Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_005126 | Photorhabdus laumondii subsp. laumondii TTO1, complete genome | 14 crisprs | cas3,cas8e,cse2gr11,cas7,cas5,cas6e,DEDDh,PD-DExK,RT,DinG,cas3-cas2,cas8f,cas5f,cas7f,cas6f,WYL | 6 | 20 | 29 | 14 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_005126_1 | 609622-609753 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_005126_1
|
1 spacers
spacers of NC_005126_1
>1.1|609664|48|NC_005126|CRISPRCasFinder GTTGGGTGTTCAGTGAGTGCATCTCGGCTTGGTAGTGCCACTGCGCCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_005126_1
The CRISPR arrays of NC_005126_1 >merge|NC_005126|1|609622-609753|CRISPRCasFinder GACGATAATACCTGCTCAGTCTGTTGACCTGTAGGTGAAAGTGTTGGGTGTTCAGTGAGTGCATCTCGGCTTGGTAGTGCCACTGCGCCAGACGATAATAGCTGCTCAGTCTGTTGACCTGTAGGTGAAAGT >NC_005126|1|1|609622-609753|CRISPRCasFinder GACGATAATACCTGCTCAGTCTGTTGACCTGTAGGTGAAAGT GTTGGGTGTTCAGTGAGTGCATCTCGGCTTGGTAGTGCCACTGCGCCA GACGATAATAGCTGCTCAGTCTGTTGACCTGTAGGTGAAAGT
>NC_005126.1|WP_011144929.1|604341_604761_-|SMI1/KNR4-family-protein MNTKLNDVIEEIERLSDGQRNDVDLPDDELISQYEKEIGFEFSNDYKEVLKKISNIFYGTIDLLSVTRDKKYYGELSQALSDAREQGLPENLLPICEDNGSYYCIDYDGKIKYWTLDGYNEESWPDLASWIKQVWIEGN >NC_005126.1|WP_011144928.1|604053_604296_+|type-I-toxin-antitoxin-system-SymE-family-toxin MANRDCNADLAISKARRSYKVGYARTRHEDRSTGMTRYYSQHPSLHLKGNWLEEAGFATGQPVQVSVEHGQLIIRLVEYN >NC_005126.1|WP_041379902.1|603583_603955_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MAASISSEEQVFMMTLGQRISALRKHAGLTQAQLAQALNVSQQAVQSWEAGRRRIQISVLPEIAKLLSVSLEELFGEESDTIPRKRGPASRLEQQIQIISQLPRAKQKLVSEMLDAVIAQAQQ >NC_005126.1|WP_011144926.1|600117_603432_-|toprim-domain-containing-protein MTRVPDTDLARLKQTVSLLGLARKQGRPMKKRGEDYVLRCPFHNEKTPSMVISPAKNLYHCFGCGAAGSVLDWVIQTEGVTLKIAIRRLRELAGLPDMDNAVVAASSLAAPPGSQAAPLPRPKLADLDDDGQALLHQVIDFYHQHLLASPEAKAWLERRGLNHPELVSHFKLGYAGHHGISGSAGLLPSKDSQEGQQLRGKLSGLGVLRTTTRQDHFRGCVVVPIIGWAESASVASRGRVLQLYGRRTQPDYKVLKDSPKHLYLSSPLAGVWNEAAMKAAAEIILCEALIDAMTFWCAGFRNVIAAFGVNGFNREHLEALQYHGVKRVLIAFDRDEAGDRGAANVAADLLEAGIEAWRVQFPPGMDANDYALKSGNAEHALGLALQQAVWLGQGTAPGAVFSHERPVLPTVTEKPQSAGVAKSSSLAAPPALTVAPVPCERTASGELLMKSGPRVWRIRGMKKSPVPDVMKVNVQVRDETSGLFHVDTLDMYHARHRQHYISTAAQELECELSVIKREAGRVLLMLEQQQDAQQQADAEASGTTAVTVSAEDEAAALALLTSPNLTEQIINDMAACGVVGESTNLLTGYLAAVSRKLDKPLAVLIQSSSAAGKSSLMDAVLNLMPEEERIQYSAMTGQSLYYLGETSLQHKILAIAEEEGVRQAAYALKLLQSDGELKIASTGKNEQSGELVTREYRVQGPVMLMLTTTAIDVDEELLNRCLVLTVNESREQTQAIHAMQRHRQTLAGLLADSEKGYLTQLHQNAQRLLRPLKVVNPYAHQLTFLSDKTRMRRDHMKYLTLIQAIALLHQYQREVKKTTHRGQVIEYIEVTQDDIALANRLAHEVLGRTLDEMPPQTRKLLLLIQEMVNAQAQIQHCQPNEVRFTRRDIRAFTHWSDSQLKNHCQRLTEMEYLLLHGGSRGHLLHYELLWDGEDNGAAHLCGLLDVGEADSETAGSERKSDPEGRKSSPSPGQVWPESGEEKPASAQTEQGPAGAQVRADENAVIKENNHRGALPVPDRDKTPAAVPTGHESKSDLNERQSASSLGQVRAKSGVKKSPSGQAEHGFSVPQVGVTEDTVIKGKKKTRPLSAPAPQSQPEVNHGKP >NC_005126.1|WP_011144925.1|599000_600131_-|site-specific-tyrosine-recombinase-XerC MANRKPRKGSLLTVDDVYRQPVGPAHDPKSLYALLLRFVAWRQERNWSETTLKVQTHHTYHFILWATDRGLYYAADITRPILERYQRYLYQYRKTNGEPLSIRTQRTQLQPLQVWFKWLTKQNLILANPAADIELPREEKRLPRYILSIDEIEHILSLPDPNTLQGARDRALMELLWSTGIRRSEAARLDIYSIDGSRKTVTIRQGKGNKDRVLPLGERALNWLQFYQQQIRPQLLVTPDIQSLFVAMDGLDGLQPNGITNAVSGYIRAAGIEKKGACHLFRHAMATQMLENGADLRWIQAMLGHASVESTQVYTQVSIRALQAVHASTHPAEQMADEKVRDADEVGLLADLYADDNADTDTPPDSSEPTSTADSR >NC_005126.1|WP_157866891.1|598513_598771_+|hypothetical-protein MSKEPATANRAQPVQRGWGGGKSMSGGRRPICLQGCWPDVGTAAKEELRVADVRLSRLEHKAQPCAPHPPMLTRGGARHNANYTH >NC_005126.1|WP_049789730.1|597087_598143_-|DNA/RNA-non-specific-endonuclease MEWVVVENNFLTAKDVHELKEELLEAEKTGANKQTIYDKFKERSEKNRQEGVADNCSHNPGCVVSVWEMMNSGTDVASGLNRTSFFSSLSSEEMAQLNRFVQAENAESAQAIYQSLPDVVKKVVEGKEFAEQFGVMPKVGGSSGIIGLGIAGKKPATKDTGNTGTKGTNAAHNQQVNKSNLATAEKDIVLIEQGKKGGWSKVLNKPEPNKIYHVRHASGEKIYHTDGLSRPVHIETSLHLSKNDRNTYQQCKAGKCGNPGDEGGHLIASIFGGPGERLNVVPMDGNLNKGAWKQMENSWAKELKAGKKVDVKIQPIYSDNSNRPVSFNVTYKVDNERPIRLNIDNVPGGKK >NC_005126.1|WP_011144922.1|596755_597091_-|hypothetical-protein MSLDDKIYAEIGQLLYNAAPDNAKKIIMDTELSPEGDCCQFKYDYIDSNDEMRWFLPEDGIIDHRLRELLVTLRQFFIENVHSERKPHWSGCIVTIDVEQMKLNIDFKYEN >NC_005126.1|WP_011144920.1|594565_594796_-|hypothetical-protein MKFIIYFLYWSLVQSIGVFITVMAVKLLVKFVLYFETGVFFIGYKDIVEAIGIGVVMGIFLGGVICLINYLQHKRF >NC_005126.1|WP_114538522.1|591408_594429_-|hemagglutinin-repeat-containing-protein MASSDLVEHSKQTSKGLLSKSSVETHDEVHERRAQSTTLSGDRVTLQTGNDLNIIGSNVAGTQDVHLAAGNQLTITTADEARHETHFKQEKKSGLMGTGGIGFSVGKASQKSTTDIDSNLNKGSTVGSSQGSVTFSAGKQLSIHGSDVVAGRDTQLSGQNIHITSAENSHTAITKTEQKQSGLTVALSGTAGGALNSAVQTVQTANNESDSRIKALQGTKAALSGVQAVQAARLADAKGGDDKANNNLVGVSLSYGRQSSRSELKQHQTTQHQHGDIRIQGGQLQAGKDLQLNASRDIQLSSSQNTEQTTGKNSSRGSSLGVGFTAGPGGTGINLSASTNHGKGRESGNGVSHNETTLDAGQTVTLNAGRDASLKGAQVSGEQITADVKRHLTLSSEQDSNRYDMKQQNVSAGVSVTLGPQPGGSLNLSASRDKIHSNFDSVQEQTGLFAGKGGYQVKVGEHTQLDGAVIASTADKDKNTLDTGTLGFGDIKNKADFKTEHHSVSISTGGSAGGMFLSNLAANTLGGANREGHAQSTTHAAVSDGALIIRDKDKQQQDVTTLSRDTDHANNALSPIFDKEKEQQRLKQAQLIGEISAQVIDIASTEGAIIATKAANAKLENISDPDREAAIKVLKDNGKTDITPALIKDQIYKTAYNAALNESGLGTGGKYHTALQAATAAIQGLAGGNIGQALAGGASPYLAGVIKDLTTDPKTHEVDIVTNTLAHAILGAVAAEVSGNNALAGAAGAAGGELAARELMKHIHGENAKVSDLSEEEKQTISTLSTLAAGLAGGIAGDSTESAVTGAQAGKNAVENNALSLPKGMSDYGRAQSSLAMKMYKEGATPDQISEELARQARGTHPEGQDPARGLIVAWGNFFGVPLDVVMSNEKMTPEKAAEIVTSGIPTSEAKVMQYVAAKAFLALAKNPVSGSKAEGSSPQWKVGEGKFSPKDKGTVTNVEHPVGKFDGKSLPNGKENIASDKTIKNDVLEHQRVGSGEKGTVVEIK >NC_005126.1|WP_049789731.1|618576_620241_-|ShlB/FhaC/HecB-family-hemolysin-secretion/activation-protein MKKKVIIFTSFLIVTTDVKAAEISDQQLIHQQERQKALEAQLAPPPADIRLSVPETAVPSTFPVDTPCFPITRVVLEGTEHFPHWLPLKRLAQQGENQCLGTQGINILMTRIQNRLINHGYVTSRVLAPSQNLNSKTLKLMIIPGKIGHIRYTAESGNYIQRITTFPPREGELLDLRDIEQGLENLQRFPTVQADMEIVPNEQLGESDIVLNWRQSRHWRLASYLDDSGSKSTGRYQGGLTLYLDNPLALSDLFYISGGRDIRSPSGRSSKNYTIHYSLPVGYWMAGITASNYDYNQKVARPTKDDKYSGESKNLNVQLSRILHRNAGQKTSVNGEIYRRTSKSFINDLEIGVQRRETAGWKLGLSHRHYIGSATLDAGVTYQRGTRWFGAQPAPEEVRGEATALLKTTQFSAALSAPFTLFSQPFIYKTQYLRQISARTLTPQDQFSIGNRWTVRGFDGERTLNGDHGWYSRNELEWQTPLNGQSLYMGMDYGEIGGPGNEQRLGKHLAGGVLGCRGSLKGVSYDLFAGIPLSKPDGFQTSSVTTGFSLYWQY >NC_005126.1|WP_125026209.1|620516_620723_-|hypothetical-protein MKGIDGIRAWLGAFNHFQGLSPLYQDISWLNKHAVTNKKSSILTERNKLAHYLINKVIVYSVTLTLIT >NC_005126.1|WP_011144932.1|621004_621649_-|YtjB-family-periplasmic-protein MIKAKLKFRLHKTAIILICIALLVFLMQGVSYFSRSHQQAQMDQFEELAKTLAKQVAFSLSDYMESGSKDLNNERILANLHHLTTNSRILDASVYLNNGTQVAHSGENVSVRDRLSLDGKKAGSYFNYQIVVPIPGKDEPKGFLRLTLDTHKLATESKQVDNTTNLLRIMILLALAIGFILAHNLLQLTPSRWQQSPYLLTANSKSSANGEEEK >NC_005126.1|WP_011144933.1|621764_622742_+|phosphoserine-phosphatase MSNNLAYHYLPEEVHKWPGLPLSLSGEEVMPLDYRAGDSGWLIYGRGLDKQRISNFQHRLGAAIVIVSSWRIDDYQVVRIAGNLTARIKRLADECRLDVVPLGQIPRLRSPGLLVMDMDSTAIQIECIDEIARLAGVGDKVAEITERAMQGELDFSDSLRERVAQLAGADADILRQVVENLPLMPGLTSLVRKLQSFDWHVAIASGGFTYFADHLRQNLRLVAAVANQLEVKNSQLTGKVIGPVVDAKYKAATLVKLAKKLDIPLEQTVAIGDGANDLKMIRKAGLGIAYHAKPKVYAQSKVTIRHADLMGVLCVLSGGLKHEER >NC_005126.1|WP_011144934.1|622888_624271_+|DNA-repair-protein-RadA MAKAVKRAFVCNECGADYPRWQGQCSACHAWNTITEVRLAAAPSSRNERLSGYAGDAGVSRVQKLSEISLEELPRFSTGFKEFDRVLGGGVVPGSAILIGGNPGAGKSTLLLQTMCQLSAQMKTLYVTGEESLQQVAMRAHRLGLPADNLNMLSETSIEQICLIAEQEQPKLMVIDSIQVMHMADIQSSPGSVAQVRETAAYLTRFAKTRGVAIVMVGHVTKDGSLAGPKVLEHCIDCSVMLDGEADSRFRTLRSHKNRFGAVNELGVFAMTEQGLREVSNPSAIFLSRGDEVTAGSSVMVVWEGTRPLLVEIQALVDHSMMTNPRRVAVGLEQNRLAILLAVLHRHGGLQMSDQDVFVNVVGGVKVAETSADLALLLSLVSSFRDRPLPRDLVVFGEVGLAGEIRPVPSGQERISEAAKHGFKRAIVPYANMPKKALPGMEVFGVKKLADALSVMDDFD >NC_005126.1|WP_011144935.1|624284_625520_+|multifunctional-transcriptional-regulator/nicotinamide-nucleotide-adenylyltransferase/ribosylnicotinamide-kinase-NadR MGQFDYLKEAIKQTGYTLQQVADASGMTKGYLSQLINDKIKSPSAQKLAALHHYLRLQYPVQNKTVGVVFGKFYPLHTGHIYLIQRACSQVDELHIILCHDEPRDRELFMSSSMSQQPTVSDRLRWLLQTFKYQKNIHIHSFDEQGIEPYPHGWDVWSDGMKAFMSKKGIHPTYIYSSETQDSPRYKEHLGIETILIDPQRSFMKISGRHIRQDPFRHWEYIPTEVKPFFVRTVAILGGESSGKSTLVNKLANIFNTTSAWEYGRDYVFSHLGGDEMALQYSDYDKIALGQAQYIDFAVKYANKVTFIDTDFVTTQAFCKRYEGREHPFVQALIDEYRFDLVILLENNTPWVADGLRSLGSEQDRKAFQQLLEDMLKSNNIEYVNVDSPDYDQRFLRCIELIQQLLAANPK >NC_005126.1|WP_041379903.1|626194_626941_+|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MNLNQIATIEAIDISYGFSNSKANQKTISDITLSIFPGEFTLINGDLCSGKSTLLAMISGLLPLDGGKILIADNELGRLNNFELDRFHLMNCGFIFQRINLSNELTVLDNLLLSLSCGITTSHQEAIVRATKALNIVGLKHKKDIYPKELRDNEKQRLAIASAIVKSPRYLFADEPTRHLNNYDCQTAIDILGFIAHNQRGTVVVASQDNRLIKHADRIITLKGGKIIHDTYLTHNIMNKTMSLYLNN >NC_005126.1|WP_011144937.1|626979_628647_-|energy-dependent-translational-throttle-protein-EttA MAQYVYTMHRVGKIVPPKRHILKNISLSFFPGAKIGVLGLNGAGKSTLLRIMAGIDNDIEGEARPQPGIKIGYLPQEPKLNLEYTVREAVEEAVSEVKHALTRLDEVYAAYADPDADFDKLAKEQGELEAIIQSHDGHNLDNQLERAADALRLPPWDAKIEHLSGGERRRVAICRLLLEKPDMLLLDEPTNHLDAESVAWLERFLHNYEGTVVAITHDRYFLDNVAGWILELDRGEGIPWEGNYSSWLEQKDARLAQEAATEAARRKSIEKELEWVRQNPKGRQAKGKARLARFEELNSVEYQKRNETSELFIPPGPRLGDKILEVENLTKSYGDRVLIDNLNFSLPKGAIVGIIGPNGAGKSTLFRMISNQEQPDSGTITLGETVKLASVDQFRDNMDDKKTVWEEISGGQDIMRIGNFELPSRAYVGRFNFKGIDQGKRVGELSGGERGRLHLAKLLQVGGNMLLLDEPTNDLDIETLRALENALLEFPGCAMVISHDRWFLDRIATHIIDYQDEGKVTFFEGNFSEYEDYKKRTLGAEALEPHRIKYKRISK >NC_005126.1|WP_011144938.1|629143_631060_+|murein-transglycosylase MAKWQCLTMAIGLIFISVAVNADSLENQRQRYQQIKQAWNVSDRAEVARLMPTLKNYPLYPYLQYRELAQDLSLATPTRIRDFIDRHPNLPPARSLSSRFINELARREEWRELLAFTSTAPKSITARCHYYFAKWATGEEQIAWQGAKEVWLNGRSLPDSCDKLFDVWQQTGHLSVKLILQRISLALKAGNTSLVSYLAKQLPQGYKSISEGLIKLQNDPVTVTDFADHTGPTDFSRVATLAAFSRFARQDPEQARVIIPSIVRVQKMTASERQRLKDIVAWQLMGDVSDEQEKWRDDVIRDSQSVALLERRVRLALGHADERGVAQWIKLLPLENQDKEEWRYWRANILLAQGNKSEGEAILRQLTEGRGFYPMVAAQKLNVSYPLMMNSAKKPDAAIASIPEVQRVRELLYWQMDSLARIEWSYLVASQDKLKQQQLARYAFDQKWAALSVQATITGKMWDYLEERFPLAWRREFSHFTANKGISQSYAMAIARQESAWNPQANSPVGAIGLMQVMPETAQDTVKQNGIQGYINSSQLINPLTNIEIGTAYLESVYQRFGNNRILASAAYNAGPTRVDRWLSNSGGRLDAIAFIESIPFSETRNYVKNILVYDVFYTYFMGKSSNVLTDAEWQRRY >NC_005126.1|WP_011144939.1|631119_631440_+|trp-operon-repressor MTTNHLTDPALSPQDHEDWQCFVTLLQQAFAENLQHPILQLLLTPDERTALATRVRIIKELMSGKMSQRELKNELGVGIATITRGSNSLKFASNDVKAWLEQQLLK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_005126_2 | 2016491-2016583 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_005126_2
|
1 spacers
spacers of NC_005126_2
>2.1|2016517|41|NC_005126|CRISPRCasFinder ACCCTTCATCTTTCAAGTTGCTTCTTTGTTGGCTGCACTCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_005126_2
The CRISPR arrays of NC_005126_2 >merge|NC_005126|2|2016491-2016583|CRISPRCasFinder CTCACCCCGGTCACATAGTTATCTATACCCTTCATCTTTCAAGTTGCTTCTTTGTTGGCTGCACTCGCTCACCCCGGTCACATAGTTACCTAT >NC_005126|2|2|2016491-2016583|CRISPRCasFinder CTCACCCCGGTCACATAGTTATCTAT ACCCTTCATCTTTCAAGTTGCTTCTTTGTTGGCTGCACTCG CTCACCCCGGTCACATAGTTACCTAT
>NC_005126.1|WP_011145973.1|2015262_2015712_-|phage-tail-protein MTITPEQIAVDYPIPAYRFVVSVGDEKIPFNNVSGLDVHYDVIEYKDGTGNYYKMPGQRQSINITLRKGVFPGDTKLFDWINSIQLNQVEKKDIAISLTNETGSQILMTWNVANAFPTSFTSPSFDAASNDIAIQEIALVADRVTIQAP >NC_005126.1|WP_011145972.1|2014004_2015087_-|phage-tail-sheath-family-protein MPITPTYPGVYIEEDASPSLSIRSGATAVPVFAVANNNSLIPDNSYIRISNWLEYLTLKGKQFDPTNTLDIALRAYFINGGGYAYLVKTTNLESQIPKLDDVTLLIAAGEDITTAVGTLCQLGKGLFAIFDGPTTQIASTQAPDDVLKPYPATQYGAVYYPWLTAEWGENKASIDIPPSAVMAGIYANVDNSRGVWQAPANVPVQGGLQPKYPMTDDLQGRYNQGKALNMIRTFPKSGTLVWGARTLEDSDNWRYIPVRRLFNSAERDIKNAMSFAVFEPNSQPTWEAVRRAIDNYLHALWQQGGLMGNKAEQAYFVQIGKDVTMTDDDIKQGKMIVKIGMAAVRPAEFIILQFTQNTAQ >NC_005126.1|WP_011145971.1|2012607_2013993_-|phage-tail-sheath-family-protein MPTTPTYPGVYIEEDASLSLSISHGNTAIPVFIGRFQPKKASATLKAIRVSSWLDFTNLFNVGCITSIAITSTKPTPTPPPPPSPSGKVAGDTATADIALDADDTNTDYTYAINTVTSTTSSDALKLYFQNGGGPCYILSIADSGNSETTALLPELIEQALEITLIVCPEQDSSYQLAIYNSLPPALLNAGYFLIADSQGKTTKPTVNVPSQTATYYPAVKISQLMQTEDSLIAVSGYEDAASNEVKNLAQLKQKNSTVYQQAVQAIQGKMKSSSNTIPASAVMAGVYCATDASRGVWKAPANVVLSGISDVTERLNDDEQGAMNLLGINAIRYFNGRGFVVWGARTLQDDDNWRYIPVRRLFNSAERDIKQAMRTAVFEPNSQPTWERVKSAIDNYLYSLWQQGALAGNKPQEAYFVQIGKGITMSDDDIKQGKMIVKVGMAAVRPAEFIILQFSQNVAQ >NC_005126.1|WP_011145970.1|2011376_2012552_-|phage-tail-sheath-family-protein MEIKQPGVTVTESLISPEPDDVFIGIPVFIGYTPSPVDKIAIKLNSLADFARSFPESGLMYYSVRHFFENGGQQAYVLSLGTEQQLSDFSSLITALQQTWITQAISAENDITLIITPDAIRFNQTEVSYIQRDLWLQFWQSVLNLCKSRRGIMGLLDAPDNPTLAAECLKQFASADQQWGAVYWPRLKSAYQDQAQNPIVLSPTAAVAAVIQNNDNQQGVWTAPANVALAKVISPVHSYIEANALFNPSGTSLNLVRSFPGKGIKIWGCRTLENTPGSPWRYIQIRRLVSYIEAHMTQLGRAFIFEPNNAITWMKLKGQAYNWLRQLWLNGGLRGTQEDQAFELLLGVGESMSETDIQAGKMIMKISLAVLIPAEFIELSLTFDTRTGTTR >NC_005126.1|WP_011145969.1|2010882_2011341_-|phage-tail-protein MSNLYTPSVSHRFIASFLFNNIPSPFDIAFQRISGLSRELQTTQHSQGGENARNTWLAEKIQHGSLLLERGVMTVTPLTLVFDRVLRGEKAVYADVVIMLLNEHSLPTASWTLSNALPVRWSTSDFDANSNTVLVNSLELRYQDMRWLGVKV >NC_005126.1|WP_011145968.1|2010706_2010886_-|hypothetical-protein MTVEIKELIIQAKVTDSTSNSSSPPTLAQETLDNARLIEIVKREVLEALREAGVHYEPN >NC_005126.1|WP_011145967.1|2010036_2010720_-|hypothetical-protein MSLIERSLSKLTLTAFKDREGKISVGSLQAMYNPDGIQLDYQTRYQQDESVNNASQSSRYMLSQPAGLTLVLLFDATMPGNNIPVETQLATLKTLCAVDASTSVPHFLKIKWGKMRWENKGYFACRATGLTIHYTLFDRDATPLRASATLSLIADESLVIQATEQQLQSPPVIAVNVTDMLSLPLIALGVSAALVGGIDYLALARQNDLDNLDDFTPGQTLQAQGDA >NC_005126.1|WP_011145966.1|2008438_2010040_-|hypothetical-protein MKIPAVDIKIAGKTLSQFSVISLTVNHQINGIPSAKITLGIAGDANAIFAPQAQAELTSCRPNQELIVQLQETVLFKGIIVRQALKFKGQDSLVTLTAKHSLQKLTDGFHSQLFSQQNDEDIIRKLFDQAKITVTIKQVPQLKIKHEQMVQFRCNDWKFLKSRLAAANIWLLPGNEAVTLATPESLNQSTVHTIKQRAGDQDIVLFEADLQFDNRHSPKTVSVQAWDITQQELSQANQAENSGVGSGQLASDSLATLTDQAWQWVFSSPQDNEQAKYLAQGILNNLRSDNVSGNFEVAGDSRYQPGDLLALNGFGQGMDGQGIITGVSQTINQRQGWRTRLTLGLLLETEPVVPQVKELHVGIVEKYQQDKQSLDRIPVRIPALDLTNSVLFARLGKPYASHESGFCFYPEPGDEVIIGFFECDPRFPVILGAMHNPKNKTPIEPSEKNPIKTLVIKQGDNKQALVLNHQDKIAAINSGEHSLSLQQDKDITLKSAKNIITTGQKINIQAKESLSATGESSVDIKGKEINLTQ >NC_005126.1|WP_011145965.1|2007979_2008426_-|GPW/gp25-family-protein MTNKILADIYGRGWTFPPQFFVKDNSHPKIQTGVTMAEGAENVRQSMKILFLTEPGERIMREDYGCGLNDYLFANINDELIAEIKTRIEERVLRYEPRAEITVIQVDQRTDLLNTLHVQVTYALRGSDINQQLEGVLEVNEGRVQVNL >NC_005126.1|WP_011145964.1|2007566_2007983_-|hypothetical-protein MSKQLVVDGDTLLFEQFFGNRQVTILEPATIQGSGHAQIQNKKIAIVGDEKEVKLQAQYITPDYPTPGTGIVTIAQLDASQQANFCHSPAAVIIVGQQFTARFTPTQPANNPSSGPDVTTPSMGKGYFIASQYIVNAG >NC_005126.1|WP_011145974.1|2016642_2017590_-|hypothetical-protein MPNSKYSEKVNHSANGAEKCSIHSNQYNINNCTLGLGLDLNKKLRTGNERNIEGAQPFIPFPSKQKQYSTSPIAMADILNESALTSQPIITDLINPQKIKMSDGVKNILNNKEGGGDLVFKALQIKPSDETLPFNALKIVDTYQEEMPNKDMSISAYWAPQGGYVDIPAQPDISRHPQYVFTPNFSGCSFVVDKMNEDTLRVRHVQGGQEDVEYNNQNIDHGMGMITAMEFRDYGYHEADDKVIENTYGFAFLKFNQEKKQWQLHYQKIAAAPNIINIKTKSSWLPFSKPSIEADTFTFKNMKVPGYSRKNINNN >NC_005126.1|WP_011145976.1|2018791_2019694_-|DUF4255-domain-containing-protein MTILIASDNAIIEVNNALNTILSQHLNINGNKIDIRFDLPEINSIQSEPTVSVFLYDINEDLQLRSAEPRRYNPMTSTLLPGWVNINCHYLITYWDANKPSSDSSSPDSQPNNQAAQVMTRVLNALINNRQLTDIPGAYTRIIPQQENLNSLGNFWQALGNRPRLSLMYSITVPMKLQNIKDNITPINQISASVEQKPNLNNSQINQALVDKLCADLGGTEDARLALAKVNLVTKFVTDNNDSNENKSIILEISGITYSTYLPKIRNIISIWVNSQKSVVKVNGIDITISKEDSKELIEI >NC_005126.1|WP_011145977.1|2019718_2021785_-|ATP-binding-protein 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>NC_005126.1|WP_011145979.1|2024610_2025561_-|hypothetical-protein MEKKSNLSNAKSNMENIKSNGPSADDLKKRFKEGSIPLQTDYADLINIADMGRWAVGKAPGQTDNPNSALKLDNGGALAVKINDNGGLKADENGLSVKIKNKSLSVDNNGLAVNAGRGLRINNDKLEVNNHHGIEIVNEGVKVKAGEGIKVDSNGVSLKMGKPISNAFSPLILEPKNDVLSVKIGNGLFDRDNGISVNPGNGIDAGYDYVAVKASNGITVDNSGVSVKAGNGITVNSNGVSVNIQQIASALADLIIPSGTIVPFYSNGSLPNGWLWCDGNNGTPNLNKGIPNEITLVAGWIKKINSAYFILNNIYP >NC_005126.1|WP_011145980.1|2025762_2028669_-|hypothetical-protein 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_005126_3 | 2126977-2128442 | TypeI-F |
I-F
Consensus repeat of NC_005126_3
|
24 spacers
spacers of NC_005126_3
>3.1|2127005|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAAGTAACTATTTTCGTTACCGTAACCTTCT >3.2|2127065|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCAAGTAGTGCTTACAAAGGAGAAGAATGTA >3.3|2127125|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGCATACCAAGCATCGAATCCCCGTTTAGATA >3.4|2127185|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAACGATAACCCCATGCTTCTAATGATTGAG >3.5|2127245|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTCCGCTGTACGTTGTACTGCACTATTTAAT >3.6|2127305|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCAAAGCACAGCAACGAACAGGCAAGGAAAG >3.7|2127365|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGATACGTCCACAGGTAGCTATTTTCGTTACC >3.8|2127425|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGGGAGTGGACCAAAGGGTAAACCTCAGTTA >3.9|2127485|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATCAAACTCCAGTCAGTATCGCTATCCGTAC >3.10|2127545|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTAAACAAACGAAGTATCGGTCTGCCGCTCTT >3.11|2127605|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGACGTGCTCCTTGGGTCCTCTCATTAAGTGT >3.12|2127665|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCATCCATCAACATTAAGCCCGTTGACGATT >3.13|2127725|30|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTAGCGCCCGATCCCTGATTCAGCTTTAA >3.14|2127783|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTACATAGGCGGCGAGTTCTGCACTGATAGAA >3.15|2127843|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAGATGAATGACATTGCGCTTCAATGGCAAAC >3.16|2127903|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAACACATCAGCAAGCTGTTGCTGTGGCAAGT >3.17|2127963|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACACGTCAGTTCGATAATAAAATCCAGGTCAT >3.18|2128023|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAATGAGAGTAAGACGATTAGATAGCGATCA >3.19|2128083|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTCTCTGTATCAATAACCGCTGTTGTGCCGC >3.20|2128143|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATGAAATTAATCGTTTCTCTTACAATATTTC >3.21|2128203|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACTATGTTGGGATATGCTGCATTATCTAGAA >3.22|2128263|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTTGGCCCACATGCGCCACAACGTGGGATGG >3.23|2128323|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTATGCACCTTGCGGAAAGCGACAAAGTGGT >3.24|2128383|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATCCCCGGTCGCTATCAGTAATTGCATCAG |
cas3-cas2,cas8f,cas5f |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_005126_3
The CRISPR arrays of NC_005126_3 >merge|NC_005126|3|2126977-2128442|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT 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>NC_005126|3|1|2126977-2128442|PILER-CR GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA ACAAGTAACTATTTTCGTTACCGTAACCTTCT GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA ATCAAGTAGTGCTTACAAAGGAGAAGAATGTA GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA CGCATACCAAGCATCGAATCCCCGTTTAGATA GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TAAACGATAACCCCATGCTTCTAATGATTGAG GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TTTCCGCTGTACGTTGTACTGCACTATTTAAT GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA ATCAAAGCACAGCAACGAACAGGCAAGGAAAG CCGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TGATACGTCCACAGGTAGCTATTTTCGTTACC GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA AAGGGAGTGGACCAAAGGGTAAACCTCAGTTA GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA AATCAAACTCCAGTCAGTATCGCTATCCGTAC GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA GTAAACAAACGAAGTATCGGTCTGCCGCTCTT GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA AGACGTGCTCCTTGGGTCCTCTCATTAAGTGT GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TGCATCCATCAACATTAAGCCCGTTGACGATT GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA GGTAGCGCCCGATCCCTGATTCAGCTTTAA GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TTACATAGGCGGCGAGTTCTGCACTGATAGAA GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA GAGATGAATGACATTGCGCTTCAATGGCAAAC GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA 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GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TTACATAGGCGGCGAGTTCTGCACTGATAGAA GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA GAGATGAATGACATTGCGCTTCAATGGCAAAC GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TAACACATCAGCAAGCTGTTGCTGTGGCAAGT GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA ACACGTCAGTTCGATAATAAAATCCAGGTCAT GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA AAAATGAGAGTAAGACGATTAGATAGCGATCA GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TTTCTCTGTATCAATAACCGCTGTTGTGCCGC GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA AATGAAATTAATCGTTTCTCTTACAATATTTC GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TACTATGTTGGGATATGCTGCATTATCTAGAA GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TCTTGGCCCACATGCGCCACAACGTGGGATGG GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA AGTATGCACCTTGCGGAAAGCGACAAAGTGGT GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA AAATCCCCGGTCGCTATCAGTAATTGCATCAG GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAG
>NC_005126.1|WP_011146059.1|2126138_2126552_+|CoA-binding-protein MSDQKIADILKRVKTIALVGASEKTARPSYKVMAYLLEQGYQVIPVSPKLAGQTLLGQRVYAQLADIPQAVDMVDVFRNADAAYDIAREAIDIKAKVLWLQLGVINEQAKILAEEAGLDVVMDRCPKIEIPRLGLEK >NC_005126.1|WP_011146058.1|2125557_2126016_-|methylglyoxal-synthase MELTTRTMATAKNIALIAHDHCKTSLLAWSKKHKSLLKKHHLYATGTTGNLIQNETGLSVTNMLSGPMGGDQQIGSLISEGKIDVLIFFWDPLNSVPHDPDVKALLRLATVWNIPVATNLASADFIVSSPLFSESVDIQVPDYQHYLNGRLK >NC_005126.1|WP_011146057.1|2123380_2125435_+|DNA-helicase-IV MELKATQIGQCLAQHPYNRVRLLNAGIEVSGEKHQYLIPFNQLINIQCKRGIIWGELEFELSDGQAVRLHGTEWQQTQRFYHYLLGEWQKWSQEMSDISANVLTAQVSEINRIGQQNRWLKKADLLQLQQQIQATFQALPLPLQRLEQFDHCRDGYQICLRWLENGEKCVEKINLQWTERMLEQHCDFFQRIEASPLNRSQSLAVINGENSVLVLAGAGSGKTSVLVARAGWLLLLQQAIPEQILLLAFSHQAVNEMNERIQSRLGVNDIKVKTFHTLALHIIQQGSNKAPKISVLETDGQKRKDFLIKHWQQQCSEKKAQAKGWREWLTDELKWEVPEGEFWHDEQLANRLSNRLECWLGLMRMHGGSQKAMIEQVQEEYLDRFQKCIRLMEPLLKAWKSELKTEGAVDYSGLIHQAVNILDKGRFISPWKHILVDEFQDISPLWAKLLTAMRTQNSQSCLFAVGDDWQAIYRFSGAERMLTSAFANYFGKGAECVLDISYRLNDRISKITNAFVQQNPNQLRKSLNGLTKGNKKSIVILPEDQLEPLLNKMSGYVTEQETILLLARYHYLKPELLKKAATRWPKLKIEFMTIHASKGQQADYVIILGLHQGQDGFPAPARESVMEWVLLPQPEDFSDAEERRLLYVALTRAKKQVWLMQDKNNPSVFVRQLEQLSVPVQRKP >NC_005126.1|WP_011146056.1|2121028_2123170_-|TIGR01666-family-membrane-protein MLTAFSGLRRFLYNSHFLYYNRILIALAGTTLVPWFLDKEPKITISLTLGVVAAALADLDDRLTGRLRNLVITLISFFIASVSIELLFPYPWLFTIGLALSTCSFILLGALGQRYATIAFGALLIAIYTMLGSSIFPLWYQQPLLLLTGAIWYNLLTLTGHLLFPIRPLQDNLARCYQQLAVYLDAKANLFDPDIIEEGYQQSVVNVAMANSVLVNTLNQAKTSLLTRLKGDNRQRGTHHTLHYYFVAQDIHERASSSHVQYQSLLHTFRYSDILFRFQRLLSVQARVCEQIAQSILWHKPYQHNPRIERAFNYLESSLQQLSQQQKHNLKITALYNLLKNLRAIDAQLASMSSGRYNLSKDREDETQLSDETLTGWRDICLRLNHHLTPQSALFRHAIRMSVLLCSGYTMIQWLDLQHGYWILLTSLFVCQPNYSATRRRLTLRIIGTVAGVLIGLPILYFVPSIEGQLVLIVISGVLFFVFRNTQYAHATLFITLLVLLCFNLLGEGFDVALPRIIDTLIGCGSAWLAVNFIWPDWKFRQLSQVINRTMNTNCRYLDAILVQYYQGKDNGLTYRIARRDAHNSDAELVSAISNMSAEPKSDQTSQEKAFQLLCLNHTMLSYISALGAHRDKLDNKAILDILNDAVCYVDTALKSILIDDDRIKQIPVNIVKRIEQAPAERNSKEQLVLQQISLLIELLPKITNIIKQINQL >NC_005126.1|WP_011146055.1|2120366_2120969_+|TfoX/Sxy-family-DNA-transformation-protein MFLSEVRFTQLKNGFSSFGALTRKPQFGGYSLLADGIMFAIIADGELYLRGNGHAEVLFKARGMKNYIYSKKGVPVTLRYYQVVESLWQDQELLSQYAYLAYHYSFIEMAGKKKIPERLKDLPNLGMSLERQLWKVGICKVEDLRLLGAKASYLKLHQYKRNSNVSLLLALAGAIEGCHSAVLPVQIRNDLLRWHKELAC >NC_005126.1|WP_011146054.1|2119584_2120118_-|cell-division-inhibitor-SulA MGIQSSWFYSSKHQSAKREGMVKEGKGGIVSELIYSNNQYSDNQYSDNQAVINRILLPLLRQSGNEARWLLWVSPHKKLSRQWLINSGLPLDKIIQLNRMSSITTVEAMERALASGNYSVVLGWLPTLSGKDTVRLQAAAQKGNALGFIMRPQDVSKETSRAESRSDLLKIHSIHYH >NC_005126.1|WP_011146053.1|2117793_2118900_-|porin-OmpA MKKIAIAVAVAVAAFTTATQAAPKDNTWYTGGKLGWSQYHDVNFYGNGYTSAIGNGPTHKNQLGAGAFLGYQANPYLGFEIGYDWLGRMPYKGSVNNGAFKAHGFQMATKLSYPIMDDLDIYTRLGGMVWRADSKATYSATNTHLKNHDTGVSPLAAIGVEYAITKDWATRLDYQWVNNIGDAGSVGARPDNGLLSVGVSYRFGQDEAAAPIVAPAPVVAPTPAPAPVVENKRFTLRSDVLFEFASSELKAEGKHNLDQLYTELANIDPNQGKVLVLGYTDRIGKDVYNQKLSQKRAQSVVDYLVSKGIPSGSISAEGHGKANPVTGSTCDKVHKPNLINCLAPDRRVEIEIQGTKEVVTQAQSQSAQ >NC_005126.1|WP_011146052.1|2117188_2117644_+|macrodomain-Ter-protein-MatP MKYQQLENLECGWKWTYLMKKHQEGELITKYIENSAAHAAVDKLIELESEPVRVLKWIEQHMNPDLSNRMKQTIRARRKRHFNAEHQHTRKKSIDLDFPVWHRLSALSQRRGNTLSETIIQLIEDAERKEKYANQMSSLKHDLEAILGKKE >NC_005126.1|WP_011146051.1|2115251_2116982_-|Lon-protease-family-protein MTTNKLDWQALLPNCVPYDALFHSASQQASASMEAVQSRLHSGLQLFCRMDSRQPFMLLKAEECDIYLSALAESIRPLLTKELPQIGGNYHIQQQKISWQPSTAGHFTPELRVAYREWIEAEQLFGRFHSHNGEIHLQPGLIHQVNGGVLILPLRTLLSQPLMWVRLKQMIIQQRFEWLSPDSNKPLPLPIPSMPLKLRLILVGDRLSLEEFQATEPELAKSALYGEFELDMPFHNEQDLSLWCNYINGLIQQWQLPPLHHNAWPELVQQATRHVEDQHHLPLDMLWLQRQLTTAALYQQENQITAQSIKQAEENRRWRHNYLPERGLEEIHKGQILIHTQGMVIGQINGLSVLEYPGHPDPVGEPSRITCVAHMGDGEFVDVERKVELGGNIHAKGMMIMQAFLISELKLDQPQPFSASIVFEQSYGEVDGDSASLAELCALISALSLQPIDQQLAVTGAVDQFGYVQPIGGINEKIEGFFEVCHRRGLTGQQGVILPAANIHHLCLNQPIVDAVKAQKFHLWSVKHVSEALPLLTGIPYYDQQETHLLAMIQDRITQANNQERPKFPWFLRWLG >NC_005126.1|WP_011146050.1|2114649_2115168_-|bifunctional-3-hydroxydecanoyl-ACP-dehydratase/trans-2-decenoyl-ACP-isomerase MVDKLKSYTKEDLIASGRSELFGENGPPLPSGNMLMMDRIIEMTENGGTHDKGYIEAELDITPDLWFFDCHFIDDPVMPGCLGLDAMWQLVGFFLGWLGGEGKGRALGVGEVKFTGQVLPTAKKVTYRINFKRVINRKLIMGLADGEVLVDGKIIYTATDLKVGLFKDTSAF >NC_005126.1|WP_011146062.1|2128482_2128803_-|heat-shock-protein-HspQ MIIASKFGIGQQVRHKLLGYLGVIVDIDVEYSLEQPQEDDIASNATLRSAPWYHVVMEDDNGQPVHTYLAEAQLAYETSDEHPEQPSLDELAESIRHQLLAPRLRN >NC_005126.1|WP_011146063.1|2129026_2129305_+|acylphosphatase MIKYGVTIYVYGRVQGVGFRYQTFRWAKLNRLTGYVCNLHDGSVKIVAYGDSEQLNTLTHWLEQGGPPGARIDNFSSQSCAVEDIADFIVRH >NC_005126.1|WP_041380794.1|2129318_2129648_-|sulfurtransferase-TusE MLVFEGQEIETDAQGYLKNSSDWEEAIALLLAKQEEITLTEPHWEVIRFIREFYKEFNTSPAIRMLVKAIAQKYGEEKGNSRYLYRLFPKGPAKQATKIAGLPKPVKCI >NC_005126.1|WP_125043751.1|2129980_2130220_+|hypothetical-protein MSVPHRSNGAGEFIRMCTHLYRRGLMYYFRRRIPADLVQVCSKSEIVQSLKTTNRVEALIRLRQLDVNLDLKFAEMRLG >NC_005126.1|WP_011146066.1|2131017_2132043_+|IS630-like-element-ISPlu3-family-transposase MKIFITSEQKIKLERLHDTTRDGQVRDRIKAILLASEGWSSVMIAQALRLHQTTVDRHISDYLNQGKLKSDNGGSDSLLSREQTDFLINHLSQHLFHHTHEIVAYVAQLWNITFSIPGMNKWLHRQGFSYKKPCGVPHKFDAEKQRQFIEYYENLKVTAKDEPILFLDAVHPTQGTKLSYGWMRKGEKKTVKTTGSRTRLNILGALNLNAIGRTVFQEYQTINDYNICCFFNEIRKSYPDYHQKIHLIVDGAGYNKAHLVKEWAYVSNIELHYLPPYSPNLNPIERLWKVMNEQVRNNRYFADKHEFRDNVFKFFTTTLPDIADSLMSRINDHFQVLKTAS >NC_005126.1|WP_011146067.1|2132246_2132786_+|hypothetical-protein MMYSVKGVQYQTLVNIPKNIGLGYSGSNGKVHLVDGDFLFYGSVDIQGENGTINKKTEVDANWTVKFNEMPCDSQGNILLKSHWFSPASNDRWLIKDKMRLMILCSKEPTHRLILETGEIIDNKVDNDYLRNMIFSYTITTALIVSNAFNLKNALIFSGHFLNYRDNPPLFRWNGILDI >NC_005126.1|WP_011146068.1|2133687_2136969_+|type-I-F-CRISPR-associated-helicase-Cas3 MNILLVSQCNKRALTETRRILDQFAERKGDRTWQTAITQEGLNTLRKLLRKTARRNTAVACHWIKSGGQTELLWIVGNLRRFNSRGVVPTNTTQRDVLKSQDENHWHSVEAISLLAAIAGLFHDFGKANTLFQQGLQGNGRFQPYRHEWVSLRLFQAFVAEQDDREWMTSLSQIEPSDEDKILSRLVKDDIDKKYANPFVNLPPLATTVAWLILSHHRLPVYPSYDDRYVRRPQLKDIDSWLINHLEPSWNSINMDNKVWSDQDKRDVWTFPNGTPIRSQTWRQKAQKFAQRALQSTSLVQYGNLNQRFTSHMSRLVLMLADHHYSSLPATLGWQDVNYGVFANTDRTTGKCKQRLDEHNIGVGQNALLLGRSLPHIRKTLPAITRHKGFKQRSKDEKYRWQDQAFYVACALRERSVEQGFFGINMASTGCGKTFANARIMYGLADEKQGCRFSIALGLRTLTLQTGDALRKRLHLEEDDLAVLIGSQAVKELHQLRQKALEPDVGSISAEALFAEHQYVSYDGSLDDGRLSHWLRKDNKLNKLLSAPVLVATIDHLIPATEGIRGGKQIAPMLRLLTSDLVLDEPDDFDINDLSALCRLVNWAGLLGSRVLLSSATLPPALIQALFNAYRAGRQDYQLACGQPGAPVNICCAWFDEYETTQQDVVNAYQFQEQHNIFVNKRIGRLKKIVPLRKAELVPIISESRKINDVINTIAEVMHHSILKLREEHHQTHSSGKTVSIGLIRMANIDPLVAVAQRLLQMPSPENVRIHYCVYHSQHPMAIRSHLEHRLDSTLTRYDEEELWQVAEIRKVLEETSERDHIFVVAATSVAEVGRDHDYDWSIAEPSSMRSLIQLAGRIQRHRRKEPREPNLHILAKNYKALKATDLKHPVYCRPGFESKDYLFANHDLHELLEPYQYELISALPRIKERDNAGDSSPFENLVDLEHQRLWEELQGGSDNKHGYCSALWWREQASWCAELQRHKPFRQSEPDELHYLWLGEEGEEAKFVALDSGQAGIKESDTFDYVPELEFALGVSAWIELDTETIYQNLADTNEMELKNVSQHFGEIRLRKKDDGEAWRYHPFLGVFGEIG >NC_005126.1|WP_011146069.1|2137062_2137323_+|type-II-toxin-antitoxin-system-Phd/YefM-family-antitoxin MYELSANEVKTHFGDMLLRAQRAPIQINKNGKLVAVVLSIDEYENIEALKIQLLKSRAIQTKADIEEGNLVDGESFFDELETGKYD >NC_005126.1|WP_011146070.1|2138002_2139361_+|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy1 MNENGLSRFIVDYIESRKQSKLEVFDKEAEKKLAKLTSMEDITPVKQKLAEQRKELEEHYEVRNWLDDAVSRVDQIRLVTHVLKFAHTDARGSSIFAVQSKANVKEDIKYLSMAALDRPAIDAAGNAAALDIAKLLLTEYREGDSLLANINRADYSALAELAKNEQQLELWINGFRQVLSDKRLSSHRLAKQLYFPVGYDKYHLLGPLFSSSLAHTMHQRITEARFGELSKEINKARKEESWRPETIVVYPNTAVQYFGSTKPQITSYLNNMRGGRVYLLPCSAPEWKNITKPPMKHRSIFDLGCEFVSLVRSTVWQMQRYLLSVQKYENTLEIQQCRQEYVDEIIDVLFNYVVGIQNLIELKGWSANEDCALKRAQQLWLDPYRCQQDETFKFEREGGDWKKEIAADFSYWLNQSLKHERLEMGLSERREWASVFKERLREFEDELPEVMP >NC_005126.1|WP_011146071.1|2139357_2140326_+|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy2 MSHLIILRKIKVENANAITGITYGFPAITHFLGFTHSISRKLQKSYNLKLENCGVICHNHQLHAYRSDPIKDKVFALTRNPLTKEAKTATINEEGRMHMTVSLLIECSGEIAGDTEANELEQYLLEICPTQRLAGGTITEIAKVDVIAFPQEGQDTRKLMRRLLPGFALLDRSELLAKHYEELKQDNPQAEMIDAWLDFSAIKMRAIPKQDDKQPEIGDPAYWEYVPKPASGYLVPLMTGYQAISPLYPAGKVDKTRDPNAPFCFVEAIYGVGEWKSPHRIDDIRQLLWCYDYQEGEGVYRCCNQQTVSRQSKPNKKVRIID |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_005126_4 | 2133398-2133556 | TypeI-F |
I-F
Consensus repeat of NC_005126_4
|
2 spacers
spacers of NC_005126_4
>4.1|2133440|26|NC_005126|PILER-CR CAACAAAACCAACATGTCCTCCACCA >4.2|2133508|18|NC_005126|PILER-CR GCATCCCGATCACTTCGG |
cas3-cas2,cas8f,cas5f,cas7f,cas6f |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_005126_4
The CRISPR arrays of NC_005126_4 >merge|NC_005126|4|2133398-2133556|PILER-CR TAATATGTAACAGTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAAAACAACAAAACCAACATGTCCTCCACCAATATGTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAAAAGCATCCCGATCACTTCGGTAATATGAATGAGTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAA >NC_005126|4|2|2133398-2133556|PILER-CR TAATATGTAACAGTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAAAA CAACAAAACCAACATGTCCTCCACCA ATATGTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAAAAGCATCCCG ATCACTTCGGTAATATGA ATGAGTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAA
>NC_005126.1|WP_011146067.1|2132246_2132786_+|hypothetical-protein MMYSVKGVQYQTLVNIPKNIGLGYSGSNGKVHLVDGDFLFYGSVDIQGENGTINKKTEVDANWTVKFNEMPCDSQGNILLKSHWFSPASNDRWLIKDKMRLMILCSKEPTHRLILETGEIIDNKVDNDYLRNMIFSYTITTALIVSNAFNLKNALIFSGHFLNYRDNPPLFRWNGILDI >NC_005126.1|WP_011146066.1|2131017_2132043_+|IS630-like-element-ISPlu3-family-transposase MKIFITSEQKIKLERLHDTTRDGQVRDRIKAILLASEGWSSVMIAQALRLHQTTVDRHISDYLNQGKLKSDNGGSDSLLSREQTDFLINHLSQHLFHHTHEIVAYVAQLWNITFSIPGMNKWLHRQGFSYKKPCGVPHKFDAEKQRQFIEYYENLKVTAKDEPILFLDAVHPTQGTKLSYGWMRKGEKKTVKTTGSRTRLNILGALNLNAIGRTVFQEYQTINDYNICCFFNEIRKSYPDYHQKIHLIVDGAGYNKAHLVKEWAYVSNIELHYLPPYSPNLNPIERLWKVMNEQVRNNRYFADKHEFRDNVFKFFTTTLPDIADSLMSRINDHFQVLKTAS >NC_005126.1|WP_125043751.1|2129980_2130220_+|hypothetical-protein MSVPHRSNGAGEFIRMCTHLYRRGLMYYFRRRIPADLVQVCSKSEIVQSLKTTNRVEALIRLRQLDVNLDLKFAEMRLG >NC_005126.1|WP_041380794.1|2129318_2129648_-|sulfurtransferase-TusE MLVFEGQEIETDAQGYLKNSSDWEEAIALLLAKQEEITLTEPHWEVIRFIREFYKEFNTSPAIRMLVKAIAQKYGEEKGNSRYLYRLFPKGPAKQATKIAGLPKPVKCI >NC_005126.1|WP_011146063.1|2129026_2129305_+|acylphosphatase MIKYGVTIYVYGRVQGVGFRYQTFRWAKLNRLTGYVCNLHDGSVKIVAYGDSEQLNTLTHWLEQGGPPGARIDNFSSQSCAVEDIADFIVRH >NC_005126.1|WP_011146062.1|2128482_2128803_-|heat-shock-protein-HspQ MIIASKFGIGQQVRHKLLGYLGVIVDIDVEYSLEQPQEDDIASNATLRSAPWYHVVMEDDNGQPVHTYLAEAQLAYETSDEHPEQPSLDELAESIRHQLLAPRLRN >NC_005126.1|WP_011146059.1|2126138_2126552_+|CoA-binding-protein MSDQKIADILKRVKTIALVGASEKTARPSYKVMAYLLEQGYQVIPVSPKLAGQTLLGQRVYAQLADIPQAVDMVDVFRNADAAYDIAREAIDIKAKVLWLQLGVINEQAKILAEEAGLDVVMDRCPKIEIPRLGLEK >NC_005126.1|WP_011146058.1|2125557_2126016_-|methylglyoxal-synthase MELTTRTMATAKNIALIAHDHCKTSLLAWSKKHKSLLKKHHLYATGTTGNLIQNETGLSVTNMLSGPMGGDQQIGSLISEGKIDVLIFFWDPLNSVPHDPDVKALLRLATVWNIPVATNLASADFIVSSPLFSESVDIQVPDYQHYLNGRLK >NC_005126.1|WP_011146057.1|2123380_2125435_+|DNA-helicase-IV MELKATQIGQCLAQHPYNRVRLLNAGIEVSGEKHQYLIPFNQLINIQCKRGIIWGELEFELSDGQAVRLHGTEWQQTQRFYHYLLGEWQKWSQEMSDISANVLTAQVSEINRIGQQNRWLKKADLLQLQQQIQATFQALPLPLQRLEQFDHCRDGYQICLRWLENGEKCVEKINLQWTERMLEQHCDFFQRIEASPLNRSQSLAVINGENSVLVLAGAGSGKTSVLVARAGWLLLLQQAIPEQILLLAFSHQAVNEMNERIQSRLGVNDIKVKTFHTLALHIIQQGSNKAPKISVLETDGQKRKDFLIKHWQQQCSEKKAQAKGWREWLTDELKWEVPEGEFWHDEQLANRLSNRLECWLGLMRMHGGSQKAMIEQVQEEYLDRFQKCIRLMEPLLKAWKSELKTEGAVDYSGLIHQAVNILDKGRFISPWKHILVDEFQDISPLWAKLLTAMRTQNSQSCLFAVGDDWQAIYRFSGAERMLTSAFANYFGKGAECVLDISYRLNDRISKITNAFVQQNPNQLRKSLNGLTKGNKKSIVILPEDQLEPLLNKMSGYVTEQETILLLARYHYLKPELLKKAATRWPKLKIEFMTIHASKGQQADYVIILGLHQGQDGFPAPARESVMEWVLLPQPEDFSDAEERRLLYVALTRAKKQVWLMQDKNNPSVFVRQLEQLSVPVQRKP >NC_005126.1|WP_011146056.1|2121028_2123170_-|TIGR01666-family-membrane-protein MLTAFSGLRRFLYNSHFLYYNRILIALAGTTLVPWFLDKEPKITISLTLGVVAAALADLDDRLTGRLRNLVITLISFFIASVSIELLFPYPWLFTIGLALSTCSFILLGALGQRYATIAFGALLIAIYTMLGSSIFPLWYQQPLLLLTGAIWYNLLTLTGHLLFPIRPLQDNLARCYQQLAVYLDAKANLFDPDIIEEGYQQSVVNVAMANSVLVNTLNQAKTSLLTRLKGDNRQRGTHHTLHYYFVAQDIHERASSSHVQYQSLLHTFRYSDILFRFQRLLSVQARVCEQIAQSILWHKPYQHNPRIERAFNYLESSLQQLSQQQKHNLKITALYNLLKNLRAIDAQLASMSSGRYNLSKDREDETQLSDETLTGWRDICLRLNHHLTPQSALFRHAIRMSVLLCSGYTMIQWLDLQHGYWILLTSLFVCQPNYSATRRRLTLRIIGTVAGVLIGLPILYFVPSIEGQLVLIVISGVLFFVFRNTQYAHATLFITLLVLLCFNLLGEGFDVALPRIIDTLIGCGSAWLAVNFIWPDWKFRQLSQVINRTMNTNCRYLDAILVQYYQGKDNGLTYRIARRDAHNSDAELVSAISNMSAEPKSDQTSQEKAFQLLCLNHTMLSYISALGAHRDKLDNKAILDILNDAVCYVDTALKSILIDDDRIKQIPVNIVKRIEQAPAERNSKEQLVLQQISLLIELLPKITNIIKQINQL >NC_005126.1|WP_011146068.1|2133687_2136969_+|type-I-F-CRISPR-associated-helicase-Cas3 MNILLVSQCNKRALTETRRILDQFAERKGDRTWQTAITQEGLNTLRKLLRKTARRNTAVACHWIKSGGQTELLWIVGNLRRFNSRGVVPTNTTQRDVLKSQDENHWHSVEAISLLAAIAGLFHDFGKANTLFQQGLQGNGRFQPYRHEWVSLRLFQAFVAEQDDREWMTSLSQIEPSDEDKILSRLVKDDIDKKYANPFVNLPPLATTVAWLILSHHRLPVYPSYDDRYVRRPQLKDIDSWLINHLEPSWNSINMDNKVWSDQDKRDVWTFPNGTPIRSQTWRQKAQKFAQRALQSTSLVQYGNLNQRFTSHMSRLVLMLADHHYSSLPATLGWQDVNYGVFANTDRTTGKCKQRLDEHNIGVGQNALLLGRSLPHIRKTLPAITRHKGFKQRSKDEKYRWQDQAFYVACALRERSVEQGFFGINMASTGCGKTFANARIMYGLADEKQGCRFSIALGLRTLTLQTGDALRKRLHLEEDDLAVLIGSQAVKELHQLRQKALEPDVGSISAEALFAEHQYVSYDGSLDDGRLSHWLRKDNKLNKLLSAPVLVATIDHLIPATEGIRGGKQIAPMLRLLTSDLVLDEPDDFDINDLSALCRLVNWAGLLGSRVLLSSATLPPALIQALFNAYRAGRQDYQLACGQPGAPVNICCAWFDEYETTQQDVVNAYQFQEQHNIFVNKRIGRLKKIVPLRKAELVPIISESRKINDVINTIAEVMHHSILKLREEHHQTHSSGKTVSIGLIRMANIDPLVAVAQRLLQMPSPENVRIHYCVYHSQHPMAIRSHLEHRLDSTLTRYDEEELWQVAEIRKVLEETSERDHIFVVAATSVAEVGRDHDYDWSIAEPSSMRSLIQLAGRIQRHRRKEPREPNLHILAKNYKALKATDLKHPVYCRPGFESKDYLFANHDLHELLEPYQYELISALPRIKERDNAGDSSPFENLVDLEHQRLWEELQGGSDNKHGYCSALWWREQASWCAELQRHKPFRQSEPDELHYLWLGEEGEEAKFVALDSGQAGIKESDTFDYVPELEFALGVSAWIELDTETIYQNLADTNEMELKNVSQHFGEIRLRKKDDGEAWRYHPFLGVFGEIG >NC_005126.1|WP_011146069.1|2137062_2137323_+|type-II-toxin-antitoxin-system-Phd/YefM-family-antitoxin MYELSANEVKTHFGDMLLRAQRAPIQINKNGKLVAVVLSIDEYENIEALKIQLLKSRAIQTKADIEEGNLVDGESFFDELETGKYD >NC_005126.1|WP_011146070.1|2138002_2139361_+|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy1 MNENGLSRFIVDYIESRKQSKLEVFDKEAEKKLAKLTSMEDITPVKQKLAEQRKELEEHYEVRNWLDDAVSRVDQIRLVTHVLKFAHTDARGSSIFAVQSKANVKEDIKYLSMAALDRPAIDAAGNAAALDIAKLLLTEYREGDSLLANINRADYSALAELAKNEQQLELWINGFRQVLSDKRLSSHRLAKQLYFPVGYDKYHLLGPLFSSSLAHTMHQRITEARFGELSKEINKARKEESWRPETIVVYPNTAVQYFGSTKPQITSYLNNMRGGRVYLLPCSAPEWKNITKPPMKHRSIFDLGCEFVSLVRSTVWQMQRYLLSVQKYENTLEIQQCRQEYVDEIIDVLFNYVVGIQNLIELKGWSANEDCALKRAQQLWLDPYRCQQDETFKFEREGGDWKKEIAADFSYWLNQSLKHERLEMGLSERREWASVFKERLREFEDELPEVMP >NC_005126.1|WP_011146071.1|2139357_2140326_+|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy2 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_005126_5 | 2142057-2143464 | TypeI-F |
I-F
Consensus repeat of NC_005126_5
|
23 spacers
spacers of NC_005126_5
>5.1|2142085|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAGGGCACGATTTCCCTTTGGTTTTATATGC >5.2|2142145|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATGTGCGGAACAATTCAGTCTGCAAATACGT >5.3|2142205|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATCGAAGAGCTTCATCCTTGTGAGTTTCTTC >5.4|2142265|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTCCAAAGAGTGAAGCCGGTTCCTCCTCCCG >5.5|2142325|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGCTGATGAGACAGTCCGATAATAGAACCCAC >5.6|2142385|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGAATGCGACTTCATCACCATTTTCAATCAT >5.7|2142445|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTACCGAAATCTTTTAGAGCGCTAGTTGTTT >5.8|2142505|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACATTTAAAACATTATTTATTGTTACTGTTC >5.9|2142565|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTACGTAATGACCAATGACGATGGACATGA >5.10|2142625|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGTCGATTTGAACGCGACTCAAGCTGCAATT >5.11|2142685|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATACCGGATTGTTAGTAAAACCTATCCACTTT >5.12|2142745|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATAAGCGGGACTAACCCGCCATTAATCAAGA >5.13|2142805|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTTGAGCAGATGCCAACTCGGGTAGTGTCCA >5.14|2142865|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTCTCGATGTGCTGGTGGGTATCCCGGCTGA >5.15|2142925|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCACGTCATTTGTACCAATTTACTGACAACAG >5.16|2142985|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTAGCGCAGATAACCCCAACTCGGAAGCTCT >5.17|2143045|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCCTATTTTTAAATAAATCATACACCTATGCA >5.18|2143105|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTGATAGCTGGCGAGATAGCAGCGGTAAGCT >5.19|2143165|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTCGTGTTTCATGTAGTAATCTATTGCAACT >5.20|2143225|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCAGGAGTACGCAAGAGCCGGACACAGATAA >5.21|2143285|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACCTATGTGTTCTGCCGACTCTTTAACGTCCA >5.22|2143345|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTAGCGAACAACGTAACATTGTTGATTCTG >5.23|2143405|32|NC_005126|CRISPRCasFinder,CRT ATTACGCAAGCTGTCACTAATGTTGCGTGCCC |
cas6f,cas7f,cas5f,cas8f,cas3-cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_005126_5
The CRISPR arrays of NC_005126_5 >merge|NC_005126|5|2142057-2143464|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAACAAGGGCACGATTTCCCTTTGGTTTTATATGCGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAAGATGTGCGGAACAATTCAGTCTGCAAATACGTGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAAAATCGAAGAGCTTCATCCTTGTGAGTTTCTTCGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATGTCCAAAGAGTGAAGCCGGTTCCTCCTCCCGGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAAGGCTGATGAGACAGTCCGATAATAGAACCCACGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATGGAATGCGACTTCATCACCATTTTCAATCATGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATTTACCGAAATCTTTTAGAGCGCTAGTTGTTTGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAAAACATTTAAAACATTATTTATTGTTACTGTTCGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAAATTTACGTAATGACCAATGACGATGGACATGAGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATCGTCGATTTGAACGCGACTCAAGCTGCAATTGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAAATACCGGATTGTTAGTAAAACCTATCCACTTTGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAACATAAGCGGGACTAACCCGCCATTAATCAAGAGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATGTTGAGCAGATGCCAACTCGGGTAGTGTCCAGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAAGGTCTCGATGTGCTGGTGGGTATCCCGGCTGAGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATCACGTCATTTGTACCAATTTACTGACAACAGGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAAATTAGCGCAGATAACCCCAACTCGGAAGCTCTGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATCCTATTTTTAAATAAATCATACACCTATGCAGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAAGTTGATAGCTGGCGAGATAGCAGCGGTAAGCTGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATGTCGTGTTTCATGTAGTAATCTATTGCAACTGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAAATCAGGAGTACGCAAGAGCCGGACACAGATAAGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAAACCTATGTGTTCTGCCGACTCTTTAACGTCCAGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAAAATTAGCGAACAACGTAACATTGTTGATTCTGGTTCACTGCCGCACAGGCAGCTTAGAAAATTACGCAAGCTGTCACTAATGTTGCGTGCCCGTTCACTGCCGTACAGGCAGCAGCGCAC >NC_005126|5|3|2142057-2143404|PILER-CR GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA CAAGGGCACGATTTCCCTTTGGTTTTATATGC GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA GATGTGCGGAACAATTCAGTCTGCAAATACGT GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA AATCGAAGAGCTTCATCCTTGTGAGTTTCTTC GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TGTCCAAAGAGTGAAGCCGGTTCCTCCTCCCG GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA GGCTGATGAGACAGTCCGATAATAGAACCCAC GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TGGAATGCGACTTCATCACCATTTTCAATCAT GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TTTACCGAAATCTTTTAGAGCGCTAGTTGTTT GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA AACATTTAAAACATTATTTATTGTTACTGTTC GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA ATTTACGTAATGACCAATGACGATGGACATGA GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TCGTCGATTTGAACGCGACTCAAGCTGCAATT GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA ATACCGGATTGTTAGTAAAACCTATCCACTTT GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA CATAAGCGGGACTAACCCGCCATTAATCAAGA GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TGTTGAGCAGATGCCAACTCGGGTAGTGTCCA GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA GGTCTCGATGTGCTGGTGGGTATCCCGGCTGA GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TCACGTCATTTGTACCAATTTACTGACAACAG GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA 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>NC_005126.1|WP_011146073.1|2141372_2141927_+|type-I-F-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6/Csy4 MDYYLEIRVLPDLEFSQQSLFEALFAKLHRALGQLSNGQVGVSFPCARKTLGDTLRIHGSSEALNDLQALPWLKGLRDYTEVIDIQPIPQETKYRCVSRVQVKSSAERLRRRAIKKGWLTGEQARQRIPISKEQRTHLPFLFLKSLSSGQSFLLFVKQGPIQDKPTSGIFSSYGLSSSATIPWF >NC_005126.1|WP_011146072.1|2140349_2141363_+|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy3 MSKSTIKTASVLAFERKLSNSDALMFAGNWKQIDGEWKPIAIQEKAVRGTISNRLKNALTSDPAKLDAEIQKANLQRVDVAALPFDADTLKVSFTLRVLGNLSTPSVCNDQDYQAELANVINGYIAEHGFKTLAARYAENLANGRFLWRNRVGAEEIKVRVSGKSGKWWEFDCEDFSLREFGKVEGKLAELAAEIEEGLAGDRSTLFNVEAFVRLGHGQEIFPSQELVLDSNSKKSKVLYQVNEIAALHSQKVGNALRTIDTWYPDATELGLGPIAVEPYGSVTSRGKAYRQPKAKMDFYTLLDNWVVKGKAPEEVEQQHYVIATLIRGGVFGEKGE >NC_005126.1|WP_011146071.1|2139357_2140326_+|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy2 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MYELSANEVKTHFGDMLLRAQRAPIQINKNGKLVAVVLSIDEYENIEALKIQLLKSRAIQTKADIEEGNLVDGESFFDELETGKYD >NC_005126.1|WP_011146068.1|2133687_2136969_+|type-I-F-CRISPR-associated-helicase-Cas3 MNILLVSQCNKRALTETRRILDQFAERKGDRTWQTAITQEGLNTLRKLLRKTARRNTAVACHWIKSGGQTELLWIVGNLRRFNSRGVVPTNTTQRDVLKSQDENHWHSVEAISLLAAIAGLFHDFGKANTLFQQGLQGNGRFQPYRHEWVSLRLFQAFVAEQDDREWMTSLSQIEPSDEDKILSRLVKDDIDKKYANPFVNLPPLATTVAWLILSHHRLPVYPSYDDRYVRRPQLKDIDSWLINHLEPSWNSINMDNKVWSDQDKRDVWTFPNGTPIRSQTWRQKAQKFAQRALQSTSLVQYGNLNQRFTSHMSRLVLMLADHHYSSLPATLGWQDVNYGVFANTDRTTGKCKQRLDEHNIGVGQNALLLGRSLPHIRKTLPAITRHKGFKQRSKDEKYRWQDQAFYVACALRERSVEQGFFGINMASTGCGKTFANARIMYGLADEKQGCRFSIALGLRTLTLQTGDALRKRLHLEEDDLAVLIGSQAVKELHQLRQKALEPDVGSISAEALFAEHQYVSYDGSLDDGRLSHWLRKDNKLNKLLSAPVLVATIDHLIPATEGIRGGKQIAPMLRLLTSDLVLDEPDDFDINDLSALCRLVNWAGLLGSRVLLSSATLPPALIQALFNAYRAGRQDYQLACGQPGAPVNICCAWFDEYETTQQDVVNAYQFQEQHNIFVNKRIGRLKKIVPLRKAELVPIISESRKINDVINTIAEVMHHSILKLREEHHQTHSSGKTVSIGLIRMANIDPLVAVAQRLLQMPSPENVRIHYCVYHSQHPMAIRSHLEHRLDSTLTRYDEEELWQVAEIRKVLEETSERDHIFVVAATSVAEVGRDHDYDWSIAEPSSMRSLIQLAGRIQRHRRKEPREPNLHILAKNYKALKATDLKHPVYCRPGFESKDYLFANHDLHELLEPYQYELISALPRIKERDNAGDSSPFENLVDLEHQRLWEELQGGSDNKHGYCSALWWREQASWCAELQRHKPFRQSEPDELHYLWLGEEGEEAKFVALDSGQAGIKESDTFDYVPELEFALGVSAWIELDTETIYQNLADTNEMELKNVSQHFGEIRLRKKDDGEAWRYHPFLGVFGEIG >NC_005126.1|WP_011146067.1|2132246_2132786_+|hypothetical-protein MMYSVKGVQYQTLVNIPKNIGLGYSGSNGKVHLVDGDFLFYGSVDIQGENGTINKKTEVDANWTVKFNEMPCDSQGNILLKSHWFSPASNDRWLIKDKMRLMILCSKEPTHRLILETGEIIDNKVDNDYLRNMIFSYTITTALIVSNAFNLKNALIFSGHFLNYRDNPPLFRWNGILDI >NC_005126.1|WP_011146066.1|2131017_2132043_+|IS630-like-element-ISPlu3-family-transposase MKIFITSEQKIKLERLHDTTRDGQVRDRIKAILLASEGWSSVMIAQALRLHQTTVDRHISDYLNQGKLKSDNGGSDSLLSREQTDFLINHLSQHLFHHTHEIVAYVAQLWNITFSIPGMNKWLHRQGFSYKKPCGVPHKFDAEKQRQFIEYYENLKVTAKDEPILFLDAVHPTQGTKLSYGWMRKGEKKTVKTTGSRTRLNILGALNLNAIGRTVFQEYQTINDYNICCFFNEIRKSYPDYHQKIHLIVDGAGYNKAHLVKEWAYVSNIELHYLPPYSPNLNPIERLWKVMNEQVRNNRYFADKHEFRDNVFKFFTTTLPDIADSLMSRINDHFQVLKTAS >NC_005126.1|WP_125043751.1|2129980_2130220_+|hypothetical-protein MSVPHRSNGAGEFIRMCTHLYRRGLMYYFRRRIPADLVQVCSKSEIVQSLKTTNRVEALIRLRQLDVNLDLKFAEMRLG >NC_005126.1|WP_041380794.1|2129318_2129648_-|sulfurtransferase-TusE MLVFEGQEIETDAQGYLKNSSDWEEAIALLLAKQEEITLTEPHWEVIRFIREFYKEFNTSPAIRMLVKAIAQKYGEEKGNSRYLYRLFPKGPAKQATKIAGLPKPVKCI >NC_005126.1|WP_011146076.1|2143511_2144339_-|5-deoxy-glucuronate-isomerase MSKLLSKYHAPDQNKRTQHITPESANWKYVHFDVYELASGEKITLPASENETCLVLVAGKATVTTPHQRFEHIGDRMQPFERKKPYAVYITAGESVEIIADTALELAVCQAPGKGSYPTRLITPQDIDAEQRGNGYNRRYVHNILPDNKPADSLLVVEVFTDEGCTSSYPSHKHDTDNAPQETYLEETYYHRLNPSQGFCMQRVYTDDRSLDESMAIYNKDVVMVPKGYHPVATLAGYDNYYLNVMAGPTRKWLFTWEKDHQWVNSGEYAQKHNN >NC_005126.1|WP_011146077.1|2144386_2145277_-|myo-inosose-2-dehydratase MAVQLGINPLTWTNDDLPTLGADTPLETCLTEGRQAGFTGFELGNKFPRQANVLGPILAAHNLVLVSGWYSGELLTRSVAEEIKAVQSHLTLLRELGANVMVFAEVTNCIHGDQNKPVHLRPQFPANRWQEYGEKLTEFARYTQEQGVQIAYHHHMGTVIETEKDVDHLMENTGDEVGLLLDTGHLTFAGADPLAVAERWAKRINHVHCKDIRPDVLNDIKNRKTSFLDAVLNGVFTVPGDGCVDYPAIFQVLKKQNYKGWLVVEAEQDPAVAHPLTYATMGYNNLRKFARDTGLF >NC_005126.1|WP_011146078.1|2145306_2147211_-|5-dehydro-2-deoxygluconokinase MEQQKKFDVICMGRIAVDLYGQQIGARLEDMGSFAKYLGGSSGNVAYGTARQGLKSSMLARVGDEHMGRFLREELQSVGCDTSHLTTDKERLTALVLLGIKDKTTFPLIFYRDNCADMAITGDDFSEEYIASARCLAITGTHLSHPNTRDAVLTALNYARRNRVKTVMDIDYRPVLWGLTSLGDGETRYITSEQVTAQLQEVLSLFDLIVGTEEEFHIAGGSTDTIEALRNIRKLTSAALVCKRGSLGCSIFTAEIPNDLNDSITIQGVSVDVLNVLGAGDAFMSGLLRGYLNNEGWEKACTYANACGALVVSRHGCAPAMPDKTELDNYLSRANQILRPDLDETLNHLHRISARKNQWDELCVMAFDHRIQFIELARQANASIKRISSLKQLLLRASREVATEAGLQGKIGLLCDSTFGQDVLNEITGQGWWIGRPIELPGSRPLCLEHGNIGSQLIDWPLEHIVKCLVFFHPEDAHPLRLEQEKKIREIYAACCKSGHELLLEVILPAEMKHSDEFYIRALRRFYNLGVKPDWWKLPPLSSESWDNINYLIEQRDPYCRGVVILGLDAPQEELEMGFNAAAGKSIVKGFAVGRTLFGQPSLKWLKNEIDDNRLIQKIKTNYHNLISLWRQRG >NC_005126.1|WP_011146079.1|2147286_2148420_-|Gfo/Idh/MocA-family-oxidoreductase MEEIRIGLIGTGYIGRTHAIAYAQAPTVFPLAGKLVCEMVAEVSAELAAKRSEQLGFRRFTDNWRKLVSDPDIHVVDICSPNFLHKEMALEAIKHGKHVYCEKPLALNSHDAKLMVEAAKKARVKTLVGFNYMKNPTAQLAKEIISNGEIGEVIHFYGTHNEDYMADPFTPIHWHCFKDKAGLGALGDLAAHIINMAQYLVGDIQTVCADMTTVIKQRPEKTGSSIMVAVENEDQAHAMVRFNSGARGIIETSRIACGRKMGLSYTITGTKGALSFTQERMAELKLYRHDEPANRQGFKTILIGPEHPDYAPFCLGAGHGIGFNDQKTVEIRDLINGIASNKAIWPDFTEGWKVSRILDAIAHSYQEQRWVNVTEIN >NC_005126.1|WP_041380033.1|2148954_2150658_-|solute:sodium-symporter-family-transporter MLAFLSFIGFTLLVAGFAYYKTHNARLTESTEGYFLGGRSLTGVYIGSSMLLMNLSTEHLIGLNGLAFRTGFIVMAWEVIAAVTIVLFAIYFLPKYLKLGISTIPEYLERRFDKNTLLITSILFLAMYIISLLPIVLYTGAIALESLFQVSNVFRIDKTTALWIMVWGVGGLGAVYAIFGGIKAIAAADTINGIGLIVGGLMVTIFALLYVGNGNAWQGLVEVYQSNPDKFNSIGSEDSLVPFSTLFTGLIVSNMFFWCTNQSIVQKALGAKNLAEGQKGVMLCALLKLIMPSIIILPGIIAFHIFKGQIDNPDNAYPELVHLILPEILVGFFAAVVVGAVFSTFSGGLNSSVTLFIVNIYKPRINQNATETQTVAMSKYLGIGLALITMIVAPLVANAPDGLFYLIQQLQGIFNAPILSVVLVGLMTKRVPPIAAKLGLLFGMSAYIICNFILKIDLHFFHLVGILFVLNVIFMLAIGYFFPAKPFADVYTEQVNITPWSMVKPVAWLITLCSISIYVFLAHNVPKVIMIIYYLSAALILSYALYQIGKTLFSKLAINSTPKRTGR >NC_005126.1|WP_011146081.1|2150773_2151760_-|inositol-2-dehydrogenase MFNIALFGAGRIGQVHAANISHHKETSLYSVVDPHQKSAELLVQQYQTKRQTIEQAMSDPQIDGVLIASATDTHADLIELAAKHHKKIFCEKPVHLDIERVRQCLATIKQYQVPLFVGFNRRYDPQFRRVKTLFDAGAIGKAESLLIISRDPSPPSAEYVKGSGGMFRDMTIHDFDMARFIIGEEPCSIYAQGSNLVDPAIGQAGDIDTAFIVMKFPSGAMATITNSRRSGYGYDQRIELHGEKGLLSAGNIKENSVELWENSGCLTAKPEHFFLQRYREAYIAEWDHFVDVMAGRATPECNGTDGEQALYLADKALESLHSGKEIRL >NC_005126.1|WP_011146082.1|2152125_2154075_-|3D-(3,5/4)-trihydroxycyclohexane-1,2-dione-acylhydrolase-(decyclizing) MESCNMNKSTMTAAQALVKFLNQQYVEADGEQYPFIRGIFTIFGHGNVVGLGQALEQDPGHLTVYQGCNEQGMAHIATGFAKQKKRKQIFAVTSSVGPGSANMVTAAATATANRIPLLLLPGDLFACRQPDPVLQQVEQFHDHTISTNDCFRPVSRYWDRISRPEQLMSAMINAMRVLTDPADTGAVTICLPQDVQGEIWDFPDYFFQKRIHRIERRPASVAMINDAVALINRKKKPLLICGGGVRYSEAHNAFRQFAEHFNIPFAETQAGKSTVIADHPLNCGGLGTTGCLAANLIAKEADLIIGVGTRFTDFTTASKSLFQHPEVEFLTINVAEFDACKLDAIPVVSDAQAGLNAIAEQLIKLNYRSGYQDEIHQARETWRKELNRLFNIEYQADFTPEIPGHLDDKLEEYSQTLQTRLTQTSVLGLLDKYLEPEAIIVGASGSLPGDLQRLWQPKQPDTYHLEYGYSCMGYEIAAAIGAKLACPNQPVYAIVGDGAYMMLHSELQTAVQENIKITVLLFDNAGFGCINNLQMSQGMGSFGTENRYRNPESGNMDGKLIKVDFAKNAESYGCKSYRVHDEQQLLCALQEAQKQTVPVLIDIKVLPKTMTHDYESCWRVGTAQVAENPAIESAAKKIKEMVATKVRQY >NC_005126.1|WP_011146083.1|2154076_2155588_-|CoA-acylating-methylmalonate-semialdehyde-dehydrogenase MEQVQNYVNGQLIPSYSTRFSPVFNPATGKQIRQVALSTAHEVEQAIEIAHQAYREWSKISPLKRARVMFQFKTLLEANIDKLARLISEEHGKIYSDAIGELTRGLEVVEFACGIPHLQKGEHSANTGTGVDSHSLMQPLGVCVGITPFNFPAMVPMWMFPIALATGNTFVLKPSEKDPSLALELASLLKQSGLPNGVFNVINGDKEAVDILLTDPHVQAVSFVGSTPVAEYIYTTASAHGKRCQALGGAKNHCILMPDADLDMASSAIAGAAFGAAGERCMALSVVLAIGDETADALIEKLRQQINKISVGPGIVATTENDMGPVISAQHQAKICDYIDSGEKQGASLLIDGRQLKVPGYENGYFIGPTLFDNVTPEMKIYQEEIFGPVLSIVRVPDYATALTLINCHQYGNGTAIFTRDGETARQFSEDVQAGMVGINIPIPVPMAFHSFGGWKRSIFGPLNVHGNDGVRFYTRMKTVTSRWPASIRLEHHSSNFVMPTME >NC_005126.1|WP_011146084.1|2155891_2156725_+|MurR/RpiR-family-transcriptional-regulator MSVASNLNEFQEQVRSRYSGLSKRLQQVARYVLDNTNSVAFDTVAVIAREADVPPSTLIRFANAFDFSGFNEMKQLFRMHMVEETASYADRARLFRELDGEQEPPEDPQHILQEFARSNVQAMQQLAARTAPEDLRNAVDLLAQAKNIYIIGLRRSFSVAAYLSYALNHLECRPLLVDGLGGMFREQINLIGEEDVVVSISFTPYAEETLMVSERAAKAGAKQIVITDSQISPLASFSDVCFVVKEAQVEAFRSQSATLCLVQSLAVSLAYRQGNTI >NC_005126.1|WP_011146085.1|2156933_2157293_+|hypothetical-protein MMSKGSRYIFVILSAISFQAFASNFDYKSDIPADNKPSADYLKKRENLQPKHWDVDKLITDNNAVEKRELARQVKEDELNRKSREFNDRVNEKIRQDLERTARIKENNGMTRSNFFDRE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_005126_6 | 2392119-2392269 | Orphan |
I-F
Consensus repeat of NC_005126_6
|
2 spacers
spacers of NC_005126_6
>6.1|2392150|29|NC_005126|PILER-CR CAACTAACATAGCGAGATAATCATGACAG >6.2|2392210|29|NC_005126|PILER-CR TTTTAGTTATGAGGGTGTGCGTTTTTATT >6.3|2392148|31|NC_005126|CRISPRCasFinder TACAACTAACATAGCGAGATAATCATGACAG >6.4|2392208|31|NC_005126|CRISPRCasFinder CCTTTTAGTTATGAGGGTGTGCGTTTTTATT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_005126_6
The CRISPR arrays of NC_005126_6 >merge|NC_005126|6|2392119-2392269|PILER-CR,CRISPRCasFinder GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAAATACAACTAACATAGCGAGATAATCATGACAGGTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAAACCTTTTAGTTATGAGGGTGTGCGTTTTTATTGTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAAAAAACC >NC_005126|6|4|2392119-2392269|PILER-CR GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAAATA CAACTAACATAGCGAGATAATCATGACAG GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAAACC TTTTAGTTATGAGGGTGTGCGTTTTTATT GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAAAAAACC >NC_005126|6|5|2392119-2392267|CRISPRCasFinder GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAAA TACAACTAACATAGCGAGATAATCATGACAG GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAAA CCTTTTAGTTATGAGGGTGTGCGTTTTTATT GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAAAAAA
>NC_005126.1|WP_011146278.1|2390995_2391913_+|tail-fiber-protein MSYKNDFKAFSTSDNANVISQDKYEVNQSLQTGFSPDNVPTHLLNKVLRQASAVSSAVTDFIATRSGNDVLDDGNIAKLTAQLNKALEQKMTTDIPSASLTQKGVVQLTNVVGNSDTLAVTQKLVQEVINSLREYTREEIDNRMKTANEIPVGSPIPWPLPHPPFGYFTCNGSAFNKLQYPKLAEAYPDGRLPDLRGEFIRGWDDGRGIDSGRGILTHQGDAIRNIVGSFPGAIALHFELAAKGVFYGNATFGVATDGNPKSVDHFTRDAVYTTYGFGFDTSRVVPVASENRPRNIAFNYIVRAA >NC_005126.1|WP_041380058.1|2389792_2390368_-|serine-acetyltransferase MNKVLSHKEELSHLTACLLSEVICSRTSFSWFKAIHRALKCPDRRFYFWWRIANYLYRTNKAKKISIRINRNLRNKYGCDLGLGCYIRKNLRISHYVGIVISRTCIIGDNFHVLQNTTIGVLNEDIQGKISIGNDVKIGANSCIISDNITIGDNVYIGAMSFINKDIPADCIAYTPKSQNEIKIKKQKIIN >NC_005126.1|WP_011146276.1|2388848_2389757_-|lipopolysaccharide-core-biosynthesis-protein-RfaZ MFLKYKYLLKLGMLCKQNITKSIYRNVSSKKMKHNMNFWPHIKISRNINGKIDAVSFNKKSININEFPKKSEKPLIIIASGPSVSTIKTDFFDDTKFDIMGVNGSYELSPEVKFKYHVIIDRTFILNRKNIVLNILKDNELILFTTMDCLNDILIHYGYLELKCKVIIIENIDQPVYQQEKELFEIKSDEIIIQNSVAFSLNLNLGFYNGTTVAYSALQIAFFLGYKEIYFAGLDMNNFSKPRFYETQNDKLDTKLNNNLHDFIIPCFNLAHEIAIRKGVKIYNLSKNSAINSFEKLDYRKI >NC_005126.1|WP_011146275.1|2387124_2387799_-|PAS-domain-containing-protein MKKINGTYISSQIINTMEASNEPWGIKDKNSRFIYGNPALKSIQNIPTSFDYEGLFDDELPWGGAAFAKEFIDHDKIVMTKGKRICSLETYTYGKENILSSYFQEKLPLYNDAKECIGILFHGWKAKDFSLINLYQYYNVLPTSIIFQPPTDTFTQREWDIIFFFLQKYTRKQIGKILNISYRTIESHMANIYHKIGVDSNQQLEEYCLINNFKRYVPEKFLLF >NC_005126.1|WP_041380057.1|2385749_2386418_-|PAS-domain-containing-protein MSNRIAISSQVINTLAVSNEPWGIKDKNSCFIYGNLALKSLQNFSNSFEFEGAYENELPWDSAKFAEQFINHDKKVMEKQQRICSIETHIFGREQILSSYFFEKSPFYHKDGDCIGVIYHGWKAKNYSLAYLHQYHDKLPASIMLQPPTDLFTHREWDIIFLFLQKNTRKQIGRILNLAYRTIEYYMTRIYRKIGINSSQQLEAYCRANNFNYYIPEKFLLS >NC_005126.1|WP_011146273.1|2383626_2384319_-|PAS-domain-containing-protein MQHIKNRPNNITPQLIHMWENSDEPWGAKDLQSRFIYANSAFYQLHNLPDDFEITGLTTGELPSPIAEYEKEFHRQDQKVLQTMQRVSSLETHPFEEHKIKQIYLCNKYPLCDEDGNCIGLTFHMCKTKNFSTAYYYDKTPPATLEFIAPNDKLTQTEWEVLFLTLRSLDEEKIGEALMISAEDVVNHIQSIYQKFNLSLHEELKDFCKENKLDAYIPARFVTIGSVELN >NC_005126.1|WP_011146272.1|2382893_2383571_-|PAS-and-helix-turn-helix-domain-containing-protein MSNKIISSQIINTMKQCNDPWGIKDKNSCFIYANQSFKTLQNLSNSFDYEGVFDDEIPWDGAEFAKEFITHDKTVMTKEQRVCSLETHVYGKNQILSSYFFEKLPIYHEDGSCMGILFHGWQAQDFSFTRLFYGKLPASIMFQPPTDLFTQREWDVIFLMLHKYTSKQIGRMLNISYRTVETHISRIYKRIGLHSTRQLEDYCRTNDYDLYVPERFVHPESRMFP >NC_005126.1|WP_011146271.1|2382052_2382733_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MDNKLIISSQVINTMEQSNAPWAIKDKNSRFMYANQACKHLQNISSSFDYEGLYDDEIPWGGAEFAKEYIIHDQKVMEKEERICLLLTHKFGKEQILSSYFFEKYPLYHEDGSCMGTMFHGWQVQDFSFTRLFHGKLPANIMFQPPTDLFTQREWDVIFLMLQKYTNKQIGIMLNISYRTVENHISRICKRIGLHSSRQLEEYCRTNDYDLYVPKRFVQPRSKMFP >NC_005126.1|WP_011146270.1|2381345_2382026_-|PAS-and-helix-turn-helix-domain-containing-protein MSNKLIISSQVINTMEQSNDPWGIKDENSCLIYVNLALKSLHNVPNSFNYEGLFDDEIPWNGAEFAKEHVTQDKIVMEEKERICSLETHLFGKEQILSSYFCEKYPLYHEDGSCMGTIFHGWQVQDFSFTRLFYGKLPASILFQPPTDLFTQREWDVIFLLLHKYTSKQIGRMLNISYRTVETHISRIYKRIGLHSTRQLEDYCRTNDYDLYVPERFVHPESKMFP >NC_005126.1|WP_011146269.1|2380504_2381185_-|PAS-and-helix-turn-helix-domain-containing-protein MDNKLIISSQVINTLKQSNDPWGIKDKNSCFIYGNLALKSLKNFSSSFEFEGLYEHELPWDGAEFAKEYIAHDQKVMEKEERVCLFLTHTFGKEKILSSYFFEKYPLYHENGSCMGTIYHGWQAQDFSFTRLFRGKLPANIMFQPPTDLFTQREWDVIFLMLQKYTNKQIGIMLNISYRTVENHISRICKRIGLHSSRQLEEYCRTNDYDLYVPKRFVQSGSRMLP >NC_005126.1|WP_041380819.1|2393561_2394188_+|tail-fiber-assembly-protein MTEQKYALEHETAVLGEDGLAIQPGWIKVYHTNQITREFINAGIEYVMLGVSLSAHSYLDAPDFPDSDDVAVCRSEDGKCWEIVPDYRGKIAYDTLTLTQQKITELGELPETLTFKQPTTGFDKWDGTKWVTDNVALKANQIEQAEQQRVTLLRHASESIALLQDAVDLNIATEVEKSALLTWRKYRVMLNRVNISLSPDIEWPEQPR >NC_005126.1|WP_011146280.1|2394242_2394992_+|tail-fiber-protein MSPKNDFKALSVINNKNIVSQEKYKISSDLQTEFPSNDVHSHLLNKALDQSSTISAVIANFIAEQSGEDVLDNGDITKLTAQLNKALEQKISDTSNIPVGIPVPWPTAVPPAGWLQCNGAVFDKSKFPKLAEAYPDGNLPDLRGEFIRGWDDRRGIDSGRRILTHQGDAIRNIQGSFAGMIALNYHLATRGAFYASQVLGIATDGSFKSINISDTDTPYGFGFEASRVVPVASENRPRNIAFNYIVRAA >NC_005126.1|WP_011146282.1|2396417_2396966_-|CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate-3-phosphatidyltransferase MQLNIPTWLTLFRIALIPFFVLAFYLPFTWAPMVCAIIFIVAAATDWFDGFLARLWKQTTRFGAFLDPVADKIMVAAALVLVSEHYHTWWITLPAATMIAREIIISSLREWMAELGKRSSVAVSWMGKVKTTAQMAALIALLWRPNFEFELGGFILLYVATVMTFWSMFQYINAAWSDLREA >NC_005126.1|WP_011146283.1|2397023_2398856_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrC MTEQFDSKTFLKTVTSQPGVYRMYDTSGTVIYVGKAKDLKKRLASYFRAQVTSRKTESLVKNIVQIDVTVTHTETEALLLEHNYIKLYQPRYNVLLRDDKSYPYIFLSADKHPRLAMYRGAKHFKGEYFGPFPNTHAVRESLILLQKLFPIRQCEDSVYRNRSRPCLQYQIGRCLGPCVKGLVSEDEYQQQVDYIRLFLSGKDQQVLTRLIERMEQASQQLKFEDAARYRDQIQAVRQVTERQFVSGTDDDLDVISVAFDAGMACLHVLFIRQGKVLGSRSYYPKIPTGTTLDEIVQTFLGQFYLQGSQNRTLPSEILLDFTLPEKDILSDSLSEISGRKIHIQTRPRGDKARYLKLARTNATIALSTRLSQQSTIHQRLDSLTKLVKLAKIQRMECFDISHTMGEQTVASCVVFDSNGPLRSEYRRYNISGITPGDDYAAMNQVLRRRYGKALDESKIPDIIFIDGGKGQLAQAIDVFQSLDVEWDKTRPQLIGVAKGSDRKAGLETLFFATEDKSIALPPDSPALHVIQHIRDESHNHAITGHRQRRSKVRNTSTLESIEGVGPKRRQMLLKYMGGLQPLRNASVEEIAKVPTISYALAEKIYNALKH >NC_005126.1|WP_011146284.1|2398839_2399505_-|UvrY/SirA/GacA-family-response-regulator-transcription-factor MINVLLVDDHELIRVGVKRILDDVKGITVVGEANCGEDAIKWCRANKVDIVLMDMNMPGIGGLEATKRILRYCPDVRVIMLTIYTENPLPMKVMQAGARGYLSKASTPQDMVNAIRAVNAGQRYIAPDIAQQMALSQISPQQDNPLSCLSDRELQIMLMITKGQKVSDISEQLNLSPKTVNSYRYRMFSKLNINGDVELTHMAIRYGLFDTESLLNSDGTI >NC_005126.1|WP_011146285.1|2399939_2400164_+|DUF2594-family-protein MNKIDLIPSSDTETLATEVTCLKVLLASILKTMGQAHAGRVVLNLERVIAEMGDEKQAKIFENTVQQIKALYRQ >NC_005126.1|WP_011146286.1|2400523_2400952_+|universal-stress-protein MYKTILVPVDISEDELTSKAVKHALSLAKETGAKLHILHVLPISSAIVNAYSLGYDEIKDKATIKAEDDLKTLIDAIDFPADRLSYSIAFGSPRDEITAAATEINADLIVIGSRRPNITTHLLGSNASGVVKYSTTSVLVIR >NC_005126.1|WP_011146287.1|2401212_2401551_+|hypothetical-protein MEKFTDKLIRLDHFVWRVIRFYFIAATFFFIGIIPGVLGFYLIEEHTFSESLLNALFMLGSQGLDPVPVSLSGKYFIAIYGVFLESVFFITLGLVVTPFIHRILHKWHLDSE >NC_005126.1|WP_011146288.1|2401729_2402167_+|universal-stress-protein MYKTILVPVDISEDELTDKAIAHAEYLAKLSDANIHLFHAVPDISRFSISYSYHYDLLNSFAKKSIARSEEELAKVAEKIDLPKERVSFSVACGSPRDKVLSTADEIKADLIVVGSRRPNISTHLLGSNASGIVGYANISVLVVR >NC_005126.1|WP_011146289.1|2402658_2403354_+|aquaporin-Z MLRKLAAELLGTFVLVFGGCGSVVFAAAFPELGIGFVGVSLAFGLTVLTMIYAVGHISGGHFNPAVTIGLWAGGRFRAVEVIPYIISQVIGGILAAAVLYVIASGQVGFDATTSGFASNGFGEHSPGGFSLQSAIVAEIVLTAIFLIVIIGATDRRAPPGFAPLAIGLALVLINLISIPITNTSVNPARSTAVAIFQNTWALEQLWFFWVMPIIGGIVGGGIYRLLFAEKQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_005126_7 | 2395199-2395826 | Orphan |
I-F
Consensus repeat of NC_005126_7
|
10 spacers
spacers of NC_005126_7
>7.1|2395227|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAGCCGGAAAATTAATGGCAAAGCATTAAGT >7.2|2395287|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGTAATTTCCTGCTTATCATTACTCTTTAAAG >7.3|2395347|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACGTTTGCACTCTTCTATATAGTGAGGGTTA >7.4|2395407|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGTAATTTCCTGCTTATCATTACTCTTTAAAG >7.5|2395467|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACGTTTGCACTCTTCTATATAGTGAGGGTTA >7.6|2395527|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGATGCCGACGAACGGCAACAATGCCGGTGAT >7.7|2395587|32|NC_005126|CRISPRCasFinder,CRT TTTGAAAACTCCCTGAAGCAATGGCGTGACCG >7.8|2395647|32|NC_005126|CRISPRCasFinder,CRT AACTTCTCCCGCACACAAAGGGAGAGTGGGCG >7.9|2395707|32|NC_005126|CRISPRCasFinder,CRT TAGAAATCCTTGAATATAGTCAGACCCGTAAT >7.10|2395767|32|NC_005126|CRISPRCasFinder,CRT AACTTCTCCCGCACACAAAGGGAGAGTGGGCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_005126_7
The CRISPR arrays of NC_005126_7 >merge|NC_005126|7|2395199-2395826|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAAACAGCCGGAAAATTAATGGCAAAGCATTAAGTGTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAACGTAATTTCCTGCTTATCATTACTCTTTAAAGGTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATACGTTTGCACTCTTCTATATAGTGAGGGTTAGTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAACGTAATTTCCTGCTTATCATTACTCTTTAAAGGTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATACGTTTGCACTCTTCTATATAGTGAGGGTTAGTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATGATGCCGACGAACGGCAACAATGCCGGTGATGTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATTTGAAAACTCCCTGAAGCAATGGCGTGACCGGTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAAAACTTCTCCCGCACACAAAGGGAGAGTGGGCGGTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATAGAAATCCTTGAATATAGTCAGACCCGTAATGCGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAAAACTTCTCCCGCACACAAAGGGAGAGTGGGCGGTGCACTGCCGTACAGGCAGATTAGAAA >NC_005126|7|5|2395199-2395586|PILER-CR GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA ACAGCCGGAAAATTAATGGCAAAGCATTAAGT GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA CGTAATTTCCTGCTTATCATTACTCTTTAAAG GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TACGTTTGCACTCTTCTATATAGTGAGGGTTA GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA CGTAATTTCCTGCTTATCATTACTCTTTAAAG GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TACGTTTGCACTCTTCTATATAGTGAGGGTTA GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TGATGCCGACGAACGGCAACAATGCCGGTGAT GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA >NC_005126|7|6|2395199-2395826|CRISPRCasFinder GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA ACAGCCGGAAAATTAATGGCAAAGCATTAAGT GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA CGTAATTTCCTGCTTATCATTACTCTTTAAAG GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TACGTTTGCACTCTTCTATATAGTGAGGGTTA GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA CGTAATTTCCTGCTTATCATTACTCTTTAAAG GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TACGTTTGCACTCTTCTATATAGTGAGGGTTA GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TGATGCCGACGAACGGCAACAATGCCGGTGAT GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TTTGAAAACTCCCTGAAGCAATGGCGTGACCG GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA AACTTCTCCCGCACACAAAGGGAGAGTGGGCG GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TAGAAATCCTTGAATATAGTCAGACCCGTAAT GCGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA AACTTCTCCCGCACACAAAGGGAGAGTGGGCG GTGCACTGCCGTACAGGCAGATTAGAAA >NC_005126|7|3|2395199-2395826|CRT GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA ACAGCCGGAAAATTAATGGCAAAGCATTAAGT GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA CGTAATTTCCTGCTTATCATTACTCTTTAAAG GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TACGTTTGCACTCTTCTATATAGTGAGGGTTA GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA CGTAATTTCCTGCTTATCATTACTCTTTAAAG GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TACGTTTGCACTCTTCTATATAGTGAGGGTTA GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TGATGCCGACGAACGGCAACAATGCCGGTGAT GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TTTGAAAACTCCCTGAAGCAATGGCGTGACCG GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA AACTTCTCCCGCACACAAAGGGAGAGTGGGCG GTGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TAGAAATCCTTGAATATAGTCAGACCCGTAAT GCGCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA AACTTCTCCCGCACACAAAGGGAGAGTGGGCG GTGCACTGCCGTACAGGCAGATTAGAAA
>NC_005126.1|WP_011146280.1|2394242_2394992_+|tail-fiber-protein MSPKNDFKALSVINNKNIVSQEKYKISSDLQTEFPSNDVHSHLLNKALDQSSTISAVIANFIAEQSGEDVLDNGDITKLTAQLNKALEQKISDTSNIPVGIPVPWPTAVPPAGWLQCNGAVFDKSKFPKLAEAYPDGNLPDLRGEFIRGWDDRRGIDSGRRILTHQGDAIRNIQGSFAGMIALNYHLATRGAFYASQVLGIATDGSFKSINISDTDTPYGFGFEASRVVPVASENRPRNIAFNYIVRAA >NC_005126.1|WP_041380819.1|2393561_2394188_+|tail-fiber-assembly-protein MTEQKYALEHETAVLGEDGLAIQPGWIKVYHTNQITREFINAGIEYVMLGVSLSAHSYLDAPDFPDSDDVAVCRSEDGKCWEIVPDYRGKIAYDTLTLTQQKITELGELPETLTFKQPTTGFDKWDGTKWVTDNVALKANQIEQAEQQRVTLLRHASESIALLQDAVDLNIATEVEKSALLTWRKYRVMLNRVNISLSPDIEWPEQPR >NC_005126.1|WP_011146278.1|2390995_2391913_+|tail-fiber-protein MSYKNDFKAFSTSDNANVISQDKYEVNQSLQTGFSPDNVPTHLLNKVLRQASAVSSAVTDFIATRSGNDVLDDGNIAKLTAQLNKALEQKMTTDIPSASLTQKGVVQLTNVVGNSDTLAVTQKLVQEVINSLREYTREEIDNRMKTANEIPVGSPIPWPLPHPPFGYFTCNGSAFNKLQYPKLAEAYPDGRLPDLRGEFIRGWDDGRGIDSGRGILTHQGDAIRNIVGSFPGAIALHFELAAKGVFYGNATFGVATDGNPKSVDHFTRDAVYTTYGFGFDTSRVVPVASENRPRNIAFNYIVRAA >NC_005126.1|WP_041380058.1|2389792_2390368_-|serine-acetyltransferase MNKVLSHKEELSHLTACLLSEVICSRTSFSWFKAIHRALKCPDRRFYFWWRIANYLYRTNKAKKISIRINRNLRNKYGCDLGLGCYIRKNLRISHYVGIVISRTCIIGDNFHVLQNTTIGVLNEDIQGKISIGNDVKIGANSCIISDNITIGDNVYIGAMSFINKDIPADCIAYTPKSQNEIKIKKQKIIN >NC_005126.1|WP_011146276.1|2388848_2389757_-|lipopolysaccharide-core-biosynthesis-protein-RfaZ MFLKYKYLLKLGMLCKQNITKSIYRNVSSKKMKHNMNFWPHIKISRNINGKIDAVSFNKKSININEFPKKSEKPLIIIASGPSVSTIKTDFFDDTKFDIMGVNGSYELSPEVKFKYHVIIDRTFILNRKNIVLNILKDNELILFTTMDCLNDILIHYGYLELKCKVIIIENIDQPVYQQEKELFEIKSDEIIIQNSVAFSLNLNLGFYNGTTVAYSALQIAFFLGYKEIYFAGLDMNNFSKPRFYETQNDKLDTKLNNNLHDFIIPCFNLAHEIAIRKGVKIYNLSKNSAINSFEKLDYRKI >NC_005126.1|WP_011146275.1|2387124_2387799_-|PAS-domain-containing-protein MKKINGTYISSQIINTMEASNEPWGIKDKNSRFIYGNPALKSIQNIPTSFDYEGLFDDELPWGGAAFAKEFIDHDKIVMTKGKRICSLETYTYGKENILSSYFQEKLPLYNDAKECIGILFHGWKAKDFSLINLYQYYNVLPTSIIFQPPTDTFTQREWDIIFFFLQKYTRKQIGKILNISYRTIESHMANIYHKIGVDSNQQLEEYCLINNFKRYVPEKFLLF >NC_005126.1|WP_041380057.1|2385749_2386418_-|PAS-domain-containing-protein MSNRIAISSQVINTLAVSNEPWGIKDKNSCFIYGNLALKSLQNFSNSFEFEGAYENELPWDSAKFAEQFINHDKKVMEKQQRICSIETHIFGREQILSSYFFEKSPFYHKDGDCIGVIYHGWKAKNYSLAYLHQYHDKLPASIMLQPPTDLFTHREWDIIFLFLQKNTRKQIGRILNLAYRTIEYYMTRIYRKIGINSSQQLEAYCRANNFNYYIPEKFLLS >NC_005126.1|WP_011146273.1|2383626_2384319_-|PAS-domain-containing-protein MQHIKNRPNNITPQLIHMWENSDEPWGAKDLQSRFIYANSAFYQLHNLPDDFEITGLTTGELPSPIAEYEKEFHRQDQKVLQTMQRVSSLETHPFEEHKIKQIYLCNKYPLCDEDGNCIGLTFHMCKTKNFSTAYYYDKTPPATLEFIAPNDKLTQTEWEVLFLTLRSLDEEKIGEALMISAEDVVNHIQSIYQKFNLSLHEELKDFCKENKLDAYIPARFVTIGSVELN >NC_005126.1|WP_011146272.1|2382893_2383571_-|PAS-and-helix-turn-helix-domain-containing-protein MSNKIISSQIINTMKQCNDPWGIKDKNSCFIYANQSFKTLQNLSNSFDYEGVFDDEIPWDGAEFAKEFITHDKTVMTKEQRVCSLETHVYGKNQILSSYFFEKLPIYHEDGSCMGILFHGWQAQDFSFTRLFYGKLPASIMFQPPTDLFTQREWDVIFLMLHKYTSKQIGRMLNISYRTVETHISRIYKRIGLHSTRQLEDYCRTNDYDLYVPERFVHPESRMFP >NC_005126.1|WP_011146271.1|2382052_2382733_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MDNKLIISSQVINTMEQSNAPWAIKDKNSRFMYANQACKHLQNISSSFDYEGLYDDEIPWGGAEFAKEYIIHDQKVMEKEERICLLLTHKFGKEQILSSYFFEKYPLYHEDGSCMGTMFHGWQVQDFSFTRLFHGKLPANIMFQPPTDLFTQREWDVIFLMLQKYTNKQIGIMLNISYRTVENHISRICKRIGLHSSRQLEEYCRTNDYDLYVPKRFVQPRSKMFP >NC_005126.1|WP_011146282.1|2396417_2396966_-|CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate-3-phosphatidyltransferase MQLNIPTWLTLFRIALIPFFVLAFYLPFTWAPMVCAIIFIVAAATDWFDGFLARLWKQTTRFGAFLDPVADKIMVAAALVLVSEHYHTWWITLPAATMIAREIIISSLREWMAELGKRSSVAVSWMGKVKTTAQMAALIALLWRPNFEFELGGFILLYVATVMTFWSMFQYINAAWSDLREA >NC_005126.1|WP_011146283.1|2397023_2398856_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrC MTEQFDSKTFLKTVTSQPGVYRMYDTSGTVIYVGKAKDLKKRLASYFRAQVTSRKTESLVKNIVQIDVTVTHTETEALLLEHNYIKLYQPRYNVLLRDDKSYPYIFLSADKHPRLAMYRGAKHFKGEYFGPFPNTHAVRESLILLQKLFPIRQCEDSVYRNRSRPCLQYQIGRCLGPCVKGLVSEDEYQQQVDYIRLFLSGKDQQVLTRLIERMEQASQQLKFEDAARYRDQIQAVRQVTERQFVSGTDDDLDVISVAFDAGMACLHVLFIRQGKVLGSRSYYPKIPTGTTLDEIVQTFLGQFYLQGSQNRTLPSEILLDFTLPEKDILSDSLSEISGRKIHIQTRPRGDKARYLKLARTNATIALSTRLSQQSTIHQRLDSLTKLVKLAKIQRMECFDISHTMGEQTVASCVVFDSNGPLRSEYRRYNISGITPGDDYAAMNQVLRRRYGKALDESKIPDIIFIDGGKGQLAQAIDVFQSLDVEWDKTRPQLIGVAKGSDRKAGLETLFFATEDKSIALPPDSPALHVIQHIRDESHNHAITGHRQRRSKVRNTSTLESIEGVGPKRRQMLLKYMGGLQPLRNASVEEIAKVPTISYALAEKIYNALKH >NC_005126.1|WP_011146284.1|2398839_2399505_-|UvrY/SirA/GacA-family-response-regulator-transcription-factor MINVLLVDDHELIRVGVKRILDDVKGITVVGEANCGEDAIKWCRANKVDIVLMDMNMPGIGGLEATKRILRYCPDVRVIMLTIYTENPLPMKVMQAGARGYLSKASTPQDMVNAIRAVNAGQRYIAPDIAQQMALSQISPQQDNPLSCLSDRELQIMLMITKGQKVSDISEQLNLSPKTVNSYRYRMFSKLNINGDVELTHMAIRYGLFDTESLLNSDGTI >NC_005126.1|WP_011146285.1|2399939_2400164_+|DUF2594-family-protein MNKIDLIPSSDTETLATEVTCLKVLLASILKTMGQAHAGRVVLNLERVIAEMGDEKQAKIFENTVQQIKALYRQ >NC_005126.1|WP_011146286.1|2400523_2400952_+|universal-stress-protein MYKTILVPVDISEDELTSKAVKHALSLAKETGAKLHILHVLPISSAIVNAYSLGYDEIKDKATIKAEDDLKTLIDAIDFPADRLSYSIAFGSPRDEITAAATEINADLIVIGSRRPNITTHLLGSNASGVVKYSTTSVLVIR >NC_005126.1|WP_011146287.1|2401212_2401551_+|hypothetical-protein MEKFTDKLIRLDHFVWRVIRFYFIAATFFFIGIIPGVLGFYLIEEHTFSESLLNALFMLGSQGLDPVPVSLSGKYFIAIYGVFLESVFFITLGLVVTPFIHRILHKWHLDSE >NC_005126.1|WP_011146288.1|2401729_2402167_+|universal-stress-protein MYKTILVPVDISEDELTDKAIAHAEYLAKLSDANIHLFHAVPDISRFSISYSYHYDLLNSFAKKSIARSEEELAKVAEKIDLPKERVSFSVACGSPRDKVLSTADEIKADLIVVGSRRPNISTHLLGSNASGIVGYANISVLVVR >NC_005126.1|WP_011146289.1|2402658_2403354_+|aquaporin-Z MLRKLAAELLGTFVLVFGGCGSVVFAAAFPELGIGFVGVSLAFGLTVLTMIYAVGHISGGHFNPAVTIGLWAGGRFRAVEVIPYIISQVIGGILAAAVLYVIASGQVGFDATTSGFASNGFGEHSPGGFSLQSAIVAEIVLTAIFLIVIIGATDRRAPPGFAPLAIGLALVLINLISIPITNTSVNPARSTAVAIFQNTWALEQLWFFWVMPIIGGIVGGGIYRLLFAEKQ >NC_005126.1|WP_011146290.1|2403736_2404456_+|phage-tail-protein MSQKNDFKAFSISDNANIVSQEKYEESQNLKTGFPPENVSTHVLNKVLRQSSTISSVVANFIATQSGEDVLDDGDIAKLTVRFNRALDKALEQKISGISSIPVGSPIPWPLSHPPSGYFTCNGSAFSRSQYPKLAEAYPDGRIPDLRGEFIRGWDDGRGVDSGRVILSAQTDNTKRIQLTKGLPDGQFLSSYQGPVDRYQFPLGRDVLESATVTSIANNTGGHETRPRNIAFNYIVKAE >NC_005126.1|WP_011146291.1|2404477_2405104_+|tail-fiber-assembly-protein MTQENILDTETAVLGEDGLAIQAGWIKVYHANSYTREFSGSDFEYVAEGVGLSAHSYLDAPNLSDSDDMAVRRSEDGSYWEIVPDHRGKIAYNTQAGVQEEVTVLGELPEILTFEQPSTDFDQWDGEKWVTDFEAQKVSQIEQAEQQRAIFRRQADEAITVLQYAVETEMASEEEKTLLLDWKKYLVLLRRVDVSSAPDINWPEQPQE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_005126_8 | 2475403-2475730 | Orphan |
I-F
Consensus repeat of NC_005126_8
|
5 spacers
spacers of NC_005126_8
>8.1|2475431|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTAAGAACGATACCAAAGACAAGTATTCCCA >8.2|2475491|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTTTATTCTTAAGAACAACGTAGTAGCTGG >8.3|2475551|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATTAAAGGGGATCAAAATGAATACATCAACA >8.4|2475611|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTTGAAGGGCTAAGTGTTGCCGGGCCGATA >8.5|2475671|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCAAGTAAACCCGGTGGCTATAATCTCATCTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_005126_8
The CRISPR arrays of NC_005126_8 >merge|NC_005126|8|2475403-2475730|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATGTAAGAACGATACCAAAGACAAGTATTCCCAGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATTGTTTATTCTTAAGAACAACGTAGTAGCTGGGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAATATTAAAGGGGATCAAAATGAATACATCAACAGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAACTTTTGAAGGGCTAAGTGTTGCCGGGCCGATAGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAAGCAAGTAAACCCGGTGGCTATAATCTCATCTCGTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA >NC_005126|8|6|2475403-2475730|PILER-CR GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TGTAAGAACGATACCAAAGACAAGTATTCCCA GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TTGTTTATTCTTAAGAACAACGTAGTAGCTGG GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TATTAAAGGGGATCAAAATGAATACATCAACA GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA CTTTTGAAGGGCTAAGTGTTGCCGGGCCGATA GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA GCAAGTAAACCCGGTGGCTATAATCTCATCTC GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA >NC_005126|8|7|2475403-2475730|CRISPRCasFinder GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TGTAAGAACGATACCAAAGACAAGTATTCCCA GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TTGTTTATTCTTAAGAACAACGTAGTAGCTGG GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TATTAAAGGGGATCAAAATGAATACATCAACA GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA CTTTTGAAGGGCTAAGTGTTGCCGGGCCGATA GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA GCAAGTAAACCCGGTGGCTATAATCTCATCTC GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA >NC_005126|8|4|2475403-2475730|CRT GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TGTAAGAACGATACCAAAGACAAGTATTCCCA GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TTGTTTATTCTTAAGAACAACGTAGTAGCTGG GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA TATTAAAGGGGATCAAAATGAATACATCAACA GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA CTTTTGAAGGGCTAAGTGTTGCCGGGCCGATA GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA GCAAGTAAACCCGGTGGCTATAATCTCATCTC GTTCACTGCCGTACAGGCAGCTTAGAAA
>NC_005126.1|WP_011146345.1|2474590_2475175_+|ribosomal-protein-S5-alanine-N-acetyltransferase MFGYRSTLPKVRLITERMVVRLVYERDAYRLAEYYSENHEFLKPWEPTRDRSHCQPSGWINRLNLIIEMQRQSAAFHFLLLDSNESEVIGVANFSNILRGAFHACYLGYSLGEKWQGKGMMYEALQPAIRYMQRQQGMHRIMANYMPDNHRSGKLLERLGFEREGYAKKYLMINGVWQDHVLTALTDEKWSGKS >NC_005126.1|WP_011146344.1|2473196_2474402_-|multidrug-efflux-MFS-transporter-MdtH MSLVSQARSLGKYFLLFDNLLVVLGFFVVFPLISIHFVEQLGWAALVVGFALGLRQFVQQGLGIFGGAIADRFGAKPMIVTGMLLRALGFAFIALATEPWILWLACILSALGGTLFDPPRTALVIKLTRPHERGRFFSLLLMQDSAGAVIGALIGSWLLQYDFQFVCWTGAGVFVLAAIWNALFLPAYRISTTRTPIWEGMERVIKDRRFFTYVLTLTGYFMLSVQVMLMFPIIVNEIAGTPAAVKWMYAIEATLSLTLLYPIARWSEKRFRLEQRLMAGLFLMSLSMFPVGLIGEINTLFGLICLFYLGTVTAEPARETLSASLADPRARGSYMGFSRLGLALGGALGYTGGGWLYDTGHALNIPQLPWFLLGIIGLITLYALHRQFNQRKIESAMLSGN >NC_005126.1|WP_011146343.1|2472595_2473159_-|lipoprotein MRKFFLGAVLLLVGLISGCDQFKDISISEELINGYLAKHVHYQKQLELHGIANADIELTELSSQIGRTEPNKIALTGRANVNVTSLLGPAKADMKLSLKAQPVFDQEKGAIFLKELEIVDYQITPEKMEKPINALVPYLNKSLSAFFDIHPIYVIKADHSKAEAAAKTLAKRLEVKPGKLVIMLTDK >NC_005126.1|WP_011146342.1|2471865_2472405_+|molecular-chaperone MNEFSIVCRILGTLFNRQPQDPILKPLLTVIVEGKLKQSWPLEQDALLDRLQQNCDLSAMQADYMALFYGDNASVPSRRSDYTGESENDIRQFLIERGMPLSDGPVDQFGSLLLGASWLEDQAAEDEVQGQIMLFDEYLLPWCGQFLGKVEAHAITSFYRTLAMITREALQALREELDS >NC_005126.1|WP_011146341.1|2470851_2471793_+|glyoxylate/hydroxypyruvate-reductase-GhrA MEIIFYHPFFDAAQWIQGMQQRLPNINIRQWKRGDNKHADYAMVWAPPYEMLANRSGLKGIFILGAGVEAILKQEQQKPGMLPAGVPLMRLEDAGMGLQMQEYAVAMVLHYLRRMDEYKLQQGQRRWKQLEPYDRKDFVVGVLGAGVLGRRVAQTLVEWGFIVRCWSRTPKQINNVVSFHGEDQLGDFLSGSKVLINLLPDTPKTRGILNLSLFSQLKPKSYLINIARGAHLVEHDLLVAIDKGYIVGASLDVFVEEPLPEMHPFWTHPRITVTPHVAAITIPDIAMDTISENIRRIEKGELSTGVVDIKLGY >NC_005126.1|WP_011146340.1|2469817_2470120_-|HigA-family-addiction-module-antidote-protein MKMFNPPHPGEIIADSLEELGLGIRDLARALNVAPSTAQRLVSCKAAVTPEMAIKLSKVLGSSPRLWLKLQETYSLDKAEKTVDISKLTPLFKPVHLSHT >NC_005126.1|WP_011146339.1|2469075_2469657_+|hypothetical-protein MKKLAVMLALGMISFGAMAVDGYKDAKFGMTEEEFLSKRLCDFEKFEGNSQIEEVSLYSCSDFSFANKKREAMAFFLNGKFKRLEINIGRLVKPVSKSLTKKYGDESSYPSQEEFENALKYNGTMSIGYDNNTVLVDIHIMCGKEGIETSRLIYTSPDVHTIPDLENKIQELRGLKEFQELLELDREKLDEDV >NC_005126.1|WP_011146338.1|2467794_2468907_+|long-chain-fatty-acid--CoA-ligase MTSYVDKQEIIASSEIDDLIFSSDPLAWSYDEQEKIRNKFVLDAFRNHYKHCQEYRHYCQVHKVDDNITEIDDIPVFPTSVFKFTRLLTSQENEIESWFTSSGTSGLKSQVARNRLSIERLLGSVSYGMKYVGSWFDHQIELVNLGPDRFNAHNIWFKYVMSLVELLYPTTFTVMEERIDFVKTLNSLERIKNQGKDICLIGSPYFIYLLCQYMKDKNISFYGDKNLYIITGGGWKSYEKESLKRDDFNHLLFDTFNLNNISQIRDIFNQVELNTCFFEDEMQRKRVPPWVYARALDPETLKPVPDGMPGLMSYMDASSTSYPAFIVTDDVGIMSREYGQYPGVLVEILRRVNTRAQKGCALSLNQAFNS >NC_005126.1|WP_011146337.1|2466758_2467733_+|LLM-class-flavin-dependent-oxidoreductase MKFGLFFLNFINSTTVQEQSIVRMQEITEYVDKLNFEQILVYENHFSGNGVVGAPLTVSGFLLGLTEKIKIGSLNHIITTHHPVRIAEEACLLDQLSEGRFILGFSDCEKKDEMRLFNRPVEYQQQLFEECYEIINDALTTGYCNPDNDFYSFPKISVNPHAYTQGGPRRYVTATSHHIVEWAAKKGIPLIFKWDDSNDVRYEYAERYKAVADKYGIDLSAIDHQLMVLVNYNEDSHKAKQETRAFIRDYVLEMYPNENLENKLEEIITENAVGDYTECIAAAKLAIEKCGAKSVLLSFEPMNDLMHQKNVINIVNDNIKKYHM >NC_005126.1|WP_011146336.1|2465661_2466741_+|LLM-class-flavin-dependent-oxidoreductase MKFGNFLLTYQPPQFSQTEVMKRLVKLGRISEECGFDTVWLLEHHFTEFGLLGNPYVAAAYLLGATKKLNVGTAAIVLPTAHPVRQLEDVNLLDQMSKGRFRFGICRGLYNKDFRVFGTDMNNSRALTECWYGLIKNGMTEGYMEADNEHIKFHKVKVNPTAYSKGGAPVYVVAESASTTEWAAQFGLPMILSWIINTNEKKAQLELYNEVAQEYGHDIHNIDHCLSYITSVNYDSNKAQEICRDFLGHWYDSYVNATTIFDDSDKTRGYDFNKGQWRDFVLKGHRDTNRRIDYSYEINPVGTPQECIDIIQKDIDATGISNICCGFEANGTVDEIIASMKLFQSDVMPFLKEKQRSLL >NC_005126.1|WP_011146346.1|2476571_2478107_+|murein-biosynthesis-integral-membrane-protein-MurJ MNLLKSLAAVSSMTMFSRVLGFIRDAIIARIFGAGVAADAFFVAFKLPNLLRRIFAEGAFSQAFVPILAEYKNQQGDEATRTFIAYVSGMLTLILAIVTVLGVLAAPWVIYVTAPGFTDTADKFTLTTNLLRITFPYIFLISLASLAGAILNTWNRFSVPAFAPTLLNISMIVFALFVAPYCNPPVMALGWAVVAGGILQLLYQLPHLKKIGMLVLPRISFRDSGVWRVMRQMGPAILGVSVGQISLIINTIFASFLVSGSVSWMYYADRLMELPSGVLGVALGTILLPSLAKSFSSGNHEEYTKLMDWGLRLCFLLALPCAVALGMLAEPLTVSLFQYGNFTAFDAVMTQKALIAYCFGLMGLIIVKVLAPGFYSRRDIKTPVKIAIVTLILTQLMNLAFVGPLKHAGLALSIGLASCFNASLLYWQLRKKNIFKPLAGWGRFLFKLVVAITVMIAVLAVTLWLMPAWEQGNMATRLLRLMVVVIAGASSYFAALVLMGFRLKDFAHRSF >NC_005126.1|WP_011146347.1|2478471_2480202_-|arginine--tRNA-ligase MNIQAILSEKVSQALIAAGAPADSEAHIRQSAKAQFGDYQANGVMAAAKKVGMPPRQLAEKVVNLLNLQGIASKVEIAGPGFINIFLDKAWIAANIETALKDEKLGVTPAKPQTIVVDYSAPNVAKQMHVGHLRSTIIGDAAVRTLEFLGHKVIRANHVGDWGTQFGMLIAYLEKVQNENASDMALSDLEAFYREAKKHYDEDEEFAIRARGYVVKLQGGDEYCRTMWRKLVDITMAQNQQTYDRLNVTLTKDSVMGESLYNDLLPSIVADLKQQGLAVESDGATVVYLDEYKNKEGEPMGVIIQKQDGGYLYTTTDIACAKYRYETLHADRILYYIDSRQHQHLMQAWTIVRKAGYVPESVSLEHHMFGMMLGKDSKPFKTRAGGTVRLTDLLDEAIERANTLIREKNPDMPEDELKKVVSAVGIGAVKYADLSKSRTTDYIFDWDNMLAFEGNTAPYMQYAYTRVASIFKRAEIDESSLTLPVILNEDREQTLATRLLQFEETITTVAREGTPHVMCAYLYDLAGLFSCFYEHCQILNAESEELRQSRLKLALLTAKTLKQGLNTLGIETVERM >NC_005126.1|WP_011146348.1|2480556_2481294_-|cyclase-family-protein MSNSILQALTVLKSKKWVDLTHSFDKDSPHFFMLDSAEFKTLFDYKDGFFTQQFSFPGQYGTHIDAPCHFVPDTRYVDELELKELVLPLIVLDQSERAKQDPNFSLSKEDILKFEEEYGIIEAGTFVALRTDWSKRWSSQKAMDNKDDSGNNQTPGWGIDALKFLFEERHIKAIGHETFDTDAAKDFRKNNALLGEDYVLKQDTYQIELLANLDQVPVRGAVIFNIVAKPKKASGFPVRAFAILP >NC_005126.1|WP_011146349.1|2481897_2482452_+|cytochrome-b MLWKNTSNQFGHLSVLLHWLVALIVYGMFALGLWMVTLGYYDTWYHKAPEIHKSIGMLLFIMMAVRVIWRFVSPPPKPLASYSRLIRVSAVLMHILLYILLFGILISGYLISTADGQPISVFDWFIVPATLIGQGEQADTAGMIHLYLAWAVVILSLLHAVAALKHHFIDRDATLKRILGFRPE >NC_005126.1|WP_011146350.1|2482478_2483057_+|YceI-family-protein MLKKTLLGLTAGALLLNASSALAANYKIDIPGQHAFIGFRIQHLGYSWLYGTFKDFDGSFTFDEQNPAENKVNVTIKIASLDTNHAERDKHLRSKDYFNTEKYPEAKFTSTEVKKEGEKYVVTGDLTLNGVTKPVILNAELMGEGKDPWGGYRAGFEASGKIKLKDFNFKADLGPKSQEADLLISIEGVREK >NC_005126.1|WP_011146351.1|2483370_2483739_-|hypothetical-protein MSDWSGSVPANAENGKSTGLILKQGDTISVVAHGWVKYGRDNVEWAAPDGPVPNNPQPSSIATLVAKIANKKFAIGNGVLHKTVPVDGELILLFNDVPGTFGDNSGEFQVEVIIESRYSPLK >NC_005126.1|WP_011146352.1|2484707_2485271_+|VOC-family-protein MTHFSSIVELQDLVAELAIFEQKLVRFKQRLNLNVEQYQADHISLRCHDISVAERWRKGFLQCGSLMSETIINGRPICLFDLEYPIAVLNWQIDCVELPYPGKKTYLHQGWEHVELVLPVAPEILSTAAKALLPQPLPAGFSVKESQPKGEQERLPNPTLAITDGEITVKFHPFTLREIVKSECSAT >NC_005126.1|WP_011146353.1|2485286_2485601_-|type-II-toxin-antitoxin-system-MqsA-family-antitoxin MKRDLFAELNEGMKAWEEANEGKLTLKTHKRRLKNDIFISPDELKSIRSKLNISQAVFAQYLHTGETTYQNWEQGRAKPNKQAVLLIKMVERNPQALEFLASLT >NC_005126.1|WP_011146354.1|2485601_2485937_-|hypothetical-protein MEAVFIELPPFERYRHNYLSDEEFRTFQNMLLKNPTTGDVIQHTGGLRKVRFTDSRRKKGKRGGIRIIYYWWVSKSQFMLFTIYDKDEMSDLTKEQCESLRKMLEMRKKGA >NC_005126.1|WP_011146355.1|2486287_2487034_+|copper-homeostasis-protein-CutC MTKLEICCFSVGCALIAQQAGADRIELCASPAEGGLTPSFGTLKQAIEQLTIPVYPIVRPRGGDFCYSHSDFEVMKNDVAQIRDMGFMGVVFGVLDEEGHIDLPRMQQLMALSGDMAVTFHRAFDMCFNPYVALDQLTQLGVKRILTSGQQQNAELGLPLLKELHQASQGPIIMAGAGVRMSNIHKFIDIGLTEVHSSASRIMLSTMTYRKAGVTMSADNEVDEFSHYCVDGGVVEVMKGMLSLTLFE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_005126_9 | 3051737-3051859 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_005126_9
|
1 spacers
spacers of NC_005126_9
>9.1|3051779|39|NC_005126|CRISPRCasFinder TATCCGTCATCTTTCAAGTTACCTCTTTTGTTGGCTACA |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_005126_9
The CRISPR arrays of NC_005126_9 >merge|NC_005126|9|3051737-3051859|CRISPRCasFinder CTCCCTTGCCGTCGCGATGCATCTTGAAATCCATAGGGTATATATCCGTCATCTTTCAAGTTACCTCTTTTGTTGGCTACACTCCCTTGCCGTCGCGATCCATCTTGAAATCCATAGGGTATA >NC_005126|9|8|3051737-3051859|CRISPRCasFinder CTCCCTTGCCGTCGCGATGCATCTTGAAATCCATAGGGTATA TATCCGTCATCTTTCAAGTTACCTCTTTTGTTGGCTACA CTCCCTTGCCGTCGCGATCCATCTTGAAATCCATAGGGTATA
>NC_005126.1|WP_011146830.1|3050494_3051646_+|cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid-synthase MSSSCIKNPKTAINSWQRMTNEMLEEAGVQINGHNPYDIQIKNANFYKRVLQQGSMGLGESYMDGWWDCERLDIFFYRVLRAGLENKMPNNLKDIVRIAITRLRNLQTPKRSWIVGHQHYDLGNDLFTHMLDPYMQYSCGYWKQAKTLEQAQLDKLKLICEKLALSPGMTLLDIGCGWGGLSAYAAKNYGVSVTGITISAEQQKYAQKQCTNLDVKIILKDYRDLHEQFDKIVSVGMFEHVGPKNYATYFDVVQRNLKPDGLFLLHTAGSNKTKTSADPWISKYIFPNGCLPSIEQIAHTSKSRFVMEDWHNFSADYDRTLMAWHERFITCWPEIENNYSPTFKRMFSYYLNACAGAFRARDIQLWQIIFSLKGIEGGLRVAR >NC_005126.1|WP_011146829.1|3048877_3050074_+|Bcr/CflA-family-multidrug-efflux-MFS-transporter MKNSSQFMFYLAGLSMLGYLAIDMYLPAFGTMQQELATSAEAISASLSIFLAGFAFAQLLWGPLSDRFGRKPIIITGLSLFSIGCLGMMWVTDATQLLVLRFIQAVGVCSAAVSWQALVIDRYEANRTKRVFATIMPLVALSPALAPLMGAWLLQHGGWRIIFLVLLAITLLLLFFTLFLQENRNNRETQVQTNNVSFLTLLKSPLFSGNVLIFASCSAGFFAWLTGSPSILGEMGYTPDDIGLSYIPQTLAFIVGGYGCRSILAKIKSDIIFPYLLIGYAISMIVLYLIAKFDEPTLFTILVPFCFMAAMNGALYPIAVANALSAYPQDSGKATALQNTLQLGLCFIASLIVSAFINNPLISTTTVMVSTVVPMALGYFIQWKKNADRCIQTVEQNS >NC_005126.1|WP_011146828.1|3047697_3048606_-|LysR-family-transcriptional-regulator MWSEYSLEVVDAVARTGSFSAAALELHRVPSAISYTVRQLEEWLAVSLFERRHRDVELTEAGAMFIKEARSVIKKMIDTRHQCQQIANGWRGQFSIAIDLVVKPERSRQLILDFYHHFPDIELFIHQEVFNGVWDALVNSRVDVAIGATRVAPVGERYSFRDMGFMPWLCVVSADHALTQLPGLLSDDQMRPYPSLCLEDTSRNLPKRDTWNLDNQRRLVVPDWESGLSCLNEGLCVGMVPKHRAMPLIRQNKLAVLELEQPLPDSPCCLAWVQNSHSPALSWLLDYLGDSETLNAEWLQDE >NC_005126.1|WP_011146827.1|3046665_3047691_+|HTH-type-transcriptional-repressor-PurR MATIKDVAKHAGVSTTTVSHVINKTRFVAEDTKAAVWAAIKALNYSPSAVARSLKVNHTKSIGLLATSSEAPYFAEIIESVENSCYSKGYTLILCNSHNNIDKQKAYLAMLAQKRVDGLLIMCSEYPEQLLGMLEDYRNIPMVVMDWGQARSDFTDTIIDNAFHGGYLAGRYLIERGHRDIGAIPGPLARNTGGGRHQGFLKALKEANIPIKEEWVIQGDFEPESGYKAMHQILNQKQRPTAVFCGGDVMAMGAICAADELGLRVPQDISVIGYDNIRNARYFSPALTTIHQPKERLGQMAFSMLLDRIINKREDAQTIEVHPRLVERRSVVDGPFVDYRR >NC_005126.1|WP_011146826.1|3045732_3046083_-|Grx4-family-monothiol-glutaredoxin MTTTIEKIERQIKENPILLYMKGSPKLPNCGFSAQAVQALSACGERFAYVDILQNPDIRAELPKYANWPTFPQLWVEGELIGGCDIIIEMYQRGELQTLIKETADKCRSQGENATE >NC_005126.1|WP_011146825.1|3044852_3045506_+|ribonuclease-T MSDKKAPNVLSGRFRGYYPVVIDVETGGFNAKTDALLEIAAVTLEMDGEGWLTPGESLHFHIEPFEGANLEPAALEFTGIDPLNPLRGAVSEYEALHAIFKMVRKGIKNNHCNRAIIVAHNANFDHSFVMAATERTGLKRNPFHPFATFDTAALGGLVLGQTILAKACITAGIPFDNNQAHSALYDTDRTAELFCEMVNRWKQLGGWPLTTTAEKTG >NC_005126.1|WP_011146824.1|3044439_3044853_+|lactoylglutathione-lyase MRLLHTMIRVGDLQRSINFYTEVLGMRLLRTSENTEYKYSLAFVGYADESEGAVIELTYNWGVDHYEMGNAFGHIALGVDDVAATCESIHKAGGSITREAGPVKGGTTIIAFVEDPDGYKIELIENKNASNALGNSI >NC_005126.1|WP_041380104.1|3044027_3044267_-|DUF1289-domain-containing-protein MAEQLEFFAIPSPCRGICQANERGFCLGCYRSREERFNWMKMSDGQKREVLRLCRQRYLRVLRAENQTDEEPPEQPSLF >NC_005126.1|WP_011146822.1|3043035_3043467_-|transcriptional-regulator-SlyA MESTLGSDLARLVRIWRALIDYRLKPLELTQTHWVTLYNISRLPQEQSQIQLAKAIGIEQPSLVRTLDQLEEKKLITRHTCANDRRAKRIKLTEDSASVIRELDGVIESTRNEILGGISREELAFLSTLVQKLEQNIIQLQSR >NC_005126.1|WP_011146821.1|3042480_3042951_+|glycine-zipper-2TM-domain-containing-protein MFKHFLVSAVAVASLSGCVNTDSLSGDTYTAGQAKQVQTVSYGTVVSVRPINIQAGSNENVLGAIGGAVLGGLVGNTIGGGSGNTLATAAGAIAGGVAGQNVQGALNTTKGVELEIRRDSGESIIVVQKQGKTAFHKGQRVRIAGQGSNITVSPRQ >NC_005126.1|WP_011146831.1|3051949_3052927_-|hypothetical-protein MDKSLENMYCCLSHHPAISDKVRNGECIKIFIGSDTEHSDIAQKMYMYKKNFDVKSDFAFLEKTSPDDIKQKISDCDLFIFLYASSTLKNASPQGPEYLTKIRSFITESWKKSVLFKDYGPHFIEAFSEPPASITERNKKLIELSNRSQKIQYTDNKGNSIVGYLEKDHKWTSIDGSGNLDVIPGEIASHIKRLNGSVSFSGTFLSTAPFAIKYGVVNDMMTINIKEGEIIGFDCEHDEFSRDFNLYLNHNHGNRIVEEFGIGTNRGVKALYGRNAGFEERHPGLHLGLGGGVKGSHHLDLIFSGGKIAFDQTVFFDNGYVNDFR >NC_005126.1|WP_011146832.1|3053333_3054011_-|riboflavin-synthase MFTGIVQGKAPLVAIDEKSNFRTHVVKFPAELLPGIETGASVANNGCCLTVTKIEGDEISFDLMKETLRLTNLGDLQLGDYVNLERAAKFGDEIGGHLMSGHIITVAEIAKIFTSENNHQIWFRIHDKQLMKYILHKGFIGIDGISLTIGDVVNNRFCVHLIPETLERTTLGKKRLGQRVNIEIDSQTQAIVDTVERVLAQKERERVASQQPETLMEECAINEER >NC_005126.1|WP_011146833.1|3054237_3055611_+|MATE-family-efflux-transporter MQKYLKEARSLLALGIPVIIAQFSQTAMGVVDTVMAGSVSATDMSAVAVGTSIWLPVILFGYGLLLALTPIIAQMNGSGRRNLIASQTQQGFWLAIFLSIIIIAILYNSKFLIDRQHNIDPILAEKAVGFIHAIMWGAPGYLFYQVLRNQCEGLSKTKPGMVISFLGLLINIPINYIFIYGKFGAPALGGVGCGVATASVYWVMFLLMRWYVKRASSQRDIRPKHRFAAPEWHILKRISALGLPIAMAVFFEITLFAIVALLISPLGVTAVAGHQIAQNFSSLMFMFPISLAAATTIRVGYNLGKKSIENARISAYTGIMVGLVFACLTATFSIILREPIALMYNDNPEVITMASHLMLFAALYQLSDAIQVVGAGVLRGYKDTRSIFYITFIAFWILGLPSGYILGLTDYIVPAMGPQGFWIGFIIGLTASAVMIFARISWTQKQPDEVILQHSTH >NC_005126.1|WP_011146835.1|3056559_3057969_+|pyruvate-kinase-PykF MKKTKIVCTIGPKTESEEKLAELLNAGMNVMRLNFSHGDYEEHGQRIQNIHSVMTKTGKQAAILLDTKGPEIRTMKLEGGNDVSLTAGQTFTFTTDTSVIGNKDRVAVTYRGFPADLAPGNTVLVDDGLIGMTVKEVTKSEVICQVLNNGDLGENKGVNLPGISISLPALAEKDKQDLIFGCQQGVDFVAASFIRKRSDVLEIREHLKAHGGENIQIISKIENQEGLNNFDEILEASDGIMVARGDLGVEIPVEEVIFAQKMMIQKCNIARKVVITATQMLDSMIKNPRPTRAEAGDVANAILDGTDAVMLSGESAKGKYPIEAVTIMATICERTDRVMPSRIEAVHCRNLRVTEAVCRGAVETAEKLEAPLIVVATYGGKSAKSIRKYFPDAPILALTTNEVTARQLLLVKGVFTQIVKEIASTDDFYRIGKEAALASGLAKKGEIVVMVSGALVPSGTTNTSSVHVL >NC_005126.1|WP_011146836.1|3058221_3059073_-|enoyl-CoA-hydratase/isomerase-family-protein MLSDQSNEYFNISIDNGVAHLQLSRPEKANSLALGFWKRFPETVEQLSRSGEVRAMVISAQGNTFCGGLDLQIFASSKEANTANPNEREAMQFSLLQMQEAISVLEHARFPIIAAVQGACLGAGFDLIAACDFCFAAENAKFRIEETNIGMMADLGILQRLQHLIPSGIARYLALTGDTLSAVQAHDLGLVVKVFPSTETLIEGALATARRIADRPPIAINGVKRAMLYSRDHGVYESLQQIALLQASIFSRQDILCSIQAKATGTKSEFQNLSEVGKAFDEP >NC_005126.1|WP_011146837.1|3059514_3059751_+|major-outer-membrane-lipoprotein MNRTKIVLGAVVLASTLLAGCSSTAKVDQLTSDIQTLNAKVDQLSNDVNAVHTDVQAAKDDAARANQRLDNQVRSYKK >NC_005126.1|WP_011146838.1|3059861_3060944_-|L,D-transpeptidase-family-protein MKRVLTFIGVLLFSGLTNTVSATEYTLPAANSRLIGENTTLVVPDDGRSLEAIAAEYKIGLLAMLEANPGTDPYLPAQGSELIIPSQMLLPDTPRQGIVINLAELRLYYFPKGKNNVIVYPIGIGQLGRNTPVMTTSVSQLIKDPTWTPTKNIRKHYAEQGVILPAVVPAGPENPMGAFALRLAAGRGEYLIHGTNADFGIGMRVSSGCIRLRPDDIETLFNAVPRGTRVQIINEAVKYSVEPSGKRYIEVHQPLSKKEDDNPQTLPIVRSADLNKFIDNNKTDKNIVEQAMVRRSGMPVLVSKGIEPETQQDLPEENPEENIVPMEDDVKGAEQAVNNDVSESFKLPPLYQPGPIYREN >NC_005126.1|WP_011146839.1|3061065_3061482_-|cysteine-desulfuration-protein-SufE MASLPDTNKLLRNFSRCRNWEERYLYMIELGAKLPPLTDEQRQPENLIAGCQSQVWILLRMNHQNKVEFIGDSDAAIVKGLVAIVFILFQGKTTQEILDLDVTEYFGKLSLEQHLTPSRTQGLHAMIHAIRNRTSKMV >NC_005126.1|WP_011146840.1|3061519_3062758_-|cysteine-desulfurase-SufS MTFSVKKVRQDFPVLTQQVNGHPLVYLDSAASAQKPVSVIERESEFCLHQYAAVHRGIHTLSSAATRMVENVRYQIAQFIHAQSHEEIVFVKGTTEGINLIANSYGRKFINNGDNIVITEMEHHANIVPWYMLAEQIGFEIRVWPLNENGELDQAILASLIDSRTKLLSFTHLSNVLGTVNPVRQIIKQARKLADEQEGRLHILVDGAQAIMHKQIDVQDLDCDFYVFSSHKLYGPTGIGVLYGRKSLLDAMPPWEGGGAMIKQVSLQKGITYAEPPWRFEAGTPNITGIIGLGAAVDYVTSLGLDEIQQHEQALMDYAMARLKEVKTLKLYGPEQRQGVIAFNLGRHHAYDVGSFLDQYGIAIRTGHHCALPVMEHYHVSSMCRASLAIYTTQEDIDALVVALQRIEQLLG >NC_005126.1|WP_011146841.1|3062754_3064071_-|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD MAGLLTNSERTEKVRQVAERNQQALARFADLYHCRHGEDSFHASLHWQTAIKTGFPQFRHEDWRYTPLDKLLNQQYSSKTWELTVAQCEQLAISMDCWRVVMVNGCFSPLLSSCEFGPYQLSLLDNKSGLPAPIQQGEIFLHLTESLAQQPLVITLKAGQVAEKPLYLLNITSSHCSEALNSSHYRYHIAVGTNASASVIEHFVSIDGQQPHMTGGRLTAEVGDNAHFTHIKLGVENSASYHFAHNDIVIGRDAQVKSTSFLLGSGLGRHNTSVKLNGEGANLSLNSLLLPQGKEVADTRTYLEHHKGHCESRQLHKTIVMDQSKAVFNGMIKVAPHALKTDGQMTNNNLLLGKQAEVDTKPQLEIYADDVKCSHGATVGRIDEEQLFYLQSRGISRRDAEHMMVFAFAAELTESIEDESLKAIVMNHIKHRLARVER |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_005126_10 | 3956599-3956691 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_005126_10
|
1 spacers
spacers of NC_005126_10
>10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder ACCCGTTATCCTTCAAGTTGCCTCTTTGTTGGCTGCACTCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_005126_10
The CRISPR arrays of NC_005126_10 >merge|NC_005126|10|3956599-3956691|CRISPRCasFinder CTCACCCCGGTCACATAGTTATCTATACCCGTTATCCTTCAAGTTGCCTCTTTGTTGGCTGCACTCGCTCACCCCGGTCACATAGTTATCTAT >NC_005126|10|9|3956599-3956691|CRISPRCasFinder CTCACCCCGGTCACATAGTTATCTAT ACCCGTTATCCTTCAAGTTGCCTCTTTGTTGGCTGCACTCG CTCACCCCGGTCACATAGTTATCTAT
>NC_005126.1|WP_011147516.1|3955724_3956324_+|tail-fiber-assembly-protein MMNKAVLDKNNIAISAGSIVVFNYDAITLEYLNSSDEYLPVGIGLPANSCIDAPPKAQEGYIACRSPDLTGWQMVPDYRGRIAYNTQTGEQKEIIKPGELPETLTFKQPSTDFDKWDGEKWVTDIEAQKANQIKQAEQQRVILRQQANEAITLLQYAIETEMASDAEKALLLAWKKYVVLLNRVDTSMVSDIKWPQIPE >NC_005126.1|WP_011147515.1|3955227_3955728_+|tail-fiber-protein MSTLVLEEIPVGIPLPWPTDIPPNGWVKCNGAIFDQTLYPQLAQAYPTGRLPDLRGEFIRGWDDGRGVDIGRYLLSGQLADIAPHSHRVVRMWSNSNGGTDGVGSAGRILNSVYQNINYGIDPRGIGIAIGMGSGGYGYMDNAIAASTGTETRPRNVAFNYIVRIA >NC_005126.1|WP_011147513.1|3942669_3953265_-|MARTX-multifunctional-autoprocessing-repeats-in-toxin-holotoxin-RtxA MGKSSNRSAEFFFTGKYDDDDGGNNIVAIGLGGEIYAKGGNDHITVGSLGATIYASSGDKTVDGGAGYLKIVNIGGDLKVHGAAGYASIDKNGNGNISFIGAAGGVSMDHRGSSGNLNFSGAAAYNNLSRRGQSGNVTFKGIGGYNGLWHETHQGDLNFNAAGAGNKIDRTWHDRYEGSKGNVIFVGGGAANSISSRVESGNIEFTGAGVDNHIIRKGKEGNIIFQGAGALNRIERLRDSKDKYEQTRGNIEFEGAGGYNKVYSDIAHGNIRFSGSGGYNEISRIGEDSDSYNKALGYASAEKIVLITAKMGSQKPQQVTAIKSTTESNTYLFAFADGKYTKISKVQLKNDPKTNKLSYYSTSWRKNGNQLKNLATENISLENGYDDISNDGDYRLSNLIFEHHQPVTIQHTVEEDLRENQWVTYASGTTAKAEDIKLIDAKMHGRSIHSNGSVLDVSAVKSNRRSNAYVYAKYVESYTKVVVVELKNDDKTGELKYYASAWYKAGDHTRDLANEDFSRANGYSSMEVGGYSLTNLKYQVDTVRRVSEHLEHIEEDSLQEWVKSSSNIGDSSGDVNFSGMGGGNLIKSSVINGNVNFEGDGIANVILHSSRSGNTHFEGAGAANIIEKSGIDGNLTFRGAGLANVLVHQSRNGEMDVYAGGAANVLVRVGDGRYLARLLAIGNISIHQGNGDSRVVMLGGYNTHTQIGKGSANWLGAGGFNVMTQKGKGSISSLLLGGANVLTKLGGDNLVSGMLGGANIITHISGDNEISDTTAIALGGANILTKKGRGDAVALMGGGANVLTHIGYGSTTGVMLGGANILTKVGNGDTTGIMLGIGNVLTHVGDDQTLGVMGAAGNIFTKVGDGTAIAAMIGAGNIFTHVGKGDAWALMGGLGNIFTKVGDGKALALMIAAGNVFTHVGNGMSVALMLAKGNIATKVGDGTTLAAMIGEANVMTHVGNGSTFAAMIGQGNILTKAGNDLALGLMVGEANIYSHVGDGTSIGLLAGKLNVMTKMGDGTTLAAMFGEANIMTHYGDGLTGVLALGKANIVTKVGKGFMGVVAAAEANVVTHMGASTTAAVLLGKGNILTKEGSGTTVGLLISDVGNIMTHIGDGTTVGFAKGKANIITKVGEGTGINAVWGEANILTHVGNGDRYNFAKGKANIITKVGGMREVTVVQGDANIITHVGNGDDYTGAWGKANVITKVGDGNNVVLAKADANIVTQVGNGDSFNALWSKGNIVTKVGDGMQVTAAKGKANITTTVGNGLSVTATHGDLNVNTKVGDGVSVNAVWGEYNVNTKVGNGLNVAIMKGKGNANIHIGDGLGINASYARNNVAIKVGNGDFYSLSIAESNTQSSHLSSLFENIKQTVFNVEGSQTINYLIRGDEANTSGVNKGRGAINLTEVSAIDGFQMDKIDEVSSDLANNLSGAITPVETPDINVIQNDLQIGDNVGSAQDQASPHADAVVRHAKQNKAAQNALSDKEKAEINHQRLQQEKDKQLKTISKSQGQLESTNQAALNTNGQVQRDVISEESRGVTEELFSLTQGMGALNNYGNYDGKSGDEWRNRFAGGYLDNIQNKLNDAKLTAQKKLADAQQHFIDKRETVITAIKKSEVGFTKSAENLDSADDDIVDAEKKAEQRKEEALLQKQRADKAVSDANTAYDKAKQRGESDSTAAENKTIQAQKNAKSVKQADNAKPDRTGAAGSGLSGNAYIPIEVEKSKSHIDPASKAEPDGWLSEDLALTAEDLAALNNAQQAVNRLQLNKGMRSENTGASIMSMFTETSSDGAVKSTLNKSRELIRKAPTISGIDLQGLGGNNPRSHSSVLKKLELILLKKDNKRFIDSTKRRLGSINTDLPSKALVAVREAFNRTVEQPDEQHVLQLEQTLAHWQQHDPKEFTQRSKLVKSLRFEMGELVAHIQAQRAESAGILGIAVAPEQVTQFGQQVSFDGIGRVVGLKGDIAQSEINRLTDLQIKPLTQTNSVAEREAPKTENESLIVFVSRLQQEAIPEGKPLIERARKLWLTGQVTNEKTKELFKDAVAQLQTYPELHTLAQQLLTDANKEKATGQYIDNLFGRHFDSELAYELVKTASPEAKNTAERTGNFLVEDFERWIGDLYPEGEKRNGAIDKKMKSFAEAIDKDFRPWFSRVPEVTTFLDDPTFANFKTMMTKVDDGFSVIKVPFLAVKMATTSGMGMDVADWKRKGDSFYLNVITKARSTSTELTAGTNAEDVKYKVKITEKQTNDYGTALPYQPANNKHDDFLYGRKVAAGRILTPGRETAFESNALERGQSVVTGASGSTNIMVHLNDYIASKQPDFSTGQSYLNTLSFLVFDGGHSVNESLVVYQALQATDEIKRKQILNSYTANYQDLADIAGESGKVWVNQALDNAFKETQEFYQKYAVVKPQSRPAVEDLEGLSGTNKGVEPTIIGDSHLKKPVDGWQKVDVTPQTDGRETRFDGQIILQMEDDPIAARAAANLAGKHPDSSVVIQLDANGKYRVVYGDLAKLSNKLRWQVVGHGRDTSEQNNIRLSGYSADELATKLKQFYQAAKLGKQAISKPDHISLVGCSLISDNKRDGFARRFITELDKQGIRSDVSARSSEVAVDATGRKFTRDENNQWVNNSPDNKIVLSLNAENKLITHTEQVRRGIAESDIDFAKVGYTQADSVTKGEIADNTEIFIKPQKREKVNTSDNSHRQLSYSGNIQVDVGEGEFTALNWGTSNVGIKVGTGGFKSLAFGDNNVMVHIGHGDSKHSVDIGGYQALEGAQMFIGNRNVSFNQGRSNDLIVMMDKSIPTPPLVNPFDDTARIAEVLKGIARSGETQDWLAAQDQQWTIAGARKFVRDMSGLDQTSSVDYKTLLDLDSQHERSSRGLQNDAESALNKKFNQWLGENGNSIEMGKMSRADKFRQANQKLAFNFAVGGRGADIQVTTGNWNFTFGDNIQSILDTNLGSLFGLMTQQYSATGMAKTTFTYTPQDLPRQLQNKLLGRLSEVGADTTLADIFGVDYTADGRIVSRTGKPVDGEAMLKEMLEVIKEFSGDQLAAFTNPGKLLDSLEAGIKAGEDGVRTFAESHGLKEKAPDKNQEQGAVVSTNGDSAQANNKAERAFGFNSLNLPNLFATMFSKDKQAEMQSLVTNLKENLTADLLNMKQKTFDFLRNSGHLQGDGDINVSLGNYNFNWGGDGKDLGAYLGDNNNFWGGRGDDVYYSLGTSNIFTGGEGNDMGVLMGRENWMFGGDGDDTAVVAGRINHVFMGEGNDQTFVFGEGGLIDAGNGQDYVVTSGNYNRVDTGAGQDYAVTIGNNNRVDLGEGDDFARVFGNDNRIDGYSGNDTIKLMGYHAMINGGEGDDHLIAAAISKFSQFNGGDGQDLLVLGGYQNSFQGGAGVDSFVVSAEVIDNRVNDINAEDMILFNGVDWKDLWFQRSGYDLVLSVNRHTQDNTAQEIFESVGSVTFNDYFNGHRAKLVTQMGDKDKSGEYEFTALSDNAVDSLIQAMSSFSPTVGDNGFIESLGSKARAAVATAWADVTLGKGKFA >NC_005126.1|WP_011147512.1|3939978_3940500_-|tRNA-adenosine(34)-deaminase-TadA MIEIYSDEYWMQQAIERAIKAWEQGEIPVGAILVADNKIISEGWNQSIIAHDPTAHAEIIVLRKGGERLRNYRLINTTLYVTLEPCTMCAGAMIHSRIQRLVYGASDMKTGAVGSLVDILRHPGMNHQIDITSGVLAEECSTMLSAFFKQRRQQHKALKAARKQQEENQDSLF >NC_005126.1|WP_011147511.1|3937683_3939990_+|arginine-decarboxylase MINLDINEQNKIMVVSSHVFRPTTANGRAFTELIEALKKNNFAVILAATFQDGIATVSSDSSLCCIFVDWTSGDNNYESHKQVLELLKEIRKHNTTIPVLLTAEYSSIDTLTLEVMGLADEFVWMLEDTAGFIASRASSLIKKYYAQLLPPFTRALLQYTQESPEYSWTAPGHQGGVALTKTAAGRELINFFGENLFRSDIGIERKILGSLLDHTGAIKESEEYAATIFGAHQSYCVLNGTSGSNRIIMGAVIGEKEIIICDRNCHKSIGQGLIMTGALPVYLIPQRNRYGIIGPIPRDQFQPEYIQQLIDQHPLKAIAIDNKPVYAVITNCTYDGICYHAEQAQDLLAKSVDQIHFDEAWFAYARFNPMYKHRYSMRDDPNDFDNNGPTIFATQSTHKMLAALSQSSYIHIRNGKKPIEHSRFNESYMMHSTTSPLYSLIATNEIAAAMMDGPQGQRLIQNAINEAVDFRLTLAKTHHQFKQKDDWFFLPWNAREIISADSGKLIPFHEANREQLATDPSCWVLKEGEKWHGFTNLSAEWCLLDPTKVGILCPGMNDNDELLENGIPAEILSAYLSQHDIVPARTTDFIVLCLFSIGVTKGKWGTLINVLLNFKKHYDANTSLKQCLPKLAKQYPEYYENMGLKDISDKIFGYIKEYEMDIEQKKSFSQLPEIVKLPRQAHLDHMAGRTEHLPLNELAGRISAVSVIPYPPGIPIILPGERFGDEHAPRLQYIRQLGEWNNKFPGFEKILEGAEMINGEYHIWVLKE >NC_005126.1|WP_049789787.1|3936137_3937553_+|membrane-bound-lytic-murein-transglycosylase-MltF MNNIKINYFVIIVIALFSAAIISLNISWPNKQQEQINRIITRGELRISTISSPLIHLTGKKEANGFDYELVQRFANYLGVKLEIKFRKNINQLFDDLEKGEADFLAAGLTYHQERLDQTRTGPAYYSVSQQLIYRKGTPRPRSFKDLKGKLLVASGSAHASTLKKIEKENFPELEWEETPQYNTRELLEQVSEGKLDYTLGDSINVALQQRTHPNLAVAFDVSEDNPLTWYLKRIDDYSLYAAMLDFFSQLTEKNVMPRLEEKYFGHVHSFDYFDTLSFLSAIDNILPTYQPLFEKYSGDISWKLLAAIAWQESHWDPQAISPTGVRGLMMLTNQTAKGLGVVDRLDPEESIKGGAIYLQNLMKRLPENIPKDERIWFALAAYNMGYGHMLDARKLTASQKGNPDSWLDVKKRIPLLSQKKYYTNTTYGYARGHEAYRYIENIRRYQLSLVGYLQAKENRKKLIPQENQPK >NC_005126.1|WP_041381011.1|3931983_3935871_-|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase MKILRGSPALSAFRITKLLSVCQEQQLPVNDIYAEYVHFAEINASLSDVDSAKLQQLLKYGPSLAEHEPQGTLLLVTPRPGTISPWSSKATDIAHNCGLSQVVRLERGVAYYIQSGEMSDTQWQILSSLLHDRMMETVFTQLEQAEKLFSRQQPVPLKRIDILQAGRSALETANIELGLALASDEIDYLMDAFQKLGRNPTDVELYMFAQANSEHCRHKIFNADWIIDSQAQPKSLFKMIKNTYEQTPDYVLSAYKDNAAVMEGSAVGRFFASAENGSYDYHQEQAHILMKVETHNHPTAISPWPGASTGSGGEIRDEGATGRGAKPKAGLVGFSVSNLRIPGFEQPWEEDFGKPERIVSALDIMMEGPLGGAAFNNEFGRPALLGYFRTYEEKVNSHNGSELRGYHKPIMLAGGIGNIRDEHVKKGEISVGAKLIVLGGPSMNIGLGGGAASSMASGQSDADLDFASVQRDNPEMERRCQEVIDRCWQLGENNPILFIHDVGAGGLSNAMPELVSDGGRGGRFELRKILNDEPGMSPLEVWCNESQERYVLAVAPEQLPLFEEICRRERAPYAIIGEATEERHLLLNDEHFDNQPIDMPLDVLLGKTPKMLRDVTTLKASGESLERRDIDLAEAVKRIMHLPAVAEKTFLITIGDRSVTGMVSRDQMVGPWQIPVADCAVTTASLDSYYGEAMSMGERAPVALLDFAASARMAVGEALTNIASAYIQDLKRIKLSANWMSAAGHPGEDAGLYAAVKAVGEELCPALGLTIPVGKDSMSMKTRWHDQGEEREMTAPLSLVITAFARVEDVRRTVTPELSTDEDNALLLIDLGQGKNTLGGTALAQVYRLLGNKTADVRSAEQLAGFFNAIQQLIAEQKLLAYHDRSDGGLLVTLAEMAFAGHCGIEADISVFDEDILAGLFTEELGAVVQIRASDRGFVESILAEHGLADCVHYLGKAQAGDDFVIFSGNTEVYRQNRSTLRLWWAETTWQMQRLRDNPACADQEHQAKQDNQDPGLNVKLTFDISEDIAAPYILQQVRPKVAVLREQGVNSHVEMAAAFHRAGFEAIDVHMSDLLSGRIGLSQFQTLVACGGFSYGDVLGAGEGWAKSILFNERVRDQFAVFFARPDTLALGVCNGCQMMSNLRELIPGAEHWPRFVRNRSERFEARFSLVEITDSPSLFLQDMVGSRIPIAVSHGEGQVEFRNRQHLEMLESNQLVALRYVNNYGQVTENYPANPNGSVNGITAVTSLDGRATVMMPHPERVSRTVNNSWHPDEWREDGPWMRIFRNARKQLG >NC_005126.1|WP_011147508.1|3931519_3931867_+|hypothetical-protein MIINKIEYTQTFENQLHERFGYLTRHIGAEASWKILETFLYNFETRVLKYPKSAPLCEETADIGLTSHHDYVDTKLQLRAIYKIDEANHTVIATLFLNTRQSLRQALIQYCLRRD >NC_005126.1|WP_011147507.1|3931260_3931533_+|type-II-toxin-antitoxin-system-Phd/YefM-family-antitoxin MYQTPNSRITTVSAFKKELASMDVSQPVTVTQNGEPLYVVQDPAQFEMQQEQMALLRLLSFAEKDIKSGRIVSSSELRNNLRKLANGDHK >NC_005126.1|WP_041381009.1|3929045_3930485_-|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MISLKKWRLFPRSLRQLVVMAFWLVLLPLLVLAYQAYQSLDQLSEQAADINRTTLADARRSEAMTGIALEMERSYRQYCVLGDKTLENLYQRQYQQYLKMLKDQMAILDEQQHIKTLNSLLSQLTKIACLNSEPTQPAAQLLEQFSNANSQMVQATRDIIFSRGEQLQKDIAEKGQFFGWQSLILFLLSALLVALFTRMIIGPVKGIERMINRLGEGQSLGVRIDSFQGPRELRSLAQRIIWLSERLAWLESQRHEFLRHISHELKTPLASMREGTELLADEVAGPLTADQQEVVAILDNSSKHLQQLIEQLLDYNRKLADGPTEQQQVSLREIVNEVVLSHSLPARSKNIQTEIQLDADILWAEPTLLMRVIDNLYSNAVHYGAESGNIWVSSRQIGKYVQINVANTGTPIPESERSMIFEPFYQGTLQRKGAVKGSGLGLSIAQDCIKRMGGELILIQSEFADVCFRIKLPLAAENE >NC_005126.1|WP_011147517.1|3957163_3957883_+|hypothetical-protein MSPKNDFKAFSINNNANIVSQQEYENRQDLKTGFPPEHITIHVLNKALRQSSTIASAVADFIATQSGDDVLDDGDIVKLIAQLNRALEQKIITKISNSALEKAKNGADIPDKNTFIKNLGLNEAAKREIGAGVNQVPDMSFFNANLGSTGWQKLPSGLIEMWGFVLVQGYGSMEAGYLNNFPIPFPNACLNVVLANGGYNPQDSGICSVHVVDRSQFRCYRSPTNHPTPVGAYFRAIGY >NC_005126.1|WP_011147519.1|3959756_3960584_+|tail-fiber-protein MNHKNDFKAFSISNNANVVSQERYEESQSLYSGFPPDNVPTHLLNKALRQSSTIASVVADFIATESSSDVLDDGNTTKLTTQLNKALDQKLTKKIPDASLTQKGIVQLTNVVGNSNTLAATQKLVSDINDNANNRLEKTQNGSDIPNKNAFVKNLGLNEAAKRAVGTGVNQIPDMSFFTSNLVQNGWQKLPSGLIEMWGIARVSTGGRPDLGYLNNFPIPFPNKCFSITLTHNDWDPRAAGIFGASVVNQSQFKCYRGSGDGQPFVYTYFRAIGY >NC_005126.1|WP_109791728.1|3960623_3960743_+|tail-fiber-assembly-protein MEKNYEQQKLFSTLKQNFYLLQIKKYRVILNRVDTSKAP >NC_005126.1|WP_011147520.1|3961156_3961984_+|tail-fiber-protein MSQKNDFKAFSISENANIMPQETYEKEQKLQTGFPTADITPELLNKALRQSSTISTVVANFIATQSGEDVLDNGDIDKLTTQFKKSLEQKNTTETRDASLTEKGIIQLTDQIGNSNTLAPTQKLVSDVNDNANNRLAKDQNGADIPDKAAFIKNLGLSDSTNITIGNGENQVPNMSFFTSSLNQVGWQKLPSGLIEMWGIASVKGNAYAEPGALNNFPIPFPNKCLNVTLTHVGNAPQHAGTFSIMMVNNTQFQCFSSIPNLQVPVAAFYRAIGY >NC_005126.1|WP_011147521.1|3961985_3962420_+|tail-fiber-assembly-protein MNDKNYVFSALNKAFYPLLLQQEYIEAGSWPNDPISVTDDIFNTFSGIPPTGKILSSDEEGLPCWEDIPPPTKEGLISIAEVQRAQFISLANEKITPLADAVELDIATDEEILSLKEWKKYRVMLNRVDTSTAPEIDWPISPLS >NC_005126.1|WP_011147522.1|3962808_3963528_+|hypothetical-protein MNPKNDFKAFSIRDGANVVAQNLYENSPELQTGFSPDGLTLHILNKALRQSSTISSVVADFIATESDSDVLDDGNITKLTTQLNRALERKIITKISDSALEKAKNGADIPNKNAFLKNLGLNEAAKREVGIGVNQIPDMSFFTKNLAETGWQKLPSGLIEMWGTALVKGNALSSPGNLNKFPIPFPNKCLNVTLTHLGTAPQYAGIFSVMIVDNTQFQCFSSITDLQNPVAAYYRAVGY >NC_005126.1|WP_011147523.1|3964215_3964476_+|YfhL-family-4Fe-4S-dicluster-ferredoxin MSLLIKKSCINCDMCEPECPNQAISMGDEIYEIDADRCTECIGHYDSPTCQSVCPINNTIIIDPDRQETEEQLWDKFVLLHHADKI >NC_005126.1|WP_011147524.1|3964478_3964859_-|holo-ACP-synthase MAIIGLGTDIVEIARIEGVVERSGERLAKRILSELEWEQYQQHEKPVRFLAKRFAVKEAAAKALGTGIRNGLAFNQFEVVNDALGKPILRLYGAAAALAQQLGATSLHVTLADERRYACATVILER >NC_005126.1|WP_011147525.1|3964858_3965590_-|pyridoxine-5'-phosphate-synthase MAEVLLGVNIDHIATVRNARGTHYPDPVQAAFVAEQAGADGITIHLREDRRHITDRDVELLKKTIQTRMNLEMAVTDEMVDIACRIKPEFCCLVPEKRQEVTTEGGLDVIGQKDKVAAAVKRLSDAGILVSLFIDAEHRQIDAANEVGAPFIEIHTGAYADAKNEVEQEKEFHRIKAAATYAASKGLTVNAGHGLTYHNVQRIAALPEIYELNIGHAIIGRAVFSGLTAAVADMKTQMRKARR >NC_005126.1|WP_011147526.1|3965784_3966510_-|DNA-repair-protein-RecO MDGWQRVFVLHGRPYSETSLLLDLFTENEGRISVLAKGARGRRSNLKGCLQPFTPLLVRWSGRGAIKTLRDADPISLALPLTGSVLYSGLYINELLSRVLEQGTAYPALFFDYLQCLQILAASEYTPEYALRRFELALLANLGYGVDYLHCAGSGEPVADTMTYRYREEKGFIASLVVDHYSFTGRELKSLATREFPDSATLKAAKRFTRIALKPYLGGKPLKSRELFRQFVRQQPEKKEN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_005126_11 | 5065612-5065700 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_005126_11
|
1 spacers
spacers of NC_005126_11
>11.1|5065638|37|NC_005126|CRISPRCasFinder AGAAGCAACTTGAAAGATGACGGATATATACCCTAAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_005126_11
The CRISPR arrays of NC_005126_11 >merge|NC_005126|11|5065612-5065700|CRISPRCasFinder GATTTCAAGATGCATCGCGACGGCAAAGAAGCAACTTGAAAGATGACGGATATATACCCTAAAGATTTCAAGATGGATCGCGACGGCAA >NC_005126|11|10|5065612-5065700|CRISPRCasFinder GATTTCAAGATGCATCGCGACGGCAA AGAAGCAACTTGAAAGATGACGGATATATACCCTAAA GATTTCAAGATGGATCGCGACGGCAA
>NC_005126.1|WP_011148427.1|5063488_5063818_+|hypothetical-protein MTLQEIGKMSLKNSGGFVARIQFSYMDGDGEKHLSQQGNNITLGLTDTVDPGDLGVPDGSTVFMHVFVVWGNDNEARKAFLYKKGSQVLASYNISGTTLSNDLGLIDIS >NC_005126.1|WP_011148426.1|5061728_5062577_+|S-formylglutathione-hydrolase MERIERHTCFGGWQDVYQHESTVLDCTMNFAVYLPPQAEHQKLPVLYWLSGLTCNEQNFITKSGAQRYAAEQGIILVAPDTSPRGEKVADDDAYDLGQGASFYLNATQNPWAPHYRMYDYVVSELPILIEAHFPVTTARAISGHSMGGHGALMIALRNPDRYHSVSAFSPIVAPSQVPWGEKAFRAYLGEDRDTWKAYDTIELLANNAEPLHMLIDIGTDDPFLEEQLRPELLKDVCENTGHPYTLNLRTGYDHSYYFVSSFIGEHIAYHANVLKEICIDNQ >NC_005126.1|WP_011148425.1|5060496_5061606_+|S-(hydroxymethyl)glutathione-dehydrogenase/class-III-alcohol-dehydrogenase MKSRAAVAFGPGRPLEVVEIDVAPPQAGEVLVKISHTGVCHTDAFTLSGDDPEGVFPVILGHEGAGVVVEVGEGVTSVKPGDHVIPLYTAECGECLFCKSGKTNLCVAVRTTQGKGVMPDGTTRFSYKGQPIYHYMGCSTFSEYTVVAEVSLAKINPEANHEEVCLLGCGVTTGIGAVHNTAKVQSGDSVAVFGLGGIGLAVIQGARQAKAGKIIAIDTNPAKFELARQFGATDCLNPNDYDKPIQQVIIEMTEWGVDHTFECIGNVNVMRAALESAHRGWGQSVIIGVAGAGQEISTRPFQLVTGRSWRGTAFGGVKGRSQLPKMVEEAMKGEIELKPFVTHTLPLERINEAFDLMHEGKSIRTVIHY >NC_005126.1|WP_157866911.1|5060024_5060168_+|hypothetical-protein MNNSQESHYLTDTLPASRTMLDIMELAMVGAKLGYFSTTRLFLKGHL >NC_005126.1|WP_011148423.1|5059683_5059989_+|hypothetical-protein MQLSGIYGCSTRIQFSYMDSDGEKYLSNKGNDINLGATKTTDPGDLGVPDGAMIFMHVSVVWGNDNEARQTFLYKKGSQSTASYVISGTTLNNNLGLIDVA >NC_005126.1|WP_011148422.1|5059324_5059582_-|hypothetical-protein MLIFANILAHIVVPAHHWYWKLAESENNHRILKSFMAIDTNGHYHITEDIPVIFQVASLLAVLTYSGHIVIYAPEDSPPCRRDAF >NC_005126.1|WP_011148421.1|5057683_5058892_-|hypothetical-protein MITQDASSKLIGFLYQFERALYRIFSSEHNSVVFGIETVDDVVEEAILASGLPSITFEQDKHSLDTRAQPYQDSSKNLWHTLHIWLDAMKVTRERYDEVTYCLVTNRIIDKKNLVVFLSEAKSEEQINTALAMLKEQAKKITGKVKSIAEEVLTYSDEELIFLIKNIELLDSHGTASGISPKEATIQLLHLPSEVKEHGDNIYQTLFGFMIDKCNTAWKVKQPVELTKEPFANLLNSEISLIKRKNFTEQPFFQTAFKNYLKQDNAEHLFIKQLQHIDISTTMCNRALEHYWAFYAERVRLQQAGEIPLSAWRARDDVLYNRWLQIKDCIELGLESEGNSQKLNMLKKIYTDTTDPNYTASLAGQRTENLYFTTGNYHDLANSPSKETFIHWHNDFLKIKEK >NC_005126.1|WP_011148420.1|5057198_5057681_-|hypothetical-protein MIYKDSNIINNSSLACFLLVYFVEQYESCSVNDDHPDLMKLLLVLPIVWHKVSRESIKKKKRTTPLIAVVQESLLIKSNLAQRVSEYAGASIQGLNLAVSSGLLMRLIEHGETRFATNFSKWPGGINKLLPKEMVQTITRLANWFSCVDTPSIYRLLLGN >NC_005126.1|WP_011148419.1|5055210_5057196_-|DUF3732-domain-containing-protein MKFTIDALILWPVNPNNNLRVIPFKSDKINIVHGISGTGKSSIISIIDYCLGASKCAIPVGIIRESVMWFAIKANIRGYKYLIARKTPSKRSVSNEYHLSPYPEELPLTLTSTHSDAVFKNKFNQLVNLTDLPLSENNEKTGFDGRASYRDMAAFNYLPQHIVANPYTLFFKADSYQNKERLKRVMPFALGIIDRQYMIREKERIDIQKQRDSLYKQQEVNKKALSSWAFDVDRLWKACVELGLLSETENQDTDAKVKSLNYINDIYTEGRIGDLLGTPNYEYTNRRLKALVAQGEEIQQHIDTLRIQIRNYEQLFSRGQGFTQAIQKEKEHIVGFDWLKNNLSPGGECIACGSKTNILSTVVDNLEKQISRINSISEVLFENPIADKEIDKLKKELRIQQDKLQKIRKEKFNLEKIDKSTNNSMNKVYVLIGRIQETLSSLKKVNNTDDISEKIKELDDQFNEIEKFFFQSNKSRTEYIVYQEINSLIEKYADNFRLERRGNIKLDKNELTLCFNVDNDRRNEFLWEVGSGANWMGYHLSVFLALHEFLSHKDRTRLPPFSFLVIDQPSQVYFPSAASGDNILDVMAEDESLQITRQNDVVATRRIFEMLAVAIEENNYFFQVIVLEHADESIWGQVKNTCEAACWKDEGDGLIPRSWSL >NC_005126.1|WP_011148418.1|5054140_5055013_-|HNH-endonuclease MTSLAALQTAISKLTVWRKGDQRAPHKPLLLLYVLSEYKKGHGQLFKYGDEIHQPLLQLLTDFGPSRKEHYPSMPFWRLRRDGFWELKNAEHCTPRRGSKEPPKRELIEYQVAGGFDSDSFQLLRRQPALVDELAQQILNEHFPESVQVSLVERLGFDINKRLNSRDPRFRDVVLRAYHYRCAVCGYDLRLDGSLVGLEAAHIKWKQFGGPCLVENGLALCTLHHSAFDRGAIGIDENLKIKISDGVNRSPVVEQLFWARDGESLYLPRNRQYYPADRFIEWHQTQVFKT >NC_005126.1|WP_011148430.1|5065884_5066787_+|polyprenyl-synthetase-family-protein MNVSTARAMNYEETLLELQSALQQHLELVLPSGAPDDKVCAAMRESTLVSGKRIRPLLLLLIVLDLGENPWKTDFLQLASAIEIVHAASLILDDLPCMDNAEYRRGRPAIHRQYGESVAILAAVALLSRAFGLIVETNLSEYDKSAAVAILSHTVGLNGLVQGQFRDLNNTLCAGNYHAIATTNDLKTGLLFDTTFQLAAIAVNAPDIIRQALRHVSQHLGQAFQLLDDLSDDLNNTGKDMYQDKEKLTMVTLLGKSKVHKQLRRHIRYIDKYLAIVYRRNLASRYFIRHWFDKNIAMFN >NC_005126.1|WP_049789804.1|5066809_5067232_+|alpha-hydroxy-acid-oxidizing-protein MKKIDHTQRKNEHLDIIFRPPQTESQVSTGFAEWRFQHCALPELDLDSIDLKCSLFGKILQAPLLISSMTGGVHRAHAINHHLAEAAQVLGISMGVGSQRVALENEANDGLSRSLRQIAPDILLFANLGAAQIRGERGFN >NC_005126.1|WP_011144786.1|5067244_5068129_-|IS982-like-element-ISPlu6-family-transposase MDNLVEIFCDVDDFCRFFIPQWEQFCLDSGHRLRRRQGHMYPSEIMTILILFHMSHYRDFKHFYLEHIWKYHHKDFPTLLSYPRFVSVAPSVLVPLCSYLTQLKGKPTGIAFIDSTRLSVCHNIRIPRHKVFAGIAKRGKNSMGWFYGFKLHLVVNHQGEILALKVTPGNVDDREPVRELSKELTGSLYGDKGYLSQELADDLAKTDVTFITKKRRNMKASMQAEWDKIMLKKRFIIETINGQLKTLSQIEHSRHRSIKGFLLCVLGGLIAYCLKLKKPSLKVFYSEDDFSMTD >NC_005126.1|WP_082303141.1|5068246_5068837_+|type-2-isopentenyl-diphosphate-Delta-isomerase MIEADALIIHLNPLQEALQQGGDRNWCHILYAIEQLVTKLGVPIIVKEVGSGLSLPVARQLAEAGVSMLDIAGAGGTSWAAIEAERASTPYHRALAMAFADWGIPTATALREIREALPNMPLIASGGIRNGVDAAKAYCMGAQLVGQAAAVIHSAALSTDAVIEHFQLIIEQIKVACFCTGSADIAALRTAVLLPT >NC_005126.1|WP_011148431.1|5068950_5070126_+|lycopene-beta-cyclase-CrtY MMYDWDLILVGGGLANGLIAMRFQQCKPHLRVLLIENTETIGGNHTWSFHQHDLTEAEHEWIAPLITYRWSGYDVIFPAFQRTLPHSYFSITSQHFASILHAYLGERIQTRLLVQELTPQKVYLQDGSSLSAGAVIDGRGWRPGPFIGSGTQAFFGQEWELEESHSLTHPILMDTSVGQDTGYRFIYVLPFSSTRLLIEDTHYVDRGPPDKALSQATIAEYAKKHGWKLGKLIREESGCLPITLTGDFTSFWAQLAGQPTCGLRAALFHPTTGYSLPHAIRLADRIVALPELTDTSLFITLRDYARQQWQHQRFFRLLNRMLFLAGDPQQRWQVMQRFYQLSPNLIARFYAEQLNSVDKARILIGKPPVPIKGALKAMFKQHKKLQGFYYD >NC_005126.1|WP_011148432.1|5070118_5071600_+|phytoene-desaturase MIKALVIGAGFGGLALAIRLQSAGIPTCILEQRDKPGGRAYVYKEQGFTFDAGPTVITAPNVIEELFTQAGKRMADYVDLLPVHPFYRLCWESGKMFDYDNDQQHLEAQIHTFNPRDVNGYRRFLDYSREAFNEGYLKLGTVPFLSFRDMLSAAPQLIRLHAWRSVYSQVARFIKDESLRQAFSFHSLLIGGNPFAASSIYTLIHALEREWGVWFPRGGTSALVEAMVKLFTDIGGEIELNAKVKRFTTHGNRVTGVQLADGRNMTCDVVASNADVIHTYKHLLGQHPVGIARARTLVRKRMSNSLFVLYFGLNHHHTQLAHHTVCFGPRYKELIEDIFYHDRLSEDFSLYLHAPSVTDPSLAPRGCASYYVLAPVPHLGTANLNWDIEGPRLRDRIFAYLEKYYMPGLLKQLVVHRIFTPFDFRDQLNAHLGSAFSFEPLLTQSAWFRPHNRDNRIDNLYLVGAGTHPGAGIPGVIGSAKATATLMLEDIAK >NC_005126.1|WP_011148433.1|5071596_5072523_+|phytoene/squalene-synthase-family-protein MNPALLKHVTQIMEQGSKSFASVTRLFDTATRHSTMMLYAWCRYCDDIIDGQELGRQISSVDKYSAREKLQMLQYLTKQAYDGLPMTEPAFAAFQTVALSNEIPQQQAFEHLEGFAMDVLCEPYRTLDDTLRYCYHVAGVVGLMMARVMGVREASVLDRACDLGIAFQLTNIARDIIEDAKAGRCYLPLEWLHQEGLMPDTLIYTENRPALARVASRLIVEAESYYTSALTGLVGLPLRSAWVIASAHGIYREIGIKVQQAGVRAWECRQRTNRGEKVTLLMAGAMKALISRVAITTPRDPKLWQRPH >NC_005126.1|WP_011148434.1|5073286_5076445_-|hypothetical-protein MKIKKVEIQAFKSYLEKKDGTFDFIHSTSGEPANFVSLFSPNGFGKTSFFDAIDFAITKKISRYVRNERLEKINLEESNQYNIKGESQLIIRNKNAPKNIETRVEVITSKSEKPFISSYKKGRKGSSDWRIQSKSITNKYFESSMLYQESIDSFLRETDSETRFKKFSEVDDELVNINSARSTLLSLKSDVSKKKQELVDTKNKLSSEINRQKDNKDYVHSINIIIKDVNEYLDEIKIDEVIAPFTKNEHFHLSARLKEAENIIKNRVKENDEKLSKIEVNLSQLKLGASIYYKYKECINERSLILDKIKFYDEVGALKESFNTLEKELLLNQDVILSLRELNKNAHEYFTYKLKLDSTLKEIEELKLKLKMNDALIKSLNDSLNEKIIFHQKVCENIDQLGKEQANLYFVFNTIKDKSTSLDGVEKELANMEIEIKKNKGQKDVADICLSSLEKLTLFDFKWLPEFFIIHEDNKNELSDIYAKYCYVYKSKVEIDGKIKSINKELESINQQQTDISFLIDKASSIVISTKQSHCPLCERDNETYDELISRINNNSMLSDIEKKKNASKSSLMEELEQLSMKLDRFNVEFIEKKKSISNGLKDEISSLENLINESSQKKSTLVESKNIFISEINKFNSSVMFMSKYDYSKHLISKVQCERDREHSISKEIEDIKESIKSRVNQIELNKKIIDLENERFKLVVHLSKYSDFIKSNQLSEGVNKDDFISFVMLKTDKLNDSQKGLKDRIGKIVIKINKLESENKDSQFKGVSKEKMNALLVDLEDKMSLLSKENQWFISVADSFDNEDNSVVYTKVKDSLELQVTGINVKNRTLSDCLAKFSSIESISSKIVDYSDTSLLEKELYSISSKVSKLSEVIVELDSDIRKLGNEIKLRVDSFFNTELINKIYSSIDPHPEYKKIVFTCTSDDNPRLLISAQSEKNDKLMSPTLSFSSAQINVLALSIFLARALSSKDDEGNPVDCILIDDPVQSIDAINTLGLIDTLRMLSIMFNKQIIVTTHDENFHELLKKKMPSDLFSSKFLRLSSFGKVSSDA >NC_005126.1|WP_011148435.1|5076445_5077006_-|hypothetical-protein MNSKNFSINNKFQELNSELGVEFFVLSVCIFDSAMINAFCYVTPTTSILKERWREISDNLNYEYLSKYEPSEFERWNNYLVFICQDAIPDNIKYEIENDKFYMRKVALELKGLEKTDIEKETKKILDEKLLLSNIRLSNNVVFDRSWEQFLGDHSKSILLAGLSGGRDGKSKSMRENWINKLLSDE >NC_005126.1|WP_011148436.1|5076995_5078321_-|trypsin-like-peptidase-domain-containing-protein MLNDELEKLKSATVRVEEGSGVLINPYSTQYSYILTAKHVVEDISVDKIEVKNIEGRNISVLDKVEHPVIDVAILKVERLDGVEISHIENFYNQEKKLKFYGYPKNKRHNHIFREQLYSYDCLLHDIQGNTSVFTINELTQYEDIEGFSGGGIFFINEENQDVSLVAIEFEVSNTQAADSKINCIRIDAYLDFLQDKGWDEIKPIHLSSFKFYRDNIFENLDLENEDSLDVVKNLLKITLNNYKIFNSYYVTPNKIVEEFANRILAHNQDLKKLYDKELWCAFLEFFAIYLSIFAPDDEDSCNSNYLERLFLNFRFIYDHNNIKFRQIFKTYILETEIGDLEPNGKIVIFTKNNLNFGCPYIDKNVSEKTLTDIGSAITGERIERVMRNKTISNEILFWPSVNDACLSCKEEELSRINIFQGDDLKELIVENYREYLSNEQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_005126_12 | 5115428-5115511 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_005126_12
|
1 spacers
spacers of NC_005126_12
>12.1|5115454|32|NC_005126|CRISPRCasFinder AGGAGCGAATCCCCGGGAGCATATACCCTATG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_005126_12
The CRISPR arrays of NC_005126_12 >merge|NC_005126|12|5115428-5115511|CRISPRCasFinder GATTTCAAGATGCATCGCGACGGCAAAGGAGCGAATCCCCGGGAGCATATACCCTATGGATTTCAAGATGCATCGCGGCGGCAA >NC_005126|12|11|5115428-5115511|CRISPRCasFinder GATTTCAAGATGCATCGCGACGGCAA AGGAGCGAATCCCCGGGAGCATATACCCTATG GATTTCAAGATGCATCGCGGCGGCAA
>NC_005126.1|WP_011148470.1|5113584_5114964_+|lysine-sensitive-aspartokinase-3 MSAVSSQCPEIGGHVVAKFGGTSVANFDAMNNSADIVLANKAVRVVVLSASAGITNLLVALAAGCDADKRADYLKQIHSIQYAIIDRLHESDTIRQEIDRLLENIKTLAKAASLATSAALTDELVSHGELMSTRLFTELLRQRGKDAEWFDIRKVMYTDESFGRAEPNYEQLQSLATEHLLPQLKNSLIVTQGFIGREENGRTTTLGRGGSDYTAALLGEALGLKRVDIWTDVPGIYTTDPRVVPAAQRIDKIAFDEAAEMATFGAKILHPATLFPAIRCGIPVFVGSSKNPQAGGTLVCDTTEAPPQFRAIALRQKQTLLTLHSLKMLHAQGFLAEIFTILSRHNISVDLITTSEVNVALTLDTTGSTSTNGSLLTNALMTELSTLCRVEVEEDLALVAIIGNQLSQTNGLGKKVFSVLEKFNLRMISHGASNHNLCLLVQGKDAEQIVQTLHQRLFE >NC_005126.1|WP_011148469.1|5111639_5113286_-|glucose-6-phosphate-isomerase MKNINPSQTSAWKALEQHFAQIKDIHLRELFEQDPDRFAKFSATFDDQILVDFSKNRITTETLKKLQALAKETDVAGAMRSLFSGEKINCTENRAVLHIALRNRSNTPMMVDGEDVMQQVNAVLAKMKDFSERVIHGEWKGYTGKGITDVVNIGIGGSDLGPYMVTEALKPYKNHLNMHFVSNVDGTHIAETLKALNPETTLFLIASKTFTTQETMTNAHSARDWFLKSAGDEGHIAKHFAALSTNGQEVKQFGIDTKNMFEFWDWVGGRYSLWSAIGLSIALSIGFENFEQLLSGAHAMDQHVANTPFEQNIPVLLALIGIWYNNFFGAETEAILPYDQYMHRFAAYFQQGNMESNGKYIDRNGHPVDYQTGPIIWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTKLIPCDFIAPAISHNPLSDHHSKLLSNFFAQTEALAFGKSREQVDAEFATSGKTVVEVEHVAPFKVFEGNRPTNSILLREITPFSLGALIAMYEHKIFVQGAILNIFTFDQWGVELGKQLANRILPELKDDNRVVSHDSSTNGLINRFKAWR >NC_005126.1|WP_011148468.1|5110819_5111326_-|chorismate-lyase MSTDSILTTVPIQWLSVDSPVLPDEVLDWLMELGSMTRRFEQYCNSVRIIPFRECFITEEQLSDENERLLTGQRYWLREIVLCGDNIPWLLGRTLIPETTLTGPDESLVDLGTVPLGRYLFSGNKLTRDYIHVGQQGNRWARRSLLRLSGKPLLLTEVFLPESPVYKR >NC_005126.1|WP_041380401.1|5109930_5110785_-|4-hydroxybenzoate-octaprenyltransferase MAQSKWLAYCRLMRINKPIGALLLLWPTFWALWMAGKGIPDMHILLVFTAGVFLMRAAGCAINDFADRKFDGYVERTKTRPLPSGAISEKESKILFVVLALISFGLVLTLNKMAIWLSAVGLALAWLYPFVKRFSHFPQFVLGAAYGWAIPMGFAAVSESLPLECWLLFLVNIFWSVIYDTQYAMVDRNDDLKIGVKSTAILFGRFDKLIIGLLQLAMLLLLVLVGYLINLGGIYYWSLLLTGTLFIYQQKLIAGRERELCFQAFLNNNYVGLVLFLGIFFSYV >NC_005126.1|WP_011148466.1|5107430_5109887_+|glycerol-3-phosphate-1-O-acyltransferase-PlsB MSSWRKIYYKLLNLPLKILVKSKLIPTDPITELRLDTTRPILYVLPYHSKADLLALRQQCLEQDLPDPLNLLEIGDTELPSYVFIDNGPRVFRYCAPKQESVKIFHAYLDLHRNNPNLDIQLLPVSVMFGRSPGREGQNAPHLRLLNGIQKFFAILWLGRDSFVRFSNTVSLRYMATEHGTDKTIAHKLARVARMHYSRQRLAAVGPRLPVRQELFNKLLASKAIEKAVSDEARTKKISHEKARQNAINMMEEIAANFSYETVRLSGRVLGWTWNRLYQGINVHNAERIRRLAQDGHELVYAPCHRSHMDYLLLSYVLYHQGLVPPHIAAGINLNFWPAGPIFRRLGAFFIRRTFKGNKLYATIFREYLGELFARGYSVEYFMEGGRSRTGRLLDPKTGTLSMTLQALLRGESRPITIIPIYIGYEHVMEVATYAKELRGATKEKEGFFQMIRGLRKLRNLGQGYVNFGEPIPLIQYLNNHVPSWRDSIDPIEFHRPEWFNPTVNQLSEKIMVNINNTAAANAINLCSTALLASRQRALTREQLLEQLDCYIQLMRNAPYATDVTVPKKTAEELLEHALQMDKFEVDKDSMGDIIILPRDRAVLMTYYRNNIQHLLVLPSLIACIVIHHRRISREALLSQVAIIYPLLKAELFMRYSKTELPEVVNTLINELTRQCLICNKEHGMLVLNPARIRPLQLLAAGIRETLQRYAITLSLLNANPVISRGVLEKESRMLAQRLSVLHGINAPEFFDKAVFTTSVNTLREEGYISDSGNAITANTQELYQVLGELMSPEIRLTIESVSLPPEHNDTEESAREG >NC_005126.1|WP_011148465.1|5106929_5107301_-|diacylglycerol-kinase MANQSKGLARIIKAIVYSVKGIRATWQNEAAFRQEIILAILAMMVAFYLDIGAIERILLIGSVMLVLIMEILNSAIEAIVDRIGSEFHELSGRAKDMGSAAVFLTMMLSLIVWGTILWHYFMA >NC_005126.1|WP_011148464.1|5106204_5106810_-|repressor-LexA MKALTARQQQVYDLVRDHISQTGMPPTRAEIAARLGFRSPNAAEEHLKALARKGVIEIVAGASRGIRLLLEESGLPLIGRVAAGEPLLAQEHIESHYQVDPALFKPSADFLLRVSGMSMKDVGIMDGDLLAVHKTQNVRNGQIIVARIEDEVTVKRFKQTGNKVELLAENPEFKPIEVDLREQGLTIEGLAVGVIRNGNWS >NC_005126.1|WP_011148463.1|5105532_5106045_+|zinc-uptake-transcriptional-repressor-Zur MKLINQKKLLEQAEVICQARGVRFTPQRLEVLRLISEQPGAISAYDLLDLLREAEPQAKPPTIYRALEFLLEQGFIHKIESTNSYVLCHHIEQPSHTSAMFICDRCGSVTERDGGTIESAIQQLAKTAGFSLRHTVIEAHGLCSPCEEIESCIKRDECQHDHRIEGSKKK >NC_005126.1|WP_109791872.1|5104170_5105316_-|DUF1266-domain-containing-protein MMKELLQNQPHYRQFPVKGYQVMKHIISEKRKLPFLSALYALINILFVIAVCMGIVLSVAIVLFIIGNVSVPDTDYLLLAQVGGVALFGVMLLLVIIYRIVKRPEWEQRRYYQQAGLSLLPEDKRQVLRLNIVGDYWLGFWSETLEHYPLQSRVAHDSYRYCLLPLSPTQEHQSQLYSDWGIIDEEGYMKMLTGLWEGVHSKHFAIDAALSDGKMFKVLAKLVEVTPDYIHKCAKPINKRPPALVWGFDLWLAIVLSRNCFCAGYISEEMAWKNMLKTADYIYEIFGSFDEFYTNFRLGNAYWSNDFDRSKERLEQFNYYKSHCDWPIASLPWPEPKGIIMERQMMTGFSALVEDVLRSNMEEQQSYEFDITELSASRVLH >NC_005126.1|WP_082302926.1|5102652_5103843_+|alpha-hydroxy-acid-oxidizing-protein MPSRRDVIVGGLSLAAAGTLSAVSSANAATANIKLTGAYKTNSAEKSLDIINLYDLEEEARKLIPTPQFDYISGGSGDEWTLRENTRAFDDFQIIPRYLAGVKEPDTTTELLGSNVDMPIFIPPIAAHGLAHTTAELGTARGAASAGTLFTAQTLSNSSLEEIAKVSNGPKWFQIYLTKDMGINRELIRRAKAMGATAIVFTVDLEWSGNREADKRNKFIFPHSLPFPNIPGAPVGATLSEITELFKRDLNFSDLEFLAKESGLPIIVKGIQSAENAKECVNHGAAAIQVSNHGGRQLDTVPAAIASLPHIVEAVGSKIPVYLDGGIRRGTHVFKALALGAKAVAIGRPILYALALGGAPGVTSILNLLKDELKLSMKLAGCAAIKDIERKFISLI >NC_005126.1|WP_125026258.1|5115589_5115871_+|hypothetical-protein MTGIDNYVTGVSECSQQRGNLKDDGYISKQMCFSLCGSYYEYQYTLWISRCIAAARERIPGSIENYVTGVSECSQQRSNLKDNGYRELCDRGE >NC_005126.1|WP_011148471.1|5115941_5116166_+|D-alanine-carrier-protein-DltC MELEQQVLSIVNKIARKNVELGDELLKKNLIDSITTVDLILELQEEFDCYIPATDAESILETPKSIINYLNNLK >NC_005126.1|WP_011148472.1|5116162_5117365_+|D-alanyl-lipoteichoic-acid-biosynthesis-protein-DltD MMLKKISINIAALLFAAITFSFIIVFVNSFNQKLVEYKYIEDDSKSINYIPTITDQHNAIDFLKEKSLEYGFKHNHVILFGSSELTNRTHKFIPYDFLTKNLNIPTIGIGKAHFELLAIYGYLSAYQEYLNKDSRIVIILSPGWFEKTDLLPQAYNSHFPSYIANKLANDESAKNIFSNYLNENQDNFENLNATQLKLIHKDNIIASSVTNILNYIAEARVNIKNIITDNHEIKADNIYVLHEGPLMKKQFQIANTEVQWLDLANDAKNIELKNMSKETQWVNKKYYEKYVKDKKSKKAFPNGIKYSKEMNAFDNILNLLTKYNVDALFIMQPLNPYVYTDTNDFKLVENIISEKIKSHGMGYLNLIEEQYQPGVLTDIMHMGEYGWLLTDKAIVEHFAK >NC_005126.1|WP_011148473.1|5117508_5118633_+|DltB-protein-for-D-alanine-esterification-of-lipoteichoic-acid-and-wall-teichoic-acid MFANFNFFIYLFSASFVFSLFFLFFNKRINSKIALSVLSIICWCIIFRYKIYIPIALSVYFYLITLIFKKNIINKLVSSLLIISPLFLVKLNLEFSHLLSVIGLSFFTFRAIDVILFSSKQQKIVIYEYFSYLFLPLVWLAGPMYRWNSFKRDLLELQVPVSLEKWFSGAGQILYGIVQKFLFAALIYNVFLSDYINKDTIESYLVVAISYSFYLYFDFAGYTNMACGAGKLFGINLPINFHYPILAKNPQDFWRRFHISLSEWLRDVIFMPLYKTLMEKAFFKNHRLFAQNISIFITLFCMGIWNGLELNYIISGALFGSYSVMHNCLINYTRDKENIANILNTKIISFFGRLTTLTFICFSLYIFSGYSFIK >NC_005126.1|WP_011148474.1|5118629_5120093_+|AMP-binding-protein MKYLNEYSESNFDLLINDRIIAPSHPENPVIVGSDKVIYWRDLYYEIKKWHSKYLELNLNRNTPLILYGHKEANFLVSIYACITYKIPFIPVDIIYPIQRLLEIASLSNTPYYYDVINNQFKTTNVDYIEFDEDNVAYIMFTSGSTGKPKGVVIGRESVYDLMRWMYNDFKLGEKPVFMNQALFNFDLSMYETFGTLVYGGTCLCISQETATDSEKFYQVLNHYQPTVWVSTPSFSYKQLLSQSFNYSLLKNLKHFLFCGEILSKNLVKHLRKRFPSAIIYNTYGPTEATVATTLIEISDQHLHSDMELLPIGESRSGSTLTLENGEIVISGAHVMRKYIGAKTEDNNRLTINQHGTRSFRTGDIGKLIDNIWYCFGRKDNQIKLNGYRIELHEIEERLMNIPIVDSAVVLPLKKEDGSIVRLVAFCKFKTITNKENLVNLLKNNLPSYMIPSEFINIDNFPVTNNSKIDTKSLLSIYNNNECEVVK >NC_005126.1|WP_011148475.1|5120300_5121338_-|DUF2156-domain-containing-protein MSMLLDAPQIIATGNAQDVLGNSHLRNVLCYSKHPLSSLLFNSETYWFTNQKGAIGFFQDKNLHMCVGGILAPDEERAALLHSFLNFTREKRAFPVFLHGDESDFVLLKNSGFSVNQLGASYSLSLDGYDMKGKRFQQLRNKINKSKRAGISVREICSQEEYYRFKPQLEQINQLWLKEKHAKALKKLVIDFNTVEVNSGQHRVYIATQGEQIQAYIVYSYTWGETSGWFHNLSRKKPDIPDGTMQFINETAINDFLKEGVVSYLHLGFTPLVEFGEEGYINDSAIFYKVAKWLSSKGGIVYPAASQRQYKMSWRPSLIEPEYIAFPRGKAMKALWSTLRTTNSI >NC_005126.1|WP_011148476.1|5121321_5123889_-|aminotransferase-class-III-fold-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MFVNQYRESLLNSVGLELDIKSAQDNQLTLSDGRVVKDFLAQYGALPFGHNPDFAIAEIDRFTKDKEPIFFQPNIHKKVRLLAEMLAEQIDKEKYTHCTFTNSGAETVEAAIKFTRLFTGRKRILSLHRSFHGKTYSALSATGSNRFKADFIYDDKLYEQVDSEDLDEIKRKLESREFAAFIIEPVQGEGGMKVIPPDTLSNILALCKDNGTLSVFDEVQTGIGRLGAFCAATLYALKPDVILFSKALGAGISPIGAMLYSDEFYLSEFDRKHSSTFANNVLAATMGIAVIEHLTKEEGKALTHVQEVSRYVDECLEQLSAKYPQHFYWQGAGLMRGLEIQDSKAASNIFINFSQRSGGLAYIICSFLLKHYGLFTMPLMSRPCSVRFEPPLNVSKEDIKTFFTAFDEVCQLVENGRYDILFSHLIDVPVADLPPASVSYPISKNNNLAQIKAPIPGLIEGKKFAFLIHTTSVNELAHSYCVSIKENYTQEQQKQLGNWITQVSSIDFNPDIAVEFGVESSTAYANGMLLFSPISPEDMMALSAKERAVLMKEYLDVAEKNGAEIVGLGAYTSVITNGGTSLVNNRQGRILTNGNSLTAVAVIEGIRSMLVENASRQTLAVVGARGSVGRLSVIGLAHNFGRIILVSRPNKARILLSELTKALLSAVLRTHDVIQPDSVMDKMRKWLFKQNPGVTDAQTLHQQVLDVVDTFGLEAIESYEYSLSQADFIVSATSEGKPFLNTNYLKDSAIVFDAARPFDFIRDGNHQIYEGGLVYQPEKVTYSDCNVIDVPAGVNLACLSETVAVALEGVSVHQSIGKSIDYNDALAIRDIARKHGFIPVQYSRNNQGERYEHVA >NC_005126.1|WP_011148477.1|5123981_5125028_-|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase MTNIVEELRKNSGKYQHLTPDRLKRLLLGSEAASQCLRLMAQSNMDGLHQVGNTIREASAWLPAIGIALTMHNHIVLACSKFPDIFEDSNVLLNEVMTSKALVASAFAEGLPGTNIFIPSLKMHSKEGKLFVNGSKKPCSLSSVADYYVLSVCDTDNNNDMRIVLVSKSDQNFKVIPFWRLGIMAESDNQEVKFSDTEISLTRLSHYKGLEQQIILSYGLSLFNYFAANTYSGILDGLTRFIPEKVVEQQTIKYTLTQADYKINVILGQMLIIAFYASQDENAVHKILALRYTLEKILEETASFIFRCCGGIKVMTTPEIMNFYLAVQLFKFHPIGEFQMINQIMQQA >NC_005126.1|WP_011148478.1|5125076_5125973_-|hypothetical-protein MNLIKQASEVEMRAKDWGLDEWFTEQISVEQSKRTHYANDPKLTYLPGDLRESLIRELSFKSISEYEATKALLLLADKAPDNINFDYMLTQIFDEGRHAKLFREHLVRIGFADIDNVAGKMESLLRGKMTNMLETLRTYFDKWVVLKNDYIAGVLIITVVLEGVLAPTSELSEIKWRPFDIVAAETQARANADELRHLTVCANIVKMALENESSLKQSALECIEEGLALWNQVSVDDLFVEREMFYQRGMQNYLRFIEGYELAPGMLLSDSTVESRLELSHSLVEQMQQSRLKYMGLV >NC_005126.1|WP_011148479.1|5126020_5126404_-|membrane-protein MINTFKILRWEFLGLFFITLFLTWQLESYINWWQFIVLFFLIDIIGYYPGRIWSLLNKKETPPPAFYTIYNICHNLFTLSVISLLWIWFFKDNYSVIALFVHICLDRGVLGNFPKLSINIFKQPTVH |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_005126_13 | 5394653-5394742 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_005126_13
|
1 spacers
spacers of NC_005126_13
>13.1|5394685|26|NC_005126|CRISPRCasFinder TACCCTACGGATTTCAAGATGCATCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_005126_13
The CRISPR arrays of NC_005126_13 >merge|NC_005126|13|5394653-5394742|CRISPRCasFinder CGACGGCAAGGGAGCGAATCCCCGGGAGCATATACCCTACGGATTTCAAGATGCATCACGACGGCAAGGGAGTGAATCCCCGGGAGCATA >NC_005126|13|12|5394653-5394742|CRISPRCasFinder CGACGGCAAGGGAGCGAATCCCCGGGAGCATA TACCCTACGGATTTCAAGATGCATCA CGACGGCAAGGGAGTGAATCCCCGGGAGCATA
>NC_005126.1|WP_041381229.1|5393765_5394542_+|siderophore-iron-reductase-FhuF MSNTNDSVTPLTTVVIEDIIQLFEQTFSHFTATMRVNADNIPATSMSFPQWSDTREFPVLIQRYQDEYYGDNDIKPNQKALYSLWAQWYFGLVIPPMILMLLEYPQAVDTHYNLFRLEFHDSGRPDIVYYHLTWLNESPLSLLHRHYSLLDRHIIPVCEKIESYQGINGRLLWNNIGYIMHWYLAEFSTRINSKSYQEIINGLFMEPQLPNGRDNPLYRTVILRHNNMQRRSCCQRNKLPGVGNCHDCPLESKVESKH >NC_005126.1|WP_011148697.1|5392775_5393588_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSSDVNSSTTTSRLTAQALSLAYGKKTIVECLNISIRDGEFSVIIGPNGCGKSTLLRAISRGITPQHGEILLDGNNIQHYKPKTVARELSLLTQGAIITEALTVYDLVSRGRYAHQSFLRQWSAEDERAVNDALHAVELQEMSQQLVSELSGGQRQRAWFAMTLAQQTPIVLLDEPTTYLDITHQIEMLDLCQRLHLQGKTLVLVLHDINLALRYASHLIMMKNGKIYAEGVPEEIINEQSIADVFGLPCRIICDPESGKPLIIPKYNPI >NC_005126.1|WP_011148696.1|5391732_5392791_+|iron-chelate-uptake-ABC-transporter-family-permease-subunit MSQINLSRPAKIRTFMLGTAVFLVPPQRTQRAILLILLLLSVLFYLSLALGKQGIDNPWLATSTPYQEFILIQLRLPRALVAIGAGATLALSGSLFQLTTRNALGSPDIIGVNAGAAAGIVATLIIWPGVLPIPLGALLGASFAVLLVYTGNISRSGQMQTTRIVISGIAIAALCMAFVNFAISNVRLEQAQQLASLLHGSLASRGWQDVGLIYGTSLFIPFLLWLGRQLNYVNLGYEVANTLGVPVRIIQLMSLSLAVILASMAVLVVGPVAFIALSAPQIARRLVRAKGTALFCSALVGALLLLASDLITLLLPTSARLPIGVITAGVGGVYLMYLLYAELRRTKSCHPM >NC_005126.1|WP_011148695.1|5390732_5391746_+|iron-ABC-transporter-permease MTNPKRRFVLLLGLGLMILLTFICIIASLSLGAKMLPLSTIWHHYWLGDSGSYSDLVINARKPRTLIGIMAGAALALSGAVTQGLLRNPLAEPGLLGVNAGAAAVVVSFSFIPILNELPRFWTAFIGASLATLLFYLLSGGQRNSNPARMVLTGAAINACLFAFVQGIVLMNAHVLDSYRFWTIGSLSAMSLAEASSLIPYLLFALILTLSLSSSLNVMVFGEDIATSLGANVARTRVLSLITATMLAAVATAMAGPIAFIGLAAPHLMRALVGSDFRWLLPYCLFAGPCLLLTSDILARLVIAPGEIMVGIITAGIGGPLLYLVIKTYRGVNYVAD >NC_005126.1|WP_011148694.1|5389719_5390736_+|iron-siderophore-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKLKRCKGFAVPLMLLVSLLAGCDKPASTNNAPSDKPGYPKEITTALGTAVIPHQPQRVVALGAGAEDIVLDLGIVPVGIESHRWGGDEQGYLPWFKQAIQQRGETLPTVIEMYPELDIEKVISLKPDLIVATQSGLTQEIYDHLSYFAPVIAYPSAPWLTTPQQQIELIARALDKQPQGEQLATELNVILRESGNTIPHISGYTFAYIKAGISSNMLSVYVRGDPRVDTLIHLGLTLLPSVSTLADPFGSFAANIGLENADYLNGADILVTWFNNEQERKAVEAQPLFQSIRAVHLGGYIPLTDQSLVVAMSYGTPLSLRWGLSQFMPVLAEAIKSS >NC_005126.1|WP_109792005.1|5387497_5389651_+|TonB-dependent-siderophore-receptor MGNSYAIAESAQNKSDKTAAQNDKILVTASRPEHEGVTEDTGMYNTTSMVTATGLNLSARETPQTVSVVTKQRMLDENLDSVNRVIDSTTGMNVRQFDSDRFGFTSRGMSINNILRDGVATYYDTRFNYGDNLLDADLLDRIEVVRGAAGLMVGPGNPSAAVNLIRKRPTRDFRGEFSAGAGSWDKWRTGLDLSGPLNDSGNLRGRFVTAYQAANSFIDRNNNERYPFYGVLEADLTENTLLTIGVDYQRNHTRGGMFGGLPIYFANGSKTDYKRSDSYAPDWAFSKVRTFSTFTSLQHNFDNGWSVKGTFTYDNSALDQKVLWATSFPNRSTNIGMVPGNMTLIDGSRRQKNYDLQVNGDYRLFNRTHHVSFGLNHQQQDFQNDYFNATCMLTRPNSCPGIGDFTSPGWQYPEPEWSNTRTYGSKGRNEQTSGYAVTQISLADPLTLILGGRVTSWQTRGDNFNTPQNASYSDEFVPYGGLIYNITQDLSVYTSYTEIFNPENQRDRNNKLLAPVSGQNYEVGLKGVAFDNSLDYSLAVFEIRQDNLPLVDNNAPRLPDLSIPRYTVDGTKTRGFEAEISGQLTDNWRLYTGYTQFRATDPNGVRINANTPNRLFKLFTTYTLPGAMSNLTIGGGVNWQDKTWLTVDGPGKTSMQAEQNSFAVVNLMSRYQFTPDLSLTVNLNNVFDKTYYTQFGQYSQYYYGAPRNIEAILRYKF >NC_005126.1|WP_011148692.1|5385533_5387357_+|IucA/IucC-family-siderophore-biosynthesis-protein MSSLHINSDNHTLHLNAENWLYANRHLVTKILRELCHEKLINPTYHGQQQYSLTIGDYQYHFQAETYQLDHIDIDAASVTKLRDNQSQPLDAIQLIIELHPLLEIPEKMLPIYLDEISSTLYGHAFKYQYNRLTAQDLAYADYQVVETTMSEGHPVFIANNGRIGFDADDYQRYAPESASPVTLIWIAVHKDKAIFSALSDLSYQQLIEEELGKYLPAQFERHLNMLGLCPSDYYLMPLHPWQWQHRIAISFAADIANNHIVYLGEGHDRYLAQQSIRTFFNITQPKKNYVKTALSVLNMGFMRGLDPHSMVTTPSVNEWLSNLVHNDSFFQQKGFTVLRERAALGYFNNYFESAIKKDSPHKKMLSALWRESPMTLLQDNQRLMTMASLLHVDYQGHSVVAALVKSSGLDAEEWISRYLDAYLSPLLRSFFTYDLVFMPHGENLMLVLDNNSPTNMLMKDIGEEIAILNGDLQLPEEINFLHVTIEDDMKINYIFLDIFDCFFRYLIPLLQKDLNLPEERFWLLVARCVHNYQSQHLHQIEKFRQFDLFKREFIRTCLNRLQMANNQQMIDLDDREKNLKFAGTLVNPLYALRHEYSVILHQAEQQ >NC_005126.1|WP_011148691.1|5383258_5385085_-|ATP-dependent-DNA-helicase-RecQ MSTAEVINTISLAEQVLRKTFGYLQFRSGQQQVIDTILEGRDCLVIMPTGGGKSLCYQIPALVQEGVTLVVSPLISLMKDQVDQLRANGVAADCLNSTQAREQQIDVIRRCRQGMIKLLYIAPERLMMDNFLEQLLEWQPAMLAVDEAHCISQWGHDFRPEYRALGQLRQRFPTLPVIALTATADETTRNDIVRLLNLNNPLIHISSFDRPNIRYTLIEKYKPLDQLWLFIRGQKGKSGIVYCNSRSRVEEISERLQKRGLSVAPYHAGLDNSQRARVQDAFQRDDLQVVVATVAFGMGINKPNVRFVVHFNIPRNIESYYQETGRAGRDGLPAEAVLFYDPADMVWLRRCLEEKEVGTQQDIERHKLNAMGAFAEAQTCRRLVLLNYFGESKQTPCGNCDICLDPPKNYDGLVDAQKALSSIYRVGQRFGIGYIVEVLRGANNQRIRDMRHDHLPVYGIGKDQSQEHWVSVLRQLIHLGFISQNIANYSALQLTEAARPILRGEVSLKLAVPRIQNLKGRSQQSKSYSGNYDRKLFAKLRKLRKSIADEENIPPFVVFNDVTLIEMAEQCPVTEGEMLLINGVGQRKLERFGNVFMALIREHLEEFG >NC_005126.1|WP_011148690.1|5382245_5383244_-|lysophospholipase-L2 MTPEMLKESWFNREVQFSVFANGPLLDFWQAREECEFIGVDNVLIRYVRFCTTIKNDRAVVIFPGRSESYVKYSEVAFDFYHLGYDIFIIDHRGQGRSSRILADPQKGHVEKFDDYIDDVEILIEREILPRHYSHCYALAHSMGAAILGGFLLRHSQVFDAAALCAPMFGINFPMPRWLATFLVNRAEKRPDMRNHYAVFTGKWRPLPYLINLLTHSYERYSRYLRYYADYPELHIGGPTYRWVRESIWIGDMLIEKAGEIETPLIILKASEDKVVNNCRLRAFCESRNKVRAFIKERSPLIIQGAHHEILFEKDKLRSQALNAICDFFDQN >NC_005126.1|WP_011148689.1|5381422_5382223_-|sugar/pyridoxal-phosphate-phosphatase-YigL MYHIVASDLDGTLLSPDHKLTSYTKETLNLLTNKGIHFIFATGRHHVDVAQIRDVLGIDAYMITSNGARVHNAMGELVFSHNVDPEIVHDLCLMEFDNVDILTNYYCHDHWYMNRECPEQKEFFQESVFHYQLFERDNFKTDDVCKVYFTCQDHDLLVALEEKIKARWGDSVNVSFSLRNCLEVMAGGVSKGHALEQVAQAMGYKLSDCIAFGDGMNDFEMLTVAGKGCIMQDAHQRLKDILPDMEVIGSNADDAVPHYLCEMYRV >NC_005126.1|WP_011148699.1|5394900_5396445_+|decarboxylase MYGDALLLDNSLTQDSHITDEDFSRYFLNMHSAGDYLDDAYNVITRIKKILQQVDKPFSGILPNELSPLFSKVNLDLPLTSLNQALDELQQLYIKDAVYFHHPKYVAHLNCPLVLPAVLAETIIGAINSSLDTWDQSAGGTLIEQKVLDWTRDKMALGTNADGIFTSGGTQSNLMAMLLARDHFCHQRNPEHKNQLHGLPADFHKLRIFTSTVSHFSTQKAAAILGLGYNAVVSVPHDSEFRMDPQALEQSINQCIEQGNIPFAIVATTGTTDFGSIDPLHPIAAIAKQYSIWLHVDAAYGCGLLVSPRRAYLLEGINLADSVTVDYHKSFFQPVSCSAFFVKNKKHLSHLTYHAEYLNPLSASQEGTPNLVNKSIQTTRRFDALKMWLTLRIMGAKRLGQAFDKVVDTAQDAYRLMAQNPYFELIHYPELSTLVFRFIPKQKLPDADIDAINAAIRKALFREGNTVIAGTKVNGRQYLKFTFLNPATSQQHLQEIVHSIVMHGNDFLATHNNN >NC_005126.1|WP_011148700.1|5396475_5397777_+|lysine-N(6)-hydroxylase/L-ornithine-N(5)-oxygenase-family-protein MITRPYDFIAIGIGPFNLGLACLTQPLKDVHSLFIDQKPGFDWHPGMMLENSTMQTPFMSDLVTLASPTHPLSFLNYIKQKGRIYSFYIRESFFLMRKEYNQYCQWAAEQLSNLRFNTRVDSISYDEDASLYTLHCSDTLTGQQHQFVCKKLVLGTGPAPYIPKCCQPFSERMVTSGDYLNNKATLQQKRSITVLGSGQSAAEIFYDLLSDIDKFDYQLNWLTRSPRFFPLEYTKLTLEMTSPEYIDYFYSLPGDKRDALNLSHKQLYKGINSSLINDIFDLMYTKRLNGKLNVNLYTNSELRQVSHANNGRDLTLALFQHEQEQSFSLDTEGVVLATGYQYQIPTFIEGIHHLIHWDEKGRYGVQRNYSIDQNNTIFIQNVELHTHGFVTPDLGMACYRNSCLIYEITGIEHYPIEKSIAFQQFSVDTEGAC >NC_005126.1|WP_011148701.1|5397776_5400194_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MSVFNPTLFEKSLPEIGTFTLRPLDLERDIPILTDWVNRDYAHYWGMINNTKQQVWEFYQDLESRHPGSVFIGIYREQPAFLLECYRAQDDLIGKYYPAHPDDMGMHILVAPPQAKIRHFTWGIFQTIMAFLFSDPTVARIVVEPDIRNEKIHKLNLRAGFVYQKALVLPNKTAKLAFCTREQHQIALQREHHATTPTHLGSLMTNAMHLQPAVWQKVNRLHLCKAIAEFSHECLLVPQQLTEKADSDGYHHYRLDSYRLNSADHLVSYTFRARRMALDHWLIDADSLQKNANGEEKALDSLLFIIEFKQQLGISDVVMTTYLEEITSTLYSSAFKHNRIGISAMDLVNTDFQALEGEMMEGHPSFVANNGRIGFDIGDFQNFSPEAASAIHLVWLAAHKSKAHFACIEQLNYQQLLEQELGTTTMAEFDQRLIALNLNPKDYFLMPVHPWQWQNKLASVFAPDIANQKLVYLGIGADTYQAQQSIRTLFNRSHPQRYYVKMALSILNMGFMRGLSPYYMATTPGINDWLFDLVTQDPILQRYRFKILREVASVGFKNSYYEQAISSDTPYKKMMAALWRENPLQLIEPGQQVMTMAALLHSDQQGNALLPALISASGLPTQEWLRRYLESYLAPLLHCLYAYDLMFMPHGENIILVLENHIPQHIFMKDLAEEILVMNPDADLPEKASRVKVDMPEDMKTLTILSDVFDGIFRYLAAILDEQGDYSQDLFWQAVAECILSYQHNHPELSEQFVRYELFTPEIKRCCLNRLQIANNRQMLDLADPAQSLQFADNLINPIAKFGHS >NC_005126.1|WP_011148702.1|5400489_5400960_+|thioesterase-family-protein MSTTLLTLEEARQVIGHAFVHNMPFNQLLGLELIRFEQDYVEIQFRNQSKLVGNIAQKILHGGVIASVLDVCGGLVCIGNALTRLVPASLEELEKRLSIMGTIDLRVDYLRPGRGELFTATSSIIRNGNKVSVARAELHNEQRAHIASVTATYLVG >NC_005126.1|WP_011148703.1|5401071_5401962_+|EamA-family-transporter-RarD MNKPQTTKGVLYAFGACFIWGIAPIYFKHIQQVPADEILTHRIIWSFFFMLLLLTLTRHWSQVVKVFHQPKKVLLLAVTATVVACNWLIYIWAVNHGHMLEASLGYFISPLVNVLFGMLFLSERFRRMQWAAVILAFTGVLIQLWQFGSIPVIGLSLAVTFALYALLRKKMNVDAQTGMTIETLWLLPVAAIYLFGFANSPTSDLTANPMTLNLWLIAAGIITTVPLLLYTEAAAHLRLSTLGFFQYVGPTLMFLLATLVYGEQIGIDRLITFGFIWAALVLFTLDAVYTQRRSQR >NC_005126.1|WP_011148704.1|5401969_5402350_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MKITIRLAGTTEQLALEALQLRASLMWEEDRELLLANPHMIELPIEYITAGYVYIAEQANVILGFCVVLPLSDGNAELDGIFIEPGFWHQGIGKQLVQITLNDLHIYPMDFKMHRGGKGANPREHR >NC_005126.1|WP_011148705.1|5402400_5402550_+|hypothetical-protein MTGIKGKVSLQVLANPPQAEGFYIALGFKHFGKEYTQLGTAIRMIKYIL >NC_005126.1|WP_011148706.1|5403115_5404066_-|magnesium/cobalt-transporter-CorA MLSAFKLENNRLLRLEFEEGEKLSDSLWVDLVEPAEQDRLQVQNELGQILATRPELDDIEASARFFEDEDGIHVHSFFYFEDAEDHAGNATVAFTIRDGRLYTLRERELPAFRLYRMRARNQTLVDGNAYEVLMDLFETKIEQLADVIENIYSVLESLSRVIMEGKQGDEFDIALSSLAEQEDISWKVRLCLMDTQRALNFLVRRARLPGAQLEQAREILRDIESLLPHNESLFQKVNFLMQAAMGFINIEQSRIIKIFSVVSVVFLPPTLVASSYGMNFEFMPELHWTFGYPGAIGLMIAAGLAPYLYFKRKNWL >NC_005126.1|WP_041381233.1|5404161_5406333_-|DNA-helicase-II MVTMDVSYLLESLNDKQREAVAAPRTNMLVLAGAGSGKTRVLVHRIAWLLSVEKASPFSVMAVTFTNKAAAEMRHRIENLIGTSQGGMWIGTFHGLAHRLLRAHHLDANLPQDFQILDSEDQNRLLKRIIKAMNLDDKQWPARQGMWYINGKKDEGLRPQHIESYGNPVEATWQKIYQAYQEACDRAGLVDFAELLLRAHELWLNKPQILQHYRGRFTNILVDEFQDTNSIQYAWIHLLAGETGKVMIVGDDDQSIYGWRGAQVENIQRFLKDFPGAETIRLEQNYRSTSNILKVANTLIANNSDRLGKNLWTDGVEGEPISLYCAFNELDEARYVVSRIKNWLENGGALKNCAILYRSNAQSRVLEEALLQASMPYRIYGGQRFFERQEIKDALAYLRLIANRHDDAAFERVVNTPTRGIGDRTLDIVRQAARERQQTLWDCCQILLQEKVLAGRAAASLQRFIELIDALSTETEDMPLHVQTDRIIRDSGLRAMYQQEKGEKAQARIENLEELVTATRQFSYQDEDENFTPLQAFLSHAALESGEGQADAYQDSVQLMTLHSAKGLEFPQVFIVGMEEGMFPSQMSIEEGGRLEEERRLAYVGLTRAMEKLTITYAESRRLYGKEVYHRPSRFIGELPSECIEEVRLRATVSRPVSHSRLGTPISANDSGYALGQRVRHPKFGEGTIVNMEGSGEHSRLQIAFQGEGIKWLVAAYARLEMV >NC_005126.1|WP_011148708.1|5406390_5407107_-|5-amino-6-(5-phospho-D-ribitylamino)uracil-phosphatase-YigB MRFYRPLAPVLAMTFDLDDTLYDNHPVMDKAEEEVLNFVRQYDPRFSHLNHQDLCAFRELTLEQHPEIYHDMTLWRWYSSKLMFCHYGFSREDADRGADDVMAHFTLWRNRIDIPESTHKTLAALAEQMPLVAITNGNAEPAACGLAPYFKFVLQAGPDGRAKPCSDMYCLAADRLGLALGQILHIGDDLNTDVAGALGSGMQACWMNTKNKKLLQTMESRLLPHIEIYDLASLTALI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_005126_14 | 5613713-5613803 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_005126_14
|
1 spacers
spacers of NC_005126_14
>14.1|5613737|43|NC_005126|CRISPRCasFinder GATAACTATGTGACCGGGGTGAGCGAGTGCAGCCAACAAAAAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_005126_14
The CRISPR arrays of NC_005126_14 >merge|NC_005126|14|5613713-5613803|CRISPRCasFinder GCAACTTGAAAGATGACGGGTATAGATAACTATGTGACCGGGGTGAGCGAGTGCAGCCAACAAAAAGGCAACTTGAAAGATAACGGGTATA >NC_005126|14|13|5613713-5613803|CRISPRCasFinder GCAACTTGAAAGATGACGGGTATA GATAACTATGTGACCGGGGTGAGCGAGTGCAGCCAACAAAAAG GCAACTTGAAAGATAACGGGTATA
>NC_005126.1|WP_011148899.1|5612937_5613375_-|rhodanese-like-domain-containing-protein MLQEIMQFINQHMTLSLIWIALLVAVIVTTTRGFFSKTKEITRAQAINLINKEEAIVVDLRSREDFRKGHIIGAVNLTPSEIKDNNFAELEKHKKQPVIVVSANGTESRTPAENLLRAGFERVCSLKEGLVGWTGENLPLARGKK >NC_005126.1|WP_011148898.1|5612391_5612868_-|protein-export-chaperone-SecB MSEQSNTEMAFQIQRIYTKDISFEAPNAPQVFQQEWQPEVKLDLDTASSELAQGVYEVVLRVTVTAALGEETAFLCEVQQGGIFSIDGIEGTQLAHCLGAYCPNILFPYARECITSLVSRGTFPQLNLAPVNFDALFMNYLQQQAEQSQGGEQTEQEA >NC_005126.1|WP_011148897.1|5611369_5612392_-|NAD(P)H-dependent-glycerol-3-phosphate-dehydrogenase MNSTVSMTVIGAGSYGTSLAITLARNGHNVVLWGHNPEHVGALQRVRCNQKFLPDVSFPDSLLLETDLIKALTASRDILVVVPSHVFGEVLKQIKPHLRPDSRIVWATKGLEADTGRLLQDVAREILGNEIPLAVLSGPTFAKELAAGLPTAIAISATESAFGDGLQQLFHCGKSFRVYKNPDFIGVQLGGAVKNVIAIGAGISDGMGFGANARTALITRGLAEMSRLGAALGADPSTFMGMAGLGDLVLTCTDNQSRNRRFGMMLGQGISVEEAQYQIGQVVEGYRNTKEVRALANRANVEMPIAEQIYQILYCNKNVIEAAQALLGRARKDESDNVRS >NC_005126.1|WP_011148896.1|5610504_5611326_-|serine-O-acetyltransferase MSLEELDEVWKNIKTEARALAECEPMLASFFHATLLKHENLGSALSYMLANKLATPIMPAIAVREIVEEAYGSDQKMIVSAARDIIAVRLRDPAVDKYSTPLLYLKGFHALQAYRIAHWIWGEDRKALAIYLQNQISMSFGVDIHPAAKIGCGIMLDHATGIVIGETAVVENDVSILQSVTLGGTGKTGGDRHPKVREGVMIGAGSKILGNIEIGRGAKIGAGSVVLRSVPPHTTAAGVPARIVGKPESEKPSLDMNQHFNGINHGFEYGDGI >NC_005126.1|WP_041380442.1|5609581_5610280_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MKAKNSKEFLHDVIEWDIYNWSHSLKYWQDHSGLELKSANILELGSRNGGLSLWAALNGANVLCTDLDGPTPKALEKHKRYNIEKSIQYDKLNASDIKYKNHFDIVMFKSVLGAVGYNFNKTAQKEAINQIFYSLKEGGELWFAENLVASPLHKFLRKNYVNWGNTWGYVTTKEMTEYLSAFSDVNYTTLGFLATLGRNEFQRKFLGVLDNKVLNKVIPKHWHYIIIGVAKK >NC_005126.1|WP_011148893.1|5608525_5609014_+|tRNA-(uridine(34)/cytosine(34)/5--carboxymethylaminomethyluridine(34)-2'-O)--methyltransferase-TrmL MLNIVLFEPEIPPNTGNIIRLCANTGFQLHLIQPLGFTWDDKRLRRAGLDYHEFANIKQHHDYFAFLENEGLTGASSARLFALTTKGTPAHSAVSYQAGDYLMFGPETRGLPPYVLDNMPPQQKIRIPMLANSRSMNLSNSVAVVVFEAWRQLDYQGAIIRE >NC_005126.1|WP_011148892.1|5607628_5608327_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MKTENSRELLNDVIEWDIGNWSHALKYWQDHSNLELKSANILELGSRNGGLSLWAALNGGNVLCTDLNGPTSKAQEKHKRYNIESSIRYGKLSALDIKYKNHFDIVMFKSVLGGIGYNSNKSAQKKAINQIFHSLKKGGEFWFAENLVASPLHQFLRKNYVNWGNAWGYVTVNEMVEYLSAFSNINYTTLGFLATFGRNESQRKFLGMLDNKVLNKVVPKHWHYIIIGVAKK >NC_005126.1|WP_041380440.1|5607133_5607409_+|DDE-transposase-family-protein MAPKAGKKLKVLVLSSRGLLKQYGKFEQGITTHDTIVHMVSCISTKLFQKYFIKWMNICRELMKSSGSATDGKTVRRSQFGATIQRNYYLG >NC_005126.1|WP_011148890.1|5605993_5607016_+|UDP-glucose-4-epimerase-GalE MPILITGGAGYIGSHTVLTLLERGADVVVIDNLCNSSPESLRRVEKLTGKSVKFYQGDILNLDLLHKIFQENKIETVIHFAGLKAVGESTRKPLEYYQNNVTGTLVLLQAMRANSVHQLIFSSSATVYGDPEFVPLTENAKVGGTTNPYGTSKLMVEQILKDFAAAEPSFKITSLRYFNPVGAHSSGMIGEDPNGIPNNLLPYITQVAIGRLECLSVYGNDYPTKDGTGIRDYIHVMDLAEGHIAAIDYLDKQQSYEVFNLGTGAGYSVLELLHAFEKASGKDIPYKITDRRPGDIAECWSDPSRARNILGWQATRNIDDMMRDSWNWQKNNPHGFRSGK >NC_005126.1|WP_011148889.1|5604620_5605793_+|ankyrin-repeat-domain-containing-protein MIVIAGKNNIAVHVLNLLKIKYNIKNLAVVINKTDSGNNTWQYSLKKRANEINVPIISLEEAERNASIFLSLEFDQLIKIGRFRTKKIFNIHFSLLPKYKGMYTSIWPILNNEISTGVSLHYIDNGIDTGEIIDQTTINIDERYTSKDIYLNYISHSCTLIEDYIEKIIKNNNIFSNPQKSKHSSYYSKNTISFSSESINLHKTAWEIGRYIRAFSFREYQLPHYQNTNYCNYEITSIRSSGRPGALIKDNENFSEFSTIDYNIILYKDKIDLLFDFCKKNNLSEIKKYIKNISGIDERNQHTWSLLMVASYHGYLGIVKYLIDSGANVNATNYKGTSVLMYAKEYALKNGDTRIIKLLIEKGANILTKDMHYKCLVEYLTEDERLKVGI >NC_005126.1|WP_011148900.1|5613923_5615231_+|murein-hydrolase-activator-EnvC MADDKEMHSRNYRRNQNSRRNDIFALLFYVFLLVIFSFNTFANQIIDNKNQLKDLQQNIAEKEKSVQQQQQKRSSLLNQLKDQENTISKIGQSLHNAQTQLSKLNKEITFLVSNIKKLEKQQKAQRDMLARQLDAAFRQGQYQGLELMFRGEEGKRGERILAYYSYLNQARQDTIVKLEQTAVDLTEQKKLEQQKQEEQKQVLTEQQQQKQQMEVARNARQKTLSELESSLKKDQKNLAELKQNETRLRDKIAKAEREAKARAEREAREAARVRAQIAAKQKQAQQKGSSYKPTEDERALMARTGGLGRPAGQAIWPVHGKVIHQFGEALQGELRWKGMVISATEGTEVKAISDGRVLLADWLQGYGLVVVIEHGKGDMSLYGYNQSALVSVGQQVRAGQPIALVGNSGGQQQPALYFEIRRQGRAVNPQPWLGR >NC_005126.1|WP_173362537.1|5615262_5616036_+|divergent-polysaccharide-deacetylase-family-protein MGTTALLLLSLQTGAARLAIVIDDFGYRPHNENKILQMPVAISIAILPDSPHGREMAEKAYKQGREILIHLPMAPLSKQLLEPDTLQPTMSSEDIDRIIQRAIQKVPYAVGINNHMGSAMTSSLPGMQKVMRSLSGYNLYFLDSVTIGNTQATKAAQGTPVRVIRRNVFLDDVQSEAETRHQLNRAISIARKNGSAIAIGHPHSTTIRALQQMLPTLPADIELVSPSRLLSGKPVGDNPHKWGKLCELNNHRLKSVG >NC_005126.1|WP_011145659.1|5616082_5616511_-|IS200/IS605-like-element-ISPlu2-family-transposase MDYRYGSHTVFQIEYHFVWVTKYRYKVLTGEVASRVRELIRQTCGSFEIRILKGVVSQDHVHILVSSPPTLAPSEIMRRLKGRTASKLFEEFSHLKKRYWGQHFWGRGYFCATVGQLTEEMIKSYLEHHFEPNPNDNFRMDN >NC_005126.1|WP_041380444.1|5617398_5618445_+|3-ketoacyl-CoA-thiolase MKITGIAGLLPSRFVSNQEVIDLVEYYSKEIFHGDLPKTLKLIGKMLNKAGINSRYWLADNEKPMELIEAAFNHALAQANIIKEDIDLLIYSSVARGFIEPANSTFVSKALGLTCRNYDVVDACNGWVAAMDIINSKMKAGEIRHAAIVNMEFIMSQNGPIFPKTFSLNSLSEVAYKFIGCTVGEAATVTIISNESPENFKFNYINRPDLSDLSTISLPDWRLFCNDTDVERIGPTGGKYQVNSHSALLHDHGEKETINLFNHHKISDDIEHIFIHTGSPKTWARLGQKMGIDDKIHHVGQRVGNIATASIPFGIFDAINQGILEKNQLCMGWAGSGGMVFAAMTFKF >NC_005126.1|WP_011148903.1|5618733_5619759_-|L-threonine-3-dehydrogenase MKALSKLKAEEGIWMIDVPEPELGHNDVMIKIRKTAICGTDVHIYNWDDWSQKTIPVPMVVGHEYVGEVVAIGQEVKGFKIGDRVSGEGHITCGYCRNCRGGRTHLCRNTIGVGVNRAGCFAQYLVIPAFNAFKIPDNISDELAAIFDPFGNAVHTALSFDLVGEDVLVSGAGPIGIMAAAVCKHVGARHVVITDVNEYRLELARKMGVTRAVNVSQENLTDVMAELGMTEGFDVGLEMSGAPAAFRTLLNTMNHGGRVALLGIPPSDMAIDWNQVIFKGLFIKGIYGREMFETWYKMATLIQSGLDLTPIITHRFSIDDFQKGFDIMRSGQSGKVILNWD >NC_005126.1|WP_011148904.1|5619768_5620965_-|glycine-C-acetyltransferase MSASFYQQINEQLEQAHSEGLFKNERIITSAQNADIAVADGSHVINFCANNYLGLANHPELIAAAKAGMDSHGFGMASVRFICGTQDTHKALERKLAEFLGMEDAILYSSCFDANGGLFETLFGPEDAIISDALNHASIIDGVRLCKAKRYRYANNDMQELRAQLEKAKADNARHIVIATDGVFSMDGVIADLKSICDLADEFDAMVMVDDSHAVGFVGAHGRGTHEYCDVMDRIDIITGTLGKALGGASGGYTAARKEVVEWLRQRSRPYLFSNSLAPAIVAASIKVLDMLKEGDALRDRLWKNANLFREKMTAAGFTLAGADHAIIPVMLGDAKLAQEFAAELLKEGIYVTGFFYPVVPKNQARIRTQMSAAHTEEQIERAVAAFTRIGKQLNVIA >NC_005126.1|WP_011148905.1|5621199_5622138_+|ADP-glyceromanno-heptose-6-epimerase MIIVTGGAGFIGSNIVKALNDEGYKDILVVDNLKDGTKFINLADLDIADYMDKEEFIASILAGDDFGDIDAIFHEGACSSTTEWDGKYMMDNNYQYSKELLHYCLERRTPFLYASSAATYGGRTDNFIEERQYEKPLNVYGYSKFLFDQYVREILPQADSQICGFRYFNVYGPREGHKGSMASVAFHLNNQINQRQNPKLFAGSEGFQRDFIYVGDAAAVNLWFWKNGVSGIYNCGTGRAESFQAVADAVVECHKDKSLTVEHIDFPEHLKGRYQRFTQADLTKLRAAGYDKPFKTVAEGVTEYMHWLNQDK >NC_005126.1|WP_011148906.1|5622148_5623198_+|ADP-heptose--LPS-heptosyltransferase-RfaF MKILVIGPSWVGDMMMSQSLYRTLKALHPNAEIDVMAPAWCRPLLDKMPEVNQALAMPLGHGALALGERRRLGVALRERKYHRAYVLPNSFKSALVPFFANIPLRTGWRGEMRYGLLNDIRTLNKEAFPLMVQRYAALAYDAKPSSAADLPQPLLWPQLDVSDEDIAESTAAFNISDHRPIIGFCPGAEFGPAKRWPHYHYAALAQQLITQKGYQILLFGSAKDHEGGEDIRNSLTGEAREHCINLAGQTSLEQAVNIIAACDAIVTNDSGLMHVAAALNRPLVALYGPSSPDFTPPLSDKAEVIRLITGYHKVRKGDSSHGYHQSLIDIQPEQVITSLEKLLQAENQS >NC_005126.1|WP_011148907.1|5623197_5624163_+|lipopolysaccharide-heptosyltransferase-RfaC MRVLLVKTSSMGDVLHSLPALTDAERNLPDVRFDWVVEEGFAQIPGWHNAVDQIIPVAIRRWRKNWFSPEIRAERRLFKEKLKLHQYDAIIDAQGLLKSAFLVTRLAYGPKHGYDRKSIREPLASFFYDCRHTVSKQQHAVERIRELFAVSLGYTKLAAQGDYGIARHFLKQKLENQGDYLVFLHATTRDEKHWPESHWRQLIAEIQPTGMKIKLPWGAEHEYQRALRLAENFPHVEVLPKLTLAQVAQELAGAKAVVSVDTGLSHLTAALDRPNITLFGPTDPGLIGGYGKEQISLKAADGNIKSITPSKVLAHLQENIG >NC_005126.1|WP_011148908.1|5624287_5625247_-|deacetylase MTRPAFIITIDTEGDDLWQNHGQISTKNTHYLPRFQHLCERFGFKPVWLTNYEMAMDDLYIEFAKDVIARGQGEIGMHLHAWNNPPLVPLTDDDMRYKPYLIEFPKEQIRAKIDLMTKLLEDKLQIKMLSHRAGRWAFNEYYAELLVEYGYQVDCSVTPRVNWRFTKGDPNGNGGTDYRHFPSYAYFMDLQNIAKEGDSPLLEVPMSIQYKHPPLMNFLKQKYDSLRGKPRSPSVNWLRPKGGNLEQMKKVVQQTLAEGSDYIEFMLHSSEFMPGGSPTFKNEQQIELLYQDLEALFNYLQPQVRGMTLAEYYQWKRLS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_005126_10 | 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder | 3956625-3956665 | 41 | NC_005126.1 | 117495-117535 | 0 | 1.0 |
NC_005126_10 | 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder | 3956625-3956665 | 41 | NC_005126.1 | 1040779-1040819 | 0 | 1.0 |
NC_005126_10 | 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder | 3956625-3956665 | 41 | NC_005126.1 | 2864399-2864439 | 0 | 1.0 |
NC_005126_10 | 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder | 3956625-3956665 | 41 | NC_005126.1 | 3964087-3964127 | 0 | 1.0 |
NC_005126_10 | 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder | 3956625-3956665 | 41 | NC_005126.1 | 4111136-4111176 | 0 | 1.0 |
NC_005126_10 | 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder | 3956625-3956665 | 41 | NC_005126.1 | 4409057-4409097 | 0 | 1.0 |
NC_005126_10 | 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder | 3956625-3956665 | 41 | NC_005126.1 | 4592801-4592841 | 0 | 1.0 |
NC_005126_10 | 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder | 3956625-3956665 | 41 | NC_005126.1 | 4667876-4667916 | 0 | 1.0 |
NC_005126_10 | 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder | 3956625-3956665 | 41 | NC_005126.1 | 4890700-4890740 | 0 | 1.0 |
NC_005126_10 | 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder | 3956625-3956665 | 41 | NC_005126.1 | 434451-434491 | 0 | 1.0 |
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NC_005126_10 | 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder | 3956625-3956665 | 41 | NC_005126.1 | 5663564-5663604 | 0 | 1.0 |
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NC_005126_2 | 2.1|2016517|41|NC_005126|CRISPRCasFinder | 2016517-2016557 | 41 | NC_005126.1 | 3506799-3506839 | 1 | 0.976 |
NC_005126_2 | 2.1|2016517|41|NC_005126|CRISPRCasFinder | 2016517-2016557 | 41 | NC_005126.1 | 3993271-3993311 | 1 | 0.976 |
NC_005126_2 | 2.1|2016517|41|NC_005126|CRISPRCasFinder | 2016517-2016557 | 41 | NC_005126.1 | 1844552-1844592 | 1 | 0.976 |
NC_005126_2 | 2.1|2016517|41|NC_005126|CRISPRCasFinder | 2016517-2016557 | 41 | NC_005126.1 | 3400967-3401007 | 1 | 0.976 |
NC_005126_2 | 2.1|2016517|41|NC_005126|CRISPRCasFinder | 2016517-2016557 | 41 | NC_005126.1 | 4167707-4167747 | 1 | 0.976 |
NC_005126_2 | 2.1|2016517|41|NC_005126|CRISPRCasFinder | 2016517-2016557 | 41 | NC_005126.1 | 4407052-4407092 | 1 | 0.976 |
NC_005126_2 | 2.1|2016517|41|NC_005126|CRISPRCasFinder | 2016517-2016557 | 41 | NC_005126.1 | 5420992-5421032 | 1 | 0.976 |
NC_005126_5 | 5.11|2142685|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2142685-2142716 | 32 | NC_005126.1 | 3446980-3447011 | 1 | 0.969 |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_005126_7 | 7.6|2395527|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2395527-2395558 | 32 | NZ_CP027261 | Pectobacterium parmentieri strain IFB5427 plasmid pPAR01, complete sequence | 37505-37536 | 0 | 1.0 |
NC_005126_4 | 4.1|2133440|26|NC_005126|PILER-CR | 2133440-2133465 | 26 | LG146436 | KR 1020160044964-A/1: Bacteriophage PM-1 and vegetable soft rot controlling composition containing the same | 8701-8726 | 3 | 0.885 |
NC_005126_4 | 4.1|2133440|26|NC_005126|PILER-CR | 2133440-2133465 | 26 | KF534715 | Pectobacterium phage PM1, complete genome | 8701-8726 | 3 | 0.885 |
NC_005126_4 | 4.1|2133440|26|NC_005126|PILER-CR | 2133440-2133465 | 26 | MN856004 | Myoviridae sp. isolate 289, complete genome | 3984-4009 | 3 | 0.885 |
NC_005126_4 | 4.1|2133440|26|NC_005126|PILER-CR | 2133440-2133465 | 26 | NC_019755 | Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.06, complete sequence | 15012-15037 | 4 | 0.846 |
NC_005126_4 | 4.1|2133440|26|NC_005126|PILER-CR | 2133440-2133465 | 26 | MN855595 | Bacteriophage sp. isolate 204, complete genome | 9700-9725 | 4 | 0.846 |
NC_005126_4 | 4.1|2133440|26|NC_005126|PILER-CR | 2133440-2133465 | 26 | KY087898 | Pectobacterium phage PP101, complete genome | 10014-10039 | 4 | 0.846 |
NC_005126_5 | 5.8|2142505|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2142505-2142536 | 32 | MT786458 | Staphylococcus phage vB_SauH_SAP1, complete genome | 57973-58004 | 4 | 0.875 |
NC_005126_5 | 5.8|2142505|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2142505-2142536 | 32 | MG557618 | Staphylococcus phage HSA30, complete genome | 86428-86459 | 4 | 0.875 |
NC_005126_5 | 5.8|2142505|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2142505-2142536 | 32 | LR215718 | Staphylococcus phage Stab20 genome assembly, chromosome: I | 130181-130212 | 4 | 0.875 |
NC_005126_5 | 5.8|2142505|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2142505-2142536 | 32 | MG721208 | Staphylococcus phage vB_SauM_LM12, complete genome | 18241-18272 | 4 | 0.875 |
NC_005126_5 | 5.8|2142505|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2142505-2142536 | 32 | KY779849 | Staphylococcus phage qdsa002, complete genome | 131598-131629 | 4 | 0.875 |
NC_005126_5 | 5.8|2142505|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2142505-2142536 | 32 | MF001365 | Staphylococcus phage SA3, partial genome | 103369-103400 | 4 | 0.875 |
NC_005126_5 | 5.8|2142505|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2142505-2142536 | 32 | MH159197 | Staphylococcus phage VB_SavM_JYL01, complete genome | 101594-101625 | 4 | 0.875 |
NC_005126_5 | 5.8|2142505|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2142505-2142536 | 32 | MN304941 | Staphylococcus phage vB_SauH_IME522, complete genome | 51084-51115 | 4 | 0.875 |
NC_005126_5 | 5.8|2142505|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2142505-2142536 | 32 | MK250904 | Staphylococcus phage VB-SavM-JYL02, complete genome | 100166-100197 | 4 | 0.875 |
NC_005126_5 | 5.8|2142505|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2142505-2142536 | 32 | KM216423 | Staphylococcus phage P108, complete genome | 66701-66732 | 4 | 0.875 |
NC_005126_5 | 5.8|2142505|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2142505-2142536 | 32 | NC_019448 | Staphylococcus phage GH15, complete genome | 128246-128277 | 4 | 0.875 |
NC_005126_3 | 3.5|2127245|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2127245-2127276 | 32 | AP014378 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S43-C22, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 16479-16510 | 5 | 0.844 |
NC_005126_3 | 3.16|2127903|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2127903-2127934 | 32 | NZ_CP039965 | Pseudorhodobacter sp. S12M18 plasmid unnamed1, complete sequence | 449214-449245 | 5 | 0.844 |
NC_005126_5 | 5.8|2142505|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2142505-2142536 | 32 | NZ_CP032091 | Pseudoalteromonas donghaensis strain HJ51 plasmid unnamed1, complete sequence | 625340-625371 | 6 | 0.812 |
NC_005126_5 | 5.17|2143045|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2143045-2143076 | 32 | NC_017078 | Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC1, complete sequence | 27697-27728 | 6 | 0.812 |
NC_005126_8 | 8.3|2475551|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2475551-2475582 | 32 | AP019515 | Halomonas sulfidaeris ATCC BAA-803 plasmid pBAA-803-A DNA, complete genome | 237256-237287 | 6 | 0.812 |
NC_005126_8 | 8.3|2475551|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2475551-2475582 | 32 | CP034667 | Proteus vulgaris strain PvSC3 plasmid pPvSC3, complete sequence | 35600-35631 | 6 | 0.812 |
NC_005126_3 | 3.2|2127065|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2127065-2127096 | 32 | NZ_CP045273 | Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301A, complete sequence | 889740-889771 | 7 | 0.781 |
NC_005126_3 | 3.4|2127185|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2127185-2127216 | 32 | AP014008 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C62A-MedDCM-OCT-S41-C20, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 33240-33271 | 7 | 0.781 |
NC_005126_3 | 3.4|2127185|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2127185-2127216 | 32 | AP014009 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C62A-MedDCM-OCT-S45-C17, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 39827-39858 | 7 | 0.781 |
NC_005126_3 | 3.4|2127185|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2127185-2127216 | 32 | MN693993 | Marine virus AFVG_250M418, complete genome | 8631-8662 | 7 | 0.781 |
NC_005126_3 | 3.4|2127185|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2127185-2127216 | 32 | NC_047711 | Uncultured phage_MedDCM-OCT-S28-C10 DNA, complete genome, group G8, isolate: uvMED-CGR-C62A-MedDCM-OCT-S28-C10 | 35669-35700 | 7 | 0.781 |
NC_005126_3 | 3.4|2127185|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2127185-2127216 | 32 | MG592629 | Vibrio phage 1.264.O._10N.286.51.F2, partial genome | 36038-36069 | 7 | 0.781 |
NC_005126_3 | 3.9|2127485|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2127485-2127516 | 32 | MF063068 | Pseudomonas phage Noxifer, complete genome | 177089-177120 | 7 | 0.781 |
NC_005126_3 | 3.16|2127903|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2127903-2127934 | 32 | MK883717 | Eschericha phage vB_EcoM-ECP26, complete genome | 62814-62845 | 7 | 0.781 |
NC_005126_3 | 3.16|2127903|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2127903-2127934 | 32 | MK883718 | Escherichia phage vB_EcoM-ECP32, complete genome | 46466-46497 | 7 | 0.781 |
NC_005126_3 | 3.20|2128143|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2128143-2128174 | 32 | FN997652 | Streptococcus phage phi-SsUD.1 complete sequence | 8184-8215 | 7 | 0.781 |
NC_005126_5 | 5.6|2142385|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2142385-2142416 | 32 | NC_023688 | Aeromonas phage PX29, complete genome | 33124-33155 | 7 | 0.781 |
NC_005126_5 | 5.6|2142385|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2142385-2142416 | 32 | MH791401 | UNVERIFIED: Aeromonas phage AsFcp_2, complete genome | 203273-203304 | 7 | 0.781 |
NC_005126_5 | 5.14|2142865|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2142865-2142896 | 32 | NZ_CP053366 | Klebsiella pneumoniae strain BA2275 plasmid p2, complete sequence | 22009-22040 | 7 | 0.781 |
NC_005126_5 | 5.14|2142865|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2142865-2142896 | 32 | MK433579 | Klebsiella phage ST11-OXA48phi15.1, complete genome | 24433-24464 | 7 | 0.781 |
NC_005126_5 | 5.14|2142865|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2142865-2142896 | 32 | MK422455 | Klebsiella phage ST340-VIM1phi10.1, complete genome | 11675-11706 | 7 | 0.781 |
NC_005126_5 | 5.14|2142865|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2142865-2142896 | 32 | MK448230 | Klebsiella phage ST16-OXA48phi5.2, complete genome | 30714-30745 | 7 | 0.781 |
NC_005126_5 | 5.14|2142865|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2142865-2142896 | 32 | MK416019 | Klebsiella phage ST11-VIM1phi8.3, complete genome | 27331-27362 | 7 | 0.781 |
NC_005126_5 | 5.14|2142865|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2142865-2142896 | 32 | MK416007 | Klebsiella phage ST405-OXA48phi1.2, complete genome | 24396-24427 | 7 | 0.781 |
NC_005126_5 | 5.14|2142865|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2142865-2142896 | 32 | MN166823 | Klebsiella phage ST512-KPC3phi13.5, complete genome | 2694-2725 | 7 | 0.781 |
NC_005126_5 | 5.17|2143045|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2143045-2143076 | 32 | NZ_CP043858 | Arcobacter cibarius strain H743 plasmid pACIB, complete sequence | 195225-195256 | 7 | 0.781 |
NC_005126_7 | 7.1|2395227|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2395227-2395258 | 32 | MN855953 | Bacteriophage sp. isolate 518, complete genome | 470-501 | 7 | 0.781 |
NC_005126_7 | 7.8|2395647|32|NC_005126|CRISPRCasFinder,CRT | 2395647-2395678 | 32 | NZ_AP023208 | Escherichia coli strain TUM18781 plasmid pMTY18781-3, complete sequence | 53325-53356 | 7 | 0.781 |
NC_005126_7 | 7.8|2395647|32|NC_005126|CRISPRCasFinder,CRT | 2395647-2395678 | 32 | KC814930 | Shigella phage SfIV, complete genome | 755-786 | 7 | 0.781 |
NC_005126_7 | 7.10|2395767|32|NC_005126|CRISPRCasFinder,CRT | 2395767-2395798 | 32 | NZ_AP023208 | Escherichia coli strain TUM18781 plasmid pMTY18781-3, complete sequence | 53325-53356 | 7 | 0.781 |
NC_005126_7 | 7.10|2395767|32|NC_005126|CRISPRCasFinder,CRT | 2395767-2395798 | 32 | KC814930 | Shigella phage SfIV, complete genome | 755-786 | 7 | 0.781 |
NC_005126_5 | 5.6|2142385|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2142385-2142416 | 32 | CP047390 | Agrobacterium sp. CGMCC 11546 plasmid pB | 45035-45066 | 8 | 0.75 |
NC_005126_7 | 7.9|2395707|32|NC_005126|CRISPRCasFinder,CRT | 2395707-2395738 | 32 | NC_031944 | Synechococcus phage S-WAM1 isolate 0810PA09, complete genome | 42818-42849 | 8 | 0.75 |
NC_005126_8 | 8.3|2475551|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2475551-2475582 | 32 | NZ_KJ776578 | Clostridium botulinum strain CDC3875 plasmid pCDC3875, complete sequence | 39235-39266 | 8 | 0.75 |
NC_005126_8 | 8.3|2475551|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2475551-2475582 | 32 | NZ_KJ776581 | Clostridium botulinum strain IFR_05/025 plasmid p05/025, complete sequence | 41634-41665 | 8 | 0.75 |
NC_005126_8 | 8.3|2475551|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2475551-2475582 | 32 | NZ_KJ776580 | Clostridium botulinum strain CDC5900 plasmid pCDC5900, complete sequence | 44046-44077 | 8 | 0.75 |
NC_005126_8 | 8.4|2475611|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2475611-2475642 | 32 | KX683428 | Mycobacterium phage TBond007, complete genome | 47301-47332 | 8 | 0.75 |
NC_005126_8 | 8.4|2475611|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2475611-2475642 | 32 | KR080206 | Mycobacterium phage ShedlockHolmes, complete genome | 47815-47846 | 8 | 0.75 |
NC_005126_8 | 8.4|2475611|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2475611-2475642 | 32 | NC_042325 | Mycobacterium virus Pixie, complete genome | 47302-47333 | 8 | 0.75 |
NC_005126_3 | 3.4|2127185|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2127185-2127216 | 32 | AP014297 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S28-C24, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 20375-20406 | 9 | 0.719 |
NC_005126_3 | 3.4|2127185|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2127185-2127216 | 32 | MF042360 | Pseudomonas phage Phabio, complete genome | 296620-296651 | 9 | 0.719 |
NC_005126_3 | 3.20|2128143|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2128143-2128174 | 32 | NZ_CP021643 | Campylobacter concisus strain P2CDO4 plasmid pICON, complete sequence | 4163-4194 | 9 | 0.719 |
NC_005126_3 | 3.22|2128263|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2128263-2128294 | 32 | NC_049850 | Burkholderia phage BcepSaruman, complete genome | 183974-184005 | 9 | 0.719 |
NC_005126_5 | 5.6|2142385|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2142385-2142416 | 32 | NZ_CP022605 | Ochrobactrum quorumnocens strain A44 plasmid unnamed1, complete sequence | 668051-668082 | 9 | 0.719 |
NC_005126_5 | 5.8|2142505|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2142505-2142536 | 32 | NZ_CP017256 | Clostridium taeniosporum strain 1/k plasmid pCt3, complete sequence | 74328-74359 | 9 | 0.719 |
NC_005126_5 | 5.8|2142505|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2142505-2142536 | 32 | KT895374 | Bacillus phage vB_BpuM-BpSp, complete genome | 2244-2275 | 9 | 0.719 |
NC_005126_5 | 5.17|2143045|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2143045-2143076 | 32 | NC_014628 | Paenibacillus polymyxa SC2 plasmid pSC2, complete sequence | 172506-172537 | 9 | 0.719 |
NC_005126_5 | 5.17|2143045|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2143045-2143076 | 32 | NZ_CP037428 | Myroides odoratimimus strain G13 plasmid pFM-G13, complete sequence | 6985-7016 | 9 | 0.719 |
NC_005126_3 | 3.5|2127245|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2127245-2127276 | 32 | NC_005010 | Enterococcus faecalis BFE 1071 plasmid pEF1071, complete sequence | 62-93 | 10 | 0.688 |
NC_005126_3 | 3.5|2127245|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2127245-2127276 | 32 | MN582070 | Myoviridae sp. ctThM1, complete genome | 81539-81570 | 10 | 0.688 |
NC_005126_3 | 3.16|2127903|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2127903-2127934 | 32 | LR778216 | Xylella phage Cota genome assembly, chromosome: 1 | 34855-34886 | 10 | 0.688 |
NC_005126_5 | 5.7|2142445|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2142445-2142476 | 32 | CP031731 | Stenotrophomonas rhizophila strain GA1 plasmid unnamed2, complete sequence | 71920-71951 | 11 | 0.656 |
NC_005126_8 | 8.4|2475611|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2475611-2475642 | 32 | CP053317 | Salmonella enterica subsp. salamae serovar 6,8:a:z52 strain 62-3163 plasmid unnamed, complete sequence | 37663-37694 | 11 | 0.656 |
1. spacer 7.6|2395527|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP027261 (Pectobacterium parmentieri strain IFB5427 plasmid pPAR01, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tgatgccgacgaacggcaacaatgccggtgat CRISPR spacer tgatgccgacgaacggcaacaatgccggtgat Protospacer ********************************
2. spacer 4.1|2133440|26|NC_005126|PILER-CR matches to LG146436 (KR 1020160044964-A/1: Bacteriophage PM-1 and vegetable soft rot controlling composition containing the same) position: , mismatch: 3, identity: 0.885
caacaaaaccaacatgtcctccacca CRISPR spacer caacaaaaccaacatgaccaccaccg Protospacer **************** ** *****.
3. spacer 4.1|2133440|26|NC_005126|PILER-CR matches to KF534715 (Pectobacterium phage PM1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.885
caacaaaaccaacatgtcctccacca CRISPR spacer caacaaaaccaacatgaccaccaccg Protospacer **************** ** *****.
4. spacer 4.1|2133440|26|NC_005126|PILER-CR matches to MN856004 (Myoviridae sp. isolate 289, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.885
caacaaaaccaacatgtcctccacca CRISPR spacer caacaaaaccaacatgaccgccaccc Protospacer **************** ** *****
5. spacer 4.1|2133440|26|NC_005126|PILER-CR matches to NC_019755 (Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.06, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
caacaaaaccaacatgtcctccacca CRISPR spacer tagcaaaaccaacttgtcctgcacca Protospacer .*.********** ****** *****
6. spacer 4.1|2133440|26|NC_005126|PILER-CR matches to MN855595 (Bacteriophage sp. isolate 204, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
caacaaaaccaacatgtcctccacca CRISPR spacer ctacaaaaccaacatgccccccaccc Protospacer * **************.**.*****
7. spacer 4.1|2133440|26|NC_005126|PILER-CR matches to KY087898 (Pectobacterium phage PP101, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
caacaaaaccaacatgtcctccacca CRISPR spacer cgacaaaaccaacatgaccaccaccg Protospacer *.************** ** *****.
8. spacer 5.8|2142505|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT786458 (Staphylococcus phage vB_SauH_SAP1, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
-aacatttaaaacattatttattgttactgttc CRISPR spacer taaca-ttaaaaaattatttattgttaatgtta Protospacer **** ****** ************** ****
9. spacer 5.8|2142505|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG557618 (Staphylococcus phage HSA30, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
-aacatttaaaacattatttattgttactgttc CRISPR spacer taaca-ttaaaaaattatttattgttaatgtta Protospacer **** ****** ************** ****
10. spacer 5.8|2142505|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LR215718 (Staphylococcus phage Stab20 genome assembly, chromosome: I) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
-aacatttaaaacattatttattgttactgttc CRISPR spacer taaca-ttaaaaaattatttattgttaatgtta Protospacer **** ****** ************** ****
11. spacer 5.8|2142505|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG721208 (Staphylococcus phage vB_SauM_LM12, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
-aacatttaaaacattatttattgttactgttc CRISPR spacer taaca-ttaaaaaattatttattgttaatgtta Protospacer **** ****** ************** ****
12. spacer 5.8|2142505|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KY779849 (Staphylococcus phage qdsa002, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
-aacatttaaaacattatttattgttactgttc CRISPR spacer taaca-ttaaaaaattatttattgttaatgtta Protospacer **** ****** ************** ****
13. spacer 5.8|2142505|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF001365 (Staphylococcus phage SA3, partial genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
-aacatttaaaacattatttattgttactgttc CRISPR spacer taaca-ttaaaaaattatttattgttaatgtta Protospacer **** ****** ************** ****
14. spacer 5.8|2142505|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH159197 (Staphylococcus phage VB_SavM_JYL01, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
-aacatttaaaacattatttattgttactgttc CRISPR spacer taaca-ttaaaaaattatttattgttaatgtta Protospacer **** ****** ************** ****
15. spacer 5.8|2142505|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN304941 (Staphylococcus phage vB_SauH_IME522, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
-aacatttaaaacattatttattgttactgttc CRISPR spacer taaca-ttaaaaaattatttattgttaatgtta Protospacer **** ****** ************** ****
16. spacer 5.8|2142505|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK250904 (Staphylococcus phage VB-SavM-JYL02, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
-aacatttaaaacattatttattgttactgttc CRISPR spacer taaca-ttaaaaaattatttattgttaatgtta Protospacer **** ****** ************** ****
17. spacer 5.8|2142505|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KM216423 (Staphylococcus phage P108, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
-aacatttaaaacattatttattgttactgttc CRISPR spacer taaca-ttaaaaaattatttattgttaatgtta Protospacer **** ****** ************** ****
18. spacer 5.8|2142505|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019448 (Staphylococcus phage GH15, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
-aacatttaaaacattatttattgttactgttc CRISPR spacer taaca-ttaaaaaattatttattgttaatgtta Protospacer **** ****** ************** ****
19. spacer 3.5|2127245|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP014378 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S43-C22, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
tttccgctgtacgttgtactgcactatttaat CRISPR spacer tttctgctggacgttgtactgcactattaaga Protospacer ****.**** ****************** *.
20. spacer 3.16|2127903|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP039965 (Pseudorhodobacter sp. S12M18 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
taacac-atcagcaagctgttgctgtggcaagt CRISPR spacer -cacacaatcagcaagctgttgctgtgtcatgc Protospacer **** ******************** ** *.
21. spacer 5.8|2142505|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032091 (Pseudoalteromonas donghaensis strain HJ51 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
aacatttaaaacattatttattgttactgttc-- CRISPR spacer aacatttaaaacattatttagagtt--tgctgaa Protospacer ******************** *** **.*
22. spacer 5.17|2143045|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_017078 (Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
tcctatttttaaataaatcatacacct-atgca CRISPR spacer ttatatttttcaataaatcattcacctcaagc- Protospacer *. ******* ********** ***** * **
23. spacer 8.3|2475551|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP019515 (Halomonas sulfidaeris ATCC BAA-803 plasmid pBAA-803-A DNA, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
tattaaaggggatcaaaatgaatacatcaaca-- CRISPR spacer gattaaaggggatcaaaatgact--atcaagcgt Protospacer ******************** * *****
24. spacer 8.3|2475551|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP034667 (Proteus vulgaris strain PvSC3 plasmid pPvSC3, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
tattaaaggggatcaaaatgaatacatcaaca CRISPR spacer tattaaaggtgatcaaaatgactatgtccaaa Protospacer ********* *********** **..** * *
25. spacer 3.2|2127065|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045273 (Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301A, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
atcaagtagtgcttacaaaggagaagaatgta CRISPR spacer atatataagtaattacaaaggagaagaatgtt Protospacer ** * ***. *******************
26. spacer 3.4|2127185|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP014008 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C62A-MedDCM-OCT-S41-C20, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
taaacgataaccccatgcttctaatgattgag CRISPR spacer taaacgatgaccccatgattctaaactttgcc Protospacer ********.******** ****** ***
27. spacer 3.4|2127185|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP014009 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C62A-MedDCM-OCT-S45-C17, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
taaacgataaccccatgcttctaatgattgag CRISPR spacer taaacgatgaccccatgattctaaactttgcc Protospacer ********.******** ****** ***
28. spacer 3.4|2127185|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693993 (Marine virus AFVG_250M418, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
taaacgataaccccatgcttctaatgattgag CRISPR spacer tagtctataaccccaggcttctaatgaatgtc Protospacer **. * ********* *********** **
29. spacer 3.4|2127185|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_047711 (Uncultured phage_MedDCM-OCT-S28-C10 DNA, complete genome, group G8, isolate: uvMED-CGR-C62A-MedDCM-OCT-S28-C10) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
taaacgataaccccatgcttctaatgattgag CRISPR spacer taaacgatgaccccatgattctaaactttgcc Protospacer ********.******** ****** ***
30. spacer 3.4|2127185|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG592629 (Vibrio phage 1.264.O._10N.286.51.F2, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
taaacgataaccccatgcttctaatgattgag CRISPR spacer taacctataaccccatgcttctacgctatgag Protospacer *** * ***************** ****
31. spacer 3.9|2127485|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF063068 (Pseudomonas phage Noxifer, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
--aatcaaactccagtcagtatcgctatccgtac CRISPR spacer ccgatcga--tccagacagtctcgctatccgtat Protospacer .***.* ***** **** ************.
32. spacer 3.16|2127903|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK883717 (Eschericha phage vB_EcoM-ECP26, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
taacacatcagcaagctgttgctgtggcaagt---- CRISPR spacer taacgcttcagcaagctgttgct----taagttctt Protospacer ****.* **************** .****
33. spacer 3.16|2127903|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK883718 (Escherichia phage vB_EcoM-ECP32, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
taacacatcagcaagctgttgctgtggcaagt---- CRISPR spacer taacgcctcagcaagctgttgct----taagttctt Protospacer ****.* **************** .****
34. spacer 3.20|2128143|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to FN997652 (Streptococcus phage phi-SsUD.1 complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
aatgaaattaatcgtttctcttacaatatttc CRISPR spacer cttgaaattaatcgttcatcttacaatagctg Protospacer **************. ********** .*
35. spacer 5.6|2142385|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_023688 (Aeromonas phage PX29, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
tggaatg----cgacttcatcaccattttcaatcat CRISPR spacer ----atgctatcgagttcatcaccactttcaatctt Protospacer *** *** **********.******** *
36. spacer 5.6|2142385|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH791401 (UNVERIFIED: Aeromonas phage AsFcp_2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
tggaatg----cgacttcatcaccattttcaatcat CRISPR spacer ----atgctatcgagttcatcaccactttcaatctt Protospacer *** *** **********.******** *
37. spacer 5.14|2142865|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053366 (Klebsiella pneumoniae strain BA2275 plasmid p2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
ggtctcgatgtgctggtgggtatcccggctga CRISPR spacer ggcactgatgtgctggttggtatcccggcagg Protospacer **. ..*********** *********** *.
38. spacer 5.14|2142865|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK433579 (Klebsiella phage ST11-OXA48phi15.1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
ggtctcgatgtgctggtgggtatcccggctga CRISPR spacer ggcactgatgtgctggttggtatcccggcagg Protospacer **. ..*********** *********** *.
39. spacer 5.14|2142865|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK422455 (Klebsiella phage ST340-VIM1phi10.1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
ggtctcgatgtgctggtgggtatcccggctga CRISPR spacer ggcactgatgtgctggttggtatcccggcagg Protospacer **. ..*********** *********** *.
40. spacer 5.14|2142865|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448230 (Klebsiella phage ST16-OXA48phi5.2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
ggtctcgatgtgctggtgggtatcccggctga CRISPR spacer ggcactgatgtgctggttggtatccccgctgg Protospacer **. ..*********** ******** ****.
41. spacer 5.14|2142865|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK416019 (Klebsiella phage ST11-VIM1phi8.3, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
ggtctcgatgtgctggtgggtatcccggctga CRISPR spacer ggcactgatgtgctggttggtatcccggcagg Protospacer **. ..*********** *********** *.
42. spacer 5.14|2142865|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK416007 (Klebsiella phage ST405-OXA48phi1.2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
ggtctcgatgtgctggtgggtatcccggctga CRISPR spacer ggcactgatgtgctggttggtatcccggcagg Protospacer **. ..*********** *********** *.
43. spacer 5.14|2142865|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN166823 (Klebsiella phage ST512-KPC3phi13.5, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
ggtctcgatgtgctggtgggtatcccggctga CRISPR spacer ggcactgatgtgctggttggtatcccggcagg Protospacer **. ..*********** *********** *.
44. spacer 5.17|2143045|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP043858 (Arcobacter cibarius strain H743 plasmid pACIB, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
tcctat-ttttaaataaatcatacacctatgca CRISPR spacer -catatatttttaataaattatacacctatagt Protospacer * *** **** *******.**********.
45. spacer 7.1|2395227|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN855953 (Bacteriophage sp. isolate 518, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
acagccg-gaaaattaatggcaaagcattaagt CRISPR spacer -gagctatgaaaataaatggcaaagcagtaaat Protospacer ***.. ****** ************ ***.*
46. spacer 7.8|2395647|32|NC_005126|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP023208 (Escherichia coli strain TUM18781 plasmid pMTY18781-3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
aacttctcccgcacacaaagggagagtgggcg CRISPR spacer agctgttgccgcacaccaagggtgagtgggca Protospacer *.** .* ******** ***** ********.
47. spacer 7.8|2395647|32|NC_005126|CRISPRCasFinder,CRT matches to KC814930 (Shigella phage SfIV, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
aacttctcccgcacacaaagggagagtgggcg CRISPR spacer agctgttgccgcacaccaagggggagtgggca Protospacer *.** .* ******** *****.********.
48. spacer 7.10|2395767|32|NC_005126|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP023208 (Escherichia coli strain TUM18781 plasmid pMTY18781-3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
aacttctcccgcacacaaagggagagtgggcg CRISPR spacer agctgttgccgcacaccaagggtgagtgggca Protospacer *.** .* ******** ***** ********.
49. spacer 7.10|2395767|32|NC_005126|CRISPRCasFinder,CRT matches to KC814930 (Shigella phage SfIV, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
aacttctcccgcacacaaagggagagtgggcg CRISPR spacer agctgttgccgcacaccaagggggagtgggca Protospacer *.** .* ******** *****.********.
50. spacer 5.6|2142385|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP047390 (Agrobacterium sp. CGMCC 11546 plasmid pB) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tggaatgcgacttcatcaccattttcaatcat CRISPR spacer ttgccttcgaattcatcaccatgttcaatccg Protospacer * * * *** *********** *******
51. spacer 7.9|2395707|32|NC_005126|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_031944 (Synechococcus phage S-WAM1 isolate 0810PA09, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tagaaatccttgaatatagtcagacccgtaat CRISPR spacer tagtaatccttgaagatagtcagactcaatcc Protospacer *** ********** **********.*. .
52. spacer 8.3|2475551|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KJ776578 (Clostridium botulinum strain CDC3875 plasmid pCDC3875, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tattaaaggggatcaaaatgaatacatcaaca CRISPR spacer tattaaaggagatcaatatgaataaagttgta Protospacer *********.****** ******* * . ..*
53. spacer 8.3|2475551|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KJ776581 (Clostridium botulinum strain IFR_05/025 plasmid p05/025, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tattaaaggggatcaaaatgaatacatcaaca CRISPR spacer tattaaaggagatcaatatgaataaagttgta Protospacer *********.****** ******* * . ..*
54. spacer 8.3|2475551|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KJ776580 (Clostridium botulinum strain CDC5900 plasmid pCDC5900, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tattaaaggggatcaaaatgaatacatcaaca CRISPR spacer tattaaaggagatcaatatgaataaagttgta Protospacer *********.****** ******* * . ..*
55. spacer 8.4|2475611|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX683428 (Mycobacterium phage TBond007, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
cttttga---agggctaagtgttgccgggccgata CRISPR spacer ---tcgacctggggctgagtgtcgccgggccgatc Protospacer *.** .*****.*****.***********
56. spacer 8.4|2475611|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KR080206 (Mycobacterium phage ShedlockHolmes, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
cttttga---agggctaagtgttgccgggccgata CRISPR spacer ---tcgacctggggctgagtgtcgccgggccgatc Protospacer *.** .*****.*****.***********
57. spacer 8.4|2475611|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_042325 (Mycobacterium virus Pixie, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
cttttga---agggctaagtgttgccgggccgata CRISPR spacer ---tcgacctggggctgagtgtcgccgggccgatc Protospacer *.** .*****.*****.***********
58. spacer 3.4|2127185|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP014297 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S28-C24, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
taaacgataaccccatgcttctaatgattgag CRISPR spacer aagtctgtaaccccacgcttctaatgaatgtc Protospacer *. * .********.*********** **
59. spacer 3.4|2127185|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF042360 (Pseudomonas phage Phabio, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
taaacgataaccccatgcttctaatgattgag CRISPR spacer tgcacgataacgccatgcttctactgtggtac Protospacer *. ******** *********** ** *
60. spacer 3.20|2128143|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021643 (Campylobacter concisus strain P2CDO4 plasmid pICON, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aatgaaattaatcgtttctcttacaatatttc CRISPR spacer aaaacttctaatcatttctctaacaatatttt Protospacer ** . .*****.******* *********.
61. spacer 3.22|2128263|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_049850 (Burkholderia phage BcepSaruman, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tcttggcccacatgcgccacaacgtgggatgg CRISPR spacer gtaacggctacatgcgccagaacttgggatgg Protospacer . * *.********** *** ********
62. spacer 5.6|2142385|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022605 (Ochrobactrum quorumnocens strain A44 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tggaatgcgacttcatcaccattttcaatcat CRISPR spacer gcgtgagcgacttcatcgccattgtcaatcca Protospacer * . ***********.***** ******
63. spacer 5.8|2142505|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017256 (Clostridium taeniosporum strain 1/k plasmid pCt3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aacatttaaaacattatttattgttactgttc CRISPR spacer tttatttataacattttttattgttaattgtg Protospacer .***** ****** ********** * *
64. spacer 5.8|2142505|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KT895374 (Bacillus phage vB_BpuM-BpSp, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aacatttaaaacattatttattgttactgttc CRISPR spacer tatattaaaaacattatttatttttatattag Protospacer *.*** *************** ***. *
65. spacer 5.17|2143045|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_014628 (Paenibacillus polymyxa SC2 plasmid pSC2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tcctatttttaaataaatcatacacctatgca CRISPR spacer tcctctttttaaataattcatacatgatcaga Protospacer **** *********** *******. .. *
66. spacer 5.17|2143045|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP037428 (Myroides odoratimimus strain G13 plasmid pFM-G13, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tcctatttttaaataaatcatacacctatgca CRISPR spacer ctgtatttttaaataaatcattcaacttcata Protospacer .. ****************** ** ** ...*
67. spacer 3.5|2127245|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_005010 (Enterococcus faecalis BFE 1071 plasmid pEF1071, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tttccgctgtacgttgtactgcactatttaat CRISPR spacer caatgtatatacattgtactgaactatttaat Protospacer . . *.***.******** **********
68. spacer 3.5|2127245|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN582070 (Myoviridae sp. ctThM1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tttccgctgtacgttgtactgcactatttaat CRISPR spacer tcgtgtgagtatgttgtactgcactattaaaa Protospacer *. . ***.**************** **
69. spacer 3.16|2127903|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LR778216 (Xylella phage Cota genome assembly, chromosome: 1) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
taacacatcagcaagctgttgctgtggcaagt CRISPR spacer agctgtatcagcaggctgttgctgaggcaggc Protospacer . ...*******.********** ****.*.
70. spacer 5.7|2142445|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP031731 (Stenotrophomonas rhizophila strain GA1 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
tttaccgaaatcttttagagcgctagttgttt CRISPR spacer cagaccgcaatcttttagagcgatagagcgcg Protospacer . **** ************** *** .
71. spacer 8.4|2475611|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP053317 (Salmonella enterica subsp. salamae serovar 6,8:a:z52 strain 62-3163 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
cttttgaagggctaagtgttgccgggccgata CRISPR spacer gagatgaagggctaagtgtatccgggctatct Protospacer *************** ******.. .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
10250 : 44489
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_005126|10250:44489|DBSCAN-SWA TTCAAGTCACATTCAATTGAGTTTTAGTTTTTTCTTTGGGATGCGGCTTAACACTTATTACTTCACCAGGTTTGGAAATAAAGCGGACAAACGTTTCATGGCTGACGAAAGTTGCACCACAATTGATGTTTTGACATTGATTATAACGTTCTTTTGTATGGCAGGAATGCTCAAAGCTGCTGCGTGCATGAGCCGCTTTACCACAAAGAGGACACTTGATCATATTTTCTTACCCTTAACTAAAACATGAACTCTCATAATGTGAACAATATAGCAATGAGATCTCATTTGAAGAACATTTATTTCATATCGAGATCATCAATTTTTAATTCCAGAGTCAGTGCTGTTGTAAAACCACCATCAGATCCATTCACCGTGTGAGTGACTGTCGTTAATGTCCATTCGGCAGCATCTATTTCTGGTTTAAAGCCGGTAACTTTGATTGGTATTTCAGGGTAGAGATCTGCACGCCCCTGAGCCAGTTGAATCGAAAACGTCGCTGCCCCACGTTGTATTTTCTCCCAAGCAACTTTGGCAGCACGTTTAGCGCTGGCTTCATCAGCATAAATACGGGAAAGTTCCAATACGTTATCTTTGCTACCTACTAAATAAGAGGTTAATTTATCAGCATTTTTCTGACTTTTTCGCTCAACGGTTAAGGTATGTTTTTTCTCCGGTTTACGGACATCCAACCAGTTTGCTACCACGCCGGTATAAGCCTCACGATCGGACAGCGTAAAATTATGATTGTCACCAGACCGACGTGTAATCACTAATCCAGGGATAACCGCACCACTGGCTGTTTTATTCTGTCCTTGCCGAATAAATATCAACTTACCATTTTTTACTGAAGCAATTGCTCCTTCCTGCCTTGCCAAGCGCGTAAGAAAACTACCATCTGACTCATTCGTCTGATCAATATGGTTAATAAATATCTTCGCAATATCCTGATGCAAATCGGCGGTAAGGTTATTTCTCGCCGCGATAGTATGGACAATATCACCTATCGTTTTCTTATGATAAGACTCTTCACGTCTCATATTGAGAGATTCACGGAAATCAGCACTACGGGCACGAATTGTTAATTTATCCGGCGCTCCACTGTGACCAATTTCATCCACAGTAAAACGCCCTTTACTAATCAGTGGCTGATCACGCCATCCTAACGCCAATGAAATTACATTACCTCTGGAAGGTAGCACCAAACTTCCATCTGCATCATCCAGTTCAATATCAAGCTGGTCAGCTTCAAAGCCACGATTATCGGTCATTGTGAGTGACATCAGGCGCGATTGAATGCGCCCGCTGATATCTTTATTGTCAATTTCCAAAAGAAATGCCGGTGCACTGCCTTTTTCGGAACCTCTGCCAAATTCAGATGTCATGACAATACCTCTCTGACTCTATCTGACAAATTGTCTGTAAGCATAGAGAATTGTTCCTGAAGATCACCGAACATTTCACCTAGAGAACTATCCACTCGCCGTAATGTCAATGTGAAATCAATTTTGCGGGCAGAACCATTCGACATAAATTCAGTTTTCGTCTGGTCAATACTCTCAATGACAAACATACCGTAAACCGTGCCACTGCCATCTATAAAGGACCAAGCTTTACCGCTATCAGCCATCACTTGTAATACCGTCAATGATAAACGACCACCGGTAATTTCTGGATATAACGAACCGGAAAGTGTCATTGTGTCGTTACCCGGCCCCAGAAATTGCCAAGCAGGCCGTATCCCGATACGGCTGTTAAAAGCATGCCGCCATGACTGCTGATGTTGCATACTCTGGTATGGTGTGGTCTTCAACATAAAAACAAATAAACCCAGTGCAGCCATCATAATTAGAATTCTCCTCTATCAGAGAATGAACTGCGTAAACGCGCCTGCTGTTTACGTTCCCGATCATCCAATTCGCGCCTAACCGCTGCTGCAATATCCTGCGCAGATTGCCCCGGTGCACCATAGATATTTATATGATAGACCGGTGATTCACTGCGATACTCTACCATCTGCCGTTTGTCTGCTTTCTTTTCCTGAATCTGAGGATAAGCATGAACCGGTAAGCTCTGAACATGCAATGGTGCGGTTCTGGCTGCGGCAGAAGGTGCCATTACGCTCAAAGAAAATGCCGCAGCGGCAGCAAGTTTGGCAGTCTGTCGTCGGCTAATAACATTGACAGGGCCAGTGACAATCTCTGGTCCATATTCACCCACAATACCAAATCGGCCAGCCGGAATAATGCCCCCTTTGTCATGCTTGGGCAGAACCGAACTAACATTAGGACTCACATTATTACTGGCGTCTTTTGAAATATCTTCCTTTGACCGCATCCAGTCAGGGAGATACTCAGACAATGAAGTCAGTTTATTTTTCAGGGCTTCCCATTTTTCATTAATCCCCTCCAATAAACTGTTAACTATCGCTGTGCCAACCTCTTTAAATTTACTGGGCAGATTCATTACGTCAGTAATAATTTCATTCCATTTATCCGAAATCGATATTTTAATATTCTCCCAGATATCCAACGTGTTCTGCTTAACTAATTCCCAAGCATTACTGATATTAGTTTTAATACTTTCCCAGGTTTGCAGAACACTCTGTTTAATGGATTCCCATTTCTCACTTAGGCTAATTTTAATATTTTCCCAAAGCTGAGAAATTTTCGGCCCCAATGTTTCCCAGTTTTGCCAAATATAAACAGCAGCCATAGCAATGACACCAATAATGGCGAGGATTGGGTTAGCCATCATCAAACGACCAACGATCATCATGGTGCTACCCAACATTTTCAGAGCATTCCCGACTAATCCGAGCGCCCTCACACCAGTACTACCAAAGAAAGTAAGACTATATTTCGCTACAGCTAATGGAAGCAATATCGAAGCGATCGCCTGTGCCAATGCGCCAAACACAGTTAATATGCCTCCGACCACCACCGTAATAGTCGCAAGCGTTGCAGCCAAGCGTGGGTTGGCTTCCATCCATTCACTGACTTTATTGACTACATTTGTTACTTGCTGAGTGACTTCTCTTGCAGGACCTTCTACGCCAGAAAACATCTGAACGCCCAGATTACTCCAAGCGGCATTGAGTTTTTGGATATCACCGGTGAGATTATTCGTCACTACAGATGCAACTTTTTGGGATTCGCCTTGAACACGTTTTAGTTCAGCGATAAAAGTTTGCAATCCTCCCTGCCCTGCCTGATTTACCAATACATCCAAAGCAGGAGCAGCATTTTCACCACCAATTGCGGTGAAATAACTCGTACGTTGTTTACCGCTCATTGAACGGGTTTTATCATCTAGTTCAACGAGAATATCAGGTAATTGCCGTAAATTACCTTTAGCATCACGAGTTTTAATATCTAGTTGTTTCAATACGGCAGCAGCAGCTTTAGGCGGTTCAGCCAACCGACTTAGTACATTGCTTAAAGCCTCTCCAGCTTCACTTCCCTTAATATTGGCATCACTTAACTTTCTTGTAGCAGCCGCAACGGTTTCAATATCAATCCCCAAAGAAGTGGCCGCTGGAGCGACAGATTTCATGGTGTCACCCAATCCCGCCAACGTTGTTTTTGAGCCAATAAGCGTTGCCGTCAAAACATCACTAACATGCCCCATCTCTTCGGATTGTAATTTAAACCCTTCCAGTACATTAGTACTAATATCAACCACATTGGCGAAATCTGTACCGCTTGCCTGAGACATTAATACCGCACCAGGCATCACATTCTTTATCTGGTCAGGAGAATACCCCTTGGAGGCATACAGGCTCTGTCCCTGTGCAATCTGACTGGCCGGAATCCCTGTACTTTTGCTCAACTCACGACTTTGGTTAAGCAACATGGCGTATTCAGGAGAATTTTTTTCAATATTGGTTTGTGCCTGAATTTTAGACATTTGAACATTAAGATCATAACCGGGCATCAGAAAGTTTTTACTGGTTGTCAGTATCTTACTACCGGCTGATTTTGCACTAGCACCATATTGACTAACGCGGTCACGAAGCTCTTTGATTTTGCTATAACGACCTTCACCGCGATTTTCTTCCTTTTTGTCACTGGTATGCGCAGTTTCCTGCGCATATTCAGGAGCAGAATAAGATTTAATTGCTTCATAAGTCTGATTTAATCGCTTAAATTCATCACGATTTTGCCGGAGAGAATCTGCCAACCTTTTATTGTTTCGCTGGGCAGATTTCAAGGCGCTGGTCAGCTTATTAACGGACTGTATTACCAATTTAAGCTGTGACTGTGTATTACTCATTTTCTGCACCACTTCGTAAGATGGCCCGATGTCGCCAGTCCAGTAATTCCGGTAGTGACATTTCATCTGTCACTGCCGGAGACCAGTGGAAAACGGTGGCAATATCTGCCACCAATTCATCTACGGTTAGTCGGTCTGGAAACCGGACTTCGCCGACTTCGGTAACAAAAAATTGACCACCTCAACACTGAGATTAATCAGATCGCCGGGTGTCATTGACAACAGGTCGCTTTTAGTGAGCGCTGGTGTGGTAACACGTGGCAAAACCAATATCATTGAATCCACATCCATCTCCAGCAAAGCCTGTAGCCGAGCACCACGCAGCGCGCCACTGTTCGGTTTGCGCACCACCACTTCAGTGATGTTGCTACTACCACGTGCAAGCGGTTCTTCTAATACGATTGTGCGCTGCTCGTCGTTTTGAGTAATTAGTGTTTCTGTCATGGTTCAACCTTGTTTATCCGATTAGATTAAAGACCCATAGCGCGACGGTGATCTGCCAAGCGATCCTCACCATTAACGACTTCAACCATGTTAACGGTATCCACTTCGATCAGAACTTCACCATCCCATGTCAATTTGAAATAGGTGTTTTTAGCGCTGATTTTGGTCTGAGTATTATCTCCCTGCTTATAAGCACCGTGGTCAAACTCATGGAAACGGCCACGCATCACGATTTCAACAGCAATCACATCGCTGGTATCATCGCGCTGGCAGGAGCCCGC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39 | Salmonella_phage(33.33%) | tRNA,tail,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
310051 : 355888
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_005126|310051:355888|DBSCAN-SWA 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37 | Planktothrix_phage(40.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
367329 : 431253
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_005126|367329:431253|DBSCAN-SWA TATGAAAATATTCATTACCGATGAACAAAAAGCCGAACTTGAACATCTCCATCACACCTGCCGTGATAAGAGGGAGTGTGATCGCATCAAAGCGGTCCTGCTGGCCTCTGAAGGCTGGAGTTCAGTGATGATCGCTCAGGCCCTGCGTCTTCATGAAATGACCGTTAACCGTCATATCAGCGATTACCTTAATCAAGGTAAACTTAAATCTGATAATGGGGGGTCTGATAGTTTGCTTTCTCAAGAACAAACTGATTTTTTAATCAATCACTTATCTCAACATCTTTTCCATCACACCCATGAAATCGTGGCCTATGTTGCTCAGCTCTGGAATATTACCTTTAGCATTCCCGGCATGAATAAATGGCTACACCGTCAGGGTTTTTCTTATAAAAAACCTTGTGGCGTCCCTCATAAATTCGACGCAGAAAAACAGCGACAATTTATTGAATATTATGAGAATCTTAAAGTCACAGCGAAAGACGAACCCATCCTTTTTCTTGATGCTGTTCACCCGACTCAAGGCACCAAACTCGGTTATGGCTGGATGCGAAAAGGCGAGAAAAAAACAGTAAAAACAACAGGAAGCCGGACTCGCCTGAATATATTGGGCGCGCTCAACCTGAATGCCATTGGTCGTACGGTGTTCCAGGAATATCAAACCATCAATGACTACAACATTTGCTGTTTTTTCAATGAAATAAGAAAGTCTTATCCTGACTATCATCAAAAAATTCATCTTATTGTGGATGGGGCGGGTTACAACAAAGCTCATCTTGTTAAGGAGTGGGCTTATGTTAGCAATATTGAGTTACATTACCTTCCTCCCTATAGCCCAAATTTAAACCCAATAGAGCGATTATGGAAGGTCATGAATGAACAGGTTCGAAATAACCGTTATTTTGCGGATAAACATGAATTTCGAGACAACGTCTTCAAATTTTTCACCACAACGCTACCGGATATAGCGGACTCGCTGATGTCTAGAATTAACGACCATTTTCAGGTGCTAAAAACTGCATCTTGAAGTTTCTTGGGTATATATTTACTATTAATATTATATTTTTATGTATTATTGTTTTTTATATTATTATTTATTTTATATTTTTTTAATTTTAAATTATATATTTAATATATAAGTCCAACCGTGAAAAATATTTATTTTAAGCATGGAAATAACAAAGCCGGAAGATCACGGGGATCTTTCCGGCTTTTTACTATTAGCTTAGGGTAATTTTATTTTCCCTTTTTTGACATTAGCTTTAATGTCGTACTTAAAATCTACACAATAGTGATTCAAGACTTCATCTAATTTAATTAGCTTTATTCTTTTGATATTTTCTTTAATTAATCTGTTAGCTACTTTTTCTGAAATAAAAATAAATCCTGCTAATAAAGTAGTCCGTATTGAAAAAATATCATAATTTAATGATTCATTATGAAAAGATAATTTATGAGGAATTAAATTTCCATATTTATCTTTTTCCAATATTGAATATTTTTCATTTAGAAATAACTCTTTGTCAGTAAAAAAAAGATAATTTAATGAGTTATTGATAGTTTTTCCATCTTTAATAGATGTCGCAATTAATTTTTTTAAAACATGATCACTTAATTTAAACTCATTGATAATATCGAAAAATCTATCAGATAGGATATGAGCCATATTGTGTTGATAATAATTAAACCACAATTTCCCAATATTTTTATTACATAACAAATATAAAGTATTAGGGCATTCCTTATCTAATAGATAATAAGGTATATCATGCCTGGAGCCTTCATAATCCCATTTTTCATTAATTTGATTCTCGGTATCTACTATAGCATGAAGATATCTTGGCATTAGTGAAGAATTATAATCGTTCATTAATACATAATAATTCATTAATTTACTCTCCCACATTTGGTTGTAGATACTTGACCAGACCATATTTTATTTTTCATATCCATCTGATTATTTTTTTAAAATCATATTTTCTTCATGTGGATGAAAAGCATCATTAAGAATCATTCCAATCATATTGTCCTGCTCATGGATAAAGAAAATTTCATTTTCTAAGAAATATAACCTTGACAATAAACTGGATTTTTTTGAGACGGAATTAAACCATTGGATTCATTCTCTTATAAATATACTATCGATAAGCTCCAGTCGGCACTGGCATACTGTGGGTATGCGCCACGGTAGATCATTAATCAGGGCAGAAGATCTGTAAGATCTTCTGCCCTACTTGAATTAACCTAATCTAATAGGCTCCTGAAGGTTATTTGAAAAATACTGACTTTTTATAAATGATATCTGTATGTTGTTTTCATTTTTCTTTAATAAGATCAGATAATTTCCTTTTTCTAAAGATATCTTCTTTCCTGAAATATATTCTGAATCATCAGGTTCTAAATCTCCTCCTGTGGTATCTTCCCCGGCACCAATGAATATTTTTCCCGATGGTGACTTTATGTTCAAACTAATATCTGGCTGTTCAATATTATCAATAATTTCAATTACATAATCGCCATCATCTCTTAAGCCAAAAAAAGCAATATTGCCTTCATTTACTTCTTTTAATTCATCGTCTGGAATACTCCACCAATCAGGAGTATCTGTTATTCTGTGTTTTATTGCTTGTAAATCAAATATAGCTAAAGTTGCTGTATCCGTTGTGAAAAAAAAGAATCGTTCATTGAAATCATCCTCAAATGAATATTATTTCACTAATTTTATCGCCAGCTTTTAATCCTGCTTTCCTGCCAGAATTTTTATCGATTAAAATTCGATTTATATAAATAAGATTCCCAAATAGCGCTACATCTTATACTACTCATAATTCTATGTATAACAATGGGTTGAAGAAGGTCATGTGTAGCAGAATTATGAAACGTTATTTATTCAGCCAAGATAGCCCTAACTCATTATCTTGGCTGACTTTTAGATATTTATATTCCTAAACTATAAATATCATTTGCTTCTTTATCCGCTTCCTTATCCATTTCTACGCTACCTAAAGCCCCCAAGTCTAGGCTATAAATAATATCACTTTCCTTATCTTTTTCTACATATATAAAGTAACCAAGATCACCATCTTGACCGATTAAAAAATAATTTGGTTTAGCCTCTTGAATGTTATATGTTTTATTTCTTTTAATAACATATTCACAATTATAAACATATATATTTTCTTGATCTTTTCCGGTTATTTCAATATAAGGTTCATTTTGAATTTTCTCGGATAAAAACTTTCTATAAAAATTAGGTAATTTAATATTCAATTCTTTTTCAATAGAATTTAATTTCTCTAAAATATCTTCTTTCTTCATGAAATTTTCCTCTTAATAAATCTAGATATCAAAGAATGGATTGTTTTTATTAGCGCCTCTAAGCTTATCAAAATATTTATAAGCATCGCCAAGGGCTTTTCTTGCTTGAGCTTTAGGTACGCCAGCATCAATCATCTCCCTATAACTTGTATGAAATTCCTCTTTCCTCATATATCTCTCTTTTTATCTTTTGTGCTGCGCTGATTTGAGCATGAGGCATCCTAGAAGTTGAATGTAATAATGTAGCGGGCGCTGATAAGTGGTTTTGCTGGTTAAGGGGAGAGCATGAGATGACAATAGCCATTGAACATTTGCAGGACATTCAGTTAACTCACCTTGAAGCGCTGGCTTTGGCCCAACTGGTCAAGCGGCTGAACTGGGCGGAGATACGCGCCTGTGCCGTGAATGACGAGGAGGCGTATCAGATTAAGGATGCCCTCGGTAAGCTTCAATCTGCTCTGGCTTACCGAGGGTATGCGCCACGGTAAATCAATAAGAACATCGGAAGATCTAGTGATTGTGAACTGCTTCTCTAAATCTAGTCATTAAATGTTGAATCTAGCTTTTGAGGGCAGTTCATCTATAATTTTATTAACTATTCTTCAAAAGAATAGGATTGAAAATAACTAATGTCTTTTTATCTTTTTTTATACCGCACGGCATAACTCCTTTTTTAAATATAGAAAATATTTCTTCTAATTTAGAGTCTTGATTAAAAGAAAATAAATATCGATAAATGCTTATCATATTTAACATGTAATTACATTCGTCATTTACTTCATTTAGAAAGTTATCGTATTCTATGTTATCAACTAACCCTTGTTTCTTTCTTGTAAGATATAGTTTTCTTTTTCTAATGTTTTCTTTAACTTGATCCTGGGTAGATATTTTTATTCTGTCAAGGATATCCTTTTCTGCTTTTTTATAATCCTCATGAAGATAAAACTCGGATACCAGATCAGAAAAAAAATCACTCCAAACCATATAGTTACATGGTATGTCTTGATCGAAAAGAAGCTTTAATGCCATATCTTTATTATCAATAATTTCATATTCATTAAATTCTCCAATAGAACCGGATAAAAAATACGAACTTTTAAAAAATTCAACCGGTTCCATATGAAAACTTATTGTCTCACCCATATTGAATTATCCTACAGTTTTACTCCAGAGATCAAAGACGCTTTGTCTGCCTGTTTAATTTACGTATTTCCCCTGAATATCAGTGTATACATCTCTTTGGATTTAATAATATTGCCATTATCCATATTTTTTTAGCTATATTTTGTATGTGAGTCACTTTTTCGATATGGTATCAGTTGATTGATTTAAATTTATTTTATCCAGAGCATTTCTTATTACATCATGATTACCTTGATGCCTTGCCATTGCACTAACCACACGGCGTTGGCGTGGCATGGGTATTCACCCACGGTAAGAAAGAAGCCAGCCGGAAGTGATTCCGGCTTTTTGTTGTTTCAGAGAAAAAACAGAATAAAATAGCAAAAATATATCTTATGTATATATTTATCGTTAATATTATATTTTTCTGTATTATCCCTTTGTTTATCTTATTATTTATTTTATATTTTTGCGATTTTAAGCTATATATTTAATATATAAGTCCAACCCTGTAAGATATTTATTTTAAGCATAAAAATAACAAAGCCGAAAGATCACGG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52 | Burkholderia_phage(10.0%) | plate,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1054824 : 1065802
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_005126|1054824:1065802|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_005126|1054824:1065802|1058314_1059037_-|WP_011145283.1|DBSCAN-SWA MKDNTMSFSVNKDLDVHSKSFDAFISYMENSNDFWAIKDREHRFVYANDTMLYYSGLPKGFSIEGRLDGECPAPWSEFENIIQASCDVVMTSQKTIPVLNTLTYGGKQKMIQPFLTNVTPLMKDGECIGIVGHGKKLEIYSMYHFENNIHPESLTFGKPTDLFTDREFDIVFFALQSLSAKDIARKLGITYRTVQSRLQFIYQKIGINSLSQLKEYCRGKGYDNYAPTRFINPNPYITLA >NC_005126|1054824:1065802|1063312_1064035_-|WP_011145288.1|DBSCAN-SWA MKDNTMSFSVNKDLDVHSKSFDAFISYMENCNEFWYIKDKESRFIYMNDYGLHHSGLPKGFNVEGKLDSECPVYWSEIADIIQSNDRRVMEEKKVIPTLITFMYGGRDKIIQPFMADVTPLIKDGESIGVVGRAKKLEIFSMYHMEINKPPESLSFGNPTEIFTDREFDIVFFALQSLSAKDIVRKLSITYRTVQSKLQFIYQKIGINSLSQLKEYCRDKGYDNYAPTRFINTNPYIPLA >NC_005126|1054824:1065802|1056028_1057222_+|WP_011145281.1|DBSCAN-SWA MRTMSALFLLFGTLFTAGGYGATFLISAYFRSQGGSDIDTGTTLSVALVGTLIGVPLVGWFAGQLEASRLAALAALAMSCGYFLLGGFSGELSYIPRIAAFLIGLGWGMFYISGPMALSERVTDADRGHWFTRFSAFQMAGICGSPILLAAAVEQAGVPIQTTFLFVGVIGILASLLLATFGIREPHGQRELSLRPWVRKITKIAASSAIRPIVMVGLGGCVFSGMMSFQSSLVEGTQANASTFFAVHAATVVVSRLLLARRLSMMPRIPLVIALMLFLIMGILALLGIPVNPMFQVLAAMLTGIGYGLVYPVIQTWAVNDSALENRHAALTWFVVAYFVGIFGFPAIGGWILVGAGKTLFILTLAAIASLELGVALLGGRWFCRIKDRLTAQNEAR >NC_005126|1054824:1065802|1061264_1061987_-|WP_011145286.1|DBSCAN-SWA MKDNTMSFSVNKDLDVHSKSFDAFISYMENSNDFWIIKDSESRFVYANDATLYYSGLPKGFNIEGRLDIECPGPWVDFVDVIQANDKNVMTSQKTIPVLNTFIYGGREKIIQPFLVDITPLMKDGKCIGIVGHGKKLEIYSMYHFENNIHPDSLTFGKPTDLFTDREFDIVFFALQSLSAKDIARKLSITYRTVQSRLHIIYQKIGINSLSQLKEYCRGKGYDNYAPTRFINPNPYIPLA >NC_005126|1054824:1065802|1059197_1059920_-|WP_011145284.1|DBSCAN-SWA MKDNTMSFSVNKDLDVHSKSFDAFISYMENSNDFWAIKDNEHRFVYANDIMLYYSGLPKGFSIEGRLVSECPAPWSELEDIVHASDGNVMTTQKTIPVLNTFTYGGREKIIQPFLVDVTPLMKDGECIGVVGHGRKLEIYSMYHFENNRHPESLSFGNPTEIFTDREFDIVFFALQSLSAKDIARKLSITYRTVQSRLHVIYQKIGINSLSQLKEYCRGKGYDNYAPTRFINPNPFIPLA >NC_005126|1054824:1065802|1060241_1060964_-|WP_011145285.1|DBSCAN-SWA MKDNTMSFSVNKDLDVHSKSFDAFISYMENSNDIWAIKDNEHRFIYANDTMIYYSGLPKGFNIEGRLDGECPAPWSEFENIIQASCDVVMTSQKTIPVLNTLTYGGKQKMIQPFMLNVTPLMKDGKCIGVVGHGKKLEIYSMYHFENNIQPDSLTFGKPTDLFTDREFDIVFFALQSLSAKDIARKLSITYRTVQSRLHIIYQKIGINSLSQLKEYCRGKGYDNYAPTRFINTNPYIPLV >NC_005126|1054824:1065802|1057784_1057994_+|WP_125026268.1|DBSCAN-SWA MVKNDWHPADIIAGLKKRGTSLAAVSRDAGLASSTLSNALHRPWPKGEKLIATALNCEPFEIWPSRYSK >NC_005126|1054824:1065802|1064196_1064919_-|WP_011145289.1|DBSCAN-SWA MKDDTMSFSVNKDLDVYSKSFDTFISYMENSNDVWVIKDKEHRFIYANDTMIHYSGLPKDFNIEGRLDGECPAPWSEFENIIQANDNNVMTSQKTIPVLHTFTYVGKEKIIQPFLVNVTPLMKDGECIGIVSHGKKLQIYSMYHFENNIHPESLTVGKPTDLFTDREFDIVFFALQSLSAKDIARKLGITYRTVQSRLQFIYQKIGINSLSQLKEYCRGKGYDNYAPTRFINPNPYIPLA >NC_005126|1054824:1065802|1062304_1063027_-|WP_011145287.1|DBSCAN-SWA MKDKTMSFSVNKDLDVHSKSFDAFISYMENSNDLWIIKDSESRFVYANDVALYYSDLPKGFNIEGRLDSECPAPWSEVADIIQANDKNVMTSQKTIPVLNTFIYGGKEKMIQPFLADLTPLIKDGKCIGVVGHGKKLEIYSMYHFENNRHPDSLTFGTPTDLFTDREFDIVFFALQSLSAKDIARKLSITYRTVQSRLQFIYQKIGINSLSQLKEYCRDKGYDNYAPTRFINPNPYIPLA >NC_005126|1054824:1065802|1065079_1065802_-|WP_011145290.1|DBSCAN-SWA MKDKIMSFSVNKDLDVHSKSFDAFISYMENSNDFWIIKDNESRFVYANDIMLYYSGLPKGFNIEGKLDSECPAPWAEFEDVIQANDKNVMTSQKTIPVLNTFTYGGRQKIIQPFMVDITPLMKDGTCIGIVGHGKKLEIYSMYHFENNIHPESLTFGKPTDLFTDREFDIVFFALQSLSAKDIARKLSITYRTVQSRLHIIYQKIGINSLSQLKEYCRGKGYDNYAPTRFINPNPYIPLV >NC_005126|1054824:1065802|1054824_1056006_+|WP_011145280.1|DBSCAN-SWA MYNLTRPIYLDNNATTPLDPDVLQTMMPYFTSAYGNAASNHHAFGWKAMEAVDNARKLISTSINATSHSDIIFTSGSTESNNLAIAGLQHRGKRGHVITSTIEHKAVLDCCSRLEAMGTEVTYLPPQSDGIVSPDLISRAIRDDTYLVSIMAANNEIGSIQKIEEIGAICKEHDIPLHTDATQALGKIKFDVQRMNISLASFSAHKIYGPKGVGALYIDSRNKNITLAPLIVGGGHERGLRSGTLNVPGIVGFGRAVELSVKNLPDESMRLRYLRDLLRSYIIENVADVRINGHLTECLPGLLNVSFNGLDADSLLLELSEVALSSGSACTSANRAPSHVLKAIGVSDTQAQASVRFGLGRFNNEDEIRYVCLRLEKAVNKLRSMVPKPFGVL |
11 | Sodalis_phage(80.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1203814 : 1240735
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_005126|1203814:1240735|DBSCAN-SWA 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37 | Shigella_phage(33.33%) | integrase,transposase | attL 1202704:1202718|attR 1239097:1239111 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1492597 : 1503443
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_005126|1492597:1503443|DBSCAN-SWA ATTACTCATTTGGTGTCTCCTTATCTAATGCCTGCAATAGCATCCCTTTGGAAATAACGCCGATATATTTGTCATTATTTCCAACCACCGGAACTGCACAAGGTGATTGTGCTACAACAGCAATCAGCTCATTGAGGGGCATATCTGCGGCAACGGAGGTTGGTTCCGCCAATATGGCGTGTTCGATAGGTTTTTTTTCCCGTAATGCTTTTTCCAATGAATTTACGGAAACGATACCGGCGAATTTTTGTCCACGTTCGATCAGGTAACCATAGTTTCTGTTTTCGTCATCAAGGACTTTCAATGCAGAAAGAGGACCAAAACCGGGTGCAATATGAAGCAGAGAGTCAGGACGGCGACGGGCAATGTCTTTAGCACTGAATACATGGCTGATATCCACGCCACGAAAGAAAGTTTTCACATAGTTATTCGCTGGATTATTCAAGATTTCATCAGGTGTCCCGACCTGCACAACAACACCGTCTTGCATAATGGCAATCCGGTCTCCGATACGCATTGCCTCATCCAAATCATGAGAGATAAAGACGATAGTCCGTGGCTGATTGCCTTGCAGGCTTAGCAGTTCATCTTGCATTTCTGTACGAATTAATGGATCAAGGGCAGAAAATGCTTCGTCCATTAGCAAAATATCTGGGTTATTAGCTAATGCTCTGGCAAGCCCTACACGTTGGCGCATCCCGCCTGAGAGCTCATCTGGATAAGATTGTGCATAATTTTCCAGGTTTACCTGTTTCAGTGCATCCAATGCTTTTTTATTGCGTTCTTGTTTGGTGATTCCGGCAAGTTCCATACCAAAGGCGCTGTTTTCCAGTATGTTTAAATGTGGCATCAGTGCAAATGATTGGAAAACCATACTGATTTTGTTACGGCGAATTTCTCTTAACGCTGCTGTTGAAATCTCAGAAATATCTTCACCATCAATTAATACTTGGCCGCGAGTCGGTTTTATCAGACGATTGAGAAGGCGTACCATTGTGGATTTGCCGGAGCCAGATAATCCCATGATGACAAATATTTCGCCTTCTTCAATAGTCAGATTGGCATTTTGTATACCAACAACCATACCTGTCTTTTCAAATATCTGATCTTTGCTCAAACCCGAATTCAGTAACTTGAAAGCATATTCTGAATGGTCGCCAAATATCTTATAGAGGTTTTTAACTTCAAGTTTAATTGCCATGAAATAGTTACTTTCCTTTCAATGGTTATTTAATGGTGTTATGCATTATTCATCTCTGCATGATTCTTTGAATATATATACCCTAACATACTGAGAGAGCCTGACAACCCTATGTTAATGATAATTAATGTAAAAAATAGTGATATTGAATGACTTAAATTAGATATATTTGTAGTTATTTCATGGTTATTAGTCATTCATTTTACCCAAATCCATGCGGTCATTGTAAGGGTTAATTGTATCTATGTTGTTGTTATTAATGAATTTTAAATTTGATCGACAAATGAATTATTCACTATGTTGTAAATAGAATCGCTTATTAGTTTATCATGTTGATTATGTCTTATTAGAATGAAATTTAATTTAAAATTAATTAGCTATATTAATGTTTTTTGTCGTTTCGGATGATATAAGAGGCGGAGATGGCAAAAAATATCCATAGAAATGGCAATAGTCATGAAAAAATGCCATAAAAATATAAGGATTTTATGGCGTTTTATCGTTTAAAAAACAGGATCAATAATATTGGTTTTTAAAGTATTAGAGTATTATGGTTATTTTGAAGTATTCCTTCTATATAAAATAAAATCATTCTCTTTAAAAATTCCAATCCTCATCCTCAGTATTCACTGCTTTACCGATAACATATGATGAACCTGAACCAGAAAAGAAATCATGATTTTCATTGGCATTCGGTGATAATGCAGAGAGGATTGTAGGGCTGACATTTGTTATTTCTGGCGGAAATAAGGTTTCATATCCAAGATTCATTAATGCTTTATTGGCATTATAATGCAAGAATTTTTTAATATCTTCAGTCCAGCCAACAATATCATAAAGTTCTTCTGTATATTTGATTTCATTTTCGTATAATTCTAATAATAATGAAAAAGTGAATTCTTTAATCTCTTTTTGCTCTAGTGTTGAATGTTTTTTTAATGATTGTTGAAATTTATATCCAATATAATAACCGTGAATGGCTTCATCTCGGATAATAAGTCGGATTAAATCGGCTGTATTTGTTAATATTCCTCGACTTGACCAATACATAGGTAAATAGAAACCTGAATAGAATAAAAATGATTCTAGAAAAACACTGGCGATTTTTTTCTTTAATGGATGATGATAACTATAATAATTTAGTATAATTTTGGCTTTATTCTGTAATGAAAAACTCTTTTCACTCCAGCGATAGGCGTCATCTACATCAGTTGTTAGGCATAATGTTGAAAAAATGGAGCTATAAGAACGTGCATGAACAGCTTCCATGAAACTAATGTTGGACATAACTGCTTCTTCGTGGGGTGTCAGGGCATCTTCCATTAACGCTGGAGCACCAACAGTGTTCTGAATTGTGTCCAGTAGTGTCAGCCCGGTGAATACCCGGATAGTCAGCTTTTTTTCTTCTGTCGTCAGTGTATTCCATGAAGTAATATCATTGGATAATGGAATTTTTTCCGGTAACCAAAAATTAGTTGTCAGTCGGTTCCAAACTTCTAGATCTTTGTCATCTTCAATTCGGTTCCAGTTAATTGCACATATAGGATTACTGATCATAATACATTTCCAGAATCATTTTATAGTGAGCATGAAACACAATCTTGTACTTCAGTGCCTTCCAGAGCCGTTTGTTTCAGACGGATGTAATAAAGTGTTTTAATTCTTTTACGCCAGGCATAAATTTGCGCTTTGTTAATATCACGGGTAGTGGCATCGTCTTTGAAGAAAAGTGTCAGGGATAATCCTTGGTCGACGTGTTGAGTGGCTATAGCATAAGTATCAATAATCTTTTCCGGTCCTATTTCGTAAGCATCTTGGTAATATTCAAGATTATTATTCGTCATAAATGGCGCTGGATAATATACCCGACCTGTTTTACCATCTTTACGGATCTCAATACGGGATACAATCGGGTGAATGCTTGAGGTTGAATTGTTGATATATGAAATAGAACCTGTAGGAGCAATAGCTTGGAGATTTTGATTGTAAATACCATGAGCCATAATTGAGGCTTTTAATTCAAGCCAGTCTTGTTGATTAGGAATTTTTATTCCTGCTTGTTCAAACAATTGAGAAACTTTTTTTGTCTGAGGTTGCCATGTTATTTCTGTATATTTATTGAAAAATTCACCATTGGCATAACGAGAATCTTTAAAGCCTTTAAAGTAGCTATTACGTTCAATGGCGATCTGATTGGAAGTACGCAGAGCGTGATAAGTAACGATATAGAAATAGATATTGGTGAAATCTATTCCCTCTTCAGAACCATAATGAATTTTTTCCCTTGCCAGATAGCCGTGAAGATTCATTTGCCCTAAACCAATAGCATGAGAATCCTGATTTCCTTTTTCGATAGAAGGAACTGAACGGATATGGCTCATATCTGATACCGCGGTTAAAGCGCGGACAGCCGTTTCAATAGAGAGGGTAAAATCAGGTGAATCCATTGTATGAGCAATATTCATTGATCCCAGATTACAACTAATATCTTTCCCAATATGGTGGTAACTTAAATCCTCTTCATATTCGCTGGCGCTGTTAACCTGTAAAATTTCGGAACATAAATTACTCATATTAATCCGACCTTTAATCGGGTTAGCATTATTCACTGTGTCTTCATACATAATATAAGGATAACCAGATTCAAATTGGAGCTCAGCTAATGCCATGAAAAATTCACGAGCATTGATTTTTGATTTCCGAATTTGTTGGTTATTTACCATTTCAGCATATTTTTCTGTCATGCTAATTTCGGACATTGGCACACCATAAACCCGCTGAATATCATATGGGGAGAATAGATACATATCTTCATTATGTTTAGCCAGCTTAAAAGTGATATCAGGAATAACAACGCCAATAGAGAGCGTTTTTATACGGATTTTTTCGTCGGCATTTTCCCGTTTTGTATCCAGAAAACGAAGAATATCGGGGTGATGAGCATGGAGATAAACGGCACCTGCACCTTGGCGTGCACCGAGTTGATTAGCGTATGAAAACGCATCTTCCAGCATTTTCATCACTGGGATAACACCTGATGATTGATTTTGAATCATTTTTATCGGTGCACCCGTTTCCCGTAGATTACTGAGTAAGAATGCGACCCCACCGCCACGTTTTGAAAGCTGTAAGGCTGAATTAACTGAACGTCCGATGGATTCCATATTATCTTCAATGCGTAGCAGGAAACAGGAAACCAATTCTCCTCGCTGTTTCTTACCGCAATTAAGAAAAGTTGGCGTTGCTGGTTGAAAACGGCCACTGATCATCTCATCCACTAGACGACAAGCCAGCATCTGATCGCCTTGGGCTAGGGTCAGTGCTACCATGCATACCCGATCTTCATAGCGTTCTAGATAACGTTTATTATCGAAGGTTTTCAGAGTATAACTGGTGTAATATTTGAATGCGCCCAGAAAGGTTTGAAAGCGGAATTTTTTGCTATAGGCTTGCTGAAAGAGCTTTTTAATAACAGTAAAATCGTATTGCTCTAGCACGTTTATTTCGTAATATCCCTCTTGTTGGAGGAAATCCAGTTTCTCTTTTAGGCTATGGAAAAATAGTGTGTTTGGATTTACATGCTGGCGAAAATAACAATGAATAGCCAGCTTGTCTTTGTCAAATTGAATATTCCCTTCACTATCGTACAGATTGAGCAAGGCATTTAAAGCATGATAATCTTGTTGTGCATTAATTTGAAAAGTCATAATTACATATTCTCTAATGAGTCATGTTGCCAGAATCTTTGAATACCTTGGCGTACCCGTTGTACATCTTCTTCAGTACCCAACAGTTCAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_005126|1492597:1503443|1495374_1497504_-|WP_011145609.1|DBSCAN-SWA MTFQINAQQDYHALNALLNLYDSEGNIQFDKDKLAIHCYFRQHVNPNTLFFHSLKEKLDFLQQEGYYEINVLEQYDFTVIKKLFQQAYSKKFRFQTFLGAFKYYTSYTLKTFDNKRYLERYEDRVCMVALTLAQGDQMLACRLVDEMISGRFQPATPTFLNCGKKQRGELVSCFLLRIEDNMESIGRSVNSALQLSKRGGGVAFLLSNLRETGAPIKMIQNQSSGVIPVMKMLEDAFSYANQLGARQGAGAVYLHAHHPDILRFLDTKRENADEKIRIKTLSIGVVIPDITFKLAKHNEDMYLFSPYDIQRVYGVPMSEISMTEKYAEMVNNQQIRKSKINAREFFMALAELQFESGYPYIMYEDTVNNANPIKGRINMSNLCSEILQVNSASEYEEDLSYHHIGKDISCNLGSMNIAHTMDSPDFTLSIETAVRALTAVSDMSHIRSVPSIEKGNQDSHAIGLGQMNLHGYLAREKIHYGSEEGIDFTNIYFYIVTYHALRTSNQIAIERNSYFKGFKDSRYANGEFFNKYTEITWQPQTKKVSQLFEQAGIKIPNQQDWLELKASIMAHGIYNQNLQAIAPTGSISYINNSTSSIHPIVSRIEIRKDGKTGRVYYPAPFMTNNNLEYYQDAYEIGPEKIIDTYAIATQHVDQGLSLTLFFKDDATTRDINKAQIYAWRKRIKTLYYIRLKQTALEGTEVQDCVSCSL >NC_005126|1492597:1503443|1499178_1499388_+|WP_041379980.1|DBSCAN-SWA MSKIKGNVKWFNESKGFGFITPEDGSKDVFVHFSAIQITGFKTLAEGQKVEFEITDGAKGPSAVNVVAI >NC_005126|1492597:1503443|1502231_1503443_-|WP_041380730.1|DBSCAN-SWA MKYTTTSRFIKSATLGIALAISASAFANGNDANLKTMIPGVPQIDAEAYILIDYNSGKVLAEMNADAHRDPASLTKMMTSYVIGQAIKSGKIHPSDMVTVGTDAWATGNPVFKGSSLMFLKPGDQVSVSMLSRGINLQSGNDACVAMADYVAGSQESFVNLMNGYVKSLGLKNTNFKTVHGLDAEGQYSSARDMALIGQALIRDVPEEYTIYKEKEFTYNNIRQTNRNGLLWDKSLNVDGIKTGHTSAAGYNLVASATEGDMRLISAVLGGHTYKGRETESKKLLTWGFRFFETVAPLKASKEFASEPVWFGDNDRVQLGVDKDVYLTIPRGRLKDLKASYVMNNSELHAPLAKNQVVGTINFQLDGKTIEQQPLVVMNEIKEGSIFGRFIDYIKLLFHHWFG >NC_005126|1492597:1503443|1494394_1495354_-|WP_011145608.1|DBSCAN-SWA MISNPICAINWNRIEDDKDLEVWNRLTTNFWLPEKIPLSNDITSWNTLTTEEKKLTIRVFTGLTLLDTIQNTVGAPALMEDALTPHEEAVMSNISFMEAVHARSYSSIFSTLCLTTDVDDAYRWSEKSFSLQNKAKIILNYYSYHHPLKKKIASVFLESFLFYSGFYLPMYWSSRGILTNTADLIRLIIRDEAIHGYYIGYKFQQSLKKHSTLEQKEIKEFTFSLLLELYENEIKYTEELYDIVGWTEDIKKFLHYNANKALMNLGYETLFPPEITNVSPTILSALSPNANENHDFFSGSGSSYVIGKAVNTEDEDWNF >NC_005126|1492597:1503443|1497936_1498167_-|WP_011145611.1|DBSCAN-SWA MSITIYSKPDCVQCSATYQVLSRRNIPYQIIDLTENPQALATIRAMGYQQIPVVVAGTQHWSGFRPDKINALIENV >NC_005126|1492597:1503443|1499978_1500944_-|WP_011145615.1|DBSCAN-SWA MSKPIQMERGVKYRDADKMALIPVKTVMTERTEILRKPEWMKIKLPADSSRIQGIKSAMRKNGLHSVCEEASCPNLAECFNHGTATFMILGAICTRRCPFCDVAHGRPMAPDTNEPVKLAQTIKDMALRYVVITSVDRDDLRDGGAQHFADCISAIREKNPSIKIETLVPDFRGRMDRALEILTATPPDVFNHNLENVPRVYRQVRPGANYEWSLKLLEKFKEAHPDIPTKSGLMVGLGETNEEILDVMRDLRRHGVTMLTLGQYLQPSRHHLPVQRYVSPQEFDEMKEEALAMGFTHAACGPFVRSSYHADLQAKGEEVK >NC_005126|1492597:1503443|1501054_1501696_-|WP_041379981.1|DBSCAN-SWA MKFQLQHKTIFLRQLGIQPYEPISDAMHLFTEQRDTNTPDEIWLVQHPKVFTQGQAGKAEHLLSLGDIPVIQSDRGGQVTYHGPGQQVMYVMIDIKRARIGVRQLVTAIEDTVIKTLAHFGVKAYARPDAPGVYVNEAKICSLGLRIRKGCSFHGLALNIAMDLEPFQRINPCGYAGMKMIQLSDLVPGITVEQVQPVLVEKFCQQLGFKLNS >NC_005126|1492597:1503443|1492597_1493797_-|WP_011145607.1|DBSCAN-SWA MAIKLEVKNLYKIFGDHSEYAFKLLNSGLSKDQIFEKTGMVVGIQNANLTIEEGEIFVIMGLSGSGKSTMVRLLNRLIKPTRGQVLIDGEDISEISTAALREIRRNKISMVFQSFALMPHLNILENSAFGMELAGITKQERNKKALDALKQVNLENYAQSYPDELSGGMRQRVGLARALANNPDILLMDEAFSALDPLIRTEMQDELLSLQGNQPRTIVFISHDLDEAMRIGDRIAIMQDGVVVQVGTPDEILNNPANNYVKTFFRGVDISHVFSAKDIARRRPDSLLHIAPGFGPLSALKVLDDENRNYGYLIERGQKFAGIVSVNSLEKALREKKPIEHAILAEPTSVAADMPLNELIAVVAQSPCAVPVVGNNDKYIGVISKGMLLQALDKETPNE >NC_005126|1492597:1503443|1497506_1497923_-|WP_041380729.1|DBSCAN-SWA MNPLIYFSSSSSNSHRFVQKLEIPAFRIPINQSDSPLNITSPYILLTPSYGGGSTKGAVPPQVIRFLNIAENRAFIRGVIAAGNTNFGEAYGIAGRIISEKCRIPLLYRFELLGTEEDVQRVRQGIQRFWQHDSLENM >NC_005126|1492597:1503443|1499464_1499839_-|WP_011145614.1|DBSCAN-SWA MINIILAIFIGGGLGSVLRWFISLRLNNISSNIAIGTLTVNCIGALIIGLGLAYFNKSTHLDPAWKLMLTTGFCGGLTTFSTFSVEVVYLLLDGKLGWALGTVLLNLFGSLLMTMLAFVLMHEL >NC_005126|1492597:1503443|1498498_1498960_+|WP_011145612.1|DBSCAN-SWA MYHHYFDTPKGFPKPYIHITADDKGVTSLYFVDEKTAPEVKNDITKQCVKELRGYFAGKRTEFSVPLNPAGTEFQQRVWLQLCKIPFGEVWSYKQLSLALGSVNYCRAVGMANSRNPISLIVPCHRVIGHDGKLVGYTGGLNIKSWLLEHEKT >NC_005126|1492597:1503443|1501827_1502091_-|WP_011145617.1|DBSCAN-SWA MKTKLNELLEFPCSFTYKVMGLAEPELVNQVVEVVQRHAPGDYSPQVKPSSKGNYHSVSITINATHIEQVETLYEELGNLELVRVVL |
12 | Mycobacterium_phage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1753138 : 1823873
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_005126|1753138:1823873|DBSCAN-SWA 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59 | Enterobacteria_phage(11.76%) | transposase,tail,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1893984 : 2041677
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_005126|1893984:2041677|DBSCAN-SWA 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113 | Sodalis_phage(10.81%) | tRNA,tail,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2049817 : 2116982
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_005126|2049817:2116982|DBSCAN-SWA ATTAAAGTTTCATAATAAAGGCTAATAAGTAATAAGGTGGAATTACATTAACGCTATGATCATGTGAAGGGGATGATGCTGTTGCTGGGTGATTATGTCCTTGTCCTCCTCCTGAGGGTGATGTGTATGCGTATCTCGCGCCATTGGCTGATTGCATTACACTATCCAGATCATTACGTATATATGAAGCATACTCGCTGTAATATTCGGTACCATATTTCATTCCCTTATTAGTCCAATAACCCATACCTCCAATATGGTAATGATAAGGTATTTGTGATTCTGTTAATGTCGTATTTTTCACAGTAACACTAACAGAAACCGTCGTTGATGTTGTATTTCTGGAATAGTTTTTTCCATTTCCACTCCCACTAGCTTTATTACTGCTTTTCCCTGTTTCAGAAATAGTTTCACTGCACATGACAAAACGGCTTCTTAAGTCTGGGGTTCCATGATTACCATCACAAAAAGCCCATCCAGTAGGAGCACTACTACCAGAAAACATCACAATCATTCCTTTAGGGAGTACTGTTTTGGGATCAATACTGACGCCGCTTGAATCAACCGTGATACCGTTACCCGCTTTGACTTTTACACCATTTTTACTCAGGCTCAAACCACTTACACCACTCCAACCATTGTTTGTATTTCCCCCTTCTAATTTCAAATAGAGACCGGAATTATCAGTTGCTACAATACCTCCACCATCCCAATACTTAACAGCTATACCATCCGAATCAACGGAAATACTACCTTTATCTTTAGCCTTAACTTCCACTCCCTTTCCACTAACAGAAATGCCATTACCCGCTTTAACTGAAACACCATCGCTATTAACATTAATCCCATTACTTGCTTTAACTTTTACACCTTCGTTAACTATTTCAATACCATGATAACCATCGACTTCAAGCTGATCGTTATTAATTTTTACCCCTCTACCGGCATTGACTGCTAATCCGTTAGGGTCAGCTAATAAGCTTTTATCCTTAAGTTTTACACTTAATCCGTCTTGATCTGCTTTTAAACCGCCGGTGGAGTTAATTTTTATTTTTAGCCCAGAGTTGTCATCTAGTTCCAACGCTGAATTTGGATTATTAGTTTGATCTGGTGCTTTGCCTACAGCCCGGCGGCCAATATCCGCAATATCAATCAAGTCGGCATAATCGGTTTGTAATGGAATACTGCCTTCTTTAAAACGGCTTTTTAAATCATCGGCTGAAGGACCCGTTGATTTAATATTGGTATTTTCTAAATTGGTTTCTAAATTGGTTTCTGAATTATATGGATTATGTTCTTTTTCCATTTATATCACCTTTTGTATAATGTGAAATGATTATGAGTTTTTCATTATAATTAAATGAAAATTAAAAAAGATACTTGATTTAATGTAAGGTTAATATTTATTTTGTTAAAGTAAATTAATTTCTTTATCATTTGAAAATTAAACATGAGCGTTTTTAATCGATATTTTTCTATATTCATGATTAAAGTCAGCGTTTATTTAAATTTTCTCCAGTATAAGGTACATACACTAACTGATTACTAATAATCACTTCTGTATTCCATTCTTTACCGGATTCACCAACCACACCAATACGTTGCTGTGCGGTAGCAATTCTCATATTACCAATACCTGTTGCGGCAGAAGGTAATCTTCCCAGGGTTAAAGTTTCTAAAACATGGTATGCCTCGTCCCCTAAGGGAGCGCCATTATTTTGCCAGCGTTGATAGGTACTGACAAAATCTTTAAAATCTTCCGGTGACAGCCAGTGGATAATCATGGAAAGATGAGCGGGAAATTCAGCCAAAATTTCGGTTTTCGCCCAAGATTCCAATTTGTAAGGATCAACGTCGTCATTTTTAACGAGTTGGCTATTAATCACCATACTGACTACAAATGAAAAGCGATCGGCTAAAGCATATTTTTCGCTGGAGAAATACCAACGATAGCGCCAGGCGTCTGCCGCTAATGGAAAATTATCCTGTGAGTCCTGGGTGAGTTTAATTAATATCTTGCCTTGAATACGATCAAATTTAATGACGTTTGCCTTGAGTTCATGATCAGATTTCTTCGGCCCGGATGGGGTAATTACATATTTCAGTGTAATTTCATCATTTTCTTCGATCATGGCAGGGAAGGGACTTTGGGGGCTGGAGGTAATCCAGCGTTCATTTTCTGTTCCCGTTTGATATATCTCACTGGCATAAACCAGTTGATAATCCATATCTTCCATCCATACCGGGCTATTACACCAGTATAGATTACCGTCATTATATGCGTTCTGTACGTCGATCAAACTACGTGCTAAAGCCGTGCTATTACGGGTGTCAAGAATAAATGACTCTCCTGTAATATCTGTGATCATTTGGCCTCGTAATATGAATTTTACTCTAATATCTTGATTTTCTTTTTCTTTAATAATTAGATTAATGACCTGACCATACAATAGCTGGCCCGTTGTCCCATTTTGGGTAATGATTAATTGTTGGTTTTTAGAATTGGGTACGCTTTTTATTTTCAGCTTATCGGGTTTTTGCTCCTTGTCGAATTTCGTGTCAGGTTTTACCGGTAATAACTGTCGATGTTCAATCAGGTAGAAAGGAAGTTCATCCAGCTTTGAGGTTTCCTCGAAACACTTTCCTCCCAAACCAAGCCGGGCAGCAATACGTTTCTGAAGCGCTGATACTTTATCAATACGAATGTTATTACGTTGATAGGTTAATTCGGGTTGCTGTGCCAAATAGCCACGTTGAGTAGAGAGAAAATCCAGTGAATCCAGAGTGAGTGGTCTGGCCGCACGATGGGTACCAAAATATTCCAATAAGTAATTCAGGATTGATAGTTCTTTTGTGTAATTTTGTGAATGGATACCGTCATCACTGTTAATTTGGGAATCATTATTTAGTTGTTTGATTAAATCGGGCATGATTTCCTGATGGACTTGCTGACCGACAGTATTCGCTTTAAAAGGCCATTGTGTACCGTATACCGTATTTCCCCGTTGTTTAAATGCTAACAGTTTCGGCAAGAGAGCGAGTTCAGCACAGCCATTAGCCAGCATTTGCTCAAAAGGCAACATAAATTGGTGCAAGTGCACTTGTTGTTGAGTCTCCGCATAGGTCTGTAATCCATAGCAGGCAGGTAACTTATTGCTGACTGGATAGTAATCCAGGACTTTACGATGTTTGCCCCAGTTTAGTAATTCGGGCTGTGTTTCAATCAAGGGTTCTGCAATGATTTTGTTCTCTATATCTTGTTTAGAAACAGTGATTTTTACTCCGCCTTTGGCGGTAATAGTGAGTGGGCTTGCTGATGAGGAAATTAAGTCTAAGGGATCGTTACCCCATAGCCTGGGATAGTATCCTTGAGCGATTGTCCAGGACCAACTATCGTCCGCCAGCGGAGAAATGTTTTCATCATGCTTGCCTAATGCCAATCGGGTAATATTTTGTACTCCGGGAATAGCCAGTAAACGATTAGCCAGATGGCTGAGCTTTAATTCTGTCGGCTTGGTGTAATCTTTAGCCGCCGATAATTCCGGTATCCAACCGTGATGTAAATAAGGGCCTTCAAATATCTCTTCATTACTGTAACCTTGTTCAATCATAGCTTGGGTGCTATAGCGTAATGGGCTTGTAAGCACCATTTGTTCCGTTGTCATATAAACTTGGGCAAATATATCAGCAAGATCACTGACATCATCATCAAGTTCAATATCAAGCTGCAATAAGAAATCCACGGGTTGCAGCCAGATAATTTTACTGACGGATTCCCCCAGATTACGGTTATCTTTTAGGAAATCATTGAGCCTTTTCTGAGTCAGTGTTTTATCATCTTCCGTTTCCCGGTTGGGAAGTAAATAAAGCCAATAGTTTCCTCTTAGTGTTAACTGTAATTGTTCTTGTTCTTGTTCTTGTTCTTGTTCTTGAATAAAACTGTATTCACGGCTTTCTTTGTTATACCAGTACTTATAACGTTCACTTTCAGGTTCGCAAATAAGCCGTACATCGTTAAAGAAAAAATAATCTTCACTTGTTTCATTGTCGGTGTCGCTGCTATGTAAGTCCAGTAAAGCCCGGCGATAATCTTCCGCAGTGATCGGGCCACAGGTCAGCATTTGTTGTGGGCCGAATTCCTGTGGAAAAATGCCATCACCCAGTGTCTGCTCTTGTTTTTCGGGGGTAAGCAAATCGCGCAGGGGTAGCGAATGGCGATAGGCGAGATCAGATGCGCCGTAACAACAGGCTTCTAATAAGGTAATACCGGGATCATTTTCTTCGGTATTGCTCCAGAGTTGCCCAGACTGTTGCTCAATGACCGTCTTAGCTTGAGTGAGTAAGGTCTCAAAGGCGATATCGTCTTTAACGATGGGAAACAGGGCGTCTTGATTATTCACTGTCTGCTCCTTTATTAGTGGAACTATTTTCTGACCAAACCAAAATCAGTACTTCATTATCAGCAGCTTCTACACTGTCGCCGACTGCTCCTGCGGTTTGGGACGATTTTTTCAACGTTAAGTTGGTGACTCGTTCAACTAAAGGTGACTGCTGAATCGTGGCTAATAATGGGTAGTAATCAATGCGATTACCGGTTGTGACGCCGATAGCGCTATCTTCTGCCCACGGCATATATTTTCGACTGAGTTCCTGTTGTAACTGATGACGGCCGTAGTCGGGATTAATCCCTGTGACAAACACCAGTTGATAGCTGATCAGCACGTCAACGTAGGTCGGGTTGTTGATTTTGAGGGTGGTCCAGGGACTGCTGAGTTGGCTTATCCAGTCGACCATTTCCGCCAGTCGGGCCGGATTCAGAATCGGGCGTAGCGCATCATCGTTATCTTTGTAGCGACTGTCGGGGATCGCAATCAGTTGTTGTTCTTTCTGTGCCGGGATTTTAGTTAACTCACTGGCAGAAGGGTATTTAACATCAAATAAGCTGACGAATTGTTCTTTCAATAAAGTGACAATGTTATCCCAGCTCAGTACCCGGTTAC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52 | Enterobacteria_phage(28.57%) | tRNA,protease,tail,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2361469 : 2405104
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_005126|2361469:2405104|DBSCAN-SWA 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42 | Enterobacteria_phage(50.0%) | integrase,tail | attL 2357318:2357350|attR 2401674:2401706 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2646925 : 2700857
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NC_005126|2646925:2700857|DBSCAN-SWA 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47 | Escherichia_phage(12.5%) | plate,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
2800482 : 2823282
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NC_005126|2800482:2823282|DBSCAN-SWA TATGTCCGTAACTACAGAACAAATTGCTGTTGATTATCCAATACCAACTTATCGATTCGTTGTCTCCGTTGGTGATGAACAAATCCCTTTCAACAACGTTTCAGGGCTAGATATCACTTATGATGTAATAGAATATAAAGATGGTACCGGTAATCACTATAAAATGCCGGGCCAACGTCAGTTGATCAATATTACGCTGCGTAAAGGGGTATTCCCTGGGGATACTAAACTTTTTGACTGGCTTAATTCCATTCAGCTTAATCAGGTTGAGAAAAAAGATGTTTCAATTAGCCTGACCAATGAAGCCGGCACCGAAATTTTAATGAGCTGGAGCGTGGCAAATGCGTTCCCAACGTCATTAACCTCCCCTTCTTTTGATGCCACCAGCAATGATATCGCAGTTCAAGAGATAAAACTCACTGCGGATAGAGTAATGATTCAGGCCGCCTAAAACGCCAGAATAACGGCTGAATTCATCATTCTACCATTCATGCAAAATATCGCTCAATAATTGGAGGCAATATATGCCAATAACACCAACCCATCCCGGCGTTTATATTGAAGAGGACGCCTCACTATCACTCTCCGTTCGTTCCAGTGTAACGGCAGTGCCTGTTTTTGCGGTTGCAAATAGCAATTCATTATTATCAAAACATCCTTTTATCCGAATTAATAGTTGGTTGGAATATTTGACACTAAAAAGCGGGCAATTTAATTCTAACGACAAACTTGATATTTCACTGCGTGCCTATTTTATTAACGGCGGTGGATATGGCTATCTTGTCAAAACCAACGACTTAGCAAACCAAATTCCAAAACTGGATGATGTCACCTTACTGGTTGCTGCCGGAGAAGATATCAAAAATGCGGTAAGTACACTTTGCCAATCGGGCAAAGGATTATTCGCCATTCTGGATGGTCCAACCACAGAGTTAAATTCTAATGGCTCATCCCAAAATGATTATGAGCTAAGCCCTTTTGCCGCCGTTTATTACCCTTGGCTGACCGCTGAATGGGGAGAAAATAAAGCCAGCGTTGATATTCCACCTAGCGCCGTGATGGCCGGTATTTATTCCAGTGTCGATAACAGCCGAGGTGTCTGGAAAGCACCGGCAAATGTTGTATTACAAAGCGGGGTGAAACCGAAATTTAAAGTCACTGATGATTTGCAAGGTACCTATAACACCGGTAAAGCCATCAATATGATCCGTGAATTTCCAAATACCGGTGTCACCGTCTGGGGCGCTCGCACACTTGATGATAGTGATAACTGGCGTTATATCCCGGTTCGCCGCCTATTTAATAGTGCAGAGCGAGATATTAAAAATGCCATGAGTTTCGCGGTATTCGAACCTAACAGTCAACCCACTTGGAAAGCGGTACATCGTGCGATCGATAACTATCTTTATGCCCTCTGGCAACAAGGGGGATTAGCCGGTAACAAAGCGGAACAGGCTTACTTTGTTCAAATCGGTAAAGGGATAACCATGACCGATGACGATATCAAACAGGGCAGAATGATTGTCAAAGTCGGTATGGCCGCGGTTCGTCCTGCTGAATTTATTATTCTGCAATTTACCCAAAATGTTGCCCAATCTTAATGGGGCGAATAATCGATTCAAGATCACCACATACTTATCCTATTTAAGGAAAACCCCATGACTTCCGCAACCTATGCCACACCGGGCGTTTATATTGAAGAGGACGCTTCACTATCGCTATCAATTAGCAATAGTCCAACCGCCATTCCCGTCTTTATTGGTAAATTTTTTGACAAAGACGGGAATCAACCTGCAAAGGGAAGCTGTATTAGAATCACCAGTTGGTTGGATTTTATCTCACAATTTTCACTTTCACCGGCCGTATCAGTAAAGGCTACAAATGTGGGTGGAAATGCCGCAAAAACCTATACCTACGCCGCTACCGTCACAGCCACTTCTCTCAGTGCCTTTGCTGTACAGCACTATTTTAGTCATGGTGGTGGAGTCTGTTATCTGTTGCCATTGATAACGACAGATGAATCAGAATTAGCAAAGCTGCCAGACCTGATTGAAAAACAACAAGAGATCACCTTATTGGTCTGCCCTGAAACAGATGTAACACTAAAACAAAAGGTCTACGGTGCAGTAAACTCCTTATTACAGCAAAAAGTAGGTTACTTCCTACTCGCTGATAGTACAGATGGGGAAAATAAACCCACTACTCAACCGGATAAAACCGCTGTCTATTACCCTAATCTAGAGACCTCTTTTACTTATAGCCAACCAGCAGATGCTGATATTATGCTAGATGGCTATGGCGGTGTTGAAACTCTAGCCAAGCTGAAAACGGCTTCTCTAGGGGAATACACTAAAGCTAAAAAAGCCGTCGATGACAAATTAAAGTCCACTAAAATTACCTTACCCCCAAGCGCCGCTGTTGCGGGTATTTATGCGGCGACCGATGCCAGTCGTGGCGTCTGGAAAGCCCCCGCTAATGTGGCATTGAATAATGCCAAACCATCCGAGCCGATCACAGATGATAAGCAAGGTACCATGAATGAAGCCGGTATTAATGCCATCCGTGCTTTTAGCGGCAAAGGTACGCTAATTTGGGGGGCCCGTACGTTAGATAAAACAGACAACTGGCGCTACATTCCAGTACGACGTTTATTTAATGCAGCGGAACGAGACATCAAGCGGGCAATGCGATTTGCCGTCTTTGAGCCTAACAGCCAACCCACCTGGAAACGAGTACAAGCAGCCATTGACAACTACCTCTATCAACTTTGGCAACAAGGTGCCCTAGCGGGAAATAAACCGCAGGAAGCCTACTTTGTCCAGATCGGTAAAGGTATCACCATGTCCGACACTGACATTCAGCAAGGCAAAATGATCGTCAAAGTGGGTATGGCCGCAGTGCGTCCGGCTGAATTTATTATCCTTCAATTTTCACAATACGTAGCACAGTAACCTTATTAAGGCGCGGTTTAACACCGCGTCTATTCAATCATTGAGGAGATGATAATGACAACAGAGACAAAACAGCCGGGCGTCACGATAACGGAAAGCCGTATATCCCTGCCACCAAACAATGAATTTATCGGTGTCCCCGTTTTCATTGGTTATACCCAAGAAAACCCAAGCAATAAAACCGCTGTCAAACTAAACAGCCTGACCGAATTTACCCAAGCATTTGGTGAATCAGGATTAATGTACTACTCCGTGCGTCACTTCTTTGAAAACGGCGGACAACAAGCCTATGCACTGTCATTGGGTGATTATCAATCATCAACCCATTTCCAACTATTGATCACCACCCTACAACAAGCATGGGTAAAACAAGCCATTGCCGCAGAAAGTGAAATCACATTGATTGTTGTGCCTGACACTACCCGTTTTAATGATCCCGACACTCAAAAAAGCCTTTGGCAACAAGCATGGCAATCAATACTTGAACTTTGTAAAAGTCGGCGCGGAATCATGGGGTTACTGGATGCCCCGGACGATCCAACACTAGCTGCTGATTGTCTGGCTGATTTTTCCTCAAGTGATCGCCAATGGGGGGCCGTATACTGGCCAAAACTGAAAAGTACCTATCAGGAAGAAGATAAACATATCGTACTTTCACCTACTGCTGCGATCGCCGCCGTCATTCAACGCAATGACCATCAAAAAGGGGTGTGGACTGCTCCCGCCAATGTTGCTTTAGCCAAAGTGATCAGCCCGGTACGCTCTTACATTGAAGCAGGTGTCCTCCTTAATCTTAATCAAAAAGGCACTTCGTTGAATCTGGTTCGCAGCTTCCCCGGCAAAGGTATTAAAATCTGGGGCTGCCGCACGCTGGACAACACGCCGGGTTCCCCCTGGCGCTATATCCAAATTCGCCGTCTGGTTTCCTATATCGAAACTCATATAACCCAACTCGGTCGAGCCTTTGTCTTTGAATCCAACAACGCCATCACCTGGATGAAATTTAAAGGTCAGGCCCACAACTGGTTACGTCAATTATGGCTAAAAGGTGGATTACGAGGCACTCAGGAAGATCAAGCATTTGAGGTGTTACTGGGTGTTAATGAATCAATGAGTGAAACCGATATCTTGGCCGGAAAGATGATCATGAAAATCAGGCTGGCCCTGTTAATTCCGGCGGAATTTATTGAGCTGAGTCTGACGTTTGATATCCGTAACTAATCCAAACAGGGGAAAAACATGCACAACTTATACACCCCATCAGTATCGCACCGTTTTATCGCCAGTTTTCTGTTTAACAGCATTCCCAGCCCACTTGATATCGCCTTTCAGCGCATATCGGGCCTGAGCCGAGAACTACAAACCACCCAACACAGCCAAGGTGGAGAAAACGCCAGAAATATTTGGCTAGCCGAGAAGATCCAACATGGCAGCCTGATGCTAGAGCGTGGTGTCATGATCATCACCCCGCTCACCTTGATATTTGATCGTGTTCTGCGTGGTGAGAAAGCGATGTATGCCGATGTCGTTATCATGCTACTGAATGAACATTCATTGCCCGTAGCAAGCTGGACAGTCAGTAACGCGCTACCCGTTCGCTGGTCCACCAGCGACTTCGATGCTAATAGCAACACCGTACTGGTGAACTCTCTGGAATTACGTTATCAGGATATGCGCTGGTTAGGAGTAAAAGCATGACGGTAGAAATTAAAGAACTGATTATTCAGACAAAAGTCATCGATCCGACGAGTGATCAACTCTCCCCTCGAACATTAGCTCAGGAAAAACTGGATAACGCCCGTTTAATTGAGATGGTGAAACGGGAGGTATTAGAAGCATTACGTGAAACAGGAGGTGCTTATGAGTTTAATTGAACGTGGTTTATCCAGACTCACCCTTTCCGCCTTCAAAGACCGGGAAGGAAAAGTTTCCGTGGGGAGCTTACAGGCGATGTATAACCCCGATACCATTCAGCTTGATTACCAAACCCGTTACCAACAGGATGAAAGTGTTAATCGTGCCAGCCAAAGCAGCCGTTATGTGCTATCT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17 | Streptomyces_phage(20.0%) | tail,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
2834275 : 2914540
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NC_005126|2834275:2914540|DBSCAN-SWA 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55 | Acinetobacter_phage(30.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
2948274 : 2956586
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NC_005126|2948274:2956586|DBSCAN-SWA CATGCAACACCAACATATACAAAAGAAAATTTTACGCACTATTTGCCCTGATGCTAAAGGACTGATCGCCAAAATTACTAATATTTGCTACAAACACCAACTGAATATAGTTCAGAATAATGAATTCGTCGATCATCGTACTGGCCGCTTTTTTATGCGTACTGAGCTTGAAGGAATCTTCAATGATGAGACATTGCTTGCTGATTTAGATGATGCACTACCGGTGGGTTCTCAACGGGAATTAAATAGTGCGGGGCGTCGGCGTATTGTCATTATGGTGACAAAAGAAGCGCATTGTCTTGGGGATTTGCTCATGAAAAGCGCTTATGACGGGCTTGATGTTGAAATTGCGGCGGTTATCGGCAATCACGCAACATTACAATCATTGGTTGAACAATTTGGCATTCCTTTCCATTTAATCAGTCACGAGGGTTTAACCCGTGAACAACATGATGAAAAACTGATTGCCCAGATTGACCAATACAAACCTGACTACGTGGTATTAGCTAAATACATGCGAGTACTGACACCAGAATTTGTCCAACATTATCCAAATCAGATTATTAACATTCACCACTCCTTTTTACCTGCATTTATCGGGGCGCGTCCTTATCATCAGGCTTATGAGAGAGGGGTAAAAATCATCGGCGCAACAGCACATTATGTGAATGATAATCTGGATGAAGGTCCAATTATTACTCAGAAGGTCATTAACATAGACCACACATACACGGCTGAAGATATGATGAGAGCGGGCCGGGATGTTGAAAAAAATGTTCTGAGCCATGCTTTATTTTGGGTTCTTGCTCAGCGGGTTTTTGTTTACGGCAACCGTACTGTAATTCTTTAAAGCTGAATTAATTGAGGCCCAAAAACAGGACACGGTAACTTATTTTCAAGCATATGCTTTACAGCGGCAGTTCATTTGATGTGATTCTGGCCGCTGTAAGCAGTAGTGGTGACTTTTCAAAAATGATGAATCATCCTTCCCCCGCCACCAGCAAACAGACCACTTATTTGCTCACAACCAGATCAATAAGGATGGAAAATCGTAAGCGGCTCATCTAAACCGTCTGGTCGGTCCGGCCGTTTCCTCTTAGTAAAGAAAACCGAGAGCTTCTGTATTACAAAGGACGTGGTTTTGAAGGAGAGCCGGATTATCCAGTTGAATTTGAAATGTAATCCTTACGTGTAGCATGTACATATACAAGTACAGATTTAAACGCCCTCATTAAATTAAGCCTCATAAAAAATATGAGGCTGATTGATCATCATTATTGCTAAATACTGTTTTGCAATTCATGCAAAGCAGCCACTTGCAAAAAGTGGCTACGATTCTTGTACAAGTTTGGGCTTGCTTTAACTTGATCATCGATTTTCTTTGATAACAAATCAGGCAGAGTGACGTTGAATTTTGTCGATTTACCTAAATATGGTTCAACATCAATGTCAATTACGGCCCATGCCCACCCTGCGTATTCTTCATCTTTGATCCAGTAATCCAATGACTTTGCTTCAGGGGGTAATTGGTTCATTTCGGCCAATAACTCTAAATGCCCAGTAATCGCTTCCTTGGAGTTTTTTATTGCATCCTCCATTGAATCACCCGCCGAGAAACAACCTGATATATCGGGCACAACCACGCCGTAAGCGTGGTTCTCATCACCAATTTCAATCGCAATAGGATATAACACGTTATACTCCTCCAATAATTTTAAGAACTCCTATCTGTTTAACTTGGTAAAAATCATAACCCCAATAACTCCAAATATCAATAAAAAATAACCTCGATAACCTTATTTAAGGGCGAGGAGCGCAGTGACGAGTCATCCTTCCCCCGTCACCAGCAAACAGACCACTTCTTTGCTCACAACAAGATCAATAAGGATGGAAAATCAGCATATCGTCACTTATTTTTAAATATCTACTTTACAGCGGCGGCTCATTTGATGTGACTCCGGCCACTGTTAGCAACAATGATACATTTCAAAATCGGGTGAAGTTCCCGAGCGGCCAAAGGGAGCAGACGGTAAATCTGCCGTCACAGACTTCGAAGGTTCGAGTTGAGCGCAGCGAAACAACAATGCGGCGCTTGCGACGCGTTGGCCCGCAGGGCGAGGAACGCAGTGACGAGTCATCCTTCCCCCGCCACCAGCAAACAGACCACTTCTTTGCTCACAACAAGATCAATAAGGATGGAAAATCAGCATATCGTCACTTATTTTTAAATATCTACTTTACAGCGGCGGCTCATTTGGTATGATTCCGGCCACTGTTAGCAACAGTGATATATTTCAAAATCTGGTGGGGTTCCCGAGCGGCCAAAGGGAGCAGACTGTAAATCTGCCGTCACAGACTTCGAAGGTTCGAATCCTTCCCCCACCACCATAAATATCCTTCAAGCCTTACAAACAAACCCAATAAAAACATACTTCTCGTTTATACCCCTTGATTCCTCCAAAAACAGACAACCTACAGCAACGCTCCTAAATTACCTACCCTTAACAGTTCCAGAGACTAACTAACATCTTTAAAAGAATTCAGTGAAAAGCGCTTACCCAACCTTAATGTACCCACAATGATATTTCTTATCACACCTTTATGTGAAATTTAACATTTCGCAAAAATCAACAATAAATAATATAAATCAAATAATTACAAAAATAACCACCTTCAAACAGCGGGCATTAGAATGTGATAACCATCGTGTATTTGTGAAATGACGTGTGAAATAATGATAAAAGAATAACAAATTATAACAACAACACCAGGGAACCACCATGAGCCAATCAATACAAAAAATAGGAATTATAGGATTGGGGGCTATGGGCATGGGAATTGCCCGCGCGTTAATACGCGCGGGCATTCCCACGTATGGATTTGATTTAAACCAAAAAGCCTGTGACCAACTACTACAAGCAGGCGCTAAAGCGGCGACAAACAACGCAGCAAATTGGGCATCAGAGCTGGATGCTATCTTACTTGTTGTTGTCAATGGTGCTCAAATAGAAAGCATCCTGTTTGAGGGCGAAACACCGTTAGTCAACCAGTTAAAAGCCGGTACGATCATTGTGCTTCACAGTACCGTTGCCGCAGAACAGGCTAAAGATTTTGCCCATCGTCTTAGCCAACACAATCTAAACATGCTGGACGCGCCTATTTCAGGGGGCGCACTAAAAGCTGAACAAGGCCAGCTCACCGTTATGGCTTCCGGTGAACCCGCATTATTTGAACAACTAAAACCCGTATTTGATGCCACCACCGAACGTCTCTACCATGTTGGAAATGAAATTGGTCAAGGCTCTACCGTCAAAACAATCCATCAATTACTTGCCGGTATACATATTGCTGCCGCAGCGGAAAGTATGGCATTGGCGGCCAAAGCCGGCATTTCTCTGGAGCTGATGTACGACATTGTCACCCACGCGGCGGGTAACTCTTGGATGTTTGAAAACCGCGTCCCCCATATTCTGGCAGGGGATTACACTGCTAAATCCTCCGTAGACATTTTTGTCAAAGATCTGAGATTAGTCTTAGAAACAGGTAGAGATCTGAAACTCCCATTACCATTATCAGCCACTGCACATCAAATGTTCCTTACTGCCAGTAATGAAGGTTTCGGCCAATGGGATGACAGCGCGGTTATCAAAACATTTAAAGGTATCACTTTGCCGGAGAAAAAATAATGACCATTAAATTGGGCGTTATCGCTGATGACTTTACCGGCGCAACCGATATCGCCGGTTTTATGGCACAAAGCGGTTGGCGAGTTGTCCAGTTACTGGATACACCTGATGAAAATATCGCCATTCCACAGGATATTGATGCTATCGTTATCAGCCTGAAAAGCCGTTCCTGCCCGATAGACGAAGCCGTGAATAACGCAGTGAAATCCTGCCGCTGGTTACGTCAGAAAACAGGTTGTCAACAAATATTCTTCAAATACTGCTCAACTTTTGACTCTACCAGCAAAGGCAATATTGGGCCGGTCACGGATGCCCTGATGGATGAACTACAAACAGACATCACGCTGATCTCCCCTGCCCTTCCCGTTAACGGGCGAACCGTTATACATGGGCATCTATTTGTCAACGGTCAACTACTTAATGAAAGTGGTATGCAGCACCATCCGGTGACACCAATGACAGATGCCAATCTACTGCGCCTAATAGAACAACAAGCTCAAGGGAAAGCAGATCTGGTGGATCTGGCATGTGTACACCAAGGCGAGCAGGCAATCCGCGTAAGGCTAAATCATTTACAACAACAAAACATACGCTACGCAATAACAGATACCCTCTCCATGAATGACCTACTGCCTATTGCCAGAGCGGCATCAGCGCTGAAATTAATCACTGGTGGCTCTGGTCTTGGTGCTGCCCTTGCCAGCACAGACACCGGTAAGCCATTGATGCCATACCAACCGGAAGGAGCAACCCCACCCGCCGAGAATAGACGCACCGTGATCCTTTCTGGCAGTTGTTCCGTCATGACCAACAAACAAGTTGCTCTATACCAGAAATTCGCTCCAACTAAAGCCCTGAATATTGATTCATGCATCAATGATCCACAATATGCCGAAAAGCTGGTTGCGTGGGTTATTCAGCAATCCGAAAACTATCTGGCACCGATGCTATACACCACTCACCTCCCAGAAACATTACAGAAAATCCAGCAACAATATGGTGCAACTACTGCCAGTGAAGCAATAGAAAACACCTTCGCCAGCGTTGTAAAAGGTCTGAGCCAGCTAGGATTCAATACCTTTATTGTCGCAGGCGGCGAGACTGCCGGTAAGATAGTACAAAGCTTGGACATCCAACAATTCAGTATCGGTGCACCCATTGCTCCCGGAGTACCTTGGGTACACGATCGACAACACAATTATTGGCTGGCATTGAAATCAGGTAACTTCGGCAATATCGATTTCTTCCTGCATGTACAGGAGATGTTTCATGAGTGAACAAGCACTAAGGTCAGAGTTAGTCGAATGGGCTCGTTCAATGTTCTACCGGGGTTATAGCAGTGGCGGTGCAGGTAACATCAGCGCCAAACTGGAAGATGGCACGATTATCATCACGCCGACCAACTCCAGTTTTGGTGACTTGCAAGCGAATCGCCTGAGTAAGCTAGATGCAGAGGGTAATTGGCTATCCGGTGACAAACCCACAAAAGAAGTTTCCATGCATTTGGCCATGTACCGCAACCGTCCCGAATGCCATGCGGTGGTCCATCTACATTCCCCTTGGTTAACTGCCCTTTCCTGCCTATCCAATCTGGATAGAAGTAACTGTCTACCTCCGATTACGCCCTACTATGTCATGCGGGTCGGAAAACTGCCTCTGGTCAAATATCTGCCACCAGGAGATGAAAGAATCGGTGAAGAAATTGCGAAGCTGGCCGCAAAACACAACGCAATCCTCCTCTCGAACCACGGACCTGTTGTCGGCGGCAAAACTTTACGGCAAGCTTTTTTCAACGCAGAAGAATTGGAAGATACCGCACGGCTCTATTTAACCTTATTGCCACACGGCTTCACGACATTAAATGAAGAGCAAGTCCAAGAACTTGAAACTCGTTACCCAAAAACTGAGTGAACAAACAAGGAATTCGTCATGGCTAAATTCGCGGCAAACTTGAGCATGATGTTCAATGATGTACCTTTCACAGAACGTTTTGCCCGTGCAGCCAAAGCTGGATTTAAAGGCGTTGAATATCTGTTTCCTTATGAAGTCGCAGCGGAAGAGCTTGCTGCCCTATTAAAACAGCATCAATTAACCCAAGCTCTATTCAACATGCCCGCCGGAGACTGGGCGGCGGGAGAAAGAGGAATAGCCTCTATGCCTGGCCGTGAAAAAGAATTTGCCGCCGGTGTGCAAACCGCGCTGAAATATGCACTGGCGCTGAACTGCAAGCAAGTTCATGCGATGGCAGGAAAGCTGCATGAACACTTCACACCAGAACAACAACGTGAGTGTTATATCAGAAACATTCGATATGCCGCTGATGTGATGGCAGAACATAACATCAACGTATTAATTGAACCAATTAATACGCGTGATATGCCGGGTTACTTTCTGACAACTCAGCATCAAGCTGAAACATTACTCAAAGAAATTGACCGTCAAAATGTTTTTATCCAGCTAGATCTTTATCATTGCCAGATTATGGAAGGGGATTTGCTACGCACCATTGAACGTCTATGGGACAAATTCAGTCACATCCAGATTGCCTCGGTGCCCGAACGCCACGAACCCGATAGCGGCGAAGTGAACTATCCGTGGCTATTTAACAAACTGGATGAAATGGGCTATCAAGGGTGGTTGGGCTGTGAATATCACCCTGCGGGTTACACCGAAGAGGGTCTGGATTGGTTGACCAAAGCACAGAAATAATCAGGAGAAGATATGCTTCCATCAGAGCGTAGGGACTTTATTTATCGCTATGTACACGAATATCGGACAATTTCTATCAGTACACTGGTTAAACTGATGAATGTCTCACATATGACAGTACGGCGGGATATCCACACTCTGGAGGAAGAAGGAAAAGTCGTTAGTGTCAGTGGCGGTGTGCAACTTAGTGATGTTTTACGTCAGGAATTGCCTTGGAATGAAAAAGCCCAGCTTAATCATCGCCATAAGCGGGAAATTGGTCAATATGCAGTCTCTATGGTTGAAGATGGACAAGTGGTCTATCTTGATGCTGGCACCACCACGTTTGAAATTGCCAGAGTCTTGGCTGAGCGTTTTAACCTCACTATCATCACGAACGATTTTTCCATTACCCAATATCTGATGAACAAACCCCAATTAAATCTGTTCCATACCGGGGGGCAGGTAGATAAGAGAAATCATTCCTGTGTTGGCCCTATCGCCGCCATGCTGCTTCGCAATCTAAATGTGGATATTGCCTTTATTAGCACCAGTTCATGGGATCTAGAGCATGGTGTCTCCACGCCACATGAAGAAAAAGTATTAGTCAAACAGGCAGTATTGGAAATCGCCCGCCGTCGTGTTTTGGTATCTGATAGCAGTAAATATGGCAAATACGGCATGTTTCGGGTCTGCCCGCTTGCAAGTTTGGATGATATTGTCTGTGACAGCCAGCTTCCGCCGAAAGTGCAGCAACAATTACGAGAACACAACCTGGTATTACATACTGTCAGCGTATAAGGATAAAAACCCTATACCCTATGGATTTCAAGATGCACCGCGACGGCAAGGGAGTGAATCCCCGGGAGCATAGCAAACGATGTGACCGGGGTGAGCGAGTGCAGCCAACAAAGAGGCAACTTGAAAGATGACGGGTATATATAACCAAAGCTATTAAACAAGGAGAGTCGCAATGAAAGTCATAATCACTGGTGGAGCAGGTTTTCTAGGCCAGCAACTCGCCAGCACTTTGCTAAACAACCATCAAACATTAAATTTCGATCAACTTATATTGACCGATATTCAATGCCCTGTCTCACCGGTTAATGATCCCCGCGTCCAGTGTCTGGCATTGGATTTAACTCAATCAAGGGCTGCGGAAAAGCTGATCGATGAAAACAGCACGGTATTATTCCATCTCGCCGCCATTGTCAGTAGTCACGCTGAAAGCGATTTTGATCTTGGCTTGCAAGTTAACTTTGATGTTACTCGCAACTTATTAAACGTTGCCCGGGCTAAAAATCCAAAATTGAAATTTATTTTCACCAGCTCCTTGGCCGTATTTGGTGGAGAATTACCCGCAACCATTACAGATCAATGTGCGGTTAATCCTCAATCATCCTATGGTGCACAGAAAGCCATGTGTGAATTGATGATTAACGATTACTCCCGCAAAGGATACGTCGATGGCCGAGTTCTTCGTCTACCGACAATCAGTATCCGCCCTGGGAAGCCAAACAAAGCAGCATCCTCTTTTGCCAGTGCTATCATCCGTGAACCTCTACACGGAGAAAGCAGCATCTGCCCAGTTTCTCGCGATCTGACTTTATGGCTCTCCAGCCCTGAAACCGTGATCCACAACTTTATACATGCGGTTCAAATTCCGGCGGAAAAATTTGGTCTTTCCCGCACAGTCAATTTACCGGGTATTAGTGTCACGGTTCAGGAGATGATTGATGCACTGGCAGAGGTTGCCGGGCAGAAAGCGGTGGAACTCATCCGCTTCGAACCAGACGAAAACATTAACCGTATTGTTGCCAGTTGGCCGGGTCATTTCGATATCAGCCGTGGCTTATCACTGGGTTTTCATGCTGATAATACTTTCAGTGATACAATCCGTGCCTTTATTACCAATAACCTGTCCCAAACTGGAGGCTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_14 >NC_005126|2948274:2956586|2951958_2953236_+|WP_011146731.1|DBSCAN-SWA MTIKLGVIADDFTGATDIAGFMAQSGWRVVQLLDTPDENIAIPQDIDAIVISLKSRSCPIDEAVNNAVKSCRWLRQKTGCQQIFFKYCSTFDSTSKGNIGPVTDALMDELQTDITLISPALPVNGRTVIHGHLFVNGQLLNESGMQHHPVTPMTDANLLRLIEQQAQGKADLVDLACVHQGEQAIRVRLNHLQQQNIRYAITDTLSMNDLLPIARAASALKLITGGSGLGAALASTDTGKPLMPYQPEGATPPAENRRTVILSGSCSVMTNKQVALYQKFAPTKALNIDSCINDPQYAEKLVAWVIQQSENYLAPMLYTTHLPETLQKIQQQYGATTASEAIENTFASVVKGLSQLGFNTFIVAGGETAGKIVQSLDIQQFSIGAPIAPGVPWVHDRQHNYWLALKSGNFGNIDFFLHVQEMFHE >NC_005126|2948274:2956586|2951053_2951959_+|WP_011146730.1|DBSCAN-SWA MSQSIQKIGIIGLGAMGMGIARALIRAGIPTYGFDLNQKACDQLLQAGAKAATNNAANWASELDAILLVVVNGAQIESILFEGETPLVNQLKAGTIIVLHSTVAAEQAKDFAHRLSQHNLNMLDAPISGGALKAEQGQLTVMASGEPALFEQLKPVFDATTERLYHVGNEIGQGSTVKTIHQLLAGIHIAAAAESMALAAKAGISLELMYDIVTHAAGNSWMFENRVPHILAGDYTAKSSVDIFVKDLRLVLETGRDLKLPLPLSATAHQMFLTASNEGFGQWDDSAVIKTFKGITLPEKK >NC_005126|2948274:2956586|2948274_2949123_+|WP_011146727.1|DBSCAN-SWA MQHQHIQKKILRTICPDAKGLIAKITNICYKHQLNIVQNNEFVDHRTGRFFMRTELEGIFNDETLLADLDDALPVGSQRELNSAGRRRIVIMVTKEAHCLGDLLMKSAYDGLDVEIAAVIGNHATLQSLVEQFGIPFHLISHEGLTREQHDEKLIAQIDQYKPDYVVLAKYMRVLTPEFVQHYPNQIINIHHSFLPAFIGARPYHQAYERGVKIIGATAHYVNDNLDEGPIITQKVINIDHTYTAEDMMRAGRDVEKNVLSHALFWVLAQRVFVYGNRTVIL >NC_005126|2948274:2956586|2955620_2956586_+|WP_011146735.1|DBSCAN-SWA MKVIITGGAGFLGQQLASTLLNNHQTLNFDQLILTDIQCPVSPVNDPRVQCLALDLTQSRAAEKLIDENSTVLFHLAAIVSSHAESDFDLGLQVNFDVTRNLLNVARAKNPKLKFIFTSSLAVFGGELPATITDQCAVNPQSSYGAQKAMCELMINDYSRKGYVDGRVLRLPTISIRPGKPNKAASSFASAIIREPLHGESSICPVSRDLTLWLSSPETVIHNFIHAVQIPAEKFGLSRTVNLPGISVTVQEMIDALAEVAGQKAVELIRFEPDENINRIVASWPGHFDISRGLSLGFHADNTFSDTIRAFITNNLSQTGG >NC_005126|2948274:2956586|2954680_2955448_+|WP_011146734.1|DBSCAN-SWA MLPSERRDFIYRYVHEYRTISISTLVKLMNVSHMTVRRDIHTLEEEGKVVSVSGGVQLSDVLRQELPWNEKAQLNHRHKREIGQYAVSMVEDGQVVYLDAGTTTFEIARVLAERFNLTIITNDFSITQYLMNKPQLNLFHTGGQVDKRNHSCVGPIAAMLLRNLNVDIAFISTSSWDLEHGVSTPHEEKVLVKQAVLEIARRRVLVSDSSKYGKYGMFRVCPLASLDDIVCDSQLPPKVQQQLREHNLVLHTVSV >NC_005126|2948274:2956586|2953228_2953870_+|WP_041380095.1|DBSCAN-SWA MSEQALRSELVEWARSMFYRGYSSGGAGNISAKLEDGTIIITPTNSSFGDLQANRLSKLDAEGNWLSGDKPTKEVSMHLAMYRNRPECHAVVHLHSPWLTALSCLSNLDRSNCLPPITPYYVMRVGKLPLVKYLPPGDERIGEEIAKLAAKHNAILLSNHGPVVGGKTLRQAFFNAEELEDTARLYLTLLPHGFTTLNEEQVQELETRYPKTE >NC_005126|2948274:2956586|2953888_2954668_+|WP_011146733.1|DBSCAN-SWA MAKFAANLSMMFNDVPFTERFARAAKAGFKGVEYLFPYEVAAEELAALLKQHQLTQALFNMPAGDWAAGERGIASMPGREKEFAAGVQTALKYALALNCKQVHAMAGKLHEHFTPEQQRECYIRNIRYAADVMAEHNINVLIEPINTRDMPGYFLTTQHQAETLLKEIDRQNVFIQLDLYHCQIMEGDLLRTIERLWDKFSHIQIASVPERHEPDSGEVNYPWLFNKLDEMGYQGWLGCEYHPAGYTEEGLDWLTKAQK >NC_005126|2948274:2956586|2949553_2949967_-|WP_011146729.1|DBSCAN-SWA MLYPIAIEIGDENHAYGVVVPDISGCFSAGDSMEDAIKNSKEAITGHLELLAEMNQLPPEAKSLDYWIKDEEYAGWAWAVIDIDVEPYLGKSTKFNVTLPDLLSKKIDDQVKASPNLYKNRSHFLQVAALHELQNSI |
8 | Escherichia_phage(57.14%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
2965715 : 2980853
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NC_005126|2965715:2980853|DBSCAN-SWA 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13 | Cyanophage(100.0%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
3110949 : 3124193
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NC_005126|3110949:3124193|DBSCAN-SWA 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12 | Tupanvirus(44.44%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
3409530 : 3466582
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NC_005126|3409530:3466582|DBSCAN-SWA 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87 | Haemophilus_phage(17.02%) | head,plate,holin,integrase,lysis,terminase,tail,transposase | attL 3409319:3409378|attR 3456149:3456251 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_18 |
3509123 : 3537385
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >NC_005126|3509123:3537385|DBSCAN-SWA 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27 | Salmonella_phage(18.18%) | plate,tail,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_19 |
3617378 : 3722172
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >NC_005126|3617378:3722172|DBSCAN-SWA 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57 | Tupanvirus(18.18%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_20 |
3777826 : 3956324
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >NC_005126|3777826:3956324|DBSCAN-SWA 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109 | uncultured_Caudovirales_phage(15.0%) | tRNA,tail,plate,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_21 |
3959756 : 4077258
Sequences of DBSCAN-SWA_21
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21 >NC_005126|3959756:4077258|DBSCAN-SWA 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131 | Burkholderia_virus(15.85%) | protease,head,plate,capsid,integrase,lysis,tRNA,terminase,tail,transposase | attL 4006395:4006425|attR 4085185:4085215 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_22 |
4080519 : 4089619
Sequences of DBSCAN-SWA_22
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22 >NC_005126|4080519:4089619|DBSCAN-SWA AATGTTCACATATATCTGTGTCTTTGAGCCGACAAAAAAAGCTCAAAAAAATGGAGCCGTACCACTTGCAATTGCACTCGAAGCCAATTCCGAAAAAATGGCTAAAGCTATGGCCATTGTTTACCTTGGGGAAGAGTACGCGGACGATATGAGCAACTTCAACACATCAAAACCGATTATTTGTAAAGATATACAAGGCTTCCCTCGCCCACCAATTGGTAAATTTGATGAAAAATTTGCTACTGAATACGAGTTCAACGGCACCACATGGCAGGCTAGAACGCTCGAACCAAAGAAAAACCCATCTATTACTACACGTGATTTTAATCACACTTACGCCACGTTAGATCTGGAAATTGCACTGGCATTACTAGACGGTGACTTTCATTGCTGGGCGATTATGTCACACAGTATGAAAGAAGCTAAGCAACTGATAACAAATAACAATGAAGCATGGCGGCAGTGGTCTACCGCATTTCGTATCAGAACCGACGCTCTGTCCATTCCACGGGAAACGCTTTTCAGAGTCGTACGTGAAGGTAAACACCACCCTGAATTTCTGACCGATGCCGTCGCTATTAAGGAATTCTTAAACTGTACTTTAAGTGATACCGACATACCCGTTGAATTACCAGAAGAGAAACCCAAGGTTTCCAATTATTCGGTGTCAACATCAGAAGCCTCAATAACAGATGTCACTCCAGATGAAGTTGAAACCCAACAGGCAGCGCTACAGGTTAAGGAGAAAAAAAGCGAAGCCAAGTCTCTCAAGACCAGAAAAACCAAGCAAACCAAAGAGGACAAAGCAGTAGAAGAGACTGCACAAGACAACACTACGGCGGATGATGAAGTCACCTCATTGCCTCCTGTCGCCACCCTGAGCACCAATGATGATAACTTCCAACATCGGGCCAATTTGCTGGAAGAAACTATCAAGGCACAAGGCAATGAACAGCAAACTAATCTCCGTATCTGGAAGGCTGTCCAACGTACCGATCCCCACTTTACAAAACCATTGGAGGGAATGGGGTTCAATGGTACAAGCATAAACAGTAACTATATGTTTATGCGGGCAACAGAACTATTCGGACCATTCGGTTATGGATGGGGCTGTAATGTCACAGAAGAAAAACTGATCAATGGTGCACCCATGTCAGAACCTATCTATGACGACAAAAATAAACAAATTGGGAGCCGATTCTTACGTGATTCTGACGGCACATTAATATGTGAACAAAATCACTCTATCAAAATTCTCTTTTGGTATCTGGTTGAATGTGACATTTGTGCTGAAATTGAAAGTTATGGTGCGACACCATACATGTACAGAACCAAATATGGAATTAAAACAGATGGAGAGGCCATCAAGAAATCACTCACCGATGCTATAAAGAAAGCGTTATCGATGCTTGGATTTTCTGCTGATGTATTTATGGGTATGCATGACAACCCTGAATATCTGGCTGACAATAATATTGAATTTGAAATCAAGGCCGCCAGTGATAAGGCCGAGGATCTAGTCAGATTACGCAAGGAACTAGACGATAAGTTCACCCGTAATACAGAAACTATGCGCACCGCTGTCAGCAAAAATGAAATTCGCGGCATAGCATCTACCCTTATCCGTGAATTAAGCATTCATTTAGGCAATTCCAAGGCCAAAGGAGACAAGGATTATGAAAAGTACTTATCTGGTCGTCTGCGTCGCTTGAATGAAATAGAGAAAGAATGTTTAACCCAATTAGAAGAGGCAAACCAATGACCACAACCGCAATTGCATTAGCAGCAGATTATGAAAAATTACAACAGTTGGTAGAAACCGGCGAGTTCTCGCCAGAAGATATCGCCGATACACTTGAAAGTATCGAATGTACTATCGGTGATAAACTTGACGCTATCATGATCCATGTTCGCAATATAGAAGGCCAAGCCAAGATTCTTGCGGATGAGTCTAAGCGACTCACTGACCGTAAAAAATCATTCGAAAGGCAAGTAAAAAACCTAAAAAAGTATGCGCTGGACTGTTTACTGAAAGCCGGCATGGATTCACTACGAACTACCAGAAACACGTTCACAGCCAGAAAAGGTATTATGAATGTCATCATTGATGATGAGTCAAAATTACCTGATGAGTTAGTTGATGTGCAGACAATTACCGCCCCGGACAAAAAAGCCATCAAAGAAGCTATTGAAAACGGTATCAATGTACCGGGAGCTCATATTGAAATCGGCCAGAGAAGCCTGCAAGTACGTTAATATTCATTACATCCCACAAATACTGGGGCAATAAATAATATGGAGTGATTTATGGCTGCACGATTAGAAATCATTATCTCATTTGATGAAAACCTAAATAAATACCAAGTAGAATGGATAACAGGAGAAAGTCAAGATATTACAGATGAAGAAAAGAAAATCATTGCTCAATTAAAAAATAAATTACTGGCCTCAATGGAAAATGAATTAACTGGAAATAATCAACATTACCTCCATTAGATATTTAACATTACCTTAAATTAACACAAGGGAATAATATCAAAAAATAAATCCGGCAAGCATGTGGAATTTACGTTTGTATTTCTCGGCATGTGTCTATTAGATGAAAAACATGCAGCAGAATACGAAATTGAAGGTAAATTAAAAGAGACCGACCAATGTTAAGACATTCACACAGTAAAAATGAAATTGTTAAATTAACGCTACCTGATGGTCGCAATGGAATCATTATTATCAATAGAAGTTGTAATGTACTCTACGATTTCCCGTTTGACGTTAAAATAGTTCCAGTATCCAATTCTCAAGCTATCGAGAAAATGAGGGACCGAAAATGATATACGGTCTGTTTCTACTTGTATGTTCTTCGATAAACTGCCAATACATTCCTTACGGCCATATTTACCAGGATGAAAAAAATTGCATAGCCGATATGGGGATGCAAGGCCCTGGAATTTTTGAGTGTTTACCCATTGAGGCCATAATTCACACTCAAAACTGATTAAGCTTAATCAGAAATCAGGTAACACAATGAATAGCATGATGGTAAATCCATTGACCGGAGAACCATCATGCAACCCTGGCAACCAGGACAACAGTTATTAACCAACTTCGATATCAAATTGGGAAGATTAGCAGCCAGTGTCAAAAATACATCTTGCAATCAAGGTGATATTACCCGTGTTTGTGCTGCCGTTGATCTGATCATTATATCAATGATGAGGCAAAACCATGTGAGGTAAATAAATGGTAAATATTGAATGTGTTCCCATATCCGCTTATTGCTATGCAACAGGGGAAACAGTTGACTCAATTAATAAACGCATTCAGCGCGGTGTTTGGCTTGATGGCGTACATGTACTGAAAGTTGAAGGTGTTAAGGAACGCTGGATTGATTTAAATGAGGTAGCTAAGTGGGCCAGGAAAAACAGCGTAGTAAATTGCCCAGAGGAATTACAGTAAGGAAACATCGTTCTGGTGAAACTATAAATATCTCTTTTACATATAAGGGGTTAAATGCCGAGAACCCCTCTCAAATCTGGAAGTGACGCCCAAAAATATTAAATATGCCGAGCGTAAACTCGGCGAAATATACAATAAAATTGAACGGGATATTTTTATTTATGCTGAATTTTTCCCTAATTCATCACGTCTAAAAATATTCGGAAATGTCAATAAAGGTAGAACAATAAAAGATTATTTAGATGAATATTTAAAAATCTGTGAAACCAGAAATTTATCACCATCCACAATTAATGGATATAAAAAATGTAAAACTGCTCTATCTGAATTACATAAAATTCCCGTTGTAGAGTTAACACCAGCAATATTAAAAACTTGGATTCAAAAACGATCAACTGCTCTGAAAACGATCAGGAACAATCTATCATTTTTACGAAGCGCCATAGATGAAGCAGTTACTGATTGCCTGATTAGTATGAATCCTGTGAATTTAGTCACAGCATCACGGTATCAAACTGAACGAATAGAAAATGATAGCGAATATATTGTTGACCCCCTATCTCCTAACGAGGTTACTGCATTACTGTCAGCAGCAGGCAATAAACAAAAACAATGGGAAAATTTATTCCTTTTTGCGATACATACAGGACTTAGAAGCTCCGAGTTATGCGCGCTTCGGTGGCAAGATATCGACTTTATTGGCAAAACCGCACATGTCCAGTCGGCAAAAGTTGTGGGAATAATAAAAGGAACGAAGACAAAAGCCGGTACCAGAAAAGTCGAACTGAACACTGACGCTATGTCGGCCCTATTAAATCAGAAGGCATTCACTTTCATGAAAGGCAACGTGATATTTGAAGATCCTAAAACAGGCGAGGCTTGGGCAGGTGCAGATGCAATTCGTAAAAAAGCCTGGGTACCTACACTGAGAAAGGCTGGAATTCGGTATCGCAACCCATATCAGACAAGGCACACATTTGCAACAAAACACATTAGCCAGGGAGTTAATCTTTTCTGGCTTGCCGCTCAAATGGGACATAAAGGCCCAGAGATGCTTTTCAGACATTATGGATCATATCTGAAAGACTATGACGGCAGCACATACAAACCCAAGCAGGTCAGTGGTGGGACATGAAAGGAGCTGCAAAGGATACGCAGCGAAGATATTTCATAAAAATATTATTTATAACAATAAGATGCAAAACAATTAACGCGGGTTCAACTCCCGCCAGCTCCACCAAATAAATCAAGGGGTTACACTAAGGTGTAGCCCTTTTTGTTTGCCCAATGTCCACTTTGCGTCCACTCATTTTATTTTTATGGGCATCAATGGACACTACCTGCACCGCCGCATTCCGTCTGGTTCATCACTGAAACTACTTAAGATGCTTGAACGTAGCCTTACGCTTATTAATGAATTAAAAGTACGCTAACTAATACTTTCACTTTCTTCCTTGTCATAATGCAAAAGGAGAAAACAATTTCAGTTCTGTATATCCTGTAAAGCCGCGCTCTATCTGATTTCTATGATAAAGCACGGCTTTTCTTTGTGAGCTTATTTTTCACGTAAAATACAATTTTCATTTAATATCAATGCATTGGGATTTTTCCGTGATCCTCTTTTGATCCAAAAACTGAAATTTCCTGAAAATCTTTTCAATCATTTCAGTTTGTGATTTCTCCCACTCCGCCAGTATTGGCGCGGTTTGGCAGTTTGCCTTGTAGGATTTTAAAATTGAAAAAATTTTTTGATCCAAAACGTGCAGGCGGGTGCGGTGTAGTGCCGTTTTCATCATAAGTTCATTTATTTCGTCATAAGTGCAACGAGACAAACCATCACTAAGGTATTTATTTGATTCTTGAGTCAAATAATACAATCGGTTAAAGTAGTGTTGTCATTGGCAAAATCCAGTGACCAAGGTTTTGCAGCCTTGCGTTCATGGACGCTGGTAAGAAGTTTTTACCAATGTGCCTGCTATCGCCCCTCTATGGCGGTTCAGGCAGGGGAGGTTAACACCTCGCCGGAAATGAACGCCGGTCTGCAAACCCTGTTTGAATCGCCACCACCAAAGAGGGAAGCAGGAATATGAAAAAAGACTGGCATACCGCCGATATTATCGCTGCGATACGTAAGAAGAATAAAATGCTGGCATCATTATCCAGAGAGCACGGTTTAAGCTCTTCAACATTAGCAAATGCTTTAACGCGCCCCTGGCCTAAAGGGGAATTACTGATTGCTCAGGAAATTGGTGTCACCCCTGCTGAAATATGGCCCAGTCGGTATTTTGACGAAAATAAGCAGCCTATCAAACGAACTGTCCGAAATGATTTACCAAACAATTCTGATATCACATAAGTTATTTCTATATCCGAAAAAGTAACAACAACCTTTAAACCACTAAGCTAATATAACACGCTGAATTATCAGTTTTTTATTACACTCACTGCCCATTCTTTAATATCAAAATTGTATTCATAGCCCTATGAAGATGTAAAACAGCCCGCATATTTTGCGGGCGAGAGAATTAATCAATAATGTGTTTCAGACAATCAAAACACAAACCCGTAGCGCTGATTGATACCACATTATTGACCTGGTACGTATTGGTTTGATTGATAACAGTGCTGTATGCATCTGGTCGCAGTTTATCAGGATATAAAAAAGGCCACGTATTAACGCAGCCTGTTAATTAATGGTGATTTTCATTCAATGGACAAAGTTAACTGATGTCCGATAGCCGATGCGACCTTACCCACCGTATCAATTTTAGTTGAGTGCCGTAAATCAAAGATACGGGTCACTTCCTGCTTTTTCACCCCCATACGGTTGGCTAATTCAATTTGCGTTAACTTGGAATCAAGAAACGCATTGAGCATAAGCACCTTAGAGGCCACGCTTAAGGGCACATCAACATAATCCTGCCCTACGGGGCCAGGAAGCGGGATTTTTTCATTATCTTCGAAGTAAAATTCAAAAGCGGTTATTAGCGCATCGAGTGCCATCTCTAGCGCCTCTTCCCGTGTATCCCCCTGGGTTAAAGCTTCGGGGATATCCGGGAATGAGACGAAATAACCGCCCTCTTCTACTGGCTCTAGTGTGACTGGATATCGCATATTTTTAATGATGAACCTGTGCGAGAACCCGCCCCTTGCGAGGCGGGTTTTTATCACAATCCTAATTGCTTAATGATTGCTTTCCTCAGCGGCTCTTTGATCTCTTGGCTAGGGTGTCTCGGCATAATGCTTCGTTTCCCCTGGTATCTCAGTTTCAGATGGTTTGTCCCATTTGAAACTTCGACGCCTTGAGCTTCCAGCCACCGTCTAAACTCGCTTTGCTTCACCACTCCTCCATTCTGTTGAACACACAAACACAGTAAACATTTATGCTTACCATGTCAACACTTTTGTTTACCACGTAGAAAAGGTAAAAATAAACCTTACCGAAGAGAGGCCAATCAATCTAGCCAATCACAGGCGAATACTTCTGTTTCAATCCATCGGATTTATAGCCCGTGTTCCTTATCACGCTGGCGTTCTCCGGCGCACCTGTGTTGTGGTGCGTATGGGCGGCAGTCTGTTCCGCCAGTGCTTTAACCACATCCAACGTCTCTAAATCAAGGTCATGACATTGATTTGCTGGCTGCCCACCCAAACCACGGGCGCGATGATTTCTTGCCTGGCACCGGCGATGCTCTGCTTAAGCAGACCAATCTTCTCTATCAGCTTTTGTCCGATTTCGATACTGGCCTCTTTCCCTACGCTGGCAACGAAATTTGATGAGGTCGCCATACTATAGTCACCGTCTGCAATTTGCCGGACAGCGCCCGCCAATAGCGTAGACGTGCCCAAAACCGTGGTTTTATCCGTGGCCTGTATCGTGGTTTCCCGTGCGACTACGTTACGTGTTTCCGTGTCTGCCCTGACTTCACGGTGCATAGACGATTCATTAATGGTCTGGTCAGTCTGACGAATCCAGTTTCCTTCCTGAGTTACCCTCTGAGAAACTTCCGCCCGCTGTTGCTGCAATTGTTCGCCTGGCTTGATATCGGGCAAGGTATTGCCCTGGCTTAATGTCTGCCGGATAAAGGGCTTATCCGGTCTGCCTGCCTCAAAGGCGATTTCAACCACCGTTCCGACTGGCGGATATTGAAACATACCGGATTCACTGCCCGCCATCGGCAAAGGCAGCGGGACAGCATGATAAACAGGAACCGCGGCATCCTGACCATCATCAGCCAATAATTGCACATCAACCGCATAGCGTGGCCGGAATGAGTCGGAGATATCGCCGCTGACCGTATTTTCAGGGTGTGCCTCAATGCGGGCAAATTTGGGTAAATGCAGCCCTGCCGATAATTCGGGGTAGGCGGCATCAATCTGACGCTGCATTGGCGTTTTGGTCTGCGACTGACCGGTCAGTTTGTTGACGGCTTCCCATGTAATGACCATGTTTTCATTGTTCAGATTGACCTTGTTCAACCGGTACTGATTGATCACTACACCTGGACGCAACGATGGGATCATGGGAATGGTCATCGCATTGCCTGCGGACTGGCACTGGCTAAATGCATTGGGGATCTCTACCGGTTTCCCCGCAAACATCGAATGCGCCCCGCTGCCCACATAAACCGAACCCTCCGGCAACTGATGCCAGAGATAATCCTCAATCGAAAAAACCTGCCCAAGATTAGCCAGCAACTGATAGCCGGTCCCATGATGAGTAAAATGCGGGATGGGTGTCTCCGTATAAGGGGCATCCGGCAATATGAAGGTCAGTCCGCTGTGCTCCTGCAACCAGTCCACAATCTGGCTCAGTGTTGGATGCTGAAATGAACACGACCATAATCGGTCAAACACACCAACCAGTTCACGCACAAAAAGACGCTGATAACCGTTTTGGGCTGGCTGTGAGCGTGCCACATAACCCGTAAACCAGCGTAATACCAAATCCGTGTAACCCACGTCCAGCCGTACCAGTTTTCCGGTGTAGTCCGTTGTCGTCTCCGCCGTGATAAAGCCACGACCACAGGATGCCAGCTCCAGCATAATATTGGCGTCAACCAGGTGAATTTCATCACCGGAAAGATAGAGCCGGTTAATCGGTGTCATTATTTAGCCGGTCCTATTGTGTCATTAATCGGTTTCAATACTTTGCTTTCAAACCAGCTTAATTTTTCCGGCGCTTCTTTTGCGGCGGCGGCCCCCTGACCTGTTTGCTTTCTGGCCTGAATATTATCGGCAGCACGGGCATCACGTTTCTCAGCAACAGATAAATGTTCACGTAAAGTAAATGTGACCTGCCATGCCTGTTTACCGTCGATCTTACTGGCATCAATGGTATGGGTGAATGTCCCGATGCGAAAGTTGATAGCACCTGCGGTCAGGTTAGCGACACGATAACGTTTCAGACTTCCCTTATCTTTGGCCTCCGCCAGTGCAAACAGGCGTGACAGCGTTTTTTGCTCAGTAAACGGAATGATCCCCGTAACACGTAACTCCTTGGGCTTAATACCTTGCTCCGCTACGGCGGTACTGGATGACTGGCCGCTTTGGTCTGTGTCCTGAAATACCACCGATGGGGTTACGGTCAGACTTTTTAATGGGATGGCCTCGCCATCAAGGGCCAGTGTGATAATTTGGCTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_22 >NC_005126|4080519:4089619|4082825_4083014_+|WP_011147664.1|DBSCAN-SWA MAARLEIIISFDENLNKYQVEWITGESQDITDEEKKIIAQLKNKLLASMENELTGNNQHYLH >NC_005126|4080519:4089619|4083758_4083974_+|WP_011147666.1|DBSCAN-SWA MVNIECVPISAYCYATGETVDSINKRIQRGVWLDGVHVLKVEGVKERWIDLNEVAKWARKNSVVNCPEELQ >NC_005126|4080519:4089619|4085833_4086064_+|WP_011147669.1|DBSCAN-SWA MSQIIQSVKVVLSLAKSSDQGFAALRSWTLVRSFYQCACYRPSMAVQAGEVNTSPEMNAGLQTLFESPPPKREAGI >NC_005126|4080519:4089619|4086060_4086330_+|WP_011147670.1|DBSCAN-SWA MKKDWHTADIIAAIRKKNKMLASLSREHGLSSSTLANALTRPWPKGELLIAQEIGVTPAEIWPSRYFDENKQPIKRTVRNDLPNNSDIT >NC_005126|4080519:4089619|4082276_4082774_+|WP_011147663.1|DBSCAN-SWA MTTTAIALAADYEKLQQLVETGEFSPEDIADTLESIECTIGDKLDAIMIHVRNIEGQAKILADESKRLTDRKKSFERQVKNLKKYALDCLLKAGMDSLRTTRNTFTARKGIMNVIIDDESKLPDELVDVQTITAPDKKAIKEAIENGINVPGAHIEIGQRSLQVR >NC_005126|4080519:4089619|4087141_4087315_-|WP_011147672.1|DBSCAN-SWA MKQSEFRRWLEAQGVEVSNGTNHLKLRYQGKRSIMPRHPSQEIKEPLRKAIIKQLGL >NC_005126|4080519:4089619|4080519_4082280_+|WP_011147662.1|DBSCAN-SWA MFTYICVFEPTKKAQKNGAVPLAIALEANSEKMAKAMAIVYLGEEYADDMSNFNTSKPIICKDIQGFPRPPIGKFDEKFATEYEFNGTTWQARTLEPKKNPSITTRDFNHTYATLDLEIALALLDGDFHCWAIMSHSMKEAKQLITNNNEAWRQWSTAFRIRTDALSIPRETLFRVVREGKHHPEFLTDAVAIKEFLNCTLSDTDIPVELPEEKPKVSNYSVSTSEASITDVTPDEVETQQAALQVKEKKSEAKSLKTRKTKQTKEDKAVEETAQDNTTADDEVTSLPPVATLSTNDDNFQHRANLLEETIKAQGNEQQTNLRIWKAVQRTDPHFTKPLEGMGFNGTSINSNYMFMRATELFGPFGYGWGCNVTEEKLINGAPMSEPIYDDKNKQIGSRFLRDSDGTLICEQNHSIKILFWYLVECDICAEIESYGATPYMYRTKYGIKTDGEAIKKSLTDAIKKALSMLGFSADVFMGMHDNPEYLADNNIEFEIKAASDKAEDLVRLRKELDDKFTRNTETMRTAVSKNEIRGIASTLIRELSIHLGNSKAKGDKDYEKYLSGRLRRLNEIEKECLTQLEEANQ >NC_005126|4080519:4089619|4083583_4083754_+|WP_011147665.1|DBSCAN-SWA MQPWQPGQQLLTNFDIKLGRLAASVKNTSCNQGDITRVCAAVDLIIISMMRQNHVR >NC_005126|4080519:4089619|4086677_4087088_-|WP_036808644.1|DBSCAN-SWA MRYPVTLEPVEEGGYFVSFPDIPEALTQGDTREEALEMALDALITAFEFYFEDNEKIPLPGPVGQDYVDVPLSVASKVLMLNAFLDSKLTQIELANRMGVKKQEVTRIFDLRHSTKIDTVGKVASAIGHQLTLSIE >NC_005126|4080519:4089619|4089082_4089619_-|WP_041380260.1|DBSCAN-SWA MSQIITLALDGEAIPLKSLTVTPSVVFQDTDQSGQSSSTAVAEQGIKPKELRVTGIIPFTEQKTLSRLFALAEAKDKGSLKRYRVANLTAGAINFRIGTFTHTIDASKIDGKQAWQVTFTLREHLSVAEKRDARAADNIQARKQTGQGAAAAKEAPEKLSWFESKVLKPINDTIGPAK >NC_005126|4080519:4089619|4085554_4085770_-|WP_049789790.1|DBSCAN-SWA MMKTALHRTRLHVLDQKIFSILKSYKANCQTAPILAEWEKSQTEMIEKIFRKFQFLDQKRITEKSQCIDIK |
11 | Pectobacterium_phage(37.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_23 |
4179207 : 4187673
Sequences of DBSCAN-SWA_23
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23 >NC_005126|4179207:4187673|DBSCAN-SWA ATCAGTGATGTATTTGTTCAAGTTCGTTCTGGCTCAACCCTGTACTTTTCATTATCGTTTCACGATCGATACCATTATCCATCAATGCACGCGCGATTTTCAGACTCGCCCGTTTTTCACCTTTCTCTTCACCTTTCTTTTCACCTTTCTTTTCACCTTTTTTTTCACCTTTCTGTAATCCTTCTTGAAGCCCTTCTTCGCGTGCGTCTTGACATTTTTGAAGCCCTTCCTTAAGCCCTTCTTGATGTCCTTTATGTTGCAACTTCTGCGCTATTGTCATCAGTACCTCCTCATACTTCGGGAACTGTTCTGCCAGTTGCCGGATAAAACCTTCTGGATCGGCGGTATCTCCCACCAGTAATATGTAGTTTAGCATGCTTTTTAGCAGCTCATATGTATAATAATCATACGCAAACAACATGGTCAGCTCTTGCTGTAACTCCGCCATATCACGTTGCCGGATATGTTTTTGTACTATTTCCAGTAGTGCAACTCGTTTGTGCGTCAGGATTTCATCATCCGGGATTACCGTCACATCTACCAACGGAAACGCGCTGGAATAGATCTCTTCTGCCAGAGCCGAAGCATCGAAGCAATCGAACCAGTTGGTACTCCACGGATATGGCCGTATTTTTCCGTGATAAAACAACACTGGAATGACCAGCGGCAATTTTTTATGTCCCTGCTCCAAATGCCATTGCATGGCTGAAATACTGTAACGCATCAGCCGGAATGCCATCATCTTATCCGGGGAACTCTGATGTTCAATCACACAATACACATAACTCTCACCCTGCGTAGTTTTTAGTGAATACAAGATGTCGGAATAATGTACCCGCAGATTGTCCTCAATAAATGACCCCGATTCCAGTCGCAGTGTATCAAGATCACAAACTGCCCGTAATGTGGCAGGTAAGTGTATCTCTAGAAAATCCCTGGCAGTATCAATATGACTTAAAAACTTTTTAAAAATAGCATCATGTGGCGTCGGTGTATTTTTTCTTTTCATAAGAGGATAGTAGCATATTTTCTTTTATATTGAAGGAATATTAAATAAATACCGTTTGCGGCTTGAATGCCGAAACGGTATTTAAGCTAACAATTAATGAACTTCGGTTAAATAATTCAGCAATAGAACATTTTTAAAAAATACACTTAATTAATCGAATCAAGCCTAATTAATTATTTTACGGAATTAATTAACTGTTTCTCTTAATATGATCTTACAGCAGATTTTAATGCCCTAATATCCGAAGCACAGAGATAGGGTTTTAAAGCATTAAATTTCTCTTCTGACCAATCATATATTTTTAACGCAAGTAGCTCATTGATAATGTGCGGCGCAAAGCGATATTTAACTAATTTAGCAGGCGTTCCAGCAACAATACTATATGGCTCAACATCTTTAGTGACAACGCTATTAGCAGCAACGATAGCGCCTTCACCAATAGTAACGCCAGGCATAATCATTGAACGCATGCCAAGCCATACGCCATCATGAATATGCGTGTCACCTTTGCCTACGTATGCCTCTTCGATGTATTCCATGAATGGATATAAACAGAACCAATCCGCTCTGTGCGTATTATTTCCACCCATAAGAATGATAGTTTCAGCACCTATGCAAACATAATCGCCAATATACAATTTATCAATTGGCCACTTAGACTCCCATTGAAGACTGATTTTATCACCGTATAAATAGCGAACGACAGATTCTTCAAAACCGCCACTCCAGCAATCGCTATAATAGCTATGGGTTCCTTTGATGACAATACTCTGATTAGTTACAGCTTCATGTAGGAATTGAATTTTTGACCAATGTTTTTCTTTCATGGTAAATAGTCTGTCTCTATTAATTATTCATTTACCATAGAATGCTTTCTATGGTGATGTATCCGCATTCAAAAATACATCACGCCTAGCTGATTCGGGGTTGATTTAATAACGGGATTCTTTTCATATTAGACAATGAGTTAGTTATTAATTTATATCGATTATTATACGTAAATTCTTTTGATTTAATTTACATCATATCAAAAGGTATATTTTCAATGCGACAGCATTTTCTAGAAAGAATACAAAACTGGAGCGAGCGAAGGGAATCGAACCCTCGTATAGAGCTTGGGAAGCTCTCGTTCTGCCATTGAACTACGCTCGCTTAAGGATAACATAAATTATTATAGCGACTTCGTTAGCATCAGCAAGCCATTATCTGCTTAAGTTGTCTATATTTCAGGCAGTTGAAAATAAAAACTCCCCTGACAGCTATGCTATAGAGGAGTTTGAATTTGAAATTTAATTCAAACGGTTATTTCTGCGGGCGCATTGCCGGGAACAGAATAACATCACGGATGGTATGGCTATCTGTCAACAACATTATCATACGGTCAATACCAATGCCCAAACCGGCGGTTGGCGGCATACCGTGTTCCAAAGCCGTTACATAATCTTCATCGTAGAACATGGCTTCGTCATCACCTTCGTCTTTCTGACGAACCTGCTCAGCAAAACGTTCCGCCTGATCTTCGGCATCATTCAATTCCGAGAAGCCATTACCAATCTCACGTCCACCAATAAAGAATTCAAAACGGTCAGTGATAAACGGATTTGCATCATTACGACGCGCTAGCGGAGAAACTTCTGCCGGATATTCAGTGATAAATGTCGGTTGAATCAGGTGGCTTTCCGCCGTTTCTTCAAAAATTTCACACTGAACACGACCAAGGCCCCAACCTTTTTCCACTTCAATACCAAGAGATTCAGCGATAGCCACCACCTTATCCATATCATCCAAATCAGCTATGTTGGTTTCAGGACGATATTTGCAAATGGCCTCTTTCATGGTCATTTGGGCAAATGGTTTACCGAAATCGAATTCCTGCTCACCATATTTAACCAGAGTATTCCCCAAAATATTCTGCGTCAGTGTACGGAATAGCTCTTCTATCAGGACAATCAGATCTTTGTAATCCGCATAGGCCATGTAGAGTTCCATCATGGTGAACTCAGGGTTATGGCGCGGAGATACGCCTTCGTTACGGAAGTTGCGGTTAATTTCAAAGACACGTTCAAAACCACCAACAACCAGACGTTTCAGGTAAAGTTCCGGCGCAATACGCAGATACATATCAATATCCAGCGCATTATGGTGAGTAATAAATGGACGAGCCGCCGCACCACCAGGGATTACCTGCATCATGGGTGTTTCCACTTCCATAAAGCCTTTACTGACCATAAAGCTACGCAGGGCCAATAAGACTTGAGAGCGAATTTGGAAAGTTTTGCGCGATTCTTCGTTGGCGATCAGATCCAGATAACGCTGGCGATAGCGAGTTTCCTGATCAGCCAAGCCGTGGAATTTATCCGGCAATGGACGCAGCGCTTTTGTCAGCAGGCGCAGTTCAGTACAGTGAATGGAAAGTTCACCGGTTTTGGTTTTAAACAGTTTGCCACGAGCCCCCAGAATGTCTCCCAGATCCCATTTTTTAAACTGTTCGTTATAAATACCTTCCGGCAGATCGTCACGGGCAACATATAACTGAATACGACCGCCCATATCCTGTAGCGTTACGAAAGAAGCCTTACCCATAATGCGACGCGTCATCATACGACCGCCAACCGTCACGTCAATATTCAGTGCTTCCAGCTCTTCCTGAGTTTTGTCGTCGTATTTCGCGTGCAAATCTTCTGAAATATTTTCACGACGGAAATCATTCGGGAATGCAATTCCATTCTCCCGTAAAGCGGCAAGTTTTTCGCGGCGAGTTTGCAGCTCATTATTTAAATCGGGGGCCTGTTCCGCACCCTGTTGTTGTTGTGACATTTTAGTTCCTCATAAGCCAGCTTTCAGGCTTGCTTCAATGAATTTATCGAGATCACCATCCAGCACCGATTGTGTATTGCGAGTTTCAACGCCGGTGCGCAAGTCTTTGATGCGTGAGTCATCCAGAACATAAGAGCGAATTTGACTACCCCAACCAATATCGGATTTATTCTCTTCCATTTCCTGTTTATTGGCGTTCTTTTTCTGCATTTCCAGTTCATACAGCTTCGCTTTTAGCTGTTTCATCGCCTGGTCTTTGTTTTTATGCTGAGAACGATCATTCTGACACTGAGTCACAATGTTGGTTGGAATATGGGTAATACGCACCGCAGATTCTGTTTTGTTAACGTGCTGACCACCCGCACCAGACGCGCGATAAACATCAATACGTAAGTCTGCCGGATTAATTTCAATATCAATATCATCATCCACTTCGGGATAGATGAAAGCAGAACTGAATGAAGTATGGCGACGACCACCAGAATCAAATGGGCTTTTACGTACCAAGCGGTGAACACCGGTTTCAGTACGCAACCAACCATAAGCATAATCGCCCATGATCTTAATGGTCGCTGATTTCAAGCCAGCAACTTCACCATCTGATTCTTCAATGATTTCCGTTTTAAAGCCTTTGGATTCAGCCCAACGCAGATACATACGCATCAGCATACTTGCCCAATCTTGAGCCTCGGTGCCACCAGAGCCTGCCTGCAAATCAAGATAACAGTCAGCACTGTCGTACTCACCAGAAAACATACGGCGAAATTCTAACTGACCCAATTTTTCTTCAAGCTGCTCCAGCTCTACCACAGCTTCATTAAAAGTCTCTTCATCGTCAGCTTCTACTGCCAGTTCCAGTAAACCTTGTACATCTTCCAGTCCCTGCTCAAGCTGATCAATTGTTTCGACAATCTCTTCTAATGAGGAGCGTTCTTTACCCAAAGCCTGTGCCCGCTCCGGTTCATTCCAAACATCAGGCTGTTCTAATTCAGCATTAACTTCTTCTAAGCGCTCTTTTTTGACATCGTAGTCAAAGATACCCCCTCAGAACCGTTGTCCGCTCAGACAGGTCCTGAATGTGGTTTTTTACCGGATTAATTTCAAACATATTTTCGTGTCTTACGTTATGTAGTCGTAGATAAATGGATAATTTTCGAACCGCGTATTGTAACGGATTCGGCACAGGGTTTATAGCACTTCAACAGATTTGTCACGTATTCATACGAGAGTACGTGACAATGACTGACTACCTGCCGATCAAACGGTTAATAGGGCCAGAGATGTTGGATCAAAAGCTGTACATTACGGTTGCCACGAAATTCATTAACATCCAGTTTATAGGCAAGTTCTACTTCGCGGACACTGTTATCGGGCCAGCGGGTAGGATCGATATTGAACGCAATACCATCCAGCATCGGCCCACCGTTTAATGGCTCTACTATCACTTTTAAATGGCGCTCTCCAACAATGCGCTGTTGCAGTAGTTTGAATTTACCGTCAAAAATTGGTTCCGGGAATGCCTGACCCCAAGGACCGCCATCACGCAACATTTCTGCAATGTCCAATGACAGTTCATTAATTGCTAATTCACCATCACTCCAGATAACACCTTCAAGTTGCGAAATATCTAACCAATCCGCCATTAGCGTAGAAAAGTGATACTGAAATTGTTCGAATTTATCCTGTTCAAGTGACAAACCGGCCGCCATTGCATGACCACCAAATTTAAGTATCAAACCCGGATGCAAAGTATCAAGCCGCTCAAGCGCATCCCGCATATGCAATCCCTGCACTGAACGACCAGAACCTTTCAAAATACCGTCACCGGCCGGTGCAAATGCGATAACAGGCCGATGAAAACGCTCTTTAATCCGGGAAGCCAAAATTCCGACTACCCCTTGATGCCATTCTGGATGATAGAGCGCTAGCCCATAAGGCAGTTCAGTGCTGGTACGTTCAAGTTTGTCACAGATTTGCAGTGCTTCCTGCTGCATTCCCTGCTCTATTTCACGCCGAGTCTGGTTAAGACTGTCCAATTCACAAGCTATCTGACGCGCCTTTGCTATGTCGTCAGTGAGCAATAACGTGACGCCAATGGACATATCATCAAGGCGACCAGCGGCATTCAGTCTTGGTCCCAGAAAAAACCCCAAATCGCTGGCTGTCAGCTTATAAGCATCACGGCTGGAAACTTCCAATAATGCACGTATCCCCGCACAACAGCGTCCTGCACGAATTCGGTTCAAGCCCTGATAAACCAGAATCCGGTTATTGGTATCTAAAGGTACAACATCGGCAACAGTTCCTAACGCAACCAAATCCAACATTTCGGCCAGATTCGGCAGCGCTATTCCTTGCTTTTCAAACCATTGATCTTTTCTCAGTGCCGCCCTTAAGGCAGACATCAGATAAAATGTGACACCCACCCCGGCCAATGATTTCGACGGGAACGAACAATCGGCAAGATTAGGATTAATAATGGCATCAGCCGCCGGCAAAACGTCACCCGGCAAGTGATGATCCGTGACAATCACTTTCATACGGTGCTGATGGGCAGCCGCAACCCCTTCATGGGAAGAGATACCATTATCCACGGTAATAATCAGGTCAGCGCCTTTTTTAACGACCTCTTCTACCACCTGTGAGCTTAAACCATAACCATTGTCAAAACGATTTGGTACCAGATAATCCAGATGGCGATATCCCATCGAGCGTAATGATCGGATCGCCAATGCCGTGCTGGTGGCCCCATCAGCATCAAAATCACCGACAATAACGATACGCCAGTGTTCATGAAGTGCAGTCAACAAGAGTGCCACCGCCTGTTCCACACCACTTAGATGCTGATAATTCAATAATCCTTGAACACCACGCTCCAATTCATTAGCTTGCTGGATACCACGAATGGCATATAAGCGACGCAGTAGTGGATGAATCTGTTGTGGAAGGTGACTGTCATTCACCGCCAAGCGGCGGCGAAGTTGTGTTTCAATATTCACTAAACTGATTTACCACGTTGCGCCAGTGCCGCTGCCAAAGCCTCTGGTGGCATATATCCACCTAACAGGCTGCCATCCTTAAGGACAATTGCCGGCGTTCCCTGCACACCAAACTGGAGACCTAATTTGTACTGGTTAGCAATATCCACCTTACAGCTCTTAATTGGCGAAACATCTTCATTTTTAAACGCAGCATCTAATGATTTCTGCGGTGTTGCACTACACCAGATAGATTGCATATCTTTAGCAGATTGGTGCTGCATACCCTGACGAGGGAATGCCAAATAGCGCACAGTAATACCCAGTTTATTGTACTCTTTCATGTTTTCATGCAATTTATGGCAGTAACCACAGGTAATATCCGTGAAAACGGTAACGACATGCTTCTCTTCTGGCGCCTTGTAGATGATCATTTGATCTCTCATTGCTTCCAGCTTTTTCATCAATAATTGATTACTGACATTCACAGGAGCGCTACCACTAACATCATAAATTGGCCCTTGTAATAAATATTTCCCGTCATCAGATAGATAAATGATACCTTGCTCAGTCACTACCGTATTTAAACCAACGATAGGTGATGGCTGGATGCTTTCTGCTTTTATCCCTAGTTTTTGCATTATTCTATGGACAGCACCATCATCAGCAAGCGCATTTCCACTAAACCAGGCCAGCAAAAGAGGGAAACATAACACGCTTTTTTTCATTTTCAGTTCCTTTAAATCCGTGCTCACCCTCGCGGATGATGTTGTTGATGTAGCAATTTGAGCCGTTCTGTTGCTACATGAGTATATATTTGTGTTGTAGATAGATCACTATGCCCCAATAACATCTGCACAACTCGCAAATCAGCGCCATGATTTAGCAAATGCGTGGCAAATGCATGACGTAAAACATGAGGAGATAACCGTCCAGTATCGATTCCAGCCAACAGCGCATAATGTTTAATACGATACCAAAATGTCTGTCGGGTCATTTGTCGCCCTCGGTTGCTAGGAAAAAGGACATCCAACGTTGCACCATTTAACAGCCCAACTCTCCCATATTCCAGATAATTCTCTAGCCAATAAATTGCTTCTTCCCCTAAAGGCACTAGCCGTTCTTTATTCCCTTTACCAATCACTCTCACCACGCCTTGACGCAAACTGACATCGGAAAGTGTCAATCCCACTAACTCAGATACCCGCAAACCACAGGCATAAAGCACTTCAAGCATGGCTTTATCCCTTAATTCCACTGGCTGATCTGTACAGGGCGCATTGAGTAGATCTTCTACCTGCTTTTCACTTAAATCTTTGGGCAATCGCTTTGGTAATTTCGGTGCAGACAAAAGTGCTGTCGGATCATCTTCCCGCATTTTTTCCCGATAAAAATAGAGAAACAATTGGCGCATGGCACTGAGTAAACGCGCCGAACTACTGGCTTTATATCCTCCATCCACGCGTTCTGCCAGAAAAGAGTGCAAATCTATCGTCTGGACAGATAATAAATTATGACCATGATGTATCAACCAGTTATCCAATGCCTGCAAATCCAACCGATAAGAAGCAAGCGTATTTTCCGCAAGATCATGTTCTAACCAGATAGCATCAAGAAATTGTTCTATCAGTGGATTAGTCAACTGAGTTGGTTGTTTTGACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_23 >NC_005126|4179207:4187673|4180418_4181042_-|WP_011147727.1|DBSCAN-SWA MKEKHWSKIQFLHEAVTNQSIVIKGTHSYYSDCWSGGFEESVVRYLYGDKISLQWESKWPIDKLYIGDYVCIGAETIILMGGNNTHRADWFCLYPFMEYIEEAYVGKGDTHIHDGVWLGMRSMIMPGVTIGEGAIVAANSVVTKDVEPYSIVAGTPAKLVKYRFAPHIINELLALKIYDWSEEKFNALKPYLCASDIRALKSAVRSY >NC_005126|4179207:4187673|4186761_4187673_-|WP_011147732.1|DBSCAN-SWA MSKQPTQLTNPLIEQFLDAIWLEHDLAENTLASYRLDLQALDNWLIHHGHNLLSVQTIDLHSFLAERVDGGYKASSSARLLSAMRQLFLYFYREKMREDDPTALLSAPKLPKRLPKDLSEKQVEDLLNAPCTDQPVELRDKAMLEVLYACGLRVSELVGLTLSDVSLRQGVVRVIGKGNKERLVPLGEEAIYWLENYLEYGRVGLLNGATLDVLFPSNRGRQMTRQTFWYRIKHYALLAGIDTGRLSPHVLRHAFATHLLNHGADLRVVQMLLGHSDLSTTQIYTHVATERLKLLHQQHHPRG >NC_005126|4179207:4187673|4186030_4186738_-|WP_011147731.1|DBSCAN-SWA MKKSVLCFPLLLAWFSGNALADDGAVHRIMQKLGIKAESIQPSPIVGLNTVVTEQGIIYLSDDGKYLLQGPIYDVSGSAPVNVSNQLLMKKLEAMRDQMIIYKAPEEKHVVTVFTDITCGYCHKLHENMKEYNKLGITVRYLAFPRQGMQHQSAKDMQSIWCSATPQKSLDAAFKNEDVSPIKSCKVDIANQYKLGLQFGVQGTPAIVLKDGSLLGGYMPPEALAAALAQRGKSV >NC_005126|4179207:4187673|4183041_4184140_-|WP_109791750.1|DBSCAN-SWA MFEINPVKNHIQDLSERTTVLRGYLDYDVKKERLEEVNAELEQPDVWNEPERAQALGKERSSLEEIVETIDQLEQGLEDVQGLLELAVEADDEETFNEAVVELEQLEEKLGQLEFRRMFSGEYDSADCYLDLQAGSGGTEAQDWASMLMRMYLRWAESKGFKTEIIEESDGEVAGLKSATIKIMGDYAYGWLRTETGVHRLVRKSPFDSGGRRHTSFSSAFIYPEVDDDIDIEINPADLRIDVYRASGAGGQHVNKTESAVRITHIPTNIVTQCQNDRSQHKNKDQAMKQLKAKLYELEMQKKNANKQEMEENKSDIGWGSQIRSYVLDDSRIKDLRTGVETRNTQSVLDGDLDKFIEASLKAGL >NC_005126|4179207:4187673|4179207_4180215_-|WP_011147726.1|transposase|DBSCAN-SWA MKRKNTPTPHDAIFKKFLSHIDTARDFLEIHLPATLRAVCDLDTLRLESGSFIEDNLRVHYSDILYSLKTTQGESYVYCVIEHQSSPDKMMAFRLMRYSISAMQWHLEQGHKKLPLVIPVLFYHGKIRPYPWSTNWFDCFDASALAEEIYSSAFPLVDVTVIPDDEILTHKRVALLEIVQKHIRQRDMAELQQELTMLFAYDYYTYELLKSMLNYILLVGDTADPEGFIRQLAEQFPKYEEVLMTIAQKLQHKGHQEGLKEGLQKCQDAREEGLQEGLQKGEKKGEKKGEKKGEEKGEKRASLKIARALMDNGIDRETIMKSTGLSQNELEQIHH >NC_005126|4179207:4187673|4184297_4186031_-|WP_011147730.1|DBSCAN-SWA MNIETQLRRRLAVNDSHLPQQIHPLLRRLYAIRGIQQANELERGVQGLLNYQHLSGVEQAVALLLTALHEHWRIVIVGDFDADGATSTALAIRSLRSMGYRHLDYLVPNRFDNGYGLSSQVVEEVVKKGADLIITVDNGISSHEGVAAAHQHRMKVIVTDHHLPGDVLPAADAIINPNLADCSFPSKSLAGVGVTFYLMSALRAALRKDQWFEKQGIALPNLAEMLDLVALGTVADVVPLDTNNRILVYQGLNRIRAGRCCAGIRALLEVSSRDAYKLTASDLGFFLGPRLNAAGRLDDMSIGVTLLLTDDIAKARQIACELDSLNQTRREIEQGMQQEALQICDKLERTSTELPYGLALYHPEWHQGVVGILASRIKERFHRPVIAFAPAGDGILKGSGRSVQGLHMRDALERLDTLHPGLILKFGGHAMAAGLSLEQDKFEQFQYHFSTLMADWLDISQLEGVIWSDGELAINELSLDIAEMLRDGGPWGQAFPEPIFDGKFKLLQQRIVGERHLKVIVEPLNGGPMLDGIAFNIDPTRWPDNSVREVELAYKLDVNEFRGNRNVQLLIQHLWPY >NC_005126|4179207:4187673|4181517_4183032_-|WP_011147728.1|tRNA|DBSCAN-SWA MSQQQQGAEQAPDLNNELQTRREKLAALRENGIAFPNDFRRENISEDLHAKYDDKTQEELEALNIDVTVGGRMMTRRIMGKASFVTLQDMGGRIQLYVARDDLPEGIYNEQFKKWDLGDILGARGKLFKTKTGELSIHCTELRLLTKALRPLPDKFHGLADQETRYRQRYLDLIANEESRKTFQIRSQVLLALRSFMVSKGFMEVETPMMQVIPGGAAARPFITHHNALDIDMYLRIAPELYLKRLVVGGFERVFEINRNFRNEGVSPRHNPEFTMMELYMAYADYKDLIVLIEELFRTLTQNILGNTLVKYGEQEFDFGKPFAQMTMKEAICKYRPETNIADLDDMDKVVAIAESLGIEVEKGWGLGRVQCEIFEETAESHLIQPTFITEYPAEVSPLARRNDANPFITDRFEFFIGGREIGNGFSELNDAEDQAERFAEQVRQKDEGDDEAMFYDEDYVTALEHGMPPTAGLGIGIDRMIMLLTDSHTIRDVILFPAMRPQK |
7 | Sodalis_phage(16.67%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_24 |
4357608 : 4421733
Sequences of DBSCAN-SWA_24
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24 >NC_005126|4357608:4421733|DBSCAN-SWA TATGTTTTCAACCAGCGCCGAACAATGGGCAAATGACACGTTTCAACATGCGGAATTAGGTGATAAACGCCGTACCAACCGCCTGGTGAAAGTGGCCTGTTCGTTGGCTAACCATATAGGACAATCGCTCGTGCAATCTCTTGACTCTCCTGCCGATGTTGAAGCGGCCTACCGACTGACCCGAAATTCCGCCATTGCGCCTCAGGCCATCGCCGAAGCCGGATTTACCGCCACCGTCGCTCACGCTCAACGTTATCATTGCCTGTTAGCGCTGGAAGACACGACAACCCTGTCATTTTCCCATGCGTCGGTCGCCGATGAACTCGGCTATACCACCTCAAAGGAAAAATCCCGGGGCATGCAGGCACACTCGGTGTTGTTATTTGCGCCTGAAGAACAACAGGTCGTGGGGTTGATAGAGCAACAGCGCTGGTGTCGAGATGTCAGTGATTATGGCAAAAGCCGACAACGCGATACACGCCCTTATGAAGGGAAAGAGAGTTATAAGTGGGAACGGGCCTCACAAGCCGTCGACAGCCGGTTAGGGGAGCAGATGGCCAACGTGATTTCTGTCTGTGACCGTGAAGCCGATATCATCGAATATCTGCGTTATAAAACGAGCCAAAAACAACGTTTCGTCATCCGTTCGATGCAAAACCGGCGTATAGAGGAAAGTCAGGATAAACTTTATGACTTTATTAGCCGGTTACAGAGTGCTGGAGAACGATTAGTTCAGGTCAGACAGAAAGGCGGGCGTCAGGCGCGTGTCGCGCATTGTGATATCAGTTATGCCGAAGTGACGTTGAAAATCCCCGAAGGAAAAAGCGGTGAGGCGGTGCGGATATTTTATGTCGGTTGCTACGAAAAAGGTCCGGAGGATGGGCTTTGCTGGCATCTTCTGACCTCCGAACCCGTCAACAGTCAGGAAGACGCCCATAAAATATTCAGTTATTACGAGCGCCGCTGGCTGATAGAAGAATTTCACAAAGCGTGGAAAACGGGCGGCACGCAGGTAGAAGCGCTGCGTATGCAAAGCAAAGATAATCTGGAGCGCATGATAGTGCTGCTGGCCTTTATTGCGGTACGAATACACCAGCTGCGTTTTATGGGTCTGAACAAAGAAGAGGCAGAGAAAGAGAGCTGTGAGACAGTATTAAGCCCCCTGGCGTGGAAATTACTGTGGTCAAAACAAGAAAAACGCCGTGTGCCGAAAAAAGCCCCGAGTTTGCATTGGGCCTTCATCAATCTGGGAAAACTGGCCGGCTGGTACGATTCCAAACGCACGGGTCGAGTCGGATGGGAACGACTTTGGGAAGGCTGGTTTCGGCTGCAAACCCTGATAGACGGCTATTTGCTGGCTAAATCAGTTGATTTGGAGATCTGATCAAGAGACAGGGGCTGCACGGGGCGGCGATGGCGAGCACGGGAATGAGCAAGGAGCCTGCGACTGCGAACCGGGCGCAGCCAGTGCAGCGGGGTTGGGGCGGGGGGAAGTCAATGAGCGGAGGCCGCAGGCCGATCTGCCTTCAGGGTTGTTGGCCGGACGTTGGCACGGCAGCTAAAGAAGAACACGGGTTTTTGCCGAGGACTGGCTCAGCCGCTGATAGCAGAAGGCGTCAGCCTTGTGCGCCACACCTGCCAATGCTGACCCGCGGGGGCGCAAGACATAATGCCAATTATACGCATTAAGCCGCTCATCAATGCTCAGGCGGTTGCCCGGGCTCACCGGCGCAGTGCGTATAATTCCCCCGCATTATGTTCAATAGGCGTTGGGCGGCCTGGACCGGCTTAACGGGGACGCTCGTGGTTGAGCCGCCTGACGACTATTTACCCCCGCGTGCGCCGATGCCGACGGGCAGTCCGGCCACGGTCTGCCCCCACACCGAACCCGCCCAACTCAACGGGGGCGTGCGGACGCTCAGCGGCTATCGGCGGTTGAGGTCGGCTCTGAACTGTCCGGCGGCGTGTCCGTGTCGGCGTTATCGTCGGCGTACAGGTCGGCCAGTAAACCCACCTCATCGGCGTCGCGGACTTTTTCGTCGGCCATTTGCTCCGCCGGATGCGTACTGGCGTGCACCGCCTGCAAGGCCCGGATAGAGACCTGCGTATACACCTGGGTGGATTCCACGCTGGCATGGCCTAACATGGCCTGTATCCAGCGCAGGTCCGCGCCGTTCTCCAGCATCTGCGTCGCCATCGCGTGCCGAAACAGGTGGCAGGCACCTTTTTTCTCGATACCCACCGCGTTGATATAAGCTGTCACCAGATTGCTGATACCGTTAGCCTGTAAGCCGTCCAGCCCATCCATTGCGACGAATAATGCCTTGACGTCTGGATTGACGATAAGTTGTGGCCGCACCTGTTGCTGATAGCGCTGTAGCCAGCTTAAGGCCCGTTCACCGAGGGGCAACACCCGGTCTTTATTCCCCTTGCCCTGCCGGATGGTCACCGTTTTGCGTTTTCCGTCAACGCTGTACACATCCAGCCGGGTTAATTCGCCCCGACGCATCCCGGTTGACCAGAGCAACTCCATCAACGCCCGGTCACGTATCCCCTGCAACGTCGTCAGGTCAGGCTGCGCCAGTATCTGTTCGGTTTCATCGATGGTCAGGATATAGCGCGGCAGGTGCTTTTCCAGTCTGGGGAGTTCAATGTCCGCCGCCGGGTTCGCCAGTATCAGATTCTGTTTGGTCAGCCATTTGAACCAGACTTTCAATGGCTCCAGTTGGGTACGTTGCGTCCGGGTGCTTAACGGTTCACCGTTGGTCTTGCGGTACTGATACAGATAACGCTGGTAACGCTCCAGTATCGGCCGGGTGATATCCGCTGCGTAGTATAAGCCGCGCTCGGTTGCCCACAGGATAAAGTGGTAAGTATGGTGCGTCTGTACTTTCAGCGTACTTTCTGACCAGCTCCGTTCCTGTCGCCACACTACAAAGCGCAGCAACAACGCATACAGGCTCTTCGGGTCATGCGCCGGCCCCACAGGCTGACGGTAGACGTCATTAACGGTCAGAAGGCTCCCCTTGCGGGGTTTACGGTTTGCCATGATTGACCTCCGGTTGAGATTGAGGGGCGGGCGCAGACAAGGGGCGCGTTTTCTTTTTTCCTTTTATCACGGTGTCTTCCGTTACCCCGACTTGCGGTACGCTGAACCCGTGTTCTGCCTGCCCGGATAGGGATTTTTTCACCCCAGACTTAGCCCGGACCTGGCCCAGACTTGAGGCAGACGGGTGTTCATTTAAGTCAGACTTGCTCTCATGACCTGTCGGGACGGCTGCCGGCGTTTTATCCCTGTCGGGTACGGGCAATGCGTCTCTGTGATTATTTTCCTTGATAACTGCGTTTTCATCTGCCCGGACTTGTGCCCCCACTGGCCCTTGTGCTGTCTGGGCTGACGCGGGTTTTTCTTCCCCAGACTCAGGCCAGACTTGCCCCGGACTTGGGGAAGACTTATGACCTTCCGGGTCAGACTTGCGTTCACTGCCGGCGGTTTCTGAGTCCGCTTCTCCGACATCCAGCAGGCCGCACAGGTGGGCTGCGCCGTTGTCTTCTCCGTCCCACAGCAGTTCATAATGCAGCAGGTGCCCCCGGCTGCCGCCATGCAACAGCAGGTATTCCATTTCCGTCAGCCGTTGACAGTGGTTTTTGAGCTGGCTGTCGCTCCAGTGGGTAAAGGCGCGGATATCCCGCCGGGTAAAGCGGACTTCATTTGGCTGGCAGTGCTGGATTTGCGCCTGTGCGTTCACCATCTCTTGTATCAGCAGTAACAGCTTGCGCGTCTGCGGCGGCATTTCATCCAGCGTGCGCCCCAGCACCTCATGCGCCAGCCGGTTAGCCAGGGCAATGTCGTCCTGGGTGACTTCGATATATTCGATGACCTGCCCGCGGTGGGTGGTTTTCTTCACTTCACGTTGATACTGGTGCAGCAGGGCAATGGCCTGTATCAGCGTCAGGTATTTCATGTGGTCGCGCCGCATCCGGGTTTTGTCTGACAGGAACGTCAGTTGATGGGCGTAAGGATTGACCACTTTCAGCGGCCTTAACAGGCGCTGGGCGTTCTGGTGTAACTGCGTCAGATAGCCTTTCTCCGAGTCAGCCAGCAACCCGGCCAGCGTCTGGCGGTGCCGCTGCATGGCGTGGATAGCCTGCGTCTGCTCACGCGATTCGTTGACCGTCAGCACCAGACAGCGGTTCAGCAGCTCTTCATCCACATCAATGGCCGTCGTCGTTAACATCAGCATCACCGGTCCCTGTACCCTGTATTCCCGCGTCACCAGTTCGCCGCTCTGCTCGTTCTTGCCGGTGCTGGCGATTTTCAGCTCGCCGTCGGACTGCAACAGTTTCAGGGCATAGGCCGCCTGCCGCACCCCTTCTTCTTCGGCTATCGCCAGTATTTTGTGTTGCAGGCTGGTTTCGCCGAGGTAATACAGGCTCTGTCCGGTCATCGCCGAGTACTGGATACGCTCCTCTTCCGGCATCAGGTTCAGCACGGCATCCATCAGGCTGCTCTTGCCTGCCGCGCTGCTGCTCTGGATTAACACGGCCAGCGGTTTATCGAGTTTGCGCGAGACTGCCGCCAGATACCCGGTCAGCAGATTGGTGGATTCGCCGACCACCCCACAGGCGGCCATGTCGTTGATAATCTGTTCTGTCAGGTTCGGCGATGTTAGCAACGCCAGCGCGGCGGCTTCGTCTTCCGCGCTGACCGTCACCGCCGTTGTCCCTGAGGCTTCGGCGTCGGCTTGCTGTTGCGCGTCCTGTTGCTGCTCCAGCATCAGCAAGACCCGCCCGGCTTCGCGTTTGATGACCGACAGCTCGCATTCCAGCTCTTGCGCCGCCGTGCTGATGTAGTTCTGACGATGCCGCGCGTGATACATGTCCAGCGTATCCACATGGAACAGGCCGGACGTTTCATCCCGCACCTGCACATTGACTTTCATCACATCAGGCACCGGCGATTTTTTCATCCCCCGTATCCGCCAGATACGTGGCCCGCT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49 | Wolbachia_phage(16.67%) | holin,lysis,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_25 |
4682834 : 4747496
Sequences of DBSCAN-SWA_25
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25 >NC_005126|4682834:4747496|DBSCAN-SWA 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59 | Cronobacter_phage(18.75%) | holin,tail,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_26 |
4799568 : 4922642
Sequences of DBSCAN-SWA_26
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26 >NC_005126|4799568:4922642|DBSCAN-SWA 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93 | Catovirus(12.5%) | plate,lysis,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_27 |
5040237 : 5102153
Sequences of DBSCAN-SWA_27
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27 >NC_005126|5040237:5102153|DBSCAN-SWA 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53 | Lactobacillus_prophage(11.76%) | tRNA,tail,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_28 |
5185076 : 5223433
Sequences of DBSCAN-SWA_28
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28 >NC_005126|5185076:5223433|DBSCAN-SWA 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27 | Phage_PS3(14.29%) | integrase,holin,transposase | attL 5215178:5215192|attR 5224707:5224721 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_29 |
5323659 : 5381222
Sequences of DBSCAN-SWA_29
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29 >NC_005126|5323659:5381222|DBSCAN-SWA 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MKNFEDFYREALSQIKHDLSNAAQEHPHLAPFTSESGDPDVLRLLEGFALTTAGIKQKIDDGFPEVINPLLRKVWPIPLHPIPSTSIVQLDMQPGSMTETTSIAKGSEISAIQQNQSITFRTTQDISIEPITLIHKTLTHSGDKSLISLTFQYHGPTTHWKTGPVTLFLGEDQKLASLLTKYIDQSLNNTYLKTSLKEQEMWLSIEIAPRLKENLVLPRPHDYFWPLQVLYEYLYLPHVNDFMSFDLSEEIAELPLGEDKQFTIILEFDCNIPIEDITPAFIPHCIPVINLAPARTKPITFEKGKSRYVLEANEIFSIDNIKLQSDPDGTSEGSAHSVPLINSAQLAACHFAEPGDNILLFNHIREESPFGGNQINLTFYDHQAKPVTEHHYREFYCQYHRYHTQARTLGIGQICIPSEQIPSHIQARNIVAASKDLPAVVNSHQHWPILSLLSIGPFFLSHIESVRSLVKQLDTFAHLDAPRSRHIQRMADGLSAIYLEPYYHFDKGIPVRGQAITLRMTPENYEHEGEMYAFAKTLHTAFSLCFVETSFHRLTVINNGTNECWEFYNMPGHQKIM >NC_005126|5323659:5381222|5359025_5359301_+|WP_011148666.1|DBSCAN-SWA MRYSEQIKPISYLKANAATVMTTLAESRSPMIITQNGEAKAVIQDIASYEQTQETIALLKILALGQQQVKAGEVTPVKDVVQRLKNKGKST >NC_005126|5323659:5381222|5368572_5370549_+|WP_011148674.1|DBSCAN-SWA MKTGLRFSCTIGNLPPMTFAVVNFTLDEALSSLFTLSLTLAAHRSDIDTDTLLLQTGLFTVTRDDILQREVKGLVESAVVGTTNRHQTQYHLTIRPEMWLLTLDQDSRIYHQLSVPDILHSILKQKKLRANMHLNNPHSTREYVTMKRESSYDFFTRLAAEEGIFFWFADDGLYLSDSYLNMRAPDTLIYNPDVTSAVEENVIYKWSLGSYMRPESTDQKDRNYHNPNYALQHNATDFEAENGTPFHIFESYGRFQKDKEGIPLTQYRLEALRVDSKSGQADSNCIRLMPGRIFTLTNHPIDAMNDRWQVVSSQHIGYVPAVLGDNGTGTTLNSHTQFIPGRNDWRPPYRYKPLADGDEIATVVGPGTEEIYVNKDGAVRVHFHWNRYDAPDDQASCWVRVAQGWNGNGFGFLATPRVGQEVIISYLNGDIDRPIITGCTYNGLNRPPLNLPAEKTRTTFRTKTHKGNGFNELRFEDANGSEEVFIHAQRDMNTQVLNDETHNIGHNRTDHIKHDAHLRIDNEYRVQTGNDISLSTGQKLHIKADDALLTQSGNEIHLSSGAKVVIDASSELTLQAAGHFLKIDAGGITSSASINFGSGAPGSGSGWGGKLPDRLDKLKQTSVVQVEKALTTPLKEICLTCLLKAEQNGTAMVIRGQS >NC_005126|5323659:5381222|5344394_5345615_-|WP_011148652.1|protease|DBSCAN-SWA MAWNQPGNNGQDRDPWGSSNKSGNSGGNKSGRNRGASDLDDLFRKLSSKLGGFGGNKGGNGSDQGAKFGGRIVSLVAAAVVVIWAASGFYTIKETERGVVTRLGKLSHIVQPGLNWKPTFIDEVVPVNVESVRELATSGVMLTSDESVVRVEMNVQYRVTDPAAYLYSVTSPDNSLRQATDSAVRGVVGKYSMDKILTANRMIVRDDTQRELEKTILPYRMGITLLDVNFQAARPPEEVKAAFDDVIAARENEQQSIREAEAYSNEVLPRAKGDAQRIIEEAKAYKARVVLEAQGEVAGFAKMLPRYKEAPEITRERLYIETMEKVLSRTRKVIVNDHNNNLLVLPLEQMLRGDVSGVKKEGTVQSDNTVASDLRVTRPTVPSNSGRGANYNRTDNLRNDIIRVGR >NC_005126|5323659:5381222|5361960_5362854_+|WP_011148670.1|DBSCAN-SWA MLDNIKIRLHYLLPKQGITHLAGWFANKKAGWLTQLAIKAFARVYKVDMNEAKSPEFSAYITFNEFFIRSLKDDIRPVVSNEHQLALPADGTISQLGNIRTDQLLQAKGHHYTLEALLAGNHQLAEIFRDGQFVTTYLSPKDYHRVHMPCDGLLKEMIYVPGDLFSVNPLTAANVPNLFARNERVICLFETQFGPMIQILVGATIVGSIEMAWCGMVTPPREGIIKRWTYPEAGTTGAISFKKGEEMGRFKLGSTVINLFAPNQIQLAGHLSSGSTTRMGELLAQAIMLEEPTDNIS >NC_005126|5323659:5381222|5380766_5381222_-|WP_011148688.1|transposase|DBSCAN-SWA 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MIHKIILARFFSVFSEAFVMFAVPVLVYTSTNSASLSSFAFGLERLFRVISLPISGWMGDRMHTLVMLFLSDILRSLVCLFLFILSFIYSDNSIVYIIISLSCVLSFFSGAGYVNLEGFVSKNMSAIELPSVNSRLQFVEQFTYIAAPAVVGVLVYKFSVYAVFAFAFFPFLISSLIWFQLQRKNRIEERANREGYNLPAIFKFLMENPPLLRVISLTFLMNVMQGAILSTAVYVITSVFSQPKGSYAQLLAYAGLVNCCVFFIAPKLCRIFDVRIVGVTAFLIALCGLTLFATGPLFVVYTLGFLLVIGSEGCFNLFSRSYRASLIPKQRFSQYLGVVLVLNQLATPLTSFICANLLNYFSYNSIYLIFSAFVLLMFIIINPYRSLKFNLHNSQ >NC_005126|5323659:5381222|5337269_5337665_-|WP_011148646.1|DBSCAN-SWA MRHYEIVFMVHPDQSEQVPGMIERYSATITNAQGQIHRLEDWGRRQLAYPINKLHKAHYVLMNVEAPQEVIDELETNFRFNDAVIRSMIMRVKHAVTEASPMVKAKDERRSRDYSLEDANMDAEEAGDSEE >NC_005126|5323659:5381222|5333232_5334261_-|WP_011148643.1|DBSCAN-SWA MNLSKNILQTIGNTPVVMLNGRYTKGINVFLKMENINPGGSIKDRIAVAMLERAEAQGELRPGMVVIEPSSGNTAIGLAMACAVKGYRFIAVLDRMVPAAKRDKIKAFGAEIIFLPEFEAGKDTVKYRIDLTKEIIKVYPNAFSPMQFENQVNPDEHYRSTGRELYEIFGNNLTACFATAGSCGTLTGISRYLKEKDPQVRIYGVEPVGSIIFGGEPGKYLVQGAGLAFIPSILDRTNIDITLKVADIDAFRVARKLARNEGILIGGTGGCAVSAALNRLDDFKPGDNIVVIIPDSGERYIDTIYNDAWLFENNFSELIEESKTEPQLEEIITNMGCVLNEF >NC_005126|5323659:5381222|5354316_5354748_+|WP_011148661.1|DBSCAN-SWA MKRFTKIAVGFLVLTTAQLSFAATSMWSQTSRAPNVYAAGYTNSSFFTTPSSVPTRATITTVSWNIGLYSNGATTQTFSVCYTPRYSSTPSLCLDVSGNLNGSTNAFIGHDAKGSFRISGILDGGTYPVYPSHYNMIKVDYQY >NC_005126|5323659:5381222|5357152_5358148_+|WP_011148664.1|DBSCAN-SWA MKSNHASTQSVNNYSTYIKLSLVAIIWGGTFVAGRYISVETPPLLSASLRFILAGMTLIIFLVLSGKMFVKINLSQLLKIIGLGLSGIYTYNLFFFYGLHHTTASRASLIVALNPAVMAIFSYLFYKERQSPLKILGIILCLLGAMIVIFSKTPQLTVGAEGNWLGDTLIFGCVLSWVAYSVFCKNIVNQIGPLHTVTYSILAGAIMLTATAIFTGQMSLSAIHTLPITDLYSLLYLGAVGSAVAYIWYYDGIQRIGSTRSGVFIALNPLTAVLLGAVLLDERLTFPMFIGGALVIGGILICNKRSTDKKLIPPEPKSGINHIAKAKNYRR >NC_005126|5323659:5381222|5336946_5337264_-|WP_011148645.1|DBSCAN-SWA MTTNRLVLSGTVCKVPIRKVSPAGIPHCQFVLEHRSQQQEAGLSRQAWCRMPVIASGQLLQVLTHSITVGSRLTVSGFISCHQGRNGLNKLVLHAEQIELIDSGD >NC_005126|5323659:5381222|5326018_5326735_+|WP_011148637.1|DBSCAN-SWA MNTSFNEILSEIKKSKTMPELEKRLLNAINYLGFEFYSIYQEEKYPFTTKKYVLITNLNIETASNYNQDNNHDSDQLMNGDYTFSIPSVCNDKISKNTDFTIEKSNSNKNEVKNSLSIKIKGYHGERSIFSVARKEGTISHNEILNKAGVLGILANECIKTFNNLKNKKDKIIIPTLSTREVEVIRWTCEGKTSAEIADILDISTRTVNFHINNVMEKLVVPNKVAAVAKAIAYNLII >NC_005126|5323659:5381222|5362880_5366216_+|WP_011148671.1|DBSCAN-SWA MRLIISLLLSLLIITPVSAAIPLDENQLKQELKQIESSKNPQDAEVAQALQGALNWIADTKSANDRTQKYQTAIDDFPKITKELRQKLLTESDTPRPIPANQPIASVEQQIIQVSSRLLEQGGQLQQEQDKGREISDSLVLLPQQQSEARRLLTEASSRLQSLGTPSTPLAEAQFALAQAEVNAHKATVNELEIAQLSANNRQEISRMRVELFKKRYHRLDLELQQLRSQLNAQRQQKAELALEHTEMLAEQSDQLPKFLLDELQLNRNLSQELNQQAQRMNVIGSKQRQAASDIIQVRQALNTIREQAQWLGGSTTLGEALQTQLARLPDMSKPQQLDRNIVKFRVDRLKYEDMLDQLQKDTKPVQKSNVALTAEQERIYDSLTRTRKELLNSLLSGYDSEILELTKLKVATSQLNDALTEVKEATHRYLFWVADVNPVSLNYPINVVQDLTRLLSLDTFSQLSGALIVMLTTQDTLLYLFGTLFLVIFSIGSLRHYHAFLERASNRIGKVTHDHFSLTLRTVFWSVVVALPLPMLWSAIGYGLQSAWQYPMATAIGYGVSATTPVLWIFMLSATFAHPNGLFIAHFRWPEERVKRALRFYQLSIFAIVPLVMALITFEHYSDREFASTLGRLCFLILCVSLSLITNSLKRAKVPLYLDKNGYGENVINTALWWILLSAPIVAALASILGYFSTSQALLGRLETSVAIWFFLLVIYHIIRRWMLIQRRRIAFDRAKQRRAEILAQRAKGEDDSTGSSSIEGAIEVEEPIIDLDAISAQSLGLVRSILTLLALVSLIWLWSELHSAFSFLENIRLWDVTTTINNVETVQPITVGSVLIAILVIIITAQLVRNLPALLELALLQHLELTPGTGFAITTLTKYTITLIGGLVGFSLIGLEWSKLQWLVAALGVGLGFGLQEIFANIVSGLMILFEKPIRIGDTVTIRNLTGSITKINTRATTLSDWDRKEIIVPNKAFITEQFINWSLSDTITRVVLTIPAPAEASCEEVTQILLTAAKRSTLILDNPAPEAYLVDLQHGIQIFELRIYAAEMGHRMPVRHEVHQLILQGFREHGITLPFPPFQASIDVIGRDIRSATTNRSGRNPPRQPGSL >NC_005126|5323659:5381222|5373850_5374585_+|WP_011148681.1|DBSCAN-SWA MSLIHPRIKLFHDLNEPITPELALRDAYQIMQKINNISSNPSYWHLPGYSLEEIEENNVFTDAGFTEYAISQLTENYDKDAKYLIATLFDIPGDIELKNRIFYQSSDVIYNNRLGKTNISIDLNLVKEKFKIQTIIEFVKALASTRNSPIVMTETRGYRLKKKQVFPDRISAGWMLYLPIEIDPTLVPMAEEIISISDKNNKKGSLIITTKDIFDIENQDHINKANDIEICLRDLQILPLMTEL >NC_005126|5323659:5381222|5378108_5378558_+|WP_011148685.1|DBSCAN-SWA MDIYQESIRFLGNGADFDENGLFQCELSFDTNDHGEALFLTIFKNETTINLHISLTSPVELPTPLPEAIAVAIGEHALEPFRGGFGIGLMPDSRRLTIYKIISLSNKPQNYVQNIFQQLLEKMEQWHHFIEQTNNAETIPEKLPVGIFI >NC_005126|5323659:5381222|5338830_5341272_-|WP_011148648.1|DBSCAN-SWA MSQDPFLGREAEKYESPIPSREYILDIIAKHTVPVSRQELAQELNLINDEDIEALRRRLRAMERDGQLVFTRRQCYALPERLDLLKGTVIGHRDGYGFLRVEGHKDDFYLSAEQLKMAIHGDVVLAQPLSLNRKGRNEARIVRVLVPKTSQIVGRYFLDSGMGFVVPDDSRLSFDILIPKDESGGARMGNVVVVELITRPARRTKAIGKIVEVLGEKMGTNMAVEIALRTHEIPHSWPPQVENQVASLNEQVPESAKKDRVDLRTLPLVTIDGEDARDFDDAVYCERKRSGGWRLWVAIADVSYYVRPQTALDTEARNRSNSVYFPSQVVPMLPEVLSNGLCSLNPQVDRLCMVCEMTISAQGRLSSYKFYEAIMNSHARLTYTKVWRMLQGDEELREHYKPLVQHIEHLHELYQALENAREQRGAISFESEEAKFIFNAERRIERIEPIVRNDAHKLIEECMILANIAAARFVEKNGEPVLYRIHDRPREESIVNLRSVFGELGLTLPGGMQPTPKDYAQLMHQVAERPDHELLQTLLLRSMKQAVYDPENRGHFGLSLNSYAHFTSPIRRYPDLVLHRAIKYLLAKQQGIVEQCGTPTGGWHSDMEQMLQLGQHCSMTERRADEATRDVADWLKCDFMQDQVGNTFTGIITSVTGFGFFVRLNELFIDGLVHVSTLSNDYYHFDNIGQRLVGEYSGKTFRLGDEVEIRVEAVHMDERNIDFKLLSTARKARNVGKTVRDRERKVELGRESSKKKGRGYRKEAHFEPDGAVRKERSADKPKGDKKKGKTLSTKTQKIVAKFKAKRAKKSADK |
53 | Lactococcus_phage(18.18%) | plate,tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_005126.1|WP_041380620.1|1053926_1054634_+|hypothetical-protein |
1053926_1054634_+
Protein sequences of NC_005126.1|WP_041380620.1|1053926_1054634_+|hypothetical-protein>NC_005126.1|WP_041380620.1|1053926_1054634_+|hypothetical-protein MNQRETNVSILAGNSRVYLNKDSEIVVEAQLKAFEAALMFAKRSQDECGQLPRISVAFDHHGIFRLQFLINNLTNSQKRNPRLSHLHASIRNIFLPVAEKYQIPLSEIRVIHEDSARQHLVHILASGEIPEIITRRMVSKNLADGKPPTSDAAYEEPTQKLTCAAITKEYFEKAAGDHKGSDTILEVFFEDCAWSRALAYVRGLQLSHMLGVSTAIRLNLVNEEGEVSQGDVITA |
235 aa aa | NA |
HTH_35
HTH_35 HTH domain information
|
NA | No | NA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NC_005126.1|WP_049789776.1|2836326_2836785_-|hypothetical-protein |
2836326_2836785_-
Protein sequences of NC_005126.1|WP_049789776.1|2836326_2836785_-|hypothetical-protein>NC_005126.1|WP_049789776.1|2836326_2836785_-|hypothetical-protein MKTDADIAHRPHSRPGREYICKQPKLSNKQQKELGLIEKDPDVVGYVLFNTRSRRFATMDENEFGMVMYADDLEEAYLAPLRLDALMNIDFLPGSDQNDNDTRPSCCLNPLPKRQQPLANLTSSIHDKFFNLTCKKTTLSNSSTVSIAKIEI |
152 aa aa | NA |
HTH_23
HTH_23 HTH domain information
|
NA | 2834275-2914540 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 2864439-2864399, mismatch: 0 acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcactcg Protospacer ***************************************** 2. spacer 14.1|5613737|43|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 2862591-2862549, mismatch: 2 gataactatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaaaag CRISPR spacer gataactatgtgaccggggtgagggagtgcagccaacaaagag Protospacer *********************** ****************.** 3. spacer 14.1|5613737|43|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 2861226-2861268, mismatch: 2 gataactatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaaaag CRISPR spacer gataactatgtgaccggggtgagcgagcgcagccaacaaagag Protospacer ***************************.************.** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NC_005126.1|WP_011146665.1|2862215_2862395_+|hypothetical-protein |
2862215_2862395_+
Protein sequences of NC_005126.1|WP_011146665.1|2862215_2862395_+|hypothetical-protein>NC_005126.1|WP_011146665.1|2862215_2862395_+|hypothetical-protein MRLKTPIALCKSDLDLFEDQLSRTDKRKARVSTIGVEKPAAHHKQEEGCKANYVTPVIF |
59 aa aa | NA |
HTH_1
HTH_1 HTH domain information
|
NA | 2834275-2914540 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 2864439-2864399, mismatch: 0 acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcactcg Protospacer ***************************************** 2. spacer 14.1|5613737|43|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 2862591-2862549, mismatch: 2 gataactatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaaaag CRISPR spacer gataactatgtgaccggggtgagggagtgcagccaacaaagag Protospacer *********************** ****************.** 3. spacer 14.1|5613737|43|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 2861226-2861268, mismatch: 2 gataactatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaaaag CRISPR spacer gataactatgtgaccggggtgagcgagcgcagccaacaaagag Protospacer ***************************.************.** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NC_005126.1|WP_049789838.1|3441541_3441871_-|hypothetical-protein |
3441541_3441871_-
Protein sequences of NC_005126.1|WP_049789838.1|3441541_3441871_-|hypothetical-protein>NC_005126.1|WP_049789838.1|3441541_3441871_-|hypothetical-protein MPANFFRDDEKWIREMLLQLDPSTRGKITVRYSEVYEAAWDEEPVSYRKDNIARRHANIRLREFVRKYAAFSQGYVTTPTELLKTGTSQQNQPIPEPLKHRGGFFSGKC |
109 aa aa | NA |
HTH_XRE
HTH_XRE HTH domain information
|
NA | 3409530-3466582 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 5.11|2142685|32|NC_005126|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_005126 position: 3447011-3446980, mismatch: 1 ataccggattgttagtaaaacctatccacttt CRISPR spacer atcccggattgttagtaaaacctatccacttt Protospacer ** ***************************** 2. spacer 14.1|5613737|43|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 3464854-3464812, mismatch: 1 gataactatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaaaag CRISPR spacer gataactatgtgaccggggtgagagagtgcagccaacaaaaag Protospacer *********************** ******************* |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NC_005126.1|WP_071824123.1|3521520_3522294_+|hypothetical-protein |
3521520_3522294_+
Protein sequences of NC_005126.1|WP_071824123.1|3521520_3522294_+|hypothetical-protein>NC_005126.1|WP_071824123.1|3521520_3522294_+|hypothetical-protein MMLFSDSSDVTLVITSCGRFDLLKQTIESFDKYNSYPIKEVVVTEDSGDKSIHSVIPEHWLPYCEIILNNPKLGQIKSIDLAYSKVKTDYIFHCEDDWLFYRDRFIEDSFVALKSDKNILQVWLRDLKEDVMLHYPFHYPSNFRELEGVCFSTLESNDFRWRGFSFNPGLRRKSDYELFMPYNLAGDTEMTLSKKYAEIDKYAVILDKSAVRHIGWDDHIKTDEEIRQRKRENRRKIKYFTFGVITGCFLMYFIKGF |
257 aa aa | NA |
HTH_38
HTH_38 HTH domain information
|
NA | 3509123-3537385 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 14.1|5613737|43|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 3536865-3536823, mismatch: 2 gataactatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaaaag CRISPR spacer gataactatgtgaccggggtgagtgagtgcagccaacaaagag Protospacer ***********************.****************.** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NC_005126.1|WP_011147316.1|3618510_3619155_-|hypothetical-protein |
3618510_3619155_-
Protein sequences of NC_005126.1|WP_011147316.1|3618510_3619155_-|hypothetical-protein>NC_005126.1|WP_011147316.1|3618510_3619155_-|hypothetical-protein MSFNKKAFLIATLLVVSHFSMACNTDPMVEHIIKSYGLQETKVMSMYKNCELDVVNTGNRIILTNNKSKNRNERAEIAMYWYRGMGIEEFKLFDSNKFKSIPCVNVPNRFCGISPEYTYAKSYPMREDKKFVIEFSTVEPGWLYNEFTTKHNCEIDVESRGESYGLGGIGALKKDKSNCQPKGYKVGDEFNKWLSEKPVKIEAIIAYIQLPISD |
214 aa aa | NA |
HTH_23
HTH_23 HTH domain information
|
NA | 3617378-3722172 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|2016517|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 3720908-3720948, mismatch: 2 acccttcatctttcaagttgcttctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgtcatctttcaagttgcctctttgttggctgcactcg Protospacer **** ****************.******************* 2. spacer 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 3720908-3720948, mismatch: 2 acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgtcatctttcaagttgcctctttgttggctgcactcg Protospacer ******.***.****************************** 3. spacer 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 3692470-3692510, mismatch: 1 acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgtactcg Protospacer ***********************************.***** 4. spacer 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 3663896-3663856, mismatch: 2 acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgttattcttcaagttgcctctttgttggctgcgctcg Protospacer *********.**************************.**** 5. spacer 14.1|5613737|43|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 3663089-3663047, mismatch: 2 gataactatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaaaag CRISPR spacer gataactatgtgaccggggtgagtgagtgcagccaacaaagag Protospacer ***********************.****************.** 6. spacer 14.1|5613737|43|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 3720971-3720929, mismatch: 2 gataactatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaaaag CRISPR spacer gataacgatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaagag Protospacer ****** *********************************.** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NC_005126.1|WP_011147317.1|3619961_3620591_-|hypothetical-protein |
3619961_3620591_-
Protein sequences of NC_005126.1|WP_011147317.1|3619961_3620591_-|hypothetical-protein>NC_005126.1|WP_011147317.1|3619961_3620591_-|hypothetical-protein MILNKKVFLISPFLLAMSSFSMACKTDPKIEKIINKNGLENTKVMSMYKNCTLSVSADTPNKVTLVNNKAANRDTKAEKAMYWYRGMGIKEYKAFHQNKYKSLPCVKGENFCGIAPEYTYSQGYLTNKNPGVVVEFSTIEPGWLYNEFTTKHKCQIKAEGGGTYGLGVIGTSASCDNKYKKLVIGNVFNKWLEKPAKIDPIISYVLLAK |
209 aa aa | NA |
HTH_23
HTH_23 HTH domain information
|
NA | 3617378-3722172 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|2016517|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 3720908-3720948, mismatch: 2 acccttcatctttcaagttgcttctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgtcatctttcaagttgcctctttgttggctgcactcg Protospacer **** ****************.******************* 2. spacer 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 3720908-3720948, mismatch: 2 acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgtcatctttcaagttgcctctttgttggctgcactcg Protospacer ******.***.****************************** 3. spacer 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 3692470-3692510, mismatch: 1 acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgtactcg Protospacer ***********************************.***** 4. spacer 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 3663896-3663856, mismatch: 2 acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgttattcttcaagttgcctctttgttggctgcgctcg Protospacer *********.**************************.**** 5. spacer 14.1|5613737|43|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 3663089-3663047, mismatch: 2 gataactatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaaaag CRISPR spacer gataactatgtgaccggggtgagtgagtgcagccaacaaagag Protospacer ***********************.****************.** 6. spacer 14.1|5613737|43|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 3720971-3720929, mismatch: 2 gataactatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaaaag CRISPR spacer gataacgatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaagag Protospacer ****** *********************************.** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NC_005126.1|WP_011147468.1|3889624_3889876_+|hypothetical-protein |
3889624_3889876_+
Protein sequences of NC_005126.1|WP_011147468.1|3889624_3889876_+|hypothetical-protein>NC_005126.1|WP_011147468.1|3889624_3889876_+|hypothetical-protein MLRPTKHSHPDRTVINVALIIISRLKGLRIENYSDLLSYTKKAVSGGDVLFLPALNFLFIMGIIEYRPKTDAIEYVANNNETI |
83 aa aa | NA |
HTH_23
HTH_23 HTH domain information
|
NA | 3777826-3956324 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|2016517|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 3906924-3906964, mismatch: 2 acccttcatctttcaagttgcttctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgtcatctttcaagttgcctctttgttggctgcactcg Protospacer **** ****************.******************* 2. spacer 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 3906924-3906964, mismatch: 2 acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgtcatctttcaagttgcctctttgttggctgcactcg Protospacer ******.***.****************************** 3. spacer 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 3805253-3805293, mismatch: 1 acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcgctcg Protospacer ************************************.**** 4. spacer 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 3893566-3893606, mismatch: 1 acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgttatctttcaagttgcctctttgttggctgcactcg Protospacer **********.****************************** 5. spacer 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 3955171-3955131, mismatch: 2 acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcactcg CRISPR spacer actcgttatctttcaagttgcctctttgttggctgcactcg Protospacer **.*******.****************************** 6. spacer 14.1|5613737|43|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 3954265-3954223, mismatch: 1 gataactatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaaaag CRISPR spacer gataactatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaagag Protospacer ****************************************.** 7. spacer 14.1|5613737|43|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 3955108-3955150, mismatch: 1 gataactatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaaaag CRISPR spacer gataactatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaagag Protospacer ****************************************.** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NC_005126.1|WP_125026219.1|4359035_4359296_+|hypothetical-protein |
4359035_4359296_+
Protein sequences of NC_005126.1|WP_125026219.1|4359035_4359296_+|hypothetical-protein>NC_005126.1|WP_125026219.1|4359035_4359296_+|hypothetical-protein MSKEPATANRAQPVQRGWGGGKSMSGGRRPICLQGCWPDVGTAAKEEHGFLPRTGSAADSRRRQPCAPHLPMLTRGGARHNANYTH |
86 aa aa | NA |
HTH_XRE
HTH_XRE HTH domain information
|
NA | 4357608-4421733 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|2016517|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 4407052-4407092, mismatch: 1 acccttcatctttcaagttgcttctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgtcatctttcaagttgcttctttgttggctgcactcg Protospacer **** ************************************ 2. spacer 2.1|2016517|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 4403552-4403512, mismatch: 2 acccttcatctttcaagttgcttctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgtcatctttcaagttgcctctttgttggctgcactcg Protospacer **** ****************.******************* 3. spacer 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 4403552-4403512, mismatch: 2 acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgtcatctttcaagttgcctctttgttggctgcactcg Protospacer ******.***.****************************** 4. spacer 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 4409097-4409057, mismatch: 0 acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcactcg Protospacer ***************************************** 5. spacer 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 4389155-4389195, mismatch: 0 acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcactcg Protospacer ***************************************** 6. spacer 14.1|5613737|43|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 4409034-4409076, mismatch: 1 gataactatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaaaag CRISPR spacer gataactatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaagag Protospacer ****************************************.** 7. spacer 14.1|5613737|43|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 4389218-4389176, mismatch: 2 gataactatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaaaag CRISPR spacer gataacgatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaagag Protospacer ****** *********************************.** 8. spacer 14.1|5613737|43|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 4403489-4403531, mismatch: 2 gataactatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaaaag CRISPR spacer gagaactatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaagag Protospacer ** *************************************.** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NC_005126.1|WP_157866891.1|4367925_4368183_+|hypothetical-protein |
4367925_4368183_+
Protein sequences of NC_005126.1|WP_157866891.1|4367925_4368183_+|hypothetical-protein>NC_005126.1|WP_157866891.1|4367925_4368183_+|hypothetical-protein MSKEPATANRAQPVQRGWGGGKSMSGGRRPICLQGCWPDVGTAAKEELRVADVRLSRLEHKAQPCAPHPPMLTRGGARHNANYTH |
85 aa aa | NA |
HTH_XRE
HTH_XRE HTH domain information
|
NA | 4357608-4421733 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|2016517|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 4407052-4407092, mismatch: 1 acccttcatctttcaagttgcttctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgtcatctttcaagttgcttctttgttggctgcactcg Protospacer **** ************************************ 2. spacer 2.1|2016517|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 4403552-4403512, mismatch: 2 acccttcatctttcaagttgcttctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgtcatctttcaagttgcctctttgttggctgcactcg Protospacer **** ****************.******************* 3. spacer 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 4403552-4403512, mismatch: 2 acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgtcatctttcaagttgcctctttgttggctgcactcg Protospacer ******.***.****************************** 4. spacer 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 4409097-4409057, mismatch: 0 acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcactcg Protospacer ***************************************** 5. spacer 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 4389155-4389195, mismatch: 0 acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcactcg Protospacer ***************************************** 6. spacer 14.1|5613737|43|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 4409034-4409076, mismatch: 1 gataactatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaaaag CRISPR spacer gataactatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaagag Protospacer ****************************************.** 7. spacer 14.1|5613737|43|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 4389218-4389176, mismatch: 2 gataactatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaaaag CRISPR spacer gataacgatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaagag Protospacer ****** *********************************.** 8. spacer 14.1|5613737|43|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 4403489-4403531, mismatch: 2 gataactatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaaaag CRISPR spacer gagaactatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaagag Protospacer ** *************************************.** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NC_005126.1|WP_041380308.1|4403543_4403750_+|hypothetical-protein |
4403543_4403750_+
Protein sequences of NC_005126.1|WP_041380308.1|4403543_4403750_+|hypothetical-protein>NC_005126.1|WP_041380308.1|4403543_4403750_+|hypothetical-protein MTGISNITLQFINIWKKGYKPWGVKNGYPYFIYGNLATKEFTYNIEKLFDWRKSYNHELPWNGSECVR |
68 aa aa | NA |
HTH_35,PRK10727
HTH_35,PRK10727 HTH domain information
|
NA | 4357608-4421733 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|2016517|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 4407052-4407092, mismatch: 1 acccttcatctttcaagttgcttctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgtcatctttcaagttgcttctttgttggctgcactcg Protospacer **** ************************************ 2. spacer 2.1|2016517|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 4403552-4403512, mismatch: 2 acccttcatctttcaagttgcttctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgtcatctttcaagttgcctctttgttggctgcactcg Protospacer **** ****************.******************* 3. spacer 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 4403552-4403512, mismatch: 2 acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgtcatctttcaagttgcctctttgttggctgcactcg Protospacer ******.***.****************************** 4. spacer 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 4409097-4409057, mismatch: 0 acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcactcg Protospacer ***************************************** 5. spacer 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 4389155-4389195, mismatch: 0 acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcactcg Protospacer ***************************************** 6. spacer 14.1|5613737|43|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 4409034-4409076, mismatch: 1 gataactatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaaaag CRISPR spacer gataactatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaagag Protospacer ****************************************.** 7. spacer 14.1|5613737|43|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 4389218-4389176, mismatch: 2 gataactatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaaaag CRISPR spacer gataacgatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaagag Protospacer ****** *********************************.** 8. spacer 14.1|5613737|43|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 4403489-4403531, mismatch: 2 gataactatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaaaag CRISPR spacer gagaactatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaagag Protospacer ** *************************************.** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NC_005126.1|WP_125026260.1|5221666_5221894_-|hypothetical-protein |
5221666_5221894_-
Protein sequences of NC_005126.1|WP_125026260.1|5221666_5221894_-|hypothetical-protein>NC_005126.1|WP_125026260.1|5221666_5221894_-|hypothetical-protein MTIPAFKGGQVYRIQRCLSGYDNFLCGRPKASVSDHTPFHMTLARDHPKAFLTGHSYHPDTGNIGWLSLTAGMRG |
75 aa aa | NA |
HTH_3
HTH_3 HTH domain information
|
NA | 5185076-5223433 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|2016517|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 5191635-5191675, mismatch: 2 acccttcatctttcaagttgcttctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgtcatctttcaagttgcctctttgttggctgcactcg Protospacer **** ****************.******************* 2. spacer 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 5191635-5191675, mismatch: 2 acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgtcatctttcaagttgcctctttgttggctgcactcg Protospacer ******.***.****************************** 3. spacer 14.1|5613737|43|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 5191698-5191656, mismatch: 2 gataactatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaaaag CRISPR spacer gataactatgtgaccggggtgaacgagtgcagccaacaaagag Protospacer **********************.*****************.** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NC_005126.1|WP_125026261.1|5222071_5222251_-|hypothetical-protein |
5222071_5222251_-
Protein sequences of NC_005126.1|WP_125026261.1|5222071_5222251_-|hypothetical-protein>NC_005126.1|WP_125026261.1|5222071_5222251_-|hypothetical-protein MASLSCVNTQKVTPRISAQQGRRMQIPDGIARRSQRRLIRARKEVQKTRQYGMYLSLSG |
59 aa aa | NA |
HTH_3
HTH_3 HTH domain information
|
NA | 5185076-5223433 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|2016517|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 5191635-5191675, mismatch: 2 acccttcatctttcaagttgcttctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgtcatctttcaagttgcctctttgttggctgcactcg Protospacer **** ****************.******************* 2. spacer 10.1|3956625|41|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 5191635-5191675, mismatch: 2 acccgttatccttcaagttgcctctttgttggctgcactcg CRISPR spacer acccgtcatctttcaagttgcctctttgttggctgcactcg Protospacer ******.***.****************************** 3. spacer 14.1|5613737|43|NC_005126|CRISPRCasFinder matches to NC_005126 position: 5191698-5191656, mismatch: 2 gataactatgtgaccggggtgagcgagtgcagccaacaaaaag CRISPR spacer gataactatgtgaccggggtgaacgagtgcagccaacaaagag Protospacer **********************.*****************.** |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NC_005126.1|WP_109792003.1|5323058_5323133_-|hypothetical-protein |
5323058_5323133_-
Protein sequences of NC_005126.1|WP_109792003.1|5323058_5323133_-|hypothetical-protein>NC_005126.1|WP_109792003.1|5323058_5323133_-|hypothetical-protein MTASYWAKVFGENMKITVIASDCQ |
24 aa aa | NA |
HTH_LUXR
HTH_LUXR HTH domain information
|
NA | No | NA |