Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018608 | Staphylococcus aureus 08BA02176, complete sequence | 15 crisprs | cas1,cas2,cas10,csm2gr11,csm3gr7,csm4gr5,csm5gr7,csm6,cas6,cas3,DEDDh,DinG,csa3,TnsE_C,WYL | 6 | 17 | 11 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018608_1 | 55513-56620 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_018608_1
|
15 spacers
spacers of NC_018608_1
>1.1|55549|36|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT TCTATAAGTTCATTAATTCCGATACCTAGATTATCT >1.2|55621|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT TTTTTTCCACCCTTTCAGATCATCTATGATCTTG >1.3|55691|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT AATTTTCTAATTCTATAAGTTCATTAATTCCGAT >1.4|55761|36|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT TATACTATTTACATAATTTTTTATGTGTCTGTCTAC >1.5|55833|37|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT TAATAGTGTTGTTCTCTATTAAAAGATACAATCCTGT >1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT TAGAATGTTATTATCTAAGTGGTCGATGTATTCC >1.7|55976|37|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT TCATACTAGCACCCCACTCTCTACTGAACAAGTATCA >1.8|56049|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT CTTAAAATCTAATTGCATTGTTATCAATTCCTTTA >1.9|56120|38|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT TCTGTAATGTATTCATTTAATGTAATCATAATTTTTTC >1.10|56194|37|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT TAGACCATTTACCTCATTATATTTATAGTCTTTATTA >1.11|56267|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT TTTTCTTTAACTGTTTTTACTGCCCATTTAATAGT >1.12|56338|36|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT ATATTTCTTCCATGAATAACACCCTCCTTTTTTCTA >1.13|56410|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT AAGTTAACGGCATTACCTAATAAAAATATTTTAGG >1.14|56481|33|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT TCATCTTTCATGTCACTGATTAATTCATTTGTA >1.15|56550|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT GGTAATAGTTGCTCAATAGGTAATAAAACGTCGGT >1.16|55760|37|NC_018608|PILER-CR TTATACTATTTACATAATTTTTTATGTGTCTGTCTAC >1.17|55832|38|NC_018608|PILER-CR TTAATAGTGTTGTTCTCTATTAAAAGATACAATCCTGT >1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR TTAGAATGTTATTATCTAAGTGGTCGATGTATTCC >1.19|55975|38|NC_018608|PILER-CR TTCATACTAGCACCCCACTCTCTACTGAACAAGTATCA >1.20|56048|36|NC_018608|PILER-CR TCTTAAAATCTAATTGCATTGTTATCAATTCCTTTA >1.21|56119|39|NC_018608|PILER-CR TTCTGTAATGTATTCATTTAATGTAATCATAATTTTTTC >1.22|56193|38|NC_018608|PILER-CR TTAGACCATTTACCTCATTATATTTATAGTCTTTATTA >1.23|56266|36|NC_018608|PILER-CR TTTTTCTTTAACTGTTTTTACTGCCCATTTAATAGT >1.24|56337|37|NC_018608|PILER-CR TATATTTCTTCCATGAATAACACCCTCCTTTTTTCTA >1.25|56409|36|NC_018608|PILER-CR TAAGTTAACGGCATTACCTAATAAAAATATTTTAGG >1.26|56480|34|NC_018608|PILER-CR CTCATCTTTCATGTCACTGATTAATTCATTTGTA |
cas1,cas2,cas10,csm2gr11,csm3gr7,csm4gr5,csm5gr7,csm6,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018608_1
The CRISPR arrays of NC_018608_1 >merge|NC_018608|1|55513-56620|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAATTCTATAAGTTCATTAATTCCGATACCTAGATTATCTGATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAATTTTTTTCCACCCTTTCAGATCATCTATGATCTTGGATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAATAATTTTCTAATTCTATAAGTTCATTAATTCCGATGATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAATTATACTATTTACATAATTTTTTATGTGTCTGTCTACGATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAATTAATAGTGTTGTTCTCTATTAAAAGATACAATCCTGTGATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAATTAGAATGTTATTATCTAAGTGGTCGATGTATTCCGATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAATTCATACTAGCACCCCACTCTCTACTGAACAAGTATCAGATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAATCTTAAAATCTAATTGCATTGTTATCAATTCCTTTAGATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAATTCTGTAATGTATTCATTTAATGTAATCATAATTTTTTCGATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAATTAGACCATTTACCTCATTATATTTATAGTCTTTATTAGATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAATTTTTCTTTAACTGTTTTTACTGCCCATTTAATAGTGATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAATATATTTCTTCCATGAATAACACCCTCCTTTTTTCTAGATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAATAAGTTAACGGCATTACCTAATAAAAATATTTTAGGGATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAACTCATCTTTCATGTCACTGATTAATTCATTTGTAGATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAACGGTAATAGTTGCTCAATAGGTAATAAAACGTCGGTGATCGATAACTATCCCGAATAACAGGGGACAGAGTG >NC_018608|1|1|55513-56620|CRISPRCasFinder GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAAT TCTATAAGTTCATTAATTCCGATACCTAGATTATCT GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAAT TTTTTTCCACCCTTTCAGATCATCTATGATCTTG GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAAT AATTTTCTAATTCTATAAGTTCATTAATTCCGAT GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAAT TATACTATTTACATAATTTTTTATGTGTCTGTCTAC GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAAT TAATAGTGTTGTTCTCTATTAAAAGATACAATCCTGT GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAAT TAGAATGTTATTATCTAAGTGGTCGATGTATTCC GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAAT TCATACTAGCACCCCACTCTCTACTGAACAAGTATCA GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAAT CTTAAAATCTAATTGCATTGTTATCAATTCCTTTA GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAAT TCTGTAATGTATTCATTTAATGTAATCATAATTTTTTC GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAAT TAGACCATTTACCTCATTATATTTATAGTCTTTATTA GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAAT TTTTCTTTAACTGTTTTTACTGCCCATTTAATAGT GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAAT ATATTTCTTCCATGAATAACACCCTCCTTTTTTCTA GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAAT AAGTTAACGGCATTACCTAATAAAAATATTTTAGG GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAAC TCATCTTTCATGTCACTGATTAATTCATTTGTA GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAAC GGTAATAGTTGCTCAATAGGTAATAAAACGTCGGT GATCGATAACTATCCCGAATAACAGGGGACAGAGTG >NC_018608|1|1|55513-56620|CRT GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAAT TCTATAAGTTCATTAATTCCGATACCTAGATTATCT GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAAT TTTTTTCCACCCTTTCAGATCATCTATGATCTTG GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAAT AATTTTCTAATTCTATAAGTTCATTAATTCCGAT GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAAT TATACTATTTACATAATTTTTTATGTGTCTGTCTAC GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAAT TAATAGTGTTGTTCTCTATTAAAAGATACAATCCTGT GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAAT TAGAATGTTATTATCTAAGTGGTCGATGTATTCC GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAAT TCATACTAGCACCCCACTCTCTACTGAACAAGTATCA GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAAT CTTAAAATCTAATTGCATTGTTATCAATTCCTTTA GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAAT TCTGTAATGTATTCATTTAATGTAATCATAATTTTTTC GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAAT TAGACCATTTACCTCATTATATTTATAGTCTTTATTA GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAAT TTTTCTTTAACTGTTTTTACTGCCCATTTAATAGT GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAAT ATATTTCTTCCATGAATAACACCCTCCTTTTTTCTA GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAAT AAGTTAACGGCATTACCTAATAAAAATATTTTAGG GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAAC TCATCTTTCATGTCACTGATTAATTCATTTGTA GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAAC GGTAATAGTTGCTCAATAGGTAATAAAACGTCGGT GATCGATAACTATCCCGAATAACAGGGGACAGAGTG >NC_018608|1|1|55725-56548|PILER-CR GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAA TTATACTATTTACATAATTTTTTATGTGTCTGTCTAC GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAA TTAATAGTGTTGTTCTCTATTAAAAGATACAATCCTGT GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAA TTAGAATGTTATTATCTAAGTGGTCGATGTATTCC GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAA TTCATACTAGCACCCCACTCTCTACTGAACAAGTATCA GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAA TCTTAAAATCTAATTGCATTGTTATCAATTCCTTTA GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAA TTCTGTAATGTATTCATTTAATGTAATCATAATTTTTTC GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAA TTAGACCATTTACCTCATTATATTTATAGTCTTTATTA GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAA TTTTTCTTTAACTGTTTTTACTGCCCATTTAATAGT GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAA TATATTTCTTCCATGAATAACACCCTCCTTTTTTCTA GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAA TAAGTTAACGGCATTACCTAATAAAAATATTTTAGG GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAA CTCATCTTTCATGTCACTGATTAATTCATTTGTA GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAA
>NC_018608.1|WP_072093071.1|54787_55099_-|DUF3387-domain-containing-protein MLSDDFLKDVEGLKQKNVAVELLNRLLKGQVKSLMKTNATVSKRFSEMLRNSINKYNSRSIETSKVIEELIQLAKDIKQEQQRGNELGLNSDEIAFLRCFSFT >NC_018608.1|WP_001015193.1|54274_54496_+|hypothetical-protein MNHETTHSDWRTVANCLASQNYISIVKGLVHHFTAIEDEEILDKIYEDFMNNGSITTVLNNDLQDIINYYLSK >NC_018608.1|WP_001092190.1|53756_54260_+|DUF1643-domain-containing-protein MNTIKSTIHTEAIFSDDEQHRYLLKKTWDEKKPVCTVITMYPHLDGVLSLDLTTVLILNQLANSEQYGAVYLVNLFSNIKTPENLKHIKEPYDKHTDIHLMKAISESDTVILAYGAYAKRPVVVERVEQVMEMLKPHKKKVKKLINPATNDIMHPLNPKARQKWILK >NC_018608.1|WP_001024805.1|53430_53742_+|hypothetical-protein MNINRYITRGISEQLSLDLQILLWHMVEEKDNQPHTDYLHIFKLQEDDNMLSITHEQEQPAYKLEYHYINYEKNQNALPKKVYVIREDDVDVFYYVMLLPEEY >NC_018608.1|WP_000175888.1|52998_53337_+|hypothetical-protein MTLSKQLKTYITERFKLNYQETWACETIDAVAEDVLPEKYIKNSPLEHKILNTFTYYNDELHEISIYPFLCYLDKELVAIGYLDNFDLDFIFLNDTHQIIIDERYLLQKGGE >NC_018608.1|WP_000676592.1|51230_52910_+|recombinase-family-protein MKGKIALYSRVSTSEQSEHGYSEKEQEQLLIKEVMKNFPGYDYETYTDSGISGKNIEGRPAMKRLLQDVKDNKIEMVLSWKLNRISRSMRDVFNIIHEFKEHDVGYKSISENIDTSNASGEVLVTMFGLIGSIERQTLISNVKLSMNAKARSGEAITGRVLGYKLSLNPLTQKNDLVIDENEAHIVREIFDLYLNHNKGFKAITTILNQKGYRTINQKPFSVFGVKYILNNPVYKGYVRFNNHQNWAVQRRSGKSDKNDVILVKGKHEAIISEDVFDQVHEKLASKSFKPGRPIGGDFYLRGLIKCPECGNNMVCRRTYYKTKKSKERTIKRYYICSLFNRSGSSACHSNAINAEVVERVINVHLNRILSQPNVIKQIASSVIEELKQKHSKQTEIKYDIDSLEKQKAKVKTQQERLLELFLDDEMDSEMLKAKQSEMNQQLEVLDQQIKEAKQANQSQDDIPNFDKLKARLILMITRFSVYLRKATPEAKNQLMKMLIDSIEITTDKQVKLVRYKIDESLIPQSLKKDWGSFFIPKFNFVINVTKKNRIENLSLLPLF >NC_018608.1|WP_001015575.1|49389_51006_+|primase MNHILEMLIKLLKVGMEAIDRKGLIAILTSSIGNDEMDDSEQAVMVYNELIDKLQLNIPKDVDYRPNIYSYFGIQKKPNDTILVEMMICIFHIKRFDSELFVFKDKGWQKVSEDELQGLISKMIQVLLVDYKPSLSTLKNVVDGIQKSTDIEKLVEHRQYIGCGRNMFNLKTFKVVDNDLEIFPKTRLDLELDINDTITDKIPPNFKQYMLELANYDHDLQYFLFQHMAVLLTADTKLRRGLFLYGTAKNGKSVYIKLVKSFFYSNDIVSKTLNELGGRFDKESLIGKRIMASDEVGKANIDEATVNDFKKLLSVEPIHADRKGRTQVEVTLDLKLIFNTNAVLNFPSSHAKALERRIAVIPCEYYVEKADPDLIEKLQDEKKEIFLYLMYVYKQIVKNDIEYLQNDRVTEISHDWLNFGYEFVSSKSANIAHQKACINLLRKLIEIKPGSRIKVSRLNEVIRDEIKVSSQVINDLVQANFNVQSRLNNGYKYWVDLGWKETDKKDDMISFDKNENVTDDEFLYEDDLNLGWEDFDDE >NC_018608.1|WP_001058155.1|49021_49390_+|hypothetical-protein MNNDRGKSLQIPQSTLLKEGSIYVATLHSVYEKNFSGDIKHQFTYEVELNQETHYVNRNITVKSMSHQLSIADWIKRHSNYNVNHINYDPYIDRKHLVLVGQYNGNYYIQDVAPLDEFGGVL >NC_018608.1|WP_000283873.1|47919_49029_+|hypothetical-protein MYQANIRDLITKLPQSNKTEHFLMNKFSNQDKVQQLQRQISQQLDQQYNELLANEKAKLDQYVEVHHNLEPLKKEIESESINLDTDKLPDIKATMLEKAKNDEHFDKIEQLFDRLDQSLNGTNRLYTQLSLIGTRTHRITTKRFNVQGLPKLVQQMILPSQFKKVYTIDFKSFEPSVAAYMTQDEQLIDYLNHEEGLYDALLRDLSLSKEKRVSVKRAFIGSFLFGGRYSSSKFKINQEVSEINWLQVMSKFKKVIEFKEQVEKYKTMPTPYGIEHDMSAFQGSSIMAIYVQTVASYIFKHILLEVYKAQCEKKTFKIIVPIHDAIMIECNDKGIAQNVAQLMKDTANQLFNGEFAHVTVEALGGIDNE >NC_018608.1|WP_001038847.1|45736_47725_+|hypothetical-protein MNKNITALKSTENTTYMQYTVHIDDQIINNIKECTKKFKILPMEDKIPLSPLLQPEYAGEVQDFISTYEQFMINFGKVILDSQGIKIQFESESLSSIQRGIQEHCYLNERTNDIDVTKEWYLCKFSNQILEEDKNQLYNALKQLMNDSKNKKQAFQEVFKVHIDIYLYNKEKSEYKYQVSSYFNLVKENPKITYKKRHLQEKQGVKGTTFTNKLKLLNKMYGVDVAKYQPFYNSNNPEYERGQFGERYISQRSNYEFNRLQYQIIDMLSKILDKHPLPKSDNNYKHIPTIEKAILSGDSHSFYEYFEDIMKEIISMENSSLKEKLLTDFTYQSQCRWYSESEKLKLQLESFMHKVLESNYYEGNKLYRMLSHAIEETINEADEDKVHFNYFKDYFLTDGGVKNWEQISEKITEFNGKVINDIQNEYNKIQFNNANRNQKLNFNYLYHCFEFSNNLVKARVNGNRGYILYFVDKYKIKMPFLDQLLINYLNQEIGQESINYNMQTLFEKERYDRSSTIEKLVATSKFKYEKDDSDLFKQLFNDVENSIDRLGIYLLNNGINSNDENARYYRSFLKELSRIKSKLTPFSLEISKSSGREQHYPDDAIDDKDERRKNKEETYHAFDDKSDIDSKLKNKINVSIDNLLSVKIKSNLYDISPNTKKQ >NC_018608.1|WP_000655859.1|56693_57599_+|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKDVIYVENHYFVTVKENSIKFRNVIDKSEKFYLFEEIEAIIFDHYKSYFSHKLVIKCIENDIAIIFCDKKHSPLTQLISSYGMTHRLQRIQSQFQLSGRTRDRIWKKIVVNKIINQSKCLENNLHNENVKLLVNLAKDVSSGDKSNKEAQAARIYFKDLYGKQFKRGRYNDIINSGLNYGYSILRSFIKKELALHGFEMSLGINHRSKENPFNLADDIIEVFRPFVDNIVYEIVFKKNINTFDVNEKKLLLNVLYEKCIIDKKVVRLLDSVKIVIQSLIRCYEENTPTYLLLPKMIEVGN >NC_018608.1|WP_000281076.1|57598_57904_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYLLVSFDLPRDTKFERRVASKYRTRLLELGFSMKQFSLYERYVSDVQKKDKILEILQQEIPDTGSITLYVLPDEVNNSQITILGKEVKVVVRKEPKLIFL >NC_018608.1|WP_000359017.1|57917_60191_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 MDKKTTLMYGSLLHDIGKIIYRSNDHAFARGTHSKLGYNFLSQFSEFKDNEVLDSIAYHHYKELAKANLANDNTAYITYIADNIASGIDRRDVIEEGDEEYEKQAFNFDKYTPLYSVFNIVNSEKLKQISGKFKFSNESNIEYPKTENIQYSSGNYTTLMKDMSYDLEHKLSIKEDTFPSLLQWTESLWQYVPSSTNKNQLIDISLYDHSRITCAIASCIFDYLNENNIHNYKDELFTKYENTKEFYQKEAFLLLSMDMSGIQDFIYNISGSKALKSLRSRSFYLEIMLEVIVDQLLEKLELTRANLLYTGGGHAYLLVSNTDKGKEKINQFNTELKNWFMSEFTTDLSLSIAFEKCSGNDLMNTSGNYRNIWRNVSSKLSDIKAHKYSSEDILKLNHFHSYGDRECKECLRSDIDINDDGLCSICEGIINISNDLRDKSFFVLSETGKLKMPFDKFISVIDYEEAERLAQNNNHIRIYSKNKPYIGVGISTNLWMCDYDYASQNKDMREKGIGSYVEREEGIKRLGVVRADIDNLGATFISGIPEKYNSISRTATLSRQLSLFFKYELNHLLENYQITAIYSGGDDLFLIGAWDDIIEVSVYINEKFKDFTLGKLTMSAGVGMFSGKYPISKMAFETGLLEEAAKTDEKNQIALWVQEKVYNWDEFKKYILEEKLLVLQHGFSQTDEHGKAFIYKMLALLRNNETINIARLAYLLARSKMTEEFTSKIFNWAQNDKDKNQLITALEYYVYQIREVD >NC_018608.1|WP_000599362.1|60193_60619_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm2 MILAKTKSGKKIDLTFAHEVVKSNVKTVKDKRGKENQVLFNGLTTSKLRNLMEQVNRLYTIAFNSTEDQLNEEFIDELEYLKIKFYYEAGREKSVDEFLKKTLMFPIIDRVIQKESKKFFLDYCKYFEALVAYAKYYQKED >NC_018608.1|WP_000286998.1|60620_61265_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm3 MYSKIKISGTIEVVTGLHIGGGGESSMIGAIDSPVVRDLQTKLPIIPGSSIKGKMRSLLAKHFGLKMKQENHNQDDESVLRLFGSSEKGNIQRARLQISDAFFSEKTKEHFAQNDIAYTETKFENTINRLTAVANPRQIERVTRGSEFDFVFIYNVDEESQVENDFENIEKAIHLLENDYLGGGGTRGNGRIQFNDITIETVVGEYDSTNLKIK >NC_018608.1|WP_000208937.1|61275_62184_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm4 MTTKVFKLSFKTPVHFGKKRLSDGEMTITSDTLFSALFIEALQLGIETDWLLNDLIISDTFPYENEIYYLPKPLIKIESKEEGNHKAFKKLKYVPVHHYNQYLNGELSAEDATDLNDIFSIGHFSLQTKVSLSAQEIDSSADSEPYSVGTFTFEPEAGLYFIAKGSEETLDQLKDIMTSLQYSGLGGKRNAGYGQFEYEIINNQQLFKLLNQNGEHSILLSTAMAKEDEIKSALKEARYILNKRSGFIQSTNYSEMLVKKSDFYSFSSGSVFKNIFNGDVFNVGHNGKHPVYRYAKPLWLEV >NC_018608.1|WP_000153149.1|62186_63209_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm5 MTIKNYEVVIKTLGPVHIGSGQVMKKQDYIYDFYNSKVYMINGNKLVKFLKRKNILDTYQNFLRYPPKNPRENGLKDYLDAQNVKQSEWKAFVSYSEKVNQGKKYGNIRPKPLNDLHLMVRDGQNKVYLPGSSIKGAIKTALVSKYNNEKNTDVYSKIKVSDSEPIDERHLAIYQKIDINKSEKPMPLYRECVDVDTEIKFKLTIEDEIYSINEIEQSIQDFYKNYYDKWLVGFKETKGGRRFALEGGMPDVLNQNILFLGAGAGFVSKTTHYQLKSREQAKRDSFDILTKKFRRTYGKMKEMPSNVPVALKGTTNQSLHVSYQQGMCKISFQELNNEVL >NC_018608.1|WP_000865879.1|63208_64477_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm6 MKVLFSPIGNSDPWSNDRDGAMLHIVRHYKPDVVVLFFTESIWNGNRNIPGRKNFDWENIVSKVSSRTKVDIKVDSIKYENDFDSYKDIFHFYINEIRTKYSDAEILLNVTSGTPQMESTLCLEYISNPHNMKCIQVSTPAPIEGPKRSFAKLETVTEDLNKVNANEKMASNRSKSINIISFREVMVRSQIKSLVNNYDYEGALNLVSDQKSFRNGKLLRKRLLELTNQIKTHEVFPEINDKYRSVALKKSLFHYLLLNMRYNRLDVAETLIRVKSIAEFILKTYIVGHWPTLIIEKDDKPYLNAEDNLSFIYKYKLLLEKRRQNLDVSRILGLPAFIDILTVLEPNSKLLKEVNAVNDINGLRNSIAHNLETLDLDKNKNYKKIMLSVEAIKNMLHISFPEIEEKDYNYFERKNKEFRELL >NC_018608.1|WP_000608705.1|64473_65208_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MINKITVELDLPDSIRFQYLGSILHGVLMDYLPNDIADQLHHEFAYSPLKQRIYHKNKKVIWEIVCMSDRLFNEIAELFTSKNRLFLKYYQVYIEIYSFNIEKVNVQNIMNQLLETEELNRYVRINIQTPMSFKYQSNYMIFPEVKRFFRSIMIQFDAFFEEYKMYDKETLDFLEKNINIVDYKLKSTRFNLEKVKIPSFTGEIVFKIKGPLPFLQLTHFLLKFGEFSGSGMKTSLGMGKYSII >NC_018608.1|WP_000669699.1|66317_66476_+|hypothetical-protein MKFKSKQLVIANQTKVINYRIQVLLKPQANIETQTQVKNNTLPETDEQSNAD |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_018608_2 | 65343-65590 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_018608_2
|
3 spacers
spacers of NC_018608_2
>2.1|65376|39|NC_018608|CRISPRCasFinder AACTCTTCTAAGACGCGATATGATTCTAATTGGTCTTCA >2.2|65448|41|NC_018608|CRISPRCasFinder AACTGATATACTCCTTTACCATGTATTAATTCTGGACCACT >2.3|65522|36|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT AACTCATATTCGATCGTGTATATCAAAACTTTATGC >2.4|65376|38|NC_018608|CRT AACTCTTCTAAGACGCGATATGATTCTAATTGGTCTTC >2.5|65447|42|NC_018608|CRT GAACTGATATACTCCTTTACCATGTATTAATTCTGGACCACT |
cas6,csm6,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,csm2gr11,cas10,cas2,cas1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018608_2
The CRISPR arrays of NC_018608_2 >merge|NC_018608|2|65343-65590|CRISPRCasFinder,CRT ATTCGATAACTACCCCGTAGAAGAGGGGACGAGAACTCTTCTAAGACGCGATATGATTCTAATTGGTCTTCATTCGATAACTACCCCCGTAGAAGAGGGGACGAGAACTGATATACTCCTTTACCATGTATTAATTCTGGACCACTATTCGATAACTACCCCGTAGAAGAGGGGACGAGAACTCATATTCGATCGTGTATATCAAAACTTTATGCATTCGATAACTACCCCGTAGAAGAGGGGACGAG >NC_018608|2|2|65343-65590|CRISPRCasFinder ATTCGATAACTACCCCGTAGAAGAGGGGACGAG AACTCTTCTAAGACGCGATATGATTCTAATTGGTCTTCA TTCGATAACTACCCCCGTAGAAGAGGGGACGAG AACTGATATACTCCTTTACCATGTATTAATTCTGGACCACT ATTCGATAACTACCCCGTAGAAGAGGGGACGAG AACTCATATTCGATCGTGTATATCAAAACTTTATGC ATTCGATAACTACCCCGTAGAAGAGGGGACGAG >NC_018608|2|2|65343-65590|CRT ATTCGATAACTACCCCGTAGAAGAGGGGACGAG AACTCTTCTAAGACGCGATATGATTCTAATTGGTCTTC ATTCGATAACTACCCCCGTAGAAGAGGGGACGA GAACTGATATACTCCTTTACCATGTATTAATTCTGGACCACT ATTCGATAACTACCCCGTAGAAGAGGGGACGAG AACTCATATTCGATCGTGTATATCAAAACTTTATGC ATTCGATAACTACCCCGTAGAAGAGGGGACGAG
>NC_018608.1|WP_000608705.1|64473_65208_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MINKITVELDLPDSIRFQYLGSILHGVLMDYLPNDIADQLHHEFAYSPLKQRIYHKNKKVIWEIVCMSDRLFNEIAELFTSKNRLFLKYYQVYIEIYSFNIEKVNVQNIMNQLLETEELNRYVRINIQTPMSFKYQSNYMIFPEVKRFFRSIMIQFDAFFEEYKMYDKETLDFLEKNINIVDYKLKSTRFNLEKVKIPSFTGEIVFKIKGPLPFLQLTHFLLKFGEFSGSGMKTSLGMGKYSII >NC_018608.1|WP_000865879.1|63208_64477_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm6 MKVLFSPIGNSDPWSNDRDGAMLHIVRHYKPDVVVLFFTESIWNGNRNIPGRKNFDWENIVSKVSSRTKVDIKVDSIKYENDFDSYKDIFHFYINEIRTKYSDAEILLNVTSGTPQMESTLCLEYISNPHNMKCIQVSTPAPIEGPKRSFAKLETVTEDLNKVNANEKMASNRSKSINIISFREVMVRSQIKSLVNNYDYEGALNLVSDQKSFRNGKLLRKRLLELTNQIKTHEVFPEINDKYRSVALKKSLFHYLLLNMRYNRLDVAETLIRVKSIAEFILKTYIVGHWPTLIIEKDDKPYLNAEDNLSFIYKYKLLLEKRRQNLDVSRILGLPAFIDILTVLEPNSKLLKEVNAVNDINGLRNSIAHNLETLDLDKNKNYKKIMLSVEAIKNMLHISFPEIEEKDYNYFERKNKEFRELL >NC_018608.1|WP_000153149.1|62186_63209_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm5 MTIKNYEVVIKTLGPVHIGSGQVMKKQDYIYDFYNSKVYMINGNKLVKFLKRKNILDTYQNFLRYPPKNPRENGLKDYLDAQNVKQSEWKAFVSYSEKVNQGKKYGNIRPKPLNDLHLMVRDGQNKVYLPGSSIKGAIKTALVSKYNNEKNTDVYSKIKVSDSEPIDERHLAIYQKIDINKSEKPMPLYRECVDVDTEIKFKLTIEDEIYSINEIEQSIQDFYKNYYDKWLVGFKETKGGRRFALEGGMPDVLNQNILFLGAGAGFVSKTTHYQLKSREQAKRDSFDILTKKFRRTYGKMKEMPSNVPVALKGTTNQSLHVSYQQGMCKISFQELNNEVL >NC_018608.1|WP_000208937.1|61275_62184_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm4 MTTKVFKLSFKTPVHFGKKRLSDGEMTITSDTLFSALFIEALQLGIETDWLLNDLIISDTFPYENEIYYLPKPLIKIESKEEGNHKAFKKLKYVPVHHYNQYLNGELSAEDATDLNDIFSIGHFSLQTKVSLSAQEIDSSADSEPYSVGTFTFEPEAGLYFIAKGSEETLDQLKDIMTSLQYSGLGGKRNAGYGQFEYEIINNQQLFKLLNQNGEHSILLSTAMAKEDEIKSALKEARYILNKRSGFIQSTNYSEMLVKKSDFYSFSSGSVFKNIFNGDVFNVGHNGKHPVYRYAKPLWLEV >NC_018608.1|WP_000286998.1|60620_61265_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm3 MYSKIKISGTIEVVTGLHIGGGGESSMIGAIDSPVVRDLQTKLPIIPGSSIKGKMRSLLAKHFGLKMKQENHNQDDESVLRLFGSSEKGNIQRARLQISDAFFSEKTKEHFAQNDIAYTETKFENTINRLTAVANPRQIERVTRGSEFDFVFIYNVDEESQVENDFENIEKAIHLLENDYLGGGGTRGNGRIQFNDITIETVVGEYDSTNLKIK >NC_018608.1|WP_000599362.1|60193_60619_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm2 MILAKTKSGKKIDLTFAHEVVKSNVKTVKDKRGKENQVLFNGLTTSKLRNLMEQVNRLYTIAFNSTEDQLNEEFIDELEYLKIKFYYEAGREKSVDEFLKKTLMFPIIDRVIQKESKKFFLDYCKYFEALVAYAKYYQKED >NC_018608.1|WP_000359017.1|57917_60191_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 MDKKTTLMYGSLLHDIGKIIYRSNDHAFARGTHSKLGYNFLSQFSEFKDNEVLDSIAYHHYKELAKANLANDNTAYITYIADNIASGIDRRDVIEEGDEEYEKQAFNFDKYTPLYSVFNIVNSEKLKQISGKFKFSNESNIEYPKTENIQYSSGNYTTLMKDMSYDLEHKLSIKEDTFPSLLQWTESLWQYVPSSTNKNQLIDISLYDHSRITCAIASCIFDYLNENNIHNYKDELFTKYENTKEFYQKEAFLLLSMDMSGIQDFIYNISGSKALKSLRSRSFYLEIMLEVIVDQLLEKLELTRANLLYTGGGHAYLLVSNTDKGKEKINQFNTELKNWFMSEFTTDLSLSIAFEKCSGNDLMNTSGNYRNIWRNVSSKLSDIKAHKYSSEDILKLNHFHSYGDRECKECLRSDIDINDDGLCSICEGIINISNDLRDKSFFVLSETGKLKMPFDKFISVIDYEEAERLAQNNNHIRIYSKNKPYIGVGISTNLWMCDYDYASQNKDMREKGIGSYVEREEGIKRLGVVRADIDNLGATFISGIPEKYNSISRTATLSRQLSLFFKYELNHLLENYQITAIYSGGDDLFLIGAWDDIIEVSVYINEKFKDFTLGKLTMSAGVGMFSGKYPISKMAFETGLLEEAAKTDEKNQIALWVQEKVYNWDEFKKYILEEKLLVLQHGFSQTDEHGKAFIYKMLALLRNNETINIARLAYLLARSKMTEEFTSKIFNWAQNDKDKNQLITALEYYVYQIREVD >NC_018608.1|WP_000281076.1|57598_57904_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYLLVSFDLPRDTKFERRVASKYRTRLLELGFSMKQFSLYERYVSDVQKKDKILEILQQEIPDTGSITLYVLPDEVNNSQITILGKEVKVVVRKEPKLIFL >NC_018608.1|WP_000655859.1|56693_57599_+|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKDVIYVENHYFVTVKENSIKFRNVIDKSEKFYLFEEIEAIIFDHYKSYFSHKLVIKCIENDIAIIFCDKKHSPLTQLISSYGMTHRLQRIQSQFQLSGRTRDRIWKKIVVNKIINQSKCLENNLHNENVKLLVNLAKDVSSGDKSNKEAQAARIYFKDLYGKQFKRGRYNDIINSGLNYGYSILRSFIKKELALHGFEMSLGINHRSKENPFNLADDIIEVFRPFVDNIVYEIVFKKNINTFDVNEKKLLLNVLYEKCIIDKKVVRLLDSVKIVIQSLIRCYEENTPTYLLLPKMIEVGN >NC_018608.1|WP_072093071.1|54787_55099_-|DUF3387-domain-containing-protein MLSDDFLKDVEGLKQKNVAVELLNRLLKGQVKSLMKTNATVSKRFSEMLRNSINKYNSRSIETSKVIEELIQLAKDIKQEQQRGNELGLNSDEIAFLRCFSFT >NC_018608.1|WP_000669699.1|66317_66476_+|hypothetical-protein MKFKSKQLVIANQTKVINYRIQVLLKPQANIETQTQVKNNTLPETDEQSNAD >NC_018608.1|WP_000592003.1|66784_68989_+|AAA-family-ATPase MIKKISLQNIATYRNYVEIKPKKINFIYGSNGSGKTTISNLIGRFNKSDDCVIETKKNSNSSILVYNKKFVEKNFSQSDIGLKGIFTLGENSINLQDNLNELRRKIQVNEENIYIKEKTIRGFEEEIEERTNIIKDKIWNHQKEISKDFPEAFVGYKNNKQKFLNQCIKVYEENILEKSEEILTNSLEKLKENYNISFSDDIKLYEVFNVNDTEKILEIEKTNLIEKVIVGGNDSLIGQFIQSLKNSDWVKQGLDYLDYSNHTCPFCNQSISEKLEQEIKDYFNEEYEQDLKKIKEIKQVYSSCFEKIESNMLFILRKSIPYLNTKLLSKEFEVLEKQYEVNQKQLKEKLRNPSQKLKIKSLVPKIENINEIISSLNESIETNNNIIRNKEREQNKFKKNLWIYIVNNMKQDLKEYVNFKNGKFKAIANIRRQISGLKNENKKTNKEIGEIETNITSVEPTVKNINEILNKFDFKGFKLQENSNAKGTYLIVREDGSNANETMSEGEYNFITFLYFYYLVYGSHESTSLTSNKIVIIDDPISSLDSNVLFIVSTLVKNLINDCRNNKNGIQQIFNLTHNIYFHKEITFLGSRERFSPNEVMYGIIRKKDNISYFNTYENNPIESSYQLMWKELNSEEMSPITSFNTMRRILEYYFNIIGGMDYEKCINKFDGIDKILCKSLISGINDGSHFISDDFVITFDEASMRNYKRVFKLVFEKLGHIQHFEMMSKNKIK >NC_018608.1|WP_014532447.1|69219_69444_+|hypothetical-protein MRHDIYEGVLFYIMKGIKPNYAELGRQYNCDPRTVKKYYEAGKENELERLKKRQQNKKASKLDPFKEIINKKLN >NC_018608.1|WP_000566444.1|70587_71232_+|ATP-binding-protein MIDLTEKEIEYQSELKFKRAVNSARFPKIKYLHDFDFMFQPSINQQEILTLKSMHFLEDSINICFLGNSGVGKTHLAISLGIEACKQNIKTRFYTFKELIDLLTVSDSKGIINKTLKQLSRIELLIIDEIGYTPITKEQADLFYQLMSLRYEWKSTIITTNIPFSSWGESFSNKIVSAAIIDRLVHHSKVFKITGESYRLKDYKTEKSLNIRQS >NC_018608.1|WP_000067245.1|71509_72133_+|hypothetical-protein MSNLHLSNIQLIFDDMRDKDYIIDSFKFKYKNENYLVFIRRFKGKFIKRINKFAKVQLTFYKESTMKNSLVVEANNNGLIVNDYNMLYNFFGIESSSFGKGLFPFYESLNEAIPNEVNLNSSKEKNISLSKELYKDDIKEMDKIYCTGVTRLSEGRKRSERRNEKAKRLRPALYEFFDDHSITFNFSPHEWKEKSDEQIKKDAVNRL >NC_018608.1|WP_001081373.1|73419_74079_+|hypothetical-protein MNRNLLTILLLIGYTYLIFNFLTTEYSLAPRIFYTLNFISLSLILLAKAKSKKLNKHTHFLDEVQLVLEKRYSTIMYILNIALVVSFISFLTGFIYLREEYPQFILYSSVLLVMSFYYIKLFYEDKNNIIYMNRKIVDFNNSEVECQLQLDDGEKNILLKQLDNFYKSTIILLFITEIMLMFYSIISSNYQTVSMVLIAIVIFISSSLLITKNVYTNRN >NC_018608.1|WP_000140912.1|74590_75562_-|amidohydrolase MTETKAIDTHAHLWNEDYLDKLGKLGSQGTEVAKGINQSASKEDLEKRFKMMDDAGVDLQIISATPQSPQWGTKEEAHQSAQEINDLYERLVQQYPDRFLAYGAVSLPYVDQAIEEAQALLKKDEFVGIAIPTIVKDKVSVADKQFEPFFAAMNELNATLYIHPTGCGAQSPLVNDYQLEWVIGAPLESTFITLQLIKNEIPQKYPNIKFHISHLGGALPFFMTRIKDNYEDWNAFNIDPYEVLNRQFWYDTANFHEPSLINSIETFGKDKFMMGSDFPYFQDEKYTRGVDYIKNSNIDPDTINGILRGNAIEFYQIEENHSH >NC_018608.1|WP_000926749.1|75614_75986_-|DoxX-family-protein MLLRHVINTYVGSEIFKSSLPKVQNSDEMAQQFEQGFGLSRRSMRLAGAFEMIGSLLLFTSIFGKLGKKLVVVGTIMINIVMGTAIYNHYKAGHGYKGAQAASKFFFLNVLSLLEVLSLTRNK >NC_018608.1|WP_001244599.1|76005_77397_-|DHA2-family-efflux-MFS-transporter-permease-subunit MRNIYAFNIDLKQRNRVIAVVMIGAFVGVLNQTLMTTILPEIMKDFTVSSSTAQWLTTIFMLVNGIMIPITAFLIERFTLRSLFFNATCFLMIGSFICMLGINFPMLLVGRSIQALGAGILMPLTQTLLFIMFPPEKRGMAMGMFGLVIGFAPAIGPTAAGWFVNIFDWRYLFLIVLLIGMIDFVFGYLSLPNITELSKPNLDKLSIILSTVSFGGLLFGFSTAGNLGWSHPMVYITIIAAIVILTVFIFRQLKLESPLLEFRVFKYNDFSVAMILIVLMFMLFIGNLTILPIYMQTMMKWSPLESGLILLPGGLIMGLLSPVTGKLFDKIGGRILSIMGMLTIMIGALLMAQFSQNTTQLYVIISFSVTMLGNAMIMTPMTTQALNALPRQYIAHGTAMNNTIRQVSAAIGTGILVTLMTGLGKTSSLSGSQGLIHGLDITFYVVALIAFIGTIIAFFIRKQ >NC_018608.1|WP_000786139.1|77510_77714_+|N-acetyltransferase MKNAIMKEVVYINFEGLEQYLNGDNTRYNMLSLDVLNYYLKQYVLTIPFKNMDVQNGMKVSAEVKDI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018608_3 | 292880-293079 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018608_3
|
3 spacers
spacers of NC_018608_3
>3.1|292911|25|NC_018608|CRISPRCasFinder GGCGAAAATACAGCTTACAATAATG >3.2|292967|25|NC_018608|CRISPRCasFinder TTGGAACAGCAATTTCTACAGACAA >3.3|293023|26|NC_018608|CRISPRCasFinder AGCGAAAAGTCAGCTTACAATAATGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018608_3
The CRISPR arrays of NC_018608_3 >merge|NC_018608|3|292880-293079|CRISPRCasFinder GTTATATTGGCGGATCCCCAACACAGAAGCTGGCGAAAATACAGCTTACAATAATGTGCGAGTTGGCAGGCCTCCAACACAGAGAAATTGGAACAGCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTAGCGAAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGGCCCCAACACAGAAGCT >NC_018608|3|3|292880-293079|CRISPRCasFinder GTTATATTGGCGGATCCCCAACACAGAAGCT GGCGAAAATACAGCTTACAATAATG TGCGAGTTGGCAGGCCTCCAACACAGAGAAA TTGGAACAGCAATTTCTACAGACAA TGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCT AGCGAAAAGTCAGCTTACAATAATGT GCAAGTTGGCGGGGGCCCCAACACAGAAGCT
>NC_018608.1|WP_000164008.1|291377_292814_+|6-phospho-beta-glucosidase MTKLPQSFMWGGALAANQFEGGYDKGGKGLSVIDVMTSGAHGKARQITESIDPNHYYPNHEGIDFYHRYKEDIALFKEMGLKCLRTSIAWTRIFPNGDEDVPNEEGLAFYDRIFDELIAQGIEPVVTLSHFEMPLHLAKHYGGFRNREVVDYFVHFARVVFERYKDKVTYWMTFNEINNQMDTSNPIFLWTNSGVALTENDNPEEVLYQVAHHELLASALAVRLGKEINPKFKIGTMISHVPIYPYSCHPKDMMEAQIANRLRFFFPDVQVRGYYPSYAKKMLARKGYDVGWQEGDDSILQQGTVDYIGFSYYMSTAVKHDVNTTVENNIVNGGLNHSVENPHIATSDWGWAIDPDGLRYTLNVLYDRYQLPLFIVENGFGAVDEVVDGHIHDDYRIEYLKAHITAAIEAVDQDGVDLIGYTPWGIIDIVSFTTGEMKKRYGLIYVDRDNDGHGTMERLKKDSFYWYQQVIASNGDKL >NC_018608.1|WP_000066924.1|290570_291362_+|PTS-glucose-transporter-subunit-IIA MSNKYKDQAQDILTAVGGVENIVDVSYDTVRMTIHMHHAIPSTANEVTQIDGVASVDENETQLVIVFNEEVKYVYQQLQLLMDDAKHQEDTNHDAVDTQETEQKAQAKVTTPILVKAPIAGRRILLKEVRDSIFREKMVGEGLAIKAHKEFKVIAPFSGKVSMIVPTKHAVGIQSEDGVDIVIHIGVNTVDLEGKGFKCFVKQNDRVEAGQTLLQFDQQYIQEQGYNSDVIVVISNSSDFNKVELTMNEIITTEDVIFKIFKN >NC_018608.1|WP_000922329.1|289717_290422_-|GntR-family-transcriptional-regulator MLKYEHIAKQLNAFIHQSNFKPGDKLPSVTQLKERYQVSKSTIIKALGLLEQDGLIYQAQGSGIYVRNIADANRINVFKTNGFSKSLGEHRMTSKVLVFKEIATPPKSVQDELQLNADDTVYYLERLRFVDDDVLCIEYSYYHKEIVKYLNDDIAKGSIFDYLESNMKLRIGFSDIFFNVDQLTSSEASLLQLSTGEPCLRYHQTFYTMTGKPFDSSDIVFHYRHAQFYIPSKK >NC_018608.1|WP_000062646.1|287200_289492_+|cbb3-type-cytochrome-c-oxidase-subunit-I MSMQSSYKRLVKVLLTILVIVFSILLVGGWYIFKNEAPRPTKIVDQQGHTLVTKGELISGQAIYEKYGLTDYGSYLGNGSYLGPDYTAEALHHYLIGMRKYYAQDIYHKQLHKLNHVEIAVVKDKVMKEIRINRYSEKEDQLVLTPGQVYGLKYLQDYYKKEFVNNPKQVGLNENMIKQFQNDDYMVAGNKIEHLSQFFFWGAWLSSTDRPGKTFSYTNNWPYDVDAGNTLPSAGILWTAISVTLLIAGLAFIIYIQKRYEFDMKPTYESERELPKIEVDSKITDSQRKVGKYLVVVMLLFLVQILLGELLAHYYVENKFFGIEIQRLFPFNIVKTWHVQLVIFWVATTWLAAGIYIVPKVLGNEPKKQGVLVDILFWALIIVVMGSMIGEWSHILGWIDSHWWLFGHFGWEYIELGKFWQILFIVGMVLWVIILCRGFLPAIRNKVQVNHDKRHLLTLLFVGAIAIPLFYLASLFIMPNSHVTFADYWRWWIVHLWVEGIFEAFAVVLIGFLMVNMKLTTIETTIRALYFQLILLLGTGIVGMGHHYYWQGDHSIWLALGSCFSALEVVPLCLLIWEAYTHYRLYKKSDIAFPYKGTFIFLASTGLWNAIGAGALGFLINTPAVNYFEHGTQWTAAHAHGSMAGVYGMFSIAIALYVFKNITKKEFWTPKVEKWIKISCWALNVGLAGMVFVTLIPVGYIQLKDGLEDGYWHSRLTSFYEQPLVKAIMWGRMPWDIIFTVGVIILVVIFIRGYRHLKPKYRV >NC_018608.1|WP_000607067.1|286158_286860_+|antiholin-like-protein-LrgB MINHLALNTPYFGILLSVIPFFLATILFEKTNRFFLFAPLFVSMVFGVAFLYLTGIPYKTYKIGGDIIYFFLEPATICFAIPLYKKREVLVKHWHRIIGGIGIGTVVALLIILTFAKLAQFANDVILSMLPQAATTAIALPVSAGIGGIKELTSLAVILNGVIIYALGNKFLKLFRITNPIARGLALGTSGHTLGVAPAKELGPVEESMASIALVLVGVVVVAVVPVFVAIFF >NC_018608.1|WP_001792906.1|285722_286166_+|antiholin-like-murein-hydrolase-modulator-LrgA MVVKQQKDASKPAHFFHQVIVIALVLFVSKIIESFMPIPMPASVIGLVLLFVLLCTGAVKLGEVEKVGTTLTNNIGLLFVPAGISVVNSLGVISQAPFLIIGLIIVSTILLLICTGYVTQIIMKVTSRSKGDKVTKKIKIEEAQAHD >NC_018608.1|WP_000645457.1|284869_285610_+|DNA-binding-response-regulator MKALIIDDEPLARNELTYLLNEIGGFEEINEAENVKETLEALLINQYDIIFLDVNLMDENGIELGAKIQKMKEPPAIIFATAHDQYAVQAFELNATDYILKPFGQKRIEQAVNKVRATKAKDDNSASTIANDMSANFDQSLPVEIDDKIHMLKQQNIIGIGTHNGITTIHTTNHKYETTEPLNRYEKRLNPAYFIRIHRSYIINTKHIKEVQQWFNYTYMVILTNGVKMQVGRSFMKDFKASIGLL >NC_018608.1|WP_000950281.1|283112_284867_+|sensor-histidine-kinase MLSLTMLLLERVGLIIILAYVLMNIPYFKNLMNRRRTWKARWQLCIIFSLFALMSNLTGIVIDHQHSLSGSVYFRLDDDVSLANTRVLTIGVAGLVGGPFVGLFVGVISGIFRVYMGGADAQVYLISSIFIGIIAGYFGLQAQRRKRYPSIAKSAMIGIVMEMIQMLSILTFSHDKAYAVDLISLIALPMIIVNSVGTAIFMSIIISTLKQEEQMKAVQTHDVLQLMNQTLPYFKEGLNRESAQQIAMIIKNLMKVSAVAITSKNEILSHVGAGSDHHIPTNEILTSLSKDVLKSGKLKEVHTKEEIGCSHPNCPLRAAIVIPLEMHGSIVGTLKMYFTNPNDLTFVERQLAEGLANIFSSQIELGEAETQSKLLKDAEIKSLQAQVSPHFFFNSINTISALVRINSEKARELLLELSYFFRANLQGSKQHTITLDKELSQVRAYLSLEQARYPGRFNININVEDKYRDVLVPPFLIQILVENAIKHAFTNRKQGNDIDVSVIKETATHVRIIVQDNGQGISKDKMHLLGETSVESESGTGSALENLNLRLKGLFGKSAALQFESTSSGTTFWCVLPYERQEEE >NC_018608.1|WP_000608834.1|282191_282866_+|iron-sulfur-cluster-repair-di-iron-protein-ScdA MINKNDIVADVVTDYPKAADIFRSVGIDFCCGGQVSIEAASLEKKNVDLNELLQRLNEVEQTNTPGSLNPKFLNVSSLIQYIQAAYHEPLREEFKNLTPYVTKLSKVHGPNHPYLVELKETYDTFKNGMLEHMQKEDDVDFPKLIKYEQGEVVDDINTVIDDLVSDHIATGQLLVKMSDLTSSYEPPIEACGTWRLVYQRLKALEVLTHEHVHLENHVLFKKVS >NC_018608.1|WP_000975356.1|280326_282048_+|poly(ribitol-phosphate)-beta-N-acetylglucosaminyltransferase MMKFSVIVPTYNSEKYITELLNSLAKQDFPKTEFEVVVVDDCSTDQTLQIVEKYRNKLNLKVSQLETNSGGPGKPRNVALKQAEGEFVLFVDSDDYINKETLKDAAAFIDEHHSDVLLIKMKGVNGRGVPQSMFKETAPEVTLLNSRIIYTLSPTKIYRTALLKDNDIYFPEELKSAEDQLFTMKAYLNANRISVLSDKAYYYATKREGEHMSSAYVSPEDFYEVMRLIAVEILNADLEEAHKDQILAEFLNRHFSFSRTNGFSLKVKVEDQPQWINALGDFIQAVPVRVDALVMSKLRPLLHYARAKDIDNYRTVEESYRQGQYYRFDIVDGKLNIQFNEGEPYFEGIDIAKPKVKMTAFKFDNHKIVTELTLNEFMIGEGQYDVRLKLHSRNKKHTMYVPLSVNANKQYRFNIMLEDIKAYLPKEKIWDVFLEVQIGTEVFEVRVGNQRNKYAYTAETSALIHLNNDFYRLTPYFTKDFNNISLYFTAITLTDSISMKLKGKNKIILTGLDRGYVFEEGMASVVLKDDMVMGMLSQTSENEVQILLSKDIKKRDFKNIVKLNTAHMTYSLK >NC_018608.1|WP_000031255.1|293389_294151_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MSKEAGHTFLAKLGKTRLRPGGKAATDWLIQQGAFSQDKHVLEVACNMCTTSIYLAHTYGCHIQGVDINKKALEKAQENISAAGLESYIQVQQANAVKLPFDDNQFDIVLNEAMLTMLPIAIKEKALREYYRVLKPGGILLTHDIVIVNESHATHVVKSLSAAINVNVSPQTKLGWLDLYHQAGFNHVHYHTGPMSLMTPKGLIYDEGIVGTIKIINNALKKENRPMFCKMFKTMTRLRKDMNYITFVAKKEH >NC_018608.1|WP_000182750.1|294402_295317_-|ribokinase MTNKVVILGSTNVDQFLTVERYAQPGETLHVEEAQKAFGGGKGANQAIATARMQADTTFITKIGTDGVADFILEDFKAAHIDTSYIIKTTEEKTGQAFITVNAEGQNTIYVYGGANMTMTPEDVINAKDAIINADFVVAQLEIPIPAIISAFEIAKAHGVTTVLNPAPAKALPNELLSLIDIIVPNETEAELLSGIKVTNEQSMKDNANYFLSLGIKTVLITLGKQGTYFATKNQSQHIEAYKVNAIDTTAAGDTFIGAFVSRLNKSQDNLADAIDFGNKASSLTVQKHGAQASIPLLEEVNQV >NC_018608.1|WP_000750483.1|295344_295749_-|D-ribose-pyranase MKKTAVLNEHISKAIATIGHFDLLTINDAGMPIPNDHRRIDLAVTKNLPRFIDVLATVLEEMEIQKIYLAEEIKEHNPTQLQQIKQLISSEIEIIFIPHEEMKSNLAHPLNKGNIRTGETTPYSNIALESNVTF >NC_018608.1|WP_000029208.1|295763_296645_-|ribose-transporter-RbsU MSIVALLIGLGPLIGWGFFPTVASKFGGKPVHQIIGATVGTLIFAIILAVVTSSGFPTGTNLLFALLSGAGWGFGQIITFKAFELVGSSRAMPVTTAFQLLGASLWGVFALGNWPGIGHRIIGFTALVVILIGARMTVWSERKEASNAKNLRRAVVLLLIGEFGYWLYSAAPQATSIDGLTAFLPQAMGMVIVAVIYGFMNMKAENPFRNKITWLQIISGFFFAFGALTYLISAQPNMNGLATGFILSQTSVVLATLTGIYFLKQHKTSKEMVITIIGLVLILVAASVTVFIK >NC_018608.1|WP_000757874.1|296876_297875_-|LacI-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MKKVSIKDVAREAGVSVTTVSHILNHNDSRFSATTIKNVHAVSECLGYAPNKHAKQLRGSKIQTIGVILPSLTNPFFSALMQSIHDHKPSDVDLCFLTSTATDLYDNIKHLIDRGIDGLIIAQYISSPDALNNYLKKHHVPYVVLDQNDHQGYTDFVRTNEYQGGQLAAQHLIELGHNNMMIVAPYDMMANMSTRVTGFVDTLRANQLPEPQIVHTELSKRGGLTIVDDIMVQSATAIFAINDELAIGILRGLIEHGISIPKDISLIGYDDIDYAAYVSPPLTTVAQPITDIGKTSLTLLLQRLQHLDKSIDMIELPTTLKIRATTGYHLSN >NC_018608.1|WP_001159764.1|298255_298648_+|hypothetical-protein MQFKLKEEEIISFLELKYPEKEFEYGRLLVGQHKRDDLDVYYFGDTFLMCTIISFKTFEIKETVELSYDAVNRIVLKDGWLFRKMRIETMQKVLKYGTSKLMLTDFQKDNYNKYIQGQKQRVIFENGHFV >NC_018608.1|WP_001066542.1|298776_300153_-|MFS-transporter MNNTQSSPRSNIIIAIMLSALTYWLFAQSFINIGPLVGQTYQTSPAVLNLSISLTSFATGIFMVAAGDIADKIGQLRMTYMGLIISMFASLLLIISDITALLIIGRILQGLSAAILLPSTVGVLNNQFKGDHLRRAISYLMISTVGGIGLAGVIGGLIATNFGWQTNFIISIVIAFIAILLLKGTPEKVSQHSHRHPFDYKGMSIFAVMIGSFTLLLTQGFEQGWFSTFSFICLSIIIITTLIFIIIERRHEVPFIDFSVLRNRPFIGAFLNNFVLNSGLGVTVVFFIYAQTHLGLSAAQSGLVTLPYAIVAVAMIRLGEKATLRFGGKLMLIIGPLFPVIGITIISMTSLQPSQYIIAVVIGFVICAIGNGLVATPGLTIAIFSMPNEKVGLATGLYKMSGTLGGAFGIALSTTVFSMLQLNYAPSVAATITFIVSIVLMILGSLSAYMIIPKTVKS >NC_018608.1|WP_000337367.1|300386_301379_+|linear-amide-C-N-hydrolase MCTGFTIQTLNNQVLLGRTMDYDYPLDGSPAVTPRNYRWTSRTGTTGQTQYGFIGTGTDMEGFIYGDGVNEHGVAISTQYFRGYSSYGSIHKADAMNITQNEIVTWILGYTTSIEDMKQQASQIHVVAVYLNDIGEVPPLHYHVSDATGHSVEVSFKEGEVVIKDNPIGVLTNHPDLDWHYSNLRQYINISPYPAPANLLEGVTIEPLGNEAGTFGLPGGFTSTERFVRMAFMKANIAQNNDKEMDLMNAFYLLDAVNIPIGIVRPHDADNHYTMYQTVINLTTRTLYIKYYGSNEIVALKLTDDLINRKDMTIFKPEKHITIRKLNDNQ >NC_018608.1|WP_000736798.1|301704_302655_+|glycine-glycine-endopeptidase-LytM MKKLTAAAIATMGFATFTMAHQADAAETTNTQQAHTQMSTQSQDVSYGTYYTIDSNGDYHHTPDGNWNQAMFDNKEYSYTFVDAQGHTHYFYNCYPKNANANGSGQTYVNPATAGDNNDYTASQSQQHINQYGYQSNVGPDASYYSHSNNNQAYNSHDGNGKVNYPNGTSNQNGGSASKATASGHAKDASWLTSRKQLQPYGQYHGGGAHYGVDYAMPENSPVYSLTDGTVVQAGWSNYGGGNQVTIKEANSNNYQWYMHNNRLTVSAGDKVKAGDQIAYSGSTGNSTAPHVHFQRMSGGIGNQYAVDPTSYLQSR >NC_018608.1|WP_000570073.1|302706_303366_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIEINNLSKRYRNKQIFNHLTMSFDSNRLTVLLGDNGAGKSTLLRMIAGIEKANDGTINYFGEKWNQRQIQNHIGYVPQDIALFEHMTVAENIKFFKSLCKNSINDTTINEYLQQLNFNDTSAKVSTLSGGNKRKINILVGLLGQPRILILDEPTVGIDLKSRHDIHQLLNIMKSKCLIILTTHHLDEVEALADDIKLIGQDPFYQHVLEDKQWAYTYY |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_018608_4 | 702625-702733 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018608_4
|
1 spacers
spacers of NC_018608_4
>4.1|702664|31|NC_018608|CRISPRCasFinder AGCCTCTAATCACTAGAGTTCAAGAGGCTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018608_4
The CRISPR arrays of NC_018608_4 >merge|NC_018608|4|702625-702733|CRISPRCasFinder AAAGGAACGCAGTTGGATGCTACCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATCACTAGAGTTCAAGAGGCTTTAAAGGAACGCAGTTGGATGCTACCGCACAACTGCATAAA >NC_018608|4|4|702625-702733|CRISPRCasFinder AAAGGAACGCAGTTGGATGCTACCGCACAACTGCATAAA AGCCTCTAATCACTAGAGTTCAAGAGGCTTT AAAGGAACGCAGTTGGATGCTACCGCACAACTGCATAAA
>NC_018608.1|WP_000901759.1|701819_702455_+|endonuclease-III-domain-containing-protein MLGTDELYKLLYRHMGPQNWWPADNDIEMMLGAILVQNTRWRNAEIALNQIKEHTHFNPNHILELPIETLQSLIRPSGFYKSKSLTIKTLLTWLARHHFNYQEINERYKAELRKELLTLKGIGSETADVLLVYIFERIEFIPDSYTRKIYNKLGYENTKSYDQLKKVITLPNHFTNQDANEFHALLDVFGKHYFRDKDIKNYDFLEPYFKK >NC_018608.1|WP_001021133.1|699673_701335_+|arginine--tRNA-ligase MNIIDQVKQTLVEEIAASINKAGLADEIPDIKIEVPKDTKNGDYATNIAMVLTKIAKRNPREIAQAIVDNLDTEKAHVKQIDIAGPGFINFYLDNQYLTAIIPEAIEKGDQFGHVNESKGQNILLEYVSANPTGDLHIGHARNAAVGDALANILTAAGYNVTREYYINDAGNQITNLARSIETRFFEALGDNSYSMPEDGYNGKDIIEIGKDLAEKHPEIKDYSEEARLKEFRKLGVEYEMAKLKNDLAEFNTHFDNWFSETSLYEKGEILEVLAKMKELGYTYEADGATWLRTTDFKDDKDRVLIKNDGTYTYFLPDIAYHFDKVKRGNDILIDLFGADHHGYINRLKASLETFGVDSNRLEIQIMQMVRLMENGKEVKMSKRTGNAITLREIMDEVGVDAARYFLTMRSPDSHFDFDMELAKEQSQDNPVYYAQYAHARICSILKQAKEQGIEVAAANDFTTITNEKAIELLKKVADFEPTIESAAEHRSAHRITNYIQDLASHFHKFYNAEKVLTDDIVKTKAHVAMIEAVRITLKNALAMVGVSAPESM >NC_018608.1|WP_000359090.1|699260_699677_+|DUF1934-domain-containing-protein MDKKVSIYTKQVLKQHNEKEKFEFTTEGTWQQRQSNFIRYVEQIEDATVNVTIKVDDDSVKLIRKGDINMNLHFVEGQATTTFYDISAGRIPLEVKTLRILHFVSGDGGKLKIHYELYQDNEKMGSYQYEINYKEIGE >NC_018608.1|WP_001200750.1|697974_698985_+|alcohol-dehydrogenase-AdhP MRAAVVTKDHKVSIEDKKLRALKPGEALVQTEYCGVCHTDLHVKNADFGDVTGVTLGHEGIGKVIEVAEDVESLKIGDRVSIAWMFESCGRCEYCTTGRETLCRSVKNAGYTVDGAMAEQVIVTADYAVKVPEKLDPAAASSITCAGVTTYKAVKVSNVKPGQWLGVFGIGGLGNLALQYAKNVMGAKIVAFDINDDKLAFAKELGADVIINSKDVDPVAEVMKLTDNKGLDATVVTSVAKTPFNQAVDVVKAGARVVAVGLPVDKMNLDIPRLVLDGIEVVGSLVGTRQDLREAFEFAAENKVTPKVQLRKLEEINDIFEEMENGTITGRMVIKF >NC_018608.1|WP_016187113.1|696954_697476_+|YwhD-family-protein MEVISLSEKKGFNFNIIKNDPLDGHKGTNIGSISLDNIAPVFIDVANKEAFIDIGGMHARAKVEKGVKWITDKAAVEGDEAKEYWLCWVTTERNEQGPYYAGLTACYLLVNKAIRRGYKSMPEHVNMMDKSMKHHIIIDQIGDENKVILKDFLMNHDEGMWKHSSDALHQAFN >NC_018608.1|WP_000180233.1|695631_696927_+|HD-domain-containing-protein MTNAYVDLKLVEEKVFKDPIHRYIHVEDQLIWDLIKTKEFQRLRRIRQLGTLYLSFHTAEHSRFGHSLGVYEIVRRLIDESFIGHDAWDNKDRPLALCAALLHDLGHGPFSHSFEKIFNTDHEAYTQAIITGDTEVNAVLRKVSPEFPREVAEVINKTHHNKLVISMISSQIDADRMDYLQRDAYFTGVSYGAFDMERILRLMRPSKDEVLIKESGMHAVENFIMSRYQMYWQIYFHPVSRGGEVLLNNCLKRAKQLYNEGYEFKLHPHDFIPFFEETVTIEQYVELDEAVVTYYLEKWTKEDDAILSDLASRFINRDLFKYIPFDGSIITISELQELFEAGGINPDYYFVSEAFSDLPYDYDRPGSNRKPIHLLRQDGKIREISNQSLVIHSITGINRQDYKLYYPREMVAKIKDKTIREAIENLINELN >NC_018608.1|WP_000477504.1|695115_695592_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MFKVRQATEKDVVQIRDVATKAWFNTYLNIYAATTVNHLLEASYNEHHLKKRLQEQLFLVVEEGNDIVGFANFIYGEELYLSAHYVKPESQHTGYGTALLNEGLSRFEDKFEGVYLEVDNKNEEAVAYYKEQGFTILRSYEPEMYGEKLDLALMYKAF >NC_018608.1|WP_000633790.1|694409_694946_+|flavodoxin-family-protein MITVLFGGSRPNGNTAQLTKFALQGLDYQWIDVTQHRFKPIRDVRHIEESITDYEDDYQEILDKVLASDTIIFASPVYWYSISAPLKAFIEHWSETLQDKRYPNFKAQMAEKDFRVILVGGDCPKIKAKPAITQMKYSLDFLGATLNGYIIGTANKPGDIMKDNYALARATEWNQLLQ >NC_018608.1|WP_000808883.1|693025_693964_+|aldo/keto-reductase MKQFVNLGKSDVEVFPIALGTNAVGGHNLYPNLDEEQGKDVVRQAINHGINFLDTAYIYGPERSEELVGEVVKEYPREQIKIATKGSHEFDENQEVHQNNQPEYLKQQVENSLKRLQTDYIDLYYIHFPDDNTPKDQAVAALQELKEQGKIKAIGVSNFTLDQLKEANKDGYVDVVQLEYNLLHRENEAVLQYCVDHQITFIPYFPLASGILAGKYDENTKFSDHRTTRRDFKPGVFEENVRRVNALEKIAAAHQTSIANIVLAFYLTRPAIDVIIPGAKRAEQVIENIKAADIVLSKDEIQYIDELFPIED >NC_018608.1|WP_000923047.1|692129_692756_+|DUF443-domain-containing-protein MLLCESKIINKNPKYRIIKYNDEYLMVDIISTWISLFFPFINWFIPKRYVKISKEDFENLNIVKPAKKNVFWPVAGISALFAVTLRKYTHLLDTQLDKKLVIAICCITFIGILIFYVRLIKKSSLNIYNPKNERSKIILIPTLKNFCFTLFGYILFGGLTMLFLDALLSMSHQNIIVYFTWIAVIMGFFLVNIALIIDKNIYVILKNQ >NC_018608.1|WP_000749060.1|702784_703672_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKSLIAFILIFMLVLSGCGMKDNDKQSSDDNGSSKSPYHRIVSLMPSNTEILYELGLGKYIVGVSTVDDYPKDVKKGKKQFDALNLNKEELLKAKPDLILAHESQKATANKVLSSLEKQGIKVVYVKDAQSIDETYNTFKQIGKLTHHDKQAEQLVEETKDNIDKVIDSIPAHHKKSKVFIEVSSKPEIYTAGKHTFFNDMLEKLEAQNVYSDINGWNPVTKESIIKKNPDILISTEAKTRSDYMDIIKKRGGFNKINAVKNTRIEVVNGDEVSRPGPRIDEGLKELRDAIYRK >NC_018608.1|WP_010922824.1|703822_704773_+|iron-ABC-transporter-permease MTFNKVLLSWIVILIITTSIYLFWQLGDINDVFNQSILINVRLPRLLEALLTGMILTVAGLIFQTVLNNALADSFTLGLASGATFGSGLALFLGLTTLWIPVFSITFSLITLITVLVITSVLSQGYPVRILILSGLMIGALFNSLLYFLILLKPRKLNTIANYLFGGFGDAEYSNVSIIAITFIIALFGIFIILNQLKLLQLGELKSQSLGLNVQLITYIALCIASMITAINVAYVGIIGFIGMVIPQLIRKWQWKQSLGRQLALNIVIGGQIMVMADFIGSHILSPVQIPASIIIALIGIPVLFYMLISQSKRLH >NC_018608.1|WP_000365352.1|704827_705547_+|HAD-family-hydrolase MDLNQIKAVVFDLEGTLLDRVKSREKFIEEQYERFHDYLIHVQLADFKKAFIELDDDEDNDKPDLYKEIIKRFHVDRLTWKDLFNDFEMHFYRYVFPYYDTLYTLEKLSQKGFQIGVIANGKSKIKQFRLHSLGLMHVINYLSTSETVGFRKPHPKIFEDMIDQLGVLPEQIMYVGDDALNDVAPARAMGMVSVWYKQEDAEIEPLEEEVDFTITTVEELLTILPIKIDNKGENYGSIY >NC_018608.1|WP_000362963.1|705530_706331_+|alpha/beta-hydrolase MDLFTRKDGTSIHYSTLGEGYPIVLIHTVLDNYSVFNKLAAELAKSFQVVLIDLRGHGYSDKPRHIEIKDFSDDIVELLKYLYIEEVAFVCHEMGGIIGADISVRYPEFTSSLMLVNPTSIEGELPEERLFRKYAHIIRNWDPEKQDKFLNKRKYYRPRKMNRFLKHVVDTNEISTKEEIQAVKEVFKNADISQTYRNVVVPTKIIAGEFGERTTRLEAKEVADLIQNADFEVYQESSAFPFVEEQERFVEDTAAFINKHHDEKHV >NC_018608.1|WP_000735556.1|706466_706973_+|hypothetical-protein MKKLLTASIIACSVVMGVGLANTSAEAASGNSIDTVKQLIKGDQSLENVKIGESIKDVLTKYKNPMYSYNENGTEHYYEFHTKKGMLLVTTDGKKNNGKVTHISMMYNDANGPTYQAVKNYVGKAVTHTEYSKVAGNFGYIEKGKTTYQFASAPKDKNIKLYRIDLEK >NC_018608.1|WP_001222139.1|707134_707851_+|hypothetical-protein MRINDKILLENIEDYFNHKGLSPHLIDDIKEKVITDIKNSEKKDQDYIEYKRKSPAQIILMIQRNLFALQMNPVIFFILNFILISYLYDKQYVQFQAITGMSLFYCLVIFPMTIVVYLRVSQKNYLRSNKIEMIMGTIIAIISLLLIILQAFNITWGVIPITNFGHQFFFFIGIILVIAGIFYKRLEFSGIGLLFCQKTLDAMIHNPQSAQTFSLIIWILLVVLVIYFTIRLSSRTRL >NC_018608.1|WP_001045424.1|708019_708808_+|alpha/beta-hydrolase MNKVTINPQIQLTYQIEGKGDPIILLHGLDGNLAGFEDLQHQLASSYKVLTYDLRGHGKSSKSESYDLNDHVEDLKILMEKLNIHEAHILGHDLGGVVAKLFTDKYAYRVKSLTTIASKKDDLIHSFTQLLIQYQDDIAGFNKSEAYILLFSKLFRNQEKTMKWYQKQRIYSIKSEDDSAVAIRSLILHKDEPMYLKKRTCVPTLLINGEHDPLIKDKNHFKLESHFLNVTKKIFEHSGHAPHIEEPEAFLSYYLNFLKSVS >NC_018608.1|WP_001018677.1|709059_709434_-|transcriptional-regulator MAITKINDCFELLSMVTYADKLKSLIKKEFSISFEEFAVLTYISENKEKEYYLKDIINHLNYKQPQVVKAVKILSQEDYFDKKRNEHDERTVLILVNAQQRKKIESLLSRVNKRITEANNEIEL >NC_018608.1|WP_021285860.1|710381_711311_-|DMT-family-transporter MLLFYIIGVIVGMFIPIQTSVNSRLSLYTKSPFYTSFISFSVGTICLIVLNIFINPDVFSLHFFSNQTFNYTWFVGGLLGVGYLTGNLLLLPKLGATLTVIATVAGQIIMGVIIDTFGLFGATIHDFNLIKAIGVLLLIVGIITMNQINKCNILLTNQKHLIFWLLLGFTFGFFPPIQTTINSLLASHTHSPAFASLVSFTIGSITLLILTAIFNRSLKLKTSHLKFGKLKPIYFTGGILGMAFVTANIILMPHMGAALTTLIGMFGQILMGILIDHFGLFGSPKIAMTSRKTIGLLCILTGIILLRLF >NC_018608.1|WP_000169038.1|711503_711728_-|DUF2922-domain-containing-protein MTKTLELSFKSSLDKPVKLQLPQLNNIVTEQVARDSMNALVDLNILKSNSGAITKVHSAQIIDKTTTVLFEAKK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_018608_5 | 864913-864995 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018608_5
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1 spacers
spacers of NC_018608_5
>5.1|864939|31|NC_018608|CRISPRCasFinder TTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018608_5
The CRISPR arrays of NC_018608_5 >merge|NC_018608|5|864913-864995|CRISPRCasFinder CACCCCAACTCGCATTGCTTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCCACCCCAACTCGCATTGCCTGTAGAA >NC_018608|5|5|864913-864995|CRISPRCasFinder CACCCCAACTCGCATTGCTTGTAGAA TTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCC CACCCCAACTCGCATTGCCTGTAGAA
>NC_018608.1|WP_000134958.1|863560_864496_+|thioredoxin-disulfide-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIETKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >NC_018608.1|WP_000057561.1|862054_863494_+|tetratricopeptide-repeat-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMANQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYHNELFVIENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >NC_018608.1|WP_001224800.1|861561_862047_+|acetyltransferase MRKFLSKTYHHTNPLWHVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >NC_018608.1|WP_000513301.1|860714_861554_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPGEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >NC_018608.1|WP_000958224.1|859776_860709_+|HPr-kinase/phosphorylase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >NC_018608.1|WP_000662684.1|856320_859167_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEARTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNINLSEQDQAIANQILKEIISRLAFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIEVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGVDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYDKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKINRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDN >NC_018608.1|WP_000229253.1|854327_856313_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrB MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVEGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >NC_018608.1|WP_000638419.1|853822_854059_+|CsbA-family-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >NC_018608.1|WP_000538141.1|853175_853826_+|HD-domain-containing-protein MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKRKEENE >NC_018608.1|WP_000749384.1|852162_853002_+|CHAP-domain-containing-protein MKKSLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQHGTQVKTPVQHNYVSNVQAQTQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKTVKSPVRKASQAKKVVKQPVQQASKKVVVKQAPKQTVAKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTPEVGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH >NC_018608.1|WP_000369722.1|865263_866175_+|RNase-adapter-RapZ MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >NC_018608.1|WP_001248939.1|866171_867167_+|YvcK-family-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >NC_018608.1|WP_000006551.1|867275_868220_+|DNA-binding-protein-WhiA MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >NC_018608.1|WP_001049165.1|868789_869377_+|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP 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MKQYLITGGTGMVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQKIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKVLFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGIILSNEGGALQTMKLPYEYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINNESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLISK >NC_018608.1|WP_000070836.1|873005_873635_+|DUF4887-domain-containing-protein MSNQNYDYNKNEDGSKKKMSTTAKVVSIATVLLLLGGLVFAIFAYVDHSNKAKERMLNEQNQEQKEKRQKENAEKERKKKQQEEKEQNELDSQANQYQQLPQQNQYQYVPPQQQAPTKQRPAKEENDDKASKDESKDKDDKASQDKSDDNQKKTDDNKQPAQPKPQPQQPTPKPNNNQQNNQSNQQAKPQAPQQNSQSTTNKQNNANDK >NC_018608.1|WP_000279414.1|875478_876489_+|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MAVKVAINGFGRIGRLAFRRIQEVEGLEVVAVNDLTDDDMLAHLLKYDTMQGRFTGEVEVVDGGFRVNGKEVKSFSEPDASKLPWKDLNIDVVLECTGFYTDKDKAQAHIEAGAKKVLISAPATGDLKTIVFNTNHQELDGSETVVSGASCTTNSLAPVAKVLNDDFGLVEGLMTTIHAYTGDQNTQDAPHRKGDKRRARAAAENIIPNSTGAAKAIGKVIPEIDGKLDGGAQRVPVATGSLTELTVVLEKQDVTVEQVNEAMKNASNESFGYTEDEIVSSDVVGMTYGSLFDATQTRVMSVGDRQLVKVAAWYDNEMSYTAQLVRTLAYLAELSK >NC_018608.1|WP_001074744.1|876627_877818_+|phosphoglycerate-kinase MAKKIVSDLDLKGKTVLVRADFNVPLKDGEITNDNRIVQALPTIQYIIEQGGKIVLFSHLGKVKEESDKAKLTLRPVAEDLSKKLDKEVVFVPETRGEKLEAAIKDLKEGDVLLVENTRYEDLDGKKESKNDPDLGKYWASLGDVFVNDAFGTAHREHASNVGISTHLETAAGFLMDKEIKFIGGVVNDPHKPVVAILGGAKVSDKINVIKNLVNIADKIIIGGGMAYTFLKAQGKEIGISLLEEDKIDFAKDLLEKHGDKIVLPVDTKVAKEFSNDAKITVVPSDSIPADQEGMDIGPNTVKLFADELEGAHTVVWNGPMGVFEFSNFAQGTIGVCKAIANLKDAITIIGGGDSAAAAISLGFENDFTHISTGGGASLEYLEGKELPGIKAINNK >NC_018608.1|WP_001260092.1|877939_878701_+|triose-phosphate-isomerase MRTPIIAGNWKMNKTVQEAKDFVNALPTLPDSKEVESVICAPAIQLDALTTAVKEGKAQGLEIGAQNTYFEDNGAFTGETSPVALADLGVKYVVIGHSERRELFHETDEEINKKAHAIFKHGMTPIICVGETDEERESGKANDVVGEQVKKAVAGLSEEQLKSVVIAYEPIWAIGTGKSSTSEDANEMCAFVRQTIADLSSKEVSEATRIQYGGSVKPNNIKEYMAQTDIDGALVGGASLKVEDFVQLLEGAK |
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NC_018608_6 | 914272-914352 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018608_6
|
1 spacers
spacers of NC_018608_6
>6.1|914297|31|NC_018608|CRISPRCasFinder AAGAACCAATACATAATAAAGCATAAGTGAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018608_6
The CRISPR arrays of NC_018608_6 >merge|NC_018608|6|914272-914352|CRISPRCasFinder TCTTTATCATTTCTGTCCCACTCCCAAGAACCAATACATAATAAAGCATAAGTGATTCTTTATCATTTCTCTCCCACTCCC >NC_018608|6|6|914272-914352|CRISPRCasFinder TCTTTATCATTTCTGTCCCACTCCC AAGAACCAATACATAATAAAGCATAAGTGAT TCTTTATCATTTCTCTCCCACTCCC
>NC_018608.1|WP_000732338.1|912865_913687_+|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKLFGLILVLTFAVVLAACGNGSKSGSDDKKITVGASPAPHAEILEKAKPLLEKKGYELDIKTINDYTTPNKLLDKGEIDANYFQHTPYLNTEKKDKGYKIVSAGNVHLEPMAVYSKKYKSLKELPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDAGLIKIKKGVKIEDAKFSDITENKKDIKFNNKQSAEFLPKIYQNEDADAVIINSNFAIEQKLNPKKDSIAVESAKDNPYANLIAVKEGHQDDKKIKALIEVLQSKDIQDFINEKYNGAVIPAK >NC_018608.1|WP_000520233.1|912152_912848_+|ABC-transporter-permease MGKSFSEIINEMITMPNIQWPEVWTAIVETLYMTVVSTIFAFILGLILGVLLFLSAKGKSIGARLFYSIVSFIVNLFRAIPFIILILLLIPFTSLILGTISGPTGALPALIIGAAPFYARLVEIAFKEIDKGVIEAAWSMGANTWTVIRKVLLPEAMPALVSGITVTAIALVGSTAVAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFIGDWLTNKLDKR >NC_018608.1|WP_000571213.1|911134_912160_+|methionine-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIELKEVVKEYRTKNKEVLAVDHVNLSIRAGSIYGVIGFSGAGKSTLIRMFNHLEAPTSGEVIIDGDHIGQLSKNGLRAKRQKVSMIFQHFNLLWSRTVLKNIMFPLEIAGVPRRRAKQKALELVELVGLKGREKAYPSELSGGQKQRVGIARALANDPTVLLCDEATSALDPQTTDEILDLLLKIREQQNLTIVLITHEMHVIRRICDEVAVMESGKVIEHGPVTQVFENPQHTVTKRFVKEDLNDDFETSLTELEPLEKDAYIVRLVFAGSTTTEPIVSSLSTAYDIKINILEANIKNTKNGTVGFLVLHIPYISSVDFGKFEKELIERQVKMEVLRHG >NC_018608.1|WP_001065802.1|910588_910885_+|thioredoxin-family-protein MNNSLDIKDVTTFYEEDKHLIFGYTPTCGTCKVSERMLDIANEILQLPLLKIDLNFYPQFCKDMQIMSTPILLLMNKDKEVKRIYAFQSVTDLLENLK >NC_018608.1|WP_001018957.1|910209_910596_+|hypothetical-protein MAIVNKVIIVEGKSDKKRVQQVIAEPVNIICTHGTMSIDKFDDMIESLYDKQVFVLADSDDEGDRIRNWFKRYLSESEHIFIDKTYCQVANCPKQYLAHVLSKHGFTCKKETPFLPNINNERLVLVNE >NC_018608.1|WP_000932205.1|908629_909508_+|DUF1963-domain-containing-protein MLNIQDVSHLSKKEQKAYNRFVESVENGNLPILPCIEMDLKEMQEETLNQSKIGGMPFLKSFKDIPLDENNVPMVLLAQINLDDLPEQQELFPVNEGILQFWISSEDQMYGMSENLKGNNINSRLVYIKEPISDLSLKDIQAHLKSLNADNEDIPFSGAFSIEFRLSKQTITCTDYKYDEDVLALWNKVNPSFALKSMFGGYDELMEPVCNTFTAKEPFNQLGGYPYFDQIDPRTNDQGLKMYDRVLLQIDSTRDGNSSIIWGDLGIANILVKSTDLEAMKFDDYMYSWDCS >NC_018608.1|WP_000290492.1|908069_908450_+|glycine-cleavage-system-protein-GcvH MAVPNELKYSKEHEWVKVEGNVATIGITEYAQSELGDIVFVELPETDDEINEGDTFGSVESVKTVSELYAPISGKVVEVNEELEDSPEFVNESPYEKAWMVKVEVSDESQLEALLSAEKYAEMIGE >NC_018608.1|WP_000589549.1|907555_907912_+|arsenate-reductase-family-protein MIKFYQYKNCTTCKKAAKFLDEYGVSYEPIDIVQHTPTINEFKTIIANTGVEINKLFNTHGAKYRELDLKNKLQTLSDDEKLELLSSDGMLVKRPLAVMGDKITLGFKEDQYKETWLA >NC_018608.1|WP_001147955.1|907091_907412_-|thioredoxin-family-protein MQAIKSNESFKSVINSDTPVIVKFEAGWCPDCRAMDLWIDPIVEQYNDYQWYTVNRDELEDVVVENEVMGIPSLLVFKNGDKIAHLHSANAKSPEQVESFLAETFK >NC_018608.1|WP_000150026.1|905602_906319_+|type-I-3-dehydroquinate-dehydratase MTHVEVVATIAPQLYIEETLIQKINHRIDAIDVLELRIDQIENVTVDQVAEMITKLKVMQDSFKLLVTYRTKLQGGYGQFTNDSYLNLISDLANINGIDMIDIEWQADIDIEKHQRIITHLQQYNKEVIISHHNFESTPPLDELQFIFFKMQKFNPEYVKLAVMPHNKNDVLNLLQSMSTFSDTMDCKVVGISMSKLGLISRTAQGVFGGALTYGCIGEPQAPGQIDVTDLKAQVTLY >NC_018608.1|WP_000752917.1|914494_914689_+|CsbD-family-protein MADESKFEQAKGNVKETVGNVTDNKNLENEGKEDKASGKAKEFVENAKEKATDFIDKVKGNKGE >NC_018608.1|WP_001183849.1|914922_915774_-|DUF368-domain-containing-protein MQQFKWINILKGFAMGTSDLVPGVSGGTIALLLGIYNQFIASISGIFSRRFWPSFTFLIPIIIGMLLAMGSLSNLFNYLLSQHHIPTMFFFGGLIIGIVPYLLKISNYKTSFTTKHYMMVIAGIAILIVITLMNNGDKHAGETLTLSTGLIIKYFIAGMCASSAMLLPGISGSFMLLVFGVYGTVMLAISEFVKLNFAGLPILLAVGFGVLAGFIISSKIIQYFLTHHKLMTFALIIGFVVGSLFAVFPGLPTNIVMWFVSLVVFIIGFIVSLTLGRITAENE >NC_018608.1|WP_000168845.1|916101_916863_+|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC MASTLEIKDLHVSIEDKEILKGVNLTINTDEIHAIMGPNGTGKSTLSSAIMGHPSYEVTKGEVLLDGVNILELEVDERAKAGLFLAMQYPSEITGVTNADFMRSAINAKREEGQEINLMQFIKKLDKNMDFLDIDKDMAQRYLNEGFSGGEKKRNEILQLMMLEPKFAILDEIDSGLDIDALKVVSKGINQMRGENFGALMITHYQRLLNYITPDKVHVMYAGKVVKSGGPELAKRLEEEGYEWVKEEFGSAE >NC_018608.1|WP_000205571.1|916961_918266_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD MTTDILNISEEQLVDYSKAHNEPSWMTELRKKALKLTETLEMPKPDKTKLRKWDFDSFKQHDVKGDVYQSLSQLPESVREIIDVDHSKNLVIQHNNTIAYTQVDDNASKDGVIVEGLADALMNHSDLVQKYFMKDAVTVDEHRITALHTALVNGGVFVYVPKNVVVEHPVQYVVLHDDENASFYNHVIIVTEESAEVTYVENYLSNASGEGNQLNIISEVIAGANSNITYGSVDYMDKGFTGHIIRRGITEADASINWALGLMNEGSQIIDNTTNLFGDRSTSSLKSVVVGTGEQKINLTSKIVQYGKETDGYILKHGVMKEHASSVFNGIGYIKHGGTKSIANQESRVLMLSEHARGDANPILLIDEDDVQAGHAASVGRVDPDQLYYLMSRGISQREAERLVIHGFLDPVVRELPIEDVKRQLREVIERKVS >NC_018608.1|WP_001825559.1|918377_919628_+|cysteine-desulfurase MNEVAEHSFDVNEVIKDFPILDQKVNGKRLAYLDSTATSQTPVQVLNVLEDYYKRYNSNVHRGVHTLGSLATDGYENARETVRRFINAKYFEEIIFTRGTTASINLVAHSYGDANVEEGDEIVVTEMEHHANIVPWQQLAKRKNATLKFIPMTADGELNIEDIKQTINDKTKIVAIAHISNVLGTINDVKTIAEIAHQHGAIISVDGAQAAPHMKLDMQEMNADFYSFSGHKMLGPTGIGVLFGKRELLQKMEPIEFGGDMIDFVSKYDATWADLPTKFEAGTPLIAQAIGLAEAIRYLERIGFDAIHKYEQELTIYAYEQMSTIEGIEIYGPPKDRRAGVITFNLQDVHPHDVATAVDTEGVAVRAGHHCAQPLMKWLNVSSTARASFYIYNTKEDIDQLINALKQTKEFFSYEF >NC_018608.1|WP_001010508.1|919617_920082_+|SUF-system-NifU-family-Fe-S-cluster-assembly-protein MNFNNLDQLYRSVIMDHYKNPRNKGVLDNGSMTVDMNNPTCGDRIRLTFDIEDGIIKDAKFEGEGCSISMASASMMTQAVKGHSLGEAMQMSQEFTKMMLGEDYVITEEMGDIEALQGVSQFPARIKCATLAWKALEKGTVAKEGKAEGTTEEE >NC_018608.1|WP_001074405.1|920232_921630_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufB MAKKAPDVGDYKYGFHDDDVSIFRSERGLTENIVREISNMKNEPEWMLDFRLKSLKLFYKMPMPQWGGDLSELNFDDITYYVKPSEQAERSWDEVPEEIKRTFDKLGIPEAEQKYLAGVSAQYESEVVYHNMEKELEEKGIIFKDTDSALQENEELFKKYFASVVPAADNKFAALNSAVWSGGSFIYVPKNIKLDTPLQAYFRINSENMGQFERTLIIADEGASVHYVEGCTAPVYTTSSLHSAVVEIIVHKDAHVRYTTIQNWANNVYNLVTKRTFVYENGNMEWVDGNLGSKLTMKYPNCVLLGEGAKGSTLSIAFAGKGQVQDAGAKMIHKAPNTSSTIVSKSISKNGGKVIYRGIVHFGRKAKGARSNIECDTLILDNESTSDTIPYNEVFNDQISLEHEAKVSKVSEEQLFYLMSRGISEEEATEMIVMGFIEPFTKELPMEYAVEMNRLIKFEMEGSIG >NC_018608.1|WP_000274033.1|921961_922276_-|hypothetical-protein MYFVLAIFTIISASVSLGYSIQACASSHNINAYYALSRSLPLFLLAIFSLVIHSAIFLITISIAMILVQFLDAIVGYKSNDVFKTYGPLATSVVNLILLIVFLF >NC_018608.1|WP_000582322.1|922644_923685_+|DUF21-domain-containing-protein MIIAIIILIFISFFFSGSETALTAANKTKFKTEADKGDKKAKGIVKLLEKPSEFITTILIGNNVANILLPTLVTIMALRWGISVGIASAVLTVVIILISEVIPKSVAATFPDKITRLVYPIINICVIVFRPITLLLNKLTDSINRCLSKGQPQEHQFSKEEFKTMLAIAGHEGALNEIETSRLEGVINFENLKVKDVDTTPRINVTAFASNATYEEVYETVMNKPYTRYPVYEGDIDNIIGVFHSKYLLAWSNKKEDQITNYSAKPLFVNEHNKAEWVLRKMTISRKHLAIVLDEFGGTEAIVSHEDLIEELLGMEIEDEMDKKEKEKLSQQQIQFQQRKNRNVSI >NC_018608.1|WP_000267231.1|923698_924766_+|nitronate-monooxygenase MWNKNRLTQMLSIEFPIIQAGMAGSTTPKLVASVSNSGGLGTIGAGYFNTQQLEDEIDYVRQLTSNSFGVNVFVPSQQSYTSNQIENMNAWLKPYRRALHLEEPVVKITEEQQFKCHIDTIIKKQVPVCCFTFGIPNESIIKRLKEANIKLIGTATSVDEAIANEKAGMDAIVAQGSEAGGHRGSFLKPKNQLPMVGTISLVPQIVDVVSIPVIAAGGIMDGRGVLASIVLGAEGVQMGTAFLTSQDSNASELLRDAIINSKETDTVITKAFSGKLARGINNRFIEEMSQYEGDIPDYPIQNELTSSIRKAAANIGDKELTHMWSGQSPRLATTHPANTIMSNIINQINQIMQYK |
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>7.1|1191237|33|NC_018608|CRISPRCasFinder GACAATGTAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACACAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018608_7
The CRISPR arrays of NC_018608_7 >merge|NC_018608|7|1191213-1191293|CRISPRCasFinder AGAATTTCGAATAGAAATTCTACAGACAATGTAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACACAGAGAATTTCGAATAGAAATTCTACA >NC_018608|7|7|1191213-1191293|CRISPRCasFinder AGAATTTCGAATAGAAATTCTACA GACAATGTAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACACAG AGAATTTCGAATAGAAATTCTACA
>NC_018608.1|WP_075773743.1|1190856_1191084_+|hypothetical-protein MLIEERGLKMTELNEIINAIQSLFESQSGYKISKNSGVPYQTVQDLRNGKTKIEDARFRTIIKLYSYYTSLKERS >NC_018608.1|WP_000857481.1|1189125_1190085_-|alpha-hemolysin MKTRIVSSVTTTLLLGSILMNPVANAADSDINIKTGTTDIGSNTTVKTGDLVTYDKENGMHKKVFYSFIDDKNHNKKILVIRTKGTIAGQYRVYSEEGANKSGLAWPSAFKVQLQLSDNEVAQISDYYPRNSIDTKEYMSTLTYGFNGNVTGDDSGKIGGLIGANVSIGHTLKYVQPDFKTILESPTDKKVGWKVIFNNMVNQNWGPYDRDSWNPVYGNQLFMKTRNGSMKAADNFLDPNKASSLLSSGFSPDFATVITMDRKASKQQTNIDVIYERVRDDYQLHWTSTNWKGTNTKDKWTDRSSERYKIDWEKEEMTN >NC_018608.1|WP_000231333.1|1188439_1188673_-|hypothetical-protein MVFKDWEINVVYSGKHEVVTNENSLFVIDEDYDVAIAINYLDNKLKVSHVNYGSEFTIDASNKVLELMIHNPNIDEN >NC_018608.1|WP_001032820.1|1187644_1187830_-|hypothetical-protein MNKHINKKTTKHLEDYKKVQQRNSEETNRGCLKSAAMLIVLFLFIIFGIVACSTHVNFFFQ >NC_018608.1|WP_000669541.1|1187046_1187397_+|complement-inhibitor-SCIN-C MKFKKYIVAGTLAVLLSTTAVSTLDGNKADASSKKDYIIQSEFHDKRIAEELKSLLDQSYVNDLAAGSLNPYYKRMIMMNQYRAKAALKSNNFAKMAEAKVGLENIYKEIDEIINR >NC_018608.1|WP_000791584.1|1186397_1186895_+|fibrinogen-binding-protein MKNKLIAKSLLTIASIGITTTTLASTADASEGYGPREKKPISINNNIVEYNDGTYKYQSRPKFNTTPKYIKFRHDYNIVEYNDGTFEYGARPQFNKPAAKTEATIKKEQKLIQAQNLVREFEKTHTVSAHRKAQKAVNLVSFEYNVKKMILQERIDQVLKQGLVR >NC_018608.1|WP_000584395.1|1185633_1186140_+|hypothetical-protein MIIKILTILLLLCILSYLVTNKKKPFLFLKTLFMGVVFIFIGYISLAISAVIIYGIIQFITIDFGSFFLMGIILILISSIFQLFIVRLLFRKKNVDLTEVVVLEHLIQWFLVYFAIYQAVNEKMDINDINIDNFQSVFFDVSNLNLVILPTLIISWVTIFNYRMRSYK >NC_018608.1|WP_000739580.1|1184555_1184960_-|formyl-peptide-receptor-like-1-inhibitory-protein MKKNITKVIIASTVIATGLLTHSNDAKAFFSYEWKGLEIAKKLADQAKQEEERIDKLMKEADKNQKPYKGETVNDLYLIVKKLSQGDVKKAVVRIKDGGPRDYYTFDLTRPLEENRKNIKVVKNGEIDSIYWDQ >NC_018608.1|WP_031774831.1|1184506_1184599_-|hypothetical-protein MLKTVKSTRSIGINKHTELNSCTPNVGKQC >NC_018608.1|WP_000739205.1|1183889_1184207_+|fibrinogen-binding-protein MKKNFIGKSILSIAAISLTVSTFAGESHAQTKAEKYNEYQTNFKKQVNKKVVDAQKAVNLFKRTRTVATHRKAQRAVNLIHFQHSYEKKKLQRQIDLVLKYNTLK >NC_018608.1|WP_001231534.1|1191476_1192193_-|superantigen-like-protein-SSL12 MRKRIMKKLIFMTTLLLLGTTATQTPNSPLNVSTDAKAYHIGQDETNINELIKYYTQPPLTFSNRWLYQYDDGNIYVEFKRYSWSAHIRLWGAESWGNVNQLRDRYVDVFGLKDEDTSQLWWVYRDTFTGGVTPAASPSDKPYSLFVQYKDKLQTIIGAHKMYQGNKPILTLKEIDFRARETLIKNKILYHENRNKGKLKIIGGGNDFTIDLSKRLHSDLANVYVKNPQKITVEVLID >NC_018608.1|WP_000794662.1|1192301_1193027_-|superantigen-like-protein-SSL13 MKNNLTKKIILSIALTMIGTATSQSPHSPISMSSEAKAYNISESETNVNELTKYYTQRHLTFSNKWLWQKDNGTIHATLLQLSWFSHIQVFGPESWGNINQLRNKYVDIFALKDYETWRTYMLAQETFTGGVTPAAKPSDKYYKLNVTYKDKAGTFIGEYQFYTGNKPVLTLKEVDFRIRQTLIKNKKLYNGDYNKGHIKITGGSNNYTIDLSKRLKSTDANRYVKNPQTAHIEILLEKPS >NC_018608.1|WP_000739586.1|1193136_1193862_-|superantigen-like-protein-SSL14 MKKNITNKIVLSTALLLLGTTSTQPPKAPISFSSEAKAYNISENETNINELIKYYTQPHLSFSGKWLWQNPNGTIHATLQTWVWYTHIQVFGPESWGNINQLRDKYVDIFGTKDEDTIEGYWTYDETFTGGVTPAATSSDKPYKLFLKYKDKQQTMIGGLEFYQGNKPVITLKELDFRVRQTLIKNKKLYNGEFNKGQIRITGGGNHYTIDLSKKLKLTDTNRYVKNPRHAEIEVILEKSH >NC_018608.1|WP_000793612.1|1194291_1195293_+|ornithine-carbamoyltransferase MKNLRNRSFLTLLDFSRQEVEFLLTLSEDLKRAKYIGTEKPMLKNKNIALLFEKDSTRTRCAFEVAAHDQGANVTYLGPTGSQMGKKETTKDTARVLGGMYDGIEYRGFSQRTVETLAEYSGVPVWNGLTDEDHPTQVLADFLTAKEVLKKDYADINFTYVGDGRNNVANALMQGAAIMGMNFHLVCPKELNPTDELLNRCKNIAAENGGNILITDNIDQGVKGSDVIYTDVWVSMGEPDEVWKERLELLKPYQVNKEMMDKTGNPNVIFEHCLPSFHNADTKIGQQIFEKYGIREMEVTDEVFESKASVVFQEAENRMHTIKAVMVATLGEF >NC_018608.1|WP_001074350.1|1195315_1196248_+|carbamate-kinase MAKIVVALGGNALGKSPQEQLELVKNTAKSLVGLITKGHEIVISHGNGPQVGSINLGLNYAAEHNQGPSFPFAECGAMSQAYIGYQLQESLQNELHSIGMDKQVVTLVTQVEVDENDPAFNNPSKPIGLFYNKEEAEQIQKDKGFIFVEDAGRGYRRVVPSPQPISIIELESIKTLIKNDTLVIAAGGGGIPVIREQHDGFKGIDAVIDKDKTSALLGANIQCDQLIILTAIDYVYINFNTENQQPLKTTNVDELKRYIDENQFAKGSMLPKIEAAISFIENNPKGSVLITSLNELDAALEGKVGTVIKK >NC_018608.1|WP_000432267.1|1196418_1197975_+|YfcC-family-protein MENTNNESEKKKRFKLKMPGAFMILFILTVVAVIATWVIPAGAYSKLSYEPSSQELKIVNPHNQVKKVPGTQQELDKMGVKIKIEQFKSGAINKPVSIPDTYERLKQHPAGPEQITSSMVEGTIEAVDIMVFILVLGGLIGVVQASGSFESGLLALTKKTKGHEFMLIVFVSILMIIGGTLCGIEEEAVAFYPILVPIFIALGYDSIVSVGAIFLASSVGSTFSTINPFSVVIASNAAGTTFTDGLYWRIGACIVGAIFVISYLYWYCKKIKKDPKASYSYEDKDAFEQQWSVLKDDDSAHFTLRKKIILTLFVLPFPIMVWGVMTQGWWFPVMASAFLIFTIIIMFIAGTGKCGLGEKGTVDAFVNGASSLVGVSLIIGLARGINLVLNEGMISDTILHFSSSLVQHMSGPLFIIVLLFIFFCLGFIVPSSSGLAVLSMPIFAPLADTVGIPRFVIVTTYQFGQYAMLFLAPTGLVMATLQMLNMRYSHWFRFVWPVVAFVLIFGGGVLITQVLIYA >NC_018608.1|WP_000149423.1|1198282_1198510_+|hypothetical-protein MTHLTKVLDTLTGICVVLLFSKYFVAYANMVFDWNLRWYLLENIPHLPIILFILMFIFGVPSEMIKDRQRKNNGV >NC_018608.1|WP_001239296.1|1198826_1199774_-|TDT-family-transporter MRLQKAPLVTSGLVLGLLGLGNLLKDLSLTLNAVCGIFAFLIWIHLLCTMLKYFNNVKEQLNSPLVSSVFTTFFMSGFLGTTYLNTFFSNITFINNLITPIWILCLVGIMTHMIIFSIKYLKDFSLVNVYPSWTVLFIGIAIAGLTAPVSGYFFIGQLTVIYGFVATCIVLPIVFKRLKAFPLQTSIKPNTSTICAPFSLVAAAYVIAFPKANAFIVIVFLLLAQIFYFYIIIQLPKLLKEPFSPVFSAFTFPLVISATALKNSLPVLMFPVIWKGLLFIEMLLATVIVLRVFIGYLHFFLKKENQDKFLRNASQ >NC_018608.1|WP_001245801.1|1200021_1200210_+|hypothetical-protein MRNQIQKLLDSDLSSLHISKQTGVPQSTIHRMRKNERSLDNMSLKNAELLYKFANGIFSNEN >NC_018608.1|WP_000398672.1|1201118_1201253_+|beta-class-phenol-soluble-modulin MEGLFNAIKDTVTAAINNDGAKLGTSIVSIVENGVGLLGKLFGF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_018608_8 | 1793333-1793415 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018608_8
|
1 spacers
spacers of NC_018608_8
>8.1|1793358|33|NC_018608|CRISPRCasFinder TATAATGTGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACACA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018608_8
The CRISPR arrays of NC_018608_8 >merge|NC_018608|8|1793333-1793415|CRISPRCasFinder GAAGCTGACGAAAAAGTCAGCTTACTATAATGTGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACACAGAAGCTGACGAAAAAGTCAGCTTAC >NC_018608|8|8|1793333-1793415|CRISPRCasFinder GAAGCTGACGAAAAAGTCAGCTTAC TATAATGTGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACACA GAAGCTGACGAAAAAGTCAGCTTAC
>NC_018608.1|WP_000277602.1|1792593_1793007_+|universal-stress-protein MYKNILLGVDTQLKNEKALKEVSKLAGEGTVVTVLNAISEQDAQASIKAGVHLNKLTEERSKRLEKTRKALEDYGIDYDQIIVRGNAKEELLKHANSGKYEIVVLSNRKAEDKKKFVLGSVSHKVAKRATIPVLIVK >NC_018608.1|WP_000160430.1|1791090_1792389_-|CBS-domain-containing-protein MTKHEQILDYIESLSIGSKISVRKIAKFLNVSEGTAYRAIKDADKMGMVATIDRVGTVRIEKRNRNEIEHLTFNEIVNIIDGQVLGGNKGITKMVSKFAIGAMELKDILKYIGPKTLLIVGNREDVQIEALKRGTAILITGGFKPSNKVIDFANEHDLPVLSSSYDTFLVANIINKALFNQKIRKDILIVQDIMTPLDDLSVLFDTMKIADYKRMANQTGHTRFPVVNESYKLVGIVTSREMINTKDDDEIDKVMTRNPIYVNAMSTVASCAHMMIWEGIELIPVVSSNKKTVGVINRQDVLKSMQLLGRQPQMGETINDQIAKYITMNQDGITVEVSPLLINHYGTVSKAAFVSIIEETIQYEMRKFKKGNVMIENLNIVYIKTVPIESHITVRFGILDVGRNFAKIEVNMHSQNDKVASALVICQMFDEV >NC_018608.1|WP_000626092.1|1789779_1790721_-|pApA-hydrolase-Pde2 MISTMNEIMKCIEDNDTIIIHRHVRPDPDAYGSQLGLKYYIQQKFPQKQVFAVGEAESSLSFIGELDNIDDKTYQDALVIVCDTANAPRIDDERYSTGRKLIKIDHHPAVDQYGDINLVNTNASSTSEIIYDLISHFNDEAIVNKDIASVLYLGIVGDTGRFLFNNTSEHTMEIAGKLIGHDIDHNALLNKMMEKDPKMLPFQGYVLQHFELMDDGFCQVKITEDVLKQFGIQPNEASQFVNTIADIKGLKIWVFAVDEGSEIRCRLRSKGQLIINDIAQDFGGGGHPNASGVSVNSWDEFEQLAKALRTKLN >NC_018608.1|WP_000226933.1|1786561_1789759_-|DNA-polymerase-III-subunit-alpha MVAYLNIHTAYDLLNSSLKIEDAVRLAVSENVDALAITDTNVLYGFPKFYDTCIANNIKPIFGMTIYVTNGLNTVETVVLAKDNNGLKDLYQLSSEIKMNALEHVSFELLKRFSNNMIIIFKNVADEHRDIVQVFDSHEDTYLDHRSVLVQGIKHVWIQDVCYQTRHDADTISALAAIRDNTKLDLIHDQEDFGAHFLTENEIQQLDVNPEYFTQADRIAQKCDAELKYHQSLLPQYQAPNDESAKKYLWRVLVTQLKKLELNYDVYLERLKYEYKVITNMGFEDYFLIVSDLIHYAKTNDVMVGPGRGSSAGSLVSYLLGITTIDPIKFNLLFERFLNPERVTMPDIDIDFEDTRREKVIQYVQEKYGELHVSGIVTFGHLLARAVARDVGRIMGFDEVTLNEISSLIPHKLGITLDEAYQIDDFKKFVHRNHRHERWFSICKKLEGLPRHTSTHAAGIIINDHPLYEYAPLTKGDTGLLTQWTMTEAERIGLLKIDFLGLRNLSIIHQILTQVKKDLGINIDIEKIPFDDQKVFELLSQGDTTGIFQLESDGVRSVLKKLKPEHFEDIVAVTSLYRPGPMEEIPTYITRRHDPSKVQYLHPHLEPILKNTYGVIIYQEQIMQIASTFANFSYGEADILRRAMSKKNRAVLESERQHFIEGAKQNGYHEDISKQIFDLILKFADYGFPRAHAVSYSKIAYIMSFLKVHYPNYFYANILSNVIGSEKKTAQMIEEAKKQGITILPPNINESHWFYKPSQEGIYLSIGTIKGVGYQSVKVIVEERYQNGKFKDFFDFARRIPKRVKTRKLLEALILVGAFDAFGKTRSTLLQAIDQVLDGDLNIEQDGFLFDILTPKQMYEDKEELPDALISQYEKEYLGFYVSQHPVDKKFVAKQYLTIFKLSNAQNNKPILVQFDKVKQIRTKNGQNMAFVTLNDGIETLDGVIFPNQFKKYEELLSHNDLFIVSGKFDLRKQQRQLIINEIQTLATFEEQKLAFAKQIIIRNKSQIDMFEEMIKATKENANDVVLSFYDETIKQMTTLGYINQKDSMFNNFIQSFNPSDIRLI >NC_018608.1|WP_000058389.1|1784883_1786113_-|NAD-dependent-malic-enzyme-4 MSLRDEALEMHKRNQGKLEVKPNVKVTNKEELSLAYSPGVAEPCKDIYEDKRKVYDYTIKGNTVAVITDGTAVLGLGNIGPEASIPVMEGKAVLFKSFAGINGVPIALNTTDTEEIIKTVKLLEPNYGGINLEDISAPRCFEIEERLKKETNIPVFHDDQHGTAIVTMAGLVNALRVVNKDIAKIKVVLNGAGAAGIAIVKLLYAYGVRNMVMCDSRGAIFEGRSYGMNPTKDVVAKWTNKDKIEGSLEEVVKDADVFIGVSVANALSQDMVKSMADNPIIFAMANPNPEIIPDDAKAAGARVVGTGRSDYPNQINNVLAFPGIFRGALEVEATHINEEMKKAAVEAIADLIDSSELNEDYCIPGPFDKRVAPSVARNVAKAAMESGVARIEVDPQDVYDKTMKLTDLQ >NC_018608.1|WP_000471571.1|1783831_1784689_-|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-beta MFKDFFNRTKKKKYLTVQDSKNNDVPAGIMTKCPKCKKIMYTKELAENLNVCFNCDHHIALTAYKRIEAISDEGSFTEFDKGMTSANPLDFPSYLEKIEKDQQKTGLKEAVVTGTAQLDGMKFGVAVMDSRFRMGSMGSVIGEKICRIIDYCTENRLPFILFSASGGARMQEGIISLMQMGKTSVSLKRHSDAGLLYISYLTHPTTGGVSASFASVGDINLSEPKALIGFAGRRVIEQTINEKLPDDFQTAEFLLEHGQLDKVVHRNDMRQTLSEILKIHQEVTK >NC_018608.1|WP_000883646.1|1782887_1783832_-|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-alpha MLDFEKPLFEIRNKIESLKESQDKNDVDLQEEIDMLEASLERETKKIYTNLKPWDRVQIARLQERPTTLDYIPYIFDSFMELHGDRNFRDDPAMIGGIGFLNGRAVTVIGQQRGKDTKDNIYRNFGMAHPEGYRKALRLMKQAEKFNRPIFTFIDTKGAYPGKAAEERGQSESIATNLIEMASLKVPVIAIVIGEGGSGGALGIGIANKVLMLENSTYSVISPEGAAALLWKDSNLAKIAAETMKITAHDIKQLGIIDDVISEPLGGAHKDIEQQALAIKSAFVEQLDSLESLSRDEIANDRFEKFRNIGSYIE >NC_018608.1|WP_000717561.1|1781650_1782619_-|6-phosphofructokinase MKKIAVLTSGGDSPGMNAAVRAVVRTAIYNEIEVYGVYHGYQGLLNDDIHKLELGSVGDTIQRGGTFLYSARCPEFKEQEVRKVAIENLRKRGIEGLVVIGGDGSYRGAQRISEECKEIQTIGIPGTIDNDINGTDFTIGFDTALNTIIGLVDKIRDTASSHARTFIIEAMGRDCGDLALWAGLSVGAETIVVPEVKTDIKEIADKIEQGIKRGKKHSIVLVAEGCMTAQDCQKELSQYINVDNRVSVLGHVQRGGSPTGADRVLASRLGGYAVDLLMQGETAKGVGIKNNKIVATSFDEIFDGKDHKFDYSLYELANKLSI >NC_018608.1|WP_001232654.1|1779871_1781629_-|pyruvate-kinase MRKTKIVCTIGPASESEEMIEKLINAGMNVARLNFSHGSHEEHKGRIDTIRKVAKRLDKIVAILLDTKGPEIRTHNMKDGIIELERGNEVIVSMNEVEGTPEKFSVTYENLINDVQVGSYILLDDGLIELQVKDIDHAKKEVKCDILNSGELKNKKGVNLPGVRVSLPGITEKDAEDIRFGIKENVDFIAASFVRRPSDVLEIREILEEQKANISVFPKIENQEGIDNIEEILEVSDGLMVARGDMGVEIPPEKVPMVQKDLIRQCNKLGKPVITATQMLDSMQRNPRATRAEASDVANAIYDGTDAVMLSGETAAGLYPEEAVKTMRNIAVSAEAAQDYKKLLSDRTKLVETSLVNAIGISVAHTALNLNVKAIVAATESGSTARTISKYRPHSDIIAVTPSEETARQCSIVWGVQPVVKKGRKSTDALLNNAVATAVETGRVTNGDLIIITAGVPTGETGTTNMMKIHLVGDEIANGQGIGRGSVVGTTLVAETVKDLEGKDLSDKVIVTNSIDETFVPYVEKALGLITEENGITSPSAIVGLEKGIPTVVGVEKAVKNISNNMLVTIDAAQGKIFEGYANVL >NC_018608.1|WP_000818532.1|1778166_1779528_+|amino-acid-permease MAEKLQRELSNRHIQLIAIGGAIGTGLFLGAGQTIALTGPSILLTYIIIGFMLFMFMRGLGEIIIQNTEFKSFADVTNTYIGPFAGFVTGWTYWFCWIITGMAEVTAVAKYVSFWFPEIPNWISALFCVLLLMSFNLLSARLFGELEFWFSIIKIATIIGLIVVGFVMILFAYKTQFGHASFTNLYEHGVFPKGASGFFMSFQMALFSFVGIEMIGVTAGETKDPVKTIPKAINSVPIRILIFYVGALAVIMSIIPWQQVDPDNSPFVKLFALIGIPFAAGLINFVVLTAAASSCNSGIFSNSRMLFGLSSQQQAPPNFSKTNKYGVPHVAIFASSALLLVAALLNYIFPDATKVFTYVTTISTVLFLVVWGLIIIAYINYSRKNPDLHKKATYKLFGGKYMGYLIFVFFIFVFGLLFINVETRRAIYFIPIWFILLGFMYLRYKRIAAKSNN >NC_018608.1|WP_000777188.1|1793512_1794202_-|metal-dependent-hydrolase MKLSFHGQSTIYLEGNNKKVIVDPFISNNPKCDLNIETVQVDYIVLTHGHFDHFGDVVELAKKTGATVIGSAEMADYLSSYHGVENVHGMNIGGKANFDFGSVKFVQAFHSSSFTHENGIPVYLGMPMGIVFEVEGKTIYHTGDTGLFSDMSLIAKRHPVDVCFVPIGDNFTMGIDDASYAINEFIKPKISVPIHYDTFPLIEQDPQQFKDAVNVGDVQILKPGESVQF >NC_018608.1|WP_000161656.1|1794376_1795432_+|aminopeptidase-P-family-protein MTKISKIIDELNNQQADAAWITTPLNVYYFTGYRSEPHERLFALLIKKDGKQVLFCPKMEVEEVKASPFTGEIVGYLDTENPFSLYPQTINKLLIESEHLTVARQKQLISGFNVNSFGDVDLTIKQLRNIKSEDEINKIRKAAELADKCIEIGVSYLKEGVTEREVVNHIEQTIKQYGVNEMSFDTMVLFGDHAASPHGTPGDRRLKSNEYVLFDLGVIYEHYCSDMTRTIKFGEPSQEAQEIYNIVLEAETSAIQAIKPGIPLKDIDHIARNIISEKGYGEYFPHRLGHGLGLQEHEYQDVSSTNSNLLEAGMVITIEPGIYVPGVAGVRIEDDILVTNEGYEVLTHYEK >NC_018608.1|WP_000690004.1|1795747_1796866_-|alanine-dehydrogenase MKIGIPREIKNNENRVGLSPSGVHALVESGHTVLVETNAGSGSFFEDVDYKEAGAEIVAEQAKVWDVDMVIKVKEPLESEYPYFKEGLVLFTYLHLANEEKLTQALIDRKVISIAYETVQLPDRSLPLLSPMSEVAGRMSAQVGAEFLQKLNGGMGILLGGVPGVPKGKVTIIGGGQAGTNAAKIALGLGADVTILDVNPKRLQQLDDLFGGRVHTIMSNPLNIELYVKQSDLVIGAVLIPGAKAPRLVTEDMIKQMKNGSVIIDIAIDQGGIFETTDKITTHDNPTYIKHGVVHYAVANMPGAVPRTSTLALNNATLPYALMLANKGYREAFKSNQPLSLGLNTYKGHVTNKGVAEAFEMEYKSVEEALQL >NC_018608.1|WP_000634175.1|1797006_1797507_+|universal-stress-protein MITYKNILIAVDGSHEAEWAFNRAVGVAKRNDAKLTIVNVIDSRTYSSYEVYDAQFTEKSKHFAEELLNGYKEVATNAGVKDVETRLEFGSPKSIIPKKLAHEINADLIMSGTSGLNAVERFIVGSVSESIVRHAPCDVLVVRTEELPADFQPQVATTQLREKYQN >NC_018608.1|WP_000040067.1|1797753_1798956_-|acetate-kinase MSKLILAINAGSSSLKFQLIRMPEEELVTKGLVERIGLKDSIFTIEVDGEKVKTVQDIKDHVEAVDIMLDAFKKHNIINDINDIDGTGHRVVHGGEKFPESAAITDEVEKEIEELSELAPLHNPANLMGIRAFRKLLPNIPHVAIFDTAFHQTMPEKAYLYSLPYHYYKDYGIRKYGFHGTSHKFVSQRAAEMLDKPIEDLRIISCHIGNGASIAAIDGGKSIDTSMGFTPLAGVTMGTRSGNIDPALIPFIMEKTGKTAEQVLEILNKESGLLGLSGTSSDLRDLSEEAESGKARSQMALDVFASKIHKYIGSYAARMHGVDVIVFTAGIGENSVEIRAKVLEGLEFMGVYWDPKKNENLQRGKEGFINYPHSPVKVVVIPTDEESMIARDVMTYGGLK >NC_018608.1|WP_000840583.1|1799043_1799991_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MAEQQTIMERLFHTLDEKAKTLNNENGQSFIENLGLAMEQVYTNERGLLEQSTLQDRRKAFQFAYLSLMQEEKIQANHQITPDSIGLILGFLVERFMNNQEELHIVDIASGAGHLSATVKEVLPEIAVMHHLIEVDPVLSRVSVHLANFLEIPFDVYPQDAIMPLPLEEADIVIGDFPVGYYPIDERSRDFKLGFEEGHSYSHYLLIEQAINALKDAGYAFLVVPSNIFTGEHVKQLEKYIATETEMQAFLNLPPTLFKNEKARKSILILQKKKSGETKPVEVLLANIPDFKNPSQFQGFMTELNQWMDTNRPKK >NC_018608.1|WP_000136251.1|1800113_1800608_-|thiol-peroxidase MTEITFKGGPIHLKGQLINEGDFAPDFTVLDNDLNQVTLADYAGKKKLISVVPSIDTGVCDQQTRKFNSEASKEEGIVLTISADLPFAQKRWCASAGLDNVITLSDHRDLSFGENYGVVMEELRLLARAVFVLDADNKVVYKEIVSEGTDFPDFDAALAAYKNI >NC_018608.1|WP_000365308.1|1800705_1801476_-|TSUP-family-transporter MDLNLTMIIIIILFGFIAAFIDSVVGGGGLISTPALLAIGLPPSVALGTNKLASSFGSLTSAIKFIRSGKVDLYVVAKLFGFVFLASACGAYIATMVPSQILKPLIIIALSSVFIFTLLKKDWGNTRTFTQFTFKKAILFAALFILIGFYDGFVGGGTGSFMLFVLLIFGFDFLSAAGNAKVLNFASNIGALVLFMVLGQVDYVIGLVMAASMIVGSYAGAHFAIKQGVGYVKVLFIIITAILILKNAFDYIQQFV >NC_018608.1|WP_000872673.1|1801519_1802743_-|tRNA-4-thiouridine(8)-synthase-ThiI MKYDHLLVRYGELTLKGSNRKKFVNQLRNNVNKSLKGLDGFVVKGKRDRMYIELEDHADINEITYRLSKIFGIKSISPVLKVEKTLEAMSATAIKFAQQFEENSTFKIDVKRADKNYPMDTYELQRELGGAVLKHFDNISVNVKRPDHEIRVEVRLDAIYMYEEVVQGAGGLPVGTGGKTLLMLSGGIDSPVAGMEVMRRGVTIEAIHFHSPPFTSDQAKEKVIELTRILAERVGPIKLHIVPFTELQKQVNKVVHPRYTMTSTRRMMMRVADKLVHQIGAYAIVNGENLGQVASQTLHSMYAINNVTSTPVLRPLLTYDKEEIIIKSKEIGTFETSIQPFEDCCTIFTPKNPVTEPNFDKVVQYESVFDFEEMINRAVENIETLEITSDYKTIKEQQTNQLINDFL >NC_018608.1|WP_072434776.1|1802742_1803891_-|cysteine-desulfurase MFILIYLDNAATTKAFEEVLDTYLKVNQSMYYNPNSPHKAGLQADQLLQQAKVQINDMVNTNMTYDVVFTSGATESNNIALKGVAYRKFDTAREIITSVLEHPSVLEVVRYLEEREGFKVKYVDVTKDGSINLEHFKELMSDKVGLVTCMYVNNVTGQIQPIPQMADVIKNYPKAHFHVDAVQAFGKISMDFNNVDSISLSGHKFNGLKGQGVLLVNHIQNVEPTVHGGGQEYGVRSGTVNLPNDIAMVKAMKIANENLEALNAFVTELNNDVRQFLNKYHGVYINSSTSGSPFVLNVSFPGVKGEVLVNAFSKYDIMISTTSACSSKRNKLNEVLTAMGLSDKAIEGSIRLSFGAMTTKEDITKFKETFTIIYEEIKELLK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_018608_9 | 1881687-1881780 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018608_9
|
1 spacers
spacers of NC_018608_9
>9.1|1881721|26|NC_018608|CRISPRCasFinder AGAATTTCAAAAAAGAAATTCTACAG |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018608_9
The CRISPR arrays of NC_018608_9 >merge|NC_018608|9|1881687-1881780|CRISPRCasFinder GCAATGCGCGTTGGGGTGTGGGGCCCCAACATAGAGAATTTCAAAAAAGAAATTCTACAGGCAATGCGCGTTGGGGTGTGGGGCCTCAACATAG >NC_018608|9|9|1881687-1881780|CRISPRCasFinder GCAATGCGCGTTGGGGTGTGGGGCCCCAACATAG AGAATTTCAAAAAAGAAATTCTACAG GCAATGCGCGTTGGGGTGTGGGGCCTCAACATAG
>NC_018608.1|WP_000492903.1|1880759_1881380_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MFSRNNNIFVDDLSVTKDNYLIAVLKMLVIFLVINYGTDVSYDHEYVGLFIILLGVVLLKILNINLLSFKKLKFTHMLYIIFGFLLMYGLDYLYDTFAPPTLNEILIDEESEDAPYHIALLSTAIIPPITEEIICRGLIIRILFRNHLFLGFIVSTVFFTLIHESDTLIGYLPYFYSGLIFGYTYLKTKRLEVPILIHFINNLLAM >NC_018608.1|WP_001168915.1|1879957_1880593_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MQKFKDLFYDDLSVARGNYFLTLLSAFLITIILLIGFVVSDTHILYGVFIVLIGIVLLRLFKINLLSFKKLTMSQVIYIIGGALLIYGLDYLYLHFHDVPTNEQELDRELQHMPLYMSIVTIAIIPAIVEEIVFRGMIIRVVFRKHLFIGLVVSSLVFASLHESDTWIGYLPYLYSGVIFGLIYLKTKRLEVVILIHFINNLSSLLILLWG >NC_018608.1|WP_001030474.1|1879216_1879660_-|hypothetical-protein MNKASFDKKVKKQLWFLNKKEKQALDQRLSSITDKDNVNFNKPITFANTYLRENVFRSKESKSYSIFVTLVVMMFAYVALLGLFLFGLITSLSGVQFFVNPKVDLSTTVVILTIIGAILLMLVSIYLIKITTSYFTKKLLEHKFNGH >NC_018608.1|WP_001153741.1|1878786_1879230_+|competence-protein-ComK MQDNSTKYLLYIQTATSNHLETNCVFLHCDYILKVPINKLVSYYAKLHLSSQSVLIETAKNILNINKLVPIYINAKTILFPLKHKRAPIQIYINAHYIVGMTAIENSTLIHFQEGIQLEVDEPFSLVSKKCHESLALKHFIENTNDH >NC_018608.1|WP_000671058.1|1878203_1878674_+|RNA-polymerase-sigma-factor MKFNDVYNKHHKIIHHLLKKYNISYNYDEYYQLLLIKMWQLSQIYKPSSNQSLSSFLFMRLNFYLIDLFRQQKRLNDIILCENHSPILTEQPTYFNEYDLRLQDVCALLKHRERQWLMLYLEGYKQYEIADIMSLSTSTIKLIKASVKRKCQRFLN >NC_018608.1|WP_000384171.1|1877780_1878005_-|hypothetical-protein MDYAHLNLEHFFARNDDLDVIRDRADFVMINNFTNEMMYRDGQIEGTIDLNQYYYKNRSNAASFIMMDYKKETK >NC_018608.1|WP_001032832.1|1876650_1877505_-|N-acetylglucosaminidase MNKHKKGSIFGIIGLVVIFAVVSFLFFSMISDQIFFKHVKSDIKIEKLNVTLNDAAKKQINNYTSQQVSNKKNDAWRDASATEIKSAMDSGTFIDNEKQKYQFLDLSKYQGIDKNRIKRMLVDRPTLLKHTDDFLKAAKDKHVNEVYLISHALLETGAVKSELANGVEIDGKKYYNFYGVGALDKDPIKTGAEYAKKHGWDTPEKAISGGADFIHKHFLSSTDQNTLYSMRWNPKNPGEHQYATDIKWAESNATIIADFYKNMKTEGKYFKYFVYKDDSKHLKK >NC_018608.1|WP_000989103.1|1875271_1876564_+|arsenite-efflux-transporter-membrane-subunit-ArsB MMTTLATFIFLVTLLFVLWQPKGLDIGFTALAGAFIAVITGVVSFSDVFEVTGIVWNATLTFVSVILISLILDKIGFFEWSAIHMLHASKGSGLKMFVYIILLGAVVAAFFANDGAALILTPIVLAMVKNIGFSKRAIFPFIIASGFIADTTSLPLIVSNLVNIISADYFNISFSQYLSRMIIPNLFSLLASLLVLWLYFRKAIPKSFDANHIKKPIDAINDLKLFKISWIVLVILLFGYLISEFTKIPVSIFTGIIAFIFLILARKSNAVNIKQVIKGAPWNIVLFSIGMYIVIFGLRNAGITLILAKILEYISNYGLFSTILGMGFISAFLSSIMNNMPTVLIDAIAIGQSNVHGMLKEGLIYANVIGSDLGPKITPIGSLATLLWLHVLTQKDVKISWGTYFKTGIIITIPVLFFTLIGLYLTLILF >NC_018608.1|WP_000221190.1|1874957_1875272_+|winged-helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTYKELATYLKVLSDSSRLEILDLLSCGELCACDLLEHFQFSQPTLSYHMKALVKTNLVTTRKIGNKHLYQLNHNIFESVINNLSKVHTSNQRCICHNLKTGEC >NC_018608.1|WP_001261672.1|1872812_1874315_-|FAD/NAD(P)-binding-protein MRVAIIGMGTAGVSVLRELVKHPKFNQLDIDLYDDKVNMGQGVPFQNDSSELLINMPSKKMSLNLDDETEFWKWYKQQTDFNFDEPAYLPRFVFGHYMKSYLSMFTKKYPNISTNYNKVQEIYTNSNIDETNLTYYICTTNSEQSWQAYDYVFLTCGTFAYHDPYNLKGKKGYIATPYPTYNTLDEVNELDDIAIIGTGLASLDVVRYVAAHHPKLPITMTSRSANLPSVRGTMIDVTFKYLTKDKLNDIKKHHFGNAPLDTLVSLFLKECAEYDIDFEKLVHRRTGNHIADLKYDLARLTEMGIFQSIIEHLKENLNWIWNSLSIEDQHQFNQKYSKMIQLNSNPMPPRTAELIIELIENKSLILKKDLEDVKHDGKLYYFSYKNQESVDIYKVVINATGAKSHLNELDQDDQLIKNLENRQIVQAHPMGGIQIIPETNQVISPRFGTLTNMIAIGQMTNGVNKLRNGVKMIVEQVAHTVSQLYDALESNEQEQRSDNQ >NC_018608.1|WP_001096494.1|1881942_1882656_-|transaldolase MAKLNVEVFADGADIEEMKAAYKNKQVDGFTTNPSLMAKAGVTDYKAFAEEAVKEIPDASISFEVFADDLETMEKEAAILKQYGENVFVKIPIVNTKGESTIPLIKKLSADNVRLNVTAVYTIEQVKEITEAVTEGVPTYVSVFAGRIADTGVDPLPLMKEAVKVTHSKDGVKLLWASCRELFNVIQADEIGADIITCPADVVKKVNTNLGRDINELSVDTVKGFAKDIQSSGLSIL >NC_018608.1|WP_000091443.1|1882914_1883217_+|hypothetical-protein MSRSKKYFYLSSLMIILSFFFNTNNVFLSGLFNSFIKLILFCSVINSIILILSIIFADRSIKSLKPDADWIRIASKSLPWIILIVILVHIFSIVHTFGFI >NC_018608.1|WP_001200546.1|1883471_1883837_+|fluoride-efflux-transporter-CrcB MQYVYIFIGGALGALLRYLISFLNTDGGFPIGTLIANLTGAFVMGLLTALTIEFFSNHPTLKKAITTGFLGALTTFSTFQLELIHMFDYQQFITLLLYAVTSYVFGILLCYVGIKLGGGLS >NC_018608.1|WP_000623484.1|1883833_1884187_+|CrcB-family-protein MISIILVMIGGGLGAIARSAVTDYFNHIFTSKLPIATLIVNLVGSFLIGLTIGLSISISWFPAFFVTGFLGGLTTFSTLAKELTLMMTPKFDIKLFLNYSLLQFIIGFIACYIGYHI >NC_018608.1|WP_000453302.1|1884436_1885270_-|aldo/keto-reductase MEVKTFYNGNTMPQIGLGTFRVENDENCMESVKYAIEQGYRSIDTAKVYGNEEQVGAGIRAGLESTGIAREDLFITSKLYFEDFGRENVAAAYEASLSRLGLKYLDLYLVHWPGTNEAIMVDTWKGMEDLYKNNKVKNIGVSNFEPEHLEALLAQVSIKPVINQVEYHPYLTQHKLKLYLAAQHIVMESWSPLMNAQILNDETIKDIAQELGKSPAQVVLRWNVQHGVVTIPKSVTPNRISENFRIFDFELSDEQMTRIDDLNQDKRIGPDPKTFEG >NC_018608.1|WP_000366160.1|1885481_1886390_-|NERD-domain-containing-protein MDLSSPVVIGLIIAVVIALIFFVLFLVALGSKKKVKRQTEEKYEQQEQNIKKSHEEALEKERIQNKKTITKQQEDYNHMISTKDREIDALKLFSKNHSEYVTDMRLIGIRERLVKEKRIRPEDMHIMANIFLPKDGFNNIERISHLVLTRTGLYIIDSQLLKGHVYNGISGGQFKDLPPMEQVFDTLDLDKSRPQTIVMDQNDDKRSLSFVNYSDQIEAIKQLAEDLQKHLGAKYTPTSILYFNPKNEGDVTISNYNQNSAVKVLVGAEQLDEFFNKFVFHGRIQYNVEDLQQMMDKIESFN >NC_018608.1|WP_000933822.1|1886514_1887708_-|methionine-adenosyltransferase MLNNKRLFTSESVTEGHPDKIADQVSDAILDAILKDDPNARVACETTVTTGMALIAGEISTTTYVDIPKVVRETIKEIGYTRAKYGYDYETMAILTAIDEQSPDIAQGVDKALEYRDKDSEEEIEATGAGDQGLMFGYATNETETYMPLAIYLSHQLAKRLSDVRKDGTLNYLRPDGKVQVTVEYDENDNPVRIDTIVVSTQHAEDVTLEQIQEDIKAHVIYPTVPENLINEQTKFYINPTGRFVIGGPQGDAGLTGRKIIVDTYGGYARHGGGCFSGKDPTKVDRSAAYAARYVAKNIVAAGLADQCEVQLAYAIGVAEPVSIAIDTFGTGKVSEGQLVEAVRKHFDLRPAGIIKMLDLKQPIYKQTAAYGHFGRTDVLFPWEKLDKVEELKDAVK >NC_018608.1|WP_000109913.1|1888079_1889672_+|phosphoenolpyruvate-carboxykinase-(ATP) MSVDTYTETTKIDKLLKKPTSHFQLSTTQLYNKILDNNEGVLTELGAVNASTGKYTGRSPKDKFFVSEPSYRDNIDWGEINQPIDEETFLKLYHKVLDYLDKKDELYVFKGYAGSDKDTMLKLTVINELAWHNLFAKNMFIRPESKEEATKIKPNFTIVSAPHFKADPEVDGTKSETFVIISFKHKVILIGGTEYAGEMKKGIFSVMNYLLPMQDIMSMHCSANVGEKGDVALFFGLSGTGKTTLSADPHRKLIGDDEHGWNKNGVFNIEGGCYAKAINLSKEKEPQIFDAIKYGAILENTVVSEDGSVDFEDNRYTENTRAAYPINHIDNIVVPSKAAHPNTIIFLTADAFGVIPPISKLNKDQAMYHFLSGFTSKLAGTERGVTEPEPSFSTCFGAPFFPLHPTVYADLLGELIDLHDVDVYLVNTGWTGGKYGVGRRISLHYTRQMVNQAISGKLKNAKYTKDSTFGLSIPVEIEDVPKTILNPINAWSDKEKYKAQAEDLIQRFEKNFEKFGEKVEHIAEKGSFNK >NC_018608.1|WP_016187361.1|1889968_1890715_-|S9-family-peptidase MPIESFTHQFEEITYLSDDLQVKALMMTPHHEVKRIVVYLRGGKGQVGRVRAGRLMQFSDSQTLVIGPYYRGNNGSEGKDEFYRGDLNDVTQLLRLLHDKYPQAFIHMVGFSRGGLQGLLTFQDLPVSSYIIWGGVSDIDLMYEERVDLRGMLRRMIGHPKKDRAAYEARQAIPNINENSPPILIVHGGKDQQVGIHHAYYLADQLELKGAAHETFYQMAEGHVPRPPAMVETLTYIKEFMNQVELHR >NC_018608.1|WP_000672013.1|1890719_1891193_-|nucleoside-triphosphatase-YtkD MKFRDKDNRQVNLTFKKDNEIADGNHVLAIPTFKNQLLFTKHNLRGIEFPGGKRERGESSAEAVTRELYEETGAKVKNIHYIAQYTIETHDQTDFVKDVYFIEVESLVSKNDYLETAGPVLFNCINDIELAQRSFLLQDSTILKCVERVQSLGFYQT |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_018608_10 | 1945160-1945302 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018608_10
|
1 spacers
spacers of NC_018608_10
>10.1|1945215|33|NC_018608|CRISPRCasFinder AATATTAAATTATGGAGCGGAAGATAGGATTTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018608_10
The CRISPR arrays of NC_018608_10 >merge|NC_018608|10|1945160-1945302|CRISPRCasFinder CACCTATACCTCGTTCCGGGAAGGAACGTGTTCTAAAAGTTGAACTACTCCCGCAAATATTAAATTATGGAGCGGAAGATAGGATTTGCACCTATACCTCGTTCCGGGAAGGAACGTGTTCTAAAAGTTGAACTACTCCCGCA >NC_018608|10|10|1945160-1945302|CRISPRCasFinder CACCTATACCTCGTTCCGGGAAGGAACGTGTTCTAAAAGTTGAACTACTCCCGCA AATATTAAATTATGGAGCGGAAGATAGGATTTG CACCTATACCTCGTTCCGGGAAGGAACGTGTTCTAAAAGTTGAACTACTCCCGCA
>NC_018608.1|WP_000063551.1|1943409_1944471_-|PTS-transporter-subunit-IIC MSNAKNADNKQFFSKILNSIGAGVVIALVPNALLGEVLKIFKSGNEILELTYQLVILIQSFMAFIIGVLAAHQFKFNGAGAAIVGTSAMIGSGAVVYSNNSFMLKGIGDIINTSLVVIIACLIYMVLQNKLGSFELIILPVLVPIVSGGIGLITLPYIRKITQAIGNVIHSFTDLNPLLMSILISVAFSLLMVTPISLVAIATAISLNGLGSGAANLGIVAACVTFLFGSLRVNSIGVNAVLLIGAAKMMIPVYLKNLIISIPLTINGIITGIIAYVLQVKGTPLSAGFGYTGLVGPINAFNRMSGDPTMNIILLALGYFVIPFVSAFIVHELCKKFIPIYSNDIYKFEVPKQ >NC_018608.1|WP_000649908.1|1941695_1943153_-|ABC-transporter-permease-subunit MKCLIRFILVLGLLISSAMVYINPTAHAEQDQTWEKIKERGELRVGLSADYAPMEFEHTVNGKTEYAGVDIDLAKKIAKDNNLKLKIVNMSFDSLLGALKTGKIDIIISGMTSTPERKKQVDFSDSYMMTKNIMLVKKDKVNEYKDIKDFNNKKVGAQKGTEQEKIAQTEIENASITSLSRLPDVILALKSGKVEGAVVEKPVAEAYLKQNPKLGISNVKFNEEEKDTVIAVPKDSPKLLSQINKTIKEVKDKGLIDKYMTNAANAMNDDSGFISKYGSFFLKGIKITILISLIGVALGSILGAFVALMKLSKIKIISWIASIYIEILRGTPMLVQVFIVFFGITAALGLDISALVCGTIALVINSSAYIAEIIRAGINAVDKGQMEAARSLGLNYRQTMKSVIMPQAIKNILPALGNEFVTLIKESSIVSTIGVGEIMFNAQVVQGISFDPFTPLLVAAALYFVLTFVLTRIMNMIEGRLNASD >NC_018608.1|WP_031774878.1|1940980_1941703_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIKINNLNKVFGDNEVLKDINLEINQGEVVAIIGPSGSGKSTLLRCMNLLEVPTKGQVIFEGNDLTEKRTQVDKLRQKMGMVFQNFNLFPHKKVVDNIILAPKLLKKDNNDELHKEALSLLDKVGLKEKADVYPNQLSGGQKQRVAIARALAMHPDVILFDEPTSALDPEVVGDVLKVMKDLAKEGMTMVVVTHEMGFAKDVSDKVIFMADGVVVESGTPVEIFEQPQHERTQNFLARVL >NC_018608.1|WP_000379980.1|1939702_1940830_-|tRNA-epoxyqueuosine(34)-reductase-QueG MDTKQLKQDIIDYAYTIGIDSIGFTTADPFDELKQKLEAYHANGYASGFEESDIALRTEPKLSLPTARSIIAIAVGYPNKLKGAPKSVRGDRRGLFARASWGQDYHTIMRKRLDMLAAFIESKVPDVEIKSMVDTGVLSDRAVAERAGLGFVGRNGFVINPKLGTWTYLGEMLVSIPFEPDDPLLDSCGDCTICVDRCPTSALVGNGQLNSQKCISFLTQTKGYMPDQYRYKIGNRLYGCDTCQQVCPKNRGINTEQDDIILEPEILKPRLVPLLRMSNKEFKQTYGHLAGAWRGKKPIQRNAILALAHFNEVDAIPELKKVATTDERPMIRATAYWAIGQILGEEARDFINANYDQEDAEVQNEMIKGLDTRRE >NC_018608.1|WP_000181394.1|1939227_1939698_-|tRNA-(uridine(34)/cytosine(34)/5--carboxymethylaminomethyluridine(34)-2'-O)--methyltransferase-TrmL MTNHIVLYQPEIPANTGNIARTCAGTNTHLHLIKPLGFRTDDKMLKRAGLDYWEFVNITYHDSIEAFFEATNGEYYLLTKFGKKTYSDFDFSNHDKDFYFIFGKETTGLPDWVKEKYQDTALRIPMSEHIRSLNLSNTAALLIYEALRQQDFPGLN >NC_018608.1|WP_001251224.1|1938469_1939069_-|glucosamine-6-phosphate-isomerase MAMNFKVFDNSQLVAEYAADIIRKQFNNNPTTIAGFHLDTDQAPVLDELKKNVEKHAVDFSQINILDYDDKKSYFEALGVPAGQVYPIAYEKDAIELIADKIKTKENKGKLTLQVVSIDEQGKLNVSIRQGLMEAREIFLVVTGANKRDVVEKLYQENGKTSFEPADLKAHRMVNVILDKEAAAGLPEDVKAYFTSRFA >NC_018608.1|WP_000031108.1|1938292_1938445_-|hypothetical-protein MSKDKDPKLNYHEEENSMVTDFEDLKELGKEMEQISDQNDQEKNSEEDSQ >NC_018608.1|WP_000901018.1|1937354_1937750_-|hypothetical-protein MLGKYWIQLLIATVIISLISIKAFPLAIGALYLPIIFKVIKLQLNLSKGLIDDVNAQTFIKSNQSGIVISVICCLLITGILYYTLDGFYASLTGVLGTLVALNPYTTIVSAILYILTAIATVEATKTKYRN >NC_018608.1|WP_000116238.1|1935773_1937159_-|class-II-fumarate-hydratase MSVRIEHDTFGEIEVPADKYWGAQTERSKRNFPVGKERMPIEVVYGFAQLKRAAALANFDLGKLSEAKKDAIVYACDQILSGELDEHFPLVVWQTGSGTQSNMNVNEVVSYVANMYLKDHQSDESIHPNDDVNKSQSSNDTFPTAMHVALYQEVETKLEPALKLLRNTLKEKEDKFDSIIKIGRTHLQDATPIKLGQEISGWRYMLDRCETMLSESKKHILNLAIGGTAVGTGINAHPEFGDKVAQYISENTGYPFVSSENKFHALTAHDEVVQLHGTLKALAGDLMKIANDVRWLASGPRAGLAEISIPENEPGSSIMPGKVNPTQCEMLTMVAVQVMGNDTVVGFASSQGNFELNVYKPVIMHNTLQSIYLLADGMETFNNNCAVGIEPIEENIDNYLNQSLMLVTALNPHIGYEKAAQIAKKAHKEGLTLKESAIQTGYVTEEQFEAWIKPEDMVDPH >NC_018608.1|WP_000669380.1|1934497_1935319_+|RluA-family-pseudouridine-synthase MKFKIPENFNDLSLRDIFQQLKVPKKDLHHLNMSKDITINDKPARLMDKVHTGDDVFVPTIDEKSNYVPSYRYAQIKYEDDDMAIVMKPKGVKTHPNDLKESNTLMNHVIYTVDSDYVEPIHRLDQETVGLLIVAKNPLMKKILDRMLEDNDITRIYKANVKALLPLKPQTIDMPIGKDKFHSNKRRVSPTGQRAITHILTSKMIKETVCQLEIKLDTGRTHQIRVHLAEIGHPVIGDPLYGDSTLRQLELESYKIEFVHPLTKEVISVSLDD >NC_018608.1|WP_000110011.1|1953124_1953571_-|peroxide-responsive-transcriptional-repressor-PerR MSVEIESIEHELEESIASLRQAGVRITPQRQAILRYLISSHTHPTADEIYQALSPDFPNISVATIYNNLRVFKDIGIVKELTYGDSSSRFDFNTHNHYHIICEQCGKIVDFQYPQLNEIERLAQHMTDFDVTHHRMEIYGVCKECQDK >NC_018608.1|WP_000869465.1|1953667_1954618_-|phosphoglycerate-dehydrogenase MKVVGLNRMREVETELQQRFSDVDFKFYKKASEIPESDLANLDILVGYDGGINEAFLRRCTNLKWIAWFATGVNTLPLDYIADHGILLTNGKGVQAKQLSEYILAFILDDYKKMKLSYDNQRQHIYDSKITGKRLSGQTVLFLGTGAIATRTAKLAKAFNMNLIGLSKSGQNKDEFDEIYTIESLESTLPNADIVINALPETQETIHLLKKKHFELMKDEALFINIGRGSIVKETLLIEVLKSRVIRHAYLDVFENEPLKPNHELYELDNVTITAHITGNDYEAKYDLLDIFKNNLVNFLNKNGLIENEVDAKKGY >NC_018608.1|WP_000939521.1|1954623_1955079_-|thioredoxin-dependent-thiol-peroxidase MLQKGEQFPIFKLENQDGTVITNDTLKGKKAIIYFYPRDNTPTCTTEACDFRDNLEMFNDLDVAVYGISGDSKKKHQNFIEKHGLNFDLLVDEDFKLAKETGVYQLKKSFGKESMGIVRTTFIIDEQGKVLDVIEKVKVKTQIEELKNILG >NC_018608.1|WP_001011603.1|1955159_1956449_+|glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase MNFSESERLQQLSNEYILGGVNSPSRSYKAVGGGAPVVMKEGHGAYLYDVDGNKFIDYLQAYGPIITGHAHPHITKAIQEQAAKGVLFGTPTELEIEFSKKLRDAIPSLEKIRFVNSGTEAVMTTIRVARAYTKRNKIIKFAGSYHGHSDLVLVAAGSGPSQLGSPDSAGVPESVAREVITVPFNDINAYKEAIEFWGDEIAAVLVEPIVGNFGMVMPQPGFLEEVNEISHSNGTLVIYDEVITAFRFHYGAAQDLLGVIPDLTAFGKIVGGGLPIGGYGGRQDIMEQVAPLGPAYQAGTMAGNPLSMKAGIALLEVLEQDGVYEKLDSLGQQLEEGLLKLIEKHNITATINRIYGSLTLYFTDEKVTHYDQVEHSDGEAFGKFFKLMLNQGINLAPSKFEAWFLTTEHTEEDIKQTLKAADYAFSQMK >NC_018608.1|WP_001807907.1|1956741_1957836_+|aromatic-acid-exporter-family-protein MRLGARIFKTGIAIILAMSIASLLPDDVGLKALAGVSAVVAMQPSIYRSFKTVSDQALGNIIGAILSVTMVTIFSDNFIIMGVTVVVLIAILFKFNLAHVATLASVTALIIMGQHTGSFYITAFYRFVLVMIGVISSSLVNFVFLPPKFETKIYYNSLNISSDIFMWFKLVLNDTTEFNNIKQDSHNLKQRVEKLEKIYDYYSEERPITKKHIHQQNRKKILFREVVQTTRQAYEVLNKLSRYQNDLYLLNNNFLLQIKLDLDSLTAFHEQILASLSKKARYNVTHVDYELDNPQKKDLLSTFQHELINHPYQTEYSFANVMQIVAAIEEYRHHLEHLDRIRISFFTYHRSDADIEIVEEDFDL >NC_018608.1|WP_000597248.1|1958026_1959763_-|SAV1866-family-putative-multidrug-efflux-ABC-transporter MIKRYLQFVKPYKYRIFATIIVGIIKFGIPMLIPLLIKYAIDGVINNHALTTDEKVHHLTIAIGIALFIFVIVRPPVEFIRQYLAQWTSNKILYDIRKKLYNHLQALSARFYANNQVGQVISRVINDVEQTKDFILTGLMNIWLDCITIIIALSIMFFLDVKLTLAALFIFPFYILTVYVFFGRLRKLTRERSQALAEVQGFLHERVQGISVVKSFAIEDNEAKNFDKKNTNFLIRALKHTRWNAYSFAAINTVTDIGPIIVIGVGAYLAISGSITVGTLAAFVGYLELLFGPLRRLVASFTTLTQSFASMDRVFQLIDEDYDIKNGVGAQPIEIKQGRIDIDHVSFQYNDNEAPILKDINLSIEKGETVAFVGMSGGGKSTLINLIPRFYDVTSGQILIDGHNIKDFLTGSLRNQIGLVQQDNILFSDTVKENILLGRPTATDEEVVEAAKMANAHDFIMNLPQGYDTEVGERGVKLSGGQKQRLSIARIFLNNPPILILDEATSALDLESESIIQEALDVLSKDRTTLIVAHRLSTITHADKIVVIENGHIVETGTHHELIAKQGAYEHLYSIQNL >NC_018608.1|WP_000251253.1|1960053_1960596_-|DUF402-domain-containing-protein MVRESIPKEGENIKIQSYKHDGKIHRVWSETTILKGTDHVVIGGNDHTLVTESDGRTWITREPAIVYFHSEYWFNVICMFREDGIYYYCNLSSPFVCDEEALKYIDYDLDIKVYPNGKYHLLDEDEYEQHMNQMNYPHDIDIILRRNVDILQQWIEQKKGPFAPDFIKVWKERYKKIRQY >NC_018608.1|WP_000284749.1|1960898_1961936_-|A/G-specific-adenine-glycosylase MYQQSSFKENLIHWFDENQREMPWRQTTNPYYIWLSEVMLQQTQVKTVIDYYHRFVERFPTVEVLSQASEDEVLKYWEGLGYYSRARNFHTAIKEVHDKYEGLVPKDPDQFKALKGVGPYTQAAVMSIAYNVPLATVDGNVFRVWSRLNDDYRDIKLQSTRKSYEQELLPYVTTEAGTFNQAMMELGALICTPKNPLCLFCPVQENCEAFDKGTFEKLPVKSKNVSKKVIEQSVFLIRNNQGQYLLQKRSEKLLHGMWQFPMFESEHARREMTEKIGHDIQPVETPIFELKHQFTHLTWKIKVYAVSGTINIERLPDDMIWFDLSDRDQYTFPVPMSKIYQFING >NC_018608.1|WP_000379101.1|1962087_1963065_+|metal-dependent-hydrolase MDTATHIAIGVGLTALATQDPAMASTFGATATTLIVGSLIPDGDTVLKLKDNATYISHHRGITHSIPFTILWPILITFLIFTFFSGTNPFHVWMWAQLAVFLHVFVDIFNSYGTQALRPITNKWIQLSVINTFDPIIFTVLCIGIVLWVVGLHPFAVFFPIIALLIIYYMIRFKMRAVIKQQALKAIQQEHHPVKVFVAPTIKFMEWRVAIQTDAHDYVGKAYGRNVVFSDKVERQKLSTDSILWKVKGNKDIRTFLNFSSIYRWQTTTLADGSTEIRLIDLRYLKNDHYSFVAIAHVTNDNVIDHSYIGWVFTEDKLQRKLYAK >NC_018608.1|WP_000886473.1|1963325_1964162_-|membrane-protein MLDNIILYFKNLPHTKRYVTERLKQSWKSFLIVLAACLILIIASETLFSFSHLTDVKEVRWLFRLIALIVFAVLMFTIYISYHHYMNDFLVTKLFNISAATPVVIMSILSFIMLVILTMVSALVKPVNFETSYIALFYFIVMATIFVGLISVTFGLIRLLTEKINIIFYGICVLCFFVLPIIFIPNPNHVFINHILMLNPMYYIVNGIAQSIIFGISSMENIPYHFYFILFLCLIAAVNFVLARYTTHAIYNKTSKVTQTDKQQDVSKDSTDEADTSS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_018608_11 | 2122249-2122461 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018608_11
|
2 spacers
spacers of NC_018608_11
>11.1|2122296|34|NC_018608|CRISPRCasFinder TGCTGGTACCACGATGCGTCTTGATGTAGTGCTA >11.2|2122377|38|NC_018608|CRISPRCasFinder TGCTGTTGTGGGAGCTTGGTGTTGGTGCCATGTTACTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018608_11
The CRISPR arrays of NC_018608_11 >merge|NC_018608|11|2122249-2122461|CRISPRCasFinder TGACGTATTGTTGCGGGAACTTGGTGTCATGACATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGTCTTGATGTAGTGCTATGATGTGCTGTTGTGGAAGCTTGGTGTCGTGCCATGCTACTTTGATGTGCTGTTGTGGGAGCTTGGTGTTGGTGCCATGTTACTTTGATGTGCTGTTGTGGAAGCTTGGTGTCATGCCATGCTACTTTGATG >NC_018608|11|11|2122249-2122461|CRISPRCasFinder TGACGTATTGTTGCGGGAACTTGGTGTCATGACATGTTACTTTGATG TGCTGGTACCACGATGCGTCTTGATGTAGTGCTA TGATGTGCTGTTGTGGAAGCTTGGTGTCGTGCCATGCTACTTTGATG TGCTGTTGTGGGAGCTTGGTGTTGGTGCCATGTTACTT TGATGTGCTGTTGTGGAAGCTTGGTGTCATGCCATGCTACTTTGATG
>NC_018608.1|WP_001187614.1|2121567_2122215_+|HD-domain-containing-protein MQQSDIISAAKKYMESIHQNDYTGHDIAHVYRVTALAKSIAENEGVNDTLVIELACLLHDTVDEKVVDANKQYAELKSFLSSLSLSTEDQEHILFIINNMSYRNGKNDHVTLTLEGQIVRDADRLDAIGAIGVARTFQFAGHFGEPMWTEQMSLDKINDDLVEQLPPSAIKHFFEKLLKLESLMHTDTAKMIAKERHDFMMIYLKQFFTEWNYHD >NC_018608.1|WP_000571550.1|2120055_2121540_+|cardiolipin-synthase MIELLSIALKHSNIILNSIFIGAFILNLLFAFTIIFMERRSANSIWAWLLVLVFLPLFGFILYLLLGRQIQRDQIFKIDKEDKKGLELIVDEQLAALKNENFSNSNYQIVKFKEMIQMLLYNNAAFLTTDNDLKIYTDGQEKFDDLIQDIRNATDYIHFQYYIIQNDELGRTILNELGKKAEQGVEVKILYDDMGSRGLRKKGLRPFRNKGGHAEAFFPSKLPLINLRMNNRNHRKIVVIDGQIGYVGGFNVGDEYLGKSKKFGYWRDTHLRIVGDAVNALQLRFILDWNSQATRDHISYDDRYFPDVNSGGTIGVQIASSGPDEEWEQIKYGYLKMISSAKKSIYIQSPYFIPDQAFLDSIKIAALGGVDVNIMIPNKPDHPFVFWATLKNAASLLDAGVKVFHYDNGFLHSKTLVIDDEIASVGTANMDHRSFTLNFEVNAFIYDQQIAKKLKQAFIDDLAVSSELTKARYANRSLWIKFKEGISQLLSPIL >NC_018608.1|WP_000138932.1|2119596_2119890_-|copper-sensing-transcriptional-repressor-CsoR MTEQDNAHHSEQIKTNLKSRLNRIEGQVRAINRMIEEDVYCDDVLTQIRATRSALNSVAIKLLEQHMKSCIMNKVNQGAQEEAMEELLVTFQKLIKD >NC_018608.1|WP_000581792.1|2119375_2119585_-|heavy-metal-associated-domain-containing-protein MIHQNTIYTAGIETEEQVSQLTERISNMIGVHQVNINIIDGQVTVSYETPANLNSIEKEIYDEGYKIVF >NC_018608.1|WP_000828354.1|2119110_2119248_-|hypothetical-protein MKRPEKIQNVVKLLSSLGVNIKKTKSRLDIINTLPASNKVSHELK >NC_018608.1|WP_001109939.1|2117644_2118847_+|rod-shape-determining-protein-RodA MNYSSRQQPDKHWLRKVDWVLVATIAVLAIFSVLLINSAMGGGQYSANFGIRQIFYYILGAIFAGIIMFISPKKIKHYTYLLYFLICLLLIGLLVIPESPITPIINGAKSWYTFGPISIQPSEFMKIILILALARVVSRHNQFTFNKSFQSDLLLFFKIIGVSLVPSILILLQNDLGTTLVLAAIIAGVMLVSGITWRILAPIFITGIVGAMTVILGILYAPALIENLLGVQLYQMGRINSWLDPYTYSSGDGYHLTESLKAIGSGQLLGKGYNHGEVYIPENHTDFIFSVIGEELGFIGSVILILIFLFLIFHLIRLAAKIEDQFNKIFIVGFVTLLVFHILQNIGMTIQLLPITGIPLPFISYGGSALWSMMTGIGIVLSIYYHEPKRYVDLYHPKSN >NC_018608.1|WP_000159641.1|2116256_2117327_-|D-alanine--D-alanine-ligase MTKENICIVFGGKSAEHEVSILTAQNVLNAIDKDKYHVDIIYITNDGDWRKQNNITTEIKSTDELHLENGEALEISQLLKESSSGQPYDAVFPLLHGPNGEDGTIQGLFEVLDVPYVGNGVLSAASSMDKLVMKQLFEHRGLPQLPYISFLRSEYEKYEHNILKLVNDKLNYPVFVKPANLGSSVGISKCNNEAELKEGIKEAFQFDRKLVIEQGVNAREIEVAVLGNDYPEATWPGEVVKDVAFYDYKSKYKDGKVQLQIPADLDEDVQLTLRNMALEAFKATDCSGLVRADFFVTEDNQIYINETNAMPGFTAFSMYPKLWENMGLSYPELITKLIELAKERHQDKQKNKYKID >NC_018608.1|WP_000611457.1|2114886_2116242_-|UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D--alanine-ligase MINVTLKQIQSWIPCEIEDQFLNQEINGVTIDSRAISKNMLFIPFKGENVDGHRFVSKALQDGAGAAFYQKGTPIDENVSGPIIWVEDTLTALQQLAQAYLRHVNPKVIAVTGSNGKTTTKDMIESVLHTEFKVKKTQGNYNNEIGLPLTILELDNDTEISILEMGMSGFHEIEFLSNLAQPDIAVITNIGESHMQDLGSREGIAKAKSEITIGLKDNGTFIYDGDEPLLKPHVKEVENAKCISIGVATDNALVCSVDDRDTTGISFTINNEHYDLPILGKHNMKNATIAIAVGHELGLTYNIIYQNLKNVSLTGMRMEQHTLENDITVINDAYNASPTSMRAAIDTLSTLTGRRILILGDVLELGENSKEMHIGVGNYLEEKHIDVLYTFGNEAKYIYDSGQQHVEKAQHFNSKDDMIEVLTSDLKAHDRVLVKGSRGMKLEEVVNALIS >NC_018608.1|WP_001178939.1|2112850_2114371_-|DEAD/DEAH-box-helicase MQNFKELGISDNTVQSLESMGFKEPTPIQKDSIPYALQGIDILGQAQTGTGKTGAFGIPLIEKVVGKQGVQSLILAPTRELAMQVAEQLREFSRGQGVQVVTVFGGMPIERQIKALKKGPQIVVGTPGRVIDHLNRRTLKTDGIHTLILDEADEMMNMGFIDDMRFIMDKIPAVQRQTMLFSATMPKAIQALVQQFMKSPKIIKTMNNEMSDPQIEEFYTIVKELEKFDTFTNFLDVHQPELAIVFGRTKRRVDELTSALISKGYKAEGLHGDITQAKRLEVLKKFKNDQINILVATDVAARGLDISGVSHVYNFDIPQDTESYTHRIGRTGRAGKEGIAVTFVNPIEMDYIRQIEDANGRKMSALRPPHRKEVLQAREDDIKEKVENWMSKDSESRLKRISTELLNEYNDVDLVAALLQELVEANDEVEVQLTFEKPLSRKGRNGKPSGSRNRNSKRGNPKFDSKSKRSKGYSSKKKSTKKFDRKEKSSGGSRPMKGRTFADHQK >NC_018608.1|WP_001190840.1|2111802_2112498_+|response-regulator-transcription-factor MQSKILIIEDDHAITHLLDVALTLDYYNVTTADNATQAHFKIQIDKPDVILLDLGLPDKDGLCLISEIRQHTDIPIIVISARQEEQTIIQALDNGANDYMTKPFNVDELRARIRVIERIAKSHQETNFVFTNGLLSIDFGSKSVVINNQEVHLTPNEFSLLELLSNHKGKVLTYEMILKRIYGYVNKTEMPSLRVHMTSLRQKLSQCHEDAKDIIKTHPRIGYQMLQWKEK >NC_018608.1|WP_001825748.1|2122494_2122815_+|hypothetical-protein MIWRCGVMGGIARGIDAMPLQFYDMALGRCNVYYAVVTLLFHTVTCICELLWKCCDIYCYTDESLCQDDIAMMNSNSVINHFLHAEISLILFGSMSNWTDAFNIGS >NC_018608.1|WP_001066880.1|2122811_2124128_-|ISL3-family-transposase MNNVILKTFDFKDKNIIFDGKLEKIEYKGRKCFFYYAKLIYTPEVCPNCNCKNINGNLIKNGSKTSRITMPKISEYPTYIMLRKQRFKCKTCERYFTAETPEVDKYCFYIKKTRSAVLNKAAEIRSEKSIAKSCSVSATTVSRIIDEAAQSLHQSPYSAFPEHIMMDEFKSVKNVSGKMSFIYADAQTHHIIDIVEDRRLSELKKYFYRFSLKARKRVKTVSIDMHEGYMTLIKEMFPNAKIVIDRFHIVQLLNRALNGIRVAVMNELRTTNQPLYNKFKRYAKLLLKPGEDLGAFEYRKVALFKEWKTQKGIVKYLLDQDDSLNDAYQYINQLRFKLKHNDYEGFIHELKHIPLSQTHSVVQRAIKTLNKHAYFIKNTFDYYNLSNGPLEGINNKIKLIKRTSFGYGSYNHLRNRILLCSKLYAPKSKKEVKQCSVA >NC_018608.1|WP_000725800.1|2124457_2125330_-|membrane-protein-insertase-YidC MKKKALLPLFLGIMVFLAGCDYSKPEKRSGFFYNTFVDPMKNVLDWLGNNLLNDNYGLAIIILVLVIRIILLPFMLSNYKNSHMMRQKMKVAKPEVEKIQEKVKRARTQEEKMAANQELMQVYKKYDMNPIKSMLGCLPMLIQLPIIMGLYFVLKDQLVDGLFKYPHFLWFDLGRPDIWITIIAGVLYFIQAYVSSKTMPDEQRQMGYMMMVISPIMIIWISLSSASALGLYWSVSAAFLVVQTHFANIYYEKVAKKEVQPFIEAYEREHNGGNNKKGKNTQVVSKKKKK >NC_018608.1|WP_000483161.1|2125415_2126057_-|thiamine-phosphate-synthase MFNQSYLNVYFICGTSDVPSHRTIHEVLEAALKAGITLFQFREKGESALKGNDKLVLAKELQHLCHQYDVPFIVNDDVSLAKEINADGIHVGQDDAKVKEIAQYFTDKIIGLSISDLGEYAKSDLTHVDYIGVGPIYPTPSKNDAHTPVGPEMIATFKEMNPQLPIVAIGGINTSNVAPIVEAGANGISVISAISKSENIEKTVNRFKDFFNN >NC_018608.1|WP_001108486.1|2126058_2126850_-|hydroxyethylthiazole-kinase MNYLNKIRIENPLTICYTNDVVKNFTANGLLSIGASPAMSEAPEEAEEFYKVAQALLINIGTLTAQNEQDIIAIAQTANEAGLPIVFDPVAVGASTYRKQFCKLLLKSAKVSVIKGNASEILALIDDTATMKGTDSDANLDAVAIAKKAYAIYKTAIVITGKEDVIVQGDKAIVLANGSPLLARVTGAGCLLGGVIAGFLFRETEPDIEALIEAVSVFNIAAEVAAENENCGGPGTFSPLLLDTLYHLNETTYQQRIRIQEVE >NC_018608.1|WP_000594966.1|2126833_2127664_-|bifunctional-hydroxymethylpyrimidine-kinase/phosphomethylpyrimidine-kinase MIKPKIALTIAGTDPTGGAGVMADLKSFHSCGVYGMGVVTSIVAQNTLGVQNIHNLNHQWVDEQLDSVFNDTLPHAIKTGMIATADTMETIRHYLMQHESIPYVIDPVMLAKSGDSLMDNDTKQNLQHTLLSLADVVTPNLPEAEEITGLTIDSEEKIMQAGRIFINEIGSKGVIVKGGHSNDTDIAKDYLFTKEGVQTFENERFKTKHTHGTGCTFSAVITAELAKGRPLFDAVQKAKKFISMSIQYTPEIGRGRGPVNHFAYLKKEGLDDELSK >NC_018608.1|WP_000396068.1|2127656_2128346_-|thiaminase-II MEFSQKLYQAAKPIINDIYEDDFIQKMLLGNIQADALRHYLQADAAYLKEFTNLYALLIPKMNSMNDVKFLVEQIEFMVEGEVLAHDILAQIVGESYEEIIKTKVWPPSGDHYIKHMYFQAHSRENAIYTIAAMAPCPYIYAELAKRSQSDHKLNREKDTAKWFDFYSTEMDDIINVFESLMNKLAESMSDKELEQVKQVFLESCIHERRFFNMAMTLEQWEFGGKVND >NC_018608.1|WP_000751995.1|2128732_2129428_-|lytic-transglycosylase-SceD MKKTLLASSLAVGLGIVAGNAGHEAHASEADLNKASLAQMAQSNDQTLNQKPIEAGAYNYTFDYEGFTYHFESDGTHFAWNYHATGANGADMSAQAPATNNVAPSADQANQVQSQEVEAPQNAQTQQPQASTSNNSQVTATPTESKASEGSSVNVNDHLKQIAQRESGGNIHAVNPTSGAAGKYQFLQSTWDSVAPAKYKGVSPANAPESVQDAAAVKLYNTGGAGHWVTA >NC_018608.1|WP_000932694.1|2129816_2130212_-|single-stranded-DNA-binding-protein MLNKIVIVGRLTKDAQIFEKEDRKIATFCVATHRNYKDENGEIVCDYLFCKAFGKLASNIEKYTNQGTLVGITGQMRSRKYDKDGQTHFVTELYVETIKFMSPKSQNNEILSDSILDIDSQNIDNHDLLEI >NC_018608.1|WP_000846746.1|2130405_2130846_+|YwpF-like-family-protein MKTFKAVRFQIVNEHGRIIEYELEDGVIINKEESGTGWLLEIVISNEHYETFKEYQDNEQLLDIRVVITRPANDPALFESTVKSIKNFKTTMSIVFECHIYTLRQQYAESLLEQLIDDGLSGEELKKSFNRMMQSKPKLKDEKLEE |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_018608_12 | 2177881-2178031 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018608_12
|
2 spacers
spacers of NC_018608_12
>12.1|2177909|29|NC_018608|CRISPRCasFinder TGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTA >12.2|2177966|38|NC_018608|CRISPRCasFinder GTTGATGCATAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTC |
csa3,TnsE_C |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018608_12
The CRISPR arrays of NC_018608_12 >merge|NC_018608|12|2177881-2178031|CRISPRCasFinder AACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTAAACTTTAGTTGTAAGGGGCTCTTATGCAGTTGATGCATAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTCAACTTTAGTTGTTAGGAGCTTCTTTCTA >NC_018608|12|12|2177881-2178031|CRISPRCasFinder AACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCA TGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTA AACTTTAGTTGTAAGGGGCTCTTATGCA GTTGATGCATAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTC AACTTTAGTTGTTAGGAGCTTCTTTCTA
>NC_018608.1|WP_000495673.1|2176771_2177863_+|hypothetical-protein MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYVQTIAIYSQFGQKPPGDAYLKVIALLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLVGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPVFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILYVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKNKKVVTEPKNTKVENDKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >NC_018608.1|WP_000019735.1|2175525_2176506_+|CDF-family-zinc-efflux-transporter-CzrB MSHSHHHHDHMHSHVNTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALIAFIYAEKNATATKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHHAHHHAHVH >NC_018608.1|WP_000003759.1|2175203_2175524_+|Zn(II)-responsive-metalloregulatory-transcriptional-repressor-CzrA MSEQYSEINTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIHHANHPKESGL >NC_018608.1|WP_001024099.1|2174386_2175052_-|SDR-family-oxidoreductase MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVPFTAGVRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIETLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSMIASKEANIKHYVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFEGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNHQEFQIISGDQDIKDALTQFENETD >NC_018608.1|WP_001127960.1|2173014_2173953_-|class-I-mannose-6-phosphate-isomerase MPLFLQPILKTKLWGGQRLSEFGYQLDNDTTGECWCVSAHPNGTSEIINGPYQGQTLDRIWSEHRELFGDFPSKDFPLLTKIVDARESLSIHVHPDNSYAYEHENGQYGKSECWYIIDAEEDAEIVIGTLAESREEVANHVQHGTIESILRYIKVKPGEFYFIPAGTVHTISSGILAYETMQSSDITYRLYDFNRQDNQYNDRPLNIEKALDVIQYNAPLPNILPESEIIENHKCTHIVSNDFFTLVKWEISGTLNYMKPREFCLVTVLEGEGQMIVDGEIFKLTTGTNFILTSEDLDSVFEGDFTLMISYV >NC_018608.1|WP_000808818.1|2172753_2172984_-|hypothetical-protein MKQFLYIALVCGVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQTSASLKFSALLINVLPLCGTFVASN >NC_018608.1|WP_000123397.1|2170708_2172082_-|EVE-domain-containing-protein MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRMSNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIAEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVQKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD >NC_018608.1|WP_001123309.1|2169837_2170251_-|thiol-disulfide-oxidoreductase-DCC-family-protein MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYQFATLKGEVGQQFFKQQPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIQLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD >NC_018608.1|WP_000070865.1|2169194_2169638_-|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein MSNQQDVVKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLEKAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS >NC_018608.1|WP_000160304.1|2168363_2169074_+|purine-nucleoside-phosphorylase MTKGTPHIQPNGVKIAKTVLMPGDPLRAKYIADNFLENVEQFNDVRNMFGYTGTYKGKEVSVMGSGMGIPSIGIYSYELYNFFDVDTIIRIGSCGALQENVNLYDVIIAQAASTNSNYVDQYNIPGHFAPIADFELVTKAKNVADQIGATTHVGNVLSSDTFYNADPTFNDAWKKMGILGIEMESAGLYLNAIHAGKKALGIFTVSDHILRDEATTPEERQNSFTQMMEIALEIAE >NC_018608.1|WP_001802298.1|2178360_2178465_-|hypothetical-protein MLLLERTSMSDFEMLMVVLTIIGLVLISTQDHKK >NC_018608.1|WP_001792784.1|2179144_2179303_+|hypothetical-protein MSKSSDALFNSLTQSFELIEGVYNELVTDNLKIVMYKPRKESTSGRINRRFK >NC_018608.1|WP_000220902.1|2179738_2179831_+|hypothetical-protein MTYGSIVAILCALFAIFFIPYMEKKDKKKK >NC_018608.1|WP_000370942.1|2179960_2180818_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINRLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQIINLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWLRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIEHFGINQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAKHFLAD >NC_018608.1|WP_000908191.1|2180885_2181668_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLIQLDQVGRMKQGKTILKNISWQINGGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATTGSVNLFGKMPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEVRNEAHQLLKLVGMSAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLSILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITGNFTKILLLKDGESVQQGLIDDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE >NC_018608.1|WP_000101714.1|2181957_2182566_-|TIR-domain-containing-protein MARKTFISYKYSEAKDLRDKIVESLGEDAKYYQGETSDSPDMSDRITEYIKKELKNKIYSTSVTIVVISPNMKESNWIDWEIEYSVKQMKRGDRTSSTNGVVGVVMKHNGDYSWLRNSVINSDGHTAIHTDNSYLYDIIVKNRFNQEPIEYTCDECKNIDALTGSFISLVEEDEFLGNPTKYIENAYEKSKKATNYNICRRK >NC_018608.1|WP_000876896.1|2182593_2183628_-|toll/interleukin-1-receptor-domain-containing-protein MKYPIRQVAEVLPEKYTRYILLKEFQRLFPYQWNIIVERQQTYKEKAQHLYKVKKIKNRYNTKSAEEYFFSIPQVKYILSAGRMKKHKENYNASEIKIKKAALEKSRKNKNWKIEERLIKAKRYTQKVDPEYLNIYMKAYHKKDITTEEKLEILTELKKFDTENIVRFFRKLNDAEQNKMIRNLAFKYLQDYGHYVKLRKNFKGKKKVYQTERASLDTKKPEDLYNDLTNKNIQSQKVYDIFISHSTKDKKTVEDIIRVFNEQNKTCYCDWTMDQDYLKRKYVGEYTKQVLKARMEQSKMLVLLRTENSVQSDWVSFEIEYFENLKKPIYIVESLEELLEAFSD >NC_018608.1|WP_044555027.1|2183721_2185191_-|SIR2-family-protein MNGDGKMTIDKKKFIEKYVKALESNTAAIFAGAGLSCGAGYVNWKTLLNEAAEELELNIDKEEHDLVGLAQHYINKKRSRGNLNTVIMEQFSTRAELTENHKLLAKLPIDTYWTTNYDCMIEKALDSEGRIVDVKRNQNQLTVSVADKDATVYKMHGDIDSIDKIILTRDDYEKYNLTHPKFREILEGDLLSKTFLFIGFSFTDPNISYILSRIRLVLEDNTRPHYCILKEVEEKEYDNTEEFMYAKIKQQLHIEDLSRFSIETLLVKDYIEITEILESIYKRYRRKTIFISGSATEYLPFNSETGKYFLHQLSKKLVENDFKLVTGFGLGVGSYVINGVADYINSNKKSKLQNHLNILPFSQDSSGDLDLKEVWKKNRLEMISECGMALFLFGNKEKDGKIVLADGLEEEYKIAERQELVRLPINVTGYKTKNLSEQYNEEINIQFKEKILKMYNEINEYKCDFSNKQSIDELVQKIVNLVIEIKKTK >NC_018608.1|WP_099184063.1|2185250_2185541_-|DUF3387-domain-containing-protein MVMEENAFYDALASHDTAEHVLGDDTLKIIAHELTQSIKENMSIDWNLCESARAKMRVIVRRLLKKYGYPPEISKQAVETVIEQAELMSEQLAMEL >NC_018608.1|WP_001156920.1|2185665_2186070_-|hypothetical-protein MQELEDYKEVQLIIIQMSSLPIGDGKRVFSYLEDGVTPRQYALATVSLFNGNEFKILEVERENCALSMLILSSTGLVNWNPLIDSLLLNLVNSSGTWVKESLEILERSNVIIQKAKHSKKEYAHRAKLLIHKML |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018608_13 | 2341811-2341896 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018608_13
|
1 spacers
spacers of NC_018608_13
>13.1|2341841|26|NC_018608|CRISPRCasFinder CGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGG |
WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018608_13
The CRISPR arrays of NC_018608_13 >merge|NC_018608|13|2341811-2341896|CRISPRCasFinder AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG >NC_018608|13|13|2341811-2341896|CRISPRCasFinder AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG CGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGG AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG
>NC_018608.1|WP_000684154.1|2340315_2341440_-|FAD-dependent-monooxygenase MKIAIIGAGIGGLTAAALLQEQGHTIKVFEKNESVKEIGAGIGIGDNVLKKLGNHDLAKGIKNAGQILSTMTVLDDKDRPLTTVKLKSNTLNVTLPRQTLIDIIKSYVKDDAIFTNHEVTHIDNETDKVTIHFAEQESEAFDLCIGADGIHSKVRQSVNADSKVLYQGYTCFRGLIDDIDLKHPDCAKEYWGRKGRVGIVPLLNNQAYWFITINSKENNHKYSSFGKPHLQAYFNHYPNEVREILDKQSETGILLHNIYDLKPLKSFVYGRTILLGDAAHATTPNMGQGAGQAMEDAIVLVNCFNAYDFEKALQRYDKIRVKHTAKVIKRSRKIGKIAQYRSRLVVAVRNRIMKMMPNALAAGQTKFLYKSKEK >NC_018608.1|WP_000417008.1|2339270_2340224_+|2-hydroxyacid-dehydrogenase-family-protein MEKVYVAGAIPEVGLKLLQEHFEVEMYEGKGLVDKDTLIKGVKDATALISLLSTNVDKDVIDAGKDLKIIANYGAGFNNIDIEYAREKSIDVTNTPKASTNATADLTIGLVLAVARRIVEGDQLSRTTGFDGWAPLFFRGREVSGKTIGIIGLGEIGSAVARRARAFDMDVLYTGPNRKEEKEREIGAKYVDLDTLLKNADFITINAAYNPKMHHLIDTEQFKMMKSTAYLINASRGPIVHEQALVQALKNNEIEGAALDVYEFEPDITDDLKSLNNVVLTPHIGNATFEARDMMSKIVANAAISAVQGEKPQFVVN >NC_018608.1|WP_000737699.1|2338407_2338908_+|CHAP-domain-containing-protein MKKLVTATTLTAGIGTALVGHAQHADAAENYTNYNNYNYNTTQTTTTTTTTTTTSSISHSGNLYTAGQCTWYVYDKVGGEIGSTWGNANNWAAAAQGAGFTVNHTPSKGAILQSSEGPFGHVAYVESVNSDGSVTISEMNYSGGPFSVSSRTISASEAGNYNYIHI >NC_018608.1|WP_000206106.1|2337748_2338171_+|DUF4870-domain-containing-protein MTTEMNDVTNHQPNRKSNDENIMAMLIYLLSLFTSIIGPLIIWLLKKDESKLVDRAGKNYLNYTISYIIWSIVLVVITFIGVFLIATDIDFIIIIGFIITFIGILSIFAFSILSFVFTIIACVKYYNGQEYVIPLTIRFI >NC_018608.1|WP_000684571.1|2336418_2337501_-|NAD/NADP-octopine/nopaline-dehydrogenase-family-protein MKIAIVGSGNGAVTAAVDMVSKGHDVKLYCRNQSISKFQNAIEKGGFDFNNEGEERFVKFTDISDDMEYVLKDAEIVQVIIPSSYIEYYADVMAEHVTDNQLIFFNMAAAMGSIRFMNVLEDRHIETKPQLAEANTLTYGTRVDFENAAVDLSLNVRRIFFSTYDRSCLNDCYDKVSSIYDHLVKEESLIKTNLENGNPEVHPGPTLLNVGRIDYAGEFALYKEGITKHTVRLLHAIELERLNLGRRLGFELSTAKESRIERGYLERDKEDEPLNRLFNTSPVFSQIPGPNHVESRYLTEDIAYGLVLWSSLGRVIDVPTPNIDAVIVIASTILERDFFEEGLTVESIGLDKLDLEKYLK >NC_018608.1|WP_000988993.1|2334923_2336324_-|Na+/H+-antiporter-NhaC MMTRKPTFLESISTMIVMVIVVVTGFVFFDIPIQVLLIIASAYAAWIAKRVGLTWQDLEKGIAERLNTAMPAILIILAVGIIVGSWMFSGTVPALIYYGLDLLNPSYFLISAFFISAVTSVATGTAWGSASTAGIALISIGNQLSISPGMAAGAIIAGAVFGDKMSPLSDTTNLAALVTKVNIFKHIRSMMWTTIPASIIGLLVWFIAGFQFKGHSNDKQIQTLLSELAHIYQINIWVWVPLIVIIVCLLFKMATVPAMLISSFSAIIVGTFNHHFKMTDGFKAIFSGFNDSMIHQSHISSSVKSLLEQGGMMSMTQILVTIFCGYAFAGIVEKAGCLEVLLTTISKGIHSVGSLICITVICCIALVFAAGVASIVIIMVGVLMKDLFEKYQVSRSVLSRTLEDSSTMVLPLIPWGTSGIYYTNQLHVSVGEFFIWTVPCYLCAIIAIIYGFTGIGIKKSSNSRLT >NC_018608.1|WP_001826088.1|2334555_2334750_-|hypothetical-protein MTKLIENLKASIFVSTLTKNLSMYSRFDAPKFGCVNGCMLFILYYRVNRIGENRSFEISTNPIF >NC_018608.1|WP_000717395.1|2333677_2334487_+|CHAP-domain-containing-protein MKKIATATIATAGFATIAIASGNQAHASEQDNYGYNPNDPTSYSYTYTIDAQGNYHYTWKGNWHPSQLNQDNGYYSYYYYNGYNNYSYNNYNNGYSYNNYSRYNNYSNNNQSYNYNNYNSYNTNSYRTGGLGASYSTSSNNVQVTTTMAPSSNGRSISSGYTSGRNLYTSGQCTYYVFDRVGGKIGSTWGNASNWANAAARAGYTVNNTPKAGAIMQTTQGAYGHVAYVESVNSNGSVRVSEMNYGYGPGVVTSRTISASQAAGYNFIH >NC_018608.1|WP_000131824.1|2331112_2333068_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTDNYSLHIFKSMKMSSVKEANLKIIYWLQGTGVVSINLQQYDVKRNDVTVIMLNDLYQIDGHDDSVCCVVEVSAKTFLKFMNANYMMRGKILTNEVASTLRILIKYLIYSKIKQQPYNANDKIINYMCVELMSLNTYDGSRHLVAEEVHDYLTNNHHKKINRKDVINQVSITNKALSDMFKATPYSNFIQYLNHIRLEHCLIDILTSKKPIEEIASSHGFNHYSRFIHLFKETYGDTPKLIRKRNSPTSHSINHSQLVEIDKNIIELFDDTNQSSSSMREIDIPFEPTKRSQMYQPKNIYIKGSNFYWMDYYTIKQIIQRLGVNPENLHIIVTIDTSNELSIEQITLLLQKIVNYNVNVVFRIKHEYKELLTSTERGKIEKLVATIFNMTFESNRCKIAFLINDLNTTAIQKLKRLIDNYIGVFELIYHLEPNELNTRYDKEIDHLIDYFILPLRQIEQVSIARSKIICDVDLINENNDLKEKITMSDINKVTELLTNYTKFRGLIMHMSIISEASKEINLTRLSIFIFIINILNQLRGIVIYQNDTMIVTKFKHEVQCVICLPAALLNENSDAIRLSCKGLQQFSHAKTKQIVLSIDKDNHTSENGVLVNDIMQQHSYWKANFIERNIYDHSLMVSSNSIVHLKYHLEI >NC_018608.1|WP_000032840.1|2330343_2331087_-|transcriptional-regulator MSKFKVKRLTAHILMLKVINDMLKYSFHLTLTQVKLLNLLVKYDNSDSNSASIDRLLKMKEIQSKMALLQMLSYLNNHQWLLKARDQRDQRKLTISINKMHIDKIEYMNNELSDYIERYFGQYTFDFSCDYVSYLLSSQELLLNLKCYLNMCQLSLEELYVLGILNLHKGQLTVKELQGEFHHPIFAVSPILKCLILKGLVKKERCELDERRVIVTIKREKFSKVTMLIQACYNYLEKGIQVKLNNK >NC_018608.1|WP_000739235.1|2342048_2342825_-|N-acetylglucosaminidase MKKNFKLRISTLLLIVILVVFSVLLIVNETKLFKNDVNYSFDEAVSMQQGKGIVQTKEEDGKFVEANNNEIAKAMTISHKDNDMKYMDITEKVPMSESEVNQLLKGKGILENRGKVFLEAQEKYEVNVIYLVSHALVETGNGKSELAKGIKDGKKRYYNFFGIGAFDSSAVRSGKSYAEKEQWTSPDKAILGGAKFIRNEYFENNQLNLYQMRWNPENPAQHQYASDIRWADKIAKLMDKSYKQFGIKKDDIRQTYYK >NC_018608.1|WP_000921246.1|2342846_2343080_-|hypothetical-protein MLKTSAVISNTLLVIGLVCLFMMKLVLAITFFAVSLSISLVVFNMMFRDRTTMKVIVNASFLIVILAIVVAYFLLSK >NC_018608.1|WP_000840813.1|2343374_2343848_-|DUF1641-domain-containing-protein MAERISSKIRRLEKSEEQIKLESLNEVTEAIAANKDSILKAIKLIKVLDDAKILDALNGAVRGRQVIINKFAVELNKDIYTGLLSNMASMVFLLGELNVSDLSDFLNKVNKGLHVANQASPNAKTSVRSLFGVLKDDDMNRSLTYMLNMLKGMSRED >NC_018608.1|WP_001155267.1|2343847_2346802_-|formate-dehydrogenase-subunit-alpha MQEHLVVTLDGKDYLVEPGTNLLEFIKSQDTFVPSICYNESMGPIQTCDTCTVEIDGKIERSCSTVIDRPMTVNTVNNDVKDAQKEALDRILEKHMLYCTVCDYNNGDCEIHNTMDAWGLQHQTYEYKEKPYEKDYGPFYRYDPNQCILCGRCVEACQDIEVNETIRIDWDREHPRVIWDNDVPINESSCVSCGQCATVCPCNAMMEVNMEGNAGYMTDTEPGSLAAMIDLTKKAEPGYGPLFAISDSEAEMRKERIKKTKTVCTYCGVGCSFEVWTKDREILKVQPSHDSPANKIATCVKGKFSWGHINSDQRLTKPLVRKNGEFHEVEWDEALNVIADNFTSIKEKHGPDALSFISSSKATNEESYLMQKLARQVIGTNNVDNCSRYCQAPATKGLFRTVGHGGDSGSIEDLEKAAMSVLIGTNTAEAHPVIASRMKRAQKLFGQKIHVFDIRKHEMAERADRFYQPKPGTDLAWLSAVTKYIIDHDLHDKAFIEEWVEDFDEYYKSLETFTMAFAEEATGIPEAELIKFAEECAKAESVVICWAMGITQQDIGSDSSTAISNLLLVTGNYRRPGTGAYPLRGHNNVQGCSDMGSMPDKITGYQSIEADDIRAKFEKEYGVKLNPKAGKDNHEMVEGIHDGQIHSLYLYGEDTGIVDSNINFVQAAFEKLDFMVVQDEFLTFTATFADVVLPASPSLEKDGTFTNTERRIQRLYQALKPLGESKPDWKIFQAIANKLGFDWNYKHPSEIMDEIARLTPLYAGVSYERLEGFNSLQWPVHPDGTDEPILYLEGFNFDNGKAKLFPLSFDNYFKQDEVYDIHVNNGRLLEHFHEGNMTYQTPMLKYKVPRAFVEISPELAEDRGIHEGAEVKLISETGEAVLQVHVTDRVKGKEIYIPLNNDAMENGDLGAINLLTNSDVDQYTDTPSYKRTSCRLEVITKRGKSPLNPNNFRVNKKRHPQYSVQVQKKWERPDYVFPGNQVDK >NC_018608.1|WP_000831053.1|2347403_2348351_-|LCP-family-protein MKRSSKSKMSLPKKIFLWVFGILVILAIVAVVYVAAKIFITGNKIHNPLDRNHSELRDKKVSLNDGDPFTIALFGVDSDADRKKKGGGERSDSIMILSINPKTKKTEIVSIPRDTRAEIVGRDTTEKIAHAYAYGGPNMAVKSLEKLMNVPIDHYATIDMDGLHNMIDSIGGVDVVSNDTFTVDGVRFTKGQQTHVNGDQALKFIRSRKEEGAGGDFGRQQRQQIVLEAMANKIASPSSITHFNSLMNEIQNNVKTDLTLGDLNTIRSNYKDANDTINKHQLSGQGGIQSDGLYYFIPSEQSKAESTKLLKDNLE >NC_018608.1|WP_000130460.1|2348483_2349281_-|inositol-monophosphatase MTDKTLQQIDKLICSWLKQIDNVIPQLIMEMTTETKRHRFDLVTNVDKQIQQQFQQFLATHFQEHQLLAEEKSNEMITNEINHLWIMDPIDGTANLVKQQEDYCIILAYFYEGKPMLSYVYDYPHKKLYKAIRGEGAFCNGIKMEEPPSLKLEDAIISFNAQVMNLDTVQDLFDASFSYRLVGACGLDSMRVAKGQFGAHINTNPKPWDIAAQFLFAELLNLKMTTLDGKAIDHLKGAPFIISNKACHETVLKILNANGGYQKYR >NC_018608.1|WP_001030125.1|2349665_2350358_+|YafY-family-transcriptional-regulator MNKAERQNLIITAIQQNKKMTALELAKYCNVSKRTILRDIDDLENQGVKIYAHYGKNGGYQIQQAQSKIALNLSETQLSALFLVLNESQSYSTLPYKSEINAIIKQCLSLPQTRLRKLLKRMDFYIKFDDTQHMTLPMLFSDILIYCTERNVMLVDHRVDDNIKAENVIFIGLLCKHGHWHAVIYDIAQDKTAELEIENIIDISYSFGKTIQTRDISIDNYHQFLNPIDS >NC_018608.1|WP_000426692.1|2350382_2351120_-|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease-SdpB MENEKKKYTFKDIAWRDLFIIPIIGVLSFALTIAAYIVPILFGYYEIDSNLIFVGTITQALAYTIGIGAFYLFHLKVMPSRLRAGFAYIKKYWLRLSITYIIALILIYTYEYMTQFLPKHLQYSETANELELNKMFEVPVFLPVAFLLIVIVGPIVEEIVFRHILIGELGKKFNFIAMSIVSVFLFAFIHVTDAKSPFEFGPYLILSIILVFTYIKSGRNLGSTIALHIANNFVSFVISVISIYA >NC_018608.1|WP_000606724.1|2351168_2351498_+|hypothetical-protein MINETKYMRQQITNLIQIIDTIKYNTLMTDWNIQTHIYKFNQIVTNELNKFKGFETSYIINENQVFYYEIITLLNKRPLRQVDYGNKIQYLNFYHTELSNALFAIKFAH >NC_018608.1|WP_000073196.1|2351942_2352815_+|MurR/RpiR-family-transcriptional-regulator MSNVLTEIDSQYPYMTKNEKKIAKFILNSPQKVIKMRSQDLASLLDISTSSVIRFSKKITDGGFHDLKINISKYVPKASSIYNVELMNNESTESLRTKLHTRTTRALNHANNELNDKTIDQICHCLKRSETIFIYGFGASFVVATDLYQKLSRIGLNIQLVQETHIFATLLATHNSNDSVILITNNGTQSEMQSMVKVIDDYHIPIITITSTRDNPVAQASNIVLTYGKTDENEMHMGATTSLFAQMFTIDILYYRYVALNYHASLDYITQSKMALDNYRKHLSNINFKH |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_018608_14 | 2518017-2518111 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018608_14
|
1 spacers
spacers of NC_018608_14
>14.1|2518045|39|NC_018608|CRISPRCasFinder GCAACTGTATTCCTCTAAAACTGTAATTTTAATTACTAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018608_14
The CRISPR arrays of NC_018608_14 >merge|NC_018608|14|2518017-2518111|CRISPRCasFinder AGGCTCTTATGCAGTTGGTGCGAAGCAAGCAACTGTATTCCTCTAAAACTGTAATTTTAATTACTAGAGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAA >NC_018608|14|14|2518017-2518111|CRISPRCasFinder AGGCTCTTATGCAGTTGGTGCGAAGCAA GCAACTGTATTCCTCTAAAACTGTAATTTTAATTACTAG AGGCTCTTATGCAGTTGTTGCGAAGCAA
>NC_018608.1|WP_001081687.1|2517009_2517831_-|histidine-racemase-CntK MNRQVIEFSKYNPSGNMTILVHSKHDASEYASIANQLMAATHVCCEQVGFIESTQNDDGNDFHLVMSGNEFCGNATMSYIHHLQESHLLKDQQFKVKVSGCSDLVQCAIHDCQYYEVQMPQAHRVVPTTINMGNHSWKAIEIIYETYVHYVIPVKQVTTEIQHLVETYVRKQQWNHKYKTVGMMLFDEQRQFLQPLIYIPEIQSLIWENSCGSGTASIGVFNNYQRNDACKDFTVHQPGGSILVTSKRCHQLGYQTSIKGQVTTVATGKAYIE >NC_018608.1|WP_001058850.1|2516180_2516999_-|D-histidine-(S)-2-aminobutanoyltransferase-CntL MNNFNNEIKLILQQYLEKFEAHYERVLQDDQYIEALETLMDDYSEFILNPIYEQQFNAWRDVEEKAQLINSLQYITAQCVKQVEVIRARRLLDGQASTTGYFDNIEHCIDEEFGQCSIASNDKLLLVGSGAYPMTLIQVAKETGASVIGIDIDPQAVDLGRRIVNVLAPNEDITITDQKVSELKDIKDVTHIIFSSTIPLKYSILEELYDLTNENVVVAMRFGDGIKAIFNYPSQETAEDKWQCVNKHMRPQQIFDIALYKKAAIKVGITDV >NC_018608.1|WP_000040594.1|2514886_2516188_-|staphylopine-dehydrogenase-CntM MSKLLMIGTGPVAIQLANICYLKSDYEIDMVGRASTSEKSKRLYQAYKKEKQFEVKIQNEAHQHLEGKFEINRLYKDVKNVKGEYETVVMACTADAYYDTLQQLSLETLQSVKHVILISPTFGSQMIVEQFMSKFSQDIEVISFSTYLGDTRIVDKEAPNHVLTTGVKKKLYMGSTYSNSTMCQRISVLAEQLKIQLEVVESPLHAETRNSSLYVHPPLFMNDFSLKAIFEGTDVPVYVYKLFPEGPITMTLIREMRLMWKEMMAILQAFRVPSVNLLQFMVKENYPVRPETLDEGDIEHFEILPDILQEYLLYVRYTAILIDPFSQPDENGHYFDFSAVPFKQVYKNEQDVVQIPRMPSEDYYRTAMIQHIGKMLGIKTPMIDQFLTRYEASCQAYKDMHQDQHLSSQFNTNLFEEDKALVTKFLEINRTLS >NC_018608.1|WP_001229077.1|2513145_2514744_-|staphylopine-dependent-metal-ABC-transporter-substrate-binding-protein-CntA MRKLTKMSAMLLASGLILTGCGGNKGLEEKKENKQLTYTTVKDIGDMNPHVYGGSMSAESMIYEPLVRNTKDGIKPLLAKKWDVSEDGKTYTFHLRDDVKFHDGTPFDADAVKKNIDAVQENKKLHSWLKISTLIDNVKVKDKYTVELNLKEAYQPALAELAMPRPYVFVSPKDFKNGTTKDGVKKFDGTGPFKLGEHKKDESADFNKNDQYWGEKSKLNKVQAKVMPAGETAFLSMKKGETNFAFTDDRGTDSLDKDSLKQLKDTGDYQVKRSQPMNTKMLVVNSGKKDNAVSDKTVRQAIGHMVNRDKIAKEILDGQEKPATQLFAKNVTDINFDMPTRKYDLKKAESLLDEAGWKKGKDSDVRQKDGKNLEMAMYYDKGSSSQKEQAEYLQAEFKKMGIKLNINGETSDKIAERRTSGDYDLMFNQTWGLLYDPQSTIAAFKAKNGYESATSGIENKDKIYNSIDDAFKIQNGKERSDAYKNILKQIDDEGIFIPISHGSMTVVAPKDLEKVSFTQSQYELPFNEMQYK >NC_018608.1|WP_000472235.1|2512197_2513133_-|ABC-transporter-permease MFKFILKRIALMFPLMIVVSFMTFLLTYITNENPAVTILHAQGTPNVTPELIAETNEKYGFNDPLLIQYKNWLLEAMQFNFGTSYITGDPVAERIGPAFMNTLKLTIISSVMVMITSIILGVVSALKRGKFTDRAIRSVAFFLTALPSYWIASILIIYVSVKLNILPTSGLTGPESYILPVIVITIAYAGIYFRNVRRSMVEQLNEDYVLYLRASGVKSITLMLHVLRNALQVAVSIFCMSIPMIMGGLVVIEYIFAWPGLGQLSLKAILEHDFPVIQAYVLIVAVLFIVFNTLADIINALLNPRLREGAR >NC_018608.1|WP_000584764.1|2511331_2512201_-|ABC-transporter-permease MIILKRLLQDKGAVIALGIIVLYVFLGLAAPLVTFYDPNHIDTANKFAGMSFQHLLGTDHLGRDILTRLIYAIRPSLLYVFVALFVSVLIGSILGFLSGYFQGFVDALIMRACDVMLAFPSYVVTLALIALFGMGAENIIMAFILTRWAWFCRVIRTSVMQYTASDHVRFAKTIGMNDMKIIHKHIMPLTLADIAIISSSSMCSMILQISGFSFLGLGVKAPTAEWGMMLNEARKVMFTHPEMMFAPGIAIVIIVMAFNFLSDALQIAIDPRISSKDKLRSVKKGVMQS >NC_018608.1|WP_000173877.1|2510519_2511335_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MTLLTVKHLTITDTWTDQPLVSDVNFTLTKGETLGVIGESGSGKSITCKSIVGLNPERLRVTGDITFDGTSMLSLSESQLKKYRGKDIAMVMQQGSRAFDPSTTVGKQMFETMKVHTSMSTQEIEKTLIEYMDYLSLKDPKRILKSYPYMLSGGMLQRLMIALALALKPKLIIADEPTTALDTITQYDVLEAFIDIKKHFDCAMIFISHDLTVINKIADRVVVMKNGQLIEHGTRESVLHHPEHVYTKYLLSTKKKINDHFKHVMRGDVCD >NC_018608.1|WP_000590515.1|2509777_2510527_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIKIKDVEKSYQSAHVFKRRRTPIVKGVSFECPIGATIAIIGESGSGKSTLSRMILGIEKPDKGCVTLNDQPMHKKKVRRHQIGAVFQDYTSSLHPFQTVREILFEVMCQCDGQPKDVMEVQAITLLEEVGLSKAYMDKYPNMLSGGEAQRVAIARAICINPKYILFDEAISSLDMSIQTQILDLLIHLRETRQLSYIFITHDIQAATYLCDQLIIFKNGKIEEQIPTSALHKSDNAYTRELIEKQLSF >NC_018608.1|WP_000675405.1|2508572_2509766_-|MFS-transporter MKGAMAWPFLRLYILTLMFFSANAILNVFIPLRGHDLGATNTVIGIVMGAYMLTAMVFRPWAGQIIARVGPIKVLRIILIINAIALIIYGFTGLEGYFVARVMQGVCTAFFSMSLQLGIIDALPEEHRSEGVSLYSLFSTIPNLIGPLVAVGIWNANNISLFAIVIIFIALTTTFFGYRVTFAEQEPDTSDKIEKMPFNAVTVFAQFFKNKELLNSGIIMIVASIVFGAVSTFVPLYTVSLGFANAGIFLTIQAIAVVVARFYLRKYIPSDGMWHPKYMVSVLSLLVIASFIVAFGPQVGAIIFYGSAILIGMTQAMVYPTLTSYLSFVLPKVGRNMLLGLFIACADLGISLGGALMGPISDLVGFKWMYLICGMLVIVIMIMSLLKKPTPRPANSL >NC_018608.1|WP_000072469.1|2507602_2508349_+|hypothetical-protein MSNTNKHYIEEYATEQSRFFKRDIGFIFLYIFLVNILPIIIVFLTFELVAVFTQQAPWGFSFPISMNISYLLAVIISLAIFRLMHEDAFIPMIRSQIVASAKYKWHILISFTLSIVLFLLLNHFDIFALNVDSFTVFDIYPLIREYGSISLIAIFSLTIILNTLICQLIFRHILIQELSRLIPLKITIVLSVILETLYYYPYINTWWEFIPALILASSATYLYLKSNRNFMVSYFYQLAVILVLHIFM >NC_018608.1|WP_000910577.1|2518779_2519142_-|hypothetical-protein MLKEKESFRLLYQAIREIADKIGDNQLETNSVSLLLLDFDFEHEVFDELYLAILKYLNTVSIENISHSELLNLIENTIPEDREINTFVKNKIIIGFANNYFPELQVLANEIKSDMASSLK >NC_018608.1|WP_000824952.1|2519404_2520223_-|SDR-family-oxidoreductase MKRLENKVAVVTGASTGIGQASAIALAQEGAYVLAVDIAEAVSETVDKIKSNGDNAKAYTVDISDEQQVVDFVSDIKEQFGRIDVLFNNAGVDNAAGRIHEYPTDVYDKIMNVDMRGTFLMTKMMLPLMMTKGGSIVNTSSFSGQAADLYRSGYNAAKGAVINFTKSIAIEYGRDGIRANAIAPGTIETPLVDKLTGTSEDKEGKTFRENQKWMTPLGRLGKPEEVGKLVVFLASDESSFITGETIRIDGGVMAYTWPGEMLSDDSWKRTLE >NC_018608.1|WP_000202032.1|2520456_2521995_+|AbgT-family-transporter MTSKHQQKGSIVNRFLNSVEKIGNKLPDPSVLFFLMCVGLAIMTWVISLFNVSVKHPGTHQTIYIKNIISHDGFTMIMNDTIKNFSEFPALGLVLAVMIGIGVAEKTGYFDKLMISVVNRAPRFLILPTIILIGILGSTAGDAATIILPPLAAMLFIKIGYHPIAGLTMAYASAVGGFAANIVVGMQDALVYSFTEPATRIVSDSIKTNVAMNWYFIAASVIVLLPTILLVTTKLIIPRLGQYDDRLMHDDHEETSSHITDKEAHALKWANISFIVTIILLIITAIPEHSFLRNAKTGSLLDDAPLINGVGLIILVVFLVPGLVYGILSKEIKNTKDLGKMFGDAVGSMGTFIVIVFFAAQLLAYLKWSNLGIIAAVKGAKLLEHQNGIVLILGIIVLSAMVNMLIGSASAKWGILGPIFVPMLILIGFHPAFTQVIYRVGDSITNPITPMMPYLPLLLTYAQKYDKRMKLGALLSSLMPYSIALSIVWTVFVIIWFLLGIPVGPGGPIFVK >NC_018608.1|WP_001146763.1|2522106_2522529_-|carboxymuconolactone-decarboxylase-family-protein MPYNYKKQNGELMSVMSQGEKFIHQSPVNDELSALIKLLISKINGCHYCVDIHKKELKELGVTQMKIDEVLSFRHLDLFTDQEKVTLEFAEMLNSIKDFKKFEIIDRLKSFYDEEQIIDLVFVVNQINGWNRLNIISDRL >NC_018608.1|WP_001807941.1|2523000_2523399_-|DUF1433-domain-containing-protein MNKKHVFIIIGVILCIRIVATVIYLKVKYDEKEKQKAIYYKEQQERITLYLKHNTKEPNTIKSVHFTSLKTGPMGDAVIEGYINENKKADFVAYGSPEHNYQFGGDMIESEKLSELLKPAQELKSQKKSKKN >NC_018608.1|WP_000037506.1|2523425_2523836_-|DUF1433-domain-containing-protein MSKKHVFIIIGVILCICIVVTAMHLKMKYDEKEKRKAIYYKEQQARITLYLKHNTKEPNTIKSVHFTNLETSPMGSAVIEGYINENKKDNFTAYATPEHNYQFGGAMIKSEGVDKLLKPAHERKSPDDIKKELNKK >NC_018608.1|WP_000905462.1|2524290_2524674_-|DUF1433-domain-containing-protein MLIILIIIVCVYLKIKIDEKEKQKAIYYKEQQERITLYLKHNTEEPNTIKSVHFTSLKRGPMGDAVIEGYINENKEDDFVAYGSPEHNYQFGGDMVESERLSELLKPAHERKSPDDIKKELNKKKNH >NC_018608.1|WP_001084931.1|2524740_2525949_+|hypothetical-protein MNSIYDKDTTYRALAKEAYHLEPDQEKIFVPYSKEKKIEFRIVAFRQNKFNGLKMAGLSPVEKGAKLNTDELYIVYAGTDPDLLADFGSDSIEDLKVGMAKFGGGLRIPPTKKERAIYGNLNKKMIDYDDGISGISQNIMTNPISQSKESYIFTGALINKQKPKHVYGAAHSLGGGLALLNGVMYNFDGVRAFSAPNTFDLLPDEVKANYRSEKYDGKFINYLHRSDIIGNSDLFAQRIGTQIYGKDVGRFSLLNPILGHGMDTFEFKGDNVRIKMDTEEMSKIASDLKASCEFVNDAIKSYQKYMDDTKAAAKRIERKYTKKIRTGNYKHIKPSDIEDYMEELSVSGKYEFYNDTAFETVMSELNRIRKNVESFADKLKHAGEKMESRDKEIGELYKIFER >NC_018608.1|WP_000505991.1|2525954_2526269_+|hypothetical-protein MGFLDDLAESIEEQSDLSEFKQAMKSELQTKVEEAKAKIESIDEDIWDWQTTVNNKRDAIEEYCEGKTAEHAIERLMQDKQDIAGMRWTAEDAEKSCKVGSWFW >NC_018608.1|WP_001124998.1|2528145_2528565_-|DUF1433-domain-containing-protein MPKKTIFIIIGVILCISIVTGGIYLKMKHDEKEKQKEIYYKEQQERITLYLKHNTKEPNTIKTVHFTNLKTGPMGDIEIYGYINSKKDYDFIAYNSPEENYQFTGGLTGSNEVLGKLKNAENLKSPEKIKEELNNKKDH |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_018608_15 | 2545963-2546073 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_018608_15
|
1 spacers
spacers of NC_018608_15
>15.1|2545990|57|NC_018608|CRISPRCasFinder TCGCCTGGCTCACTCGGCACTTCTGGTGTCGGTGGTGTTGGTGTTTCCGGCTCACTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_018608_15
The CRISPR arrays of NC_018608_15 >merge|NC_018608|15|2545963-2546073|CRISPRCasFinder GGTACTTCTGGTGTCGGTGGCGTTGGTTCGCCTGGCTCACTCGGCACTTCTGGTGTCGGTGGTGTTGGTGTTTCCGGCTCACTCGGTACTTCTGGTGTCGGTGGTGTTGGT >NC_018608|15|15|2545963-2546073|CRISPRCasFinder GGTACTTCTGGTGTCGGTGGCGTTGGT TCGCCTGGCTCACTCGGCACTTCTGGTGTCGGTGGTGTTGGTGTTTCCGGCTCACTC GGTACTTCTGGTGTCGGTGGTGTTGGT
>NC_018608.1|WP_000721337.1|2541110_2541977_-|UTP--glucose-1-phosphate-uridylyltransferase-GalU MKKIKKAIIPAAGLGTRFLPATKAMPKEMLPILDKPTIQYIVEEAARAGIEDIIIVTGRHKRAIEDHFDSQKELEMVLKEKGKSELLEKVQYSTELANIFYVRQKEQKGLGHAISSARQFIGNEPFAVLLGDDIVESEVPAVKQLIDVYEETGHSVIGVQEVPEADTHRYGIIDPLTKNGRQYEVKKFVEKPAQGTAPSNLAIMGRYVLTPEIFDYLKTQKEGAGNEIQLTDAIERMNNDNQVYAYDFEGERYDVGEKLGFVKTTIEYALKDDSMREELTRFIKELGL >NC_018608.1|WP_000217726.1|2540676_2540985_+|hypothetical-protein MTVNIVVSIVFCISMVVLSIYVAITKDFTLISYINQTTIADKHKNQIAYIFALCISLSAVFLMSAILCFEYDFIALAFLFLTIALLLIALFYVCFYKITKYP >NC_018608.1|WP_000678764.1|2540266_2540533_+|hypothetical-protein MKGSKQILLIMGIISLIVLFIFTLFIMAQYAKHYEQKSDSSNAHTLNSSSAIIEQHTMSNLASLDLYAPVRNITSSRDIHPIYFMTKD >NC_018608.1|WP_078064770.1|2538192_2539983_+|phospho-sugar-mutase MIPAFRCSFCDRLCFFYFWGVFLYNSLHKCKGFSFHVLLSLTEILKGCLATMDKELWIERANDSLVKHFYEQQSDIEQREGFESKLTFGTAGIRGKFGLGEGRLNKFTIEKLALGLSRYLNAQTNNPTIVIHYDIRHLSTEFAQIIANVLANHQITVYLPDTYKTTPELSFAVRNLNTTAGIMITASHNPKDYNGIKVYGSDGAQLSTDASELVSRYIEDVGDPLQIDISFSKHNSSYIKPLPKSVAENYIKHIQNMIGYIPKSDLQVVFTSLHGTSVPIVPELLKSLNFNQFNLVEAQCKPDPNFSSVQSANPEDHRAFDQAVELANKSHADLLISTDPDADRLGIAERDAHGHITYFNGNQIGALLLNYRIQQTSQLRHRLMIQSIVSSELTKSLARYNNVEYKEVLTGFKFIAQEIRQLDDHQNMIFAFEESYGFLSEPFVRDKDAVQIVPLIIKYASELKLYGKTLKDELEQIYQTVGRHEDTLFSHTLEGLEGKKKIESIMTHFRSHPPQEIQGLKVKAIEDYLTSEVHQLDKDTTSQINSPKSNVIRVLFDEGFIALRPSGTEPKIKLYVSLKCPNFDDVAQKINAMIFS >NC_018608.1|WP_000282632.1|2536961_2538155_+|DNA-(cytosine-5-)-methyltransferase MYNNIITKNESDNSIPLNYGDFIKEKRNKLNMTQKELADSIGLPKFGDRTIRRWENYETSPSYLEYKTIMNFPDTPPYLNPNIYDYKMIDLFAGIGGTRLGFQLHGNVKCVFSSEWDKFSAKTYKANFGETPKGDITQIIADEIPTHDILVAGFPCQAFSQAGLKKGFNDTRGTLFFDIARILKAKRPKCFLLENVKNLRSHDKGKTFDIIMNTLLELDYDVSSSILRARDFGCPQNRERIYIVGFDKQQIKNAENFSFPEPLPIETSLGSILESNVNDKYTISDRLWYGHQRRKREHKAKGNGFGYSIFNETSPYTNTLSARYYKDGSEILIEQNKKNPRKLTPREAARLQGFPENYIIPVSDTQAYKQFGNSVSVPVVHAIASNIFQVLQQNKNN >NC_018608.1|WP_016187290.1|2535936_2536866_-|hypothetical-protein MTNLNNQLKEFKNTIKVERSKLLPSPFDMVYKNFEKLGYHKQNEQFFYDNASIIIDELRNQSWIEFKKIEKEFSKKLYSHLLDQDSENYKNMTVKEGIEKFTSKHTDEIYALQLSNTQSRRSRAGKEFESIIELVLMGANIEFVTQGSIGSGVFESSELAKLVDCVVPGAAEYNLNKRNTSLISTKTSLRERWQEVGDEMSRTKAKEMYLVTLDESISEKTLKLIEKNNIIIVTTKSVIDKNYLNSSNVISFEDMLNELHIQLLQWNNYGYPATELNNKKELYQTLIEKYDGNMFVRNYYENMLSNINV >NC_018608.1|WP_031774865.1|2534920_2535694_-|tandem-type-lipoprotein MIHSRKLRLCLYLVLLAVFIGACGMKKEESSKDKQIKENFTKTLNLYPTKNLEDFYDKEGFRDQEFEKGDKGTWIVDSEMVIELKDKKMESRSMVLYINRNTRTTKGNFIVRELWEDSKGYAQSKDTKYPVKMEHNKIIPTKPIADDKLRKEIENFKFFVQYGDFKDINDYKDGDISYNSNVPSYSAKYQLSNDDYNVKQLRKRYDIPTKKAPKLLIKGDGDLKGSSIAHKNLEFTFIENKEENIYFTDSINFKPTE >NC_018608.1|WP_000581897.1|2534044_2534809_-|tandem-type-lipoprotein MIHSKKLTLGICLVLLIILIVGYVIMTKTNGRNAQIKEAFNKTLNVYPTKNLEDFYDKEGFRDQEFDKRDKGTWIINSGMNIQLKGGALKSRAMVLYINRNTRTAKGYFLISETTEDKKGYVHNKDKKYPVKMEHNQIIPTKPIRDDKLKKEIENFKFFVQYGDFKDYKDGDISYNPNVPSYSANYQLNNDDYNVQQLRKRYDISTKRAPELKLRGSGDLKGSSVGSKELEFNFIRNKEENVYFTDSINFKPTE >NC_018608.1|WP_014937076.1|2533011_2533797_-|tandem-type-lipoprotein MIHSKKLKLCLCLIILSVFIGGCGMKKEESSKDKQIKENFNKTLSLYPTKNLEDFYDKEGFRDEEFEKGDKGTWIIHSKMIIETNGRNMESRGMVLYINRNTRTTKGNFVIREITEDSKGYSDSKDKKYPVKMENNRIVPMKPIHDEKLRKEIEDFKFFVQYGNFKDINDYKDGDISYNPNVPSYSAKYQLSNDDYNVKQLRKRYDIPTKKAPKLLLKGDGDLKGSSVGSKNLEFTFVENKEENIYFTDSVQYTPSEDNNL >NC_018608.1|WP_000083859.1|2531659_2533015_-|hypothetical-protein MSQTEYQIKPGNIKANSEETSTVSKISYEIENANNSGLKKGKINEQIEGLKEEGKFPKNLKYLKSYTDPNTGTTTTAFKNKDTGKVTLGMTGTNLHFEEMGNVLKHPFNHSDQDMKDMKEMLKDFGADANIGLGAVTDKDPHFKDTQDFIKDIKKEYEIDTITGHSLGGRDAIILGVSNDIKNIVVYNPAPLSITDFRIIALNNMTYSAIGDIEIKEMLKNYNGHIVRFVSDKDELDGFVSQFMYDTAGEKIVLNNGEGHDMGAFLRKYAQAKILAELRKVKGYEDANNKSFKSVKDNTKSKLGKVEELRVNWLQANGGALTSSQLKLLESVSALIIAEGLSQLVKEESNQLEKMYDNMKDKFQENWKNSQEAGNKIGTKLSHDGVLTALRNGDAYESKFETEPLTKIEQKLKELNDINSDCHNYVSKIKDSVNAIVGNDQLLASQIAGVI >NC_018608.1|WP_000481425.1|2549213_2550572_-|gluconate-permease MFNEIWPLISVVLGIVILLVLIIGFKLNTFISLIITSMITALMLGIPLTKIMETIEKGMGSTLGHIALIFGLGAILGKLLADGGGATRIADTLIQKFGQKHVQWAMLVAAFIVGIALFFEVGLVLLIPLVFTVAKRANVSVLKLGLPMVTALSVTHGFLPPHPGPVVIAKELKANVGDVLLYGMIIAIPVTLIAGPIFNKVAQKMIPSAYTREGDISALGAQKEFTDQEMPGFGMSLLTATLPVILMLVSTITQLVTGHDKPTNLFESIIYMIGTAGTAMLIAVLFAIVTMGLMRKRKMNHIMESVTNAIYPIGMMLLIIGGGGTFKQVLIDGGVGNTIAKMFEGTEMSPILLAWIVAAVLRIALGSATVAAISTTGIVLPLLQSSDVNVALVVLAIGAGSVILSHVNDAGFWMFKEYFGLTVKETFLTWSLLETIISVSGIIFILFISLFV >NC_018608.1|WP_000876647.1|2550688_2552242_-|gluconokinase MKYMIGVDIGTTSTKSVLYDENGTFIMKHQIGYDLHTPNVDVSEENPDELFDAVLMTIKYIMRESKVNQDDIKFVSFSAQMHSLIAMDQQHQRLTNNITWADNRAAKYATVINEVHDGNAIYQRTGTPIHPMSPLAKIFWMKHEWQDVFQRTAKFADIKTYIFYHLFDRYIIDYSMASATGMFNLETLDWDVGALELLGISEEMLPELVPTTYVMKGMKERYATLMGLNEDTPFVIGASDGVLSNLGVNSVGKGEVAVTIGTSGAIRTVIDKPRTDYKGRIFCYVLTEDHYVIGGPVNNGGVVLRWLRDELLASEVETAKRLGVDPYDVLTQIAKRVKPGADGLIFHPYLAGERAPLWNANARGSFFGLTLSHKKEHMIRAALEGVLYNLYTVYLALIEVMNETPKMIKATGGFAKSEVWRQMMSDIFDTELVVPESYESSCLGACVLGLKAVGDIEDFSIVSSMVGATNNHTPIEENVAVYQELVSIFINLSRSLTENYEQISDFQRQHMAENKTQ >NC_018608.1|WP_000274558.1|2552266_2552944_-|GntR-family-transcriptional-regulator MYGYPEKWLEGMTTGEGIAAELRLGIVNGHIAEGTLLTENQMAKQFNVSRSPIRDAFKLLQQNQLIQLERMGAHVLPFGEQEKKEMYDLRLMLESFAFSRVKNQERLPIVKEMKKQLEMMKVAVKFEDAESFTKHDFEFHETLIKASNHQYLNSFWSHLKPVMMALVLTSMRQRMQQNPQDFERIHHNHQVFIDAVEQYDSQILKEAFHLNFDDVGKDIEGFWLN >NC_018608.1|WP_000074000.1|2553100_2553865_-|MerR-family-transcriptional-regulator MSNYSTGELAKLCNVTTRTIQYYDRKGILKPQGFTEGKRRVYTEQQRQTLELILLLKDLGCALSDIDMLLKGEGTLKTLNTLLTMKQQEINQQVKQQQAVLDKIKNVQYYVNEASTSPITHLKDIEHVMSKSAEMKSIRRNIWISAGIIGIIQYSSIISAILMKNKWPFLIALPFMISYGIGITIYYQRKVAYLCPNCQHIFSPSLWAVIKAKHTATTRRFECPNCHETHYCIEVPKTHMSTEQLEVPRTKNNN >NC_018608.1|WP_000289136.1|2554029_2554722_-|GTP-pyrophosphokinase-family-protein MYVDRKPSLYLEDLRHDFKNSLSKFENGDEAFDTLLGFVELDHIYSSALKEISTKLSILDDNFNHIYKHNPIHHMERRVKEMRSLIEKLNRKGLQISAETAKEHILDIAGIRVVCNYLDDIYLIEEMLLKQEDVQLIKRKDYIQHPKENGYRSLHIVVSIPVFLAERVEVLPVEIQIRTIGMDMWASLEHKIRYKNNAETEKYRDLLKECATEITEVEDKLQQIHSEITE >NC_018608.1|WP_001117057.1|2554952_2555369_-|DUF2188-domain-containing-protein MPFTMKGYPEKWKEFEVIKRQKAIEIANAMLKEGYLEKDVVPIAAKKAKDWYRALSKEEIKALEEENFVQFHTATMEKTEVDSEYATTDNEEHIQEQSNQDKSYFDSESIVNQSGGVRQREPLMDGPHPKVVESFKDV >NC_018608.1|WP_000586373.1|2555507_2557331_-|FUSC-family-protein MIIPAIIGYLCGNFQFGLLVATGTLAHIYVFKGPSRSKLRTVIICNLAFAICMILGTLTATTPLVFGMTLLIVTVIPFYIFTALKIAGPSSTFFIVTFSLPINLPIAPEEALYRGFAILVGGVLATMMVLITILLSKNKAEEQAIQNDFKLISKLLHAYNDKSAFSQVAKTAVDSFKASDKLLITSNSSSDKLSGRFQKLLLLHTSAQGIYSELLELNAKQIRPLPDELIEMMDHIITQRDDRNKNVRYWRKEVTVTEEFQNLFNHILKIDEMVHANEARIAYEAEMRKPLYSKRIYQNLTLDSIVFRNTLRYAAIMMIAIFIALMFDFEKAYWIPLSAHTVLLGTSTIHAIERGIARGLGTILGVLVLSVILLFSIPTPVAVILMGIAALFTEALVGANYTIAVVFITIQVILMNGLASQNLTINIAFPRVIDVAMGIVIAIIGLFVLGQRTASALLPYVMAEVVRKEATLFHYLFSENQYKDDVYQKNTAMNLSVKLNNMTQVYNAANGELFSDKTLIQNYYPSLFALEEISFMLNRAMANEDRLTINEQLMGEYLATFENIAKHLELNTELEIKILPDLPQYNYIQSAMMNIQHNGFRERDKNV >NC_018608.1|WP_000660709.1|2558242_2559520_-|MFS-transporter 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
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aagaaccaatacataataaagcataagtgat CRISPR spacer aagaaccaatacataataaatcattagtgat Protospacer ******************** *** ******
29. spacer 13.1|2341841|26|NC_018608|CRISPRCasFinder matches to position: 914074-914099, mismatch: 2, identity: 0.923
cggggccccaacatagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacatagtagcaggcgg Protospacer **************** *** *****
30. spacer 13.1|2341841|26|NC_018608|CRISPRCasFinder matches to position: 959012-959037, mismatch: 2, identity: 0.923
cggggccccaacatagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacacagaagctggtgg Protospacer *************.*********.**
31. spacer 13.1|2341841|26|NC_018608|CRISPRCasFinder matches to position: 1396924-1396949, mismatch: 2, identity: 0.923
cggggccccaacatagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacacagaaactggcgg Protospacer *************.****.*******
32. spacer 13.1|2341841|26|NC_018608|CRISPRCasFinder matches to position: 2133362-2133387, mismatch: 2, identity: 0.923
cggggccccaacatagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacacaaaagctggcgg Protospacer *************.*.**********
33. spacer 13.1|2341841|26|NC_018608|CRISPRCasFinder matches to position: 2473738-2473763, mismatch: 2, identity: 0.923
cggggccccaacatagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacacagtagctggcgg Protospacer *************.** *********
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | LR215718 | Staphylococcus phage Stab20 genome assembly, chromosome: I | 8632-8665 | 1 | 0.971 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | LR215718 | Staphylococcus phage Stab20 genome assembly, chromosome: I | 151156-151189 | 1 | 0.971 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | NC_028765 | Staphylococcus phage phiIPLA-RODI, complete genome | 142110-142143 | 1 | 0.971 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MT786458 | Staphylococcus phage vB_SauH_SAP1, complete genome | 38112-38145 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MK584893 | Staphylococcus phage vBSM-A1, complete genome | 134685-134718 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MN539738 | UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM-D, complete genome | 11747-11780 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MG721208 | Staphylococcus phage vB_SauM_LM12, complete genome | 140752-140785 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MT080600 | UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW71, complete genome | 109558-109591 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MT080596 | UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW42, complete genome | 56245-56278 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MN304941 | Staphylococcus phage vB_SauH_IME522, complete genome | 31337-31370 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | NC_019726 | Staphylococcus phage JD007, complete genome | 82079-82112 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | NC_047721 | Staphylococcus phage SA5, complete genome | 65209-65242 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MK656892 | Staphylococcus phage vBSP-A20, complete genome | 129559-129592 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | KR908644 | Staphylococcus phage IME-SA119, complete genome | 38972-39005 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MH136584 | Staphylococcus phage HYZ21, complete genome | 132706-132739 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MN539736 | UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM-A, complete genome | 106506-106539 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MT411892 | Staphylococcus phage Metroid, complete genome | 8259-8292 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MT411892 | Staphylococcus phage Metroid, complete genome | 149057-149090 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | KJ206562 | Staphylococcus phage 812 isolate host-range mutant 812F1, complete genome | 7044-7077 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | AP018375 | Staphylococcus phage phiSA039 DNA, complete genome | 341-374 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MK417514 | Staphylococcus virus Sa83, complete genome | 6799-6832 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MK417514 | Staphylococcus virus Sa83, complete genome | 144749-144782 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MN336263 | Staphylococcus phage Sb1M_9832, complete genome | 137149-137182 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MG557618 | Staphylococcus phage HSA30, complete genome | 106173-106206 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MH107769 | Staphylococcus phage vB_SauM_0414_108, complete genome | 8583-8616 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MH107769 | Staphylococcus phage vB_SauM_0414_108, complete genome | 149914-149947 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MN336262 | Staphylococcus phage Sb1M_6168, complete genome | 137149-137182 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | AY954969 | Bacteriophage G1, complete genome | 102377-102410 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MK331931 | Staphylococcus phage Sa30, complete genome | 6811-6844 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MK331931 | Staphylococcus phage Sa30, complete genome | 145146-145179 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | KJ206563 | Staphylococcus phage 812 isolate host-range mutant K1/420, complete genome | 7057-7090 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | JX080302 | Staphylococcus phage 676Z, complete genome | 6846-6879 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | JX080302 | Staphylococcus phage 676Z, complete genome | 146963-146996 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MN047438 | Staphylococcus phage vB_SauM-515A1 | 6398-6431 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MN047438 | Staphylococcus phage vB_SauM-515A1 | 147256-147289 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MF405094 | Staphylococcus phage JA1, complete genome | 6396-6429 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MF405094 | Staphylococcus phage JA1, complete genome | 145880-145913 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | KY779849 | Staphylococcus phage qdsa002, complete genome | 8838-8871 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MN336261 | Staphylococcus phage Sb1_8383, complete genome | 138524-138557 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MN539737 | UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM-C, complete genome | 106597-106630 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | EU418428 | Staphylococcus phage A5W, complete genome | 6822-6855 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | EU418428 | Staphylococcus phage A5W, complete genome | 143909-143942 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | KP687431 | Staphylococcus phage IME-SA1, complete genome | 119848-119881 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MK417516 | Staphylococcus virus J-Sa36, complete genome | 6851-6884 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MK417516 | Staphylococcus virus J-Sa36, complete genome | 146679-146712 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MT080602 | UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW74, complete genome | 100515-100548 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MH159197 | Staphylococcus phage VB_SavM_JYL01, complete genome | 121244-121277 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | KJ206561 | Staphylococcus phage 812 isolate host-range mutant K1, complete genome | 7022-7055 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | KP687432 | Staphylococcus phage IME-SA2, complete genome | 138889-138922 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MT080593 | UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW36, complete genome | 129181-129214 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | NC_047722 | Staphylococcus phage Staph1N, complete genome | 6822-6855 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | NC_047722 | Staphylococcus phage Staph1N, complete genome | 144014-144047 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MK250904 | Staphylococcus phage VB-SavM-JYL02, complete genome | 119816-119849 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | NC_047723 | Staphylococcus phage A3R, complete genome | 6674-6707 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | NC_047723 | Staphylococcus phage A3R, complete genome | 139386-139419 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | NC_047720 | Staphylococcus phage ISP complete genome | 102381-102414 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | JX080303 | Staphylococcus phage Fi200W, complete genome | 6801-6834 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | JX080303 | Staphylococcus phage Fi200W, complete genome | 146880-146913 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MG656408 | Staphylococcus phage B1, complete genome | 6821-6854 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MG656408 | Staphylococcus phage B1, complete genome | 147629-147662 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | KF766114 | Staphylococcus phage K, complete genome | 6853-6886 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | KF766114 | Staphylococcus phage K, complete genome | 146684-146717 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | NC_025416 | Staphylococcus phage MCE-2014, complete genome | 5530-5563 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | KR902361 | Staphylococcus phage IME-SA118, complete genome | 12724-12757 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | AB853331 | Staphylococcus phage S25-4 DNA, complete genome | 9095-9128 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MH844529 | Staphylococcus phage 812h1, complete genome | 6799-6832 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MH844529 | Staphylococcus phage 812h1, complete genome | 148949-148982 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | KC012913 | Staphylococcus phage Team1, complete genome | 6809-6842 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MK331930 | Staphylococcus phage CH1, complete genome | 104770-104803 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | JX080305 | Staphylococcus phage P4W, complete genome | 6819-6852 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | JX080305 | Staphylococcus phage P4W, complete genome | 145992-146025 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | KJ206560 | Staphylococcus phage 812 isolate host-range mutant 812a, complete genome | 7057-7090 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | KM216423 | Staphylococcus phage P108, complete genome | 86796-86829 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MF398190 | Staphylococcus phage vB_SauM-fRuSau02, complete genome | 6821-6854 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MF398190 | Staphylococcus phage vB_SauM-fRuSau02, complete genome | 147209-147242 | 2 | 0.941 |
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NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | MT554104 | Staphylococcus phage ESa1, complete genome | 151229-151262 | 2 | 0.941 |
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NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | JX080304 | Staphylococcus phage MSA6, complete genome | 146990-147023 | 2 | 0.941 |
NC_018608_1 | 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55906-55939 | 34 | NC_019448 | Staphylococcus phage GH15, complete genome | 4693-4726 | 2 | 0.941 |
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NC_018608_1 | 1.13|56410|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 56410-56444 | 35 | MK922547 | Staphylococcus phage SA30-CTH2, complete genome | 3197-3231 | 2 | 0.943 |
NC_018608_1 | 1.13|56410|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 56410-56444 | 35 | KJ210330 | Staphylococcus phage GRCS, complete genome | 3491-3525 | 2 | 0.943 |
NC_018608_1 | 1.13|56410|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 56410-56444 | 35 | MK936475 | Staphylococcus phage SA03-CTH2, complete genome | 14280-14314 | 2 | 0.943 |
NC_018608_1 | 1.14|56481|33|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 56481-56513 | 33 | NC_013373 | Staphylococcus sp. CDC3 plasmid SAP020A, complete sequence | 26794-26826 | 2 | 0.939 |
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NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | LR215718 | Staphylococcus phage Stab20 genome assembly, chromosome: I | 151156-151190 | 2 | 0.943 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | NC_028765 | Staphylococcus phage phiIPLA-RODI, complete genome | 142110-142144 | 2 | 0.943 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MH159197 | Staphylococcus phage VB_SavM_JYL01, complete genome | 121244-121278 | 2 | 0.943 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MK250904 | Staphylococcus phage VB-SavM-JYL02, complete genome | 119816-119850 | 2 | 0.943 |
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NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MN539736 | UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM-A, complete genome | 106506-106540 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MT411892 | Staphylococcus phage Metroid, complete genome | 8259-8293 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MT411892 | Staphylococcus phage Metroid, complete genome | 149057-149091 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | KJ206562 | Staphylococcus phage 812 isolate host-range mutant 812F1, complete genome | 7044-7078 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | AP018375 | Staphylococcus phage phiSA039 DNA, complete genome | 341-375 | 3 | 0.914 |
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NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MK417514 | Staphylococcus virus Sa83, complete genome | 144749-144783 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MT786458 | Staphylococcus phage vB_SauH_SAP1, complete genome | 38111-38145 | 3 | 0.914 |
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NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MN336263 | Staphylococcus phage Sb1M_9832, complete genome | 137149-137183 | 3 | 0.914 |
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NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MH107769 | Staphylococcus phage vB_SauM_0414_108, complete genome | 8583-8617 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MH107769 | Staphylococcus phage vB_SauM_0414_108, complete genome | 149914-149948 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MN336262 | Staphylococcus phage Sb1M_6168, complete genome | 137149-137183 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | AY954969 | Bacteriophage G1, complete genome | 102377-102411 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MN539738 | UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM-D, complete genome | 11746-11780 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MG721208 | Staphylococcus phage vB_SauM_LM12, complete genome | 140751-140785 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MK331931 | Staphylococcus phage Sa30, complete genome | 6811-6845 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MK331931 | Staphylococcus phage Sa30, complete genome | 145146-145180 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MT080600 | UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW71, complete genome | 109557-109591 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | KJ206563 | Staphylococcus phage 812 isolate host-range mutant K1/420, complete genome | 7057-7091 | 3 | 0.914 |
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NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | JX080302 | Staphylococcus phage 676Z, complete genome | 146963-146997 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MN047438 | Staphylococcus phage vB_SauM-515A1 | 6398-6432 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MN047438 | Staphylococcus phage vB_SauM-515A1 | 147256-147290 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MF405094 | Staphylococcus phage JA1, complete genome | 6396-6430 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MF405094 | Staphylococcus phage JA1, complete genome | 145880-145914 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MT080596 | UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW42, complete genome | 56244-56278 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | KY779849 | Staphylococcus phage qdsa002, complete genome | 8838-8872 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MN336261 | Staphylococcus phage Sb1_8383, complete genome | 138524-138558 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MN539737 | UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM-C, complete genome | 106597-106631 | 3 | 0.914 |
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NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | EU418428 | Staphylococcus phage A5W, complete genome | 143909-143943 | 3 | 0.914 |
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NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MK417516 | Staphylococcus virus J-Sa36, complete genome | 6851-6885 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MK417516 | Staphylococcus virus J-Sa36, complete genome | 146679-146713 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MT080602 | UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW74, complete genome | 100515-100549 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MN304941 | Staphylococcus phage vB_SauH_IME522, complete genome | 31336-31370 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | NC_019726 | Staphylococcus phage JD007, complete genome | 82078-82112 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | KJ206561 | Staphylococcus phage 812 isolate host-range mutant K1, complete genome | 7022-7056 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | NC_047721 | Staphylococcus phage SA5, complete genome | 65208-65242 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | KP687432 | Staphylococcus phage IME-SA2, complete genome | 138889-138923 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MT080593 | UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW36, complete genome | 129181-129215 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | NC_047722 | Staphylococcus phage Staph1N, complete genome | 6822-6856 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | NC_047722 | Staphylococcus phage Staph1N, complete genome | 144014-144048 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MK656892 | Staphylococcus phage vBSP-A20, complete genome | 129558-129592 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | NC_047723 | Staphylococcus phage A3R, complete genome | 6674-6708 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | NC_047723 | Staphylococcus phage A3R, complete genome | 139386-139420 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | NC_047720 | Staphylococcus phage ISP complete genome | 102381-102415 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | JX080303 | Staphylococcus phage Fi200W, complete genome | 6801-6835 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | JX080303 | Staphylococcus phage Fi200W, complete genome | 146880-146914 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MG656408 | Staphylococcus phage B1, complete genome | 6821-6855 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MG656408 | Staphylococcus phage B1, complete genome | 147629-147663 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | KF766114 | Staphylococcus phage K, complete genome | 6853-6887 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | KF766114 | Staphylococcus phage K, complete genome | 146684-146718 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | NC_025416 | Staphylococcus phage MCE-2014, complete genome | 5530-5564 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | KR902361 | Staphylococcus phage IME-SA118, complete genome | 12724-12758 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | AB853331 | Staphylococcus phage S25-4 DNA, complete genome | 9095-9129 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MH844529 | Staphylococcus phage 812h1, complete genome | 6799-6833 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MH844529 | Staphylococcus phage 812h1, complete genome | 148949-148983 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | KC012913 | Staphylococcus phage Team1, complete genome | 6809-6843 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MK331930 | Staphylococcus phage CH1, complete genome | 104770-104804 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | JX080305 | Staphylococcus phage P4W, complete genome | 6819-6853 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | JX080305 | Staphylococcus phage P4W, complete genome | 145992-146026 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | KJ206560 | Staphylococcus phage 812 isolate host-range mutant 812a, complete genome | 7057-7091 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | KM216423 | Staphylococcus phage P108, complete genome | 86796-86830 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MF398190 | Staphylococcus phage vB_SauM-fRuSau02, complete genome | 6821-6855 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MF398190 | Staphylococcus phage vB_SauM-fRuSau02, complete genome | 147209-147243 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | KR908644 | Staphylococcus phage IME-SA119, complete genome | 38971-39005 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MT554104 | Staphylococcus phage ESa1, complete genome | 8560-8594 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MT554104 | Staphylococcus phage ESa1, complete genome | 151229-151263 | 3 | 0.914 |
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NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MH844528 | Staphylococcus phage 812, complete genome | 148757-148791 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | NC_007066 | Staphylococcus phage G1, complete genome | 102377-102411 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | NC_022920 | Staphylococcus phage S25-3 DNA, complete genome | 6622-6656 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | JX080304 | Staphylococcus phage MSA6, complete genome | 6796-6830 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | JX080304 | Staphylococcus phage MSA6, complete genome | 146990-147024 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | MH136584 | Staphylococcus phage HYZ21, complete genome | 132705-132739 | 3 | 0.914 |
NC_018608_1 | 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR | 55905-55939 | 35 | NC_019448 | Staphylococcus phage GH15, complete genome | 4693-4727 | 3 | 0.914 |
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NC_018608_1 | 1.25|56409|36|NC_018608|PILER-CR | 56409-56444 | 36 | MT926124 | Staphylococcus phage vB_SauP_EBHT, complete genome | 2846-2881 | 3 | 0.917 |
NC_018608_1 | 1.25|56409|36|NC_018608|PILER-CR | 56409-56444 | 36 | MK922548 | Staphylococcus phage SA46-CTH4, complete genome | 3204-3239 | 3 | 0.917 |
NC_018608_1 | 1.25|56409|36|NC_018608|PILER-CR | 56409-56444 | 36 | MK922547 | Staphylococcus phage SA30-CTH2, complete genome | 3197-3232 | 3 | 0.917 |
NC_018608_1 | 1.25|56409|36|NC_018608|PILER-CR | 56409-56444 | 36 | KJ210330 | Staphylococcus phage GRCS, complete genome | 3491-3526 | 3 | 0.917 |
NC_018608_3 | 3.1|292911|25|NC_018608|CRISPRCasFinder | 292911-292935 | 25 | NC_014792 | Enterobacteria phage vB_EcoM-VR7, complete genome | 154175-154199 | 3 | 0.88 |
NC_018608_3 | 3.2|292967|25|NC_018608|CRISPRCasFinder | 292967-292991 | 25 | MW117966 | Synechococcus phage S-H9-1, complete genome | 42366-42390 | 4 | 0.84 |
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NC_018608_9 | 9.1|1881721|26|NC_018608|CRISPRCasFinder | 1881721-1881746 | 26 | NZ_CP017210 | Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_cp9, complete sequence | 2023-2048 | 4 | 0.846 |
NC_018608_3 | 3.2|292967|25|NC_018608|CRISPRCasFinder | 292967-292991 | 25 | NZ_CP038259 | Acinetobacter baumannii strain 39741 plasmid pEH_gr13, complete sequence | 11151-11175 | 5 | 0.8 |
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NC_018608_9 | 9.1|1881721|26|NC_018608|CRISPRCasFinder | 1881721-1881746 | 26 | NC_010631 | Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN01, complete sequence | 3460-3485 | 5 | 0.808 |
NC_018608_9 | 9.1|1881721|26|NC_018608|CRISPRCasFinder | 1881721-1881746 | 26 | NC_010632 | Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN02, complete sequence | 13739-13764 | 5 | 0.808 |
NC_018608_1 | 1.15|56550|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 56550-56584 | 35 | NZ_CP043848 | Staphylococcus epidermidis strain NCCP 16828 plasmid unnamed, complete sequence | 50879-50913 | 6 | 0.829 |
NC_018608_2 | 2.2|65448|41|NC_018608|CRISPRCasFinder | 65448-65488 | 41 | MF417907 | Uncultured Caudovirales phage clone 7F_7, partial genome | 31442-31482 | 6 | 0.854 |
NC_018608_2 | 2.2|65448|41|NC_018608|CRISPRCasFinder | 65448-65488 | 41 | KY653129 | Staphylococcus phage IME1365_01, complete genome | 11951-11991 | 6 | 0.854 |
NC_018608_3 | 3.2|292967|25|NC_018608|CRISPRCasFinder | 292967-292991 | 25 | NZ_CP047617 | Lactococcus raffinolactis strain Lr_19_5 plasmid pLraf_19_5_1, complete sequence | 79395-79419 | 6 | 0.76 |
NC_018608_9 | 9.1|1881721|26|NC_018608|CRISPRCasFinder | 1881721-1881746 | 26 | MK448662 | Streptococcus satellite phage Javan97, complete genome | 6198-6223 | 6 | 0.769 |
NC_018608_2 | 2.5|65447|42|NC_018608|CRT | 65447-65488 | 42 | KY653129 | Staphylococcus phage IME1365_01, complete genome | 11951-11992 | 7 | 0.833 |
NC_018608_2 | 2.5|65447|42|NC_018608|CRT | 65447-65488 | 42 | MF417907 | Uncultured Caudovirales phage clone 7F_7, partial genome | 31441-31482 | 7 | 0.833 |
NC_018608_1 | 1.3|55691|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55691-55724 | 34 | MN694790 | Marine virus AFVG_250M551, complete genome | 33981-34014 | 8 | 0.765 |
NC_018608_1 | 1.3|55691|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55691-55724 | 34 | NZ_LR214999 | Mycoplasma conjunctivae strain NCTC10147 plasmid 3 | 55978-56011 | 8 | 0.765 |
NC_018608_1 | 1.3|55691|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55691-55724 | 34 | LR214965 | Mycoplasma fermentans strain NCTC10117 genome assembly, plasmid: 11 | 45570-45603 | 8 | 0.765 |
NC_018608_1 | 1.8|56049|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 56049-56083 | 35 | KY794641 | Staphylococcus phage vB_Sau_CG, complete genome | 109779-109813 | 8 | 0.771 |
NC_018608_1 | 1.8|56049|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 56049-56083 | 35 | MT080601 | UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW72, complete genome | 22386-22420 | 8 | 0.771 |
NC_018608_1 | 1.8|56049|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 56049-56083 | 35 | MT080589 | UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW26, complete genome | 34496-34530 | 8 | 0.771 |
NC_018608_1 | 1.8|56049|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 56049-56083 | 35 | MT080585 | UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW18, complete genome | 5835-5869 | 8 | 0.771 |
NC_018608_1 | 1.8|56049|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 56049-56083 | 35 | MT080591 | UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW29, complete genome | 2371-2405 | 8 | 0.771 |
NC_018608_1 | 1.8|56049|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 56049-56083 | 35 | LR215721 | Staphylococcus phage Stab22 genome assembly, chromosome: I | 9990-10024 | 8 | 0.771 |
NC_018608_1 | 1.8|56049|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 56049-56083 | 35 | LR215721 | Staphylococcus phage Stab22 genome assembly, chromosome: I | 152264-152298 | 8 | 0.771 |
NC_018608_1 | 1.8|56049|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 56049-56083 | 35 | AB853331 | Staphylococcus phage S25-4 DNA, complete genome | 9001-9035 | 8 | 0.771 |
NC_018608_1 | 1.8|56049|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 56049-56083 | 35 | NC_022920 | Staphylococcus phage S25-3 DNA, complete genome | 6528-6562 | 8 | 0.771 |
NC_018608_1 | 1.20|56048|36|NC_018608|PILER-CR | 56048-56083 | 36 | KY794641 | Staphylococcus phage vB_Sau_CG, complete genome | 109779-109814 | 8 | 0.778 |
NC_018608_1 | 1.3|55691|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55691-55724 | 34 | NC_013940 | Deferribacter desulfuricans SSM1 megaplasmid pDF308, complete sequence | 123527-123560 | 9 | 0.735 |
NC_018608_1 | 1.7|55976|37|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55976-56012 | 37 | MT104467 | Pseudomonas phage MR4, complete genome | 16929-16965 | 9 | 0.757 |
NC_018608_1 | 1.7|55976|37|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55976-56012 | 37 | KJ749827 | Escherichia phage ECBP5, complete genome | 17768-17804 | 9 | 0.757 |
NC_018608_1 | 1.3|55691|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55691-55724 | 34 | NZ_CP028886 | Borrelia turcica IST7 plasmid lp32-A, complete sequence | 1427-1460 | 11 | 0.676 |
NC_018608_11 | 11.1|2122296|34|NC_018608|CRISPRCasFinder | 2122296-2122329 | 34 | NC_027332 | Acinetobacter phage YMC13/03/R2096, complete genome | 68639-68672 | 11 | 0.676 |
NC_018608_11 | 11.1|2122296|34|NC_018608|CRISPRCasFinder | 2122296-2122329 | 34 | KY000079 | Acinetobacter phage AM24, complete genome | 74925-74958 | 11 | 0.676 |
NC_018608_1 | 1.3|55691|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55691-55724 | 34 | NZ_CP052077 | Ralstonia solanacearum strain FJAT445.F50 plasmid Plas1, complete sequence | 1264667-1264700 | 12 | 0.647 |
NC_018608_1 | 1.3|55691|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55691-55724 | 34 | NZ_CP052079 | Ralstonia solanacearum strain FJAT445.F1 plasmid Plas1, complete sequence | 1264689-1264722 | 12 | 0.647 |
NC_018608_1 | 1.3|55691|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55691-55724 | 34 | NZ_CP052125 | Ralstonia solanacearum strain FJAT1452.F1 plasmid Plas1, complete sequence | 1264689-1264722 | 12 | 0.647 |
NC_018608_1 | 1.3|55691|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55691-55724 | 34 | NZ_CP052123 | Ralstonia solanacearum strain FJAT1452.F50 plasmid Plas1, complete sequence | 1264689-1264722 | 12 | 0.647 |
NC_018608_1 | 1.3|55691|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55691-55724 | 34 | NZ_CP052081 | Ralstonia solanacearum strain FJAT442.F50 plasmid Plas1, complete sequence | 1264689-1264722 | 12 | 0.647 |
NC_018608_1 | 1.3|55691|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT | 55691-55724 | 34 | NZ_CP052083 | Ralstonia solanacearum strain FJAT442.F1 plasmid Plas1, complete sequence | 1264689-1264722 | 12 | 0.647 |
1. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to LR215718 (Staphylococcus phage Stab20 genome assembly, chromosome: I) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
tagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer tagaatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer ******************************.***
2. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to LR215718 (Staphylococcus phage Stab20 genome assembly, chromosome: I) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
tagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer tagaatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer ******************************.***
3. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028765 (Staphylococcus phage phiIPLA-RODI, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
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4. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT786458 (Staphylococcus phage vB_SauH_SAP1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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5. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK584893 (Staphylococcus phage vBSM-A1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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6. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN539738 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM-D, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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7. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MG721208 (Staphylococcus phage vB_SauM_LM12, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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8. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT080600 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW71, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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9. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT080596 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW42, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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10. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN304941 (Staphylococcus phage vB_SauH_IME522, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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11. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019726 (Staphylococcus phage JD007, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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12. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_047721 (Staphylococcus phage SA5, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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13. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK656892 (Staphylococcus phage vBSP-A20, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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14. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to KR908644 (Staphylococcus phage IME-SA119, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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15. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH136584 (Staphylococcus phage HYZ21, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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16. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN539736 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM-A, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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17. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT411892 (Staphylococcus phage Metroid, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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18. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT411892 (Staphylococcus phage Metroid, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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19. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ206562 (Staphylococcus phage 812 isolate host-range mutant 812F1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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20. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to AP018375 (Staphylococcus phage phiSA039 DNA, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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21. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK417514 (Staphylococcus virus Sa83, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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22. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK417514 (Staphylococcus virus Sa83, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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23. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN336263 (Staphylococcus phage Sb1M_9832, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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24. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MG557618 (Staphylococcus phage HSA30, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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25. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH107769 (Staphylococcus phage vB_SauM_0414_108, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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26. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH107769 (Staphylococcus phage vB_SauM_0414_108, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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27. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN336262 (Staphylococcus phage Sb1M_6168, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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28. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to AY954969 (Bacteriophage G1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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29. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK331931 (Staphylococcus phage Sa30, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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30. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK331931 (Staphylococcus phage Sa30, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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31. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ206563 (Staphylococcus phage 812 isolate host-range mutant K1/420, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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32. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to JX080302 (Staphylococcus phage 676Z, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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33. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to JX080302 (Staphylococcus phage 676Z, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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34. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN047438 (Staphylococcus phage vB_SauM-515A1) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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35. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN047438 (Staphylococcus phage vB_SauM-515A1) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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36. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MF405094 (Staphylococcus phage JA1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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37. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MF405094 (Staphylococcus phage JA1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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38. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to KY779849 (Staphylococcus phage qdsa002, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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39. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN336261 (Staphylococcus phage Sb1_8383, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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40. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN539737 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM-C, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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41. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to EU418428 (Staphylococcus phage A5W, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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42. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to EU418428 (Staphylococcus phage A5W, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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43. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to KP687431 (Staphylococcus phage IME-SA1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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44. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK417516 (Staphylococcus virus J-Sa36, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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45. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK417516 (Staphylococcus virus J-Sa36, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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46. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT080602 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW74, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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47. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH159197 (Staphylococcus phage VB_SavM_JYL01, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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48. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ206561 (Staphylococcus phage 812 isolate host-range mutant K1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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49. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to KP687432 (Staphylococcus phage IME-SA2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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50. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT080593 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW36, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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51. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_047722 (Staphylococcus phage Staph1N, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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52. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_047722 (Staphylococcus phage Staph1N, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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53. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK250904 (Staphylococcus phage VB-SavM-JYL02, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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54. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_047723 (Staphylococcus phage A3R, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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55. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_047723 (Staphylococcus phage A3R, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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56. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_047720 (Staphylococcus phage ISP complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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57. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to JX080303 (Staphylococcus phage Fi200W, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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58. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to JX080303 (Staphylococcus phage Fi200W, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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59. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MG656408 (Staphylococcus phage B1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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60. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MG656408 (Staphylococcus phage B1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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61. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to KF766114 (Staphylococcus phage K, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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62. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to KF766114 (Staphylococcus phage K, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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63. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_025416 (Staphylococcus phage MCE-2014, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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64. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to KR902361 (Staphylococcus phage IME-SA118, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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65. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to AB853331 (Staphylococcus phage S25-4 DNA, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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66. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH844529 (Staphylococcus phage 812h1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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67. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH844529 (Staphylococcus phage 812h1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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68. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to KC012913 (Staphylococcus phage Team1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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69. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK331930 (Staphylococcus phage CH1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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70. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to JX080305 (Staphylococcus phage P4W, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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71. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to JX080305 (Staphylococcus phage P4W, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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72. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ206560 (Staphylococcus phage 812 isolate host-range mutant 812a, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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73. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to KM216423 (Staphylococcus phage P108, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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74. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MF398190 (Staphylococcus phage vB_SauM-fRuSau02, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
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75. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MF398190 (Staphylococcus phage vB_SauM-fRuSau02, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
tagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer taggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer ***.**************************.***
76. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT554104 (Staphylococcus phage ESa1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
tagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer taggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer ***.**************************.***
77. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT554104 (Staphylococcus phage ESa1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
tagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer taggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer ***.**************************.***
78. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH844528 (Staphylococcus phage 812, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
tagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer taggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer ***.**************************.***
79. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH844528 (Staphylococcus phage 812, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
tagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer taggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer ***.**************************.***
80. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007066 (Staphylococcus phage G1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
tagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer taggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer ***.**************************.***
81. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_022920 (Staphylococcus phage S25-3 DNA, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
tagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer taggatgttattatctatgtggtcgatgtattcc Protospacer ***.************* ****************
82. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to JX080304 (Staphylococcus phage MSA6, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
tagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer taggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer ***.**************************.***
83. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to JX080304 (Staphylococcus phage MSA6, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
tagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer taggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer ***.**************************.***
84. spacer 1.6|55906|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019448 (Staphylococcus phage GH15, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
tagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer taggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer ***.**************************.***
85. spacer 1.13|56410|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT926124 (Staphylococcus phage vB_SauP_EBHT, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
aagttaacggcattacctaataaaaatattttagg CRISPR spacer aagttaacagcattacctaataaaaatatttttgg Protospacer ********.*********************** **
86. spacer 1.13|56410|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK922548 (Staphylococcus phage SA46-CTH4, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
aagttaacggcattacctaataaaaatattttagg CRISPR spacer aagttaacagcattacctaataagaatattttagg Protospacer ********.**************.***********
87. spacer 1.13|56410|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK922547 (Staphylococcus phage SA30-CTH2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
aagttaacggcattacctaataaaaatattttagg CRISPR spacer aagttaacagcattacctaataagaatattttagg Protospacer ********.**************.***********
88. spacer 1.13|56410|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ210330 (Staphylococcus phage GRCS, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
aagttaacggcattacctaataaaaatattttagg CRISPR spacer aagttaacagcattacctaataaaaatatttttgg Protospacer ********.*********************** **
89. spacer 1.13|56410|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK936475 (Staphylococcus phage SA03-CTH2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
aagttaacggcattacctaataaaaatattttagg CRISPR spacer aagttaacagcattacctaataagaatattttagg Protospacer ********.**************.***********
90. spacer 1.14|56481|33|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_013373 (Staphylococcus sp. CDC3 plasmid SAP020A, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
tcatctttcatgtcactgattaattcatttgta CRISPR spacer tcatctttcatatcattgattaattcatttgta Protospacer ***********.***.*****************
91. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to LR215718 (Staphylococcus phage Stab20 genome assembly, chromosome: I) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctagaatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .******************************.***
92. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to LR215718 (Staphylococcus phage Stab20 genome assembly, chromosome: I) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctagaatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .******************************.***
93. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to NC_028765 (Staphylococcus phage phiIPLA-RODI, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctagaatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .******************************.***
94. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MH159197 (Staphylococcus phage VB_SavM_JYL01, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ttaggatgttattatctatgtggtcgatgtattcc Protospacer ****.************* ****************
95. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MK250904 (Staphylococcus phage VB-SavM-JYL02, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ttaggatgttattatctatgtggtcgatgtattcc Protospacer ****.************* ****************
96. spacer 1.26|56480|34|NC_018608|PILER-CR matches to NC_013373 (Staphylococcus sp. CDC3 plasmid SAP020A, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
ctcatctttcatgtcactgattaattcatttgta CRISPR spacer ctcatctttcatatcattgattaattcatttgta Protospacer ************.***.*****************
97. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MN539736 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM-A, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
98. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MT411892 (Staphylococcus phage Metroid, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
99. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MT411892 (Staphylococcus phage Metroid, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
100. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to KJ206562 (Staphylococcus phage 812 isolate host-range mutant 812F1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
101. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to AP018375 (Staphylococcus phage phiSA039 DNA, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
102. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MK417514 (Staphylococcus virus Sa83, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
103. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MK417514 (Staphylococcus virus Sa83, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
104. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MT786458 (Staphylococcus phage vB_SauH_SAP1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
105. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MK584893 (Staphylococcus phage vBSM-A1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
106. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MN336263 (Staphylococcus phage Sb1M_9832, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
107. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MG557618 (Staphylococcus phage HSA30, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
108. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MH107769 (Staphylococcus phage vB_SauM_0414_108, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
109. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MH107769 (Staphylococcus phage vB_SauM_0414_108, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
110. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MN336262 (Staphylococcus phage Sb1M_6168, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
111. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to AY954969 (Bacteriophage G1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
112. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MN539738 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM-D, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
113. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MG721208 (Staphylococcus phage vB_SauM_LM12, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
114. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MK331931 (Staphylococcus phage Sa30, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
115. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MK331931 (Staphylococcus phage Sa30, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
116. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MT080600 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW71, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
117. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to KJ206563 (Staphylococcus phage 812 isolate host-range mutant K1/420, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
118. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to JX080302 (Staphylococcus phage 676Z, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
119. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to JX080302 (Staphylococcus phage 676Z, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
120. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MN047438 (Staphylococcus phage vB_SauM-515A1) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
121. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MN047438 (Staphylococcus phage vB_SauM-515A1) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
122. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MF405094 (Staphylococcus phage JA1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
123. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MF405094 (Staphylococcus phage JA1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
124. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MT080596 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW42, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctagaacgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .*****.************************.***
125. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to KY779849 (Staphylococcus phage qdsa002, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
126. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MN336261 (Staphylococcus phage Sb1_8383, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
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127. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MN539737 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM-C, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
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128. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to EU418428 (Staphylococcus phage A5W, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
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129. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to EU418428 (Staphylococcus phage A5W, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
130. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to KP687431 (Staphylococcus phage IME-SA1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
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131. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MK417516 (Staphylococcus virus J-Sa36, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
132. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MK417516 (Staphylococcus virus J-Sa36, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
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133. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MT080602 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW74, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
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134. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MN304941 (Staphylococcus phage vB_SauH_IME522, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
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135. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to NC_019726 (Staphylococcus phage JD007, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
136. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to KJ206561 (Staphylococcus phage 812 isolate host-range mutant K1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
137. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to NC_047721 (Staphylococcus phage SA5, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
138. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to KP687432 (Staphylococcus phage IME-SA2, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
139. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MT080593 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW36, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctagaacgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .*****.************************.***
140. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to NC_047722 (Staphylococcus phage Staph1N, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
141. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to NC_047722 (Staphylococcus phage Staph1N, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
142. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MK656892 (Staphylococcus phage vBSP-A20, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
143. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to NC_047723 (Staphylococcus phage A3R, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
144. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to NC_047723 (Staphylococcus phage A3R, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
145. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to NC_047720 (Staphylococcus phage ISP complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
146. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to JX080303 (Staphylococcus phage Fi200W, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
147. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to JX080303 (Staphylococcus phage Fi200W, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
148. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MG656408 (Staphylococcus phage B1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
149. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MG656408 (Staphylococcus phage B1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
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150. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to KF766114 (Staphylococcus phage K, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
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151. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to KF766114 (Staphylococcus phage K, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
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152. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to NC_025416 (Staphylococcus phage MCE-2014, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
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153. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to KR902361 (Staphylococcus phage IME-SA118, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
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154. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to AB853331 (Staphylococcus phage S25-4 DNA, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
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155. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MH844529 (Staphylococcus phage 812h1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
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156. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MH844529 (Staphylococcus phage 812h1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
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157. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to KC012913 (Staphylococcus phage Team1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
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158. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MK331930 (Staphylococcus phage CH1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
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159. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to JX080305 (Staphylococcus phage P4W, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
160. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to JX080305 (Staphylococcus phage P4W, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
161. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to KJ206560 (Staphylococcus phage 812 isolate host-range mutant 812a, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
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162. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to KM216423 (Staphylococcus phage P108, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
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163. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MF398190 (Staphylococcus phage vB_SauM-fRuSau02, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
164. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MF398190 (Staphylococcus phage vB_SauM-fRuSau02, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
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165. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to KR908644 (Staphylococcus phage IME-SA119, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
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166. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MT554104 (Staphylococcus phage ESa1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
167. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MT554104 (Staphylococcus phage ESa1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
168. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MH844528 (Staphylococcus phage 812, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
169. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MH844528 (Staphylococcus phage 812, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
170. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to NC_007066 (Staphylococcus phage G1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
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171. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to NC_022920 (Staphylococcus phage S25-3 DNA, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctatgtggtcgatgtattcc Protospacer .***.************* ****************
172. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to JX080304 (Staphylococcus phage MSA6, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
173. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to JX080304 (Staphylococcus phage MSA6, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
174. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to MH136584 (Staphylococcus phage HYZ21, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
175. spacer 1.18|55905|35|NC_018608|PILER-CR matches to NC_019448 (Staphylococcus phage GH15, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
ttagaatgttattatctaagtggtcgatgtattcc CRISPR spacer ctaggatgttattatctaagtggtcgatgtactcc Protospacer .***.**************************.***
176. spacer 1.25|56409|36|NC_018608|PILER-CR matches to MK936475 (Staphylococcus phage SA03-CTH2, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
taagttaacggcattacctaataaaaatattttagg CRISPR spacer aaagttaacagcattacctaataagaatattttagg Protospacer ********.**************.***********
177. spacer 1.25|56409|36|NC_018608|PILER-CR matches to MT926124 (Staphylococcus phage vB_SauP_EBHT, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
taagttaacggcattacctaataaaaatattttagg CRISPR spacer aaagttaacagcattacctaataaaaatatttttgg Protospacer ********.*********************** **
178. spacer 1.25|56409|36|NC_018608|PILER-CR matches to MK922548 (Staphylococcus phage SA46-CTH4, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
taagttaacggcattacctaataaaaatattttagg CRISPR spacer aaagttaacagcattacctaataagaatattttagg Protospacer ********.**************.***********
179. spacer 1.25|56409|36|NC_018608|PILER-CR matches to MK922547 (Staphylococcus phage SA30-CTH2, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
taagttaacggcattacctaataaaaatattttagg CRISPR spacer aaagttaacagcattacctaataagaatattttagg Protospacer ********.**************.***********
180. spacer 1.25|56409|36|NC_018608|PILER-CR matches to KJ210330 (Staphylococcus phage GRCS, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
taagttaacggcattacctaataaaaatattttagg CRISPR spacer aaagttaacagcattacctaataaaaatatttttgg Protospacer ********.*********************** **
181. spacer 3.1|292911|25|NC_018608|CRISPRCasFinder matches to NC_014792 (Enterobacteria phage vB_EcoM-VR7, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.88
ggcgaaaatacagcttacaataatg CRISPR spacer gacgaaaatacatattacaataatg Protospacer *.********** ***********
182. spacer 3.2|292967|25|NC_018608|CRISPRCasFinder matches to MW117966 (Synechococcus phage S-H9-1, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
ttggaacagcaatttctacagacaa CRISPR spacer ttggaacagcaatttctactggtat Protospacer ******************* *..*
183. spacer 9.1|1881721|26|NC_018608|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053838 (Aliiarcobacter faecis strain CCUG 66484 plasmid pAFAEC, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
agaatttcaaaaaagaaattctacag CRISPR spacer agaatttcaaaaaataaaatctattg Protospacer ************** *** ****. *
184. spacer 9.1|1881721|26|NC_018608|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017210 (Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_cp9, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
agaatttcaaaaaagaaattctacag CRISPR spacer acaatttcaaaaaagaaatattacac Protospacer * ***************** .****
185. spacer 3.2|292967|25|NC_018608|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038259 (Acinetobacter baumannii strain 39741 plasmid pEH_gr13, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.8
ttggaacagcaatttctacagacaa CRISPR spacer ctggaacagcaatttctccagaggt Protospacer .**************** **** .
186. spacer 9.1|1881721|26|NC_018608|CRISPRCasFinder matches to NC_008443 (Borrelia burgdorferi strain Ip21 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
agaatttcaaaaaagaaattctacag CRISPR spacer ccaatttcaaaaaagaaattttccac Protospacer ******************.* **
187. spacer 9.1|1881721|26|NC_018608|CRISPRCasFinder matches to NC_010631 (Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN01, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
agaatttcaaaaaagaaattctacag CRISPR spacer tgaatgtcaaaaaagaaattcttgaa Protospacer **** **************** *.
188. spacer 9.1|1881721|26|NC_018608|CRISPRCasFinder matches to NC_010632 (Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN02, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
agaatttcaaaaaagaaattctacag CRISPR spacer tgaatgtcaaaaaagaaattcttgaa Protospacer **** **************** *.
189. spacer 1.15|56550|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP043848 (Staphylococcus epidermidis strain NCCP 16828 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.829
ggtaatagttgctcaataggtaataaaacgtcggt CRISPR spacer gggaatagttgctcgataggtaataaaacgtttac Protospacer ** ***********.****************. ..
190. spacer 2.2|65448|41|NC_018608|CRISPRCasFinder matches to MF417907 (Uncultured Caudovirales phage clone 7F_7, partial genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.854
aactgatatactcctttaccatgtattaattctggaccact CRISPR spacer tattcatatactcccttgccatgtattaattctggaccacg Protospacer *.* *********.**.**********************
191. spacer 2.2|65448|41|NC_018608|CRISPRCasFinder matches to KY653129 (Staphylococcus phage IME1365_01, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.854
aactgatatactcctttaccatgtattaattctggaccact CRISPR spacer tattcataaactcctttgccatgtattaattctggaccacg Protospacer *.* *** ********.**********************
192. spacer 3.2|292967|25|NC_018608|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP047617 (Lactococcus raffinolactis strain Lr_19_5 plasmid pLraf_19_5_1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.76
ttggaacagcaatttctacagacaa CRISPR spacer ctggaacagcaatttctacattatc Protospacer .*******************
193. spacer 9.1|1881721|26|NC_018608|CRISPRCasFinder matches to MK448662 (Streptococcus satellite phage Javan97, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.769
agaatttcaaaaaagaaattctacag CRISPR spacer gctttttcaaaaaagaaattctagac Protospacer . ******************* *
194. spacer 2.5|65447|42|NC_018608|CRT matches to KY653129 (Staphylococcus phage IME1365_01, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.833
gaactgatatactcctttaccatgtattaattctggaccact CRISPR spacer atattcataaactcctttgccatgtattaattctggaccacg Protospacer . *.* *** ********.**********************
195. spacer 2.5|65447|42|NC_018608|CRT matches to MF417907 (Uncultured Caudovirales phage clone 7F_7, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.833
gaactgatatactcctttaccatgtattaattctggaccact CRISPR spacer atattcatatactcccttgccatgtattaattctggaccacg Protospacer . *.* *********.**.**********************
196. spacer 1.3|55691|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694790 (Marine virus AFVG_250M551, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
aattttctaattctataagttcattaattccgat CRISPR spacer aattttctatttctataatttcattacactctag Protospacer ********* ******** ******* ..* *
197. spacer 1.3|55691|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR214999 (Mycoplasma conjunctivae strain NCTC10147 plasmid 3) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
aattttctaattctataagttcattaattccgat CRISPR spacer gtttagctaattctataagttcattgtttctggt Protospacer . ** *******************. ***.*.*
198. spacer 1.3|55691|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to LR214965 (Mycoplasma fermentans strain NCTC10117 genome assembly, plasmid: 11) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
aattttctaattctataagttcattaattccgat CRISPR spacer gtttagctaattctataagttcattgtttctggt Protospacer . ** *******************. ***.*.*
199. spacer 1.8|56049|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to KY794641 (Staphylococcus phage vB_Sau_CG, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
----cttaaaatctaattgcattgttatcaattccttta CRISPR spacer ttggttta----ctaatttcatggttatcaattcctttt Protospacer .*** ****** *** ***************
200. spacer 1.8|56049|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT080601 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW72, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
----cttaaaatctaattgcattgttatcaattccttta CRISPR spacer ttggtttaa----taatttcatttttatcaattcctttt Protospacer .**** ***** **** **************
201. spacer 1.8|56049|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT080589 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW26, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
----cttaaaatctaattgcattgttatcaattccttta CRISPR spacer ttggtttaa----taatttcatttttatcaattcctttt Protospacer .**** ***** **** **************
202. spacer 1.8|56049|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT080585 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW18, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
----cttaaaatctaattgcattgttatcaattccttta CRISPR spacer ttggtttaa----taatttcatttttatcaattcctttt Protospacer .**** ***** **** **************
203. spacer 1.8|56049|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT080591 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW29, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
----cttaaaatctaattgcattgttatcaattccttta CRISPR spacer ttggtttaa----taatttcatttttatcaattcctttt Protospacer .**** ***** **** **************
204. spacer 1.8|56049|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to LR215721 (Staphylococcus phage Stab22 genome assembly, chromosome: I) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
----cttaaaatctaattgcattgttatcaattccttta CRISPR spacer ttggtttaa----taatttcatttttatcaattcctttt Protospacer .**** ***** **** **************
205. spacer 1.8|56049|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to LR215721 (Staphylococcus phage Stab22 genome assembly, chromosome: I) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
----cttaaaatctaattgcattgttatcaattccttta CRISPR spacer ttggtttaa----taatttcatttttatcaattcctttt Protospacer .**** ***** **** **************
206. spacer 1.8|56049|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to AB853331 (Staphylococcus phage S25-4 DNA, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
----cttaaaatctaattgcattgttatcaattccttta CRISPR spacer tctgtttaa----taatttcatttttatcaattcctttt Protospacer .**** ***** **** **************
207. spacer 1.8|56049|35|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_022920 (Staphylococcus phage S25-3 DNA, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
----cttaaaatctaattgcattgttatcaattccttta CRISPR spacer tctgtttaa----taatttcatttttatcaattcctttt Protospacer .**** ***** **** **************
208. spacer 1.20|56048|36|NC_018608|PILER-CR matches to KY794641 (Staphylococcus phage vB_Sau_CG, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
tcttaaaat-ctaattgcattgttatcaattccttta CRISPR spacer -cttggtttactaatttcatggttatcaattcctttt Protospacer ***.. * ****** *** ***************
209. spacer 1.3|55691|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_013940 (Deferribacter desulfuricans SSM1 megaplasmid pDF308, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
aattttctaattctataagttcattaattccgat CRISPR spacer ctttgactaattctacaagttcatttattctatt Protospacer ** *********.********* ****.. *
210. spacer 1.7|55976|37|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT104467 (Pseudomonas phage MR4, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
tcatactagcaccccactctctactgaac-aagtatca CRISPR spacer atttactagcaccccactcactacggaacttagcagc- Protospacer . **************** **** **** **.* *
211. spacer 1.7|55976|37|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ749827 (Escherichia phage ECBP5, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
tcatactagcaccccactctctactgaac-aagtatca CRISPR spacer atttactagcaccccactcactacggaacttagcagc- Protospacer . **************** **** **** **.* *
212. spacer 1.3|55691|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP028886 (Borrelia turcica IST7 plasmid lp32-A, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
aattttctaattctataagttcattaattccgat CRISPR spacer tcttttctaattctttaagtttattattcttttc Protospacer ************ ******.**** *... .
213. spacer 11.1|2122296|34|NC_018608|CRISPRCasFinder matches to NC_027332 (Acinetobacter phage YMC13/03/R2096, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
tgctggtaccacgatgcgtcttgatgtagtgcta CRISPR spacer gatcaataccacgatgcgtcttgaagtggtagaa Protospacer .....****************** **.**. *
214. spacer 11.1|2122296|34|NC_018608|CRISPRCasFinder matches to KY000079 (Acinetobacter phage AM24, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
tgctggtaccacgatgcgtcttgatgtagtgcta CRISPR spacer gatcaataccacgatgcgtcttgaagtggtagaa Protospacer .....****************** **.**. *
215. spacer 1.3|55691|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP052077 (Ralstonia solanacearum strain FJAT445.F50 plasmid Plas1, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.647
aattttctaattctataagttcattaattccgat CRISPR spacer tgagacggaatactataagttcattaactccgga Protospacer . . *** ***************.****.
216. spacer 1.3|55691|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP052079 (Ralstonia solanacearum strain FJAT445.F1 plasmid Plas1, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.647
aattttctaattctataagttcattaattccgat CRISPR spacer tgagacggaatactataagttcattaactccgga Protospacer . . *** ***************.****.
217. spacer 1.3|55691|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP052125 (Ralstonia solanacearum strain FJAT1452.F1 plasmid Plas1, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.647
aattttctaattctataagttcattaattccgat CRISPR spacer tgagacggaatactataagttcattaactccgga Protospacer . . *** ***************.****.
218. spacer 1.3|55691|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP052123 (Ralstonia solanacearum strain FJAT1452.F50 plasmid Plas1, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.647
aattttctaattctataagttcattaattccgat CRISPR spacer tgagacggaatactataagttcattaactccgga Protospacer . . *** ***************.****.
219. spacer 1.3|55691|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP052081 (Ralstonia solanacearum strain FJAT442.F50 plasmid Plas1, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.647
aattttctaattctataagttcattaattccgat CRISPR spacer tgagacggaatactataagttcattaactccgga Protospacer . . *** ***************.****.
220. spacer 1.3|55691|34|NC_018608|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP052083 (Ralstonia solanacearum strain FJAT442.F1 plasmid Plas1, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.647
aattttctaattctataagttcattaattccgat CRISPR spacer tgagacggaatactataagttcattaactccgga Protospacer . . *** ***************.****.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
348092 : 392677
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_018608|348092:392677|DBSCAN-SWA TTTAGTACACAAGTTTTTCTAATTTTTGCTCTAACTCTCTGTCCATTTTCTCTGTTACATGTGTATACACCTTTATAGTCGTTTTTTCATCTGTATGTCCTACTCTTTTCATAATTGCTTTTAACGATATATTCATTTCCGCCAATAAACTTATGTGTGTATGCCTTAGTGTGTGAGTAGTAACTTTTTTATTTATATTTAATGATTCTGCAGCTGAGGACAATCGTTTGTTTATCCTACTGCCTTGCATAGGATTTCCTTGGCAAGTTGTGAATATAAACCCTCTATCAACATAGCTTGGTTCCCATTGTTGCATCTTTTTATTTTCTAACATTATTTTTTTCAATACATTTGCTATCCTTGAATTGATAGCGATTTTTCTTTTTGAACCTGCGGTCTTCGTAGTATCTTTGTGACCAAATCCAGCATTACATTTGATTCTGTGAATAGTGCCATTAATATCGATCGTTTTATTTTTGAGGTCTACATCTTTAACTTGGAGCGCTAATAACTCACCTATGCGCATACCTGTTAAAGCTTGAACTTCAACAGCCCCAGCAACTAAAATACGAGCTCTATACTGCATGTTATTATCGTTCAGTATAAAATCGCGTATCTGTATTACCTGTTCCATCTCTAAATAGTTGTACATTTTCGCTTCTTCTTTTTCTATATCTTCTATCGTCTTACTCTTCTTTGGTAGTGTGACGCTATTTAATATGTGTTCGTTTGGATAATTGTAAAATTTAACGGCGTATTTAATAGCTTCTTTCATATGTCCAAGTTGACGCTTTACCTGATTTGCAGAATATACGTTTGATAATTCGTTAATAAATGTTTGCATGTACTTTGTATCAATTTTGTTTAAAAGTAAATTTTGAGAACTGTTCTTTTTGATGTTTTTGATTCTTGTTTTCAAATTATCAAGCGTCGTTACTTTAAAGCCAGATGTTTTTATATGATATTCAAGCCATTCATCTAATAACGCGTGAAAAGTCAAAGTTTTTAATTCGCTTGACGACTTGTTGTTCAGTTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTAAACGAAACATTGCTTCTTTTTGAGATTGTTTTGTATTCTTGTTCAACACAACACTTACGCGCTTCCATTTATCTGTGTATGGATCTTTGTACTTCTCGTAATATCTGTATTTAGTTTCGTTATTTTTGTTTTTAAATTTTTCAATCCACATGTTTATACCTCCTGTAGGAACGTACGTTCTGTAAATTTGTAAAAAATAATAAGGGTAGGTGGGCTACCCAAAATTTAGTACTAGGTACTAAATATGTTATAATAAAATAAAAAGTAGGTGATAAGATGACTCAATTTCTAGGGGCGCTTCTTCTTACAGGAGTTTTAGGTTACATACCATATAAATATCTAACAATGATAGGTTTAGTTAGTGAAAAAAACAAGGTTATCAATACTCCTGTATTATTGATTTTTTCTATTGAAACATGTTTGATATGGTTTTATAGTTTTATAATTTTTAATAATGTTGATTTAAAAAATTTGAATTTAATTCAGTTGCTTACAGGTCTAAAAGCAAATATTTTGTTTCTATTTATTTTTGTTTTAACAGTGTTTGTATTTAATCCTTTAATTGTTAAATTTATTATCTGGTTAATTAATATAACCAGAAAGTTTATGAAATTGGATTGTATAAGCTTATTAGACAAAAGAGACAAGTTGTTTAATAACAACGGTAAACCAGTATTTATAGTTATTAAAGACTTTGAAAACAGAATCATTGAAGAGGGTGAACTTAAAACCTATAATTCAGCTGGTAGCGATTTCGATTTACTAGAGGTTGAGCGACAAGATTTCAAAGTATCTGATTTACCGTCAAACGATGAATTGTATATTAAACATACACTTGTAGACCTTAAACAACAAATTAAATTGGATTTATATTTAATGAATGAATATTAATCTTTTTTCTTAGCTTTTTCTGATAAAGTGCTTTTTAAGTTTTCGCTGGCACCCGGCTTTTCAAAACTTTTGTTTATTGGGTTACTACGGGTAGCTTCTTGTTTTTTGTTTTTATCCGCCATAAAATTCTCACCACCATTCAACGTCTACACTAGTAGGCGTTTTTTGATTTTTATATTAAAGGGCTATAAAAAGCTGTTAATACTTCAATTCTTTAATCCACATATATTTAAAAGTGAGGTAGTAGGTAATAAATATAAGACTTAAAGTTAAGATTGCTTTTTTCATGTCAATTTCTCCTTTGTTTATATTTATATTAAATCACTAAATAGACGTTATTAATCACAATACAATTAATTGATTGTAAGATACTTAGTCGTATAATTCTATATACCTATTAGTAAATTCTTCTGCTGTTATTTCTCCATTTTCTTTTTGTTGTTGAAGTTTAGAAGCTTCTTTTTGAATTGCATCGTATTTTTCACGAGAATACCCATATTTTTCCATCTCTTTATAATTAGCTTCGTTTATTTGTTCTTGTTGCTGAGGTGTGACACAACCACCAACTGTGCATTGTGTACCATCAGGTTTTGTGTAACCTATAACGTCACCTGCGCCTTGTGCTTGGTACCAAGTATTACCATCTGCATCTACCATGCCGTTAACATTGTGACCATTTTTTACTCTTTGTGATATTTCGTCTTTAGTTAAAGGTCTATTGGTTTGTTGATCGTTGTTAACGTTTGTGTTGTTCTCGTTGTTTACTTGATTATTGTTATCGTTTTGATTAGCATTTTCTTTTTTCGCTTCTGCTTTTTCTTTAGTTTCTTTCTTTTTATCTTTGTTATCTTTCTTTGTTTCAGTTTTTTTGCTTTCCTCTTTCTTATCGCCGTCGTGGCTACCACAAGCGCCTAAAACTAACGCACTCGCTAATGTTAAACCTAATAATCTTTTCATTTTAATTTCTCCTTTGTTTATATTTCTTTATATTTAAAAACTCTCAATGGCTCAAATGTAATTGAGTATTCGCCGTAGTGAGTCCCAATACCATATATCTTTTTATATTGTTCTATTGCTTCTAATATGTATTCTTCACTCAATTGCAGATACTCAGACAACTCATACAAGTTACGTACACCATAATTGTAAGCTTCCACAATTTCGCGTAACGGGACTGCTGAGATAAAGCCGTGTCGCCTTGCGTAATTTTCGAACTTGCGATTGTTGAATTTCGAGTAATCGGCTATATCACCGTATGTAAGTTTATTATGTGCTAATTCTTCAAAGAGAATTCCTGCCTTTTCTCTATCTGATAAGCCACGCTTTATTAAAATTAAATCTCCTAACCATACCCCATCCAAATTATCTGGAAGCACATCAGCCTCTCTTATTTCAATATAATCATGTTGTATTAAAGTTTCTTCATATAATCCCATCTGATACATCCTTTACTTACGTTTGCTTCTTATATAATCTGCATAATCTAAAACTCTTTGCCATTCATCATCTGTCAATTCTCCTTCAAGGTGAGCTGCACGATGTTGTACTTCATCATCGTTTTCTTCAACCCACCCCATTAAATATGCAGGATTAACATTTAATGCAGTAGCTATACTTTCTATAGTATCGTTTTTTAAATTTTTGATATTTCCGCTTTCATAACGCTGTACAGTAGCTTCAGTTTTACCAATTTTTCTTCCTAGTTCGGCCAAAGTCATACCTTGTTTTTCTCTTGATTGTTTCATTCTTTTTGAAAAGCACATCGTAATACAGCTCCTTTTACTTGATAGTTCTATTATAAGGAAAACTTTCGGCATTTGCAATATTTTTCTAAAAAACTTTCGTAAAGTGCTTGACCTCTTTCGTAACATCATGATAAGATTACTTACGTAATACGAAAGGTGGTGAAAAGAAATGCCTATAGATGCTAAACTTTTGAAATCTAAAATGGCTTTGAAAGAACATAACATCAAAACCCTTTCTGAAGAAATTGGTGTTAATAGAGATACTTTATCTAATATGATTCACGGGAGAACGAAACCGTCGTACCCGGTAATAAATGGTATTTATTTTGCGTTAGAATTGACACCTCAAGAAGGAAGAGATATTTTTTTTAACGAAGACTTACGCAAAAAGAAAGTTTTAACTTAAGGAGGAAACTGAAATGCAAGCATTACAAATAGTAGAACAGAACGAAACACATTATGTAGACAGTAGAGAAGTTGCGGAAATGATAGGAAAGCGACACGACAATTTAGTAAGAGACATTAAAGGTTATATCAAGGTTTTAGAGGACTCCTCAAAATTGAGTAGTCATAATTTCTTTGAAGAAAGCACCTATGTTAATTCACAAAACAAAGTACAACCTTGTTACCTACTAACCAAAAAAGGTTGCGACATAGTAGCAAACAAGATGACAGGTAGTAAAGGCATTTTGTTTACTGCAACTTATGTTGATGCATTTCATAAAATGGATGAATACATTAAACAACAAGCACAGCTTAATGTACCACAAACACCAATGCAAGCATTAGAGATGATGTTCAAAGCACAAAAAGACCAAGAACAGTTTAACAAACAAATGCAACAAGAAATCACAGGCATTCGTCACATTGTCGGTATTGAAACGAAAAACTGGCGTAACGACACAAACAAAATGTTATCTGCGATTGCACAACATTTAGGTGGCGGAGCAATGCACCAGAAAGTTAAGTCTGAAGCATATAAAGCTTTAGAAGAAAAAGGACGCTGTAATTTAAAAATTCGTATGCAGAACCGCAAAGGCAAAATGCTAGCGAATGGTGCAACGAAAACCCAGATTAACAAGTTGTCAAAATTAGATGTGATTACTGATGAACCTAGATTGGTTGAGATATACATTTCAGTGATTAAGAGTATGGCGATTAAATACGGTGTAGATATTAGCCAATTTGAAATTTAAACAAACATCTTAAAAGGAGGAACAACAAATGTTACAAAAATTTAGAATCGCTAAAGAAAAAAGTAAATTAAAACTCAATTTACTAAAACATGCAAACAGTAATTTAGAAACA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66 | Staphylococcus_phage(93.94%) | plate,head,capsid,integrase,portal,tail,terminase,holin,protease | attL 347982:347999|attR 393412:393429 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
457292 : 469137
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_018608|457292:469137|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_018608|457292:469137|463259_463484_+|WP_001058503.1|DBSCAN-SWA MNNEQKEVIQDIYNTLEAVAYNTSMEYIHNCVDGKKEWTENVNREEHLQAIIEWALQQIENNFDFDNDTEVEEL >NC_018608|457292:469137|462813_463074_+|WP_000080597.1|DBSCAN-SWA MSQLLSEQASQQLVNSIVDIAEKIALEKVKQSRKRYLIQKEVMEEYNVTHKVITEWEMMGLRKVKIGKTIRYDRQDIENVIEQMKN >NC_018608|457292:469137|468645_469137_+|WP_000253082.1|DBSCAN-SWA MVSDFESNDKITEVELLMHYNPKVINSKIKAMRSQIESLYHLNMNHVITNDNDMLVSVSYPLDKLVLYIIEEKDKFEYYMKTAQDRLNLFKDIIKNYSENEQQDVMRYMLSSGKVKNEGVIERLKVDIYKVESRKRQERQNQREELHRIEFNKHLEQVKKELS >NC_018608|457292:469137|460418_461555_-|WP_000592970.1|integrase|DBSCAN-SWA MIKKYKKKDGSTAYMFVAYLGTDPITGKQKRTTRRGFKTEREAKIAEAKLQTEVSQNGFLNNDITTFKEVYELWLEQYQNTVRESTYQRVLTLFDTAILEHFQDVPIKKITVPYCQKVINKWNKKYSDIKAIRIYTSNVFKYAVSLKIIVDNPFAHTKAPRKKEAQQDASTKYYSSDELKQFLTFVEDDPLYYAIFRTLAFTGFRRGELMALTWKDIDFTKQTISINKTCARGANYKLIIQEPKTKSSHRTISIDDKTASVLKSWRTHQRVESLKYGHNTSDKHQHVFTTVRDNKPLYPEHCNKALDLICEKNSFKRIKVHGFRHTHCSLLFEAGLSIQEVQDRLGHGDIKTTMDIYAHVTEKQRDQVADKFAKYINF >NC_018608|457292:469137|463120_463267_+|WP_000773833.1|DBSCAN-SWA MKLNLLYITLTSLLTILLLAISNTYVAFSTYALLITYGFNLTGGLENE >NC_018608|457292:469137|457292_458759_+|WP_000264071.1|DBSCAN-SWA MWESKFAKESLTFDDVLLIPAQSDILPKDVDLSVQLSDKVKLNIPVISAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVIHKNMGVEEQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEESVYEAEALMGKYRISGVPIVDNKEDRNLVGILTNRDLRFIEDFSIKIVDVMTQENLITAPVNTTLEEAEKILQKHKIEKLPLVKDGRLEGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEHGRLLVAAAIGISKDTDIRAQKLVEAGVDVLVIDTAHGHSKGVIDQVKHIKKTYPEITLVAGNVATAEATKDLFEAGADIVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCATEARKHGKAIIADGGIKFSGDIIKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGATEIFQGRQYKVYRGMGSLGAMEKGSNDRYFQEDKAPKKFVPEGIEGRTAYKGALQDTIYQLMGGVRAGMGYTGSHDLRELREEAQFTRMGPAGLAESHPHNIQITKESPNYSF >NC_018608|457292:469137|462540_462768_+|WP_000494396.1|DBSCAN-SWA MFTKKSELKQQFLKPKTKLKEERLKRGLSATYLAQLIGIDRRQYESKEKGLFSFHDYEIKIISEFLDIDKEVFFI >NC_018608|457292:469137|463484_463784_+|WP_001103964.1|DBSCAN-SWA MNWEIKSLFSDLKLLKDSFEDLKDNHGWYFDKLYPHEPNHVLNKTEAIKEGLSYHERRIHNNQMFDLLHLYTKQFDSIIQKFHELEKASSFADQSQDNA >NC_018608|457292:469137|458783_460325_+|WP_000424968.1|DBSCAN-SWA MEMAKEQELILVLDFGSQYNQLITRRIREMGVYSELHDHEISIEEIKKMNPKGIILSGGPNSVYEEGSFTIDPEIYNLGIPVLGICYGMQLTTKLLGGKVERANEREYGKAIINAKSDELFAGLPAEQTVWMSHSDKVIEIPEGFEVIADSPSTDYAAIEDKKRRIYGVQFHPEVRHTEYGNDLLNNFVRRVCECKGQWTMENFIEIEIEKIRQRVGDRRVLCAMSGGVDSSVVAVLLHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEGDMVMEQFGEGFNMNIIRVNAKDRFMNKLKGVSDPEQKRKIIGNEFVYVFDDEASKLKGVDFLAQGTLYTDVIESGTKTAQTIKSHHNVGGLPEDMEFELIEPINTLFKDEVRKLGIELGIPEHLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEDKLEIVRESDAILRQVIREEGLEREIWQYFTVLPNIQSVGVMGDYRTYDHTVGIRAVTSIDGMTSDFARIDWEVLQKISSRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPSTIEWE >NC_018608|457292:469137|467421_468480_+|WP_000657541.1|DBSCAN-SWA MKEFKEQFGYQLSNFDDMDIKGYANLYQKDIGKDVSMIEQGLKQLSITETEVLLPEQINKKLLGVLNMNEVNQSSNTWVGTLTKQLVSSENNFNIQELPTARKEVFKELLVNRELPQTLRDVITITDDEHVESIPALSYIKDKLATNGIELSLNGSSKYFDRREGHIYTEVADSVVHGSDRTLDDLLKEIFINECVSYETTLLLDKNNASGLIDKDNQDLSLYNQGIKEVSNTSMYDGIKQAMKDIPQTFRRKVSVVMNTEHHDKLIKELAQMGLGTLAGDLTKLFNVSHVVVTDDAQDIFVGDFGHAIYAKYEPIMYNKKKQALKGVYQFALNYVFDIKIVPELLRIVKVK >NC_018608|457292:469137|463874_466238_+|WP_000985239.1|DBSCAN-SWA MAIKKKDRIIGVKELEIPQELKLVPNWVLWRAEWNEKQQNYGKVPYSINGYRASTTNKKTWCDFESVSIEYEVDEQYSGIGFVLSDGNNFVCLDIDNAIDEKGQINSELALKMMRLTYCEKSPSGTGLHCFFKGKLPDNRKKKRTDLDIELYDSARFMTVTGCTIGQNDICDNQEVLNTLVDEYFKENLPVNDVVREESNTNMQLSDEDIINIMMKSKQKDKIKDLLQGTYESYFESSSEAVQSLLHYLAFYTGKNKQQMERIFLNYNNLTDKWESKRGNTTWGQLELDKAIKNQKTIYTKSIDEFNVIPQGSKDVKQLLNQLGHEERTKMEENWIEEGKRGRKPTTISPIKCAYILNEHLTFILFDDEENTKLAMYQFDEGIYTQNTTIIKRVISYLEPKHNSNKADEVIYHLTNMVDIKEKTNSPYLIPVKNGVFNRKTKQLESFTPDYIFTTKISTKYNPNVVRPNLNGWDFDHWLYEIACADKEIVTLLWEVINDSMNGNYTRKKAIFFVGDGNNGKGTFQELISNLVGYKNVASLKVNEFDHEFKLSVLEGKAVVIGDDVPVGINIEDSSNFKSVVTGDSVLVNVKNKQPYRTEFRCTVIQSTNGMPKFTDKTGGTNRRLLIVPFNADFNDSNENVDIKEKYLKDNHVLEYVLYKAINLEFDRFTIPQVSKKMLEIYKQDNDSVYDFKIEEFDQWNIQKVPKKVVYYRYRAFCEENGYMGKMSDRTFYRRFEKYLGKEWNTDAKCRYSSIDELEEIVGYINRTLMPFGQQHRSYKNENLKIV >NC_018608|457292:469137|461638_462424_-|WP_000819103.1|DBSCAN-SWA MAELPTHYGTIIKTLRKYMKLTQSKLSERTGFSQNTISNHENGNRNIGVNEIEIYGKGLGIPSYILHRISDEFKEKGYSPTLNDFAKFDKMYSYVNKAYYNDGDIYYSSYDLYDETIKLLELLKESKINVNDIDYDYVLKLYKQILSTDTEKSIINYETLANTRKSSDKKREVTIEEIGEFHEKYLKLLFTNLETHNDRKKALAEIEKLKEESIYLGEKLRLVPNHHYDAIKGKPMYKLYLYEYPDRLEHQKKIILEKDTN >NC_018608|457292:469137|466659_467004_+|WP_001081424.1|DBSCAN-SWA MNRNRMKQIILEYIKNNDSTSFVEIENVFEEQGFKYKGNGAYTSGNHKNIIFWMGWNEEAFNIVADLKRDGLIEMQICPPMYYLIDGKGLRLPIVKNKNIKIDHWLPVTFSLVN >NC_018608|457292:469137|467228_467435_+|WP_000884055.1|DBSCAN-SWA MLDHTNESVKRVFKYRDKQELLNKYHELLDKYFLHNISFYEEDKNNERIYGLVVHTKNKLGDEDYERV |
14 | Staphylococcus_phage(33.33%) | integrase | attL 460314:460334|attR 473819:473839 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
796787 : 804608
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_018608|796787:804608|DBSCAN-SWA ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTTACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTTCGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTGTTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTGCGGTTCTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTTGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCGTTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCGTGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAACGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCGTAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGTCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAGTAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCAAGTGGAACAATAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCTATGACTGGTACTAGACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCGTAGCCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTAAGCAACATAATGCGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGCTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTACAATCTTATGGAATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGATAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCAGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCGCCTAAAATTAATACAGAGGCAACAGCACCAACTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACTCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGTCAAAATAAGAGGAGGGCGGTTTTTTTAAGTAAGAAAATATTTGTCTGAACTACTTATCACTAAAAAACACTTCTGATATAGCGAATTAAGAATATCAGAAGTGTTTTTTAGTTTTGGTATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCAAAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTATTATTATTTTCAGCAGATTCATCTAAGCTATTAAATGTTGAAATAAATAACATAATACCACCAATGATGAAAATGGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATAGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTACTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCTACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACGCATTGTGCAATCACTTCATCTAATTTTTTTAAATCAGGCGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTGCCTTGTGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGGTTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCCTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTTACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGACCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACGACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGGCTAAAGTTCACTAAAAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACACGGAATGTGATGTGCAGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_018608|796787:804608|801859_802528_-|WP_000446724.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >NC_018608|796787:804608|800038_800623_-|WP_000637685.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDESAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLFWQKVYKF >NC_018608|796787:804608|797842_798529_-|WP_000149347.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMTEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >NC_018608|796787:804608|802879_803473_+|WP_000604516.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAVEHITFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NC_018608|796787:804608|801438_801858_-|WP_000941336.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >NC_018608|796787:804608|803456_804608_+|WP_001217786.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCSHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >NC_018608|796787:804608|798503_798977_-|WP_001037805.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIIVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >NC_018608|796787:804608|796787_797843_-|WP_000244415.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NC_018608|796787:804608|799317_799758_-|WP_001093557.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAVASVLILGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >NC_018608|796787:804608|800721_801435_-|WP_001062968.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVIAQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
816578 : 830894
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_018608|816578:830894|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_018608|816578:830894|816578_817637_+|WP_000663034.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPSHVPVLIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEHFIPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NC_018608|816578:830894|820261_821767_-|WP_000193750.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVILAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NC_018608|816578:830894|830132_830894_+|WP_000616865.1|DBSCAN-SWA MIQVGNLTKTINNQMILDDISIEIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDEGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHEIVNDALDLLQLQDIRKRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVAMKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMDIQIEHIRNQRICLYFKD >NC_018608|816578:830894|819074_819992_-|WP_000429003.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKAKDYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTYDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILSANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISITTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NC_018608|816578:830894|826880_827852_+|WP_000562498.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NC_018608|816578:830894|824294_824693_+|WP_000692521.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NC_018608|816578:830894|822106_822607_-|WP_000930016.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEQMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NC_018608|816578:830894|828221_829193_+|WP_000876311.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGKILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDIFHLSDSQQNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSISGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >NC_018608|816578:830894|817795_818338_+|WP_000197271.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPYAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >NC_018608|816578:830894|829179_830136_+|WP_001245567.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTFLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVIILVITIFLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWIVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >NC_018608|816578:830894|824655_826761_+|WP_000855505.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NC_018608|816578:830894|822626_823493_-|WP_001068490.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGKLSSQPLLLTRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQTQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKVIKK >NC_018608|816578:830894|820082_820190_+|WP_014936998.1|DBSCAN-SWA MVINEIDVYRVGRENIVIAVYNEHIKFLFILISCI |
13 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_5 |
970555 : 993784
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_018608|970555:993784|DBSCAN-SWA 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23 | Streptococcus_phage(94.74%) | integrase | attL 959011:959028|attR 998059:998076 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1020708 : 1060453
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_018608|1020708:1060453|DBSCAN-SWA 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36 | Streptococcus_phage(50.0%) | bacteriocin,holin,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1092505 : 1100978
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_018608|1092505:1100978|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_018608|1092505:1100978|1094806_1095070_+|WP_000848351.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLEDEKENA >NC_018608|1092505:1100978|1099380_1100409_+|WP_000030815.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIETNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDVSRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NC_018608|1092505:1100978|1095071_1095743_+|WP_000666799.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NC_018608|1092505:1100978|1092505_1092988_+|WP_001807816.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGIDIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILATRMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >NC_018608|1092505:1100978|1097903_1099388_+|WP_000483707.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKIKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKMLAQESPVKADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NC_018608|1092505:1100978|1094102_1094807_+|WP_000174055.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIATDKDIETLKTKALEINQVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >NC_018608|1092505:1100978|1095735_1097925_+|WP_000032750.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYEDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKNYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLADSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPIVGMVGLIENVDYLNDFQPQVGDKLYVIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESIDLSSEVKKGESIKTAIRQGVLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSLIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NC_018608|1092505:1100978|1092974_1094099_+|WP_001010409.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVVVLDPAEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITYFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >NC_018608|1092505:1100978|1100411_1100978_+|WP_000238668.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLDSFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1357219 : 1363482
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_018608|1357219:1363482|DBSCAN-SWA 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TTATTAACATCTTACAACAAAGTGCCAATTATGGGCATTTTTTATGAATTTTTATAGGTGTTGCACTTAATATTACAATCCGTCATGTAAAAAAACGAAAAAAGTTTTAAAAAAAGTGTTGGATACAAAACAGGTTGGAAAGAGAAGAAAAAATGACAAATATCGCAAAAGCCAAAAGCGAAATCTTCCGCAACTACACTTTAGGCTTTGCAACACTTGCCACAATAATAAAAATGTTTTTTATAGAGGGGGATATCCCCTCCCTCGTATTATATTACGAGGTGATGAAAATGACAAACTTAACTAAAATTAGAATAATAATCTTTATTAATTATCTAATCGGAATTTTAGCTTTAATATTTGCCTTTTATATAATCTTAATGTCAATAGCGGTTTAAAAATGCTGTTTTATGGCGGTTTGAAAATGTAGTTTTTTAGCAGCTTAAGATTGTCGTATATTTAATGATTTTTCGGTTTTATAATCTTTTAATCGATATGATTCTCCAGTAATTTTAAATACTTTTGAATGGTGAACTAACCGATCAATTATAGCTGCTGATACAATCTTATTACTAAATGACTCTCCCCAACTCGAAAATGTAATATTAGTCGTAATTATTGTTGATTTCATTTCATATTTTAGTGACATTAACTGGTAGAATAAATCAGCTTGTTCTTTGGTGATGGCAGAATAACAAATTTCATCAATGATAAGTAACTCTATTCTGCTTAATTGTTTTAATGTTTTATTAATGATTTCTTTGGAATCTGTGACAGTTAATAAGTCTATTAATTCTTTGAAAGTATAGAATCTAGTCTTTATATTTTGTTTACATGCCTCAATTCCTAATGAGATTGTTAGGTGTGTTTTACCAACAACACGGTTATCTAAGAAACAAATATTTATATTATCTTCAAAAAATGTTATTTTTTTAGTCTCATTTTGTATTTTATTTTTACAGTATTCTCGTAGAATAGTATATTTACCTTCATATCCCTTTTCCTCTATATATTTAAAAATGGCCATAGCTGTATATCCTAATTCAATTTTTTTATTATTAATTTCTTTAAATGAATCTAGTTTTGATGTTTACTTATTTTGTTGTCTTTTCTTCAATCGTTCTAATTCATTTTCTTTTCCTGCTTCATAATATTTTTTAACTGTTATTGGATCACAATTATATTGTCGACCAAGCTCAGCATAATTTGGTTTAATACCTTTCGTAATGTAAAATAGCACTCCTTCATAAATGTCATGTCTCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_018608|1357219:1363482|1363308_1363482_-|WP_001215406.1|DBSCAN-SWA MRHDIYEGVLFYITKGIKPNYAELGRQYNCDPITVKKYYEAGKENELERLKKRQQNK >NC_018608|1357219:1363482|1360737_1361154_+|WP_000477489.1|DBSCAN-SWA MFKVNYSILSYYPDIYLHSNLAVGVAFEIIGESYHKNEIKFITQRRKISSFDDEIDNLVLINMFLDGLKCEFEQTNQSIKNYKKKFVNNFYFENIEYKMFDSLKEVNNFIEKTYKYVLHIGLDKKERLKKTEKELLNS >NC_018608|1357219:1363482|1361240_1362188_-|WP_000121214.1|transposase|DBSCAN-SWA MSYNHLTLTERARIEVLRQENYSLRSIARKLKRSVSTISREISRNNLNQSYQAETAQKNYETKRKLCGRPTRFTPELGNIIKYYLKCHWSPEQIVGRLLQNQICFKTIYRWINSNMINFELISCLRQKGKRQKPKETRGKFNIGRPISQRPKEVKKRNTFGHWEADTIVSSRGKSKGCIATFAERKSRYYYCVLMPDRSSNSMETAINNLIKHLPKGAVKTITVDRGKEFSCYQNIENQFNINVYFADPYSAWQRGTNENTNGLLREFFPKKTDLAKVNQEQLNYALDSINYRPRKCLNWKFPYEVLCDELLHLN >NC_018608|1357219:1363482|1359538_1359649_+|WP_001788716.1|DBSCAN-SWA MKMTIKVRKTNKKEKIEFLIGTFIIILVILGFKIMK >NC_018608|1357219:1363482|1358631_1358838_+|WP_001002341.1|DBSCAN-SWA MNEIETIISEIEKLLTNNTPYSISKNSGVPRQTVTDLKVGNTKIKDAKFKTIIKLYEYQKLSENNSEC >NC_018608|1357219:1363482|1360041_1360227_+|WP_000006110.1|DBSCAN-SWA MSEYKKKIIELIESNLTGYEISKKTGVSQYVLSQLRQGKREVDNLTLNTTEKLYEYANKVL >NC_018608|1357219:1363482|1358103_1358331_+|WP_074347689.1|DBSCAN-SWA MFTKITNQFKEIYNTIEKLLNDKSISNYRINQDTGVSYGGISELRSGKRKVNNLTLETAEKLYNYQKQLEIMIED >NC_018608|1357219:1363482|1362660_1363245_-|WP_000974166.1|DBSCAN-SWA MAIFKYIEEKGYEGKYTILREYCKNKIQNETKKITFFEDNINICFLDNRVVGKTHLTISLGIEACKQNIKTRFYTFKELIDLLTVTDSKEIINKTLKQLSRIELLIIDEICYSAITKEQADLFYQLMSLKYEMKSTIITTNITFSSWGESFSNKIVSAAIIDRLVHHSKVFKITGESYRLKDYKTEKSLNIRQS >NC_018608|1357219:1363482|1357219_1357417_+|WP_001807853.1|DBSCAN-SWA MNCYDEIYNTIKKLIENKEISSYQINKDTGISYGNINAMRRGERRIENLSLKNAKILYEYAKKVL |
9 | Staphylococcus_phage(57.14%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1637007 : 1645319
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_018608|1637007:1645319|DBSCAN-SWA ATTAATTACAACATTCTCGATTATGCTGATGATCGACAAAACGTACAGGATGTCCATAAATTTTTGAAATTTCAACTTCATCAAGTGATTTAAACTCATCAGTTGTACCATGGAAATGCAAATGCTTATTTAAACATGCTACTTCAGTAGCAGTATCTGCTACAACACCAATATCATGAGTAACTAAGATAATAGTGATACCTTCTTGTTTTAATTGATCTAAAGTATTATAAAATTCACTTACATGTTTTGCATCAATACCATTCGTCGGTTCATCAAGTACTAATACTGCAGGTTCTGAAATCAATGCTCGAGCAATCATTACACGTTGTTGTTGACCACCTGATAATTCTGCTATATTTTTATGAATTAAATCACTTATATTCAGTCTTTCTAGTACTTTAATCACTTTTTCATTATCTTTGCTATTAAATGTTTGGAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAATCCTAGAATCAACTTCAATAATGTTGATTTACCAGCACCATTTGGTCCAACAATTGCTAAAAATTCACCTTTATTTATTTTAATGTTTATATTTTCTAACACTTTTTTATGATCATAGTAGTAATTGACATTTTTCAATTCAAAGACTGGTGTCATCGTATTCTCACCTCGCATTCAACTATACAACTCCTGGTAACATATGTAAACAGTAATGTTTACGACTCAAAATTAGACAAAATAAAGAGATATGCCCCCTTCAAGTTTTATTTATCGCATTTCTTGAAGAGAGCATTATCATCTTATTGTTGCATAACCTTATTTTTTAATTCTGGGTCAAATTGCTGTTGTTTTAACATTTCAATTTCAAGTTTATATGGCGGTTTTTTATTTTTCTTATCTTCACCAACATAAGGTGTTTCTAAGATTTTCGGAATATCTTTAAAACTATCATGATGCACAATGTAATTTAATGCATCAAAACCAATGTAACCGAAGCCAATATTTTCATGTCGGTCTTTTTGAGCGCCACGGTCATTTTTAGAATCATTGACATGAACAACTTTAATTCTGTCGACTCCAATGATTTTATCAAATTCATTTAATACGCCATCAAAGTCCTCTTTCACATTATATCCAGCATCATGCGTATGACATGTATCAAAACATACTGATAAACGTTCGTTATTATGAACTCCATCAATAATACGTGCTAACTCTTCAAACGAGCGACCAATCTCTGTACCTTTACCTGCCATCGTTTCAAGCGCAATACGTACATTATTGTCATTCGTTAAAACTTCATTTAATCCTTCAATAATCTTATTAATTCCGGCATCAACACCAGCTCCAACATGTGCACCTGGATGTAATACAATATCTTTAGCGCCTATAGCTTGCGTTCTTTCAATTTCTTGTTGCAAGAAATCTACACCAAGATTAAACGTTTCTGGTTTGGTTGTATTTGCAATATTAATGATGTATGGTGCATGAACAACAATATTAGATAAGCCATATTTTTCCATCACTTCATGACCTTTAGTTATATTTAAATCTTCAATACTTTTACGGCGCGTGTTTTGAGGTGCACCAGTATAAATCATAAATGTTGTTTCACCATATTCATGCGCTTCTATAGCAGAACCTTCTAACATCTTTTTACCACTCATTGAAACATGTGATCCTAATAACATAAAACACACCTAACCTTTTTTGTTTTGCTTACGTTTTTGTCTATTTTGCTGCTTACTAAATTGTTTACGCTCTTGACGTTTCATTTTTTCAACTTCTTGTTTAAATTTCTTCTTATAACCTGGTTTAACTTTGTTTTTAATTTTACTTCGAACTTTGTTCTTCACTTGATTAGTTAAATGGTCATCTTTGCGCATTCTTGCTTGACGCTGATTGTGCGCTTTAACTTCTTTTAACTCACCATCTTTAATATCAACAGTATTGAAAACAAAACCGCGATCTTCTATTAATGAAATATTGTGTTCTTCATCAGGACTATAAAGCGTAATTGCTACACCTTTATAATTCCCACGGCCTGTTCGGCCAACTCTATGTGTAAAGAAGTCAATATCATTTGGCACATCAAAATTGATGACATGACTAACACCTTCAATATCAATACCACGAGATGCTAAATCGCTGGCAATAACGTATTGGAATTCTAAATTACGTATACGTTTCATTTGTTGTTTACGTTCACGTGGCGTTAAACCACCATGAATCATACCAACTTTAATACCAGCTTCATTTAGTGAACGTGCTAAATCATTTGCATTATCTCTACTATTACAGAAAATAATACATAAGTATGGATTTAGTATATCAATTAAATTTAAAGTCTTTTCAACTTTAGCTGCACCTTTAGTAGGTATTAAAAAGAATTCGATGTTCTTTTTATTTTGTTTTTTACTGTCGACAGCTACATATTCTGGATGACTTAAATATTTATTTAAAAATGGTTGTAACTGTTGTGGAATTGTAGCACTAAACACCGCAATATTTGCATTATCTTCCAATCTTGCAGCGATGTAATCTACATCTTCAATTAATCCTAAGTCAATCATAAGATCCGCTTCATCAATAACTAAATATGATGCTAAGTGCACATGTAAATGTCCCGTTATAGCTAAGTCATTAATTCTAGTAGGGGTGCCTATAATCAATTGTGGTTGTGCATTACAACGTTGTCTATCTTTCTCTATATCTGTACCACCAATAAAAACTTTAACTGAAACGTCAGCTTTAAATTGGCTTAAATGGTTCGCTGCATCGTATAGTTGTTGTGCAAGTTCTCTTGTTGGTGCAACCACGATTGCTTGTGGTTCTTTTATTTCACTATCAATTAACTGCATTAATGGTAATAAAAATGCATGAGATTTTCCTGTACCCGTTTGAGATTGACCAATTAAATTTGTTCTCTTTAGTATTCTTGGAATAATTCGATTCTGAATTTCAGTTGGTTTTTCAAAATTAAGGTCTTTCACAGCGTCAATTAAACTAGATTCTAGATTAAATTGTTCGAATGGATGTTTTGCCATGATTTGGCCTCCTTATATATTCATCTTTACTATTATAAAGTATAAATGTGCTATTTTAAATAAAAATATTAAAACCTCGAAATTTCAAAATTTAGAAATCCCGAGATTTTAGTTTAAATATATTGAAATGGATCTGTATTAATTGTAGATGCTTCAACATCTATATTTATTTTTTCTGTATTGAACCAATTCATTAGTAACGTTTTTAAACCTTCTTTCATCACATATTCGCTGTAATGATTAATATCAATTAAGTTCACACCCTGAATTTTAGCATCTAAGGCATCATGATGTTTAATATCACCTGTAACAAAGACATCTGCGCCTTGTTGAACAGCTTGATATTCATATCCAATACCTGAACCACCAATAATTGCAATACGTTTAATTTTCTGATTAGACTCACCAACAAAACGGACACTTGGGATATTTAATTTAGATTTAAAATCAGCTGCGAAATCTTCCAATGTCATTTGATTATCCACTTCTGCCATAACGCCAAGTCCATAAAGAGATGTTTGTTTTATCTCAATAAAATCAAATACCGGTGTTTCATATGGATGGTATTGTTTAATTAATTGCTCAGCCCTTGACTTTTGACATGCATCTATCATAAATTCAATTTTAACTTCATCTACATATTCAATTTTATCAATTTGTCCTATTGTTGGATTAGCTTCACCAACTGGTTTGAATTGACCTCTTCCTTCACTTTCAAAGAAACAATATTCATAATTACCTTCTTGTGCTAATCCATTTTCACTAAGCTTATCTTTAAATGGTCCAACATTATCCTTAGGTATATATGTTTGAACTTTATAGTATACATCTTGTTGATTATTTATTATTGAAATGTTCTTCAATCCCATCGCCTTAGCCAACATCATATTGACACCATGAGGATTTACATCTAAATTTGTATGCATCGCTATTAAATTAATGTCATGTTGAATTAGTTTTCTAATAATCGAACCATAACCATTAGCTTTTAATGATGTTACGCCTTTAAAGATTAGAGGATGATGACTAATAATAGTATTATAACCTTTTTCTATCGCTTCATTTACTACTTCCAACGTACAGTCTAATGCTGTTAAAACACCAGTAACTTCAACATCTTCATCACCTATTAACAATCCTACATTATCCCAAGATTCAGCAGTTCTAAATGGCACATGATAATCTAACAATGTCATTAAATCAGCTATTTTCATTACTATAACACCCTTTCAATTACAGCAATTTCGTCATTAATTTGAGCTAAACGTTGATGATGTTGTTCAGTATTGAGTTTCGATTTAATATGATAAAGTGCTTCTAACTCTCTTTGCCATTTTTTTATAAAATATTCATTTTTGTTGTTCAATAATTTTGGTCCGAATTTCAATTCATCAGATGATAGCTCTATTAATTGCGTAGAATATTCTGCTACAACAATTTCATAAATATGGCCTTTTTCTTCCATTATTATTTCATCAATTATTTCATAATTCAATTGTTGTAATGTTTGTCTTAAATTTTCAGTTTGGATATTACTTTGTAAAATCAACCTTGGATGTTGACTTAACTTATCTTGCCCATCTTTTAAAATTTTAGCAATAAGTGGTCCGCCCATACCACAAATTGTGATATTATCGATTACATCCTCAGGATGAATAACACTTAAGCCATCCCCTAAACGTACATCAATTCTATCTACTAATTGATTTGCAGCTACATTTTTCACAGCAGCTTGAAAAGGACCTTGAATAACTTCTCCTGCAATACCGCAATCGCATAAATGGTTTTGAATTGCATAGATTGGCAAATAAGCATGATCTGAGCCAATATCCGCGATTGTACCTTGTTTTAAAAATCGACTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTCTTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCAATCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAGTCTTTCAAACGTTTACTACGACTTGGATGTCTTAATTTTCTAAGTGCTTTTGCTTCGATTTGTCGAATACGTTCACGTGTAACACCGAAAACTTTACCAACTTCTTCAAGTGTTCTTGTTCTGCCGTCATCAAGACCAAATCTTAATCGTAATACATTTTCTTCTCTATCAGTTAATGTATCAAGCACATCTTCTAATTGCTCTTTTAATAATTCATAAGCAGCATGATCTGAAGGACTTTGTGCTTCCTGATCCTCAATAAAGTCTCCTAAATGACTATCATCTTCTTCACCAATTGGTGTTTCTAATGAAACAGGTTCTTGCGCAATTTTTAAAATTTCACGAACTTTTTCTGCTGGTAAATCCATTTCTTCACCAATCTCTTCTGGTGCTGGATCTCGACCTAAGTCCTGTAATAATTGACGTTGAACACGAATTAATTTATTAATTGTTTCTACCATATGCACAGGGATACGAATCGTACGTGCTTGGTCAGCAATTGCACGAGTGATTGCTTGTCTAATCCACCATGTTGCATATGTTGAAAACTTAAATCCTTTGTTAAAGTCAAATTTTTCAACAGCTTTAATAAGACCCATATTACCTTCTTGGATTAAATCAAGGAATAACATACCACGACCTACGTATCTTTTAGCAATACTTACAACTAAACGTAAGTTCGCTTCTGCAAGTCTTGATTTTGCTACTTCATCACCTTGTTCAATACGTTTGGCTAATTCGATTTCTTCTTGTGCACTTAATAAGTTAACACGCCCAATTTCTTTAAGGTACATACGAACTGGGTCATTTATTTTAACACCTGGAGGGGCACTAAGATCACTTGGATTCAGTTTCTCGTCAGTATCTGAACTATCTTTTTCATTAACTAGTGAAATATCATTATCATTTAATTGATCAAAGAAATCATCCATTTGATCAGAGTCGATATCGAAATTCTGAAGTTTTTCAGCAATTTCTTCATGACTTAAATGACCCTCTTTTTTACCTTTTTCAATTAATTGCTTCTTAACATCTTCTAATGTTAATGTCGGATCAATTGTTTGTTTTTTAATTTTAACTGTGTTATCAGACATGAAACGGCCTCCCGATTTTAAATATGAACATTCGAAATTTATTCAATATTGCTATTTTAAACTAAATTCTTAATTAATTCATCCATATTTTTAATTTTATTTTACAAATTGGAACTAATCCCAATATTTATTTTTCAATAGTGTTGTTTAAATGCGGTAACTATCATTTACCCTTATACATTTTGACATAATCATTATTCGTAGTATTCTTTAAAATCACATGCTACATGCGTTCTTTATTCTTAGCAACAATTTGCTGTAAATAGTATTTCTGTAATTCTACATCGCCAATCCTTGTAGCTTCCCTTAATTTATGATTCAATGACTCAATTGTTTCTTGTCCGTTTTCATTAATAACATTGACATAATCATCAATTTCATTTTCATATGGTTCATCATTCAAACTATATTGTTCTAAGCTAATTAGTGTTTCTCTCAACTCATTTGAATTAACATACTGCACAGCATCACTGATATTATATTGATCATTTTCCGCATAAAAATCATGTAAGACTTCGAATACATATTTAAAATGCTGATTTGTGAAGTTATCCTTATCAACACTTTCATAATAATTTAAAAATGTATCTTTATCTCTCATTAAATGTTTTAAAAATGCTCGCTCTGCTTTTTCTTGCCGGCTCAAATTGTCAAATTGTGCCATACCAATTGGCTCAGGTTCAATGTAACCGCCATACTCATCTTCTGGATAATAATTGACTGGTGCTTGATTGAATTGTATTTCGTTAGCTAATTGCTCAGGACTAACATTGAAAAATGGTGCAACATCATTTAAAGCCTTTTGTTGCAAAATCGATGACTTCATAAGTGAAATGTCATGACTCAGTTCTTTCAAATAACGTTCATATGAAAGGTCATTACGTGCAATTTCATCTTTTAATATACTCACTTTATAATGTGCAAATGACTTTTTATCATTTTTTACAAAAGCAGTAAATGCGTCGTTGCCATACTTACCAATGTATTCATCAGGATCCATGCCAGATGGCAATTGTATAACAAATACATTTAGCCCTTGCTGTAACAAATGTTGACCTGTTTTAAGTGTTGCTTCACTACCCGCAAAATCCCCATCAAACATTAATGTTATATTTGATGTTAACTTTCGTATAAAGGTAATATGTTCATCTGACAACTGTGTACCCATTGTTGCAACAACGTTTTTCAAGCCAGCAGTATCAGATTTTATAACATCCATAAAACCTTCTAGTAATACAATTTCATCTAATTTTCTAATTGATTTACGTGCTTTATCTAAGTTATATAACAACTTTCTTTTTTGAAAGATAGGTGTTTCAGGACTATTTAAGTATTTTGGTTCTTGACCGGTATATGTTCGACCTGAATATCCAACAATTCTTCCTTGCGCATTTTTCAAAGGAAACATAATACGATTTCGAAATCTATCGTAATAACTGAAGTTTTCTTCGTTACGTGATAATAATCCGGCTTCATATGCTAATTCAATATCGTAACCCTTTTTTTGAAGAAAATCATGACAAAAATGTGAGCTATCGGGTGCAAAGCCAATGCCTCGCTCTTTAATAAGCGCATCTGTAAAACCACGTTCTTGTAAGTACGTTAATGCTTGTTCGCCTTCGACTGTCTTTGTTAAAGCGTAATAGTAAAATTCTTGTATTAACTCATGCATTTCAATCATTTGTAAATCATCAGAAGCAATTTGAACATTTGAGTTAGATTGTGTTGCCTCAATATCTACAGCAACATTAACTCTATCACCTAATTCTTTAACCGCTTCAACAAATGATATGTCTTTAATTTCTTGAGTAAATTGAAAAACATTGCCACCTTTTTTACAACCAAAACAATGGCAAATTTGTTTATCTTCAGAAACTGTAAATGAAGGTGTCTTTTCATCATGAAAAGGACACAAACCTATATAATTGCGTCCTCTCTTTTCTAATTTTACATATTCACTTACCAAGTCTAAAATGTCGGTTTTATCTTTTATTTCATTAATGATCGATTGATCTATTCGCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_018608|1637007:1645319|1643519_1645319_-|WP_001217255.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIARNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKALNDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPVNYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYSLNDEPYENEIDDYVNVINENGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >NC_018608|1637007:1645319|1637007_1637793_-|WP_001213908.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >NC_018608|1637007:1645319|1637918_1638809_-|WP_000924214.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >NC_018608|1637007:1645319|1638818_1640165_-|WP_001062170.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKADVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAITGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >NC_018608|1637007:1645319|1640278_1641379_-|WP_000683941.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDYHVPFRTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGSIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPHGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDACQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADFKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIQGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI >NC_018608|1637007:1645319|1642189_1643296_-|WP_001283055.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD >NC_018608|1637007:1645319|1641381_1642059_-|WP_000624563.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCDCGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIHPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL |
7 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1714744 : 1723787
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_018608|1714744:1723787|DBSCAN-SWA ATTATTCGTCATATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGATACCGCCTAATTTTTCGACTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTTAAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCAAAGCCAATCCCCATTGAATAAGCTACAGGACAGCCAATGATAAAGCCACGCGCTTCAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAATTGATATACTTTGCTGGAATCAATCGATCTTTTATCAGGTTGTTGATTGATTCGAATTAAACCATCTTCTTGTGTTACAAATTTTAAGTCTAAGAAAACTTTCAACATGAATTTAAGTGTATCTGGTTTCACACTTAAATGTTCACACAATAACATACCCTCTTTCTGGATATTTGTTTCTTGTTTAGTTATTAATGCTTTATAACACTTTTTAAAAATATCCATATTAGGTATACCATCGAAGTAAATCGAATGATTATGTTGCAAAACTATATAAAGTTGAGAAAATTGCAGTTGTTGCAAGGAATTAGACAAGTCTTCCATTGACATTGGTAAATCTCTTAATACTACTTTATCAGTTTGTTGTTTAATTTCTTCACCATAATAATATTCATTCGCATTTACTTTATCACTTTTAGGATGAATAAGCACGACAATATTTTCATCATTTTCTGTAAAAGGTAAACTTTTTCTCTTACTTCTATAATCTAATATTTGCTGTTCATTCATCGCAATATCTTGAATAATTATTTGCGGTGATTGATTACCATTCCATTCGTTGATTTGAACAGATCCTAATATATTAATTGGCTGTTCATCTTGTAACTCAGGTTCTAAGTGTCCATTTTGCCAAAATAGCGCGGCGATATTACTTTCACCAAGTGTCAATTTTAGATGATTTTTTTGTTGACCTATCGCCTTAACTGAAGAAACTGATAAATCATCCATTTCAAAAATAGGTCTAGAAAAATCTGTTCCGAAGGGTCTTAAACGATTCATATCACGAATATTTTTAATCGTTATATCATTTTCTGTTAATAATACATCTACTGGCTTTACGGGATCTAACGAAGTTGTTTTAGATAATTCTTTCATCCATTTATTTAAACCTTCAGCTAACGATTCTATATTTTCAATATCCATCGTCATACCTGCAGCCATATGATGGCCGCCAAATTTAGCGATTAACTCTTGATGTGCTGATAGTATTTCAAACATCGACACTTGATCAATTGATCTGGCGGAACCTTTTGCATGATTTTGCTCCCTATCAATATTTAAAATTAATGTTGGCAAAGCAAATGTTTCGACAATTTTCGAAGCAACAATACCTAAGACACCTTCATGCCAATTTTCTTTTGCTAAAAGTAAAAATAAATCTCCATTTTTAACTTTCGTTTCTGCCATAGCCATTGCTTCTTCTGTGATAGTTGCTACAATATCTTTTCTTTCACGGTTAAAATGTTCAACTTGTTCTGCTAAAAATGCAGCTTCTTCTTCGTCGTCAGTCATCAACAATTCGCAAGCTAATGATGCGTCATCTAAACGACCTACAGCATTAAGTCTAGGTCCAATAATAAAACCAATTGTTTCTTCATCAATATTGTCATTGTATCCCGCTTCTTTTAGCAATGCTTTAACAGAGGTCGGACATTGATCATTTAAGACTTTTAATCCTTGTTTCACTAATGATCGATTTTCATCAGTTAAGGATACTAAGTCCGCAATGGTACCTATCGCAACTAATGCTTTAAAATAATCAGGTACATTTTCAATCAATGCTTGTGCTAATTTGTACGCAACACCTGCACCACACAATTGTTGGAACGGATAATTAAACGATGGATGCATTGGATGTACGATTGCATATGCTTCTGGTAATATACTACCAATTTCATGATGATCAGTTACAATGACATCAACTCCTAAATCTTGAACCATTTTAATTTCATTATGACCTTGTATGCCATTATCAACAGTTATGATTAATGTTATGCCTTCATCATGAGCATTTCTAAATGCTAGTTCGTTTGGTCCATATCCTTCGGTAAAGCGGTTAGGAATATGCCATCCTACTTGTGCACCTAAAAGTTGTAATGTTGTCACTAAAATTGTAGTTGAGGTAACACCGTCGGCATCGTAATCACCATAAACTAGGATTTTCTCATCATTCGCTATCGCTCTTTTAATTCTATCAATAGCCTTAGTCATATCGCTCAATTGCAATGCATCATGATTGACATCTGTGTCTGAAATGATGGATTCAATTGCTTGTTCATCAATAATCGATTTACTTTCTAATATTTTTTTTACGATTGGCGTTAACTTTAATTTTGATGTTAATTCATCACTTATGTATTCAGCTGGTTTAGTTAATTTCCACTTATACTTCGGTTTAATCATATATATTTACGCCTCATTTCCAAAAGACATTATATCTAAAATTACTTTAAATAAAAAGCACTTATCTAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTATATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTAAACTCTTTAATGTTTCACATACCGCTTAATTCATTTTAAACTAAAATCTTTTCATCGTTCGATTTCTTTTCTTTATATACAACTAATTTGTGTTTCGGCGATTTTTTCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATCGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACGTTACGATTGTATCATTAATTGAATAACCGACAATTGTTAATACAGCGGCGATAAATGTTAAATCTACTTCAATTCTAAATAAACTGAAAATCGCTACTATAATGAATACATCATGTAATAATGCCAATACAGATGAAAGACCCATGCGCCATTCAAATCGTAATGATACATAGATGATGATACCTATCGATGCATAGATTAATGCAAGCATTGCATTTTTTGCTAATTCCTGTCCAATAATTGGTGATACAGTGTTAATTTGAGGTGTGTCACCGAATTTCGATTTAATATTATCACTCAATTTATTATCTTGAGCACGCGTTAAATCGTCTTTAAATTGAACAGTTGCTACTTTATTATCTTTACCATTGATTTGAATTTGATCCGCTTTAAGTCCACTATCTTTTACAACTTGCTCAACCTTTTGTTGAGTAATTGCTTGTTTAGATTGGAAATCTACACGTGTACCACTTGAGAAATCAATTCCTAGGTTTAACTTGAAGATATAAAGAATAACTAAACCGACAACTACAATTAAAATACTTACTCCAATTAATGGCTTAGCTAATTTAACAAAATTCCATTTCTCGAATGAAGTTTTAAGGTCATGAACATCTACACCTTCATTAATATCATGTCGTTTATTCTTTTTAACACCAAATAACCAATATTGATTTTTGAATATATTTGATGAAACAAGTAATGATAATAAGAATCTTGATAAGAACACGGCTGTAACAAAGATCATTAGAATACCTAATAATAACATTGTCGCGAAACCTTTAACTGAACTTTCACCGAAGAAGAATAATACTGCTGCGGCGATAACTGTTGTTAAGTTAGAATCAAAAATTGTTAGGAACGAACTTTTGTTTGCTTTAGAAAAGGCTTGCTTTATCGTTCTACCTATTCGAAGTTCATCCTTAATACGCTCATACATGATAATATTGGCATCTACAGCCATACCTACACCTAATACCAACGCCGCTAATCCTGGTAAAGTTAGAACCCCGGAAATGAAATTAAATGCTACTAAAGTTAGATAGATATAAGTTGTCAATGCAATAATCGCTACTAAACCAGGTAAGCGGTAGAATCCAAGCATGAATAAATAAATTAATGCTACACCAATAAACGATGCAAACACAGTTTTATCTAATGCATCTTGACCAAATTGGGCACCTACTGAGTTTGAATAAATTTCTTTCAAGTCAACTGGTAAAGAACCTGCATTTAACAATTCGGCGATTTGTTTTGCTTTTTTAACGCCTTCTTGTCCTTTAAATCCACCAGAGATTTCTACGCTATCAGAATTGATTGGTTGATCAACACTTGCTGCAGAAATAAATTTTGGGTTTTTCTTTTGTGCTTCTTTTTTATAGCTGTCACCTTTTTTGAAATCTAACCAAACAACCATGACATTATCACGTTTCTTAGAGATTTCTTCCGTTACTTTTTTAAATTTGTTTTTGTCTTTTACTTTAAAAGTAACTGTCGGCTGGTTTGTTTCCTGTTTAAATTCTTGTTTGGCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_018608|1714744:1723787|1720314_1720575_-|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >NC_018608|1714744:1723787|1717760_1720040_-|WP_000749801.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQYWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >NC_018608|1714744:1723787|1715284_1717558_-|WP_000595008.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDVNHDALQLSDMTKAIDRIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSILPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKNGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQIIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPMSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCEHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >NC_018608|1714744:1723787|1714744_1715263_-|WP_000364542.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >NC_018608|1714744:1723787|1721755_1722781_-|WP_001019177.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSNRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >NC_018608|1714744:1723787|1722782_1723787_-|WP_001005766.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDAIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE >NC_018608|1714744:1723787|1720593_1721733_-|WP_001112045.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1852989 : 1900835
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_018608|1852989:1900835|DBSCAN-SWA 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47 | Staphylococcus_phage(91.89%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_018608.1|WP_000384171.1|1877780_1878005_-|hypothetical-protein |
1877780_1878005_-
Protein sequences of NC_018608.1|WP_000384171.1|1877780_1878005_-|hypothetical-protein>NC_018608.1|WP_000384171.1|1877780_1878005_-|hypothetical-protein MDYAHLNLEHFFARNDDLDVIRDRADFVMINNFTNEMMYRDGQIEGTIDLNQYYYKNRSNAASFIMMDYKKETK |
74 aa aa | NA |
LuxR_C_like
LuxR_C_like HTH domain information
|
NA | 1852989-1900835 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 5.1|864939|31|NC_018608|CRISPRCasFinder matches to NC_018608 position: 1881678-1881648, mismatch: 1 tttcttttcgaaattctctgtgttggggccc CRISPR spacer tttcttgtcgaaattctctgtgttggggccc Protospacer ****** ************************ |