Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_020525 | Acinetobacter baumannii D1279779 plasmid pD1279779, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
| NC_020547 | Acinetobacter baumannii D1279779, complete sequence | 5 crisprs | DEDDh,csa3,cas3,WYL | 0 | 2 | 4 | 0 |
1. NC_020547
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_020547_1 | 780215-780291 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_020547_1
|
1 spacers
spacers of NC_020547_1
>1.1|780241|25|NC_020547|CRISPRCasFinder GATGATTCCAGTAATCGGGCTTAAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_020547_1
The CRISPR arrays of NC_020547_1 >merge|NC_020547|1|780215-780291|CRISPRCasFinder ATATCTCCATCACCACCAATACCACCGATGATTCCAGTAATCGGGCTTAAGATATCTCCATCACCGCCAATACCACC >NC_020547|1|1|780215-780291|CRISPRCasFinder ATATCTCCATCACCACCAATACCACC GATGATTCCAGTAATCGGGCTTAAG ATATCTCCATCACCGCCAATACCACC
>NC_020547.2|WP_000208333.1|778303_779197_+|PhzF-family-isomerase MTTIYVVDAFTTQPNTGNRAGVVLDADHLTTQEMQDIAAFAGYSETAFVLSPKDQSHNIHVRYFTPTHEVPICGHATIATHFLRATTGHQSDYPLIAKTGAGHLPVSIFGSPEALLVKMTQGRVEFLPPFNESQRTELASALGVSESDFADLPIQVVTTGHSKVMVPMLSRNKLDELIPNNEKLKAISAEIGCNGFFPFVLEGSRQEPITYGRMFAPAIGINEDPVTGNANGPAGAYLVHHDLIECDQKVSYWGYQGFAIEKPGRVLVTVEKIDSILHVSIAGQAVLVGSVLYSGKD >NC_020547.2|WP_001103914.1|777215_778079_-|LysR-family-transcriptional-regulator MNWDDTKVLLAIGRTGGLSRSAKLLGISVSTVHRRAVELEKSLNAVLFSRDSDGYTLTHVGKHFFALAEKAEEHLIAMERYNDQGQQSLFRIALPELIGQQLLQSKLTALQLKHPDLQLEISTSVVPVDFSRREADIILRLVRPESGRYIIRRLGQLEYGLYGSKDYLASFKEHAETADDLLNHRIIGWDRSLQYTFLAQWMRELTQDAAPALSFDNMHSQLRAVIEGQGVTALPCFVAKASGLVPILPMQTLKQDVWLMRHLDTKDSDYSTLISETIEKELQEYLL >NC_020547.2|WP_001156088.1|776297_776990_-|hypothetical-protein MQEIKSLLEQLNQLEPLPAKNRETYLESLTRRGYKYMIAITGVLFLILVILAIWHKVSPFTDQGREIAKWFALLTIFIPAIYIIIDIGIGLVSIFKFKSRSFDWLILEIDHDKKAIESLIKYKKETLLEAQDWLQLKCSRLSSRISTFIGNSDKYAVFSLIGLGWSVWKELSKVPSISFSLSNGDIVQTLLLYGTAFLTGIALGSMVINYQIQRYKYQIELIEFALKQKN >NC_020547.2|WP_000482247.1|775230_776115_-|hypothetical-protein MFNKKIINEYKKNLDFCTNFWLNDNHGHSGSLLNLDDVSKIEKDDVWNNIFITYKSDLKSTQKFRNILKELITIKVEEQKILDLSEIKFIYGGKSINCFDFMKDCDLASWWKSATKNNSANEHIYKNEVKYLRECFNEKNRLEGVNGFIKRSWHKGLMVCHSDSNHRIGNIANICTHNPTLEIPYIEKLTTYQLNQNILDEILKEYSLYIIIEEDHFNKNIFNKMDDICIKQNAFCLELTKKCTRFSLSGLHFENFKIRIYFIEKTLKNLLLRTQLNLQLHNNKLIKELLKNKE >NC_020547.2|WP_000032760.1|774486_775173_+|His-Xaa-Ser-repeat-protein-HxsA MSKFIKSLAIFAASAPIINNKATAAIGVNVDTYDNLEPVSIRPLNYEYENMFAGHRSHSSHRSHSSHSSHYSGSGYSGYSGSRNPVYSVPTYTPPSYASSSSSVKKVTTPSSKPTTLRSNSNIVVKNYSNIPTSSNTTSQSYYDNSENLNNIAEENDPVLMRVLQVKRVQMALVNRGYYSGKIDGDLGKNTRKAIANYQIDKNLAINGRMTTELLNSLGILAVNYYEE >NC_020547.2|WP_001226477.1|773248_774439_+|His-Xaa-Ser-system-radical-SAM-maturase-HxsC MRKIKLDSVTQHTPQIFRVLNLNNLYVEWLPDQSILVPITTIQEVQVFDRYIRSDLDNLYPIYSSDLMNIVGEKNLFIPENQVLEPNDVVAIDLNKKNLNVLLRASDTHHTLFLTNRCNNYCIMCSQPPTKHDDSWLIEQALEIIDHLSYVPMNIGLTGGEPLLLDKNLRLIIDTIHHKFPSTKIDVLTNGRLFSNSEVAESILSNLETQVNWLIPLYGHADLLHDFVVQQHSAFEETLEGFYVLQNYEQPIQLRIVLVKPVLENLLNLCNYIRSNLPFINEVAFIGCEPIGFALANRELSQVDIKEWWKELENAADILINSKIRFIFMNIPLCCLPENLWDFAAQSISDWKNTYDPVCQECDLRGKCCGLFSWYKNGWMPSTIKPIKLLKPSMNN >NC_020547.2|WP_000899402.1|771819_773241_+|His-Xaa-Ser-system-radical-SAM-maturase-HxsB MLFSNTELMPFNFKRMANENYLITSVTGDFEFISNENLRKLIAKDESLDIELYLKLKSKFFLISKNALGTKRALASRLHSKKSTVLNGPALHIIVVTIQCMHSCSYCQVSRKQEGDKFTISMEDLFLACDTIFESTSETLTVEFQGGDPLLRYDLVKTAIEYISEKNKLHNRLIRFVVTTTLHQLTSEMCSFFKEHQVVLSTSIDGLADLHNKNRPIANRDAYERTLEGLELARKELGQDSVSALMTTTRKSLDYPHEIVDAYVKLGFKEIFIRGLSDYGFAKKNSKRLAPTQSEFLNFYSKALERVLYWNNEGYELIEVHAAILLNKILSPFDQGYIDLQSPSGAGLSCMVYNYDGYVYPSDEARMLKETGDISLRLGKIGEPLSQLLSSNLQRNIIASSLNFNDPSCRECAYLPYCGPDPISAYNEFSMMTPPTHLTSHCKRYMGLFDLIFNRYQDSESFRKIANRWAFSK >NC_020547.2|WP_000192295.1|771545_771818_+|hypothetical-protein MTQKLIKFGFDFHSELLLDEILQALKFCPVQYDIEQISEQHYFFEVSEPKEKLLILNFINDFYLRKELNAKIAPEQKSFIDAIIRASISK >NC_020547.2|WP_015451412.1|770807_771362_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MPTLEISSKKLQVVQTAIQLFTTHGFHNAGVDLIIKEAKIPKATFYNYFHSKERLIEMCIAFQKSLLKEEVLSIIYSSRYYTQKDKLKEIIVLHTNLNSLYHLLLKAVFEIKRLYPQAYRMAVEYRKWLHRELFDLIFSCETRAFKFDADMVLNLIDGLMLQVLSSNCLDERDVVLERFWERNI >NC_020547.2|WP_000249482.1|769631_770123_+|flavin-reductase MVQATDFRNAMSLLTSAVSVVTTAGMSGRFGFTASAVCSVTDTPPTLLVCMNQAASSHAHFLDNKILTVNVLGAHHEHISKAFSSKLTPEERFKHGEWIELETGAPVLEDALVSFDCEIEQIQQVGTHTIFICPIVAIKQSQHDQSLVYFNRAYHQVGQTETV >NC_020547.2|WP_000025830.1|783268_784552_-|ribonucleotide-diphosphate-reductase-subunit-beta MSILSWDDFEDDSQKPAAPEHKSASVNPEKTPDSQNVSAAQPSSQSVAAPQSTGTHSVRSTNPTDSMARASEALEHLDVAPGLEELEMGAQRVQVDDKAMINCRADLNQLVPFKYEWAWQKYLDGCANHWMPQEVNMNHDIALWKSENGLTEDERTIVMRSLGFFSTADSLVANNLVLAIYRHITNPECRQYILRQAFEEAIHTHAYQYCIESLGMDEGEVFNMYREIPSVARKAAWGLKYTQSLSDPTFHTGTPENDQRLLRNLIAFYCVLEGIFFYCGFTQILSMGRRNKMNGVAEQFQYILRDESMHLNFGIDMINQIKIENPHLWTAEFQQEVIQMILEGTMLEIEYARDTMPRGVLGMNASMMEEYLKFICNRRLSQLGLPEQFAGVTNPFAWMSEMMDLRKEKNFFETRVTDYQTGGALSW >NC_020547.2|WP_000465010.1|784689_784824_-|hypothetical-protein MFFHLSHNYMLGVGILIFAFIFFYTPMVYAFFKIRKQQRKQNKL >NC_020547.2|WP_000111540.1|784880_787715_-|ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-alpha MSVITSTPGQIQVIKRTGDVAAFDAEKISVAIGKAFLAVEGQQSADSSRIHDRITQLTEMVLNTFTRRLPSGGTIHIEEIQDQVELALMRTGEHKVARAYVIYRDQRASARKDTNSNHHPTLQVTDANGQLQPLDLSALQATVNRAAEGLEGIDVQAIIDETVKNLYNGVKESDIATTMMMATRTRIEQEPNYTYVTARLLRDELVSTGLAFLGLPADTAENNALEAFLKKGVELDLLSPDLLKFDLEKLAAAIQPERSNQFTYLGLQTLFDRYFIHSNGVRFELPQLFFMRVSMGLALNEQDKEERAIEFYNLLSSFDYMASTPTLFNSGTLRPQLSSCYLTTIGDDLYDIYGAMRDNAMLSKWAGGLGNDWTPVRALNSYIKGTNGKSQGVVPFLKVANDTAVAVNQGGKRKGAVCAYLETWHLDIEEFLELRKNTGDDRRRTHDMNTANWVPDLFMQRVFEDGEWTLFTPSETPDLHDLTGAEFAERYAYYESVAKEQNMLHKKVRAKDLWRKMLSMLFETGHPWITFKDVCNLRSPQQHVGVVHSSNLCTEITLNTNQDEIAVCNLGSINLVQHVKGGVLDREKLARTVKTAVRMLDNVIDINYYAVPQAKNSNLKHRPVGMGIMGFQDALYEMGMAYGSDEAVNFADESMEVISYYAIQTSSDLAVERGAYSTFKGSLWDQGILPIDSLEIVAKSRPERMFEVDRTQRLDWDSLRAKVQKDGMRNSNVMAIAPTATISNICGVSQSIEPTFQNLYVKSNLSGEFTVINPYLVRALKERGLWDTVMVNDLKHFEGSVQKIARIPEELKAIFATAFEVEPRWIVDAASRRQKWIDQAQSLNLYISGANGKKLDITYKMAWLRGLKTTYYLRALGATSAEKSTINTGALNAVKPATVEAAAPAAAPVVEAKKPEAVEEDGFTQAAPVPMACSIDNPDCEACQ >NC_020547.2|WP_000143214.1|788044_788251_+|hypothetical-protein MTFKNNKQIIKIPENSKINKMQQNMVVMYQFGERLLVYNVNVCILQMINECICKIFKIHVMRFIGAMI >NC_020547.2|WP_000076440.1|788247_788964_+|response-regulator-transcription-factor-BfmR MSQEEKLPKILIVEDDERLARLTQEYLIRNGLEVGVETDGNRAIRRIISEQPDLVVLDVMLPGADGLTVCREVRPHYHQPILMLTARTEDMDQVLGLEMGADDYVAKPVQPRVLLARIRALLRRTDKTVEDEVAQRIEFDDLVIDNGGRSVTLNGELVDFTSAEYDLLWLLASNAGRILSREDIFERLRGIEYDGQDRSIDVRISRIRPKIGDDPENPKRIKTVRSKGYLFVKETNGL >NC_020547.2|WP_015451415.1|789053_790646_+|sensor-histidine-kinase-BfmS MVAVFGYLLVQIINYQRAQEYRESLTDGISYVISEGVARQPGKQQKIDWISDASDLLELPIYYTDASKVELSRTEKKRIEAQKSVVRYDASNSIAYVIIGLRDDPQHYLSIKVDKITERQMKALPIFVLDYLMFYPGQEQEYLAKIQKHFSYPINIQNIQDVNLDSEQIGRLRQDQSVMLYKDSATVRGTTISIVSPIPNHLAQVLVLGPVPMFNWMPLQLSAGITLFSLFLLSLGVYGLILPLERKIRQVRYALNRMKSGDLSLRVPIEGSDEMANLASSYNNMSDHIQRLIEAQRELMRAVSHELRTPVARIRFGTEMLAEEDDYNHRMHQVDMIDKDIEALNTLIDEIMTYAKLEQGTPSLDFAEIVLFEVLDQVAVETEALKTQKEIELIPPPLYVKVDAERRYLHRVVQNLVGNAVRYCDNKVRITGGIHSDGMAFVCVEDDGPGIPEQDRKRVFEAFARLDDSRTRASGGYGLGLSIVSRIAYWFGGEIKVDESPSLGGARFIMTWPAHRFKQPPLKTNKKAPA >NC_020547.2|WP_011858483.1|790668_790968_-|hypothetical-protein MRHIESYIHKHPDADNAIFDLRDVYEIFRQDFASTTTNLEGILHIADSYRVETLNGDQPLIQKYQIDAKNNSLLIDFNTDALNSLRSGKPILEPDATQL >NC_020547.2|WP_001147024.1|791114_792536_-|sensor-domain-containing-diguanylate-cyclase MPYSLREFSFSTSLKFFLLFTIIITLCCFIGIASRPLSFLAFFWPANSVFLGLLLRFPQTRQIGSFAGAFTGYMIADLVNGTPLFLTLILTISNYLYVVTTLALAILFHRHIKAAYQGYSYLLLFALCGIGSITGALFAATFVPMFNTKFMIGSFWAEFGYWVTSELQNALLLLPIILNIPPYLKIKNHLKGNHIYIKAIDFLPLFAVLISIGVSYYDSGPGSLLYPIAALIWCAIRYKPIIVALITSFTSAYIIYHVSGHYLLLYPQDYLGNTISIRIGLIMMTVAPLTVSSISALHSKLIQKLQHAIAHDELTSSLTRRQFLQSVRLLQEKVQKENKTSAFFMLDVDHFKKVNDSYGHLIGDRALQTCVTTIQNILHPHDLLGRFGGEEFAIFIPDTTREAAFELAERIRIQISQQPIYVYGKLPIFVQVSIGISLYSPSYHRSIESLFKEADDALYQAKRQGRNRVFISL >NC_020547.2|WP_002000166.1|793035_793515_+|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-A MLTVPLLLGGKSWGRAKQEQFESGVVSAGGARIRLSAKFYLVAIFFVVFDLEALYLYAWSTSVREVGWLGYTTVVIFVVDLLIALVYAFSVGALSWAPADRRKLAGEKIKVGSPTMNIAEITRFNSIEELVTDPTGQIPAQSSGRVKSKTTPALSSEKE >NC_020547.2|WP_000878003.1|793521_794199_+|NADH-quinone-oxidoreductase-subunit-B MKYTLTRANPDADQYPLQDRQIVTDPLEEEVNKNVFMTRLEDVLHTAVNWGRKNSLWPFNFGTSCCYVEYATTLTGVHDLSRFGAEVIRASPRQADLMIVAGTCFVKMAPVIQRLYEQMLEPKWVISMGACANSGGMYDIYSVVQGVDKIIPVDVYVPGCPPRPEALIQALMLLQDQIQLERRPLSAVIGDDLQPVYKPKMMPERDRKNAQRIAVKNLRSMDEIK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_020547_2 | 1487375-1487538 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_020547_2
|
3 spacers
spacers of NC_020547_2
>2.1|1487398|37|NC_020547|CRISPRCasFinder GCCAGAATCTTTTTGATTAGATCCTTGTTGTTGGCCG >2.2|1487458|16|NC_020547|CRISPRCasFinder CTGGTTATTTTGTTGC >2.3|1487497|19|NC_020547|CRISPRCasFinder ACCGTGTTGCTGTTGATTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_020547_2
The CRISPR arrays of NC_020547_2 >merge|NC_020547|2|1487375-1487538|CRISPRCasFinder TGGTTGTTATTTGAGTTTTGTTGGCCAGAATCTTTTTGATTAGATCCTTGTTGTTGGCCGCGGTTATCATTTTGCTGTTGTTGCTGGTTATTTTGTTGCTGTTGATCGTTTTGCTGTTGGTTACCGTGTTGCTGTTGATTACGGTTGTCATTTTGCTGTTGTTG >NC_020547|2|2|1487375-1487538|CRISPRCasFinder TGGTTGTTATTTGAGTTTTGTTG GCCAGAATCTTTTTGATTAGATCCTTGTTGTTGGCCG CGGTTATCATTTTGCTGTTGTTG CTGGTTATTTTGTTGC TGTTGATCGTTTTGCTGTTGGTT ACCGTGTTGCTGTTGATTA CGGTTGTCATTTTGCTGTTGTTG
>NC_020547.2|WP_000132045.1|1486941_1487259_-|hypothetical-protein MTDQNTDHAQLVAGDHNYSDSRWRESYLTRPYYQEAQLTTPDLDYDRDFSAAYELGHRARSESKEGTQFEDMEGSLQQKWEELKAESRLKWEHAKQAIKDAWDDM >NC_020547.2|WP_000498470.1|1486636_1486906_+|hypothetical-protein MFVYFTDGTCINDCEIYGVKAKYEQNKYVVEVTIKPTHVLATTPSVQFKKEVFDDPNLANQYLSHNFNMPPFFNAHNFRTIKKPISQGQ >NC_020547.2|WP_001136759.1|1486120_1486549_+|hypothetical-protein MPQYLKIAEKIYQNVKEKKGFTDDPMEDLNNLMIELRQEIKGTKLKLLYNYIDFAEILIKPLQESKIKLDLSLIPKSKNTQEFVLWLAGFIERITTGGQEKLPPIRAKITLPAYAYEETYPSQKKPVNNGEEIIEYFKKNQS >NC_020547.2|WP_000251635.1|1485707_1485851_+|hypothetical-protein MVRIFCAVSMVLAIAMGMSACQDRNSKNDGMHEASDPATSHDMNKNS >NC_020547.2|WP_001984002.1|1484447_1484738_-|hypothetical-protein MFFLYRFVLVSLLTIGVLNLMGCRPMSKNEFNTRCVWAGHDLSACNCIYNSLEQHYSPQFVESLPKLSLQNIDAKMNFVETMNQTMQQCQLSASKH >NC_020547.2|WP_000119776.1|1483540_1484446_+|LysR-family-transcriptional-regulator MSYFDINRSGELAIFIRVIELGSFSAVARACNMTPSAVSKLISRLEKRLGVRLLNRSTRQFQLTSEGCQFYEQGIQILNDLDELEQAVTANHTPKGRIRIHTSFSYWAHFLLPCISLFNQRYPEIELEAHLSDEVINLVEQRIDVAIRTGPLKSSNLVARSLGSTYKHYVCSPVYIEKYGCPEHPDELHEHQLLDVSYQRQNKTWLFKKATQEISLTPSKVLKVNHGEAILQLALAGAGIAQLNEFQIRNALQQKQLVKILEDWNIHASEEFHAVWIGHDKYVPNRVRTFLDFLVEHASIN >NC_020547.2|WP_000781136.1|1482190_1483429_-|SGNH/GDSL-hydrolase-family-protein MKLYQATLFSLVLITSFAQADVENSQWITTWSASPQKVWNKDFVFPTLIPEQVSNQTIRQMSKISLGGEAVRLVFTNQYGKQPLYIDQTTIGLANAVTLKSKSTYPVYFSGQLKARILPGKQLISDPIQLPVPDHAQLVVNSFIQKSTTFKTFHWDAKQTSWLISGNQTTNLTTPTDAKTTTARLLLSAIEVKPKQKAHVVAVVGDSITDGATATLDANTRWTDFLAKRLSAHQVAVINSGISGNRLLTDGMGDSVLKRLNSEVFQYAGVKTLIVLVGINDISWPGTAFAPKQQIPSFEALTQGYRRVVSEAHKHNIQVIGATLLPFSGALPNTPLDNYYQPNKDQLRQRINHWMRTSHTFDGVLDLDEGLKDPKHPNRLNPIYDSGDHLHPNDRGNQHMAELVDLDQIIKN >NC_020547.2|WP_104133595.1|1480861_1482145_+|DcaP-like-protein MKILNTTVQKSLLAVSVTLLMSSAFAGQVNPEIEQLRQEIKELRAMLQTNMEAQKSLAQKRVEQAAPVVTQAPRPIQQTLTKSGAEFNLYGYIRADASYQIKGASTMYNNISGVPLENTTEESAQKDQLHSTVYVTRFGLNFKTPTAVGDVGGKLEMDFFGAATRDQFRIRHAYLTFDKWLIGQTWSTFIAPEYYPETIDAGTFVGSALLRSPLVRYSDNLTANTSFAVSVEDPKYTAATDPDNKMRLPALVGRLNHKFANGSMLSGRSFVAEKRTNNDSEWAWGVGLGGKYQITPDTLLKADYYHVKGDGRFLLWSNSGYAIDDQNNMHSNEFDTVSLGITHQFTPQIRSTLGYGYMKAKDDNRFAELQRTNTTQNKQLWQGWVNALYNPYKPITLGIEYVYGERETFDNRNGIDNRFNMIASYDF >NC_020547.2|WP_001029914.1|1479945_1480617_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MAKDFNSPKVVEGYDVHIRKLIPGYEVIHQQVDAILQSVLPPDAHILIVGCGTGYELEYLLKRHTNWQFTAVDPSLTMLQKAQEQVEILGKSTQVTFVHGETSALPLESSFDAALSILVAHFIADDIKPVFFKDIYDRLKEKAILLTYDLMTCVNPQNLQALRYLCLAQGLTEEQCQKMLERMAQDFFSLTTEGYIKLLEKTGFESVQSYTQILTYQGFIAKK >NC_020547.2|WP_001183749.1|1478180_1479875_+|AMP-binding-protein MQQERLSYASGPSTQPLLGMTIGEQFDQACQQYAEKEAIVSFHQNRRLTYKALQNEVNAFACSLLKLGLKKGDRLAIWSPNCVEWTITQFAAFKAGIILVNLNTAYKSHELEYVLNKVSCKGLIIASQFKTTDYQELLTKIAPELTTCTDKVLSSERLPHLKFVIKIDDQQHTGIYRFSDLLTTPTSEQLEQLKQLARQLQFDETINIQFTSGTTGNPKGTMLTHHNILNNGYFVGEGIRLTPQDKVCISVPLFHCFGMVMGNLACVTHGSTMVYPSAVFNPLETLKAIHQERCTAAYGVPTMFIATLEHEQFNEFDLSSLRTGIMAGSPCPREIMQRVIDRMHMSEITICYGMTETSPVSVQSSVNDSIDKRVSTVGHVHPHVEIKIVDLEGQIVPQGTLGELCVRGYSVMAGYWGEEEKTREVIDAAGWMHTGDIAEMDQDGFIKIKGRIKDVVIRGGENLFPKEIEDFLYTHPDVSDVQVIGLPDAKYGEELCACIILHEHHQVDEDSIRQFCKEHISHNKVPRYVRFFNEFPMTASGKAQKFKLQEIMRAELNLTGNVFD >NC_020547.2|WP_031951484.1|1488031_1488964_+|IS5-like-element-ISAba13-family-transposase MNKLTPKIYRTTNWSSYNRALINRGNIAIWFDPATQWYAPSKGKQGRNQTYSDAAIQCCLMIKSLFRLSLRMVTGFVQSLIHLCGLNWIAPDYTTICRRQQHIDIVISYQKSCDGLYLIVDSTGLKFLGEGEWKRKKHQPEYRRQWRKLHIGIDAKTLQIRAVQLTTNNVSDSQVLGDLLDQIPQDERVDSVYTDGAYDTKQCRQVIADRQAHAVIPPRKNAKPWKDKKMGSLERNELLRTVKRLGRTIWKKWSGYHRRSLVETKMHCIKLLGDKLSARNFQSQVNEIHARMAVLNKFTDLGRPHTRVVT >NC_020547.2|WP_001145688.1|1489712_1491122_+|iron-containing-redox-enzyme-family-protein MPVVVKKRLLDLLQDNQQNYYELFVFFLDPDVSSFEKEKKARDFLVKEIDKLEMKEIDFPSDINLIKAWCENDNKKNCQEFQAYLNRRQSGQDREYFKNVAQAFEFLIKVSPTKKVDGAWLYSSVHYWNDPIFHELIITYLEELGLGEPKANHVCIYDDLLRSLGLDSFDLLLEDEYYHQAVVQLALGYAPPEFIPEIVGFNLGYEQLPLHLLISNYELAELGIDSKYFNLHITIDNIDNGHAYKAIKVIEDIYNKYRDKELFLTKLKHGFALNNHGVSSSSIIKNLNTEDFVHRIFKRKALVGQLIHNETRQFGCKTINQWLSNPDDIPGLITHLTEHKWIKFNTNPEQSVFWRMINEENGKMFGVFNPVERQIIHDWIAGSDHSSSFLAYSRELKNSQRIQDYLFSYISDGELDALQERVQQSNDLAIKICKLTPFLAPDSHHKSIGLWSTRKYVELLFPYLGTFKN >NC_020547.2|WP_086300312.1|1491176_1493321_+|catalase-HPII MDMNDNTKSTNKTSEMAGADAANKANTTQKTEQLDTVRDDATNEALTTNQGVKIADNQNSLRAGIRGSTLLEDFILREKITHFDHERIPERIVHARGVGAHGYFQAYEGNERLTKAGFLTDPTIQTPIFVRFSTVQGPRGSADTVRDIRGFAIKFYTQEGNFDLVGNNAPVFFVQDGIKFPDFVHAVKPEPDTEIPTGATAHDTFWDFVSLVPESAHAVIWAMSDRAIPRNLRSIQGFGVHTFRLINAEGKSHFVKFHWTPKQGLSALVWDEAQKLAGKDPDFHRRDLYEAIEQGFYPEWELGVQIVEEEDEMNFDFDLLDPTKIIPEELVPVTPIGRFVLNRNVDNFFAETEQVAFCPGHVVPGIDFTDDPLLQARLFSYTDTQLSRLGGPNFHQIPINKPVCPFHNNQRDGIHQHTIHKGQAAYQPNSIDGNWPVETPPAASNGGFESYPEKISGHKLRQRSETFSDYFSQPRLYYKSLAPHEQKHVVDAYTFELSKVQRKHIRERQVQQILANIDLDLARQVGANLGIEVPDLTLNYKKTAVEKSAKLSFLAFPPEDIQGRKVAVLIHNMVKSDALEAIKNWAIKEGVILHLLAPSLAPVKDHKDSVIVADGMQMSEPSIAYDAVIIPDGDNLNTVMQDGVARHYLLEAYKHLKPIVFLGNKSDLLEPLGLVADEGTLIEDEFQHVAEKFKNLIKAHRVWSREQIAAHVPA >NC_020547.2|WP_000432325.1|1493376_1494255_-|glucose-1-dehydrogenase 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NA
Consensus repeat of NC_020547_3
|
1 spacers
spacers of NC_020547_3
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_020547_3
The CRISPR arrays of NC_020547_3 >merge|NC_020547|3|1495441-1495526|CRISPRCasFinder TCAGAAGAAGCTCGTGAAGCTGGCCGTGCTGCACATGCCAGTGGTAACGCACATGAATTTACCTCAGAAGAGGCTCGTGAAGCTGG >NC_020547|3|3|1495441-1495526|CRISPRCasFinder TCAGAAGAAGCTCGTGAAGCTGG CCGTGCTGCACATGCCAGTGGTAACGCACATGAATTTACC TCAGAAGAGGCTCGTGAAGCTGG
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MPVVVKKRLLDLLQDNQQNYYELFVFFLDPDVSSFEKEKKARDFLVKEIDKLEMKEIDFPSDINLIKAWCENDNKKNCQEFQAYLNRRQSGQDREYFKNVAQAFEFLIKVSPTKKVDGAWLYSSVHYWNDPIFHELIITYLEELGLGEPKANHVCIYDDLLRSLGLDSFDLLLEDEYYHQAVVQLALGYAPPEFIPEIVGFNLGYEQLPLHLLISNYELAELGIDSKYFNLHITIDNIDNGHAYKAIKVIEDIYNKYRDKELFLTKLKHGFALNNHGVSSSSIIKNLNTEDFVHRIFKRKALVGQLIHNETRQFGCKTINQWLSNPDDIPGLITHLTEHKWIKFNTNPEQSVFWRMINEENGKMFGVFNPVERQIIHDWIAGSDHSSSFLAYSRELKNSQRIQDYLFSYISDGELDALQERVQQSNDLAIKICKLTPFLAPDSHHKSIGLWSTRKYVELLFPYLGTFKN >NC_020547.2|WP_031951484.1|1488031_1488964_+|IS5-like-element-ISAba13-family-transposase MNKLTPKIYRTTNWSSYNRALINRGNIAIWFDPATQWYAPSKGKQGRNQTYSDAAIQCCLMIKSLFRLSLRMVTGFVQSLIHLCGLNWIAPDYTTICRRQQHIDIVISYQKSCDGLYLIVDSTGLKFLGEGEWKRKKHQPEYRRQWRKLHIGIDAKTLQIRAVQLTTNNVSDSQVLGDLLDQIPQDERVDSVYTDGAYDTKQCRQVIADRQAHAVIPPRKNAKPWKDKKMGSLERNELLRTVKRLGRTIWKKWSGYHRRSLVETKMHCIKLLGDKLSARNFQSQVNEIHARMAVLNKFTDLGRPHTRVVT >NC_020547.2|WP_000108365.1|1487364_1487586_-|hypothetical-protein 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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Consensus repeat of NC_020547_4
|
1 spacers
spacers of NC_020547_4
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_020547_4
The CRISPR arrays of NC_020547_4 >merge|NC_020547|4|1820716-1820840|CRISPRCasFinder CTTTGTCCTGAGAAGCGACTAAAGCTTCGCAAGAAGACGAGAACTATGTTCGAGTGGAAGAGGATAAACAAAGCAATGCTTTGTCCTGAGAAGCGACTAAAGCTTCGCAAGAAGACGAGATCTAT >NC_020547|4|4|1820716-1820840|CRISPRCasFinder CTTTGTCCTGAGAAGCGACTAAAGCTTCGCAAGAAGACGAGAACTAT GTTCGAGTGGAAGAGGATAAACAAAGCAATG CTTTGTCCTGAGAAGCGACTAAAGCTTCGCAAGAAGACGAGATCTAT
>NC_020547.2|WP_000421182.1|1818990_1820646_+|TIGR01244-family-phosphatase MELKRVNQDFYVAGQITANDIVKTADQGIKTLICNRPDGEGADQPNVIEIEEAAQRHGLNVIYQPVISGKITDQQVTEFKQLYQNAQKPVLAYCRSGMRAISLWALAEVAPQDAALLVESGNKLGFNLKGLVPRILKRDHEPATIPCYSVVIVGAGAAGISVASSLLCREPHLDIVIIDPADTHYYQPGWTMVGGGIFKPQVTARSMTSVIPSKVKWMKAAVAGFDPEHNQVILEGCQPIQYKALVVCPGLKLNWHGIEGLVETLGKNGVTSNYRYDLAPYTWELVQQLNSGKAIFTQPPMPIKCAGAPQKAMYLSADYWLKQGKLKDISIHFYNTGAVLFGVKEYVPALMQYVEKYGSELHFNHQLVKVDGPAKKAWFKVVNDENAALVETDFDMLHVVPPQQAPDFIRASTLTDEAGWVSVNPQTLQHTQHANIFALGDVMNAPNAKTAAAARAQAPIVAVNVLAQLNGEQNFCEYNGYGSCPLTVERGKIVLAEFGYGGKLLPSFPKWIIDGQKPSRLAWLLKEQILPPIYWQGMLKGREWMVKPERG >NC_020547.2|WP_000465460.1|1818285_1818981_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MFFKQFFEQESSTYTYMLGCEETREAVLIDPVASDIEIYTKELEQHQFTLIYTLDTHVHADHITAANLLREHFHCKSVLHRNSEVSCGDILITDGCMLKVGNLSIEARYTPGHTNACTSYLVGNMVFTGDALLIDGCGRTDFQQGNAGTLYDSIHKQLFSLPDETIVYPGHDYKGHLSSTIGYERLNNSRLGQNRSREDFIELMNNLNLPYPKQIDKALPANQACGSISQL >NC_020547.2|WP_001096449.1|1816822_1818094_-|sigma-54-dependent-Fis-family-transcriptional-regulator MAKLNFESEQNFYILFEQLKALFPNASLFLADTTTQAIHYKFNTDDISVESIAALTQDHHNQYLEINTPKMRKRFIYQEHDIYIAEHRIIGKLHILQPVSIENDIVDEVELTEQLQDLAKVFNSCSPEMTRMFSIIQRVAITEFPVLVRGESGSGKELVAQAIHDYSQRKNKIFVAINCAALNSNILESELFGHVKGAFTGAIRDHKGVFERAAGGTLFLDEIAEIPLELQAKLLRVLETGEFTPVGGEKPIQANVRIITATHKALREEAKAGRFRHDLLYRLRVIPIFIPPLRERKVDIPLIVDQILKESSTQLDTMPRHVNQKAMQVLLNYDWPGNVRELKNTLLYALTMANGKDEIEIEDLPNELLNADDYVKLPETNTELSPENVQAALEKYNHNLNMVANIFGISRTTLWRYRQKHKL >NC_020547.2|WP_000637007.1|1815841_1816753_-|bestrophin MIVRDKSNVFKLLFAWKGTILPKVLPALSFVVLISACVVWLSYYHWIQIPTVPAIGFTIFGVILSICTGFRNNACYDRWWEGRKLWGALIANARHIVRDSHVLSNEQREHLIHQVLIFSNLLRDRLRQQTVEPTKFLEHAYLNNSSLNYLNEHINAPQFVLENIQKDLVKILKDGEISDIIYGTLTRHIVELGNIQAGCDRIAGTPLPYSYSVLLHRAVYCFCFILPFSLEAALGIWTPLIVGLIAYMFLGLDALSAQIEEPFGLQENDLPLDSIVRLIERESLSSLGQPLPPIIEAQNNNLL >NC_020547.2|WP_000642309.1|1814735_1815794_+|2,3-butanediol-dehydrogenase MKAARFYDRGDIRIEDIPEPEVTPGTVGIKVAWCGICGTDLHEFMEGPIFIPPCGHPHPISGESAPITMGHEFSGVVYAVGEGVDDIEIGQHVVVEPYIVADDVPTGLGDNYHLSKNMNFIGLGGRGGGLSEKIAVKRRWVHPISNKIPLDQAALIEPLSVGHHAFVRSGAKAGDIALVGGAGPIGLLLSAILKAKGLKVIITELSAKRKEKAKESGVADYILDPSEVDVVSEVMKITNGDGVDVAFECSSVNKVLDTLVAAVKPTGVIVIVSIWSHPASINVHSVVMKELDVRGTIAYVNDHQETIKLVEEGKINLEPFITQRIQLDDLISQGFETLIHNNESAVKIIVQP >NC_020547.2|WP_000238449.1|1813920_1814706_+|acetoin-reductase MVKGLQNKVALVTGAAQGIGRGIALRLAQEGAHIALVDMKQDRLNDVQQEIQALGVNASTFIADVSDREQVYAAINHAEQTLGGFDVMINNAGIAQVQAIADITPDEFQKIVDINIGGVLWGIQAAAAKFKQRQHKGKIINACSIAGHDGFALLGIYSATKFAVRALTQAAAKEYASHGITVNGYCPGIVGTDMWVEIDKRFAEITGAAIGETYKKYVEGIALGRAQTPDDVAALVAFLASEDSDYITGQSILTDGGIVYR >NC_020547.2|WP_001287536.1|1812490_1813894_+|dihydrolipoyl-dehydrogenase MSEAQFDLIVIGAGPGGYVAAIRAAQLGLKTAIVEERHLGGICLNWGCIPTKALLAGAELATQFKHAGQFGFQVSQLDFDIQKLVQHSRQVSAQLVQGIDYLLKKNQVTVFSGRAQLTAKEKIEVTDAQGNSQALSAPHIILATGAKARHVPQLPVDGTYVWSYKEALVPEQLPKSLLVVGSGAIGSEFASLYQDLGCQVTLIDLAKQILPTEDAEVAQFVRKQFEQKGMKVLTDAVVQSIQIENEQVHCVVETANDVQTLVFDRVLSAIGVQPNTTGLGLERLGVELNPQGFVAIDDYCKTNVAGLYAIGDVAGAPCLAHKASHEAMICVEKIAGVANVHSLDRSQIPGCIFTHPQVASIGLTENAAKAKNLPIRIGKFSLTANGKALAIGDASGFVKTVVHAETGELLGAHMVGHEVTEHIQGFAIAKYLEATDESLAQVIFPHPTLSEAMHESILASMQRAIHM >NC_020547.2|WP_005132016.1|1810950_1812480_+|2-oxo-acid-dehydrogenase-subunit-E2 MSEIKTLEIPKWGLSMEEGTIAQWLIKEGDSFNKGDEICEIETTKIVNVLEAPFAGTLRKILAKDGDTLPVGGLIAVCADSEVSDAEIEKFIASLGGSAAQAPSEQSKAETSAPIAEKAEQPQTVAASASAPAKVAKGDYAVPESLQGYQTSNELFATPHALKLAEKHNVNLAKVTGSGREGRISVQDIQKAVQAAGGQWPDVKQQTQAKVVKSTADDSQVLATPVARRLAKQWGINLNDCRVSGTRGRVCKEDVEAVYYRNNPTSVNEQSAQCAVAQPQSTITTVAMNGMRKAIASRLQTAKRNAPHFRLVVDLNVEALQKLRKQINETVPQVKLSINDMLIKAAAAALIKVPEVNVQFDEATQSILQFSQADISVAVAIPNGLITPIVKAANQKSLAQISDDMRDLATRAKTGKLQPDEFQGGSFSISNLGMLGIKQFDAIINPPQGAIMALGASESRAVVENGNVVVREIVTATLSCDHRVIDGAVGAKFLASFKQFVENPALILV >NC_020547.2|WP_001133053.1|1809929_1810949_+|alpha-ketoacid-dehydrogenase-subunit-beta MPNKSFRNAIKEAIESEMRRDPTVFVVGEDVRGGHGGKNTEENQLEGFGGVLGVTKGLWTEFGSERVIDTPITESAIIGMAAGAAATGLRPVADLMFMDFYGVCHDMLYNQAAKFRYMFGGKAKAPMVVRGMIGAGFSAAAQHSQSPYNVFAAVPGLKVVVPSSPYDVKGLLIQAIRDDDPVVFCEHKMLYDIKGEVPDDAYTIPFGVANYTREGTDVTIIALGLMVHRANEVADKLAKDGISVEVVDPRTISPLDEEGILESVASTGRVVIVDESAARCGFGHDVAALIAQKGFHYLKAPVELVTPPHTPVPFSPVLEKEWIPSVERIEQAVRKTLEA >NC_020547.2|WP_001177519.1|1808953_1809916_+|thiamine-pyrophosphate-dependent-dehydrogenase-E1-component-subunit-alpha MQLTEEQLLAAYKRMRDIREFEDRLHEENTNGDIPGFIHLYSGEEAVAVGICENLTDKDYITSTHRGHGHCIAKGCDIHAMMLEIFGKDDGLCRGKGGSMHIADLDKGMLGANGIVGGGPPLAIGAALTAKTLKTGGVGLSFTGDGGSNQGLTFEAMNMAVVLKLPVIFVFENNGFGEGTGHDYAVGSKDIAGRAAGFGLPAVKVDGTDFFAVYEAAQTAIERARRGEGPSVIETITNRFYGHFEGDPGLIRSKEEVEFIKENKDPLKIFREKVKGKIDEAKLDEIDASSKANVDDAVAKARAAAYPKPEQLLTDVYVSY >NC_020547.2|WP_000925654.1|1820898_1821690_+|sulfite-exporter-TauE/SafE-family-protein MLLLVVEGIVIGFLLGLTGAGGGILAVPALMTSQGWSVAQAAPIGLLAVALSTLIGTIEGLFKKIVRYRAAIWIALIGAPMAHIGILIANTISPIWLMLMFSLVMFTVGYRLISNRVSDFHNPPCQVNPSTGRFIWNFKTGGVLASIGIIAGLLTGMLGVGGGFVIVPALRKVTNLDMHSIVATSLMIIFLISGMSIVMHIAEGFHYPVAITSAFALACAFGMLLGRRAIRFIPSVIVQKVFALMVFAVAIYMVIKIVNLTNI >NC_020547.2|WP_000822386.1|1821799_1822804_+|hypothetical-protein MKRINVAICGFGRIGQQIAELLLNRSTYYKQKYQIDARLVGVCNSSSGLIDQEGLQASKWLDKTQYQAGLTEQKFLEQVQADVIIETGPSDYVTGGKGLFYLNYALTHNMNAIAVSKGALVVEGKKIISLAHQHNKKLFFSGATAAALPTVDLFEYNLAGCQILEVEGVFTGTTNFILNDMLQHECAFTESLEKAQAKGIAEPDSSFDVDGWDTAAKITILANTVLGADVKIQDIPRQGISHVTADHIRDWKKGNVIPRLVGFIHIKNQQIQTGVELRLVPANHPFAHLQGSNKCIRVLTQEMGEFVVSGGASAPLATAAAALKDFELMLKTGC >NC_020547.2|WP_001023744.1|1822836_1823754_-|EamA-family-transporter MNILLYVAVVLIWGTTWIGIAVQSHYATPVVAILWRFAISALLLWVVLLFSGKLQRIALKDHLFCMLQGLCVFGLNFICFYTAVKYVNSGLESVIFSMAVFFNAINALIFFKQKPSPNFAPAALLGLSGIVLLFWHDLINSQFNAQLLMGIGLCAIGTYGFSLGNMISVRHQKRGLNIFSTNCYAMTYGALVMLILALFTGQDLMPPMNFPFLSSVLYLAVFGTVIGFSAYFSLVGRIGAAKAAYSTLLFPLVALTVSTFFEGYEWTLNAVFGILLILLGNYLMFSKFEIGKKLFSSQKNCEKQA >NC_020547.2|WP_000331400.1|1823920_1824775_+|AraC-family-transcriptional-regulator MAYQTLEQLQQSKAKLHETVVLDENMQLAFWSNQQDRVSVCSDHHTLSLYIQDGYESYQKTPAGWKNGGGPGRFCLLPEHQESTWDIRGGLKFVHLYYTDQHLRDVAEKIWDKEPNQIELNEVVFNDDERIRALYQFFLLDCDWQDSSNHLQMSTTASLLLNHLIRKYSSVQWQQPTIKGGLAPHKLKYIQEWIEDHLDQALTLSDLANVVNLSEYHFAHMFKQSMNMAPHQYVMQRRLTKAKGLIQSSQLSLQDIALVCGFSSASHLSHRFKQFYGMSPSQLR >NC_020547.2|WP_079263703.1|1824771_1825167_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTVTIPHDIQSSDCQRVSQVLARVGEKWSILIVMTLASHPHRFSEIKRRINGISQRMLTLCLRGLERDGLVKRTVYPVVPPHVEYELTPLGHSLTEPVIALGQWAQQHIADIDAARAAFDAAQEKPITLDV >NC_020547.2|WP_000771642.1|1825262_1825871_+|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase MKLLQIDTSILGEQSVSRQLTSSVIRQLSTAYPDAEIIHHDFALEPIPHLSDAEFLAWQGVEPNNEIAQQRVARNTQYLDEFLSSDIVIIGAPMYNFSFPSQLKAWLDRLSVAGKTFRYTENGPQGLVEGKRVIIASSRGGVYSEGSPAETLDYQETYIKAFFNFIGVTDITFVRAEGIAFGPEARQAALDNAAAQIAQLAG >NC_020547.2|WP_001186376.1|1825954_1827304_-|chromate-efflux-transporter MQQKQLNTPDDSVEQVNFWQAFLFWLKLGFISFGGPAGQIAVMHQELVEQKRWISEKRFLHALNYCMLLPGPEAQQLATYIGWLMHRTVGGLVAGILFVLPSLFILIGLSWVYIKFGDVPVIAGIFYGIKPAVTAIVFHATYRIGSRSLKNKFLWVVAIAAFFAIFVLKLPFPLIVLSAGIAGYLASKKYPELFSSAAGHKASQKDYGPAYIDDDTPTPEHAKFHWSRLARLIFVAIALWLLPILALGAYFGWHHSYTQMAWFFTKAALLTFGGAYAVLPYVYQGAVNHFGWLSPTQMIDGLALGETTPGPLIMVVAFVGFLGGVNHSLLGSEHLFFAGALGAVIVTWFTFLFSFVFIFAGAPIIESTHNEIKFTAPLTAITAAVVGVILNLALFFSYHVLWPQGFSGHFDIVAALITVAAFIALFRFNINVLYVIFASALVGLAVTFF >NC_020547.2|WP_000080819.1|1827545_1828289_+|GntR-family-transcriptional-regulator MSQLPQDPKNHKPLYDQLRELILNKIVNGEYAVLSQIPSENEFAEQFGVSRITVRQALNQLQLEGYIFKVPGKGTFVSKPKTFQNISSLQGFAEAMSSAGHEILNRVISAELKQVPMHVVPKLKLPVKANVYEIQRVRLLNRQPVSYELTYLPEHIGLKLKEKAIDLRTTDIFKALEQECDIPLGHADLSIDATVADEELAALLQVEIGTPVLRVERLTHDANGQPIDYEYLYFSGDTFQYRLRIHR >NC_020547.2|WP_000448780.1|1828317_1830051_+|fumarate-reductase/succinate-dehydrogenase-flavoprotein-subunit METKYLEFDIVVIGGGTAGPMAAIKAKQENPNLKVLLIEKANVKRSGAISMGMDGLNNAVIPGYATPEQYTKEITIANDGVVNQTTVYAYAKHSFITIQQLDQWGIKFEKDETGEFAVKKVHHMGAYVLPMPEGHDVKKVLYRQLKRAQVKINNRIVTTKLLKNEQGAINGVLGFDCRSGDFYVIKTKAAILCCGAAGRLGLPASGYLMGTYENPTNAGDGYAMAYHAGAELANLECFQINPLIKDYNGPACAYVTGPLGGYTANSKGERFIECDYWSGQMMWEFYQELESGNGPVYLKVDHLAEETIQTIEEILHTNERPSRGRFHEGRGTNYRQDMVEMHISEIGFCSGHSASGVWVNEKAETSVKGLYSAGDMAAVPHNYMLGAFTYGWFAGVNAAQYVKAVEDSELNQSEIEAEKARIFAPLNCSEGLPPEQVEYKLRRFVNDYLQPPKTRQKMEIGLKRFEEIKQDIKRISARNPHELMRAAEVSFIRDCAEMAARASLFREESRWGLYHYRADFPQKNNSDWFCHAHLKKDEYGNMVSFKKPIEPYVVPINQDEAVSYDRLRIQKDVALAE >NC_020547.2|WP_000864073.1|1830071_1830317_+|ferredoxin-family-protein MAFIFKEVQHRTVAPVIIDEDKCIADKGCTVCVDVCPMDLLAIDPTTQKAFMQFDECWYCMPCEKDCPTDAVKVNIPYLLK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_020547_5 | 3003186-3003270 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_020547_5
|
1 spacers
spacers of NC_020547_5
>5.1|3003210|37|NC_020547|CRISPRCasFinder GATTATCAATCTTCTTTACTCTACGCGCAGTTTCACT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_020547_5
The CRISPR arrays of NC_020547_5 >merge|NC_020547|5|3003186-3003270|CRISPRCasFinder GCTTGTCTTGCGCCAAAATTAAAAGATTATCAATCTTCTTTACTCTACGCGCAGTTTCACTGCTTGTCTTGCGCCAAAGTTAAAA >NC_020547|5|5|3003186-3003270|CRISPRCasFinder GCTTGTCTTGCGCCAAAATTAAAA GATTATCAATCTTCTTTACTCTACGCGCAGTTTCACT GCTTGTCTTGCGCCAAAGTTAAAA
>NC_020547.2|WP_000077304.1|3002621_3003125_-|L,D-transpeptidase MSQFKLEDADILIDLANQTLSLPKHNKFYVVSTGKNGIGEQENTGKTPRGWHRVAKKFGMQSPKNTVFIARQPTGEVYSSELAAQFPERDWILSRILWLDGLEEGFNKGEGHDTMQRYIYIHGTPDKEPMGVPMSHGCIRMRNEEIIELFDLVSEDALVYLSEQSLT >NC_020547.2|WP_001198160.1|3001102_3001888_+|YdcF-family-protein MQVSKWIRIFLAVIGSILFLDGLFLAFLNKIHVGTLVPLVLGAFFCLYALFYYHLERFFFYHYRLHTLWRFGWLCFWIWLIGLGYFFNFIKENKDASQNLPAVKAIIVLGSGVENGEPSAILAKRLDTAAPVALSQPQAKVILTGGLDFSEKEPEALVMSRYLKQHFHITKDRMILEDKSTSTELNLKNSKPLLEQAHISVNQPIAIVTSDFHTPRAAAIAKKQGYTQVYMVAAETPLITRYNAWLREYFAYASGWLLNEY >NC_020547.2|WP_000473055.1|2998429_3000976_+|PepSY-domain-containing-protein MFKKFLFQIHWFLGISAGLILSIMGVTGAIYSYDQQILKWVNTDSYVVQVQSSPKLTPAQLYQHFTTIQPEIKINSITIAKDPTASSVVNIEKEGERRGYNMMVNPYTAQVLPEVQGRKLLLLIQQIHRNLTAGEFGKQITGACALMLIYFVLSGLYLRWPKKHSARQWLAVKPKLKGRNFIWDLHAVVGTWVIVFYLLFACTGLYWSYDWWRSGMFKVLGVEQPKMQGHGGSGRNKDQLPKIQLDNAQLITALNQTWSGFNNQIGRDYSTLTVNLPKKDDGKIELSFVDATPQHERARNQAVYNYKTANIEKMELYEDKKLNQKIMSSMLPVHRGSFFGPVYQFVAMLASLAMPLFFVTGWMLYLKRRKQKKLTQAARQSLAGHYIDQNAKPWLITYATQTGVAEQLAWRTATSLQEAHQPVQVKSVQQLTEADLQQHEQILFVISTYGTGEAPDLASNFAKKLLKTNLRLQHVKYAVLALGSKEYPDTYCSFGHTVDDWLKNNGAKALFDIIEVDNANPADIQNWNQALVKATKLDLHTVNIEKVFDNWTLQQRDLLNPNSLGQPAYNIELTANHEAIWQAGDIAEIQPGNSPERINKFLQHHHILKNAVVDSLQVSIEKALWNKDLTGEIEPFANLDHLLEQLPTLPTREYSIASIPSQQVLRLVVRQQYDESGDLGLGSGWLTQHTEINQNVALRIRTNESFHLIDDNRPIICIGNGTGIAGLMSLLHTRTRHNYTENWLIFGERQRAHDFFYASTIEAWQTMGMLKRLDLAFSRDQEQRVYVQDIIRQNAAELINWIERGAVLYVCGSIDGMASGVDQALIHILGEEQVDELRQQGRYRRDVY >NC_020547.2|WP_000125649.1|2997696_2998272_+|SdpI-family-protein MTAKTLYAYTLQPVPYEVSEAEQRNAQLLIWRSTNKISTKIWAIMGVILALAILGLIFIKNYSTVICWVAIVCVVLYYLGRKYGLEWYVKRKMNEFPVQEIKGIRLGVQPHGIVMRQQMGLQEGVGTIGWKNIYEWYNTPDFILVNFKVKDPKGQEQQGAYILPKRMDSKNFSFNTIRKHLKESVGEPKTL >NC_020547.2|WP_002016809.1|2995421_2997596_+|TIGR01666-family-membrane-protein MKSWFKRLKRATYNTSFMYNVRMLIAFSGTAFVPYFLGHQLATIPLTLGVVAAGLSDIDDRFSVRIMNLIYTYIGFFITAASVQLLFPYPMLFALGLIASCIGWILLGSLGRRYATISYGCLVVSVYTMLGVHLFDQWYIQPALLVAGAAWYGLIATISFLLFPVRQLQDKLAASYASLGDFLFAKSNLFDVDMTPASYQQSMIDLSLENGKLITIFNDLKTALLTRLKGDRGQKGTRRSLHYYFVAQDIHERADSAHIDYQKLAKIFQHSDILFRFQRILAIQGKACQELNECILQRKPYIHNKRFKQSFENLRLSLVKLRNDQQYDLLWVNALFALYRNLKSIDSQLLNLETEQHIQSDKVKQAENQLKDDDLKGWNDIVVRIKQNLTPESVLFRHAIRVSIVLFIGYVFIQMTHIEYGYWIMLTALFVSQPNFNATKRRLRLRIVGTLVGIIVGLSIVFLVPSVEGQLVMLILSGVLFFELRSKQYAQATAFITILALINFNLDGSAVAAAIPRFVDTLIGCALAWFGVTFIWPDWKFRRLPRSIRRSLQAQCNYLAEVVKQYHEGHNHALNYRIVRRAAHNTDAEVASLISTLATEPDFDPTRKSDIFEFLCLNHTFLSYIAALGAHREKIQDQAVLNVLDQALDDIQGALLRDEMPDLTAQNMLQTIRQRLSQNDEDDQKSLIILQQLSLMLSVLNRFSMLKQRLSHDLDNDASELASL >NC_020547.2|WP_015451613.1|2994064_2995294_-|multidrug-effflux-MFS-transporter MSEQTAQRQYSIGWIMLLALLTALGPLSIDMYLPALPQMAHDFGVSTQMVANTLPAYFFGLAIGQLVYGPLSDRIGRKKPLYFGLALYAVASLFCVLATNEWSLIAARILQALGGCVGVVMARAAIRDRLDVQGSAQAFSSMMIVMGLAPILAPMIGAWILIWFPWQAIFIALSIVGAICWLCVHFFFKETLAVDKRLKLSLYQVATLYGAIFKDASFRLPMFAGCLTGAALFCYISSAPAVFMDQYGLNQQEFAYVFGLNAFGIMLMSSLNKHLTTRVEITKRLKAGSMVQVTGASIVLIAGLISAAPLWLVMLGLFLAISGIGLTGPNAMALAMSKQGARAGTASAIMGSMQFACGLLGGVLLNFLIWSASLNMGVMMVLFTLSGFIVVLKSDSTSKKPITLLILRE >NC_020547.2|WP_001047593.1|2993346_2994051_+|nitroreductase MNLEQVRLVDEAITSRHSVRAFLSTPIEPEVIKDILRVASRAPSGTNTQPWKVYVVTGHKRDEMVERVCAAQIEVSKNPELAEQYKETFAYYPEKWVSPFIDRRRENGWGLYGLLDIKKGEKEKMAAQQLRNFKLFDAPVGIFFTVNKAMGIGSKMDIAMMIQNVMVAAKARGLDTCPQAAWNHFHPLVLDILGAADDEELVCAIALGHADPEHIVNTFITPREPVENFAVFLD >NC_020547.2|WP_002010643.1|2992632_2992836_-|hypothetical-protein MSLPLINKQFMKQGLAITIATMKMNVTHATTEPQEIQQLGTDLNALFFNEKEKGTDSRVMTMACYSL >NC_020547.2|WP_000490937.1|2992309_2992450_-|hypothetical-protein MFSGAMNLFYLKGAFSHVTFKGLVLGMMLLKLVTVIAIQVTLKVFP >NC_020547.2|WP_001005337.1|2990734_2992210_-|alanine:cation-symporter-family-protein MNEQLNATLMSWVQFFNEPLWDFLVIFLLAVGIFYTVLTGAVQIRMFLQSIRVMKSSRTEGEDEHGLTPFQAFVTGLASRVGVGNIAGVAIAIAIGGPGAVFWMWVTAVLGMSSAFIESTLAQLFKVRDSNSKQFRGGPAYYITQGLRSKTFGVIFALALIFTYGFVFNSVQINAIANASSHAWGWDKANLIAHLGGVDLEISWVGLALVVMVALAIFGGIKRIAKFAEMFVPLKAGLYLSVALYIALSNYAILPDVLKLIVTEAFHFNAAAGGFFGAAVSMAMMQGIKRGLFSNEAGMGSAPNAAAASDVKHPVNQGLVQMLGVFVDTFIVCTSTAIIILVSGVYQDAGFVGVELTQRALETQVGHWGADFLAVLLFLFCYSAVLGNYAYAESNVQFINNNPKVMFIFRIFVLVMVYFGAIGSVPLVWSMADLFMGIMATINLVAILLLTPMARTLLKDYRAQLKQGIKEPVFKINKYPELKKKVDSDIW >NC_020547.2|WP_001259504.1|3003275_3003644_-|YbaN-family-protein MRTLFWRTLVVIFITLGIIGAILPGMPTTVFLILAAWAASKGWPQMDEWLLNHPKYGPTLRDWRANGTVPRKAKWIATIMMTASGILMLFTSAPFWVKVFTDTTMLVVAIWLWLRPEPKLKD >NC_020547.2|WP_001017520.1|3003748_3004657_+|DUF1853-family-protein MNIASIKTSYFEPWLQFSHPMVRQLAFTIASPNLLSQLPCSLTIRHNFQLHTDQRWEQHFQNYLPRLKQLDAAPEPLLQFMSRLKSTRLGLRFENLLWFWLQEDQYHPYQLLGHSIQKIDGAKTLGELDFLVLNQNTQEIEHWEVALKYYLGEGQLNLEQWIGLNRQDTLSKKLYHFTDKQFQFSEALGFKVQQRFAVLKGQLYLPLNLPQEQPIPEWVNLKRRLGTWGTEIPKSDFYRLERHEWLCPHQKASSNTAYWWTDGLYCQNINETRFYMFRHPALLSLKPSLIKNNGVLQETTSL >NC_020547.2|WP_001984826.1|3004755_3004899_+|entericidin-A/B-family-lipoprotein MMKKVLVASVMVAFVLTGCNTFKGFGQDVSKAGDAVTNTAQKTENKM >NC_020547.2|WP_001016572.1|3005024_3006158_+|succinyl-diaminopimelate-desuccinylase MNHSDTLSLSLELLQQPSVTPIDHTCQTIMADRLAKVGFHIEPMRFGDVDNLWARRGTEGPVFCFAGHTDVVPTGRLDAWNSDPFAPEIRDGKLYGRGSADMKTALAAMVVASERFVAKHPNHKGSIAFLITSDEEGPAVNGTVKVIETLEKRNEKITWCLVGEPSSTHKLGDIVKNGRRGSLNAVLKVQGKQGHVAYPHLARNPIHEASPALAELCQTVWDNGNEYFPATSFQISNIHAGTGATNVIPGALEVTFNFRYSTEVTAEQLKQRVHEILDKHGLQYEIVWNLSGLPFLTPVGELVNAAQTAILNVTGTETELSTSGGTSDGRFIAPTGAQVLELGVLNATIHQINEHVDVHDLDPLTDIYEQILENLLA >NC_020547.2|WP_000022121.1|3006294_3007176_-|alpha/beta-fold-hydrolase MSIHKELHILETDDHVEFALWKVAKSENNLIKKEAIFLSHGAFSDKTVCMGIAVYLANHGYICFILEWRGHGTSPKTDIPFNFETVALYEYKAAFHYIYHHFNMDSLHCVTHSGGGLCLTMFLINYPEYLKNIQSITFIACQAFGAVNDSFDFIKLFSAKLVVKGLGQIPANKFKLGRVNESYYTMQPWFNWNLKKIFISEFKNIDYKKHMNSIRVPIYSISGSGDKFIAPVKGCYKYLEAFENQNNVFREFGYLNNNLENYSHSRIVLSQNAAKEVWPTILQWIDKNSKEVL >NC_020547.2|WP_015451615.1|3007407_3007836_-|hypothetical-protein MDQQELQHLITVSTGFIDAYIIECNDQVPMLLPQNIVLSAMDVKNGVKHIEWHDVKLPVYSVHNAIDQHAVALVIEGEDISQRFALICKTMPVSTRLRISEIVDEMDEHEAEQHPAVFKYVRMQHQRYYIPNLEYIEKTLGL >NC_020547.2|WP_000658880.1|3007868_3012389_-|Hpt-domain-containing-protein MKEILKTLTEAMTLPEDSYSEQDAEFLEIFIEEIEEIFVDLQPLINKWMQSDNIATLTEIRRHFHTLKGSGRMIGAKSSAELAWTVEDTLNRVINQSLQLTPTIQSYVQLVFKFYFLKLVDNFKQKRAHTLDFRPLILLGQQLQQQQSLEPALEELLQLSNTLTAETVTGLELGYIEQDSLAEPIIQTTHTEIEINLDETLTLFMEEAEEHLATIHQFLDQELHQYDSYNALIRALHTLRGSSAMAQVETIFEASTKVEHLFKILLQEELSSHSEEILLLQEYRKFVRDSLELLSRYSSSEQLEARLQQFNQSWDAYVEQHGDRTDPLMPSHGLVSQLLQLDVSELLDAELDFEKGIRNEFPDYLERLSEQADLLLQHTHSQAMLGLHEYTSQLKESYEVLLDKPALLQSDYIFEIYQKAHQQLIQLFDALAAGQRVGVVKQHQSILEELKLYTQYTPDISNDLPQHDSTSFEPISNIELEPEVVATVENFSDSADWAVLGQSVQQDRQYISSTQVNRNFDADLLDIFLEEAEELLEGIDTDLNIWIGEQENFAALNNLMRYLHTLKGGANMVQATYLGLIAHELESIYERLIQKQLVATSDLIDFIRLVQDDLADRLQIMREQQLDYAAPYTINALKRAGQNSNFQPLPVVEAFDTESEIFSEQEVISEVIIDEIPVELEPALAELETHHDQVFDTAVTELATPVEVITSVTSQENRVAADEQDIEAVVEQTFLEEATELLEMAESLLKQWFEQRTNRSILLQLQRAVHSLKGGARMVGLEAVQAIAYQLENAFEQFALHHFNSNIYDHLLESAIAWLKDAIFNHNYQHFDGLQQSLENIQFFETTIQIPTKLTRADLFSSEPVMTFIQGDGTEPPPMMGAWEQTERLDQNNEMIRVSADLIEKMIDLSGENSINRSRIEMDLSQFSHTLVEMELAIQRLADQLRRMEGELETQIIAKHGIEHSRYTDFDPLEMDQYSSLNQLSKSLAESASDLVDFKNTLSDKIRDTESLLLQQSRIQAEIQEGLMRTRLVPFSRLLPRLQRIVRQTSTALNRPAELFVNNTEGELDRNILERLVTPLEHMLRNAIDHGLEDRMQRQQANKPETGRIELNIQRQGTDVVVVFSDDGQGIDVEKVRQKALLAGLIKPEQDLEQQDILQLIFHPGLSTAEQVTQISGRGVGLDVVQSDIKSLGGHVSVESVYGQGTTFTIRVPTTVAVSDALMVKVADQQFAIPLAQIERIIRVSPASLEQYFESPQELFEYENKRYPLRYLSEFVGNQPIPRLNGVMYSLPVLMIKANNGQTVALLVDQLIGSRAQIVVKPIGQQFSSIGAIAGATILGDGQVCLILDGQNIARQIQSTQRHKQLSEAVYRQRESDERRLIMIVDDSVTVRKVTSRLLERQGYDVVTAKDGVDAIEQLENIKPDLMLLDIEMPRMDGFEVLNLVRHHDMHQYMPIIMITSRTGEKHRERAFSLGVSQYMGKPFQEEELLENIDALLVAFESEVKS >NC_020547.2|WP_000505931.1|3012535_3014614_-|methyl-accepting-chemotaxis-protein MGFKLKKKSGNRGATGKSSVNFIAKIQSKIEQFASLFGESEKSKPILYAALLCLVCALISLAYLFYNVPRHNQLIRSLGELRLLSQTISKQATEATESGSQEAITKLQQSKKDFDENLLEIENIHGKSTDEYQKVEKIWGEVSKNIDLISSHQRVLNQLYDTNISISETVPEIQAEYNLMVDQMARQGLPSSQVIIAKNQVFIAERILRSINSVLSGTDGNVSTSDFSVDIETFGTYLNAELNGNAELGVDRIADPALRESLESIKSEYDKVLKSAAATVLKNGSQIVNVRQASSQIFSKSDVMLESLGHLSDVARKNWLTLFLGAVLILSLGGLIFSVFKLITLRSVMDKQRVARLQEEYDRNQNAILRLLDEIADLADGDLRSYATVSEDFTGAIADSINFAIDQLRDLVSRIHETSQEVARYTQDTQSITNQLAEASEHQAQEIAGASTAMNEMAQSIDQVSANASESAEVAQRSVQIASNGAQVVNRSIEGMDTIREQIQETSKRIKRLGESSQEIGNIVSLINDIADQTNILALNAAIQASMAGEAGRGFAVVADEVQRLAERSASATKQIETLVKTIQTDTNEAVISMEQTTTEVVRGANLAKDAGIALDEIQKVSGDLAKLIASISDAAKLQSASASHIATTMTVVQEITSQTTTATFDTARSVSELANMAESLRESVTDFKLPD >NC_020547.2|WP_000729762.1|3014660_3015197_-|purine-binding-chemotaxis-protein-CheW MAANGFIELLRLSKRGNKNYASVQNEAQRWSGIAFEMRGQYFVAPLGEVSEVIYPPKYTPVPNTQSWVKGLANIRGRLLSVSDLAHFISGQRSSFSSTQKVLCISHHDQYVGLVVDQVLGIQHFNKKSFFSQSSDLEENLKEYCQGYFHQHNQHWHVFLFSRLLQNPHYMNASTKFIN >NC_020547.2|WP_000101096.1|3015257_3015620_-|response-regulator MARILIVDDSPTETFRFKEILTKHGYDVLEASNGADGVTLAKAEQPDLVLMDVVMPGVNGFQATRQITRDEDTKHIPVVIVSTKDQATDRVWGKRQGAIDYLIKPIEEKQLIDVIKQFLN |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_020547_1 | 1.1|780241|25|NC_020547|CRISPRCasFinder | 780241-780265 | 25 | NZ_CP040048 | Acinetobacter baumannii strain VB1190 plasmid unnamed1, complete sequence | 572758-572782 | 3 | 0.88 |
| NC_020547_4 | 4.1|1820763|31|NC_020547|CRISPRCasFinder | 1820763-1820793 | 31 | NC_028924 | Polaribacter phage P12002L, complete genome | 39532-39562 | 8 | 0.742 |
| NC_020547_4 | 4.1|1820763|31|NC_020547|CRISPRCasFinder | 1820763-1820793 | 31 | NC_028763 | Polaribacter phage P12002S, complete genome | 39352-39382 | 8 | 0.742 |
1. spacer 1.1|780241|25|NC_020547|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040048 (Acinetobacter baumannii strain VB1190 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.88
gatgattccagtaatcgggcttaag CRISPR spacer gataatgccagtaatcgggcttaaa Protospacer ***.** *****************.
2. spacer 4.1|1820763|31|NC_020547|CRISPRCasFinder matches to NC_028924 (Polaribacter phage P12002L, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
gttcgagtggaagaggataaacaaagcaatg CRISPR spacer gatgctatggaagagtataaaaaaagcaatt Protospacer * * .******** ***** ********
3. spacer 4.1|1820763|31|NC_020547|CRISPRCasFinder matches to NC_028763 (Polaribacter phage P12002S, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
gttcgagtggaagaggataaacaaagcaatg CRISPR spacer gatgctatggaagagtataaaaaaagcaatt Protospacer * * .******** ***** ********
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
1107185 : 1150958
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_020547|1107185:1150958|DBSCAN-SWA 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62 | Acinetobacter_phage(88.24%) | transposase,capsid,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
1220462 : 1277306
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_020547|1220462:1277306|DBSCAN-SWA TATGGCGGCGCCCAATTCTTCGGCAGGGTGGTTAGAGCGTTTATTTAAGTTAAGCGACAATAAAACCACGTTTCGAACAGAAGTTCTTGCTGGTGTAACTACATTTTTAACAATGTGCTACATCATCATTGTCAATCCACTCATTTTATCTGAAACCGGCATGGATCATGGCGCCGTATTCGTTGCGACCTGTTTGGCAGCAGCAATCGGTTGCTTAGTGATGGGTATTATTGCTAATTATCCAATCGCCTTGGCACCCGGTATGGGGCTTAATGCTTATTTTACCTATTCGGTTTGTATGGGCATGGGAGTGCCATGGCAGACAGCTTTAGCAGCTGTTTTTGTTTCAGGTGTAGTATTCCTTGCAATTAGTTTCTTTAAAATTCGTGAGGCGATTGTCAATGCAATCCCGATGTCACTTAAATTTGCGATAGGTGGTGGTATTGGTTTATTCCTTGCGCTTATTGCGTTAAAAAATGCCGGAATTATTGTCGCAAACCAAGCAACGTTGGTCGGTTTGGGCGATATTAAACAACCTACTGTATTATTAGCTTTATTTGGCTTTTTACTTATCGTAATTTTGCATCAGCTTAAAGTCCGCGGTGCGATCATTATTAGTATTTTAGTCGTTACAGCAATTGCCACAGCTTTAGGTCTAAATGAATTTAAGGGTGTGGTTGGTGAAATTCCTTCAATTGCGCCAACATTCATGCAAATGGACTTTGAAGGGTTGTTTACCGCAAGTATGGTTGGTGTCATCTTCGTATTCTTTATTGTTGACTTGTTTGACAGTACAGGTACTTTGGTTGGCGTTTCACACCGTGCCGGCCTTTTACAAGATGGTAAATTGCCACGTTTGAAAAAAGCGCTATTTGCTGACTCTACTGCAATCGTTGCTGGTGCTGCATTAGGTACATCATCAACTACGCCATATATTGAATCGGCTTCAGGTGTAGCAGCAGGTGGACGTACGGGTTTAACCGCGGTAGTTGTCGCTTTCTTATTTATCTGCTGTTTATTCTTGGCACCTCTTGCTCAATCAGTGCCGGGTTTTGCAACAGCACCCGCTTTATTGTTCATTGGTGTATTGATGATCCAAGGGATCACTCACATCGATTGGGATGATATTACAGAAGCTGTACCAGCCTTTTTAACGATTGTATTTATGCCATTTGCTTACTCAATTGCAGATGGTATTGCAATGGGCTTTATCAGCTATGCATTAGTTAAATTATTTACGGGTAAGGCAAAAACTGTTCCATACATGGTGTGGATTATTGCTGCCCTTTGGGTATTTAAATTTATCGCCTTTGGCGGTTAATACGATTGTTTATAATTTCCTTCTAGAACTATTTTAGTGATAGGGATATAAGAAGGAAATTATAGAAGGGTGTGCTTACCACACCCTTTTTTCTTTAGATGTGGAGTTAATATGAATCAAGTCGAGCTGATTCAGGCCTTACCAAAAGCCGAGTTGCATGTGCATATTGAAGGGACCTTTGAACCTGAATTAATGTTTGCCATTGCACAGCGTAATCAGATTCAGATTCCTTACAAATCTGTTGAAGAAGTAAAGCAAGCTTATAACTTTCATAATCTTCAATCATTTTTAGATATTTACTATGCTGGTGCAAATGTTCTTGTTCATGAGCAAGATTTCTACGACTTAGCATGGGCATATTTTGAAAAGTGTGCAGAAGATCGTGTCGTTCATACAGAAATGTTCTTCGATCCGCAAACTCATACTGACCGTGGTATTGCTTTTGCAACGGTGATCAATGGGCTTAAACGTGCATGTGCTGACGCAAAAGCCAAATTTGGTATCAGTTCTCAGCTGATCATGTGTTTCTTACGTCATTTAAGCGAAGAAGCTGCATTTGAAACGCTTGAGCAAGCTTTACCGTTTAAACAAGATATTATCGCTGTAGGACTTGATTCAAGCGAAGTAGGCCATCCACCAGCTAAATTTGAACGTGTTTTTGCTAAAGCGCGTGAAGAAGGCTTCTTAATCGTGGCTCACGCAGGTGAGGAAGGTCCACCTGAATATGTGTGGGAGGCTTTAGACCTGCTCAAAGTCAACCGTATTGACCACGGCGTGCGTTCTGAAGAAGACGAACAATTAATGGCTCGTTTAATTAATGAAAAAATGCCATTAACGGTTTGTCCTTTAAGTAACTTAAAGCTATGTGTTGTTAAGGATATGAAAGATCACAATATCCGCCGTCTTTTACAAAAAGGCGTACACGTGACTGTTAACTCAGATGATCCTTCATATTTCGGCGGTTATATGAATGATAATTTCTTTGCCATTCAACAGGCATTAGATTTAACCAATGATGAGTTGAAGCAACTCGCAATTAACTCTTTTGAAGCCTCTTTCATTTCAGATGAAGAGAAACAAAAGTGGATTTCAGAAATCCAGAAAATCTAAATAAAAAAACCGCCTGTGATAGGCGGTTTTTTTAACATTGAATTTATTTAGGTTGTTTGGTCATACTGTTTAAAACATTGTCTTTATCTACAAAGTGATGTTTTAAAGCTGCAAGTACATGTCCAACAATAAGTAAACCTGCAAACCATGAAATATAAATATGTAATGGCTTAACAATAGCTAATAACTCAGGGTTATCTTGCACCAGGCGTGGAATTTCAAATAAATATAAAACCGGAGCAGGGTGACCAGCACTCCAGCTAAATAGACAGCCAGTGACAGGTAAAGCAACTAAAATCACATACAGTAATAAATGTCCGATGTGAGCTAAAGTTTTCATTGTTGGTGACATCGTGTCAGGTAATTGTGGGGCAGGATGGGTGTAACGCCAAAACAGACGAATGACCACGAGGAAGATAATGGTTGTGGCAATATTCTTATGTAGTGTAATGACATCGCCTTTAAAGCTGCCATCAACGTCATAACTTAGAAAATTTCCACTATAGAAACCAATCACCCAAGCAGTGATAAAAATGATGGCCATGACCCAATGCAGAATCTGTGCAGTACGGGTGTAGTATTGAGAGGTTGAGGCAGGCATAAAAGACCCTTTTTTTGTCATTCTAGCGCTAGATTTTATGGGAAACTGTTAAATTTGAGAAATGTTGTTCCCGTAACAGAGCGTGCTATAAACAGAACGCTTCAATTTAAAAAAACACGGTTAAGTTGAGCTGGAGATTAAGGGACTTAATTTGCATAAATGCATCAATTTATTTGTTTCTTCTAAGCACAAGTTTAGGCAAAATACGCGCTGCTTACGTTCGATCAAAGGAAAAAATGATGAAAAAATTGATGCTCGCTGTAGCACCAGTTGTTTTAGCTTTAACTGCATGTGCAACCACTACAGGTACCGGTACTGGCGGTGCTTCTGCACAAACGACAACTCAACAGTTAGGCGTGGCTGCATTAAAAGTTGCTGTTAATGCGAAATGTATTACAGAAATTAATAATGTTGCTGCATGGAAGACAGCAACAAAATATATGACTGCTGAACAGCGTGATAGCATCCAAACGAACGTTTGCGGCTGTGTAAGTGAAAAAGCACCAAATAGTGTGACTGCAGTAGAATTAGCTGCTGCTGCGCTTGACGTGAATGCACGTGCTACAATCGTAAACCAAGTGGTTTCTAAAACTGTAAATGCTTGTGTGGCAGAAGCTTTACAAAAATAATTGATGTTTTAAGCATTAAAGAAGGCCGATTCTTATAAATCGGCCTCTTTTTCATTGGAGTATACATGTTTGTTGCAGGCGTAGATGAGGCAGGACGAGGCCCATTAGTGGGTTCAGTTGTTGCTGCAGCTGTTATTTTAGATCCGAATAATCCAATTTTAGGATTAAACGACTCTAAAAAATTAACTGAAAAGAAACGTGAAAAGTTGTTTATTGAAATTCAAGAAAAAGCTTTAGCATGGTCAATAGCAGAAGCTACACATGCAGAAATTGATGAGCTGAATATCTTGCAGGCAACTTTTTTGGCTATGCAACGTGCAGTGGATGGTCTGAAAACACAACCTCAAAAGGTAATTGTAGATGGTAATCAAATTCCCAAAGGAATTGTTATTCCTTGCGAGGCGATTGTAGGGGGGGATGCAAGCCATGCCGAGATTAGTGCGGCGAGTATCTTGGCTAAAGTCACGCGTGATCGTCAAATGGCAGAATTAGATCAACAATATCCATTATTTGGTTTTGCCAAACATAAAGGTTATCCAACCAAAGCACACTTTGAAGCCATTGCAGCTCATGGCGTGATTGATCAACACCGTCGTAGTTATGCACCTGTAAAACGCGCATTAGGTCTATAAATTTATATATTCCCAAAAAATTTAAAGCGACTATAAAGTCGCTTTAATTAGGGAGAGAACAACTTCATACTAACGATTGAAGTTTTTCTGTGCATAATTATCATCTTCATATGAAACTTGATAATCTTGATCAAGATGTTGAAGGTGTTCATGCATTGCACGTTCATGTTGAATACGTTGATAAATTTCTTCGCGATGAACAGAAACCTCTTTTGGTGCATTTACACCAATTCGAACTTGGTTTCCTTTGACGCCAAGCACAGTAACACTGACTTGATCCCCAATCATTAATGTTTCCCCGACACGGCGGGTCAGAATCAGCATGTTTATCTCCTTGCTAAACGCTTAAAACTGCAATATTGGTACCCAAATAAAAAGCTCAACCTCAGTTTTCAGTCAGATTCTAACAGAAATATGAGAACAAAGTCATATTTTGATAATCACTGCCAAAAAACTTTCCGTTTAATATAACAGAGCCGCTATAAAAAAAACTATAGCGGCTCTGTGTTTTCTTTGATTATTGTCGGACAAGTAAACATTTTTTAATGAATTCTTGACCGTTCGGTAAAATTAAGCGCGTGCGCTGCTTTCACCATGTTCACGATCTAAACCAAAAGCGGTATGTAAGCAACGAACTGCAAGCTCAAGGTATTTTTCATCAATAATGACAGAAACCTTAATTTCAGATGTTGAAATCATAAGGATGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_020547|1220462:1277306|1274669_1277306_-|WP_000199457.1|tRNA|DBSCAN-SWA MTSAEIREAFLRYFETQGHTRVASSSLVPANDPTLLFTNAGMNQFKDCFLGLEKRDYVRATTSQKCVRAGGKHNDLDNVGYTARHHTFFEMLGNFSFGDYFKRDALKFAWEFLTSEQWLALPKDKLYVTVYHTDDEAYDIWNKEIGLAPERIIRIGDNKGEKYASDNFWAMGDTGPCGPCSEIFFDHGEHIWGGLPGSPEEDGDRFIEIWNNVFMQFNRTADGVLHPLPAPSVDTGMGLERISAVLQHVNSNYDIDLFQHLLKAAANIIGIEDEGQPSLRVVADHARSCCFLIADGVNPSNEGRGYVLRRIIRRAVRHGNKLGATGTFFYKMLQPLIEVMGQAYPELEARREVIEATLIREEEQFAKTLEQGLKLLEGELAQLKDKTIPGATVFKLYDTYGFPTDLTADIARERGFIIDEAGFEVEMAAQRQRARDAGKFAVDYNNIVKVEGETQFDGYTNTTGQGQIVAIYKDGVQVDEVSEGDEALIVLNQTPFYAESGGQIGDTGIFKNETGIFEVQDTKKSGGAFVHQGIVTVGNLKTSQNVEAIVKADIREATARNHSATHLLHAALRQILGSHVQQKGSLVASDILRFDFANDQPVSFEQLQQVERLVNAEIIANTAVTTELLDIETAKAKGAMMLFGEKYGDEVRVLSMGSVIDEKNFSIELCGGIHVKRTGDIGLFKITSEGGVAAGVRRIEAVTGTKALEVVQKADHDIQHINSLLKAQKDQTVERVQANVELVSALQKQIEQLNQKLANFQAADLIDQVQTIAGRQTLITTVQGVDAKALRNLHDSVKSKLENAVIVLAGVEGDKVSLLASVASQYTANLKAGDIIKHLATELGGKGGGKPDLAQGGAPLNEKFGQVMAALPAWLEQK 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76 | Acinetobacter_phage(80.0%) | tRNA,capsid,integrase,terminase | attL 1226586:1226606|attR 1274585:1274605 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
2194873 : 2257410
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_020547|2194873:2257410|DBSCAN-SWA 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54 | Enterobacteria_phage(30.0%) | transposase,holin,coat | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
2540608 : 2555405
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_020547|2540608:2555405|DBSCAN-SWA 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10 | Acinetobacter_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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