Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_020291 | Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT), complete sequence | 12 crisprs | RT,DEDDh,cas3,csa3,PD-DExK,WYL,DinG,cas2,cas1,cas4,cas5,cas7,cas8b2,cas6,cas14j | 1 | 7 | 12 | 0 |
NC_020292 | Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT) plasmid Csp_135p, complete sequence | 0 crisprs | PD-DExK | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_020291_1 | 629602-629699 | Orphan |
II-B
Consensus repeat of NC_020291_1
|
1 spacers
spacers of NC_020291_1
>1.1|629634|33|NC_020291|CRISPRCasFinder TTGTATTATTATTAGCTTTGAATAACATTAAAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_020291_1
The CRISPR arrays of NC_020291_1 >merge|NC_020291|1|629602-629699|CRISPRCasFinder GGATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAATGTTGTATTATTATTAGCTTTGAATAACATTAAAGCGATTGACATTAACATGAGATGTATTAAGTTTA >NC_020291|1|1|629602-629699|CRISPRCasFinder GGATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAATG TTGTATTATTATTAGCTTTGAATAACATTAAAG CGATTGACATTAACATGAGATGTATTAAGTTTA
>NC_020291.1|WP_015390683.1|627797_629381_+|AAA-family-ATPase MRKKFNVTGTCIPNKHYMVNTSNKMKKIIRLIEDEEYFIINRPRQYGKTTTLYLLEKLLNEDSEYLVISISFEGIGDLIFEEEKRFSKGFLNLIERTLFMGNEEISEFVKNEKNDVETMDDLSHFLTKFILKCNRKVILMIDEVDKSSNNQLFLSFLGMLRNKYLLRNTGKDYTFYSVILAGVHDVKSLKLKIRPEEESKYNSPWNIASDFNVDMSFSEEEIGTMLDDYTENKGVVLDKAYFAERLYFYTSGYPFLVSKLCKIIDEKIMAEEELKWEKDYMELAVKEILKESNTNFDSLIKNIENNNDLKVLVKRIILDGTDITYNQDNLIINMAIMYGIFKNNNGKVNIHNRIYEQRIYNYMSSLIETSTEVGAYNQSAKFIKVNGDLDIEKILVKFQEFLKHEYSEKREEFLEADGRLVFLAFISPVINGTGFAFKEVQGGEEKRFDIVITYNKKMYILELKKWNGEEYHKKGMLQLAEYLEQYSLEEGYLLIFDFRKLKGEAGNVARSTVTFEGKKKEIVEVYC >NC_020291.1|WP_015390682.1|626306_627572_+|YibE/F-family-protein MKVNLNWNSSIKICGKIIGPIAVLLIYIVMAVSFSSHTPIYNPYSSGAGGELHYEKGKVVSIDEQVINPSGFSELYIGRQIVNVLIESGQYEGQTFQVNNALNYDTNFVLHKGQDIVVSINTSTGDKSLVNVYMFAPSRVVPLLVLIGIFIGVMCLVGGWRGFHSILGIVFTLTTVLFIFIPLLFHGVSVVFATILLVIITSCVTLFLVGGFDRKSISAILGTVAGVIVSVIIMLIFSKLLGISGYTSTDADAMLNIASQTKLQVKDLLFTGIIIASLGAVMDIAISIATSINELKKQKEDATFKELFSSGMNIGRDMMGTMSNTLILAFLGESIFSFILMYSYQVQFRQLFNSNSIAIDILNAICGSLAVVLTVPIVAAIAAKLLQGSQSSYKAQDGELAENKEMTSTLKNGYALEMSRK >NC_020291.1|WP_015390681.1|624534_626193_+|metallophosphoesterase-family-protein MRINKNVKFILPIAVATVMATSACIPFITNVNAEITGSSGIQGFSLPKVTGAYNINAGVGSDPKELDFAWFTQASGKAQIKIARTADMKGTDFPSSATIQDADQMAVKATQSIDQKYTVLADIKGVGNPANEGDNVYNGKKALNAPTGEYSNKAKVKDLDSDTQYSYSVSDGQGNWSPIYTINTLPADKVTFAAFGDPQIGAFDNSKGTAKSNATGGHKNLSDDKTAWKNMLKLVTQNKDLNFLFTMGDQINDYNYLIQPSNASDGQWYQYRDFFNPDDSVNYMQSMPLAAFSGNHDHQMGEYYGYHYNQPNLGKLGATQYGNDGDYWFTAGPVLFMVLNANNYGTADHDQFIAEAIKVNPNAKWKVASWHQSAYSEANHNTKNEIDDPVLTIRNTWTKMMDKYKIDVVLQGHDHYYTRTAQMLNGNVVDPSTGAPETLKNNGSAQAPGTSNPNATYATKEYPNSVTNPKGTVYFTLDTGTGSKYYDVNKGNNDSIGGSADHSFSVVGWQGYVPSYSDISFTNDTFTIKTYATSDFTVENQTLIDSYTITKK >NC_020291.1|WP_015390680.1|623866_624295_+|DUF86-domain-containing-protein MNKERLIKIIEDMQECIVDINECLELLATRKDDKLIIKLSKSSLRQLFVSFHTILEDLCSIVLKEIKKYKIGITLHDSLIILKENGIINEETYVFLEKSRLLRNRISHRYKEPKHEELIEHILTYNNKFEEIVKIAKAYLRD >NC_020291.1|WP_015390679.1|623462_623870_+|nucleotidyltransferase-domain-containing-protein MDKEQIIDKLKSNEFVDFINKYNIITVILFGSINGNDFNEESDVDLAMIADTEIELDRVLDIELFLQNLLDREIDVLDLRNDEVDLFVKINILNNGKVIYSLDNNEALEAIYNETDRIYKENENFMYFRRGDVLY >NC_020291.1|WP_015390678.1|622688_623000_-|hypothetical-protein MKKIIFVFLILSFVIIGATTPITTNVFKEGIYNLSDFEALLTDKIYEVQNVSTNKSSLVIILDNNLATLQSIKLNPKSIKYDLTPLKSNYKIIVVGDGDIYIS >NC_020291.1|WP_015390677.1|621513_622503_+|AraC-family-transcriptional-regulator MSTNKFILDRKFADLIESLGISIAEVLKKSNLPEDLFSHQMPSLTAIEYINFMEILKELSNDECIPIRIGTIENIETFSPPIFAAYCSRNVLTCMKRISTYKKLICPLVFLVNENKDNITLELTFENTENELPEFLVAIEMVFLVQLIRNATKIRIIPKEVVTKHKIDNDNYEKFFGIRPKVGTRNILTISKEDAFRSFISQNDAMWEYFEPELRRRLSELDIDDTYAARVRSALIELLPAGEGSIDDVSSKLGCSTRTLQRKLKEEDTTFQKQLNHTRELLARHYLKNSAISSDDIAYLLGYQDLNSFVRAFNAWTGMTISEYKKKIN >NC_020291.1|WP_081603970.1|620808_621444_+|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase MKVKVIAKDLTLPQAPSEIYNEVKDAGIEVDYLINNAGFGGHGYFHERPMELDLQMIQVNIVTLTTLTRLFLPDFVKRNSGKVLNVSSTAVLMAGSLQAVYYASKAYVLSFSNAIAQELHDTNVTVTALLLGATETKFTKTYDMSNTPLFAKTVSQHIVAKDGYNAMLQGKLDIIAGVTVPQKVMMSMLQFMPKKLMLKQIYQIQQKNKNE >NC_020291.1|WP_015390675.1|619911_620394_+|flavodoxin MKKLVIYYSHDGNTKFIAETIAREINADITELKTKKTMNASGLMKVGWGVRQLVSQSEPVLCAMEKNPTDYDLIIIGSPVWTYTFAPPIRTFLKNYSMLGKKIGLFCCHGGQKGKTLENMKKLLDGNMIIGECEFLEPLSYEKENNKKKAIVWAKKIVNE >NC_020291.1|WP_015390674.1|618676_619495_+|oxidoreductase MSKKVALITGASSGIGKSTAIELNKRGFIVYGAARRKDMMQDLEVKGIHTISLDVTNDESMVKCVNEILNKEGKIDVLVNNAGYGSYGAIEDVPMEEARRQVEVNVFGLARMVQLVVPSMRKNKSGRIVNISSMGGKIWTKFGGWYHATKFAVEGFSDCLRLELEPFGIDVVVIEPGGITTDWGIIAAEKLRDASAKGAYAQAASKTADGMIKNYTGNQMSKPELIARCIGKAITVRRPKTRYLVGYFAKPMVFMKAVFGDRAYDRIIKMFS >NC_020291.1|WP_015390684.1|630538_631831_+|histidine--tRNA-ligase MKNNKVQPSILPGFMELLPKEQQIFRDMVRKITNVYEQNGFLEMDTPIIEKSEVLLAKSAGETEKQVYRFNRGSNDLSLRFDLTVPFARFSAQYFNELTFPFKRYQIGKVYRGERNQRGRYREFYQCDIDIIGNNKLSVNNDALVISMVSKGFKAIGLKDYKFQISNRKILSAILKDLEIINAIEVMGLIDKYDKIGKEEFLNSLVELVGQEKADVINKAININGSNEEIMKQLRELAMNSEEFEKGLEELSVVRNMLKIFGVEEDEYVINIKIIRGLDYYTGTVFETFLTGNEGYGSICSGGRYDNLAQNYTDNILPGVGISIGLTRLFFVLKEIGFLKDYKVEKSIEYLIIPIGDTLEYCAEVYNGLLRKGKYAEIYLEDDKLKKKLNYANKLGIPNVILIGEDEVLNKQVKIKDMVSGEETIVGAED >NC_020291.1|WP_015390685.1|631909_632233_+|hypothetical-protein MKKFTILFLILLCLSFNIMTISPLAQTSGIKEGLYTVSDLKLAPNSTYVIQNQSSADSVFVLVFNENNVVQQSLRLETKSPKFNLFPLKSEYKILIIGNGDISISET >NC_020291.1|WP_015390686.1|632331_632643_+|hypothetical-protein MKNFFISLLILLFLSFNITLIPLAIGNIFKEGLYTPSDLNLPSKPSYNIQNISSTDNVYVLVFDKTHSLYQSIRMEPNSPKYVVSFDPDFRIAVIGKGEVFFS >NC_020291.1|WP_015390687.1|632792_633632_-|amino-acid-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKIFTLIVIIGLIAIIGCDTNSSKITTTNIASVKDRLQTIKEKGTLTFVSADAPPFAYINPETNKLSGIDADIIAEIAKRLGINKIEEKKIKFADLLNQLNTDDSIDLAADGIYITPEREEIVSFTQPLYKESEVVIVPKASKINFKDDLKNAVVGTIRGTKFADLIQDWKKNNLVKNVLFFEDNTNLLNAINNGEIDAGVSDSALVEYSLKNNSFYLKILSDYTPEIHGLVGIAVKKSDITLLNNLNEKINEMKADGTLYAILVDNGLDKSNTIENQ >NC_020291.1|WP_015390688.1|634422_634755_-|antibiotic-biosynthesis-monooxygenase MSITVNLYYSGINGNARKFAEEMENSGTAAAIRNEDGNEKYEYFFPMNDPETVLLIDSWRDQNAIDAHHASPMMTTIAHLRNKYDLHMKVERYVSDTVEVPSSDVKFIRE >NC_020291.1|WP_015390689.1|635271_636993_+|HAMP-domain-containing-protein MRWLNNLKVGKKLTLLIICSLIGLFAVGITGYYFLLSSSKSIDSMYNERLLSSEWLSESRVHARAITADIYRLMVTTDNAENESLIKDIDNRAEQFNNYMNQYKNLKLDSFETSKIKEIEDKLSKYREGRKVVISLAKENKNQEAYEYYEKNVDIYVQAFMNSLVELGDHNRQIAEEINNADKLNFKIAVGTFLIIVITASILIIVLGVLITKRITKRLNDFVIFIGALSQGDFSLKIKPENLKDKSEFGTVSNALDKMTNNIRELVKQLGDTSKQLVSSSEELTASAEQSADASNLVATAVTTMANGADDQLAFANSTTKVVENISDKINVVSENTKSVSTLTDNAQTSANAGEEAVEKAINQMEIIERKTNETSTIISELEEKSAKIGQIIDTIEGISEQTNLLALNAAIESARAGEAGKGFSVVADEIRKLAEQSQEATKEIAKIINDVQSKTNSAVSVMNESSKEVDTGAMVVNVAGTSFREILQMISAISEQIHQISKSINEISVGTKASVTSVNNIQNISMKIADETQTISAAAEEQLASVEEIASSSKILSQMSEDLGSIITKFKI >NC_020291.1|WP_015390690.1|637393_637840_+|HIT-family-protein MSCKMCEKQKNIKDDPYFIMELETGYVILGWFQRFKGYTVFNCKEHGPELHNLEHSFKIKHLEEMSIVAEAVSNIFKPDKMNYELLGNGCSHIHWHLYPRVKGDTPIVSSVYQLSNEELFDESTRPNEEQREEMKEKIKNEIVRLLSR >NC_020291.1|WP_015390691.1|639394_641560_+|YhgE/Pip-domain-containing-protein MSIIFKIYKRDMKKIITNTPLMIIIVGLLLVPALYAWINIIASWDPYGNTKGLLVAAVNNDKGAEIKNMEINVGKEVIDKLKDNQSIGWTFVEQNEAENGVRYGKYYASITIPEDFSSSLLSVAANGEPNRAKLIYSVNEKINAIAPKITKSGLTSLQSEITKSVTEEVSNTILNYMNAYGTELEQIKPQLENFINVVSDIDTNLPQIGESINNAYNGAVNMNNFIKNIQGNIYNITNFLDNAQNVIKASNDFFTKFNSAIKNISPYIKSDLAGIKANVNGAKDNLNSFKNSVDTDAKGAQEALKAADANVENAISVINNDINILQSINDILHSDLLSSFINKMQNIRDQLVQNKLNIDNLIKTLSNGSKNFSDAVASVIQNIDKISQFMDDSIGNFDNTISPQISRLVNNTTDMANNSLGLLESEKNTMPLINNLLKDADIGTALGEEHIKSIKDKFPQIEESIHANTEKLKNLNDDEKFNELATFLQKNTKNVSSFLADPIELVQNRVFPIPNYGSAMAPFYSTLAIWVGGFTLLSILSVHVEPFEKVKNLGTTKMFFGRFLTLATLSVLQTIIIILGNLFFIKTYTVDPVVLLIFSIYVGLVFMMIIYTLVSVFGNVGKALALIIMVLQVSASGGTFPIQLTPKFFQNVSPMLPFAYAIGGMREAEGGIIWSSLYYNIGILSIYFFISIIIAIFLKEKVNKKSEKFVNKMRESGLVGE >NC_020291.1|WP_015390692.1|641802_642036_+|hypothetical-protein MKSLLNVFILLALIVALLLAVIAIIRGYKGMKISKQFETSDKKIKFAYWLLSAIHMWVGIVVTLCYVIAGMLILNRL >NC_020291.1|WP_015390693.1|642048_642303_+|hypothetical-protein MGIILLPFIAAIIGIIIFLICFIGTCLIIIGGTGMAMNKIYLKQMKTNNVLLKPQFNISSIILGIIFIIFPLGCVLSGVIYSLA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_020291_2 | 629945-630175 | Orphan |
NA:II-B
Consensus repeat of NC_020291_2
|
3 spacers
spacers of NC_020291_2
>2.1|629977|35|NC_020291|CRISPRCasFinder CCAGTTTGACTTTATAGCCTTCTGTATATTGCTTG >2.2|630044|34|NC_020291|CRISPRCasFinder GAATAAGGTCCATAGCTTCTACAACTTCAATTTC >2.3|630110|34|NC_020291|CRISPRCasFinder AAATTGCACTTTTCGCTTTCATATCGTCAAAACG >2.4|629977|46|NC_020291|CRT CCAGTTTGACTTTATAGCCTTCTGTATATTGCTTGTGATTAACTTT >2.5|630044|45|NC_020291|CRT GAATAAGGTCCATAGCTTCTACAACTTCAATTTCTGATTAACTTC >2.6|630110|45|NC_020291|CRT AAATTGCACTTTTCGCTTTCATATCGTCAAAACGTGATTAACTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_020291_2
The CRISPR arrays of NC_020291_2 >merge|NC_020291|2|629945-630175|CRISPRCasFinder,CRT GGATTAACTTCAACATGAGATGTATTTAAATACCAGTTTGACTTTATAGCCTTCTGTATATTGCTTGTGATTAACTTTAACATTAGATGTATTTAAATAGAATAAGGTCCATAGCTTCTACAACTTCAATTTCTGATTAACTTCAACATGAGATGTATTTAAATAAAATTGCACTTTTCGCTTTCATATCGTCAAAACGTGATTAACTTTAACATGAGATGTATTTAAATA >NC_020291|2|2|629945-630175|CRISPRCasFinder GGATTAACTTCAACATGAGATGTATTTAAATA CCAGTTTGACTTTATAGCCTTCTGTATATTGCTTG TGATTAACTTTAACATTAGATGTATTTAAATA GAATAAGGTCCATAGCTTCTACAACTTCAATTTC TGATTAACTTCAACATGAGATGTATTTAAATA AAATTGCACTTTTCGCTTTCATATCGTCAAAACG TGATTAACTTTAACATGAGATGTATTTAAATA >NC_020291|2|1|629956-630175|CRT AACATGAGATGTATTTAAATA CCAGTTTGACTTTATAGCCTTCTGTATATTGCTTGTGATTAACTTT AACATTAGATGTATTTAAATA GAATAAGGTCCATAGCTTCTACAACTTCAATTTCTGATTAACTTC AACATGAGATGTATTTAAATA AAATTGCACTTTTCGCTTTCATATCGTCAAAACGTGATTAACTTT AACATGAGATGTATTTAAATA
>NC_020291.1|WP_015390683.1|627797_629381_+|AAA-family-ATPase MRKKFNVTGTCIPNKHYMVNTSNKMKKIIRLIEDEEYFIINRPRQYGKTTTLYLLEKLLNEDSEYLVISISFEGIGDLIFEEEKRFSKGFLNLIERTLFMGNEEISEFVKNEKNDVETMDDLSHFLTKFILKCNRKVILMIDEVDKSSNNQLFLSFLGMLRNKYLLRNTGKDYTFYSVILAGVHDVKSLKLKIRPEEESKYNSPWNIASDFNVDMSFSEEEIGTMLDDYTENKGVVLDKAYFAERLYFYTSGYPFLVSKLCKIIDEKIMAEEELKWEKDYMELAVKEILKESNTNFDSLIKNIENNNDLKVLVKRIILDGTDITYNQDNLIINMAIMYGIFKNNNGKVNIHNRIYEQRIYNYMSSLIETSTEVGAYNQSAKFIKVNGDLDIEKILVKFQEFLKHEYSEKREEFLEADGRLVFLAFISPVINGTGFAFKEVQGGEEKRFDIVITYNKKMYILELKKWNGEEYHKKGMLQLAEYLEQYSLEEGYLLIFDFRKLKGEAGNVARSTVTFEGKKKEIVEVYC >NC_020291.1|WP_015390682.1|626306_627572_+|YibE/F-family-protein 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MRINKNVKFILPIAVATVMATSACIPFITNVNAEITGSSGIQGFSLPKVTGAYNINAGVGSDPKELDFAWFTQASGKAQIKIARTADMKGTDFPSSATIQDADQMAVKATQSIDQKYTVLADIKGVGNPANEGDNVYNGKKALNAPTGEYSNKAKVKDLDSDTQYSYSVSDGQGNWSPIYTINTLPADKVTFAAFGDPQIGAFDNSKGTAKSNATGGHKNLSDDKTAWKNMLKLVTQNKDLNFLFTMGDQINDYNYLIQPSNASDGQWYQYRDFFNPDDSVNYMQSMPLAAFSGNHDHQMGEYYGYHYNQPNLGKLGATQYGNDGDYWFTAGPVLFMVLNANNYGTADHDQFIAEAIKVNPNAKWKVASWHQSAYSEANHNTKNEIDDPVLTIRNTWTKMMDKYKIDVVLQGHDHYYTRTAQMLNGNVVDPSTGAPETLKNNGSAQAPGTSNPNATYATKEYPNSVTNPKGTVYFTLDTGTGSKYYDVNKGNNDSIGGSADHSFSVVGWQGYVPSYSDISFTNDTFTIKTYATSDFTVENQTLIDSYTITKK >NC_020291.1|WP_015390680.1|623866_624295_+|DUF86-domain-containing-protein MNKERLIKIIEDMQECIVDINECLELLATRKDDKLIIKLSKSSLRQLFVSFHTILEDLCSIVLKEIKKYKIGITLHDSLIILKENGIINEETYVFLEKSRLLRNRISHRYKEPKHEELIEHILTYNNKFEEIVKIAKAYLRD >NC_020291.1|WP_015390679.1|623462_623870_+|nucleotidyltransferase-domain-containing-protein MDKEQIIDKLKSNEFVDFINKYNIITVILFGSINGNDFNEESDVDLAMIADTEIELDRVLDIELFLQNLLDREIDVLDLRNDEVDLFVKINILNNGKVIYSLDNNEALEAIYNETDRIYKENENFMYFRRGDVLY >NC_020291.1|WP_015390678.1|622688_623000_-|hypothetical-protein MKKIIFVFLILSFVIIGATTPITTNVFKEGIYNLSDFEALLTDKIYEVQNVSTNKSSLVIILDNNLATLQSIKLNPKSIKYDLTPLKSNYKIIVVGDGDIYIS >NC_020291.1|WP_015390677.1|621513_622503_+|AraC-family-transcriptional-regulator MSTNKFILDRKFADLIESLGISIAEVLKKSNLPEDLFSHQMPSLTAIEYINFMEILKELSNDECIPIRIGTIENIETFSPPIFAAYCSRNVLTCMKRISTYKKLICPLVFLVNENKDNITLELTFENTENELPEFLVAIEMVFLVQLIRNATKIRIIPKEVVTKHKIDNDNYEKFFGIRPKVGTRNILTISKEDAFRSFISQNDAMWEYFEPELRRRLSELDIDDTYAARVRSALIELLPAGEGSIDDVSSKLGCSTRTLQRKLKEEDTTFQKQLNHTRELLARHYLKNSAISSDDIAYLLGYQDLNSFVRAFNAWTGMTISEYKKKIN >NC_020291.1|WP_081603970.1|620808_621444_+|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase MKVKVIAKDLTLPQAPSEIYNEVKDAGIEVDYLINNAGFGGHGYFHERPMELDLQMIQVNIVTLTTLTRLFLPDFVKRNSGKVLNVSSTAVLMAGSLQAVYYASKAYVLSFSNAIAQELHDTNVTVTALLLGATETKFTKTYDMSNTPLFAKTVSQHIVAKDGYNAMLQGKLDIIAGVTVPQKVMMSMLQFMPKKLMLKQIYQIQQKNKNE >NC_020291.1|WP_015390675.1|619911_620394_+|flavodoxin 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MGIILLPFIAAIIGIIIFLICFIGTCLIIIGGTGMAMNKIYLKQMKTNNVLLKPQFNISSIILGIIFIIFPLGCVLSGVIYSLA |
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NC_020291_3 | 634173-634260 | Orphan |
II-B
Consensus repeat of NC_020291_3
|
1 spacers
spacers of NC_020291_3
>3.1|634197|40|NC_020291|CRISPRCasFinder TTAAATCCGATCCAATGAATAAGATGCAAATCTATATTAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_020291_3
The CRISPR arrays of NC_020291_3 >merge|NC_020291|3|634173-634260|CRISPRCasFinder GATTAACTTCAACATGAGATGTATTTAAATCCGATCCAATGAATAAGATGCAAATCTATATTAAGATTAACTTCAACATTAGATGTAT >NC_020291|3|3|634173-634260|CRISPRCasFinder GATTAACTTCAACATGAGATGTAT TTAAATCCGATCCAATGAATAAGATGCAAATCTATATTAA GATTAACTTCAACATTAGATGTAT
>NC_020291.1|WP_015390687.1|632792_633632_-|amino-acid-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKIFTLIVIIGLIAIIGCDTNSSKITTTNIASVKDRLQTIKEKGTLTFVSADAPPFAYINPETNKLSGIDADIIAEIAKRLGINKIEEKKIKFADLLNQLNTDDSIDLAADGIYITPEREEIVSFTQPLYKESEVVIVPKASKINFKDDLKNAVVGTIRGTKFADLIQDWKKNNLVKNVLFFEDNTNLLNAINNGEIDAGVSDSALVEYSLKNNSFYLKILSDYTPEIHGLVGIAVKKSDITLLNNLNEKINEMKADGTLYAILVDNGLDKSNTIENQ >NC_020291.1|WP_015390686.1|632331_632643_+|hypothetical-protein MKNFFISLLILLFLSFNITLIPLAIGNIFKEGLYTPSDLNLPSKPSYNIQNISSTDNVYVLVFDKTHSLYQSIRMEPNSPKYVVSFDPDFRIAVIGKGEVFFS >NC_020291.1|WP_015390685.1|631909_632233_+|hypothetical-protein MKKFTILFLILLCLSFNIMTISPLAQTSGIKEGLYTVSDLKLAPNSTYVIQNQSSADSVFVLVFNENNVVQQSLRLETKSPKFNLFPLKSEYKILIIGNGDISISET >NC_020291.1|WP_015390684.1|630538_631831_+|histidine--tRNA-ligase MKNNKVQPSILPGFMELLPKEQQIFRDMVRKITNVYEQNGFLEMDTPIIEKSEVLLAKSAGETEKQVYRFNRGSNDLSLRFDLTVPFARFSAQYFNELTFPFKRYQIGKVYRGERNQRGRYREFYQCDIDIIGNNKLSVNNDALVISMVSKGFKAIGLKDYKFQISNRKILSAILKDLEIINAIEVMGLIDKYDKIGKEEFLNSLVELVGQEKADVINKAININGSNEEIMKQLRELAMNSEEFEKGLEELSVVRNMLKIFGVEEDEYVINIKIIRGLDYYTGTVFETFLTGNEGYGSICSGGRYDNLAQNYTDNILPGVGISIGLTRLFFVLKEIGFLKDYKVEKSIEYLIIPIGDTLEYCAEVYNGLLRKGKYAEIYLEDDKLKKKLNYANKLGIPNVILIGEDEVLNKQVKIKDMVSGEETIVGAED >NC_020291.1|WP_015390683.1|627797_629381_+|AAA-family-ATPase 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>NC_020291.1|WP_015390678.1|622688_623000_-|hypothetical-protein MKKIIFVFLILSFVIIGATTPITTNVFKEGIYNLSDFEALLTDKIYEVQNVSTNKSSLVIILDNNLATLQSIKLNPKSIKYDLTPLKSNYKIIVVGDGDIYIS >NC_020291.1|WP_015390688.1|634422_634755_-|antibiotic-biosynthesis-monooxygenase MSITVNLYYSGINGNARKFAEEMENSGTAAAIRNEDGNEKYEYFFPMNDPETVLLIDSWRDQNAIDAHHASPMMTTIAHLRNKYDLHMKVERYVSDTVEVPSSDVKFIRE >NC_020291.1|WP_015390689.1|635271_636993_+|HAMP-domain-containing-protein MRWLNNLKVGKKLTLLIICSLIGLFAVGITGYYFLLSSSKSIDSMYNERLLSSEWLSESRVHARAITADIYRLMVTTDNAENESLIKDIDNRAEQFNNYMNQYKNLKLDSFETSKIKEIEDKLSKYREGRKVVISLAKENKNQEAYEYYEKNVDIYVQAFMNSLVELGDHNRQIAEEINNADKLNFKIAVGTFLIIVITASILIIVLGVLITKRITKRLNDFVIFIGALSQGDFSLKIKPENLKDKSEFGTVSNALDKMTNNIRELVKQLGDTSKQLVSSSEELTASAEQSADASNLVATAVTTMANGADDQLAFANSTTKVVENISDKINVVSENTKSVSTLTDNAQTSANAGEEAVEKAINQMEIIERKTNETSTIISELEEKSAKIGQIIDTIEGISEQTNLLALNAAIESARAGEAGKGFSVVADEIRKLAEQSQEATKEIAKIINDVQSKTNSAVSVMNESSKEVDTGAMVVNVAGTSFREILQMISAISEQIHQISKSINEISVGTKASVTSVNNIQNISMKIADETQTISAAAEEQLASVEEIASSSKILSQMSEDLGSIITKFKI >NC_020291.1|WP_015390690.1|637393_637840_+|HIT-family-protein MSCKMCEKQKNIKDDPYFIMELETGYVILGWFQRFKGYTVFNCKEHGPELHNLEHSFKIKHLEEMSIVAEAVSNIFKPDKMNYELLGNGCSHIHWHLYPRVKGDTPIVSSVYQLSNEELFDESTRPNEEQREEMKEKIKNEIVRLLSR >NC_020291.1|WP_015390691.1|639394_641560_+|YhgE/Pip-domain-containing-protein 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MGFLFKNKHFDYQALRTLGTTPVGQADISEVTATSQKIKNGSCSSWCTEWEKTADRVRKFGEECLKEGLETSASESFLRASNYYRTAEFYLNYGSNKEYMDKINTLSTQCFNLAIKYGPYHIEPVEIPFEWISLPGHFYHADTKGPAPTIIVISGNDGTKEELYAIGIAAIKRGMNCLAFDGPGQGESIRRRNIPFRYNYETAIFPAVDFVLKDLSVDHDRIILWGESLGGYFAPRAAAFEKRISACIANGGLYDCLSLNPKKREATLNKIHKHATTFNLISRMLMKMSVALDWRFRHGFLTFGVDTPAEYVLSYKNFCLDGVTSKISCPVLVIGNESDKKAWNTQSKILYDKLECPKDYLFFTNNEGAGYHCQVGCRIYANDRIFNWIEKTIATI >NC_020291.1|WP_015390698.1|646473_647268_-|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase MKEKQKYIVITGASSGIGYETAKAFAKRNKNLVIVARSKDNLEKLKEEILQENPLLNVIIKCVDLSITSKVHQLYEELKPYCIETLINNAGFGNYSSVADQDIEKIETMLRLNIDALVILSSLFVRDYKDVTGSQLINISSSGGYIIVPNAVTYCASKFFVSTFTEGLARELKACNAKLQAKVLAPAATKTNFGNIANNVQKYDYDKSFGTYHTSKQMADFLLKLYDSNEVIGLVNRETFEFELSSPLFNYSGNSQNNQTCYTL |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_020291_4 | 638183-638343 | Orphan |
II-B
Consensus repeat of NC_020291_4
|
2 spacers
spacers of NC_020291_4
>4.1|638213|36|NC_020291|CRISPRCasFinder GAGGAATGATGACAGGCAATGAAGTAAGAGACTGGA >4.2|638279|35|NC_020291|CRISPRCasFinder TAGAGTACAGGATGTGTTGTTTGCATTTTTTGAAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_020291_4
The CRISPR arrays of NC_020291_4 >merge|NC_020291|4|638183-638343|CRISPRCasFinder GATTAACTTTAACATGAGATGTATTTAAATGAGGAATGATGACAGGCAATGAAGTAAGAGACTGGAGATTAACTTTAACATGAGATGTATTTAAATTAGAGTACAGGATGTGTTGTTTGCATTTTTTGAAAGATTAACTTCAACATTAGATGTATTTAAAT >NC_020291|4|4|638183-638343|CRISPRCasFinder GATTAACTTTAACATGAGATGTATTTAAAT GAGGAATGATGACAGGCAATGAAGTAAGAGACTGGA GATTAACTTTAACATGAGATGTATTTAAAT TAGAGTACAGGATGTGTTGTTTGCATTTTTTGAAA GATTAACTTCAACATTAGATGTATTTAAAT
>NC_020291.1|WP_015390690.1|637393_637840_+|HIT-family-protein MSCKMCEKQKNIKDDPYFIMELETGYVILGWFQRFKGYTVFNCKEHGPELHNLEHSFKIKHLEEMSIVAEAVSNIFKPDKMNYELLGNGCSHIHWHLYPRVKGDTPIVSSVYQLSNEELFDESTRPNEEQREEMKEKIKNEIVRLLSR >NC_020291.1|WP_015390689.1|635271_636993_+|HAMP-domain-containing-protein MRWLNNLKVGKKLTLLIICSLIGLFAVGITGYYFLLSSSKSIDSMYNERLLSSEWLSESRVHARAITADIYRLMVTTDNAENESLIKDIDNRAEQFNNYMNQYKNLKLDSFETSKIKEIEDKLSKYREGRKVVISLAKENKNQEAYEYYEKNVDIYVQAFMNSLVELGDHNRQIAEEINNADKLNFKIAVGTFLIIVITASILIIVLGVLITKRITKRLNDFVIFIGALSQGDFSLKIKPENLKDKSEFGTVSNALDKMTNNIRELVKQLGDTSKQLVSSSEELTASAEQSADASNLVATAVTTMANGADDQLAFANSTTKVVENISDKINVVSENTKSVSTLTDNAQTSANAGEEAVEKAINQMEIIERKTNETSTIISELEEKSAKIGQIIDTIEGISEQTNLLALNAAIESARAGEAGKGFSVVADEIRKLAEQSQEATKEIAKIINDVQSKTNSAVSVMNESSKEVDTGAMVVNVAGTSFREILQMISAISEQIHQISKSINEISVGTKASVTSVNNIQNISMKIADETQTISAAAEEQLASVEEIASSSKILSQMSEDLGSIITKFKI >NC_020291.1|WP_015390688.1|634422_634755_-|antibiotic-biosynthesis-monooxygenase MSITVNLYYSGINGNARKFAEEMENSGTAAAIRNEDGNEKYEYFFPMNDPETVLLIDSWRDQNAIDAHHASPMMTTIAHLRNKYDLHMKVERYVSDTVEVPSSDVKFIRE >NC_020291.1|WP_015390687.1|632792_633632_-|amino-acid-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKIFTLIVIIGLIAIIGCDTNSSKITTTNIASVKDRLQTIKEKGTLTFVSADAPPFAYINPETNKLSGIDADIIAEIAKRLGINKIEEKKIKFADLLNQLNTDDSIDLAADGIYITPEREEIVSFTQPLYKESEVVIVPKASKINFKDDLKNAVVGTIRGTKFADLIQDWKKNNLVKNVLFFEDNTNLLNAINNGEIDAGVSDSALVEYSLKNNSFYLKILSDYTPEIHGLVGIAVKKSDITLLNNLNEKINEMKADGTLYAILVDNGLDKSNTIENQ >NC_020291.1|WP_015390686.1|632331_632643_+|hypothetical-protein MKNFFISLLILLFLSFNITLIPLAIGNIFKEGLYTPSDLNLPSKPSYNIQNISSTDNVYVLVFDKTHSLYQSIRMEPNSPKYVVSFDPDFRIAVIGKGEVFFS >NC_020291.1|WP_015390685.1|631909_632233_+|hypothetical-protein MKKFTILFLILLCLSFNIMTISPLAQTSGIKEGLYTVSDLKLAPNSTYVIQNQSSADSVFVLVFNENNVVQQSLRLETKSPKFNLFPLKSEYKILIIGNGDISISET >NC_020291.1|WP_015390684.1|630538_631831_+|histidine--tRNA-ligase MKNNKVQPSILPGFMELLPKEQQIFRDMVRKITNVYEQNGFLEMDTPIIEKSEVLLAKSAGETEKQVYRFNRGSNDLSLRFDLTVPFARFSAQYFNELTFPFKRYQIGKVYRGERNQRGRYREFYQCDIDIIGNNKLSVNNDALVISMVSKGFKAIGLKDYKFQISNRKILSAILKDLEIINAIEVMGLIDKYDKIGKEEFLNSLVELVGQEKADVINKAININGSNEEIMKQLRELAMNSEEFEKGLEELSVVRNMLKIFGVEEDEYVINIKIIRGLDYYTGTVFETFLTGNEGYGSICSGGRYDNLAQNYTDNILPGVGISIGLTRLFFVLKEIGFLKDYKVEKSIEYLIIPIGDTLEYCAEVYNGLLRKGKYAEIYLEDDKLKKKLNYANKLGIPNVILIGEDEVLNKQVKIKDMVSGEETIVGAED >NC_020291.1|WP_015390683.1|627797_629381_+|AAA-family-ATPase MRKKFNVTGTCIPNKHYMVNTSNKMKKIIRLIEDEEYFIINRPRQYGKTTTLYLLEKLLNEDSEYLVISISFEGIGDLIFEEEKRFSKGFLNLIERTLFMGNEEISEFVKNEKNDVETMDDLSHFLTKFILKCNRKVILMIDEVDKSSNNQLFLSFLGMLRNKYLLRNTGKDYTFYSVILAGVHDVKSLKLKIRPEEESKYNSPWNIASDFNVDMSFSEEEIGTMLDDYTENKGVVLDKAYFAERLYFYTSGYPFLVSKLCKIIDEKIMAEEELKWEKDYMELAVKEILKESNTNFDSLIKNIENNNDLKVLVKRIILDGTDITYNQDNLIINMAIMYGIFKNNNGKVNIHNRIYEQRIYNYMSSLIETSTEVGAYNQSAKFIKVNGDLDIEKILVKFQEFLKHEYSEKREEFLEADGRLVFLAFISPVINGTGFAFKEVQGGEEKRFDIVITYNKKMYILELKKWNGEEYHKKGMLQLAEYLEQYSLEEGYLLIFDFRKLKGEAGNVARSTVTFEGKKKEIVEVYC >NC_020291.1|WP_015390682.1|626306_627572_+|YibE/F-family-protein MKVNLNWNSSIKICGKIIGPIAVLLIYIVMAVSFSSHTPIYNPYSSGAGGELHYEKGKVVSIDEQVINPSGFSELYIGRQIVNVLIESGQYEGQTFQVNNALNYDTNFVLHKGQDIVVSINTSTGDKSLVNVYMFAPSRVVPLLVLIGIFIGVMCLVGGWRGFHSILGIVFTLTTVLFIFIPLLFHGVSVVFATILLVIITSCVTLFLVGGFDRKSISAILGTVAGVIVSVIIMLIFSKLLGISGYTSTDADAMLNIASQTKLQVKDLLFTGIIIASLGAVMDIAISIATSINELKKQKEDATFKELFSSGMNIGRDMMGTMSNTLILAFLGESIFSFILMYSYQVQFRQLFNSNSIAIDILNAICGSLAVVLTVPIVAAIAAKLLQGSQSSYKAQDGELAENKEMTSTLKNGYALEMSRK >NC_020291.1|WP_015390681.1|624534_626193_+|metallophosphoesterase-family-protein MRINKNVKFILPIAVATVMATSACIPFITNVNAEITGSSGIQGFSLPKVTGAYNINAGVGSDPKELDFAWFTQASGKAQIKIARTADMKGTDFPSSATIQDADQMAVKATQSIDQKYTVLADIKGVGNPANEGDNVYNGKKALNAPTGEYSNKAKVKDLDSDTQYSYSVSDGQGNWSPIYTINTLPADKVTFAAFGDPQIGAFDNSKGTAKSNATGGHKNLSDDKTAWKNMLKLVTQNKDLNFLFTMGDQINDYNYLIQPSNASDGQWYQYRDFFNPDDSVNYMQSMPLAAFSGNHDHQMGEYYGYHYNQPNLGKLGATQYGNDGDYWFTAGPVLFMVLNANNYGTADHDQFIAEAIKVNPNAKWKVASWHQSAYSEANHNTKNEIDDPVLTIRNTWTKMMDKYKIDVVLQGHDHYYTRTAQMLNGNVVDPSTGAPETLKNNGSAQAPGTSNPNATYATKEYPNSVTNPKGTVYFTLDTGTGSKYYDVNKGNNDSIGGSADHSFSVVGWQGYVPSYSDISFTNDTFTIKTYATSDFTVENQTLIDSYTITKK >NC_020291.1|WP_015390691.1|639394_641560_+|YhgE/Pip-domain-containing-protein MSIIFKIYKRDMKKIITNTPLMIIIVGLLLVPALYAWINIIASWDPYGNTKGLLVAAVNNDKGAEIKNMEINVGKEVIDKLKDNQSIGWTFVEQNEAENGVRYGKYYASITIPEDFSSSLLSVAANGEPNRAKLIYSVNEKINAIAPKITKSGLTSLQSEITKSVTEEVSNTILNYMNAYGTELEQIKPQLENFINVVSDIDTNLPQIGESINNAYNGAVNMNNFIKNIQGNIYNITNFLDNAQNVIKASNDFFTKFNSAIKNISPYIKSDLAGIKANVNGAKDNLNSFKNSVDTDAKGAQEALKAADANVENAISVINNDINILQSINDILHSDLLSSFINKMQNIRDQLVQNKLNIDNLIKTLSNGSKNFSDAVASVIQNIDKISQFMDDSIGNFDNTISPQISRLVNNTTDMANNSLGLLESEKNTMPLINNLLKDADIGTALGEEHIKSIKDKFPQIEESIHANTEKLKNLNDDEKFNELATFLQKNTKNVSSFLADPIELVQNRVFPIPNYGSAMAPFYSTLAIWVGGFTLLSILSVHVEPFEKVKNLGTTKMFFGRFLTLATLSVLQTIIIILGNLFFIKTYTVDPVVLLIFSIYVGLVFMMIIYTLVSVFGNVGKALALIIMVLQVSASGGTFPIQLTPKFFQNVSPMLPFAYAIGGMREAEGGIIWSSLYYNIGILSIYFFISIIIAIFLKEKVNKKSEKFVNKMRESGLVGE >NC_020291.1|WP_015390692.1|641802_642036_+|hypothetical-protein MKSLLNVFILLALIVALLLAVIAIIRGYKGMKISKQFETSDKKIKFAYWLLSAIHMWVGIVVTLCYVIAGMLILNRL >NC_020291.1|WP_015390693.1|642048_642303_+|hypothetical-protein MGIILLPFIAAIIGIIIFLICFIGTCLIIIGGTGMAMNKIYLKQMKTNNVLLKPQFNISSIILGIIFIIFPLGCVLSGVIYSLA >NC_020291.1|WP_015390694.1|642938_644183_+|DUF2334-domain-containing-protein MIYDKQLFSIESNLKISFEGKLLKFISPIYRDINRYFLPLVEFIGLIGGAFNITGSKIDILFKGKSPIFINYETDDYKFTLVNSVLYLSLFDICSMLNAKSKWDYDSSSIFLYLDRNKYESYTRPPGRNALIRFEDVTAGDEYLDSDNLEKFRIVADYMFSNGVPFHIAWIPRFVDPPNSIDNDISKDYSMPNSNFLFTMEYLLSRNGVIGLHGYTHQYQKEVSADGTEFNEERNNDEKSIRKRVEAAINMAKKLELPVKFFESPHYAATQFQQSIFEQYFDVIYEGYVGIWGRKIVKSPRNHRTLYIPTPLSYVEDKDSTKEMLDRINHLSENTLASLFYHPNIDFEYITLQNDTSGYPISNYSENSPLHRIIKKLYDKGYSFAKITDLGFNNTKNISIELVRLYKYFKNKIL >NC_020291.1|WP_015390696.1|644466_645087_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MNQEQETHAPRQKRSELTRSKILDTALELFCQKGYYKTTTNEIATCANISIGNLYFYFPNKETIFLEILDRYHQSFLAIHETFLSEMENLNDNFRDFLMKLMEVIIKNHEESKALNQEIQILSFSNPKVAEILETQQTHVENAVLRYFQKIKDKIKVHDIEAATSITFSLINSIVDQIVFSKNKISRKRLLEETVNAVEAYLFVVD >NC_020291.1|WP_015390697.1|645138_646329_-|alpha/beta-hydrolase MGFLFKNKHFDYQALRTLGTTPVGQADISEVTATSQKIKNGSCSSWCTEWEKTADRVRKFGEECLKEGLETSASESFLRASNYYRTAEFYLNYGSNKEYMDKINTLSTQCFNLAIKYGPYHIEPVEIPFEWISLPGHFYHADTKGPAPTIIVISGNDGTKEELYAIGIAAIKRGMNCLAFDGPGQGESIRRRNIPFRYNYETAIFPAVDFVLKDLSVDHDRIILWGESLGGYFAPRAAAFEKRISACIANGGLYDCLSLNPKKREATLNKIHKHATTFNLISRMLMKMSVALDWRFRHGFLTFGVDTPAEYVLSYKNFCLDGVTSKISCPVLVIGNESDKKAWNTQSKILYDKLECPKDYLFFTNNEGAGYHCQVGCRIYANDRIFNWIEKTIATI >NC_020291.1|WP_015390698.1|646473_647268_-|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase MKEKQKYIVITGASSGIGYETAKAFAKRNKNLVIVARSKDNLEKLKEEILQENPLLNVIIKCVDLSITSKVHQLYEELKPYCIETLINNAGFGNYSSVADQDIEKIETMLRLNIDALVILSSLFVRDYKDVTGSQLINISSSGGYIIVPNAVTYCASKFFVSTFTEGLARELKACNAKLQAKVLAPAATKTNFGNIANNVQKYDYDKSFGTYHTSKQMADFLLKLYDSNEVIGLVNRETFEFELSSPLFNYSGNSQNNQTCYTL >NC_020291.1|WP_015390699.1|647376_647748_+|MerR-family-transcriptional-regulator MNYSIGEFSKLTNLSIDTLRYYEKEGLITPERKENGRRYYSEKDVTWIAFIKRLKETRMPIKEIQEYAKLRAIGDKTMAERMEMLIKHRTALEEEIMRANENLQKLNEKIDFYKSAIDEKLIL >NC_020291.1|WP_015390700.1|647940_648642_+|radical-SAM-protein MSNFSYKDIYMEDVRRVLEVNILPEKHCNFDCIFCPIGRSQNKVDTQKSFDKIDSSLAELESKIETGKAELIFINSKGEALVHDKIDDIIDFVKAKGLQVRLLSNGYLLSREEYIEISNKCDEVVGEIKVITEEDFQKVQRPIEGYTLAEYISNMASFNKQYKGKFIFEITIIKGYNDDEKSIEKIKAVIKEISPDEIIVARMEEDRFKKKLGITDERYEEISKALLDDVWKF >NC_020291.1|WP_015390701.1|648721_648973_+|hypothetical-protein MLEYRYDTQLLIEGENLDEDKINEYFTKNFKGDCLLAVGDEELIKIHYHTNEPWKVLEYCASLGEIYDIVIEDMERQSKGLKG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_020291_5 | 1174106-1174207 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_020291_5
|
1 spacers
spacers of NC_020291_5
>5.1|1174133|48|NC_020291|CRISPRCasFinder AACTGGATGGCAATATATTGGAGGTACATGGTACTACTTAAATCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_020291_5
The CRISPR arrays of NC_020291_5 >merge|NC_020291|5|1174106-1174207|CRISPRCasFinder ATCAGATGGTACTAGAGGTGCAATGAAAACTGGATGGCAATATATTGGAGGTACATGGTACTACTTAAATCCAATATCAGATGGTACTAAAGGTGCAATGAA >NC_020291|5|5|1174106-1174207|CRISPRCasFinder ATCAGATGGTACTAGAGGTGCAATGAA AACTGGATGGCAATATATTGGAGGTACATGGTACTACTTAAATCCAAT ATCAGATGGTACTAAAGGTGCAATGAA
>NC_020291.1|WP_015391159.1|1171445_1171982_+|glutathione-peroxidase MIYDFNVKAVRGREVSMEDYKGKVLLIVNTATGCGFTPQYEGLQKLYDKYKHNGFEILDFPCNQFLEQAPGSDEEIVSFCQLKYRTTFKTFSKIDVNGENASDLYKYLREQAPKAAEDEASEGLYDKLKGYGFSTDGDEIKWNFTKFLIDKEGNVIERFAPTYEPEKIAEKIEELLKK >NC_020291.1|WP_015391158.1|1170973_1171285_+|thioredoxin MVKVIEENVFKSEISEGIVVVDFFATWCGPCKMLSPILDDLSAEMEGKVKFIKVDVDSCTEIVNEYDVSNIPAVFIFKNGEKKDVLVGFSPKENIKEKIDLYL >NC_020291.1|WP_015391157.1|1170090_1170957_+|NAD(P)/FAD-dependent-oxidoreductase MSERYDLAIIGSGPAGLSAALNAKIRKKKFIIFGTNELSAKLTKAEKINNYLGFYGKSGAEIRDEFVKHLDFMDISIKEEKINNIYAMGDYFALMVNEKMYEATSIILATGVNFGKPFKGEEEFLGKGVGYCATCDAPLYKDKVVTIIAYNKHEEAEVNFLSTIASKVYYLPMYKEKVDVNESVEIIKDIPLEIIGDKKVNKLILKNSEIETDGIFILRDSVAPGQLVPGLKMDGSHIEVDKKMKTNLKGCFAAGDIVGVPYQYIKAAGEGNIAALSAVSYIDEVSKK >NC_020291.1|WP_015391156.1|1169573_1170047_+|glutathione-peroxidase MNFYDFAANKMNGKEIKMEEYKGKVILIVNTASKCGLTPQLEGLENLYKEYKDKNFEILGFPCNQFANQDPGTNKEISEFCLINYGVTFMMFEKIDVNGQKAHPIYKFLKENAKGTFGSEIKWNFTKFLIDKEGNVIKRYAPITTPEKIKSDIEKLL >NC_020291.1|WP_015391155.1|1169040_1169475_+|MarR-family-transcriptional-regulator MDKYNSIKLENQLCFPIYALSREIIKLYKPFLDKFNLTYTQYVTMLVMWEDEKITFKNLGKKLHLDSGTLTPVLKKLESANLIIKYRTKEDDRVVVVELTEEGRKLKDDILEVPQNMFCKLQMSGADALELKNRLNDVLKIFDN >NC_020291.1|WP_015391154.1|1168026_1168791_-|dioxygenase MIKPLFLAHGSPMMAIEKSVYTKFLNNLGHSINPKAIVVFTSHWTTEKITISSIDSIYDTMYDFYGFPKELYQIKYPAKGSSSLALTIQNKLIASGIQTKLDSARGLDHGTWTVLQHLYPNADIPVIQVSINCTLSVEEQIRIGAALKDLSQEDILIIGSGNTVHNLRLVNWDSSDTDPWAQEFDDWLINKIETNDFKALYDYRNSAPHANLAAPTQDHLVPLFITLGSSPNLSPKIIYRDYQLGNLSYLCYEF >NC_020291.1|WP_015391153.1|1166430_1167888_+|MFS-transporter MDSRKINIMIALLVAMFLGAIEGTVVTTAIPTIVKELQGFEIISSVFSVYLLTSAISTPIYGKLSDLYGRKNILSIGIIIFLIGSFLCGLSQNMYMLIICRAIQGIGAGAIFTVTYTIIGDVFTIEERPKIQGIISAVWGIASLAGPFIGGILIDILSWHWIFFINIPFGIVSVILIQRNLNESFEKKKHKIDFAGIITLSAAMLVFLNIFMSTENTNTTSNKFIVISLVITIVLLMLFYKIEEKAEEPIVPFDIFTKSSTIVNLVSLLDSTILIGANVYMPIYIQNVLGFSPEISGLALAPMSASWLIASVFLGKMIMKHGGKAVIVMSNIILFISTVLLITLDIKSSLVIVLVYVFIMGFGFGGAFTTLTIIVQESVEFNQRGVAMSTNSLLRTLGQTIGVSIFGSIFNLYIVKYFVKLGINGVEPSDLYKASSGNAILTSEQISLSLNSSLHVLFIIFVVICIVASALSVLMPKMIESYEKR >NC_020291.1|WP_015391152.1|1164734_1166210_-|6-phospho-beta-glucosidase MTIRRFPEGFLWGGATAANQVEGGWKDGGKGISVSDCARHHLDVDVTNYKKHNTVTSKDIEEALKTDDESLYPKRHGSDFYHHYKEDIKLFAEMGFKVYRMSIAWSRIFPNGDDIEPNEEGLQFYDNVFDECLKYGIEPLVTMSHYEPPINLVLNYNGWYSRELVGFFEKYVTTICTRYKDKVKYWLTFNEIDSMIRHPYTTGGLIEDRFPGMNWEQVIFQAMHHQFIASALATKICHEIIPEAKVGCMLTKLTYYPYTCKPEDVLKAQQDMRATYCYSDTQVFGEYPSYLLARFKNNGIIIKKEPGDDEIMRNYPVDFVSFSYYMSSCTAASTEGLDISAGNTITAIKNPYLPSSAWGWQIDPIGLRISMVDLYDRYRKPLFIVENGLGARDEVNTDGTIDDQYRIDYFNSHFKSMLDAIEYDGVECLGYTSWGCIDIVSESTKQMSKRYGFIYVDCDDYGNGTFKRIPKKSFYWYKNVIKSNGECLFEN >NC_020291.1|WP_015391151.1|1164443_1164635_-|hypothetical-protein MHNEKNRNNANTGNNSEELLIDISSSKSPASDTEDMLETNNSNISRSSISPETIDVNDDDDDD >NC_020291.1|WP_015391150.1|1163599_1164328_+|DUF523-domain-containing-protein MYIISACLCGVNCRYNGKSGSNERCLKLFREGKAVLVCPEQLGGLPTPRNPVELDNTASQIIEGNGKAISNKGEDVTEKFLNGAYETLKIAKELGATKAILKEGSPSCGANFVHDGTFTGNRINGKGITAKILENEGITVFSDEDLEINNSKLVYLNEFDREKAKKRRLFELEEEDDEEEEYFDLTENLTDMSELPPKVEENVKKLMISLARDLMGFEELDEIAEATGLSIEEVEEILNEEE >NC_020291.1|WP_026106441.1|1174587_1175823_+|exonuclease-SbcCD-subunit-D MRILHTGDWHLGKNLEGISRMDEQEEFLNDFVEIVEENNIDLIMIAGDVYDSSNPPARAEKMFYDTLKRLSKNGERLTLVIAGNHDNPDRLVAAGPLAREHGIIMVGTPKTVVPCGDYGKHKILDSGEGFIEIEINNEKTVILTVPYPSEKRLNEVIYNYMEDEEEKAQSYSEKIFSLFDSLKSHYREDTINLVISHLFAMGSEESGSERSIQLGGTYIVDGNCFPKEAQYIALGHVHKPQVVPGTNKRARYCGSPIHYNKKEINFEKKCYIVEVKAKEEGKIEELNLKVYKPIEIWKCADIDDAIAKCEENKARKCFVYLEIETDRYIREDEIKQMKELKKDILEIMPKIKGTTEEEVDFNLNEKSFEEIFIDFYTKERGTAPEEDVVSLLLSIINEEEGEINETSKIED >NC_020291.1|WP_015391162.1|1175797_1179286_+|AAA-family-ATPase MRPVRLKIRGLNSFIDEQTIDFDKLTDRGFFGIFGPTGSGKSTILDGITLALYGNLARKSSNFINTNCDRLNVNFEFQISGSETRKYIIDREFRRKKDGSINSGKCKIVDITDSEEVLADSVKNMNKKVEEIIGLNLEDFTRTVVLPQGKFSEFLKLEGKDRRDMLERLFNLEQFGDNLTRKLNTKISKERTENSVLIGQLSVYSDISDEKLKEKQAELQLTILNLENLKKELDNIEKNYKENEELWKLQLELLEYKNKEKLLKEKEEEINKDIEKIRLGEAGEKVIPYIKAYENTKKEFTKNEVEFQDLKVKIEKIKEEQENIEKSWNEIKDKKENKLPQLMIQEEKIKNAIEEKKLLEKILAEINMLMTHIEEVKIKLEKGQKDLIEIENEIKIKDKEIKEDEKRYDEIKIDELIKEKVQEGILCEEKISSLKNNISKDTEKKAKIEKENDDIIASGKALKETIEEATKELEEKLNQHEYLLNNPPGEQKDLLNLKQVILENEQNWSNFNKFTNEIAASKKEIVKLNTEIEKIQMEEAKNNQELEELKAKEKEIMTENIAHTLRMELKDGEACPVCGAIHHIKENIKVLSATDISLIENKIKEKEEFIKVVNNNIIENQTKVITLNEKISNNESEIINIGSEFKEKTLEKLQEEFINLEKALENYNKDKEGLDKIINELKNNINIKNGEINELRAVVRTNMKQLKELEENIKVNTQEFNELNNNVNLLKSETLITNFIEKNEEIKAVEKERERLAKKIKENRVAIENLENRKEKLNNEVISIKELLVKYNADLAAYEKNRDEKLLAIRSKVSEESNLDNMLSEVQENIKNINEEFFSAQKNKDRIQKEFTDNNEKLIDVGSKYKELIKRKKDEEAQLEVSIDSEGFKSLEEVKANLIEKEEINKYKEKIDDYRENLSKVKGTIESLLNKIDGKTLNEEDYTKVKLLKEQKEIEFSSVNENKIKVDEELKKIKIKLNEQRELFEKKNKLEHKLALLGDLEKLFKGKKFVEFVAINKLKYISIEASKRLREITHGNYGLEVDENGKFMIRDYKNGGAERDSSTLSGGETFIASLSLALALSAQIQLKGTAPLELFFLDEGFGTLDDELLEVVMGSLERIHNEKLKVGIISHVEAIKNRVPIKLMITPAECGMGGSKVRIERS >NC_020291.1|WP_015391163.1|1179358_1181005_-|hydroxylamine-reductase MVQEMFCFQCEQTAGGKGCTKVGVCGKTPEIAAMQDLLIYQLKGISIYANELIKKGEVIDKTIVSFVEDSLFMTLTNVNFDPAAHLTKLKKSQEIKEALRKKVSTDGIKAPEALYDLAASTEAMLEDAKKAGIMYDENLNPDIRSVRETIKYGLKGISAYSHQARFIKHSSDEVDNFYFKALAALTDNDLTLDDLIKLLVETGEKSVKIMETLDTANNGLYSSPTPTKVNVNIKKGPFIIVSGHDLKDLEMLLQQTEGKGINIYTHGEMLPSHGYPELNKYPHLVGNFGSAWQNQQKEFDNIPGCILMTTNCLMKPKDSYQDRLFSTSVVGWDRIKHIEKDENGHKDFSEVINKALELGGFKEDEEVKEILVGFGHKATLSHAETIINAVKDGKVKHFFLIGGCDGAKPGRNYYTEFAEKVPKDSIILTLACGKYRFNKLEFGEVAGLPRLLDVGQCNDAYSAVRIALALADAFNCGVNDLPLSIILSWYEQKAVADLLALLSLGVKGMYLGPSLPAFLTPNVLQFLIDNFDIKPISTPDEDLKQILG >NC_020291.1|WP_015391164.1|1181194_1181938_-|response-regulator-transcription-factor MNIKVLIVDDEQGMRTIIKKILDKSSGFEVVGDTDNGEEAIKIFKEHRPEVVFFDIEMPGCNGIDCAKILTDIDPKTIIIFATAHQEYMSDAFQLYAFDYLVKPFKIERVLHTLDRIKTLNKPNYEDGIDKIIKHEKGLDKLMIKNKEGISFVDTKEIVLIQREDSSTVIYTQSDSFTTSISLSEIEEKLDHSQFFRSHKSYIINLSLITKIYPYGRWTYIVKLKNTEKDALLTHEKYEEIKKLFSL >NC_020291.1|WP_015391165.1|1181956_1182337_-|hypothetical-protein MKSNEIFKSTLTALKDSFITNDKIGLRVNFQYPFGTLPKNEFTISTSLRPEDDNGASDVSIPVGDNKDYTEANSSYNKQQSASSNPQGVIDSITQELTSVKLQQAIILSEIVGKPRSKTRRQRRRF >NC_020291.1|WP_015391166.1|1182364_1183339_-|flotillin-like-protein-FloA MINLIIVAIAVVCLVFLFITFIPIGLWISSLAANVQVSIFNLIGMRLRRVVPSKIVIPLIKSTKAGMGLTVNQLEAHYLAGGNVDNVVNALIAAHRADIDLQFEKAAAIDLAGRDVLEAVKMSVNPKVIETPNVSAVAKDGIELLVKARVTVRANLERLVGGAGEATILARVGEGIVTTVGSSTSHKIVLENPDAISKTVLSKGLDAGTAFEILSIDIADVDVGRNIGAQLQTLQAEADKNIAQAKAEERRAMAVAKEHEMRAAVVEAESEVPKAMAYALREGKLGIMDYYDMQNVIADTSMRSSISSAGNKTQISNNDNKKMK >NC_020291.1|WP_015391167.1|1183411_1183909_-|membrane-bound-serine-protease MSTFLPDITLLTLLLLIIGFGLVFLEMHIPGFGIPGILGAICLILAVALTAQNFAEGLVMTLGILAILGIMLGVVLTFFTKGKFFKPLILPDVQRKEHGYISSSDLDYLLGKKGIALTDLRPSGSIDIDGVKFDVISDGEYISSGTKVEIFKVSGVKLLVKKTKD >NC_020291.1|WP_015391168.1|1184108_1184957_-|GHKL-domain-containing-protein MAIKKQVYNISKIVLVSIFLNLIQIISITLFIYYKYKNPYMIEGNFILNVIAISIGVNSIITGIIFYNLLFKKGNNNLIDTLNYLEALNKTLRTQRHDYLNHIQVIYSLMELEEYDEARRYIEPVYKDIIRVSKALKTSKPAVNALLQAKLQVAEKNNIDMELEIKSDLQYLNIEPWEFCRIIGNIIDNAIFSLKEKPDNKYILVEFSEDLENIRINISNNGNMIPKDIIDKIYDAGFTTKGNKGDGMGLAIVKEIIENFSGTISVISTIQRTSFEVVIPKK >NC_020291.1|WP_015391169.1|1185228_1186956_+|phospho-sugar-mutase MNYKEKYNLWIESDVINEETKNELKSISDEKEIEDRFYQDLDFGTGGLRGIIGAGSNRMNIYTVAKATQGFADYLNANFKEPSLAIAYDSRNMSKEFAKAAALTLCANNVKVFLYESLRPTPVLSFTVRELKCAGGIVVTASHNPKIYNGYKVYDEFGGQVTDEKANIIINCVNAVDDFSKIKSIDEKEALEKGLLKYIGEDVDRAYYDRVKGLTIRTDLVKEKADNLNVIYTPIHGSGNVPVRAVLKELGYSNVKVVKEQEAPDGNFPTASYPNPENPDVFKLALDMAKDENPDIIFGTDPDCDRIGVVVKDSSGEYKVLTGNQTGLLLTHYVLSSLKETNKLPQNGVVIKTIVTTEGARSIAEDFDIELMDVLTGFKYIGEKIREFEDAGNKTYLFGFEESYGYLAGNFVRDKDAVIASMLICEMCLYYKQQGKSLYDALIDLYEKYGYFTENLVSIELKGKEGQEKIASCIEAMRNDPLNEVDGVKIVKRLDYKLSTEEDTVNNTKTTIDLPKSNVLKYILENGSYFVVRPSGTEPKMKVYLAVKSNSLDNAGKDIAEFKEKVMEKINAKLS >NC_020291.1|WP_015391170.1|1187114_1188215_+|tetratricopeptide-repeat-protein MSNYKTLYKDKLSKLLFLEMKKEGFKKNLNIPQEVKFKNDDLYMPISAEYVAANANNEIKLNNLPIYYFVEGMFIVFGADKNVKYIDDYGTILGYIPDSEECVKSLIADRIKKDRLEDAYILLKGLYRYTKEEEILTKLLAVGETIREKDSSFGELLLEDIDECKDNFEKSPEPYLYKALILKDKGDYKGAQVEINEYMNKGGKQTSEIKQIITDINNIGGFEKAVEYLKDEPKKAIDLLLPLSEEFKENPLIYYYLGVGYRRIDNYNKAIHYLTQSLSIESGSLETVNELGMNYACLGDYEEAVKYFRKAFEASKEVEICTNIVMCYINLGDKEQAKLNLDIAKKLAPEDPIVIEIDQMLNRTVK |
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NC_020291_6 | 2066409-2066536 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_020291_6
|
2 spacers
spacers of NC_020291_6
>6.1|2066435|20|NC_020291|CRISPRCasFinder TAGCTGCTCTTTTTATAAGG >6.2|2066481|30|NC_020291|CRISPRCasFinder TTCTTATATGCAGATAGTTTCCGTATTGCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_020291_6
The CRISPR arrays of NC_020291_6 >merge|NC_020291|6|2066409-2066536|CRISPRCasFinder GCATAGCCACTCTTTTTATGAGTGCATAGCTGCTCTTTTTATAAGGGCATAGCTGCTCTTTCTAAGGGAATGTTCTTATATGCAGATAGTTTCCGTATTGCAGCATAGCTGCTCTTTTTATAGGGGCA >NC_020291|6|6|2066409-2066536|CRISPRCasFinder GCATAGCCACTCTTTTTATGAGTGCA TAGCTGCTCTTTTTATAAGG GCATAGCTGCTCTTTCTAAGGGAATG TTCTTATATGCAGATAGTTTCCGTATTGCA GCATAGCTGCTCTTTTTATAGGGGCA
>NC_020291.1|WP_015391958.1|2065459_2065996_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MLDVKYYIYSLLMYLLICISPVILYIKFKEKANVLAYLKLTGNSRKGVIVGSVISIIFVVLIIIKNTIIGFDKFNTNLGLLWISGLLVGFFEEIPFRGFLLQKLWNHMNFWKANLLTTIIFVLFHIPVWMSSNTPLLKAAVSIGAVSLALGYLFKEYKSLWIPIICHSIYNLCIWMGL >NC_020291.1|WP_015391957.1|2064492_2065089_-|AgrB-like-protein MILSKPLSEKCTKFIKNNTSASTEDLEKIHYGILVIFLTIFKSIILFATAYFLGILGYALTAFLVFAALRIFASGVHANSTFQCIIINYILFFGNVYLSRNIQRNLLLVSILFLISFALILLYAPADTEERPLISLKLRKSLKIKSIIVIIAFYILALLLHNNIYTNLITFSILEGALVVTPIAYRLFGKKYANYKNL >NC_020291.1|WP_015391956.1|2063473_2064205_-|response-regulator-transcription-factor MNNIIICEDNLDQRKKIEAIISNETKKFNCKIALSTNNPHEVIQYIDNSQNSFIYFLDVDLNSDLNGFQLAHLIRTYDPKGYIIFLTAHAELTLLTFQYKVQALDYIVKGDINAIKVKIADCLNAVHNNLNAAKTKNDNKLSIDVGSNVIFLDFDEILFFETAGKEHKISVHTFKGQYEFYGTLKNIEQAVSSNFYKTHRSYLVNTKKIKSIDKSKMIVEMTNSEICYVSLRYIKGLLKKCLK >NC_020291.1|WP_017810738.1|2062163_2063486_-|GHKL-domain-containing-protein MLEIVLNILFPLIIMLEILVPALNFTFFVKPNKNILIKFSIIIYILIGYFFINTKAALPIYVMPLCIFTCLLLIYRNFFISVIFSAFIWILLFISDAITGAILIYLLKYNYSDINANLLLNFMSELLILLNVFVLSKIIRLILLKISSRIDINIKISNKPPIAFIISILLIIFLYYQYSLKDFVVTWNKNMLLFNALNLFIFFILITTITYYCFTILVNKHRSKEYSQLQNYTNMLENMYSDLRSFKHDYLNILSTLAGYIETDDINGLKNYYYNDLLPESDEIVNKDMSLSYLSHIKISPLKALLSSKIVNAHSKGIDVKIEMADDIELINMSVIDICRIIGILLDNAIEASILCDNKFIHFAAINTDNEVIFNIRNSCLSSTPPIHKLYQKNFSTKGEGRGLGLNNVKDIINKRYKNVLFNTTIEDCIFVQELLIRNK >NC_020291.1|WP_015391954.1|2060675_2062094_+|cellulase-family-glycosylhydrolase MFKVKKGVALLIAYALTISCVPMIHGNAAEISPINSSIEKNLNQDVVSSTNSDISTSSFVTCDGNKFKVDGHDFYFVGQNNYYLPYAPDYMVDDVFADAQAMGSKVMRTWGFIDGASSCDVVLQPSLGVYSEEGFKHFDYAVKKAKESGIKLVIPFVNNWKDFGGMDKYVEWTGAGNHDAFYTNEACKTAYKNYIYHFLNRTNTYTGVKYKDDPTIMTWELGNEPRCKSDATGETLYNWAKEMSEYIKSIDSKHLVALGDEGFFKRDGAKYNWDWNYTGGEGVDWDKLISIPTLDYGTFHLYPDGWNESVDWGTKYIKDHIDAANLVNKPAVLEEYGIKNNQLNVYTTWGNAVINNGGAGLMPWMLSGIGFDNRTLYPDYDGFRIIYPSDIATLLSDNAKVMNAKSIATTGPSVMLGDVNEDNAVDVLDYTALQKYLLVGTGDINKANADVNKDARINTADLFALRKIILEG >NC_020291.1|WP_015391953.1|2058820_2060647_+|endoglucanase MIKTKKGLAFLIACALITSVLPMTSVHAEETNSINISIDTGADNAKISPYIYGANYDSNGNEGTIPQVATASRLSGNRLTGYNWENNASNAGSDWKHSSDNYLNMNRPYDTQNIPGEVVTNFHDEALKNGSTYSLATLQLAGYVAKDKNGSVSESEAAPSARWDQVKVRKGSAFSQTPDLTDNYVYMDEFVNSLISKYGKSDTATGIKGYSLDNEPGLWSGTHPRIHKDKVTCAELISKGTDYAKMVKDMDSKAEIFGPVLYGMGAYQSLQSAPDWDSVKGNYKWFPEYYLDNMKKASEKDGRRLLDVFDIHYYSEATGGGIRVTESNDTNVDCNKARIQAPRTLWDSTFKEDSWIGQWCGDFTPIIPKMQSAINTYYPGTKLGITEYNFGGNNHISGGIAQADTLGIFGKNNVYFAALWPFDGKSDYTQAAFNLYRNYDGKKSTYGDIKVKAETSDVDNSSVYSALDSKDPSKLHVIMINKNYDKPMTMSFNIGGNKVYQSGKVWAFDESSAQITERTPITNITDNKFQYTVPKLTACHIVLDLKQGSTTMPGDVNNDGEVNVLDYIALQKYIMNPSAGIELKNADLNGDGKINSADLFELRKKINE >NC_020291.1|WP_015391952.1|2056653_2058795_+|endoglucanase MLKRKGYISSIISIILLTGFIGTLCPIKVKADESSIKYNYGEALQKSIMFYDFQRSGKLPNDKRDNWRSDSGMDDGKDVGLDLTGGWYDAGDHVKFNLPMSYTSTMLAWSLYEDKEAYEKSEQLKYIKDEIKWANDYFIKCNPEKDVYYYQVGDGGQDHSWWGPPEVMQMKRPSYKVDINNPGSTVTAETAASLASAALVFKDSDSEYSQKCLKHAKELFEFADETRSDSGYKAASPYYTSNSGFWDELSWAATWLYMATGDSAYLDKAESYVPHWSVEQQTSTISYTWGHCWDDVHYGAELLLAKITNKETYKESIERNLDFWTTGYNGRRVTYTPKGLAWLSDWGSLRYATTTAFLAGVYADWSGCSKEKASTYNNFLESQVNYALGSTGRSFVVGFGENSPKNPHHRGAQGSWLDDKKVPGYNRHVLYGALVGGPSSNDSYTDDVENFRCNEPACDYNAGFVGALAKMYEKHGGEPIKDFKAIEQKTNDEFYAEAGVNASGPNFMEIKALLYNKSGWPAKVGDKLSFKYFIDISEIIKAGYTSKDITISTNYNQGAKVSNLIPWNEAQNIYYVNVDFSGTKIYPGGQPNYRKEVQFRMSAPEKCSWDNSNDFSYKGISTVPGGTPLQTSNIPVYDDNVLVYGNTPDKGDKPAIIGDVNNDGEVNILDYIALQKYIMNPSASIELKNSDLNGDGRVNTSDLFILRRTIIEQ >NC_020291.1|WP_015391951.1|2056237_2056381_+|cyclic-lactone-autoinducer-peptide MTISRIKGLVAMGLSAAAMFVAATSSSMCFSCHFEEVKMPKSLYKRD >NC_020291.1|WP_015391950.1|2053441_2056057_+|cellulose-1,4-beta-cellobiosidase-CelK MIRKKIACLMLAGSLFMSFVPTTFANAADKVSVGNLIKNNTFDNGVGLPWNQVETYPADADFDIDNGTYNVTIKTPDETKSKDTRWGVQFRHRGLTLEQGHTYEVSFTVKATADCKVYPKIGQQGKEYKEYWNYNHKGWEPLSLKANQPVTVKETFTMTDPTENACEFAFHLAGDCLAANLPYTVSFDNINLKDPQFPGYDKEPEEPTNAVRVNQVGYFTDLEKKATVVSSSTTPIAWRLLDSSNNVVKSGQTTVFGKDHASGDNVHTIDFSDFKTEGKGYKLAVDSADVSPKESMKFDIGNSIYSKMKSDAIKYFYNNRSGIEIKGNYAGRADLARPAGHPNDVLGNAPNTWYKANYTLDVTGGWYDAGDHGKYVVNGGISTWTMMNQYERALYNKVDLKRAPFGDGTMNIPESGNGIPDILDESRWNLQTLLKMQVPDGNELAGMVHHKAHDERWTALGIRPDQDPQKRYLQPPSTAATLNLAAIAAQGSRLWKSYDSAFASKCLASAEKAWDAAVAHPDKLAPLTGAIGGGAYGDNKVDDEFYWAACELYATTGESKYLDYIKSSKYYLQMPTSLTGGEDNGITGPFDWGNVQGLGTITLALVPNGLPKEDVDTAKKNIKAAADAFITNENKEGYGTPMTEGPYGSPLNDGSAPSGKGYPWGSNSLVVNEGIVMAYANDFSDKTDNKYINGAERSMDYILGCNPNVQSYITGYGSNPLENPHHRFWAYQTDNTFPKAPAGAMAGGPNSGLEDPWVKGSGWKPGSRPAAKCFMDNIESWSTNEVTINWNAPFAWMSSYMDDNGGQKGGNAVKGDVNNDGEVDSMDYIALQKYIMDPSNSNINTANADLNGDGKINTADLFALRKTIINS >NC_020291.1|WP_015391949.1|2050799_2053025_+|endoglucanase MIKAKLKILVASVMCSAICLTPLFNTAAMAATTAQNASTTQTDEYQQRFMTMWGKIHDSKNGYFKNFTDGGTTLKVPYHSVETFMCEAPDYGHETTSEAYSYYMWLEAMYGKFTGNWNEFKNAWDSADKYIIPHGQDQAGMNAYNPNSPATLANEYPTINKYPSKLLFGTPVGKDPINNELKNAYGSGEMYGMHWLLDVDNWYGYGNRGDANSNAPAYINTFQRGSEESVWKTVPQPSYETFKWGGKNGYLDLFTGDNNYSKQWRYTDAPDADARAIQATYWADEWAKTQGKDVSQYVSKASKMGDYLRYSMFDKYFKPIGVGADQQTEASGQHYLLSWYYAWGGGAGGDWSWKIGCSHNHFGYQNPMTAWVMSKDADFKPKSSGGASDWNKSLDRQLELYQWLQSSEGGIAGGATNSLTTDAGSYQKYPEGTPTFYGMAYDWQPVYHDPPSNNWFGMQTWSMQRVAELYYKTGDKRAQAVLDKWTKWVKSVVKLNDDGTYAIPNNLTWSGQPDTWNGTYTGNPGLHVDVKDYSQDVGVTSSLANTLTYYAAASNKYSTFDKDSAKLAKELLDRMWKLDQDSKGLSVEEERADYSKIFDTKVYIPDGWSGKMPNGDVIKPGVSFLDIRSKYKQDPDFAKVEEAYKEGKAPVFKYHRFWAQSEAAIANGAYSILSKEFPADSILKGDVTGDGTVDIQDYIALQKYILDPATQINAANADVNGDGRVNTADLFALRKMVLDNQ >NC_020291.1|WP_015391959.1|2066706_2068188_+|cellulase-family-glycosylhydrolase MKIKVNYIAIIMTMLFSLMAPINVLAAENDNSDDYLHTDGSKIFDAEGNEVRLTGIAWFGNETPNYSYHGLWANTLDDILDKVADNGFNLLRVPLSVQLVNEWRQGNYPMPDSINDYVNPDLKNKNSLEILDKSVSVCKKKGIKVMLDMHRVIDGSQSNAWYTDKYSVEDYEECWKWLTNHYKNDDTVIAMDIFNEPHGKAYRQEQCAKWDESTDADNWKHEAEKVGKEILDINPNLLIMVEGVETYPKEGKDYSSKDVNNYYGTWWGGNLRGVQDHPIKIENHPNQVVYSPHDYGPGVSNQPWFENGFTKESLVKEVWEPNWFYIQQKNIAPLLIGEWGGNMDGSDNQKWMQGLADFIKENNINHTFWCLNPNSGDTGGILGYDFKTVDTAKMALVKPTLWQEKESGKFIGLDHKINLGKNGTHVAANTNVNPAVKLGDVNGDGSVDTMDYIALQKYVMDSSNTINTKNADINGDNRINTADLLSLKKLILQ >NC_020291.1|WP_015391960.1|2068222_2069362_+|endoglucanase MRIRLKGFLQLASMVIVTLIMFGNVQVASASTEIQNNRELQYGAWIGSWPTAQGLTDFQNLQQRHLDVVNMFIDWNTDFDHIKPNFDAIYANNSIASLTWEAHGLSNADIRDGKKDNYIRQMAKDIKAYNKRMIIRLFHEANGNWYAWAVGDSKINTNETYVAAFRHVVDIFRQEGAANVKWDFNVNASSVGQGASYLGHYPGDDYVDIISIDGYNWGTTQSWSSWQSFDQIFSQAYNALKIKNKPMAISEFSSAEKGGDKAKWYEDAFNNIRSEKYNLINTVVCFNENKETDWRINSSESALEAFKKAINLGKSSNVEPEVRLGDVNDDGSKDAMDYIALQKYIMDSSNTINTKNADINGDNRINTGDLFVLKKLILE >NC_020291.1|WP_015391961.1|2069753_2070974_-|multidrug-effflux-MFS-transporter MEIIKDNYVEKEKKQKYLGKKGFLAFITLLSAFIPLSTDIYLPALPKMVESLNTNTSIVNLTLILFFAFYALGTILWGPLSDKYGRRTILIIGLTIYTIASISCVFSGNVYQLILFRILQAIGCGAATAVSTAIVKDSYSGRKLVTVLALVQSTAMLSPIISPVIGAMILSVLSWRGVFEVLGALGILTLAGSIAMEETIEKRYTGSIISSISNIGVVSRNRSFMSLLITFSIMSIPSMSFISASSYIFVDGFGLSPKVYSYYFAANAVFFLLGPLAYVKLSKHYNKIPYITIAYIVMAISGFSMFITGNLSPVIFMISLIPASFFGSLIRPQTTSIMLNQIPEETGAASSLINCALTLFGCIGMIVISSNFFNRIIIMGLMYLITSVISLILWLILSKKHEYNIV >NC_020291.1|WP_015391962.1|2071263_2072148_-|MBL-fold-metallo-hydrolase MITSTNFCKVQKLDDDLYVITQAALVHFYLILGQKKAILIDAGYGFEDIRPIIRSITSLPVMLVLTHGDPDHSYGSEYFGDVWLYQPDYGQIMGFDTKHERQFIAEMGVNFLKENKPEAIEHFDSKAFAERSLLRTLTPHFVKDGELFDLGGKTLEVIFTPGHSYGHIMLLDREKKRLFSGDMICDYVIIYFFESDRNAPFSMALDSWKKIKRLENDIKDIYSAHGQLPITMNYVDAYIECFSGEFQQNYLKDKPFDRGPLGRGYQHIYKTVNIQYSDKRLEEFLGHKVERIDL >NC_020291.1|WP_015391963.1|2072452_2072788_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKRKSEDDYVENCPISSVQKIVRGKWTMVIVFFLSQGTLRFGELSRKMPQVTQANLTKELRMLEEYRIIHREIYKEVPPKVEYSLTELGVKFLPVLKSLEKWAIEYEKMSN >NC_020291.1|WP_015391964.1|2073698_2074958_+|tetracycline-efflux-MFS-transporter-TetA(P) MVNKLSAYKIYLLFSAITAMCFSLTATVMIVYHIENVHLNPLQLILVGTTLETACFIFEIPTGIVADVYSRKLSIIIGAVLTGGGLILEGSISSFIFVLTAQIVWGVGSTFISGSLEAWIAEEERTKDLDRIYIKGAQVGQIGSVVGIVLSTVIANFSVRLPIIVSGVLFIILALFLGLYMPENNFKPSAPEDLNTFKKMEYTFKSGLKFIKSKSIIMILLSVTLFYGLSSEGYDRLSNAHFLQDTMLPKLWNLHPVTWFGIFGIAGMVLSAIVMHFMSNRLDDDKNNSGKLLLGINIFYILFMFIFAITKNFSLMLMAYLATNTFRTINEPIFSAWINGHIDDKARATVLSINGQINALGQILGGPIIGIIATNISISIGIACTSLLVTPVLILYVASMIMDKKVADRVGGGDYEENN >NC_020291.1|WP_015391965.1|2074941_2076900_+|tetracycline-resistance-ribosomal-protection-protein MKKIINIGIVAHVDAGKTTITENLLYYSGAIKAVGRVDLGNTQTDSMELERKRGITIKSSTVSFTWNDVKVNIIDTPGHVDFISEVERSLSVLDGAIIVISGVEGIQSQTRILFNTLKKLNIPTIIFINKLDRIGANSNKVLKEIKKNMSSKVVRLQKVYDEGSKEVYIKNLHDICMMNDDVINVLSDLDEAFLEKYISGMEIDKREIQEKLSLYAREGKLYPVFCGAAAIGLGIEDLLEGICSYLPFAGDDCVRDLSGVVFKIERTSTNEKKVYVRLFNGKISVRDKIQMPNKETVEKVKKINRLENGKITEAQSIKAGDIGILYGLASFQVGDVIGISNNKVKNISMAKPTLKTTISAIDKEKNPELFRALTFLSEEDPLLELEMNDLDKEIHVNLFGEVQMEILSAIIDDFYGIKVEFSNIQTIYKEAPKGVGTSIIHIKEEANPFYATVGLKIEPLGRGEGLKYISNVSVGSLPKSFQNAIEEAVIKTSKQGLFGWEVTDAKVTLTCGEFFSPVSTPADFRNVTPMVFMEALYKAQTVLLEPLHEFELRIPQNVLSKAIWDLETMRATFDNPVVIEDEFSIKGLIPVENSKEYKMKIASYTQGKGMFVTKFYGYNEVPAEFGKVNPRTTYDPLNKKEYLLHKLNAIRD >NC_020291.1|WP_015391967.1|2077233_2077533_+|hypothetical-protein MIGTGLGKILSGITIAAMITGAGIGFDRMINTNKIDSTTAVIQKAEQQIDEIGKQNDADKGTVQKLIDYVKGLEKQIDDTNKKLDDLDREASKLNSMLK >NC_020291.1|WP_015391968.1|2078239_2078992_+|SGNH/GDSL-hydrolase-family-protein MFQSKIFKMVPVVLLVFLFTLIIPKNTNAEVISGNFSEKSINNLPISKVTTVKGNDVLVIGESFIALSHDITKYLEQDARNAGVLANNENFRDYAVSGTKLSGGIYPSIPNQYNNAAKQSKVKYVIMDGGGNDCLQPTGQYAQDATNALKNLLAQMKKDEVLKVVYFFYPEPQSDFGGLKNRLDILRPQIQNIVNNNISPKCYWLDLRPVFAGKYSQYIKADGIHPTADGSKAAADAIWKVIQNNNVFNK >NC_020291.1|WP_017810737.1|2078975_2079128_+|hypothetical-protein MYLINNKYILKKLEFDKTIISEEVQNISNKEGRFLVNEIANEVLNLKERF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_020291_7 | 4306294-4306455 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_020291_7
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2 spacers
spacers of NC_020291_7
>7.1|4306318|45|NC_020291|CRISPRCasFinder TTGCAATAACACCTTTAATTATTGCTATAGTTTGACAGACATAAC >7.2|4306387|45|NC_020291|CRISPRCasFinder AGGAATGGGTGCATTCAATCATTGCAAAAATCTAAATACCATAAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_020291_7
The CRISPR arrays of NC_020291_7 >merge|NC_020291|7|4306294-4306455|CRISPRCasFinder TATTCCTAATGGGGTAACAAATATTTGCAATAACACCTTTAATTATTGCTATAGTTTGACAGACATAACTATTCCTAATGGGGTAACAAGTATAGGAATGGGTGCATTCAATCATTGCAAAAATCTAAATACCATAACAATTCCAAATAGTGTTCAAAATAT >NC_020291|7|7|4306294-4306455|CRISPRCasFinder TATTCCTAATGGGGTAACAAATAT TTGCAATAACACCTTTAATTATTGCTATAGTTTGACAGACATAAC TATTCCTAATGGGGTAACAAGTAT AGGAATGGGTGCATTCAATCATTGCAAAAATCTAAATACCATAAC AATTCCAAATAGTGTTCAAAATAT
>NC_020291.1|WP_015394044.1|4303977_4305267_-|hypothetical-protein MDNEIKRIPCKNRDCDKTILEATAVKTEGYCYPCYNSIKAKEREEYIRKNKKDVNLYEGITDLVEIIKIMHMNKKYDPLINYISYPMTKEEVYASLLPKDVKRLKKYAMELFKNDNDEWEQILLHLVCINRVNIDEILEVLIDEFKIFESSLFYNASDYIAELLMEKLKSKDDRLSINHILLALAMIGNDRVVKAFNEWKKNEPDFSKDLYIKAYEYALEGGWKLDDQGKRKNLYYEKSYGIKKGFSEKDTPVKFFKTQDGKCEWCGRKLKSLFTIDLQNENMKFLDLDGENINISTCNNCTCYGFVYTDIDTKGNATWSKYNAEPAYLNTHDDEEFEEGNYDKKVYIDLNVKADNYAANQFLEVSFTKIGGMPAWIQDAEYPKCPKCKEEMKFVGQASMEDFEDYGEGICYGFVCNECKIAATGYQQT >NC_020291.1|WP_015394043.1|4303327_4303888_+|nitroreductase-family-protein MNEVIQNILSRRSVRAFKEDQISDEDLNLILEAAKFAPSGMGKQEWHFTAIQNKEKIEQLVSAAKEVMQNSPIEQFKKMGSNPNFNPFYNAPTIIITAYEKNAPTKVSDCAVALENIFLAANSLNIGSCWIHILALAGDDPKVRSILTELGVPANYEVSGTAALGFNSKEASNAAPRKEGTVNIVK >NC_020291.1|WP_015394042.1|4302101_4302998_-|LysR-family-transcriptional-regulator MNWQQLEYFKKIAETENFTEAANLLSVTQPALSKAISKLEEELEVSLFEKNGRNIRLTRYGSMFLKHAETAISEINEGIQELKDMVNPTTGTISIASLYTIGTHFIPTIISEFLNECPNIKFEYCMESTVNILKGLENGNFDLGFYDEIEANITNNKEVESIPIKREELVLIVPKNHYLAKNTEISLEDLKDENFVFYSERTKSKICSLFENCGFIPKVIMKPSQNSLIGTGFVSAGLGISVVPNTPNLKADGVAILKIKENHCYRTIHMGWRRKGNMSSSAEKFKEFIIEEISRLKF >NC_020291.1|WP_015394041.1|4301057_4301960_-|ribokinase MKVLSFGSLNIDYVYSVEHFMKPGETQASHSLDIFCGGKGLNQSIALSRSKAQVYHAGAVGESDSAMLINALESAGVNTKYIKRVKGNSGHAIIQKDITGQNSILLFGGANQQISVEYIKEVLSNFENGDFIILQNEISCIKEIMEEAYVRGLKIVFNPSPMNSEVLKYPLNNVEYFILNEVEAREIIESEEDGEELIKAVANKFPNAKIILTLGEKGAFYRFKDIQLKHNSYSVEVTDTTAAGDTFLGYFIGSIAKEYGVEEALELASKAAAISVTRLGASTSIPELDEVINNKFIEKA >NC_020291.1|WP_015394040.1|4299244_4300966_-|hypothetical-protein MNIENSIILINDEDKTEEIVDCYQSEEDKLEVRFKNGESNTYNKDQIKLSTEGKLIELKNVVIYENEVKITNILMAIIFEEFNIVKIIFKNGENKLFEREQLNISDNGFDEAVVENNFMYFREVAKKLDLYNVYNNGVSEAFERISMINPNSALVDYLNPKEIETIEDFDFAIYPYGFNLRQQEAVEKAVTNKISIIESVSIEERTEAILNITATVVLEGKNVIIVTKDNFSTLKYLEILKKSDIDFTVNHLKEEGNNFINVCEQWLRNSGSRFGNQNIADKKEECLNIQNELVEKLENIAKIESLEKEQTYLLAENVKVEKELQSKEVNIPPAILKFNQEKLLAFKEEYISIIKKQGHIGFFTKIMFIFKYSIWDFSFYDIDPELLEKAIEEVYNDRKVDEINEEIKALKNDLDKNKIDGEIEKIQEKSMEVLKCGLYENFKYIEGMYTSQEEENEPIKKKVNYPILTSARDFFINSIYDNCIFDFVILDEAADMDIATGVLALARGRNIIVVDDLNEIKTKLDEGLADELKTVFDMNEVNSGYKYMDNSLISSLNQVFKQVPKTELSKKNN >NC_020291.1|WP_015394039.1|4298220_4298640_-|hypothetical-protein MRLYFKVKQAGSRKNFIAKEEIVLECIPTTLRELIKCIVTKNVKEFNENIKKERLVDYLTNKEIENRAEAGKVSFGSIYNESKQDLGKALDSAYLAYEDGIYKVFVGDKEAGKLDEEIELKDADTLTFIKFTMLAGRLW >NC_020291.1|WP_015394038.1|4293297_4298202_-|DUF4132-domain-containing-protein MYFDKEKEEIIFSYLKEIIEKNSSDKDIALAKEISENINPPYRELEKKADSLKVLLWDESIKAIEEVFEGENYKKIELLLQEDYAELGKVIWDNATKYPYSIGYCRRSYRTKKSSQLYLNKNIEKLKELVYLKASGFSLVKYFENNKEKYRGIDVIGDLIAVELDRDNNEVLEKIKEVIYSDNNTSIITREIIRGLLMSENEEAHRILGELLLAAKLQEGLRQVIVENLDEGSKKAFMYILKLIIDNNLIRFSSVVRGFSVWTGLYLEAEKPKLILKCFEAAYSVLKDKEYQKECLASDDNILLYTGIWSVAFDELEDVKELLNELLHGKVKYKKLAALQFLSQIQFETYKHKIACEMLEEEDLEVVGSALKNIFTGISTYSLIYNKHLIEPYADLGEAYYGMELFNKLKTVLDNMPKKEVIFKESLFPWISFELTKTELMDNMLLAVSMSYNDEILDVLVDYKDKMSVQTREVFVKKFLKKPGNLKQRNALIEACGDRGQSVREAAFKNINAIELNKEDCVYIEDLLKYKSGDLRKNAIKLLLKQSNEELIKSINNLINSKDENKKLAAIDIVNAIEGDTNHKTIFEESLKAVAAMEDVLQKGKLLTENIGNDQKEVKNLNNGFGLYDPSKDYEPIEIENNNFDIQSKFCSTEEEIIKIVNTFSELIDKNRDLEYETTRWDGNKEMITLGGSYYLQPFNTESRKLNNFPLADEIRTAARNNGLDSWKLLELNFYMRAVHYRAYSGNSKWYVEFLELNFNYGIVYKLSKSIEKIKYYQLIKDYIILLVDDIPQDEIFEISKTITEYIYTKVPKHRHIEEYSQGGYYNNGTRIKAYFSAASEINNWLYLLKNNSETDEKFKEYFNIAYNYYKASEYNVAGSLEIYDFGRALDIGLIDDNEALKEIMGRPNSSQNIGLLTSVHKYHRERVLKYGKLLELADKAVEVICEIEVNRGELDTEVSLLASKVGKCYGVNIFASIILASEKDTYIRGYNFVSGDCTKKQILSHLLKCCYPKAYETAETLKKFLKGKKVTSKQLIEAAMYSPGWLDIVAEYLGYEGLKSACWYFHAHVNDYFSDEKTAIVARYTPITVEDLKDGAFDQEWFKEAYETLGEKNFKVVYDSAKYIAGGALHKRSQLFADATLGKLDLEEVKNRVKDKRNKDYLLTYGLIPVKNKEDVLERYEYIQEFIKESKKFGAQRQASEKRSGSIALLNLARNAGFSDSNRLIWNMETLKIQSVLEYLKPKAIDEVEVQLVIDEFGQADVACIKGGKALKNIPAKLKKNEYILEINQLKKDLKDQYSRARKSFEDAMENGEIFKGGELIEFCKNPVLAPIIKSLVFKTNAFIGYLQENSLVNYKNEILKLKEEDDITIAHPLHLYEAEVWRDYQKDIFEKKIVQPFKQVFRELYLPNKDELKEQTLSRRYAGHQVQPKKTLALLKTRGWMASDEEGLQKVYYKENIIATIYALADWFSPADIESPTIEFVRFEDRKTYKPLNLEEVSKLIFSEVMRDLDLVVSVAYVGGVDPEVSMSTIEVRTAIVEEILKLMKLSNVKLKGTHAHISGVHGEYTVHLGSGVVHKLGSGAINIIPIHSGQRGKLFLPFIDSDPKSAEIISKIAILAEDNKLKDPSILEQIV >NC_020291.1|WP_015394037.1|4292595_4293234_-|lactate-utilization-protein MDNNVEWYLKKRVDRTLESLKNNNMKGYYIEKREQLFEILKNLIIEKSIIGIGDSITLSETGVIDFLREGNYEFLDKYRDGITSEEKKQIYIQNFSADTFICSTNALTENGELYNIDGNGSRVAPMIYGPKQVIIVVGINKIVKNIEEAEKRVRNYAAPIDAKRLDKDTPCTKLGYCVDCKSPNRICNHFISIRGQFVKDRIKVIIGEELGY >NC_020291.1|WP_015394036.1|4292232_4292568_-|SnoaL-like-domain-containing-protein MNTEEIVQKQLEFYNDHDLESFISTYHDEIEIYNLMNNSIMIRGKEQLKNSYRERFEVLNVYANIQNRIVIGNKVIDHEYVTGLEEDKIKKAVAIYEVENNLIKRVWFVFE >NC_020291.1|WP_015394035.1|4290879_4291809_-|2-dehydropantoate-2-reductase MDNKKVCVVGMGGVGGYVGCILAKHFDNVYFFARGKRLESIKQNGLKLCSNAHGETVIHPKMASDNAEEMGAMDYIFLCVKNFSLEQVCAEILPMINENTVIIPLLNGVGISEEARRLIGKGTIIDGLVYIISGSDKDFVIHHTSSYCNIHIGCEVKKNLEDSILLEVQKLLQSEEITCIIEKDIIAAIWEKYILNCAFNVITAYYNATIGELRKNENAIMQVKLLLNEACKVARELKINIDDNLEEIHFNRIMYKQSDQATSSLQRDMEAGRQSELEVFSGKLLQLAASCEIKIPTTEFFYEELKKKC >NC_020291.1|WP_015394046.1|4306753_4307536_-|rRNA-pseudouridine-synthase MRLDKFLAESAIGSRKKVREYIKEGSVKVNGEVITEPAIEINENFDVVEYINEIVVYTGKVYYMFHKPAGCITAKTDAVNKTVFDFFDNTSMKGVFHVGRLDKDTEGLLLLTNDGEFEHKIMHPKKHVEKTYFFWALGSLDEADKNQLEQGICIGQDKEIMTKPAKIEVDKFGMYKELKHKITIDNITSIASMHPNQPVVSGYLTISEGRKHQVKRMLKAVGCYVVYLKRISIGGLTLDETLEKGSHRHLTESEILKVLE >NC_020291.1|WP_015394047.1|4307633_4308590_-|lactate-dehydrogenase MSNIIFLNSSKINFDNKLDFSLLDNLGKVTKYEDSSNEEILKRIKDQEIVITKEMTIGRDLIEKFPPCVKLICEAGTGYNNIDIEAAKEKNIAVCNVPGYSSEAVAQLVITFILNLTSSLAAQQRMIENKNYDNFTKYLQVPHFEIQNKTLGVVGAGAIGKQVMKVAKALGMNILVYSRTPKDLGDSTIKFVSLEELLKNSDFVTLHCPLTNATKHLINKSTLELMKPEACIINTSRGAIINELDLIEALKNKKIAGAALDVQEQEPPELNNPLFNMKNVILTPHIGWRCLESRQRLLNLLADNIEGFTTGNPINIVK >NC_020291.1|WP_015394048.1|4308626_4309619_-|tetratricopeptide-repeat-protein MIKKIITLILISTLIITLSTISGCNIGKYNTLGNFKSEEPKKLYKDKKYDEAIKSIDSFLEKYPKNKEAIALKAYILIGSGKNDEGLVLLTDLYDNGEKDSTTLNNISWAYNNLHMYEMANKYIDICLKNSPGDSEEFVNKGNALYGLKKYDEALLYYDNALYKDSEDTLALYGKALSLYASEKYSEGLVNFKKYVEIGGTNKSANSYIMNSYLKLKDHNGAIEEFNNQIKKNPDNLSLYISLGSIYEKQGDFEKAISCYDTIINKKIDFAAAYYNKGVCLVKLGKKDEACNNLKLAIKYDEEYIYDIEDATEFDSLRNYDKFKEILKKN >NC_020291.1|WP_017810460.1|4309816_4309912_-|hypothetical-protein MSASTEEVASSAQILNNMTNQMIEEVNEFKV >NC_020291.1|WP_015394049.1|4309984_4310440_-|YhcH/YjgK/YiaL-family-protein MIIADLKDFNHYCNGNEKIQRAFKFIQETNLKELEAGKHLIDGEDVFVLVQEYLTKEPELCRFESHERYIDIQFIVSGTEKMSWLPINKLALAKNDLAKTDKVLYKDSSEGNNFIVNEGQFVIFYPEDGHKACIAIDEPCLVKKLVLKVSL >NC_020291.1|WP_015394050.1|4310476_4311223_-|SDR-family-oxidoreductase MLLEGKIAIVTGASRGIGREIALTLAENGASLVISGNKEDLLKEVAGEIEKLNQKCIIHTGDISKPETSKDIASKAIEAFGKIDILVNNAGVNTRIPTLELQPEEWQKVININLSGTFYSCSAVLPHMIKQQYGKIINVSSTTAKTPHRNASPSYGASKAGVNYLTQHLALEMAKNNICVNAVCPGPIETDMSLQWTEDYRKQVLAKIPLGRIGESKDVANTVLFLASNMSDFITGESININGGTYMN >NC_020291.1|WP_015394051.1|4311483_4312680_-|neuraminidase MSNIEQGKLYQVEGDLERVEAALPSFCIQNHASNVMPLANGDLLCAWFSGTQEGIADISIFMSRLNKGETVWTEPVKLSEDPTKSEQNPILFPAPNGDLWLIYTAQKSGNQDTAIVRYRVSSDNGYTWGPIETLFDKPGTFVRQPIVVLDNSEWLIPIFYCYTPQGQKWNGDYDVSAVKISADNGNTWTEYEVPNSTGCVHMNVEKLHDGTLLALYRSRWADNIYMSRSTDNGRTWTEPVPTELPNNNSSIQFTVLNNGHLALIFNDINAEKATERRASLYDEIEDDEEASEAVDNTENSFVPEDNGTERKTAFWGTPRAPLAIAISEDGGKTWPYKRNIEVGDGYCMSNNSKEKVNREFSYPSVKQTSDGKINITFTYFRQYIKHVCVSEEWVKKGE >NC_020291.1|WP_015394052.1|4313017_4314430_-|sodium:solute-symporter-family-protein MNQHFSTSSLMLIGGMIIVYILFTSWLTVKLRSKTNEQFMTAAKSMPAFIVGILMMSEYIGAKSTVGTAQEAFTAGLAASWSTVAATIGFVLFGLFMVKRMYNSGQVTISGMIEQKFGKSTKIAVSLIMIYALLLVNVGNYISGAAALSSVFSVNLPIAYLVIAVVSTFYFAFGGMKSIAYVTILHTALKYFGVILILVFALSQTGGITPMVQNMPSFYFTWDGHIGATTVIAWIVATIGSIFSTQYIIQAISSTKSAAEAKKSTIYAGILCLPIAVFLGVIGVAAKYLYPDMKSVYALPVFINGMNPFLAGLVTTSLVASIFVSVSTVALAISSLVVKDFYVPYYKPSAEKEFKMTRIFSLIIGFVPLLFVFMFPSILSLSFFTKALRLTIAIIAVMGFFLPMFNSNRGATLGLLGAAITTSVWYALGNPYGIDNIYIAIATPIIIMLIERLFGGNKKKVENLKEEAAS >NC_020291.1|WP_015394053.1|4314526_4315522_-|4-hydroxythreonine-4-phosphate-dehydrogenase-PdxA MKPIIAITMGDAAGIGPEIIVKALEHKSVYDICRPLVIGDLKILERATAVTKSKVTFNKVEHASECKFNMGTIDCIDLDLLPADLTFGELSGKAGDAAFQFIKKAVDLAKAGEIQVICTAPLNKAALHLGGHMYPGHTEILADLTETEDYSMMLTTPKLKVIHLTTHKGLIDAINSINPDRTYKVVNLANDTLKSAGNKNPRIAVAGINPHCGENGMFGYGEEEEKLIPAIEKAAAEGVNVTGPYPADTVFFRAIRGEFDIVVACYHDQGHVPVKVSGFEDGVNITVGLKGGIIRTSVDHGTAFDIAGKNIADEASMIAALVSGAELAPKQ >NC_020291.1|WP_015394054.1|4315518_4316811_-|four-carbon-acid-sugar-kinase-family-protein MKPIRLAVIADDITGASDCGGQLIHYGLNVSVILNNNSIIEGDREAIIYNTDSRSVSQEEAYTKVKYICEKIKGEKYDIVYKKIDSTMRGNIGQEVNAVYDVFKPDFVLIAPGYPENGRQIIDGIHFLNNIQLHETEVANDPKTPVTDSNITRLIQKQSNKDVGHISCGDLHEGFEKVATLLEEFKKNNICYITVDSIQGSDLESLAEYICKARCSAIWVGSAGLMNYLPKVYGLKQKGMDLSIKPAEKPVLLVVGSVSAIGRVQLEHLLNVKDVIGLEMNSSEVLLDNEVKEKEINRLKEEAKKAFNENKNIALFSSNNVKEIQAIGAKIGKTPIELSNIIADTLGELAVELINALDINHLFLTGGDTAYQVLDKLDVKELRLMDEVEPGIPIGYTKTNKEIYAITKAGNFGSKLAMVNALNKLKGGTI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_020291_8 | 4341559-4341685 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_020291_8
|
1 spacers
spacers of NC_020291_8
>8.1|4341598|49|NC_020291|CRISPRCasFinder TTTAATATTCATAAAAAGGAGTTTTAAAATGGCAAAAGCATTTATATTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_020291_8
The CRISPR arrays of NC_020291_8 >merge|NC_020291|8|4341559-4341685|CRISPRCasFinder GGAGTTACTGCATCATTCTTTTTTGCATTTACTTTTATATTTAATATTCATAAAAAGGAGTTTTAAAATGGCAAAAGCATTTATATTAGGAGTCACTGCATCATTCTTTTTTGCATTTACTTTTATA >NC_020291|8|8|4341559-4341685|CRISPRCasFinder GGAGTTACTGCATCATTCTTTTTTGCATTTACTTTTATA TTTAATATTCATAAAAAGGAGTTTTAAAATGGCAAAAGCATTTATATTA GGAGTCACTGCATCATTCTTTTTTGCATTTACTTTTATA
>NC_020291.1|WP_015394072.1|4340812_4341367_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MKDLNLIIGNKLKDIRNKRNLSLEEVAKLTGVSKAMLGQIERGKSNPTVSTLWKIATGLKISFSLFIDENQEDLKVINQKDISPIIEDNDRMKLYPIFPFDANKGFEIFTIELEPACNHISTPHNEGVEEYIIVTEGEIEIDINNKIFKLQKGNSIRFMANCPHSYKNINQGRSVFQNIILYFK >NC_020291.1|WP_015394071.1|4339358_4340477_+|NADH-dependent-flavin-oxidoreductase MELKNLIKSKNLNTKITLRNPIVMAPMTTFSANEDGTVSDAELSYYKKRAKEVGMVITATTYVAPSGKGFQGEFAAYNKSFLPSLRKLAETIKGEGALAILQIFHAGRMALPDEIPGGQPISASAVAAERPGAVVPKEMTEAEIQELIKAFSETTKLAIEAGFDGVEIHGANTYLLQQFISPHSNRREDFWGGSRDKRRNFPLAVIAEVKKTVKEKGAENFIVGYRFSPEEIENPGITLEDTLSFVDILADQGLSYLHASLMNFWQSSIRDAKETSPVINKLIDQIHGRVPFIGVGAINTPEDALKALESGVDLVALGREIIIEPDWTSKIQLGKASEIRTKLNKNDREVLSVPVPLWNAIVNTPGWFPIEE >NC_020291.1|WP_017810459.1|4336745_4338731_+|HAMP-domain-containing-protein MKINNIRNKLGISLVGICMLPLIILGLVSYFQSKAILNQKLSTTSQQTLIEVNTGMDNYFSSFGNMVSMLSQNYDVINSDNDINVTFIPGVLKSVKDVNPDIFSAYFGTKDGKFNIYPNSKMPDDFNPTARPWYKQAMEHKGQVIVTLPFKDSQTGKSVVSIAKTVERNGEVIGVCAMNLSLETLSGKITEKKVGNSGYVFISDSDGNVIAHPNKDIINTNEASKLAVWNEIKTSDSGFTTYTYNGQKKFGAFDTNSMTGWKVVAILNESELSTDTKAILITTITSIFIMLIISILVSLFLSKGIAANIKNLKKVFEKAENGDLTVSIEPVTKDEFLDLATSFNSMMHNISNLIQNAASSSNEVLETSTNLASMSEEVTASISDVAKAIEDVAHGATQQAQNAQNGVTEMNELSKKLDKISENSTQIDMLSNNTKTLGTKGLSIINTLIDKTNKTKTSTSEVNRIIQDMNESTIKISSISEAIAEITEQTSLLSLNASIESARAGEAGKGFAVVAAEIGKLAEESKNSTEEIKSIIENIQKKSTIAVQAIKATEDIVIEQDLEVTNTQKIFDDILNSINTMINKIDEIKFSIKDVGEKKENTMIEIENISSISEETASSSEEVTASTEEIASAMDRFTKYAETLKSLAEKLDNELDNFKVT >NC_020291.1|WP_015394069.1|4334015_4336415_-|transcription-antiterminator MYNLNVRQIEFINLLLEEKQYKPIKYYTEFLNVSDKTLKKDLIIIEEYLNKHNVELDKKHSIGIMIKDTMNAKLILHRVLQSQESKNNKISINYRRIEIIKNMLTDPHNNTSIQKLSDKYYVSKTSIVNDFKYIEEWFSLFNLKLEKTVEGTQINGLEVDIRRAIASLLFEYSKDGKNKNTIEELAIRLDAITLNALSELFEKEKIIYVNRLLLDLEKKYNCRINDPYYINLLTHILISMVRGSQGRKIYKKSDIGKFKPEKDYEEAALCINKINRDFGMTLDESEVYYLYQYFVSFGLIKDMSGKEDTVLSELDCLAINYRNRITHCMEEILQVNISKYQNIMEKLLLHIRPMLNRMKHDIHISNPLINDIKEQYPILLNVCKAATLMVSFDMKLNHIPIDEVGYLTLYYQLGLEENYATRKRVLVVCHSGYGTSKLLMTRLKRYFPEFEIIESASASRMMNINLEEIDFIISTVPLELEKNSYLLVSTFLNEHDIKNISDFLLNNKSKHLRLTSSTKLIGEYLKEELIYFNKEENEVKKQINRNIKRSIIFNPIDINRNLKIQLGFCKDECILGLSINDIENNEKQLTFYIAMENVEIMTLILKEAFNFNIKEDYANYLMKCKKEKDVKQYFKLNGEGGMKMEVDLAKVIQKETIKLDMKATTKDEALKELTELLYDSGTLSNKEEFLEDVYYRETLGSTGIGNGIAIPHGKSKFVNKTSIAFGKTRSDIKWETLDGKPVNFIILFAVTESDKNSVHVRLLSKVAARLGDDEVCEALLGAKSSEEVYEIFTSSDEIQ >NC_020291.1|WP_015394068.1|4333631_4333943_-|PTS-IIB-component,-Fru-family MKIVGIAACTSGIAHTYIAKEKLVRAAKALNHEIHIETQGTIGTEDELSPKEISEADVVIIAADIKVGGRERFKGKKVIDVSTDIVIKSPKALINKIQQELGL >NC_020291.1|WP_015394067.1|4332524_4333601_-|PTS-fructose-transporter-subunit-IIC MLKKLELKKHAMTGISYMLPLVVAAGLLIAIGNLAGGNPSLISDYKASYSIWQASVTLGVFGMQLLPAVMGAAISYSIADRPGIAPGLLMGMVANAMGAGFLGGMLGGYLSGYFVVFLKNNIKVPKWAQGLLPMMIIPLISSVVIGLVMFFVVGRPIASVSASLTSMLNNMQGGSKAIFGLIMGAMAAFDFGGPVNKVASLFADGLLLQGVYGPEAIKICASMIPPFGVALSWVIRRARYSKSESDNIKIAFPMGICMITEGVIPIAAVDPLRVIFSCSFGAAIGGMLIMLLDVGSPVPSGGMFIVPAMQNPIGFLIALGVGSVITAILLVILKKDAKEQVIEEEEEEEVDLSNLQIK >NC_020291.1|WP_015394066.1|4331636_4332497_-|class-II-fructose-bisphosphate-aldolase MYVSMTEMLKKANEENYAVMAINCFNLETARSVIKAAELENAPIIINLVQDHLIDHCDSELITPIVKTLASRTSIKVALNFDHGQEVLFIKKAIDDGFSSVMVDASRFGLQGNIDMTKEVVNYAHSKGVSVEGEIGCLGGTEGGAFTNDHMYTNPDEALKFAKETGIDALAISIGTSHGNYPDGMVPEFDFERLKTIKELTKMPLVLHGGSGSGRDNILKAVKYGINKINVGCDFMNANVQAITAILKEKPDINYYVLMHQVEQDSIDIVRNYIKLSGSNNKNLNI >NC_020291.1|WP_015394065.1|4330726_4331596_-|ketose-bisphosphate-aldolase MLMNMKELLSIAQENKFAVPAFNTSSNMILRGVMEAAKEKQAPVIIAIHPDELSFLEDSFIATVKEEAFKSEVPVVIHLDHGGTFEQILRAIRCGFTSVMIDASHMSFEENIAITKKVVEAAHPLNVSVEAELGTIGTTGNGGEYGANEIIYTDPEKAKEFVDRTGVDTLAIAIGTSHGIYPKDMKPKLKLDLLKIIRETVQIPLVLHGGSANSDDEIAESVKLGISKINISSDIKDAFYKKCREILTEDLGAREPNAIYPPCIEAMKEVIYHKISLFNDEDKVKCYNK >NC_020291.1|WP_015394064.1|4327419_4330563_-|efflux-RND-transporter-permease-subunit MRITEISVKRPAAMWMAVILFIGLGIMGYKSMGADLMPSMNIPVISIMTTYNGASAEDVKKDIVKPIEDAVSGISGVDVLNSTSGEGYGTVTITFKMSANINTAYLDVQKAVEVVSARLPKAADKPTLFKMDMSAIPIMIVSINGDSSYEELYNQSDILKQKLEKIPGVGNISLMGADKKQLMIKIDKATMEYYGVNVDALMGALQASNVNIPAGDIKQENLDQAVRIIGQFNSIDAVKNLLVPAGNGVNIRLGDIAKIDLEVPDATVLTRYGGNKTIAMILGKQSDSNVVEVADSVKKELEDIRKSLPKGTEVNILMDTTTFINSSLTQIKHNLIEGIITTAIVLYLFFRSFRSSLVVLIAIPTSLVATFFMMYQMHFTLNMLSLMGLSLVVGTLVDDSIVVIENIQRHMDMGKNPLQAAIDGRKEVGMAAIAITLCDVVVFAPVSLVSGLVGQMFREFGLTIVAATMFSLIVSFTITPMLSSRLLKNQNNDEKIAPKETFLSRINSKFARKSSDKKGSFDKLVEVYRKTLIWSLDNRKKVLAFVIAGVVLSVMLIPMGMIKSEFIPVADQSSFTISLKLAPGSTLKQTDAKVSEVEKYLQGTKEVKDYFSLIGHDGESTADKSIAQIFVNLVPKGERKKSQSELASEIRTFGKKMSGVDLNVAESSSSGGSSKPVSIKIKGNDSSTIRDLSKEVEKLLNTVSGITDISNSTSSRSSELRVNIDNLAATQYKISTSNIGSVVRMALAGTNVGVYRSNNEENDITLKFENGQINSAEDLKSLMITNSAGEEIPLSQVASIQKIDGAPSISREDKQDMVSVEANIQGRVLGEVTDDINSKLKALSIPDGYSISFGGNQKQMADSFSSLGLALCASLALVYMILVVLYESFLTPFIRMMALPCAIIGAFGLLALTGQTLNLMSMIGLIMLEGLASKNGTLLIDYTNTLMKRGMNLREALIESGVTRLRPIIMTSATMIVSMLPVALSMGEGTEMKKSMAIVIIGGMLASTILSPIVLPIIYTLMADLKNKVSFKKKKSHSLEGGSTYEV >NC_020291.1|WP_015394063.1|4326179_4327430_-|efflux-RND-transporter-periplasmic-adaptor-subunit MKFKELMKKKKLIVGIILAVVVVAIIFSFPKSKPVDVAQEVKNVKTEKITTGTISARVEYAGNLKPAKEVVVLPKAGGRVATVNVKVGDKVSVGQTLFTLDTTDYAAQLEQAQAGVSAASANLERTSDSGFTQQLLQAEQLVEKLQIQYNTVKDSYDKTQTLYSANAVSKKEYDDAKAQYDAITIDLKNAKDSLELLKSKSGPQATKAAAAALEQAQAGVSAVQNQINNATITSPIDGVVSEKAVEVGQIAGGQSGSVTVIDYSGLEAEVNVPDKMLTKIKEGLSVPVTINALPDAKIVGVIESISPNTSSKNNFYVVRVKVDNSNADIKAGMFAKISLPAEQKDDILMVPNETIKMENGVNYLYTVDNDEVKKIAVETGISNEKFTEVKGKVQDGLPVITEGQNLLSDGEKVNLV >NC_020291.1|WP_015394074.1|4342865_4343756_-|hypothetical-protein MIKTDTNFNLLNSHITTLIKKDMYLNRIIEKCPNCESKHYIKYGLFKGFQRYKCKECGKTFSKATSSLWSYSKKKPTQWVKFTEYGLERKSLRFCAEKLGLSLVTAFYWRHKVLHGLNYDSVPEKLSGDVHIAKKLIPENFKGSKNITITVRHNIWVVAAKDCEDSIIIKPISRCHWHLPSFNKKIYYLIDEKAYIVPYGDRYISLVAKAHNKKHIKEVKNDKIIWSFQIILEKWLKKYHGVASKYLEKYLALFILYITKKEINCMEIFKKLSFENKFIKILDIGRLKTQSNSVLL >NC_020291.1|WP_015394075.1|4344110_4345112_-|biotin-dependent-carboxyltransferase-family-protein MRISVLNPGLQSTIQDLGRHGYQKYGVIVSGAMDAYSMRLANIAIGNTEKEGVLEITMIGPSLELEKGTLFSITGGNISPTIDGKKIPMGRPIYLKEACVLNFGACIAGCRSYLAIAGGFEVPEVMESKSTYLRAQFGGFNGRTLKKGDILNLGVKSVEAKKIIEKLQQITSKGEFTAPSWYIGDSIAENSNSTFVRVFKDRQFNNISEESVSKFFNSEFNVDNKSDRMGYRLCGEKIELKESLEMISEEVSVGTIQIPPDGNPIVLLADRQTTGGYPKLAHVASVDIQKIVQLKPNDKIKFKQITLKEAERLYLEREKYINKVKKTIKFIIS >NC_020291.1|WP_015394076.1|4345111_4345822_-|5-oxoprolinase-subunit-PxpB METGKFKTEISQISETAALVEFGREISETINKKVRTFCAYLDENPFHGMIEYVPAFASVSVIYNPLDMNSEAPYEVVKGILDDIIAKLDFSSVYEENIVEIPVCYGGEFGQDIGEVAKINNISVDEVIKIHSEGKYLVYMLGFAPGFPYLGGMSEKIAAPRRETPRTAIPAGSVGIAGMQTGVYPIETPGGWQLIGKTPLKLFDLKRKSKSLLKSGDIVKFYPISYEEYVQLKEEE >NC_020291.1|WP_015394077.1|4345969_4346749_-|5-oxoprolinase-subunit-PxpA MYKVDLNCDLGESFGAYKLGLDEEIISYVSSANIACGFHAADPLVMDHTVKLAKAAGVNIGAHPGFPDLVGFGRRNMNVSPNEAKAMVQYQIGALDAFCRAQGIKMQHVKPHGALYNMAGKDLKLAEAICQGIYEVNSELILLALAGSEMIKAAENIGLKVAREAFADRAYEEDGSLVARAKEGAMITDEAVVIKRVIKMIKENNVTAITGKDISIKVDSICVHGDGAKALEFVKKIRLSLEAENIEIVPLYKVLLDTL >NC_020291.1|WP_017810457.1|4347107_4347896_-|putative-hydro-lyase MDYSKMKPSEVRALIREGKITGPTSGMCAGYAQANLVILPKELAYDFLLFSQRNPKACPILEVSDVGSRSLRYIAEGADIAKDIPKYRVYEEGVLTGEYTSIEHLWRDDFVSFLIGCSFSFESELLEAGVPVRHIEENCNVPMFITNIDCEPAGIFNGKMVVSMRPIPYDQIVKSVMVTGSMPKVHGTPIHIGDPSVIGISEISRPDFGDSVKIKEGEVPVFWPCGVTPQAVVMNVKPKIVITHSPGHMLITDTKNIDIKFS >NC_020291.1|WP_015394079.1|4348316_4349390_-|DUF4392-domain-containing-protein MNQQELTIFNLGENLDNIVNLDPRGYGVCRILYSAARKYTKEPLTTNAAKKLVNTLKDGDLVYIMTGFVLLPFKKAEMDGIVSSMILARALIKAFNVKPVIICPEDNMEAVKNLAQVIGVHLYDTMQELKEYPISIAAVPFTKDINEAEKQADEIIAKGLPSAVISIECPGANSIGVYHNAVGLAVTELEAKQDILFTKLQAKGVLNIAIGDLGNEIGMGTISEHLQEYVPYAAEGKCNCGCNGGIAVATKADNIITATVSDWGCYGLIAAIAYLKKDLEILHTKELQEEAMVVASRSGMIDMYGWLVPAIDGFGLSMNLSIVNLMRECVSYAIKLEDTCATWFDKVIELGFYEKVV >NC_020291.1|WP_015394080.1|4349400_4350249_-|D-amino-acid-aminotransferase MENLGYYNGKFGLLEEMTVPMLDRVCYFGDGVYDATYSRNHKIFALDEHIERFYNSAGLLGIKIPHSKEQVKEILKEMVLKVDSGEQFVYWQITRGTGMRNHAFPGDEVPANLWIMLKPLNIKDMSKKLKLITLEDTRFLHCNIKTLNLLPSVIAAQKTEEAGCQEAVFHRCDRVTECAHSNVSIIKDGVLKTAPTDNLILPGIARAHLIKMCKAFNIPVDETAFTLKELMEADEIIVTSSGQFCMATSEIDGKPVGGKAPELVKKLQAALLNEFLEETNAD >NC_020291.1|WP_015394081.1|4350629_4351085_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator MDKMDYKILKCLKANARIKAATISSQIHLSVSAVLERIHKMEKNEVIQNYTIIVDQKKLDNDVTALMEVSLEHPKFYDTFTLAIKGNDNIVSCYYLTGDYDFMLKIICQSSDHLEKIHRSIKSIEGVSATKTHFVLKNIKNTFCVIPEVED >NC_020291.1|WP_015394082.1|4351094_4351799_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLKVENINISYGAIHAIHDLSLEVKSGEIVTLIGANGAGKTSTLRAISGLNPVKSGEITYEGKVISNIGAHKIVGYGLSQVPEGRRVFGDQTIEENLLLGAYLRKSKAEIKASMEEVFNLFPRVKERRKQLAGTMSGGEQQMLAIGRALMAKPRLLLLDEPSMGLAPIVVEEIFEIIKNIRKAGTTILLVEQNANAALQIADRGYVLETGSVVLEGLAQDLLHDDSVRKAYLGE >NC_020291.1|WP_015394083.1|4351800_4352571_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSLLSVENLTIRFGGLTAVSDVNMEIGEHQLIGLIGPNGAGKTTLFNMLTGVYKPTEGKIELNGERIDGTKPYNITSKHISRTFQNIRLFKDLTVIENVMISFNYQAKSSLFTSIIKTPAHILEEEKMKQEALEILKIFKLDDKAEELASNLPYGKQRRLEIARALAAKPKLLLLDEPAAGMNPQETVELTELIRWIKNQFKISILLIEHDMKLVMNVCEYIYVLSFGEIIAKGIPKEIQKNPQVIEAYLGKGAAQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_020291_9 | 4375620-4375720 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_020291_9
|
1 spacers
spacers of NC_020291_9
>9.1|4375643|55|NC_020291|CRISPRCasFinder CCGTATTGCAGCATAGCTGCTCTTTTTAGAAGTGCATAGCTGCTTTTTATAATTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_020291_9
The CRISPR arrays of NC_020291_9 >merge|NC_020291|9|4375620-4375720|CRISPRCasFinder ATAATCTTGGTTGCAGATAAGTTCCGTATTGCAGCATAGCTGCTCTTTTTAGAAGTGCATAGCTGCTTTTTATAATTTATGATCTTGGTTGCAGATAAGTT >NC_020291|9|9|4375620-4375720|CRISPRCasFinder ATAATCTTGGTTGCAGATAAGTT CCGTATTGCAGCATAGCTGCTCTTTTTAGAAGTGCATAGCTGCTTTTTATAATTT ATGATCTTGGTTGCAGATAAGTT
>NC_020291.1|WP_015394102.1|4373620_4375555_-|DUF2075-domain-containing-protein MIVYQASKKDFMKHVTNDEISILIDREYKSKIGKSREKEFQAWDNSMLYMFKALNTKEIPDECGVAIEYKIPGTSMRVDFILTGLDEYDKENIIIVELKQWTHLEEVKEENDIVLTYLNNSKIPKTHPSYQAWTYANLIEDYNDAVETKLIKLHPCAYLHNYIKKKENDPLLSEIYNNSLNLAPAYTRGDALKLREFICRYVKKSDQGKGIYFIEGGKIRPSKSLQDALKVMIDGNEEFIMIEDQKVAFESIMRTVRDCIKNEKKKTIIVEGGPGTGKSVLAINLLVKICNRNLNCQYVTKNAAPRNVYCEKLKGNYTQKYINNLFKGSGVYTDTSQNEIDVLIIDEAHRLNAKSGMFKNLGENQIKEIINTAKVSIFFVDNNQRVTMDDIGSIEEIEKHARALEVKTRKLKLTSQFRCNGSDGYVSWLDDVLEIAETGNFDGFEFDFDFRVFDDPSEMKKAIEEKNEVNNKSRLVAGYCYEWATKKKENYNKYDIEFPEYDFKMKWNLSNSPTWAIDKESVNECGCIHTCQGLEFDYVGVIIGQDLRFENGKLITDLFKRAKTDKSLNGVKKLYKEDKEKALKISDELIKNTYRILMTRGLKGCYIWCEDKSLSNYFKERLNSFMRQIVVKEIEGEYMYLLRE >NC_020291.1|WP_015394101.1|4372789_4373536_-|hypothetical-protein MNKIIYFNKIVIITMIVALLEGCGEKTQQVETSPSNQNTASEDKFSSNTDKKEEIKAVETTKQDFKEINIDANLKKKLDTFFSNFSEAHLKSFEKDKLDDSSLIVFGIRHIMLNNFKLIQLKGDTGYVKAEDVDAKALFYFGKKVNQHKNTGEYIFENGLYKIRMASGDEYTFSQINKLYDLGNNKYKAEVSVYIASSGYTGDSHGTIEEWKASGGEIPKLSNKVTATIEKISQDGNERFILTEYNIN >NC_020291.1|WP_008418503.1|4372034_4372211_-|30S-ribosomal-protein-S21 MSEIKVGENESLEQALRRFKRKCSASGILSEAKKRQHYEKPSVKRKKKSEEARKRKFK >NC_020291.1|WP_015394099.1|4370945_4371578_-|YkgJ-family-cysteine-cluster-protein MMKLLYDVEGKVNYDKINKNTTVKDVLDAVDIFLNNNPLNCNECEESCCKRSWSVEMDNICVNRLSSWNDEAVLDFIQEKLVKKKNYYRDFDQYVLNKKMDCNFITETNLCTIYEDRPIICRLYICISRSYRYNLIRELIGSTYLKALIHEEKIRNNNFTNETINKYKRNPAVLAKDYNILLEKVFDYSEDEGWLDIDEREELYKERILE >NC_020291.1|WP_015394098.1|4370652_4370847_-|hypothetical-protein MPSTTKLMEEFLDEIMEESSYSSFERAIEPVRKEEYLKDEYFCTREVLVGSLKSKELPYNFLSS >NC_020291.1|WP_015394097.1|4369224_4370172_-|hypothetical-protein MSISNEKVKLDEVLKFLFSTSKKVLVNLLNGIFQENYSSDQVKLSVSNNEFVMDTFDTLRGDVFFDILNSESDKISYHLEFQTRNDSTMVIRMFEYGLRKAKEQSRNNDDFRTIFFPKQKVIFFEENRNIMDIIKLKIVLPSGESFLYSVPVMKYWEYSDKKLLEDKMYPLLPLQLFNLRRELEQYKRKNDIKKINELSIKAKEIAEKIANESKELFEKNEIIGEDFHKMLLAIQNLIEYLNRNYFNDEKIEEEVIRVTKTLFDPEVEKRKAIEIAKNLLDILDNETIALKTGLELEEVIKLRNAMQTKVSKYML >NC_020291.1|WP_015394096.1|4368104_4368983_-|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MTADSKIISSREIIKSSMNKTLKELNLEDDFLFAKVMSDKEICKELLEKILEVEIEKVEMIQEQKAIDLLLESKGIRLDVYVKDENNTIYNVEMQRGKHKNLAKRLRYYQGSIDLDLISKGEDYRKLTKSYIIFICTFDLFSKGRHKYAFRNICLEDNSIELNDEAEKIILNTKGFMKDLSEELLEFLAYVEDSRDEVVKNFNGNLVKSIHERVKEVKNDVSMEVEFMHLLKECEAQFGTYKILEKDKVKIEEGIEQGEKKKALEMLKDNEPIEKIIKYSKFSKEEILKIKI >NC_020291.1|WP_015394095.1|4366293_4367997_-|hypothetical-protein MNINNFKEYIDKTILKRGYDYYTDGNILNSCNVEDNTYTFEVQGSEYYQVVVQLDDNGEIIHSECDCPYDFGPICKHEVAAYFELAEHMSKSVNKNDKNANNVINNEKLIKKKAKEPEIKEVLSNLSKEKLIDIILEITQNNRILKNSLVVRYSKGNSEQELHKCKKLIDSIVRKHLGREDFISYREAGDFVSDMEVLLEKIKETEDIILAFDIAFLVIDEGIEAFQYADDSDGDIGYLVSETINLIGEVIGYNEDIDVNIKEELFEKLLSKSESKVFDEWTDYRIDMLELCAEVAATEVIRNKLKTKLNYLIDNNSNNEYMKYSDESMHHILFNMVNKYGTEEEAEQFIKDNLKFSSFRELFINKYLNEKDYEKVIELALEGEKQDARFAGLILKWKQMRYKAYKELDLKDDQRNLAKELLFEGKFEYYKELKELAEDKISFYNNLKQELKVKEDWHSKSMFLQIILEEKDLNEIMDYVRDNPTSIDRYADILIDKFKDEVIEIYKKYIKFEASRASNRSHYKSVCAIIRKYKKIAGKQSQIPIVNELIALYRKKPAFLDELSRIK >NC_020291.1|WP_015394094.1|4365166_4366105_+|tyrosine-type-recombinase/integrase MTHNNKIVSDNINNYINTLKIERNLSEKSIKAYVSDLSSFSDWLKDNNAEEIDINTINQYITWLQNYKKLKDTSIKRKYVTLKSFFKYLLRKNLITSYPFEHMRISFKTTKKLPKTLSSQDIIKLLKSPIEDLNNIKTEFRKIICIRNLAIIELLYCVGIRIGELVNINLNDLNFNDQTLLINGKGRKERLLYISSSDVIDTLKTWINSRDSLAPKGDALFINKYGDRLSIYSIEDIYSKYIKLANIETKSTPHYLRHTFATQLLNNGADIRAVQEILGHSSITTTQIYTEVSTERKKQVLLQYNGRNLLKI >NC_020291.1|WP_017810455.1|4364456_4364969_-|hypothetical-protein MDNNSVIKKLTMCGNSLKKLYKFLPENSIKAIPYTTSGESKYDLEVNINGVEFKGKEDNSNIVINSLHRNYTKEELMAIQKIATKCYTYPFGGLEFSFGLNIFRNDKTEITIINLLDKYNIEPFLESLDSEGHIELKISNVKYFSTEAFINFVLELQTLIYLLDEKYDDN >NC_020291.1|WP_015394103.1|4375743_4376061_-|nucleotide-pyrophosphohydrolase MKETINRIRKFRDDRDWSQFHTPANLSKAISIEAGELLEEFLWDEENYNKEHVLEELADVMVYCIHMADALGVDLEEIINSKMNKNEEKYPVEKAKGNSKKYTHL >NC_020291.1|WP_015394104.1|4376329_4377211_-|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MTADSKIISSGEIIKSSTNKTLKELNLEDDFLFAKVMSDKEICKELLEKILEIEIEKVEMVEEQKTIDLLLESKGIRLDVYVKDEKNTIYNVEMQRGKYKNLPKRLRYYQGSIDLDLISKGEDYRKLAKSYIIFICTFDLFNKGRHKYTFQNVCLEDNSIILNDEAQKIILNTKGILNDLNEELLEFLNYVEDSTDDKVKSIKGNLVKSIHKRVQEVKNDVSMEVEYMTLLERDREKIEEGKVELLLKLLIKKFKIIPDEYKDKLKSLSEENIELIATEIFDMKSIEDLKKYF >NC_020291.1|WP_015394105.1|4377443_4377809_-|aspartyl-protease MKLEYKSGLLFVDMKIGYKGNNVLLKNVVVDTGAAHTIINPDSVYKLGIKAEADDYGIGGEHYSYRNNINSVSIGSDCIEDINIDFGIIDEEGYINWLLGLDVLLKLGITINLKELELYSS >NC_020291.1|WP_015394106.1|4377805_4378051_-|hypothetical-protein MKWEEVRNIYPNKFVLLRSLEAHIEDNKKCIDDVAVVRALDDEEASDLLIKCKGDTFVFHTSKKELSMNIIQMPILRGVFK >NC_020291.1|WP_015394107.1|4378431_4379022_-|hypothetical-protein MYNNQFPCCPYYMNQAAYPYYNVMRRNTAPKFAAFSGTVTRIEDFYPGQDDASVGCYKLISLENIDRGPVNFVISPRTYFVDHKLVEVGDEVTGFYDANAPALLIYPPQYPAIVMAKDTVYQNVTVDYFNNQLISSDGNLKLNIDISTEVILTNDQIFNRFPRNKNLIVVYGPTTKSIPAQTTPYKIIVLCGQNLV >NC_020291.1|WP_015394108.1|4379240_4380317_+|GIY-YIG-nuclease-family-protein MDLKEKIRDLPSVPGVYLMKDSLGSIIYVGKSKNLKNRVGSYFQNIKSRTPKVEKLIKNLKDFDYIITDTEFEAFMLECTLIMELKPRYNRLMKNPLSYTYIKIDLGEKYPSIEISSTNNQNEHTLYFGPYTNKNAAEKAIQCIKDFYKINCNYNYKNGTSCLNYSLNLCIGMCLDIAATTKQYENITFKVIASLNDTDNTLLKEIEEKMLIASEKFDFETATKYRDYMASVTYLTNNRKTIKFAEENNNIVMIEALNEHLIKLFLIKKSNVLFSKTYNMKDINVKQLNEIIKINIIHYFKTITSDSIEINKDEIDKTQIIHSYLQSSKCNYITIPENLLNLECNSELDALITKLLII >NC_020291.1|WP_015394109.1|4380634_4381291_-|leucine-rich-repeat-protein MKKSKLTKVIASVLVVASVLLLNPIGASAEWKQDYNGWWYSEGDSWAKGWRYISGNWYYFGTFGYMEKNQDVDGWYLDNNGVGIKCIKAGEFDILKSTSGIVKFNRNVPWGPGETGIPLVIPGKIGDIEIKSIGNRGFYDCGFLTDVTIPDSVTSIGDSAFGRCVSLKRIIIPDSVESIGRDAFYACDEAVFYVNSEKTKQYLIKYGISPSKIILNTK >NC_020291.1|WP_158399838.1|4381434_4381992_-|hypothetical-protein MVLVYYSSDTCELGVIYVALAQSQNSFGSDGGIVWYGKIKDIHLVKRNEIIELPKDSDSLYYRLEIDKWCRLERKIEIAKYQVRSFIYTTFYLLNNARSVTELCIKSKEEFRLFLELRRFHNKSSIEVDREIEVQSEINAFNFDGINIVVNDEGIMSIVDKTVIEVSKDDFIKKPIKSIKELLRK >NC_020291.1|WP_017810453.1|4382042_4382222_-|hypothetical-protein MVYKKIKKIADENGVRIKKISDNYVVGSHVVEIIDGRVIRVNGKIVRFNELKRQCFKKL >NC_020291.1|WP_015394111.1|4382299_4382524_-|hypothetical-protein MNIEYVAFYQSQKVFREDSGIRYYGKIKEIKRYKRSECKEIPCEKGSEEEKYLRIDFEWIKEIPKIEPIQYGHK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_020291_10 | 5276834-5278564 | Unclear |
I-A:NA
Consensus repeat of NC_020291_10
|
26 spacers
spacers of NC_020291_10
>10.1|5276863|36|NC_020291|CRT AATAGCTGAATCTTTTATTGTTCATTTTTCATCATA >10.2|5276928|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAAAAGAGAAATAGTAGTATGGTCAAAGATTAAAAT >10.3|5276993|37|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CAACAACTGGTGGAAGTAGTGGTGGTTCACATCATTC >10.4|5277059|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTAGCCCACCCAATTTCTCTAAACATATAATAATTT >10.5|5277124|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAAGGAGAAATAAATTTAACTGATGTAATAAATATA >10.6|5277189|37|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCCGAAATATCCAAAGCACAAAAAGAAGGCAGAACAG >10.7|5277255|37|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AATTTACACTAGAAGGGGCTACAAAGGAGCCAGTAAA >10.8|5277321|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GTTTCTTAATTTGCTTTTTCCTCCCATTCTAGTAAT >10.9|5277386|37|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATGGAAAAATAATTATTGAAACTAGTCTTGATACCAA >10.10|5277452|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATAAATATCACTTGTAAATCTATCTATTGTACCTTT >10.11|5277517|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GCAAGAAGCAATGTCGGGCATGATGGTATTAATGCA >10.12|5277582|37|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTCACATTTTTGAGTATACAACAACAAAATATATGCC >10.13|5277648|37|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTGTACAAAAATATCATCAATGATAATGTTATAATCA >10.14|5277714|37|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAGTAATAATATTTTCTTTAGAAGCTATAACAAAGTT >10.15|5277780|35|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GTATAAAGAAACTTTTTGTATGTTGCCACGTAAGC >10.16|5277844|37|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTTCAATCGATAAGGATAAGCTTTCTTTTGAGGAAAA >10.17|5277910|37|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CAAATTTATCATTTGAAGCTAAAATGGCTAATATGGT >10.18|5277976|37|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTACTTTTGATATATCAGTATTTTTAAATTCATAAAG >10.19|5278042|37|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAAACACAAGATTGTAACGTGGATGGCAACATTCCAC >10.20|5278108|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGATTTCAGAATTTTAATATTAAATGGTGATTGCGT >10.21|5278173|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTAAAATAATAATTCATTTATTGAGATAGGAGAATG >10.22|5278238|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GTGATATCTTTTATTATTCTTAAGCAACCATTTAAT >10.23|5278303|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAATTGAACTGATTCATTATTGAATAGATGATCTAA >10.24|5278368|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CAATTAATGTTAAACTTTCATCATCTAAACTCATTG >10.25|5278433|37|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTATGCAACAACGCGTCATAAGTGATTTAGAAGCATT >10.26|5278499|36|NC_020291|CRT,CRISPRCasFinder TCATAATATTCACGTATAGTCTTATCAACCATCTTA |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6,WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_020291_10
The CRISPR arrays of NC_020291_10 >merge|NC_020291|10|5276834-5278564|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAATTTTATTGAATTACAATATATAAAACAATAGCTGAATCTTTTATTGTTCATTTTTCATCATAATTTACATTCCTCATAGTCAATATAAAACTAAAAGAGAAATAGTAGTATGGTCAAAGATTAAAATATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACCAACAACTGGTGGAAGTAGTGGTGGTTCACATCATTCATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACTTAGCCCACCCAATTTCTCTAAACATATAATAATTTATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACAAAGGAGAAATAAATTTAACTGATGTAATAAATATAATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACTCCGAAATATCCAAAGCACAAAAAGAAGGCAGAACAGATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACAATTTACACTAGAAGGGGCTACAAAGGAGCCAGTAAAATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACGTTTCTTAATTTGCTTTTTCCTCCCATTCTAGTAATATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACATGGAAAAATAATTATTGAAACTAGTCTTGATACCAAATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACATAAATATCACTTGTAAATCTATCTATTGTACCTTTATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACGCAAGAAGCAATGTCGGGCATGATGGTATTAATGCAATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACTTCACATTTTTGAGTATACAACAACAAAATATATGCCATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACTTGTACAAAAATATCATCAATGATAATGTTATAATCAATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACTAGTAATAATATTTTCTTTAGAAGCTATAACAAAGTTATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACGTATAAAGAAACTTTTTGTATGTTGCCACGTAAGCATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACCTTCAATCGATAAGGATAAGCTTTCTTTTGAGGAAAAATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACCAAATTTATCATTTGAAGCTAAAATGGCTAATATGGTATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACTTACTTTTGATATATCAGTATTTTTAAATTCATAAAGATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACAAAACACAAGATTGTAACGTGGATGGCAACATTCCACATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACAGATTTCAGAATTTTAATATTAAATGGTGATTGCGTATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACTTAAAATAATAATTCATTTATTGAGATAGGAGAATGATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACGTGATATCTTTTATTATTCTTAAGCAACCATTTAATATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACAAATTGAACTGATTCATTATTGAATAGATGATCTAAATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACCAATTAATGTTAAACTTTCATCATCTAAACTCATTGATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACCTATGCAACAACGCGTCATAAGTGATTTAGAAGCATTATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACTCATAATATTCACGTATAGTCTTATCAACCATCTTAATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACT >NC_020291|10|2|5276834-5278563|CRT TAATTTTATTGAATTACAATATATAAAAC AATAGCTGAATCTTTTATTGTTCATTTTTCATCATA ATTTACATTCCTCATAGTCAATATAAAAC TAAAAGAGAAATAGTAGTATGGTCAAAGATTAAAAT ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC CAACAACTGGTGGAAGTAGTGGTGGTTCACATCATTC ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC TTAGCCCACCCAATTTCTCTAAACATATAATAATTT ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC AAAGGAGAAATAAATTTAACTGATGTAATAAATATA ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC TCCGAAATATCCAAAGCACAAAAAGAAGGCAGAACAG ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC AATTTACACTAGAAGGGGCTACAAAGGAGCCAGTAAA ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC GTTTCTTAATTTGCTTTTTCCTCCCATTCTAGTAAT ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC ATGGAAAAATAATTATTGAAACTAGTCTTGATACCAA ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC ATAAATATCACTTGTAAATCTATCTATTGTACCTTT ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC GCAAGAAGCAATGTCGGGCATGATGGTATTAATGCA ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC TTCACATTTTTGAGTATACAACAACAAAATATATGCC ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC TTGTACAAAAATATCATCAATGATAATGTTATAATCA ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC TAGTAATAATATTTTCTTTAGAAGCTATAACAAAGTT ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC GTATAAAGAAACTTTTTGTATGTTGCCACGTAAGC ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC CTTCAATCGATAAGGATAAGCTTTCTTTTGAGGAAAA ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC CAAATTTATCATTTGAAGCTAAAATGGCTAATATGGT ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC TTACTTTTGATATATCAGTATTTTTAAATTCATAAAG ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC AAAACACAAGATTGTAACGTGGATGGCAACATTCCAC ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC AGATTTCAGAATTTTAATATTAAATGGTGATTGCGT ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC TTAAAATAATAATTCATTTATTGAGATAGGAGAATG ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC GTGATATCTTTTATTATTCTTAAGCAACCATTTAAT ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC AAATTGAACTGATTCATTATTGAATAGATGATCTAA ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC CAATTAATGTTAAACTTTCATCATCTAAACTCATTG ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC CTATGCAACAACGCGTCATAAGTGATTTAGAAGCATT ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC TCATAATATTCACGTATAGTCTTATCAACCATCTTA ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC >NC_020291|10|1|5276899-5278498|PILER-CR ATTTACATTCCTCATAGTCAATATAAAAC TAAAAGAGAAATAGTAGTATGGTCAAAGATTAAAAT ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC CAACAACTGGTGGAAGTAGTGGTGGTTCACATCATTC ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC TTAGCCCACCCAATTTCTCTAAACATATAATAATTT ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC AAAGGAGAAATAAATTTAACTGATGTAATAAATATA ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC TCCGAAATATCCAAAGCACAAAAAGAAGGCAGAACAG ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC AATTTACACTAGAAGGGGCTACAAAGGAGCCAGTAAA ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC GTTTCTTAATTTGCTTTTTCCTCCCATTCTAGTAAT ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC ATGGAAAAATAATTATTGAAACTAGTCTTGATACCAA ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC ATAAATATCACTTGTAAATCTATCTATTGTACCTTT ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC GCAAGAAGCAATGTCGGGCATGATGGTATTAATGCA ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC TTCACATTTTTGAGTATACAACAACAAAATATATGCC ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC TTGTACAAAAATATCATCAATGATAATGTTATAATCA ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC TAGTAATAATATTTTCTTTAGAAGCTATAACAAAGTT ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC GTATAAAGAAACTTTTTGTATGTTGCCACGTAAGC ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC CTTCAATCGATAAGGATAAGCTTTCTTTTGAGGAAAA ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC CAAATTTATCATTTGAAGCTAAAATGGCTAATATGGT 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ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC GTGATATCTTTTATTATTCTTAAGCAACCATTTAAT ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC AAATTGAACTGATTCATTATTGAATAGATGATCTAA ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC CAATTAATGTTAAACTTTCATCATCTAAACTCATTG ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC CTATGCAACAACGCGTCATAAGTGATTTAGAAGCATT ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC TCATAATATTCACGTATAGTCTTATCAACCATCTTA ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAACT
>NC_020291.1|WP_015394870.1|5275716_5276625_-|LysR-family-transcriptional-regulator MTLQQLKYVVTVADKGTISDAAKELFISQPTITNAIKDLEKEMHITIFNRTNKGIVVSNIGNEFLAYARQVLEQANLLEEKFLNAKEQSPRFSVSTQHYSFAVNAFVDVIREFGGNQYDFTLRETQTYEIIEDVSRMKSEIGILYTSSKNEEVIMKFIKQNDLEFEELFEAKPHVFISSKHPLAERKEITLEELEDYPYLSFEQGDYNSFYFSEEILSTLDRNKNIKVRDRATLFNLAVGLNGYTVSTGVISKELNGENIIARPLMVEEYMRIGVIRQRKMPLSRYGEAYMAALKKHVLEYV >NC_020291.1|WP_015394869.1|5274438_5275551_-|5-methyltetrahydropteroyltriglutamate---homocysteine-S-methyltransferase MKDNAPFKYDIVGSFLRPEHLKHAREEFAKGKINADELKKIEDEAITDLIAKQKAVGLQVITDGEFRRSSWHLDFMWAFNDVGHEKTKKGIPFHGEPALIDDTFLVGKVSIDNHPFVEHFKFVKQFEDENTVARQTIPAPAQFFFQMIIPDNLERTKSIYQNEEELIQDIAKGYKKVIQELYEAGCRNIQFDDCTWGVCVDPNACFILGTDEEGLQQIIEKLIRINNLAIEDKPEDLVINTHICRGNFHSTWACQGGYDRVAKDLFANENVNAFYLEFDDERSGDFKPLQYVSEDKKVVLGLITTKSSTLEDKKNIIERIHEAEKYIPLERLALSPQCGFASTEEGNKLTEEEQWEKLRLIQEISKEVWK >NC_020291.1|WP_015394868.1|5272990_5274133_-|hypothetical-protein MDKTIDILKTTNYDKFKCTADKCKFTCCEGWDVSVDGDTYNKWEKGKCSEILKNIKVEKSGDSVSYSIAKENHETCPFLDMKGLCEIVKKHGEEYISSICHTFPRVENKFEDRRELSLSCACPEVVEIISGLSGKINIFSDNKKATKNNLLELKVRDTLVNIVQQDDFLLEEKLLVCFQMLLDILEDEELSEEGLEEELEKYEDSKYLQEVIGKCKEIDSDINESVEEINYLLLDITKNYKEVSSFEFLLKDISDFAEAVKVGNLSVKWQEYKILFEQHSEFAENWIVSDIISSCISDDIEELIISFELIILEYLMVRYAVFLKYCINNNKEIEIQDIKDYIVTLSRIIGNNSEAVTEFLRDGFEDPILEIGYLCFISLF >NC_020291.1|WP_015394867.1|5272072_5272756_+|Crp/Fnr-family-transcriptional-regulator MKNLILELEKADLFTNKTKEELQNLITKIEYKFINAAKNEYVFNSLTSTKFIGIVLSGKVNVERILPYGKLILMYTKKSGDMFGEVAVFSEANHYPCNVVAKEDSSILLISKDEFFKLLTLDNIILENFLKIISNKAFQLNSRVEALSFVSTKQKVAFSLLNDFHIEKNLLIKLPFSKKMWADNLNVSRASLYKALEELCADSIISMDKTNLIEIIDSQKLEDIVLN >NC_020291.1|WP_015394866.1|5268096_5271966_-|CoA-substrate-specific-enzyme-activase MNKLGIDIGYSTFKYVYLDSKNNLIESDYIFHKGNITKYYKELLEKIKASNKEKSIKIGITGSLASRINLSKEYHINNSISLIEGTLLKNKSVKAIIELGAQETKYITDIEHNNMKFFMNTSCAAGTGSFLEEQALRLSIDIKDISAYIDKATEVPRIAGRCSVFSKTDMIHHMQDGVKIEDILQGLCYALVRNYKANVLQKNELKKPVMLSGGVINNKGVVKALKDILKLKEEDIVINENFELLTCFGACKIAEEKGLIIDVNKLESLGEAIIEKPKNNVYEQLNKFGMDDSLDKHNCISTNTKEGYLGVDIGSTSINFVVIDEDKNVIDYIYTKTNGKPKEVVYEYLEKLKERLGKEFKFKGIGTTGSGREYIGKLINADLIVNEITAQAEGAVNVCSDVDTIFEIGGQDSKYICIENKLVKDFEMNKICAAGTGAFIEEQIKKLGISLEEFGKIALKGDDPCNLGDRCTVFIEGNIGKAIGEGESIENISAGLAYSIVKNYLNRVVGARPIGNKIFLQGGIAHNQAVVNAFRALLKKEIMVPEFFSVTGALGTAVLTKESMRNKDKINKQAEFISYLDENEKYFLDGYVNNKELTKKTIGIPRVLFLNKMFPMFNEIFKKLGYNVLISDATNEDIIALSQEYSFEETCFPVKLINGHVAWLLERKVDYIFLPHLYTMKHAGSKVREDYACVYIQTSPKIIESVFNLEARNIKLISPVLSFNFGKQYMIKTLLGIGKVLGKNKIETTAAVMSGMKKFMNYEKKMEAIGNKVLKDIDKDEKVFVIVSRVYNIVDPALNMGIEKELIKRGYRVLHLSHLEASEMNIGEEYSNMYWPFGQHIIMGAKIIKNHKNLYPIYITNHGCGPDTILMHYFKKEMENKPYLHIEVDEHSSKVGVITRVEAFINSLKNCENNDSLEAENIIKAQNKRQTKNKIDFEEEILIPYMYPFSNILKAFLERKNKKVTILEPVSEKTIELGKNFSRGKEYFSLTGMLAEVTNKIKNDEKEYTLYFPTTEGSETFGQYGKLIQYKALECGKNLKLEAPFIEDYLGNKDFGLEFFKALVIGDLINLSSENKRELCLKDLIETIKNNEISNEYFDKTLKNIRNYISKKEGLKKLLIIGEAIVVNKDYLNSNMIKSLQNDYEVIKQPLSEELYMLFSDFCNKRNKVNKPLIRILNEAKTIIEKVNLSLEIRSPFNRNSESLNEVLIDKLPQYAGGSGRYRLAKLVTAENVDGIIIVSSMYENTATILKILREKYKELLNIPILDLYFDSNISKNNEELIETFIAYL >NC_020291.1|WP_015394865.1|5267580_5267919_-|cupin-domain-containing-protein MEELIKNIVKSKAIDFDSLVSCKEGQIETVTMAQKKGVGLTALAFGKGEGVGPHAAKGDAMIYIHQGIATVKIGDEEMEAHKGQVVVMPANIQHQVTAKEDMKMLLIVVKEG >NC_020291.1|WP_015394864.1|5267240_5267576_-|hypothetical-protein MKYLRNINPFEPIKMKDMVNHSGNKIASKALVDNDKHEVRFFSFAKGESIDKEYYEMESLFIVIEGEAKVVYKENSEAVIKEGEIFALEADIQYGIEAVSDVKLLNILIRG >NC_020291.1|WP_015394863.1|5265369_5267172_+|hypothetical-protein MIKRITKSTSILICIASIISIAPAHAADYKVLDAQEGTIYSATAKGKGIFLDGEINGEEEAVYWVSEDGKYNKLNGINTGATFSDLLLNKYLEIDDGSSDYSYIDITDNCKLLDYDVREDLEDAEAILLKSKIKHDNAGRFDESYYSSSNLISATIEGKNKFLSSSNGLAIYKYKLKEPQINGDYYSTIYANLQGNYVDVDYDLGNLKVSMSTTSSAVTIKNTKDTYEIKQDGITYELKAVIKENKYVTSDSDTIYRLADLTIYKKEKGASDSTYKSATNELKFGKDCYQVTDGNSVTVLQKFSMTPAIDTIDGIKSPKDSTIYFIADEDGNNEYLLGKSVADAIKKIGLSKGAGKVKLTANSQGLYSMYQDTAQKKLYVEKLKLKSKNGFNYIDYDDYYSSDVDSIDSLNTPGGFPWFVNNAYVKAWDGKNFNKLYRIDGSMDSVSITSKDNMIAWNTDTGVYSIVHNITSTKDKNAISGSDTINPQTTTNAAITLNNSSNGWVLNQDNTWTYTLQDGTKKTGWFNTNGSWYYFNADGIMSTGWIKDNDIWYFLDTSGLMKTGWINYNSSWYYCNPSGAMLHDTVIDGYKLGIDGAWTN >NC_020291.1|WP_015394862.1|5263950_5264991_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKRKILLLIMSVTLMTTIFTSCGNTTTNNNIPKPKDSYSSSENSSTKTSYPVNFDAFDSKGNIYKQTFNEAPKKAITNNQSSTELLLTLGLKDSLIGTGDLDTPIPENLLNDYNSIPSVAKKGDVAKEVVIGSGTDLVIGRSASFEDSRYGSISSLNQVGINTYVQLASKMNADINLTTIIQDVKNVGVIFNVQDKANKLADSLQKTLDKVKSKVPNKGERKKVLLVVNYSGGAFTVYGANASLQKEMLNVLNADNVVKKGGSVSFENVISANPDYIVYVTANKNSATDNDAVDRILTESTIQNVNAIKNKNIISVDYTELMGYGIRTFDCLEKLASAFYPENFKS >NC_020291.1|WP_015394861.1|5263130_5263922_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MEIKGDLMDVEIKNLNITLSKKEIIKGIHLTVTGNKFVGLIGPNGSGKSTLLKALYRVLKPTYGDIYIYGKNIESYSKKSSAKILGVVSQFNNINFDFNVIDIVLMSRSPHKNLLEKDTKVDYDIALNALSLVGMLESAQKSFNLLSGGEKQRVLLARAITQEPKILILDEPTNHLDIKYQLEVMNIVKKLNICVLAALHDLTLASQFCDEIYVLKDGQIVCQGIPKDVITKEMIKEVYDVNSNVFVNPTTKRISIDYFTEDL >NC_020291.1|WP_015394871.1|5281036_5281300_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFIILTYDVGEKRVNRVRKCLKKYLTWTQNSVFEGEITEGKLHKCLADVNKFIERDEDSLYIYMVKNIHNIKKEVIGQQKNYDELFL >NC_020291.1|WP_015394872.1|5281301_5282285_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGRDYYIFSNGRIKRKENTIYFVDSEENKKAIPVEEVERLHLFGEVDLNTKFLNHISKYSILINIYNYYGFYSGTYYSKKKNVSGLVLVNQSRMYLEFSLRLKLAKAFIDSANHHMLRNLRRHKITTQEYIDKIEKERQVMNNSNTIQEVMGAEGRARKAYYEAFNTFIKEDFYMEKREKRPPTDPINALISFGNSLMYTTVLGEIYKTQLDPTISYLHEPSTKRFSLSLDIAEIFKPLIVDSIIFTMINKGMIKKDDFQIENEVCLLNENGKKKFIRELENKLSTTVKHRSLHRNVSYRNLIKLECYKIIKMAIENEEYKPLKAWW >NC_020291.1|WP_015394873.1|5282289_5282808_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MNIDFENLKVSGLKVDYYFICKRKLWLFDKGISMESANDRVMQGTVVHKESYKKAKTKELLIDNLIRLDIIDDNYVREVKITSRMRHADEMQLLYYLYYLKRLGIERKGTLNYVKEKKVEEVILTKENEALVEEALIGISELLQEKYPPKVEAYPHCSKCAYYEYCFVKEEE >NC_020291.1|WP_015394874.1|5282851_5285068_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MIYYAKTKPMETIKEHTDNVLKEYENLKNTYEIEINNVVRNFMEPEYFWKLLEFCCEYHDYGKCNVQFQNKLRKKIIEMKDIDPKSEEFNEIPCDKHEEIPHNYLSPAFLPTEELKQISEPLRNIIYQAIAYHHERKSIPDQNEIKEYIKNTLDKELDGMNKHMGNNISKVFGGYAGKIENVVRIKERDENYKFYIMLKGLIHRLDHSASAHVKVEEKLQKTVGKCTEDFFKNKDWDFRAPQEFAMKNREDNLLIIASTGIGKTESALLWINDKKGFFTLPLRVSLNALYSRVKDDIGYDSVGLLHSSALEYMEKQGDDEAYKTYEEASLLNKKLSFSTIDQIFKYPFKYLGYEKVLATLAYSRVVIDEIQAYSPEIAAVILYSVKQLIEMGGKFMIMTATLPRIYKDKLKEFNIEFKEEKFISDNDRHKIKLVEDEIINSVEKVSELGRKNKVLVIVNTVDKAIEYYKLLEDKKVNVNLLHSLFNNNDRSKKEEEIKKFTKEGNKECGIWVTTQIVEASLDVDFDYLISEMSTLDSQFQRYGRCFRKRTFKGADPNIFIYTSNASGVGGVYDEEIFNKSIELLMPYDNQILKEAIKVDLVDKLYSKEMLKGTKFLKKFIEACNVLENIIPYENTSREAQKVLRDIDSVRVIPNDLYNKNMNLFDEVIEDRNSDRHKLFREINNLTISIPRQKLKKFSKLNNELRVDPVAKIDNILLINAKYTKEEGLCLGELYDNIF >NC_020291.1|WP_017810384.1|5285207_5285879_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 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MKIYNSEQWFYKLGIVGFNRIINYNKDYYGLDVDKYNYNVSSDFIEFDSELLEDFPTYYYNYFINEYNVSESMNEKLNKLLGAAKDKDKFQERLNDIKKVIGERNKKIEKLQVAEFDKCKDIHSKIGKVKFEQLAEVEELVKKYEDIVQLEHLNHPMTVINFKSILYNSFFGQISFLNLTHNNKSIDYQKEMFFKDYIKPVLDGEKFSKIIKANDEVELKKYIEIKKEDAAKCPKNELNNIDRVVSIINTALFGKKRKAESVNDVLENYNICRICDDNISFGDDYTDGNFIPLAISNANSKNLFWMFDSRYPICPLCKLVLFCTAAGCTKIFKSYLNDKYDYNDKLYYGFVSIEGDLLELIQGNDNFRNVTKKDGTFEEFILDSVKQNRKISSWQLENILYVEFNADYRSRNSKLNYFNIPTYLARFLRDKDTYTELDNMKNSREKMKIFDLMIQRKDLKHVIDLELRALVNEEAYANRDILRTIRIRNYLKQYKGGCKKVDELAKKNLNYLYFQGVDISKIYRSNNSENKITGLSYRLLNSAKAENKKDFMDTIIRIYMSVDKEIPMIFLEVMKESKLDFEEIAHSFIAGLNSKGKENDDRVEGEN >NC_020291.1|WP_015394878.1|5288633_5289371_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRIKVIFKAEENKFPLSYRMMISSVIKKSLEISDEEYFKNMYYYEEKKNKRIKPFTFSVFFKDYKIEKEEVNLNGQGSIIISTPDYNFGIILYNGLLRLRKHEYKKYKINIEKVLLEKEKLISEGEILCKTLSPINIKSKDNRAVAIEDLEQFNAELNYISNIALETYNGKGLKEELKFTPVKMKKVVAKEKITDFKLLNGKEFIYIEGYAGIFKLQGSIEDLNLLKQLGVGFRRSEGFGLFDLV >NC_020291.1|WP_015394879.1|5289462_5290413_-|WYL-domain-containing-protein MGNLNNTLKMLFILKSGGTIKAKDIASRLEVDEKQVRRYKENLDEFFDIESISGKNGGYKLNAAYFPFKEVLTEEEVILLKEAISSLDANYIENNPKLIKAIEKINYTIFNSEDEEDSCEQIIPYSRVNRMDRDLKKVSEDIYKNILDNQELIIEYKDNKGESTERRVQPYQFITYKGEKYLVAFCLLRDEIRFFKLRRIMDYKITSEKFQKVVDVKKLLEDYKKNSIGIFGGEKYNLKLEIKYPMANTIKERIWVENQEIDDTVFQDKIIFKATMTGGPEIISWILSMGTCVKVIEPEELKQDIHKKLKEMIKNI >NC_020291.1|WP_015394880.1|5290673_5291426_-|TSUP-family-transporter MIQYIIVCPLVFLAGFIDAIAGGGGLISLPAYMLAGVPVHFAIGTNKMSSSMGTVIATYRFARNGYIKLKLAACSVICALLGSPLGAMLSLKINDSYLKLLMLVILPVTAFYVLRKRDFNQKQNIENDVDIQTYFKCMLIAFLIGAYDGFYGPGTGTFLILLLTGIANLSLNNAAGTTKAINLSSNIAGLATFIINAKVLFPLGIAAGLFSIAGNYFGAGYFTKSGAKIARPIIITVLSIFLIKVLIEML |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_020291_11 | 5278601-5280855 | Unclear |
I-A
Consensus repeat of NC_020291_11
|
34 spacers
spacers of NC_020291_11
>11.1|5278630|36|NC_020291|CRT TTATCTTATTGAAAGCTGATAAATACGATAATAATA >11.2|5278695|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTATGGTTGGTGTTGTAGCTACAAGCGGTGGAGCTA >11.3|5278760|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CCTTTACTAGTAAATCTACTCTAACTTTTATCCTAT >11.4|5278825|37|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAGAACATTATGACGTTTATAACATGGAATATATTGA >11.5|5278891|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTGGAAATCTGATAGTTTTAGACAATATTAAAAGG >11.6|5278956|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTGACAAAATTTATAAATCTGTTAAATTATATATG >11.7|5279021|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAAATTTATATAGAACATAAAGGGAATATTACTCCA >11.8|5279086|38|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GCATTAAGAAATTTTTTTATAATATTAGCCATTCTATC >11.9|5279153|37|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GTGATGCGATTGACTTCATTATGAAATATAAAAATTT >11.10|5279219|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAACTGAACTGATTCATTATTAAACATATGGTCCAG >11.11|5279284|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TATTCTTTCTCTTTTATTCATGTGTATATCTCCTTT >11.12|5279349|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGATTATAATTCTTTCAATTCTTTAATTTCTTCAAT >11.13|5279414|38|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GTTCTAAAAGTTATTGGAACTGGCACACTCCAATCTTT >11.14|5279481|37|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATGGAATTCAAAGAACATACAACTATGTAAAAAACGA >11.15|5279547|37|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAACATTATCCTTAATGTACTCTATCATTATTTCTTT >11.16|5279613|37|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATGATGTGTTAATATCTACAATAACAAATGTAAACCA >11.17|5279679|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTATACATTTATTGCAAGAAAAAAGCAATAAAAATA >11.18|5279744|37|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AATGTGGAAAGCTTCAAAATTCAGAAATTATGATTAG >11.19|5279810|37|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTGATTAGTGACCATGTTAATGAAACAATTAATTTGA >11.20|5279876|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTTAACAAAACAATTAATGTCTATGGCATTTGAAAA >11.21|5279941|37|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GAAGACAAGAAACTTGATGAACAAAAACAAATTCAAA >11.22|5280007|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTTTATGAAATTGAAGAAAAGAAGAAAAGCAGCAAG >11.23|5280072|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTAAAGAAAAAAAGAGGCTGGAACGTGAAATTTGG >11.24|5280137|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGAATATATAATTGATGGGGATGGTATCTTAGTTGT >11.25|5280202|37|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTAGAGGTAATAAGTTAACTCTTATGAAATCTTATTT >11.26|5280268|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTAATAGATTCAAATGGAAGATTAAAATAATTAAA >11.27|5280333|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTCTATAAGCATTGTAATAAGTTCCATATAAAGCAG >11.28|5280398|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTAAAAATACAACAGATACATTATTTATTTTTAATA >11.29|5280463|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GTAACGCCAAAAAAGAACAATCAGAGAGTAGCCTAT >11.30|5280528|37|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTGAAATAGTTAACTGGTTTAAAAACATGAAGAAAAA >11.31|5280594|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTGATGAACATAAAATTGATATGAATAATATCCATG >11.32|5280659|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CAAGTGATGCAGGAAAGTTTTACATGAAAATACCAA >11.33|5280724|37|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GAAGAAAGTGAGGTTGATTGCAATGGCATTAGGTAAA >11.34|5280790|37|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTTTAGGCGGTAAATTAAGAACTTGTCTCCATTCATT |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6,WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_020291_11
The CRISPR arrays of NC_020291_11 >merge|NC_020291|11|5278601-5280855|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder 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ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC CTTTAGGCGGTAAATTAAGAACTTGTCTCCATTCATT ATTTACATTCCTCATAGTTAATATAAAAC
>NC_020291.1|WP_015394870.1|5275716_5276625_-|LysR-family-transcriptional-regulator MTLQQLKYVVTVADKGTISDAAKELFISQPTITNAIKDLEKEMHITIFNRTNKGIVVSNIGNEFLAYARQVLEQANLLEEKFLNAKEQSPRFSVSTQHYSFAVNAFVDVIREFGGNQYDFTLRETQTYEIIEDVSRMKSEIGILYTSSKNEEVIMKFIKQNDLEFEELFEAKPHVFISSKHPLAERKEITLEELEDYPYLSFEQGDYNSFYFSEEILSTLDRNKNIKVRDRATLFNLAVGLNGYTVSTGVISKELNGENIIARPLMVEEYMRIGVIRQRKMPLSRYGEAYMAALKKHVLEYV >NC_020291.1|WP_015394869.1|5274438_5275551_-|5-methyltetrahydropteroyltriglutamate---homocysteine-S-methyltransferase MKDNAPFKYDIVGSFLRPEHLKHAREEFAKGKINADELKKIEDEAITDLIAKQKAVGLQVITDGEFRRSSWHLDFMWAFNDVGHEKTKKGIPFHGEPALIDDTFLVGKVSIDNHPFVEHFKFVKQFEDENTVARQTIPAPAQFFFQMIIPDNLERTKSIYQNEEELIQDIAKGYKKVIQELYEAGCRNIQFDDCTWGVCVDPNACFILGTDEEGLQQIIEKLIRINNLAIEDKPEDLVINTHICRGNFHSTWACQGGYDRVAKDLFANENVNAFYLEFDDERSGDFKPLQYVSEDKKVVLGLITTKSSTLEDKKNIIERIHEAEKYIPLERLALSPQCGFASTEEGNKLTEEEQWEKLRLIQEISKEVWK >NC_020291.1|WP_015394868.1|5272990_5274133_-|hypothetical-protein MDKTIDILKTTNYDKFKCTADKCKFTCCEGWDVSVDGDTYNKWEKGKCSEILKNIKVEKSGDSVSYSIAKENHETCPFLDMKGLCEIVKKHGEEYISSICHTFPRVENKFEDRRELSLSCACPEVVEIISGLSGKINIFSDNKKATKNNLLELKVRDTLVNIVQQDDFLLEEKLLVCFQMLLDILEDEELSEEGLEEELEKYEDSKYLQEVIGKCKEIDSDINESVEEINYLLLDITKNYKEVSSFEFLLKDISDFAEAVKVGNLSVKWQEYKILFEQHSEFAENWIVSDIISSCISDDIEELIISFELIILEYLMVRYAVFLKYCINNNKEIEIQDIKDYIVTLSRIIGNNSEAVTEFLRDGFEDPILEIGYLCFISLF >NC_020291.1|WP_015394867.1|5272072_5272756_+|Crp/Fnr-family-transcriptional-regulator MKNLILELEKADLFTNKTKEELQNLITKIEYKFINAAKNEYVFNSLTSTKFIGIVLSGKVNVERILPYGKLILMYTKKSGDMFGEVAVFSEANHYPCNVVAKEDSSILLISKDEFFKLLTLDNIILENFLKIISNKAFQLNSRVEALSFVSTKQKVAFSLLNDFHIEKNLLIKLPFSKKMWADNLNVSRASLYKALEELCADSIISMDKTNLIEIIDSQKLEDIVLN >NC_020291.1|WP_015394866.1|5268096_5271966_-|CoA-substrate-specific-enzyme-activase MNKLGIDIGYSTFKYVYLDSKNNLIESDYIFHKGNITKYYKELLEKIKASNKEKSIKIGITGSLASRINLSKEYHINNSISLIEGTLLKNKSVKAIIELGAQETKYITDIEHNNMKFFMNTSCAAGTGSFLEEQALRLSIDIKDISAYIDKATEVPRIAGRCSVFSKTDMIHHMQDGVKIEDILQGLCYALVRNYKANVLQKNELKKPVMLSGGVINNKGVVKALKDILKLKEEDIVINENFELLTCFGACKIAEEKGLIIDVNKLESLGEAIIEKPKNNVYEQLNKFGMDDSLDKHNCISTNTKEGYLGVDIGSTSINFVVIDEDKNVIDYIYTKTNGKPKEVVYEYLEKLKERLGKEFKFKGIGTTGSGREYIGKLINADLIVNEITAQAEGAVNVCSDVDTIFEIGGQDSKYICIENKLVKDFEMNKICAAGTGAFIEEQIKKLGISLEEFGKIALKGDDPCNLGDRCTVFIEGNIGKAIGEGESIENISAGLAYSIVKNYLNRVVGARPIGNKIFLQGGIAHNQAVVNAFRALLKKEIMVPEFFSVTGALGTAVLTKESMRNKDKINKQAEFISYLDENEKYFLDGYVNNKELTKKTIGIPRVLFLNKMFPMFNEIFKKLGYNVLISDATNEDIIALSQEYSFEETCFPVKLINGHVAWLLERKVDYIFLPHLYTMKHAGSKVREDYACVYIQTSPKIIESVFNLEARNIKLISPVLSFNFGKQYMIKTLLGIGKVLGKNKIETTAAVMSGMKKFMNYEKKMEAIGNKVLKDIDKDEKVFVIVSRVYNIVDPALNMGIEKELIKRGYRVLHLSHLEASEMNIGEEYSNMYWPFGQHIIMGAKIIKNHKNLYPIYITNHGCGPDTILMHYFKKEMENKPYLHIEVDEHSSKVGVITRVEAFINSLKNCENNDSLEAENIIKAQNKRQTKNKIDFEEEILIPYMYPFSNILKAFLERKNKKVTILEPVSEKTIELGKNFSRGKEYFSLTGMLAEVTNKIKNDEKEYTLYFPTTEGSETFGQYGKLIQYKALECGKNLKLEAPFIEDYLGNKDFGLEFFKALVIGDLINLSSENKRELCLKDLIETIKNNEISNEYFDKTLKNIRNYISKKEGLKKLLIIGEAIVVNKDYLNSNMIKSLQNDYEVIKQPLSEELYMLFSDFCNKRNKVNKPLIRILNEAKTIIEKVNLSLEIRSPFNRNSESLNEVLIDKLPQYAGGSGRYRLAKLVTAENVDGIIIVSSMYENTATILKILREKYKELLNIPILDLYFDSNISKNNEELIETFIAYL >NC_020291.1|WP_015394865.1|5267580_5267919_-|cupin-domain-containing-protein MEELIKNIVKSKAIDFDSLVSCKEGQIETVTMAQKKGVGLTALAFGKGEGVGPHAAKGDAMIYIHQGIATVKIGDEEMEAHKGQVVVMPANIQHQVTAKEDMKMLLIVVKEG >NC_020291.1|WP_015394864.1|5267240_5267576_-|hypothetical-protein MKYLRNINPFEPIKMKDMVNHSGNKIASKALVDNDKHEVRFFSFAKGESIDKEYYEMESLFIVIEGEAKVVYKENSEAVIKEGEIFALEADIQYGIEAVSDVKLLNILIRG >NC_020291.1|WP_015394863.1|5265369_5267172_+|hypothetical-protein MIKRITKSTSILICIASIISIAPAHAADYKVLDAQEGTIYSATAKGKGIFLDGEINGEEEAVYWVSEDGKYNKLNGINTGATFSDLLLNKYLEIDDGSSDYSYIDITDNCKLLDYDVREDLEDAEAILLKSKIKHDNAGRFDESYYSSSNLISATIEGKNKFLSSSNGLAIYKYKLKEPQINGDYYSTIYANLQGNYVDVDYDLGNLKVSMSTTSSAVTIKNTKDTYEIKQDGITYELKAVIKENKYVTSDSDTIYRLADLTIYKKEKGASDSTYKSATNELKFGKDCYQVTDGNSVTVLQKFSMTPAIDTIDGIKSPKDSTIYFIADEDGNNEYLLGKSVADAIKKIGLSKGAGKVKLTANSQGLYSMYQDTAQKKLYVEKLKLKSKNGFNYIDYDDYYSSDVDSIDSLNTPGGFPWFVNNAYVKAWDGKNFNKLYRIDGSMDSVSITSKDNMIAWNTDTGVYSIVHNITSTKDKNAISGSDTINPQTTTNAAITLNNSSNGWVLNQDNTWTYTLQDGTKKTGWFNTNGSWYYFNADGIMSTGWIKDNDIWYFLDTSGLMKTGWINYNSSWYYCNPSGAMLHDTVIDGYKLGIDGAWTN >NC_020291.1|WP_015394862.1|5263950_5264991_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKRKILLLIMSVTLMTTIFTSCGNTTTNNNIPKPKDSYSSSENSSTKTSYPVNFDAFDSKGNIYKQTFNEAPKKAITNNQSSTELLLTLGLKDSLIGTGDLDTPIPENLLNDYNSIPSVAKKGDVAKEVVIGSGTDLVIGRSASFEDSRYGSISSLNQVGINTYVQLASKMNADINLTTIIQDVKNVGVIFNVQDKANKLADSLQKTLDKVKSKVPNKGERKKVLLVVNYSGGAFTVYGANASLQKEMLNVLNADNVVKKGGSVSFENVISANPDYIVYVTANKNSATDNDAVDRILTESTIQNVNAIKNKNIISVDYTELMGYGIRTFDCLEKLASAFYPENFKS >NC_020291.1|WP_015394861.1|5263130_5263922_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MEIKGDLMDVEIKNLNITLSKKEIIKGIHLTVTGNKFVGLIGPNGSGKSTLLKALYRVLKPTYGDIYIYGKNIESYSKKSSAKILGVVSQFNNINFDFNVIDIVLMSRSPHKNLLEKDTKVDYDIALNALSLVGMLESAQKSFNLLSGGEKQRVLLARAITQEPKILILDEPTNHLDIKYQLEVMNIVKKLNICVLAALHDLTLASQFCDEIYVLKDGQIVCQGIPKDVITKEMIKEVYDVNSNVFVNPTTKRISIDYFTEDL >NC_020291.1|WP_015394871.1|5281036_5281300_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFIILTYDVGEKRVNRVRKCLKKYLTWTQNSVFEGEITEGKLHKCLADVNKFIERDEDSLYIYMVKNIHNIKKEVIGQQKNYDELFL >NC_020291.1|WP_015394872.1|5281301_5282285_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGRDYYIFSNGRIKRKENTIYFVDSEENKKAIPVEEVERLHLFGEVDLNTKFLNHISKYSILINIYNYYGFYSGTYYSKKKNVSGLVLVNQSRMYLEFSLRLKLAKAFIDSANHHMLRNLRRHKITTQEYIDKIEKERQVMNNSNTIQEVMGAEGRARKAYYEAFNTFIKEDFYMEKREKRPPTDPINALISFGNSLMYTTVLGEIYKTQLDPTISYLHEPSTKRFSLSLDIAEIFKPLIVDSIIFTMINKGMIKKDDFQIENEVCLLNENGKKKFIRELENKLSTTVKHRSLHRNVSYRNLIKLECYKIIKMAIENEEYKPLKAWW >NC_020291.1|WP_015394873.1|5282289_5282808_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MNIDFENLKVSGLKVDYYFICKRKLWLFDKGISMESANDRVMQGTVVHKESYKKAKTKELLIDNLIRLDIIDDNYVREVKITSRMRHADEMQLLYYLYYLKRLGIERKGTLNYVKEKKVEEVILTKENEALVEEALIGISELLQEKYPPKVEAYPHCSKCAYYEYCFVKEEE >NC_020291.1|WP_015394874.1|5282851_5285068_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MIYYAKTKPMETIKEHTDNVLKEYENLKNTYEIEINNVVRNFMEPEYFWKLLEFCCEYHDYGKCNVQFQNKLRKKIIEMKDIDPKSEEFNEIPCDKHEEIPHNYLSPAFLPTEELKQISEPLRNIIYQAIAYHHERKSIPDQNEIKEYIKNTLDKELDGMNKHMGNNISKVFGGYAGKIENVVRIKERDENYKFYIMLKGLIHRLDHSASAHVKVEEKLQKTVGKCTEDFFKNKDWDFRAPQEFAMKNREDNLLIIASTGIGKTESALLWINDKKGFFTLPLRVSLNALYSRVKDDIGYDSVGLLHSSALEYMEKQGDDEAYKTYEEASLLNKKLSFSTIDQIFKYPFKYLGYEKVLATLAYSRVVIDEIQAYSPEIAAVILYSVKQLIEMGGKFMIMTATLPRIYKDKLKEFNIEFKEEKFISDNDRHKIKLVEDEIINSVEKVSELGRKNKVLVIVNTVDKAIEYYKLLEDKKVNVNLLHSLFNNNDRSKKEEEIKKFTKEGNKECGIWVTTQIVEASLDVDFDYLISEMSTLDSQFQRYGRCFRKRTFKGADPNIFIYTSNASGVGGVYDEEIFNKSIELLMPYDNQILKEAIKVDLVDKLYSKEMLKGTKFLKKFIEACNVLENIIPYENTSREAQKVLRDIDSVRVIPNDLYNKNMNLFDEVIEDRNSDRHKLFREINNLTISIPRQKLKKFSKLNNELRVDPVAKIDNILLINAKYTKEEGLCLGELYDNIF >NC_020291.1|WP_017810384.1|5285207_5285879_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKALKLKLYQETVCYKKPYAFKVTETYPLPPYSTVIGMLHGIIGAGKDDYHEMEVSVQGKYEGIFTAYNTTRFYNGDDITSMPLNVHMLYGVSLVIHVVSDEDTLNKIYEGFRTTDTAFTLGRREDLARLDDIKFVELNKLLKEDEFDDEKDIKLKYSMYVPDKYQTSLRGIGYKINKVYRIVNDLRQWGKINVKYVECDESLDNGEYYIDDDSIEKDIAFLA >NC_020291.1|WP_015394876.1|5285885_5286794_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MGKSITCSIIFQGQSLNYGEGIGNISELKKLTRNDGNFYTLATRQALTYDVRRLGEEIFGWNLQTVDKSKGTIQFKNQYTIKDSEEMDLFGYMKTAKKEGDEKGGSAIRPAVARVSTAISLEPYKSDMDFLSNKGFADRIGEHPNLANSEQHLSYYTYTLTIDLDKVGVDGDLNLDNSEKAKRVNQLLDLVKILNRNIRGRQENLSPLFIIGGTYDIANPFFMGRIELEINKGKFNIKTKPLEDALDMTILECNVKDNTNIGVVSGVFGNEEELDKLVKEGVSNIESFFKQLKNKVNAYYGV >NC_020291.1|WP_015394877.1|5286795_5288619_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MKIYNSEQWFYKLGIVGFNRIINYNKDYYGLDVDKYNYNVSSDFIEFDSELLEDFPTYYYNYFINEYNVSESMNEKLNKLLGAAKDKDKFQERLNDIKKVIGERNKKIEKLQVAEFDKCKDIHSKIGKVKFEQLAEVEELVKKYEDIVQLEHLNHPMTVINFKSILYNSFFGQISFLNLTHNNKSIDYQKEMFFKDYIKPVLDGEKFSKIIKANDEVELKKYIEIKKEDAAKCPKNELNNIDRVVSIINTALFGKKRKAESVNDVLENYNICRICDDNISFGDDYTDGNFIPLAISNANSKNLFWMFDSRYPICPLCKLVLFCTAAGCTKIFKSYLNDKYDYNDKLYYGFVSIEGDLLELIQGNDNFRNVTKKDGTFEEFILDSVKQNRKISSWQLENILYVEFNADYRSRNSKLNYFNIPTYLARFLRDKDTYTELDNMKNSREKMKIFDLMIQRKDLKHVIDLELRALVNEEAYANRDILRTIRIRNYLKQYKGGCKKVDELAKKNLNYLYFQGVDISKIYRSNNSENKITGLSYRLLNSAKAENKKDFMDTIIRIYMSVDKEIPMIFLEVMKESKLDFEEIAHSFIAGLNSKGKENDDRVEGEN >NC_020291.1|WP_015394878.1|5288633_5289371_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRIKVIFKAEENKFPLSYRMMISSVIKKSLEISDEEYFKNMYYYEEKKNKRIKPFTFSVFFKDYKIEKEEVNLNGQGSIIISTPDYNFGIILYNGLLRLRKHEYKKYKINIEKVLLEKEKLISEGEILCKTLSPINIKSKDNRAVAIEDLEQFNAELNYISNIALETYNGKGLKEELKFTPVKMKKVVAKEKITDFKLLNGKEFIYIEGYAGIFKLQGSIEDLNLLKQLGVGFRRSEGFGLFDLV >NC_020291.1|WP_015394879.1|5289462_5290413_-|WYL-domain-containing-protein MGNLNNTLKMLFILKSGGTIKAKDIASRLEVDEKQVRRYKENLDEFFDIESISGKNGGYKLNAAYFPFKEVLTEEEVILLKEAISSLDANYIENNPKLIKAIEKINYTIFNSEDEEDSCEQIIPYSRVNRMDRDLKKVSEDIYKNILDNQELIIEYKDNKGESTERRVQPYQFITYKGEKYLVAFCLLRDEIRFFKLRRIMDYKITSEKFQKVVDVKKLLEDYKKNSIGIFGGEKYNLKLEIKYPMANTIKERIWVENQEIDDTVFQDKIIFKATMTGGPEIISWILSMGTCVKVIEPEELKQDIHKKLKEMIKNI >NC_020291.1|WP_015394880.1|5290673_5291426_-|TSUP-family-transporter MIQYIIVCPLVFLAGFIDAIAGGGGLISLPAYMLAGVPVHFAIGTNKMSSSMGTVIATYRFARNGYIKLKLAACSVICALLGSPLGAMLSLKINDSYLKLLMLVILPVTAFYVLRKRDFNQKQNIENDVDIQTYFKCMLIAFLIGAYDGFYGPGTGTFLILLLTGIANLSLNNAAGTTKAINLSSNIAGLATFIINAKVLFPLGIAAGLFSIAGNYFGAGYFTKSGAKIARPIIITVLSIFLIKVLIEML |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_020291_12 | 6007076-6007161 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_020291_12
|
1 spacers
spacers of NC_020291_12
>12.1|6007102|34|NC_020291|CRISPRCasFinder TGGTTGTAAGTAATACCAAGTTCCATTGTCATTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_020291_12
The CRISPR arrays of NC_020291_12 >merge|NC_020291|12|6007076-6007161|CRISPRCasFinder AACCAACCAGTTTTCATTGCTCCTGATGGTTGTAAGTAATACCAAGTTCCATTGTCATTTAACCAACCAGTTTTCATTGCTCCTGA >NC_020291|12|12|6007076-6007161|CRISPRCasFinder AACCAACCAGTTTTCATTGCTCCTGA TGGTTGTAAGTAATACCAAGTTCCATTGTCATTT AACCAACCAGTTTTCATTGCTCCTGA
>NC_020291.1|WP_015395450.1|6005193_6006639_-|hypothetical-protein MDRIFRSVIIGAFFCGLSFISPSSLDLVNTGVYASERQPFLRNITLSEGSKLKFDQDVHSYIVDVGKDIDVVSIKVKPDEPENTVKIDGEIVTKDDSYKKWVNLKKGKNKVEIEVEDANTQAVSKYTVFVYRGGKDAVYLKDIRVDDETIGFDNSINFYNLELDEGTEMVELNAVTEDENYTVTVNKTELKASNITRLRLHDMGKYTLTITVTDKETGRVGIYTLNIYLGIPVTPDVQGAINAVLKPNQWLIVNGRWRYNDSKGDPLKSTWFYDNKYKRYFHFSGAGNMQTGWIKDNGKSYYLNKFGMMETGWVLFEDKWYYLGADGAMRTGWLQDEGKWYFLNEDGSMETGWIIKNGKWYCLNNDGAMETGWIPYKYKWYYLNSSGEMEIGWTKIDGEWYYFNYDGSMKSGEWFKYTGDWYYLNFVGNMRHRIESIANSGWLAQNGKYYYFNEDGTMNNQTKTIDGYTYDFNQDGSVKFD >NC_020291.1|WP_015395449.1|6002411_6004640_-|hypothetical-protein MRTKKFSLRKIISYLLIFTVFFTVLQIGNTNKANAATQETTQVPGLVINIGDLTENVTRIVDKDSLGGYICEYLPIGKGLTLTSTSGYSITSVTSNSTNMVIGQIGNASGGQNYTISSITDYSDFILTVTIKDSAGNSVTYPIKMRFEADSSLDFNTLRVTLDSQTPQNFPYSQIDANGNYSMKADATINTAKIELLDISGTPMTFTVNGASSNIVNLVGGDNIIKIKRTNQNVSKQYTLVITKKGLPKLQALVPSTGALTPAFDKDVNEYIVTVPTDQTTVSFIPTAVDNSSTIKVNGVSVASGSKSQNIKLSEGNNEVDIVLTTKDGDVGTYIVNVTRTPLFRSTGLTSLTLTSGTLSPTFNKGITEYTATVENSITSVGVTPTAEDPNATITVNGKKVPSAATSPNISLDEGVNTINVKVTDTKGNTQTYVVNVTRKYSKDNVNLATLSVTDGTLSPKFDPETYLYSVKVAKNIEKVRILFSAQNDSAKIKVNGKEYTNGQSDYIKLEVGANNVDVQVVAEDGTTTTTYKLSLIRGDIEGKNQWVLVAGEWRFYNAAGIQVKNDWVKYDNQWYFCDINGDRKTGWIFESGNWYYLNDDGIMITGWQYDKGYWYYLQGDGSMRTNAWATYDGKWYYFNNYGQLQTGWYFYKGKYYYMDDHGVMQKGWVTYDKNKYYLNDDGSMRTGWLYTGKIWYYLDDSGMMVRGWKNIGGKNYYFDANGVMKTGMFFLDGQWINLNNA >NC_020291.1|WP_015395448.1|6000839_6002147_-|methyl-accepting-chemotaxis-protein MDGNKKNISLKAKLIITYVIMSVLVLISGFVNFKQLSDIRNGLANGDTIASDIITTTGLCVISVVIAVIAAMYMNKSIIKRLNNLQTFAKQLAAYDFTEECEMAKNDEIGNTGRELNIAQKNIRELITIILNESSNMSALSQELSANIEEVTAKLEEVDRSSKNINVTMTETSATAEEIAASIEEVNTNMEGLAGKAEAGSTNAEKIKKRAEGIKNDSQIAIRNTAQIRDQKEKNIAKAIQDAKVVEEVKVMAGAIADIAEQTNLLALNAAIEAARAGESGKGFAVVAEEIRKLAEESSQTVVTIQDTIGKINEAVKNLSENSNDILNFMSTEVDKQLQDYAKVGEKYSNDGEFVSTMSEELVSMAQEVEATVEQINQALQSTAADVQKSSVSSENIQAEIGRSSSAMEQVAHAATEQAKIAIHLNELVQKFKVK >NC_020291.1|WP_015395447.1|5998269_6000324_-|diguanylate-cyclase MSIKHKTLLIGFLSMLSIIGITISIFNFSYFGYIDKEHERRLKRNFEVIDYLINKEEDNMQRLITDWGQWDDTYRFIAEPNQEFVNSNLQEETIENLNLKNIVFVNNNKEIVYSKESSVSKEFSKKLVERLLGVNTNFNGDEGKNGLLSYKEKTYIVAIIPVTSSNKHAKSNGFIIMAREVDKNIITYIEEIAGVKLTLSDFQQENYKQNDEVSFINIDNNTVIYNKKYSEAVKIIKDINGESSISASLIDNGYNNDQIGYFFKSFILQFLGLIVIVLIIDVLIINKYILKRLSKLTKFMEKVGKSKDTSLNIEISGKDEVYKLAAATNKMLSELNCANDEIRFLSYCDKLTKLNNRAYIEKILDELDENKFENYFILMGDLNGLKLTNDALGHFEGDKLLVLVGKILKEICAEDDVISRWGGDEFVILVRNKDSYYVTDLIDRIKEKCNNETEFHFKISIAWGYAGYYEENSNTENVMSLAEKRMYRSKLMENKSARSAAIQSLLKTLHEKDSETEEHTIRIKWLSLKLGKKLGLTTEKLDELELLSSLHDIGKIGIPENILMKPGKLTDEEWVIMKTHCDIGYRIASSTPELAHIANKILAHHERYDGTGYPNKLKGEEIPLLSRIISIVDSYDVMTHRRIYKETYEKEYVIEELKKCSGEQFDPYLVKEFIKLLEEENILL >NC_020291.1|WP_015395446.1|5996093_5998097_-|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase-family-protein 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>NC_020291.1|WP_015395444.1|5990744_5991809_-|hypothetical-protein MKHKILKKLIASSLVSLALVTLVPVGASAAWISGSDGAWYYSMGYSFATGWKYINGSWYYFDSMGKMQTGWIPYGDNWYYADLSGAMQTGLIQIEGKIHLFSSSGEMQKGSSMINGQLCNFDDNGVYIGSYPITPIKAFDYYGNSTMPYASNQLITSNSTMSKDIPSDGLYHPKQYTIKFKDPDADNEDDELLKTKTVDENSQMYLYIPTKSGYTFVEWNTKSNGNGTGYLDSDRIYVTKDMTLYAQWEENTNSNNNNNGNNTDTVKVTSIAVSGASGLKSIAVGGSLQMTCIVSPGDATTQSVKWSILSEGGSATISTTGKLTGTGAGKVIVKAAATDGSGVVGTTEITISAS >NC_020291.1|WP_015395443.1|5988605_5990201_-|peptide-chain-release-factor-3 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MKIKRKLITFVLAFAMVLSFIPTLSVKAATTDFKIISDTKVTAKEAEEWAESKGATETFVGLADLYFKYAPDHGDVNPAIAYVQAAKETGFGKFGGVIDESYHNPCGLKKPEGGGDTDPNAHQKFASWDEGVQAHLDHLALYAGADGYPRSDTPDPRHFATVKGRATTVNSLGTKWAPSATYGEEVNKLYKDLMDFAGVDYPKDTIDDSTNTDNSKDNNQSSNGTPNPGKPESKPNVQNVSSVIPENQIKNDTTIIDDKTNITSTVGWKNEDGNWYYYKSDNTKAIGWIKPDSNWYYLNDEGKLQTGWFKYNSKWYYSDSSGAMVKGWKQIGDEWYFLSDSGTMATGILFDGSNSYYLQDSGAMAEYKGWKKIGDKWYFFEAGSKIKTGWLKDNNNWYYLQGDGSMVTGIKKIDNKNYMLNQDGSMATGWIQQSNIWYYFNQDGSMATGWILDNGTYYYLYDNGAMAKGWINLGDAWYHLENGGAMSTGWVTSNGDTYYLNPSTGRLVTNTTQDGYKIGSDGKRQNASTVKNDDSTSSGSNSSQNDKGNSGSNSSQGDVDNSGTNSPINNNTSNGKKTIVIDAGHDYGKDYGAESTIDGVTYSETELNIQVADKLKKELKAKGYNVLMTRDLGSKPSYGSLTASLTHKVTTANNVNADFFISIHHNSAGATAQGVMTLYSNEPQDTSFGGKLNSARIDKSRKIATLINNNIASKLNLNNRGGQEQNLFVCRNANMPAVLVEVGFITNKEEAIRCADPSSQQKVAEAIAEVIANNV >NC_020291.1|WP_015395452.1|6009493_6011185_-|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase-family-protein 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MIRRTNKITSLLLATAAVVSMVPAYAADIKKVDTEVGTVYNAIAYKDGKDLVNGKIKDNEGTYYYVNGKYTNLNDIDSGSDYTIYGTKYAEVENGDYYVDLDTGKVTKDSMRKNDLDDAESSLRKKIKEVNRYNSNSNLPTDFIKIAGNKFSENWYATKFYTIATNLDNAGDKPTIYTDAKGNYIDADYNLGKIKVETTGSGVSGEVTVENTVDKKILKSGSTTIATVDAKIVNSATKELGQDKDNIYRYTQVKITLTPANGITLPSSVKINGKIFAVDASNHTVILDTIQKISKAQNSDTIKDAKYAKSVSNYIISNDNGSVLSNESNYLALAKVSGTEARVIGEKLVLFNINNTKGSDPNLKIQAATLKGKNGYYYTDVEKKADIKAEYSTDINKAAIDTDIEGNIYILDSGYIKKFDGTDDWTKIYKVDGAFDSLSVYDNNNMITWSQHDEVYSVIGGKKQDDNPTPTPNVTKGWVKATDGTWSYNKADGTKTIGWFQDGNGWYYTNGAGVMQTGWQYVGGLWYYLNPVSDGNMGAMKTGWQNIGGTWYYLNPISNGAMGAMKTGWINDNGTWYYCNSSGAMLADTVVNGYVLGKNGAWIR >NC_020291.1|WP_015395454.1|6013702_6014830_+|hypothetical-protein MNKKIKKIIVFTLICAAFSTFMSSTINMGNQCAYAYSNDEISNLGLTTSTGIIIPIYNSVSNKEKNRVKKYDKIPIVIYSKLASNQDNIKLGTIEADAKDIRVFVGTEKIKLADINSVIKFEKGEKKSIYIRLYDSKNDFDSSFNTEYQLNVEREVGEDNDTDEDTVTLKDYDDVYLTQLSLSSDDKQIDLNFNKEQAIYNVTVDQDIKYLRIKAVPEQDNYRLTINDKDVDTKGSNKNVRTEALDEDKTLIKIRIVSTDHKRRDYYLNVTKNTSKTSTTDTTSSNTINPPENNISQYALTNGVWQFKKTDGTIATGWTNIGNQLYYFDETGAMKTGWLKDASGKWYYLNAGGDMAKNTTVDGYKIGTDGVYVGK >NC_020291.1|WP_015395455.1|6014954_6016358_-|ATP-binding-protein MFIGREYEINALNKLYSKEEFQFIVMYGRRRVGKTTLLSEFCNNKPAIFFVAEEYNSSLSLRNFSKQILEYFKMTDYISTFESWEKAFMFLAKESEDKQLILVVDEFPYLVQSNNTLPSLLQNLIDHYLKKTKLFIVVCGSSMSFMEKEVLSYKSPLFGRRTAQMLIEPFDFYNSSKFFPKYSFNERVMTYGIIGGIPQYLEKFNEKNTIEDNIKQELLDKSSYLYEEPKNLLKQELREPAVYNSIIEAIANGYTKINEISTKIGEPKDKCSKYLSSLIDLHIVSKETPIMEKENSRKSIYKLNDNLFKFYYNFIFSNKSLIEQHMGDFLYEKKIEPQIPKYLGEIFEKVCIDFMNYQNRNGDLPFIYTNIGRWWGNNPKTKKQEEIDIVAIDDTMILFGECKWRNEKLDMDVVNSLIKKSEINVFEKFQKKFYSFFSKSGFTDSVKDYSNNNKNILLFGPEELIGD >NC_020291.1|WP_015395456.1|6016657_6018208_-|AAA-family-ATPase 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MNFKPLPIGIDNFEKLITRGYYLVDKTLLIKDLLDNKADVNLFTRPRRFGKTLNMSMLQYFFENSSEDNSYLFENLNIMKTGEQYTSHMGQYPVINLSLKSSKQPTFDLALKCIKDEIVNEFRRHDYILESDKLNEEREEYRSIARKDGDEGLYVTALKFLSDCLEKYHGKKVIILIDEYDVPLENAFFEGFYDRMIAFIRSLFESALKTNSSLEFAVITGCLRISRESIFTGLNNLDIISILNDYYDEYFGFTQAEVSNMLMDYGLSEKEELTRNWYNGYIFGQAQVYNPWSVVKFVKDLYKNPNVFPSSYWANTSSNSIVRSLIERADNVTKNEIELLIEGKTIEKPVHEDITYDEIYDSMDNLWNFMFFTGYFKKVNERISETNQKYVELEIPNEEVKYIFRTKILKWFHDKIKVKDLSILYSAIFEKDRDTFQKELNKLLRETISFNDAYENFYHGFVVGVLANMHEYIVKSNRESGDGRSDIFIKSPSIFDPAVIIELKVCDNPKDIFKMSDKALEQIEEKKYEEELNQEGYENIIKYGISFYRKDCIVKCRDCHLVKVGD >NC_020291.1|WP_015395459.1|6021861_6023256_-|hypothetical-protein MYFNERVNKKRYIFIAFAIVFFIAQCFITLYPGDDTYFIETVSKSKSIISFVIMRYETWGGRIASEFFIGIFSLLPLFIWRILNTIIAVMFVVFISNIIKLSISKDSFEKHSNIIDVFVCLSFFMIPISVTTRACSWFTGSFYYLWPTFFCLIAMSPFIYKIYNKDISKKHCIIAMLSVLYASYMEQTAAVLICFGIMTVLYLYKRDKKFYLGLVAENLLVLINLIIYTLSPGNELRNISETKTWYPGFDSLSLFQKVYQGVCWTHSHLVRETTILMLVISLLLFIIVFNRNSKWSVRISAFIPSMYFIGSLAPINKMVLSTTSYEYPYDIQTILDKIFFNPMLDIVPAVISSVIIFSIVILMFMCIKNKNERYLCIIFYLAALACGYILGFSPTIFASGPRIFFMTNILLLIIGGILLKNILEEVPINKMLWKISSIFYCSLASIYALIYVGGIAIKTIFKIK >NC_020291.1|WP_015395460.1|6024362_6025535_+|acyltransferase MIQNEKSLDGLRGLAAFIVIIHHYLVGFYPSTYTGNINSIRTSSGFDALISRTPFNLFFNGNASVCMFFILSGYVLSCKFFKYKEKNIVISSAIRRYLRLMIPVLSSIVLVFILMKFKLFYNIQASTITGSDWWLGSFYNFEPNTFEMLKQGLYRVFFFSETSYNAVLWTMHYELFGSFIVFGFLFIFGKIKTRVITYIVIIFLLFNTYYLAFILGMFLSDIHSVNCKLINKINFRFPKIFFLITGLYLCSYPSGVDVTGSIYNYIKISKFNDVVMLYHIIGSFFIMITLLNSYKLKNFFSNKIFLFLGKISFSMYLIHLIVLCSFSSFIFLNLINYFRYYQTFFIMLILSIPLIILISHCFYKYIDSNSIKLSKILYKKYLEHNTKNFF >NC_020291.1|WP_015395461.1|6026015_6026969_-|glycosyltransferase-family-2-protein MKKISILIPTYNEEENVIPLSQEIINLFKNKLENYEYEIIFIDNYSKDKTRESLLNLCQKNKNIKAIFNAKNFGQFNSPYYGLCQTTGECTILLCADFQDPISMIPKFIKEWEGGYKIVCGIKTKSKENKIMYFLRSCYYTMIKKMSSVEQIEHFTGFGLYDKSFIDVLRNLGDPSPFLRGIVAELGFERKDIAYEQEKRRSGKTSNNFYKLYDAAMLSFTSYTKIGLRLATIAGFVLSALSIIISVIYLILKIIYWNDFPLGVAPILIGVFFFGSIQLFFIGLVGEYIMSMNTRIMKRPLVIEAQRINFDEKQQQE |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_020291_6 | 6.1|2066435|20|NC_020291|CRISPRCasFinder | 2066435-2066454 | 20 | NC_020291.1 | 2722980-2722999 | 1 | 0.95 |
NC_020291_6 | 6.1|2066435|20|NC_020291|CRISPRCasFinder | 2066435-2066454 | 20 | NC_020291.1 | 910586-910605 | 2 | 0.9 |
NC_020291_6 | 6.1|2066435|20|NC_020291|CRISPRCasFinder | 2066435-2066454 | 20 | NC_020291.1 | 4561423-4561442 | 2 | 0.9 |
NC_020291_6 | 6.1|2066435|20|NC_020291|CRISPRCasFinder | 2066435-2066454 | 20 | NC_020291.1 | 5926267-5926286 | 2 | 0.9 |
1. spacer 6.1|2066435|20|NC_020291|CRISPRCasFinder matches to position: 2722980-2722999, mismatch: 1, identity: 0.95
tagctgctctttttataagg CRISPR spacer tagctgctctttttataggg Protospacer *****************.**
2. spacer 6.1|2066435|20|NC_020291|CRISPRCasFinder matches to position: 910586-910605, mismatch: 2, identity: 0.9
tagctgctctttttataagg CRISPR spacer tagctgctctctttataggg Protospacer **********.******.**
3. spacer 6.1|2066435|20|NC_020291|CRISPRCasFinder matches to position: 4561423-4561442, mismatch: 2, identity: 0.9
tagctgctctttttataagg CRISPR spacer tagctgctttttttgtaagg Protospacer ********.*****.*****
4. spacer 6.1|2066435|20|NC_020291|CRISPRCasFinder matches to position: 5926267-5926286, mismatch: 2, identity: 0.9
tagctgctctttttataagg CRISPR spacer tagctgctctctttataggg Protospacer **********.******.**
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_020291_1 | 1.1|629634|33|NC_020291|CRISPRCasFinder | 629634-629666 | 33 | LT615366 | Enterococcus phage VPE25 genome assembly, chromosome: VPE25 | 41134-41166 | 6 | 0.818 |
NC_020291_1 | 1.1|629634|33|NC_020291|CRISPRCasFinder | 629634-629666 | 33 | LT546029 | Enterococcus phage VFW genome assembly, chromosome: VFW | 41065-41097 | 6 | 0.818 |
NC_020291_1 | 1.1|629634|33|NC_020291|CRISPRCasFinder | 629634-629666 | 33 | LT546030 | Enterococcus phage VPE25 genome assembly, chromosome: I | 41134-41166 | 6 | 0.818 |
NC_020291_1 | 1.1|629634|33|NC_020291|CRISPRCasFinder | 629634-629666 | 33 | MT119361 | Enterococus phage vipetofem, complete genome | 44143-44175 | 6 | 0.818 |
NC_020291_11 | 11.12|5279349|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 5279349-5279384 | 36 | KJ019082 | Synechococcus phage ACG-2014i isolate Syn7803US120, complete genome | 173350-173385 | 8 | 0.778 |
NC_020291_1 | 1.1|629634|33|NC_020291|CRISPRCasFinder | 629634-629666 | 33 | GQ478082 | Enterococcus phage phiFL1B, complete genome | 27079-27111 | 9 | 0.727 |
NC_020291_1 | 1.1|629634|33|NC_020291|CRISPRCasFinder | 629634-629666 | 33 | GQ478083 | Enterococcus phage phiFL1C, complete genome | 26807-26839 | 9 | 0.727 |
NC_020291_1 | 1.1|629634|33|NC_020291|CRISPRCasFinder | 629634-629666 | 33 | GQ478085 | Enterococcus phage phiFL2B, complete genome | 24911-24943 | 9 | 0.727 |
NC_020291_1 | 1.1|629634|33|NC_020291|CRISPRCasFinder | 629634-629666 | 33 | NC_013646 | Enterococcus phage phiFL1A, complete genome | 26855-26887 | 9 | 0.727 |
NC_020291_1 | 1.1|629634|33|NC_020291|CRISPRCasFinder | 629634-629666 | 33 | NC_013643 | Enterococcus phage phiFL2A, complete genome | 24355-24387 | 9 | 0.727 |
NC_020291_6 | 6.2|2066481|30|NC_020291|CRISPRCasFinder | 2066481-2066510 | 30 | CP046596 | Acinetobacter indicus strain FS42-2 plasmid pFS42-2-1, complete sequence | 74266-74295 | 9 | 0.7 |
NC_020291_12 | 12.1|6007102|34|NC_020291|CRISPRCasFinder | 6007102-6007135 | 34 | NZ_CP043762 | Paenibacillus sp. 37 plasmid pART37, complete sequence | 25632-25665 | 9 | 0.735 |
NC_020291_12 | 12.1|6007102|34|NC_020291|CRISPRCasFinder | 6007102-6007135 | 34 | NC_012961 | Photorhabdus asymbiotica plasmid pPAU1, complete sequence | 15903-15936 | 9 | 0.735 |
NC_020291_10 | 10.3|5276993|37|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 5276993-5277029 | 37 | LR721753 | Aliivibrio wodanis 06/09/160 plasmid 2 complete sequence | 14844-14880 | 10 | 0.73 |
NC_020291_10 | 10.13|5277648|37|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 5277648-5277684 | 37 | NC_014557 | Bacillus sp. BS-02 plasmid pBS-02, complete sequence | 1095-1131 | 10 | 0.73 |
NC_020291_10 | 10.13|5277648|37|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 5277648-5277684 | 37 | NC_013963 | Bacillus sp. BS-01 plasmid pBS-01, complete sequence | 6898-6934 | 10 | 0.73 |
NC_020291_11 | 11.31|5280594|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 5280594-5280629 | 36 | NZ_CP007767 | Campylobacter peloridis LMG 23910 plasmid pPEL1, complete sequence | 30031-30066 | 11 | 0.694 |
NC_020291_11 | 11.31|5280594|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 5280594-5280629 | 36 | NC_012040 | Campylobacter lari RM2100 plasmid pCL2100, complete sequence | 25962-25997 | 11 | 0.694 |
NC_020291_11 | 11.31|5280594|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 5280594-5280629 | 36 | NZ_CP044261 | Campylobacter armoricus strain CA639 plasmid pCA639-1, complete sequence | 28716-28751 | 11 | 0.694 |
1. spacer 1.1|629634|33|NC_020291|CRISPRCasFinder matches to LT615366 (Enterococcus phage VPE25 genome assembly, chromosome: VPE25) position: , mismatch: 6, identity: 0.818
ttgtattattattagctttgaataacattaaag CRISPR spacer ataaattatttttagctttgaataagattaatg Protospacer *. ****** ************** ***** *
2. spacer 1.1|629634|33|NC_020291|CRISPRCasFinder matches to LT546029 (Enterococcus phage VFW genome assembly, chromosome: VFW) position: , mismatch: 6, identity: 0.818
ttgtattattattagctttgaataacattaaag CRISPR spacer ataaattatttttagctttgaataagattaatg Protospacer *. ****** ************** ***** *
3. spacer 1.1|629634|33|NC_020291|CRISPRCasFinder matches to LT546030 (Enterococcus phage VPE25 genome assembly, chromosome: I) position: , mismatch: 6, identity: 0.818
ttgtattattattagctttgaataacattaaag CRISPR spacer ataaattatttttagctttgaataagattaatg Protospacer *. ****** ************** ***** *
4. spacer 1.1|629634|33|NC_020291|CRISPRCasFinder matches to MT119361 (Enterococus phage vipetofem, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.818
ttgtattattattagctttgaataacattaaag CRISPR spacer ataaattatttttagctttgaataagattaatg Protospacer *. ****** ************** ***** *
5. spacer 11.12|5279349|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to KJ019082 (Synechococcus phage ACG-2014i isolate Syn7803US120, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
tgattataattctttcaattctttaatttcttcaat CRISPR spacer ttctacttcttctttcaattctttgattgcttcaat Protospacer * * * ***************.*** *******
6. spacer 1.1|629634|33|NC_020291|CRISPRCasFinder matches to GQ478082 (Enterococcus phage phiFL1B, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
ttgtattattattagctttgaataacattaaag CRISPR spacer ctagctttttattagctttaaataacattccat Protospacer .*. ** ***********.********* *
7. spacer 1.1|629634|33|NC_020291|CRISPRCasFinder matches to GQ478083 (Enterococcus phage phiFL1C, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
ttgtattattattagctttgaataacattaaag CRISPR spacer ctagctttttattagctttaaataacattccat Protospacer .*. ** ***********.********* *
8. spacer 1.1|629634|33|NC_020291|CRISPRCasFinder matches to GQ478085 (Enterococcus phage phiFL2B, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
ttgtattattattagctttgaataacattaaag CRISPR spacer ctagctttttattagctttaaataacattccat Protospacer .*. ** ***********.********* *
9. spacer 1.1|629634|33|NC_020291|CRISPRCasFinder matches to NC_013646 (Enterococcus phage phiFL1A, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
ttgtattattattagctttgaataacattaaag CRISPR spacer ctagctttttattagctttaaataacattccat Protospacer .*. ** ***********.********* *
10. spacer 1.1|629634|33|NC_020291|CRISPRCasFinder matches to NC_013643 (Enterococcus phage phiFL2A, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
ttgtattattattagctttgaataacattaaag CRISPR spacer ctagctttttattagctttaaataacattccat Protospacer .*. ** ***********.********* *
11. spacer 6.2|2066481|30|NC_020291|CRISPRCasFinder matches to CP046596 (Acinetobacter indicus strain FS42-2 plasmid pFS42-2-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ttcttatatgcagatagtttccgtattgca CRISPR spacer ccagctgctgtagatagtttccgtattgca Protospacer .. . **.*******************
12. spacer 12.1|6007102|34|NC_020291|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP043762 (Paenibacillus sp. 37 plasmid pART37, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tggtt--gtaagtaataccaagttccattgtcattt CRISPR spacer --gtcagataagtcataccaagttccattctcacaa Protospacer **. .***** *************** ***.
13. spacer 12.1|6007102|34|NC_020291|CRISPRCasFinder matches to NC_012961 (Photorhabdus asymbiotica plasmid pPAU1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
tggttgtaagtaataccaagttccattgtcattt CRISPR spacer acgtacccagtaataccaagtttcatcgtcatta Protospacer ** . **************.***.******
14. spacer 10.3|5276993|37|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to LR721753 (Aliivibrio wodanis 06/09/160 plasmid 2 complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
caacaact-----ggtggaagtagtggtggttcacatcattc CRISPR spacer -----gctttgaatgtggaaatagtggtggttctcatcatgc Protospacer .** ******.************ ****** *
15. spacer 10.13|5277648|37|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_014557 (Bacillus sp. BS-02 plasmid pBS-02, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
ttgtacaaaaatatcatcaatgataatgttataatca CRISPR spacer taattttacaatatcatcaatggtaaagttataatat Protospacer * .* . * *************.*** ********
16. spacer 10.13|5277648|37|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_013963 (Bacillus sp. BS-01 plasmid pBS-01, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
ttgtacaaaaatatcatcaatgataatgttataatca CRISPR spacer taattttacaatatcatcaatggtaaagttataatat Protospacer * .* . * *************.*** ********
17. spacer 11.31|5280594|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP007767 (Campylobacter peloridis LMG 23910 plasmid pPEL1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
ttgatgaacataaaattgatatgaataatatccatg CRISPR spacer aaaatgaaaataaaattgatatcaataattttagct Protospacer .***** ************* ****** *. ..
18. spacer 11.31|5280594|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_012040 (Campylobacter lari RM2100 plasmid pCL2100, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
ttgatgaacataaaattgatatgaataatatccatg CRISPR spacer aaaatgaaaataaaattgatatcaataattttagct Protospacer .***** ************* ****** *. ..
19. spacer 11.31|5280594|36|NC_020291|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044261 (Campylobacter armoricus strain CA639 plasmid pCA639-1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
ttgatgaacataaaattgatatgaataatatccatg CRISPR spacer aaaatgaaaataaaattgatatcaataattttagct Protospacer .***** ************* ****** *. ..
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
789315 : 862261
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_020291|789315:862261|DBSCAN-SWA 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65 | Clostridium_phage(83.33%) | tRNA,plate,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1066247 : 1197944
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_020291|1066247:1197944|DBSCAN-SWA 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118 | Clostridium_phage(74.58%) | head,portal,terminase,capsid,integrase,transposase,protease,coat,tail | attL 1087378:1087399|attR 1179522:1179543 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1269739 : 1279487
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_020291|1269739:1279487|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_020291|1269739:1279487|1273557_1274037_+|WP_015391248.1|DBSCAN-SWA MQVAIFFGSKSDTEVMRGAANALKEFGIEYKAFVLSAHRVPEKLEETLEEIQAQGCQVIIAGAGLAAHLPGVIASKTILPVIGVPVKAALEGVDALYSIVQMPKSIPVATVGINNSYNAGMLAVQMLSVNNNELKNKLKEFRLNMKKKFIEENAEGVEL >NC_020291|1269739:1279487|1277352_1277961_+|WP_015391252.1|DBSCAN-SWA MFKIAVLVSGGGTDLQSVIDAVENKELNVKIEMVIGSRDNIYALERAKKHGIETFVISRKEYGEKASDKILELTKGKVDLIVLAGFLAILDGDILKEFDNKIINIHPSLIPSFCGAGMYGLKVHEAVIKSGVKFSGCTVHFVNSEVDGGAILLQEVVPVYFEDDAETLQKRILEKEHLILPEAIRLISEGKVEFVNGKAKIS >NC_020291|1269739:1279487|1276363_1277365_+|WP_015391251.1|DBSCAN-SWA MITYKEAGVNIEEGYRSVKLIKEYAAKTMSQYVLNGLGSFAGMVELPSGYEKPVLVSGTDGVGTKLEIAFKNKKYDTVGIDCVAMCVNDILCHGAKPLFFLDYIACGKLEAEVASDLVKGISDGCIDSDCALIGGETAEMPGFYSEGEYDMAGFAVGIADKDKIINGSNIKEGDKLIGIASSGVHSNGYSLIRKVFPDLNEEFKGEEVWKTLITPTKIYVKPVLKLLESYEIKGMAHVTGGGFIENVPRMFNGGNFTAVINKDSYPLPAIFERIIEKGVDKEHMYNTFNMGIGFVLAVNEKDVAPIIKALVEMGEKAYEIGYVTSGGEGICLK >NC_020291|1269739:1279487|1274923_1276354_+|WP_015391250.1|DBSCAN-SWA MNNSNFELIMDPSNDKFKDECGVFGVYANQPIDVATMTYYGLYALQHRGQESAGIAVADGEKIDIHKGLGLITEAFKPEDLSKLQGHIAVGHVRYSTAGGKGIENAQPIVSTSKIGSIAMAHNGNLVNDDVIRELLEDAGQIFHTSTDSEVIACLIARSAKKGLAKAVVDAMSAIRGSFALTIMSKDKLIGARDPHGIRPLSLGKIEEGYILTSESCALDAIGAELIRDIEPGEIVIIDADGIQSYRYSENTKCQTCAFEYIYFARPDSRIDGLEVHTTRVKAGEQLFKEHPLDADIVIAVPDSGIPAAIGYAKASGIPFDTGFIKNRYVGRTFISPSQEIRERAVAVKLNPLKVNLEGKRVILIDDSIVRGTTSKHLIESLRRAGVKEVNFLIASPSVKYPCYFGIDTPYRSELVAANHTVEEIRDMIGADYLGYLSEEGVYRSCGDRDGFCMGCFNGIYPVATPIEEISKDLER >NC_020291|1269739:1279487|1277978_1279487_+|WP_015391253.1|DBSCAN-SWA MKKRALISVFDKDGVLDFAKFLVSKDVEIVSTGGTYKYLKENGVEVIEINEVTNFPEMLDGRVKTLHPLVHAGILAIRDNEEHMNTLKGRDIHTIDYVVVNLYPFFEKVKEDLEFEEKVEFIDIGGPTMLRAAAKNFQDVVVISDKNDYNVVMEEIKTNGETSLKTKKRLAGKVFNLMSAYDGAISNFLLADDEEEYPEYLSVSYKKMQGLRYGENSHQTAAVYSATMLDGAMNTFEVLNGKELSYNNFKDCDIAWKCANEFDEPACCALKHNTPCGVAVGKDSYEAYMKAYEVDPTSIFGGIIGFNRKVDKKTAEEMVKIFLEVIAAPEYDEDALEVLKTKKNLRVLKFNNKPKADKYMVTVDGAMLIQEEDNKLIEEIKVVTDKKPTDEEMKDLLFGMKVVKYVKSNAIVVAHNGIALGIGGGQVNRIWPTEDALKRGKGATILASDAYFPFGDVAETAAKAGIKAIIQPGGSIRDQESIDVCNKYGVAMVFTGYRHFKH >NC_020291|1269739:1279487|1269739_1273486_+|WP_015391247.1|DBSCAN-SWA MLDIRSVFVEKKNGFNVEAQSLLNDFKENLGIFALEDVRLVNKYIISDISEEYYKKALHTIFSEATVDVVYESKLPVNEGEVAFGVEYLPGQYDQRADSASECLALLTAEDKVEIKSAKILILKGNLSQEDIEKIKKYYINPVDSREVDIDSKELSVPSSIPNDVQILEGFINKTLEQLQAFHSEQGLAMSIDDLLMIQDYFKEEKRDPSITEIKVIDTYWSDHCRHTTFSTILEDVQIENNIYTAPIKASYEEYLKSREYVYGEKEKSKTLMDMAVIAMKELRKRGKLDDLDISEEINACSINVRIETDKGLEDYLVMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCLGGAIRDPLSGRTYVYQAMRVTGAADPTVPVKDTLEGKLPQRKITLGAAHGYSSYGNQIGLATGQVQEVYHPNYAAKRMEVGAVIAAAPKENVVREEPKLGDVIILLGGRTGRDGVGGATGSSKEHTVDSINECGAEVQKGNAPTERKLQRLFRNATVAKMIKRCNDFGAGGVSVAIGELCRGLDIDLDKVPKKYEGLDGTELAVSESQERMAVVVTKENADEFIRLSNEENLEATLVANVTDTDRLRLFWRGKNIVDLRRTFLDTNGATQKTNVKVTAPLAYPYTVGDVKVNEEWINNLKKLNISSQQGLSERFDATIGHGTVLMPFGGKYAKTPAEGMAAKIPVLNGESSDATLMTFGFNPELGTWSPYHMAYYAVIESITKLAAMGGDYKKARLTFQEYFEKLGSEASRWGKPFAALLGAYEAQMAFETAAIGGKDSMSGSFGDLDVPPTLVSFAVGVEKAKHVISPEFKEAGSSLVLLQTEKLDDGTINIEKLKKNLEVLHKLIQDEKVISASAIKYGGVSEAITKMSLGNRIGAELDNLTKDELFGFNYGTILLEVKNSINVKDEFKESLYKEVGKTIASAFIISKEYDLNLDIAALEKTYEEKLKSVFKIKTKDVQEKVETVLYDKKSTLSPKVKVTKPKVVIPVFPGNNCEYDCARAFEKEGAEVTQVVFRNITKEALNESIERLAKEISTAQILMVPGGFSAGDEPDGSGKFIANALRNEQISNSVMELLKNRDGLALGICNGFQALIKLGLVPYGEIVDIKEDMATLTYNNINRHMSSIISTKVVSNKSPWFSEVNLGDIHSVAISHGEGRFVAPESLIKELIANGQVATQYVDFDGNVSLNMPFNPNGSMYGIEGITSPDGRVLGKMAHSERIGTDLYRNIPGDFDQKIFKAGVGYFR >NC_020291|1269739:1279487|1274036_1274744_+|WP_015391249.1|DBSCAN-SWA MEKLEMMYEGKAKKIYATDKADEVIIYYKDDATAFNGEKKGQIEDKGVMNNEITAILFELLEKKGVKTHFIKKLNDREQLCKKVEIVPLEVIVRNVAAGSMAKRLGLEEGYKLKTTVFEFSYKDDELGDPLINSYHAVAIGAATFEEIDVILKMTATVNDVLKEVFAAQNINLIDFKIEFGRCADGTIVLADEISPDTCRFWDATTGEKLDKDRFRRDLGNVKDAYVEILKRISK |
7 | Cyanophage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1358860 : 1367652
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_020291|1358860:1367652|DBSCAN-SWA 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AAAGAATGCACATGGGTTCCTATACATGGTATTGGCAATATTAGTAAGTGCTTCATTTTTTTCTTATAAAAAATTAGGAAGAGATGCAATAGTGTATATACTTTTTATATGCCAATTTTATGCTATTACTGATGAATTTCACCAAGCTTTTGTTCCAGGAAGAACTTCTTTAGTAAGTGATGTTTTAGTTGATTTTATAGGGAGTTTAGTAGGCTTAATAATTTTTTATTTGATTTATTATAAAATATATAAAGCTAAGATTAGATCTAGATTAAGCACGAAGAAATTATAGTTTTCTACTGCTTTTTTATTTTTCTAAATCTGTTATAATAATAGTTAGCAAATCAAGAAGGTATGATTAGATATTATTAAAGACAAAGAGGTGCAAGCAATGCGACCACTAGCAGATTTGATGCGCCCAAATAAATTGGAAGATTTTGCGGGACAAAAGCATATTTTAAGTGAAGGGAAGCCGTTATATAATTTGATTGAGAGTAAGAATATATGTAATTGTATATTTTATGGGCCTCCTGGAACTGGTAAAACAACTTTAGCTAACATAATGGCTAATTATGTAGATAAGAAATTCTACAAATTAAATGCAACGACAGCATCTGTGAAAGATATTCAAGAAATTACGGATAATATTAATAATTTACTAAATTATAATGGAGTAGTTCTATACATAGATGAACTTCAGCATTTTAATAAAAAACAACAGCAGGCATTATTAGAATTTATTGAAGATGGAAGAATAACGCTGATTGCAAGTACTACTGAAAATCCTTATTTCGTTATACACAAAGCTATAATAAGCAGATGTAATATATTCTCATTTAAGCCATTAAATACTTCTGATATTATTATTGGACTTGAAAATTCTATTAAAAAGTTAACTTCAGAAGGAATAAAAATAGAATATTCTAATGAAGCTCTTACATATATTGCTGAGATATCTCAAGGTGATTATAGAAAAGCATATAATATTTTAGAAATTGCTATAAATTCGCAGGTAAAGAACGTTAGAGTGATTTCAAGTGAATATATAGAGAGCCTAGGACAGTCCAATATGAGGGCCGATTCTAGTGGGGATGAGTTTTATAACTTGTTAAGTGCCCTTCAAAAAAGTATTAGGGGAAGTGATGCTGATGCATCGATTCATTATTTAGCACGACTTATCAAAAGTGGTAATTTAACTTCAATTATAAGAAGGATTTCTGTTATTGCAGCTGAAGATATAGGCCTTGCTTTTCCAACAGCACTGTCTGTTGTCAATTCGGGAATAGAACTAGCTTTAAAGGTAGGATTGCCAGAAGCAAGAATAATACTTTCTGAAATAGTAATTTATTTAGCAACATTACCTAAATCAAATAGTGCAATTTTAGCTATAGATGCAGCTATGAATGATTTGGAAAATATCAATTTTGGAGATGTTCCTATGCATTTAAAAGATGCACATTATATGGGAGCCGCTAATCTTGGAGTAGGTGGATATAAATATCCACATAATTATAATGATCATTATGTAAAACAAGAATATTTGCCAAAAGAATTAGAAGGAAGAATATATTATAATGGGCAAAATAATAAATACGAAGAAAGCATAAAAAATTATTGGGAAAAAATTAAAAATCAATAATTATCGTTTGACAAAAGCCGAGTAATTTGGTAAGATATAAGCGAAATTAATATATTTTATATATAAAGAGGTGAAAGAATGAAACTTTCAACTAAAGGAAGATACGGGGTTAGAGCCATGGTAGAGTTAGCGGCTAATTATGGTGGAGCACCGGTTTCAATAAAGACTATATCAAAAAAGGAAAATCTTTCTGAATATTATTTAGAACAATTATTTAGCCCGCTTAGACGTGCTAATGTTATAAGAAGTATAAGAGGTGCACAAGGTGGATACGTTTTATGCAAACCTCCTAGGGAAATAACTGTTGGAGATATAATGACTATTTTGGAAGGTCCTGTTGAAATAGCGGATTGTATTGACGGAGTTGAATGCGATAGTTCAGATTGCTGTGCTACAAAAGCAGTATGGGAAAAAATAAAAAATAGTATAGATAGTGTTATGAATTCAATAACATTACAAGATATACTTGATGATCACGAAGCTCTTCAAAAGAAAAATAGTGGCATTAAGATTGCAGATAGGAGTGAATAATAATGAAAAATGTATATATGGACTATTCAGCTACGACTTATGTTAAACCAGAAGTTTTAGAAGAAATGCTTCCTTATTTTACACAAAAGTTTGGAAATCCATCTTCATTTTATGGGATATCAAGAGAAACTAAAAAAGCTATAGATAAAGCAAGAGAACAAATAGCAAAAGCGTTAAATTGTTTACCAGAAGAAGTGTATTTTACTGGTGGTGGATCTGAAGCAGATAACTGGGCGATAAAAGGAATTGCTTCAGCCCATAGAAATAAAGGAAATCACATTATTACAACTAAAATAGAGCATCATGCAGTTCTTCATACTTGTGAATACTTAGAGAAGAACGGTTTTGAAGTTACATATTTAGATGTTGATGAAGAAGGTTTTGTTAGATTAGAAGATTTAAAAAATGCTATAACTGATAAAACAATTTTAGTCAGCATTATGTTTGCGAATAATGAAATTGGAACAATTGAGCCAATAAAGGAAATCGGAGAAATCTGTAGGGAAAAGAAAATTTTCTTCCATACTGATGCAGTTCAAGCTATTGGGAATGTACCTGTAGATGTTAAAGAAATGAACATTGATATGTTGTCACTAGCAGGTCATAAGCTTTATGGACCAAAAGGAATTGGAGTTTTATATATCAAAAAGGGAATTAAGATTGATAACTTAATTCATGGTGGAGCTCAAGAAAGAAATAGAAGAGCAGGAACAGAAAATATCGCATCTATTGTAGGTCTTGGTAAGGCAGTTGAACTTGCAACTGTAAATTTAGAAGAGCATATGAGTAAGTTAACAGCTCTTAGAGATAAGCTTATAAATGGACTTTTAGAAATTCCTTATACAAAATTAAATGGACCAAGAGGAGATAAGAGATTACCTGGAAATGCAAATGTATGTTTTAGATTTATTGAAGGTGAATCAATTCTTTTATCACTAGATTTTAAAGGTGTTTGTGCATCAAGTGGTAGTGCTTGTACATCAGGATCCTTAGATCCATCGCATGTATTACTTGCAATTGGACTTCCACATGAAATTGCTCATGGATCATTAAGACTTTCCATGGGTGAAGGATCAACTGAAGAGGATGTAGATTATGTTCTTGAAGTTGTACCACCAATTATTGAAAGATTAAGAAATATGTCACCATTATGGGATGACTTTTTAAAGAAGGGAGAAAAATAATATGATATATAGTGAAAAAGTAATGGAACATTTCCAAAACCCAAGAAACGTTGGAGAAATAGAAAATGCAAATGGTGTAGGTGAAGTAGGAAACGCTAAGTGTGGAGATATAATGAAGATTTATTTAAAAGTTGAAGATAACATTATAAAAGATGTTAAATTTAAGACTTTTGGATGTGGATCAGCTATTGCATCATCATCAATGGCAACTGAATTAATTAAAGGAAAGACTTTAGATGAAGCTTGGGAATTAACAAATAAGGCTGTTGCAGAAGCATTAGATGGCCTTCCACCAGTAAAAATGCATTGTTCTGTACTTGCAGAAGAAGCAATCCACAAAGCTATAAATGATTATAGAGCAAACAATGGATTAGAAGTTATACCAATGGAAGAACATAGCGATGAAGATTTACATGCGGCTGTTCATGGCGAAGAGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_020291|1358860:1367652|1361448_1362360_+|WP_015391329.1|DBSCAN-SWA MKILITGAKGQLGNELQDIINSGKAEIGQVSELIIKSEVIPLDIDELDITNLEMVKAKLNKLKPDVIINCAAATNVDGCENNQDFAFKVNSIGPRNLAIVSEKIGAKLVQVSTDYVFSGVGNKPLTEYDLTTPYSVYGKTKLLGENYVREFSSKYFIVRTAWLYGHIGNNFVYTMRRLAKEKDMITVVNDQKGNPTYANDLAYHILKLLQTEEYGIYHCTGKGECTWYDFAKMIIELSGENCKVTACTSEEYKTLAKRPKYSSLDNVMLRYTVGDEMRDWKDAIKSFINKIDSNYNYRDGVRE >NC_020291|1358860:1367652|1358860_1360276_+|WP_015391326.1|DBSCAN-SWA MDKSKKLQRKQKTQYRDQLMEVEVELQGKSKVPSNSRVLPNRESVNDGAFDTSRLLEEVLERNNMLLALKRVISNKGSHGVDGMKTDELREHIKKHWETIKVKLLESKYNPSPVRRKEISKPDGGVRLLGIPTVQDRLIQQAIAQVLSKIYEPLFSENSFGFRPHRGAKDAITKSKQYITQGNRWVIDMDLEKFFDKVNHDILMNKLEKKIQDKRLLSLIRKYLKSGILINGVSVASEEGTPQGGPLSPLLANIMLDELDKELERRGHKFCRYADDNNIYVKSKRAGFRVMKSITNIIENNLKLKVNKDKSAVDFVSKRKFLGFSFYFSKSGAEIRIHEKSIKKFKEKVKFYTNRNKGISMEYRLHKLNQITKGWINYYGIANARGKLIELDKWIRRRLRACIWKQWKKISTKQRNLAKLGIDKYKAWEYANTRKGYWRISKSPILSKSLNNKYLESLGFISLTQTYQMRH >NC_020291|1358860:1367652|1365576_1366029_+|WP_015391333.1|DBSCAN-SWA MKLSTKGRYGVRAMVELAANYGGAPVSIKTISKKENLSEYYLEQLFSPLRRANVIRSIRGAQGGYVLCKPPREITVGDIMTILEGPVEIADCIDGVECDSSDCCATKAVWEKIKNSIDSVMNSITLQDILDDHEALQKKNSGIKIADRSE >NC_020291|1358860:1367652|1366031_1367213_+|WP_015391334.1|DBSCAN-SWA MKNVYMDYSATTYVKPEVLEEMLPYFTQKFGNPSSFYGISRETKKAIDKAREQIAKALNCLPEEVYFTGGGSEADNWAIKGIASAHRNKGNHIITTKIEHHAVLHTCEYLEKNGFEVTYLDVDEEGFVRLEDLKNAITDKTILVSIMFANNEIGTIEPIKEIGEICREKKIFFHTDAVQAIGNVPVDVKEMNIDMLSLAGHKLYGPKGIGVLYIKKGIKIDNLIHGGAQERNRRAGTENIASIVGLGKAVELATVNLEEHMSKLTALRDKLINGLLEIPYTKLNGPRGDKRLPGNANVCFRFIEGESILLSLDFKGVCASSGSACTSGSLDPSHVLLAIGLPHEIAHGSLRLSMGEGSTEEDVDYVLEVVPPIIERLRNMSPLWDDFLKKGEK >NC_020291|1358860:1367652|1360851_1361442_+|WP_015391328.1|DBSCAN-SWA MGNFKFIKSEIDGAYIVESKVFGDERGYFMEVYNEEAFKEAGLNMTFVQDNESKSSKGVLRGLHFQRKHSQGKLVRVTKGEVFDVAVDLRIGSETYGKWEAVILSDENKKQFYIPKGFAHGFLVLSEEAVFNYKCTDFYAAEYDSGVMWNDPDIDIKWPLDRIQNMILSEKDKKHPSLKELDLSRYSDYYICPKEV >NC_020291|1358860:1367652|1367214_1367652_+|WP_015391335.1|DBSCAN-SWA MIYSEKVMEHFQNPRNVGEIENANGVGEVGNAKCGDIMKIYLKVEDNIIKDVKFKTFGCGSAIASSSMATELIKGKTLDEAWELTNKAVAEALDGLPPVKMHCSVLAEEAIHKAINDYRANNGLEVIPMEEHSDEDLHAAVHGEE >NC_020291|1358860:1367652|1362356_1363406_+|WP_015391330.1|DBSCAN-SWA MKIYLVTGGAGFIGSNFILYMLTKYKDIKIINLDKLTYAGNLENLKSIENDKRYTFVQGDICDKDLVSSLFKINNINYVVHFAAESHVDRSIKEPEIFAKTNVLGTVNMLNCAKTAWGSEEGFIDGVKFLHVSTDEVYGSLGDEGFFVETTPIDPHSPYSSSKASSDLMVKSYYDTYKMPVNITRCSNNYGPFQFPEKLIPLLINNCLQHKDLPVYGDGLNIRDWLFVEDHAKAIDMVINGGRLGEVYNVGGHNERINIQIVKTVIEYINKNVDKNVTESLIKYIEDRKGHDRRYGIAPDKIKTELGWYPETSFEVGIKKTIKWYLDNSKWMKNVTSGEYQKYYDKMYN >NC_020291|1358860:1367652|1364250_1365498_+|WP_015391332.1|DBSCAN-SWA MRPLADLMRPNKLEDFAGQKHILSEGKPLYNLIESKNICNCIFYGPPGTGKTTLANIMANYVDKKFYKLNATTASVKDIQEITDNINNLLNYNGVVLYIDELQHFNKKQQQALLEFIEDGRITLIASTTENPYFVIHKAIISRCNIFSFKPLNTSDIIIGLENSIKKLTSEGIKIEYSNEALTYIAEISQGDYRKAYNILEIAINSQVKNVRVISSEYIESLGQSNMRADSSGDEFYNLLSALQKSIRGSDADASIHYLARLIKSGNLTSIIRRISVIAAEDIGLAFPTALSVVNSGIELALKVGLPEARIILSEIVIYLATLPKSNSAILAIDAAMNDLENINFGDVPMHLKDAHYMGAANLGVGGYKYPHNYNDHYVKQEYLPKELEGRIYYNGQNNKYEESIKNYWEKIKNQ >NC_020291|1358860:1367652|1360495_1360777_+|WP_015391327.1|DBSCAN-SWA MSPLADLMRPSDLKDFVGQQHILSQGKPLYNLIESNNICNCIFYGPPGTGETTLANIMANYVDKKFYKLNATTASVEDIQEITDNINNLLNYN >NC_020291|1358860:1367652|1363656_1364151_+|WP_015391331.1|DBSCAN-SWA MRKIIILLCLFWMGFIFYMSSNNGQISHEQSTKVVNIIEDSKSKLENKSNNQAKAEKENLAFLDKLIRKNAHGFLYMVLAILVSASFFSYKKLGRDAIVYILFICQFYAITDEFHQAFVPGRTSLVSDVLVDFIGSLVGLIIFYLIYYKIYKAKIRSRLSTKKL |
10 | Pseudomonas_phage(12.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1497531 : 1507486
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_020291|1497531:1507486|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_020291|1497531:1507486|1497531_1498620_+|WP_015391456.1|DBSCAN-SWA MDEKYMDRALELAKKGIGRVNPNPLVGAVIVKDNEIIGEGYHECYGMAHAERNAIKNAVRDVVGSTIYVTLEPCAHYGKTPPCVDLLIEKRFKKVVIGMLDPNELVAGKSIEKLKQHGIEVVVGIREEECKKLNEIFIKYITSKLPFVVLKSGMSIDGKIATYNGESKWITSKESREDSQKLRNRLHSIMVGINTIITDDPELTCRINKDKNLIRIIVDTKLRISLESKVILNSDKKTIIATTINADGNKKQKLRELGMKIIEVPSKNNKVDLKELINKLGQEGIDSILIEGGGTLNFSALEEGIVDKVVFYIAPKILGGTNSKSSISGKGFSKLSEAVNLIDMRYRTVGKDLVVEGYVEKK >NC_020291|1497531:1507486|1505464_1507486_-|WP_015391462.1|DBSCAN-SWA MKTLSTHKDVTKNHDITNLTLSGIIVALGVVYGDIGTSPLYVMKSILEGNGGLENVSETFILGALSLIFWTITILTTIKYVLITLNADNNGEGGIFSLFTLVRHRAKWLIVPAMVGGSALLADGMLTPAVTVTSAVEGLDLIPSFKESLGANQDSIIIIVIAIISLLFFIQHFGTDLIGKMFGPIMFLWFSCLAIFGLIGISHDWTLLRALSPYYGVRTLFSNENKLGFFILGSVFLSTTGAEALYSDLGHVGKNNIYGSWPFVKICLLLNYFGQGAWILSAKKNPTFLNSEALNPFFQLIPYKFLLFGIIISTLAAIIASQALISGSFTLVSEAIKLNLFPRLHTMYPSSSKGQLYMPSVNTLLWIVCVGIVLYFKNSARMEAAYGLSITVTMLMTTILLFNYLLKRKTPFFISISILIFFGVLEFSFFIANIVKFMHGGFIAALIASAILFVMYVWIKSYYIKMRLIENVPIENYKGQLNLLRQDPDRPKYTTNLVCLTNSSKPKKIERKLMYSILDKRPKKADVYWFVNIVVTDEPYLAEYSADTFGTSYIVKVQIKLGFRVEQKLNVFLRQISTELVESGEIQIQSRTYTTMPDRKIGDFRFLLILEQLSYESRLNFWEEFILKAKLFIKRYTVSPEKWFGLEHSDVDVENVPLFIGGNNNIKLKRISK >NC_020291|1497531:1507486|1498634_1499288_+|WP_015391457.1|DBSCAN-SWA MFTGIIEEIGIVQEFNFVNGFGIIRVGCVNVLEGTKIGDSIATNGVCLTVKEISTNSFKAEVMGETLAKSNLGRLKTGDKLNLERALKLSDRLGGHIVSGHIDGVGKIISIKEESNGTWFTISAPKEVLKYIIYKGSIAIDGISLTVAYVDDLVFKVSVIPHTLDNTILPGKKMDSNVNLECDLVGKYIEKLFTGNKSNEEVESSNITMEFLKNSGF >NC_020291|1497531:1507486|1500855_1501320_+|WP_015391459.1|DBSCAN-SWA MNIFEGNLVSEGLKFGIIVGRFNEFIGGKLLDGALDGLKRHGANEADIDIAWVPGAFEIPLVAKKMAQNNKYDAVICLGAVIKGATSHYDYVCSEVSKGIASVSLESEKPVIFGVLTTNTIEQAIERAGTKAGNKGYECAVSAIEMANLLRAIK >NC_020291|1497531:1507486|1501686_1502982_+|WP_015391460.1|DBSCAN-SWA MKNKILALVLATVIISGNLIPVSATPSNEQLDASRQKYADIENKIKDIEAKIYDLDMKMEPLQASIDKNKAEIRNINIVTENTKKDIEQCKKDINDLDLALGKRVKIMYSSGDLEFNYLNFILNSDSTSEFFSRVQAVGTIIEKDKSYIDGIKSKRIELNDKVKSLDDKKTEINKLNKEVQDNLNQLASNKKAEQELAAEAQTEKSKFDVEYLSLLERDAVKTQFDVIDSSNSSSADIEGAVSQLASIRDNQIKSPIVTKEINDKIQKGKAAASKKKDQEAKAAAESQRQAQAQVSSTSTKSTSSSNKKSNSSVSAPAAGNAQAILNEAYKHLGKSYVWGATGPSNFDCSGFTEYVYEHAAGVDISRTTYTQINVGQPVSQDQLKPGDLVFPHAGHVGIYVGNGQMIHAPQTGDVVKVGPVYSFYAGRRIL >NC_020291|1497531:1507486|1499338_1500532_+|WP_015391458.1|DBSCAN-SWA MKFNSIEEGIKDIQEGKMVIIVDDEGRENEGDLVIPAEMVTGENINFMIKYARGLVCAPVDEEIAAKLCLNPMVEKNTDNHETAFTVAVDHKDTTTGISAFERAYTINKLVDSNERDSFRRPGHVFPLIAKRDGVLERRGHTEAAVDLAKLAGFKGAAAICEIINDNGTMARRDDLIGFAKEHSLKILTIEDLIKYRKQDNFSVTKEAEAYLPTEYGDFKILAFSEKNSSKCHLALIKGDITTDEPVLTRVHSECLTGDALGSRKCDCGEQYAAAMEMIEKEGRGILLYMRQEGRGIGLLNKIKAYHLQDTGLDTVDANLALGFKEDMRDYKVSADMLKILGISNIRLITNNPAKIKDLEKNHINVVERIPIEMPINKNDEFYIRTKKERMNHLINL >NC_020291|1497531:1507486|1503059_1505051_-|WP_015391461.1|DBSCAN-SWA MKQNNINKLTLAGIVVTLGVVYGDIGTSPLYVMKSILEGNGGLQNVSENFILGVLSMVFWTITILTTIKYVIITLKADNNGEGGIFSLFTLVRNRAKWLIIPAMIGGSALLADGMLTPAVTVTSAVEGLDLIPSFKELFGHYEHSIIIIVIAIISLLFFIQHLGTDLIGKMFGPIMLIWFSSLAIFGIISLSHNWTLLRALSPYYAINTLFSSENKLGFFILGSIFLSSTGAEALYSDLGHVGRRNIYGSWPFVKICLLLNYFGQGAWILSAKNNAKFLGLSELNPFYQMVPASFLVFSIIISTLAAIIASQALISGSFTLVSEAIKLNLFPRLHTMYPSSSKGQLYLPSVNKVLWIVCIGIVLYFKNSAHMEAAYGLAITVTMLMTTILLFNYLLKKKTNLIIAISILLFFGALEISFFLANIVKFMHGGFIAALIAFSILSIMYIWIKGYYIKMRLIEHVPIDDYKDILDQLRQDKDRPKYTTNLVCLTSSSKPKQIERKIMYSILDKRPKKAEVYWFVNIVVTDEPYVAEYSVDTFGTSYIVKVQIKLGFRVEQKLNVFMRQISTDLVESGEIDVQSRNYSIMPDRKVSDFRFLLILEQLSYESDLNYWEELILKLKLFIKRYTVSPERWFGLEHSDVDIETVPLFLGHHNHAVLKRVPK |
7 | Staphylococcus_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2672466 : 2682606
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_020291|2672466:2682606|DBSCAN-SWA TATGGCAGCGCAATTTTCTAACACAGAAGTAAAAGCACCTACTATGGGAGGAAGACCAAAAGGAGGCGGAAGGAATCGTTTTGGTCCAACTGAGAAACCTAAAAATACAAAAGGTACATTAATGCGAATAATTAAGATATATATGAGGTGGGGAAAAACTATCTTTGTAGCCATAGTATTAACAATTATATCTTCATTAATTTCAGTTTCAATTCCATATTACATAGGAAAAGCTTTTAATACTTTTAATATTGAAACTAGAACAGTAGATACAAAATTACTCATTTGGTTTTTAGGAACAATTACAATTTTATACATGATAAATTGGATTATTTCATCTATAAATGGTGTTATAATGTTAAAGGTTTCGCAAAAACTTGTGTTCGCAGTGCGTACTGAGTTTTTTCAAAAGCTACAGAAGCTTCCTTTAAAATTTTTTGATACTCGTTCTCATGGTGATACTATGAGTAGAATTACAAATGATGCAGATAACATAAGTTCTACTATTGCACAAACAACTACCCAATTAATATCAAGTATATTAACTTTAGCTGGATCATTAATAATAATGCTATCACTTAATGTTTTTTTAACTTTAGTTGTTTTATTATGTATTCCTTTAGTTATGCTTTTAACGAGGGCAATTGCTAGAAATAGCCGATCTCATTTTTCAGCGCAGCAAAGGAGTTTAGGGAGCCTTAATGGAGTTATAGAGGAAAATATATTAGGGTTAAAAATGGTAAAAGCTTTTGGAAAACAACAGGATATTTTAAAGCAGTTTTCAACTATTAACGAAAAATTATACGAAAGCAGTACTAAAGCTCAAATATGGTCTGGATATATGATGCCTATTATGAATGTTATCAATAATTTAATCTTTGCAATAGTTGCAATTGTTGGAGGGATATTATCAGTTGGATATGGAGTATCTGTTGGAACTGTAGTTAGTTTCTTGAGTTATTCAAAACAATTTTCTATGCCATTAAATTCTATTGCAGGCATGTTTAATACAATTCAGTCAGCATTAGCAGGAGCTGAACGTGTATTTGAAATTTTAGATAGTGAAGAAGAATTTGCTGATTTTGAAAATGCAATTGAAATTATAGAGCCAAAAGGTAAAGTTGTCTTTGATAATGTGTGTTTTTCATATGATAAGTCTAGAACTATATTAAAGGATGTAAGCTTTAAGGTTGAGGCGGGAGAGACAGTTGCATTAGTTGGAGAAACTGGTGCTGGAAAGACCACTATTGTTAATCTTCTGACACGTTTCTATGATGCTTTGAGCGGACAAATTGTAATTGATAATGAACCAATTACAAATATAAAGAGGAATAATCTTAGAAAGTGTTTCTCAGTTGTCCTTCAAGATACTTGTTTTTTCACTGGTACAATTATGGATAATATTCGTTATTCACAAATTAATGCAACGGATGAACAAGTGATAGCAGCAGCTAAAATTGCTCGGGCTCATGACTTTATTGATAAATTGCCAAAGGGATATAATACAAGGGTGTCTGGATCAACGGATAATCTAAGTCAGGGACAGCGCCAATTAGTTGCAATTGCTAGAGCAGTATTATGTGATAGTCCTATTTTAATTTTAGATGAGGCAACCAGTAGTGTTGATACTAAAACAGAAAAAGATATTCAGCGTGCTTTAGTAAGTTTAATGAAAAATCGAACAAGCTTTTTAATAGCCCATCGTTTATCTACTATCAGAGATGCAGATAAAATTATGGTTATTGGGGACGGAAAAATATTGGAAAGCGGAAATCATGAAGCTCTTATGGATTTAAAAGGCCAATATTATAATATGGTAATTAGTCAAATGGGAAAATTAAAGTAAAAATGAAGATAAACATCAATGCTCGTTGGTTAAAATAAGTTAATCAATGAGCATTGATGTTTTTTTCAAAATTAAGCAATTTGCTTAAAAAATTAACAAACTCTATTAAAAATACTAAAAAAATAAAAAAAATGCAATTTAAATACGTTTACACTGAAAAAGTGTGATATAATATGAAAGATGGTTTGCGAATTGAAAAGGAGAGATTAAATGTCAAAGAATTTTAAATGGACAAACATTATGAAAAAGTCAATTGCTTTTGGAATGGCTTTAAGCATTTGTTTAGGTGCAAAAGCTATATCATTAGGAAATGTAGCTAATGCAGCAACAGCAAACAGAGCATTGATTTGTTCAGCAACAGCATATACTGGAGGAACTGGAAACATTACAGCAAGTGGATTACCAGTGCAAAGAGATCCAAGTGGACTTAGCACAGTGGCAGTAGATCCAAATGTAATACCGTTAGGATCGCATTTATATATTGAAGGATATGGATATGCAATTGCAGCCGATACAGGTGGAGCAATAAAAGGAAATATAATAGATGTATACTTTAATAGTTCTAGTGAATGTAATAATTGGGGTACAAAAACAGTTCATGTCACAGTATTAGGAAATAAATAACATAATTGTGCAAATGTTAATGTTCCAGTAAAATAATTTGGATGAAAAGATCTGAATTTAATGCGCAGTAGTTTTCAATTATAGTTGCAACTTGTAGTTACAATTGAATGTATGAAAAAAAGTAAAACAGTCGTAATAGACGGAAAGTTATGTTAAAAGCAGAAAACCGCGTTAAGAATGTTCAAAATTAAACAGCATAGATTGTCAAGCAAAAAAGTGTAACCATCAACGAGTTTAGTACTATTAATTTTGGTACTAATAAAAAAACAATATAATTTTGGCAGTGACATCATGATAACTTTCTATTTAGATAAACTTAAGATAAGGTTATCTAAAAAAATTAAATATTATATGGGAACCCCCGATTTTTCGGGGGTTTTTGTATAATTATAATTATATTAAAGAATATCAATGCTGTTGCAATAATATTTGACAAAATGCTATAATTAAAACAATACTTATCCAATAAAATAATTATAAGATAAATCTGTCATTAATTACTATAAACATTGTGGCTAGAATATTGAGAGGTTATATATGGGGAGGGTGATTATGTCTAGGATACCTATATTAAAAAAAATTGTAATCTTCAGTAGAACATGCTCATTAAGAATTTTAATTAGTGCTTTATTTATAGCATTAATGACTACAACTATTGGAATTATAACGTTTATTGTATTTAGAAACTGGAATCTTTCAGAAAAAACTACAATAGAAAATATTCAGGAGGATACAAACAAGGATATTTTCAACGAAATACAATTACTATTTTCTATACCTTTGTATAACAATGAAATTAATCATAGTATGATTGAAAATAAAGTAATTGATATACATAATGAAAAGCAAAGAGATAAATTTTTTGCAGGGGTTGTTAAATCAGGGAATGATGAAATTTATAGCTTTAGTTTTGGAACAGAAAATGGGGAATATTATGGAGCACGAAAAAATGAAAATGATCAAATAGAAATTTATAGAAGTAATGCTGATACCAATGGTCATTCAATGTACTATAGCGTAAATGATGATTTATCAGAAGGAACTTTTGTAAAGGATTATGGTAACTTTGATCCTAGAACAAGGGATTGGTATATACAAGCAAAAGAACAAAAAAAGACTGTATTTTCCGATATTTATAAACATTTTATAAAAGATGACTTGGCTTTATCGGCAGCATATCCTATTTACAATAAAGACGGTACAATTCAAGGGGTAATGGGAACGCACATAACTCTTTCAACTCTTAATGAATCTTTAAAAAAAATAGCAGACAATAAATCAGCAACAGCATACATAATTGAAAATAACTCTGGATACTTAGTAGCAAATTCTTTAGAAAAGCCTAATTTTGAGAAGCTATCAGATGGAAATATAAAAAGAACACTAATTGGAGAATTTAGTGATAAATCAATAAATGATGCATACGAAAATTATAAAAATACTTCTAATACCACCTTTGTAACAAAAATTGGAAATGAAACTTATCATATAAAAATTTTTGAATATGAAAAAGAAGGACTAGATTGGCTTATAGTAACTTCAATGCCTGAAAGTGTCTTTACAAAAGAAATTACTAATTCCATTAATATTGCAATTTTTCTTAGTATAACATCACTTGCTTTAGCAATAATAATTCATCTACAAAGTACTAAATTTATTTTAAGACCTATTGAAGAATTGACTATTTCAGCGGATAAATTTTCAAAAGGAGATTTATCTGAAAGAGCCAAAATTTTTCGAAATGATGAAGTTGGAAAATTATCTACGGCTTTTAATCATATGGCAGAGGAATTATATTCATTGATAAATAATCTGGAAGACAAGATTAATGAAAGAACCAATGAATTAATTGCAGCTAAAGATATTGCTGAAGAAGCGAACAGAGCTAAAAGTGAATTTTTGGCAAACATGAGCCATGAAATAAGGACACCTATGAATGGAGTAGTTGGATTTTTAAGTCTTTTAGAGAAAACTGATTTAAATACGTCTCAAAGAGAATTTATTGATACAATTAAGGTTTCCTCTGAGACTTTGCTGGCAGTGATTAATGATATATTGGATATTTCTAAAATTGAAGCTGGAAAAATGGAACTTGAAAATATTCCTTTTAATATTACTACCATAATTGAGAGAACGGTATTCTTGTTCAATGGGAGAGCAAAGGAGAAGGAAATTAAATTGAATTTATCTATAGATTCAAAGATTCCTGATTTTTTGAAGGGGGATTCAACAAAGTTAAGGCAGGTTATAAGTAATTTAATTAGTAATGCTGTTAAATTCACAAATGAAGGTGAAATTCTTGTTGAAGCTTCATTAGTCAATCAGACTGAAGTCGATACAGAAATTTATTTTAAGGTCAGAGATACTGGAATAGGTATGAATGAACATGAAATGGCTAAATTATTCAAACCATTTAGTCAAGCTGATTCCTCATCGACTAGAAAATATGGTGGTACTGGATTAGGTCTTGCAATATGTAAGAAAATAGTTGAGCTTATGGGAGGGACAATCGGAGTTGTAAGCAAAAAAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_020291|2672466:2682606|2675487_2678328_+|WP_015392514.1|DBSCAN-SWA MSRIPILKKIVIFSRTCSLRILISALFIALMTTTIGIITFIVFRNWNLSEKTTIENIQEDTNKDIFNEIQLLFSIPLYNNEINHSMIENKVIDIHNEKQRDKFFAGVVKSGNDEIYSFSFGTENGEYYGARKNENDQIEIYRSNADTNGHSMYYSVNDDLSEGTFVKDYGNFDPRTRDWYIQAKEQKKTVFSDIYKHFIKDDLALSAAYPIYNKDGTIQGVMGTHITLSTLNESLKKIADNKSATAYIIENNSGYLVANSLEKPNFEKLSDGNIKRTLIGEFSDKSINDAYENYKNTSNTTFVTKIGNETYHIKIFEYEKEGLDWLIVTSMPESVFTKEITNSINIAIFLSITSLALAIIIHLQSTKFILRPIEELTISADKFSKGDLSERAKIFRNDEVGKLSTAFNHMAEELYSLINNLEDKINERTNELIAAKDIAEEANRAKSEFLANMSHEIRTPMNGVVGFLSLLEKTDLNTSQREFIDTIKVSSETLLAVINDILDISKIEAGKMELENIPFNITTIIERTVFLFNGRAKEKEIKLNLSIDSKIPDFLKGDSTKLRQVISNLISNAVKFTNEGEILVEASLVNQTEVDTEIYFKVRDTGIGMNEHEMAKLFKPFSQADSSSTRKYGGTGLGLAICKKIVELMGGTIGVVSKKDEGTTFYFNLILNNPSEEEIFNLKQEDKNMTDIKFMEKSDLRILLVEDNEINRRFFINSLKLIGLSCDIAVNGLEALNACKIKDYHIIFMDCQMPEMDGYEATRKIRQLEAGSKHTTIIAMTAHSMKGDANECFKAGMDDYLSKPFVFEQMVEMLQKHSKTDDNRTLKNSSDSSEDRINKNKDSSFDDIVKLLTEESGFDEEFCRELVEDFCIQAEKLLTEIKDNIAKDNLIEARTNLHKLKGSAGTVRANDIAKIAVEAEEKAKIGSKDLLIELIQKAENLLNKLL >NC_020291|2672466:2682606|2674521_2674935_+|WP_015392513.1|DBSCAN-SWA MSKNFKWTNIMKKSIAFGMALSICLGAKAISLGNVANAATANRALICSATAYTGGTGNITASGLPVQRDPSGLSTVAVDPNVIPLGSHLYIEGYGYAIAADTGGAIKGNIIDVYFNSSSECNNWGTKTVHVTVLGNK >NC_020291|2672466:2682606|2678349_2679768_+|WP_015392515.1|DBSCAN-SWA MRGNILIIDDSSIERKIINQAIKNRLDDINIFEVDNGLDISKKLLENNIHACVLDVMMPQKNGFQVLQEIKEDCNLMDIPVIVCTGISDKAAVEKALSLGAFDYFAKPLTEEAIKISLPLKIKNAIDLMKRKEEIIYLSYHDQLTGLYNRRFFEEELARINTRSNLPITLIMGDLNGLKLINDSFGHAMGDEVIKRVGKMMKLGSREDDIVARLAGDEFVIISPKTDEKEACKIINNIMSLLAKEKVGSVEVSISLGYGCKYNDEEKIEDVFKKAEDTMYGKKVFESQSMRGRTIKTVINTLREKSKIESEHSFRVSALCKRVGEALDLPINEINKLVSAGELHDIGKIIVDERTINKPGKLTADEWEEVKRHSEIGYRMISTVDDMTEIANYILYHHERWDGSGYPKGLKGEEIPFISRIITIADAYDAMVSERCYKDILSKEAAIEELKNNAGSQFDPDLVKIFINKVLK >NC_020291|2672466:2682606|2672466_2674311_+|WP_015392512.1|DBSCAN-SWA MAAQFSNTEVKAPTMGGRPKGGGRNRFGPTEKPKNTKGTLMRIIKIYMRWGKTIFVAIVLTIISSLISVSIPYYIGKAFNTFNIETRTVDTKLLIWFLGTITILYMINWIISSINGVIMLKVSQKLVFAVRTEFFQKLQKLPLKFFDTRSHGDTMSRITNDADNISSTIAQTTTQLISSILTLAGSLIIMLSLNVFLTLVVLLCIPLVMLLTRAIARNSRSHFSAQQRSLGSLNGVIEENILGLKMVKAFGKQQDILKQFSTINEKLYESSTKAQIWSGYMMPIMNVINNLIFAIVAIVGGILSVGYGVSVGTVVSFLSYSKQFSMPLNSIAGMFNTIQSALAGAERVFEILDSEEEFADFENAIEIIEPKGKVVFDNVCFSYDKSRTILKDVSFKVEAGETVALVGETGAGKTTIVNLLTRFYDALSGQIVIDNEPITNIKRNNLRKCFSVVLQDTCFFTGTIMDNIRYSQINATDEQVIAAAKIARAHDFIDKLPKGYNTRVSGSTDNLSQGQRQLVAIARAVLCDSPILILDEATSSVDTKTEKDIQRALVSLMKNRTSFLIAHRLSTIRDADKIMVIGDGKILESGNHEALMDLKGQYYNMVISQMGKLK >NC_020291|2672466:2682606|2680133_2680562_-|WP_015392516.1|DBSCAN-SWA MIVRDIMSKDIVSLNSEDSIERAAQIMSQFDVGSVPVCKNEELVGIVTDRDITLRSVAPGGFSNEQKIKDVMTSNPVTGNPNMNIHDAAKIMSEQQIRRLPIIENNHLVGILSLGDISVEPSLQNNAEEALKNISEPTKNQQ >NC_020291|2672466:2682606|2680626_2682606_-|WP_015392517.1|DBSCAN-SWA MNIKKKFVTLVLTFAMILSFIPTLNVQAATTDYKLISESEVTSKEAKNWAKSKGASSDFLKLADLYFKYSSDHGDVNPAIAYVQAAVETGYGNFGGVLDSSYYNPCGLKKSSGSGTDKDTYQKFDSWDEGVQAHLDHLALLAGVKGYPRDSSYDEKQSSSLKGKAIKISDLSGIWATNTSYGDQIINLYKDLINSTKDNTNTDSKDNSSPNPGKPETIPNSPNITTVVGINNSPVNITSTIGWRQIYGSWYYYTSDKNKAKGWIKPDNYWYYLQDDGTMATGWIQLSGTWYYLDDSGAMIIGWRYLGGCWYYLQGDGSMVTGLRKIDGNNYLFDPSGEMLKGWKLLDNHWYYFNSDGSMATGWIKDNNLSYYLYETGAMAKGWITINGVWYYFKDNGSMQKGWFTASNGDLYYLDMSTGKMLTNTTVDPYIIGTDGKAIKKSTSDTNNSSSNSKTDTTPSNTNASTNSNLIYAIDISNHDGNIDFSKVKYSGTKYVYIKATEGTTFVDPYLSTYYTNAQNVGIKTGFYHFLVGTSAPETQAQNFYNNIKNKKSDLKPCLDIETSGFNVSDYAVRFINEFKRISNMNICIYTYSNFISNLDGRLSSYPLWEANYNNTAFKNLPSNSIWTSRIGHQFTDSGKINGINANVDLDAFTQDILN |
6 | Bacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2907642 : 2937657
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_020291|2907642:2937657|DBSCAN-SWA 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46 | Clostridium_phage(18.75%) | portal,capsid,integrase,coat,tail | attL 2902083:2902099|attR 2938828:2938844 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2942215 : 2952705
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_020291|2942215:2952705|DBSCAN-SWA 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ATGTTATTAGATTTATAAATAAGTTTAAAGAGCTATCAAGCTTTACTATAGGAGTTTATACTTATACTGGATTTATGGATAATCTAGATAATAGAATTGCAAATTACCCATTATGGGAGGCGAATTATAATAATGATCCATGGAACTTATCAGATAATTTTTTTACAAACAGGGTTGGACACCAATACACTGAAACAGGTTCAATCAACGGTATAAGTACAGCTTGTGATATCAATGATTTCAATGAAGGAATATTAATGAATACAACCGGTTATGTAATTACAACTTATTTGCCTAATGGGTATCAAGGCAATAATGAATTTAATGGAGTGGATTCTGATTATGTACTTCAGTATTTTAAAGGCATACGTTGCTATTTCAGGGGGAATGAAAAAGGGGTATGGATAGAAACACAAATATTACCTTTAGAAAAATGTAGAGAACTCCAAAAAGTTCTAGGAAGTTGGTTCTATTCAATAGAAACAAAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_020291|2942215:2952705|2946172_2947684_+|WP_015392793.1|tail|DBSCAN-SWA MAEKFYSLLTNIGKAKIANSIGLGTKVNFMIMKVGDGGGSYYEPTEDQADLKNTTWQGNINHVEIDNDNPSWLNIQVMIPSSVGGFTIREYGAFDEEGNMLGICKCAETYKPKIEDGSTKELLLNLTLAVTNTESVNLKIDPTIIFAKKSEIDQLRTDINAQLSDFVYQTAGGTSTSITLTMQTLVNGYFKTFIASANNNGAATTINGKKLYKPGTTTAPNLIAGKAYTVWYNQAGDCFFIKASAEGDAIAANVLAGKKFSNDNDTGLVGTLDLSNLVSGNIKSGVSINGVSGKASVVDTSDANALAGQILNGQTAYVNGNKVAGNMPNHSGADSPANSIAGTGAGRIYVRPQAGYYDGSVASYVDDGNYNPANIVSGKSILGLWGSATVASLGGVKIASGTITNIQYNSSNSQYYGTISGLSFTPSIIIMYYAGGIIQYPDAMIGVFCSQFVGNKYTVTKANASGYGSYLVDSTNIYNGGFKLPTFWGYYTNYPWQYIAIGN >NC_020291|2942215:2952705|2944039_2944495_+|WP_015392790.1|DBSCAN-SWA MGLFPEDFYSNTQSAKVKNEIPLLKDYAIDLKTGEVLYDENNNEIIVEGLDAVIVQSWRKIYIPKFDVNNNEGYSIYGKNFGSQINKLIGKGKNYGETFAHQMLVECLVDNVYVTGINNISTKLEKSSYLINYTMETIYGNYQDSYYIPLD >NC_020291|2942215:2952705|2949876_2951049_+|WP_015392797.1|DBSCAN-SWA MKNYFKKFSTMFIMLLVVIGVGVIQNGTVANAATIGEPLTSPEAGWTAVDDTDSKIVSPKGTINNYTERSHYNRSLRIVAGMNGKIVFQFYGTKFRIISEISSLRSSKINVKIDGINVDNITMQGNTSVNQALVYEKLGLPLTIHYVILTNVDGGIANTNMDLDAIHLDDNGYLVPYVESISLNKTSPILTVGDSRQLTAITTPLGLDLTWTSSNSNIARVDSTGKVTGVAEGAVIIKATTENGLTEICTVPVMPRGTDPNLEPRELEYIVNTARAKGDNTNNPGGEVTIIFHGSSDTTLSLVKTADVKDVWIGDNFTYTLVITNTGSKTAKAVVVNDPAPNHIDFNVSGVTTTQGTVDSSSTSKNIIVNVGDILPGGTVTIKIPSTVIA >NC_020291|2942215:2952705|2943686_2944040_+|WP_015392789.1|DBSCAN-SWA MPKSFGDQFWEEIEKHRSKNKIDEPFEIGKVISEDPLIIEIEGLPLYRNNLYINPSLLPWDEEVKAITTTVSEHNHQIILIQHFSKLKIDSYVACYGIEYNDISKTYQKYVVLEVVQ >NC_020291|2942215:2952705|2948401_2949484_+|WP_015392796.1|DBSCAN-SWA MKNYFKKFSIMFVMSLTLMLGCCVNVFAADDFVTGTTNLNNTTENSATRGVQLTAPEKGWKRYDNNYSGVNYTGNWQTNDNASDFYNKSLKFSTDVNAKITFYAYTSKIRFISPITMYSWSDDVKIKVDDNEYTYSHYNSTSIWQTIVWENLKLEKKIHKIEITNPNNTLYWSIDAIDIAEDGYIVSNDESITLDKSTMNLTEGETGQLIATTTPAGAQVTWKSSDPSIATIEVDPTNGKITKVNALKEGTCTITATIADGSNLSASCTINITKKTEPTPDNPTTDSKTGAILIINLTDGETKVFDVSSSEVDKFKSWYNNKSEFENKLTYVFNKTVNSNISVEEDVVHNQITSFEIRKY >NC_020291|2942215:2952705|2951409_2951844_+|WP_015392799.1|DBSCAN-SWA MIKALITILVKLVEAKLEKAGVETLILKNKNYITVAKQIWDMVDENFRISQSIEEKVSSKIDTFNLALLKEFPELKQDDIDKLRQSVAGSVNAGKQAVLDNSTILKQLQEKNDKLALENTDLKNKLANINAQSTVVNTVQETVA >NC_020291|2942215:2952705|2951153_2951390_+|WP_015392798.1|DBSCAN-SWA MNDELVKDKLERCETRLNNHGDRLDKLEQDGRELKTELKNLCENLKNLTSMMKWFITAIGGALVSFFFYAVQAGIFNK >NC_020291|2942215:2952705|2942215_2943673_+|WP_035280720.1|DBSCAN-SWA MRELIAVSDIEHMSISEAQALEKSLGAQKVKELLKLDNLTTDNGEDAEAVNNTLSAPNAILKKYGIIQDIIIKSKKEDPLIKSYRILNENCKPKETIEVECIGDINYKVGFGVHLIVPFLKGYEDCFMYVKEVEHEWKSDNLFISKLTLTKSRVMDEVEWSDLDDDDSTDSSTAGSKLWDKIYTLLKQQEGKNYVWGATGPDSFDCSGLVQYCYNQYSSELGLRLGRTTYEQCKQGKEIGNDKGVWIPGDLLFWKGSDTPPSHVSIYIGGNKMIHAPKTGDVVKTVDVTRTDIYAVRRVIPEEVAESIKEDNIPSDYEGNLNSVDSNCSTFISNMSKYGYKDIITSKSNALSVDPYLAAAIIAIESEGNPKCGGTYYGLMQVENGSGDPSTNIGQGIEEYKKKRSAVGIQVHVILSAYNSGEGTVEQACKQSGYNMSNVTIKQLGDALYDYVKAHNPSWDANEKKYYASKVLKAYNILKSKKALE >NC_020291|2942215:2952705|2947707_2947989_+|WP_015392794.1|DBSCAN-SWA MQTLIIYDNTGTIFSSPITGSYKKPQGDLKYLEIELPENKVLKSIDTSETPNIPILEDIPKTDLEKTQDQLLETQAQLANLQEQILVKENGGK >NC_020291|2942215:2952705|2945561_2946173_+|WP_015392792.1|DBSCAN-SWA MLLKDYISPLVCNKMVSKALEVQQPQIDNVIANINDLTNQGFIESATWSLDLWEEEFGIKSKLNDTLENRRNLVLAKKRGTGTTTVGTVKNVCNSFVDKTTVTEYSNEYYFDLLLESYNGFHNYLEDLMEIIEDLKPAHLNVNYHLKAITQSNLYIASVGFTSEIINVYPWTPSNLESKLDVYIPSHQPSSLESINVYPKEAI >NC_020291|2942215:2952705|2951913_2952705_+|WP_015392800.1|DBSCAN-SWA MKGIDVSNHNGNINFNQVKMAGVEAVYIKATEGTTFTDNYLETNYSNAHYAGLKAGFYHFLVGTSSPETQATSFYNAIKNKTNDLIPMLDIETKFDGLMDYVIRFINKFKELSSFTIGVYTYTGFMDNLDNRIANYPLWEANYNNDPWNLSDNFFTNRVGHQYTETGSINGISTACDINDFNEGILMNTTGYVITTYLPNGYQGNNEFNGVDSDYVLQYFKGIRCYFRGNEKGVWIETQILPLEKCRELQKVLGSWFYSIETK >NC_020291|2942215:2952705|2944504_2945572_+|WP_015392791.1|plate|DBSCAN-SWA MSYYRSEEDIYNEMFLGYTATSIGKESLLYNACMPVCIKLSEAYLALDEVTKQIFAKKAVESGYSSFLDLRVEEMGIKRKESTYALIEITVNGTAKMIFPKDSIVGTSDNRLYITQSDLILDDNGSGKVKVRAEKAGSKYNVTANEINYLPIKYSGIKSITNEKAYFDAYDEETNESLYYRYSLKVQIPATSGNKYHYQNWALEVDGVGSAKVYPLWNGNGTVKVVISSSNYRAASSDLIKTVADHIEENRPIGPTVTVVSVEELPLIISLKLIYDSVSYTLDTIKTNIQNSISQYLKDVALKTDHISIAKVGAIILSTSGVTDYSNLTINGSTINLPIADNQIAVLSGVVCNVT |
12 | Clostridium_phage(90.0%) | plate,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
3970653 : 3980546
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_020291|3970653:3980546|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_020291|3970653:3980546|3976100_3977279_+|WP_015393756.1|integrase|DBSCAN-SWA MAVKTNFTSNGKEYYRLTCDIGIDANGKRIRKQFVGKNKKEAEQKKQDYLNKSRMGIQDKTLWFSQSMRSWLFEVVKMSGNIKASSFSRYAGIYSKYFKNCSISHISLDKLESIDIQRYYNDLHKQGKSSNIIKNNIKLLKQFLNYAVDCGYILRNPCSGKRVVIPKDKTKNITDKITDVPIFSKESMQKILSLKEDTKIRYLSLISYATGMRRGEILGLKESDIDYDNMEIHIRRNLVTTLVYDDDGTKHKETFIDKTKTNTSVRDIPLPNNLIPIIKSAIALKKKDMLKCGNSYNRTNKDFIFLTEAGEYIDAGNIDKSWIYFLKRCKVDHLKFHALRHTYATLQFENNIRIETVSKLLGHASIEITSNIYTHVMKKEKQKAIDTLALLN >NC_020291|3970653:3980546|3978140_3980546_-|WP_015393758.1|DBSCAN-SWA MAFKVVSLFCGPGGIDLGLKMAGFDIIWGVDRDKSSCETHKKWSNAEIINDDINNIDIDDIPNSDIIVSSLIPPFFLSRITGEVKDINLNGTTLDIISKKMPKGCIYEGPAGLILSNKQEILKEFLNNFEKIGYRIYYQILNYKDYGIPQNKRKLVIIGIRKDINHIYEFPSIQNKNITIQEAFKGLDNKELNLDDRLSISLKDKERKKVTILDKNMISPSIALGRLPINSDIPMKEDKLFTISYQEAAIIQSFPIEFNFSGNKAIKFRQIINAFAPKLAFEIANQLKNVLDKENSLNKDILPMESYRIPKNTDTYEIRNNIKCHEEVIKLEKLMLPDRYEGLEDNREKYDITKIILPVKEGIDKILELYEEIESSNRGAFLILKGKSGCGKTTFLRTLDVFIENIEIKTIFNDIDLVESINSMQDTKKRLRVVIIEGRESLLESSSREINDSIHSINRFLRGKNGKNTLVVWPCNDKEIIDVLVDTAENIGGTALLDLDETYFEFQGPSEEFYLTIAKQTIELLNNGKTLLDFGLTDEAANSLIDKVETIGEYLKIINKVIRKNKKFVEGLVKREPCKMWIIVLAGNEPDKDVAALTKGEFLSADINRMLISTNANIVEDLKRYQDKIGILSNYFDCRIIYMPIVTTLSVIRDFADDKLEEILRKYKMSDKKDGSGVERLLNSELAKMINSDYKAQAKKGKTGPNSIDAFEKLTDIASKNDKILNKTFGKALIEASLIDEFASEGNFGAGLTRRTDLVCKTILGEIRLEFMWRKKTSQAEIANYTLTKLYNYGKAIGLLE >NC_020291|3970653:3980546|3974386_3974578_-|WP_017810492.1|DBSCAN-SWA MIRKFEGFTANDLIEILSNYPRNLKVCNQILGENFPFKQVEECTYYDWKDGKKINEHKGILIK >NC_020291|3970653:3980546|3977354_3978014_-|WP_015393757.1|DBSCAN-SWA MNIKGLTKKNIVEFINTYYMHIFLVAYSFFGVWYLISLWFPSIGDGMFIPVLFSLITLITHFCELQSIFQTKLKKDIFIDKYYEYKPENISENNFVLEDKQKIEIYKIMFEEDKKEKSDKVSKNQKKKGINKINFFFIMFAHIIILACYSKWAVMNTSNKGLTDNAKNVTDVLSYFCNAYTYSIFLLFFVQVIYENDFKRLYLDKVFKKHILFGKSRKK >NC_020291|3970653:3980546|3970653_3970953_-|WP_015393745.1|DBSCAN-SWA MKNECPIDGQISIFDLLVIEVIKTKEISIKKEENIESDKLDSIVKLYSESCSRIVKTLSGALLVELDDKTLYFNSTGINEFELAKDAAIIPGEEIIIVI >NC_020291|3970653:3980546|3972407_3973052_-|WP_015393750.1|DBSCAN-SWA MVPQENSQPLAVSCECRNIEKLKSEWRYSGINVEQSKHTFFNFEVWNKASERLKDTAAAYCTNFDEIKDKRRNSILLCGQVGSGKTHVSVAIALYFLKQRIKVVYMPYRDVITKIKQNMIDQEYYGKMISKYKLCEVLLIDDLFKGKINESDLNIMFEIINYRYLNFLPIIVSSEFSINRLLAFDEGVGSRIYEMSKDYVVEIEKDIGNNYRLK >NC_020291|3970653:3980546|3971082_3971307_+|WP_015393746.1|DBSCAN-SWA MAVTKTIDSASLSIEVQKGTDKAGDPIYTKKAFSGIKTNAAPENVYAVAEAIKGVMQAKTRDYFINEASILANA >NC_020291|3970653:3980546|3971699_3972095_-|WP_015393748.1|DBSCAN-SWA MDRPKDFHNRLECPYCKRSEEHGGECKGKSIVRSRDEGCLYFDMDEKGCIRNTDQKIPFNLYSDIPPIGMWQDGWTICNQRTMIKIKKIYALSWNDRKGLLYVKCNLEYFINEFSEEFEKQESKPNLKVIK >NC_020291|3970653:3980546|3973083_3974244_-|WP_015393751.1|DBSCAN-SWA MADVVMWVKFKVNMYEDTKLKIIDSEDKRDLYHYIWSRSIVLAGKVNLGGYLYINEKMPHTIKTLAIEFNRSVEEVKDAFKILRKLEMIELTEDKVFKIKNWEKHQNVEGMERAKQLNINRVAKCRAKKKAANDNGEGEIELASSASDVVKAAGNEADIQVGENTSNDINQDIKESQNNDTTENNNKDSSDENCNVTCNAENSNCNVTVMEQNKKEIKKKNKKKEIEIENENSVGDINNKSSTFIEEVSKSSLLENNNTKNESSENDINLKALELIQYHEKITGKVGGCDYVSLRAAIDIHGVKWVKMAMDVGFEKNCPDIKYAIGILKNWRREGYPEENMEVKKNGVRSTGTSNTTDTNKFAGFKPKEPRKLTEAQRKWAEENLI >NC_020291|3970653:3980546|3972096_3972339_-|WP_015393749.1|DBSCAN-SWA MKESGMVRKVDALGRFVIPSEIRNVLGISEGDPLEIVKVNNEIVVKKYHRGCIFCGCEKGILAFKDLIVCEGCRKDFGQE >NC_020291|3970653:3980546|3974996_3975218_-|WP_015393754.1|DBSCAN-SWA MNLKQLRKESGIKAYKIAERLHISRMQFSNIEKGKCKVDMLKMEKLSKIYEKSIDEIKAACEGTYYERRRDNI >NC_020291|3970653:3980546|3971349_3971568_+|WP_015393747.1|DBSCAN-SWA MEYTLSMTFLTSSGEKSTLNVPGVKTDITKEAINSLMDTIIAKDVFVTNSGNLVKKSGAQVTQRQVTKFDVA >NC_020291|3970653:3980546|3974773_3975022_-|WP_015393753.1|DBSCAN-SWA MNEEEIIFSKLYDVIKNSCLNRKTLTVLECAEFINVSKEKIRELINKPNTDFPYFKVGAKVLINRDLLQEWLQKISLEHRQI |
13 | uncultured_Caudovirales_phage(28.57%) | integrase | attL 3962867:3962884|attR 3987312:3987329 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
5934548 : 5943292
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_020291|5934548:5943292|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_020291|5934548:5943292|5941882_5943292_+|WP_015395412.1|DBSCAN-SWA MIFSTTLFLFIFLPLTLLIYYLPIFKNKTLKNIILFIASIIFYAWGEPTFVLILLFSIIVTWLLGLLVDKYRSTKMVTFILVITVIFNIGLLFFFKYLNFTIDNLNSLLGLHISNPRIQLPLGISFFTFQALSYVIDVYRKKIDAQKNLLNIGLYLAFFPKLAQGPIVRYETIAQEISNRKENLTDFSEGIMRFIQGLGKKVLIANNLALVADYSFQLAAAPGNNLSVSLAWLGAIAYTFQIFFDFSGYSDMAIGLGRMFGFHFLENFNYPYISKSVSEFWRRWHISLQTWFRDYIYIPLGGNRVSNLKFLFNIFIIWLLTGIWHGANWTFILWGLMYFVLLAAEKFTGFNKKLKGFGYVYTLFFVMIGWVIFRSDNISIAIEYIKIMFGIGANGILDNQFILYLSEFKYYFIAAILCSVPLKDWLSPKFKFDGIIYNTIYCVWYVLILFISISFLVKGAYNPFIYFKF >NC_020291|5934548:5943292|5939968_5941852_+|WP_015395411.1|DBSCAN-SWA MLIKIFKNFVIFSMIFLLNITLIDNITYAAEQTTTIANSSDTANSTQQSAKTTEESKDKDSKTSTTTTKDETKPVDKLNKTLADESKENFIDYGWKTINNKKYYIVNNKISETTGWVMEKDLNPNIKRNDKNYNAQYYLDEDFSVVVGWKQIDDNWYYFNSDGVMQTGWINNNGTYYLDDSGVMQTGWNKINGAKYFFTQTGQMVTGKSLIGDKWYFFSNIGQLQTGFYTNNGKTYFSDDDGIMLTNKWVSNSKHKFYIKSDGTIAIGDIFINGVMEKFNNNGYYQGSDPNNKNYLYIKFLNVGDADCAFIKLPSGETVLIDTGTPESAKSVVDFLNSQNLKTDFFKASKDGQAINNSNAIDNKTDAENINNTIISTNSATTAAAVRANNGKGVIDYVILTHPHSDHIGGLIELMNNFNIGKIFVPKYFEMQDYAPGATTVSASDIDIIKYDYKVYKATMDAIAKSGIPVVEADPQAFVDSEHILQFLHQNKKYSDLEANTYYKEYGALNDRSAITFLNYGDLQTLFTGDMQWHAESDFAMNKSLKNNEVDILKVPHHGNVGSSSYTFIGYVKPTIGVISRSKSRVVTNNEPYNTLIACGVKIYETSATDGVSVYATKDNWNIETAN >NC_020291|5934548:5943292|5936444_5937428_-|WP_015395408.1|DBSCAN-SWA MTKVSIITPVYNVEECIERCIKSVINQTNKDFEFLLIDDGSKDRSIHIAKELLEKSIINYRIITQKNSGVSAARNKGIEEASGEYITFLDSDDYIDSRFIELMYEKAEETCSEVVFCDYSEVDAQENVLVKNRTKCLSDFISGKEAALKQLNDDITIGMRSAIYKASIIKGNNLLFDSKRKYGEDMIFIVKALLYSKKVISVNEILAFYVIWGNSVTQNVSLKHLDGYYSYTDLLEEVKTDVSLKEIEKFLIEFKIPYSISHIFSVLSKDSNFHKDLFEFLNRTDVKGYLKAYKMQRFNKNNLRYFIQAKGMAYCPKLLLKIFNGLR >NC_020291|5934548:5943292|5937627_5938476_-|WP_015395409.1|DBSCAN-SWA MNDIDYSNYEELGLRDAQIIMAGILKEVADICDKYGIKYFLDAGTLIGAVRHKGFIPWDDDIDIGMLREDYRKFLSIIKNELPEHLFLQTHENDLYYDIYQVPCKIRYNNTLFIEEKIVENPKMHNGLFIDILPYDSLPKKKWVYTIQRKISNFILRSFVRCREIPEKLTFKNKLTHFIYKIVVKIFPTQRRQKLFDFLINWNDINSEYMGYGVDTTWSEYIYKKKDFFDLIKVEFEGEYFNAPKNYDAVLTQLYGDYMTLPKEEDRVWHAKTIKKLSSMDN >NC_020291|5934548:5943292|5934548_5936411_-|WP_015395407.1|DBSCAN-SWA MKSWKTPIIMIIDMFMVNMAYLFAINITNTGSFTLIAKIYTNDCVVLSLIYLVCFYLFKTYDSLWHLTGTDEFLLGVGGNILAGILSIGYTRIFGSTIPLNVSVVGILLSIFFVLGYRILYRVYRRTLLYIPFKYSSDQRRVMIVGAGSAGTMIINEMMARRELKYNPIVLIDDDKTKLGKRISGVKIEGNRYDIPYIVREQEIDLILIAIPSLDAKNKAEIIEICKDTNCKLQIIPGMYEILSGDATVSRIKDVDLEDLLGRDPIQLDNKGISDYIEGKTILVTGGGGSIGSELCRQIAVFNPKRLIIFDIYENNVYDIQNELREEFPDMNLTVLIGSVRDRKRLHEVFTKYKINVVFHAAAHKHVPLMEDSPKEAIKNNVFGTLNLALEASEANISRFVMISTDKAVNPTNIMGATKRLCEMIIQAMDKQSKTEFVAVRFGNVLGSNGSVIPLFKRQIANGGPVTVTHKKIIRYFMLIPEAAQLVLQAGAFAKGGEIFVLDMGKPVKIYDLACDLIKLSGLEPNRDIKIVFTGLRPGEKLFEELLMSEEGLEDTVHKKIHVGKPTFENMDTLKEKLEQLKNLLELNDIGEIKHQMQKIVPTYHYKNEDEVAAENADKE >NC_020291|5934548:5943292|5938825_5939806_+|WP_015395410.1|DBSCAN-SWA MENNNDLISVIVPVYNVEKYLPKCIDSILNQTIKNLEIILVDDGSLDNSGKICDDFSKTDNRIVVIHKENGGLSSARNAGLEIAKGNYIGFVDSDDWLDENMYEQLLDLIKATDSDISCCKFFRTADEKEKAPCVDNEIIKSFNNIDGLGNFYTDLYTQTVVAWNKLYKRELFDNVTYPVGKIHEDEGTTYKLFYKANKITYTNRPLYYYRVTPNSITTRKFNKKRLDILDVYDEKIKFMRTINNDNLYSKTLKWYLFTLINCYFECSNGMEDSQQYISSIKSKISETYKEYKTNPKKQFHWTILFSIFNISPKLYKLILNSAKSH |
6 | Catovirus(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
6024362 : 6032530
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_020291|6024362:6032530|DBSCAN-SWA 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CTAACATGTAACTCTCCTTTTGATTCATAAGTATTCACCTGACCAGTAATAAATATACATGGTATAGAATCAAAGTAGGCATTCGCTATTCCTGTAATAAGATTTGTAGCCCCTGGCCCACTTGTAGCATATGCAACACCAGGTTTATTTGATGCCTGAGCATATCCACATGCACAAAATGCAGATGCTTGTTCATGATAATTTACGTGTGCCGATATAAAATCTTTGTACTTATCAAAAGACTCCATAAGATGTGTTACCATTCCTCCTGGATATCCAAATACATCTGTAACTCCTTTTTCAATCAAAAAAGTTACAATATAATCACTTAGTTTCATATTTTAATTCCTCCAATACTTACTTAAATGCCCAAAACTTATTTAATATAAAATTTAAAGGTATAGTAATAATTAAATTTAATATTGGTGCAATAATATTAGAAAGATTTAAATGGTCAACCATAACTACTAGTAAAATTGTACTAAATACAAATGTTGTACCATATGAAACAAAAGTTTTTATCATGGGTTTCAAATTACCTTTATTACTCTTTTTAAATACATACCTATTATTCCAATAGTAAGCATTTAATACACTTACAATAAATCCAATTGTATTTGCAACAATATAATTAACTTTAAAATATATTAACACATAATATATTAAAAGGGAAATAAGAGTATTCGATGCCCCTACTATTCCAAATTTAATAAATTGAATTATTATCTTCCAAAAACCTTGTGTTCTAAAACTTTCAATTGAAAATAACTTCATTATTTCACAGCCTCTTTAATTGTTTTAGCCATATAATCAATCATTTCATCTGTCATTCCTGGGTAAACTCCAACCCAAAAAGTATCATTCATGACTCTATCAGTATTTTTCAAATCCCCAACAACACGGTATCCTGTTCCCTCAGTTCTCATCTCATCAAAACACGGATGTTTAATAAGGTTTCCTGCAAATAGCATTCTTGTTTGAACTCCATGCTCTTCAACATATTTAACAACCTTATTTCTATCTACACCTTCTTTACATGTTATAAGAAAACCAAACCAGCTTGGATCAGAATTTTCACACGGAACAGGTAATATTAGTTTATCTTCAACTTCTAATAAACTTTCCTTTAATCTATAAAAATTATGTTTTCTTCTTTCAACAAATGAAGGAAATTTTTTAAGTTGAGCACATCCTATAGCAGCTTGCATATCTGTAGCTTTTAAGTTGTAGCCAAAATGTGAATATACATATTTATGATCATATCCGACAGGTAATTCACCATATTGTTTATCAAAACGATGTTTACATAAATTATCCATACCAGAAGGACATACACAATCTCTTCCCCAATCTCTAAATGAACGGATTATTTTATTAAGTAATGCATCATTTGTATATACTGCACCCCCTTCACCCATTGTCATATGATGTGGTGGATAAAAACTTGAAGTTCCAATATCTCCAATAGTACCTGTAAACTTTTCTTCTCCATCAATAGTATATTTTGACCCTAATGCATCGCAATTATCTTCTATAAGCCATAAATCATTCTTATCACAAAATTCTTTAACAGCTTTTAAATCAAAGGGATTTCCCAATGTATGTGCAATCATAACTGCTTTAGTTTTTTCTGACAAAGCCTTTTCAAGCATTGTTACATCAATATTATATTGTGGAATTGCAACATCAACAAAAACAGGAACTGCACCAAATTGAATCATAGGAGTAACAGTAGTTGGAAATCCTGCTGCAACAGTAATAACTTCATCTCCACGTTTAACTGCCCTTTCTCCAAGTAATGGCGATGTTAATGCCATAAATGCGTTCAAGTTAGCACTTGAACCAGAATTAACTAGACTACAGTATTTAACATTTAAATATTTAGCAAATTCACTTTCAAATTCATCTGTATATCTTCCTGATGTAAGCCAGAATTCAAGAGAACTATCTACAAGATTAACCATTTCTGCATTGTCATAAACCCTTGATGCATAGGGAATTCTTTGTCCATATACATAAGCATCTTTTTTATGATATTTATCACAATATTGACTAACAAGTTTTAAAATTTCTTCTTTATCTTTTTCTTGATTTAATTTACCAGCCATTCTTATTCTCCTTTGAAAAATTCTATAATTTGTTTATTCATGCATTCATTAATATCCTTCTGTTCAAAATAACATTTTGCCCATTCAACTGTTTTTTCAATTGCAGTATCTATATTCCATCTAGGTTTCCATCCAAATACGGATTTAATTTTAGAACAATCTAATTTTAAAAAATTAGCTTCATGAGGTCCTCCCATAAATTTATCTTCCCAATCCATATTTTGCCCCCATTTTTTGCAAAAAACATCTACTAAAATACCTGTTGTTATGCAATCTAATTCGTCTGGTCCAACGTTATAATAATCAGCATATTTTATGTCCTCATATTGCTTTTGAGCAATCATAAGATATGCACTTAACGGTTCAAGAACATGTTGATATGGTCTGGTTGAATGCGGATTTCTTACTAGTATAGTTTCCTTCTTTTCAGCTGCTCTTATACAATCTGGAACAATTCTATCTTGAGCAAAATCTCCTCCACCTATTACATTACCTGCTCTTGCTGTAGAAATAGCCACTTGTCCATCAGCAAAAAATGAATTCTTATAACTATGGGTAACAAGTTCTGAACAAGACTTACTATTTGAGTAAGGATCAAAACCATCTAATGGTTCATTTTCACGATATCCCCATTCCCATTCGTTATTTTTATAAACTTTATCTGTTGTTACATTTAAAAATGATTTTACGCATGAATTCTGTCTAACACACTCAAGTATATTAACAGTTCCCATTACATTTGTTTCATATGTATATACTGGATCTTTATAGCTATCACGTACAATAGGTTGTGCTGCAAGATGAAAAACTATTTCTGGTTTATTTTCATTAAAAACTTTCATTAGTTTATCTAAATCTCTTATATCACCTATTGTTGAATTTATTTCTTTTCCAACACATGAAATTTCAAATAAATTAGGATTAGTAGGTGGTATCAATGAATATCCTGTAACTACTGCTCCAGCTTGCACAAGGATCTTACAAAGCCAAGATCCTTTAAATCCAGTATGACCTGTAACCAAAACCTTTTTCCCTTTATAAAAATTCAAATCAACTACCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_020291|6024362:6032530|6026015_6026969_-|WP_015395461.1|DBSCAN-SWA MKKISILIPTYNEEENVIPLSQEIINLFKNKLENYEYEIIFIDNYSKDKTRESLLNLCQKNKNIKAIFNAKNFGQFNSPYYGLCQTTGECTILLCADFQDPISMIPKFIKEWEGGYKIVCGIKTKSKENKIMYFLRSCYYTMIKKMSSVEQIEHFTGFGLYDKSFIDVLRNLGDPSPFLRGIVAELGFERKDIAYEQEKRRSGKTSNNFYKLYDAAMLSFTSYTKIGLRLATIAGFVLSALSIIISVIYLILKIIYWNDFPLGVAPILIGVFFFGSIQLFFIGLVGEYIMSMNTRIMKRPLVIEAQRINFDEKQQQE >NC_020291|6024362:6032530|6024362_6025535_+|WP_015395460.1|DBSCAN-SWA MIQNEKSLDGLRGLAAFIVIIHHYLVGFYPSTYTGNINSIRTSSGFDALISRTPFNLFFNGNASVCMFFILSGYVLSCKFFKYKEKNIVISSAIRRYLRLMIPVLSSIVLVFILMKFKLFYNIQASTITGSDWWLGSFYNFEPNTFEMLKQGLYRVFFFSETSYNAVLWTMHYELFGSFIVFGFLFIFGKIKTRVITYIVIIFLLFNTYYLAFILGMFLSDIHSVNCKLINKINFRFPKIFFLITGLYLCSYPSGVDVTGSIYNYIKISKFNDVVMLYHIIGSFFIMITLLNSYKLKNFFSNKIFLFLGKISFSMYLIHLIVLCSFSSFIFLNLINYFRYYQTFFIMLILSIPLIILISHCFYKYIDSNSIKLSKILYKKYLEHNTKNFF >NC_020291|6024362:6032530|6027968_6029699_-|WP_015395463.1|DBSCAN-SWA MKLSDYIVTFLIEKGVTDVFGYPGGMVTHLMESFDKYKDFISAHVNYHEQASAFCACGYAQASNKPGVAYATSGPGATNLITGIANAYFDSIPCIFITGQVNTYESKGELHVRQKGFQETDIISIVKSITKYAVKIDDENNVKYEFEKAFDICISGRPGPVLIDIPMNILRADIIPDDLKHYEAQNPKEISDYYNYMTNTMLQMINFSRRPVILAGNGINIANVRNDFRDFVNLIGIPVVTSMIGRDVLPNNVENGFGFVGAYGDRCANFIISNSDLIISIGSRIDCRQTGSNLKMFGENAKIIRLDIDSGELTNKIKADEIDFVVDLKKIFPILNTEKFELKDRYEKWLNVCKEIREELKGIDSQYETDIIEELSYKVPEDSIITTDVGQNQVWVAQSFNIRSNQKMLFSGGHGAMGYSLPSAIGAYYGSRKNVICFNGDGGLQMNIQELQFIVREKIPVKIILLNNKSLGMIRHFQEMYFESNFVQTKKDGGYTIPDFDKISNAYGLRYINIKSVKQISECEDILIDDKPCFIELSLTDTTYVSPKLAMGKPIHDQDPLLDRDLFNRLIKICNI >NC_020291|6024362:6032530|6029718_6030135_-|WP_015395464.1|DBSCAN-SWA MKLFSIESFRTQGFWKIIIQFIKFGIVGASNTLISLLIYYVLIYFKVNYIVANTIGFIVSVLNAYYWNNRYVFKKSNKGNLKPMIKTFVSYGTTFVFSTILLVVMVDHLNLSNIIAPILNLIITIPLNFILNKFWAFK >NC_020291|6024362:6032530|6030134_6031469_-|WP_015395465.1|DBSCAN-SWA MAGKLNQEKDKEEILKLVSQYCDKYHKKDAYVYGQRIPYASRVYDNAEMVNLVDSSLEFWLTSGRYTDEFESEFAKYLNVKYCSLVNSGSSANLNAFMALTSPLLGERAVKRGDEVITVAAGFPTTVTPMIQFGAVPVFVDVAIPQYNIDVTMLEKALSEKTKAVMIAHTLGNPFDLKAVKEFCDKNDLWLIEDNCDALGSKYTIDGEEKFTGTIGDIGTSSFYPPHHMTMGEGGAVYTNDALLNKIIRSFRDWGRDCVCPSGMDNLCKHRFDKQYGELPVGYDHKYVYSHFGYNLKATDMQAAIGCAQLKKFPSFVERRKHNFYRLKESLLEVEDKLILPVPCENSDPSWFGFLITCKEGVDRNKVVKYVEEHGVQTRMLFAGNLIKHPCFDEMRTEGTGYRVVGDLKNTDRVMNDTFWVGVYPGMTDEMIDYMAKTIKEAVK >NC_020291|6024362:6032530|6031471_6032530_-|WP_015395466.1|DBSCAN-SWA MVVDLNFYKGKKVLVTGHTGFKGSWLCKILVQAGAVVTGYSLIPPTNPNLFEISCVGKEINSTIGDIRDLDKLMKVFNENKPEIVFHLAAQPIVRDSYKDPVYTYETNVMGTVNILECVRQNSCVKSFLNVTTDKVYKNNEWEWGYRENEPLDGFDPYSNSKSCSELVTHSYKNSFFADGQVAISTARAGNVIGGGDFAQDRIVPDCIRAAEKKETILVRNPHSTRPYQHVLEPLSAYLMIAQKQYEDIKYADYYNVGPDELDCITTGILVDVFCKKWGQNMDWEDKFMGGPHEANFLKLDCSKIKSVFGWKPRWNIDTAIEKTVEWAKCYFEQKDINECMNKQIIEFFKGE >NC_020291|6024362:6032530|6026980_6027892_-|WP_015395462.1|DBSCAN-SWA MKNVVVTGATSFIGIHIIKEYIKNNWIVIAVVRPNSKNLDRLPKSNLLTVVEIDIENIGRLTEKIETIKIDIFYHLAWDGVRVPYRDNAILQNKNYICAINALKIAKKLGCNTFIGAGSQAEYGKCIGKIDENYPARPVTEYGKAKLKTYRALKKIANENNIKFIWTRIFSVYGIYDYQGTLVMSVLDKMKRDESIELTKCIQSWDFIHVEDLARAMYLLANKSCVEGIYNIASGDSRKLKDFIKDMKRISKSKSELKFGAISYNSEGFISFEPVVDKLKQNLGWSCEINFEEGIKMLLESIG |
7 | uncultured_Caudovirales_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
6045223 : 6052500
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NC_020291|6045223:6052500|DBSCAN-SWA ATTACTTAACCACCTCCCATTTATGTTCTATAAATAATCGTCCCTCGGAAAAATATTCATTTGTAACTAAAATTCTTTGAGCTTCAGTCTTATAATCAATGCATACTATACCTTCATTATTAAAAATACCTACATCTATGCTATAACTACCACCCAATACAGGTATAGATGGAACAATATATTTAACTTTATGTCTTCCATATTTGTTAGGTACAACAATCTTGTCTAAATAAGTATTTGGCCCAAATATATAGTCTCTATTAGGTGTATATAATGCTACTCCAATTAAAAATCCTGGAATTCTATCATCATATATTTCATATTCAATAATAACTTCTAAATTATCAAAAGTCTTAAATTTTGAAGAATTACAAGTAACACTTGTAATTCTTGCTAATATTCCGTTTCCTGGTATATCTGTAATTTTATCTTCTTCAACTTGTGATAACTCTTCTTTTTTAGTCTCCTCTTCACTTTGCATACTTATCCCAGTATTCAATTTTTCACCTAGTAACATATAAGCTTCATACTTATCTACTATTTCACTTGATCCTCCAATTTCTACAACTTCACCTTTATTTATCCATATTCCTTTAGTACAAAATCTTTTTACTTGCTCAGTTGCATGCGAAACAAAAAGAATAGTTGTCCCGTTGTCTTTTAGTTGCTTCATTTTATCAATACATTTTGTTTGAAATCTAGTATCTCCAACGGATAATGCCTCATCAACTATTAAAATTTCTGGTTCAACATTTATAGCTACTGCAAAAGCTAATCTTGCAAACATACCTGATGAGTATGTTTTTACAGGTTGATTTATAAATTCACCTATATCTGCAAAATCCATTATTGGTTGTACCCTCTGCTGCATTTCTTCTCTTGTGTACCCCATCATTGTTCCATTAAGATAAATATTTTCAATTCCAGTATATTCTGGATTAAATCCAGCTCCTAATTCTAATAATGCTGATATTTTACCATTTACCTCAATATTACCAGATGATGGTGTAAGTACACCTGTTATTATTTTTAATAATGTTGACTTTCCAGATCCATTAGTTCCTAGTATTCCAACAGTTTCTCCACGTTTAATTTCAAACGATATATCTTTTAATGCATAATGTTCTCTACCATATTTTTTTTTAGATATGCTTAAAGATTCCTTCAATCTATCCATAGGCTTATCATACAGTTTATATATTTTACTTAAATTTTCTACTTTTATTGCTATTTCCGACATACAAATCTCCCTTATAATACATCTGCAAAATGTGGCTTTAATTTTTTAAATATTGTTGCTCCAATAGCAAATAACCCAAGTGTTATTATCCAAAAATATAATGTTTGAAAATATCTTTGGAAAAACCAAACATGGTTTAAAAATGTATCTCTATATCCTTCAACTATATAATACATTGGACTTATCTTTAATATCCACTGATATTTTTCTGGAACCATTGTATAACTCCACATTATAGGTGTCATCCATACACCAATCTGTAAAAAAATATTTATTATTTGTCCTAAATCTTTAAAGAAAATTACTATTGCACTTGTTGCATATGATATTGCAAGTACTATAGCAAATACACAAAACGAATAATATATTAATTGTACTGTATATATCGATGGATAAAATTCATATATCCATGCTACCACAAACAAAAAACCTATAAATACTAAATGTACAAATAATGCTGATACTATTTTCACTATAGGTAGTATACTTATTTTAAACACAACTTTTTTTACTAAATAGCTATATTCTAACATACAATTTGTAGCATTTAATAATGCTTCCTGAAAGAAAAACCAAGGTACTAATCCCCCCATAAGCCATAATATAAAGGGTACACCTTTAATTGGTGAACCTGACCTTAATCCAACTCCAAACACGAACCAATAAACTAGTATTGTTACTATAGGTTGAATAAATGCCCAAATAATGCCCAAATAAGAACCTGCGTATTTTGTTTTGAAATCATTTTTTGCTAATCCCCATATTAAAGTCCTGTTATTTTTAATTTCTTGAATTAAGACAAGTACACCTTTTGATTTTCTAAGAACAATTAATATTAATATATCTATTAATATACAAATGATTGATTTTAAAACATAATTTATAATATTTTCGTATTCAAAAAGAGATTGTTCTACTCTTATGTCAACCTTATATGTTATGTGTGGATCAGTCCCTGTTGTTAATAAATCAATTGCTCCTTCTTCTTGTTTTGTTTCTCCAATTTGATTTTGATTGCTTTTATCTAACAATTGGTTTAAATCTAAGTTTATTTCCTTACCAAAATAGGATAATTTAACATCAGATATATTAGTCTTCCCAGGCTGCTCACCAAAATCGAATCTCAATTCTTTTGTGCTCTTTGGAATTGTAAACTCTAACTTTTCCTTATTATTTATATCAGTATAATCTATCTTTTGTGATTGTTCTTCCTTCCATGAAGAATCATTTCCATAAAACAGCTGATATGAATCTTGTTTGTCAGATATTACTTCATAACTCAAAGTAATATTTTTACTTTCCAAATCACAATATTTAAACACTGCTACATTAGATAAAAATACAATAAATATTAGTACTATTAATTTAACAAATTTTTTCTTACTCATTTTATATTATCCTCTTACTTGAGTTCTATTAAGTATCTTTCTAAAGCATTTTTCCAATCAGGCAACAAATTAAATCCATTATCCAAAAGGCTCTTCTTTGAAAGTCTTGAATTTAAAGGCCTTTCCGCTTTTGCTGGATACTCGCTTGTCGGAATAGGATTTATCTTGCAACCTAAATCCGCTTTTTTCATAATTTCTGCTGCAAACTCTGCCCAAGAACAAAAACCTTCATTAGTTGCATGATATACACCATATTTTTCAGATATAGCCATATCGCATAAAAGTGGTGCTAAATCAAAAGTATATGTAGGACTTCCTATTTGATCACACACAACATTTAAACTTTCTTTCTCTTTCCCAAGTCTAAGCATTGTTTTAATAAAGTTGTTTCCATTAACTCCAAACACCCATGAAATTCTAACAATAAAGTACTTATCCAAAACTTCCTTAACCTTTAATTCACCTTCGTATTTAGTCTTTCCATAAACTGAATGTGGCTCAATTTTACCGTCAACTTCAAATGAAGTGTCTCCTTTACCATCAAACACATAATCTGTAGATATGTAAATCATCTTAGCATCTATTTCTTTACAAGCCTTTGCTATATTCTCTGTACCATATACATTGACTTTTGTACAAGCTTCTTCTTCATCCTCCGCTCTATCAACCGCTGTATATGCTGCACAATGTATTACACATTCTGGCTTTAACTTTAAAATATGCTGCCTAACAGCATTAGCATCTGTTATATCCAATTCTGCTCTATCAATTCCAATACACTCGATATTCCTTCTATTTAATTCCTTTACAATATCAAAACCTAATTGTCCATTTACTCCAGTAACTAAAATCATTTTAACTCTCCTTTTACAGTACACCTTTCTTTGCCATTTTAATGATATACTTAAATATGCATTCTGGCAAAAAAGGTAATACAATTTCTATAATTATTGAAACCTTGTGGAAGTCTCTATACTTAATCATAACTTTCAAATTTTTAATATTAGGTTTAAAAAAATATTTTTTTCTAGAATCCAACCAAATTAAACAACTTTTTATATGTTCCTCTAATTCAGCATACTTTAATCTTTTCTCTAGTGATTTATATCTATAAATAAAATCCTCTATCCTCTTACTATAATATGTTTTTTTATCATGAACATCTTTTAAAATACCTGTTTGATTTGAACTATGTTGCCTATATCTTACTAAAGGCCTATTTATGAATTCTATTTTCCCATTTAATGCCGCTATAATAGCAATCCATTGATCATGAACTAATGTTTTTTCAAAAGGTATTGCTTTCATTGAAATATCTCTTTTAACAATCATTGCACATCCTGTCACAAAATTAGTCATCAGCAATTCTTTTGCCAAGTTATATCCAGACTTATATATAATTCTTTTTCTTATTTCAGTTATGCTTTTAGCTATCTTCTGTCCATTCTCATCAATTATTGAAAGATCACTGCACACAAGTGTCACATCTTTTTCATAAAATTTATCAATCATTAATGTTATTTTTTCTTTTTCCCATATATCATCCTGATCACAATATGCAAAAAACTCTCCATTTGCTATTTTAGTAAGTTCTTCAAACGCTTTATTAGAGCCCTCATTTTTAGTTCCACTAACTACAACATATGAAAAGTTTGTTATATACTTTCCTATCAATTCTTCACTAATAGGAAACTCTGGACAATCATCATAAACTAATAATTCTATATTTTCATAAGTCTGCTCATTCAAAGAATCCAGCTGTTCCACAATCCACTTTTTATTAGGTTTATATACAGCCATTAATATAGAAACTAGCGGAGAATCGTCTTTGCTATAATTTTTTTCTAAATTATTATCTTCGATAATCATATTACTCAACTGTAGATTCTCCTCTGCTTATAATCTTAAAACTTAACTGTTGATTTCAATGCATAATTGCTCACATCTAATCTATCTCCGAATGTTCTTGGTTGTGCTTCACACTCTTAGTAAGGTACTTGTTTATTTAAGTTAAATGATCTTGGTTTCGCTTCGCACTTTATTTATAGATGAATGATCTTAATTGCAACATAGCTGTTTTATTTATAGGTACATGTTCTTGGTTGTGCTTCGCACTCTATCTAGAAGTGTACATCTTTTCATAATAACTTTGATATTCACCACTTATTATATTTTCCCACCAAGCCTTATTGTCTAAATACCACTTAATTGTCTTTTTTATTCCTTCATCAAAGGTTGTTGTTGGAAGCCATCCAAGTTCATTATGAATCTTTGTAGGATCTATTGCATATCGCATGTCATGTCCTTTACGGTCACCAACATATTTTATAAGCTCCTCTGTTTTTCCTAATTCTCTTATAATGGTTTTAACCACTTCTAAATTAGTTCTTTCATTATGTCCACCAATATTATATACTTCCCCAACTTTGCCTTTGTGTATAATTAAATCAATAGCTCTACAATGATCTTCTACATAAAGCCAGTCACGCACATTTTCTCCTGTTCCATACACAGGTAATTCCTTATCATTTAAGGCATTAGCTATCATAAGAGGAATTAATTTTTCTGGGAAATGATATGGTCCATAATTATTTGAGCATCTTGAAATAGTTACAGGTAAATTATAAGTTCTATAATATGCTCCAACTAAAAGATCAGCTGATGCTTTACTTGCTGAATATGGGCTTGATGTATGCAATGGAGTTTCTTCTGTAAAAAATAAATCTGGTTTATCTAAGGGTAAATCTCCATACACTTCATCTGTTGATACCTGATGGTATCTCTTTATTCCATATTTTCTGCATGCATCCATAAGCACTTGCGTACCCATAACATTAGTTTTTAAGAATACTTCAGGATTTTCAATAGATCTATCCACATGACTTTCTGCAGCAAAGTTCACTACAATGTCTGGAATTACTTTCTCAAACATTTCATAAACTGCCTTTCTGTCTGCTATATCTATTTTATAAAAACTAAAATTAGGATTATCTTTAACTGACTCTAATGTTTCCATATTTCCTGCATAAGTTAAAGCATCCATACAAATAATTTTATAATCTTCATATTTATTAAGCATATAGTGAACAAAATTTCCGCCTATAAATCCTGCTCCACCAGTTACAACAATTTTCATCCTTCAATCCTCACTTCTTATATTAATAATTAATTACTTATTATATATAAATGTACAATCACTATCCTTCAATAATGGTGCCTTTTTATCTTTTTCTGAAAGAATTGGATTTTCTATTCCCCATTCAACACCTATTTCTGGATCGTTAAATTTAATACTTCTATCACTCTCATAGTTATAATAATTATCTGTTTTATATACAAACTCCACATCATCAGTTAAAGTCAAAAATCCATGTCCAAAACCTCTTGGAATAAATAATTGCTTTTTATTTTCATCCGAAAGTTCAACAGCTACCCATTGTTTATAAGTTGGAGAACCTTTTCTTAAATCAACTGCCACATCAAGCACAGCCCCTTTGACACAACGTACTAATTTCGCTTGGGCATGTTCTCCATTTTGAAAGTGAATTCCTCTCAATATTCCTTTTCCTTTAGAATAAGATTGGTTATCCTGCACAAAATCACAAGCTATTTCCGGAGTCTTAATCCTAGAATAAGTTTCCATAAACCATCCTCTTTCATCACCAAAAACCTGTGGTTCAACTATATAAACACCTTCTAATTTAGTTTTAATCAAATTCATTACTTAAACCTCTTTTCACTGTACAATTGACGATTAACAATTGCCAACTAGTAAATCACTTTATTTTCCGCAACATTTTTAAGATGTTGTCCATAAGGACTTTTTCCATACTGCTCTGCACCTTCTAACAAAGTTTCTTTAGTTATCCAACCATTTTTATAAGAAATTTCTTCTAGACATGCAATCTTAAGTCCTTGTCTTGTTTCAATTACCTTTACATATTCAGAAGCCTCTGTTAAACTATCAACTGTTCCAGTATCAAGCCATCCATATCCTCTTCCAAGAGTAATAACATCTAATTTTCCATTTTCAAGATAAATCTTATTTAAATCTGTAATTTCCAACTCTCCTCTTGGTGATGGTTTTAAATTTTTAGCATATTCACAAACCTTGTTATCATAAAAATAAAGCCCTGTAACAGCATAGTTTGATTTTGGTTTTTCAGGTTTTTCTTCTAGAGATACAGCCTTACCATTTTCATCAAATTCTACTACTCCAAAACGTTCTGGATCTTCTACATAATACCCAAAAACTGTTCCACGGCCTTCATTTTCTACTGCTCTTTTTAAATGTTTAGTTAACCCATTTCCATGGAATATATTGTCTCCAAGTATCATTGCACATTTATCATTTCCAATAAACTCTTCACCTAATATAAAAGCTTGAGCTAATCCATCTGGAGATGGTTGTACTTTATAAGATAAATTAATTCCATATCTAGAACCATCACCTAAAAGCTTTTCGAAATTAGGTAAATCATTTGGTGTTGAAATTATTAATATTTCTTTAATCCCTGCCAACATTAACGTTGATAATGGATAATAAATCATAGGTTTATCATATACTGGCAAAAGCTGCTTTGAAGTTACCATAGTTAATGGGTAAAGTCTTGTACCACTTCCACCTGCAAGTATTATACCTTTTGTCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >NC_020291|6045223:6052500|6046473_6047850_-|WP_015395478.1|DBSCAN-SWA MSKKKFVKLIVLIFIVFLSNVAVFKYCDLESKNITLSYEVISDKQDSYQLFYGNDSSWKEEQSQKIDYTDINNKEKLEFTIPKSTKELRFDFGEQPGKTNISDVKLSYFGKEINLDLNQLLDKSNQNQIGETKQEEGAIDLLTTGTDPHITYKVDIRVEQSLFEYENIINYVLKSIICILIDILILIVLRKSKGVLVLIQEIKNNRTLIWGLAKNDFKTKYAGSYLGIIWAFIQPIVTILVYWFVFGVGLRSGSPIKGVPFILWLMGGLVPWFFFQEALLNATNCMLEYSYLVKKVVFKISILPIVKIVSALFVHLVFIGFLFVVAWIYEFYPSIYTVQLIYYSFCVFAIVLAISYATSAIVIFFKDLGQIINIFLQIGVWMTPIMWSYTMVPEKYQWILKISPMYYIVEGYRDTFLNHVWFFQRYFQTLYFWIITLGLFAIGATIFKKLKPHFADVL >NC_020291|6045223:6052500|6049966_6050986_-|WP_015395481.1|DBSCAN-SWA MKIVVTGGAGFIGGNFVHYMLNKYEDYKIICMDALTYAGNMETLESVKDNPNFSFYKIDIADRKAVYEMFEKVIPDIVVNFAAESHVDRSIENPEVFLKTNVMGTQVLMDACRKYGIKRYHQVSTDEVYGDLPLDKPDLFFTEETPLHTSSPYSASKASADLLVGAYYRTYNLPVTISRCSNNYGPYHFPEKLIPLMIANALNDKELPVYGTGENVRDWLYVEDHCRAIDLIIHKGKVGEVYNIGGHNERTNLEVVKTIIRELGKTEELIKYVGDRKGHDMRYAIDPTKIHNELGWLPTTTFDEGIKKTIKWYLDNKAWWENIISGEYQSYYEKMYTSR >NC_020291|6045223:6052500|6045223_6046462_-|WP_015395477.1|DBSCAN-SWA MSEIAIKVENLSKIYKLYDKPMDRLKESLSISKKKYGREHYALKDISFEIKRGETVGILGTNGSGKSTLLKIITGVLTPSSGNIEVNGKISALLELGAGFNPEYTGIENIYLNGTMMGYTREEMQQRVQPIMDFADIGEFINQPVKTYSSGMFARLAFAVAINVEPEILIVDEALSVGDTRFQTKCIDKMKQLKDNGTTILFVSHATEQVKRFCTKGIWINKGEVVEIGGSSEIVDKYEAYMLLGEKLNTGISMQSEEETKKEELSQVEEDKITDIPGNGILARITSVTCNSSKFKTFDNLEVIIEYEIYDDRIPGFLIGVALYTPNRDYIFGPNTYLDKIVVPNKYGRHKVKYIVPSIPVLGGSYSIDVGIFNNEGIVCIDYKTEAQRILVTNEYFSEGRLFIEHKWEVVK >NC_020291|6045223:6052500|6048717_6049728_-|WP_015395480.1|DBSCAN-SWA MSNMIIEDNNLEKNYSKDDSPLVSILMAVYKPNKKWIVEQLDSLNEQTYENIELLVYDDCPEFPISEELIGKYITNFSYVVVSGTKNEGSNKAFEELTKIANGEFFAYCDQDDIWEKEKITLMIDKFYEKDVTLVCSDLSIIDENGQKIAKSITEIRKRIIYKSGYNLAKELLMTNFVTGCAMIVKRDISMKAIPFEKTLVHDQWIAIIAALNGKIEFINRPLVRYRQHSSNQTGILKDVHDKKTYYSKRIEDFIYRYKSLEKRLKYAELEEHIKSCLIWLDSRKKYFFKPNIKNLKVMIKYRDFHKVSIIIEIVLPFLPECIFKYIIKMAKKGVL >NC_020291|6045223:6052500|6051019_6051571_-|WP_015395482.1|DBSCAN-SWA MNLIKTKLEGVYIVEPQVFGDERGWFMETYSRIKTPEIACDFVQDNQSYSKGKGILRGIHFQNGEHAQAKLVRCVKGAVLDVAVDLRKGSPTYKQWVAVELSDENKKQLFIPRGFGHGFLTLTDDVEFVYKTDNYYNYESDRSIKFNDPEIGVEWGIENPILSEKDKKAPLLKDSDCTFIYNK >NC_020291|6045223:6052500|6047864_6048704_-|WP_015395479.1|DBSCAN-SWA MILVTGVNGQLGFDIVKELNRRNIECIGIDRAELDITDANAVRQHILKLKPECVIHCAAYTAVDRAEDEEEACTKVNVYGTENIAKACKEIDAKMIYISTDYVFDGKGDTSFEVDGKIEPHSVYGKTKYEGELKVKEVLDKYFIVRISWVFGVNGNNFIKTMLRLGKEKESLNVVCDQIGSPTYTFDLAPLLCDMAISEKYGVYHATNEGFCSWAEFAAEIMKKADLGCKINPIPTSEYPAKAERPLNSRLSKKSLLDNGFNLLPDWKNALERYLIELK >NC_020291|6045223:6052500|6051618_6052500_-|WP_015395483.1|DBSCAN-SWA MTKGIILAGGSGTRLYPLTMVTSKQLLPVYDKPMIYYPLSTLMLAGIKEILIISTPNDLPNFEKLLGDGSRYGINLSYKVQPSPDGLAQAFILGEEFIGNDKCAMILGDNIFHGNGLTKHLKRAVENEGRGTVFGYYVEDPERFGVVEFDENGKAVSLEEKPEKPKSNYAVTGLYFYDNKVCEYAKNLKPSPRGELEITDLNKIYLENGKLDVITLGRGYGWLDTGTVDSLTEASEYVKVIETRQGLKIACLEEISYKNGWITKETLLEGAEQYGKSPYGQHLKNVAENKVIY |
7 | Enterobacteria_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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