Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019776 | Cyanobacterium aponinum PCC 10605, complete sequence | 11 crisprs | cas14j,DinG,csx1,csm6,csm3gr7,csx19,cas10,csa3,cas2,cas1,csx18,2OG_CAS,c2c9_V-U4,cas6,csm5gr7,csm4gr5,csm2gr11,RT,cas14k,cas3,WYL,DEDDh,cas8b5,cas7,cas5,cas4,Cas14c_CAS-V-F | 0 | 6 | 2 | 0 |
NC_019777 | Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence | 2 crisprs | DEDDh,WYL,cas10,cmr3gr5,cmr4gr7,cmr5gr11,cmr6gr7,csx1,csx18,cas1,cas2 | 0 | 58 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019776_1 | 54-810 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019776_1
|
10 spacers
spacers of NC_019776_1
>1.1|91|34|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTCTAGCCGATATTTTCTCGTCAAACCATTCGT >1.2|162|37|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGACGATGTGATCGGTGAATTGGAAGCTCACATTCAA >1.3|236|35|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGGATTATTGGGATTAGTATTGGGATTGGGAAT >1.4|308|34|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTACAATACAGTTATACAACTAAGTAAAAAGGTA >1.5|379|35|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGGAACTACTAAAGTAAGAATAGAAATAATATCTT >1.6|451|33|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTAATAAGAGATTGGAAAATTTTGCGAAGTTC >1.7|521|36|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTGCAAAAGATGAAGCCTTGAAAAAAGGCAGTGAA >1.8|594|35|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAATTGATAATGACCCTGCTGGAGAAAAAAAAGCC >1.9|666|35|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTACATAAAAGGAGCAGAAGAAGGCATAAAAATTC >1.10|738|36|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCAAAAAGCCAATCAATATCAGTATTAAATCTGCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019776_1
The CRISPR arrays of NC_019776_1 >merge|NC_019776|1|54-810|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAACGTTCTAGCCGATATTTTCTCGTCAAACCATTCGTGTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAACTGACGATGTGATCGGTGAATTGGAAGCTCACATTCAAGTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAACTTTGGATTATTGGGATTAGTATTGGGATTGGGAATGTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAACGTACAATACAGTTATACAACTAAGTAAAAAGGTAGTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAACAGGAACTACTAAAGTAAGAATAGAAATAATATCTTGTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAACAGTAATAAGAGATTGGAAAATTTTGCGAAGTTCGTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAACACTGCAAAAGATGAAGCCTTGAAAAAAGGCAGTGAAGTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAACTAATTGATAATGACCCTGCTGGAGAAAAAAAAGCCGTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAACTTACATAAAAGGAGCAGAAGAAGGCATAAAAATTCGTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAACATCAAAAAGCCAATCAATATCAGTATTAAATCTGCAGTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC >NC_019776|1|1|54-810|PILER-CR GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC GTTCTAGCCGATATTTTCTCGTCAAACCATTCGT GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC TGACGATGTGATCGGTGAATTGGAAGCTCACATTCAA GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC TTTGGATTATTGGGATTAGTATTGGGATTGGGAAT GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC GTACAATACAGTTATACAACTAAGTAAAAAGGTA GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC AGGAACTACTAAAGTAAGAATAGAAATAATATCTT GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC AGTAATAAGAGATTGGAAAATTTTGCGAAGTTC GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC ACTGCAAAAGATGAAGCCTTGAAAAAAGGCAGTGAA GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC TAATTGATAATGACCCTGCTGGAGAAAAAAAAGCC GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC TTACATAAAAGGAGCAGAAGAAGGCATAAAAATTC GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC ATCAAAAAGCCAATCAATATCAGTATTAAATCTGCA GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC >NC_019776|1|1|54-810|CRISPRCasFinder GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC GTTCTAGCCGATATTTTCTCGTCAAACCATTCGT GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC TGACGATGTGATCGGTGAATTGGAAGCTCACATTCAA GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC TTTGGATTATTGGGATTAGTATTGGGATTGGGAAT GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC GTACAATACAGTTATACAACTAAGTAAAAAGGTA GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC AGGAACTACTAAAGTAAGAATAGAAATAATATCTT GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC AGTAATAAGAGATTGGAAAATTTTGCGAAGTTC GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC ACTGCAAAAGATGAAGCCTTGAAAAAAGGCAGTGAA GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC TAATTGATAATGACCCTGCTGGAGAAAAAAAAGCC GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC TTACATAAAAGGAGCAGAAGAAGGCATAAAAATTC GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC ATCAAAAAGCCAATCAATATCAGTATTAAATCTGCA GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC >NC_019776|1|1|54-810|CRT GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC GTTCTAGCCGATATTTTCTCGTCAAACCATTCGT GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC TGACGATGTGATCGGTGAATTGGAAGCTCACATTCAA GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC TTTGGATTATTGGGATTAGTATTGGGATTGGGAAT GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC GTACAATACAGTTATACAACTAAGTAAAAAGGTA GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC AGGAACTACTAAAGTAAGAATAGAAATAATATCTT GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC AGTAATAAGAGATTGGAAAATTTTGCGAAGTTC GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC ACTGCAAAAGATGAAGCCTTGAAAAAAGGCAGTGAA GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC TAATTGATAATGACCCTGCTGGAGAAAAAAAAGCC GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC TTACATAAAAGGAGCAGAAGAAGGCATAAAAATTC GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC ATCAAAAAGCCAATCAATATCAGTATTAAATCTGCA GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC
>NC_019776.1|WP_015217894.1|1141_1780_+|DUF3386-domain-containing-protein MTQTLTAEQLFRNAYENRYTWDENFPGYTCDITYKTPTATYTAKGKIESNLQFSISDIEDSSAQKAIQQQLWEITIHRVNHSFEKSHGENTFSFGETDADGAVEILVGGASQGNKYKVKDNVVTLVYRKIRDIFVTINTFEVLHTDKGYLSLGYDSIYADAQTGEQKGAKSIFHDKFEKVGDYYVLTNRQIITEENEQPTITEFSFSNIVFN >NC_019776.1|WP_015217895.1|2022_3237_-|CCA-tRNA-nucleotidyltransferase MILHNFLKQNLPFDVNLLPDNCYLVGGAVRDILLKRSRSYLDLDFVLPHKPIETAKIIAREYQAGFVVLDPVRYIARVVFPHATIDFAGQEGDSIYQDLARRDYTINAIAFHCREGVIIDPFQGEIDIKKGILKMISRDNLADDPLRLMRGYRQASQLDFTIESFTRATIKDLKELLKNVAMERVNQELAYLFETKKGSYWLKEAFKDGLLDLCFPSADEKMVNLLANIDESAQFLSSKYRSNFPDNYSWYKEAKLACLTNQNPSIAETELINLKYSRQEIKSVLTILQFTNNLTEIDFQKNKRKQYFFFQSVGDYFPNLAVFALAHNVSKDLILQLMELYQNPEDAIAHPQPLLSGKDIMKYLNIAPSPLIGKILTEIQIAYIEGKINNKETAIDFIKNNFIT >NC_019776.1|WP_015217896.1|3411_5880_-|macro-domain-containing-protein MGKLILFTIQAGSFQTGFYLTLQICEDSCDRIAHPFATFTGKLPPCQPIRQHYQQWQESYRSLNQKVRLGSSPQQITHISDSCRQSASQLKETLSNWYNSSFPDFARVRENLLSELNRDESVRLLIQTEISELIFLPWHLFFEPFLSKYPQAEIAIAPIEYKSLNTPQKQRQNIRILAVLGNDEGINLKPDLETLNNLEKAEIKTLINPCRKELFAHLYEEEWDLFFFAGHSGKNPLTQQGQLYLNQEDIITIEEFNKAIMKSIQKGLRLAIFNSCDGLGLAKDLAALHLPQTIVMGEMIPDKVAHVFIKEFLANFAQNQTLYLAVRQARERLQELENEYPCATWLPIICQNPASLPLTWQNLQGLDFAPISIKTIKPPENFQHLVLETLINQTQLIIEYESLTETNTEVIVNYIDKDLSFAEDINRIISEAGGKNINRELKQEQVKNLGQILITNGGQLRADKIFHAVIYDYHNHSLTDRNLISTVISRCLNLSDSSGRNSIAFPFLSPVNSTVEVDEIGLIFAQEIVKYLEGNTKLNSVKIILQNYNQNKNITDEKLYRFYLSFKQYIELKKEINHRQSLLSDLVKIYQKRSMSSAVEILHLYQDSLNRFETEWINNRWKEKQENNSYDYQLPLENITQQINSQKSVVVNEEIVTSLHQNYHEKAATIWQDLVNLEDEEEIIILLRKLGLDIDGFAWINDQYEIAIASVKARQKKVNEMLKNQVQQLEKGQELLQKTLVNLYQEGSLNKKEEGEERRLLFREYPKVDIKVKIEELPEEYRLEKISYSADKKALKEAIERGEDLSNYAKIDPNLKAQFGFK >NC_019776.1|WP_015217897.1|6176_7535_-|cation:proton-antiporter MAWFYPVFATATSTETASPTLILAGVLLTLIVIYFASKVGGELCSRIGLPAVLGELVGGVVIGVSALKLVIFPEGGLSGDESLIIQFLETTANLEPSSAEKVFDTVSEVISIFSELGVIILLFEIGLESDLKELIRVGPSASVVAVAGVVVPFALGTFGLDYFFHLPLIPSIFAGAALTATSIGITAKVLAELGQLSSKEGQIIIGAAVLDDILGIIVLAVVASLAKTGEIQISQIVYLIISAGAFLIGAILIGRLISPWLVGLVNQMKTRGDILITGLIFAFTLAYIANVIQLEAILGAFAAGLILAETEKRKELEEQIIPVADMFVPIFFVCVGAKTDLSVLNPAVPSNREGLIIASFLIVVAIIGKVVAGFTIWAQPEVNRLAVGVGMIPRGEVGLVFAGVGAASGALSPATDAAIIVMVIVTTFVAPPLLKLVFKEPVPTTETETKVN >NC_019776.1|WP_015217898.1|7689_8607_+|TIGR01777-family-protein MKIAITGATGFIGEKLVSKLAIQHQIVIFTRSIEKAKSAFKASLLSNLEFVSYTPKQAGEWQKKIDGCDAVINLAGAPIAERWTTDYKREILESRQLGTRMIVEAISQGENKPKVLINASAIGYYGTSETETYTEISPAGNDFLAEVCQSWENEAQKVTSEGVRLVIFRLGIVLGNGGALAKMIPPFKIFAGGPIGSGKQWFSWVHIDDVVNMIENALTSDNIEGTFNATAPYPVTMNQLCETLGNVLKRPSWLPVPSIALELLLGDGAKVVLEGQKVLPQKTQEVMNYDFQYSNLKSALEDIVG >NC_019776.1|WP_015217899.1|8714_9326_-|GAF-domain-containing-protein MNSPRQHSSEALALEVASLKKLVVDLSKYKRAMEAQKELFRSILMMSNVASGKLMLRSILLEISEVTRDLLKAQDASLFILNPKGVITESILARGPTIQEEKTHLIGTILDRGLAGWVYRYRRMALVKDTQQDERWLNFENQPYEVGSALCVPFLRGSLVLGILTLTHPKPRHFNEDMEDFMSMFSPSIAIALDHARVYLESH >NC_019776.1|WP_015217900.1|9898_10246_-|hypothetical-protein MIINKNKTLAISFAFIALASFFAPANAQSNNINGKNEPFQSNERNPFYGDGINPLDIIHNANFFNSRSGSDFAEDTENNINSEAENFKQLQQKRILEMQQQKQTPSQEVETNTQN >NC_019776.1|WP_015217901.1|10328_10874_-|pentapeptide-repeat-containing-protein MKKREYWLDLLHHVPKWNHWRELNPEETIDLSGINLNSYDLEAINFSGCNLSHVNFIGSNLRFANLSSADLSHSNLIGVNLRLANMRQSVLFKARLHRSNLSEANMVQSFICESDFSKAIFYETELGESKIYKTSFSHAKLVNTHLGKADIFMCNFDHAIMESVDLRWANVIKTSINFNQV >NC_019776.1|WP_015217902.1|10971_14142_-|alpha-mannosidase MINKLRLLTELDIKNNWYFSDKDYAQSPKIIEQNWQNAVINEKGYLVWEKGNKVRWFAQKIIIPHSLDSNYPLEGLDLRLFLTWWAESAQIFVNGQLKVEGDLFDSSCRLLVTENVKPHQEFLITIRLISPNHDIGGLMISRCVYEAKKGEIDPSFVANELTVLSQYLDNFHPDKKPFLDLAIQELNWEYVDNKSLFHQELANLRDKLLPLSNYIKERCFYPLGHAHLDMAWLWTLEETYEVAQRTFNSVLNLQKEYKYLTFGHTTAYLYQWIESHNLLLFNQIKNAIASSQWEILGGMWIEPEVNLISGESLVRQLLYGQKYFKEKFGKYNKVAWLPDTFGFPWQLPQILRQAEIEYFVTGKLHWNDTNKFAYGCFWWQSPDGSQILTLMSPPNVTGVMDTNPITMTNYSIDWEKQTGLKDIFWLPGVGDHGGGPTRDMLEVAQRYDDSPFFPKIKFSTAEDYLNKISTISPQNYPVWNSELYLELHRGCYTTHGDQKYQNRYCEKLLYQAELFSTIATILHNQFIPEYQVDNHIQSQIEANWQKLLLNQFHDILPGTSITPVFTEANQLYQEIITSTNNILSNSLNAIASYIKLPNFNLEYDYEVTIFNSLNWIRSEIVELDIEGEKYKIYDGEGKELLTQISHEGKLLFLAENVPSVGYKSFYLTNKILPLLRGFREDHDTILKEDINTGKMPVPHNGMEIIEEDITYILENDSLRVIIDKKTGNIDGIFDKVNQREIIKGEGNELQLFEDKGQYWDAWNIDPNYENYRLDNPQLVSINWLEKGILRQRIRVIKTYNKSEFIQDYILDFQSPILKIKNKVNWQEDYTLLKVSFPFNLESDYVTYEIACGNIQRTTKPQTDEEKAQWEVYGHHWADLTDNNDNYGVSLLNDCKYGYSAKPNQLRLSLLRSPKWPDPKCDRGFHEFSYGIYGHKQGWKEGKTVQKGYEFNISLLALLTEKREKKDLGLKTNHEFINIEENNFVLMTFKQAEKNPSQMIIRGYECEGKSSLLTFKNEFDLKIIKRINVLENNAPNVEDTLIKPYEIFSLLLANQQI >NC_019776.1|WP_015217903.1|14278_14527_+|hypothetical-protein MRIIETKINITDEHLLNIKLPEDITVGEYEIAIIINPVTKSTNSHPINQLAGKVKAFKNINSVEWQKEIRGEWDEIRLSDRY |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019776_2 | 33156-33258 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019776_2
|
1 spacers
spacers of NC_019776_2
>2.1|33185|45|NC_019776|CRISPRCasFinder TACCTGCCACCTCTCCCCCCATCCCCTCGTCTTCCTACCCCCCGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019776_2
The CRISPR arrays of NC_019776_2 >merge|NC_019776|2|33156-33258|CRISPRCasFinder CTCCCTTAAACCTGACACCTGCCACCTGATACCTGCCACCTCTCCCCCCATCCCCTCGTCTTCCTACCCCCCGAACACCTGCCACCTGATACCTGACACCTCT >NC_019776|2|2|33156-33258|CRISPRCasFinder CTCCCTTAAACCTGACACCTGCCACCTGA TACCTGCCACCTCTCCCCCCATCCCCTCGTCTTCCTACCCCCCGA ACACCTGCCACCTGATACCTGACACCTCT
>NC_019776.1|WP_015217917.1|32047_33094_-|tRNA-preQ1(34)-S-adenosylmethionine-ribosyltransferase-isomerase-QueA MSPDQQLSSYDYYLPSELIAQNPVTPRDSSRLLVIEGENSPKHQIFADLPQFLSAGDLLVVNNTRVIPARLYGEKSTGAQVEVLLVEETRDNCWLALVKPGKRFSVGSEIYFGDGLLKATVVDKDEATGGRYLEFSWQEGESFWHLLEKVGNIPFPPYVTESSANPSQYQTVYAQKQGAIAAPTAGLHFTDRLFEQLKAEGINKTEVTLHVGIGTFRPVEVEDIVNHDMHQEWIEIDEATVNLIRATKARGNKVIAVGTTVVRTLEGVCKECGDLQAFEGKTNLFIYPGYEFKVIDGLITNFHLPKSSLLMLVSALIGRERLMMVYEEAIREKYRFYSFGDAMLIKDC >NC_019776.1|WP_015217916.1|30832_32008_-|glycosyltransferase-family-2-protein MTIIIAILSFKLLLFQGVCTFILLSRLARGARRIPPLTPKLPYLALIGKVSVIIPTLNECDRISPLLESITRQSYETREIIFVDSNSTDGTQEKIENYSKKDPRIHLITDPPLPKNWVGRPWALHNGFLNSSENSEWILGVDADTIPHKNLVATVLDFAIQQDYDLVSFSPQFILKSMGEWWLQPSLLMTLLFRFESSGVNTNNPSTIMANGQCFLIKRNILTEINGYTYAANSFCDDVTLARYVASLGYKVGFADGSKIIKVRMYEGLQDTWQGWGRSLDLKDASSKLQLWGECLFLLLIQALPLPLFFLCLFFYPHFDFLSFKLLFALNTFLVIIRFALLGAIASSYQFNKSISELTFILSPFADILAVTRIILSAFTKPSQWRGRVYE >NC_019776.1|WP_015217915.1|29752_30619_-|ABC-transporter-permease MIARSFSRKKNTFKQLSNVLLMVGIIITLTFIFFAFSAPLLENIGIIQDPLESLSNPINQPPNSKYWFGTTGQGYDVFSRTIFGSQAALKVVITATFLSLIIGVPLGLISGYFGGKIDKILLFLMDTIYTLPGLLLSVTLAFVVGRGVINAALALSISYIPQYYRVVRNHTTSVKTELFIEAAQAMGASPTRIIYKYLFFNVVQSIPVLFTLNAADAILILGGLGFLGLGLPEDVPEWGHDLKLALDGLPTGIWWNALFPGLAMATMVTGLSLLGEGLSERLNPLHRS >NC_019776.1|WP_083887240.1|27406_29302_+|ribonuclease-J MKDKKVYTIKGRRTRKTITTENIAPTPAEKSNSNNQPHVKIVPLGGLHEIGKNTCIYEYEDEMILVDAGIGFPTDGMHGINVVLPDMTYLKENNHKIKAMIATHGHEDHIGGIPYHLKQVDFPLIYGPRLAMSLLSDKLEEAGLLEKTKIHTVSPREVVKIGKHFRVEFIRNTHSIADSFTLAIHTPIGVLIHTGDYKVDHTPVDGEYFDFHRLAQLGEEGVLCLLSDSTNSEVPGFTPSEMSVYPGLDRAFTQAQGRLMVTTFATSVHRINIILALAMKHNRKVGVVGRSMLNVIAHARKLGYIKCPDHIFVPLRTLRSLPDDQILILCTGSQGEKFAAMTRISRGEHPHIKVREGDTIVFSANPIPGNTIAVVNTIDRLMIQGANVIYGKQAGVHVSGHGCQEDQKLMLALTKPKFFVPVHGEHRMLVKHSETAQSVGVPKENIVIIDNGDSIDLTVDSIAKGEKVPSGIQLVDTAGVVHEHVMEERQQLAEDGVITIAAVIDSKGNLLVEPQVNLRGVVCTMEVPSLERLITRTVDRTISDRIKSNLLLSEGDNINWNSIRIEVETNLSRVIQREINSEPLVIFILQVQEGITNNNGQINNESLSDSDDNDEGDGKFTRRRRKATANV >NC_019776.1|WP_015217913.1|26104_26998_+|4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate-synthase MSNYIFGRVLTAMVTPFNGDGSVNYGVAEKLADHLVNNGSDGLVICGTTGESPALESDEKYQLLKVVKNAVGDRAKIVMGTGSNSTQKAITETKKASQIGIDGSLQVVPYYNKPPQEGLYQHFGAIARSCPDVPIMLYNIPGRTGKNLEAETTAQLAQDFDNIVAVKEASADLDQTAKINRIAPPDFLIYSGEDFLTLPMMTVGCVGVVSVASHLVGKQMQMMIQSYEKGDNFQAQKIQKQLYPLFKVLFCNTNPIPVKYALQLQGWDIGGFRLPLCNLPPHQQKEVEEVLNNLELI >NC_019776.1|WP_015217912.1|24996_26007_+|aspartate-semialdehyde-dehydrogenase MSNQVRVAILGATGAVGTELINLLIERKFPLKDLKLLASPRSAGKKVTFQDQTLEIEAVDDNSFDDVDIVLASAGGSTSKQWAEKIVAAGAVMIDNSSAFRMNPDVPLVVPEINPNDVHNHKGIIANPNCTTILMGVAIYPLHQIQPIKRVVVSTYQSASGAGARAMEEVKTQSEAILKGENPQPEILPYPLAFNLFPHNSPLMDNGYCEEEMKMVNETRKIFGDDDIRITATCVRVPVLRAHSEAVNIEFAQPFPLNKARDIIAQAPGVKLVEDWQNNYFPMPMDATGKDEVLVGRIRQDLSNPNSIELWLCGDQIRKGAALNAVQIAELLVHDN >NC_019776.1|WP_190275017.1|22943_23906_+|ribose-phosphate-pyrophosphokinase MLPQQVSDNNRLRLFSGSANIGLATEVARYLGMDLGPMIRKRFADGELYIQIQESIRGCDVYLIQPCCHPVNDNLMELLIMIDACRRASARQITAVIPYYSYARADRKTAGRESISAKLVANLVTTAGAHRVLAMDLHSAQIQGYFDIPLDHVYGSPVILDYLNHKNIEDLVVVSPDVGGVARARAFAKKLNDAPLAIIDKRRQAHNVAEVMNVIGDVKGKNAVLVDDMIDTAGTLLEGARLLKKEGANKIYACATHPVFSGPAISRLSSDVFEEVIVTNTIPLPVDSYFPQLKVLSVANLLGETIWRIHEDSSVSIMFR >NC_019776.1|WP_015217910.1|22063_22729_-|ATP-dependent-dethiobiotin-synthetase-BioD MQTLLIAGTDTDAGKTIITTAFRAYLQKKKSHLVTALMKLLQTGEIGDEEFYCQYFDDAVIPLRYQAPLAPPLSAKLEGKSIDLNIVRNRLLDLQKSHDFVLVEALGGLGSPITEELIIADIAHDWVLDTILIVPVKLGAIAHTVANVALAKQYNIKLTGIIFNCVQDYTPTQINQWTPKGLIESLTGISVLGYFPYLGDVNSLNLDELANISEPIFSQLI >NC_019776.1|WP_041922571.1|20246_21743_-|transglutaminase MTTEREYREWHKQRNKQVKRRQRKKSNFGFFVFLIIAISLGVTIKSNPQIIDYLQNQLESPNLSSFFNAFRFRVNSLKSLTEEFITEIDEPVVITENYQLLEKRNFSDIDRKAKSIKYTGNSVEELSQILSKYAKTEADKARIIYTWITYNISYDVGALNDLFNNNIYPDVRTEIVLNTRSTICSGYANLYQQLAKKMGLKSVIILGYAKGENYIVGLDNNVNHAWNAVKIDSNWYLIDTTWGSGTVTNNGFNAQFNPFYFATNPREFIYTHFPENDKWQLLNPIMSRSEFDSLANVSPTLFEYDIQLLSHPNVNISTDENNVNIALKVPKNVIAIASLKSKEKQLQDNYTFVQKQGENILINASFPEKGEYKLDIFAKPKDETNSYPLVVSYNILASGNGNQFPKTFQHFNEYNGYLETPLNNSLNPNQNTYFKLKIDQALEVKAVNKSTNQWHDLERYGNVFAGNINVGNGDIILYAKFPQDSRYWALLEYGNNSL >NC_019776.1|WP_015217908.1|18934_20245_+|FAD-binding-oxidoreductase MNNNFSVPSLETIKKQLHNQDLEFIEIFDWGQESPWKECIEASELKNGLPRYIIVPNTNKMLSQFLKICCKNKWRILPLGNGSKLHWGNLPSGASVLVSTHKLNKIIEHAQDDLTITVQSGMKIKDLQDFLASFNQFLPIDPIYSQFATVGGVVATANTGSLRQKYGGVRDLILGISFFRSDGEEAKAGGKVVKNVAGYDLMKLFTGSYGNLGIITEVTFRLFPVPSDSITLLLTGGQEKINQLQKKICASALTPTSADLLSESLINGLNLNFSLGLALRFQGIEESVSQQSARVKQWAEDIGLLIHQWDSEKELDLWTRLKDMVFQGANNRGIICKVGILPTKIAELFALTQGSGFVNMGTGVGYVCLPKGIKNHQVRGIRNFCQDNEGYLTVLESGASTIKQEIEPWGYVGNGLEMMKKIKSNFDPFNIFVDRL >NC_019776.1|WP_015217918.1|33320_34571_+|histidine--tRNA-ligase MDSIQAIRGTKDILPEEIVYWQYLEKTAADILTKAAYREIRTPIFEQTNLFERGIGEATDVVGKEMYTFTDRGDRSLTLRPEGTAGVVRSYIQNKLFASGGVERLWYTGAMFRYERPQAGRQRQFHQIGLELLGSKSPRADVEVIAIATDILKALGLKNLSLQLNSVGNQEDRQKYRQALVDYLTPYKADLDPDSQDRLTRNPLRILDSKDQKTQEITENAPSILDHLGEDSRYHFEQVCGLLTELGIDYQLNARLVRGLDYYTHTAFEIQSADLGAQATVCGGGRYDGLISQLGGNETPAIGWAMGMERLILLLQNLNPLTPQCPDIYFVSRGEKAENQALIMAQKLRHNDFNVELDLSGSNFGKQFKRGDRSGAKICLILGDEEVENKTVQIKHLVTGEQKTVSQDELINVLKK >NC_019776.1|WP_150108966.1|34716_35469_+|aquaporin-Z MKKYIAEFFGTFWLVLGGCGSAVLAANFGGEGNPLELGFLGVSLGFGLTVLTMAYAVGHISGGHFNPAVSFDLFAGKRFSGSDLLPYIIAQVLGAILAGAVLFIIASGNGALDLSGSNPLATNGYGSHSPGGYNLFAPLITEIIMTFMFLVIIMGATDRLALGGFGPSAIGLALTLIHLISIPVTNTSVNPARSTGVALFCGNMEIIAQLWLFWFAPIVGAVLGGWFYYQFLETGIESRPLQPIESEPRD >NC_019776.1|WP_015217920.1|35528_35927_+|DNA-sulfur-modification-protein-DndE MRSPIERIKLSKKAKDQLIKLRKVTKIEQWNILCRWGFCRSLREKHTPAPYPIPADSNVEMSWNTFGGEIAEILLLALIHRCHQDGFETNAETLNQQFRLHLHRGINYLVTDLESKTLSDFVALGIKKDDSQ >NC_019776.1|WP_015217921.1|35996_36242_-|RNA-binding-protein MSIYVGNLSYDISENDLQSVFADYGEVKRVYLPLDRETKRKRGFGFVEMSNDDEEIKAIETLDGAQWMGRQIKVNKAKPRD >NC_019776.1|WP_015217922.1|36521_37919_+|magnesium-transporter MSDNFKATENNSRHELRDLVRSQLQILLDQNNLKGAKSLLIPVQPVDIAEAIASLSESAQAIAFRLLDKNKAIEVYEHLEAKIQGILIEDFKRQEVIDIVDKMSPDDRARLFDELPATIVSRIITQLSDQERQATNLLLGYQENTAGRIMTPEYIFVKETFNINETFAKIRSLANTSELIYYVYVVNETRQLTGVVSFRDLVIHGRQTIVKDIMTQDIIYVKTDTDQEEVANLIKRYDFFALPVVDRELRIVGVVTVDDVIDILQKKATEDIYALSAIQGEGENYFKTNLFTITKRRVGWLLVLLLTNTVTGGIIGAQEDIIAQYTILAAFMPLLADTGGNIGAQSSTVVIRGISTEEVRELGTTKVIIREGLAGLLLGFVLGLVTMIWAYLLPSNDNNLIVAFAVGITLTAICTLASIAGSALPFLFRRLGLDPALMSGPFITTAVDVLGILIYFNIARAMLGF >NC_019776.1|WP_015217923.1|38000_39398_+|magnesium-transporter MSENTVTVKNDSRHELRELVSSQLQILLEQNNLEGVKALLLPVQPVDIAEAIESLPSQMQLIAFRLLNKTEAIDVYEHLDYTVQQSLIEQFKRQEVIDIVDKMSPDDRAHLFDELPASVVSRILEQLSPEERQATNLILGYEEDTAGRIMTPEYISLKQNLTVEQTLEKIRSLAPNSELVYYMYVVDQSRHLVGIVSLRDLVLHEPQQTLENIMTKDVIYVKTDMDQEEVARLIQRYDLLALPVVDKELRLVGIVTVDDVIDVLEQEATEDIYALGAVSSDGDNYFQTNLFTVARRRVTWLLVLLLTNTVTGSIIGAQEDVLTQVTVLAAFIPLLIGTGGNIGTQSSTVVIRGLSTDEISDLGPAKVVFREAIAGLLLGLILGLLATIWAYFLPQTDKNIIVSLSVGISLIAISTLASISGSALPFLFRRLGLDPALMSAPFITTAVDVLGVLIYFNIARLMLGI >NC_019776.1|WP_015217924.1|39951_40503_-|photosystem-II-reaction-center-PsbP-family-protein MLKSIATFIVIILTVTLSACVSPTGGLNPYVDGADGYKFLYPNGWMAVDVKEASEGVDVVFRDFIERSENLSVIISDVNKNMDLSDLGSPTDVGYRFMQIVNQDTNNQREAELISAEKREQNLEDYYLLEYKVKLGDNQYRHNLASVVTKNGKLYTFNISTTESRWENVENRFKTIVKSFTVT >NC_019776.1|WP_015217925.1|40732_41299_-|orotate-phosphoribosyltransferase MENNNSAWRQQLLNLLVEYAYQEGDFTLSSGQKSSFYLNGKQVTLRAEGALLVGKLIFSMLSDDTDAIAGLTLGADPMVSAVSVVSAYENKPIPALIIRKEAKGHGTKAYIEGPTLKQGALVTVLEDVVTTGKSAMLAVERLTDAGYKVNQVISLVDRLSGGRELYQSHGLSFASIFTIDEIQAHSRK >NC_019776.1|WP_015217926.1|41372_41783_+|hypothetical-protein MLSKFSRFLTIAALTTLTCVITHPSSAQPETSEMGEEIEIVTVPLTINQLVNEAFWENSGDFFEQASMGGQLNTIFGWRKFPQGSYPENNITEDGLLLYAILSDYFRQLQEREPIIRTRDLANPFDTSLRENPQYQ >NC_019776.1|WP_015217927.1|42112_42415_+|hypothetical-protein MGIMSNSTILASSLVILSSLTIGVASGLISFYVGSESLKSVNTPPENPTQKINEQEKEVQDNKKFSIIPEQKILVKVYDYVHKQQEASKVKQSQSNSNPQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019776_3 | 1064438-1065555 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019776_3
|
14 spacers
spacers of NC_019776_3
>3.1|1064475|54|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT ATGGCAGTCCGATCCTCTGGGACTATGCGCCCAAATTTGGGTTCATGGTGCTAC >3.2|1064566|35|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATTGTTAGTGATTCTTGCAGTTGTAGCTTATTAT >3.3|1064638|37|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATGTGGTGGTGCGTGGGGAAGGGGCGTAAGAGTAT >3.4|1064712|36|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCGTTCAGTACGCTAAATTGTAGTGGGGCGAAAGCC >3.5|1064785|40|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACTTAGATGGGGTTGGCTACCAAGTTGATAGCGAAATTGG >3.6|1064862|42|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTCAATATTTGCAGTACGGAAAAACTGTCAATTTTGTTAA >3.7|1064941|40|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAGAAGAAGAAAAACAAGCTCGTCGTACTGCAAAAGCGGC >3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAATACAACAGGGAATACAACAGGGAATAGTAAGCGAA >3.9|1065093|37|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTACATACGAAAAAGGGCATGGTATATTATTTACAAG >3.10|1065167|45|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCGTAACAACTCCTTAGAGCTTCGTGCCAAAGGTCATAATGTGCC >3.11|1065249|42|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TACAGTCGCAAGGAGACGATTAGGGGGGTGTAAAAACCATTG >3.12|1065328|40|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGTTATGCACAACAGCTGTACGAGATTGATAACCATGGA >3.13|1065405|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACTACTACAAAACACCTTACAAGGCTTGGATCTTGACA >3.14|1065480|39|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTTAAATACTATATATCTTTAGCAGAAGCCACTTCCGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019776_3
The CRISPR arrays of NC_019776_3 >merge|NC_019776|3|1064438-1065555|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAACATGGCAGTCCGATCCTCTGGGACTATGCGCCCAAATTTGGGTTCATGGTGCTACGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAACTATTGTTAGTGATTCTTGCAGTTGTAGCTTATTATGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAACTAATGTGGTGGTGCGTGGGGAAGGGGCGTAAGAGTATGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAACTCGTTCAGTACGCTAAATTGTAGTGGGGCGAAAGCCGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAACACTTAGATGGGGTTGGCTACCAAGTTGATAGCGAAATTGGGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAACTTTTCAATATTTGCAGTACGGAAAAACTGTCAATTTTGTTAAGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAACGAGAAGAAGAAAAACAAGCTCGTCGTACTGCAAAAGCGGCGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAACGAATACAACAGGGAATACAACAGGGAATAGTAAGCGAAGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAACTTACATACGAAAAAGGGCATGGTATATTATTTACAAGGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAACTCGTAACAACTCCTTAGAGCTTCGTGCCAAAGGTCATAATGTGCCGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAACTACAGTCGCAAGGAGACGATTAGGGGGGTGTAAAAACCATTGGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAACAAGTTATGCACAACAGCTGTACGAGATTGATAACCATGGAGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAACACTACTACAAAACACCTTACAAGGCTTGGATCTTGACAGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAACGTTTAAATACTATATATCTTTAGCAGAAGCCACTTCCGTGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC >NC_019776|3|3|1064438-1065555|CRISPRCasFinder GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC ATGGCAGTCCGATCCTCTGGGACTATGCGCCCAAATTTGGGTTCATGGTGCTAC GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TATTGTTAGTGATTCTTGCAGTTGTAGCTTATTAT GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TAATGTGGTGGTGCGTGGGGAAGGGGCGTAAGAGTAT GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TCGTTCAGTACGCTAAATTGTAGTGGGGCGAAAGCC GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC ACTTAGATGGGGTTGGCTACCAAGTTGATAGCGAAATTGG GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TTTTCAATATTTGCAGTACGGAAAAACTGTCAATTTTGTTAA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC GAGAAGAAGAAAAACAAGCTCGTCGTACTGCAAAAGCGGC GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC GAATACAACAGGGAATACAACAGGGAATAGTAAGCGAA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TTACATACGAAAAAGGGCATGGTATATTATTTACAAG GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TCGTAACAACTCCTTAGAGCTTCGTGCCAAAGGTCATAATGTGCC GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TACAGTCGCAAGGAGACGATTAGGGGGGTGTAAAAACCATTG GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC AAGTTATGCACAACAGCTGTACGAGATTGATAACCATGGA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC ACTACTACAAAACACCTTACAAGGCTTGGATCTTGACA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC GTTTAAATACTATATATCTTTAGCAGAAGCCACTTCCGT GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC >NC_019776|3|2|1064438-1065555|CRT GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC ATGGCAGTCCGATCCTCTGGGACTATGCGCCCAAATTTGGGTTCATGGTGCTAC GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TATTGTTAGTGATTCTTGCAGTTGTAGCTTATTAT GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TAATGTGGTGGTGCGTGGGGAAGGGGCGTAAGAGTAT GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TCGTTCAGTACGCTAAATTGTAGTGGGGCGAAAGCC GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC ACTTAGATGGGGTTGGCTACCAAGTTGATAGCGAAATTGG GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TTTTCAATATTTGCAGTACGGAAAAACTGTCAATTTTGTTAA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC GAGAAGAAGAAAAACAAGCTCGTCGTACTGCAAAAGCGGC GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC GAATACAACAGGGAATACAACAGGGAATAGTAAGCGAA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TTACATACGAAAAAGGGCATGGTATATTATTTACAAG GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TCGTAACAACTCCTTAGAGCTTCGTGCCAAAGGTCATAATGTGCC GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TACAGTCGCAAGGAGACGATTAGGGGGGTGTAAAAACCATTG GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC AAGTTATGCACAACAGCTGTACGAGATTGATAACCATGGA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC ACTACTACAAAACACCTTACAAGGCTTGGATCTTGACA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC GTTTAAATACTATATATCTTTAGCAGAAGCCACTTCCGT GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC >NC_019776|3|2|1064529-1065555|PILER-CR GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TATTGTTAGTGATTCTTGCAGTTGTAGCTTATTAT GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TAATGTGGTGGTGCGTGGGGAAGGGGCGTAAGAGTAT GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TCGTTCAGTACGCTAAATTGTAGTGGGGCGAAAGCC GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC ACTTAGATGGGGTTGGCTACCAAGTTGATAGCGAAATTGG GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TTTTCAATATTTGCAGTACGGAAAAACTGTCAATTTTGTTAA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC GAGAAGAAGAAAAACAAGCTCGTCGTACTGCAAAAGCGGC GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC GAATACAACAGGGAATACAACAGGGAATAGTAAGCGAA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TTACATACGAAAAAGGGCATGGTATATTATTTACAAG GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TCGTAACAACTCCTTAGAGCTTCGTGCCAAAGGTCATAATGTGCC GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TACAGTCGCAAGGAGACGATTAGGGGGGTGTAAAAACCATTG GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC AAGTTATGCACAACAGCTGTACGAGATTGATAACCATGGA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC ACTACTACAAAACACCTTACAAGGCTTGGATCTTGACA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC GTTTAAATACTATATATCTTTAGCAGAAGCCACTTCCGT GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC
>NC_019776.1|WP_015218729.1|1063388_1064129_-|methyltransferase-domain-containing-protein MKHLNIIISVIFIFVFTLIMFASSLVYEPVQTTDNQYYEYRALHNRDGIGKYYLGREIAKVMGHQEFLWLERPSREAEEQPSKVIEALNLSPDDTIADIGAGSGYFSFRLAQKVPEGLVYAVDVQPEMIDIIDFLAEESPNLPVLPVLGSETSPNLPPESINFALMVDTYHEFNHPREMMENIVKALKPQGKVVLVEYRKENPLIMIKGVHKMSEKQVKKEMEAVGLKWLKTDEFLPQQHYLVFEK >NC_019776.1|WP_015218728.1|1062699_1063392_-|glutathione-S-transferase-N-terminal-domain-containing-protein MIELYYWATPNGHKITIFLEEAHLDYKIIPVNIAKGEQFNPDFLKISPNNRIPAIIDTEPTDKKESISIFESGAILLYLAQKTGKFLSSDIRQYAKTLEWLFWQVGGLGPMAGQNHHFGLYAPEKIPYAVDRYVKETNRLYGVLNKQLEGKDYIVGDYSIADMACYPWIVPYANQQQDITEFPHLEAWFKRMGEREGVIRAYKIAEQFKQPTVTEDSRSILFGQTASTIN >NC_019776.1|WP_015218727.1|1062271_1062703_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MQPEIIIGDYQQLKTECNLIRYRVFVIEQNVPETLELDDRDSICIHLLLKLNNYYIGTGRIDLQQQGKIGRLAVLPSFRNKGYGQIILHNLELVARENQLNSVWLNAQKQSLNFYLKSGYNTISDEFLEANIPHLKMIKYFSD >NC_019776.1|WP_015218726.1|1061115_1062054_-|ribokinase MKKVIVFGSINMDLAVTVPYLPSKGETLTGNNFNLSGGGKGANQAIALSRLGVNTELVGRVGNDEFGKQLKETLTDNEVNHDHVIIDDNHPTGVAIITVEASGDNQIIVVSGANGAVNEQDLANLESLLPSASYLLLQLEIPLWIITEAIALAKKYNVKVILDPAPALRLGEDIYKELEIITPNLIEASQLLGYEVDNSETAQKAGDWFLDRGVKTVIITMGEKGVYCATKEQKYWVSTPSVTVVDTVGAGDAFNAGLTTALIEGHPLPIAIQWGVINGSLSVTKSGSQSAFAHRHEFDQALGQYELNLEIL >NC_019776.1|WP_015218725.1|1060391_1060745_+|metal-sensitive-transcriptional-regulator MTTVFPENNPQQHKHSHNNNKQHHHGHIHSEESQRKIINRLSRIEGHVRGIKTMINEGRDCPEVLIQIAAIRGALDRVARLILDEHLSECITRAAEEGGIEEEIAALKSALDRFLPS >NC_019776.1|WP_015218724.1|1059448_1059877_+|SufE-family-protein MSSNTHSRPEKLDKIVQKFKRRDNPKQKYEQLLWYAQKLEPMPETEKTPENKVSGCVSQVYITSTLDQGKIFYQGDSDAQLVKGLVAFLIAGLNGLTPQEIITLTPDFIEETGLQVSLTPSRANGFINIFKKMQQQAIFLSH >NC_019776.1|WP_015218723.1|1058948_1059359_-|hypothetical-protein MILKFSHPFSYLWLATMVCLIYGGNMGEVQAQNQEIKGMTGGNKNSGDCGYVSDKPNYVLQLNEQAYSLNVILETQAEKPSLLILGPGEGDRFCILGDTKSGKNPQMGGVWAAGKYLIYVGDSQGSQNPFTLKISR >NC_019776.1|WP_015218722.1|1057469_1058825_-|tRNA-(N6-isopentenyl-adenosine(37)-C2)-methylthiotransferase-MiaB MNQEKRLYNITTFGCQMNKADSERMAGILENMGFEFTEDPNQAKVLVYNTCTIRDNAEQKVYSYLGRQAKRKHQEPDLTLVVAGCVAQQEGEQLLRRVPELDLVMGPQHANRLDSLLEQVFAGNQIVATEPIHIYEDITKPRRESEVSAWVNIIYGCNERCSYCVVPNVRGVEQSRTPEAIKAEIEELAKQGYKEITLLGQNIDAYGRDLPGVTETGRHKHTLTDLLYYIHDIEGIERIRFATSHPRYFTERLIKACYELPKVCEHFHIPFQSGDNEILKAMKRGYTHERYRDIIAKIREYMPDAAISADAIVGFPGETEEQFQNTLKLVEDIGFDQLNTAAYSPRPNTPAAEWENQIDEQEKSDRLQRLNHLVAIKAGERSLRYQDRIEEVLVEDINPKDTTQVMGRTRGNRLTFFAGNLAELKGKVVSVKITEVRAFSLTGNALSLATV >NC_019776.1|WP_051018177.1|1054561_1057081_-|plasma-membrane-proton-efflux-P-type-ATPase MSTSSIIPDVSNLSLEEAIKSLNSSATGLSSGEAENRISQYGYNELASKTVNPILQFLSYFWNPISWMIEAAVIFSAAVGDWADFIIISVLLLGNGLIGFFEEKSAGDAVAALKAQLALNAIALRDQKWTSIPAKNLVPGDVIRIKIGDVLPADCMLLECDPLKIDQAALTGESLPVNRSTGEIVYSGSVCKKGQAEAIVTATGVNTFFGKTAKLVADTENSSHFQKAVLKIGNFLIIIAMVLIAVIVIERLLSGELEIVRLLKFCLVLTVASIPVAMPTVLSVSMSAGAQQLAKRDTVVTRLSSIEELAGMNLLCSDKTGTLTLNQLTLGEPFLMPNVSEEDLILMATLASQSDDPDPIDSVITSNLTNTEQLNNYQVTHFTPFDPISKRTEALVKTTEGKKFAVSKGAPQVILDLAIDKGKIKAKVNNAIESYAKKGYRALGVAKTNEQGEWHLLGVISLFDPPRPDSKMTITEAGKLGVPVKMVTGDQVLIGKETSRQLGLGTDILDAKIFRETPATMIAQLDEQILQADGFGQVFPEDKYHIVDTFQKHGNIVGMTGDGVNDAPALKKADVGIAVSGATDAARAAADIVLLSPGLSVIVDAIKLSRQIFARMTNYTLYRITATVQILVFTTLAILFFDSYPLTAIMIVLLALLNDGAIMTIAFDNAKIAPKPQQWKMSEVLTTASVLGAINVTATFLIYFLAKKYWTFFEVTDKLHPAAATPLQTLVFFNIALLGMMTLYSVRTRDAFWTLSPAKPFLLATGISVTISTLLAIFGFFDLIKPIGFAWALFNWGYCFIWFLILDRTKITIKSLFDKNNHGLGSKYLKQWDKLKMRI >NC_019776.1|WP_015218720.1|1051031_1054379_+|PAS-domain-S-box-protein MIDYQPLTVSPGTKLSAVIALMSECNNHCSLLSNYSDECQRFSRGSCVLVIEKNKVKGIITERDILQYKALGLDLSETKAKKVMSSPVFSISPSASLWELQKQMETKKVRHLVCCNKRGELVGVVTQTSLLRSLNPIEMTNVIELLRDRIYKLENQLKVFAQFVNHEQSLEKIKSVNILMIEDNATTVEILKRRLGLESDYKFNVIHYSTLKEGKDAVTVYGRNYFNLVILDLNLTDSQGLSTLETFKENFPEIATIVLTAEYQKKVALNAIKKGAQDYLIKSIFLGQKNIEQDCFILPLLTAIERQEKENQIEKQNIEIYLANEKLKHSLNENKQIKKTLEDFNLLLNNRVKQKTSILRKIVDKLNQEIKERKQIEKNLTLSENKLDRIINDASEGILIVDSEGTIVFANAEATRILQKADENIIGNKFDIPIINNQPLDLTLVDKNGQQLFEEVRVSSTEWEGKLANLVILRNVSERIEYEQNLAENEEKFRQLAENIEEVFYIFDIQKNQLIYLSSVFQKIWGLSQQKVLKNPEIWLKSIHPSDYKNLTNHWLTNPTLIYDHYRENTEVEYRIIRPDKKIRWINHKSFTVKDKRGSIYRIVGILTDITELRQTQEYLQQLNRELEDKVDLHTRELLNFKSALDQSAIVTISDPYGNITYVNDQFCQISGYSQEELLGQNHRIVNSHYHPDEFWQEFWMTISQGNIWRGEVKNIKKNGGYFWVDMVVVPFFDHYQAISQYIAIRYDITERKEAQEIIERNLATFDVAADGLAILEGDRYIYMNRLHLEIFGYSSIEDLPENNWRCLYETDQINLIETEIFPLLMVNKKWTGEAIAKRKDGTTFPEELSLTLTDKGYLICVCRDITQRKKSERQLREALAKAEEVNELKSRLINLTSHEFRTPLTVIASSVGILKSFRDRLSPEQQAEHFNTIETYIQHTTELLDDILLINRSETKQLHYQPQQINIKDFCLHLVNHLQNTYGEYQIIFEINNESSLEEEQYNRLLDPKLLTQILTNLVSNSVKYSGVNSRIDVLLIVEAKNIILQVKDRGIGIPVNDQKYLFDTFYRGDNVGNIQGTGLGLPIVKECVNLCKGTITFTSVINQGTTFSINIPC >NC_019776.1|WP_015218730.1|1066037_1066430_+|hypothetical-protein MIEGYTDFPDEDELMQEEGEVVYSLCWDSGAPGAGADCELIYSWKGQYVVCLSYDVNRPAYPSLIEAIMGAELNFVNDATTEIESTELSSEQIIPLLAIDINSDLHELTINREDWEVDKQGNFTRIVYDS >NC_019776.1|WP_015218731.1|1066426_1066735_+|cupin-domain-containing-protein MINPDNLFDNIPSLVEGEDFSELLNCRNVVIERIVSSKNPDNKVYCQEQDEWVILIKGKAQLRIKDDIVNLKAGDYLFIPAMTPHQVLTTSNNCLWLAIHIY >NC_019776.1|WP_015218732.1|1066827_1067250_+|NfeD-family-protein MSSPLVWLIIGCILCLMEFIFPTAFVELMMGLSAIIIAGLALIIPYNNLLIVLWMVLSVLLIYFAKKYLEPKKKDPLLLEGNEGITITAIEAGKTGRVMYEGSLWLAICSDETMKIPPDEKVFIVSREGNILSVLPRKLL >NC_019776.1|WP_015218733.1|1067273_1068230_+|SPFH/Band-7/PHB-domain-protein MEQLFILVFLVGSALFSSVKIVNEKNEYLVERLGSYNKKLSPGLNFVIPFLDNVVYKDTIRDKILDVPPQSCITKDNVAITVDAVVYWRIVDMVKAYYKIENLQSGMENLVLTQIRAEIGKLELDETFVARSEINSVLLRELDIATDPWGVKVLRVELKDITPSPAVQQSMEQQMAAERKKRASILNSEGERDSAINSAKGSAEAKILEAESMKKASIMEAEARKQQQILQAQATAEALQIIVDQVKNDPQAQTALQFLLTQQYLEMGKVIGSSDSSKVMFIDPNNILSTLNGISSIIDNDNQLTKFSAPIIKENKSS >NC_019776.1|WP_015218734.1|1068778_1069708_-|phytoene-synthase MLQLPKKLQPKQPLASLEESYEYCRQVTAKYSKTFYLGTLLMPKEKRSAIWAIYVWCRRTDELVDGPQAKLTTPETLDLWEQQLESVFAGQPIDDPDVALVDTLKRYPMDIQPFKDMIAGQRMDLYRNRYETFNDLYLYCYRVAGTVGLMSSAVLGIDNSYKNAPWYDKTVYIPEKEAIALGIANQLTNILRDVGEDIGRGRIYLPLEDLERFNYTQEDLFNKVIDERWYDLMKFQINRAKEYYQQAESGIKALNPDGRWPVWSALMLYQGILDVIAKNNYDVFNRRAFVPTPNKIIYLPVAWLRAQAL >NC_019776.1|WP_015218735.1|1069970_1071380_-|15-cis-phytoene-desaturase MRVAIAGAGLAGLSCAKYLADAGHTPIVLERRDVLGGKVAAWKDEDGDWYETGLHIFFGAYPNMLQLFHELGIEDRLQWKEHTMIFNQPEKPGTYSRFDFPDIPAPLNGLVAILRNNDMLTWGEKIKFGMGLLPAIIQGQDYVEEMDKYSWSEWMAKQNIPPRIEKEVFIAMSKALNFINPDEISATILLTALNRFLQEKNGSKMAFLDGSPTERLCQPIVDYITERGGEVRLNAPLKEILLNEDGSVKGFLIRGLNGEADEVFEADLYVSAMPVDPLKVILPASWKEISFFQKLEGLEGVPVINLHLWFDRKLTDIDHLLFSRSPLLSVYADMSNTCKEYSNPDRSMLELVLAPAAEWISKSDEEIIEATMQELRQLFPQHFTGENQAKLLKSHVVKTPRSVYKATPGRQAYRPDQKTPISNFYLAGDYTMQRYLGSMEGAVLSGKQAAQVISKDFPATVAKPEASLV >NC_019776.1|WP_051018178.1|1071539_1071806_-|hypothetical-protein MTSAETAARIRREGENFKSIPESDASTDTTGGYTVSREGLVNNYAVEPEMYVNQPGDLREKEEAEKVARARELKEVNSDDGDKGVGVV >NC_019776.1|WP_015218737.1|1072277_1072583_+|hypothetical-protein MANITENKQAYQEKVKAQIDKINAQIEQMSAKAKEAKADVAVEYNNQLEKLYAQRDAVQSKFKELQDAGEEAWGEIQKGFDKAWNELNDSFNQAWSKFQEK >NC_019776.1|WP_015218738.1|1072812_1073544_-|heme-oxygenase-(biliverdin-producing) MTVNLATMLKEGTKKSHSMAENMGFIKCFLKGVVEKNSYRKLAANLYFVYGAMEEEMERLKDHPIVGKIYFPELNRQPSLAKDLQFYYGANWKNEIQITPAGQAYVDRIHEIANNQPELFAAHSYTRYLGDLSGGQILKNIAQKAMNLDGEGTAFYEFETISDEKAFKNMYRQALNDLPVDEATAEKIVDEANDAFAMNMKMFQELEGNLIMAIGKMLFNTLTSRRRRGSTQSDNQGELATQR >NC_019776.1|WP_015218739.1|1073682_1074294_-|phospholipase/carboxylesterase MTLDVISHNPTNNKSPEFVFVLLHGWGANYHDLIALIPMLNLPSCLFLFPNAPYLHPQVPGGRAWYELDNNNEGISASLDQFYRWLLSLEDITNLPLSKTFVGGFSQGGAMSLDVGLQLPVAGVISLSGYLHFEPTSDRNPFPPTFMSHGTQDAVIPIESARVARKKLENVGVKLTYHEFDIGHEIIPAQAHLIHDFILKVVA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019776_4 | 1141144-1142196 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NC_019776_4
|
13 spacers
spacers of NC_019776_4
>4.1|1141181|44|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT CCTAAAGATGCGATCGCAAATTCTTTTTTGTCGGGAATTTTGGA >4.2|1141262|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCCAAAGACTGAAGCGGATTTGATCGCCGAGGAGGCAA >4.3|1141337|32|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGTAAGAATAGCCCTCTTTATTCTTATTCCA >4.4|1141406|41|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTCGGGAAAAGCCTCCCGTTCCCACACACCAGAAAGGTTC >4.5|1141484|45|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGAAAAGGATCTTAAAATTATGTCTAACTCTACCTCTGCTACTTT >4.6|1141566|43|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATTGATCAAACTACTACTAAAGCGTTCTTTCTATTTAAAGAA >4.7|1141646|42|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCTAGCTGAAGGCGTAAAAATCAGCCTGAAGGATGTATACGA >4.8|1141725|45|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTTACGCCACCATATTGCCCTTCAAAATCCCTGCTTTCCCCGTC >4.9|1141807|41|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTGCCGAATAGACATCCAATCCATTCGGCATTCTAAAGGG >4.10|1141885|45|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTGGACGAGATGGCTTTTACGCCCCCCCGAAACAAGACGAAGAAG >4.11|1141967|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATCCACATTACTGTTTCTAGTGATGATTCCGCTTCTAA >4.12|1142042|44|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTAACACTTTGTTAGTGTATTAATATGAGGTTAGGAACACCAC >4.13|1142123|37|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCAGAGATTGGTTCTTGTTTGGACGAAGTAATTGGGA |
cas2,cas1,csx18 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019776_4
The CRISPR arrays of NC_019776_4 >merge|NC_019776|4|1141144-1142196|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTCTTTATCCCCCTACTGAGTCAATGAGGAAATTAACCCTAAAGATGCGATCGCAAATTCTTTTTTGTCGGGAATTTTGGAGTTTCCGTCCCTTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAACTCCAAAGACTGAAGCGGATTTGATCGCCGAGGAGGCAAGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAACTTGTAAGAATAGCCCTCTTTATTCTTATTCCAGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAACTTTCGGGAAAAGCCTCCCGTTCCCACACACCAGAAAGGTTCGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAACAGAAAAGGATCTTAAAATTATGTCTAACTCTACCTCTGCTACTTTGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAACAATTGATCAAACTACTACTAAAGCGTTCTTTCTATTTAAAGAAGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAACCCTAGCTGAAGGCGTAAAAATCAGCCTGAAGGATGTATACGAGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAACGTTTACGCCACCATATTGCCCTTCAAAATCCCTGCTTTCCCCGTCGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAACCTTGCCGAATAGACATCCAATCCATTCGGCATTCTAAAGGGGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAACGTGGACGAGATGGCTTTTACGCCCCCCCGAAACAAGACGAAGAAGGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAACATCCACATTACTGTTTCTAGTGATGATTCCGCTTCTAAGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAACGTTAACACTTTGTTAGTGTATTAATATGAGGTTAGGAACACCACGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAACTCAGAGATTGGTTCTTGTTTGGACGAAGTAATTGGGAGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC >NC_019776|4|4|1141144-1142196|CRISPRCasFinder GTCTTTATCCCCCTACTGAGTCAATGAGGAAATTAAC CCTAAAGATGCGATCGCAAATTCTTTTTTGTCGGGAATTTTGGA GTTTCCGTCCCTTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TCCAAAGACTGAAGCGGATTTGATCGCCGAGGAGGCAA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TTGTAAGAATAGCCCTCTTTATTCTTATTCCA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TTTCGGGAAAAGCCTCCCGTTCCCACACACCAGAAAGGTTC GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC AGAAAAGGATCTTAAAATTATGTCTAACTCTACCTCTGCTACTTT GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC AATTGATCAAACTACTACTAAAGCGTTCTTTCTATTTAAAGAA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC CCTAGCTGAAGGCGTAAAAATCAGCCTGAAGGATGTATACGA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC GTTTACGCCACCATATTGCCCTTCAAAATCCCTGCTTTCCCCGTC GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC CTTGCCGAATAGACATCCAATCCATTCGGCATTCTAAAGGG GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC GTGGACGAGATGGCTTTTACGCCCCCCCGAAACAAGACGAAGAAG GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC ATCCACATTACTGTTTCTAGTGATGATTCCGCTTCTAA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC GTTAACACTTTGTTAGTGTATTAATATGAGGTTAGGAACACCAC GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TCAGAGATTGGTTCTTGTTTGGACGAAGTAATTGGGA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC >NC_019776|4|3|1141144-1142196|CRT GTCTTTATCCCCCTACTGAGTCAATGAGGAAATTAAC CCTAAAGATGCGATCGCAAATTCTTTTTTGTCGGGAATTTTGGA GTTTCCGTCCCTTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TCCAAAGACTGAAGCGGATTTGATCGCCGAGGAGGCAA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TTGTAAGAATAGCCCTCTTTATTCTTATTCCA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TTTCGGGAAAAGCCTCCCGTTCCCACACACCAGAAAGGTTC GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC AGAAAAGGATCTTAAAATTATGTCTAACTCTACCTCTGCTACTTT GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC AATTGATCAAACTACTACTAAAGCGTTCTTTCTATTTAAAGAA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC CCTAGCTGAAGGCGTAAAAATCAGCCTGAAGGATGTATACGA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC GTTTACGCCACCATATTGCCCTTCAAAATCCCTGCTTTCCCCGTC GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC CTTGCCGAATAGACATCCAATCCATTCGGCATTCTAAAGGG GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC GTGGACGAGATGGCTTTTACGCCCCCCCGAAACAAGACGAAGAAG GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC ATCCACATTACTGTTTCTAGTGATGATTCCGCTTCTAA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC GTTAACACTTTGTTAGTGTATTAATATGAGGTTAGGAACACCAC GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TCAGAGATTGGTTCTTGTTTGGACGAAGTAATTGGGA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC >NC_019776|4|3|1141225-1142196|PILER-CR GTTTCCGTCCCTTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TCCAAAGACTGAAGCGGATTTGATCGCCGAGGAGGCAA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TTGTAAGAATAGCCCTCTTTATTCTTATTCCA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TTTCGGGAAAAGCCTCCCGTTCCCACACACCAGAAAGGTTC GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC AGAAAAGGATCTTAAAATTATGTCTAACTCTACCTCTGCTACTTT GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC AATTGATCAAACTACTACTAAAGCGTTCTTTCTATTTAAAGAA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC CCTAGCTGAAGGCGTAAAAATCAGCCTGAAGGATGTATACGA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC GTTTACGCCACCATATTGCCCTTCAAAATCCCTGCTTTCCCCGTC GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC CTTGCCGAATAGACATCCAATCCATTCGGCATTCTAAAGGG GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC GTGGACGAGATGGCTTTTACGCCCCCCCGAAACAAGACGAAGAAG GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC ATCCACATTACTGTTTCTAGTGATGATTCCGCTTCTAA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC GTTAACACTTTGTTAGTGTATTAATATGAGGTTAGGAACACCAC GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC TCAGAGATTGGTTCTTGTTTGGACGAAGTAATTGGGA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGTGGAAATCAAC
>NC_019776.1|WP_015218799.1|1139790_1141053_-|insulinase-family-protein MTQTQKYIHKTILSNGITLVVTENPTTDIIAGKIFCRQAGSLWEAKHQAGLFHLLASVMAKGTRNLSSLEIAEKVESIGAALGTDTSSDYFLVSMKTITEDFPEIMALASEILRFPSFPLDEIALEKNITIQNIVSQKEQPFNVAFSQLRQMIYGQHPYGFSLLGTEETVANLIQDDLRFYHQQHFRPDRLVISLAGNIDLNSAVEVVEKVFGDWFPPEDALIKIDSLEQRELLSPKARSHHTSQDTQQSIIMMGYLVPEMTHPDYPVLKLLSTYLGNGLSSRLFVELREKRGLAYDVSAFYPTRVDKSQFVVYMGTAPHNADIAQEGLYNEIKRLRENPLTTEEIQTAKNKLLGQYALSKQTNGEFAQVFGWYETLGLGIEYDNIFPQKISSVTIEDIQRVAQEYLQDQFLCVSKVGPK >NC_019776.1|WP_015218798.1|1137760_1139716_-|precorrin-3B-C(17)-methyltransferase MKYIFADYHPLHFITTSPEKIEQLEYLNKITQGFLWLPKKIHNDNLSANFYDSSLREHLVNIWSNSKCIVFCLTLGAVTRLIAPLLTNKKTDPAIIVIDPAFEYIICLTGEHQHQGDKLTEILAELLSAKAIITSASSNLNLPAIDSFGYTFGWKKGEGDWTKVSANITQNKPTLIKQESGLNWWCQNLPINHPFIFGEGIKDNSKEGEKREEDFLKQSDDDFAKSIFTEAEKQVQAMVYIGVNKTPRVDIPIVSWHPRGVWVGIGCERDTSPILIENAVNSVLAQYNLEKNAIASLATIDLKADEVGILELAQKWQLPLKTFTSEELNLIDVPNPSSIVEHEVGTKSVAEASALKAGSWSNLPENNFSPTLIAPKQIFKQEGLKGAVTVAIALSNLEYNPRQGKLYLIGTGPGAIEYLTTAAKTALRDAEIIIGYGLYIDLIKPLLHPSQIIETSNITQEKQRAERAIALAQWGLKVAVISSGDCGIYGMAGLVLEILANQNWDGKQPPIQVFSGITAMQSVAAKIGSPLMHDFCAISLSDLLTPWDVIEKRLHAAATGDFITAIYNPRSQTRQQQIITAQNIFLQYRSGNTPVAIARSVTREDESIILTTLEEMLNHPIDMVTTVLIGNSSTKRYHDLLITPRGYLGQC >NC_019776.1|WP_015218797.1|1136580_1137552_-|SDR-family-oxidoreductase MKILVIGATGTLGRQIVRHAIDQDYSVRCLVRNRGKAGFLKEWGAELVKGDICEFKSIESALEGVDAVIDAATARATDSLTIRQVDWEGKVNLIQACAKANIKRYIFFSLLNAEKFEDVPLMNIKHCTELFLQESGLDYTIFKIGGFMQGLIGQYGIPILDNQPVWVSGENTPIAYMNTQDMAKFVIKALEIPETVKKTYPLVGSRAWTGDEIIQLCERLSGKTAKISRIPLGLLRFLRGFTRWFKWTRNASDRLAFAEVLASGIALDAPMDEVYETLKIDPQEITTLEAYLQEYFDRIMKKIREIDYEKSKMKKRKKNSFFK >NC_019776.1|WP_015218796.1|1135143_1136403_-|SufS-family-cysteine-desulfurase MTLTYKKTIADEVRQDFPILHQKIHDKPLIYFDNAATSQKPRAVIEALRHYYEYDNANVHRGAHTLSARATDAYEGARDKIAKFINAKSRNEIVYTRNASEAINLVAYSWGLAHLKAGDEIILSVMEHHSNIVPWQIIAQKTEAILKFVELTPSQEFDFNHYQSLLSEKTKLVSLVHVSNTLGCINPVTEIITSAREKGAKVLIDACQSLPHLPIDVQGMDCDWLVGSGHKMCATTGIGFLYGKEELLEAMPPFLGGGEMIADVFLDHFTCGELPHKFEAGTPAIGEAIAFGTAIDYLSNIGMENIHQYEEELTAYLFQQLNEIPNLTIYGNQPTTEGKGRAALAAFNVKDIHGSDLSTLLDHEGIAIRSGHHCTQPLHRYLNISGSARASLYFYNTFAEIDAFIVALKETIDFFTQMN >NC_019776.1|WP_015218795.1|1133445_1134819_+|UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine--D-glutamate-ligase MGKVYIIGLGKSGIAAAKILKKNHEEVTIYDSSNSPSLEIIKNDLAKENIVVKLGENLPLNNVQNPDLIVVSPGVPWDIPILEEARRKGIKTIGEMELAWQYLSKTPWIGITGTNGKTTTTALVEAMLKMGGIKTSACGNIGYAACDLALESLDNPLEWVVAEISSYQIESSMDLSPRIGIWTTFTPDHLARHKTLENYHRIKASLLQRSYLKILNGDDPYLHNFGLDLDWKNVYWTSVRGKEYLLGDIEKGVYLEDSWIVAFKELIAPVSLFKMVGKHNLQNLLMATAAARLAGVSKKAIADTISSFTGVPHRLELITNIDGVAYINDSKATNYDAAQVGLDSVASPTILIAGGEAKEGDDTAWINTIKEKCVSVLLIGEAASFFAERFEASGFGQYEIVETMENAVKRARELASDLKAKVVLLSPACASFDQYQNFEQRGENFRQICYDLTQKDN >NC_019776.1|WP_015218794.1|1132836_1133382_+|RDD-family-protein MYSEENQFRRVPKAPFERRAYAFLIDFIIVWIFSSLVTNIFLELVIFVLLWFIFRVIIVQINKGQSLGRWAMDLKIADIRRKRQPSMVSMSKREGVIALIAFTAMIGLKINFKDSLLMVLLLTPIIVDGLTIFSDDEYNQAFHDRLCDTIIIQTRRGFSLDLRLKKLFKEAKETWQKKRKK >NC_019776.1|WP_015218793.1|1132143_1132623_+|ATP-dependent-zinc-protease MNDHSHHKNLPLIGWREYLSLPELGVEKIKAKIDTGARTSALHAYHIHPYQERDPEGIGGTGRTLIKFQVHPIQRETHTTVSCIAPLLEYRKVTSSGGHATVRPVIITSVQLGDYNWDIELTLTNRDVMGFRMLLGREAIRKRFLVDAGNSFLNKIKKK >NC_019776.1|WP_015218792.1|1131217_1131988_+|NYN-domain-containing-protein MHNFDINNDNLNLEGKYIENHLDFEDTTDLEEENLTEKEHPKPQLIPRPEYNPNYQVNSTNIITNSTEINHNYYENHTHNSHVNPHRLRDRISIFVDGNNMFYAQQKNGWFFDPRKVIDYFSEESGFMLINAFWYTGLKDSQDQRGFRDALISLGYTVRTKILKEYYDDSSGRFSQKANLDIEIVVDMFNTVDQYDRVVLFSGDGDFERAIELLRSKNTHITVVSTDGMIARELRNATDRYIDLNEIRNCIEKKDY >NC_019776.1|WP_015218791.1|1130072_1130906_+|sulfurtransferase MGSTQVTVSAQWLKDNLGRSDLKIIDCRFRLADSQWGYQEYQKSHIENAYYLDLNQDLSDVVQSHGGRHPLPKIDAFTSKLEEFGIIKGETTVIAYDDLRLAFSARLWWLLRYLGHDRIFILDGGWQEWQKLGYPVSNKIPDRVRGSFLPEIRSDLLVDKDYVESRLNFDSTIIIDARSGDRYRGEHEPIDPIAGSIPGAKNIFWQEMTTDDSFLKSEEELTSLWSSYLEYPEIILYCGSGVTACVNLLALFKINISQSKLYAGGWSDWCSYPEHFR >NC_019776.1|WP_015218790.1|1129335_1129767_-|hypothetical-protein MKKLSNLLWFSGLLGLVTLGLGATMSESLAQIRGEDSDRFFRQGNEMMEEQIREIQRESVRQQQEEKAQMGDMDDMDMNDMDMENPENMDGFEEDRDEKETELETELEMKQPSGVELKEVEENPEGLDDNVPESPENEIEVQM >NC_019776.1|WP_015218800.1|1142558_1143155_-|hypothetical-protein MISDSLISKYQIINRYKQLTGEALNKNNYLEILSLTELLKKLLTETYQGSDNQFVRSKQINFHLFKEKFSTQYNLEEIDSKHLWQEIYYLLKGNATYSINEKGLIALEDYQQQIQNYSFLPLNVNHQKIYKLAEKYQQWLKENNYWDDNDLSRYLLTHLHEDNIGKYYIYGDNIHHWSEISLKLICQLTTAEKTFALT >NC_019776.1|WP_015218801.1|1144026_1144197_-|hypothetical-protein MTTPIIAEKIRAIASKKEVLEQLLEKPDLGNLRLDVNQALEELEELIEELNKTFPS >NC_019776.1|WP_015218802.1|1144325_1145975_-|MBL-fold-metallo-hydrolase MIKRQEKFSAPEISFSCYPFGVGHYTEGVALQLTLGNYRLLLDCGVEDISLLVNQDQPPFDWVFCTHAHQDHARGLLALHKCYPNLPIYTSDVTGKLLPLNWLDKKDSASISFPQVLPWRSPFHLQSDLTVELYPAGHLPGASAFLFQYHHRDRVYKIFYTGDFCLSNLQLVEGLSLDSLRGLNPDILIIEGSYGTARHPHRRHQEKQLMARIKTAIESQVNVIMPVPTFGLGQELLKLLRSHHEFTGRNLDIWVDGDLASACDLYLDLISYFPENVQNFAKHQPLFWDDKIKPRMRRVTKNTARHQLIVEPSIVLTDKISHLQEYCQDNGQKWLILISEQSKIKQTDEFKSLTQKYDPERIIIEDYLLAEHSDGRNTTQLIHNLRPQHIIFVHGLPNYLADLTSLEELQNRYQLHSPAVGVKVDLPIGAQFMQPKITTQNNYEGELNETGAYVTITLPEQINKDPRWQNFADTGLIEARWQGEELVLRGLSQRELLQQNSLLRRQLNPESCGNCRHFDNQHCHNQESPLNGFTVPHDGYCPLFEVDDI >NC_019776.1|WP_015218804.1|1146199_1147201_-|NAD(P)/FAD-dependent-oxidoreductase MRLSSKNLDTRLDTVYDAIVVGGGMGGLSAAIYLARYGLKCLVIEKGKGRSMWMQDLRNYVGLDPDTPGRDIINHGTKQAVDWGADHLRGYVEDVTDEGDTFAVKVKVGKKDSIYPVFRSKYLIAASGVIDVLPELDDMQNVYDYAGYTLHVCMICDGFDMWDQKAVLIVGKESQINAAFVLNWFTPYITVLTHGLCTVSDEMKQKLAEHGYPLYESAIARFVGEDHKMQGVELVDGTFIEATTGLINMGSIYHNHYLKGIEGLEWDGENLVTNEMAQTSHDRIFALGDLKKGLNQVSVAVADGTLAATQIWRNIRRQSPPRKWESNLSTTIQ >NC_019776.1|WP_015218805.1|1147805_1148375_-|peroxiredoxin MAVLERVPDVVFKTRVRDESIQPNPYRWEDKTTQDIFGGKKVVVFSLPGAFTPTCSSNHLPRYEELYDEFKALGVDEIVCVSVNDAFVMFKWGREIGAKNVFLLPDGNGEFTRKMGMLVDKSNLGFGLRSWRYSMFVNDCKIEKIFVEPNFSDNCPTDPFEVSDADTMLAYLKGEQPKGVSEPRKEFVG >NC_019776.1|WP_015218806.1|1148558_1148984_+|transcriptional-repressor MVISKDNIIKTLKSKGLRVTPQRFAVYSNLLHRCDHPTAEQILTDLNQEVPTLSQATVYLSLQTLQNVGLVKEVLLEEGVCRYDANVDPHHHFLCECCGEIEDIPWESLTGINISNLRQGLKVDRFEVTVYGRCDRCSDSH >NC_019776.1|WP_015218807.1|1151233_1151524_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MIKLWLICYDVKDDKRRTQLAKLLEQHCERVQYSVFECPLDVKKLEHLLSTRWLKVLNLQEDSLRIYPLDASAKQKIKIYGLKDNPPYESPDYLIL >NC_019776.1|WP_015218808.1|1151520_1152528_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MTALYLTEPGTKVHYKNQTFTIKKNQTYTCRLSELELLVILPGVQLTDAVISALLDQGIEAIFLRQDGQFRGRLQASFASNPLIRLAQYRTVETSFGLAFAQKFAYGKIRNQRALLQIKNRATKGKIAQLSESIDTINVYQLQLKNIDKPRTRDELMGIEGISARSYYQALQHFFPPHWQFNGRNRRPPKDPINALLSWGYGVLLARIFAVCVKAGLDPYLGFFHSIQPYRPNLVLDLMEEFRPILVDYAVISLIQSQMLDIADFQPSSDGQGIWLSVTAKKLLLRELEERMNQYLLYPPQNRKLKLNQIFLEQARMLARCLLESSLDYEPFFIK >NC_019776.1|WP_015218809.1|1152620_1152929_+|hypothetical-protein MNFALVRTIVRFRNVFVAILNGVITWIILIIAPLGLFTVIICTIAVFLSSVIFGLVGDFFLFMMLRQGNFNGVTGVGENRKFVDSELPSMRYSESIRKKNYD >NC_019776.1|WP_015218810.1|1152999_1153929_-|UPF0104-family-protein MTKLRQLIPILFVIILLSISVAAIASELKKYNINSVWQYLQNISQQRKMLALLVTGFGYALMTGYDILGFIHIKQKLSVLKIAFTAFVSYAVGNTVGFTAFSGTAIRYRYYGLWGVNKIKIGELIVFTHLTFWLGLLSISGIVSILDPLTLPSAIKLPFASIHPLGFIFLSLVLIYFIISVTIKHSVTIAGEEITFPKPIISLGTIIVAGLDWGLAALVLYLLLPPNLSMTYIGFFGIYIVALTAGLISTVPGGLGVFETVMLYLRPESISAPQMLGGLIAYRFVYYLLPLIFAVVLILLEAWKKRHPK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019776_5 | 1149597-1150977 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NC_019776_5
|
17 spacers
spacers of NC_019776_5
>5.1|1149634|39|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCCCCAGGACGTACTAAAAGTCTTCCAAGAGGAGAGTAC >5.2|1149710|45|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACGGAAGCTAAAGAACTATTGGCTGAAAGACGAGAAGAAGAAAA >5.3|1149792|43|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGTGATGAGCAATTAGCTCGTTTAGGTGAAAGAGTGGTAGTT >5.4|1149872|39|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATAGAATAGATTTAACAATAGTTCTTCATAGCAATTGT >5.5|1149948|51|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTAGATGAGAGTAGTATTGCCGCACTGGATGAGTATATAAATCAATGGCA >5.6|1150036|37|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATGGTTGGGTGCAAGGAGATGAGATTATATACCCTA >5.7|1150110|41|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTGAACTAACAACGTCTCCTTTTTTTACTCGCCGTCCATC >5.8|1150188|39|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAATAGAAGCGTTTAGAAATCAGTTAAAAGGGATGAAA >5.9|1150264|45|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GACGAATACTATAACTCCGATACGTCCGACATTGGTGTAATGGAG >5.10|1150346|43|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGCTGGCCTTTGCCCTCAGGGTATAGCGGTTACACTGACGCTA >5.11|1150426|38|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAATAAAAGAGGAGGGTACTAAAATCCCTATGACTAA >5.12|1150501|38|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCCAAGGCTGCTCAGGGGCAGGTAGTACAGGTGCTCAT >5.13|1150576|40|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTAAATAAAGCACATTTCGGAATAATCCCATTATTATGA >5.14|1150653|44|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAGATCAAATTAATGTATATGTTAGAGACAGTTTAACTTTCTTG >5.15|1150734|43|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATTTATCTGCTAGGTCTGTTCTTTCGTGAACCTTGGCTAAAT >5.16|1150814|50|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTCGTGCAGGCTAATCACCTCCACGTTACCCTAGCATTTGGGGTAACAC >5.17|1150901|40|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTAAAAGAATTACAAGAAGAACTAGGACAAGTAAACAAA |
cas2,cas1,csx18 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019776_5
The CRISPR arrays of NC_019776_5 >merge|NC_019776|5|1149597-1150977|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAACCCCCCAGGACGTACTAAAAGTCTTCCAAGAGGAGAGTACGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAACAACGGAAGCTAAAGAACTATTGGCTGAAAGACGAGAAGAAGAAAAGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAACTAGTGATGAGCAATTAGCTCGTTTAGGTGAAAGAGTGGTAGTTGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAACGATAGAATAGATTTAACAATAGTTCTTCATAGCAATTGTGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAACCTTAGATGAGAGTAGTATTGCCGCACTGGATGAGTATATAAATCAATGGCAGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAACGATGGTTGGGTGCAAGGAGATGAGATTATATACCCTAGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAACGCTGAACTAACAACGTCTCCTTTTTTTACTCGCCGTCCATCGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAACCAAATAGAAGCGTTTAGAAATCAGTTAAAAGGGATGAAAGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAACGACGAATACTATAACTCCGATACGTCCGACATTGGTGTAATGGAGGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAACAGCTGGCCTTTGCCCTCAGGGTATAGCGGTTACACTGACGCTAGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAACGAAATAAAAGAGGAGGGTACTAAAATCCCTATGACTAAGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAACCCCAAGGCTGCTCAGGGGCAGGTAGTACAGGTGCTCATGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAACGGTAAATAAAGCACATTTCGGAATAATCCCATTATTATGAGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAACGAGATCAAATTAATGTATATGTTAGAGACAGTTTAACTTTCTTGGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAACGATTTATCTGCTAGGTCTGTTCTTTCGTGAACCTTGGCTAAATGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAACTTTCGTGCAGGCTAATCACCTCCACGTTACCCTAGCATTTGGGGTAACACGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAACAGTAAAAGAATTACAAGAAGAACTAGGACAAGTAAACAAAGTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC >NC_019776|5|4|1149597-1150977|PILER-CR GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC CCCCCAGGACGTACTAAAAGTCTTCCAAGAGGAGAGTAC GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC AACGGAAGCTAAAGAACTATTGGCTGAAAGACGAGAAGAAGAAAA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC TAGTGATGAGCAATTAGCTCGTTTAGGTGAAAGAGTGGTAGTT GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC GATAGAATAGATTTAACAATAGTTCTTCATAGCAATTGT GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC CTTAGATGAGAGTAGTATTGCCGCACTGGATGAGTATATAAATCAATGGCA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC GATGGTTGGGTGCAAGGAGATGAGATTATATACCCTA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC GCTGAACTAACAACGTCTCCTTTTTTTACTCGCCGTCCATC GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC CAAATAGAAGCGTTTAGAAATCAGTTAAAAGGGATGAAA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC GACGAATACTATAACTCCGATACGTCCGACATTGGTGTAATGGAG GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC AGCTGGCCTTTGCCCTCAGGGTATAGCGGTTACACTGACGCTA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC GAAATAAAAGAGGAGGGTACTAAAATCCCTATGACTAA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC CCCAAGGCTGCTCAGGGGCAGGTAGTACAGGTGCTCAT GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC GGTAAATAAAGCACATTTCGGAATAATCCCATTATTATGA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC GAGATCAAATTAATGTATATGTTAGAGACAGTTTAACTTTCTTG GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC GATTTATCTGCTAGGTCTGTTCTTTCGTGAACCTTGGCTAAAT GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC TTTCGTGCAGGCTAATCACCTCCACGTTACCCTAGCATTTGGGGTAACAC GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC AGTAAAAGAATTACAAGAAGAACTAGGACAAGTAAACAAA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC >NC_019776|5|5|1149597-1150977|CRISPRCasFinder GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC CCCCCAGGACGTACTAAAAGTCTTCCAAGAGGAGAGTAC GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC AACGGAAGCTAAAGAACTATTGGCTGAAAGACGAGAAGAAGAAAA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC TAGTGATGAGCAATTAGCTCGTTTAGGTGAAAGAGTGGTAGTT GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC GATAGAATAGATTTAACAATAGTTCTTCATAGCAATTGT GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC CTTAGATGAGAGTAGTATTGCCGCACTGGATGAGTATATAAATCAATGGCA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC GATGGTTGGGTGCAAGGAGATGAGATTATATACCCTA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC GCTGAACTAACAACGTCTCCTTTTTTTACTCGCCGTCCATC GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC CAAATAGAAGCGTTTAGAAATCAGTTAAAAGGGATGAAA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC GACGAATACTATAACTCCGATACGTCCGACATTGGTGTAATGGAG GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC AGCTGGCCTTTGCCCTCAGGGTATAGCGGTTACACTGACGCTA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC GAAATAAAAGAGGAGGGTACTAAAATCCCTATGACTAA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC CCCAAGGCTGCTCAGGGGCAGGTAGTACAGGTGCTCAT GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC GGTAAATAAAGCACATTTCGGAATAATCCCATTATTATGA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC GAGATCAAATTAATGTATATGTTAGAGACAGTTTAACTTTCTTG GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC GATTTATCTGCTAGGTCTGTTCTTTCGTGAACCTTGGCTAAAT GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC TTTCGTGCAGGCTAATCACCTCCACGTTACCCTAGCATTTGGGGTAACAC GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC AGTAAAAGAATTACAAGAAGAACTAGGACAAGTAAACAAA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC >NC_019776|5|4|1149597-1150977|CRT GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC CCCCCAGGACGTACTAAAAGTCTTCCAAGAGGAGAGTAC GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC AACGGAAGCTAAAGAACTATTGGCTGAAAGACGAGAAGAAGAAAA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC TAGTGATGAGCAATTAGCTCGTTTAGGTGAAAGAGTGGTAGTT GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC GATAGAATAGATTTAACAATAGTTCTTCATAGCAATTGT GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC CTTAGATGAGAGTAGTATTGCCGCACTGGATGAGTATATAAATCAATGGCA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC GATGGTTGGGTGCAAGGAGATGAGATTATATACCCTA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC GCTGAACTAACAACGTCTCCTTTTTTTACTCGCCGTCCATC GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC CAAATAGAAGCGTTTAGAAATCAGTTAAAAGGGATGAAA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC GACGAATACTATAACTCCGATACGTCCGACATTGGTGTAATGGAG GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC AGCTGGCCTTTGCCCTCAGGGTATAGCGGTTACACTGACGCTA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC GAAATAAAAGAGGAGGGTACTAAAATCCCTATGACTAA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC CCCAAGGCTGCTCAGGGGCAGGTAGTACAGGTGCTCAT GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC GGTAAATAAAGCACATTTCGGAATAATCCCATTATTATGA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC GAGATCAAATTAATGTATATGTTAGAGACAGTTTAACTTTCTTG GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC GATTTATCTGCTAGGTCTGTTCTTTCGTGAACCTTGGCTAAAT GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC TTTCGTGCAGGCTAATCACCTCCACGTTACCCTAGCATTTGGGGTAACAC GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC AGTAAAAGAATTACAAGAAGAACTAGGACAAGTAAACAAA GTTTCCGTCCCCTTACGGGGTAAATGAGGAAATTAAC
>NC_019776.1|WP_015218806.1|1148558_1148984_+|transcriptional-repressor MVISKDNIIKTLKSKGLRVTPQRFAVYSNLLHRCDHPTAEQILTDLNQEVPTLSQATVYLSLQTLQNVGLVKEVLLEEGVCRYDANVDPHHHFLCECCGEIEDIPWESLTGINISNLRQGLKVDRFEVTVYGRCDRCSDSH >NC_019776.1|WP_015218805.1|1147805_1148375_-|peroxiredoxin MAVLERVPDVVFKTRVRDESIQPNPYRWEDKTTQDIFGGKKVVVFSLPGAFTPTCSSNHLPRYEELYDEFKALGVDEIVCVSVNDAFVMFKWGREIGAKNVFLLPDGNGEFTRKMGMLVDKSNLGFGLRSWRYSMFVNDCKIEKIFVEPNFSDNCPTDPFEVSDADTMLAYLKGEQPKGVSEPRKEFVG >NC_019776.1|WP_015218804.1|1146199_1147201_-|NAD(P)/FAD-dependent-oxidoreductase MRLSSKNLDTRLDTVYDAIVVGGGMGGLSAAIYLARYGLKCLVIEKGKGRSMWMQDLRNYVGLDPDTPGRDIINHGTKQAVDWGADHLRGYVEDVTDEGDTFAVKVKVGKKDSIYPVFRSKYLIAASGVIDVLPELDDMQNVYDYAGYTLHVCMICDGFDMWDQKAVLIVGKESQINAAFVLNWFTPYITVLTHGLCTVSDEMKQKLAEHGYPLYESAIARFVGEDHKMQGVELVDGTFIEATTGLINMGSIYHNHYLKGIEGLEWDGENLVTNEMAQTSHDRIFALGDLKKGLNQVSVAVADGTLAATQIWRNIRRQSPPRKWESNLSTTIQ >NC_019776.1|WP_015218802.1|1144325_1145975_-|MBL-fold-metallo-hydrolase MIKRQEKFSAPEISFSCYPFGVGHYTEGVALQLTLGNYRLLLDCGVEDISLLVNQDQPPFDWVFCTHAHQDHARGLLALHKCYPNLPIYTSDVTGKLLPLNWLDKKDSASISFPQVLPWRSPFHLQSDLTVELYPAGHLPGASAFLFQYHHRDRVYKIFYTGDFCLSNLQLVEGLSLDSLRGLNPDILIIEGSYGTARHPHRRHQEKQLMARIKTAIESQVNVIMPVPTFGLGQELLKLLRSHHEFTGRNLDIWVDGDLASACDLYLDLISYFPENVQNFAKHQPLFWDDKIKPRMRRVTKNTARHQLIVEPSIVLTDKISHLQEYCQDNGQKWLILISEQSKIKQTDEFKSLTQKYDPERIIIEDYLLAEHSDGRNTTQLIHNLRPQHIIFVHGLPNYLADLTSLEELQNRYQLHSPAVGVKVDLPIGAQFMQPKITTQNNYEGELNETGAYVTITLPEQINKDPRWQNFADTGLIEARWQGEELVLRGLSQRELLQQNSLLRRQLNPESCGNCRHFDNQHCHNQESPLNGFTVPHDGYCPLFEVDDI >NC_019776.1|WP_015218801.1|1144026_1144197_-|hypothetical-protein MTTPIIAEKIRAIASKKEVLEQLLEKPDLGNLRLDVNQALEELEELIEELNKTFPS >NC_019776.1|WP_015218800.1|1142558_1143155_-|hypothetical-protein MISDSLISKYQIINRYKQLTGEALNKNNYLEILSLTELLKKLLTETYQGSDNQFVRSKQINFHLFKEKFSTQYNLEEIDSKHLWQEIYYLLKGNATYSINEKGLIALEDYQQQIQNYSFLPLNVNHQKIYKLAEKYQQWLKENNYWDDNDLSRYLLTHLHEDNIGKYYIYGDNIHHWSEISLKLICQLTTAEKTFALT >NC_019776.1|WP_015218799.1|1139790_1141053_-|insulinase-family-protein MTQTQKYIHKTILSNGITLVVTENPTTDIIAGKIFCRQAGSLWEAKHQAGLFHLLASVMAKGTRNLSSLEIAEKVESIGAALGTDTSSDYFLVSMKTITEDFPEIMALASEILRFPSFPLDEIALEKNITIQNIVSQKEQPFNVAFSQLRQMIYGQHPYGFSLLGTEETVANLIQDDLRFYHQQHFRPDRLVISLAGNIDLNSAVEVVEKVFGDWFPPEDALIKIDSLEQRELLSPKARSHHTSQDTQQSIIMMGYLVPEMTHPDYPVLKLLSTYLGNGLSSRLFVELREKRGLAYDVSAFYPTRVDKSQFVVYMGTAPHNADIAQEGLYNEIKRLRENPLTTEEIQTAKNKLLGQYALSKQTNGEFAQVFGWYETLGLGIEYDNIFPQKISSVTIEDIQRVAQEYLQDQFLCVSKVGPK >NC_019776.1|WP_015218798.1|1137760_1139716_-|precorrin-3B-C(17)-methyltransferase MKYIFADYHPLHFITTSPEKIEQLEYLNKITQGFLWLPKKIHNDNLSANFYDSSLREHLVNIWSNSKCIVFCLTLGAVTRLIAPLLTNKKTDPAIIVIDPAFEYIICLTGEHQHQGDKLTEILAELLSAKAIITSASSNLNLPAIDSFGYTFGWKKGEGDWTKVSANITQNKPTLIKQESGLNWWCQNLPINHPFIFGEGIKDNSKEGEKREEDFLKQSDDDFAKSIFTEAEKQVQAMVYIGVNKTPRVDIPIVSWHPRGVWVGIGCERDTSPILIENAVNSVLAQYNLEKNAIASLATIDLKADEVGILELAQKWQLPLKTFTSEELNLIDVPNPSSIVEHEVGTKSVAEASALKAGSWSNLPENNFSPTLIAPKQIFKQEGLKGAVTVAIALSNLEYNPRQGKLYLIGTGPGAIEYLTTAAKTALRDAEIIIGYGLYIDLIKPLLHPSQIIETSNITQEKQRAERAIALAQWGLKVAVISSGDCGIYGMAGLVLEILANQNWDGKQPPIQVFSGITAMQSVAAKIGSPLMHDFCAISLSDLLTPWDVIEKRLHAAATGDFITAIYNPRSQTRQQQIITAQNIFLQYRSGNTPVAIARSVTREDESIILTTLEEMLNHPIDMVTTVLIGNSSTKRYHDLLITPRGYLGQC >NC_019776.1|WP_015218797.1|1136580_1137552_-|SDR-family-oxidoreductase MKILVIGATGTLGRQIVRHAIDQDYSVRCLVRNRGKAGFLKEWGAELVKGDICEFKSIESALEGVDAVIDAATARATDSLTIRQVDWEGKVNLIQACAKANIKRYIFFSLLNAEKFEDVPLMNIKHCTELFLQESGLDYTIFKIGGFMQGLIGQYGIPILDNQPVWVSGENTPIAYMNTQDMAKFVIKALEIPETVKKTYPLVGSRAWTGDEIIQLCERLSGKTAKISRIPLGLLRFLRGFTRWFKWTRNASDRLAFAEVLASGIALDAPMDEVYETLKIDPQEITTLEAYLQEYFDRIMKKIREIDYEKSKMKKRKKNSFFK >NC_019776.1|WP_015218796.1|1135143_1136403_-|SufS-family-cysteine-desulfurase MTLTYKKTIADEVRQDFPILHQKIHDKPLIYFDNAATSQKPRAVIEALRHYYEYDNANVHRGAHTLSARATDAYEGARDKIAKFINAKSRNEIVYTRNASEAINLVAYSWGLAHLKAGDEIILSVMEHHSNIVPWQIIAQKTEAILKFVELTPSQEFDFNHYQSLLSEKTKLVSLVHVSNTLGCINPVTEIITSAREKGAKVLIDACQSLPHLPIDVQGMDCDWLVGSGHKMCATTGIGFLYGKEELLEAMPPFLGGGEMIADVFLDHFTCGELPHKFEAGTPAIGEAIAFGTAIDYLSNIGMENIHQYEEELTAYLFQQLNEIPNLTIYGNQPTTEGKGRAALAAFNVKDIHGSDLSTLLDHEGIAIRSGHHCTQPLHRYLNISGSARASLYFYNTFAEIDAFIVALKETIDFFTQMN >NC_019776.1|WP_015218807.1|1151233_1151524_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MIKLWLICYDVKDDKRRTQLAKLLEQHCERVQYSVFECPLDVKKLEHLLSTRWLKVLNLQEDSLRIYPLDASAKQKIKIYGLKDNPPYESPDYLIL >NC_019776.1|WP_015218808.1|1151520_1152528_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MTALYLTEPGTKVHYKNQTFTIKKNQTYTCRLSELELLVILPGVQLTDAVISALLDQGIEAIFLRQDGQFRGRLQASFASNPLIRLAQYRTVETSFGLAFAQKFAYGKIRNQRALLQIKNRATKGKIAQLSESIDTINVYQLQLKNIDKPRTRDELMGIEGISARSYYQALQHFFPPHWQFNGRNRRPPKDPINALLSWGYGVLLARIFAVCVKAGLDPYLGFFHSIQPYRPNLVLDLMEEFRPILVDYAVISLIQSQMLDIADFQPSSDGQGIWLSVTAKKLLLRELEERMNQYLLYPPQNRKLKLNQIFLEQARMLARCLLESSLDYEPFFIK >NC_019776.1|WP_015218809.1|1152620_1152929_+|hypothetical-protein MNFALVRTIVRFRNVFVAILNGVITWIILIIAPLGLFTVIICTIAVFLSSVIFGLVGDFFLFMMLRQGNFNGVTGVGENRKFVDSELPSMRYSESIRKKNYD >NC_019776.1|WP_015218810.1|1152999_1153929_-|UPF0104-family-protein MTKLRQLIPILFVIILLSISVAAIASELKKYNINSVWQYLQNISQQRKMLALLVTGFGYALMTGYDILGFIHIKQKLSVLKIAFTAFVSYAVGNTVGFTAFSGTAIRYRYYGLWGVNKIKIGELIVFTHLTFWLGLLSISGIVSILDPLTLPSAIKLPFASIHPLGFIFLSLVLIYFIISVTIKHSVTIAGEEITFPKPIISLGTIIVAGLDWGLAALVLYLLLPPNLSMTYIGFFGIYIVALTAGLISTVPGGLGVFETVMLYLRPESISAPQMLGGLIAYRFVYYLLPLIFAVVLILLEAWKKRHPK >NC_019776.1|WP_150108929.1|1154027_1154828_+|hypothetical-protein MDKIKTKIGWKNNLDKLLFILASLYLILILGLWLKNRQQTVNSQSQTVNPNKQIISESNLIETNTINNQNTEENLLNDENISPNQEDIENQILSTGNNITSTLEIPPLPSNQSTVNNIPLPPPDLQPLPIPQPPQPVANSSITTNNLSNNNTKPNLTSSSSIPKVNKVPVIASLSKDNSNIPEQIALNSVPESTEEKTQGNYTLIGLVQLPDSKSVALFKVNNITEKVSLGKEIGATGWVLMAVNEKQAVVSKQNQSVYLQVGETF >NC_019776.1|WP_015218812.1|1155122_1155986_-|aldose-1-epimerase MFNIAVKQEEYLIYILKDIENDSRLEIVPEKGGIVTNWKIQGQNILYLDQERFKNPSLSVRGGIPVLFPICGNLPENIFYFEDKKYILKQHGFARDLPWKVIGQSHSKSAKIILSLKSNQETLEVYPFEFELIFSYELLGKKLIIEQSYENKSNKKMPFSTGFHPYFYCGNKDKLKLNIPATEYQNKTGDKTFSFDGNLDYNSPEIDIAFTKLQGNKASFTDEKRDLTVKVKYDDFFSTLVFWTLEGKEYICLEPWSSPRNSINTKEQLKYLQPQEIFHTQIEIEVS >NC_019776.1|WP_015218813.1|1156100_1156790_-|phosphatidate-cytidylyltransferase MLVNLSNQIGSILLITVYIGGLLLIAEILNRLHKTDSELTRKIVHIGTGNVILLAWWLNITSDVILLAVITASIVAIASYYLPILPSVNSVGRHSLGTLFYAISIGILTALFWHEGEKQFTAIGILIMSYGDGMAALIGQKWGKHKYQLLGNKKSWEGSLTMTLVSILVVISIFGIVATIQTKLFIIALLIGIFATILETFSSFGIDNLTVPVICGILAYYLQNIFTIN >NC_019776.1|WP_015218814.1|1156779_1158159_-|putative-bicarbonate-transporter,-IctB-family MSTLKHSQDEKFFLLNWLKGSLIGNLVGLLSPWRSSSYLLGYSDIITAIFVCLVIISSPFTSNTLVGIILLAGGGFWVLLTVSDIDKNQITPIHLCIFAYWLISVAATAFSPLKMAALSGLVKFTLYLLLFALASRVFAKTKMRALIMGTYLLVSLIVSAYGVRQQFIGVKPLATWTDPTSPLADTTRVYSFLGNPNLLAGYLIPAVAFSVVALIVWKTKPQKILAGFALVINVACVYFTGSRGGWLALIGTGIVFLLGFKFWWNEYLSPFWRKWLIPTVITSFLLLVGVAMIFVEPLRIRIFSLFSWRGDSSNNFRINVWISALQMLQDYPLIGIGPGNEVFNQIYPLYMQTKFTALSAYSIFLEIALETGLIGLFSFLAVIVTTFKRGMVLIKKMKPSNDLQAIWILGAIASLAGLATQGLFDTVWYRPQINTLWWLCVAMVAAVYSLKSETDNHVS >NC_019776.1|WP_015218815.1|1158445_1159366_-|alpha/beta-fold-hydrolase MKLKDNSDNAQKYGKQRDWFWHGWRIRYSFYPANMSGKNQIPILLLHGFGASLKHWRYNIPVLRQNHSVYAIDLLGFGNSEKAYAEYGIPFWSELVKDFWDNFINQPCIIIGNSIGSLIALNAVANYPKIARGLVMISLPDIYGRREVIPPFLYPILQKIENLVAFPLLIRLIFYLVRQRGIITRSLKLAYVDHKNVNDELIDIIMTPPQDKGAARALIALTRYVNDFNVSAKTLLSQVHIPILLLWGKCDRLIPPIMAEKLAQINPQITLKLLDNLGHCLHDENPDLFHQLFFEWEKLIINLSSV >NC_019776.1|WP_015218816.1|1159415_1160288_+|dTDP-4-dehydrorhamnose-reductase MTTKILLFGSNGQVGTELSTHLSKIGDLTLINRSIVDLTSEKDVRNCIRDCKPQFIVNAAAYTAVDKAESEPQLAQQINAIAPQIIAEESNKINAQFIHISTDYVFDGKSNIPYLESDNTNPLGVYGKSKLQGEENIKENSDNYIILRTAWVYGKYGKGNFLKTMLRVGEERDILKVVIDQIGCPTYAEDIAIIIKKIIEQNKGEKYRQDIYHFTNLGVCSWYDFAVNIFRQARKLNYPLKVKEIIPISTTEYPTPAQRPAYSVLSTRKIRNDYNINGDYWLESLERYFQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019776_6 | 2477105-2477266 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019776_6
|
2 spacers
spacers of NC_019776_6
>6.1|2477129|45|NC_019776|CRISPRCasFinder TGATGGAGATAGTTATGAGGGGGAAATAAAAAATGGTATTCCTCA >6.2|2477198|45|NC_019776|CRISPRCasFinder AGATGGCGGAGTATATGAGGGAGATTTTGAAAACGGCAAACAAGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019776_6
The CRISPR arrays of NC_019776_6 >merge|NC_019776|6|2477105-2477266|CRISPRCasFinder TGGTAAAGGTGAGCGTAAATATGCTGATGGAGATAGTTATGAGGGGGAAATAAAAAATGGTATTCCTCATGGTAAGGGTATTTATAAATTTGCAGATGGCGGAGTATATGAGGGAGATTTTGAAAACGGCAAACAAGTTGGTAAGGGTATATATAAATTTGC >NC_019776|6|6|2477105-2477266|CRISPRCasFinder TGGTAAAGGTGAGCGTAAATATGC TGATGGAGATAGTTATGAGGGGGAAATAAAAAATGGTATTCCTCA TGGTAAGGGTATTTATAAATTTGC AGATGGCGGAGTATATGAGGGAGATTTTGAAAACGGCAAACAAGT TGGTAAGGGTATATATAAATTTGC
>NC_019776.1|WP_150108949.1|2475897_2476107_+|hypothetical-protein MDFISSKIGKRYYFILIAIALILVFYRLLQIIITPLTGILIDRTSYKQIINCNDAGSGFCIISTTLASV >NC_019776.1|WP_015219866.1|2474428_2475442_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MAKIITSNDWEEIWAESHDNGTYISYSRNKYGYIIQGKHPYLGRNRCYGIDLRNGLSIEYNEVEFSDDLVILRDKLNQPLFGLSFFLSGKVRIERHGLTGKSEESIGRYYSDCNCDVKETEWWTKGEKFSRIYIEIEPQKFFNSFSQEDLSQIPPFLRQTLVEKQTQPYYDQGNITREMQKILRQILNCPYQGFMKQIYLESKSVELIALHCQQFQQNQLQDCRLQTGNLSDIDRIYQAKEILLKNLENPPTLMELSRRVGLNDFKLKRGFRELFGTSTFKYLHDYRLEQAKQLLTSGEMKVEDVALKVGFNSRSYFASAFRQKYGVNPKQFQKIYN >NC_019776.1|WP_015219865.1|2474139_2474376_-|hypothetical-protein MNIKYLEHKVRFLTNEKGQKTDVLIPLIVWEKLISLLNEKLSENSNTKAELIAELKQSLLDAQEGKTFPLEELWEGIE >NC_019776.1|WP_015219864.1|2473803_2474136_-|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MTEIRYTLPFQRQLKQLAKRYRNIKNDIQPTVKELQKGNFVGNQIKGVQQTIFKVRAKNTDIPTGKSGGYRIIYQVISGEIVLLLLIYAKSDTANITVQEIEKIIKETLN >NC_019776.1|WP_015219863.1|2471174_2473664_-|TonB-dependent-siderophore-receptor MQLNRFFLYLLPIVTITLLIDISVKAEESKVLRLSKIEPIAQKAELLLAQEIVEIRGIKLEPSETGLQIILETESLSKLQPLIYTQENTLIIDVLDVVLALSDGEEFRAENPSDQISEIRATPLDNNAIRIIVTGKTGIPTAQVVPSESNLVLSLTAGDTATSETEIEVVATQEGQEDTGYFVPDTSTATRTETSLQDIPQSIQVIPQQVIRDQRSDVSDALLNAPSVRNSAPSNFDSLRLRVRGFFSQPTLNGIKETNGLSSNVGPDLTGIERIEVIGGPNSVILGATSPGGTVNFVTKQPLRDPYYFVEATFGSFDFYRGEVDLSGPLDEEEKVLYRLNASYRDQGFFTERSQTRNLVIAPVLSLELGENTNLTVEGIYKYLEQEDYNLGLPAIGTIFSNPNGQIPNTRITNEGDLDVTTARIGYRLEHKFNENLSLNNVFRYGYLNYDGIGINIGSQLLSDNRTLLRTANDLNDRYRDYRFTTNLAGKFLTGSIAHQLLFGIDLGRLNNSLKFTGRSGAPIDLFNPIYGQPAGVVTFELDTNTVTDELGILLQDQVTITENLKLLISGRFDTFMQTNKDFLADTETSQSGSAFSPRVGIVYQPIKPISLYFNFSRSFEPAIGTAFDGSNFEPTRGTQYEVGVKANLNERLSATLAFYDITQSNVLTSDPNNIGFSIQTGEQNSQGIELSVAGEILSGWNIIASYAYNDGRVTQDNSIPVGNRIQGTTANAASLWTTYEIQEGDLQGLGFGLGLFYVGDRAGDTGNTFEVPNYLRTDAAIFYRRNNFSAAINIKNLFDTDYFENAFNNLRVSYGAPFTVQGTISWKF >NC_019776.1|WP_041922810.1|2470173_2471130_-|iron-siderophore-ABC-transporter-substrate-binding-protein MRGVKHLFFLLFLSGILIFSVLSCGVNNSLKDSQVSNQDCRVVQHARGETCIPLNPQRIVTLDFNSLAVILALDVKPIATWITTEIEDDFPYFQNKTDDIEVLRNSSGQPNLEKLLSLKPDLILVISHSWFEPIYDKLSQIAPTVILPWEEIKGDWKQHLQEAGRVFDQTEKANQLMDDYDNRIQELKGLMGDRPPKISFMFVADGQIVITRQKSFAGGILHELGFLNPLFTDSGDNDLPISEEILPTIDSDILFVAPLKKDDRSVIEKLQQKPLWSKVKAVQNNQVYVVDFSVWRGLNIFAAHEVLNDLEKYLVNTP >NC_019776.1|WP_015219861.1|2469854_2470169_-|DUF1636-family-protein MAKHTLFVCKSCHRASQERPENPPFDDDIFLDKLNALCSEQFLDDEIEIRSIGCLWACDRGCVVSVGSVDKPTYLFVNLTPEESSLPLMEFLQLYLHSKKGNIP >NC_019776.1|WP_015219860.1|2469432_2469672_-|hypothetical-protein MKMIQVKGEIKQGELKIKTPLEMSDGEVDLIIFKQSQEAEEFQTMRQLAKENGYDSREKIMDLIHQVKLEMLEEKGRTK >NC_019776.1|WP_015219859.1|2468968_2469433_-|hypothetical-protein MFNLQRLCLDTNVYIIGIEDVDSPEAKILKAIGYFGKDNTTIDAEIILSHEVIDQIRRVGKYLWNKDKTGFAISLIWSRLNFHYVDVDFRWRELSSKIVSQGVIPTEDVEIYLTAKLGLCDCFVSSNRGLIKAIADFECLTPSEFVNKYFESIN >NC_019776.1|WP_015219858.1|2467008_2468775_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSSKNHPLFRLLKYSKNYQTQISIATIATILNTIFDLAPSYLIGVAVDIVVLKEDSFIAQWGFTNTITQLAILSLITLLVWSLESLSEFIYERLWRNLAQTLQHELRFDAYSHLQELELSYFEERSTGTLLSILNDDINQLERFLDSGAESIIRFITTIIFVGGSFILIAPQVAWLAILPIPFILWGSLAFQKRLAPLYADVRDKAGLINTRLANNISGIATIKSFTAEIYEQSRVKNESEAYRRSNRSAIALSSVFIPAIRLIIVMGFIATLFFGGVAVSQNQLTVGTYGFMVFIVQYLLWPFATLSELMDQYQRAMASIRRVMGLLDTPIRIHSGNKTFSTPIKGEISIVNVNFAYDNGVKVLKNLSMDIRAKSNIGIVGATGSGKSTLVKLLLRFYEIDHGEITIDGVNIQELYLHDLRKAIAWVSQDVFLFHGTVAENIAYGNFDATLTEIIQAAKLAECDDFIQQLPQGYDTIVGERGQKLSGGQRQRIAIARGILKNPPILILDEATSAVDNETEAAIQKSLQVITKDRTTIAIAHRLSTIRNCDRIYVMDKGQIVEQGKHEELLALEGIYHSLWAVQSGIN >NC_019776.1|WP_015219868.1|2477667_2478633_-|glutathione-synthase MKKFLFIIDPIAQLDPTHDSSVAMMESAQVLGHEVYITTIDKLSVVGGKAYGHISPVTLKPVQLIEGKWIAEKEWYQVGDAFFSPLEFCDVVLMRKDPPVTTAYLYATYILDLVDSQKTKVVNSPQGIRGANEKMYALQFTDVIPETIVTQSKKVIADFLQEKQALILKPLGGKAGEGILFMQEGDRNFNSLIEISTKQGQEPIMVQEYLPSAKEGDKRIILLGGKPIGAVNRIPTGKEFRGNMAVGGRVAQTEITPRELEICDAIAPTLLDDGLIFVGIDVIGGYLTEINVTSPTGIREIDRLDHVNLGQETIKFLLEVE >NC_019776.1|WP_041922811.1|2478634_2478895_-|glutaredoxin-3 MSAKVEIYTWSSCPFCLRAKALLREKQIEFTEYCIDGDNAARMAMTERANGRSSLPQIFIDDQHIGGCDDIYALDRAGKLDQILYS >NC_019776.1|WP_015219870.1|2479332_2479644_+|hypothetical-protein MKHFCDDWIQEWCDHNGWTDWFLECRDYWAFPPHSVMPLPIPKETLMEIKAEKGFSPEEKIWLSISVAISIAGGVFSYFLNCPMPVVLAFAFTAIIIANFELD >NC_019776.1|WP_015219871.1|2479840_2480443_-|superoxide-dismutase MAYQLPNLPYEYNALEPYISKSTLEFHHDKHHAAYVNKFNDAVAGTELDNQPIETIIKKFAEDTSKQGIFNNAAQAWNHSFYWQCMKPNGGGNPTGVLADKINTDFGSFEKFIEAFKNAGATQFGSGWAWLVLDGDTLKVTKTPNADNPFTKNQIPLLTMDVWEHAYYLDYQNRRPDYINDFIEKLVNWDFVAQNFSEAL >NC_019776.1|WP_015219872.1|2480975_2481806_+|M48-family-metalloprotease MFKYYRKLVYLLTSIFVASSLIITDVQPSNAIPWQELIFRGIQLIQINNISDQQEREIGGQIRQQLISQGKVKLYRDENLSAYVNQIGRRLVAVSGRPNIPYRFEIVDNPQVNAFATMGGYIYLHTGLITAADNEAELASVIAHEIGHVVARHSQKQMQQQAVTQGLLSVAGLDRTQVVQLGVALAVDLPYSRQDEYEADTLGLEMLKGAGYAPQAMVDFMRKLAKTGGRTPTLLSTHPASGDRAIALEQKIPASRGYQGDGLDEQAYRYQIRSLL >NC_019776.1|WP_015219873.1|2481864_2482878_-|thiamine-phosphate-synthase MEQKQAIYRILDANLDRAREGLRIIEEWCRFGLNNQTMAESCKQMRQELSQWHSPEIRAARDTVNDVGTTLTHPKEEKRENLDSVLLANLCRIQEALRVLEEYSKLINGKFALTMKQMRYQVYTLESQLMNKNNHQLLSQSSLYLVTSPVENLYEVVESALQGGLKLVQYRHKDETDVVRYEQASKLKQLCHKYNALFLVNDRIDLALAVNADGVHLGQTDLPISVARQLLGKDKIIGKSTTNPEEMKNAIADQVDYIGVGPVYETPTKAGKKAAGLEYVRYAQENASIPWFAIGGIDETNIEDVVRAGATNVAVVRAIMVADNPKEVTQNLLKKLS >NC_019776.1|WP_015219874.1|2482884_2484093_-|tetratricopeptide-repeat-protein MVHNSNISLAMIVKNEAHNLPKCLDSVKDIVGEMIIVDTGSTDNTKEIGINYGAKVYDYQWNDDFAQARNFGLQYVSGDWVLVLDADEVFNPKIISQITPLMEKDDCLVINLIRHEIGTVSSPYSSLSRLFRRHPQISFSRPYHALIDDSVIALQEKEKQWKIFDSNEVAIAHYGYQPEVIAQQEKAQKARKAMESYLAQNPHDAYVCSKLGALYVSLGEIKKGLKLLKTGLKSSLATSTTLFELHYHLANAYVKEGQISLAVKHYQKAIASPILGKLKLGAYHNFGSLCYQRGQYQQALNLYRQCIIIEPHYAFAYYNLGLTHRAMGNISLAMETYRQSIKLNPEYPWAYQNLGVLLLQQGYMEESAEVFQKAYNLHKQQNRPVAENLKEELKLVGLNLND >NC_019776.1|WP_015219875.1|2484425_2485313_+|acetylglutamate-kinase MSKKIVESEYYREQEATRVRILSEALPYIQKFSGRTIVVKYGGAAMKDGTLKEYVIRDIVFLASVGVNPVVVHGGGPEINTWLTKLNIEPQFKDGLRVTDATTMDVVEMVLVGRVNKELVSMINRAGGSAVGICGKDGNLVKARSVDQENVGFVGEVTNVDISLVDALVKSGYVPIISSVAADNEGQAHNINADTFAGEIAAALGAEKLILLTDTPGILKDYHDHSTLLYKLTIQEARDLIDNDIVSGGMIPKVNCCVRSLAQGVKAAHIIDGRIPHALLLEIFTDDGIGSMIVP >NC_019776.1|WP_015219876.1|2485409_2485838_+|DUF393-domain-containing-protein MSSANYIIIYDGNCNLCVNFTKLLERFDRGKLFRYIPMQNTAILETLNITPQDCEQGMILKKIEDNSLIWQGSEAAEKIIELLPNGQLFINAYRSIPNLKFIGDKSYLKIRDNRYQWFGGREKTYYSPYNLNCKNNSDCLVN >NC_019776.1|WP_015219877.1|2485869_2486346_+|hypothetical-protein MNSKNLEIFVKTININDYIILNKEKLLPDWQQVPKTIIFLFFRCQHSLNGNNLKSEEIEKERLLLEFYTLGKKFYYHSQNQKILSEVICPKTGFPIYSNKGKEIFITQQLVKRYLPSFKVKTKECGLFHPLWGQAVYPCIILSGAELTINKSIISAIT |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019776_7 | 3180046-3182768 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NC_019776_7
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37 spacers
spacers of NC_019776_7
>7.1|3180083|35|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGTTCTTCAAGTTCTGGCGGTTCTTTGATTTCTG >7.2|3180155|38|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACAGCAGAACTGCGATAACCAGAAGAAATTATTACAG >7.3|3180230|34|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCCATAAATTACTAACTACTTTTGTTACAACTA >7.4|3180301|37|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAGATAACATTTCACTAAAGCCTTTAGCACTGGTGA >7.5|3180375|38|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGCTTCAGCCCACGTCAAGGCTCTTTCCCATGTGCCGA >7.6|3180450|35|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGAACACCCCATGAGCAAAACCCAATGGAAAAAT >7.7|3180522|37|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTACCTCTCTCCATTTATAACCAATGCGAATTTCCGT >7.8|3180596|33|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCAGTCGTAGGAAACTGCTTCTAACCAACGATT >7.9|3180666|35|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTACTACTGTGCTTTTTTGAGCAACCTCATCGTA >7.10|3180738|36|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGTTTTCATCATAATAAATAGCTTCATAATTGGT >7.11|3180811|34|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAACAGTGCCTATAGGTTATGCACAACTTGTTA >7.12|3180882|34|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCCTCCCAATTATTTAATGCGATTCTTCTGGTT >7.13|3180953|33|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGTACTCTTGAGACTTCTCTACCAATTCTTTT >7.14|3181023|35|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTATCTAAATCTAATAAAGAGTTTGACGATTTTA >7.15|3181095|37|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CACCTCCAGAAGGCATAGAGCTTAATTTTCTTCCTTT >7.16|3181169|34|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACCTTCGCCTTCTTTCTCCCCCAATTAAGATGC >7.17|3181240|35|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTATTCCTCCTTTTTATTTCGATTATCATCCTCAT >7.18|3181312|36|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTAACAAAATCATTGGAGAATTAAATTATGAGCT >7.19|3181385|43|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGTTTTGTTGCTTCAAATTTAATTATAATTTAATTATATGG >7.20|3181465|39|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCAAATCCTTGATTCCCTAGCTGATTAGCTGTATTTAAA >7.21|3181541|36|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTAACTCAATCCCTCAAGGGCAGTCGTCTTGTCAA >7.22|3181614|33|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACATTCTGGACAATAATGAATAGCCCAATCACA >7.23|3181684|36|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTATGCTACTTTTAAAGGTTAATTCTAACCATGA >7.24|3181757|36|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTTTAAACGAGTTCATTGTGCAAGGGTAAATACC >7.25|3181830|33|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCCCCCCAAAGCAATAGTAGTTTTTTCAATTCT >7.26|3181900|35|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGACTCCAAAAGAAGACGCTCCTTACCCCATTGA >7.27|3181972|37|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGATTGTGACGGATTGTGACTAATGTGACGGATGGG >7.28|3182046|35|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACCAGAATTTTTCTTTAACCAATTTTCCCCCGAAT >7.29|3182118|35|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAGATAAAATAAATTTGCGCCCAGTGATTGAGGT >7.30|3182190|36|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTACAATTACTTGATCCCCCACCGAGGGCATGGAG >7.31|3182263|32|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTTCATCGGGATTGACCAAACCACAATTATT >7.32|3182332|35|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGACCCTAGACGCTTATTTAAAACTCAATTTAACA >7.33|3182404|33|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTCTTGTCGCATCAGGACATAAAATGTTTCGT >7.34|3182474|36|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTATTAGTTTTGAATCTCTGTGCTAATTTACCA >7.35|3182547|38|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTAATTGGATAGACCATTTCAACCTCCGTATTTGTGT >7.36|3182622|36|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTCCATATCCTCAACTTGACGAGTAATAGCAGTCC >7.37|3182695|36|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT GAGGGCATAATCAGGACAATTATCAGGACATACTAT |
cas2,cas1,cas4,cas6,cas3,cas5,cas7,cas8b5 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019776_7
The CRISPR arrays of NC_019776_7 >merge|NC_019776|7|3180046-3182768|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACTGGTTCTTCAAGTTCTGGCGGTTCTTTGATTTCTGGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACAACAGCAGAACTGCGATAACCAGAAGAAATTATTACAGGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACTTCCATAAATTACTAACTACTTTTGTTACAACTAGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACTCAGATAACATTTCACTAAAGCCTTTAGCACTGGTGAGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACGGCTTCAGCCCACGTCAAGGCTCTTTCCCATGTGCCGAGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACTAGAACACCCCATGAGCAAAACCCAATGGAAAAATGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACCTACCTCTCTCCATTTATAACCAATGCGAATTTCCGTGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACGCAGTCGTAGGAAACTGCTTCTAACCAACGATTGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACGCTACTACTGTGCTTTTTTGAGCAACCTCATCGTAGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACTTTGTTTTCATCATAATAAATAGCTTCATAATTGGTGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACCAAACAGTGCCTATAGGTTATGCACAACTTGTTAGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACTTCCTCCCAATTATTTAATGCGATTCTTCTGGTTGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACAAGTACTCTTGAGACTTCTCTACCAATTCTTTTGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACATTATCTAAATCTAATAAAGAGTTTGACGATTTTAGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACCACCTCCAGAAGGCATAGAGCTTAATTTTCTTCCTTTGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACAACCTTCGCCTTCTTTCTCCCCCAATTAAGATGCGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACCTATTCCTCCTTTTTATTTCGATTATCATCCTCATGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACATTTAACAAAATCATTGGAGAATTAAATTATGAGCTGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACAAAGTTTTGTTGCTTCAAATTTAATTATAATTTAATTATATGGGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACCCAAATCCTTGATTCCCTAGCTGATTAGCTGTATTTAAAGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACTCTAACTCAATCCCTCAAGGGCAGTCGTCTTGTCAAGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACACATTCTGGACAATAATGAATAGCCCAATCACAGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACAATTATGCTACTTTTAAAGGTTAATTCTAACCATGAGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACAATTTTAAACGAGTTCATTGTGCAAGGGTAAATACCGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACGCCCCCCAAAGCAATAGTAGTTTTTTCAATTCTGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACTTGACTCCAAAAGAAGACGCTCCTTACCCCATTGAGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACCTGATTGTGACGGATTGTGACTAATGTGACGGATGGGGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACACCAGAATTTTTCTTTAACCAATTTTCCCCCGAATGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACGAAGATAAAATAAATTTGCGCCCAGTGATTGAGGTGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACAGTACAATTACTTGATCCCCCACCGAGGGCATGGAGGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACGCTTCATCGGGATTGACCAAACCACAATTATTGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACAGACCCTAGACGCTTATTTAAAACTCAATTTAACAGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACTTTCTTGTCGCATCAGGACATAAAATGTTTCGTGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACTTTTTATTAGTTTTGAATCTCTGTGCTAATTTACCAGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACATTAATTGGATAGACCATTTCAACCTCCGTATTTGTGTGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACGTTCCATATCCTCAACTTGACGAGTAATAGCAGTCCGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACGAGGGCATAATCAGGACAATTATCAGGACATACTATGTTTAAACTCTAATTAATACCTATACATTAGTTAGAAG >NC_019776|7|5|3180046-3182694|PILER-CR GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC TGGTTCTTCAAGTTCTGGCGGTTCTTTGATTTCTG GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC AACAGCAGAACTGCGATAACCAGAAGAAATTATTACAG GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC TTCCATAAATTACTAACTACTTTTGTTACAACTA GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC TCAGATAACATTTCACTAAAGCCTTTAGCACTGGTGA GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC GGCTTCAGCCCACGTCAAGGCTCTTTCCCATGTGCCGA GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC TAGAACACCCCATGAGCAAAACCCAATGGAAAAAT GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC CTACCTCTCTCCATTTATAACCAATGCGAATTTCCGT GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC GCAGTCGTAGGAAACTGCTTCTAACCAACGATT GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC GCTACTACTGTGCTTTTTTGAGCAACCTCATCGTA GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC TTTGTTTTCATCATAATAAATAGCTTCATAATTGGT GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC CAAACAGTGCCTATAGGTTATGCACAACTTGTTA GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC TTCCTCCCAATTATTTAATGCGATTCTTCTGGTT GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC 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>NC_019776.1|WP_015220469.1|3179543_3179816_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYIIISYDIKDDKKRTKIHKILKSYGEWVQYSIFECELTETQYAKLRHRLSKLIKDDSDSIRFYSMCKCCQGKIERIGGEMPRDNTIFVV >NC_019776.1|WP_015220468.1|3178516_3179524_+|type-I-D-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGTIYITKDDTFIGKIDERIHVKADRKQILDVPFIKVDGLVILGRSNFSPALVAELLERKIPMSFLTTTGKYLGRLEPELTKNIFIRKAQWKTEDNSEKALHIVKGFIRGKLKNYRNFLQLRNRQNNHEKLEISINQIQDIIDGLERKNNVNSLRGLEGAGSAIYFSCFNLLIKNNEFSFNTRNRRPPTDPVNSLLSLGYALLRHDIQSAVNIVGFDPYLGYLHVAHYGRPALALDLMEEFRPIVTDAVVLNVINNKKITPKDFIIEPLSNAVSLTKEGLQIFLRAYEEKKQSKFKHPVLNRQCTYQESFEIQARFLAKYLMDETKQYPPLIIKK >NC_019776.1|WP_015220467.1|3178088_3178457_+|four-helix-bundle-protein MNSIIYQKAYKFSLRIIKAYKYLIEEKKEFILSKQLLRSGTSIGANIAEANGAISKADFRHKMSIAYKESLETQYWLSLLKDSEVIDVKSYQSIYQDVVEISKILCSIVKNTKAKNNKSNTS >NC_019776.1|WP_015220466.1|3177420_3178011_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKNQLISIASLNHYSYCPHRFWRMFCASEFTDNQYTIDGTTLHERVHTVGDLNLGETWQIRAIYLKSEQYKLIGKADLIEAENGTFYPVEYKRGKKGEWANDELQVVAQALCIEEMTGTHVHTGYIYYAQTHQRQEVEINSSLRQSAIASIKAIQEIIEKETIPKAEYSKKCKGCSLYSACLPMAKDKINRYRESE >NC_019776.1|WP_015220465.1|3176986_3177367_-|clan-AA-aspartic-protease MGLVFSEIQLRNPSKSNLQPIKVNALADSGAVHLCIPEHIKIQLQLNEVDQKEVTLADGSRKLIGYVGPIEIKFKNRIGFSGALVMGDQVLLGAIPMEDMDLIIIPSNRKLDVNPNSPNIASSIVM >NC_019776.1|WP_015220464.1|3176111_3176939_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MPHSLVINFTPISDIPVGYTSGKHLHALFFTLVNSVNPELAQYFHQSEANKSFTVSSLQVISNYKNRDNFLNYKQQNNIKKGSNCWWRITLLDDTLFSKLTKLWLNLRPQKPYHLGSGELMITSVLASPDSHLWANAISYQELYNQASETERNITLKIYTPTAFRQGKYDVSLPTAELVFNSLLRKWEKYSNISFSNANFDCLFPAYFDINTEIIIEPKTKFIGCIGTINYKILGEVETTLIKQINTLADYSFFSGLGRKTTMGFGIIKRLKSSP >NC_019776.1|WP_015220463.1|3173307_3176040_+|CRISPR-associated-helicase-Cas3' MSKLLTKKRKYPYNFGRVFFPDSQVIPEKILFQPLGNHVGNVVKLVKLWDKKDFPDQSSLERVIEASKIHDMAKPQTFSLQVETNKKEKFKKYIYSFKGHRFKAQHDDLWIETLAQGHHNFSTDCVTNDAYKLRKYKNYQDILNKDSLAYAKELYILEMCDQIEAELACLLKDKTQGEERTFMEYTIKIDENNPNIYRIDPFPFSDDLEYIELTFKYWVFTLLAENKEKLQQLIDKNEENKLGKTLDEIVKDWWEKVEAKPQEEELITIQLKPYQSLNCEYHKDCDYWYQNLTKFQTPNPMQREVFTAITNNEDIAVLLKAPTGVGKLEAVLIPTLALGYRLILPLPTRSLLEDHQERIENYLKKLSKLYPQKEFSLVVDTGSQMYRYIYFNGEKVPSRVKNPRRHLYKGDVILTTLDKFMYRYFGYGDKQKSFIFPLRINDNQNKTIICFDEAHSYDNLAFTNFCNLVKALYETGRNLVLMTATLPKNQIPRFDYLQEGLIDYIDNIDNKEKLDQFLEKNLKQPYPNEKILLWKSEVAIQASPEGKESNNFQQEFINLILNEWQSQENHRLITVVEKVKDAVEIYKQVKEELGTNLDDEGRFLFLYHGRISDTPKDKTHENYQYSRSGVYQQIKQRDNDQKPYLIITTSAIEVGCDLNCQTLITQLCPPENLIQRAGRCNRKGNIANAKVIIIGDSIPDFLNTLTDSELQLYQEKLRSHHSQNFNANEIMKCVSQTQQVDDYRVVELFSQLQEYVYEANLTCKPTHEKGLVITRSWIPSATLIYEDAQITVPLDRLIVKKDQETDKTNQYANVTVEESYYDQETTQWKTRTLRWGNAYQKNIIIKINKSQDGIVFDAGFHEYDYNAEFGFVDLPGVFVKWKPKNFEQQLAYKDGDKTIAVINYITPNND >NC_019776.1|WP_015220462.1|3172499_3173315_+|hypothetical-protein MYCLKISIAPTSAMTFRILPSSILNIATYPFVPPTTLSGYLRRLVMLSMKLEIPETDINKNNPPVYALPRKYITLGAYPVRDNFTAIHRTYRKGMREFNHDVFSRLYIEKEKADFQLHTWEYLITSELIGYVVTKSAEDLKPLQEIKGFGCKLGKEGFAVIQDISQPIKLTQITKEAIPSTIVPMEALLATNQFVNGCDIYNLYRYNWLTNQDNLNDNSPTAVNGFIPFVASYFQNQLTPELDYLTDSNNQINIPLSLINLLQLKGEITNV >NC_019776.1|WP_015220461.1|3171551_3172427_+|hypothetical-protein MTTGLPKTDQEKVHFDIYAILEGSQELYFGHETQVNINLVETVKLSTKNGEDLEKCYLSPTKRRGIERRCLIWAPVKSLGKLLGDKLDCGIPKTCVKIDCPICSTYGGLKVGEKTLIGRVSHGGGVAIQPILPEQKQRAMHPSRIASPESGKDETPTPFKREYNQPGILYPVYNHCLSLTDEDFATVAYAFLDSLPRIGAGNPKGIGLAEDAEKLLLVVDRYLVPKGKRPIISPSETNPESAIENFWRLAQTPEENTDYIQVKHFERWIGDKALEKLQEYASIFVDEVLQK >NC_019776.1|WP_015220460.1|3168962_3171548_+|hypothetical-protein MNENQLSIFDTNVVNDIKQINETLPSYIPQISYDLDSYTEAILISALASQSIIDSDNYLLSFLASNPKTKIILSSFNSPQLTRKLKKSKQQKQVEKPSLENKNNQVFYDNQQIGEIKLLYKPSIPGELQAKLAYLSTIDRFLEYLQTHYYSINLGETDYHIHIFIPAKYRLNIEQEWVKFVKKVLFSIEDKDNDKLPRLPQTFISMLKSITLAGRGFSTINVPIITQDQGIILASLYLAVFQQVKQRQDDRESLIKQLKKELNIDSLSEKERNSKEKELQKKEEMQKKEYKKYCEGFEKTFIKILTEHKSLFDEQDKINLQLQDASLNKRQINKLKKEKEKVGAKIIFSQDFVNQKTKLLENSGGNPFLFIVQDQKENQDKFAIINQLSKSFNRTATEQINSTRGDIFAQCLVEMYRLLENQTFETIPHSLLTEKSIITRVRSPGDDGNKFCYSCGVVLDKPQWRVARFMFERPSQRRQSSSSEDRPYICATCSVLAFASPLKVTDESIIIKLNAKNNNDIFQYKIKDYLRMLANKEMHLNSGHYLILTSDKTTGGDIASNKLGQVQYARAKIADIFPLEVLTDFDFCLVLQGSQQIKLESRHLIFIKGLMEGYAQKIIESGKEINSKLGDAIRYIEQDLPYLADYTLAKVFVNFRKTPNISLKNQILLEKTRKNYYQIMRENFMNSVQLKKQFTLYEDVASLTGLLYPFIQSFKKGAFSKEKPEDAKREVGKLIEKVNDGIIFHNYFCKYSYIKIVGEDEKRSITSVSFKKYPDNEFIYEQVKDLLENTDKLNISGREQKTEDLSTEYLTLYPDDIERAFNFFRQKYSSDKDWKTLTYHLELSIYARFPEQLQKSSKGDN >NC_019776.1|WP_015220470.1|3183651_3184779_-|DUF4388-domain-containing-protein MYGNLQEIDVNSLLNFLANQKKTGLLLIEKKYDVFLTPIFYFIFIYQGYIIFAGDENSSTLTRLKQYLTPYELQNNVKFIRDEINKSNSIVEYEGLLILIKYNYLSFEQQKNIANKIIEEVIFQVMNLRQGNFIWQDNFSLQPLNFFFKLEDILPKVIEDLYQWHKLSHYFQSPLQCPIISYSDKEELINQDLSVKFNHKIDGQTSLLQLSRFANKSIINVAELIYPYCQQNLIKMINRYAVNQGEIKKKNYRKVICLSENKNWLQEVEIILEGENYICLNANNLSESLNYIFKTKVDLIIFQLETGNEEAEKLCKVVRSLMEYQTLPIVIVADNFCFQNYLKLKIYGANEYISQKIFQKQGVALIKKYVDDNYE >NC_019776.1|WP_041922515.1|3184789_3185014_-|hypothetical-protein MMKNGVPELLDPNLLKSAREIYNTYRYFHVKLSKPPIGVAINRKTHRGQLLFTKRPILLPWENFIPIHQIESEN >NC_019776.1|WP_190275032.1|3185447_3187745_-|BamA/TamA-family-outer-membrane-protein MINIWCVAVNKNSKNYLKTISLGLTQAQKEGVSITANKKNIVENPSLLTTKIPQQTIFHIKPKSLWSKPLTLTLLSLISVTTPLKALAETEKKSPQLFSHDPETPHLSIPVTYPTEPLNEDKIIKDSSSYLAQNLLSQTDTTTSPDTQESQQENQPPSTPNSPQNETPQEPRVLVSEVLVTGVDPELTDLVYNTIRTTPGRTTTRSRLQEDINAIYATGFFRNVRVTPEDTQYGVRITYQVEANPVLQKVEIQTLPEKTDEQSLLPPEVINEAFAEQYGQILNLRDLQEGITELNKWYTDNGYDLAQVVGAPQISEEGVVTLVIAEGQIADIQVKFFNSEQEETNGRTRDFIVTREMKLKPGDIFNRRTAQQDLQRVFGLGIFEDVKLSFSPAEDPSEVVMNVEIVETNTGSLAAGAGISSTSGIFGTVSYQERNLGGNNQTIGAEFQLGERELLFDLSYQDPWIAGDPYRTSYTGNIFRRRSISLVYDGTDTETIRTEVNNDSPRVVRTGAGISFSRPIAEDPFSPAEWVLSTGLQYQHIEVQDADGDLSPRSGEAFGRQKLAYNASGVDDLITWRFNVSQDTRNNGLTPTSGSLLLLGTEQTIPGTGILFNRVRASYSYYIPLKLIDFDFTEGPQTLAFNFQGGTVFGDLPPYEAFVIGGSNSVRGYGEGDLGNGRSYFQATAEYRFPIISFVGGALFFDYGTTLGSGGAVIGRPAEVRGLNGDGFGYGLGVRVQSPVGPIRIDYAINDEGDSRIHFGIGEKF >NC_019776.1|WP_015220473.1|3187760_3188507_-|phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide-synthase MSTSAQKLYEGKAKIVYATEKEQEYLTYFKDDATAFNAQKKGTIVGKGEINCTVSSALLKWLESKGIPTHFIDQPSSREMLVKAVKIIPLEVVVRNIAAGSLCKQTGLNQGEKLPFPLVEFYLKNDELGDPLLTRDRLSILNIIPSEQIEQLKQYALQINQHLQEFFQSCQITLVDFKLEFGFDSENNIILADEISPDTCRLWDELEQDKQKRVLDKDRFRQDLGKIESAYQEVQQRVLTQIEKLKNS >NC_019776.1|WP_015220474.1|3188695_3189643_+|hypothetical-protein MKPLAKLIGQPLAIELLESAIAINRIAPAYLFIGAEGIGKALAAKCFTEMLLISPDEDYASACQKLYAGNHPDFLWVEPTYNDKGQLLTAKEAEEKGLKRKTAPQIRIEQVREISQFLSRPPLKGDRSVVVIEGAELMAESAGNALLKTLEDPGKATIILIAKSTDSILSTLVSRCQIIPFFRLSEEHLKLVLYRANKAEVLDYPQLVNLSQGCPGKAIADWQKLTDIPSDLINKLTKFPKNIIEGLVLAKEITKNLELDTQLWLADYLQYFYWEKERKSELIISLEKVKKLLFRYVQPRLVWDCFFLENILENN >NC_019776.1|WP_015220475.1|3190092_3191313_-|6-phosphofructokinase MKTKKRIGILTSGGDCPGLNAIIRAVVKYATLRGWEVYGIPRGTDGFIDFVHGKLNIEELKLHPHGYDLPGVLQGLDVLQFMSGSVLGSLSRGNPQEDQVTQDIIKGYEALELDALIAIGGDGSLDIIYDLAKKGNWNLVVIPKTIDNDVAFTERSVGFDTARNTVTQALYDLTFTAASHERIMVVQVMGRDAGHLSLHAGIAGGADCILIPELTPQLTEDTLVGMCEYIAQLRKDRRKFALIVIAEGVKGLNAEKDPYIAETLADLLKEKSHQLCSTEGDRYCGLNQIDTRAMVLGHLQRCGVPSSFDRILATVFAIKALDLIGEECYNRLVIWQNGSVESKSLEQIMPMIKWCHQEKTCPAPVDPEGFMVRTALSLGIYLGESHYHPHTSNYPYTPLASTITNE >NC_019776.1|WP_015220476.1|3191720_3192272_-|photosystem-I-assembly-protein-Ycf4 MTANNFIYKQQIIGSRRFSNYFWAIAVSFGGVGFLLAGLSSYLHTNLLIVSDTSELQFIPQGIALTFYGVAGTLLASYLWLMIILNVGSGYNEFDKKKGKVTIYRQGFLGKNRKIELVYDIDDIQAIRAEIKEGLNPKRVLYLRVKPKRDIPLTSVGEPMPLSQLENQGAELARFLTVPLEGL >NC_019776.1|WP_015220477.1|3192485_3193892_-|Rieske-2Fe-2S-domain-containing-protein MTIAQHEEKNIKKSLTSLPIGGEDPNKFDYKEVWYPVFFVNDLHKDKPSRFTLLDEDLVIWWDKKDQQWRVFQDMCPHRLAPLSTGRIDEDGLLECPYHGWTFSGKGDCQSIPQQPEGENRHKSPRACVKSYPSAIAHDMLFVYAGKKENAFLTPMPITQPLIENVEKWTILKTFRDIPYDALTLLENVLDSSHVSYTHHGTVGNRSNAAPVELEVKTADRQGFTGFWAEGPRKGKLGSQSTTFIAPNLMWHDLTSKQLGRTMTVVYVTPISKGKCRVFALFPFQFASKIPQFFIKLTPQWYSHLNQNTILEDDQIFLHYQERYLEKLGGSRKFNQAFYLPTKSDLFVSELRKWVVNYNAYLFPEQEFPETPNHDQLIERYYSHTEQCSSCSGALKNIKTIRFSALIITGIVWSLIPLIFFYVEKLPNFIFPLVSIISVINFSLYLYLGKLEKRFYQGEKIPSRNRKS >NC_019776.1|WP_015220478.1|3194108_3196001_+|S9-family-peptidase MTEVNCVSYGKWRSPLTSDLIVSATIGLSTPRFDGEDIYWLESRPLEGGRSVIVKYSPNGEHQDITPAPFNVRSRVHEYGGGAFLVQDSTVYFCNNSDQRVYIQKVGESPQPLTPESKLRYADFCLDKSHNRLICVCEDHSEENHEPQNKLVTINIITGEVKTLCKGADFYASPRISPNNSQLAWLSWNHPNMPWDSTELHLADINPDGSLTNITLVAGGENESICQPEFSPNGILYFSGDRSLWWNLYYRDEKGNIHSAYPLDAEFGYPHWVFGESVYGFEREDKIICTYTQDGCWFLGSIDKKTKSLTDYEIPFTNIAYLQVQGEEILFAGSSPSQPGAIVKMNLNHGQYEILKQSSNTIIDEGYISQPIPLEFPTSNGKTAYAWYYPPQNKDFVAPEGELPPLLVKSHGGPTAMTSASYNLRIQYWTSRGFAFVDVNYGGSTGYGRDYRQRLKGNWGIVDVEDCVNVAQYLVKEGKVDGDKLAISGGSAGGYTTLAALTFFDTFKAGASYYGVSDLEILATDTHKFESRYLDSLIGKYPEEKEIYQMRSPLYHIDKLSCPVIFFQGLEDKVVPPNQAEMMYNALKEKGIKTSYITFADEQHGFRKAENIKKALDTEYNFYIEIFSNH >NC_019776.1|WP_015220479.1|3196048_3196483_+|XisH-family-protein MPAKDVYHDIVKNALIKDGWMILAAPYTIEYEDDNLYADLLAQKTLLAQQQDRKIVVEIKSFLNPSPMNDFQNALGQYLLYRDFLNFSHKNYELYLAVKSSVFNSFFQRKSIQAVIKHYGVDFIVFNQNREEIISWVKLSNIEN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019776_8 | 3183041-3183587 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NC_019776_8
|
7 spacers
spacers of NC_019776_8
>8.1|3183078|36|NC_019776|CRT CTTTTCCTTTTTTCCTTAATACCTGAGTAGCCTTAT >8.2|3183151|37|NC_019776|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATCGCACACACCCTAATAACTATGAATAAACATGATA >8.3|3183225|37|NC_019776|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ACCAAGCGAAAAAGATACTCGTCATACCCGTCACCAT >8.4|3183299|35|NC_019776|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAGCTTTTAATGCATAATTGACACTGCGATCCGTC >8.5|3183371|38|NC_019776|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TACGGAGCGCAATCAAGAGGCAAAACAGCCGGGACAGT >8.6|3183446|35|NC_019776|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GAGAACACCACCGCCTCATCGGCTGATTGTCGAGC >8.7|3183518|33|NC_019776|CRT GCATTTTCCGTGAATGCGGCAGTCTTGAAAATT |
cas2,cas1,cas4,cas6,cas3,cas5,cas7,cas8b5 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019776_8
The CRISPR arrays of NC_019776_8 >merge|NC_019776|8|3183041-3183587|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAACTTCTTACCAATGATACCTATAAGGGATTGAAACCTTTTCCTTTTTTCCTTAATACCTGAGTAGCCTTATGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACATCGCACACACCCTAATAACTATGAATAAACATGATAGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACACCAAGCGAAAAAGATACTCGTCATACCCGTCACCATGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACTAGCTTTTAATGCATAATTGACACTGCGATCCGTCGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACTACGGAGCGCAATCAAGAGGCAAAACAGCCGGGACAGTGTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAACGAGAACACCACCGCCTCATCGGCTGATTGTCGAGCGTTTAAACTCTAATTAATACTTATAAGGGATTGAAACGCATTTTCCGTGAATGCGGCAGTCTTGAAAATTGCTAAGGAGTAATTTTGTACTTACAAGGAATTGAAAC >NC_019776|8|6|3183041-3183587|CRT TAACTTCTTACCAATGATACCTATAAGGGATTGAAAC CTTTTCCTTTTTTCCTTAATACCTGAGTAGCCTTAT GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC ATCGCACACACCCTAATAACTATGAATAAACATGATA GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC ACCAAGCGAAAAAGATACTCGTCATACCCGTCACCAT GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC TAGCTTTTAATGCATAATTGACACTGCGATCCGTC GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC TACGGAGCGCAATCAAGAGGCAAAACAGCCGGGACAGT GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC GAGAACACCACCGCCTCATCGGCTGATTGTCGAGC GTTTAAACTCTAATTAATACTTATAAGGGATTGAAAC GCATTTTCCGTGAATGCGGCAGTCTTGAAAATT GCTAAGGAGTAATTTTGTACTTACAAGGAATTGAAAC >NC_019776|8|6|3183114-3183517|PILER-CR GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC ATCGCACACACCCTAATAACTATGAATAAACATGATA GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC ACCAAGCGAAAAAGATACTCGTCATACCCGTCACCAT GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC TAGCTTTTAATGCATAATTGACACTGCGATCCGTC GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC TACGGAGCGCAATCAAGAGGCAAAACAGCCGGGACAGT GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC GAGAACACCACCGCCTCATCGGCTGATTGTCGAGC GTTTAAACTCTAATTAATACTTATAAGGGATTGAAAC >NC_019776|8|8|3183114-3183517|CRISPRCasFinder GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC ATCGCACACACCCTAATAACTATGAATAAACATGATA GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC ACCAAGCGAAAAAGATACTCGTCATACCCGTCACCAT GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC TAGCTTTTAATGCATAATTGACACTGCGATCCGTC GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC TACGGAGCGCAATCAAGAGGCAAAACAGCCGGGACAGT GTTTAAACTCTAATTAATACCTATAAGGGATTGAAAC GAGAACACCACCGCCTCATCGGCTGATTGTCGAGC GTTTAAACTCTAATTAATACTTATAAGGGATTGAAAC
>NC_019776.1|WP_015220469.1|3179543_3179816_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYIIISYDIKDDKKRTKIHKILKSYGEWVQYSIFECELTETQYAKLRHRLSKLIKDDSDSIRFYSMCKCCQGKIERIGGEMPRDNTIFVV >NC_019776.1|WP_015220468.1|3178516_3179524_+|type-I-D-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGTIYITKDDTFIGKIDERIHVKADRKQILDVPFIKVDGLVILGRSNFSPALVAELLERKIPMSFLTTTGKYLGRLEPELTKNIFIRKAQWKTEDNSEKALHIVKGFIRGKLKNYRNFLQLRNRQNNHEKLEISINQIQDIIDGLERKNNVNSLRGLEGAGSAIYFSCFNLLIKNNEFSFNTRNRRPPTDPVNSLLSLGYALLRHDIQSAVNIVGFDPYLGYLHVAHYGRPALALDLMEEFRPIVTDAVVLNVINNKKITPKDFIIEPLSNAVSLTKEGLQIFLRAYEEKKQSKFKHPVLNRQCTYQESFEIQARFLAKYLMDETKQYPPLIIKK >NC_019776.1|WP_015220467.1|3178088_3178457_+|four-helix-bundle-protein MNSIIYQKAYKFSLRIIKAYKYLIEEKKEFILSKQLLRSGTSIGANIAEANGAISKADFRHKMSIAYKESLETQYWLSLLKDSEVIDVKSYQSIYQDVVEISKILCSIVKNTKAKNNKSNTS >NC_019776.1|WP_015220466.1|3177420_3178011_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKNQLISIASLNHYSYCPHRFWRMFCASEFTDNQYTIDGTTLHERVHTVGDLNLGETWQIRAIYLKSEQYKLIGKADLIEAENGTFYPVEYKRGKKGEWANDELQVVAQALCIEEMTGTHVHTGYIYYAQTHQRQEVEINSSLRQSAIASIKAIQEIIEKETIPKAEYSKKCKGCSLYSACLPMAKDKINRYRESE >NC_019776.1|WP_015220465.1|3176986_3177367_-|clan-AA-aspartic-protease MGLVFSEIQLRNPSKSNLQPIKVNALADSGAVHLCIPEHIKIQLQLNEVDQKEVTLADGSRKLIGYVGPIEIKFKNRIGFSGALVMGDQVLLGAIPMEDMDLIIIPSNRKLDVNPNSPNIASSIVM >NC_019776.1|WP_015220464.1|3176111_3176939_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MPHSLVINFTPISDIPVGYTSGKHLHALFFTLVNSVNPELAQYFHQSEANKSFTVSSLQVISNYKNRDNFLNYKQQNNIKKGSNCWWRITLLDDTLFSKLTKLWLNLRPQKPYHLGSGELMITSVLASPDSHLWANAISYQELYNQASETERNITLKIYTPTAFRQGKYDVSLPTAELVFNSLLRKWEKYSNISFSNANFDCLFPAYFDINTEIIIEPKTKFIGCIGTINYKILGEVETTLIKQINTLADYSFFSGLGRKTTMGFGIIKRLKSSP >NC_019776.1|WP_015220463.1|3173307_3176040_+|CRISPR-associated-helicase-Cas3' MSKLLTKKRKYPYNFGRVFFPDSQVIPEKILFQPLGNHVGNVVKLVKLWDKKDFPDQSSLERVIEASKIHDMAKPQTFSLQVETNKKEKFKKYIYSFKGHRFKAQHDDLWIETLAQGHHNFSTDCVTNDAYKLRKYKNYQDILNKDSLAYAKELYILEMCDQIEAELACLLKDKTQGEERTFMEYTIKIDENNPNIYRIDPFPFSDDLEYIELTFKYWVFTLLAENKEKLQQLIDKNEENKLGKTLDEIVKDWWEKVEAKPQEEELITIQLKPYQSLNCEYHKDCDYWYQNLTKFQTPNPMQREVFTAITNNEDIAVLLKAPTGVGKLEAVLIPTLALGYRLILPLPTRSLLEDHQERIENYLKKLSKLYPQKEFSLVVDTGSQMYRYIYFNGEKVPSRVKNPRRHLYKGDVILTTLDKFMYRYFGYGDKQKSFIFPLRINDNQNKTIICFDEAHSYDNLAFTNFCNLVKALYETGRNLVLMTATLPKNQIPRFDYLQEGLIDYIDNIDNKEKLDQFLEKNLKQPYPNEKILLWKSEVAIQASPEGKESNNFQQEFINLILNEWQSQENHRLITVVEKVKDAVEIYKQVKEELGTNLDDEGRFLFLYHGRISDTPKDKTHENYQYSRSGVYQQIKQRDNDQKPYLIITTSAIEVGCDLNCQTLITQLCPPENLIQRAGRCNRKGNIANAKVIIIGDSIPDFLNTLTDSELQLYQEKLRSHHSQNFNANEIMKCVSQTQQVDDYRVVELFSQLQEYVYEANLTCKPTHEKGLVITRSWIPSATLIYEDAQITVPLDRLIVKKDQETDKTNQYANVTVEESYYDQETTQWKTRTLRWGNAYQKNIIIKINKSQDGIVFDAGFHEYDYNAEFGFVDLPGVFVKWKPKNFEQQLAYKDGDKTIAVINYITPNND >NC_019776.1|WP_015220462.1|3172499_3173315_+|hypothetical-protein MYCLKISIAPTSAMTFRILPSSILNIATYPFVPPTTLSGYLRRLVMLSMKLEIPETDINKNNPPVYALPRKYITLGAYPVRDNFTAIHRTYRKGMREFNHDVFSRLYIEKEKADFQLHTWEYLITSELIGYVVTKSAEDLKPLQEIKGFGCKLGKEGFAVIQDISQPIKLTQITKEAIPSTIVPMEALLATNQFVNGCDIYNLYRYNWLTNQDNLNDNSPTAVNGFIPFVASYFQNQLTPELDYLTDSNNQINIPLSLINLLQLKGEITNV >NC_019776.1|WP_015220461.1|3171551_3172427_+|hypothetical-protein MTTGLPKTDQEKVHFDIYAILEGSQELYFGHETQVNINLVETVKLSTKNGEDLEKCYLSPTKRRGIERRCLIWAPVKSLGKLLGDKLDCGIPKTCVKIDCPICSTYGGLKVGEKTLIGRVSHGGGVAIQPILPEQKQRAMHPSRIASPESGKDETPTPFKREYNQPGILYPVYNHCLSLTDEDFATVAYAFLDSLPRIGAGNPKGIGLAEDAEKLLLVVDRYLVPKGKRPIISPSETNPESAIENFWRLAQTPEENTDYIQVKHFERWIGDKALEKLQEYASIFVDEVLQK >NC_019776.1|WP_015220460.1|3168962_3171548_+|hypothetical-protein MNENQLSIFDTNVVNDIKQINETLPSYIPQISYDLDSYTEAILISALASQSIIDSDNYLLSFLASNPKTKIILSSFNSPQLTRKLKKSKQQKQVEKPSLENKNNQVFYDNQQIGEIKLLYKPSIPGELQAKLAYLSTIDRFLEYLQTHYYSINLGETDYHIHIFIPAKYRLNIEQEWVKFVKKVLFSIEDKDNDKLPRLPQTFISMLKSITLAGRGFSTINVPIITQDQGIILASLYLAVFQQVKQRQDDRESLIKQLKKELNIDSLSEKERNSKEKELQKKEEMQKKEYKKYCEGFEKTFIKILTEHKSLFDEQDKINLQLQDASLNKRQINKLKKEKEKVGAKIIFSQDFVNQKTKLLENSGGNPFLFIVQDQKENQDKFAIINQLSKSFNRTATEQINSTRGDIFAQCLVEMYRLLENQTFETIPHSLLTEKSIITRVRSPGDDGNKFCYSCGVVLDKPQWRVARFMFERPSQRRQSSSSEDRPYICATCSVLAFASPLKVTDESIIIKLNAKNNNDIFQYKIKDYLRMLANKEMHLNSGHYLILTSDKTTGGDIASNKLGQVQYARAKIADIFPLEVLTDFDFCLVLQGSQQIKLESRHLIFIKGLMEGYAQKIIESGKEINSKLGDAIRYIEQDLPYLADYTLAKVFVNFRKTPNISLKNQILLEKTRKNYYQIMRENFMNSVQLKKQFTLYEDVASLTGLLYPFIQSFKKGAFSKEKPEDAKREVGKLIEKVNDGIIFHNYFCKYSYIKIVGEDEKRSITSVSFKKYPDNEFIYEQVKDLLENTDKLNISGREQKTEDLSTEYLTLYPDDIERAFNFFRQKYSSDKDWKTLTYHLELSIYARFPEQLQKSSKGDN >NC_019776.1|WP_015220470.1|3183651_3184779_-|DUF4388-domain-containing-protein MYGNLQEIDVNSLLNFLANQKKTGLLLIEKKYDVFLTPIFYFIFIYQGYIIFAGDENSSTLTRLKQYLTPYELQNNVKFIRDEINKSNSIVEYEGLLILIKYNYLSFEQQKNIANKIIEEVIFQVMNLRQGNFIWQDNFSLQPLNFFFKLEDILPKVIEDLYQWHKLSHYFQSPLQCPIISYSDKEELINQDLSVKFNHKIDGQTSLLQLSRFANKSIINVAELIYPYCQQNLIKMINRYAVNQGEIKKKNYRKVICLSENKNWLQEVEIILEGENYICLNANNLSESLNYIFKTKVDLIIFQLETGNEEAEKLCKVVRSLMEYQTLPIVIVADNFCFQNYLKLKIYGANEYISQKIFQKQGVALIKKYVDDNYE >NC_019776.1|WP_041922515.1|3184789_3185014_-|hypothetical-protein MMKNGVPELLDPNLLKSAREIYNTYRYFHVKLSKPPIGVAINRKTHRGQLLFTKRPILLPWENFIPIHQIESEN >NC_019776.1|WP_190275032.1|3185447_3187745_-|BamA/TamA-family-outer-membrane-protein MINIWCVAVNKNSKNYLKTISLGLTQAQKEGVSITANKKNIVENPSLLTTKIPQQTIFHIKPKSLWSKPLTLTLLSLISVTTPLKALAETEKKSPQLFSHDPETPHLSIPVTYPTEPLNEDKIIKDSSSYLAQNLLSQTDTTTSPDTQESQQENQPPSTPNSPQNETPQEPRVLVSEVLVTGVDPELTDLVYNTIRTTPGRTTTRSRLQEDINAIYATGFFRNVRVTPEDTQYGVRITYQVEANPVLQKVEIQTLPEKTDEQSLLPPEVINEAFAEQYGQILNLRDLQEGITELNKWYTDNGYDLAQVVGAPQISEEGVVTLVIAEGQIADIQVKFFNSEQEETNGRTRDFIVTREMKLKPGDIFNRRTAQQDLQRVFGLGIFEDVKLSFSPAEDPSEVVMNVEIVETNTGSLAAGAGISSTSGIFGTVSYQERNLGGNNQTIGAEFQLGERELLFDLSYQDPWIAGDPYRTSYTGNIFRRRSISLVYDGTDTETIRTEVNNDSPRVVRTGAGISFSRPIAEDPFSPAEWVLSTGLQYQHIEVQDADGDLSPRSGEAFGRQKLAYNASGVDDLITWRFNVSQDTRNNGLTPTSGSLLLLGTEQTIPGTGILFNRVRASYSYYIPLKLIDFDFTEGPQTLAFNFQGGTVFGDLPPYEAFVIGGSNSVRGYGEGDLGNGRSYFQATAEYRFPIISFVGGALFFDYGTTLGSGGAVIGRPAEVRGLNGDGFGYGLGVRVQSPVGPIRIDYAINDEGDSRIHFGIGEKF >NC_019776.1|WP_015220473.1|3187760_3188507_-|phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide-synthase MSTSAQKLYEGKAKIVYATEKEQEYLTYFKDDATAFNAQKKGTIVGKGEINCTVSSALLKWLESKGIPTHFIDQPSSREMLVKAVKIIPLEVVVRNIAAGSLCKQTGLNQGEKLPFPLVEFYLKNDELGDPLLTRDRLSILNIIPSEQIEQLKQYALQINQHLQEFFQSCQITLVDFKLEFGFDSENNIILADEISPDTCRLWDELEQDKQKRVLDKDRFRQDLGKIESAYQEVQQRVLTQIEKLKNS >NC_019776.1|WP_015220474.1|3188695_3189643_+|hypothetical-protein MKPLAKLIGQPLAIELLESAIAINRIAPAYLFIGAEGIGKALAAKCFTEMLLISPDEDYASACQKLYAGNHPDFLWVEPTYNDKGQLLTAKEAEEKGLKRKTAPQIRIEQVREISQFLSRPPLKGDRSVVVIEGAELMAESAGNALLKTLEDPGKATIILIAKSTDSILSTLVSRCQIIPFFRLSEEHLKLVLYRANKAEVLDYPQLVNLSQGCPGKAIADWQKLTDIPSDLINKLTKFPKNIIEGLVLAKEITKNLELDTQLWLADYLQYFYWEKERKSELIISLEKVKKLLFRYVQPRLVWDCFFLENILENN >NC_019776.1|WP_015220475.1|3190092_3191313_-|6-phosphofructokinase MKTKKRIGILTSGGDCPGLNAIIRAVVKYATLRGWEVYGIPRGTDGFIDFVHGKLNIEELKLHPHGYDLPGVLQGLDVLQFMSGSVLGSLSRGNPQEDQVTQDIIKGYEALELDALIAIGGDGSLDIIYDLAKKGNWNLVVIPKTIDNDVAFTERSVGFDTARNTVTQALYDLTFTAASHERIMVVQVMGRDAGHLSLHAGIAGGADCILIPELTPQLTEDTLVGMCEYIAQLRKDRRKFALIVIAEGVKGLNAEKDPYIAETLADLLKEKSHQLCSTEGDRYCGLNQIDTRAMVLGHLQRCGVPSSFDRILATVFAIKALDLIGEECYNRLVIWQNGSVESKSLEQIMPMIKWCHQEKTCPAPVDPEGFMVRTALSLGIYLGESHYHPHTSNYPYTPLASTITNE >NC_019776.1|WP_015220476.1|3191720_3192272_-|photosystem-I-assembly-protein-Ycf4 MTANNFIYKQQIIGSRRFSNYFWAIAVSFGGVGFLLAGLSSYLHTNLLIVSDTSELQFIPQGIALTFYGVAGTLLASYLWLMIILNVGSGYNEFDKKKGKVTIYRQGFLGKNRKIELVYDIDDIQAIRAEIKEGLNPKRVLYLRVKPKRDIPLTSVGEPMPLSQLENQGAELARFLTVPLEGL >NC_019776.1|WP_015220477.1|3192485_3193892_-|Rieske-2Fe-2S-domain-containing-protein MTIAQHEEKNIKKSLTSLPIGGEDPNKFDYKEVWYPVFFVNDLHKDKPSRFTLLDEDLVIWWDKKDQQWRVFQDMCPHRLAPLSTGRIDEDGLLECPYHGWTFSGKGDCQSIPQQPEGENRHKSPRACVKSYPSAIAHDMLFVYAGKKENAFLTPMPITQPLIENVEKWTILKTFRDIPYDALTLLENVLDSSHVSYTHHGTVGNRSNAAPVELEVKTADRQGFTGFWAEGPRKGKLGSQSTTFIAPNLMWHDLTSKQLGRTMTVVYVTPISKGKCRVFALFPFQFASKIPQFFIKLTPQWYSHLNQNTILEDDQIFLHYQERYLEKLGGSRKFNQAFYLPTKSDLFVSELRKWVVNYNAYLFPEQEFPETPNHDQLIERYYSHTEQCSSCSGALKNIKTIRFSALIITGIVWSLIPLIFFYVEKLPNFIFPLVSIISVINFSLYLYLGKLEKRFYQGEKIPSRNRKS >NC_019776.1|WP_015220478.1|3194108_3196001_+|S9-family-peptidase MTEVNCVSYGKWRSPLTSDLIVSATIGLSTPRFDGEDIYWLESRPLEGGRSVIVKYSPNGEHQDITPAPFNVRSRVHEYGGGAFLVQDSTVYFCNNSDQRVYIQKVGESPQPLTPESKLRYADFCLDKSHNRLICVCEDHSEENHEPQNKLVTINIITGEVKTLCKGADFYASPRISPNNSQLAWLSWNHPNMPWDSTELHLADINPDGSLTNITLVAGGENESICQPEFSPNGILYFSGDRSLWWNLYYRDEKGNIHSAYPLDAEFGYPHWVFGESVYGFEREDKIICTYTQDGCWFLGSIDKKTKSLTDYEIPFTNIAYLQVQGEEILFAGSSPSQPGAIVKMNLNHGQYEILKQSSNTIIDEGYISQPIPLEFPTSNGKTAYAWYYPPQNKDFVAPEGELPPLLVKSHGGPTAMTSASYNLRIQYWTSRGFAFVDVNYGGSTGYGRDYRQRLKGNWGIVDVEDCVNVAQYLVKEGKVDGDKLAISGGSAGGYTTLAALTFFDTFKAGASYYGVSDLEILATDTHKFESRYLDSLIGKYPEEKEIYQMRSPLYHIDKLSCPVIFFQGLEDKVVPPNQAEMMYNALKEKGIKTSYITFADEQHGFRKAENIKKALDTEYNFYIEIFSNH >NC_019776.1|WP_015220479.1|3196048_3196483_+|XisH-family-protein MPAKDVYHDIVKNALIKDGWMILAAPYTIEYEDDNLYADLLAQKTLLAQQQDRKIVVEIKSFLNPSPMNDFQNALGQYLLYRDFLNFSHKNYELYLAVKSSVFNSFFQRKSIQAVIKHYGVDFIVFNQNREEIISWVKLSNIEN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019776_9 | 3295676-3295764 | TypeV |
NA
Consensus repeat of NC_019776_9
|
1 spacers
spacers of NC_019776_9
>9.1|3295699|43|NC_019776|CRISPRCasFinder GGCAGAAAATAACTTCTATCATGTTTATAAATTTTTATGGTTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019776_9
The CRISPR arrays of NC_019776_9 >merge|NC_019776|9|3295676-3295764|CRISPRCasFinder TTCTAAAGTGGTTATGATAAATTGGCAGAAAATAACTTCTATCATGTTTATAAATTTTTATGGTTCTTCTACAGTGGTTATGATAAATT >NC_019776|9|9|3295676-3295764|CRISPRCasFinder TTCTAAAGTGGTTATGATAAATT GGCAGAAAATAACTTCTATCATGTTTATAAATTTTTATGGTTC TTCTACAGTGGTTATGATAAATT
>NC_019776.1|WP_015220559.1|3294819_3295650_+|thermonuclease-family-protein MAFILIKGRFHVVGYSPDGDSIRFQAYNLEHWSKLQGISPELNEENHAQIRLIGIDSLETHFRQCQQSVKWALNAAHFLLESLEIDEVKWNEEKNIIISAQDKIEGFILVKKTDQHGRPLAFVFKGEIDHPDGEEFFLPINLFFESVNYQSLLSGQSYPTYYRGIAPTLRKKMTWAVNQARKNKKGLWEFDLTNHGFNVWDLFDEEKTVIILPKLFRRLVSYLETSDNLDYFKHSVVKSEKVLILPNKRKKLFRDIIIQDEHFFKLSELPEDLVYL >NC_019776.1|WP_015220558.1|3293805_3294510_+|SIMPL-domain-containing-protein MLFNQSKLLLTIGCFGLLSMQPVLAQEQMLKTITVTGEGIERIPTTIANVQLGVEIQGENASQVQEEVAQKSNSLVNLLKSRSVQRLQTSGIQLSPNYSYNDNQRKLIGYVATNLVSFELPIDKVGAVLDESVKVGATRIDNVTLSAEEDAIASAQEKALVKATASAQKQANVILQTLNLTAQEIVTINVNGANSPNPVMMPKMRSAMDASVANTPVVGGEQTVSASVTLQIRY >NC_019776.1|WP_015220557.1|3291676_3293545_+|biosynthetic-type-acetolactate-synthase-large-subunit MVISNTTSPVNLSSSDVVPIKCTGAYALMDSLCRHGVKHIFGYPGGAILPIYDELYRFEAKGELQHILVRHEQGAAHAADGYARATGKVGVCFGTSGPGATNLVTGIATAHMDSIPMVIITGQVTRAAIGSDAFQETDIYGITLPIVKHSYVARNAADIPWIIAEAFHIASTGRPGPVLVDIPKDVGLEEFYYQPLNPGEVKLPGYRPTVKGNPRQISAALDLISEAKQPLLYVGGGAVLSNAHAQIKELAELFQIPVTTTLMGLGAFDEHSSLSVGMLGMHGTAYANFAVSECDLLIAVGARFDDRVTGKLDEFASRAKVIHIDIDPAEVGKNRRPDVPIVGDVRQVLEQMLQRARELDLPNTDGLTQDWLKRIDKWKEDYPLVVPHPEDALSPQEVIVEVGRQAPHAYYTTDVGQHQMWSAQFLKTGPRRWISSAGLGTMGYGLPAAMGAQVALADEDVICISGDASFQMNLQELATLAQYNIKAKTVIINNGWQGMVRQWQETFYGERYSASNMATGMPNFELLAQAFGVKGITVRNRDELKGAIASMLEHDGPVLLDVHVKRDENCYPMVAPGKSNAQMLGLPKKAPEKQHLEVQVCTNCGTRNSGESNFCSECGTKL >NC_019776.1|WP_041922906.1|3290041_3291328_+|glutamate-5-semialdehyde-dehydrogenase MDLLTIATQAKTSAHHLATLSESARNTALNAIASALTERKEEIVKANEKDCSLAENNISSALYARLKLGESKLQSAIAGVRDVAKLRDPLGSISLKRELDQNLVLERVSCPLGVLGVIFEARPEALIQIASLAIKSGNGVILKGGKEALHTCTVLTEIIQKALQETEVNPYTVQLLTTREEIKALLDLDEYVDLIIPRGSNEFVRYVQENTKIPVLGHADGICHLFIDEFADLQPAVKITVDAKTQYPAACNAIETLLIHEKIASQFLPAIAQALEEKGVKLKGDEATRKIIDCEKAVEDDWRTEYSDLILALKIVDSIEDAIAHINKYGSKHTDGIVTTNLDNAEKFLNEVDSAGVYHNCSTRFADGFRYGFGAEVGISTQKMPPRGPVGLEGLVTYKYKLRGQGQIAADYSGINAKPFTHKDLDFN >NC_019776.1|WP_015220555.1|3287320_3289498_-|molecular-chaperone-DnaK MGRVVGIDLGTTNSVVAVMEGGKPLVIANAEGSRTTPSVVGFNKDGELVVGQMARRQGVLNPQNTYYGIKRFMGRRYGELSEASKRVPYTIRRDEMDNIKIRCPRLKKEFAPEEISAMILRKLAEEAERYLGEEVTGAVITVPAYFNDSQRQATKDAGKIAGLEVLRIVNEPTAASLAYGLEKKSSEKILVFDLGGGTFDVSILEVGDGVLEVRATSGDTQLGGNDFDKKIVDYLAEQFLETEGVDLRRDRQALQRLTEAAEKAKIELSGVSTSEINLPFITATEDGPKHIETTLSRAKFEELCGDLVSRLRRPIIRALKDAGLSPVQIDEVVLVGGSTRIPMVQELVRSFIDIEPNQNVNPDEVVAVGAAVQAGILSGEVKDILLLDVTPLSIGVETIGGVTKKLVPRNTTIPVRRSDVFSTSENNQTSVEIHVVQGEREMASDNKSLGRFKLTGIPPAPRGVPQVQVSFDIDANGILQVIARDKTTGREQSIIVQGASTLSQSEINRMIQEADEFAREDRERRDRVEKRNRAKALTDQAQRRLREVTLDFGSQFTNPYRRDIDNLCREILDSLEQDDDRRLDRSQADLEDVLYELNREVRLQYNDEEEGFFESIKKTFIGDDDDDFDYNPRDRRNVYRNSPDTTLYGGKVNPSRDSRRDYRDPYSPPPASNTPYSGSSVSRPTPPPRTPSRRSPDYPPERGYRVSKDREIPYENDWNDDDDWF >NC_019776.1|WP_015220554.1|3286678_3286924_-|four-helix-bundle-protein MDLVVICYQLTSLFPKTEIYGLSSQIQRAAVSIPANIAEGKGRNHLGDYIRHLSMANGSLKELETHLMIIGRLGYLNLSSG >NC_019776.1|WP_015220553.1|3284456_3286208_-|succinate-dehydrogenase/fumarate-reductase-flavoprotein-subunit MFKHDVFIVGGGLAGCRAALEIKKQNPALDVALVAKTHPIRSHSVAAQGGIAASLKNVDPDDGWKAHAFDTVKGSDYLADQDAVEYLTKEAPEVIIELEHLGVLFSRLEDGRIAQRAFGGHSHKRTCYAADKTGHAILHELVNNLRRFGVTIYEEWYVMELIFEGKEAKGVVMFNIGDGRLEIVSAKAIMFATGGYGRVFNTTSNDYASTGDGLAMSALTKGAATPNASLPLEDMEFVQFHPTGLYPVGVLISEAVRGEGAYLRNSEGERFMARYAPNQMELAPRDITSRAIVMEIRAGRGINPDGSSGGIYVHLDLTHMGKEKIMSRVPFCWEEAHRLVGVDAVTQPMPVRPTAHYCMGGIPVNTDGRVRLNGEELTEGFFAAGECACVSVHGANRLGSNSLLECVVYGRRVGRAIASYVSNRNLPDIDEKKYLAKAEKRIKDLLNQKGNIRINSLRQEFQDCMTEHCGVFRTEEVMGEGLSRIQNLKAKYSQIYLDDKSRYWNQELIEALELQNIMIVGEIILTSAFHRQESRGAHSREDFPGRNDQQYLQHTLAYYSSRGVKIDYMPVVINMFEPKERKY >NC_019776.1|WP_015220552.1|3283701_3284184_+|chemotaxis-protein-CheW MNTANLPNQPSSSTEKVKLLVFSIGNLNTALHIDAVEKVVNYNQIFGSGLNHFGLVNLGDKEITVVDLHKKLFNSPQALSTEGKKYLLLVKNSGGETFGIVISQTPELYDVPLNVIRILPPSYRRADTLKIASHVAVFRENEEEKTIFLLDPDELINPNT >NC_019776.1|WP_015220551.1|3281248_3283498_+|glycoside-hydrolase MSHPLYVAFIWHQHQPLYKSRLSNHDFGGQYRLPWVRLHGTKDYLDLMLILEKYPKLHQTVNLVPSLMLQLEDYAKGDVLDPYLALSLTAVSQLTIQQKEFIINHFFDANHYHMIRPHRRYDELYQERHDLGTKWCLKNWQDNDYADVLAWHNLAWIDPVFWDDPEIAGWLRKGKRFNLEDRRNIWKKQREIISRIIPQHKKMQDAGQLEVTTTPYTHPILPLLADTNAGQVAVPKMRLPSVRFQWEEDIPRHLDKALAMYQERFGRSPRGLWPSEQSVSPTILPHVAKRGFDWLCSDEGVLGISIEHYFYRDETGNVYDPDRLYRPYRLETENGDLSIVFRDHRLSDLIGFSYGSMTADNAAKDLIGHLEAISRRLKSKQEEDQTSLEQPWLVTIALDGENCWEFYEQDGKIFLETLYERLSRQEDIQLVTVSEFIDKFPPTEVIKRDRLHTGSWIDANFTTWIGDPDKNKAWEYLQAARETLAKHPEATETTNPEAWEALYAAEGSDWFWWFGDPHHSSHDDMFDQLFREHLIALYQALKEPVPEYLYKPVAEPRKQEEDYIPGSFIHPPIDGQGEDEDWERAGKIIIGGSRGTMHRSSVIPRIFYGWNHLSFYLRFDLKQGINSGKDLPSELHLAWYFADVVGSNNGLPLADVPDKDPVNHYFRYHLGIHIPSQTCWLEEAGGDFKWHSRHCEVRIALDRALEIAFPWKNLHVDPDQKIYLVAVLADNGKFKEALTQEHPICIQVP >NC_019776.1|WP_190275001.1|3280419_3280872_+|PEP-CTERM-sorting-domain-containing-protein MDVSIACEGAFAGNNENQDLSGLFNVSNWTQYAKVDGDSGTSNGLTVNGGGTSSTWSLTGIDFNSFDIMAILKGGPTFSAYLLDSAGLNWNTDGILKGNYKPGPGLSHFTIYTSAKTPQPVPEPLTILGTGLALGLGGLFKSKQKQKLEG >NC_019776.1|WP_015220560.1|3296497_3297802_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKTNIRLFLSLFISLNWVTVGCGLLGTNTEDSGNNANTTSGAESLKVGTLLPITGDLSSIGQNMPTAVQLAVDTINACGGVNGQPVTLVKEDSQTDPVAGSAAMTKLTEVDKVAGVVGAFASSVSTAALDVAVRNNVMMISPGSTSPIFTQRAKTGDFNGYWARTAPPDTYQAQALAALAKKQGFQNVSTVVINNDYGVAFEQEFVNSFQDLGGTVLNSSNPVRYDPKAVTLDSEASATFANNPQAVAGVLYAETGSLLLQAAFKQGLTNGVTVLLTDGVYSEDFTKQVGKTADGNSIIAGALGTVPGADGKALEDFKNLWAERTNNTPITAFVPHTWDATILLMLAAQAAGENSGEAIKGKIREVSGGEGTEVTDPCQAMELLRNGEQINYQGASGNVDIDENGDVVGVYDVWQVQPDGSIEIIDKVSPIVQ >NC_019776.1|WP_150109007.1|3297908_3300143_-|CHASE2-domain-containing-protein MSQKQLQSFFWQWRGVWVATPLICIAIILTRYLGFFQPLELFAYDLLIKMRTSLPQDDRIVIVGIGEEDVEKIGSAIISDEIYANVIQNLLKQQPIAIGLDIYRDVPIPPGTDKLSQLFRENQNIVGIEKMVGDTRQYRVKPNPILKEKKQIGFNDVILDPDNKIRRALLALPDKQAFSLSMYLALLFLQKENINLTTVGEKNYWQLGNTVFIPLEKNDGSYAQADSGGYQILLNYRDNVNHFDTVSLLDVLENRIPSDWGKNKIILIGFVGESFQDVHLTPYTNSPDQRMPGVEIHGHIISQIIDSAKGNQDSRTLIKTWSETKENLWIIFWTLLGAIVTWNLRKSSNFRQGIVIFVGIEFILVAIVYFAFLANWWIPLLPPLTGLIAVAGGITIYTARNASKIRFTFGRYLSTEIVNTLLESPQGVKLGGERRTITILTSDLRGFTAVSEQLPPEEVVKILNFYLGYMANIISEYQGTIDEFMGDGILVLFGAPISRNDDADRAIACAIAMQLAMKEINQQIEIWGYSPLKMGIGINTGEVVVGNIGSEKRTKYGIVGSEVNLTYRIESYTKGREILISEKTLHSLRNEVQIAETREVSPKGVKKPITIYKIISIKGKYSLFLPEIEEQIIDINEEIKIKYSPLNDKDITEDIYQGKIAKIIIKDIEIGAIVQANCKEKFLPNPLDNLKLNFTNWAYPDDFYGKVVINNREDSSFKIYFTYLPPQIEQKLFNLRLSVMDKKK >NC_019776.1|WP_015220562.1|3300541_3301747_-|trypsin-like-peptidase-domain-containing-protein MNKLISQIFVSSSLLIMGTALGVWGSRQLATLNQSSVSDTIPPETSLQPVANSVFPPFKQSSPQKQGNFNFISEVAQKVGPAVVRIEATRQVSFNNSENFEHPLFKHFFPEQIPFERTERGTGSGFIVSDDGLIMTNAHVVEGTSFVSVLLPSGKTYEGRVLGIDSMTDVAVVKITAENLPTVILGKAKNLIIGEWAIAIGNPLGLDNTVTVGIISAKDRSSSEVGVSDKRVKFIQTDAAINPGNSGGPLLNARGEVIGINTAIRADAQGLGFAIPIETASRIAEQLYTTGKASHPYIGIQMITLNQDTIKNDNIPQNLGFENVPEKGVLVVKVMENSPASQAGFLPGDVINNVNNIEVLTAQDVQEQVEISTIGEVIPIRIDRQGKFITLKVYPAEFPIE >NC_019776.1|WP_015220563.1|3302001_3303420_-|efflux-RND-transporter-periplasmic-adaptor-subunit MNKKTFFRHKMLTSISLITLLTYGCGSENSSAPQPKAIPVSTTVLNSSTLIDSTEFVGSLEAVERVNLAPKINGRIMNIFVEEGAIVNRGQLIAELEPEQQQEDVNAATANIQAQVAAYNQSLADLRQTEAQRDSSSSDVARLKASVSSAQANLKTAEANLESAIADLDLAQVNYERSVFLVEQGVLPKQDLDDKTRDLNSSKANVEAQRKTVDAFRSNVASAQEALKSAQSNFAAAQERVESAKANVARSQANIEEAQSNRGSIEQNLAFTRLIAPIDGRVGDFQEFKLGDFLNVGQTLTTITNNRRFHLNLNIPTENIDNLRLGLPVEIIKTDGGVGVRGAVTYIAPLVNQDNQSINIKITFENDGTLKDQQYVRTRLIWDTKPGILVPTNVVTSLGGQKFVFVAREGKSNDDKTTMMAHQVPIQVQGIQGQDYQVTSGIQQGDRIITNRILDLRDKTPISLQEVTSQVN >NC_019776.1|WP_015220564.1|3303701_3304292_-|GUN4-domain-containing-protein MNIKALIFSAIISFSFVSLPHQNSFAQSDLSESSSNLVSPETKIDYSNLENYLKNKEWREANNETRNIILSATGRMDIGWVRENDLKKISCEDLKKIDDLWYTNSNGRFGFRVQLPIYIETGNRPGKLIADDAYNRFGDRVGWRKDNDWIIFIENLNFTDNAPIGHLPNPRSEYSVTGGRLAYSVLAERMVQCNLN >NC_019776.1|WP_015220567.1|3308330_3309812_+|glutamate-synthase-subunit-beta MGKATGFLEFARELPVDKDPLERINNWDEFHRPLPEEKLRNQGARCMDCGTPFCHTGELINGMATGCPINNLIPEWNDLIYRGLWKEALDRLHKTNNFPEFTGRVCPAPCEGSCVLGINNPPVTIKNIECSIIDHGWDMGWVVPEPPKTRTGKKVAVIGSGPAGLSAAAQLNKAGHSVTVYERDDRPGGLLMYGIPNMKLDKEKVVLRRIKVLAAEGIKFVCNTEIGKDISPEQLLEENDALILCIGAGKPRDLPIEGRDLGGIHFAMEFLTANTKSVLNSNKEELICAKGKDVVIIGGGDTGTDCVGTSIRHGCKSVTQLEIMPKPPEVRAKNNPWPEYPKIYRLDYGQEEAAAKFGHDPRVYTTTATKFEADDQGNVAAVHTVEVEWQRNEQGRFIPQPIEGTEKRIPAQLVLLAMGFLGPEQMLLEKMGLESDVRSNIKADYGQYATNLPKVFAAGDCRRGQSLVVWAFNEGREVARECDRFLMQKTNLP >NC_019776.1|WP_015220568.1|3310150_3312478_+|DUF3488-domain-containing-protein MQQLRNNPTIRELIEKMEAMPKPPTEESILFRTLVQIMVIVGIIATDVAAQSLYPMSIWAIPLSIVGAIVSWRRRKKKNIALKIALAMGMIITLMIFLGNLVQSLNDTRLVLAEFLVQLQVLHSFDLPRRKDLGYSMIIGLILIGVSATLSQTLAFAPWLLALLLLGIPTLVLDYRSRMGLNVWEENFRQLKQEKNLFRQKQLWQSSPLSPKKILSLSLIILSLGLFIFAIMPRYPSYQIQSFPVSAPEGFENRDFQGGDRSIVNPGYNPDGTLRGDIMGDGQGGTGVDDGGYYGFNTTINQNTNNLITERKILFRIRSQAPGFWRVLSFDRYTGQGWEISREDQTIDVKRNFWNYQFNISLPAITAETKKIIQTYTVVRDLPNIIPALSYPQYLYFPSAVIALDTEGSMRSPAGLIEGLTYTVISRVPYRSQTDLQLAGDNYPDTIAKYYLDIPPSAKENLREKAEELMVKAGRELPSNYDKALYLAQALKQNYQVKTDNPLLEEGEDIITAFLANGGGFPDQFATVYTMMLRALDIPARFTVGFASGQFNPFTGYYIVHNTDAHALTEVYFPSYGWFYFDPLPGHEIIPPSFQDDNPFGVLGIFWKWIAGWLPPPITAFITALFSTITDSILNIFRAGWLGKLWQFLTGSFLGILVGVLGLIMFAFFGWLGFLAVRKFLYRNYLSRLNPTEKLYREMLDLLKEKGYPKLPSQTPKEYCESLRDFLILEQWEIVFLISNNYVQWRYGDITPNMDYLTSQYQLLKKSFAQLSLLK >NC_019776.1|WP_015220569.1|3312640_3313804_-|lipid-A-disaccharide-synthase MRLFISTGEVSGDLQGGLLVKALFQQAEKLNIPLEIEGLGGKKMAEAGAKLIADTTAIGSVGLWESVPFIIPTLQIQNKAKKYLQTHLPDAIILIDYVGPNLAIASSLKKKYPNTPIIWYIGPQFWVWTPLGQDVEQLVKVTDKLLAIFPEEAKFYQEKGMNVTYVGHPLTDRIKKAPSRETARKKLGIQETERMIVLLPASRQQELKYLLPVMVESAKKIQAKFPTIKFYLPISLAKYKQEIERVINQNQLKITLFEGETLEILAGADLAITKSGTVNLELGLLKIPQIVIYKVNKLTMWVARKILNFSIPFMSPVNLVSMTEIVPELLQEKATVENITHLAEELLFNSSRQHQLSQDYATMIKVLDNQEDSVCDRVAQEIINYIL >NC_019776.1|WP_015220570.1|3313857_3314310_-|lipoprotein-signal-peptidase MKKNPIFWIVAIIALIIDQITKYLVVISFPEIGDTMPLWQGVFHFTYVQNTGAAFSFFQGGVGWLKWLSLIVSLGLMIFAWKEKLSKIEQFAYGFILAGALGNGVDRFLFGYVVDFLDFRLINFPVFNMADVCINIGIVLLIYATIKMSR >NC_019776.1|WP_015220571.1|3314504_3316640_-|glycine--tRNA-ligase-subunit-beta MANFLLEIGTEELPADFVDSAIAQWDSKIKDNLKSEFLEPTEIKIYGTPRRLAVLIEGLAEKQPDREEEIKGPPVTAAFKDGKATPAAEGFARKQGVSLEDFQVRETEKGEFIFIQKKMMGEATKDILQRLVPQWITGLEGRRFMRWADDELRFPRPIRHLVALWDSEILPLELNLGTNVLRSDRISTGHRVLHPATVVINSAQDYVATLEKASVLVDVKTRYKKIEEEIKHLATLVKGKAEIYPDLLTEVTNLVEYPTPVLGKFEAEFLQLPSEVITTVMVTHQRYFPIKDEKGELMPYFITISNGDPTKSDIIATGNAKVIRARLADAQFFYQADCDEHLETYLPELENVTFQEDLGTMHDKVNRIIGICQQISEQLGLNELQKSEVESTASLCKADLVTQMVYEFPELQGIMGEKYALKSGESPTVAKGIFEHYLPRNAGDIMPETLNGQIVGIGDRIDTIVGIIGLGMMPTGSSDPFALRRSANAIINITWHGNLEINLEELLTQACEDFVTSHPDKKSPLNAIQEFFTQRIHTLLQDELNIDYDLVNAVLGDNDSEYITRALTNLLDIRNRALFLQEIRNNGLLSQIYETVNRSTKLAVKGSLKTDKLEINQVINPEYFESNSEQDLYQALQKLAPISQEAKRESNYQLLIDGLLEINPIISNFFDGENSVLVMAEDEKIKTNRLNLLGLLRNYSRVLADFGAIVK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_019776_10 | 4073709-4074460 | TypeV |
NA
Consensus repeat of NC_019776_10
|
9 spacers
spacers of NC_019776_10
>10.1|4073747|36|NC_019776|PILER-CR TTTACTTAAGTTTGCGGAATCTCCTTATATTGGTGG >10.2|4073821|34|NC_019776|PILER-CR ACTAGTTCCTTAGCTTCCGTTTGTTTTGCATCGA >10.3|4073893|40|NC_019776|PILER-CR CTTTCGCTTGAAATCCCAAGAACTCTGCACACCCTGCAAA >10.4|4073747|37|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT TTTACTTAAGTTTGCGGAATCTCCTTATATTGGTGGG >10.5|4073821|35|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT ACTAGTTCCTTAGCTTCCGTTTGTTTTGCATCGAC >10.6|4073893|41|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT CTTTCGCTTGAAATCCCAAGAACTCTGCACACCCTGCAAAG >10.7|4073971|40|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT TTTCACCTGTCCTTTGATGCCAGAAAATACATAGTAGCGC >10.8|4074048|57|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT AAGTAGTAGCAAAATTGTAGAAAAATTTTCACTCAATGGGAGTGAAAATATCACTGT >10.9|4074142|39|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTCGACACTAATAGTTCTGTTTAATTCAACAGGGGAAGA >10.10|4074218|47|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAATCTAAGATAATGAGCAAAACCGTAATCAAAAGAGATGGCAGAAA >10.11|4074302|40|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCAACTACCGCTCAGTAATATGAAACTTAATCATAACTTC >10.12|4074379|45|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTCCCCAACGATTTTATCTACGGCTGCTTTAAGACGTGCAACGCG |
cas14j |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019776_10
The CRISPR arrays of NC_019776_10 >merge|NC_019776|10|4073709-4074460|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAACTTTACTTAAGTTTGCGGAATCTCCTTATATTGGTGGGGTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAACACTAGTTCCTTAGCTTCCGTTTGTTTTGCATCGACGTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAACCTTTCGCTTGAAATCCCAAGAACTCTGCACACCCTGCAAAGGTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAACTTTCACCTGTCCTTTGATGCCAGAAAATACATAGTAGCGCGTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAACAAGTAGTAGCAAAATTGTAGAAAAATTTTCACTCAATGGGAGTGAAAATATCACTGTGTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAACTTCGACACTAATAGTTCTGTTTAATTCAACAGGGGAAGAGTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAACAAATCTAAGATAATGAGCAAAACCGTAATCAAAAGAGATGGCAGAAAGTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAACCCAACTACCGCTCAGTAATATGAAACTTAATCATAACTTCGTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAACTTCCCCAACGATTTTATCTACGGCTGCTTTAAGACGTGCAACGCGGTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC >NC_019776|10|7|4073709-4073970|PILER-CR GGTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC TTTACTTAAGTTTGCGGAATCTCCTTATATTGGTGG GGTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC ACTAGTTCCTTAGCTTCCGTTTGTTTTGCATCGA CGTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC CTTTCGCTTGAAATCCCAAGAACTCTGCACACCCTGCAAA GGTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAACTTTCACCTGTCCTTTGATGCCAGAAAATACATAGTAGCGCGTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAACAAGTAGTAGCAAAATTGTAGAAAAATTTTCACTCAATGGGAGTGAAAATATCACTGTGTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC TTCGACACTAATAGTTCTGTTTAATTCAACAGGGGAAGA GTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC AAATCTAAGATAATGAGCAAAACCGTAATCAAAAGAGATGGCAGAAA GTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC CCAACTACCGCTCAGTAATATGAAACTTAATCATAACTTC GTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC TTCCCCAACGATTTTATCTACGGCTGCTTTAAGACGTGCAACGCG >NC_019776|10|10|4073710-4074460|CRISPRCasFinder GTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC TTTACTTAAGTTTGCGGAATCTCCTTATATTGGTGGG GTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC ACTAGTTCCTTAGCTTCCGTTTGTTTTGCATCGAC GTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC CTTTCGCTTGAAATCCCAAGAACTCTGCACACCCTGCAAAG GTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC TTTCACCTGTCCTTTGATGCCAGAAAATACATAGTAGCGC GTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC AAGTAGTAGCAAAATTGTAGAAAAATTTTCACTCAATGGGAGTGAAAATATCACTGT GTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC TTCGACACTAATAGTTCTGTTTAATTCAACAGGGGAAGA GTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC AAATCTAAGATAATGAGCAAAACCGTAATCAAAAGAGATGGCAGAAA GTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC CCAACTACCGCTCAGTAATATGAAACTTAATCATAACTTC GTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC TTCCCCAACGATTTTATCTACGGCTGCTTTAAGACGTGCAACGCG GTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC >NC_019776|10|7|4073710-4074460|CRT GTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC TTTACTTAAGTTTGCGGAATCTCCTTATATTGGTGGG GTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC ACTAGTTCCTTAGCTTCCGTTTGTTTTGCATCGAC GTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC CTTTCGCTTGAAATCCCAAGAACTCTGCACACCCTGCAAAG GTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC TTTCACCTGTCCTTTGATGCCAGAAAATACATAGTAGCGC GTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC AAGTAGTAGCAAAATTGTAGAAAAATTTTCACTCAATGGGAGTGAAAATATCACTGT GTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC TTCGACACTAATAGTTCTGTTTAATTCAACAGGGGAAGA GTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC AAATCTAAGATAATGAGCAAAACCGTAATCAAAAGAGATGGCAGAAA GTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC CCAACTACCGCTCAGTAATATGAAACTTAATCATAACTTC GTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC TTCCCCAACGATTTTATCTACGGCTGCTTTAAGACGTGCAACGCG GTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC >NC_019776|10|8|4074105-4074460|PILER-CR TTTACTTAAGTTTGCGGAATCTCCTTATATTGGTGG GGTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC ACTAGTTCCTTAGCTTCCGTTTGTTTTGCATCGA CGTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC CTTTCGCTTGAAATCCCAAGAACTCTGCACACCCTGCAAA GGTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAACTTTCACCTGTCCTTTGATGCCAGAAAATACATAGTAGCGCGTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAACAAGTAGTAGCAAAATTGTAGAAAAATTTTCACTCAATGGGAGTGAAAATATCACTGTGTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC TTCGACACTAATAGTTCTGTTTAATTCAACAGGGGAAGA GTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC AAATCTAAGATAATGAGCAAAACCGTAATCAAAAGAGATGGCAGAAA GTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC CCAACTACCGCTCAGTAATATGAAACTTAATCATAACTTC GTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC TTCCCCAACGATTTTATCTACGGCTGCTTTAAGACGTGCAACGCG GTTCGATTCCACATTTACCCCGTAAGGGGACGGAAAC
>NC_019776.1|WP_015221205.1|4072703_4073186_+|cupin-domain-containing-protein MEGKKTFILRAAEIADSIQTFSHPWNSKSEISGVYLGRTVGLKRTGVNFARIAPGKESFVYHSHYREEEWIYILSGRGIAEIDGEEFEVGSGDFMGFPTPSVPHHLRNIGDEDLVYLVGGENLEVEVADFPRLKKRMLRRGDSVEIYDTSDAKPFGVLDE >NC_019776.1|WP_015221204.1|4071638_4072541_+|transcriptional-regulator-GcvA MLRRQLYSLNGLQSFEAVARHLSFQKAAEELDVTSTAVSHQIKKLEKELGLLLFRRRPRPLTLTPAGELLFPRVQKSLDVLDNAILELRQINNPTELTVSVLNVFASKWLVPRLNDFQRRHPDIDVRLQTSNTVVDLQARTVDIAIRYGQGNYSGLEVHHLIQDQFTPVCSPKLFAHKQNSITPKEISQHTLIHFDWLNYGSEAPSWKNWLAKAELSEINADKGLKFDDENLAIQAAIAGQGIALCSSIHVQDDVKMGFLIQPFDITLPGFIYSVVYLKNHPKKAFILQFVSWLEEQTYI >NC_019776.1|WP_015221203.1|4070641_4071298_-|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase MTKILQIDASARVTRSLSRGLTNAFYQNWSASRPNDIWIKRDVGLNPPSAISEEWIASAFTPLDKRTPEQVAILRESDELLEELEPADIIVIGTPMYNYGMPSSLKAWIDQVIRIGRTFSFDLARGEQPIEPILTDKILVILASCGEGGFGFGEANASQNHLDTAIITASKLMGVTEHYVIRVEYQEFGDARHQKSVEDAHGKIPKLVQQLIQKIGDQ >NC_019776.1|WP_015221202.1|4070217_4070553_+|DUF4188-domain-containing-protein MYSSAFIFEPGEYDEQFYFLDNQIHEAAASVNGFLGRESWESIDGKRKNAIYYWESMDALKEFSRHPKHIEAKRQYTKWYKGFHVVISEVKHSYGDGKLEHITPNDRAKNS >NC_019776.1|WP_015221201.1|4068131_4069967_+|ferrous-iron-transport-protein-B MSCHSATTKVLPNSQKRIAVIGQPNTGKSTFFNRLTGSNASVGNWSGITVDLLQAEINLNNEVVEVVDLPGIYDFNGFSDDEKVVQRFLETFPLDLAIIIINATQIDRTLRLILEMKRLGLPCVVMLNMADEAKRYGVEINHYQLQEILGIPCFSISAKYGKGFTQAVRGIEKALSTQEDSFILKDIHDFLSTNPVTETEINSILEKTVKVPPEEIKTITDKLDRILLHPIFGIPLFFISMLGIFFLIWYLGLPSQDIMGNITDWISGQIIEPTIQPLPEIVQNFLLNGVWLGVATVASFVPLIVLFFFVMAAVEDSGYLARSAYLMDALMEKLGLDGRAFVMQMMGFGCNVPALMGTRVIRSQPMRWLSMLIIPFALCSARLAVFVFIIAAIFPSNLGPIILFSLYLLSFIASFFVAFVFSKTKEFQSQEPFIIELPPYRLPTLRQVLLRGWGEVKEFLRRATNFIIIGCVAVWFLTYFPENSIGLETWGGQLGILLQPIMQPIGIDPYLTLSLIFGFIAKEIVVGSFATIYGLSSSALTQHIALTITPAAAVSFCVFCLLYTPCLSTVATIKAESKSTIFTLFSLLFSLVYAWICAFIFYHLALTLFPI >NC_019776.1|WP_015221200.1|4067479_4068046_+|metal-binding-protein MPSGKIHDQITWFCLPLVIILFFIVTKSLLLTALGGFGFIFSGLMFGPDLDIYSIQFQRWRFFRFIWLPYQKTLKHRSIFSHGFLLGTLIRVIYLSLILFILAILGVAIAQLIFGFGWHWQKFIFNSYGVLKNNYWQEVLSLFIGLELGAMSHYLADDIGSRWKSHQKKKPVSRKKNKKVVKKTSRNK >NC_019776.1|WP_015221199.1|4065020_4066823_-|proline--tRNA-ligase MRLSSMLFATLREDPAEAEIKSHKLLLRAGYIRRIGSGVYSYLPLMWRVLQKVSQIVREEMNATGAQECLLPQMQPADLWQESGRWDTYTKAEGIMFSLTDRQNRQLALGPTHEEVITAIARDMIKSYRQLPVHLYQIQTKFRDEIRPRFGLMRGREFIMKDGYSFHTSPECLKNTYNDMDQAYKNIFTRCGLSFRPVEADSGAIGGSGSQEFMVLAEAGEDEILYTEDGLYSANVEKAVSLPADKVASPFTSYEKKATPNTETIEKVCQFLGCSATNIVKNVLYQAVYDSGKIVLVLIHIRGDQDVNEVKLTNELVKLASNYNANTVLSLTVPDENAQQKWAEKPLPLGYIAPDLSDDYIAQNKEVAGEFLRLADETVVNLENFVTGSNETGYHVVGANWGQQFTLPKLTVDVRKAKVGDRALHNQEQTLQTARGIEVGHIFQLGTKYSQAMGATYTAEDGTEKPFVMGCYGIGVSRLAQSAVEQSHDKDGIIWPVAIAPYHAIVVIPNITDEQQVKVAEEIYHNLNQAGVETLLDDRDERAGVKFKDADLIGIPYRIVTGRSLKDGKVELVERSTKNSQDIPVEEIVKIVSEMINNNS >NC_019776.1|WP_015221198.1|4064445_4064949_-|late-competence-development-ComFB-family-protein MVSEPQTYKNVMEAFVQEEIEFQLQNNKALSRSADYINLLEVATFALNRLPCYYASSIEGIERQRRRIKEKRELKQKISFVVSQAFAAVERDPLRRSTPIIEEDKKDIFDEARSAVYQAKDTLPETELSWIISFMEAFLTNITYNSVSAEEVVKLYYLLYYYWQENQ >NC_019776.1|WP_015221197.1|4063405_4064173_-|twin-arginine-translocase-subunit-TatC MTTQQLENSVQDKNSPEYWDEVPNPAEMSFFDHLEELRQRIFVSLIAVLLSAIACFAFVKTIVAWLEVPAQGVKFLQLAPGEFFFVSIQVAGYTGIILAAPVILYQIVQFVLPGLTRKERRFLAPVVFGSSILFFAGLAFAYYVLIPAALKFFIGYGGDVVEQLWSIDKYFKFILLLMFSTGLAFQIPVIQLLLGMLGIVSSQQMLSGWRIVILASLILGAVITPSTDPLTQSLLGGAVLMLYFGGIGMVKLIGK >NC_019776.1|WP_015221196.1|4062351_4063020_+|DUF4335-domain-containing-protein MSSSIERQYMSPNCVLSLQGFSEESDNQEAISVMSVLTLAKCQIIGNSTTLQGGLTFLEHLLHAVSSYTHDLLSGLNHPVESKDKNDYIYLTNLEDKKRHLLIWQKEKGQTDDQLELELTTVQLFDLLDALDQLYQDPLTLPQLKDEIKPLSRRHRQAEVSFVEQSTPATLGFVGFTLAAIALFFIPNPNNIKDPNQEPQPARETNQQVIPVETPSKPNENE >NC_019776.1|WP_015221206.1|4074509_4074767_+|HNH-endonuclease MSRYSKDWNKIACAIKQKADWKCSQCGADFKNKSSRGSCLQVHHWNRIPEDNRPENLVALCNICHLKYHRGGKSNILIGQLSLNL >NC_019776.1|WP_015221207.1|4074763_4075093_+|hypothetical-protein MTYPTWYQEAIARGIDFIVIVYEKAEGFVFCPSNLETTFRVGGDYDGSFYTNGEGALRHYYNCLNPAFEEKIAWFIPFVNKIVNKEDFSLDDLELNHHPIRIIKGRWPW >NC_019776.1|WP_041922569.1|4075199_4075457_+|HU-family-DNA-binding-protein MSINQKELVKRIAKKINQKDEVIEEIVNATLDEIYDCLKAQESVNFRNFGTFYIQRKRDSTVFKFNPSQRLRKLFGWSSTYRGDI >NC_019776.1|WP_155084367.1|4075459_4075618_+|hypothetical-protein MTPPYWQEAVIFLHQQDKIISQLVTSYPQQPLKNNHNNPFETLVKAVIGQQI >NC_019776.1|WP_015221208.1|4075790_4076984_+|IS200/IS605-family-element-transposase-accessory-protein-TnpB MLKAYKYRIYPTDEQKVLLAKTFGCCRWFYNFALDLTNETYKATGKGLSRDEIINKLPQLKKEKEWLSEVPSQALQQVALDLSSAFLNFFEKRAKFPKFKKKGNKQSVRFPQGIKLDGDYLTLPKLKKVYCKVSRLPEGKLKSVTISMTSSGKYFASCLYDDGQDLPEQNSEGKAVGIDLGVKDFAITSDGSKYGNLNYYRKYEQKLAKKQKRLAKKQKGSNNRHKARKAVAKVHEKITRCREDFLHKLSRKLVDENQVIVVENLAVKNMVRNHKLAKSINDCGWGQFCTMLKYKAEWEGKTYIEVDRFFPISKTCNHCLYQVDSLTLDIRRWQCPKCETIHDRDVNAAKNIRDEGLRILAVGHIASASGERVRPSKGTAFVRHLSVKEESPVTPQG >NC_019776.1|WP_015221209.1|4077943_4078972_-|23S-rRNA-(adenine(2503)-C(2))-methyltransferase-RlmN MAIKEKEVLLGKSLSELTTWVENQGQPAYRGKQLYQWLYEKGATSLMDITVFPKQWRENQAENIIGRSQVHYCSTASDRTCKYLLKLADGLIIETVGIPTDKRLTVCVSSQVGCIMACDFCATGKGGFTRNLYAHEIIDQILTVQNDFGERVSNVVFMGMGEPLLNLPQVVKAIKSINEDVGIGARSLTISTVGLPNKILELAQHKLQITFAVSLHASNQAVREKLIPSANHYPLEQLLADCREYVKMTGRRVTFEYILLSGVNDLPQHAQELAQHLHGFQTHVNLIPYNPISEADYQRPSPERVSQFKKLLQQEKIAVSVRYSRGLDADAACGQLRASKMK >NC_019776.1|WP_015221210.1|4079218_4080199_+|J-domain-containing-protein MEFKDYYSVLGVDKKASGEEIKKAFRKLAVKYHPDRNPDNKAAEEKFKEISEAYEVLGDTEKRKKYDQFIRYGRPMGQRTTSRNTTTWGNTYQTRSSNDMDFDFGKYNSFDEFIADLLGRPFGNTRTQTTGFSDFGGFNTGTTASQGRGNDIEKSITLTYYQAYHGVQTKLDLGSEIVTVKIPAGAKNGTKVRLKGKGQINPISNHKGDLYLKVELKPHDFFSFEDDKLVCEVPITPYEAVLGGEVNVPTPEGEVMVKIPAGIRHGQSLRLKGKGWSNPKGGNGDLLVKIAIATPKNISDQEKEYYEKIRSISQDDPRLSLKNIKL >NC_019776.1|WP_015221211.1|4080412_4080667_+|SemiSWEET-transporter MEWITIIGLMAGSLTTISFLPQAIKTWRSKSAKDISLAMFLCFCLGVVLWIIYGLFIMDIPVLVTNIVTLILAGTILFFKLKYK >NC_019776.1|WP_015221212.1|4080670_4080967_+|hypothetical-protein MSLIFILSFNIFICVINFYLLWQLIRIKKYLKTLNTRLIYINKNLPLIIKEVSLSILTTALEIKKIKEKYRRLKNNISNVQKILTISRIIYKIVYQTN >NC_019776.1|WP_015221213.1|4081000_4081366_+|hypothetical-protein MIEPKFKNAQEYELAQVLMQPIFIRLLDNIRKESELSNYDVSYEEINEPFPSYIVAIKKENKTEKNNVWELCFQVCFNNYSESTTQPVTTDKTLFEEDGQLNWQTLDEKTKTLVKSLFSSN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019776_11 | 4113500-4114042 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_019776_11
|
7 spacers
spacers of NC_019776_11
>11.1|4113537|35|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAGATAAAAGGAGGTGAGTTAATCCACTTAAAA >11.2|4113609|32|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAAAGTTGCAAGGTTTAAAAGGTTGCTTACG >11.3|4113678|34|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGGATAGACTTAATTAAAGAATTTGAGGGCTTTA >11.4|4113749|35|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGTTAAAGCGATAAGTATTATTGTTTTTATCCCA >11.5|4113821|38|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTACCATCGCCATCAACAATATATTGCTTATTAATCG >11.6|4113896|35|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCGATGATTTTAGATTTGAAAAGTGGAAGCGACTT >11.7|4113968|38|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACTTTTTCATTCATTAAATCCACATTTTGCCATCGTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019776_11
The CRISPR arrays of NC_019776_11 >merge|NC_019776|11|4113500-4114042|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAACAAAAGATAAAAGGAGGTGAGTTAATCCACTTAAAAGTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAACGAAAAGTTGCAAGGTTTAAAAGGTTGCTTACGGTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAACGGGATAGACTTAATTAAAGAATTTGAGGGCTTTAGTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAACTGGTTAAAGCGATAAGTATTATTGTTTTTATCCCAGTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAACATTACCATCGCCATCAACAATATATTGCTTATTAATCGGTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAACCCGATGATTTTAGATTTGAAAAGTGGAAGCGACTTGTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAACAACTTTTTCATTCATTAAATCCACATTTTGCCATCGTAGTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC >NC_019776|11|9|4113500-4114042|PILER-CR GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC AAAAGATAAAAGGAGGTGAGTTAATCCACTTAAAA GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC GAAAAGTTGCAAGGTTTAAAAGGTTGCTTACG GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC GGGATAGACTTAATTAAAGAATTTGAGGGCTTTA GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC TGGTTAAAGCGATAAGTATTATTGTTTTTATCCCA GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC ATTACCATCGCCATCAACAATATATTGCTTATTAATCG GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC CCGATGATTTTAGATTTGAAAAGTGGAAGCGACTT GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC AACTTTTTCATTCATTAAATCCACATTTTGCCATCGTA GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC >NC_019776|11|11|4113500-4114042|CRISPRCasFinder GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC AAAAGATAAAAGGAGGTGAGTTAATCCACTTAAAA GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC GAAAAGTTGCAAGGTTTAAAAGGTTGCTTACG GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC GGGATAGACTTAATTAAAGAATTTGAGGGCTTTA GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC TGGTTAAAGCGATAAGTATTATTGTTTTTATCCCA GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC ATTACCATCGCCATCAACAATATATTGCTTATTAATCG GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC CCGATGATTTTAGATTTGAAAAGTGGAAGCGACTT GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC AACTTTTTCATTCATTAAATCCACATTTTGCCATCGTA GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC >NC_019776|11|8|4113500-4114042|CRT GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC AAAAGATAAAAGGAGGTGAGTTAATCCACTTAAAA GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC GAAAAGTTGCAAGGTTTAAAAGGTTGCTTACG GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC GGGATAGACTTAATTAAAGAATTTGAGGGCTTTA GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC TGGTTAAAGCGATAAGTATTATTGTTTTTATCCCA GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC ATTACCATCGCCATCAACAATATATTGCTTATTAATCG GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC CCGATGATTTTAGATTTGAAAAGTGGAAGCGACTT GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC AACTTTTTCATTCATTAAATCCACATTTTGCCATCGTA GTTTCAATCCCTAAGAGGTATTAATAAGAGTTTAAAC
>NC_019776.1|WP_015221237.1|4113116_4113413_-|hypothetical-protein MNQTIEVNIADILVRLEGKIDKLENKIDHLTNEVNEVKINVAKLDEKLNSVESNFKTNFEGLDKRLVNLEFVYRGAGVAIIGGILLAIFRFLFPDFTI >NC_019776.1|WP_190275006.1|4112887_4113058_+|hypothetical-protein MLLSHTIIKKEFQSLRGINKSLNYSRKDYVNARRCINGTDKAREIANIAKKWEIKL >NC_019776.1|WP_190275005.1|4112548_4112872_-|type-II-toxin-antitoxin-system-Phd/YefM-family-antitoxin MTIEQMIKSFDQLSAQEQDNLLEILRQRRSQLTKGEDLPNESELEEAITPSTAKVETVDDLKVDLGKEKQGFWSALQDFRRRVDLESLDDDTFDNLRDKSPGRDVIL >NC_019776.1|WP_015221234.1|4109565_4112283_-|CBS-domain-containing-protein MDLILCHQTADFDALGAAVGLTKLHPGAKIVLTGGAHPSVRKFLALHRDELALMEFRSVNPALIRHLFIVDTQRRDRIGKAVEWLELDNVKSVTIYDHHEENGQISADNFLKYIEKVGSCSTIICELLQQKSIGLNSVEATAMALGIHVDTGSLTFEQTTPRDALALAWLMTQDVNIRTLGEYVEPSLAPALRKLLPHALKSIQSLTVNGYTISWLLVETPHFIPGLSNLTSRIIDLVETDVLLFGHYYGHNVEKQKQGKLTIIGRSSLESVNLAQIFTAFTGGGHSSAASFTLRCPNPHDIIEQLLTQIENQIPSPLTARDLMAYPVRTIRPYTTIEEAQRILLRYGHSGLVVVNKEKELVGVISRRDIDLALHHGFSHAPVKGYMTKNVQVINPETALSEIEELMVKNDIGRLPVMENGQLIGIVTRTDVLRHLHSARLNSHPNSSNNLPLVSCLLPSLEKKLHPPIWKLLQQTATYAQQQGWHLYLVGGGVRDLLLTDNHTTLNLQDIDLVVDGFHRATTPEAGVKLAEALQAIYPQSRLSIHGQFQTAALLWHKDPQLGSLWLDIATARTEFYPYPAANPEVESSSIRQDLYRRDFTINALAVRLTQPHQGELLDFFGGVEDVRSHFIRVLHPNSFIEDPTRIYRAVRFAVRLNFDIETQTREYIDYAVNSGVFERVSLEKNSIPALTTRLKAELTYILQAQYWQPALKLLQEVGALRCLHRNCQITPNLWWQIRCLDRWLKYYHADSYNPSVSSWLLRLEIILSSFPEGVIVANNLELPKESIQRLSHLSENNEKIKHYLPTCQNISEKVEFLANYQSITLLLIAVKNSKPIRRTIWNYLMHWSKVKSPLDGKDLQKLGYKPSKLYKEILNKVLALYLDGKIKNQREAENFVLKNYPMNN >NC_019776.1|WP_015221233.1|4109145_4109463_-|hypothetical-protein MTIGKITNKIAISSRQKSVSPNLELINNARKSNKNKVEKKNNNYSQSQKYLTIFKYLILSTTIIFSFGGLGFGLALRYGHSWKVSHSLQELGVRSSDLGVKTNKD >NC_019776.1|WP_015221232.1|4108316_4108712_-|glycine-cleavage-system-protein-GcvH MTLEYPEDLRYLDSHEYVRLDGEIATIGITAFAIEELGDIVFLELPELGDAIEVEDNIGTIESVKAVSEIYAPVAGTVIDRNDMLIESPEAIADDPYGEGWLIKVRLDNPDDELENTLSVQEYRSLIEPEE >NC_019776.1|WP_015221231.1|4103483_4107902_-|PAS-domain-S-box-protein MSSFSFSLEYQPPYFPVTFISADESFSRVLSLSEEHPHNSIFFIVQKEEKESSSCRKYLGILARKNLSKYTQDSEDNDSLKAENLDLLPIVSIKKSELTNLFIVLYKFISSGSDYLAIINDNSDIIGVLAHEDLRDYIEIHTNFNYQEIEKLVSELNITITEDISEKKADKKQGKIFIKNNNKDSQVKTKNNSDTILHLDKIIDEHREQERYWHKLIEGAAAISGKDFFNKIAEYISINFDVDYVFITEKKEQYLETLVFLVNGKIQNNFCFPCTNFPCGKAVQEGIFTCQNNLRSLFPNNEFLEKSEMEGFAGVQLINGNKEVIGGLSVGSKSFIPKIKLEMIADILQVFAARITSELEREKAVTELTNLQQQLKNEIIIKTTQLEINERKYRTLIENFPGIVYSCLNDNFWTMEFLSGEILNITGYYPEEVTGNKLISYADLIHPDDRDIVNELIQESLQKKEIFTVEYRLQHRDGHIRWVYEKGQGVYDFQGNLIHLCGAIIDVSDRKLAEEALKHSEKDLFNAKEMLELVLNTIPQRVFWKNTQSVLLGCNQAFANDFDSTVSELQGKQINEICFNSEDAHQYQQCDCEVINTREPIYHQQYTYHRRDGSTMYIEGSKFPLKNNEGEIIGILGTYQDITQRKEYEAKLAQENNFNQQILENMAEGLCVCSEISDFPYIRFSVWNHKMEEITGYTLEEINQKGWYQSLYPDPNLREKAIERMKRMRQGEHIHKEIWRIIRADSQPRLIQISTCIVQKMDNSTHILALMQDVTEQKRAEKALKQSESRYRKIVETANEGIWILNKKGITTFVNRTLADMLGYSAEDIRGKSFLSFMEDSEKVFAQQLFERRIQGVSEQHDFKFLRADGSTLWAILSTSPIFNDEGEFIGALGMITDISDRKLIESHINELSKRLKLAVESAQIGIWELDLKTQKLTWDEQMYKLYDVPIGTPCYYKTWTNALHPEDFEDTVNLFERASLDLAEYDTVFRVIHSDGKIIYIKANGMLEKDEEGKPLKMIGINYDITPQKEAEIVLKESNENLEKINLELEKTTRMKDEFLASMSHELRTPLNSILGLSEALKEQVFGTLNQKQLDSLNNIHRSGRHLLDLINDILDLAKIESGKTEFNFSLVDVVSLSLDSLNFIRYLAEKKNITLTFINEIPSSHKLCQIDDRRIRQALINLLNNGIKFTPEGGKIKLKINLVTKINSTYQELETGETFIHFSVTDTGIGIAEENISKLFQTFVQIDSRLNRQYAGTGLGLALVKRIVDAHGGFVGVESEINQGSCFSFYIPYSKDVKEYHSAFWHPKNPHRVNLFTKKKIKENDESLLYNGRLEFSSNNSEQKTAINSINNLILLVDDNEENIYAVSDYLKIKGFSLEIAKNGKDALNKLEEVNPCIILMDIQMPELDGFETIRLIKENPRWQNIPIIAVTALAMTGDKEKCLNAGADDYLSKPFRLKDLIEKINKVLS >NC_019776.1|WP_015221230.1|4102344_4103415_-|response-regulator MPKKQVILIVDDDPNNFDVIEGLLYKYDYKLFYTSSGKSALAQIDSIKPDLILLDVMMPEMNGMEVCQIVKEKKEWQCIPIIMVTALNDKNDLAQCLEMGADDFISKPVNGIELAARVQSMLRIKSQYDSLQEMLKLREEMTSIIVHDLRNPLTNIILCAGILKMPNLSQEVYRQKLEEINNSGDVLNNQIDTLLQMAKIQSGKMVLAYKETNLSELLNIELKSFHNIAKANNINLILKVPDTTKYFFLDSQLIRRVIQNLLSNAVKFSSENSNIICELNYFDHSFEIKIIDSGKTISDQQKEFIFKKYQIGESVKGVKQIGLGLSFCKMAIEAHNGTIRVENNPEGRGNVFIISI >NC_019776.1|WP_015221229.1|4100655_4102086_+|Ni/Fe-hydrogenase-subunit-alpha MGKTVVIDPVTRIEGHAKISIYLDDQGEVNNARFHVVEFRGFEKFCEGRPMFEMAGITARICGICPVSHLLASAKTGDKILGVKILPSAEKLRRLMNLAQITQSHALSFFHLSSPDFLLGWDSNPSTRNVFGLMAADPDLARAGIRLRSFGQNIIELLGARKIHAAWAVPGGVRSPLSESGRQWIMENLPEAKQTTELALSLLKKLLDSQLITEIDTFGKFDSLFMSLVADNGNWEHYGGHIRFVDSQGNIVADKLSEDNYQDYLGEAVESWSYLKFPYYKPLGYPDGIYRVGPLARLNVCDRIGTPQADQELREFRHRAGGRIATSSFFYHYARLLEIVVCLEHIEILMNDPDLLSPKVRSQAGINFLEGIGVSEAPRGTLFHHYQVDENGLIKKVNLIIATGQNNLVMNKTVTQIAKHYIHGLDIPEEMLNRVEAGIRCFDPCLSCSTHAIGQMPLQIELVSSKGEVINTCQRD >NC_019776.1|WP_015221228.1|4097342_4100579_+|N-6-DNA-methylase MDVNYYLQEIENILQKGSERSHYPTLKTFIDTAMLGVSAVIEEKGNQAGIPDFTVRKNHRVIGYIEAKKISENLDLILETEQLQRYLDSAIALNFVLTNFLEFRWYKNGKLQQKIIIGEVKNNQIIATKEADKFIDLIHNFLSNEGKIINNYTELAMEMATVTKALCYSIESALKQENETGELRQLKLVFQDLLLPDLDSNNFADMYAQTIAYGLFTARIGHHEKTPLAPLNKGENNNKSLPSTVGEGLGVRAENFNDEFNAETASYYLSDNIPFLKGLFDTVISTNIAEKIKWAISLLIELLANADMGNILENFGRETKREDPVVHFYETFLSAYSAKLRKNRGVYYTPEPVVYFIVKAVNDVLETYFYLDDGLANTHVNILDPATGTGTFLYEIIKQIYENFNRYGVRNWHELLKQKRVLKRLFGFELLMTPYTIAHLKLGLLLKTLGYRFQEKERLNIFLTNSLDEGIKKSELLFAEYISQEANQAAEVKTETPINVVIGNPPYAGHSANKGSWIDGLIKDYYQVDGMDLNEKNPKWLQDDYVKFIRFGQWRIEKTGAGILAFVTNHGYLDNPTFRGMRQQLMNSFDCIYLINLHGNAKKKEVSPDGTPDKNVFDIQQGVAIIIAVKDIPKDKSFLTFKGEPHTIKNGIYYYDMWGSRESKYQQLKELNLYEINWETVNPQSPFYLFTPQDTFLLEEYNQGWKITDIMPINVLGFQTHRDHFAIDFDRDKLYNRIEEMRDKNISDDEYYEKYNLKDNRDWKLKKARQEIKNDPQWEDKLIDCLYRPFDWRFCYFSYVAMDYPRRELMNHVMGKDNLCLLTSRQQANIGYRHCWVADFPPESCVVSTTSREGNQVFPLYIYPDTENGQILTQQEEKQANFSPEFLKAITDKLGYTPSPEIIFYYIYAVLHSPNYRQRYAQFLKIDFPRIPLTNNPDLFKQLAEKGEILVNLHLMKKLPDIKTTMSNFISNDNLPIFTQEKGEFHYQGDDKNEVTQVKYDENKQQVMINKDCYFCDVNKSLWEFKIGGYQVLEKWLKDRKKENISLTEKDIIHYQNILIVLQKTMEVMREIDDIYKF |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019776_1 | 1.3|236|35|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 236-270 | 35 | MN694620 | Marine virus AFVG_250M860, complete genome | 26860-26894 | 9 | 0.743 |
NC_019776_1 | 1.3|236|35|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 236-270 | 35 | MN694630 | Marine virus AFVG_250M859, complete genome | 27340-27374 | 9 | 0.743 |
NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | NZ_KU312044 | Escherichia coli strain 1292 transconjugant plasmid pNVI1292, complete sequence | 77083-77120 | 9 | 0.763 |
NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | NZ_KR905386 | Escherichia coli strain MSA1088 plasmid pTMSA1088, complete sequence | 15478-15515 | 9 | 0.763 |
NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | NZ_KR905388 | Escherichia coli strain MSA970 plasmid pTMSA970, complete sequence | 17183-17220 | 9 | 0.763 |
NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | NZ_KR905387 | Escherichia coli strain MSA992 plasmid pTMSA992, complete sequence | 15478-15515 | 9 | 0.763 |
NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | NZ_KR905390 | Escherichia coli strain DV10 plasmid pDV10, complete sequence | 15467-15504 | 9 | 0.763 |
NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | NZ_KM085449 | Escherichia coli O104:H7 strain RM9387 plasmid pO104_H7, complete sequence | 157170-157207 | 9 | 0.763 |
NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | NZ_KM085449 | Escherichia coli O104:H7 strain RM9387 plasmid pO104_H7, complete sequence | 157182-157219 | 9 | 0.763 |
NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | NZ_KR905384 | Escherichia coli strain DV45 plasmid pDV45, complete sequence | 22126-22163 | 9 | 0.763 |
NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | NZ_KR905389 | Escherichia coli isolate 4809.66 plasmid p4809.66, complete sequence | 22118-22155 | 9 | 0.763 |
NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | NZ_KR905385 | Escherichia coli strain 5312.29 plasmid p5312.29, complete sequence | 22126-22163 | 9 | 0.763 |
NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | NZ_CP009105 | Escherichia coli strain RM9387 plasmid pO104_H7, complete sequence | 157169-157206 | 9 | 0.763 |
NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | NZ_CP009105 | Escherichia coli strain RM9387 plasmid pO104_H7, complete sequence | 157181-157218 | 9 | 0.763 |
NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | NZ_CP027341 | Escherichia coli strain 2015C-3121 plasmid unnamed | 22173-22210 | 9 | 0.763 |
NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | NZ_CP027341 | Escherichia coli strain 2015C-3121 plasmid unnamed | 22185-22222 | 9 | 0.763 |
NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | NZ_CP027341 | Escherichia coli strain 2015C-3121 plasmid unnamed | 22197-22234 | 9 | 0.763 |
NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | MN419431 | Escherichia coli strain 2016-40-19138 plasmid p19138, complete sequence | 68836-68873 | 9 | 0.763 |
NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | MN419431 | Escherichia coli strain 2016-40-19138 plasmid p19138, complete sequence | 68848-68885 | 9 | 0.763 |
NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | NZ_CP043035 | Escherichia coli strain XDL plasmid pXDL-2, complete sequence | 27214-27251 | 9 | 0.763 |
NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | NZ_CP043035 | Escherichia coli strain XDL plasmid pXDL-2, complete sequence | 27226-27263 | 9 | 0.763 |
NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | NZ_CP043035 | Escherichia coli strain XDL plasmid pXDL-2, complete sequence | 27238-27275 | 9 | 0.763 |
NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | NZ_CP033633 | Escherichia coli isolate ECCNB12-2 plasmid pTB-nb2, complete sequence | 114277-114314 | 9 | 0.763 |
NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | NZ_CP033633 | Escherichia coli isolate ECCNB12-2 plasmid pTB-nb2, complete sequence | 114289-114326 | 9 | 0.763 |
NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | NZ_CP033633 | Escherichia coli isolate ECCNB12-2 plasmid pTB-nb2, complete sequence | 114301-114338 | 9 | 0.763 |
NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | NZ_CP033633 | Escherichia coli isolate ECCNB12-2 plasmid pTB-nb2, complete sequence | 114313-114350 | 9 | 0.763 |
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NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | NZ_CP029742 | Escherichia coli strain AR_0085 plasmid unnamed1, complete sequence | 6181-6218 | 9 | 0.763 |
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NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | CP027378 | Escherichia coli strain 2013C-4404 plasmid unnamed2 | 395-432 | 9 | 0.763 |
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NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | CP027379 | Escherichia coli strain 2013C-4404 plasmid unnamed3, complete sequence | 16204-16241 | 9 | 0.763 |
NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | CP027379 | Escherichia coli strain 2013C-4404 plasmid unnamed3, complete sequence | 16216-16253 | 9 | 0.763 |
NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | CP027379 | Escherichia coli strain 2013C-4404 plasmid unnamed3, complete sequence | 16228-16265 | 9 | 0.763 |
NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | NZ_CP016548 | Escherichia coli strain O177:H21 plasmid unnamed2, complete sequence | 68539-68576 | 9 | 0.763 |
NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | NZ_MG825371 | Escherichia coli strain 1106 plasmid p1106-IncFII, complete sequence | 31108-31145 | 9 | 0.763 |
NC_019776_3 | 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1065018-1065055 | 38 | NZ_MG825371 | Escherichia coli strain 1106 plasmid p1106-IncFII, complete sequence | 31120-31157 | 9 | 0.763 |
NC_019776_7 | 7.25|3181830|33|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3181830-3181862 | 33 | NZ_CP044459 | Acinetobacter indicus strain B18 plasmid pB18-4, complete sequence | 2001-2033 | 9 | 0.727 |
NC_019776_7 | 7.25|3181830|33|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3181830-3181862 | 33 | NZ_CP039144 | Acinetobacter sp. 10FS3-1 plasmid p10FS3-1-1, complete sequence | 185668-185700 | 9 | 0.727 |
NC_019776_11 | 11.6|4113896|35|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 4113896-4113930 | 35 | NC_019429 | Anabaena sp. 90 plasmid pANA02, complete sequence | 49074-49108 | 9 | 0.743 |
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NC_019776_1 | 1.8|594|35|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 594-628 | 35 | MN022787 | Salmonella virus VSe12, complete genome | 36722-36756 | 10 | 0.714 |
NC_019776_1 | 1.8|594|35|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 594-628 | 35 | MN694156 | Marine virus AFVG_250M53, complete genome | 27129-27163 | 10 | 0.714 |
NC_019776_7 | 7.25|3181830|33|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3181830-3181862 | 33 | NZ_CP048109 | Klebsiella michiganensis strain BD177 plasmid unnamed1 | 206890-206922 | 10 | 0.697 |
NC_019776_7 | 7.25|3181830|33|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3181830-3181862 | 33 | NZ_CP031818 | Klebsiella pneumoniae strain INF235-sc-2280127 plasmid unnamed1, complete sequence | 365416-365448 | 10 | 0.697 |
NC_019776_7 | 7.25|3181830|33|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3181830-3181862 | 33 | MN543575 | Klebsiella pneumoniae strain GH44TC plasmid pGH44TC_fusion, complete sequence | 257783-257815 | 10 | 0.697 |
NC_019776_7 | 7.25|3181830|33|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3181830-3181862 | 33 | MN543576 | Klebsiella pneumoniae strain GH44TC plasmid pGH44TC_vir, complete sequence | 252515-252547 | 10 | 0.697 |
NC_019776_7 | 7.25|3181830|33|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3181830-3181862 | 33 | NZ_CP024517 | Klebsiella pneumoniae strain KSB1_10J plasmid unnamed2, complete sequence | 176077-176109 | 10 | 0.697 |
NC_019776_7 | 7.25|3181830|33|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3181830-3181862 | 33 | NZ_CP024497 | Klebsiella pneumoniae strain KSB1_7E plasmid unnamed1, complete sequence | 176095-176127 | 10 | 0.697 |
NC_019776_7 | 7.25|3181830|33|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3181830-3181862 | 33 | NZ_CP024501 | Klebsiella pneumoniae strain KSB1_4E plasmid unnamed2, complete sequence | 176193-176225 | 10 | 0.697 |
NC_019776_7 | 7.25|3181830|33|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3181830-3181862 | 33 | NZ_CP032356 | Klebsiella variicola strain 15WZ-82 plasmid p15WZ-82_Vir, complete sequence | 250417-250449 | 10 | 0.697 |
NC_019776_11 | 11.3|4113678|34|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 4113678-4113711 | 34 | MN693689 | Marine virus AFVG_250M368, complete genome | 32856-32889 | 12 | 0.647 |
1. spacer 1.3|236|35|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694620 (Marine virus AFVG_250M860, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
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2. spacer 1.3|236|35|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694630 (Marine virus AFVG_250M859, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
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3. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KU312044 (Escherichia coli strain 1292 transconjugant plasmid pNVI1292, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
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4. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KR905386 (Escherichia coli strain MSA1088 plasmid pTMSA1088, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
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5. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KR905388 (Escherichia coli strain MSA970 plasmid pTMSA970, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
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6. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KR905387 (Escherichia coli strain MSA992 plasmid pTMSA992, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
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7. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KR905390 (Escherichia coli strain DV10 plasmid pDV10, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
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8. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KM085449 (Escherichia coli O104:H7 strain RM9387 plasmid pO104_H7, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
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9. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KM085449 (Escherichia coli O104:H7 strain RM9387 plasmid pO104_H7, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
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10. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KR905384 (Escherichia coli strain DV45 plasmid pDV45, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
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11. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KR905389 (Escherichia coli isolate 4809.66 plasmid p4809.66, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
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12. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KR905385 (Escherichia coli strain 5312.29 plasmid p5312.29, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
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13. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP009105 (Escherichia coli strain RM9387 plasmid pO104_H7, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
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14. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP009105 (Escherichia coli strain RM9387 plasmid pO104_H7, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
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15. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP027341 (Escherichia coli strain 2015C-3121 plasmid unnamed) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
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16. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP027341 (Escherichia coli strain 2015C-3121 plasmid unnamed) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
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17. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP027341 (Escherichia coli strain 2015C-3121 plasmid unnamed) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
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18. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN419431 (Escherichia coli strain 2016-40-19138 plasmid p19138, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
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19. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN419431 (Escherichia coli strain 2016-40-19138 plasmid p19138, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
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20. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP043035 (Escherichia coli strain XDL plasmid pXDL-2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
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21. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP043035 (Escherichia coli strain XDL plasmid pXDL-2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
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22. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP043035 (Escherichia coli strain XDL plasmid pXDL-2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
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23. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP033633 (Escherichia coli isolate ECCNB12-2 plasmid pTB-nb2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gaatacaacagggaatacaacagggaatagtaagcgaa CRISPR spacer gaatacagcagggaatacagcagggaatacagcaggga Protospacer *******.***********.********* . . *.*
24. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP033633 (Escherichia coli isolate ECCNB12-2 plasmid pTB-nb2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gaatacaacagggaatacaacagggaatagtaagcgaa CRISPR spacer gaatacagcagggaatacagcagggaatacagcaggga Protospacer *******.***********.********* . . *.*
25. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP033633 (Escherichia coli isolate ECCNB12-2 plasmid pTB-nb2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gaatacaacagggaatacaacagggaatagtaagcgaa CRISPR spacer gaatacagcagggaatacagcagggaatacagcaggga Protospacer *******.***********.********* . . *.*
26. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP033633 (Escherichia coli isolate ECCNB12-2 plasmid pTB-nb2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gaatacaacagggaatacaacagggaatagtaagcgaa CRISPR spacer gaatacagcagggaatacagcagggaatacagaaaggc Protospacer *******.***********.********* .*. *.
27. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP029742 (Escherichia coli strain AR_0085 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gaatacaacagggaatacaacagggaatagtaagcgaa CRISPR spacer gaatacagcagggaatacagcagggaatacagcaggga Protospacer *******.***********.********* . . *.*
28. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP029742 (Escherichia coli strain AR_0085 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gaatacaacagggaatacaacagggaatagtaagcgaa CRISPR spacer gaatacagcagggaatacagcagggaatacagcaggga Protospacer *******.***********.********* . . *.*
29. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP029742 (Escherichia coli strain AR_0085 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gaatacaacagggaatacaacagggaatagtaagcgaa CRISPR spacer gaatacagcagggaatacagcagggaatacagcaggga Protospacer *******.***********.********* . . *.*
30. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP029742 (Escherichia coli strain AR_0085 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gaatacaacagggaatacaacagggaatagtaagcgaa CRISPR spacer gaatacagcagggaatacagcagggaatacagaaaggc Protospacer *******.***********.********* .*. *.
31. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP032880 (Escherichia coli strain SCEC020022 plasmid p1_020022, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gaatacaacagggaatacaacagggaatagtaagcgaa CRISPR spacer gaatacagcagggaatacagcagggaatacagcaggga Protospacer *******.***********.********* . . *.*
32. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP032880 (Escherichia coli strain SCEC020022 plasmid p1_020022, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gaatacaacagggaatacaacagggaatagtaagcgaa CRISPR spacer gaatacagcagggaatacagcagggaatacagcaggga Protospacer *******.***********.********* . . *.*
33. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP032880 (Escherichia coli strain SCEC020022 plasmid p1_020022, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gaatacaacagggaatacaacagggaatagtaagcgaa CRISPR spacer gaatacagcagggaatacagcagggaatacagaaaggc Protospacer *******.***********.********* .*. *.
34. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP027378 (Escherichia coli strain 2013C-4404 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gaatacaacagggaatacaacagggaatagtaagcgaa CRISPR spacer gaatacagcagggaatacagcagggaatacagaaaggc Protospacer *******.***********.********* .*. *.
35. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP027378 (Escherichia coli strain 2013C-4404 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gaatacaacagggaatacaacagggaatagtaagcgaa CRISPR spacer gaatacagcagggaatacagcagggaatacagcaggga Protospacer *******.***********.********* . . *.*
36. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP027379 (Escherichia coli strain 2013C-4404 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gaatacaacagggaatacaacagggaatagtaagcgaa CRISPR spacer gaatacagcagggaatacagcagggaatacagaaaggc Protospacer *******.***********.********* .*. *.
37. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP027379 (Escherichia coli strain 2013C-4404 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gaatacaacagggaatacaacagggaatagtaagcgaa CRISPR spacer gaatacagcagggaatacagcagggaatacagcaggga Protospacer *******.***********.********* . . *.*
38. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP027379 (Escherichia coli strain 2013C-4404 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gaatacaacagggaatacaacagggaatagtaagcgaa CRISPR spacer gaatacagcagggaatacagcagggaatacagcaggga Protospacer *******.***********.********* . . *.*
39. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP016548 (Escherichia coli strain O177:H21 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gaatacaacagggaatacaacagggaatagtaagcgaa CRISPR spacer gaatacagcagggaatacagcagggaatacagaaaggc Protospacer *******.***********.********* .*. *.
40. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_MG825371 (Escherichia coli strain 1106 plasmid p1106-IncFII, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gaatacaacagggaatacaacagggaatagtaagcgaa CRISPR spacer gaatacagcagggaatacagcagggaatacagcaggga Protospacer *******.***********.********* . . *.*
41. spacer 3.8|1065018|38|NC_019776|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_MG825371 (Escherichia coli strain 1106 plasmid p1106-IncFII, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gaatacaacagggaatacaacagggaatagtaagcgaa CRISPR spacer gaatacagcagggaatacagcagggaatacagaaaggc Protospacer *******.***********.********* .*. *.
42. spacer 7.25|3181830|33|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP044459 (Acinetobacter indicus strain B18 plasmid pB18-4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gccccccaaagcaatagtagttttttcaattct CRISPR spacer ttcacccaaaccaacagtagttttttcaagctg Protospacer .* ****** ***.************** ..
43. spacer 7.25|3181830|33|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP039144 (Acinetobacter sp. 10FS3-1 plasmid p10FS3-1-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
gccccccaaagcaatagtagttttttcaattct CRISPR spacer ttcacccaaaccaacagtagttttttcaagctg Protospacer .* ****** ***.************** ..
44. spacer 11.6|4113896|35|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019429 (Anabaena sp. 90 plasmid pANA02, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ccgatgattttagatttgaaaagtggaagcgactt---- CRISPR spacer ccgatgattttagatgtgaaaact----gtggtttctga Protospacer *************** ****** * *.*..**
45. spacer 1.8|594|35|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694015 (Marine virus AFVG_250M337, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
taattgataatgaccctgctggagaaaaaaaagcc CRISPR spacer ctgttgataatgaccctgctggaaagaagctagaa Protospacer . .********************.*.**. **
46. spacer 1.8|594|35|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN022787 (Salmonella virus VSe12, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
taattgataatgaccctgctggagaaaaaaaagcc CRISPR spacer tcggagataatgatcctgctggtgaaaaaatttgc Protospacer * . ********.******** ******* *
47. spacer 1.8|594|35|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694156 (Marine virus AFVG_250M53, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
taattgataatgaccctgctggagaaaaaaaagcc CRISPR spacer ctgttgataatgaccctgctggaaagaagctagaa Protospacer . .********************.*.**. **
48. spacer 7.25|3181830|33|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP048109 (Klebsiella michiganensis strain BD177 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
gccccccaaagcaatagtagttttttcaattct CRISPR spacer gatgttgttagcaatagcggttttttcaattct Protospacer * . .. ********..**************
49. spacer 7.25|3181830|33|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031818 (Klebsiella pneumoniae strain INF235-sc-2280127 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
gccccccaaagcaatagtagttttttcaattct CRISPR spacer gatgttgttagcaatagcggttttttcaattct Protospacer * . .. ********..**************
50. spacer 7.25|3181830|33|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN543575 (Klebsiella pneumoniae strain GH44TC plasmid pGH44TC_fusion, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
gccccccaaagcaatagtagttttttcaattct CRISPR spacer gattttgttagcaatagcggttttttcaattct Protospacer * .... ********..**************
51. spacer 7.25|3181830|33|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN543576 (Klebsiella pneumoniae strain GH44TC plasmid pGH44TC_vir, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
gccccccaaagcaatagtagttttttcaattct CRISPR spacer gattttgttagcaatagcggttttttcaattct Protospacer * .... ********..**************
52. spacer 7.25|3181830|33|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024517 (Klebsiella pneumoniae strain KSB1_10J plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
gccccccaaagcaatagtagttttttcaattct CRISPR spacer gatgttgttagcaatagcggttttttcaattct Protospacer * . .. ********..**************
53. spacer 7.25|3181830|33|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024497 (Klebsiella pneumoniae strain KSB1_7E plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
gccccccaaagcaatagtagttttttcaattct CRISPR spacer gatgttgttagcaatagcggttttttcaattct Protospacer * . .. ********..**************
54. spacer 7.25|3181830|33|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024501 (Klebsiella pneumoniae strain KSB1_4E plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
gccccccaaagcaatagtagttttttcaattct CRISPR spacer gatgttgttagcaatagcggttttttcaattct Protospacer * . .. ********..**************
55. spacer 7.25|3181830|33|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032356 (Klebsiella variicola strain 15WZ-82 plasmid p15WZ-82_Vir, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
gccccccaaagcaatagtagttttttcaattct CRISPR spacer gattttgttagcaatagcggttttttcaattct Protospacer * .... ********..**************
56. spacer 11.3|4113678|34|NC_019776|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693689 (Marine virus AFVG_250M368, complete genome) position: , mismatch: 12, identity: 0.647
gggatagacttaattaaagaatttgagggcttta CRISPR spacer aatgcttttataattgaagaatttgaaggcttta Protospacer .. .. . *****.**********.*******
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
2000984 : 2059608
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_019776|2000984:2059608|DBSCAN-SWA TATGTTTGAACGCTTCACAGAAAAAGCGATAAAAGTGATTATGTTAGCCCAAGAAGAAGCTCGTCGCTTGGGTCATAACTTTGTTGGTACTGAGCAAATACTGCTCGGTTTGATTGGAGAAGGCACTGGAGTAGCGGCAAAGGTGCTCAAATCGATGGGAGTTAATCTCAAAGACGCTCGGATTGAAGTAGAAAAAATTATTGGGCGTGGTTCTGGTTTTGTAGCGGTAGAAATTCCATTCACTCCAAGAGCGAAAAGAGTCCTAGAATTATCTTTGGAAGAAGCTCGTCAATTAGGTCATAATTACATCGGTACAGAACATTTGCTTCTCGGTTTAATTCGTGAAGGAGAAGGGGTTGCCGCTAGAGTTTTAGAAAATCTGGGAGTGGACTTAGGTAAGGTTCGCACTCAAGTAATTCGGATGTTAGGTGAAACAGAAACCACTGCAGTAGGTGTGGGTGGTGGTAGTCGCTCTAATAAAACTCCTACTTTGGATGAATTTGGCTCTAATTTGACGGTTTTGGCGGTGGATGGGAAATTAGATCCTGTGGTTGGTCGTCAAAAAGAGATTGAACGGGTAATCCAAATTTTGGGTCGTCGCACTAAAAATAATCCTGTGTTAATTGGTGAACCCGGGGTTGGTAAAACTGCGATCGCAGAAGGTTTAGCTCAACGTATAGCGAATAAAGATGTTCCTGATTTATTGGAAGAAAAAAGAGTTGTCACCCTTGATATTGGTTTATTGGTAGCTGGTACGAAATATCGTGGTGAGTTTGAAGAAAGACTCAAAAAAATCATGGATGAAATCCGTCAAGCAGGAAATGTTATTCTTGTAATTGATGAGGTTCATACTTTAATTGGTGCTGGGGCGGCAGAAGGTGCGATCGATGCGGCGAATATCCTCAAACCTGCTTTAGCTAGAGGTGAGTTACAGTGTATCGGTGCCACCACTCTTGATGAATATCGTAAGCATATTGAAAGAGATGCGGCTTTAGCAAGACGTTTTCAGCCCGTCATGGTGGGTGAACCTAGCGTAGAAGAAACCATCGAAATTTTATTCGGGTTACGGGAAAAATATGAGCAACATCACAAGCTCAAAATTGCTGATGAGGCTTTAGCGGCGGCGGCTAAATTGTCTGATCGTTATATCAGCGATCGCTATTTACCAGATAAAGCTATTGACCTTATTGATGAGGCTGGTTCAAGAGTACGCCTCTTAAATTCTCAACTTCCTCCCGAAGCAAAAGAATTAGACCAAGAATTGAGACAAGTTCTTAAAGAAAAAGATGAAGCGGTGAGATCCCAAGATTTCGATAAAGCAGGAGAATTGCGCGATCGAGAAATGGAGATTAAAGCCGAAATCAGATCTTTAGCAGATCAGAAGAAAAAAAGTGCCGACATTAACGATAATCCCATTGTCGATGAAGAAGAAATAGCTCATATCGTTGCTTCTTGGACTGGTGTACCCGTTCAAAAATTAACCGAATCTGAAGCTGATAAACTCTTACACATGGAAGAAACTCTCCATCAAAGAATTATCGGTCAGGAAGACGCTGTAAAAGCTATTTCTCGTGCTATTCGTCGTGCTAGAGTGGGCCTGAAAAATCCTAACCGTCCGATCGCATCTTTCATCTTTTCTGGTCCCACTGGTGTAGGTAAAACCGAACTTACCAAAGCTCTTGCAACCTACTTCTTTGGCTCAGAGGATGCAATGATTCGCTTAGATATGTCAGAATTCATGGAACGCCATACTGTTTCTAAATTAATTGGCTCTCCTCCCGGGTATGTAGGTTATAACGAAGGAGGACAGCTAACAGAAGCAGTTCGTCGTCGTCCTTATACTGTAGTGCTTTTCGATGAAATTGAAAAAGCCCATCCTGATGTATTTAACCTACTACTACAAATTTTAGAAGATGGACGCTTGACCGATTCTAAAGGTCGTACCGTTGACTTTAAAAACACCCTCTTAATCATGACCTCGAACATCGGTTCAAAAGTCATTGAAAAAGGTGGCGGTGGTTTAGGATTTGAATTGGAAGAAGATCAAAATGAATCTCAATACAATCGCATTCGTTCTCTAGTTAACGAAGAATTGAAAAACTACTTCCGTCCAGAGTTTCTCAACCGCTTAGATGAAATAATCGTCTTCCGTCAACTCAATAAAGAAGAAGTAAAAGAAATTTCGGAAATCTTGTTAAAAGAAGTCTTTGCCCGTTTAACTGAGCAAGAAATTACCTTACAAGTAACCGATAAATTCAAAGAGCGTCTAATCGAAGAAGGATTTAACCCTGCTTATGGAGCTAGACCTTTACGTCGTGCTATCATGAGACTACTTGAAGATATTTTAGCAGAGGAAATTTTATCTAAACGTCTTCAAGAGGGTGACTCTGCTATTGTGGATATTGGCGAAGATGGAAAAGTCATCATCAATGCCCAAAGAGAAAATCCTTTATTAGCAAAAGCTAACTAAATTTGGCTTTAGGGTTCGGAGTTAGGGGTTAGGGGTTAAAATAACTAGATAACCTGAGTTTGGGATAAATTTTCATCTATGAGTGATAGGGAAAAGGGCAATGGGCAAGAGGCAAACCCCCCTTTATCCCCCCTCGAGAGGGGGAGGGCAAAGGTAAATAGTTGAGTTCATAATTAAGAATTAAGAATTAAAAACTCCGAACACTTATTATTTATTACTTGTTTCCTCCTCTCCTCTCATCACCCTTTGTCTCTACTCATTACTCCTTACTGATTACTCATTACTTTCTCCGAAACGCCTAATTATAAGAAATTATCTTTATTTTCTCTTTGTTGTAATAATTTGAGAGCTTTTTTAATATCCTGTGTTTTATTTTTATGGGCAATTAGAGTGGCATTTCCTTCCCTAACAATAACTAAATCTTCTACCCCAATCGTCATGACAATTTCGTCAGACTGATTGTTATAAATAATATTATTTTCGCTATCTTGATTAAGAGAATCTCCCACCAGAATATTGTTATTTTCCTTTGCCAAAAGTCTTTCTAAAGCATTCCAATCTCCTAAATCATCCCAACCAAATTCGGCCCGAATCACGTAAGCTAAATCAGTTTTTTCCATTAAGGCATAGTCAATACTAATTTTTTCTAACTGTGTATAAGCTGACTTTCCCTTTTCTTGTAAAGGTTGTAAAATTTGCGGTGCGTGTTTTTGTAATTCTTCTAACACCACTTCTACAGGAAAAATAAACATTCCACTATTCCAACTATATTTTTGCGTTGCAATAAACTCTTTTGCTGTCTTCTCGTCAGGTTTTTCAGTAAAGCGAGTTACTCGATAGAAGGAAATACCATCATTTTCTTCTTGTTTCTCCCCTTGTTCAATATAACCATAACCGGTGGAAGGATAGTCTGGTTTAATTCCTAAAGTGATGATACCTTGCTTTTCTTGAGCATATTTTATTCCAGTCTCAATGATTTTCTCAAATTGTTCTTGATTCCCGATATAATGATCCGCAGGAAAAAAAGCTGTAATTGCATCTTCACCATAGCGACGCTTTACTTCTAAACTAGCCCATGTAACAGCGGGGGCTGTATCTTTTGCTGTGGGTTCAACTAAAATATTATCAGGTGGCAATGAGGGTAACTGCTGTTTCACCCCTTCCGCTAATAACTCAGAGGTGATAACCAATAAATTTTGCCAACCTCCTGCTAGGTTTAATAAGCGATTTGCGGTGGTTTGCAATAAACTTTCATCACTGTTATCCAAACACAGAAACTGTTTTGGACGTTGTAAACGACTTAAAGGCCAAAATCTTTCTCCTTTTCCTCCTGCTAAAATAACAGGTATAAATTTGTTATTTCTCATAATTAAAAATGTTTGCTGATTCTATATAAAATCTAAATCAAATGAAATTGGAAGGGTAAAAAATAAATAATAATTCTTGCTTATAAATGTTCAATTATTTATCATACTTGTTCATAAGTCTAGCTATAAGCCCGAAATGCTCAGAAAAATCGAATTCTTTACCAGATGTCTATTTCCCTCTTCCAGAAAAATTGTAATTGAATTTGTCAAGAAATTCTTTTTGACGAAGTCATTTAAGGTCACTATAGTATGGTATATGTATCAGTGATCTAAACCACAAAAACAACCTCAATTTTTGAACCCGAAAATAAATTGGCACGTCAATCCTATAATTCTAAATCTAAAATAAAAAAAACCTATTCTGTGAAAAAATCAGTTTCTCCTTTATTACAGGGCTTTATTTGGGGAGGATGTTTTACCCTCACTGCGGCTGTTTCGGGTTTTGTGGGTATGACAGTGGCATTGAAAAGCCCTTTGCCTGTAAATATAGAGCCTTTTACGGAAAAGTTACAGGCTTTGAAACGTTTTGGTTTGTCAGCGTTATTTACGTCACCTCTTGAGCAGTCAACTAATATCTTAGTAATGGGTATTGATAGAGTGCCTAATGCCGAGGGTATAGATAAATTTACCGGTCGTAGTGATACAATGTTACTGGTACGTTTAGAACCTGAAACTCATACCTTAAAAATGCTATCTATTCCGAGGGATAGTCGTGTGCGTTTACCAAATGGGGCTTACACAAAGATTAATGGGGCAAATGCAAGAGGGGGAGTGCCTTTAGTTAAAGAGGTTATTCAAGATAATTTAAACGGTGTTACAGTAGATCATTATATCAGGGTGACTACTGACGCATTTAAAAAGTTAGTGGATTTGGTTGGGGGTGTGGAGGTTTATGTGCCTGTAGATATGCAATACATCGATCGCACTCAAGGATTGTATATTGATTTAAAACAAGGAAAACAAGTCTTAAATGGAGAAGAAGCAGAACAGTTTGCTCGTTTTCGTCAAGATAATTTAGGTGATATAGGTAGGGTACAACGACAACAAATACTGTTGAAAGCATTGGGTGACAAGATGCGATCGCCCCAAATGATATTTAAAACACCGCAAATAATTGACTTATTGCAAGAAGAAATAGATACAGATTTAACATCTTCACAAAT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46 | Bacillus_phage(27.27%) | protease,bacteriocin,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
2767974 : 2779672
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_019776|2767974:2779672|DBSCAN-SWA 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ACTTTCATAATGAATTTTTCTAGCTAAATAAATAAGTGCGAAAAAAATAAAAGAGCAATGGGCAATGGTAAGTAGTGAATGGTGTTGGGGTGAATAGTGAATGGTTGATAATTAAGAATTAAGAATTAAGAATTAAAAACTCTGAACACTCATTACCTTCTTCTAAAACCTAAAACCTAAAACCTAAAACCTGCAACCTGAAACCTGAAACCTGAAACCTGACACCTCAAAACCCTAAGCCCCTACTTCCCTAACACCCTACCTAACATCTCAAATTAAGTTCCCACTGTCCAAGAGTTCATATACTCAATTTGTTCAGGGGTTAAAGAGTCGATATTAATACCCATTCCTTGTAATTTCAAAGCGGCAATTTCTTGATCCACTTCGGTAGGAATAGAATGAATACCGGGTTGTAAAGTCTCTTTATTTTTCACTAAGTATTCACAAGCTAAGGCTTGGTTAGCAAAGCTCATATCCATTACCGCACTGGGATGTCCTTCGGCGGCGGCTAAGTTGACTAAACGTCCTTCGCCAATAACAATTACGGATTTACCGTTTTTGAGGATATATTGTTGAGTAAAGTTACGAACTTCTTTGATTTCTGTGCTGAGAGTTTTTAAGGCTTCTAAGTCGATTTCGATGTCAAAGTGACCAGAGTTACAAACCATTGCACCATCTTTCATTACGGCGAAATGTTCTTCTCTGATGATATGTTTATTACCTGTTACGGTTACGAAAACATCACCAATGGTGGCGGCTTCAGCCATAGGCATTACACGGAAACCATCCATTGCAGCTTCGATCGCTTTTACGGGGTTAATTTCAGTTACGATAACATTGGCACCCAAACCACGCCCGCGCATGGCGACACCTTTACCGCACCAGCCATAACCAGCAACCACAAGGTTTTTACCTGCTAATAAAACGTTAGTTGCACGGATGATACCATCAAGGGTAGATTGACCTGTACCATAACGGTTATCGAAGAAATGTTTGGTTTCTGCGTCATTGACATTCATGGCGGGGAAGGTTAGTACACCATCTTTAAACATTGCCTCTAAACGGACAATACCAGTGGTGGTTTCTTCAGTAGTACCAATTAAGTCCGCTAGTTGATGTTGTCTTTCTTTAACAAGGGTAGCTACTACGTCAGAACCGTCATCAATGATAATATTGGGTTTATGATCCAATGCGGTTTGTACGTGACGATGATAAGTAGCGTTATCTTCCCCTTTGATAGCAAATACGGGAATACCGTAGTCTTTAACTAAACAAGCGGCAACGTCATCCTGAGTAGAAAGAGGGTTACTAGCGATTAAAATAGCATCTGCACCACCTGCTTGAAGTGCGATCGCTAAATTTGCGGTTTCAGTAGTAACGTGACAACAAGCCACTAAGCGGATACCAGCAAAAGGCTTTTCTTGACGAAAACGCTCGGTAATTTGAGCTAAAACGGGCATTTCTCTTGCCGCCCATTCAATTCTCTGCTTACCGACACCAGCCAAGTTAATGTCCTTAATGTCGTAATTAATTTTTGTTGGTGTTGCAACCATTAGCAATTATGCTCAATAAAAGTTTACATTTTTCATCATACCCCATGTCGATCAGCTTTAACCTGAGTTCAATTTTTTAAACGCAAAAAATTTTAAACTGCCAGAAAATGGTTATTTTAGGGGGATTGAGAAGTTGGCAAATTAGGGAGAAACTAATTTTTAATAGCTAACTAACTGCTTAGTTGAATAATGGTTTACCCCAAATAACAGTTTCCTTGCTATAGATAACCATTCCGGGTTTTGCTCCTTTTGGCTTATAAACATGGTTGGGATTAGTGTAAACTACAGGCACTTGTTCGCTTTCTCTACCTTGACTGTAATAAGCGGCTAAGTTGGCAGTGAATTGTAAATCTTTTTCTTCTGGTGCATCTCCAGCGTTTAAGCGTAATAAAACATGAGAGCCTGAGATTTCTTGTGCATGAAACCATAAATCATAATCAGTAGCAGTTTTGAAGGTTAGAATGTCATTTTGACGATTATTTCTCCCGACTAAAACTTCATAACCTGATGGTGTTTGATAGCGTCTCGGTTGAGATTCTTCTTCACTGTTGTGATTATTTCGATACTGTTTATCTTCTATATATTTCTGATTGATTAATTCTGATTTAATCTCTTGAAGAGTTGTTAGATCGTCTTTTTCTTGATAGTCTAATTGTTGCAAATTTATTGCTATTTGTTCTAAATAATTTACTTCTTCATTCACTTCATCCAATAAGGGCTTTACTGCTTGTTTTGCTCTTTTTAATTTTTGATATTTTTTATACAATATTTGGGCATTTTGAATTATATTTTTGTCAGGAGCTAAGTTAATTTTTACGGGTTCTCCAGTGGTAAAATCGTTAAGAGTAATTTCTTTCATTCCTACTTGCCATTGATTTAGGTGAGCCATTAATAAATCAGCTTTGTTACTATATATTTCGCAGTTATCAGATTCTTTTATTTTTTCTAAATATTTATTTTTTTTTGTTTTTAATTTCTTTAATATATTTTTTATTTTTTGTTGTAGTTGTTGTTTAAGTTGAATAAAATTTTCTTGATATATTTTTTGGTTATAGTATTCGTTAATAACAAAATTAATATTTTCTGCTTGCTTTGGCTCTCCTAAAACTGTATATCCTTCGGATGTTAAATGAGAATAAAACTGATTTTTTTCTATAGATGTTAACCAAGTTTGCCAATTTTGATATAATTCTTTCCACTCATTTTGTGTTAATTCTTGATTAGTTTTACTTAAATCTATGTTACTTTTGTGCAATAAATCCTTGGCAATATTCGGACTAATTCCTCGATAACTTTTTATTAATTGTTTATCTATTCTTCCGGGTATTAAACTAACTTTTTCTTGCCATGTTTCTTGGGATTCTTCTAGTTTGGGAATATTTCCTGTTAATGGTGGGGGTAGTTGATAAATTTGACTGGTTTCGACGGTGCGCAGGGTGGATTTGTCGGCGGTAACTTGTTTGGCAACGGTGATAATTTGATTGTCGGCATTGGTGAGAATAACATTGCTATATTTGCCCATAATTTCTACGTAGAGATGATTTAAGGGGGATTCATTGGGGCGTTGTGCAAATTGAAAATCAATAACTCTTTCCCAATCACTTACTATTTCTATCCCTATCAAAGCATAACCATTTATTAAGTGTCTGAGTTGATCGCTAAAAGTAAAAGTATCTTTACCACGAGGAGGCGGATTACCAACGCAAATTCTGGCGGCTTGGGGATGCCATGAAATGGTTAACCATGATTTTTTCTCAATATTTCTCAAACAAAGACTAATAGAGGTGCGATCGCACTGGTAAACTTGTTCTAAGCGAGAGGGAATATAATTTTCTTGGAGGGAATAACAAACGGCTTTCAGGGTTGTGTAGTCAAAAGGTTGCATGGATGAGTAATGGAGAGTAGAAATATGAATTATTGGGGGATTAAGGTTTTAGGGGGAAATTTTTAATTGTTAATTATCTTCAAATTTGTAGCCTACACCGACAACGGTTTTAATAAAAGAAGGTTGAGCAGGATTAGGTTCAATTTTTTTGCGTAAACGGCGAATGTGAGTATCAACGACTCTTTCATCTCCAAAAAAATCTGCTCCCCATAGTTTATCAATTAACTGCTCTCTACTCCAAACTTTTCCAGGATAACTAATGAAGGCAGAAAGTAGATTAAATTCAAGGGCGGTTAAGTCTAATTCTTCCGGGGGTTGATTCTCTAGTTTGCGGGTGGCGATATGTTCGTCTAAATTGAGTATAAAGTGGGGGGTTTCATATATTTGTGACTGTTTTTCGTGGCGTAAACTACGGCGTAGCAATGCCCTAACTCTGGCAACTAATTCTCTGGGGCTAAAAGGTTTTACTAAGTAATCATCTGCCCCTGTCGATAAACCAATGATGCGATCGAGCTCTTCTCCTTTTGCAGTTAACATGAGAATATAAGGGTCTTTTGTCATGCCTTGATTACGAATGCGAGTACACACTTCCAATCCATCTAATTGGGGTAACATCAAATCGAGAATAATTAAGTCTGGTTGAATAGTTTGAGCCTGTTGAAGGGCAGTGACTCCATCATAAGCATGATGACAAGTAAAACCCTCTCGACTTAAACAACTATTAATCAATTGGGCGATTTCCCTTTCGTCTTCAACAATTAAAATTTCCATCTTTATAAATTAGGCTACTGCATATCTTCTATTTACAGGTGAAGACAGGGGGATGAGGAGAGAGGGAGAGGTTAATTAAACACTTTTGCCCTCCCCCCTCTTGAGGGGGGATAAAGGGGGGTTTCCTTTAAGGAGAGACACAGAGGAGTTTCCCTTTTGCCTTTTGCCTCTTGCCTTACTTTAGATACCTATAACATACTTACGCCATTCATGGTTAAGATTATCTTTGGTACATTTAACAATTTCAAAGTGAAGACTACTATAAGGCTTTCTCGGTGATTTGTGTAACGGCATATGAGCTTCTTTTGGAGTTCTATTTCCTTTTTTTATATTACAACGCACACAAGCGGTAACAAGATTCTCCCAACTGTCTGCACCTCCACGAGAACGAGGTAGAATATGGTCTAAGGTTAATTGATCTCCTCTGTAACCACAATATTGACAAGAATGGCGATCGCGCTCTAGGATATTTCTTCTAGTTAAAGGAATATCTTTATAAGGTACTTTGACATAGTGACGTAACCTAATAACTGAAGGAAAGGGAAAAGTCGGATAAATAAAATTTTCATAATGTTCTAACTGTTCGGCTTTTCCTTTGAGTAATAAAATAACCGCTCTTTTCCAGTTAGTAATATTAAGCGGTTCATAGGAGGCATTCAAGACTAAAACCTTACCCATAAACGTATTTTCTTAAATATTTTATTGCTGATGGTAGCACAAATTTTCTGAAAGTGACTATTAATCAACTTTTTCAGCGATAGATTCAGAAAAAATCCATTTTTCCAGTCATATTTTTGATAAACTTTCTAATAGATAATTTAAGAAATATTTTTATTGAGGAAAAAAATAAATGGTAGAGCCTTTATTACTTGGTATTGTTTTAGGTTTAATTCCTGTAACCTTAATTGGTTTATTTTTCGCCGCTTACCGTCAATACAGACGTAGCAGTGAAATTGGACTCGAATAAACATTCATAAATCTTTCAACTCTTATCCCCTAACTCCTGTACGGGCGAATGGCCATTCGCCCCTAACTGACTCCTAACCCCGAACCCTAAATCCTTAATTTATGATTATTTTCTGGCATCGTCGAGACTTAAGAATTAACGATAATATCGGTTTAGCAAAAGCCTACACAAGAGATAAAAAAGTTATCGGTGTATTTTGCTTAGACCCTAATATTTTAAATAGAGATGACATCGCACCTGCCAGAGTCAAATACTTATTAGGATGCCTAGAAGCATTAAAAACTAAATATCAAAAACTCGGTAGTGATTTATTAATTTTTCATAACACCCCAGAAGAGATTATTCCTTCCCTTGCAGAAAAACTCAAAGCTGATGCGGTTTACTGGAATTTAGACGTTGAACCTTTTTCTCGCCACAGAGATAAAAATGTTAGTCAAGCATTGAAAGAAAAATCCATCGAAACTCAAACTTTTTGGGATCAACTTTTACATTCTCCCGGGGAAATTCTCTCTAAAAGTAATCAAACGGCTTATACTGTTTACACTCCCTTCTGGCGCAACTGGGAAGCACAGCCTAAATCATCTCCCGTTGACTCACCTCAACAACTCACAGGTTTAAATGATTTAGAAAAAACCATTGTCAAAGAATTAGGCACTATTAATATACCTTCTCTTAATGATTTAGGTTTCCCATGGGATGCAGATTTGCCTTTGTCGCCCGGAGAAGAATCCGCCCTCGAAAGGTTAGAGTATTTCTGTCAATCTCTTATTTATAATTATGAGTGCGATCGCAATTATCCCTTTCTTGACGGCACATCTCAACTAAGTGCCGCCCTAAAATTTGGTGCAATATCTGTAAGAACTATTTGGAAAAAAAGTCAAGCAGAATTAACAAATTGTAATAGTGACGAAGCTAGAGAAAATATTATTGCATGGCAGAAAGAAATTGCGTGGCGAGAATTTTACCAACATTGCTTATACTTCTTCCCTCAATTAGCAGAAGGAGCATATAGAGAACAATTTAAACAATTCCCTTGGGAAAATGATGAAAAAAAATTTCAAGCATGGTGTGAAGGTAAAACAGGTTATCCCATAGTTGATGCGGCAATGAGACAACTCAATGAAACAGGATGGATGCACAACCGTTGTCGGATGATTGTGGCTAGTTTCCTTACCAAAGATTTAATAATTGATTGGCGGTGGGGAGAAAAATATTTTATGCAAAAACTCTATGATGGCGATTTAGCCGCAAACAATGGCGGTTGGCAATGGAGTGCTTCTAGTGGAATGGACCCCAAACCTTTAAGAATTTTTAACCCCGCATCTCAAGCTCAAAAATTTGACCCAGAAGCTGAGTATATTCGCACATGGCTACCAGAAATTAGACATTTGGATACTAAGGATTTGGTGACAGGAAAAATATCTCCTCTCGAAGCGAGTAGTTGTGGTTATCCCTTACCCATAGTTGATCATAGTCAACAACAAAGAGAATTTAAAAGGCTTTATCAATTAGTGAAGGGTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_019776|2767974:2779672|2776480_2777182_-|WP_015220134.1|DBSCAN-SWA MEILIVEDEREIAQLINSCLSREGFTCHHAYDGVTALQQAQTIQPDLIILDLMLPQLDGLEVCTRIRNQGMTKDPYILMLTAKGEELDRIIGLSTGADDYLVKPFSPRELVARVRALLRRSLRHEKQSQIYETPHFILNLDEHIATRKLENQPPEELDLTALEFNLLSAFISYPGKVWSREQLIDKLWGADFFGDERVVDTHIRRLRKKIEPNPAQPSFIKTVVGVGYKFEDN >NC_019776|2767974:2779672|2772483_2772981_-|WP_015220131.1|DBSCAN-SWA MKVFSCIVGFILSILLLLTPNHVLAASSSAVTSTIDNKDLSQQDFSSQNLQSMEFSNVKLNGANFSNSDLRGAVFNAARLEEANFHGADLTNGFIYVTSLNRADLTDAILREAIMKRTTLKGANVDGADFTFAVLDNEQVIELCKNAQGINPVTGASTRQSLGCP >NC_019776|2767974:2779672|2778032_2778149_+|WP_015220136.1|DBSCAN-SWA MVEPLLLGIVLGLIPVTLIGLFFAAYRQYRRSSEIGLE >NC_019776|2767974:2779672|2774704_2776411_-|WP_015220133.1|DBSCAN-SWA MQPFDYTTLKAVCYSLQENYIPSRLEQVYQCDRTSISLCLRNIEKKSWLTISWHPQAARICVGNPPPRGKDTFTFSDQLRHLINGYALIGIEIVSDWERVIDFQFAQRPNESPLNHLYVEIMGKYSNVILTNADNQIITVAKQVTADKSTLRTVETSQIYQLPPPLTGNIPKLEESQETWQEKVSLIPGRIDKQLIKSYRGISPNIAKDLLHKSNIDLSKTNQELTQNEWKELYQNWQTWLTSIEKNQFYSHLTSEGYTVLGEPKQAENINFVINEYYNQKIYQENFIQLKQQLQQKIKNILKKLKTKKNKYLEKIKESDNCEIYSNKADLLMAHLNQWQVGMKEITLNDFTTGEPVKINLAPDKNIIQNAQILYKKYQKLKRAKQAVKPLLDEVNEEVNYLEQIAINLQQLDYQEKDDLTTLQEIKSELINQKYIEDKQYRNNHNSEEESQPRRYQTPSGYEVLVGRNNRQNDILTFKTATDYDLWFHAQEISGSHVLLRLNAGDAPEEKDLQFTANLAAYYSQGRESEQVPVVYTNPNHVYKPKGAKPGMVIYSKETVIWGKPLFN >NC_019776|2767974:2779672|2767974_2771709_-|WP_015220130.1|DBSCAN-SWA MSINNVNSQSLTLLFNSYFPRNTQKIISENKQKSVNNNFLNQYQLSLIDKFVDGIALLIDEKFVYLNQAHLSLFGYNQEELLGRSWLSLYNSAEGLRIQEEIFPILREKGFWRGEAKGLRKDKTEFWQEVSLQLIDSQTLICNCRDITERKIMEQDLSRSHDLLTIIENAQSQFIANGDKGLLFDHLLENLLTLTGSEYGFISELDYNTDGKIEFGDSYMKNIGKPFLKVHSISNVAWNEETIRLYEETQGRGMEFHNLNTLFGAVIYTGKPVISNHPSKDKRSGGTPQGHPPLNSFLGIPFKSHGQLLGMVGIANREGGYSEELVEYLQPFVSVCSNLIDAYKIEKRRLESEKQLRENQIALRQQERVIKNLYQICSSPQLNFKQKLQGIFTLGRKAFNLDVAMLTNIDDSYCRIVQWQSSPKYREIFNREITLNLEDSFCFLAYQKKEPFSIDHVSNSSYIRHPAHVNLSIESYLGTRVEVFGKSIGTLCFFSLDSHGVKITSIMKEQIKLMAQWIGYELEKEKSEALIQHQFKQEILLKKITQEIRQTLNFDQLFDTAAKTILNAFQVNRCHLFTYDKSQSSCLTMVAEAITGDFPPMWGANIDLSEGNDHFNQVIMSDRALVNNNVYQDPLLQPMTPFCQEIQLKSMLCVRTSYKGEANGIIGLHQCDRFRQWTSEEINLLQSVAEQLGIAISQVKLLEQEKQQKQQLEKQNQALLKAEKQAKEASEAKTEFLASMSHEIRTPMNGIIGMTELLLDTQLNSEQKNFVEIINHSSNTLLTIINDILDLSKIESKKIDLESTTFNIHECLESVISLMELQAEKKGINLIYIANPQDNYWFKGDVTRLRQVVLNLVSNAVKFTHQGEVIVRLNVASQELDSCYLKIIVEDTGIGIPQDRRESIFQAFSQVDASTTRQYGGTGLGLTIARKLVELMGGSLTVSSIVGKGSKFCVSLTLEKTNDENDQYLSLKQQNHLRGKKALIIADSSVMAEMLSLQALALGLESQICHSANFSTDQLHQVAVVIADYPLQHLNRFDLAESLRLSHPNLALIWLTPLSLVTKENLAQTCPFVTVITKPVKQFQLCDTIQKLLIKNEIVSNNSIFISPKQQNLIHKDISILLVEDNLVNQKVARLMLNKLGYRWIEIANNGLEAIKMIQNKTYQLIFMDMQMPLLDGVATTKEIRKLGNQIQQPWIIAMTASALSTDRDSCLEIGMNDYLSKPVKSDTIIQALKRFESLSCLAS >NC_019776|2767974:2779672|2778250_2779672_+|WP_015220137.1|DBSCAN-SWA MIIFWHRRDLRINDNIGLAKAYTRDKKVIGVFCLDPNILNRDDIAPARVKYLLGCLEALKTKYQKLGSDLLIFHNTPEEIIPSLAEKLKADAVYWNLDVEPFSRHRDKNVSQALKEKSIETQTFWDQLLHSPGEILSKSNQTAYTVYTPFWRNWEAQPKSSPVDSPQQLTGLNDLEKTIVKELGTINIPSLNDLGFPWDADLPLSPGEESALERLEYFCQSLIYNYECDRNYPFLDGTSQLSAALKFGAISVRTIWKKSQAELTNCNSDEARENIIAWQKEIAWREFYQHCLYFFPQLAEGAYREQFKQFPWENDEKKFQAWCEGKTGYPIVDAAMRQLNETGWMHNRCRMIVASFLTKDLIIDWRWGEKYFMQKLYDGDLAANNGGWQWSASSGMDPKPLRIFNPASQAQKFDPEAEYIRTWLPEIRHLDTKDLVTGKISPLEASSCGYPLPIVDHSQQQREFKRLYQLVKG >NC_019776|2767974:2779672|2777362_2777860_-|WP_015220135.1|DBSCAN-SWA MGKVLVLNASYEPLNITNWKRAVILLLKGKAEQLEHYENFIYPTFPFPSVIRLRHYVKVPYKDIPLTRRNILERDRHSCQYCGYRGDQLTLDHILPRSRGGADSWENLVTACVRCNIKKGNRTPKEAHMPLHKSPRKPYSSLHFEIVKCTKDNLNHEWRKYVIGI >NC_019776|2767974:2779672|2773248_2774526_-|WP_015220132.1|DBSCAN-SWA MVATPTKINYDIKDINLAGVGKQRIEWAAREMPVLAQITERFRQEKPFAGIRLVACCHVTTETANLAIALQAGGADAILIASNPLSTQDDVAACLVKDYGIPVFAIKGEDNATYHRHVQTALDHKPNIIIDDGSDVVATLVKERQHQLADLIGTTEETTTGIVRLEAMFKDGVLTFPAMNVNDAETKHFFDNRYGTGQSTLDGIIRATNVLLAGKNLVVAGYGWCGKGVAMRGRGLGANVIVTEINPVKAIEAAMDGFRVMPMAEAATIGDVFVTVTGNKHIIREEHFAVMKDGAMVCNSGHFDIEIDLEALKTLSTEIKEVRNFTQQYILKNGKSVIVIGEGRLVNLAAAEGHPSAVMDMSFANQALACEYLVKNKETLQPGIHSIPTEVDQEIAALKLQGMGINIDSLTPEQIEYMNSWTVGT |
8 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019777_1 | 14244-14663 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_019777_1
|
5 spacers
spacers of NC_019777_1
>1.1|14281|47|NC_019777|CRISPRCasFinder AGGTAAAAGAACTTATCTTGATCCCTCGTATGTCTATAAATGCTTAA >1.2|14365|37|NC_019777|CRISPRCasFinder TCCTTCAGTTTGAGTCTGATACAGTTCCTTGTACCAA >1.3|14439|39|NC_019777|CRISPRCasFinder TGCCATTAATGATTACAGCTGGGAATAGTTTAGGCAAGA >1.4|14515|38|NC_019777|CRISPRCasFinder CCATATCATCAAAGCGGCGTGTGAATAAAGTAAATGCC >1.5|14590|37|NC_019777|CRISPRCasFinder GTGAAGATGACGTCATCTTGATTAACTCCCACCAAAG >1.6|14281|48|NC_019777|CRT AGGTAAAAGAACTTATCTTGATCCCTCGTATGTCTATAAATGCTTAAC >1.7|14365|38|NC_019777|CRT TCCTTCAGTTTGAGTCTGATACAGTTCCTTGTACCAAG >1.8|14439|40|NC_019777|CRT TGCCATTAATGATTACAGCTGGGAATAGTTTAGGCAAGAG >1.9|14515|39|NC_019777|CRT CCATATCATCAAAGCGGCGTGTGAATAAAGTAAATGCCG >1.10|14590|38|NC_019777|CRT GTGAAGATGACGTCATCTTGATTAACTCCCACCAAAGG >1.11|14366|37|NC_019777|PILER-CR TCCTTCAGTTTGAGTCTGATACAGTTCCTTGTACCAA >1.12|14440|39|NC_019777|PILER-CR TGCCATTAATGATTACAGCTGGGAATAGTTTAGGCAAGA >1.13|14516|38|NC_019777|PILER-CR CCATATCATCAAAGCGGCGTGTGAATAAAGTAAATGCC >1.14|14591|37|NC_019777|PILER-CR GTGAAGATGACGTCATCTTGATTAACTCCCACCAAAG |
DEDDh,WYL,cas10,cmr3gr5,cmr4gr7 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019777_1
The CRISPR arrays of NC_019777_1 >merge|NC_019777|1|14244-14663|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTATCTATATTTCCACTACCCCGAAGGATAGCGATAGGTAAAAGAACTTATCTTGATCCCTCGTATGTCTATAAATGCTTAACGTTTCCATTAATTCCACTACCCATAAGAGTAGCAATTCCTTCAGTTTGAGTCTGATACAGTTCCTTGTACCAAGGTTTCCATTAATTCCACTACCCATAAGAGTAGCAATTGCCATTAATGATTACAGCTGGGAATAGTTTAGGCAAGAGGTTTCCATTAATTCCACTACCCATAAGAGTAGCAATCCATATCATCAAAGCGGCGTGTGAATAAAGTAAATGCCGGTTTCCATTAATTCCACTACCCATAAGAGTAGCAATGTGAAGATGACGTCATCTTGATTAACTCCCACCAAAGGGTTTCCATTAATTCCACTACCCATAAGAGTAGCAAT >NC_019777|1|1|14244-14663|CRISPRCasFinder TTTTATCTATATTTCCACTACCCCGAAGGATAGCGAT AGGTAAAAGAACTTATCTTGATCCCTCGTATGTCTATAAATGCTTAA CGTTTCCATTAATTCCACTACCCATAAGAGTAGCAAT TCCTTCAGTTTGAGTCTGATACAGTTCCTTGTACCAA GGTTTCCATTAATTCCACTACCCATAAGAGTAGCAAT TGCCATTAATGATTACAGCTGGGAATAGTTTAGGCAAGA GGTTTCCATTAATTCCACTACCCATAAGAGTAGCAAT CCATATCATCAAAGCGGCGTGTGAATAAAGTAAATGCC GGTTTCCATTAATTCCACTACCCATAAGAGTAGCAAT GTGAAGATGACGTCATCTTGATTAACTCCCACCAAAG GGTTTCCATTAATTCCACTACCCATAAGAGTAGCAAT >NC_019777|1|1|14245-14663|CRT TTTATCTATATTTCCACTACCCCGAAGGATAGCGAT AGGTAAAAGAACTTATCTTGATCCCTCGTATGTCTATAAATGCTTAAC GTTTCCATTAATTCCACTACCCATAAGAGTAGCAAT TCCTTCAGTTTGAGTCTGATACAGTTCCTTGTACCAAG GTTTCCATTAATTCCACTACCCATAAGAGTAGCAAT TGCCATTAATGATTACAGCTGGGAATAGTTTAGGCAAGAG GTTTCCATTAATTCCACTACCCATAAGAGTAGCAAT CCATATCATCAAAGCGGCGTGTGAATAAAGTAAATGCCG GTTTCCATTAATTCCACTACCCATAAGAGTAGCAAT GTGAAGATGACGTCATCTTGATTAACTCCCACCAAAGG GTTTCCATTAATTCCACTACCCATAAGAGTAGCAAT >NC_019777|1|1|14329-14663|PILER-CR GTTTCCATTAATTCCACTACCCATAAGAGTAGCAATT CCTTCAGTTTGAGTCTGATACAGTTCCTTGTACCAAG GTTTCCATTAATTCCACTACCCATAAGAGTAGCAATT GCCATTAATGATTACAGCTGGGAATAGTTTAGGCAAGAG GTTTCCATTAATTCCACTACCCATAAGAGTAGCAATC CATATCATCAAAGCGGCGTGTGAATAAAGTAAATGCCG GTTTCCATTAATTCCACTACCCATAAGAGTAGCAATG TGAAGATGACGTCATCTTGATTAACTCCCACCAAAGG GTTTCCATTAATTCCACTACCCATAAGAGTAGCAAT
>NC_019777.1|WP_015221251.1|13828_14077_+|hypothetical-protein MNLIFIEARGGLTTSEQLLGVINQHPQGLGLTIKQLSYSINRPVSMINLCLKQLSSRKQVKIQLRGMQKLVYPYDSCNHLKI >NC_019777.1|WP_015221250.1|13018_13777_-|3'-5'-exonuclease MITRKYTLLLFDIKDSNSVKSKRQLTKKQKLGLEKGRIKREIKQFLNHEYDRILDYNRAVKWANKWRNDKFLILDTETTGLENTEIIEIAVINQDKQILINTLVKPACFIPYEVIKIHSITNEMVADAPCFTNIYDRLKEILSNQNVLIYNTSFDHPIINSECRRNELPRINFNSHCLMEMYAIFMGEYSGYYDDYKWQPLNGGHRALDDCLRAFEVLEEMADSTIDIVEYLYDIFSDSILTKEEICHCYQE >NC_019777.1|WP_015221249.1|11855_12935_-|MmcB-family-DNA-repair-protein MLDIDKLEKAEHQIEQLLITPESSWREVAKIAIVVRQKELFKQSGQTSFTAWVHHIAKKCDRQPSLIWRYIKAGKYYLYTVGSKEIEEIDHAVASPEALENLEKVERNAPAPVYEKLKQQVLEGNITVKETRAIEQQYRPLNAKTNRGRPTKGNEGKYEHLGLIGEKTIDNETKQISTQQIAPSIVRSLKINLVDWTKKCSQMRYPPKHYQDHTEVRINFEGKRLRIDFMTVIRWSYKRPKDVFIVEIKSSQQDFISDHKWHKYLNFCHYFCFAIPSQNLSLIKMIEETTNSEVGILLIDLMAEVNEHLSYPVEIYRYPKKLTPSSVSFIYETLYERVLNWSGSDEQDICINDENDTDS >NC_019777.1|WP_015221248.1|11483_11831_-|hypothetical-protein MDKLITNIASLGVSGLILLFLMFFSGYTGAAAITTALATLGGPLGMLGGIGVLLLLTKISEGIAEYGFENIAKGVVTEMRNKGKTKLEIVLEIEQFPLISVELKQKLIKFAKEYF >NC_019777.1|WP_041923004.1|10875_11325_-|hypothetical-protein MNPQMLHTACYRGFYSTYEIKDNQLLLQEMVVGEIKGQYPEINGVEPKQQDYGVYYENLRLLTDFTGVIRIAKELIDTLYIHMGYQKGTAYNTLLELKFQHGNLIDIRDLSKQNTRKRGAFKKSIEKTSPLNIIDNSFDLTFDDLLEEN >NC_019777.1|WP_041923002.1|9941_10508_-|hypothetical-protein MNKKYLIIIITFFISFIPNFIVLANNQNQEIIQEVYKNRKKINLCPDALVWDYAQTVSEVIKFNQQEYIVIFYCFLAAYQTNFSFVKYVKTNSGNQIELLKLDGFQENELGKLERTNVDNFAGFIYRDEKNPSILKIHTISGCAKNIGALATYKINGSNFTLLEYRAKTDCTDVFVEPENYPLIYRAK >NC_019777.1|WP_015221246.1|9001_9922_+|ParB/RepB/Spo0J-family-partition-protein MASKKTPLKTSLNNRIDALFGGDNQDLQSSQRPKTMAIDVLILPEYQPRQYFDSESISQLAESIKVHGILEPLLVRPAGEGKYEVVAGGRRYRAVQLLSLTEVPVIILNLTDDEALEIAILENLQRENLNPIEETEAILKLLSGKLNQDVQEVISLLYRLRNEGKEEFKRNVSPNSEIVETVFQTVGITAKSFVETRLPLLKLPSDILSVLRQGKIAYTKAIALSKIKDEQQREKLLKDAIELNLSVRQIKARIKELNKRETKDTPSIKIDITVKQMKKKKLWETEPKKWEKVEKLLEKINLLLED >NC_019777.1|WP_015221245.1|8059_8821_+|ParA-family-protein MKTNVIALFNQAGGVGKSTLTMNLGYALAKKKKKVLLLDLDPQASLTTFMGIEPHELDITVYDALVETFHLNIKNKIHGLDLAPTNINLSLAEMELVSALNREQRLKQVLFPILPNYDFILIDCPPSLGILSILALTAATHLLVPIETEFKSYFGTGLLLDTVARIRRHVNPDLDFAGFVPMKFDKRRSQHLRTYEQMKEELTKLGTVFTPIPDSTVFPDSTEERLPLALYKPKHPAVKVFNDIAKHLLQLNK >NC_019777.1|WP_015221244.1|6344_8048_+|ATP-dependent-helicase MKWSNYQQKIFESIAPSHNMLIEAVAGSGKTTTIIEIVKLLKKKGLVSRNNGNGLVCAFNKHIEVTLSQKIKGTKFVSKTLNAIGHGILVRHSYPRQIKINTNKYYSICEQVIDYFSPSYLFELKLKGLVNAEYKGKKNGVIGFERLKARRKSDYPYVFDEFNDFVQVVNTCRKEYSKHFLSIEDLQNLMAEYPLEISDYLKKKELHQTIAVEAINKALEYGINSYLNESTIDFSDQLWLPLTMGLFPITKYDWIIVDESQDLNLNQARLIKVLGKSSSTYIFVGDSKQSIYLFNGAKPDCMSLIKKYFNCNKYPLSLCYRCPPNHLKLAKEYNPQIEAFKQEDGLIKQLTITEVRDLVKGCYQTGTEILLISRLNYIFFDVLCQCAFGDKIKVSLLGKDLAGELVKLARQILPSRFTDFSKINQILNGYVEYYSEQMDSSKADYCKCLMSTWRYIEPSTINDLENVLNSVIISEGVIKFGSIHRAKGTESDHVVILGDNLLPYIPTNRELTSKETQQEENLTYVAFTRSKKNLYLVPYTNGNDEHREVELNLNDDNIFGADINYGF >NC_019777.1|WP_015221243.1|2622_5979_+|DUF3987-domain-containing-protein MKPIKEVTKQNPCPHCGKPDWCYSIGNLSVCNRDNPPADGWYQTNKTDRDGHFYYAPIHDLPEKQPKQSNTRTWEYLDPTGNKLVRVVRIDPQKIIWQEYWLEHPDLAKFRTEGYWVKLSQKDYDKGKCTQAQWELFNQLKEEKRQHIPIYRYHEIQKAISENKTIFIVEGESCADKLWELGIPATTNIGGSKKWRSSHTQDLLEGSRERSAVPSIVLCPDRDKPGVEHTERIYQDFPHAQWLYAFPLSPLWNVSLPHSNGLDIEDWIDELKHSYRLSDNQIVKTIYSSIENYRNLNSELNTDLFNQSLSVNNVNTLSSNSVGVGNSSVNKSVSTSINNHQQCQQMNEAELIAKLHEIIDIAPSKSTITVLFFQLSKSTGRSVNEIRKLYQDLIADIEKENDRPIVKQEIKQLLTLESTHLDLGDYLPIEMVKPLNHIAEILGSNSLSQLTALLPVVASIINPDTKLTLVKSSKFYARPIFYSAVVGESGCAKSPTIKIFTDPLTQYMQGKAENVYQHQLAEYEAIKADKSIDNKPPKPNAIEYYVSDVTSECLAQIINEQPHKGFLMYYDELSGLIKQNNAYRGGRGADQEKILSGRDGTGWKVNRKGGDRFHNSRSTYSILGAITPDILRQQMGTCQDESGYWARFCYSYLPMKKCKFPDNELNIDIYPMLCSLYENLERLPAYQYHLCPLGVNIYEDFFNEMEDNKINEPNQAMRTVYAKFKRVAGEIALLLQSLHKAFYHIDDENNEITYIDPEFVAMGVELAKRYISEIKAIYLRHEGSDEKNLSPIYSRIIMLSQRKGWLKARDLKQGDRYFRKLTTVEIRHHFQNLIDLGFGVIRGVGKAMEWCFSNSETESLHNLKKGEQKRVTQNLTSNKPEPYSYAYQPSPPNSELITHNSNYHSLTFNVDNVDEFVDNQNQPQNTENNKVKSVIPINIDNVDNYSNREIKTEKSELLKNELNNNKSEIIPNPHTQLSTTVNIEDSDSILSSNSFYEPSSPSDILQDKPTQGSELKSEPLAPQSPSLKSDSKPKTTKNSSLSHQHQNTNLSQSSINPKPRFDGGDKYEGLYAIVPVEYAKSQILVNLRQEKSYLIGKESGMTKWIKVPLSKVIEYRQK >NC_019777.1|WP_015221252.1|15243_15849_-|histidine-phosphatase-family-protein MTQRRKFLRLLAVSFIAIACGNQYPVVSQQNLSDDYLWSKLQEKGKVYVVLFRHAFAPGTGDPPNFSLNDCSTQRNLSSEGKAQAIRMGEAFKSRQINVTKILSSQWCRCLDTANLMNVGKVQSFPPLNSFFSTPSRLEEQTNQLRKFLLEETHQDGVIVLVSHQVNITAISDIFPRSGEGVVLHIDSNNNQIKVLGRIFP >NC_019777.1|WP_041923005.1|15857_16211_-|hypothetical-protein MIKIIDGLMEVPTVNDYTSALRKIEMTELQTELLRIQYSAPHHQIKLEDLAIAVSKPIETINAVYGNLAHKIKDLLAVEIIGEGYWKVLSIGYEQDNRYYWQMRNQVVYALRELNWF >NC_019777.1|WP_015221254.1|16328_17198_+|Abi-family-protein MLFNKSPKTIDEQIELLISRGMIITDHPKVHDVLTHVNYYRLGAYWLPFEQDHENHIFRSGTYFDDVLNLYIFDRKLRLLVLDAIERIEVSCRTQWAYFMAHNHGSHSYLDSTLARKESYWVSNLQSLENEVKRSKEVFIEHYKNKYTQPDLPPIWAVSEVMSLGLFSRWFTNLKPMATRKKIANQYNLDHEILASFLRHLTEVRNICAHHSRLWNRKFTVTLTIPKNPTYLAEKMNQNEKRRLYNTLVMLNYLLNFVSPNNSWYKQLIELIQEHQINHNLMGFTEKHS >NC_019777.1|WP_015221256.1|18354_18654_-|hypothetical-protein MKIDKCDRCQFYSNSPHLVCAVHPSGVDKDCLDYRLNPSYIFEEQWCPDGYVYYDGELIKLPDKPNKERQLWLLNNHPAFISNPLNCTWYNQEDVYLLS >NC_019777.1|WP_015221257.1|18761_19079_-|hypothetical-protein MTILYEDEYIICDDDALTILYYYFPFGDKRIPYKKINQVSTQEMTWWTGKARIWGGSLSYWLNLDPKRPCKDKLIIIDEGELTKPVITPDNPEQVYQILLSEVYS >NC_019777.1|WP_015221258.1|19635_20160_+|hypothetical-protein MTNQNENGCAGCLSLIIALFVVGLLVSYWQLVLAFVFVIFVFWVLFKIITSICHSVFGGRNTSSYRPMTTKFNSNDANTPFYTIDMKADAIDHPSASKTIKPKQKSSNLVKKDSPKTEIEMTVNTSNKSKLVKKNVQTNLTGDIDINIKDKKIKSVKYTKTTIEEVVYEIDTDD >NC_019777.1|WP_015221259.1|20250_22389_-|WYL-domain-containing-protein MLCHFLIGVPASGKSTFAQLLAKTGNYQIISTDTIRQQLYGDEVIQGNWLKIEDEVINQMKEAIALKQGIIYDATNAQRAWRMDLLSKIQKQIGKIDWLGWYLNLDLKIAQTWNSQRERTVPDNIIERMSDSLQQFPPHVAEGFINIVEIKQPQQCNLSFIEEKLNGLERCIINRNNRTKIENIILHRYSKLLDFDRLMHLISLLIAYPELGNLQYAYPDILEQIFGNPVTFDDSLSEISAVMAKLKGNIYADKLAIEKDLQFLINYGLIKHNITEPKYESSLTEINDNLDDIITHYASDKYTFERILNTIKTIADYPFLPNVKADFLNQLCPNEQSVKDSSKSNLSGHLTNLTYKLMKLEKCPDKHLKARRDLLRKDIQFILKPYQILPKTMRNGYFLGTGILSERELIETFRLLQTQAKNIDDPLALNLYNRFKDKMKWANFYDHYTYPVRVIANRSMIDIKSLDSKTLSNQTQRIQEIIEQGKLVTLNKFANRGSYEGEEKGAFCAWLLQIVFYNFAWYLGFEQEGGENHKLFRFERLDRLYIQKETDKTRTITEQKKALNKLTKLLSASYGLYLGNDVEQQKLFLSSDKQKAQETVELWFTEKIFGFIAEGTKRFPTQQMKMTKPPRSLSNSNSSLFSLSKSKNPQYPYRFQVTLPIWSLDEFDFIRWILGFGGEVKVHKPKKLQEKIITLSSNTIDVYQQQKIESVL >NC_019777.1|WP_015221260.1|22597_25675_+|type-III-B-CRISPR-associated-protein-Cas10/Cmr2 MARPYWQSKIWGLLHDPILKALSSSRDLSREGRWDLLKCMEGWHSPKDSSSQENFHREWLKRINLCDLIASASDRTTIGRLPPEHSSITYREEGLNVHHLLSGKPQQIIVDNWHSQLNNGKRKEFLENIEVEALQPILNWEDAEKVHWWLWRCYPEVIAQQNQNTNLLPAETRLPDASLWSHTSITSAIAGGLAGYYTDDSQYPRKGEHFKQRSRPYLTTFSFTPVQELIKASRKMRDFWAGSWLLHYLSAKVAWAIASKYGADTLLYPCLYQQPLIDHWLLQKYPDLKEWIKQPSTESLLTAGFPNVLVMILPNNGKDEETIKDNPVRSAMEYANNTLKQEWQNIGKEVLEFIQNRHEGKKWENINLHTYDNWLKAQWQHYWVSLPLGSPNIEELSMSPRPKKGEQEKSPEDREYDKWINQQNDYANPQPYLFSDSERDFLAAIFNLNQDETESDSNKTFRYKQPNLNVGSWWASTFDQLRYSLNAVKNARNWRIPTAFGPRSTISGLGSVVHPIIDESKPEWITEGETAQFWANNLGLFDGIEELNATEVLKRGLHQILLSQLGIASQSEQTKVSVLYPDLSSGVAGYLRNLAKQGDIEAINYYHQACKNISTKFPWVNKGKDAPANLPWGIPWIAKHHPDWQNPRLLNAGWLMDDFNSTSEDIETVKQQKQEELSKLRTEIAKFYPTGENPTDWYILAAGDGDGMGEWLKGTKLKPYADYIPEALKTKIEQMPEKYRSSLKKFLEVPKRMGPATHSALSRALLDFSNQLVPYLTESRYAGRLIYGGGDDVLAYTNLWEWDNWLWDLRQCFKGADDPQKEFISKGDYWQCGNNQSESLSSRPLFTMGSSASISFGITISHHSVPLAIALENLWEAEEKAKEHEYQENGAKIAKDAVQVRVIYGNGNILTATAKFDVFPTWQTLINSELDLTSSLFEVAGEYIKQFPIPEYNAIMPWVKAFSERRTNLKEEKLRKFKKQLTEFIQRMWVTNQPEFLNQEISNWLRLGAFIIRSRKIKTGDLSTK >NC_019777.1|WP_015221261.1|25740_26868_+|CRISPR-associated-protein,-Cmr3 MFWYKLTPIDVLLLRDGKPFSPGERAWAASVFPPNGHTLAGAIRGLLGKKTNFNLIGSFLTYGDQLYFPRPLNYVGKNLLYPLPWLESDYPLQKILWDRLQPAPLLLKQLKEREPKTSKSEEKTGKYISFNQLKNLLTKAVNEHHNKVELELENPVESEPYFSETRSHNAINSQTGQVKESDGYFVENAIRLKQGWSLAIALDFKLPTPNIMQLGGEGHRVIIEECPDLAQQWQELTKLSQGNFEENQANKSKSLAYLTTTGIFERKYQNNKVYCQAWPWEWKLAHRVNGNQTIGNLVSVATAKPVPISCRIQDREKNTSIPAPQVFGATAGSVYYLNQPEYLYAENPQSPPTKGLEVAKKWRSLGYSQLLWFKY >NC_019777.1|WP_015221262.1|26881_27781_+|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr4 MSDFRVGYLYSLSPVHCGGEGDLGNILEIAREVHTNFPYIPGSTLRGNIRDELESIDETIAEKLFGRKLDDNGQMGVHQVWFGDARILWIPMRTMSHNNQDVFTWVSCHSLIRDHALIAHLPPVSLPNCAVGTSGGTYHVADAQINVTPISTLSDAQKGAITLSGDWSPSLGDSVKTAWENSHLILPDADFQILMEHSLWTQVRNKIQDSGDQAGSAEVFWTDVCIPRDTIFYYSWGYKLKTNHQITSEYHDKLMEIIQGLIQVGGQANVGRGWVQSWVANSASPVDDSQAKQTANINS |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019777_2 | 32652-35999 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_019777_2
|
44 spacers
spacers of NC_019777_2
>2.1|32688|34|NC_019777|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAGTTTTGTTTTACTAATCCCCCAATGAATTAG >2.2|32758|37|NC_019777|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATATATATCTATATCTCCCTGCGATTATTAAACAGT >2.3|32831|39|NC_019777|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGTTTTTCAGCCTCAACACGGGCGGTTTCCTGAGTTAG >2.4|32906|41|NC_019777|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGTAAAGAGGGTTTGTTCTCTTTAGTGCTAAACGGTAAACA >2.5|32983|38|NC_019777|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGCACATAATGTAACTTTGGTGGGAGTTTATCAAGAT >2.6|33057|39|NC_019777|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGACCTGACCGCGTAGACCCTCGATAGCAAAAAACTTCT >2.7|33132|39|NC_019777|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAGCCCCTGTTATAGCTTCATAAAAAGGAAAGAAACTC >2.8|33207|42|NC_019777|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAACACGCTAGTTAAGATATCACTAGCTAAATGCTGTACAG >2.9|33285|45|NC_019777|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGCATCGGAATATCATTACCTTGGCGAACAGCATTGATAGTATC >2.10|33366|39|NC_019777|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGATATGCGATCACTATACACGTTCATCTCAATCACTGC >2.11|33441|35|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT TAGAAGGCAATCGTGACATCTTCAGCTTATCCCAT >2.12|33512|48|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT TTAAAAGCCCAATTAGCAAATTCAGTATCTCGCGAAGAGTTTAATGAG >2.13|33596|42|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGAAGGCTTGGTGTTGCTGAACTAGCTCTGCTATAGCCGGG >2.14|33674|36|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTCATACCAACTTGTATCTTGGCAAGAAAAGTTTAT >2.15|33746|36|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTAAGTTTTTATTACTACCTATGATAAAGGCATTCG >2.16|33818|39|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCAATTAGATGCAAACCCTGAATTGGTTGACAAATTAAA >2.17|33893|40|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CATATCCGCGTCCTCATCGAAAGTCATCCCTTGGGTGAGA >2.18|33969|37|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTCCAAGTTAATCAACAATATTGATTTGACGTTTAAA >2.19|34042|37|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AACTTGCCCATTCAGAAGGTACGGGCTTAAATTTACT >2.20|34115|38|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCAACATTGCGCTCTGTTGTCTTTAAGGTGGAGGCAGG >2.21|34189|43|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAATATCGTAACAGAGTTCTGGAGAATAGATAGGTAGCAACTG >2.22|34268|40|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGAATTTAAGAATATAGTGGGATATCCGCCAGAAGCAGCC >2.23|34344|42|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATCTCTTCTTCAGTTTTCTGCTCTGCCTCGGCTACTTTATC >2.24|34422|37|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAGGTATATCCCCACCTTTAATAACATCAGCATTAAT >2.25|34495|39|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTCATACCCTTTTCTTCTTGAGTTAAATCAGCCCAGTT >2.26|34570|37|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATCCAACAGTCTCTGGGCAATTAGCATGTAACCAAT >2.27|34643|40|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAGATCTAGGTGATACAATTCATCTGGACGCATAGATTT >2.28|34719|40|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTAGAAGTAATAGTAGAATTAACAATAGCAGATTTACCG >2.29|34795|38|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCATAGCTCCTCTTTCGAGGAGGCTGAATTATTAACCA >2.30|34869|38|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCAGTCATATAAAGCTGTACAGTCTCGTGGGAACTAGA >2.31|34943|40|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTAGACGAGTTGAGGATAGCTTGCCAAGAAAAAGAAAAA >2.32|35019|38|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAAAGATAATGCGGTTTCATAATCTCCAGCAACACTAC >2.33|35093|39|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGGTCGTCCTCCTGAGTTGCCATCTCCTCGAGAATAAGA >2.34|35168|40|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACATGGCTAACGTTGCCGTCACTGGAGAGAACGGTCTATT >2.35|35244|42|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCACATGGCAGCGTCATCTGCTAAGTCGGAATATTTTTCAGG >2.36|35322|46|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGGTTGAAAAAGAAGTTAAGGGATTTACTGTGTTCGTGCCATTAAC >2.37|35404|37|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAATAAATCTTTTCAGTTCGAGTATATTCGTCCTCGG >2.38|35477|36|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT TTTATTTCATCGTAGCTAACAGTTACTACATAATCA >2.39|35549|44|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTACCCAGAAACAAATCCAAGCATGAGCACCTGTACTACCTGCC >2.40|35629|38|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCAATATTGGTATCGTTGTTTTGTTTAACAATGAAAGG >2.41|35703|38|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTATTGAGAGATGATCATCAGTTTATTATTATTTAAG >2.42|35777|40|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGTTCATATCTATGAACTAAATAAAGTACATAAAAAAGAA >2.43|35853|41|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGGCTTCGATGGTTTTAGACGAAGCTTTTTCGTTAACGCA >2.44|35930|34|NC_019777|CRT TTGGGATTATAACGATAACACGCTATGTAATTAT |
csx1,cmr6gr7,cmr5gr11,cmr4gr7,cmr3gr5,cas10,WYL,csx18,cas1,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_019777_2
The CRISPR arrays of NC_019777_2 >merge|NC_019777|2|32652-35999|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR,PILER-CR 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>NC_019777.1|WP_015221267.1|31178_32483_+|hypothetical-protein MASILFSFVGNQDPVSHNTNEEGSIVTLVRYLLAQQKTIKKIILLYTETTAKGAKETQEWLLDILENSPFKPEDFSLIQVQEKLSTDPVNLSLVIEEVKTQIKKIQEIQKGDDILELNSSSGTPTMKASLGVLQGAGYLPKSNIWQVRNPREMREGQARVFKTNVDILKQEFDIKVIKEQVSNYNYNGALKTLSNSSLVDNGIGYFLQYGAYRLAFNFKDASEYIRDFRSFFEERLTKEINRLASKNQESILIELYYHILAHLKTKEYSQFLILVFGFQEFVLKFLVRKFISPDLLNKSWNQNLKQSVINACNNYEHGELRKYVQKYRQYNQTLQIDKMSRIVMLRIIQYPSFSCPKSLIDNLLHLESYCDKRNELVHQFEGVSESDITETELNDMVNKIQSILSDLFPDSFIKESCFAVLNKKIMAKLINSDG >NC_019777.1|WP_015221266.1|29391_31149_+|hypothetical-protein MLYTAPKLIELLEKQHQNRGKADLFKQGIFTIQWRAKCGSHPHPDLETMIPASEPCGTWTPNNGCPRNIARPEAKRNVGENYQYFRELPYRGYLPASSIRGLVRAWATKQGGEIKSEMERLLGKQEDDTINAGKIEFLDAYPEKETKVTLDIVNPQQDFQVYHNGQSTPLSFYTLGNGNNKIRVKVAIRGIEGKVTSEEVAQVWKWVEQALSLYGVGSRTASGYGAIQANSKLKLRSQPNHKTKTFTFSLYSQGCGGASVKDIQLRPSHWRGWLRSWVLRFLLGVMSRQDAERTIGELMGTINAENDNSSQMGCLRLEMNLQKLGKKEWYLESDDSPDFYLWKGNLKLTAPTNILNKIILPIVKFAVSVGGVGRGWRRPLHIFTMNNGRESARGCHLILHHKVKDKTTEELKTKLFGLFPNQPQTWQTTYDNWLNSVREIWGSRIRLNANNNSQAEVFSPHTCSVYVVPYPKEDPLDNNTWGDFDYVEDTRGEGMDLIYQPTYKRKQDVGGNAGSGGAYCSWVSIKRVNAHHPEIKNSFCQEVVCIFMGGIPVNHPNHLRARFLRDLARINGSRNLFGLIAPNPQ >NC_019777.1|WP_041923006.1|29048_29354_+|hypothetical-protein MNNPNMTNDGLQILYNRYYKDNLERQLELEKMRLDDQVSREITKVKKLYNLSNQDLAKLINTDPLTIDSLENGDYEGDSFLMLSLIANALKMAVRFELVSA >NC_019777.1|WP_015221264.1|28677_29052_+|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MPQIKIIFYQEQNGKVPLLEWLDRLPNKVQTKCFVKLERLSQLGHELRRPEADLLRDNIYELRIGFQVINYRILYFFYKNQAIIVSHGLTKEKRVPPLEIDKAITNKNKFEQNPELHTYYQELS >NC_019777.1|WP_041923010.1|28218_28617_+|hypothetical-protein MMVQPEQMSLTAHQQIQIYLQSKNRPSLEEKDLTAILRLSTHLRVFGLLSAVGYINQSNDQQGEVRQRTIPVWRSLLGQLINPENPPQARELMETVQNMARNNSTEYMMMWRKSLILSQYWNFWGRAYTQND >NC_019777.1|WP_015221262.1|26881_27781_+|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr4 MSDFRVGYLYSLSPVHCGGEGDLGNILEIAREVHTNFPYIPGSTLRGNIRDELESIDETIAEKLFGRKLDDNGQMGVHQVWFGDARILWIPMRTMSHNNQDVFTWVSCHSLIRDHALIAHLPPVSLPNCAVGTSGGTYHVADAQINVTPISTLSDAQKGAITLSGDWSPSLGDSVKTAWENSHLILPDADFQILMEHSLWTQVRNKIQDSGDQAGSAEVFWTDVCIPRDTIFYYSWGYKLKTNHQITSEYHDKLMEIIQGLIQVGGQANVGRGWVQSWVANSASPVDDSQAKQTANINS >NC_019777.1|WP_015221261.1|25740_26868_+|CRISPR-associated-protein,-Cmr3 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>NC_019777.1|WP_015221259.1|20250_22389_-|WYL-domain-containing-protein MLCHFLIGVPASGKSTFAQLLAKTGNYQIISTDTIRQQLYGDEVIQGNWLKIEDEVINQMKEAIALKQGIIYDATNAQRAWRMDLLSKIQKQIGKIDWLGWYLNLDLKIAQTWNSQRERTVPDNIIERMSDSLQQFPPHVAEGFINIVEIKQPQQCNLSFIEEKLNGLERCIINRNNRTKIENIILHRYSKLLDFDRLMHLISLLIAYPELGNLQYAYPDILEQIFGNPVTFDDSLSEISAVMAKLKGNIYADKLAIEKDLQFLINYGLIKHNITEPKYESSLTEINDNLDDIITHYASDKYTFERILNTIKTIADYPFLPNVKADFLNQLCPNEQSVKDSSKSNLSGHLTNLTYKLMKLEKCPDKHLKARRDLLRKDIQFILKPYQILPKTMRNGYFLGTGILSERELIETFRLLQTQAKNIDDPLALNLYNRFKDKMKWANFYDHYTYPVRVIANRSMIDIKSLDSKTLSNQTQRIQEIIEQGKLVTLNKFANRGSYEGEEKGAFCAWLLQIVFYNFAWYLGFEQEGGENHKLFRFERLDRLYIQKETDKTRTITEQKKALNKLTKLLSASYGLYLGNDVEQQKLFLSSDKQKAQETVELWFTEKIFGFIAEGTKRFPTQQMKMTKPPRSLSNSNSSLFSLSKSKNPQYPYRFQVTLPIWSLDEFDFIRWILGFGGEVKVHKPKKLQEKIITLSSNTIDVYQQQKIESVL >NC_019777.1|WP_015221258.1|19635_20160_+|hypothetical-protein MTNQNENGCAGCLSLIIALFVVGLLVSYWQLVLAFVFVIFVFWVLFKIITSICHSVFGGRNTSSYRPMTTKFNSNDANTPFYTIDMKADAIDHPSASKTIKPKQKSSNLVKKDSPKTEIEMTVNTSNKSKLVKKNVQTNLTGDIDINIKDKKIKSVKYTKTTIEEVVYEIDTDD >NC_019777.1|WP_015221269.1|37461_38820_+|hypothetical-protein MNLSDNFDKVRSDITWLISTRPDLVAKAKLIAQGKYDPNQDNTLDNNDKKFLRCFLNLIIVNPNDLHGKVYVTDNVESRSHLTASSITIANWINGISNFPLFFFLVETTFLPIVGGMGAILATGAVLGIGNTFGASVAKCRKGNRSWSLWGGLLALVGLNVIQTGATGIGVEMMNNRSELNRIYATKIANNYLTDKENQITYLQQSENPIYLNVKERCDVGTTQFNTLPPRHPNRDALYVSLYGAFAQKDTNWNNLPFEKLPVCRQVTRLENEKNQELETAILSYQNLLTERSQTGSDLVFLEKFALQVFNEHFTNQREIKSGTILVGLATTEVFNKLSKGKWTELGLSYFIFILSAITSIASCVMALTHALSKDVQNSYDPQLQIIIDDYFQEMRQALMIAQANDTHIISELDPTIQSLENSYHYEYEPNDMGTGNINHPLPEGNEKEWQN >NC_019777.1|WP_015221270.1|38797_39256_+|hypothetical-protein MKKNGKIDLPTIQALVNQYQEGEIIPSQPTPETTPSPNPSQFSANYTKINSDNNTINNTNVTNVPPPENPPVKIEAEIINEDKEKKAPISETITVNNEIPIDTQQLERIILELQLTETAQNLAKPPKKRLKSPHLGEIEKRLNQFIYKNNSY >NC_019777.1|WP_015221271.1|39268_39565_+|hypothetical-protein 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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22. spacer 2.8|33207|42|NC_019777|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
caaacacgctagttaagatatcactagctaaatgctgtacag CRISPR spacer caaacacgctagttaagatatcactagctaaatgctgtacag Protospacer ******************************************
23. spacer 2.9|33285|45|NC_019777|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctgcatcggaatatcattaccttggcgaacagcattgatagtatc CRISPR spacer ctgcatcggaatatcattaccttggcgaacagcattgatagtatc Protospacer *********************************************
24. spacer 2.10|33366|39|NC_019777|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tgatatgcgatcactatacacgttcatctcaatcactgc CRISPR spacer tgatatgcgatcactatacacgttcatctcaatcactgc Protospacer ***************************************
25. spacer 2.11|33441|35|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tagaaggcaatcgtgacatcttcagcttatcccat CRISPR spacer tagaaggcaatcgtgacatcttcagcttatcccat Protospacer ***********************************
26. spacer 2.12|33512|48|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttaaaagcccaattagcaaattcagtatctcgcgaagagtttaatgag CRISPR spacer ttaaaagcccaattagcaaattcagtatctcgcgaagagtttaatgag Protospacer ************************************************
27. spacer 2.13|33596|42|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aagaaggcttggtgttgctgaactagctctgctatagccggg CRISPR spacer aagaaggcttggtgttgctgaactagctctgctatagccggg Protospacer ******************************************
28. spacer 2.14|33674|36|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttcataccaacttgtatcttggcaagaaaagtttat CRISPR spacer ttcataccaacttgtatcttggcaagaaaagtttat Protospacer ************************************
29. spacer 2.15|33746|36|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctaagtttttattactacctatgataaaggcattcg CRISPR spacer ctaagtttttattactacctatgataaaggcattcg Protospacer ************************************
30. spacer 2.16|33818|39|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gcaattagatgcaaaccctgaattggttgacaaattaaa CRISPR spacer gcaattagatgcaaaccctgaattggttgacaaattaaa Protospacer ***************************************
31. spacer 2.17|33893|40|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
catatccgcgtcctcatcgaaagtcatcccttgggtgaga CRISPR spacer catatccgcgtcctcatcgaaagtcatcccttgggtgaga Protospacer ****************************************
32. spacer 2.18|33969|37|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctccaagttaatcaacaatattgatttgacgtttaaa CRISPR spacer ctccaagttaatcaacaatattgatttgacgtttaaa Protospacer *************************************
33. spacer 2.19|34042|37|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aacttgcccattcagaaggtacgggcttaaatttact CRISPR spacer aacttgcccattcagaaggtacgggcttaaatttact Protospacer *************************************
34. spacer 2.20|34115|38|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tcaacattgcgctctgttgtctttaaggtggaggcagg CRISPR spacer tcaacattgcgctctgttgtctttaaggtggaggcagg Protospacer **************************************
35. spacer 2.21|34189|43|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaatatcgtaacagagttctggagaatagataggtagcaactg CRISPR spacer aaatatcgtaacagagttctggagaatagataggtagcaactg Protospacer *******************************************
36. spacer 2.22|34268|40|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tgaatttaagaatatagtgggatatccgccagaagcagcc CRISPR spacer tgaatttaagaatatagtgggatatccgccagaagcagcc Protospacer ****************************************
37. spacer 2.23|34344|42|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatctcttcttcagttttctgctctgcctcggctactttatc CRISPR spacer aatctcttcttcagttttctgctctgcctcggctactttatc Protospacer ******************************************
38. spacer 2.24|34422|37|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gaggtatatccccacctttaataacatcagcattaat CRISPR spacer gaggtatatccccacctttaataacatcagcattaat Protospacer *************************************
39. spacer 2.25|34495|39|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cttcatacccttttcttcttgagttaaatcagcccagtt CRISPR spacer cttcatacccttttcttcttgagttaaatcagcccagtt Protospacer ***************************************
40. spacer 2.26|34570|37|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aatccaacagtctctgggcaattagcatgtaaccaat CRISPR spacer aatccaacagtctctgggcaattagcatgtaaccaat Protospacer *************************************
41. spacer 2.27|34643|40|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttagatctaggtgatacaattcatctggacgcatagattt CRISPR spacer ttagatctaggtgatacaattcatctggacgcatagattt Protospacer ****************************************
42. spacer 2.28|34719|40|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tttagaagtaatagtagaattaacaatagcagatttaccg CRISPR spacer tttagaagtaatagtagaattaacaatagcagatttaccg Protospacer ****************************************
43. spacer 2.29|34795|38|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ccatagctcctctttcgaggaggctgaattattaacca CRISPR spacer ccatagctcctctttcgaggaggctgaattattaacca Protospacer **************************************
44. spacer 2.30|34869|38|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gcagtcatataaagctgtacagtctcgtgggaactaga CRISPR spacer gcagtcatataaagctgtacagtctcgtgggaactaga Protospacer **************************************
45. spacer 2.31|34943|40|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cttagacgagttgaggatagcttgccaagaaaaagaaaaa CRISPR spacer cttagacgagttgaggatagcttgccaagaaaaagaaaaa Protospacer ****************************************
46. spacer 2.32|35019|38|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
taaagataatgcggtttcataatctccagcaacactac CRISPR spacer taaagataatgcggtttcataatctccagcaacactac Protospacer **************************************
47. spacer 2.33|35093|39|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aggtcgtcctcctgagttgccatctcctcgagaataaga CRISPR spacer aggtcgtcctcctgagttgccatctcctcgagaataaga Protospacer ***************************************
48. spacer 2.34|35168|40|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
acatggctaacgttgccgtcactggagagaacggtctatt CRISPR spacer acatggctaacgttgccgtcactggagagaacggtctatt Protospacer ****************************************
49. spacer 2.35|35244|42|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gcacatggcagcgtcatctgctaagtcggaatatttttcagg CRISPR spacer gcacatggcagcgtcatctgctaagtcggaatatttttcagg Protospacer ******************************************
50. spacer 2.36|35322|46|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aggttgaaaaagaagttaagggatttactgtgttcgtgccattaac CRISPR spacer aggttgaaaaagaagttaagggatttactgtgttcgtgccattaac Protospacer **********************************************
51. spacer 2.37|35404|37|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaataaatcttttcagttcgagtatattcgtcctcgg CRISPR spacer aaataaatcttttcagttcgagtatattcgtcctcgg Protospacer *************************************
52. spacer 2.38|35477|36|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tttatttcatcgtagctaacagttactacataatca CRISPR spacer tttatttcatcgtagctaacagttactacataatca Protospacer ************************************
53. spacer 2.39|35549|44|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtacccagaaacaaatccaagcatgagcacctgtactacctgcc CRISPR spacer gtacccagaaacaaatccaagcatgagcacctgtactacctgcc Protospacer ********************************************
54. spacer 2.40|35629|38|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tcaatattggtatcgttgttttgtttaacaatgaaagg CRISPR spacer tcaatattggtatcgttgttttgtttaacaatgaaagg Protospacer **************************************
55. spacer 2.41|35703|38|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tttattgagagatgatcatcagtttattattatttaag CRISPR spacer tttattgagagatgatcatcagtttattattatttaag Protospacer **************************************
56. spacer 2.42|35777|40|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cgttcatatctatgaactaaataaagtacataaaaaagaa CRISPR spacer cgttcatatctatgaactaaataaagtacataaaaaagaa Protospacer ****************************************
57. spacer 2.43|35853|41|NC_019777|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaggcttcgatggttttagacgaagctttttcgttaacgca CRISPR spacer aaggcttcgatggttttagacgaagctttttcgttaacgca Protospacer *****************************************
58. spacer 2.44|35930|34|NC_019777|CRT matches to NC_019777 (Cyanobacterium aponinum PCC 10605 plasmid pCYAN10605.01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgggattataacgataacacgctatgtaattat CRISPR spacer ttgggattataacgataacacgctatgtaattat Protospacer **********************************
59. spacer 2.44|35930|34|NC_019777|CRT matches to NC_048053 (Dickeya phage vB_DsoM_JA29, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
--ttgggattataacgataacacgctatgtaattat CRISPR spacer cgttagca--ggaacgttaacacgctttgtaattat Protospacer **.* * . **** ********* *********
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation |
---|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|