Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_016050 | Rickettsia japonica YH, complete genome | 2 crisprs | PD-DExK,cas3,DEDDh | 0 | 1 | 1 | 0 |
1. NC_016050
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_016050_1 | 494077-494178 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_016050_1
|
1 spacers
spacers of NC_016050_1
>1.1|494104|48|NC_016050|CRISPRCasFinder GTTCAGTGATCTAAACATTCCTTTTGAAGAACTAATTGCAAAAAAGGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_016050_1
The CRISPR arrays of NC_016050_1 >merge|NC_016050|1|494077-494178|CRISPRCasFinder ATTGCAGCAAAAATTATATCAAGAATTGTTCAGTGATCTAAACATTCCTTTTGAAGAACTAATTGCAAAAAAGGAATTGCAGCAAAAATTATATCAAGAATT >NC_016050|1|1|494077-494178|CRISPRCasFinder ATTGCAGCAAAAATTATATCAAGAATT GTTCAGTGATCTAAACATTCCTTTTGAAGAACTAATTGCAAAAAAGGA ATTGCAGCAAAAATTATATCAAGAATT
>NC_016050.1|WP_014120712.1|492539_493460_+|site-specific-tyrosine-recombinase-XerD MAFIAQFLEMLLAERALSKNSILSYKRDLFDFQNYLAKQKLSELNITTENIRDWIEYLASNDLQARSINRKISTIKSYYEFLISENHTAFNPVLNVDLPKYQNKLPEILSIAQIKSLLEHCSHNNSPEGIRLNAMIHLLYASGLRVSELVSLKLADILTNKTSKGEVRKIFSVLGKGNKERVIVINEQAVISIAKYLAIRDVFVNKAKPSNLIYLFPSSALAGYMTRQNFAILLKSAALYAGLNPEYISPHILRHSFASHLLEGGADLRVIQELLGHADISTTQIYTHLQTNHLKKALLHHPLNKN >NC_016050.1|WP_004995979.1|490241_490715_-|DUF2155-domain-containing-protein MKLLKIIFIITICINFPIFAENLESVTTTEDIENDVFIPLDENHPILNPNDNINDSSEFKNYTNGKIIALNNITATSEEIDFKVGEEKYFGNIKIKLHKCIKNLDPYNEDNYLLMTITEYKIDEDPNLLFQGWMISSSISLSTFEHPIYEIFAKDCF >NC_016050.1|WP_014120711.1|489005_490241_-|O-antigen-ligase-family-protein MQYLISSLIFLIPSLGMLAGLSTAATVTIFLLISFLRSINSHCERLKGAWQSSNNVIPWLDHGIQKIKKDWIPLQAHGMTMLFTAWCFISCLFAIHLINSLATFTQVFILLFLGFAVSNSSPFQNRLQLKKALIFGILTAILLFFIEYSSHGFLTRIFKTSFGLYMLDRGCALLSITAWVAIIILLSNDKKRHALMLYILVLYLLSISDSLASFLGFGIGGVIFILTRFMKPIFFKLIAISLITGSLLFPVIAKQIEPQDLSEQYLATQPSAAHRLFIWHFVANKIIEKPILGYGLASSKYIEADDSEMIDYNGEKWHPLPLHPHNNILQITLELGIIGLILFLCLVYKYLKQISNLKNKNFKAISYACFINYYIIGMISYNIWQIWWISSGIWVLVLMKLLVKPDIVIDN >NC_016050.1|WP_024704512.1|488476_488848_-|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-A MLQNSELLQEYLPIAIFFCIAVLVSGLIMILPNLLSTKKYNKDKLEPYECGFEPFSDARAKFDIRFYLVAILFIIFDLEIAFLVPWAISLNTIGKIGFFSMMFFLFVLIIGFIYEWKKGALDW >NC_016050.1|WP_004995988.1|487947_488472_-|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-B MKNNFYQEDELLSNELSNRGFLLTKVDDVIGWARANSLWPMTFGLACCAVEMMQAAASRYDMDRFGMLFRPSPRQSDLMIVAGTLTNKMAPALRKVYDQMAEPKWVLSMGSCANGGGYYHFSYSVVRGCDRIVPVDVYVPGCPPTAEALIYGLMQLQKKIKRTTGFKYDARQTH >NC_016050.1|WP_014120709.1|487241_487970_-|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-C MTLDKLIERLAAKSSILITPITVKDYLAYKIEPNFLLPFLKVLKESEELRFTLLTDLFGADFPQNNVVNSVGLGHKEQDAKPITNRKATSDNVGKSKSIDYKRFEVVYNLLSLKLNKRLIIKVYISEKETIPSAMNIFSAACWYEREVYDMYGVNFEGNDDKRRILTDYEFEGHPLRKDFPLTGYTQVKYDEKLKKVAYEPVDLDIEYRDFDFSSHWHSPSYVLPGDEKATDVIPAKSGIQK >NC_016050.1|WP_014014181.1|485967_487143_-|NADH-dehydrogenase-(quinone)-subunit-D MTNNTKTITLNLGPQHPATHGVLRLILEMDGEVVNNADPHIGLLHRGTEKLIEHKTYLQAIPYFDRLDYVSPMCQEHAFALAVESLLECEVPRRAKFIRVLFSELTRILNHTLNIGSQALDIGATTPLLWLFEEREKIMEFYEHVSGSRMHSNYFRPGGVAADLPEGLLEDIDKFIEQFPPKLHDIESLLNENRLWKQRLVDIGVASQKEAMDWGFSGPMLRGSGIAWDLRKSNPYDVYDEMDFKVPIGKNGDCYDRYFVRMLEMYESIKIIKQCIEKMPKGAVKTDDPKLTPPTRAKMKESMEAMIHHFKLYTEGYDVPAGETYKAVEAPKGEFGVYLYSQGGNRPYRCRIKAPGFAHLQGLDFMSKGHLMADVITIIATLDIVFGEIDR >NC_016050.1|WP_014120707.1|485605_485878_-|GIY-YIG-nuclease-family-protein MYWVYILCSNKHGTLYIGITNNIIRRAYEHKQTIIKGFTAKYNIIKLVYKEEFTDIQEALTRETNLKKWQSSVKIELIEKTNPEWKDLIK >NC_016050.1|WP_014014179.1|485040_485544_-|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-NuoE MNTKITNFTFDKKNLNLAEEIIKKYPPHGKRSAILPLLDLAQRQNGGWLPVPAIEYVANMLAMPYIRAYEVATFYTMFNLKRVGKYHIQVCTTTPCWLRGSDDIMKICEKKLGVKLKETTEDQKFTLSEIECLGACVNAPVVQINDDYYEDLTQKKMGKIIDKLQND >NC_016050.1|WP_024704511.1|484799_485048_-|membrane-protein-insertion-efficiency-factor-YidD MTRILLLLLRFYQYFISPLLGNNCRFHPTCSEYAKEAISMHGSIKGLWLTFKRIIKCQPFCDGGYDTVPISIKNSKTLNKKI >NC_016050.1|WP_024704513.1|494674_495838_+|DUF5410-domain-containing-protein MATKNKKETVNTETKNLANLVIQEIGNKNFDFVVLQKMQQAFSTASKQKQREAFISLLDKKLNKEQLHKLNQAIMENANELMPDNDPNFVCRTPNNKVFQEILLLEAKRSGMKAKFNDKGELQSLDVKDITQEILDHYRILQEKFYPKRDSIDLIDSRIAQSINFLLYAPLFRESDIYTTLGLKSAEIEREIQDPNGKYAKQLVDAKIGTNINFNTKENLENKAHEGKETKISSIIEKAITKLKKDKKVNIEDKRQGAIKRHLSKSLEGASDYILTFKKNALVDVIYQGLDKRQAWWSKIVNYIGIKSYSISKKNLEKIGTIINSEMKNSHTPLKIEVQEQLKQISKELNRLNNLVLPLEAKKVQAKSKKPPVPPKPEHLKKRNHGL >NC_016050.1|WP_014120714.1|495845_496628_-|enoyl-ACP-reductase-FabI MTTGLLQGKKGLITGIANNMSISWAIAQLAKKHGAELWFTYQSGVLEKRVKPLAEEIGCNFVSELDVTKPKSISNLFDDIKEKWGNFDFLLHGMAFADKNELKGRYVYTSLENFHNSLHISCYSLLELARSAEALMHNGGSIVTLTYYGAEKVIPNYNVMGVAKAALEASIKYLANDMGENHIRVNAISAGPIKTLASSAIGDFSTMLKSHAATAPLKRNTTQEDVGGAAVYLFSELSKGVTGEIHYVDCGYNIMGSNKL >NC_016050.1|WP_014120715.1|496703_498218_+|apolipoprotein-N-acyltransferase MYKPKIICLLLGILSGLVFAPTFFIPALLTLSYLCYIVQKSENWYEATKFGYLFGFGHFLSGIYWISIGVSVYIADFWWAIPFALFGLPIVLACFISASCTLSFFAKNNKYYQFIFCLCWVLFEWVRSWIFTGFPWNLIGYAFSFSDILIQPLSIIGIYGLSFIVIYISTSAYPLFSKQFTQLKILLASSVLVLTIIVIYGAVRLSNNHTNFTDIKVRLVQPSIPQTEKWNEEEFWHNLMLHINLSENLEPTDLIIWSEAALVVPDDIPQVKSKLLKMLNSTNAILITGGISDNKKQGDEFELYSAMYALDKNNHKLFEYHKSHLVPFGEYMPLKKILPFKKLTHGLMDYKEGNGGLVYLEKYNLKIKPLICYESIFSDFVRTNNEIADVIINITNDAWYGKSSGPYQHFHISRSRAVENGLPMIRVANNGISAIVDPFGRTIKKLNLNEINYTQDLIPKKLISPTIFSQFGNFTILLLIVFILLINYLLALILDNQRVLALLY >NC_016050.1|WP_109559307.1|498315_498462_+|hypothetical-protein MNDSIKHPDKLASERLKERRLAVGITQKELGQAFSVLVLSKLKNMKKV >NC_016050.1|WP_014120716.1|498913_499717_+|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MSKSKAIENNGISNTNSPNGKYMAPRPEGVKPTCVVITYSVSKDIKAVLEVLDERGASVHYIIDKDGTQKEYHNDLTDQAFYAGKSSWKGEVGVNKFGIGVMLINDAKSDFPEEQIGKLKEFLKDVAERYPNLDLKHDLVGLGEVTVNREGNAHIAPGSKFPWKELAEAGFGRYFETTQEQKSELLLSLDSTGEKVNTLQENLKEYGYGVESTSTFDQFTQQAVRVFNDRYGTGLPNEEPPISWTEAGQDVLSQLLGQTVLEQTENA >NC_016050.1|WP_014120717.1|500375_501293_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MFISNIFQKFFSFLFVLFITAAVYADQKKVAVIVPLEHAAMTEIISGIKESLKDIDAEIIVKNAHADSNILLAIIKQIKDQDIDIIIPIGTTASQTVISHITNKPIVCAAAMINSKNLPLVTGVNDEIQITDTISKLPFLQNITLIYSSSEKVIPEVEMLKLYAGKNNISLHTVMIQNFNDMPMAVKNAPENTQSFIILKDHLIVSGINILKQEAFKRRIPIIASDEGSVISGATIAVGVQEKQIGVEAGLMAKKILQGIEPKDIPFGDMKDLTLFINLKSFVKQDILTKENLSVLPFARKELEE >NC_016050.1|WP_024704514.1|501297_502137_+|ABC-transporter-permease MNILVTALEQSLIMLPLILGIYISYRILKITDLTVDGTYVLGAAVFARSLSFGLFPALIFAVIAGGIIGSIVSVMQKNNRINGLIAGILASFMLYSVNLQIMQRPNISVLGMPTLLSVLDLENWLIPLVIINCLIICSVIILLKGKLGLFLRAFGFNKDLLINLGKPAELYRTIGFSISNCLAALTGTLSAQVNGFADINMGFGVALVGIGAIVIGRHILIHANNFNVFKEIFSCLIGILFYFIALGFLLRIGIDPINLKLILGIVLFISLSSVKREAL >NC_016050.1|WP_014120719.1|502133_502856_+|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MKPYLYAENIQFKVKERIEPIIAETTLNIAKEEFVVILGHNGSGKSTLAKILAGYLKPTSGKVCLDQVRIDKIPKGQKASTLVTLTQKAEERLFTELTLEENIILWESRFSSNERLASSELLELTGAPKRFLPLLSQPLGKFSGGEKQIILLALIIAHPPKILFLDEHTANLDPKASLEVMKKTAEIIEKHKITSVMITHNLEDAVNYGKRLIVLDSGKVVLDYLKPPGFSLKELKEILN >NC_016050.1|WP_014120720.1|502935_503358_-|hypothetical-protein MGAKSANYYKDMDVNDYNYDLPDEEGVAKNTHEKLLKDVMQRLKNGEDKDGIINTLIEISINEDTRAELIEKVLNYNVNDNNPVAAPTLVTPVATPIVVPAPSTSTEEKLSAEVKTRLTIEKIRMILLISYFFIRLLTRM >NC_016050.1|WP_014120721.1|503381_503822_-|ankyrin-repeat-domain-containing-protein MDVNTKDGKGRIPIHYATYSKQHEITQILLQPGSEIDTVDNYGGTPFFYLLLKHESGQNKTLLDFFLNNKVNLNINACGESIFNHALTSRDKWLLEKLISKGADIGQGVLLHNPFDHSIAELVKIGVDKEKIIYALKNIILILMSN |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_016050_2 | 1182567-1182667 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_016050_2
|
1 spacers
spacers of NC_016050_2
>2.1|1182603|29|NC_016050|CRISPRCasFinder GTGTTTCTAGCATATTAATATCTCAATAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_016050_2
The CRISPR arrays of NC_016050_2 >merge|NC_016050|2|1182567-1182667|CRISPRCasFinder TAACTTTAATATATTATGTTTATAAGGTTTTTAAAAGTGTTTCTAGCATATTAATATCTCAATACTAACTTTAATATATTATGTTTATAAGGTTTTTAAAA >NC_016050|2|2|1182567-1182667|CRISPRCasFinder TAACTTTAATATATTATGTTTATAAGGTTTTTAAAA GTGTTTCTAGCATATTAATATCTCAATAC TAACTTTAATATATTATGTTTATAAGGTTTTTAAAA
>NC_016050.1|WP_014121122.1|1182118_1182550_-|RNA-polymerase-binding-protein-DksA MLETPKLPMGYKPSQDEEYMCPNHLEYFRQKLLRWKEDLLKESQETLNNLKEENLKESDLNDCATHETERAFELRSRNRYCKLMSKIEEALSRIKNGEYGYCEETGDPIGIKRLEARPIAALCIEAQERHENYERSHLDEPGN >NC_016050.1|WP_014121121.1|1181337_1181985_+|septum-formation-inhibitor-Maf MKQNRKNLPIILASSSPARIELLNRIKIIPSQIIPADIDETPNLRELPAPLAMRLAYEKAIKIASQIEESAIIIAADTVAAVGRRILPKATTYEEVKNCIKMLSGRRHRVYTGLCIIKKENDQLTVRQKIVQTIVKFKKLSEEEVNFYCSLDEGIDKAGGCKISGYAEAFISFISGSYSNVMGLPLFETVNALTSLGFRCSSVMPAKMNYCHSAT >NC_016050.1|WP_010977828.1|1181110_1181326_+|translation-initiation-factor-IF-1 MSKDDLIQFTGTVLELLPNATFRVKLENDHVIIAHTSGRMRKNRIRILLGDKVMVEMTPYDLTKGRVIHRH >NC_016050.1|WP_186822684.1|1180019_1180238_-|dihydrolipoamide-dehydrogenase MDIQPIENSIKFGGQNATYDVSNESPNAEEFVASFNLVPANDVDGQLRVHVASGSREIALNADSGNGTGGTI >NC_016050.1|WP_024704382.1|1178117_1178402_-|hypothetical-protein MFTQVTNLTGGINITCGKAVDLMFTGPSSVSGAIGSSTSKVGDITISGDVLNCTGGINAGYVILINGGDIKFKGTTNSLDISEGSSFSLFAFKS >NC_016050.1|WP_024704381.1|1177230_1177512_-|hypothetical-protein MPRATTKFHYKTKIVSENFKGSSSNSSAEYTNAALVQAPINYGSHKFNDDVWLQKAVIGTNAITFAPKKTAFIASDLGANTISCRSSNNDVYL >NC_016050.1|WP_012151363.1|1176218_1176458_+|BolA-family-transcriptional-regulator MAISVEELEKILKESFPNSTMKITDLVGDQDHYALEISDVQFNGLSLINQHKLVKNALSEILNKKLHAITIKTIAVPEK >NC_016050.1|WP_004997291.1|1175737_1176064_-|ribosome-silencing-factor MKKETEELKLFILECLSEKKAEDIEVIDLTGKHKLADYIIFASGRSTKNVGAIAEYVALELKNNAGINSNIEGLGKSEWVLIDAGTILINIFYPEVREHFKLEEIWKR >NC_016050.1|WP_024704380.1|1174013_1175741_-|cation:proton-antiporter MNDHILINVIILLGTAVFIVAILKRLRLSPVLGYLIAGAAIGDHGLKIVTYDQTKLLGELGVVFLLFAIGLELSFERLKAMRRYVFGLGSLQVLTTAIVIAGAMVLIDGNSSAAIITGGGLALSSTALVMQVIEENRSQSTQIGRVSLAILLLQDLAVVPLLVIVPLLAGNNKASLAAALGIALLKAVTALLTIFIVGRVFLRPVFSFISSESNNASELPISMTLLIVLSAAWATETFGLSLALGAFVAGVLVAETEFRLQAEESIYPFKSLFLGLFFMTVGMNIDALEMYEKISHILTLSIALIGIKTLIITAFCILFGFNKGVAFYSGLLLSQGGEFGFILFSLGKDSGVLEESTADILLLVVTFTMALTPLLAALGQKIAEKVDKGLGKTPTQMIELGARDLTNHIIIAGLGNTGKMVARVLEAEGISYVILDLDDERVKEELSNGLPVFKGDVSQADTLKALGTERAFAIILTMNNQVTIKKSLKTISGNYQDIPVVVKLKNLKNAREFYDLGATTIIPESYETGLQIGGTVLKNIGISEQEINRIKVQFRLGNYIIEKKEDALSEAEDND >NC_016050.1|WP_014014834.1|1173541_1174021_-|SH3-domain-containing-protein MIKILITLIIVILSTTINADNKKLPIPRFVSIKSNEVNARSGPTTKSTVEWVFVKKGEPVEITAEYKQWRQVRDINGEGGWIHSSVLSGKRSVVITSDKEIELTKSADPKSRVIAKLMPKVRCSLKKCKKQFCQITCKDYTGWISKKVIWGVYDDNDRY >NC_016050.1|WP_014014843.1|1182717_1183635_-|tyrosine-recombinase-XerC MLDTSIQALINKWQKYLVLQRNYSNHTAISYNNDLKHFLEFMNYYNSELVTINHIKTADIRLIRSWLAKRNCDNFTASSISRGLSAVKNFYRFLEKTTQLNSHIIFSIKSPKKTKLLPKALSEDDVVISLEHIEEYGNVKWVELRNKALLVLIYASGLRISEALSITKLHLQNLEFIRIIGKGSKERIIPWLPIAKNLITQYLEILPYKLGDNEPIFRGKQGKKLQPPVFNRELIKLKHFYGLPQHLTAHSFRHSFASHLLEHGADLRSLQELLGHKSLSTTQNYTKTSIKHLEAVYTTAYPIKK >NC_016050.1|WP_004997244.1|1183810_1184098_+|phasin-family-protein MKSYMNPEFYMSSMKNIPSVDLASITNTMQRAMNILLITNQIATESMQSLLKKNSEIIQNNVNTILNTTKEAATSKDFKQASECHQKCLKSIYIF >NC_016050.1|WP_014121123.1|1184145_1184748_-|phospholipase-D-family-protein MKRKNNKFIEISIAFILGMALGIYGQNPDYFTNLISQKSLALSTLQIKHYNISELSRSKVSTCFTPPAGCTKFIANQIDKAEESIYMQAYGMSDALITTALINAQARGVKVRILLDRSNLKQKFSKLHELQRAKIDVGIDKVPGIAHNKVIIIDKKKVITGSFNFTAAADKRNAENVIIIEDQELAESYLQNWLNRKASN >NC_016050.1|WP_014121124.1|1185747_1187226_-|UbiD-family-decarboxylase MSFKDLPEFLKFLEKNGELKRIALEVKTNLEITEISKRVLAQGGSALLFENVIKVDGIKSDIPVLTNLYASINRICMGLKLKSPKELRELGVLLAFLKQPQPPASFKDTLSMLPLAKRIFAMSPKTVSKAACHEIVIDKPNINILPIQRCWPDDISPLITWGIVFTRGPTKDKIDNYNLGIYRMQVISENKLLMRWLKLRGGAEHHKRWKEAKKEPFPTAIVIGANPAVTLAAVMPIPENISEYNFAGLLGNKKVELVQCKTIDLKVPAHSEIVLEGYVSLEEYLPEGPFGDHTGYYNDVEEFPVFTVTAITMKKNPVYLSTYTGAPPDEPSILGEALNEIFIPILQQQFPEIVDFWLPPEGCSYRVAVVSIKKSYPGHAKRIMLGIWSYLRHFMYSKFVIVVDDDIDVRNWQEVIWAIATRSDPRRDTSFIDNSPIDYLDFASPESGLGSKMGIDATDKIYPETNRKWGKKIEMSQEVIDKVNSMWNSLKI >NC_016050.1|WP_014121125.1|1187380_1188955_-|SurA-N-terminal-domain-containing-protein MLDNIRKTADSFIMRVLFAMIAFAFIGFGIKDVLNGRRSGDIVTFSHVKNISQEDFLRAKSLEINSISKQTGTSLTDEEIAQLNIDNRILKRLVYDNVLDYLVSYYDLDLSDDTVKILVKESPVFKNEQGVFNIKIFKTYFRNSYMDEEKYLLNFKEKALKNIFVGTFIESFYVPKVMTDNIVDYMAEKREVELIQIDLQNKPKDLQIPTPTGQQLKDFYQDNKTAFEVPEKRSFSYIKANIKDLKVSVTQDELLEFYNENKDEFGDQSFEAVQQQLHDLLKAQKIDILNMEFAKKLEDETAAGSSLVEIAEKYKLPIQNVNYISYAELIEDKIIAENADSIFELSEGELSYPIETEDKSYLILVELKSIQPAKIPEFDAIKEQVNKAWIKRNIADVNLKIIKDLAKEYNSDQENIKELKATGIKISKKSYIRSEMENDLTLTPEILLSIFNTTIGSNTPVFQVGDEVYFAHIKSSSVDELTAKNIHVNSEKNIIYNIKNSVIDELINYTIIQNDMQVKANFSK >NC_016050.1|WP_014121126.1|1189148_1195664_-|autotransporter-outer-membrane-beta-barrel-domain-containing-protein MANISPKLFQKAIQQGLKAALFTTSTAAIMLSSSGALGVAAGVIATNNDAAFSNDAAANNWNQITARGEADGNPAGGPQNNWAFTYGGDYTITADVVNCIIKAINVANTNPVGLNIAQNTVVGSIITGGNLLPVTITAGKSLTLNGNNAVAANHGFNAPADNYTGLGNITLGGVNAELIIQSATPANITLAGNIDGGGIITVKTDAAINGTIGNTNALATINVGAGKATLGGAVIKATTTKLTNAASVLTLTNANAVLTGEIDNTTGGDNVGVLNLNGALSQVSGNIGNTNTLATINVGAGKATLEGAVIKATTTKLTNAASVLTLTNANAVLTGEIDNTTGGDNVGVLNLNGALSQVSGNIGNTNALATINVGAGTATLGGAVIKATTTKLTNAASAVTFTNPVVVTGALDNTGNANNGIATFTGNSTVTGNIGNTNALATVNVGAGLLQVQGGVVKANAINLTDNASAVTFTNPVVVTGALDNTGNANNGIATFTGNSTVTGNIGNTNALATVNVGAGLLQVQGGVVKANAINLTDNASAVTFTNPVVVTGALDNTGNANNGIATFTGNSTVTGNIGNTNALATVNVGAGLLQVQGGVVKANAINLTDNASAVTFTNPVVVTGALDNTGNANNGIATFTGNSTVTGNIGNTNALATVNVGAGLLQVQGGVVKANAINLTDNASAVTFTNPVVVTGALDNTGNANNGIATFTGNSTVTGNIGNTNALATINVGAGTATLEGAVIKATTTKLTNAASVLTLTNANAVLTGEIDNTTGGDNVGVLNLNGALSQVSGNIGNTNALATINVGAGTATLEGAVIKATTTKLTNAASVLTLTNANAVLTGEIDNTTGGDNVGVLNLNGALSQVSGNIGNTNALATVNVGAGLLQVQGGVVKANAINLTDNASAVTFTNPVVVTGALDNTGNANNGIATFTGNSTVTGNIGNTNALATVNVGAGLLQVQGGVVKANAINLTDNASAVTFTNPVVVTGALDNTGNANNGIATFTGNSTVTGNIGNTNALATVNVGAGLLQVQGGVVKANAINLTDNASAVTFTNPVVVTGALDNTGNANNGIATFTGNSTVTGNIGNTNALATVNVGAGVTLKAGGSLAANNIDFGARSILEFNGPLDGGGNIIPYYFKGAIANGNNAILNVNTKSLTAYHSTIGTVAEINIGAGNLFTIDASAGDVTILNAQDINFRVPDSALVLSNFTGVGAKNILLAADLVAPGADEGNVVFDGGVNGLNIGSNVAGTARNIGDGGGNKFNTLLIYNAVTITDDVNLEGIQNVRIENNADFTSSTAFNAGIIQINDATYTIDANNGNLNIPAGNIQFAHADAQLILQNSSGNDRTITLGANIDPDNDNEGVVILNSVTAGKKLTIAGGKTFGGAHKLQTIVFKGAGDCSAAGTTFNTTNIELDITGKLELGAAKANVVLFNDAVQLTQTGHIGGFLDFNAKNGTVILNNNVSVAGAVQNTGGTNNGTLIVLGASNLNRVNGIAMLKVGAGNVTIAKGGNVKIGEIQGTGTNTLTLPANFNLTGSINKTGGQALKLNFTNGGSVKGVVGTAANSVGDITTAGATSFASSVNAKGTATLGGTTSFANTFTNTGAVTLAKGSITSFAKNVTATSFVANSATINFGNSLAFNSNITGSGTTITLGANHVTYTGTGSFTDTLTLNTTFDGAAKSGGNILIKSGSTLDLSGVSTLALVVTATNFDMNNISPDTKYTVISAETAGDLKPTPKENVKITINNDNRFVDFTFDASTLTLFAEDIAADVIDEDFAPGGPLVSIPNAANIKKSLELMEDAPNGSDARQAFNNFGLMTPLQEADATTHLIQDVVKPSDTIAAVNNQVVASNISSNITALNARMDKVQVANKGPVSSGDEDMDAKFGAWISPFVGNAKQKMCNNISGYKSDTTGGTIGFDGFVSDDLALGLAYTRSDTDIKLKNNKTGDKNKVESNIYSLYGLYNVPYENLFVEAIASYSDNKIRSKSRRVIATALETVGYQTANGNYKSESYTGQLMAGYTYMMPENINLTPLAGLRYSTIKDKGYKETGTTYQNLTVKGKHYNTFDGLLGAKVSSNINVNEIVLTPELYAMVDYAFKNKVSAIDARLQGMTAPLPTNSFKQSKTSFDVGVGVTAKHKMMEYGINYDTNIGSKYFAQQGSVKVRVNF >NC_016050.1|WP_014121127.1|1195993_1198228_-|DNA-translocase-FtsK MLYYINKILSNNKVQAVILGIIGLGIVTVLTSYNIDDPSFNSVTTDYHSNLVGIFGSYLSDCLYQFFGLAAFIIPLACFVWGRNCWYGRYRGSFVRMFVMLLALVSSSTLLSKIKLEFIPANAGGAIGIIASNFFERFTNQLYLLLIFFTFIILVVLFEIKFTSLSNFIIKLGKFLIYRIQSFLHNVFSRLSSIRLFPTKNNDKINITSSYQKPVSEKVKFPEEARSVSANPIKFFSKPVSPKISQSEIAELPPISLLRDPENHHVKGASSSELKQKAEELLTVLNDFGVKGQIININQGPVVTQYEFEPAAGTKTSRVVGLSDDIARSLSALSTRIAVIPGKNVLGIELPNKQREFFCLKELIETPEYQDKSTLLPLVLGKDLAGKPLIADLAKMPHLLVAGTTGSGKSVGINAMIVSLLYRYTPEECRFIMIDPKMLELSAYDGIPHLLTPVVTEPSKAVVALKWAVKEMENRYRMMSNIGVKNIAGYNAKILEAVKEKRVIERSIQTGFDPETGKPIYETVTMNMEKLPYIVVIVDEMADLMLVAGKDIEMLIQRLAQMARAAGIHIIMATQRPSVDVITGVIKANFPSRISFKVTSKIDSRTILGEQGSEQLLGMGDMLFMGSTSKISRVHGPFVNEAEIEQITEYLKESGTPEYISAVTEQPEEDDSSIDIGDGTSDEVLYKKAVQIVRYERKSSISYIQRSLRIGYNKAANLVEKMEKEGIVSPPNHTGKREILLPER >NC_016050.1|WP_014121128.1|1199171_1199951_+|type-I-methionyl-aminopeptidase MTIKIHTGKDFIKMRAAGKLAAETLDFITDHVKPNVTTNSLNGLCHNFITSHNAVPAPLNYKGFPKSICTSINHVVCHGIPNDKPLKNGDIVNIDVTVILDGWYGDTSRMYYVGDVAIKPKRLIQVTYDAMMKGIEVVRPGAKLGDIGHAIQSYAEKHNYSVVRDYTGHGIGRVFHDEPSILNYGRSGTGLTLEEGMFFTVEPMINAGHYDTILSKLDGWTVTTRDKSLSAQFEHTIGVTKDGFEIFTLSPKKLDYPPY >NC_016050.1|WP_158309290.1|1199984_1200098_-|palindromic-element-RPE4-domain-containing-protein MIAGSSLFKCFLDPVVKTRDDTECVFGSTQQCPAGMT >NC_016050.1|WP_014014852.1|1200197_1200506_+|RadC-family-protein MLENNLLEFSNDEIDTHHYIGHRKRVKERFVAAGAEHFSDYELLEVMLFSAIPRKDIKPLAKKLLDHFDITDLINLDKERLLSIKGTNENLYINFALLELIN |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_016050_2 | 2.1|1182603|29|NC_016050|CRISPRCasFinder | 1182603-1182631 | 29 | NC_042028 | Acinetobacter phage AB1, complete genome | 29746-29774 | 6 | 0.793 |
1. spacer 2.1|1182603|29|NC_016050|CRISPRCasFinder matches to NC_042028 (Acinetobacter phage AB1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
gtgtttctagcatattaatatctcaatac CRISPR spacer gtgtttcaagcatcttaatatctccaaga Protospacer ******* ***** ********** * .
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
403876 : 441619
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_016050|403876:441619|DBSCAN-SWA 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45 | Aureococcus_anophage(10.0%) | portal,protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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