Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP007201 | Sulfurospirillum multivorans DSM 12446 chromosome, complete genome | 1 crisprs | cas3,csa3,DEDDh,cas6,cas8b1,cas7b,cas5,cas4,cas1,cas2,WYL,RT | 2 | 20 | 7 | 0 |
1. NZ_CP007201
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP007201_1 | 1124522-1134169 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NZ_CP007201_1
|
147 spacers
spacers of NZ_CP007201_1
>1.1|1124552|34|NZ_CP007201|CRT GATTTTGTATTTTAGAAAGCACCATAATCTAGCC >1.2|1124616|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GCAATCCATTCAGACAAATCGCCGTCAAAGTTATTT >1.3|1124682|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGTCGTAGAATACACCGAAGAAGATTATAAAGTAGA >1.4|1124748|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTTGTATATTCGCCTCCGTCAGGGTGCGACATTTTG >1.5|1124814|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TACATATAAGATACCGCCTACCTTACGTCCACGTGC >1.6|1124880|34|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GCAACTAATAGAATACGTGCCAATAACTCACCGT >1.7|1124944|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGCAAAGATGCAATAACAAAAATAATAAAAGATATA >1.8|1125010|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TACATATAAGATACCGCCTACCTTACGTCCACGTGC >1.9|1125076|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTTAGTAATATTTGCCTAAAACTATGTACATGACCG >1.10|1125142|35|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ACTGGTGCAGTTATTGACGGCAATCCATTAAGAGC >1.11|1125207|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CGTGTTAACAGAACGTGACTTCTTAGAACAATACAA >1.12|1125273|35|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTAATTAGAAGCCTCTTTTACATTGCTTTCGATTG >1.13|1125338|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATAAGATATTGTTTGCAATCACTTTCTCTCATCTTA >1.14|1125404|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AATTGCAGTGTGCAGAGAGTGCCACGATTACTGTCA >1.15|1125470|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATGCTTTCCATTCTCCATATCCTCGTTCTCTGAACG >1.16|1125536|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTGTAAACTCCTTGAATAATCGTATTTTTTTGGGA >1.17|1125602|35|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCGCTTCCCGTTTTGTTGTAAAGAATTTCGCTACT >1.18|1125667|37|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAAAAGATAATGCGATGAGCATTATCGGAATGATTAG >1.19|1125734|35|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTGAGGCACGCACATGTCATCAGTAACGCAAAAGG >1.20|1125799|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CGTAACTTCTTAACCCACGTTTCAGTCTCGGTAATA >1.21|1125865|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CATTCCACCTCTGTTAAACTGTTTAGAGGCATCTTG >1.22|1125931|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AATTATGATGATTACCCAGATTTTGAACTTATTAAT >1.23|1125997|38|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CCGTAAATGCTTCTTACCTGCGCTAAGCTCTCATAAAA >1.24|1126065|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGACTTTAAAAATAATACTCTTAAATGTTTAATCGG >1.25|1126131|38|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ACGCCACGCAAACCAACAGATTAACGTTAATACGCAAA >1.26|1126199|35|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TATTGTTTTAATGCCCCCTTGGTTATAGGCATACA >1.27|1126264|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCTCTTCTCTTTTGGTAATGAAAGGAGCACGGATAA >1.28|1126330|37|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CGCAATTACGCCAGTTTATAAACCAACGTATAACACA >1.29|1126397|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AATATAAAACCTTTCATTTCCCTACTCCCTTCCCTT >1.30|1126463|35|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GAATGTAAGGCAGTCATGTTTTTCGCACTCGTTTT >1.31|1126528|37|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATGGTAGAAGGTATTGAATTTTATCTTAAAAATTTAA >1.32|1126595|35|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGGAACTTAAGCACGTCCAAAAGTTTATCTGTGTA >1.33|1126660|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTTTATACAAAAGAACAAGTGGTGGACGGGTTTGA >1.34|1126726|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAAATGATGGAGTAGTAGAACGTGCGGGAGCTTCTA >1.35|1126792|35|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CAGCTTTACAATTTAGATAGTTTTGATGCGTTTAA >1.36|1126857|34|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAGTCAAGCATGATCGTATTACATTCTTCCAAAA >1.37|1126921|35|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTGCTTAACGCTTGTTTACGTACGCTTAATTTTGC >1.38|1126986|35|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AATAAACTACAATAAAAAGTTTTTGGCATTGCGTC >1.39|1127051|37|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGCTAGGCTCGTTTAACTTCCACGTTGACTCTAAATT >1.40|1127118|37|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CAAATTAAAGAAGCTTACGAGAACAAATGCATTTCTG >1.41|1127185|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GACACGTATGCCTTTGCAAGTGCTTTTTTTGGCACT >1.42|1127251|34|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTGATAGCTTAACTGGTGATATTCCTTTAGCTTC >1.43|1127315|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTTTAGGGGCGTTTAGACTGCTTTTTTATGTCTAG >1.44|1127381|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCGTAAAATCTCCATAAAGTCGGCGTGCTCTCGTTC >1.45|1127447|34|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATGGGATTTAATCCGCATTTAAATTTGATTACTT >1.46|1127511|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCGCTCACGGTTTCCGCTTGGCTTTCGCTTGGCTCG >1.47|1127577|37|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCGGGGCAACCGCCCCTGATTGGCTCGAATATGTCGC >1.48|1127644|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CGGGGCAACCGCCCCTGATTGGCTCGAATATGTCGC >1.49|1127710|33|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTGAACGGTTTGTTTTTTTGCGTTCTTGCTAAG >1.50|1127773|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GACTGACGGTGAAGAAGAATGGCAAGTAGGTACATG >1.51|1127839|34|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTATTTTCCTTATTGATAAATTATACCATTCGC >1.52|1127903|34|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ACGGTAGGCATATTCCCTAAAACCTTAACTTTCA >1.53|1127967|35|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAGAGTGCCAATATTAGAGACGGTGCTGATTTCTG >1.54|1128032|34|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GTCTGTGTAGGTTGTGGTATTTAATAGTCCCATC >1.55|1128096|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGTCGTAGCTTGTCCCGCTTGTGAGCGGGATTTCGT >1.56|1128162|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGTCGTAGCTTGTCCCGCTTGTGAGCGGGATTTCGT >1.57|1128228|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTTTAGGGGCGTTTAGACTGCTTTTTTATGTCTAG >1.58|1128294|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTTTGTCTTTCCTCTCATCGCAAAGCGGGCGACCAT >1.59|1128360|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGTGTTCCCGCTTGAATTTGAGCCACGAGCATAGCT >1.60|1128426|34|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTATTGCCTGCTTAAAATCAATCTTCTTTTTTT >1.61|1128490|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTCGTCATCATTGTGGCTTTCGATAAATTGGGTCA >1.62|1128556|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTTTGTCTTTCCTCTCATCGCAAAGCGGGCGACCAT >1.63|1128622|35|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CAAAAGAAGATATTTTGCTAATGCAGAACTTCGCC >1.64|1128687|35|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CAAGCGGGACAAGCTACGACATGACGAACGCCTCC >1.65|1128752|34|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GATGAAGCGATGACAATGCGGGCATTTTTTACGA >1.66|1128816|35|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CGAGCACATCGCCCGCTTTTAGCGAGCCGATGAGG >1.67|1128881|35|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAGGAATTGTACTAAGAACAAAACCACGCAAATAT >1.68|1128946|35|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGTCGTAGCTTGTCCCGCTTGTGAGCGGGATTTCG >1.69|1129011|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGTCGTAGCTTGTCCCGCTTGTGAGCGGGATTTCGT >1.70|1129077|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GTAGTTCGATGGCGTTCGATGATATGGAAACTGAAG >1.71|1129143|35|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAACAGCAAGTACATGAGAAAGATTGACACTTTAG >1.72|1129208|35|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCTCTAAATAACATTAGATGTCTCCTTCTTTCCAA >1.73|1129273|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GTTATAATTCTCCTAATGACACCCCTAGCGCATTTG >1.74|1129339|34|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTGGTGGTCGCACAGTCGATAAAGATTTTGGCAT >1.75|1129403|34|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTAAATCCACTTACTCTGCTTTTTTCTTTTGCCC >1.76|1129467|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGCTTCTAAAACTGACGGTAACACTAGGGGTGCTGG >1.77|1129533|32|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAAGTCGTTCATTATTGCACACGCTCTCTTTT >1.78|1129595|35|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAAATAAAAGGAGAATAGTTCATTTCAGTTCTTAG >1.79|1129660|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GCGTGTACGGAGTAACGACAGTAACAGACGTTAAAG >1.80|1129726|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AATTTACAAATGTTGGAGCTCAAACTGCACGAATTA >1.81|1129792|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGCTTAGCTGTGAGGTGGTACGACTAGGTAAATATA >1.82|1129858|34|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TACAGTTATCTATATAGATACTCTCGAGAATCTT >1.83|1129922|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTAAGATAGCACCACAAGATTGGAAGAGTAAGTTAG >1.84|1129988|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CCTCGTGGACATGAGGACGAACTCGCAGAAATGACA >1.85|1130054|35|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTTGGCGGTTGTCGAACATGGGAGATGCGGAAGCG >1.86|1130119|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CAAAGCGTAGGAGAGATTAGCGTATCTTATGCGCAA >1.87|1130185|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTTATTGAGTATAAAAGCAAAGATTTTAAAATTAT >1.88|1130251|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAAGCTATCTTTCCGCCCTCTGTGTACTCTATTGGA >1.89|1130317|35|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTGTAGAAAGTACACCCTGCTCGTCTGTCATTAC >1.90|1130382|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTATTACAAGTGATACAACTGGCGCAACTTCTGCAC >1.91|1130448|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CCACTAAGCCTACAAGCACAAAGAACAATCAAGACG >1.92|1130514|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTCAAAAAGAGGGAACAGCCGCACAAGCAGACAACC >1.93|1130580|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAAAATTTTGAAAAGTCGTGCCAATCATCACATACC >1.94|1130646|35|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GATGCACTTGGTTCTTTTACAAGTAAAACGGTAAA >1.95|1130711|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GATACTAATACTCTGCATTGTGCATTATCCTCATCA >1.96|1130777|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGCAGGTACACTTCGAGGCTCTCAAAAGGACAGATT >1.97|1130843|37|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GGGTTACTAAGAGATAGAAAAGGAGCCTTAGCAGTAA >1.98|1130910|37|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAAGTCGACTATGATTAAGTTCTTAGACTTTGGTACA >1.99|1130977|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TATGCAATGGAGAACAAAGATTTATTATTGAGAAAT >1.100|1131043|35|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCGTTTACATACACGCATTTAGGGGTAAGCGAGCT >1.101|1131108|34|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GAGTTTGAAAATGCATATAAACAAACAATGCTAA >1.102|1131172|35|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder TGTATGGCGATCTTAACAACGATAAACAATCCTTT >1.103|1131237|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder CGTATGTTAAGAAACTCATGCCGGTTTAAGTTTA >1.104|1131301|35|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder TCCAATTTTAAAAGATTTGGAACAAAAAGAAAATA >1.105|1131366|35|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR CGTATGTTAAGAAACTCATGCCGGTTTAAGTTTAA >1.106|1131431|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR GATAAATTAAAAGTTTCATCTGGCTTAAATTCAG >1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR CAATAAGCAGAGAACAATCCAAACTTACTTATAA >1.108|1131559|35|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR TGATTGGTGTCATAAAAATAAAGCGTTGAGCCAGG >1.109|1131624|35|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR ACTAAATAAAACATACCACCTATTAATGCGCCTAC >1.110|1131689|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR GTTGGTTAGTCATTTTCCACTCCTTGATTTTTTC >1.111|1131753|36|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR CAAATTACACCATGCTCCTGTGGACCGAGATGACCT >1.112|1131819|35|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR GACAAATACCTTAACCCCTGGGTCTCCTGCAAGCG >1.113|1131884|35|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR TCCCTGCGGATGAGTGGGTAAATATGCCTGCTACA >1.114|1131949|37|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR TAGGCAAAATACAATACTTCGCCGCATAGGTTTTAAC >1.115|1132016|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR ATACTTGCGTAAGATAAACACGCCTTTTCACTTT >1.116|1132080|36|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR CTATGGTAAAAAATACTATGGCATCGCTAGATAAAC >1.117|1132146|36|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR AGCTCTTATAGAGAAGTTTAATGATGAAAGTATAGG >1.118|1132212|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR TCGCTTGCAATAGGCTTTACCTTGTCGCCTAGTT >1.119|1132276|36|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR CCTATGTAATAATTTATTACCCAGTACAAATATAAG >1.120|1132342|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder CAAACCACTGCACGATCACGAACCACTGCATCAT >1.121|1132406|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder ACGCTTAAGCGTAGTTCACTCAAATACCAATAAC >1.122|1132470|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder TGGCGTACAGTTTGGGGTGATCCTGAAATACAAA >1.123|1132534|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder GTGACTACTGCAAACTTAGGAAATGGTATAGTAG >1.124|1132598|36|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder GGAAGTAGATAGCGTTAACGTTCTTAACCAAGATTA >1.125|1132664|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder TTTTGTCCCAAAATTCTCCTTTAAAAAAGACATA >1.126|1132728|36|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder CATAAGCAAAGAATTATAAACAGTAAGCCTTTACAC >1.127|1132794|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder CCTATCTCTGTTTGTGTTAATTTAAACAGTTTCC >1.128|1132858|35|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder TTTACTAAAAAGGATAAACATGTCTAGAGTACTCG >1.129|1132923|38|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder TTAAACGCCAGGACAAAAACGGTTACAACGGTGCGTTC >1.130|1132991|36|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder CTTGATACATGTCCTCATACGTGCTGCTAAACCAAA >1.131|1133057|37|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder TCTTCTCCAATGCGATCTCAGGCGCAGACTCATTTCA >1.132|1133124|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder TAGCATTTAAGATCAATCAATGACATGTAATCAC >1.133|1133188|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder AGGCTGAAGAAAAAGAGACCATTTACCATAACAA >1.134|1133252|36|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder TAAGAAAAGCACTCTGCCAAAAGTTGAAAAAGTCCA >1.135|1133318|36|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder CGGACTCATCAGGGCTTAAGTGTGTGTCTAAAAACT >1.136|1133384|35|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder AGGTTTTAGTGATGCAGAAATAGAGGCTATTCAAA >1.137|1133449|35|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder TTTACTAAAAAGGATAAACATGTCTAGAGTACTCG >1.138|1133514|38|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder TTAAACGCCAGGACAAAAACGGTTACAACGGTGCGTTC >1.139|1133582|36|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder CTTGATACATGTCCTCATACGTGCTGCTAAACCAAA >1.140|1133648|37|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder TCTTCTCCAATGCGATCTCAGGCGCAGACTCATTTCA >1.141|1133715|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder AGGCTGAAGAAAAAGAGACCATTTACCATAACAA >1.142|1133779|36|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder TAAGAAAAGCACTCTGCCAAAAGTTGAAAAAGTCCA >1.143|1133845|36|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder CGGACTCATCAGGGCTTAAGTGTGTGTCTAAAAACT >1.144|1133911|35|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder AGGTTTTAGTGATGCAGAAATAGAGGCTATTCAAA >1.145|1133976|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder GTGGAACACAACATAACCAAAGAGCAGAATTAAA >1.146|1134040|35|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder ACGGACGATGGTACGACATCTATTTGCTAAACTCA >1.147|1134105|35|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder TAGTTAGGATCGCTACAATTACGCTCTTTGATTTG |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7b,cas8b1,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP007201_1
The CRISPR arrays of NZ_CP007201_1 >merge|NZ_CP007201|1|1124522-1134169|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder,PILER-CR 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>NZ_CP007201.1|WP_025344294.1|1114569_1115049_-|Cys-tRNA(Pro)-deacylase MSLKKTNAARFLDTLKLPYEMTSYEVDEEDLSAVHAAASLGVDASCVFKTLVARDDAKRIVVACIPAADEIDLKALAKVAQAKRCELVAVKELLALTGYIRGGCSPLAMKKHYATFIDESIHQHEKVYVSAGLRGVQLRLSPLVLIEASKAMCASLTKH >NZ_CP007201.1|WP_025344304.1|1134250_1134607_+|hypothetical-protein MARSLSIDIWGLDWYIETGIKVENEASYDFPMIGNYNVVDGKIVHLHDYMLSDKLFKACKDFGGVLLEKCSFLYIPRDKEGELNPNDEQSFEGTFLDALVFIKKELEKEEKRRKYPYM >NZ_CP007201.1|WP_025344305.1|1134619_1135234_-|hypothetical-protein MFSKIKKFFEIKPDDTLDYMDPDKLLKNKKRVLKDPLNQADEDEFFRQMEEEEQFIDHLNAQEEEQTAPQNNASRESVLKKMRQCMQERDWNPKHHPKIMIALATLVLGIVILAIILHETPNPLIGKWRPQGKNVFLPVGDIEFAKDKFQALGISTMVKYDIDETKIQVIDVATDTGIIFYITGDKTIEVNLLGVKTSYKKMEK >NZ_CP007201.1|WP_025344306.1|1135393_1135843_+|hypothetical-protein MLPNAVNPKKTTKSLKPKTTAKKVASKARKTDAQKVPKRPSLLLNLLASCVVLLFIGFGIKYVIDHTINYNPLLGKWRAQTVLGIMEIEFDRSSISSFGTKNPVTYDILEDKVIVIDDTIKVGNTYKIVDENTISTEAGGFKTVYKKVK >NZ_CP007201.1|WP_025344307.1|1135878_1136241_+|hypothetical-protein MHHKEHNTLDLLEQFTHNTQTSSNKSDDNENRMFQELGQFMSKSDKKGSNSIFGIPNFIWYIIMLGMFGYLIKEIFFLNEINDVSTAVSTINQSVTKEISEIQNSAHKALENANAKKKER >NZ_CP007201.1|WP_190278605.1|1136384_1136639_+|BrnT-family-toxin MFEYDETKSKANKEKHGIDFEEAQALWQNKQHAVFDSVYVNNEWRHLLVGLIGELCYVAIFTMREDHIRIISVRRCRKNEKEIL >NZ_CP007201.1|WP_190278606.1|1136635_1136917_+|CopG-family-transcriptional-regulator MKTISAEEFDRKFDNGEDILPYIDLSSKRTLKEFEKEMLAVKKVNVDLPSWAIASLDQEAKRMGVTRQSIIKMWLIQKLDDLSLNRKSLKQVG >NZ_CP007201.1|WP_025344310.1|1136926_1137433_-|hypothetical-protein MFKDDDTLNLLDKYRKNKFQEKENGQFKTNYQNNNGVPHFVWIAVVVFIGYFIITNFMDRLEEQRIARKMEAVGEQFSRAVKEEIKQQEKAIKEITGTSLKIMESTPKIQITPNTVTPQMTPKVEQTKKNVTITLTPEQSSNQKQIQKTEETEEIKPGSSSSNVGYYR >NZ_CP007201.1|WP_025344311.1|1137449_1137764_-|hypothetical-protein MKKILILVGLLTSMYAIPPCELPNQMVCAYLYKGAMSSEIIIVNLSRDNILVKNISATLDGQSKSISDLQLSPGQSYTMLKSRYDDHLKKPYYYIGSMDYKTIK >NZ_CP007201.1|WP_148295270.1|1137773_1137956_-|hypothetical-protein MNEDFTQDQDKLLDLLKAPIEKIFDNPVHSVYGDTSGDKGLGIDQLENLKVNNINITQTN >NZ_CP007201.1|WP_084613085.1|1138564_1138816_+|hypothetical-protein MANREVTGQKAATAASKTLQSSTASKSSKSAAGSALSQTKSPSKVTSPQTATAASKTLQSSTASKSAKSAAGSALTQKPNRSK |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP007201_1 | 1.131|1133057|37|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder | 1133057-1133093 | 37 | NZ_CP007201.1 | 184704-184740 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP007201_1 | 1.140|1133648|37|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder | 1133648-1133684 | 37 | NZ_CP007201.1 | 184704-184740 | 0 | 1.0 |
1. spacer 1.131|1133057|37|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder matches to position: 184704-184740, mismatch: 0, identity: 1.0
tcttctccaatgcgatctcaggcgcagactcatttca CRISPR spacer tcttctccaatgcgatctcaggcgcagactcatttca Protospacer *************************************
2. spacer 1.140|1133648|37|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder matches to position: 184704-184740, mismatch: 0, identity: 1.0
tcttctccaatgcgatctcaggcgcagactcatttca CRISPR spacer tcttctccaatgcgatctcaggcgcagactcatttca Protospacer *************************************
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP007201_1 | 1.60|1128426|34|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1128426-1128459 | 34 | NC_022111 | Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence | 1322808-1322841 | 4 | 0.882 |
| NZ_CP007201_1 | 1.127|1132794|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder | 1132794-1132827 | 34 | MK573636 | Escherichia phage vB_EcoM_PHB13, partial genome | 29722-29755 | 6 | 0.824 |
| NZ_CP007201_1 | 1.101|1131108|34|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1131108-1131141 | 34 | NZ_CP032824 | Arcobacter cryaerophilus ATCC 43158 plasmid pACRY43158, complete sequence | 10782-10815 | 7 | 0.794 |
| NZ_CP007201_1 | 1.136|1133384|35|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder | 1133384-1133418 | 35 | MN693171 | Marine virus AFVG_25M555, complete genome | 21978-22012 | 7 | 0.8 |
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| NZ_CP007201_1 | 1.49|1127710|33|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1127710-1127742 | 33 | MK448793 | Streptococcus phage Javan523, complete genome | 39650-39682 | 8 | 0.758 |
| NZ_CP007201_1 | 1.49|1127710|33|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1127710-1127742 | 33 | MK448845 | Streptococcus phage Javan118, complete genome | 35214-35246 | 8 | 0.758 |
| NZ_CP007201_1 | 1.53|1127967|35|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1127967-1128001 | 35 | NZ_CP054613 | Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence | 495756-495790 | 8 | 0.771 |
| NZ_CP007201_1 | 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1131495-1131528 | 34 | KY883636 | Vibrio phage JSF1, complete genome | 2173-2206 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP007201_1 | 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1131495-1131528 | 34 | KY883640 | Vibrio phage JSF17, complete genome | 34545-34578 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP007201_1 | 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1131495-1131528 | 34 | KY883637 | Vibrio phage JSF2, complete genome | 81049-81082 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP007201_1 | 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1131495-1131528 | 34 | KY065147 | Vibrio phage JSF4, complete genome | 28563-28596 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP007201_1 | 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1131495-1131528 | 34 | KY883639 | Vibrio phage JSF14, complete genome | 37224-37257 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP007201_1 | 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1131495-1131528 | 34 | HQ641348 | Vibrio phage ICP1_2006_D, complete genome | 42451-42484 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP007201_1 | 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1131495-1131528 | 34 | KY883634 | Vibrio phage JSF5, complete genome | 124975-125008 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP007201_1 | 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1131495-1131528 | 34 | HQ641354 | Vibrio phage ICP1_2004_A, complete genome | 42588-42621 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP007201_1 | 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1131495-1131528 | 34 | HQ641349 | Vibrio phage ICP1_2006_C, complete genome | 42451-42484 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP007201_1 | 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1131495-1131528 | 34 | KY883635 | Vibrio phage JSF6, complete genome | 128047-128080 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP007201_1 | 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1131495-1131528 | 34 | MH310934 | Vibrio phage ICP1_2006_E, complete genome | 42521-42554 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP007201_1 | 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1131495-1131528 | 34 | HQ641353 | Vibrio phage ICP1_2001_A, complete genome | 43186-43219 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP007201_1 | 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1131495-1131528 | 34 | HQ641352 | Vibrio phage ICP1_2005_A, complete genome | 42591-42624 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP007201_1 | 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1131495-1131528 | 34 | MH310933 | Vibrio phage ICP1_2011_A, complete genome | 42402-42435 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP007201_1 | 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1131495-1131528 | 34 | MN419153 | Vibrio phage ICP1_2017_F_Mathbaria, complete genome | 42472-42505 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP007201_1 | 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1131495-1131528 | 34 | HQ641350 | Vibrio phage ICP1_2006_B, complete genome | 42604-42637 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP007201_1 | 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1131495-1131528 | 34 | MN402506 | Vibrio phage VMJ710, complete genome | 10596-10629 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP007201_1 | 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1131495-1131528 | 34 | HQ641351 | Vibrio phage ICP1_2006_A, complete genome | 42611-42644 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP007201_1 | 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1131495-1131528 | 34 | MH310936 | Vibrio phage ICP1, complete genome | 41311-41344 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP007201_1 | 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1131495-1131528 | 34 | KY883638 | Vibrio phage JSF13, complete genome | 109025-109058 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP007201_1 | 1.128|1132858|35|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder | 1132858-1132892 | 35 | AP013632 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C28-MedDCM-OCT-S36-C291, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 399-433 | 8 | 0.771 |
| NZ_CP007201_1 | 1.137|1133449|35|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder | 1133449-1133483 | 35 | AP013632 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C28-MedDCM-OCT-S36-C291, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 399-433 | 8 | 0.771 |
| NZ_CP007201_1 | 1.7|1124944|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1124944-1124979 | 36 | LC168164 | Tenacibaculum phage pT24 DNA, complete genome | 226519-226554 | 9 | 0.75 |
| NZ_CP007201_1 | 1.49|1127710|33|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1127710-1127742 | 33 | NZ_LR215026 | Mycoplasma ovipneumoniae strain NCTC10151 plasmid 2 | 2161-2193 | 9 | 0.727 |
| NZ_CP007201_1 | 1.101|1131108|34|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1131108-1131141 | 34 | NZ_CP053838 | Aliiarcobacter faecis strain CCUG 66484 plasmid pAFAEC, complete sequence | 61286-61319 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP007201_1 | 1.101|1131108|34|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1131108-1131141 | 34 | NZ_MK715471 | Arcobacter cryaerophilus strain M830MA plasmid pM830MA, complete sequence | 67755-67788 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP007201_1 | 1.110|1131689|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1131689-1131722 | 34 | NZ_CP042616 | Escherichia coli strain NCYU-26-73 plasmid pNCYU-26-73-1, complete sequence | 151291-151324 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP007201_1 | 1.110|1131689|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1131689-1131722 | 34 | MN693898 | Marine virus AFVG_250M937, complete genome | 51034-51067 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP007201_1 | 1.125|1132664|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder | 1132664-1132697 | 34 | NZ_CP047124 | Lactobacillus hilgardii strain FLUB plasmid unnamed3 | 13136-13169 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP007201_1 | 1.125|1132664|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder | 1132664-1132697 | 34 | NZ_CP047124 | Lactobacillus hilgardii strain FLUB plasmid unnamed3 | 27277-27310 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP007201_1 | 1.125|1132664|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder | 1132664-1132697 | 34 | NC_014633 | Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence | 423475-423508 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP007201_1 | 1.125|1132664|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder | 1132664-1132697 | 34 | MH321490 | Staphylococcus phage Quidividi, complete genome | 22361-22394 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP007201_1 | 1.125|1132664|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder | 1132664-1132697 | 34 | MH321491 | Staphylococcus phage Twillingate, complete genome | 24506-24539 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP007201_1 | 1.36|1126857|34|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1126857-1126890 | 34 | MG592578 | Vibrio phage 1.208.B._10N.222.52.A7, partial genome | 30291-30324 | 10 | 0.706 |
| NZ_CP007201_1 | 1.64|1128687|35|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1128687-1128721 | 35 | NZ_CP040675 | Exiguobacterium mexicanum strain A-EM plasmid punnamed1, complete sequence | 67611-67645 | 10 | 0.714 |
| NZ_CP007201_1 | 1.75|1129403|34|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1129403-1129436 | 34 | MN692973 | Marine virus AFVG_117M33, complete genome | 22289-22322 | 10 | 0.706 |
| NZ_CP007201_1 | 1.85|1130054|35|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1130054-1130088 | 35 | NZ_CP014311 | Burkholderia sp. PAMC 26561 plasmid unnamed4, complete sequence | 87145-87179 | 10 | 0.714 |
| NZ_CP007201_1 | 1.101|1131108|34|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1131108-1131141 | 34 | NC_018501 | Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p02, complete sequence | 154325-154358 | 10 | 0.706 |
| NZ_CP007201_1 | 1.42|1127251|34|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1127251-1127284 | 34 | NZ_AP017566 | Pseudanabaena sp. ABRG5-3 plasmid ABRG53f, complete sequence | 53709-53742 | 11 | 0.676 |
| NZ_CP007201_1 | 1.65|1128752|34|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1128752-1128785 | 34 | NZ_AP019636 | Enterobacter sp. 18A13 plasmid pECC18A13-2, complete sequence | 3861-3894 | 11 | 0.676 |
| NZ_CP007201_1 | 1.113|1131884|35|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1131884-1131918 | 35 | AP019560 | Staphylococcus phage SP120 DNA, complete genome | 10643-10677 | 11 | 0.686 |
| NZ_CP007201_1 | 1.113|1131884|35|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1131884-1131918 | 35 | KX827369 | Staphylococcus phage SpT152, complete genome | 36144-36178 | 11 | 0.686 |
| NZ_CP007201_1 | 1.113|1131884|35|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR | 1131884-1131918 | 35 | MK075003 | Staphylococcus phage phiSP44-1, complete genome | 36024-36058 | 11 | 0.686 |
1. spacer 1.60|1128426|34|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_022111 (Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.882
--attattgcctgcttaaaatcaatcttcttttttt CRISPR spacer ttattatt--cttcctaaaatcaatcttcttttttt Protospacer ****** ** *.*********************
2. spacer 1.127|1132794|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder matches to MK573636 (Escherichia phage vB_EcoM_PHB13, partial genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.824
cctatctctgtttgtgttaatttaa-acagtttcc CRISPR spacer gctatctctgtttgtgttgattcaacatagtttt- Protospacer *****************.***.** *.*****.
3. spacer 1.101|1131108|34|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032824 (Arcobacter cryaerophilus ATCC 43158 plasmid pACRY43158, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
gagtttgaaaatgcatataaacaaaca-atgctaa CRISPR spacer gagtttgaaaaagcatataaagaactagatggtg- Protospacer *********** ********* ** .* *** *.
4. spacer 1.136|1133384|35|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder matches to MN693171 (Marine virus AFVG_25M555, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
aggttttagtgatgcagaaatagaggctattcaaa CRISPR spacer aggtttaactgatgcagaaatagaggcattataat Protospacer ****** * ****************** * .**
5. spacer 1.144|1133911|35|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder matches to MN693171 (Marine virus AFVG_25M555, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
aggttttagtgatgcagaaatagaggctattcaaa CRISPR spacer aggtttaactgatgcagaaatagaggcattataat Protospacer ****** * ****************** * .**
6. spacer 1.49|1127710|33|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MK448793 (Streptococcus phage Javan523, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
ctgaacggtttgtttttttgcgttcttgctaag CRISPR spacer ctgaacggcttatttttttgcgttgacttttag Protospacer ********.**.************ . .* **
7. spacer 1.49|1127710|33|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MK448845 (Streptococcus phage Javan118, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
ctgaacggtttgtttttttgcgttcttgctaag CRISPR spacer ctgaacggcttatttttttgcgttgacttttag Protospacer ********.**.************ . .* **
8. spacer 1.53|1127967|35|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP054613 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
-aagagtgccaatattagagacggtgctgatttctg CRISPR spacer tacgcatg-caatattagacacggtgctgatgtcgt Protospacer * * .** ********** *********** **
9. spacer 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KY883636 (Vibrio phage JSF1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
10. spacer 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KY883640 (Vibrio phage JSF17, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
11. spacer 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KY883637 (Vibrio phage JSF2, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
12. spacer 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KY065147 (Vibrio phage JSF4, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
13. spacer 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KY883639 (Vibrio phage JSF14, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
14. spacer 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to HQ641348 (Vibrio phage ICP1_2006_D, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
15. spacer 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KY883634 (Vibrio phage JSF5, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
16. spacer 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to HQ641354 (Vibrio phage ICP1_2004_A, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
17. spacer 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to HQ641349 (Vibrio phage ICP1_2006_C, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
18. spacer 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KY883635 (Vibrio phage JSF6, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
19. spacer 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MH310934 (Vibrio phage ICP1_2006_E, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
20. spacer 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to HQ641353 (Vibrio phage ICP1_2001_A, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
21. spacer 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to HQ641352 (Vibrio phage ICP1_2005_A, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
22. spacer 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MH310933 (Vibrio phage ICP1_2011_A, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
23. spacer 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MN419153 (Vibrio phage ICP1_2017_F_Mathbaria, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
24. spacer 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to HQ641350 (Vibrio phage ICP1_2006_B, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
25. spacer 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MN402506 (Vibrio phage VMJ710, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
26. spacer 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to HQ641351 (Vibrio phage ICP1_2006_A, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
27. spacer 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MH310936 (Vibrio phage ICP1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
28. spacer 1.107|1131495|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KY883638 (Vibrio phage JSF13, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
----caataagcagagaacaatccaaacttacttataa CRISPR spacer
tctgcaat----agagcagaatccaaacttacttattt Protospacer
**** **** * *****************
29. spacer 1.128|1132858|35|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder matches to AP013632 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C28-MedDCM-OCT-S36-C291, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tttactaaaaaggataaacatgtctagagtactcg- CRISPR spacer gttgctaaaaaggataaaaatgtcta-aatataaga Protospacer **.************** ******* *.**. *
30. spacer 1.137|1133449|35|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder matches to AP013632 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C28-MedDCM-OCT-S36-C291, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tttactaaaaaggataaacatgtctagagtactcg- CRISPR spacer gttgctaaaaaggataaaaatgtcta-aatataaga Protospacer **.************** ******* *.**. *
31. spacer 1.7|1124944|36|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to LC168164 (Tenacibaculum phage pT24 DNA, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tgcaaagatgcaataacaaaaataataaaagatata CRISPR spacer gctaagaaagcaatcacaaaattaataaaagatatt Protospacer .**..* ***** ****** *************
32. spacer 1.49|1127710|33|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_LR215026 (Mycoplasma ovipneumoniae strain NCTC10151 plasmid 2) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
ctgaacggtttgtttttttgcgttcttgctaag CRISPR spacer tttttttgtttgtttttttgtgttcttactaat Protospacer .* . *************.******.****
33. spacer 1.101|1131108|34|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053838 (Aliiarcobacter faecis strain CCUG 66484 plasmid pAFAEC, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gagtttgaaaatgcatataaacaa----acaatgctaa CRISPR spacer gagtttgaaaaagcatataaagaacttgatggtg---- Protospacer *********** ********* ** *...**
34. spacer 1.101|1131108|34|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_MK715471 (Arcobacter cryaerophilus strain M830MA plasmid pM830MA, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gagtttgaaaatgcatataaacaa----acaatgctaa CRISPR spacer gagtttgaaaaagcatataaagaacttgatggtg---- Protospacer *********** ********* ** *...**
35. spacer 1.110|1131689|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP042616 (Escherichia coli strain NCYU-26-73 plasmid pNCYU-26-73-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gttggttagtcattttccactccttgattttttc CRISPR spacer caagatatgacattttccgctccttgatttgttc Protospacer *.* * ********.*********** ***
36. spacer 1.110|1131689|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MN693898 (Marine virus AFVG_250M937, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gttggttagtcattttccactccttgattttttc CRISPR spacer cttgtttagtcattttcccctccttatgtctatt Protospacer *** ************* ******. *.* *.
37. spacer 1.125|1132664|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP047124 (Lactobacillus hilgardii strain FLUB plasmid unnamed3) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ttttgtcccaaaattctcctttaaaaaagacata CRISPR spacer ttaaagttttaaattctcctttataaaagacata Protospacer ** . ... ************* **********
38. spacer 1.125|1132664|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP047124 (Lactobacillus hilgardii strain FLUB plasmid unnamed3) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ttttgtcccaaaattctcctttaaaaaagacata CRISPR spacer ttaaagttttaaattctcctttataaaagacata Protospacer ** . ... ************* **********
39. spacer 1.125|1132664|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder matches to NC_014633 (Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ttttgtcccaaaattctcctttaaaaaagacata CRISPR spacer tatctcatcaaaattttcctttaaagaagacatt Protospacer * *. . .*******.*********.*******
40. spacer 1.125|1132664|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder matches to MH321490 (Staphylococcus phage Quidividi, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ttttgtcccaaaattctcctttaaaaaagacata CRISPR spacer atatgtttcaaaattctcctttaaaaacagtcta Protospacer * ***..******************* ... **
41. spacer 1.125|1132664|34|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder matches to MH321491 (Staphylococcus phage Twillingate, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ttttgtcccaaaattctcctttaaaaaagacata CRISPR spacer atatgtttcaaaattctcctttaaaaacagtcta Protospacer * ***..******************* ... **
42. spacer 1.36|1126857|34|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MG592578 (Vibrio phage 1.208.B._10N.222.52.A7, partial genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
aagtcaagcatgatcgtattacattcttccaaaa CRISPR spacer tgctcaagcatgatagtattccattcttctccgt Protospacer . *********** ***** ********. .
43. spacer 1.64|1128687|35|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040675 (Exiguobacterium mexicanum strain A-EM plasmid punnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caagcgggacaagctacgacatgacg----aacgcctcc CRISPR spacer agagcgggaaaagctacgacctgacgacgaagcga---- Protospacer .******* ********** ***** *.**
44. spacer 1.75|1129403|34|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MN692973 (Marine virus AFVG_117M33, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttaaatccacttactctgcttttttcttttgccc CRISPR spacer cttgtgcagctttctctgcttttttcgtttgcca Protospacer .* . * .*** ************* ******
45. spacer 1.85|1130054|35|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014311 (Burkholderia sp. PAMC 26561 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
cttggcggttgtcgaacatgggagatgcggaagcg CRISPR spacer ttacggagttgtcgaacatggaagacgcggaaatt Protospacer .* * .**************.***.******..
46. spacer 1.101|1131108|34|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_018501 (Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p02, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gagtttgaaaatgcatataaacaaacaatgctaa CRISPR spacer gagtttgaaaaatcatataaacaaaatgcaacat Protospacer *********** ************ ... .*
47. spacer 1.42|1127251|34|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_AP017566 (Pseudanabaena sp. ABRG5-3 plasmid ABRG53f, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
ttgatagcttaactggtgatattcctttagcttc CRISPR spacer ttgatagcttaactgttgatcttcataggtgaca Protospacer *************** **** *** * . .
48. spacer 1.65|1128752|34|NZ_CP007201|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_AP019636 (Enterobacter sp. 18A13 plasmid pECC18A13-2, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
gatgaagcgatgacaatgcgggcattttttacga CRISPR spacer cgctatgcgctgacaatgcgggctttttttgatg Protospacer .. * *** ************* ******. .
49. spacer 1.113|1131884|35|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to AP019560 (Staphylococcus phage SP120 DNA, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
tccctgcggatgagtgggtaaatatgcctgctaca CRISPR spacer gatttgcggttgagtgggtaaatattcctaacaac Protospacer ..***** *************** ***. .*
50. spacer 1.113|1131884|35|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KX827369 (Staphylococcus phage SpT152, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
tccctgcggatgagtgggtaaatatgcctgctaca CRISPR spacer gatttgcggttgagtgggtaaatattcctaacaac Protospacer ..***** *************** ***. .*
51. spacer 1.113|1131884|35|NZ_CP007201|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MK075003 (Staphylococcus phage phiSP44-1, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
tccctgcggatgagtgggtaaatatgcctgctaca CRISPR spacer gatttgcggttgagtgggtaaatattcctaacaac Protospacer ..***** *************** ***. .*
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
25979 : 52664
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP007201|25979:52664|DBSCAN-SWA TTTAATTCTGCGAAGCCATATTTAATTTCTCATTATATCTTTTTTCAAATTCATTGGGTGAAATATAACCAAGATAACTATGCCTTCTAGTTGAATTATAAAACATTTCGATGTAGTAAAATATGTCTGATTGTGCTTCTTCTCGTGTAATATAAATCTGCTTTTTGACACATTCACGCTTAAATGTTTTAAAAAAGCTCTCAGCAACTGCATTATCATAACAATTTCCTCGCCTGCTCATACTAGGGATAAGGTTGTATTTTTGGAGAAGTGCTTGCCACTCGTATGAGCTATATTGTGAGCCTTGGTCTGAGTGTACAATCACTTCATGATGTGGTTTTTGTCTAAAGGTTGCCATTTCCAGGGCTTTTAGAGCCAACCCAGTTGTCATGCGATGACTTGTTGCCCATCCTGCTATTTTTCTGCTAAAAAGATCTAATACAACTGCTAAATAAAACCATCCTTCGTATGTTTTGATATAGGTTATATCTGTTACCCATGTGTGATTTGGCTCTTGAACATTGAAGCACTGTCCAAGATGGTTAGGATGCGCCACATGTCTTTTCCCTTTTTTGTAACGAGGTTTTCTCTGCTTTACACCTGCACCAAAGAGTTTGGCTTCACCCATCAATCTTGCAACGCGTTTTTTATTAACACCAATACCTGATGCCACAAGATCTTTTGTAACAGTTCGATATCCATAAATACGCCCACTATGCTCATAAGCCTCTTTAATGTGGTGCAACACAACTTTATTAGCTATGTCACGCTTTGACTCTGGTTGTTTAGCCCATGCGTAATAACCACTAAAATGAACTTGCAAAGTTTTGCACATTCTTCTCACAGGATAGAGTGGCTCATACTCTTTGATAAAGGCGTACTTTACTTTTGGTTTTTGGCAAAGTACGCTGCGGCCTTTTTTAGAATATCGCGCTCCTCTGTGACTCTTTTTAATTCTGCTTTGAGCTTTCTATTTTCCGATGACAAATCTTTGGAAGCTTGGTGTTGTGAGGTACTTTGCGGATTACTGTAGATTTTTATCCATGCTTTGAGCGAATCAGGATGCACTCCCAATCTTTGTGCAGTATCTTTAATGGGATAACCATTTTTGATAATTTGGTTGACAGCCTCTTGTTTGAACTCGTCTGTGTATAGTTTATTTGCCATGGAATGACTTTCTCCTCTTGGTATTTTATTTGGTCATTATCGACCAGATTAACAGTTTCAAGAGTGTCTAGTATTGTGGGGTCATTCCATTCATTAGCTCTAGTAAAACTATCTTCAGTTAATTTTGAACCGAATTTAGTTTCCATTCCTGCTTTAGCTTCCATTTGTCTAACGCCTTCTCTTCCTGCTCCGTAAGCTGTTTGAGAAGTTAAAAGCGAATTAGAACCCATCGTTCCTGCAAAATCTAAACTAGATTTCTTTCCTTCTTGGGAAAGAACATTAGATAAGCTCCCTACTTGAGACATTTTAGCGGACAACTCATTATAGGGTTTAGAACTGTCATAATTGAGCTTATTTTGAAAGTTCGCACCTTGATTAAGGTTAGTGCCTATCTCTATACCTTCTTTTGTTCCTGCTTGAATATTTTGATAATGTAAAGCTTCTGCATAACTCAAATCTTTACCAGTGGATTGAGATACAGATTCTTTTAATTGGAGAGCTTTAGAATCTGAAGATATACTCATTGCAGATAAATTTTTAGAGAGGCTTTGAGTCATATTTGAAGCGATACTACTTAACATAGTAAAAGAACCGCTCATTAAACCCCACGAGATCATAGGAACAGAAACATATAAATAACCTGCAACTCCTGCCATCGCAGCAGAATCAGAAAGCATTTGCATTGAGTTATATGCTGTTACATCTCCACCGAATGAATTTTCAGCGTATTTCAAAATAAAGAAGTTTAAAATAGAAGCGCAAACACCCCACATTTCTATCCATACTAAAGCTTTAGCATAGTTTTTGAAGATAGATATGCCATTAATCAAACCAATAACAACAATCAAAGGAAATAAAGCATATAAAAGACCTCTTAAAACAACTTGTAAGATCGGTAACATTTTAGACATATAATAGCCACTAGCTAAATTTGTTTGAATATATTCTGCTCTTGTTTTCCTTTCTGCATAAGCAATACCCGTAGGTAATTTTGAATTACTTAAAAAAGAATTGATTAACCCCGATTGTATTGCTAATTCTTCAAAATTAGATTTAGGTAATGAAGTTTGTTTTGTAATAACTTCGACATCTCTATCGTCAACGTTTTTAAAAACTTTTGACATCGTGTCTTTATAAGAAGTTAAATCATTAGAAGATAATTTAGTCCACAAAGCACCACATTCGTATACATCTCCATTAACTGAAGCAGTATAGGAATTAACAGGAATATTACCGACTGTAATAGATGAGGAATACCAGGAATCTAATGTACTTTTAATACTTGTTGAACTATATAATTCATCGATTCTTTTCTGACCTTCGTCTCCCTTCCCTGAAAATGGAACTAAAATACAATCAGCTACAAATCTTTCAACGTCATTACCGAAATTATGTGAAGAGTCATTAAACTTATGATTCAAAATATCAATCGAATCTCTTAGCGAAGAAACATAACCACCACTAGCAAGAGAATAATTACCACTTCCACTATAACTCATTGCTGTTTGAAATAAGTTTGTCAAACCATTACCAAAAGAATTAAAAAATGAATAAGAGTAAGCTAAAACAGTCGGAATGTTCGCAACTGCCGTTCCTGTTGTAATCGTTGTATTATTGTCATAATATAAAGGATAGTTATCTGTTTTAATATATACTGTAGAGCTTACAGAAAAAACAACTGAAAGAACACCAACCACAAAAATCTGATACATTGAAAAGCTTTTTAAACCCTCGGTTCCTAGTTTTCCAGTTATAGCATTGATGAAAACAAAAACACTACCAAACAACGCCACTAATTTTAAAAGAGATAAATAATCTTCACTATGAAATATCATAGCTACTGCATTTAAGATAGAAAACATACTATCAACTTCTTCAGCAGATGATACAGTTACTAAGTAATCGTCAGCTAAAGCACCCAAAGAAAATAAACATAAGATTGAAATTACCTTTATCATTTATATACTCCTGTATTGTTTTTGGGAACCCCTAAAAGGGAAGAAATAATAAGGGAGAGAGATAATAGGTGAGTTCATTAAACGCCATAAAAAGCAGCAATACGGGGAGTGAGCTTTTTAGCTCATTGCAGTTATAGAAACTTTTTTTAGCAAAAGTGCGATTCTAAAAAAAACCGTAAAAAACTTGCAAAATACTTAAATTCTATTTCCAATTAACAGAGAAGACAAAATATGATGTCATTGGCAATATTCGTAGTGACGCAATAAATGACAGATGACAAAATAGAAATAATCCCTTAAATAGGGGGTTAAAAGAGGTTTTATGACGCTGTGACACACAAATAGCTAAAAAAAATTCTCTAAATTAAGAACACTTGTTCTTATGAATCAACAATATTTTAGATGGATTACGTCATAAATGCTTACAAAGCACGATACTATCGAGGTTTGAAGGTGTCATAGTAGCGTCATAACTGCGTCATTGTGCTGTCATCGTGTCATTTATCTTATTTATATATATTTCTTCTAAACTCCCTAAAATAGGGATAAATAAAAGAATATATAAGAGAAGAGTTAACAAATTTAGGGGAATTCTTCTATGACGCAGTAGTGTCATTGTGCTGTCATAGTGTCATTCCACTTTTAAAATTGAAATCGAGCGAAATTCATATTATTAAGACAACTTTTCATAAAATAATAACAATTACAAAAAGGGGTCATAGTATGAGGCTAATGTTATTGGTTTTATTTATGGTTGTTGGTTTATTTGCCAACGAGGTTAAAGTTGACGGAAAGTATAGTAATTTATTAGGCAATCCGTTTAAGAGTGTTTTAGAAACTAAATCACAAGATATTTCTATTGTTTCAAATGAATCAAAGTTAATCTCTTTAACTGTAGAAACAAATAGGAATGATTTTAGTTTTAGTAAACCATCGTTAGAGGTTTTAAACACTTCGTGCAACAATGTTTTAAAATCATTTGTATCAGAAGATTTTAACATCGTACAAACTGCTTCAAGAAAAATCTCGTGTGAAATTCTTCCAACAACAATCGTCAAAATTGATTATGTAATGAAAGACGATAAATTTATGGATCAAATTTCTGACATCGTTATTCACTTAGCAATTAGAGTAAATGATAATGGCAAGGTATATGAAGATAGTATAGATATGAACAAAGACCTTAATCTAAAAGGTGCTATGAAATATGATATCTTTGCAATTAGATCAGAATTGAATTTAGATAGAGAAACAATGGAAGAAAGTATCCAAAAAATTGTAGAAAATGCTATCTATTCAATTTTATCAAAAAATAAAAAAGGATAAGGAATGTTAAATATAATTAAAGGATTATGTATTATTTTATCTTTGACATTTTTAACTGGTTGTGGAACAAAAGGTTTATATCATGAAGATTATGTTTCTAAAGAAATCAAACCTAATTTAAACAAAGTTTCTAATACAAAAGTTTGTTTGAAGGATTATGCTAATGTAATTGCTGTTAGGTCTAATTCAAGACCTAATGTTCCTGCTACTGAAATTGCTCTCAATGCAGGAGAGATTAATACAAATATATTAAATCTTTTTACTAAACAATATTTTACTAAAGTGGAAAAAAATTGTGGTAATGAGTCTATTTATATAGATTCATATATTCAAAGTTTTAAATTTGATTTACATACTTTTGGGGGAGGTGAAATATTTGTCTTAAATAATATAAAAGTTTTCAAAGACAATAAAATTATTTTAGAAAAAACATATGATATTCAAGCTGATAACAAAATTGTATTAGGAATTTTTGCGATTAAAGACACTGCCTTTGATAGTGTAATTGAATTATATCATAGAGCACTTTTTGAATTTTATGAAACAGAA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>NZ_CP007201|25979:52664|39408_40497_-|WP_168156756.1|transposase|DBSCAN-SWA MIKKFLAEGLSKSAIARKLGISRDTVRRYANLPDDYVPHINRPPVINSVDPYLPHIAKMLEMAEATKSEIPLTVIYEEIKKLGYEGSLRWLQQVIQRYELRSRAKLDEPIIRFETKPAQQMQVDWIEFPKDNLSAFVATMGYSRASYVEYVNNEKIETLIGCHMNAFSYFGGVPTECLYDNMKTVILGRNSYGRGKHKLNPLFEDFAKHCGFSIKVCKPYRAKTKGKVERFNHYLRYNFHNGLIVRLSMKHYALTLDNANAEVLKWLDNTANKRIHQTTLQIPFELLAQEQLQLRPVPKAYQGIHPKALIESVAKKYTPINSYHDIDKLYIPHRDIQCYDEFIPIVANIILPVGLYGGALWN >NZ_CP007201|25979:52664|48462_49647_-|WP_025343262.1|transposase|DBSCAN-SWA MSRKKGQSYSAEQKTKIVLELLKEEETIAQIATKYKIASQSITKWKKQFLENASLAFEPTRAAQEFKDEIKSKDEEIAELQKQLGKSVVEKEWLAKKLESSVSLNKRKTLVENELELSKTLQCKLLHISRATHYYKPVPISEQNLKIMHTIDEIATDNSEYGYRYIHQQLLEDGYNIGKDRVLKYMQLMGIQALYPTKKRLTSIKNPEHTIFPYLLKEYWSRTGKTKQIYVPAPNEVWSGDITYIRTNGGFMYLAAVIDWHTKAILAYKISNSMDATLATDVLKTALLKYPKPKIFNSDQGSQYTSYEHTQVLKQNDIQISMNGKGRSIDNIVIERFFRTLKHGNIYISDYQSIKELKEGVKNYIHKYNFKRFHSAIGYQKPMNLYLEFIKNVG >NZ_CP007201|25979:52664|40619_41507_+|WP_084613054.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP007201|25979:52664|35927_36329_+|WP_025343249.1|DBSCAN-SWA MEHDNKIKKTVRLEPSIYEAVEGYRGATRDNFTGAFESLILKGLENVNTTQMISKVIKDELKNIRQDQQKNTDRIISVLMGITRFIGRIYAHTFLTVEEVKHKNKEEIKEFEKFGITKSIEELRSKEEVKDNE |
24 | uncultured_virus(25.0%) | transposase,integrase | attL 30996:31055|attR 51400:52714 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
202897 : 276957
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP007201|202897:276957|DBSCAN-SWA CTCATTTGTATTCCACAGCAAAACCACGGTCAAAGTTGATTAATCCACATATCAAATTAAAGCGTAGATTGAATCGTTTTCTTCTGTTTCTGTATTTTTGGGTGAGTATCTGAAATGTTTTGATTTTAGCATTCACATGTTCAACACATATTCTAGCACTTGCTTTTTGTCTGTTTTCCTCTTTTTGCTCCTCACTCAAAGGATGAAGTTTGGAGGCTTTATGGGGAATTTGACAATGGCTATGTTCTTTGGCAATACCCAGATATCCCAAATCAACATAAACACAGGTCTTGGGCATCAAGGGGAGATTAGATTCTTGAAACAGTCTAAAATCATGTGTCGTACCTTTAGCGGTATGCACACACATAATCCTCTCCTCTTTATCAATCACAATCTGTCCTTTAAGGGTATGACGCTTTTGCTTACCTGAGTAGTACTCTCTTTGCTTTTTTTGGGTCTTTGACAAGGCGTTTCTGTCGCATCAATGACAACAAAAGAGAGGGCAACATCACTTTTATAGAGTTCTCTCTTGCTTGGCAATGAAAATCTACCAGACTTAATCAACACTTCTTCTACTTCACATACAATCCTTGAAGCCGTTGATTCACTCACACCATAATCAAATCCAATATGTTCAAGGGTGCGATACTCACGATAATAGCCAAGCATCAAAAGTACTTTATTTTCTGGTGAAAGAGATCTCCTCCCTCCTACACCTAATCCTTTTTTACGATTCTCATCGTATTGCCTAAACACCTCTATCATTGCGTTAAATGTCTCTTCATTAACGCCAATATGGCGCTTAAAATCTTTGGGTTTATGCTTTTGCATTTGTTCATATTTTTTCATGCCTCTTGCCAAGCATTTTTAGTGCCTTTTATTTGAGTTTTGCAAGATGTCTATTATAAAAACAGTGGTGATTATGTTCAAGAAGTAACGGAGAGTTTGGATGAGCTCTTTTTTAAACGGAACGAAAACAATGAGACAAAACTTGCCAATTACTATGATAAATTGATCGAAAAATACAACAATGAAATTGGGCAAAAAGCGCTGTTTGAAAAAGCAAAATTATTGCTCAAACAAGAGCGATTTGAAGAGGTTTTAAACCTTCAAAAAGAGCTTGAGCGCGTACCGGACCGCTTTGAAATTAAGCCTGAAGAGTTGGTCTATGAAGCGGCAAAAGCTTTGGCATTGCAACAACTTCAGAAAGATGAATGCCATACTGTGGTCAATCTCATTGAAACCTATAAACTTCAAATTACTGAGCCTGAATACGAAGAGAAACTTTTTCAATGTTTTATGCGTGTATCGCGCTTTGATCGAGCTAGGGAGATTTCAACAGCACATCTTAAAGACAGCACTCTTTCAAACAGGTACTACTGGGCTCAAAAAGAGGTTCAAGCACTCTTTAAAATGGGCAAATACCCAGAAGCACTTGCGTTTAAAGAAGATCTGAAAACCCTCTCTTTTTCACTCAGAGAAACCATTGGACTAGAGACGATTCGCGATCTTTTCTTCTCGTTGGTCAAACTCAAAAACCTTGAAGGTGCCGCTTCGTTGGCGGAGGGTATTAAAATTCTCTATCCTAATGAAGCGAGCAATTTGGATATCTATTATGAGATTGTGAAAATGGCGAGTGATGCTAAAAACGATCTTCTGCTCGTAACATACGCAGAGGCAAGCCTTGAGATGCAAAAGAAGTTTAACTCCACAGCCCTTAGCCCCACACTGGAGTTTAGTTATGTGGATGCGCTAAAGCGTTTGGGTCGAGATGAAGAGGCTTTACGTATCGCAGAGTCGCTTCTACCTCAAAATTTAACACCTAAAGATAGAATACGACTCTTCTATCAAGCAGGAGAGCTCAGTTTAAAATTGCAAGATACGGCTAAAGCCAAATCGTATTTTACACAGTGCGTCGCCATTAACGATAACAGCTCATGGAAAAATATCTGCCAACAAAATCTTGATTTAATGCCTTAAAACGTATTTTGTAAGAAGTAAAAAGCACCAAAGGTGCGTGGGCTTACTGCCGAAGTAAACCCAGTGTTAACGTAGTTTTTTCACAGAAACTTCGTTTTGAGCTTTGCTTTAAAAACGTGTTCAGAGTTCTGTAAGAACTCTATTAAAACAATATAGACTTGATCTCGCAAAAAGCGTCCATGGAGTAGCGTCCACCCATTCTGCCTAGACCTGATTGTTTCATGCCACCAAAGGGAGGGTTTTTTGCCTTTGATGCAGCAGTATTGATCAGAACTCTTCCACTTCGTATCTGTTTAGCAAATTCATACGCCTTCGTTTCATCGCTTGAAAAGACATATGCAGAGAGCCCAAAAAGAGTGTCGTTTGCCATGCTGAGCGCTTCTTGCTCACTCTCGTAAGGTAGAACGCATAAAACGGGGCCAAAGATCTCTTCTTGCACGATTTTTAATGTTTGATCGTGACAGATAAAAACGGTTGGTTTGACAAAATAGCCTTTCTCAAATTCTTGAACCCTTCCAAGTCCACCGCACAAAAGCTGCGCCCCTTCTTCAATACCACTTTTGATGTAGGCTTGTACCGTATTAAACTGGGTTTGGTTGATCATTGGACCAATCTTTGTCTCTTCGTTTTTTGGATCGCCGATTGTGAGTTTTTGGATCGTTTCGAGGAGTAGCCGTTTGACTTCGTTCAATTTTGCTTTGGGGACTAAAAGTCTACTGCCTGCATGGCACGCTTGCCCGCTATTGCTATAGGCACTGCTTAAGACATGAGGAATCACTTTGGCTAAATTCGCATCTTCTAAAAGAATCGTAGGGGATTTTCCACCGAGTTCGAGGGTCATACGTTTAATGGTTTTAGAGCAGTTTTCAAAAATTTTTTTGCCTGTTTTGGTACTTCCAATAAACGAAATAGCATTGACAAGCGGATGTTTTGTTAAAATTTCACCGACACTCTCACCGGTGCCATGAACGACATTGACAACACCTTTGGGAACATTGGCTCTGTGCAAACACTCTAAAAACGCTTGGGTTTCAAGGGCATTAAATTCACTGGGTTTAATCACCAGTGTACATCCAAGTGCGATGGCAGGAGCGATATTACTACATAAATGCGCTAGATTGGCATTCCACGGAATGATCACGCCAATGACGCCCACGCCCTCTTTGATTGTTATGGAGTAGTCATCTTTTTTGATAAAATCGTAGCTTTTAAGCTCTTCTTTGATCGCTAAAAAGAGGTTGATAGCATTTTTGGTTCGTCTGCGTGTCGTGGTAATCGTCGCGCCAAATTCTAAAACGGCTAAGTCAATCAGTCTCTCTTCGTGCTTGATCAGTTCATCATGAATATGCTGTAAAATCTCCATTCGTTCCTGAATCGACGTTTTTGAAAAGGATTCAAACGTCGTCGCTGCGCAATGAATGGCTTCGTCCATTTCAGAAGGCATGCTCAAATAAATTTGAGCGATTTCCTCTTCGGTTGTAGGATTTTTCAGCGTTAAGCTTTTGCTCGAATCAATTTTTTTAAATTCGCCGTTGATGTAGTTTTGGTCGATTATTTTCATTTAATGAGATTACCTTTATCGTTGTTAAGATTTAAAATGCGTTTCAATGGCGCCAAAAAGATCATTCACATCGCCTTTGGGATGCGGCGGAAATTGCGAAGCATTGAAGGTGCGTTGGCGTTTGGCTAAATGAATTGTATTAAAGCTAATGCGCTCGCTAAGAGCATTAAACGTCAATTTCCCATCGAAATAATCCAACACCTCTTTGATGCCAATCGCTTTCATACATTGGGGCGCTCTGCTGTACCGTTTTTCCAACCCAAAGACTTCATCCACCAAACCTTGTGTGAGCATGTTCTGCGTGCGCAGTGCAATTCTTTGCGCAAGAATTTCTCGTGGCGTATCAATTTCAAACAGGGCAACCTCTTTAATGAGAGGCGCTTGCTTGGCATGCAAAAGATAGGCTGAGGGAATTTCACCTGTTGTCAAAAAGATCTCCAACCATTTCTCGATGCGGTAACGATCACTGGAAGCAATTTTACTCGCAAATGCCTCATCATGCGCGTTTATGAGCGCATACGATGTTTCGAGATTCAGCAGGAGATGATCGATTTTTTCTTTTACATATAAAGATATTTCAGGCTTGATACTGAGTCCTTCCATCATCGCTTTGAGGTAAAAACCTGTACCACCTACGATGATCAGATTTTTCCCCTCACGCAAAGCTTCGTGTTTTGCTTCGTTAAAGAGCTCAAAAAACATCGTGACATCAAAATGCTCGCTGGGCAAAAGAACATCCATCCCAAAATGCTTTATGCCTTGTCGCTCCTCAAGGGTGGGTTTTGCAGAAGCAATATCAATCTCTTTATAGATGCTGAGCGAATCAAGCGATACAATATGTGCGTTATATTTCAGCGCCAATTCGATGGAAAGTGCTGTTTTACCTGAAGCCGTTGGTCCTAAAATAGCGATGGTTTTCAATGAGTTTCTCTTACATGTAAGTCTGAGTACCGTTGTACTTTTGCGCCTTTTAGCGGTGCTGTGCGTGCAATTATAACACTTTTAAAGGGTTTTGTTGTAAAATCAAGCCATCTTAAACGTAAAGGTTAGTATTGCAACAACTCTGGCTCAAACTCAAAGATATTAGTGATTTGATCGTCTTTAAACACTCCGTTTTCGCACTCCCTTTTATTTTCGTGGCGATGATTGTCTCCTCCAAAGCGCAAAGTGGCACCGTCTGGTTTGGATTTAAACTGTTAATTTTTGGACTACTCGCCGCTGTAAGTGCGCGTAATTTTGCGATGGCATTTAACCGCTATGCCGATCGCGATATTGATAAGTACAATCCACGAACCGCCAATCGCCCGAGTGTCGATGGACGCATTGGTACGTTCAATATGCAGCTTTTTATTGCGCTCAATGCTATTGTTTTTATTGTCGTCGCATATCTTATTAATGATCTTGCCTTTTACCTCAGCATTCCAATTTTGATTATTTTGGGCGGTTATTCCCTGTTTAA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82 | Escherichia_phage(28.57%) | transposase,protease,tRNA,integrase | attL 248239:248298|attR 262348:264445 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
973001 : 1034266
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP007201|973001:1034266|DBSCAN-SWA 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58 | uncultured_Caudovirales_phage(25.0%) | transposase,protease,integrase | attL 969977:969993|attR 1000231:1000247 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1712316 : 1739465
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP007201|1712316:1739465|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP007201|1712316:1739465|1715596_1716073_-|WP_025344892.1|DBSCAN-SWA MKKALIVGVLALVSTLSFATEKLGTQNFAPETLEKIKTFKTMSPMSLDKATEFDAGILTGLAYSSGNNDSLAGIFPVFSDLYWATTCSNEYNNVNEWHHNYNNTRANSYKSTILTRLRAQADTNADAKLAYRAIIVAERIANCGSEDDVRGNFIELIK >NZ_CP007201|1712316:1739465|1726730_1727168_+|WP_025344909.1|DBSCAN-SWA MSTNPIISGLLDKKKEILGSIEGYEALIKKARLNLSVLNQTIALFDESYTKTSTRKMPHRYFETGEAKKLILDVLKSSDVPLKTNEIALRVAEKKGIPLDNEAQQHNFQKTIIASLSTIEASGLVQKVGKDGLMIIWKIKELDSK >NZ_CP007201|1712316:1739465|1712316_1713519_+|WP_025344888.1|transposase|DBSCAN-SWA MEIQIDTETILQHIREGKALGGKDGALAPLIKQLTEAALQAEIESHLTQDLQKNRKNGFSSKTMKSEVGNFELDVPRDRTGTFEPQIVKKNQTHMSDQIEQKILSLYALGNSYSQIADHIEEIYGVGFSKATISAVTDKILPMLHEWRIRPLDALYPFIFMDAIHYKVKEEGKYISKAFYTVLGVKTDGRKEVLGLYLGENEGAKFWLHVLTDLQNRGVNDILIASVDGLKGFPEAINSVFPHTEVQLCIVHQIRNSIRFVGSLHQKQFASELKAVYQAFSKEEAENELDKLEEKWGKKYPIVFTSWRNKWENLSLYFQYPEDIRRVIYTTNIIESVHRQFRTLTKTKGAFPNDDSLLKLLFMGIKNAEKKWTMPIRNWSLTLSQLSIHFEGRLNNALNL 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35 | uncultured_virus(20.0%) | transposase,integrase | attL 1711821:1711835|attR 1736230:1736244 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
2384625 : 2398136
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP007201|2384625:2398136|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP007201|2384625:2398136|2389657_2390416_-|WP_025345568.1|DBSCAN-SWA MRLSFFEVESIVMTFKEVFGQGKIYLFGSRADDTQKGGDIDLFLDVPYSEDIYSKKTVFLIKLEEKIGEQKVDIVFQRDDTRLIEQEIHKHKVELNMDQIKLQKYFQECEKHLQRMKKAYDVTKEILPLSHHQYSNLTDEEVKNIDQFLFRFSKLQDTIGDKIFKLILQNYNPDFQKLSFLDFLHELEKREILTSAEDWILLRKVRNNIAHQYDDEPEAMSQAINDIFAQFDTLKHIFENLKNNYKVEMPHE >NZ_CP007201|2384625:2398136|2388696_2389665_-|WP_025345567.1|DBSCAN-SWA MNKTSKIYVAGHRGLVGSAIVKNLTCKGYTNIITRTHAELDLTHQEAVKSFFEQEKPEYVFLAAAKVGGIVANNTYRADFIYENLQIQNNVIHQSYVQGVKKLLFLGSTCIYPKNTPQPMNEESLLTNELEYTNEPYAIAKIAGIKMCESYNLQYGTNFISVMPTNLYGPNDNFDLQTSHVLPALIRKIHEAKQRVDKEVEIWGSGKPRREFLYSEDMADACVFIMEKVDFKDVAKDKKEVRNTHINIGTGKEVSIQELAELVQKVIGYEGKLIYNTSKPDGTMLKLCDSSKLHALGWNHKMELDEGIKTVYELFVSQGLQK >NZ_CP007201|2384625:2398136|2392882_2394049_-|WP_025345571.1|DBSCAN-SWA 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13 | Synechococcus_phage(18.18%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
2464305 : 2472321
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP007201|2464305:2472321|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP007201|2464305:2472321|2471316_2472321_-|WP_025345651.1|DBSCAN-SWA MKILVTGGAGYIGSHSCVELQNAGFDVVVYDNFSNSTFESLKRVMQITGKQLSFISGDVRDEVALEKALIGCDAVIHFAGLKAVGESVEKPLAYYDNNVHGTLCLLRVMQKLNIKKLVFSSSATVYGDPEFLPFTENHPLRTTNPYGQTKLVIEEILRDLFRSDPTWQIMILRYFNPVGAHESGLIGEDPQGIPNNLMPYIAQVAIGRRECVNVFGNDYPTRDGTGVRDYLHVVDLALGHVKALQALNKPQCTAINLGAGKGYSVLEVINAFSKVSGKEIPFEVMPRRAGDIAEFYSDPTLAQKLLGWEVEYDLDKICEDMWRFQIKNPKGYVL >NZ_CP007201|2464305:2472321|2469860_2470436_-|WP_025345649.1|DBSCAN-SWA MTFTRSAIPDVIIIEPKVHGDERGYFVETFRHDKFENFLGYKVNFCQDNESRSHHGVLRGLHYQLAPYAQSKLVRVIDGRVLDVAVDIRVGSPTFGKYVSVELNGKNKKQMFVPRGFAHGFVVLSETCTFTYKVDNYYAPECDRGISFNDSNLGIDWQITSELLHLSVKDTKQPKLEDTLDLFEYGRNYYA >NZ_CP007201|2464305:2472321|2467994_2469002_-|WP_190278592.1|DBSCAN-SWA MRNILLTGTAGFIGSNFVPYFLEKYPEYTLINLDLLTYAGNLENLKECEGNSRYKFIKGDICNRELVEFIFREYDIQGVIHFAAESHVDNSIKNPGVFVQTNINGTFTLLDIAYKYWMDKPFTCKAKYQDARFHHISTDEVYGTLGETGFFTESTPYAPNSPYSASKASSDMIVRSYQETYGLNSVITNCSNNYGPKQHDEKLIPTIIRKALSNQSIPIYGDGKNIRDWLYVLDHCKGIDLVYHNGKSGQTYNIGGRNERTNLQIVDRICTILDEKVPTTKSYKELITFVEDRSGHDRRYAIDATKLENELGWKADENFDSGIVKTIEWYLRKYN >NZ_CP007201|2464305:2472321|2464305_2465586_-|WP_025345643.1|DBSCAN-SWA MNSTAIKVSHLTKIYKLYDKPVDRLKESLHPLKKQYHKEFYALDNINFEIKKGETVGIIGKNGAGKSTLLKIITGVLTPTNGSVHVHGRIASLLELGAGFNPEYTGVENIYFQGSLMGYTREEVAQKVDEIIAFADIGDFVYQPVKMYSSGMYARLAFAVAINVDPDILIVDEALSVGDFAFQFKCFQKFQAFQKAGKTILFVSHSTQQIIQYCNKAMLIHSGNLIKYSDDVKQTTYDYEVLIRKHDGFNIEELKEVEKTQVQNIELDFDITPNKEVNEHRFGTHEAIFAKVTLSHDEKATSTDAVLTAGKKVYLRFYILAKREFPSIVMGTSIKNRDGITIWGDNTIDTPITLTQGLNKISMEFDLNIVAGEYFIDCGMADISFTPRVELDQRWPFDKINIVTSHRTIQGFAYAPTDIILESIAK >NZ_CP007201|2464305:2472321|2465582_2466155_-|WP_025345644.1|DBSCAN-SWA MSIIKFETIESKLIKYKEQFVIVDSDLAQLYGVETREINQAVGNNPDKFPDEYIIELTKEEKTELIKNFDRFNNLKHSTVTPKVFTEKGLYMLATIIKSKIATETTLNIIETFAKVKELSRNINAIMKTEEEARQKELANKSNKILEEIIEIEPDILADDEDGEIVETTTKFEFNLGFAKVSRSIKKIKK >NZ_CP007201|2464305:2472321|2466304_2467189_-|WP_025345645.1|DBSCAN-SWA MHTIIPVESQSIQNKIYTIRDKQVMLDEDLAVLYGVEAKRLNEQVKRNIERFPEKFRFQLTENEYENLRSQFATLSFEKGWGTHRKYLPYVFTEQGVSMLSAVLKSQTAIEVSIKIIDTFVEMRKFISLNANIFQRFERVEQRLSLHDEQFNKIFEAIENNEVQQKQHIFYDGQIFDAYLFVSDIIKSAKTSIKLLDNYIDESTLVLFTKRDIKVTMKIYTKTISKQLQLDIQKHNAQYPKIEIETFDLSHDRFLIIDDMDVYHFGASLKDLGKKWFAVSKIDIDSFEMLRKLK >NZ_CP007201|2464305:2472321|2467188_2467998_-|WP_025345646.1|DBSCAN-SWA MRYIKAFYRFLRDIYQNRRLLKDLVKNDFKSRYLNNYLGILWAFIQPTISVLIFWFVFQVGFKAAPVQDVPFILWLVAGMIPWFFLSEALASATNAILDSTFLVKKIVFRVSLLPIVKITSAVIVHLFFMAFMMSMYIIYGYEPNLYWLQMFYYLFSAIILLLGISWITSSVVIFFRDLGQLVSMSIQFGFWLTPIFWSLSMVPKEYRWLFELNPAHYITQGYRDALINHVWFWEKPMEALQFWGITLVFFVLGAIVFRKLRPHFADVL >NZ_CP007201|2464305:2472321|2469001_2469868_-|WP_025345648.1|DBSCAN-SWA MLNILVTGSHGQLGSEIHELSHEYPNTYFFTDKEELDITDAKTLRQYIEHNAINAILNCAAYTTVDKAESEEELADKINHLAVKYLATIAKEHNIKLIHISTDYVFDGTIYRPYLETDATNPQSIYGKTKLLGENALLHTKLPNSVIIRTSWVYSSYGANFVKTMLRLGKEKESIGVIFDQVGSPTYAKDLAKTILEILPKINNTQTEIYNYSNEGVASWYDFAQEIMKMAKLTCKVNPIETSQYPTPAKRPHYSLLNKSKIKNEYTIEIPYWKDSLEVCLRKMGERK >NZ_CP007201|2464305:2472321|2470432_2471320_-|WP_025345650.1|DBSCAN-SWA MKGIILAGGSGTRLYPITKGVSKQLVPVYDKPMIYYPLSVLMLAGIREVLIISTAQDLPRFQELLGDGKEIGMAFTYIVQPSPDGLAQAFILGEEFIGNDSVCLVLGDNIFYGQGLTGLLEKSVENAKQESKATVFGYYVSDPERYGVVAFDEEDNVLSLEEKPKDPKSNYAVVGLYFYPNSVIKIAKGVKPSERGELEITSVNQAYLAMGDLKVELMGRGYAWLDTGTHESLLDAGQFIQTIEHRQSLKVACLEEIAYEKGYITKEQLLILAEPLKKNQYGQYLIRRANQGKRR |
9 | Enterobacteria_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
2892337 : 2919407
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP007201|2892337:2919407|DBSCAN-SWA 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23 | Escherichia_phage(50.0%) | transposase,integrase | attL 2894706:2894722|attR 2928995:2929011 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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