Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_021217 | Helicobacter pylori UM037, complete genome | 2 crisprs | cas14j,cas3,cas2,DEDDh | 0 | 1 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_021217_1 | 498134-498232 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_021217_1
|
1 spacers
spacers of NC_021217_1
>1.1|498164|39|NC_021217|CRISPRCasFinder AGCAGTAAAAAGTTTTACAAACTCCATAAAAACCATGGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021217_1
The CRISPR arrays of NC_021217_1 >merge|NC_021217|1|498134-498232|CRISPRCasFinder TTAGAAACCGAGACTAAAAACGACAAAAAGAGCAGTAAAAAGTTTTACAAACTCCATAAAAACCATGGGTTAGAAACCGAGGCTAAAAACGACAAAAAG >NC_021217|1|1|498134-498232|CRISPRCasFinder TTAGAAACCGAGACTAAAAACGACAAAAAG AGCAGTAAAAAGTTTTACAAACTCCATAAAAACCATGGG TTAGAAACCGAGGCTAAAAACGACAAAAAG
>NC_021217.3|WP_000554114.1|497478_497931_+|hypothetical-protein MHQNNKTFLPSQSAHLSKIILFLNTGFLAYLLSACGANVPIEEVLVKDPKETKAQEVAREEKAIQQENATIDARTTPLINRFTNYNAYGSLNGFYNSVDNLNSPMQNGMYGGYYMPYYYMPYGFMPYGSGLMPYGPYGYGAPGYFPYVFY >NC_021217.3|WP_015644310.1|496370_497288_-|outer-inflammatory-protein-OipA MKKVLLLTLSLSFWLHAERNGFYLGLNFLEGSYIKGQGSIGKKASAENALNEAINNAKNSLFPEQNTKAIRDAQNALNEVKDSTKIANRFAGNGGSGGLFNELSLGYKYFLGKKRIIGFRHSLFFGYQLGGVGSVPGSGLIVFLPYGFNTDLLINWTNDKRASQKYVERRVKGLSIFYKDMTGRTLDANTLKKASRHVFRKSSGLVIGMELGASTWFASNNLTPFNQVKSHTIFQLQGKFGVRWNNDEYDIDRYGDEIYLGGYSVELGVKVPAFKVNYYSDNYGDKLDYKRVVSVYLNYTYNFKH >NC_021217.3|WP_015644311.1|495616_496303_+|7-cyano-7-deazaguanine-synthase-QueC MEQEICVISFSGGQDSTTLAVWAKKRFKKVCLVGFDYAQKHSVELECAQKIASLLQLPYEIISLNFLENITRSALFKNSNDLMGHSHAQNKDLPNSFVPNRNAIFITLLHSYAQKIGASNIALGVSQADFSGYPDCKEDFIKSIEHALNLGSNTAIKILTPLMFLNKAQEFQMAKDLGVLDLVIKETHTCYQGERKILHAYGYGCDKCPACQLRKKGFEEFQTKILFQ >NC_021217.3|WP_015644312.1|494345_495554_-|CCA-tRNA-nucleotidyltransferase MFELEKELKELFDIYEKSPYELYLVGGCVRDCLMGITPKDYDLTSNALASESKELLLKHHFRVLETGIKHGTITALKNHQGYEITTFRIEKGHIKHRKPKELVFSTHLTDDLKRRDFSMNAIAYSPIKGIIDPFKGQNAIENQTIECVGEARLRFFEDALRILRSLRFSATLGFKIAASTKEAVFACKDLLKHLSKERLQSELNKLLMGKNAYEVAKEYQEILELVIQEKIENLGFLKNAPLNLELRLLGFFKHQKSLENLHYHKKTCILFSKAKECHKAFLNIHNKTELKFLLKNYDLEPFNLALDFYALKNPKHALKIKGLLKEIFDSNEPFKKEHLALKGGTLQSLGYQHQKISEILNACLNLVIAHPKNNALEWLIKWVKDHYLPNDAINHSPIGRKN >NC_021217.3|WP_031245442.1|493828_494332_-|hypothetical-protein MITMNAIQWPKKWIPGETDNFVSNEVIVKGLDFNKVVQHLRDASCWEKYYKNSGNIHMHNQDNTILKDKTRFRFETFGFLVEAQVEEFELKDTILRLAWRGWNEAKGDEYLEVYHAWIVEKLDNDRVRILTQESQSGVPAKALAKSMPNAMLNGHQAWLDGLVAYSR >NC_021217.3|WP_015644314.1|492956_493814_-|NAD(P)-dependent-oxidoreductase MKIGWIGLGAMGTPMATRLRDANLEVSVYNRTESKAAPLKEKGVVVYTNPIDLAAKVDLIFTMLSDKTAIDAVLVPEFWEQMSKKIVVNMSTIAPLESLALEKIAQKHQVTYLEAPVSGSVGAAKVGALLILSAGNEEVITQLKPVLVHLGSQIFYLGKIGQGAGAKLSINSLLAQMGVAYSEALLLAKHLGVDAELFLQIIGQSGMNSPLFQAKKGMWLQDNYPAAFSLKLMLKDIRLAKNEAGEAIQLPFLSKAQELYSQAEKSGLGALDMAVVYHYLEKGEH >NC_021217.3|WP_015644317.1|490818_492138_-|glutamate--tRNA-ligase MLRFAPSPTGDMHIGNLRAAIFNYIVAKQQHKPFLIRIEDTDKERNIEGKDQEILEILKLMGISWDKLVYQSHNIDYHREMAEKLLKENKAFYCYASAEFLEREKEKAKNEKRPFRYLDEWATLEKDKHHAPVVRLKAPNHAVSFNDAIKKEVKFEPDELDSFVLLRQDKSPTYNFACACDDLLYEISLIIRGEDHVSNTPKQILIQQALGSDNPIVYAHLPIILDETSGKKMSKRDEASSVKWLLNQGFLPVAIANYLITIGNKVPKEVFSLDEAIEWFSLENLSNSPAHFNLKYLKHLNHEHLKLLDDEKLLELTLIKDKNLLGLLRLFIEECGTLLELKEKISLFLEPKDIVKTYENEDFKERCLALFNALKSMDFQAYKDFESFKKEAMRLSQLKGKDFFKPLRILLTGNSHGVELPLIFPYIQSHHQEVLRLKA >NC_021217.3|WP_015644318.1|490528_490822_-|YggT-family-protein MIFSTLINAIAVILSTLLTIYMWVIIIYSLISFVQPNPNNPIMQILARLCEPVFYFLRSRFKLVFNGLDFAPLVVVIVLKFLDLTLIQWLFALAKNL >NC_021217.3|WP_015644319.1|488837_490520_-|lytic-transglycosylase-domain-containing-protein MRFFILFFIGALGVGFSQTELSLKDLEKKPTGIVRDYYLWRYISDKKTTLENAKKAYELTQNKNNALQKAMQEKGSDNAEKSPDVKLPEDIYCKQITLESMLETTDTFQNSCIAIALKSKIRDFDKIPLQTLKPLQEKIKEAYPVLYEELEILQSKHVSASLFKANAQVFSALFNHLSYEKKLQIFEERIPIKELNRLLDEDYPAFNRLIYQVILDPKLDHFKDALTKSNATQSNAQTFFILGINEILRKKPSKALKYFERSEAVVKDDDFSKDRAIFWQYLVSKKKKTLERLSQSSALNLYSLYASRKLQTTPSYRIISHIQNLSQEDPPFNTYDPFSWQIFKEKTLSLKDEGAFNAMLKSLYYEKSTPELTYLLSQRNKDKIYYYLSPYEGIIEWQNVDEKAMAYAIARQESFLLPAVISRSFALGLMQIMPFNVGPFAKRLGMDNIDLNDMFNPNIALKLGNYYLNHLKKEFNHPLFVAYAYNAGPGFLRRWLESSKRFKEKNHFEPWLSMELMPYSETRLYGFRVMLNYLIYQEIFGNFIPIDAFLEQTLNSKDKP >NC_021217.3|WP_015644320.1|488019_488841_-|UTP--glucose-1-phosphate-uridylyltransferase-GalU MIKKCLFPAAGYGTRFLPITKTIPKEMLPIVDKPLIQYAVEEAMEAGCEVMAIVTGRNKRSLEDYFDTSYEIEHQIQGTNKENALKSIRNIIEKCCFSYVRQKQMKGLGHAILTGEALIGNEPFAVILADDLCISHDYPSVLKQMTSLYQKYQCSIVAIEEVALEEVSKYGVIRGEWLEEGVYEIKDMVEKPSQEDAPSNLAVIGRYILTPDIFEILRETKPGKNNEIQITDALRTQAKRKRIIAYQFKGKRYDCGSVEGYIEASNAYYKKRL >NC_021217.3|WP_015644308.1|498485_500024_-|hypothetical-protein MAFVFLFKCVNEKASLDFTPLLEQIAFHLQVRFYSVYKDNTTSFYLQASAEITLEFAQKLSEILPFSLDFSFLSLKEITEPLDENLFQTTSLSKPLFMNAKEHQDFLDKNASLYANALGFVKNTAFKGDIIHSPKELIDCLTQLKERLKTQDFIPVHTSRGALSLSLKKPSPSVIFSDLSSVLSCTKLPLEDAKYLASLEKPSIKASLKSVFKDTFKNDEIIAQLPYDPILDLLCRILQDEGIEFVFMHESRSCEALLHYEALFKTPKRLITPAKNFVLENHLSTLPFKDELEFLSTTPNSIVLYFSFKRPTRLLLHANGSLKTLLSVSFDFNQIFNTLKQDEKASRMLQNYATKFPDFYARVLELSKYQLGGANLLDFFQILGFVLGYSEDFCTQSVIPLAKECLRPKGPRIDYKILKDDSLKMALNFSKVMHSAMSFRLAGVENEILSLGILDSLAEFLGNFIWDNAQNFSVQEVTIAGDFFGEKVFLDLFVRYFPKTLALKTHEFLDYE >NC_021217.3|WP_000078656.1|500025_500562_-|hydrogenase-biosynthesis-protein-HydD MSQKILILGIGNILFGDEGIGVHLAHYLKRNFSFFPSVDIVDGGTMAQQLIPLITSYEKVLILDCVSAKGVEIGSVYAFDFKDAPKEITWAGSAHEVEMLHTLRLTEFLGDLPKTFIVGLVPFVIGSETTFKLSSEMLNALETALKAIETQLNAWGVKMQRTDHIALDCIAELSYKGF >NC_021217.3|WP_015644307.1|500558_501233_-|Ni/Fe-hydrogenase,-b-type-cytochrome-subunit MDKMNKVVLHKEYSGFVRFFHWVRALSIFTLIATGFYIAYPFLQPNSSFYKGVYLLQAYVRSFHVMFGFLLISALIFRTYLFFTKESLMERRSFSQLLSPKAWIDQMKAYFLISGKTHTKGSYNPIQLVAYFTLVVLIVLMSLSGIVLYYNVYHAGLGAFLASAFKWFEALCGGLANVRFIHHLATWGFILFVPVHVYMVFFHSIRYDSSGADSMINGYGYTKE >NC_021217.3|WP_015644306.1|501245_502982_-|nickel-dependent-hydrogenase-large-subunit MSKKIVVDPITRIEGHLRIEVIVDDDNVITDAFSSSTLFRGLETIIKGRDPRDAGFIAQRICGVCTYSHYKAGITAVENALGITPPLNAQLVRSLMNMALLFHDHVVHFYTLHGLDWCDIMSALKADPIQAAKLSFKYSPYPINTGAGELKAVQKRLSDFAKSGSLGPFSNGYYGHKTYRLSPEQNLIVLSHYLKLLEIQREAAKMTAIFGAKQPHPQSLTVGGVTSVMDILDPTRLAEWKSKFEVVANFINHAYYPDLVMAGEMFANEPSVIKGCGLRNFIAYEEVLLGRDKYLLSSGVVLDGDISKLHPIDESLIKEEVTHSWYQYEDTKEVQLHPYDGQTNPHYTGLKDGESVGIENKIIPAKVLDTKNKYSWIKSPRYDSKPMEVGPLSSVVVGLAAKNPYVTEVATKFLKDTKLPLEALFSTLGRTAARCIEAKTIADNGLLAFDALVENLKSDQSTCTPYHIDKNQEYKGRYIGQVPRGMLSHWVRIKNGVVENYQAVVPSTWNAGPRDSQNQRGAYEMSLIGTKIADLTQPLEIIRTIHSFDPCIACSVHVMDFKGQSLNEFKVEPNFAKF >NC_021217.3|WP_015644305.1|502991_504146_-|hydrogenase-1-small-subunit MFYDEKKTYQKIEERLEVISSFNAHNEHKNLQDEFKGAGISRRDLLKWAGMMSTTLALPASFAPLTLKAVEVANRLPVIWLHMAECTGCSESLLRSADPTIDSIIFDYINLEYHETIMVASGFQAEKSLHDAIEKHKNNYILMVEGGIPQGTEYFLTQGPNAETGAEECRKAAQYAAAIFAIGTCSSFGGVQAAYPNPSNAQPLHKIIDKPVINVPGCPPSEKNIVGNVLYYLMFGALPKLDAYNRPSWAYGNRIHDLCERRGHFDAGEFVEHFGDENAKRGFCLYKMGCKGPYTFNNCSKLRFNSHTSWPIGAGHGCIGCSEPNFWDTMSPFEEPLANRSIKTAFDGLGADKVADKVGTTLLSATAIGIVAHALLSKAVKNKE >NC_021217.3|WP_000756740.1|504306_504891_+|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase MKKVLIINGGKAFGSSGGKLNETLTDHAKKTLESLGLEVDTTIVDKGYNHSQEVEKIVSADATIWQMPGWWMGEPWIVKKYIDEVFTSGHGKLYASDGRSSQNPTKNYGKGGLMQGKKYMLSLTWNAPIEAFNDPSEFFEGVGVDVVYLHLHKAFQFLGLSALPTFICNDVVKNPQVEQYLNSLTTHLHQAFGK >NC_021217.3|WP_015644304.1|504937_506992_-|DUF262-domain-containing-protein MRVKESTVNDFFALTSTIFSIPVYQRNYTWEEKNCEKLLQDIVSISQNKKTHFMGSITYILHHIDDEKSLRQLQEFVIIDGQQRITTIMLLLKAIETKIPNEEVKKEIDGLLNLSGQRLRLKPIKSDKEAFDLVMQNRSHEIQGVSHIRNNYKFFTKELDKYLEKGYRIEEIYGAFLRLKIVAIGLELGEDDPQVVFESINATGVQLKGLDLIRNYLMMGENSDNQNRLYETYWVPLEDWLGEKDLNDFIKTYLRIYLEKKLSEKEREVYYALKAHHRDNFSDDIQGLMSDMREYGRIYQIFLDRDHYFLHRGDPQQLANLRLRIKDLVKIKFGVAKPFILRCARDFEEGKLDYENFCEILQILISYFVHRSVCGDPAPALAELLYSLYRQLGEDVSADALKRYLGKSVGLAFPDNDRIKDEFIARKLKAPAKNVCKFILLEIEKLSNAEPPREENLEVEYFYPDQKNITQEWRDGVGDYLTFEQYYLHNFGNLTLKEKNQRLSSKSYEEKIALMEKYSSLHLNDYFINTHSWGIEEVKNRSEYLADQFCQVGLFKDLPKEYRTREIHKTLDDNLTHHKLSSVKLPNGQRRMTKNAEELVSVVINYLLENAREAFESYTGDELPSYIYWNKEKAEARDRDGTLVVPFEKYGFYYVSGANLQNVGSNLKDLILGCDLNPRDFIVE >NC_021217.3|WP_015644303.1|507226_508285_-|sel1-repeat-family-protein MLKKSLLLLVFLVLQLSGAEENNQAPKNTPPELNPANAKGTPNPNTQITPKNDNSNLLDKLGSPENAQTELSAGIDLAKKGDYQGAFKLFSQSCDNGNAAGCFAVGAMYANGVGIQTNRLKAARYYEMGCSGGDATACANLAQMYENKKNADSNDKENALQLYAVACQGGDMLACNNLGWMFANGSGVPKDYYKAISYYKFSCENGNDMGCYNLGLMSNVNNIYGIDKAKLSQVDLNYLACNAGDMMGCANLGWIYANGDLGAPLNNHYAAKYFQMACDGGILGSCNNLGVLYQKGLGVPQDDQRALDLFSYACDNGFESSCRNYGNFKEHLLRVNPNYGRLFMPYNSYEIP >NC_021217.3|WP_015644302.1|508296_509502_-|2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-carboxylate-N-succinyltransferase MINKFKNFVSNYQQSNHYKEPLGFGIARVDIAPISKKILCATYPVLNWKDENLGSYAVFCNSLSKDKILKESASERVIEIDESFVLKALDFYTPFLNEAYSNKMTHKNIQVVLELLKALEENRLKNSDGESLYRLVILYEDKPCESVESAYMKLLALSLGKAPLRSLNLEGIFNQLSNAAWSGNKPYELEWLRMNEVALKMRGHFPSIDFIDKFPRYLMQLIPEFDNIRLLDSSKTRFGAYLGTGGYTQMPGASYVNFNAGAMGVCMNEGRISSSVVVGVGTDIGGGASVLGVLSGGNNNPISIGKNCLLGANSVTGISLGDGCIVDAGVAILAGSVVEIEENEFKKLLEVNSALEKHANNLYKGKELSGKNGVHFRSNSQNGKLIAFRSVKKIELNQNLH >NC_021217.3|WP_015644301.1|509504_510584_-|flavodoxin-dependent-(E)-4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl-diphosphate-synthase MLENRVKTKQIFIGGVAIGGDAPISTQSMTFSKTADIESTKNQIDRLKLAGADLVRVAVSNEKDALALKELKKVSPLPLIADIHFHYKFALIAAQSVDAIRINPGNIGSKDKIKAVVDACKEKNIPIRIGVNAGSLEKQFDQKYGPTPKGMVESALYNAKFLEDLDFTNFKISLKASDVMRTIEAYRMLRPLVIYPFHLGVTEAGNLFSSSIKSAMALGGLLMEGIGDTMRVSITGELENEIKVARAILRHSGRLKEGINWISCPTCGRIEANLVDMASKVEKRLSHIKTPLDISVMGCVVNALGEAKHADMAIAFGNRSGLIIKEGKVIHKLAEKDLFETFVIEVENLAKEREKSLKD |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_021217_2 | 734532-734672 | Orphan |
I-B
Consensus repeat of NC_021217_2
|
2 spacers
spacers of NC_021217_2
>2.1|734559|33|NC_021217|CRISPRCasFinder AACAGCGCAAGTTCAAGCTTTGATAATAGTAGT >2.2|734619|27|NC_021217|CRISPRCasFinder GGCAACGCCAGCTTTAATAACGACACC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_021217_2
The CRISPR arrays of NC_021217_2 >merge|NC_021217|2|734532-734672|CRISPRCasFinder TTCAATCAAGGCACTTATAATTTTAGTAACAGCGCAAGTTCAAGCTTTGATAATAGTAGTTTCAATCAAGGCACTTATAACTTTAATGGCAACGCCAGCTTTAATAACGACACCTTCAATCAAGGGACTTATAACTTTAAT >NC_021217|2|2|734532-734672|CRISPRCasFinder TTCAATCAAGGCACTTATAATTTTAGT AACAGCGCAAGTTCAAGCTTTGATAATAGTAGT TTCAATCAAGGCACTTATAACTTTAAT GGCAACGCCAGCTTTAATAACGACACC TTCAATCAAGGGACTTATAACTTTAAT
>NC_021217.3|WP_015644136.1|732676_733675_+|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MKIFINGFGRIGRCVLRAILERNDTNPDLEVIGINDPANWEILAYLLEHDSAHGLLNKEVRYSHYKLIIGSLEIPVFNSIKDLKGVDVILECSGKFLEPKTLENYLLLGAKKVLLSAPFMGEYDEKQYPTLVYGVNHSLYQNQAIVSNASCTTNAIAPICAILDKAFGIKEGMLTTIHSYTSDQKLIDLAHPLDKRRSRAAASNIIPTTTKAALALHKVLPNLKNKMHGHSVRVPSLDVSMIDLSLFLEKKALKEPINDLLIEASKGVLKGVLEIDLKERVSSDFISNPSSVIIAPDLTFTLENMVKIMGWYDNEWGYSHRLVDMAQFLYHY >NC_021217.3|WP_015644137.1|731839_732532_-|Bax-inhibitor-1/YccA-family-protein MALYDRANSRNAYAEDSVLHESELVSFVKTTYKFFAGSLLLATIGALLGLMNFQAVVQYKWVFFIAEIVAFFGLMFSKSKPGLNLFMLFAFTSLSGVTLVPLLGMVIAKAGLGAVWQALGMTTIVFGLMSVYALKTKNDLANMGKMLFIALIVVVVCSLINLFLGSPMFQVVIAGASAILFSLYIAYDTQNIVKGMYDSPIDATVSLYLDFLNVFISILQIIGIFSDRDK >NC_021217.3|WP_015644138.1|728483_731741_-|carbamoyl-phosphate-synthase-large-subunit MPKRTDISNILLIGSGPIVIGQACEFDYSGTQSCKTLKSLGYRVILINSNPATVMTDPEFSHKTYIQPITPENIAAIIEKEKIDAILPTMGGQTALNAVMQMHQKGMLEGVELLGAKIEAIKKGEDRQAFKEAMLKIGMDLPKGRYAYNELEALEAINEIGFPAIIRASFTLAGGGSGVAYNIEEFQELAKNALDASPINEILIEESLLGWKEYEMEVIRDSKDNCIIVCCIENIDPMGVHTGDSITIAPSLTLTDKEYQRMRDASFAILREIGVDTGGSNVQFAIHPETLRMVVIEMNPRVSRSSALASKATGFPIAKVATMLAVGFSLDEIKNDITNTPASFEPSLDYIVVKIPRFAFEKFAGVSSTLGTSMKSIGEVMAIGGNFLEALQKALCSLENNWLGFESLSKDLEAIKKEIRRPNPKRLLYIADAFRLGVCVDEVFELCQIDRWFLSQIQKLVKAEDGINSSVLTDAKKLRGLKNLGFSDARIAAKIKENENLEVSPFEVELARMNLQIAPNFEEVDTCAAEFLSLTPYLYSTYALNPLPPIENKQEKKEKKILIIGSGPNRIGQGIEFDYCCVHASFALKDLNIKSVMLNCNPETVSTDYDTSDTLYFEPIHFECVKSIIQRERVDGIIVHFGGQTPLKLAKDLAKMQAPIIGTPFKVIDIAEDREKFSLFLKELDIKQPKNGMAKSIDEAYSIANVIGFPIIVRPSYVLGGQHMQILENIEELHHYLESVTHALEISPKNPLLIDKFLEKAVELDVDVICDKKEVYIAGILQHIEEAGIHSGDSACFIPSNLNPEILDEIERVSTKIALHLGVIGLLNIQFAVYENSLYLIEVNPRASRTVPFLSKALGVPLAKVATRVMVLEDLKEALKFYDKKNIVGYSKGVYKPKMPHFVALKEAVFPFNKLYGSDLILGPEMKSTGEVMGIARSLGLAFFKAQTACFNPIKNKGLIFVSIKDKDKEEACVLMKRLVQLGFELCATEGTHKALEKAGVKSLKVLKISEGRPNIMDLMMNGEISMAINTSDHKSQDDAKLIRASVLKNHVSYFTTLSAIEVLILALEESSKEDELLALQDYLK >NC_021217.3|WP_015644139.1|728047_728479_-|hypothetical-protein MALVYLAQSDTTIGLLSKDSEKLNALKGRPKNQSVLIESADFSTLKSLVRTPNAFKNLIRRSAKTTFIYPNSKAVRVIRGRHGDFLKRFKTLYSTSANLTQCAYDKEIASNLADVIVSDERGLFESASSKIFRLYKNKKVRIR >NC_021217.3|WP_015644140.1|723367_724912_-|outer-membrane-beta-barrel-protein-HofG MRQEKYFLTSSLSLLSFLLCPVEAFDYRFSGRVENFSKIGFNNSQINTKKGIYPTESFIDIVTLAQVKVNLLPKGTENHRLSVSLGGAIAAIPYDKTKYDINQANGKVFGSIVENFIGGYHGYFFNKYLGPAYAGTSQSASYHARPYVVDTAFLKYDYKDVFGFKAGRYEANIDFMSGSNQGWEVYYQPYKTETQRLRFWWWSSFGRGLAFNSWIYEFFATVPYLKKGGNPNNSNDFINYGWHGITTTYSYKGLDAQFFYYFAPKTYNAPGFKLVYDTNRNFENVGFRSQSMIMTTFPLYYRGWYNPETNTYSLEDSTPHGSLLGRNGVTLNIRQVFWWDNFNWSIGFYNTFGNSDAFLGSHTMPRGNNTSYIANEISVTTRHAGMIGYDFWDNTAYDGLADAITNANTFTFYTSVGGIHKRFAWHVFGRVSHANKNALGQLGRANEYSLQFNASYAFTESVLLNFRITYYGARINKGYQAGYFGAPKFNNPDGDFSANYQDRSYMMTNLTLKF >NC_021217.3|WP_015644141.1|721240_722830_+|Hop-family-adhesin-AlpB MKQNLKPFKMIKENLMTQSQKVRFLAPLSLALSLSFNPVGAEEDGGFMTFGYELGQVVQQVKNPGKIKAEELAGLLNSNTTNNTNINIAGTGGNVAGTLGNLFMNQLGNLIDLYPTLNTDSIHQCGATNNGSSGNTTAAAATSSSPCFQGNLALYNEMVGSIKTLSQNISKNIFQGNNNTTSQNLSNQLSELNTASVYLTYMNSFLNANNQAGGIFQNHTNQGYGSGVTAQQIAYILKQASITMGPSGDSGAAAAFLDAALAQHVFNSANAGNDLSAKEFTSLVQNIVNNSQNALTLANNANISNSTGYQVSYGGNIDQARSTQLLNNTTNTLAKVTALNNELKANPWLGNFAAGNSSQVNAFNGFITKIGYKQFFGENKNVGLRYYGFFSYNGAGVGNGPTYNQVNLLTYGVGTDVLYNVFSRSFGSRSLNAGFFGGIQLAGDTYISTLRNSPQLASRPTATKFQFLFDLGLRMNFGILKKDLKSHNQHSIEIGVQIPTIYNTYYKAGGAEVKYFRPYSVYWVYGYAF >NC_021217.3|WP_015644142.1|719665_721219_+|Hop-family-adhesin-AlpA MIKKNRTLFLSLALCASISYAEDDGGFFTVGYQLGQVMQDVQNPGGAKSDELARELNADVTNNILNNNTGGNVAGALSNAFSQYLYSLLGAYPTKLNGNDVSANALLSGAVGSGTCAAAGTASGNSLNTQSACTAAGYYWLPSLTDRILSTIGSQTNYGTNTNFPNMQQQLTYLNAGNVFFNAMNKALEKNGAATTSGTNGATGSDGQTYSTQAIQYLQGQQNILNNAANLLKQDELLLEAFNSAVAANIGNKEFNSAVFTGLVQGIIDQSQAVYNELTKNTISGSAVNRAEINSNQANAVQGRASQLPNALYNAQVTLDKITALNNQVKSMPYLPQFRAGNSRSTNILNGFYTKIGYKQFFGKKRNIGLRYYGFFSYNGASVGFRSTQNNVGLYTYGVGTDVLYNIFSRSYQNRSVDMGFFSGIQLAGETFQSTLRDDPNVKLHGKINNTHFQFLFDFGMRMNFGKLDGKSNRHNQHTVEFGVVVPTIYNTYYKSAGTTVKYFRPYSVYWSYGYSF >NC_021217.3|WP_015644144.1|716508_718539_+|ATP-dependent-helicase MLETLQLNPEQLKAAKALKGYNLVIASAGTGKTSTIVGRILYLLDNGIKPEEILLLTFTNKASNEMIARVAKYFKSSSKIEAGTFHAVAYRYLKEHYPNLSLKQPKELRKLLESIVDTKNALTDDDKKPYTSQHLYALYSLYTNALKQEDFSAWLSHKNPEHTPYAALYENILEEFENTKKKHNYIDYNDLLLLFKKAMLERPSPYKEVLCDEFQDTNPLQESILDAINPPSLFCVGDYDQSIYAFNGADISIISNFTQKYQNARVFTLTKNYRSSKEILDLANQVIQRNERIYPKNLEVVKSGKFNKPTLLNYNDNIAQCQDIAKRIVIRKNFKEVAVIFRNNASADQLEAALRSHNVPSKRKGSASFFESKEVALALDICALIFNPKDIMAAIHILSYISDIGSNTAKDIHEALMLLGNGDLKSALIQPNKEAKIYTKKKEITSMGLFEEIFALENSSRFNSVIDKAFHSHPVLMHPKISLNGAKMLSDFFILYTKAPTHSPSALIKHILESAFFQTFKTRLLKERSKNKDGSYNEFKKLQAQKRFNEKMDLLSSLAKNYQNLGRFLNGTLIGSSEATQGEGVNLLSVHASKGLEFKDVYIIDLMEGRFPNHKLMNTGGGIEEERRLFYVAITRAKENLWLSYAKNELRENAKPKEHKPSVFLYEAGLLKPDSK >NC_021217.3|WP_152477697.1|715366_716500_+|N-6-DNA-methylase MYKWDIKTLGQVFTPKNIVDFMLTLKHNQGSVLEPSAGDGSFLKRLKKAVGIEIDPKICPKNALCMDFFDYPLENQFDTIIGNPPYVKHKDIAPSTKDKLHYSLFDERSNLYLFFIEKAIKHLKPQGELIFITPRDFLKSTSSVKLNEWIYKEGTITHFFELGDQKIFPNAMPNCVIFRFCKGDFSRITNDGLQFLCKKGILYFLNQSYTQKLSEVFKVKVGAVSGCDKIFKNEKHGNLEFVTSITKRINVLEKMVFVNKPNDYLLQHKDSLMQRKIKKFNENNWFKWGRMHHISPKKRIYVNTKTRQKNPFFIHQCPNYDGSILALFPYNQNLDLQNLCDKLNAINWQELGFVCDGRFLFSQRSLENALLPKDFLN >NC_021217.3|WP_015644146.1|714756_715374_+|hypothetical-protein MIPTQLNEIAEFLKTNPYNLSQPLQDGRLNSSVNEEEILNTIKDYFPIQLPRAREWWDFSFKKNDIFYPVNIKTTTTKTADNLNGKLGIYYALCDLLPEFNNEIAWEKYFHKLHKDLGTNTNRDYYFLIINKNDPKDVFINSLKGIQTLQPNNLPFQCKWDNNREIVQRSFIESKNFILSALAKSVKLRANIYLTFKEFFGEFFV >NC_021217.3|WP_015644052.1|741329_742433_+|Hop-family-outer-membrane-protein-HopJ/HopK MQKALLHSSFFLPLLLSFCIAEENGAYASVGFEYSISHAVEHNNPFLNQERIQTISNAQNKIYKLNQVKNEITNMQNTFNYINNALKNHAKLTPTEMQAETYYLQSTLQNIEKIVMLSGGVASNPKLAQALEKMQEPITNPLEFEENLKNLELQFAQSQNRMLSSLSSQIAQISNSLNALDPNSYSKNISSMYGVSLSVGYKHFFTKKKNRGLRYYLFYDYGYTNFGFVGNGFDGLGKMNNHLYGLGIDYLYNFIDNAQKHSSVGFYVGFALAGSSWVGSGLGMWVSQTDFINNYLTNYQAKMHTSFFQIPLNFGVRVNVNRHNGFEMGLKIPLAVNSFYETHGKGLNTSLFFKRLVVFNVSYVYSF >NC_021217.3|WP_001115881.1|742502_742709_-|4-oxalocrotonate-tautomerase-family-protein MPFINIKLVPENGGPTNEQKQQLIEGVSDLMVKVLNKNKASIVVIIDEVDSNNYGLGGESVHHLRQKN >NC_021217.3|WP_001099619.1|742871_743453_+|recombination-protein-RecR MNTYKNSLNHFLNLVDCLEKIPNVGKKSAFKMAYHLGLENPYLALKITHALENALENLKTCSSCNALSESEVCEICSDESRQNSQLCMVLHPRDVFILEDLKDFLGRYYVLNSIEEVDFNALEKRLIEENIKEIIFAFPPTLANDSLMLYIEDKLQHFHLTFTKIAQGVPTGVNFENIDSVSLSRAFNSRIKA >NC_021217.3|WP_015644134.1|743449_744595_+|tRNA-pseudouridine(13)-synthase-TruD MNLNFMPLLHAYNHASIDFHFNSSARDFCVHEVPLYEFSNTGEHAVIQVRKSGLSTLEMLQIFSQILGVKIAELGYAGLKDKNALTTQFISLPKKYAPLLEKNTSNFQEKNLKILSLNYHHNKIKLGHLKGNRFFMRFKKMTPLNAQKTKQVLEQIAQFGMPNYFGSQRFGKFNDNHQEGLKILQNQTKFARQKLNAFLISSYQSYLFNSLLSKRLEISKIISDFSLKENLEFFKQKNLSVDSNALKALKNQAHPFKILEGDVMCHYPYGKFFDALKLEKESERFLKKEAAPTGLLDGKKALYAKNLSLEIEKEFQHNLLNSHAKTLGSRRFFWVFAENVISQYIKEKAQFELGFYLPKGSYASALLKEIKHEKGENNDEF >NC_021217.3|WP_080218803.1|744533_745514_+|zinc-metalloprotease-HtpX MRARCSKKSSMRKEKIMTNFEKIIAQNRIKTNAVLATYCAIFAFIGLLVDAIRINANDLGIALFKLMTFQIFPTITIIMFLVAFVVIVICIQNFSSIMLSGDEYKLIDTSKVLSSKENQIHRLLLELLEEAKLHFEPKLYIINAPYMNAFASGWDESNSLIALTSTLVERLDRDELKAVIAHELSHIRHNDIRLTMCVGILSNIMLLVANFSVYFFMGNRKNSGANLARMILLLLQIILPFLTLILQMYLSRTREYMADSGAAFLMHDNKPMIRALQKISDDYANNDYKGIDQNSTRSAAYLFNAEMFSTHPSVKNRIQSLRRRVI >NC_021217.3|WP_015644132.1|745514_746057_+|GTP-cyclohydrolase-I-FolE MENFFNQFFENIGEDKNREGLKETPKRVQELWKFLYKGYKEDPRVALKSAYFQGVCDEMIVAQNIEFYSTCEHHLLPFFGNISVGYIPNEKIVGISAIAKLIEIYSKRLQIQERLTTQIAETFDEIIEPRGVIVVCEAKHLCMSMQGVQKQNAIIKTSILRGLFKKDPKTRAEFMQLLKS >NC_021217.3|WP_015644131.1|746072_746984_+|polyprenyl-synthetase-family-protein MNNPNLSFYYNECERFESFLNHHHLHLESFHPYLEKAFFEMVLNGGKRFRPKLFLAVLCALVGQKDYSNQQTEYFKIALSIECLHTYSLIHDDLPCMDNAALRRNHPTLHAKYDETTAVLIGDALNTYSFELLSNALLESHIIVELIKILSANGGIKGMVLGQALDCYFENTPLDLEQLTFLHEHKTAKLISASLMMGLVASGIKDEELFEWLQAFGLKMGLCFQVLDDIIDVTQDEEESGKTTHLDGTKNSFVNLLGLEKANDYAQTLKTEVLNDLNLLKPAYPLLQENLNALLNTLFKGKT >NC_021217.3|WP_015644130.1|746980_747778_+|5'/3'-nucleotidase-SurE MKKILLTNDDGYHAKGIKALEQALEEMAEIYVVAPKHEKSACSQCITITAPLRAEKIKGKEGRHYRIDDGTPSDCVYLAINELFKHVCFDLVISGINLGSNMGEDTIYSGTVAGAIEGTIQGVPSIAISQILSNKNTPFSFDLAQKIIQDLVQNIFTKGYPLKGRKLLNVNVPNCSLQEYKGERITPKGYRLYKKEVHKRTDPKNESYFWLGLHPLEWQKRENEDRLSDFDAIASNHASITPLNLDLTSYDDLKSLESWHEGMLK >NC_021217.3|WP_015644129.1|747774_748434_+|hypothetical-protein MSKNHRLAFLGLIVGVFFFFSACQHRLHMGYYSEVTGDYLFNYNSTIVVAYDRSDAMTSYYINVIVYELQKLGFYNVFTQAEFPLDKAKNVIYARIVRNISAVPFYQYNYQLIDQVNKPCYFLGGQFYCSQTPTDYYAINGFSEQILMSANSHFILDWYDVVLQKRVLYVDGSVSGRTCGYQMLYRDLIKSTIKRIDFNRPERYYYNLRLPLYQPCYRE >NC_021217.3|WP_015644128.1|748435_749038_+|6-pyruvoyl-tetrahydropterin-synthase-family-protein MVIRRLYQFCASHVVRNCSSVKCAQNIHGHNYEVEVFIETNRLDSANMALDFGLMQQEMQVFIESFDHAHHFWDKESDEFQRFIENHCVRYVKCSFNLSAESYALMFLYYLTRILQKSVFSNNEGELKVSSVRVHETKNGYAESFLKDLENPHFKSLVHPNCVSFSQGIQSLWHDKDFFNKIISDEKQCFFHAKPLHQIP |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_021217_2 | 2.2|734619|27|NC_021217|CRISPRCasFinder | 734619-734645 | 27 | NZ_CP022727 | Erwinia persicina strain B64 plasmid pEP2, complete sequence | 67408-67434 | 3 | 0.889 |
NC_021217_2 | 2.2|734619|27|NC_021217|CRISPRCasFinder | 734619-734645 | 27 | NZ_CP034186 | Deinococcus sp. S14-83 strain S14-83T plasmid unnamed2, complete sequence | 116558-116584 | 6 | 0.778 |
1. spacer 2.2|734619|27|NC_021217|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP022727 (Erwinia persicina strain B64 plasmid pEP2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.889
ggcaacgccagctttaataacgacacc CRISPR spacer ggcaacgccagcgttaataccgacagc Protospacer ************ ****** ***** *
2. spacer 2.2|734619|27|NC_021217|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP034186 (Deinococcus sp. S14-83 strain S14-83T plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
ggcaacgccagctttaataacgacacc CRISPR spacer ggcagccccagctttaataacgaactg Protospacer ****.* **************** .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
386918 : 414706
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_021217|386918:414706|DBSCAN-SWA AATGAGACACAAAAATGAGACAGATACAAGCTTCAACCAGCTTAAAGAAATCACGCAAGCGATACAGGCGCAAAAAAACAGCGCGCCAAAAAGCGATAACGACAACACAAGCGAGATCACAAGCCAAAGCACGCCAAAGCCGACAGCGCACGCTAAAAAAGGCGCTTTAAAACCTACAAAAAGAGCCTTTAGCGATCGTCAAATAGCCACGATTAGAGACAACTTGCAAGCAGGCGTTAAAGAAAGCCAAAGGGGGCGTTAATGCGTAATCACACCATCTATTTAAGAGGAGACGCCCTCTATTTGAACTACACTAAAAACAGCAAGCGCCACCGAACGAGTTTAAACAAGCTTACTAAAAGCCTGAATTTAGAAAACGATAAAGCGTTAGAGTATTTAGAGAGCTTGAGTTTAGAGAAAATTCTAAAAATGCTAAAAGGGGCGGTGAAGCCTAATAAAGAGCCAAAGCAAGAAAGCCAAAGAGCGGCTAAAAAAACTAAAAACACAACCATAGCGCAAGCTAAAGAAAGCTTTTTTAACCAAAAAATAGGGCTTAAGGCAGAAAGCTTACGATTCATGCACTTAAGATTCACCACGATTTTGAAGCTAATGAACGTTAAAGAGAGCTCCAAAGTGTCTAAAATCACTAAAGAGAGCGTTATCAATTACCACAATAACGCTTATAAAAAATATAAGAAGAACACTTTGATAAGCCTTAACGCTTTATTGAAAAGTTTTTTAGAGTTTTGCGAACAAGAGGGATATACAGAAAAAAACCCATACTTTAAAATCACGATGAAAAACGCTAAAGAGGGTGAAAAAATCAATCCGTTTAGCTTAAATGAAATCAAAGCGATTCTACAGAGCGCGCCCGATTTAAGACTGAGGGCTTTTTTAACAACAGCGTTTTTTACGGGCTTAAGAACAGGCGAACAATTAGCGCTTTTATGGAGCGATGTCGATTTTGAAAACAAAAAAATCAACATTGACAAATCCTTGAACCTTTCAGGTGTTATCACAAGCCCTAAAAATAAAACAAGCATTAGAGAAGTGGATCTATTAGAGCCAGTGGAAAAAATCCTAAAAGAGCTAAAAGCAAGCGAACCCACTAATAAAAAAATGATTTTTCTTAACATTCCTAAAAGGACTCAAGGTTTTCAACTGATGTTCAAAAAACTTTTAGAATCCTTGAGCTTGAAAGACAGAAAGCTTTACACCACACGGCACACTTTTGCAAGCTTAATGTTAAGCCAGGGAGAAGAAGCCATGTGGGTTAGTAAAACGCTAGGGCACAAGGATTTAAATACCACTTACAAAGCTTACAGCCACTACATACCACAGCAAGAGAAAGAACGAGCGGCGTTTCTTAAGGGGATACTATGAACAACCAAAACAACAACCAGGAGAACACCATGGGATTATTCCACTATTTGACTTACAAGATCATCAAAGAAAATAATACGGATTTGAGTCTTTTTGATTTCATTCAAAAATTAGAAAGACTCCAAAAAACGCACACGATCAAACAGAGCGTTTGCAATGTGAGGAATAAGCGCGTAACGGGCTATTCTATCTTACTCCAAAAAAAGGCGGTTTGACATGGAAGTTTTGAAAGGATCAAAAATGATCACCTATGAAATTGACGCTCAACAGCTCAAAAAGCCAAAAAAAACGATTTTAGAAGCGAAATCAAAGTTATTTTTAAGCGTTTCACTCGCGCTTATTCTTTTAGCGTTTTATCTAATCTTCAAAGTGGAAGGAGTCTAAAATGAACTACATACTAAAACAACCCATGAAATTTGGCTATACGCAAATTTCTAACAATATTTGCGACGATGAACGAGTCTCTGATATAGCGATAGCGATTTACGCTTATATCAAAAAGCACGCAACCACTTTTAAGCTATGTTTAGAGGACATAGCAAAACGCTTCAATCGTAGCTTGCCAACCGTTCACAAATATTTGAACGAGTTGAAAGAGTTAGGTTATTTGGAATTTGAGAGGGAGCGCAAAAGCGATGGAACATTTGGGAAATTTTTACGATTTTTTTTAAAAAATTATCCAAAAAATCTAAGCGAAAAACAAGCCAAAAAAGAAGCTAACCTAAATAAAATCATTTTATTTAGGTTAAAACCGCAAAAAGAAGCCTCTAACGCCCATGATAGCGAAGCTCAATCCACAAGCAAAAATTTTAATTCGTTTACCTCAATAAAAGATCAAAATAAACATGAAAATATACGCGGCGTGAATGAAAATTTTTTCACTGAAGAATTTGCAGAAAAAAATCAAGTTTCCAAGAACGATCAAGATTTAAAAAGTTCAAAAATTAAAAATCCTAGTTTGTTTAATCGTTTTAGCGCGTTTTTTAGCTCTATTTTAGGGAATTTAGACACCAAACATCTAAGCCAAGCCGAAAGGTCAGCGTTTGAAGAATTTTTGAATTATCGCAGCGAGAAGCACAAATTAAGCTATAGCACTAAAAAAGCGTTATTACACCAAGCCGAAGCCTTAAAAGCGCAAGGATGCGATTTAGTGGCTTGTATTAATCAATCCATTCGCCGAAACTATAACGAAATCTATGAGGTCATGCATTTTGAAAAGCCAAGCTACAAAAGCGAAGCCAAAGACGACGAAGTCATGGGACATTTTGATAATGATTATAAGCCAAATCCCAAATATAACGGATATTGCATTTGGTAGGCAAAGAGGATAAAGCGATGAGACCATGTCACTATAAACACAAGAAAAAGAACTTTAAGCCTAAAGTGGAGACCGAATGCATTCTTTTTGAAAATGTGTTGTTAGAAATTTTGCAACTTATCAAAGAGCAAGAGGGAATGAGCAGAAGCGTGATCGTTGAAAGAATGATTATTTATTTTTTAGAAAAAGAAAAAGGAAATAAAGATGAGAGAGCATGGTTTAAATCTCAGCGAGTTTATAGACGAACACTTAAGAACTACGAGAAAAAAGTTGAAGCTAAGAGAAAGCAACTACAAAAATCTAAAAAGGATGCAAAGAAAAAAGCGTTATACATTTGCAAGAATAGTCCGTTTAGCTATTTTAGAGGGTATTAGGAAATTTCAAGAAGAAAACCTATTTTTGAACTTGCAAATAAAAGATTTTGAGATCGCTATAAGAGTTTTAGAAGAAAAGAACAACAGAAATAAACAATAAGGAAACGGCATGGAAAATTTGATAATGAATAGTTTCATAAACTATCCGAACGATTTGGAGGATTTTTTAGAAGATATACACATTTCAAGCTTTACGATTTTCAATCAAAAAATCATTCAGGCTTTGTTAGAGATGAAAAACAAAAAACAAGTCGTGCAGCTTGAAACTATAAGGCTAAAAATAGGCGATGAAGCGTTTGAAAGTAAAGAATTTAGCGCCATTTTGCAAGCGGATAGCTATCCGAACTATTTAGACTTGAAAAGCGATTTCAAAAGTTATTTGAGTTTGAAGATGCAGGAGCATTTAGCGAACGAGTTGATAAAAGCCACACGAAAGAGCGAGATTTTTGATTTTGATTTTTTAGGGAAGTATATCAAATTAGGATCTAACCGAAACGGAAAGTATTATTGGGAGTGGGAAAAGTTTTTTGAATCAAAACCCAAAATAGAAAAAATACACACAGGAATTGACTTTTTAGACAACATTAGCGATGGCGGTTTTGAAGTGGGCCAGTTGATTTTACTCAGCGGCGATCCCGAATCCGGTAAAACGCTTTTAGGTATCCAATACATCACCAACGCCCAACAAAAACACAAAGTCACTTATTTTGGTTTTGAATTTAGCGTGAGAAAACATATAGAAACCTTGAACTCTAAAGATTTCAAAATCAATAAAGAAAATTATTTCATTGACGATCTCAGTTGCGAAATCAATGAACTAGTCTCACAGATTAGAGGCTTAGCTAAGGAAGGGCATAAGCTTTTTATTATTGATAGTCAGATGAAAATACAAGCTCCCATCGTAGGAAGAACGATTGAAGAAGTAGAGACGATAAAATTCACTACTTTAGCCGACTTAGCCAAGCGCTTGCAAGTTATTATTATTTTGATTATTCAAAACAGCAAAAACGACAGCTACGCTCCAACAGGGAGCCGTAAGGGCGCTCATGAAGCGCATGTAATGATTAGGATTGAAAAGATCAAGAGCGGAGAACTAAAACACATTAAGGACTACAACGAGAGAATCAAACACCGCAAGGTTTTGATTTTGAAAAACAAACAAACAGGATTACAAGGCATTCAATTTTTTAGAATTAATGATTACCGGTTGTTTGAAATCAGCACAAATTACAAAGAGCTAAAAGCAAGCGACTTTAGCGGCTATGATATAAACGACTTTAGCGAGTGAAAGGATCTACAATGGTTACTAACTTTGAAGGCCTAAAAAATATCGTTAGCGTTGTTGATGTTGTAGAAAAATACCTAGACTTATACAAATGCGGAGCGAATTTGAAAGCGTGTTGCCCGTTTCATGATGAAAGAAGCGCCTCTTTTTTCATCAGCAAAGAAAAGAATATTTTTAAATGCTTTGGGTGTGGCGTTAGCGGTGATGCGTTTAAATTCTTGCAAGAATTTAAGAAAATCAGTTTTACCGAAGCGATTCAAGAAATAGCCTCCATGTATAACTACCCGATAGAATACGACAACAACGAAGAGAAACAAGAAAAAGAAAGGCTAAAAGAAATTTTAGCGTTTGCTAACAACCTTTTCAAAGAAAGGATTTCAAAAGAGCCTGTTGTTTTAGAGTATTTGAATAGGAGAGGCGTCACACTAAAAAAGATTAAAGATTACGGTTTAGGTTTTTGCACTAATGAAGAGAAAGACGAATTAAAAAAGCGTTTTACCCCTTGTGATTTGATAGCGAGCGGGCTTTTTAGTGATGCAAACCAAGAAAGAGATCTTAAAATCTTTTGCAATTACAGGATCACTTTTCCTTTGAAAGACAGTAAGGGGGATATTGTGAGTTTTAGCGCTAGAACTTGCAC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32 | Helicobacter_phage(100.0%) | transposase,integrase | attL 378191:378250|attR 424096:424368 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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