Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_019551 | Francisella tularensis subsp. holarctica FSC200, complete sequence | 0 crisprs | csa3,cas3,DEDDh,RT,cas4,cas2 | 0 | 0 | 3 | 0 |
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---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
67789 : 75604
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_019551|67789:75604|DBSCAN-SWA 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TCTATTGTGAGAGTTTACAAATGCCTCACAATATACTGGTTGTGTTTCTATATCAACGTTTCTAAGAGCAGCTAGCTTTTCAGGATTATTAGATATTAATCGGCAGCGGTTGACATTGTTATATTTTAGGACTTGTATAGCTAGATCGTATTTTCTTGCGTCAGCGGGTAAGCCAAGAGCTAAATTAGCTTCAAGAGTGTCCATATTTTCATTCATCTGCAAATTATAGGCTTTAAGCTTATTTGTTAAACCAATACCTCTACCTTCTTGGTCAAGATATATAAAAAAGCCACCCTCTTCGCTAATCATTTCAATTCCTTTATGTAATTGATCTTGGCAGTCACAGCGTAGCGAGCCAAAAATATCTCCTGTTATGCAAGATGAATGCATTCTTACTAAAGGATTATTACCAGAATAAGGTTTAGATAAAACAACAACTTCATCACCACTAAAGTTATCTTTATACACACTCATTTCCAATTCGCCAATTTTCTTGAATGGTATAGTAGAGCTTGCCATTTTCGTGACAAAAATTTCAGTTGCTAAACGATATTGGTAAAGCTCTGCAATAGTTAAAAGAGGCAGATCGTGCTTTTTAGCAAATGCTTCTAGTTCAGCAGCTTTCATCATGGTGCCATCTTTATTCATTAGCTCACATAGAACTCCAGCGCTATTAAAACCACTTAGTTTCATAAGATCAACAGTTGCCTCAGTATGACCATTTCTACCAAGTACGCCTTTATCATTGGCTATAAGAGGGAATATATGTCCAGGTCTAGCTAATTCTTCTGCTTTAGCATCAGCTTTTGATGCAACTTGAATAGTATGTGCTCTATCCTTTGCTGATACTCCTGTAGTTACCCCTTCTTTAGCCTCTATAGTTACAGTAAAAGGAGTTGTAAAAGTACTATTGTTTTGGTCAGCAGCTACCATTGGCGTTAGATTTAATTCTCGTGCTTTCTTTGAGTCCATTGCCAAACAAATGATGCCACTTGTATGCTCAAGCATAAATGTGATATTTTCTTCTGTGGCTTTTTGACCCGGTAGAATTAGATCACCCTCATTTTCTCTATCATAATCATCAAGTACAACTACGGGTTTGCCTTGCTTAAGAGCTTCTATGGCATTCTCAACATTATTTTTTATTTGCTCAAACATTTTCTTTAAATCCTTGTATATATTTATAGATATATTTACCTGTTGCATCAGCTTCAAGATTTACCATAGAACCATTACTATAGTTTTTTGCGATAGTAACTTCAATGGTGTGAGGTATCAAAGTTACAGTAAATGAATCTTTGAGTACATTTATTACAGTTATACTCATACCATCTATGGTTACAAAACCTTTCTTTATTAAGTATTTTAGAAATTCTCTAGAAGCAGAAATTTCAATTAACCATGCACCACCGACATTTTGAATACTTTTGATTTGCCCTGGTTCATCAATATGACCTTGTACCATATGCCCACCAATATGATCACCATAGCGCATTGCAAGTTCGATATTTACTAGTTGGTTCTCCTTAAGAGTATCAAGATTAGTTTTTTTAAGTGTCTCTGGTACTGCATCAAAATTAGCTGTTAAGTTTTGCTTATCAAGTTTTGTAACAGTAAGACAGGTACCATTAATCGCAACACTATCACCAATGCTACATTGAAGACTATTATCAAATTTGATACAAAAAGTTTTTAGACTATCTTTAGTTGTTATTTTTTTAATTGTTCCTAGTTGCTGAACTATGCCACTAAACATTAGAATTTTCCTTAAAACAAGAGTTTATTATTATATCCTCTCTTACAGAGATTTGATTGAAGCTTAGCTGCTGTTTGGGGTTATAATCAGCTATTATTACCGGAGCTAAGTATGTATAAAATTCATTAACAAGTTTTTGATTAATAAAACTATTTAGGGTTTTATTACCACCTTCAACAAGAAGACTAGTTATTCCAATCTTACCCATCTTCTCAAGTAAGGTATCTAAACAAACCTGATGTTGACTTTGTGGTAATAGCCAATATTCAATGCCAAGTTGGTTAAGCTTGGTTGCTACTCGTGCAGAGATCTTTGAACAAACAAAAATCGTTTTGGCATGCCTTTGATCTAAAACTCGCCAATTATGATTTATTGTTGTCAGATGATTAGCAAGTATAAATCTAGTTGAATGTTTTATTTTATTGATATTTATTCTTACATCAAGACTTGGATTGTCATCAATTAGAGTTTGCTTGCCAATTAAGATAGCGTCACAAATATTGCGCAATTCATGAGTATTTACGAATGCTTGATGTGAGCTTATTTTTTTTGAGTCACCATCATTAACAGCTATTTTACCATCTAATGACATAGCCCATTTTGCATAAACAAAAGGTTTTTTGGTTGTTTGATAATGAAAAAATATTTTATTTAACTCTTGTGCTTGTTTCTCTAGTAAGCCTACTTCGACTGTTATACCAGCATTTTTGAGTCTTTCGACGCCTTTGCCAGCAACTTTAGGGTTTGGATCAAGAGTAGCAATAATTACTTTTTTTATCCCAGCTTTGATTATGGTATCAGTACAGGGAGGAGTTCTTCCACAGTGACAGCATGGTTCTAGTGTTACGTATGCTGTAGCTCCTTTTGCTTTATCAACCGCTTTTGTCAGTGCGTGAACCTCTGCATGCGCTTCTCCTACAGTTTCATGCCAACCTTCCGAGATAATTGCACCATTTTTTACTATTATGCAACCAACCATTGGATTAGGTGATACTGTAAGTCTACCTCTATTTGCTAGAGTAAGTGCTTGTTGCATATAATATTTATCGATATTTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_019551|67789:75604|70686_71679_-|WP_003014029.1|DBSCAN-SWA MEFSMRNIFKKTLLILLLSVIIASCGMLSNDQFVYLGHGENSPDYQLYYDKTQKLFVLIDKRNGCFQKDDTGTCLAFTLKQAREFREYVLAKMIEIDVRLAKDDYGNYAIEELRKAGVTTVNKPIKTKKVFATPVKQIVLDRKQQYHLVRKEYEIDSNLVAMVVNDKEGKKRIKVAYTVYFPGLEKEYSTELRPFIIDPEYLYTHMTIDAVHEAQFMQRDVMKSQTNVKKKVDDYLKDVVDSDKKDTGYTHQEVASSVAALDNDLITKADEQREDKETTLASGSSISTIAKKPINQESSGSTIQTATKTASTTQVDSNDTPKTTLASDNK >NC_019551|67789:75604|74536_75604_-|WP_003014043.1|DBSCAN-SWA MKNIDKYYMQQALTLANRGRLTVSPNPMVGCIIVKNGAIISEGWHETVGEAHAEVHALTKAVDKAKGATAYVTLEPCCHCGRTPPCTDTIIKAGIKKVIIATLDPNPKVAGKGVERLKNAGITVEVGLLEKQAQELNKIFFHYQTTKKPFVYAKWAMSLDGKIAVNDGDSKKISSHQAFVNTHELRNICDAILIGKQTLIDDNPSLDVRININKIKHSTRFILANHLTTINHNWRVLDQRHAKTIFVCSKISARVATKLNQLGIEYWLLPQSQHQVCLDTLLEKMGKIGITSLLVEGGNKTLNSFINQKLVNEFYTYLAPVIIADYNPKQQLSFNQISVREDIIINSCFKENSNV >NC_019551|67789:75604|72734_73946_-|WP_003014037.1|DBSCAN-SWA MFEQIKNNVENAIEALKQGKPVVVLDDYDRENEGDLILPGQKATEENITFMLEHTSGIICLAMDSKKARELNLTPMVAADQNNSTFTTPFTVTIEAKEGVTTGVSAKDRAHTIQVASKADAKAEELARPGHIFPLIANDKGVLGRNGHTEATVDLMKLSGFNSAGVLCELMNKDGTMMKAAELEAFAKKHDLPLLTIAELYQYRLATEIFVTKMASSTIPFKKIGELEMSVYKDNFSGDEVVVLSKPYSGNNPLVRMHSSCITGDIFGSLRCDCQDQLHKGIEMISEEGGFFIYLDQEGRGIGLTNKLKAYNLQMNENMDTLEANLALGLPADARKYDLAIQVLKYNNVNRCRLISNNPEKLAALRNVDIETQPVYCEAFVNSHNRNYLITKKIKAKHTIKGI >NC_019551|67789:75604|69587_70667_+|WP_010032231.1|tRNA|DBSCAN-SWA MENKKVIVGISGGVDSSVSALLLKQQGYDVTGVFMKNWEEDDTDEFCSAEQDIADAQAVCDSIGIPFKKINFTAEYWDNVFEHFLIEYKAGRTPNPDILCNKEIKFKAFLSYVHLLGGDYIATGHYAQTRLAADGSVQLVKGLDDNKDQTYFLYTLGQEQLRQTIFPIGNIEKSKVREIAKENNLVTFDKKDSTGICFIGERKFKEFLSKYLPAQKGEIHDENGIKIGMHDGLMYYTIGQRQGLGIGGVKDRPEVPWFAAKKDLENNVLIAVQGHDHPLLFKQSLQAIELSWVAGMAPADKFRCAAKVRYRQKDQSCEVEVNQDGSVNVTFDQPQRAITPGQSVVFYIDDVCLGGGVII >NC_019551|67789:75604|71760_72279_-|WP_003014032.1|DBSCAN-SWA MSLEILKYPHPVLKEVAKEVTKDEINDDLRATIAEMHELMLEANGVGLAAIQVGIKKRFFIMYDNLEEQNPEIITIINPEIIEQNGKIIDEEGCLSFPGVSAKVNRATVVKIKALNEFGEEIEVEKDGFLARCIQHEIDHLNGITFFDHLGSLKRKMIEKKYKKLMQENAKS >NC_019551|67789:75604|67789_69574_+|WP_003014022.1|DBSCAN-SWA MKNIRNFSIIAHIDHGKSTLSDRFIQVCNGLSEREMKEQVLDSMDIERERGITIKAQSVTLDYTARDGQTYQLNFIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGALLVVDAAQGVEAQTVANCYTAIEQNLEVIPILNKIDLPFAEPDRVAQEIEEIIGIDATGATTCSAKIGIGVEDVLETIVAKVPAPEGDVNAKLQALIIDSWFDNYLGVVSLVRVKNGTIKKGEKFKVMSTGVAYQVDRLGVFTPKMKDLDHLKAGEVGFIVAGIKDIHGAPVGDTLTHAHNPTDKPVPGFKKVQPQVYAGMFTISSDDYPDFREALEKLSLNDASLFFEPEVSQALGFGFRCGFLGMLHMEIIQERLEREYNLDLITSAPTVVYKAIKKDGEIIEVDNLSKLPEPGAIAEIQEPIVRANILVPKDYVGSVITICIEKRGVQVDLNYVGNQVSITYDLPMIEVVSDFFDTLKSVTKGYGSLDYELIRYEPANMVCLDVLINGDKVDALASIVHKDQAKYKGRELVERLKELIPRQMFEVAIQAAIGGTIVARSTVKALRKNVLAKCYGGDVSRKKKLLEKQKEGKKRMKNIGSVEIPQEAFLSVLKK >NC_019551|67789:75604|73938_74544_-|WP_003014040.1|DBSCAN-SWA MFSGIVQQLGTIKKITTKDSLKTFCIKFDNSLQCSIGDSVAINGTCLTVTKLDKQNLTANFDAVPETLKKTNLDTLKENQLVNIELAMRYGDHIGGHMVQGHIDEPGQIKSIQNVGGAWLIEISASREFLKYLIKKGFVTIDGMSITVINVLKDSFTVTLIPHTIEVTIAKNYSNGSMVNLEADATGKYIYKYIQGFKENV >NC_019551|67789:75604|72281_72725_-|WP_003014034.1|DBSCAN-SWA MRKLAIVVSEFNSLITDKMLEGALEEAYAQGLKDSQICIKKVTGAVELPYAAKLLAETKEFDAIVLLGCVIRGETDHYDYVCDQVSYGTQKVMHQYNLPVIFGILTTHNKEQALERVGGKKGHKGKYSIQAAITMAKMKKDILEQGV |
8 | Staphylococcus_phage(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1454770 : 1463483
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_019551|1454770:1463483|DBSCAN-SWA 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TTGTGCAAATGATCTTAGCTTTTCTAAGTCTTCATTTGTAAATGGTTCTAGATGACGCACAATCATAGCAGGTCTTGTATCATCTATTGCTATTTCTAATTGTGCTATATGTTGATATATAGATAACGTCTCTATAAATGAAGATATTTCTGTTATTTTGTCACCGACAAGGGGATTTAAAACGATACACTTATCTATATCTGCCAAGAACCTACCATTACGCTCTCTAAAGCCAACAAGAATTTTACCTTTTTTACTGACATACCTAACACCCAAACGTGCTTTATTACGATATCCTTCAGTATTACTCGTGCGTAGTGGTGGTAAAATATTCTCTGGCTCAACACCATTACCAATATATTTTAATTGATTAATTAAAGTTTGTTGCTTATGCTCGATCTGTGCATCTGTAGACATATGTTGTAAGCTACAACCTCCACATATTTGAAAATGGTCACAAGGCGGATTAACTCTATTTAATGATTTTTTAACATACTCAACTACTTTTGCTTCATCGAATTTTGCTTTTGTGAATGTATATTCAAATTTAACTACTTCGCCAGGTAATGTGAAAGGTATAAAAGTAGTTTTACCATCAACTTTTGCAATACCTCTACCATCATGACTTAATGCTGTAATTTCAGCCTCAAAGATTCCCTCTTTTAGCTTATTATGATATCTAGATCTTCCCATAAATAATTAAACAAAAAAATATTACGACAATTGTATTTAATTCAAATCATAAATACAACTTAATCACAAAACTTAGTCTTAGCTTTTACTATTTTAGATTGATAGATTTATCATCATATGCTGCGACATGACCTGGAGCAAACTGATAAACCCCAGCTTTTGAATGTGAGAAAATCATATCTATATTCCCATTAGTTGCTAAACCTGGAATTTTTTGTGGATATAAAGCGAACTCAACTTTAGCTAATGAAGATGATAAAAGCTCTATTTGTCCTTTTTGTGGTTTAGTATCTAAAGATTTAGTAGGACCATATGCTCCACCAATATTTGCAAAAATATCATAGCGTATATCTTGAGACTGAGATTTATTTGGCACAAATATAAACATATTTGACCCCTTCATTGTCTTAGCTCCAAAACCAGCAGCAAACCAACCACTACCTTTTTCGCGCCATTGTTTATTTTTATTAAGATCAACTTCTAAAATAGCACAAATATGATCTTTATATTGCGCATACCTAAAAGACATATCTCTCATACCTATAGTTTTATATTTCAAATCAGTTGGGCATATCGAAGTACTATCTACTGTATCTGCATAGGATATAGAGCAAACGCCTGCTGATAAAAATAATGAAGCTATTATAAACTTTGTTTTCATAAAATCTCCTCGTAAAGCTTATTAAAGAGATTTTAGCATATAAAAGTTAAATATTATTAAAGATAAATTTAGAGATAAAAGTTATTAGACATAAAAAAAGCGACTTAAGTCGCTTTTTAAATCATGGTGGGTGCTGAGGGGTTCGAACCCCCGACCCTCGCCTTGTAAGGGCGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAAGCACCCGATAGCAAAGAATTATATAGAGCTTTTAATACAAGTCAAGGTATTTTTTCAAAAGATTGAAAAATTATCCTTCTATCTCATTTCTTAAAATTTGTTCTGAGGTAATTTCTGACTCAGCAATTTCTCTTAAAGCCACAACCGTTGCTTTTTCTTTTTTCTCATTTTCCATAGATTCAGAGTAGCCATTTTTTAGTATCTTATTTGCTCGCATAGAAGCTAAAACTACTAAATCAAATCTTGTTTCTACTTTATCTAAGCAATCTTCTACTGTTACTCTAGCCATTTTTTACTCCATTTTTTTTCAATAATTGTCTTACTTTATTATATATTATATCAATTACAGTTTTATTTTGCGCACCATCTGGAATTATAATATCTGCTTTTCTTTTTGATGGCTCAATAAACTTAATATGCATTGGTCGCACTGTTTCTAGATATTGATTTATGACACTCTCAACGCTTCTGCCTCTTTCATTTTGATCACGCATCAAGCGTCTGATAAAACATAAGTCAGCAGGCGTATCCATATATACCTTAAAATCCATCATCTTTAATAATTTACGATCATTAAATAGCATAATTCCTTCTAATATAATTACACTTACACCTCCAGTAATTTTTTCTGCTTTTTCTTCAACCCTTGAATGAGTAGTGTAATCATAATGAGGAATATAGATATCATTACCTTGAACTAAATTGTTTAAATCTTTTCTTAACAATTTATGATCAAAAGCATCAGGATGATCATAGTTGATTTTACAAGCCTCTTCAAAGCCAACCATCTCACCCCAATTTTTATAATATCTATCCTCAGAAATTACAGCAATTTTGTTTAAATGTTTTGATTTTAATTTTTTGATGATAGCATTTGAAAATAATGTTTTACCAGAACCAGAACCACCAACTATACCTATTATAAAAACATCGCCTTTACCAGCCATTATTTATGCCCTATAGTTCTGTCTTTGGTTGACTTTTTACTAAATGATCAAGCTCTTTTAGCAAACTTAAAAATTCTTTTATTTTATACATTGGGAACGAATTAGGTCCATCACTTTTTGCCTCATCAGGATTTGGATGAGTTTCCATAAAAAGTCCATCTATACCAACAGCCATAGCTGCTTTTGATAAAACTGGTACAAACTCTCTCTGCCCACCAGAAGAACTACCTTGTCCTCCTGGTAATTGCACTGAATGAGTAGCATCAAATACTACCGGACATCCTGTAGCTTTCATAATCTCAAGTGAACGCATATCTGAAACTAGATTATTATAACCAAAGCTTACACCTCTTTCGCAAACCATAATCTGCTCATTGCCTGTAGATTTAGCTTTTGTTACTACATGCTGCATATCCCAAGGTGCAAGAAACTGACCCTTTTTGATATTTACAGGTTTTCCTTGCTTACAGACCTCAAGAATAAAGTTTGTTTGACGGCATAAAAAAGCAGGAATTTGTAATACATCAACAACTTCAGCAACCTCAGCAAAGGGTGTATCTTCATGGACATCTGTAACGACAGGCACATTATAAGTCTTTTTGACCTTAGCCAAAATTTCAAGACCTTTATCTACACCTAGCCCTCTAAAGCTATTTATAGATGAGCGATTTGCTTTATCAAAAGATGACTTATAAACAAAATTTATTCCAAGATCCTTAGTTACCTCAGCAAGATATCCAGCAGTATCCATCGCCATTTGCTCAGATTCAATGACACAAGGACCAGACATTAAGAAAAATGGCTTACCATTTCCTACTTCAAAATTAGCAATTTTCATAAGATTTTTATTTAAATACACTTGTGATAATTATACAGAAAAAGATGAACCACAGCCACAAGTAGTTTTCGCATTTGGATTTCTAATTACAAAGTATGCACCTTCGACATCATCTTTGTAGTCAACATCAGCACCAACCAAGTACTGAAAACTCATAGAATCTACCAAAAGGCGAACACCATTTTTAGTAATAACCATATCATCTTCTTTTACTTCATTATCAAAAGCAAAAGCATATTGAAACCCAGAACAGCCCCCACCGGTGATGTATACTCTAAGGCTAAGAGAATTATCACCCTCCTCTTCAATTAGTTCTTTAACCTTTAAAGAAGCGGCTTCTGTAAAGTTTATCGGATCAACGCTTTGAACTACTTCACTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_019551|1454770:1463483|1462274_1463102_-|WP_010031164.1|DBSCAN-SWA MKIANFEVGNGKPFFLMSGPCVIESEQMAMDTAGYLAEVTKDLGINFVYKSSFDKANRSSINSFRGLGVDKGLEILAKVKKTYNVPVVTDVHEDTPFAEVAEVVDVLQIPAFLCRQTNFILEVCKQGKPVNIKKGQFLAPWDMQHVVTKAKSTGNEQIMVCERGVSFGYNNLVSDMRSLEIMKATGCPVVFDATHSVQLPGGQGSSSGGQREFVPVLSKAAMAVGIDGLFMETHPNPDEAKSDGPNSFPMYKIKEFLSLLKELDHLVKSQPKTEL >NC_019551|1454770:1463483|1460550_1461123_-|WP_010031162.1|DBSCAN-SWA MKTKFIIASLFLSAGVCSISYADTVDSTSICPTDLKYKTIGMRDMSFRYAQYKDHICAILEVDLNKNKQWREKGSGWFAAGFGAKTMKGSNMFIFVPNKSQSQDIRYDIFANIGGAYGPTKSLDTKPQKGQIELLSSSLAKVEFALYPQKIPGLATNGNIDMIFSHSKAGVYQFAPGHVAAYDDKSINLK >NC_019551|1454770:1463483|1454770_1456141_-|WP_003016861.1|DBSCAN-SWA MSSQIKQVFARQILDSRGNPTVEVDVVLESGAFGRAAVPSGASTGIREALELRDGNKALFIGKSVYKAVENVNTKIAQAVKGLDALDQRLIDKTMIELDGSENKKNLGANAILGVSLATARAAASHLRKPFYRYLMDVKEYLMPVPMMNVINGGSHADNNVDMQEFMIVPAGFDTFSEALRCGTEVFHTLKKVLIADGYSVAGVGDEGGYAPDLPSNEAAIEAILKAVKEAGYEPGKHVFIALDPASSEFYKDGKYELKSENKSLTTEEMIDYYAAWVEKYPIVSIEDGLAEEDWAGWKLLTEKLGNKVQLVGDDLFVTNPSILAKGIEKGIANSILIKLNQIGTLTETFEAMAMAGQAGYTCVVSHRSGETSDTIIADLAVATCSGQIKTGSLSRSDRIAKYNQLLRIEEELGENAIYPGIKAFVFNSDEEVEEVVQEIIVEDSEAEKVVVQVEE >NC_019551|1454770:1463483|1461598_1462264_-|WP_003016871.1|DBSCAN-SWA MAGKGDVFIIGIVGGSGSGKTLFSNAIIKKLKSKHLNKIAVISEDRYYKNWGEMVGFEEACKINYDHPDAFDHKLLRKDLNNLVQGNDIYIPHYDYTTHSRVEEKAEKITGGVSVIILEGIMLFNDRKLLKMMDFKVYMDTPADLCFIRRLMRDQNERGRSVESVINQYLETVRPMHIKFIEPSKRKADIIIPDGAQNKTVIDIIYNKVRQLLKKNGVKNG >NC_019551|1454770:1463483|1461387_1461606_-|WP_003016869.1|DBSCAN-SWA MARVTVEDCLDKVETRFDLVVLASMRANKILKNGYSESMENEKKEKATVVALREIAESEITSEQILRNEIEG >NC_019551|1454770:1463483|1458467_1459103_-|WP_003016865.1|DBSCAN-SWA MYIGLDISGSNISAGIFDEQKNLIKTAKVKSKGKSDADVILAQIFKVINKLLDSSNKNKIKAIGIGGGLVLNGKLYTGNSGLAAELGHTIIKQGSAYCLGCGSQGCLEAYAGKVGIEKKIENLAKKNINSTLIDFVMENGGKLKSSHIKKALDDQDEIAMDILSEAMEYLGTGLGSALNMINPSMVILGGGVMEAIGERYLAQIKRAAMKN >NC_019551|1454770:1463483|1456249_1457503_-|WP_003016862.1|DBSCAN-SWA MEVRAMTVRQTLLIIITPIIAMCVLSFGNGFFTTYSSIELNDLGRSSLMIGIISAAYFFGMTAGSYFSQFTIIRVGYIRAFVLFASLMAISTLIVGANKSVAVWILFRFLCGYSLAALFIIIESWCILSSDKKNRGLIFSIYLFVYYGTQALSQLMINVHFSNGLLAYCFISSLCSIAIVLMAFTKTVAPVPHSEEICSPAKIIKKVPLAMVASVIGGSLLGSIYTLLPIFLVRVGSDHDMISVLMMTTILGGMLLQVPIGKLSDLIDRRKVIFLAGAGIFITSIFIFAFHTSYFLFAIIMFIFGGSAFVIYPLSISHASDFLNENEILGAIGVLTIAYGLGSVISPVVISGVMSVFGPFGFFIITALLSISLCLYSAYRISVRKSATDRATFTIATPESLNFTEAQEIISEKSSEE >NC_019551|1454770:1463483|1463132_1463483_-|WP_003016875.1|DBSCAN-SWA MSEVVQSVDPINFTEAASLKVKELIEEEGDNSLSLRVYITGGGCSGFQYAFAFDNEVKEDDMVITKNGVRLLVDSMSFQYLVGADVDYKDDVEGAYFVIRNPNAKTTCGCGSSFSV >NC_019551|1454770:1463483|1459112_1460462_-|WP_003016867.1|DBSCAN-SWA MGRSRYHNKLKEGIFEAEITALSHDGRGIAKVDGKTTFIPFTLPGEVVKFEYTFTKAKFDEAKVVEYVKKSLNRVNPPCDHFQICGGCSLQHMSTDAQIEHKQQTLINQLKYIGNGVEPENILPPLRTSNTEGYRNKARLGVRYVSKKGKILVGFRERNGRFLADIDKCIVLNPLVGDKITEISSFIETLSIYQHIAQLEIAIDDTRPAMIVRHLEPFTNEDLEKLRSFAQENNYWIYLQSKGPDTIFRLYPQGDVEPKKLSYQPAAGIDIGFEPNDFTQVNNDINKKMIKRAIELLDISENDSIIDLFCGLGNFTLPISQHAKTVIGVEGEPTMVKRAKETADNNNITNVNFYAANLFESFEDKEWFNNFEYNKMLLDPPRAGAQEVCNNIEKFNVKRIVYVSCDTAALARDAGILVNTKGYKLISAGVMDMFPHTMHVESIAVFEKI >NC_019551|1454770:1463483|1457590_1458355_-|WP_011457500.1|DBSCAN-SWA MNIQVINDFFSRLANYFRGFKNIKLSNIFNDWNIFEILWLVISVTSLGIISILTTNDYLVITTIATVTGMLNILLVAKGKIINYFFAFINNLTYAYVCYNQGIYGQFLLFTFFFFPMQFYGLYTWTKPQNISENNDIITKSLSVKQRTYLTIAIIIATYIYGTFILKGYFNQQVGLIADSLTGVVSVVAIILMVKAYIEQWVLWIIINILSTIIWLQQYFSGTGEGIAFLAMWLIYLLNALYGYINWIKLKKID |
10 | Streptococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1536177 : 1613749
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_019551|1536177:1613749|DBSCAN-SWA 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58 | Phaeocystis_globosa_virus(29.41%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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