVLVFDEIDTFLFARENGQRSWERSQVNEMLTQIEKFEGLLVVSTNLMDGLDPAALRRFDLKLHFNYLKPEQAIKFAQEQVNKLSLPDLTDVEQDRIAQLRNLTPGDFAAVARRHRFAPFDNLDEWLKAIKAECEIKQGKVARRIGF >NZ_CP009158.1|WP_005714049.1|589048_589837_-|SDR-family-oxidoreductase MGFLAGKRILVTGLASNRSIAYGIAKAMKAQGAELAFTYLNDKLQPRVEEFAKEFGSDIVLPLDVATDESITNCFAELSKKWEKFDGFVHAIAFAPGDQLDGDYVNAATREGYRIAHDISAYSFVAMAQAARPFLNKDAALLTLSYLGAERAIPNYNVMCLAKASLEAATRVMAADLGKEGIRVNAISAGPIRTLAASGIKNFKKMLAAFEQTAALRRTVTIEDVGNSAAFLCSDLASGVTGEVLHVDAGFSITAMGELGEE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP009158_6 | 1493012-1493152 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009158_6
|
2 spacers
spacers of NZ_CP009158_6
>6.1|1493036|39|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder GTGAACCGGGTCCTAAAGGTGAACAAGGTATTCCAGGCC >6.2|1493099|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder GTCCTGCGGGTCCAGCAGGACCACAAGGCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009158_6
The CRISPR arrays of NZ_CP009158_6 >merge|NZ_CP009158|6|1493012-1493152|CRISPRCasFinder CTGCGGGTCCAGCGGGACCAAAGGGTGAACCGGGTCCTAAAGGTGAACAAGGTATTCCAGGCCCTGCGGGTCCAGCGGGACCACAAGGTCCTGCGGGTCCAGCAGGACCACAAGGCCCTGCGGGTCCAACGGGATCACAAG >NZ_CP009158|6|6|1493012-1493152|CRISPRCasFinder CTGCGGGTCCAGCGGGACCAAAGG GTGAACCGGGTCCTAAAGGTGAACAAGGTATTCCAGGCC CTGCGGGTCCAGCGGGACCACAAG GTCCTGCGGGTCCAGCAGGACCACAAGGCC CTGCGGGTCCAACGGGATCACAAG
>NZ_CP009158.1|WP_005711417.1|1489908_1490250_+|iron-sulfur-cluster-insertion-protein-ErpA MSDILVPLIFTDAAAKKVKFLIEGEENPELRLRVYITGGGCSGFQYGFTFDDKLNEGDLTIENLDVALVIDPMSLQYLIGATIDYVEGLEGSRFVVQNPNASSTCGCGASFSI >NZ_CP009158.1|WP_038514586.1|1488622_1489798_+|Obg-family-GTPase-CgtA MKFIDEALIRVEAGDGGNGCVSFRREKFIPKGGPDGGDGGDGGDVYLIADENLNTLIDYRFEKRFAAGRGENGRSAGCTGHRGSDITLRVPVGTRAIDNDTQEVIGDLTKHGMKMLVAKGGYHGLGNTRFKSSVNRAPRQKTNGTPGEKRDLQLELMLLADVGMLGLPNAGKSTFIRAVSAAKPKVADYPFTTLVPSLGVARVGADRSFVVADIPGLIEGAAEGAGLGIRFLKHLERCRVLIHLVDIMPIDESDPAQNISIIESELYQYSEKLADKPQWLVFNKIDTIGEEEARERAEAIVEEIGWEGDYYLISAATGQNVSALTRDIMDFIEANPRVEEEEKAKEEVAFKWDDYHQQAMQHPITEDDWDDLDDDGWTEEDDEGVEFIYKP >NZ_CP009158.1|WP_010787206.1|1487665_1488586_+|DMT-family-transporter MKPQRPLLGFSLALLTAMMWGSVPIAAQKVLSVVNAQTLVWARFIVAAIGLLLILGFTKKLPKLTAFTPRFLWLIGLGVVGLSLNFFLFSYSLNFISPTTSQVLWQLAPFTMILCGVVIFKEQFGRHQQIGLLLLIIGLIAFFNERFEEIFQLGTYAFGLLVGAGAAIVWVVYAIAQKIMLAKFSSQQILLIIYTGCALLLTPFASQINIDEFDPFLLGCFIFCCLNTLIGYGAYAEALNHWDASKVSVVTILVPIFTMVFSSIGHWAFPDTFASPDMNLLSYIGAFIVVSGTILSAVGHKLVKRK >NZ_CP009158.1|WP_005711421.1|1486399_1486657_+|50S-ribosomal-protein-L27 MATKKAGGSTRNGRDSEAKRLGVKRFGGESVLAGSIIVRQRGTKFHAGSNVGMGKDHTLFATADGKVKFEVKGEKNRKYVSIIAE >NZ_CP009158.1|WP_005711422.1|1486067_1486379_+|50S-ribosomal-protein-L21 MYAVFQSGGKQHRVSEGQVVRLEKLEVATGEKVEFDSVLMVVNGEDVKIGTPVVAGGKVVAEVVAHGRGEKVRIVKFRRRKHSRKQQGHRQWFTEVKITGIQA >NZ_CP009158.1|WP_038514583.1|1484718_1485870_+|N-acetylglucosamine-6-phosphate-deacetylase MGRYALTNCVIYTGSDVLYQHAVIVNGEQIEAVVHQSQVADGVHQIDLEGANLSAGFIDLQLNGCGGVTFNEDISVKTLEIMQETNLKSGTTSYLPTFITSPDEGMKQAVQVMRDYLAKYKNQALGLHLEGPYLSVAKKGVHRPEYIREISGEMLDFLCKNGDVITKLTLAADNPTADHIQKFVEAGIIVSIGHSNATFAEAKRRIEQGIGFATHLHNAMSPISSGRDGGVVGAVLDSDIYAGIIVDGLHVDWSNVRIAKKVKGDKLVIVTDAVAPAGTTDMEYFIFVGKKVWYKDGKCVDEFGSLGGAAITMIESIRNMMQHTDLPLDEVIRMCTLYPARAIHVEDKLGSIEAGKIANLTAFNHQFEVLGTAVNGNWKWTQL >NZ_CP009158.1|WP_010787210.1|1483914_1484709_+|glucosamine-6-phosphate-deaminase MRLVPLDCAEQVSRWAARYIVDKINAFQPTAEKPFVLGLPTGGTPLQTYKELIKLYQAGEVSFKHVVTFNMDEYVGLPPEHKESYHYFMFHNFFNHIDIPVENVNILNGMAEDVDAECERYEAKIRSYGKIHLFMGGVGVDGHIAFNEPASSLSSRTRIKTLTEDTLIANSRFFDNDVNKVPKFALTVGVGTLMDAEEVLILVTGYNKALALQACVEGAVNHLWTISALQLHRRAVVVCDEPATQELKVKTVKYFKQLEQNIAR >NZ_CP009158.1|WP_005711427.1|1482690_1483515_+|diaminopimelate-epimerase MQFSKMHGLGNDFMVIDGVTQNVYLTEELIRKWADRHRGVGFDQLLLVEPPYDPELDFHYRIFNADGSEVSQCGNGARCFARFVTLKGLTNKQDIGVSTAKGKMVLSLQDDGQVRVNMGEPIWEPAQIPFTANKFEKNYILRTDIQTVLCGVVSMGNPHCVLQVENIQTANVNELGALLERHERFPERANIGFMQVINRNHIKLRVFERGAGETQACGSGACGAVAVGIMQGLLDSRVQVDLPGGTLHIEWQGVGSPLYMTGDAEHIYDGAVKS >NZ_CP009158.1|WP_005711429.1|1481215_1482538_-|anaerobic-C4-dicarboxylate-transporter MSAMFLIEFAVVLLCILIGARLGGIGLGVMGGLGLAILSFGFGLKPAGLPIDVMFMIMAVVSAAAAMQAAGGLDYMIKIATNILRRNPKHITFIAPAVTWTFTFLAGTGHVAYSVLPVIAEVSRHNGIRPERPLSMAVIASQFAIVASPIAAAVVSVAAMIEPQGYSIGDILLVTIPGTILGLFCACLFVNKMGKELKDDPNYQRLLQDPEYVARNHVDTNPAEIQISPTAKTSVSLFLFGALLVVFMGSFKELRPVFDGKAMGMAHTIEIVMLTVAALIMLICKPNGNAITQGSVFHAGMRAVIAIFGIAWMGDTLMDAHMTEVKDMVKGLVETAPWAFAFALFVLSVLVNSQGATVATLFPLGVALGIPAPILIGVFVAVNGYFFVPNYGPIIASIDFDTTGTTKIGKFIFNHSFMIPGLLSMAFCLVFGLVLANVLL >NZ_CP009158.1|WP_021115558.1|1479523_1480954_+|sodium/pantothenate-symporter MNLELLLPLIAYLIFVFGVAYYAYRQRTSGSFLSEYYVGGRSMSGFVLAMTTAATYVGASSFIGGPGAAYKYGLGWVLLAMIQVPAVFLSLGIVGKRIAILALQTKSLTINDLLLARYQHRFVVWIASFALLLSFFAMMTVQFIGAGRLLETTLGISYGTAIIIFAVTVGIYTFIGGFRAVVLTDTIQGLVMVVGTLLLLGGVIYATGGVEAAITQLENINPQLTAPYGIDERPLDFTFMTSFWVLVCFGLIGLPHFAVRSMAYKDSKALHRALIIGTVVVAVLMFGMHLAGALGRAVIPDLKVADQVIPTLMLQVLPPVVAGIFLAAPMAAIMSSIDSMLIQSSSTLIKDLYLAIKPQAVENEEKIKRFSTITTLVISVLLVIAAINPPEMLIWLNLLSLGGLEATFLWVIVLGLFWKKANATGAICSMIAGLSSYVLMTSLSIKIFSFHAIVPALVIGLIAFLVGNRCVTLKKD >NZ_CP009158.1|WP_038514589.1|1494088_1494952_-|IS256-family-transposase MNEKQLHALAAEFAKNLKTPEDLNQFSRMLKKITVEAALNGELTDHLGYEKHQPRKGKNARNGYTSKTVICDEGEIEIETPRDRDWIAENEGAKFWANVLTELQNRGLKDIFIACVDGLKGFPEAINAVYPKTKIQLCIVHLVRNSLKFVSWKDYKAVTADLKQVYQASTEAQARENLTALSQKWQAKYPLVAKGWEDNWANIATFFDYPADIRKAIYTTNAVESLNSVIRRVIKKRNVFPTDDSVFKVIWLAIKDASKKWTMPIQNWKLAMNRFMIDFGDRLDDHR >NZ_CP009158.1|WP_010787269.1|1495725_1496778_-|UDP-glucose--hexose-1-phosphate-uridylyltransferase MSQKFELNDHPHRRYNPLKDEWILVSPHRAKRPWSGQVDKAAVEQLPSYDEKCFLCPTNTRVSGDVNPDYQGTYVFANDFAALMQDTPDAPPSDNPLFKIQGVRGLARVICFSPDHSKTLPELPVEKIRGVVDTWNAQLEELGKDYLWVQAFENKGAMMGCSQPHPHGQIWANSFLPNEIATKDKNLRRYYEQHGSNLLVDYAQAELKDGTRTVTETEHWLAVVPYWAAWPYETILMPKRHIKRMSELSEAEKDDLALAIKKLTCRYDNLFECAFPYSMGWHFAPFFKDGQDIEHWQLHAYFYPPLLRSATVRKFMVGYEMLAEAQRDLTPEQAAEKLRAVSEEMHYKQR >NZ_CP009158.1|WP_005713188.1|1496944_1498588_-|chaperonin-GroEL MAAKDVKFGNDARVKMLKGVNVLADAVKVTLGPKGRNVVLDKAFGAPTITKDGVSVAREIELEDKFENMGAQMVKEVASKANDAAGDGTTTATVLAQAIVNEGLKAVAAGMNPMDLKRGIDKAVAAVVEELKSLSKPCEMSKEIEQVGTISANSDSTVGKLIAQAMEKVGKEGVITVEDGTGLEDALDVVEGMQFDRGYLSPYFINKPEAGTVELENPYILLVDKKISNIREILPVLEAVAKAGKPLLIIAEDIEGEALATLVVNTMRGIVKVAAVKAPGFGDRRKAMLQDIAILTAGTVISEEIGMELEKATIEELGQAKRVVISKDNTTIIDGVGDEVQIKARVAQIRQQIEDSTSDYDKEKLQERVAKLAGGVAVIKVGAATEVEMKEKKDRVDDALHATRAAVEEGIIAGGGVALVRAASKVADVVKGDNEEQNVGIRLALRAMEAPLRQIVTNAGEEASVVARNVKDGNGNYGYNAATEQYGDMLEMGILDPTKVTRSALQFAASIAGLMITTECMVTDLPKEEKADLGAGMGGMGGMGGMM >NZ_CP009158.1|WP_005713186.1|1498698_1498986_-|co-chaperone-GroES MKIRPLHDKVILKREEIETKSAGGIVLTGSAATKSTRGTVIAVGNGRTLDNGTVLPLNVKVGDVVIFNEYGVKEEKIDGETVLILSEDNILAIVE >NZ_CP009158.1|WP_005713184.1|1499377_1500778_-|two-component-system-sensor-histidine-kinase-QseC MKLLKNTSLRFRLMIVISCTALLIWLVSTAVAWVQVRHEVDEVFDAQQVLFAQRLASSDLRTLLMERKPQRTFNGEHHKKSFKKIAFDDDALAFAIFNAQGERILSDGHNGANFPFKRASGFTKSRLNHEDDDEWRIFWLPIGDRFFVAVGQEQDYRDDLVQGMVFSQMWIWFASLPLLLGLIVWVIKRELLTLQRVGEQVQQRTPDDNSPLSTDVPKEILPLVSSLNQFFDRTSTMLLRERRFTSDAAHELRSPLAALKIQTEIAQLAGDDTALREKALHNLTQGINRATQLIEQLLTLSRLDNLTELEGVEDIHWDKLIPSLVGELYFQAQKREMEIEFEQKGVPAVKQGQPLLLSLMLRNLVDNAMKYCPQGTTIRITLEPQCIIVEDNGGGVDEADLAKLGQRFYRPAGQNEKGSGLGLSIVRRIAELHGYYISMDNVYNVKGGKGLRAIINLSGLCRQTPS >NZ_CP009158.1|WP_010787266.1|1500764_1501436_-|response-regulator MRILLIEDDPLIGEGLKLGLSKSGFSVDWFTDGKTGLDALSSAPYDAVVLDLTLPKMDGLEVLQSWRRANQDVPVLILTARDTLDERIMGLQRGADDYLCKPFALAEVVARLQALIRRRYGHTNPVIEHSLVKFDPNQRKVFLREQEVTLTTREYNLLELFMHNKDRVLTRSFIEEKLYTWDDEVSSNALEVHIYNLRQKLGKQFIRTVHGVGYALGKNDEVA >NZ_CP009158.1|WP_005713180.1|1501496_1501862_-|NirD/YgiW/YdeI-family-stress-tolerance-protein MKKLTLLSALLLSTVSLSAFADKGYYQNGGFTNSQQAVTQASQVSSMSDDQYVVLQGKLVKQLDKDNFTFRDASGEITVDIDDDAWRGLNVTPNDEIRLYGEIDKSLVGTEVDVHRVEKVN >NZ_CP009158.1|WP_016528409.1|1502030_1502891_-|TonB-dependent-receptor MGNSESYFNNRRSLRPFQLKYIRQTNSTKIHASEGKVNPILNVIWNITSNLALKTKLNYASRSPALATTNTITDNRANLAQVRGRRDVDSNLKPEQSRLAEVGFEWKHSGARLVASLFDEKVTNYYSGVTAPTITNLGNLRTKGYDAEASYEIAGLKVGVGASYSRATPEGFKLSEGVLDIVPKGRQWKTTLSYTFENPNLEIGYRGRYAEAKTFVITTRSGDERIRKAGYGVHDIYANLRLLKDDLSLDFAINNIGNKRYQSHSQRLHSHINPGRQYIIGANYRF >NZ_CP009158.1|WP_005624479.1|1503054_1503225_-|50S-ribosomal-protein-L33 MAAKGNREKIKLVSTAETGHFYTTTKNKRNMPEKMEIKKFDPVVRKHVVYKEAKIK >NZ_CP009158.1|WP_005713177.1|1503236_1503473_-|50S-ribosomal-protein-L28 MSRVCQVTGKRPVVGNNRSHAMNATKRRFLPNLHTHRFWVESENRFVTLRLTAKGMRIIDKKGIDAVLAEIRARGEKI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP009158_5 | 1492778-1492946 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009158_5
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2 spacers
spacers of NZ_CP009158_5
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009158_5
The CRISPR arrays of NZ_CP009158_5 >merge|NZ_CP009158|5|1492778-1492946|CRISPRCasFinder CTGCGGGTCCAGCGGGGCCTAGGGGTGAACCGGGTCCAGTGGGGCCAGCTGGACCACAAGGTACACCTGGTCCAGCAGGACCACGAGGACCGCAGGGAACAGCGGGTGCTCAGGGACCTAAGGGGGATAAAGGCGAACCAGGAGAAGCGGGTCCAGCAGGACCACGAGG >NZ_CP009158|5|5|1492778-1492946|CRISPRCasFinder CTGCGGGTCCAGCGGGGCCTAGGG GTGAACCGGGTCCAGTGGGGCCAGCTGGACCACAAGGTA CACCTGGTCCAGCAGGACCACGAG GACCGCAGGGAACAGCGGGTGCTCAGGGACCTAAGGGGGATAAAGGCGAACCAGGAG AAGCGGGTCCAGCAGGACCACGAGG
>NZ_CP009158.1|WP_005711417.1|1489908_1490250_+|iron-sulfur-cluster-insertion-protein-ErpA MSDILVPLIFTDAAAKKVKFLIEGEENPELRLRVYITGGGCSGFQYGFTFDDKLNEGDLTIENLDVALVIDPMSLQYLIGATIDYVEGLEGSRFVVQNPNASSTCGCGASFSI >NZ_CP009158.1|WP_038514586.1|1488622_1489798_+|Obg-family-GTPase-CgtA MKFIDEALIRVEAGDGGNGCVSFRREKFIPKGGPDGGDGGDGGDVYLIADENLNTLIDYRFEKRFAAGRGENGRSAGCTGHRGSDITLRVPVGTRAIDNDTQEVIGDLTKHGMKMLVAKGGYHGLGNTRFKSSVNRAPRQKTNGTPGEKRDLQLELMLLADVGMLGLPNAGKSTFIRAVSAAKPKVADYPFTTLVPSLGVARVGADRSFVVADIPGLIEGAAEGAGLGIRFLKHLERCRVLIHLVDIMPIDESDPAQNISIIESELYQYSEKLADKPQWLVFNKIDTIGEEEARERAEAIVEEIGWEGDYYLISAATGQNVSALTRDIMDFIEANPRVEEEEKAKEEVAFKWDDYHQQAMQHPITEDDWDDLDDDGWTEEDDEGVEFIYKP >NZ_CP009158.1|WP_010787206.1|1487665_1488586_+|DMT-family-transporter MKPQRPLLGFSLALLTAMMWGSVPIAAQKVLSVVNAQTLVWARFIVAAIGLLLILGFTKKLPKLTAFTPRFLWLIGLGVVGLSLNFFLFSYSLNFISPTTSQVLWQLAPFTMILCGVVIFKEQFGRHQQIGLLLLIIGLIAFFNERFEEIFQLGTYAFGLLVGAGAAIVWVVYAIAQKIMLAKFSSQQILLIIYTGCALLLTPFASQINIDEFDPFLLGCFIFCCLNTLIGYGAYAEALNHWDASKVSVVTILVPIFTMVFSSIGHWAFPDTFASPDMNLLSYIGAFIVVSGTILSAVGHKLVKRK >NZ_CP009158.1|WP_005711421.1|1486399_1486657_+|50S-ribosomal-protein-L27 MATKKAGGSTRNGRDSEAKRLGVKRFGGESVLAGSIIVRQRGTKFHAGSNVGMGKDHTLFATADGKVKFEVKGEKNRKYVSIIAE >NZ_CP009158.1|WP_005711422.1|1486067_1486379_+|50S-ribosomal-protein-L21 MYAVFQSGGKQHRVSEGQVVRLEKLEVATGEKVEFDSVLMVVNGEDVKIGTPVVAGGKVVAEVVAHGRGEKVRIVKFRRRKHSRKQQGHRQWFTEVKITGIQA >NZ_CP009158.1|WP_038514583.1|1484718_1485870_+|N-acetylglucosamine-6-phosphate-deacetylase MGRYALTNCVIYTGSDVLYQHAVIVNGEQIEAVVHQSQVADGVHQIDLEGANLSAGFIDLQLNGCGGVTFNEDISVKTLEIMQETNLKSGTTSYLPTFITSPDEGMKQAVQVMRDYLAKYKNQALGLHLEGPYLSVAKKGVHRPEYIREISGEMLDFLCKNGDVITKLTLAADNPTADHIQKFVEAGIIVSIGHSNATFAEAKRRIEQGIGFATHLHNAMSPISSGRDGGVVGAVLDSDIYAGIIVDGLHVDWSNVRIAKKVKGDKLVIVTDAVAPAGTTDMEYFIFVGKKVWYKDGKCVDEFGSLGGAAITMIESIRNMMQHTDLPLDEVIRMCTLYPARAIHVEDKLGSIEAGKIANLTAFNHQFEVLGTAVNGNWKWTQL >NZ_CP009158.1|WP_010787210.1|1483914_1484709_+|glucosamine-6-phosphate-deaminase MRLVPLDCAEQVSRWAARYIVDKINAFQPTAEKPFVLGLPTGGTPLQTYKELIKLYQAGEVSFKHVVTFNMDEYVGLPPEHKESYHYFMFHNFFNHIDIPVENVNILNGMAEDVDAECERYEAKIRSYGKIHLFMGGVGVDGHIAFNEPASSLSSRTRIKTLTEDTLIANSRFFDNDVNKVPKFALTVGVGTLMDAEEVLILVTGYNKALALQACVEGAVNHLWTISALQLHRRAVVVCDEPATQELKVKTVKYFKQLEQNIAR >NZ_CP009158.1|WP_005711427.1|1482690_1483515_+|diaminopimelate-epimerase MQFSKMHGLGNDFMVIDGVTQNVYLTEELIRKWADRHRGVGFDQLLLVEPPYDPELDFHYRIFNADGSEVSQCGNGARCFARFVTLKGLTNKQDIGVSTAKGKMVLSLQDDGQVRVNMGEPIWEPAQIPFTANKFEKNYILRTDIQTVLCGVVSMGNPHCVLQVENIQTANVNELGALLERHERFPERANIGFMQVINRNHIKLRVFERGAGETQACGSGACGAVAVGIMQGLLDSRVQVDLPGGTLHIEWQGVGSPLYMTGDAEHIYDGAVKS >NZ_CP009158.1|WP_005711429.1|1481215_1482538_-|anaerobic-C4-dicarboxylate-transporter MSAMFLIEFAVVLLCILIGARLGGIGLGVMGGLGLAILSFGFGLKPAGLPIDVMFMIMAVVSAAAAMQAAGGLDYMIKIATNILRRNPKHITFIAPAVTWTFTFLAGTGHVAYSVLPVIAEVSRHNGIRPERPLSMAVIASQFAIVASPIAAAVVSVAAMIEPQGYSIGDILLVTIPGTILGLFCACLFVNKMGKELKDDPNYQRLLQDPEYVARNHVDTNPAEIQISPTAKTSVSLFLFGALLVVFMGSFKELRPVFDGKAMGMAHTIEIVMLTVAALIMLICKPNGNAITQGSVFHAGMRAVIAIFGIAWMGDTLMDAHMTEVKDMVKGLVETAPWAFAFALFVLSVLVNSQGATVATLFPLGVALGIPAPILIGVFVAVNGYFFVPNYGPIIASIDFDTTGTTKIGKFIFNHSFMIPGLLSMAFCLVFGLVLANVLL >NZ_CP009158.1|WP_021115558.1|1479523_1480954_+|sodium/pantothenate-symporter MNLELLLPLIAYLIFVFGVAYYAYRQRTSGSFLSEYYVGGRSMSGFVLAMTTAATYVGASSFIGGPGAAYKYGLGWVLLAMIQVPAVFLSLGIVGKRIAILALQTKSLTINDLLLARYQHRFVVWIASFALLLSFFAMMTVQFIGAGRLLETTLGISYGTAIIIFAVTVGIYTFIGGFRAVVLTDTIQGLVMVVGTLLLLGGVIYATGGVEAAITQLENINPQLTAPYGIDERPLDFTFMTSFWVLVCFGLIGLPHFAVRSMAYKDSKALHRALIIGTVVVAVLMFGMHLAGALGRAVIPDLKVADQVIPTLMLQVLPPVVAGIFLAAPMAAIMSSIDSMLIQSSSTLIKDLYLAIKPQAVENEEKIKRFSTITTLVISVLLVIAAINPPEMLIWLNLLSLGGLEATFLWVIVLGLFWKKANATGAICSMIAGLSSYVLMTSLSIKIFSFHAIVPALVIGLIAFLVGNRCVTLKKD >NZ_CP009158.1|WP_038514589.1|1494088_1494952_-|IS256-family-transposase MNEKQLHALAAEFAKNLKTPEDLNQFSRMLKKITVEAALNGELTDHLGYEKHQPRKGKNARNGYTSKTVICDEGEIEIETPRDRDWIAENEGAKFWANVLTELQNRGLKDIFIACVDGLKGFPEAINAVYPKTKIQLCIVHLVRNSLKFVSWKDYKAVTADLKQVYQASTEAQARENLTALSQKWQAKYPLVAKGWEDNWANIATFFDYPADIRKAIYTTNAVESLNSVIRRVIKKRNVFPTDDSVFKVIWLAIKDASKKWTMPIQNWKLAMNRFMIDFGDRLDDHR >NZ_CP009158.1|WP_010787269.1|1495725_1496778_-|UDP-glucose--hexose-1-phosphate-uridylyltransferase MSQKFELNDHPHRRYNPLKDEWILVSPHRAKRPWSGQVDKAAVEQLPSYDEKCFLCPTNTRVSGDVNPDYQGTYVFANDFAALMQDTPDAPPSDNPLFKIQGVRGLARVICFSPDHSKTLPELPVEKIRGVVDTWNAQLEELGKDYLWVQAFENKGAMMGCSQPHPHGQIWANSFLPNEIATKDKNLRRYYEQHGSNLLVDYAQAELKDGTRTVTETEHWLAVVPYWAAWPYETILMPKRHIKRMSELSEAEKDDLALAIKKLTCRYDNLFECAFPYSMGWHFAPFFKDGQDIEHWQLHAYFYPPLLRSATVRKFMVGYEMLAEAQRDLTPEQAAEKLRAVSEEMHYKQR >NZ_CP009158.1|WP_005713188.1|1496944_1498588_-|chaperonin-GroEL MAAKDVKFGNDARVKMLKGVNVLADAVKVTLGPKGRNVVLDKAFGAPTITKDGVSVAREIELEDKFENMGAQMVKEVASKANDAAGDGTTTATVLAQAIVNEGLKAVAAGMNPMDLKRGIDKAVAAVVEELKSLSKPCEMSKEIEQVGTISANSDSTVGKLIAQAMEKVGKEGVITVEDGTGLEDALDVVEGMQFDRGYLSPYFINKPEAGTVELENPYILLVDKKISNIREILPVLEAVAKAGKPLLIIAEDIEGEALATLVVNTMRGIVKVAAVKAPGFGDRRKAMLQDIAILTAGTVISEEIGMELEKATIEELGQAKRVVISKDNTTIIDGVGDEVQIKARVAQIRQQIEDSTSDYDKEKLQERVAKLAGGVAVIKVGAATEVEMKEKKDRVDDALHATRAAVEEGIIAGGGVALVRAASKVADVVKGDNEEQNVGIRLALRAMEAPLRQIVTNAGEEASVVARNVKDGNGNYGYNAATEQYGDMLEMGILDPTKVTRSALQFAASIAGLMITTECMVTDLPKEEKADLGAGMGGMGGMGGMM >NZ_CP009158.1|WP_005713186.1|1498698_1498986_-|co-chaperone-GroES MKIRPLHDKVILKREEIETKSAGGIVLTGSAATKSTRGTVIAVGNGRTLDNGTVLPLNVKVGDVVIFNEYGVKEEKIDGETVLILSEDNILAIVE >NZ_CP009158.1|WP_005713184.1|1499377_1500778_-|two-component-system-sensor-histidine-kinase-QseC MKLLKNTSLRFRLMIVISCTALLIWLVSTAVAWVQVRHEVDEVFDAQQVLFAQRLASSDLRTLLMERKPQRTFNGEHHKKSFKKIAFDDDALAFAIFNAQGERILSDGHNGANFPFKRASGFTKSRLNHEDDDEWRIFWLPIGDRFFVAVGQEQDYRDDLVQGMVFSQMWIWFASLPLLLGLIVWVIKRELLTLQRVGEQVQQRTPDDNSPLSTDVPKEILPLVSSLNQFFDRTSTMLLRERRFTSDAAHELRSPLAALKIQTEIAQLAGDDTALREKALHNLTQGINRATQLIEQLLTLSRLDNLTELEGVEDIHWDKLIPSLVGELYFQAQKREMEIEFEQKGVPAVKQGQPLLLSLMLRNLVDNAMKYCPQGTTIRITLEPQCIIVEDNGGGVDEADLAKLGQRFYRPAGQNEKGSGLGLSIVRRIAELHGYYISMDNVYNVKGGKGLRAIINLSGLCRQTPS >NZ_CP009158.1|WP_010787266.1|1500764_1501436_-|response-regulator MRILLIEDDPLIGEGLKLGLSKSGFSVDWFTDGKTGLDALSSAPYDAVVLDLTLPKMDGLEVLQSWRRANQDVPVLILTARDTLDERIMGLQRGADDYLCKPFALAEVVARLQALIRRRYGHTNPVIEHSLVKFDPNQRKVFLREQEVTLTTREYNLLELFMHNKDRVLTRSFIEEKLYTWDDEVSSNALEVHIYNLRQKLGKQFIRTVHGVGYALGKNDEVA >NZ_CP009158.1|WP_005713180.1|1501496_1501862_-|NirD/YgiW/YdeI-family-stress-tolerance-protein MKKLTLLSALLLSTVSLSAFADKGYYQNGGFTNSQQAVTQASQVSSMSDDQYVVLQGKLVKQLDKDNFTFRDASGEITVDIDDDAWRGLNVTPNDEIRLYGEIDKSLVGTEVDVHRVEKVN >NZ_CP009158.1|WP_016528409.1|1502030_1502891_-|TonB-dependent-receptor MGNSESYFNNRRSLRPFQLKYIRQTNSTKIHASEGKVNPILNVIWNITSNLALKTKLNYASRSPALATTNTITDNRANLAQVRGRRDVDSNLKPEQSRLAEVGFEWKHSGARLVASLFDEKVTNYYSGVTAPTITNLGNLRTKGYDAEASYEIAGLKVGVGASYSRATPEGFKLSEGVLDIVPKGRQWKTTLSYTFENPNLEIGYRGRYAEAKTFVITTRSGDERIRKAGYGVHDIYANLRLLKDDLSLDFAINNIGNKRYQSHSQRLHSHINPGRQYIIGANYRF >NZ_CP009158.1|WP_005624479.1|1503054_1503225_-|50S-ribosomal-protein-L33 MAAKGNREKIKLVSTAETGHFYTTTKNKRNMPEKMEIKKFDPVVRKHVVYKEAKIK >NZ_CP009158.1|WP_005713177.1|1503236_1503473_-|50S-ribosomal-protein-L28 MSRVCQVTGKRPVVGNNRSHAMNATKRRFLPNLHTHRFWVESENRFVTLRLTAKGMRIIDKKGIDAVLAEIRARGEKI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP009158_7 | 2261836-2261939 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009158_7
|
1 spacers
spacers of NZ_CP009158_7
>7.1|2261871|34|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder TTGTGAGTAAAAAAATAAAAGGAAATTGAGATGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009158_7
The CRISPR arrays of NZ_CP009158_7 >merge|NZ_CP009158|7|2261836-2261939|CRISPRCasFinder TTTCATAAAATGTAGGTCGGGCATTTATGCCCGACTTGTGAGTAAAAAAATAAAAGGAAATTGAGATGGTTTCATAAAATGTAGGTCGGGCATTTATGCCCGAC >NZ_CP009158|7|7|2261836-2261939|CRISPRCasFinder TTTCATAAAATGTAGGTCGGGCATTTATGCCCGAC TTGTGAGTAAAAAAATAAAAGGAAATTGAGATGG TTTCATAAAATGTAGGTCGGGCATTTATGCCCGAC
>NZ_CP009158.1|WP_021109865.1|2259844_2260432_+|5-formyltetrahydrofolate-cyclo-ligase MNNISPLSISEQRNQLRKQMRAKRLALTADEQAFAAQDIIPKSLALIERYSAQHIAFYLPFNGEISPLALMDRLIKQGKKIYLPVLHPFSANQLLFLQYQGEPQLERNRFGILQPKLDVRNVLPLNELEMIFVPLVACDTQGNRLGMGGGFYDRTLAQAKQLISVGLAHQCQQLEYLPLESWDEPLDYVVVGNQA >NZ_CP009158.1|WP_005713118.1|2259265_2259595_+|cell-division-protein-ZapA MSKNNIELSLFGQVLRLYCPPEQQEALLASAKRLEDRVAVLKEQSGIIQLEKVLSIVALNLNYELEQEQRKNAENKNVLMACVEQLDSSLAKFQSSGMDSVSVGQENNE >NZ_CP009158.1|WP_010786192.1|2258645_2259191_-|UPF0149-family-protein MAISQSSDFKQLISELHIDYTPAEFHGFLSGLIAGGIQDESWKTLTYQFTNDGHAFSQAPLAKLTEFYQQLSDSFDEANTLFSLWLNEEDGFAMADGIAEWTGHFLLGLGLAQPTLQQETDEVGEAIDDLDEIAKLGYSEEDKNDELLDSGEEIIEYLRVVTLFLHSHFAKPKMAEKPKVH >NZ_CP009158.1|WP_038515072.1|2256839_2258621_+|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase MIRLEHSQLLGKLNFIDQYIHAKNAADASTIDANANVTQKNLATMEQELMKDFFVQINRAKVSGKIAEIFGQSLADEYLRQIEAHEIYVHDETSLKPYCVSVTLYPFLRDGLTKLGGESQAPQHLASFCGSFINLVFAISSQFAGAVATVEFLTYFDYFARKDYGDNYLQTHQHEIANHLQQVVYSINQPAAARGYQSVFWNISIYDHYYFDAMFGNFVFPDLTVPNWQTTSALQDFFMQWFNQERTKAILTFPVVTAAMLTENDKCKDSDFADKMAKALAEGNSFFIYQSDNPDSLASCCRLRNEIADHSFSYSLGAGGVATGSINVITLNMNRLEQDGRDLATEVSKIHQYQYAYRKLMEDYLKAGMLPVYDAGFISLDKQFLTIGINGMVEAAEFRGIKVGYNSAYIDFVRERLFAIYQANQTAYKTYGVKFNTEFVPAENLGVKNAKWDKEAGYVVPRECYNSYFYVVEDEQINALDKFLLHGKALVEYLDGGSALHLNLEEALSQQSYRSLLDIAAKTGCNYFCINVKITLCNTCDHIDKRTLSQCSCCGSKDIDHATRVIGYLKRISSFSSARQKEQALRHYHRQAA >NZ_CP009158.1|WP_005713113.1|2256372_2256843_+|anaerobic-ribonucleoside-triphosphate-reductase-activating-protein MKQIRFISEQIVWQEVPNETSLAFLISGCPLGCKGCHSIESWKLGSGQFLSEIYLQQRLAQYQGLISCVLFMGGEWLPELLLQRLQLVRQSGLKTCLYTGLELEQLPPEILAVLDYVKTGRWIAELGGLNCITTNQRFINLQTGEVLNAHFRQDKQ >NZ_CP009158.1|WP_005713111.1|2255634_2256198_+|anthranilate-synthase-component-II MLLIIDNHDSFTFNLVDLLRKIGVEMQVVSVEELDLDDVERFSHIMISPGPDVPRAYPQLFAMLERYHQHKSILGVCLGHQTLCEFFGGELYNLNQVRHGQQRPLIQQQANPLFKNLPKQFNIGLYHSWAISQKSLENTPLVATATCDQGVLMAVKHRSLAIYGVQFHPESFITEYGEQMLRNWLGH >NZ_CP009158.1|WP_038515070.1|2254018_2255635_+|DNA-recombination-protein-RmuC MNLDPIWLYATIALLLLISLWLFFSYSRSQRDSQERQQDLEQLQQQFSTLSQKYEQISLEKNQVEQFAVQQQTKAESTLERLNERDLAIQKLQQQLKQAELQEDQLERYINELKERIGSAQTKAESLEEQLQQTQLQLQHQQAESGQLQAKFSQSQQELTELRTTLSEKQANFEAQQKNFLEVRQQLNVEFQHLAQQILEEKSKSFSESNQSALNLLLNPFKEQIESFQKRVNEVHSEAIKGNADLGAEIKRVLEIGLSMSQEAQNLTTALKGNNKIAGNWGEIQLESALQTAGLLAGEHYIAQESYRDEEGKRFAPDFVVKLPDDKHLILDSKVSLIAYDQAVRSEDNFAIQQALDEHCRSLRTHIDGLSKKNYSQLIGIKSPDFVLMFVPIEPAYIEAMKHDPQLFNYGYERNVILVSHTTLMPILRTVANLWRIERGNAEAREISEKAGDIYNQVCVIAERLAKLGNTLNTASNQYNQSVTALVGKQGLLGKVERFQQLSAKAQQTTPQVELLETDWDTTRLHLLVEKPITQDNV >NZ_CP009158.1|WP_021112748.1|2252816_2253839_-|porphobilinogen-synthase MTQYLSTSFPAHRPRRLRKHDFSRRLVAENSLTTSDLIYPVFIIEGENQRVRVPSMPGVERLTLDQLLIEAELLVKYGVPAIALFPVVGDAKKSLMAEEAYNPDGLAQRAVRALKQAFGEKLGVITDVALDPFTTHGQDGIIDEDGYVVNDITTEILVKQALSHAQAGADIVAPSDMMDGRIGAIRQALEAHGFINTQIMAYSAKYASNYYGPFRDAVGSAGNLKGGNKKTYQLDPANGNEGLHEVALDIQEGADMVMVKPGMPYLDLVYRVKETFGVPTFAYQVSGEYAMHMAAIQNGWLKEKECIMESLLCFKRAGADGILTYFAKQVAEWLYQEKYK >NZ_CP009158.1|WP_038515068.1|2252026_2252608_-|Crp/Fnr-family-transcriptional-regulator MLMNLLHPTDLKRCQLTHLHSFTKGMTVYKQGETAKEFYYVNNGLIGLYHTLDNGKESLVRLYQKGDYFGYRTLFGDDGYHCNAKVLVEAEIIRIKPKDIDTFFVENPKMSKFLLQSLANELREAEQRLAKSAYLRTLDRVIDSIYFLTENFPYYNWTHREIAEYAGCETETAIRITKELKRNGLLQDWHKQK >NZ_CP009158.1|WP_038515066.1|2250808_2252020_-|anaerobic-sulfatase-maturase MFENAPKAHFHLMAKPSSFQCNIKCEYCFYLEKEYTIEQDVRFMNEDTLRNYVRNYIQSSAGQRVEFAWQGGEPTLLGLDFFKQAVRFQQEFANGKTITNAFQTNGIALNRQWAEFFKTHQFLIGISIDGLSEVHNKYRISVNGQPTFERVKRAVDLLKDYGVEFNTLTVINDQNWHKGRETYLALKELGSTFMQFIPIVETGCGTAPFAKKEVKPTAFSVPPQGYGHFLLEVFKEWVQQDVGKIYVLEFDNLLGQWLGYPSSSCVHQETCGESLIVEANGDVYSCDHFVYPAYKVGNLNEQPLGEIAHSQPQRNFGQQKRTVLTQPCWACDVRPFCHGGCPKHRMISLPNEANKHNYLCQSYQLFFRKTASFMRKMRDIIRSGGSAGDIVNFIGDKDANKNI >NZ_CP009158.1|WP_016527523.1|2262956_2263982_-|Gfo/Idh/MocA-family-oxidoreductase MEINMYNVGVIGLGLIAYGIDKDPNRKIIWSHIKAYKSIENIRISSVCDVKKSLVDSIQKECDIPNGYTDYKEMLKSNKFDIVSICTPIQTHFDIIKECIKNGVKVIFCEKTISYSLEESKEIVELCDKHNVIIAVNYIFRWDNLIQEIKGLLDSNAIGNIYSLVGYGATALHTSTSHLIDLLLYFSGSDIEYVVGDIQKDFVRNVHGISDVGGTGMIKFKSNSIGFIKGTSSSPMKYMFELDILGENGRIRLYNNGSSYDLYKFSSSENSSGSKYEHLDLVYSKHNTTPNERMIDAILSLIEGIETGKQPVSNIKTAIESIEVIESIKLSSMNGNIIKFQ >NZ_CP009158.1|WP_016527524.1|2263971_2264874_-|DMT-family-transporter MGNDSFIRFSYVLLMGFGFPIMRYMSIHFDTLNNNAVRFLSGGLLFVFICILKYRTELLKLLREPSIILYLLLLAIFMTGNMYFFINGLKYTSALAGSIFGIMSMPLAVIMAAIFFQDEREKVKQKSFYIGSVLSVIGSLIFVIYSNKTGGGNDFITGSLFLGTAIFIQSIQNLFVKKVAKKLNAIVISASTATLSGLVYLLLASNTGVIYQLQDISSGLLIGLIFAGMYGVLTGMLFAFYIVQKQGVVVFNIIQLTVPLSTAFIGYFTLGETISIYQGFGAAIVIVGCVISLRKKSHGD |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP009158_4 | 4.3|576844|50|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder | 576844-576893 | 50 | NZ_CP009158.1 | 1812985-1813034 | 0 | 1.0 |
NZ_CP009158_3 | 3.1|487276|39|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder | 487276-487314 | 39 | NZ_CP009158.1 | 268439-268477 | 1 | 0.974 |
NZ_CP009158_4 | 4.4|576925|41|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder | 576925-576965 | 41 | NZ_CP009158.1 | 268586-268626 | 1 | 0.976 |
NZ_CP009158_4 | 4.4|576925|41|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder | 576925-576965 | 41 | NZ_CP009158.1 | 944254-944294 | 1 | 0.976 |
NZ_CP009158_6 | 6.1|1493036|39|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder | 1493036-1493074 | 39 | NZ_CP009158.1 | 268439-268477 | 1 | 0.974 |
NZ_CP009158_3 | 3.2|487339|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder | 487339-487368 | 30 | NZ_CP009158.1 | 661953-661982 | 2 | 0.933 |
NZ_CP009158_6 | 6.2|1493099|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder | 1493099-1493128 | 30 | NZ_CP009158.1 | 661953-661982 | 2 | 0.933 |
1. spacer 4.3|576844|50|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to position: 1812985-1813034, mismatch: 0, identity: 1.0
ctaaaggagatagaggtccaaaaggtgatacaggtgagagaggtgcaact CRISPR spacer ctaaaggagatagaggtccaaaaggtgatacaggtgagagaggtgcaact Protospacer **************************************************
2. spacer 3.1|487276|39|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to position: 268439-268477, mismatch: 1, identity: 0.974
gtgaaccgggtcctaaaggtgaacaaggtattccaggcc CRISPR spacer gtgaaccaggtcctaaaggtgaacaaggtattccaggcc Protospacer *******.*******************************
3. spacer 4.4|576925|41|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to position: 268586-268626, mismatch: 1, identity: 0.976
acaaaggtgatacgggtccagcaggaccacgaggccctgcg CRISPR spacer acaaaggtgatacgggtccagcaggaccacaaggccctgcg Protospacer ******************************.**********
4. spacer 4.4|576925|41|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to position: 944254-944294, mismatch: 1, identity: 0.976
acaaaggtgatacgggtccagcaggaccacgaggccctgcg CRISPR spacer acaaaggtgatacgggtccagcaggaccaccaggccctgcg Protospacer ****************************** **********
5. spacer 6.1|1493036|39|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to position: 268439-268477, mismatch: 1, identity: 0.974
gtgaaccgggtcctaaaggtgaacaaggtattccaggcc CRISPR spacer gtgaaccaggtcctaaaggtgaacaaggtattccaggcc Protospacer *******.*******************************
6. spacer 3.2|487339|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to position: 661953-661982, mismatch: 2, identity: 0.933
gtcctgcgggtccagcaggaccacaaggcc CRISPR spacer gtccaacgggtccagcaggaccacaaggcc Protospacer **** .************************
7. spacer 6.2|1493099|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to position: 661953-661982, mismatch: 2, identity: 0.933
gtcctgcgggtccagcaggaccacaaggcc CRISPR spacer gtccaacgggtccagcaggaccacaaggcc Protospacer **** .************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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NZ_CP009158_3 | 3.2|487339|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder | 487339-487368 | 30 | JX411619 | Mycobacterium virus Rebeuca, complete genome | 2324-2353 | 5 | 0.833 |
NZ_CP009158_3 | 3.2|487339|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder | 487339-487368 | 30 | NC_041982 | Mycobacterium phage Twister, complete genome | 2157-2186 | 5 | 0.833 |
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NZ_CP009158_6 | 6.2|1493099|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder | 1493099-1493128 | 30 | MN586038 | Mycobacterium phage WalterMcMickey, complete genome | 2157-2186 | 5 | 0.833 |
NZ_CP009158_6 | 6.2|1493099|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder | 1493099-1493128 | 30 | JX411619 | Mycobacterium virus Rebeuca, complete genome | 2324-2353 | 5 | 0.833 |
NZ_CP009158_6 | 6.2|1493099|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder | 1493099-1493128 | 30 | NC_041982 | Mycobacterium phage Twister, complete genome | 2157-2186 | 5 | 0.833 |
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NZ_CP009158_6 | 6.2|1493099|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder | 1493099-1493128 | 30 | NC_008269 | Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1, complete sequence | 1105772-1105801 | 6 | 0.8 |
NZ_CP009158_6 | 6.2|1493099|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder | 1493099-1493128 | 30 | MG925349 | Mycobacterium phage Mendokysei, complete genome | 2648-2677 | 6 | 0.8 |
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NZ_CP009158_3 | 3.2|487339|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder | 487339-487368 | 30 | NZ_CP012105 | Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-6, complete sequence | 10193-10222 | 7 | 0.767 |
NZ_CP009158_3 | 3.2|487339|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder | 487339-487368 | 30 | KU716094 | Mycobacterium phage Eidsmoe, complete genome | 4673-4702 | 7 | 0.767 |
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NZ_CP009158_3 | 3.2|487339|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder | 487339-487368 | 30 | NC_023716 | Mycobacterium virus Alma, complete genome | 4674-4703 | 7 | 0.767 |
NZ_CP009158_3 | 3.2|487339|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder | 487339-487368 | 30 | MG872835 | Mycobacterium phage Conquerage, complete genome | 4673-4702 | 7 | 0.767 |
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NZ_CP009158_6 | 6.2|1493099|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder | 1493099-1493128 | 30 | NZ_CP012105 | Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-6, complete sequence | 6835-6864 | 7 | 0.767 |
NZ_CP009158_6 | 6.2|1493099|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder | 1493099-1493128 | 30 | NZ_CP012105 | Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-6, complete sequence | 10193-10222 | 7 | 0.767 |
NZ_CP009158_6 | 6.2|1493099|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder | 1493099-1493128 | 30 | KU716094 | Mycobacterium phage Eidsmoe, complete genome | 4673-4702 | 7 | 0.767 |
NZ_CP009158_6 | 6.2|1493099|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder | 1493099-1493128 | 30 | MH371122 | Mycobacterium phage Priya, complete genome | 4674-4703 | 7 | 0.767 |
NZ_CP009158_6 | 6.2|1493099|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder | 1493099-1493128 | 30 | NC_023716 | Mycobacterium virus Alma, complete genome | 4674-4703 | 7 | 0.767 |
NZ_CP009158_6 | 6.2|1493099|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder | 1493099-1493128 | 30 | MG872835 | Mycobacterium phage Conquerage, complete genome | 4673-4702 | 7 | 0.767 |
NZ_CP009158_3 | 3.2|487339|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder | 487339-487368 | 30 | NZ_CP054620 | Azospirillum oryzae strain KACC 14407 plasmid unnamed5, complete sequence | 17585-17614 | 8 | 0.733 |
NZ_CP009158_6 | 6.2|1493099|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder | 1493099-1493128 | 30 | NZ_CP054620 | Azospirillum oryzae strain KACC 14407 plasmid unnamed5, complete sequence | 17585-17614 | 8 | 0.733 |
NZ_CP009158_7 | 7.1|2261871|34|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder | 2261871-2261904 | 34 | NZ_CP012107 | Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-8, complete sequence | 4646-4679 | 9 | 0.735 |
NZ_CP009158_7 | 7.1|2261871|34|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder | 2261871-2261904 | 34 | NZ_CP009710 | Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 strain IP32953 plasmid pYAC_2, complete sequence | 24762-24795 | 11 | 0.676 |
NZ_CP009158_7 | 7.1|2261871|34|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder | 2261871-2261904 | 34 | NC_006154 | Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 plasmid pYptb32953, complete sequence | 17818-17851 | 11 | 0.676 |
NZ_CP009158_7 | 7.1|2261871|34|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder | 2261871-2261904 | 34 | NC_006154 | Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 plasmid pYptb32953, complete sequence | 18587-18620 | 11 | 0.676 |
1. spacer 3.2|487339|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to MK494124 (Mycobacterium phage Kristoff, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
gtcctgcgggtccagcaggaccacaaggcc CRISPR spacer gacccacgggtccagcaggaccgcaaggcg Protospacer * **..****************.******
2. spacer 3.2|487339|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to MN586038 (Mycobacterium phage WalterMcMickey, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
gtcctgcgggtccagcaggaccacaaggcc CRISPR spacer gacccacgggtccagcaggaccgcaaggcg Protospacer * **..****************.******
3. spacer 3.2|487339|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to JX411619 (Mycobacterium virus Rebeuca, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
gtcctgcgggtccagcaggaccacaaggcc CRISPR spacer gacccacgggtccagcaggaccgcaaggcg Protospacer * **..****************.******
4. spacer 3.2|487339|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to NC_041982 (Mycobacterium phage Twister, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
gtcctgcgggtccagcaggaccacaaggcc CRISPR spacer gacccacgggtccagcaggaccgcaaggcg Protospacer * **..****************.******
5. spacer 6.2|1493099|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to MK494124 (Mycobacterium phage Kristoff, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
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6. spacer 6.2|1493099|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to MN586038 (Mycobacterium phage WalterMcMickey, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
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7. spacer 6.2|1493099|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to JX411619 (Mycobacterium virus Rebeuca, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
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8. spacer 6.2|1493099|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to NC_041982 (Mycobacterium phage Twister, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
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9. spacer 3.2|487339|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to NC_008269 (Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
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10. spacer 3.2|487339|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to MG925349 (Mycobacterium phage Mendokysei, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
gtcctgcgggtccagcaggac---cacaaggcc CRISPR spacer gtactgcgggtccagcaggacagacgccag--- Protospacer ** ****************** *.* **
11. spacer 6.2|1493099|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to NC_008269 (Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
gtcctgc-gggtccagcaggaccacaaggcc CRISPR spacer -cccggtggggtccaccaggaccacgaggcc Protospacer .** *. ******* *********.*****
12. spacer 6.2|1493099|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to MG925349 (Mycobacterium phage Mendokysei, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
gtcctgcgggtccagcaggac---cacaaggcc CRISPR spacer gtactgcgggtccagcaggacagacgccag--- Protospacer ** ****************** *.* **
13. spacer 3.2|487339|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012105 (Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-6, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
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14. spacer 3.2|487339|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012105 (Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-6, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gtcctgcgggtccagcaggaccacaaggcc CRISPR spacer gagatcctggtccaacaggaccacaaggcg Protospacer * * * ******.**************
15. spacer 3.2|487339|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012105 (Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-6, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
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16. spacer 3.2|487339|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to KU716094 (Mycobacterium phage Eidsmoe, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
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17. spacer 3.2|487339|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to MH371122 (Mycobacterium phage Priya, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
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18. spacer 3.2|487339|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to NC_023716 (Mycobacterium virus Alma, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
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19. spacer 3.2|487339|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to MG872835 (Mycobacterium phage Conquerage, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
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20. spacer 6.2|1493099|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012105 (Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-6, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
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21. spacer 6.2|1493099|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012105 (Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-6, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gtcctgcgggtccagcaggaccacaaggcc CRISPR spacer gagatcctggtccaacaggaccacaaggcg Protospacer * * * ******.**************
22. spacer 6.2|1493099|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012105 (Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-6, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
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23. spacer 6.2|1493099|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to KU716094 (Mycobacterium phage Eidsmoe, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
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24. spacer 6.2|1493099|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to MH371122 (Mycobacterium phage Priya, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
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25. spacer 6.2|1493099|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to NC_023716 (Mycobacterium virus Alma, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
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26. spacer 6.2|1493099|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to MG872835 (Mycobacterium phage Conquerage, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
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27. spacer 3.2|487339|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP054620 (Azospirillum oryzae strain KACC 14407 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
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28. spacer 6.2|1493099|30|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP054620 (Azospirillum oryzae strain KACC 14407 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
gtcctgcgggtccagcaggaccacaaggcc CRISPR spacer gtccggcaggtccagcaggaccaggaactg Protospacer **** **.*************** .*. .
29. spacer 7.1|2261871|34|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012107 (Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-8, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ttgtgagtaaaaaaataaaaggaaattgagatgg CRISPR spacer tcttgagcgaaaaaataaaaggaaattttcaacg Protospacer *. ****..****************** * *
30. spacer 7.1|2261871|34|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009710 (Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 strain IP32953 plasmid pYAC_2, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
ttgtgagtaaaaaaataaaaggaaattgagatgg CRISPR spacer tcgtgagaaaaaaaataaaaggcaatgtcagccc Protospacer *.***** ************** *** ...
31. spacer 7.1|2261871|34|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to NC_006154 (Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 plasmid pYptb32953, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
ttgtgagtaaaaaaataaaaggaaattgagatgg CRISPR spacer tcgtgagaaaaaaaataaaaggcaatgtcagccc Protospacer *.***** ************** *** ...
32. spacer 7.1|2261871|34|NZ_CP009158|CRISPRCasFinder matches to NC_006154 (Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 plasmid pYptb32953, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
ttgtgagtaaaaaaataaaaggaaattgagatgg CRISPR spacer tcgtgagaaaaaaaataaaaggcaatgtcagccc Protospacer *.***** ************** *** ...
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
20289 : 28670
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP009158|20289:28670|DBSCAN-SWA ACTAATGTTTGGTATCCGATTGACTTTGTGGTTGTAGATATTCTTCTCGATTCGGATCAACTTGTTTTGATTTACGAATCATTGGCTCAATAGTTGTACCTTGTACCAAAATAGAGAACATCACAACAGAATATGTCATCACCAGAATTAGATCTTTAACATCAATACCATTGGCATAAGCAGTTTTGGCTGGAATAGAAAGTGCCATTGCTAATGCCAAACCTCCACGTAATCCGCCCCAGCTCATGATTTTTAAGGTATATGGATTGTAAGTACGGAACTGTTGTAGCGCCTTATATGGTAACCATAAGCTGATATAGCGAGATGCTAGACAAATCGGAATTGTCAGAATCATCATCACAATACCGTAGATATTAAAATCGACGAGTAAGATCGCAAAACCGATAAGGAAGAAAAGCAGAGAATTTAAGAAATGGTCAATCATTTCCCAGAAGTGATCAAGATAACGTTGGCTCTGTTCAGAAAAGCCTGAACGACGGGTCCAGTTACCAATCATAATGCCTGCCACAATCATTGCCAACGCACCTGAAACGTGCAGAACATTGTTTGCAAACATAAAGCCTGCGGTTGGAATGGTCAAAGTTAATAAAATTTCTAAGCTACCATCATCGGTTGATGAAATTAAAATATGAGCAAGGAAGCCTAGCACAAATCCAAACAGGATACCGCCGATAGCTTCATGCAAAAAGAGGCTCATAATTCCACTAAAACTGGCTTCTTGACCACCAAATGCAACAGCAAACACAGTGACGAAGATAACTAAACCAACACCGTCATTGAAAAGCGACTCACCTTCTACTTGCATAGATAAACGCTTCGGTGCTCGTAAATTTTTGATGATCGCAAGTACAGCAATTGGGTCAGTTGGAGAAATCAGAGCACCAAAAACGATACAGTAAATCAAATCAATTTGTAGCCCAATTAAGTTGGCTACCCCATAGACGAAGAAACCAATAATCAAAGTTGAAGCTAAGGTTGAGAATAACGCAAAAATGGTAATTTCCCATTTTTGATCTTTAAGAACAGGGAGTTTAATTCCTAGTGAACCTGCAAAGAGTAGGAACCCTAAAATACCGTTAAGTAAGAAACTCTTGAAGTCGATCTGTTCCATGACTTCTGTTGCGACAGCATCAAGGTTAAACCAGCCGAAAGTTCCGAGTAACAGTAGTAAGAGAGAACCGATCATTGCTGCAGCTGTAATAGCAATGGTCGATTGGATTTTATCGCTGATTTTATGAGTAATGAAACCTAATAAAATAGAAAGTGCTGATAAAAAACAGATATAAGTATAAATACCCATGATGGTATCCTTATGGAGACAAAAAAGAAAGATCCTTGTTATAAATAGTCTGCAAATTAAACCAAATTTTTAATCTGATTGCAAAAAAATAAAAGATATTAAGTGAGCTATTTCACAAGTAACAATTTGAGAATTTTCCACTTTAACGGTATAATTAAGAGTAGTTTTTTGTAATTTTAGGGATCATAAAGATGATTGAAAAAATGCATGAGAAATCTGGTGGGTGGGTATTTAAAATCATTTTTGCATTAGTTTCTCTTTCGTTTGTATTAGGCGGTATTGGTGGTGGGTTGATGGCTACAGACAATTCCGTTGCCAAAGTCAATGGAGAAGAAATTTCTCAACAAGTATTTAGCCGAGCAAAAAATCAGCAGCAAAATATCCTAAATGCTCAATTAGGTGAGCGTTTTTGGGATTTAATGGACAATCCTATTTATGTCAAACAGTTCCACGAGAGTATTTTAAATGGTTTAGTTGATGACGAGCTTCTTCGTCAATACGCTAAGAGCCTTAAAATTGACGTTAGTGCCGATCAAATTAAATCAGAAATTGTAAACAGTCCTGCTTTCCAACAAGATGGTAAATTTAATAATAATTTATATCAGCAAGCATTACGTAATAATGGTTTAACGGCTGATGGTTATGCTGCAATTGTTTATGAAGGCATGCTATTTGCACAAATTCAAGAGGCTATTGTAAATAGTAGTTTTACCGTTCCTGCACAACAAGAACTATTAGCGAAATTATTGTTACAAAAACGTCAAGTACGTCTGGCGACCTATTCAATTGCAAAAGAGGTGAACAATCAAACCGCTTCTACAGAAGAAATGCAAGCCTATTATGAGGCAAATAAAGCGAATTTTGTTAATCCAGAAAAATTGACCGTAGAATATATTTCTATTGAACCAAAGGATTTGGCTAATAAAATTCAAGTTACTAACGAACAAATTGACACTTATTATCAAACAAACAAAGCTAAATATACGACAAAAGGCGAAGCGAAAATCGCACATATTCAAGTAGCCACTGAAGCTGAAGCAAATGAAATCGTACAAGCACTCGCTAAAGGTGAGGATTTTGCACAATTAGCAAAAGCAAAATCACAAGATAAATTATCTGCTGCTCAAGGTGGAGATTTAGGTTGGGCGAAAGCGGGCGTCTTCCCGAAAGCCTTTGAAGATGCGGCTAATATGTTAGACGCTGGAAAAACAAGCCAACCAATCAAGGTAGATAATGCTTTCCATATTATAAAAGTATTAGAACGTAATGTAGAAACTGTTGTGCCGTTAGAGAAAGTAAAAGCTCAAATTACGGATACAATTCGTAACGAGTTACTTTTAACGGAGTATTCAAACATCACCCGTGAAATGGCAAACGTAGCATTTGAAAATAGTGGCTCACTTGAAGCGGTTGCAAAAGTAGCGAATGTTCTAGTTCATAAAACAGATGCTTTCACACGTGAAACTGTACCTGCTGAACTTGATAACGAGAAAGTCCTACGCGTTTTATTCGACAGTGAAGTGCGCCAAAATGGGCAAAATTCAGAAGCTATTGATTTAAGTGATGCCACAAATACTAAAACGATGTTTGTTCGTGTAAGTCACTATCAAGCTGAAAACGTACAAACTTTTGACGAAGCAAAATCAGCAGTTGAACAAGCAGTGAAACAACAAAAAGCGCTCAAAGTCTTAGAAGAGAAAGCCACTACACAAGTTGCAGCATTGAATAAAGGCGAAACAGTAGAAGTCGCATTTGGTGCCTCTGAAGAACTTGTCTTTGCACAGGCACAAATCACTGAACCGGCTTTAGCACAAGCGGTCTTTTCAATGGCAAAACCTGCAGAAAAACCGACATATCAGACCGCTCGTAATACGAATGGTGACGTGGTTGTTATCGCTTTAGATAAAGTGAGCGATGGCACAGCTGACGAGTTTAAACCTTTACAAGCACAGTTTAACCAAGCAGAGCGAGTTGTGTTACGTAATGATTTACTCAAAGATTTACGTGAACGTGCAAAAATAGAAGTAAATCAAGACTTCCTTGACCAACTCGAAAGCAGCAAATAATATAAATGTGAATTTGGTTAAAAATTTGTAATTGACTTTATCTATAAATTTCCGCAAAATTCACGTAAATTTTTTAATCTTCAGGGCAGGGTGAAATTCCCGATCGGCAGTAAAGTCTGCGAGCGGCGGCGAAAGCCAAAGCAGGAACTGGTGAAATTCCAGTACCGACAGTGATAGTCTGGATGGAAGAAGAGCTAGAATGTCTACACTCGAACACTGTTCGAGTGCTTTTCTTATGCTTTTAACGCCTTGAGATCGTGAGATTTCAAGGCGTTTGTTTTTTCCTCTCCCGTTTACGGGAGAGGGAGGAGCCAATTCGGTAGAATTTGCGGAGGGAGAGGGTTTGCAATAAACTTCCCTCTCTCTGCTTTTCGTAAAGCCGTTACTTTGCTCAAAGCTGTCTCTCTCCCGTGAACGGGAGAGAATTATTCTTCTTCCTTGCCCTTCAATTTATGATTTAAAACCCAAAATGACACACTCTATTTTTATGGCTCGTGCCATTGAACTGGCTGAACTTGGTCGTGGCTGGACAAATCCTAATCCGTTGGTTGGTTGTGTGATTGTCAAGGACGGCAACATTGTTGCGGAAGGCTATCACCAACGCTACGGCGAATGGCACGCCGAACGTAAGGCGATTTTACATTGTCAGGAAGATTTAAGCGGAGCAACGGCTTACGTTACCCTTGAGCCTTGCTGTCACCACGGACGGACACCGCCCTGTTCTGATTTGTTGATTGAACGGGGGATTAAAACCGTCGTTATCGGCTCAAGTGACCCCAATCCTCTCGTGGCAGGCAAAGGTGTGGCACAACTTCGCCAAGCGGGGATTGAAGTGATTGAAAATGTGATGAAAGCCGAATGTGATGCGTTAAATCCAATTTTCTTTCACTATATTCAAACCAAACGCCCTTATGTGTTGATGAAATATGCGATGACCGCAGACGGTAAAATTGCCACCGCAACAGGCGAGGCCAAATGGATCACAGGGGAGCAAGCCAGAGCCAATGTGCAATGCACCCGACATCAATACAGTGCGATTATGGTTGGAGTAGATACCGTGTTGGCGGATAACCCGATGCTCAATAGCCGAATGCCAAATGCCAAACAGCCAGTACGGATTGTGTGCGATAGCCGGTTACGTACGCCATTAGAGTGTCAATTAGTCCAAACTGCCAAAACCTATCGCACGATAATTGCGACAGTTTCAGACGATTTGCAAAAAATCGCCCAATTCCAACCGCTTGGGGTGGAAGTACTGGTCTGTAAAGCAAAAGACAAGCGGATCGATTTAGCCGATCTTTTACAGAAACTCGGCGACCAAGGCATTGACAGCTTATTGTTAGAAGGTGGTTCAAGTTTAAATTTCAGTGCGTTAAACGCTGGCATTGTAAACCGTGTGCATTGTTATATCGCCCCGAAATTAGTCGGTGGAGTTACCGCCAAAACGCCCATCGGTGGTGAAGGGATCGGCGTGTTGGCAAATGCGGTGCAATTGAAAAATGCAAAGATCCGCCAAATCGGCGAAGATCTTCTGATTGATTATGAAGTAGGAACACATTGATATGTTCACAGGTATTATTGAAGAAGTCGGCAAAGTCGCCAAAATCCACAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP009158|20289:28670|21800_23675_+|WP_005712135.1|DBSCAN-SWA MIEKMHEKSGGWVFKIIFALVSLSFVLGGIGGGLMATDNSVAKVNGEEISQQVFSRAKNQQQNILNAQLGERFWDLMDNPIYVKQFHESILNGLVDDELLRQYAKSLKIDVSADQIKSEIVNSPAFQQDGKFNNNLYQQALRNNGLTADGYAAIVYEGMLFAQIQEAIVNSSFTVPAQQELLAKLLLQKRQVRLATYSIAKEVNNQTASTEEMQAYYEANKANFVNPEKLTVEYISIEPKDLANKIQVTNEQIDTYYQTNKAKYTTKGEAKIAHIQVATEAEANEIVQALAKGEDFAQLAKAKSQDKLSAAQGGDLGWAKAGVFPKAFEDAANMLDAGKTSQPIKVDNAFHIIKVLERNVETVVPLEKVKAQITDTIRNELLLTEYSNITREMANVAFENSGSLEAVAKVANVLVHKTDAFTRETVPAELDNEKVLRVLFDSEVRQNGQNSEAIDLSDATNTKTMFVRVSHYQAENVQTFDEAKSAVEQAVKQQKALKVLEEKATTQVAALNKGETVEVAFGASEELVFAQAQITEPALAQAVFSMAKPAEKPTYQTARNTNGDVVVIALDKVSDGTADEFKPLQAQFNQAERVVLRNDLLKDLRERAKIEVNQDFLDQLESSK >NZ_CP009158|20289:28670|24144_25236_+|WP_005712138.1|DBSCAN-SWA MTHSIFMARAIELAELGRGWTNPNPLVGCVIVKDGNIVAEGYHQRYGEWHAERKAILHCQEDLSGATAYVTLEPCCHHGRTPPCSDLLIERGIKTVVIGSSDPNPLVAGKGVAQLRQAGIEVIENVMKAECDALNPIFFHYIQTKRPYVLMKYAMTADGKIATATGEAKWITGEQARANVQCTRHQYSAIMVGVDTVLADNPMLNSRMPNAKQPVRIVCDSRLRTPLECQLVQTAKTYRTIIATVSDDLQKIAQFQPLGVEVLVCKAKDKRIDLADLLQKLGDQGIDSLLLEGGSSLNFSALNAGIVNRVHCYIAPKLVGGVTAKTPIGGEGIGVLANAVQLKNAKIRQIGEDLLIDYEVGTH >NZ_CP009158|20289:28670|20289_21609_-|WP_005712132.1|DBSCAN-SWA MGIYTYICFLSALSILLGFITHKISDKIQSTIAITAAAMIGSLLLLLLGTFGWFNLDAVATEVMEQIDFKSFLLNGILGFLLFAGSLGIKLPVLKDQKWEITIFALFSTLASTLIIGFFVYGVANLIGLQIDLIYCIVFGALISPTDPIAVLAIIKNLRAPKRLSMQVEGESLFNDGVGLVIFVTVFAVAFGGQEASFSGIMSLFLHEAIGGILFGFVLGFLAHILISSTDDGSLEILLTLTIPTAGFMFANNVLHVSGALAMIVAGIMIGNWTRRSGFSEQSQRYLDHFWEMIDHFLNSLLFFLIGFAILLVDFNIYGIVMMILTIPICLASRYISLWLPYKALQQFRTYNPYTLKIMSWGGLRGGLALAMALSIPAKTAYANGIDVKDLILVMTYSVVMFSILVQGTTIEPMIRKSKQVDPNREEYLQPQSQSDTKH >NZ_CP009158|20289:28670|25237_25882_+|WP_005712141.1|DBSCAN-SWA MFTGIIEEVGKVAKIHKQGEFAVLTITGSKIFTDMHLGDSIAVNGVCLTVTEFGANHFSADVMSETLARTSLGELQPNSPVNLERAMAANGRFGGHIVSGHIDGTGEIVSITPANNSVWYQIKTTAKLMRYIIEKGSITIDGISLTVVDCDENSFRASIIPHTLSETNLGTKKVGSIVNLENDVIGKYVEKLLSPKQSEPQSNITEEFLKRVGF >NZ_CP009158|20289:28670|27305_27767_+|WP_005712146.1|DBSCAN-SWA MAIITGNLVATGLKFGIVCARFNDFINDKLLSGAIDALVRHGASESDIDTAWVPGAFEIPLVAKKMAESGKYDAVICLGTVIRGSTTHYDYVCNEAAKGIGAVSLQTGVPVIFGVLTTENIEQAIERAGTKAGNKGSECALGAIEMVNVLKGL >NZ_CP009158|20289:28670|27878_28670_-|WP_038513274.1|DBSCAN-SWA MIELNNLFITFNKGTVIENPVLRGLSLNVAEGEFVSVIGSNGAGKSTLLNVISGDYPIDSGEIFIQGKEVSKLTSWQRAKQVARVFQDPMTGTCEALTIEENMALAYQRGQKRGLGFALNRQVRELFKEKLSLLGLDLENRLTDQMGRLSGGQRQAVSLLMASLQPSNILLLDEHTAALDPKTTAFVLELTNKIVREQKLTTLMVTHSMRQALDYGDRTVMLHQGQVAFDVAGDARKKMDVPDLLRLFEQSRHEKLSDDGLLL >NZ_CP009158|20289:28670|26013_27213_+|WP_038513271.1|DBSCAN-SWA MFQFSSVEQALDALRQGKIIIVSDDEDRENEGDFICAAEFATPENINFMATYGKGLICMPISTAIAKKLDLPQMVSYNTDNHETAFTVAIDHIDTGTGISAFERSLTVLKVVDDNAKPSDFRRPGHMFPLLAKDGGVLVRNGHTEATVDLTRLAGLKHAGLCCEIMANDGTMMKMPELQAFATKHNMPFITIAQLQEYRRAKDCLIEQISVVKMPTKYGDFTAHSFIEKITGKEHVALVKGDIGNGEEVLCRIHSECLTGDAFGSQRCDCGQQFAAAMSQIEQEGRGVLLYLRQEGRGIGLINKLRAYELQDKGMDTVEANLALGFGEDEREYHIGAQMFRSLGVKTIRLLTNNPAKIEGLQQVGLNIVAREPIMVEPNKHDLEYLKVKQVKMRHLFNF |
7 | Staphylococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
34458 : 43914
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP009158|34458:43914|DBSCAN-SWA GTTAAAAGTTTGCTAATCGTTGTTGATTAAGCTGGGGTATGGCTTGTTCAATGAATGGGTCAAGCCATACGTTAAACTCGTGTGCGATGTCGTAGGCTTTTCCTGCAATATCGTTTTTAACATAGCGAGAAATGCCCAAATCTTCGTACAGTTTACGGTGGAATACTTCTACTTCTTTGGCAAAGGCTCTGGCTCTTACAAGATATTTGGCAATTTGTTCTGCATCTAAACCTGCAATGGTGATGTCTTTTTTACTGCGGTCAATCGGGCGGTATTGGTTGCCGAGTGTGTTTAAGAAGTTGATAACGCGTTCAAACATTGTTTGCGGTAGTTGGTCATACTTCGCTACGTTAAAAGTGCTTTTGAGCCGAGAGTAGATTTCTTGCCAGTGTAATCCTGTTCGATAGTGAGCCTGTTGTACCGCTTCCTGTATAGCTCGTTGTTGCTCAGGGGTAATTGTAAGCGGTGCGATTTGTTGTTCATTTTGCAAAATCTCACGATCAAGAATATCCAGTACCCATTTGCGAAACTCTTTGGCGACTTTGGTGCGGGCGAACATTGCGATGAGGTGCGCACCACGCAAAGAGAAGACGCGAACTTGTTGTTTTCCGCCTGCGGTTTGCAGTTCGATAAGTGCGGTCATTTCTGCGGTAAATTCGTCTGCGTTGCGGTTGTAGATTTTTACGATTGCTTTTGTAGGATCAGCGTATTCTAATGCTGTACCTAAATCGCTTGCTGTTAAGAATGTGTGGTTGTTTTTATTGATAACCGAAAGAGTAGTGTTTTGAAATGTTAATGTAGTCATTTTATTATTCCTTGTGTTTGTTTTAAAACTCATCACAAGCTACTGCAATAACTGGTGATGAACTGGCTAAGGTTTGCAGTAACCGTTACACAAGGAAGACGGCAGATCTTTCGATCTCCTTAACCAGCCCATCATTGACTACTTTTAAAGGGGTTCCCCAATTTGGGGGTACCTTTGAAAGGTTTGATTTGACTAGATTTCGGCTATAAAAAAAGTCGCTTTTGGCGACTATCATTATCTCCGCCACTCAATTCAGGACTGCGATCCCGACTTTCTGTTGAAAGTGGGAGTATCTTAAACTGAATTGGGTGACGGTGTCAATAAAAAAGCCTGCGTGGTGCAGGCTTTTAAAATCAATTATTATTTTCTTCGGTGTTATTTGACTTTGGTGCTTCAATTTTTTTGCCGATCACAAACACCCCTGCAATAGTCGCCAACACACTAATCATTACTGTTGCAGCTAATCCTGGGTGACCTTGTGAAACAAGATAAAAACAGAAGCCTGCTACAATAACAACACTCAACATACCAAACCATAAACCGAGTGATTTTTGTTTTAGTGAGGTTTTATTTAATTCAAAACGTTCATTTTTTGCCTGTTCGGCATAAGTCATCACTCTGTCGCCAAAGTTAGGAATATGCTTGGCATATTCTGCCATTTCTCTTGCTGGTGGCAGTGGACCGTGGTGTAAAGACATTGCTTGTTGAACAATGATTGTTTGTGCTGCATCGGTATTGATAACTTCAGCAAGTAATTCTGGGTCTTTAGTAACAACTTCGACGATTTCTTGTTTATTTTCGCTGTGCATTAACAACTTCTCCTATCCCTTTTCGTAAATCATCACCAAGCTGCCTAAAATCATTCTGCATATTTTTTAAGTCATCTTGTGGAGAACCGATATCAATTGAAGCAAATAATGGGGCGATATTGAACATAGAACCAAAACCAATAAAGAAATTGGCAATGCATTGATGTTTTGTCATTTTCATATTGATTTCCTAAATTAAAGTTATTAAGCCACACACAAAAAAAGCCTGCAAATGCAAGCCCTGTCACGTTCTGTATTTTAAAAAAGCACTTTCTGTTGAAAGTGGGGGTATCTTAAATCAAAGGGCGGTGGGTGTCAATACTAGATAAAACAAAGGGGAGCCTTTTAGCTCCCCACTTCACGATTAAGTTAGCTTGTTATCGCTTTGCTTAATCGACCAAACATTTTTCAGCTTGGTTTTACAAGCCCCTTTCGGGTTCACTGTTAATTTAACTTAACTTTAAGGCTTTAGCAACTGCTTTTTTGATATTTGCAAAATCTTCATCATCGATCACAGGTACGACATATTCACGTTTTTTTAGCTTATAACGATCTAATCTTGATAATGATACTGTATAAACCATATCACATTTAGCCCAACATTGAATATTGCTTTTATCAGGTAACGGGTTATTAGGCATTGGGTAGTGATAGGGCTCTAATGGCTCCGGTTTGGTAGTACTTAATGGCACAATGGTAACCAATTCGCTATTTTTCTTGTGCTTTGATATAACGACAACAGGACGAGTTTTCACCATTTCAGGGGCAATAAAACCCGAAAAATCGCACATTACAACGGCTTTTTCTTTAGGTTGATATTTTAATGCCATTTTAAAATCCTTGTAATAAAAAAGCCGTAAAATACGGCTTGAAAGTGCGGTTATCTTAATCCTAATTGGCGGTGGGTGTCAATATCAATAAATTATATAAATAATGCTTGTATTTTGTTTTTATTATTTATATAATGAACTTGTTTTCGGAATGGTTCTGAAAATAAGAAGCCCGACTGAAATCGGGCCTTTAAAAAAGGAGCTAGGATTATGTTTTGGAAAATCGCAATCCTAGTTATCTTGTTAGTGGTAAGCTCAAATGCTTACTAGTTAATAGATAACCCTGCGGGGGATATGTGGAAGTGTCCCCCAACGGCTCCTAATATAACAACTTCAGTTTTAAAAATCAACCAAAGGTAATAAAAATGGCAAACGCTCAAACAGAACATTCTCGTAAACTTCGTGCGGAAACTTCACGCCGATTAAATGATAAAGCCTTAGCGGAAGGTAAAGCACGCCGTATTTTAATGCAATTACCTTCGGAAGTTGCCGATGAATTTGATGCCATTTGTGCTGAAATGGGTGTTTCTCGTCCACAGGCGATCAAGGCTTTATGTGCGTTGTATCGGGGGAAGTAGGGGAGGTTTTTTCTCCTGTTAAAAATTAAACCCCTGCCCGTGTGTTACGACTTTTTCGATTTCTTCGTAGCGGCGGACGTTAAATTTCTCAAACTCTAATACTTTGACTAGGCTTTCTGCTTTAGCCTTGAGTTGTTCGAGTTCTTGCTGTTGTTTGAAATTCTGTGCGACAAGTTCTGAAATGTGTTCGTTTGCTCGAATAACGGCAAGGGCTTGCCGTGAGCAGAGTGTTACATAATAGTTTAACTGCTTACGCAGTTTGAAAGGATTGAGGGTTTTCATAGTGGTTCCTTTGGTCAATCGAGTTAGTTAAGAATTCTACTTTGAGCAACTTCAATCAGTAGTTTGTATTCGTGATGGGTCTTGTCATCGTGGACTTCTTTTGATTTTGATAAAAACTCGTCCACCGTGCCTGTAAAGCAACCACGAGTAACAATTAACCCAAATTTTCCATTAAAGACCGTAAGCGTTCCATTTTCTGAGCCTACATTACTTGCCCAAAAAATCATTTTGCGTTCAGAGATAACTGCAAAAGATCTCACCCGAGCATCACCGAACACCCGAGCGATATCGTACACCCGAGCATCACCGCACACCCCAGCGTTACCGTACACGCAAGCGTCACCGTACACCCGAGCATCACCGAACACCCGAGCGTTACCGAACACCCAAGCCTTACCGTACACCCGAGCATTACCGTACACCCGAGCATTACCGAACACCCGAGCGTTACCGAACACCCGAGCATTACCGTACACCCCAGCGTTACCGTACACCCAAGCATTATCGTACACCCCAGCGTTACCGTACACGCAAGCGTCACCGCACACCCGAGCATTATCGTACACCCAAGCATTACCGCTATGATCTAAATTCTTTTCGGTTTCGATATAACCGCCTAATTGGCCTGCTCCAACTAAACCAAATGTAATAAGTGCTTTAATTCGATAGAGCGTTCTGCCTAAATGTTCTACTGTGTCATCTTTGAGTAGTTCGTATTTCTTTTGTGTAGTTTGTTCTGTCATTTTTAATTTCCTCGCAATAAAAAACCGCCTGTATTGCTACAAGCGGTTGGTTTTCGTGAAAATGTTGCAATAAAAAAGCCACCGTAAAAACGATGGCTTTTCTTAAAACTTCTTGATTTTGTTAGTACACTAATCTATAATGCACTTGTTTTCAGCAATGGTGCTGAAAACGAGCTGGGTCCGACCTTAAATCTAACCCAACTTTTGGAGGGATAACATATGCTTTACCGCATTATCCTAGTTATCATTCTCTTAGTAATTAGCTTGCCGGCTTACTAAGTTGAATGAACTAAGCAGGGGGAGAAATCTCCCTGCTCTTCAAAACTGATATTAAGGATTTATTATGGCATTGTCAAGAAGTGAGATTGTGGCTCGCAGTGATGCAAAAAAGGGGATGCAAGCCAAAACCTATAAACTTCCGCAAGCGTTGGTGGCTGAAATTGAGTTGTTAGCCAAACAGTGCGGTATCTCTCAAGGATTGTTAATTGCTCAAGCCGTTGAGCTGTTTAAGCAATCGCAGAAAGGGGCGTAATGCCCTTTATTAAAACGCCCTCAAAACTAAGGGCGTTAATTAAACTCAAAACGGTATTTCATCATCAAAGTTATTTGCTGGCAGACGTTCATCATCAGCATAACCGTCCCATTCTTTCTGTTTTGTTTGTTGTTGCTGTTTTGGCTTACCCTGTGGTTCTTGTGCCCAGTTGTTGTTACTGTTACCACCTTGCGAACTACTGAGCATTTCGAGTTTGTCGGCGATAATCTCGGTGGTATAGCGGTCTGTACCGTCTTGTGCTTGCCATTTGCGGGTACGAAGTTTCCCTTCAATGTAAACCTTAGAGCCTTTCTTTAGGTATTGCCCCATAATTTCGGCTAATTTCCTAAAAGCGATAATGCTGTGCCATTCGGTATTTTGCTTTTTCTCGCCCGTTTGTTTGTCGGTCCATTCTTCCGAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP009158|34458:43914|34458_35262_-|WP_038513278.1|DBSCAN-SWA MTTLTFQNTTLSVINKNNHTFLTASDLGTALEYADPTKAIVKIYNRNADEFTAEMTALIELQTAGGKQQVRVFSLRGAHLIAMFARTKVAKEFRKWVLDILDREILQNEQQIAPLTITPEQQRAIQEAVQQAHYRTGLHWQEIYSRLKSTFNVAKYDQLPQTMFERVINFLNTLGNQYRPIDRSKKDITIAGLDAEQIAKYLVRARAFAKEVEVFHRKLYEDLGISRYVKNDIAGKAYDIAHEFNVWLDPFIEQAIPQLNQQRLANF >NZ_CP009158|34458:43914|39081_39561_-|WP_038513288.1|DBSCAN-SWA MAGVNKVIIVGNLGNNPDMRTMPNGDPVVKISVATSEEWTDKQTGEKKQNTEWHSIIAFRKLAEIMGQYLKKGSKVYIEGKLRTRKWQAQDGTDRYTTEIIADKLEMLSSSQGGNSNNNWAQEPQGKPKQQQQTKQKEWDGYADDERLPANNFDDEIPF >NZ_CP009158|34458:43914|36054_36252_-|WP_015939642.1|DBSCAN-SWA MKMTKHQCIANFFIGFGSMFNIAPLFASIDIGSPQDDLKNMQNDFRQLGDDLRKGIGEVVNAQRK >NZ_CP009158|34458:43914|37266_37479_+|WP_010786204.1|DBSCAN-SWA MANAQTEHSRKLRAETSRRLNDKALAEGKARRILMQLPSEVADEFDAICAEMGVSRPQAIKALCALYRGK >NZ_CP009158|34458:43914|38847_39036_+|WP_010786201.1|DBSCAN-SWA MALSRSEIVARSDAKKGMQAKTYKLPQALVAEIELLAKQCGISQGLLIAQAVELFKQSQKGA >NZ_CP009158|34458:43914|41389_41929_-|WP_038513299.1|DBSCAN-SWA MIKLQILQNPNKKYFGEMWVDKHLVFQGIPMTSEIIAIRNLNKAIDRYNSQKGLVGKRAIPHYPEIEGHNPIVIEQAKKVGLKVTVIQAEQVEQIAPTEQVEIETAPTEQVEPKPKPSQPKRKPFTPYGLKGYLVDKNGNVRLMLDRRANANTIVLEPQMFGALAEMVKKTQEQQNAST >NZ_CP009158|34458:43914|42326_43130_-|WP_038513306.1|DBSCAN-SWA MTTLTFQTTTLSVINQQNQIWLSALDIGKALGYSNGDIGIKNIYNRHQDEFTPCMTALIDMSTAGGIQKVRVFSLRGTHLIAMFSHTKVAKEFRKWVLDILDREISQNEQQISPLTITPEQQRAIQEAVQQAHYRTGLHWQEIYSRLKSTFNVAKYDQLPQTMFEHVINFLNTLGNQYRPIDRSKKDITIAGLDAEQIAKYLVRARAFAKEVEVFHRKLYEDLGISRYVKNDIAGKAYDIAHEFNVWLDPFIEQVLPQLNQQRLARF >NZ_CP009158|34458:43914|37497_37761_-|WP_005712171.1|DBSCAN-SWA MKTLNPFKLRKQLNYYVTLCSRQALAVIRANEHISELVAQNFKQQQELEQLKAKAESLVKVLEFEKFNVRRYEEIEKVVTHGQGFNF >NZ_CP009158|34458:43914|36520_36901_-|WP_005712166.1|DBSCAN-SWA MALKYQPKEKAVVMCDFSGFIAPEMVKTRPVVVISKHKKNSELVTIVPLSTTKPEPLEPYHYPMPNNPLPDKSNIQCWAKCDMVYTVSLSRLDRYKLKKREYVVPVIDDEDFANIKKAVAKALKLS >NZ_CP009158|34458:43914|41925_42246_-|WP_021115189.1|DBSCAN-SWA MKTLIKKLNLKYLLGALLIAFVTGGSLTGCEEPELVSTLPVESNFQAEKIWTEDDFKQAEITPEEVNYNALALHLPPPDNVTGEDVKLIKQHNQNQLNKLIVGAKR >NZ_CP009158|34458:43914|43725_43914_+|WP_005714998.1|DBSCAN-SWA MALSRTEINARSEAKRGIVTKSFKIHQSVSEQIDRLAVELGISKGKVLEQAIELFEQSQKGA >NZ_CP009158|34458:43914|37784_38504_-|WP_038513285.1|DBSCAN-SWA MTEQTTQKKYELLKDDTVEHLGRTLYRIKALITFGLVGAGQLGGYIETEKNLDHSGNAWVYDNARVCGDACVYGNAGVYDNAWVYGNAGVYGNARVFGNARVFGNARVYGNARVYGKAWVFGNARVFGDARVYGDACVYGNAGVCGDARVYDIARVFGDARVRSFAVISERKMIFWASNVGSENGTLTVFNGKFGLIVTRGCFTGTVDEFLSKSKEVHDDKTHHEYKLLIEVAQSRILN >NZ_CP009158|34458:43914|39560_40220_-|WP_038515078.1|DBSCAN-SWA MYNLKVRCSQLHQLMSEPRSKADKDAGKISDTAKNAVREIAKFDLFGYQSFDGNKYTEKGNQLEDQAIKLSGFTRGLVLKKNTERRENAFITGECDIYVPSRKLIIDTKCSWDIGSHPFFQDEAEEKAKKAGYDYQMQGYMWLWDCEEAQIDFVLFPTPLDLISSYDNSEKLIDLVEQIPQSKRITTVTIKRDEEVIAKIQERLTSAQNYYQQIIQEYM >NZ_CP009158|34458:43914|40282_41200_-|WP_038513294.1|DBSCAN-SWA MTTQTTPATQNKENKFPIKTLFESPNVQQKLQALLNKNAATFTTSVLQIVNSNAMLRNADPMSVFNAACMAATLNLPLQNGLGFAYIVPYQNRKEKKTEAQFQLGYKGLIQLAQRSGQFKRLVAVPVYEKQLIAEDPINGFEFDWKQKPAKDEKPIGYYAYFKLINEFTAELYMSTQDVYDHAARYSQTYKKGYGVWHDNFEAMAIKTVLKLLLSKQAPLSVEMQQAVLADQAVVKDVENAEFSYPDNEVQEAEFTELKVNDDVFEKCKQNIISGDATLQDLCDNGYEFSKEQYAILEELENKRE >NZ_CP009158|34458:43914|35615_36071_-|WP_015939641.1|DBSCAN-SWA MHSENKQEIVEVVTKDPELLAEVINTDAAQTIIVQQAMSLHHGPLPPAREMAEYAKHIPNFGDRVMTYAEQAKNERFELNKTSLKQKSLGLWFGMLSVVIVAGFCFYLVSQGHPGLAATVMISVLATIAGVFVIGKKIEAPKSNNTEENNN >NZ_CP009158|34458:43914|41196_41403_-|WP_038513297.1|DBSCAN-SWA MRVPDPMRYETKDDYYDALEKFEAHQQAKYNDEVVPDEWDEFCEEVLICNPRERDYQDQTWLFGRKDV |
16 | Mannheimia_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
48234 : 59745
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP009158|48234:59745|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP009158|48234:59745|50619_51975_+|WP_026916582.1|DBSCAN-SWA MSENLRKITYEVEVSTVGSLLNGGLTAQAREVLSWLKPEMFLTFKLGEIYSNIQRQASKDNLIDMLLLSSEYGVQLADMAETIKSVVSASNLTGYATKVFNFYQRREVLKVLVSLAGELNLARDEQLDAIATKGVEHISALLNKSASVAPTGMGSLLDGYYQLLQDRHKPEFKRRLLFTGIQALDDILQGIDETDICVVGGRSGNGKTETAITFTKNILEQGGSVLFFSLEMSRQQIMDRLIASASGVNSAKLRNPEWLSDEDFARMSEATSVMKDQKLFVVDKGALSVEEITAITERHLAEHKKLNAVVVDYIGLVNHGALDGRVNRTYQIGETVERLKAFSKQVHVPFILLSQLSRDAEGSTPNNANLSDSKALENVASQIIMVHNQRDKETNEPARYTHWIVTKNRNGKVGTAYVEFQNGRFIECDQALAWESFQKKNEQQRRANKGF >NZ_CP009158|48234:59745|52975_53158_-|WP_005715063.1|DBSCAN-SWA MDSKTIIKMIEADGWYLVATSGSHHQFKHPTKQGRVTVPHPKKDLKKGTELSILKQAGLK >NZ_CP009158|48234:59745|55498_57385_-|WP_010786228.1|DBSCAN-SWA MSTNQETRGFQSEVKQLLQLMIHSLYSNKEIFLRELISNASDAADKLRFKALSQPELYEGDGELRVRISIDEALGTITISDNGIGMSREQVIDHLGTIAKSGTKEFLNALGSDQAKDSQLIGQFGVGFYSSFIVADKVTVRTRAAGSDASQGVLWESAGEGDYTVADIEKAGRGTDVILHLRDDEKEFLSEWRLRDIIGKYSDHIGLAVEIQTKEYDDEGKETGTKWEKINKAQALWTRSKNEISDEEYKEFYKHISHDFADPLIWSHNKVEGKQEYTSLLYVPSKAPWDLFQREQKHGLKLYVQRVFIMDDVEVFMPNYLRFMRGLLDTNDLPLNVSREILQENKVTQSLRTALTKRSLQMLEKLAKDNIEQYQQFWNAFGLVLKEGVGEDFANKNQVAALVRFASTHTDSSEQAVSLSDYIARMKEGQKAIYFLTADSYQAAKNSPHLELFNKKGIEVLLLSDRIDEWFISHLTEFDGKPLQSITKSDLDLGDLADKEEEETQKVQEAEFASFLERAKGYLGERVKKVVLTHRLTDTPAVVSTDSDEMTTQMAKLFAAMGQQAPEVKYTFELNPEHSMVKRIADIADEAEFNDWIELLFEQALLAERGTLENATAFIKRMNKLLGA >NZ_CP009158|48234:59745|48234_48888_-|WP_038513322.1|DBSCAN-SWA MKKQWNQYVREKMQEQNLRQDDIAESMGKTQGAIGHWLTGRRMPNVNEVAQMINLTGVNKVILNGDGTIEDFDPNITPTSVKKSRAYPLISSIQAGTWTEVFDYRDTEGYDYIDTEIDAGPDAFFLRVSGMSMEPKFSEGDLVLIDVRKRPHPGDFVAAVNGNGEATLKRYRELGELSPSGNPHFELVPLNQDFPTLSSMKQDIRIIGVAVEHRGYL >NZ_CP009158|48234:59745|53404_53983_+|WP_038513329.1|DBSCAN-SWA MIKPKVKKRKCKCCGGEFKSADSFRKWCSAECGVKLAKIAQEKARQKAIEKRNREERAKIKATRERLKSRSEWLKDAQAVFNEYIRLRDKDDPCISCRRFHQGQYHAGHYRTVKAMPELRFNEDNVHKQCSACNNHLSGNITEYRINLVRKIGVERVEALEGYHPPVKWSAEDCKEIIKTYRAKIKGLKRGG >NZ_CP009158|48234:59745|53972_54437_+|WP_051617452.1|DBSCAN-SWA MADKLLEEPKQVWIENLLNLWGEWAFSGLDFESRMNMLARLMLQAEPSRISKPVREMCDDELGLVISSVIGYCIKNPCPQDYKYLEAKYVYGLSVYAIAKYQWEKDKSKTLRTWQRKVGESIKASEWVVAKFLDLAIKNHKSGASPTICVNTCF >NZ_CP009158|48234:59745|49729_50620_+|WP_026916583.1|DBSCAN-SWA MNAVVKVKETPIFKLGENRQSQEARKVSVDDGFTAIPNELLKAILRSKVLGWKGSYLLATILKTLSWHKESDWFTHSQVCEMMGIEPTKYHVNQLSAARKELIKEQVLFEDGKKTGVNLDVFNWEMVNPEKVGSSRNNRELVPEIVGNKYPEKVGNTKETITKEKINNTPLPPKGESAIADEQPQAVKCEQHSAKPEKIKSPPMDYQAVADLYNQANQNSGSRLPMVEKINDARRKGIKKLMAELREPSLECAELYFNALFASLRPFHTGENGGWVANFDWAIRPATVLKVREGAL >NZ_CP009158|48234:59745|49569_49752_+|WP_016528087.1|DBSCAN-SWA MNEHHTELHSSEKSSFWQEMEYRKRCYAELERRNFAGNVDYDEIFNQIDKDLSDECSSKS >NZ_CP009158|48234:59745|59124_59745_-|WP_038515085.1|DBSCAN-SWA MKNIVVMISGNGSNLQAIIDAIDTGKINGRICAVISNKATAYGLERAKQAGISTFIFTKKDFSDNLAMDNAIAEQIEALQADLIVLAGYMKILTPEFTARFTGKILNIHPSLLPKYAGLNPHQRAMEAGDSEHGTTIHFVNEEVDGGAIILQAKVPIYPDDELDDVIERVYEQEHRYYSLVVQWFCDDRLKLIEGKAYLDNQLLSP >NZ_CP009158|48234:59745|52073_52502_+|WP_038515080.1|DBSCAN-SWA MEHKQKYFLRTEKIKNNALEFVKALPIDEKKPLVVEVKPITRNLEQNAKFHAMCGDIAKQVQFNGEWLPLEAWKVLLISAHAEATKEGSCLVTGLEGELVNIRESTAQMSVKRMASLIEYATSWGVSNGVHFNDRWNFWGMK >NZ_CP009158|48234:59745|52535_52949_-|WP_005715065.1|DBSCAN-SWA MLYPIAIEPGDETHAYGVIVPDIPGCFSAGDTLEEAYQNVKEAIVFHLEGLVEDGEEIPMPTSIDNHRKNPDFAEYDFFFGFVDVDISHLLGKAERINITLPSYLIKRIDDFVAVHKEYKNRSNFLAKIAADKILTA >NZ_CP009158|48234:59745|57490_58918_-|WP_021115161.1|DBSCAN-SWA MSNMRIEVDLLGEREVSNDVYWGIHTLRAVENFNISKNTISDVPEFVRGMVMVKKATALANGELGAIPKKIAKAIVQACDEILVNGRCMDQFPSDVYQGGAGTSVNMNTNEVVANLALELLGHKKGEYHIINPMDHVNASQSTNDAYPTGFRIAVYNSIMQLISKVLYLQHGFENKADEFANILKMGRTQLQDAVPMTVGQEFKAFSVLLDEEVKNLKRTAELLLEVNLGATAIGTGLNTPEGYAPLAVKYLAEVTQLPCTLSEHLIEATSDCGAYVMVHGALKRTAVKLSKICNDLRLLSSGPRAGLNEINLPELQAGSSIMPAKVNPVVPEVVNQVCFKIIGNDTCITFAAEAGQLQLNVMEPVIGQAMFESIDILANACVNLRDKCIDGITVNKEICEGYVFNSIGIVTYLNPFIGHHEGDIVGKICATTGRSVREVVLERGLLTEEQLDDILSVENLMNPKYKAKRFTEDE >NZ_CP009158|48234:59745|49023_49230_+|WP_012621794.1|DBSCAN-SWA MNRISEFRKAANLTQVEIAKLINKTQGAFGHYETGLREPSLSTAKKIVRVLNEHGVACSLDDVFPVGS |
13 | Mannheimia_phage(36.36%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
130783 : 169848
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP009158|130783:169848|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP009158|130783:169848|153791_155027_+|WP_038513427.1|terminase|DBSCAN-SWA MKVQLNLPPKLIPVFTLQDVRHRGAYGGRGSAKTRTFAKMTAVVAYQRAMQGESGVILCGREFMNSLEDSSLEEIKQAIQSEPWLANFFDVGEKYVRTKCGRISYIFTGLRHNLDSIKSKARILLAWIDEAESVSEMAWRKLLPTVRENGSEIWLTWNPEKKGSATDLRFRQHQDESMAIVEMNYSDNPWFPDVLEQERLRDKARLDDATYRWIWEGDYLEESEAQVFRGKYQELEFKPLPDFEGPYHGLDFGFAHDPTAAVKCWVFKDELYIEYEAGKVGLELDDTATFLQKGIASIEQYVIRADSARPESISYLKRHGLPRIDGVSKWKGSVEDGIAHIKSYKKIYIHPRCQQTLNEFRLYSYKTDRLSGDVLPTLVDAHNHYIDALRYALNPRIQRKGDFSQNPLKLY >NZ_CP009158|130783:169848|165525_165786_+|WP_021109522.1|DBSCAN-SWA MFLFSCVKAVFIGWLMSWVIFFVLGAFAQDITLFYATIFGLSVTLIGSVAFGLYKNKVYLDRLKKELEIQQQKDAEKNQVKHVIIK >NZ_CP009158|130783:169848|152756_152906_+|WP_080716922.1|DBSCAN-SWA MQCERSEFGGTTYGDAIEYLVKVMGERDLCAGQVDSIREWQARTKQGFK >NZ_CP009158|130783:169848|153292_153808_+|WP_038513424.1|terminase|DBSCAN-SWA 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42 | Mannheimia_phage(75.0%) | tail,transposase,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
181871 : 190050
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP009158|181871:190050|DBSCAN-SWA TATGCAAACTGAAAAACGCTCTCGTGGTCGCCCAAAATCTGGTTTAACTCTTCAGGAACTGCAAGCAAGAAGCGAAGCTAAGCGTGGGGTTAAGCTCAAAGGCTTTAAACTTCATCAAGAAACGATAGAGCTTATTGAACGCCTTGCCGAGCAACACGGTATTTCACAAACACAGGTGATTGTGCAAGCGGTTGAGTTATTTAATCAGAAAGGGGCGTAATGCCCTTTATTCTTTCATTAGCGCCATCCAAAATAGAGTTTTCCCTAGTTTTTGTTTGACTACACTTAATTTCAGGTTGATGATGCTGAGAATTAAGCATAAACACGTTAATGAAATCAACCAGCTCATCTGCCTAGTCCCCATTAAAAATTAAACCCCTGCCCGTGTGTTACGACTTTTTCGATTTCTTCGTAGCGGCGGACGTTAAATTTCTCAAACTCTAATACTTTGACTAGGCTTTCTGCTTTAGCCTTGAGTTGTTCGAGTTCTTGCTGTTGTTTGAAATTCTGTGCGACAAGTTCTGAAATGTGTTCGTTTGCTCGAATAACGGCAAGGGCTTGCCGTGAGCAGAGTGTCATATAATAGTTTAACTGCTTACGCAGTTTGAAAGGATTGAGGGTTTTCATAACGGTTCCTTTGTAATAAATAGAGTGGGGTGTAGTAGGTATCTATTACGTTATTTGCAATAGGATTTGCGTGTTGAATGATGGCGGATATACCCAAGAGTGAAAGTTGCACATAGCACATCTGAACACTTTTTAAGTCGATATCTTGCGCAATAACGAGTAATTGTTGCTGCGGATTATAGCCTTGTGATTTTAATGTTTCGCAAAAGCTGATAATTAATGCACCGCTTCCGCAAGTGGGCTCGTTCAGCGTGAAATAGCCTTTCTCGTCTATTTCGCTTGGGGCAATAAGCATATTTGCCATCACTTGACCCGTAGAAAGAGGTGTGAAACATTGTCCACGTTGTTTGTTGGCAATTTGTAGCTTCATATAGCATTGGCCTAACACATCTTGAGGTTCTTCTTCTAAAAGATTAAGAAGAATTTGTCCCAGCTGATGAAATTGATACATCTCATCATCGGTGTAGCGTGATTTAATGGAGAAGTATCTTTCATCACGATCTTGAAAGGGTTTGCTAATGGCACAAGCACAGATTTCAACAAAGTCTTGAAACACTCTTAAATTGTCATGTTTACGCCCCATTGTTTGGATAAGAGAAAGCAACTCATTCACATTAGATATTCTCCAAAAGCGCAGATAGTGCCGCAGGCTCTACTGCAAAATCCCAATACATTGTGCTTGAGGCTCTTTTGTTGTCGGGATCTGAATTGATGTTTACTTGGGTTTTATTTTTAGGCAATATCTCTCTAGGGAGTAGGAGAATACGATAGCCACTCGGTGGGCCATCACTTTTTTCAACTTCATCATCTGAAGCAAAAAGGCAAAAGAAATCCGGTAAGTTATCAGGATCGTACCTTAAAGCATATTGATTCGAGCCTCTAACTTTCCTAACCGAAGAATACTTCACGTCAATCTCTTTGTTGTTTACAACAAAATCAAAACGAGGATTATTCATTTGATACTGCATATTCATATCAATAGCAGAAGGGACTAAACGTTTAAATTCATTCTCCGCCCAATCTCCTTTTAAACCAGTTTCTGCTCGCTCTTTATAACTCGCCCAGTTTGGGGATAAATTTAACTGTTCAAGGGTTTTTGCCACAATCCACACGGTCAAACCAACATCTTTTGTGATTTCTTTAAGGTCGCCATTGTGTCGATAATAACTATCCAAGACGCGATATTGTGTTGTTTCCGTTTGTTTAACAAAACCGTGATACTTTAATGTAAGGTAAACGATACCTGCCCGCAGATTTAAGGCGTCAGCAAATTTCGCTACATCCGCATAGGACGTATAATGTTCTTTTGCCATTTTAAGCAACTGCTGTTCTTTGTCTTTATCTGCGATAATTTGTCTTTTTTGTGGTTGCAAATAAGGCTCAATATTTTCTGTCATTATTAACTCCATAAAAAAACTCACCTAGATAGCGAGTTAGTTAAGAATTCTACTTTGAGCAACTTCAATCAGTAGTTTGTATTCGTGATGGGTCTTGTCATCGTGGACTTCTTTTGATTTTGATAAAAACTCGTCCACCGTGCCTGTAAAGCAACCACGAGTAACAATTAACCCAAATTTTCCATTAAAGACCGTAAGCGTTCCATTTTCTGAGCCTACATTACTTGCCCAAAAAATCATTTTGCGTTCAGAGATAACTGCAAAAGATCTCACCCGAGCATCACCGAACACCCGAGCGATATCGTACACCCGAGCATCACCGCACACCCCAGCGTTACCGTACACGCAAGCGTCACCGTACACCCGAGCATCACCGAACACCCAAGCGTTACCGAACACCCAAGCCTTACCGTACACCCCAGCGTTACCGTACACGCAAGCGTTACCGAACACCCAAGCCTTACCGTACACCCGAGCATTACCGTACACCCGAGCATTACCGTACACCCAAGCATTATCGTACACCCCAGCGTTACCGTACACGCAAGCGTCACCGCACACCCGAGCATTATCGTACACCCAAGCATTACCGCTATGATCTAAATTCTTTTCGGTTTCGATATAACCGCCTAATTGGCCTGCTCCAACTAAACCAAATGTAATAAGTGCTTTAATTCGATAGAGCGTTCTGCCTAAATGTTCTACTGTGTCATCTTTGAGTAGTTCGTATTTCTTTTGTGTAGTTTGTTCTGTCATTTTTAATTTCCTTGCAATAAAAAACCGCCTGTATTGCTACAAGCGGTTGGTTTTCGTGAAAATGTTGCAATAAAAAAGCCACCGTAAAAACGATGGCTTAGTGAAATAATGCTTGATTTAGTTAGATAACTAACTTATAATAACTTTGTTTTCAGTAATAATGCTGAAAACGAGCTGGGTCTGACCTTTAATCTACCCAACTTTGAAGAGGATAATCAAATGTTTAAATACATTATCCTAGTTATCATCTTGTTAGTACTTAGCTCGCCAGCTTACTAATTTGATGATAATTTAACGAGAGGGAGAAATCTCTCTCGTTCTTCAAAACTAATGTTAAGGATTTATTATGGCGATGTCAAGAACCGAAATTGTTAAACGCAGTGAGGAAAAACACGGTATTAAACTCAAAGCCTTCAAACTTCCTTTAGTTGTGATTGCTGAAATTGAGCAGTTAAGTACAGAGTTAAATATTCCACAAAATCAGTTGATTATTCAAGCCGTTGAGCTGTTTAAGCAATCGCAGAAAGGGGCGTAATGCCCTTTATCAAAACGCCCTCAAAACTAAGGGCGTTAATTAAACTCAAAACAGTATTTCATCATCAAAGTTATTTGCTGGCAGACGTTCATCATCAGCATAACCGTCCCATTCTTTCTGTTTTGTTTGTTGTTGCTGTTTTGGCTTACCCTGTGGTTCTTGTGCCCAGTTGTTGTTACTGTTACCACCTTGCGAACTACTGAGCATTTCGAGTTTGTCGGCGATAATCTCGGTGGTGTAGCGGTCTGTACCGTCTTGCGCTTGCCATTTGCGGGTACGAAGTTTCCCTTCAATGTAAACCTTAGAGCCTTTCTTTAGGTATTGCCCCATAATTTCGGCTAATTTCCTAAAAGCGATAATGCTGTGCCATTCGGTATTTTGCTTTTTCTCGCCCGTTTGTTTGTCGGTCCATTCTTCCGATGTGGCGACACTAATTTTAACGACGGGGTCACCGTTTGGCATTGTACGCATATCAGGGTTATTGCCGAGATTGCCGACTATGATTACTTTATTCACGCCTGCCATTACATATACTCCTGAATGATTTGTTGATAATAATTTTGTGCTGAGGTGAGCCTTTCTTGGATTTTGGCAATCACTTCTTCATCTCGCTTGATGGTGACGGTGGTAATTCGCTTGGATTGTGGAATTTGCTCTACTAGGTCGATTAGCTTTTCGCCGTTGTCGTAGCTTGAGATTAAATCAAGCGGAGTGGGGAAGAGTACAAAGTCGATTTGTGCTTCTTCGCAATCCCAAAGCCACATATAGCCTTGCATTTGGTAGTCATAACCTGCTTTTTTGGCTTTTTCTTCGGCTTCGTCTTGGAAAAAGGGGTGAGAGCCAATGTCCCACGAGCATTTTGTATCAATAATGAGCTTGCGTGATGGAACGTAAATATCACATTCGCCCGTGATGAAGGCGTTTTCTCTGCGTTCTGTGTTCTTTTTAAGAACCAATCCACGAGTAAAGCCACTTAATTTGATGGCTTGCTCTTCAAGCTGATTACCTTTTTCGGTGTACTTGTTGCCGTCAAAGGATTGGTAGCCGAACAAGTCAAACTTTGCAATCTCTCGCACCGCATTTTTGGCAGTATCGGAAATTTTGCCCGCATCTTTATCTGCTTTTGAGCGTGGCTCGCTCATTAGTTGGTGAAGTTGAGAGCAACGGACTTTTAGGTTATACATTTTTTCCATTGTGTTTCCTTTGGGTGATGATGGTGGATTAAACTTAATTTGATGGGTGTCAATCATTCCCTTTTATTTTCGAGCTCTTCTAAAATCGCATACTGCTCTTTGCTGAATTCATAGCCGTTATCGCATAAGTCTTGCAAAGTGGCATCACCGCTGATGATGTTTTGCTTACATTTTTCAAACACGTCATCATTGACTTTTAATTCGGTAAATTCAGCTTCTTGAACTTCATTATCAGGGTAAGAAAATTCTGCGTTTTCTACATCTTTGACAACCGCTTGATCTGCCAGTACCGCTTGTTGCATTTCTACGGAAAGTGGGGCTTGTTTAGAGAGTAGCAACTTAAGAACCGTTTTGATTGCCATCGCCTCAAAGTTGTCGTGCCATACGCCATAACCTTTTTTATAGGTTTGTGAGTAGCGTGCGGCGTGGTCGTACACGTCTTGGGTACTCATATAGAGTTCGGCAGTAAATTCGTTGATCAACTTGAAATAAGCATAGTAGCCGATTGGTTTTTCATCTTTGGCTGGCTTTTGTTTCCAGTCAAATTCAAAACCGTTTATTGGGTCTTCAGCAATCAGTTGTTTCTCGTAAACTGGCACTGCAACAAGGCGTTTAAATTGCCCTGACCGTTGTGCCAGTTGAATTAAGCCTTTATAGCCGAGTTGGAACTGGGCTTCCGTCTTTTTCTCTTTTCGATTTTGATACGGCACAATGTATGCAAAACCTAAGCCATTTTGTAGCGGTAGATTGAGCGTTGCTGCCATACACGCCGCATTAAATACACTCATTGGATCGGCATTGCGAAGCATTGCGTTGCTATTGACGATTTGCAGAACGCTGGTGGTAAATGTCGCAGCGTTTTTGTTAAGCAATGCTTGTAATTTTTGCTGTACGTTTGGGCTTTCAAATAAAGTCTTAATCGGGAATTTGTTTTCTTTGTTTTGAGTTGCTGGTGTGGTTTGTGTGGTCATACGTCTTTTCTCCCAAATAGCCAAGTTTGGTCTTGGTAATCTCGCTCTCTTGGATTGCAGATGAGAACTTCTTCGCAAAACTCGTCCCATTCATCAGGGACGACTTCATCGTTATATTTCGCTTGTTGATGTGCTTCAAACTTTTCTAGTGCGTCGTAGTAATCATCTTTGGTTTCGTATCGCATTGGGTCAGGTACTCGCATTTTGTTGCTCCTGAGTTTTCTTCACCATTTCCGCTAATGCTCCGAACATCTGCGGTTCAAGTACAATCGTGTTGGCGTTGGCTCTTCTGTCTAGCATTAGGCGGACATTGCCGTTTTTATCTACCAGATAGCCTTTTAAGCCGTAAGGGGTAAATGGTTTGCGTTTGGGCTGTGATGGCTTCGGCTTCGGCTCAACTTGTTCTGTTGGTGCTGTTTCAATCTCAACTTGTTCCGTCGGTGCTATTTGCTCAACCTGCTCTGCTTGGATAACTGTTACTTTTAGCCCAACTTTTTTAGCTTGCTCAATTACAATCGGATTATGCCCTTCGATTTCAGGGTAGTGAGGGATAGCTCTTTTACCGACTAAGCCTTTTTGACTGTTATATCTATCAATGGCTTTGTTTAAATTTCGGATAGCAATAATTTCCGATGTCATTGGTATGCCTTGAAACACTAGATGTTTATCCACCCACATTTCACCGAAGTATTTTTTATTTGGGTTTTGTAAAATTTGAAGTTTGATCATCTTTTTGCTCCTACAATCAGTTTGTTAAGTTGGTTTTGGTTATGTTGTTTAATCAGCTTCACATCTTCACCTGTAACGTTATCAGGCGGTGGAAGATGTAGGGCTAATGCGTTGTAATTTACCTCTTCAGGGGTGATTTCAGCTTGTTTGAAGTCATCTTCCGTCCAAATCTTCTCTGCTTGGAAATTGCTTTCTACGGGGAGAGTAGAGACAAGCTCAGGCTCTTCACAGCCAGTTAAACTTCCGCCTGTCACAAAGGCGATAAGCAAGGCACCGAGTAGGTATTTCAGGTTGAGTTTTTTGATAAGTGTCTTCATTTTTTATTCCTTTTGTTGAATTTTGGGTGTAGGAAGCCACCGCAGGCTTTCGGGGAAAGTGCGGTGGGGTTGGGTTGTGGTTAAAATCTTGCTAATCGTTGTTGATTAAGCTGAGGTAAGACTTGTTCAATAAAAGGGTCAAGCCATACGTTAAATTCGTGTGCGATGTCGTAGGCTTTTCCTGCAATATCGTTTTTAACATAGCGAGAAATGCCTAAATCTTCGTACAGTTTACGATGAAATACTTCCACTTCTTTTGCAAAGGCTCTTGCTCTTACCAAGTATTTGGCAATCTGTTCTGCTTTTTCGTGTGGAAGAACGACATCAGGTTTAGGTTCAAGCGGTACGATTTGCGTAGAATTTTGCAATTCGCCTTTATGCATTGCGAGAAACGCTCTTAATACGACCAAGTGGAATTTTGGGCTGATCCACATTGCGTAAGCGAGGGCGAGTTCTTCGCAGGCGTATGTTCCGCCTTGTGTGCCTCGTAGGGTTTTAATTGGGAGAACGGCGATGTTTTCTTTTTGAATTTCAGAAATAAGATCTTGCGTTTGCTGATTTTTAACAAAGAAAGTTGGGCGATGTTTAGGATCATTACCACTTGCTAAATGTAGATCATTTAATGAATAAAGGTTTTCGTATGTACGAATAGAAGTTTTAAGAATTGATAAGTTTGACATTTTATGCCCCTTGATTTTCAGTTAGTCTTTCGATCAACCTTAGTAGGGTTGATCGGGCTTCAACTACCAAATCAAGCTGGCGGAGCTTATTTCCCGAAGGTGTTTTATTAGGCTCTCTCGACCCGACCACTGAAATGTGAGAAATCTCACATTTAAATTTTAGGCATAAAAAAACCGCTTTTTAATCGGAGCGTTAGATAACCGACTTGATTTAGTAGTGTGGTTATCTTAATCCGAAGTAGCGGTTTTTGTCAATGGGATTTACTCTGTTTCCGAGATTTTAAATTGAACAGCAACGAGAGAGTAATCATCAATAGGTGATTTCTCTATTCTTTTTTGTAAGGTTGCTGAAAATTTCACAATGCTATTCATCGTTTTTTCAGAGAAGCGTGGGCGATGTTCCCAAAAATGATGAGCACCGTCTGACATAATGTAGATGGAGACCTCATTATTCTCATCCTTAATTTCTGACATCGGAATAAAGAATTCATCTGGTTTCATTTCGACTTGTGTAGAAATTGCCGTGGTGATGACATTTTTTCCTGATAGCTCTTTTAATTCTTTCTTTGTATAGATTTTTTCATCAAATAACTTTTGATGAGTTGTGTGATCTTTCGTTTTTTGGCGAAGTTTATTACCTTGCTTTATATATAGACGACAGTCACCAATATGCCCTATGCACAATCCTTCTTGTGTTAAATAACCAAATGTTAAGGTTGTAGATGCTTGGTTATATTCTGGGTCAAGTTTTTTAATTTCAGCCAAACTAGCGGAAAATACATTATTGTAAGCTAGTTCTAGGTTTTTGATCGCGATTCTGGAGGCAATTTCTCCGCCTTTGTATCCTCCAACACCATCAGCCACTGCAAATAAGTAACCGTTATTGTGTTTAGTGCAAGATAGAATATGATCTTGATTTTGCCGTATTTGTTCTTTTGGAAAAGAGAATGATGCACTAGCAATTAAGTTAATCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP009158|181871:190050|182465_183110_-|WP_021109857.1|DBSCAN-SWA MNELLSLIQTMGRKHDNLRVFQDFVEICACAISKPFQDRDERYFSIKSRYTDDEMYQFHQLGQILLNLLEEEPQDVLGQCYMKLQIANKQRGQCFTPLSTGQVMANMLIAPSEIDEKGYFTLNEPTCGSGALIISFCETLKSQGYNPQQQLLVIAQDIDLKSVQMCYVQLSLLGISAIIQHANPIANNVIDTYYTPLYLLQRNRYENPQSFQTA >NZ_CP009158|181871:190050|185230_185710_-|WP_038513480.1|DBSCAN-SWA MAGVNKVIIVGNLGNNPDMRTMPNGDPVVKISVATSEEWTDKQTGEKKQNTEWHSIIAFRKLAEIMGQYLKKGSKVYIEGKLRTRKWQAQDGTDRYTTEIIADKLEMLSSSQGGNSNNNWAQEPQGKPKQQQQTKQKEWDGYADDERLPANNFDDEILF >NZ_CP009158|181871:190050|187345_187552_-|WP_038513297.1|DBSCAN-SWA MRVPDPMRYETKDDYYDALEKFEAHQQAKYNDEVVPDEWDEFCEEVLICNPRERDYQDQTWLFGRKDV >NZ_CP009158|181871:190050|183111_183894_-|WP_035491341.1|DBSCAN-SWA MTENIEPYLQPQKRQIIADKDKEQQLLKMAKEHYTSYADVAKFADALNLRAGIVYLTLKYHGFVKQTETTQYRVLDSYYRHNGDLKEITKDVGLTVWIVAKTLEQLNLSPNWASYKERAETGLKGDWAENEFKRLVPSAIDMNMQYQMNNPRFDFVVNNKEIDVKYSSVRKVRGSNQYALRYDPDNLPDFFCLFASDDEVEKSDGPPSGYRILLLPREILPKNKTQVNINSDPDNKRASSTMYWDFAVEPAALSALLENI >NZ_CP009158|181871:190050|186431_187349_-|WP_038513294.1|DBSCAN-SWA MTTQTTPATQNKENKFPIKTLFESPNVQQKLQALLNKNAATFTTSVLQIVNSNAMLRNADPMSVFNAACMAATLNLPLQNGLGFAYIVPYQNRKEKKTEAQFQLGYKGLIQLAQRSGQFKRLVAVPVYEKQLIAEDPINGFEFDWKQKPAKDEKPIGYYAYFKLINEFTAELYMSTQDVYDHAARYSQTYKKGYGVWHDNFEAMAIKTVLKLLLSKQAPLSVEMQQAVLADQAVVKDVENAEFSYPDNEVQEAEFTELKVNDDVFEKCKQNIISGDATLQDLCDNGYEFSKEQYAILEELENKRE >NZ_CP009158|181871:190050|187538_188078_-|WP_038513299.1|DBSCAN-SWA MIKLQILQNPNKKYFGEMWVDKHLVFQGIPMTSEIIAIRNLNKAIDRYNSQKGLVGKRAIPHYPEIEGHNPIVIEQAKKVGLKVTVIQAEQVEQIAPTEQVEIETAPTEQVEPKPKPSQPKRKPFTPYGLKGYLVDKNGNVRLMLDRRANANTIVLEPQMFGALAEMVKKTQEQQNAST >NZ_CP009158|181871:190050|183930_184650_-|WP_038513477.1|DBSCAN-SWA MTEQTTQKKYELLKDDTVEHLGRTLYRIKALITFGLVGAGQLGGYIETEKNLDHSGNAWVYDNARVCGDACVYGNAGVYDNAWVYGNARVYGNARVYGKAWVFGNACVYGNAGVYGKAWVFGNAWVFGDARVYGDACVYGNAGVCGDARVYDIARVFGDARVRSFAVISERKMIFWASNVGSENGTLTVFNGKFGLIVTRGCFTGTVDEFLSKSKEVHDDKTHHEYKLLIEVAQSRILN >NZ_CP009158|181871:190050|189336_190050_-|WP_016527556.1|DBSCAN-SWA MINLIASASFSFPKEQIRQNQDHILSCTKHNNGYLFAVADGVGGYKGGEIASRIAIKNLELAYNNVFSASLAEIKKLDPEYNQASTTLTFGYLTQEGLCIGHIGDCRLYIKQGNKLRQKTKDHTTHQKLFDEKIYTKKELKELSGKNVITTAISTQVEMKPDEFFIPMSEIKDENNEVSIYIMSDGAHHFWEHRPRFSEKTMNSIVKFSATLQKRIEKSPIDDYSLVAVQFKISETE >NZ_CP009158|181871:190050|185709_186369_-|WP_035497980.1|DBSCAN-SWA MYNLKVRCSQLHQLMSEPRSKADKDAGKISDTAKNAVREIAKFDLFGYQSFDGNKYTEKGNQLEEQAIKLSGFTRGLVLKKNTERRENAFITGECDIYVPSRKLIIDTKCSWDIGSHPFFQDEAEEKAKKAGYDYQMQGYMWLWDCEEAQIDFVLFPTPLDLISSYDNGEKLIDLVEQIPQSKRITTVTIKRDEEVIAKIQERLTSAQNYYQQIIQEYM >NZ_CP009158|181871:190050|184996_185185_+|WP_012621814.1|DBSCAN-SWA MAMSRTEIVKRSEEKHGIKLKAFKLPLVVIAEIEQLSTELNIPQNQLIIQAVELFKQSQKGA >NZ_CP009158|181871:190050|182233_182497_-|WP_038513471.1|DBSCAN-SWA MKTLNPFKLRKQLNYYMTLCSRQALAVIRANEHISELVAQNFKQQQELEQLKAKAESLVKVLEFEKFNVRRYEEIEKVVTHGQGFNF >NZ_CP009158|181871:190050|188475_189075_-|WP_052157554.1|DBSCAN-SWA MSNLSILKTSIRTYENLYSLNDLHLASGNDPKHRPTFFVKNQQTQDLISEIQKENIAVLPIKTLRGTQGGTYACEELALAYAMWISPKFHLVVLRAFLAMHKGELQNSTQIVPLEPKPDVVLPHEKAEQIAKYLVRARAFAKEVEVFHRKLYEDLGISRYVKNDIAGKAYDIAHEFNVWLDPFIEQVLPQLNQQRLARF >NZ_CP009158|181871:190050|188074_188395_-|WP_021115189.1|DBSCAN-SWA MKTLIKKLNLKYLLGALLIAFVTGGSLTGCEEPELVSTLPVESNFQAEKIWTEDDFKQAEITPEEVNYNALALHLPPPDNVTGEDVKLIKQHNQNQLNKLIVGAKR >NZ_CP009158|181871:190050|181871_182090_+|WP_012621817.1|DBSCAN-SWA MQTEKRSRGRPKSGLTLQELQARSEAKRGVKLKGFKLHQETIELIERLAEQHGISQTQVIVQAVELFNQKGA |
14 | Mannheimia_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
193915 : 224378
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP009158|193915:224378|DBSCAN-SWA TCTACAAATAACTCCTATGCTCAACCGCTACGCCTATAATACGAATATCTTGTTTCATTGAGCTAAGCGTTGGGAAATCTTGATTTAATGGCACTAGCTCAAAATGTGGATTGCCTGATGGTGATAACTCTCCAAGTTCACGATAACGTTTTAAGGTCGCTTCGCCATTGCCATTTACTGCTGCAACAAAATCGCCAGGATGTGGGCGTTTTCTGACATCAATCAACACTAAATCCCCTTCGCTGAATTTAGGCTCCATAGACATTCCTGACACTCGTAAGAAGAATGCATCTGGACCTGCGTCAATTTCCGTGTCGATATAGTCGTACCCTTCTGTATCTCGATAGTCAAAGACTTCAGGCCATACTCCAGCTTGAATTGAGCTAATTAAAGGGTATGAGTATGAATTCTTAACTATTACAGGCTCTACATTCGGGTCGCCAAAAGCAAGCTTTGCTGGATCTATACCAATAACTTTTGCTATCACTTCAATATCATCAAGATCAGGCATTCTTACATTTGTTTCGTAGTTAGCAATTCTAGATTGCCCCCATTTAGAACGCTCTCTTGTATCAATTTTTGATACAGCTTCTGCAAAATCCTTTTGGTTCATTCCTGTTTTGGCTCTAAAAGCTTTTATCCGCTCACCTATTTTCATATACCGCTCCTTAACCTATAACCAAACAATAATATCACGCAATGAAATATCATCAAAATCACAAAAAGTGTTTTACATAAATCACTTGATGTGATTAAATGTGCGTTATCTTAATCACAAAAAAGGATAACTATGAATAATCTTGCAAAAGTAAGGGAAAGCGTAGGTATTACTCAAAAGCAATTAGCCGATCAACTCGGATTTGGACAACCAAGAATAGCTAACTATGAAACTGGTAATCGAACTCCATCGTTAGCTGATGCTAGAAGAATTGTATCTGCTCTTAATAAATTTGGTGCTACAACATCTTTAGACGACGTTTTTCCTGTTGGCAGTTAATTTACCCAAAGGAGTGTGCAATGGCACGCAATGAATTAAGCAAGTCTGCAATGAAGAATGCGGACTTAATCAGACAGAAGGCATCATAGACGAAAGATGCTCAAGCGGCAGAATATGTTGGTGTAGATGCATCAACGATTTGTCGTTTTAAGGCAGAACATTTAGACAAATTCTGTGCTTACCTTGATTTTTTAGAATTGGAAGTATCAGAGAAAGGTTTAAATCGTTTGACAGACAGTGAACTGGATGCCCTCAAGCTATTTGCAGAGAAGGGCGTTCATGCTATTGGAAAATAAAAACCCACGCTGGAACGTGGGTATATCAAAGGGAGATAATGTTTATGAAAACAGAGTTATTATCTACTAATCAGAGAGAAAATGCAACCCTAACGATGAGTAGTCGGGAGATTGCACGAATCACAGAAAGCAGACACCGTGATGTGTGCTTATCTATTAGAAACCTGATGAATAAAGGGGTAATTGGGGGGTATGCGGAAAGTCCGTACACCCATGAGCAAAATGGGCAAGTCTATTACGAGTATCATATTAATAAACGTGATACTTATGTGATTGTGGCTCAATTCTCTCCTGAATTTACTGCTCGTTTAGTTGATCGTTGGCAAGAGTTAGAGCAAAAGCAAGTGCAACAACTCCCTAGCTATTCAGAAGCATTACGCCAACTCGCCGATAAAATCGAAGAGAGTGAGCAAAAATCCCTTCAAATTGCCTCAATGGAAAGTTATTTCCGTAATGGGATTTCACCGTTTGAGTTTGTCAAAGGCTTGAATGGAGTGAACGCTTTGAAAATTGGGGCGTTTTTAGTGGATAAAAACTGGCTCTATCAAGATGGTAATCATAAACGTGTGAAGTCGTACGCTCGTGATCAGTATTTGACGGAAGAAACGACGGAGATTTCGCAACACGGAAAAGATCCGTTTGTGGCATATAAACCTGTTTTACTCAAGAAAGGAGCTGCAAAGCTCTATGAGTGGTACACAAAGCGAGAATTACCGATGAAAGCAAATTGGAATGGCGTATTTACACAAGATAAGGTGGTGGGATTATGAGTTTTAGCCAAAAATTACGCCAACTGGGACAGCCTATTGCGTACTATCCACAATTAGCAAAACCGTTAGGCGGTGTGACAGCGGCAATTTTATTTGGGCAATTATTCTTTTGGCAGGATAAGACCTCAAACCCATTAGGCGTATATAAAACACAAGCTGAGCTTGAGCAGGAAACGGGATTAAGTCGCCGTGAGCAAGAAACGGCTCGCAAAAAATTAGTTGAGCTAGGCATATTGGTTGAAACTCACAAACGCTTAGAGCACCGCATTTATTTCAAACTGGATTTAGTTAAATTTGATGCATTAATGGACGACATTCGGGAAGAAGCAAAACCGCCATTACCCAATGTCACTAATGAACATTCCCCAATGGCGGAAAGCGACATTCGGGAAGAAGCAAAACCGCCATTCGTTAATACAGAGAATACTTCAGAGAATACTAACAATAATACTTCCCTGACGGGAAGTATAAACGCGCGCGAGAAAAAATCCGCAGATTTGATTTTGTTGGAAAAGTTTGGGATTACCGAACAACTGGCAAAAGATTTCATCGTTCATCGGAAATCTTTCAAAGCTCCGATCACCGAAACTGCGTTGAAAGGTTTTCAGCGTGAGGCGGATAAAGCCAAAATTCCTATTCAACAAGCTATTGCGATTTCGATTGAGCGTGGTTGGCGTGGGTTCAATGCTGGTTGGGATTGGCAAAATGACGGAGTTTCTGCAAAAAATCCACAAAATCCGTCCGCTCGTAATACTTCCAAGCCGTTTATCCCTGATGACGAAGGCAACTGGGCGGAAGGTATGTCTATCACGCTAAGGGGAAGTTAATGCAAAACGTGGCATCAATGAACTTGAAAAGCCTTGTCGGGCAAGAGCCAAATTACCAAGTGCCAGCAAAGGCAACGGCAATTCCTGACGGTGCGATTAGAACCGTTAATCAATTATTCATTCAGCTTCGGGCGATTTTTCCTGCGTGGAAGAATTCATTTCCTGATGCAGACAGTTACCGTGAAGCAAAGCGGATTTGGCTTGAAACGTTGGTGAACGAAAAAATTACGACGATTGAGCAACTGCAAAACGGGATTGAGCGAGCGAAAAAATCTAAAAATCCATTCTGGCCAAGCGTAGGCGAGTTTGTGGAGTGGTGTAAAGCGGTGGACTATGAAGCGTTAGGTTTGCCTGATGAGGATAAACTTTACAAGCGGTTACAAGCGTTTATGGCATTTGGTATGGAAGAAATCCAGAAGTTTAAGTTTGTTTCTACGGCGGAGTATTACTTGATTACCGATTTGTATGTGCGTTGTCGGACTGGTGAATGGAGCGATAAGCAACTCAAAGATGAGATTAAAAAATCCCTCGTCAAAATGAGCAAGCGGTTAAAAACAAGGGAGGTTTTACCAGAACCAAAGCTGGCATTACCTCAAGAAGTGAAAGCAGTCGATCGTGAAAAGGTGAGGGCTTTCTGGGGTGGTTTGTTGAAACAGGTTAGGGGGTTTTAGGTGAGTTTTGATGTAGGTGGGTATGAGTGATTACAAATGCCCCAAATGTGGCGGAGATCTAGAAGATTTAAGCATTAACGATGATTGGGGCTGGCACGTTGAAGAGCCTTATCGCTGTAACGGTCATTACACAGGGCGATTCCCCAACATCAGCAAGGATTGTGCGATGAACAGAACGAAGTCTTGTGGGTATTTTACGAAAGAGCAGGTTAAGAAGTAAGGAGGTTGGTAGGTATGGAACAAAGGTTGGTAGGTATGGAGCATAAGCAAAAATACTTTCTACGCACTGAGCAAATCAAAAACAATGCCCTTGAATTTGTGAAAGCGTTGCCGATAGATGAGAAAAAGCCGTTAGTGATTGATGTGAAGCCTATTACTCGTAACCTTGAGCAAAATGCCAAATTCCACGCAATGTGTGGCGATATTGCCAGACAGGTGCAATTTAACGGCGAATGGCTACCGCCTGAAACGTGGAAGGTCATTTTAATTTCTGCCCACGCTGAAGCAACGAAAGAAGGCTCTTTTTTGGTCACAGGATTGGAAGGCGAATTAGTGAATATTCGTGAGAGTACGGCTCAAATGAGCGTAAAACGAATGGCAAGTTTAATCGAATATGCAACTTCGTGGGGTGTTTCTAATGGGGTGCATTTTAATGACAGATGGAATTTTTGGGGGGTGAAATGATGGAAATTAAATCTTTTTCTTTTGGAAAATTAATTGCGGATTTAGCTATTGTTGGTGGCTTTGTTTATTCGCACTTGTATCTCACGGATGGCGCAGTAAATGTTTATATTTGGGCTTTCTGGGCATTTTCTATTTTAACTTTAATGTCTGCGTTTATTAAGCCCACTAAGTTTTTGTTCACGGAAAACAGAGCCAAGCAAATGATTATAAGTGAGTTAACTATTAGCTTGGTCTTGGTTTATTTTGGGTATCCAGTATTAGCTACGGTCGGTTTTATATCAACTCTTGCTTATGCTGGCTGTAGAACTGTAAAGAACAACAAGAAAACAGGTAAACACAATGAGTAGTTACTTCTGCCCAAACTGCCAATCAATTCTTAAAGACTGGCGTAGGTTTTCTGAAAAGTCAGAGATTGATAAGGTAAAACCGTTTGAATGTACTGGCTTGAAGTGCACTAAGCGGTGGAGTGAGGAAGAATTGGAGGCATTTAATGATAAAGCCGAAAGTGAAAAAGCGTAAATGCAAATGCTGTGGTGGTGAGTTTAAGTCTGCGGATAGCTTTAGAAAATGGTGTAGTGCTGAATGTGGTGTGAAACTTGCCAAAATAGCCCAAGAGAAAGCACGTCAGAAAGCCATAGAAAAGCGAAATCGAGAAGAAAGGGCAAAGATTAAAGCAACGAGAGAACGCTTAAAATCTCGTTCTGAATGGCTTAAAGACGCTCAGGCTGTTTTTAATGAATACATTCGTTTACGAG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39 | Mannheimia_phage(80.0%) | tail,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
348741 : 400237
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP009158|348741:400237|DBSCAN-SWA 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52 | Pseudomonas_phage(15.38%) | transposase,tRNA,terminase,protease,integrase | attL 361376:361391|attR 409331:409346 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
473897 : 481391
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP009158|473897:481391|DBSCAN-SWA TATGTGCGGCATTGTTGGGATTATCGGTCAAACCCCTGTAAATCAGGCGTTATATGACGGACTTACGTTATTACAACATCGGGGGCAAGATGCGGCAGGGATTGTCACAATTGACGATGAAAACCGCTTCCGCCTACGTAAAGCAAATGGATTAGTCAGTGATGTGTTTCGTCAAGAACATATGTTACGTTTGCAAGGAAATGTTGGCATAGGACACGTCCGTTATCCAACTGCAGGCAGCTCAAGTGTATCCGAAGCACAGCCTTTTTATGTCAATTCCCCTTATGGCTTAACCCTAGTACATAACGGCAATCTCACCAACAATGCAGAATTAAAACGCCTACTGTTTAACCTAGCCAAACGCCACGTTAATACAAACTCAGACTCAGAATCTTTACTCAATATATTTGCTTACTATCTCGATCAATATCCACACGAACCCCTAACACCTGAAAATATCTTTGAAAGCGTTCGCAAAACTAACCAAGTTATTCGAGGGGCTTATGCTTGTTTAGCGATGATTATCGGACACGGAATGGTGGCATTTCGCGATCCACTCGGTATCCGACCGCTTGTACTCGGCAAACGAGAAATTGACGGCAAAACAGAATATATGTTTGCTTCAGAAAGTGTTGCACTTGATGTTGTTGGATTTGAATATGTTCGAGATGTACAAGCAGGCGAAGCCATTTATATTACCTTTGATGGACAATTCTACTCAGCAATCTGTGCCGATAACCCGAAATTGAACCCTTGTATCTTTGAATATGTCTATTTCGCTCGACCAGATTCTGTTATTGATGGCGTATCTGTTTACGCAGCAAGAGTACATATGGGGAAATTCTTAGGCGAAAAAATTGCGAAAGAGTGGACAGATATTCTGGCGGATATTGATGTGGTTATCCCGATTCCTGAAACTTCTACCGATATTGCCTTACAAATTGCAACAGTACTGAAAAAAACTTATCGCCAAGGGTTTGTGAAAAATCGCTACGTTGCTCGAACCTTTATTATGCCGGGGCAGGCACAACGAAAAAATTCAGTCCGTCGCAAGTTGAATGCCATTGCCTCTGAATTTAAAGGAAAAAATGTATTACTTGTTGATGATTCAATTGTTCGTGGCACTACCTCAGAGCAGATTGTTGAAATGGCTCGACAAGCGGGGGCAAATAAAGTCTATTTTGCCTCAGCTGCCCCTGAAGTACGTTATCCAAATGTATATGGTATTGATATGCCAACCTGTGAAGAACTGGTTGCTTATAATCGTAGCGTGGAACAAGTTGCTGAAATGATTGGTGTAGATCGCCTGATTTTCCAAGACTTATCGGCGCTCTTTAAGTCTGTTCAGTTAGAAAATCCAGATATTCACAACTTTGACGCTTCTGTTTTCACTGGGGAATATATAACAGGCGATGTGAGTTGCGAATACTTAAATGCGATAGCTCAAGCGCGCAATGATAAAGCCAAAACCGCCCAAGCGAAGCAGGCAGGTAATTTGGAAATTCATAATGAATAATCAAGAATGAGGCATAGCAGGCAAAAGTGTTGGTTTTAATTATTTCCCCTAATTATTAGGCGGCATAGTAGACAAAATGCCTTTAGTATTTGACGACTAAAGGCATTTCTCGTAGGGAAGTTAATTATGATTATTCATCTTTATCGATTCGGCTAAACACCGCACTTTGCTGATTTTTATATTTTGCATCTTTACGAGCATTATATGGATGTTCTGCGTAACCACTTAAAATTTCAAAGCTCAATGCACCAATTGCCATATTAGGACGTAATGCAAGCGGTAACTTTCCCGCATTAAAAAACTCAAGTACGATTTTGCCTTCCCAACCTGGATCGATACGATGGGCAGTAACGTGTACCATTAACCCAAGTCGAGCCAAAGAAGAACGGCCATCAAGCCAGCCGACTATGTTGGCAGGTAGTTTCACTGATTCAAGCGTTGTTGCTAAAGCCAGTTCCCCAGGGTGTAGGAAAAAGGCTTCATCATCGGCAATCAGGATTTCATCACTCATCACACGATTAAGCTGTGCCGTCATTTCTTCACGTGGGCCGCTTAAATCAATATAAGGCGTTGAATGTTCACGAAACACACGGAAAGAATTACCCAAACGGACATCAATCGTCGCTCCACTGATTTTTTCATTTGATGGGCGAGGCGTTAGGCTGATAATCCCTTCATCAAGATAACGTTCAATATCTTTGTCACATAAACGCATAATTCCCCCTAATATATTAACTATGTCCTAATAGCTGTTTAATTTGTGCTTTCAAGATATTAATCGCAATACGGTTTTTACCGCCTTTTGGAATAATAATATCCGCATACTGTTTAGATGGTTCAACAAATTGTAAGAACATTGGGCGAACCGTTTTACGATACTGATTTACGATAGATTCCATTGTTCTGCCACGCTCCTCCATATCACGCTGTAAACGACGGATAAAACAGATATCTAAAGGGGCATCAACGAAAATAGACACATTAATTTCATCACGAATTTTTTCATCAGTAAGTAATAAAATACCTTCAAGAATGATGATTTTTTTAGGAGTGAAGTGGGTTACGGTTTCTTTGCGATTATGTTCTGCATAATCATATTCTGGAATATCAACAGCTTGCCCTTGTTTGAGGCTTTTAAGATGGGTAACTAACAGTTCGTGATCCATTGAGTTTGGGTGGTCGTAATTGGTTTTTACCCGTTCTTCCATTGCAAGATGGCTTTGATCTCGGTAATAAGCGTCTTCAGAAATAATACCAATATCATCTTGCCCCAATTCCGCTTGCAATTCTTTGTAAATAGTCGAAGCAATAAGACTTTTACCAGAAGCTGAAGCCCCTGCAATTGCAATAACAATACAAGATTCCTTTTGAGTGGTGTTTGACATAATTAAATCCTTGAACACACAACTGGAGAATTTAGGGAATTATATCGCAAAATCCGTAATCTTTTGAAGATAATTACCGAATTTTGGAGCCTGTACTAATTTTAGTAGTATTCATGCTTCATGTCAGTTCAGTATTCATTTAAACAAATGTGTATAGTAAACATGAATTACATCTAATTAAATGTAGGTTTACAATCTTCTTGCTTGCCAAAAACTTCTAGACCAATAAGGTGAATTAATATCTGAATAAATTACCCCACCTTTTGTTGAAGCGTGAAGAAACTGCCCATTTTTGACGTAAATGCCAACATGTCTGCCATTTGGCCCACGACCAGTTTTAAAAAAGACAAGATCACCCGTACGTAATTCACTCTTTGAGATTTGTATGCCTGCTTTTGCTTGATCTACTGTTATTCGAGGTAAATCAATACCAAATAACTCTCGGAAAGTAAGTTGCACAAAACCAGAGCAATCAATACCGCTTTTTGTTATACCGCCTAGACGGTAGCGTGTACCTTTCCACTCTCTTTGATGTTCGCTTAAACTGCTAATCACAAAAATGGAGTCTGAAAGCTGCCCTTTATGTTTATTTCCGCTTTTATCTTGAACCGTAGTGATTTTTGATACACAAGCGGACAACAAAAATGCACAAAACAGCATTGTGTATAAAGAAAAATGCTTTTTTATTAACTGAGAAAACATTGCGATCCTTAAAAATATTCTGCGAAATACCAAGATTTCGCAGAATAATCATTTAGGCTTTTACCTTCGCATTTTCGACACGTTCACGCAATTTTTGTCCAGCTTTAAAAACCACAACTCGACGAGCAGACACTGCAACATCTTCGCCGGTTTTAGGATTACGACCTGGACGAGCTTTTTTATCACGAACAGTAAAATTGCCGAAGCCCGACAGTTTTACCTCTTCACCGCTCTCTAACGAGCGACGAATTTCTTCAAAAAAGTCCTCAACAAATTGTTTTGCGATACGTTTATCTAAACCACATCTTTCGACAAGGTTTTCTGCGATTTCAATTTTGGTAAGTGCCATAATTTATCCTTAAAATCTAATCTCTTAGATAAGCATTAAAACGTTGTGCAAGTGTTTCGAGAACAGCTTGAAGCACCGCATTAATTTCTTCCTCTTCAAGAGTTTTTTCAGTGTCTTGAATCGTTAAGCTGATCGCTAAACTTTTCTTACCTTCAGGTAAATTTGTGCCTTGGTAAACGTCAAATAAATTCACTGCCACAAGTTTAGCTCCACCTGCTTGTCTAGCCACATCAAGTAGATCACCTGCAGGTAAATTGCTATCCACAACCACGGCAATATCACGTTTATTTGCAGGGAAACGTGAAATTTCTTTTGCATTTGGTACTGAACGCTCTGCAATCGCAGACCACAATAATTCAAAAGCAACAGGTTTACCTGACAATCCGAGTTTTTGAACAACTTTAGGGTGAATTGTGCCGATATAACCGATCTCTTGATCGTCGAGTAAAATAGCAGCAGATTGTCCTGGGTGGAACGCAGGATATGATTTTGCAACAAAACGTAAACGATTGCCAGCATTTGTTAGTGATAAAACACGTTCTAAATCCCCTTTTAGATCAAAGAAATCGACGTTTTCTGCTTTATGTTCCCAATGTGCTGGACGTTTATCCCCTACAATCACTGCACCTAATACAAATTCTTGGCGTATGCCATTTTCTGCATTGGTATCAGGAATAAAGCGTAAACCACTTTCAAAAATACGCACTCGATTTTGCTGGCGATTTTGGTTATAAGCAACGGTTTCAAGTAAGCCTGTTAAAAGCGACACACGCATTGCCGACATTTCACTTGAAATCGGATTTGGTAGAATTAACGCTTCTTGGCTTGGATGTAACAGCTCTTGCACTTTTGGATCAACAAAGCTATAAGTAATCACTTCTTGATAATCGCTATCGACCAAAGCCGTTCTCACACGAATAGCTTCTAAAATCTTCTCTGGGAAGCCTTTCATCTGTAAATGAGCAAGCGGTGCGTTATTTGGAATGCTGTTATAGCCGTAAATACGAGCTACTTCTTCCACAAGATCTTCTTCGATCTCAATATCAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP009158|473897:481391|473897_475412_+|WP_010786632.1|DBSCAN-SWA MCGIVGIIGQTPVNQALYDGLTLLQHRGQDAAGIVTIDDENRFRLRKANGLVSDVFRQEHMLRLQGNVGIGHVRYPTAGSSSVSEAQPFYVNSPYGLTLVHNGNLTNNAELKRLLFNLAKRHVNTNSDSESLLNIFAYYLDQYPHEPLTPENIFESVRKTNQVIRGAYACLAMIIGHGMVAFRDPLGIRPLVLGKREIDGKTEYMFASESVALDVVGFEYVRDVQAGEAIYITFDGQFYSAICADNPKLNPCIFEYVYFARPDSVIDGVSVYAARVHMGKFLGEKIAKEWTDILADIDVVIPIPETSTDIALQIATVLKKTYRQGFVKNRYVARTFIMPGQAQRKNSVRRKLNAIASEFKGKNVLLVDDSIVRGTTSEQIVEMARQAGANKVYFASAAPEVRYPNVYGIDMPTCEELVAYNRSVEQVAEMIGVDRLIFQDLSALFKSVQLENPDIHNFDASVFTGEYITGDVSCEYLNAIAQARNDKAKTAQAKQAGNLEIHNE >NZ_CP009158|473897:481391|477864_480252_-|WP_038513747.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKFSESWLREWVNPAITIEQLCDQITMLGLEVDAVEAVAGEFNGVVIGEVVECAQHPDADKLRVTKVNVGGERLLDIVCGAPNCRQGLKVACATDGAVLPGDFKIKKTKLRGQPSEGMLCSFSELGIKEDHSGIIELPADAPVGIDFRDYLKLNDRAIEISLTPNRADCLSIAGIAREVGVVNQLAVNAPEIQAVPATIADKVTIELQAPEACPRYLGRVVKNVNVKAQSPLWLQEKLRRCGIRSIDPIVDITNLSLLELGQPMHAFDAAKINGTIQVRMAKEGEELILLDGTTAKLQPNTLLIADQNGPLAMAGIFGGEASGVSAETKDVVLEAAFFAPLAITGRARQYGLHTDASHRFERGVDPELTRKAMERATALLLEICGGEAGEIVEAVSSAHLPTSKQVVLRRSKLDSLLGHHIETETVTDILARLGLNPSYADESWTVQSPSWRFDIEIEEDLVEEVARIYGYNSIPNNAPLAHLQMKGFPEKILEAIRVRTALVDSDYQEVITYSFVDPKVQELLHPSQEALILPNPISSEMSAMRVSLLTGLLETVAYNQNRQQNRVRIFESGLRFIPDTNAENGIRQEFVLGAVIVGDKRPAHWEHKAENVDFFDLKGDLERVLSLTNAGNRLRFVAKSYPAFHPGQSAAILLDDQEIGYIGTIHPKVVQKLGLSGKPVAFELLWSAIAERSVPNAKEISRFPANKRDIAVVVDSNLPAGDLLDVARQAGGAKLVAVNLFDVYQGTNLPEGKKSLAISLTIQDTEKTLEEEEINAVLQAVLETLAQRFNAYLRD >NZ_CP009158|473897:481391|480407_481391_-|WP_005714554.1|tRNA|DBSCAN-SWA MQNLENIVAEALQAVEKASDVASLEALRVEYFGKKGHFTLLMQGLRDVPADERPAVGAKINEAKQKAQDALNGKKEQLETEELNAKLASESIDVSLPGCKTELGGLHPVSITIERVVKFFSELGFSVEKGPEIETDYYNFDALNIPAHHPARADHDTFWFDAERLLRTQTSGVQIRTMEKMQPPIRIMAPGRVYRNDYDQTHTPMFHQIELLYVDKKANFTELKGLLHDFLRAFFEEDLQVRFRPSYFPFTEPSAEVDVMGKNGKWLEVLGCGMVHPNVLRNVGIDPDEYTGFAVGMGVERLTMLRYNVTDLRSFFENDLRFLKQFK >NZ_CP009158|473897:481391|476986_477499_-|WP_038513743.1|DBSCAN-SWA MFSQLIKKHFSLYTMLFCAFLLSACVSKITTVQDKSGNKHKGQLSDSIFVISSLSEHQREWKGTRYRLGGITKSGIDCSGFVQLTFRELFGIDLPRITVDQAKAGIQISKSELRTGDLVFFKTGRGPNGRHVGIYVKNGQFLHASTKGGVIYSDINSPYWSRSFWQARRL >NZ_CP009158|473897:481391|477551_477848_-|WP_005710633.1|DBSCAN-SWA MALTKIEIAENLVERCGLDKRIAKQFVEDFFEEIRRSLESGEEVKLSGFGNFTVRDKKARPGRNPKTGEDVAVSARRVVVFKAGQKLRERVENAKVKA >NZ_CP009158|473897:481391|475542_476127_-|WP_005710639.1|DBSCAN-SWA MRLCDKDIERYLDEGIISLTPRPSNEKISGATIDVRLGNSFRVFREHSTPYIDLSGPREEMTAQLNRVMSDEILIADDEAFFLHPGELALATTLESVKLPANIVGWLDGRSSLARLGLMVHVTAHRIDPGWEGKIVLEFFNAGKLPLALRPNMAIGALSFEILSGYAEHPYNARKDAKYKNQQSAVFSRIDKDE >NZ_CP009158|473897:481391|476143_476797_-|WP_010786629.1|DBSCAN-SWA MSNTTQKESCIVIAIAGASASGKSLIASTIYKELQAELGQDDIGIISEDAYYRDQSHLAMEERVKTNYDHPNSMDHELLVTHLKSLKQGQAVDIPEYDYAEHNRKETVTHFTPKKIIILEGILLLTDEKIRDEINVSIFVDAPLDICFIRRLQRDMEERGRTMESIVNQYRKTVRPMFLQFVEPSKQYADIIIPKGGKNRIAINILKAQIKQLLGHS |
7 | Mollivirus(14.29%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
543835 : 549843
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP009158|543835:549843|DBSCAN-SWA TTTACCCAATAAAATTCAACTGTTGGCTTTGGTGGACTTTTACTCTAGCGTGGATAAATAACTGGTCTTGATTTTCTTCAGTGATACTCCACTTTTCATAGAGTTTGTTATCTGAAATCACCAATAATTGATCGCCTGTATTTTGCAATCTTTTCACATACAAATGTCCTTTGTATGTAAATACATAAACACCATCACCAGCAAACTCATTTACGCTAATATCAACAAAAAGCATATCACCTGATGAAAATGTTGGGTGCATAGAATCACCACTTAAATTAATGATTCTGATGTATTGAGGTGCCATATTACGAAAGAGTGAATAAAATTGCTCAGGCACATAACGCATCTGATTGACAACTTCAACTAATTCAGTGCTTGATCCGAAGCCTGCACTAGCACTCACATCTAATACATCAATGATGACAAAATTATTTATATCTTGTTCCTGTAATTCTTTTTCTTCATTGCCTCTCATTGCATTAATGACGACGGATTGATCGAGATGTATTTGATCCAACCATCCTCTAGGTTTATTCATACCATCTTCTAGCTTGGCGGCAATTTTGTCGCCGATACCTTTGGGTTTTCCGTTTTGAATGGCGTTTTTATTCTTAATTTGTAAAAGATAACTAACTGCAATACCTGTTCTATTTGCTAATTCAGACGTATTTTTAGCCTCATCAATTAGACGTAGTAAATTATCGTGTCTGATTTCTTTTAAAGGTCTCATATTACCTCCTGACTAAATAACTACCTCTATTTTATTATCATTTCGATAATAATTAAATATGATCTAATTAATTGCTTTTGTTTTACCTTTAAGATAATATAAATATTATCTATCAAAGAAAAAAGGTACTATGGATGCAATTACAAGAATACTTAGATATTTCAAAACGAGGTGAAATGGCTCGTTTATCAAAAGCGATAGGGGTTGCTCAGCCCATTGTGTCATTTTGGGTGAGTGGTCGTCGTCAAGTTCCAGCAGAGCGTTGTCCAGAAATTGAAAAATTTACGGAAGGGAAGGTGACGTGTGAAGAGCTACGCCCTGATGTGAATTGGGCTGTATTACGAAATTCAGGCAAATAAAAACCCACGCTGGAACGTGGGTTAGTTACGGAGGTTTTCACTTATGAATGAACATCATACCGAGTTGCATTCTAGCGAAAAATCGTCCTTTTGGCAAGAGATGGAGTATCGAAAGCGATGTTATGCCGAACTAGAGCGTCGTAATTTTGCAGGTAACGTGGACTATGACGAGATTTTTAACCAGATTGATAAGGATTTAAGCGATGAATGCAGTAGTAAAAGTTAAAGAAACACCGATTTTTAAGTTAGGCGAAAACAGACAATCACAAGAGGCTAGGAAAGTGAGTGTTGATGATGGATTTACGGCAATTCCAAATGAGCTTCTAAAGGCAATTTTACGCTCAAAAGTATTGGGCTGGAAAGGCTCTTACTTGTTGGCAACCATTCTTAAAACGCTTTCTTGGCATAAAGAAAGTGATTGGTTTACTCACTCTCAAGTCTGCGAAATGATGGGCATTGAACCAACAAAATATCATGTCAATCAACTTTCAGCAGCACGTAAAGAGCTTATCAAAGAGCAAGTCTTATTTGAAGATGGTAAAAAAACGGGTGTAAATCTAGATGTTTTTAACTGGGAAATGGTGAATCCCGAAAAAGTAGGGAGTTCCCGAAATAATAGGGAATTAGTTCCCGAAATTGTAGGGAATAAGTATCCCGAAAAAGTAGGGAACACAAAAGAAACTATTACAAAAGAAAAAATAAATAATACCCCCTTACCCCCTAAAGGGGAATCGGCTATCGCCGATGAACAACCGCAAGCGGTGAAATGTGAACAACATTCTGCAAAACCAGAAAAGATTAAATCACCGCCTATGGACTATCAGGCGGTAGCTGATTTGTATAACCAAGCTAATCAGAATTCGGGTTCAAGATTGCCGATGGTGGAAAAAATCAATGATGCTCGTCGGAAAGGGATTAAAAAATTAATGGCTGAGCTTAGAGAGCCAAGTTTGGAATGTGCTGAGCTGTATTTCAATGCGTTGTTTGCAAGCCTGCGTCCGTTTCATACTGGTGAAAATGGCGGTTGGGTGGCTAATTTTGATTGGGCAATTCGCCCTGCGACGGTGCTGAAAGTTCGTGAAGGAGCGTTGTGATGTCTGAAAATCTGCGAAAAATCACTTACGAGGTCGAGGTAAGTACCGTTGGTTCTCTGTTGAATGGTGGATTGACGGCTCAGGCGAGAGAGGTGTTGAGTTGGTTAAAACCTGAGATGTTTTTGACGTTCAAGCTAGGTGAAATCTATTCAAACATTCAACGCCAAGCGAGCAAGGATAATCTGATTGATATGTTGTTACTGAGTTCTGAGTACGGTGTTCAGCTTGCCGATATGGCGGAAACCATAAAATCAGTGGTGTCTGCATCAAACTTAACGGGATATGCTACGAAGGTTTTTAATTTCTATCAGCGTAGAGAAGTGTTGAAAGTGCTTGTGAGCCTTGCTGGTGAGTTGAATTTAGCTCGTGATGAACAGTTAGATGCGATTGCAACAAAGGGCGTTGAGCATATTTCTGCGTTGCTGAATAAGAGTGCGAGTGTTGCACCTACGGGAATGGGGAGTTTGCTTGATGGCTATTATCAACTACTGCAAGACAGGCATAAACCTGAATTTAAACGGCGTTTGTTGTTTACTGGTATTCAAGCCTTGGATGACATTTTGCAAGGCATTGATGAAACCGATATTTGTGTCGTTGGTGGGCGTTCTGGTAATGGTAAAACCGAAACGGCAATTACGTTTACGAAAAACATTTTAGAGCAAGGTGGTTCGGTGTTGTTTTTCTCTCTTGAGATGAGCAGACAACAAATTATGGATCGTCTGATTGCCAGTGCAAGCGGTGTTAATTCTGCAAAACTTCGTAATCCTGAATGGTTGAGTGATGAAGATTTTGCTCGAATGAGTGAGGCTACAAGTGTGATGAAAGATCAAAAGCTCTTTGTGGTGGATAAAGGAGCTTTGTCTGTTGAAGAGATTACGGCGATCACAGAAAGGCATTTGGCTGAGCATAAAAAGTTAAATGCAGTGGTGGTTGATTATATTGGTTTGGTTAATCATGGGGCGTTAGATGGGCGAGTGAACCGTACTTATCAGATCGGAGAAACCGTAGAGCGATTAAAGGCATTTTCTAAACAAGTTCACGTCCCGTTTATTTTACTTTCGCAGTTAAGCCGAGATGCAGAGGGTTCTACCCCAAATAATGCAAACTTGAGTGATTCCAAGGCGTTAGAGAATGTTGCAAGCCAAATCATTATGGTTCACAACCAGCGAGATAAGGAAACAAATGAACCTGCGAGATATACGCATTGGATTGTGACAAAGAACCGTAACGGCAAGGTTGGGACTGCTTATGTTGAGTTCCAAAATGGACGATTTATTGAGTGTGATCAGGCATTAGCTTGGGAATCTTTCCAGAAGAAAAATGAACAACAGAGAAGAGCGAATAAGGGGTTTTAGGTGAGTTTGGATTTTATTAAGAAGGTAGGTGGGTATTTTAGAAAAGAGCAGGTTGGTAGGTAAGGAGGTTGATAGGTATGGAGCAAAGGTTGGTAGGTATGGAGCATAAACAAAAATACTTTTTACGCACTGAGAAAATTAAAAACAATGCCCTTGAATTTGTGAAAGCGTTGCCAATAGATGAGAAAAAGCCGTTAGTGGTTGAAGTGAAGCCTATTACTCGCAACCTTGAGCAAAATGCCAAATTCCACGCAATGTGCGGCGATATTGCTAAACAGGTGCAATTTAACGGCGAATGGCTACCGCTTGAAGCGTGGAAGGTTCTTTTAATTTCTGCTCACGCAGAAGCAACGAAAGAAGGTTCTTGTTTGGTCACAGGATTGGAAGGCGAATTAGTGAATATTCGTGAGAGTACGGCTCAAATGAGCGTAAAACGAATGGCAAGTTTAATCGAATATGCAACTTCGTGGGGTGTTTCTAATGGGGTGCATTTTAATGACAGATGGAATTTTTGGGGGATGAAATAACCTACGCTTAGTGGTTAAGCGTAGGTGTAAGCGTTAAGCGGTTAAGATTTTATCCGCTGCGATTTTAGCTAAGAAGTTGCTACGGTTTTTATACTCTTTGTGAACCGCAACAAAATCATCAATGCGTTTGATGAGATAGCTAGGGAGGGTGATGTTGATGCGTTCGGCTTTTCCGAGTAAATGGCTAATATCAACATCAACAAAGCCGAAAAAGAAGTCATATTCTGCAAAATCAGGGTTTTTGCGGTGGTTATCAATGGAGGTTGGCATCGGAATTTCTTCTCCATCTTCAACTAAGCCTTCAAGGTGGAACACGATGGCTTCTTTGACATTTTGATATGCTTCTTCGAGGGTATCGCCAGCAGAGAAGCACCCTGGAATATCAGGCACGATAACGCCGTAAGCGTGAGTTTCGTCACCTGGTTCAATTGCAATTGGGTATAACATATTTTGTCCTTGTGGTTATAGCAGGGCTATTTTAGCCCCGCTTGTTTAAGTATTGAGAGTTCAGTTCCTTTTTTTAAATCCTTTTTCGGATGAGGCACTGTTACTCGCCCTTGTTTAGTTGGATGTTTGAATTGATGGTGGCTTCCACTTGTTGCAACTAAGTACCAACCGTCCGCTTCAATCATTTTAATTATGGTTTTGCTATCCACATTATTGTGCTCCTTTGTTGTTTTTCATGTGTGTATTATACTTATTTTTATGTTTTTATCAACTGTTTATATGTAAGATGTGTATTTTAGGTGAATAAATGAAATTTTACTGCCCAAACTGCCAATCAATTCTTAAAGACTGGCGTAGGTTTTCTGAAAAGTCAGAGATTAATAAGGAGAAGCCGTTTAAGTGTACTGGCTTGAAGTGCGGTAAGCGGTGGAGTGAGAAAGAATTGGAGGCATTTAATGATAAAGCCGAAAGTGAAAAAGCGTAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP009158|543835:549843|547473_547902_+|WP_038515080.1|DBSCAN-SWA MEHKQKYFLRTEKIKNNALEFVKALPIDEKKPLVVEVKPITRNLEQNAKFHAMCGDIAKQVQFNGEWLPLEAWKVLLISAHAEATKEGSCLVTGLEGELVNIRESTAQMSVKRMASLIEYATSWGVSNGVHFNDRWNFWGMK >NZ_CP009158|543835:549843|548804_549383_+|WP_038513329.1|DBSCAN-SWA MIKPKVKKRKCKCCGGEFKSADSFRKWCSAECGVKLAKIAQEKARQKAIEKRNREERAKIKATRERLKSRSEWLKDAQAVFNEYIRLRDKDDPCISCRRFHQGQYHAGHYRTVKAMPELRFNEDNVHKQCSACNNHLSGNITEYRINLVRKIGVERVEALEGYHPPVKWSAEDCKEIIKTYRAKIKGLKRGG >NZ_CP009158|543835:549843|548375_548558_-|WP_005715063.1|DBSCAN-SWA MDSKTIIKMIEADGWYLVATSGSHHQFKHPTKQGRVTVPHPKKDLKKGTELSILKQAGLK >NZ_CP009158|543835:549843|544969_545152_+|WP_016528087.1|DBSCAN-SWA MNEHHTELHSSEKSSFWQEMEYRKRCYAELERRNFAGNVDYDEIFNQIDKDLSDECSSKS >NZ_CP009158|543835:549843|543835_544567_-|WP_016528089.1|DBSCAN-SWA MRPLKEIRHDNLLRLIDEAKNTSELANRTGIAVSYLLQIKNKNAIQNGKPKGIGDKIAAKLEDGMNKPRGWLDQIHLDQSVVINAMRGNEEKELQEQDINNFVIIDVLDVSASAGFGSSTELVEVVNQMRYVPEQFYSLFRNMAPQYIRIINLSGDSMHPTFSSGDMLFVDISVNEFAGDGVYVFTYKGHLYVKRLQNTGDQLLVISDNKLYEKWSITEENQDQLFIHARVKVHQSQQLNFIG >NZ_CP009158|543835:549843|549372_549843_+|WP_038513800.1|DBSCAN-SWA MADKLLEEPKQVWIENLLNLWGEWAFSGLDFESRMNMLARLMLQAEPSRISKPVREMCDDELGLVISSVIGYCIKNPCPQDYKYLEAKYVYGLSVYAIAKYQWEKDKSKTLRTWQRKVGESIKASEWVVAKFLDLAIKNHKSGASPTICSKYLFLR >NZ_CP009158|543835:549843|546019_547375_+|WP_026916582.1|DBSCAN-SWA MSENLRKITYEVEVSTVGSLLNGGLTAQAREVLSWLKPEMFLTFKLGEIYSNIQRQASKDNLIDMLLLSSEYGVQLADMAETIKSVVSASNLTGYATKVFNFYQRREVLKVLVSLAGELNLARDEQLDAIATKGVEHISALLNKSASVAPTGMGSLLDGYYQLLQDRHKPEFKRRLLFTGIQALDDILQGIDETDICVVGGRSGNGKTETAITFTKNILEQGGSVLFFSLEMSRQQIMDRLIASASGVNSAKLRNPEWLSDEDFARMSEATSVMKDQKLFVVDKGALSVEEITAITERHLAEHKKLNAVVVDYIGLVNHGALDGRVNRTYQIGETVERLKAFSKQVHVPFILLSQLSRDAEGSTPNNANLSDSKALENVASQIIMVHNQRDKETNEPARYTHWIVTKNRNGKVGTAYVEFQNGRFIECDQALAWESFQKKNEQQRRANKGF >NZ_CP009158|543835:549843|545129_546020_+|WP_026916583.1|DBSCAN-SWA MNAVVKVKETPIFKLGENRQSQEARKVSVDDGFTAIPNELLKAILRSKVLGWKGSYLLATILKTLSWHKESDWFTHSQVCEMMGIEPTKYHVNQLSAARKELIKEQVLFEDGKKTGVNLDVFNWEMVNPEKVGSSRNNRELVPEIVGNKYPEKVGNTKETITKEKINNTPLPPKGESAIADEQPQAVKCEQHSAKPEKIKSPPMDYQAVADLYNQANQNSGSRLPMVEKINDARRKGIKKLMAELREPSLECAELYFNALFASLRPFHTGENGGWVANFDWAIRPATVLKVREGAL >NZ_CP009158|543835:549843|547935_548349_-|WP_005715065.1|DBSCAN-SWA MLYPIAIEPGDETHAYGVIVPDIPGCFSAGDTLEEAYQNVKEAIVFHLEGLVEDGEEIPMPTSIDNHRKNPDFAEYDFFFGFVDVDISHLLGKAERINITLPSYLIKRIDDFVAVHKEYKNRSNFLAKIAADKILTA >NZ_CP009158|543835:549843|544701_544926_+|WP_016528088.1|DBSCAN-SWA MQLQEYLDISKRGEMARLSKAIGVAQPIVSFWVSGRRQVPAERCPEIEKFTEGKVTCEELRPDVNWAVLRNSGK |
10 | Mannheimia_phage(44.44%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
557267 : 562606
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP009158|557267:562606|DBSCAN-SWA TTTACTGTCCTGCCAACGCCTTAATCACAAAATTTTCAATCATTTCAATATCTTCATCGGTAAAGCCTAACAACTCACGCTGATCATATTTCACCTTCCAATTTGCACTTCTCACCACTCGACCTTTTAACCCGTACTGGTGAATTTGTGCAATATGTGCGTCACTGCCACTGTAACCCAACTCGATATTATCCCCAGCGGTTCTTAACTTCATAAATCGGGCTGACTTCAATTTTAAGAACATTGCATTTTGTTTAATCTTTCCCTTGCGTTTCTTACGTTGTACTTTGCGTGGCGTGTACGACGAGCCGTCAGGATTTTGCTGTGCGGTAATACGTCTGCGTTGGCTACGAGCCAATTCACGCCCGATTTGTTGATATAGCAACCGTCGCCGTGGTTTGCTGATATTTTTGAGCAACGCATTAAACGCTGATTTAACCTTGATAATGTCGTCTGTCGCCATTATTCCATCGCTCCCATTCGCTCATACACCTGTTCCCCTTTCACAAAATAGTCAGCCGTTCCAGAGGTTGCCATTCGGTCGGCTGTGGCTCTTCGGCGTGGTGAGCTTGGTAATGATCGCCTTCTTGTTTGACAATAACACGCTCGGTCAGTGGAATTTTGATGTAAATATCGTGGGTGGCGTTGTTGTTTGGGTCAATTTCAAAGGTGATGCTGTCCTGTTTGTTGGGATTGGTTATCAGCTCCGATTGTTGCAAGCGGACAAATTCCATCACAGGCACAAACAGTAAATCAGGGTGTTCAGGGAAATCTTCCACCACAATTTCTAAGTCGTAGAGATATTGATAACTGAGTGATGTCGCCCCTGTCGTCCAGATTTTGCCGTTGGCATAGTAAATCTGTAACTGCTCAGGATTTTTGGCAAAATAGGGAATGGTTTTGGTGAGCAGGTCACGCAATTTGTCTGGTTTAATCATTTGCGATAGCCTTTTTGTTTGTATTCATAAATTTGTTGGCAGTCAATGCAACGGGTGCAACCTTGCACGTTTTGGCGACGGGCTTCGGGAATTGGTTCGTCGCAATCTTCGCAATGGGTCAGGCTGTAAGCGGTCGGTTTGTTGCGAAGTTTTGCAAGGGCAAATTCTCTTTCTTTTTCGGCAAGCTCATTGGCTCGGTCAATTTGGTCTTTCATCGCTTTTTCTCGTTGGGTTAAATAGCGATATTGTGAGTAAGTAGCAAAGGCGGGGCGAATGGTTGTGGGTGTGGATTTGGGGGTAACAAAAAGCCCCGATGGGTCGAGGCTGTGGAGTTAGTTTTTTGTAACAGGTTTAAGAGTTCCTTCCGCTTTTGCTTTTTGATAGGCTTGACGGAACTCTTTTAATTTTTGGCGTTTAAGTTCAACGGCGGTCATTTTTTTCATTATTCCCTCCTGTATAGGTCGGTGTTTTAATAATAAAGCAATCTTGTTGATCGCCTAAATTTGATACTGTTTCAAAGTCTGACATAAAGGAACTCGGATTGCAACACATTTTACTGTACATTCTTGCTAGTGATGGGCGATCTGCAACGAAAACATAGCAATCAGGCTTGAATAAAAGGTAGTGTTCATACACTAATTTTTCAAGGTGTGATTTCAGAGCTTTAATTTCCGTTTTACCAAATTGATGATTCAACGGTGACGCATATAAATCTTCATTGCCTGTTTCAATATATTCCTTAACAGCAAATTTAATTGAATGTGTTTTTTTATGCTGAATGATTTCTGCAATAGTCGGATCTTGTTCTAAAAATAATAGAGTATCTTTATCATCAGAAAAAATCGCCATATAAGTGACATTGACAATTTGAAATTCGGTAGAGATATAAATAATCCCACTATCGTTGTCTTGTGTTTTGGTAAAATGATAAGAGAGCATTTATCTGTAATATTCTGCTGTTTAAAAACTCAGGCAATCCTAAGACAAAGCTCTCTGTCTGTCAATGAAGTGATTATTCCGCAATACGCTTATTGTAACCTTCCACACACGCTTCCCAGCCTTGAATTTCCACCTGGCAAAGCTCAATCGTCGTCAAACTTTGGTCGAGCGATTTTGCAAGATCAGCGTTGGTCTTTATCTCGAACCTGGGGCTGTGGCACTGCTTTATTTGGGGGCAAAGGAGCGGAATTGGCTTTACTGTTCGATACTGTACCGCTTCTTTGGTTGAGCAACCGACTAACGCCAGTAGGCACAGGCTGATAGCTCCAAGATTGATTGTTTTCCAGTTCAAGTAAAATTTCATTGGTGCGTTTCTCCGCTTGGGTGAGCTTAGTTAAAACTTGTTGATGTAATTTATCCACCTGCTTTTGATACTGCAGAATATGTTGGTTTGCCTGTTCTAGCTGGTTGGCTAGGCTTTGGTTATCCGCTCGCACTAAAGCAATTTCTTCTTGTTTGGATTGGTTGTCCGCCTGCAGTGTTTTGCGTTCATAACAGAGAAAGGCATTAATGCAGACACCAATCAGCAAGGCGATAATCATCGCTTTGCCAAAACTTTTCTCAATCATACCGCTTATAATGCTAAACATAGTGCTTTTTCCTTTTCTCGTCTGATTTCTAAACCACGCAGTTTTTTGCCATTGGCATAGACCCAACGGCTAAACTGTTCACACATTGCAGGGCTGTAACCTTGATTGGCGAGTTTGAACAAGGTCGAATGTCGCATTGTTCCGCAACCTGCATTGAAGGTAATTGATGTCAATGCGTCAAACGCTCCTTGTGGCATTTTTTTGCCGTTGGCGTAGCGGTTTACGCACCGTTCCGCTTCGGCTAAATCTTTTGCCCAGCGGTCAGCAATTTCTTTGTCGCTGTAAATTTTGCGTTCAATCTTACCGCTTGTGGCTTCGGTTGAACCAATGCCGACGGTGAGTACATTCGCAGGGCAAACATAAGGATCTCGTCTGCACCCTTCAGTGTTGCCGATAATGTCTAAGCCTTTTGGACTGGTGCGGATTTCAGGGTGATTAAGCTGTACTAAGCCGATAATTGCACCGATACCGCAGACCATCGCTCCGCCGAATTTAAGATTTTTGTTCATCGTCTAAAATGTCCTTTAAGTTGATTTTATAACGCTCAAGGGCTTTTTCTTTCAGTTTGATTTCTCGGTCTTTGTAGTACCAATTCATCAATAGGGTAAACAAGCCGAATAAAATCCCCATTATTACGCCCCGTCGGCTGCGTGGTTTGCTCGGTTTAGTCGGTGTCGGCTTGGTTTAACTGCTTCTGAAGTTTTTTAACACTGCCTTGCACACCGATGTTTAAATTCAGTTCTAATGCCCGTTCTAAGTAGCTGAGTGCCGTTTCAGGCTGTGTCGTTTCAAGTAGCAAGCCGATTTCACGGTAGAGCCTTGCTCGACTTTCGTCTGGCATATCTTTCTCTTTGGTGAGTTCGTCCACTCGTAACAAGTAGCTCACTTCAAACGGCTTTTGCACCTTCTGGGCTTTTTTCGCTGCGTCAGCAAACTCTTCAGCAAGCATTGAGCAAAGCGAACGACTAAAGCCGTCAGGCAATGTCAGGTCTTGATGAATGGCGTAATCGGCAATTTGTAAAGCAAGGTGATACTCGCCACAATCCACCGACCATACTTGCCACGTCATCAGTACATTGTCCTGTTTGCCGTTGCCCGCACTCAATGCCCCTTCAATCCACGGCAAATAGTGGTGCAGAATGCTTTTTTTATAACTGGCTCGCTGTTCCATTGAGGCAATGGCTTTCAGGTCTTTTTTATGACGGGCCAGTAAGTAGAGCATTTTTTCGTATTCGTCGAGGTTTTCTAGTTGAGCTTGCTCAGAAGATTGAGCAAGCTCCGCAGTTACTCGCAAATAGTGGGCTTGAGTTGGTCGCATTAACCGCCTACTCCAGTAGTATCAGGTGAACCAAGCATACTAATGTTTTTCAACAGGGCGACTTGTGCATAATTTTCGACAACGAAATCATCGTTAGAAGAAACGAAATTTTTACCCGTAAAAATGTGGTTGTAATCCACACCGTTGTCTTGTGCTACACCTGCAAGGTAAGTGTTAAATTTGGTCGCTGTTTCTGGTCTCATATTCTGTCCTTTTTAGAAAACACGTTCATTATTTAATTCACCACCCGTAATTTCAGGGCGTGGCGTGTAGCCGTGTTCTGGCTCACTGCCGATAACATCAACACGGCTTTGTAAAGCGGTGAGATCGGCGGATAATTTTTCAAAATCTGCACACAATGCCATTTTTTCCGCTTCGGTTTGTTTTAGCTTATCTTCTAGCTCTGTAAATTTTTCTGCTAAAAGCAACTGTGCCTGTTCGTGTTCAGCAAAACGAGCTTCAACGTCGGCTTTATGTTGGGCTGTGTCAGCTTTTTCTTTACTAAACATCGCTTTCATTTTTTCAAAGAATGACACTGGCTCTTCTGCAAAGGTAAGCGAACATTCCACCGCTTCAGTGGTAAAGATTTCGCCTTGCTTTGCACCGTCTTTCGTTGTGAAAGAAAGATATTGTGTGCCTAAGCTGGCTGGCGTGTCAGTCACGGCTAAACCTGTCAAATAGGCTTTGCCTGTTTTGGCAAAATTGGTGCGAACTTCAATAGAGGTATAAACCTTCTGCTTGCTTTTCACTAACTCGACTAATTCATCTGTCGGCTCAATTTGTGCATAAAGCTGTAATTTGCCTTCATCATTCTCTTCTGCCTTAACGGCTAACACATCACCGTAGCATTTTGAATGGGCAAGTTCAGGGTCGAACCCAAACAAGTGAAAATGTTCAAGGTTGATACGAGCGCCGTAGGTTTTCGGGTCGTACGTTTCGGCAATATCAGAAAGCCACTGGCGTTCGATCTGACGACCGTCCACCGTTGCTCCTTCTGTGGCTACCACAAACCAGTTGGATTTTTTCGGCATAAATGCTTCCTCGAAATGAGAATGTTCAAAATTGCCGATATGGTGATTGGATTTTCAAACAGGTGCAAAGCGTTGCGGTTGTTAAGCAGGATTTAACAAAAGGGACTGTTCTACAAACGCCGTCCGTTTCATAACAATAGCCATATTTTCAACGATGACGCAAAACAATGACGGATATTGCAACAAACCAAGCGGAACAGACCGCTTTAATTAATATGAATACCCACCGTGAAGCCCAATTAAAGTATTGGGCAGGCTATTCACTCACGGAAATTGCCAAAATGCTTAACATTCCCGTGTCCACTATCGCCAGCTGGAAGAAACGGGAAAAATGGGACGAAGCACCTTTGTTTGAACGTGTGAGCGGTAATATTGAGAACCGTTATATGTTGCTGTTACAAAAGGACGTTAAAACAGGGTACGATTTTAAAGAGTTGGATTTTTTAATGCACCGCCGAGAGTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP009158|557267:562606|561326_562142_-|WP_038513813.1|capsid|DBSCAN-SWA MPKKSNWFVVATEGATVDGRQIERQWLSDIAETYDPKTYGARINLEHFHLFGFDPELAHSKCYGDVLAVKAEENDEGKLQLYAQIEPTDELVELVKSKQKVYTSIEVRTNFAKTGKAYLTGLAVTDTPASLGTQYLSFTTKDGAKQGEIFTTEAVECSLTFAEEPVSFFEKMKAMFSKEKADTAQHKADVEARFAEHEQAQLLLAEKFTELEDKLKQTEAEKMALCADFEKLSADLTALQSRVDVIGSEPEHGYTPRPEITGGELNNERVF >NZ_CP009158|557267:562606|562309_562606_+|WP_051453330.1|DBSCAN-SWA MTDIATNQAEQTALINMNTHREAQLKYWAGYSLTEIAKMLNIPVSTIASWKKREKWDEAPLFERVSGNIENRYMLLLQKDVKTGYDFKELDFLMHRRE >NZ_CP009158|557267:562606|558624_559143_-|WP_012621781.1|DBSCAN-SWA MLSYHFTKTQDNDSGIIYISTEFQIVNVTYMAIFSDDKDTLLFLEQDPTIAEIIQHKKTHSIKFAVKEYIETGNEDLYASPLNHQFGKTEIKALKSHLEKLVYEHYLLFKPDCYVFVADRPSLARMYSKMCCNPSSFMSDFETVSNLGDQQDCFIIKTPTYTGGNNEKNDRR >NZ_CP009158|557267:562606|560285_560423_-|WP_010786754.1|DBSCAN-SWA MGILFGLFTLLMNWYYKDREIKLKEKALERYKINLKDILDDEQKS >NZ_CP009158|557267:562606|557769_558204_-|WP_035491384.1|tail|DBSCAN-SWA MIKPDKLRDLLTKTIPYFAKNPEQLQIYYANGKIWTTGATSLSYQYLYDLEIVVEDFPEHPDLLFVPVMEFVRLQQSELITNPNKQDSITFEIDPNNNATHDIYIKIPLTERVIVKQEGDHYQAHHAEEPQPTEWQPLERLTIL >NZ_CP009158|557267:562606|561110_561314_-|WP_038513810.1|DBSCAN-SWA MRPETATKFNTYLAGVAQDNGVDYNHIFTGKNFVSSNDDFVVENYAQVALLKNISMLGSPDTTGVGG >NZ_CP009158|557267:562606|559325_559793_-|WP_038513804.1|DBSCAN-SWA MFSIISGMIEKSFGKAMIIALLIGVCINAFLCYERKTLQADNQSKQEEIALVRADNQSLANQLEQANQHILQYQKQVDKLHQQVLTKLTQAEKRTNEILLELENNQSWSYQPVPTGVSRLLNQRSGTVSNSKANSAPLPPNKAVPQPQVRDKDQR >NZ_CP009158|557267:562606|558200_558419_-|WP_010786750.1|DBSCAN-SWA MKDQIDRANELAEKEREFALAKLRNKPTAYSLTHCEDCDEPIPEARRQNVQGCTRCIDCQQIYEYKQKGYRK >NZ_CP009158|557267:562606|560457_561111_-|WP_012621779.1|terminase|DBSCAN-SWA MRPTQAHYLRVTAELAQSSEQAQLENLDEYEKMLYLLARHKKDLKAIASMEQRASYKKSILHHYLPWIEGALSAGNGKQDNVLMTWQVWSVDCGEYHLALQIADYAIHQDLTLPDGFSRSLCSMLAEEFADAAKKAQKVQKPFEVSYLLRVDELTKEKDMPDESRARLYREIGLLLETTQPETALSYLERALELNLNIGVQGSVKKLQKQLNQADTD >NZ_CP009158|557267:562606|559777_560302_-|WP_038513807.1|DBSCAN-SWA MNKNLKFGGAMVCGIGAIIGLVQLNHPEIRTSPKGLDIIGNTEGCRRDPYVCPANVLTVGIGSTEATSGKIERKIYSDKEIADRWAKDLAEAERCVNRYANGKKMPQGAFDALTSITFNAGCGTMRHSTLFKLANQGYSPAMCEQFSRWVYANGKKLRGLEIRREKEKALCLAL >NZ_CP009158|557267:562606|557267_557729_-|WP_005713954.1|DBSCAN-SWA MATDDIIKVKSAFNALLKNISKPRRRLLYQQIGRELARSQRRRITAQQNPDGSSYTPRKVQRKKRKGKIKQNAMFLKLKSARFMKLRTAGDNIELGYSGSDAHIAQIHQYGLKGRVVRSANWKVKYDQRELLGFTDEDIEMIENFVIKALAGQ |
11 | Mannheimia_phage(85.71%) | tail,capsid,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
646242 : 702344
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP009158|646242:702344|DBSCAN-SWA AATGAAAACAACTTCAGAGATTAGACAAGCCTTTTTGGAATTTTTCCAAAGCAAAGGGCATACGATTGTGCCAAGTAGCTCGCTTGTACCTGAAAATGATCCAACCTTGCTTTTCACGAATGCAGGAATGAACCAGTTTAAAGATGTGTTCTTAGGATTAGACAAGCGTAGTTATAACAGAGCAACCAGCTCTCAACGCTGTGTGCGTGCTGGCGGTAAGCATAATGACCTTGAGAATGTAGGTTATACCGCTCGTCACCATACCTTTTTTGAGATGTTAGGTAACTTTAGTTTTGGTGATTATTTTAAACCCGATGCGATTGCATTTGCGTGGGAATTTTTAACATCACCGCAGTGGTTAGCGTTACCAAAAGAGAAATTGTGGGTGACAGTCTATGAAACAGACGATGAAGCCTATGATATTTGGAATAGAGAGATTGGTGTGCCTGCTGAGCGTATTGTGCGTATTGGTGATAATAAAGGTGCGCCTTATGCGTCAGATAACTTCTGGCAAATGGGCGATACGGGTCCTTGTGGTCCTTGTACTGAGATCTTCTACGATCACGGTGACCATATTTGGGGAGGCCCACCAGGCTCAGCAGAAGAAGATGGCGACCGTTTCATTGAAGTATGGAACGTGGTCTTTATGCAGTTTAATCGTCAAGCAGATGGTACTTTAAAGAAATTACCTAAGCCGTCGGTAGATACGGGTATGGGTTTAGAGCGTATCAGTGCGGTGTTGCAACACGTTAATTCAAACTACGAAATCGACATTTTCCAAGCGTTAATCAAAGAGATTGCTTCTTTGTTAAATGTGACAGATTTAGACAATAAATCGTTACGCGTAATTGCAGATCATATTCGTTCTTGTGCGTATTTGATCGCTGATGGTGTGATGCCGTCAAATGAAGGTCGTGGTTATGTGTTGCGTCGTATTATTCGTCGTGCGGTGCGTCACGGAAACATTCTTGGTGCGAAATCAGCGTTCTTCTATCAATTAGTGCCAACCCTTGCAAAAGCAATGGGGCAGGCTGGCGAGATTTTGACGCAGAAACAAGCGCATATTCAGAAAGCGTTAAAAGCAGAAGAAGATCAGTTTGCGCGTACCCTTGAGCGTGGTTTGGCGTTATTAGAAGATGCGTTAGCCAAAGTGGAGAATAAGGTTTTATCAGGTGAAGTGGCATTTAAACTTTACGATACTTATGGTTTCCCACTGGATTTAACGGCAGATGTTTGCCGTGAACGTAGTATTACCATTGATGAAGCTGGCTTTGAGCGTGAAATGCAAGCTCAACGTGCAAGAGCACAGGCAAGCAGTAATTTTGGTACAGATTACAATTATGTGATTAAAGTTGATGGCTCAACGGAGTTCAAAGGCTATGAGGTCACAGAATGTGAAGCGACTGTCGTTGCGTTGTTTAGCAATGGTAAAGCGGTTGAAGCTATTCAATCGGGGGAAAATGCAGTCGTTGTCTTGGATCGTACCGCTTTCTATGGAGAGTCGGGCGGTCAGGTTGGTGATAGCGGTGTGATTGCTTCAGATATTTGCAACTTTGAAGTCAATGATACGCAAAAATATGGTCAAGTCTTTGGGCATATTGGTCAATTAGCTTCAGGCACTTTATCAGTTGGTGATAAGGTGAAAGCAGAAGTGAATACGACACGTCGTCACGCTATTACCTTAAACCATAGTGCGACCCACTTATTACATTCGGCTCTTCGTCAAGTGTTAGGTGATCACGTTGCACAAAAAGGTTCTCTTGTGTCAGAAAATTCACTTCGTTTTGACTTTTCTCAAGGTGAAGCGATTTCAAAAGCTGACTTAGAAGAGATTGAGCGTATTATTAATACGAAAATTCGTGAAAACATTGTAGTTACAACTGAAGTAATGGATCTTGAATCAGCGAAGCAAAAAGGTGCGATGGCACTTTTCGGTGAGAAATATGGAGATAGAGTTCGCGTTGTAGATATAACAGCAGCGTTTTCTGTAGAACTTTGTGGTGGTACTCACGTTAAACAAACAGGTGAGATTGGCTTATTCAAAGTGGTATCTGAAGGTGCGGTTGCCGCAGGTGTTCGCCGTATTGAAGCGGTGACAGGCGAAAATGCAATCGGCTTATTACATCAGCAACAACAAATTCTTAACCAAAGTGCTGAGTTATTAAAAGCAGATACGGCAAGCCTTGTTGAGAAAATCCAGCAGCTACAAGAGAAAAGCAAGAAAGTAGAAAAAGAGCTACAACAGCTCAAAGATAAACTTGCAGCTCAAGCTGGTGGAGAATTAGCAAAACAAGCTCAACAAATCAACGGGGTTAATGTGGTTGTTCAACGTTTAGAAAACGTTGATGCAAAAGCATTAAGAACGATGGTCGATGACTTGAAAAATCAACTAGGTTCAGCGGTGATTGTCTTTGCAACACAAACTGATGAAAAAGTTAATTTGATCGTAGGTGTAACAAAAGATCTTACAGACAAAGTAAATGCAGGCGAACTTGTTGGGTTAATGGCTCAAGAAGTTGGCGGTAAAGGCGGTGGTAGAGCTGATATGGCAATGGCAGGCGGTAGCCAACCAGAAAATATAACCCAAGCCCTCAATGTTGCGACGAATTGGATTCAAGCAAAACTCTAATTATAAGGGGCAAGTTAGAATGACTTTGGCTTGCCCTGATTAAATCTAAAAGGAGAGATAGTTATGCTTATTCTAACCCGTAAGATTGGCGAAAGTTTATTGATCGGTGATGATGTAGAAATTACTGTCCTAAGTATTCGTGGTAGTCAAGTTAAATTAGGGGTGAAAGCACCTAAGGAAATTTCGGTTCACCGTGAAGAAATTTATCAAAGAATCAAAGTGTTAGCAGATGAAAATCCCTCGGAATAAGGTAGATTGATATTTACTGAGGTTTTTATCTAACGCAATGTGAATTTGAGTCTGGAACCAAATGTCACAAACAGATAAATTGAAACGCAGTGTTCAATTTTTTGAAAAAATTTGTGCAAAACAGACCGCTTACTTAAGGTAGGCGGTTTACTTTATCTAAATATATTAAGGATTTTTCTATGAAAGTGATTATTCCTGTCGCAGGTCTTGGTACTCGTATGCTTCCTGCAACCAAAGCAATCCCAAAAGAAATGCTAACCATTGCAGACAAACCGTTGATTCAATATATTGTAAACGAGTGTGTGGCTGCAGGAGTAAGAGAAATTGTGCTTGTCACTCATTCATCTAAAAACGCTATCGAAAACCACTTTGATACATCGTTTGAACTCGAAACAATGTTAGAAAAACGAGTGAAACGTCAGCTATTAGATGAAGTGCGTTCGATTGTACCTAAAGATGTGACCTTGATGCACGTTCGTCAGGGGCAAGCGAAAGGATTAGGGCACGCGGTATTATGTGGTCGAGCTGTGGTAGGAAATGAGCCTTTTGCAGTGGTATTGCCTGATGTGTTATTGGCAGATTTTACTGCAGATCAAAAAACAGAAAACTTAGCAGCAATGATTCAACGTTTCAAAGAAACAGGCAAAAGCCAAATTATGGTTGCACCTGTGGCGAAAGAAAATGTGAGTAACTATGGTATTGTAGATTGCCAAGGTGCAGAATTACAACCTGCAGGTACAGCGAAGATTGCTAATATCATTGAAAAACCAAGTATTGAAGAAGCTCCGTCTAATTTTGCCGTTGTGGGACGTTATGTCTTCTCTGCAGAAATTTGGGATTTACTTGCCAAAACACCGGTTGGTGTGGGTGATGAAATTCAATTAACCGATGCGATTGATATGTTGATTGAACAACAAGAGGTGGATGCCTTTCATATGACAGGTAAAACCTTCGACTGTGGTGACAAATTAGGCTATATGGAAGCCTTTGTAGAATACAGTTTGAACCACGATAAATTCGGCGGTAAATTTAAAGATTATCTGAAAAAATTATCGAAGTCGCTGTAATTAAATTTATATAAAATGTAGGGACACACTGCGTGTGTCCGTTCAAAATTTTTATTAATAATGGTTGGTGGACACACGCAGTGTGTCCCTACGCTAACAAGGAGCAAATGTGATCGTCAAAAAAATAGCACAAGCGGTAGGTTTTGGGCTTTTTTGTGCTGGCTTGATTCTTTATGTTGCCCCTTGCTTAAACAAAAGCACTCAAACAGAGATTATCAGCTTTCACGATGCGGTAAGAATTGCGTCGCCTGCGGTAGTCAATGTTTATAATCAGGCCTTTGATTCTACCCATTCTGATACAGGGGAGTTACAAGTAAACAATTTGGGATCGGGCGTGATTATGACCTCAACGGGTTATATTTTAACGAATAAACACGTTATCCAAAATGCAGATCAAATTTTAGTGGCACTGCAATCGGGGACGATTTCGAGTGCTACATTGGTAGGATCTGACACCTTAACTGATCTTGCTGTTCTCAAAATTCAAGCAGAAAACTTGCCTACAATTCCTCAAAATTCAAAACGCGTGGCTAAAATCGGTGATGTGGTTTTAGCAATTGGCAATCCGTTAAATTTAGGGCAGAGTATTACGCAAGGCATTATTAGTGCAACGGGGCGCAATGCATTATCTGAAATGGGTCGGCAAAACTTTATTCAAACTGACGTTTCTATTAATAAGGGTAATTCAGGCGGAGCTTTGGTAAATACGGCTGGTGAGTTGATTGGCATTAACACTTTAAGTTTAGGAAAAAACAGTGATGAATTGGCAGAAGGATTGAATTTTGCGATTCCGATTTCCTTAGCAAATAAGGTGATGGAAAAAATTATTCGTGACGGGCGTGTTATTCGAGGCTATTTTGGTGTTAATAGCTCGTTGTACTATACGGCTAAACAGCTAGGAGTCGGTGAAAAAGGGATCTTAATTACTACAGTAGCTGAAGGTGGACCTGCGAATAAAGCAGGGATTTTAGCTGGTGATTTGATTTTACGTTTAAATGATACAGAAGCCCAAACTCCAGCTCAAATGATGGAATTGATTGCAGAAATGAAACCAA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61 | Mannheimia_phage(44.83%) | transposase,tRNA,terminase,tail,integrase | attL 661811:661848|attR 709934:709971 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
752254 : 766068
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP009158|752254:766068|DBSCAN-SWA AATGACCACTGAAATCAATTACGAAGGCGTTGAACAAATGCCGATTAAGCGTTTTACGGAAGACGCTTATCTCAATTACTCAATGTATGTCATTATGGATCGTGCTTTGCCTTTTATTGGCGACGGTCTAAAACCTGTGCAACGTCGTATTATTTATGCGATGTCTGAGCTTGGCTTAAATGCTGCAGCAAAATATAAAAAATCTGCACGTACTGTCGGTGATGTGCTAGGTAAATTTCACCCGCACGGTGATAGTGCCTGTTATGAAGCAATGGTTTTGATGGCACAGCCGTTCTCTTATCGCTATCCATTAATTGATGGACAAGGAAACTGGGGAGCGCCAGACGATCCTAAATCCTTTGCTGCAATGCGTTATACCGAATCAAAACTCTCCAAAATGGCTGAAATTCTATTGGGGGAGTTAGGACAGGGTACGGTTGATTATCAACCAAACTTTGATGGTTCATTAGAAGAGCCTAAATATCTTCCAGCTCGTTTACCTCATATTTTGTTAAATGGCACAACAGGTATTGCTGTTGGTATGGCGACAGATATTCCGCCTCATAATATTAACGAGTTAGCGGCAGCTTCAGTAAAATTATTGGATAATCCAACCGCTAGTCTTAGCGATATTTTGGACGTGGTTCAAGGCCCTGATTACCCAACAGAAGCTGAAATTATTACACCGCGCTCAGAAATTGCAAAGATTTATGAGCAAGGTAGAGGCTCTATTAAAATGCGAGCGGTATGGAAACGAGAAGAGAATAATATTGTTATCAATGCCTTACCTCACCAAGCCTCGCCATCTAAAGTGATTGAACAGATCGCCACGCAAATGCGAAATAAAAAATTGCCGATGGTTGATGATATTCGAGATGAGTCTGATCACGAAAACCCTATCCGCATTGTGCTAGAACCACGTTCTAACCGTATTGATTATGATGGCTTAATGGATCATCTGTTTGCTACCACTGATCTTGAAAAAAGCTACCGTATCAATATGAATATGATCGGGCTTGATGGTAAACCTGCGGTGAAAAATTTGCTGACCATTCTTACTGAGTGGTTAGCATTCCGTAGAACAACGGTCACACGTCGTTTAAATTTCCGCTTGTATAAAATCATCAGCCGTTTACATATTTTAGAGGGCTTGATGATTGCCTTCCTTAATATTGATGAAGTGATTGAGATTATTCGCAATGAAGATAATCCCAAAGATGAATTAATTGCACGTTTTCAATTAAGCGATGAGCAAGCCGAAGCTATTCTAAACTTACGGTTACGCCATTTGGCAAAACTGGAAGAACACGAGTTAAAAGCAGAACAGCAGAAACTTGAAGAAGAACGGGAACATTTGCAAGGGATCTTAGGTTCAGAGCGTCGTTTAAATAACTTGATTAAGAAAGAGATTGAAGCCGATGCCAAAGCCTTTGCCAGCCCTCGCCGCTCACCACTTGTGGAGCGTGCTGAAGCGAAAGCGATTTCAGAAAGCGATTTAACGCCAACAGAGCCTGTGACGGTAATTCTTTCCGAAAAAGGCTGGGTACGTTGTGCTAAAGGACACGATATTGATGTGCAGAACCTAAGTTACAAAGCTGGCGATAGCTACCTTGCCCACGCTTATGGTAAGAGCAATCAGCCAGTTGTCTTTATTGACAGCACAGGGCGTAGCTATGCTCTTGATCCTCTTAGCCTACCTTCTGCTCGTTCGCAAGGTGAACCTATTACGGGCAAAATCAGTTTACCTGATGGGGCAACGGTGCAATATGTACTAATGGCGGAGGAAAGTCGTAAGGTACTAATGGCTTCGGATTCGGGCTACGGGTTTATTTGCCAATTTGAAGATCTGGTTTCTCGCAATAAGGCAGGGAAAGCGGTTATTTCCTTAACGGAAAATGCAAAAGTGCTACCACCGCAGTTGTTAAAAGAGGGTGAAGAAAATCTGTTAGTGGCAATGAGCAATACAGGGCGAGTGTTAGTCTTCCCAGTTTCTGAATTGCCTGAGTTATCTAAAGGCAAGGGAAATAAGATCATCAACATTTCTGCACAAGCTGCGAAAGAACGAGCAGAGCTACTTTCTCGATTACTTATAATCAACCCAACAAGTTCGCTGGTTTTCGTTTCAGGTAAACGTAAAATTACGCTAAAACCAACAGATATTGAACATTATCGTGGCGAACGAGCAAGAAAAGGCACGCAACTTCGAGGGCTAAGTGGTAATGTTGAAGTTGAAATTGTAGATTAATCTCAAGGGGAGTTGCATTCCCCTTGATACATTCTATCGAACCTCTACCACCTGACTTACCACCTTTCCCTGTGCTAAACGAGTGACTATCGTTTCACCGATTGAAATATCCTGAGTGGATATCAGTGCTTTGCCCTGTTGGTTTTGTGTCACAGAATAACCCCTTGCCAAAATAGAAAGTGGGCTTAAGCCGTCTAACTGAGTGCAAAGAGTTTGAAATTGCAGGCGACGTTGGCTGATATTCTTCTCAATGGCATAGCTTAAACGTTGCTCTAGCTTGTGCAAATGTTGTATTTGGGCTGAAATACGGTAAGGAAGCGGATTTCGTTCCATTCGTTGTAGTGTATTTTTCCAACGCTGTTGTTTACGCAACAATAGCTGTTCCATCTGCTGTTTCAGCTGTTTTTCTAAGTGCGAAAGCTGTTGGAGGCGTTGCTGTAATTGACGCTGTGGGTGTTGCGCCTGTAAACGAAGTTGCAAGCGGTCAAATCGAGCTAATTTTTCACTCCATAAGCGATCAAAGGCTAAATTCACTTTATCTGCGTGATGTTGTAACTGTCGTAACAACTCTTGCTGATCACGGCTGACCAACTCTGCCGCAGCCGACGGCGTTGGCGCACGCAAATCTGCCACAAAATCTGCAATAGTCACATCGGTTTCGTGTCCAACGGCACTGATAACTGGGATCTGAGAGTGATAAATCGCCCAAGCGACCGCTTCTTCATTAAAGCACCATAAATCTTCCAACGAGCCACCGCCACGGCCGACAATCAGCACATCACACTCTTGACGGCGGTTTGCCAGCTCGATCATCTTCACAATATCAGCTGTCGCTTCTTTGCCTTGCACTAAGGTCGGATAAATCACCACTTCAAGAGTTGGGTCACGGCGTTGTAAAATATGCAAAATATCTTGCAACGCTGCACCACTTGATGATGTCACAATGCCAACACGTTTGACGAACGTAGGAATAGGCTTTTTATGTTCTTGAGCAAATAACCCTAACCCAGCCAATTTCATTTTAAGCTGTTCAAATTGCTGTTGTAACAAGCCATCGCCAGCCGGCTGCATTGTTTCAATGATCACTTGATAGTCACCCCGTGGTTCATACAGGCTAACATTCGCTCTTACCAACACTTGCATTCCATTTTGCGGACGGAAATTCACTCGCATATTTTTCATACGAAACATTGCACAACGCACCTGTGCTTGTTCGTCTTTCAGGGTTAAATACCAATGCCCAGAAACAGGTTGCGAAAAGTTTGAAATCTCGCCGATAAGCCAAACACTGCCAAATTCGACTTCAAGCATCTGTTTAACGGAGTAATTGAGCTGACTGATGGTTAGGATATGGTTTTTCATAATAAAATTTAAAGGATTCAATATGTTATCCTCAAATAAATTATCCCCTTGTCAATATTGTAACTAAAACAAATAATGACAAGAGGATAACACAACAAATCTATTTGTTAATTTTATGGATAAACAGGTAGACGTTTACAAATATCCAAAACTTTCACTTTAGTCACTTCAATTACCGCAGCTTCGTTATCCTTACCGATGTTATCTAATACATCGCACATCCAACCTGCAAGTTCCCGTACTTCAGCCTCTTTAAAACCACGACGAGTTACAGATGGAGTACCAACACGAATACCAGAAGTAATGAATGGTTTTTGTGGATCGTTCGGTACTGCATTTTTATTAACAGTAATATTTGCTTTACCTAAAGCTATATCTGCCGCTTTACCCGTTAAACCGTGGCTCACTAAATCAACAAGGAATAAGTGGTTTTCTGTACCATTTGAAACAACGTTATAGCCACGTTGTTTAAATACTTCCACCATGGCTTTTGCATTTTTCACCACTTGTTGCTGATAAACCTTATACTCAGGCTCTAATGCTTCTTTAAAGCAAACTGCTTTTGCAGCAATAATGTGAACTAATGGGCCACCTTGTTCACGAGGGAATACCGCATTTTGTAGTTTTTTATAGATTTCTTCATCTTTCGCATTGGAAAGAATTAAACCACCACGAGGACCTGCAAGAGTTTTATGTGTTGTCGTTGTTACAACGTGTGCGTGAGGGAGTGGGCTTGGATAAACACCTGCTGCAATTAAACCTGCAACGTGAGCCATATCGACGAATAAATAAGCGCCGACTTCATCTGCAATTTCACGCATTTTCGCCCAATCAACAATTTGAGAATAAGCAGAGAAGCCACCTACAATCATTTTTGGTTTAACTTCGTGAGCCTGTTTACGTAGTGCATCATAGTCAATAACCCCTTCAGCAGTGATACCGTATTGTTCTGCGTGATACACTTTTCCTGAGAAACTAACTGAAGCACCGTGAGTTAAGTGTCCACCATGTGCAAGGCTCATACCTAAAATAGTATCACCTGGCATCAATAATGCACCATAAACTGCCGCATTTGCCTGAGAGCCTGAATGCGGTTGTACGTTGGCATAATCTGCACCGAATAACTCTTTCGCACGTTCAATCGCTAACTGCTCTACAATATCTGCATATTCACAGCCGCCATAATAACGTTTACCAGGATAACCTTCTGCGTATTTGTTGGTAAATTGTGAACCCTGAGCTTCCATCACACGAGGACTTGCATAGTTTTCAGAAGCAATAAGTTCAATATGCTCTTCTTGACGACGATTTTCGCCTTGAATAGCTTGCCATAATTCTGGATCATAATCTGCGATATTCATATCACGTCTTAACATTGGTTTCTCCTATAAGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP009158|752254:766068|760976_762191_-|WP_080716934.1|DBSCAN-SWA MKKDLVYRQKYLETVRPFMGKRLIKVFTGQRRVGKSYLLFQIMQEIQTADENAHIIYINKEDLAFSHITTAESLNDFVQEQKKSGQKNYIFIDEIQEITDFEQALRSLLLDDELDLYCTGSNAHLLSRDIAGSLSGRAIEISVHSLSYFEFLEFMKLDDSDKSMSLFLKYGGLPYLKDLPLQDNIVFEYLRNIYSTIAIRDIVNRYALRNVQFLEQLTQFLASNIGNLFSAKKISDFLKSQKIATSSTQVQNYAEYLANAFLIHKVPRYDIEGKRIFEIGEKYYFEDLGLRNALIGYRVQDRGKLLENCIFNHLQIAGYDVKIGGLNSQEIDFVAEKNGERIYVQATLTINEEKTLEREFGNLLKIQDNYPKYVVTMDEFEGNTFEGVQCLSLREFLKEILGQM >NZ_CP009158|752254:766068|759366_760587_+|WP_038513975.1|DBSCAN-SWA MSKHLTEQRFIDFPIHDSVLAALDSKGFEFCTPIQAKTLPYTLIRQDIAGQAQTGTGKTLAFLVATFHHLLNHDIPTKHNQPRALILAPTRELAVQIASDASILTQYADLRLALAYGGDGYDKQLKEIERGVDILIGTTGRVIDYVKQGIIDLDKIQVVVLDEADRMFDLGFIKDIRYLMRKCPKPEERFTMLFSATLSHRVRELAFEDMHNAEYVEIEPLQRTGHRIKEELFYPSNEDKMALLLTLMEEEWPDRCIVFANTKHKCEEIWSYLSADGHRVGLLTGDIPQKKRLALLDSFTQGELDILVATDVAARGLHIPDVTHVFNYDLPDDREDYVHRIGRTGRAGESGVSISFACERYAVNLPAIEEYIGHAIPVSQYDSEVLLALPKPQKAKTRTLQGRKYK >NZ_CP009158|752254:766068|754531_755860_-|WP_038515156.1|DBSCAN-SWA MKNHILTISQLNYSVKQMLEVEFGSVWLIGEISNFSQPVSGHWYLTLKDEQAQVRCAMFRMKNMRVNFRPQNGMQVLVRANVSLYEPRGDYQVIIETMQPAGDGLLQQQFEQLKMKLAGLGLFAQEHKKPIPTFVKRVGIVTSSSGAALQDILHILQRRDPTLEVVIYPTLVQGKEATADIVKMIELANRRQECDVLIVGRGGGSLEDLWCFNEEAVAWAIYHSQIPVISAVGHETDVTIADFVADLRAPTPSAAAELVSRDQQELLRQLQHHADKVNLAFDRLWSEKLARFDRLQLRLQAQHPQRQLQQRLQQLSHLEKQLKQQMEQLLLRKQQRWKNTLQRMERNPLPYRISAQIQHLHKLEQRLSYAIEKNISQRRLQFQTLCTQLDGLSPLSILARGYSVTQNQQGKALISTQDISIGETIVTRLAQGKVVSQVVEVR >NZ_CP009158|752254:766068|752254_754498_+|WP_038513969.1|DBSCAN-SWA MTTEINYEGVEQMPIKRFTEDAYLNYSMYVIMDRALPFIGDGLKPVQRRIIYAMSELGLNAAAKYKKSARTVGDVLGKFHPHGDSACYEAMVLMAQPFSYRYPLIDGQGNWGAPDDPKSFAAMRYTESKLSKMAEILLGELGQGTVDYQPNFDGSLEEPKYLPARLPHILLNGTTGIAVGMATDIPPHNINELAAASVKLLDNPTASLSDILDVVQGPDYPTEAEIITPRSEIAKIYEQGRGSIKMRAVWKREENNIVINALPHQASPSKVIEQIATQMRNKKLPMVDDIRDESDHENPIRIVLEPRSNRIDYDGLMDHLFATTDLEKSYRINMNMIGLDGKPAVKNLLTILTEWLAFRRTTVTRRLNFRLYKIISRLHILEGLMIAFLNIDEVIEIIRNEDNPKDELIARFQLSDEQAEAILNLRLRHLAKLEEHELKAEQQKLEEEREHLQGILGSERRLNNLIKKEIEADAKAFASPRRSPLVERAEAKAISESDLTPTEPVTVILSEKGWVRCAKGHDIDVQNLSYKAGDSYLAHAYGKSNQPVVFIDSTGRSYALDPLSLPSARSQGEPITGKISLPDGATVQYVLMAEESRKVLMASDSGYGFICQFEDLVSRNKAGKAVISLTENAKVLPPQLLKEGEENLLVAMSNTGRVLVFPVSELPELSKGKGNKIINISAQAAKERAELLSRLLIINPTSSLVFVSGKRKITLKPTDIEHYRGERARKGTQLRGLSGNVEVEIVD >NZ_CP009158|752254:766068|757582_758593_-|WP_038513972.1|DBSCAN-SWA MSANTINLKNRHFLRLMDFTPNEIQYLLDLSAKLKADKKAGREVPTMQGKNIALIFEKSSTRTRCAFEVAAFDQGANVSYIGPSGSQIGHKESMKDTARVLGRMYDGIQYRGYGQVLVQTLADYSGVPVWNGLTDEFHPTQILADFLTMIEHSNKPLNQIKLAYLGDARNNMGNSFVEGAALMGVDLRLVAPKQFFPEQTLLDEVAEMATKTGAKITCTEDVAEGVKDVDFVYTDVWVSMGEPESAWESRINLMKPYQVNAELMKLTGNPNVKFLHCLPAFHDDQTLVGKEIAEKYGMNGLEVTDEVFESEASIVFDEAENRMHTIKAVMVATLAG >NZ_CP009158|752254:766068|758741_759020_+|WP_010786777.1|DBSCAN-SWA MIISFKHKGLKLFFETGSTAGIQANHASKLAFQLATLNQAKSALDMNAPSWNLHQLQGNLAGHWSIKVSGNWRLTFKVQNGHAEVVDYQDYH >NZ_CP009158|752254:766068|763239_766068_+|WP_038513981.1|DBSCAN-SWA MQHIDIRGARTHNLKNVNLVLPRDKFIVITGLSGSGKSSLAFDTLYAEGQRRYVESLSAYARQFLSLMEKPDVDHIEGLSPAISIEQKSTSHNPRSTVGTVTEIHDYLRLLFARVGEPRCPDHDVPLAAQTISQMVDRVLEEPEGKRLMLLSPVVKDRKGEHAKLLENLTANGYIRARIDGEICDLSDPPKLELQKKHTIEVVIDRFKVRSDIATRLAESFETALELSGSTAIIADMDDPNAEELVFSSSFACSHCGYSLTELEPRLFSFNNPAGACPTCDGLGVQQYFDERKVVQNPDMSLASGAIKGWDRRSFYYFGLLKSVAKHYDFDIEMPFNQLPKKIQNIILNGSKDEIEFVYVNDRGDSVKRVHTFEGVLNNMARRYKETESNAVREELAKYINNRTCTDCEGSRLRREARYVFLEKTNLPMVSEKSIGEALEFFEGLHLSGQKAQIAEKILKEIRERLSFLVNVGLNYLSLSRSAETLSGGEAQRIRLASQIGAGLVGVMYVLDEPSIGLHQRDNERLLNTLIHLRNLGNTVIVVEHDEDAIMAADHIVDIGPGAGVHGGQIIAQGTAQEIMQNEASITGKFLSGKEKIEIPKQRTPRDESKQLVLKGASGNNLKEVDLAIPVGLFTCITGVSGSGKSTLINDTLFPIAQNALNRAENSDVAPYKSIDGLAYFDKVIDINQSPIGRTPRSNPATYTGLFTPIRELFAGTQEARARGYTVGRFSFNVRGGRCEACQGDGVIKVEMHFLPDVYVPCDHCKGKRYNRETLEIRYKGKTIHQVLDMTVEEAREFFDAVPMIARKLQTLIDVGLSYIRLGQSSTTLSGGEAQRVKLAAELSKRDTGKTLYILDEPTTGLHFADIKQLLTVLHRLRDQGNTIVVIEHNLDVIKTADWIVDLGPEGGSGGGQIIAEGTPEEVAKDKKSHTARFLKEILKKG >NZ_CP009158|752254:766068|755973_757236_-|WP_010786776.1|DBSCAN-SWA MLRRDMNIADYDPELWQAIQGENRRQEEHIELIASENYASPRVMEAQGSQFTNKYAEGYPGKRYYGGCEYADIVEQLAIERAKELFGADYANVQPHSGSQANAAVYGALLMPGDTILGMSLAHGGHLTHGASVSFSGKVYHAEQYGITAEGVIDYDALRKQAHEVKPKMIVGGFSAYSQIVDWAKMREIADEVGAYLFVDMAHVAGLIAAGVYPSPLPHAHVVTTTTHKTLAGPRGGLILSNAKDEEIYKKLQNAVFPREQGGPLVHIIAAKAVCFKEALEPEYKVYQQQVVKNAKAMVEVFKQRGYNVVSNGTENHLFLVDLVSHGLTGKAADIALGKANITVNKNAVPNDPQKPFITSGIRVGTPSVTRRGFKEAEVRELAGWMCDVLDNIGKDNEAAVIEVTKVKVLDICKRLPVYP >NZ_CP009158|752254:766068|762395_762938_-|WP_021115958.1|DBSCAN-SWA MAGVNKVIIVGNLGNDPDMRTMPNGDAVATLSVATSESWNDKMTGERREVTEWHRIVFFRRQAEVAGQYLRKGSKVYVEGKLKTRKWQDQNGQDRYTTEIQGDVLQMLDSRSSGGDFGGNQGSGWNQAPAQTNYNQGGYSDNYAQNNNFNGGNATRPQPAQKPAAQAEPPMDNFDDDIPF >NZ_CP009158|752254:766068|759030_759303_+|WP_005712616.1|DBSCAN-SWA MKMYNPAHPGLILREYIEGYNVTEVAKRLGVTRVTLSRILNGKAAISPEMALRLSQLLKTSPELWLGLQSQYDLWQLEQRPSFNIQPLFA |
10 | Bacillus_virus(12.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1399825 : 1494952
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP009158|1399825:1494952|DBSCAN-SWA 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75 | uncultured_Caudovirales_phage(22.22%) | transposase,tRNA,terminase,protease,head,tail,portal,integrase | attL 1393293:1393308|attR 1466697:1466712 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1602133 : 1610504
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP009158|1602133:1610504|DBSCAN-SWA ATCAGGTTCTTCGCCCATTTCGATGGGCATTCACCGCTAACATCTGCACAATTTTAAAAATCTGGTCTGTCGTGCACCATTGCAAACGCTCAATACCAAACGACCGCTTGCAGATAGCGTGAACATAATGCCAAGACTTACCACTACTAGCGATAAAGGCTTCAATCTTTCTAATATAACTTTGACGCACCTCATCTGCATTACTGGCTGTCGGGCGTTTACCATATTGTTTCGATTTCACCTTAAACCCTTTGGCACGCATACCTTGCAACACAATCATCAACTCAGAATCCGTCATCATTGAGCAACTAGGCTTATCCACCAACTCCATTAAAAAAAGCTTATAGGCTTCATCACTCATCTTCAGCTCATTCTTCCCAATATGGATTTTCTGTATCATCTGTTTACGAGTTTGTGCGTACATTCTCTTTCTCCTGTTGCCACTGTTTCCAATCAGCAAAGCCGTGTAAATTCACACATTCATCTTCACCTCTCAACCGAACCAAGCGATCAATGTACTGGATATTCGCTGTCCGATTGTCGCTTTTTACCCTTTCCTGTGCTTCTTCACCCGAAAGCACCTGATTATTTTCTTCCGTTCTAACCACCGCAAACTGTGGCTTCACGCTTTCATACACTTTTTTCAGGTAATTATGATTGCTCAACGGCTCAAATTTGCCATTCTCACGACGATTACGTCGCACCTGCTCAACCGTATCTGCCAACGCTTTTGCCAAGACATTAGAGCAAGGGTAAAGCTCCAACAAACTTTGCAAAATCCGCAACGCACGCCCATTGCTTAAACTACTTTTTGCAGGTTTAAACAGCCCCAAATATGCCACCGCAGGACGACCACAACCAGCAGTCATTTCGGTAATCGTTTTAAGTAACTCTCGCCCAGCATCATCTTCAACCAACGCTTCCAGCGTTAAATCTGAGTGACAAATCGGGCAACGACACAATTTCATTTTGCACCTCCCTAAGAAAACAGAGATAAACGCTGTCGTTTATCTCTATTCTCTCAACCACCGCCCCAAGTGCATTTCACAATTTCATTAGGCTCTGCCGATAAAAATAGTGTGGGGCGGTGTGAGTGGTTTTTTTAGTGATTACATAGTTTCCTCCTTGTTTTTGAATTAGCTCAATCTAATTGAAACACCATTTCCTATAACAACACGTTTTTTGTCTTGCTCTGCATATTTCTGCAATAAGGAATAAGTCTTTGGCATTAGATCCTTTGTAATTTCTTGATTATAAGTTGCTTCCAATTCTGCCCAATTTTTGATAATTTCCGCCCAAACAGGACAGATAGACGTTAACTTACTCAAATGATTTCGCATTGTTGGTGCGACAGTTAGTAATTGCATACAACGCCTTAAATCTGCAGGATCTTGTGGATAACATGCTCGTTTTGGTACCACATCAAAGCCAACTACAAACGCCATTGTTTTACTACTTAACCCTGTTTCACCATCAGCCAGCCATTCAATTATTTGTTGTTGCATTTTGTTCATTTTATTTCCCCACCACTTAAACAAAACTCTCTAACTTCGTTTCCCCTGTAAACTCTAGCGCTGTAGCACTTGCAATTTTGAGTAAGGCATTAAGCTGACCTTCAAGGTATTCCGTTAAAATAGCGTGCTTATGTGCTTCTCTTGTACCGTTTAACTGACGAGCAATATCGGCATATTCGGTAAAACGCATCGAGCGGATTTTTAAATGTTCATCCAACTTAAAATTTACAATAAACGCCTCTTCGCTTTCATAACGCATCGCCATAGATTGCACACGAAAACCATTTTGTAACGCCCCTAACGCTTTTTCCTTGCCGTCTAACGTATCCAAATGGCGACAAGTCAAAAACTCTTCATTGTCGTTTGCCAACTTACGCAAAGTCGCTTCGTGTTGGAAATGTAGATATTTAAAAAGCGGTTCACCTTTTTCCAAAAATTTAGTCAATTTAGTGTTTAAACCCAACTTTTCTTCCGACACAACAATGCTTTTAAAACCTGCAAGTTCAAATAATTTAATCAAGTGGTTCAACGCTAAACGGCTATGCTTAGAGCGGTTATTTGTAAAAAGTAGCTCTTTTTCTGGACTGTAAAACACATTGACTAATTCACTCGAAAATGGCACAACTTGCAGTAAATGAGCTTCGGCAGTTTGTCGCCACTCTTTATCAGTATTCGGCACAATCTTCGGCATTCTTTCATCTCGAAGTGATTCTGATTTTTTCAGCTCATAAATTTTGGCTGAAAGTAACTCTTTAGTCACTTTTTTAAAGGTTGTCCGCAAAGTAAAGAACAACCCATTATCCAGTTCTAACACTTTCGTATTTGTCATCGGATTTTTGACTAACTCAATGGTGGTATAACTGTCCGCAGGCTCAAAAGTAGCCTCTTCTAACACTTCTTTCACATTGTCCACAGGGAACTTAATGCTATGAATGTTGCATTGTGTCATTTGAATAAAATCACTGTTTTTCATCTTAGTTTTCCTCTTGGTTAGTTGATAATTTAAGCTTCACCCGCTGAATCTGCCCAGCCACGTCCATCAAAACCACGCCAGCCAGTGCCAAATCGCCCATTTCGACTAATTCCGTCGCCCCTTGTAGCTTTTCAATCAGGTCATACAAGCGGTCTTTTATTTGCCATTTTTCGCTATCGGTCATCATTTACCCCTTATGGTTAAAACACATTATTAACGCCCCTTTCACCGTTCCCCCTCTTTGACAAAGAGGGGGTTAGGGGGAGATTTAAAGAGCGTTTAAATGGGTTTTAAGCCCCCTGCTCAAACGGCTTAATCACAAAATCTTCCACACCTTGCTTAATCGTCACGCCAGCAATCCCTTTGGCAACTTCAGGCTCAAGTAGTAGAGCTTCTTTGTTGATCTCGTTTTTGGTACGAATAAAGCGGTCAAAGCCCATACGCTGCATAAACTCAAGCACCGCATCTGCCCCACGAATTGCCACAGAAGGCGGTCGTTGGCGCCATTGCACTTCGCCTGTCACAAAGTTAGCGGTTTTACTCTTGCCGTTTTCCGTCAACTCATCACGGTGAGCTTCACAGTATTCCTGCACCGCTTGCTGTAACGGCTCAATCTCTGCCTGTAAACGTTTTAACTCAGGGGCGTAACGCTCACTGGTTTCGCCGATAATATCGTTCATCTCCGTTGTCAAACGGGTATGTTCACGGCTTAAATCCCCGATCTCTTTAATTGCACTTTGCACTTGCTCTTCCGTGGTAAAACGCAGTTTTGCTGGTTGTTTTACTCGGGTTTTCGTTGGTTGTTTTGCCATTTTCTTAACTCCTAAACTTTCGCTTCCCACCACACTCTAATCCCTTCGATCATCGTGTAGTAACCTTTCCATCTACCTAAATCTTCGCTATGCCCTTGGGCATACCAGTTTGCTTTTCTTGACTCAATTAACGCTCTTGCCACCCCCTCATTACCTGAAATATCCACTTTGATTCGTGGTTTAATCTTCGTAAAATCAATCATCAACACCGTAAACCCTAACGCATTGATATGCCCAATCGCCTTTTGTGTTTGGCGTAAATACTTCACCGCCATCTGATTTGCTCTATTAATTGTGCGCCCCATCTCACACCACCTTTTCTTTTCCCAACTTCACAACGACCACCCGTTGCCCTCTATTCCTGCGGTGATAGCTCGGCGTTGACCATTTCCGCACCGTTTTTGCTGTCACCCCTAACTTGATTGCTAACTCTTCGGCTGTACCGTCAGCCACATTCTCTTCGCCACGATACGCCGCATAGATCTGACGGTATCTCATTTGCCACCTAACCAATCAACATCTTGGTATACTCTTTAATCAACCGTTCATCAATTTGACATTCATTGATATGACTTAAACGCACCACACCACGAATCAACTTGTTCAAACGTCTCGCATTACCTTGACTATGTTTAAAAAATAACTCGTTATATTCCCCTGTGTTCAATGCTCTTTCTGTCAATAAATGCAAATCCTTTTCAGGTAACGCATTACCGAGAGAACTCGTTCGCCAAATGCGGTTATACACCTGAGCTAAATCGTTATGCCTGCCTTTTAAGTTAATTAACAAACGCTCAGTCCCAACCAATGCAACACCCACTTTAGTTGCATCGTGGATACGGCGAATAAACTCCAACGAGCGAGTAGGTAAATTCTCCGCCTCATCAATGATAATGACCCGTTCACTACCCTTTAACCTTGCCACAATCCCATCAAACAGCTGATCAAGCGTACCTCGGTTGTTTAAATTCAGTTTTTCACTGATTTTCTGCAACAGCACTTTTGCGGTGTAGCTCATATTGGTCTCAATTAAAATTACCCCTGTATTCTCTTTCGCATACTGCAACACCGCTTGCGTTTTACCCAAACCTGACGCACCATACACCGCACACATATCACCCTCAATGTGTGCCTCTTGAATAGTTGCCATAATCTGACGAGCAGTAAAAGTCGGCACAAACTCCGCACTCACCTTATACTCAAGCACCTTATCTTTTTGGCGAGCCAAAAACTGCTCCACCTTAATATTCAACTCTTCAACATTGCCGTCATACTCACCCCTCAAATACAAACTCACCGTAGCAATCGACACCCCTAATTTATTTGCAACCTCTTTTTGCCCAATTTTGGTGCGTTCCATATAATCTTTTAATAGTTGGTTTTTCATCGCTTATTTCCTATAATCAAAGTCTCTTTTTTCATCAACAGGCTTCGTTATGCTTAAAACTCCACCTGACCTTAATAAACTCACTAAATCAGAGCTACATTCACTCCTCGTTTTGCTAACTGGGATACAAGGTATTCAGTCTGAGCTTGTTCACTCTCTATTTCGCCAATTAGCAACCCTATCACCAGAGATTGCAGAGCAAGCCCTAAGTGATTTTTCAAATGTTGTTGATATGCAACTGGATCTACTTGAGGCGGAAGGTGTGGATTCGCAAACGCTTGATACACTTTCTCAAGTAGCGGACGATCTGTATT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP009158|1602133:1610504|1604620_1604806_-|WP_038514649.1|DBSCAN-SWA MMTDSEKWQIKDRLYDLIEKLQGATELVEMGDLALAGVVLMDVAGQIQRVKLKLSTNQEEN >NZ_CP009158|1602133:1610504|1602536_1603100_-|WP_038514647.1|DBSCAN-SWA MKLCRCPICHSDLTLEALVEDDAGRELLKTITEMTAGCGRPAVAYLGLFKPAKSSLSNGRALRILQSLLELYPCSNVLAKALADTVEQVRRNRRENGKFEPLSNHNYLKKVYESVKPQFAVVRTEENNQVLSGEEAQERVKSDNRTANIQYIDRLVRLRGEDECVNLHGFADWKQWQQEKENVRTNS >NZ_CP009158|1602133:1610504|1603268_1603646_-|WP_016057756.1|DBSCAN-SWA MNKMQQQIIEWLADGETGLSSKTMAFVVGFDVVPKRACYPQDPADLRRCMQLLTVAPTMRNHLSKLTSICPVWAEIIKNWAELEATYNQEITKDLMPKTYSLLQKYAEQDKKRVVIGNGVSIRLS >NZ_CP009158|1602133:1610504|1602133_1602556_-|WP_038514644.1|DBSCAN-SWA MYAQTRKQMIQKIHIGKNELKMSDEAYKLFLMELVDKPSCSMMTDSELMIVLQGMRAKGFKVKSKQYGKRPTASNADEVRQSYIRKIEAFIASSGKSWHYVHAICKRSFGIERLQWCTTDQIFKIVQMLAVNAHRNGRRT >NZ_CP009158|1602133:1610504|1605737_1605929_-|WP_038514659.1|DBSCAN-SWA MRYRQIYAAYRGEENVADGTAEELAIKLGVTAKTVRKWSTPSYHRRNRGQRVVVVKLGKEKVV >NZ_CP009158|1602133:1610504|1605442_1605736_-|WP_038514655.1|DBSCAN-SWA MGRTINRANQMAVKYLRQTQKAIGHINALGFTVLMIDFTKIKPRIKVDISGNEGVARALIESRKANWYAQGHSEDLGRWKGYYTMIEGIRVWWEAKV >NZ_CP009158|1602133:1610504|1609319_1609589_-|WP_005822937.1|DBSCAN-SWA MSTLTEPKKTAQDWHRADIIAALHKAGWSLRQLSLQHGYSQASTLKNALDRPWRKGEQIIADAIGVPPEEIWAGRFAQRSLKKFAERTL >NZ_CP009158|1602133:1610504|1603662_1604619_-|WP_016528532.1|DBSCAN-SWA MKNSDFIQMTQCNIHSIKFPVDNVKEVLEEATFEPADSYTTIELVKNPMTNTKVLELDNGLFFTLRTTFKKVTKELLSAKIYELKKSESLRDERMPKIVPNTDKEWRQTAEAHLLQVVPFSSELVNVFYSPEKELLFTNNRSKHSRLALNHLIKLFELAGFKSIVVSEEKLGLNTKLTKFLEKGEPLFKYLHFQHEATLRKLANDNEEFLTCRHLDTLDGKEKALGALQNGFRVQSMAMRYESEEAFIVNFKLDEHLKIRSMRFTEYADIARQLNGTREAHKHAILTEYLEGQLNALLKIASATALEFTGETKLESFV >NZ_CP009158|1602133:1610504|1604909_1605431_-|WP_038514651.1|DBSCAN-SWA MAKQPTKTRVKQPAKLRFTTEEQVQSAIKEIGDLSREHTRLTTEMNDIIGETSERYAPELKRLQAEIEPLQQAVQEYCEAHRDELTENGKSKTANFVTGEVQWRQRPPSVAIRGADAVLEFMQRMGFDRFIRTKNEINKEALLLEPEVAKGIAGVTIKQGVEDFVIKPFEQGA >NZ_CP009158|1602133:1610504|1607333_1609310_-|WP_038514664.1|integrase,transposase|DBSCAN-SWA MSENNLKTHYSAKELLLLSLTCLPNSVQGIIYQAKKQLWETRKRVGQGGGNEYELSSMPEAVQTEIRSRFAVAVVESKPKKLPAVKADVDLANLTTKQREIADARIGMIQYVLDLEQSMSRIKAVTYVCELAKSGRLPPHLAVLVETANAKKSKKRTVSVRTLNGWVVDYCKATSVEQRLKLFAPLVRQEVKAEEIWWLSWLLGIYRQKNALSVQESYRYFEAEWVERYADNPMMLEAMPNISKVRRAMAKLPIHILEKGRLSGSKYKQLLPYVMRDWSPFVANDIWIGDGHSLKLKVAHPVHGRPFTPELTMIVDGASRKIVGWSLSLSENAFAVLDALRHGIATHGVPAIYYSDNGGGEKNKILDAEVTGILPRFSIHHATGIAGNPQGRGIIERLNKTVGLRIAERFETYYGKNADPEATRKMLARQLAYANAKNGKELTALQKKARRELPSWEELKAVIQEVIDWYNNEHVHSEIHCTPAVKYKRVTDTEKVVWLSDVELRDIQRPEFIRTTNRGLIEWNNHKYFSLNLLDYQGEEVVIGVDIHDPMWVQVRTKDGRFICNAEFEGHKQDAFPQSFVEQKREERAKGRLKRKEQQVAEIMAERNPVITIEHQQSELITTSYQPKREKVSVRPIFTSVVEREEWEKKQALIEAVG >NZ_CP009158|1602133:1610504|1609784_1610504_+|WP_052157583.1|DBSCAN-SWA MTEKFKNKSMIGNRIREQREKLGLSRNEMADRLDVSLSALQNWEMNEREPQASMIIKIAEFLGVAPNYLLTGEQSQPQEAKSIVARAFEALEKERAEQDEVEMLSSFESIEVSAGFGSFNVGVTEPDGQVPYDSNLLRNLGVKPKHCGVFWANGSSMLPTIHNGDQLLVDFSKKEVKNNKVYLVQNGDSVWVKRVKIEWDGVELISDNKEEYRPIRISADEAQNLQIIGQVVHIGHNLI >NZ_CP009158|1602133:1610504|1605936_1606818_-|WP_016057750.1|DBSCAN-SWA MKNQLLKDYMERTKIGQKEVANKLGVSIATVSLYLRGEYDGNVEELNIKVEQFLARQKDKVLEYKVSAEFVPTFTARQIMATIQEAHIEGDMCAVYGASGLGKTQAVLQYAKENTGVILIETNMSYTAKVLLQKISEKLNLNNRGTLDQLFDGIVARLKGSERVIIIDEAENLPTRSLEFIRRIHDATKVGVALVGTERLLINLKGRHNDLAQVYNRIWRTSSLGNALPEKDLHLLTERALNTGEYNELFFKHSQGNARRLNKLIRGVVRLSHINECQIDERLIKEYTKMLIG >NZ_CP009158|1602133:1610504|1606901_1607324_-|WP_016057749.1|DBSCAN-SWA MKKSELLKQFQREEQLNVERKKVREARRAELNAPLNNRATCLVEFNGVAFELFLEVRKLAPLKANTDRPLLEKVYQAFANPHLPPQVDPVAYQQHLKNHLGLALQSLVIGLLIGEIESEQAQTEYLVSQLAKRGVNVALI |
13 | Haemophilus_phage(100.0%) | transposase,integrase | attL 1596588:1596601|attR 1610360:1610373 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1876184 : 1940125
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP009158|1876184:1940125|DBSCAN-SWA ACTAAATGCACAATGCAAAGCTGAATTTTCGTTTTAGATAACCAAGATGGTCGGTCAGTTCACCATTTAACGCAGCCTCGACGGTGATTTTCTTGAGCATCCGTGAAAATTGATTGAGGTCTTCTGGTGTTTTTAGGTTTTTGGCAAATTCCGCTTCCAAGGCGTGAAGTTGTTTTTCGTTCATAATAAAATACCTGTGTCTGAATGTATTATCTCAGAAACAGGTATTTACACAAATTGTGGGAGAGGCTCTCTTGGGGAGCGTGAATCATTGGAAGATCAAACAATGAATATAAAATAATCAAAGCGGAAACAACATCGGCACCAAAAATACTGCTAACAGCATTACCAAAAGCGTAAACGGTAATCCTACTTTCACAAAATCCATAAAACTATAGCCACTTGGTGCAAGTACCATCGTATTCACAGGAGATGAAACGGGGGTAATAAAAGAGGCTGAGGCTGAAATAGCGACAATCATTGCAAATGGTACTGGCGAAAAATTTAGCTGTTGTGCGATAGCAATGGCAATCGGCATTACTAAAATTGCAGTGGCTGTATTTGAGATAAAGGCATTGATGATGGCGGTAAAAATAAATAACACCATCAACACAAAATGCACCCCTAAGCCTTGCATAATCTCAGTGAGCATTTGAACAATCAGATCGATCCCGCCTGTTTTTTGTAATGCAATGGAAAATGGCATCATACCGACAATTAAAACAATACTCGGCCAATGGATTGATTCGTAAGCACTTTTCATATCAACACAACGGAATTTGCCCAACATCAAACAGGCAATCAAAGCCGCAATCACATTCGGCACTAACCCTGTAATCATCAACACCACCATTGTGACAATCGAAAAAATTGCGTGAGGTGCTTGGCTAATCGCTGGTGCTGCGTGTTTGCTCTCTTCGGGAGCTTTGAGTAGGAAGAAGTCACGGTTATTGTGATCGAGTTTGAGCAAATTATTCCATACCCCCATAATCAGCAAGGTATCACCAAATTCTAACGGGGTTGAAATCAGATTATCTTCAATCAATGTATCCCCACGTTTTAACCCGACGACACTTAAGCCATAGGTAGAACGCAATTTAAGTTCACTAATACTTTTTCCGATACTTCCTGCTTCAGGCATAATCGAAAATTCCGCCATTCCAACAGATTTTGCGTGTTCTGAGAAATAGTCCCCTTTCAACTCAATTATGCGTAAACCAAAGTCCTCACACCGTTGCAAAAAGCGGTCTAAATCAATATTAATATCCATCAACAGAATATCTTTTCCTTGCAAAGTTTCCGTGCCATAGGCGGCAATAGAAAGTGTTCTTAAACGTTTAACACGTTGAATAGCCACGATATTTAGCCCATACTCACGGCGGAGATTTAATTCATTGATCGTTTTTCCAATCAATGATGAGCCAGCATCGATCACTACCATTTTCGCTCGCCCAGTTAAATTATATTCCGCAATAAGCTGTTGCATTGATGAACCATTTTTATTTTCAGCACGGACGGTTTCGCCATTATCTAACCAACGGCGAGCAAAAAGCATATAAACAATCCCTAGCACCAATACCGAAACGCCAATCGGCGTAAAACTGAAGAAACCAAAACCTTGATGTCCTGTTTTAACTAATTCAGAGTTAGCTACAAGGTTGGGCGGTGTCGCAATTAAGGTCATCATACCGCTAATAAGCCCAGCAAAACTCAACGGCATCATTAAGCGTTTCGGAGAAATCCCCATACCCGAACAAATTGCCAACACCACAGGAATAAAAATGGCCACAATCCCCGTTGAACTCATAAAAGAGCCAAGCCCGGCAATAGATAACATCAACAACACTAAAACCTTAACTTCGCTTTCCCCTGCAACACGCATTAGCCACTCACTCACCTGATAGGCAATCCCTGTTCTTACCAGTCCCTCACCCACAATAAAGAGCAAAGCAATCAAAATCACATTCGGATCACTTAATCCAGCAAACACCTCATTGACCGAAAGAATGCCACTTAGACTAAAAAAGGCAATAACGAGTAAGGCAACAATATCCATTCGTAATTTATTGCGAATGAACTGCCAAATTGCAAATGCCAATAAGGCAAGCACCCAAAACAGTGGCGATAAGAGAAAATCAGGGAGGGAATAAAGTATCGGTTGCATAAGCATTATCAAGGAAGTTGAACAATAGTTTGATTATACCGATTTTCAGAAAATTAACAGGGAGTTTTCTCAAATTCCGCTAAAAAATTTGGCATATCTCTATTAGGTGCTCTCGCTAGAATTTAATTGGTTATATTGAAGTGTTCACAAGAGCCCTTTGGGCTTTTACCAACAAAATTATTAACTTTTTCTTAATAGCATATGAAAATACATTATGTCGCAAATAATATCAGGGATATTTATTTCTAAAAGCATAAGAATGTTAATTTTTTTATAAAAATGTTAAGTAACCGAAATTTTTGCAGGGTTTACAGGTTGGCAATTTTGGTCAATCTGCGTATAATTCGGAAGATTTTGATTGCGTAACTTTAGATTAGTTTACACAAAGAAATCGTTTACTTTTTTATTAGGTTTTAGTTAAAAATGTCTGCGGTTCTTCGACAAACGAAACAACTTTATCAAAAAGCACTCGGTATCGAGTTAATTCTGCTGTTCTGCATAGCAGGAGCAGTGGGGATTGGGTTGGGCTTAAATCGCTTTATTTCGTTATTATTAGGGGAAATTGCGGCGTTGCTTCCGCATTGTGTGTTTGTGTATTGGGTGTTTTTTCGTCAGTCGGTAATAAATCCCCAAAATATGACCGCTTTTTATCGTGGGGAAGGGCTGAAATGGCTCACGACGATTGTTGTGATTGTAGTGGCATTTAAAAGTTATGGTGCTATGCACTATGTTTCGTTTTTTTGTGGGTTCTTTTTTATTATTCTTTGTAATAGTCTTTTGCCTATTGCATTGAAATGGCATTCAAAATAAATTTCTTTTAATTTCAAAGGGATAAGCTATGGCTGGTCAAACAACGGCTGACTATATTGGTCACCACTTATCGTTCTTAAAAACAGGGGACGGTTTTTGGAATGTGCATTTAGATACTCTGTTTTTCTCATTAGTAGCAGGTGCAACTTTCCTCTTTTTCTTCTCTCGTGTGGCGAAGAATGCAACAGATGGCGTACCAGGTAAATTTCAATGTTTTGTTGAAATGATTGTCGAGTGGGTTGATGGTTTGGTTAAAGATAACTTCCACGGTAGTCGTGAGGTTGTTGCTCCTTTAGCTTTAACTGTGTTCTGCTGGGTGTTCGTAATGAATGCTATCGACTTAATTCCTGTGGATTATCCACCACAATTTGCTGCATTATTAGGGATTGACTATTTGCGTGCTGTTCCAACAGCAGACATTAGTGCAACCTTAGGTATGGCGATCTGTGTATTCTGTTTAATTATTTTTTACACCATTAAATCGAAAGGTTTTTCTGGTTTTGTTAAAGAATATACGCTTCACCCATTTAACCACTGGGCATTTATTCCTGTAAACTTTGTACTTGAGATCGTAACGTTATTGGCGAAACCGATTTCTCTTGCATTCCGTTTATTCGGTAATATGTATGCAGGTGAGTTAATTTTTATCCTGATTGCAGTGATGTATATGGCGGATAACTTCTTGCTTCAAGCATTAGGTTTGCCATTACACTTAGCTTGGGCGATTTTCCATATTTTGGTTATTACGTTACAAGCCTTTATCTTTATGATGCTAACGATTGTTTACTTGAGTATTGCTTATAATAAAGCGGATCACTAAACAAACTGGATTGGTGAGCGGTTACTTTTATGCAAAAAATTGCAATGATTAGACCGCTTATGAAACCCGATCATATTTATTGAAACTTTTTTATTAACCCTAGCCATAAGGCTAATTTCCTTACTTTTATGGAGAACATTATGGAAACTGTAATTACAGCAACTATTATTGGCGCATCAATCCTACTTGCTTTCGCAGCATTAGGTACTGCAATTGGCTTCGCTATCTTAGGTGGTAAATTCTTAGAGTCTTCAGCTCGTCAACCAGAATTAGCAAGCAGCTTACAAACTAAAATGTTTATCGTTGCAGGTCTTTTAGATGCGATTGCAATGATTGCAGTAGGTATTTCTTTACTTTTCATCTTCGCAAACCCGTTCATTGATTTATTGAAATAAGTCGGATTTGTTTTTAACCGTAGTTACTCAAGAGTAACTTAGCCGACTTAAGGAGGGCGTTGTGAACTTAAATGCAACACTAATAGGCCAACTGATTGCATTCGCACTATTTGTGTGGTTCTGTATGAAGTTTGTATGGCCACCGCTTATTAAAGCGATTGAAACGCGTCAAGCAAATATTGCAGACGCTCTTGCAAGTGCTGAGAAAGCGAAGCAAGAACAAGCTGATACTAAAGTTTTAGTTGAGCAAGAACTCGCTAAAGCTCGTGAAGAAGCGCAACATATCATTGATTTAGCAACAAAACGTCGCAATGAAATTTTAGAATCTGTTCAAGCAGAAGCTGAAGCAGAGAAAGCGAAAATTATTGAGCAAGGTTACGCAGAAGTGGAAAACGAGCGTCGTCGTGTTCAAGAAGAACTTCGTCAAAAAGTGGCTGCATTGGCGGTTGCTGGTGCAGAGAAAATTGTGGGTCGTTCTGTTGATGCAGCGGCAAACAATGACATCATTGATAAGCTAGTTGCAGAATTATAATTAAGGGGGGCAGATGTCACAATTAACAACAGTAGCTCGCCCCTATGCTAAAGCAGCTTTTGATTTTGCTTTAGAACAAGGTCAGTTAGATAAATGGCAGGAAATGTTACAGTTTTCTGCATTGGTTGCTGAAAATGAAGATGTGCAACATTTTATTCATTCATCTTCTGCAGCCACTCAAGTTGTCGATACCTTTATCGCAATTTGCGGTGATCAACTCGATCAATATGGGCAAAATTTCATTCGAGTCATGGCTGAGAATAAGCGTCTTTCGGCGTT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57 | Shigella_phage(17.65%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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