Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_017187 | Arcobacter butzleri ED-1, complete genome | 1 crisprs | PrimPol,DEDDh,csa3 | 0 | 0 | 2 | 0 |
1. NC_017187
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_017187_1 | 1014066-1014172 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_017187_1
|
1 spacers
spacers of NC_017187_1
>1.1|1014092|55|NC_017187|CRISPRCasFinder CTTAGTTGGATGGAATCAAAATGGAACAATTAAAAACTCTTATGCATCTGGTTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017187_1
The CRISPR arrays of NC_017187_1 >merge|NC_017187|1|1014066-1014172|CRISPRCasFinder GTAACTGGAAATAATAATTCTGGTGGCTTAGTTGGATGGAATCAAAATGGAACAATTAAAAACTCTTATGCATCTGGTTATGTAAATGGAAATAATAATTCTGGTGG >NC_017187|1|1|1014066-1014172|CRISPRCasFinder GTAACTGGAAATAATAATTCTGGTGG CTTAGTTGGATGGAATCAAAATGGAACAATTAAAAACTCTTATGCATCTGGTTAT GTAAATGGAAATAATAATTCTGGTGG
>NC_017187.1|WP_014468652.1|1011530_1012202_-|response-regulator-transcription-factor MFEFKNFSILFVEDDLEIQKNMSKILSLLCNKVYVASNGLEAYEIFTNNVIHIIITDYEMPFINGYDLVLKIREISQNIPIIILSNYTDKEKLLKCIPLNLTSYLEKPIIYEKLLETLQLCKNQIENNATLYLTINDTLKYDFNTKSLIQDGNYIKLTTLEIQIFEYLLNKKNQLVYNDELLSVIFENDYYGNIKNIIYRLRKKVSKDVIVNYKNLGYMLNTK >NC_017187.1|WP_014468651.1|1009620_1011528_-|sensor-histidine-kinase MKITLFLLIFTSFLFSNSLIIENDNFGKNSLQKYTQIYTDETSSLNFEEIKNKIFFTNIKNNFTATKNSIWSNFSIINKSNKKIEIFLENEKAGIDIIDIYILKNENFYEKIELGDYRDIKLRELKTKKSTFKLILDENSTYTFFIKYKSYSSISTLWYIYDKKSFEKSLNIESIIWGFFIGVVIALCLHNLFIYFSTRDFIFLSYIFVSIFSALYQLSINGIFYQLFENENLKYLSGLNWVFSFTTLIFVIIFHISFLKPKINSFMFKSLFICLLINICVVIFYSFSLEHEELRYAVTYTNFITYLIVIVLFTTTIWAIKDKYIGARFYLFVQLFYFSISFYVFMVLVGYFESFEYFWLVIPIVVLFDIFFLSIALYIKVKEIEKRKKESEQFIISQARFTTMGNNIANMIHQWKNPIAQIGSQIALLESIYKLDKKNFDEAIEQTLPQMKDSILFLNHVMNDIYNFYKNPSSKEYFNIADEIDSLLRILNDEIKVNSITINKNITPLNFYGYKASFLNVLMIILENSIYQLKTFKKQSRKIFIYLEKIDDSQIVLTIEDNGGGIESSHLEKIFDLNYSSKKDKGSGIGLALAKELIEKRLNGKISVENTLVGASFIISLKIGTDILDENTNSY >NC_017187.1|WP_014468650.1|1008522_1009617_+|glycoside-hydrolase-family-3-protein MIKRFLILAILFVSNSLFADENYSKAQIEKMIAKMVILGFNGTSVDKNDEIYKNIQSGLGGVILFDKDPNDKTKIKNIKDKNQLKNLNTQLQAISNQKLLISIDQEGGVVQRLKKDSGFVDTLSAKDIATNGEDFAKQSYKALAKDLKDVGINLDFAPVVDLSINKNNKVIVTRGRSFGESSSEVIKYSSIFVDELRKQNVISVLKHFPGHGSSLADSHLGFVDITKTWNQKELEPYKYFIKNNDVDMIMTAHVFNENLDKNYPATLSYNINTKLLREDLGYKGVLVTDDLQMSAISKHYDLKQTLTLAINSGVNMLLFANQLAKPVTLKEIVDTVYLQIQNKQINLQKIIDSNNKIDKLLKKI >NC_017187.1|WP_004509216.1|1008244_1008511_+|DnaJ-domain-containing-protein MDYSEFEKAVDMFGILTTVSKKDIKNKYLKLSKKYHPDMPEGSNEKFTELKKNYDLLLAYMDNYCYSFDEEEFKRQFPAFTNYKNWMK >NC_017187.1|WP_014468649.1|1007674_1008157_-|DnaJ-domain-containing-protein MYNNTIIYIFNRIISVAIFLFILYLIFTNFGTFLIIIAILVSIIAFIIYNFKKKLKQSNFNNFEFKFDNSQFQNGKFDFDFKDFQNFNNSSFQGFSNTARFDEVSKAKEFFGFTQTPTKEEVKKRYKELAKKYHPDLNDGNEEKMKELNHYRDILMNIVE >NC_017187.1|WP_014468648.1|1005524_1007645_+|efflux-RND-transporter-periplasmic-adaptor-subunit MFQQQQEQTILPKIRNDLKLLETSVGEDGSKKWLLFDPIQNKYFDISLDTFELISNWQSDIELEEFIKILEEKNYQIEKESLKTFVDFLINNNLIVCDDSKFTSRMISIQKQSKQNIFKWLIHNYLFIRIPLLKPDKWLERNKTRVDFFYSNLWQNIVLSLGIIGIIFVLRDWDSFISTFMYLFTKEGFFYYFLSLVFVKSFHELGHAFTAKKYGCKVPTMGVAFLVLFPVLYTDTTNAWKLKSKYQRLKIVIAGMKVELYLALIATFLWSFAPEGILKSILFIIATTSWISSLLINISPFLRFDGYYALSDLTDTKNLQPRSFAMARWFLRKNILGLEEVKPESLTKSKEKFFIIYAIGTWIYRFFLFLGIAVLVYYYAFKVLGIILFLVEIVWFLLLPIYKELKVWWSKKSQLEFNKRNKISLAVFLIIVFLIFIPWNTNIKMPAIIESKNYFEFYPSENGYIEEIYFNSGENVKKGQLLLLIKSPELELKISQIEKEIEQMKMEIDKQAGLKENLNKRFILEESLQKKLNEKEGLEKIIKKFEVRANFDGKIYFNDVFKPNQWISKKEVVFTLYDNLDYRIVGFCNENDFKLLKENSQSKFIFSSGDIKDIHSNLTTISKVSIPYLEFPELSSDYKGEIATRLENKKIKTEQAYYKITIDLQKNELDLKSRKVGVLVTKGEASSFISRIFKKAVSVVIRESEF >NC_017187.1|WP_014468647.1|1004178_1005525_+|efflux-RND-transporter-periplasmic-adaptor-subunit MESNISKLLQLEHNCRNCENIKELYFQIVNNTRSIVNYSQGILLTPDLKDKYKVVAISDISMVDSTSPYVQWLEEIIDDLQKSEKSKDIFIVDMKNDLKEENSKVSHEYAPPNLVYIPLKNTKEDREVNYVFLLFKEENWDENDILMLKHLSSSLAYFLFAMRRCSLFQSLKKISFKSRYFKIAAVFLFVLMLMPVRLSVLAPLEVDAKNPYVVSSPLNGVIEEVKVFPNDKIEKNQLIVQFDDVDFTNNYLVAKRTLDVTNAELFTTKQSSFLDPKQKSQISSLENQVKLKEAELSYAKDQLDKTKIYSKEDGIAIINNPNDWKGRPVTTGERIFLIANPNSIELKIMLPASDAIFLEENAIVKAFFDNDPINSWSAKVKYVSYKPELTEQNILSYRITAEFEDIKENGYIPSIGLRGTAKIYSKKVTLFFYLFRKPITSVRQWIGW >NC_017187.1|WP_014468646.1|996611_1004159_+|DUF4347-domain-containing-protein MKRRNLKKPVISVLEQRVLFDGAAVATAVDVLDNSSFSSSTTKDSTTVNDVTNNSAENSVHKAQAVQGFEKDRREVAFVDITVKDYQTLVDGVGQGVETYLVSSMDEIKSILQNQTNIDSIHILSHGKTGEITVGNDILNKNTLQNFDEVLESMKSSLTQDGDILLYGCNVGNDGKGQEFIDLLASETQADIAASNDITGSNNLGGDWDLEAKSGTIETTAIVVNEYNHSLAYLTTDSDGGFTSSSEISGSIATTDKINYARGPGYYNDLYTLSGVANGTQVKLYIAQGTLSDPYIQVTDSNGTIIAQDDDSGDSGAANGYDAYVKFTWNNSYTIRATTYSTGAVGTYTIYTDTGTLVIKPDTTPTFTSSPVTLNISDTPDDNSIPTSSGSFTATDAENDALNFSGGGTNSFGTLSVSSNGSWTWSPNNAYINSLTSNATTSYTVSVSDGINIRNQTFTVNIVSATNDAPVITSSNSVSFQENTATNVAAYTITATDAENNTLTYSISGTDSQYFNINSTTGQITFKNSPDYETKTSYSLMITALETNGTGLSASKMVTISIANVNEPPIIESSNISNYTENGSPVVLSPSLTIDKGETSTLASAQISISSGFISGDILNFVNDGSTMGNIVASYNSATGILTLTSSGATATLAQWQSALRSISYHSTSETLSLTQMTRTISWKVSDGNLESTVDTSTLKVTGVNDAPTISVSTPSGFTETTTMDKQTLSQNGTVTFSDVDNNVNITYSYNNNISWSGGTLNSTLSSALIAGFNTSATNVSSGTTSWSYNVNNVDLNFLAAGETITLSYNVIATDIAGATAMTTITFTITGTNDAPVFGTVTTGSTTITAPTAGTTNPNAGIETFNNGLLRFGNGSIDSVNASTGMLEQPFYYKDGNWYQLTYSTYQLNMAIAADYNNGSAKTDVDWNLEGTVNLTPTFTNTTVNNSGFNSSTGTGTIVWTGEIVVGSAHLKVTNVYTLEAGAKYIKANTYIENIGSTSTENLRFWVGTRDDYVAGSDSPAKQKGNIVDGEFQMISNSSEQAKAIKIYTGTGANATAVLFYSTNSNVNTVIAPRYGWSTSNEYSPGIDPLNSVYNQSYSDGGYAMFTNLNNVATGQTVMFDWYYAAGAVSELSDITSSLEQATSTNLQENSSSLVLADDYTITDLDSTDSVNVTVSSVQINTPTGLTLPANYTDDVIKNMLQITSNPVITSGSTTGTVSWNFNSGSDYTFNFLGRGQTLTLLYTLTATDSNGATATTVVTISIDGANDAPRVVVDSQDSDIATISETNSTISTNGTLSIADPDMIDTSFSVSKSSVVVSGMTNGLTANTAALLNMLTVNTQNFDINWAFNSGNQYFNYLSAGETLTITYTIAVSDSSNAVTNKTITINITGTNDSVSLNTPATIYYTDTDGNDVFSATTSQLTASDLDKNTTFTYGIDNGTISGTTVTKTGTYGVLTLNTATGVYTYTPNSNAINALTSNSSETFTVTVNDGNGSIDTKSLVIQIESVNDAPLLGGNSSPNTFVENGSAVQVDSNITVTDLEGTSYDEGYVSFDIKTNKGALDNLSISSIGGISLAGANVKYGNTVIGTVDSILNGQNGKELRIHLNDNAYSLQVQALARAITFSNPSDNFNDSARSIDIKVNDGGNGGETSARYSIKTVTVNLQSVNDLPTINLGNSTFLVEKIIGQNDNGTLSLGNILSVADLDNNSLTVTIQTTNYGLITINSSILNGVNSSQIIGNGSRTVTITGTIEQINNTLNASNGITYVAGFGNDYITPGADYLKITAKDTLNGESSSQKLVMVLPAIPNIFSDNVVGKEDDVSNIIVNINNLVTDINDNGGTYVFGTGTPDITNSSGNITTNGSLTPFDNSTYIYDNSGKVIGYQLEHGKIILNEGKNRVDNTDFAKFTFIPNENWYGVQTFLYQFTSNDGEVSNIAQIAIFVTPVNDAPVISIVNNNITIDEDNPFVFENSNLITLLDLDVIDNTQILDLTLNVTNGKLELSQMTDLTILEGANNSSIIKIRGSLASLQNAISGLKYTPNQDYNGSDTLSIKLNDNTNIGEGNSLEDIKTINFVINPVNDAPEFTDQTDSVTEGEQISGILPASDIDSSSITFSINGNAPTGFVLHNDGSYSFDSSSYDYIGRGETDTIIIPVTVTDAEGLTKTANFSITITGTNDAPTVSVENIDAKIPFGDTYTKDISNLFDDKDLSNVFTYQASNLPSGLTIDPNTGIISGRVSQSGNFVISITAIDSEGAKVTRTYNMLVVAPAQNQPAKPDSTPTIITNNPTGENPNNGTKLNNYADNSNNSAGVINFSSSDGFVVDTGKGFLDTKTSNNQETLSQNNSASDKNLANANNNNSNDSRTIQANVDLNVSTTGKVLFGQGSQDSFSIVGITIEDIKVQSDFIKVKVVDTNIAQSYVVTQIDGTALPVGLSFDPKTGNISGKIPADLDELKISIKAINSDGTTRVLNLKLDLKQLKQKTQAEVNERFVGFKEQIAFENQKLDSYGSHLAKLFA >NC_017187.1|WP_014468645.1|995880_996594_+|efflux-RND-transporter-periplasmic-adaptor-subunit MKKFLGLILLISTLYSNENLTARAVIISLDKTVLSSEIAGEIIELSKYEGDSFKKGETLIRLDCSIYKAQKKKIEVEKEIARLELEKNKKLDTYGSIGTFEIQISQENFNKQKAESDIVSINVERCDIKAPFDGRIASKKVSKYQSIKPQDELLEIIGTDNLEAKVVVPSSWLIWLKKGIQLDLNIDETGTTVKAQVVQMDSIVDPTSQSITVRAKLLKPFDNITPGMSATANFYEN >NC_017187.1|WP_014468644.1|994071_995871_+|TolC-family-protein MVKKTSKVIALSIMTSFVITACSIKPEPILKEEIKEQVKNDLNVLNEVVLPVTKPITLDEAIQRGLKYNLQKKVKVLETALSQQQLDLVYYDMLPSLTASAGYSERNNYAASASTSFLNGNPQPLGSNPSYSVSQEKERTTADIGFSWNILDFGLSYVRAQQQADKFLIAKEKEKKVEHNLTQEIRRAYYQAVSAQDLLKRIQPMMVEVNKALADSKEVQNQRVAKSPMESLSYQRELLDILRSLHTLESSLISAKVELAELMGLKPGINFELADKVEKDYEIPQFSMNLDEMEKIALENRPEVTETRYQERISDKEITAAKLKMLPGINLNTSLSYENSDYLLNNDWHSYGANVSWNLLNVFKGSEMNKLAKTQVEVAKEQKLALSMAVLSQVHLSIVKFNQAKKEYFLAKDYLNVASDIYNLTEVENNLNINSRLILIKEKLNNILATLRYSYAYANVQNSYGTIFASLGVEEKDLEKAEEKIGLISNENQEKPNAEKTVIVPTTQVEVKKEIKKEATIINNPIKKEIKVADSFYNKNFYNSEISIYQGEKLSINGEDYIVKKSDDIFKIAKKHGVSLKSIVIENFWLIEKNRVKFK >NC_017187.1|WP_014468654.1|1014713_1016381_+|ShlB/FhaC/HecB-family-hemolysin-secretion/activation-protein MKLVKRVVTLSLLSSVVLLGVTPNFNSGNIEKQIQAPKDIPTAQKPSVELKGLKSSSAIKDFDESKKAFIKDFTFSGNTKISSQELSELLKDYKAKELSFKQIQEVLSLVNKYYRTKGYFVSRAYLVSQDLEKNNNILQVSILEGSYGEFKVENSSLVNDSVIQNILDSVKDKDIIDTNSIQRVTNLINDRAGSVVTKAAISPGQKVGTSDFDIGVEATKRVNGYIVADNYGSRYTGYNRLQSLLNINSPFNIGDKISISGLVSNGADLKNGKIAYELPLNSYGLKADFGYSRTNYNLIEEYESLDAKGNSNIYEVGLSYPLLRTTNENLYLKGKYYYKDLNDYMSGDKYEDKSISSFVTSLDYDKNYSIGNLPARIFANLNLTSGHLSSKDSNPNNGNYNKIDTYIANDIYFSDIFSLNSMLIAQKVLGHKNLDGNEDLSLGGVNSVRVYSYSEQSGENGYVLNLEFLTKLPNISSYSHKVGLFYDIGDVYTEKNQDTTFERKRLKDIGLGYYANYEDFFARVQMAWNANSDEIQSEYTNHKNSKLLLQAGWVF >NC_017187.1|WP_014468655.1|1016424_1016937_-|hypothetical-protein MLFALDAQYFIGTNLKKTQAKIEHDIEVYTPFGTVNESLEQTIKDSALELKIGTILNNTYRIYLSGVEYKTNLFKVKMINGNYEYLIPITNDFRLFSGVHMGTFKNNMVYGVQGGFIYDITKSIEFEAGGFYSRYKKEVKVKGEKFGFEFTDNIKIENSKSLFAGFNYKF >NC_017187.1|WP_014468656.1|1017056_1017845_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MNIIDFENIDVGYDEKIVLKDINLKIKEGEHWAILGANGSGKSTLMKLIQSEIHPRHTKEFKKEIFGKSRYSIFELRCELGIITNDLHNYFAKEAGYLTGFEVVLSGHYGSIGIFTHQDFTKEQILKAKEVMQFLEIEDLKDKKVAAMSTGQLRKCIVGRALIHNPKAFVLDEPTVGLDIKAQINFIKMLKKLALRSSIILVTHHLEEVFEEIKNVALVYNQTIYKSGKKEDILTSENLSEIFETKLTLKEKNKRYFIEEIL >NC_017187.1|WP_014468657.1|1017983_1018463_+|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MIQYYQELLYYVQKMVGDKEKAKDIIQESYSRMLDIDKISPIENKRAFLYKLAKNIVFDIVRKDKHILSIEYFEEEYNIPEKEQPDELLFEENQQEMLFEILDTIPAKNAQAFILHVFEGFTRKEIASKMGITVSAVEKHIIRATEKIKDKLKDIEGYN >NC_017187.1|WP_014468658.1|1018462_1019398_+|FecR-domain-containing-protein MKTINEEAIFWLIKEKEGLNEAEKIELKQWLEKNPFHQKSYNTNKLLRENFSKISGNMREKLVEKANQGAKKTKFIEQTKKFFLAASLFFCIGFGLDYFFIPVYSQNLVSIQEKENIFMLPDSSKIVLDVNSSLNVNYYKSSRNVDFIAGRAVFYVSKNKDKPFIIKTKDEKIEVVGTAFEVSNLNDSFSVKVKEGRVKVFFDKKIAYLNQGEKIFIDKNKKIELAKTQVEDIATWEKGFLTFDKTTLKDSLEEFSRYKNIKIEFQDEKVSKTEITGKFDIDDFDKFLMALPKIYSVKVDKSQNTFKFSKK >NC_017187.1|WP_014468659.1|1019473_1020529_+|NAD(P)-dependent-alcohol-dehydrogenase MKGFAMLKIGQVGWIEKEKPTCGVMDAIVKPIAVSPCSSDVHTVWAGALGDRHDMILGHEAVGEVVEVGSLVKDFKVGDKVVVPAITPDWNSLEAQAGYSMHSGGMLAGWKFSNFKDGVFAEYFHVNDADGNLALLPDDVDPIEAVMLCDMVPTGVHGAELADIKFGDSVCVIGIGPVGLMAVRASAIRGASRLFAVGSRPNCIEVAKDFGATDIINYKNGDIVEQVMEKTKGKGVDRVIIAGGDVDTFVQATNILKPGGTIGNVNYLGSGDFVKIPRLAWGNGMAHKTIVGGLMPGGRLRIEKLVSLIQSKRINPKKLITHTFNGMEHIEEALLLMKDKPRDLIKPVVIF >NC_017187.1|WP_014468660.1|1020554_1021175_+|hypothetical-protein MNIKKLKELEESFFEYYPNGFEDDKLLPIIKRFNSAKFHEETKELFKKENFSQPEIICDNFSKIISKSPLISLFEKPKVRDAIKSMSIYEKDMFCIVLHELLYGNFKDGFEDIVDILIQKNLAKWSIITLIPYYFSPTKEFFIKPTTTKNVLKYLEIENLVYKPKPTFEFYNAYKKVLNEMKKQVSKKLTSDNSGFTGFLRMGIEP >NC_017187.1|WP_014468661.1|1021171_1021765_-|Crp/Fnr-family-transcriptional-regulator MKINNDEIFESLNKTMNSYFPISKTTWEEFKKICKIRTIKKNEYAFDMYDKVNAISFVYSGLFRTFIINEKGEEYTKNFFWETRFYGPMVALLTNTPITSIVQALEDSIVVDIQHDKYREILAKYDDLKMYHILYLEKHWIMQKDDNGYSLVLEDAKQRYERFKKEFGHIISRLSQYQIASYLGISPTHLSRIRKES >NC_017187.1|WP_014468662.1|1021877_1022747_+|DMT-family-transporter MSKNLNAHFIILLATFLVGGSFIVSQKLSGIIDPISITLLRFVIASLLLAPIVLFNQKYRKKVISTFKRAMIISFFYSIYFIGLFKSLEFTTALNTGTIFTLVPLLTVLVFKQKISFNQYLIYLIGIIGTCMVIFKGNLELFLSLSLNKGDVIFIFSTFCMALYSISAKYFHKQDDELVVLVFMTLVGGIVWMSLALVLFDVPLNWQEISSKEFLYLGYLTVFATLVTSYLYQKATIVLGPKKVMAYVYLNPGAIAILLFVFEFKSINFWMFLGILISSFATLILLKKE >NC_017187.1|WP_014468663.1|1022747_1023089_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MISLNGKVYECPSKIPLDLVDDKWKFLILWNLAFKALRISELSEKISDISQRTLSRKLKALEEVSLVKRVVFAEVPPRVEYSLTIHGERLLEVFEMMSKWGEQYAKEVNSVIE |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
404907 : 412652
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_017187|404907:412652|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_017187|404907:412652|411275_412652_-|WP_014468202.1|DBSCAN-SWA MKINLSIKKKLLFYSFFIQTIILVIFSFSLYKALELSTVDKLEATLKVIVLDITDDVLERKKITDNILDEEKEYNFEPLYIRILDAKTHKEVIKTDNFPNNIDHNDDYLDKLKENVITFEEQHSYFVSRIKIDFHGEQSIIIEAVTTKDILTSTLENLLYILGFILPIILIFAIIGGNFVIYKSFLPIENILVELKQINANDLSARLKTTNTKDEIFYLINEINSLLSRLENSFERISQFSSDASHELKTPLTIIKGEMEVTLRKDRTINEYKEALKTSLEEISGIEQTINDLLFLAKNEQELIVDKQEEFYLDELADEAINELKNFAKLHKIKMSLIIEDSVEMKGFASLLKIAIKNILKNAIQFSHENQEVIVKIFKENDLLNISIEDFGIGIPTNEQEKIYEKFYRTDKSRNKNSGGTGLGMSIMKKIVDIHKGKISLISQENIGTKITLSFSIK >NC_017187|404907:412652|408063_408924_+|WP_012012251.1|DBSCAN-SWA MKDLLNSFEDYLLKNLPISKTFHPHFEDALADMLKAGGKRFRPMLLLSVVKSNKSLLVPNAMSVALGVEFLHTYSLIHDDLPAMDNSDLRRGFQTLHKKYDEVTAILVGDALNTEAFNLIANASLHNDIKVELIKCLAHNGGINGMIIGQAIDCHFEKQKIQLNQLEFLHIHKTARLIAASLKMGAIISEYDLQTQEKLYNFGIDLGLLFQIQDDIIDETCTEEEAGKTTQNDGFKNSFVNLLGLDGAKKSADDLALKCIDSLNTFEENLKKSLEELLLKYINRHK >NC_017187|404907:412652|409059_409317_+|WP_004510495.1|DBSCAN-SWA MNFKPLGERVLVKRTEVENKTASGIYIPDNAKEKPQTAKVVAIGNKVEDVKVGDTIVFEQYRGTEFKLEGEEYLILNIENVIGVM >NC_017187|404907:412652|404907_406095_+|WP_014468200.1|DBSCAN-SWA MNSPISVSTLNLQIKSLLETTFIQVYVEGEISNLTYHNSGHIYFSIKDENSTLSCVMFKGNTKYLKFQLENGLKIVITGSLTVYAPRGNYQLLCNKIEPSGIGSLSLAFEQLKTKLEAKGYFERSGKKTLPRYPKKIAIVTSPTGAAIEDMKKVATHRWSLVEFILIPTLVQGEGASLDIANSIKYADKLNCDIMIVGRGGGSIEDLWAFNEEIVANAIYEAQTPIISAVGHEVDYLISDFVADIRAATPSNAIEIALPDINEHRIYLDSLENEITNRFKNILFNKEQELKNMKKLFEQNSIETKFNFIQTQINFIKSSLKINLNQKFLGYQNQIDLLKSNYLSNHPDKKEKNGFVQISKSNKVINLADLKIGDEIELQTPKYIASCTLNKLVKQ >NC_017187|404907:412652|409316_410951_+|WP_004510496.1|DBSCAN-SWA MAKEILFSDNARNRLYSGVEKLADAVKVTMGPRGRNVLLQKSFGAPTITKDGVSVAREIELKDTLENMGAQLVKEVASKTNDEAGDGTTTATVLAHSIFKEGLRNVTAGANPISLKRGMDKACEAILAELKKSSKVVANKTEIEQVATISANSDSAIGKMIAEAMDKVGKDGVITVEEAKGISDELDVVEGMQFDRGYLSPYFVTNPEKMIAEFNNPFILLYDKKISSLKEMLPILESVNQSGRPLVIIAEDVDGEALATLVVNRLRGSLHIAAVKAPGFGDRRKAMLEDIAVLTGGTVISEEMGMKLETAEFSCLGTASKIVIDKDNTTIVDGNGDNERVVARVNQIKAEISNTTSDYDREKLQERLAKLSGGVAVIKVGAATETEMKEKKDRVDDALSATRAAVEEGIVIGGGAALIKASKKVNLDLTGDERIGADIVLRAISAPLKQIAINAGFDAGVVANEVEKSSNENLGFNAATGEYVDMFEAGIVDPAKVERVAMQNAVSVASLLLTTEATVSDIKEDKPAMPSMPDMGGMGMPGMM >NC_017187|404907:412652|406675_407191_-|WP_173362951.1|DBSCAN-SWA MLCCFTLFLNAANPIATFKTSKGDIEVELRPDLAPKAVENFVTHSKNGYYNGQIFHRVIKNFMIQGGDPTGTGAGGESIWKEDFADEFAKNAVFDKPGILAMANKGPNTNNSQFFITTVPTYWLNGYHTIFGYVINGFDVVKEIENVRTNGKYNGDKPLEDVKIISISIKE >NC_017187|404907:412652|406168_406648_+|WP_004510490.1|DBSCAN-SWA MENNRDKAVSSSKITEFMTFELGAMKYAIELPKIKEILTYPDNITTLPNTSKWVKGLINSRGEVVPILDIRIKFNTGPAVYDENTSIITVITEDKRMIGIVVDLVDDVQKLDTSMLAQVAEMGSAIPPKYLKGYVRLDNNQMLVIMDIERVVDKEELQD >NC_017187|404907:412652|407362_407746_+|WP_004510492.1|DBSCAN-SWA MTFEMLYSKIHRATVSDANLNYVGSITIDEDLMKAANLRVGQKVDIVNINNGERFQTYIIKGKAGSKDMCLNGAAARKVEIGDKIIVIAYATFSEAELENYKPTVVLVDDKNNIELITHELEGGKYV >NC_017187|404907:412652|407738_408059_+|WP_012012250.1|DBSCAN-SWA MFDGLDLKNLNLGDMLNQFQDMAKNAQNENASRIFTSKAGGGMVEISINGNSEVVDLKIDDSLLEDKDSLQILLISCMNDVIKQSDENKKMMAMNLMGGLGSFGQK |
9 | Indivirus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
1937820 : 1944745
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_017187|1937820:1944745|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_017187|1937820:1944745|1942780_1943545_-|WP_014469350.1|DBSCAN-SWA MLEINEIFGPTIQGEGKLVGTPSIFIRFGKCNFSCTGFGVIYETPSGIKKCACDSYYAVDKEFKDTWTKYQSYNDIVAEVDNLISTYNYNYKIDIVITGGEPLLYWNKKEFQKLLKHYIENGYKVTIETNASLNINFEFDYQKEILFSMSVKLSNSLEPLNKRINKNTLVKILENTKDSYMKFVIGKDFLNKAKAEIIEILKDIPKCEVYLMPLGDTADEINKNCEDVINMAIENGFKYCDRLHIRVWNNKRGV >NC_017187|1937820:1944745|1938928_1939273_+|WP_014469347.1|DBSCAN-SWA MCIFCKIVNGEIPNQTILEDENFLAFNDINPTRKIHVLIIPKEHYDSFQVTPTNIMSSMSEFIQKVATKLNIDKSGYRLITNIGNHGGQEVHHLHFHMIGGESVGRLVRDKEDI >NC_017187|1937820:1944745|1943537_1944062_-|WP_014469351.1|DBSCAN-SWA MKWEISKEFDFCYGHRVWSQTLNIDFSLDACLKCRHLHGHQGKVIVYLESNELNNSMVTDFKHLNWFKAFLDDVLDHKFILDINDPLFSTLVPNIKKEDLIKFDEGYFSINLTNFKNEELELYESYVVVDFVPTSENLSAWFLKIVQEKMNGLNIKVSKIEFLETPKSKSTFYA >NC_017187|1937820:1944745|1939283_1940219_-|WP_014469348.1|DBSCAN-SWA MATYLEFEEKIKKIEEDIIVAKTKADEPAVDILEKKLEKEVEKTFKNLNDYQKLQLARHPDRPYALDYISGLLKNAYEVHGDRHYVDDHAIVCYFGFIDNQKVLVIGEQKGRGTKEKLQRNFGMPSPEGYRKALRAAKMADKFQIPILMLVDTPGAYPGIGAEERNQSEAIAKNLFEFADLTTPTISVVIGEGGSGGALAISVADRLAMMRYSVYAVISPEGCSAILWNDPTKVETAANALKITAENLKELNLIDDVINEPLIGAHRQKEQAIFALKEYFLKSLTELKKLTPQERLDKKYQKLMNLGSFTK >NC_017187|1937820:1944745|1937820_1938813_-|WP_012147935.1|tRNA|DBSCAN-SWA MTQWIEKINNAKSLEELENLRIDTLGKKGVLTLEFAKMKSVPNEDKKAFAENLNIQKTLITQALDTKKLVLEKDALNEKLEAEKIDVTKFNNELSCGATHPVVETMNKIITYFQNLNFAVEEGPLVEDDFHNFEALNLPKYHPAREMADTFYNKDFTLLRTHTSPVQIRTMLSQKSPIRMIAPGTVFRRDFDITHTPMFHQIEALVVDEADKVSFANLKHVLVEFLQHMFGEVEVRFRPSFFPFTEPSAEVDISCVFCKGEGCRVCSQTGWLEVLGCGVVDENVFKAVGYENKSGYAFGLGIERFAMLIHNIGDLRSLFESDTRLLGQFK >NC_017187|1937820:1944745|1940276_1941536_-|WP_014469349.1|DBSCAN-SWA MRRIVITGLGTINSTGHNVKESFEAVTNGVCGIDTITLFDASEFPVQIAGEVKNFDPETVMDKKEVKKADRFIQLGIKAALEAMIDSGYVTQEDKKVDSSIADRFGIISGSGIGGLSTIEKNSVTCENRGPKKISPFFIPSSLANMLSGFISIEHNLKGPSLGHVTACAASTHALNDAVKTIVLGGADRILVVGAESAVCGAGVGGFAAMKALSTRNDNPKKSSRPFDIDRDGFVMGEGAGALVVETLESALARNAKIYCEIIGFGESGDANHITSPVIDGPLRAMKAAFEMAKNITGEYPKIDYINVHGTSTPVGDKNETSAIKELFGGKEKCPPVSSTKGQIGHCLGAAGAIEAVFAIKALDEGIIPPTINVENQDPECDLDVVPNVARKLELTTVMSNNFGFGGTNGSVIFKKYTK >NC_017187|1937820:1944745|1941979_1942723_-|WP_004510945.1|DBSCAN-SWA MKFTGSNVLVTGASRGIGAEIAKTLASFGLKVWINYRSGAQAAEAIKEEIEKAGGKAAIIKADVTNEEEFVNAIKTIIDADGELAYLVNNAGITKDKLALRMSVQDFTDVINANLTSAFIGCKEALKVMGKKRFGSVVNISSIVGEMGNPGQTNYSASKGGLNAMTKSFAKEAASRGIRYNAVTPGFIQTDMTDELKEEVKAEYEKNIPLSRFGQPSEIADAVAFLLSDHSSYITGEILKVNGGLYV >NC_017187|1937820:1944745|1941652_1941883_-|WP_004510944.1|DBSCAN-SWA MALLDDVKAVVVEQLDCDPAEVKEDSKFIEDLGADSLDVVELVMALEEKFDIEIPDEDAEKILTVADAIKYIENNA >NC_017187|1937820:1944745|1944058_1944745_-|WP_014469352.1|DBSCAN-SWA MNKVSTKKAICILSGGMDSTLSSYIAKKDGFEIITVHFNYGQRTQNRELKAFRDICNELDIKSKYEIDIPFFTQIGANALTDMSIDVPTGGLEAGVPITYVPFRNGIFLAITAAIAEKEGATAMYIGVVQEDSSGYPDCTEEFIQDMKKAINQGTKEDTKIEIITPLVHLSKAQIVQEAIKLNVPLELTWSCYKEEEEACGVCDSCRLRLNGFEQAGKKDPIKYKEFQ |
9 | Campylobacter_virus(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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