Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_021733 | Acinetobacter baumannii BJAB0715, complete sequence | 4 crisprs | DEDDh,RT,csa3,cas3,WYL | 0 | 0 | 8 | 0 |
NC_021734 | Acinetobacter baumannii BJAB0715 plasmid pBJAB0715, complete sequence | 0 crisprs | PD-DExK | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_021733_1 | 1689510-1689673 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021733_1
|
3 spacers
spacers of NC_021733_1
>1.1|1689533|37|NC_021733|CRISPRCasFinder GCCAGAATCTTTTTGATTAGATCCTTGTTGTTGGCCG >1.2|1689593|16|NC_021733|CRISPRCasFinder CTGGTTATTTTGTTGC >1.3|1689632|19|NC_021733|CRISPRCasFinder ACCGTGTTGCTGTTGATTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021733_1
The CRISPR arrays of NC_021733_1 >merge|NC_021733|1|1689510-1689673|CRISPRCasFinder TGGTTGTTATTTGAGTTTTGTTGGCCAGAATCTTTTTGATTAGATCCTTGTTGTTGGCCGCGGTTATCATTTTGCTGTTGTTGCTGGTTATTTTGTTGCTGTTGATCGTTTTGCTGTTGGTTACCGTGTTGCTGTTGATTACGGTTGTCATTTTGCTGTTGTTG >NC_021733|1|1|1689510-1689673|CRISPRCasFinder TGGTTGTTATTTGAGTTTTGTTG GCCAGAATCTTTTTGATTAGATCCTTGTTGTTGGCCG CGGTTATCATTTTGCTGTTGTTG CTGGTTATTTTGTTGC TGTTGATCGTTTTGCTGTTGGTT ACCGTGTTGCTGTTGATTA CGGTTGTCATTTTGCTGTTGTTG
>NC_021733.1|WP_000132045.1|1689076_1689394_-|hypothetical-protein MTDQNTDHAQLVAGDHNYSDSRWRESYLTRPYYQEAQLTTPDLDYDRDFSAAYELGHRARSESKEGTQFEDMEGSLQQKWEELKAESRLKWEHAKQAIKDAWDDM >NC_021733.1|WP_000498477.1|1688770_1688992_+|hypothetical-protein MFVYFTDGTCINDSEIYGVKAKYEQNKYVVEVTIKPTHVLATTPSVQFKKEVFDDPNLANQYLSHNFNMPPFF >NC_021733.1|WP_001136759.1|1688254_1688683_+|hypothetical-protein MPQYLKIAEKIYQNVKEKKGFTDDPMEDLNNLMIELRQEIKGTKLKLLYNYIDFAEILIKPLQESKIKLDLSLIPKSKNTQEFVLWLAGFIERITTGGQEKLPPIRAKITLPAYAYEETYPSQKKPVNNGEEIIEYFKKNQS >NC_021733.1|WP_000251635.1|1687841_1687985_+|hypothetical-protein MVRIFCAVSMVLAIAMGMSACQDRNSKNDGMHEASDPATSHDMNKNS >NC_021733.1|WP_001984002.1|1686582_1686873_-|hypothetical-protein MFFLYRFVLVSLLTIGVLNLMGCRPMSKNEFNTRCVWAGHDLSACNCIYNSLEQHYSPQFVESLPKLSLQNIDAKMNFVETMNQTMQQCQLSASKH >NC_021733.1|WP_000119785.1|1685675_1686581_+|LysR-family-transcriptional-regulator MSYFDINRSGELAIFIRVVELGSFSAVARACNMTPSAVSKLISRLEKRLGVRLLNRSTRQFQLTSEGCQFYEQGIQILNDLDELEQSVTANHIPKGRIRIHTSFSYWTHFLLPCISLFNQRYPEIELEAHLSDEVINLVEQRIDVAIRTGPLKSSNLVARSLGSTYKHYVCSPVYIEKYGCPEHPDELHEHQLLDVSYQRQNKTWLFKKATQEISLTPSKVLKVNHGEAILQLALAGAGIAQLNEFQIRNALQQKQLVKILEDWNIHASEEFHAVWIGHDKYVPNRVRTFLDFLVEHASIN >NC_021733.1|WP_020753041.1|1684325_1685564_-|SGNH/GDSL-hydrolase-family-protein MKLYQATLFSLVLITSFAQADVEKSQWITTWSASPQKVWNKDFVFPTLIPEQVSNQTIRQMSKISLGGEAVRLVFTNQYGKQPLYIDQTTIGLANAATLKSKSTYPVYFSGQLKARILPGKQLISDPIQLPVPDHAQLVMNSFIQKSTTFKTFHWDAKQTSWLISGNQTTNLTTPTDAKTTTARLLLSAIEVKPKQKAHVVAVVGDSITDGATATLDANTRWTDFLAKRLSAHRVAVINSGISGNRLLTDGMGDSVLKRLNSEIFQYSGVKTLIVLVGINDISWPGTAFAPKQQIPSFEALTQGYRHVVSEAHKHNIQVIGATLLPFSGALPNTPLDNYYQPNKDQLRQRINHWMRTSHTFDGVLDLDKGLKDPKHPNRLNPIYDSGDHLHPNDRGNQHMAELVDLDQIIKN >NC_021733.1|WP_086225857.1|1682996_1684280_+|DcaP-like-protein MKILNTTIQKSLLAVSVTLLMSSAFAGQVNPEIEQLRQEIKELRAMLQTNMEAQKSLAQKRVEQAAPVVTQAPQPIQQTLTKSGAEFNLYGYIRADASYQIKGASTMYNNISGVPLENTPEESAQKDQLHSTVYVTRFGLNFKTPTAVGDVGGKLEMDFFGAATRDQFRIRHAYLTFDKWLIGQTWSTFIAPEYYPETIDAGTFVGSALLRSPLVRYSDNLTANTSFAVSVEDPKYTAATDPDNKMRLPALVGRLNHKFANGSMLSGRSFVAEKRTNNDSEWAWGVGLGGKYQITPDTLLKADYYHVKGDGRFLLWSNSGYAIDDQNNMHSNEFDTVSLGITHQFTPQIRSTLGYGYMKAKDDNRFAELQRTSTTQNKQLWQGWVNALYNPYKPITLGIEYVYGERETFDNRNGIDNRFNMIASYDF >NC_021733.1|WP_001029900.1|1682081_1682753_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MAKDFNSPKVVEGYDAHIRKLIPGYEVIHQQVDAILQSVLRPDAHILIVGCGTGYELEYLLKRHPNWQFTAVDPSLTMLQKAQEQVEILGKSAQVTFVHGETSALPLESCFDAALSILVAHFIADDIKPAFFKDIYKRLKEKAPLLTYDLMTCVNPQQLQALHYLCLAQGLTEEQCQKMLERMAEDFFSLTTEGYIKLLEETGFESVQPYTQILTYQGFIAKK >NC_021733.1|WP_001183735.1|1680330_1682025_+|AMP-binding-protein MQQERLSYASGPSTQPLLGMTIGEQFDQACQQYAEKEAIVSFHQNRRLTYKALQDEVNAFACSLLKLGLKKGDRLAIWSPNCVEWTITQFAAFKAGIILVNLNTAYKSHELEYVLNKVSCKGLIIASQFKTTDYQELLTKIAPELTTCIDKVLSSERLPHLKFVIKIDDQQHTGIYRFSDLLTTPTSEQLEQLKQLARQLQFDETINIQFTSGTTGNPKGTMLTHHNILNNGYFVGEGIRLTPQDKVCISVPLFHCFGMVMGNLACVTHGATMVYPSAVFNPLETLKAIHQERCTAAYGVPTMFIATLEHEQFNDFDLSSLRTGIMAGSPCPREIMQRVIDRMHMSEITICYGMTETSPVSVQSSVNDSIDKRVSTVGHVHPHVEIKIVDLEGQIVPQGTLGELCVRGYSVMAGYWGEEEKTREVIDAAGWMHTGDIAEMDQDGFIKIKGRIKDVVIRGGENLFPKEIEDFLYTHPDVSDVQVIGLPDAKYGEELCACIILHEHHQVDEDSIRQFCKEHISHNKVPRYVRFFNEFPMTASGKAQKFKLQEIMRAELNLTGNVFD >NC_021733.1|WP_000482091.1|1690005_1690485_-|CinA-family-protein MFNKCCELLAKEKIKIAFFESASAGYLAYRFSLSPYSGDILIGSLVSYDLRVKENTLHISEELIEKYTAESMQVTVEMINKGKELLHADLYVACTGLLKKGGSETPEKPVGTFFYSIYYKNNFYNFRRVLRGPAFLKLRKLIYYVTQDIKLIILEDKRR >NC_021733.1|WP_001145679.1|1690800_1692210_+|iron-containing-redox-enzyme-family-protein MPVVVKKRLLDLLQDNQQNYYELFVFFLDPDVSSFEKEKKARDFLAKEIDKLEMKEIDFPSDINLIKAWCENDNKKNCQEFQAYLNRRQSGQDREYFKNVAQAFEFLIKVSPTKKVDGAWLYSSVHYWNDPIFHELIITYLEELGLGEPKANHVCIYDDLLRSLGLDSFDLLLEDEYYHQAVVQLALGYAPSEFIPEIVGFNLGYEQLPLHLLISNYELAELGIDSKYFNLHITIDNIDNGHAYKAIKVIEDIYNKYRDKELFLTKLKRGFALNNHGVSSSNIIKNLNTEDFVHRIFKRKALVGQLIHNETRQFGCKTINQWLSNPDDIAGLITHLTEHKWIKFNTDPEQSVFWRMINEENGKMFGVFNPVERQIIHDWIAGSDHSSSFLAYSRELKNSQRIQDYLFSYISDGELDALQERVQQSSDLAIKICKLTPFLAPDSHHKSIGLWSTRKYVELLFPYLGTFKN >NC_021733.1|WP_085941324.1|1692264_1694409_+|catalase-HPII MDMNDNTKSTNKTSEMAGADAANKANTTQKTEQLDTVRDDATNEALTTNQGVKIADNQNSLRAGIRGSTLLEDFILREKITHFDHERIPERIVHARGVGAHGYFQAYEGNERLTKAGFLTDPTIQTPIFVRFSTVQGPRGSADTVRDIRGFAIKFYTQEGNFDLVGNNAPVFFVQDGIKFPDFVHAVKPEPDTEIPTGATAHDTFWDFVSLVPESAHAVIWAMSDRAIPRNLRSIQGFGVHTFRLINAEGKSHFVKFHWTPKQGLSALVWDEAQKLAGKDPDFHRRDLYEAIEQGFYPEWELGVQIVEEEDEMNFDFDLLDPTKIIPEELVPVTPIGRFVLNRNVDNFFAETEQVAFCPGHVVPGIDFTDDPLLQARLFSYTDTQLSRLGGPNFHQIPINKPVCPFHNNQRDGIHQHTIHKGQAAYQPNSIDGNWPVETPPAASNGGFESYPEKISGHKLRQRSETFSDYFSQPRLYYKSLAPHEQKHVVDAYTFELSKVQRKHIRERQVQQILANIDLDLARQVGANLGIEVPDLTLNYKKTAVEKSAKLSFLAFPPEDIQGRKVAVLIHNMVKSDALEAIKNWAIKEGVILHLLAPSLAPVKDHKDNVIVADGMQMSEPSIAYDAVIIPDGDNLNTVMQDGVARHYLLEAYKHLKPIVFLGNKSDLLEPLGLVADEGTLIEDEFQHVAEKFKNLIKAHRVWSREQIAAHVPA >NC_021733.1|WP_020753042.1|1694463_1695342_-|SDR-family-oxidoreductase MENTTNQYPSEVPAQVQPHQPGDQEKMHPEPEIIKASHKGSEKLKGKVAVISGGDSGIGRSVAVLFAREGADIAVLYLEEDQDAEITKQLIEKEGQQCLLLKGDISDPDLAKQNIDKVLQHFGKINILVNNAGVQYQQKEIESISNEQLEKTFKTNIFAMFYLTKEAIPYMEEGDSIINTTSITSYQGHDELIDYASTKGAITSFTRSLSNNLMKQKKGIRVNGVAPGPIWTPLIPSSFDAETVEKFGKDTPMGRMVQPSEVAPAYLFLASDDASYITGQVIHVNGGQIVNG >NC_021733.1|WP_000983630.1|1695483_1695897_-|hypothetical-protein MMQPTHTHSTLQYIHISVPEILLSNIQIKNSWQDYNQEWSYRLDPPHASHPFQRDLYIIKSKNIETEDIKKLLDNIVVKNNKNKDDLKNIVEAETVIKEILDLSNYIPIENWLNDTGNRSIIESMIDKNKVKLLDII >NC_021733.1|WP_020753043.1|1696381_1697425_+|general-stress-protein MANTRYEDDNNSSGTSNRGFASMDPERVREIASKGGRAAHASGNAHEFTSEEAREAGRAAHASGNAHEFTSEEAREAGALSHKNDDRNGRGRSRYDDDDEDDDRGRSGGRGRGRSRDDDDEDDDRGRSGGRGRGRSRYDDDDEDDDRGRSGGRGRGRSRYDDDDEDDERGRSGGRGRGRSRRDDDDEDDDRGRSGGRGRGRSRYDDDDEDDDRGRSGGRGRGRSRRDDDDEDDDRGRSGGRGRGRSRYDDDDEDDERGRSGGRGRGRSRRDDDDEDDDRGRSGGRGRGRSRYDDDDEDDDRGRSSGRGRGRSRRDDDDDDDDRRGRSDGRGQNSRNQKRDAYGRFTS >NC_021733.1|WP_085940413.1|1697538_1698629_+|IS4-family-transposase-ISAba1 MTHLNELYLILNKYLKWNKSHLKCFALIMLVIILKQTCNLSSASKALPIKCLPQSFYRRMQRFFAGQYFDYRQISQLIFNMFSFDQVQLTLDRTNWKWGKRNINILMLAIVYRGIAIPILWTLLNKRGNSDTKERIALIQRFIAIFGKDRIVNVFADREFIGEQWFTWLIEQDINFCIRVKKNFIVTNHLGKNHKISDLFRHLKVGQIECRKRRILVGRVKLYISALQLENGELLLVVSPQFNANAIQDYALRWEIETLFSCLKGRGFNLENTRLTDPRRVKKLIAVLAISFCWCYLTGEWQHDQKKAIKIKKHGRLSMSLFRYGLDYVQMAIQRLIGFGKKEEFKEILAILRRQNPDRIRVL >NC_021733.1|WP_020753044.1|1698674_1698911_-|hypothetical-protein MKNQRDAVLGYADEQHAYYIRLIENDAVLGESYGIFCENPESEAAENIMTTLFLKKSFWLNGSEFTDIVKGLHPLTHS >NC_021733.1|WP_001124837.1|1699193_1699805_+|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit MPKKKEFEHGGARENAGRKAQFNEPTKVIRVPESQVNFIKNWLLNNVKTDNQTDFTSKLKIQQIHPNNDKIYHIPLATERVAAGFPSPAQDDIEQALDLNEYLIRNENATFIVKANSLSMLDAGIDIDDPLIVDRSIPAKSGDIVIALIDNDFTVKRLMIDTQFQPPKVWLKAENPDYQNIYIEEGQELVIWGVVTYNLKRMR >NC_021733.1|WP_002048382.1|1699875_1700487_-|LysE-family-translocator MAFNIFIAFWSVSILFIITPGADWAYAISAGIKGKVVVPAVAGMLFGHFITILLVAAGVGLLVANNPTALMILTVAGSAYLLWMGINLLLTPPTPNQSGSEKAQSWLSWATKGVYVSGLNPKVFLLFLALLPQFIDTTASWSVTTQILAFGVVHMISCAIIYLMVGYGSEAILKTRPQAAQLVGRFSGGLMVVIATCLLIGQI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_021733_2 | 2018555-2018656 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021733_2
|
1 spacers
spacers of NC_021733_2
>2.1|2018579|54|NC_021733|CRISPRCasFinder TCCTGAGAAGCGACTAAAGCTTCGCAAGAAGACGAGAACTATGTTCGAGTGGAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021733_2
The CRISPR arrays of NC_021733_2 >merge|NC_021733|2|2018555-2018656|CRISPRCasFinder GAGGATAAACAAAGCAATGCTTTGTCCTGAGAAGCGACTAAAGCTTCGCAAGAAGACGAGAACTATGTTCGAGTGGAAGAGGATAAACAAAGCAATGGTTTG >NC_021733|2|2|2018555-2018656|CRISPRCasFinder GAGGATAAACAAAGCAATGCTTTG TCCTGAGAAGCGACTAAAGCTTCGCAAGAAGACGAGAACTATGTTCGAGTGGAA GAGGATAAACAAAGCAATGGTTTG
>NC_021733.1|WP_000465452.1|2016201_2016897_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MFFKQFFEKESSTYTYMLGCEETRVAVLIDPVASDIEIYAKELEQHQFTLIYTLDTHVHADHITAADLLRERFHCKSVLHRNSDVSCGDILITDGCMLKVGNLSIEARYTPGHTNACTSYLVGNMIFTGDALLIDGCGRTDFQQGSAGTLYDSIHKQLFSLPDETIVYPGHDYKGRLSSTIGYERLNNSRLGQNRSREDFIELMNNLNLPYPKQIDKALPANQACGSISQL >NC_021733.1|WP_002126138.1|2014738_2016010_-|sigma-54-dependent-Fis-family-transcriptional-regulator MAKLNFELEQDFYILFEQLKALFPNAILFLVDTSTQAIHYKFNTDDISVESMAALTQDHHNQYLEINTPKMRRRFIYQEHDIYIAEHRIIGKLHILQPVSIENDIVDGVELTEQLQDLAKVFNSCSPEMTRMFSIIQRVAITEFPVLVRGESGSGKELVAKAIHDYSQRKNKIFVAINCAALNSNILESELFGHVKGAFTGAIRDHKGVFERAAGGTLFLDEIAEIPLELQAKLLRVLETGEFTPVGGEKPIQANVRIITATHKALREEAKAGRFRHDLLYRLRVIPIFIPPLRERKVDIPLIVDQILKESSTQLDTMPRHVNQKAMQVLLNYDWPGNVRELKNTLLYALTMANGKDEIEVEDLPNELLNADDYVKLPETNAELSPENVQAALEKYNHNLNMVANIFGISRTTLWRYRQKHKL >NC_021733.1|WP_000637000.1|2013757_2014669_-|bestrophin MIVRDKSNVFKLLFAWKGTILPKVLPALSFVVLISACVVWLSYYHWIQIPTVPAIGFTIFGVILSICTGFRNNACYDRWWEGRKLWGALIANARHIVRDSHVLSNEQREHLIHQVLIFCNLLRDRLRQQTVEPTKFLEHAYLNNSSLNYLNEHINAPQFVLENIQKDLVKALKDGEISDIIYGTLTRHIVELGNIQAGCDRIAGTPLPYSYSVLLHRAVYCFCFILPFSLEAALGIWTPLIVGLIAYMFLGLDALSAQIEEPFGLQENDLPLDSIVRLIERESLSSLGQPLPPIIEAQNNNLL >NC_021733.1|WP_000642319.1|2012651_2013710_+|2,3-butanediol-dehydrogenase MKAARFYDRGDIRIEDIPEPEVTPGTVGIKVAWCGICGTDLHEFMEGPIFIPPCGHPHPISGESAPITMGHEFSGVVYAVGEGVDDIEIGQHVVVEPYIVADDVPTGPGDNYHLSKNMNFIGLGGRGGGLSEKIAVKRRWVHPISNKIPLDQAALIEPLSVGHHAYVRSGAKAGDIALVGGAGPIGLLLSAILKAKGLKVIITELSAKRKEKAKESGVADYILDPSEVDVVSEVMKITNGDGVDVAFECSSVNKVLDTLVAAVKPTGVIVIVSIWSHPASINVHSVVMKELDVRGTIAYVNDHQETIKLVEEGKINLEPFITQRIQLDDLISQGFETLIHNNESAVKIIVHP >NC_021733.1|WP_020753118.1|2011836_2012622_+|acetoin-reductase MVKGLKNKVALVTGAAQGIGRGIALRLAQEGAHIELVDMKQDRLNDVQQEIQALGVNASTFIADVSDREQVYAAINHAEQTLGGFDVMINNAGIAQVQAIADITPDEFQKIVDINIGGVLWGIQAAAAKFKQREHKGKIINACSIAGHDGFALLGIYSATKFAVRALTQAAAKEYASHGITVNGYCPGIVGTDMWVEIDKRFAEITGAAIGETYKKYVEGIALGRAQTPDDVAALVAFLASEDSDYITGQSILTDGGIVYR >NC_021733.1|WP_001271394.1|2010406_2011810_+|dihydrolipoyl-dehydrogenase MSAAQFDLIVIGAGPGGYVAAIRAAQLGLKTAIVEEQHLGGICLNWGCIPTKALLAGAELATQFKHAGQFGFQVSQLDFDVQKLVQHSRQVSAQLVQGIDYLLKKNQVTVFNGRAQLTAKEKIEVTDAQGNSQVLSAPHIILATGAKARHVPQLPVDGTYVWSYKEALVPEQLPKSLLVVGSGAIGSEFASLYQDLGCQVTLIDLAKQILPTEDAEVAQFVRKQFEQKGMKVITDAVVQSIQIENEQVHCVVETANDVQTLVFDRVLSAIGVQPNTTGLGLERLGVELNPQGFVAIDDYCKTNVAGLYAIGDVAGAPCLAHKASHEAMICIEKIAGVANVHSLDRSQIPGCIFTHPQVASIGLTENAAKAKNLPIRIGKFSLTANGKALAIGDASGFVKTVVHAETGELLGAHMVGHEVTEHIQGFAIAKYLEATDESLAQVIFPHPTLSEAMHESILASMQRAIHM >NC_021733.1|WP_001289733.1|2008860_2010396_+|2-oxo-acid-dehydrogenase-subunit-E2 MSEIKTLEIPKWGLSMEEGTIAQWLIKEGDSFNKGDEICEIETTKIVNVLEAPFAGTLRKILAKDGDTLPVGGLIAVCADSEVSDAEIEKFIASLGGSAAQAPEAPSEQSKAETSAPVAEKTAQPQTAAASASAPAKVAKDDYAVPESLQGYQTSNELFATPHALKLAEKHNVNLAKVTGSGREGRISVQDIQKAVQASGGQWPDVRQQTQAKVVKSTADDSQVLATPVARRLAKQWGINLNDCRVSGTRGRVCKEDVEAVYYRNNPVSVSEQPVQCAAQPQSTVTTVAMNGMRKAIASRLQAAKRNAPHFRLVVDLNVEALQKLRKQINETVPQVKLSINDMLIKAAAAALIKVPEVNVQFDEATQSILQFSQADISVAVAIPNGLITPIVKAANQKSLAQISDDMRDLATRAKTGKLQPDEFQGGSFSISNLGMLGIKQFDAIINPPQGAIMALGASESRAVVENGNVVVREIVTATLSCDHRVIDGAVGAKFLASFKQFVENPALILV >NC_021733.1|WP_001133053.1|2007839_2008859_+|alpha-ketoacid-dehydrogenase-subunit-beta MPNKSFRNAIKEAIESEMRRDPTVFVVGEDVRGGHGGKNTEENQLEGFGGVLGVTKGLWTEFGSERVIDTPITESAIIGMAAGAAATGLRPVADLMFMDFYGVCHDMLYNQAAKFRYMFGGKAKAPMVVRGMIGAGFSAAAQHSQSPYNVFAAVPGLKVVVPSSPYDVKGLLIQAIRDDDPVVFCEHKMLYDIKGEVPDDAYTIPFGVANYTREGTDVTIIALGLMVHRANEVADKLAKDGISVEVVDPRTISPLDEEGILESVASTGRVVIVDESAARCGFGHDVAALIAQKGFHYLKAPVELVTPPHTPVPFSPVLEKEWIPSVERIEQAVRKTLEA >NC_021733.1|WP_004841245.1|2006863_2007826_+|thiamine-pyrophosphate-dependent-dehydrogenase-E1-component-subunit-alpha MQLTEEQLLAAYKRMRDIREFEDRLHEENTNGDIPGFIHLYSGEEAVAVGICENLTDKDYITSTHRGHGHCIAKGCDIHAMMLEIFGKDDGLCRGKGGSMHIADLDKGMLGANGIVGGGPPLAIGAALTAKTLKTGGVGLSFTGDGGSNQGLTFEAMNMAVVLKLPVIFVFENNGFGEGTGHDYAVGSKDIAGRAAGFGLPAVKVDGTDFFAVYEAAQTAIDRARRGEGPSVIETITNRFYGHFEGDPGLIRSKEEVEFIKENKDPLKIFREKVKGKIDEAKLDEIDAASKANVDDAVAKARAAAYPKPEQLLTDVYVSY >NC_021733.1|WP_000364551.1|2005512_2006499_-|lipoyl-synthase MDLKRQIETGIKLRGIDKVSRIPIKILPTEELPKKPEWIRAKITDFEEIQRIKNLLRQQKLHSVCEEAACPNLPECFAGGTATFMIMGDICTRRCPFCDVAHGRPMPLDENEPKHLAETVANLNLKYVVITSVDRDDLHDGGAAHFVKCIEEIRNRCPDTLIEILVPDFRGRLETALSTLSLSPPDVFNHNIETVPRLYKAMRPGSDYQHSLNLLKRFKKYCPDIKTKCGLMVGLGEIEAEVIALLNDLKDHDVDLVTIGQYLQPSKSHAPIHRFVNLQEFERYTQHGQRLGFKNIWSAPMVRSSYFADRQYFGESAPKPFSREDVLS >NC_021733.1|WP_000925651.1|2018756_2019548_+|sulfite-exporter-TauE/SafE-family-protein MLLLVVEGIVIGFLLGLTGAGGGILAVPALMTSQGWSVAQAAPIGLLAVALSTLIGTIEGLFKKIVRYRAAIWIALIGAPMAHIGILIANTISPIWLMLMFSLVMFTVGYRLINNRVSDFHNPPCQVNPSTGRFIWNFKTGGVLASIGIIAGLLTGMLGVGGGFVIVPALRKVTNLDMHSIVATSLMIIFLISGMSIVMHIAEGFQYPVAITSAFALACAFGMLLGRRAIRFIPSAIVQKVFALMVFAVAIYMVIKIVNLTNI >NC_021733.1|WP_000822394.1|2019657_2020662_+|hypothetical-protein MKRINVAICGFGRIGQQIAELLLNRSTYYKQKYQIDARLVGVCNSSSGLIDQEGLQASKWLDKTQYQAGLTEQKFLKQVQADVIIETGPSDYVTGGKGLFYLNYALTHSMNAIAVSKGALVVEGKKLINLAHQHNKKLFFSGATAAALPTVDLFEYNLAGCQILEIESVFTGTTNFILNDMLQHECAFTESLEKAQARGIAEPNSSFDVDGWDTAAKITILANTVLGVDVKIQDIPRQGISHVTTEHIRDWKKENIIPRLVGFIHIKNQQIQTGVELRLVPANHPFAHLQGSNKCIRVLTQEMGEFVVSGGASAPLATAAAALKDFELMLKTGC >NC_021733.1|WP_001023744.1|2020694_2021612_-|EamA-family-transporter MNILLYVAVVLIWGTTWIGIAVQSHYATPVVAILWRFAISALLLWVVLLFSGKLQRIALKDHLFCMLQGLCVFGLNFICFYTAVKYVNSGLESVIFSMAVFFNAINALIFFKQKPSPNFAPAALLGLSGIVLLFWHDLINSQFNAQLLMGIGLCAIGTYGFSLGNMISVRHQKRGLNIFSTNCYAMTYGALVMLILALFTGQDLMPPMNFPFLSSVLYLAVFGTVIGFSAYFSLVGRIGAAKAAYSTLLFPLVALTVSTFFEGYEWTLNAVFGILLILLGNYLMFSKFEIGKKLFSSQKNCEKQA >NC_021733.1|WP_000331400.1|2021778_2022633_+|AraC-family-transcriptional-regulator MAYQTLEQLQQSKAKLHETVVLDENMQLAFWSNQQDRVSVCSDHHTLSLYIQDGYESYQKTPAGWKNGGGPGRFCLLPEHQESTWDIRGGLKFVHLYYTDQHLRDVAEKIWDKEPNQIELNEVVFNDDERIRALYQFFLLDCDWQDSSNHLQMSTTASLLLNHLIRKYSSVQWQQPTIKGGLAPHKLKYIQEWIEDHLDQALTLSDLANVVNLSEYHFAHMFKQSMNMAPHQYVMQRRLTKAKGLIQSSQLSLQDIALVCGFSSASHLSHRFKQFYGMSPSQLR >NC_021733.1|WP_004835232.1|2022629_2023025_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTVTIPHDIQSSDCQRVSQVLARVGEKWSILIVMTLASHPHRFSEIKRRINGISQRMLTLCLRGLERDGLVKRTVYPVVPSHVEYELTPLGHSLTEPVIALGQWAQQHIADIDAARAAFDAAQEKPITLDT >NC_021733.1|WP_000771644.1|2023120_2023729_+|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase MKLLQIDTSILGEQSVSRQLTSSVIRQLSTAYPDAEIIHHDFALEPIPHLSDAEFLAWQGVEPNNEIAQQRVARNTQYLDEFLSSDIVVIGAPMYNFSFPSQLKAWLDRLSVAGKTFRYTENGPQGLVEGKRVIIASSRGGVYSEGSPAEALDYQETYIKAFFNFIGVTDITFVRAEGIAFGPEARQTALDNAAAQIAQLAG >NC_021733.1|WP_020753120.1|2023812_2025162_-|chromate-efflux-transporter MQQKQLNTPDDSVEQVTFWQAILFWLKLGFISFGGPAGQIAVMYQELVEQKRWISEKRFLHALNYCMLLPGPEAQQLATYIGWLMHRTTGGLVAGILFVLPSLFILIGLSWVYIKFGDVPVISGIFYGIKPAVTAIVFHATYRIGSRSLKNKFLWFVAIAAFFAIFFLKLPFPLIVLSAGIAGYLASKKYPELFSSAAGHKASQKDYGPAIIDDDTPTPEHAKFHWLRLAKLIFVAIALWLLPILALGAYFGWHHSYTQMAWFFTKAALLTFGGAYAVLPYVYQGAVNHFGWLSPTQMIDGLALGETTPGPLIMVVAFVGFLGGVNHSLLGSEHLFFAGALGAVIVTWFTFLFSFVFIFAGAPIIESTHNEIKFTAPLTAITAAVVGVILNLALFFSYHVLWPQGFSGHFDIVAALITVAAFIALFRFNINVLYVIFASALVGLAVTFF >NC_021733.1|WP_000080821.1|2025403_2026147_+|GntR-family-transcriptional-regulator MSQLPQDPKNHKPLYDQLRELILNKIVNGEYAVLSQIPSENEFAEQFGVSRITVRQALNQLQLEGYIFKVPGKGTFVSKPKTFQNISSLQGFAEAMSSAGHEILNRVISAELKQVPMHVVPKLKLPVKANVYEIQRVRLLNRQPVSYELTYLSEHIGLKLKEKAIDLRTTDIFKALEQECDIPLGHADLSIDATVADEELAALLQVEIGTPVLRVERLTHDANGQPIDYEYLYFSGDTFQYRLRIHR >NC_021733.1|WP_020753121.1|2026175_2027909_+|fumarate-reductase/succinate-dehydrogenase-flavoprotein-subunit METKYFEFDIVVIGGGTAGPMAAIKAKQENPNLKVLLIEKANVKRSGAISMGMDGLNNAVIPGYATPEQYTKEITIANDGVVNQTTVYAYAKHSFTTIQQLDQWGIKFEKDETGEFAVKKVHHMGAYVLPMPEGHDVKKVLYRQLKRAQVKINNRIVTTKLLKNEQGAINGVLGFDCRSGDFYVIKTKAAILCCGAAGRLGLPASGYLMGTYENPTNAGDGYAMAYHAGAELANLECFQINPLIKDYNGPACAYVTGPLGGYTANSKGERFIECDYWSGQMMWEFYQELESGNGPVYLKVDHLAEETIQTIEEILHTNERPSRGRFHEGRGINYRQDMVEMHISEIGFCSGHSASGVWVNEKAVTSVKGLYSAGDMAAVPHNYMLGAFTYGWFAGVNAAQYVNAVEDSELNQSEIEAEKARIFAPLDCSEGLPPEQVEYKLRRFVNDYLQPPKTRQKMEIGLKRFEEIKQDIKRISARNPHELMRAAEVSFIRDCAEMAARASLFREESRWGLYHYRADFPQKNNSDWFCHAHLKKDEHGNMVSFKKPIEPYVVPINQDEAVSYDRLRIQKDVALAD >NC_021733.1|WP_000864074.1|2027929_2028175_+|ferredoxin-family-protein MAFIFKEVQHRTVAPVIIDEDKCIADKGCTVCVDVCPMDLLAIDPTTQKAYMQFDECWYCMPCEKDCPTDAVKVNIPYLLK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_021733_3 | 2301252-2301396 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021733_3
|
1 spacers
spacers of NC_021733_3
>3.1|2301298|53|NC_021733|CRISPRCasFinder CCGCTTTGTCTTGCTCAGGTGGCGTTTTTTTATACCTGTAAAAAGTTCAATAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021733_3
The CRISPR arrays of NC_021733_3 >merge|NC_021733|3|2301252-2301396|CRISPRCasFinder AAATTAACCATAACTATGTTCATCTCGCGCTTCGCCAAAGCTTTAGCCGCTTTGTCTTGCTCAGGTGGCGTTTTTTTATACCTGTAAAAAGTTCAATACAAATTAACCATAACTATGTTCATCTTGCGCTTCGCCAAAGCTTTAG >NC_021733|3|3|2301252-2301396|CRISPRCasFinder AAATTAACCATAACTATGTTCATCTCGCGCTTCGCCAAAGCTTTAG CCGCTTTGTCTTGCTCAGGTGGCGTTTTTTTATACCTGTAAAAAGTTCAATAC AAATTAACCATAACTATGTTCATCTTGCGCTTCGCCAAAGCTTTAG
>NC_021733.1|WP_000616034.1|2300967_2301201_+|hypothetical-protein MIQRISHHDLEHVYATAVNTIQSQMNFQDAVAQLEEVARAGHGKAALFLAELYYQGFRVERDSMKAQYWQKLATMQA >NC_021733.1|WP_000185571.1|2300392_2300752_-|hypothetical-protein MTNTIDGFVFDNPPKEEQIIELAHYHRKLLDEAIFHQEIHLGDYCLAQRKRVFDYARQLDPNQKAWFYQVYDGELRKIADEDELHPADAEEGLSIFAMLLVLVIIAAILYFSVIRSLMG >NC_021733.1|WP_000955083.1|2299965_2300292_-|hypothetical-protein MLTFKENFLKLKSELKADQCFNLVVIIIIGCIFMLSYLALLRPVNSEQYQRIVQLSRQATYPRTQDMAELIMAQSEIHRAEYLKLMHAYQFEHNHIKQYPALAQEDTQ >NC_021733.1|WP_020753209.1|2298751_2299858_-|signal-recognition-particle-docking-protein-FtsY MQQQSNMQNKFLIDAEIGDDDVTLPNLPAIDVPIVESPVKQEVKAEEVVEAAPSTEPEQPKSGFFGRMKEGLSKTRRNFTDGMVNILIGGKEIDDELLEEVEEQLLVADIGVDATKTIITNLTERTARGDLIYSHSLYKALQEELVALLAPRVKPLHIDLNKSPYVILMVGVNGVGKTTTIGKLAKRLQGEGKKVMLAAGDTFRAAATEQLQIWGERNDIAVVAQGHGADSASVIFDAFESARAKGIDVLIADTAGRLHNKSNLMEELKKVKRVMQKIDATAPHEIMLVVDAGTGQNAINQVQEFDQAVGLTGITITKLDGTAKGGVLFNIASRTHVPIRFIGVGEKIDDLRPFSAKSFVAALFETEK >NC_021733.1|WP_000102943.1|2297966_2298563_-|nitroreductase-family-protein MSTFLDKIKNRRTIYAIGKNVALDRTKIEETIREAVKHSPSAFNSQSSRVVTLYGESHAKFWNLVREALRKIVPADAFAGTNAKIDSFVAGVGTVLFYEDQAVVKSLQEQFELYADNFPVWSEHSSAIAQFATWTALSELGLGASLQHYNPIVDADAAEAFDVPATWKLRAQLVFGSVEAPAGEKAFISDEDRFKTFN >NC_021733.1|WP_020753208.1|2297069_2297741_-|DUF2057-domain-containing-protein MTLRLSVAAMGLLLSGSVFSAVTITAPEEIVILAVNGQEVNSGLFRSSKNNYKVDAGETSLSVRYQEYFEHLSGEHDIVKSGVVTIQTPALKDGQTYKLAMVDAPKQFEQAKKYAEQPTVALYNSNNELIVQQTGANNEARPWFASGLLGKVTDFTTKSSKQQPDAVYAVAKPTTTQANAPVATTMPPTGVAQTNDQRLAEIWKKSSKAERQKFMACLAEQSN >NC_021733.1|WP_000593796.1|2296472_2296997_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MIKLNFRLAEFSDIPTLVELINQSYREQQGRSWTTEVEYVKGQRINKEQLKHQLELPNSVLLIGEIDSSKVVTCIGLTFQSNTVEIGTFCTDPHVQNMKIGRCVLEYAEQFALHKVPELDSAIMYVLNVRSELIAYYERRGYIKTGNHEPYPLDANVGLPLIPIKLIEMKKDLK >NC_021733.1|WP_085916945.1|2296160_2296460_+|cyd-operon-YbgE-family-protein MMATAMTASNQRKAQAFAMAISFLLALPLAVILLVHPSLMLDANGHYNHSQLMLVMVGISGGFIYGVGFVPHFWLWKWLFSPWIAWPLMLLGYYIWFLT >NC_021733.1|WP_000270276.1|2296058_2296160_+|cytochrome-bd-I-oxidase-subunit-CydX MWYFAWILGILMACFAGVLSALYIEHHQNLDEE >NC_021733.1|WP_000575163.1|2294899_2296045_+|cytochrome-d-ubiquinol-oxidase-subunit-II MIEYELLKIIWWVLVGVLLIGFALTDGFDMGSMALMPFVGKTDNERRAAINTIAPHWDGNQVWFITAGGALFAAWPMVYSVAFSGMYWALLLVLFALFLRPVGFDYRSKLENTQWRNSWDWGLCIGGAVPALVFGVAFGNLFLGIPFSLDSTLRSEYSGSFFALLNPFALVCGIVSLSMLCAHGGAWLMLRTDGALKQRSAKATQIMAAIFLVCFLVIGAWLYFGQVPGYSYAAAVDPNAALNPLAKEVVTNNNPGWMNNYSSYPITKVAPVLAILGAIIAFFTASKAKAGLSFAGTSLMIVGAILTAGFALFPFLLPSSVNPNSSLTMWDAVSSHRTLGVMTVAACIFVPIILIYTSWSYYKMWGVITNKHIESNSHSLY >NC_021733.1|WP_077163451.1|2301678_2302011_+|DUF2750-domain-containing-protein MIKIYILRTMMYCGVLWGLFDEGWAIKSDQEDFIFPFWLNGVQAHRYAKTHWPNYKPRKITPKDFHESLLPTLTRLKVTPALFNSSHRKLKLSTQQMHHFFFNHPKWQVA >NC_021733.1|WP_000156920.1|2302151_2302583_+|CBS-domain-containing-protein MTIVAQVIKNKSEQAIFTISPEATVLEAITIMAEKGIGALVVAEGEQVVGILSERDYTRKVTLMERSSYSTTVAEIMTAKVITVGLNNTVEECLQLMTDRHLRHLPVLDNGKLVGFISIGDLVKAAMEDQKVLIEQLKQYISG >NC_021733.1|WP_000129938.1|2302633_2303842_-|aspartate-aminotransferase-family-protein MTDITLAPVQPDQPTHLMATYGRQAISFVRGRGAYLYAQDGTEYLDALTGIAVCGLGHAHPAIAEAIAEQAATLVHTSNLFEIPWQTAAAQKLAEVSGMEEIFFSNSGAESNEGAIKIARKFGTQQGISLPKIIVAEQSFHGRTLATLSATGNKKVQDGFAPLVEGFIRVPFGDIEAIQEAALQHPDIVAILIEPIQGEGGINTAPQGFSYLEEVRQICNQHNWLMMLDEIQTGNGRTGKYFAYQHTNIIPDVLTTAKGLGNGFPVGAVMTQGKAVGLLGPGSHGSTYGGTVLGSRVVYTVIDTIQKENAVENAAVVGNYIVDQLRAQLSDKNVQVRGFGMMIGIQLPKDCAELVAIARDEYKLIINVTAGSVVRLLPPINMTQAQADILLERLVALITNYL >NC_021733.1|WP_000138830.1|2304069_2304411_+|Grx4-family-monothiol-glutaredoxin MTEQARDTEALIRDQIAKHPVLLYMKGTPQFPQCGFSARAVEALSQIGRPFAYVNILENPDIRATLPKIANWPTFPQLWVNGELIGGSDIMLEMFQNGELKPLIEQYSAAPEA >NC_021733.1|WP_000121851.1|2304457_2304781_-|hypothetical-protein MSYQLVELENATANIICPICKLAVIDWTQEQYVQPCEHTVFIAMDLGFEFVADRFEQVMNQNVDELHEDPNMNIFDAITTTPYKNLTILKADLGVDGLFRYVGISVC >NC_021733.1|WP_000954523.1|2305024_2305927_+|LysR-family-transcriptional-regulator MLTDLDDFYCFALVVEHGGFSAAERVTDIPKSKLSRRVYNLEENLGVRLIQRSSRHFAVTDIGMDIYRHAQVMMNAAQAAHDLVDHLSIQPRGVVKVSVPVDIAQNQLPKILPAFLKKYPEIRLQLIVSNRRVDVINEGIDIALRVRSKLDDDPSLVLRQFALIEQSLFASQAYLNEFGNIKSPDELSDHRILSLSEEHLDQQFILHGPDNQLKKVKVSPTIMGTNIYMLAQLASQNCGIALLPDTAAEDFVKSGQLVQILPDWKAAHGIFHAVYPSRRGLLPAVRVFIDYLVEHLSEHP >NC_021733.1|WP_001202783.1|2305978_2306773_-|type-I-methionyl-aminopeptidase MRASTVTIKTEQDLEKLRVSGRLAAQVLEMIGEYVKPGVTTEYLDNICNDYIVNTLKVIPANVGYHGFTKTICTSVNEVVCHGIPSQNKILKDGDIINIDVAIIKDGYFGDTSRMYYVGNVNPHAKKLVETTYEAMVAGIHVVKPGATLGDIGYAIQSVAHREGYSIVREYCGHGIGKVYHEQPNILHYGQRGQGLVLKKGMVFTIEPMVNAGKPQVKELNDGWTVITQDHSLSAQWEHMVAVTDTGFELLTPWPEGVGNYPEI >NC_021733.1|WP_001186687.1|2307125_2308427_+|branched-chain-amino-acid-transport-system-II-carrier-protein MQQLRTGDIIALGFMTFALFIGAGNIIFPPIVAQQAGDHVWLAAIGFLITAVGLPVITIMALSRMQGSIEIISSPLGRIASLILTVVCYLSVGPLFATPRTATVSYEIGFSSYFGTSSSSLLIYSAIYFAFVTVVSLYPNKLLDTVGHVLAPLKIIALAILGIAAVMIPAGYVPTPINHYVNSPVSEGFVNGYLTMDTLGALVFGIVIIQAIYSRGVTDNKLVTKYAIIASLISGVGLTLVYLSLFKLGLGSHEVAPNAANGAVILHAYVQHAFGNMGSLFLTGLIFLACMVTAIGLTCACAEYFAQLTKLPYKLLVFILVGFSFIISNLGLTKLIAVSVPVLSAIYPPAIVVIMLSFFWKFWHKPSFIVGSVTSIALIFGIIDGLKVAGFGDYLPNFLQHLPLNEQNLAWLIPSLVVLVVTTLIDKVKHKSI >NC_021733.1|WP_000838063.1|2308618_2309038_+|heme-binding-protein MKSKYYLTLADAEFLMEEAQKYAIEHNFKVSIAIVDETSSLLLMKRLDGASPLTTHLCLEKAKCSSMSGRPSKFYEELLQNGRLGFLSMPSAKGMLEGGKAIIYEGQILGAIGVSGVQSFEDAEIAQHAIDVFLKKQSS >NC_021733.1|WP_000949688.1|2309297_2309543_+|hypothetical-protein MLSLHFNKQVFINTLNSKDSVVYGVTTLALMLTLLFQGMIKGNLKPEYFMYAMVVSFVFCVWAFVDHKMRKLAKRRLSQQK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_021733_4 | 3338258-3338342 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021733_4
|
1 spacers
spacers of NC_021733_4
>4.1|3338282|37|NC_021733|CRISPRCasFinder GATTATCAATCTTCTTTACTCTACGCGCAGTTTCACT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021733_4
The CRISPR arrays of NC_021733_4 >merge|NC_021733|4|3338258-3338342|CRISPRCasFinder GCTTGTCTTGCGCCAAAATTAAAAGATTATCAATCTTCTTTACTCTACGCGCAGTTTCACTGCTTGTCTTGCGCCAAAGTTAAAA >NC_021733|4|4|3338258-3338342|CRISPRCasFinder GCTTGTCTTGCGCCAAAATTAAAA GATTATCAATCTTCTTTACTCTACGCGCAGTTTCACT GCTTGTCTTGCGCCAAAGTTAAAA
>NC_021733.1|WP_000077301.1|3337693_3338197_-|L,D-transpeptidase MSQFKLEDADILIDLANQTLSLPKHNKFYVVSTGKNGIGEQENTGKTPRGWHRVAKKFGMQSPKNAVFIARQPTGEVYSSELAAQFPERDWILSRILWLDGLEEGFNKGEGHDTMQRYIYIHGTPDKEPMGVPMSHGCIRMRNEEIIELFDLVSEDALVYLSEQSLT >NC_021733.1|WP_001198164.1|3335831_3336617_+|YdcF-family-protein MQVSKWIRIFLAVIGSILFLDGLFLAFLNKIHVGTLVPLVLGAFFCLYALFYYHLERFFFYHYRLHTLWRFGWLCFWIWLIGLGYFFNFIKENKDASQNLPAVKAIIVLGSGVENGQPSAILAKRLDTAAPVALSQPQAKVILTGGLDFSEKEPEALVMSRYLEQHFHIAKDRMILEDKSTSTELNLKNSKPLLEQAHISINQPIAIVTSDFHTPRAAAIAKKQGYTQVYMVAAETPLITRYNVWLREYFAYASGWLLNEY >NC_021733.1|WP_000473032.1|3333158_3335705_+|PepSY-domain-containing-protein MFKKFLFQIHWFLGISAGLILSIMGVTGAIYSYDQQILKWVNTDSYVVQAQSSPKLTPAQLYQHFTTIQPEIKINSITIAKDPTASSVVNIEKEGERRGYNMMVNPYTAQVLPEVQGRKLLLLIQQIHRNLTAGEFGKQITGACALMLIYFVLSGLYLRWPKKHSARQWLALKPKLKGRNFIWDLHAVVGTWVIVFYLLFACTGLYWSYDWWRSGMFKVLGVEQPKMQGHSGSGRNKDQLPKIQLDNAQLITALNQTWSGFNNQIGRDYSTLTVNLPKKDDGKIELSFVDATPQHERARNQAVYNYKTANIEKMELYEDKKLNQKIMSSMLPVHRGSFFGPVYQFVAMLASLAMPLFFVTGWMLYLKRRKQKKLTQAARQSLAGHYIDQNAKPWLITYATQTGVAEQLAWSTATSLQEAHQPVQVKSVQQLTEADLQQHEQILFVISTYGTGEAPDLASNFAKKLLKTNLELQHVKYAVLALGSKEYPDTYCSFGYTVDEWLKNNGAKALFDIIEVDNANPADIQNWNQALVKATKLDLHAVNIEKVFDNWTLQQRDLLNPNSLGQPAYNIELTASHEAVWQAGDIAEIQPGNSPERINKFLQHHHILKNAVVDSLQVSIEKALWNKDLTGEIEPFANLDHLLEQLPTLPTREYSIASIPSQQVLRLVVRQQYDESGDLGLGSGWLTQHTEINQNVALRIRTNESFHLIDDNRPIICIGNGTGIAGLMSLLHTRTRHNYTENWLIFGERQRAHDFFYASTIEAWQTMGMLKRLDLAFSRDQEQRVYVQDIIRQNAAELVNWIERGAVLYVCGSIDGMASGVDQALIHILGEEQVDELRQQGRYRRDVY >NC_021733.1|WP_000125649.1|3332425_3333001_+|SdpI-family-protein MTAKTLYAYTLQPVPYEVSEAEQRNAQLLIWRSTNKISTKIWAIMGVILALAILGLIFIKNYSTVICWVAIVCVVLYYLGRKYGLEWYVKRKMNEFPVQEIKGIRLGVQPHGIVMRQQMGLQEGVGTIGWKNIYEWYNTPDFILVNFKVKDPKGQEQQGAYILPKRMDSKNFSFNTIRKHLKESVGEPKTL >NC_021733.1|WP_001984830.1|3330150_3332325_+|TIGR01666-family-membrane-protein MKSWFKRLKRATYNTSFMYNVRMLIAFSGTAFVPYFLGHQLATIPLTLGVVAAGLSDIDDRFSVRIMNLIYTYIGFFITAASVQLLFPYPMLFALGLIASCIGWILLGSLGRRYATISYGCLVVSVYTMLGVHLFDQWYIQPALLVAGAAWYGLIATISFLLFPVRQLQDKLAASYASLGDFLFAKSNLFDVDMTPASYQQSMIDLSLENGKLITIFNDLKTALLTRLKGDRGQKGTRRSLHYYFVAQDIHERADSAHIDYQKLAKIFQHSDILFRFQRILAIQGKACQELNECILQRKPYIHNKRFKQSFENLRLSLVKLRDDQQYDLLWVNALFALYRNLKSIDSQLLNLETEQHIQSDKVKQAENQLKDDDLKGWNDIVVRIKQNLTPESVLFRHAIRVSIVLFIGYVFIQMTHIEYGYWIMLTALFVSQPNFNATKRRLRLRIVGTLVGIIVGLSIVFLVPSVEGQLVMLILSGVLFFELRSKQYAQATAFITILALINFNLDGSAVAAAIPRFVDTLIGCALAWFGVTFIWPDWKFRRLPRSIRRSLQAQCNYLAEVVKQYHEGHNHALNYRIVRRAAHNTDAEVASLISTLATEPDFDPTRKSDIFEFLCLNHTFLSYIAALGAHREKIQDQAVLNVLDQALDDIQGALLRDEMPDLTAQNMLQTIRQRLSQNDEDDQKSLIILQQLSLMLSVLNRFSMLKQRLSHDLDNDASELASL >NC_021733.1|WP_000003701.1|3328808_3330023_-|multidrug-effflux-MFS-transporter MSEQTAQRQYSIGWIMLLALLTALGPLSIDMYLPALPQMAHDFGVSTQMVANTLPAYFFGLAIGQLVYGPLSDRIGRKKPLYFGLALYAVASLFCVLATNEWSLIAARILQALGGCVGVVMARAAIRDRLDVQGSAQAFSSMMIVMGLAPILAPMIGAWILIWFPWQAIFIALSIVGAICWLCVHFFFKETLAVDKRLKLSLYQVATLYGAIFKDASFRLPMFAGCLTGAALFCYISSAPAVFMDQYGLNQQEFAYVFGLNAFGIMLMSSLNKHLTTRVEITKRLKAGSMVQVTGASIVLIAGLISAAPLWLVMLGLFLAISGIGLTGPNAMALAMSKQGARAGTASAIMGSMQFACGLLGGVLLNFLIWSASLNMGVMMVLFTLSGFIVVLKAIRQAKSQSLS >NC_021733.1|WP_001047593.1|3328076_3328781_+|nitroreductase MNLEQVRLVDEAITSRHSVRAFLSTPIEPEVIKDILRVASRAPSGTNTQPWKVYVVTGHKRDEMVERVCAAQIEVSKNPELAEQYKETFAYYPEKWVSPFIDRRRENGWGLYGLLDIKKGEKEKMAAQQLRNFKLFDAPVGIFFTVNKAMGIGSKMDIAMMIQNVMVAAKARGLDTCPQAAWNHFHPLVLDILGAADDEELVCAIALGHADPEHIVNTFITPREPVENFAVFLD >NC_021733.1|WP_002010643.1|3327362_3327566_-|hypothetical-protein MSLPLINKQFMKQGLAITIATMKMNVTHATTEPQEIQQLGTDLNALFFNEKEKGTDSRVMTMACYSL >NC_021733.1|WP_000490937.1|3327039_3327180_-|hypothetical-protein 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
981704 : 989801
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_021733|981704:989801|DBSCAN-SWA TATGCTATCGGATGCCCAAGTAAAGTCATTAAAACCTAAAGAATCTAGATATTCAGTAGCAGATGGGGAAGGATTAAACATTTCCGTTTTTCCTAATGGAAAAAAGAAATGGGTTTTGTCTTATCGCCAAAATGGAAAGCAAAATCAAAAGATGTTGGGTGAATATCCTATTATGGGATGTAAAGAAGCACGCCAACTAGCAAGACAATTAAAATTAGAATATCAGGGCAAGGTCGCCAATTCTCCACCAGTCCATAAGGTGGTTGAGGAATGGTTGAGTATCATGAAATCACAATGGACCAGCAAAAAATACTATGACACAGTCGAATATCGACTTGCATATCTAACCGAGGATTTTAAAAATCTTCCAATTAATGAAGTTGAAAGAAAGCACATCTCGAAGAAAATTAAAGAAATTGTTGCAAAGGGTACTTTAGAAACAGCAAGCCGAGCATTAAGACTTGGAAAGCAAGTATTTGATTTTGCAATTGCCTCAGATTATACAGATCGTAATCCATGTACATTAGTAGAGGATGTAATACCTGAATATGAATCTGACAGCCATCCTTGTTTACCTGTGAGTGAAATGCCAGAATTCTTTAAACGCATGAAAGCGAGTCATTCTAGCTCAATAGTAAAAATGGCCATGCTTTTAGTTTGTTATACCGGAACCCGAATAACAGAATTGTTAAAAGCTAGGTGGGATACTGGAGAGATAGATTTTGAAAACAAAGTCTGGATAATTCCTGCAGAGCGAATGAAAAAAAGAAAAGAATTAATGGTCCCACTGGTACCGCAAATCTATGCTTTGTTTAAGGAACTCGAAAGCGTCAAAACAGATGATGGGTACATATTTAAAAAACGTGGAAAACCTTATGAGCACATGACATCTGAGTCGGTTCTCACAATGATAAAAAGAATGGGCTACACAGATAAAATGGTTACTCATGGTTTTCGTTCATTGTTTTCGACTCATGCTAATGAAAGTAAATTGTTCCGTGGTGAGGTTATCGATTATCAAATTGCCCACGTGAACAAAACAACAAAAGCAGATAAGACAAGTAAAATTTATAACCGTGCCGAATATTGGGATGAGCGAGTAGAGCTTATGACTTGGTATGCGAATGAAGTAGAAAATTGGATTGGTACTAACTCATGAACCAAAGTTTATTTGTCGGTTTTTGGAATATAAATTTATCTCCTCCTATAGGAAATAGATGGAATAAATCAAAAGTTGATAAAAAAATAAAAGTTTCTAGGGTAATTCAAGGGCTCTTGAAACTCGATTTTGATTTTTTATGTCTTTGTGAGGTTTCACCTGAGGATATGGAGTTTATAGATAATAGTATTCAACTTATTGGGATGGGCTATGATTACAATATTTATCGAAAAAATTATGGAGGCTTATATTTTGATACATGTGTAATATTTAAAAATACTTTTGATTTTGTTCAATCAAAAGTAGAAGTCGATGGTGAAGAAAAGAATAAGCTTAAAGTCTTTCAAAAATATGAATTTCTAAGTGGGCACTTAGAAGAAAGAATTATATTTTATGTTACTCATTGGTTATCTCAATTAAATGATAATAAGGAAAAAAGAAGAACAGTCGCATCATTTATTAAAAAAGATACTAATGATGAAAAAAAATTTTTCAATAAAACGAAGTTTGTTGTTTTAGGGGATTTTAATGTTGAACCTTATGATTCGGCAATATTAGAGGGGTTAAGAAGTACTAGGGATCAAAAAGTTATCTCTAATAATTCTTCACTGTTTTACAATCCTTTTTGGAAATTTTTACAAATTAAGGAAGATCAACCCTCAGGTACCCATCACTGTACTAAAAATGAGTTCCATCACTGGCACATTTATGATCAAATCTTAGTTTCAGGAAACTTTTTCCGTGATGGATGGAATTTGGATGATAATCTAGTTCTTGTCTTTGATGATAAGATGATTAGTTCTTTACATAATGATTCATTTAGTAACCCTTCAGATCATTTGCCTATCTGTCTAAAGTTGGAGAAAACAAAATGCATTTAGATTTAAGTTTAGCAGTTGAAGAGGGTATGCAATCCTCTGTAACCAGAGACAAAAGTATTGAAGAAATTGATAATGTATTATTTGAAGTAGACCAAGCAGTTAAGAAAGCAACAAATAATAAAGTTGAATTTGGTTGGAGAAAAAAAGGGTTTAATACGTTAGGTTTATTAACGGGTCTTACTTCACTTCCAATTACAGATGTAAAAATTGAATCTCAAGAGCCTGAGTCGCGTGTTCTCTATGTTTCTGCAACAGATGACAAAACACAAAGATTTGATATAACAATATTAGTGATAAGTCCTGATGGCTTCCCATGTGAAATGAATGTTAACGGCAACAAGCTTATATCACATGATGCTGAATCCTTATTAGAGCAATTTAAACCCTTACTTTCTAGTGCTTTTGTTGGAGATAAAATAAGAAAATTAATGAAAAAAGGCGCTTAATTAGCGCCTTAAATTTTGAATCTAATCATAGCAAGTAATTATGAAAGCAATTTTTTGTAGGTTTTAAATTGAACGAATTTCTAATGTATAAAATTGATAAATGGGTAAATCAAAATGGGTAATAAATACTACGATCAATTAGTAAATAATGATTCTCATTTTGAAATTACGTTTAATGATTTTGAGGAGTTTATAACTTTTATTCGTCCAGATAAATTACATGTAAAAGATCTTATGACTCAATTAAGATTGGAATTTAACCCATCAGCTGTTAATTTTCCTTTTTTTAAGATAAAAGATTTTAAAGGGTATAGTACATTAGACAAATCGATCATTTATCGGGGACATGGAGAAAGTGATTGGGATTTAAAACCAACCTTTTATCGTAATAAAAAAAATATTGGGTGGGTTAAGACAAATTGGAGTGTAGATCAAAATTATGAGTCAGAAATTTTATTGAAATTCCAAGATTCCTGTGATTTAGCTGGTGTTCAATTACCATCAGATAATGATCAATTGAGAAGAAGACAAAAAAATAAGTTAAGTAAATATAGGAAATCGTTTGGAAGAGATCAGCTAGATTGGTTTGATGATGATTTTTTTGAGTTAGCTGTATATGCACAACATTATGGAGTTGAAACTAGATTGCTGGATTGGACCAAAAATCCGTTTGTAGCTAGTTATTTCGCTTGTTCTCATGCACTCAAAATGAATTATGATCCAAATTCAAAATTTTGCATTTGGGTATTAAATTCTGAAAGTATTACAAATGAATTGAATCAAGTACTCGAAGTGCTAGATCCACCTAAAGGCCTTAATCAGCATATTTCTCATCAACAAGGTGTCTTAACTTACACAAAAAATCACATCAAAATCTTTAATAAATTTGGAACTCGACCATGCTTAAAAGATATTCTAAAGTATTATGAAAGTGGTTACAGGTTATTAAAAATAACTTTAGGATATGAATTAATCGTTGAATTATTTAATTATTGTAATATTCATAATTTCAATGCATGTCACTTATTTCGTGGTGCCAACGGTGCTGCAATGCACACCACTGATTTATTAAATTTTGATGACTATAAATATCCTATAGAAGATTAAAGGCGCTTATTTAGCGCCTTGAATCTCAACTTTAATCTTTGCTACTGATTGAGATGTCCAACCCTTATAAGTTTTGGATTCTCGATCAGGCGGGAATTTCTCCAAATAATATTTTTTAAAAGTATTTGGAGCCATTCCGAGTTCTTTAGCTAATTGTCTTAAAGAATACCAAGACATTTAAATCTCCTGACTTTCCGCTTTAACTTCTTTCAGTGATTCAATTGACTTAATCCAACTTAAAATGTGTGGCTTAGTTATTTCATCCTGACCGTGAAACCAGTAGAACTTTTTTTCTTTTTCAAGAACGTAATAAGGTTCACCAGATCCATTAGGCACAAGAAAATAATGGGTAGCATCTTTGGGTGCTGATTCAAGTATTTCTAATTCACTCATCCCTCAGCTCCCGATTCAATATCCAACTTCATTGCACCTTCTTCTGGATATTCGGTCATCCAAAAGTAATAGCCTTTTCCACTGTGGCCATCTTCAAAGAATTTAATTGTTAGTTCAGTATCAAGTTGATCTAAATCTTTCTCACCATCTGGATTTACAAATTCGAGAAGGCTTTTTAGTTGATGACCGCTAAGTGTTATGCTCATTGTTCAGCTCCCGATACGTTTGGCACACTATGAAAATGCATCCAGTGAGAAGGTGGGTCATTATAATAATTTGCCCATACACTATTTAGATCTTCATCAATAGTTATATAGTCTTGTTCTGGAGTAACATCTGGCGCATCATCCCAACAAATAAGTACCATTATGTCTGTAGGTGGCTCTTCATCTTTTACGCTGATCCAAGTGGGCCCAGCTTGGGCTTTTGCTGCAGCCCAAGCTTTTGCACTTGTATAAAAGTCAGCTTCATATTCAGGGCTTCCATCTTTGGCCCATTTATATGCAATTGGGTCATCATTTTTATACCAATCAGCATGAGCTTGCATTTCCTTTTTCCAAAGTAACCAAGCTTTATTTGTCACTATATTAAAATAGCCATTCATGGTTTCACTAAATACAAGAATGTCATTTTTTCGAATATTGCTTTCTTGCTTGAAAGTTTCAGTTTTTTTGAAATTTTCTTCAAAAAAAGCACGGTCATAAAAAATCATGAATTAGCTCCCATTCTGCTTGAATAAAGAGCTTTATTACTTTCGACAATTTCTTCACATTCTTTTTGACTACCAACGAAGAAATAATCTTTTTTCAGTTCACCAGCCTCAAATTTAGCTACCCAAGTACCGTAGACCTTTTCGGCTGAGATATATGCATAGCGTTGCTTTGTGATTGAAATGATATCTTCAATGTCTAAACAATCACCCAAACAATTAAAGTCTTTTTCTTTATTTACGCAATTTTCAGGCTCTTCATTGTCTTGCCACATAGTTTTAATTTGGTCTTCAACAATTAGAAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_021733|981704:989801|986397_986934_-|WP_000609004.1|DBSCAN-SWA MINLANQREALIAEVEVFKKDSMELWFVPDLAASYTNRDFFSYSIIEDNQVFFMIEQTRQLWEFWNKAKDHNLPKGSVLIVEDQIKTMWQDNEEPENCVNKEKDFNCLGDCLDIEDIISITKQRYAYISAEKVYGTWVAKFEAGELKKDYFFVGSQKECEEIVESNKALYSSRMGANS >NC_021733|981704:989801|989429_989801_-|WP_001260065.1|DBSCAN-SWA MRTNYLRGSKRYENNLNGQVNQKSTFREFVGKDEEHGLYKVRLGYTVYAANHTLTRVYTVNENNELTPVSQYTLNTKEWILRNLETEIKYRRGRELGQILQKTHIPSPDRKAYKIRRGFLGTR >NC_021733|981704:989801|985473_985689_-|WP_001292077.1|DBSCAN-SWA MSELEILESAPKDATHYFLVPNGSGEPYYVLEKEKKFYWFHGQDEITKPHILSWIKSIESLKEVKAESQEI >NC_021733|981704:989801|982858_983743_+|WP_001076477.1|DBSCAN-SWA MNQSLFVGFWNINLSPPIGNRWNKSKVDKKIKVSRVIQGLLKLDFDFLCLCEVSPEDMEFIDNSIQLIGMGYDYNIYRKNYGGLYFDTCVIFKNTFDFVQSKVEVDGEEKNKLKVFQKYEFLSGHLEERIIFYVTHWLSQLNDNKEKRRTVASFIKKDTNDEKKFFNKTKFVVLGDFNVEPYDSAILEGLRSTRDQKVISNNSSLFYNPFWKFLQIKEDQPSGTHHCTKNEFHHWHIYDQILVSGNFFRDGWNLDDNLVLVFDDKMISSLHNDSFSNPSDHLPICLKLEKTKCI >NC_021733|981704:989801|983733_984189_+|WP_000549863.1|DBSCAN-SWA MHLDLSLAVEEGMQSSVTRDKSIEEIDNVLFEVDQAVKKATNNKVEFGWRKKGFNTLGLLTGLTSLPITDVKIESQEPESRVLYVSATDDKTQRFDITILVISPDGFPCEMNVNGNKLISHDAESLLEQFKPLLSSAFVGDKIRKLMKKGA >NC_021733|981704:989801|987106_987397_-|WP_000986115.1|DBSCAN-SWA MMRNIPDSMSFPFTVWMCENGYYPSHKNGFIILKRGKEVAKISMNETKDGYPMNDICQKKFASFCRAWMNRDKHFIEQLRLRGLARLNQKSYQMVA >NC_021733|981704:989801|988578_989259_-|WP_000643997.1|DBSCAN-SWA MKAIILDTETNKLNGYPIEIAYAPFSLENGQLLVHKDEVFNRFYSCPEPIDLEAMAVHNIIEADIEGQPSCESFRLPEGVEFIVGHNIDYDIKALNKCGPAIKAKAICTLALARDVWPDLTSHKLAVLYYFVMSNREEARKHLRHAHSARADVYFTGIILIALIERLGIKDLNSLFLMSEAVRLPKIMTWGKHKGTPLKELPRPYISWLLNKEDLDPHLRKALQNI >NC_021733|981704:989801|985685_985895_-|WP_000028957.1|DBSCAN-SWA MSITLSGHQLKSLLEFVNPDGEKDLDQLDTELTIKFFEDGHSGKGYYFWMTEYPEEGAMKLDIESGAEG >NC_021733|981704:989801|984303_985296_+|WP_000527288.1|DBSCAN-SWA MGNKYYDQLVNNDSHFEITFNDFEEFITFIRPDKLHVKDLMTQLRLEFNPSAVNFPFFKIKDFKGYSTLDKSIIYRGHGESDWDLKPTFYRNKKNIGWVKTNWSVDQNYESEILLKFQDSCDLAGVQLPSDNDQLRRRQKNKLSKYRKSFGRDQLDWFDDDFFELAVYAQHYGVETRLLDWTKNPFVASYFACSHALKMNYDPNSKFCIWVLNSESITNELNQVLEVLDPPKGLNQHISHQQGVLTYTKNHIKIFNKFGTRPCLKDILKYYESGYRLLKITLGYELIVELFNYCNIHNFNACHLFRGANGAAMHTTDLLNFDDYKYPIED >NC_021733|981704:989801|985302_985473_-|WP_000119264.1|DBSCAN-SWA MSWYSLRQLAKELGMAPNTFKKYYLEKFPPDRESKTYKGWTSQSVAKIKVEIQGAK >NC_021733|981704:989801|981704_982862_+|WP_000947475.1|integrase|DBSCAN-SWA MLSDAQVKSLKPKESRYSVADGEGLNISVFPNGKKKWVLSYRQNGKQNQKMLGEYPIMGCKEARQLARQLKLEYQGKVANSPPVHKVVEEWLSIMKSQWTSKKYYDTVEYRLAYLTEDFKNLPINEVERKHISKKIKEIVAKGTLETASRALRLGKQVFDFAIASDYTDRNPCTLVEDVIPEYESDSHPCLPVSEMPEFFKRMKASHSSSIVKMAMLLVCYTGTRITELLKARWDTGEIDFENKVWIIPAERMKKRKELMVPLVPQIYALFKELESVKTDDGYIFKKRGKPYEHMTSESVLTMIKRMGYTDKMVTHGFRSLFSTHANESKLFRGEVIDYQIAHVNKTTKADKTSKIYNRAEYWDERVELMTWYANEVENWIGTNS >NC_021733|981704:989801|987537_988566_-|WP_000805204.1|DBSCAN-SWA MKPTLFTPETWAEFTQQLKNSWEKDNAGTDSPIFVVQEKKIVWGLDPASDSVEITNIVDADDESTYKSIDDFFESLKATDKHALNGLAIEEEDELFLDVKASTQINILSDWNERNIHICHGKYFWEDVNCHLTRSAADAFIKRKSHDFGELRVFVKSLYWCEEFKNLLNAIISGEVGLTSIDDDNILNVLGPIEPKADKEINSTQAKKSAKKANNKEENWTRYHNDKPVESPLAGLIEKLKKTKTADAANSLIEETKDWASEDQKSFLTELNKHLVIIAGQSKENISISERVKRATDLTTLDAIEIDISEADERIQEPLMELVIKRRKELEVENNFLLESPQ >NC_021733|981704:989801|985891_986401_-|WP_000578497.1|DBSCAN-SWA MIFYDRAFFEENFKKTETFKQESNIRKNDILVFSETMNGYFNIVTNKAWLLWKKEMQAHADWYKNDDPIAYKWAKDGSPEYEADFYTSAKAWAAAKAQAGPTWISVKDEEPPTDIMVLICWDDAPDVTPEQDYITIDEDLNSVWANYYNDPPSHWMHFHSVPNVSGAEQ >NC_021733|981704:989801|986926_987106_-|WP_000464381.1|DBSCAN-SWA MFEVKTAVQFDDDDVWIGSVLISKCGGNDEWTAYLDNDVEKEFETLEQAVTYCLEQAND |
14 | Acinetobacter_phage(57.14%) | integrase | attL 977031:977045|attR 988943:988957 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1231804 : 1244152
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_021733|1231804:1244152|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_021733|1231804:1244152|1232931_1233183_-|WP_000654846.1|DBSCAN-SWA MKDQYKKVSQKHMLGFMYYLQLLGYVIVRQGMDQAMFLTKHYAVPVAWRRITIDYHNRLNKPAQQLYKEFVEWTKEEYAEMVA >NC_021733|1231804:1244152|1236489_1236732_+|WP_000051960.1|DBSCAN-SWA MSLGEEMFEWRKQMVEKLLLQESNIDQLEEKVDRAEKILFGDCTAAFKIECTLRNAYALKAILDDFATKNNCKVSIVECE >NC_021733|1231804:1244152|1240873_1241755_+|WP_000064627.1|DBSCAN-SWA MSNFVPNSFQVPNAFVDEVLNKISDAACKIYLVICRKTRGWNKEMDSISLTQFEEITGKSRPTVVKCLNELIKVGLVVEQPSTIHGNTFKLGNDTSVGLVLKFPSKNFLLPEIYGQTSKNSLPLLVKNFNYTSKNFLPLLVKIFNTQSITIKNNSQSNKKINKKRGSVSEKPKTEKPNEFNPRSVELPACVDSELWNNFVDMRISIKKPLSENAVKLILKKLISFGPLANQSLENSIIGNYQGVFEPRQNQIQENPQSHNVPEEPGYFTQMYAESNRSNVIDVTPVSQDFGGY >NC_021733|1231804:1244152|1235246_1235570_-|WP_000064463.1|DBSCAN-SWA MSNFKKHPDGYKSFLGRDDKGLYSVRIGWQVYASNANGSVLYKVKDGFKTPLNVFRFQTDYPKVWNELTQEIDFQRRKQLAIKLRETNIPTYDRKAYKTKRGFTGSR >NC_021733|1231804:1244152|1242554_1242893_+|WP_000647826.1|DBSCAN-SWA 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24 | Acinetobacter_phage(95.65%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1248110 : 1276045
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_021733|1248110:1276045|DBSCAN-SWA 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35 | Acinetobacter_phage(93.33%) | capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2070810 : 2127641
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_021733|2070810:2127641|DBSCAN-SWA 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50 | Escherichia_phage(20.0%) | capsid,integrase,transposase | attL 2113968:2113983|attR 2133157:2133172 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2440797 : 2490410
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_021733|2440797:2490410|DBSCAN-SWA 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64 | Pseudomonas_phage(16.67%) | integrase,tail,head,coat,plate,transposase | attL 2437467:2437482|attR 2478641:2478656 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2535312 : 2584312
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_021733|2535312:2584312|DBSCAN-SWA 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75 | Acinetobacter_phage(90.91%) | capsid,terminase,integrase | attL 2534982:2534997|attR 2584464:2584479 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2844160 : 2858286
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_021733|2844160:2858286|DBSCAN-SWA 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9 | Acinetobacter_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2921926 : 2991610
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_021733|2921926:2991610|DBSCAN-SWA 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56 | Bodo_saltans_virus(30.77%) | tRNA,protease,integrase,transposase | attL 2960035:2960094|attR 2991622:2992802 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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