Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_021744 | Lactobacillus helveticus CNRZ32, complete sequence | 1 crisprs | cas14j,cas14k,csa3,Cas14u_CAS-V,DEDDh,cas3,DinG,cas2 | 0 | 0 | 19 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_021744_1 | 711731-711910 | TypeV |
NA
Consensus repeat of NC_021744_1
|
2 spacers
spacers of NC_021744_1
>1.1|711752|58|NC_021744|PILER-CR ATGCTGGATCCACAAACCAGTGTGTTAACCCCTTCACCAATTCCGCCATAAACGGTCC >1.2|711831|59|NC_021744|PILER-CR TCTCCTCCGTGACAGGGAGGCGAGATAAACCACTGCTCCAATGGACCAATCAGAGGAGG |
cas14j,cas14k |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021744_1
The CRISPR arrays of NC_021744_1 >merge|NC_021744|1|711731-711910|PILER-CR ATGTGGGATTCGAACCCACGCATGCTGGATCCACAAACCAGTGTGTTAACCCCTTCACCAATTCCGCCATAAACGGTCCATGTGGGATTTGAACCCACGATCTCCTCCGTGACAGGGAGGCGAGATAAACCACTGCTCCAATGGACCAATCAGAGGAGGATGTGGGATTTGAACCCACGC >NC_021744|1|1|711731-711910|PILER-CR ATGTGGGATTCGAACCCACGC ATGCTGGATCCACAAACCAGTGTGTTAACCCCTTCACCAATTCCGCCATAAACGGTCC ATGTGGGATTTGAACCCACGA TCTCCTCCGTGACAGGGAGGCGAGATAAACCACTGCTCCAATGGACCAATCAGAGGAGG ATGTGGGATTTGAACCCACGC
>NC_021744.1|WP_096001369.1|709436_710666_-|IS200/IS605-family-element-transposase-accessory-protein-TnpB MFDIILKRKEGTNVLKGIKLRLYPNRTQQNQLEQMFGNDRFVWNQMLAMMNERYQNNKDLPFLGKFKLNYLLKPLKKEYPFLKNSDSSSLQVVNEFLTQSWKNFFQDKTGQIGKPRFHSRKYLKKSYTGKSIIKTAGKRYLKIPKLGYVKTSKTGVLQNTKVKRYTVVLEPTGKYYLSLQVEISEPEKYSLTGKRVGIDVGAADLAILSNGLKYPSFNSSYFEKKAKVWQRKYARRRHLAKLLVLQDRNKKVPCPRSLESFTNWQKAQKSKAKCQAKAANQRRDYLHKLTTHLVKQYDVIAIEDLKTKNLQKNHHLAKSIANASWRMFRQMLEYKCEWYGKKLIAVDPKNTSRICSKCGYNSGAKPLEIREWTCSKCQTKHDRDINAAVNILHKGSTKLNGQGLAMVTS >NC_021744.1|WP_003633105.1|707185_708514_+|uracil-transporter MSKKENFRNPDAILDVYEKPEFGQGVLLSLQHTFAMFGSTVLVPILIGINPSIALLSSGIGTLVHMILTHFKIPAYLGSSFAFVATMQALMKADGYPAVAQGAIASGLVYVIVALIIAKVGSGWVNKVLPPIVVGPIIIVIGLSLATTAANDAMMNNQKYDLTYFGVAIFTLVMTLVFQMCFKGFTSLVSIMLGIICGYVLACFLGIVDFSGVEKAAWFSIPSLDVMGISYHFKWYPAAILAMAPIAFVTMTEHMGHIMVLNSLTKRNFFKNPGLHRTMMGDGISTIIAGFIGGPPTTSYGENIGVLAMTKVHSVWVLAGAAVCAIIFSFVGKLAALIESIPMPVIGGISFLLFGTIASNGLKILVDDKVDFGEKRNMLIASVILVIGIGGAYLQLGNFQLTSVALSTIIGMILNWVLPKKAASEKALEEKNKQKQDGKIYQ >NC_021744.1|WP_020829065.1|706642_707173_+|bifunctional-pyr-operon-transcriptional-regulator/uracil-phosphoribosyltransferase-PyrR MAKEIIDAIGMKRALMRMTYEIVERNKGTENLVLVGIKTRGLYLAQRIAANLKKLEDVEISVGAIDVLQYRDDLPESKKEKMIHNQQLDFDITDKNVVLVDDVLFTGRTIRAALDALMDQGRPAKINLAVLVDRGHRELPIRPDFIGKNIPTAMNEEVKVSMTEVDDKDSIELINK >NC_021744.1|WP_020829064.1|704882_706352_-|MFS-transporter MNKKQLFMVTLALLLANIMSGLDATIINTAIPAIVSDLHGIQYMGWIVACFLLGMSVSVPIWGKLGERMGNKFAFELSLALFILGSLLEGIALDIYFFLIARILMGVGAGGMGSLPYVIVGYIYPNIKRRTVILGYIAASFSAASIAGPLVGGWIVDTLSWHWVFYINVPLGLIAIILSFVYYKGIRKPNKNTQFDKLGAFTLIAGLTSFLIGIQLLGMVSLPVVLGFIILSILLLVVFIRAERKAKSPVVPLSVFTNKALVGDFLIFALAWGSSIAVNTYLPMWAQTILGASALVGGMTLIPNSIVDIVGSQTAPYFLRHVNNYRLLIANLTIMAITAVGLIFAPISTPYQILALIAAFSGFGVGSIFVILQIKVQVDASEKDMAPATSLSFLIRILALTIMAAIYGVIMNLALGRGIAGHPGITMTMMNKLSDAESAKSLPVQLLPTMRKIFYGGIREIMIVSLVLLVAAYVVNYLYNRHEAKIIAE >NC_021744.1|WP_020829063.1|703653_704859_+|multidrug-efflux-MFS-transporter MKEKPIWKKNLFVLSIAVFIAGIAFSEVMPFLPLYIDTLGKFSHQQLNFWSGFIYSGTYLVSALISPWWGKLADKKGRKPMTLRASLGMAIVIGCMGLVTNVYQLFILRMLQGVFAGFVSNSNALIATETPKEKSGQALGTMASSFTAGNLLGPFIGGALASIFSYRVTFFITGGLLLISFFLSLFFVHETDFKPVTEKKLDKASGIIKELRSPQLIFGLLLTTLIIQAANNSINPIVSLYVKQLMANHGNVVFISGVIAALPGIATFLAASRFGALGDRIGTHKIIVGGFIGATILFFLTAFVQNTVELGILRFLVGFTDACLFPQVQTLLTKNTPAKITGRIFSWNQSAMYVGNIFGPLLGSTISGLTSYSIVFIVTTIIVVFNLILFKFNVINNLRQK >NC_021744.1|WP_003633113.1|702444_703527_-|M42-family-peptidase MQKEQEIQMLKEFSDANSTSGFEEEFVKLFTSYAEKTANIEVDGMLNVYASKKENKGDRPVIQLDAHSDAVGFITQAVRPNGLIKFVPLGGWVKYNIPALKVKVRNRDGEYIPGVVATKPPHFMTAAERNNVPDVVDMSIDVGSSSREETIKDYKIDTGCPIFVDVKCEYHEKSGLFFGKDFDDRFGAGAMIDVLDNLKGEETNFDVVAALSSQEEVGLRGAYVTARKVKPDLCLVLESCPADDTFTPDWLSQTGLKRGPMLRDMDTTFLPNPKFQQYACDLADKNNIPYTRSVRTGGGQDGAAIYYENGAPTIVIGIPVRYEHSPYCFSSYKDFKASVDLATAIIRDITQEKLDSFKKF >NC_021744.1|WP_020829062.1|700717_702340_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MITVSDLSLKFGGRTLYEDVNLKFTPGNCYGVIGANGAGKSTFLKLLEGKLEPTTGSISIDPNERMSSLNQDHFAFEDFTVMDTVIQGHKELYQVMKEKDALYAKPDFGDEDGIKAAELESKFAELDGWNAEANASKLLQSLDIPESEHQMLMKELPESEKVKVLLAQALFGNPDILLLDEPTNGLDVHTVEWLENFLADYPNIVIVVSHDRHFLNQVCTEMCDVDRGKIQLYVGNYDFWYESSKLANELVANQNAKKEEKIKQLQEFIARFSANASKSRQATSRKKQLDKITLDDIKPSSRKYPFVKFEMHRDLGNDLVKVENVSYSVDGEKILDNVSFIVRPGDKVAFLSRNALATTALLDIIAGKIKPDTGTVTWGQTTAFNYMSRDLNANFNNDDLTILDWLRQYATKEQDDNTFLRGFLGRMLFSGEEIEKKIKVLSGGEKVRCQLSRMMLESANVLIMDDPTNHLDLESITALNDALVAYPGSILFTSHDHEFIQTIANHIIEVGPKGIVSRQDTTYDEFLDKESIQDQVEKIY >NC_021744.1|WP_003626854.1|699769_700441_-|hypothetical-protein MDNLPFSSVTDKLDNIPFNYDHAGTKEVVVNNVIGDYFNPVTKKYEISDHTFVVGYIKDSNLDQDIAIEQMQQAAMNIINELNKRQMPPHMVMPHLLTDVEKAKQVVTDDDVKISQLSKETGISEEILSDYRENPVTLKKASNSTIERLITKYYEKYFNRNEIEKFRFMLIKTVMAYLKENKKDEIDYDPVYELYKLCQQADWHRLARMEEIWRAFYTVDNQH >NC_021744.1|WP_020829061.1|699087_699756_-|type-1-glutamine-amidotransferase MRVNVLQHAPNEGPGSIQDWCHEHNHEMFVYYPTDFGILPTIDETDLLVILGSPNSPNDKLDWIKNERVLIKQMLKANKPILGICFGSQQSAKTLGYEVLDAPAKEVGWAPVYLQDHTIENIPKKLTALHWHQQMSEIPEDAKLLFSSDLVKNQGYLLGNNVIGLQFHFEPKEDNVREIAINDGAYALENNDLHQTPQEIIAHGVPKENKDVMFVLLDYITK >NC_021744.1|WP_003633120.1|698226_699045_+|transporter-substrate-binding-domain-containing-protein MKKRFFLSTLLIGIALFTLSACSQNKKQNVYQTVKSTKTINWGVKADTPLFGSMNIKTGKINGFEIDLAKALTKEMLGKNAKANFVTTTANTKIQLLKNRNVDAVIAAMTITPEREKQVNFSKPYFPAGQSIMVAKNNKIKNVKDLNNKKVLVVKGTTAADAVKKFAPKAEILQFDDYGQAFTALKAGQGDAFVTDNGILVGILRDSSGYKLVGGNFTNQPYGIAVNKGQTEMDKQINLALTKLEKDGTYNRLLKKWFGNIPGFNVKTAEKY >NC_021744.1|WP_041806185.1|712312_713638_-|IS200/IS605-family-element-transposase-accessory-protein-TnpB MRKKVVPRNKAKYEHLASEYLVAGNSKLDQCSHASHDLYNRDLYDLRQGFFKRNYVKGYCDLDQRFKKRYSARESMLYHSLFYVQSAQQTLKEVNTIWSAWLKALKAYQANPGKFTGRPRMPKYLAKGQRHVFFVTNQNAKVKDDYLIIPKLGFKLKLTPHLKAIQRVAFKPVYGGYKAIVQYKTNRDIDYLPDNGRYMGIDPGVDNAFACVANIQKAPLLVNGRAIKSVNQYYNKERSRLKALQARYHQLESIVDTQQGKKPVYRETKAMRRITAWRNRKIRQFAHKASKRIVDYALSCGANTIVIGNNKSWKRSSDMGRKNNQNFIGIPHKVMIDMIQYKANLAGISVIRTNESYTSQTSALDHEKPCWENGSQSRKRQGKTPINRRIHRGLFQSNNGRLVNADITGALQIIRKVFPKFSLDEGIEDAVLHPVKWSPLI >NC_021744.1|WP_003627960.1|713667_714276_-|IS607-family-transposase MKAGKVMDLLQISRSTLKRYREKGILEAKKLPTGQYDFDDDSVFLLKNKHSKRLTVLYGRVSTYKQKADLANQMQELSDFAQSKGFQANDSFQDIASGISFKNRKQFFKMLDLILAGKVKRVIITRKDRLSRVGFELFEYLFQNYGTEIDVISDEMNPKTDEQELFEEIISLLHCFSMREYSHRRAERKLFEATLNQKEKTK >NC_021744.1|WP_020829066.1|714378_714879_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MIIKPLISEDEAKETSRLFQKCWQNTYKDILPDVFLDNIPENAWVKRLNESGRHNLIFIDDDNKIRAAVSYGRPRDTRMLGCGELMALYVEPDFQGFNIGKTLLNAAENELKKMGYGKIYLWCIDGDENARQFFEHFGWVNNATEKFVEIAGKEYKYLLYSHKLLV >NC_021744.1|WP_041806186.1|715089_716496_-|ISLre2-like-element-ISLhe10-family-transposase MESIIADIVKIIKSENNVIAREKALMCYFFDLIRELMTAALEEVDAGLVEETKKQGYQIEKKNKRSVVTAFGEISYWRRRYVCPGKKAQYPLDKLMGYDKYKRYSVLAVKDVLQVSAVATYRNTALAVNTLSCFKISHSQVGKLIVQAGKQIKAQQQSEERYDGITQKKKAPVLYLEGDGVVIKGTKKRLEFHRYQVCEDIINLSKTRRKRVQAKEFVSLSRLDALQEIKAYLANAYDLSDTLIISNADGGAGYAKKDFDEIVGYCRQHEHFLDVFHLNKKIKDRLGFMPAMQSKLISAVEFKYDRHLTDVILDTIESNLVDELNTPENHENLRRLRSYLHRRWVDIKPFKMRHLSVIKAIGCCESNHRKYTYRVKGQGKYWSEDGAEGILRVLTCIKNNELEYWLSSEFAGGQLDIGDQEDLKGAVRASLRKTHGVHLGIHHGAIESLTAGHSYLDDFSRKINQINI >NC_021744.1|WP_035509267.1|717767_718196_-|hypothetical-protein MINNWVSSSKELQLLVDDYLLMVNYRSVIENDLVNYTQGIESYFRNERLTLRDKINKFIEELPKSYRELLSEHVGNTDYWIGKLVSTRVFLTHGDRENMAVSNPYKLVQMTKIFGFMVRIFILQKLGITIDKPKILNKDQNV >NC_021744.1|WP_003633083.1|718404_718605_+|cold-shock-protein MQTGTVKWFNADKGFGFITGSDNKDVFVHFSAIKTDGFKSLEEGQKVSYDVEQGGRGPQATNVVPQ >NC_021744.1|WP_012211524.1|719959_720916_+|IS30-family-transposase MKWAVSNSKWESLIPRAVVVPKPLCHEKLNATAVGGAYSAVKAQQNYQQRRLKSRRLRVLENLKLRDFVLHCILQRQWSPEQIAGRLSLENSNWHISYNTIYRGIERNNLGVKRKRHGARGFARKLRHRGKTRKVKGTVNERRGRFNNVPSVHERPVSCENRTRFGHWEGDTVRGKIGRSGLVSLVDRKSRYLLSERVPKVNAKNVTQAMIDLLHTVTPKRVRTLTPDRGTEFAGYREVGKELGISVYFPDLHAPQQRGTNENTNGLIREYFSKGNDLDELTDQDIAKFVKDLNNRPHKVLVWKTPSEVFFGKKLHLI >NC_021744.1|WP_003633078.1|721033_721591_-|YdhK-family-protein MKKLVWYVCAVVAMLFLVAGCSSNSTQKEGSSTHSHSSEKTEMHEHTGSKKVHGLKKAEQPKYKAGTKVKLTADHMKGMKDANATIVNAYDSKLYAVDYKSTSDKKMVKDHKWVTINEIEGNRKEYKKGDKVTLKADHMAGMKNSSATIVEIQKGPAYMVNYQPTNGGKQVTNHKWVAEDEIEKR >NC_021744.1|WP_003633076.1|721772_722024_-|PspC-domain-containing-protein MTKKKLTKSSDKIVSGVFGGIAEYFGWDKAIVRIIGAFLIIFPGNIIGGAILYAVTALVMTDPTQGDHCDDGDSVIKGEFREK >NC_021744.1|WP_003633074.1|722069_722417_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKIQVTADLLDGLVLALLNREDYYGYALTQEMQKAISISESTMYPVLRRLKKEGYLTTYDQPFQGRNRRYYQITSDGEQHLEQVYKMWTDYKESLDQVFIPDKEHDLTHKNDIEA |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
10519 : 139803
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_021744|10519:139803|DBSCAN-SWA TTTAATCAAAGTAAGATTCTAAGGTGTCCTGAACCTGACCAAAGCCTTTGTGAATTCGGTTGAAGTAGCGGTCATTGTAACTCATTACTTGGATGCCAATGAAAGTATCAAGCGACTGTTCAGTCGGCAACTCTGCTTTGGGCTTAGCCTTGCGCTTAATGACGTTGTTAAAAGATTCAATCATGTTGGTAGAGTAAATTGAAGCTCTGATCTGCTTAGGATAATTATAGAAGACCAGCAGGTACGGCTCGATGTCTTTCAGGTTTCTTATGACATGATTATAACTCTTGTTCCATTTGGCATAGAAGGCATGCAATACATCAACAGCTGCTGCTTTATTGGCTTGCTGGTGAATCTGCTTGAATTCGTTCATAATTGCCTCGCGATCCTCCACGCGTACTTTAGCGCGGATATTACGCATGACATGAACCAAGCAACGCTGGAAATGAGCTTGAGGATAGGTCTTTGCCAGTGCTGTCTTCATGCCCACAACGCCATCTGAAAGAAAAAGCTCTGCTTGCTCTAAGCCGCGAGACTTCATGCTTTGGAGCAGCTCCGTCCAGACTTCAATGTTTTCATTGGGCGCAATGCAGTAGTCGATAACTTCCTTGTGGCCATTAGGTTTGATGCCAATGGCAATATAGACAGCTTCACGTTCAAAAGTTTCTCGGCGCAGAGGAACGTAGGTAGCGTCTAGATAAACGCAGAAGAACTTATCGCTAAGCTTACGCTTGTGATAGGCCTCTACCTTGGGGATCATCTGCTTAGAAATATTGGATACTTGAGCGGGGCTGTAATGGCTGCCATACATTTTTTCAATCAAATCAGCTATCTCTCTGGTAGTTACGCCTTTAGAGTAAAGCTTGATGATCATGTTTTCCAACACATCTGCATGCTGCTTGTAGTCAGGCAGCGTGTGCTGATGAAACAGGCCGTTGCGGTCTCGTGGCACCTGGATTTCAATTTTGCCAAACTGCGTATCCACCTTGCGAAAGTAGGTACCGTTCCTAGAATTGCCGGTATTCCAGCCGTCTCTTGCATAAGGATTATAACCTAAAAAGGCGGTTAATTCAGCTTCTAACAAGTCATTAACTGCTTGTTGTAATTCTTTACGCAATAAATCATTAATTTTGTCTTGATTGAATAGAGCTTGAGCAATATTTTTGGTAAAATCATTCATGAAGGAGTTCTTCTTTCTGTATGTTTTTTTGTTCAAACCAATCATACGAGAAAGGAACTCCTTTTTCTAATATTTTAAGAAATTAATTTAAGGAATCATTCATCCTTACACAAACTATTTTACAGTCTCTTTGATCTTGATATTAAAGAAAAAAATATTGTTTTCAAAGACTATTTCTACAAAATGATCCAGATGAAAAAGCACAAAATCTATGAAGCAGAATTGATTCAGCCTGCTTGTCCTTACTGTGGCTCCTTGGCTCTCCTGCATAATGGACATCTGGTTACCAACATTCGCTATTTAACAGCTAATGCCAGCCATCCAGCAACTATTAGACTGGCTAAGCAGCGAGTTAGATGCCGTGATTGCAGTCGCTGGTCAATGGCCTAATCAGAATTGGCAAGCAAGTACTGTTCTATTTCTAATGCCTCTAAGCTAAAAATTTTGTCTGCGTTAACTGAAGATCGTTCGATGACCAGCATTGCCAGAGAAAACAATGTTTCGATCAATACCGTCCAGAGAGTGCTGGGCAACTGTTCACACCGATTTATTGACAGCTACGAATATTTGCCAGCTCATCTAGCTTTTGATGAGTTCAAAGGAGTCGACCGCCAGCTGCACTTTATCTGCTTGGATGGCGATAATCATCAAGTCGTGCAGATTCTTAGAACTCGCTACAAGAAGACGCTGCTTAAGTATTTTGGACGTTTTTCGCCTCAAGCCAGAGCCAACGTTAGAACCGTCACGATGGATCTTAGTTTTTACTATCAAGATATCGTCAGAGCTTGTTTTCCTAATGTTCAGATTGTCATCGATCGCTTTCACATGATTCAAATGCTTACTCGTTCTTTTAACTCGCTCAGAGTTAAAGTCATGAATAAAAGATCCAGACAGTATCAGCTGCTCAAATTTCCCTGGAAGCTATACTTGATGGAAAAAATTCATCTTCGCTACAACTGGCACTATAAAGACTGCTTAACACAAGCTCAAGTAGTCATGGAAGGCATCAGTGCCAATACTGCTTTAGAGAACTCATATAACCTGATGCAGAGTTTTATTCAAGCAATTGAAACAAACAACACTCAAGAGCTTAAATCATTGATTACCAGCAAAGATTCAATTGGAACCCTAATGCATAGACGCTGCTAACTTTTAAATACAATCTAAAAGCGGTGCTTAACGGTGCGGCGCTGCCTTATTCTAATGGCTGTCTTGAAGGCTTCAACCGCAAAATCAAGCAAATCGAACGAACAGCTTTCGGCTATTCTAATTTTATCAATCTATTAACCAGAATTCGTTTAGAGGAAAATCAATATACAGAAAAAGAACCAAACAGCCTTTTAATGACTGCCTGATTCTATTCATTTACTCTCTATCAACAGGATTTGACAAAGAGCCAAAAAACAATAAATCTTGTATAAATTGTAATAAAATCTTAAAAACAGAAGCCATCAATTAGGGCTTCTGTTTCACTTAATTTAAAGTATTCTAGCCATGATATTTACTTCTTTTATACCCGGGAGTTTGACAGTTTAAAAACTTAAAATTTGGCCTTAGCCTTGTCGCTAAGCCTTTTTCTTTGTCAATCTTTTATTATTTTGGACAAGAAAAGATGATCAAGAAATTCTCAGCTGCCAAGTTGACCCCCTAAAAATAAGCAGCGCGTCTTCAATGTCAGCTATCTTTTCTTGCAGGAAATTTTCACCCAACTCGAATTAAAAAAGACCTGCCAGGATACTCAAGCTAAAACCAATACTCATTATGATTTATATGAAATACCAGCTTGACTGATGAATTACATGAAAAGTTAGACAATGAGCTGATTACACAGAAAAAGATCAAAAAAATTTTGAAGCAAACCAAAAAAGAGAAAAAGTACGCAGAAAAATTAGACTTAAAAAACCCCCAAAAAACTTAATATAATAAACTTTAGGAGGCTTTTTTTATTTCTAAACTGTCAAACTCAGGATTGTACCTTAACTAGGATTTTATTTCTAATTTTTTCGGACTCTTTTTGATGAATATCACTTAGTGTCTAAATTAATAACTTGATCAAATTTTTGTTTATCTTCAATACTCATTATATGTTCAATCTCAATAATTGTTTGAGGAAGACTTTGTAATAGAGCGAAAATTTGTTTGCGACTGTTATCATCAAGACCTGATAAACCTTCATCAACAAGTAAAAAGTCCTTTTTATTCAATAATGCACGAGCAATTTCTACTTTTCGTTTCTCTCCACCAGATAAAGATAATCCTTTATCACCAATTTGTGTGTCTAAATAATTTTTATTTGCTAAATATTCTAACTTAACTTTTTTCAAAACTTTAATTAGACGAGAAGAAGGAATATCTTTTCCTAAAGTCAGATTGAAACGTAATGATTCTGAAAAAATATAGGTATCTTGCCCAACAATTCCAAAATTAGAAAGGAAATTATTTTTATTTAACTGCTTATCAATTAAAATTTTACCTTTAATCAAAGGTAATTCATTTAACAAACTTTTAAATAAAGTTGACTTGCCAATTCCAGATCTTCCAGTTATTAAAACTTTATCTCCTTCAAAAATTTCAAAATTAATATTCTTTAATATAGCATGATTATTATATCCAAGAGTACAATGATCAAAGATAATTTTTTTTTGTCAGAAAGATTTACAAACGATAGGTTATCGTATTGTCTTGGCTCTGGCTTTTGTAATACTGTATTTTCTAATAAAGGGCGAACCGAATTCAACTGATTAGTAATATTTACTATTGAAATAATTGGGCTAGTTAAGCGATCAGATGCTAGAAAAAGTGAAATTAACCCTCCAACAAGTATTTGCCCCTTGACTACAAAAAATGATCCTACTGCTAAAGAGATAACCATAGAAAAAGTATATGAAACTTGAGCAAAAAAGTTAGAAGTATTACGACGAAAGTTCATAAAAAAATACTTTCTTTCCTCCATTAGCAACGCATTTTTAATAAATAATTTTAATCTTGTATAAGCATTAGCATGTCTAATAGTATTAAAACCATGTACAGCATCACTTATCTTTAAATTGTAAATTTCATAGCTCTGATTCCAGCTTTTAGTTCCATCTTGAATCCAATTTCTTGTGAGTCTAGGAACTGCTGCAGGTAATAAACCACAAAATAGGAAAACTAAAGCTGCAATACCATTTATATTTAGAATATATATAAGCGAGACAATAGTTTGATCAATACAATAAATCAAGGTAATGACTGAATCAATACATTGATTCTCAATTTGTTTAACATTGACATTAATGAAGTTCAATGTATTTGCCATTTTACTTTCACTAGGAGAATAGGTGAAAGTATTAAAAGCTCTTGAACGTAAAAATTGATTACTAGATTTGATAATTTTTCCCCAACAAAATTGCCAAAGATAAAAACTTATATTCAAAAAAAGCATTAAAACAAGGTATAATATGAGAATTCTAGGAATATCATTGAAATTTTTTTGAGAGAGTGTGTTAGTTATTTTTCCAATTATGTAAGGGGAGATAATCCCATCTAAGGATGCAAATGCACTAGTTGTTATCAACGTAAAAAATAAAAATTTGTTTTTAATTAGTAATTTTTTAAAGAATGAAGTAATAGTCATGGTGAACACCTTTATTCATTTCTAAGGTAATTGCAGATAGAATACCAAGCGTTCCAGCACCTATATCATCTGAAATAAAGGCTTGCCCGTCTGATGGCCATCCAGAATGTTTTTTGGAATTTATAAAGCTAGAAAATAAATGATTATTGTAGTAATCATTTAAATGCTTTAGTTTTGTGTAAAGACGCTTAGGAATCTTTTTTC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106 | Streptococcus_phage(11.11%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
280811 : 339134
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_021744|280811:339134|DBSCAN-SWA 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48 | Streptococcus_phage(25.0%) | integrase,holin,transposase | attL 317601:317616|attR 334980:334995 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
349851 : 418863
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_021744|349851:418863|DBSCAN-SWA 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57 | Bacillus_phage(16.67%) | bacteriocin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
424412 : 483079
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_021744|424412:483079|DBSCAN-SWA 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53 | Clostridioides_phage(14.29%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
498807 : 646771
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_021744|498807:646771|DBSCAN-SWA 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115 | Lactobacillus_virus(11.76%) | bacteriocin,protease,transposase,tRNA,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
659400 : 720916
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_021744|659400:720916|DBSCAN-SWA 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48 | Bacillus_phage(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
732826 : 775294
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_021744|732826:775294|DBSCAN-SWA 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37 | Streptococcus_phage(28.57%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
870619 : 916009
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_021744|870619:916009|DBSCAN-SWA 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49 | Lactobacillus_phage(16.67%) | integrase,tRNA,transposase | attL 870526:870549|attR 907572:907595 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
987128 : 1055083
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_021744|987128:1055083|DBSCAN-SWA 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52 | Bacillus_virus(33.33%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1066082 : 1109533
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_021744|1066082:1109533|DBSCAN-SWA 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34 | Planktothrix_phage(12.5%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1204535 : 1294338
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_021744|1204535:1294338|DBSCAN-SWA 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56 | Lactobacillus_prophage(12.5%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1298699 : 1356006
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NC_021744|1298699:1356006|DBSCAN-SWA 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53 | unidentified_phage(12.5%) | integrase,tRNA,transposase | attL 1302808:1302867|attR 1316840:1318026 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1374478 : 1477665
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NC_021744|1374478:1477665|DBSCAN-SWA 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111 | Lactobacillus_phage(69.81%) | head,terminase,tail,plate,capsid,portal,integrase,tRNA,transposase | attL 1374382:1374408|attR 1463058:1463084 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1482119 : 1545400
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NC_021744|1482119:1545400|DBSCAN-SWA 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52 | Prochlorococcus_phage(13.33%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1555204 : 1617559
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NC_021744|1555204:1617559|DBSCAN-SWA 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53 | unidentified_phage(14.29%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
1628152 : 1783097
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NC_021744|1628152:1783097|DBSCAN-SWA TTTAATCAAAGTAAGATTCTAAGGTGTCCTGAACCTGACCAAAGCCTTTGTGAATTCGGTTGAAGTAGCGGTCATTGTAACTCATTACTTGGATGCCAATGAAAGTATCAAGCGACTGTTCAGTCGGAAACTCTGCTTTGGGCTTAGCCTTGCGCTTAATGACGTTGTTAAAAGATTCAATCATGTTGGTAGAGTAAATTGAAGCTCTGATCTGCTTAGGATAATTATAGAAGACCAGCAGGTCCGGCTCGATGTCTTTCAGGTTTCTTATGACATGATTATAACTCTTGTCCCATTTGGCATAGAAGGCATGCAATACATCAACAGCAGCTGCTTTATTGGCTTGCTGGTGAATCTGCTTGAATTCGTTCATAATTGCCTCGCGATCCTCCACGCGTACTTTAGCGCAGATATTACGCATGACATGAACCAAGCAACGCTGGAAATGAGCTTGAGGATAGGTCTTTGCCAGTGCTGTCTTCATGCCATCTGAAAGAAAAAGCTCTACTTGCTCTAAGCCGCGAGACTTCATGCTTTGGAGCAGCTCCGTCCAGACTTCAATGTTTTCATTGGGCGCAATGCAGTAGTCGATAACTTCCTTGTGGCCATTAGGTTTGATGCCAATGGCAATATAGACAGCTTCACGTTCAAAAGTTTCTCGGCGCAGAGGAACGTAGGTAGCGTCTAGATAAACGCAGAAGAACTTATCGCTAAGCTTACGCTTGTGATAGGCCTCTACCTTGGGGATCATCTGCTTAGAAATATTGGATACTTGAGCGGGGCTGTAATGGCTGCCATACATTTTTTCAATCAAATCAGCTATCTCTCTGGTAGTTACGCCTTTAGAGTAAAGCTTGATGATCATGTTTTCCAACACATCTGCATGCTGCTTGTAGTCAGGCAGCGTGTGCTGATGAAACAGGCCGTTGCGGTCTCGTGGCACCTGGATTTCAATTTTGCCAAACTGCGTATCCACCTTGCGAAAGTAGGTACCGTTCCTAGAATTGCCGGTATTCCAGCCGTCTCTTGCATAAGGATTATAACCTAAAAAGGCGGTTAATTCAGCTTCTAACAAGTCATTAACTGCTTGTTGTAATTCTTTACGCAATAAATCATTAATTTTGTCTTGATTGAATAGAGCTTGAGCAATATTTTTGGTAAAATCATTCATGAAGGAGTTCTTCTTTCTGTATGTTTTTTTTGTTCAAACCAATCATACGAGAAAGGAACTCCTTTTTCTAATATTTTAAGAAATTAATTTAAGGAATCATTCATCCTTACACAAACTATTTTACAGTCTCCTTCTTTACCACAATTAGGACAAATTTTCTTCATTTTATTTTATACTTAATCACAAAAATATTATTATAACTACACTTATTATATCCTAATAACACTGTTTTTTTAACAGAAGTAATTTTTTAGAAAAATTTAGCAAAAAACAGTTCCAATATTTAAAAAAATAACTATAATATCATGTTAGATAATTAATATAGAAGAGGTGAATATTTTATCATGAAGAATTACACCATTGATCACGACATATATTTAATGAACCACAAAAATGGTGACGTTTTAAAAGTAACTGTCAATAAAGAAGACTCAGTTAAGATTTTACAATTATATCGGCAAGATGGTCTTGGCAATTATTATCTTGATAAAAATTCACGGCTGAAAAAACAAGATAATTTGACCACTAAAGAAGATATTGTTAAAGCAAGTAAGAAAATTGGTGGTCACAATACTCATCATATTGATAAATGGCATCATCAAGTTGTTCCTATCTACAATGCTCAACATCAAATTACGGGCTTCAAGCCGAAGTTAGTCCTTGATCACCATATTAGAATTCAAAATGCCAAAAGATATTTACGCCACTTAGATCATCATCATGTAATCTACTTGTCTACTACCAGCAGAAACACCTTGCTCAAGCCAATAAATCACCTTAAAAATGCAATTTATGCAGACCGTAACAAGGAAATGGTTTTAGCACATAAGATTCACAAATTAAGTCGATAATGAAAAACTCCTTTTAGCAGATTTATTCCAGATTTTGAATGTCCAAATACGTTTAATTTGTAAATCCTTTTTACTAATCTGCATGATTTCTTCAGATTGAGAACTATGACGCAATAAAAGCCTGACCATGTCCTAATTTAATATAAGGACTTATTTTTATTTTTGAAGCCAATCGTGTAAATTGTCCCCAAGGCAGCCATGGCAATTTCTGCATAATATAGCGATTAGGTACGTTTTTCAGTTTATAAGCAACTATATGCGCACGTGTATTATGTGAGGATTTATACATAGTTGCATACATTGAGCCATTTGAAATTGTCACCCCCTCTGGTACTGGTCCAATCATACCAGTTTGAGAGCGACCTTGACTTAAAGTGGCTGGCTGATAAAAATAAGTTTTTAACTTAAATGATCCACTTTTTAATACATGAGGCTTAGTTTCTGGAGCATAACTTGCGCCTTTTCCCCAATTACCTGAAGTTCTATAATGCTTAAACCAGCTGCTAGCACTCTTACCTGTCTGTTCAGGTTTATCTGCTACGCCAACTCCTTCTTGAGCATCCCCTCTTACTTCATGTTCACTTGCACTATTAGACAAAACTTCATCTTGGGATGCTTTAACTTTATTAGGATTTACAACTGTTCCTGTCGAATCTGTAGCAAAGTTAATTGCATCTTTCGTAGGGAAACTATAATAAGGGTTATTAACCAAACTGATCTTTTTTAACAACGCTAATTTTATTTCTTAAAAAACTCGCTGATTAAGCCAACCTGCTTTATGCCCATCAATCCAAACGAAATAATATTTCGACTTTCCCACTTTTTTTACAGCACTTGCTTGAAAATTGCCATACTTAAACGTGCGAGCTAGCCCCACACTTCCTACTGGGCCTCTATGTGTCATCCCTTGATAAATTCGATAATTACTATTACCATTTATCATCTTAGTTTGAAACGGATTTGGGCCAAACCCAAAAAAGCATCATTAAACTTATAATGATGAATATCTTCAATTTTTTCATTAATATTCCTCCAATAATAATCCCTGTTATCATTGTAAGGAAATATCTACATTAATCAATACAAAAAAAGCCGAGTTTCACAAAGAAAACTCGACTTTTTCATATATATTAAATTTTTAGTTTTCTATAATTAAGCTCTTAAGATCGTCTGATAACTTAACTGGTGCATATTTAGCACTTACCATCTTCAAAGCAGATAACTTAACATAGCGTTTCTTACCAATGTAAACGTATCTGGTCTTACCGTGCTTAACAATCATTGAAGACTTATATTTTTTACCCTTCTTGATCTTCTTTTTAGTTGCTTTGAAGTAAACTTTCTTTGATTTTCTAGTTTTCTTATAAGCATAGTAAATCTTTGCACCCTTCTTTGATTTAGGGGGTAACAACGATATACTTCAAATCTCTGTTTTGGTAAGCTTCTTGAATAGCTTTAGCATCACTTTCAGCTTGTTTTACCCAATCTGCTTGACTTGGGACTGCAGTAGCAGCAGTTACAGCGCCAGCTGGAATAAAGATCATTGATTCTTTGCCATCAATTTCCTTATTTTCAACATAATAAGCAGGAAGTTGGTGACCTTCTGAACCTTGAGCAGTAGCTGTAAATGCTACAGAATAATAAACTTGGATAGTTTGTCCTTTAGTATATGTAGAAGCAACTGGCTTAACAGATTTACCATCTTCTCCTACAGCAAGTAAAGTTGGTTTATCGCTATTAATAGTTACAGTTACTGATCTACGCTTAACGCTAACTGTACCCTTTTTATCATTTGAATTCTTAGTAGTTGTTTGAGTAGTATTAGCCGCATGTGCTGTTTGACTTAATACTGCTCCACTACCAGCTAAACTAGTAGAAAGCATTACAGCTGCAGCAATAGAAGTAAATAATTTCTTAGTTTTCATAGATTATCTCCCAATCTAAACACTTATAGTTCTATTATAACACCTTTTATATTACATACTAGTTTAGTCCTTCACAAAGTAAGTGTCAATATTTTTGCGGTAGGCTATTAACCATTAGTCTGACCTTAATTTCTTAAATATTTATTTGACTTAATTTTCTGCCGAAATCATCCAAATAGCTATGACCTGCTGTTAAGCTTTCAATGGCGCCGTGATGAATGCCTAGATGAGCTTCATGCGTCTTTCTTAGGCTGGCACGAACTGCACCTTTCAATTCAATATCGAGCTGTCCACCTGCAAACTCACTGCTAAGCCAGTATTCCAGCTCTTTGTTTTTAATGCAAGTCAGCACACGCAGAATTCCTTCGGCACCATCTTCTGACCAGTATTTTCCTTGCCCTTTGACGCGATAAGTATACTTGCGGTGATTGCTCTCACAGCAGCCAATTGCCTTAATTACTGACAAATGACGCATCTTAAACGGCTTAATATCCACCCAGCGACGATGAAGATAGCTGCGCAGGCGCCTTAGGTTTTCATGATTTTCTGGCGTATTCAGCTCATCAACCAGATTGCTTTCAATCGTGTCTAAAATTACATCAGTTAAGTGACGGTCATATTTAAACTCAACTGCACTGATCAATTTGCTTTGCATAGCCGGCATAAAGCCTAAACGGTCCTTGATCTTTTTATTCAAGTGAAAGACATCCAAGAAGTGTTCGTGCTGCCGGCAATAGCCAACTATTTCATCAAAATCTTTCTTGGCATAGCCAGCACCGCCATCGGCATTACTGATGATTAAAGTATCGCTTAAGTCATAGGTATTGGCTAAATAAGCTTTAATTTCTCGCAAAGCATCCAAGCGGCTTAAAGAAACAAACTCTTTGGCCTGTACTCTCTTTCTGCGCGTCTTGCTTAAATTAATAATATCCTCGCAGACCTGATAGCGATGAAACTCTAGTCGCTTCTTGGTGCCCTTGATCACAACGCCATCGCCTTCAAGATAAAGCACTGGCACCTTTTTCTTTTGGGTAATGCCATCGTATATTTCCT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111 | Lactobacillus_phage(12.12%) | tRNA,bacteriocin,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
1833610 : 1906473
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NC_021744|1833610:1906473|DBSCAN-SWA 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56 | Staphylococcus_phage(26.67%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_18 |
1927177 : 2003549
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >NC_021744|1927177:2003549|DBSCAN-SWA ATTATTTATCACCTGGAACTGGCAAACCCAGTTGCAAATATGCCTTGTCTGTCACCATTCGGCCACGTGGCCCAAGCAAAATAAATCCATGCTGCAACAAATAAGGCTCATAGAGTGATTCGATCGTTTCCATATCTTCACCCACATTAGCAGCTAAAGTTCTAATTCCAACCGGTCCGCCATTATAGCCTTCAATCATTGTCCGCAATAAACGACGATCAGTTTGATCTAATCCCTCATCATCAACTTGAAGCTGCTTCAATGCACCTTCAGTTGTAGCAAGAGAAATTGTCTTTTCACCTTTAACTTCGGCGAAATCACGAACCCGCTTCAAAAAACGGTTGGCTACACGTGGCGTTCCCCGTGAACGACGAGCTAGCTCATGAGCTGCTTCGGGTGCAATGGAAGTATGGAAAACATCGCTTGATCTTTGGACAATCTTTTCAAGTTCATCAATTGTGTAGTACTGCATGTGTTCGACAATACCGAATCGATCTCGCAAAGGTGCGGACAATTGCCCAGCCAAGGTCGTTGCCCCAATCAAAGTAAATGGTGGCAATGGCACATGAACGGCATGAGTAGTCTGTCCTTCACCAATTACAATATCAATATAATAGTCTTCCATTGCAGAATACAAAACTTCTTCAACAGGCTTAGCAAGACGATGGATTTCATCAATAAACAGCACATCCCCTGGATCAAGGTCTGAAAGCAGAGCTACTAAATCGCCTGCTTTTTCAATTGCTGGACCACTTGTACTCTTTAAATGCACACCCAGTTCATTTGCAATTACAAAAGCTAAAGTCGTCTTACCTAAGCCTGGTGGTCCATAAAGCAAGACATGGTCCAAAGCCTCATCACGCTGTTTTGCGGCTTTAATATAAATGGACATTTCCTTTTTAACCCGTTTTTGACCTAAATATTGATCTAAAGTTTGGGGTCTCAAAGATAATTCCATTGCCTCTTCTTCAGAGTTTTCTACTTCACCTGAAGTTACTGCATCTTCATTTTCTACCATCAGTTTCACTTCCTTACTTATTATCAATCTTTACCATTATAACAAGATCTACTTCTTAAGCAGTAATGCCAAGCCTTTTTTAATATATTGATCGGCTGTATCCGCATTAACTTCTTCAAGCTTAGGAGTAATTCGATCTAATTCTTTTTGAGTATAACCCAAGGCAATCAACGCTAACAAGGCATCATTCAATGCTGGTGGGATATTTCCTTGTTCTTCATCTTGACGATCAAGTCGAGCAACATAATCGCGTAGCTTGCCCTTCAAATCAAGCACAATCTGAGAAGCCGTTTTTTTACCCACACCAGGGAAACGAGTAAGATACTTAACTTCTCCCTGCTCAATTGCTTCGGCCAAAGAATTGGCATCTTCAGCTGCCATGATAGCCAATGCGCTTTTAGGGCCGATCCCACTAACGCTTAACAGCTTAAGAAAGAGCTCCTTGTCATCTTCGCTTTGAAAACCATACAAGGTAATTCCCGTATCTCTTACAACTTGTTCAATAAAGATTTTAGCTTTATCTCCCTTTTGATAGGCGAAAGGAGTTGGACTATATACCTTATAACCTACACCATTTACATCAACTACGATATAACTAGGCGTAATGACTGTAACTATTCCTTCAAAATATTCGTACATTTATTCACCTTTCTTGAACATTTTTCTTAATTCATTTTGACTTATCCGCACTAAAATAAGGCGACCATCTGCATCGTGATACGGATCGGACGTTTTACGCAAATCTGTGATAATTTGTGTACCTTCTGCAGCGGATAAATTAATTTTGCCTTTAACACTGCGTTTTGCTTCTAAAGCTGCCACTCGTTTAAATAAATTTTGTGTTTTGCCTTTATCAAGATTTAAATAATTATCCAAAATTTCACGAATGGATTCTTCAACATGATCGTGGATCCAGGTAGGATATGAGCGCACAATAAAACTATTTTGACCAAATTCATCTAAATATATACCTAGCTGTTTAATTTGATAAATCTTATCCTTAATTTGTAGAAAATCTAAATTGCCAAATTCTAAAACAATCGGTGTCAGTAAGCCTTGTTGAACTATTTTTTTAGAGGTAATAGTTTGATAAATCTGTTCAAACTGAAGACGTCTTCTGGCTGCCACTTGGTCAATCAAATACAAATCGCCATCATTTTCAGCTAGCAAATATGTATCAATTTTTCCCACATAAGCAAGACGCGGCAAATTATTAGCAAGAGTTTCATCCCCAGTCGAAATAACTTCTTGATCCACCTTTTTATTGCTAAATGGCATCAACTTCTGCTGCAAAGCAACATTCTTATCCCAAGTTTTAGTAATGATATATTGATCATCTTCCCGAGGAATATTGATATCCACATAGTTATGCTCAGTTTCGTTCTTAGGCTCTTCAGAATTTTTAGCTTCTTGTTTTACTAAAAATTCTGGCTTTTCAGCTTCTTCATGAACTTCTGGCGTTTTACGCGTTGTATTAACAACATCTTGATTCAAGTTGAATTCTAATTGATCAACTAGAGTCTCACGTTTATTTTCTAAATTGGCAAAACCACTGCTTTGTTCAGTTTTGTCTAGCAAAGCATCGCTAATGGCACCAGTGATCAAACGACTGAGCTCTTTTTCCTTAGATAAACGAACCTCTTGCTTGGTTGGATGGACATTCACATCCACTAGCATTGGATCAACGTGAATAGCGATCACAACGATTGGATAATGACGCGCTGCTAATTTTGAGCCATAACCATCCATAATGGCATTATTTAATTGAAAGTTCTTAATATAACGGCCATTCAATAAAACCGAAATAAAGTTGCGCGTAGAGCGTGTTAATTCAGGCTTGGACATTAAGCCTGTAATCTTAAAATCGCTATCTTTTGCTTCAAAACTTTCCATTTTTTCAGCAATATGTCGACCGTATACATTGGCGACTGTTTGCTTCAAATTGCCATTGCCAGTTGTTCTGAATAAAACTTTGCCAGTATTCGACAAGGTGAATGAAACATGTGGATAACCTAATGATAAACGGTTAATGATATCCACAATTTTCATAATTTCGGTCCGCGGACTACGCAAATATTTTAATCGAGCAGGCGTATTAAAGAACAAATCTCGAACTGTAATTTTAGTCCCCTTTTGTGACGCTGCATCTTCTTGGCCCTTTTTACTGCCGCCACTAAAGTCCGCCTTAATTCCAATTGCATTTTCTGTAGCCGTTACAATTTCAACATGGCTAACAGCGGAAATTGAGGCTAAAGCTTCACCGCGGAATCCTAAAGTAGAAACTTTAAACAGATCATGCTCATTGCTAATCTTGCTTGTAGCATGCCTAGTAAAGGCTAAATCTACTTGGTCACGTGCAATACCAGTCCCATTATCTTGAACTACGATTTGCTTTAATCCGGCATCAATAAAATCGACTCGAATTCTAGTTGCACCCGCATCTAATGAGTTTTCCACAAGTTCTTTAACTACACTAGCAGGACGCTCTATTACTTCACCTGCTGCAATCTGATTAGTTAAATTTTCAGATAGCTCGTGAATTTTAGCCATTATTTATCATCCTTCAAGTCTTTTTGCCAATTAGCCACCATTTGCATAATCTGCAGTGGTGTCTTATCAGCTAAATAAAGATTAGAAATATCATCCAGCACCTCTTGTTCCGCATCGGTCATTGGACTGTTTTCACTATCGTTATCATCCACTTCATCAGAAGCAGCTTCCGGTTGGGCAAATAAATCTAGCTGTTGGCTAACTGGAGCCAATTCACTGCCTTGTGCTTCTAGACGCTTTAGCAACTTAGTTGCTTCACGTAAAACGGTACGTGGCAAGCCAGCAAGCTGTGCAACATGGATACCATAACTTTGATCAGCAGGACCTGGCAAAATCTTGTGTAAGAAAATTAACTTACCGTTTTCTTCAGTTGCACCAACATGGATATTTTTCAAATAATCCAGCGTTTCATCAAGACTTGTTAATTCATGATAGTGAGTGGCAAAAAGTGCTTTAGCTCCTACTTTATCATGCAGATATTTAACAATTGCACCTGCTAAAGCCATACCGTCATAAGTAGCTGTACCACGTCCAATTTCATCGAATAATACAAGACTGCGTTTAGTAGCATATTGCAAAGCATCATTTGCTTCACTCATTTCCACCATGAAAGTACTTTGACCAGAGATCAAATCATCGGCTGCACCAATACGGGTAAAAATTTGATCAAAAATAGGCAAAGCAGCACTATCAGCGGGAACAAAAGAACCAACTTGGGCCATAATTGCAATTAATGCCATCTGCCGCATATAAGTACTCTTACCTGACATGTTTGGTCCAGTAATCAAAAAGATATTTGTAGCAGAATCCATCTTCACATCATTAGGAATGTATGAACCTGCAGTCATTACTTTTTCCACAACCGGGTGACGGCCATTAACGACATCAATGTCTTGACTATCAGTATGGAAAGATGGACGACAATAATTATTTTGTTCAGCAACTGTAGCGAAGCTACAATAAACGTCCAAGGCAGCTAATTGATTGCCTAATTTTTGCAAAGCAGGAATGTACTTCTTAACTTCATCACGCAATTGAACAAATAAATCATATTCCAGATCAGTTGAGCGAGTTTGAGCCTCTAATATTAGATTTTCGTGTTCTTTTAACTCTGGGGTAATGTAGCGTTCGGCATTAGTTAAGGTTTGCTTACGAGTATAGCGATCAAGAGGCACCTTGCTCTTGTTACCATTAGAAACCTGAATATAATAACCAAAGACCTTATTGAAACCTACTTTTAAGTTTTCAATTCCTGTCTTTTGACGTTCATCAGTTTCCATTTGAACCAGCCATTTTTTACCATTATTCATGGCATCCCGATAGCGATCAAGCTGTTTATCCACACCATCTCTGATTAATCCACCTTCTGTAGTTAAAAGCGGTGGATCTTTTACTAAAGTTGTAGAAATTAATTCAGCAACACCCTTTAAAG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63 | uncultured_virus(11.11%) | integrase,tRNA,transposase | attL 1928303:1928319|attR 1976570:1976586 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_19 |
2057731 : 2149970
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >NC_021744|2057731:2149970|DBSCAN-SWA 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76 | Lactobacillus_virus(13.64%) | tRNA,bacteriocin,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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