Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_016928 | Staphylococcus aureus subsp. aureus M013, complete genome | 11 crisprs | cas3,DEDDh,DinG,csa3,WYL | 8 | 2 | 10 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_016928_1 | 769643-769728 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_016928_1
|
1 spacers
spacers of NC_016928_1
>1.1|769671|30|NC_016928|CRISPRCasFinder CAGAGAAATTGGAACGCCAATTTCTACAGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_016928_1
The CRISPR arrays of NC_016928_1 >merge|NC_016928|1|769643-769728|CRISPRCasFinder CAATGCGAGTTGGGGTGGGGCCCCAACACAGAGAAATTGGAACGCCAATTTCTACAGGCAATGCGAGTTGGGGTGGGCCCCAACAT >NC_016928|1|1|769643-769728|CRISPRCasFinder CAATGCGAGTTGGGGTGGGGCCCCAACA CAGAGAAATTGGAACGCCAATTTCTACAGG CAATGCGAGTTGGGGTGGGCCCCAACAT
>NC_016928.1|WP_000197262.1|769011_769554_+|5'-3'-deoxyribonucleotidase MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >NC_016928.1|WP_000663039.1|767794_768853_+|histidinol-phosphate-transaminase MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISSHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEHFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NC_016928.1|WP_000180997.1|766040_767555_+|ABC-transporter-permease MTNFFDILSERKGQLFSTMIEHIQISFIALLIATAIAVPLGILLTKTKTISEIVMNIAAILQTIPSLALLGLMIPLFGIGRVPAIIALVVYALLPILRNTYTGIKEVDPSLIEAAKGIGMKPFRRLTKVELPIAMPVIMAGVRTAMVLIIGTATLAALIGAGGLGDLILLGIDRNNASLILLGAIPAALLAIIFDLILRLMAKLSYKKLLMTLGVIVMIIILAIAIPMFAQKGDKITLAGKLGSEPSIITNMYKILIEEETKNTVEVKDGMGKTAFLFNALKSDDIDGYLEFTGTVLGELTKEPLKSKEEKKVYEQAKQSLEKKYQMTMLKPMKYNNTYALAVKRDFAKQHNIRTIGDLNKVKDQLKPGFTLEFNDRPDGYKAVQKAYNLNLDNIRTMEPKLRYQAINKGNINLIDAYSTDAELKQYDMVVLKDDKHVFPPYQGAPLFKESFLKKHPEIKKPLNKLENKISDEDMQMMNYKVTVKNEDPYTVAKDYLKAKGLIK >NC_016928.1|WP_000589262.1|765070_766048_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIKFKNVTKRYGKHVAVDNISFNINEGEFFVLIGPSGCGKTTTLKMINRLIHLSEGYIYFKDKPISDYPVYEMRWDIGYVLQQIALFPHMTIKENIAQVPQMKKWKEKDIDKRVDELLEMVGLEPEKYKNRKPDELSGGQRQRVGVIRALAADPPVILMDEPFSALDPISREKLQDDLIELQTKIKKTIIFVTHDIQEAMKLGDKICLLNEGHIEQIDTPEGFKNNPQSEFVKQFMGSHLEDDAPCVEENAIIRDLDIMKPIDEVTTMSAYPIVYDNQQIEVLYQHLSESERVIVMQEDSVGQYVIDRKDIFKYLSQKKEVAQHD >NC_016928.1|WP_000983680.1|763067_764849_+|DNA-helicase-RecQ MMQQTLSHYFGYETFRPGQEEIISKVLDHRNVLGVLPTGGGKSICYQVPGLLLGGTTIVISPLISLMKDQVDQLKAMGIQAAFLNSSLTQKEQQRIEKALSNGEIQFLYVAPERFENRYFLNMLQRIKIHLVAFDEAHCISKWGHDFRPSYQNVISKVFTLPQDFTIIALTATATVEVQQDIREKLNIAQTDQIKTSTKRRNLIFKVNPTYQRQKFVLDYIKTHDEDAGIIYCSTRKQVEELQEALESQKIESVIYHAGLSNKEREEAQNDFLFDRVKVVVATNAFGMGIDKSNVRFVIHYNMPGDLESYYQEAGRAGRDGLKSECILLFSERDINLHEYFITVSQADDDYKDKMGEKLTKMIQYTKTKKCLEATIVHYFEPNEKLEECEQCSNCVQQDKSYNMTQEAKMIISCIARMKQQESYSVIIQVLRGESTDYIKYKGYDQISTHGLMKGYTTSELSHLIDELRFKGFLNENDEILMCDTSIKKLLSNEVEVFTTPFKQKATEKVFINTVEGVDRVLFSQLVEVRKKLSDKLTIAPVSIFSDYTLEEFAKRKPASKQDMINIDGVGSYKLKHYCPAFLETIQNYKAKV >NC_016928.1|WP_000525113.1|761172_763056_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MGMEAYKIEHLNKSYADKTIFDNLDLSISEGEKIGLVGINGTGKSTLLKVIGGIDDDFTANVMHPNQYRIRYSSQKQDLNEDMTVFDAVLSSDTTTLRIIKQYEQAVQAYADDQSDKLFKRMMDAQEAMDQHDAWDYNAEIKTILSKLGIHDTTKYIKELSGGQQKRVVLAKTLIEQPDLLLLDEPTNHLDFESISWLINYVKQYPHTVLFVTHDRYFLNEVSTRIIELNRGKLASYPGNYESYIEMRAEREVTLQKQQQKQRALYKEELAWMRAGAKARTTKQQARINRFNDLENEVNQQYKDDKGELNLAYSRLGKQVFELEDLSKAINDKVLFEHLTEIIQKGERIGVVGPNGAGKTTLLNVLSGEDQQFEGKLKTGQTVKVAYFKQTDETLDRDIRMIDYLREESEIAKEKDGTSVSITQLLERFLFPSATHGKKVYKLSGGEQKRLYLLRLLVHQPNVLLLDEPTNDLDTETLTILEDYIHTFGGTVITVSHDRYFLNKVAQSYWFIHDGQMEKIIGTFEDYESYKKSLDKNKSTLKQQSKSSTTVRKKNGLSYKEKLEYEQLMKRIEQAEVRMEEIDVLMIEASADYGKIKELNEEKEQLEIQYDLDITRWSELEEIKEQQ >NC_016928.1|WP_000098285.1|758961_760902_+|lipoteichoic-acid-synthase MSSQKKKISLFAFFLLTVITITLKTYFSYYVDFSLGVKGLVQNLILLMNPYSLVALVLSVFLFFKGKKAFWFMFIGGFLLTFLLYANVVYFRFFSDFLTFSTLNQVGNVESMGGAVSASFKWYDFVYFIDTLVYLFILIFKTKWLDTKAFSKKFVPVVMAASVALFFLNLAFAETDRPELLTRTFDHKYLVKYLGPYNFTVYDGVKTIENNQQKALASEDDLTKVLNYTKQRQTEPNPEYYGVAKKKNIIKIHLESFQTFLINKKVNGKEVTPFLNKLSSGKEQFTYFPNFFHQTGQGKTSDSEFTMDNSLYGLPQGSAFSLKGDNTYQSLPAILDQKQGYKSDVMHGDYKTFWNRDQVYKHFGIDKFYDATYYDMSDKNVVNLGLKDKIFFKDSANYQAKMKSPFYSHLITLTNHYPFTLDEKDATIEKSNTGDATVDGYIQTARYLDEALEEYINDLKKKGLYDNSVIMIYGDHYGISENHNNAMEKLLGEKITPAKFTDLNRTGFWIKIPGKSGGINNEYAGQVDVMPTILHLAGIDTKNYLMFGTDLFSKGHNQVVPFRNGDFITKDYKYVNGKIYSNKNNELITTQPADFEKNKKQVEKDLEMSDNVLNGDLFRFYKNPDFKKVNPSKYKYETGPKANSKK >NC_016928.1|WP_000022323.1|757483_758488_+|allophanate-hydrolase MSIIIEKSGLFSSFQDFGRRGYEHDGVIPCGALDTLAHEIANRLVANDKNEATLEMTNKMATIRFTEPTLIALAGGNVKAYTEHMTISPYKLYLLDKGDVLKFRETSYTSRVYLAVGGGFELDAWLGSNSTDFNVKIGGFKGRTLQDGDEIKLKRDYTARHHKLFENLAHTKQTDWGIDGYALSFNYMSDVFHVVKNKGTEDFKEDAIQRFVKHDYKVTSKANRMGMMLEGEKIKAFYEDMPPYQTVKKGTIQIKRDGTPIILLNDHYTLGSYPQIGTIASYHLTKLAQKPQGSRLKFQFIDILTAEKNLVKYSNWLNQLFHGIEYRMQLEMMK >NC_016928.1|WP_000708692.1|756789_757500_+|allophanate-hydrolase MKIYSQGDQAIVVAIEKEVSKSLTEDLLTLRSYLIEQNYPFIIEIVPSESDMMIVYDARDMIKHHNIQSPFLYMKALIESIHLNIKHDFNQQDLIEIPIVYGSKYGPDLESLLKHYKIKLETFIELHSKAQYFVSMMGYSPGFPYLTGLNKKLYINHTSKQKKFIPAGSVVLEGKKCGIVTTDTINDWLVIGYTPLSLFNPKESDFARLKLGDNIKFRPINENELEVGAFKDVNHN >NC_016928.1|WP_014363392.1|756486_756693_+|hypothetical-protein MIIVYIALLLILVYVNYRLVNRLLSENRIYVVRLIATITTVISFILVYALIHELMPFVVRAMDLMYHQ >NC_016928.1|WP_000429011.1|770161_771079_-|lipid-kinase MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILSANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NC_016928.1|WP_031760357.1|771171_771273_+|hypothetical-protein MVITDIDVYRVGRENIVIAVYNEHIKLLFILIS >NC_016928.1|WP_000193751.1|771350_772856_-|peptide-MFS-transporter MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NC_016928.1|WP_071665613.1|772917_773166_-|hypothetical-protein MIFLTYWCVFHLAYIIGYIKITFYTKVHQKNISTRIKQHFYRNLLHFNVNKYIFILSLINCARLIAEYSQYFYFFVICGIFS >NC_016928.1|WP_000930014.1|773195_773696_-|NADPH-dependent-7-cyano-7-deazaguanine-reductase-QueF MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NC_016928.1|WP_001068497.1|773715_774582_-|EamA/RhaT-family-transporter MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NC_016928.1|WP_001790091.1|774966_775233_+|hypothetical-protein MCLMYNETHNIVLVKRKRHNILCFVCKCFIYEEITFKSNLTQKFNSYYQLIVIFLENVLSKWKISNDVNTTYSDFYTFNPYKLLFSQI >NC_016928.1|WP_000692521.1|775382_775781_+|protein-NrdI MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NC_016928.1|WP_000855509.1|775743_777849_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-alpha MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYSVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NC_016928.1|WP_000562498.1|777966_778938_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-beta MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_016928_2 | 946685-946842 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_016928_2
|
2 spacers
spacers of NC_016928_2
>2.1|946725|27|NC_016928|PILER-CR ATTGGAAATCCAATTGGGGCTCCGCGT >2.2|946792|19|NC_016928|PILER-CR CTGTGTTGGGGCCCACTCC >2.3|946785|29|NC_016928|CRISPRCasFinder ACTCCCCAACTCGCATTGCTTGTAGAATC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_016928_2
The CRISPR arrays of NC_016928_2 >merge|NC_016928|2|946685-946842|PILER-CR,CRISPRCasFinder AACTTGTATTGCTTGTAGAAATTGGAAATCCAATTGGGGCTCCGCGTCCAACTTGCATTGCTTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCACTCCCCAACTCGCATTGCTTGTAGAATCTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCC >NC_016928|2|1|946685-946829|PILER-CR AACTTGTATTGCTTGTAGAAATTGGAAATCCAATTGGGGC TCCGCGTCCAACTTGCATTGCTTGTAG AATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCACTCCCC AACTCGCATTGCTTGTAGA ATCTCTTTTCGAAATTCTC >NC_016928|2|2|946756-946842|CRISPRCasFinder TCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCC ACTCCCCAACTCGCATTGCTTGTAGAATC TCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCC
>NC_016928.1|WP_000390575.1|946371_946680_+|metal-sulfur-cluster-assembly-factor MEEALKDSILGALEMVIDPELGIDIVNLGLVYKVNVDDEGVCTVDMTLTSMGCPMGPQIIDQVKTVLAEIPEIQDTEVNIVWSPPWTKDMMSRYAKIALGVS >NC_016928.1|WP_001182436.1|945433_946258_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MQPHLICLDLDGTLLNDNKEISSYTKQVLNELQQRGHQIMIATGRPYRASQMYYHELNLTTPIVNFNGAYVHHPKDKNFKTCHEILDLGIAQNIIQGLQQYQVSNIIAEVKDYVFINNHDPRLFEGFSMGNPRIQTGNLLVHLKESPTSILIEAEESKIPEIKNMLTHFYADHIEHRRWGAPFPVIEIVKLGINKARGIEQVRQFLNIDRNNIIAFGDEDNDIEMIEYARHGVAMENGLQELKDVANNITFNNNEDGIGRYLNDFFNLNIRYYC >NC_016928.1|WP_001124491.1|944065_945382_-|CoA-disulfide-reductase MPKIVVVGAVAGGATCASQIRRLDKESDIIIFEKDRDMSFANCALPYVIGEVVEDRKYALAYTPEKFYDRKQITVKTYHEVIAINDERQTVSVLNRKTNEQFEESYDKLILSPGASAHSLGFESDITFTLRNLEDTDAIDQFIKANQVDKVLVVGAGYVSLEVLENLYERGLHPTLIHRSDKINKLMDADMNQPILDELDKREIPYRLNEEIVAINGNEITFKSGRVEHYDMIIEGVGTHPNSKFIESSNIKLDRKGFIPVNDKFETNVPNIYAIGDIATSHYRHVDLPASVPLAWGAHRAASIVAEQIAGNDTIEFKGFLGNNIVKFFDYTFASVGVKPNELKQFDYKMVEVTQGAHANYYPGNSPLHLRVYYDTSNRQILRAAAVGKEGADKRIDVLSMAMMNQLTVDELTEFEVAYAPPYSHPKDLINMIGYKAK >NC_016928.1|WP_000902813.1|943504_943894_+|hypothetical-protein MLHLHILSWVLAIILFIATYLNISKNQGGTPYFKPLHMVLRLFMLLTLISGFWILIQSFMNGGANHMLLTLKMLCGVAVVGLMEVSIAKRKRHEQSHTMFWITIALIIITMVLGVILPLGPISKLFGIG >NC_016928.1|WP_000670755.1|942275_943178_+|FAA-hydrolase-family-protein MKFLSFKYNDKTSYGVKVKREDAVWDLTQVFADFAEGDFHPKTLLAGLQQNHTLDFQEQVRKAVVAAEDSGKAEDYKISFNDIEFLPPVTPPNNVIAFGRNYKDHANELNHEVERLYVFTKAASSLTGDNATIPNHKDITDQLDYEGELGIVIGKSGEKIPKALALDYVYGYTIINDITDRKAQSEQDQAFLSKSLTGGCPMGPYIVTKDELPLPENVNIVTKVNNEIRQDGNTGEMILKIDELIEEISKYVALHPGDIIATGTPAGVGAGMQPPKFLQPGDEVKVTIDNIGTLTTYIAK >NC_016928.1|WP_000154915.1|938456_942110_+|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddA MTIPEKPQGVIWTDAQWQSIYATGQDVLVAAAAGSGKTAVLVERIIQKILRDGIDVDRLLVVTFTNLSAREMKHRVDQRIQEASIADPANAHLKNQRIKIHQAQISTLHSFCLKLIQQHYDVLNIDPNFRTSSEAENILLLEQTIDEVIEQHYDILDPAFIELTEQLSSDRSDDQFRMIIKQLYFFSVANPNPTDWLDQLVTPYEEEAQQAELIQLLTDLSKVFITAAYDALNKAYDLFSMMDGVDKHLAVIEDERRLMRRVLEGGFIDIPYLTGHEFGARLPNITAKIKEANEMMVDALEDAKLQYKKYKSLIDKVKSDYFSREADDLKADMQQLAPRVKYLARIVKDVMSEFNRKKRSKNILDFSDYEHFALQILTNEDGSPSEIAESYRQHFQEILVDEYQDTNRVQEKILSCIKTGDEHNGNLFMVGDVKQSIYKFRQADPSLFIEKYQRFTIDGDGTGRRIDLSQNFRSRKEVLSTTNYIFKHMMDEQVGEVKYDEAAQLYYGAPYDESDHPVNLKVLVEADQEHSDLTGSEQEAHFIVEQVKDILEHQKVYDMKTGSYRSATYKDIVILERSFGQARNLQQAFKNEDIPFHVNSREGYFEQTEVRLVLSFLRAIDNPLQDIYLVGLMRSVIYQFKEDELAQIRILSPNDDYFYQSIVNYINDEAADAILVDKLKMFLSDIHSYQQYSKDHPVYQLIDKFYNDHYVIQYFSGLIGGRGRRANLYGLFNKAIEFENSSFRGLYQFIRFIDELIERGKDFGEENVVGPNDNVVRMMTIHSSKGLEFPFVIYSGLSKDFNKRDLKQPVILNQQFGLGMDYFDVDKEMAFPSLASVAYRAVAEKELVSEEMRLVYVALTRAKEQLYLIGRVKNDKSLLELEQLSISGEHIAVNERLTSPNPFHLIYSILSKHQSASIPDDLKFEKDIAQVEDSSRPNVNISIVYFEDVSTETILDNDEYRSVNQLETMQNGNEDVKAQIKHQLDYQYPYVNDTKKPSKQSVSELKRQYETEESGTSYERVRQYRIGFSTYERPKFLSEQGKRKANEIGTLMHTVMQHLPFKKERISKVELHQYIDGLIDKHIIEADAKKDIRMDEIMTFINSELYSIIAEAEQVYRELPFVVNQALVDQLPQGDEDVSIIQGMIDLIFVKDGVHYFVDYKTDAFNRRRGMTDEEIGTQLKNKYKIQMKYYQNTLQTILNKEVKGYLYFFKFGTLQL >NC_016928.1|WP_000172334.1|934979_938456_+|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddB MTLHAYLGRAGTGKSMKMLTEIKQKMKADPLGDPIILIAPTQSTFQLEQAFVNDSELNGSLRTEVLHFERLSHRIFQEVGSYSEQKLSKAATEMMIYNIVQEQQKYLKLYQSQAKYYGFSEKLTEQIQDFKKYAVTPEHLESFIADKNMQTRTKNKLEDIALIYREFEQRIQNEFITGEDALQYFIDCMPKSEWLKRADIYIDGFHNFSTIEYLIIKGLIKYAKSVTIILTTDGNHDQFSLFRKPSEVLRHIEEIANELNISIERQYFKQLYRFNNQDLKHLEQEFDALQINRVACQGHINILESATMREEINEIARRIIVDIRDKQLRYKDIAILYRDESYAYLFDSILPLYNIPYNIDTKRSMTHHPVMEMIRSLIEVIQSNWQVNPMLRLLKTDVLTASYLKSAYLVDLLENFVLERGIYGKRWLDDELFNVEHFSKMGRKAHKLTEDERNTFEQVVKLKKDVIDKILHFEKQMSQAATVKDFATAFYESMEYFELPNQLMTERDELDLNGNHEKAEEIDQIWNGLIQILDDLVLVFGDEPMSMERFLEVFDIGLEQLEFVMIPQTLDQVSIGTMDLAKVDNKQHVYLVGMNDGTMPQPVTASSLITDEEKKYFEQQANVELSPTSDILQMDEAFVCYVAMTRAKGNVTFSYSLMGSSGDDKEISPFLNQIQSLFNQLEITNIPQYHEVNPLSLMQHAKQTKITLFEALRAWLDDEIVADSWLDAYQVIRDSDHLNQGLDYLMSALTFDNETVKLGETLSKDLYGKEINASVSRFEGYQQCPFKHYASHGLKLNERTKYELQNFDLGDIFHSVLKYISERINGDFKQLDLKKIRQLTNEALEEILPKVQFNLLNSSAYYRYLSRRIGAIVETTLSALKYQGTYSKFMPKHFETSFRRKPRTNDELIAQTLTTTQGIPINIRGQIDRIDTYTKNDTSFVNIIDYKSSEGSATLDLTKVYYGMQMQMMTYMDIVLQNKQRLGLTDIVKPGGLLYFHVHEPRIKFKSWADIDEDKLEQDLIKKFKLSGLVNADQTVIDALDIRLEPKFTSDIVPVGLNKDGSLSKRGSQVADEATIYKFIQHNKENFIETASNIMDGHTEVAPLKYKQKLPCAFCSYQSVCHVDGMIDSKRYRTVDETINPIEAIQNINIDDEFGGEQ >NC_016928.1|WP_000711897.1|934244_934820_+|signal-peptidase-IB MKKELLEWIISIAVAFVILFIVGKFIVTPYTIKGESMDPTLKDGERVAVNIIGYKTGGLEKGNVVVFHANKNDDYVKRVIGVPGDKVEYKNDTLYVNGKKQDEPYLNYNLKHKQGDYITGTFQVKDLPNANPKSNVIPKGKYLVLGDNREVSKDSRAFGLIDEDQIVGKVSFRFWPFSEFKYNFNPENTKN >NC_016928.1|WP_000758211.1|933704_934229_+|S26-family-signal-peptidase MKKVVKYLISLILAIIIVLFVQTFVIVGHVIPNNDMSPTLNKGDRVIVNKIKVTFNQLNNGDIITYRRGNEIYTSRIIAKPGQSMAFRQGQLYRDDRPVDASYAKNRKIKDFSLRNFKELDGDIIPPNNFVVLNDHDNNQHDSRQFGLVDKKDIIGNISLRYYPFSKWTIQFKS >NC_016928.1|WP_000007965.1|933124_933700_+|TVP38/TMEM64-family-protein MSFHQVEEWFEIFRQFGYLPGFILLYIRAIIPVFPLALYILINIQAYGPILGILISWLGLISGTFTVYLICKRLVNTERMQRIKQRTAVQRLISFIDRQGLIPLFILLCFPFTPNTLINFVASLSHIRPKYYFIVLASSKLVSTIILGYLGKEITTILTHPLRGILMLVVLIVFWIVGKKLEQHFMGSKKE >NC_016928.1|WP_001044212.1|947333_949148_+|acetyltransferase MNKTKGFTKYKKMIYMPGLDGLRAIAVLGIIIYHLNKQWLTGGFLGVDTFFVISGYLITSLLLKEYDDTGIIKLKSFWIRRLKRLLPAVIVLLMVVGTATLLLKSENIIRVKHDIIAAIFYVSNWWYIAKDVNYFEQFSFMPLKHLWSLAIEEQYYIFFPVILVTLLLTIKKRYKIGFIFWGVSIISLGLMMFIYSINGDHSRVYFGTDTRLQTLLLGVILAFLWPPFKLKNDPPKVVKYIIDSIGSLSFIVLILLFFIINDETNWIYDGGFYLISILTLFIIASVVHPSTWIAKIFSNPVLVFIGKRSYSLYLWHFAVISFVHSYYVDGQIPVYVYFIDISLTIIFAELSYRFIETPFRKEGIKALNWRPSYIPQFIRMAIVVTLLIPFMLILVGAFNKYGKDIIGEKANSFDTTIEDNYLMRIAPIDNIHIDGLVSEKKKESSDVYNNIKPLLIGDSVMVDIGESFKSSVPKSRIDGKVGRQLYQTLPLVKANYSQYKKSSDQVVLELGTNGDFTVKQLDDLLNQFGKAKIYLVNTRVPRIYEANVNRLLADAAKRKSNVTLIDWYKRSQGHSEYFAPDGVHLEYKGVLALKDEILKALKKK >NC_016928.1|WP_000353962.1|949350_951960_+|ATP-dependent-chaperone-ClpB MDINKMTYAVQSALQQAVELSQQHKLQNIEIEAILSAALNESESLYKSILERANIEVDQLNKAYEDKLNTYASVEGDNIQYGQYISQQANQLITKAESYMKEYEDEYISMEHILRSAMDIDQTTKHYINNKVEVIKEIIKKVRGGNHVTSQNPEVNYEALAKYGRDLVEEVRQGKMDPVIGRDEEIRNTIRILSRKTKNNPVLIGEPGVGKTAIVEGLAQRIVKKDVPESLLDKTVFELDLSALVAGAKYRGEFEERLKAVLKEVKESDGRIILFIDEIHMLVGAGKTDGAMDAGNMLKPMLARGELHCIGATTLNEYREYIEKDSALERRFQKVAVSEPDVEDTISILRGLKERYEVYHGVRIQDRALVAAAELSDRYITDRFLPDKAIDLVDQACATIRTEMGSNPTELDQVNRRVMQLEIEESALKNESDNASKQRLQELQEELANEKEKQAALQSRVESEKEKIANLQGKRAQLDESRQALEDAQTNNNLEKAAELQYGTIPQLEKELRELEDNFQDEQGEDTDRMIREVVTDEEIGDIVSQWTGIPVSKLVETEREKLLHLSDILHKRVVGQDKAVDLVSDAVVRARAGIKDPNRPIGSFLFLGPTGVGKTELAKSLAASLFDSEKHMIRIDMSEYMEKHAVSRLIGAPPGYIGHDEGGQLTEAVRRNPYSVILLDEVEKAHTDVFNVLLQILDEGRLTDSKGRSVDFKNTIIIMTSNIGSQVLLENVKETGEITEPTEKAVMTSLNAYFKPEILNRMDDIVLFKPLSIDDMSMIVDKILTQLNIRLLEQRISIEVSDDAKAWLGQEAYEPQYGARPLKRFVQRQIETPLARMMIKEGFPEGTTIKVNLNSDNNLTFNVEKIHE >NC_016928.1|WP_001047064.1|952018_952888_-|LysR-family-transcriptional-regulator MNLDWYYTFVILAKTLNYRLASEEINLTIPSIHKQIKNLEQHLNVKLFETYKNQIILTEDGHTFLPIAQSFIEQYESGIKHIQLKKTMFQSKLNVVVSSYIATFIMPKFLKSFFNEHPFIDVSLHVKNENIEKDINNHTYDIGISRNQPKLREVHSEKVCEGKIVLIAPNKENNHLLTEASLFEKYKIISDNHPEYWSSLKNNILNIYEKAQFLSINDVHTSIKLIEMNQGISFLPLYITTNSDYNISVINTKILQAPISFTYIYSKKEIPEILVFIKSFKKYIANEQL >NC_016928.1|WP_001806371.1|952997_953240_+|hypothetical-protein MIRIQDNTIRDGMQQSNVRKSLFIKKEVLKQINKLNINSVEVGMCTTIEDEFNIHQFRDILSPEKELVVLTRLNEKEIKK >NC_016928.1|WP_000404422.1|954124_954766_+|Sua5/YciO/YrdC/YwlC-family-protein MEILNDSVKSFEKLYLQLQDGFPVIVPTDTNYNLCSLPNNDLCIDKIFEYKKRSKDKPLSLFIDKPEDWKLYGDNQNTEIVDKLVEIFWPGPLNIILKNKTSYNYMLNNSDSIAIGCVQNKTMRRFISYINSPIAITSANISGTADDILITENEAIKHMGENVRYMLRSQNKTNYKTSSTIIKVTDNKIELLREGDIKFEEIKERLGTGIIYE >NC_016928.1|WP_000695347.1|955860_956376_+|YbhB/YbcL-family-Raf-kinase-inhibitor-like-protein MKIKTEFKGNNIPYEYAAGADVSDSINGNPIKSFPFEVTELPEGTKYLAWSLIDYDAIPVCGFAWIHWSVANVSVSGNSISIKADLSRTKGDYVQGKNSFTSGLLAEDFSEIENHYVGPTPPDKDHQYELTVYALGHSLNLKNGFYLNEFLKEVNQHKIDQTSINLIGRKI >NC_016928.1|WP_000769690.1|956686_957121_+|MAP-domain-containing-protein MKLKSFITVTLALGMIATTGATVASNEVSAAEKDKLPATQKAKEMQNVPYTIAVDGIMAFNQSYLNLPKDSQLSYLDLGNKVKALLYDERGVTPEKIRNAKSAVYTITWKDGSKKEVDLKKDSYTANLFDSNSIKQIDINVKTK >NC_016928.1|WP_000682089.1|957377_957563_-|DUF2929-domain-containing-protein MKHLVTFFWALLLMQMVNFVLNSLVGGDSLNVVNPIIMAVLFTIFTAIFAAVIKPPKDSSQ >NC_016928.1|WP_001100526.1|957857_958799_+|3-oxoacyl-ACP-synthase-III MNVGIKGFGAYAPEKIIDNAYFEQFLDTSDEWISKMTGIKERHWADDDQDTSDLAYEASVKAIADAGIQPEDIDMIIVATATGDMPFPTVANMLQERLGTGKVASMDQLAACSGFMYSMITAKQYVQSGDYHNILVVGADKLSKITDLTDRSTAVLFGDGAGAVIIGEVSEGRGIISYEMGSDGTGGKHLYLDKDTGKLKMNGREVFKFAVRIMGDASTRVVEKANLTSDDIDLFIPHQANIRIMESARERLGISKDKMSVSVNKYGNTSAASIPLSIDQELKNGKLKDDDTIVLVGFGGGLTWGAMTIKWGK >NC_016928.1|WP_000081240.1|958810_960055_+|beta-ketoacyl-[acyl-carrier-protein]-synthase-II MSQNKRVVITGMGALSPIGNDVKTTWENALKGVNGIDKITRIDTEPYSVHLAGELKNFNIEDHIDKKEARRMDRFTQYAIVAAREAVKDAQLDINENTADRIGVWIGSGIGGMETFEIAHKQLMDKGPRRVSPFFVPMLIPDMATGQVSIDLGAKGPNGATVTACATGTNSIGEAFKIVQRGDADAMITGGTEAPITHMAIAGFSASRALSTNDDIETACRPFQEGRDGFVMGEGAGILVIESLESAQARGANIYAEIVGYGTTGDAYHITAPAPEGEGGSRAMQAAMDDAGIEPKDVQYLNAHGTSTPVGDLNEVKAIKNTFGEAAKHLKVSSTKSMTGHLLGATGGIEAIFSALSIKDSKVAPTIHAVTPDPECDLDIVPNEAQDLDITYAMSNSLGFGGHNAVLVFKKFEA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_016928_3 | 1065200-1065292 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_016928_3
|
1 spacers
spacers of NC_016928_3
>3.1|1065230|33|NC_016928|CRISPRCasFinder TAAAAGAGGGATACTTGCGTCGAGCGCAAGCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_016928_3
The CRISPR arrays of NC_016928_3 >merge|NC_016928|3|1065200-1065292|CRISPRCasFinder AAAAGCCCCTAACAACTAAAGGTTGTAAGGTAAAAGAGGGATACTTGCGTCGAGCGCAAGCATAAAAGCCCCTAACAACTAAAAGTTGTAAGG >NC_016928|3|3|1065200-1065292|CRISPRCasFinder AAAAGCCCCTAACAACTAAAGGTTGTAAGG TAAAAGAGGGATACTTGCGTCGAGCGCAAGCAT AAAAGCCCCTAACAACTAAAAGTTGTAAGG
>NC_016928.1|WP_000033477.1|1064142_1064718_-|thiamine-ABC-transporter-permease MSKGLKLSEILVTVLISVVFAVIYNLWWFVYNGVQATGLHLEQLTNGVWFMAAIVCYLIIPKPGIALLAEFAAGAGETIIMGRFDIPTIVYAFIQGLACELVFAIFKYQSRSVMVAMLAGFCTAIAAFPIDYFYGYLNEVAGWNLTLFIVFRLISGAVVAGVLSYLLVKALDKTGVTKLFRPAAKEDYDNL >NC_016928.1|WP_000273256.1|1061929_1062736_-|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT MYEQWKVRQSFVDDVNIITKLFLGIILFFFIIFVHNFDFMLYITILMLVFLLMFNGTQFKITAIFITISIGFALLSSLFMILYGNGSHTILKFGFIHITTESLVRGLHVSLRTIAISFFGILIALTSQVVMIFYSLMQHLKVKSKVAYAFMAAIRMIPLMISSLIQLRRSLKMRYQMIDAANYRGLKRFKHLIIPLLSQNIRKAHQLSVAMESKGFRDGPRTYYYNVPFSYKDVIFIIVLIAIITLAYYCSITLPITGIDDVRLGRVG >NC_016928.1|WP_071665620.1|1061627_1061825_-|hypothetical-protein MFIQTCCGASFLLHIHNHKFGTEINVLDSTTKKAMKKSIVIDSFIANLSIFKYTYLSCSALFAMS >NC_016928.1|WP_001101926.1|1060416_1061664_+|phosphoribosylamine--glycine-ligase MNVLVIGAGGREHALAYKLNQSSLVKQVFVIPGNEAMTPIAEVHTEISESDHQGILDFAKQQNVDWVVIGPEQPLIDGLADILRANGFKVFGPNKQAAQIEGSKLFAKKIMEKYNIPTADYKEVERKKDALTYIENCELPVVVKKDGLAAGKGVIIADTIEAARSAIEIMYGDEEEGTVVFETFLEGEEFSLMTFVNGDLAVPFDCIAQDHKRAFDHDEGPNTGGMGAYCPVPHISDDVLKLTNETIAQPIAKAMLNEGYQFFGVLYIGAILTKDGPKVIEFNARFGDPEAQVLLSRMESDLMQHIIDLDEGNRTEFKWKNESIVGVMLASKGYPDAYEKGHKVSGFDLNENYFVSGLKKQGDTFVTSGGRVILAIGKGDNVHDAQRDAYEKVSQIQSDHLFYRHDIANKALQLK >NC_016928.1|WP_000709285.1|1058916_1060395_+|bifunctional-phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide-formyltransferase/IMP-cyclohydrolase-PurH MKKAILSVSNKTGIVEFAKALTQLNYELYSTGGTKRILDEANVPVRSVSDLTHFPEIMDGRVKTLHPAVHGGILADRNKPQHLNELSEQHIDLIDMVVVNLYPFQQTVANPDVTMDEAIENIDIGGPTMLRAAAKNYKHVTTIVHPADYQEVLTRLRNDSLDESYRQSLMIKVFEHTAEYDEAIVRFFKGDKETLRYGENPQQSAYFVRTSNAKHTIAGAKQLHGKQLSYNNIKDADATLALVKKFDTPAAVAVKHMNPCGVGIGDTIEQAFQHAYEADSQSIFGGIVALNRAVTPELAEQLHSIFLEVIIAPKFTGEALDILKQKKNVRLLEIDMIIDSNEEEFVSVSGGYLVQDKDNYVVPKEEMKVVTEVAPTDEQWEAMLLGWKVVPSVKSNAIILSNNKQTVGIGAGQMNRVGAAKIALERAIEINDHVALVSDGFFPMGDTVELAAQHGIKAIIQPGGSIKDQDSIDMANKHGIAMVVTGTRHFKH >NC_016928.1|WP_000238670.1|1058335_1058902_+|phosphoribosylglycinamide-formyltransferase MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNKDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NC_016928.1|WP_000030810.1|1057304_1058333_+|phosphoribosylformylglycinamidine-cyclo-ligase MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDLFLEPTKLYVKPVLTLKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGDIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NC_016928.1|WP_000483727.1|1055827_1057312_+|amidophosphoribosyltransferase MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSNQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NC_016928.1|WP_000032747.1|1053659_1055849_+|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase-subunit-PurL MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKNYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGVLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NC_016928.1|WP_000666799.1|1052995_1053667_+|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase-subunit-PurQ MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NC_016928.1|WP_000064214.1|1065301_1065436_-|hypothetical-protein MSNENQNKKAAEKAKEVEEKLKDKKEEKTEDINQTKQDIQDTLN >NC_016928.1|WP_000009075.1|1065587_1066883_+|hypothetical-protein MSFLRKHAEIIFSYLIGIVSLFTGLIILINLPLIKQLNGGKKVDTHVHNVWEFLNAFFSEIIKVMSRFIGNFPIVSAIVIIIFGILVMLIGHTLLRTIKYDYDISIFFLVIGIMYFIITLILMTQVYGFFAVIFIIPFTIHIGYIVYKDELNQENVKNHYMWIIVSYGISYLITQIALYGRIDANEIESIDILSVNAFFIIMWLLGQMAIWNFLFLRRALPLTKQELGEEEPELSRTSKGNVTNQTKIHLKQLQDKTTEYARKTRRSVDLDKIRAKRDKFKKKVNDIIDIQEDDIPDWMRKPKWVKPMYVELFCGVVIFLFTFLEFNNRNALFVSGDWKLSQTQYVIEWVTLLILLFIIIAYIATTLTFHLKGKFYYLQLFMGSILFFKLLTEFINIMIHGLLLSVFITPTLLLMLLAIIISYSLQLRERP >NC_016928.1|WP_001797763.1|1066903_1067107_-|hypothetical-protein MILQMDNFSTILFALKLCIQFSILNSHHLNQSNLVTKKVLSINFIDLYLNKLEIYLTYSVHIKMFNR >NC_016928.1|WP_000685063.1|1067307_1068480_+|class-I-SAM-dependent-rRNA-methyltransferase MKIATLNKGKETKYFNGYPLIEEEDIYSQDHLKEGDIFQIVTDKSQYVATAYVGRQHKGLGWVLTYDKAQEINTAFFVKLFNTALAERDYYFNIDGTNAFRLFNAEGDGVGGLTIDNYDGHLLIQWYSKGIYKFKYAILEAVRKVFDYKSIYEKVRFKDSEYSGGFVEGDAPEFPIVIEENFTFYNVDLEDGLMTGIFLDQKEVRKKLRDQYAKERHVLNLFSYTGAFSVIAASEASSTTSVDLANRSRSLTEENFGLNAIDPKSQYIYVMDTFDFYKYAARHGHSYDTIVIDPPSFARNKKRTFSVQKDYDKLINGALNILSSEGTLLLCTNASVYPLKQFKNTIKKTLEESGVDYELTEVMGLPKDFKTHPHYKPSKYLKAVFVNIRH >NC_016928.1|WP_000505962.1|1068533_1069076_+|hypothetical-protein MGFKNNLTSNLTNKIGNSVFKIENINEKGAMPTTIKELNERRQRAEAIVKRKSLMSSTMSVVPIPGLDFGVDLKLMKDIIEDVNKIYGLDHKQVNSLGDDVKERVMSAAAIQGSQFIGKRISSAFLKIVIRDVAKRTAAKQTKWFPVVGQAVSASISYYFMNKIGKDHIQKCENVIKNVM >NC_016928.1|WP_000437472.1|1069229_1069496_+|phosphocarrier-protein-HPr MEQNSYVIIDETGIHARPATMLVQTASKFDSDIQLEYNGKKVNLKSIMGVMSLGVGKDAEITIYADGSDESDAIQAISDVLSKEGLTK >NC_016928.1|WP_000040057.1|1069498_1071217_+|phosphoenolpyruvate--protein-phosphotransferase MSKLIKGIAASDGVAIAKAYLLVEPDLTFDKNEKVTDVEGEVAKFNSAIEASKVELTKIRNNAEVQLGADKAAIFDAHLLVLDDPELIQPIQDKIKNENANAATALTDVTTQFVTIFESMDNEYMKERAADIRDVSKRVLSHILGVELPNPSMIDESVVIVGNDLTPSDTAQLNKEFVQGFATNIGGRTSHSAIMSRSLEIPAIVGTKSITQEVKQGDMIIVDGLNGDVIVNPTEDELIAYQDKRERYFADKKELQKLRDADTVTVDGVHAELAANIGTPNDLPGVIENGAQGIGLYRTEFLYMGRDQMPTEEEQFEAYKEVLEAMNGKRVVVRTLDIGGDKELSYLNLPEEMNPFLGYRAIRLCLAQQDIFRPQLRALLRASVYGKLNIMFPMVATINEFREAKAILLEEKENLKNEGHDISDDIELGIMVEIPATAALADVFAKEVDFFSIGTNDLIQYTLAADRMSERVSYLYQPYNPSILRLVKQVIEASHKEGKWTGMCGEMAGDETAIPLLLGLGLDEFSMSATSILKARRQINGLSKNEMTELANRAVDCATQEEVIELVNNYVK >NC_016928.1|WP_001289624.1|1071453_1071687_-|glutaredoxin-family-protein MSEIIVYTQNDCPPCTFVKNYLTEHQIVFEERNINNQQYRNEMIDFDAFSTPFILLNGNPMYHVDLDEINKVLNIQD >NC_016928.1|WP_000381849.1|1071883_1073245_+|cytochrome-ubiquinol-oxidase-subunit-I MDTVEISRFLTAMTLAVHIIFATIGVGMPLMFAIAEFLGIRKNDLQYIAMAKRWAKAYTITVAVGVVTGTIIGLQLSLIWPTFMEMGGHVIALPLFMETFAFFFEAIFLSIYLYTWDRFKNKWTHFLISIPVIIGGSFSAFFITSVNSFMNTPAGFELKNGKMVNVQPIEAMFNPSFIVRSFHVITTAGMTMAFVIASIAAFKLLRNRQPKDTVYHKKALKMSMIVGFFSTLLSMLAGDLSAKFLHKFQPEKLAAYEWHFDTSSHAKLLLFGVLDEKTQQVKGAIELPGLLSFLADNSVKTKVQGLNDFPKSLHPPMIVHYFFDLMVTMGILCFVISGVYVLTLMFKKLRKFSTHKWMLYGILLTGPASMLAIEFGWFLTEMGRQPWIVRGYMRVAEAATQAGGITFVTILFGILYIILMYTCAYVLIRMFKNKPAYEDVNRLAKKQGGEIEK >NC_016928.1|WP_000638454.1|1073241_1074261_+|cytochrome-d-ubiquinol-oxidase-subunit-II MIYAFIGITVLWLFLFCYIIIASIDFGAGFFALHSKLTGDEKKINHLISRYLNPVWEVTNVFFVFFFVGFVGFFPESIKYLGTVLLIPGSIALIMISLRNSFYAFENYGQDTKLAWMIMYGVSGLLIPASLSTALTITEGGYINVRNNVIDLDWVQLLLSPFAWSVVFLAIISVLYISSGFLTYYAKKANDEPAYNLTRQWHIFLGPPMIIICLFVFLSLRIQNSEHFYSAVFDYWWMFAISFLFFTLASLLTFFKKKHGLAFVFVILQMMFAFFGYGISKLPYLLYPFVKITDAYVNPEMGWTLVIVFILGLLLLLPSLILLLRLFVFDKEYVEGKKS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_016928_4 | 1149386-1149628 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_016928_4
|
4 spacers
spacers of NC_016928_4
>4.1|1149404|37|NC_016928|PILER-CR AGAATTTCAAAAAGAAATTCTACAGACAATGCAAGTT >4.2|1149459|38|NC_016928|PILER-CR AAGCTGACGAAAAATCAGCTTACAATAATGTGCAAGTT >4.3|1149515|38|NC_016928|PILER-CR AAGCTGGCAGAAAGTCAGCTTACAATAACGTGCAAGTT >4.4|1149571|40|NC_016928|PILER-CR AAGCTGGCAGAAAGTCAGCTTACAATAACGTGCAAGTTGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_016928_4
The CRISPR arrays of NC_016928_4 >merge|NC_016928|4|1149386-1149628|PILER-CR GGCGGGGCCCCAACATAGAGAATTTCAAAAAGAAATTCTACAGACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGACGAAAAATCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCAGAAAGTCAGCTTACAATAACGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGCAGAAAGTCAGCTTACAATAACGTGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACATAG >NC_016928|4|2|1149386-1149628|PILER-CR GGCGGGGCCCCAACATAG AGAATTTCAAAAAGAAATTCTACAGACAATGCAAGTT GGCGGGGCCCCAACACAG AAGCTGACGAAAAATCAGCTTACAATAATGTGCAAGTT GGCGGGGCCCCAACATAG AAGCTGGCAGAAAGTCAGCTTACAATAACGTGCAAGTT GGCGGGGCCCCAACACAG AAGCTGGCAGAAAGTCAGCTTACAATAACGTGCAAGTTGG GGTGGGGCCCCAACATAG
>NC_016928.1|WP_001802045.1|1149005_1149230_+|hypothetical-protein MLIQERGLKMTELNNIINSLQSLFESESGYKISKNSGVPYQTVQDLRNGKTKLEDARFRTIIKLYSYYVSLKEH >NC_016928.1|WP_000765708.1|1148902_1149049_+|hypothetical-protein MKLFYIVFLIIIWLNIFLGNEIIHTLTVLITTLYIVNSRKGIKNDRVE >NC_016928.1|WP_000857485.1|1147270_1148230_-|beta-channel-forming-cytolysin MKTRIVSSVTTTLLLGSILMNPVANAADSDINIKTGTTDIGSNTTVKTGDLVTYDKENGMHKKVFYSFIDDKNHNKKLLVIRTKGTIAGQYRVYSEEGANKSGLAWPSAFKVQLQLPDNEVAQISDYYPRNSIDTKEYMSTLTYGFNGNVTGDDTGKIGGLIGANVSIGHTLKYVQPDFKTILESPTDKKVGWKVIFNNMVNQNWGPYDRDSWNPVYGNQLFMKTRNGSMKAADNFLDPNKASSLLSSGFSPDFATVITMDRKASKQQTNIDVIYERVRDDYQLHWTSTNWKGTNTKDKWTDRSSERYKIDWEKEEMTN >NC_016928.1|WP_000231631.1|1146560_1146794_-|hypothetical-protein MVFNDWEINVVYSGEHEVVANEKSLFVIDEFYDVAIAIYYLDGKLKVAHVNYGSDFTIDVANKVFELNIQNPNVDEH >NC_016928.1|WP_031844937.1|1146148_1146367_-|hypothetical-protein MINFGLIIVPLLTTNDADFVWTSSSLIYMILLTSIILIVYIKTKDSLQLTIFILNIALIILYCTPLLFIYVF >NC_016928.1|WP_001032817.1|1145756_1145942_-|hypothetical-protein MNKHINKKATKLLEDYKKVQQRKSEETDRGCLKSVIMLIVLFFLIIFGIVACSTNVNFFFQ >NC_016928.1|WP_078065140.1|1145277_1145604_-|hypothetical-protein MFGARQLAHYCKLTFRQLLCWDPTPTCFVCRNWGSNFSMLGPRQLSLSVGIGDPISLCWGPPQLALFVEFLFEILCVGAPRVLKKLVTCVFSYSQLTTNIALELEMII >NC_016928.1|WP_000669535.1|1144690_1145041_+|fibrinogen-binding-protein MKFKKYILTGTLALLLSSTAIATLEGNKVEASSKKDYIIQSEYHDKQIADELRSLLNKSNVYDLAAGSLNRYYKQTIMMNEHRAKAALRSNNFDKMAEAKVALEKIYKEIYEIINR >NC_016928.1|WP_000791583.1|1144039_1144537_+|hypothetical-protein MKNKLIAKSLLTIAAIGITTTTIASTADASEGYGPREKKPVSINHNIVEYNDGTFKYQSRPKFNSTPKYIKFKHDYNILEFNDGTFEYGARPQFNKPAAKTDVTIKKEQKLIQAQNLVREFEKTHTVSAHRKAQKAVNLVSFEYKVKKMVLQERIDNVLKQGLVK >NC_016928.1|WP_000584398.1|1143274_1143781_+|hypothetical-protein MIIKILTILLLLCILSYLVTNRKKPFLFLKTLFMGVVFIFIGYISLAISAVIIYGIIQFITIDFGSFFLMGIILILISSIFQLFIVRLLFRKKNVDLTEVVVLEHLIQWFLVYFAIYQAVNEKMDINDINIDNFQSVFFDVSNLNLVILPTLIISWVTIFNYRMRSYK >NC_016928.1|WP_001038858.1|1149901_1150618_-|superantigen-like-protein-SSL12 MNKNITKNIILTTTLLLLGTVLPQNQKPVFSFYSEAKAYSIGQDETNINELIKYYTQPHFSFSNKWLYQYDNGNIYVELKRYSWSAHISLWGAESWGNINQLKDRYVDVFGLKDKDTDQLWWSYRETFTGGVTPAAKPSDKTYNLFVQYKDKLQTIIGAHKIYQGNKPVLTLKEIDFRAREALIKNKILYNENRNKGKLKITGGGNNYTIDLSKRLHSDLANVYVKNPNKITVDVLFD >NC_016928.1|WP_001063565.1|1150725_1151451_-|superantigen-like-protein-SSL13 MNNNITKKIILSTTLLLLGTASTQFPNTPISSSTEAKAYYINQNETNVNELTKYYSQQHLTFSNKTLWQKDNGTIHATLLQFSWYSHIQVYGPESWGNINQLRNKSVDIFGIKDQETIDSFALSQETFTGGVTPAATSNDKHYKLNVTYKDKAETFTGGFPVYEGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKSKKLYNNSYNKGQIKITGADNNYTIDLSKRLPSTDANRYVKKPQNAKIEVILEKSN >NC_016928.1|WP_000739527.1|1151545_1152271_-|superantigen-like-protein-SSL14 MKKNIMNKLVLSTALLLLGTTSTQLPKTPISFSSEAKAYNISENETNINELIKYYSQPHLSLSNKWLWQKPNGSIHATLQTWVWYSHIQVFGSESWGNINQLRNKYVDIFGTKDEDTVEGYWTYDETFTGGVTPAATSSDKPYRLFLKYSDKQQTIIGGHEFYKGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKNKKLYNGEFNKGQIKITADGNNYTIDLSKKLKLTDTNRYVKNPKNAQIEVILEKSN >NC_016928.1|WP_000793607.1|1152708_1153710_+|ornithine-carbamoyltransferase MKNLRNRSFLTLLDFSRQEVEFLLTLSEDLKRAKYIGTEKPMLKNKNIALLFEKDSTRTRCAFEVAAHDQGANVTYLGPTGSQMGKKETTKDTARVLGGMYDGIEYRGFSQRTVETLAEYSGVPVWNGLTDEDHPTQVLADFLTAKEVLKKDYADINFTYVGDGRNNVANALMQGAAIMGMNFHLVCPKELNPTDELLNRCKNIAAENGGNILITDDIDQGVKGSDVIYTDVWVSMGEPDEVWKERLELLKPYQVNKEMMDKTGNPNVIFEHCLPSFHNADTKIGQQIFEKYGIREMEVTDEVFESKASVVFQEAENRMHTIKAVMVATLGEF >NC_016928.1|WP_001074342.1|1153732_1154665_+|carbamate-kinase-1 MAKIVVALGGNALGKSPQEQLELVKNTAKSLVGLITKGHEIVISHGNGPQVGSINLGLNYAAEHNQGPAFPFAECGAMSQAYIGYQLQESLQNELHSIGMDKQVVTLVTQVEVDENDPAFNNPSKPIGLFYNKEEAEQIQKEKGFIFVEDAGRGYRRVVPSPQPISIIELESIKTLIKNDTLVIAAGGGGIPVIREQHDGFKGIDAVIDKDKTSALLGANIQCDQLIILTAIDYVYINFNTENQQPLKTTNVDELKRYIDENQFAKGSMLPKIEAAISFIENNPKGSVLITSLNELDAALEGKVGTVIKK >NC_016928.1|WP_078065166.1|1154901_1156392_+|YfcC-family-protein MILFILTVVAVIATWVIPAGAYSKLSYEPSSQELKIVNPHNQVKKVPGTQQELDKMGVKIKIEQFKSGAINKPVSIPNTYERLKQHPAGPEQITSSMVEGTIEAVDIMVFILVLGGLIGVVQASGSFESGLLALTKKTKGHEFMLIVFVSILMIIGGTLCGIEEEAVAFYPILVPIFIALGYDSIVSVGAIFLASSVGSTFSTINPFSVVIASNAAGTTFTDGLYWRIGACIVGAIFVISYLYWYCKKIKKDPKASYSYEDKDAFEQQWSVLKDDDSSHFTLCKKIILTLFVLPFPIMVWGVMTQGWWFPVMASAFLIFTIIIMFIAGTGKSGLGEKGTVDAFVNGASSLVGVSLIIGLARGINLVLNEGMISDTILHFSSSLVQHMSGPLFIIVLLFIFFCLGFIVPSSSGLAVLSMPIFAPLADTVGIPRFVIVTTYQFGQYAMLFLAPTGLVMATLQMLNMRYSHWFRFVWPVVAFVLIFGGGLLITQVLIYS >NC_016928.1|WP_000149420.1|1156699_1156927_+|hypothetical-protein MTHLTKVLDTLTGICVVLLFSKYFVAYANMVFDWKLRWYLLENIPHLPIILFILMFIFGVPSEMIKDRQRKNNGV >NC_016928.1|WP_001239297.1|1157232_1158180_-|permease MRLQKAPLVTSGLVLGLLGLGNLLKDLSLTLNAVCGIFAFLIWIHLLCTMLKYFNNVKEQLNSPLVSSVFTTFFMSGFLGTTYLNTFFSNITFINSLITPIWILCLVGIMTHMIIFSIKYLKDFSLENVYPSWTVLFIGIAIAGLTAPVSGYFFIGQLTVIYGFVATCIVLPIVFKRLKAFPLQTSIKPNTSTICAPFSLVAAAYVIAFPKANAFIVIILLLLAQIFYFYIIIQLPKLLKEPFSPVFSAFTFPLVISATALKNSLPVLMFPVIWKGLLFIEVLLATVIVLRVFIGYLHFFLKKENQDKFLRNASQ >NC_016928.1|WP_001245798.1|1158429_1158618_+|hypothetical-protein MRNQIQKLLDSDLSSLHISKQTGVPQSTIHRMRKNERSLDNMSLKNAELLYKFANGIFSDED >NC_016928.1|WP_000398672.1|1159530_1159665_+|beta-class-phenol-soluble-modulin MEGLFNAIKDTVTAAINNDGAKLGTSIVSIVENGVGLLGKLFGF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_016928_5 | 1224033-1224125 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NC_016928_5
|
1 spacers
spacers of NC_016928_5
>5.1|1224063|33|NC_016928|CRISPRCasFinder AATAAGCGGAACGCCTGAGCTAAAGCTCATGCA |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_016928_5
The CRISPR arrays of NC_016928_5 >merge|NC_016928|5|1224033-1224125|CRISPRCasFinder TAAGAAACAGTAATCAATAAATTGATAACTAATAAGCGGAACGCCTGAGCTAAAGCTCATGCATAAGAAACAGTAATCAATAAATTGATAACT >NC_016928|5|4|1224033-1224125|CRISPRCasFinder TAAGAAACAGTAATCAATAAATTGATAACT AATAAGCGGAACGCCTGAGCTAAAGCTCATGCA TAAGAAACAGTAATCAATAAATTGATAACT
>NC_016928.1|WP_000167269.1|1223174_1223909_+|3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein]-reductase MTKSALVTGASRGIGRSIALQLAEEGYNVAVNYAGSKEKAEAVVEEIKAKGVDSFAIQANVADADEVKAMIKEVVSQFGSLDVLVNNAGITRDNLLMRMKEQEWDDVIDTNLKGVFNCIQKATPQMLRQRSGAIINLSSVVGAVGNPGQANYVATKAGVIGLTKSAARELASRGITVNAVAPGFIVSDMTDALSDELKEQMLTQIPLARFGQDTDIANTVAFLASDKAKYITGQTIHVNGGMYM >NC_016928.1|WP_014363411.1|1222256_1223114_+|[acyl-carrier-protein]-S-malonyltransferase MNKTAIIFPGQGAQKVGMAQDLYNNNDQATEILTSAANTLDFDILETMFTDEDGKLGETENTQPALLTHSSALLAALKNLNPDFTMGHSLGEYSSLVAADVLSFEDAVKIVRKRGQLMAQAFPTGVGSMAAVLGLDFDKVDEICKSLSSDDKIIEPANINCPGQIVVSGHKALIDELVEKGKSLGAKRVMPLAVSGPFHSSLMKVIEEDFSSYINQFEWRDAKFPVVQNVNAQGETDKEVIKSNMVKQLYSPVQFINSTEWLIDQGVDHFIEIGPGKVLSGLIKK >NC_016928.1|WP_000239738.1|1221277_1222264_+|phosphate-acyltransferase MVKLAIDMMGGDNAPDIVLEAVQKAVEDFKDLEIILFGDEKKYKLNHERIEFRHCSEKIEMEDEPVRAIKRKKDSSMVKMAEAVKSGEADGCVSAGNTGALMSAGLFIVGRIKGVARPALVVTLPTIDGKGFVFLDVGANADAKPEHLLQYAQLGDIYAQKIRGIDNPKISLLNIGTEPAKGNSLTKKSYELLNQDHSLNFVGNIEAKTLMDGDTDVVVTDGYTGNMVLKNLEGTAKSIGKMLKDTIMSSTKNKLAGAILKKDLAEFAKKMDYSEYGGSVLLGLEGTVVKAHGSSNAKAFYSAIRQAKIAGEQNIVQTMKETVGESNE >NC_016928.1|WP_001548538.1|1220700_1221273_+|transcription-factor-FapR MRGETLKLKKDKRREAIRQQIDSNPFITDHELSDLFQVSIQTIRLDRTYLNIPELRKRIKLVAEKNYDQISSIEEQEFIGDLIQVNPNVKAQSILDITSDSVFHKTGIARGHVLFAQANSLCVALIKQPTVLTHESSIQFIEKVKLNDTVRAEARVVNQTAKHYYVEVKSYVKHTLVFKGNFKMFYDKRG >NC_016928.1|WP_001151491.1|1218438_1220499_+|DNA-helicase-RecG MAKVNLIESPYSLLQLKGIGPKKIEVLQQLNIHTVEDLVLYLPTRYEDNTVIDLNQAEDQSNVTIEGQVYTAPVVAFFGRNKSKLTVHLMVNNIAVKCIFFNQPYLKKKIELNQTITVKGKWNRVKQEITGNRVFFNSQGTQNQENADVQLEPVYRIKEGIKQKQIRDQIRQALNDVTIHEWLTDELREKYKLETLDFTLNTLHHPKSKEDLLRARRTYAFTELFLFELRMQWLNRLEKSSDEAIEIDYDLDQVKSFIDCLPFELTEAQKSSVNEIFRDLKAPIRMHRLLQGDVGSGKTVVAAICMYALKTAGYQSALMVPTEILAEQHAESLMALFGDSMNVALLTGSVKGKKRKILLEQLENGTIDCLIGTHALIQDDVIFHNVGLVITDEQHRFGVNQRQLLREKGAMTNVLFMTATPIPRTLAISVFGEMDVSSIKQLPKGRKPIITTWAKHEQYDNVLMQMTSELKKGRQAYVICPLIESSEHLEDVQNVVALYESLQQYYGVSRVGLLHGKLSADEKDEVMQKFSNHEIDVLVSTTVVEVGVNVPNATFMMIYDADRFGLSTLHQLRGRVGRSDQQSYCVLIASPKTETGIERMTIMTQTTDGFELSERDLEMRGPGDFFGVKQSGLPDFLVANLVEDYRMLEVARDEAAELIQSGVFFENTYQHLRHFVEENLLHRSFD >NC_016928.1|WP_000623917.1|1216603_1218250_+|DAK2-domain-containing-protein MISKINGKLFADMIIQGAQNLSNNADLVDSLNVYPVPDGDTGTNMNLTMTSGREEVENNLSKNIGELGKTFSKGLLMGARGNSGVILSQLFRGFCKNIESESEINSKLLAESFQAGVETAYKAVMKPVEGTILTVAKDAAQAAVEKANNTEDCIELMEYIIVKANESLENTPNLLAVLKEVGVVDSGGKGLLCVYEGFLKALKGEKVEAKVAKLDKDEFVHDEHDFHGVINTEDIIYGYCTEMMVRFGKNKKAFDEQEFRQDMSQFGDSLLVINDEEIVKVHVHTEYPGKVFNYGQQYGELIKLKVENMREQHREVIRKEQHTAKPKMETVETAIITISMGEGISEIFKSMGATHIISGGQTMNPSTEDIVKVIEQSKCKRAIILPNNKNILMASEQAASIVDAEAVVIPTKSIPQGISALFQYDVDATLEENKAQMADSVNNVKSGSLTYAVRDTKIDGVEIKKDAFMGLIEDKIVSSQSDQLTTVTELLIEMLAEDSEILTVIIGQDAEQAVTDNMINWIEEQYPDVEVEVHEGGQPIYQYFFSVE >NC_016928.1|WP_000171418.1|1216214_1216589_+|Asp23/Gls24-family-envelope-stress-response-protein MTLEISNDYGKIDISNEVIASVVGGKAVECYGIVGMASRQQVRDGIAEILGHENYAKGIKVTENNGVVDIDMYIIVSYGVKISEVANNVQSTVKYTLEKSLNVSVNSINIYVQGVRVNNTGKKA >NC_016928.1|WP_000517908.1|1215583_1215772_-|50S-ribosomal-protein-L28 MGKQCFVTGRKASTGNRRSHALNSTKRRWNANLQKVRILVDGKPKKVWVSARALKSGKVTRV >NC_016928.1|WP_000547905.1|1214560_1215202_+|thiamine-diphosphokinase MHINLLCSDRHLPQDIWAKSNEGKWGGVDRGALILLKHQIIPFFSVGDFDSVSKEERQLLTEQLQIKPVQAEKADTDLALAVDKAVALGFDSITIYGATGGRLDHFFGAIQLLLKKAYYKHDVHIEVIDQQNKIELLPKGQHTVEKDKSYPYISFIPMTDDVELSLAGFKYNLARQMLNIGSTLTISNEIESLQAKVTVHDGLILQIRSTDLN >NC_016928.1|WP_000164340.1|1213909_1214554_+|ribulose-phosphate-3-epimerase MTKLYPSLLSVDFLVLQHELKRLEEAGVDGVHFDVMDGQFVPNISIGLPILDAVRKGTTLPIDVHLMIENPEKYIASFAEHGADMISIHVESTPHIHRAIQMIKHLDKKAGVVINPGTPISQIEPILDIVDYVLVMTVNPGFGGQSFIDQCVEKIAGLNAIKMERQLNFDIEVDGGVNTDTAKVCVENGATMLVTGSFFFKQEDYKKVTQALKG >NC_016928.1|WP_000426914.1|1224214_1224448_+|acyl-carrier-protein MENFDKVKDIIVDRLGVDADKVTEDASFKDDLGADSLDIAELVMELEDEFGTEIPDEEAEKINTVGDAVKFINSLEK >NC_016928.1|WP_000043237.1|1224563_1225295_+|ribonuclease-3 MSKQKKSEIVNRFRKRFDTKMTELGFTYQNIDLYQQAFSHSSFINDFNMNRLDHNERLEFLGDAVLELTVSRYLFDKHPNLPEGNLTKMRATIVCEPSLVIFANKIGLNEMILLGKGEEKTGGRTRPSLISDAFEAFIGALYLDQGLDIVWKFAEKVIFPHVEQNELLGVVDFKTQFQEYVHQQNKGDVTYNLIKEEGPAHHRLFTSEVILQGEAIAEGKGKTKKESEQRAAESAYKQLKQIK >NC_016928.1|WP_000262685.1|1225441_1229008_+|chromosome-segregation-protein-SMC MVYLKSIDAIGFKSFADQTNVQFDKGVTAIVGPNGSGKSNITDAIKWVLGEQSAKSLRGSKMEDIIFSGAEHRKAQNYAEVQLRLDNHSKKLSVDENEVIVTRRLYRSGESEYYINNDRARLKDIADLFLDSGLGKEAYSIISQGRVDEILNAKPIDRRQIIEESAGVLKYKKRKAESLNKLDQTEDNLTRVEDILYDLEGRVEPLKEEAAIAKEYKTLSHQMKHSDIVVTVHDIDQYTNDNRQLDQRLNDLQGQQANKEADKQRLSQQIQQYKGKRHQLDNDVESLNYQLVKATEAFEKYTGQLNVLEERKKNQSETNARYEEEQENLIELLENISNEISEAQDTYKSLKSKQKELNAVIRELEEQLYVSDEAHDEKLEEIKNEYYTLMSEQSDVNNDIRFLKHTIEENEAKKSRLDSRLVEVFEQLKDIQGQIKTTKKEYQQTNKELSAVDKEIKNIEKDLTDTKKAQNEYEEKLYQAYRYTEKMKTRIDSLATQEEEYTYFFNGVKHILKAKNKELKGIHGAVAEIIDVPSKLTQAIETALGASLQHVIVDSEKDGRQAIQFLKERNLGRATFLPLNVIKSRVVATDIKSIAKEANGFISIASEAVKVAPEYQNIIGNLLGNTIIVDHLKHANELARAIKYRTRIVTLEGDIVNPGGSMTGGGARKSKSILSQKDELTTMRHQLEDYLRQTESFEQQFKELKIKSDQLSELYFEKSQKHNTLKEQVHHFEMELDRLTTQETQIKNDHEEFEFEKNDGYTSDKSRQTLSEKETHLESIKSSLKRLEDEIERYTKLSKEGKESVTKTQQTLHQKQSDLAVVKERIKTQQQTIDRLNNQSQQTKHQLNDVKEKIAFFNSDEVMGEQAFQNIKDQINGQQETRTRLSDELDKLKQQRIELNEQIDAQEATLQVCHQDILAIENHYQDIKAEQSKLDVLIHHAIDHLNDEYQLTVERAKSEYTSDESIDALRKKVKLMKMSIDELGPVNLNAIEQFEELNERYTFLSEQRTDLRKAKETLEQIISEMDQEVTERFKETFHAIQGHFTAVFKQLFGGGDAELQLTEADYLTAGIDIVVQPPGKKLQHLSLLSGGERALTAIALLFAILKVRSAPFVILDEVEAALDEANVIRYAKYLNELSDETQFIVITHRKGTMEFADRLYGVTMQESGVTKLVSVNLNTIDDVLKEEQ >NC_016928.1|WP_000007686.1|1229007_1230258_+|signal-recognition-particle-docking-protein-FtsY MSFFKRLKDKFATNKENEEVKSLTEEQGQDKLEDTHSEGSTQDVNDLAENAEVKKKPRKLSEADFDDDGLISIEDFEEIEAQKMGAKFKAGLEKSRQNFQEQLNNLIARYRKVDEDFFEALEEMLITADVGFNTVMTLTEELRMEAQRRNIQDTEDLREVIVEKIVEIYHQEDDNSEAMNLEDGRLNVILMVGVNGVGKTTTIGKLAYRYKMEGKKVMLAAGDTFRAGAIDQLKVWGERVGVDVISQSEGSDPAAVMYDAINAAKNKGVDILICDTAGRLQNKTNLMQELEKVKRVINRAVPDAPHEALLCLDATTGQNALSQARNFKEVTNVTGIVLTKLDGTAKGGIVLAIRNELHIPVKYVGLGEQLDDLQPFNPESYVYGLFADMIEQNEEITTVENDQIVTEEKDDNHGAK >NC_016928.1|WP_000531320.1|1230244_1230577_+|putative-DNA-binding-protein MGQNDLVKTLRMNYLFDFYQSLLTNKQRNYLELFYLEDYSLSEIADTFNVSRQAVYDNIRRTGDLVEDYEKKLELYQKFEQRREIYDEMKQHLSNPEQIQRYIQQLEDLE >NC_016928.1|WP_000863474.1|1230602_1231970_+|signal-recognition-particle-protein MAFEGLSERLQATMQKMRGKGKLTEADIKIMMREVRLALLEADVNFKVVKEFIKTVSERALGSDVMQSLTPGQQVIKIVQDELTKLMGGENTSINMSNKPPTVVMMVGLQGAGKTTTAGKLALLMRKKYNKKPMLVAADIYRPAAINQLQTVGKQIDIPVYSEGDQVKPQQIVTNALKHAKEEHLDFVIIDTAGRLHIDEALMNELKEVKDIAKPNEIMLVVDSMTGQDAVNVAESFDDQLDVTGVTLTKLDGDTRGGAALSIRSVTQKPIKFVGMSEKLDGLELFHPERMASRILGMGDVLSLIEKAQQDVDQEKAKDLEKKMRESSFTLDDFLEQLDQVKNLGPLDDIMKMIPGMNKMKGLDKLNMSEKQIDHIKAIIQSMTPAERNNPDTLNVSRKKRIAKGSGRSLQEVNRLMKQFNDMKKMMKQFTGGGKGKKGKRNQMQNMLKGMNLPF >NC_016928.1|WP_000268754.1|1232315_1232591_+|30S-ribosomal-protein-S16 MAVKIRLTRLGSKRNPFYRIVVADARSPRDGRIIEQIGTYNPTSANAPEIKVDEALALKWLNDGAKPTDTVHNILSKEGIMKKFDEQKKAK >NC_016928.1|WP_000687320.1|1233280_1234018_+|tRNA-(guanosine(37)-N1)-methyltransferase-TrmD MKIDYLTLFPEMFAGVLNHSIMKRAQENNKLQINTVNFRDYAINKHNQVDDYPYGGGQGMVLKPEPVFNAMEDLDVTEQTRVILMCPQGEPFSHQKAVELSKADHIVFICGHYEGYDERIRTHLVTDEISMGDYVLTGGELPAMTMTDAIVRLIPGVLGNEQSHQDDSFSDGLLEFPQYTRPREFKGLTVPDVLLSGNHANIDAWRHEQKLIRTYNKRPDLIEKYPLTNADKQILERYKIGLKKG >NC_016928.1|WP_000181404.1|1234120_1234471_+|50S-ribosomal-protein-L19 MTNHKLIEAVTKSQLRTDLPSFRPGDTLRVHVRIIEGTRERIQVFEGVVIKRRGGGVSETFTVRKISSGVGVERTFPLHTPKIEKIEVKRRGKVRRAKLYYLRSLRGKAARIQEIR >NC_016928.1|WP_000915249.1|1234714_1237321_-|membrane-protein MLKKWLNSNVKQFFVITFMSVILTLILFSTHIYDYIVNGTVFSGAGDGFRQMMPFQMYLYEHLSSFSSLYDASFGLGGDYMKGLSYYYSLSPLMWLNFLFIKIGETVGIFNPTTIHFWPTNQLIMAMIRAIITFVVTFYLFKILHFKRSTNMIATILYGMSTVVIYFNFTWSFYGNLLYLLPLSILGLERYFQQRKIGIFIVAIALTLFSNFYFSYYQAIIIGCYYLYRLIFTYKYDIVSRTQKLICVISATVLSVLSSVFGLFTGISAFLENDRKQNPNVDIPFLTPLDYHYFFFSDGFFITISILTFVALLSFKLYRFYFYRLFAIITWILFIGSLSQYFDSAFNGFSFPERRWVYILALSSSALCGLFIQHLSTLNMKYYLIRTIPVSIIALLYVLLSPTHPLALIVGIILLMVLAVILKFSLWRYKKLTVAILVLIVMIQQIVILDNNKNMAIKPYQQSLSTLKQHDYHSNYVNQLIKKINQNATGPFNRIDYMSDYALNSPFIYHYNGISLYSSIFNGDILKYYDKTLQINMPIDKNSTYRLLGNRQNLLSLWNVNDRIRVNHDDNLPYGFKINSEHKDNKVRWIHSKNTIHYPSAHITNKVFSNKELKSPLDKEQAMLQGIVSNNTKDVNTHFKANKNLLSDSTIKLNSAAWQSPTKHLLQVKQNNGGLTVQLPKSVSNQFKDLYFEMDLELLSPDKAHDVKVNEYTQERNKLTYKYRRFVTPVTIRIKASDRIRLSLPKGKYRVNLKGIYGEDYTTLKDASNSLEAVKVSKTKQGYTITKNKNSSGYIVLPTAYNQGMKATSGDQSLKVEQVNGVMTGIKAPKNITKIQLSYTPPYYYLLITITIFGIICSIIFTRWARQK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_016928_6 | 1432081-1432160 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_016928_6
|
1 spacers
spacers of NC_016928_6
>6.1|1432106|30|NC_016928|CRISPRCasFinder GCTTTCCGCAGCTACTATGTTGGGGACCCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_016928_6
The CRISPR arrays of NC_016928_6 >merge|NC_016928|6|1432081-1432160|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGGCTTTCCGCAGCTACTATGTTGGGGACCCGCCAACTTGCACTTTATTGTAAGCTG >NC_016928|6|5|1432081-1432160|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTG GCTTTCCGCAGCTACTATGTTGGGGACCCG CCAACTTGCACTTTATTGTAAGCTG
>NC_016928.1|WP_000192137.1|1430903_1431563_-|DNA-binding-response-regulator MTQILIVEDEQNLARFLELELTHENYNVDTEYDGQDGLDKALSHYYDLIILDLMLPSINGLEICRKIRQQQSTPIIIITAKSDTYDKVAGLDYGADDYIVKPFDIEELLARIRAILRRQPQKDIIDVNGITIDKNAFKVTVNGAEIELTKTEYDLLYLLAENKNHVMQREQILNHVWGYNSEVETNVVDVYIRYLRNKLKPYDRDKMIETVRGVGYVIR >NC_016928.1|WP_000180678.1|1426465_1429264_-|2-oxoglutarate-dehydrogenase-E1-component MTNERKEVSEAPVNFGANLGLMLDLYDDFLQDPSSVPEDLQVLFSTIKNDDSIVPALKSTSSQNSDGTIKRVMRLIDNIRQYGHLKADIYPVNPPKRKHVPKLEIEDFDLDQQTLEGISAGIVSDHFADIYDNAYEAILRMEKRYKGPIAFEYTHINNNTERGWLKRRIETPYKVTLNNNEKRALFKQLAYVEGFEKYLHKNFVGAKRFSIEGVDALVPMLQRTITIAAKEGIKNIQIGMAHRGRLNVLTHVLEKPYEMMISEFMHTDPMKFLPEDGSLQLTAGWTGDVKYHLGGIKTTDSYGTMQRIALANNPSHLEIVAPVVEGRTRAAQDDTQRAGAPTTDHHKAMPIIIHGDAAYPGQGINFETMNLGNLKGYSTGGSLHIITNNRIGFTTEPIDARSTTYSTDVAKGYDVPIFHVNADDVEATIEAIDIAMEFRKEFHKDVVIDLVGYRRFGHNEMDEPSITNPVPYQNIRKHDSVEYVFGKKLVNEGVISEDEMNSFIEQVQKELRQAHDKINKADKMDNPDMEKPADLALPLQADEQSFTFDHLKEINDALLTYPDGFNILKKLNKVLEKRHEPFNKEDGLVDWAQAEQLAFATILQDGTPIRLTGQDSERGTFSHRHAVLHDEQTGETYTPLHHVPDQKATFDIHNSPLSEAAVVGFEYGYNVENKKSFNIWEAQYGDFANMSQMIFDNFLFSSRSKWGERSGLTLFLPHAYEGQGPEHSSARLERFLQLAAENNCTVVNLSSSSNYFHLLRAQAASLDSEQMRPLVVMSPKSLLRNKTVAKPIDEFTSGGFEPILTESYQADKVTKVILATGKMFIDLKEALAKNPDESVLLVAIERLYPFPEEEIEALLAQLPNLEEVSWVQEEPKNQGAWLYVYPYVKVLVADKYDLSYHGRIQRAAPAEGDGEIHKLVQNKIIENALKNN >NC_016928.1|WP_001115452.1|1425183_1426452_-|dihydrolipoyllysine-residue-succinyltransferase MPEVKVPELAESITEGTIAEWLKNVGDSVEKGEAILELETDKVNVEVVSEEAGVLSEQLASEGDTVEVGQAIAVIGEGSGNASKENSNDNTPQQNEETNNKKEETTNKSADKAEVNQTTDDNQQRVNATPSARRYARENGVNLAEVSPKTNDLVRKEDIDKKQQAPASTQTTQQAPAKEEKKYNQYPTKPVIREKMSRRKKTAAKKLLEVSNNTAMLTTFNEVDMTNVMELRKRKKDQFMKDHDGTKLGFMSFFTKASVAALKKYPEVNAEIDGDDMITKQYYDIGVAVSTDDGLLVPFVRDCDKKNFAEIEAEIANLAVKAREKKLGLDDMVNGSFTITNGGIFGSMMSTPIINGNQAAILGMHSIITRPIAIDQDTIENRPMMYIALSYDHRIIDGKEAVGFLKTIKELIENPEDLLLES >NC_016928.1|WP_000334509.1|1423794_1424604_-|hypothetical-protein MCGLRSITLGTTNIEQTKHFMVDILGLNCEELLENSIRFGDADISPGTRLQFIQVPSEQLEESHFVGIGLRTPTDSGLEEYAEILSSKEIPFTTTKELNGNKYFSFEDNNGHIFSIYSNENNYGVGLGMPSFESAVNPLHQVQGLGPVILKVNHVDITGQILTNIFGLEVFAEYQPFDNADYHVQVFKIGTGGLGGEIHLMPVETEMTMPEYGAVDQVEFETKDADFFNQAKSRLDEVEIPYQTLEQDDIESIRITENSGLSFIFTLQK >NC_016928.1|WP_000902174.1|1423562_1423766_-|hypothetical-protein MLHETWKERTPIKKVEVINTDAKKFTVSDMLTVGKQYDVINETEEYYQIIDNSGLIGGYYKTYFKEV >NC_016928.1|WP_001185421.1|1422590_1423382_-|MoxR-family-ATPase MALKHYKNSDSTVFNDAKALFDLNKNILLKGPTGSGKTKLAETLSEVVDTPMHQVNCSVDLDTESLLGFKTIKTNAEGQQEIVFVDGPVIKAMKEGHILYIDEINMAKPETLPVLNGVLDYRRQITNPYTGEVIKAVPGFNVIAAINEGYVGTLPMNEALKNRFVVIHVDYIDGDILKNVIKEQSLLQDDKQIEQIIKFNEDLRTMSKQGQISEEAASIRALLDLCDLITVMPVERAIKRTIIDKLEDEREQQAIYNAVELNF >NC_016928.1|WP_001283670.1|1420690_1422577_-|nitric-oxide-reductase-activation-protein-NorD MSDRFIKFNDEQLDAKQVMMLQDLARLLLKNEQTQVKIQKFPYYNPVQNVLITSWFWSHRPSHIEMAGLKTDVMLAAYGYHMMDVQIVNEVVQDKTFKHPKFYQQLFKLLEDMRVLNSIKVERPSTAKLIDLRLDTRISYTESQIKVYRTKTQYTDLLFLYLEHAFLSQDFFDIPSIHSDLDDILVNMFLYLPNFFQNQNSEDNMYLAQRIMYQVDDILKEDMLNEYYYLPKTLYNTLASPEFEDLKRTDASQVDGQDDTSEDDDNQSEKADSKSADSESKGGAYLEMELHEGQNSETLGNDEAREGDATDDMTDMMTKKGKGSNDTLNREEGDAVGQSQAFQLDGVNKNVEIKWQIPEIEPQYVLEYQESKQDVQYEIKDLIQIIKKTIEREQRDARFNLTKGRLQKDLINWFIDDQYKLFYKKQDLSKSFDATFTLLIDASASMHDKMAETKKGVVLFHETLKALNIKHEILSFSEDAFDSDEHAQPNIINEIINYDYSTFEKDGPRIMALEPQDDNRDGVAIRVASERLMRRNQHQRFLIVFSDGEPSAFNYSQDGIIDTYEAVEMSRKFGIEVFNVFLSQDPITEDVEQTIHNIYGQYAIFVEGVAHLPGHLSPLLKKLLLKSL >NC_016928.1|WP_001039275.1|1419122_1420466_-|branched-chain-amino-acid-transport-system-II-carrier-protein MNKNTWVIGFTLFAMFFGAGNLIFPPNLGLDSGQFFWPAILAFVLTGIGLPLLGVIVGALDKEGYIGALNKISPKFSILFLIIIYLTIGPLFAIPRTASTSFEMTITPIIHSNSSIALFIFTIIYFIVVLYICLNPSKLIDRIGSLLTPLLLITILAMIIKGYLDFSGNSAGKGNEALYHSNFSSFAEGFTQGYLTMDAIAAIAFSMIVVNAVKLTGITKTNQIFKQTLTAGLIAAVALIFIYISLGYIGNHMPVSDMTLDQLKSKDRNIGTYLLTTMASTGFGSFGKYLLGIIVALACLTTACGLIVAVSEYFHRIVPKVSYKAFVLVFILMSFIIANQGLNAVISMSIPVLSIVYPVAITVVLLILIAKFIPTKRISQQIPVIIVFILSIFSVISKLGWLKINFIESLPLRAYSLEWFPVAIIATILGYLVGIFVKQDPIKYQQE >NC_016928.1|WP_000138424.1|1417912_1419049_+|toxic-anion-resistance-protein MTENKSFKESHPLDDFISDKELSNTTIQKEKLTIEQQKQVDTISKQINPLDNEGLLAFGSGLQKQMSQFSHQMLDEVQSKDVGPIGDTLSDLMSKLKSVNPNELNTDKPSMLKRIFSRAKSSINEIFSRMQSVSAQVDRITIQLQKHQTHLTRDIELLDTLYDKNKQYFDDLSLHIIAAQQKKLQLENEKLPQLQQQAQQSTNQMDIQQVADMQQFIDRLDKRIYDLQLSRQIALQTAPQIRMIQNVNQALAEKIQSSILTSIPLWKNQMAIALTLMRQRNAVAAQRAVTDTTNDLLTANAEMLKQNAIETATENERGIVDLDTLKRTQRNIIETIEETLIIQQHGREERQLAEKELQQLEQDLKSHLVNIKGPNKQS >NC_016928.1|WP_001788788.1|1417251_1417881_+|5-bromo-4-chloroindolyl-phosphate-hydrolysis-protein MTVRYNISHIFGVLVGIPVAFLTSIFGMIALDVSFLIDMSIGIVGFLMTYLPIQKLTSRKYLNEIGLTRKDYRYIRNQLNHTHQKLRGILKTYVNIRSIKDFRQINDIYQISRSIYTTVRQRPASFYKVEGFFYSHIDNALNLVDAYTRLAKMPKKSINEQQKLEQTRITLDEVKRTLIADLKRLNEDDYERLDIEMELNKLHQKHHQD >NC_016928.1|WP_000084773.1|1432704_1433319_-|phosphatase-PAP2-family-protein MSQWKRISLLIVFTLVFGIIAFFHESRLGKWIDNEVYEFIYSSESFITTSIMLGATKVGEVWAMLCISLLLVAYLMLKRHKIEALFFALTMALSGILNPALKNIFDRERPTLLRLIDITGFSFPSGHAMGSTAYFGSGIYLLNRLNQGNSKGILIGLCAAMILLISISRVYLGVHYPTDIIAGIIGGVFCIILSTLLLRNKLIN >NC_016928.1|WP_000160908.1|1433335_1434406_-|undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide-beta-N-acetylglucosaminyltransferase 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MLKKDKSELTDIEYIVTQENGTEPPFMNEYWNHFAKGIYVDKISGKPLFTSEEKFHSECGWPSFSKALDDDEIIELVDKSFGMLRTEVRSEESNSHLGHVFNDGPKESGGLRYCINSAAIQFIPYEKLEELGYGDLISHFDK >NC_016928.1|WP_000159902.1|1438162_1438696_-|peptide-methionine-(S)-S-oxide-reductase MTKEYATLAGGCFWCMVKPFTSYPGIKSVVSGYSGGHVDNPTYEQVCTNQTGHVEAVQITFDPEVTSFENILDIYFKTFDPTDDQGQFFDRGESYQPVIFYHDEHQKKAAEFKKQQLNEQGIFKKPVITPIKPYKNFYPAEDYHQDYYKKNPVHYYQYQRGSGRKAFIESHWGNQNA >NC_016928.1|WP_000166052.1|1438785_1439625_-|DegV-family-protein MTKQIIVTDSTSDLSKEYLEANNIHVIPLSLTIEGASYVDQVDITSEEFINHIENDEDVKTSQPAIGEFISAYEELGKDGAEIISIHLSSGLSGTFNTAYQASQMVDANVTVIDSKSISFGLGYQIQHLVELVKEGVSTSEIVNKLNHLRENIKLFVVIGQLNQLIKGGRISKTKGLIGNLMKIKPIGTLDDGRLELVHNARTQNSSIQYLKKEIAEFIGDHEIKSVGVAHANVIEYVDKLKKVFNEAFHVNNYDINVTTPVISAHTGQGAIGLVVLKK >NC_016928.1|WP_000175746.1|1439639_1440119_-|dihydrofolate-reductase MTLSILVAHDLQRVIGFENQLPWHLPNDLKHVKKLSTGHTLVMGRKTFESIGKPLPNRRNVVLTSDTSFNVEGVDVIHSIEDIYQLPGHVFIFGGQTLFEEMIDKVDDMYITVIEGKFRGDTFFPPYTFEDWEVASSVEGKLDEKNTIPHTFLHLIRKK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_016928_7 | 1978689-1978770 | Orphan |
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Consensus repeat of NC_016928_7
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1 spacers
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DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_016928_7
The CRISPR arrays of NC_016928_7 >merge|NC_016928|7|1978689-1978770|CRISPRCasFinder TGTTGGGGCCCCGCCAACCTGCATTACCTGTAGAATTTCTTTTTTCGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATT >NC_016928|7|6|1978689-1978770|CRISPRCasFinder TGTTGGGGCCCCGCCAACCTGCATT ACCTGTAGAATTTCTTTTTTCGAAATTCTCTA TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATT
>NC_016928.1|WP_000636142.1|1977747_1978506_-|methionine-aminopeptidase MIVKTEEELQALKEIGYICAKVRNTMQAATKPGITTKELDNIAKELFEEYGAISAPIHDENFPGQTCISVNEEVAHGIPSKRVIREGDLVNIDVSALKNGYYADTGISFVVGESDDPMKQKVCDVATMAFENAIAKVKPGTKLSNIGKAVHNTARQNDLKVIKNLTGHGVGLSLHEAPAHVLNYFDPKDKTLLTEGMVLAIEPFISSNASFVTEGKNEWAFETSDKSFVAQIEHTVIVTKDGPILTTKIEEE >NC_016928.1|WP_001110179.1|1977144_1977531_-|hypothetical-protein MNYVERYIEQFLRATVRNNIKHYLLMLDEKMKNLDDYMRYLITKKEQLSKLIDSLMLTLENKYIDIAEAFQIQCAREINNQEIENIKSELNKVEAYYAQIETQIQQTSTEKIATEKTSYLINYMNAVA >NC_016928.1|WP_000149064.1|1976428_1977130_-|transporter MTHKYISTQMLIIFTALMIIANFYYIFFEKIGFLLVLLLGCVLVYVGYLYFHKIRGLLAFWIGALLIAFTLLSNKYTIIILFVFLLLLIVRYLIHKFKPKKVVATDEVMTSPSFIKQKWFGEQRTPVYVYKWEDVQIQHGIGDLHIDLTKAANIKENNTIVVRHILGKVQVILPVNYNINLHVAAFYGSTYVNEKSYKVENNNIHIEEMMKPDNYTVNIYVSTFIGDVEVIYR >NC_016928.1|WP_001017131.1|1975388_1976432_-|two-component-sensor-histidine-kinase MNHYIRTIGSMLILVYSMLAAFLFIDKVFVNIIYFQGMFYTQIFGIPVFLFLNLIIILLCIIVGSVLAYKINQQNDWIKTQIERSMEGETVGINDQNIEIYSETLDLYHTLVPLNQELHKLRLKTQNLTNENYNINDVKVKKIIEDERQRLARELHDSVSQQLFAASMMLSAIKETKLEPPLDQQIPILEKMVQDSQLEMRALLLHLRPLGLKDKSLGEGIKDLVIDLQKKVPMKVVHEIQDFKVPKGIEDHLFRITQEAISNTLRHSNGTKVTVELFNKDDYLLLRIQDNGKGFNVDEKLEQSYGLKNMRERALEIGATFHIVSLPDSGTRIEVKAPLNKEDSYDD >NC_016928.1|WP_000153526.1|1974769_1975399_-|DNA-binding-response-regulator MTIKVLFVDDHEMVRIGISSYLSTQRDIEVVGEGASGKEAIAKAHELKPDLILMDLLMEDMDGVEATTQIKKDLPQIKVLMLTSFIEDKEVYRALDAGVDSYILKTTSAKDIADAVRKTSRGESVFEPEVLVKMRNRMKKRAELYEMLTEREMEILLLIAKGYSNQEIASASHITIKTVKTHVSNILSKLEVQDRTQAVIYAFQHNLIQ >NC_016928.1|WP_000037087.1|1973439_1974657_+|YihY/virulence-factor-BrkB-family-protein MSKKDHSSSKYLNSVKEAQEESKKKNKSNPKIDVDRTYIEPQQFQSKKPKKEDQVFFLSRLNKPAKYKKDSNFLSYLIYRIGKDDASGLAAQMTYHFVLAMFPMLLFLLTLLPFFNIKQSQITNMLSNAPAETSTLIKSVIGDITQNSSGGLLSIGLILAIWSASNGMTAIMNSFNVAYDVEDSRNGIVLKLLSVVFTVVMGVVFVVALALPTLGSVISHFLFGPLGFDEQVKWIFNLIRIVLPIIIIFIVFIVLYSVAPNVKTKLKSVLPGAVFTSIIWLAGSFGFGWYISNFGNYSKTYGSIAGIIILLLWLYITSFIIIVGAEINAIIHQRSVIKGKTPEEAALEHDDNNKNHYNENTRYEYAEDTNATHQRTYHVDEHPSDTYPEDDKNIKDKIVDKLKKD >NC_016928.1|WP_000428172.1|1972886_1973162_+|hypothetical-protein MENKFVPGILIGAVIGGAISLADKSTRQALVQSVKDAKNGNRTRKPSKVSKIKDEVLYWKDVVEEIRRNNPELERSLKDAKETFVNRKNQR >NC_016928.1|WP_000228666.1|1972415_1972880_+|protein-tyrosine-phosphatase MVDVAFVCLGNICRSPMAEAIMRQRLKDRNIHDIKVHSRGTGSWNLGEPPHEGTQKILNKHNIPFDGMISELFEATDDFDYIVAMDQSNVDNIKSINPNLKGQLFKLLEFSNMEESDVPDPYYTNNFEGVYDMVLSSCDNLIDYIVKDANLKEG >NC_016928.1|WP_000180460.1|1972068_1972269_-|DUF1128-domain-containing-protein MTNEEKVLAIREKLNIVNQGLLDPEKYKNANEEELTDIYDFVQSRERLSPSEVTAIADALGQLRHD >NC_016928.1|WP_078065149.1|1970809_1972066_-|aminopeptidase MGILTNYKEKLQQYAELLVKVGMNVQPKQPVFIRSSVETLELTHLIVEEAYHCGASDVRVVYSDPTLKRLKFENESVEHFANHEIKSYDVEARMDYVKRGAANLALISEDPDLMDGIDSQKLQAFQQQNARAFKGYMESVQKNQFPWVVAAFPSKAWAKRVYPELSVEEAYIKFIDEVFDIVRIDGNDPVENWRQHIANLSVYAQKLQQKNYHALHYVSEGTDLTVGLAKNHIWEDATSYVNGKEQAFIANIPTEEVFTAPDRNRVDGYVTNKLPLSYNGTIIDQFKLMFKDGEIIDFSAEKGEAVLKDLINTDEGSRRLGEVALVPDDSPISNRNTIFYNTLFDENAACHLAIGSAYAFNIEGGTEMTVEEKIASGLNDSNVHVDFMIGSSDLTIYGIFEDGSKELVFENGNWASTF >NC_016928.1|WP_000999708.1|1979034_1980021_+|aromatic-acid-exporter-family-protein MNDQWYKHLIGARTIKTGIAIFLTAVFCMALDLTPIYAILTAVVTIEPTAKASLIKGYRRLPATVIGAGFAVLFTYLFGDQSPFTYALSATFTILFCTKLKLQVGTNVAVLTSLAMIPGIHDAYIFNFLSRTLTAIIGLVTSGLINFMVFPPKYYGQVEEKLSKTDALMYKLFYDRCQELILSRLQSDKSEKAYKNIFNLNNQVETLISYQRDELSYHKKKECDWKLLNQLTKRAYTNRLFITHLSNIIYLPKNTRVNFSGDEKMALLKISSSIKDIFYDGSFKREDDSVETLRSTIKAHEISGENQIKSHILYEVLMIYRLLDSRYA >NC_016928.1|WP_071621415.1|1980065_1980122_+|hypothetical-protein MIFSQNLFRRPTPTCTLL >NC_016928.1|WP_025174552.1|1980453_1980867_-|hypothetical-protein MKPTKVILRDASYVHSKTSITFILKDVVIEEDNKIYYFDTSATFEDQEIKFEFALFDSDMDNLKHMEYDNPVTEIYFIEPDLHFTIIDFNQELLCIYIDFDSGLRHSNMATESGISLRINVTKSDFNKFINELASLH >NC_016928.1|WP_001790257.1|1980895_1981006_-|hypothetical-protein MDGNNQIDVCFFVLVNNYYTMSIYPRIINSNGDYAT >NC_016928.1|WP_000544973.1|1981091_1981823_-|glutamine-amidotransferase MHELTIYHFMSDKLNLYSDIGNIIALRQRAKKRNIKVNVVEINETEGITFDECDIFFIGGGSDREQALATKELSKIKTPLKEAIEDGMPGLTICGGYQFLGKKYITPDGTELEGLGILDFYTESKTNRLTGDIVIESDTFGTIVGFENHGGRTYHNFGTLGHVTFGYGNNDEDKKEGIHYKNLLGTYLHGPILPKNYEITDYLLEKACERKGIPFEPKEIDNEAEKQAKQVLIDRANRQKKSR >NC_016928.1|WP_001250333.1|1981824_1983138_-|DUF1727-domain-containing-protein MRQWTAIHLAKLARKASRAVGKRGTDLPGQIARKVDTDILRKLAEQVDDIVFISGTNGKTTTSNLIGHTLKANNIQIIHNNEGANMAAGITSAFIMQSTPKTKIAVIEIDEGSIPRVLKEVTPSMMVFTNFFRDQMDRFGEIDIMVNNIAETISNKGIKLLLNADDPFVSRLKIASDTIVYYGMKAHAHEFEQSTMNESRYCPNCGRLLQYDYIHYNQIGHYHCQCGFKREQAKYEISSFDVAPFLHLNINDEKYDMKIAGDFNAYNALAAYTVLRELGLNEQAIKNGFETYTSDNGRMQYFKKERKEAMINLAKNPAGMNASLSVGEQLEGEKVYVISLNDNAADGRDTSWIYDADFEKLSKQQIEAIIVTGTRAEELQLRLKLAEVEVPIIVERDIYKATAKTMDYKGFTVAIPNYTSLAPMLEQLNRSFEGGQS >NC_016928.1|WP_000949467.1|1983429_1983930_+|non-heme-ferritin MLSKNLLEALNDQMNHEYFAAHAYMAMAAYCDKESYEGFANFFIQQAKEERFHGQKIYNYINDRGAHAEFRAVSAPKIDFSSILETFKDSLSQEQEVTRRFYNLSEIARQDKDYATISFLNWFLDEQVEEESMFETHINYLTRIGDDSNALYLYEKELGARTFDEE >NC_016928.1|WP_001790679.1|1984011_1984104_-|hypothetical-protein MTKNTIISLENEKTQINDSENESSDLRKAK >NC_016928.1|WP_000613738.1|1984320_1984875_+|DNA-polymerase-III-subunit-epsilon MIQDAFVALDFETANGKRTSICSVGMVKVIDSQITETFHTLVNPQDYFSQQNIKVHGIQPEDVENAPTFDYVFPYMMQFIADLPVVAHNAAFDMNVLHQSIQNIGLPTPNLTYFCSYQLAKRTVDSYRYGLKHMMEFYQLDFHGHHDALNDAKACAMITFRLLKNYENLTYVTNIYGKNLKDKG >NC_016928.1|WP_000140176.1|1984941_1986012_-|DNA-polymerase-IV MTERRIIHIDMDYFFAQVEMRDNPKLKGKPVIVGGKASSRGVVSTASYEARKYGVHSAMPMSQAHKLCPNGYFVTSNFGAYRETSAQIMSIFRSYTDKVEPMSLDEAYLDITELVRPDLPASKIAQYIRKDILEQTHLTASAGVSYNKFLAKLASGMNKPDGMTVIDYQNVHDILMTLDIGDFPGVGKASKKVMHDNGIFNGRDLYEKTEFELIRLFGKRGRGLYNKARGIDHSEVKSSRVRKSVGTERTFATDVNDDEEILRKVWELSGKTAERLNKLQKSAKTVTVKIKTYQFETLSKQMSLRDSVSSEEDIYNIAYLLYNDLKDPDVPIRLIGVTVGNLEQSTYKNMTIYDFI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_016928_8 | 2038456-2038541 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_016928_8
|
1 spacers
spacers of NC_016928_8
>8.1|2038485|28|NC_016928|CRISPRCasFinder TTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_016928_8
The CRISPR arrays of NC_016928_8 >merge|NC_016928|8|2038456-2038541|CRISPRCasFinder TGTTGAGGCCCCACCCCAACTTACATTGTTTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCCACCCCAACTTACATTGT >NC_016928|8|7|2038456-2038541|CRISPRCasFinder TGTTGAGGCCCCACCCCAACTTACATTGT TTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTA TGTTGGGGCCCCACCCCAACTTACATTGT
>NC_016928.1|WP_000206634.1|2037017_2038241_+|succinyl-diaminopimelate-desuccinylase MTTFSEKEKIQLLADIVELQTENNNEIDVCNYLKDLFDKYDIKSEILKVNEHRANIVAEIGNGSPILALSGHMDVVDAGNQDNWTYPPFQLTEKNGKLYGRGTTDMKGGLMALVITLIELKEQNQLPQGTIRLLATAGEEKEQEGAKLLADKGYLEDVDGLIIAEPTGSGIYYAHKGSMSCKVTATGKAVHSSVPFIGDNAIDTLLEFYNQFKEKYSELKKHDTKHELDVAPMFKSLIGKEISEEDANYASGLTAVCSIINGGKQFNSVPDEASLEFNVRPVPEYDNDFIESFFQNIINNVDSNKLSLDIPSNHRPVTSDKNNKLITTIKDVASSYVDKDDIFVSALVGATDASSFLGDNKDNVDLAIFGPGNPLMAHQIDEYIEKDMYLKYIDIFKEASIQYLKEK >NC_016928.1|WP_000595398.1|2034489_2035506_-|bi-component-leukocidin-LukGH-subunit-G MIKQLYKNITICSLAISTVLTVFPATSYAKINSEIKAVSEKNLDGDTKMYTRTATTSDSQKNITQSLQFNFLTEPNYDKETVFIKAKGTIGSGLRILDPNGYWNSTLRWPGSYSVSIQNVDDNNNTNVTDFAPKNQDESREVKYTYGYKTGGDFSINRGGLTGNITKESNYSETISYQQPSYRTLLDQSTSHKGVGWKVEAHLINNMGHDHTRQLTNDSDNRTKSEIFSLTRNGNLWAKDNFTPKDKMPVTVSEGFNPEFLAVMSHDKKDEGKSKFVVHYKRSMDEFKIDWNRHGFWGYWSGENHVDKKEEKLSALYEVDWKTHDVKFVKVLNDNEKK >NC_016928.1|WP_078065150.1|2034100_2034199_-|hypothetical-protein MLGPRQLALPVEFLFEILCVGTTQSTNTNITL >NC_016928.1|WP_000239607.1|2033004_2033997_+|phosphodiesterase MVKKTKSNSLKKVATLALANLLLVGALTDNSAKAESKKDDTDLKLVSHNVYMLSTVLYPNWGQYKRADLIGQSSYIKNNDVVIFNEAFDNGASDKLLSNVKKEYPYQTPVLGRSQSGWDKTEGSYSSTVAEDGGVAIVSKYPIKEKIQHVFKSGCGFDNDSNKGFVYTKIEKNGKNVHVIGTHTQSEDSRCGAGHDRKIRAEQMKEISDFVKKKNIPKDETVYIGGDLNVNKGTPEFKDMLKNLNVNDVLYAGHNSTWDPQSNSIAKYNYPNGKPEHLDYIFTDKDHKQPKQLVNEVVTEKPKPWDVYAFPYYYVYNDFSDHYPIKAYSK >NC_016928.1|WP_000669723.1|2030879_2032616_-|MAP-domain-containing-protein MKFKSLITTTLALGVLASTGANFNNNEASAGAKPLDKSSSSLHHGYSKVHVPYAITVNGTSQNILSSLTFNKNQNISYKDLEDRVKSVLKSDRGISDIDLRLSKQAEYTVYFKNGAKRVIDLKAGIYTADLINTSEIKAININVDTKKHIEDKKKDKANYQVPYTITVNGTSQNILSNLTFNKNQNISYKDLEDKVKSVLESNRGITDVDLRLSKQAKYTVNFKNGTKKVIDLKAGIYTANLINSSDIKSININVDTKKHVENKAKRNYQVPYSINLNGTSTNILSNLSFSNKPWKNYKDLTRQIKSVLKHDRGISEQDLKYAKKAYYTVYFKNGGKRILQLNSKNYTANLVHAKDVKRIEITVKTGPKAKADRYVPYTIAVNGTSTPILSKLKFSGDPRVGYSDITKKVKSVLKYDRGISDRELKFAKKATYTLHFKNGKKQVVNLNSNIFTPNLFSAKDIKKIDINVKQHTKSKKNKSNNVKFPVTINKFENIVSNEFVFYNASKITINDLSIKLKSAMANDQGITKHDIGLAERAVYKVYFKNGSSKYVDLKTEYKDGKVFKATDIKKVDIELKF >NC_016928.1|WP_001068527.1|2029314_2030601_+|hypothetical-protein MNPLAQSLNEQLQQSNATAFAMLSDLGQNMFYPKGILSQSAEAKSTTYNATIGMATNKDGKMFASSLDAMFNDLTPDEIFPYAPPQGIEELRDLWQQKMLRDNPELSIDNMSRPIVTNALTHGLSLVGDLFVNQDDTILLPEHNWGNYKLVFNTRNGANLQTYPIFDKDGHYTTDSLVEALQSYNKDKVIMILNYPNNPTGYTPTHEEVTTIVNAIKALADKGTKVIAVVDDAYYGLFYEDVYTQSLFTALSNLNSNAILPVRLDGATKEFFAWGFRVGFMTFGTSDQTTKEVLEAKVKGLIRSNISSGPLPTQSAVKHVLKNNKQFDKEIEQNIQTLKERYEVTKEVVYADQYHSHWQAYDFNSGYFMAIKVHDVDPEELRKHLIEKYSIGVIALNATDIRIAFSCVEKEDIPHVFDSIAKAIDDLR >NC_016928.1|WP_000990056.1|2029016_2029115_-|hypothetical-protein MMWWQEGMMTLITGGLLIIFRLWLELKWKNKK >NC_016928.1|WP_000681969.1|2028598_2028775_-|hypothetical-protein MKHLTKIFVVLAIILFIVGYYLQATNHESQGIKLLLAAIMFMICAFISRSNDRRKNNK >NC_016928.1|WP_000691584.1|2027678_2028059_-|GntR-family-transcriptional-regulator MKIILKNNSDFPIYEQIKQQVKQNILKGHVAPGEHLPSMRELAKDLQVSLITTKRAYEDLEKDGFVTTIRGKGTFVKEQDSSILKEKQFFTIENLVKELVNEAQAIEMSLEELQDILTFIYEEESS >NC_016928.1|WP_000991298.1|2026785_2027682_-|phenol-soluble-modulin-export-ABC-transporter-ATP-binding-protein-PmtA MNAIELSNVNYSSDQFNLKNISFKVPQGFVTGFIGRNGAGKTTIIRLIMDLYQPQTGVIRVLEEDMALNPIELKNRIGFVYAENYFNERWTTKQLEKMIAPFYRKWDHQVFEFYLEKFDLPINKSIKTFSTGMKMKLSLAVAFSHHAELYIFDEPTSGLDPLARNELLEIIQQELIDENKTIFMSTHIISDLEKIADYIIHLSDGEVILNGSKEQLLQRYQVVSGAIEDLDDELASLLIFEEHKRTGFIGLTEHAQVFKEILGHKVNITTPSIENLMVYLEKRKPKYHENIKLMEEGF >NC_016928.1|WP_001045084.1|2038681_2039989_+|TrkH-family-potassium-uptake-protein MNKVHKPLYFYLMLFFSTTIIGALLLYLPFTGKKPISFLDALFIASSAFTVTGLSPVDIGSQFNILGEIVILLLIQIGGLGIVTVTLLTLVFLNRKISMKNRFLIMVTWNIDEPGGVIKLIKHLAIYSLVTELIGMICLCLSFIPKFGIGKGLFLSLFTSVSAFNNAGFALFKNNLIDYSSDPIVIITTSILIIFGGIGHFVVIDFINCKKLSKLSLHSKLVLTTTSILIIIGAITFFLLEQFNTMQNMGLVEKIGNSFFQSVTTRTAGFNSIDIAIINKSTALMLMLLMFIGGAPLSAAGGIKITTFAVAFIFVLNYIRKENNVSVFNKEISDKHIKLSIVTINISFLFISIITFILSIINPNISLIKLLFEVVSAFGTVGLSMNLTTEYHGITKIIIIFVMLCGKVGLLTLLRTFIPPKSPKNYRYTKGQIYL >NC_016928.1|WP_000240638.1|2040529_2042146_-|molecular-chaperone-GroEL MVKQLKFSEDARQAMLRGVDQLANAVKVTIGPKGRNVVLDKEFTAPLITNDGVTIAKEIELEDPYENMGAKLVQEVANKTNEIAGDGTTTATVLAQAMIQEGLKNVTSGANPVGLRQGIDKAVKVAVEALHENSQKVENKNEIAQVGAISAADEEIGRYISEAMEKVGNDGVITIEESNGLNTELEVVEGMQFDRGYQSPYMVTDSDKMVAELERPYILVTDKKISSFQDILPLLEQVVQSNRPILIVADEVEGDALTNIVLNRMRGTFTAVAVKAPGFGDRRKAMLEDLAILTGAQVITDDLGLDLKDASIDMLGTASKVEVTKDNTTVVDGDGDENSIDARVSQLKSQIEETESDFDREKLQERLAKLAGGVAVIKVGAASETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTALVNIYQKVSEIEAEGDIETGVNIVLKALTAPVRQIAENAGLEGSVIVERLKNAEPGVGFNAATNEWVNMLEAGIVDPTKVTRSALQHAASVAAMFLTTEAVVASIPEKNNDQPNMGGMPGMM >NC_016928.1|WP_000917289.1|2042221_2042506_-|co-chaperone-GroES MLKPIGNRVIIEKKEQEQTTKSGIVLTDSAKEKSNEGVIVAVGTGRLLNDGTRVTPEVKEGDRVVFQQYAGTEVKRDNETYLVLNEEDILAVIE >NC_016928.1|WP_000197629.1|2042680_2043424_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MTRLWASLLTVIIYILSQFLPLLIVKKLPFVQYSGIELTKAVIYIQLVLFLIAATTIILINLKIKNPTKLELEVKEHKKYIIPWALLGFALVMIYQMVVSIVYTQIFGTQQTSPNTERLIVIARKIPLFIFFVSIVGPLLEEYVFRKVIFGELFNAIKGNRIVAFAIATTVSSLIFALAHNDYKFIPIYFGMGVIFSLAYVWTKRLAVPIIIHMLQNGFVVIFQLLNPEALKKATEQANFIYHIFIP >NC_016928.1|WP_000120338.1|2043448_2044648_-|hypothetical-protein MSYHWFTKMLLSTSILILSSSSLGLATDTVEAKDNLNGEKPTTNLNHNVTSPSVNSEINNNETGTPPESNQTGNEGTDSNSRDANPDSNNVKPDSNNQNPSPDSKPDPNNPNPVPNPKPDPDKPKPNPEPKPDPDNPKPKPDPKPDPKPDPDNPKPKPDPKPDPDKPKPNPNPSPDPNQPGDSNHSGGSKNGGTWNPNASDGSNQGQWQPNGNQGNSQNPTGNDFVSQRFLALANGAYKYNPYILNQINKLGKDYGEVTDEDIYNIIRKQNFSGNAYLNGLQQQSNYFRFQYFNPLKSERYYRNLDEQVLALITGEIGSMPDLKKPEDKPDSKQRSFEPHEKDDFTVVKKQEDNKKSASTAYSKSWLAIVCSMMVVFSIMLFLFVKRNKKKNKNESQRR >NC_016928.1|WP_000522383.1|2044844_2045471_+|nitroreductase MGLFKKDKKAMTFDNAMEERRSIYNLKDSISISDDELESMIAHAVKHVPSSFNSQSTRIVLLLNDNNNKFWDNTKAILKEVMGENRDFEPTEQKIDNFKHSYGTILFYEDQDVVSGLQEQMPNYYDNFAIWSTQTNAMHQFAIWTALATKGIGASLQHYNPLVDEMTSNEFNIPKSWKLIAQMPFGDIREAAGEKSFNPVEDRFVIKK >NC_016928.1|WP_071665664.1|2045661_2045727_+|hypothetical-protein MVCRNWCSNFSMLGPHQLLSI >NC_016928.1|WP_000867953.1|2045831_2046617_+|carbon-nitrogen-family-hydrolase MKVQIYQLPIIFGDSSKNETQITQWFEKNMNDEVDVVVLPEMWNNGYDLEHLNEKADNNLGQSFSFIKHLAEKYKVDIVAGSVSNIRNNQIFNTAFSVNKSGQLINEYDKVHLVPMLREHEFLTAGENVAEPFQLSDGTYVTQLICYDLRFPELLRYPARSGAKIAFYVAQWPMSRLQHWHSLLKARAIENNMFVIGTNSTGFDGNTEYAGHSIVINPNGDLVGELNESADILTVDLNLNEVEQQRENIPVFKSIKLDLYK >NC_016928.1|WP_001823225.1|2047215_2047350_-|delta-lysin-family-phenol-soluble-modulin MSCLILRIFILIKEGVISMAQDIISTISDLVKWIIDTVNKFTKK >NC_016928.1|WP_001105712.1|2047585_2048155_+|histidine-kinase MNYFDNKIDQFATYLQKRNNLDHIQFLQVRLGMQVLAKNIGKLIVMYTLAYILNIFLFTLITNLTFYLIRRHAHGAHAPSSFWCYVESILLFILLPLVILNFHINPLIMIILTVISLGVISVYAPAATKKKPIPVRLIKRKKYYAIIVSLTFFIITLIIKEPFAQFIQLGIIIEAITLLPIFFIKEDLK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_016928_9 | 2286026-2286110 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_016928_9
|
1 spacers
spacers of NC_016928_9
>9.1|2286056|25|NC_016928|CRISPRCasFinder TGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_016928_9
The CRISPR arrays of NC_016928_9 >merge|NC_016928|9|2286026-2286110|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTATGCTGACTTTTGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT >NC_016928|9|8|2286026-2286110|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTATGCTGACTTT TGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCG CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT
>NC_016928.1|WP_031844964.1|2285776_2285947_+|hypothetical-protein MFRFISFGQLVVYSTTFIPKKDILQLNDMECDINVKEPLKIYYVVILKSGIEMIFS >NC_016928.1|WP_000066900.1|2285300_2285651_-|HTH-type-transcriptional-regulator-SarV MSNKVQRFIEAERELSQLKHWLKTTHKISIEEFVVLFKVYEAEKISGKELRDTLHFEMLWDTSKIDVIIRKIYKKELISKLRSETDERQVFYFYSTSQKKLLDKITKEIEVLSVTN >NC_016928.1|WP_000184418.1|2283987_2285199_+|MFS-transporter MTNQGSLNKSPIFTKSFTINFFVNFIVYLCMYLLLVVIAGYSKQAFDASDSLAGLVVGLFIVGSLIGRFATGKFVNQIGPKRLLFIGLIALIITQLLYFIDRSLAFLIFVRLINGIATAVVTTATGTIAAYVTPVNRKSEGISLFSLSLVLGTAIGPFLGMLLITKYAINLLFIICVILGILGLIISLFIKVDFEVTNNKTETNVIDKPRFSIHQFIAKEAIPVAVIMLLIGVTYASILTYLQAFALERHLVTAASYFFICYAIASLITRPIAGRLMDDKNENIIVYPAFIMLFLSFVCLISSYQSWLILLAGACLGLGYGNLSSAMQSIAIKVSPPIKYGIATSTFYVGLDAGVGFGPSFLGLFTHMFSYSEIFGFMAALAIITMLVYFLIHGRHVTRNAMN >NC_016928.1|WP_000951066.1|2283554_2283995_+|MarR-family-transcriptional-regulator MLSQEFFNSFITIYRPYLKLAEPILEKHNIYYGQWLILRDIAKYQPTTLIEISHRRAIEKPTARKTLKALIENDLITVENSLEDKRQKFLTLTPKGHELYEIVCLDVQKLQQAVVAKTNISQDQMQETINVMNQIHEILLKEAHND >NC_016928.1|WP_000600972.1|2282627_2283392_-|VOC-family-protein MILKFDHIIHYIDQLDRFSFPGDVIKLHSGGYHHKYGTFNKLGYINENYIELLDVENNEKLKKMAKTIEGGVAFATQIVQEKYEQGFKNICLRTNDIETVKNKLQSEQVEVVGPIQMERDTHKDGKAKWQLLYIMNQDDDEIKPPFFIQWEESDSMRTKKLQKYFQKQFSIETVIVKSKNRSQTVSNWLKWFDMDIVEENDHYTDLILKNDDIYFRIEDGKVSKYHSVIIKDAQATSPYSIFIRGAIYRFEPLV >NC_016928.1|WP_031844963.1|2282384_2282636_+|hypothetical-protein MRTIILSLFIIMNIVAIIMTLSQPLTVNYFSLRVILIFFTFILSIFFILIKSSRLNNTLTILSIVLAIIHMGILAHSTYVYLY >NC_016928.1|WP_000413855.1|2280730_2281996_-|lipid-II:glycine-glycyltransferase MEKMHITNQEHDAFVKSHPNGDLLQLTKWAETKKLTGWYARRIAVGRDGEIQGVAQLLFKKVPKLPYTLCYISRGFVVDYSNKEALNALLDSAKEIAKAEKAYAIKIDPDVEVDKGTDALQNLKALGFKHKGFKEGLSKDYIQPRMTMITPIDKNDDELLNSFERRNRSKVRLALKRGTTVERSDREGLKTFAELMKITGERDGFLTRDISYFENIYDALHEDGDAELFLVKLDPKENIAKVNQELNELHAEIAKWQQKMETSEKQAKKAQNMINDAQNKIAKNEDLKRDLEALEKEHPEGIYLSGALLMFAGSKSYYLYGASSNEFRDFLPNHHMQYTMMKYAREHGATTYDFGGTDNDPDKDSEHYGLWAFKKVWGTYLSEKIGEFDYVLNQPLYQLIEQVKPRLTKAKIKISRKLKRK >NC_016928.1|WP_000592328.1|2277446_2280614_-|AcrB/AcrD/AcrF-family-protein 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>NC_016928.1|WP_001161085.1|2276942_2277260_+|hypothetical-protein MQFYLILLAILYLIVSFISIFKMEVVFTRILRIIMGVLLLFVLALTTMSFPKENWWVFIVLLLLVGNVEVTGFKMLKKDLKGVNILNLMSLFIFVIYFILTIVLF >NC_016928.1|WP_000051210.1|2276533_2276698_+|hypothetical-protein MSLENQLAELKYDYVRLQGDLEKRESLNLDTSALVRQLKDIENEIRNVRAQMQD >NC_016928.1|WP_001824308.1|2286287_2287310_-|GTP-3',8-cyclase-MoaA MVEQIKDKLGRPIRDLRLSVTDRCNFRCDYCMPKEVFGDDFVFLPKNELLTFDEMARIAKVYAELGVKKIRITGGEPLMRRDLNVLIAKLNQIDGIEDIGLTTNGLLLKKHGQKLYDAGLRRINVSLDAIDDTLFQSINNRNIKATTILEQIDYATSIGLNVKVNVVIQKGINDDQIIPMLEYFKDKHIEIRFIEFMDVGNDNGWDFSKVVTKDEMLTMIEEHFEIDPVEPKYFGEVAKYYRHKDNGVQFGLITSVSQSFCSTCTRARLSSDGKFYGCLFATVDGFNVKAFIRSGVTDEELKEQFKALWQIRDDRYSDERTAQTVANRQRKKINMNYIGG >NC_016928.1|WP_000643988.1|2287329_2287929_-|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase MKAIILAGGHSVRFGKPKAFAEVNGETFYSRVIKTLESTNMFNEIIISTNAQLATQFKYPNVVIDDENHNDKGPLAGIYTIMKQHPEEELFFVVSVDTPMITGKAVSTLYQFLVSHLIENHLDVAAFKEDGRFIPTIAFYSPNALGAITKALHSDNYSFKNVYHELSTDYLDVRDVDAPSYWYKNINYQHDLDALIQKL >NC_016928.1|WP_000866974.1|2287935_2288169_-|molybdopterin-converting-factor-subunit-1 MKVLYFAEIKDILQKAQEDIVLEQGLTVQQFEDLLFERYPQINNKKFQVAVNEEFVQKSDFIQPNDTVALIPPVSGG >NC_016928.1|WP_000808500.1|2288174_2288621_-|molybdopterin-synthase-catalytic-subunit MKQFEIVTEPIQTEQYREFTINEYQGAVVVFTGHVREWTKGVKTEYLEYEAYIPMAEKKLAQIGDEINEKWPGTITSIVHRIGPLQISDIAVLIAVSSPHRKDAYRANEYAIERIKEIVPIWKKEIWEDGSKWQGHQKGNYEEAKREE >NC_016928.1|WP_000602934.1|2288634_2289120_-|molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-protein-B MILQIVGYKKSGKTTLMRHIVSFLKSHGYTVATIKHHGHGKEDIQLQDSDVDHMKHFEAGADQSIVQGFQYQQTVTRVDNQNLTQIIEKSVTIDTNIVLVEGFKNADFEKVVVYRDEEELQVLQQLSNVCYSINVREHEDFTAFEQWLLNKIKNDCDTQLT >NC_016928.1|WP_000259720.1|2289116_2290376_-|molybdopterin-molybdenumtransferase-MoeA MVVEKRNPIPVKEAIQRIVNQQSSMPAITVALEKSLNHILAEDIVATYDIPRFDKSPYDGFAIRSVDSQGASGQNRIEFKVIDHIGAGSVSDKLVGDHEAVRIMTGAQIPNGADAVVMFEQTIELEDTFTIRKPFSKNENISLKGEETKTGDVVLKKGQVINPGAIAVLATYGYAEVKVIKQPSVAVIATGSELLDVNDVLEDGKIRNSNGPMIRALAEKLGLEVGIYKTQQDDLDSGIQVVKEAMEKHDIVITTGGVSVGDFDYLPEIYKTVKAKVLFNKVAMRPGSVTTVAFADGKYLFGLSGNPSACFTGFELFVKPAVKHMCGALEVFPQIIKATLMEDFTKANPFTRFIRAKATLTSAGATVVPSGFNKSGAVVAIAHANCMVMLPGGSRGFKAGHTVDIILTESDAAEEELLL >NC_016928.1|WP_000134534.1|2290438_2290933_+|cyclic-pyranopterin-monophosphate-synthase-MoaC MTEFTHINQQGHAKMVDVSDKQITKRTAVAHSSITVNETIYKQISNNTNTKGNVLNTAQIAGIMAAKNTSTIIPMCHPLPLTGIDVHFSWDETNAPLYTLNIQTTVSTTGKTGVEMEALTAASATALTIYDMTKAVDKGMIIGETYLESKSGGKSGDFQRQSGQ >NC_016928.1|WP_000503820.1|2290934_2291441_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein MGEHQNVKLNRTVKAAVLTVSDTRDFDTDKGGQCVRQLLQADDVEVSDAHYTIVKDEKVAITTQVKKWLEEDIDVIITTGGTGIAQRDVTIEAVKPLLTKEIEGFGELFRYLSYVEDVGTRALLSRAVAGTVNNKLIFSIPGSTGAVKLALEKLIKPELNHLIHELTK >NC_016928.1|WP_000076924.1|2291471_2292476_-|molybdopterin-biosynthesis-protein-MoeB MSQERYSRQILFKQIGEIGQSKINQKCALIIGMGALGTHVAEGLVRAGIAKLIIVDRDYIEFSNLQRQTLFTEEDALKMMPKVVAAKKHLLALRSDVDIDDYIAHVDYYFLETHGQDVDVIIDATDNFETRQLINDFAYKHRIPWIYGGVVQSTYTEAAFIPGKTPCFNCLVPQLPALNLTCDTVGVIQPAVTMATSLQLRDAMKVLTEQPIDTKITYGDIWEGSHYSFGFSKMQRSACTTCGDIPSYPYLNKNEQRYATLCGRDTVQYENASITHDILVQFLKQHQLNYRSNSYMVMFEFKGHRIVAFKGGRFLIHGMTRTSDATHLMNLLFG >NC_016928.1|WP_000913006.1|2292644_2293250_-|molybdenum-ABC-transporter-ATP-binding-protein MLKINLKYQLKNTLIRINIDDTEPKIYAVRGPSGIGKTTVLNMIAGLRKADEAIIEVNGQLLTDTAKNVNVKIQQRRIGYLFQDYQLFPNMTVYKNITFMAEPSEHIDQLIQTLNIDHLMKQYPMTLSGGEAQRVALARALSTKPDLILLDEPFSSLDDTTKDESITLVKRIFNEWQIPIIFVTHSNYEAEQMAHEIITIG |
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NC_016928_10 | 2440586-2440678 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_016928_10
|
1 spacers
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>10.1|2440611|43|NC_016928|CRISPRCasFinder GCTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCTACTACGTTCCTTTGTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_016928_10
The CRISPR arrays of NC_016928_10 >merge|NC_016928|10|2440586-2440678|CRISPRCasFinder TTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGGCTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCTACTACGTTCCTTTGTCTTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAG >NC_016928|10|9|2440586-2440678|CRISPRCasFinder TTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAG GCTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCTACTACGTTCCTTTGTC TTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAG
>NC_016928.1|WP_000019124.1|2439509_2440376_-|cation-transporter MSHNENLKLAQRGAYLSLIVYIILSIVKYVTGFVFNSAAVRADALNNMTDIIVSLAVIIGLKISIKPADRNHPYGHLKSENISSLLVSFVIMFVGIQVVIQNAPRLFKEDDVVPNAITIIVSLISGLIMLIVFAVNQSLAKRTKSSSLNSAAKDNLSDSLVSIGTAIGLIFTQIGFPIVDIILATLLGLLIVYTGFGIFKEAIFMLSDGFNETELEAYRNDILEVDEVQKVKSIKGRYHGSSVFIDVTIVVDANLSLVEAHQICDNVEHHLHKKGISSVYVHPEPDHL >NC_016928.1|WP_001125208.1|2438497_2439184_-|2,3-bisphosphoglycerate-dependent-phosphoglycerate-mutase MPKLILCRHGQSEWNAKNLFTGWEDVNLSEQGINEATRAGEKVRENNIAIDVAFTSLLTRALDTTHYILTESKQQWIPVYKSWRLNERHYGGLQGLNKDDARKEFGEEQVHIWRRSYDVKPPAETEEQREAYLADRRYNHLDKRMMPYSESLKDTLVRVIPFWTDHISQYLLDGQTVLVSAHGNSIRALIKYLEDVSDEDIINYEIKTGAPLVYELTDDLEVIDKYYL >NC_016928.1|WP_000762708.1|2438239_2438344_+|hypothetical-protein MKLDLQTARRNLNSPNIKTRKRALKIIKQHKRAK >NC_016928.1|WP_031845057.1|2437995_2438115_-|hypothetical-protein MSKNECRFLDGEGEALNVEETKINDDYYYADGWIFWIIK >NC_016928.1|WP_078065183.1|2436626_2438030_-|MFS-transporter MLMGGFFGLLNETLLVTALPSIMKDFEISYTQVQWLTTAFLLTNGIVIPLSALVIQRYTTRQVFLVGISIFFLGTLLGGLSPHFATLLVARIIQALGAGIMMPLMMTTILDVFQPHERGKYMGIFGLVIGLAPAIGPTLSGYLVEYFNWRSLFHVVAPIAAVTFLIGFKTIKNVGTTIKVPIDFISVIFSVLGFGGLLYGTSSISEKGFDNPIVLVSMIGGIVLVALFVLRQYRLSTPLLNFAVFKNKQFTVGIIIMGVTMVSMIGSETILPIFVQNLLHRSALDSGLTLLPGAIVMAFMSMTSGALYEKFGPRKLALVGMAIVVITTAYFVVMDEQTSTIMLATVYAIRMVGIALGLIPVMTHTMNQLKPEMNAHGSSMTNTVQQIAGSIGTAALITILAHASKNFSPTMSDYNGMNKIDMMNQIKVDTMLHGYHAGFLFALLITVVSFFCSFMLQGKKKEVDSRQ >NC_016928.1|WP_000825921.1|2435726_2436506_-|amino-acid-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKRLLFVMIAFVFILAACGNNSSKDKEANKDSKTINVGTEGTYAPFSFHDKDGKLTGYDIDVIKAVAKEEGLKLKFNETSWDSMFAGLDAGRFDVIANQVGINPDREKKYKFSKPYTFSSAVLVIRENEKDIKDFDDVKGKKLAQTFTSNYGKLAKDKGADITKVDGFNQSMDLLLSKRVDGTFNDSLSYLDYKKQKPNAKIKAIKGNAEQSRSAFAFSKKADDETVQKFNDGLKKIEENGELAKIGKKWFGQDVSKSK >NC_016928.1|WP_000479576.1|2435026_2435746_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MFLNLNSEQQHALDAAKQAFGPMLEGLVKYSIPITLVTFVLGLIIALFTALMRISTSKILRSISRVYVSIIRGTPMIVQLFIIFYGIPELGRLLTNDADNQWTLAPVVAAIIGLSLNVGAYASEIIRGGIISIPKGQTEAAYSIGMTYGQTIQRIILPQAIRVSIPALGNTFLSLIKDTSLLGFILVAEMFRKAQEVASTTYEYLTIYVLVALMYWVVCFIISIIQGIYESYIERGYRS >NC_016928.1|WP_000615464.1|2434298_2435030_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIQLNNIHKSFNDVEVIKGIDLSVEQGEVVTLIGRSGSGKTTLLRMINALEIPTEGTVYVNGKTYTSKDKKSQIEVRKQSGMVFQSYNLFPHKTALENVMEGLITVKKLKKDEARGKSLELLEKVGLTLVKDQRPHALSGGQQQRVAIARALAMNPKVMLFDEPTSALDPELVNDVLKVIKDLANEGMTMVIVTHEMRFAKEVSNNIVFIHEGMIGEQGAPEEMFNRPKTEELRRFLNVINEE >NC_016928.1|WP_001012236.1|2432951_2434202_+|aminoacyltransferase MNFVTLTSDEFNAFTTKHFSHYTQSAIHYNHRVDLKGDVHLVGVKDDNGQVIAGCLLTEARTLKFFKYFYTHRGPVMDYTNQSLVAFFFKALTSYLKKQNCLYVLVDPYLIENLRNADGEIVKSYDNRAFVRTMDTLGYKHQGFPVGYDSMSQIRWLSVLDLKDKTEDQLLKEMDYQTRRNIKKTYDIGVKTKTLTIDETQTFFDLFHMAEEKHGFKFRELPYFEEMQKLYDDHAMLKLAYIDLNEYLKTLQLKQQQLTAELSGVEEALEENPNSKKNKTKRTQLEQQLNSNKRKIDNTIEQIEQDGAVLNLASALFIYNEHEVYYLSSGSNPKYNAYMGAYHLQWEMIKFAKAHHIDRYNFYGITGDFSESSEDYGVQQFKKGFNAHVEEYIGDFIKPIKPLLYKVQTYLNHKRR >NC_016928.1|WP_000819839.1|2432334_2432697_-|cystatin-like-fold-lipoprotein MKRFVAMVLLLLVFISGCGNDKYVKEIDEAVKIQNQKQEQLAKKGNGDRVDHFERKDANIYVYDKDKIIILAYKPLSNDDEVHYYAYDFSDKRVSYKQDFDSRRYYQQHDADYHEENMTN >NC_016928.1|WP_014532694.1|2440882_2440978_-|hypothetical-protein MLTNRLTSVNYVKKRLIQNIQRILSKEVLYG >NC_016928.1|WP_000792557.1|2441072_2442383_+|hypothetical-protein MKNKYISKLLVGAATITLATMISNGEAKASENTQQTSTKHQTTQNNYVTDQQKAFYQVLHLKGITEEQRNQYIKTLREHPERAQEVFSESLKDSKNPDRRVAQQNAFYNVLKNDNLTEQEKNNYIAQIKENPDRSQQVWVESVQSSKAKERQNIENADKAIKDFQDNKAPHDKSAAYEANSKLPKDLRDKNNRFVEKVSIEKAIVRHDERVKSANDAISKLNEKDSIENRRLAQREVNKAPMDVKEHLQKQLDALVAQKDAEKKVAPKVEAPQIQSPQIEKPKAESPKVEVPQIQSPKVEVPQSKLLGYYQSLKDSFNYGYKYLTDTYKSYKEKYDTAKYYTDKYFKYKGTIDKTVLSVFGNGYKSYIQPLKVEDQKNYVSKSYAQVRNYVTETLNTGKVLYAFYQNPNVVKAAITTAETAASIKNIFSSFTSFFK >NC_016928.1|WP_071665646.1|2442556_2442739_-|hypothetical-protein MMFLHYVMFKRFIGRRRLYSYITMFCKSYSIKLSFNYGACSGRGIDCAIVCENLKLIKLR >NC_016928.1|WP_000594519.1|2442873_2443803_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB-subunit-A MIKNKILTATLAVGLIAPLANPFIEISKAENKIEDIGQGAEIIKRTQDITSKRLAITQNIQFDFVKDKKYNKDALVVKMQGFISSRTTYSDLKKYPYIKRMIWPFQYNISLKTKDSNVDLINYLPKNKIDSADVSQKLGYNIGGNFQSAPSIGGSGSFNYSKTISYNQKNYVTEVESQNSKGVKWGVKANSFVTPNGQVSAYDQYLFAQDPTGPAARDYFVPDNQLPPLIQSGFNPSFITTLSHERGKGDKSEFEITYGRNMDATYAYVTRHRLAVDRKHDAFKNRNVTVKYEVNWKTHEVKIKSITPK >NC_016928.1|WP_000916705.1|2444370_2445318_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgCB-subunit-C MLKNKILATTLSVSLLAPLANPLLENAKAANDTEDIGKGSDIEIIKRTEDKTSNKWGVTQNIQFDFVKDKKYNKDALILKMQGFISSRTTYYNYKNTNHIKSMRWPFQYNIGLKTNDKYVSLINYLPKNKIESTNVSQTLGYNIGGNFQSAPSLGGNGSFNYSKSISYTQQNYVSEVEQQNSKSVLWGVKANSFATESGQKSAFDSDLFVGYKPHSKDPRDYFVPDSDLPPLVQSGFNPSFIATVSHEKGSSDTSEFEITYGRNMDVTHAIKRSTHYGNSYLDGHRIHNAFVNRNYTVKYEVNWKTHEIKVKGQN >NC_016928.1|WP_000783428.1|2445319_2446297_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB/HlgCB-subunit-B MKMNKLVKSSVATSMALLLLSGTANAEGKITPVSVKKVDDKVTLYKTTATADSDKFKISQILTFNFIKDKSYDKDTLVLKATGNINSGFVKPNPNDYDFSKLYWGAKYNVSISSQSNDSVNVVDYAPKNQNEEFQVQNTLGYTFGGDISISNGLSGGLNGNTAFSETINYKQESYRTTLSRNTNYKNVGWGVEAHKIMNNGWGPYGRDSFHPTYGNELFLAGRQSSAYAGQNFIAQHQMPLLSRSNFNPEFLSVLSHRQDGAKKSKITVTYQREMDLYQIRWNGFYWAGANYKNFKTRTFKSTYEIDWENHKVKLLDTKETENNK >NC_016928.1|WP_000200957.1|2446348_2446816_-|hypothetical-protein MTSKDITQISVIAAILTILAVLKIPSIIPGLDFQLSAPVALLILAFFGIKKYFLGGLLSSVLLLIFGVFNPINVIISIIFRVIAIAVVYLLKINVLSLILASVLGSLISRLLLSIILNLPVWVVLLNAIPGVIFTLIVAIPLYLTLRKRMAVLLR >NC_016928.1|WP_000286874.1|2446826_2447519_-|6-carboxyhexanoate--CoA-ligase MYSIKMRSSNQDVHISGAETICEFDKIEQTVQRFYNKGFFHENGQPDFLNIKIQKIMEPIQQIKALQIIEDDKANLQHLTQECGVTEQALNQGMTYIKNETVYTGAIILSAISGKRLDSFGQRGIRATHFSFEDINNKGDLNERVTDALAIASCINAHPYIKGELCVSDDLTYTTGYFASAKIGYHRLFDIKPVNTRYGGRIIFVDDRIDLNHYISFLESTPKQVVYETV >NC_016928.1|WP_000971541.1|2447529_2448645_-|aminotransferase-class-V-fold-PLP-dependent-enzyme MMFQEQIDLLQQKGLYRSLKSVGYIDRQYIEVENKRCTNYTSNDYLGLGQIAFDKDDFERFMRKYSYHLSSSRLISGSSTAYEEIETMLAGWLGYSACTILNSGYDANLALFNIFKNTNCVVFSDQENHASIIDGIKLSGLEKVIYKHLDIADLEKRLAECPNQNIQKIIISDSVFSTNGDVVDIGQLVSLKHKYNATLILDVSHSFGIENYSNYQGVDILTSSLSKACGAYGGVILSSNDVKDMLINHGRPLIYSSSLPIYNLYFIKRNIEKLINADDRRTKLNSLSKYFNQKLKALNVNYNSSNSPIKFIEFDDIEAAENIHQTLLKHHVFTSYLRYPTVTKPMLRISLSYFHTEQDVDRLFEILHQED >NC_016928.1|WP_001046638.1|2448622_2449630_-|biotin-synthase-BioB 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_016928_11 | 2782384-2782469 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_016928_11
|
1 spacers
spacers of NC_016928_11
>11.1|2782414|26|NC_016928|CRISPRCasFinder CCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_016928_11
The CRISPR arrays of NC_016928_11 >merge|NC_016928|11|2782384-2782469|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT >NC_016928|11|10|2782384-2782469|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT CCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCG CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT
>NC_016928.1|WP_000491384.1|2781806_2782160_-|DUF3147-domain-containing-protein MFSIGSAILHFVIGGIAVALASIIADKVGGKLGGIIATMPAVFLAAIIALALDHRGTQLVEMSMNLSTGAIVGILSCILTVFLTSLYINHKGYRKGAIFTVVCWFVISLAIFSIRHL >NC_016928.1|WP_000779135.1|2781343_2781739_-|DUF3147-domain-containing-protein MKLTLMKFFVGGFAVLLSYIVSVTLPWKEFGGIFATFPAVFLVSMFITGMQYGDKVAVHVSRGAVFGMTGVLVCILVTWMMLHMTHMWLISIIVGLLSWFISAVCIFEAVEFIAQKRLEKHSWKAGKTNSK >NC_016928.1|WP_001054123.1|2780523_2781093_-|XRE-family-transcriptional-regulator MNLSKQIKKYRERDGYSQEYLAEKLYVSRQSISNWENDKSLPDIHNLLMMCELFNVTLDDLVKGTIPFVPDIKVQRSLNLWAYVMIIFMTLAAILTGPLIVYWNWAWGITVMVIYGIGYYASMKIEDFKKVHKMDNYDRIVAFMNGKDPSEVQTTKARNIKTSVLSFIAFVGAIILVALISMYLANKFL >NC_016928.1|WP_001059079.1|2780196_2780397_+|cold-shock-protein MNNGTVKWFNAEKGFGFIEQENGGDVFVHFSGIASDGYKTLEEGQKVTFEITEGQRGDQAVNVQTV >NC_016928.1|WP_000672036.1|2779613_2779805_+|hypothetical-protein MKFRELVKQSYEDLKNLTVTWYNVIALAMIVIVLSVVTTPIIGIPVGLLGGAYYLKRREEKGK >NC_016928.1|WP_000586238.1|2778659_2779157_-|hypothetical-protein MIINLETQQIHFDLEHETPYFQSPEKNRIRLDIDVLNKKQISNIINVIFNNQSKTKCTFLSEYLYPVKFREKTRIGRFFNITNWYEEIHSTDEKYVIATIKNIKNKDLIDYSLYIKKGLVEPFIVFYNQENIFYISNTVIDIISVSKDTLGYIKSEFNDHCASPY >NC_016928.1|WP_000672028.1|2777861_2778053_+|hypothetical-protein MKFRELVKQSYEDLKNLTVTWYNVIALAMIVIVLSSVTTPIIGIPAGLLGGAYYLKRREEKGK >NC_016928.1|WP_000143679.1|2775888_2777769_+|ABC-transporter-permease MTFNHIVLKNLRQNLKHYAMYLFSLFFSIVLYFSFTTLQFTKGVNNDDSMAIIKKGALVGSIFLFIIIVIFLMYANHLFVKRRTREFALFQLIGLTRQNILKMLALEQMIVFLITGVVGVLCGIAGAQLLLSIVSKLMSLSINLSIHFEPMALVLTILMLIIAYILILFQSSLFLKRRSILSMMKDSIKTDVTTAKVTTAEVISGVLGIAMIALGYYMATEMFGTFKALTMAMTSPFIILFLTVVGAYLFFRSSVSLIFKTLKKSKNGRVSITDVVFTSSIMYRMKKNAMSLTIIAIISAVTVTVLCFAALSKSNTDQTLISMAPNEFNVVASQDAQQFESKLSQQHITFTKNYYETITVNNVKDQVITLENGSDSGRTNSILSANTKLTGNNAIITNTKSLPNIINIHLNKDLVVKGTKNETFRVTQEDKGKVYPLNLSFNSPVVEVSPEKYQQLKTQNNVHTFYGYDIKQTSQKEKAQAIAKQFGDKVITYDDMKKEVDATNGILIFVTSFLGLAFLVAAGCIIYIKQMDETEDELSNFRILKRIGFTHTDMLKGLLLKITFNFGLPLLIAILHAVFAAIAFMKLMGNISFMPVIIVIIVYTLIYIVFALIAFVHSNKLIKKTI >NC_016928.1|WP_000154165.1|2775140_2775899_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MTILSVQHVSKTYGKKHTFQALKDINFDIQKGEFVAIMGPSGSGKTTLLNVLSSIDQISSGSVIANGQELNKLNQKALAKFRKESLGFIFQDYSILPTLTVKENIMLPLSVQKMSKATMEENYKAITTALGIYDLGNKYTSELSGGQQQRTAAARAFVHKPQIIFADEPTGALDSKSANDLLQRLEEMNKSFDTTIVMVTHDPVAASFAERVIMLKDGQIHTQLYQEGRSKQAFYEDIVHLQSVLGGVSNDI >NC_016928.1|WP_000410770.1|2774338_2774851_-|membrane-protein MEKGNQGIKWSSLIMGVLLLMLAVVIFTFPIENFYAITWLIGLFVLINGVIQIVYRRKAKALVGGNQNWILFMGIVDILFGLIVIFNVGASSAFFIYMFAFWFIFSSIAGLFTFSGSGSLKLISVIFNLLGIVFGVILLFNPLMGIVFISTMIAIAFVFVGVIYVVDALA >NC_016928.1|WP_078061161.1|2782481_2782559_+|hypothetical-protein MLGPSPQLALPVEFLFEILCVGAPD >NC_016928.1|WP_000742837.1|2782769_2783609_-|nucleoid-occlusion-protein MKKPFSKLFGLKNKDDIIGHIEEDRNSNVESIQIERIVPNRYQPRQVFEPNKIKELAESIHEHGLLQPIVVRPIEEDMFEIIAGERRFRAIQSLNLPQADVIIRDMDDEETAVVALIENIQRENLSVVEEAEAYKKLLEIGDTTQSELAKSLGKSQSFIANKLRLLKLAPKVLLRLREGKITERHARAVLSLSDSEQEALIEQVIAQKLNVKQTEDRVRQKTGPEKVKAQNLRFAQDVTQARDEVGKSIQAIQQTGLHVEHKDKDHEDYYEIKIRIYKR >NC_016928.1|WP_000215588.1|2783651_2784371_-|16S-rRNA-(guanine(527)-N(7))-methyltransferase-RsmG MTVEWLAEQLKEHNIELTETQKQQFQTYYRLLVEWNEKMNLTSITDEHDVYLKHFYDSIAPSFYFDFNQPISICDVGAGAGFPSIPLKIMFPQLKVTIVDSLNKRIQFLNHLASELQLQDVSFIHDRAETFGKGVYRESYDVVTARAVARLSVLSELCLPLVKKGGQFVALKSSKGEEELEEAKFAISVLGGNVTETHTFELPEDAGERQMFIIDKKRQTPKKYPRKPGTPNKTPLLEK >NC_016928.1|WP_000249657.1|2784370_2786248_-|tRNA-uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34)-synthesis-enzyme-MnmG MVQEYDVIVIGAGHAGVEAGLASARRGAKTLMLTINLDNIAFMPCNPSVGGPAKGIVVREIDALGGQMAKTIDKTHIQMRMLNTGKGPAVRALRAQADKVLYQQEMKRVIEDEENLHIMQGMVDELIIEDNEVKGVRTNIGTEYLSKAVIITTGTFLRGEIILGNMKYSSGPNHQLPSITLSDNLRELGFDIVRFKTGTPPRVNSKTIDYSKTEIQPGDDVGRAFSFETTEYILDQLPCWLTYTNAETHKVIDDNLHLSAMYSGMIKGTGPRYCPSIEDKFVRFNDKPRHQLFLEPEGRNTNEVYVQGLSTSLPEHVQRQMLETIPGLEKADMMRAGYAIEYDAIVPTQLWPTLETKMIKNLYTAGQINGTSGYEEAAGQGLMAGINAAGKVLNTGEKILSRSDAYIGVLIDDLVTKGTNEPYRLLTSRAEYRLLLRHDNADLRLTDMGYELGMISEERYARFNEKRQQIDAEIKRLSDIRIKPNEHTQAIIEQHGGSRLKDGILAIDLLRRPEMTYDIILEILEEEHQLNADVEEQVEIQTKYEGYINKSLQQVEKVKRMEEKKIPEDLDYSKIDSLATEAREKLSEVKPLNIAQASRISGVNPADISILLIYLEQGKLQRVSD >NC_016928.1|WP_000362507.1|2786314_2787694_-|tRNA-uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34)-synthesis-GTPase-MnmE MDLDTITSISTPMGEGAIGIVRLSGPQAVEIADKLYKGKHLLNDVPSHTINYGHIIDPESKEVVEEVMVSVLRAPKTFTREDIIEINCHGGILTINRVLELTMTYGARMAEPGEFTKRAFLNGRIDLSQAEAVMDFIRSKTDRASKVAMNQIEGRLSDLIKKQRQSILEILAQVEVNIDYPEYDDVEDATTEFLLEQSKEIKQEINHLLDTGAQGKIMREGLSTVIVGKPNVGKSSMLNNLIQDNKAIVTEVAGTTRDVLEEYVNVRGVPLRLVDTAGIRETEDIVEKIGVERSRKALSQADLILFVLNNNEALTQEDYTLYEVVKNEDVIVIVNKMDLEQNIDINEVKDMIGDTPLIQTSMLKQEGIDELEIQIRDLFFGGEVQNQDMTYVSNSRHISLLKQARQTIQDAIDAAESGVPMDMVQIDLTRTWEILGEIIGETASDELIDQLFSQFCLGK >NC_016928.1|WP_001789343.1|2787837_2788191_-|ribonuclease-P-protein-component MLLEKAYRIKKNADFQRIYKKGHSVANRQFVVYTCNNKEIDHFRLGISVSKKLGNAVLRNKIKRAIRENFKVHKSHILAKDIIVIARQPAKDMTTLQIQNSLEHVLKIAKVFNKKIK >NC_016928.1|WP_000240855.1|2788311_2788449_-|50S-ribosomal-protein-L34 MVKRTYQPNKRKHSKVHGFRKRMSTKNGRKVLARRRRKGRKVLSA |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_016928_4 | 4.1|1149404|37|NC_016928|PILER-CR | 1149404-1149440 | 37 | NC_016928.1 | 2285969-2286005 | 0 | 1.0 |
NC_016928_11 | 11.1|2782414|26|NC_016928|CRISPRCasFinder | 2782414-2782439 | 26 | NC_016928.1 | 617062-617087 | 0 | 1.0 |
NC_016928_11 | 11.1|2782414|26|NC_016928|CRISPRCasFinder | 2782414-2782439 | 26 | NC_016928.1 | 1286670-1286695 | 0 | 1.0 |
NC_016928_2 | 2.2|946792|19|NC_016928|PILER-CR | 946792-946810 | 19 | NC_016928.1 | 825166-825184 | 1 | 0.947 |
NC_016928_2 | 2.2|946792|19|NC_016928|PILER-CR | 946792-946810 | 19 | NC_016928.1 | 1286737-1286755 | 1 | 0.947 |
NC_016928_2 | 2.2|946792|19|NC_016928|PILER-CR | 946792-946810 | 19 | NC_016928.1 | 1286795-1286813 | 1 | 0.947 |
NC_016928_2 | 2.2|946792|19|NC_016928|PILER-CR | 946792-946810 | 19 | NC_016928.1 | 1980142-1980160 | 1 | 0.947 |
NC_016928_2 | 2.2|946792|19|NC_016928|PILER-CR | 946792-946810 | 19 | NC_016928.1 | 2320328-2320346 | 1 | 0.947 |
NC_016928_4 | 4.1|1149404|37|NC_016928|PILER-CR | 1149404-1149440 | 37 | NC_016928.1 | 369262-369298 | 1 | 0.973 |
NC_016928_4 | 4.1|1149404|37|NC_016928|PILER-CR | 1149404-1149440 | 37 | NC_016928.1 | 369317-369353 | 1 | 0.973 |
NC_016928_4 | 4.1|1149404|37|NC_016928|PILER-CR | 1149404-1149440 | 37 | NC_016928.1 | 861504-861540 | 1 | 0.973 |
NC_016928_4 | 4.1|1149404|37|NC_016928|PILER-CR | 1149404-1149440 | 37 | NC_016928.1 | 881577-881613 | 1 | 0.973 |
NC_016928_4 | 4.1|1149404|37|NC_016928|PILER-CR | 1149404-1149440 | 37 | NC_016928.1 | 1786150-1786186 | 1 | 0.973 |
NC_016928_4 | 4.1|1149404|37|NC_016928|PILER-CR | 1149404-1149440 | 37 | NC_016928.1 | 1788367-1788403 | 1 | 0.973 |
NC_016928_4 | 4.1|1149404|37|NC_016928|PILER-CR | 1149404-1149440 | 37 | NC_016928.1 | 2320347-2320383 | 1 | 0.973 |
NC_016928_4 | 4.2|1149459|38|NC_016928|PILER-CR | 1149459-1149496 | 38 | NC_016928.1 | 825128-825165 | 1 | 0.974 |
NC_016928_4 | 4.2|1149459|38|NC_016928|PILER-CR | 1149459-1149496 | 38 | NC_016928.1 | 1665052-1665089 | 1 | 0.974 |
NC_016928_4 | 4.2|1149459|38|NC_016928|PILER-CR | 1149459-1149496 | 38 | NC_016928.1 | 1980104-1980141 | 1 | 0.974 |
NC_016928_4 | 4.2|1149459|38|NC_016928|PILER-CR | 1149459-1149496 | 38 | NC_016928.1 | 2782442-2782479 | 1 | 0.974 |
NC_016928_4 | 4.3|1149515|38|NC_016928|PILER-CR | 1149515-1149552 | 38 | NC_016928.1 | 779120-779157 | 1 | 0.974 |
NC_016928_4 | 4.4|1149571|40|NC_016928|PILER-CR | 1149571-1149610 | 40 | NC_016928.1 | 779120-779159 | 1 | 0.975 |
NC_016928_9 | 9.1|2286056|25|NC_016928|CRISPRCasFinder | 2286056-2286080 | 25 | NC_016928.1 | 1874396-1874420 | 1 | 0.96 |
NC_016928_9 | 9.1|2286056|25|NC_016928|CRISPRCasFinder | 2286056-2286080 | 25 | NC_016928.1 | 2286112-2286136 | 1 | 0.96 |
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NC_016928_11 | 11.1|2782414|26|NC_016928|CRISPRCasFinder | 2782414-2782439 | 26 | NC_016928.1 | 779160-779185 | 1 | 0.962 |
NC_016928_11 | 11.1|2782414|26|NC_016928|CRISPRCasFinder | 2782414-2782439 | 26 | NC_016928.1 | 825042-825067 | 1 | 0.962 |
NC_016928_11 | 11.1|2782414|26|NC_016928|CRISPRCasFinder | 2782414-2782439 | 26 | NC_016928.1 | 1845551-1845576 | 1 | 0.962 |
NC_016928_11 | 11.1|2782414|26|NC_016928|CRISPRCasFinder | 2782414-2782439 | 26 | NC_016928.1 | 2028412-2028437 | 1 | 0.962 |
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NC_016928_11 | 11.1|2782414|26|NC_016928|CRISPRCasFinder | 2782414-2782439 | 26 | NC_016928.1 | 2320386-2320411 | 1 | 0.962 |
NC_016928_1 | 1.1|769671|30|NC_016928|CRISPRCasFinder | 769671-769700 | 30 | NC_016928.1 | 810712-810741 | 2 | 0.933 |
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NC_016928_2 | 2.2|946792|19|NC_016928|PILER-CR | 946792-946810 | 19 | NC_016928.1 | 617003-617021 | 2 | 0.895 |
NC_016928_2 | 2.2|946792|19|NC_016928|PILER-CR | 946792-946810 | 19 | NC_016928.1 | 926502-926520 | 2 | 0.895 |
NC_016928_2 | 2.2|946792|19|NC_016928|PILER-CR | 946792-946810 | 19 | NC_016928.1 | 1145418-1145436 | 2 | 0.895 |
NC_016928_2 | 2.2|946792|19|NC_016928|PILER-CR | 946792-946810 | 19 | NC_016928.1 | 1361370-1361388 | 2 | 0.895 |
NC_016928_2 | 2.2|946792|19|NC_016928|PILER-CR | 946792-946810 | 19 | NC_016928.1 | 1700143-1700161 | 2 | 0.895 |
NC_016928_4 | 4.1|1149404|37|NC_016928|PILER-CR | 1149404-1149440 | 37 | NC_016928.1 | 779232-779268 | 2 | 0.946 |
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NC_016928_4 | 4.1|1149404|37|NC_016928|PILER-CR | 1149404-1149440 | 37 | NC_016928.1 | 1286758-1286794 | 2 | 0.946 |
NC_016928_4 | 4.1|1149404|37|NC_016928|PILER-CR | 1149404-1149440 | 37 | NC_016928.1 | 1286816-1286852 | 2 | 0.946 |
NC_016928_4 | 4.1|1149404|37|NC_016928|PILER-CR | 1149404-1149440 | 37 | NC_016928.1 | 1680333-1680369 | 2 | 0.946 |
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NC_016928_4 | 4.1|1149404|37|NC_016928|PILER-CR | 1149404-1149440 | 37 | NC_016928.1 | 2745431-2745467 | 2 | 0.946 |
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NC_016928_4 | 4.2|1149459|38|NC_016928|PILER-CR | 1149459-1149496 | 38 | NC_016928.1 | 1145551-1145588 | 2 | 0.947 |
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58. spacer 4.3|1149515|38|NC_016928|PILER-CR matches to position: 1149687-1149724, mismatch: 2, identity: 0.947
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59. spacer 4.3|1149515|38|NC_016928|PILER-CR matches to position: 2286083-2286120, mismatch: 2, identity: 0.947
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60. spacer 4.3|1149515|38|NC_016928|PILER-CR matches to position: 2320402-2320439, mismatch: 2, identity: 0.947
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61. spacer 4.4|1149571|40|NC_016928|PILER-CR matches to position: 183879-183918, mismatch: 2, identity: 0.95
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64. spacer 4.4|1149571|40|NC_016928|PILER-CR matches to position: 779176-779215, mismatch: 2, identity: 0.95
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65. spacer 4.4|1149571|40|NC_016928|PILER-CR matches to position: 825012-825051, mismatch: 2, identity: 0.95
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66. spacer 4.4|1149571|40|NC_016928|PILER-CR matches to position: 1149687-1149726, mismatch: 2, identity: 0.95
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67. spacer 4.4|1149571|40|NC_016928|PILER-CR matches to position: 2286081-2286120, mismatch: 2, identity: 0.95
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68. spacer 4.4|1149571|40|NC_016928|PILER-CR matches to position: 2320402-2320441, mismatch: 2, identity: 0.95
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69. spacer 11.1|2782414|26|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to position: 2124320-2124345, mismatch: 2, identity: 0.923
ccgccagcttctatgttggggccccg CRISPR spacer ccgccagcttctgtcttggggccccg Protospacer ************.* ***********
70. spacer 11.1|2782414|26|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to position: 2124658-2124683, mismatch: 2, identity: 0.923
ccgccagcttctatgttggggccccg CRISPR spacer ccgccagcttttgtgttggggccccg Protospacer **********.*.*************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_016928_1 | 1.1|769671|30|NC_016928|CRISPRCasFinder | 769671-769700 | 30 | KC139649 | Salmonella phage FSL SP-069 hypothetical proteins, RdgC exonuclease, hypothetical proteins, TerL, hypothetical proteins, deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase, hypothetical proteins, NinH, head morphogenesis protein, hypothetical proteins, capsid related protein, hypothetical proteins, enolase-like protein, hypothetical proteins, tail fiber, hypothetical protein, putative endolysin, hypothetical proteins, and DNA polymerase genes, complete cds | 9669-9698 | 9 | 0.7 |
NC_016928_1 | 1.1|769671|30|NC_016928|CRISPRCasFinder | 769671-769700 | 30 | KC139636 | Salmonella phage FSL SP-062 hypothetical proteins, RdgC exonuclease, hypothetical proteins, TerL, and hypothetical proteins genes, complete cds | 9669-9698 | 9 | 0.7 |
NC_016928_1 | 1.1|769671|30|NC_016928|CRISPRCasFinder | 769671-769700 | 30 | NC_025443 | Salmonella phage 9NA, complete genome | 7835-7864 | 9 | 0.7 |
NC_016928_7 | 7.1|1978714|32|NC_016928|CRISPRCasFinder | 1978714-1978745 | 32 | NZ_CP024776 | Bacillus thuringiensis LM1212 plasmid pLM8, complete sequence | 3826-3857 | 9 | 0.719 |
NC_016928_7 | 7.1|1978714|32|NC_016928|CRISPRCasFinder | 1978714-1978745 | 32 | NZ_CP009062 | Borreliella afzelii K78 plasmid lp28-1, complete sequence | 16532-16563 | 10 | 0.688 |
NC_016928_7 | 7.1|1978714|32|NC_016928|CRISPRCasFinder | 1978714-1978745 | 32 | NZ_CP018749 | Borreliella garinii strain CIP 103362 isolate 20047 plasmid lp28-7 | 15178-15209 | 10 | 0.688 |
NC_016928_7 | 7.1|1978714|32|NC_016928|CRISPRCasFinder | 1978714-1978745 | 32 | NZ_CP028869 | Borreliella garinii strain 20047 plasmid lp28-7, complete sequence | 11910-11941 | 10 | 0.688 |
NC_016928_7 | 7.1|1978714|32|NC_016928|CRISPRCasFinder | 1978714-1978745 | 32 | NZ_CP028878 | Borreliella bavariensis PBi plasmid lp28-7, complete sequence | 4741-4772 | 10 | 0.688 |
NC_016928_7 | 7.1|1978714|32|NC_016928|CRISPRCasFinder | 1978714-1978745 | 32 | NZ_CP028879 | Borreliella bavariensis PBi plasmid lp28-9, complete sequence | 11876-11907 | 10 | 0.688 |
NC_016928_7 | 7.1|1978714|32|NC_016928|CRISPRCasFinder | 1978714-1978745 | 32 | NZ_CP017215 | Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_lp28_6, complete sequence | 11994-12025 | 10 | 0.688 |
NC_016928_7 | 7.1|1978714|32|NC_016928|CRISPRCasFinder | 1978714-1978745 | 32 | NC_018987 | Borrelia burgdorferi 297 plasmid 297_lp28-6, complete sequence | 12713-12744 | 15 | 0.531 |
NC_016928_7 | 7.1|1978714|32|NC_016928|CRISPRCasFinder | 1978714-1978745 | 32 | NC_017412 | Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-7, complete sequence | 17252-17283 | 15 | 0.531 |
NC_016928_7 | 7.1|1978714|32|NC_016928|CRISPRCasFinder | 1978714-1978745 | 32 | NC_017419 | Borreliella burgdorferi N40 plasmid N40_lp28-2, complete sequence | 17030-17061 | 15 | 0.531 |
NC_016928_7 | 7.1|1978714|32|NC_016928|CRISPRCasFinder | 1978714-1978745 | 32 | NC_017408 | Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-6, complete sequence | 14812-14843 | 15 | 0.531 |
NC_016928_7 | 7.1|1978714|32|NC_016928|CRISPRCasFinder | 1978714-1978745 | 32 | NC_015920 | Borreliella bissettii DN127 plasmid lp56, complete sequence | 16601-16632 | 15 | 0.531 |
NC_016928_7 | 7.1|1978714|32|NC_016928|CRISPRCasFinder | 1978714-1978745 | 32 | NC_011779 | Borreliella burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp28-2, complete sequence | 16934-16965 | 15 | 0.531 |
NC_016928_7 | 7.1|1978714|32|NC_016928|CRISPRCasFinder | 1978714-1978745 | 32 | NC_001852 | Borreliella burgdorferi B31 plasmid lp28-2, complete sequence | 16891-16922 | 15 | 0.531 |
NC_016928_7 | 7.1|1978714|32|NC_016928|CRISPRCasFinder | 1978714-1978745 | 32 | NZ_CP017219 | Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_lp56, complete sequence | 14876-14907 | 15 | 0.531 |
1. spacer 1.1|769671|30|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to KC139649 (Salmonella phage FSL SP-069 hypothetical proteins, RdgC exonuclease, hypothetical proteins, TerL, hypothetical proteins, deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase, hypothetical proteins, NinH, head morphogenesis protein, hypothetical proteins, capsid related protein, hypothetical proteins, enolase-like protein, hypothetical proteins, tail fiber, hypothetical protein, putative endolysin, hypothetical proteins, and DNA polymerase genes, complete cds) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
cagagaaattggaacgccaatttctacagg CRISPR spacer agctttaattggtacgccaatttctacatc Protospacer . ****** ***************
2. spacer 1.1|769671|30|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to KC139636 (Salmonella phage FSL SP-062 hypothetical proteins, RdgC exonuclease, hypothetical proteins, TerL, and hypothetical proteins genes, complete cds) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
cagagaaattggaacgccaatttctacagg CRISPR spacer agctttaattggtacgccaatttctacatc Protospacer . ****** ***************
3. spacer 1.1|769671|30|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NC_025443 (Salmonella phage 9NA, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
cagagaaattggaacgccaatttctacagg CRISPR spacer agctttaattggtacgccaatttctacatc Protospacer . ****** ***************
4. spacer 7.1|1978714|32|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024776 (Bacillus thuringiensis LM1212 plasmid pLM8, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta CRISPR spacer caaattaggatttcttttttcgaaatccttga Protospacer ***.*****************.**. *
5. spacer 7.1|1978714|32|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009062 (Borreliella afzelii K78 plasmid lp28-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta CRISPR spacer ggaaatagaatttgttttttagaaattcttgt Protospacer . .******** ****** ********.
6. spacer 7.1|1978714|32|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018749 (Borreliella garinii strain CIP 103362 isolate 20047 plasmid lp28-7) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta CRISPR spacer ggaaatagaatttgttttttagaaattcttgt Protospacer . .******** ****** ********.
7. spacer 7.1|1978714|32|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028869 (Borreliella garinii strain 20047 plasmid lp28-7, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta CRISPR spacer ggaaatagaatttgttttttagaaattcttgt Protospacer . .******** ****** ********.
8. spacer 7.1|1978714|32|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028878 (Borreliella bavariensis PBi plasmid lp28-7, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta CRISPR spacer ggaaatagaatttgttttttagaaattcttgt Protospacer . .******** ****** ********.
9. spacer 7.1|1978714|32|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028879 (Borreliella bavariensis PBi plasmid lp28-9, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta CRISPR spacer ggaaatagaatttgttttttagaaattcttgt Protospacer . .******** ****** ********.
10. spacer 7.1|1978714|32|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017215 (Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_lp28_6, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta CRISPR spacer ggcaacagaatttgttttttagaaattcttgt Protospacer . * ..******* ****** ********.
11. spacer 7.1|1978714|32|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NC_018987 (Borrelia burgdorferi 297 plasmid 297_lp28-6, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.531
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta--- CRISPR spacer ---acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer ********* ******* *
12. spacer 7.1|1978714|32|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NC_017412 (Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-7, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.531
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta--- CRISPR spacer ---acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer ********* ******* *
13. spacer 7.1|1978714|32|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NC_017419 (Borreliella burgdorferi N40 plasmid N40_lp28-2, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.531
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta--- CRISPR spacer ---acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer ********* ******* *
14. spacer 7.1|1978714|32|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NC_017408 (Borreliella burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-6, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.531
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta--- CRISPR spacer ---acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer ********* ******* *
15. spacer 7.1|1978714|32|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NC_015920 (Borreliella bissettii DN127 plasmid lp56, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.531
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta--- CRISPR spacer ---acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer ********* ******* *
16. spacer 7.1|1978714|32|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NC_011779 (Borreliella burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp28-2, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.531
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta--- CRISPR spacer ---acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer ********* ******* *
17. spacer 7.1|1978714|32|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NC_001852 (Borreliella burgdorferi B31 plasmid lp28-2, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.531
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta--- CRISPR spacer ---acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer ********* ******* *
18. spacer 7.1|1978714|32|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017219 (Borreliella burgdorferi strain B331 plasmid B331_lp56, complete sequence) position: , mismatch: 15, identity: 0.531
acctgtagaatttcttttttcgaaattctcta--- CRISPR spacer ---acaagaatttctaaaaaacaaattctgttgcc Protospacer ********* ******* *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
747993 : 755813
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_016928|747993:755813|DBSCAN-SWA ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTCACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTACGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTATTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTGCGGTTTTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTTGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCGTTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCGTGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAACGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCGTAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAGTAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCGAGTGGGACAACAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCGATGACTGGTACTAAACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCGTAACCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTAAGCAACATAATGCGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTACAATCTTATGGGATTTAATAGTTATATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGATAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCTGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCACCTAAAGCTAATGTTGTGATAACAGCACCAGCTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACTCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGTCAAAATAAGAGGAGGGCGGTTTTTTTAGTAAGAAAATATTTATCTAAACTAGTTATCACTATAAAACACTTCTGATATATCGAACTAAGAATATCAGAAGTGTTTTATAGTATTGGTATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCACAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTGTTATTATTTTCAGCAGTTTCATCTAAGTTATTAAATGTTGAAATAAACAACATAATACCACCAATGATAAAAATGGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATAGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTTATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTACTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCTACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAACGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACGCATTGTGCAATCACTTCATCTAACTTTTTTAAATCAGGTGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTGCCTTGTGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGGTTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCAGTCATGAGTTTTATATCGCTTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTCACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGACCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACGACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGGCTAAAGTTCACTAAAAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACACGGAATGTGATGTGCAGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_016928|747993:755813|752644_753064_-|WP_000941336.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >NC_016928|747993:755813|753065_753734_-|WP_000446724.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >NC_016928|747993:755813|749048_749735_-|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >NC_016928|747993:755813|749709_750183_-|WP_001037807.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >NC_016928|747993:755813|754661_755813_+|WP_001217800.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIVRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >NC_016928|747993:755813|751244_751829_-|WP_000637683.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNNLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >NC_016928|747993:755813|747993_749049_-|WP_000244415.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NC_016928|747993:755813|750524_750965_-|WP_001093553.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAAGAVITTLALGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >NC_016928|747993:755813|754084_754678_+|WP_000604508.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDIINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHITFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NC_016928|747993:755813|751927_752641_-|WP_001062976.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKSDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVIAQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
767794 : 782304
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_016928|767794:782304|DBSCAN-SWA 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17 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
862735 : 884236
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_016928|862735:884236|DBSCAN-SWA 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MNWEIKDLMCDIEVIKQKINDVATKHAWFVEDRFVKNELETKREHINFSASYLEHRIQNEHTVELLHVYLKEFSELIQKFHEIEKASSENFDEESDDAKNSIKVAE >NC_016928|862735:884236|881652_881709_-|WP_071665655.1|DBSCAN-SWA MIFSQNLFRRPTPTCTLS >NC_016928|862735:884236|871006_871876_+|WP_001002732.1|DBSCAN-SWA MNEIKLKYDTQVSVVHYESLDSRSFKSFSMPKWSKLVNKLSVPIEANYKYARGVAVYGDIKDNTNDHGEIIKKHRNDKNVIYRNVIVLDYDEINDVKQLHDAISSVLSSVAWYWHTSFSHTTEQARIRLYIPLNERISADDYRKYTKVLANKIGHKVDEGSYQPSRCFALPVIQKGHIFIKRVNDCPIMDVDMLEQWSKEYKQSNGSPNIKGYTRRDSAYWRDIAFGVSEGERNSTLASITGYLLRRYVDPNLVYGLVSAWASVCKPPINQSEVNNTFKSILKKDSKNS >NC_016928|862735:884236|869731_869995_+|WP_000243851.1|DBSCAN-SWA MVLNLKRLRAERIACGITQDEMAHKMGWKTRTPYAKRENGIVDIGANEFIKMAKILGYETNNLDIFFTNNVPRKERKNILKGGELNV >NC_016928|862735:884236|862735_863761_+|WP_000571213.1|DBSCAN-SWA 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>NC_016928|862735:884236|875450_875792_+|WP_001190615.1|DBSCAN-SWA MQSIAEKETYHLPTEHLQVFNVIKNTSNKYITKTKILNQLGYEYNSSNERWLRRVINSLVYDYGYPIGCSYKPSERGYYIITTEQEKQQAMRSIKKLADGSMKRYEALKRIKV >NC_016928|862735:884236|882294_883146_-|WP_001183851.1|DBSCAN-SWA MQQFKWINILKGFAMGTSDLVPGVSGGTIALLLGIYNQFIASISGIFSRRFWPSFTFLIPIIIGMLLAMGSLSNLFNYLLSQHHIPTMFFFGGLIIGIVPYLLKISNYKTSFTTKHYMMVIAGIAILIVITLMNNGDKHAGETLTLSTGLIIKYFIAGMCASSAMLLPGISGSFMLLVFGVYGTVMLAISEVVKLNFAGLPILLAVGFGVLAGFIISSKIIQYFLTHHKLMTFALIIGFVVGSLFAVFPGLPTNIVMWFVSLVVFIIGFIVSLTLGRITAENE >NC_016928|862735:884236|876668_877196_+|WP_000771368.1|coat|DBSCAN-SWA MKLLKTKNCLYYRNGDNKLSEYQLLTQFNPAFINKKIKMCEFQIESMYHMSASTTTCDEIMGVVSVSYPIEKLVIKIIETKAGLQNYKNRSINNMALLKKVLNHYTEKEQKQVVKYMRSNGRYKPYNVIERLQVDLYQASIKQRSERQKQRNTAIENSKIARVNAYHQSSYVKVV >NC_016928|862735:884236|874011_874296_+|WP_000998181.1|DBSCAN-SWA MNDKEKIYNQLHHDAPIQIMPAPENLFVEYIEDGEVWYSPVVCIALSKAHNINFYDSDDVGCIDKAATCSIKKFNPETGEFEQFSKMAQKEITQ >NC_016928|862735:884236|883474_884236_+|WP_000168845.1|DBSCAN-SWA MASTLEIKDLHVSIEDKEILKGVNLTINTDEIHAIMGPNGTGKSTLSSAIMGHPSYEVTKGEVLLDGVNILELEVDERAKAGLFLAMQYPSEITGVTNADFMRSAINAKREEGQEINLMQFIKKLDKNMDFLDIDKDMAQRYLNEGFSGGEKKRNEILQLMMLEPKFAILDEIDSGLDIDALKVVSKGINQMRGENFGALMITHYQRLLNYITPDKVHVMYAGKVVKSGGPELAKRLEEEGYEWVKEEFGSAE >NC_016928|862735:884236|868736_869195_-|WP_000281657.1|DBSCAN-SWA MYLYEKMVIENKEIPIDDGKSLGNFEGLYDNGVILINKNLSERRKAEVLYEELAHHKLTYGNILDQSKFNNRKFENYARRHGFISAVPLREIVEAYNYGVRNLYELSEYLQLSEEYILEAIEQYKKIYGIGTHYGEYSITFEPLRVFKYKEI >NC_016928|862735:884236|880445_880556_+|WP_000139423.1|DBSCAN-SWA MTEQMYLILFLLSLPLLLFIGRKTHFYCLDKKNGRR |
35 | Staphylococcus_phage(77.78%) | terminase,integrase,coat | attL 861042:861063|attR 881704:881725 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
972499 : 1016217
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_016928|972499:1016217|DBSCAN-SWA 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40 | Streptococcus_phage(33.33%) | bacteriocin,protease,holin,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1050447 : 1058902
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_016928|1050447:1058902|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_016928|1050447:1058902|1052026_1052731_+|WP_000174047.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHIKLLNIATDKDIETLKTKALEINQVLKNLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATSANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >NC_016928|1050447:1058902|1050898_1052023_+|WP_001010401.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVAVLDPAEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISSQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETCECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITYFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >NC_016928|1050447:1058902|1053659_1055849_+|WP_000032747.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKNYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGVLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NC_016928|1050447:1058902|1057304_1058333_+|WP_000030810.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDLFLEPTKLYVKPVLTLKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGDIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NC_016928|1050447:1058902|1052730_1052994_+|WP_000848350.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >NC_016928|1050447:1058902|1050447_1050912_+|WP_072491658.1|DBSCAN-SWA MGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGIDIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >NC_016928|1050447:1058902|1052995_1053667_+|WP_000666799.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NC_016928|1050447:1058902|1058335_1058902_+|WP_000238670.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNKDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NC_016928|1050447:1058902|1055827_1057312_+|WP_000483727.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSNQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1316832 : 1321781
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_016928|1316832:1321781|DBSCAN-SWA TATGAATTGCTATGATGAAATATACAATACAATCAAAAAATTGATAGAAAACAAAGAGATAACGAGTTATCAAATTAATAAAGATACAGGAATAAGTTACGGTAATATTAATGCTATGCGCCGTGGAGAAAGAAGAATAGAAAATTTAAGCTTAAAGAATGCAAAGATCTTATATGAATATGCGAAAAAGGTATTATAATATAAGCATTGAGTTCAATAGGCATACAATAACTGCCCAAACTAGTGACTGAGTGGGAGTTTTTATAGTATTAAAAGTTTTCTAAAAGCGAAAGAAATCATGTTTACTGATTTACTTATGTTTTTAGAAATAGTATAATAATTTTATATAATATATAGAACTTCAGTATACCTTTTGAGTATATATGGAGTTCTTTCTTTTTTACAAGATGTATATGTATAAATGGAAATGTTTATTACATTACATAAAAACCTTTAGGTGCTCTTAGATGGATGTTAATCATAAAACAAAGAGATTTTGAAAAATATAGGCTATTATAATTTAGAATTACAAATTATTAATCTTGCCATTGGATATGGGAATTCAAACATATCACTTACTCCAATTTGTGGAATGTTAAATAACTATAAAGAGGAAAGGAGAAAAAATGATAAGAATGGTTAAAGAAAAAGAACGAATAGCAAAATTAAATTTCGAATAGCTGTGACGAGCTTAATAATTCAAGTACTTAATTTTATCAAATCGTTCTTTTAAAAAGGCAAAGGGCAAAAGACCTTTACCACATTAAATAGGGAGGTGGTATTTATGACAAGAGAATTAAGGAAAAAATTAACTCTCTACCTTAACATTGCAACTTTAATATTATTTATTATTAATTTAACTAGAAAAAATAAACTATTCTTTCATTTTGACAAAAATAATGAACCAGTTTAAAGAAATTTATAATACAATAGAAAAATTACTAAATGATAAATCAATATCTAATTATAGAATTAATCAAGACACTGGTGTTTCTTATGGTGGTATAAGTGAATCAAGAAGCGGGAAAAGAAAAGTGAATAATTTAACTTTAGAAACAGCGGAAAAACTCTATAATTACCAAAAACAATTAGAAATAATGATTGAAGATTAAAATAAGGCCATATCTTTTGAAATATCATGGAGTGAGCCTTTTAAATCATATAATTTTAAAGTATATTAAAGATGGATAGCTTAATGTGAATATAAATAAAAAATTATCGAATAATATAATATAGAATATATGAAGACAAGAAATTTTATCAATATATAATAAAAAAAGCCAATACTATTAGGTATTAGTTTTTGAATTAACTAGTTTGGCAACTACAAAGAAACAATGTATTGCTAAACGTAGTTACTGCATTAGGATTATTATAATTATAAATAGAAAGAGAGCGTGATTAAAAATGAATGAGATTGAAACTATTATAAGTGAAATAGAAAAGTTATTAACTAACAATACACCATATAGTATTTCAAAAAACTCAGGTGTACCACGTCAAACAGTTACTGATTTAAAGGTAGGTAATACTAAAATAAAGGATGCCAAATTTAAAACAATAATCAAGTTATACGAGTATCAAAAGTCGTCAGAAAATAATTCAGAGTGCTAATAAATATACCTTGTTTGATTAGGTGGACAAGAAATTAAATTTCTAATGATTTCATGGTTGTCTGTCCACGCTTTGTCCACCTCAATAAAATTATCTCTAGGTTTTTAAAATTGTACATGTTTAAACAATCAAAAGTATGCATTATTATATTATCATTTCCATAAAAATTTAAATGATCTTTAAGTGATGATATAAAAGGCTGAACATAGTAAATAAGTTAACTTTAATGCAGCATACTATACATATTTTATAATAATGTTTATGCACATAATTTTTTATTGACAATTTTTTATATTAAATTGTGTAATTGGCATATATGATGATTTGTGATAATTATATTGTAATATAGCATTTGGTTTTATGATTCTAAAATTAATAGATTTGAAAAGTATACTTTATTTCATGAAAGTTTTTGGTACATTTATTTGAAAATGTTTTTATTACAAAGTTACATGGCTAAATGTTTCTTAACAAAATTAATTCATCGAGTGTAAAGAATCGTGTGGTAAACATAATTTATATAGATTATAAGGAGGTGAAAATGGTCGAGGAAGTAAAAACGATAAAATAGTTTGAATGTTTTGATTTCAATTCTGATAGGACTATTGAATTTGCAAACTAATAAGAATGTGAGGTTTGATTTAATTCGAAGTCATATTCTTTGAATAAAATATTACTTTCTTACCATTAGTAAAATGAAGATGACTATTAAAGTGCGAAAAACAAATAAAAAAGAGAAAATAGAATTTTTAATAGGGACGTTTATAATTATTCTAGTAATATTAGGCTTCAAAATTATGAAATAAATGTATAGTATTTGAGAAGTCTATATGACTCCGGAAAAATTAAAGTCTAAAGATATTTCAATATCTCAAATTTAATAGACTACTGGAATTAGTAGTTTGAATATTGAAAGACTCTAATCTAATAAAAATACATAAAAGGTTAAACTTTAGAAGTGGTTGTAAACTTCAATGAATACTAAACATTGAAGTTTAGTAAAAGGCGTAAGGTATACAAGACAAATCGTTTGTCTTTGACAAAGTAATTGATGATGTAAAGTCGTTAATATGTAGAAACAAAAATTGAAAATATGAAATTTAACTATTATGAAGTGATGATAGCCATTAATGAATAGAAAAATAATAAAATCATTTATAAATAAAAAATACGTTAAGTTCACAGAATTTCGAAAAAAAGCAGTAAACATTGTACAGATATGGAGATGAAAAAAATGTCAGAATACAAGAAAAAGATAATTGAATTAATTGAAAGTAATTTAACAGGATATGAAATTTCTAAAAAAACTGGAGTTTCTCAATACGTACTTTCACAATTAAGACAGGGCAAACGCGAAGTAGATAATCTAACCCTGAATACAACAGAAAAATTATATGAATATGCCAATAAAGTTTTGTAATATAACTACTGTATAAATTAATCAAGCTATGTTTATTTGATTTAACTATTAATAAAAATCATATGGTGAATGGATATTATAATAATTAAAATACAAAAATAGTAGATTCCAATTTGTGAAAAAGGAGTATGTTGTTTCATTTAGAATTTATTGCACGAAATTAGCATCGAATAAGGGAAAATAAGTGTTAAGTTTTAAATGATAAAAAAGATTGGAATGGATCGTCTTGAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTCGAAGGGGGCATTTCCATTAAATTGTTATAGCTTTTTATATTTGTATAATGAACATATAAGTTTAAGAAGATGCGAGTGAAGGAAATAAAAAAGCTCAAATGTACCAAATTGTTAATCTTAATAAATCTCTACTTTATAAAGATTGAATGGACATTCGAGCGTTAATCAGTCAGGAGGGAATTTCACTCCTACAATTTAATAATAATACTTGCTTCACCACTGTACAAGGAGTGATTTGTTATGTTCAAAGTGAATTATTCGATTTTAAGTTATTATCCAGAATATAATATCGCAGTAAGTTGGCAACGTTTAAGAGAAGGAAAAATAATAAAAAACAAGATTTAATACTGCTGCGTCATGAGGCGCTTGAACATTATTTGATGAATAAGTATAATTACAACTATGATTATGCACATAAAATTGTATCAAAAAATACGATTATTCAATTTTTATAAAAATAAGGTGGATTAAATGCTTACATTAATAAAATTGAAAGAAGATGAACAGGTTATAATATATGAATATATACCTGAAGATGATATAAGTAACGGTAAAGGTTCAGTAACTTTTAATAAAAAAGATGCAGAGGTTATAGATTTTTCATTATCTGAAATAGAAAATGAAGAATATTTTATGTTATATCGTAATAAGTCTTTTTCTGTAGTAAGAGACTTTATCGAGAAGCAAGAATTTCCCGAAAATTATAAAATAGCTTGGTATTAAAGCATCCTTTCTACACAGATAAAGAGAAAGTGGTGCTATTTTTATACACTTTTTTAACTATTTACTGAAATAGCAGAATCACAAAAGTTAACATATTTAAAAGAACTTGGTGAAGATGGTGAATATAAATATGTTGCCAAAATAGATAGTGAAACATCTAAATTATGTCATTCACTCAACGGAAAAATATTTAAAGTTAAAGATATGATACCAGGTGTGAATGCGCCACCTATGCATCCTTGGTGTAGAAGTACCGCAGTGCCATATGTCGGCAAATGGCGAGACAAGTTCTTTAAAGAGCGTGAAGGTAAATATCAGGTAGAAGTAAAAGAAGCAAAATTACAGGAAAAAGCTAAAAACCAGATGAAAGAAATGATTGAAAGTGGTAAAATAAAAATAGAAATAAATCCTGAAAAACAGAATAGACATTCTTTAGGTCATAGACTATACGAAGAATATAAAAAAAGAATTTGTTGAAAGGAAAACAAACACCGAGTTATACACTACTAAAAAATGATGAATTAAATAAAATGCTAAATCAAAAATTTGGCACTGGACGGTTGATTATTGAAAATGAAAGAAAATGGAAAAATAAAGAAATAATTAATTTTGGTCAAATTATAGGAAAATATTACATAGATGGAAAATTTATAGAAACTAAATGGGGTACTGTTCATTATTCCAAAACTGGTAGTCATATTATTCCAAATGGAAAGGAAGGTAAGTAATGAAGTTATGGACTTACATTGGTAAAAAAGTAATGATCGAGTTAACTAATGGGCAAAAATTTATTGGAGAAGTTACAAATTATGACGATGAAATAGATAACGAAAGTGGAGAAGATTCTATACATTTAGATGACGGAATAGATTTATATGATTTTGATGAAAGCCAAATCAAATATATTGAAGTTTTAAAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_016928|1316832:1321781|1319140_1319251_+|WP_001788716.1|DBSCAN-SWA MKMTIKVRKTNKKEKIEFLIGTFIIILVILGFKIMK >NC_016928|1316832:1321781|1320607_1320859_+|WP_000956747.1|DBSCAN-SWA MLTLIKLKEDEQVIIYEYIPEDDISNGKGSVTFNKKDAEVIDFSLSEIENEEYFMLYRNKSFSVVRDFIEKQEFPENYKIAWY >NC_016928|1316832:1321781|1321332_1321587_+|WP_001813273.1|DBSCAN-SWA MKGKQTPSYTLLKNDELNKMLNQKFGTGRLIIENERKWKNKEIINFGQIIGKYYIDGKFIETKWGTVHYSKTGSHIIPNGKEGK >NC_016928|1316832:1321781|1318238_1318445_+|WP_001002343.1|DBSCAN-SWA MNEIETIISEIEKLLTNNTPYSISKNSGVPRQTVTDLKVGNTKIKDAKFKTIIKLYEYQKSSENNSEC >NC_016928|1316832:1321781|1316832_1317030_+|WP_001659797.1|DBSCAN-SWA MNCYDEIYNTIKKLIENKEITSYQINKDTGISYGNINAMRRGERRIENLSLKNAKILYEYAKKVL >NC_016928|1316832:1321781|1319679_1319865_+|WP_000006110.1|DBSCAN-SWA MSEYKKKIIELIESNLTGYEISKKTGVSQYVLSQLRQGKREVDNLTLNTTEKLYEYANKVL >NC_016928|1316832:1321781|1321586_1321781_+|WP_000780597.1|DBSCAN-SWA MKLWTYIGKKVMIELTNGQKFIGEVTNYDDEIDNESGEDSIHLDDGIDLYDFDESQIKYIEVLK >NC_016928|1316832:1321781|1317718_1317943_+|WP_078065144.1|DBSCAN-SWA MTKIMNQFKEIYNTIEKLLNDKSISNYRINQDTGVSYGGISESRSGKRKVNNLTLETAEKLYNYQKQLEIMIED >NC_016928|1316832:1321781|1320376_1320481_+|WP_000477491.1|DBSCAN-SWA MFKVNYSILSYYPEYNIAVSWQRLREGKIIKNKI |
9 | Staphylococcus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1498628 : 1580608
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_016928|1498628:1580608|DBSCAN-SWA 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105 | Staphylococcus_phage(84.42%) | portal,capsid,integrase,protease,holin,tail,head,terminase,tRNA | attL 1558444:1558458|attR 1576425:1576439 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1636435 : 1644746
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_016928|1636435:1644746|DBSCAN-SWA ATTAATTACAACATTCTCGATTATGCTGATGATCGACAAAACGTACAGGATGTCCATAAATTTTTGAAATTTCAACTTCATCAAGTGATTTAAACTCATCAGTTGTACCATGGAAATGCAAATGCTTATTTAAACATGCTACTTCAGTAGCAGTATCTGCTACAACACCAATATCATGAGTAACTAAGATAATGGTGATACCTTCTTGTTTTAATTGATCTAAAGTATTATAAAATTCACTTACATGTTTTGCATCAATACCATTCGTTGGTTCATCAAGTACTAATACTGCAGGTTCTGAAATCAATGCTCGAGCAATCATTACACGTTGTTGTTGACCACCTGATAATTCTGCTATATTTTTATGAATTAAATCACTTATATTCAGTCTTTCTAGTACTTTAATCACTTTTTCATTATCTTTGCTATTAAATGTTTGGAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCTATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAATCCTAGAATCAACTTCAATAATGTTGATTTACCAGCACCATTTGGTCCAACAATTGCTAAAAATTCACCTTTATTTATTTTAATGTTTATATTTTCTAACACTTTTTTATGATCATAGTAGTAATTGACATTTTTCAATTCAAAGACTGGTGTCATCGTATTCTCACCTCGCATTCAACTATACAACTCCTAGTAACATATGTAAACAGTAATGTTTACGACTCAAAACAAGACAAAATAAAGAGATATGCCCCCTTCAAGTATTATTTATCGCATTTCTTGAAGAGAGCATTATCATTTTATTGTTGCATAACTTTATTTTTTAATTCTGGGTCAAATTGCTGTTGTTTTAACATTTCAATTTCAAGTTTATATGGCGGTTTTTTATTTTTCTTATCTTCACCAACATAAGGTGTTTCTAAGATTTTCGGAATATCTTTAAAACAATCATGATGCACAATGTAATTTAATGCATCAAAACCAATGTAACCGAAGCCAATATTTTCATGTCGGTCTTTTTGAGCGCCACGGTCATTTTTAGAATCATTGACATGAACAACTTTAATTCTGTCGACTCCAATGATTTTATCAAATTCATTTAATACGCCATCAAAGTCCTCTTTCACATTATATCCAGCATCATGCGTATGACATGTATCAAAACATACTGATAAACGTTCGTTATTATGAACTCCATCAATAATACGTGCTAACTCTTCAAACGAACGACCAATCTCTGTACCTTTACCTGCCATCGTTTCAAGCGCAATACGTACATTATTGTCATTCGTTAAAACTTCATTTAATCCTTCAATAATCTTATTAATTCCGGCATCAACACCAGCTCCAACATGCGCACCCGGATGTAATACAATATCTTTAGCGCCTATAGCTTGCGTTCTTTCAATTTCTTGTTGCAAGAAATCTACACCAAGATTAAACGTTTCTGGTTTGGTTGTATTTGCAATATTAATGATGTATGGTGCATGAACAACAATATTAGATAAGCCATATTTTTCCATCACTTCATGACCTTTAGTTATATTTAAATCTTCAATACTTTTACGGCGCGTGTTTTGAGGTGCACCAGTATAAATCATAAATGTTGTTTCACCATATTCATGCGCTTCTATAGCAGAACCTTCTAACATCTTTTTACCACTCATTGAAACATGTGATCCTAATAACATAAAACACACCTAACCTTTTTGTTTTGCTTACGTTTTTGTCTATTTTGCTGCTTACTAAATTGTTTACGCTCTTGACGTTTCATTTTTTCAACTTCTTGTTTAAATTTCTTCTTATAACCTGGTTTAACTTTGTTTTTAATTTTACTTCGAACTTTGTTCTTCACTTGATTAGTTAAATGGTCATCTTTGCGCATTCTTGCTTGACGCTGATTGTGCGCTTTAACTTCTTTTAACTCACCATCTTTAATATCAACAGTATTGAAAACAAAACCACGATCTTCTATTAATGAAATATTGTGTTCTTCATCAGGACTATAAAGCGTAATTGCTACACCTTTATAATTCCCACGGCCAGTTCGGCCGACTCTATGTGTAAAGAAGTCAATATCATTTGGCACATCAAAATTGATGACATGACTAACACCTTCAATATCAATACCACGAGATGCTAAATCGCTGGCAATAACGTATTGGAATTCTAAATTACGTATACGTTTCATTTGTTGTTTACGTTCACGTGGCGTTAAACCACCATGAATCATACCAACTTTAATGCCAGCTTCATTTAGTGAACGTGCTAAATCATTTGCATTATCTCTACTATTACAGAAAATAATACATAAGTATGGATTTAGTATATCAATTAAATTTAAAGTCTTTTCAACTTTAGCTGCACCTTTAGTAGGTATTAAAAAGAATTCGATGTTCTTTTTATTTTGTTTTTTACTGTCGACAGCTACATATTCTGGATGACTTAAATATTTATTTAAAAATGGTTGTAACTGTTGTGGAATTGTAGCACTAAACACCGCAATATTTGCATTATCTTCCAATCTTGCAGCAATGTAATCTACATCTTCAATTAATCCTAAGTCAATCATAAGATCCGCTTCATCAATAACTAAATATGATGCTAAGTGCACATGTAAATGTCCCGTTTTAGCTAAGTCATTAATTCTAGTAGGGGTGCCTATAATCAATTGTGGTTGTGCATTACAACGTTGTCTATCTTTCTCTATATCTGTACCACCAATAAAAACTTTAACTGAAACGCCAGCTTTAAATTGGCTTAAATGGTTCGCTGCATCGTATAGTTGTTGTGCAAGTTCTCTTGTTGGTGCAACTACGATTGCTTGTGGTTCTTTTATTTCACTATCAATTAACTGCATTAATGGTAATAAAAATGCATGAGATTTCCCTGTACCCGTTTGAGATTGACCAATTAAATTTGTTCTCTTTAGTATTCTTGGAATAATTCGATTCTGAATTTCAGTTGGTTTTTCAAAATTAAGGTCTTTCACAGCGTCAATTAAACTAGATTCTAGATTAAATTGTTCGAATGGATGTTTTGCCATGATTTGGCCTCCTTCTATGTTCATCTTTACTATTATAAAGTATAAATGTGCTATTTTAAATAAAAATATTAAAACCTCGAAATTTCAAAATTTAGAAATCCCGAGATTTTAGTTTAAATATATTGAAATGGATCTGTATTAATTGTAGATGCTTCAACATCTATATTTATTTTTTCTGTATTGAACCAATTCATTAGTAACGTTTTTAAACCTTCTTTCATCACATATTCGCTGTAATGATTAATATCAATTAAGTTCACACCATGAATTTTAGCATCTAAGGCATCATGATGTTTAATATCACCTGTAACAAAGACATCTGCGCCTTGTTGAACAGCTTGATATTCATATCCAATACCTGAACCACCAATAATTGCAATACGTTTAATTTTCTGATTAGACACACCAACAAAACGGACACTTGGGATATTTAATTTAGATTTAATATCAGCTGCGAAATCTTCCAATGTCATTTGATTATCCACTTCTGCCATAACGCCAAGTCCATAAAGGGATGTTTGTTTTATCTCAATAAAATCAAATACCGGTGTTTCATATGGATGGTATTGTTTAATTAATTGCTCAGCCCTTGACTTTTGACATGCATCTATCATAAATTCAATTTTAACTTCATCTACATATTCAATTTTATCAATTTGTCCTATTGTTGGATTAGCTTCACCAACTGGTTTGAATTGCCCTCTTCCTTCACTTTCAAAGAAACAATATTCATAATTACCTTCTTGTGCTAATCCATTTTCACTAAGCTTATCTTTAAATGGTCCAACATTATCCTTAGGTATATATGTTTGAACTTTATAGTATACATCTTGTTGATTATTTATTATTGAAATGTTCTTCAATCCCATCGCCTTCGCCAACATCATATTGACACCATGAGGATTTACATCTAAATTTGTATGCATCGCTATTAAATTAATGTCATGTTGAATTAGTTTTCTAATAATCAAACCATAACCATTAGCTTTTAATGATGTTACGCCTTTAAAGATTAGAGGATGATGACTAATAATAGTATTATAACCTTTTTCGATTGCTTCATTTACTACTTCCAACGTACAGTCTAATGCTGTTAAAACACCAGTAACTGCAACATCTTCATCACCTATTAACAATCCTACATTATCCCAAGATTCAGCAGTTCTAAATGGCACATGATGATCTAACAATGTCATTAAATCAGCTATTTTCATTACTATAACACCCTTTCAATTACAGCAATTTCGTCATTAATTTGAGCTAAACGTTGATGATGTTGTTCAGTATTGAGTTTCGATTTAATATGATAAAGTGCTTCTAACTCTCTTTGCCATTTTTTTATAAAATATTCATTTTTGTTGTTCAGCAATTTTGGTCCGAATTTCAATTCATCAGATGATAGCTCTATTAATTGCGTAGAATATTCTGCTACAACAATTTCATAAATATGGCCTTTTTCTTCCATTATTATTTCATCAATTATTTCATAATTCAATTGTTGTAATGTTTGTCTTAAATTTTCAGTTTGGATATTACTTTGTAAAATCAACCTTGGATGTTGACTTAACTTATCTTGCCCATCTTTTAAAATTTTAGCAATAAGTGGTCCGCCCATACCACAAATTGTGATATTATCGATTACGTCCTCAGGATGAATAACACTTAAGCCATCCCCTAAACGTACATCAATTCTTTCTACTAATTGATTTGCAGCTACATTTTTCACAGCAGCTTGAAAAGGGCCTTGAATAACTTCTCCTGCAATACCGCAATCGCATAAGTGGTTTTGAATTGCATAGATTGGCAAATAAGCATGATCTGAGCCAATATCCGCGATTGTACCTTGTTTTAAAAATCGACTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAGTCTTTCAAACGTTTACTACGACTTGGATGTCTTAATTTTCTAAGTGCTTTTGCTTCGATTTGTCGAATACGTTCACGTGTAACACCGAAAACTTTACCAACTTCTTCAAGTGTTCTTGTTCTGCCATCATCAAGACCAAATCTTAATCGTAATACATTTTCTTCTCTATCAGTTAATGTATCAAGCACATCTTCTAATTGCTCTTTTAATAATTCATAAGCCGCATGATCTGAAGGACTTTGTGCTTCCTGATCCTCAATAAAGTCTCCTAAATGACTATCATCTTCTTCACCAATTGGCGTTTCTAATGAAACAGGTTCTTGCGCAATTTTTAAAATTTCACGAACTTTTTCTGCTGGTAAATCCATTTCTTCACCAATTTCTTCTGGTGCTGGATCTCGACCTAAGTCCTGTAATAATTGACGTTGAACTCGAATTAATTTATTAATTGTTTCTACCATATGCACAGGGATACGAATCGTACGTGCTTGGTCAGCAATTGCACGAGTGATTGCTTGTCTAATCCACCATGTTGCATATGTTGAAAACTTAAATCCTTTGTTAAAGTCAAATTTTTCAACAGCTTTAATAAGACCCATATTACCTTCTTGGATTAAATCAAGGAATAACATACCACGACCTACGTATCTTTTAGCAATACTTACAACTAAACGTAAGTTCGCTTCTGCAAGTCTTGATTTTGCTACTTCATCACCTTGTTCAATACGTTTGGCTAATTCGATTTCTTCTTGTGCACTTAATAAGTTAACACGCCCAATTTCTTTAAGGTACATACGAACTGGGTCATTTATTTTAACACCTGGAGGGGCACTAAGATCACTTGGATTCAGTTTCTCGTCAGTATCTGAACTATCTTTTTCATTAACTAGTGAAATATCATTATCATTTAATTGATCAAAGAAATCATCCATTTGATCAGAGTCGATATCGAAATTCTGAAGTTTTTCAGCAATTTCTTCATGACTTAAATGACCCTCTTTTTTACCTTTTTCAATTAATTGCTTCTTAACATCTTCTAATGTTAATGTCGGATCAATTGTTTGTTTTTTAATTTTAACTGTGTTATCAGACATGAAACGGCCTCCCGATTTTAAATATGAACATTCGAAATTTATTCAATATTGCTATTTTAAACTAAATTCTTAATTAATTCATCCATATTTTTAATTTTATTTTACAAATAGGAACTAATCCCAATATTTATTTTTCAACAGTGTTGTTTAAATGCGGTAACTATCATTTACCCTTATACATTTTGACATAATCATTATTCGCATTATTCTTTAAAATCACATGCTACATGCGTTCTTTATTCTTAGCAACAATTTGCTGTAAATAGTATTTCTGTAATTCTACATCGCCAATCCTTGTAGCTTCCCTTAATTTATGATTCAATGACTCAATTGTTTCTTGTCCGTTTTCATTAATAATATTGACATAATCATCAATTTCATTTTCATATGGTTCGTCATTCAAACTATATTGTTCTAAGCTAATTAGTGTTTCTCTCAACTCATTTGAATTAACATACTGTACAGCATCACTGATATTATATTGATCATTTTCCGCATAAAAATCATGTAAGACTTCGAATACATATTTAAAATGCTGATTTGTGAAATTATCCTTATCAACACTTTCATAATAATTTAAAAATGTATCTTTATCTCTCATTAAATGTTTTAAAAATGATCGCTCCGCTTTTTCTTGACGGCTCAAATTGTCAAATTGTGCCATACCAATTGGCTCAGGTTCAATGTAACCGCCATACTCATCTTCTGGATAATAACTGGCTGGTGCTTGATTGAATTGTATTTCGTTAGCTAACTGCTCAGGACTAACATTGAAAAATGGCGCAACATCATTTATAGCCTTTTGTTGTAGAATTGATGACTTCATAAGTGAAATGTCATGACTCAGTTCTTTCAAATAACGTTCATATGAAAGGTCATTATGTGCAATTTCATCTTTTAATATACTCACTTTATAATGTGCAAATGACTTTTTGTCATTTTTTACAAAAGCAGTAAATGCGTCGTTGCCATACTTACCAATGTATTCATCAGGATCCATGCCAGATGGCAATTGTATAACAAATACATTTAGCCCTTGCTGTAACAAATGTTGACCTGTTTTAAGTGTTGCTTCACTACCCGCAAAATCCCCATCAAACATTAATGTTATATTTGATGTTAACTTTCGTATAAAGGTAATATGTTCATCTGACAACTGTGTACCCATTGTTGCAACAACGTTTTTCAAGCCAGCAGTATCAGATTTTATAACATCCATAAAACCTTCTAGTAATACAATTTCATCTAATTTTCTAATTGATTTACGTGCTTTATCTAAGTTATATAACAACTTTCTTTTTTGAAAGATAGGTGTTTCAGGACTATTTAGGTATTTTGGTTCTTGACCGGTATATGTTCGACCTGAATATCCAACAATTCTTCCTTGCGCATTTTTCAAAGGAAACATTATACGATTTCGAAATCTATCGTAATAACTGAAGTTTTCTTCGTTACGTGATAATAATCCGGCTTCATATGCTAATTCAATATCGTAACCCTTTTTTTGAAGAAAATCATGACAAAAATGTGAGCTATCGGGTGCAAAGCCAATGCCTCGCTCTTTAATAAGCGCATCTGTAAAACCACGTTCTTGTAAGTATGTTAATGCTTGTTCGCCTTCGACTGTCTTTGTTAAAGCGTAATAATAAAATTCTTGTATTAACTCATGCATTTCAATCATTTGTAAATCATCAGAAGCAATTTGAACATTTGAGTTAGATTGTGTTGCCTCAATATCTACAGCAACATTAACTCTATCACCTAATTCTTTAACCGCTTCAACAAATGATATGTCTTTAATTTCTTGAGTAAATTGAAAAACATTGCCACCTTTTTTACAACCAAAACAATGACAAATTTGTTTATCTTCAGAAACTGTAAATGAAGGTGTCTTTTCATCATGAAAAGGACACAAACCTATATAATTGCGTCCTCTCTTTTCTAATTTTACATATTCACTTACCAAGTCTAAAATGTCGGTTTTATCTTTTATTTCATTAATGATCGATTGATCTATTCGCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_016928|1636435:1644746|1642946_1644746_-|WP_001217251.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKAINDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPASYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERSFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYSLNDEPYENEIDDYVNIINENGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >NC_016928|1636435:1644746|1636435_1637221_-|WP_001213908.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >NC_016928|1636435:1644746|1639705_1640806_-|WP_000683914.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFRTAESWDNVGLLIGDEDVAVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPHGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDACQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGVSNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI >NC_016928|1636435:1644746|1641616_1642723_-|WP_001283055.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD >NC_016928|1636435:1644746|1637346_1638237_-|WP_000924210.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDCFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >NC_016928|1636435:1644746|1638227_1639592_-|WP_001062178.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKVRCVLCY >NC_016928|1636435:1644746|1640808_1641486_-|WP_000624567.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCDCGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVERIDVRLGDGLSVIHPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL |
7 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1850265 : 1896193
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_016928|1850265:1896193|DBSCAN-SWA ATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAATTCTTTCAATGGTAAATCCATTCCTTCAGAACCTGTATTTGGAAGTTCTTTGTCAACTTTGCGTGGTTTATGTGTCGCTTCTTTTTTAATAGGCGTACAAACTTTTGGAGCTGACTGAATTACTTTTGGTGATACTTTCGTCGCTTCAGCTGGTAATTTAATTGCTAAAATTTCATCAACAATGAATTGCGTATGTTGTTTGATGTCATTTAATGTCGCATCTTCATCAATCATTATATTGCCATCTGCAACATATTGATCAATTAATACTTTTACTTTAGCTAATTGTTCTGGTGTTGCGATCGCTTTGAATTTCGCATATGTTTGTTGAGCAATGTTATCAATGCGCAGTAAGCTATTTTCTTTTTCAGTAATTACTGCTTCTATATCGCCTAATGCAACATTAAATCGTTTTAAAACTGCATCTACATCAGCATTAGTTCGTGCTGTTTTTAATTCTTCATCCATTTGTAATTTTAATGCAGTTATAGCTTTTAATGCATCAGCCTTATTACGATCACTTACTTTTCGATAATTTTGCACTAAATCAGTGACGCGTGCAAGATCATCATTAATCGTTTTTTCAGCATCTGGCTTTTTAATAGGATGTACATCTAAATCATGTATTGTTTGTAGATTTAATGATGCTGTTTTATCAACTTGTGTATTGCTACGATCTTGATCAATTTGTCCAATAGCAGTGTCATAAATATTTTGTAACTGTGCTAATATACTATTTCTTTCTTCTACCGTTGCTTGTATATTCGCTTCAATTGCTTGTTTTTTATCGTTGAATAATGTTGTCAATTGTTCTCGAGCAGACGCCTTTCTGTTAATAACAGGTTCGATTTCACGAATTTCGTTTTTCTCATCATGCAATAAATATGCCACATCAGCATTAGTCACTGCACTAGCAATTTGTTGTTTAGCTTTAATTAACTCTTTTTCAACTTGGGCAATTGCAGCATTTTGTTCTTCATCTGTCGCTTCGTTATTTGCTTTAATTAAATTAATTTTATTTGTAGCGATATTTTGAATTTGTTGTAATGCTGTTGCTTTAACTGTTGTCGCTGGTTTAATTTTTGAAATAATATTTTGAGTATTTATACTATCTTGATTAACTTGAGCAGTCTTATCTGCATGATTGATCTGATCAATAGCCTGATTAAGTGCTTGTTCTACTAAATGTTTAGCAGCTAGTCTTTCTTCTTCAGTTGATAAATCGCTTTGATCGATTAGTGCATTTTGAGCTTCGGCTTTTATACCAACAGATTGACGCGCTGATGGTTTAACTTGAACTTTAGGTAAAATCACTTTGATGTTGTCGTTGCCATCAGTCTCAGTTCGATCCACTTCTGCATTCGTTTTGTTTTGTGCAATGTCATTTTTAATTGTATTTACAATTTTATTTAAAGTATCAATAGCAACATCTCTTTCATCTTGAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCTATTGCCTTTATTGTTTGATTTCTAACATCAGTAACAGCAGCATCTTGATTTGTATTTTCTATTTCTTGTTGTGCTTGTTTGAGTGTGTCGCTAATTAATTGATTCGCTTCATCTAATTCATCAACTGTTGCATGTGGTGTATCTTTTATTAATTCTACTTGATTTTCTGCACTTGCTTTTATTGCTTGTTGTGCTTCAGGCTTAATTACAATACGAGGTTGTACACCTTTTAGTGTAGCAATGCCATTTGTTTCAACACGTTTCACATCATTATTCGTTACTGCTTGATTGATGTTTTGTAATGCGAGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCAGCTTGCTCAATTTCTTGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCACCAGCTCTAACAATATGTTCAGGCGTTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTAGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGATTTTATCTAGTGCTGCTTGTCTTTCTTCTGCTGTCGCTTCTTTATCCTGATTAATCTTCGCACGTAATTCATTCGCTTTTTGATTGATTTTTTCACGTGCAGCTGGTTTAACTTTAGTTTCAGGTTGAATAATTTTAATTGCTGATACACCATTTGTTGCTGCTTGATTCACCTGACTGTTCATTTGAGCTTGGTCAATAGCTGCAAGTGCTTTTTCTTTTTCTTTAGCTAATGCTTGTGAAGCAACTTCTTTCTCATTATCTGTTGAATCAAGACTATTATCAATTTGCTGTTGCTTTTCTTTAACAGCTTTTTCAATATCTGCAATTGCCTTTGGTTTAATTACTACTTCAGCTTCAACATTATCTATAGCATTTATCGCTTGATTTGTAGTTGCGTCTACCTGATCATTTGTTTGGTTTTGATTAATTTGATTAAATGCTTGATCTTTAAGTTGATTGATTTGATTAACAGCAGCCTGCTTTTCTTCATCAGTTGCATTAGGCGTTTGTTTAACCGCTTCAATACGCTTCGCCACTTCAGCAGTGATTTTATCTCGCGCTGCTTGTTTTTTTACTACGTCAACTTGAACAGCATCGATATTATTCTCTGCCACTGTCGTAGCTTGGTCTACTTCCGCATTTGTGTTAGCTTGTTTAATACTTTCAATAGCTTGTTGTCTGTCTTGATTTAAAGTATTAATCGCAGCATTTTTCTCATCATTCGTTGCATCTGGTGTAGCATTGATTTCAGCTAATTTAGCATTATAATGCTGATTGATTTGTGCTAATGCTGAAGGTTTTTTAACAATATTTGGCTGAATCGCATTAATTGCTTTTGTACCTAATTGTTGCGCTTGATCTACTTCCGCATTTGTATCAGCTTGATTTATATTATTAATTGCCGTTGCTAACTCTTGATCCACTTGATTTAAAGCCACTTGCTTTTCTTCAGTTGTTGCATTTGTGTTTTGATTAATTTCTTGCTTTTTAGCAGTTGCTAAATCATTTAATACACCTGTAGCAGTTTGTTTCTTCGTTACATGCGGTTGAACTGCGCCGATTTGATTGACTGCATCGTCTCTAATACTATTGACCATCGCAGTAGTAGACGTCACACCAATATCAGTTAATGCTCTATTTTTAAGTGTATTTACACGATCTATCGCTTCTTGCTTCTCTTCTCGAGTCGCACCTGGTGTAGCATTGATATTCGTAATAGCCTCTCGCGCTTTATCATTTACAGCATTTCGAGCATCCGTTTTAACTTGTGTTGCCGGTTGAATCACAACTATATTTTGTGTGCCCTGATCTTTTGCTTGTGCAACTTCTTGATTCGTATCTGCTGCATTAATATTTTGCTTCGCTGTGGCTACAGCTTGATCAAGTAATTGTTGTGCTGCTTGTTGTTCTTCGAGCGTCGCATCATTATTATTAAATATCGTATTATGTTGCGTTTCCGCACTTTTATCGATGGCATTTTTTGCATCTGTTTTTACTTTTGTAGCTGGTGTAATTGCTTGTATTCCTTGAATCGCATTTGTCTTCACTTGTTCAACATCAGCATTGGTATTAGCGTTTAAAATGTTTGTATTTGCTGCAGTTACAGCAGCATTCACTTTGTCAATTGCTGCTTGTCTTTCTTCTTGAGTCGCATCAGGATTAGCATTGATCTCTGCGATATGTTGTTGTACATCATGTGATACGGCATCCCTTGCAGCTTGCTTAACAACAGTTACCGGAGCAATTGGATTAATGGCATTTAGACCATCACCTTTGGCGTTATCAACATCAGCATTTGTTGTTGCTTGATTAATTTGTTCTAAAGCATGGTTGGTTGCTTGAGTTAATTCGTTCAATGCTGCATTTTTCTCTTCCTGCGTTGCTTCTCTATTATTATTTATTTGTTGTCTTTTCGTTGCTGTTGCTTGGTTAATTGCATCTCTTGCAGCTTGTTTATGTGTCACTTGAGGAACAACTGCTCCTATAGTATTGATGCCATTATTTTTAGCTGTTTCAACATCATCATTGGTAGTAGCATTCGTAACATTATCAATAGCATCTGTTTCATCCGTTGTTAATTGATTTAATGCATCTTGAATTTCATCTTGAGTAGCATCTGGTGTGTTATTGATAATTTCTCTTTGTTTCGCTGCTTTATCACGTATAGCTTTTTTAGCATTTGGTTTAACAACCGGTGTTGCAGTATCACCACTTAAGGTCTGTATACCTTGATCTTTAATTCTAGTAACGCCATCACCAGTCGTTTGGTCACCAATATCACCAATAATATTGCCTTTGTGTTCCTCGATAATTTGATTCGCTGCTTGTTTTTCTTCATCTGTCAGTTCATCATTTTGGTTAATTAAATCTTGCATTTGATCAGCTTTTTGATTTACTGCATTTTCAGCATCAACACTTCGAATTAACGTGTGTTGCATTTGATTAGTTAATGTATCAATATCTGCTTGAGATACTCTTTGATCTAATGGAACATTGTTACGATTTTCATCTAAAATTGTTTGTGCACGTCTTTTGAGAGCATTAAAAATATCTAATGAGGCAAATGTATAATCTGCTTGTTGAATTCGTCTATCAACTTCACCTTGTAATGCGTCTTTATTCATTATGATATCGATTGTATATGGATTAGTACTTACAGTATGACTTTCAGCAGGTGAATTAATAAAATCTTGTGTATATGTCTTATATGTTAATGTATCGTTAAATGTTACTTTTCTTGGTGTTGGAACATTATTAACACGCAACTTATACTTTAAATCCAATATTTTATCAGGCATTAGTCTTGCTGGGGAGTTCGCTGTACCT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45 | Staphylococcus_phage(94.29%) | protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1901746 : 1908879
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_016928|1901746:1908879|DBSCAN-SWA 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GTAAACTATTATACGGGAATGCTAAAGTGTAAATGTCAATATAAAAATGTACATAAATGATTGTATAAGAATGTACAAAATTGTTTGCTAAGTAATTTCCTTCTTAGGTGAATGATCTTTTAATCTATACGATTTGCCAGTGATTTTAACTACACTTGAATGATGCAATATCCTATCCAAAATCGCATTTGCGATTTTGGGATCATCAAATATTTCATTCCATAAGTTGAAATTGATATTTGTGGTAAATATTGTACTTTTCTTCTCATATCTTAAATCTATTAATTGAAAGAATAGTTTGGCATCTTCACTTCCAATAGGTAAGTACCCAATCTCATCTATGATTAATAACTTATACTTGCTATAGTGCTTCAATCTATTTTCTAATCTGTTCTCTAGTTTTGCTTTTCTTAAATTCTCTATCAAATGATGACATTTAATAAAGTAAGTACTTACTCTATTTTTAGCTGCAGCCATACCAATGCCTGTAGCTAAATGTGTTTTACCAACGCCACTTGAGCCTAAAAAGACAATGTTTTGATATTTTTCTATAAAACGCAAATCTGTAAAATCCCAAATTTCTTGTTGATTGATGCTCGGTTGAAAATTAAAGTCAAAATCTGATATTTCTTTTTTAAACGGAAATGCCGCCACCTTTACCATCGATTCAATCAAATTTTTCTCTTTAATTTCGATTTCGTAGTCACTTAATTTAATTAGTGTATCTATAAATGACAGGTTGTTTTTAATACTAAAATCGATAACATCATCAAGATGATTAATCATTTGATTCATTTTCAAATATTCTAAATTCGCTTTTAAGCGCTTATAATTCGTCGAATTATTCATCATACAACTCTCCAATCGCATTCAAATTATCTATCGCAATCTGATTAATATCATCCATTTCTCTATTTCCAAAAGAAGATGACAGTGTTTCTAAATAATGTTCTTTTTGATAATTTAATTTACGTTGTGTGATGAGATGTTCACAAATCGATTTAGTGTTATAATAAACGTGTAGTTTTTGATCATAAACTTGAACTTCAACTATTTTCCCACAATATTCAGCTGGTACTGAATATTGATTGGACTTATATGTAATCATATTAGAGTGGTTGACTTTCAAATATTTATGTTTCACTTTATATGAGTTTCTTACATTCACATTCGGTAGTGGTTGTAAGAAACTTTTTTCTTTTTCTAAAGCAATAATAGGTATTTTACCTGTACTCGTATGAACTGAGTAGTTCAGTCGCTCATTAAGATTAGAAATAAACTTAGGAATCTCTTCCAAATATAATTCGCCTTGATAAGCATGAATTTCATCTAATATTTTCATTATCGATTCTACTTTACCCTTTGTTCTAGGACGGCCGGCAATACAAGGTTTTACTTTAAAATTAAAATCATCAGCGAATTGTTTAAATCTACGATTTATTTGACCATTTGTACGTTCTGTTCTGGGTTGATCCATGACCGTTTTCATGTTATCCGTTACAAGTTCATTAGGCACACCTCCCATTAGCTCAAACGCTTGTGTCAATAAATTAAATAAGACATCACTTGATTTATTCATTGTCACTTGCATGATTACAAAACGGGAATAAGGAAGTAGTAGTACGCCTATATTTAGTGAAACGATTTGATTATCCTTCGTTTTAAAGTTAATGCCTTCTTTCCAGTCAAACTGTGCTTGATGACCGGCTTTTGTTTCGAATCTCGTTGTGCCTTTAGGCGACATCCGTTGATAACCTTTCATAAAATAACGATTAAACTCATCATGTTTAAGGATATAAGCTCTAAATGTAGAATACGCACACGTTAACCCATGTTTATCCTTCAAATATTGCCAAAGAATACGCTTATAGTAGAACTTTTGTTCACTAGTGTCTGAAAGTAATTTTTCTATGATAGGGTAATACTTGTCAATAATAGACTGACGATTTCTCTTTTTGGTTGGCTCAAAGCCATTTAAATATTTATCAACTGTTCTTCTATCAACATCCATGTGTCTCGCTATTTCACTTTTGTTTATTTTCATGTTTAAGTTCTCCATAACAATTTTTAATTTTGGTAAATCTGTAAGAGTAGTAACTTCAAAATCAGTATTTATGTCTAAAGATAATTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_016928|1901746:1908879|1904616_1904967_-|WP_000702263.1|DBSCAN-SWA MKIRKSILAGTLAIVLASPLVTNLDKNEAQASTSLPTSNEYQNEKLANELKSLLDELNVNELATGSLNTYYKRTIKISGQKAMYALKSKDFKKMSEAKYQLQKIYNEIDEALKSKY >NC_016928|1901746:1908879|1903813_1903993_+|WP_000669789.1|DBSCAN-SWA MKFKTTKECKSNNIFKRSQEINNRESEKGCLWGISMLILLFLLILFGITACSSSIHFIN >NC_016928|1901746:1908879|1906579_1906735_+|WP_001791824.1|DBSCAN-SWA MRCSDCNISMLLRYMYRVKGKKDINCRISVRLLGHLTGYIVHSYYIQLIIT >NC_016928|1901746:1908879|1905651_1906101_+|WP_000727649.1|DBSCAN-SWA MKKKLATTVLALSFLTAGISTHHHSAKAFTFEPFPTNEEIESNKKMLEKEKAYKESFKNSGLPTTLGKLDERLRNYLKKGTKNSAQFEKMVILTENKGYYTVYLNTPLAEDRKNVELLGKMYKTYFFKKGESKSSYVINGPGKTNEYAY >NC_016928|1901746:1908879|1907586_1908879_-|WP_000777467.1|transposase|DBSCAN-SWA MKLSLDINTDFEVTTLTDLPKLKIVMENLNMKINKSEIARHMDVDRRTVDKYLNGFEPTKKRNRQSIIDKYYPIIEKLLSDTSEQKFYYKRILWQYLKDKHGLTCAYSTFRAYILKHDEFNRYFMKGYQRMSPKGTTRFETKAGHQAQFDWKEGINFKTKDNQIVSLNIGVLLLPYSRFVIMQVTMNKSSDVLFNLLTQAFELMGGVPNELVTDNMKTVMDQPRTERTNGQINRRFKQFADDFNFKVKPCIAGRPRTKGKVESIMKILDEIHAYQGELYLEEIPKFISNLNERLNYSVHTSTGKIPIIALEKEKSFLQPLPNVNVRNSYKVKHKYLKVNHSNMITYKSNQYSVPAEYCGKIVEVQVYDQKLHVYYNTKSICEHLITQRKLNYQKEHYLETLSSSFGNREMDDINQIAIDNLNAIGELYDE >NC_016928|1901746:1908879|1904016_1904325_+|WP_001795394.1|DBSCAN-SWA MKNHTNIINILLVIVNSLTHFLTLNTSFFNNSASDFCFIIGAIFFLIGIFVAIYGMKRATYWLNLLILFTNIFYFLHFCVLLLLKYIGFKLFIYEGCVLLFI >NC_016928|1901746:1908879|1902851_1903397_-|WP_049280116.1|DBSCAN-SWA MTEQSMYGIGASATRFDSKNIYIRITDIDEKSRKLNYQNLTTPDELNNKYKLKRNDILFARTGASTGKSYIHKEEKDIYNYYFAGFLIKFEIDEQNNPLFIYQFTLTSKYNKWVKVMSVRSGQPGINSEEYAKLPLVLPNKLEQQKIAEFLDRFDQQIELEKQKIEILQQQKKGLLQSMFI >NC_016928|1901746:1908879|1904303_1904564_+|WP_001791826.1|DBSCAN-SWA MCIVIYLIYSLIVYFICIINFFIMAAPFLMTNADYVWTPMTTVTLFILSLIIFLIFIKTKDVVHLTIFILNLLFSILYCLPILFYL >NC_016928|1901746:1908879|1901746_1902601_-|WP_001044434.1|DBSCAN-SWA MNKTNFGDYLNKSKSRKIYKIFDQNLKQEFSYWQFRKLFKSYTRQSDVHELKVCTQNDGTIEQIWIDKANQFGVSVTWKDNSIIGFVMRPLINYDAIKNETTLKYAVPTTDCYEVFWGGDNELYNYHYLYPHQRYAIDLVIKENHKTYKNLGKVNTDYFCFGKDIIAPANGTVEKVVSGVQDNSIGSTNESQFLGNYIVIKHAENEYSLIAHLQQYSIIVDEGQNVKYGDIIGKVGNSGNSTEPHIHFQVMNDKNIEACTSLKIRFINNRELIKGDVVCGLQGE >NC_016928|1901746:1908879|1906195_1906492_-|WP_001110822.1|DBSCAN-SWA MPAGYTLDKNNVPYKKETGYYTVANVKGNNVRDGYSTNSRITGVLPNNATIKYDGAYCINGYRWITYIANSGQRRYIATGEVDKAGNRISSFGKFSAV >NC_016928|1901746:1908879|1906832_1907594_-|WP_001066124.1|transposase|DBSCAN-SWA MNNSTNYKRLKANLEYLKMNQMINHLDDVIDFSIKNNLSFIDTLIKLSDYEIEIKEKNLIESMVKVAAFPFKKEISDFDFNFQPSINQQEIWDFTDLRFIEKYQNIVFLGSSGVGKTHLATGIGMAAAKNRVSTYFIKCHHLIENLRKAKLENRLENRLKHYSKYKLLIIDEIGYLPIGSEDAKLFFQLIDLRYEKKSTIFTTNINFNLWNEIFDDPKIANAILDRILHHSSVVKITGKSYRLKDHSPKKEIT >NC_016928|1901746:1908879|1906398_1906653_-|WP_001791825.1|DBSCAN-SWA MISFLPFTRYIYLNNIEILQSLHRILNGVVIFIGSVYQVSVMLKHQLKMKRIHQCQQVIHSIKTMYRIKKRLVITQLPMLKVIT |
12 | Staphylococcus_phage(63.64%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_016928.1|WP_000384172.1|1875675_1875900_-|hypothetical-protein |
1875675_1875900_-
Protein sequences of NC_016928.1|WP_000384172.1|1875675_1875900_-|hypothetical-protein>NC_016928.1|WP_000384172.1|1875675_1875900_-|hypothetical-protein MDYAHLNLEHFFARNDDLDVIRDRADFVMINNFTNEMMYRDGQIEGTIDLNQYYYKNRSNAASFIMMDYKKGTK |
74 aa aa | NA | NA | NA | 1850265-1896193 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 9.1|2286056|25|NC_016928|CRISPRCasFinder matches to NC_016928 position: 1874396-1874420, mismatch: 1 tgtcagcttctgtgttggggccccg CRISPR spacer tgtcagcttctatgttggggccccg Protospacer ***********.************* |