Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019954 | Tepidanaerobacter acetatoxydans Re1, complete genome | 9 crisprs | cas8b1,cas7b,cas5,cas3,cas2,csx1,cas10,csm3gr7,csx10gr5,csx19,csx20,csa3,WYL,cas3HD,cmr6gr7,cmr4gr7,cmr5gr11,cmr3gr5,DEDDh | 0 | 3 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019954_1 | 121467-121639 | TypeI |
NA
Consensus repeat of NC_019954_1
|
2 spacers
spacers of NC_019954_1
>1.1|121503|31|NC_019954|CRISPRCasFinder TTAAAATCTGCCAGAAGTTCACTAAGACCCA >1.2|121570|34|NC_019954|CRISPRCasFinder TTTAACTCCATTACTTAATCGATGCGGAGAGACG |
cas3,cas5,cas7b,cas8b1,cas6,cas2,csx1,cas10,csm3gr7 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019954_1
The CRISPR arrays of NC_019954_1 >merge|NC_019954|1|121467-121639|CRISPRCasFinder GGTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAACTAAATTTAAAATCTGCCAGAAGTTCACTAAGACCCAGGTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAACAAATATTTAACTCCATTACTTAATCGATGCGGAGAGACGCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGGCTCACATCTTCTT >NC_019954|1|1|121467-121639|CRISPRCasFinder GGTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAACTAAAT TTAAAATCTGCCAGAAGTTCACTAAGACCCA GGTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAACAAATA TTTAACTCCATTACTTAATCGATGCGGAGAGACG CGTTTTTAGCCTACCTATAAGGGCTCACATCTTCTT
>NC_019954.2|WP_013777245.1|118780_121270_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MQYLAHYDKGKQEKQFLNEHLTSVATLAKTRVLPCVVFDDLDSSKIEEICYWTGYFHDLGKYSIYFQDYLQKGISSPLKNHAHISACFAYSYLSNKATSRFDSDKTLLFFIYTCIRLHHTSLKCKGLFNYGIWEDLIPISKNISDKSNEIIKDLGLAQDMSDEEFRALIDIEKFKANAFSLERIPLMFNNSRISNPKWYFLLIYLFSMLIDTDKLDSANIKSEKISTVPPENVTSYIFSKHGKKSDTELINNREKARKSMIEVVESLSNDALKNVRFFTITAPTGIGKTLSSLQCALDLQQKIAETEGYTPRIITAIPFINIIEQNKLEYENVMGKECKIAVHHRLSDFGVAKSKDETIPVDRVLLETESWEADVILTTFVQLFQSLFSSTNKMLKKINKLAGSIVILDEIQAIPEKYMPLIGASLQMIAKYYGTRFILMTATQPKILQFGSMLLQYTEKNSKQIESIELLPNHEEYFKCLTRTKFVPLLENVLDTEDFLDVFFNKWDYTKSCLIVVNTIKRSIDVYKKIKEELALRGFKLPVYYLSTNIIPLKRRDVIQEVKDLLESEQPVILVSTQTIEAGVDLDFDMAFRDFAPLDSLVQTAGRVNRQGKKGNYSPVYIIQLENDSHYIYDLSLREVTINLLKELLTAQEEIKETDYVSLTKRYYDLILKEGVDDASKRIWNDGILKLDFDKLEEFKLIESPGEVYDVFIEKELSATNLADAYEQVLGYKDSFDYDLSKIFPDFKSDQFEKTLNVFQRKALLRLIMAKMHDYIIQVRVSRLKENRPVEFKERGNIESSLYWVPPTKCDDYYDEDTGFKDESGDGFI >NC_019954.2|WP_013777244.1|117962_118727_+|CRISPR-associated-protein-Cas5 MKVISFHLKGKMAHFRKFYSNASALSYFVPPRTTICGIIAGLLGLERDGYYDDFSLDNCKITITSCSPLKKTMQKLNYLMIKSVQDLNGSQENHSQTATELVIPQDIRSGYIDYKIWFHHCDNKIMSDVESIINDCSPFYESKWSCVALGSAFNLGWIEKGEILEAEEKFVKSKKLVSSSIPIHNIEEIKVDEINTNKVYKLIKEEVPLEFDQQRRITKEGLKEILINVNGDYIPAVVDSFVSLDNGEVITWLE >NC_019954.2|WP_013777243.1|116907_117960_+|type-I-CRISPR-associated-protein-Cas7 MLINQNSDFLFGFQATMSNPNGDPDQENKPRMDYETSTALVSDARRKRDVRDFLKNKGYKIFVDTLADQKVPMDKMLEYITDTFLENSGNIELLFKENPNLKVQWEKVFGTTENPNKEYNEKKEKLKKNKDFIRLNNIFLTEIIKKELIDIRLFGSAMAVEGVSKTFTGPVQLNWGYSLHPVELIKSNTITSIMNEDNSTFGKKYKLYYALMAHYGTINKYNAKLTGMTEKDRELFRKALGQSLMANQTDSKQGQEPIFYLEILYAPEFDGYLGDLRRFLNVEYATYAIRSLDDIKVDFSRLNDAINNVKNKGYIDKVIGWVNPFIPNESFMNLPEFENIDLLAPIKTEE >NC_019954.2|WP_013777242.1|114747_116847_+|CRISPR-associated-protein MSIPKLTALIGESASERFQDEFTPLMKSIKKVKDDETPYIVFLVMDLAKEEIYFKLNKKLTEDSVNEYYYFGNNSGSGAQYYLTRDSKSLRYLLTRTFNELYISLSKNDLENGELAKLIKKMEEKKLVKLGKKQGENCFNLEKLSLAKSGKVKDIKLGRGKSDVNDIYLEGKRYHPEDFIRIFLQDANKKNKFVLIVPKVITEDGHEIILSTHDEYLELVRRENKLGSNQNLTKDSNKNKRICYICKKEGPDVSSEYSKKFSRTGINKIFTTTTINTSPFLKKSDYDKVYSICIDCYQKLKAGEKVISMDFRSKIAGEDVFIIPQGLLGDFDYNYLGILKKDVDLAFKSSDAKEWFETIKSEQDLSGVRQYLVNFIIYRTDGTSLTVLETIEDVPMLRLEKIMEIFANITNELKPHIKNFSLGSVYRLIPVKVNDKGKQIDVGRVLSLYKAILSGEKISSRTLFDYALEGLEKGIKQLEKATINNYYNMGLTRYLNGYEDFFIKRLIFGYIVLFKACQELNLLDREVFKFQKEEEDDFMDNFETPSKEVNALIRRIEEFLKRQGFNNNAKAMFYLGVLVNRVAMAQMEKEHKKKPILKKIQFQGMNAKEVYGLYQDVVEKLIQYNKMTLFTEAIMNRFHYYYGSLDGDWKLDDRANVFYIMAGYSYMVGNKALDFTKEEEEAEIGVGDEEEVSEDRIEE >NC_019954.2|WP_144312809.1|113752_114481_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MYFWPENGQYLTLPIHYNHIVQAVIYDSLDEDISNFLHEKGFSYEKRSFKMFAFSRLMGTYEIDKGKEKIILQKPVSLVVTSPYRNFCTSLANGLLLKSTVRLGNTNMQVTNVSFAKDMIYQDKIQISTLSPIVVYSTLMRPDGRKYTCYFEPGEKDFDEIMEKNLRKKYIAFHKTEPPEGNVKLEPLRQPKLSIIKYKNTIIKGYSGRFILSGPAPLLQIAVESGLGSKNSQGFGCVEVEG >NC_019954.2|WP_013777240.1|112616_113336_+|hypothetical-protein MNRLIKRLLILMLVTILILAGCAKENDSKPVVSQPPDTSSVGNENEPVPNQAASPDENIGDTNSNLTDENADSETMFKVQDSKQIQGWKELIVKDYAYTTEDWESYSFRENSPIISYSLNFPGNWNVDYSIFTDENGAKVAELLPTIIMKEGQSLLDNWEPNSECELISRENIKVGDLTGVKIILKSYPYGGDIEMWYPHTYYLTDGKQVFIMSFYALELDSEEQELFDKIIKTFQFLS >NC_019954.2|WP_013777239.1|112178_112601_+|transcriptional-repressor MDVEELLKKQRLKVTPQRKAIINVLESSDGVLSAQDIFTEVIKILPNINFSTIYRNLDLLLERGILCRITPESGGILYELRREEGHHHHVICKKCGASIPLDYCPMGNIEKELSRKGFTPTEHRFEIYGYCNKCSKKIKE >NC_019954.2|WP_013777238.1|111375_112188_+|metal-ABC-transporter-permease MMYILSFDFMQRAFMAGIITALLASVMGVFIVLRRMSMVGDSLSHAALAGVAGGMLVGIYPFYGALIFSGAAAVLIEIIRSAFSKYAEVALAVVLSGGMGLAVVFISIGKSFNADLMSYLFGSLVAVSSQDLLLIAILGFIIMFSMILLYRELFSITFDEEAARLSGIPVKAVNMYFTLMTALVVALSIRVVGALLISALMVIPAAVGMQLAKSFKSTFIIAVGVAIFSVVSGLYTSFIFDLAPGGTIVLIATAILMIVLCVKGAVKQWM >NC_019954.2|WP_013777237.1|110551_111379_+|metal-ABC-transporter-ATP-binding-protein MSSNSLCAGFGRVYDGEAGDDMEDIIDTSKIKDNEVISLKNVDFSYNGTLVLTNINITVEKGDFIAILGPNGSSKSTLLKIMLGLLTPKAGEVKIFGQNVRHFKEWSKIGYISQQAANTNTSFPATVEEIVSSGYYTGFGRLFDKAERKAATGEALAAVKITDLSNRLIGQLSGGQRQKVFLARALVKKPEALFLDEPTTGIDAVSQQEFYEMLAKLHKNRMTIVMITHDIDAAIKRATKVGYMEDGNINIYENNGNLSGILASRLIGEGARGRI >NC_019954.2|WP_013777236.1|109647_110562_+|zinc-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKIAKSFLVLLLILSISVLTTACSNNSQVVLPNQPNDQQNSLKIYTTFYPLYDFTKKIVGDNAQVENLMPAGVEPHDFEPSPKQTAMIYDGDIFIFLGESMELWAKKMAGDLDKKGVAVVEAGKGLIENNDPHIWLDPVMAKEMAQKIFDGVVAKDPEHSEVYQENLNNLMQKFDELDKNLNEIISSSSEKNIVTSHSFLGYVARRYGLEQTAITGLSPQEEPSPKKMAELVEFCKAKKIKYILDEPGEVSKLSQTLADEIGAEILIINPLGTLQPNEVKAGEDYFSVMEKNLEVLKRVLSYEQ >NC_019954.2|WP_013777246.1|121829_122093_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFIILVYDVGEKRVAKVLKICRKYLTWVQNSVLEGEISAANFKKLKLELKRVIDEDEDSVIFYILRTTKYSERQSMGIKKGGDELFI >NC_019954.2|WP_013777247.1|122469_122892_+|methylaspartate-mutase-subunit-S MKYDDKKTIVLGVIGSDVHSVGIRILDEAFSEAGFNVVNIGVLSSQEDFINAAIETDADAILVSSLYGHGELDCKGFKEKCVEAGLGDVILYVGGNLVVGKQDWPATEKKFLDMGFDRVYPPGTLPEIPINDLKNDLGIK >NC_019954.2|WP_013777248.1|122922_124317_+|glutamate-mutase-L MELALLIDIGSTYTKVTAVDLETVELKARAQAATTVAEDVNIGINKALEELKAMGIDPAKAKHKLACSSAAGGLKMVAVGLVPELTTEAAKRAALGAGAKVGHVFCYELTDDELNQIARYSPDIILLAGGTDGGNKDVIIHNAEKLAELKVDAPIIVAGNKTAASAAEKALRAASKEVYVTENVMPKLECLNIEPAKKIIREVFLSKIIYAKGLSKVSNYVDSPIIPTPSAVMKAAELLAKGSDNEAGYGEVMIVDIGGATTDVDSAATGEPTKAGVTLRGLEEPFIKRTVEGDLGMRYSALALVEEVGIKNMLKNYLPCGMDEKTLQEYVKKISIDTDYVPCNETDKQIDCGIAKAATDLAVKRHVGRIETVYSPFGAAYVQHGKDLTKLDFMIATGGVLIYSENPKEILRHGLYDSSRPEVLAPENPKMLLDEKYLLSSLGLLSEIAPDKALNLAKKYLKEL >NC_019954.2|WP_013777249.1|124336_125791_+|methylaspartate-mutase-subunit-E MEVQNKKWDMKKFSEMRQEVLNQWPTGKEVDFEEAVRYHQNLPKNQIMTNKLREAATKNNTLIQPRAGVALLDEHIELLKFLRQKGKADVLPTTIDSYTRQNRYEEAEKGIKESEKAGRSLLNGFPAVNYGVKKCRKVIESVDCPVQVRHGTPDARLLAEITLAGGFTDFEGGGISYNVPYAKKISIEQSIYYWQYVDRLVGIYEENGISLNREPFGPLTGTLVPPCISHSIGIIEGLLAAEQGVRNITLGYGQCGNLIQDVAAVETLKELSAEYLKDYDVMLTTAFHQWMGGFPQDEAQAFGVISWGAATAALSKATKVIVKTPHEAFGVPTKEANAEGLRATRQVINMLKDQRMISSQELEKEKEIIKRETRQILSKVYELGEGDWAKGAVRAFEAGVLDVPFAPSQFNAGKILPARDNSGAVRFLNFGSIPFDDKIKEFHRRKLAERAKAENREVSFQMVIDDIYAIGQGMLVGRMDSKIA >NC_019954.2|WP_013777251.1|127070_128441_+|acyclic-terpene-utilization-AtuA-family-protein MEELKVLSPTAILGYGFPEESFQRGLEQHPDFIAVDAGSTDPGPYYLGAGVSFTDRQAVKRDLKLMLKAGKKLKIPVLVGTAGGSGANEHLYWTEDIIKEIAREENLELKVAVIEAQIPKEEILKKYEEGKIEPLAPAGELSREDIEETTRIVAQMGVEPIIDALENDVDLVLAGRAFDPTAFAAPCIKAGFPKGLALHMGKILECASIAATPGSGSDCMMGTLRHDCFILEALNPKRKCTVTSIAAHTLYEKDDPYRLHGPGGIINLEETEFTQIDERRVKVSGSKFIPSEEYTIKLEGAKKTGYRTISIAGTRDPIMINQIDDILEAVKDMAKNNFSNIKSDDYQILFALYGKDGVMGKLEPLKDKPSHEIGIIIEVVAKTQEMANTICSFTRSSLLHYGYPGRIATAGNLALRYSPSDIEAGEVYEFSIYHLLAVEDPKEYFPITVKTIKGSE >NC_019954.2|WP_013777252.1|128442_128754_+|DUF4387-domain-containing-protein MGIPITEVAEVIRSKNSGPYELTMDIIFKDFDSYENVKQKNIINKKLISSLYQIPEEDIISIINFDPAKAIKITIKRPLVAGAVGESDVYGAQQHAPLLGIEV >NC_019954.2|WP_023211308.1|130000_130957_+|ATP-grasp-domain-containing-protein MKIAILIDEPRVSYLPGEEGLNEDLQKRKTVKNLKEVLSKRFECSLVKADSDIISKLQNENVSLVFNLCNGIRGETRQAQIPAILEFSGIPYTGSSILGHTLAINKNYACKVFKGSGVTTPEFISIYDKDDLMQLRNKEIKFPVLVKPCDEGSGRGIHQDSLVYDFRSLKRKVQQELRLYNPPIMVTEYIKGREFTVGILGNGNNLKVLPILEISFEALPDDLAKFYSFEVKANYADKTIFRCPAPLDNKLKTKIENTAKKAYNALSLRDYARVDVRVKDDTPYVLEVNSLPGLQKGYSDITKMASACNLAMKALSLK >NC_019954.2|WP_013777255.1|132919_134299_+|hypothetical-protein MDIFTSFTDLVLLVGTNPLPNYIVIKYFLKHNEKLKRIWLIYSEETNVQAGTEELAENITSVIKKEFLSNKPDLKFKHMPLSDVGSASTILDELQRNMKIEVSSPNIFHLNYTGGTKSMAVQTYKYFLENFGKRCTFSYLDGRDFKLKGDQSSAHVTKDLRYEIGISVESLFELHGYEKKGGQNNPSYPDTVKKFEEIIRLGKLNEYLSWKKSTIREFFYEGSNCIKKKNRFLTHNNIYSDEDVKRFKQNFKDKMTDEIILELLKSIPKENSILDENGDIWVPDKSTTNKEYKERVGDSVENFLDGKWLEVYVYNVICQKIKQNEKLNELYKKGQLIIDNNYEIKKKNTEKKHFEIDVILLNGYQVCGISCTTASDDSTCKNKGFEIIHRARQMGGEEAKSILIACLEDKESRSIEDFYEDLKDTSGSRTHEFMVLGLKDLTPEKLWEKIYEHIWGADL >NC_019954.2|WP_013777256.1|134295_135864_+|hypothetical-protein MSKVTAILADTVSIQKYVYSSNRLKENIGASSIIANIYKESLANTLEKTLEHGVSLDEWEKQPETIAIKNSNTDFEVGYIGGGNALLFFNNEATAKEFISEWTRSLLLEAPSLNVAFAISEFNIDNFQNEMKNLFKQLEINKSKYFPQTFLPKHGITADCPYSGLSAEVYKPGTNDEKGAYISSASYVKYKHIDIDDAKVEVERISNGKFSLTTNIEKLGQTKGQNHIAIVHIDGNSMAEHFKSCENLVAIRKLSKRLKDIMQSVYEEFLNYIFEQMDLLLSDESGFNIQLENGKYIIPFRPILREGDDITFITDGRLGIPFAQKYLELMSDKTLYNENKLSACAGVAIIKTKYPFFRGYNLTEELCQSAKREARENKGTSWLDFHISYGGFSGTLEGIRKNKYTTSSGQLHFGPYLVASSDISNEKNIFHLKRGIKTFKNKEEWPRSKVKEFREYLTLGKSASQQFIDEARFKGRKLYGFKETSKTYNINVWQDGFTPYFDMIELMDLIPEYFLAETRQVK >NC_019954.2|WP_015294800.1|135865_136525_+|hypothetical-protein MSEYKITIKLESNCMLGAGEGWGSVIDADIVFDNVGLPYLPARRLKGCLRESAKEVLEMMECAGIKKFESQIIDKVFGCSGDATGAGIVFNNLYLPNYKDVYDWCKWALQECNSAVSPEIIVNSFTSIKQQTSINNEGIADDKSLRTFRVLKRGIEFEGAVNIKEEDKEAVDLLALACLNLRYIGTMRNRGYGKIVCRFKKGNEDLSQSCIEQIEREAI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019954_2 | 131275-132509 | TypeI |
NA
Consensus repeat of NC_019954_2
|
18 spacers
spacers of NC_019954_2
>2.1|131305|37|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATTTTCTTTTTTTTATGCATCATAGACACTTCAAGT >2.2|131372|37|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGGAAAATACAGGTAAGGAATTGTTTATAAATGCGAA >2.3|131439|36|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCACCAGGAACAAAATCAATTTCAGCAATCGATGAA >2.4|131505|37|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACGATATAAAAGTCAAAGATACTGATGTCATAGTGG >2.5|131572|38|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTCTTTCAGCAAATCTACGGGCTATCCTCTTGGCGTA >2.6|131640|37|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTGCTGAGCCGCTAAATGTGATTGTGCTGTTTACTTT >2.7|131707|37|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTGTTCCGTATCCTTTTTGCCATAAACCAGTTTTGT >2.8|131774|35|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTGCTTCTTCAACACCTTTTTCAATTCCAGTGTG >2.9|131839|39|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTAGATAGAAACCCATACTTAGATAGAAGCCTTCTTAAC >2.10|131908|38|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACCAATGCAGTTAAATAAACTTTTTAATGATCTACTAA >2.11|131976|37|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTAATTATGGGGCCTTTTATTATCCTAACGTCAAGAG >2.12|132043|37|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATTTTATGCAGAAGAGGATGGATTAGACTTTGAAGA >2.13|132110|38|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTTCTCTCCGTTGTCTTTGTTTCGCTGTCTCCCTCTC >2.14|132178|36|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTCCAATCGGTCTTTACCTCCACCATTTGAAACCTC >2.15|132244|36|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCATCATGGTTATCCAGCTTATTAACGAGCTGGGCC >2.16|132310|36|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATCATCAGCCGCCGCTCCTTCCGCCGGTATGAATT >2.17|132376|36|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGGTATGATTTTCAGGGTGTTGGTGGTAGAACAG >2.18|132442|38|NC_019954|CRISPRCasFinder,CRT AAATATTCTTTTTTAAGGCATCGCATATCCTCAAGCAA |
cas2,cas3,cas5,cas7b,csx1,cas10,csm3gr7,csx10gr5,csx19,csx20 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019954_2
The CRISPR arrays of NC_019954_2 >merge|NC_019954|2|131275-132509|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTATTTTCTTTTTTTTATGCATCATAGACACTTCAAGTATTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGGGAAAATACAGGTAAGGAATTGTTTATAAATGCGAAGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTCACCAGGAACAAAATCAATTTCAGCAATCGATGAAGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAACGATATAAAAGTCAAAGATACTGATGTCATAGTGGGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTCTCTTTCAGCAAATCTACGGGCTATCCTCTTGGCGTAGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGTGCTGAGCCGCTAAATGTGATTGTGCTGTTTACTTTGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTCTGTTCCGTATCCTTTTTGCCATAAACCAGTTTTGTGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATTGCTTCTTCAACACCTTTTTCAATTCCAGTGTGGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGTAGATAGAAACCCATACTTAGATAGAAGCCTTCTTAACGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACACCAATGCAGTTAAATAAACTTTTTAATGATCTACTAAGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGTAATTATGGGGCCTTTTATTATCCTAACGTCAAGAGGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCATTTTATGCAGAAGAGGATGGATTAGACTTTGAAGAGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTCTTCTCTCCGTTGTCTTTGTTTCGCTGTCTCCCTCTCGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGTCCAATCGGTCTTTACCTCCACCATTTGAAACCTCGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTCATCATGGTTATCCAGCTTATTAACGAGCTGGGCCGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTATCATCAGCCGCCGCTCCTTCCGCCGGTATGAATTGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTTGGTATGATTTTCAGGGTGTTGGTGGTAGAACAGGTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAACAAATATTCTTTTTTAAGGCATCGCATATCCTCAAGCAAGTTGTTAACATACCTATAAAGGCTTGAAAT >NC_019954|2|1|131275-132441|PILER-CR GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TATTTTCTTTTTTTTATGCATCATAGACACTTCAAGT ATTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GGGAAAATACAGGTAAGGAATTGTTTATAAATGCGAA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCACCAGGAACAAAATCAATTTCAGCAATCGATGAA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AACGATATAAAAGTCAAAGATACTGATGTCATAGTGG GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCTCTTTCAGCAAATCTACGGGCTATCCTCTTGGCGTA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GTGCTGAGCCGCTAAATGTGATTGTGCTGTTTACTTT GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCTGTTCCGTATCCTTTTTGCCATAAACCAGTTTTGT GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATTGCTTCTTCAACACCTTTTTCAATTCCAGTGTG GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GTAGATAGAAACCCATACTTAGATAGAAGCCTTCTTAAC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ACCAATGCAGTTAAATAAACTTTTTAATGATCTACTAA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GTAATTATGGGGCCTTTTATTATCCTAACGTCAAGAG GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CATTTTATGCAGAAGAGGATGGATTAGACTTTGAAGA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCTTCTCTCCGTTGTCTTTGTTTCGCTGTCTCCCTCTC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GTCCAATCGGTCTTTACCTCCACCATTTGAAACCTC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCATCATGGTTATCCAGCTTATTAACGAGCTGGGCC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TATCATCAGCCGCCGCTCCTTCCGCCGGTATGAATT GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTGGTATGATTTTCAGGGTGTTGGTGGTAGAACAG GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC >NC_019954|2|2|131275-132509|CRISPRCasFinder GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TATTTTCTTTTTTTTATGCATCATAGACACTTCAAGT ATTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GGGAAAATACAGGTAAGGAATTGTTTATAAATGCGAA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCACCAGGAACAAAATCAATTTCAGCAATCGATGAA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AACGATATAAAAGTCAAAGATACTGATGTCATAGTGG GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCTCTTTCAGCAAATCTACGGGCTATCCTCTTGGCGTA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GTGCTGAGCCGCTAAATGTGATTGTGCTGTTTACTTT GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCTGTTCCGTATCCTTTTTGCCATAAACCAGTTTTGT GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATTGCTTCTTCAACACCTTTTTCAATTCCAGTGTG GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GTAGATAGAAACCCATACTTAGATAGAAGCCTTCTTAAC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ACCAATGCAGTTAAATAAACTTTTTAATGATCTACTAA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GTAATTATGGGGCCTTTTATTATCCTAACGTCAAGAG GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CATTTTATGCAGAAGAGGATGGATTAGACTTTGAAGA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCTTCTCTCCGTTGTCTTTGTTTCGCTGTCTCCCTCTC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GTCCAATCGGTCTTTACCTCCACCATTTGAAACCTC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCATCATGGTTATCCAGCTTATTAACGAGCTGGGCC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TATCATCAGCCGCCGCTCCTTCCGCCGGTATGAATT GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTGGTATGATTTTCAGGGTGTTGGTGGTAGAACAG GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC AAATATTCTTTTTTAAGGCATCGCATATCCTCAAGCAA GTTGTTAACATACCTATAAAGGCTTGAAAT >NC_019954|2|1|131275-132509|CRT GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TATTTTCTTTTTTTTATGCATCATAGACACTTCAAGT ATTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GGGAAAATACAGGTAAGGAATTGTTTATAAATGCGAA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCACCAGGAACAAAATCAATTTCAGCAATCGATGAA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AACGATATAAAAGTCAAAGATACTGATGTCATAGTGG GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCTCTTTCAGCAAATCTACGGGCTATCCTCTTGGCGTA 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>NC_019954.2|WP_023211308.1|130000_130957_+|ATP-grasp-domain-containing-protein MKIAILIDEPRVSYLPGEEGLNEDLQKRKTVKNLKEVLSKRFECSLVKADSDIISKLQNENVSLVFNLCNGIRGETRQAQIPAILEFSGIPYTGSSILGHTLAINKNYACKVFKGSGVTTPEFISIYDKDDLMQLRNKEIKFPVLVKPCDEGSGRGIHQDSLVYDFRSLKRKVQQELRLYNPPIMVTEYIKGREFTVGILGNGNNLKVLPILEISFEALPDDLAKFYSFEVKANYADKTIFRCPAPLDNKLKTKIENTAKKAYNALSLRDYARVDVRVKDDTPYVLEVNSLPGLQKGYSDITKMASACNLAMKALSLK >NC_019954.2|WP_013777252.1|128442_128754_+|DUF4387-domain-containing-protein MGIPITEVAEVIRSKNSGPYELTMDIIFKDFDSYENVKQKNIINKKLISSLYQIPEEDIISIINFDPAKAIKITIKRPLVAGAVGESDVYGAQQHAPLLGIEV >NC_019954.2|WP_013777251.1|127070_128441_+|acyclic-terpene-utilization-AtuA-family-protein MEELKVLSPTAILGYGFPEESFQRGLEQHPDFIAVDAGSTDPGPYYLGAGVSFTDRQAVKRDLKLMLKAGKKLKIPVLVGTAGGSGANEHLYWTEDIIKEIAREENLELKVAVIEAQIPKEEILKKYEEGKIEPLAPAGELSREDIEETTRIVAQMGVEPIIDALENDVDLVLAGRAFDPTAFAAPCIKAGFPKGLALHMGKILECASIAATPGSGSDCMMGTLRHDCFILEALNPKRKCTVTSIAAHTLYEKDDPYRLHGPGGIINLEETEFTQIDERRVKVSGSKFIPSEEYTIKLEGAKKTGYRTISIAGTRDPIMINQIDDILEAVKDMAKNNFSNIKSDDYQILFALYGKDGVMGKLEPLKDKPSHEIGIIIEVVAKTQEMANTICSFTRSSLLHYGYPGRIATAGNLALRYSPSDIEAGEVYEFSIYHLLAVEDPKEYFPITVKTIKGSE >NC_019954.2|WP_013777249.1|124336_125791_+|methylaspartate-mutase-subunit-E MEVQNKKWDMKKFSEMRQEVLNQWPTGKEVDFEEAVRYHQNLPKNQIMTNKLREAATKNNTLIQPRAGVALLDEHIELLKFLRQKGKADVLPTTIDSYTRQNRYEEAEKGIKESEKAGRSLLNGFPAVNYGVKKCRKVIESVDCPVQVRHGTPDARLLAEITLAGGFTDFEGGGISYNVPYAKKISIEQSIYYWQYVDRLVGIYEENGISLNREPFGPLTGTLVPPCISHSIGIIEGLLAAEQGVRNITLGYGQCGNLIQDVAAVETLKELSAEYLKDYDVMLTTAFHQWMGGFPQDEAQAFGVISWGAATAALSKATKVIVKTPHEAFGVPTKEANAEGLRATRQVINMLKDQRMISSQELEKEKEIIKRETRQILSKVYELGEGDWAKGAVRAFEAGVLDVPFAPSQFNAGKILPARDNSGAVRFLNFGSIPFDDKIKEFHRRKLAERAKAENREVSFQMVIDDIYAIGQGMLVGRMDSKIA >NC_019954.2|WP_013777248.1|122922_124317_+|glutamate-mutase-L MELALLIDIGSTYTKVTAVDLETVELKARAQAATTVAEDVNIGINKALEELKAMGIDPAKAKHKLACSSAAGGLKMVAVGLVPELTTEAAKRAALGAGAKVGHVFCYELTDDELNQIARYSPDIILLAGGTDGGNKDVIIHNAEKLAELKVDAPIIVAGNKTAASAAEKALRAASKEVYVTENVMPKLECLNIEPAKKIIREVFLSKIIYAKGLSKVSNYVDSPIIPTPSAVMKAAELLAKGSDNEAGYGEVMIVDIGGATTDVDSAATGEPTKAGVTLRGLEEPFIKRTVEGDLGMRYSALALVEEVGIKNMLKNYLPCGMDEKTLQEYVKKISIDTDYVPCNETDKQIDCGIAKAATDLAVKRHVGRIETVYSPFGAAYVQHGKDLTKLDFMIATGGVLIYSENPKEILRHGLYDSSRPEVLAPENPKMLLDEKYLLSSLGLLSEIAPDKALNLAKKYLKEL >NC_019954.2|WP_013777247.1|122469_122892_+|methylaspartate-mutase-subunit-S MKYDDKKTIVLGVIGSDVHSVGIRILDEAFSEAGFNVVNIGVLSSQEDFINAAIETDADAILVSSLYGHGELDCKGFKEKCVEAGLGDVILYVGGNLVVGKQDWPATEKKFLDMGFDRVYPPGTLPEIPINDLKNDLGIK >NC_019954.2|WP_013777246.1|121829_122093_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFIILVYDVGEKRVAKVLKICRKYLTWVQNSVLEGEISAANFKKLKLELKRVIDEDEDSVIFYILRTTKYSERQSMGIKKGGDELFI >NC_019954.2|WP_013777245.1|118780_121270_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MQYLAHYDKGKQEKQFLNEHLTSVATLAKTRVLPCVVFDDLDSSKIEEICYWTGYFHDLGKYSIYFQDYLQKGISSPLKNHAHISACFAYSYLSNKATSRFDSDKTLLFFIYTCIRLHHTSLKCKGLFNYGIWEDLIPISKNISDKSNEIIKDLGLAQDMSDEEFRALIDIEKFKANAFSLERIPLMFNNSRISNPKWYFLLIYLFSMLIDTDKLDSANIKSEKISTVPPENVTSYIFSKHGKKSDTELINNREKARKSMIEVVESLSNDALKNVRFFTITAPTGIGKTLSSLQCALDLQQKIAETEGYTPRIITAIPFINIIEQNKLEYENVMGKECKIAVHHRLSDFGVAKSKDETIPVDRVLLETESWEADVILTTFVQLFQSLFSSTNKMLKKINKLAGSIVILDEIQAIPEKYMPLIGASLQMIAKYYGTRFILMTATQPKILQFGSMLLQYTEKNSKQIESIELLPNHEEYFKCLTRTKFVPLLENVLDTEDFLDVFFNKWDYTKSCLIVVNTIKRSIDVYKKIKEELALRGFKLPVYYLSTNIIPLKRRDVIQEVKDLLESEQPVILVSTQTIEAGVDLDFDMAFRDFAPLDSLVQTAGRVNRQGKKGNYSPVYIIQLENDSHYIYDLSLREVTINLLKELLTAQEEIKETDYVSLTKRYYDLILKEGVDDASKRIWNDGILKLDFDKLEEFKLIESPGEVYDVFIEKELSATNLADAYEQVLGYKDSFDYDLSKIFPDFKSDQFEKTLNVFQRKALLRLIMAKMHDYIIQVRVSRLKENRPVEFKERGNIESSLYWVPPTKCDDYYDEDTGFKDESGDGFI >NC_019954.2|WP_013777244.1|117962_118727_+|CRISPR-associated-protein-Cas5 MKVISFHLKGKMAHFRKFYSNASALSYFVPPRTTICGIIAGLLGLERDGYYDDFSLDNCKITITSCSPLKKTMQKLNYLMIKSVQDLNGSQENHSQTATELVIPQDIRSGYIDYKIWFHHCDNKIMSDVESIINDCSPFYESKWSCVALGSAFNLGWIEKGEILEAEEKFVKSKKLVSSSIPIHNIEEIKVDEINTNKVYKLIKEEVPLEFDQQRRITKEGLKEILINVNGDYIPAVVDSFVSLDNGEVITWLE >NC_019954.2|WP_013777243.1|116907_117960_+|type-I-CRISPR-associated-protein-Cas7 MLINQNSDFLFGFQATMSNPNGDPDQENKPRMDYETSTALVSDARRKRDVRDFLKNKGYKIFVDTLADQKVPMDKMLEYITDTFLENSGNIELLFKENPNLKVQWEKVFGTTENPNKEYNEKKEKLKKNKDFIRLNNIFLTEIIKKELIDIRLFGSAMAVEGVSKTFTGPVQLNWGYSLHPVELIKSNTITSIMNEDNSTFGKKYKLYYALMAHYGTINKYNAKLTGMTEKDRELFRKALGQSLMANQTDSKQGQEPIFYLEILYAPEFDGYLGDLRRFLNVEYATYAIRSLDDIKVDFSRLNDAINNVKNKGYIDKVIGWVNPFIPNESFMNLPEFENIDLLAPIKTEE >NC_019954.2|WP_013777255.1|132919_134299_+|hypothetical-protein MDIFTSFTDLVLLVGTNPLPNYIVIKYFLKHNEKLKRIWLIYSEETNVQAGTEELAENITSVIKKEFLSNKPDLKFKHMPLSDVGSASTILDELQRNMKIEVSSPNIFHLNYTGGTKSMAVQTYKYFLENFGKRCTFSYLDGRDFKLKGDQSSAHVTKDLRYEIGISVESLFELHGYEKKGGQNNPSYPDTVKKFEEIIRLGKLNEYLSWKKSTIREFFYEGSNCIKKKNRFLTHNNIYSDEDVKRFKQNFKDKMTDEIILELLKSIPKENSILDENGDIWVPDKSTTNKEYKERVGDSVENFLDGKWLEVYVYNVICQKIKQNEKLNELYKKGQLIIDNNYEIKKKNTEKKHFEIDVILLNGYQVCGISCTTASDDSTCKNKGFEIIHRARQMGGEEAKSILIACLEDKESRSIEDFYEDLKDTSGSRTHEFMVLGLKDLTPEKLWEKIYEHIWGADL >NC_019954.2|WP_013777256.1|134295_135864_+|hypothetical-protein MSKVTAILADTVSIQKYVYSSNRLKENIGASSIIANIYKESLANTLEKTLEHGVSLDEWEKQPETIAIKNSNTDFEVGYIGGGNALLFFNNEATAKEFISEWTRSLLLEAPSLNVAFAISEFNIDNFQNEMKNLFKQLEINKSKYFPQTFLPKHGITADCPYSGLSAEVYKPGTNDEKGAYISSASYVKYKHIDIDDAKVEVERISNGKFSLTTNIEKLGQTKGQNHIAIVHIDGNSMAEHFKSCENLVAIRKLSKRLKDIMQSVYEEFLNYIFEQMDLLLSDESGFNIQLENGKYIIPFRPILREGDDITFITDGRLGIPFAQKYLELMSDKTLYNENKLSACAGVAIIKTKYPFFRGYNLTEELCQSAKREARENKGTSWLDFHISYGGFSGTLEGIRKNKYTTSSGQLHFGPYLVASSDISNEKNIFHLKRGIKTFKNKEEWPRSKVKEFREYLTLGKSASQQFIDEARFKGRKLYGFKETSKTYNINVWQDGFTPYFDMIELMDLIPEYFLAETRQVK >NC_019954.2|WP_015294800.1|135865_136525_+|hypothetical-protein MSEYKITIKLESNCMLGAGEGWGSVIDADIVFDNVGLPYLPARRLKGCLRESAKEVLEMMECAGIKKFESQIIDKVFGCSGDATGAGIVFNNLYLPNYKDVYDWCKWALQECNSAVSPEIIVNSFTSIKQQTSINNEGIADDKSLRTFRVLKRGIEFEGAVNIKEEDKEAVDLLALACLNLRYIGTMRNRGYGKIVCRFKKGNEDLSQSCIEQIEREAI >NC_019954.2|WP_023211309.1|136525_138082_+|hypothetical-protein MAYLKITINLLSPIILSADVPDNNLTETFDYIPASSLIGLFAAKYISQEHLEYAHNNTNFYKWFLKGDLVFTNAYISEKDDYDEIDMLPTPLCIKKQKKGERILNILLNTEDEQTVFISPYSYIERSTIKTGELAKKINFHHMRDRLRGHTKDEAMFNYEALMPGQIFKGEIYGDSTTLREFRKTFGEKIIGRLGKSRNTEYGEVEISLSKIINEDIDALTDEDLEDEDYILLTFISPCILVNENGFPDPSLPNLKCYLENIWGKDSFEIENCVMRTTSIENYISVWKMKRPIETAISAGSTVKLVFKNNLPFENIKNGFEKMANDGIGERRNEGFGRIKLNMATAEEYYKKTIKPNQNKPESKVPQGAKQIFENVIQNMFKEEFERKAYEDAAGFSCLPSNSLLGKLGLILSKCQKEEEFKKSIDELRNNAKSQLEDCRNKTKRCNLYEYIKNFDTTKIIESIYNDITKADYLKLTKISEYNVKDEKELLLELWKIYFGVFFRRMRQRQKVAKKEVL >NC_019954.2|WP_013777257.1|138081_139467_+|hypothetical-protein MDNAKVTGRFLIRGKLDLESPLLIGTGEKGYIDISVQKDDNGIPYIPASSMRGVLRHYFFNNLTIQGTDKTQIEYFWGSSKNQDDKDTYQSSFILEDLYALNKPNIVVRDGIKIDNKRGIAEDEKKFDYEVVEPGAEFGFNAEVVLRECFSKEMFLKIISTLISALENGQISLGSMTTKGFGRCRLSECKVYEYDFTQGTNKTKDVILWLKGESTEEQLITLDLNEIFLPKKNKFSLKATFNIRNSLIVKAYTGMPKEPDSIHIISAGKDILPGTSLKGALRARAVKIINTLEGQSDELVKELFGWASDEASDKNKKIKSRLILDEAYIQNSVKETQFRTKIDRFTGGVIKTALFDSTPVWSGKDNAKVTINIEINDCKNWEAGLVMLLLKDLWTGDLAAGGEKNIGRGTFEGQSAEIYFNGNHYIIEQRGDKLRVNCGKDELENLVSAFVEKCKSGRAGV >NC_019954.2|WP_013777258.1|139463_140021_+|TIGR03984-family-CRISPR-associated-protein MNGLKLANIKSTSKPMELNIASWQDLQKNINENFKEKSYAVVYLDYKVLIGKINEKNLKFYNDEVFDPKFIVKMRVFNEEKELLLWRRDEYKFEGRMRLDNEGDNIQYFVEVDQVLWGNPKSINNEWTVLKEARGTEIYIPYLYKPEYSSSKRLAIRTRNYVGYNEIGQAGYTDCRFVSFCEGGK >NC_019954.2|WP_013777259.1|140023_141640_+|TIGR03986-family-CRISPR-associated-RAMP-protein MEKAKLINIRKSKKGKLIGEVQFEDGKTMSIPPGAKLNVSLNNIECSIERNSGAITNITIDEKVIFSKASNSDPVSQKINKKHYTNKTTKQASNKAAQPSKAHAPYNFIPLNDTVIEGQPIPDFDCYHSEHAGLKRFNGYIECQLESITPIYIRDTYTTEEIIKKEESNEDNPDFFSPGGIARIPGSSLRGMIRTMVEIMSWGKFGFYEDKRLFYRGLADKSNLRLEYQNNMSSYDRNTRKSSYKYTIGDHIPENLKRKELIDIPESIFGKISEKQSFASRVFFEDATLMPGQNDIFVSDEPLTPKILSSPKPTTFQHYLEQPSDVTVKNLNHWNTKEAKIRGYKLYWHKDGLGWEYEGNDEEKAKNKRILTKIKPIKPGIKFKYRIRFENLSQEEIGAILFAIDLPENCYHKIGMGKPLGLGTIKIRPALFLINRESRYTNLFENENWNLGVEESNIQKFKDAFEQYVLNQVNKLENSDLSSLWNHERMKHLKVILDFENTKLKGWKQETDYMELKEFKNRPVLSKPLEVYNKFTTN >NC_019954.2|WP_013777260.1|141877_142273_+|hypothetical-protein MRQAFLLFSHQLTKSQQDELENKFKVDKIIYLPSDLQSIWSNVPPELPSIKDYLEEIFCWLKEHSKPNDIVLVQGEFGAVFLTANFCIKEGLVPIYSTTRRDVAETILDDETIQTKRNFIHVRFREFEKWD >NC_019954.2|WP_013777261.1|143220_143619_+|hypothetical-protein MKKYCIIILIVCMMLVLTACGNPNSEVVGEYDTSKLGGDFVKSSNEAYAIGANKDKMPVFKDTDKAFKQALIDYAEGFKAIQKEFNLKPINKKNWEAYKTYGWQLSADNDEEIRKQGREITQFFDIYENSFK >NC_019954.2|WP_013777262.1|143808_144111_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MNIGHRIKQIRIAKGLQGIQLAEKVGITNVYLSYLENGTKIPSIETLQKICDALGITLSEFFMDENANLPPEYQELIENVKVLSPKQLELLNEFLKTLRQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019954_3 | 142529-143157 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_019954_3
|
9 spacers
spacers of NC_019954_3
>3.1|142559|36|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGACTTAAAGTTCATCCCATCGCTGTCGCAATGTG >3.2|142625|37|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACGACATGAACCAACCAGCAGAGATAACAGATACACA >3.3|142692|38|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGTTATTATAAGGCTATTATGTTCTTTACATCTATA >3.4|142760|38|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGGAAGCAAGAGAACCAATTACAATAACATTCAAAGGA >3.5|142828|37|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTGCAACAGTGTGGGAACCAAAAAGGAACTTTAGTG >3.6|142895|37|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTTTACGTAGGCCGTTGTAATCCCTAATGATAGC >3.7|142962|36|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCCCAACCGCCCCAGGATCTTTCCCGCCATGCTAA >3.8|143028|35|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTCTTGTGATGATCTTGATACATTGTAGTTAGGG >3.9|143093|35|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGTCTCCAAATTCGTTGTATTCTAGACCTATACTG |
csx20,csm3gr7,csx19,csx10gr5,cas10,csx1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019954_3
The CRISPR arrays of NC_019954_3 >merge|NC_019954|3|142529-143157|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAACTGGACTTAAAGTTCATCCCATCGCTGTCGCAATGTGGTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAACACGACATGAACCAACCAGCAGAGATAACAGATACACAGTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAACTTTGTTATTATAAGGCTATTATGTTCTTTACATCTATAGTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAACCGGAAGCAAGAGAACCAATTACAATAACATTCAAAGGAGTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAACCTTGCAACAGTGTGGGAACCAAAAAGGAACTTTAGTGGTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAACTTTTTTTACGTAGGCCGTTGTAATCCCTAATGATAGCGTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAACTTCCCAACCGCCCCAGGATCTTTCCCGCCATGCTAAGTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAACTTTCTTGTGATGATCTTGATACATTGTAGTTAGGGGTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAACCGTCTCCAAATTCGTTGTATTCTAGACCTATACTGGTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAACT >NC_019954|3|2|142529-143157|PILER-CR GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC TGGACTTAAAGTTCATCCCATCGCTGTCGCAATGTG GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC ACGACATGAACCAACCAGCAGAGATAACAGATACACA GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC TTTGTTATTATAAGGCTATTATGTTCTTTACATCTATA GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC CGGAAGCAAGAGAACCAATTACAATAACATTCAAAGGA GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC CTTGCAACAGTGTGGGAACCAAAAAGGAACTTTAGTG GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC TTTTTTTACGTAGGCCGTTGTAATCCCTAATGATAGC GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC TTCCCAACCGCCCCAGGATCTTTCCCGCCATGCTAA GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC TTTCTTGTGATGATCTTGATACATTGTAGTTAGGG GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC CGTCTCCAAATTCGTTGTATTCTAGACCTATACTG GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAACT >NC_019954|3|3|142529-143157|CRISPRCasFinder GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC TGGACTTAAAGTTCATCCCATCGCTGTCGCAATGTG GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC ACGACATGAACCAACCAGCAGAGATAACAGATACACA GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC TTTGTTATTATAAGGCTATTATGTTCTTTACATCTATA GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC CGGAAGCAAGAGAACCAATTACAATAACATTCAAAGGA GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC CTTGCAACAGTGTGGGAACCAAAAAGGAACTTTAGTG GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC TTTTTTTACGTAGGCCGTTGTAATCCCTAATGATAGC GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC TTCCCAACCGCCCCAGGATCTTTCCCGCCATGCTAA GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC TTTCTTGTGATGATCTTGATACATTGTAGTTAGGG GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC CGTCTCCAAATTCGTTGTATTCTAGACCTATACTG GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAACT >NC_019954|3|2|142529-143157|CRT GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC TGGACTTAAAGTTCATCCCATCGCTGTCGCAATGTG GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC ACGACATGAACCAACCAGCAGAGATAACAGATACACA GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC TTTGTTATTATAAGGCTATTATGTTCTTTACATCTATA GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC CGGAAGCAAGAGAACCAATTACAATAACATTCAAAGGA GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC CTTGCAACAGTGTGGGAACCAAAAAGGAACTTTAGTG GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC TTTTTTTACGTAGGCCGTTGTAATCCCTAATGATAGC GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC TTCCCAACCGCCCCAGGATCTTTCCCGCCATGCTAA GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC TTTCTTGTGATGATCTTGATACATTGTAGTTAGGG GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC CGTCTCCAAATTCGTTGTATTCTAGACCTATACTG GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAACT
>NC_019954.2|WP_013777260.1|141877_142273_+|hypothetical-protein MRQAFLLFSHQLTKSQQDELENKFKVDKIIYLPSDLQSIWSNVPPELPSIKDYLEEIFCWLKEHSKPNDIVLVQGEFGAVFLTANFCIKEGLVPIYSTTRRDVAETILDDETIQTKRNFIHVRFREFEKWD >NC_019954.2|WP_013777259.1|140023_141640_+|TIGR03986-family-CRISPR-associated-RAMP-protein MEKAKLINIRKSKKGKLIGEVQFEDGKTMSIPPGAKLNVSLNNIECSIERNSGAITNITIDEKVIFSKASNSDPVSQKINKKHYTNKTTKQASNKAAQPSKAHAPYNFIPLNDTVIEGQPIPDFDCYHSEHAGLKRFNGYIECQLESITPIYIRDTYTTEEIIKKEESNEDNPDFFSPGGIARIPGSSLRGMIRTMVEIMSWGKFGFYEDKRLFYRGLADKSNLRLEYQNNMSSYDRNTRKSSYKYTIGDHIPENLKRKELIDIPESIFGKISEKQSFASRVFFEDATLMPGQNDIFVSDEPLTPKILSSPKPTTFQHYLEQPSDVTVKNLNHWNTKEAKIRGYKLYWHKDGLGWEYEGNDEEKAKNKRILTKIKPIKPGIKFKYRIRFENLSQEEIGAILFAIDLPENCYHKIGMGKPLGLGTIKIRPALFLINRESRYTNLFENENWNLGVEESNIQKFKDAFEQYVLNQVNKLENSDLSSLWNHERMKHLKVILDFENTKLKGWKQETDYMELKEFKNRPVLSKPLEVYNKFTTN >NC_019954.2|WP_013777258.1|139463_140021_+|TIGR03984-family-CRISPR-associated-protein MNGLKLANIKSTSKPMELNIASWQDLQKNINENFKEKSYAVVYLDYKVLIGKINEKNLKFYNDEVFDPKFIVKMRVFNEEKELLLWRRDEYKFEGRMRLDNEGDNIQYFVEVDQVLWGNPKSINNEWTVLKEARGTEIYIPYLYKPEYSSSKRLAIRTRNYVGYNEIGQAGYTDCRFVSFCEGGK >NC_019954.2|WP_013777257.1|138081_139467_+|hypothetical-protein MDNAKVTGRFLIRGKLDLESPLLIGTGEKGYIDISVQKDDNGIPYIPASSMRGVLRHYFFNNLTIQGTDKTQIEYFWGSSKNQDDKDTYQSSFILEDLYALNKPNIVVRDGIKIDNKRGIAEDEKKFDYEVVEPGAEFGFNAEVVLRECFSKEMFLKIISTLISALENGQISLGSMTTKGFGRCRLSECKVYEYDFTQGTNKTKDVILWLKGESTEEQLITLDLNEIFLPKKNKFSLKATFNIRNSLIVKAYTGMPKEPDSIHIISAGKDILPGTSLKGALRARAVKIINTLEGQSDELVKELFGWASDEASDKNKKIKSRLILDEAYIQNSVKETQFRTKIDRFTGGVIKTALFDSTPVWSGKDNAKVTINIEINDCKNWEAGLVMLLLKDLWTGDLAAGGEKNIGRGTFEGQSAEIYFNGNHYIIEQRGDKLRVNCGKDELENLVSAFVEKCKSGRAGV >NC_019954.2|WP_023211309.1|136525_138082_+|hypothetical-protein MAYLKITINLLSPIILSADVPDNNLTETFDYIPASSLIGLFAAKYISQEHLEYAHNNTNFYKWFLKGDLVFTNAYISEKDDYDEIDMLPTPLCIKKQKKGERILNILLNTEDEQTVFISPYSYIERSTIKTGELAKKINFHHMRDRLRGHTKDEAMFNYEALMPGQIFKGEIYGDSTTLREFRKTFGEKIIGRLGKSRNTEYGEVEISLSKIINEDIDALTDEDLEDEDYILLTFISPCILVNENGFPDPSLPNLKCYLENIWGKDSFEIENCVMRTTSIENYISVWKMKRPIETAISAGSTVKLVFKNNLPFENIKNGFEKMANDGIGERRNEGFGRIKLNMATAEEYYKKTIKPNQNKPESKVPQGAKQIFENVIQNMFKEEFERKAYEDAAGFSCLPSNSLLGKLGLILSKCQKEEEFKKSIDELRNNAKSQLEDCRNKTKRCNLYEYIKNFDTTKIIESIYNDITKADYLKLTKISEYNVKDEKELLLELWKIYFGVFFRRMRQRQKVAKKEVL >NC_019954.2|WP_015294800.1|135865_136525_+|hypothetical-protein MSEYKITIKLESNCMLGAGEGWGSVIDADIVFDNVGLPYLPARRLKGCLRESAKEVLEMMECAGIKKFESQIIDKVFGCSGDATGAGIVFNNLYLPNYKDVYDWCKWALQECNSAVSPEIIVNSFTSIKQQTSINNEGIADDKSLRTFRVLKRGIEFEGAVNIKEEDKEAVDLLALACLNLRYIGTMRNRGYGKIVCRFKKGNEDLSQSCIEQIEREAI >NC_019954.2|WP_013777256.1|134295_135864_+|hypothetical-protein MSKVTAILADTVSIQKYVYSSNRLKENIGASSIIANIYKESLANTLEKTLEHGVSLDEWEKQPETIAIKNSNTDFEVGYIGGGNALLFFNNEATAKEFISEWTRSLLLEAPSLNVAFAISEFNIDNFQNEMKNLFKQLEINKSKYFPQTFLPKHGITADCPYSGLSAEVYKPGTNDEKGAYISSASYVKYKHIDIDDAKVEVERISNGKFSLTTNIEKLGQTKGQNHIAIVHIDGNSMAEHFKSCENLVAIRKLSKRLKDIMQSVYEEFLNYIFEQMDLLLSDESGFNIQLENGKYIIPFRPILREGDDITFITDGRLGIPFAQKYLELMSDKTLYNENKLSACAGVAIIKTKYPFFRGYNLTEELCQSAKREARENKGTSWLDFHISYGGFSGTLEGIRKNKYTTSSGQLHFGPYLVASSDISNEKNIFHLKRGIKTFKNKEEWPRSKVKEFREYLTLGKSASQQFIDEARFKGRKLYGFKETSKTYNINVWQDGFTPYFDMIELMDLIPEYFLAETRQVK >NC_019954.2|WP_013777255.1|132919_134299_+|hypothetical-protein MDIFTSFTDLVLLVGTNPLPNYIVIKYFLKHNEKLKRIWLIYSEETNVQAGTEELAENITSVIKKEFLSNKPDLKFKHMPLSDVGSASTILDELQRNMKIEVSSPNIFHLNYTGGTKSMAVQTYKYFLENFGKRCTFSYLDGRDFKLKGDQSSAHVTKDLRYEIGISVESLFELHGYEKKGGQNNPSYPDTVKKFEEIIRLGKLNEYLSWKKSTIREFFYEGSNCIKKKNRFLTHNNIYSDEDVKRFKQNFKDKMTDEIILELLKSIPKENSILDENGDIWVPDKSTTNKEYKERVGDSVENFLDGKWLEVYVYNVICQKIKQNEKLNELYKKGQLIIDNNYEIKKKNTEKKHFEIDVILLNGYQVCGISCTTASDDSTCKNKGFEIIHRARQMGGEEAKSILIACLEDKESRSIEDFYEDLKDTSGSRTHEFMVLGLKDLTPEKLWEKIYEHIWGADL >NC_019954.2|WP_023211308.1|130000_130957_+|ATP-grasp-domain-containing-protein MKIAILIDEPRVSYLPGEEGLNEDLQKRKTVKNLKEVLSKRFECSLVKADSDIISKLQNENVSLVFNLCNGIRGETRQAQIPAILEFSGIPYTGSSILGHTLAINKNYACKVFKGSGVTTPEFISIYDKDDLMQLRNKEIKFPVLVKPCDEGSGRGIHQDSLVYDFRSLKRKVQQELRLYNPPIMVTEYIKGREFTVGILGNGNNLKVLPILEISFEALPDDLAKFYSFEVKANYADKTIFRCPAPLDNKLKTKIENTAKKAYNALSLRDYARVDVRVKDDTPYVLEVNSLPGLQKGYSDITKMASACNLAMKALSLK >NC_019954.2|WP_013777252.1|128442_128754_+|DUF4387-domain-containing-protein MGIPITEVAEVIRSKNSGPYELTMDIIFKDFDSYENVKQKNIINKKLISSLYQIPEEDIISIINFDPAKAIKITIKRPLVAGAVGESDVYGAQQHAPLLGIEV >NC_019954.2|WP_013777261.1|143220_143619_+|hypothetical-protein MKKYCIIILIVCMMLVLTACGNPNSEVVGEYDTSKLGGDFVKSSNEAYAIGANKDKMPVFKDTDKAFKQALIDYAEGFKAIQKEFNLKPINKKNWEAYKTYGWQLSADNDEEIRKQGREITQFFDIYENSFK >NC_019954.2|WP_013777262.1|143808_144111_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MNIGHRIKQIRIAKGLQGIQLAEKVGITNVYLSYLENGTKIPSIETLQKICDALGITLSEFFMDENANLPPEYQELIENVKVLSPKQLELLNEFLKTLRQ >NC_019954.2|WP_013777263.1|144379_145669_+|serine-dehydratase-subunit-alpha-family-protein MSNELYQKAIEQVKEEMVPALGVTEPAAIALSAAKAYEVIGGEVKKVTVWVDEGVFKNGFSCAIPGTCEKGNEMAAALGVIAGKPDFGLRVLEDVTEEDVSRAKELIKEGKIEIKVKRGVSDIFIDAIVETDKGKGRAVIKDKHTNIVLVEKDGKEIFKKQLETKTSEGKAFDISRLKLKDLIDIAEHAPYEDISFILEAVRVNDELAQAGKQGEGMELGRGISDLIEEGYLKEDILTYAMAYTGYAVDARMGGVSKPAMSICGSGDHGLVATLPLIAIANKKEIPEEKLVRSILLSYLVTMYIKTFAGRLSAFCGCAVAAGTGSSAGICYLLGGNNEQIGFTIDNMAADITGIICDGGNFGCSLKAVTAASTAILSALLALKNIHIPKDSGIVGNTVEETMQNIGKIASPGMTKTNDVILDIMINRHD >NC_019954.2|WP_013777265.1|148885_150361_+|aldehyde-dehydrogenase MNKPIDKNYQLLIGGRWVDAKDGETFETNNPANGELLATCANAGKEDVDEAVKAAWKAFETWKDVSAQEKSGILLKIADLIDENAEKLAMIETLDNGKPIRETRNIDVPLSSDHFRYFAGAIRAEEGQAVMIDKNTLSIILREPIGVVGQIIPWNFPLLMAAWKLAPALAAGCTVVIKPSSSTPLSILELGKLINDVLPPGVVNIVTGSGATTGNYMLEHPGFRKLAFTGSTEVGYSIAEAAAKKLIPSTLELGGKSANIYFPDCPWEKAIEGVQLGILFNQGQVCCAGSRVFVHEDIYEEFLAECVEAFKKIKVGLPWEEDTIMGTQINEGQLKKILNYIEIGKQEGARLACGGSRITENGLDKGCFMQPTIFADVDNKMRIAQEEIFGPVACFLKFKDEEEVIKMANDSEYGLGGAVWTKDINRALKVARGIETGRMWINDYNNLPAHTPFGGYKKSGIGRETHHMMLDHYTQKKNIMISMNENKAGLY >NC_019954.2|WP_013777266.1|150667_151240_+|manganese-catalase-family-protein MSEDFVDLKGCKTPETYNKCAYPAPYPEIKVARENPYYGKLLLEDYAGRAGELTAVNQYIYHHFVLEPEYEEVAELLSCVALVEMHHMEILADTILKLGVDPRQRTIATNEVEIYWDAGFVYYGTVLCDMITANIAGEWAAISNYRKHQQMINDLYVKKILERIILDEIYHVQLFSQVTEKYCKPNIKKE >NC_019954.2|WP_013777267.1|151588_152620_+|DctP-family-TRAP-transporter-solute-binding-subunit MSKKNLALLLISLLIIGLLAGCGGGQQNGNDAAPSGNQDKGGTITIKVGHVLAPTHPYTLGLQKFAELVDEKTDGKIKVEVFHSSQLGNERDMVEALQLGTQEMTLVSTAPLASFTKQFLVFDLPFVFKDTESARKVLDSELGQGLLNSLESQGIMGLCYFENGFRHVTNSKHPINKPEDLKGIKIRTMENPIHMATFKVMGADPTPMAFGELFTALQQKTIDAQENPLPIIETSKFYEVQEYLSLTGHFYAPAPLLISKSFFEGLAPELQAALKEAAIEARDYERGLLDDMNAKLVEELKEKGMKVNEPDKTLFVEAVQSVYKQFESDITPELIQKVVDAQK >NC_019954.2|WP_013777268.1|152670_153147_+|TRAP-transporter-small-permease MEKVKKIFNNIEEFFVVILLLIMTVVVFWQVVCRFVLKASLPWSEELSRYILVWVTFLGASIGVKRGAHIGVEAFLMLLPKQARKLVNYLISAVCVIFCFIVFKESLSIIEMQIANAQVSPAMQIPMWWAYLAIPVGMVLMSIRFIQVSLKLKSEGEV >NC_019954.2|WP_013777269.1|153149_154430_+|TRAP-transporter-large-permease MSAILFGSFILFAIMGLPIAIVLGLSSVMAISMASNIPLMVVAQRMFTACDSFPLMAIPFFMMAGSLMESGGISRRLINLANKLVGSMTGGLAQVGILTCMFFAAISGSGPATVAAIGSILIPAMIEAGYDAGFAAAIMAAAGAIGVTIPPSIPMVTYGVVGGVSIGSLFMGGFGAGLVVGLSLMAAVYIISKKRGYYGEKERPTFLDILKAVKEAFWAILMPIIILGGIYGGIFTPTEAAAVAVVYGFVIGFFIYRELSVKDLPKIFVNTAVSTSVVMFIISTAQVFGWIMTSQRIPDQIAQAFINFSTSPYVILLLINLLLLVVGCFMETNAAIIILAPIFLPLIVKLGIDPILFGLIMVVNLAIGMITPPLGVNLFVACGICDMTLERISKSVLPFLIAMIVALMLITYIPGITMFLPNLLTK >NC_019954.2|WP_013777270.1|154445_155696_+|DUF2088-domain-containing-protein MDYPVIYRIKQRFDEYKIVNIEQAVQKELEVLKERNAIKPGMNIAVTCGSRGIANISLIIKTTIDYLKDLGARPFVIPAMGSHGGATAEGQTMVLEKLGVTPETMGVPVVSCMDVVKIGETPESVPIYMDKNAYNADGIIVINRVKPHTDFKGNIESGLLKMLAVGLGKHKGCSTIHANGLEDTIPKVARAILEKAHVIFGLAILENSKDETYKLKGLFPQDFEREERLLLKEAKSIVPKLPWDYLDILVVQEMGKTFSGTGMDTKVIGRIRVFGEEEMEKPCINKIVVLDLSDNSYGNALGVGLADITTKTLVDKIDFDVTYANTIPTTYLERGKIPVIMKDDREAIKTAMMTIGNVPLDRLKLAIIPNTLHLEEIYATKAAIEALKDKDKISVLDEGHPLNFDESGSLIVNWRR >NC_019954.2|WP_013777271.1|155698_156079_+|hypothetical-protein MKLMHTSLPEFKLKLQSAVIKQSPNKTFELKGIENLKSAKMQSLRTGRIEFAIQEIAEDKDIDKVEVVVMPRVPETMHTVIVKGIEKDGTCKKAILEVINIIHPTEEAELVDAKEVDDRRPPIGRH |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019954_4 | 147551-148516 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_019954_4
|
14 spacers
spacers of NC_019954_4
>4.1|147581|35|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGCTTCTAAAGGCGGGACTAACAATCAAATACTA >4.2|147646|39|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTAATACATATATGCCTTGGCGGGTCTGGAAAACGGCT >4.3|147715|36|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTTTCGGCTCTGATGGATTTAGCCCCGATGCTCT >4.4|147781|37|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATCGTACACCTTAAAAGGTGTCTTGATAACTTTGAA >4.5|147848|37|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTCTAAAATCGTATTGGCTAAAAAACTAATATTAC >4.6|147915|36|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATATGAATTTATAGATAAAATGGAGCAACAAGGC >4.7|147981|36|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTTTTTAAGTGCCCATGATTTTCCGGTCAGCGGCA >4.8|148047|36|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCTTCTCGTATACATGATGGATAGCGAAAAAAGAA >4.9|148113|36|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGGAAGAAACCTTACAACTTGTGCTAGAAATGCGAT >4.10|148179|38|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTAATAGATAAACTGTATGGAGAGCAAAGCGAAATAT >4.11|148247|38|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGCTATTTAATCTGGCAGTTTTATTCGTTACTGGGTCT >4.12|148315|35|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCGAGTATATCATCTCTCATTTCACTTATGGCTTG >4.13|148380|37|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAGTAGTAACCGGAATAAACTCCTTCCAAAGCTCTC >4.14|148447|40|NC_019954|CRISPRCasFinder ACATAATTTATCCGTTTATCTATATCAACTGTAGCCATGG >4.15|148447|39|NC_019954|CRT ACATAATTTATCCGTTTATCTATATCAACTGTAGCCATG |
csx20,csm3gr7,csx19,csx10gr5,cas10 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019954_4
The CRISPR arrays of NC_019954_4 >merge|NC_019954|4|147551-148516|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATGCTTCTAAAGGCGGGACTAACAATCAAATACTAGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTTAATACATATATGCCTTGGCGGGTCTGGAAAACGGCTGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAATTTTCGGCTCTGATGGATTTAGCCCCGATGCTCTGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTATCGTACACCTTAAAAGGTGTCTTGATAACTTTGAAGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAATTCTAAAATCGTATTGGCTAAAAAACTAATATTACGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAAATATGAATTTATAGATAAAATGGAGCAACAAGGCGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTGTTTTTAAGTGCCCATGATTTTCCGGTCAGCGGCAGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATCTTCTCGTATACATGATGGATAGCGAAAAAAGAAGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGGGAAGAAACCTTACAACTTGTGCTAGAAATGCGATGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGGTAATAGATAAACTGTATGGAGAGCAAAGCGAAATATGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAGCTATTTAATCTGGCAGTTTTATTCGTTACTGGGTCTGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGCGAGTATATCATCTCTCATTTCACTTATGGCTTGGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATAGTAGTAACCGGAATAAACTCCTTCCAAAGCTCTCGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACACATAATTTATCCGTTTATCTATATCAACTGTAGCCATGGTTTATAGCCCTACCTATAAGGAATTGAAAC >NC_019954|4|3|147551-148446|PILER-CR GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGCTTCTAAAGGCGGGACTAACAATCAAATACTA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTAATACATATATGCCTTGGCGGGTCTGGAAAACGGCT GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AATTTTCGGCTCTGATGGATTTAGCCCCGATGCTCT GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TATCGTACACCTTAAAAGGTGTCTTGATAACTTTGAA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AATTCTAAAATCGTATTGGCTAAAAAACTAATATTAC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAATATGAATTTATAGATAAAATGGAGCAACAAGGC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGTTTTTAAGTGCCCATGATTTTCCGGTCAGCGGCA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATCTTCTCGTATACATGATGGATAGCGAAAAAAGAA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GGGAAGAAACCTTACAACTTGTGCTAGAAATGCGAT GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GGTAATAGATAAACTGTATGGAGAGCAAAGCGAAATAT GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGCTATTTAATCTGGCAGTTTTATTCGTTACTGGGTCT GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GCGAGTATATCATCTCTCATTTCACTTATGGCTTG GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATAGTAGTAACCGGAATAAACTCCTTCCAAAGCTCTC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC >NC_019954|4|4|147551-148516|CRISPRCasFinder GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGCTTCTAAAGGCGGGACTAACAATCAAATACTA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTAATACATATATGCCTTGGCGGGTCTGGAAAACGGCT GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AATTTTCGGCTCTGATGGATTTAGCCCCGATGCTCT GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TATCGTACACCTTAAAAGGTGTCTTGATAACTTTGAA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AATTCTAAAATCGTATTGGCTAAAAAACTAATATTAC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAATATGAATTTATAGATAAAATGGAGCAACAAGGC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGTTTTTAAGTGCCCATGATTTTCCGGTCAGCGGCA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATCTTCTCGTATACATGATGGATAGCGAAAAAAGAA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GGGAAGAAACCTTACAACTTGTGCTAGAAATGCGAT GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GGTAATAGATAAACTGTATGGAGAGCAAAGCGAAATAT GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGCTATTTAATCTGGCAGTTTTATTCGTTACTGGGTCT GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GCGAGTATATCATCTCTCATTTCACTTATGGCTTG GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATAGTAGTAACCGGAATAAACTCCTTCCAAAGCTCTC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ACATAATTTATCCGTTTATCTATATCAACTGTAGCCATGG TTTATAGCCCTACCTATAAGGAATTGAAAC >NC_019954|4|3|147551-148515|CRT GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGCTTCTAAAGGCGGGACTAACAATCAAATACTA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTAATACATATATGCCTTGGCGGGTCTGGAAAACGGCT GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AATTTTCGGCTCTGATGGATTTAGCCCCGATGCTCT GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TATCGTACACCTTAAAAGGTGTCTTGATAACTTTGAA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AATTCTAAAATCGTATTGGCTAAAAAACTAATATTAC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAATATGAATTTATAGATAAAATGGAGCAACAAGGC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGTTTTTAAGTGCCCATGATTTTCCGGTCAGCGGCA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATCTTCTCGTATACATGATGGATAGCGAAAAAAGAA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GGGAAGAAACCTTACAACTTGTGCTAGAAATGCGAT GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GGTAATAGATAAACTGTATGGAGAGCAAAGCGAAATAT GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGCTATTTAATCTGGCAGTTTTATTCGTTACTGGGTCT GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GCGAGTATATCATCTCTCATTTCACTTATGGCTTG GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATAGTAGTAACCGGAATAAACTCCTTCCAAAGCTCTC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ACATAATTTATCCGTTTATCTATATCAACTGTAGCCATG GTTTATAGCCCTACCTATAAGGAATTGAAA
>NC_019954.2|WP_013777263.1|144379_145669_+|serine-dehydratase-subunit-alpha-family-protein MSNELYQKAIEQVKEEMVPALGVTEPAAIALSAAKAYEVIGGEVKKVTVWVDEGVFKNGFSCAIPGTCEKGNEMAAALGVIAGKPDFGLRVLEDVTEEDVSRAKELIKEGKIEIKVKRGVSDIFIDAIVETDKGKGRAVIKDKHTNIVLVEKDGKEIFKKQLETKTSEGKAFDISRLKLKDLIDIAEHAPYEDISFILEAVRVNDELAQAGKQGEGMELGRGISDLIEEGYLKEDILTYAMAYTGYAVDARMGGVSKPAMSICGSGDHGLVATLPLIAIANKKEIPEEKLVRSILLSYLVTMYIKTFAGRLSAFCGCAVAAGTGSSAGICYLLGGNNEQIGFTIDNMAADITGIICDGGNFGCSLKAVTAASTAILSALLALKNIHIPKDSGIVGNTVEETMQNIGKIASPGMTKTNDVILDIMINRHD >NC_019954.2|WP_013777262.1|143808_144111_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MNIGHRIKQIRIAKGLQGIQLAEKVGITNVYLSYLENGTKIPSIETLQKICDALGITLSEFFMDENANLPPEYQELIENVKVLSPKQLELLNEFLKTLRQ >NC_019954.2|WP_013777261.1|143220_143619_+|hypothetical-protein MKKYCIIILIVCMMLVLTACGNPNSEVVGEYDTSKLGGDFVKSSNEAYAIGANKDKMPVFKDTDKAFKQALIDYAEGFKAIQKEFNLKPINKKNWEAYKTYGWQLSADNDEEIRKQGREITQFFDIYENSFK >NC_019954.2|WP_013777260.1|141877_142273_+|hypothetical-protein MRQAFLLFSHQLTKSQQDELENKFKVDKIIYLPSDLQSIWSNVPPELPSIKDYLEEIFCWLKEHSKPNDIVLVQGEFGAVFLTANFCIKEGLVPIYSTTRRDVAETILDDETIQTKRNFIHVRFREFEKWD >NC_019954.2|WP_013777259.1|140023_141640_+|TIGR03986-family-CRISPR-associated-RAMP-protein MEKAKLINIRKSKKGKLIGEVQFEDGKTMSIPPGAKLNVSLNNIECSIERNSGAITNITIDEKVIFSKASNSDPVSQKINKKHYTNKTTKQASNKAAQPSKAHAPYNFIPLNDTVIEGQPIPDFDCYHSEHAGLKRFNGYIECQLESITPIYIRDTYTTEEIIKKEESNEDNPDFFSPGGIARIPGSSLRGMIRTMVEIMSWGKFGFYEDKRLFYRGLADKSNLRLEYQNNMSSYDRNTRKSSYKYTIGDHIPENLKRKELIDIPESIFGKISEKQSFASRVFFEDATLMPGQNDIFVSDEPLTPKILSSPKPTTFQHYLEQPSDVTVKNLNHWNTKEAKIRGYKLYWHKDGLGWEYEGNDEEKAKNKRILTKIKPIKPGIKFKYRIRFENLSQEEIGAILFAIDLPENCYHKIGMGKPLGLGTIKIRPALFLINRESRYTNLFENENWNLGVEESNIQKFKDAFEQYVLNQVNKLENSDLSSLWNHERMKHLKVILDFENTKLKGWKQETDYMELKEFKNRPVLSKPLEVYNKFTTN >NC_019954.2|WP_013777258.1|139463_140021_+|TIGR03984-family-CRISPR-associated-protein MNGLKLANIKSTSKPMELNIASWQDLQKNINENFKEKSYAVVYLDYKVLIGKINEKNLKFYNDEVFDPKFIVKMRVFNEEKELLLWRRDEYKFEGRMRLDNEGDNIQYFVEVDQVLWGNPKSINNEWTVLKEARGTEIYIPYLYKPEYSSSKRLAIRTRNYVGYNEIGQAGYTDCRFVSFCEGGK >NC_019954.2|WP_013777257.1|138081_139467_+|hypothetical-protein MDNAKVTGRFLIRGKLDLESPLLIGTGEKGYIDISVQKDDNGIPYIPASSMRGVLRHYFFNNLTIQGTDKTQIEYFWGSSKNQDDKDTYQSSFILEDLYALNKPNIVVRDGIKIDNKRGIAEDEKKFDYEVVEPGAEFGFNAEVVLRECFSKEMFLKIISTLISALENGQISLGSMTTKGFGRCRLSECKVYEYDFTQGTNKTKDVILWLKGESTEEQLITLDLNEIFLPKKNKFSLKATFNIRNSLIVKAYTGMPKEPDSIHIISAGKDILPGTSLKGALRARAVKIINTLEGQSDELVKELFGWASDEASDKNKKIKSRLILDEAYIQNSVKETQFRTKIDRFTGGVIKTALFDSTPVWSGKDNAKVTINIEINDCKNWEAGLVMLLLKDLWTGDLAAGGEKNIGRGTFEGQSAEIYFNGNHYIIEQRGDKLRVNCGKDELENLVSAFVEKCKSGRAGV >NC_019954.2|WP_023211309.1|136525_138082_+|hypothetical-protein MAYLKITINLLSPIILSADVPDNNLTETFDYIPASSLIGLFAAKYISQEHLEYAHNNTNFYKWFLKGDLVFTNAYISEKDDYDEIDMLPTPLCIKKQKKGERILNILLNTEDEQTVFISPYSYIERSTIKTGELAKKINFHHMRDRLRGHTKDEAMFNYEALMPGQIFKGEIYGDSTTLREFRKTFGEKIIGRLGKSRNTEYGEVEISLSKIINEDIDALTDEDLEDEDYILLTFISPCILVNENGFPDPSLPNLKCYLENIWGKDSFEIENCVMRTTSIENYISVWKMKRPIETAISAGSTVKLVFKNNLPFENIKNGFEKMANDGIGERRNEGFGRIKLNMATAEEYYKKTIKPNQNKPESKVPQGAKQIFENVIQNMFKEEFERKAYEDAAGFSCLPSNSLLGKLGLILSKCQKEEEFKKSIDELRNNAKSQLEDCRNKTKRCNLYEYIKNFDTTKIIESIYNDITKADYLKLTKISEYNVKDEKELLLELWKIYFGVFFRRMRQRQKVAKKEVL >NC_019954.2|WP_015294800.1|135865_136525_+|hypothetical-protein MSEYKITIKLESNCMLGAGEGWGSVIDADIVFDNVGLPYLPARRLKGCLRESAKEVLEMMECAGIKKFESQIIDKVFGCSGDATGAGIVFNNLYLPNYKDVYDWCKWALQECNSAVSPEIIVNSFTSIKQQTSINNEGIADDKSLRTFRVLKRGIEFEGAVNIKEEDKEAVDLLALACLNLRYIGTMRNRGYGKIVCRFKKGNEDLSQSCIEQIEREAI >NC_019954.2|WP_013777256.1|134295_135864_+|hypothetical-protein MSKVTAILADTVSIQKYVYSSNRLKENIGASSIIANIYKESLANTLEKTLEHGVSLDEWEKQPETIAIKNSNTDFEVGYIGGGNALLFFNNEATAKEFISEWTRSLLLEAPSLNVAFAISEFNIDNFQNEMKNLFKQLEINKSKYFPQTFLPKHGITADCPYSGLSAEVYKPGTNDEKGAYISSASYVKYKHIDIDDAKVEVERISNGKFSLTTNIEKLGQTKGQNHIAIVHIDGNSMAEHFKSCENLVAIRKLSKRLKDIMQSVYEEFLNYIFEQMDLLLSDESGFNIQLENGKYIIPFRPILREGDDITFITDGRLGIPFAQKYLELMSDKTLYNENKLSACAGVAIIKTKYPFFRGYNLTEELCQSAKREARENKGTSWLDFHISYGGFSGTLEGIRKNKYTTSSGQLHFGPYLVASSDISNEKNIFHLKRGIKTFKNKEEWPRSKVKEFREYLTLGKSASQQFIDEARFKGRKLYGFKETSKTYNINVWQDGFTPYFDMIELMDLIPEYFLAETRQVK >NC_019954.2|WP_013777265.1|148885_150361_+|aldehyde-dehydrogenase MNKPIDKNYQLLIGGRWVDAKDGETFETNNPANGELLATCANAGKEDVDEAVKAAWKAFETWKDVSAQEKSGILLKIADLIDENAEKLAMIETLDNGKPIRETRNIDVPLSSDHFRYFAGAIRAEEGQAVMIDKNTLSIILREPIGVVGQIIPWNFPLLMAAWKLAPALAAGCTVVIKPSSSTPLSILELGKLINDVLPPGVVNIVTGSGATTGNYMLEHPGFRKLAFTGSTEVGYSIAEAAAKKLIPSTLELGGKSANIYFPDCPWEKAIEGVQLGILFNQGQVCCAGSRVFVHEDIYEEFLAECVEAFKKIKVGLPWEEDTIMGTQINEGQLKKILNYIEIGKQEGARLACGGSRITENGLDKGCFMQPTIFADVDNKMRIAQEEIFGPVACFLKFKDEEEVIKMANDSEYGLGGAVWTKDINRALKVARGIETGRMWINDYNNLPAHTPFGGYKKSGIGRETHHMMLDHYTQKKNIMISMNENKAGLY >NC_019954.2|WP_013777266.1|150667_151240_+|manganese-catalase-family-protein MSEDFVDLKGCKTPETYNKCAYPAPYPEIKVARENPYYGKLLLEDYAGRAGELTAVNQYIYHHFVLEPEYEEVAELLSCVALVEMHHMEILADTILKLGVDPRQRTIATNEVEIYWDAGFVYYGTVLCDMITANIAGEWAAISNYRKHQQMINDLYVKKILERIILDEIYHVQLFSQVTEKYCKPNIKKE >NC_019954.2|WP_013777267.1|151588_152620_+|DctP-family-TRAP-transporter-solute-binding-subunit MSKKNLALLLISLLIIGLLAGCGGGQQNGNDAAPSGNQDKGGTITIKVGHVLAPTHPYTLGLQKFAELVDEKTDGKIKVEVFHSSQLGNERDMVEALQLGTQEMTLVSTAPLASFTKQFLVFDLPFVFKDTESARKVLDSELGQGLLNSLESQGIMGLCYFENGFRHVTNSKHPINKPEDLKGIKIRTMENPIHMATFKVMGADPTPMAFGELFTALQQKTIDAQENPLPIIETSKFYEVQEYLSLTGHFYAPAPLLISKSFFEGLAPELQAALKEAAIEARDYERGLLDDMNAKLVEELKEKGMKVNEPDKTLFVEAVQSVYKQFESDITPELIQKVVDAQK >NC_019954.2|WP_013777268.1|152670_153147_+|TRAP-transporter-small-permease MEKVKKIFNNIEEFFVVILLLIMTVVVFWQVVCRFVLKASLPWSEELSRYILVWVTFLGASIGVKRGAHIGVEAFLMLLPKQARKLVNYLISAVCVIFCFIVFKESLSIIEMQIANAQVSPAMQIPMWWAYLAIPVGMVLMSIRFIQVSLKLKSEGEV >NC_019954.2|WP_013777269.1|153149_154430_+|TRAP-transporter-large-permease MSAILFGSFILFAIMGLPIAIVLGLSSVMAISMASNIPLMVVAQRMFTACDSFPLMAIPFFMMAGSLMESGGISRRLINLANKLVGSMTGGLAQVGILTCMFFAAISGSGPATVAAIGSILIPAMIEAGYDAGFAAAIMAAAGAIGVTIPPSIPMVTYGVVGGVSIGSLFMGGFGAGLVVGLSLMAAVYIISKKRGYYGEKERPTFLDILKAVKEAFWAILMPIIILGGIYGGIFTPTEAAAVAVVYGFVIGFFIYRELSVKDLPKIFVNTAVSTSVVMFIISTAQVFGWIMTSQRIPDQIAQAFINFSTSPYVILLLINLLLLVVGCFMETNAAIIILAPIFLPLIVKLGIDPILFGLIMVVNLAIGMITPPLGVNLFVACGICDMTLERISKSVLPFLIAMIVALMLITYIPGITMFLPNLLTK >NC_019954.2|WP_013777270.1|154445_155696_+|DUF2088-domain-containing-protein MDYPVIYRIKQRFDEYKIVNIEQAVQKELEVLKERNAIKPGMNIAVTCGSRGIANISLIIKTTIDYLKDLGARPFVIPAMGSHGGATAEGQTMVLEKLGVTPETMGVPVVSCMDVVKIGETPESVPIYMDKNAYNADGIIVINRVKPHTDFKGNIESGLLKMLAVGLGKHKGCSTIHANGLEDTIPKVARAILEKAHVIFGLAILENSKDETYKLKGLFPQDFEREERLLLKEAKSIVPKLPWDYLDILVVQEMGKTFSGTGMDTKVIGRIRVFGEEEMEKPCINKIVVLDLSDNSYGNALGVGLADITTKTLVDKIDFDVTYANTIPTTYLERGKIPVIMKDDREAIKTAMMTIGNVPLDRLKLAIIPNTLHLEEIYATKAAIEALKDKDKISVLDEGHPLNFDESGSLIVNWRR >NC_019954.2|WP_013777271.1|155698_156079_+|hypothetical-protein MKLMHTSLPEFKLKLQSAVIKQSPNKTFELKGIENLKSAKMQSLRTGRIEFAIQEIAEDKDIDKVEVVVMPRVPETMHTVIVKGIEKDGTCKKAILEVINIIHPTEEAELVDAKEVDDRRPPIGRH >NC_019954.2|WP_013777272.1|156094_157117_+|hypothetical-protein MGELTVRFIKQGTGPKQGAPINIALIDKRDVEASGKSLEDVIHMVAKVVGGPVGINVFDMDAVTTTSDGLVVEGAIITMAAGDIGKVHKEFGILHMEEMEVTHELIKEEPHLVQWEKYYKGKKLFRGPDPNKKLIPVHNVVMTGKAVNNNSATEMMNAVTMEEILLPILGQLQIMKDEPIVFGLTGEVISVGIGMTVAEKYGRVFPTRQFRAGDTAHGSGEYAKTLKANIPCIVAPKSVLAGYIIQALDAGMIPGLHIGCSPAVLAVANAKGAKIALDKITEKAKIELKSVGVDVDHMKPAVSLMTNKEIIEKADDIIPGVVDPVLISSSNIVTKLTLSI >NC_019954.2|WP_015294809.1|157130_157493_+|hypothetical-protein MDNQVIVFVDKTYVRITGIQIKGLKPFELEQTLKNTLQRPIRVIGVTGSAIEMDIYGMEPEAVYKDEKGIIKAISTVSGITAADVIKIAQAERSVEVSVEKFPKGKYSGCARERWLNFDK >NC_019954.2|WP_013777274.1|157482_158013_+|molybdopterin-binding-protein MTSKAIIIPTGDEILNGTVVDTNSPAIMALILERFPGCEVTRITPSVDNETTIITKLKRAIEEKADLIFIIGGSGGGHRFIPNAARDFTHTAILKMFPNSCFKEIYGKNGHLWSKLIAAKESNSLLVNVPGPYVEAVAAAEAALDSILKGETDPQIIVERTSEAVSRQYPSGGEIK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019954_5 | 237246-240316 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019954_5
|
45 spacers
spacers of NC_019954_5
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019954_5
The CRISPR arrays of NC_019954_5 >merge|NC_019954|5|237246-240316|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT 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>NC_019954.2|WP_023211328.1|235404_236751_-|MATE-family-efflux-transporter MTVGTPWKRIVEFSIPMLVGNIAQQLYNTVDSIVIGRYVGDNALAAVGSALPIFNFLLVFFVAVSTGAGIMVSQYFGAKDREKLSRSIGACITLTAIVATIIMIIGPIVVRPMLVLINTPESIIDWCASYLLILLVGNWGFSYFNILSGILRGLGDSLSALMFLLISTVLNIFLDIWFVAGLNMGVPGVALATVIAQVISAVLCAMKLKTMDYVFDLNLNMLKPKKEYVVQLLKLGLPSGLTQVIFSLAMITVQSLTNTFGEMIIACNVIVMRVDGFAMMPNFTFGVAMTTFAGQNVGAKKMDRVEEGTRQGLAIAVGVSIVITIIILIFGRYLMDIFTDTAELVDLSMKMMRILAVGYVAMAVTQVLSGVMRGAGDTMTPMWISLITTIFLRVPIAYGIAYLTRSAQYPNGRPESVFVSLLIAWVSGAVITSIFYKKGNWREKVLLS >NC_019954.2|WP_013777359.1|234214_235408_+|[FeFe]-hydrogenase-H-cluster-maturation-GTPase-HydF MNDTPRANRLHIGLFGRRNSGKSSLINAITGQEIALVSDFPGTTTDPVYKAMELLPIGPVVFIDTAGLDDVGDLGELRIKKTLEVMDKTDIALVVFSTENLDFSLEKRWCQELRSRNIPIIGVVNKIDKRDVDIKDLTKEFDFPFIKVSANKRENIGKLKEMIHQNAPMDFELSTLVGDIITPKSLVVLVTPQDIQAPKNRLILPQVQTIRDILDNNCMALVAKETELLDLLNCLNKKPALVITDSQVFHIVSKIVPEDIPLTSFSIIMSRYKGELSTLVRGAKAMDELKPNDRVLIEEACTHHPLENDIGRQKLPALLENKAGGKLQIEIKVGGDFPEDLTPYALILHCGACMLNRKQMLTRIIRAREQNVPITNYGMAFAHAQGILERTTRMFEP >NC_019954.2|WP_013777358.1|233157_234207_+|[FeFe]-hydrogenase-H-cluster-radical-SAM-maturase-HydE MNIYQLVDSICAGYVPSVDEVELLLNADEPETSYIFSMADNITERYCSNKIHIRGIIEFSSYCRCNCAYCGLNAGNHKLSRYRMQPQEIIDTAAKAYEAGYKTLVLQSGEDLWYTREKISWIIKGIKSIGDIAITLSIGEREYEDYKQWKKDGADRFLLKHETINQSLYNKLHTHSNIESRIKCLLQLKELGYQVGDGFMIGLPGQTLRDIAEDILFLNELDVDMAGIGPFIPHKDTILKDAKAGSNMITLKAVAVTRLILKKVHLPATTALWTLDNQDGKKALKAGANVVMLKLEPYKYRRLYEIYPKDFDAKSNIKQERLKIEELILSMGKQVAEDRGDSIKLIERQ >NC_019954.2|WP_013777357.1|232643_233033_+|30S-ribosomal-protein-S9 MKQAVLATGRRKTAVAKVWIMPGSGKITINKRPIDDYFGFETLKAEVKRPLEKINGLDKFDVIASVKGGGYTGQAGAIRHGIARALLKIDGDFRPILKKEGYLTRDPRMTERKKYGLKKARRAPQFSKR >NC_019954.2|WP_013777356.1|232189_232624_+|50S-ribosomal-protein-L13 MSTFMAKKEEVKRDWYVIDAAGKPLGRLATQVAMILKGKHKPIYTPHVDTGDYVIIVNADKVILTGKKMDNKMYYSHTGYPGGIKSQNFRSLMSKSPEKVVYKAVWGMLPHNALGRKMIKKLKIYAGAEHPHEAQKPQSLTVKI >NC_019954.2|WP_013777355.1|231394_232126_+|tRNA-pseudouridine(38-40)-synthase-TruA MNVKILLEYEGTAYSGWQRQKNAISIQEVLENAIKSITGEAVNVIGSGRTDAGVHALGQVANFKTQTKIPIEKLPYAINSKLPEDIVVKHAEIVPEDFHARFWAKAKIYTYTIYNAKFPSPLLKRYSYFYPRPLNVRAMKKAADMLIGTHDFASFMASNSPVKSTVRCIERLEVFQNGDIVKFEIEANGFLYNMVRIIAGTLLDVGINKKKANDIISIIKSKDRSMAGKTLPPQGLCLIKVIY >NC_019954.2|WP_013777354.1|230586_231381_+|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT MREITIGQYIPGDSIVHRLDPRTKIIITLAYMILLFMLNNFYGYIFPVGFIILATLLSGISVRYLLKGLKPLIFIIILTFLLNSFMTKGRVIYQLGPLDITYEGLSQGAFMAIRLILLIIGTSLLTLTTSPISLTDGIEVLLSPFKKIGMPAHELAMMMTIALRFIPTLLEETDKIMKAQMARGADFESGNLINRAKNLVPLLVPLFISAFRRADDLAMAMEARCYHGGENRTRMKELKMTFLDIATFIVFILIAGGGIASRFV >NC_019954.2|WP_013777352.1|228910_229747_+|energy-coupling-factor-transporter-ATPase MKIAAEIVALDVYYQYAASSDLALKNINLRIEPGEFVAIIGPNGSGKSTLAKLFNGLYTPSEGDIFVAGFNTKNQDDIWKIRQKAGMVFQNPDNQIVATIVEEDVAFGPENLGIPPEEIRHRVKEALEIVELTEYADKAPHLLSGGQKQRVAIAGILAMKPDCIILDEPTAMLDPVGRKEVISTVKKLNRNEGKTIVLITHFMEEAVQADRVLVMEKGKVVMEGKPNEIFSQVERLKKLGLDVPQVTELAYKLTKDNVPVRRDILTVEEMVDCLCQLM >NC_019954.2|WP_013777351.1|228532_228865_+|50S-ribosomal-protein-L17 MRKLGRPSGHRKMMLRNLTTDLLKYGRIETTETRAKEVRRMAEKMITLAKKDDLAARRLVLAEVLDETTVKNLFDNIAPKYKDQNGGYVRITKVGPRQGDAAPKAILELV >NC_019954.2|WP_013777350.1|227569_228517_+|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-alpha MMDIEKPRIELIEASADNTFGRIVVEPLERGYGTTLGNSMRRVLLSSLPGAAVTSIKIDGVQHEFSTIPGVTEDTTEIIMNIKALAIMMHSDEPKLLRIEAQDEGEVKAKDIIADADVEIMNPELHIATLEKDAKLFMELTLEKGKGYVTADKNKKPNHPIGVIAIDSIFTPVHKVNFNVEHTRVGQRTDYDRLIMEIWTNGTIKPDDAVSAAAKILMDHFSLFAGLTEKPQVEDAPVEEEKDDREKILEMPIEELDLSVRSYNCLKRAGINTIYELTQKTAEDMMKVRNLGKKSLEEVETKLSTFNLSLKQPED >NC_019954.2|WP_013777361.1|242182_243094_+|DMT-family-transporter MSSEKRMYISLFSVACFWGTSWSVSKIGLRELSPVHLAVLRFILASIIFFCIVKLFYRDYVIEREDRKWLWILGFLGVVLYFFIQYYGLDMTTTVNSSILIATSPIFTIFLSAKLFHQEKLNYSDLLGILIAFVGVFLVFTAGKGISIGRSTIYGDLLLLLNSLVWALFTVLGKNLVDKYDPFVVMAYINIYATITVLPIAFTPAFINSVKAASITTWAAALYLAVFCSVYSYYMWYKGIKTIGASKTAVFNYVNPMVAVIIGIILLKEDWNIYTIIGGILVFIGVYAASARKGDERIETVDS >NC_019954.2|WP_013777362.1|243200_243881_+|phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide-synthase MEKIREGKTKTVFDTGDGNILLKFRDDVTGTGDVVDPGANTVIGKIEGKGNASLKLSKHFFELLKRDGIRTHYIDADLKENTMLVKRADTFGDGLEFICRLKAAGSFVRRYGRYVEEDQPLDYLVEITLKDDDRGDPLINEEALVQLKLMTKEEVSEAIALTKKITKIVKQECERFDLELIDIKFEFARVEGEIAVIDEISGDNMRVRKNGQAVMQKELCDIICGK >NC_019954.2|WP_013777363.1|244073_244985_-|thioredoxin-disulfide-reductase MYDVTIVGAGPAGLSAGLYAARAKLSTVIIEKMYPGGQAAITYRIENYPGFSDGIGGIELTDAMKSQAEKFDAKFLNGCVEKIEKQDGVFRVFMNGESITAKTVILASGAQPKKIGVKGEQEFTGKGVSYCATCDGAFYFDRTVAVVGGGDTAIEEALFLTRFASKIYVIHRRDQLRATKILQERAFQNDKISFVWDSVVNEIRGEDAVKEVIVKNVKTGSLNSIPIDGIFVAIGQSPATNFVKNLVVLDEQGYIITNDKMMTDVRGIFAAGDVRQKPLRQVITAAADGAIAAVEAGRFIEGQ >NC_019954.2|WP_013777365.1|246207_247428_-|patatin-like-phospholipase-family-protein MFGLVLEGGGAKGAYQIGAWKALRELGVDIKGVAGTSVGALNGAMIVQGDFEKTYDTWYNISFDKILNIDDSEIAAIKNRELFPENFFHVVRTIRELFFEHGLDITPLRQLLNCNICEDKVRHSGKDFGIVTVALTDLKPVELYIEDIPEGKLVDYLMASANLPIFKMDKIDGKLFIDGGFFDNFPIKLLMAKGYKDIIGIRLYGIGRTRRINKDKLNLITIEPSEDLGGTLDFSSERARRNLNLGYYDTLSVINKYSGRFYYIIANHPEDYYANIFFNLSRQTVLKLANIMGLPEKMPYRRLLFEKIIPRLSEILGLGSKASYKDIFIGILEKAAVLDGIEKFKIYDFDEFLYTVISKHQKTSEHISDKIPRLLKKSDLVLKTVKEQLSPEIIDVFIDELKIRFN >NC_019954.2|WP_013777366.1|247879_248356_+|transcription-elongation-factor-GreA MAKKEVVLTQEGLKKMEEELEYLKSVKRREIAARIKQAIDFGDISENSEYDEAKNEQAFVEGRIALLEEKLRNAKLIDEVDISTDVVSVGSKVKLKDLDTGDIFEYMIVGSAEANPIENKISNESPVGNALIGEKKGSIVEVSVPAGIIKYEIMDIMK >NC_019954.2|WP_013777367.1|248373_249855_+|lysine--tRNA-ligase MDYLNDQSEINEIQKVRLQKLQELKDMGVNPFGDKYPYSHNCQQIKANFDELENQNVKIAGRIMAIRGHGKAAFFDIQDNTGKIQVYIRKDNVSDDTFNLYKLLDIGDIVGIEGNVFKSKRGEISVSVNNMTILAKSLRPLPEKWHGLKDTDIRYRQRYLDLIVNPEVKQTFLTRSKIISAMRQFLDDKGFVEVETPVLSPIAGGAAARPFVTYHNALDMQLYLRIATELYLKRLIVGGFEKVYELGKDFRNEGISIKHNPEFTMVELYQAYADYKDMMKLAEDMIAYIAEKVLGTTKITYQGEEIDLTPPWTRMTMVEAVKHFTGIDFDSIASDEEARKVARELHIEEIKDCDTKGKVLNLIFEEKVEQNLVQPTFIYDYPIEISPLAKKKEDNPDLTYRFEAFVTGREIANAFSELNDPIDQRERFLQQLKEREAGDEEAHAFDEDYINALEYGMPPTGGMGIGVDRLVMLLTDSYSIRDVILFPTMRPKQ >NC_019954.2|WP_013777368.1|255397_255865_+|MarR-family-transcriptional-regulator MTNDNDRKLAESLDTLLRSITRWMKYIHRQQLVKADNLDITQKQYRVLCILEKNGPYKMSDLGEIVHTSYGSLTVMIDRLVDKNLVERCFLPEDRRVVMVKITPAGSQILKQYREDFLDLIEKNLERLNSEEKKRLQAAIDDIKSIVEENCNFLL >NC_019954.2|WP_013777369.1|255984_256443_+|NUDIX-hydrolase MLTRICSGGVVFFKDKVLILKNEKGEWVLPKGVIRPGRLAQEVAIERVKLEAGVNARIVSCVGETCYEFYSVTRQRPVCNQITWFLMEALSENCNPNVELNFSDGGFYPIEEALDMITYSQDKSLVRTSYKRYLEYCKEKEKNEDEKDEVIV >NC_019954.2|WP_013777370.1|256466_256655_-|hypothetical-protein MVEIDILAELSDMKIIDYRNTLTIVSLIEVLTEKGIICSNDVALKAQTLDAISEEQIKIHTI >NC_019954.2|WP_041591468.1|256739_257744_-|AIR-synthase-family-protein MKAGKVPPELLKSSVYPYVGKLRKEVLVHSGFGEDCSIIDFGDSVAVLSTDPITGADIHSSHLAVYVSCNDVAACGAEPIGILVTLLLPIGSNESLLKELMKEINEAANKVGIEILGGHSEITSAVSKSIISTTAIGITGKDKFVTSSGAKPGDAIIVTKTLGLEGSAILASDFEEFLIKKLPRETIEKAKNFIEKISVVDDGIIASKVGVSAMHDITEGGLLGACYEVAEASGVGVEIYQDLLPILPETQDICKAFGINPLGLISSGSMFICTPFADEVIAALNESKIDAAVIGKVTSQEQGKFIVSSGKKCPIVPFERDELYNAIEKVHNQL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019954_6 | 240442-241551 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019954_6
|
16 spacers
spacers of NC_019954_6
>6.1|240472|38|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTATAAATGGGGTGAAATTATGGATCTTACGACAATTA >6.2|240540|36|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCAGCCTTGGCACCAGCTCTATTGGTATATATCCGG >6.3|240606|36|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGAATTGTCCTTGGATGACATCCCGCCATATTTGCC >6.4|240672|37|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCAGCCTTGGCACCAGCTCTATTGGTATATATCCGGC >6.5|240739|37|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAATCTCATATTCTTTTTTCATAGTCTTCGTTCACC >6.6|240806|39|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACGACTATCCCGGGAGAACACCCGAGACTGCCCAATTTT >6.7|240875|42|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACCAGAGCAGGCGCGAAACCCGTAGTTGCTGTTGGCATTGCC >6.8|240947|37|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGGCTGTCCTGGCTCGGGAATGAATTGAGAAGTGAC >6.9|241014|37|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATGCCTACAAAGTCTTTTTATCAAGTGCTATCCGCA >6.10|241081|39|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAAAAGAGGAGAGAATATCAAGAACTGGCAAGGGATTC >6.11|241150|38|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTACTTTGTCCCAGTCAATACATGCCCATATTTCATA >6.12|241218|38|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAAACTTGTCAACCGATTCGCTAATAATACCTTCCAC >6.13|241286|36|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGCTCTAATGCCCTAAATTGGTCTAACCCGTTCTTT >6.14|241352|35|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCACAATCTTTTTTTGCGCAATCACTCTTGTCTGG >6.15|241417|39|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCCCTTGAATTCACTTTTGATAATGAATATATCAAAGAA >6.16|241486|36|NC_019954|CRISPRCasFinder,CRT GCTTTTCTTCTTTTGTCTTTATCTTTCTCTATCCCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019954_6
The CRISPR arrays of NC_019954_6 >merge|NC_019954|6|240442-241551|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTATAAATGGGGTGAAATTATGGATCTTACGACAATTAGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCCAGCCTTGGCACCAGCTCTATTGGTATATATCCGGGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTGAATTGTCCTTGGATGACATCCCGCCATATTTGCCGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCCAGCCTTGGCACCAGCTCTATTGGTATATATCCGGCGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATAATCTCATATTCTTTTTTCATAGTCTTCGTTCACCGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACACGACTATCCCGGGAGAACACCCGAGACTGCCCAATTTTGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACACCAGAGCAGGCGCGAAACCCGTAGTTGCTGTTGGCATTGCCGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTCGGCTGTCCTGGCTCGGGAATGAATTGAGAAGTGACGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTATGCCTACAAAGTCTTTTTATCAAGTGCTATCCGCAGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTCAAAAGAGGAGAGAATATCAAGAACTGGCAAGGGATTCGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTCTACTTTGTCCCAGTCAATACATGCCCATATTTCATAGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATAAACTTGTCAACCGATTCGCTAATAATACCTTCCACGTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGGCTCTAATGCCCTAAATTGGTCTAACCCGTTCTTTGTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAACTCACAATCTTTTTTTGCGCAATCACTCTTGTCTGGGTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAACGCCCTTGAATTCACTTTTGATAATGAATATATCAAAGAAGTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAACGCTTTTCTTCTTTTGTCTTTATCTTTCTCTATCCCAGCTTATAACCTACCTATAAGGGACTTGAAA >NC_019954|6|5|240442-241485|PILER-CR GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTATAAATGGGGTGAAATTATGGATCTTACGACAATTA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCAGCCTTGGCACCAGCTCTATTGGTATATATCCGG GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGAATTGTCCTTGGATGACATCCCGCCATATTTGCC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCAGCCTTGGCACCAGCTCTATTGGTATATATCCGGC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATAATCTCATATTCTTTTTTCATAGTCTTCGTTCACC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ACGACTATCCCGGGAGAACACCCGAGACTGCCCAATTTT GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ACCAGAGCAGGCGCGAAACCCGTAGTTGCTGTTGGCATTGCC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCGGCTGTCCTGGCTCGGGAATGAATTGAGAAGTGAC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TATGCCTACAAAGTCTTTTTATCAAGTGCTATCCGCA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCAAAAGAGGAGAGAATATCAAGAACTGGCAAGGGATTC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCTACTTTGTCCCAGTCAATACATGCCCATATTTCATA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATAAACTTGTCAACCGATTCGCTAATAATACCTTCCAC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GGCTCTAATGCCCTAAATTGGTCTAACCCGTTCTTT GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC TCACAATCTTTTTTTGCGCAATCACTCTTGTCTGG GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC GCCCTTGAATTCACTTTTGATAATGAATATATCAAAGAA GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC >NC_019954|6|6|240442-241551|CRISPRCasFinder GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTATAAATGGGGTGAAATTATGGATCTTACGACAATTA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCAGCCTTGGCACCAGCTCTATTGGTATATATCCGG GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGAATTGTCCTTGGATGACATCCCGCCATATTTGCC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCAGCCTTGGCACCAGCTCTATTGGTATATATCCGGC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATAATCTCATATTCTTTTTTCATAGTCTTCGTTCACC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ACGACTATCCCGGGAGAACACCCGAGACTGCCCAATTTT GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ACCAGAGCAGGCGCGAAACCCGTAGTTGCTGTTGGCATTGCC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCGGCTGTCCTGGCTCGGGAATGAATTGAGAAGTGAC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TATGCCTACAAAGTCTTTTTATCAAGTGCTATCCGCA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCAAAAGAGGAGAGAATATCAAGAACTGGCAAGGGATTC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCTACTTTGTCCCAGTCAATACATGCCCATATTTCATA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATAAACTTGTCAACCGATTCGCTAATAATACCTTCCAC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GGCTCTAATGCCCTAAATTGGTCTAACCCGTTCTTT GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC TCACAATCTTTTTTTGCGCAATCACTCTTGTCTGG GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC GCCCTTGAATTCACTTTTGATAATGAATATATCAAAGAA GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC GCTTTTCTTCTTTTGTCTTTATCTTTCTCTATCCCA GCTTATAACCTACCTATAAGGGACTTGAAA >NC_019954|6|5|240442-241551|CRT GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTATAAATGGGGTGAAATTATGGATCTTACGACAATTA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCAGCCTTGGCACCAGCTCTATTGGTATATATCCGG GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGAATTGTCCTTGGATGACATCCCGCCATATTTGCC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCAGCCTTGGCACCAGCTCTATTGGTATATATCCGGC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATAATCTCATATTCTTTTTTCATAGTCTTCGTTCACC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ACGACTATCCCGGGAGAACACCCGAGACTGCCCAATTTT GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ACCAGAGCAGGCGCGAAACCCGTAGTTGCTGTTGGCATTGCC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCGGCTGTCCTGGCTCGGGAATGAATTGAGAAGTGAC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TATGCCTACAAAGTCTTTTTATCAAGTGCTATCCGCA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCAAAAGAGGAGAGAATATCAAGAACTGGCAAGGGATTC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCTACTTTGTCCCAGTCAATACATGCCCATATTTCATA GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATAAACTTGTCAACCGATTCGCTAATAATACCTTCCAC GTTTATAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GGCTCTAATGCCCTAAATTGGTCTAACCCGTTCTTT GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC TCACAATCTTTTTTTGCGCAATCACTCTTGTCTGG GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC GCCCTTGAATTCACTTTTGATAATGAATATATCAAAGAA GTTTATAGCCTACCTATAAGGGATTGAAAC GCTTTTCTTCTTTTGTCTTTATCTTTCTCTATCCCA GCTTATAACCTACCTATAAGGGACTTGAAA
>NC_019954.2|WP_023211328.1|235404_236751_-|MATE-family-efflux-transporter MTVGTPWKRIVEFSIPMLVGNIAQQLYNTVDSIVIGRYVGDNALAAVGSALPIFNFLLVFFVAVSTGAGIMVSQYFGAKDREKLSRSIGACITLTAIVATIIMIIGPIVVRPMLVLINTPESIIDWCASYLLILLVGNWGFSYFNILSGILRGLGDSLSALMFLLISTVLNIFLDIWFVAGLNMGVPGVALATVIAQVISAVLCAMKLKTMDYVFDLNLNMLKPKKEYVVQLLKLGLPSGLTQVIFSLAMITVQSLTNTFGEMIIACNVIVMRVDGFAMMPNFTFGVAMTTFAGQNVGAKKMDRVEEGTRQGLAIAVGVSIVITIIILIFGRYLMDIFTDTAELVDLSMKMMRILAVGYVAMAVTQVLSGVMRGAGDTMTPMWISLITTIFLRVPIAYGIAYLTRSAQYPNGRPESVFVSLLIAWVSGAVITSIFYKKGNWREKVLLS >NC_019954.2|WP_013777359.1|234214_235408_+|[FeFe]-hydrogenase-H-cluster-maturation-GTPase-HydF MNDTPRANRLHIGLFGRRNSGKSSLINAITGQEIALVSDFPGTTTDPVYKAMELLPIGPVVFIDTAGLDDVGDLGELRIKKTLEVMDKTDIALVVFSTENLDFSLEKRWCQELRSRNIPIIGVVNKIDKRDVDIKDLTKEFDFPFIKVSANKRENIGKLKEMIHQNAPMDFELSTLVGDIITPKSLVVLVTPQDIQAPKNRLILPQVQTIRDILDNNCMALVAKETELLDLLNCLNKKPALVITDSQVFHIVSKIVPEDIPLTSFSIIMSRYKGELSTLVRGAKAMDELKPNDRVLIEEACTHHPLENDIGRQKLPALLENKAGGKLQIEIKVGGDFPEDLTPYALILHCGACMLNRKQMLTRIIRAREQNVPITNYGMAFAHAQGILERTTRMFEP >NC_019954.2|WP_013777358.1|233157_234207_+|[FeFe]-hydrogenase-H-cluster-radical-SAM-maturase-HydE MNIYQLVDSICAGYVPSVDEVELLLNADEPETSYIFSMADNITERYCSNKIHIRGIIEFSSYCRCNCAYCGLNAGNHKLSRYRMQPQEIIDTAAKAYEAGYKTLVLQSGEDLWYTREKISWIIKGIKSIGDIAITLSIGEREYEDYKQWKKDGADRFLLKHETINQSLYNKLHTHSNIESRIKCLLQLKELGYQVGDGFMIGLPGQTLRDIAEDILFLNELDVDMAGIGPFIPHKDTILKDAKAGSNMITLKAVAVTRLILKKVHLPATTALWTLDNQDGKKALKAGANVVMLKLEPYKYRRLYEIYPKDFDAKSNIKQERLKIEELILSMGKQVAEDRGDSIKLIERQ >NC_019954.2|WP_013777357.1|232643_233033_+|30S-ribosomal-protein-S9 MKQAVLATGRRKTAVAKVWIMPGSGKITINKRPIDDYFGFETLKAEVKRPLEKINGLDKFDVIASVKGGGYTGQAGAIRHGIARALLKIDGDFRPILKKEGYLTRDPRMTERKKYGLKKARRAPQFSKR >NC_019954.2|WP_013777356.1|232189_232624_+|50S-ribosomal-protein-L13 MSTFMAKKEEVKRDWYVIDAAGKPLGRLATQVAMILKGKHKPIYTPHVDTGDYVIIVNADKVILTGKKMDNKMYYSHTGYPGGIKSQNFRSLMSKSPEKVVYKAVWGMLPHNALGRKMIKKLKIYAGAEHPHEAQKPQSLTVKI >NC_019954.2|WP_013777355.1|231394_232126_+|tRNA-pseudouridine(38-40)-synthase-TruA MNVKILLEYEGTAYSGWQRQKNAISIQEVLENAIKSITGEAVNVIGSGRTDAGVHALGQVANFKTQTKIPIEKLPYAINSKLPEDIVVKHAEIVPEDFHARFWAKAKIYTYTIYNAKFPSPLLKRYSYFYPRPLNVRAMKKAADMLIGTHDFASFMASNSPVKSTVRCIERLEVFQNGDIVKFEIEANGFLYNMVRIIAGTLLDVGINKKKANDIISIIKSKDRSMAGKTLPPQGLCLIKVIY >NC_019954.2|WP_013777354.1|230586_231381_+|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT MREITIGQYIPGDSIVHRLDPRTKIIITLAYMILLFMLNNFYGYIFPVGFIILATLLSGISVRYLLKGLKPLIFIIILTFLLNSFMTKGRVIYQLGPLDITYEGLSQGAFMAIRLILLIIGTSLLTLTTSPISLTDGIEVLLSPFKKIGMPAHELAMMMTIALRFIPTLLEETDKIMKAQMARGADFESGNLINRAKNLVPLLVPLFISAFRRADDLAMAMEARCYHGGENRTRMKELKMTFLDIATFIVFILIAGGGIASRFV >NC_019954.2|WP_013777352.1|228910_229747_+|energy-coupling-factor-transporter-ATPase MKIAAEIVALDVYYQYAASSDLALKNINLRIEPGEFVAIIGPNGSGKSTLAKLFNGLYTPSEGDIFVAGFNTKNQDDIWKIRQKAGMVFQNPDNQIVATIVEEDVAFGPENLGIPPEEIRHRVKEALEIVELTEYADKAPHLLSGGQKQRVAIAGILAMKPDCIILDEPTAMLDPVGRKEVISTVKKLNRNEGKTIVLITHFMEEAVQADRVLVMEKGKVVMEGKPNEIFSQVERLKKLGLDVPQVTELAYKLTKDNVPVRRDILTVEEMVDCLCQLM >NC_019954.2|WP_013777351.1|228532_228865_+|50S-ribosomal-protein-L17 MRKLGRPSGHRKMMLRNLTTDLLKYGRIETTETRAKEVRRMAEKMITLAKKDDLAARRLVLAEVLDETTVKNLFDNIAPKYKDQNGGYVRITKVGPRQGDAAPKAILELV >NC_019954.2|WP_013777350.1|227569_228517_+|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-alpha MMDIEKPRIELIEASADNTFGRIVVEPLERGYGTTLGNSMRRVLLSSLPGAAVTSIKIDGVQHEFSTIPGVTEDTTEIIMNIKALAIMMHSDEPKLLRIEAQDEGEVKAKDIIADADVEIMNPELHIATLEKDAKLFMELTLEKGKGYVTADKNKKPNHPIGVIAIDSIFTPVHKVNFNVEHTRVGQRTDYDRLIMEIWTNGTIKPDDAVSAAAKILMDHFSLFAGLTEKPQVEDAPVEEEKDDREKILEMPIEELDLSVRSYNCLKRAGINTIYELTQKTAEDMMKVRNLGKKSLEEVETKLSTFNLSLKQPED >NC_019954.2|WP_013777361.1|242182_243094_+|DMT-family-transporter MSSEKRMYISLFSVACFWGTSWSVSKIGLRELSPVHLAVLRFILASIIFFCIVKLFYRDYVIEREDRKWLWILGFLGVVLYFFIQYYGLDMTTTVNSSILIATSPIFTIFLSAKLFHQEKLNYSDLLGILIAFVGVFLVFTAGKGISIGRSTIYGDLLLLLNSLVWALFTVLGKNLVDKYDPFVVMAYINIYATITVLPIAFTPAFINSVKAASITTWAAALYLAVFCSVYSYYMWYKGIKTIGASKTAVFNYVNPMVAVIIGIILLKEDWNIYTIIGGILVFIGVYAASARKGDERIETVDS >NC_019954.2|WP_013777362.1|243200_243881_+|phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide-synthase MEKIREGKTKTVFDTGDGNILLKFRDDVTGTGDVVDPGANTVIGKIEGKGNASLKLSKHFFELLKRDGIRTHYIDADLKENTMLVKRADTFGDGLEFICRLKAAGSFVRRYGRYVEEDQPLDYLVEITLKDDDRGDPLINEEALVQLKLMTKEEVSEAIALTKKITKIVKQECERFDLELIDIKFEFARVEGEIAVIDEISGDNMRVRKNGQAVMQKELCDIICGK >NC_019954.2|WP_013777363.1|244073_244985_-|thioredoxin-disulfide-reductase MYDVTIVGAGPAGLSAGLYAARAKLSTVIIEKMYPGGQAAITYRIENYPGFSDGIGGIELTDAMKSQAEKFDAKFLNGCVEKIEKQDGVFRVFMNGESITAKTVILASGAQPKKIGVKGEQEFTGKGVSYCATCDGAFYFDRTVAVVGGGDTAIEEALFLTRFASKIYVIHRRDQLRATKILQERAFQNDKISFVWDSVVNEIRGEDAVKEVIVKNVKTGSLNSIPIDGIFVAIGQSPATNFVKNLVVLDEQGYIITNDKMMTDVRGIFAAGDVRQKPLRQVITAAADGAIAAVEAGRFIEGQ >NC_019954.2|WP_013777365.1|246207_247428_-|patatin-like-phospholipase-family-protein MFGLVLEGGGAKGAYQIGAWKALRELGVDIKGVAGTSVGALNGAMIVQGDFEKTYDTWYNISFDKILNIDDSEIAAIKNRELFPENFFHVVRTIRELFFEHGLDITPLRQLLNCNICEDKVRHSGKDFGIVTVALTDLKPVELYIEDIPEGKLVDYLMASANLPIFKMDKIDGKLFIDGGFFDNFPIKLLMAKGYKDIIGIRLYGIGRTRRINKDKLNLITIEPSEDLGGTLDFSSERARRNLNLGYYDTLSVINKYSGRFYYIIANHPEDYYANIFFNLSRQTVLKLANIMGLPEKMPYRRLLFEKIIPRLSEILGLGSKASYKDIFIGILEKAAVLDGIEKFKIYDFDEFLYTVISKHQKTSEHISDKIPRLLKKSDLVLKTVKEQLSPEIIDVFIDELKIRFN >NC_019954.2|WP_013777366.1|247879_248356_+|transcription-elongation-factor-GreA MAKKEVVLTQEGLKKMEEELEYLKSVKRREIAARIKQAIDFGDISENSEYDEAKNEQAFVEGRIALLEEKLRNAKLIDEVDISTDVVSVGSKVKLKDLDTGDIFEYMIVGSAEANPIENKISNESPVGNALIGEKKGSIVEVSVPAGIIKYEIMDIMK >NC_019954.2|WP_013777367.1|248373_249855_+|lysine--tRNA-ligase MDYLNDQSEINEIQKVRLQKLQELKDMGVNPFGDKYPYSHNCQQIKANFDELENQNVKIAGRIMAIRGHGKAAFFDIQDNTGKIQVYIRKDNVSDDTFNLYKLLDIGDIVGIEGNVFKSKRGEISVSVNNMTILAKSLRPLPEKWHGLKDTDIRYRQRYLDLIVNPEVKQTFLTRSKIISAMRQFLDDKGFVEVETPVLSPIAGGAAARPFVTYHNALDMQLYLRIATELYLKRLIVGGFEKVYELGKDFRNEGISIKHNPEFTMVELYQAYADYKDMMKLAEDMIAYIAEKVLGTTKITYQGEEIDLTPPWTRMTMVEAVKHFTGIDFDSIASDEEARKVARELHIEEIKDCDTKGKVLNLIFEEKVEQNLVQPTFIYDYPIEISPLAKKKEDNPDLTYRFEAFVTGREIANAFSELNDPIDQRERFLQQLKEREAGDEEAHAFDEDYINALEYGMPPTGGMGIGVDRLVMLLTDSYSIRDVILFPTMRPKQ >NC_019954.2|WP_013777368.1|255397_255865_+|MarR-family-transcriptional-regulator MTNDNDRKLAESLDTLLRSITRWMKYIHRQQLVKADNLDITQKQYRVLCILEKNGPYKMSDLGEIVHTSYGSLTVMIDRLVDKNLVERCFLPEDRRVVMVKITPAGSQILKQYREDFLDLIEKNLERLNSEEKKRLQAAIDDIKSIVEENCNFLL >NC_019954.2|WP_013777369.1|255984_256443_+|NUDIX-hydrolase MLTRICSGGVVFFKDKVLILKNEKGEWVLPKGVIRPGRLAQEVAIERVKLEAGVNARIVSCVGETCYEFYSVTRQRPVCNQITWFLMEALSENCNPNVELNFSDGGFYPIEEALDMITYSQDKSLVRTSYKRYLEYCKEKEKNEDEKDEVIV >NC_019954.2|WP_013777370.1|256466_256655_-|hypothetical-protein MVEIDILAELSDMKIIDYRNTLTIVSLIEVLTEKGIICSNDVALKAQTLDAISEEQIKIHTI >NC_019954.2|WP_041591468.1|256739_257744_-|AIR-synthase-family-protein MKAGKVPPELLKSSVYPYVGKLRKEVLVHSGFGEDCSIIDFGDSVAVLSTDPITGADIHSSHLAVYVSCNDVAACGAEPIGILVTLLLPIGSNESLLKELMKEINEAANKVGIEILGGHSEITSAVSKSIISTTAIGITGKDKFVTSSGAKPGDAIIVTKTLGLEGSAILASDFEEFLIKKLPRETIEKAKNFIEKISVVDDGIIASKVGVSAMHDITEGGLLGACYEVAEASGVGVEIYQDLLPILPETQDICKAFGINPLGLISSGSMFICTPFADEVIAALNESKIDAAVIGKVTSQEQGKFIVSSGKKCPIVPFERDELYNAIEKVHNQL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019954_7 | 1375922-1376035 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019954_7
|
1 spacers
spacers of NC_019954_7
>7.1|1375952|54|NC_019954|CRISPRCasFinder CATAAAATACACATCCATCAATCAATTAAAATACACATCCATCAATCAATTCAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019954_7
The CRISPR arrays of NC_019954_7 >merge|NC_019954|7|1375922-1376035|CRISPRCasFinder TCTAAATCTGATAATTAATTGCTACAATCACATAAAATACACATCCATCAATCAATTAAAATACACATCCATCAATCAATTCAATCTAAATCTGATAATTAATCGCTACAATCA >NC_019954|7|7|1375922-1376035|CRISPRCasFinder TCTAAATCTGATAATTAATTGCTACAATCA CATAAAATACACATCCATCAATCAATTAAAATACACATCCATCAATCAATTCAA TCTAAATCTGATAATTAATCGCTACAATCA
>NC_019954.2|WP_013778398.1|1375000_1375609_-|transcriptional-repressor-LexA MYENLTHRQKQILDYIHNYFKTKGYPPSVREICVATNLKSTATVHSYLVQLEEKGYIKRDPQKPRAIEIMDTGIVIDKDVIQIPLVGKVTAGEPILAQENIENVFAFPKEMLPDANIFMLAVKGDSMIEAGILNGDYVMVQSTNTAKNGDIVVALLEDEATIKRFYKETDHIRLQPENRFMEPIIVKDLKILGKVVGLYRRF >NC_019954.2|WP_013778397.1|1373681_1374992_+|methionine-gamma-lyase-family-protein MKKVRANVFDEDIDRIAITDYGISLDIINKSRKVMEEIQSILKYIENVVEFNQVKILTAMKQSCLSDYHLMDSTGYGYNDTGRETIEEVYKNVFKAEDALVRPQIVSGTHSITLCLLGVLKPGDELLSATGTPYDTLKSVIWGDNCGSLKDYDIKYREASLLDGKPDFKAIKENINNNTKMVLIQRSRGYSLRPSLSITDIQKLIKYIKSLKNDVICFVDNCYGEFVETKEPIEVGADLCAGSLIKNPGGGIAPTGGYIAGKSELVKKCFYRLTAPGLDKNCGPSIFSNRLIAQGLFYAPNIVGEALKGAIFTAKIMEELGFEVYPRYNERRSDIVTAVILRNKDTLINFCRGIQKVGPIDSHVQPEPWAMPGYDHQVIMAGGSFIQGSSIEFSADAPIREPYAAYIQGGLSFYHVKLGILSGIQTLIDSGNLDIK >NC_019954.2|WP_013778396.1|1373435_1373663_+|hypothetical-protein MPYFNKILFTAFEISIFLFGYVLGRRMGKKEGVIEGMSLVPLDWRKQLFETSICPLCNQELNIKVNYDNVHNREL >NC_019954.2|WP_144312824.1|1372809_1373406_+|hypothetical-protein MSKLFILRKILSIFLTGCVIKLMDDYLDQDIDVLEDEPNLFTILELGGLPYALLLLSLAFFLDLVTALSLFLASFALGMGGNLTAKMPSGLYGYQESFIVLLLGFMSLKINMLSSMLIIAVIQLWDDVKDYKRNKINKKNLAFLLGKVECSLLAVICFLLSFYLDSIKAVSSIISTYLITYIIRLILIKNEKATSETI >NC_019954.2|WP_144312823.1|1372226_1372817_+|50S-ribosome-binding-GTPase MGKTNVGKTLFLINFAEYLGVKSFNIEFVNNTGSKTSEKIIPQTAVSYLVDKNPHKTRCLQSIIINVPVGKGKKKIKIVDTSGFIDGIHPNIEIRKAISQTLTTVRDSDIILHIIDASAVKNKDLPSSMGEVDYQIAQFAQLKKSYAILANKMDLPGANEGFEKIKQEFSGNLIFPISALHKTGFKEVKIFVMHNI >NC_019954.2|WP_013778393.1|1371200_1372208_+|AAA-family-ATPase MIDKIDNKMKNELNDHAKIHDMLISGLITTADALIMMTDLDSHKITFEKVSDEEEKLEDIMKELDELIGLSKVKNLVKEIQAFSEIQRKRAEEKLLAEPQVLHMIFKGNPGTGKTTVARLLGKIFKHIGILEKGHTVEVERADIVGEYIGHTAQKTRDQIKRARGGILFIDEAYSLARGGEKDFGKEAIDTLVKAMEDYKDDLIVILAGYKDEMDWFLQINPGLRSRFPIQIEFNDYSVDELMQIAKMMAEKRQYRFSPEALLQFEDILQSSMDNMFYNKLGNARLVRNMIEKAIRRQALRLVSQSKISRISREDLLQIEPEDIPVDISEFGGGH >NC_019954.2|WP_013778392.1|1370737_1370995_+|RNA-chaperone-Hfq MTKVQINLQDSFLNQIRKDNIPVTIYLVNGFQLKGMVRGFDNFTIVLDSDGKQQLVYKHAVSTIAPLRTINLNQGMIDQRKTDED >NC_019954.2|WP_013778391.1|1369755_1370700_+|tRNA-(adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase-MiaA MHKKFLVVIVGPTAVGKTEIAIEVAQKIDAEIISADSMQIYRYMDIGTDKPSLEERKRIPHHMIDIVDPDEEFSAVDFQVETKRHIQDIYQRHKIPLLTGGTGFYINSVCYDYTFSQVGKDTALRRQLQNEAQKRGNEYLYEELTRLDPKAAKKIHPNNLRRVIRALEVCLKTGIPFSYYEEKTKKQQSAYDLLMFGLTMPREELYQRINRRVFSMIENGLVDEVQQLLKMGYSKNLNSMQGLGYRQIIDYLDGNVTLEEAIRLIARDTRHYAKRQYTWFLRDKNILWLDISKEGKEKIITNIIRSIEGKMINT >NC_019954.2|WP_013778390.1|1367909_1369751_+|DNA-mismatch-repair-endonuclease-MutL MGKINILEQDIASQIAAGEIIERPVSVVKELVENSIDAGSKNIIVEIEKGGKKSIRVIDDGEGISRDDIRLAFERHATSKINVIEDIFHINTLGFRGEALASIAAVSNLSVTTKTRNEPIGTICKISAGVIEDVSETASKNGCLIEVKNLFFNTPARLKFLSSDTHENSRITDLITRFAMGNINISFRLIIDKKELFYSSGNGDYREVIAKVYGMDLAKQILYIEKAFDNGKIWGYISKPSFNRGNRTGQTFFVNNRFVKDLGLTFCLERAYKTMIPIRRFPIAIIFIDIDNSLVDVNVHPSKMEIKFQNENQVHHALFHAINETLKNHVLIPKETLSISPVKQSQQQISIETQVELTSDGLPDNEYDVSDSSNINNQTAATKEFVREAYTVIDVDAIKNKEHLQNDSYIPIESDETMQIIKKYEFQKILGQLFNTYIVVESKNRFYLIDQHAAHERILYEYYSKKYAKQLSNSQTLAAPYVLYLSAQEMMLLDNYKEDILKIGFDFSIFGSDSILIRSVPYIFNKPVDPITLRDALDQLSSNEYARYPSKERLIISMSCHAAIKAGDVLSPIEIQELLDQLKKTEVPYTCPHGRPTIIDITLNELQKKFKRI >NC_019954.2|WP_013778389.1|1365287_1367897_+|DNA-mismatch-repair-protein-MutS MDTPMIQQYKEIKDKYRDYIVFFRLGDFYEMFFDDAYICSKELEITLTSRDSDNKVPMAGVPYHAADQYIAKLVAKGYKVVICEQVEDPKLAKGIVKREVVKIVTPGTITDLNALEENKNNYLGCVFKNKHEFGLAFVDLMTGEFDITNLKSSYPYHEIINEVSRFSPRECLANHELSQEKSLNRKLKENLKLCFTFRDATYFDEQSALILLMSQFGEEKIKKLENRKPALIAAGACLRYLNETQKLNLSHINSISFYENHDFMVLDFICSKNLEITENLRDRKKTGSLLWVMDKTSTAMGARLLRKWLEQPLLDILKIKQRQDAIEELFNDFFLRSDLKEQLKNIYDIERLSGKLVCGNANARDLLAIKNTIKSLPQIKHILTRCNSKLLHQIYEQLDPLEDICLLLEKSIFEDPPLTIKEANVIKDGYNSEIDMLRKASREGKAWIADLERKERESTGIKSLKIGFNKVFGYYIEVTKSNLSMVPENYIRKQTLANAERYITEELKEYESLILNANEKLQELEYNLFCEIRDQLIKEIPRLKQSAYNLSLLDVLLSLAEVSYSNNYIKPEVNLSDEINIIDGRHPVVELTQKEELFIPNDTQIDCSDNLISVITGPNMAGKSTYMRQVALIVLMAQIGCFIPAKKAKIGIVDRIFTRIGASDNLALGQSTFMVEMTEVADILNNATNKSLLILDEVGRGTSTFDGLSIAWAVIEYIQKNLKAKTLFATHYHELTALKKLKGVKNYKITVKEKGDDVIFLRKIVPGEADKSYGIQVAKLAGVPNAVINRARKILVDLEQNQTQTQGELAISHIAACSDKSSQSTNEYQLNLSALKNEEIIEQIKSVNIDTITPLEALNFLFSIKKQLV >NC_019954.2|WP_013778399.1|1377014_1378217_-|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase MFISEKARNISPSPTLAVDAKAKRMKKEGHNIIGFGAGEPDFDTPEYIKLAAISAINQGFTKYTPVGGIEELKIAVSNYFEEEIGVKYASNQIIISNGAKQCLYNALYCLINEGDKVLIPSPYWVSYPEMVKLCGGISVFVPTTENNNFMLKAETLEKYIDEKTKVIIINSPNNPCGSVYPKQDLEQIAELAVKNNLFVISDEIYDKLIYDGLKHVSIATTYENILERTLLINGMSKSFAMTGWRIGFAAGPKQLIEAMENFQSHSTSNPNSIAQKASIEALTNLAKKQDTISKMVEEFSKRRTYMAKRINEMKNLSCNLPKGAFYVFMNISETFNKQYDGRIIKNSTDFAEVLLEKHNVAVVPGIAFGADDYIRLSYATSMENIKRGLDRIEEFVNALK >NC_019954.2|WP_013778400.1|1378334_1379441_-|ATPase-AAA MGEGCITRYFPGNNTPDGYCSFFDYILSWKQSRRIIILKGGPGVGKSTMIRKISNELVQKGLDIELLHCTADSDSLDGLIVKDYNIALVDGTSPHIIDPKFPGCIDEIINFGEYWNEANLFENKDIIFDLQEKVSNLYKRVYKYLKTSKMILDDLENIYSNAVINKLREAKIEEIVNQVFKKDVKVNNNKISFQRHMFASGITPEGSIHFLDELFGNVHQRFILSGNPGTGKSDLLKKILDHATSEGFDADVFHCPIDPKKIEHIIIKELDVGFVTSVKPHILSSIRQNDEIINMDFVLDYSKLKGLEEYIEYDKSVSRELFEKAIETLGNIKKVRNELEKIYASNMDFEAIKTVDEQILSKILRYIK >NC_019954.2|WP_013778401.1|1379510_1379678_-|YpmA-family-protein MGANSKLELIAKKEITYNDELYKLVDFLNKNLKNKQIIIGISKKNNKAIISIYET >NC_019954.2|WP_013778402.1|1379701_1380472_-|5'/3'-nucleotidase-SurE MNILITNDDGIYSEGLTALVQEMSEVANITVVAPDRERSATAHAITMHKPLRTEKIHIPNSKASGWKVNGTPSDCVKLALEALLDFTPDLVLSGINRGPNLGTDVIYSGTVSAAIEAALSGIPAIALSIISHNHNYENVSFNSAAQIVKKLCMQILERVFPEDSLLNINIPSVEQDEIVGVAITHLGTIKYKNSFDRRMDPRGKIYYWLAGEAIDNDEIGSDVWAVKNKYISITPLLFDLTKYEVIETLKKWDLQI >NC_019954.2|WP_013778403.1|1380483_1381698_-|tetratricopeptide-repeat-protein MTKKEVYDVLLNLKNAENNKNNKKKQYNIQFIWMSFLFWIGKYSKALCYINKLSKENNTVKIYCWKGVMYYFLKDYSNALLFLEKAEIIDPKNIDIKCLSAEIFFATAQLEKAEVRYRSLIGSDSKYQILGLYGIGRCLLKTNRYDEALGFFNKALLCIKQEDQHNLVKILNKKGLCLIELNKMEEARLCFEECLRNSPDDYNVQLNLALTLSKLKKFEEAAEIYKKILSKTPHNIIAINNCASCLAECDKNYEALEYYNIGLNIDPNNPDLLINKGYCLYKLGQYNIALECLNEAEKIVKNDIILYNNKALCLVALGKYDEALKLFNKLLDSNKCHSDDLLFNKAYCLVKKGMYSEALTCLANIKNKSSHNFDFYILKGICFEQLGNHEAAVKNFNKSLIIAR >NC_019954.2|WP_013778405.1|1382378_1383359_-|M42-family-metallopeptidase MKVLIKELTEVFGPSGSEEKIRRKIIDEIKPYADSITVDRLGNIIASKAGPGERLMLAAHMDEIGIIITNIDEKGFLRFSNIGGISPFTLIGQRVVFANGTLGVIGMEKMDDIKNLKINKMFIDIGVKSKEDAFKRVNIGDTGVYDKECSIIGDHIISNSLDDRVGCAILIEVLKRLKNPNYNLFVVFTVQEEVGLRGAKTSAYGVNPDFAIAVDVTDTGDTPESEKMAVELGKGPAIKVKDSSVICHPEVKKALIDAAERKSTPFQLEVLEKGGTDTGAIHLTRSGVPSGALSIPTRYIHTPTEMVNFNDIVQSVELLIELIEGK >NC_019954.2|WP_013778406.1|1383360_1384374_-|M42-family-metallopeptidase MLLKQLSNAFGVSGAEGEVRDIIRQNLCNVGKSKTDALGNLFIEKTSKCNKPSLMLCAHMDEVGFMIKYIENNGLLRFDTVGGIDERILVSKNVVVGSNKIKGVIGAKAIHLQDPNEREIPLKSKNLYIDIGAKDKEDAETKVKIGDYAVFDTEFSSVDNIIIGKALDDRIGCYIISEILKKTYNVPITGVFTVQEEIGLRGSAVAAYTVNPDFAIVVEGTFASDVPDTKEEEYCTTLGKGPAITFMDRTYIAEKNLINWIIEVADNHNIPYQYKRTTFGGTDGGRIYTTYQGIPTVIFSVPCRYIHSPIAIANFKDIEHTISLIDVIIHYVQERGI >NC_019954.2|WP_013778407.1|1384364_1385414_-|M42-family-metallopeptidase MDLSEVLVRLIEPAIPSGSEFQNNELIKEVFSNYCDEVKCDKFGNIISLKRGFSPEYKIMLAAHMDEIGLMVKHIDDKGFVHFAFIGGVDQRILPAQEVIIHGRKNILGIIGSKPPHIQETDERKKAVKAENMFIDTGLTPQDVQRYITIGDFITFKRKPVELLNNCFSSNALDDRAGIAVMLVALEELSKLKHAVSVYAVATAQEEVGLRGAIVSSYGICPDIGIAIDVCHGNMPDTPEYNTQKLGLGPALALGPNIHPKLYNRLKQIAEDYKIPYQLDPQPSATGTDAWAIQITKEGIPTALVSIPLKYMHTTVETLCLDDIKMSGRLLALFIASLCKDFMEGLACY >NC_019954.2|WP_144312798.1|1386428_1387232_-|protein-glutamate-O-methyltransferase-CheR MCKGVSSLNYDEFTVEIKKLCDIDLSNYKEKQMKRRIDSLIKRNGHESYDSYLTQLKKSEQHLKEFLGYITINVSEFFRNPAQWQILEQELIPELISRKNTLKIWSSACSTGEEPYSLVMLLDKMGLINRASIIASDIDEEALEQARIGIYTSKGIANVPEEMVKANFIKENDNYVIKDKIKKAVDFKIINLLEDPFPSNCDLILCRNVMIYFTEKAKEKLYKKFYNALSDNGIFFVGSTEQIMMPQKYGFISRKHFFYQKIVGGNK >NC_019954.2|WP_013778409.1|1387457_1387832_-|S-adenosylmethionine-decarboxylase-proenzyme MKNLGRHILAEIYDCDPTILNNSGLIEEILVKAALEAGAEVREVAFHKFSPQGVSGVVIISESHLTIHTWPELGYAAVDVFTCGDRVNPWDACNYISKGLCAKHMDATEVKRGLFDMPVKAINF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019954_8 | 1767715-1767831 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019954_8
|
1 spacers
spacers of NC_019954_8
>8.1|1767745|57|NC_019954|CRISPRCasFinder CTTATGAACCATATCAAATTTTGCATCGGTTTCCTTACGGTTGGCTTCAAACTTAGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019954_8
The CRISPR arrays of NC_019954_8 >merge|NC_019954|8|1767715-1767831|CRISPRCasFinder ATCGGTTTTATCGGATAGATCTTTGATTTCCTTATGAACCATATCAAATTTTGCATCGGTTTCCTTACGGTTGGCTTCAAACTTAGTATCGGTTTTATCGGATAAATCTTTGATTTC >NC_019954|8|8|1767715-1767831|CRISPRCasFinder ATCGGTTTTATCGGATAGATCTTTGATTTC CTTATGAACCATATCAAATTTTGCATCGGTTTCCTTACGGTTGGCTTCAAACTTAGT ATCGGTTTTATCGGATAAATCTTTGATTTC
>NC_019954.2|WP_013778765.1|1766915_1767143_-|hypothetical-protein MEEIVKVAILENEIEAKLLSSLLKEYKIPHFIGTYHDAAYDGIFQTQKGWGFVEAPTYYKSQILDILSDIRKGSN >NC_019954.2|WP_013778764.1|1765571_1766660_-|fructose-1,6-bisphosphatase MGSKITLSVIKADVGGFVGHGSVHPDMLKNAEEILEQQGKELLVDFFVTNVGDDINLILTHKEGINSEKVHKLAWNTFLSCTEVAKSLKMYGAGQDLLSDAFSGNIKGMGPGIAEMEFEERPSEPVIIFMADKTEPGAWNLPLYKIFADPFNTIGLVIDPKMHSGFCFEVLDLVEDKKVTFSCPEELYDLLIFLGASNRYVVKSVYTKNKEIAAVSSTQKMNQMAGRYVGKDDPVLIVRCQSGLPAVGEVLEPFANPHLVTGWMRGSHYGPLIPVSQKQAVPTRFDGPPRAIAMGFQLANGRLIGPQDLFADVAFDRARQKALKAADYIRQMGPFEPHRLPLDEMEYTTMPQVMEKLKNRFK >NC_019954.2|WP_013778763.1|1764625_1765381_-|arginase-family-protein MDFGVNIIKTDNSLDYQKKLLEEADTIIDLTSYKGLRFCSYSKILDEISNKLRKLSLGICFLGSGDFHHLSFSLISNISVKPILLLIDYHADMYETFPDMISCGSWAMQALKEEKVRKCIVVGVDAKDPAINKFKFQDEYVTFFPINIPQKLMIPKVLDELSKSQDPIYISIDKDVLCKEDAATGWEQGLMHLDELLELLLHIKKTGKVIGVDVCGEWVLPIDEIMFSIQDRYSMQLNQIANVKILERMLH >NC_019954.2|WP_013778762.1|1762806_1764390_-|HEAT-repeat-domain-containing-protein MQKRIQEKAPKVDYRLLYKKQILDYLESLKDTEQTIWQMDESMKRLFRIGEQVIPVCLAKLRENDEEIAPIVCYALEFANDYSVVEPLMDILIMPNVSDRIKARILAVLTHYGIDASELPLEIIMEDFDKMASDSMAEMLEDIESDPFLIPYILDDLDEFSLEMKLAYIKDLGAQKDERAIPILEIMASVDDYPVAHEAIKALGQIKSGKALYVLYKLATKSAEEDIQRIAHRESQRLKFNGISMEFFEPWENLQNPAKVFISSIDGIGSRVLWIAWKNPFKSRKLSFMNLLISADMGVRDCWGVSNITTREFNSSVKDFSRTTVVTKCDLDYAITLLGDALFFNKTKDYPIPYQFYFWKHLLEQNCRINCEPYYPQFTGYDLELIEKDQECFKSTFDLFNHSFFNDWFIAHPRVYDYAEENKSRKGYLIKKMTYQKAEKLFARFTEELIEPNADKVKRMLELSADFLDKAGQTEIAKTALCAFLHMDIKPLHHHPFIQRMIIESIKVALNNMKNGFDMRFNPGDFE >NC_019954.2|WP_013778761.1|1761577_1762774_-|methionine-adenosyltransferase MGKNFLFTSESVTEGHPDKICDQVADAILDSILSKDPLARVACEVAVTTGLVMVMGEITTDCYVDIPSVTRETVKQIGYTRAKFGFDCDTCAVITSINEQSPDIAMGVNCAYEARQSMDNADEFDKIGAGDQGMMFGYAVNETSELMPMPISLAHKLARRLADVRKNDVLPFLRPDGKTQVTVQYEDSKPVRVDKIVVSAQHSSSVELLTLEEGIIEEVIKKIIPAHLMDKKTQIYVNPTGRFVVGGPHGDSGLTGRKIIVDTYGGYGRHGGGSFSGKDPTKVDRSASYAARYVAKNIVAAGLASKCELQLAYAIGVSRPVSVMIDTFGTGILPDEEIEKLVINNFDLRPGAIIRDLDLRRPIYRQIASYGHFGRDELDLPWEKVDKAEILKNQAGSL >NC_019954.2|WP_013778760.1|1760259_1761414_-|sensor-histidine-kinase MHKTQINIEYLNEVINSTIDAIEKGQKEIFNIFEHARQECERIQRELEDLKAQVKDRIREVDNLAKLEKSAKFKLMIVSRDFEKHSEEDIKAAYEETKDIQIRLSIERQKEIQLREKRDDLERNLKSMLNILNQSEHLMMQLGVALGFLKGDLKDMSGHISDINERRNLAAKIIKAQEEERQRVARDIHDGPAQTLANIVIQTDICERLMERDLNEAKKELNQLKKIVRSSLQELRKIIFNLRPSSLDNLGLQAVTKRYCEEFQEETGIRTEFRFFGDKTRLGSEIEVTIFRLIQEALTNVKKHSKAKNCIVKLEFGDGKANLVIADDGVGFEVSTKDSSDSEQHFGIMTIKERVALVDGSFNIESEPGQGTKLFATIPFANRL >NC_019954.2|WP_013778759.1|1759597_1760245_-|response-regulator-transcription-factor MEKITVVLADDHVLMRKGLRKILEMEEDIEVIDEASDGIEAIEKVMEKKPQVLLLDINMPKLNGIEVTKSLREKNVDSQIVILTIYDDREYLLELLKLGISGYVLKDIEPQGLIEAVRSASRGETYIQPNLTRALVAEYNRLTQPVSNNDVRKNLTAREKEVLADIAKGMSNREISIDLGISEKTVKNHVSSILRKLNLMDRTQAAVFAIKNRLV >NC_019954.2|WP_041591439.1|1756662_1759506_-|sigma-54-interacting-transcriptional-regulator MTRKEKVFIALKNLSSDVSAAKIAEDLSFGFDAETISKVTEIDRSNVSRELNELVRENKAIKIIGRPVKFFAKSCLEEILQIKYEGDGVIEDVNNFLHNTNFANDELNTKENDPFARIIGETGSLELAIKQAKAAILYPPRGLHTLITGPTGVGKTTFAEVMYQYAIYNGNISKDAELIVFNCSEYADNPQLILSQLFGYVKGAFTGANQDKAGLIESADGGILLLDEIHRLPPEAQEMLFLLMDKGIYRRLGETDKYHTASILIIGATTENLNSVLLQTFLRRIPMTINLPSLEDRPLNERLEFIETFFMSEASNVKVPIRIHKDVIRAFLLYDCYGNIGQLKGDIQLLCARGFLDYKTYNKKEIEINIHLLPEHIYSGLLSRHKDYSEVFELLEYGKDYYIYKPDDKKLAETINLNSFDVSDNLYKEITKKYNHYLNIGFSNDKISEIINNDIIKYLKKLLKKYDHNTEKALLDKNELFKIINPKVYNAAETALILAEQKLNKHFSNRAIIGLAMHISALMERIADKSLIYYEEINKIALNNPSEFKVAKMIREVLQQELGISIPTGEIGFLTMFLSAVDTGDDYSKIGVIVLAHGEATATSIADVANTLLATEHCKAIDMPLDMKVDNALEKTIEMVKKVDEGKGVLLLVDMGSLTAFAEIITQKANVLTKSIENISTPIVIEAVRKSLLPEMTLSVLVEDLNRANPYIGRIISGDIKNRVNISSSKTILTTCISGMGAAVKIAQLLKNTLNFVDEYNVKIQPVNKAENLDNILDKNGYDDVIAVVGTVDLHIPQVPFIPIDELIIGDGVRKLEKSITGSNNYIKSKKQSEENVFINMLEELLTFLNPIKAYNVVNDSYTATIKLLGIKDSARIKSRYIFHNCCMIERLIQNDILPYNNIDELIQKKMSIYEKVKLSLANIEEAFGITVPDTEIGYIIDLLDTQ >NC_019954.2|WP_013778757.1|1756028_1756448_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MLGILIVTHSNFGKELLRSAELIVGRQENIETLGLEHGDSVEELYKKVKDSLKKLDRGEGVLILTDLFGGSPSNVTAAAMKENNIKVESISGVNLPMLIEALDLRNTTDLECIIDKIIQTGIFGIKNIKLELKEKSNSA >NC_019954.2|WP_013778756.1|1755542_1756016_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIB MADITMVRVDERLVHGQIIIKWLQAKNANKIIIVDNELCKDPIMGNFLSMTVPQNVNLEIYDIYEAVETLNASESNDKAIILLKNLYLVKFMHQKGVKIKEINIGRIPSGPGKKKIHQNVFLSDEDIDAIEYFREKAVPIIVQMVPDSLPILIYDVI >NC_019954.2|WP_013778769.1|1768601_1768778_-|hypothetical-protein MTKGEIDKSLEYVKGTMAYEDMELPDDTLEIYEKYLKEKITDSRARELLIKKNLSKEV >NC_019954.2|WP_049779037.1|1769123_1769348_-|hypothetical-protein MLDPYLFPDSEVLKNKLDIKEKDKLEIVEAEYTSLLIGAIAEENTIKGDFSFEHLCQMHCYIFRIYMNGPGNQE >NC_019954.2|WP_023211536.1|1769340_1769532_-|antitoxin-VbhA-family-protein MGMSKEKAWNYALGIIKVAGLEPSPEFLKLVDKEKRGEITMEDIKRILDKKYKMKEERDGKNA >NC_019954.2|WP_015295585.1|1770467_1770893_+|hypothetical-protein MYLQMLEKAIMLLQKYSITEFPIRIDVIDEITFKEGIKLQITKYLKKAFYYEDSKEKIIYLGHKVKATYQQREYILHETAHMYHCGNTALLPHLVVDKNESQAEDFEREFLLRQSRSPNMTFEMLVDLYYEDSTHRVRWSN >NC_019954.2|WP_023211538.1|1770909_1771257_+|hypothetical-protein MIDTHVLPVFKQKVISEITKADIRRWQNLMLKKKNPRNDKPYKPTYLHQLSAILNFAVEFYSLPKNPCSRVKSIGKKRADEMNFWTLDQFNEVTACEELPAYRVAFMMLYWAGNG >NC_019954.2|WP_013778772.1|1771899_1773435_-|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase MENTRETVVILDFGGKYAQMVARRVREAQVYCELLSYKTPWEEILQRQPKAIILSGGPSGIFTDNAPACDERVFNGDVPILAIGYGMQLMVKSLGKDIKPGSKREIGPADLLVDIDQGLFQGMGRKMTVFMDSGDLPASLPEGFEVLAHTQKTPFAAIGNGKNLYGVQFHPEESHTQCGREILNNFLFGIAGCSGTWSTRAFIQEQIKLIKDKVADKKAICALSGGVDSSVAALLVHKAIGDNLTCIFVDHGLLRKNEAENVIKTFKDKFHMNLIAVDASKRFLSKLKGVTDPEKKRKIIGEEFIRVFEEEAAKLGKVNFLVQGTVYPDVIESVNPIGGAVKSHHNVGGLPEDLEFELIEPLRELFKDEVRKIGLELGLPEELVYRQPFPGPGLAVRVLGEVTEDKLSILREADFIVTDEIKKAGLYKELWQAFAILPNIQSVGVSADRRTYTHTIAVRAIVSEDGMTGEWARLPHDLLDSISTRITSEVEGVNRVVYDITPKPPSTIEWE >NC_019954.2|WP_013778773.1|1773615_1774803_-|ABC-transporter-permease MNFFESIVIAWESIIANKMRSLLTMLGIIIGVSSVITISALGQGGQFAISKEMDAFGANRFGVYYKYNSDNPLTQADFFTIQDVKAIKDISPVVENIAPVSWDSANVRLKGKQIGVQIAATTSDYIKIANLKLDAGRFLNHEDDNGKKHVAVISESLAKELFNSSGAVGEKIMVGNQPFKVIGVLRREETVFSGQDNKLMYIPISTYFSISGSDWVDNIEGKAISQADVDTAIEHSLSILHRRHHNTDKYQAWNSQKEMDSVNKVTGIITIIISAIAGISLLVGGIGIMNIMLVSVTERTREIGIRKALGAQETDIMMQFLIESLVLSFFGGIIGMLLGFGVSKIIAGFIKLPTVLSWQMIALAFTFSAGVGVCFGLYPARKAALHDPIDALRYE >NC_019954.2|WP_013778774.1|1774789_1775473_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MILIENMAKVYRNGENKVSALRDVNLHVKKGEFVAIMGPSGSGKSTLMNILGCLDKPTSGEYYLDGKSIAQLNSRQLAHTRNKKIGFVFQNFNLLPRINSLRNVEIPMIYARVAPNERRKKAMEALKSVGLEDRWHHKSNELSGGQKQRVAIARALVNSPEIILADEPTGNLDSKSGAEIMDIFADLHMKGTTIVLVTHENEIARYAQKVVIFRDGRKVEELSSELL >NC_019954.2|WP_013778775.1|1775472_1776699_-|efflux-RND-transporter-periplasmic-adaptor-subunit MNKRKKILIIAVILLIGVAFFIIRAKRQPNTAMALPTVKAIKGDISSKITALGNVETRQKQEVYSGIQGMVEYIAEEGQQVKKGDVVLKIDDGELKLELEQAQSKVKQQNVELSRLLGGPRPEELKKARIKYQEALTSYEAALEDYEKNQGLFNEGAISENEYINIKRELDVKKNQLAIMEVELSLLENPDEHEIALKQAALEEAEKSLANITKKLDKTIILAEFDGIVIKQEIKQGMTVSSGNLLLSIGSPDDLQIDIGVNEYDASNIKVGQKAIITGDGFGDKIYKGEVVKIAPSASTIQTSRGNETTVKATIKVNDPDENIKPGFSTTAEITIEDKQGAVLLPLECVISGEKGKKVMLVKDGAISEREVKTGIENELYTEITYGISEGDEVLQNPSANSSFEGDA >NC_019954.2|WP_013778776.1|1776914_1777979_-|ABC-transporter-permease-subunit MTLQTLPFNKALLKKDWKMTKWLCFAVAGILFFTMTLGVINTYNNYQRTIQEMEKHPEWYAGYDKDEYKAELKNLLQDKFKQLSGMGAMLVVFTPMAAAALLFGEEKRKKTFEILATMPFSRTEIFFNKVVIAFVNAILPFLINAVIMAAALWFSKGLRDFYSAGMVMSWFGADAFRLFVILSFSLLFASLTGTSISQLVLTIIFFIFPIGFTGLLYMNMAVWGYRISVIDEFLNIFGSYTMPGILSNIKEVPITFHLISAIIMLAAAKLLFDRNKLERSGETLEFETIETFFKFGVAVCTSMLIGVIVTGCAGSFIYFTNNVPRIFTIIGYIIGIFLGWFVASYSIKTNRAKV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019954_9 | 2541765-2541891 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019954_9
|
1 spacers
spacers of NC_019954_9
>9.1|2541804|49|NC_019954|CRISPRCasFinder ATTGCTACTATTTCTTATAACACAGAGGGACTGTCCCCTTGTGTTTAAT |
WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019954_9
The CRISPR arrays of NC_019954_9 >merge|NC_019954|9|2541765-2541891|CRISPRCasFinder AAAAAAGAAGAACCAACCGGTTAAGGTCAGTTCTTCTTGATTGCTACTATTTCTTATAACACAGAGGGACTGTCCCCTTGTGTTTAATAAAAAAGAAGAACCAACCGGTTAAGGTCAGTTCTTCTTG >NC_019954|9|9|2541765-2541891|CRISPRCasFinder AAAAAAGAAGAACCAACCGGTTAAGGTCAGTTCTTCTTG ATTGCTACTATTTCTTATAACACAGAGGGACTGTCCCCTTGTGTTTAAT AAAAAAGAAGAACCAACCGGTTAAGGTCAGTTCTTCTTG
>NC_019954.2|WP_013779472.1|2540877_2541669_-|ImmA/IrrE-family-metallo-endopeptidase MIDLDFRRKSNGVPILSKAEIETLAEMVIKDYNPKLLEEPGSLDVEDFAEGYADLEMDYKDLTHNQSILGMTVFCNCYIPIYNAEENKAEEIPVDEGTIIVDNSLLNDGQLRRGRFTLGHEISHWLLHRHIYMIDKNQLSLFDFLPNDTQPVIKCRSTDIENSGKRQFETDDDWMEWQADYMASALLMPKKAFTRAVKEKFKAMGLKKDYFEVGTDFELNLRAEVLPYELADLFDVSVTAVRIRLKGLNFIRKQQENNQSLFG >NC_019954.2|WP_013779471.1|2540476_2540863_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MNKFGEFITARRKAEKITLRKMAELLDFSPAYWSDIEKGRRNPPNINKLEELARILKLTSEEKYHMIDLASEDRDEIPMDLPDYIKDSGLARTALRKARRMDEKEGSSDITERAWKEFIKTLDEERGK >NC_019954.2|WP_013779470.1|2540104_2540473_-|hypothetical-protein MNNLFKDMLAEHFEQEIYDFLQDHIMNNYDQYDLTRRANEVNEVLEASLDLAEVLRVYNIKQDGSDVAFNMLVSCDIEIGDYFAGENITESVCQWFELSCSAVLENATLTDFSIDGIEAYNK >NC_019954.2|WP_013779469.1|2539367_2540090_-|ImmA/IrrE-family-metallo-endopeptidase MNLSKDLVPIISKKDMDIEAAKFLEKYCPAALEKPMPIPVEDIAEFKMGLEIDYANLDKNCDTLGMVLFSNGMVELYDKETKKYFKRPYEKGTILVENDLVELDNKGRERFTIAHELVHWDKHQLRFMTLSYQDKTLAKACRCPSEKVHRPKKPDEWVEWQADNLAAAILMPAEMFRLKAEEIKNKYRGRVGTKINEFMWKGFSPGMIAEFITDELADFFQVSKQAAGIRIQTLGINLPK >NC_019954.2|WP_013779468.1|2538590_2538914_-|HTH-domain-containing-protein MGPNERRMEIIEALCRRRQDTMSNLAIEFGVSVRTIKNDIDILSLSYPIETIRGRYGGGVRVADGYYLHKKYLKPEQQELLERLCANLSGNDLMVMNSIIKDFALNA >NC_019954.2|WP_013779467.1|2538320_2538572_-|hypothetical-protein MSDLHYALAEELEKLAAGYRALARGEVKPYEANIQDISIVLTEKIKKGKVSEIKALLKKYGATKLVEVKKKDYEAFYKEAKHL >NC_019954.2|WP_013779466.1|2538024_2538306_-|hypothetical-protein MSKMKLALDVVENLRSLADSIEALTDVVEGNEPKEKVEDNLPTLEQVRAKLAALTQSGKQAEVKALITKYGAKKLSEIPEDKYPELLKDAEGI >NC_019954.2|WP_013779464.1|2536331_2536865_-|DUF2815-family-protein MSTKVVTGKVRFSYANVWEPQSVNGSDPKYSVSLIIPKSDKKTIEKIKAAIEVAKQEGASKLGKKIPANLKTPLRDGDIDRPDDEAYADSYFVNANSFTKPGIVDKNVEPILDQTEFYSGCYGRASITFYAYNVNGNKGIACGLQNLQKLEDGGPLGGKSRPEDDFEPVEIEEDFLG >NC_019954.2|WP_013779463.1|2534373_2536332_-|DNA-polymerase MTILSIDIETYSSVDLTKCGVYAYTQAEDFEILLFGYAFNNDPVEVIDLASGEQIPDEVTNAITDSAVIKTAFNANFERTCLAKYLNKPMPPEEWRCSQAHALTLGLPLNLAGVAKCLGLADQKMSEGKALIRYFSIPCKPTKANGGRTRNLPHHDREKWETFKAYCKQDVVVERSIRKRLENYPMTDKELKLWSLDQKINDYGVRVDRQLVENAICCDGIHQKELMAEAIDLTGLENPNSPAQLKTWLKGNHNIQVDSLSKANVEELLNKINHPTVTRVLELRQDMSKTSVRKYEAMDRAMGGDGRIRGLLQYYGANRTGRWAGRLVQVQNLPRNNMKDLDLARKLLLAGDYESLELLFDSVPDVLSQLIRTAFVPSPGHRFIISDFSAIEARVIAWLAGEKWVVDTFKGHGKIYEMTASKMFGVPMELIVKGNPEYELRQKGKVAVLACGYQGSVGALKAMGALNMGLKEDELPAIVAAWRESNPNIVKLWWDVEDAAIRAVKDRTSITMQYGLKFYYKSGVLFIRLPSGRNLAYVKPRIELDTRFNKDKLTYEGIMLGNKWARIDTYGGKLTENIIQAIARDCLAESLLRLDKAGYKIAFHVHDEVVLDVPQGFGSLKEVEEIMSQDINWAKGLPLRAEGFETNYYMKD >NC_019954.2|WP_013779462.1|2534163_2534358_-|hypothetical-protein MFYVKAKINDAVEIAAEIHDDNVFCTCPGCGCEVEVDLAEVFSNSDSDLYGTAVYCTKCRLEGK >NC_019954.2|WP_013779473.1|2541904_2544163_-|Ig-like-domain-containing-protein MLRISKRLLSLLLALTLILSMTTVAFAKDYDLINKNTLTRNDFFDLTDDMDFFSDVLDNPGQYVIEVNGKYYEVEQVDAATQDGTGIDEAVVGLVPVDLDTDEELKVVSVSAINAKEVQIKFSKAVKKDTVITTGAPDTLKNITFTNIGSAPAITSTSAEAKLSEDGKTLTITASGTEYFDGQYAVLVPVAVTDLDGNPIEAYSAVVTLKDTVRPTISGPTYPDNNTVKFEFSEPMNLTSGTTLEGISTLKDKNGATVSITGLITLATDKKSFTLNMAGLTVDEEYKLTIVGAKDFAGNLISPNPVTVSFKKQVVDNVNPEVVSVEAVNDSKLVVTFSEPIKTTPTIFKLNIGSTGTPVAVTTSNATVSDDKTVVTVDLTTAGFTSLSGLKRVDITEFQDLSGNPATITDSAYNTLINFVPDTEAPVVKTVTVETISGTRYIVVEFDEDVTVTAAALTPVTYVVDGVQKTLTGGIAVAAVSGYDKDSDGNDESVKIDTENYDGSGAVMPNGEYTITLPANLVADAAGKKNAQTTINVTIGDIADTTKPAVLSGLAGINLPDNDTVTIQFTEEVTNATALNTANYTVEGEKVFVSAIFDGDKTKVKLTLRDGAIDVNGERSLEIKNIADNAGNVMDPVTYPVDFTENVKPQMLSAKIVDVDKILVTFSEGIKATSAIPANFTVKVNGVSDTVTGVTEEDGATAVADGDTKVLLTLTTGIANLSDVVTVEIADETIEDVNGNLNKGAKTVTATR >NC_019954.2|WP_013779474.1|2544246_2547246_-|S-layer-homology-domain-containing-protein MRKAKKLLVTLLVLTFVMSTFSVGFAATTTDTKDLPTEVVRAMALGYLKGDAQGNLNLENPITRAEALAIIIRVSGLETSAELMKGQTKFADVNPDPSLEWATGYINLGVGQGIINGYPDGTFRGNANVTYAEMAKMILYAMNYGVTVEGAPWPAGVMGKADDLGLFDKVSSAPDAPAIRGDVVKMIDNSLTIKHLEQTGYGDLKQYVEGDKTFLSKMDVDELEDVRVTEIARVNDKLDDDEIELTEYDKNGKKVDSNIYTLIADVNPEAIFGLKVDAWVNDDDEVFFVEVSTEDKDILLDAVDAEESDEDEIYLKEADKAYKWADSAVAYVNFEEKDLDEIPEDAYGKFVLDRGQVAFANLFDFDEVGVVTAVDGKVIEFININTDEDEVDLSDYDDVYIYNPDFTKADVKDIDEDSAIFFWEGDDDDVYIIVKNETVKGNVDSVKEDKIKVDGKEYKRGSFKGTKALITLDKGDNYEEWADLEAVEDFVDEDVMLVLDLRGRVLLVTGAAKATSGNLYGIVTYAKSGRYPTLTVFNKEGKEVDYVAESSKEFDELTDLKYNANTPQYAALKYKLTSDSEIAEERSVYAVIEGTDITSRKSYDSDVKASEVIFEGKLTKDTDKKTFKLNGESFYISSDTVIMKALNEDGELDPETISVDRFVSIGVSQYNEAVVFGEAGKDADLIVMLNKAFEGTEEDYFYGVVTDKPYKSGSSYYATINVFGEGEKDYKVNDAADFKKGVVVAFNLNSKDEAVLKTSKLYDDKILKKYDDGFVTIDGKVYKVDSAAVLYNKDKDGDLDKKIGRTKLKEYANKRIDFALDDGIVVAAVVYDGKDGSSDTKVTGEVTYINVDEELIEVDGKVLELDKRVRLVDADGKTIAIGPKDVAKQLKVGDILSKITEEDGVVTEMKLAKDDDDEPGVPEEELTAEATLGSLLGVKYAEITLSDSSRIDEVKNVKVNGVVRDYNIKGDIIRVNFGSEITDIKLILNDGSVIDVTIK >NC_019954.2|WP_013779475.1|2550092_2551175_-|peptidoglycan-bridge-formation-glycyltransferase-FemA/FemB-family-protein MEIKIINQDEKKFFNDFMAWGPKGHVLQSYEWGEVKLHTGWEPIRLLVMDEGKPKAGISILKRKLPIPGFNKCIFYAPRGPVADYTDKDTLRFLFTKIKSMAKQHGAILLKIDPDIKAPNDEVVKNLRSLGFNLIDSGKDFDGVQPKFVFRLDISKPLEEIAADFHHKTRYNIRLAKRKGVTVKVGRREDLKPFYDILEETCIRDEFLVRSFDYFETLWDELVENGLARLFMAEYEGRYIAGTLAFIFGDKAWYIYGASSNEDRNVMPNYALQWAMIEWAKQNNCTMYDFRGVSGDLSPDNPLYGLYRFKKGFNGEFTEFIGEFDMPLSPFFYYLWVQVIPAYRKIRKDVVNFFRRAKKR >NC_019954.2|WP_013779476.1|2551305_2552562_-|methyl-accepting-chemotaxis-protein MKGIRLRVVLITMLLVAFSLGGYIYCFHGEDFASTNNLLAAAAAVLVSGIISFLVTKGASRPLEAIEQSLSAIAKGDFTVKAKRIIGDDIGALADVYNDSLDKVRKILKNAKDTTADMLASAASIGKITHQSKEMSSNIETSIKNALNHITDRLKEMKDLIDGMSDMLSQMTGGVEQIAVSSSEAAATASDASQLAESGRTAMDQVTLQMGKIKESSNYTASVIKSLGESSETIGQIVETITGIADQTNLLALNAAIEAARAGEQGRGFAVVADEIRKLAEQSGDAAKQIGQLIGTVLNEVDKAVKAKDQGSANVENGIKAVKSAAETFEQILVAVGKVAEQMQEISAATEQMAASTESTSESFKKMTDISLDGSNQAQTIIDSIEKQQKLLDEIASSVLRLGEDADKLDKIMNVIKI >NC_019954.2|WP_013779477.1|2552625_2554233_-|CTP-synthase MSTKYIFVTGGVVSSLGKGITAASLGRLLKSRGLSVTMQKCDPYINVDPGTMSPYQHGEVYVTDDGAEADLDLGHYERFIDVSLTKNSDITTGEIYWTVINKERQGKYHGKTVQVIPHITNEIKERIIRVGEESKADVVITEIGGTVGDIEGLPFLEAIRQMKTDVGRDNVLYIHVTLVPYISTAGELKTKPTQHSVKELRSIGIQPDIIVCRSEYAIPKDLKEKIALFCNVEPECVIQNYDAETIYEVPLILKDEGLDEIVAKKLGVDGRKAQLAEWVEIVQRIKNPLKQVNIALVGKYVELHDAYLSVVEALCHGGAANDAKVNIKWVHSEELEQESEKLSSVFYDIDGIIVPGGFGERGIEGMIKTVEYARENKIPFFGIGIGMQCAIIEFARNVCGLKDAHSTEINPETPHAVIDFPPEEKALNVKGAMRLGSYPCRVAENTIAMAAYGKELISERHRHRYEFNNDYRKVVTNFGLVLSGISPDDKFVEIIELKEHPWFLGTQFHPEFKSRPNKPHPLFTNFIKAAVNLKN >NC_019954.2|WP_013779478.1|2554432_2555071_-|MBL-fold-metallo-hydrolase MKIRWFGHSCFLLESKDGTKIVTDPFDGSVGYKIPMVEADIVTVSHDHYDHNYVEGIQGDPEVVKSTGECAISGISIKGIPAFHDEAKGAKRGPNIIYTFEIDGIRVCHVGDLGHLLSKTQIEEIGDVDVIMIPVGGTFTLDADGAAALIEQLSPKITIPMHFRTPAVSMPIDPVDKFVEKMGDVEHLDSNTIEINPETLDNQNRIVVLNYE >NC_019954.2|WP_013779479.1|2555224_2556934_-|arginine--tRNA-ligase MKDLKTQVQQKLMDIVMSALNKAIDDGALPIKDIPDFHIEVPQDKGHGDFATNIAMILAREAKMPPRKIGEVIAERVDTTHSNLIEKIEVAGPGFINFYLVPTWVNAVISDILKYGSDFGRCNTGEGKKVQVEFVSANPTGPMHMGNARGAALGDALASILEMVGFDVTKEFYINDAGNQIENFGLSLEARYLELMGKQGEIPEGGYHGEDIIEHMKDLIEQEGDRFLYMDSPTRRAYFINYALEKNIERMKKDLENFGVHFDVWFSEQSLHSSGKVNEVIKILTDRGYTYEKDGALWFKASQFGETKDEVLIRANGLPTYFASDIAYHKNKFDRGFDWVINIWGADHHGHIARMKGALEALGYDPDKLTVIIMQLVRLYRNGEIARMSKRTGRAVTLADIVEEVGKDAARFFFNLRSADTHLDFDLDLAIKQSDDNPVYYVQYAHARISSILRQAKEQGVDIPNVNNLTQNDMNKYADLLIEESEIELIKKLADFPGEIKLAADNLAPYRITVYSQELASAFHSFYNKCRVLTDAQDLTTARLLLVMAVQQVIKNALAILGISAPDRM >NC_019954.2|WP_013779480.1|2557023_2557374_-|hypothetical-protein MDLGWLKMIINVITNEAVMEPLIALILGYGVNIYAKNRRFKIIMDITADIVDYIEENYKDWGITGNEKMDKFLELFIKEFKKQVGRKPKDVEIETARIRAEALVQRARRDGGGKKR >NC_019954.2|WP_015295929.1|2557393_2558002_-|orotate-phosphoribosyltransferase MTDEDILKLFYETGVLKTGHFLLTSGRHSDKYMQCAQLLQYPKSTEQVCAKLAENVKDLGIQTVIGPAMGGIIISYEMGRQLNTRAIFTEREEGKMALRRGFTVKPGERILVVEDVVTTGGSVKEVISLIKELGGEVAAVAALVDRSGGKVDFGVPAHYLLKLQVESYAPEECPLCKKKLTYNKTRQSKKIISALIPPSRII >NC_019954.2|WP_013779482.1|2558040_2558736_-|orotidine-5'-phosphate-decarboxylase MSYDYSKVIIALDTPDEQKALEIVRLLKDKVSVFKVGLELFCSQGPKIVKKINNEGCKVFLDLKLHDIPNTVAGAAKACLSTGAFMLDVHASGGCQMMRKAREAVDNADVSPKPILLAITVLTSLDESDLAAVNINKSPTEQVKTLALMAKESGLDGVVASPKEISVIREAAGDDFLIVTPGVRPAWAATGDQKRVMTPAQALDEGADYIVVGRPVTAAPDPAEALNKLFQ |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019954_2 | 2.8|131774|35|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 131774-131808 | 35 | MK448998 | Streptococcus phage Javan636, complete genome | 7076-7110 | 7 | 0.8 |
NC_019954_4 | 4.6|147915|36|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 147915-147950 | 36 | LR694610 | Escherichia phage rV5_ev168 genome assembly, chromosome: 1 | 109903-109938 | 7 | 0.806 |
NC_019954_4 | 4.6|147915|36|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 147915-147950 | 36 | LR694611 | Escherichia phage rV5_ev158 genome assembly, chromosome: 1 | 109955-109990 | 7 | 0.806 |
NC_019954_2 | 2.8|131774|35|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 131774-131808 | 35 | NZ_CP018741 | Bacillus cereus strain FORC_047 plasmid pFORC47_1, complete sequence | 152926-152960 | 9 | 0.743 |
NC_019954_2 | 2.8|131774|35|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 131774-131808 | 35 | NZ_CP018741 | Bacillus cereus strain FORC_047 plasmid pFORC47_1, complete sequence | 159466-159500 | 9 | 0.743 |
NC_019954_2 | 2.8|131774|35|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 131774-131808 | 35 | HM452126 | Aeromonas phage phiAS5, complete genome | 5323-5357 | 9 | 0.743 |
NC_019954_2 | 2.8|131774|35|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 131774-131808 | 35 | NZ_LR214939 | Mycoplasma salivarium strain NCTC10113 plasmid 2 | 55477-55511 | 10 | 0.714 |
NC_019954_2 | 2.17|132376|36|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 132376-132411 | 36 | MN694515 | Marine virus AFVG_250M511, complete genome | 10209-10244 | 11 | 0.694 |
1. spacer 2.8|131774|35|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448998 (Streptococcus phage Javan636, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
attgcttcttcaacacctttttcaattccagtgtg CRISPR spacer attgcttcttcaacacctttttcaaatgcttcgaa Protospacer ************************* * * .* .
2. spacer 4.6|147915|36|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LR694610 (Escherichia phage rV5_ev168 genome assembly, chromosome: 1) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aaatatgaatttatagataaaatggagcaacaaggc CRISPR spacer aaactgtaatatataaataaaatggagcaacaagcc Protospacer ***. *** ****.****************** *
3. spacer 4.6|147915|36|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LR694611 (Escherichia phage rV5_ev158 genome assembly, chromosome: 1) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aaatatgaatttatagataaaatggagcaacaaggc CRISPR spacer aaactgtaatatataaataaaatggagcaacaagcc Protospacer ***. *** ****.****************** *
4. spacer 2.8|131774|35|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018741 (Bacillus cereus strain FORC_047 plasmid pFORC47_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
attgcttcttcaacacctttttcaattccagtgtg CRISPR spacer ttgccttcttcaatacctttttcaatacctttttt Protospacer * *********.************ ** * *
5. spacer 2.8|131774|35|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018741 (Bacillus cereus strain FORC_047 plasmid pFORC47_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
attgcttcttcaacacctttttcaattccagtgtg CRISPR spacer ttgccttcttcaatacctttttcaatacctttttt Protospacer * *********.************ ** * *
6. spacer 2.8|131774|35|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM452126 (Aeromonas phage phiAS5, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
attgcttcttcaacacctttttcaattccagtgtg CRISPR spacer tttgctacttcaacacgtttttcaatagcatcgac Protospacer ***** ********* ********* ** .*
7. spacer 2.8|131774|35|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR214939 (Mycoplasma salivarium strain NCTC10113 plasmid 2) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
attgcttcttcaacacctttttcaattccagtgtg CRISPR spacer attgcatcttcaacacatttttcaatgttttcatt Protospacer ***** ********** ********* .. ..*
8. spacer 2.17|132376|36|NC_019954|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694515 (Marine virus AFVG_250M511, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
tttggtatgattttcagggtgttggtggtagaacag CRISPR spacer attggtctgattttgagggtgttggtgtaggcttta Protospacer ***** ******* ************ .* . .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
937832 : 990453
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_019954|937832:990453|DBSCAN-SWA AATGCTGCATGTGGTGTTATTGGAACCTGAAATACCTCAAAACACTGGCAATATTGCCAGAACTTGTGCTGCGACTGATTCGGTGCTGCACCTTATAGGGCCTTTGGGTTTCAGCTTAGACGATAAATATTTAAAAAGGGCCGGGCTTGATTACTGGTCGTTGCTGGATGTGAGATATTATGGCAGTTATTTGGAATTTGAGGAGAAAAACCCCGGCGGATGCAAATATTTTTTAACAACAAAGGCAAAGCAGTGCTATGCGGATGTAAGTTATGAACCTGACTGCTATCTGGTATTTGGAAAGGAAACGGCGGGGCTTCCGGTCCCGCTTCTTAAGGCTAACCGTGAAAGATGTATCAGAATTCCAATGACGGATGAAGCCCGCTCTCTAAATTTGTCGAATTCTGTTGCTATCGTAGTTTATGAAGCACTGCGTCAAATGGGATTTAATGGGCTTAAAACAGCGGGCCCTTCTAAAGCTTAAAGTAAAAAATACCGGCTGTGATTTACAGAATATCACGACCGGTATTTTTAATTGGAGTAAAGTTCTTTTTATACTTTAAACTTGTTAACAAGCACTAGGAGATCTTCGGCAAGCTTTGCCAAATCTTGAGATGATGCGGATATACTTTCCATAGTAGCTGTTTGTTCTTCTGTTGAAGCTGAAACCTCTTGGGTTCCGGCAGCAGTTTCTTGGGAAATACTGGATATATCATAAATCATGCGGACTATGGTATCTATATGACTATATTGCTCCGCCAATTCACTTGAAATATTTTTAGCTCTGTCTGCAACCTTGTTTATTTCTGTTATCAGGGTATCAATATGGTCATTTATGTCTTGAATGAGCTCCTGCCCTTCCTCTACTTCCTTTTTGCTGTCAGCCATGGAGTTTACGGCAAACTTACTGCTGCTTTGGATAGTCTTAACTATATTTGATATTTCTTTTGCCGCTTCACCAGACTGCTCGGCAAGTTTGCGTACTTCATCGGCTACAACCGCAAAGCCCCGGCCGTGCTCACCGGCTCTGGCTGCTTCAATTGAGGCATTTAAAGCGAGCAGGTTAGTCTGGTCTACAATCTCACTTATAATACTGGTAATATTGCCTATTTCGCGCAGTTTTACGTCAAGATCCTCCATTATTCGATTTGAATCATCGACTGATGTTTTTATTGAATCCATTTTATCTTTAGACAGGCGAATTTTCTGCTGGCTTTCCTGTGCCTTTTGCGTCATATTCTCTGCTGAACTTGCTGTTGAGCGTGCATTTTCCTCTACATTGCCGTTGGAGATAACCAGTTGATTTACAACTTCGGATATTTCTTCTAATTTTTTGGCCTGATCATTGGCTCCTACAGCTATTTGCTCCACTGCTTCAGCTACCTGTTGAGCTGATAATGAGCTTTGTTCGGCACCGGAAGCAAGCTCCTCAGCCGAAGCCGAGAGATTTTCAGCAGCAACAATGACCTCTTGAACCAAGTTTTTTAAATGTAAGGTCATCGTATCAAACGAAGCGGCAAGTGCACCGATTTCTGTGTTGTCTTTTAATTTTACAACACCTGTAAGGTCATTATTGGCCACACTTTGTGTAACATGAAGCAGAGCTTGTAATGGGTTCGTTATAATACGTCCAAGCAGCATGCTTAAGCCAAGACTGATGAGTGCAACTATCAAAGATATAGTTGCAACAGTTTTAGTTATAGACGATATATGGGCAAAAGCTTCATCTGTAGGCTGCTGTACAAATATTCCCCAGTCCAGCAGCTTATAGTTGCCAAAGGCTACGAATTGCTCTTTTCCTTCGTCATCCGTATATGTAGTAAATCCTTTTTCGGAATTTAAGGCCTTTTTTACGAAGTCATATTTTGAATAATTTTCTCGGGCTTTAACAAATTTGTAATCTTTATGAGCTACTACGGTACCATCCTTGTCGGTAATAAAAGCAAAGCCTTCTTCGCCTACTTTCATATTCATTACTATTCGCGTCAAACTTACCAAAGATACATCCGCACTGATTACACCAATAGGTTGGCCAGTATCTGATAAAATAACATTGGAAATCGAAACAATAGAGTTTCCAGACATAGAGTCTACCCTGACATTAGAAATGAAATTTCCTTTAGCCTCTAAAGCACCGTTGTACCAAGCCTCATCAGCAAGATTATAGTTATCCGGAAAAGTTGCAAAAGGCACGGCAAAAACACTTTGATCTTCAATGTTTGCAACATATATGCGGAGAACTTGAGGGTTTTGCTGAGCTACGTCATACAAAAACGAAGATATTTGGTCTTGATCCATAGTCCTTACGGTTTTAGTACTTGCGATAAAAGCAACAAGGTTTTTGTTTTGTTCAATGAAAAGGTCTATGTTGTCATTTAAGTTATTTACTATTATATTTGCCTTATCTTGGACTTCGCTTGTGATTGCATCCCTAAATATATATGTAACTACAGCACCCATGCATATAAGAGGAATAATTGACATAAGGACAAAGAAAGCTGCCAGCTTAGTTCTTAAGCTGCTCTTGACATTGGTCGTAATATTTTTTGATTTTTTTGGTTGTTTTTTGTCCCGCTTTAGTTTTAGTGGCTTAATTTTCAAAAATATGACCCCCTCAAATATTATTGTGATTATAAATCAGAAAATAAAATAAATAAAAGCAAAAGCCCTAATGGGCATTTTAATAGATTACATAAACAAAGGCAATTATAGGTTACTCCCTTAAAAGCCTTCGCTTACCAGCAGCCTGGCTGCCATAGTTTTTCGCGAAAAAGCCAGAAAAACTTTAGGCCCATGGCTTTGCGCCCACCTCTTTGGAGGAGTTTGCCAAATTATATCTTTCTACTAATTATATCTAATGCTGTAATATTATACAAGCAAAACCGCCGACAAAATATTGGATTTTTTTATTATCAATGTTACAATTTAAAAAGCAGCATTGATTAGACTGGAGGAAGTTTTTTGAAAAATAAAATAAAAGCAGCATTGCAGCTAAACGGTCGTTATGAAGTGCAAATAGAAAAGATGGCGCATGAGGGGCAGGGAATAGGAAAGATAGATGGCCTTACCGTTTTTGTGGAAGGTGCAGTGCCCGTCTTTAGACTTTAACACCATGAATATTTAGGAGCAATCAAAATATAAAACATAAGAAATCGGCGCAAATATGCGCTTTTTTTATTCTAAAAGTACTTGCAAAAAAATCTTTCTTGGTGTATGATTAATGGTGTTAAATGGTGTTCTGAGAGGGGGCGCTCTATGGCTTACTTCCTTAAAAAATCAAACCTAAAAAAAGGGGTCTATCTTCAGATCTATGAATCTTTCTACAACCGCGACAAAAAGGAGACCGCACATAAATCATATATGGCTCTCGGCTACGTACAGGACCTGATCGACGCTGGTATCCCTGACCCAATTGCCTATTATTCCGATGTCGTCAAGCAGATGAACATAGACGCAAAGCGCATTAAAGAAGAAAGTAAGGCAAGGCAGATCGCTGCATCCCCTGAAAGGCACCTCGGCTATTTTCTTTTACAAAATATTTATAAAAGCCTACATGTCTCCAATTATCTGGATCTAATGCAATCCGTTAGGGACTTCCGTTTCAAGCTTTCCGATCTAATGGAAGCCCTCATATACAGCAGGGTGGTTGACCCACGCTCCAAAAGCAGAACCTGCCATGATATTCTCCCCAAGCTGTATGAGTCTTATGGGCTTACTTATGACCAAATCTTAGATGGCGTCGAGTACATGGGCCATGAATACGAAAAAATTATTGAGATCTTCAACCACCAGGTCAACCTTAAATATCCCCTAGATGCATCTACCACTTACTTTGACTGCACAAATTTCTATTTTGAGATCGACAAGGAAGATGAATTCAGAAGGAAGGGGCCTTCAAAAGAAAACAGGCATGACCCCATCATCGGACTGGGGCTGCTGCTGGATGCAAACCAGGTTCCCATCGGGATGAAACTCTACCCCGGTAACGAAAGCGAAAAGCCCGTTATTCGCCAGGTCATAAAAGAACTCAAGGAAAGGAACCAGATATCCGGCAGGACGGTGCAGGTCGCCGACAAAGGCCTTAACTGCGCAAACAACATCATCAGTGCCCTGAAAAACAAGGACGGCTACCTTTTCTCGAAATCGGTGAAGCAACTCCCCGAAACTGAAAAGACGTGGGTCCTCTTAAAGAACGACTACAAAAAAATCACTGACAGCAATGGTACGCTACTCTACGAGATCAAGGAATGCATCGATGAATTTCCTTACACCTATACAGACGAAAATGGGAAGAAACATACCGTCAGGCTGAAGGAAAAAAGAGTTGTCACCTACAACCCCAAGCTGGCGGAGAAAAAGAAGTATGAGATAAACAGAATGGTTGAAAAAGCAAAAATGCTAAAAGCAAGTCAGGCAAAGAAGAGTGAATTCGGCGAATGCAGCAAATATGTCACCTTTGGTTGTGCCGACCCCAAAGGGAATGCCATCGACGGCAAGGTAAGGGTAACCATTAACCGGGAGGCCATTGACAGGGATTTAGAGCTGGCTGGCTATAATCTCCTTGTCACGTCAGAAACCAAAATGAAAGCAGATAATATATATAACACCTACCATAACCTCTGGAGGATTGAGGAATCGTTCAAAGTGATGAAATCCTACCTTGATGCACGTCCTGTCTACTTGCAAAAGACAGCATCCATCCATGGGCATTTCCTGGTCTGCTATCTGTCTGTACTCCTCATCAGGCTCTTGAAATTCAAAGTGCTAAAAAACAAATACTGCACGGAGAGGCTTATTAATTTCATCCGGGAGTTCCGGGTTGTAGAATTGGAACAGGATAAGTATGTGAATATCACGGCTTCTTCTGATTTCATAAAAAGCCTGGCGGCTGAGCAGGGATTACCAATTACTAATTATTTCCTTAATGAGTCACAAATAAAAAAGATGCTAAAGCACAGGTTTTGAGCTTTAGCACCATTTTTTTATTTTTATTCCTAAAG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54 | Erysipelothrix_phage(18.18%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1081288 : 1111233
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_019954|1081288:1111233|DBSCAN-SWA 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47 | Paenibacillus_phage(10.71%) | capsid,head,integrase,tail,portal,transposase,terminase | attL 1084543:1084602|attR 1111324:1111410 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2466860 : 2556934
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_019954|2466860:2556934|DBSCAN-SWA 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95 | Erysipelothrix_phage(20.93%) | capsid,head,integrase,protease,holin,tail,bacteriocin,portal,tRNA,transposase,terminase | attL 2494794:2494817|attR 2527294:2527317 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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