Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_017731 | Providencia stuartii MRSN 2154, complete sequence | 6 crisprs | DEDDh,cas3,csa3,WYL,DinG,cas1,cas3-cas2,cas8f,cas5f,cas7f,cas6f | 0 | 7 | 8 | 0 |
1. NC_017731
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_017731_1 | 3363490-3363650 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_017731_1
|
1 spacers
spacers of NC_017731_1
>1.1|3363543|55|NC_017731|CRISPRCasFinder TAAGATAACAAAATCCAGTCATATTAGATGGGTCGTTAGCTCAGTCGGTAGAGCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017731_1
The CRISPR arrays of NC_017731_1 >merge|NC_017731|1|3363490-3363650|CRISPRCasFinder TTGACTTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCATCTTAAGATAACAAAATCCAGTCATATTAGATGGGTCGTTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCATCT >NC_017731|1|1|3363490-3363650|CRISPRCasFinder TTGACTTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCATCT TAAGATAACAAAATCCAGTCATATTAGATGGGTCGTTAGCTCAGTCGGTAGAGCA GTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCATCT
>NC_017731.1|WP_004917784.1|3362307_3363075_+|cell-division-protein-CpoB MNSNFRHLFVGLSLLVGVAAPWAAIAQAPIINVGSGSSGDRLTQLETAVNSQGQILYQIQQQIADNQRDIDTLRGQIQENQYKLNQIVERQKDLYMQLGQVSGGTTESSNSSAAADSSTSAPAPEASGGGEKEDYNAAVALAMKSKSKAQIDEAIGALQSFIKSYPKSSYQSNANYWLGQLNYNKGSKDDAAFYFATVVKEYPKSQKSSEALYKVGLIMQDKGQKDKAKAVYQQVLKQYPNSAGAKLAEKKLSSL >NC_017731.1|WP_014657760.1|3361787_3362285_+|peptidoglycan-associated-lipoprotein-Pal MQLNKVLKGLMIALPIMAVAACSSNKNNDQNGADSSMNQTNSGLSAEELARQQMQELQNNNIVYFGFDKYNVSPEYADMLDAHAAFLRNNPSVKVVVEGHADERGTPEYNIALGERRANAVKMYLQSKGVAGDQVSLVSYGKEKPAVLGHTEADYAKNRRAVIAY >NC_017731.1|WP_004917780.1|3360452_3361745_+|Tol-Pal-system-protein-TolB MKQAFKVVLGFLMLWATVAQAEIRIEITEGVNSAQPIGVVPFKWSGSGTPPQEIGQIVGADLRNSGKFNPIEPSRMPQQPATASEVVPEAWTALGINAVVVGQIQPAADGSYVVSYQLVDVAGSPGTVLSQNQYKVTKEWLRYAAHTASDEVFEKLTGIRGAFRTRIAYVVTNKGGQYPYELRVSDYDGYNQFTVHRSPEPLMSPTWSPDGERLAYVTFESGSSALVIQTLSTGAVRQVASFPRHNGAPAFSPDGTKLAFALSKTGSLNLYIMDLASGQIRQVTDGRSNNTEPSWMPDSQTLVYTSDQAGRPQIYKININGGSPERVTWEGTQNQDADVSPDGSFIVMVSSGGGQQHIAKQDLATGNVEYLTKTFLDETPSIAPNGTMVIYSSSQGLGTILQLVSTDGRFKARLPATDGQVKFPAWSPYL >NC_017731.1|WP_004917777.1|3359194_3360313_+|cell-envelope-integrity-protein-TolA MGKTKEKKDNLRLSLLTSLALHVLLIGLIIIGSLVSVVKLGGGGEEGTVIDAVMVDPGAVVQQYNQMQQQENSAKQAAKERKEKERKQEAELREKQEQEQKRLQQLEQERIQSEREAQERQKQVEQQQKQAAEAARKAKEEQKIAEEAAAKAKAEKERLIKEQAAAKEKAEAEAKKEAEAIKAKAAADAKAKAEKEAKAKAEKEAKEKAEKEAKAKAAKEAKAKADKEAKAKAAKEKAEAAKNSAEIDNLLGDLTSTGPSREGGAASAGQGGGKRSGASNADVENYASKIKAAIQSKFYDSDTYRGRTCELKLQIAPDGLLVSITPKNNASNDPALCSAAIRAANLATLPRPPADVYEAFKKQGSTVVFSPK >NC_017731.1|WP_004917775.1|3358735_3359158_+|colicin-uptake-protein-TolR MARNSRRRELKSEINIVPLLDVLLVLLLIFMATAPIISQSVEVDLPDAAESQTVSSSDNPPIILEVAGVGQYNMLIDGERLELLPPEQIAAEAKAQLDKNPKAIFLIGGAKEVPYDEVIKALNILHQAGIKSVGLMTQPM >NC_017731.1|WP_004917773.1|3358034_3358718_+|Tol-Pal-system-protein-TolQ MTDMNIVDLFLKASLLVQIIMFVLIGFSIASWAIIIQRTKILNAAAREAEAFEDKFWSGIELSRLYKESQARRDSLSGAEQIFHAGFKEFVRLHQANIHAPDAVVTGASRAMRISMNRELESVEAHIPFLGTVGSISPYIGLFGTVWGIMHAFIALGAVKQATLQMVAPGIAEALIATAIGLFAAIPAVMAYNRLNQRVNKLEQSYDNFMEEFLAILHRQAFSADKK >NC_017731.1|WP_169342104.1|3357633_3358038_+|tol-pal-system-associated-acyl-CoA-thioesterase MIVMLFRWPVRVYYEDTDAGGVVYHARYLAFFERARTEMLRDKGINQQSLLAENIGFVVRSMTTDFVRAARLDDLLEIETQIIEMKRASLTFQQRLIDSQGNLLCGATALIACVDTSKMKPTALPKSIVAEFKQ >NC_017731.1|WP_004917770.1|3357222_3357510_+|cyd-operon-protein-YbgE MLVDKSYQLLDKGPVRILILILALGIAGSVMWDPTQFAAKTSSFLIWQGLLLIWATCSGMIFGVGFRPNKLIWRLLFHPLPAIIILIWGLVKVFS >NC_017731.1|WP_008912071.1|3357102_3357216_+|cytochrome-bd-I-oxidase-subunit-CydX MWYFAWILGTLLACSFAVIAALALEHAEDKAAAKDGE >NC_017731.1|WP_004917768.1|3355950_3357090_+|cytochrome-d-ubiquinol-oxidase-subunit-II MFDYEVLRFVWWILIGVLLIGFAVTDGFDMGVGFLLPILGKTDTDRRIMINSVAPHWDGNQVWLITAGGAMFAAWPQVYAAAFSGFYVAMILVLAALFFRPVGFDYRSKLENPKWRNMWDWGLFIGGFVPPLVIGVAFGNLLLGVPFQIDSQQYLTYTGNLFGLLNPYGLLAGVVSLMMIVTQGATYLQMRTTGELHLRVRKATYVTALLTLLAFAGAGAWLVMGIDGYVVTSTIDTLSVSNPLNKTVEVASGAWLTNFNNYPVLWALPALGVVLPLLTMLFSKADKNALAFVSSSLTIACIILTCGVAMFPFIMPSNIMPNASLTMWDATSSLFTLQVMTVVAIIFVPIVLAYTAWCYYKMFGRLDKNFIEGNKHSLY >NC_017731.1|WP_014657761.1|3364112_3364859_+|phosphatase-PAP2-family-protein MKKLLAVFCAGAFVSTSVFAAIPPGNDVTTKPDLYYLKNSQAIDSLALLPPPPEVGSILFLNDQAMYEKGRLLRNTERGEQAAKDADLAAGGVANAFSEAFGYPITEKDAPEIHKLLTNMIEDAGDLATRSAKEKYMRIRPFAFYGVATCNTKDQDKLSKNGSYPSGHTAIGWASALVLSEINPENQDKILKRGYELGQSRVICGYHWQSDVDAARIIASGAVATLHSNPEFQKQLQKAKDEFAKLKK >NC_017731.1|WP_004917792.1|3364938_3365814_-|aminoglycoside-6-adenylyltransferase MESPASLINKIISVSLLDPRIDAVILTGSRGREQQIDHYSDIDIELVGSGVTALFHDQQWIHQFGQPLVALHLTNGGENEPECPTCLAIYEQGRKVDFTFAEPSRLQKMKQYGLDNTYARGYTILLDKSGITDNLPDSDQVQLPPKQLSQNKFTFIVNEFWYESHQVAIALSRNELWSAWSRDVDMKNALLTMLECYVSNKSKGQQDVWYHGRAYQQWMPEHIIQAMETLFDYRNAQQAAYSLHLLMKCFDEITVEVAQQLNYTIDHTLGQRMQTLVVGMLQDNSLLPEGI >NC_017731.1|WP_004917794.1|3366063_3367104_+|quinolinate-synthase-NadA MSEFIDFNQSVYPFPARPALLSSEEKAFYRERIKALLLEKNAVIVAHYYTDPEIQALAEETGGCVADSLEMARFGARHSASTLLVAGVRFMGETAKILSPEKTVLMPTLDAECSLDLGCPEADFARFCDQHPDRTVVVYANTSAAVKARADWVVTSSIAVELIEHLDSLGEKIIWAPDRHLGRYVQQQTGADILCWQGACIVHDEFKTQSLSKMKALYPEAAVLVHPESPQAVVELADAVGSTSQLIKAAQTLPHPSMIVATDKGIFYKMQQACPDKSLYIAPTAGEGATCRTCAHCPWMAMNGLKAIAQALESHGEQHQIYVSEALRQKAMLPLNRMLDFAESLK >NC_017731.1|WP_004917797.1|3367181_3367898_+|nicotinamide-riboside-transporter-PnuC MDFFSTSNVLVNIPLWDSVYELSYIEAVGTVAGLLCILLASLEKTINYLFGLINVTLFGVIFFQIQLYANLLLQVFFFIANIYGWYAWSRVDNQQQTELKIRWLSLPKATITVIISLFVIIYLTYNIDWVFGVLAEWAINILNLFGANLTMPVLEPDAFPFWDSTMTVLSVVAMILMTRKYVENWLLWVIINVISIIVFYKQGVYAMSLEYLILLGIALNGSRLWVKSAKQNGSVPLS >NC_017731.1|WP_014657762.1|3368265_3369321_+|3-deoxy-7-phosphoheptulonate-synthase-AroG MNYQNDDVRIKQIKELLPPIALLEKFPATDKAAFTVHEARLAIHNILSGEDDRLVVVIGPCSIHDTKAALEYAERLNKLREELKDSLEIVMRVYFEKPRTTVGWKGLINDPNMDNSFNINEGLRIARELLVKINDQGLPTAGEFLDMISPQYVADLMSWGAIGARTTESQVHRELASGLSCPVGFKNGTDGTIKIAIDAINSARSPHCFLSVTKWGHSAIVNTSGNPDCHIILRGGKEPNYSAEHVKAVREGLVNAGLTPSIMIDFSHANSNKKFERQMIVADDVSEQLRQGDRSITGVMIESHLVEGNQSLESGEPLVYGKSVTDACIGWDDTEKVLRQLSDAVIARRQK >NC_017731.1|WP_004917800.1|3369871_3370558_+|porin-family-protein MRKLQLASLTFALISTMGSAFASTNQEGYYGSARLSKVWQKADSMDTSLRPGIGQFVSGDDKDDFYNASLAAGYQYGNGWRTEGEYSFNKKAEYTSGSTAFSTSFNHHKTESQRLMLNVYRDYDIYQGISVYGTVGLGVAKVKSSGWQGNAARQYGSNTDTNLAYSIGAGVSYEPIDKLNFDLGYRYIDLGKIESGMNRFANARGIQDEQMKAHLKSQELVLGVRYLF >NC_017731.1|WP_004917803.1|3370641_3371394_-|2,3-diphosphoglycerate-dependent-phosphoglycerate-mutase MAVTKLVLVRHGESEWNKENRFTGWTDVELSDKGREEAKNAGQLLKDEGFVFDFAYTSVLKRAIHTLWNILDQVDQQWLPVEKSWKLNERHYGALQGLDKSETAAKYGDEQVKLWRRGFAITPPELTKDDERFPGHDPRYAKLSSEELPVTESLATTIERVVPYWEQEIKPRVAAGEKVIIAAHGNSLRALVKYLDNMGEEEILNLNIPTAVPLVYEFDENMKPIKHYYLGNQDEIAAKQAAVANQGKAK >NC_017731.1|WP_014657763.1|3371565_3372396_-|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MASWFILAASLTTLATHRFIATFLLLLATTIALFTGVLSWQAILLFVAITVIGVIGWRFQYHVWVKVISEVTLVICAVGLLIHFFPGFHNLKYLDSVIVGEQSRPFTMYFNFDKALVPFVLLFCLPSLFSAQAPKTAKPWQWWLLIIAVPMLLVVAAIAGGLGFEWHLPTWLPAFIICNLLFVSLAEEALFRGYLQQRLTQWFGSPYLALVVCALVFGAVHFAGGPLLILFATLAGIIYGLAWMWSGKLWLAVSFHFGLNLLHLLFFTYPVKMVAG >NC_017731.1|WP_014657765.1|3374259_3375051_-|molybdenum-dependent-transcriptional-regulator MQAEILLTLKLQGSLFADPRRISLLKQIKATGSISQGAKLAGISYKSAWDAINEMNQLADDILVDRATGGKGGGGTTLTHYGERLLQLYDLLAQIQQKAFDVLKEDTLPLDSLLAAISRFSLQTSARNQFFGTLIARDHHQVQQHVQVLLADNKTIINAALTEQSANRLRLTEGKEVLALIKAPWIKLTKQPIKNSEFDNQLAGKITALERGQENSEVIVTLLGGESLCSTLSNQEVDSQQLQLNDNVTALFNADQVIIATLC >NC_017731.1|WP_014657766.1|3375297_3375447_+|multidrug-efflux-pump-associated-protein,-AcrZ-family MLEILKSMGFALLMVPVVMFLIMGLIYGLGAFFNLLSKAHVPHHHTEKE |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_017731_2 | 3671895-3671998 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_017731_2
|
1 spacers
spacers of NC_017731_2
>2.1|3671925|44|NC_017731|CRISPRCasFinder TATCAATAGAAACAGTGCCCTCAAAATTGAGGAGGGTTAACGAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017731_2
The CRISPR arrays of NC_017731_2 >merge|NC_017731|2|3671895-3671998|CRISPRCasFinder TGTGATTATTGCCATAGCCGGAAAGGGTAATATCAATAGAAACAGTGCCCTCAAAATTGAGGAGGGTTAACGATTGTGATTATTGCCATAGTCGGAAAGGGTAA >NC_017731|2|2|3671895-3671998|CRISPRCasFinder TGTGATTATTGCCATAGCCGGAAAGGGTAA TATCAATAGAAACAGTGCCCTCAAAATTGAGGAGGGTTAACGAT TGTGATTATTGCCATAGTCGGAAAGGGTAA
>NC_017731.1|WP_014657967.1|3671580_3671772_+|hypothetical-protein MQKTTKKKTNRYFNGVPTTRLIVTCEQSVIDKVDAHIRADRVTRGNRAEFVRQAIIEKLQRDT >NC_017731.1|WP_014657966.1|3671051_3671504_+|ProQ/FinO-family-protein MTINQRKTLTLKRKNPPATNTPKSIQAKTPQEAPQQPKKKNKADIHAKKKQRRIDRIAKHWTLFSEPEAKPLMIGIKEAMIAEVADKGLDIPESHIKQGLHAYINRKAYLKALILGGNRFDIHGQPSGEVTPEQQATAAQKLKQWGKPEQ >NC_017731.1|WP_014657965.1|3670271_3671009_+|competence-protein-CoiA-like-family-protein MLTANTDLGDRIVAKEAVKKGVRYFCPECHSEVILKQGKVLTAHFAHKPPVSCYYGSGESEQHRRAKEEISKALQFWEDTEYVEIEKSFGDVRADIYAVIRNVKVAIEIQKSTLTPEIIVKRTEAYTKKGIYILWIALADERINKYSYIPKWWEKWLHAAYFGRLYYWDCLDSVIPVSFGDVQTYVEETSWGGGYMKTLKRYKRPIQHSPVSIVESFTPAFGKAWSYGSFQIPNRLIFTQRKEIK >NC_017731.1|WP_014657964.1|3667519_3669892_+|toprim-domain-containing-protein MKPIDIIREVKLKANGQWQNILSSLGVEVPLNTHTACPACGGKDRFRFDDKDGNGTFICSQCGAGDGLDLIQRIFGGSVTEAAQEVASIIGIDTRSDNPPTYSSDEVKAQQEAQRAQQEETKAREKAEKHKRFTERYSRTIAHIKRGESDYIKAKGFQGVEMDLLPDGSLIIPLLDGNGTITAAQTIKPNGEKRLLLDSSKNGSYYPINEPINVHTVIIAEGLATAMTCHLIQPEAYTVAAIDAGNLIHVAKVMRTKYPESKIIIAGDNDIKPDQSNTGKLAAEKAAKAVNGITALPPTDDKADWDDYRLSHGIEAARQAFNEVLGLQGGKAIMKPKNTKRKMKPRNNLAQLADNEKALLLAEQYEGVAVHPESEAFYTYQQGVWLKTSFLDLSREMGRVYMQHNTNFSKRALNNVVEALKIVAPVMGEPCQSLIPFSNGVFDIKTKLFSPHSPSNWLLNHNGIEYTPAKPDENLRDDAPNFHKWIDHAANSDPYKMKRIFAALYMVLANRYDWQLFLEITGEGGSGKSVFTQVATLLAGQHNTASGNMAALDTARGRAQFVGKSMITLPDQPKYTGEGTGIKAITGGDAVEIDPKHEQQYTEIIRAVVIATNNTPMIFTERAGGVARRRVIFQFNNKVKDEDKDPLLSKKIAEEIPVIVRRLLATFDDPEEAKMLLIEQRDSAEALEVKRASNPVLDLCAALAFMSEPRGLEMGGGRKVEEERQPRKYLYHLYLSFIEYQGLGRPLSVTEFGKAIKEAAKEYKSEYLTRTINGRRQTNVQLTDDVNAFL >NC_017731.1|WP_014657963.1|3666908_3667505_+|hypothetical-protein MNISNINAFEHSEYGVILITGAANQEAISYSEALDALNDGSFDGDLLLGFELVLAISKGERDAFFNPTNQQRVVLWRWIVAASFVMEQADNNGSHQADNGKGGKITAAVYRNKHAALTIYAASERLLLANHVEGVAYEAFGSNDGASMAIRMYMDFINLEPRQGCRLSDRGREGLSILHDDLIRAIENGEFGNTATIH >NC_017731.1|WP_014657962.1|3666714_3666909_+|hypothetical-protein MKQEQKRELEMLLEPHQSKVLMLITLLSTWLEAEECNETRDMIWAVLIVVYSIRDEMNEAAEGK >NC_017731.1|WP_014657961.1|3666541_3666715_+|hypothetical-protein MRTFQIAGYGTTPKGLTLGINRRVISATQKEAQSQVMREAQRDGLTDIRINYVREVK >NC_017731.1|WP_014657960.1|3666335_3666545_+|hypothetical-protein MKTIKLKVGHLSALKEVEHINEEIQALLTPLLTAVENEADTDTHFPLRAVNRLVCAQGKEITRLAEVLK >NC_017731.1|WP_014657959.1|3666159_3666339_+|hypothetical-protein MSKPIPLDVATYKAQQCNSLFTVILEQASNECSKELLDLISIACDLNEEIWQSLAEATK >NC_017731.1|WP_014657958.1|3665221_3666163_+|host-cell-division-inhibitor-Icd-like-protein MITLCSIKGIAYQVNDSLLAGNNSILANRSLTKNLVNQSAKIYANQSGEYFSDCNSGEHLSTPKRGSAKRGEFTPFDKGDFSHLIQGLIGVTTQGRIEFFEFIKKGSQSATLGNVDIEYRASENYQDSDHFAVSTDKSECLVKNFDDNHFTFLLTFGYSKNALAKSSVRIGVLNQLTATHDAPCVFFCVNAYAHLLNAVLYRAYSMVAAAEQPKGWLESVNSSNANSTVVTTPEIGVSSGDSLTKLTEIIVMMATPTQTQFKFLFLAVKRTDKTDTPHRIEATASNEHDARLMLVRDYILSFAGRLPVKEVAA >NC_017731.1|WP_158309817.1|3672281_3672455_+|hypothetical-protein MMLRKGTQAGTQRNDIIRIGNYLIIPRTSLWVCTEIAYFNLLTWLPLWLPAKRHILR >NC_017731.1|WP_014657968.1|3672532_3672721_+|hypothetical-protein MLQREAIEAVMMELAHQQGLSLNGRDRLDIRTGVAQIIQAKERHRRRMTAPTYQWTMPEPKR >NC_017731.1|WP_014657969.1|3673171_3673738_+|cytochrome-b/b6-domain-containing-protein MSILKSIWDFLGLYQTKKIRILHVLILLLVISQIIVSNWMTGTKSVVIPFFEETYLFTWIHIVSGFVLFFLTFFLVVLCFNQRGFRYFYPYLWGDFKQIKEDINSLLAKKLPDSSPKGLAATVQGLGLGALSIVILSGIAWFFLWLQQSPLALEARSIHKSLTILIEIYIYGHGGLGIIHFIIWKKVK >NC_017731.1|WP_014657971.1|3675394_3675799_-|hypothetical-protein MSQDFNVYLSSKSLPSPFEWQAEIAKVNKSLIMDTDFDLLTFSGFLPYQLDNEITGFEYGSWFMDDDHKKEINIPTADFCILFSVGNRPLELIAAVISAYCLVKLTDGVLSDPQAGIHIPPSQIDSWMKAMLAK >NC_017731.1|WP_154640039.1|3676158_3676320_+|hypothetical-protein MRKAKSTRITTSGTVIKSPEKVKTATGKVMATMTIQAESDKRSPDFHNHVGWL >NC_017731.1|WP_014657972.1|3677033_3677582_+|tyrosine-type-recombinase/integrase MSTRKYLTQQEISRLLAACHLSRHPERNSCLIYMCFIHGLRASEALSLKLSDLNLESNELYVHRLKNGFSVNHPLIDEEIPLIKAWLKIRNTWKGKESQWLFLSERGTAMTRQRFYQLFSRLGELAELTLGIHPHMLRHACGYALADRGADTRLIQDYLGHTNIQHTVRYTASNPARFRGVW >NC_017731.1|WP_004918238.1|3677981_3678296_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MQSNLSPKEIVGSNIHKARRAKGLSGSELADLLLCSQQHVSRIERGVIRLHLEQIKQIANSLDIDINCLLDGVGFQNNSINYIHNMECYFKAEGWFSGTSQFMK >NC_017731.1|WP_004918240.1|3678306_3678537_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MSGNIIKPTFNIIVGKKIKRYRKEMNLTAEELGRYIGVSQQQISRYESGVNHINIDFLSQLSELFKVPIQVFLIED >NC_017731.1|WP_014657973.1|3678716_3679253_+|type-1-fimbrial-protein MKMKSIAMATFMALGLASAANAADQGHGKITFKGAIIDAPCSISPNSIDQTVELGQISNMALVDGGKSTPRPFEITLDNCDITKLAKGVQLTFSGAAASFDNTNKTLGIVGTGAGAGVQITNGSGNVVTLGTATPFQQIQNGNNTLNFAAYLKGNGGDIDTITAGDFSSVADFTLSYE >NC_017731.1|WP_014657974.1|3679320_3679857_+|type-1-fimbrial-protein MNHSITSGVFSLILSIGTLTAVSTAHAQGSVSMNGSIIETACAIDVGSRDQTIDMGSIALTQIRRDGQGPARPFVIRLVNCVLERQNPDKPNWQYFRVTFDGSHDRGLFGVNGQAQGVGLQIQREGDGEIAIPGQGMSVSALTAGTKDLTYRLRLVANNRPLVSGQYYSQLRFKLDYE |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NC_017731_3 | 3839179-3839686 | TypeI-F |
I-F
Consensus repeat of NC_017731_3
|
8 spacers
spacers of NC_017731_3
>3.1|3839207|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTAGATTCAATGGCTATAAGTTTATATTCTT >3.2|3839267|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTAGAGAAAGGCGATTTAAAGAAAGCCAAG >3.3|3839327|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAGCTAAGTCACGAACGCCTACACCTAGTTC >3.4|3839387|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTATTCGTCCAGCCCTCGATTACAACCAAC >3.5|3839447|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTAGAAGCCCACTTTATAATTGACCAGGGT >3.6|3839507|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAGTGTCAGCGCTAAAGCCGATTTGTGTAA >3.7|3839567|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAACATGACGAAAATTATGCGTTGGCTAAGAG >3.8|3839627|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAAAATGACAAAGCGCAGTTGGAACAATAAC |
cas1,cas3-cas2,cas8f,cas5f,cas7f,cas6f |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017731_3
The CRISPR arrays of NC_017731_3 >merge|NC_017731|3|3839179-3839686|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAAATTAGATTCAATGGCTATAAGTTTATATTCTTGTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAAAATTAGAGAAAGGCGATTTAAAGAAAGCCAAGGTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAATTAGCTAAGTCACGAACGCCTACACCTAGTTCGTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAATTTTATTCGTCCAGCCCTCGATTACAACCAACGTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAAAATTAGAAGCCCACTTTATAATTGACCAGGGTGTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAAAAAAGTGTCAGCGCTAAAGCCGATTTGTGTAAGTTCACTGCCGTATAGGCAGTTTAGAAAAAACATGACGAAAATTATGCGTTGGCTAAGAGGTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAACAAAAATGACAAAGCGCAGTTGGAACAATAACGTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA >NC_017731|3|1|3839179-3839686|PILER-CR GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA ATTAGATTCAATGGCTATAAGTTTATATTCTT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AATTAGAGAAAGGCGATTTAAAGAAAGCCAAG GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TTAGCTAAGTCACGAACGCCTACACCTAGTTC GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TTTTATTCGTCCAGCCCTCGATTACAACCAAC GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AATTAGAAGCCCACTTTATAATTGACCAGGGT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AAAAGTGTCAGCGCTAAAGCCGATTTGTGTAA GTTCACTGCCGTATAGGCAGTTTAGAAA AAACATGACGAAAATTATGCGTTGGCTAAGAG GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA CAAAAATGACAAAGCGCAGTTGGAACAATAAC GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA >NC_017731|3|3|3839179-3839686|CRISPRCasFinder GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA ATTAGATTCAATGGCTATAAGTTTATATTCTT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AATTAGAGAAAGGCGATTTAAAGAAAGCCAAG GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TTAGCTAAGTCACGAACGCCTACACCTAGTTC GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TTTTATTCGTCCAGCCCTCGATTACAACCAAC GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AATTAGAAGCCCACTTTATAATTGACCAGGGT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AAAAGTGTCAGCGCTAAAGCCGATTTGTGTAA GTTCACTGCCGTATAGGCAGTTTAGAAA AAACATGACGAAAATTATGCGTTGGCTAAGAG GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA CAAAAATGACAAAGCGCAGTTGGAACAATAAC GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA >NC_017731|3|1|3839179-3839686|CRT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA ATTAGATTCAATGGCTATAAGTTTATATTCTT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AATTAGAGAAAGGCGATTTAAAGAAAGCCAAG GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TTAGCTAAGTCACGAACGCCTACACCTAGTTC GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TTTTATTCGTCCAGCCCTCGATTACAACCAAC GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AATTAGAAGCCCACTTTATAATTGACCAGGGT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AAAAGTGTCAGCGCTAAAGCCGATTTGTGTAA GTTCACTGCCGTATAGGCAGTTTAGAAA AAACATGACGAAAATTATGCGTTGGCTAAGAG GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA CAAAAATGACAAAGCGCAGTTGGAACAATAAC GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA
>NC_017731.1|WP_014658063.1|3837985_3838921_+|flagellar-hook-associated-protein-FlgL MRLSTNMIYHQRLQDMNNAQARWMDAGSQLASGKRVSKPSDDPQASSQAVRVNQSENRNQQYVASRGFAKTGMLLQMSVLTQMTEVTTQIDTTIIQASNQGSLSDSDRMSLAEQLSGLKDQLVALGNTTDGNGRYIFAGYKSDKPPFEVNAAGDVIYKGGDKAIMQNVSSDREMTTYFTGAQVFATDSNNVVNVFKALNEGIAALKTPQDQATQSEKEAAQKALDSANTAVKSALDKISNIESKQGLQLQEIDQLNFLADTRSIQNSQRISELLDTNWTGVTTDYYKEMAMFQASQDIFKDLNSMSLFGGR >NC_017731.1|WP_014658062.1|3836317_3837958_+|flagellar-hook-associated-protein-FlgK MLNNVMNNALSGVNAAQGGLSVISNNLANAGVGYYHRQSAVFGENPGTMTPNGYFGNGTYFSHVRREFDEFINQQYGQSRARSGEYEAYAKNSSQVDDLLTNDIEDISSNIGSFFTALDAASSDASDKTLIDVFLGKSNALVGQFKEADRRLQEMERDVNRQIETKVKDINTYAEKIAGLNQQIARVRSVSGSEPNDLLDVRDRLVSEINSLIGVKVIEQNGNYNVTFANGLPLVTGENANRLEAVPSSQDDSRFSIGFVGANGQVREIADDAFRGGELSGVLRSRKEVIDPAYQKLNKLALVFASKFNEVHKKGFDANGNPGKDFFEIGKGNVVSNTFNRGKAEFDFNYSDVSQVTGNNYEMRFDGKEWNVTRLPEGFAVTVDRSTPDTLKFDGIELKITQNNAQSGDSFLVKPVNGVINGMQSLISDAANFAAAGEKGSGPGDNDNLKELVKLQDQKLIGGTSTFSDYYATIVNDVGNQTKQAQIDSETQNKMTESFYQQEQAVSGVNMNEESIQMQKIQQFFNANAQVLKTVDDLFNALMRAF >NC_017731.1|WP_004918619.1|3835092_3836073_+|flagellar-assembly-peptidoglycan-hydrolase-FlgJ MNDMQLMQGAAFDLQSLSHLKRELTDSPDKGLRQVTQQLEATFVQMMLKSMRDALPQDGLFSSDQTRMLTSMYDQQIAQDLSQKGLGFGEMMYQQLTQMQGDTSSEDVPVKPFNMDDRLIDSLPNQAMAQIVRRFAPLGDALSSSMQKVKSLSLNSQNFISRLIEPAKVASQKSGISHLLVLAQAALESGWGRREILTAEGKTSHNLFGIKAGKSWQGPVTNIMTTEVINGKSIKMRDDFRVYGSYEEAIADYINLLTENPRYRDVKHAQSPEVAARRLHQAGYATDPNYADKLITLINQIRGYQTADKAASRAVQAYTVDLSDIF >NC_017731.1|WP_014658061.1|3833989_3835093_+|flagellar-basal-body-P-ring-protein-FlgI MNKLVTLLLTLLCLFATSAYSERIKDLTTVQGVRDNALIGYGLVVGLDGTGDQTMQTPFTTQSLSNMLSQMGITVPPGTNMQLKNVAAVMVTAKLPPFARSGQAVDVVVSSMGNAKSLRGGTLLMTPLKGVDGQVYAMAQGNILVGGAGASAGGSSIKVNQLAGGRITGGATIERELPTSFGQNGIINLQLNDDSFTLAQDISDAINRLRGAGTATPLDSRTVQLRVPMNNSDQVRFLAQIQELNVRTPIAEAKVILNSRTGSVVINRSVTLESCAVAHGSLSVMVERQTQVSQPNTPFAGGQTVVTRNTNIGVREQGGALQKVNASVQLNQVIQALNTLGATPTDLMSILQAMESAGCLRAKLEII >NC_017731.1|WP_014658060.1|3833216_3833948_+|flagellar-basal-body-L-ring-protein-FlgH MTKNGFTPEIKGDSFFSPSKVLVIALVLATSGCAYVKPRPLVDTQTSALPTAPTAPAPNGAIFQSAQPAYYGYQPLFEDRRPRNVGDILTINLQENVSASKNSSANANRSGKTGFLAAILPGFMQGWLGGSNTELDVKGSSDFSGKGGANANNTFRGTITVTVDQLLANGNLHVVGEKRIAINQGTESIRFSGVVNPRTIGADNNVSSTQVADARIEYVGDGYINESQTMGWLQRFFLNVSPY >NC_017731.1|WP_004918612.1|3832308_3833091_+|flagellar-basal-body-rod-protein-FlgG MIRSLWIAKTGLDTQQTNLDVISNNLANVSTNGFKRQRAVFEDLLYQNIRQPGAMSSEQTSLPSGLQLGTGSRPVATMRIHSQGALNKTGNTTDIAIKGQGFLHVQLPDGTDAYTRDGALQPNQDGQLVTSSGYQIVPAITIPDNANSLTIARDGTVSITVYGDNQPQQIGQITLTTFINDAGLESMGENLYMETASSGAPNESAPGTNGAGLLYQHMLETSNVNVAEELVNMIQTQRAYEINSKAVSASDQMLQRLTQL >NC_017731.1|WP_014658059.1|3831533_3832289_+|flagellar-basal-body-rod-protein-FlgF MDHVIYTAMGGARHALENQAIVSNNIANVSTSGFKAQLAAMRAVPIHGDSQQTRTLVVASTPGADMSQGPLNYTGRPMDVALNDKHFLAVELADGSEAYTRNGNIQISPDGELVIGERRLQGDGGPINVPPNAELTIGEDGTVTALLATDPPTMLGQIGRLKVVEAQPQDLIRGEDGLFHLSPQAAAANGNGLAQSERASVTSGVIEGSNVNAAEAMVSMIANARYFEMQMKVVRSADENAQKANQLLAVS >NC_017731.1|WP_004918608.1|3830297_3831518_+|flagellar-hook-protein-FlgE MSFSQAVSGLNAASAGLDSIGNNIANSATNGFKGATTSFADMFAGSGVGLGVNVAAVTQNFKDGPITRTDRPTDVAISGNGFFRVQDQNGDIFYSRDGQFIRDKSGNLVNNQGMTVTGYPAGLDENGNVVVQSGGVPQGLNIPTDMMDAQASDLAKLTINLNSEDKVKSKPFDINNPDDTGSYNFSTTMTAFDSQGNTHEISVYFVKTDDNKWTAYAKDAGDKVAKKLGDMEFDGNGRLNSPTNAVFAFDYQGLNGANNGTLQIDLNKTRQQKVSESSVSAIDVNGYPAGEYTNFKVEDNGLIVANYSNQQKRVVGQVALSAFANPNGLVSQGGNVWAPSNASGNPMDGVPGVGQFGKLTSGALESSNVDMSQELINMIVMQRNYQSNAQTIKTQDQMLQTMVNLR >NC_017731.1|WP_014658058.1|3829427_3830267_+|basal-body-rod-modification-protein MGIAATMYDSLDNTTAGPEPLKSNIPNKNKSQTDDMRDTFLKMIVTQMQNQDPTKPMENAELTSQLAQIATLESMNKLSDKVSGISSQIGSGQSLQATQLVGKGVLIPRNEIVLAPLKTQNDSDNTAISKPTNPLPDDETSRALSAANDNGGDDDVSQGDYISSPFGFFLPKMADSVEITIRDKNRAIIRTISYDTEVKPDIYDMSWDGRDDNGKLVADTNSKYFFDVRAVSNGAEIEVTKLGYTRVNGVTPGTDAPLLDVGIGQSVPLSSIFKVYPSS >NC_017731.1|WP_004918605.1|3829010_3829415_+|flagellar-basal-body-rod-protein-FlgC MALLSIFDISASALTAQSQRLNVSASNMANAESVVGPDGEPFRAKQVVFQMTPQGRNGVGGVRVSQLIEDPTPPRMEYKPGHPLADEKGYVRMPNVDMVGEMINTISASRSYQANLEVMNTAKTLLQKTLTIGQ >NC_017731.1|WP_004918626.1|3839958_3840339_-|DUF805-domain-containing-protein MNWYLEVIKNNYANFNGRARRKEYWIFSLINFIIIIPLYLVVLASTNDYTGDINGLGIVALVLLMIYCVAILIPSLAVTVRRLHDIDKSGWWYLLTFIPFGGLVIFVFTCLDGTPGNNRFGSNPKE >NC_017731.1|WP_014658064.1|3840538_3840712_-|DinI-like-family-protein MVTIKIRFNENKKNQLPISTFEALKNEVTKRLSAKYSDLRVDINWGTQDNISIDGLG >NC_017731.1|WP_154610394.1|3840784_3840934_+|hypothetical-protein MMKKAHFTETQIINILKLAGSGMKVEDICRHWSAVLVQVLTRQRNDDHF >NC_017731.1|WP_014658067.1|3842937_3843231_+|DUF1240-domain-containing-protein MKDRILFSFLTGLFGFGAPIVLYFSYFGFILAFKKKPTKKTIKAANYLAGIVIIGAFISLFFCFEIKFNLTSKGYTECYKSSIFAPTEYVISKDMCK >NC_017731.1|WP_004918636.1|3844149_3845127_+|type-I-F-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 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MMVTFVSQCEKHALKRTRRVLDAFANRIGDNTWQTLITEDGLQTVKKMLRQSASRNTAVSCHWIRSRSRSQLLWVVGNRNKFNSQGHVPVNRTEKSFLGSEFENDWKYLSLIAAVARLAALFHDWGKASRLFQDKLNPAVKMPFKGDPVRHEWVSSILFSSLVKIHSAEESEEKWLDALIHQEWDESQLQQCVNDNCLASNPLAELPDAAALLTWLILTHHKLPFLDEQELCNWQDKAINLHTQLLAKIKQSWGYRNGNDDAQFQQRIKMCFEFPNGLLSNSKAWVQAVQQAATDLKNQLPLFQQAMADGSWRVIAHYARLCLMLGDHNYSSQGNDPQWHSDIALYANTHKIRNINNIPQVTFKQKLDEHLVKVAETARDIAETLPYFESEPPFASDVPKLAYDKNSTGKFSWQEDAVNSIYQYRKERNDDIKGYFIVNMASTGCGKTRANAKIMQALSEDKQSLRYILALGLRTLTLQTGDEYKDQNKIGLGERDLAVLIGSKAVAQLHQNAKENENASEASNDTSSHQTNSESNDLKPHQTGSESQEMLFDENEEMLRWDENKWSGILPEEVLSTVLTREKDRALLYAPVLACTIDHIIGATETIRGGRYILPCLRLMSSDLVIDEVDDFIEADSAAIARLIHMVGLLGRKVMISSATITPDTALAYFHAYQSGWHAHAKSRQQSLEIGCMWIDEGEYDPVKEKCKSSTLAATLVANDENTPYFYQQYHGKFIDKRAKVLGQQPARRKALIVPTPKDNTQESQQCYFNHILNAVLTQHHYHAFLDKRTGIQVSFGVIRVANILPCIDLTRFLLECECPDEVEIRTMAYHSQQVLLLRHEQEQHLDSVLKRKEKSGEEPDALNDAIIRQHIAQVSAEGKAKHLIFILVATPVEEVGRDHDFDWAVVEPSSWRSIIQIAGRVRRHREGEVAQPNMALLQYNLKGFEEGNDNPFSRPGYENRYINLGLSTHDLYELVDEQQLNKSVDAIPRIQKQASYESKKHTNLACLEHAAIKYTFKIEHIFPPKRAENSATSSRRTTRRSNHQTIPSNAASHIWGYTHGNWWMTAISQQIASFRSGAPSFRLVLEILPRGEMQFSEYHRENGWVNVGAQNGIHFIEFPESMKKRLWLVRDYAKSLESQTEEAEQITSLSRFYGEITFLKCLNVHDGYRYDDQMGVYPIKR >NC_017731.1|WP_014658069.1|3848822_3850094_+|CRISPR-associated-protein-Csy1 MLDPAIEAFFAERKEGWLKKNLKASMSEAEVHQIEQQCEDTFALSQWLPNAAKRAGQISLSTHPCTFSHPSARKIKNGYVSAIIANAKQANDGFLRSSNVAVEPDALGNAAALDVYKFLTLQMQDGATLLAHIEAETQLAKTLLTLNNESYQEIRNGFLAMSATDDSVVTSSKIKQVYFPVWLDDEDYHLLSILTPSGLLFEMRRRIDDIRFSEQTKTLRDLKRKGEYSEVGFKEIYGLTTIGFGGTKPQNISVLNNQNAGKAHLLLSLPPVLNIRETRLPKTNFFTDTINPWHTKETFQAFHGLINLPKDKRGNRFIEYRDNRIQEYVDYIIVMMWKVRRALEQENITLPNKISNYQKTWLFPDNQEQRDNTDDWLEILIPEIARQFIAGYKVVNGKKALFLGNDEFNAIVDVVARYKELLR >NC_017731.1|WP_014658070.1|3850090_3851038_+|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy2 MNNSMNLIKLSHLKVHNANALSSPFTIGFPAMTAWLGFMHALELKLRKIGFLELQLESIAVISHECNLQTYKGPSDFVSSIVGTGNPLDKEGNRSAFIEEARCHLDVSLLIEFSDRNDEYGNVLTDKSIVDRIYELIPMMKLAGGDILSVDLPQMHYLPANDDMGKYRRSLFNSLMPGYALIERRDLMVSAMEDGQDAMDALLDYVTVHNQCVEVDSQNESKNKHYEWKVQRKTAGWIVPIATGYQGISPLGQAKNQRDPNVPHRFAESLVTLGQFVMVNKIGHPNEILWKYSNNLENSLYLCQQVESKYFTSGE >NC_017731.1|WP_004918643.1|3851040_3852066_+|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy3 MAKNNDVASVLAFEKKLVPSDGYFYGTSWDHKSQCTPLVLQEKSVRGTISNRLKGPVKNDPLKLNAEVEKANLQTVDACALGTQQDTLKHQFTLKILGGVETPSACNNASFKESYTKAAKEYIAREGFRELGRRYAHNIANARFLWRNRVGAEKIEVEVKVLNKGQEQQWTFDATQYSIRSFEKQDDKVNELGAKIAAALANSEGALLLEITTYAQLGQSQEVYPSEELVLDKGKGDKSKILYHVNGHAAMHSQKIGNALRSIDTWYPDYNDEVNSAGAIAIEPYGAVTNLGRAYRTPSDKQDFYTHFDKWARGEKLARLEDEHYVMAVLVRGGVFGESDK >NC_017731.1|WP_004918644.1|3852074_3852710_+|type-I-F-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6/Csy4 MDYYQEITLLPDSTIPLDFLWQKVYQQIHIALVENKSEAGDSEVAVAFPEYGSVGFRLGKKLRLLAKTEKTLTQLNISHWLMRLADYVHIKSIQAVPEHATPISYVRQHVKGAKRLELDRYKKAQLYSVKSGQPIEVCLSAIKEPQTRSRLPFIWMESQQTKSKTEGDGHRPFPLFIRCVAAKEAKAGTFNCYGLSQSMGKGEEVATVPHF |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_017731_4 | 3852851-3853058 | TypeI-F |
I-F
Consensus repeat of NC_017731_4
|
3 spacers
spacers of NC_017731_4
>4.1|3852879|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTAACATTGCATCTGCCGTGGTGGAGTTATT >4.2|3852939|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTGAGAAGCAAGAATGTAGTCCTTTTTAGC >4.3|3852999|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAGCCTGAACACATCTAGCCTCAAAGTCTT |
cas6f,cas7f,cas5f,cas8f,cas3-cas2,cas1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017731_4
The CRISPR arrays of NC_017731_4 >merge|NC_017731|4|3852851-3853058|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAATTTAACATTGCATCTGCCGTGGTGGAGTTATTGTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAATTTTGAGAAGCAAGAATGTAGTCCTTTTTAGCGTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAAAAAAGCCTGAACACATCTAGCCTCAAAGTCTTGTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA >NC_017731|4|2|3852851-3853058|PILER-CR GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TTTAACATTGCATCTGCCGTGGTGGAGTTATT GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TTTTGAGAAGCAAGAATGTAGTCCTTTTTAGC GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA AAAAGCCTGAACACATCTAGCCTCAAAGTCTT GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA >NC_017731|4|4|3852851-3853058|CRISPRCasFinder GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TTTAACATTGCATCTGCCGTGGTGGAGTTATT GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TTTTGAGAAGCAAGAATGTAGTCCTTTTTAGC GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA AAAAGCCTGAACACATCTAGCCTCAAAGTCTT GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA >NC_017731|4|2|3852851-3853058|CRT GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TTTAACATTGCATCTGCCGTGGTGGAGTTATT GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TTTTGAGAAGCAAGAATGTAGTCCTTTTTAGC GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA AAAAGCCTGAACACATCTAGCCTCAAAGTCTT GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA
>NC_017731.1|WP_004918644.1|3852074_3852710_+|type-I-F-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6/Csy4 MDYYQEITLLPDSTIPLDFLWQKVYQQIHIALVENKSEAGDSEVAVAFPEYGSVGFRLGKKLRLLAKTEKTLTQLNISHWLMRLADYVHIKSIQAVPEHATPISYVRQHVKGAKRLELDRYKKAQLYSVKSGQPIEVCLSAIKEPQTRSRLPFIWMESQQTKSKTEGDGHRPFPLFIRCVAAKEAKAGTFNCYGLSQSMGKGEEVATVPHF >NC_017731.1|WP_004918643.1|3851040_3852066_+|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy3 MAKNNDVASVLAFEKKLVPSDGYFYGTSWDHKSQCTPLVLQEKSVRGTISNRLKGPVKNDPLKLNAEVEKANLQTVDACALGTQQDTLKHQFTLKILGGVETPSACNNASFKESYTKAAKEYIAREGFRELGRRYAHNIANARFLWRNRVGAEKIEVEVKVLNKGQEQQWTFDATQYSIRSFEKQDDKVNELGAKIAAALANSEGALLLEITTYAQLGQSQEVYPSEELVLDKGKGDKSKILYHVNGHAAMHSQKIGNALRSIDTWYPDYNDEVNSAGAIAIEPYGAVTNLGRAYRTPSDKQDFYTHFDKWARGEKLARLEDEHYVMAVLVRGGVFGESDK >NC_017731.1|WP_014658070.1|3850090_3851038_+|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy2 MNNSMNLIKLSHLKVHNANALSSPFTIGFPAMTAWLGFMHALELKLRKIGFLELQLESIAVISHECNLQTYKGPSDFVSSIVGTGNPLDKEGNRSAFIEEARCHLDVSLLIEFSDRNDEYGNVLTDKSIVDRIYELIPMMKLAGGDILSVDLPQMHYLPANDDMGKYRRSLFNSLMPGYALIERRDLMVSAMEDGQDAMDALLDYVTVHNQCVEVDSQNESKNKHYEWKVQRKTAGWIVPIATGYQGISPLGQAKNQRDPNVPHRFAESLVTLGQFVMVNKIGHPNEILWKYSNNLENSLYLCQQVESKYFTSGE >NC_017731.1|WP_014658069.1|3848822_3850094_+|CRISPR-associated-protein-Csy1 MLDPAIEAFFAERKEGWLKKNLKASMSEAEVHQIEQQCEDTFALSQWLPNAAKRAGQISLSTHPCTFSHPSARKIKNGYVSAIIANAKQANDGFLRSSNVAVEPDALGNAAALDVYKFLTLQMQDGATLLAHIEAETQLAKTLLTLNNESYQEIRNGFLAMSATDDSVVTSSKIKQVYFPVWLDDEDYHLLSILTPSGLLFEMRRRIDDIRFSEQTKTLRDLKRKGEYSEVGFKEIYGLTTIGFGGTKPQNISVLNNQNAGKAHLLLSLPPVLNIRETRLPKTNFFTDTINPWHTKETFQAFHGLINLPKDKRGNRFIEYRDNRIQEYVDYIIVMMWKVRRALEQENITLPNKISNYQKTWLFPDNQEQRDNTDDWLEILIPEIARQFIAGYKVVNGKKALFLGNDEFNAIVDVVARYKELLR >NC_017731.1|WP_014658068.1|3845123_3848672_+|type-I-F-CRISPR-associated-helicase-Cas3 MMVTFVSQCEKHALKRTRRVLDAFANRIGDNTWQTLITEDGLQTVKKMLRQSASRNTAVSCHWIRSRSRSQLLWVVGNRNKFNSQGHVPVNRTEKSFLGSEFENDWKYLSLIAAVARLAALFHDWGKASRLFQDKLNPAVKMPFKGDPVRHEWVSSILFSSLVKIHSAEESEEKWLDALIHQEWDESQLQQCVNDNCLASNPLAELPDAAALLTWLILTHHKLPFLDEQELCNWQDKAINLHTQLLAKIKQSWGYRNGNDDAQFQQRIKMCFEFPNGLLSNSKAWVQAVQQAATDLKNQLPLFQQAMADGSWRVIAHYARLCLMLGDHNYSSQGNDPQWHSDIALYANTHKIRNINNIPQVTFKQKLDEHLVKVAETARDIAETLPYFESEPPFASDVPKLAYDKNSTGKFSWQEDAVNSIYQYRKERNDDIKGYFIVNMASTGCGKTRANAKIMQALSEDKQSLRYILALGLRTLTLQTGDEYKDQNKIGLGERDLAVLIGSKAVAQLHQNAKENENASEASNDTSSHQTNSESNDLKPHQTGSESQEMLFDENEEMLRWDENKWSGILPEEVLSTVLTREKDRALLYAPVLACTIDHIIGATETIRGGRYILPCLRLMSSDLVIDEVDDFIEADSAAIARLIHMVGLLGRKVMISSATITPDTALAYFHAYQSGWHAHAKSRQQSLEIGCMWIDEGEYDPVKEKCKSSTLAATLVANDENTPYFYQQYHGKFIDKRAKVLGQQPARRKALIVPTPKDNTQESQQCYFNHILNAVLTQHHYHAFLDKRTGIQVSFGVIRVANILPCIDLTRFLLECECPDEVEIRTMAYHSQQVLLLRHEQEQHLDSVLKRKEKSGEEPDALNDAIIRQHIAQVSAEGKAKHLIFILVATPVEEVGRDHDFDWAVVEPSSWRSIIQIAGRVRRHREGEVAQPNMALLQYNLKGFEEGNDNPFSRPGYENRYINLGLSTHDLYELVDEQQLNKSVDAIPRIQKQASYESKKHTNLACLEHAAIKYTFKIEHIFPPKRAENSATSSRRTTRRSNHQTIPSNAASHIWGYTHGNWWMTAISQQIASFRSGAPSFRLVLEILPRGEMQFSEYHRENGWVNVGAQNGIHFIEFPESMKKRLWLVRDYAKSLESQTEEAEQITSLSRFYGEITFLKCLNVHDGYRYDDQMGVYPIKR >NC_017731.1|WP_004918636.1|3844149_3845127_+|type-I-F-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MDDFSPADLKTILHSKRANMYYLEHCRVMQKDGRVLYFTEAKNENLYFNIPIANTTVLLLGTGTSITQAAMRMLSQAGVLVGFCGGGGTPLYMSTEVEWLTPQSEYRPTEYLQGWMRFWFDDKKRLAAAKTLQRSRISYLQKTWQSSRELQNEGFIYNDTLIQNALETFHTRTEAADDPQTLLLTEAQLTKALYKYAANNTGQKNFTRQHQAMDKANAFLNHGNYLAYGLAASCLWVLGIPHGFAVMHGKTRRGALVFDVADLIKDAIVLPWSFICAKEGASEQEFRQQILQSFIDNHALDFLFDTVKTIALQTGSEQQIQEPKL >NC_017731.1|WP_014658067.1|3842937_3843231_+|DUF1240-domain-containing-protein MKDRILFSFLTGLFGFGAPIVLYFSYFGFILAFKKKPTKKTIKAANYLAGIVIIGAFISLFFCFEIKFNLTSKGYTECYKSSIFAPTEYVISKDMCK >NC_017731.1|WP_154610394.1|3840784_3840934_+|hypothetical-protein MMKKAHFTETQIINILKLAGSGMKVEDICRHWSAVLVQVLTRQRNDDHF >NC_017731.1|WP_014658064.1|3840538_3840712_-|DinI-like-family-protein MVTIKIRFNENKKNQLPISTFEALKNEVTKRLSAKYSDLRVDINWGTQDNISIDGLG >NC_017731.1|WP_004918626.1|3839958_3840339_-|DUF805-domain-containing-protein MNWYLEVIKNNYANFNGRARRKEYWIFSLINFIIIIPLYLVVLASTNDYTGDINGLGIVALVLLMIYCVAILIPSLAVTVRRLHDIDKSGWWYLLTFIPFGGLVIFVFTCLDGTPGNNRFGSNPKE >NC_017731.1|WP_004918654.1|3854499_3855282_-|flagellar-type-III-secretion-system-protein-FliR MLTITSETLTLWLSQGFYPFIRLLALFGTAPFFNEKQSITKVRVILAFFIILIVSPQLPVVNIPLFSAMGLWVIVQQIVIGVAIGLTMQMAFAAVRHAGEVIGLQMGLSFATFFDPTGGPNMPILGRILNLIMLLLFLSFDGHLWLIYILIHSFELIPIQVSPLSRDGFWSLAQFASSIFINGLMLALPFITLFLILNLALGILNRMTPQLSVFVVGFPLTLTIGISMLGLIISILPRYSERLIHQAFEQLSLMFGLLGG >NC_017731.1|WP_004918656.1|3855284_3855554_-|flagellar-biosynthesis-protein-FliQ MTPESVMALGTEAMKIALMLAAPLLLAALVAGLTISLLQAATQVNEMTLSFIPKILSVIAVIIIAGPWMLNLLLDYMRTLFSNLPFIIG >NC_017731.1|WP_014658072.1|3855563_3856307_-|flagellar-type-III-secretion-system-pore-protein-FliP MFSVKSPAMIASLLLMLPMQALASLPPVISRTLPDGGQSWSLPVQTLLFLTLLGFIPALLLMMTSFTRIIIVLGLLRNALGTPSAPPNQVLLGLALFLTFFVMSPVADQAYREAYQPFSEDKISLETALERGTAPFRTFMLGQTRESDLALFARIAKVGEIQEAKDVPMRILVPAFITSELKTAFQIGFTIFIPFLIIDLVVASVLMALGMMMVPPATVSLPFKLMLFVLVDGWQLLLGSLSQSFFN >NC_017731.1|WP_004918662.1|3856319_3856748_-|flagellar-biosynthetic-protein-FliO MKTTPFISQTEQPSSQISPAISNSDSLVQVSGALGGIILLILAGAWLVKKLGFAPRNLGKPSLIKVKSSCSLGNKERVVVVEMNNEWLVLGVTAQSVNLLHQCPAKNETALTSVTEPLTFQSILKKKQDAANHAASNLSNYN >NC_017731.1|WP_004918665.1|3856772_3857189_-|flagellar-motor-switch-protein-FliN MSEAKNSPDASTNHDSEDLWAEALEQQKKAESASAGAQAFANLDGQNALNQLSDINLIMDIPVRLSVELGRTKMTIKKLLSLSQGSVVSLDGLAGEPLDILINGYLIAQGEVVVVSDNYGIRITDIITPSERMRRLSR >NC_017731.1|WP_004918669.1|3857181_3858189_-|flagellar-motor-switch-protein-FliM MSDNILSQAEIDALLNDDAPSSNESATQPKDKEQVRPYDPNTQRRVIRERMQSLEIINERFARQFRMGLFNMLRRSPDITVGGIKIEPYHEFARNLPVPTNLNLIHMPPLRGTALFTFEPALVYIAVDNLFGGDGRFPVRSEGKEFTNTEQRIIHRMLKLALSAYRDAWRPIADIDVEYVRSEMQVKFTNITTSPNDIVVTTPFLVEIGNTIGEFSICIPIAMIEPLRERLINPPVEQGHQENEAWVSNLVTQVKRSELELVANFVDIPLRISRLLQLQKGDVIPIEKPDRLIVSVDGVPVLTSQYGTQNGQYALRVEHLINPVLNTLDEESTNE >NC_017731.1|WP_004918672.1|3858194_3858677_-|flagellar-basal-body-associated-protein-FliL MSSSSNTSKNSNKGLLVLFALLAIAGAGFGGYTWWTTQQTANSVNEEEKSPKLSQPIFMDLEPFTVNLPGLNESPDRVLYINITLRLANEKSRKQLHDFLPEVRSRLLLLLSEQKPKALSTHDGKLQLMQAIKKTLSPTVIPGENDQEITDVLFTTFILR >NC_017731.1|WP_014658074.1|3858842_3860204_-|flagellar-hook-length-control-protein-FliK MDVNNTGSPAITAANGAKNGHTQPNQSRADDNQEAVVPFQAALESQQPTPQKASTSEPTMDKQANQKPASADERLTTKAHEPSTGKEKEQAEQAIEQLNYSRHLRNGSEQPALQSQLLAQSDAVEQVWLANLKNAVDQQTLSSATTKFADGQRAALVPFAQKTQPLNDSLVAMATMDEPIDLSAQMQLAGEEESPSLGAFIKNEREPRKDQPLFSLNEGRESLTKNLSSDFMPLNKKLADKEAPNSIVPTFAAADNGALIKGAFTPTTGSDAIQMAPSSPTQTVSLTPLPNSSQIVSTNVPVIPMQPGVPLGSEAWQQQLNQHMLFFSRQGVSHAQIRLHPEELGSLNVHLRIEDNQAVMHFVSPHSQVRAAMETMMPILRNALQESGIHLAQGSVGQDNFSDQSNADTHSEQGHEKNLYGGQTLSSVTSTEMAAVSPTTSTIRTRGGIDTFA >NC_017731.1|WP_004918676.1|3860204_3860648_-|flagella-biosynthesis-chaperone-FliJ MSKNNALDTLLSLAVEASEEAAKVLAQVRQTQVQMTQQLNMLENYQAEYRQKLNQTLHSGIDADKWQNYQQFLVTLELTIEQQQQQLSLWEQRVSEANRHWQEKQQRVNAFDTLIQRAEQTKNQRLNRLEQKQMDEYAQRAMLRRNQ >NC_017731.1|WP_004918680.1|3860658_3862023_-|flagellum-specific-ATP-synthase-FliI MTVRMSRWIAALEGFESRMKGIPMIRRYGRLTKITGLVMEAEGIKMPLGATCFVERAINDRHDEVVCEVVGFNGPRMLLMPLADLEGIAPGARVYAQTNGDDGQTSRLLPLGDELLGRILDAQGTPLDGKGPLDAKQRAPLITPPINPLERTPIHSVLDVGVRAINALLTVGRGQRMGLFAGSGVGKSVLLGMMARFTQADIIVVGLIGERGREVKDFIENILGAEGLKRAVVVAAPADVSPLLRMQGASYATRIAEYFRDLGKNVLLIMDSLTRYSMAQREIALAIGEPPATKGYPPSVFAKLPALVERAGNGKNGGSITAFYTVLTEGDDQQDPIADSARAILDGHIVLSRSLAESGHYPAIDIEASISRAMTELIDKQHYRQIQRFKQLTSSYQRNRDLINVGAYATGSDPLLDMAIQYYPRMSKFLQQDIDERCDYQSACEQLVHAVPNE |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_017731_5 | 3957641-3957788 | Orphan |
I-F
Consensus repeat of NC_017731_5
|
2 spacers
spacers of NC_017731_5
>5.1|3957669|32|NC_017731|CRISPRCasFinder AATACGACCCCGAATAAAGCACACATGATCTG >5.2|3957729|32|NC_017731|CRISPRCasFinder ATTAATCTCCTTATCGATGCTATTGACGTACC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017731_5
The CRISPR arrays of NC_017731_5 >merge|NC_017731|5|3957641-3957788|CRISPRCasFinder GTGTACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAAAATACGACCCCGAATAAAGCACACATGATCTGGTGTACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAAATTAATCTCCTTATCGATGCTATTGACGTACCGTGTACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA >NC_017731|5|5|3957641-3957788|CRISPRCasFinder GTGTACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA AATACGACCCCGAATAAAGCACACATGATCTG GTGTACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA ATTAATCTCCTTATCGATGCTATTGACGTACC GTGTACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA
>NC_017731.1|WP_014658149.1|3956745_3957396_+|DUF4431-domain-containing-protein MIRLFLFLIFVFPSITYAASFDCAKAQSNVEKLICNTPELSKADDELYVDYLQAKLVTGNSDEFKRLVKKNWELRVKNCDTKSCLLDWYHRSTIIYRNIAASQPVDEQDISEFNYYYNSPVKLRGVIRLEKPDGFLTLRTDNIISVSSKEPEDSEGEPTEWGIGALHLAPRNSDQFNQLKEIQGKKVDITCDLYHATNIHHKTPVLCSVEHYVLVK >NC_017731.1|WP_014658148.1|3955019_3956015_-|chitinase MSSDNIINTQVVDDAAAMPDISNKKIMMGFWHNWAAGASDGYQQGQCANMNLTDIPEEYNVVAVAFMKGEGIPTFKPYNLSDAEFRRQVGVLNSQGRAVLISLGGADAHIQLKTGDEDKLTNEIIRLVETYGFDGLDIDLEQTAISSANNKTVLPAALKKVKEHYAAEGKNFIISMAPEFPYLRINGAYLDYINALEGYYDFIAPQYYNQGGDGIWVDETTSGKGAWLSQNSDAMKEDFLYYLTESLVTGTRGYTKIPPSKFVIGLPANNDAAGSGYVIDKQAVYNAFARLDAKNLSIKGLMTWSVNWDNGKSKTGVAYNWEFKTRYAALL >NC_017731.1|WP_014658147.1|3953630_3954233_+|DJ-1/PfpI-family-protein MFNVAIIIFDEFTDIDYFLMRDIFGRCREDWNVSVLGTKPFHTSTLGQKVETDGHVSLANQADVVLFSSGQQGVPNALADKSFMQSFKLNSQQQIIGSICAGSFILHKLGLLNDIQATTHPDARNAFINMGADVEDKPLVIRGNIGTAGGCLSALYLTGWIAEKLFDSDKRRQMHRQILPANQHELYEQIIVNAITEAQH >NC_017731.1|WP_014658146.1|3952696_3953035_-|hypothetical-protein MKNKHTTQDYMQKFMIKQNEVIVPYLRQVIHPTELKSVFCIYEMIEQGENIYTYLVNGEMVVIFEISRIDHSITHDRTLPIREYAQEIKGRQWHRYIRELQAFAEQEDSQVN >NC_017731.1|WP_154598717.1|3951927_3952065_+|hypothetical-protein MMASCVYLLLNGYELTTPKNEVIEMANGMATKEYSLIELDGWLSF >NC_017731.1|WP_072197223.1|3951654_3951921_+|death-on-curing-family-protein MLNISEKFVAGITYLSVDDLKSINSVLIVLQTLNEPIEVEVLNFNDLSLSQSSSSHVNYYQQTDDMFVLVSSLIKSWIRNHPVTNANK >NC_017731.1|WP_014658145.1|3950292_3950568_-|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MKKLFSEAFLLNAGMGYGPNGKHVMIIITSVLFAMIHHQYNSPATFIMIFVMSVIFCHVRIQTNSLMAPIILHMINNAVAMLLLFLLNDTP >NC_017731.1|WP_014658143.1|3947850_3948240_+|VOC-family-protein MNFQHFRIARPVSNLTKSREMYCGGLGLEIIGSFSNHDGFSGCMLGKVELGWHIEFTECHEHPVSPSPTNEDLLVLYIPNREEWLDVCLKMDNAGFNRVRSFNPYWDIEGVTFSDCDGYRVVLQNGKWG >NC_017731.1|WP_014658142.1|3947330_3947606_+|MafI-family-immunity-protein MDKFKINNRPKMKTNKKIMELGEKLKDRLPLERVMFAVEYVNYCESPLALETLRDYIEEYDVVITHDEYNSFIEIAEELNIQLDTKDLIVR >NC_017731.1|WP_014658141.1|3947037_3947259_-|hypothetical-protein MSHNSSRSKALNSELPLNQRASHVRSCANHVSARLGITREELFKITMKATGVDLNKPESESDLMKAFIYFEQL >NC_017731.1|WP_014658150.1|3957948_3958443_-|hypothetical-protein MSKFQCSCGHIIRDNTDYLSYKAYYISDQDFYDFLDELEGESRDNFASVAYKYVRDIYQCTKCNNIFIFRGDFFHEFQATQPDSHSLLISNMRDKWPGFLRGYFIKGKGEIYWETNQQNDYLTGLTREQVESTYYHKLNEFQSLGILRDAFLHVDGVMLHEYNR >NC_017731.1|WP_014658151.1|3958837_3959617_+|elongation-factor-Tu-B MKAIYLLLGLLFSSFAFSAENSVMILGDDYRHTLVKELEGATFVTHGKNDSLIQQVKQAFNQDSIILVINMADGPTQNLRESILIARQSGHNSVQVYYHGKHLPKEMLNDDDFKKLMTLVVKEVNELLDLYEIQITGAYYDWERDFPEKFQLQKNIMAKFSPEPNTLMTEIHSYAYVFTKEEASDNTIITDGTVLAFACQDVIGNATVRSQDPIKRGGNYSHIVLELEKPTLIPLHARCLGTLNNTLAMAFITLLENEK >NC_017731.1|WP_004918896.1|3960190_3960418_-|HEAT-repeat-domain-containing-protein MNHSRQKIILNTLIQLTQGTNNEVKLTAISILGDYKYAIQNEETLNRLIELCFDPNKEVAITALKSLGKLSIHFQ >NC_017731.1|WP_040133041.1|3960806_3961439_-|lytic-polysaccharide-monooxygenase MKNLIIPLIYPSILGTVLTLFSFYASAHGYIRMPESRAYLCSFNDYLKEPKTPLNNDCGLGPEYEPQSIETQKGFPESGPPDGLIASGGGIERFSPLDVQTPTRWHKIDMKTGLNTFTWYLTMAHATDNWRFFITKNGWDQSAPLTRSAFELTPFCQRDDHGAMPLIEVDINFICDVPADHEGYHVILATWDVDNTQNAFYQVIDVNLSN >NC_017731.1|WP_004918906.1|3961742_3961907_-|hypothetical-protein MKKLLFIISILCSSAYATNTVTWCSPEPNPVTGKPDCITYTPGMGGIDSGGEGP >NC_017731.1|WP_071599649.1|3962243_3962786_-|sulfatase-like-hydrolase/transferase MPKFIESIDNPAKKKLIVVHLIGSHSPFCKRISNKYDKFYKSKDLSCYVQSIKNTDLQLPLLHDILSKSKNSWSMLYFSDHGLSFIDNQQDLIHGDKHRQNFETPLFITSSDSNTREIISAQRSGLNLFHLLAEWLGIHEKNIQSSCKIISNNECKDQNIAIDFDQKIIYFNELLNDSIK >NC_017731.1|WP_004918910.1|3962973_3963270_+|antibiotic-biosynthesis-monooxygenase MLKVIAEDFIQLEAINIVLPLYRELVEATKREPLCIAYDLYVDQKDRGHFIFIEEWPDQAALDAHCKSEHFQRLVPMINQYQRKEPSFIFMDDALAKI >NC_017731.1|WP_014658153.1|3964289_3964769_+|membrane-protein MNKLFRMCNLLLLTASFSVVSLSSYADPNPNGGHGHRQGKEHQKNKPNKGHNGNGKEKADHLSLNKSNSISVSLTYNEARALALDSGITGYHALPPGIAKNLARGKPLPPGIAKKVVPPSMLVQLPHYPGYEWSIVGNDLVLIALSTAVVTSIINNVFD >NC_017731.1|WP_014658154.1|3964894_3965251_-|DUF305-domain-containing-protein MLPIAAILTISIASFSSFANSNHSMHAQAPASNEMQKELNQSMDKMHADMAKGMNEENADIAFAQGMIAHHLGAIDMAKIELKYGTDPEMRKLAEEIINAQGPEIEQMQKWLEKNKTK >NC_017731.1|WP_148271221.1|3966603_3967416_+|transferrin-binding-protein-like-solute-binding-protein MARNIMKNLSLTALTIVLSSVAFSTSGETVSGQSQAYDSNGVEVNVGKTQFAQGTHSGVIGDPGVGLKTIANGTRIGFSGFKSLAPENEQGVNVLPASSGGHGGAMGEFHFTQVANAEVYFGDWSKTGSVGDQTHTAFFSGKEATESVPTAGQAEYTIAGINQFDGPGKLSGVFNADFGSKKYTGALNGQSLNITMNGNIQDKGQFSGSAIANGSIQGKSSGQFFGKNADVVAGITTFDSDHTKDTSFGGSKSAITYIAGGKDFHLLRLL |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_017731_6 | 3963734-3964061 | Orphan |
I-F
Consensus repeat of NC_017731_6
|
5 spacers
spacers of NC_017731_6
>6.1|3963762|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGAATTGCTAATGACCTTCTTGAGGCTGCTAT >6.2|3963822|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATTGGCAGAATACGAAAGTAGGTAATACCGT >6.3|3963882|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGAACAACGCTCGTCCACTCTGACTGATTCC >6.4|3963942|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTAGCTGGAAAGAAGATATGATAGGGGATGGT >6.5|3964002|32|NC_017731|CRISPRCasFinder,CRT ATTGCTATAATTCGACCGAAATCATCTGGGTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017731_6
The CRISPR arrays of NC_017731_6 >merge|NC_017731|6|3963734-3964061|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAAAGAATTGCTAATGACCTTCTTGAGGCTGCTATGTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAAGATTGGCAGAATACGAAAGTAGGTAATACCGTGTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAAAAGAACAACGCTCGTCCACTCTGACTGATTCCGTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAACTAGCTGGAAAGAAGATATGATAGGGGATGGTGTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAAATTGCTATAATTCGACCGAAATCATCTGGGTAGCTCACTGCCATATAGGCAGCTTAAAAA >NC_017731|6|3|3963734-3964001|PILER-CR GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AGAATTGCTAATGACCTTCTTGAGGCTGCTAT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA GATTGGCAGAATACGAAAGTAGGTAATACCGT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AAGAACAACGCTCGTCCACTCTGACTGATTCC GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA CTAGCTGGAAAGAAGATATGATAGGGGATGGT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA >NC_017731|6|6|3963734-3964061|CRISPRCasFinder GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AGAATTGCTAATGACCTTCTTGAGGCTGCTAT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA GATTGGCAGAATACGAAAGTAGGTAATACCGT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AAGAACAACGCTCGTCCACTCTGACTGATTCC GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA CTAGCTGGAAAGAAGATATGATAGGGGATGGT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA ATTGCTATAATTCGACCGAAATCATCTGGGTA GCTCACTGCCATATAGGCAGCTTAAAAA >NC_017731|6|3|3963734-3964061|CRT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AGAATTGCTAATGACCTTCTTGAGGCTGCTAT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA GATTGGCAGAATACGAAAGTAGGTAATACCGT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA AAGAACAACGCTCGTCCACTCTGACTGATTCC GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA CTAGCTGGAAAGAAGATATGATAGGGGATGGT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA ATTGCTATAATTCGACCGAAATCATCTGGGTA GCTCACTGCCATATAGGCAGCTTAAAAA
>NC_017731.1|WP_004918910.1|3962973_3963270_+|antibiotic-biosynthesis-monooxygenase MLKVIAEDFIQLEAINIVLPLYRELVEATKREPLCIAYDLYVDQKDRGHFIFIEEWPDQAALDAHCKSEHFQRLVPMINQYQRKEPSFIFMDDALAKI >NC_017731.1|WP_071599649.1|3962243_3962786_-|sulfatase-like-hydrolase/transferase MPKFIESIDNPAKKKLIVVHLIGSHSPFCKRISNKYDKFYKSKDLSCYVQSIKNTDLQLPLLHDILSKSKNSWSMLYFSDHGLSFIDNQQDLIHGDKHRQNFETPLFITSSDSNTREIISAQRSGLNLFHLLAEWLGIHEKNIQSSCKIISNNECKDQNIAIDFDQKIIYFNELLNDSIK >NC_017731.1|WP_004918906.1|3961742_3961907_-|hypothetical-protein MKKLLFIISILCSSAYATNTVTWCSPEPNPVTGKPDCITYTPGMGGIDSGGEGP >NC_017731.1|WP_040133041.1|3960806_3961439_-|lytic-polysaccharide-monooxygenase MKNLIIPLIYPSILGTVLTLFSFYASAHGYIRMPESRAYLCSFNDYLKEPKTPLNNDCGLGPEYEPQSIETQKGFPESGPPDGLIASGGGIERFSPLDVQTPTRWHKIDMKTGLNTFTWYLTMAHATDNWRFFITKNGWDQSAPLTRSAFELTPFCQRDDHGAMPLIEVDINFICDVPADHEGYHVILATWDVDNTQNAFYQVIDVNLSN >NC_017731.1|WP_004918896.1|3960190_3960418_-|HEAT-repeat-domain-containing-protein MNHSRQKIILNTLIQLTQGTNNEVKLTAISILGDYKYAIQNEETLNRLIELCFDPNKEVAITALKSLGKLSIHFQ >NC_017731.1|WP_014658151.1|3958837_3959617_+|elongation-factor-Tu-B MKAIYLLLGLLFSSFAFSAENSVMILGDDYRHTLVKELEGATFVTHGKNDSLIQQVKQAFNQDSIILVINMADGPTQNLRESILIARQSGHNSVQVYYHGKHLPKEMLNDDDFKKLMTLVVKEVNELLDLYEIQITGAYYDWERDFPEKFQLQKNIMAKFSPEPNTLMTEIHSYAYVFTKEEASDNTIITDGTVLAFACQDVIGNATVRSQDPIKRGGNYSHIVLELEKPTLIPLHARCLGTLNNTLAMAFITLLENEK >NC_017731.1|WP_014658150.1|3957948_3958443_-|hypothetical-protein MSKFQCSCGHIIRDNTDYLSYKAYYISDQDFYDFLDELEGESRDNFASVAYKYVRDIYQCTKCNNIFIFRGDFFHEFQATQPDSHSLLISNMRDKWPGFLRGYFIKGKGEIYWETNQQNDYLTGLTREQVESTYYHKLNEFQSLGILRDAFLHVDGVMLHEYNR >NC_017731.1|WP_014658149.1|3956745_3957396_+|DUF4431-domain-containing-protein MIRLFLFLIFVFPSITYAASFDCAKAQSNVEKLICNTPELSKADDELYVDYLQAKLVTGNSDEFKRLVKKNWELRVKNCDTKSCLLDWYHRSTIIYRNIAASQPVDEQDISEFNYYYNSPVKLRGVIRLEKPDGFLTLRTDNIISVSSKEPEDSEGEPTEWGIGALHLAPRNSDQFNQLKEIQGKKVDITCDLYHATNIHHKTPVLCSVEHYVLVK >NC_017731.1|WP_014658148.1|3955019_3956015_-|chitinase MSSDNIINTQVVDDAAAMPDISNKKIMMGFWHNWAAGASDGYQQGQCANMNLTDIPEEYNVVAVAFMKGEGIPTFKPYNLSDAEFRRQVGVLNSQGRAVLISLGGADAHIQLKTGDEDKLTNEIIRLVETYGFDGLDIDLEQTAISSANNKTVLPAALKKVKEHYAAEGKNFIISMAPEFPYLRINGAYLDYINALEGYYDFIAPQYYNQGGDGIWVDETTSGKGAWLSQNSDAMKEDFLYYLTESLVTGTRGYTKIPPSKFVIGLPANNDAAGSGYVIDKQAVYNAFARLDAKNLSIKGLMTWSVNWDNGKSKTGVAYNWEFKTRYAALL >NC_017731.1|WP_014658147.1|3953630_3954233_+|DJ-1/PfpI-family-protein MFNVAIIIFDEFTDIDYFLMRDIFGRCREDWNVSVLGTKPFHTSTLGQKVETDGHVSLANQADVVLFSSGQQGVPNALADKSFMQSFKLNSQQQIIGSICAGSFILHKLGLLNDIQATTHPDARNAFINMGADVEDKPLVIRGNIGTAGGCLSALYLTGWIAEKLFDSDKRRQMHRQILPANQHELYEQIIVNAITEAQH >NC_017731.1|WP_014658153.1|3964289_3964769_+|membrane-protein MNKLFRMCNLLLLTASFSVVSLSSYADPNPNGGHGHRQGKEHQKNKPNKGHNGNGKEKADHLSLNKSNSISVSLTYNEARALALDSGITGYHALPPGIAKNLARGKPLPPGIAKKVVPPSMLVQLPHYPGYEWSIVGNDLVLIALSTAVVTSIINNVFD >NC_017731.1|WP_014658154.1|3964894_3965251_-|DUF305-domain-containing-protein MLPIAAILTISIASFSSFANSNHSMHAQAPASNEMQKELNQSMDKMHADMAKGMNEENADIAFAQGMIAHHLGAIDMAKIELKYGTDPEMRKLAEEIINAQGPEIEQMQKWLEKNKTK >NC_017731.1|WP_148271221.1|3966603_3967416_+|transferrin-binding-protein-like-solute-binding-protein MARNIMKNLSLTALTIVLSSVAFSTSGETVSGQSQAYDSNGVEVNVGKTQFAQGTHSGVIGDPGVGLKTIANGTRIGFSGFKSLAPENEQGVNVLPASSGGHGGAMGEFHFTQVANAEVYFGDWSKTGSVGDQTHTAFFSGKEATESVPTAGQAEYTIAGINQFDGPGKLSGVFNADFGSKKYTGALNGQSLNITMNGNIQDKGQFSGSAIANGSIQGKSSGQFFGKNADVVAGITTFDSDHTKDTSFGGSKSAITYIAGGKDFHLLRLL >NC_017731.1|WP_014658156.1|3967436_3968897_+|DUF560-domain-containing-protein MGLFRAGILWLLLYSSVAIGEISDIDNYRFLLKDKAEFSRKSPVIENNKPFIKDDIKINFDGKEYQVSNTLNEMGMAIYIALNRGQYDDVERLLSYYQQLSGYDVLLVEFAKAQMARANHDYAQAIFHYQTILALKPDFLRVELELARTYFEDQQNNEASSQFKRVLEKYQQQLPQSVLATISQFTTELSKRNSWSGSFSVGYGYNSNINQVPGDKRQRCYRNAVQQFCYGAGLADKGTKFIYDGDIKRTFSLYQHHSLLFKAYTYGNKYDGAAEYNENTSHIRVYYQYQDAKKSFAIGPISEFKWVGERQHYYGVGVGMEAEYRFLPQFSLSTVIDHQKINYRSPYQSQDGNKSQAYITGIYALSSDAVIFGGVDSGYVNKVYDSDSYKQYGIRGGIFKDVSQYYHLLGIASYKQTRFNAPQYALGSQNRMDDEQLYLAKLSLPKYSIATMTPSISYRYRVNKSNIDALYSYQQSEIEIRLEKRF >NC_017731.1|WP_014658157.1|3968914_3971914_+|TonB-dependent-receptor MKIKKIITMNIVTGISLTLISGLVLAKEQEDLGTIIVKDNAETIKERDQKGYDDQYDKNESNIYLGKDLVERYKGTNPADVLNSAVGVYSGDARNSGALDPNIRGIQGQGRVPVTVDGTEQAQTVWRGYNGANNRNYVDPNMISSITIQKSASLNPNVKTSVGGGIAIKTLNIDDVVAPDETFGFDLKLETSSNSTKPRVPNLDYGHDYRDDPAIMDNIKNGNKARMLFNDPGLLVTPKSRGDANFFNFKDNAVRVAVGTRQSRFDIMAAYSYRDQGNYFAGKRGANRYKDDVFSYDPKNPSKPVDPYLPFAANVFAPGKEVTNTSSEMESYLVKTNLFLSDSQKVSLGYTHTTNHYGEIMPSRISFMELDGKVPQWTLAKFNIQAFHADYYLNPEDNPYVNMKLGYWMTKTTSDTNTSGGFPREPKERDMGFEYGWMPRNPNIDGTLVPGASLNSTNKRQGLNLSNQMALTDSLDLTLMGSFSKETVDTEDDIFEYSGSSTSTIFRAVPREGERQENTFAFNFEWRPTDWLNVTAGAQRTSYWSKDHLLDKRRDAKDVNFARPHQLLSKNYDISRTITQNEYDTLTRFTNAEGQKLDDVMDSPYYLERFVEEALNLQKHSLDYAGFRSANGQGEFRIDEKNKAKWRPDGKNKLTRETNPFYNGTIDTKAQTVDPFTGKVVNQYIPNQSRSSDEQEDIRYLSEEERFRHQGKKKAHAWAPSFSASAYLTDNDRVYASYTETVRMPSIFEDTVGFSGSRGYASLTEKFEPERGKTVEVGYVRNLQSLLGAERFADVRINYYHTVIENAFERDIYLKFTQVDKHKTSGIELQARYDNGNYFGDIGLDYRLQNEVCDSASIAALDPTNKFNMSECVDAGFPGGFLRTQLQPKYSINANLGMRFLDERLEIGSRMRYHSRAENNDEKKMMDKYPANYAPLNNSPMRWEPVFVADAYVSYGISDNVKMELLATNILDEYYVDPLTRTMMPAPGRTLRLNFTSHF >NC_017731.1|WP_014658158.1|3971962_3972280_+|hypothetical-protein MKKTRFLTVTLSVLLHAVIIMGFIHLAQEEKNQQHQAVMDAPVMSIALTHAIEETAPTDSDMTPMVEPEAEIVPPVVVETAQVVLPKKEKKIERPKKRSKSQISV >NC_017731.1|WP_158309818.1|3972398_3972716_+|TonB-family-protein MGQPKNGMSNLADTQQINAYREKLRQEVERHKRYPRRAKSMKKQGVAQVQFRLTETGEITSARIVSSSGSELLDNAALAAVEKSQSVGKPPSGFAHIVTFKIEFK >NC_017731.1|WP_004918937.1|3972735_3973167_-|hypothetical-protein MKKYLLPISLFVNVVLLITIIVVGALFFNLKSKIDSTVEQIKNGQYAELVKDNTANLIPEGLKNFKKIEPNQSQCDYFYQQIDSLIGYLEENPTIAGSEKYVKQLNNLKKSAEKTPSTLKETACEKGISTINFIGEKISTATE >NC_017731.1|WP_014658160.1|3973795_3974173_+|hypothetical-protein MNKVLFSIIATFFFCSSAVAQSQAHDKVRTHENALIALSFTENSTSQANQIAMARHAEKANIEKPTINGLSKTFSNMDAHEKAATALSFTENSQSYAVQRVLINIWQEAKLNKLNEIAHRHSMRY >NC_017731.1|WP_014658161.1|3974190_3975834_-|thiamine-pyrophosphate-binding-protein MYETITVGEAIARTLEQYQVSTVYGVISIHNLPIADAIGRRGMIDFTPSRGEAGAVTMADAHGRFTGLGVALTSTGAGAGNAVGSMIEAMNACSPIIHITGQVEKAYLDMDAGFIHETRDQLGFLKASSKQAFRVHSAEQAVAVLHKAIQVAQTVPCGPVSIEIPIDIQSAQVPLSLLSAPLTVQPLPEATADQVDAIWQKLQHAQRPLLWIGGGALHASDAIKKLADQGVAVISSTHGRGILSDEHPFSLRAFHNADAIDTLMRSCDITLVAGSRLRSNETKTWSLPLPQPLIQIDIDPLAANRNYRADLVVTADCHSILNALASKLEQAKRTISPQWQQQVQEATQQAEAQLRAQCGPYSQLSDAVEQVLPDHGIFVRDITVSGSLWGSRLLKATQPLHNIHSLAGAIGLGLAMAIGSAKANPQTPVIGLVGDGGLMLGIGELATMAQEQLPIVLLIMNDHGYGVMRGIQEKYFADRQYYNELLTPSFTRLAESMGIKALTVDKAEDFKSTLQRAIELKQPVVVEVLMENIGKMNFSGPPQKKLF |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_017731_6 | 6.2|3963822|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3963822-3963853 | 32 | MW057855 | Providencia phage PSTCR3, complete genome | 4397-4428 | 2 | 0.938 |
| NC_017731_6 | 6.4|3963942|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3963942-3963973 | 32 | MH517022 | Acinetobacter phage SH-Ab 15599, complete genome | 65363-65394 | 6 | 0.812 |
| NC_017731_3 | 3.2|3839267|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3839267-3839298 | 32 | NC_019690 | Pseudanabaena sp. PCC 7367 plasmid pPSE7367.01, complete sequence | 121669-121700 | 7 | 0.781 |
| NC_017731_4 | 4.3|3852999|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3852999-3853030 | 32 | NC_014534 | Gloeothece verrucosa PCC 7822 plasmid Cy782202, complete sequence | 64248-64279 | 8 | 0.75 |
| NC_017731_6 | 6.1|3963762|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3963762-3963793 | 32 | NZ_AP017978 | Neochlamydia sp. S13 plasmid pS13, complete sequence | 56283-56314 | 8 | 0.75 |
| NC_017731_5 | 5.2|3957729|32|NC_017731|CRISPRCasFinder | 3957729-3957760 | 32 | MK448736 | Streptococcus phage Javan35, complete genome | 35797-35828 | 9 | 0.719 |
| NC_017731_5 | 5.2|3957729|32|NC_017731|CRISPRCasFinder | 3957729-3957760 | 32 | MK448781 | Streptococcus phage Javan5, complete genome | 37819-37850 | 9 | 0.719 |
| NC_017731_5 | 5.2|3957729|32|NC_017731|CRISPRCasFinder | 3957729-3957760 | 32 | MK448938 | Streptococcus phage Javan44, complete genome | 35798-35829 | 9 | 0.719 |
| NC_017731_5 | 5.2|3957729|32|NC_017731|CRISPRCasFinder | 3957729-3957760 | 32 | MK448729 | Streptococcus phage Javan31, complete genome | 36270-36301 | 9 | 0.719 |
| NC_017731_5 | 5.2|3957729|32|NC_017731|CRISPRCasFinder | 3957729-3957760 | 32 | MK448911 | Streptococcus phage Javan34, complete genome | 35797-35828 | 9 | 0.719 |
| NC_017731_5 | 5.2|3957729|32|NC_017731|CRISPRCasFinder | 3957729-3957760 | 32 | MK448742 | Streptococcus phage Javan37, complete genome | 35328-35359 | 9 | 0.719 |
| NC_017731_5 | 5.2|3957729|32|NC_017731|CRISPRCasFinder | 3957729-3957760 | 32 | MK448691 | Streptococcus phage Javan17, complete genome | 36270-36301 | 9 | 0.719 |
| NC_017731_5 | 5.2|3957729|32|NC_017731|CRISPRCasFinder | 3957729-3957760 | 32 | MK448916 | Streptococcus phage Javan36, complete genome | 35797-35828 | 9 | 0.719 |
| NC_017731_5 | 5.2|3957729|32|NC_017731|CRISPRCasFinder | 3957729-3957760 | 32 | MK448708 | Streptococcus phage Javan23, complete genome | 37816-37847 | 9 | 0.719 |
| NC_017731_5 | 5.2|3957729|32|NC_017731|CRISPRCasFinder | 3957729-3957760 | 32 | MK448897 | Streptococcus phage Javan28, complete genome | 37817-37848 | 9 | 0.719 |
| NC_017731_5 | 5.2|3957729|32|NC_017731|CRISPRCasFinder | 3957729-3957760 | 32 | MK448948 | Streptococcus phage Javan46, complete genome | 36213-36244 | 9 | 0.719 |
| NC_017731_6 | 6.1|3963762|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3963762-3963793 | 32 | MN694658 | Marine virus AFVG_250M284, complete genome | 16299-16330 | 9 | 0.719 |
| NC_017731_3 | 3.6|3839507|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3839507-3839538 | 32 | NZ_CP025467 | Klebsiella pneumoniae strain JS187 plasmid p187-1, complete sequence | 130299-130330 | 10 | 0.688 |
| NC_017731_3 | 3.6|3839507|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3839507-3839538 | 32 | NZ_CP021962 | Klebsiella pneumoniae strain AR_0139 plasmid tig00000008, complete sequence | 7207-7238 | 10 | 0.688 |
| NC_017731_3 | 3.6|3839507|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3839507-3839538 | 32 | NZ_CP012570 | Klebsiella pneumoniae strain UCLAOXA232KP plasmid pUCLAOXA232-4.X, complete sequence | 107512-107543 | 10 | 0.688 |
| NC_017731_3 | 3.6|3839507|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3839507-3839538 | 32 | NZ_CP031803 | Klebsiella pneumoniae strain MSB1_8A-sc-2280397 plasmid unnamed3, complete sequence | 107279-107310 | 10 | 0.688 |
| NC_017731_3 | 3.6|3839507|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3839507-3839538 | 32 | NZ_CP012565 | Klebsiella pneumoniae strain UCLAOXA232KP plasmid pUCLAOXA232-4, complete sequence | 107512-107543 | 10 | 0.688 |
| NC_017731_3 | 3.6|3839507|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3839507-3839538 | 32 | NZ_CP016924 | Klebsiella pneumoniae isolate 23 plasmid pIncFIB_DHQP1400954, complete sequence | 67186-67217 | 10 | 0.688 |
| NC_017731_3 | 3.6|3839507|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3839507-3839538 | 32 | NZ_CP032187 | Klebsiella pneumoniae strain AR_0075 plasmid unnamed2, complete sequence | 38103-38134 | 10 | 0.688 |
| NC_017731_3 | 3.6|3839507|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3839507-3839538 | 32 | CP052390 | Klebsiella pneumoniae strain C17KP0052 plasmid pC17KP0052-2, complete sequence | 107695-107726 | 10 | 0.688 |
| NC_017731_3 | 3.6|3839507|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3839507-3839538 | 32 | NC_016838 | Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS1, complete sequence | 119274-119305 | 10 | 0.688 |
| NC_017731_6 | 6.1|3963762|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3963762-3963793 | 32 | MK088078 | Marinobacter phage AS1, complete genome | 28840-28871 | 10 | 0.688 |
| NC_017731_6 | 6.1|3963762|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3963762-3963793 | 32 | JF719738 | Enterobacteria phage SP isolate SP_1_FR, partial genome | 2483-2514 | 10 | 0.688 |
| NC_017731_6 | 6.1|3963762|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3963762-3963793 | 32 | GQ153933 | Mutant Enterobacteria phage SP isolate SP_2 maturation protein, read-through protein, coat protein, and replicase genes, complete cds | 2526-2557 | 11 | 0.656 |
| NC_017731_6 | 6.1|3963762|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3963762-3963793 | 32 | GQ153935 | Enterobacteria phage SP isolate SP_ancestral maturation protein, read-through protein, coat protein, and replicase genes, complete cds | 2526-2557 | 11 | 0.656 |
| NC_017731_6 | 6.1|3963762|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3963762-3963793 | 32 | JF719740 | Enterobacteria phage SP isolate SP_3_FR, partial genome | 2482-2513 | 11 | 0.656 |
| NC_017731_6 | 6.1|3963762|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3963762-3963793 | 32 | GQ153934 | Mutant Enterobacteria phage SP isolate SP_3 maturation protein, read-through protein, coat protein, and replicase genes, complete cds | 2526-2557 | 11 | 0.656 |
| NC_017731_6 | 6.1|3963762|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3963762-3963793 | 32 | GQ153932 | Mutant Enterobacteria phage SP isolate SP_1 maturation protein gene, partial cds; and read-through protein, coat protein, and replicase genes, complete cds | 2359-2390 | 11 | 0.656 |
| NC_017731_6 | 6.1|3963762|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3963762-3963793 | 32 | X07489 | Bacteriophage SP genomic RNA | 2526-2557 | 11 | 0.656 |
| NC_017731_6 | 6.1|3963762|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3963762-3963793 | 32 | JF719739 | Enterobacteria phage SP isolate SP_2_FR, partial genome | 2484-2515 | 11 | 0.656 |
1. spacer 6.2|3963822|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MW057855 (Providencia phage PSTCR3, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
gattggcagaatacgaaagtaggtaataccgt CRISPR spacer gattggcagaatgcaaaagtaggtaataccgt Protospacer ************.*.*****************
2. spacer 6.4|3963942|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH517022 (Acinetobacter phage SH-Ab 15599, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
ctagctggaaagaagatatgataggggatggt CRISPR spacer atacgtggaaagaagatatgattggcgatgct Protospacer ** ***************** ** **** *
3. spacer 3.2|3839267|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019690 (Pseudanabaena sp. PCC 7367 plasmid pPSE7367.01, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
aattagagaaaggcgatttaaagaaagccaag--- CRISPR spacer tactagaccaaggcgatttaaagaaa---aagcgc Protospacer *.**** ***************** ***
4. spacer 4.3|3852999|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_014534 (Gloeothece verrucosa PCC 7822 plasmid Cy782202, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aaaagcctgaacacatctagcctcaaagtctt CRISPR spacer ttaatgccgaacacgtctggcctcaaagtctc Protospacer ** *.******.***.************.
5. spacer 6.1|3963762|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP017978 (Neochlamydia sp. S13 plasmid pS13, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
agaattgctaatgaccttcttgaggctgctat CRISPR spacer agaattgctgatgatcttcttgagtttcagac Protospacer *********.****.********* .* *.
6. spacer 5.2|3957729|32|NC_017731|CRISPRCasFinder matches to MK448736 (Streptococcus phage Javan35, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
attaatctccttatcgatgctattgacgtacc CRISPR spacer aagcaactccttatcagtgctattgacgtcag Protospacer * * *********..************
7. spacer 5.2|3957729|32|NC_017731|CRISPRCasFinder matches to MK448781 (Streptococcus phage Javan5, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
attaatctccttatcgatgctattgacgtacc CRISPR spacer aagcaactccttatcagtgctattgacgtcag Protospacer * * *********..************
8. spacer 5.2|3957729|32|NC_017731|CRISPRCasFinder matches to MK448938 (Streptococcus phage Javan44, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
attaatctccttatcgatgctattgacgtacc CRISPR spacer aagcaactccttatcagtgctattgacgtcag Protospacer * * *********..************
9. spacer 5.2|3957729|32|NC_017731|CRISPRCasFinder matches to MK448729 (Streptococcus phage Javan31, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
attaatctccttatcgatgctattgacgtacc CRISPR spacer aagcaactccttatcagtgctattgacgtcag Protospacer * * *********..************
10. spacer 5.2|3957729|32|NC_017731|CRISPRCasFinder matches to MK448911 (Streptococcus phage Javan34, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
attaatctccttatcgatgctattgacgtacc CRISPR spacer aagcaactccttatcagtgctattgacgtcag Protospacer * * *********..************
11. spacer 5.2|3957729|32|NC_017731|CRISPRCasFinder matches to MK448742 (Streptococcus phage Javan37, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
attaatctccttatcgatgctattgacgtacc CRISPR spacer aagcaactccttatcagtgctattgacgtcag Protospacer * * *********..************
12. spacer 5.2|3957729|32|NC_017731|CRISPRCasFinder matches to MK448691 (Streptococcus phage Javan17, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
attaatctccttatcgatgctattgacgtacc CRISPR spacer aagcaactccttatcagtgctattgacgtcag Protospacer * * *********..************
13. spacer 5.2|3957729|32|NC_017731|CRISPRCasFinder matches to MK448916 (Streptococcus phage Javan36, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
attaatctccttatcgatgctattgacgtacc CRISPR spacer aagcaactccttatcagtgctattgacgtcag Protospacer * * *********..************
14. spacer 5.2|3957729|32|NC_017731|CRISPRCasFinder matches to MK448708 (Streptococcus phage Javan23, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
attaatctccttatcgatgctattgacgtacc CRISPR spacer aagcaactccttatcagtgctattgacgtcag Protospacer * * *********..************
15. spacer 5.2|3957729|32|NC_017731|CRISPRCasFinder matches to MK448897 (Streptococcus phage Javan28, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
attaatctccttatcgatgctattgacgtacc CRISPR spacer aagcaactccttatcagtgctattgacgtcag Protospacer * * *********..************
16. spacer 5.2|3957729|32|NC_017731|CRISPRCasFinder matches to MK448948 (Streptococcus phage Javan46, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
attaatctccttatcgatgctattgacgtacc CRISPR spacer aagcaactccttatcagtgctattgacgtcag Protospacer * * *********..************
17. spacer 6.1|3963762|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694658 (Marine virus AFVG_250M284, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
agaattgctaatgaccttcttgaggctgctat CRISPR spacer tatagtgctaatgaccttcttgagtatgcagg Protospacer . * ******************* *** .
18. spacer 3.6|3839507|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP025467 (Klebsiella pneumoniae strain JS187 plasmid p187-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aaaagtgtcagcgctaaagccgatttgtgtaa CRISPR spacer cgccgctgcagcgctaaagtcgattggtgtac Protospacer . *. ***********.***** *****
19. spacer 3.6|3839507|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021962 (Klebsiella pneumoniae strain AR_0139 plasmid tig00000008, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aaaagtgtcagcgctaaagccgatttgtgtaa CRISPR spacer cgccgctgcagcgctaaagtcgattggtgtac Protospacer . *. ***********.***** *****
20. spacer 3.6|3839507|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP012570 (Klebsiella pneumoniae strain UCLAOXA232KP plasmid pUCLAOXA232-4.X, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aaaagtgtcagcgctaaagccgatttgtgtaa CRISPR spacer cgccgctgcagcgctaaagtcgattggtgtac Protospacer . *. ***********.***** *****
21. spacer 3.6|3839507|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031803 (Klebsiella pneumoniae strain MSB1_8A-sc-2280397 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aaaagtgtcagcgctaaagccgatttgtgtaa CRISPR spacer cgccgctgcagcgctaaagtcgattggtgtac Protospacer . *. ***********.***** *****
22. spacer 3.6|3839507|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP012565 (Klebsiella pneumoniae strain UCLAOXA232KP plasmid pUCLAOXA232-4, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aaaagtgtcagcgctaaagccgatttgtgtaa CRISPR spacer cgccgctgcagcgctaaagtcgattggtgtac Protospacer . *. ***********.***** *****
23. spacer 3.6|3839507|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016924 (Klebsiella pneumoniae isolate 23 plasmid pIncFIB_DHQP1400954, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aaaagtgtcagcgctaaagccgatttgtgtaa CRISPR spacer cgccgctgcagcgctaaagtcgattggtgtac Protospacer . *. ***********.***** *****
24. spacer 3.6|3839507|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032187 (Klebsiella pneumoniae strain AR_0075 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aaaagtgtcagcgctaaagccgatttgtgtaa CRISPR spacer cgccgctgcagcgctaaagtcgattggtgtac Protospacer . *. ***********.***** *****
25. spacer 3.6|3839507|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP052390 (Klebsiella pneumoniae strain C17KP0052 plasmid pC17KP0052-2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aaaagtgtcagcgctaaagccgatttgtgtaa CRISPR spacer cgccgctgcagcgctaaagtcgattggtgtac Protospacer . *. ***********.***** *****
26. spacer 3.6|3839507|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_016838 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286 plasmid pKPHS1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aaaagtgtcagcgctaaagccgatttgtgtaa CRISPR spacer cgccgctgcagcgctaaagtcgattggtgtac Protospacer . *. ***********.***** *****
27. spacer 6.1|3963762|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK088078 (Marinobacter phage AS1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
agaattgctaatgaccttcttgaggctgctat CRISPR spacer ctcgctgctcatgaacttcttgaggctggtgc Protospacer ..**** **** ************* *..
28. spacer 6.1|3963762|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JF719738 (Enterobacteria phage SP isolate SP_1_FR, partial genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
agaattgctaatgaccttcttgaggctgctat CRISPR spacer tctattgctaatgacctctttgaggcctatgg Protospacer **************..*******. *.
29. spacer 6.1|3963762|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to GQ153933 (Mutant Enterobacteria phage SP isolate SP_2 maturation protein, read-through protein, coat protein, and replicase genes, complete cds) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
agaattgctaatgaccttcttgaggctgctat CRISPR spacer tctattgctaatgacctctttgaggcctacgg Protospacer **************..*******. ..
30. spacer 6.1|3963762|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to GQ153935 (Enterobacteria phage SP isolate SP_ancestral maturation protein, read-through protein, coat protein, and replicase genes, complete cds) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
agaattgctaatgaccttcttgaggctgctat CRISPR spacer tctattgctaatgacctctttgaggcctacgg Protospacer **************..*******. ..
31. spacer 6.1|3963762|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JF719740 (Enterobacteria phage SP isolate SP_3_FR, partial genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
agaattgctaatgaccttcttgaggctgctat CRISPR spacer tctattgctaatgacctctttgaggcctacgg Protospacer **************..*******. ..
32. spacer 6.1|3963762|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to GQ153934 (Mutant Enterobacteria phage SP isolate SP_3 maturation protein, read-through protein, coat protein, and replicase genes, complete cds) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
agaattgctaatgaccttcttgaggctgctat CRISPR spacer tctattgctaatgacctctttgaggcctacgg Protospacer **************..*******. ..
33. spacer 6.1|3963762|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to GQ153932 (Mutant Enterobacteria phage SP isolate SP_1 maturation protein gene, partial cds; and read-through protein, coat protein, and replicase genes, complete cds) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
agaattgctaatgaccttcttgaggctgctat CRISPR spacer tctattgctaatgacctctttgaggcctacgg Protospacer **************..*******. ..
34. spacer 6.1|3963762|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to X07489 (Bacteriophage SP genomic RNA) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
agaattgctaatgaccttcttgaggctgctat CRISPR spacer tctattgctaatgacctctttgaggcctacgg Protospacer **************..*******. ..
35. spacer 6.1|3963762|32|NC_017731|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JF719739 (Enterobacteria phage SP isolate SP_2_FR, partial genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
agaattgctaatgaccttcttgaggctgctat CRISPR spacer tctattgctaatgacctctttgaggcctacgg Protospacer **************..*******. ..
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
414543 : 425766
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_017731|414543:425766|DBSCAN-SWA ATTACGGTTTTTCCGGCCACTCAATATTAGGTGCTAAAGAAGTATCAACACGATTTAGTAAAACGCGGTATTTTTTCCACGCTTGCAGCGCTGCGGCTTCTTCATCGGTTGCCAGTCCTGTATCGATGGAGTCTTGCAGATAAGTCAGCATATTATTTGCTTCATCCAGTCGTTGTGATTTCTCCTGTTCAGCCTGCTCGATTAATGCGGCTTTTTGGGCTTCAGTGTCAGTGACCCATTTTTTACCGTTCCATGCATCGAATTCCGTTTTTGGCTCTAAAAGTGTGAGTGTTTCAGGTAAATCGCCGATAAAATCGACTTCAACAGGCTGACGGGTCTCTGTGTTGTAAGCCGTTTTCCCTCGATGGTCAGCAACATGCAACCACGATTGTTCATCAGCACTTCGTATAATTGCAACGTCAGGCTTTTCGGGTAATTCCGGTGCGTCTAAATAAGCGCCGGCAGGTAAACCACCGCCAATCGTGACATACTCCATTGTCGCGCCGATATACTCGCGCGTTGCTTCATTGATGTAATACGTTTTTACCCAGCCATTGTTTGACACGTAACCATCTTGGCCAATTACACCAGTAATAATATCTAAATTATATTTGCTCATTATGCTGCTCTCACGATATATAAAAATGCAATGTTACGGGGGCGAGTTTCATTTGCTGTTCTTGCGCTATTTGAAGCGTCAAAGCTGAATTTTTGAATTTGTCGTGTTACAAATGATGATGTGACAACTGTTCCATTTGCTGTTATTGATGTAAAAGCTCCGCTCGAACCACTTGATGGTGTTTTTTCAGAAGAAATTGAAATTTCTCCTTTAATATTTTGAATTGCATCAGTTTGAGCAGATAAAACTACTCGCCCGTTATCAATATTCCGCCCAGCGTCAAGGCCGCGAATAAACTCACCGCGTAAATCAGGTAATACGCCAGATGGATAAGCTTTAGCAAGCAAGGGGTAAGTCGTTTTATTAAATGTCTGACCATTGCAGATTAAATATCCGCTAGGAGCCGTGGCTTGAGGCCAAGGGATAGGTGCTCCCACGGGGTAATCACTTAATTCAGATGATGAACCTGAAACTTTTAAATTTCCGTTGTGGTCTTTTGTTGTGTTTCCGGTTGAGTAAATTTCGAACCAACTACTCCACGAGCCCTCGTTTCTTTGTCTGTACGCAAGCAACTTTGATGTGTTACCTTGAATTTGTAATGTCATTCCAGCGCCACTTGAGCCGCCAGATCTGCATGCATGGATTAGCGGGGAGTAGCTGTGAAAATTATTACCCGCCGTTGTATTTCCTCCTCCACCTGCATAAAACCCACTCTCAAGTGGAATGTCGTTTGCGTCTGAGTATATCTTTCCTGTTGTACCAATACCATAATCACCAACCACCATCGCTGTTCCAGATTTTTTTGGTATGATAAATGTATTTTCTCTTTCGTTATTTACATTTCGATATGAAATATCCAACATTACAGATTCATTACTTGATGATTCCGCACGTATTGATTTTCCATTTTTTCTATAAATAGAAATACCAGGCCAGTTATCTGTAGCAACAATTTTAATTGTTGAGTTATTAACGGTTAGTCGATTACCTATTGATACTTGACCCGCTATGTCGCCCCCAGTTTTATCAAACTTTCCATTTAACCCATTTTTTAGCGCCGTATTTGTTGCATAATCTCCCGCTGGGGCATAATTCCCCTTTGGTTGATACTTAGTATCAGACTCTAATTTTGAATAACTGTAGCCTGACGGGAGGTAATTACCTTTAGGTTGGAATCGAGTATCCGATTCAACTTTAGTGTAGCTTTCCCCTTTTAGTGCATAATTACCTTTAAGTTGAAATTTAGTGTCCGTATCTGTTTTAGTGTAATAATTACCCAACCCCAAAAACACACCCAGCGTAGACCATGCAGCTTGCGATTTATCCGGTTGCTCCCCTTTCGTTTCTTTATTGGAAACATAGATAACCCCATTCCACTGAACGATGGCCGTTTTTGGGTAAGATAGCGCCGCATCCCACTCCGCGACACCACGCTGCGTCAAGTACATCAACCACTCATCAACACGCTTACCTATGGCGTTAAACCATTCCAATGGCGGCTTGCCAGCAGTTCTGTCTAAAGTAATCCCCCACCCACGCAATACATCTGGGAATGTTTCAATTTCCCCCGTTTTCGCATCTTGCGCGAATATTTTTAAGTCTGGCTTTTTAATGACTGACATTCATTAACCTCGTGAATTTTCCATCGTTAAAACCAAATGCCGATTGATCCTCCGCCCAACCAAATGGGTGTGCATCGGTAATAACGAGATATTGATAATTAACCCCTATAGGCCTCGATAAAATATCGAGATCTTTGATGGCATGGATCCGAAACGGTGTTAAATAATTGGCAGGGATAACCACATTCATCGACATATCATAATTGTCGATAATAAAGGCTTGCTCCCCCAATAAGTGACGTAAGGAATAGGTAATATTGGCGATATCGGGTTTTTGGTAATTTTTAATGATCTTGGCTTTGATAAAAAAGCGGTAATCATCATCCCCCAATACCGATGATCCTTTGAGTGAATCACCATAACGATAAAAGGCCCCAATATTGAAGCCTAGCGCGCCTTCAATCCCCCGAAAGCCAAAATAGTCTTTCGGCACCAATGATTTCATGACCCGATGAAGACCGACATGTTTGCCGATTAAATCGAGTCCATACCCCGTAGCAGTGTCGATATTTAATATGGTCGATAACGTAATGACCGATTCAAAGAGTTGCTTTGTTTCAGAAAGCAAAAGCCCGACGGTTTGTCGGGCTTTAGGTTTTCCTCGGTACTGCCAAATCAAAAAGTCTTCGCGTGGTTTACTCAATCAGCACCTCCACATCTTCTGGCCTGATTTGTGCGCATTGGCGAACCCCTATTGAAACAGCATCGTGCCCATTTACGGTAATTGATTTAATGTAAAAGCCTTGTACTGCATTTACTTGGCAAGTTAAACGCATCGCATAAACCGATTCACCAATATCAAATTCAGTGGCGGCTAACGCGGCTTTAATGGCATCGGTATCGATATCATGGAAGCCCCCCACTCGTTCAAGTAGTAATTTGACTTTAACATTCACCAAAGCGGCGCGATCAAAATAGACGGTTCGCGGTGCGCCAGCATACGTTTGTGTATTACTGATACGCCCAAATACCCCACACCCGCCCACTTTCTTACTTAAAATCATTCGCCCAATATCATTATCATGGCCACCAATAACAACGGCATTTAATGTGTGCGGTGGAATGCCTTTTTCATCCGTTTGATTGGTGTAGTTTTCGTAGACCTTAGCTTGTTTTACATCCGGTAAATCAAGCAGAGCGCCTTCTAATCCTTGATAATCATCATGATTATTGATGGCATGCGAACGCATAAAGCGTAATAACAAATTGCCATCTGTTTCCTCAAAAGCGCCCTCTTTTGCCGCTTTTGTGGTTGTGATGCTATCAACCCCAATGGTCACCGTGTCCATGGTTAAGGAGCGATTTGCTGGCAACGAAAAAGCGCCAAGCTCCTGACTTCGTAGATCCACTCTTGCGGAGCCGTTACTCCCTAACGTGACATCCGCCAATGTGACCCACTTGGTGCGATTATCATCAGACAATAAGCTCCCTTTATGTACGGTAACGCCCTGTTTACCTGTGATCACCACCTCATTGAGATAACTGTAATCGGCCCCTCGGCGAACAATGCCGGCATACATTGCGCGTTGTTCTAGCCATGATCCAATGGCCTTATAGGGGTCAAGCATCTGCGCTATCAGTGCAATTGCTTGATTAATATTATCTATCTCTTGAGAAAATAAACCGATCATTTGACCATCAGGACTATCGGCATCGAGATTAATATCATCCCCATAAATGCGTTTAAATCCTTCCGTTAAGCGTTGGTGAACGTCAGTCAGCTTATCAATCACTATGCCTGTTTCAGTAATTTGGAGCATCTGTCATTACCTCTTTTTTATGACCGTAAATATCAATATAAGTGACTGATATCGCCATCAACCTTGTATCAGGATTGAGTTGAATATCAAATTCGGTAATTTGCTCAACCCCTTGCGTATTTAATACACTCGCTTTTATTTCAGCCTCCATCGCTATCAAATTAGGGTTTTTGCGTAAATAATCGAACCATTTAATGCCATGTTCGCGATTAAGAAACCAATCCTGTTTCAATGACAATAGGCGAGTTAGCACCGATTGTGCGATAGCTTCCGAGCGAATGTTGTAATCTGCTCTCCCTCGCCCAAAACACCAATCATGGTTATCATCAAGCCGACGTACTTTCATTAGTTAGGACCTCCTGTATTGCCTCCTCCCGTTTGCACTCCGCTGTGCGTGTGGGTATCGCCAATATTTTTGCCATTATGTTTAAGTGTGCCGCCGGATGATTCACTATTACCATTCACTGAATGGTTACCTTTAATCAACGCATTACCTGTTAACTGATAATTACCTTGGTGTTCAATATCGCCTTTAATCATGATCTTTCCCGACTGCATACGAATAAACGTTGAGCCATCATCCGTTTGTAGCGATAGTGAATCACTCGAATAATTAGGAATTTTATTGGGTTGACTACTGCCTTGAGGTAAAAAGAAGGCATCGGATAGGTCATGAAAACGGTGATCAAGCGGTTGCGACTGTTTACCGGAAACATACCAGCCGTCAATGCAACGCTCGGCAAAAATCACCAGCCCCTCATCCCCCTCACGTACAGGCACTGTGACACAGAAACCACCTCCCCGATAAAATCCAACCGGAACATCGACTAACGGCGGCAACGCAATCACTTTTCCCTCTTTAGTGACATGGCTGATCATTAATTCAACCGTCGCACTATGCCCATTGCAAGACAGTAATTTACCGGGCAACGCAGTATGAATATCGTAGCGCTGGTTCTGAGCGTGTTGATTCATCACATCAAGAAGTGTTGGCTGTTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_017731|414543:425766|421489_423274_-|WP_014656231.1|DBSCAN-SWA MGIEQLLTIIGLNEEQVVKLKGVVTALGAAATSTATVIGQLGEKLSNAGLTIDNLKAVVSGLVTAIDFMSNKFFSFIGGAVAGARELSQEKSVLFTISEKELQQADEYQSVTKKTSLSIESIKTKLVLGLLPNLTEVINRFNEWLDANKALISEGLTQLVVWGSKGIQAIGNAGRAINLLVEKTIGWKAAIIGVIAVLAAFKKAALIAFAANPVMWVAAAVAGLMVLLGDLMAYLDGGESQFSEFWAPAIEWIQSVLAWWNTFYAENKLIFDGIAQAWALTIDSAVMIFRGFFKYIGNALKLLFGLFSGNTAMMGEAWEGMTEGLKEIWAGFEHYFHGFATAFLALWQVLIQGVIQAWDVIKNAAKMAFEWVLSVAKTFIDGLSSVFFAIIDYLLAPFQSAFDLIQSLYEIFTDDSTSWTEKLNLAFAAIQEFLTAPFKAGWEFIRNLFDLSDTDIGKFIHDLANTFNGVTELIKKPFELAFNWVNQKLDELTSGIISILTALGIIDDKYQSEKKLVQISNLAGGLIKQNLADPNLSNVTTSNHKSIVVNQGDVNVKQDIHTMDSRQAGVLAVEGINQYVNEIAYHSLKSANAD >NC_017731|414543:425766|419541_420366_-|WP_004921005.1|DBSCAN-SWA MKQLGRQLKLVIGNDDESFEITQLRVTFDIKKTLTPEPNPAVIRIYNLNASHRNLLTSKVFNRAALSVGYEELQLIYAGDIIEVKVTESAEDIICELICGDGFKAYTCTLVNKTLSSGNRDRDILTENAQAMDIDIGVIELPNDRQLPRAKVMFGDARELLHKIAKNNQSDWSIQDGQLMLLPKQKVITDNESFVLSQETGLIGKPEKSEDGLTITCLCHPTLKIGALIRLQSITSEFNGDYKITQLSHTGDFMERDWYSRLVCVDGTFDKVKQ >NC_017731|414543:425766|417418_418543_-|WP_014656227.1|plate|DBSCAN-SWA MLQITETGIVIDKLTDVHQRLTEGFKRIYGDDINLDADSPDGQMIGLFSQEIDNINQAIALIAQMLDPYKAIGSWLEQRAMYAGIVRRGADYSYLNEVVITGKQGVTVHKGSLLSDDNRTKWVTLADVTLGSNGSARVDLRSQELGAFSLPANRSLTMDTVTIGVDSITTTKAAKEGAFEETDGNLLLRFMRSHAINNHDDYQGLEGALLDLPDVKQAKVYENYTNQTDEKGIPPHTLNAVVIGGHDNDIGRMILSKKVGGCGVFGRISNTQTYAGAPRTVYFDRAALVNVKVKLLLERVGGFHDIDTDAIKAALAATEFDIGESVYAMRLTCQVNAVQGFYIKSITVNGHDAVSIGVRQCAQIRPEDVEVLIE >NC_017731|414543:425766|418526_418889_-|WP_004920995.1|DBSCAN-SWA MKVRRLDDNHDWCFGRGRADYNIRSEAIAQSVLTRLLSLKQDWFLNREHGIKWFDYLRKNPNLIAMEAEIKASVLNTQGVEQITEFDIQLNPDTRLMAISVTYIDIYGHKKEVMTDAPNY >NC_017731|414543:425766|415160_416783_-|WP_014656225.1|tail|DBSCAN-SWA MSVIKKPDLKIFAQDAKTGEIETFPDVLRGWGITLDRTAGKPPLEWFNAIGKRVDEWLMYLTQRGVAEWDAALSYPKTAIVQWNGVIYVSNKETKGEQPDKSQAAWSTLGVFLGLGNYYTKTDTDTKFQLKGNYALKGESYTKVESDTRFQPKGNYLPSGYSYSKLESDTKYQPKGNYAPAGDYATNTALKNGLNGKFDKTGGDIAGQVSIGNRLTVNNSTIKIVATDNWPGISIYRKNGKSIRAESSSNESVMLDISYRNVNNERENTFIIPKKSGTAMVVGDYGIGTTGKIYSDANDIPLESGFYAGGGGNTTAGNNFHSYSPLIHACRSGGSSGAGMTLQIQGNTSKLLAYRQRNEGSWSSWFEIYSTGNTTKDHNGNLKVSGSSSELSDYPVGAPIPWPQATAPSGYLICNGQTFNKTTYPLLAKAYPSGVLPDLRGEFIRGLDAGRNIDNGRVVLSAQTDAIQNIKGEISISSEKTPSSGSSGAFTSITANGTVVTSSFVTRQIQKFSFDASNSARTANETRPRNIAFLYIVRAA >NC_017731|414543:425766|420675_421407_-|WP_014656230.1|DBSCAN-SWA MDITSGIFTGRASVITRTIGQFELDCTIRETHTSALRITKNPVESGADIADHAFLEPKSLSITGTVVGYEPAKYFNDFLGFDTEAMGEYPLPLEISSSIWQAEAMLGQYITIGRVLANKVQKVIAPWYPDVLKPFADSSQTLDRASRAYESLLAIQKMGEPIDVQTGLRLYKNMMLTSIGATQDKPGAVEFSLNLEEVFIVESQTAKGLHPDLKQQPQKSNMGRTQPEAKSAHTFRETLGGRS >NC_017731|414543:425766|423418_423811_-|WP_014656233.1|DBSCAN-SWA MEKDNITYEHRHSNFIEAKTHAMKLLGMLKGCIAMNGEQVDIDVGGVLANIGSTEMQGVEKFILKWVIAKDADGNVIQLDKVDVFNTHFNTYRSHYYPLIVNGLVFHFADFLPDGVASKVNMPSLVNLTA >NC_017731|414543:425766|414543_415161_-|WP_014656224.1|tail|DBSCAN-SWA MSKYNLDIITGVIGQDGYVSNNGWVKTYYINEATREYIGATMEYVTIGGGLPAGAYLDAPELPEKPDVAIIRSADEQSWLHVADHRGKTAYNTETRQPVEVDFIGDLPETLTLLEPKTEFDAWNGKKWVTDTEAQKAALIEQAEQEKSQRLDEANNMLTYLQDSIDTGLATDEEAAALQAWKKYRVLLNRVDTSLAPNIEWPEKP >NC_017731|414543:425766|416769_417426_-|WP_014656226.1|DBSCAN-SWA MSKPREDFLIWQYRGKPKARQTVGLLLSETKQLFESVITLSTILNIDTATGYGLDLIGKHVGLHRVMKSLVPKDYFGFRGIEGALGFNIGAFYRYGDSLKGSSVLGDDDYRFFIKAKIIKNYQKPDIANITYSLRHLLGEQAFIIDNYDMSMNVVIPANYLTPFRIHAIKDLDILSRPIGVNYQYLVITDAHPFGWAEDQSAFGFNDGKFTRLMNVSH >NC_017731|414543:425766|418888_419545_-|WP_014656228.1|DBSCAN-SWA MKQPTLLDVMNQHAQNQRYDIHTALPGKLLSCNGHSATVELMISHVTKEGKVIALPPLVDVPVGFYRGGGFCVTVPVREGDEGLVIFAERCIDGWYVSGKQSQPLDHRFHDLSDAFFLPQGSSQPNKIPNYSSDSLSLQTDDGSTFIRMQSGKIMIKGDIEHQGNYQLTGNALIKGNHSVNGNSESSGGTLKHNGKNIGDTHTHSGVQTGGGNTGGPN >NC_017731|414543:425766|423810_424245_-|WP_004921015.1|DBSCAN-SWA MSVYNHKSLMVSINGYEITAFDESADALSIAPVGDDGAWTFGANGRGVYVFSGNQSGILTLKLLQHSADNHFLSNLRNQMLSSQSAPAPLELYIKDTWNGDEIVGHVGFFTTPPTQTRGAGHNAQSWVIQFERVITKLGKGAFN >NC_017731|414543:425766|424254_425766_-|WP_014656234.1|DBSCAN-SWA MSLSIKEIINAQILPQAAAVQRRDLSMIAIFTSEMGNAFVDASSRYIFVSNEQDVANLFGTKSSTYKAAQALFSARPKLKRAMIARFAKEKQTIAATANALKGSTISVGLNVLKAITDGAMTLNLAGSDILLSALDFSKAIDFSDIAKVINQKLPSDANVQAVWDAIGKRMIIQSKTAGVDAKTRFGYVKPSTSGTYVGNLLKLEEGQATLTVGAAAQTVNAELPSEALHKLQNVYQNWYGVYFADSLTDEQLDDAHAWVTAADLKVMAYTATRDEQIEWNNSNILKKLFDKNSGRLMVQFNKTGDNHAGAELLAIAVSTVWQGQNTAKTVKFKQQTSVRSDDRVTQDAAQKCRRLGINFYTDYDGINMLAEGTMLGGTFIDEVMGLDAFIDACQKQAFTTLQASPTKIPQTDKGQAMLIGSLIVIGNEFKRNGFLAGGIWRGSDIGEVTFGDRLDEGFYFYSDSFDVQSQADREARKMMPIMCAIKLAGAGHSADLLIQFNR >NC_017731|414543:425766|420340_420679_-|WP_014656229.1|DBSCAN-SWA MIYEIPVSNEPIQEQLFTLFGKALKLTLYYNKISKNWQFDLFDTNENKVITQMQGLAVNAPSLIEKNLPFILTLSDKSRFGINSISQSELGERLLLYIVDKGFWYETIRQTT |
13 | Haemophilus_phage(44.44%) | plate,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
932191 : 985019
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_017731|932191:985019|DBSCAN-SWA AATGGCAAGCATACTACTGACAGATAGTAAAATACGAGGATTGAAGCCTAAGAAATCTGCGTACTATACTTGGCAAGCATCAGCGACTAGGGGCACTGGCAGACTTGGCGTAAAAACATATCCATCAGGAAGAAAGGTTTTTGTTTATCGTTACTTCAAAGATGGAAAAGAAAAATTCATATCTCTTGGTGACTATCCAAATTTATCATTAGCTGATGCCGCTGTAAAATCTGTCGCTGCTGCCGCTGAATCGTCATCACCTGAAAAAATTAAATATGAACACGCAACTGTAAAACAGCTCTTTGACGACTACATTGAAGATCAGAAGCGACAAGGTAAGCGTTCGTACGATAAAACACAAAATAGGCTAAATCAGGTCTTAGAAAGCAAGCATATAAACCCATCAATGGCTGCTAAAGATGTTACACCCGATCATATAAAAAGAATACTGTCTGAATTTATTAATCGCGGTGCATTAGCTGGCTCAAACAAAGTTAGGGCTAATTTACATGCTGTGTTTAATTTCGGCTTATTTGCTGACAACGATCCTGCAAAAATTAACGAACGGGTTATTTACGGTTTGGATAGAAACCCTGTTGCTGCTGTCCCTAGACAAAAAGGAGCAGACAAAGCATTAGATAGATTTCTGTCATGGGATGAATTAAAACACTTGCTGGAGTTATTTAATAAGCCAAGCAATGAATGTCCTATCAACCCAGATTACGCGCGACTGTTTTTATTCTGTGTTTATGTTGCCGGACAAAGACCATGGGAAATCATTGCGAACACTCGTGATAATTTTGATAAAAATAACAATACATTGACAATCCCCCCTCATATTTCAAAAACTGGTGATTATCATGTGGTTCCTCTAGTCCAACCAGCTATTGATATTCTCAATATTCAAGAATTGCTGTATCCAGAATCAAAATTCCTTTTCCCTAGTAACACCAGAGAAGGCCACCTCTTAACAGATGAATTCGCAAAACAACTGAACAAATTTTGCAAAAGTACGGGATTTGAAAAATTCACACCACGAGACATAAGACGAACATTTAAAACATTGGCTGGGGAGATGGGGATTAGCTCGGAAATGCGCGACTTGGTTCAAAACCACAAAAGACCTGGGGTATCTAAAAAACACTATGATAGATACGATTACTTAAAAGAAAAGCGTGAAGTTCTCGACGCTTGGAACGAAAAGCTATTTTCGTTGTTTGACGAATAAACAAGATGCGCTAGCCAAGCGGCTGGCGCAACTCTCTCAATCCAACTCGCATAAAATCAACAAACATCTTGATCTCCATTATCGAATTACTGTATATAATTACAGTTCATTTTACTGTATATAAATACAGCCATTTGATTTATGAAGGAGCATTTATGGTTAATATCAAAATAAGACTTGATCTCAACATGAAAGGGAAGCTCCCTATCGGCACCTTTCAAGCGCTTCAAGCTCAAGTTGAGAAGAGATTAAAAAACAAATACCCTGAATTAAATGTGGATATTGGCTGGGGAGCTCATACTAGCCTAAATATTGATGGGCTAAAAAAGAATGAAAAAAAAGACTACATCGAAGAAGTGCTGCAAGAGATTTGGGAAGATGATAGCTGGCTCCCCGAAGGAAACCAAACGGAAGATATAGAATATTTTGACAAATAAATTAAACGAGCCAACTCAAGCTGTTGGCTCATTCCAATTTGAGTAGATTAATTAGCATGGGAGGAAGAGGTAATTATTATCTGGGTATCCAAATACTGTTTTTCCTTATCAATATCTGTTAATTCATTTTCAACTAAACTTTCTTTAGTTATTAGTTCAAAAAATTCCCCAATATCAATATCTAACACTTGTAATGAAGAAATTAATTCATCAATACCAATCCTATTAATCCCCCTCTCGTAACGATATAATTGCTGTTCACTTTTAATTCCAGCTTGTTTAGCTAGCTGAAATGCTGTTAGCCCACGCTGTATTCTTAGCTTCTTAAGGTGAAATCCCACTAATTTAGAAATTGAGTTAGTGCTCTTCATATTGTGCCCCTTTAGTGTAATTAACATCTCGAAATGAAGCTCTTGATATAACCTTTACCTTTAACTGAAACAATTTTCAATACATTGAAGAAACTTTCTTATAATTTATCGCACTATATTATTCTCTTTTTATATTAATTTCACTTTTCTGCTCCTCCTCCGCTTGCCTCTCCGCCTCCTCTTTCGCCAATCGCTCGGCTTCTGCTTGCTTGAGGTTGTAGATAGAATTCACTGGCATTTCGACACGCATATCTATCCAGCGAGACTCAGGAACGTCGCACGGCTCGTAGTTTTCGAAGTAAACAGGCACACCTTCTTCATCAAAGTGCTTAATGCGTTTGTTCTGGAAGCGTTCTGGCATATCTGCGTTCTGTTGGTGGAAAACAAAAACTTCAATATCACCATCAGGTCTCACCTCATAATCAATAAGCACCATGTTTTTACCGTTATGGTCTTGAGGGATGACAAAGCCGTTATCGATCCCCCATGCACCATCTGCATTAAAGCCTACAACACCTTTAATGAGGTAATGGCCTATACCAAGGTGCTCCATTTCAACGCCTTCTGACTCTTCGTTAAGCTCAATGTGATCAGCAAATAATTTCACAATTGGCGATGCTGCTTTTAAGTTGCCGTTGGAGTCTTTGGTGGTGTTTGCTTCAGTATAAAATTCGTACCACTTACCCCATCCAAATATGTCCTTTGAGCGGCGCCACGTAGATGTTATTTCACGGTTGGAACGGAATGCGATTTGTGATGCTGTATACCCAGATTGCATATGCAGAACCATCAGAAAATTCATAGCTTCAGGTAACTCGGGTTGTGACGACGATGCTGCAACATAAACACCGTTTTCTGTAATTTCATTCCAATTCGATGATGACTTGGCCCCAGCACCCCAACCATAATCACCAACTTGCATTAGTGTGCCAGATTCAGCAGGCAAGGCATGCGTCCCTTTAGTCGACTTAACTGCGTTCTTACTGAAGGTCACATCACCAGAGATAGTTCCGCCAGCTTTATCAAACTTCCCATCTAGCTGCTTATCCCGCTCTGCTTCTGTGCGTGTTTTTCTCACAGTGCCATCAGGGAGTTTGACATCAATAACTCCCGACTCCGTCATTATGCGATTCTGTATATCACTGAACTGTACGTTAGATGAATTCATTGCAACAATCGCGTTTGCTGCTGCTGAAATTGAATCCATTGTTGTTGTGAAAATAACGTATTTAGCACCAGTTTGTGCTGTCGGGATTGGAAAGTTTAATGTTAGTTCTGTGTTCGACTGTATTGAGTGAATGCTGTTGTTATGAACAGTGTTGCCGATTTGAATCTGTATCATCTGCATTGGAAGTACAAGATTAATATTCTCTTTCCACTTAGTGCCCATTCCAATTAGTTTTGTGCTGTTTGCTGTCGTTGTGACTGTTCCTACGTTGTACATAATATTCTCCGAAATTTAGATACAAAAAAACCGCAATTAAGCGGCTTGTTTATGTGATAGACTTTTAACTGATTTTAAATGATGATGAGTTATGTTTGCAGGCAATAACCATTGCTGGCAGTATCTTAGTCGTACACTTCCCTGCATGATATGTGGTGTATCTAACTGTAACGACAACGTCTTTTTTGCTAGCTGGTATTGTTGCGTAGAATGAGCAAACTAATTTCCATGACCTTCCATTTATCATCTTTGTTGTTTGCGGTGTATGTGTTACCCCATCAATAATGATTTGAACATAGGCATCGATAATTGCGTCTGAATAAGACCCTGTTGACTCAAACTGCATCGTTGGCATTAATAAATCAACATCATACGGCATTCCCCCTGTATAAATGATCTTTGACTCAATGACTTGGTCATATTTACTACCATGGGTTTCTTCTTTGGTGGCATACTTGTAAGTTGCTGCTACCGCATTATCGCCAATTAACTTTTCAACATAAACAGTTCCATTAAACTCACCATCAGTTGCATAAATCTTCCCGGTTATTTCAGCGTCATTTGCAATCAGCTTCCCGTTTTCAAAATCCAGCATGAGACCTTTTTTAGCTGAAGGATCCCAATTTTTGGATTTGATAGTCGAACCAATTAACAGCTTTTCAATTGTCGCTTGATTAATAAACGCTTCATTGATAAACACCTGCCCATTTTCAACAAAGAAAACTGGCTCTAACTTGCCGCTGGATGGATTGAAAATGCCGAACGTATCGGCGCTAAAGCCGATTTGTGTGACCACCTTGCCGTTTCTTACTTCCGCTCCCATCATGAATTTCGCATCGTAATATTGATTGTTCCAGTTGATGCCGGTCTTAATTGTGTAGATAGCAGAGCCATTGCCGTTGTGGTCAAAAATGGTTTGCCCACGTTGCTCAATCGCTGCCTGCTGATTGTCAAACTCAGCTCTCGTCAACTGACTGAAATCCGCCAAAGCTTGCTCGTTGTCGCTGATTGACTGCTTGTTATCACTGATTGACGACTCTGCTTGACCGATTCGAGTAGATAAATCTGTGTTAACTTTAGCAATCGCTTGGTCTTGCTTCGCAATCGCTTCTTTCTGCGTGTCAATTTGAGCTTGAACGGTGTTAATCCTGCTATCAAACTTCGCGTTGAGCTGCTCATGGCTTTTTGCAACTGATTGCTGAGTATCTGCCAGCGCTTCTTCTACTCGCGTAAAACGAGCGCCGTTCTCACCGAGTTGAGCATCAATTTGCGTGAACTTCTGCGCATAAGCTTTATCGTTATCAGCAACAATTTTGTTAGTTTCACGGATAGAAGCTTTAGCACGCAAAATCTCAGTGCCTTGCTGATTCTGCTGAACTGCAAGTTGCAATGTGCTTTCAGCGTGGGTGCTATCGGCATTCGCTTGCGTGTGTTGCACATTCGCAATGGATGAACTGTTGTCATTAAACTGGGATGTTTGAAGTTGCTGAAGCTCCGTGACAGTCTCATCCGTTTTCGCT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69 | Proteus_phage(19.44%) | tRNA,holin,integrase,terminase,portal,lysis,tail,head,protease,capsid | attL 931980:932028|attR 973294:973342 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
2798594 : 2870609
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_017731|2798594:2870609|DBSCAN-SWA 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58 | Escherichia_phage(37.5%) | integrase,transposase | attL 2835745:2835763|attR 2879600:2879618 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
3253362 : 3263955
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_017731|3253362:3263955|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_017731|3253362:3263955|3256276_3258409_-|WP_071821176.1|DBSCAN-SWA MENTKNKTTVDYHALNAMLNLYNSAGEIQFEKDKEAAHHYFRQHVNQNTVFFHDLKEKLDFLVNENYYEPQVIEQYDFAFIKKLFKQAYAHKFRFQTFLGAFKYYTSYTLKTFDGKRYLERYEDRVCMVALTLAQGNQALASYLVDEIISGRFQPATPTFLNCGKKQRGELVSCFLLRIEDNMESIGRSVNSALQLSKRGGGVAFLMTNLREQGAPIKLIENQSSGVVPVMKMLEDAFSYANQLGARQGAGAVYLHAHHPDIMRFLDTKRENADEKIRIKTLSLGVVIPNITFQLAKENKEMYLFSPYDIEREYGVPMSEISVTEKYHEMVNNKAIKKYKINAREFFQTLAEIQFESGYPYILFEDTANRANPIAGRINMSNLCSEILQVNRPSFYEDDLSYREVGKDISCNLGSMNIAKMMDAPDFAQSVAIAVRALTAVSDMSHIRSVPSIEQGNHQSHAIGLGQMNLHGYLARERIHYGSEEALDFTNIYFYTITYHALKTSNQLAIERKATFKGFEHSEYANGRYFDKYINQSWLPKTQTVQELFRRSGIEIPTQADWLSLKQSVMEHGIYNQNLQAIPPTGSISYINNSTSSIHPIVARIEIRKEGKIGRVYYPAPFMNNDNLEYYQDAYQIGPEKIIDTYAVATQHVDQGLSLTLFFKDDATTRDINRAQIYAWRKGIKTLYYIRLRQTALEGTEIDGCVSCTL >NC_017731|3253362:3263955|3253362_3254565_-|WP_004917599.1|DBSCAN-SWA MPIKLEVKNLYKIFGEHPDQAFKLLESGMSKDDIFEKTGQTVGVQDANLAINEGEIFVVMGLSGSGKSTLVRLLNRLIEPTSGQVLIDGEDISNISEKALRQVRRTKISMVFQSFALMPHMNVLDNTAFGMELSGISKEQRHQKAMDALRQVNLEKWAYSYPDELSGGMRQRIGLARALANDPDILLMDEAFSALDPLIRTEMQDELLSLQGDKQRTIVFISHDLDEAMRIGDRIAIMQGGVVVQIGTPDEILNNPANDYVKTFFRGVDISQVFSAKDIARRRADALLHIAPGFGPRSALKVLNDDDRYYGYLISRGHTFAGVVSVESLEKALQNNQGIESAVISSIEPIQGETPLNEVISTVAQAPCAVPVINEKNRYLGVISKGMLLQALDKETSNEQ >NC_017731|3253362:3263955|3260389_3261355_-|WP_004917612.1|DBSCAN-SWA MSKPIQIERGIKYRDADKMALIPVKNVVTEREEILRKPDWMKIRLPADSTRIQGIKAAMRKNGLHSVCEEASCPNLSECFNHGTATFMILGAICTRRCPFCDVAHGRPNAPDANEPVKLAQTIKDMGLRYVVITSVDRDDLRDGGAQHFADCISAIREKSPSIKIETLVPDFRGRMDRALEILTETPPDVFNHNLENVPRLYRQVRPGANYDWSLKLLERFKEAHPDIPTKSGLMVGLGETNEEIIEVMRDLRRHGVTMLTLGQYLQPSRHHLPVKRYVSPAEFDEMKEEAMAMGFTHAACGPFVRSSYHADLQAKGEEVK >NC_017731|3253362:3263955|3261477_3262122_-|WP_014657709.1|DBSCAN-SWA MDVKTLSARTIIVRQLGLAPYQRVSDAMHQFTENRDKETADELWLVEHPRVFTQGQAGKAEHLLAPGEIPVIQSDRGGQVTYHGPGQQVMYVMLDLKRNKLGVRDLVTALETTVVKTLAHYQIEAYPRPDAPGVYINGDKVCSLGLRIRKGCSFHGLALNINMDLEPFNRINPCGYSQLKMTQMCHFIPNLTLPDVQPVLIEQFCDTLGFHIVQ >NC_017731|3253362:3263955|3259360_3259831_+|WP_004917609.1|DBSCAN-SWA MYCQYLAAPEKFPKPWVQITADDEGVTSIYFVEQKSYPEQKNTHSELCVKQLTEYFNHQRKEFTVKLNPQGTEFQKKVWGHLCSIPFGERWSYKDLALKLGSVNYCRAVGMANSRNPISLIVPCHRVLGHDGKLVGYTGGLDIKDWLLAHEKEYAN >NC_017731|3253362:3263955|3258842_3259070_-|WP_014657707.1|DBSCAN-SWA MAIITIYSKPDCVQCHATYQALERKSIPYQVIDLTQDDEALQFVRKLGYQQVPVVVADQEHWSGFRPDMISRLSA >NC_017731|3253362:3263955|3260037_3260247_+|WP_014657708.1|DBSCAN-SWA MSKVKGNVKWFNESKGFGFITPEDGSKDVFVHFSAIASEGFKTLAEGQKVEFEITEGAKGPSAVNVVSL >NC_017731|3253362:3263955|3262382_3262646_-|WP_004917614.1|DBSCAN-SWA MKTKLNELLEFPCSFTYKVMGLAEPELVDQVVEVVQRHAPGDYSPEVKPSSKGNYHSVSITINATHIEQIEKLYEELGALERVRMVL >NC_017731|3253362:3263955|3258419_3258833_-|WP_004917606.1|DBSCAN-SWA MQTESLIYFSSRSGNCHRFVEKVGLPATRLPIGEQQSSIIATTPFVLLLPTYGGGGSRGAVPKEVIRFLNIESNRRLIRGVIAAGNTNFGEAYAIAGDIIATKCQVPYLYRFELLGTERDVQRVRDGLNAFWQQRHN >NC_017731|3253362:3263955|3255291_3256263_-|WP_004917602.1|DBSCAN-SWA MTTHISSAPVKAINWNRIEDDKDLEVWNRLTTNFWLPEKIPLSNDISSWNTLTAAEQQLTIRVFTGLTLLDTIQNTVGAPSLMSDALTPHEEAVLSNISFMEAVHARSYSSIFSTLCSTSDVDDAYRWSEENSALQNKAKIIMSYYCDSHPLKKKVASVFLESFLFYSGFYLPMYWSSRGKLTNTADLIRLIIRDEAIHGYYIGYKFQKSLLKYDEKTQKEIKDFTFSLLFDLYENEVNYTQELYDTVGWTEDVKKFLHYNANKALMNLGYEALFPDVVTDVSPAILSALSPDANENHDFFSGSGSSYVIGKAVSTEDDDWDF >NC_017731|3253362:3263955|3262746_3263955_-|WP_004917615.1|DBSCAN-SWA MKNFAPSRTLRHTLLGASLLFTMTQANANEPFPNSPVPAVPEIDAEAYILIDYNSGKVLAEKNADQRRDPASLTKMMTSYVIGQAIKSGKIGAEDIVTVNEDAWATGNPIFKGSSLMFLKPGDRVSVSQLTRGINLQSGNDACVAMADYVAGDQANFIQLMNGYVSKLGLQNTHFQTVHGLDAEGQYSSARDMALLGQALIRDVPDEYAIYKEKEFTFNNIRQTNRNGLLWDKSLSVDGIKTGHTNAAGYNLVASATEGQMRLISVVMGGKSMKGRDAESKKLLTYGFRFYETVKPLQAGVEFASEPVWFGDENNVKLGVTEDLFLTIPRGRLKDLKASYDISTSELEAPLKKGQAVGTINFQLDGKTIEQRPLVVLKDVEEGGFFSRLIDYIKLLFHRWFG |
11 | Mycobacterium_phage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
3494659 : 3505355
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_017731|3494659:3505355|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_017731|3494659:3505355|3494659_3495505_+|WP_014657828.1|DBSCAN-SWA MDHSSVKVALAQFNSLLGQKQHNLERMAAFCHQAAEQGAKLICFPELATTGYRGDLLATQLWDLSDDEGSETYRLFSALATQLDLTIVSGFAERGSYLGEVYNAVGVWNPGCEGVSGVYRKVHAFGIEKQWFSSGNSYPVFDTPFGKIGVMICYDMGFPEVARILTLNGAELLLVPSAWRIQDKDMWDINTACRALENGSHLLAVNRWGNEEDLHLFGGSKIVGPRGQVLSEASCDGETLLIGEVDFRVQAHTRLNIPYLRDRKPQSYEALVQNSQVTGEL >NC_017731|3494659:3505355|3498422_3500708_+|WP_004918072.1|protease|DBSCAN-SWA MLNQELELSLNVAFAKAKDNRHEFMTVEHLLLALLSNASAREALDACKVDLVVLRQELEHFIAQTTPLLPENDNRDTQPTLSFQRVLQRAVFHVQSSGRNEVSGANVLVAIFSEQESQAAYLLRKHDVSRLDVVNFISHGTIKGEASASSEQDTPNSNVNHEEQPVSDDHMDNFTTNLNQLAKQGKIDPLVGRQAELERTIQVLCRRRKNNPLLVGESGVGKTAIAEGLAWRIEQGDVPEVMNGCTIYSLDIGSLLAGTKYRGDFEKRFKSLLKMLEKDSKSILFIDEIHTIIGAGAASGGQVDAANLIKPLLSGGRIRVIGSTTYQEFSNIFEKDRALARRFQKIDIVEPTTEETVRIINGLKPKYESHHDVRYTAKAIQAAVDLSVKYITDRHLPDKAIDVIDEAGARTRLVAPSKRRKTIGVPEIESVVARIARIPEKTVSSSDKERLKTLDSRLKMLVFGQDDAITALTEAIKMSRAGLGQDHKPVGSFLFAGPTGVGKTEVTVQLAKALDIKLLRFDMSEYMERHTVSRLIGAPPGYVGFDQGGLLTDAVIKHPHSVVLLDEIEKAHPDVFNILLQVMDHGTLTDNNGRKADFRNVIVVMTTNAGVQETQRRSIGFAEQDNSTDAMSEIKKVFSPEFRNRLDGIIWFNSLSMDIIIQVVDKFIVELQAQLDEKGVSIEVSQEARRWLCEKGYDKAMGARPMARVIQDNLKKPLANELLFGSLTNGGSVRIGLDNKSNTLTYSFSSVHKASPEDAVF >NC_017731|3494659:3505355|3503588_3505355_-|WP_014657832.1|DBSCAN-SWA MDKTRQTELVRWLKQHSTSAKRWLRISMLLGVVSGLLIIAQAWFLAVILQALIMEHTPREQLLTPFILLLAVFVLRALLTVIRERVGFRCGQVVRQEVRNMVLNKLQALGPVWVKGKPAGSWATIVLEQIEDMQEYYSRYLPQMYLAGIIPIMILIAIFPFNWAAALILFATAPLIPIFMALVGLGAADANRRNFVALGRLSGSFLDRLRGLDTLRLFFREKAEVQQIRESTEDFRSRTMEVLRMAFLSSGVLEFFASISIAIVAVYFGFSYLGELNFGSYGLPVTMFAGFLALILSPEFFQPLRDLGTYYHAKAQAVGAAESLVTLLESDGEQKTETGDKTPQDKPIQIEANKLEIYSHDGQRLVGPLDFTIEPQQRIAVVGQSGAGKSSLLNLLLGFLPYKGSIKINGDELKELCPDKWRALIGWVGQNPHLPEQTLIENICLGKPTASEAEIQQAIDDAYVSEFLPMLPDGLNTRLGDYAARLSVGQAQRVAVARTLLKPSRILLLDEPAASLDAHSEKRVMHTLNQLAQQQTTIMVTHLLEETVNYDQIWVMANGQIIQRGHYAQLSQSEGPFARLLAHRSEEL >NC_017731|3494659:3505355|3501843_3503586_-|WP_014657831.1|DBSCAN-SWA MRVLLPFLALYRRHWFLILLGMILAIVTLLASIGLLTLSGWFLAGAAIAGFPGLYYFNYMLPAAGVRGAAIFRTAGRYAERLVSHDATFRVLAHLRVFAFSKILPLSPGGISRFRQGEILNRLVADVETLDHLYLRVLSPIFAAFVVIFVLIFGLSFLDPRLAWTLGCIMLFLLFTLPFVFYRAGKPIGQELTYLRAHYRTVLTSALQGQAELTLFGALPRFRQTLANIESQWQVRQQQQANLTGVSQAIILFASGFTATLLLWMAADHVGGNTNPGALIALFVFCALAAFEALGPVAVAFQHMGQVIASAERVSQLIDAKPEVTFPDNGLSLPQLESLVVDNISFTYPEQPFAVLKQVSLSLLPGQHIALLGKTGCGKSTLLQLLTRAWDVDSGMIKINGQNISDYSEQALRSLMSVVPQRVHIFSDTLRNNLLLANDKATDKQLIEVLDQVGLGNLLENEQKLNAWMGEGGRQLSGGEQRRLGIARALLHNTPLILMDEPTEGLDAQTEQQILALLKEKCADKALIVITHRMQGIEQMDTICVMDNGEIVEQGSHQALLDLKGRYFQFRQRHLQQQAL >NC_017731|3494659:3505355|3497436_3497688_-|WP_004918068.1|DBSCAN-SWA METGTVKWFNNAKGFGFICPENGGEDIFAHYSCIQMEGYRTLKAGQKVNFSINTGPKGNHANLIIPIESSTLNHTSAEATPQE >NC_017731|3494659:3505355|3500774_3500993_-|WP_004244560.1|DBSCAN-SWA MAKEDNIEMQGTVLDTLPNTMFRVELENGHVVTAHISGKMRKNYIRILTGDKVTVELTPYDLSKGRIIFRSR >NC_017731|3494659:3505355|3501133_3501835_-|WP_014657830.1|tRNA|DBSCAN-SWA MFQLDDDSYLFPPVHEAMREPNGLLAIGGDLAPDRLKAAYYDGIFPWFNPGEMPLWWSPDPRAVLMVGELHISRSMKKLLRKQKYRVTVNHAFKDVIAACAIRDEGTWILPEVREGYQALHEQGIAHSIEAWYGEELIGGLYGVNMGHLFCGESMFSRMNDASKFAFITFYFHFLRYNGQLFDCQVLNHHTASLGAKEISRRDFLHILYRWRNKAIDPACWLPQSIEIPPLFE >NC_017731|3494659:3505355|3498071_3498392_+|WP_004918070.1|protease|DBSCAN-SWA MSDFLGTFKTDVVFKDEVEQVLQPPSMYKVILNNDDYTPMDFVVEVLQKYFSFDEERATQIMLDVHFQGKGVCGIFTAEVAETKAAQVNSYAREHEYPLLCTIEKV >NC_017731|3494659:3505355|3495501_3496251_+|WP_004918066.1|DBSCAN-SWA MSILSSVVDVYRLFLRSGDELTVTTLVNELGMPKSSASRLLKQMAEHGLLEKKNDAPIYRPGLIIMELAHRARGMNPLIDMALESLDELTKETGFTTYVSLRDKDKVRVVHARIGNSMLQVITQPGTKLPIAGTSTGKALLARYSLSEREVIICQEPQEKQDKLRQELNQIEERGWAFSINESVPGVASVSSTVYDPAQGTLYALCLSLPASQITSELLAQLATKICHKASYLGSMVGDPYWLKRSSES >NC_017731|3494659:3505355|3496394_3497333_+|WP_014657829.1|DBSCAN-SWA MSLKQTLCAYELIDSAVVNGDDIVALFKNFTTIEASSKTVRDGKGQSDFVRIVIPGTHGKRQGNHAPTLGIIGRLGGIGARPSRIGLVSDADGAIAAIATALKLAEMREKGDVLMGDVIITTHICPTAPTRPHSPVDFMDSPLNDETMNENEAIPEADAILSVDTTKGNRLINHKGYALSPTVKDGYILPVSEDLLHLMEWSSGQNAVTFPLAVQDITPYGNGLHHINSIMQPAVSTTAPVVGVAICTQTIVPGCSTGASHEVDIAASVKFMIEVAKAFGSGNCQFYDEEQFALLKSLYGDVSFLQTHGRPH |
10 | Paramecium_bursaria_Chlorella_virus(16.67%) | tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
3534845 : 3592457
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_017731|3534845:3592457|DBSCAN-SWA 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78 | Proteus_phage(19.57%) | holin,integrase,terminase,tail,transposase,capsid | attL 3530940:3530954|attR 3536883:3536897 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
3656324 : 3671504
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_017731|3656324:3671504|DBSCAN-SWA 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20 | Morganella_phage(40.0%) | integrase | attL 3659114:3659127|attR 3663875:3663888 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
3924509 : 3945528
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_017731|3924509:3945528|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_017731|3924509:3945528|3931618_3931864_+|WP_014658119.1|DBSCAN-SWA MTPLVKNKIIHLANQSEIARRLGTKPQTVNLWFKNGVPAQKVLSLCECLEWRITPHEVAPDIYPNTNDGLPSEHLVLQVSN >NC_017731|3924509:3945528|3940376_3940748_-|WP_014658132.1|DBSCAN-SWA MSNDKDAENGLIPFSELNQTSVNLGQAVQQANQMHNTLSQMGIVDATFHTGTLYKNTGTSAIVAGNGLLVEQKQHTTTVTFLNEGSTPDQAINEMMVNNTQEVTAAFANTSQPSISNFLNNKK >NC_017731|3924509:3945528|3925534_3925753_-|WP_014658108.1|DBSCAN-SWA MKSDHDIITHEEMIELTGYQFPSKQCEVLTRSGIFFVKRPDGYPKTTWGHFNNPLKQRAQVHAQEEPDFGAM >NC_017731|3924509:3945528|3929975_3930311_-|WP_014658117.1|DBSCAN-SWA MKAQPKTPLNVTLYIHAQKQFDGSYRYRPSTFKYDIDSGLGFVVSECNVEIPFQELTTEQLVNAEIEALRSEQNKILADAHVKSSLLEDQIQMLLCVEGKPISKIDEEIPY >NC_017731|3924509:3945528|3938597_3939191_+|WP_014658129.1|DBSCAN-SWA MAQHSFIKMSNDTLVPANPAARDFLHSKIKCGDVLSADFKKARNPRFHRKYFALLNLGYEYWEPTGGTISPEEKGLVRGYVKFLSYYTDNDDALQSAADIYLEEIAQKRAHNISATKSFDAFRYWVVEQSGRYETFEMPDGSLRRVAKSISFAKMDDLAFGELYKATLDVLWNFILFRKFPTQQAAENAAAQLLDFT 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MNNALMTETVSQIGRMNITGNVIPANWWHHIKMPSGKPDNIGIILLSEIIYWYRPAEIRDEFTGELQGWRKRFQSDKLQRSYQSFADQFGFTKREVTEAIKRLKAKGVITLEFRTINTVSGPCNNVMFIEPVVESIHEITNSISLINNQTELGHVSVIGLTSKRDRGYVETEQPPHTEVIAPTSKRETNTEITTETTTEIIDGTSGEPDDNKPSSKIKLNYGKIIDSYHDILPDMPAIKVLTDERKRKIKNFWIKFKFNQERWENYLTYVSSNCCWMLEERENGRGGLWRRKNLDYLITERCYVAVKEERANDK >NC_017731|3924509:3945528|3939561_3940341_+|WP_014658131.1|DBSCAN-SWA MKLENTLKNFHPKSPTFGNVAGCTSPDRITGTDIMAAMGMTESQAKFGMTAFLAKNDVSKEDKFSTVEALTQYAKKITPKLVAKAAGKKLGHCLIILARMAFEDYARSAGSVYQCSACSGKGLIYKMKDVVKHPGITTLEGETIIDPNIREELVGELCQDCNGKGQLTNRCRCKGRGKVLDEEQTELQGAPVFKLCDRCAGRGYKRVPSSIAYNAIKHLVPDLNERTWRRNWKPFYEKLRSKCFIEESIAEQAFSKVIK >NC_017731|3924509:3945528|3927914_3929963_-|WP_014658116.1|DBSCAN-SWA 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>NC_017731|3924509:3945528|3936242_3936584_+|WP_014658126.1|DBSCAN-SWA MKMTASERKAKQRERQKQQGLVKVELLLDEQEMGMLQRNCALRRPGRDPYDIAEYLSMLIRIDDRSVISLVTELNKQRCKKCNEQLPVDKCCLSGSDECWNTLGWHELKLNIE >NC_017731|3924509:3945528|3935427_3936225_+|WP_050979653.1|DBSCAN-SWA MQQIKHPVSRYHGGKFRLAKWIISYFPEHRCYVEPFGGVASVLMLKERSYAEVYNDLDGEVVNLFRVLRDPNLNTQLQEACVLTPYSRDEFILAKEFITDPLERARRMVVRACMGFGSAAGLNGNSGFQSDSKREYSIYSHLWAKYPENLSAFCQRLQGVIIENRPALDLIKKHDSTDTLFYLDPPYVPSTRVAGNRYYNFEMTNEQHSELLQVIKSVSGKVAISGYNCDLYNNELSGWRKVTKDARISAGRGTRIRTECLWMNY >NC_017731|3924509:3945528|3925736_3925922_-|WP_014658109.1|DBSCAN-SWA MQLQPWKPEEQLLTDFDIKLGRLAASVKNKQLTEADIKRACDTADLLILLMMRQDQNEKRS >NC_017731|3924509:3945528|3935015_3935186_+|WP_041705276.1|DBSCAN-SWA MIIKDPITHESLVRDNRPIFPDDGCDYSQCHIDRLNAAARARTKAPYQPVLKPQKR >NC_017731|3924509:3945528|3943154_3943583_-|WP_014658137.1|DBSCAN-SWA MKLTDIFERLHKCIEALNKHTDELPSISKRVSSVASNLAAYTVVNGLIFLIAIKASCRFPEFQGAFYHVSAFFIGILFFLFINDVFTNYFPLKPIKHEKLSLKLIFVYIAIIVGAVVITWLYVASVYQPLFSIPESLSKCTT >NC_017731|3924509:3945528|3943680_3944691_+|WP_014658138.1|terminase|DBSCAN-SWA MAKPDWGTLQQQFLTEHAKSGISPKEWCEDQGLNYATARRYIKRPAAQSAQKTAHKKLHTAHEKECAKEPVRKSDISTAQSRGQDNAHDDENTFNLRNYGLSDLQAKFVNEYLVDLNRTAAYKRAGGKCEGNSAYVSASRMFRNVKVNRAITDALAERERRTEITQDAVLKMWWDIATADVNELTEYRRLCCRHCWGFGFNYQWRDAVEYDDAVKKAMAASKAPPQDVGGYGYDDTLDPNPDCPRCNGAGIGRAHFHDTRDLTGAARRLFAGVKEGKFGVEVITRNQDDALKMVAQHLGMVKTRTELTGKDGEPIKTEVANMTSQEAADAYKKLMG >NC_017731|3924509:3945528|3941209_3941542_-|WP_014658133.1|DBSCAN-SWA MERRRYIVFNVKGFSSIYNDFAGEDIPFRLMLERASGGTEVVNLNLHSKLDMMFYQTLLSYCYGSPSFSNPNNLLGPKYLRAGISLDDSGLIGFDMSNNIIPDNDVYDDN >NC_017731|3924509:3945528|3933543_3934962_+|WP_014658123.1|DBSCAN-SWA 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MTQKENTKCALCGNNAEKIQNSHFFPKFVYRELAPMLLEGHEKIITYRNNAKPLFKEIKSYLLCHICEELFTKNGENYVAKKWRKNKQTNISDLLLAYLKRCSMTSNLSIFHDITDLDDNYLFYFASSMFWRATFNWTCYDRLSLSDSLVDELKNYLLLGTQPQNYKIVSVPIYMVDAYSLIFPKKYGRKDFISGEFYYFTMLNHCFILIESHFMSKFLKNMNSNISGRLLYHIDSKILQEGILYEFIDNYKKSNRPQGLKYTTNLKWINKYIYRPSICINGSFKLNLSDELQNKLRNIHALGSEKDYYFFAFIEKYGHLSPYAHSYLTFKQKNIAFSMK |
32 | Pectobacterium_phage(42.86%) | holin,integrase,lysis,terminase | attL 3912877:3912894|attR 3943845:3943862 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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