CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP006745	Candidatus Endolissoclinum faulkneri L5 chromosome, complete genome	0 crisprs	NA	0	0	1	0

1. NZ_CP006745

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	800302 : 807084	7	Staphylococcus_phage(50.0%)	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP006745|800302:807084|DBSCAN-SWA
ACTAAACACCCTTGCGACGTCCCCCCCGTCGCGAAGTTTGACGCCCTAAGCCAATTCTCTTTGCAAATTCAGAGCGCTGAGTTGCATAGTTCGGAGCCACCATAGGATAGTAAGCAGGCAAACCCCACTTAGCTCGATAATCTTCGGGAGTCATCTCATAATTAGTCCGCAGATGGCGTTTAAGCATTTTTAACTGTTTACCGTCCTCTAGACAGACTATATAATCGGGAGTAACTGACTTTTTCACCGGAACCGCAGGCTTCGTTGGCTCAGACTCCGGTTCTATACCGACCTCATTCAAATTGTTAAGTGCATCATGCACCGTATTAATCACTTCAGTAATTTGATTAGGGGCAACTGAATTATTACTCAGATACGCCGCTACAACTTGCGTTGTCATTTTGATCATTGATTTACCAGTGGCTGCTTCAATTCTAGCCTCATCACTCAATCTCATTAAAAAACCATTTCGAATTAAATTTATCAGGATTATATATGGACACATAACTGATGCAGACAGAAGAGAAATTCAACATACTACGTTGGAAAAATCTTAACATTTTTTTATAGCTTGCTCAGCTTAAATCTGAAATTTTAATTCCCTGTATTACTTGTAATTCGATAATTCTCTGTATTACTTGTGATTTCGAGATATCTCAGAACTAAAATTTAAAAACTAAAGAATTCTTTGGGGCGCCTTAAAATATATTCTTAAATCTTTGGGGCGCCTTAAATATATTCTTAAATCTTTGGTGCGCCTTAAATATATTCTTAAATCTTTGGGGTGCCTTAAATATATCCTAAAATATTTAGGGTGCAGAGTGCTTTTATTTTCTATTATTTATGGTGCCTTAGTATATTTTTTATTCTTAAATCTTTGGGGTGCCTTAAATATATCCTAAAATATTTAGGGTGCAGAGTGCTTTTATTTTCTATTATTTATGGTGCCTTAGTATATTTTTAGGAAAATAATTCTTGATTTAGAAGTTAACGGATTGTGGTAATTAAAACAGCAAAATTCATTATCTGAGTTTTGCTGTTTTAATTTAGAGGTTATTGCGCTACTTTTGGTTTAGAGGTTATTGCGCTACTTTTGGTGTTTCAAGCTATTATATTGGGTAATGCTAACTTTTAATTTATTAGGATCTTTACACGATGAGCTCTGCTACGATTGCCATTGCGTCAGATCATGCTGGTTTCCCGTTAAAGTCAGATCTAGCAAACTTTTTGCGCAGAAAAGAATTCGAAGTACTCGATCTTGGAATTAACGGTACAACTTCTGTCGATTATCCAGATTTTGCCGTAGCTGTAGCGCAAGCATTGTTGGACGGAAAAGCATCACGTGGGGTCCTTGTGTGCGGCACGGGGCTAGGAATCAGCATTGCTGCCAATCGATATCCCTGGGTACGAGCTGCTTTGTGTCACGACGTAACAACTGCAAGACTTTGTCGAGAACATAACGACGCTAACGTGATAGCTCTAGGGGCCAGACTACTTGGCATAGAGGTCGCACGGGATTGTCTTGAAGCTTTTCTTACTACTTATTTTTGTGACCACCGCCATACTAAACGGTTAGTAAAAATGACTAACCCGCCAAACCTCAATAACGTTAAAGAACAGCTTTAACTTATAATACGTTCGACTCTTCTTAAATCACGTTTAATTATTTTGAGCTCCTAAGGAGGCCGATCTCTTCATGACTCTAACAATAAATCCTCGCACAGAAGCAACGAACTTTTTTGCTGCTAGTTTAGCCGAAAAAGATATTGAACTCAATAATGCAATCTCTAAGGAATTATTCCGTCAGCAATCTCAAATTGAGCTAATTGCATCGGAAAACATTGTATCTCGCGCTGTACTGCAGGCGCAGGGATCCGTTCTAACTAACAAATATGCTGAAGGTTATCCTCATCAGCGTTATTACGGCGGATGCGAATTTGTCGACATAGCTGAACAGCTAGCAATTGATAGAGCTAAAAAACTTTTTAAGTCCTCTTTCGTAAATGTACAGCCTCATTGCGGTGCTGCAGCTAATCAAGCTGTTTTTTTAGCTTTACTTAAACCTGGAGATACGATCCTAGGAATGTCACTTGATGCTGGCGGTCATTTGACACATGGGGCAAAAGCAAACTTATCAGGTAAATGGTTTAATGCTATAGGCTATGGTTTATCTAAAAAAGATGGACTGATCAACTACGATCAGGTAGAGGATTTATCTAAAACCCATAAGCCTGCTATGATAATTGCTGGTGGTTCGGCATATTCGCGCAAAATCGAATTCGTACGTTTTCGAGAGATTGCAGATAGCATAGGTGCTTATTTTATGGTCGACATGGCTCATTTCGCTGGTTTAGTTGCTGCTGGAGTTATGCCTAGCCCTGTACCCCATGCAGATGTTGTAACCACAACTACTCACAAAACCTTGCGTGGACCACGTGGTGGGATGATAATATCTCGCGACAAAAACATTGGGAAAAAGATCAACTCTGCTGTTTTCCCTGGTTTGCAGGGTGGACCACTTATGCATGTCATCGCTGCCAAAGCTGTAGCTTTTGGAGAAGCGCTTCAGCCTGAGTTTACAACATATGCTCAAGCTGTGGTTGATAACGCTGAAGCGCTAGCAGAAGTATTAAAAGATCATGGACTAAACCTTGTGTCAGGAGGAACAGATACTCATTTAATTTTAGTTGATTTGCGATCAAAAAATCTAACCGGTCTTGATGCGGAACATGCCATGGAACGTGTCGGCATTACCTGTAACAAAAACGGTGTACCGTTCGATCATCATAAACCAACGGTTACCTCCGGTGTGCGTCTTGGTACTCAAGCAGCTACAACTCGCGGCTTTGGCTTGGAAGAGTTCCGTCAAGTTGGTAGAATTATCGGTCAAGTAATAAACGGTCTAGCCAACAACGCAAATGGAAATAGCCAAATGGAAGCAGAAGCTCTAACTAAAGTCGAAGCCTTATGCAATAGATTTCCAATCTATTCATTTTATTAGCATGTTTCATGCAAAGAATGCAGTATTGTCATTAATAGAGAACAAAAGTATTAAAGATCGCCAATCTTGTTTAAGGTTCGGCACTGAATCAAGCAGTTTTTAAGCTGAATAAAAATTTGTGAAATAACTGCTGAATAAGAAAAAGCACGCTATAGATTAATATAGAAACAAGTAAATCAAATTGATAGGAATTGCTCTGCAAGAGCCCCTTAGCAGATTTAGTAAGTATTGAATGCCTTTAAGAATAATTGACTAATTTTGTCAATTATTCTTAACTTATTTAAAGTTGTGACTATACAGATTGTACAATACTCCACGATTTACAGAGCTTTAGATACTTCATTGAAAAATCAATATCAAAAACGCATTAATCAGCTATTGACTGCCAATCTAATCCGTAGGTTGCTATGACATTAGATTCCTGCATCAACATAGCTGACAAATGTTTTATGAGGATTGCCTTACGTCTTGCTCGGAGGGGATTGGGACGAACAGGGGATAATCCGTCTGTAGGATGCGTATTAGTCCGCGACGGCGAGATACTAGCAATGGCCCGTACTTCTGATGGCGGTCAACCACATGCAGAAACTAATGCTTTACTAAGAGCAGGGCAGAAAGCTTTAGGGGCAACTGCTTATATAACTTTAGAGCCATGTATTCATTGGGGTAAAACTCCTCCTTGTTCTGAAGCCTTAATCAAAGCAGGAGTAACTCGTGTTGTTTTAGCCATGAACGATCCAGACTGTCGAGTTAATGGCGGCGGATTTGCAATGCTCACCTCAGCTGGAATTAAAGTGATAACCGGGGTGTCCTTGGTAGAGGCCCAGAAAGTTATCGCTGGATATATTTATCGCAAGAAAATCGGTCGACCGCTTGTAACATTAAAACTTGCCACCAGCTTAGATGGGTGTATTGCTACAGCTGCGGGTTCGTGCCGCTGGATTAGTGGTTCAACAGCGCGCGCAAGGGGGCATTTACTTCGTGCCAAACACGACGCTATTCTCATCGGTTCAGGGACTGCTACAGCTGATGATCCGGAGCTCACTTGTCGTTTGCCTGGGCTAGAAGCACAATCACCTGTACGCGTAGTGCTTGACAGTAATTTAAGTATTGCTCATTCGGCTAAGCTTGTTACTACTGCTAAACAAGTTCCAACTTGGGTGATTTGCGGTACAAAAACGAACCCTAAAAAGCGCGAGAAGCTGGAAGCTTGTGGTGTGACTGTACTACCTGATATAAGCGATAAAAATTCTCGGCCAGCAGTTGATGTCATTATGTCGCTACTAGCACAACGCGGCATCAATAATCTCCTAGTGGAAGGAGGGGCTACTGTTGCTGGTGAATTTATTCAGCACAAAGTAGTTGATATCATAGCATTATTTCGATCACCCATAACAATAGGCGACGGGAGGGCATCTTTAAAAGGTCTTTCTGTTATGGATTTGCAAGAAGCCCCGCGTTTCGTTTCAGAAGGAATAGAAAAGCTTGGGGCAGATACTCTAGAAATTCTACGTCGACCGGAGCGTCTAATCTGATTTTATGTTTACAGGAATAATTACAAATGTTGGCTACTTAAGTTCGCTTGAACAGCGGAGGGGTACGCGCCTGGTGATAGAGACTAAGAAGAAGATGGATTGTATGGCTATTAGCGATTCCATATCCTGTAGTGGAGTCTGTCTTACAGTGATTGAGAATAATAAAGATAGTTTTACAGTCGATGTATCTACAGAAACTTTATCTAAAACCACAATCGGTAGTTGGGTTAAAGGCATGCGAATCAATTTAGAAAGCTCTATGACTTTAACTTCCAGATTAGGGGGGCATTTAGTTACTGGCCATGTAGATGGGCTAGCAAAAATTCTCGAAATCGAGCGAGAAGATAACAGTTATCGACTATCTGTAGAGGCGCCAGAATACTTGAGTGCTTTTGTCGCTACAAATGGTTCAATATGCCTTGATGGCGTTTCTCTAACAGTAAATTCAATTAATGGAAGAAATTTCTGTCTAAACTTGGTTAATTACACTTGGAATAACACAACTTTTTGCGATAGATCGGTAGGTGATAATTTGAACATGGAAGTGGATTTGCTTGCGCGATACGTTACTCGTTTAGCTGAAACAGGAACAGTGCTAATGTCTTCGCTAGTCAGTCCAACAATTAAATCGTGATGTCCAATCAGCGAATGCTATATCCATTAAAAGTTTATCCAGGCGTGCTATCTACTATAGATGAGGTAGTGGAAGAGGCTCGTTCCGGGCGGATGTTTATACTGATAGATGACGAAAATCGAGAAAATGAAGGTGACCTTTGCATAATCGCTGAAATGGCTACTCCGGAAACTATCAATTTTATGGCAAAGCATGCACGCGGGCTAATTTGTCTTTCTTTAACACGAGAGCGGATAGATAAGCTTGGCTTACCTCTAATGTCCTCACGCAATGAAACAAGGCATAAAACTGCCTTTACAGTCTCAATTGAGGCGAGAAACGGAGTTACTACAGGTATTTCAGCTCATGATCGTGCCCATACTATCCAGGTTGCCATCGATGTACAGTTAGGACGTGAAGATATAGTCACGCCAGGTCACGTTTTACCACTTATGGCGCGTGAAGGAGGCACTTTGGTACGAGCTGGGCATACTGAAGCTGTAGTAGATATTGCCCGTATGGCTGGATTAAACCCTTCGGGTGTTATTTGCGAAATTATGAATGATGATGGCACTATGGCTAGGCTGCCAGATCTTATGAAATTTGCCCGGTTTCATAAGATGAAGATTGCCACTATTGCCGACCTTATTGCTTATCGCAGACGAACTGAAAGTATTGTTGATCGTGCAGTGGAAACCTCATTGCATAGCAAGTTTGGAGGCGACTGGCGTATGATAGTTTACACTAATAAGATCAGCTATGCTGAACATGTTGTTCTTGTTAAGGGTGACATAACCACCAAAACTCCTGTGTTAGTACGCATGCATGCGCTTAACGTTCTTGAAGATGTACTAGGCAATGATGCTGGTAATCGTGACGGCATATTGGGGTCTGCAATGACACTAATCGGTAATGTCGGACGTGGTGTTGTCGTGCTGATCCGCGAACCAAGTGCTACTTCATTGTCAGACCTAGTACATGACAAATTGCGTGCAGAAGCAGAAGGTCGTACAACCAACGAAGAACTTCGTGACTACGGGGTTGGCGCACAAATACTTCTAGACTTAGGGATAAACTATATGATCCTATTGTCCAATACTAAACGCACAATTATCGGTTTAGACGGCTATGGTCTAAAAGTTGTCGAACAACGTTCAATAACTGTAGACAAATAAAAGAATGTAAATATGCATAGAATACTAATAGTTAAAGCTGGGTTTTATGAAGAAATAGTCAATGAGCTATTACGTGGCGCAGTTCAGCACCTGCAAATGATAGGCGTTAAATATGATCAAATCACTGTACCTGGCGCTTTTGAAATCCCAGGAGCGATTTCTATGGCCTTTCAAAGCTCTTTAAAAGGAGGAGTATCATATGATGGTTATTTACCCTTGGGTTGTGTAATCCGTGGTGAAACCAATCATTACGATTATATCTGTAGCGAAAGTGCGCGCGGTATTATGCAGCTGTCTTTACGCAATAACTTAGTGATTGTTTACGGCATATTGACTGTAGAAAACGCTCAGCAGGCTTGGGAACGCGCTAAAATAGAAAATGGGAAAAATAAAGGTAAGGAATTTGCAGAAGCTTGTATGAAAATGATATCATTGCGTTGTCGATTCTCAATAACATGA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP006745|800302:807084|801456_801927_+|WP_025300575.1|DBSCAN-SWA
MSSATIAIASDHAGFPLKSDLANFLRRKEFEVLDLGINGTTSVDYPDFAVAVAQALLDGKASRGVLVCGTGLGISIAANRYPWVRAALCHDVTTARLCREHNDANVIALGARLLGIEVARDCLEAFLTTYFCDHRHTKRLVKMTNPPNLNNVKEQL
>NZ_CP006745|800302:807084|804841_805471_+|WP_025300578.1|DBSCAN-SWA
MFTGIITNVGYLSSLEQRRGTRLVIETKKKMDCMAISDSISCSGVCLTVIENNKDSFTVDVSTETLSKTTIGSWVKGMRINLESSMTLTSRLGGHLVTGHVDGLAKILEIEREDNSYRLSVEAPEYLSAFVATNGSICLDGVSLTVNSINGRNFCLNLVNYTWNNTTFCDRSVGDNLNMEVDLLARYVTRLAETGTVLMSSLVSPTIKS
>NZ_CP006745|800302:807084|805470_806625_+|WP_025300579.1|DBSCAN-SWA
MSNQRMLYPLKVYPGVLSTIDEVVEEARSGRMFILIDDENRENEGDLCIIAEMATPETINFMAKHARGLICLSLTRERIDKLGLPLMSSRNETRHKTAFTVSIEARNGVTTGISAHDRAHTIQVAIDVQLGREDIVTPGHVLPLMAREGGTLVRAGHTEAVVDIARMAGLNPSGVICEIMNDDGTMARLPDLMKFARFHKMKIATIADLIAYRRRTESIVDRAVETSLHSKFGGDWRMIVYTNKISYAEHVVLVKGDITTKTPVLVRMHALNVLEDVLGNDAGNRDGILGSAMTLIGNVGRGVVVLIREPSATSLSDLVHDKLRAEAEGRTTNEELRDYGVGAQILLDLGINYMILLSNTKRTIIGLDGYGLKVVEQRSITVDK
>NZ_CP006745|800302:807084|803709_804837_+|WP_081713430.1|DBSCAN-SWA
MTLDSCINIADKCFMRIALRLARRGLGRTGDNPSVGCVLVRDGEILAMARTSDGGQPHAETNALLRAGQKALGATAYITLEPCIHWGKTPPCSEALIKAGVTRVVLAMNDPDCRVNGGGFAMLTSAGIKVITGVSLVEAQKVIAGYIYRKKIGRPLVTLKLATSLDGCIATAAGSCRWISGSTARARGHLLRAKHDAILIGSGTATADDPELTCRLPGLEAQSPVRVVLDSNLSIAHSAKLVTTAKQVPTWVICGTKTNPKKREKLEACGVTVLPDISDKNSRPAVDVIMSLLAQRGINNLLVEGGATVAGEFIQHKVVDIIALFRSPITIGDGRASLKGLSVMDLQEAPRFVSEGIEKLGADTLEILRRPERLI
>NZ_CP006745|800302:807084|800302_800758_-|WP_144079724.1|DBSCAN-SWA
MRLSDEARIEAATGKSMIKMTTQVVAAYLSNNSVAPNQITEVINTVHDALNNLNEVGIEPESEPTKPAVPVKKSVTPDYIVCLEDGKQLKMLKRHLRTNYEMTPEDYRAKWGLPAYYPMVAPNYATQRSEFAKRIGLGRQTSRRGGRRKGV
>NZ_CP006745|800302:807084|806637_807084_+|WP_025300580.1|DBSCAN-SWA
MHRILIVKAGFYEEIVNELLRGAVQHLQMIGVKYDQITVPGAFEIPGAISMAFQSSLKGGVSYDGYLPLGCVIRGETNHYDYICSESARGIMQLSLRNNLVIVYGILTVENAQQAWERAKIENGKNKGKEFAEACMKMISLRCRFSIT
>NZ_CP006745|800302:807084|801997_803302_+|WP_025300576.1|DBSCAN-SWA
MTLTINPRTEATNFFAASLAEKDIELNNAISKELFRQQSQIELIASENIVSRAVLQAQGSVLTNKYAEGYPHQRYYGGCEFVDIAEQLAIDRAKKLFKSSFVNVQPHCGAAANQAVFLALLKPGDTILGMSLDAGGHLTHGAKANLSGKWFNAIGYGLSKKDGLINYDQVEDLSKTHKPAMIIAGGSAYSRKIEFVRFREIADSIGAYFMVDMAHFAGLVAAGVMPSPVPHADVVTTTTHKTLRGPRGGMIISRDKNIGKKINSAVFPGLQGGPLMHVIAAKAVAFGEALQPEFTTYAQAVVDNAEALAEVLKDHGLNLVSGGTDTHLILVDLRSKNLTGLDAEHAMERVGITCNKNGVPFDHHKPTVTSGVRLGTQAATTRGFGLEEFRQVGRIIGQVINGLANNANGNSQMEAEALTKVEALCNRFPIYSFY

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_144079724.1|800302_800758_-	MucR family transcriptional regulator	A0A1P8VVG0	Erythrobacter_phage	9.3e-20	43.9
WP_025300575.1|801456_801927_+	ribose 5-phosphate isomerase B	NA	NA	NA	NA
WP_025300576.1|801997_803302_+	serine hydroxymethyltransferase	A0A219Y950	Aeromonas_phage	5.4e-97	52.8
WP_081713430.1|803709_804837_+	bifunctional diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase RibD	A0A1V0SE20	Indivirus	3.9e-43	34.0
WP_025300578.1|804841_805471_+	riboflavin synthase	A0A2H4PQS5	Staphylococcus_phage	4.9e-27	36.5
WP_025300579.1|805470_806625_+	3,4-dihydroxy-2-butanone-4-phosphate synthase	A0A2H4PQS2	Staphylococcus_phage	4.9e-57	39.0
WP_025300580.1|806637_807084_+	6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase	A0A2H4PQS3	Staphylococcus_phage	1.8e-15	40.0