Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_HG917868 | Clostridium bornimense strain M2/40 chromosome M2/40_rep1 | 4 crisprs | cas14j,WYL,cas6,cas8b2,cas7,cas5,cas3,cas4,cas1,cas2,csa3,DinG,DEDDh | 0 | 3 | 6 | 0 |
NZ_HG917869 | Clostridium bornimense strain M2/40 chromosome M2/40_rep2 | 1 crisprs | DEDDh,WYL,csa3 | 0 | 2 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_HG917868_1 | 217843-223120 | TypeV |
I-A
Consensus repeat of NZ_HG917868_1
|
80 spacers
spacers of NZ_HG917868_1
>1.1|217872|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTAAAGAAAATAAATTTATAAGTCGTAAGATAAGA >1.2|217937|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATATTAGTTCAAAATGCGTAGATATTTATTTTTATT >1.3|218002|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGTTTAGGTGCTAATGAGATTAGAAGAAGTTATACAA >1.4|218068|38|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTATTTACCTTTTAGGCTTGTATATGATTATTCTATG >1.5|218135|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAGATAAATGAGATTTCCCTGCTCCAGGATTACCT >1.6|218200|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAGATAAATATAAAGATGATGTACCAGAAGAGATT >1.7|218265|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTGTATACAAATACAATATACAAACTATACAAACA >1.8|218330|38|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTACTGTGTTTCTATCATTCTTTGTAAAATTAATCGC >1.9|218397|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAAATTGGAGGGTATGAATATGAGATCAATATTAC >1.10|218462|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTAATTTGAAACCACACTATTCTATTGAAACTTTAA >1.11|218528|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTAAGTATGCCTTGTTGTTCATAATTAATTACTGC >1.12|218593|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAGGATATACAATCTCAAATAGATAATAATGCTACGG >1.13|218659|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTAGTAGCATTGTTACTATAGTTCTTATTGTCTTT >1.14|218724|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTGGCATCAATATATCCTGTTTTTATTGTATCTTTA >1.15|218789|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACAATCTTTTTTATATATTCCGTAATATATTCCATT >1.16|218855|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGGGAAATGCTTATGGAACTTTGGTATGTTTAGGT >1.17|218920|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTATAGTAAAACCATATTGATATTCTCCATAATATC >1.18|218986|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATAGTGCTGATGTAATAGGCAATATAGACAACAGT >1.19|219051|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATATGAAGCAATTCAAGGTACTGAAGACAACTCATT >1.20|219116|38|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCTACAAGAGATACTTATAAATTTTATGGTGTGGCTA >1.21|219183|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTAACACTTATATAATATCATACATTGTAATACTTT >1.22|219249|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGAGAAACACCAAGCGCAACTTTAACTATTGAATCA >1.23|219314|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGTACGAAAAAGACACAGAATAATCAAACGAACCA >1.24|219379|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGATTTTTAACCCCTCGTGTTTCACGACCCCTTTAC >1.25|219445|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTCAGTAAGTACTTTTGTATATTTACTTGTCATA >1.26|219510|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAATAGAATTAATATTCCTAAGGCTGTATCCCATG >1.27|219575|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTAAAATGGTTTTATATGCATTAGTAAAATCGTTTG >1.28|219641|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAATGGTTGTTCTTCTATTAGACAAACTTTTAATC >1.29|219707|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCACCAACACTTTTGCTATATACAGATTCAAAATAC >1.30|219772|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTAAAACACTCCTAACTTAAAAACCTTCTTAACTT >1.31|219837|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTATCTGTTTCTATACTTATTATTTTATTGTTCTTAT >1.32|219903|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTACATCTCACCTTTCTCTATTTTGTATTTATTA >1.33|219968|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTATAAGCATATCTATAAATAATTTACTAGATAGA >1.34|220033|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGATTTACTAGGGTTTAGAAGGCTATATAGATTATC >1.35|220098|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCAACTAGTTTGATTGGATTATAACAAGTGTTTCCAG >1.36|220164|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTAAACAGGTATTTGTAACCGTTTATCAAAAATA >1.37|220229|35|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTAGAGCTGTATTGATGTCCTGCGTAGTTATTACC >1.38|220293|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTAAGTTTCAGTGGAATCTATTGATAAAGTGTGAG >1.39|220359|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTATTAATTCGGCATCTCCTGTAGTCGAACCACTA >1.40|220424|39|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGGTTTCGTTTGTAGCAATGATTGTTTTTTCTACTATT >1.41|220492|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCAAATTACCCAAACACCCATTATGTCGTTGTACT >1.42|220557|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGTTGTTAACTGGTTTAATCAACTTTCACCGGCAG >1.43|220622|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAAAAGCACTCGGCATCAATATGTCAGTTGCTAAT >1.44|220687|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAGAACGGAAAAGACGTACAGGGTGCTATTTTGAAA >1.45|220753|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTGTTAATATTCATGAGTTAATTATAAAATAAAAAA >1.46|220819|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCAGGTATTGGAAATGGTGTAAAGGCGGCTATGCCAA >1.47|220885|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCATAAGTTTGCATAGAATAACTATAAGTGCCATCAC >1.48|220951|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCCACTTGTTCTTCTTGCTTTGGAACGTTGTTCTTC >1.49|221017|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCTCTATCACTTGGCAATTCATGCATAAGATTTTTT >1.50|221083|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGTCTAATTTAACTTTTATTATAGATTTTTCCATAA >1.51|221149|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACGAGATTATAACACGTTTTAATTTTTAATGTCAAGG >1.52|221215|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTAAATAAAAGAAATTACTTATAGTATCCAATTGA >1.53|221280|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATACTAAAGTGTTTTCTAGTATACTAAAAAAACTTG >1.54|221346|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGTATTCTAAAAACTTCTCTTCATCTGTTTCTGTTT >1.55|221412|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCGGGTAAATCTGTATCAGTAGGAAGATACATTTTA >1.56|221477|38|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAAATGATGTAGAAAAAGTTGAATATGAAGGTCTTGT >1.57|221544|38|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCTTTTTTTTTATGTTGTGGGGTGGGGGGTCCCCACG >1.58|221611|35|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGATTTAACATCTATTGAAGATAAAAAAGAGCGT >1.59|221675|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTATAATACAGCGAGAAACTTATCTAAAAGTCATT >1.60|221740|38|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGAAAAAAGAGCCAGTTGTTAGGAATAATTGTATTATG >1.61|221807|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGTTGGCATACTGTTCTTTAAGGTCTGATATTATTC >1.62|221873|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCCAATAAATTTGTTTCTTTACCTATCTCTCGATAAG >1.63|221939|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAACAGCTATAACAAACTTTATCATAACTGTTAAC >1.64|222004|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAGAATAACTACAAATGGGTTGATAAGACAGAACAA >1.65|222070|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAACATAAACATGTAAAAGTAGCTGTGCCATCATCAT >1.66|222136|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGTTGCATATGCAACATCAGAACCTAAAGAAGTTTT >1.67|222202|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCATCATAATTATTGTTGTTAGGTGTTGTATTACTCT >1.68|222268|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACACATAAGAAGAATAAAAATAGCCGCCACCAGTTA >1.69|222334|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTACTATAAACTTAGTATCTATACCCTGTTTTTTGC >1.70|222400|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATCCATACTCTTTTGAGTTGGCTTGTTGTAACTA >1.71|222465|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCACCTAACACATCATAAGCTTGTGATCTAGTTAAGC >1.72|222531|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGATCATCGAGAATTATTAAATCTGCTTTAGTAATG >1.73|222596|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGATGAAGATGTATATAAGAAACTTTGTGAACTTGC >1.74|222662|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTTTGTAATTCTATGTAATTAAATTCTTTATCTATC >1.75|222728|36|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTAAAAATCAATATCTTCAAATCCTACATTGTACTT >1.76|222793|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGTGTTTTTTGTAATATTCTCTAATGCAATCTTCTA >1.77|222859|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATACAGAGGTTAATGTATCTTATAAAGAAGATTGGT >1.78|222925|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTAGTATCAGAGGCCGGGAAGAATATTAAATTATAAA >1.79|222991|35|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTACTATGTTAATACCAATCTTACTCCAATCCAC >1.80|223055|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAGATTCTAAATATCCTTCTTTAAAAGGTGTTTTTG |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6,WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_HG917868_1
The CRISPR arrays of NZ_HG917868_1 >merge|NZ_HG917868|1|217843-223120|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATATTAAAGAAAATAAATTTATAAGTCGTAAGATAAGACTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATATATTAGTTCAAAATGCGTAGATATTTATTTTTATTCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATCGTTTAGGTGCTAATGAGATTAGAAGAAGTTATACAACTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTTTATTTACCTTTTAGGCTTGTATATGATTATTCTATGCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATATAGATAAATGAGATTTCCCTGCTCCAGGATTACCTCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTTAGATAAATATAAAGATGATGTACCAGAAGAGATTCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATATTGTATACAAATACAATATACAAACTATACAAACACTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATATTACTGTGTTTCTATCATTCTTTGTAAAATTAATCGCCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATACAAATTGGAGGGTATGAATATGAGATCAATATTACCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATCTTAATTTGAAACCACACTATTCTATTGAAACTTTAACTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTGTAAGTATGCCTTGTTGTTCATAATTAATTACTGCCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATGAGGATATACAATCTCAAATAGATAATAATGCTACGGCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTCTAGTAGCATTGTTACTATAGTTCTTATTGTCTTTCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATGTGGCATCAATATATCCTGTTTTTATTGTATCTTTACTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTACAATCTTTTTTATATATTCCGTAATATATTCCATTCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTTGGGAAATGCTTATGGAACTTTGGTATGTTTAGGTCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTCTATAGTAAAACCATATTGATATTCTCCATAATATCCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTATAGTGCTGATGTAATAGGCAATATAGACAACAGTCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATATATGAAGCAATTCAAGGTACTGAAGACAACTCATTCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTTCTACAAGAGATACTTATAAATTTTATGGTGTGGCTACTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATATTAACACTTATATAATATCATACATTGTAATACTTTCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATAGAGAAACACCAAGCGCAACTTTAACTATTGAATCACTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATAAGTACGAAAAAGACACAGAATAATCAAACGAACCACTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTTGATTTTTAACCCCTCGTGTTTCACGACCCCTTTACCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTTTTCAGTAAGTACTTTTGTATATTTACTTGTCATACTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTAAATAGAATTAATATTCCTAAGGCTGTATCCCATGCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTCTAAAATGGTTTTATATGCATTAGTAAAATCGTTTGCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATAAAAATGGTTGTTCTTCTATTAGACAAACTTTTAATCCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTCACCAACACTTTTGCTATATACAGATTCAAAATACCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTTTAAAACACTCCTAACTTAAAAACCTTCTTAACTTCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTTATCTGTTTCTATACTTATTATTTTATTGTTCTTATCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTTTTACATCTCACCTTTCTCTATTTTGTATTTATTACTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATGTTATAAGCATATCTATAAATAATTTACTAGATAGACTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTGATTTACTAGGGTTTAGAAGGCTATATAGATTATCCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATCCAACTAGTTTGATTGGATTATAACAAGTGTTTCCAGCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTTGTAAACAGGTATTTGTAACCGTTTATCAAAAATACTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATCTAGAGCTGTATTGATGTCCTGCGTAGTTATTACCCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTTGTAAGTTTCAGTGGAATCTATTGATAAAGTGTGAGCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTCTATTAATTCGGCATCTCCTGTAGTCGAACCACTACTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATATGGTTTCGTTTGTAGCAATGATTGTTTTTTCTACTATTCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATATCAAATTACCCAAACACCCATTATGTCGTTGTACTCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATAAGTTGTTAACTGGTTTAATCAACTTTCACCGGCAGCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTTAAAAGCACTCGGCATCAATATGTCAGTTGCTAATCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTAAGAACGGAAAAGACGTACAGGGTGCTATTTTGAAACTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTGTGTTAATATTCATGAGTTAATTATAAAATAAAAAACTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATCCAGGTATTGGAAATGGTGTAAAGGCGGCTATGCCAACTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTCATAAGTTTGCATAGAATAACTATAAGTGCCATCACCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTTCCACTTGTTCTTCTTGCTTTGGAACGTTGTTCTTCCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATCTCTCTATCACTTGGCAATTCATGCATAAGATTTTTTCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTAGTCTAATTTAACTTTTATTATAGATTTTTCCATAACTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATACGAGATTATAACACGTTTTAATTTTTAATGTCAAGGCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATGGTAAATAAAAGAAATTACTTATAGTATCCAATTGACTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATAATACTAAAGTGTTTTCTAGTATACTAAAAAAACTTGCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATAAGTATTCTAAAAACTTCTCTTCATCTGTTTCTGTTTCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATGCGGGTAAATCTGTATCAGTAGGAAGATACATTTTACTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATATAAATGATGTAGAAAAAGTTGAATATGAAGGTCTTGTCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATCTCTTTTTTTTTATGTTGTGGGGTGGGGGGTCCCCACGCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTTGATTTAACATCTATTGAAGATAAAAAAGAGCGTCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATACTATAATACAGCGAGAAACTTATCTAAAAGTCATTCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATAGAAAAAAGAGCCAGTTGTTAGGAATAATTGTATTATGCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTGGTTGGCATACTGTTCTTTAAGGTCTGATATTATTCCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATGCCAATAAATTTGTTTCTTTACCTATCTCTCGATAAGCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATAAAACAGCTATAACAAACTTTATCATAACTGTTAACCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTAAGAATAACTACAAATGGGTTGATAAGACAGAACAACTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATAAACATAAACATGTAAAAGTAGCTGTGCCATCATCATCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTAGTTGCATATGCAACATCAGAACCTAAAGAAGTTTTCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTCATCATAATTATTGTTGTTAGGTGTTGTATTACTCTCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTACACATAAGAAGAATAAAAATAGCCGCCACCAGTTACTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATATTACTATAAACTTAGTATCTATACCCTGTTTTTTGCCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATAAATCCATACTCTTTTGAGTTGGCTTGTTGTAACTACTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTCACCTAACACATCATAAGCTTGTGATCTAGTTAAGCCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATAGATCATCGAGAATTATTAAATCTGCTTTAGTAATGCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTAGATGAAGATGTATATAAGAAACTTTGTGAACTTGCCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATGGTTTGTAATTCTATGTAATTAAATTCTTTATCTATCCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATCTAAAAATCAATATCTTCAAATCCTACATTGTACTTCTTTTATCTTAACTATGAGGAATGTAAATTAGTGTTTTTTGTAATATTCTCTAATGCAATCTTCTACTTTTATCTTAAC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MRINNSDNWFYKAGIVGFDRIIRYNEDFCNLDSGLYNYVVHDNYIEFDEKLLENFHKYYFNYFFGRYNSAKDQEEKIRFYIRRCEKEDKFKDNLGKIRELVKNNNKKIKKFEVKEVNRCLEIQKELGMVKKYSEKNKVEELLNEYIDILKDNYINTQITLNKFKSILSKSFFGQVSFLNVCNNSKTLAQQEDILFKDYIDPILVMCKLNEILKKNDEEMLREFIEECLLKNKRNGEIEKVLKDFKKGLFGKIRKEKDAMSIFMQYNSCSMCGNEVSIGSNYYEGNFVPLAISNENAENMYWNFNTKHPICSLCKLILLCTSAGMTDIYKGYLDDKYDYNNKLYYGFISIDGDLRDVIKQNNNLANKKDKDSKLQAYILDSIAEKEQISKWQLDNILYIEFNTDYSSKNTKMNYLNIPRYLAEFLKSKSELLYKIKDKKVRVEIFDAILKQVDLKHLIDKFLRSTLQENEQYVVNVFPIIKVRVYLKLYKGECDMVDKLYDKKLNYVYMQGREVGGILKSNSQENKILGLSYRLLNATKATNKKEFMDTVIRIFMSVEKEVPMIFLDVIKEGSLEFEDISYSFISGLTSQDSKIKEGGEK >NZ_HG917868.1|WP_044035841.1|209512_210250_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRIRIVGRVKDGIIPIGYRMMIVSLLKKAIEKGDKEYFNKLYYYNEKKNKKIKSFCFGTYLQNFMFEEEGIKVDGKINITISTPDYMLGVSMYNGLLKLSTYKYKDKYEFIKEKVILEKEKIISDEHVVLKTLSPIVMKDSEGKKVDIDSENYEKELNYISNIILESYRGYGLKRKLVFIPVNMKKSVVKEEIAGFTKEINKRYIYINGYSGIFTMEGDVEDLNLLLQLGIGFRRSEGFGLISLV >NZ_HG917868.1|WP_044035840.1|208475_209417_+|WYL-domain-containing-protein MLGNLLKMWFMLLDGRVRQIKDIARELEVSERQVKRYKEELAVYVDIESITGKYGGYRLRETYIPFKGLLTEEETELLRYYIDSLDSFPLEEKDKINKIIGKINYSILNKNDNVSNFNEIIPYSTVRMMDENRKNLISDIYKAIVENREVDITYKNNNGKCTKRKVQPYKYITYKGEKYLVAYCLMREDIRYFKMIRIQCYKLLDSIFNRTIDIDNVINQEIHNSVGIFGGKEYKLVLEVSPPMANTISERIWVEDQCVEELEQGEIRFTATMKGGPEIISWILSMGDTVKVIEPLELKDEIGEKLKKMIRNL >NZ_HG917868.1|WP_044035839.1|207881_208310_+|hypothetical-protein MLCKNAELFLEEAKRRGIEGIEVKEEEHNLQRAMFYQDLDNGIEMRNMVIFDSNNDVVVVSGMDFVTGVNMEKRYIIYDVLSQLNRVIDNFTYILKKGQIVIDSTYLVGGGDNFDAAILFDILIKMKAIVNRDAIHLIKLAH >NZ_HG917868.1|WP_044035849.1|223309_223522_-|DUF2922-domain-containing-protein MKSLVMKFITETGSKVSINVPKVKENLDETKVKEVMNLIKEKAVFTFKGGDIIALDSAQITETNTTEITL >NZ_HG917868.1|WP_044035850.1|223539_223755_-|DUF1659-domain-containing-protein MATTVQTNKNIQLSFLTTDENGKESTTKVTLPNLKVDANLDDVAAVVDSYAELKEGSLSKAAIIDESLLVK >NZ_HG917868.1|WP_051483618.1|223991_224822_+|hypothetical-protein MNDRKGLVVIKIISIISIVITIVYTLTGFVSGNCEDLLISKIQSIVKAEDDAADEELDKEVKNVTLADEEEDTEYQDEEDIEHVEEDVEDDVDIEEEEECTNTEEDEEITEEPVNNNEDTEDIEENTVEVSNVTVDNENKNTIVDSKVENPTEVNVEQVTYPRIVKNSDGTIALLRSQQEQPIAIVLDEYVNGFLEFNYNYCVITAPEVEYSIEFECNGNVEVAVGTGSTNVYRRYVNRKVKNNDKLNIKLTAKINGTEESTSFQRTINRGIFGFR >NZ_HG917868.1|WP_051483619.1|224901_225618_-|C39-family-peptidase MRKIKIISILISIIMVLIGVISLIYNDSNSETSNKNIFSAMPSGEYKIEGIDTLNQFPEMPTGCEITSTTMLLNWYGVNVDKEELGESIEKADVPSYVDGTLQGASPNEYFIGDPFSSDGYGVYHKPIANLIDQYTDGKSKDITGCSFNKLLRTVANGYPVVTWVTINMKESSVGSYWTNGDETIEWIIPEHAVLLVGFNENEVIINDPYTGTEYTVDKDIFENRWISLGRQAVTISD >NZ_HG917868.1|WP_044035851.1|225806_226355_+|metal-dependent-hydrolase MKGRQHVLIGTTATVATGIGLICSGSSVTNFIPIVIGGIIGSYIPDIDSHKSKAAQIFNKLFVILIVVLAILYCLGITLDLERFIGGLDANDPKTLAVLIFAVVTILGKLSPHRMFTHKWFGTMLFCYSVYLMGNMYFTIGFTTGYILHIVADTMTKNGKYLKFFQFKLPCRNSKNKFDISW >NZ_HG917868.1|WP_051483620.1|226355_226784_-|prepilin-type-N-terminal-cleavage/methylation-domain-containing-protein MLKNNKKKSGYTLMELIIVLSIIALLAAIAIPKYSKMTMEAKKSTDKMNAKLIHNNVSILLADSTSGFSEAISYNTYIKITDSGHSIAEQKIASTFQNVPKAKAIPGDFFAYIKTDESVEIYVEKNTGNYIAVYPKGEDLYN >NZ_HG917868.1|WP_044035852.1|226972_228085_+|ATP-binding-protein MGEVSAENVFKPGCFSRYTYVCRHAPCIEETYEDKLEQDLKVSGCLISIVGPSKSGKTLLCEKVVENNRLIEISGIDFDEDNNLWKVILKKLNFTLEEWNKDKIINYFNKNNLVLLLDDFHYASKATQLNIAKQLKYALNKELKVIVISLPLLTDEAIRKNVDLIGRLILINVEPWKEKELQWIAINGYKKLDMNISRKNISNMATESLTSPQLMQSICLNLYFLIANSNIKNEDIGDKLLEKAYKITTLNFDYKDVIKALREGIRSRLNTRETYMVSGGKYLNSNELVINAIALNPPKMIMTVDELFLRVDSIIIDDKKTIKSEIEATLAKIVEMLKVEDPLYQVISYDGINLEILDPLFLFYLRWSGM >NZ_HG917868.1|WP_044035853.1|228244_231100_+|SNF2-helicase-associated-domain-containing-protein MRIEDFEDIIIKKVSPIVRSGGKELYKKGLVKSIKGKRFETFYALYGVVESENRIKEFNTYMKINLVNGNIDKASCGCDNFKRLSRGNNFFICSHLVATTEKFLVAMKKKTGVNPSKKVNKDNTILRILRKVSNDKILYEIRTYLGKDKIVIKDKNLRDFLEVNIDKKIKFTYEYLEINTKIINKPLPLSFTIKDDEKNLIVTTHKKMPISLTEKNDVYFFNNEIYLPPKDQIDNYIDTYNDEKIYPKTIKSYNEILDNLSKISSNIIIKESVREFASEYYKPEFFLYKEENKIYCTVNIYYGNKRINILVDSNDVIREKKKEETLLIKICGIGFVRKGERLEFIGDDEVLFDILSSKNEGIHKLGKVILGKAFKENGVYNYCNINGEIVKDDDKYIFYYSIDGMNNDEIFSAYEAYKEGKEFYKSNNGGFINFRDKGVKDFFNLLGGLGISVGSNEIIVDEDKEIYISEAVTNLPMIKGKENLHRAEEILSEEIEVPQGFKGNLRNYQVEGFRWFKGLSKLGLGGILSDEMGLGKTIQTIAFILSEKGEKFIIVAPTSLIYNWKSELEKFAEGLKVAVVHGAKRKEIIKNIQEYDALLTSYGTLKRDIELYKDIEFGYCILDEGQNIKNPDAESTKIVKAINSKNRFVLTGTPIENNLMELWSIFDFIMPGYLFSKEVFKKKFIFNNDVETLKLLINPFILRRTKKDVITELPDKIEKKVFVDMTAKQSKVYKDYMKDVLSTLQNYGDNKIEIFSYLTKLRQICLDPSIIIEDYEGGSGKVKAALKLIKERDGKILLFSQFTSILDKLKEELEGANIKYLHLDGSVAAKQRIKRVEEFNNEESIKVFLISLKAGGTGLNLTSASTVIHFDPWWNPAVEDQATDRAHRIGQRNVVEVIKLIAKDTIEEKIIQLQENKRLLIENVISGELGEGDLLKKLSVEDIKEIFRENK >NZ_HG917868.1|WP_044035854.1|231277_237295_+|hypothetical-protein MKKNKSKKIAIKTKQMIAKVLIIICLITNINTNYIVLAQDENTNTEIESAIEWLETNQNEDGTWGDSIQQITTYQVLDVLQSELDSEKSYKEGLKWAKEQEESTVDYQARRLMIKELVTKDNIEDLIKNQNEDGGFGLTDLYGSDVVDANLVLTVLLDQNEQEVDVENRLVNYILNHQNEDGSFSYFEDTTESVKLTAEVIIALNKFSNICENNSYNVQQSIRKAGDYLLSKQNDNKLWGDSLEDIRASLKAFSAVLNTEGIQESSYIEKVVSGLQLENGSVMNDAYATALYIELMKKISEIPKAEIDSINIYKKDNADKTLCKSYKAYEDMTIEVAANYDEEKAEVNVFILDEHGGVVFQDNKLKTDWEVKNQSPGQYRVVVQIIDSKSRYIISSAEENFTIEESVQVDNFETLIDCDSTMVGEPITINTKVAFDNLSNVDVNLILRTQILKGDVVVKEDSKIQELSKSKESYDVELMTFEPEVTEPATYTFKVEAIQNDNLVGSNEKEFIVYERLSNTGVYITQDKDKEKLYPGKDNLKLNFHLKGLKENDEKVMSYRSFSVLAALADESTSSFAYSGNIMSNEYIEFYLNGRGYTLGTKEGNPEYISDNNKNLLYGHPGSGTSYTTVNIDDNKYIYSPNVQGVTPDLSEGSVTSVEKIGNVKIKQKFAIVNNSNTGRNDMVEIRYIVKNEDTVSHSAGLRIMLDTMLGYNDAAPFRVPGIGALSYEKELVGDKIPQYWQAFDNLSNPSVVAQGTFYKEGMIKPDLVQFMNWSRVNSYSWYLTPTGSSTGDSAVTVFWNPTELLPGEEREYVTYYGIGELNSDISGSLVASITGASKLEATEEGYDPNPFLVTAYAYNMGLEEIGNVKARVVLPTGLKLAEEEKETHLFGNMGVGEEKQTSWNVVAEDSLVDKTLTYSVVYSVNGVDIKTINRNVFVPKQINNIAGRDVVLETVIPSSEFKINPEKVTPAPSEIIEKEDGNQLLRWNFDKIDIDEVIDLQVELNGESLISEAKYVVTKDTTLSYTNRENERETRKLKNMSVEVNKYELESEITTDKKEYTANENVIITNKTKNLHDYSMNLTGKVTIYDSNNEVVEVLDNNIESIWQGNEEKEDNYTFNTKELLMGTYKIEVQWFEGSKIIQTTDAYFNINKDGSIKHNVFVDKQQYNANDVVTYTNKISNTSINCIEKGLTLETVITNEQNEVVKNELVSLEDILSSTQVTKNGTFKLNDNKAGQYKVTATIYLDDKKISEETTLFEVISTQENLFGVKGNLKVLNSIITPAEEVSFESLIENTGNENIHNMPQIIRIIQVGTEKEMKKYQWESNVEVGNSDNKTFTWGDKSIEAGDYIIQYEAIKPNGETKLIASNNFTVKYIEDDFEKENDLWNYMGTAHRSDGGYAVLTENKNHENGAMWLKQGISLPFVTTFKYKAGGGTGADGFTFMFAKKANELGNEGREMGFNTGNGYAIEFDSFYNKFHGEQTSVNRAHIALGKDLLSTGNKGEIIDSLAMNVTEEVASKLSDDNWHDVEVRVTEDGVQLYLDGERVLVYKGKLDTTYDGFGFSSATGTENNHHYIDNVIIRENTEIALEDIKDDFTETNSKWDYLGSAYRSDEGYAVLTENKTWQTGAMWLNDVVSAPFTSKFKYKAGEGNGADGFVFMFGKESNKIGASGGTLGFSEGNGYGLEFDSFYNGSSENINNNNRHIALFKDKLTSTLKVNATDAIAAKVSDNKWHDVEVKVKTDGIEVFIDGESVMTWYGKIDKTYNGFGFAAATGDYTNSHFIDDVEIKEDVEEITENIKDDFSADTGLWNYMGTAARLEDGFARITPNENWKNGAMWLKKETTNKFTTKFKYKAGESSCGTNSDGFTYMFYKNPNQLGNTGETLGVQADSGYFIEFDSFYNGSNSEKIGKNSAHIALMKNSTSGEVLQFNNDDSITSKIADGQWHDVEVSVTSESVQVYVDSLLVIDYKGTLDTTYTGTGFSGATGGYNQNTFIDDFEIDITR >NZ_HG917868.1|WP_162148679.1|237366_240999_+|hypothetical-protein MKDKWKVTFKSIALTLIVIMTINCSSPGEVWREIKSNANKLWGDKETLTTVDRTKLGSLQETVSANKEKSKEAIENDNLDESKKLLEETLEAIESNEDKINKEFKNIEKYLDKNNLDVAKSRLTEVKNQFKDLVNSKDKIEEAINSDDKDKILAVLDDESIFGKDENTYKSLGDDALPHNNEEAVYVTEEATAISNDAIEYSLDKDTDDNEEYLKETLDTKITEVIKKKSDELSDNPLDIYKFVRNNVDFEAYAGSRKGAAGALEQLAGNDYDQSSLLIALLRSKNIPARYVTGTVDVSVENAMVWTGAETPKVAADMLASMGNKTTAITSGGEIVTIRIEHVWVEAYCSLCEYRGQGEVTDEKEWIPFDPSFKTYKKVEGTINSVEKDIETSDIADDFYYGGVKTEDNFGVKNIYNDDLKYAADDIKSQLEKYINEETLEGKRLIDVVGGLEIIPEEIDLLPFSIPNTLVSIDSRSSEIDNNKREKVSIEVSDTYGIGGELSLNKTAVELYGKKLTLSWIPATDSDEEIISNYGSVFDTPAYLVEVKPVIKADGEVIAEGSAIGLGQVENFSIVLDRVGLSSQSVTAVLTAGGYYALGLDYGAISENEITNIQSRMKEAEENAAEKDYYSDEVAGEILNGIIKSYFGELDSMNKISAEMSGVKDTRCLSFGISGFKPTVKYLYGTPVDLKLGSVYVDIGGDAHSVVSRDGDKEKEKSYMIKTGMIASAMESSIIEQMCGLPAVSTVSILNKATEQGETLYSVTKENVNEVLPLLNVGDYVKNEIVNVVNSGKEVTIPKNEINYYDWTGSVYIVMDNDTGAAGYMIAGGYAGGEGANDLSSVNVWEVFEHFIDGFTEGIKGAIPFIIIGTIVAIIAPEIVAVVATILCYAFIISSIVSFTELTILYAKGEYTTQEYLNFVAEIEGMLCSGLAMEKVMKSSLYKSIQEKFTNTFIKTYNVSKETVSKVWDRYGKNKADSLLGKIKSAKEAGATETELIKVTEVLTADQYSKYLEVMEKVYSKGEIEAKNIDKAKDSALRDVKNEKLSVDEIYENAVKSSISSVTDIIKAVENGDIVLSNNLQKGNYGEMKMDVYFESQGYDRISIDKVTDLNEPTHHGIDGVYYKADGEPKYIIGEAKYGSSTLGNTKDGKQMSSNWIDKRLVDAVGETNADKIIMEKMLNADNIKSQLVHISDKGEITISILDDEANIVK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_HG917868_2 | 379114-379206 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_HG917868_2
|
1 spacers
spacers of NZ_HG917868_2
>2.1|379144|33|NZ_HG917868|CRISPRCasFinder AAATGATATACAGGCACTTAAGAAGGAGGAACC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_HG917868_2
The CRISPR arrays of NZ_HG917868_2 >merge|NZ_HG917868|2|379114-379206|CRISPRCasFinder TTATTCTACAGATGACATAGTTAATCCACAAAATGATATACAGGCACTTAAGAAGGAGGAACCTTATTCTACAGATGACATAATTAATCCACA >NZ_HG917868|2|2|379114-379206|CRISPRCasFinder TTATTCTACAGATGACATAGTTAATCCACA AAATGATATACAGGCACTTAAGAAGGAGGAACC TTATTCTACAGATGACATAATTAATCCACA
>NZ_HG917868.1|WP_044035955.1|377468_378323_+|16S-rRNA-(adenine(1518)-N(6)/adenine(1519)-N(6))--dimethyltransferase-RsmA MNQRKDVIDTADVVKKYGFKFTKSLGQNFLIDHNVIDQIVEGAGVSSEDTVIEIGPGVGTLTKELLKRAKKVIAIEIDSDLIPILSEELKEHNNFQLIHQDAMKVDFNKIIEENENVKVVANLPYYVTTPIITNLLNAKYKFKSITVMIQKEVAERMNSEPNCKDYGSLSLLVQYYCDTKIIMKVPPMCFIPRPKVDSIVIRLDRLEETRVTVDDEKLFFRVIRDSFNMRRKTLWNGMKNIGLDKEKLEEAFKDSGIDQKRRGETLTIQEFADLANAINKKINN >NZ_HG917868.1|WP_044035954.1|376893_377442_+|ribonuclease-M5 MIKEIIVVEGRDDVTAVKAAVDAEVIAVSGFGINKNTIDKIKEAQKRKGVIILTDPDFAGEKIRRIISKRVDGVKHAYISREEGTKDGDIGVENASPESIREALSKAKAVIEEKREVFTANHLVYYKLVGDTKSKERRQLLGKILGIGYCNGSQMVKRLNNFNIKEEEFVKAMDKIEKQLSK >NZ_HG917868.1|WP_051483630.1|375644_376691_+|DUF348-domain-containing-protein MKIDFKGFFKKPMAVISIVLSVGLVFTGISFKKTVYIDVDGTTTKVTTYKGKVEDVISDIDLKLETEDSVKPKLTSEIKNGQTIKIKRAVSLDLIVDGKTVVIKSAADSVKDLIESKSMSKKLQSEKISPIREQDKIEPTLDTKITSNMKVIIKRIEKKNEVTQAEIPYSTEKVVDDSMYKDDKEKVVVAGKPGIKEVTTEVTTEDGNVVATSVIGERVIEEPTNEKIAYGTKEKVVPTVNVPSRGGNIPYKSKLTMKSTAYSSSDKGVTGITASGMKATRDPNGTSTVAVDPRVIPLGTKLYIEGYGYAIACDTGSAIKGNKVDVYFNSVSECYSWGSRNVDVYILE >NZ_HG917868.1|WP_044035953.1|374711_375482_+|TatD-family-hydrolase MKIFDTHSHYDDEAFDGDREELIKIIIENDVVGIINCAADMKSVKSTIELTKKYPMFYGAIGVHPCSADEINEETIEELRMAAKNEKIVAIGEIGLDYYYEDNPSREIQKNAFRAQMQLAKELSKPVIIHIRDAHEDALKILEEFEEVRGIIHCFSGSVEIARKCVKIGYMLGIGGVVTFKNARKLVEVVKEIPMENLLLETDCPYMAPVPHRGERNNSMYISEVIKKIAEIKSISEEEVADIALRNSHNFTKNIW >NZ_HG917868.1|WP_051483629.1|374360_374654_+|DUF1292-domain-containing-protein MDKEVIQADHCECEEEHNEKSNIVSFMTEDGEKVDLELIETVVVKGKKYILLAPVGNEDDAYVYKVVTNADGKDELIAIEDDKELSLVMKEYEKTFA >NZ_HG917868.1|WP_051483628.1|373545_374310_+|DUF3298-and-DUF4163-domain-containing-protein MKRAATMVLGIFMALTSIISFCRYGNGMIFLSEECANASQNITINEEKPIVIKDIVKEENKPEYKFRIHIPKITGLKDIKKQNSINDTISEEILRFKDYFIENTKSGNNSEAEVHYTVTNNKKIFSLLIYYYEYYGGAHGLTTKRSINIYVPNSGGIKENENFLLLEDFFLDKVDYKTMINNYIINEIKKEPEKYFEDTLQKYSGFNENNFYFNDKGLVVYFQSYEIAPYASGSPEFNIPYSFLKNYIKKDFIP >NZ_HG917868.1|WP_044035952.1|371088_373017_+|methionine--tRNA-ligase MCKKNFYITTPIYYPSDKLHIGNTYTTVAADALARYKRLTGYDVMFLTGTDEHGQKIQQRAEAKDMQPKAFVDEIVAGIKDLWNMMDISYDKFIRTTDDYHVKTVQKIFKKLYDQGDIYKGSYEGWYCTPCESFFTDTQLVNGNCPDCGRPVEKTKEESYFFKMSKYADRLIEYIETHPEFIQPESRKNEMLNNFLRPGLQDLCISRTSFSWGIPVEFDPGHVVYVWIDALSNYISALGYGSDNDELYKKFWPADVHLIGKDILRFHTIYWPIILMALGEPLPKQVFGHGWLLVDGGKMSKSKGNVVDPVLLVNEFGCDAVRYYLLHEIPFGSDGLYNSEIFMNKFNSDLANDLGNLVSRTSAMIIKYFGGEVLAPSSEEDNFDKELKAVTLSMPEKVEAAMNAFKIPEALDEIWTVVRRANKYIDETTPWILGKDESKKDRLATVLYNLLEALRFVTVELEAFLPNTASKIKEQLKFENVSYESLKSFDGVKVGTKLEKGEVIFPRIDVEKKLEELAAMKEAQAPKREIKPIKEEITIEDFEKIDLRVVKVLACEPIKGAKKLLKLKVDLGGEERQVVSGISQYYKPEELVGKNVVLVANLKPVKLRGELSQGMILAASSDDDKELFVVDPGKLETGSVVR >NZ_HG917868.1|WP_044035951.1|370398_370701_+|hypothetical-protein MDKTDERKEIGKAINDMGDRLHILKIYIAKMERMSSLYRDLITDLNNNKVQNFTDRMKKIKNVENEDNIEVVFSNLWVIVKDFEKDYRTLKNNEEKDKYK >NZ_HG917868.1|WP_044035950.1|369271_370201_-|tetratricopeptide-repeat-protein MSNRRHKRKHNNKPFIVTSIIFLIFIVLMISILITYLTSSKKTRNDMIQAAKIENYEEVLKDSNKLISKGDYLDLAYEYKGYSLMHLNKSDEALDTYLKLVKKGTKNALIYNQIGIIYNDKLHNHEEALNYFNKAIDLDDSNANFYTNRGITYQWLNNNSEAINNFDKSIELDSKNSYNYYYKGVSLLNENDLDNSIENLEKAIKLNNNDATFYVSLGNAYIKKSSFDKALDSFNEAIKLDKKSINAFIGKGSSLYEEKQYDEALEAFDTALELDKNNKYALIGKGNVLSAKGDTTTAEEYYNKADAIK >NZ_HG917868.1|WP_051483627.1|368571_369147_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MRNIEITNGCSEDAPSIAALIYETEEYPEHEWGPYPKEKIIKKLEQLVQVKGNRYSYDRTKVIKIDNKVVGVLLTLRGNEIRKLTYNTYFKFIDFDRSFKNVICNVRNILSYIFFKECNINEYYIANLAVDKEYREFGIGKTLLEEAEDLAKEKGYNKISLLAKDRGIVRYYKKFKYNLENMNHLKMVKFI >NZ_HG917868.1|WP_044035957.1|380207_380999_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MKPFLLEIGKLKIAGYGTMILIGVIVAYCLFTYRGKKRGYNVDNLFDITVFSLIGGFLCSKLLYIVIENPKLLLNPVEIVKTFSQGFVVYGGIIGGFIVFILMCKRYKYSPLKVGDLAVASLAIGQGFGRIGCLLAGCCYGRTTDSVIGITFHNSFIAPNEVALVPTQIISSIFDFILAGVLIWYLSFLEKKNIGHNPGKVTGAYLILYSIGRFIIEFFRGDLERGFIGTLSTSQFISIGIIVFGLIVFNLDKIKRLKYKEGI >NZ_HG917868.1|WP_044035958.1|380999_381818_+|hypothetical-protein MKKVISVILIFMTIFLNSCAMTDKIGWTNSDFEYIKDGMVTEIKIQNTRDKGYTFVISDPVKLQGFYKILSSAKSVKSKSEYVPDYSIEIEKVDGSVENFNYVIGNPNDGGNFYSEDKYYNVSSRLDSEVFNYFEDIRKPKDFDEVYYYGVIRGSLNKFREDTKTNDTVTLNLNDDVTIQKYITSIELEGYKKKMKDLEIVETSKNEGKITMSVKTTGFRTTTSSGKYVSIYKAIITFHNRGTNEEKVYYSVSNNSGGKWVTDITDTKPEDF >NZ_HG917868.1|WP_044035959.1|381951_382806_+|Mrp/NBP35-family-ATP-binding-protein MVGCESCNECEKKTKKDICNLKFGTIKNVIAVISGKGGVGKSTVSGLLATELRKSGYEVGILDADITGPSIPRFFGVNEKRSLINPEPYTGDAMFEPVITTLGLKIMSLNLLVDKEDDPVIWTSSVAHKVLKQMYTDTKWGDLDYLIIDMPPGTGGIAITIMNTFPIDGLLVVGTPQDMVSVIVKKVINMAEKLSIPMIGLVENMAYITCGCCGQEIKLFSNKTTEQYENYFGIPLIAELPMDLKLLESLDEGNAEEYVFKVNKYKDLFEKFMDRYKEMKTEAK >NZ_HG917868.1|WP_044039648.1|382822_383272_-|PadR-family-transcriptional-regulator MMSPEDIKKEEKRLYEEYKAKLSELKKVKKEREAVGSIFTKGLLPIYVLYILSLQPTNGNDISNKIGERTNGLWTPSTGGIYPLLKKLEKEGLIEGKWDNPKKKVQKIYELTSLGKEEFNHRKELLKDKMLESLQVFNMVYEDLYNDIK >NZ_HG917868.1|WP_044035960.1|383273_384128_-|DegV-family-protein MEKIALITDSICDLSKEIIKKYDIKVLPLKIIYKNREYIDGVDISAEDVYAKLKIEIPTTSMPSVGEVEALYEKLVAEGYTHVIGTCISSGLSGTFNNFNLVAEDFSDRIKSYIIDSLSISKAEGELMVVAGEMIEQGKSFDEIIKVLPKCRDNIKCFFTFSTLEYLKKGGRIGKISGTIGELLNLKPIVSIDSKDGKYYTYDKVRGDKNAFNKLVSIATDLINEGPCKVKVLHGDALPKAERLYEILKQLPNVKSIELGVLSAVAGVHSGPGFLAFGVIKDFE >NZ_HG917868.1|WP_051483840.1|384380_385229_+|YitT-family-protein MIVIGTAILALGVNWFLEPVGLVTGGLSGFSIVVKTVSENIIGYGIPLSVTTFVLNIPLFIIIFMQRGFNFMKKTLYGVVSLSLALWYTEYIPNIFNVNDDLFLCSIFGGAFVGAGLGIVLKVSATTGGTDTLASIIKFKFPYFPIQQLMLIIDGIIILSGFFIFGPKNGMYAILAVLVTSKVISVILEGMHYAKAAFIMTDKTEEVAKEVMEKIPRGATGLKARGMYSKNDKEMLFVVVSQKQITQLRDLVKSIDEKAFITIADVREVLGEGFIENYGESL >NZ_HG917868.1|WP_044035962.1|385406_385967_+|50S-ribosomal-protein-L25 MTNVAFNISERNESGKVVRRRGEIPCVLYGEHLEKPISAKITRGEVDKLLTCAKSSILSLNLNGTTENCVVKELQKDNYGKVIHIDFQYVNKDENIKLGIPVIYTGQGLLESKRLFLETFLSEVELYGEADKFPENIEFDVSTFNYGDTVLAGDLKLEEGMKLVTNSDVVLAKVDGNNAVEEDTEE >NZ_HG917868.1|WP_044035963.1|386602_387796_-|alanyl-tRNA-editing-protein-AlaX-L MKKLFYTDPYIKEFTAEILEIKEIDSKFHVTLDQTAFFPGGGGQCGDLGFIENHKVVDVYESEDTIYHVVEKKPIKIHKVKCSIDWNRRFDGMQQHLGQHVLSGCFYKLFGANTFAIHLGSEISTVDIEGTLTEEQVREAERYANEVISEGLTVDFLIPTKKELKSLTLRRALPNTKEDISIVKIDDLDINACCGVHPRNTRDLRMIKIKKYEKHKQGTRIEFLSGDRAISDSLKKDNFANMICKYLNCNEEEVINGIKNLNASLKDTLDENKKIKNQLATYEIKELINEAETIGDMKVLKKIYTAETVKYVNTVISKIVENDNMVTLMAVVSEDKVNLIFACSKNLKDVKVNEILKDTITLIDGRGGGSPFLAQGGGKNNGNLENALNYAFNKLKN >NZ_HG917868.1|WP_051483631.1|387893_389006_+|FAD-dependent-oxidoreductase MKKFICTICGYIHEGNTPPEVCPLCGAGPELFKEVKEESNDRFTKNTEEKFVILGNGAAGFYAAKAIRERNKTAEITMVTNEGDLSYYRPALSDLINDEVNEEFYLADYKWYNGKNIKNIVNTNIVKIDEENKTLISDDGENIKYDKLILANGSSNFIPPFKGKDLDGVYTLRNIKDLEKIKKALKEAKKVVVIGGGALGLEAAYEIYLQKKGLTVIEAAPVLLGRQLKPEQSEELLKTIRNTGTEVIVSGAVEEIVGETKVTGVKLQDGTIIEADMVLTSIGVRSNIALCQNTSIDSNRGVLVNEFMETTLENVYACGDVAEFEGLVIGLWPIAVEQGKVAGANAAGEKIEFKYDKYPLILDVFGMKFQ >NZ_HG917868.1|WP_084485342.1|389075_389813_+|tRNA-pseudouridine(38-40)-synthase-TruA MRNLKMTIQYDGGRYKGWQKQKEGESTIQWKIENVLKRMTGEEIQVIGCGRTDAGVHAENYIANFHTNSELSVETMMDYLYEFLPEDIVVKSIKDTTERFHARYNAKGKTYVYRINNGEVRNVFNRKYTYHTSVKLNLDAMREGAKYLVGTHDFQSFTSQKPKTKSTERHIKYININKTGDMIEIEVDGNGFLWNMVRIIVGTLLEVGMGHMKPSDVGRILEEKKRSESGPIAQAKGLCLKEVHY |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_HG917868_3 | 1653092-1653183 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_HG917868_3
|
1 spacers
spacers of NZ_HG917868_3
>3.1|1653115|46|NZ_HG917868|CRISPRCasFinder CCATCTGGCCCTCCAAGTGGAACATACTTTTCTCTTCTGAAAGAAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_HG917868_3
The CRISPR arrays of NZ_HG917868_3 >merge|NZ_HG917868|3|1653092-1653183|CRISPRCasFinder TTCCACCATTACCACCATCGCCTCCATCTGGCCCTCCAAGTGGAACATACTTTTCTCTTCTGAAAGAAATTGCACCATTACCACCATCGCCT >NZ_HG917868|3|3|1653092-1653183|CRISPRCasFinder TTCCACCATTACCACCATCGCCT CCATCTGGCCCTCCAAGTGGAACATACTTTTCTCTTCTGAAAGAAA TTGCACCATTACCACCATCGCCT
>NZ_HG917868.1|WP_044037900.1|1651629_1651920_-|ribosome-assembly-RNA-binding-protein-YhbY MITSKQRSYLRSLSNNITPIFQIGKGGIDDNMLKAIESALEARELIKISILNNSDYGAREASDEICKKLKCDGVQAIGKKIVLYKKSSKKPVIELP >NZ_HG917868.1|WP_044037897.1|1650418_1651594_-|nicotinate-nucleotide-adenylyltransferase MKKAIFGGTFDPLHIGHLNIAFEALYLLDLDEVIFVPTGNPPHKKNITSNYHRVNMIKGTIDKYDKLSLSTYEIEKEDKSYTFETLEYFRNIEKNTEWYFIVGEDCLLNIEKWKNPDKVLNYATLVVFKRTDNNVNRLKEYKDVIEKKYNTDIILLDNKVIDISSTFIRKSIYQNREVSFLLPSYVRKYIKKFRLYEKGDTLILKEKIKNALKDTLNSDRYDHTIRVVDEAKKLALLYGIDEEKAEIAALAHDCAKNISYDELKEICEKGNMIFTEDDLNSKPIWHAYAAAIIAKEEFNINDEDILNAIKYHTTGRRNMTALEKIIYLADYIEPGRTFEKIQEVRVLAYDKNIDEALIKAINNTIEFLISKGSIIHKSTIEARNYLIMNTK >NZ_HG917868.1|WP_051483748.1|1649042_1650407_-|LCP-family-protein MNNKWGRILRNILVMMMVITGSIGSAVTYLYSGFIFKSDVYGSSETKKEEEIPKITDPVNILITGVDIGTPGEESGSASNPQRTDTIMVAHYEPSLDQMTVISIPRDTKVYSKRQNCYIKITEVHAYGDLHNSGIQDLEETVEELLGININYYMKIDYSGFHEMIDAIGGVTVTIPQTMIYDDPVQDLHINFTKGDVVTLDGQKAEEFFRWRKNNEGIANEKDGGDLGRIDNQVVFIKAFIEKVASPSIVTKIPVLLQSLSNVLYTNMDGDYILKYALNFAKLGVDKVEFATLRGDTPPWEPGEASYFIYYPEWNRDILQALNGKQFFSRYDKNVKIINKSSDSGIGDKLKTILVNDYSYNKYNVNIENNSEEVVENTSLDVYGIDEKYDNVIKDDFLTNVINHNEKSEDTKYDIVVTLGNNSIDIINNYTLKEKVIDTSSNSSTSTNSSNSSY >NZ_HG917868.1|WP_044037895.1|1648487_1648874_-|RidA-family-protein MEKEIISTINAPAAIGPYSQAIRVGNLVFTSGQLPLIPSTGELVKYDIKKATVQCLENIKAILDEAGTSFDKVVKTMVFLRDMEDFEDMNEIYSKYFAVKQPARSCVQVAKLPKNAPIEIEVIALVTE >NZ_HG917868.1|WP_044037893.1|1647528_1648422_-|RluA-family-pseudouridine-synthase MSNFISYIVDEVDNGEKIRNYLKYKCNLSSRFCRSAALNKNILVNGEIVKLSYILKAGDKIEINLKKEENQDIEAEKMDLDIIYEDSDIIIINKPPNLVVHPTKSHQSGTLANGVLYHFRENGDSSIVRLVSRLDMNTSGLIIIAKNQFSHMALQRDMTEGHVDKIYRAICHNKMKYSEGTINLPIYASEESKPRRIIDDRGQRSITHYKVIEELNDATYIELKLETGRTHQIRVHLAYYEYPIFGDNLYGKEEKEFIDRQSLHAYKLRFNHPKTGERMEFIAPIPDDMNNLLNKLK >NZ_HG917868.1|WP_044037891.1|1646845_1647472_-|helix-hairpin-helix-domain-containing-protein MKEFFNKYKILIIVVICLLGFLLIFSNFNSSINDEEDAFKKYSKETEIKEDSEDSYTEKNKEEEIFVYIGGAVVKPNVYKLMEGSRIKDLVQVAGGFLDNAESKDINLAQKLNDEDYIYVYSVGESEVDATIDSVVNSSIRKDGCININKATVEELKSIDGIGEVRASKIVEYREENGPYKNIDELKTIGARIGEKTFETIKDKVYVP >NZ_HG917868.1|WP_044037889.1|1644439_1646815_-|cation-transporting-P-type-ATPase MHSLRWDEVLRNLDTTISTGLSSDEIDARRSKYGDNVIKEYRNKIFNNLKNFIMSKFFLIATVYSVFTWFYSQYKIVCYISLLFVLLIAFIIIRKVNNPISFDRVNNKEVRVKRDGLIKYIKSAELVVGDIVFIEEDDISPADIRIIQGNNITVKEIFINGEDVPVNKFSLEIDESSDFKERSNILYKGSKIVSGHGIGVVIAVGYNTKLGEKLLDHVIENNRLKLLKYIDNMISPIYVLSMIISIFELILMKNSYSKSLAITLPLIPVYILLFIKCIKNEFRKDEIEVSGILDLEKLNNTDYIVIEDKDSFYDDDIDIIEIIIDEKRYSTLSLAPDEYMITRAFEILHICSLDVPEGFDNKISKKIIDFLDDMKFNYNESKSKIKSIFTLPYNIENDVVTKVIAVENGYRAYSLGNINTIINSSTFRISNELEVKLEEDYIEKIKELDIEMSKKGFKTVAFSYRAFNYKPSEYENIESNMVFVGVLVYKSRVNCNYETNIQLIRDMNIKVLTYTNDNKLVAFNKGKLLGNIYKESDIISGVELKNIDKDEMNRNIEGYKVLSKVTKDQIEDIVKELRIKKYNILYSGDSIGDLGILKESSVSIYKGNNNNSLCKEVCDFTIKNNHLTKILKGMELSKQIIKRFNYIQGFFISFFGTVLLSNIIIMKLCERSLYNYIELFILNVVCISIYIGYLMLNLESEKVTYYKKYKFNNSLACIKLNIKDIVISTLIILIPFIIPFLQFSVKKYLSLIIFILIYTIKALLNGYRESKVQDIILILPSIIILLYIFLM >NZ_HG917868.1|WP_044037887.1|1642768_1644388_-|ComEC/Rec2-family-competence-protein MKNILSFIKIFCEEKLQGKYIGGFPLLAIILSINYWFNDCKIITTIMLFIVTIFIFSYYKVRYTIIFIVAFFSTSFLCINYLSYSDVNKLCIVENNGINSIGESGNHLILVNNSDLKVGYEYLLEGKFTKALDLNKGYYGIYDVENIKECKKTYRYFIIRLRGIIKDKYSEKLDKKAAMKIDSLLLGDTSTLPSIEKEKMKSLGIYHIISISGFHLSLLFKLLDKFTSKTLSIVFILSYIIFLGAPVPVLRAFIMILINIFSYKLYRNYDGVNALIISAIIILILNPIKLYSLGFLLSYAGVFGIYFFNDFFKKKLIFLPETIGESIAVSISATVATAPFIFATIKGISVNCIIANLFLAPIFSLIIALIFISLFSIFFNPVLDFLCYVINIVSRIIDYMIDKLYYNTLDEIFFSSEVAILLIAYIFIAFLYKSNIEVKRIILGTTILFYIFILNPIHRVELIKYKDSYGIVEREAKNSTFYYYGKIKSMKEEEFLKKYLLVNEIYSNANKKFDIINCRENYYYQSSPVVIDTYILEGE >NZ_HG917868.1|WP_044037885.1|1641749_1642766_-|DNA-polymerase-III-subunit-delta MIDYFKLKDDIKNNKFKNNYILMGVNEHLIKECVEDIVKKNVKEEFLDLNYIKFDGFKLDFQEVINACETLPFFDEKKVVVIYRGDFLRNSKDKEHKKNFKEYKEYIKNIPSTTILITYCVFDNKREKIPSEVKPLSKNSELVEFKQLKGEALNKVLRSLFKEKEKEIGRAELSYLSSILDGNIDVINNEIEKLINYCKDRPITKEDIIKLMPPLNENDIFNLVDSISKRKIKDALDILSELINRGEKEPMILFMILRQYRLLYKIKSFSEQGYDSKSISKELKINEFVCNNLYILSKKYSFITLEKSIEKILETEKAIKSTSSEDNLELLLISLGAL >NZ_HG917868.1|WP_044037883.1|1641456_1641717_+|30S-ribosomal-protein-S20 MANIKSAKKRIKVTEKKTLRNKMIKSALKTTIKKFEVAVAAGNTEEATVAFGAAVKALDMAASKGIIHKNKAARGKSRLNAKLVAM >NZ_HG917868.1|WP_044037906.1|1653338_1653641_-|50S-ribosomal-protein-L27 MFIIDLQLFAHKKGVGSSKNGRDSESKRLGTKCADGEFVLAGNILVRQRGTKIHPGTNVGKGGDDTLFAKVDGIVRYERMGRDKKKASVYPIAVEEAINE >NZ_HG917868.1|WP_044037908.1|1653645_1653972_-|ribosomal-processing-cysteine-protease-Prp MIKIDFQKHCDKLISFNISGHAGFDESGRDIVCSAVSVLSGAVINGVTEILKIDAPYDFSDGHMSISLSSLSDEEIEKCQVLMETMLVSLKSLEVNYKDYVNVHIKEV >NZ_HG917868.1|WP_044037910.1|1653974_1654286_-|50S-ribosomal-protein-L21 MYAVVVTGGKQYKVEEGNTIFVEKLEAEVGSTVELDKVLAVSKDGEIKVGKPVVEGAKVVAKVVAQDKAKKIIVFKYKPKKDYRKKQGHRQPYTKLVIEKIEA >NZ_HG917868.1|WP_044037912.1|1654398_1655838_-|ribonuclease-E/G MKELFIDRDKDILRIAIKNKGKLEKLYIEEEEKEPIQGEIYKGIVKKVIPNLRSAFIDIGFKKNAYMYIDDKFNNNEIKNGDEVIVEILKEGTRDKGPKVTNMLSIQGKYIVLDSSSDKLRFSSKIDNEENKVNIVQGILKPKDIGVIIRTKAIGVSVSDINEEIGLLYDTYLNILKKGQFSLKPSKIYDGGGTIGKVLRNIVEDDIKITLNNINDYNRIIEMKFLQMNKKYDINYYEENIPIFEKYGIENEILKLRNKKVKLPCGGDIVIDRTEAMTVIDVNTGKNIKGKNAEKTIFDTNVEAAKEIVRQILLRNISGIIAIDFINMNSKTYKKNIIDILKKYLHEDDNKFSIVNFNELNIVHISRMKKGKSILEYIDERCTICHGKGTILKFSYLKMLMRNEIVRQMKEYTVRKFHIAINKAYKDVIENKKQLLIDEYREIECDIYITYTNEIDTYKVEPIIFENMRKKLEEFKITK >NZ_HG917868.1|WP_156930525.1|1656004_1656715_-|DUF2344-domain-containing-protein MKVRYLIKFTKESNIKFISHLDLMRTIHRTVRRSGIKAKYSKGFNPHMIMSIAQPLSVGVYSDSEYLDIELEEIISEKTVIDKLNMAAPSGIKFLDAKMIVEKENTKKPPTAMAAVEGAKYIIKIKYNDDILLKDELQDLYLKENWQTIKKSKKGEKLVDIKPMIKEFEYTIENNLLTIETIVACGSRENLSADLLGNFIKENTSNAVSDAFIEIRRLELYGMKNKKLVPLNKAIV >NZ_HG917868.1|WP_044037914.1|1656692_1658552_-|TIGR03960-family-B12-binding-radical-SAM-protein MNRINDDILYRVEKPARYIGGEYNSFNKDLNNVDIRFAFCFPDVYEVGMSHLGMKILYHTLNQREDTFCERVFAPWDDMEKLLREKEIKLFTLETKDSIDNFDFVAFTLQYEMSYTNILNMLNLGGITIRASERGEDEPIVLMGGPCSTNPETLYDIADIFSLGEGEDHLNEIIDCYKKCKAKGMSKKEFLREASHIESTYIPSLYDVTYNEDNTIKEFKPKYEDVPKTVKRRVINNYNDVEYPDKLVVPYTEIVHDRIMLETMRGCTRGCRFCQAGMIYRPVREKKTETLMKQADKLLKATGYEEISLTSLSICDYSDVKNLVLSMVERYKDDKIGVSLPSLRIDSFSVDLINEIQKVRKTGLTFAPEAGSQRMRDVINKGVNEEDLLTSVSDAFKNGWSTIKLYFMVGLPYETVEDVKGIAHLGEKVVDEYYKIPKNERNRGLKVTISTSIFVPKPFTPFQWAPMDNLENVREKIAALRGEIKSRAISYNWHETLVSYMEAVIARGDRRICDVIIKAYEKGARLDGWSEFFNYDIWMEAFKECNVDPEFYVHRERDYEEILPWDFIEIGVTKNYLKKENEKAKKAALTQDCRLGCTGCGVNRNAFAKGECFEGALFN >NZ_HG917868.1|WP_044037916.1|1658620_1659442_-|M50-family-metallopeptidase MIKINKRFFIYVIIIVIATRSLSILYSFLFIIIHEIAHLLVAICFKYKGYTIEIDILGARLHYKDIEDMSIKEDIIISLAGPIINIIMGLIFCLLSLYEEMIINYILGFFNLIPVIPLDGGRILKNLLTKRYLYKKANVITIYISMVIGVFFLVTAIILGIEFKFNISLLLISILIIYCSYREKRRIVYVVMGDLMKKREKFFKKGYIESIVVSISYNKSLLSVLTLIDKGKYTLFYILDDSMNVIKVISEEEVLKGVKEYGDITIKEYINLP >NZ_HG917868.1|WP_044039815.1|1659841_1660975_-|rod-shape-determining-protein-RodA MLSNLKINKKLLGEIDFTILMIAIVIVIFGVLNIYSATYNKTLDGVPIGFEYAKLQLMWLGVGLIAIYFILTIDYSFFRNYAYVFYGASIILLLINKVAGTVSKGANSWIQIGSRAIQPSEFAKLAIIIIVAKKIEDMDGKIDSFKKLFIIFIYAIIPTSLVIIQPDMGMTMVIFFTVLGMVVVGKLDWKIIGGGFLALFIAIAVVWNSGLIEDYQKNRIITVFNPARDPLGDGYHVIQAKIAIGSGGLTGSGYMNGSQTKGGFIPEAWTDFIFSVVGEEWGLLGSVGLLALYGIMIFRMINIARESKDVFGSILVAGVTGSMLFSILENAGMNVGLMPITGITLPFMSYGGSSMLVYFMSLALVLNVGMRRKKINF >NZ_HG917868.1|WP_044037918.1|1661106_1661370_-|cell-division-topological-specificity-factor-MinE MDFFKFFTEKQAPKDVAKERLKLILIHDRQDLSPTILEKMKNEILEVISKYVEIDNADVDVKLTTDNNMDGCGPALIANIPIKKLKE >NZ_HG917868.1|WP_044037919.1|1661387_1662182_-|septum-site-determining-protein-MinD MGEAIVITSGKGGVGKTTTTANIGTALASLGKSVVVVDGDTGLRNLDVLMGLENRIVYTLLDVIEEKCRLKQALIKDKRFENLALLPTAQTRNKEDINMEQMVSLVGELKKMYDYVLIDCPAGIEQGFENSIAAADRALIVVNPEVTSVRDADRVIGKLDAKGIEDHKLIINRMNPAMAASGDMLNVNDIVEILAVKLIGVVPDDKGITVSTNKGEPIVLEDSAISGRAFKNIARRILGEEVPFLQLKAEEKGFLASIKKIFSK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_HG917868_4 | 2299388-2299478 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_HG917868_4
|
1 spacers
spacers of NZ_HG917868_4
>4.1|2299411|45|NZ_HG917868|CRISPRCasFinder TCCACTGCATCTATATATGTCTAATTGTCATATTAACACCTGTTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_HG917868_4
The CRISPR arrays of NZ_HG917868_4 >merge|NZ_HG917868|4|2299388-2299478|CRISPRCasFinder TAGTTAAGTAGTGGTGACAAGCCTCCACTGCATCTATATATGTCTAATTGTCATATTAACACCTGTTCTAGTTAAGTAGTGGCGACAAGCC >NZ_HG917868|4|4|2299388-2299478|CRISPRCasFinder TAGTTAAGTAGTGGTGACAAGCC TCCACTGCATCTATATATGTCTAATTGTCATATTAACACCTGTTC TAGTTAAGTAGTGGCGACAAGCC
>NZ_HG917868.1|WP_044038971.1|2296881_2299221_-|endonuclease-MutS2 MEERTFKILEVQKVLDKLVSYSNTEKGKEMSATLMPFNNEYEVNRALKETKEAYTYVIKKGRAPIYSDKGLKEVLSRAEKGGELNAKEILIVGRSLRTAREITVYLDSDDIDENSLRDSAVNITTIKWLEDKIEQCIIDEDEISDNASRALGAIRRNLREKGIEIKERVGSMVRNYSKYLMENIYTVRGDRYVLPVKVEYKSTVKGLVHDVSSTGSTVFIEPMELVTLNNEIKELKLKEMAEIERILNEISRDINKNVKALKMNREIISDLDFIFAKGAYGLEIEGIVPEINSNGIYNIVQGRHPLIPSDKVVPLDINSGEDFTTIVITGPNTGGKTVTLKTVGLLHVMALSGMMIPAYQGSVINVFEGIYADIGDEQSIEQSLSTFSSHMTNIISILGKAKSNSLVLFDELGSGTDPTEGSALAISILEELRSRGCSIISTTHYSELKRYGLNTAGVENASVEFDVATLRPTYRLLMGIPGKSNAFEISRKLGLSDDIIKFARENIAKDTLEFEDLIRSLSEKTMEAEKLSRENETLRNEAKDLYEKYKTKLDRIDEVREKSVEAGKEKAKKIIEEAKEEADKILKEMREMERHGITSNMRHEMEKKRKALKDKAEKMESAKKAQGGGLTKVSEGQEVKIISLNAKGVVLSFDDKKQEAVVQAGIMKITSKYSDLQGATVTKSEKKATKREVKLNLKSVSTSLDIRGLDGEEGKYRTDIYLDEAFVAGLEEVTIIHGKGTGALKTAILSMLRNHPHVKKFRDGEYSEGGNGVTVVTLK >NZ_HG917868.1|WP_044038970.1|2296442_2296877_-|DUF523-domain-containing-protein MKLVSMCLCGVNCKYSGGNNFDEGVLEIINCGEAIPVCPEVMGGLGTPRIPHEIVGGDGFDVLEGRARVISKDGEDNTAAFIAGAEKVLEIAKKLDIKEVILKSKSPSCGNGKIYDGSFSGILIDGVGVTTALLIKNGISVSSI >NZ_HG917868.1|WP_051483803.1|2293154_2296064_-|insulinase-family-protein MMVNNLNPNYTIVEETKVEEINSEAYSLEHNGTGAKILILKNEDDNKTFSITFRTTPENSTGVAHILEHSVLCGSEKYPVKEPFVEMAKGSLNTFLNAMTYPDKTMYPIASRNNKDFKNLMSVYLDAVFFPNIYKDETILMQEGWHYELENPEDELKYKGVVYNEMKGVYSSPDSMVYRKIYRGLLPDTTYGVDSGGNPKDIPNLTQEEFINFHKKYYHPSNAYIVLYGDIDVNERLEFLHNEYLSKFSKEKIDSKIKLQKPFKETKEIQEYYSISKDDDDKNKSFFTYNFAVSSTSDVTKNLAYEVLEYVLIDAQGAPLKKALLEKGLCEDVYGSFDKGIAQPVFSIIAKNVDENKKDEIKNVIMDVLKNVIDEGVDKKFLEAALNKKEFYLREGDFDRYPKGVIYSMVVNDSWIYDGDPLRYLVYEDDLKELREKINTNYYEELVKEAFIDNKFATLMMVSPKKGLEEEETKALHDKLQKIKASMDKDTIDTIVKNTELLKKKQETPDSPEALKVIPTLELSDIDKEAEKLPLTVGKYNNNTYLYSNIFTNKILYPTFLFNTKSVAEEDISYIPILARLLTRVNTKNYTYEELAKEIDFYTGGIDCGSSAFFYNDTDTDFFPYMSVKGKTTEANTKKLLELMDEVILNSSFEDKNRVKEIIFELKSRIESSLNSRSHVIAATRALSYVNKNHRYLERNSGYSFYLFLCKLCEDIDNDFDGFKNKMEQLRSEIFNKDNLYILLTCGEEEEKIFKNEIDIFYNSLGDKKFEPKDYKLELEADNEGFTTSGTVQYVAKAGKIDNYNGSAAVLKSILSLDYLWNKVRVMGGAYGCFASIGRSGNLFFTSYRDPNLNNTIDVYNNAYEYIKNFDATKDEMKKYIIGTIAEIDAPLTPAAMGEKAQANYLKRLTYEEVQKEREEILSTTVEDIRAHSEDIKKVMEDNNLCVIGNEKKIKENCDEFHSIEPLVK >NZ_HG917868.1|WP_051483802.1|2291990_2292866_-|hypothetical-protein MHRKSIFLTEKSKYYTILKCINDMNRDITINRACPHCCGDNIIKYGKVKSNKAQIFYCKTCERRVVETIGTPFYRSRKNNEIWDKYFENMWNGYNIRECAKKIDISQNTSFSWRHKILSYYLKFFKRKPLNDEVDVMVRTYVQNSKKEKESAIENVEKEALTLKLGEKCYFFFTKNNDGTIEFLPFDKYPLARLSLKRKLDIIFSNVKKVGIYGNNVIKSYAKKCVKEVTKVMVDSELFLYERDMRSWISGFWGVSFRYISNYFNWFRIYYINNKRYKETRQYIYGAEKII >NZ_HG917868.1|WP_044038968.1|2290364_2291834_+|aminotransferase-class-I/II-fold-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MYKLEQNKTPLFDALISYVNNETIPFHVPGHKKGLGVDEDFKNFIGENPFKIDVTVFKSVDSLHHPKGAIKEAQILAADAYGADATFFSVHGTSGAIQAMIMSVVSDGDKIIIPRNVHKSITTGIILAGAIPVYMTPEFDKNLGIAHGVTKATVEEALKNNPDAKAVLIINPTYYGVATEIKAIANLVHSYNIPLIVDEAHGPHLAFSEKLPISALEAGADICAQSTHKIIGAMTQVSLLHVKSKLVDTNKVKQMLSLLQTTSPSYILMASLDTSRRQIALHGKELLKDTIELYTYAREEINKIPGFYSFGNEILGKPGVFALDPTKLTISCRELGITGDELEKILATKYHIQMELSDFYNVLAVGSFGDTKENIDLLISALKKISEEFYGKKTPLQDFLDIPDIPESKLTPRQAFYSSKVSVRLEDSIGKISGEFLMAYPPGIPILCPGEIITSKIISYVNQLKSAGLYVQGTEDPEVEFIKIVTDSL >NZ_HG917868.1|WP_084485416.1|2289646_2290210_-|50S-ribosomal-protein-L25 MMKNLNINNREGSNNSLRRKGLLPGVLYGEKIKNTLFEISEMELASELAREGSSGMCNVHYGNEDFTAIVREVQKDPVTRKIIHIDLEKISASDKVTSEVPLNFIGEGAVESIGGVVIKEKEKLKVKGPASEIPSSINIDVSKLKYGETITGSDVEFGSEISLAEDGNSVLAVVLSKGNQVEEENVE >NZ_HG917868.1|WP_051483801.1|2287894_2289277_-|polysaccharide-biosynthesis-tyrosine-autokinase MEEVKVVEEFSNEISFSQIIFALKKRWKIIFATTIFFTALVALITFFFIDPVYEVHTKVFIGKDAEVNYDNNDVQMYQKLLLTYAQILKTEDLIGTALNNVDSDMTMEEVMKDITVEPITDTQILQIKLTGKNKDDLAVVLESITEEFIKESKEIVPNGNVKIIRHVKEAEAPISPNKKMNIILGFLIGLVSGMAIVFLIEYMNNTYKSKEEVERNLKLPVLGVIPKFGRKREKLVMEEEPRSLEAECYRTMVTNIQYSSIDSRCKTIVVTSSQKGEGKTTISGNLALSLAGWGNRVVLIDCDIRRAALHKAFNISNSKGLTDVLVNQASLKDVAVGIKETLLLIPAGRVSPNPTELLNSKAMELLLEELKETCDYVILDTAPVEAVADAQILSAKADGTLVVIKSGDTRINVIQDALNLLNKVRGKILGVVLNATEDGRLSKMYQYYGEEHKKKGDKVS >NZ_HG917868.1|WP_044038966.1|2287205_2287865_-|sugar-transferase MERLVLENVESDAIEVKTSKIYLFIKRIIDIMGALIGLILLSPLLVIVGVLIKIESKGPIIFSQDRIGKNGKIFRMYKLRSMVANAEELKEKLIKENEMSGPMFKIKDDPRVTKIGRFIRKTSIDELPQLLNVLKGNMSLVGPRPSLPNEVLEFEPWMNKRLMVKPGLTCYWQVMGRNNIDFEQWMLLDIKYVETRSIIVDIKLIIKTFFVLFGDKNAS >NZ_HG917868.1|WP_044038965.1|2285846_2287193_-|UDP-glucose/GDP-mannose-dehydrogenase-family-protein MEIVVAGTGYVGLVTGACLAEVGHKVTCVDIDEKKIEIMKKGISPIYEPGLDEILDKNYKKGKLDFTTDYKEAYRKADVVFIGVGTPERVDGSANLDYVFSVCRQIAKNVTKDCLVVVKSTVPIGTNDKVEEFLRENVENNIHIEVASNPEFLAQGTAVRDTLFASRIVIGVESEKARDILMNIYERFNQPIVVTNRRSAEMIKYASNDFLALKISFINEMANVCEIVGADIEDVAKGMSYDSRIGNKFLSAGIGYGGSCFPKDTKALHWLANDHGYEVKTIKATIEVNENQKYKLFRKAKEVFGSLKNKRVAILGLTFKPGTDDLREAPSIENVRRLLDEGAKVIAYDPVGENNFKKIYPTEIIYAESMEEAINDSDMAFIFTEWDEIKSIGIDVFIEKMKTPIIFDGRNCFNLDNIYEKEVYYYSIGRKTIKNFSKKKLNEKIFLK >NZ_HG917868.1|WP_084485414.1|2284265_2285594_-|polysaccharide-biosynthesis-tyrosine-autokinase MSEALVEKPVNIIRLVRIIRTRWKIVIFVTSFLTLLTIILNLFVLQPVYQCNVKMFIGKSIDEDGNYSNNDIVMYQSLMKTYVEIIKTEDLVERSLSKIDSKIEPAEVLSNLSVDAINDTQILQVTLEGEDKREIYEILASITEEFVATAKTVVPNGNVQVIRNAKEPQNQISPNIEINIVIGILSGVLLSGIIVFIKEFKGSCIETKEEVEGKLGIPVLGMIPKNYKDTDIFEVDKNPKSVISEEYRRLRTNLKYTSFEKYHRVFQVTSAVSGEGKSTVSINLALALAEEAKVVLIDCDMRKPSIHKKLNISRKGGLSDILIGKCDIMDVAYRYNKNLLIITSGNSIENPSEMLSSRAMERMVRRLKDVVDYVIIDSPPVQAVTDAQILSTRCDGTILVVKSGETKAKEVLNTIDLLNKVKGNILGIVLKYVEVNNKKYVQ >NZ_HG917868.1|WP_044038972.1|2299508_2301845_-|U32-family-peptidase MEKIELLAPAGSLESLYAAVNSGCDAVYLGGSKFSARAYASNFGEEEMKEAVLYCHLNSVKIYVTINTLIKDKEVREAIEYVNFLQSIGVDGVIVQDLGLAYLIRKNFKDIELHGSTQISIHNGEGAKALNDLGFKRIVLARECTLKEIEYISKDLGIETEIFVHGALCVSYSGQCLMSSMIGGRSGNRGKCAQSCRQNYKLINEKTGEETEGYLLSPKDLAFIENIGEIIESGTASLKIEGRMKRPEYVAGVVSMYRKAIDAYYAGEPFDYDTAMKNLAKLFNREGFSKGYLFKNTGSDMMSFKFPRNTGVVIGEAVSSNEVLLKENIVIGDGIRFGEEGFTISSISVKGKSVEEAYMGDVAKLKEGKFKEGEKIYKTSDVKLLKSYENTFKTQYLKKNPLDIEVYFKIGDKMKLTTSFKGKVFEVYGEEVQTPLKRPLFKENIEENLKKTGNTPFEVNSITFSEYEEGFMAISALNNLRRTLIEKIINWVKIDRGLVEKLDLNRETKNIKELPSLLVIVQNLKQLKGAYEGGARDIAINPFMRGTNIDFSQIPEDLNLYLRLPTIIKEEYRMVSAYIEQNIDKIKGLITSNFGITSEFHNRTSIIFDYKGNLFNKYSIDFLESMVDGVTLSLELNKSELKDVSKGTPLTPYVYIYGKVESMISEYCPIGATFGGKCEVKGCNIACEKGDFVLRDRLKEDFRVKTDKFCRSHIYNSHPLNLIDNIKELKGINISNFRVDFVDEDEDRVHHIVEAILSGDNIEGEGKFTKGQYKRGVE >NZ_HG917868.1|WP_051483804.1|2301897_2303031_-|cell-division-protein-ZapA MNKVVVKVNGVEYTLKGEEKEEYLQSVAAYVDKKVQMILDKNSKLSSTDASVLASMNIADELFKWDKYIAELEDKNSILKSSQKSYNDKINELQSKINELEENAKKAASEDTEEIKKELDDLRNNYIELDKKYATLKEKYNGVKNYNNKVKEEKTNVIKEKEAKIKELEVANKEIVELKKVNTELESSQKDFEKIRNRSSEIENELKTCMGQLEDTKSKLEETTRQLEAADRKVQYSNQTVEDTSKNLRECNKKLNETKEKLREAEVKIENDTKMINNLNMKISRMEKDSKQEPSDQANALREAVEKEAANVKAQFEILEEESKKLKGENEKLLSRNKELKFSLQSAKYKVMDLEKKFLDSQITIATLKKNSNKMFK >NZ_HG917868.1|WP_044038973.1|2303211_2303607_-|DUF1284-domain-containing-protein MKEIKLRYHHIMCIHTYSGHGYDEKFAENIEKIIKIFKEEPNINIRFIDNCDDVCKSCPNRNGEYCLGEDSIREKDNRVKKYFELDRKSIDTYKDLVGEIKPTFSELQDISEVCGRCDFKKLCNKVLPKNI >NZ_HG917868.1|WP_044038974.1|2303593_2304136_-|biotin-transporter-BioY MKIKDITLIALFTALISVCAQITIPIQPVPITGAIIGIFITGAVLEKKQGLIVGIVYLLLGAVGIPVFTGFGAGISSIIGPTGGYLITYPIMIYLIAWCIEKFKKENIVFLSIYMIFSLVPCYLVGTIWLAISCKLGIYEAILSGVAPFVIFDVMKGILGAVVAVAINRALVKGHIYERN >NZ_HG917868.1|WP_044038975.1|2304514_2306887_-|phenylalanine--tRNA-ligase-subunit-beta MLVPIDWLKDYVEIKEDAKDLGDALTLSGSKVEKVEVYGEEIQNVVTGKIVKITKHPEADKLSICQVDIGAEEPIQIVTAATNMKEQDVVPVALHGSTLHGGLKIKKGKLRGEVSNGMFCSLEELGLAEEGTCHGLHIMDTNTPLGVDIKEAVDFGGGVIEFEITSNRQDCFSVYGIAREVAATYGRELKGLNTSYKTSGGNVNDIVKAEIKDSLCRRYMARAIKNVKIGPSPSWMQNRLNEAGIRPINNIVDITNYVMVELGQPMHAYDRRDIAEGTIIVERAKDNEKFTTLDEVERTLTSEMLTIRDGKGTIGLAGIMGGLNSEVKEDTTEIIFEAANFEGVNIRLTSKELNLRTDASGKFEKDLDPNLPALALDRACALVEELGCGEIVNGTIDIYNEKKEEGHLTVSISWINKFLGTEIHGIEMKRILESLGMATEINGDNLEITTPTFRSDMNIREDVAEEVVRIYGYNKVEATMPSIHATKSGKSEKMQLNDELAKVLIGSGLYESIAYSFVSPKVFDKILLPADSELRNVVEIKNPLGEDYSIMRTTTIPSMMESLARNYSRNNKECRLFENGKIYIKEEGKELPNEINILTIGLYGGVDYLNLKGVVENILDHFKVKSAKFERESENPSFHPGKTAKVVIGREVIATVGEVHPDVAENYGIDERAFIAVINLDKLYSFIKKNNKYTPLPKFPSVTRDLAVLIDDEVLVADIEEVIKKQGGNLVEEYSLFDVYKGAQVPEGKKSVAYSIVYRDPNKTLKDSDVNKVHDKIVRTLEHKLGATLR >NZ_HG917868.1|WP_044038976.1|2306906_2307929_-|phenylalanine--tRNA-ligase-subunit-alpha MQEKLKLIETTAIDELNKAVTKEDIEAVRVKYLGKKGEVTLILRGMGGLSPEERPIVGKLVNDVRGNLEGRIENALTDIKKKEKEERLKNEVIDISMPGDKSPLGGKNPLTITMEEIQDIFLSMGFSIEEGPEVELDYYNFEALNIPKNHPARGEQDTFYINDNVVLRTQTSPVQIRVMENQKPPIKMISPGKVYRSDAVDATHSPIFYQVEGLVIDKGITFADLKGMLETFVKKMFGDKMVTKFRPHHFPFTEPSAEMDATCFVCGGEGCKVCKGEGFIEILGCGMVHPKVLENCGIDPNEYSGFAFGFGLDRMVMQKFGIDDIRLLYEADMRFLKQFK >NZ_HG917868.1|WP_044038977.1|2308311_2309106_-|RNA-methyltransferase MNVITSKDNNIIKEIKKLKDRKTRSAKGEFLVEGFRFVEEALKSDFEIKTLIIEESVEDKLSNYNIDKYLDKVETIYVTKSIMKILASTETPQGILAVVKNKDIKLKDNEGFYIFCDKVQDPGNLGTIIRTAHASGALGVILRKGTVDLYNDKTLRSTMGSVFNVPVVYDNDDLDIIMSLKNKGFKVVSSSLDTDYNFYDIDLTGKCIIVVGNEGNGISSEIFAISDEKFKIPMPGGAESLNVGIATSVIAFEAVRQRNFKIKC >NZ_HG917868.1|WP_044038978.1|2309107_2309788_-|TrkA-family-potassium-uptake-protein MRKKVKEKQYIVIGMGRFGTSVALTLAELGREVLAIDKDVDRIQDISDKVTHAVTLDSTDENDLKAVGIGNFDVAIVAIGKDIQASIMTTLLLKELGVKYIAVKANNDLQEKVLIKIGADKVISPEKEMGIRVANNLVSSNILDYIEVSPDYSLTEFLVPKSWVNKTIKELNLRVEYGINVMAIKRDGVIEVSPSPDLALLSGDIIVAIGSNDIEELRDFVATEEE >NZ_HG917868.1|WP_044038979.1|2309796_2311164_-|ATP-synthase-subunit-J MSKHILGRIKIKPVQVLALGFMAVLLIGAGILMLPISTATGEKTSFIDALFTSTSAVCVTGLVTVDTASHWSYFGKTVIIFLIQIGGLGFMSFATLFALILGKRVSLKERLILQEAVNATYISGIVKLVKYILSFTFAIEGIGAAILATQFIPEHGLLKGIYFSIFHAISAFCNAGFDLIGDSLFPYQNNAVVILTISALIIIGGIGFAVLLDLFNASQSTRLYTHTKFVLVLTAILLVTGTVFIFIMEYNNPETIGNMGFGGKLLNSFFASVSSRTAGFYSIPLEYLTTGSIFLYFILMFIGGSPGSTAGGVKTTTIGLICLTVVSGLRGKEDTELFKRRISKDVIYKAFSILFLSLMIVVAITMLLSNTEADTLVNGELVPLEGIIFEAISAFGTVGVTLGITPYLSFVGKLLIILTMYIGRVGPITLVMAITRQKKKNAGNIKYPEAKILIG >NZ_HG917868.1|WP_044038980.1|2311299_2311656_-|50S-ribosomal-protein-L20 MARVKRAMNARKKHKKVLKLAKGYYGGKSKLYRTANETVIRALRNAYVGRKLKKRDFRKLWIARINAAARMNDMSYSKFMNGLKKAGIEINRKMLSEIAIHDPKAFAELVETAKKSLA |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_HG917868_1 | 1.66|222136|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 222136-222172 | 37 | JN800508 | Clostridium phage phi24R, complete genome | 6315-6351 | 10 | 0.73 |
NZ_HG917868_1 | 1.79|222991|35|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 222991-223025 | 35 | MN693045 | Marine virus AFVG_25M135, complete genome | 19787-19821 | 10 | 0.714 |
NZ_HG917868_1 | 1.80|223055|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 223055-223091 | 37 | LR721753 | Aliivibrio wodanis 06/09/160 plasmid 2 complete sequence | 73973-74009 | 10 | 0.73 |
NZ_HG917868_1 | 1.80|223055|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 223055-223091 | 37 | NZ_AP019717 | Clostridium butyricum strain NBRC 13949 plasmid pCBU1, complete sequence | 404352-404388 | 10 | 0.73 |
1. spacer 1.66|222136|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JN800508 (Clostridium phage phi24R, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
tagttgcatatgcaacatcagaacctaaagaagtttt CRISPR spacer ttttagagggagcaacatcagaaactaaaaaagtttt Protospacer * * * . . ************ *****.*******
2. spacer 1.79|222991|35|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693045 (Marine virus AFVG_25M135, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tttactatgttaataccaatcttactccaatccac CRISPR spacer ttacaaatgttaatagtaatcttactccaataaca Protospacer ** ********* .**************
3. spacer 1.80|223055|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LR721753 (Aliivibrio wodanis 06/09/160 plasmid 2 complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
ttagattctaaatatccttctttaaaaggtgtttttg CRISPR spacer tttcattttaaatatccttctttaaaaggttccacaa Protospacer ** ***.********************** .. . .
4. spacer 1.80|223055|37|NZ_HG917868|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP019717 (Clostridium butyricum strain NBRC 13949 plasmid pCBU1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
ttagattctaaatatccttctttaaaaggtgtttttg CRISPR spacer atttatgaaaaatatgcttatttaaaaggtgttttca Protospacer * ** ****** *** ***************..
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
166022 : 175966
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_HG917868|166022:175966|DBSCAN-SWA TATGAAAGTCAAAATAGTATCATTTATCTTGGTTATAGTTTTAGTTAGTGAACTATTTATTGGTATTAAACCCATACAAGCTACACCGAATGATACTAAAAATCAATATGTTGAAGCGATAATGAAGGTCGAGGAAGCTAATGACGAAGTAAGAAAATGTGATGAAAAGATTAGTCAATTGATAGTAGAACAAAATGATACAAATAGTAAAATAGAAAGTATTAAAGTTGAGATAGAAAATAAAGAAAAAGAAATCGAAAAGACAGAAGAAACTATTGTCGGAGATGCAGAAGAGTTAAAGAAAAGAGTAAGAACTACATATAAAAATGGTAATGATATTACTTTAGATATTGTATTTGATGCAAAAAGCTTTTCGGATTTATTATATAGAAGGGAACTAATAAGAAATATAACAGGATATGAAGTAAGAGCTATAGATAGAACTAAAGAGGCTAAGAAGACTTTAGTTAATTGTAAGAAAGACTTAGAAAAAGAAGTTGAGAATTTATCAACGCTAAAAGAAGACTTACAAAAACAAATTGAGTCTATACAGGCAGAAAAAGTTGAGCACGAAAAAGTTAAGACAGAGGCAGAGGCTGTAAGTAAACAGTATGCGGAACAATTAAAAGTTATATATGGAGAAATAGAATCTAAGGCACAAATTTTACAAGCACAAATTAGTGCAGGGGTAAAAGTGACATCTACAGGAGAAACTGTTAGTGAAACTGCATTAGCTATATTAAAAGAGGCAAATAATCATTTAGGGAAGAAATATGTATGGGGAGCAACAGGACCGAATACTTTTGATTGTTCTGGTCTAACGCAGTATGTTTATGGTAAGTTAGGAATATCGTTAACGAGAACTACCTATACACAGGTAAGACAAGGGCAATATGTAGCGCCAAAGGATGTGCAACCAGGGGACTTAGTATTTTTTGGGTCTATAAGGTCACCACACCATGTTGGAATATATGCAGGAGATGGAATGTTTATTCATGCTCCTCAGACTGGTGATGTAGTTAAATATTCAAAGTTAAGCTATATGCCGGATTATACGCAGGCTAGGAGAATAATAGGATAGGGTATAGTGATTTTAACTTTTGTTAAGATAAAGGTTTTATACATAATATAAGAAAAGCTCAGGCACAGAATAAGTGTGCTTGAGTTTTTTTATTTTTTTAGAAAACTTCATTTTATCTTTATAAAATTGTATAATAATTACAATAAAGTAAAATATATGGATAGGAGGGCGGGTTTTATTTATAATTTGGAATTGAGGTAAGAGTAGGGATGGGAAAAAGAGAGATATGCTTAGTGATAATGGCTACAATGATAACATTTGCAAATGGAAAGATAATAGTAAAGGCAGAGCCTAGTATTGAAGAAAAACGAGAAGCATATGAGACAGCTGTAGAGGAAGTTGAAAAGTATAGCGATGAGATAAAAAAGATAGATAATAAGATATCGGTTCTTATGGAGGAACAAAAAGAAATTGAGATAAAGATAGATGATAAGAAAAAAGATATAGAAGATAAGAAAAGAAATATACAGGAAGAGAGTATAGAGTTAGAATATAATGAAGAAACTTTTAGGAAGATGATAAGATCAACTTATAAGTATGGAAAAGATGAAGTTATTAGTATGGTGGTTGAAGCTAAAACTATTGGAGATTTTATAGAGAGAACAGAGGTTATTAAAGGCTTATCTAAATATCAAGAGAACTTAGTGAATAATATAAAAAATAAGAAGGCGTTATTGATATCCGAAAAAGATACAATTGAACATGATGTAGAGAATTTAAATTGTCTAAAAGATACATTACAAGATAGTATAGAAGAAATAGAGGATATAAAAGAGGCTGAAGAAGGATATTTGTTAAAAGCAAAGGAAGTAAAAGAAAAATATCAGGCTGAATTAGCCCTTATGGAAGAAGAGACTAAAAACGATTTGACATTAATGAAAGAGAATTTGAAATACGATAATGAAATAACTAATAAAACTGTTTTAGATATTTTAAATGAAGCTGACTCTCATATAGGGAAACTATATGTATGGGGGGCGACAGGACCGGACACTTTTGATTGTTCAGGATTTGTGCAATATGTGTATGGTAAGGTAGGAATAGAACTTACGAGAACGACATATACGCAAGTAGCAGGAAGAGGTACTTATATTCCTAAGGGAGAGGAACAACCAGGGGATCTAGTGTTTTTTGGTTCTATGACAGAACCACATCATGTTGGAATATATGTAGGAAAGGGAATGTATATACATGCGCCACAGACAGGGGATGTAGTGAAGTATTCTAAGTTGGCATATTCAAAAGACTATTGTCAAGCGAGAAGAATTATAGAAAATTAATATTATATAAATAAGAGGCTGTTGCACTAAAAATTAGAGCACAGTCTTTTGTTTTGATTTTAGTTTAAAATGATAAATTGAATAGTTTTTTTGTAAAAAGTAATATAATAATATAAATATAAAAATAAATTTTAATATTTTTTTATTTTTATTTATGGAAATAAAATCATGAAAACTATTTCAAAATAATGACAGTAAAAGCAAAAAGTTGGACAAGTAATTTTTGGAAAACATTATAGTACTTACTGATATAATTAGATTTATGGGGGTGGAGCTGGTGGATAGATATGCATGCAAATAAGTACAATAAACGATTTATTATTACATATAAACCATAAAATGGGACATGGTATTACCAACTTCTTAATAAAGGGCAAAATATTTCTTCATTTTATCTTCACACAAAAAATTAATAATGTAAAAGAAGAAACAAGAAACATTAAGAAAAAATTAAGATATATTATAAAAGAAATTTAAAAATATATGTAATTAAATAAAAAAAATTAGAGATATATGATATTTAAATATGATTTAAATATTTTGGAATGGGGGAAGAAAAATGAAGAAGAAAGGTATATGCTTAGCTTTAGTTGTAGCGACGTTAGCGATGACTACTAGTATTGGAACAGAAGTAAAAGCGGATCCAACATTAGATAGTGCAAAAAGTCAATATTCAGAAGCGTTACAAAAAGTTGAAGCTGTAAACGAACAAGTAAGAAAGTTAGATTCTGAAATCAGTGCATTAGTGGACAAGCAAAACACAACAGAGAAATCTATTTCAGAAAAACAAGATGAAATCGCTAAGAAGCAAGAGGAAGTGGAAAAGACTAAAGCTGAATTGCAAAAAAGTGAAGACGATTTCAAAAAAAGAGTACGAGCTGTATATAAGAACGGAAATGATGTAGTAATTAACGTTTTAGTAGAATCAAAATCAATGGGTGATTTATTAGAAAGAACTCAAACTGTTAAAGAAGTTTCTAAGCGTGAAAAAACTATAATGGAAACAATGAAAACAGAAAAGATTGAACTAGAAAAAGCGAAAGCAAAAGTTGAAGAAGAAGTTGTAGCTTTAAATTCATTAAAGGATGAATTACAAAAGCAAATAGAAGAAGTTAATAAGCAAAAGGAAGAGCAACAAGTTGCTTTAGCTGAAGCAGAATCTGTTAAAAATAAATATGCTACAGAGGTAAAAGCTATTGAAGATGAAATGGCGGCAGAAGCAGCTAGACTTCAAGCACTAAGAGCTCAACAAGCAACTGCTACAATAGCACAAGCTTCACCAAGTACACCATCAAGAGGACCAGAATCAACTACAGCTACTGCAGCAGCAGTTTTAGCAGAAGCTGAGAAACATTTAGGTAAACCATATGTTTGGGGAGCAAAAGGACCAAATTCATTTGACTGTTCAGGATTTGTTCAATATGTATTTAGACAAGTTGGAATAAGTGCTCCAGCGCCAACATATACTCAAGAAAAATTAGGTACATATGTTCCAAAAGGACAAGAACAACCAGGAGATTTAGTTTTCTTTGGACAAGTTGGTAATACTCATCACGTCGGAATATATGTAGGCGGAGGTATGTATATACACGCACCACAAACTGGAGATGTTGTTAAGTATTCATATCTATCAGGTTCAAGAGATTATAGTTTTGCAAGAAGATTATTAAATTAATTTTATGAAAAAAGAATATTTTGAATAATTATAAGACTGTCGCGCTAATAAATTAGTACGACAGTTTTTTTATTGATAATTGTGGCGAGATTGTTCTGTTAATTTCTTTTATATATAATTTCAGTAAGAAAATTTAGAGGCAACATAATAAATTTGACATATAAAGGATAATAAGATAAACTTATATTACATAAAGTGACAAATAGGCATAAAATTTGATTTATATTTATAATATGTAACAAATACTACATATTATCTACAAAACAATATGAGAAATTTATAAAAAGATATATTTTACTATATGGTAGAAAAATAGGGGTATAAATCTTATAGGGGGAATAAGTATGAGAGTGAAGAAATGTTATGTAGTGTTAAGTTTGATTCTAATAGTTAGTTTTATATCACCACAAAATATAGTCAATGCTACACCGAGTAAAAGCGAAACACAATCTCAATATGATGAAGCGATGAAAAAAGTAGAAGCTGCAAATGATAAGATTAGAAAATGTGATGATAAGATTAATACATTACTTACTAAGCAGAAGGAAACAGAAGCAGCTATAGATGCAAAACAAAAAGAAATAGCAGATAAAGAGGCAAATATAAATGAAAGTTCTAAAAATTTAGCTGATAAAGAAGATGACTTTAAAGATAGAATTAGAAATACATATAAAAATGGAAATGACACTACGTTAAGTATAATATTAGATGCTGAAAGCCTTGGAGATTTAATAGAGAGAAAAGAGATTGTTAGAAATGTATCTCTTTCTGATATAAGAGCTATGCAGAAGATAAAAGAAACTAAAGATAGCTTAGATGAAGAGAAAAGAAGCCTTGAAAAGGAGGTATCAGAATTAGATACACTGAAGAATGACTTACAAGGACAAATAGATACTATTAACACTGAAAAGGCAGCCAGTGAGAAGGCTAGAAAAGAAGCAGAGGCATTAAAAACTAAGTATGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_HG917868|166022:175966|168941_170057_+|WP_051483613.1|DBSCAN-SWA MKKKGICLALVVATLAMTTSIGTEVKADPTLDSAKSQYSEALQKVEAVNEQVRKLDSEISALVDKQNTTEKSISEKQDEIAKKQEEVEKTKAELQKSEDDFKKRVRAVYKNGNDVVINVLVESKSMGDLLERTQTVKEVSKREKTIMETMKTEKIELEKAKAKVEEEVVALNSLKDELQKQIEEVNKQKEEQQVALAEAESVKNKYATEVKAIEDEMAAEAARLQALRAQQATATIAQASPSTPSRGPESTTATAAAVLAEAEKHLGKPYVWGAKGPNSFDCSGFVQYVFRQVGISAPAPTYTQEKLGTYVPKGQEQPGDLVFFGQVGNTHHVGIYVGGGMYIHAPQTGDVVKYSYLSGSRDYSFARRLLN >NZ_HG917868|166022:175966|166022_167102_+|WP_051483611.1|DBSCAN-SWA MKVKIVSFILVIVLVSELFIGIKPIQATPNDTKNQYVEAIMKVEEANDEVRKCDEKISQLIVEQNDTNSKIESIKVEIENKEKEIEKTEETIVGDAEELKKRVRTTYKNGNDITLDIVFDAKSFSDLLYRRELIRNITGYEVRAIDRTKEAKKTLVNCKKDLEKEVENLSTLKEDLQKQIESIQAEKVEHEKVKTEAEAVSKQYAEQLKVIYGEIESKAQILQAQISAGVKVTSTGETVSETALAILKEANNHLGKKYVWGATGPNTFDCSGLTQYVYGKLGISLTRTTYTQVRQGQYVAPKDVQPGDLVFFGSIRSPHHVGIYAGDGMFIHAPQTGDVVKYSKLSYMPDYTQARRIIG >NZ_HG917868|166022:175966|172712_174176_+|WP_044035812.1|DBSCAN-SWA MKEKRRIRDSIAKRLFFMTSSIFLGITIFNVLLQWLFFEGYYNHQKKNSLEKQVQSFKSEYEDQYTDIDLMQMMREYQQKYSITIAVVDKNGSYTMPSTQVPRVDNERLQLIRNIVIWFQDDPVGNRFIKESKESKYELNTLAYVTTGENDEYIIGITSLEQVNEASGISLQLNLYFAIISVVILTVISVLYSNTISKPLIKINRVAKKIAKLDFSEKCVVERNDEIGSLSESINIMSNNLEEALMSLRRANVKLKEDIEKERQLEKMRKEFIADVSHELKTPIALIKGYAEGIQDDVLDKEEAVKIIIDESDKMTKLVMDMINLSQLENGTFKMKKERFNLSQTIKAVADKSKALCYDRKITVKEKIDENLYVYGDNVRLEQVLLNYLSNGIRHCYDEGEIIVTATRKDNDVLVEVENTGNHIDDSDIEKIWEKFYKVDKGRKRDGSTGLGLSITKNIINVHGGNVAVENTEKGVKFSFIIPYSNK >NZ_HG917868|166022:175966|174664_175966_-|WP_051483614.1|DBSCAN-SWA MNEFNNFQDDNNTSSTNNNNSSNNIDDTVSMNSDDINFIMKDSDSDFAQDVPFTSVHNGNNNNNNGTNKYNNKKPKRGLGKTIALCVLISAVVGTGSGVASSLITNNLTSSGNSNNVKTVTNTEQLSFSTTGGVSIPDIYNKVSPAVVGITTQNLTLNQFQVQGGSGSGFIFSEEGYVLTNYHVIEGASKISVMFSNKTTADATVVNYDSDLDVAVLKISGDIEMPAVLELDASADVLVGEPVIAIGSPLGETFLNSLTSGIISAKDRRIEDSDGIKNYIQTDAAINPGNSGGPLINAYGKVIGINTAKISDSSVSGMGFAIPITAVVDVVNDLVANPLNNSVTLGVSIQNLTETQLKYLQIDHGVLVSQVSAGSIAANGGIQANDVITKFNGTEISSTSELQKAKGKVSSGDKVDVEINRSGKTMTLTLDIQ >NZ_HG917868|166022:175966|172072_172735_+|WP_044035811.1|DBSCAN-SWA MKINILVVDDEVRIRDLLGAYLTKEGYNIFYASNGKEALDIFKDNIINFVILDVMMPIMDGIVALKEMRKIKNVPTLMLTAKSEEEDMLLAYGIGADDYETKPFSPKVLVAKINAMIKRNYNVESEDLVIDEEGHRVLVDGKEVSLSKTEFDLLKYFVANEGIVLSRDRILDKVWGYDFEGDLRAVDTGIKRLREKLKDKASYINTVRGVGYKYERKEEN >NZ_HG917868|166022:175966|171527_171770_-|WP_044035810.1|DBSCAN-SWA MKSTGVVRRVDELGRIVIPIELRRTLDIAEKDALEIYVDGEEIILKKYEPACIFCGNARDVINYKGKNICTSCLNELGSK >NZ_HG917868|166022:175966|170401_171460_+|WP_044035809.1|DBSCAN-SWA MRVKKCYVVLSLILIVSFISPQNIVNATPSKSETQSQYDEAMKKVEAANDKIRKCDDKINTLLTKQKETEAAIDAKQKEIADKEANINESSKNLADKEDDFKDRIRNTYKNGNDTTLSIILDAESLGDLIERKEIVRNVSLSDIRAMQKIKETKDSLDEEKRSLEKEVSELDTLKNDLQGQIDTINTEKAASEKARKEAEALKTKYAAELEAINKSIAAEAQQIGGTTNTGTATVSNVLAEAKKHLGKQYVWGATGPNTFDCSGFTQYVYKKCGISLTRTTYTQVKGIGTYVAPGNEKPGDLVFFGSLKSPHHVGIYVGNGIFIHAPQTGDVVKYTKLIYMTDYTQARRIIS >NZ_HG917868|166022:175966|167311_168382_+|WP_051483612.1|DBSCAN-SWA MGKREICLVIMATMITFANGKIIVKAEPSIEEKREAYETAVEEVEKYSDEIKKIDNKISVLMEEQKEIEIKIDDKKKDIEDKKRNIQEESIELEYNEETFRKMIRSTYKYGKDEVISMVVEAKTIGDFIERTEVIKGLSKYQENLVNNIKNKKALLISEKDTIEHDVENLNCLKDTLQDSIEEIEDIKEAEEGYLLKAKEVKEKYQAELALMEEETKNDLTLMKENLKYDNEITNKTVLDILNEADSHIGKLYVWGATGPDTFDCSGFVQYVYGKVGIELTRTTYTQVAGRGTYIPKGEEQPGDLVFFGSMTEPHHVGIYVGKGMYIHAPQTGDVVKYSKLAYSKDYCQARRIIEN |
8 | Clostridium_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
664953 : 766170
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_HG917868|664953:766170|DBSCAN-SWA 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105 | Erysipelothrix_phage(78.02%) | tail,head,protease,portal,terminase,capsid,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1234376 : 1242295
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_HG917868|1234376:1242295|DBSCAN-SWA TATGAAAAGAACAATAGCAGTAGTATTAGTAGCAATTGTAATAGCAAATAATAATGTTTATGCTACTTCAGTAAATGATTTAGAAAATAAGAAAAGTAGTATTGAGAACACATTAGAGGAAAAAAAAGGTGAGATTAATGAAAAAAGAAATCAAATAAAAGATACATCTAAAGAGCTTTCAGATACAGAAAAGGAGCTTGCAGATTTAGATAGTAGTTTAAATGAAATTCAAAATAAGATTAGTAATATAAATACAGAAATAAAAAATATAGAAAAAGAAATGATAGATTTAGAATCTGAGATGGAAGAAAATCATGAAAAAATAGAAGAAAACTATGAAATAATGAGTGAGATAATAAGAATAGATTATGAACAGCAAATAGGTGGATACCTCAATCTTTTATTAGGGGCAAAGAATTTTCAGAACTTTCTTATGAGATTTGAAATTATATCTAATCTTATAAAAAGTGGTGATAGGGCGGTAGAAGAAATTAAAGTATTGCAGGTAGAGTTGGAGTCTAAAGAAAAAGTATTAGCAGAAAAAAAGATTGATTTAAATAATAAGAAGATAGAAGTTGAAAAAGAAGAAGGAAATTTAACTGCATTATTAGAAAAGAAGCAAGGAGAAGTCACTGCATATATAGCATCTAGACAAGCTTTAGAAAATGAAATAAAGTTAACTGAAAATGAAATCAAAGAACTGGAATTACGTGGTAATGCTATTGAAGAAGAAATTAAGAATATAATAGCAAGTAGTAATAGTAGCAACAACAATAGCAGCAATAGTGGTAACAGTAATAATAGTGGTAACAATAATAACAACAATAATAACAACAATAATAACGGAGTTGTAGACAGTACAAGCTTTTTATGGCCAGTACCAGGATACTCGTATATTTCATCCTACTATGGAAGTAGAATAGATCCTATAACTGGAAAACCAGGAGCTTTTCATAAAGGAATAGATATACCAGCGCCAGAAGGCACACCTGTAGTTGCAGCAAGATCTGGAAAGGTTATAATTTCTAGGTTCGACAGTTCATATGGATATTTTGTTGTAATTGATCATGGTGATGGTCTGTCTACTTTATATGCACATAACTCTCAATTAGTTGCTAGTGTTGGACAAACAGTGGAAAAGGGCCAAGTTATTGCTAAAGTTGGTACCACAGGTAGTTCTACTGGAAATCATCTTCATTTTGAGGTGAAAGTAAATGGTACTGCAGTAGATCCAATGAATTATTTAAACTAAATATAATAATTGTAGGAGATATTAAAAATGATAAGTTTTAAAAATGTTAATTTAATATATGATAATGATGTACAAGCACTCAATAATATCAATTTTAGAATAAATAAAGGAGAATTCGTATTTCTTGTAGGTACATCTGGTTCAGGAAAATCATCACTAATAAAAACAATATTAAAAGAAATAGATTGTACAAGTGGTGATATAAATGTAAATAGTCAGTCAATAAAAGAATTAAAAAATAAAGATATTCCTTATTTTAGAAGAAGACTTGGAGTGATATTTCAAGATTTTAGGCTTTTAAATGAAAAGACAGTATATGAAAACGTGGCCACTGCTATGAGAGTAGTAGAAGCAGATGAAAATAATATAAAGAAAAGGGTACCAATTGTTCTTGAAAAAGTAGGGCTTAAGAATAAGTTAAATTGCTATCCTAGAGAATTATCGGGGGGAGAGCAACAAAGAGTTGCTATAGCTAGAGCTATTGTAAATGATCCATTACTTATTTTAGCAGACGAACCGACAGGTAATTTAGATCCTGAAACTACATTAGAAATTTTAAAAATTTTAAATGAAGTAAATAAAAGTGGAACAACTATATTAATGGCTACTCATGATAAAGAAGTTGTAAATAATATGAGAAAAAGAGTAATATCAATGAAAAATGGTAAGATTATTCATGATAATATTGAAGGAGGATATAAGCTTTGAAATTAAAAACAATAAGAAGACTTGTAAAAGAAGGTGCTAAAAATATTATTACTCATAGATTAATGGCATTTGCATCTATTGTCACTGTAATGATTTCATTAATAATTTTTGGAGCTTTCTATATCACTATAAACTTAACAGATAAATTAGTTGAAAATATGAAAGATTCTGTTGAGATAATGGCGTTTATAAAGGATGATGTTTCAGAAGGTGATATTGATACTATAAAGAATTCTATTAGTAAGATAGATGGAGTAGAAAATGTTATTTATATTTCACCAGAAGAAGGTTTAGAGAGCTATAAAACTTCATTGGACAATGATAATGATGAAGAAATGAAAAGAATTGTTGAAGTAGTATCTGAGAATAAAGAAAATCCAATTCCAGGTAGTTTCTCAATAAAAGTAAGAGGAGCGGACTTTATAAAAAAAGTAAGCAACGAAGTATCTAAATATGAGCAAATATATAAAATAGATAATGGAAATTTAATAACAAAATTTTTAACTAAAACAAGTAGTATTGTTAAAGTAATAGGAATAGGAATAATGAGTTTTCTGTTAGTAGCTGCAGTATTTCTAATTGCAAACTCTATAAAGATTTCAGTATTTGTGAGGAAACAAGAAATTAGTATAATAAAATATATAGGGGCAACCAATAGTTATGTAAGATTACCATTTATAATAGAAGGTGTTATAATGGGTATAATTGGTGCTGTTATTAGTGTTATAGTTATTTCAATAGGATATTCTTTAATAGAAGACAATATTATTAATTATATTGGAAGTACAAATTATAATATTATTGTACCTAGTATTAGTAATATGATTTTAAAATTGATGTCTATAGAGGTACTAATAGCTTCACTAATTGGAGTAATAGGAAGTTGTATATCTATAAGAAAGTATCTAAATGTTTAAGTATACAATATTGTTAGATATAATGAATTTAATATATAATTACTATAGAAGCTAGGAAATTCTTCCTAGCTTCTATAGTAATTTTCTTATATAGGAATGGAGGCTATAGATATGGAGACTAGTGGAAATGTAGCAGAAAAATCTAAGATTAAAGTGAAGAAACCTAGTTTATATAAAGTGATAATGCATAATGACGATTACACGACAATGGAATTTGTTTTATCAGTTTTAGTAAATATATTTAAAAAAGATGTAGGAGAAGCGAATAAAATAATGATGGATGTCCATAAAAAAGGTATAGGAATAGCTGGTATATATACTTATGATATAGCTGTTACTAAAGTTAGTAGGGCTATGGATCTTGCAAAAGAGGAAGGATTTCCATTTAAATTGACTATAGAAAAGGAGTAGGGTATGAATATAACAGAGGGTGTAAATGAAATTATTCTTAATGCTTATGAAAAGTGTAAGAATAGTAATAGTGAATATATAACGCCAGAGCATTTATTATATGCGGCAACTTTTAATGAAGATATTAGTAGTTCTATTGAAGAATGTGGTGGAGATGTAAAGTTATTAAGAGATAATCTTGAAAATTATATTGATAATTATGTTACTAAACTAGATGAAGGTGAACCTGAAGAAAGTTTGGCATTTCAAGAATTATTATTTATATCTAGTAGCCAAGTGGTAAGTTCAGGTAAGCATATTGTTGATATAGAACATATAATTGCTGCTATATTTGATTTAGAAGAGAGTTTTGCGAAATTTTATTTGGAAGAACAGGGTATAAGTAAAAGAGATATATTGTATAGTTTGTGTCATAGAGATAGGGAAGAATATTTTATTGAAGAGTATGAAGAGGAAGAATCTAATGATAGATTACCGATTTTAACCAAGTACACTACTAATCTTAATGAATTAGTTAAAGATAGTGACGAAAATATATTGATAGGAAGAGAAGATATACTAGGAAGAACTATAGAGATACTCTGTAGAAAAACTAAAAATAATCCTATTCATGTAGGAGAACCAGGAGTAGGTAAGACTGCCATAGCTTTAGGATTAGCAAGATTGATTCAAGATGGAAAAGTACCAGAAAAACTTAAGGGTGCAGAAATATTTTCTTTAGATATTGGAGGAATTCTTGCTGGTACAAAATATAGAGGCGATTTTGAAGAAAGAATGAAAAAGATTTTAGATGAAATTAGTGATTATGATAATCCTATTGTATATATAGATGAAATACATAATATAGTTGGAGCTGGTTCCTTAAATTCTGGTTCTTTAGATGCTTCAAATCTTTTAAAGCCATATTTACTTCAAGGAAAAATTAAGTTTATTGGTGCTACTACTTTTGAAGAATACAAGAAGTATTTTGAGAAGGATAAAGGATTAAGTAGAAGGTTTCAAGTTGTAGAAGTCAATGAAACTTCTGTTGAAGAAACAATAAAAATTTTGATGGGTTTAAAAAAATCCTATGAAAAATATCATAATGTTAAATACTCAGAAGAAGCTATTAGATCAGCCGTCGTTTTAAGTGATAAGTATATAAATGATAGATTTTTACCAGATAAAGCTATAGATATAATAGATGAAGCTGGAGCTTATATGAATATACAAAATGATATTAATAAAGATGAAAATAATGTAAGTGAAGAAATAGTAGAAGAGATTATATCAAGAGTGTGCAAAATTCCTAAAAAGACAGTTGAAAGTAATGAGTTAGAGAGTTTAAGAAATCTTGATAAGTCTTTGAGGAAAAATATATATGGACAAGAAAATGCCATTAGAGAAGTATCTAGATGTATAAAATTATCTAGAGCCGGCTTAAGTGATGAGAATAAACCAGTAGCATCAATGTTATTTGTAGGACCTACAGGTGTAGGTAAGACAGAAATAGCTAAAACTATAGCTAAGGAATTAGGCATAGAATTAGTTAGATTTGATATGAGTGAATATGGAGAAAAGCATGCAGCATCTAAGCTTATAGGAGCTCCTCCTGGTTATGTGGGATATGAAGAAGGCGGATTACTTACTGATGCAATTAGAAAAAAACCACATTGTGTTTTATTACTAGATGAAATAGAAAAAGCGCATGAAGATATTTTTAATGTTTTATTACAAGTTATGGATTATGCTACTCTTACTGATAATCAAGGAAGAAAAGCTGATTTTAGAAATGTAATAATAATTATGACATCTAATGCTGGTGCAAAAAATGTAGGCAAGAATCTATTAGGGTTTGGAGAACGAAAGGTGCTTGATACAGTAATTGAAGAAGAGGTTAAAAAGACATTTACTCCAGAATTCAGAAATAGGTTAGATAATATAATTGTTTTTAATAATGTAGATAAGGATATGGCTTTAATGATCACTAAAAGGGAATTAGACAAATTTAAGGAAAAACTTGTTAAAAAGAATATAGATATCGAATTTACAGAAAAAAGTATATTTGAAATTTCTGAAAAAGGAGTATCAAAAGAATTCGGAGCAAGAGAAATAATAAGAGTTATAAATTCAGATATTAAAACATTGTTAGTAGAGGAGATACTATTTGGATTTTTAAAAGATGGTGGAAAGTGTATAGTAGATTTTGATGAAAATAAGTTTCTTCTTTTAAATAAGTGTAACCCTATCTAGGTGATAATAACTATAATATATAGAAAGAAATATTATAGAGGGAAGTAAAATGAGTAAAATCATTTCAGGGTATGTAGCGGATTGGGGTGCAGATTCATTAATTGCATCTGATGCTAAGAAAATGGATATAGTAAATTATGCATTTGCTACTATATCTAATGGAAAAGCTGTTGAAAGTTGGATTCATGTAGATAAGTTATTGGCTTTTAGAAGTAATAATCCAGATCTTAAAGTATTAGTATCTATAGGAGGTTGGGCAGCTGATGGCTTTTCTCAATTAGCAGCTACAGCAAGTGGACGTGAGGTTTTTGCAAATTCGGCTATACAACTTATGTTGAAATATGATTTTGATGGAATAGATATTGATTGGGAGTATCCAGGATTATCAGTTTCAGGTATAGCTTCTTCACCAGAGGATAAGTATAATTTTACCCTTATGATGGAAGAGATACGGGCACAATTAGATGTATTAGGAACGCAAAATGACAAAAAGTATCTTCTTACTATGGCAGTAGGATCTGATGATAGTGTATTACGAAATTTAGAAGTTGCGAAACTATCTAATATTGTAGATTATGCTAATTTAATGACTTACGATTTTGCAATGGGGCTAGAGTTATTAACACAAAGATACCAAACTAATTTATATAGTGAACCTGTTATAGCAAAAAGAAGTGTAGATAATACAGTAAAAAGATATATGGCGGCAGGAATGCATAAGAAAAAAATAATGATAGGTGCGGCATTTTATGGTTATGGACTAACTAATGTTAATATATGGGAAAACAATATGGCTGTTATGTTAGGACAGACTGCAAGATCATTGCAATATACCTATACAAGAATATATAATGAGTTAATTGTAGAAAAGGGATATACAAGGTATTGGGATAGTATTGCTAAAGCTCCATGGTTATATAATGGTAATACCTATTTTACTTATGATGATCCAGAATCAATAAAATATAAAGGAAAATATGTTTGGTCAAAAGATATCGCTGGAATGATGTTCTGGGAATATAGCCAAGATAAAACTCATACTTTATTAGAGGCTATGTATAGGGAATTAAAGTAATAAAAACCAACACCTAAAGTGTTGGTTTTATTACTTTAAAATTCTTTGTCTATCATTTTATGTTTAAAAGTTTTTATATTGTTTGAATAATCAGAAACAATGTTTCCGTGACCGATAAGCTTATATTTATATATTAATAGTCCATCAAGTCCCACAGGTCCTCTTGCATGAATTTTATTTGTACTGATACCTACTTCTGCTCCAAATCCATAGCGGAATCCATCACTGAATCTAGTAGAGCAATTCCAAAATACGTTTCCAGAGTCTACAAGATCCATGAAAATTTTAGCCTTTGATTCATTTTTAGTGATTATAGCATCAGTATGGCCAGAGCCGTAAGTATTTATATGTTCGATAGCATCTTCTAATGAATTTACAATTTTTATAGAAAGTTTATAATCTAAATATTCTGTTTTCCAATCTTCTTCAGTGGCTAAATCTACATCAATTATTTTAGTAGTTTCGGTGCATCCTAGCAAAGAAACGTTCTTTTTATCTAATTCCTTTTTTAGTAGAGGAAGATATTCTTTAGCTATATCTTTATGTACTAGTAAAGTTTCTGTTGCATTACATACAGAAACATATTGAGTTTTTGAGTCAGTAACTATGTCTACGGCCATTTTTATATCAGCATCACTATCTACATAACAATGACAAATTCCATCGGCATGGCCCATTACAGGTATTGTTGAATTATTCATGATGTATTGTACAAATTCATTAGAACCTCTAGGTATTAGTAAATCAATATACTTATCTAATTTAAGCATTCCATTTACATCATCTCTACTTTCAAGAAGATGAACCCATCCAGAAGGAATTCCAGCATTAGTAGAAGCTTCAACAATAATTTCTGTAAGTATTTTATTTGTATTAAGAGCTTCGCTACCGCCCTTTAATAAAGCAGCATTACCACTTTTTAAGCAAAGGGAGGAAATTTGTACTAAAGCATCTGGTCGAGATTCAAATATAACACCAATAACACCAATTGGACAACTTACCTTATATAATTCTAAATCTTCATCTAGTTGCTTACACCATAGTGTTTCACCAACAGGATCTGGTAAAGATATTAAGCTGTTAATGCCAGCTATGACTTCATTTAATTTATTGTCATCAAATTTTAGTCTTTTTAGTAGAGGAAGTGCTAAGTTACTTTTTTCACCAGCTTCAATATCTTTTTTATTTGCATCAAAAATTTCTACTTTTCTCTTTTCTAGCGCTTCAGCAATTGCTTTAAGAGCATTATTTTTTGTTGCAGTATCACAAGCAGCTAAATTAATAGAAGTTTTTTTAGCTATTTTAGCTAGTTCCATTATATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_HG917868|1234376:1242295|1234376_1235627_+|WP_051483714.1|DBSCAN-SWA MKRTIAVVLVAIVIANNNVYATSVNDLENKKSSIENTLEEKKGEINEKRNQIKDTSKELSDTEKELADLDSSLNEIQNKISNINTEIKNIEKEMIDLESEMEENHEKIEENYEIMSEIIRIDYEQQIGGYLNLLLGAKNFQNFLMRFEIISNLIKSGDRAVEEIKVLQVELESKEKVLAEKKIDLNNKKIEVEKEEGNLTALLEKKQGEVTAYIASRQALENEIKLTENEIKELELRGNAIEEEIKNIIASSNSSNNNSSNSGNSNNSGNNNNNNNNNNNNGVVDSTSFLWPVPGYSYISSYYGSRIDPITGKPGAFHKGIDIPAPEGTPVVAARSGKVIISRFDSSYGYFVVIDHGDGLSTLYAHNSQLVASVGQTVEKGQVIAKVGTTGSSTGNHLHFEVKVNGTAVDPMNYLN >NZ_HG917868|1234376:1242295|1235654_1236335_+|WP_044037199.1|DBSCAN-SWA MISFKNVNLIYDNDVQALNNINFRINKGEFVFLVGTSGSGKSSLIKTILKEIDCTSGDINVNSQSIKELKNKDIPYFRRRLGVIFQDFRLLNEKTVYENVATAMRVVEADENNIKKRVPIVLEKVGLKNKLNCYPRELSGGEQQRVAIARAIVNDPLLILADEPTGNLDPETTLEILKILNEVNKSGTTILMATHDKEVVNNMRKRVISMKNGKIIHDNIEGGYKL >NZ_HG917868|1234376:1242295|1236331_1237252_+|WP_044037200.1|DBSCAN-SWA MKLKTIRRLVKEGAKNIITHRLMAFASIVTVMISLIIFGAFYITINLTDKLVENMKDSVEIMAFIKDDVSEGDIDTIKNSISKIDGVENVIYISPEEGLESYKTSLDNDNDEEMKRIVEVVSENKENPIPGSFSIKVRGADFIKKVSNEVSKYEQIYKIDNGNLITKFLTKTSSIVKVIGIGIMSFLLVAAVFLIANSIKISVFVRKQEISIIKYIGATNSYVRLPFIIEGVIMGIIGAVISVIVISIGYSLIEDNIINYIGSTNYNIIVPSISNMILKLMSIEVLIASLIGVIGSCISIRKYLNV >NZ_HG917868|1234376:1242295|1237363_1237663_+|WP_044037201.1|protease|DBSCAN-SWA METSGNVAEKSKIKVKKPSLYKVIMHNDDYTTMEFVLSVLVNIFKKDVGEANKIMMDVHKKGIGIAGIYTYDIAVTKVSRAMDLAKEEGFPFKLTIEKE >NZ_HG917868|1234376:1242295|1237666_1239895_+|WP_044037203.1|protease|DBSCAN-SWA MNITEGVNEIILNAYEKCKNSNSEYITPEHLLYAATFNEDISSSIEECGGDVKLLRDNLENYIDNYVTKLDEGEPEESLAFQELLFISSSQVVSSGKHIVDIEHIIAAIFDLEESFAKFYLEEQGISKRDILYSLCHRDREEYFIEEYEEEESNDRLPILTKYTTNLNELVKDSDENILIGREDILGRTIEILCRKTKNNPIHVGEPGVGKTAIALGLARLIQDGKVPEKLKGAEIFSLDIGGILAGTKYRGDFEERMKKILDEISDYDNPIVYIDEIHNIVGAGSLNSGSLDASNLLKPYLLQGKIKFIGATTFEEYKKYFEKDKGLSRRFQVVEVNETSVEETIKILMGLKKSYEKYHNVKYSEEAIRSAVVLSDKYINDRFLPDKAIDIIDEAGAYMNIQNDINKDENNVSEEIVEEIISRVCKIPKKTVESNELESLRNLDKSLRKNIYGQENAIREVSRCIKLSRAGLSDENKPVASMLFVGPTGVGKTEIAKTIAKELGIELVRFDMSEYGEKHAASKLIGAPPGYVGYEEGGLLTDAIRKKPHCVLLLDEIEKAHEDIFNVLLQVMDYATLTDNQGRKADFRNVIIIMTSNAGAKNVGKNLLGFGERKVLDTVIEEEVKKTFTPEFRNRLDNIIVFNNVDKDMALMITKRELDKFKEKLVKKNIDIEFTEKSIFEISEKGVSKEFGAREIIRVINSDIKTLLVEEILFGFLKDGGKCIVDFDENKFLLLNKCNPI >NZ_HG917868|1234376:1242295|1241005_1242295_-|WP_044037206.1|DBSCAN-SWA MNIMELAKIAKKTSINLAACDTATKNNALKAIAEALEKRKVEIFDANKKDIEAGEKSNLALPLLKRLKFDDNKLNEVIAGINSLISLPDPVGETLWCKQLDEDLELYKVSCPIGVIGVIFESRPDALVQISSLCLKSGNAALLKGGSEALNTNKILTEIIVEASTNAGIPSGWVHLLESRDDVNGMLKLDKYIDLLIPRGSNEFVQYIMNNSTIPVMGHADGICHCYVDSDADIKMAVDIVTDSKTQYVSVCNATETLLVHKDIAKEYLPLLKKELDKKNVSLLGCTETTKIIDVDLATEEDWKTEYLDYKLSIKIVNSLEDAIEHINTYGSGHTDAIITKNESKAKIFMDLVDSGNVFWNCSTRFSDGFRYGFGAEVGISTNKIHARGPVGLDGLLIYKYKLIGHGNIVSDYSNNIKTFKHKMIDKEF >NZ_HG917868|1234376:1242295|1239944_1240970_+|WP_044037204.1|DBSCAN-SWA MSKIISGYVADWGADSLIASDAKKMDIVNYAFATISNGKAVESWIHVDKLLAFRSNNPDLKVLVSIGGWAADGFSQLAATASGREVFANSAIQLMLKYDFDGIDIDWEYPGLSVSGIASSPEDKYNFTLMMEEIRAQLDVLGTQNDKKYLLTMAVGSDDSVLRNLEVAKLSNIVDYANLMTYDFAMGLELLTQRYQTNLYSEPVIAKRSVDNTVKRYMAAGMHKKKIMIGAAFYGYGLTNVNIWENNMAVMLGQTARSLQYTYTRIYNELIVEKGYTRYWDSIAKAPWLYNGNTYFTYDDPESIKYKGKYVWSKDIAGMMFWEYSQDKTHTLLEAMYRELK |
7 | Clostridium_phage(16.67%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1508377 : 1597285
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_HG917868|1508377:1597285|DBSCAN-SWA ATTATAATGAAATAACTTCTAAATCCTCTATCGCCTTATTCACTAGTCCTTCGATGTCTAACGCCTCTTCAGAAGCTTCTATATGTTTTAGAACCGGTCTTGTTTTAGGATGCTTTGGAACAAAAATCGTACAACAATCTTCATATGGTAATATTGAAGTATCATATGTACCTATTTCTCTAGATATATCAATTATATCTTCTTTATCCATAGAAATAAGTGGTCTAAAAGCAGGTCTATCTGAAACATTATCTGTAACTACAAGACTTTCCATAGTTTGTGATGCTACTTGACCTATACTTTCACCAGTTGTAACAGATTCAAACTTTTCACTTTCAGCAATTTTACATGCAACTCTCATCATGAATCTTCTCATAATTATTGTTAATTCATCTTCTCTACATTTTTTCATTATTTCCATTTGAATTTCAGTAAATGGTACTACAAATAACTTCATTTCACCTGTATAATTCTTAAGAATTCGTGCAAGTTCTACAACCTTTTCTTTAGCCCTTTCTGAAGTATATGGATGTGAATGATAATAAACTGCTGATACTTTCACTCCTCTTCTTGCCATAAGATATCCCGCAACTGGTGAATCTATTCCTCCTGAAAGCATAAGAACAGTACCTCCATTAGTACCATATGGCATTCCACCTACAGCTTTTACTTTTTTAGAATATACATAAGCTGCCTTCTTTCTTACCTCTATATAAATTTTATTTTCTGGTTCTCTCACATCTACAGAGAGACTAGAATCACTTTGTAAGATTTGTGATCCTACATATCTACTAAGCTCCATAGAATTCATTGGAAATTCTTTATTTGCTCTATTACTTTCAACTTTAAATGTTCCACCATTTAATTCTTTAGCACATGAAATTGCTGTATTACATATAGCTTCTAATTGAACTTCACATTCATCTACTATACAAATTTCTTTTACTCCAAAAACTTTGCTTACCTTTTCTACAAGCAAATCTATATCTTCAGAATATATAAATGTTCTTCCATCATCTCTAATAAATTCATAAGGAACATCCTTTAAAACTTTTTTTATATTTTCCATAAGCTTTTGTTCAAACTTATTTCTATTTAATCCCTTTAAAAAAATCTCTGATGCATATTTTACTAAAATTAATTTTCTCATCTTTTTATTCTCCTTAAAAATGTTAATGACTGTTTTAATATTTCTATAACTTTATCTACTTCTTCTATTTTATTATCTTCTGAAAATGAAAATCTTATAGCTCCTTCAATATATTTGTTATTCAATCCCATTGCCTTAAGAACATAACTTCCACTTCTTGCTGAAAGTTTAGATGTACAAGCTGATCCTGTAGCAACATATACATCTTCTTCTTCTAATAAATGCAATAGTACTTCTGCTCTAATTCCTTCAAAAGATACATTAAGAATATATGGAGAAAACATTTCATCTACTGGGCTATTTATATGTGAACCATCTATCTCTTTTAATCTACTAATCATATATTCTTTTAATTTTAATACATAATTAAAGTTCTTATCTCTATTTTCACTTACAATTCTAGCTGCTTTCTCCATACCTATAACTCCTGCTATATTTTCAGTACCAGCTCTTAGACCTTTTTCTTGACTTCCACCTTTAATAATAGAGTTTAAGTTTAACCCAAATTTAATATAACAAAATCCGACTCCATTTGGTCCGTGAATCTTATGACCTGATGCAGTAAGTAAATCTATGTCCATATCTTTTACATCAATTGTAATTTTTCCGAAACTTTGTACTGCATCTACATGAAATTTAGCTCTTTTACTACATGATCTTATCGTCGCTGCTATACTTTTAATATCTTGAATAGATCCAACTTCATTATTAACATGCATTATAGAAACTAAAACCGTATCTTTACAAATTGCTTTAGTTAATTGTTCTAAAGATATTTGCCCCTTATTATCTAAGTCAAGATAAGTAACCTTTACCCCGTATTTTTCCAACTCCTCTGAAACCTTAAGTACTGAATGATGCTCAAACCTAGTTGTTATTAAGTGATTTCCTGGTTTCAACAATCCCTTTAATATAAGATTATTTCCTTCACTTCCACCTGATGTGAAAAACACTTCATTTTTACCACAATTTATTATATTAGAGATACTTTCTCTACTTTTATCTAATCTTTTTTCGCATTTTACACCCATTTTATGAATAGATGATGGATTTGCAAAATACATTCTCATTCCATCTGCTACTTCACTTATTACTTCTTCATAAGGTTTAGTAGTAGATGCATTATCAAAATAAATCATATCTTTGCTCCTTTTTTATATTTCCTATAGGCTTTCTTGGTTATTAGAAAAAACTTATCTATTAATATATAATAACAGAAATTTATTATATATTAAAGTTATATTCATAACCTTATGTAACTTCGTGCATAATAATTCTATACATTATTTTAGGAGCTGTTATTAAGTGAAATTTTTTAATCGTGATAAATTCAAACAAATACTTTTCATATTGGTAGGATGTACTATTAATTCTCTAGCAATAAATATCTTTTTAGTAAACGCAAATCTCTTAAGTGGTGGCGTTTCTGGTATAGCTTTAATTGTACAGTATTTAACCTCTATTCCTGCAGGATATACTACATTAATTTTAAATATACCACTTTTAATACTAAGTTATTTTAAAATAAATAAGTCTTTCACATTCTTCACCATTATAGGCACATTAGGATCTGTTGTTACACTAATACTTACAACAAATATGCAAAAATTTATAACTCTCAAGGATCCATTACTATTATCTATATATGGAGGTGTACTACAAGGAATTGGGATTGGCATAGTTTTTGTTTATAATGGATCTACAGGCGGATTAGATATAATAACTGCCTTAATAAAAAAACATAAGGAAGATATTAACATAGGAACAGTTTCTTTCCTCTTAAATGGTATTATCGTTCTAATTGGCTGCTTTATTTTCGGGATTTCAATAGCATTATACACATTATTACTTATGTATATAAGCAGTTTTACTCTTGATAAAACCATTCAAATATTTAATAGAAAAAGACTTGTTTTAATAATTTCAGACAAAGAACCAGAAGTAACTAGGCGTATTATGGATAAAGTTCAAAGAGGTGTCACTCTACTTTATGGTGAAGGTGCTTATACAAAAGAAAAACGTAACATTATATATACTATTGTTGAAATTTCACAATTACCTGCTGTTAAACAAATAGTTCGTAATGAAGACATTAATGCTTTTATAACTGTATTAGATGTAAGTGACGTAGAAGGATTAGGATTTAAGAAAAATTTGCCGTTATAATAAGTTAGCCATCAAAGTTATTAATACTCTGATGGCTATATACTACATTGTTTTAAAAAATTCGGATAATATTTTTTCTTCAATATCAGAAAAACTATATTCTTTTAAATTTTTTTCCTTAATCCAACTGAATTCATTAATATCAGCACTGCATACTATTTGTTCTTTTAACTTTCCAGAGAAAACAATATTTTTATTATCTCCTTCTTCATATACTTTGTAAGGAAGCAAATCAAAAATGTTACACTTTAAATCCTTACCTACAGCTTTTGTTATGTACTTTTCAGGATCTTGTTTTTCTGTTATGTCTTTACTTAATATAGACCAAACTTTTGGCTCGAATTTTTTACTTTTTCCCTTTTGTACTATTAATACGTTCTTAAAATCATCATAAATAATAATGGAACTTTTTATTTTTTTACCCATATATGTATCCCCCTTTAATAAACAAGCTGCCCCTAGTTTAAAAAGTTACTCTCATATACATATTATATAATCATACAAGATAAATATAAATACTTTTTTAGAATTTTTGATTAATTTTTGGATAAATTTATTAACTCCTTAGAAAACTAAGGAGTTAATTGCTATATTATGTCTTTTTTGGAATCGATAAAAGTAAAATCTTCCATAATAATAGAAGTAGTATAAACTTTAATACCATCATTATTGAAATAACTTCCAGTGCTAATCTTACCTTCTACTGCTAACTTTTGACCTTTATGTACATTTCTTGATAGAATTTCAGCTTTTTTACCAAATGCCACTACATCGACAAATGTTGTTTTTTTCTCTTTAGTTGATATTACATATTCATTAACAGCTAATGTAAATCTTGTATATGGAATTTCTCCGTCCTTAGATTTACATAATTCCAACTCTCTAGTTACATTGCCTATAAGACTTACTCTATTCATATTCACATTCCTCCTTGAGATTACTGATATCTACATTATTAACACAAATGTATGTTCTCTATACACTTTTTTAAAAAAATTTTAAAAATTATTAATTCCGTGATAAACTTATTATATAAAATATAGGAAAAGGTGATAAAATGAGTAATATAATTAAGAATGTTACAGATATAATCGGTAATACACCATTAATGGAATTATGCAAACTTAACAAACTAAATAATTGTAACTCCACAATACTTGCAAAACTAGAATTTCTTAATCCTGGTGGAAGTATAAAAGATAGAATAGCATTATCTATGATAGAAGACGCTGAAAAAAAAGGATTAATTAATAAAGATACTACTATTATTGAACCAACTAGCGGAAATACTGGAATAGGCCTTAGCTGTGTAGCTGCATCTAAAGGATATAAAGTAATACTAACAATGCCTGATACAATGAGCATAGAAAGACGTACTCTTTTAAAGGCTTACGGTGCTGATGTAATTTTGACAGATGGAGATTTAGGAATGCAAGGTTCCATTGATAAAGCTAATGAATTGGCAAAAGAGATTGGTAATGCCTTTATCCCTCAACAATTTTGTAATAGTTCAAATGTACAAGCACATAAACTTAAAACTGCAGAAGAAATATGGAAAGATACTGATGGAAATATTGATTTCTTTATAGCTGGTGTTGGTAGTGGCGGAACTTTGACAGGGGTTGGTCAGTATCTTAAAGAAAAAAATCCAAACATACAAATAGTAGCTGTTGAACCTGCATCT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>NZ_HG917868|1508377:1597285|1546870_1547179_-|WP_044037674.1|head,tail|DBSCAN-SWA MTILEKVKENLILKHDLDDELLKMYITAAISYAESYQHLPQEFYSENTMPPTTEQAVIMLSSHFYESRDGSTAGFFADSVQAGQQVWNTVNLLLRLDREWKV >NZ_HG917868|1508377:1597285|1530293_1531865_-|WP_044037640.1|DBSCAN-SWA MAVSRNVTVIPAIKRVGNNKTSESKPKIRVAAYCRVSTDSEEQASSYEIQIEHYTNYIKKNKEWELAGIFADDGITGTNTKKREEFNRMIEECMAGKIDMIITKSISRFARNTLDCLKYIRQLKDKNIAVFFEKENINTMDSKGEIMLTIMASLAQQESQSLSQNVKLGIQYRYQQGEVQVNHKRFLGYTKDENKQLVIDPEGAEVVKRIYREYLEGASLLQISRGLEADGILTAAGKAKWRPETLKKILQNEKYIGDALLQKTYTVDFLSKKRVKNNGIVPQYYVENSHEPIIPRELFMQVQEEMVRRANLRGRKGGKKRVYSSKYALSSIVYCGHCGDIYRRVHWNNRGYKSIVWRCVSRLEEKGSECTAPTINEETLQTAVVKAINELLANKEPFLSTLQKNIATVFNEENDNATDDIDGKLEELQQQLLIQAKSKNDYEDVADEIYRLRELKQNALVENAEREGKRQRIAEITDFLNEQSYELEEYNEQLVRRLIEKVTIYEDKLTVEFKSGIEIDIEI |
87 | Erysipelothrix_phage(56.45%) | tail,head,integrase,protease,tRNA,portal,terminase,capsid,holin | attL 1500781:1500798|attR 1602167:1602184 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2359618 : 2370101
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_HG917868|2359618:2370101|DBSCAN-SWA ATTAGTGTTTGAAGTGTCTTATTCCTGTGAAGACCATTGGTATTCCATACTTGTTACAATTTTCAACCGATAATTTATCATTAACAGATCCACCTGGTTGTACAATTGCACCTACTTTATATTTAGCACATTCATCAACAATATCTCCAAATGGGAAGAATGCATCTGAAGCAAGAATTGCTCCTTCTGTGTTTGCTCTCTCTAAAGCATCTTTTGCAGGCCAAATTCTATTAACTTGTCCTCCACCTATTCCTAAAGTCTTACCATCCTTAACTACAACGATAGCATTAGACTTAACATATTTAACTACCTTCATTCCAAATTCCATATCTTTAAGTTGAGCTTCTGTTGGAGCTTTTTCTGTTACAACCTTGTATTCATCAACTAATTTTCTATCTGATTGTTGAACAAGAAGTCCACCATCAACTTTAACTAATTCATGAGTATCACAAGCTTTAGTTTCACACTTAATAACTCTTAAATTCTTCTTTTTCTTTAATACTTCAAGAGCCTCTGCAGTAAATCCTGGAGCAATAACTATTTCAAGGAATATCTCTACAAGTTTTTCTGCTGTAACAGCATCTACTTCCTTATTAAAAGCAACAATACCACCAAAAATTGAAGTTGGATCACATTCAAAAGCTTTATTGTAAGCATCTAAAGTTGTATCTGAAACTGCAACACCACATGGAGTATTATGCTTTAATGCACAACAAGCAGTTTCTTCAAATTCACAAACTACCTTCCAAGCTATATCCATATCCTTGAAGTTATTATATGAAAGTTCCTTCCCATTTAATTGCTCTATATCTTTCATCGCACCTTTTTCTGTTGTAGAAACATAATAAGCTGCAGTTTGATGTCCATTTTCACCATATCTTAAATCCATAGACTTCTTATATGAAATATTGTAATACTCATTGTATTCATCTTCTAATAAGAAGTTTGCAATAGCACCATCATAAGCACTCATTAAGTTAAACACCTTACCAGCCAACTTCTTCTTAAATGCTAATGATACTTCTCCAGCCTCCATTTGTCTCTTAACTTCATCATAATCTTTAGTATCTGAAATTACGATAACATCTTGGAAATTCTTAGCTGCTGCTCTAAGCATTGTAGGTCCACCGATATCTATAAACTCAACCTTTTCTTCAAATGATAAATCTTCATTAACTTTATCAAAGAAAGGATATAGATTTACAATAACTATATCTATTGGTGTAATATTTTTCTCAGCTATTTTAGCCATGTGTTCTTTGTTATCTCTTATAGCTAAAATACCACCATGGATATATGGGTTTAATGTCTTAACTCTTCCATCTAAAATCTCTGGGAACCCAGTTACTTCAGTAATATCTATTACCTTAACTCCATTTTCTTTTAAGTATTTATAAGTACCACCAGTTGATACTATTTCAACGCCTCTATTTTCAAGAAATTGTGCCATTTCTAAAATTCCATCTTTATAAAAAACGCTAATTAAAGCTCTCATGTTACACCCTCCAGTGCACAGTGCACAGTGCACAGTGCACAGTTAATACCGTGACTGACACCTTAGCAATTGTGCAATTATTTATTAATTATTCTTTAAATCGTACACTTCTTACTATAGAATGTAACATTTTGCATAATTCCTTACACTCCTGAAGTATACCTTTAGTATCACTTAAACTTAAATATCCCGATTCCAAAAGTAATTCAATCCAGTACTCTGTCTCCTCGGCTTCTTTTAATGCTATATTCATTTTATGTCCAAAGTCCCTTTTAGACTCTCCCCTAAGTGCTTCTCTAACATTTGCACCAATACTGTTCACTGCCCTACTGTGCACTGATGTAGGTTTTTCTTCCTTCTACTCTCACTTTTCCTTCACTTATTAACTTTAGTGCTTCAGGTAATGCTTTATGTTCTTCCACAAGTATTCTTTCTTGTAATTGTTTTGGAGTGTCCTCTCCATATACCGGTACTGATTTTTGAAGAATGATAGCCCCCGTATCTGTTCCTTCGTCTACAAAATGTACTGTACATCCTGATATCTTTACACCATATTCAATAGCTTTTTCGTGGACATGAATTCCGTAAGCACCTTTTCCACAAAAGCTTGGTATAAGAGATGGATGAATATTAATAATTCTATTTCTAAATTCATCTATTAATTCTTTTTTTATAATAGAAAAGAATCCTGCTAAAACTATTACATCTACATTACCTTTTAATGTTTCAAGAATCTTTCCACTTAAGGAATCTCCATATTCTTTTTTATCATATGTTAAAGTTCTTATGCCTGCTTTTTTTGCTCTTTCTAAAGCATATGCACCTTTCGTATCACTAATTACGTATTCTATAGACACTTTGTCTAAATAACCATCACTAACTCTATCTATAATGGTTTGAAGATTACTTCCACCACCAGATACTAACACTGCTATTTTAAGCATATATTTTCCCCTTCATTTTCATCAACATATCCAATTTCATGGGCAACTATTCCATGGCCAACTAAAATTTCCATTATTTTGTTTACATCTTCCCTAGCAACGCAAATAACAAATCCTATACCCATATTAAATGTATTATACATTTCTTCTTCTTTAACACCACGTCTCATAAGTTCTTTAAATATTGATGGGATTTCATAAGAATTTTTGTTTATTACAGCTCTATGGTTTTTATTCTTAAACATTCTTGGAATATTTTCTATAAATCCACCACCAGTTATATGAGCCATACCATTGATATTTACTTTTGATAATAAATCAAGTACTGGCTTAACATATATTCTTGTAGGAGTTAATAAAACTTCTCCCATTTTCTTTCCCTCAAACTCTTCATCTAAATCAGTAATAAGTTTTCTTACTAATGAATATCCATTTGAGTGAATCCCTGAAGATTCTAATCCTATTAGAACATCACCAGACTTTATATTACTTCCATCAATAATTTCATCTTTCTCTACAACACCAATAGCAAAACCGGCTATATCATATTCACCTTCTTTATAGAAACCAGGCATTTCTGCAGTTTCTCCGCCAATTAATGCACATCCAGCTTGTTGACATCCTTCTGATACACCTTTAACTATGTCAGCTGCTTTTTCTGCTTCTAATTTACCGCAAGCCATATAATCTAAAAATACTACTGGTTTTGCTCCATGACAAAGTATGTCATTTACACACATTGCTGTACAATCTATTCCAACTGTATCATAAGTATTCATCTTAAATGCTATTTCAAGCTTTGTTCCAACTCCGTCTGTTCCTGAAACTAAAACTGGATTTTTATATCCTTGTCCAAGTTCGAACATTCCTGCAAATGATCCAAGACCATTTAAAACTCCTGGTATGAAAGTTTTTTCTGTATATTGTCTCATTAGTTGTACACTTTTGTAGCCTTCTTCTATATTTACGCCACTTTCTTTATATAAACTCATCTAAGTTTCCCCGCTTTCATAATTTTAATCTTCTAAACGAACCTTGCTCATTTCCATTGGTGCTGATACTGGATATTCACCAGCAAAACAGCCTAAACAAAAATCATTTTTTCCACCTAAAGCTTCTACTAATGAAGGAATTGATAAATATCCTACAGAATCACTTCCTATAAAATCACTAATTTCATCTAAGCTTCTTTGAGCAGCAATAAGTTCACTTCTATATGGAGTGTCTATACCAAAATAGCATGGATATTTAACTGCTGGAGCAGCTGATCTAAAGTGAACTTCTTTTGCGCCAGCTCTTCTCATAATATCTACTAACTTCTTAGAAGTTGTTCCCCTTACAATAGAATCGTCAATAAGAACTACTCTCTTTCCTTCAACTAAACATCTAAGTGCATTAAGTTTTATTGATACTGCCTTTTCTCTTAATTCTTGTGTTGGTGCAATAAATGTTCTTGCAACATATTTATTTTTTACAATACCCATTGCATAAGGTATTCCTGAAGCTTTTGAATATCCTACTGCTGATGGTATACCGGAATCTGGTACACCTATTACTAAATCTGCATCTGCTGGAGCGTCTTTGTATAGTAGCTCTCCTGCTTTTACTCTTGCTTCATATACATTTATTCCATTCATTATAGAATCTGGTCTTGCAAAATAAATATATTCAAAAGCACAAGCCTTAGTTATTGCTTTTTCATTTAATTTTATACTTCTTAATCCTTCATCATCTATAATTACTATTTCACCTGGCTCTACATCTCTAACAAGTTCAGCTCCTATAACATCAAGAGCACAGCTTTCAGATGATAATACATAACCATCGTCTATCTTACCTATACATAATGGTCTTATTCCATGAGGATCTCTTACCCCAATAAGTTTGTCCTCTGTTAATATTACTATAGCGTATGACCCCTTAACCGCTTGAACTGTATCCACTAAAGCTTTTTCTATCCCCTTAGAAGCTTTGCGTGCTATCATATTTAAAATAACTTCTGTATCAATTGTTGTTTGGAAATTATAACCTGACTCTTCTAATAATTCTCTTAAAACATCAGTGTTAACTAAATTTCCGTTATGAGCTATAGCCATTTGTCCTAATTTGAATTTTGAAAGTAATGGTTGTGCATTTATAAGTCTAGTATCACCTGTTGTAGAATATCTTACGTGACCTATAGCTGCTTTACCGGTCATATTATTTAATGTTTCATCATCAAATACATCTGGAACAATCCCCATACCTTTTTCAAGAATTAGATTTCCATCTTGATTAACGCATATTCCTGAACTTTCTTGTCCTCTATGCTGAAGTGCATATAATCCATAATAAACATAATGGGCAATTGTTGTTTTTTTGTTTGAGTATATACCGAAAACACCACACTCGTCTTTGAACTTATCACACTCTCTAATTGTCATATTAGATTTCCTCACTTATTCTCTTTAATATTTCTACATAAGCTTCTTTAACATTTCCCATGTCTCTTCTAAATCTATCTTTATCAAGTTTTTCACCAGTTGTAGCATCCCAGAATCTGCATGTATCTGGTGAAATTTCATCAGCTAGTAAAATCTCTCCGTCAGCTGTCTTACCAAACTCTATTTTGAAATCAATAAGATTTATATTTTGTTTTAAGAAAAATTCTTTTAGTGTATCGTTTATAACTGCTGTCATATCATAAATTACTTTTAATTCTTCAAAAGTAGTAGCGCCAATTGCTACAGCGTGATAATCATTTATTAGTGGATCTCCTAAATCATCATTTTTATAAGAAAGTTCAAATACTGTAGTTTTTAATTCAGTTCCCTCTTCAAGACCTAATCTCTTTGCCATTGACCCAGCAGCAACATTTCTTACTATAACTTCTAAAGGTATTATTGTTACCTTCTTACAAAGTTGATCTCTTTCATTTAATTTTTCAATAAAGTGAGTTTTAACACCCTTCTTTGCTAAAAGCTCAAATAACATTGAAGTTATTGCATTGTTCAATTCACCCTTAGAATCAATTTGTCCCTTCTTTTCTCCGTTAAAAGCAGTAGCATCATCTTTATAATGAACTATTACCTTATCATCATCATTAGTTCTAAATATTTGTTTTGCCTTACCTTCATACATCATTTCTAACTTTTCCATTATAGTTCCACTCCTTCTTCATTATCCCTAATAAAATTAACTTTCATATCTTTTCTATACTTTTCTAACTTGTCCTTAATTTCCGGATACTTAACTCCTAAAATTTGAGCTGCTATCATACCAGCATTATAAGAATTGTTAATACCTACAGTAGAAACTGGAATACCCTTTGGCATTTGAACTATTGAGAATAATGCATCCATCCCTTCTACTGCACCCTTTATAGGAACACCTATTACAGGTAATGTTGTTTGAGATGCTATTACACCTGGAAGATGAGCTGCAAGCCCAGCACCAGCAATAATTGCTTCACATCCAGTTTCCTCTAAATTTTTTATAACCTCTGATAACTTTTCCGGTACTCTATGAGCTGATAATACATGTGCTTCAAATGGAATATCAAATTCTCTTAAAGCATTTGCAGCCCCCCTCATCACTTCTGTATCGGATTTACTTCCAAATATGATTGCTACCTTCATAAAAAAACCTCCGTTTTTTATGGCACAAGGCACAAGGCACAGGGCACAAGTATTTATGCGTCCTGAACTTCTTGTGTTTCTCGCACCTTCCTTACAATTGAATTCAATATTTTGCATAACTCTTTACATTTATTAAGCATTTCATTAGCTACTTCATCTTCTAAGTATGATGAAGCTATCAATAATTCTATCCAGTACTCAGTTTCATTAGCCTCTTTCAAAGCTATATTCATTTTATGACCAAAATCTTTCCTAAACTCCCCACCAAAATCCTCTCGAACATTGGCCCTAATACTAGTACCAGCTCTTAGCAATTGTTTAGATAATATAAACTCTCTCTTTTTACATCTAATAAAGTGATATGTTCTTATAATATCTAAAGCAAAATTAAAAGACTTATTAACTATCACACTATTAGTCATTTTAGTATCACACCCCTGAGTAATTAATTACCAAAGATACGAACATTTATTCAGTAATTATAAATTATTTAAAACTTCTTATATTAAATCAACTTGTGTCACAATTACAAATATCCTATACACACTTAGCACTTTTACAGCACAGCTGTAAACAATCAAAGCCGTCCGCAGGACTACAATGTAATTCCTCCACCGGAGGAGGAATTACAACCCTGCCTGTGCACTGTGCCATGACATCTGTACCCTATCTAAAGTAATTTACCCCATTTTTAAATAATTGTTGATCTTTCTCACCTAAAATATTCTTAGCTACACCATTTCCGATTCTTTCAGAGTGTCCCATTTTACCAAAGACTCTTCCGTCTGGACTTGTTATTCCTTCTACTGCACATACAGAACCGTTTGGATTGAATTCTATATCGTAAGTTCCTTGTCCTTCAAAGTTAACGTATTGTGTTGCTATTTGTCCGTTTTCTATTAGTTTCTTCATAACTTCATCATTAGCTACAAATCTTCCTTCTCCGTGAGAAACTGCTATGCTATGAAGTTTTCCTAAATCATCATTAGATATCCAAGGTGATTTATTTGAAACAACTTTAGTTGTAACCATTCTTGAAACGTGTCTACCAATCTTATTAAATGTAAGTGTTGGTGAGTTTTCATCTAAATCTCTTATTTCACCGTATGGAACTAATCCTAATTTGATAAGTGCTTGGAATCCGTTACAGATACCTAACATTAAACCATCTCTATTCTTAAGCATTTCATGAACAGCTTCTTTTATCTTTTCATTTCTAAATACTGCTGATATAAACTTACCTGATCCATCTGGCTCATCCCCTGCTGAGAATCCACCTGATAACATAATCATTTGTGAAGTATTTATTCTCTTAACCATTTCTTCAATTGATTCTTCTACTTCATGAGCATTTCCATTTCTGAATACAAATACATCTGTTTCTGCTCCTGCTTTCTTGAATTCCCTTGAAGTATCGTATTCACAGTTTGTTCCTGGGAACACTGGTATAAATACTTTTGGTTTTGCAATTTTAATAACTGGAGAAACTTTTTCTTTTGCTTCATATAATGGCATATCTATCTTAGTTTCTTCTATTTTTGCTTCTGTTCTAAATACTGATTCAAGTTTAGAATCCCATGATTTTCTTAATTCATTAACATCGATTTTTTCATCACCGTAAACTAATGAATATTCTTCTGTAGTTTCACCAATTACTCTATATGAAACTCCTTCTAATTCTTTTATAGTATCTTCTTCAACTTCAAGAACTATTGATCCATAGCTTGGTTCTACTAAATCTTTTATTGATAATTCGCTATTTATCTTAACTCCAATTTCATTACCAAAAGATCCTTTAGCTAAGTTTTCTATTACACCACCAAATCTTACTGATGATGATGATAATACTAAGCCTTTATTTATTAATTCTTTAACTTTAGCGAAATTAGTTTTAAGTTCTTCTAAGTTTGGCATATCTCCATCTTTTCTATTATGAAGAATTTCTACTAACTTACTTCCTACTTTCTTAAATTCAGAAGATACAATATTTTGTACTTTATCTGCAACTACTGCAAAAGTTACTATTGTTGGAGGAACTTTTAAATCTTTAAATGTTCCTGACATTGAGTCCTTACCGCCGATAGCTGGTATCTCAAAAGCTCTTTGTACTTCATATGCTCCAAGTAATGCTGCTAGTGGTTTACCAAATGCTTCTTCACTATTCATTCTTTCAAAGTATTCTTGCATTGAAAGTCTTACTTTACTAGCGTCCCCTCCAAGAGCTGTAATCTTAGCTAATGCTTCAATTACTGAGTACATACCACCATGGAATGGACTGAATGTTGTAAGATAAGGATTATAGCCAAAAGTCATTAATGAAACTGTATTTGTCTCTCCTTCAAGAACTGGAATTTTCCCTACCATACCTTCCTGTGGTGTTCCTTGTGTCTTACCTCCATAAGGCATAAGTACTGTATTACTTCCAATAGAAGAGTCGAACATTTCAACTAAACCTCTTTGAGAACATACGTTTAAATCTGTTAATATTTCTTCAGCTACAGTTTTAAAGTCTTTTCCTTGATACTTATTAACAGAAGTTTCAAAATAATTTTCTTCTTTAGGTTCTAGAACCTTTGCTTTTGTATGAGAAGTTACACCATTTGTATTTAAAAAGTCTCTACTTAACTCTACAATTGTGTCGCCTCTCCATTTTAATCTCATTATGTTTTCATCTGTAACTTTAGCAACTACTACAGCTTCTAAGTTTTCTTCATTACATAATCTTAAGAATTCTTCTCTATCTTTTTCTTCTATAACTACTGCCATTCTTTCTTGTGATTCAGAAATAGCAAGCTCTGTACCATCTAATCCTTCGTACTTCTTTGGTACTAAATCTAAATCTATGTCTAACCCATCTGCAAGCTCACCAATTGCTACTGATACTCCCCCTGCTCCGAAGTCGTTACATCTAACAATTTTTCTTGATACCTCTGGATTTCTAAATAATCTTTGTATCTTTCTTTCTGTTGGTGCATTACCTTTTTGTACTTCTGATGAACATGTATCAATAGAAGTTTCTGTGTGTTCCTTTGAAGAACCTGTTGCTCCACCACATCCATCTCTACCTGTTCTACCACCGATTAATACAATGATATCTCCTGGCACTGGTCTTCTTCTAACTACATTATCTTTTGGTGCTGCTGCAACAACCGCTCCAAGTTCTAATCTCTTAGCTACATAACCTGGATGATATATTTCTGCAACTTGTCCTGTTGCAAGTCCAATTTGGTTACCATATGAAGAATATCCATGAGCTGCTCCTTGAGTTATTTTTCTTTGTGGTAACTTACCTGGAAGAGTTTCTTCTACAGGTACTGTTGGATCTGCTGCTCCTGAAACTCTCATTGCTTGGTATACATATGTTCTTCCTGAAAGTGGATCTCTTATAGCTCCACCAATACAAGTAGCTGCTCCACCAAATGGTTCAATTTCTGTTGGATGGTTATGTGTTTCATTTTTAAACATTAATAAATAATCTTCATCTTTTCCATCTACATCAACTTTAACATTTATTGAACAAGCATTAATTTCTTCACTTTCATCTAAATCTGTTAATACACCTTTTTTCTTAAGTTCCCTAACAGCTATAGTTGCAAGATCCATTAAACAAATATTCTTTTTCTTTCTATCTTTGTATGCAAATTCTCTTCCTGCTAAATAATTTTCATATGAAGCTTTAACTAAACTTGCATACTTCCCTTCTTCAAAAGAAACCTCATCAATTATTGTTTCAAAAGTAGTATGTCTACAATGATCTGACCAATAAGTATCTATAACTTTAATTTCTGTTATAGTTGGATTTCTTTTTTCTGTATCTCTAAAGTACTGTTGACAGAAAGCTAAGTCATCTATTGTCATAGCTAGTCCATTTTCATTTAAGAAATTTTCTAAGCCACTTCTATCTAAATCTATAAATCCATCTACTATTTTAACTGCACTTGGCT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_HG917868|2359618:2370101|2364480_2365194_-|WP_044039017.1|DBSCAN-SWA MEKLEMMYEGKAKQIFRTNDDDKVIVHYKDDATAFNGEKKGQIDSKGELNNAITSMLFELLAKKGVKTHFIEKLNERDQLCKKVTIIPLEVIVRNVAAGSMAKRLGLEEGTELKTTVFELSYKNDDLGDPLINDYHAVAIGATTFEELKVIYDMTAVINDTLKEFFLKQNINLIDFKIEFGKTADGEILLADEISPDTCRFWDATTGEKLDKDRFRRDMGNVKEAYVEILKRISEEI >NZ_HG917868|2359618:2370101|2366339_2370101_-|WP_044039020.1|DBSCAN-SWA MSYIRTVYVEKKEGFNSENEHLLKDFKINLNLANLEKVRMVNRYDLAGLSDDAYYRAKKLILSEVNVDNVYDEEFPLNEGENYFLVQYLPGQFDQRADSARQCIQIITEDDSCEITSSKVVILKGRLSIDEIEKVKNYFINSVDSREISIEKPETLMPKVEKPSAVKIVDGFIDLDRSGLENFLNENGLAMTIDDLAFCQQYFRDTEKRNPTITEIKVIDTYWSDHCRHTTFETIIDEVSFEEGKYASLVKASYENYLAGREFAYKDRKKKNICLMDLATIAVRELKKKGVLTDLDESEEINACSINVKVDVDGKDEDYLLMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCIGGAIRDPLSGRTYVYQAMRVSGAADPTVPVEETLPGKLPQRKITQGAAHGYSSYGNQIGLATGQVAEIYHPGYVAKRLELGAVVAAAPKDNVVRRRPVPGDIIVLIGGRTGRDGCGGATGSSKEHTETSIDTCSSEVQKGNAPTERKIQRLFRNPEVSRKIVRCNDFGAGGVSVAIGELADGLDIDLDLVPKKYEGLDGTELAISESQERMAVVIEEKDREEFLRLCNEENLEAVVVAKVTDENIMRLKWRGDTIVELSRDFLNTNGVTSHTKAKVLEPKEENYFETSVNKYQGKDFKTVAEEILTDLNVCSQRGLVEMFDSSIGSNTVLMPYGGKTQGTPQEGMVGKIPVLEGETNTVSLMTFGYNPYLTTFSPFHGGMYSVIEALAKITALGGDASKVRLSMQEYFERMNSEEAFGKPLAALLGAYEVQRAFEIPAIGGKDSMSGTFKDLKVPPTIVTFAVVADKVQNIVSSEFKKVGSKLVEILHNRKDGDMPNLEELKTNFAKVKELINKGLVLSSSSVRFGGVIENLAKGSFGNEIGVKINSELSIKDLVEPSYGSIVLEVEEDTIKELEGVSYRVIGETTEEYSLVYGDEKIDVNELRKSWDSKLESVFRTEAKIEETKIDMPLYEAKEKVSPVIKIAKPKVFIPVFPGTNCEYDTSREFKKAGAETDVFVFRNGNAHEVEESIEEMVKRINTSQMIMLSGGFSAGDEPDGSGKFISAVFRNEKIKEAVHEMLKNRDGLMLGICNGFQALIKLGLVPYGEIRDLDENSPTLTFNKIGRHVSRMVTTKVVSNKSPWISNDDLGKLHSIAVSHGEGRFVANDEVMKKLIENGQIATQYVNFEGQGTYDIEFNPNGSVCAVEGITSPDGRVFGKMGHSERIGNGVAKNILGEKDQQLFKNGVNYFR >NZ_HG917868|2359618:2370101|2361200_2361449_-|WP_084485417.1|DBSCAN-SWA MHSRAVNSIGANVREALRGESKRDFGHKMNIALKEAEETEYWIELLLESGYLSLSDTKGILQECKELCKMLHSIVRSVRFKE >NZ_HG917868|2359618:2370101|2363072_2364479_-|WP_044039016.1|DBSCAN-SWA MTIRECDKFKDECGVFGIYSNKKTTIAHYVYYGLYALQHRGQESSGICVNQDGNLILEKGMGIVPDVFDDETLNNMTGKAAIGHVRYSTTGDTRLINAQPLLSKFKLGQMAIAHNGNLVNTDVLRELLEESGYNFQTTIDTEVILNMIARKASKGIEKALVDTVQAVKGSYAIVILTEDKLIGVRDPHGIRPLCIGKIDDGYVLSSESCALDVIGAELVRDVEPGEIVIIDDEGLRSIKLNEKAITKACAFEYIYFARPDSIMNGINVYEARVKAGELLYKDAPADADLVIGVPDSGIPSAVGYSKASGIPYAMGIVKNKYVARTFIAPTQELREKAVSIKLNALRCLVEGKRVVLIDDSIVRGTTSKKLVDIMRRAGAKEVHFRSAAPAVKYPCYFGIDTPYRSELIAAQRSLDEISDFIGSDSVGYLSIPSLVEALGGKNDFCLGCFAGEYPVSAPMEMSKVRLED >NZ_HG917868|2359618:2370101|2361438_2362056_-|WP_044039014.1|DBSCAN-SWA MLKIAVLVSGGGSNLQTIIDRVSDGYLDKVSIEYVISDTKGAYALERAKKAGIRTLTYDKKEYGDSLSGKILETLKGNVDVIVLAGFFSIIKKELIDEFRNRIINIHPSLIPSFCGKGAYGIHVHEKAIEYGVKISGCTVHFVDEGTDTGAIILQKSVPVYGEDTPKQLQERILVEEHKALPEALKLISEGKVRVEGRKTYISAQ >NZ_HG917868|2359618:2370101|2365726_2366095_-|WP_044039019.1|DBSCAN-SWA MTNSVIVNKSFNFALDIIRTYHFIRCKKREFILSKQLLRAGTSIRANVREDFGGEFRKDFGHKMNIALKEANETEYWIELLIASSYLEDEVANEMLNKCKELCKILNSIVRKVRETQEVQDA >NZ_HG917868|2359618:2370101|2362043_2363048_-|WP_044039015.1|DBSCAN-SWA MSLYKESGVNIEEGYKSVQLMRQYTEKTFIPGVLNGLGSFAGMFELGQGYKNPVLVSGTDGVGTKLEIAFKMNTYDTVGIDCTAMCVNDILCHGAKPVVFLDYMACGKLEAEKAADIVKGVSEGCQQAGCALIGGETAEMPGFYKEGEYDIAGFAIGVVEKDEIIDGSNIKSGDVLIGLESSGIHSNGYSLVRKLITDLDEEFEGKKMGEVLLTPTRIYVKPVLDLLSKVNINGMAHITGGGFIENIPRMFKNKNHRAVINKNSYEIPSIFKELMRRGVKEEEMYNTFNMGIGFVICVAREDVNKIMEILVGHGIVAHEIGYVDENEGENICLK >NZ_HG917868|2359618:2370101|2359618_2361112_-|WP_044039013.1|DBSCAN-SWA MRALISVFYKDGILEMAQFLENRGVEIVSTGGTYKYLKENGVKVIDITEVTGFPEILDGRVKTLNPYIHGGILAIRDNKEHMAKIAEKNITPIDIVIVNLYPFFDKVNEDLSFEEKVEFIDIGGPTMLRAAAKNFQDVIVISDTKDYDEVKRQMEAGEVSLAFKKKLAGKVFNLMSAYDGAIANFLLEDEYNEYYNISYKKSMDLRYGENGHQTAAYYVSTTEKGAMKDIEQLNGKELSYNNFKDMDIAWKVVCEFEETACCALKHNTPCGVAVSDTTLDAYNKAFECDPTSIFGGIVAFNKEVDAVTAEKLVEIFLEIVIAPGFTAEALEVLKKKKNLRVIKCETKACDTHELVKVDGGLLVQQSDRKLVDEYKVVTEKAPTEAQLKDMEFGMKVVKYVKSNAIVVVKDGKTLGIGGGQVNRIWPAKDALERANTEGAILASDAFFPFGDIVDECAKYKVGAIVQPGGSVNDKLSVENCNKYGIPMVFTGIRHFKH >NZ_HG917868|2359618:2370101|2365193_2365673_-|WP_044039018.1|DBSCAN-SWA MKVAIIFGSKSDTEVMRGAANALREFDIPFEAHVLSAHRVPEKLSEVIKNLEETGCEAIIAGAGLAAHLPGVIASQTTLPVIGVPIKGAVEGMDALFSIVQMPKGIPVSTVGINNSYNAGMIAAQILGVKYPEIKDKLEKYRKDMKVNFIRDNEEGVEL |
9 | Prochlorococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2619281 : 2627221
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_HG917868|2619281:2627221|DBSCAN-SWA ATTAAAATCTATATGAAAAATCTTCCTTTGCAAGTGTTAAATTACAACTATAATATGGATCACCTTTCTCTAAAAAGTCGGCATATCTTTCTCTAAATCTATTAAATTCTCCCATAAAACGCTTTTGTTTTTCTTCAGTATCTTCTAATCCTCTACTTTTTGATTCATAATGATATAACTCAGCATATGGAGTCCATACATTAACTCTACCTGTCATTAATACTCTTAAGCAAAAATCAACATCATTATACGCTACCTCAAAAGTTTCATCTAATCCATTTACTTCATCAAAAACACTTTTCTTAATTAATAAACATGCACCTGTAACAGCACTTAAGTTTTGTGTTATTCCTAATCTTAAAAAGAATCCATAATCATTTTTATCAAATCCTCTATGTGCATGTGCTGCGGCACCTCCAAGTCCTACTATTACACCACCATGTTGAATAGTGTCATCTGGATAATAAAGCTTAGCTCCTACACACCCAACATCTTCTCTTTGTGATAATGATACCATCTTAGTTAACCATTCTTCATTAATAACTTCAACATCATTATTTAAAAGTAAAATATGTTCTCCAGAAGCAAATTTTGCTCCAAAATTATTAATAGCAGAATAATTAAATCCTTTTTCCCATGTTACCACTTTTATATTTGAGTATTTTTCTTCTATTTCTTTATAATATTCAAATGTTTCTTCTAATTCAGAATTATTTTCTATTACTATTATTTCATAATTCTTATAACTAGTTTTATTAAAAATAGACGTTATAGTTCTATTTAAATCTTCAACATGATCTTTTGTAGGAATTAAAATAGAAACTTTAGGATTTCCAATTATCTCATATTCTACTTCATAAGTTCCTATATATTTTCCATCAACAGTTTTTCCTTTTATACCCATTCTCTTTAATTGTTCATCGATAGCCTTTTTAGCAGAATCATAACAATACATTTTATTTTTAGGATTACCAGCTGTTGATCCTGAATGTACCCTCCATGAATATAAAATTTTAGGAATATGATGTATATTCTGAGCATTTTCTGTTGCTCTTAAAATTATATCGTAATCTTGACTTCCATTAAAACCATATCTAAACCCACCAATTTTATCCATCAAATCTTTTCTAAATACAGAAAAATGACAAATATAATTATAGCTTCTAAATGTATCTGGCGCAAAATCTTGCTTAAAGTGAGGATCAAATCTATAGTCACTTTTCTCATTTATCTTGTCTTCATCAGTATATATAAAATCTATAGTATTATCCTCATTTATTGCTTTTACAACTTCATATAATGCATTTGGCTCTAATAAATCATCATGATCGAATAAACCTATATAATCACCAGTAGCTATATAATATGCTTCTTGTGTATTACCATCAATACCCTTATTTTCATCAAGATACTTAACTTTTATTTTTTCATATTTTGATGAATACTCGTCTAATATCTCATTAACATGTGGTGTTTCTGAGTTACCATCAACTATACACAATTCCCAGTTAGAATAAGTTTGATTAATAACTGAATCTAGTGTTTCTATTAACAAATGTTTAGGTGTTTTATAAGTAGGAATTAATATACTAATTTTAGGTTCATACTGAAATTTATATGATCTTTGATATTCTAATTCTGAGTTAGTTGGAAGATGATTGCTTAACCAATAAGTATAATCTAATCTTTCTCCTCTAAGTTTTCCATATGCTTTTCTTAGAAAAGCTTTAAATCCCTCATCTTTTATAAACTCTTTCGCCCTTCTGATATTGGCAATATTTATATTTTTTATTATAACATAAATTAATTTAATAAATTTCTTTATACCTCTAAAGAAATTTAGTATCTTATCTCTTACATTATATAACCTAACCAAAAATCTCCATCCTGAAGAATTATATATTGTTCTTAATTCTTTAACATGCTTATCAAGTTCCTTAGCAGCAACTTTATCCATATCTTCATATTCAATTTTCATGCAAATATTATCGTTTTTATCAGAATATATATTACATTTTCCATCATCATAAGATATTTCGAAAATTAAATCTTCATTATAAATTCCTAGTACAATAGGAAATCTAACTTCTATCCATTTATTATTTATATCTTCAGACTTACCTATACTAACTAAATTTTTTTCATTATCCTTATATATATTTATAGATATTTTAGATTTTATATCTTCATCACCTATGTATAAATATATAGACTTAATATTATAAACGCTACTTACATATTTAAATTTATATGGTGATTCTTTTGATATTTCTATCTTCTTATTTGGAATCGTTCCTAAAATTACCTCGTTTTTGTTCCTCATTAGAATATTCCTTTCTTAAATATTTCCTATTTCATGATATAATTGTATCATTTCATCAACAGGACCTTCTATCATCTCTCCGCCCTTTTTAATAAATAATACTCTATCACATATCATTTTTATTGAATTCATATCGTGTGATACAAATAATATAGTTTTTTTATCTTTTTTAAATTCAAGAATCTTATTAATACATTTCTTTTGAAATGCTTCATCTCCAACTGCTAATACCTCGTCTATAACAAGTATTTCAGGATCTACATGAATTGCCACAGAAAAGGCTAATCTCATATACATACCTGATGAATAATTCTTTACAGCAGTATCCATAAATTGACCAACCTCAGAAAATTCCACTATTGAATCGTATTTTTTACTTACTTCTTCTTTACTAAGTCCTAAAATTGATCCATATAAATAAACATTTTCTCTACCTGTCAAATCTGGTTGAAACCCAGCTCCAACTTCTAATAAAGATGATACTTTTCCATTAATTATAATCTCTCCACTATCTGGATACAATATCTTTGTTACCAATTTTAAAGTTGTACTTTTTCCTGTTCCATTTTGACCTATTATACCTACTGTTTCTCCCTTATTTACGTTAAAAGAAGCATCTTTAAGAACTTGATATTTTTGTATTTCTAACTTATTTCTTCTTAAAACGAAATTTATAAATTTTTCTTTTATAGAATAGCTTTTATTTTGATATATATTGAACGCTTTACTTACGTTTTTGAATTCAATTACTGACATAAGATTTCACCTTCTTTACTATATTTCCTCTGCAAATCTTTTTTGAATCTTATTAAATACTTTAAATCCAATCCATAAAAATACCATTGCAATTATTGCTAAAGCTAAAACAACTTTTGCACTTGGAAATCTATTTTCATAAAGACATGCCCTTATAGAATTAAGTACTAATGTCATAGGATTTAAATACATTAAAGGTCTTATTTTTTCTGGTATAAGCTCCATTTGATAAATAACTGGAGTTAAATACATCCATGCCATAAATGCAACTTCAACAAAATGAGATACATCTCTATATATAACATTTAAACTACTTAATATTAATGTTAGTCCTATAGTAAAAATCAAAAATAAAAATAAAACTATAGGAAATGCAATTATTGGTATACCTATTGGTATCTTTGCAATAAATATTCCTGCAAAAAGTATAATTAATGTTATTAGATAATTTACAAAACTAGATAAAACTATTGATAGTGGAATTATTTCTCTAGGAAAGTATACCTTTTTTATTAAATGAGCATTATTTACTATAGATTGTGTTCCACCCATTATAGCAGTCTGAAATGTTGTCCAAGGTAACAACCCTGATAATATGAAAATAGGATAGTTTGGATCTGGATTCCTAAATATAACTTTAAATGCAAATGTATAAACCATCATCATAATTAATGGATTAAAAAAAGACCATACAAATCCTATTGCAGAATTTTTATATTTCAATTTTAATTCTTTTGAAGTTAAATTCTTTAACAACTCTTTTGACTGCATTATTTCCTTTATTCTTTCAACCAAAATTTTCACCCTTTCTATACAAATATATTTTCAATAGATTATACACAATATACTCAAAAGACTAACAAATAGATTTTGTTAGTCTTTTAAATCTTATTTAAAACTCTATTTTACTATCTTTAAACAAAGGCCACTTTTTATCTTTTTCTGATAATAATACTTCATCAATTCCTTCTAATGGCCATTCTACTGCTACATCTGGATCATTCCAAATTATACCCATTTCGAATTCTGGATGATAGAAATCTGTACATTTATAAGTAAATTCTGCTTCTTCAGACAATACTACAAACCCATGAGCAAATCCTTCTGGAATATAGAATTGCTTTTTATTTTCTTCGCTTAATACAACCCCTACATATTTACCGTATGTTGGAGAATCTTTTCTTAAGTCTACTGCTACATCGTAAACTTCACCTTTAATAACTCTTACAAGTTTACCTTGAGTATGTTCAGTTTGAAGATGTAATCCTCTTAAAACACCCTTTTTAGACTTTGATTGATTGTCTTGAACAAACTTCATATCAAGACCTGCCGCTGCAAACTCTTCATAATTATAAGTTTCCATAAAGTATCCTCTGTTATCACCGAATACTGTAGGCTCGATTATATAAACATCTTTAATTTCAGTTTCTATAAAATTAAATTTTCCCATTAAAATTCACCCTAACTTTTATTTATTACTATACATCTTATTGTAATAGTTTTGATATTCTCCTGAAGTAACATTTTTCATCCAATCCATATTATCTAAATACCACTTAATTGTAAGCTTTATTCCTTCTTCATATGGAGTTTCTGGATACCATCCTAATTCATCTTTTATTTTAGTTGGATCTATACCATATCTTCTATCGTGACCTTTTCTATCTTCTACAAAAGTCATTAAAGTTTCATTTACTGATTCATCTACATTATCATGAACATATTCAATTATAGTCTTAACTATATGAATGTTTGTTCTTTCATTGTGTCCACCAACATTGTAAACTTCTCCTAATCTACCGTTTCTTATAACCATATCGATAGCTTTACAGTGATCTTCAACATATAACCAGTCTCTTACGTTTAATCCATCTCCATATATAGGAAGCGGCTTCTTATTTAAACAGTTATTGATAACTAATGGTATAAGCTTTTCTGGAAATTGATATGGTCCATAGTTATTTGAACATCTTGTAATGTTTATTGGCATCTTATAAGTTTCTCCATATGCCTTAACCATTAAATCTCCACCAGCTTTTGATGATGAATATGGTGAGTTTGGATCAAGTGGAGTAGTTTCCATAAAGTATCCTGTTTCTCCTAATGAACCATAAACTTCATCAGTTGATACTTGAAGGTATTTAACTCCTTCTTTCCATCCATTTTCTGTTTCCCAAGCTTTCTTAGCTGCATTTAATAAAGTAACAGTTCCAAGTACATTTGTCTTAGCGAAAATTTCTGGTTCCTTTATACTTCTATCAACATGTGATTCTGCTGCAAAGTTTACAACATAATCAATTGTAAATTCTTCAAATAAAGCTTCTACAGCTTCTGCATCACAGATATCCACTTGTCTGAATATGTGATTTGGATTATTTTCAACATCTTTTAAATTTTCTAAATTACCTGCATAAGTTAATTTATCAATGTTTACTATTCTAACATCATCATATTTTTTTAACATGTAAAGTACAAAATTTGAGCCTATAAATCCAGCTCCTCCAGTTACTAAATAAGTCTTCATATCTTTCCTCCTAAATATTACTCTTCTGATATACTTTTTAAATACTTACCATAATTAGTTTTCATCAATGGCTCTGCAAGAACTAATAATTCTTCTTTGCTTATCCATCCATTTCTATATGCAATTTCTTCAAGGGAAGCAATATATGTTCCTTGAGTACTTTGAACTGCTTCTACAAAGTTTGATGCCTTAAGCATTGACTCATGAGTACCTGTATCAAGCCAAGCCATTCCTCTACCGAAACAGTTAACTTTTAGAGTCTTCTCTTCCATATAAACTTTATTTAAATCAGTAATCTCAAGTTCACCTCTTGGTGATGGCTTTAGTGATTTAGCTTTTTTAACAACAGAATTATCATAGAAATATAATCCTGGCACAGCATAGTGTGACTTCGGATTTTCTGGTTTCTCTTCTAAAGAAATAACAGTATCATTTTCATCAAACTCTACAACACCAAAAGCCCTAGGATCTTGAACATAATATCCAAATATCTCAGCACCCTTCTCTAATGATGCAGCTTTTTGTAAATGCTTAGAAAAACTTTGTCCCCAGAAGATATTATCCCCTAAAATCATAGCAACATTATCATCACCAATAAATTCTTCACCTATTATAAATGCTTCTGCTAATCCGTTTGGTTTTTCTTGAAGAGCATATTCTATATTTAATCCATATTGACTGCCATTTCCAAATAATTGCTTAAATAATGGTAAATCTCTTTCAGTAGATATGATTAATATATCCTTTATTCCTGCTAACATAAGTACAGACATTGGATAATAAATCATTGGTTTATCATAAATAGGAACTAATTGTTTTGATATCGCTTTTGTAACAGGGTATAATCTAGTTCCTGACCCCCCCGCTAATATAATACCTTTCATAGTTTCTCTCCTTCTGCATTCTCTTAATAACTCTTATTATATTCTTCTTTTACACATAAATATATTTTAATACTATTATATTAAGATGTCATTATATTAATATTCTAAGCATTTGCCTTTTTATATATCAATTCCGCCAAAGACTTAGCTAAACTATTAATTTCATCTTGATCCTCACCTTCAAGCATAACTCTTACTAATGGTTCTGTACCAGAAGGTCTTATAAGTACTCTACCTTTTCCATCTAATATCTTTTCTATTCTCTTTATCTCTGATGCAATTTCTTCATCAACTAAGTAAATATTTTTTTTGTCATTTGGTATAACAGCATTTTCAAGAACTTGTGGTAATGAAGTAACTATATTTGATAGTTCCTTTAATGTCTTGTTATTCTCCTTAATTATTTCACATAACTTAACTGCTGTTAATAACCCGTCACCGGTAGTGTTATAATCTAAGAAAATAATATGTCCTGATTGCTCTCCGCCTAAATTATATCCTCTTTTTATCATTTCTTCAAGAACATATCTATCTCCAACTTTAGTCTTCGCAGTCTTAATCTCTTCTTTGTCTAATCCTAAGAAAAGTCCCATATTACTCATTACAGTAGTTACTAAAGTATTTTCAACTAATTTTCCTTTTGATTTAAGATATTTAGCAAATACAGCCATAATCTTGTCTCCATCCACTAAATTGCCTTCATTATCTACAGCTAAACATCTATCAGCATCACCATCAAAAGCTAACCCTAAATCACAACCTTTTTTCACTACATAATCCATCAATTCTTCCATATGTGTAGATCCACATTTCTTGTTTATATTAACACCATCAGGATTATCATTTATAACATATACTTCTGCCTTTAATTCTCTAAAAGCTTTAACTGCAGCTTTATACGCAGCTCCATTAGCACAGTCTAAAGCCACCTTTAGTCCATCTAATGTAATATTAACTGTATTTTTTATATATTTTACATACTGTTCTATAGCAGTCTCATCTTCTATCTTTCTTCCAACATCTCCTGAAACAGGCGACGGAACTTCTTCTAAATTATTTTCAATAACATATTGAATTCTATCTTCTATTTCATCTTTTAGTTTGTATCCTTTACTATCAAAAAACTTAATTCCATTATACTCAACAGGATTATGTGATGCTGAAATCATTACTCCGGCATCTGCATTGTATTTTCTTGTTAAATACGCAATTGCTGGTGTTGGCACAACTCCTACGCATACAGCTTCTGCACCAACTGATAGTATTCCAGAAACTAATGCACATTCTAACATTTGTCCTGAAATTCTTGTATCCATCCCTACTAGAATTTTGGGTTTATGAGTTCCTTCTGTTAAAACGTATGCTCCGGCTCTTCCAAGCTTAAAAGCTAATTCTGGTGTAAGTTCTGTATTAGCTACTCCCCTTACTCCATCTGTCCCAAACATCCTACTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_HG917868|2619281:2627221|2619281_2621237_-|WP_156930578.1|DBSCAN-SWA MDKVAAKELDKHVKELRTIYNSSGWRFLVRLYNVRDKILNFFRGIKKFIKLIYVIIKNINIANIRRAKEFIKDEGFKAFLRKAYGKLRGERLDYTYWLSNHLPTNSELEYQRSYKFQYEPKISILIPTYKTPKHLLIETLDSVINQTYSNWELCIVDGNSETPHVNEILDEYSSKYEKIKVKYLDENKGIDGNTQEAYYIATGDYIGLFDHDDLLEPNALYEVVKAINEDNTIDFIYTDEDKINEKSDYRFDPHFKQDFAPDTFRSYNYICHFSVFRKDLMDKIGGFRYGFNGSQDYDIILRATENAQNIHHIPKILYSWRVHSGSTAGNPKNKMYCYDSAKKAIDEQLKRMGIKGKTVDGKYIGTYEVEYEIIGNPKVSILIPTKDHVEDLNRTITSIFNKTSYKNYEIIVIENNSELEETFEYYKEIEEKYSNIKVVTWEKGFNYSAINNFGAKFASGEHILLLNNDVEVINEEWLTKMVSLSQREDVGCVGAKLYYPDDTIQHGGVIVGLGGAAAHAHRGFDKNDYGFFLRLGITQNLSAVTGACLLIKKSVFDEVNGLDETFEVAYNDVDFCLRVLMTGRVNVWTPYAELYHYESKSRGLEDTEEKQKRFMGEFNRFRERYADFLEKGDPYYSCNLTLAKEDFSYRF >NZ_HG917868|2619281:2627221|2622377_2623154_-|WP_044039335.1|DBSCAN-SWA MVERIKEIMQSKELLKNLTSKELKLKYKNSAIGFVWSFFNPLIMMMVYTFAFKVIFRNPDPNYPIFILSGLLPWTTFQTAIMGGTQSIVNNAHLIKKVYFPREIIPLSIVLSSFVNYLITLIILFAGIFIAKIPIGIPIIAFPIVLFLFLIFTIGLTLILSSLNVIYRDVSHFVEVAFMAWMYLTPVIYQMELIPEKIRPLMYLNPMTLVLNSIRACLYENRFPSAKVVLALAIIAMVFLWIGFKVFNKIQKRFAEEI >NZ_HG917868|2619281:2627221|2624900_2625767_-|WP_044039338.1|DBSCAN-SWA MKGIILAGGSGTRLYPVTKAISKQLVPIYDKPMIYYPMSVLMLAGIKDILIISTERDLPLFKQLFGNGSQYGLNIEYALQEKPNGLAEAFIIGEEFIGDDNVAMILGDNIFWGQSFSKHLQKAASLEKGAEIFGYYVQDPRAFGVVEFDENDTVISLEEKPENPKSHYAVPGLYFYDNSVVKKAKSLKPSPRGELEITDLNKVYMEEKTLKVNCFGRGMAWLDTGTHESMLKASNFVEAVQSTQGTYIASLEEIAYRNGWISKEELLVLAEPLMKTNYGKYLKSISEE >NZ_HG917868|2619281:2627221|2623827_2624883_-|WP_044039337.1|DBSCAN-SWA MKTYLVTGGAGFIGSNFVLYMLKKYDDVRIVNIDKLTYAGNLENLKDVENNPNHIFRQVDICDAEAVEALFEEFTIDYVVNFAAESHVDRSIKEPEIFAKTNVLGTVTLLNAAKKAWETENGWKEGVKYLQVSTDEVYGSLGETGYFMETTPLDPNSPYSSSKAGGDLMVKAYGETYKMPINITRCSNNYGPYQFPEKLIPLVINNCLNKKPLPIYGDGLNVRDWLYVEDHCKAIDMVIRNGRLGEVYNVGGHNERTNIHIVKTIIEYVHDNVDESVNETLMTFVEDRKGHDRRYGIDPTKIKDELGWYPETPYEEGIKLTIKWYLDNMDWMKNVTSGEYQNYYNKMYSNK >NZ_HG917868|2619281:2627221|2625871_2627221_-|WP_044039339.1|DBSCAN-SWA MSRMFGTDGVRGVANTELTPELAFKLGRAGAYVLTEGTHKPKILVGMDTRISGQMLECALVSGILSVGAEAVCVGVVPTPAIAYLTRKYNADAGVMISASHNPVEYNGIKFFDSKGYKLKDEIEDRIQYVIENNLEEVPSPVSGDVGRKIEDETAIEQYVKYIKNTVNITLDGLKVALDCANGAAYKAAVKAFRELKAEVYVINDNPDGVNINKKCGSTHMEELMDYVVKKGCDLGLAFDGDADRCLAVDNEGNLVDGDKIMAVFAKYLKSKGKLVENTLVTTVMSNMGLFLGLDKEEIKTAKTKVGDRYVLEEMIKRGYNLGGEQSGHIIFLDYNTTGDGLLTAVKLCEIIKENNKTLKELSNIVTSLPQVLENAVIPNDKKNIYLVDEEIASEIKRIEKILDGKGRVLIRPSGTEPLVRVMLEGEDQDEINSLAKSLAELIYKKANA >NZ_HG917868|2619281:2627221|2621618_2622359_-|WP_044039334.1|DBSCAN-SWA MSVIEFKNVSKAFNIYQNKSYSIKEKFINFVLRRNKLEIQKYQVLKDASFNVNKGETVGIIGQNGTGKSTTLKLVTKILYPDSGEIIINGKVSSLLEVGAGFQPDLTGRENVYLYGSILGLSKEEVSKKYDSIVEFSEVGQFMDTAVKNYSSGMYMRLAFSVAIHVDPEILVIDEVLAVGDEAFQKKCINKILEFKKDKKTILFVSHDMNSIKMICDRVLFIKKGGEMIEGPVDEMIQLYHEIGNI >NZ_HG917868|2619281:2627221|2623251_2623809_-|WP_044039336.1|DBSCAN-SWA MGKFNFIETEIKDVYIIEPTVFGDNRGYFMETYNYEEFAAAGLDMKFVQDNQSKSKKGVLRGLHLQTEHTQGKLVRVIKGEVYDVAVDLRKDSPTYGKYVGVVLSEENKKQFYIPEGFAHGFVVLSEEAEFTYKCTDFYHPEFEMGIIWNDPDVAVEWPLEGIDEVLLSEKDKKWPLFKDSKIEF |
7 | Enterobacteria_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_HG917869_1 | 90443-91519 | Orphan |
III-B
Consensus repeat of NZ_HG917869_1
|
16 spacers
spacers of NZ_HG917869_1
>1.1|90473|36|NZ_HG917869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCAACTTTATAATTTTCATATTCTTTAGTATTTTGC >1.2|90539|35|NZ_HG917869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGTAAATTTTAATGTGCCTAATAATTCAATAGT >1.3|90604|36|NZ_HG917869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTTGTCCCTAATTCTTCGAATAAATAGCCATGCC >1.4|90670|36|NZ_HG917869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCTCACTTTTTGCATAAAAAAAGAACTAGTAAAAAC >1.5|90736|36|NZ_HG917869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTAGAATTAGATAAGTTCTAACTCTACTGAATAATA >1.6|90802|34|NZ_HG917869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGGTAAGGATATAAACTTCTTAATCGTAGCTAG >1.7|90866|36|NZ_HG917869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTTGATGATAAGTGGCAAGAGGTTGAACCTCCTAC >1.8|90932|34|NZ_HG917869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTAATGATGGAGTTAAGTAGTGGAGCGACTATT >1.9|90996|35|NZ_HG917869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTACAGGATGTTCAAGTTGTAGTAGGATGGCTAC >1.10|91061|36|NZ_HG917869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTACACCAGAAGCAGTGGCACAATATAGCGGTTCTG >1.11|91127|35|NZ_HG917869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAAGTGGATTATGTGGTAAATTATATTTTTTATG >1.12|91192|35|NZ_HG917869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAACTATAATAACTATTATCTCCTTGCCAACTCTC >1.13|91257|36|NZ_HG917869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAATCACTTAATTTATCTTTTGCAGTTGCTACAGTT >1.14|91323|36|NZ_HG917869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAACAAGGTTTTTCATTTCCTCATATTGGAAAAGG >1.15|91389|35|NZ_HG917869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATTGGAAAAGGTAATCCATGTTTAGTTTATCACT >1.16|91454|36|NZ_HG917869|CRISPRCasFinder,CRT CATCTACTTTTACTAAAATATCTAACAGTAGTTTTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_HG917869_1
The CRISPR arrays of NZ_HG917869_1 >merge|NZ_HG917869|1|90443-91519|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAATGCAACTTTATAATTTTCATATTCTTTAGTATTTTGCGTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAATTTTGTAAATTTTAATGTGCCTAATAATTCAATAGTGTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAATTTGTTGTCCCTAATTCTTCGAATAAATAGCCATGCCGTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAATCCTCACTTTTTGCATAAAAAAAGAACTAGTAAAAACGTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAATGTAGAATTAGATAAGTTCTAACTCTACTGAATAATAGTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAATATGGTAAGGATATAAACTTCTTAATCGTAGCTAGGTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAATTCTTGATGATAAGTGGCAAGAGGTTGAACCTCCTACGTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAATTTTAATGATGGAGTTAAGTAGTGGAGCGACTATTGTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAATACTACAGGATGTTCAAGTTGTAGTAGGATGGCTACGTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAATTTACACCAGAAGCAGTGGCACAATATAGCGGTTCTGGTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAATTAAAGTGGATTATGTGGTAAATTATATTTTTTATGGTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAATAAACTATAATAACTATTATCTCCTTGCCAACTCTCGTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAATTAATCACTTAATTTATCTTTTGCAGTTGCTACAGTTGTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAATTTAACAAGGTTTTTCATTTCCTCATATTGGAAAAGGGTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAATTATTGGAAAAGGTAATCCATGTTTAGTTTATCACTGTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAATCATCTACTTTTACTAAAATATCTAACAGTAGTTTTAGTTGAACAATAACATAAGATGTTTTAATGT >NZ_HG917869|1|1|90443-91453|PILER-CR GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT GCAACTTTATAATTTTCATATTCTTTAGTATTTTGC GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT TTTGTAAATTTTAATGTGCCTAATAATTCAATAGT GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT TTGTTGTCCCTAATTCTTCGAATAAATAGCCATGCC GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT CCTCACTTTTTGCATAAAAAAAGAACTAGTAAAAAC GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT GTAGAATTAGATAAGTTCTAACTCTACTGAATAATA GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT ATGGTAAGGATATAAACTTCTTAATCGTAGCTAG GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT TCTTGATGATAAGTGGCAAGAGGTTGAACCTCCTAC GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT TTTAATGATGGAGTTAAGTAGTGGAGCGACTATT GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT ACTACAGGATGTTCAAGTTGTAGTAGGATGGCTAC GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT TTACACCAGAAGCAGTGGCACAATATAGCGGTTCTG GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT TAAAGTGGATTATGTGGTAAATTATATTTTTTATG GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT AAACTATAATAACTATTATCTCCTTGCCAACTCTC GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT TAATCACTTAATTTATCTTTTGCAGTTGCTACAGTT GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT TTAACAAGGTTTTTCATTTCCTCATATTGGAAAAGG GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT TATTGGAAAAGGTAATCCATGTTTAGTTTATCACT GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT >NZ_HG917869|1|1|90443-91519|CRISPRCasFinder GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT GCAACTTTATAATTTTCATATTCTTTAGTATTTTGC GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT TTTGTAAATTTTAATGTGCCTAATAATTCAATAGT GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT TTGTTGTCCCTAATTCTTCGAATAAATAGCCATGCC GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT CCTCACTTTTTGCATAAAAAAAGAACTAGTAAAAAC GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT GTAGAATTAGATAAGTTCTAACTCTACTGAATAATA GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT ATGGTAAGGATATAAACTTCTTAATCGTAGCTAG GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT TCTTGATGATAAGTGGCAAGAGGTTGAACCTCCTAC GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT TTTAATGATGGAGTTAAGTAGTGGAGCGACTATT GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT ACTACAGGATGTTCAAGTTGTAGTAGGATGGCTAC GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT TTACACCAGAAGCAGTGGCACAATATAGCGGTTCTG GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT TAAAGTGGATTATGTGGTAAATTATATTTTTTATG GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT AAACTATAATAACTATTATCTCCTTGCCAACTCTC GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT TAATCACTTAATTTATCTTTTGCAGTTGCTACAGTT GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT TTAACAAGGTTTTTCATTTCCTCATATTGGAAAAGG GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT TATTGGAAAAGGTAATCCATGTTTAGTTTATCACT GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT CATCTACTTTTACTAAAATATCTAACAGTAGTTTTA GTTGAACAATAACATAAGATGTTTTAATGT >NZ_HG917869|1|1|90443-91519|CRT GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT GCAACTTTATAATTTTCATATTCTTTAGTATTTTGC GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT TTTGTAAATTTTAATGTGCCTAATAATTCAATAGT GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT TTGTTGTCCCTAATTCTTCGAATAAATAGCCATGCC GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT CCTCACTTTTTGCATAAAAAAAGAACTAGTAAAAAC GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT GTAGAATTAGATAAGTTCTAACTCTACTGAATAATA GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT ATGGTAAGGATATAAACTTCTTAATCGTAGCTAG GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT TCTTGATGATAAGTGGCAAGAGGTTGAACCTCCTAC GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT TTTAATGATGGAGTTAAGTAGTGGAGCGACTATT GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT ACTACAGGATGTTCAAGTTGTAGTAGGATGGCTAC GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT TTACACCAGAAGCAGTGGCACAATATAGCGGTTCTG GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT TAAAGTGGATTATGTGGTAAATTATATTTTTTATG GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT AAACTATAATAACTATTATCTCCTTGCCAACTCTC GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT TAATCACTTAATTTATCTTTTGCAGTTGCTACAGTT GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT TTAACAAGGTTTTTCATTTCCTCATATTGGAAAAGG GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT TATTGGAAAAGGTAATCCATGTTTAGTTTATCACT GTTGAACAATAACATGTGATGTTTTTAAAT CATCTACTTTTACTAAAATATCTAACAGTAGTTTTA GTTGAACAATAACATAAGATGTTTTAATGT
>NZ_HG917869.1|WP_051483868.1|88216_90202_+|sensor-histidine-kinase MRYKYRAIISVCVTLYMFLFICDIDDVFGDIDNNDDEINVLVISSYYGYSKWEKGVLEGFTDSDELGVNLINVSLYFDGIEGIAEKTYVDSVNKMIQEKYGEKYIDCIVTLDDESFMFARANLFNENSVMYKKPIVFLGVNFDMNLSEDEKQYISGIIDDTDEVGAINLILDSDKHIENIYLVAGESKYAEAMASKMPFFRKFANRDYEFEIIQDSRLGNVEERLKDISDEDSAILLVGKFVDDVGVIMESKSVISSIQSKSDVPIYSTAQAYIEGGAIGGVVGNPYKSGKVLAEMVDSVLSHGDIHVSVNPDNKLSVPIVNFRALREYGINPLLLPKDSVVMNKRSYELMVPLYIQNILWISAALIIMVLFYMIYRHIRDMRYAKYIIDEAMYREKVRSDFIVAISHEFRTPINVISSCLKLLEVTVDRGNYEKEYILEKFSLMKKNSNRLLKQVNNLIDTSELNNGYLNLSLNNYNIVEVVEDSVGTIINFAKNKGIEVVFDSEEEEIILAIDKNKIERVILNLLSNSVKYIGDGSNILVMVSISNVTEDERYVSVSVKDDGIGISKDIVDLVFQQFKRGDVDNGLIRECEGSGLGLYIVRRIVELHNGEINIISEVGKGTEVIFKLPLYTIEGDSSGVLATDMSSVDYKADIEFSDLN >NZ_HG917869.1|WP_044040088.1|87346_87787_+|bacitracin-resistance-protein-BacA MLDQKTIEIVKSTVPALKEHGVEITKTFYKNMFENNPEVKRLFNMDRQASGEQPKALAMTILAAAQNIDNLEVLLPAVKKIGERHCDVQIKEEHYPIVGANLLVAIKEVLGDAATDEVIDAWGKAYEVIAKIFIDVEKEIYESRNK >NZ_HG917869.1|WP_044040087.1|86671_87067_-|Rrf2-family-transcriptional-regulator MQISKFTDYAFRSLIYLARNRDETTTVDKLAKYLEVSEHHMKKVIHKLAKTGYIISTKGRNGGLKLGLEPSEINLGKVLVATEENLNLVECMANPKLCPLMTSDCNLKRILSKSLQAFINELSKYTLEDIL >NZ_HG917869.1|WP_044040086.1|86182_86350_-|hypothetical-protein MDMLELIIKSFATIYIIRLVLKHNLFISKLIIKIKFLGIHIELNGKEKKHPSDQE >NZ_HG917869.1|WP_044040085.1|85135_86005_+|carbon-nitrogen-hydrolase-family-protein MRIFALELNNDIKGIQNRKQYIESLIAKLPSPDLVVLPELAICSYMASQDIWQYADDCGKDTAVWATEISRKYNTYIGVGYLDKENGDYYNRYMIAGQKGVCGTVTKSEGEAAVFKRGWFENTISTPFGNVGIAICYDSKRKHFYESVKTKELSLIIFPHGCPADPKKSKEEIENNDFFCTTYMKAFDIPVVYVNSKGKLEYMPGIMGRMMAEAGFMMNGKSKIYAPSGKSIEVDVAEVIAMDISLSSKKIKNNIHFYGDDLVKGNWLFRQFVLKPDTKAGIKEYYTNR >NZ_HG917869.1|WP_044040084.1|84144_84915_+|trypsin-like-peptidase-domain-containing-protein MNINDLSTQLLYTTVPIFGIKSDGSQVSGTGFIFSIFDKDDTSKSIPLLITNYHVMEDVINGFIEFSLAENNMPIKGKSIRINFDGDVLKNKLGSLDLIAIPLADALNNLNKNNINVFYRTISKEMIPTTSQVEELSALEQITFIGYPSGLYDNYNKTSLIRQGITATPIWNDFKGEPIFLIDAGVFPGSSGSPVFIYNQGSYPTKDGISIGSRLLFVGIISETILRQGTTYLDLGRVINSRAMYNELENIMRPYI >NZ_HG917869.1|WP_044040083.1|83679_84129_+|hypothetical-protein MDNTFEPIDTTTNCTVADVSINDTNIGSATTTLTYPIRQPEEYVNDFMVSLRASEIRKVRKYCEDAKKSEFPWSEILLAISTTCIGCFLGALTSNVELNSLKGIIMYVVSLVIASGTFVAYLFIRRGSISDVNDLADKVKEYIVDPDNI >NZ_HG917869.1|WP_044040082.1|81946_83344_+|MBOAT-family-protein MVFSSLTFMFAFLPMVLLAYFIMPKAVRNLTLFLFSLLFYAWGEPIYILIMIFSTIVDYFHGMLIYKYKQCDNNKKSRLILISSIFINLSLLVFFKYSDFFISSVNTIFGSNLKLLNLSLPIGISFYTFQTMSYSIDIYRGTVTPQRNIIDFGTYVALFPQLIAGPIVQYKTIAHQLRNRKESLDQFTYGIIRFVSGLGKKVLIANNVGLIWEEIISSDLSTISVLSSWIGIIMFALQIYFDFSGYSDMAIGLGNMFGFKFKENFNYPYESKSITEFWRRWHISLGSWFKEYVYIPLGGNRRYQVRNICIVWLLTGLWHGASWNFVIWGIYFGSTLLLEKFILKKFFNINSRIYALLLILIGWVIFAFDNLQHGLIYIKSMFSISSNVFIDSNALYILTSNITIIVIGIIASTSIPKKITRYFLKGKENSWTFSIVTSVYILGILILSTASLVNSSYNPFLYFRF >NZ_HG917869.1|WP_051483867.1|81173_81764_-|DUF4358-domain-containing-protein MKKKILVLFLAATLGVTSLVGCAKSDVTLNNQQSTGIENSENNDGVVAEKSVEAIRKAVVDAYGDKYLATMSLSKEEINERFGLTDDMYKDAVADIPAMSTHVDTFVAVEAKEGKVNEVFDALTEYRDMLINDTMMYPMNELKTQSSEVYKYDDYVFFIMLGGYDDSLEEDSELLAYYEDQNDIAKNIIDDMLNTK >NZ_HG917869.1|WP_044040081.1|79935_81060_+|hypothetical-protein MKNKNFIVAGVFVVFIFIVSLLNIISPTKIYSEKEKRKLAQSPELNKETIFSGKFTREYEEYFNDQFVFRDNWISLNTKYKILSLNKDINDVYLGKDNYLFEDTSSYDTKKLYKNMDHLKNLIIKYKDSIGENNINIMLIPNGSEILSDKLPKYATVLDQQRILKDAEVMYKDNFINTYDILKRNKSKYIYYKTDHHWTTLGAYYAYNAWADKTNHEIETFSSDNTKIVSTNFLGTIYSKINYAKEPDIITIYNPEEKYSVNYDSNTSSSTSLYNLEYLEKKDQYSVFLDGNHGLVTITSSNTNGKNLLIIKDSYANCFIPFIADEYEKIHVIDLRYYNSSLESYIEDNDISELLVLYNINSIAKDTNLYKVTR >NZ_HG917869.1|WP_044040089.1|92210_92861_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MSIGEKINDLRKKNNLSQDQFAELFNVTRQTVSNWENGKSYPDLEMTLKISNKFRISVDELLQNNETIVRKINSEKKEKSNLLILLGILFFAVIVFVFCFYIKYEEKNEISFEMNKSKTYHTQETNRSFLDAGVGYFTLIKDGKVDIKAIGDTDDGELHIVITDDKNKKIYYQIDGEEIEDSQSVYFNSGSYMIQVTADDYTEDIVSLTYHVKVNN >NZ_HG917869.1|WP_044040090.1|92892_93651_+|pilus-assembly-protein MNKKILSGSTIKIIAVITMCIDHFGQVVLKNGVVMNAPYKFFSDAQFSALLSIVDLCHMLGRVAFPLFCYLLVEGFIHTHNLRRYILNLGLFAIVSEPIYDLTFYGSVFSSEGQNVLFTLLIGILTLTCIKKLNDNIWVAIFFNFISGSVAYILNLDGWYYGAIMITVMYMFRRHKFMKYLLTAVVMYLCELDYSLKGLLDPYFWMALLSLFIMVLYNGQRGMKIKYFFYIFYPGHLLFLYVLTTFIIVPQL >NZ_HG917869.1|WP_044040091.1|93690_94470_+|sulfite-exporter-TauE/SafE-family-protein MMLYVIYILAGIGAGIVTGLAGLSAAVVITTLLVSICGWKSYDAVTVALAADVLASLLTAYTYYKNKNIDLKNGMLVTITAFIGTIIGSYSGFLFSQSQPDGLGYISMLTTIFLGIKFLVKPIEEGYDADSGSEQISKKKIILAMFFGCGIGWICGFTGSGGGILMLTVFTLLLGYNLKVAVGTSTMIMTLVALTGTISHFYMGATIQLIPMLLVIIFCVSAAYFSAKFANKCEIKKLNKVVGTCLGILGVITILIKLI >NZ_HG917869.1|WP_044040092.1|94877_95912_+|sulfate-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKIKKVVSLLLVAIIGGTLLTSCSDENKNKDTVEITNVSYDPTRELYEAYNKEFQKYYKDKTNKDVVITQSHGGSGKQARAVIEGNEADVVTLALGYDISAIEKAGLIESGWQSKFDKNSSPYTSTIVFLVRKGNPKNINDWDDLVREDVGIITPNPKTSGGARWNYLAAWAYSYKKNNGDEEKVKKYMKDLFGNVLVLDSGARGATTTFVENGQGDVLLAWENEAYLSLKEHPDEFEIVTPSISMLAEPPVAVVDEVVDKKGTREVATEYLEYLYSDIGQRIAGENYYRPTNEEIAKEFSDVFNLDMELINIDDKIFGGWDKAQKEHFDDGGIFDEIYDGEQG >NZ_HG917869.1|WP_044040093.1|95924_96755_+|sulfate-ABC-transporter-permease-subunit-CysT MGKSKKRAVIPGYKVSMGVTITFLSLIVLIPLASLAINASGMGFNKFISTVTNPRVIAAYKVSFLCAFIATIVNSFFGVIIAWTLVRYDFKGKRIIDGLIELPFALPTAVAGIALTTLYSDKGMIGKYFDAIGIKISYTRVGIIAAMIFIGIPFVVRSIQPVLEGIDKQYEEAATMLGASRVRIFFKVIFPEILPALLTGFGLAFARAVGEYGSVVFISGNMPFKTEIAPLLIMSKLEQYDYTGANAIALVMLVISFLILFLINSIQVYTNKFVKE >NZ_HG917869.1|WP_044040094.1|96765_97587_+|sulfate-ABC-transporter-permease-subunit-CysW MEKSKFVKWLLISVTVIFLFLMLIMPLVVVIIEALKKGLISYKDAITDEYTIQALILTLEATIAAVVINTVFGLFAAWTITKFHFRGKKLLTTLIDIPFAISPVIAGLIFILTFGRIGWAYDFLQAANIKIVFAVPGIILATIFVTFPFVAREIIPVLNAQGKDEEEAAALMGAKGFKIFTKITLPHIKWALLYGIILCTARAMGEFGAVSVLSGHLKGKTNTLPLHIECLYNEFNSNAAFAVSSILVILAIIILILRNIAEHKSKKYSKVSK >NZ_HG917869.1|WP_044040095.1|97603_98665_+|sulfate-ABC-transporter-ATP-binding-protein MYVELKNINKGFENYKASDNVNFQIEKGKLIALLGPSGSGKTTILRMIAGLETPDSGDIIIDGVRVNDVEASKRGIGFVFQNYALFRYMTVFDNIAFGLEVQKKDKKFINERVKELISLIGLEGLEKRYPHQLSGGQRQRVAFARALAPNPQLLLLDEPFAAIDAKVRHELRTWLREMIDKVGVTSIFVTHDQDEAIEVADEIIVTNKGRVEQKGTPLEIYNKPATPFVAKFIGQSIVINDFGKLRGFDEYSHYSKAVIRPEFIKVLKKGAINQHISATEEGVVEAVAYRGSYLEVKVRIGDISVTTTVQLSEELVEVGEKVQVLIYKLYAFNNEEVILIKNRKMENNNSVYI >NZ_HG917869.1|WP_044040096.1|98674_100366_+|adenylyl-sulfate-reductase-subunit-alpha MKEVRIEKITTDVLIIGGGTAGCYSAITLGEESNLNVLVVEKANIKRSGCLAAGVNAINAYIVKGKTAEDYVDYAKKDADGIVREDLLLTMSEGLNKVTKKLEDLGLVILKDENGEYVARGTRNIKINGENIKPILAEATKAQKNVSILNKVNITDFIVKDNRIYGAIGVAVDDNILYEISAKAVICATGGAAGLYRPNNPGFSRHKMWYPPFNTGAGYAMGIRAGAEMTTFEMRFIALRCKDTIAPTGTIAQGVGAKQVNSKGEVYENKYGLTTSERVYGTVKENQEGRGPCYLRTEGIDNSKNDDLKKAYLNMAPSQTLKWVESGKNPSEANVEIEGTEPYIVGGHTASGYWVDSNRRTTIKGLYAAGDVAGGCPQKYVTGALVEGEIAAKAVIKDLENYTATVVDEIDNFVAEKKKEVESFLNNEEGLFSIEAIEEAMQKVMDSYAGGISTNYQYNEKQLKVAEEKINQIEKLTDSLKANDFHELMFIYEIKERLVICKSVIAHLNARKETRWHSFAENLDYPNKDDKWLKYVNSKVVDGKIEIILRDLVGRGEVYEHSN >NZ_HG917869.1|WP_044040097.1|100349_100664_+|4Fe-4S-binding-protein MSIAINKEKCVGCKGCTKVCPGSLLEIDENNKAYIKYPKDCWGCCSCIKECKFSAISLYLGADIGGRGSKLSVNIEGDIAHWKIEEGNGNIEEININRKDSNKY >NZ_HG917869.1|WP_044040098.1|100681_101581_+|sulfate-adenylyltransferase-subunit-CysD MRELSHLDQLEAEAIYIIREVAAECEKPVMLYSIGKDSSVMLHLAMKAFYPEKPPFPFMHIDTTWKFKEMIEFRDKTAKELGIDMIVYSNEEGVKNGINPFEHGSAYTDIMKTQALKQGLKKYGFTAAFGGGRRDEEKSRAKERVFSFRNEAQAWDPKNQRPEMWKLYNTKINKGESIRVFPLSNWTEKDIWQYIKREKIDIVPLYFAKERPVVYRDGNIIMVDDDRFKFLPGEKVEYKKVRFRTLGCYPLTGGCESEADTLDEIIEETLGAVSSERTTRVIDNEAAGSMERRKREGYF |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_HG917869_1 | 1.1|90473|36|NZ_HG917869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 90473-90508 | 36 | MN694404 | Marine virus AFVG_250M623, complete genome | 26531-26566 | 9 | 0.75 |
NZ_HG917869_1 | 1.11|91127|35|NZ_HG917869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 91127-91161 | 35 | MF360958 | Salicola phage SCTP-2, complete genome | 229619-229653 | 9 | 0.743 |
1. spacer 1.1|90473|36|NZ_HG917869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694404 (Marine virus AFVG_250M623, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
gcaactttataattttcatattctttagtattttgc CRISPR spacer tctaatttataattttcatattctttactatcagat Protospacer * * ********************** ***. ..
2. spacer 1.11|91127|35|NZ_HG917869|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF360958 (Salicola phage SCTP-2, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
taaagtggattatgtggtaaattatattttttatg CRISPR spacer aatacttcattaggtgttaaattatattttttaac Protospacer * * * **** *** ****************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation |
---|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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