Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_014721 | Caldicellulosiruptor kristjanssonii I77R1B, complete sequence | 13 crisprs | cas14j,cas14k,csa3,cas4,Cas14b_CAS-V-F,cas3,DEDDh,cas6,cas2,cas1,cas5,cas7,cas7b,cas8b1,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,csm2gr11,cas10,csx1,cmr3gr5,cmr5gr11,cmr4gr7,cmr6gr7,cmr1gr7,csx20,csm6,csx10gr5,WYL | 0 | 22 | 6 | 0 |
NC_014719 | Caldicellulosiruptor kristjanssonii I77R1B plasmid pCALKR01, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_014721_1 | 207297-207461 | TypeV |
NA
Consensus repeat of NC_014721_1
|
2 spacers
spacers of NC_014721_1
>1.1|207329|34|NC_014721|PILER-CR AAGGAAAGAAATTTTACTATGTTGATTTTGGTAG >1.2|207395|35|NC_014721|PILER-CR AGGGCAGGTTATAAGCCACCAGAAAAGAATGTGCT |
cas14k |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014721_1
The CRISPR arrays of NC_014721_1 >merge|NC_014721|1|207297-207461|PILER-CR GTTTCAATCCCCAAAGGGGAGGCTACAAACTGAAGGAAAGAAATTTTACTATGTTGATTTTGGTAGGTTTCAATCCCCAAAGGGGAGGCTACAAACACAGGGCAGGTTATAAGCCACCAGAAAAGAATGTGCTGTTTCAATCCCCAAAGGGGAGGCTACAAACAG >NC_014721|1|1|207297-207461|PILER-CR GTTTCAATCCCCAAAGGGGAGGCTACAAACTG AAGGAAAGAAATTTTACTATGTTGATTTTGGTAG GTTTCAATCCCCAAAGGGGAGGCTACAAACAC AGGGCAGGTTATAAGCCACCAGAAAAGAATGTGCT GTTTCAATCCCCAAAGGGGAGGCTACAAACAG
>NC_014721.1|WP_013431592.1|207053_207209_-|hypothetical-protein MRVWTRREDVDKTLKTIAYYYDKLKVPNLQLIKNTKEILAKSNRKGLVQYF >NC_014721.1|WP_041736949.1|205953_206598_-|putative-7-carboxy-7-deazaguanine-synthase-QueE MKFNVVEKFVSIEGEGIRSGYPAVFVRFAGCNLSCSWCDTNYATENPKYEQIDIDTLLSFIASTGIKRVTLTGGEPLIQPYIYILIDRLIYEGFEVNIETNGSVSIKHVPRDAIITMDYKCPSSGMEDRMIVDNINFLGQKDVLKFVVGTYEDLKSAERIIKTFKPRCNIFFSPVFGKIEPREIVKFLLENELFDARLQLQLHKIIWSPDARGV >NC_014721.1|WP_013431590.1|204978_205890_+|TIGR00269-family-protein MKCVRCRKKGVIHLKRHNAAFCQECFLYYYKNQVKKNIKRHRMFDKEDKVLVVISGGKDSMALWHILASEGYNVTGMYINLGIGQYSDKSQQVVESFAQKNGLELIVKDIKKEYGLDIYKLSKLLKRSTCSVCGSIKRYLFNKVAYDGGFSAVATGHNLDDEAATLLGNVLSWEEGYLARQSPVLESTHPKLVKKVKPLYTLTERENLFYVLINKIEFLHDECPHAVGARSILYKEVLNRLEEESPGTKQRFITSFLEKGRRHFQDAQEKLELRECSICGQVTTTEVCSFCRFVKLSNQNTEN >NC_014721.1|WP_013431589.1|204758_204953_+|MoaD/ThiS-family-protein MKVIFVGKNKEIEVKGPKSALSLAKELGISLEANVFIKNGEIVAPDDVLSDNDTIEIISAVSGG >NC_014721.1|WP_029227833.1|204219_204621_-|zinc-ribbon-domain-containing-protein MFFIGIFGIEEKAKAIRQIEVSMCPFCTKRGTHTLFKVYSYFHFFFIPIFRWNVRYFLQTSCCNRVYLITNAQLARDLERGENIPITLADVELFRRFEQDFGYEDGRSDFCPNCQRRVSKTFLYCPYCGSKLE >NC_014721.1|WP_013431587.1|203814_204192_-|reactive-intermediate/imine-deaminase MKRFIVSNDAPKPVGPYSHAVLVGNMLFVSGQLAINPVSGKIEGDDIKAQTQLVFKNIEAILKEAGFSFEDVVKVNVYLTSLEDFAKFNEVYSTIFTKNFPARTTVEAKLLPGALIEVDVIAAKE >NC_014721.1|WP_041736623.1|203135_203801_-|7-cyano-7-deazaguanine-synthase-QueC MRAVVVLSGGVDSTTLLYDVKSQGYEVFAISFLYGQKHSKELEFAKKTCKLLSVPHKIVDISFFAELAPSALTTPDWNVPEGYYTDSTMKQTVVPNRNMVLLSISAAYAISLGAKKLFYGAHAGDHPIYPDCRKEFVEAMKNALYLADYIGLELEAPYVDMKKEDILRRGLELGVDYSLTWSCYKGGQKACGRCGTCTERIEAFKKVGMKDPIEYEIEIDC >NC_014721.1|WP_013431585.1|201856_203089_+|IS200/IS605-family-element-transposase-accessory-protein-TnpB MDKTYILPVPEEYQVLARELSKQSGKIYSKAVSFLKKMDKKGIKISRKTFDRYMEWWIHQKDFVLHSQSKQAAYQQAWTAYQATLRKLKKARKKGKDTSRIRLPYKNKKYNKVVFKESAIHLSDNVLTFSNKKGHKAIFLKGVMIKTAPKYAELIYHHSKKKYYLHVIVEVKEREIEKGKGVLAVDLGVIHPMVCFDGQRVLIYNGGVLNSKLRYRNKKIADIQQKLSLCQKGSKRFRKLEKAKRKVLRNVRNQIRDVLEKYTSHLIGYCVKNGIGTIVLGDLKGIRNGANHGKVANQKIHQWMFGRIAKRIEEKAKFAGIDVVYVKENGTSQVCPVCDSKNKPENRKYECRSCGFKYHRDGVGAINIYRKYTGEMLLVVGLLACPTGVRYKAHLCCPAEWNIHPAGKTA >NC_014721.1|WP_013431584.1|199863_201612_+|M23-family-metallopeptidase MAKNIAKSKTSATATVLDQKKARFVSKDTRENEFKKNLKEPLIKPEKSLVLADAKKEKKKLKDKKTTKRENNSYLHRFWEAISSKAKSTIIKKTPVFKNKPESFIFSHKYFRKNALKSILEEILRIVIGLRFIGNIRNSKEGMLKLKITATLAFMIFMIFSIHRIPTTYQKAYAVLLNGSVVGYVKDKTEAQKLFSNLKEEISSKLRTDQFVFQNKPQLKEIPPGQYKSTSLDDLKNTIIEKGVVLVKRYALFVNSKAYMVFEDPQIPQKVLLKLKSVYYKNEAASARFLEKVEIKPVYVKPSVFVATEDQALTKIMFGKDEVIEYTIKEGDTLWDLARKYDISVDDIFASNPGLSEKIMPGQKIKLSKMTPLINVVLEKEVEFEDILPKQVKVIKSENYYTTQTIVKQEGKDGRAKIKAKIVYMNGLEYDRKILSQQILQRPVDRIVVVGTKKTPRYFATGRFSYPVWGLLTSRFGYRGREFHEGIDLAVPWGSNVYAADGGVVEFAGWSGGYGKLIIINHQNGYQTYYGHLSRFLVSPGQKVAKGQLIAKSGSTGRSTGPHLHFEVRKNGVPQNPLRYLQ >NC_014721.1|WP_013431583.1|196909_199621_+|carbohydrate-binding-protein MRKGLKITSLIVSLVFLLGLLPTGIFGAVETSVQSYVFDFEDGTTMTFGEAWGDSLKCIKKVSVSTDLQRPGNKYALRLDVEFNENNGWDQGDLGAWIGGVVEGQFDFTNYKSVEFEMFVPYDEFAKAKGGFAYKVVLNDGWKELGSEFSITVNAGKKVKINGKDYMVIHKAFAIPDDFRTKKRAQLVFQFAGQNCNYKGPIYLDNIRVRPEDASNLSKEDYGSSEEEEISEDFFTGVTLVYPQEGKNFVYNFEKDTMGFYKYSGDGFAKKTKSMEFSQDLKTSTNAGSLKLNANFQGTAFEEMNIAVKLTDKEGKLFDLGKYSALEYTIYIPNPDKVAGKIMSASAVDSPWKIIKDFTLLNYKDKTTWKEINGKTYAVIKCKDNLYNVKEKAGVLVLRIAGSYVKYTGPIYIDNVTLIAGKKVAPKVERISLPNPKTYYKVKIEAESASDGWAYSVEKENAKFSGKGYVLLFGNNMGNTLYNIKVPKTGHYIFTLAISTLGLVKDGSIDIWIDGDLKGGAKVPNVKGKFQEVVVRKKIYLTAGEHTISLQKSGGYTIAVDYFVIEELVAANKSKLSVSSKLVTPNPHPNAQRLINYLSSIYGEKILSGQQSSGEGKEVQMIFDVTKRYPAVRSFDFMDYSPSRVQHGTKGTDVDEAIKWWKSGGIVAFCWHWNAPTGLIDQPGKEWWRGFYTEATTFDLKKAMDNPNSEEYKLILRDIDAIAEQLKKLQAEGVPVLFRPLHEASGGWFWWGAKGPEPYIKLWKLMFDRLVNYHKINNLIWVWNGQDAAWYPGDQYVDIIAEDIYEEKAQYSPYTERFVKALKYTNANKMIALSECGTIPDPAVLKQEGVSWLWFSVWAGSYVMTGSKYNDEWNDNHMLRKIYNNDYVITKDELPDIKSIPLK >NC_014721.1|WP_013431593.1|207839_209090_+|2-hydroxyacyl-CoA-dehydratase MSYMMLYSRLLNSLIQNNKNGYWLLKSGILIGKNYVKYFPDKRLPRSFQYLHEVVFDWTYKGIASKSSVWVNLFAPSEILLAFGFNPIFVEAISAFLSGLDVEDELILRVESQGISESFCTFHKAFLGAAISNLLKKPKFLVATSSICDANLNTFRFLSETLKLPFFFLDVPSEDSKEARQYLKAQLSSMIKSIEKLTGRKLNLDYLAKIIKKENVTKKLIKESLKLRATKNIKTTLTFEMFMLYPSHVFCGTDQALRFYQMFVDDLKNSEERDGKSIFFIHTLPIFEENFKEYFNFSNKINVLGMDLNFDFLEEINEQDPIEAICEKLLKNPYNGDFKRRFEHIKTLIEVLKPDGVLQICQMGCKQSIGCSMLLKSNIETLGIPFTSIDVDCVNKKNNSKGQIRTRLEAFLERVK >NC_014721.1|WP_013431594.1|209105_210725_+|2-hydroxyacyl-CoA-dehydratase MIAYVCKYTPVELIKAFGEEAYKLEPKVASVENAERFLHTNLCSFSKAVLEYILQNDIKRIVLTACCDSMKRVYDVLKDKMEFIDIIDVPRMDLPQSIEYFSFELKRFKEKLSHYLKKEFDREIFEREVRKLTNNYKSEECEIAILGAHAREDIVKVATELSKGRVLNLTCSGLRTCLQDNKFDGSIEDYARILLSLLPCMRMNMKRDLLNKNHYKGIIYDTIKFCDFYSFEYAKIKDRQNILKIEVDYAQDLSQQIVTRIEAFIERIEKPQIKSTEKQGRKKYFAGIDSGSTSTKVVIIDDNKNILSYFVTKTGFDVIKSAKSSLEKACELAGLKIEDIGFIVSTGYGRISIPFANLQVTEITCHAKGIHFLFPSARTIIDVGGQDSKVIKIDQNGNVVDFVMNDKCSAGTGRFIEYMARVLEVQVEEFSKWQEGKEDLTISSMCTVFAESEVISLVAQGKRREDIIRAINKAVATKIISLVNRVKAEEDFIFTGGVAKNKGIFSELEKRLGLKLFTPFEPQITGALGAALIGFEKRG >NC_014721.1|WP_013431595.1|210819_211233_+|Rrf2-family-transcriptional-regulator MKLTQAADYALRMVLHLSKKRGMVVEADTIAQEEKIPKRFLLKISRDLVKAGIIESVRGKNGGYTLAKKPEEITMKDVIIAVEGTLALTRCLYDPLACNKKATGYCAVHKAFCSVMEKVSDELEKYTFDKLVSMDGN >NC_014721.1|WP_013431596.1|211336_213214_+|anaerobic-carbon-monoxide-dehydrogenase-catalytic-subunit MKVQEFCEIADKELEKFVKQKSNLETSFNRVRPQSLKCGFGIQGICCRLCANGPCRITPDQKRGVCGADAHTIAARNFLRAVAAGAACYLHVVENTAENLKQMAQNSVSFKGKRTLHKLAEILNVPNRDEKELALQISQMVLEDLYKPRWKKMELTKFLSYPARYQKWEELNLLPGGAKSEVFDALVKTSTNLSSDPVDMLMHALRLGIATGLYGLILTNMLNDIIMGEPVIRTAPVGFRVIDPDYINIMPTGHQHSLFWALMEMINQKEAEQLAQSVGAKGFRIIGCTCVGQDFQLRGEHSNSVFCGHAGNNFTSEAVLATGAIDLVVSEFNCTIPGLEPIAEKYMVKMMCLDDVAKKSNAELVQYSPQNAYEIAKKILNEAAESYKLRRTKVQIDIPVDHGFDQSLTGISEDSLREFLGGDYRPLIDLIARGEIKGIAAIVGCSNLTSLGHDVFTVELTKELIKRDILVLSAGCTSGGLENCGFMSKGAEKMAGEKLRKVCEKLNIPPVLNFGPCLAIGRLEMVAAELARTLNIDIPQLPLVLSAPQWLEEQALADGAFGLALGLPLHLSIPPFITGSSLVTEILTEKLSDITGGMLIIDGDVKSSADKLEAIVNERRRQLGI >NC_014721.1|WP_013431597.1|213234_213672_+|4Fe-4S-dicluster-domain-containing-protein MKRVFINPEMCMGCLNCILACAVHQKKLKSVLELDITRQDIDFANQVVINHNRQIIPLSCRHCETPECVLSCMSGALTKDQKTGYVTVDKEKCAGCFMCVMSCPYGMIKPTKDKKKALKCDMCFDRETPACVESCPTKAIYLIEV >NC_014721.1|WP_013431598.1|213694_214975_+|NAD(P)/FAD-dependent-oxidoreductase MRYVIIGASAAGINCAKTLRNLDNNADIAVISKDNKIYSRCLLPEFIGGKKDFDKMSFINENFFEENNINWIKNTTIKNIQASKKRIVCCDGRTYEYDKLLIATGSCPVVPPIDGLNEALKTGKVFVLRDIEDAINIKEAAKYSKSAVVVGGGFIGLQVAENLREYGILVFVVEMKDHILPQQLDKKAAKRYEALFKKHGVRIVTGEVVKQIIYSERQNTIGLILSNGDFIYTDMLVIASGVRPSFPDIEEGKVKIEHGIIVDEYQRTDDPDIFAAGDVCQSYETFSGSYRVAPIWPLAVKQGQIAGYNMAGFCKPMENNFGFKYSMKFFGIPTISYGYPEAPDNTYEVVALEGEDYYYKVIYKDGILYGAIIQGDIVGAGVMGKLIEGKYNLSKKLDKGDLSKIFSLSYGDFFSEKADGSFEFVV >NC_014721.1|WP_013431599.1|215316_215751_+|MarR-family-transcriptional-regulator MELREKKIRLLRLLKEVSVKIKEALKYRGDKVEIPAPHWMIMAMLDENGKMKVGDLSKKIGLSNSTVSGILDKLEDQGFVERIRSNEDRRVVWVQTTQKFKECLYMHFKEAEKQFENLLSRATEEEIDKVLEGFETLKRILERQ >NC_014721.1|WP_013431600.1|215785_218011_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MKKVAKYLKPYTLLVLAAILFVFIQAMSELTLPDYMSKIVNVGIQQSGIENAVPEAIRSSTMEKVLLFVPQNKKDDILSMYELVTKDSHNYSKYLKKYPILSKEDVYVLKTKEKDKIDKVNVDLGRAILAAFGIEKMMSSAKGKSFNFNGRQIPAGVDLFAILKQLPQQQVMQIQQEINKKFASLGDSMIVQAAASAIKDEYKKIGIDIGKIQTSYIIKMGLLMLLLTLISAISTVLVAFFAAKSAAGVARDMRRDVFSTVESFSIEEFDKFSTASLITRTTNDIMQIQMLLVISIRMIFFAPVMGIGGVLKALSKSHSMSWIIALAVIVLLGLIMILYAIAMPKFMIMQKLIDKLNLVARENLSGIMVVRAFNAQKFEEERFDEANKDLTKVGLFVNRAMAVLFPSMMFIMNGVTLLIVWVGAHYIQNSSMQVGDMLAFMQYSIQIIFAFLMLSMLFILVPRAAVSAKRIEEVLSTQPSIKNPAKPEEFKEDMKGMVEFKNVSFKYPGAEEYVLHNINFKILPGQTVGIIGRTGSGKSTLVNLIMRFYDATEGEVLVNGVDVKKVRLEDLRAKIGYVPQKSWLFSGTIRSNLKIGNHFATDEDLKQAAEIAQALEFIEEKPQKFDTEIAQGGTNVSGGQKQRLSIARALVKNPDIYIFDESFSALDFRTELKLRRALKERLKDKTVIIVSQRIATLLHADQIIVLEDGEVVGIGKHEELLKSCETYREIALSQLPEEAVS >NC_014721.1|WP_013431601.1|218007_219891_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSERQSAPSQMHMRRPRRHGPGPMGPGFVGEKPKDFKTAMKKLIKYLSSYKVSLVAVMVLAMLSAAFSIAGPKILSKAITKIFEGIMSKISGTGNGIDFEYVGKIILILLGLYIVSALFGYIQGWIMSGISMKLTYRLRKEISQKINRLPLKYFESTNQGEILSRITNDVDTLTQTLNQSLTQIITSTTMVIGALVMMLSINVLMTVVALLIIPLSFSVVALIIGKSQKFFMQQQEYLGHVNGHVEEVYGGHIVIKAFNAEKKSIEKFNNLNNKLYEAAWKSQFLTGVMMPLMNIIGNLGYVVVTVMGSYLTIKGAIEVGDIQAFVQYIRSFTQPIAQIANISNILQQTAACAERVFEFLEEEEEVPDTPNPEIKLDSIKGDVEFRNVKFGYRPDKVVIKNFSAKIKAGQKIAIVGPTGAGKTTIVKLLMRFYDVNDGSILIDGHDIREFKREDLRSLFGMVLQDTWLYNGTIKDNIRYGKPDATDEEVIRAAKLAHVDHFIRTLPQGYDTVLNEETTNISQGQKQLLTIARAILKDPKILILDEATSSVDTLTEIQIQRAMDNLMKGRTSFIIAHRLSTIRNADLILVMDHGDIVEQGTHKELLQKGGFYAQLYYSQFEKEEELAG >NC_014721.1|WP_013431602.1|220091_220532_+|DNA-binding-protein MRAFELKNPNGISMFILNLEPDELLFESIQNFVREKGIKNGCIVSGIGTLKKLVYHRVTTVEPNPTNEFLEVQGPIELSSMQGLVVDFQPHIHFVASDLKSTYSGHLENGSIVLYLAEVLILKLDDINLKRIPDEKGISFINLLQE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_014721_2 | 2496982-2506688 | Unclear |
I-A
Consensus repeat of NC_014721_2
|
147 spacers
spacers of NC_014721_2
>2.1|2497011|37|NC_014721|CRISPRCasFinder TGGAAAGATGATGTCATAACACTTGTCGCTTTATTAG >2.2|2497077|38|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR TAGTTATAAGCGTAAACATCACGCTGTATATTTGTTGT >2.3|2497144|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR TCCATCTATACGTTGCCTTTGATTTTGCCCCTTGAC >2.4|2497209|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR TAGTCCATTATCTTTGTTAAACCAAAAACTATTATGC >2.5|2497275|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR GAGATTACAGACATTGACGGCAATGTTTTGTATTACG >2.6|2497341|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR GAGATTACAGACATTGACGGCAATGTTTTGTATTACG >2.7|2497407|35|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR ACATTGAGTGCCATTCAGCATCCCACCTTTACATA >2.8|2497471|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR AGCTTGGCTTTTTTGTGTTGATACATTTCTAAAATA >2.9|2497536|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR CAACGATTAAACAACTTTATGAAGCTGTAACAGCAGT >2.10|2497602|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR TGGCGAAGAGCCACCAGAAAGCATTTTGAAGCTTGC >2.11|2497667|38|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR CGGTAACTGAGTGGTAACTAAAAAATCCAGCAAAATCA >2.12|2497734|35|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR ATGGCTAATATCGTAGAAGTTGCTTATAAACTCAA >2.13|2497798|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR TTTCAATATATGCCCAAAAAATAAGACCAGCCCTACT >2.14|2497864|39|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR TGTGTTCAGCCAATGGAAATTTCTTGACAAAACAATCTT >2.15|2497932|38|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR AGAATTAATCCAGGATTTCGTTTCTCGAAATGCACAAT >2.16|2497999|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR CTGAACAACAACAGAAAGCAGCAATGATGTATGCAAC >2.17|2498065|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR CCATAAAACACCGTTCTTTTCAAACAAAACCTGTGC >2.18|2498130|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR GTTTAATGTTGAATCCAAAAGTCTTGCCTCCAAAGCC >2.19|2498196|36|NC_014721|CRISPRCasFinder TCAACAAATTAACACCACAGCAGCAACAACAGATTG >2.20|2498261|36|NC_014721|CRISPRCasFinder AAATTAAATTGCCACATTTGGACGAGTTATTTGACA >2.21|2498326|38|NC_014721|CRISPRCasFinder TGTTAAAGTGCTTTTAAGAGAACTCTCAGCTTTTGAAA >2.22|2498393|36|NC_014721|CRISPRCasFinder TTGGTATAGTGGCATACCTACCGCCGGTAAAGCCCT >2.23|2498458|37|NC_014721|CRISPRCasFinder CGTTTTGCTCTAATGCTGTGCTTGGTCCTGCCATGTG >2.24|2498524|37|NC_014721|CRISPRCasFinder TCTCTATCTGTATGTTTGTCAATGCCCATTTCAAAAC >2.25|2498590|38|NC_014721|CRISPRCasFinder TCTCTTTCAACTCAAGACATAACTTTTCTGCCCTTGTC >2.26|2498657|37|NC_014721|CRISPRCasFinder CAACCATGCCTTGTCCAGCCTTCATAACCATTGTCAC >2.27|2498723|36|NC_014721|CRISPRCasFinder CGATGTATTGCTATATCTCTCTACTTCTTCAGCATT >2.28|2498788|38|NC_014721|CRISPRCasFinder CTTGGTAGTTTATATTGCACACCCGTATCGTGATAATC >2.29|2498855|38|NC_014721|CRISPRCasFinder AAATGCTAAACAAGATGAGCAGTTCAGAATTGACTGAA >2.30|2498922|36|NC_014721|CRISPRCasFinder AGTTCTTCTCTCAGCGTCTCTGCGTCGTATTCATAC >2.31|2498987|37|NC_014721|CRISPRCasFinder TTGCCATCCACCCTGCATAGAACACTAACCCCAGCAA >2.32|2499053|36|NC_014721|CRISPRCasFinder GCAACAAGGTTACAAGATAAATTAAAGCTTCTTAAA >2.33|2499118|38|NC_014721|CRISPRCasFinder TATCGATGACTTTCCAAGTTAGAAAGTCACCTTTGCAA >2.34|2499185|38|NC_014721|CRISPRCasFinder AAAATTTTGTTATTGAATTTCCGAACAACATCGCACAG >2.35|2499252|36|NC_014721|CRISPRCasFinder TCTGCTGTATTTCATGACACATTTTGACAAAAAAAT >2.36|2499317|40|NC_014721|CRISPRCasFinder CAGCTGCTGAAATAATCTTAGCTGGTATGCAGCGTGATTT >2.37|2499386|35|NC_014721|CRISPRCasFinder AAATGGTGTGTTCACAAAGGTTATATATTACAGAA >2.38|2499450|36|NC_014721|CRISPRCasFinder TCTTTGAATTTGTATTCAGTTGACCTTGAAATTTCG >2.39|2499515|37|NC_014721|CRISPRCasFinder TAATGAGCTTATAATAAAAGTCATAAGCGTTCATCCA >2.40|2499581|36|NC_014721|CRISPRCasFinder AAGATAGGAAATATTATAAGAAGGTATGAGCTTACT >2.41|2499646|37|NC_014721|CRISPRCasFinder TGCCTTAATAATCGCATATACAGTTTTTACACAGAAG >2.42|2499712|35|NC_014721|CRISPRCasFinder CTCTCTACATATTGTATTGAAGTACTCAAGCATCG >2.43|2499776|38|NC_014721|CRISPRCasFinder TTACAAACTGGTTGCAGAAAGAAAATGAGAAAATTCAG >2.44|2499843|37|NC_014721|CRISPRCasFinder TACACCTTCAAGCATCCTGAGCAACGTTTCACACGCA >2.45|2499909|38|NC_014721|CRISPRCasFinder CTTAGCCAATTCTCTTTTGAGTCCGCTGAAATCCGCAC >2.46|2499976|39|NC_014721|CRISPRCasFinder CTCAGTAATTAGAATAACCTTATCGGGTGTTCCGCCTTG >2.47|2500044|36|NC_014721|CRISPRCasFinder GTTGAAATATTCTTGTTTGCAAAGTGACAGTGCTCT >2.48|2500109|35|NC_014721|CRISPRCasFinder TTTTTTGTATAAAAACTTTTCAAAGTAGAGATAAG >2.49|2500173|37|NC_014721|CRISPRCasFinder CCTTCACGAAAATGTCAACATAGCTTGGTGCCACCTC >2.50|2500239|36|NC_014721|CRISPRCasFinder GTTGAAATATTCTTGTTTGCAAAGTGACAGTGCTCT >2.51|2500304|36|NC_014721|CRISPRCasFinder CTCCTTTGTCACATTACTATAAATCAAAAAACCCAA >2.52|2500369|36|NC_014721|CRISPRCasFinder TTGTCAAGCCTCCTCAGAAAAATTTAGCTACCAGTA >2.53|2500434|37|NC_014721|CRISPRCasFinder CTTTTTTGTCCTTTTTGGGAGCTTCAATGCTTTCAAA >2.54|2500500|36|NC_014721|CRISPRCasFinder ATGTTGGCAAACGTCTAATATTCCGCCTGTCTCAAT >2.55|2500565|38|NC_014721|CRISPRCasFinder TTCTCCTTTGTCACATTACTATAAATCAAAAAACCCAA >2.56|2500632|36|NC_014721|CRISPRCasFinder ATGTTGGCAAACGTCTAATATTCCGCCTGTCTCAAT >2.57|2500697|36|NC_014721|CRISPRCasFinder CCTTTAGTTAATTGCTGCGCTGCCTCTTGCCCTGCT >2.58|2500762|39|NC_014721|CRISPRCasFinder CTGAATGTCCAGCCCATGTAAAACACGCATATCAACAGT >2.59|2500830|38|NC_014721|CRISPRCasFinder AAATCATGGACCTGCTACATTCATGCGAGACATATTTG >2.60|2500897|37|NC_014721|CRISPRCasFinder GTTGAATTCTCTCCTCTGGGATAGGCTGTCCGCAGGT >2.61|2500963|38|NC_014721|CRISPRCasFinder TATTCTTTCAAATTCAATAGTAACAAATTTTGCTATTG >2.62|2501030|36|NC_014721|CRISPRCasFinder GAGTTATAACTAACTTGTAATCTGCCATAATAATGT >2.63|2501095|38|NC_014721|CRISPRCasFinder TCAAACTTTTTATGCCAGAACCTTTTTGTCTCTTTTAA >2.64|2501162|36|NC_014721|CRISPRCasFinder TGTCGTTTGGAATTTTCATGTACTGCGGTTTGATAG >2.65|2501227|37|NC_014721|CRISPRCasFinder CGTAATATTGTATACCATCAATTTCTGCTATAACAGT >2.66|2501293|36|NC_014721|CRISPRCasFinder CAAATTCCATACTTGCATTTCTTTTTTGTCCTTTTT >2.67|2501358|38|NC_014721|CRISPRCasFinder TCTAATTCTTGTCAAATCTAAGATAGCGGGTTTGGGTT >2.68|2501425|37|NC_014721|CRISPRCasFinder AAAGGAATAGCTAATGGGATTTTGGAATTTATAAAAG >2.69|2501491|36|NC_014721|CRISPRCasFinder TTTTTTCAGCCTGTTCGACCGCCCCAAATTGCATAC >2.70|2501556|37|NC_014721|CRISPRCasFinder TTATTATAAGCTGTTTTAATTCTTTCAAAAGTTTCCC >2.71|2501622|37|NC_014721|CRISPRCasFinder GAAAGAATCTTTCTTATTTCGAGTTTATCTGCATCTA >2.72|2501688|37|NC_014721|CRISPRCasFinder AATGACAATAAAACATGATGAAATAGAAAACATTACA >2.73|2501754|37|NC_014721|CRISPRCasFinder TCCCACGAATAATATAATCATGCACTCCGTCATTTGC >2.74|2501820|37|NC_014721|CRISPRCasFinder TCAAATGTCTTACCTGTTGCATCTTGTATAAACTTTT >2.75|2501886|36|NC_014721|CRISPRCasFinder TGTTACAAGCTTGATAAACAATTATCTCATGACAGA >2.76|2501951|37|NC_014721|CRISPRCasFinder TTTGGTCATATCTCTGCAATCTCTCTAATTCTGTATC >2.77|2502017|36|NC_014721|CRISPRCasFinder CTTCTTCGGCTGTTTTAATCCAAAATGCTTCTTCTT >2.78|2502082|36|NC_014721|CRISPRCasFinder TTTGTCGCCCAGCAACCATGCAGCATATAAATTACC >2.79|2502147|36|NC_014721|CRISPRCasFinder GCTAAGAAAAATTTTGTGCTTCCTTTTCAATTTGCG >2.80|2502212|36|NC_014721|CRISPRCasFinder CTTTTTGACACATTTCAGCTGTGAATTTTTCGTGTG >2.81|2502277|36|NC_014721|CRISPRCasFinder TAACCTTCATGAACGCCATCTCGTCAATCAGTGCCT >2.82|2502342|36|NC_014721|CRISPRCasFinder TGAATATACTGACGACTGTAGAACAATCCTTAGCAC >2.83|2502407|37|NC_014721|CRISPRCasFinder GGTGATTACTCTTGTGGCAAACTACATTCTTGAGTAT >2.84|2502473|38|NC_014721|CRISPRCasFinder TATTGTCCTGGAAAAAGAATTTTGTTTCCAAGAGCTAC >2.85|2502540|35|NC_014721|CRISPRCasFinder AAGTTGATTTGTATTATCTTAACGAGCTAAGAGCA >2.86|2502604|37|NC_014721|CRISPRCasFinder AACATGTAACAGTTTTTGCAAAAGCCGAAAACGAAAA >2.87|2502670|37|NC_014721|CRISPRCasFinder CAAGCCAATCCTCACGGTTCTTTCTCCAGAACACCGT >2.88|2502736|36|NC_014721|CRISPRCasFinder AGGATTAGTTCCAGAAACAATAAGTCGCATTGAGAA >2.89|2502801|36|NC_014721|CRISPRCasFinder AAATTGCTATGCAAGACGAATGGCAAGCAGACTGCG >2.90|2502866|36|NC_014721|CRISPRCasFinder TTTAAAAGTTAAACAATTTTCAACTATTTTTGAGAT >2.91|2502931|37|NC_014721|CRISPRCasFinder TAAAGGAGATGATTTGGAATGCGTATTTGCATTGACC >2.92|2502997|37|NC_014721|CRISPRCasFinder CAAGCCAATCCTCACGGTTCTTTCTCCAGAATACTGT >2.93|2503063|36|NC_014721|CRISPRCasFinder GAACTTGATTTTGACACAAATTACATTAAAACAATT >2.94|2503128|39|NC_014721|CRISPRCasFinder TTTTGATTTCTTGCACATTGATTCCGCACTCCAGCAGCA >2.95|2503196|37|NC_014721|CRISPRCasFinder GTTGAGCTATACAATACAATCTGCAAATCACTGCCCA >2.96|2503262|37|NC_014721|CRISPRCasFinder CACTACGTGCAAAAAGTCCATAAAAACTCTCACTATT >2.97|2503328|36|NC_014721|CRISPRCasFinder TTTGTGCTTATTTCTTCAAGCCTTTGAGCTTTTGCA >2.98|2503393|37|NC_014721|CRISPRCasFinder AGCCACAAACATATTTTCTGTTTCACATACTTTAAAC >2.99|2503459|37|NC_014721|CRISPRCasFinder GAAAAACAAATTGTAACACATGCTTGCAGTGCAGTTC >2.100|2503525|37|NC_014721|CRISPRCasFinder GATAACCCCCATATTGCAATGGGAGTGTCCCCAAAAA >2.101|2503591|37|NC_014721|CRISPRCasFinder TGTTTGAGATGAAAGATGGATGGTTTTTGAAATATGT >2.102|2503657|35|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR CTTGTCCTTAACTCTTTCCAAAAATCAAGCAACTC >2.103|2503721|38|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR TACTGTGATGGTTGCTGCTTTGACTGCAAGCACTATGA >2.104|2503788|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR ACCCGTATGCATGTAAGCCCTGAATTCCAAAATATTT >2.105|2503854|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR CTTGATAAACCTTTTTGCCTTTAAATTTCGATTTCTC >2.106|2503920|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR TGTACCATCTCACATGCCTCCTTTTCATTTTCTTGAG >2.107|2503986|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR AGGATTGGAATTCTTTCGTCTGCTCTCTGTTGATTTT >2.108|2504052|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR AGATTTGTCAAGTTGGGGGAATTGGACGCCGATTGG >2.109|2504117|38|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR TTGTAAAAAAAACGTCTCAGATGTATAACCTCGTCATA >2.110|2504184|35|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR TGAATTATTTCGTTTAGTTCAGTTAATAGTTCAAT >2.111|2504248|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR CATTCCAGCACGGTATTTAATAGGACAGTTAATTTCA >2.112|2504314|38|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR TTTGGCTGCTTTTCTATGTGTTACGTGAAAACTCAAAG >2.113|2504381|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR CCGCACATGTCTAACAAAAGTTTTCTACGTTCTTGCC >2.114|2504447|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR TCAAGTTAAAATTTTCGTAGTCTATTAGGACCTCAAA >2.115|2504513|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR AAACTTTTTGATGCTGTAATAGTACACAAGCTTGAC >2.116|2504578|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR AATTGAACAGTTAAAGGCAGCAGAGAACAGGTTTAAC >2.117|2504644|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR AAAACACAAACATCTGTTTACCTCTTTTTCCTACAAG >2.118|2504710|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR CAGCACGTCAAATTTTACAAGAGATAGCAAAAATGCA >2.119|2504776|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR CTGGCTTTTTTATTTTATCAAGCACAAAAAACAAGCG >2.120|2504842|39|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR CAGAAGCTTTTTCGCAAAAAGAAGTAAGCCAGTCCGAAT >2.121|2504910|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR ATTTTCACCGTCCTTTGTTATGAAAACCAGAGAGGGA >2.122|2504976|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR GAATAGGGCAACAAAACAAATGCACATACATTCATT >2.123|2505041|38|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR TTAGGAATTGGAAGAGCTACTTTAAGCAATTACGAACT >2.124|2505108|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR ACAGCGTTGATAGAAAAGTTAACACAGTTTTTTAATC >2.125|2505174|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR TTTTGTTTTCTAAAAGTTTCAATATAGCTTCAATTTC >2.126|2505240|38|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR GTGATATAATATAATTAGAAAGTTGAAAATAAAAAACG >2.127|2505307|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR TCATTGACCTGCACCTTCTTTTGTATCACCAGTGTCC >2.128|2505373|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR TATAATGCCTATAATTTGTTTTATTGCTTCAGGGCTA >2.129|2505439|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR AGGTGTTATTGTTGACCATTACCCAGCTAAAGTTTA >2.130|2505504|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR TCAGCCTTGACACATTGCTACATCGCAGCGGCACCAT >2.131|2505570|38|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR TGAAGTTTGTGGTAAGTTTGCAAATGAGATGTATCATC >2.132|2505637|38|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR AACTCAATGAACTTGGCACGCCAGTTTGTCGTTTCGTC >2.133|2505704|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR CTTCATAAAGTTGTTTAATTGTTGTTGTCGTGTCTGC >2.134|2505770|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR GTACAGACAAAAATAAAAAATGAGCACGCTTTTTTTA >2.135|2505836|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR ATGGAATAACATATTCTCAAGCAGTCTTTTCATTTGC >2.136|2505902|39|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR AAACGAGACGAAAAACCTGTAGTGTTTTGGCGTCGCAAC >2.137|2505970|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR AACACTTGAAATTTATCCTGTATCAGACCTGCACGT >2.138|2506035|35|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR ACCTATTAATCTTCAAACTCAAGAAACACCAACAA >2.139|2506099|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR TAGATTTTTGCGTTGATATAGGCTTTGTTTCTATTTT >2.140|2506165|35|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR TTTAATCTGGTAGCTGTATTTACAAGGACATTGTT >2.141|2506229|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR AAAGGAGGTGTGCTGAATTGATAGTGGCAAGTAAAA >2.142|2506294|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR ATTTTTGCAATCCCTTTTGAAAGCACCAAATCCTCT >2.143|2506359|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR GGACTACCTGTATCCTTGATAAGAGTTAAAATTCCAA >2.144|2506425|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR TTGCCAATCCTGCTTGAACTATAAACTGTTTTGTTGC >2.145|2506491|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR TTTCTATGATGTCCTTAATATCAATTATTCTATCTT >2.146|2506556|38|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR TCGCTTGATTGGTGAACTCAACAAATACATCAAAGACA >2.147|2506623|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR AGGTAAAACTCAAGGTCGATATGGACAGGGGAAATCA >2.148|2497011|38|NC_014721|CRT TGGAAAGATGATGTCATAACACTTGTCGCTTTATTAGG >2.149|2497077|39|NC_014721|CRT TAGTTATAAGCGTAAACATCACGCTGTATATTTGTTGTG >2.150|2497144|37|NC_014721|CRT TCCATCTATACGTTGCCTTTGATTTTGCCCCTTGACG 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cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014721_2
The CRISPR arrays of NC_014721_2 >merge|NC_014721|2|2496982-2506688|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR,PILER-CR 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MQKSLYLTSNGRLRRHENTLYFETGVEKRSIDIENVEQIHIFGEVDLNTKALNYISQYGIVLHFYNYYGFYAGSFLPRKKNVSGDVVVRQALHYLDREKRLFLAYCFVESAVYHMMRNLRERKEAEAFLIAIEDEWGKGRFNISNIAELMGLEGRIRNIYYQSFNQFLPEDFAMEKREKRPPTNPINALISFGNSLIYSHTLSQIYQTQLDPTISFLHEPSEKRFSLSLDISEIFKPLIVDTVIFKLLNNRQISLEHFDEDLNYCYLNQEGRKIFIKEFQSKLETTVRHRQLSRNVSYKGFIRLECYKLIKHFIGDQVYSPLKAWW >NC_014721.1|WP_013433569.1|2508268_2508781_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MEDIQEFSDVKFQGIKINYLYVCKRKLWLFSKNITFENTSDKVLLGKVLHEYSYPKESTKEVLIDNLIMIDILSDGSIREVKYSSKMKEADIMQVVYYLYYLKQKGIQKQGIINYPKEKRKEVLELTPEYEEKVKQALKEIEEITTKPFPPPAQKQRICKSCAYFEFCWG >NC_014721.1|WP_013433570.1|2508800_2511134_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MKIDSYKNIELYAKRFKNDKGSKYQTIYQHTMDLLNNMEKLFEEYKEEIKEGCKRLQIDYQKLKYLLRLAIIYHDLGKANSKFQQKIRDKTKVHEVPQVKGLSKEVPHNFISIVFVNLEDEIEKGNITCEDFQNLLFAIAFSHDRDFDVNFQYFNKYICEDVSKYIENQTLKPLLELLPSVPDRDKVVESSNYTYRVINQLRELMFKDSYDLSDKKVIFRIFLKGLLHRIDHSSSAGISAEEAKINNFPEKVEVYLKSKCSFTGFKDFQRKAMELSEKNVILFAPTGSGKTEFGLNWAFKSKLIYTLPIRVSINAMYERLAKIFGEDKVGILHSDSMIYLLEKYLNLECENQELEALFDSVDLAKNLSLPIIVTTGDQIFTSALKWPGFEKIYSLFLYSKIIIDEPQSYSPESLAIIIKTLEEIINLNGKFCLMSATINPLILKHLGEWAEYLQAYSDEELKKRYSHIISIKELSILDCVDEIVEHAKQKNVLVICNTVKRSQEVYQVIKENLKRFGEIPVELLHSRFLEGQKRQKEQVVISNHRKNGIVISTQLVEASLDIDYDILFTELASADSLLQRMGRVYRKRPYNELCPNVIILTKDPSGIGKVYQKEIVDRTEEFLKKFDENKITEYDKKELNEYVYDIDALSSTNFISKFKKAYELLELGFRADRKIEAQKIFRDVVTISGIPREIFNKNIEEISEALKKINSRSKRSIEKLKLISSIRKYTVTAPAYFFAKGGASCYNKDLGIYILDCEYDDQLGLIPPKGLEQSDIW >NC_014721.1|WP_013433571.1|2511123_2511870_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MLNNLLKIKIYQPFANFRKPFSYGIIDSYPLPPPSTVKGWLHNILGARDGKYYKMAVSICGKFNSVVYDIQRIIKFDRLRGEDDTAPVVSDVSARVVNGIIYVTNLVDVQLCIHVNAEKYVLEKIYENIFDSYWGLGRKEDLMRIDEVKFFEPSKVEYKKYIKKRPPEIGMYLKSSTAEKLMIDGIRFRLNNRYEKTKDGLRIFTHKKDVVFIETLEQLNPMAMVDQEVMVDDENIIVDLIGDGEYEN >NC_014721.1|WP_013433572.1|2511872_2512802_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MNKNAGITITVVFEAMSLNYGESLGNISELKKLTRENKIYTYMSRQALRFEKYKFMLENAGIKETPVTGDEQVVQFKKEATIAEYPEIDLFGYMKTSGQGQNAQTRTAVVKITPAVSLEEYKNDIEFATNLNLAKRANTNPNPYQLEQHKSLYTYTVAIDLDRLGKDFNEKGEVVEEIPADEKLKRLYSLFDAIKFLSREIKGRRENLSPLFAIGGLYPIKNPFFLNRIRIIKEDSAYAIDPRLLHSTCELTLPNGKKVFDYTLLGILEGFFANEEELKKLLPASSGTIDYFFENLKERARKYYEEGTV >NC_014721.1|WP_013433549.1|2514380_2515598_-|IS110-family-transposase MEIMYPRCCGLDIHKKTVVACVITPEEKEIRTFSTMTEDILAMVDWIKSKGCTHVAMESTGSYWKPIYNILEIEELNPMVVNANHIKNVPGRKTDVKDAEWIAGLLQHGLLQGSYIPSREQRELRELIRYRRSLIEERAREINRIQKVLEGANIKLSSVVTDIMGKSSRAIIEAIINGEEDTVVLSELAQKRLKNKKEELKKALKGLIGPHQRLMLKTQLAHIDFLDEQIGLLDEEIKRRMLPFEEDLERLDTIPGVGRRTAEHIIAEIGTNMDQFPSAAHLCSWAGVAPGNNESAGKRKSGRTRKGNEKLRSVLVEAARAAAHTKDTYLSAQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILTIVYYLLKRKERYNELGVNYYEERKKEAIVKQSIKKLESLGLKVIVENAV >NC_014721.1|WP_013433575.1|2516065_2516851_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRAKFIFEVSEKQGQVHELPIYYRTIFMSFLKRALSLYNQEYFNRLYWWEDKKNKWQKPFVFAVNLPNMNFQDDTVSFRGDILLNLSTSDYEFFVNMYNSLLNNRLYPYPLTDSCKIALKRTYLVREPEKFDSKMTFKTFAPILIEKKEGNKKVPVLPFDEEFEEVFNDVVDFEIKNIRLLRGQHKGLQKRLTFRPINVQKTVVKHRISEFVETTGKDIMFLTGFSGLFELSGDPEDLKELYQNGIGFRRGQGFGFVEVAK >NC_014721.1|WP_013433576.1|2517911_2518295_+|GntR-family-transcriptional-regulator MLKLVISQTSNQPIYEQIKNQIKKQIIEGSLKAGEALPSIRVLAKELNVSVITTKRAYEELEKEGFIVTVPARGTFVAEIDKEKISNLGAKEIEEDLQKVVRKAKLLRIELKKLIDMIEKLYKGDET >NC_014721.1|WP_013433577.1|2518296_2519172_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIALCVRNLTKTYKNFKLEIQELTLESGYIMALLGRNGAGKTTLIKCILDLVKKESGEVLIFEKPFNCDEVQIKQRLGVVLENPIVPGYLKPKEVKEIMKAFYKTWDDKLYKKLCDLFEIDQNKRIFQLSKGTVMKFSIALALSHRPDLLILDEPTSGLDPVARNQFVEILQEFVQSEEKAVFYSTHIVSDIENVADFVTIIDGGKIVFSSSRESIQDDYCIVKGAANEYDKIPKSAVLSLKKSTLSFEALCRKKDVKLSQDEFVIEKPSIEKFYVMLVRRDEDDEVLEVV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_014721_3 | 2652729-2654679 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NC_014721_3
|
29 spacers
spacers of NC_014721_3
>3.1|2652759|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCAAAAGTCTGCAAACATAGACGGCTCAAGGCTTAG >3.2|2652825|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTTACTTCCTTTTGTTGTAATAAAGATTCTTTCACC >3.3|2652892|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAAAAACAATACAATGTGATAATATATAATCGTGA >3.4|2652958|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAAGTAAACAAAAAACCATTTTACCAATCCCATAT >3.5|2653024|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCATAATAAGAAGGTTTAAAAAAATTGAATATACTAT >3.6|2653091|38|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTATTTGGTTGTCTAAAAACGTGTCAAGTAGTTTATC >3.7|2653159|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTATACATAGCAGTATCCAACATAGGTAATGAATA >3.8|2653224|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCCCTACCCCCGCCGCCAACCTTCCATTTCTTTCCC >3.9|2653290|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGATAAGTGAATTCTTCACCAAGCGCTTGAACAACG >3.10|2653357|34|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGTAAAGCAACCTGAACATTTTTTGCTACGTCG >3.11|2653421|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGGAGGAAGTGCTCCACTGTTGGGAGGAGTAGAAC >3.12|2653487|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTATTATACCCACCTTCATATCCATGTCAACCCTGA >3.13|2653553|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTGCTTGAAGTTTGAAATAGTCTTTTTTGTGCTT >3.14|2653618|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTACAATGAAGCGATAAACAACTAAATTGCACAAAA >3.15|2653684|38|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTATGTATGTCAATAGTTTTTTAAACTTTCTCTACAA >3.16|2653752|34|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACCACAGACCTTAAATACCCAGACAAAGCCTTCA >3.17|2653816|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATTTGCCATTATAACATTGTTGTTTTTGTGTCC >3.18|2653881|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAATTTAGATGAATTTAAAAAATATTTAATGACTA >3.19|2653947|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAATACTCAACATCCTATCTATATTCAAAGCCGA >3.20|2654012|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATTATTGCTTTGTTTGTGTTATAATCTGTCTTGA >3.21|2654077|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTCTCATCCAATTCACATATCCAACGATAATCAG >3.22|2654143|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACTTTTTCCAGGTATTTCTCTATATCTTCCATTTT >3.23|2654209|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAGATGGAGAATTAAGTGAGGGATGGCGTTGTCC >3.24|2654274|33|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTACTGTATCAGTATGATGAACTGGTATTGCT >3.25|2654337|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCAGGACGGCAGTCAGGAAATTTTCCAAAACATAG >3.26|2654403|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAATTTTTTAACGATACATTTCTGAACAATAATCG >3.27|2654469|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGAGCACTTTGTTCATCTCATGCACTGCTGCTTCG >3.28|2654535|35|NC_014721|CRISPRCasFinder,CRT TATTTCCCTGATTGTTACATGTTCTGTCCATTTAA >3.29|2654600|50|NC_014721|CRT GGGAGGGGGGTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGTAGGCGGGTGGGGAT |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7b,cas8b1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014721_3
The CRISPR arrays of NC_014721_3 >merge|NC_014721|3|2652729-2654679|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACGCAAAAGTCTGCAAACATAGACGGCTCAAGGCTTAGGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTCTTACTTCCTTTTGTTGTAATAAAGATTCTTTCACCGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACACAAAAACAATACAATGTGATAATATATAATCGTGAGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTAAAGTAAACAAAAAACCATTTTACCAATCCCATATGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACGCATAATAAGAAGGTTTAAAAAAATTGAATATACTATGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTCTATTTGGTTGTCTAAAAACGTGTCAAGTAGTTTATCGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACCTATACATAGCAGTATCCAACATAGGTAATGAATAGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACCCCCTACCCCCGCCGCCAACCTTCCATTTCTTTCCCGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACCTGATAAGTGAATTCTTCACCAAGCGCTTGAACAACGGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACATGTAAAGCAACCTGAACATTTTTTGCTACGTCGGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACCTGGAGGAAGTGCTCCACTGTTGGGAGGAGTAGAACGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACCTATTATACCCACCTTCATATCCATGTCAACCCTGAGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACGCTGCTTGAAGTTTGAAATAGTCTTTTTTGTGCTTGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACGTACAATGAAGCGATAAACAACTAAATTGCACAAAAGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTTTATGTATGTCAATAGTTTTTTAAACTTTCTCTACAAGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTAAAACACCACAGACCTTAAATACCCAGACAAAGCCTTCAGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACAAATTTGCCATTATAACATTGTTGTTTTTGTGTCCGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACATAATTTAGATGAATTTAAAAAATATTTAATGACTAGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTTAATACTCAACATCCTATCTATATTCAAAGCCGAGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACCATTATTGCTTTGTTTGTGTTATAATCTGTCTTGAGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTTTTCTCATCCAATTCACATATCCAACGATAATCAGGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACAACTTTTTCCAGGTATTTCTCTATATCTTCCATTTTGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTAAGATGGAGAATTAAGTGAGGGATGGCGTTGTCCAGTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTCTACTGTATCAGTATGATGAACTGGTATTGCTGGTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTTCAGGACGGCAGTCAGGAAATTTTCCAAAACATAGGTTTATAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAATTCAATTTTTTAACGATACATTTCTGAACAATAATCGGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAATTTGAGCACTTTGTTCATCTCATGCACTGCTGCTTCGGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTATTTCCCTGATTGTTACATGTTCTGTCCATTTAAGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAGGAGGGAGGGGGGTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGTAGGCGGGTGGGGATGAGTTGTAGCTTTCCTGTTCGGTTTGAGGA >NC_014721|3|4|2652729-2654534|PILER-CR GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC GCAAAAGTCTGCAAACATAGACGGCTCAAGGCTTAG GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TCTTACTTCCTTTTGTTGTAATAAAGATTCTTTCACC GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC ACAAAAACAATACAATGTGATAATATATAATCGTGA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TAAAGTAAACAAAAAACCATTTTACCAATCCCATAT GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC GCATAATAAGAAGGTTTAAAAAAATTGAATATACTAT GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TCTATTTGGTTGTCTAAAAACGTGTCAAGTAGTTTATC GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC CTATACATAGCAGTATCCAACATAGGTAATGAATA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC CCCCTACCCCCGCCGCCAACCTTCCATTTCTTTCCC GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC CTGATAAGTGAATTCTTCACCAAGCGCTTGAACAACG GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC ATGTAAAGCAACCTGAACATTTTTTGCTACGTCG GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC CTGGAGGAAGTGCTCCACTGTTGGGAGGAGTAGAAC GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC CTATTATACCCACCTTCATATCCATGTCAACCCTGA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC GCTGCTTGAAGTTTGAAATAGTCTTTTTTGTGCTT GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC GTACAATGAAGCGATAAACAACTAAATTGCACAAAA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TTTATGTATGTCAATAGTTTTTTAAACTTTCTCTACAA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTAAAAC ACCACAGACCTTAAATACCCAGACAAAGCCTTCA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC AAATTTGCCATTATAACATTGTTGTTTTTGTGTCC GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC ATAATTTAGATGAATTTAAAAAATATTTAATGACTA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TTAATACTCAACATCCTATCTATATTCAAAGCCGA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC CATTATTGCTTTGTTTGTGTTATAATCTGTCTTGA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TTTTCTCATCCAATTCACATATCCAACGATAATCAG GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC AACTTTTTCCAGGTATTTCTCTATATCTTCCATTTT GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TAAGATGGAGAATTAAGTGAGGGATGGCGTTGTCC AGTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TCTACTGTATCAGTATGATGAACTGGTATTGCT GGTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TTCAGGACGGCAGTCAGGAAATTTTCCAAAACATAG GTTTATAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAT TCAATTTTTTAACGATACATTTCTGAACAATAATCG GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAT TTGAGCACTTTGTTCATCTCATGCACTGCTGCTTCG GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC >NC_014721|3|2|2652729-2654599|CRISPRCasFinder GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC 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>NC_014721.1|WP_013433668.1|2651063_2652299_-|hypothetical-protein MHSAEHKEENTLTKRPGFPKDATPKQNTSYKLLLRKELKNVQNFGKFFFELDVLTIAGVSRCLKDGNNFESVKRFVKERLERYQFDANEIHLIIDYLNADNFSFKLMVNEGIERIEKDRFIIEAFVKCYIARYFANRLFEGYKGLMKEIEKDFSEMCGQENLYFFGELKKWIISYDIWPKTAQQYAEIASSFKDEIEDVYSKVFSEVQKRRLIKIGKKKDHQEESQNIAEKAVKSQAEAVAGTRENEEFRKLKEKLENYELMVNMLQEQIEELREINSELQKEREMLLQERQQLPEKILIKLFNDLNSPQFGNLLDKIYVYANDLEPVDSSTAQEIFTNIISVLSLYNIVGHLSKEEYKSTISIKKEEIGSIYRCDRPAQSDKQVYEAQILYPKWTYNQKTVANKFVRIKS >NC_014721.1|WP_013433667.1|2649349_2651047_-|Hsp70-family-protein MHIGIDLGTTNTVVSYAKRKARGGVEPQVMRITQLDEYNSSIQEEILPSVLFLDFDGNIVIGKKAKHMKQYHPDRTISNSKRYMGTSMVFRIEDRAFTPVDVAANILKVCKRTIELNLGGKPVQQVTITVPASFNTDQIRDTRNAALKAGFDPDRIRIIPEPTAAFIDFINEQSELVEEDRLVDISTPKRVLVFDLGGGTCDIVVMDVVQSGNCLKVEEKAVGRYSELGGIDFDLAATRYLLQKFFVDNKIKEGDVEPVEQSQMVNKLMAFCEKAKEFFSNQMMLNPEIESTNPSFKMNIPEFWRGKSQLFSITLKEYNTATRDLYHSSGIKAKTIEDYERCKNIVDPIYETLERYEIDKNSIDYIFATGGMSLYYKVVQRLKELFPKSQVIKASNPLEAVSRGAAIFSFYEVEIKRQNEKASISKPTIKEPSSAEMEIVTKTVLAEAIMIDVEEGLPREIISKNQPVPYKGVIRDSFRVTSPSGIKIDIYAGEDPYDCKMRIQKSFTGNFRSPVTPGTPLDIEYEIDENKYLKLRVVVKDNMNPPIDLDVDSDVKTVGLEKVKE >NC_014721.1|WP_013433666.1|2647720_2649340_-|hypothetical-protein MDKVFKDFKEINIDLFENIFIPEMDSLEKSIVGTSNINYVSNRLFMWMFSKEDVKEFESIFGLLRQPKYGYVRSEFKRKLISQCNKMLKEGICPIEPMLYASKTVNRIISNDVEDHEDISDVICEVEKYDRNMVVKTLEHIITRWSWYPQLKIALLAAGKVSDDDLIQMAYNKFSDNKYLNYLKPELLKMLVYSKKASFVPQMVSILSTLERDSTSDRAIANFFRENFDKYVGREGVTELNIYYEMNYSFIKDFAKSIIQAVLKDCPLPLQDGPDKKFTYFKQLCIAYSKQKQNEKLREEILKNLFDSSYSAFSSMVYCLRYTKDKALATYLEDAVLRRKDAKIGDYKNAILTLGFLGADNHDFVMELSKRDKDLKYAMYGFFIVQGSETYCTLMADELIFCKDLSELGSIHRVLREVINVSPKLRSIIKEKLKAALLDDSKEVRKIALLNIQPYWRHIIDKDILNFLFEQIGYPDKPIKFSIEEQSIVLKIAKDVINNFGRNIYKYLDYVRRRNDFDPNIKQLATRILLNDFEPAPPQ >NC_014721.1|WP_013433665.1|2645918_2647697_-|MBL-fold-metallo-hydrolase MLLDSHEKYIALKENNVDVQKELCRNLYRAGNYLTCFLLSSKLVEMGEEREKIVQLSSLARLGYIDLVFHAFESDKEKIERHILAFADEDLDIAVDLLFSVDTIDECESELAKRIENASKSYENCRLWLDLRRLSEKFRSKNYIVCNNISCILEKIEKTEDSFIKTRASYRLYDLGIEKCREYLNEKYLKHEEKQKTGFNTSDDIYCFEIPENIAKKIWYFNYQDHHVHFFTYPDHNIHFLRFENEILVLDCGSNPKEFSIVDIEGFLTQKGYSTNMIKAVLISHAHYDHYSCLQYLPHSIPLYATKETIDLIFIVNREHLESKKINLVKCNEEFEVGKFRITPFSNGHILGSVGFDIQFGNKRLIYTGDFSLHNQMTAEGMNLQDILKRGKVNYLVSEHTYGQKDFAIKYEDAAKCLAYAVDFLVTLGIKVFIPAFSIGRAQEVIEIIFAFCRTKPMVVVDGLAKDISLYYSARSGKNFFHNVILGSSKDIENNVQGADVIVASSGMLQSHSTAVKYLQILKDTKFGFIKTGYIEDQHYIHEMVKVMMNSDVYYFDIPLSAHSNYFELLQTFRVLEPEKIILVHGQGIKGL >NC_014721.1|WP_013433664.1|2643263_2645795_-|glycoside-hydrolase-family-9-protein MKTARLLVCFVLVCFILTTTILLDNNKGEAAMYNYGEALQKAIMFYEFQMSGKLPKWIRNNWRGDSGLNDGKDNKIDLTGGWYDAGDHVKFNLPMSYTATMLAWAVYEYKDAFVKSGQLQHILNQIEWVNDYFVKCHPEKYVYYYQVGDGGKDHAWWGPAEVMPMERPSYKVTKTNPGSTVVAETAAALAAGSIVIKQRNSKKARIYLKHAKELYDFAAETKSDAGYTAANGYYNSWSGFWDELSWAAVWLYLATGDKYYLSEAKKYVSNWPKIAGSNTIDYRWAHCWDDVHYGAALLLAKITDENTYKQIVEKHLDYWTIGYQGQRIKYTPKGLAWLDQWGSLRYATTTAFLAFVYSDWKGCPSSKKKVYRKFGEGQVNYALGSSGRSFVVGFGKNPPKRPHHRTAHGSWANSQSEPPYHRHILYGALVGGPGLDDSYSDDVGNYVNNEVACDYNAGFVGALAKMYLLYGGKPIPNFKAIEKPSNDEFFVEAGINASGSNFVEIKAIVYNQSGWPARVTNNLKFRYYINLSEIVSQGYKPSQISLNTNYNQGAKVSGPYVVDSKKHLYYILIDFSGTPIYPGGQDKYKKEVQFRIAAPQNARWDNSNDYSFKGLDKTGGGQVIKTKYIPLYDGKKLVWGIEPNTKNLTLRTSQIPANGDADKKSKTILSKNTSSAKTSSKQNKEVKNVVKVLYKNMEINKTSNSIRLYLKIINNSQETIDLSKVKIRYWYTADDGVMKQSAVCDWAQIGAVNVTFRFVRLRKAVAKADHYLEIGFTNNAGKIQPGKDSGDIQLRFNKSNWGNYDQSNDWSWVQSMTSYGENKKITLYIDGKLVWGQEPTKDT >NC_014721.1|WP_013433663.1|2640701_2643155_+|PBP1A-family-penicillin-binding-protein MQSKNKKVKKQTPFRLFLKSFLRTLLALLIASMAVLIGAGFGMVTGYIKAIPPNALDIITSSADSQTTIVYDQSGNEIARLHGNENRIRVPYSKIPKNLINAFVAIEDERFWQHNGIDIKRIFGAIFKNIKTGSLSEGASTITQQLVRNKLLTFEKSFKRKIQEQYLAIQLEKRWTKEQILEEYLNTINLGSGAYGVGAAAYTYFGKDVSQLTLAECALIAGITQNPSYYNPYVFPDHAKKKQEIVLKKMLELGYITEQEYLEAKNQPLVYVKKDISAESAYKHPYFVDSVIDEAVEILSDKKRISEDEAENLIYGGGLKIYTTMDEAIQSTMEDVFSDPSIMPKIRHYDASGVPQPQAAAVLIDFRTGAVKGIMGGRGNLKGVRLLNRATMSVRQPGSSIKPIADYALALENGYTAATVIDDVPFSIGGYTPRNWYKSNVVSGKRGYKGFMTVREALQWSANVPAVKVAYNLGIQNVYRNLKRFGFTTLAPQDMNSLSIAIGGFTYGVKPIELTAAFAAVANSGVYIKPYFITKIEDKNGITIFERTPYKRRVMDEKNAYILTNTLQSVVTARITVGVRFSYPVAGKTGTTDDSKDRWFVGYTPNYALGVWVGEDKPVALSYLTGTNPALKIFKGIMDKVVSKKGVSPEFLRPAGIVERYICKESGKLATSLCRQDPRGSQVIKEIFAEGTEPTEYCDRHVKLKVCTESKKLATQYCPTTIEKVFIKRDNPIWPSKNSSVVPPDDYMYQAPTEYCDIHKAPQEVVVPQEGNTSQNEPSGFQKLKPPSTRQSNQQASEKNIPFDHSTTESNTYSIQQ >NC_014721.1|WP_013433662.1|2639461_2640517_-|[FeFe]-hydrogenase-H-cluster-radical-SAM-maturase-HydE MKVRDILEKACHENILTKDEIKLLLMAEGEDKDLLFKTADRVRKEHVGDEVFLRGLIEFSSYCKNDCFYCGLRRSNNQAQRYRMQEDEIVEVAKRAYQMGYRTVVLQSGEDMYYNKDMLCSIIKKIKSSVDVAITLSIGERSYDEYKAFKDAGADRFLMRFETSNRQLYEKYHPGMSFENRIECLKWIKSLGYELGTGFLIGLPGQTIDDLVQDILLVKELDADMIGIGPFIPHPQTPLKDAKEGSVDLTLKSIAILRLLIPDANIPATTALGTLDPLGRQKGLMCGANIVMPNVNDLKYKLKYELYPGKICINEDATKCRGCIESIIVSLGRKVGQGKGQSRHYKRAAAS >NC_014721.1|WP_013433661.1|2638665_2639367_-|hypothetical-protein MSMKRGKGNTKKVWLVVLIVAICALGILAGYYMAGYLAKKPATVDQTLQGNKPSQQLQEENDQNATSQAQKKQATNSQPSEQQQQDTTISSEVYKAFARFDGGVDAHTIQLTLLNTEFDYKEFEIDEKVKQGVELSEGEIVEIEFEKPQDGGNPRIVSLKKPDKVTLKGKFVGLADNNFAEFVFDQKHVVLQISNVADKVSYLDENTDVEVTFKTNQQNPQSNPVVEDIKVLK >NC_014721.1|WP_013433660.1|2637206_2638622_+|MFS-transporter MHVQEDRKINKNILIATTLSSFLVPFMSSAVNIAAPDIAKSFKLNAEELNLVISIFLIFSAAFILPMGKLSDTFDRTKIFKTGLLLFTLSTLMCALSNTVEILFVFRALQGFFSAFTFVTSMAILIENHSPQIRGRLLGINTAVVYLGTSLGPFLGGVLVKLWGYRSIFLFGFAIGLVGSFVSLFLLHKEVKNTRQAKLLDSLKSLDKIGTILSMTGLFLLMYGASTFELGNTSKILFFAGLILMIIFVVAEVKLQNPILDVKLFVKIPQFGFSNLAALINYSCTFSASYLLSLYLQLVKALPSQLAGSVLIVQPLSQVITSLISGRASEKIEPRKLATAGMVLTTIGLFVFSLFSSKTSLVLTVANLLLMGIGFGLFSSPNTNVVMSCVPKSLYGTASSTISVMRVVGQAFSMAIVSFVSIMFLKGVKLSHENYLLILKSMKTSFLVFASLSILGIVASYKRGNIYSRNS >NC_014721.1|WP_013433659.1|2636319_2636970_-|hypothetical-protein MKVAWSATHQEFLLTDGYYFSGLYKELCKRKIEIEEVDHFDRLFEYDVIVFNYPENPFSDDEKEKIREALVQKGKRIIFTAHFKNKDGVSEICNSITREYGIDILPEGIKDEIHHLEDDLFIITTDEVKLYREGVKEVVFPYSAPLEVGKGAEIVLRARKTSLTDSGKKSPVLIAQRRFESGGKLIVCGSCIFWDNFSLFRLDNLQFVVNMFEGAE >NC_014721.1|WP_013431836.1|2655064_2656768_+|IS1634-family-transposase MFVKITNAGGYQYVRLVENYRENGKVKQRVLFNFGRLDILKDDPAFKNIVKKLSDIVAETTTENAKAVTIESEEDISDAVVKNWGYIVYRKLWQELEIDKFLKGKAAKERKIKFDVDKVSFLMTIQRLIEPMSKLRTYHQRSKYFGFEEDIDLNQLYRCLDFLDSVKEDLETYLYQRNKDLFKMVVDVVFYDVTTIYFESCRADELKNFGFSKDNKVNEVQVVLGLLVDKEGRPIGYELFPGNTIDSKTMVKILRKLKEKFSIDKIIIVADKGLNSRINLKMIKEAGYDYIVASRLKNASKEILDEVFNEEGYKRLDGKRCLNAEEIYGDEFKYKVLERTNIVKDEEGKEFKIEENLIITYSSKRAKKDKEDRERLVRKAKELLENKGSITALEKKGARKYLKKKSKSEEYVLDEEAIKRDEKFDGYYAIQTSKKDMDVEEVLGAYHDLWKIEQSFRVMKSCLEVRPIYHFTESRIKGHFVICFLAFLLQRTLEYILRRKGKGISSERIMEAIYSMNFFEIEIKGKKYLIKQRIEGGAGDILNVMKIKGPKNFMTYEEGLEFIGISK >NC_014721.1|WP_013404366.1|2657832_2658096_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFVILVYDVNEKRVAKALKKCRQYLTWVQNSVFEGNISEGTLRRLILELERILDLSEDSVIIYKFQNTWYSERQIIGIEKNPVDFMT >NC_014721.1|WP_013433671.1|2658101_2659094_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKDLYVFNSGFLRRKDNTIMFETNEGKKYFPVEEIESVFIFGEVDINKRFLEFMTEKNICVHFFNRYEYYVGTYYPREHYNSGIVILKQVEFYNDYNKRMTIARSIVEGAVLNMLVVLRYYNSRGNMLKDEIETIERMRHNINSCDDVNTLMALEGNIREIYYRCFNKILDDENFTFVRRSKNPPLDRINALISFGNSLLYATTLGEIYQTQLDPRIGYLHSTNQRKFSLNLDISEIFKPIIVDRVIFSLVNKKVLSEKHFERELNGIILNDQGKKLFVSEYNQKLYSTITHPKLNCQVSYKRLIRMEAYKLQKLFLENIEYKPFVARW >NC_014721.1|WP_013433672.1|2659135_2659633_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MDVYMTGVYIWYYNICKRQVWLMAHGVLPDENDDNIVLGRFLHEYYYKKDQKEIKFGNAVFDILYQDKDEIVIGETKKSSKFKEASRYQLLFYIKLLKEAGISAKGVLFYPEERKKEEVELTVEDEEKLQKMIAEIETIIEKDSPPPAAYCRYCPKCAYREYCFA >NC_014721.1|WP_013433673.1|2659662_2662086_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MEYYSHKNPDKLLYAHLLEVYHYAMNTNVELKSWEKEALQVICLCHDFGKFTTFFQSHLNGVSNKCSQHGFISALFGVFCWMQKKGLWLQQVKNQISEDEVISLLIYACILHHHGDVKDISKNLPEKFAGDFKADVNLVQKIDDAYVQIEDLRCNAEDIKPLLEKIGLGSEFEKFLAQQRGFIEDILRYLKRIEYGIRFIGVMPQTFKDGINLYFIQQKLYSLLIWADKMSAANYKVLSPCYASSDTLIVARDKVIRPTADKNLQRIRQSVFEVVLSNIEKNKEKDIFSITTPTGTGKTLAGVFAAVKLKELLRKSGRIIYALPFTSIIDQNYDVVKNLFEAIEDFEKNRDRYLLKHHHLTDGEYRGKEEALKEITDEITVYEKVASECFIENWTSGFVVTTFVQLLETLISNRNRMLKKFHAFYDSVLILDEIQAIEVDLLPLVEEVLRKLSKLFKCKIILMTATKPLIFEDACELAGFCDYSIFNRTKLVYHHSDLKVAEFVDFFLREVYEDEKSFLIVANTINQSLQIYNGIKNNLKDKEVIYLSANLVPRDRKEVIKKIEEALESGRKPIVVSTQVIEAGVDIDFDCVIRDIAPIDSIIQCAGRCNRHNQKSQGKVLVVNIKDDSGRSFAKRVYGNTAIEISNMLLLQHPEVEEKDYGMLIDNYFSMVKENKSFKKSEEFLRSIRLLKFDSILEKEELTISRFSLIQQRGGYVSVIIRSNEEIEDAYQSYINSFSIKDYYKRREIYLELKNILFEHTISVPSKYVQIFDEEKGILSLPPTSCERYYNPETGFVYDPNDNVIFA >NC_014721.1|WP_013433674.1|2662175_2662928_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKFLVFDLKGKFAHFRKFYTNSSSLSYLVPPRTVIEGVVAAILGFERDSYYEELSAENLLIAVQKIERTYKIVQTVNYIKATSVNELKNPNTHTQVPLELLAGYNGFVGFRVFAMPRDEKMYSQLKSRLESGRSEFPIYFGSAPFAAKTEFLGEFEAYRWEDSSARILTVLDTGLIKSLNLSLESSAGLALMKDRMPCDFDKDRFATKVKTYIHDENLNPIWVDLDSSAKDKVYFIKEFSSDKELCISLM >NC_014721.1|WP_013433675.1|2662949_2663834_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csh2 MEKKIIDKNSEILFTYDAKLCNPNGDPDEENRPRMDWEKEINLVSDLRVKRYIRDYLDDQGIPIYVRKIDGKSVKPEEVIKSVGEDIDELETFIDIRLFGATIPIKGETRTYIGPVQFNWGYSLNKVELLEASITSHFASREKNQQGAIGKDYRVKYSFIAFSGIVSSKRAKITRLTEDDVRFLDRAMKEAIPLQATRSKIGQYPRLYMRVEYVDDKTLLGDLRDYIRLIEVVEKPRKIEDVQLDITALVEFLEKNKDVISKIYYFKNPDLCLVCGGNAVDFKDAFGTFELEEV >NC_014721.1|WP_013433676.1|2663855_2665919_-|TIGR02556-family-CRISPR-associated-protein MIEEIVEIGDILIGDSSGNEAYLAALIEEIEVPSGNEKNFVAKIDFSTKEKIITINCAEEVKDSTAKDYVYVGSAEGSNSPQWFASTKSFAYFLTETIPNLAERSIPVVSDICKKILDDYFVNIKEYLLSSTDLTEEEKMLLNQRIEKKYMYFLNADHVMVNDNKKLTERPISQIYKELIRKGKSTDKVFKQLRDAFTKECTDGLKKLTELKPQQIGLYVLCVDGKPLTSYPEYVDAVVAYKRQVKKGAEKTGKKQKEGNICYICLGTDGLSFEGLKKPKFKYFTTNQNIFASYLDQKNYAKNITVCEKCLSKLVAGDIFLRNKLKTQLGSFDVYVLPTFVYTSAKLTKNYLEDLTLNITNSLNTAWNYNSLEKLRDDISNFLSFFDQNHYFLLNLIFYREAQAGTKIMKFIPDINPSIFDKIYNAASKVFSQYIDLIGNDPSFRISLESIYYSVPIRLKNRNESTEAQRLLNIYDAIFSGKRIARDFLIENFIKAVGVVVYGKEGYNLSKFIGNDIASMVIRMVFVMKFLEFLDCLEVERGMDVSQLNLSDDLKSYIQQMNYDEPKTALFLLGVLIGEIGAKQYLATKDRQDDSAGHKPILNKINYNGIDRPKLIRLCSDVHNKLRQEKLLPYTEMIFAEMKRLLDKHIDSWKLDKYETLFYILSGYAYKTQKVILNATNSQDTSN >NC_014721.1|WP_013433677.1|2668835_2669102_-|UPF0175-family-protein MEGIKIEIELPKEILNYISLNEITNDKVLKELIIYKLIKDEKISFGKGAEILGMSKIELIEELSEYGVNYFDQPIEEVIEDKNAIDKM >NC_014721.1|WP_049772728.1|2675774_2676659_+|MFS-transporter MYGISSALDTGTIEAEIINQLKLSGMQIDKFISNSNRLNFIALLIGSSIGSFIYYAIGIKLYWISIILTIISTICVGIFYKGETSEKTKISLFEIFKRMLVQSKDGIKEMRKKESLKLMIALTFVGQFFFQTHFQLWQALFLSRGINKHNFYLFYVVFQLLSIVAYSIQVSKVSSNKLGRHFGILAILLILFLGLLKTTNNILFILVYITWVFIFTVFDFISNYIFAKNVSNERISSLTSLKSSCGRVGSLLCMLESGLILKLTSVSNIVIINFAFAMVMSTLIVIRYLRSEAG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_014721_4 | 2666352-2668217 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_014721_4
|
27 spacers
spacers of NC_014721_4
>4.1|2666382|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCTATAGATATGATAAGAATGAAGTATAGAATTAAGG >4.2|2666449|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGTTGACTGGATAGTTGTATTTTCTAATACTTCG >4.3|2666514|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAACAAGAAATTCGTAGAAACGTTAACAGGACAAAAG >4.4|2666581|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGATTTCAATTGATTTGGATGAGATATATTTGTGG >4.5|2666646|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTTGTCTGTTAGTGCTTCTCTTTTTTCCTCTTGCG >4.6|2666712|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGATTTTTTATTGCAATTTTTTTAATTAACCTGAAA >4.7|2666778|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAATCTTTCAGGAATTAGGCATAATGATTTATCT >4.8|2666843|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGTCTTCCAAATCCGGATTGAAGTTTGGTTTGTG >4.9|2666909|38|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGCCACGCTTCAAAAAATGCACTGTCACTTTACCATCA >4.10|2666977|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATAAATCTTCATTTAAAAAACTGCTAATCTCATATC >4.11|2667044|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATATTCGCATGCGCGGCGCCATAGTTCGCCGCCATG >4.12|2667111|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCATTTTTTTTACTCCCCCTTTTGTTTTTTCTTTT >4.13|2667177|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAAATGAAACAATAAACTTTTCAAAGTCAAAATTA >4.14|2667243|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGGATTTGTAGGCAATGCTGTTACGGCTAAACTG >4.15|2667308|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATTCTTTGATGTTAAATTCTAAGTCGTTATATAAA >4.16|2667374|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGTAGTTCTTTAATTTTACGTTGCAGAGCTTTTT >4.17|2667440|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACTGTCCATAAGCTAAAAGCTTTTTCACAACTTCC >4.18|2667506|38|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CACCACATTGCTTGCTACTTCAGTAAGCAAAAGATATT >4.19|2667574|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGTAATCTCTGCACCATTTAATATTACTTCATATGA >4.20|2667641|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGAGTGGCCAAATAGTTTCACGTCAACCGTACAGT >4.21|2667706|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTGCTGGAAAATTGTAATTCATTTTGTTTTCACA >4.22|2667771|34|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTATGGTTTGTTGGTGTTTTTGTGCTTGCTTTGG >4.23|2667835|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGATTATTGCATTCGGTAAAGTATGAATACAACATTA >4.24|2667902|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTGTTAGAAGTTGGCAGCCAAGCCTTATACTTGTAG >4.25|2667969|35|NC_014721|CRISPRCasFinder,CRT TTAATCACTCTTTTCTTTATCTCTTCCCATTCCTG >4.26|2668034|75|NC_014721|CRISPRCasFinder GGAGGGGGTTTGTAGCCTTCCACTTGGAGATTGAAAACAAAAAAATAGATGTTTTACTTGGAAAAAACTCAAATG >4.27|2668139|49|NC_014721|CRISPRCasFinder GGAAGCCTTGACCCTGTTTGTAGCCTGCCCCTTGGGGATTGAGGAGGGG |
cas8b1,cas7b,cas5,cas3,cas4,cas1,cas2,cas6,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014721_4
The CRISPR arrays of NC_014721_4 >merge|NC_014721|4|2666352-2668217|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAACCCTATAGATATGATAAGAATGAAGTATAGAATTAAGGGTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAACAAGTTGACTGGATAGTTGTATTTTCTAATACTTCGGTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAACTAACAAGAAATTCGTAGAAACGTTAACAGGACAAAAGGTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAACAGATTTCAATTGATTTGGATGAGATATATTTGTGGGTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAACGCTTGTCTGTTAGTGCTTCTCTTTTTTCCTCTTGCGGTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAACTGATTTTTTATTGCAATTTTTTTAATTAACCTGAAAGTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAACCAAATCTTTCAGGAATTAGGCATAATGATTTATCTGTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAACTTTGTCTTCCAAATCCGGATTGAAGTTTGGTTTGTGGTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAACCGCCACGCTTCAAAAAATGCACTGTCACTTTACCATCAGTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAACAATAAATCTTCATTTAAAAAACTGCTAATCTCATATCGTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAACTATATTCGCATGCGCGGCGCCATAGTTCGCCGCCATGGTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAACCTCATTTTTTTTACTCCCCCTTTTGTTTTTTCTTTTGTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAACTCAAATGAAACAATAAACTTTTCAAAGTCAAAATTAGTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAACTCGGATTTGTAGGCAATGCTGTTACGGCTAAACTGGTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAACTATTCTTTGATGTTAAATTCTAAGTCGTTATATAAAGTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAACAAAGTAGTTCTTTAATTTTACGTTGCAGAGCTTTTTGTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAACAACTGTCCATAAGCTAAAAGCTTTTTCACAACTTCCGTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAACCACCACATTGCTTGCTACTTCAGTAAGCAAAAGATATTGTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAACTAGTAATCTCTGCACCATTTAATATTACTTCATATGAGTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAACTGAGTGGCCAAATAGTTTCACGTCAACCGTACAGTGTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAACATTGCTGGAAAATTGTAATTCATTTTGTTTTCACAGTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAACGTATGGTTTGTTGGTGTTTTTGTGCTTGCTTTGGGTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAACGGATTATTGCATTCGGTAAAGTATGAATACAACATTAGTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAACTCTGTTAGAAGTTGGCAGCCAAGCCTTATACTTGTAGGTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAACTTAATCACTCTTTTCTTTATCTCTTCCCATTCCTGTTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAGGTGGAGGGGGTTTGTAGCCTTCCACTTGGAGATTGAAAACAAAAAAATAGATGTTTTACTTGGAAAAAACTCAAATGGTTTGTAGTCTCCCTACTGGGGATTGAAACGGAAGCCTTGACCCTGTTTGTAGCCTGCCCCTTGGGGATTGAGGAGGGGGAATGTAGCTTGTCCTTTGGGAAGTGAAAC >NC_014721|4|5|2666352-2667968|PILER-CR GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC CCTATAGATATGATAAGAATGAAGTATAGAATTAAGG GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC AAGTTGACTGGATAGTTGTATTTTCTAATACTTCG GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC TAACAAGAAATTCGTAGAAACGTTAACAGGACAAAAG GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC AGATTTCAATTGATTTGGATGAGATATATTTGTGG GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC GCTTGTCTGTTAGTGCTTCTCTTTTTTCCTCTTGCG GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC TGATTTTTTATTGCAATTTTTTTAATTAACCTGAAA GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC CAAATCTTTCAGGAATTAGGCATAATGATTTATCT GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC TTTGTCTTCCAAATCCGGATTGAAGTTTGGTTTGTG GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC CGCCACGCTTCAAAAAATGCACTGTCACTTTACCATCA GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC AATAAATCTTCATTTAAAAAACTGCTAATCTCATATC GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC TATATTCGCATGCGCGGCGCCATAGTTCGCCGCCATG GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC CTCATTTTTTTTACTCCCCCTTTTGTTTTTTCTTTT GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC TCAAATGAAACAATAAACTTTTCAAAGTCAAAATTA GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC TCGGATTTGTAGGCAATGCTGTTACGGCTAAACTG 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>NC_014721.1|WP_013433676.1|2663855_2665919_-|TIGR02556-family-CRISPR-associated-protein MIEEIVEIGDILIGDSSGNEAYLAALIEEIEVPSGNEKNFVAKIDFSTKEKIITINCAEEVKDSTAKDYVYVGSAEGSNSPQWFASTKSFAYFLTETIPNLAERSIPVVSDICKKILDDYFVNIKEYLLSSTDLTEEEKMLLNQRIEKKYMYFLNADHVMVNDNKKLTERPISQIYKELIRKGKSTDKVFKQLRDAFTKECTDGLKKLTELKPQQIGLYVLCVDGKPLTSYPEYVDAVVAYKRQVKKGAEKTGKKQKEGNICYICLGTDGLSFEGLKKPKFKYFTTNQNIFASYLDQKNYAKNITVCEKCLSKLVAGDIFLRNKLKTQLGSFDVYVLPTFVYTSAKLTKNYLEDLTLNITNSLNTAWNYNSLEKLRDDISNFLSFFDQNHYFLLNLIFYREAQAGTKIMKFIPDINPSIFDKIYNAASKVFSQYIDLIGNDPSFRISLESIYYSVPIRLKNRNESTEAQRLLNIYDAIFSGKRIARDFLIENFIKAVGVVVYGKEGYNLSKFIGNDIASMVIRMVFVMKFLEFLDCLEVERGMDVSQLNLSDDLKSYIQQMNYDEPKTALFLLGVLIGEIGAKQYLATKDRQDDSAGHKPILNKINYNGIDRPKLIRLCSDVHNKLRQEKLLPYTEMIFAEMKRLLDKHIDSWKLDKYETLFYILSGYAYKTQKVILNATNSQDTSN >NC_014721.1|WP_013433675.1|2662949_2663834_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csh2 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MFNTEIVGRMMKYDNDVYSRYRAEIWFDYTKKAINEIKEGALLAVQNFSSTSDKIRYCILEITSVIPLHYGLDNDLSGYPGFLTEAAENIYRDWEEQEEEPLDDATKIRCLAIPTNFEIIIDKDKKVSIGIESNLPMIGAEAFLLDEELTNRILNYDIDKSGDVIEIGHLIRDENVKILLKVEELLRVHFGVFGFTGAGKSNLLSTLVRKILTESNLPVKIVIFDLMGEYSTLLVDLLVKLNNSMIVGIGEKTFVGSLISLMKADRSLPEYKDLLKKATIDVVNSSLYPKGLVSHKDLFKKAFFRILQSRKVKIWQSGDIAVADFAKMYERTLLKGNLGKSEALVKKLYEQLLRKTNPLNATVCLALIQYIENKYLSDEKLGSIARSNLELFVNELKKKYEELKEFGFSNENVIDQKKLIEILNSPDDKALVIFQSHDPDELRNLAYQIGMAIFEDRRRSGKIDPVVSFIFDEADEFIPQDAKDSYERSSEVVMHLARRGRKFGLGIGIATQRITYLNTNIMAQPHTYFVSKLPRKSDQERITDAFGISEDMFKQTFKFKKGCWLLVSYDAIGLEAVPLPIYVQNANDAVLEFLRTLQ >NC_014721.1|WP_013433679.1|2678774_2680625_-|hypothetical-protein 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_014721_5 | 2669623-2673685 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_014721_5
|
61 spacers
spacers of NC_014721_5
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cas8b1,cas7b,cas5,cas3,cas4,cas1,cas2,cas6,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,csm2gr11 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014721_5
The CRISPR arrays of NC_014721_5 >merge|NC_014721|5|2669623-2673685|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR 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>NC_014721.1|WP_013433677.1|2668835_2669102_-|UPF0175-family-protein MEGIKIEIELPKEILNYISLNEITNDKVLKELIIYKLIKDEKISFGKGAEILGMSKIELIEELSEYGVNYFDQPIEEVIEDKNAIDKM >NC_014721.1|WP_013433676.1|2663855_2665919_-|TIGR02556-family-CRISPR-associated-protein MIEEIVEIGDILIGDSSGNEAYLAALIEEIEVPSGNEKNFVAKIDFSTKEKIITINCAEEVKDSTAKDYVYVGSAEGSNSPQWFASTKSFAYFLTETIPNLAERSIPVVSDICKKILDDYFVNIKEYLLSSTDLTEEEKMLLNQRIEKKYMYFLNADHVMVNDNKKLTERPISQIYKELIRKGKSTDKVFKQLRDAFTKECTDGLKKLTELKPQQIGLYVLCVDGKPLTSYPEYVDAVVAYKRQVKKGAEKTGKKQKEGNICYICLGTDGLSFEGLKKPKFKYFTTNQNIFASYLDQKNYAKNITVCEKCLSKLVAGDIFLRNKLKTQLGSFDVYVLPTFVYTSAKLTKNYLEDLTLNITNSLNTAWNYNSLEKLRDDISNFLSFFDQNHYFLLNLIFYREAQAGTKIMKFIPDINPSIFDKIYNAASKVFSQYIDLIGNDPSFRISLESIYYSVPIRLKNRNESTEAQRLLNIYDAIFSGKRIARDFLIENFIKAVGVVVYGKEGYNLSKFIGNDIASMVIRMVFVMKFLEFLDCLEVERGMDVSQLNLSDDLKSYIQQMNYDEPKTALFLLGVLIGEIGAKQYLATKDRQDDSAGHKPILNKINYNGIDRPKLIRLCSDVHNKLRQEKLLPYTEMIFAEMKRLLDKHIDSWKLDKYETLFYILSGYAYKTQKVILNATNSQDTSN 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_014721_6 | 2689674-2691480 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_014721_6
|
27 spacers
spacers of NC_014721_6
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cas10,csm2gr11,csm3gr7,csm4gr5,csm5gr7,cas6,csx1,cmr3gr5,cmr5gr11,cmr4gr7 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014721_6
The CRISPR arrays of NC_014721_6 >merge|NC_014721|6|2689674-2691480|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT 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>NC_014721.1|WP_013433687.1|2688140_2688794_-|hypothetical-protein MAKANEELEIKNKIDEIKELMKNKKYYAVIEKYNEFLKVRKNAEVEQILNEAIKEAKDIYVLSAKVYYLAVLSCGALLEDIRNKIVMNWHSFIYDSFTPYNSIDDAVTQALEQKAKEVSDAKNYKESIDKFYAMLKEIPFEDPKLSEMCTAIKEVYDSFYDFYQLVLYPSGNYVSFSTETSTKNNLLAKKLNELNILLERENIKNENEDNSSISGSL >NC_014721.1|WP_013433686.1|2685335_2687819_-|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 MIFYSAHQREEDRNFDYTLFLGAILHDIGKFYMRTENPDAKKNISKEYEAFYQAEGKYAPRHQEWGAFFVEHFLPESLKGVTSLVLYHHRPSSYDQLLISVADKISAKVDRKDIIEEEAAGDKSKYLISVLSQINLDRDKKEPKKPFYKLLKKRYDVENPTEGFSSNAKEDYQNLWTEFSRKISILRDGFESSFDLEDFATAVYNLLRIYTYNVPSAFYHSQPDISLWAHSKSTAAIAFCLDRQLKKEFSQENERIRDLEAINTKLLPGNESAIKKGDYPYFCLVKGDVSGIQDFVFDTSMDGALKALKAKSFYISFLLDTIARYILKEENMPVCNLIYNGGGHFYLLMPRYFMEKISHYQQKIDKILFSAHRGALNVLLEAAEVDLYDFARNFGDCFDRVSRNIQKKKACKLKNVLEETKMEFFEPWEDHDLKCPHCGRKIEPKEDNPDYCRFCDSFVKLGDELMKSLFIVDSWGEEKEFSEFFNIHNVLKAFGRTIEFSNHYESVANTLILDRSRIEDLQIKKKEIERGQKGSRQGFESEFYEDLDISTHVPFKDVNEEVLMLIDDIAESAKGIKTWGIVRGDVDNLGSIFKDGLGKDNSISRVMTLSEEFSLFFGYYFNKLVKKQDGNILVIYAGGDDFCILGQWDVLPQIAYKIYTEFRNFSCHNPDVTLSMGFEIAPDKKYPIYRVAMVCGDHLDQAKEYEREDGKKKDCFAFGANFVGWEEFEDLKKLKEAIADLVGNKNVSKALINGIYAVCNLKKVAQAQKELFKAWRFVYFMARLKERHSKFSAELEDVLDKIIDKKTNALYKHSYLAARWAELELRR >NC_014721.1|WP_013433685.1|2684892_2685303_-|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm2 MPAQGGNVALSLKNDILSKIETAIDPEKDKDGKAFSDVAEKTGQLLKESGVTVTQIRKVFTEVKRLSPEDANYKYKLKLLKAKLAYTAGRFNKMKDFQEIINKALPVAEKSPEALNRFKDFFEAAVAYHKYFGGKE >NC_014721.1|WP_013433684.1|2684037_2684865_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm3 MDVILKGKYIIKCKIKAVTGLHIGEGNNSIEIGGIDNSVVKDAEGKPYIPGSSLKGKMRALMEFAEGKVKDNLLIVSVKRSGKPEICIHMCEDIDCPVCGLFGRNHGKHVTKEEFIRNPNAEGKDFSDAVIPTRLIVRDAKLIESSITDEMKENLDLEWTEVKFENNIDRITSKANPRQSERVPAGAEFSAEFVVNRYEVDGSDDGQRYLSKFIKAMKLLEDDYLGGQGSRGNGKVKFVDIEIVYKDSSDYEKDSSDLKPIAKADSLDQLKLSTN >NC_014721.1|WP_013433683.1|2682998_2684009_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm4 MSKGKLYRVSMRFSSPLHIGEKEKIYNITQTFAHSDTLMSGIINAYSLLYGNSSTNELLDGFLRKSPPFEVSSTMPYVQGEFFVPKPVGLNLHHYKDEGKIEVENDKELKKIKFIRENDLLYNFPDKYKVAGSFLLPKDMLYKFVESKKAISLGKVKERARVSIDRLSSSSNIYYFSHFEFESSAGLWFYLRINDQSLEEKIKAAIRLLGDEGLGGDRTCGLGSFEANFEESSMPEENDSAKYYMSLSLVNPQSEDEIKNAISYEILTRSGYIYSKAGLGIKRKAVRVFSEGTVFSGKVCGRVVDVTPQKFSQHRVYCFALAFLLPLPEGVMMIDS >NC_014721.1|WP_013433682.1|2681824_2683009_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm5 MTHEPFESRTYEIEVLTPTIIGGQDKIQSFEFVKDGDYLYFINFDRLLEENLFKESFIDELSRGLSTGDRDFNIKDVLARYNIDFKNSSKYKLKLEGVKRLSKEVVPFVKSAGRFYIPGSSLKGAIRSFVTKALNRNFIQLYENDLSSAYQKTLNSADRRNSVDPKHVSKDAEEKIFATPYESPFKHLKISDSDFVSSENAGVYEIKVMNICGGQVKWFAGRSNEDDPDRAVSIIAEGIKPGAKLIGSIKVEKDFVEGNQVVRGIKEKIGVNATATSPTEFLADVLKAVSKDYIQREINFYTKYKQAQIVSEYQKLLNVLNSLDKNQFLIQIGFSTGYLSKTVGIFFNKNHFEKLAKVDRQSKIYPELFPKTRRLVFKNGQVWTVPGWIKVTIK >NC_014721.1|WP_013433681.1|2681204_2681828_-|hypothetical-protein MMGCDEKVAKYFTFHFWAREDGVFLPSSYYSKVYEVLKSLLATEQFTISPIKTKNKKEVEDGVWVFEDFRIYLATPFLEFVTQNILKIYESLNGLFEGIYLKKISCRSQQPKASGNLISGVFAQKDGVCLEYDRQPEIFSEVLRRQLLNIYCQRFGVYPEDQRFFFVIKDGLKKQHLIKSRIEYFGRYEIFASGDLLDMFCQMFCVK >NC_014721.1|WP_013433680.1|2680935_2681073_-|hypothetical-protein MSLSALLGASIMMHGLVQGLKVFAAVVALGFVIKGLWQGFKKELA >NC_014721.1|WP_013433679.1|2678774_2680625_-|hypothetical-protein MSKLSQIYGYWKNSIKASMKRYDENMERSLKHLQNFYSTVLKYYIIDWSRYFESQPFRHSLRQKMESFFGKNEINFVAIDGTCVKDEGSDFITFFAGAYGARGKIIIKHEGEKIKYERWDFARDVTMVAQIPVFPYEIEFVASSPELSQMQFYSDKDIQEILNLHTSLMKLAEIYLAYHVVSSSTVDMPQIILLDLAPSTLLRVPYVNYKSTNYLGYKYLNDTIKLSDVIVALSHPYNSLLGVPSRKKYRRYALLLSKLDEVCSQNHKNYFTYKELTEICHLSIEDIKEIVRFLDATGVVEDDEAAGIKLFVNLSQRWSYLVSFFDYICNQIFIRKNPTALEFSNFSEESNIKKLISHDDINFLISIGIRALIEKCWEKNVFLIGIVKDSKSRYFCRNFLNVLSSQNMLGDGNENVDIKNFQIAMSDRLVFENCAALSTELCAPWSSVEFDSAFATLFVDRNNSVTGVKGHIVADDRIFAKSIAQFYLQRSKKQCKMGHAIFVERLLHPNLDRQFLDVVLLENSKLGRLSPFIHLDKKVINWGQAMNIYFLDVLTRNHFPEVIGYPEPLHKADRGAKTLLRFAKGVIHSSQQLYRKDPLNMTFRKFRDKLEFEDEE >NC_014721.1|WP_013433678.1|2676972_2678769_-|ATP-binding-protein MFNTEIVGRMMKYDNDVYSRYRAEIWFDYTKKAINEIKEGALLAVQNFSSTSDKIRYCILEITSVIPLHYGLDNDLSGYPGFLTEAAENIYRDWEEQEEEPLDDATKIRCLAIPTNFEIIIDKDKKVSIGIESNLPMIGAEAFLLDEELTNRILNYDIDKSGDVIEIGHLIRDENVKILLKVEELLRVHFGVFGFTGAGKSNLLSTLVRKILTESNLPVKIVIFDLMGEYSTLLVDLLVKLNNSMIVGIGEKTFVGSLISLMKADRSLPEYKDLLKKATIDVVNSSLYPKGLVSHKDLFKKAFFRILQSRKVKIWQSGDIAVADFAKMYERTLLKGNLGKSEALVKKLYEQLLRKTNPLNATVCLALIQYIENKYLSDEKLGSIARSNLELFVNELKKKYEELKEFGFSNENVIDQKKLIEILNSPDDKALVIFQSHDPDELRNLAYQIGMAIFEDRRRSGKIDPVVSFIFDEADEFIPQDAKDSYERSSEVVMHLARRGRKFGLGIGIATQRITYLNTNIMAQPHTYFVSKLPRKSDQERITDAFGISEDMFKQTFKFKKGCWLLVSYDAIGLEAVPLPIYVQNANDAVLEFLRTLQ >NC_014721.1|WP_013433688.1|2691679_2693098_-|TIGR01897-family-CRISPR-associated-protein MKVIYQVGRLDNPAQATKEFYIKNFHGEKVDESGKAELSSIVLRDFLRKRNYEAKTVIVYPVSIVFNSKLPEYIQPEELKNELVEIFKDPSNYLKNPHEFIDRIELERNRDEKLIVHSLGEYLGISLDANYDDIVLEILFDMIERYLKGELEELYLDISSGHNIYISAILEAARHFAVFSHLVNWIDDTKSPKIYITFSDPIIGSSAKSFEIHIQQQRFTAFFSSPIKSKEAADYNFSFLREIYPDPNNNSKGSEAVKLKQQAREKRKKLKEKIEMFCLLFSAIKNNVPLYLYYQHYHSADEIKEEIFKLIDHAKARLCSDYQKSPNLNKRAYIDAVLSLGFYIGIVNVLEKYNVTMFCHDTGIDIETVKNSFSEIYLIFRLHTNIVMLGNEVSNTQEKLKQIGDISTWTGLYRIIDPDKSAGEIDPRNFFAHSGFERNATEVRTENDRVLVRYSLNVNFNDINCWLKRRLE >NC_014721.1|WP_013433689.1|2693232_2694327_-|DUF1848-domain-containing-protein MIISASRRTDIPAFFGDWFINRIKEGFAMYRNPMRPTQVFAVSLHPKDVDAIVFWTKNPKNFLDKLKYLDEYIYYFQFTLTPYAQDLEPGIPNKDEVIETFIKLSDMIGKKRVIWRYDPIIITDKMPLDYHKEKFEELSEKLSPYTQKCIISYVDFYSKAEDELNKINAKRLEQDDLYNLFSAVGSIGKKYNLSVETCAEDVPVEYLGLKKAHCVDGELINELRKEKGFQDKEYRKDNNQRKACGCVQSIDLGIFNTCKHFCVYCYANFSRNSINKNAQKYDVSSPLLCSALDLDKDEVRIREKDGSKKLEISHILEQDKNQERTISQLDFCVQQINFVEKNTNSSLEKKVLDHIKRIKQRTLL >NC_014721.1|WP_013433690.1|2694360_2695284_-|hypothetical-protein MCLLVYDVMRMAKERHSSVCLSSLNSLFQRESNCERCLPKVHFKRKNNGNVRDYDCKNMIYYYCGRYSLKHAGELFTLLQQISHRLPDNPRILSIGCGPCTDLFAFEAYFKTYKPYKKIEYHGLEKNMLWKDIHDFITKHGKKHNLSRFRITYIDVMSEVQKVEEIIKNEKPNIISFQYVLSDMAKYHPVSSVKRFAEEFVQKAFEILPKSTMIVFNDTNVLQSYAERNPDEVKGRDILEPLADKFWHSRNISVFKYYFPYRNDPSLQFGGAHSKCEVDMGNVPADLKNYFEIWYEYRSAQLVLIKN >NC_014721.1|WP_013433691.1|2697590_2698010_-|hypothetical-protein MKKRLISFLLLVFFLLIFEGSAYSGTKQIANIVSKDYSDYQKILWVVSHGYMSLISGNFMPESYVKRRHFAKVLIKLSGDIANLANPEKSTFVDVLKTDFRNYETGNTASSRILCGLIYVLSFRIFIPSILHNYKIFIF >NC_014721.1|WP_013433692.1|2698251_2699061_-|ATP-dependent-Clp-protease-proteolytic-subunit MSFWDLLILYVIATSLQPIMKQRMIESARQKLIARIEKKRGSRVILLVHRQETMSFLGFPIYKYIDINDSEEVIRAISMTDSSVPLDIILHTPGGLVLASLQIARAIKRHTGKVTVHVPHHAMSGGTLIALAADEIVMAPDAVLGPVDPQIGEFPAVSILEVVKQKPIADIDDKTLILADVAKKALRQTKDAVLELLSGNYPDDVAENIATQLVEGKWTHDYPITYEKAKELGLKVRCDIDKEIQQLMSLYPQPVVKKSSVEYLWQPRK >NC_014721.1|WP_013433693.1|2699090_2699819_-|rhomboid-family-intramembrane-serine-protease MIPLKDTIPSREKPFMTWTLILINVFVFLYQVSMPQEAAQEFVFRYGFVPERFTQLLSHGFVVAASVSIWSIITSMFLHGSWMHLISNMWSLWLFGDNVEDRVGHFRFLIFYILSGIAAALTHWFFNANSPIPTVGASGAISGVMGAYFLMFPLSRIVTLIPLGFIPIFIEIPAIFFLGIWFLSQVSSGILELFGPVFGSGIAWWAHIGGFVFGVLTINMFKKRYRRYHNFFDDEIFYYRYF >NC_014721.1|WP_041737088.1|2699985_2701077_-|hypothetical-protein MNWYRLIFMQKQPIHVGSFLWGVVNETNIFIPGWTMWGALTNQFLKTNKNKEIEDAKKIFERITNFYPAIGPKETTCSESISQQLQYLFPQYEEGNFGFKKYIFKDGILQNAEDNKKDGFISEDEFKFEFVDTIISTAVEPLSRKAKDESLHEFEFILPMSKKNLYNRKNNEIKQLYWVGLIGFENNALNKINKLIDNSKNNSDKQQSTNECNGNGKKGYQDYKSFLEEVFSTVFIGGDVRYGYGELKLCSCEEVKSDAELNHWNINIDNGTARISSDAPLRQYLKFSNKMQIEGEIKLIAEFDFTKNVPSILKAGYFVNVGSKISHNVKQQNADEGNGNEKNVEQLDLSKYQLIKGKFEKID >NC_014721.1|WP_013433695.1|2701088_2701637_-|hypothetical-protein MSDGYMLEHAINEIAFELVNEKILDENEINKLLGVLSNDGVYAMWVYALDKLDKINWDFHADKNKLKDVRIFKLLEKISKLDKFITRTLEYDNLLEQISCLSKKIKEIDEKIGALKKEKENKKEEEIKQWQIEKEKVEKERRKKLNKYFLDLADNLENLLYFKELFEKTLIYARYHARAMED >NC_014721.1|WP_013433696.1|2701633_2702833_-|hypothetical-protein MCNGTEKLDKELDKEIKVYGLAMDPIYIGTGGYTIGRVDNTIVRDPTTKLPKIPGSSLAGTWRYYTALELLSKIKDRQPDVDTIKNIDKSTVVEKIKEWINNSNVWNNLNDWYSFYGNVVAKITCAGQDNRPQEELSNAPYKDKEGKTGHCGHCIVCKGFGFSKKDFSWQGMIYFSDLHILFFPVFTRLGTMWVTTKEILRSAGLYKNKEESEEQICIALGKIEQNKEAGHINLGWIYLPYKVKFHSINLDEMKFGDFKLSSAKVIIVPEKLFSQIVNSNLEVRTSVSIDPITGAAKEGALFTSEAIPRGTIFYGNIRIFDKSVFAGLESKAGELPSADNLREALDASKHFFETLGIGGMTTRGFGRLKLELKDEETEDEEGTCTQSTADNTADGGEQG >NC_014721.1|WP_013433697.1|2702836_2706508_-|CRISPR-associated-protein-Csx11 MPGLNLKNLGVYRDEILKAEIISYFSLIEKTFADWWKDPKHGSYFKNSSTTNSINIGNEIENLLNALKSIDLCFNKNININTSSFQINSWDDFINNNWRNWRDISLKKDNKKVLQVLFGSCEGLNSGVEKGFPKDGLHIKSNEPYFSNSYGTMYNAVIEDFIENIRSYLFSIPFNKNDLKNKIDVFWTENFKRKSILNKYKISELKNNIPSNNIKELLDLIKNFNVSIDIRNEFLKNFAILYCFIPSDSRFPANDTSLFDQAFMSAALFKSKLSEILLKYGNIPINEVEKHREFKWRILGIQYDKLGLAEKGYKPQQIQWYREISREIDDEIKTLLEYEYPIGNEIYRDETGIYFLVGEDLGEDLNDDSNLARLKSELKEIEEKIMGIFKTKSIDEFYPAIFLTKSSRGLMNLSYLLEKAKENFLKANWSKKKTDICIEKSESGRAIGICQVCRQRLVFKSDKSNEDKIICNTCYREKTQGRIDKWLENIGKETIWMDELKDKNGKVALVTMKFELHDWLNGDMLNSLLVREENFNEYLDIIKELLNLIKNQLFKDELKSLDISNAENNIKKFLSLYDENVIFEPFEKIFDTLKNNGSINNVPAKYKDLAQRLLNKEDWLENFSFFDKQSKIVTINKKTNNKKSIQDYLNNDGAKSHLYKVFAINYLILQIYNTLLERSIGDRWEEFIKQKLGNKIDFKYKKIYWQNLTDDDIDFLSTLILQFLLRKNPSPARLRRIWESTREFFEDIKINLVYNDENLIKIPKWRRGRILLSFKCAENIQEGIYESKGVQFYKPKNINTLYLISSIEEYLKAFKPEKLKEIEKKTNEIKQNTNKSDDEKINEILKIDIDENDVELINITIKSVESNNEYDLDITGIELVNYQPYMSIIDPTPISWQFIIPAEYVPNLIENVMEKYYRYFKFVYGKLPLHIGVVVQDYKQPLYVGIKALRRIRRDVADCEKLEINIEKDKVERKIRKYQIKVEEDNDSIAYYSLYWGEHSNKDYEFYIKPDDKYKRWIASIRKNKKFRKPKKIEKSKEFKKINKKINKKITIIPNTFDFEFLDTNTRRNEIYYDKSNKWKRKVPLKSLRPYDLETWEKFKKFKELFSKENRTGVARSTRLQKMISVIYNKLEDLRDIESAAGKKTIADINNEGIKAFLSASFINILKLKEDKELAEGIKKLFDIDKSGENDNLYRLLKEKMTLDNLQFFLDMYEFWHKAIGEV |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_014721_7 | 2695882-2697289 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_014721_7
|
21 spacers
spacers of NC_014721_7
>7.1|2695912|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAAGCTTCTCTCTGTTGTCATCTGCCTCCATGAAGG >7.2|2695979|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATTTTGAAAAGCCCTACTTATATAGCGCATTACG >7.3|2696044|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTTGCATATTGACCAGCAGCAGAAATACCTAAAG >7.4|2696109|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTTTCTCCATCATTGTTATCATCCTCGATGTCGT >7.5|2696174|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCCTACTATACTCTCGCCACCGCAAAAACTGCAAAG >7.6|2696240|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTTCAAACACTGCTGCTTCGATAAGTTGTTCAGCT >7.7|2696306|34|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGACGGTGCTGAGAGGTTCAGTTCCTGGTTTCAT >7.8|2696370|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTACCTGCATAGCGTCTATTTCCCACCATTGCAC >7.9|2696435|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTACCTATTGGCTATCAATTTCAACCGATAGCTTTG >7.10|2696501|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCTTCATCTATCACTTCTACAGCTGGTGGATTGT >7.11|2696566|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGCTAACCCTTACCCTTACATTTCCCACTGTTAG >7.12|2696631|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATTGCTGTAGTAAACACCGGGAAAATACAACCT >7.13|2696696|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGATTTTGAAAAGCATTGAAGAGTCGCTTAGAGCTC >7.14|2696762|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGGTGTGTACTTTACAAATCTGTCATCTTTCAAAAG >7.15|2696828|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAAAACATACACCGCATTTACTACACTGTTTACTA >7.16|2696894|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGAAAACTAAAAAATGGTTTGTCATTTGGTCGAGTA >7.17|2696960|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTTTTGTGAACTCATGTAAAGAATCATAACTCTTA >7.18|2697026|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACATTCGGATTTCTAAGGAGAGATTGGAGAATGTT >7.19|2697091|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGCTATTATCCGTCAGTCCGCTTTCAAATTGTGG >7.20|2697157|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAAGTTTACAAACATAGACTATCTTAATAGTTACAA >7.21|2697224|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,CRT ACAGAACAATGATGGCAAACGCTGAAGAAATAGATG |
csx1,cas10,csm2gr11,csm3gr7,csm4gr5,csm5gr7,cas6,cmr3gr5,cmr5gr11,cmr4gr7,cmr6gr7,cmr1gr7 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014721_7
The CRISPR arrays of NC_014721_7 >merge|NC_014721|7|2695882-2697289|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTGTAGCCTCCCCGTTGGGGATTGAAACTAAAGCTTCTCTCTGTTGTCATCTGCCTCCATGAAGGGTTTGTAGCCTCCCCGTTGGGGATTGAAACCATTTTGAAAAGCCCTACTTATATAGCGCATTACGGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTCTTGCATATTGACCAGCAGCAGAAATACCTAAAGGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACACTTTCTCCATCATTGTTATCATCCTCGATGTCGTGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACCCCTACTATACTCTCGCCACCGCAAAAACTGCAAAGGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACAGTTCAAACACTGCTGCTTCGATAAGTTGTTCAGCTGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACCGACGGTGCTGAGAGGTTCAGTTCCTGGTTTCATGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACCTTACCTGCATAGCGTCTATTTCCCACCATTGCACGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTTACCTATTGGCTATCAATTTCAACCGATAGCTTTGGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTTCTTCATCTATCACTTCTACAGCTGGTGGATTGTGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACCAGCTAACCCTTACCCTTACATTTCCCACTGTTAGGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACAAATTGCTGTAGTAAACACCGGGAAAATACAACCTGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACAGATTTTGAAAAGCATTGAAGAGTCGCTTAGAGCTCGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACAGGTGTGTACTTTACAAATCTGTCATCTTTCAAAAGGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTCAAAACATACACCGCATTTACTACACTGTTTACTAGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACAGAAAACTAAAAAATGGTTTGTCATTTGGTCGAGTAGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTCTTTTGTGAACTCATGTAAAGAATCATAACTCTTAGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACACATTCGGATTTCTAAGGAGAGATTGGAGAATGTTGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACAAAGCTATTATCCGTCAGTCCGCTTTCAAATTGTGGGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTTAAGTTTACAAACATAGACTATCTTAATAGTTACAAGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACACAGAACAATGATGGCAAACGCTGAAGAAATAGATGGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAGGT >NC_014721|7|9|2695882-2697223|PILER-CR GTTTGTAGCCTCCCCGTTGGGGATTGAAAC TAAAGCTTCTCTCTGTTGTCATCTGCCTCCATGAAGG GTTTGTAGCCTCCCCGTTGGGGATTGAAAC CATTTTGAAAAGCCCTACTTATATAGCGCATTACG GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TCTTGCATATTGACCAGCAGCAGAAATACCTAAAG GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC ACTTTCTCCATCATTGTTATCATCCTCGATGTCGT GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC CCCTACTATACTCTCGCCACCGCAAAAACTGCAAAG GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC AGTTCAAACACTGCTGCTTCGATAAGTTGTTCAGCT GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC CGACGGTGCTGAGAGGTTCAGTTCCTGGTTTCAT GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC CTTACCTGCATAGCGTCTATTTCCCACCATTGCAC GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TTACCTATTGGCTATCAATTTCAACCGATAGCTTTG GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC TTCTTCATCTATCACTTCTACAGCTGGTGGATTGT GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC CAGCTAACCCTTACCCTTACATTTCCCACTGTTAG GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC AAATTGCTGTAGTAAACACCGGGAAAATACAACCT GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC AGATTTTGAAAAGCATTGAAGAGTCGCTTAGAGCTC GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC AGGTGTGTACTTTACAAATCTGTCATCTTTCAAAAG 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>NC_014721.1|WP_013433690.1|2694360_2695284_-|hypothetical-protein MCLLVYDVMRMAKERHSSVCLSSLNSLFQRESNCERCLPKVHFKRKNNGNVRDYDCKNMIYYYCGRYSLKHAGELFTLLQQISHRLPDNPRILSIGCGPCTDLFAFEAYFKTYKPYKKIEYHGLEKNMLWKDIHDFITKHGKKHNLSRFRITYIDVMSEVQKVEEIIKNEKPNIISFQYVLSDMAKYHPVSSVKRFAEEFVQKAFEILPKSTMIVFNDTNVLQSYAERNPDEVKGRDILEPLADKFWHSRNISVFKYYFPYRNDPSLQFGGAHSKCEVDMGNVPADLKNYFEIWYEYRSAQLVLIKN >NC_014721.1|WP_013433689.1|2693232_2694327_-|DUF1848-domain-containing-protein MIISASRRTDIPAFFGDWFINRIKEGFAMYRNPMRPTQVFAVSLHPKDVDAIVFWTKNPKNFLDKLKYLDEYIYYFQFTLTPYAQDLEPGIPNKDEVIETFIKLSDMIGKKRVIWRYDPIIITDKMPLDYHKEKFEELSEKLSPYTQKCIISYVDFYSKAEDELNKINAKRLEQDDLYNLFSAVGSIGKKYNLSVETCAEDVPVEYLGLKKAHCVDGELINELRKEKGFQDKEYRKDNNQRKACGCVQSIDLGIFNTCKHFCVYCYANFSRNSINKNAQKYDVSSPLLCSALDLDKDEVRIREKDGSKKLEISHILEQDKNQERTISQLDFCVQQINFVEKNTNSSLEKKVLDHIKRIKQRTLL >NC_014721.1|WP_013433688.1|2691679_2693098_-|TIGR01897-family-CRISPR-associated-protein 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>NC_014721.1|WP_013433682.1|2681824_2683009_-|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm5 MTHEPFESRTYEIEVLTPTIIGGQDKIQSFEFVKDGDYLYFINFDRLLEENLFKESFIDELSRGLSTGDRDFNIKDVLARYNIDFKNSSKYKLKLEGVKRLSKEVVPFVKSAGRFYIPGSSLKGAIRSFVTKALNRNFIQLYENDLSSAYQKTLNSADRRNSVDPKHVSKDAEEKIFATPYESPFKHLKISDSDFVSSENAGVYEIKVMNICGGQVKWFAGRSNEDDPDRAVSIIAEGIKPGAKLIGSIKVEKDFVEGNQVVRGIKEKIGVNATATSPTEFLADVLKAVSKDYIQREINFYTKYKQAQIVSEYQKLLNVLNSLDKNQFLIQIGFSTGYLSKTVGIFFNKNHFEKLAKVDRQSKIYPELFPKTRRLVFKNGQVWTVPGWIKVTIK >NC_014721.1|WP_013433681.1|2681204_2681828_-|hypothetical-protein MMGCDEKVAKYFTFHFWAREDGVFLPSSYYSKVYEVLKSLLATEQFTISPIKTKNKKEVEDGVWVFEDFRIYLATPFLEFVTQNILKIYESLNGLFEGIYLKKISCRSQQPKASGNLISGVFAQKDGVCLEYDRQPEIFSEVLRRQLLNIYCQRFGVYPEDQRFFFVIKDGLKKQHLIKSRIEYFGRYEIFASGDLLDMFCQMFCVK >NC_014721.1|WP_013433691.1|2697590_2698010_-|hypothetical-protein MKKRLISFLLLVFFLLIFEGSAYSGTKQIANIVSKDYSDYQKILWVVSHGYMSLISGNFMPESYVKRRHFAKVLIKLSGDIANLANPEKSTFVDVLKTDFRNYETGNTASSRILCGLIYVLSFRIFIPSILHNYKIFIF >NC_014721.1|WP_013433692.1|2698251_2699061_-|ATP-dependent-Clp-protease-proteolytic-subunit MSFWDLLILYVIATSLQPIMKQRMIESARQKLIARIEKKRGSRVILLVHRQETMSFLGFPIYKYIDINDSEEVIRAISMTDSSVPLDIILHTPGGLVLASLQIARAIKRHTGKVTVHVPHHAMSGGTLIALAADEIVMAPDAVLGPVDPQIGEFPAVSILEVVKQKPIADIDDKTLILADVAKKALRQTKDAVLELLSGNYPDDVAENIATQLVEGKWTHDYPITYEKAKELGLKVRCDIDKEIQQLMSLYPQPVVKKSSVEYLWQPRK >NC_014721.1|WP_013433693.1|2699090_2699819_-|rhomboid-family-intramembrane-serine-protease MIPLKDTIPSREKPFMTWTLILINVFVFLYQVSMPQEAAQEFVFRYGFVPERFTQLLSHGFVVAASVSIWSIITSMFLHGSWMHLISNMWSLWLFGDNVEDRVGHFRFLIFYILSGIAAALTHWFFNANSPIPTVGASGAISGVMGAYFLMFPLSRIVTLIPLGFIPIFIEIPAIFFLGIWFLSQVSSGILELFGPVFGSGIAWWAHIGGFVFGVLTINMFKKRYRRYHNFFDDEIFYYRYF >NC_014721.1|WP_041737088.1|2699985_2701077_-|hypothetical-protein 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>NC_014721.1|WP_148222732.1|2706495_2707656_-|hypothetical-protein MKVIEVFKYDAFAKAIENFEDFKSSDEKVNNYLELKFKDLTKRKDELNNFKENKREYFIGAEKFQNVQKISGIFFDEVENKPDRNSPNICLKNLPPYSFIILASFTLKQPYFSKDDDEFYIISNPVLKEKAFKVPMIRGSSWKGALAAAFKDLLNEETNPDKRAKMVDSYLRIFGAGSESIKAIEDYLKEKSSNIENFKEKLLEFIFFELGLVVDKNLLDEIKKQDSYEKLKKILEEQISKKCARNSKDLPIEFQTHKGRTVFYPTYFDRLSLEVINPHDRRKRAGTQPIYYEVVPEGTKGILQIIYIPFDGILKEDKVLKSEAEQDLENLLSAVDKLSEKGIGAKTKLGWGTFDFCEGEEQYYFTNKDLDISEKLKSKGWRKCQG >NC_014721.1|WP_013433699.1|2707633_2708698_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr1 MGRKEVTVKLETITPLWTGDAWLQNKKIRPSSLIGSLRFWFSVYWKVIINKNTEKLNDKNVIADDLREFKDLRGKKATFRQILFERIAKREDYKCFDEVLDDVFEELGLPVPSRLFGCTGWKSRVDIRRISYKEEEIESKNLDFKFPFSKDSKFNTEFWIKKSLFNNENNNENKVVLYKNIEFTLKAPNYWWDRYLSDFFSFYKDKIILVGGKLSFGFGMVKMMIEGSQEIQEINEQEINESNKNDANWNDIIRMDKIENIKYEKQCNVLGYNFRYFLRREEEKKYREKNFGKQGVASSIYVSNLIRDSSNHIYIYLINFNNPFSGNKNLSEKIFNNYKELLNEKLKSEGDRSV >NC_014721.1|WP_013433700.1|2713437_2713992_+|biotin-transporter-BioY 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NC_014721_8 | 2708850-2712824 | TypeIII |
I-A
Consensus repeat of NC_014721_8
|
60 spacers
spacers of NC_014721_8
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cmr1gr7,cmr6gr7,cas10,cmr4gr7,cmr5gr11,cmr3gr5,csx20 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014721_8
The CRISPR arrays of NC_014721_8 >merge|NC_014721|8|2708850-2712824|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR 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>NC_014721.1|WP_013433699.1|2707633_2708698_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr1 MGRKEVTVKLETITPLWTGDAWLQNKKIRPSSLIGSLRFWFSVYWKVIINKNTEKLNDKNVIADDLREFKDLRGKKATFRQILFERIAKREDYKCFDEVLDDVFEELGLPVPSRLFGCTGWKSRVDIRRISYKEEEIESKNLDFKFPFSKDSKFNTEFWIKKSLFNNENNNENKVVLYKNIEFTLKAPNYWWDRYLSDFFSFYKDKIILVGGKLSFGFGMVKMMIEGSQEIQEINEQEINESNKNDANWNDIIRMDKIENIKYEKQCNVLGYNFRYFLRREEEKKYREKNFGKQGVASSIYVSNLIRDSSNHIYIYLINFNNPFSGNKNLSEKIFNNYKELLNEKLKSEGDRSV >NC_014721.1|WP_148222732.1|2706495_2707656_-|hypothetical-protein MKVIEVFKYDAFAKAIENFEDFKSSDEKVNNYLELKFKDLTKRKDELNNFKENKREYFIGAEKFQNVQKISGIFFDEVENKPDRNSPNICLKNLPPYSFIILASFTLKQPYFSKDDDEFYIISNPVLKEKAFKVPMIRGSSWKGALAAAFKDLLNEETNPDKRAKMVDSYLRIFGAGSESIKAIEDYLKEKSSNIENFKEKLLEFIFFELGLVVDKNLLDEIKKQDSYEKLKKILEEQISKKCARNSKDLPIEFQTHKGRTVFYPTYFDRLSLEVINPHDRRKRAGTQPIYYEVVPEGTKGILQIIYIPFDGILKEDKVLKSEAEQDLENLLSAVDKLSEKGIGAKTKLGWGTFDFCEGEEQYYFTNKDLDISEKLKSKGWRKCQG >NC_014721.1|WP_013433697.1|2702836_2706508_-|CRISPR-associated-protein-Csx11 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_014721_9 | 2720576-2722684 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_014721_9
|
31 spacers
spacers of NC_014721_9
>9.1|2720606|26|NC_014721|CRT CTATAATGCATTTGATATCAATTATT >9.2|2720662|36|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGTACCACTTTGTAAAAGTCGTCTACAGTCTTGCAA >9.3|2720728|36|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ACTCAGAATAATCCCGTCGAAATTATGCGGGATTAC >9.4|2720794|38|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GCTTATGTTATTCCCAATACCGAAATAATTTACACTTA >9.5|2720862|39|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTACCTTTTGCTTCAAGATTTCTTTGTCTATGTCTTCT >9.6|2720931|37|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTTTTATAACCTCCTTTTTGTTTTACAATTATAATT >9.7|2720998|36|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGTGTTTCATCACTCATCTGTTGAACATCTTTTAGC >9.8|2721064|38|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATCCCCTTTCACCGTTGAATCCTTAGCCCGCCACTCCC >9.9|2721132|39|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCTGCACTCCTTTCTTGATATCTTCAAACGGGTAAAATT >9.10|2721201|39|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTCATCGAGGAGTATGACGCTGTATGCAAAAACTGCTA >9.11|2721270|38|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GTCCTCAGCGGTGGAACAAGTCCGCAGTACACAACGAG >9.12|2721338|35|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATCTGTAGAGGCTGTAGACACATTGGAGTACTTGA >9.13|2721403|39|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATCATTCTATCTTGCTGAGCTACAAGGATTATATCATAA >9.14|2721472|38|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATCAATTCGTTAAATGTACTATTCAATCTTTCATACTG >9.15|2721540|37|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GGTAGTACAATAAACCTATACGACTCTGTCAATGCAA >9.16|2721607|38|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGTATCTTTTTTAGCAGTTACCTGTTGCCCAGTCTTTA >9.17|2721675|38|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTGCATCATCGTTTTATACTGTTGTGGAGACAGAAAA >9.18|2721743|38|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGCTTTATATCAACTGGCTGGCACACCTGTTGGTCTTG >9.19|2721811|37|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATCTCTACAAGGTAGTATTCGATTACTGCCCCCTCAG >9.20|2721878|40|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTTCCCATTTCTTCTTTGCAGCTTCAAGCCTTAAGGCTA >9.21|2721948|37|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCTTGTAGTTTAGCTAATTCTTCTTCATTTGTGCTGG >9.22|2722015|37|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTTTGTAAAAGATATTATCATGATGCTTTTTATAAAA >9.23|2722082|36|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGTTTCATAGCACCTACAATTAATATGTTCCCTGTT >9.24|2722148|37|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTTCTGCTCCTAAGTCGTCTAAAACAAGCAATGATG >9.25|2722215|38|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTTCTACACCTCTCTTTTTGCAATATTCAATAAAACC >9.26|2722283|37|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGGTCTTTGTCGAACAGAAGCCATGTAAACGCGTCAA >9.27|2722350|37|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTGTTGATTCTGGACCAAAGCTTATCTCTCTTACAA >9.28|2722417|36|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTTAAAAGCTTCTCAAGTTCTTTTTGCAGTTCGCT >9.29|2722483|37|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CCCTTATTTTAATTCTGTATATCATTTTTATTTTTCC >9.30|2722550|37|NC_014721|CRT,CRISPRCasFinder CAATTTGTTGAATGATAACAGCATTGCTACCTATTAC >9.31|2722617|38|NC_014721|CRT,CRISPRCasFinder GTTGGAGTGCAGAAGAGGCAATTGCTTTTTTAAAGTGG |
csx20,cas4,cas1,cas2,cas8b1,cas7,cas5,cas3,csx1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014721_9
The CRISPR arrays of NC_014721_9 >merge|NC_014721|9|2720576-2722684|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GTTTGTAGCCTGCCCTTTGTTTAATTCTTTCTATAATGCATTTGATATCAATTATTGTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAACTGTACCACTTTGTAAAAGTCGTCTACAGTCTTGCAAGTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAACACTCAGAATAATCCCGTCGAAATTATGCGGGATTACGTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAACGCTTATGTTATTCCCAATACCGAAATAATTTACACTTAGTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAACTTTACCTTTTGCTTCAAGATTTCTTTGTCTATGTCTTCTGTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAACTTTTTTATAACCTCCTTTTTGTTTTACAATTATAATTGTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAACAGTGTTTCATCACTCATCTGTTGAACATCTTTTAGCGTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAACATCCCCTTTCACCGTTGAATCCTTAGCCCGCCACTCCCGTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAACTCTGCACTCCTTTCTTGATATCTTCAAACGGGTAAAATTGTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAACTTTCATCGAGGAGTATGACGCTGTATGCAAAAACTGCTAGTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAACGTCCTCAGCGGTGGAACAAGTCCGCAGTACACAACGAGGTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAACATCTGTAGAGGCTGTAGACACATTGGAGTACTTGAGTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAACATCATTCTATCTTGCTGAGCTACAAGGATTATATCATAAGTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAACATCAATTCGTTAAATGTACTATTCAATCTTTCATACTGGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACGGTAGTACAATAAACCTATACGACTCTGTCAATGCAAGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTGTATCTTTTTTAGCAGTTACCTGTTGCCCAGTCTTTAGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTTTGCATCATCGTTTTATACTGTTGTGGAGACAGAAAAGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTGCTTTATATCAACTGGCTGGCACACCTGTTGGTCTTGGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAATATCTCTACAAGGTAGTATTCGATTACTGCCCCCTCAGGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTTTTCCCATTTCTTCTTTGCAGCTTCAAGCCTTAAGGCTAGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTCTTGTAGTTTAGCTAATTCTTCTTCATTTGTGCTGGGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACCTTTGTAAAAGATATTATCATGATGCTTTTTATAAAAGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTGTTTCATAGCACCTACAATTAATATGTTCCCTGTTGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTTTTCTGCTCCTAAGTCGTCTAAAACAAGCAATGATGGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACATTTCTACACCTCTCTTTTTGCAATATTCAATAAAACCGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTGGTCTTTGTCGAACAGAAGCCATGTAAACGCGTCAAGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACATTGTTGATTCTGGACCAAAGCTTATCTCTCTTACAAGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACTTTTAAAAGCTTCTCAAGTTCTTTTTGCAGTTCGCTGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACCCCTTATTTTAATTCTGTATATCATTTTTATTTTTCCGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACCAATTTGTTGAATGATAACAGCATTGCTACCTATTACGTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAACGTTGGAGTGCAGAAGAGGCAATTGCTTTTTTAAAGTGGGTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAGAA >NC_014721|9|8|2720576-2722684|CRT GTTTGTAGCCTGCCCTTTGTTTAATTCTTT CTATAATGCATTTGATATCAATTATT GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC TGTACCACTTTGTAAAAGTCGTCTACAGTCTTGCAA GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC ACTCAGAATAATCCCGTCGAAATTATGCGGGATTAC GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC GCTTATGTTATTCCCAATACCGAAATAATTTACACTTA GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC TTTACCTTTTGCTTCAAGATTTCTTTGTCTATGTCTTCT GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC TTTTTTATAACCTCCTTTTTGTTTTACAATTATAATT GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC AGTGTTTCATCACTCATCTGTTGAACATCTTTTAGC GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC ATCCCCTTTCACCGTTGAATCCTTAGCCCGCCACTCCC GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC TCTGCACTCCTTTCTTGATATCTTCAAACGGGTAAAATT GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC TTTCATCGAGGAGTATGACGCTGTATGCAAAAACTGCTA GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC GTCCTCAGCGGTGGAACAAGTCCGCAGTACACAACGAG GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC ATCTGTAGAGGCTGTAGACACATTGGAGTACTTGA GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC ATCATTCTATCTTGCTGAGCTACAAGGATTATATCATAA GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC ATCAATTCGTTAAATGTACTATTCAATCTTTCATACTG 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GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC CCCTTATTTTAATTCTGTATATCATTTTTATTTTTCC GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC CAATTTGTTGAATGATAACAGCATTGCTACCTATTAC GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAAAC GTTGGAGTGCAGAAGAGGCAATTGCTTTTTTAAAGTGG GTTTGTAGCCTTCCCGTTGGGGATTGAGAA >NC_014721|9|11|2720632-2722549|PILER-CR GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC TGTACCACTTTGTAAAAGTCGTCTACAGTCTTGCAA GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC ACTCAGAATAATCCCGTCGAAATTATGCGGGATTAC GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC GCTTATGTTATTCCCAATACCGAAATAATTTACACTTA GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC TTTACCTTTTGCTTCAAGATTTCTTTGTCTATGTCTTCT GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC TTTTTTATAACCTCCTTTTTGTTTTACAATTATAATT GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC AGTGTTTCATCACTCATCTGTTGAACATCTTTTAGC GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC ATCCCCTTTCACCGTTGAATCCTTAGCCCGCCACTCCC GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC TCTGCACTCCTTTCTTGATATCTTCAAACGGGTAAAATT GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC TTTCATCGAGGAGTATGACGCTGTATGCAAAAACTGCTA GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAC GTCCTCAGCGGTGGAACAAGTCCGCAGTACACAACGAG 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>NC_014721.1|WP_041736916.1|2719682_2720081_-|hypothetical-protein MNKLFLIFNHQLSEEQEKEAREVLKVEEIVSLPPQLQDFWSSIPPDVELTEEMFEGITAFLLQNKGEKENFCLVQGDFGATVYIVSWCFKNGFVPIYATTKRVAKEVVRPDGSVELHKVFRHERFRKYILCR >NC_014721.1|WP_013433707.1|2719282_2719636_+|stage-V-sporulation-protein-AE MEYLKAFLVGGLICVVGQILIDKTKLTSARVLVLFVTLGAVLQGLGIYQKLVEFAGAGATVPLPGFGYSLAKGAIEEVNRIGLVGAFTGGVSKTAGGISAAVFFGYVISLIFNPRSK >NC_014721.1|WP_013433706.1|2718224_2719235_+|stage-V-sporulation-protein-AD MKLGRSTYRFESNVAISDCFTVVGKKEGQGPLSIYFDMVIEDEYAGQKSWELAEGKLLNIAITKLVQRTGENPDNIDLILSGDLLNQLSSSHFAARDLDIPFVGIYGACSTFALSVGLASIFVDSSFAKNVIAATSSHFCSAEKQFRYPLELGTQRPPTSQWTVTGAAAFLIRQEDSLQSPKVTHFTVGRILDFGIKDPNNMGAAMAPAAFDTIMRHFSDTKRSFEYYDMIITGDLGYVGRKLLEELFKKEGISFCSELFDCGILMFDPKTQNTGAGASGCAASACVFGAYLYKLLRERTFERILIVPTGALMSASTVQLGESIPVIAHALAIEMV >NC_014721.1|WP_013433705.1|2717747_2718206_+|stage-V-sporulation-protein-AC 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MQQNIQGMVSDIIYRNLENSYTVFEIICDDEVFTAVGIVPDIAIGEKVSVYGEFYVHPVYGQQLKVSYLEKLLPQTKDEIYLYLSSGVIKGIGQKTAKKIVDTFGDDTARVLQEEPEKLLQIRGMTPEKVERIRNMFAFQKFLKDIMSIFSQYGLSQNHAMRLFKLYGFSALSLLQENPYFLLDVFPELDFKKVDRLALDMGVMPDDRRRISAKILNLLTLAANNEGHTCLPENRLKQLCSKTLDLPVEKIEEALEALEVERRVVKDEVDSQDMVFLYGYYECERYIADKILSMLKEYDDIADIDEKISMFEERNGIAFSPNQKKAIKMALTQGVSIITGGPGTGKTTIIKCIIQIFEGEGKKVFLCAPTGRAAKRMQAACERESKTIHRLLEMTVLDTHVIFQKGPSNPLKCDVIIVDEMSMVDSFLMNYLLAATKPSTRIVLVGDKDQLPSVGAGNVLKDLIKSEIVPCTTLTEVYRQSENSFIVLNAHRINRGEYPHLQKESDFYFIQKNSQEEILKTVVELVTKKLPNYLSCDPMTDIQVLCPSKKGIVGMYNLNRVLQQHLNPPHPSKKEYAYKENLFRVGDKVMQIKNNYSLEYEIVQGEEKGRGSTGIFNGDIGVVKDIDRAQGALEILFDDEKLVYYDFSLLDDLELAYAMTVHKSQGSEFRCIVMPVVETYPILMTRNLLYTAVTRAKELVVLVGKKSALEYMIANQKEAMRYSGLCDFLLRGQSNTQLQAL >NC_014721.1|WP_013433700.1|2713437_2713992_+|biotin-transporter-BioY MENAKGTNTTKMLVLSALFTAIVAVCAQVSIPIGPVPFTLQVLAIFLASLVLPPKYAFLSLLVYDLLGAVGVPVFAGFTGGLSKFVGPTGGYLMAFPIAAFVTSYINTKKPIKNEAANASVALILGLAIIYIFGFLYLSWAAHMTLKKAFAAGVAPFIIPDVIKLAIAYLIARAIKSRKVLNIA >NC_014721.1|WP_013433710.1|2722834_2723215_+|hypothetical-protein MSYLPKSPKEVYEQILLEYQAYSEFKKRIEGKCYLPHDPENVLYLYCNSTFNEEYEEMLKSKQIENYVEPQTEEEWEYYAEEDEYCKEEFENDFEFFDADYEMSSEMDDIVDDPDFWDSFDYEWGD >NC_014721.1|WP_013433711.1|2723362_2723866_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MERFLDIKGHIVQAYVVCKRQAWLLSRNISPVQDNPFLEIGKLISQQFYKHDKKEVYFDGVVLDLIRKEDEVLVVGEIKKSSKKVAAAILQLKFYLYKLLKHNIKARGKLLIPEEKKTYDVELTFEDIETIESLLSEITEVLSSFLPPLPQKIKACAKCSYKEFCWA >NC_014721.1|WP_013433712.1|2723862_2724858_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKRPIYIFSDGVLKRKNNTLYFESEGVQKFIPVENTSEIYIFGEVELNKRFLEFLTQSEIILHFFNRYGYYVGSFYPREYLNSGYMILKQAEHYLDTQKRLSLARTFVEGSYKNMRQVLKYYQSRGIDELERYIQQMENLFGSISNINDINTLMAIEGNIRQTYYSAFDLIIDKDDFKFEKRSKRPPKNALNALISFGNSMMYTIVLSEIYRTHLDPRIGYLHTTNFRRFTLNLDVAEIFKPIIVDRLIFSIISKNMLKPEHFEQNLEGIVITDSAKKLFIDELEQRLSTTISVKNIGNYVSYRQLIRIELYKIEKHLMGEKEYQPYVSQW >NC_014721.1|WP_013433713.1|2724873_2725137_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYTILVYDVNEKRVAKALKVCRKYLNWVQNSVFEGEISEAKLKKLKFELSQKLNLHEDSVIIYNFQSLLYSQREILGVEKNNLDRFI >NC_014721.1|WP_013433714.1|2725213_2727136_+|TIGR02556-family-CRISPR-associated-protein MIEAVAEIGKFLIEKKSKASGKSCADDQSNNLSSFLTPVESEKVILICLKQKQTEFEYCGLDLQNPLVSRAQLYLFSQGAKGGGTNYSPVCILTKPKTPKTMTEEQVKQATKEQVEKVFKQKVENWFLNKALPLAKKFSKQGDISKEDAYFIQCISQAVSENREKIIEDISELLFEVEFEKQKSSALLTFSIDGKYIGEYEIFKSFLLELIKEKAERSSSQDKTCSICKQKRENVSGTVNVFKFYTIDKPGFIRGGFSSENAWKNFPVCSSCQIHLSEGRKYLEKELQFKFYNFKYLLIPQLIFSTSSAYSEVLDILQNTKKEISLGEKALERITDDENEILDVISTFNDSISVTFLFMVPQMGAERIVLMIEDVLPSHLKNIFDAKRHTERKYRTVFNNPDINFTFQQIKHFFSKSNRLKKKSDLDSYFLEITESIFKKKPIDFQFLAAHFCRRLQDSIANKDFFDFYTSCSYAIEVLEFLNKLEILKLKGDEFGMSYETPFDEILNEFPVASANPAVKGIILVGALCDILMRIQSTALSKTPGKMPPFAKNLKGLRLKQSDIVSLLPKIENKLMEYSSFGKANRLIASSASELLLKSPVDWKLSADEVSFYFACGMNLGQKIREHAKKLTGDTDEQEA >NC_014721.1|WP_013433715.1|2727200_2728181_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csh2 MENAKEIIKNRSEVLFLYDVTDANPNGDPLDENKPRIDPETDTCIVTDVRLKRTCRDYWAEYKNLPVFILREISEDGKLMTKSDKFSKYNLSKEKLKDYIDIRLFGGTTTLKSKDEKKKSKSDEDLSEETGAITFTGPVQFKFGRSLHKVEYMLVKGTTVMPSGEGKDQGTFTECYILPYALIAFYGVVNENAALCQELPVTEEDIQLLLEALWCGTKNLISRSKFGQMPRLLVRVEYNQSGFYIGELDKLVKLISQKSDTAIRSPEDFQLDITRLVEKLTKHQDKIQKVQVSVDHSISFVCEGKFVHLKDALSFLGDRVKLLQFE >NC_014721.1|WP_013433716.1|2728203_2728935_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKVAVFDIKADFGFFGKFYSTSSPITYPFPPFPTIQGMVGAILGLDKKEYLDILEYGKFRAGIRILNPVKKIRMGINHIDTKEGRWQPIKTKNRQPRTQMRFELLKDPRFRIYATLATESLFSRLVEFLQQHRSYFTLSMGLSEFLADFEFAGVFEAVEKGMPDDYVSLCTPIPLSYLDSKAEIPLRIEAGKSYFKERMPLYMLSTREVVKYEDVIFEPTGKELLARPSSYVEVQNGENILLF >NC_014721.1|WP_013433717.1|2728909_2731378_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MEKTSFCFDSKNLSGLFSHPGKDGGIEGAKPLEVHLANTSILANSFASEKNIALCSTKFLSQIAKITALLHDIGKATSFFQKYLFDKKKTKSRHTRHSLISAICVWGTLNRLIEEKKIQEDKTFEGFTAILAFFATLKHHGDLEATSDMLLLSEDDIELCYEQIENIDKEKFNTLILNISCLCPEIGFLTIDSLREFVDHAKVSIKLFKRAFRKLFDTEMKFFFMLNLLYSILLDADKTEAIFGTLVDIPELNLSYTDVDSFRRRIFKPENFENSIKALRDSAFEEAINCEIDENRRIYTLCLPTGLGKTIISFAFALKLRELAQKRFGSKFRIIYSLPFLSIIEQNYDVISKILSFCGLDITSDILLKHHHLSDIVYKTKDGLQNNQEEIFDTDIAKLLIEGWNSNIIVTTFVQFLESIMTNKNSNMRKFHRIANSIIILDEVQAINSEYWFLCKNLFEKMCSSLNCFIILSTATMPFIVDKKTAVEIVKPEKYFDKLCRTVLHFDNNFSKIGLEEFVAKFEFEKEKTYLFVMNTVSSAKKLYELINQRFPDMQDEITILTTHIIPKERLRRIEQIKNKKYKIVVSTQLVEAGVDVDFDHVVRDIAPLDSIIQAAGRANREGKKGKSKVTVIELVSDRGRLFATEVYDSLLIDATKKILSQFQKVDESKFAELIFEYYKELARRGVIETSSDDKGTSQKFLEAIYRLLYTSSDSETDAIGSFKLIEDEPYKVDVFVEADEEAKIIWQRFEEICEIKDFFERKKKFLEIRKSFYDYIISVPKTTNLPVNFENLIFRIPHSQLSDFYDPITGFKTKGESYLSF >NC_014721.1|WP_148222733.1|2732622_2733876_-|TIGR01897-family-CRISPR-associated-protein MYFIGSLVSESSKIDEKCKKEIENIWDNENVYLENPYNFFNNGFPYAAEKDELKVIHSIGSYIYGKKGEEPKEIQFDSAYSDIVLEIFLDMLERYLKKEEPVSEVYVDISSGHNIYVSALLEALRHFATFMNLSCWLVKSKRPKLFAAICAPILPGNKNVYNIYIEDQQFIVFFESPIKLSDIENIKEKITAEFTDYLKEVLERFLLVFSAIKNNIPLYLFDRYTEIDSLNSVYNLLLEIIKYLNARISKNYKSSPKLDRRMWVKIINSLGFYIGIIENLRAYKIFPVVSEKGVMVKDIEKKIKNIYEKFGLTNIFDILEVELNKLGRPKESKGGGNRIEDLIENSALENIFQQKKRSILKTYQDDKERLQRNFFAHCGLEENFIEVEKKNNDIYVKYSDGIPEIRDIIKEFLLNRV >NC_014721.1|WP_013433719.1|2733988_2734552_-|hypothetical-protein MDTSSQLAKIVENFEGLYKEISNMVASLGRFNEVLDKFNETINKVKLYSETADVLKQLQRHQEQLLELENKLNTEYTKLYAKNLKILRDLEQWIDKEVEQKIDDLVSSMEELHEHMREETEKMQKKLSFLIKMNEEDFESLSNIIEDLLNQRKSIIVAEKSFFSLLKKKIEGRPTIKPRNIKRKRLE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_014721_10 | 2731763-2732193 | TypeI |
NA
Consensus repeat of NC_014721_10
|
6 spacers
spacers of NC_014721_10
>10.1|2731792|38|NC_014721|PILER-CR,CRT TTTTCAACAGCTGTATCTGATGTGGTATCAGTCTCAGG >10.2|2731859|40|NC_014721|PILER-CR,CRT TTCGCGAGGATATAACCCTGAAATATCCAATTCACACCAG >10.3|2731928|37|NC_014721|PILER-CR,CRT TATTGTAAGACACTGATTTTTATTTAATATTTGCATA >10.4|2731994|36|NC_014721|PILER-CR,CRT TTAACATCAAGAGAGGTGTAAGCAAACACATCTGCA >10.5|2732059|37|NC_014721|PILER-CR,CRT CCAGCATTTCTTCTGCTGGCAGGGCAAATTCATACCC >10.6|2732125|39|NC_014721|PILER-CR,CRT CATGGGTAATCTACCACTAAGAATTACTCCCATTGGTTC >10.7|2731793|37|NC_014721|CRISPRCasFinder TTTCAACAGCTGTATCTGATGTGGTATCAGTCTCAGG >10.8|2731860|39|NC_014721|CRISPRCasFinder TCGCGAGGATATAACCCTGAAATATCCAATTCACACCAG >10.9|2731929|36|NC_014721|CRISPRCasFinder ATTGTAAGACACTGATTTTTATTTAATATTTGCATA >10.10|2731995|35|NC_014721|CRISPRCasFinder TAACATCAAGAGAGGTGTAAGCAAACACATCTGCA >10.11|2732060|36|NC_014721|CRISPRCasFinder CAGCATTTCTTCTGCTGGCAGGGCAAATTCATACCC >10.12|2732126|38|NC_014721|CRISPRCasFinder ATGGGTAATCTACCACTAAGAATTACTCCCATTGGTTC |
cas3,cas5,cas7,cas8b1,cas2,cas1,cas4,csx20,csx1,Cas14b_CAS-V-F,csm6,csm2gr11,csm3gr7 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014721_10
The CRISPR arrays of NC_014721_10 >merge|NC_014721|10|2731763-2732193|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAATTTTCAACAGCTGTATCTGATGTGGTATCAGTCTCAGGGTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAATTCGCGAGGATATAACCCTGAAATATCCAATTCACACCAGGTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAATATTGTAAGACACTGATTTTTATTTAATATTTGCATAGTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAATTAACATCAAGAGAGGTGTAAGCAAACACATCTGCAGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACCAGCATTTCTTCTGCTGGCAGGGCAAATTCATACCCGTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAACATGGGTAATCTACCACTAAGAATTACTCCCATTGGTTCGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAT >NC_014721|10|12|2731763-2732192|PILER-CR GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAA TTTTCAACAGCTGTATCTGATGTGGTATCAGTCTCAGG GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAA TTCGCGAGGATATAACCCTGAAATATCCAATTCACACCAG GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAA TATTGTAAGACACTGATTTTTATTTAATATTTGCATA GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAA TTAACATCAAGAGAGGTGTAAGCAAACACATCTGCA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA CCAGCATTTCTTCTGCTGGCAGGGCAAATTCATACCC GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAA CATGGGTAATCTACCACTAAGAATTACTCCCATTGGTTC GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA >NC_014721|10|9|2731763-2732193|CRISPRCasFinder GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAT TTTCAACAGCTGTATCTGATGTGGTATCAGTCTCAGG GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAT TCGCGAGGATATAACCCTGAAATATCCAATTCACACCAG GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAT ATTGTAAGACACTGATTTTTATTTAATATTTGCATA GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAAT TAACATCAAGAGAGGTGTAAGCAAACACATCTGCA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAC CAGCATTTCTTCTGCTGGCAGGGCAAATTCATACCC GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAAC ATGGGTAATCTACCACTAAGAATTACTCCCATTGGTTC GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAAT >NC_014721|10|9|2731763-2732192|CRT GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAA TTTTCAACAGCTGTATCTGATGTGGTATCAGTCTCAGG GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAA TTCGCGAGGATATAACCCTGAAATATCCAATTCACACCAG GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAA TATTGTAAGACACTGATTTTTATTTAATATTTGCATA GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAAA TTAACATCAAGAGAGGTGTAAGCAAACACATCTGCA GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA CCAGCATTTCTTCTGCTGGCAGGGCAAATTCATACCC GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAAA CATGGGTAATCTACCACTAAGAATTACTCCCATTGGTTC GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAA
>NC_014721.1|WP_013433717.1|2728909_2731378_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MEKTSFCFDSKNLSGLFSHPGKDGGIEGAKPLEVHLANTSILANSFASEKNIALCSTKFLSQIAKITALLHDIGKATSFFQKYLFDKKKTKSRHTRHSLISAICVWGTLNRLIEEKKIQEDKTFEGFTAILAFFATLKHHGDLEATSDMLLLSEDDIELCYEQIENIDKEKFNTLILNISCLCPEIGFLTIDSLREFVDHAKVSIKLFKRAFRKLFDTEMKFFFMLNLLYSILLDADKTEAIFGTLVDIPELNLSYTDVDSFRRRIFKPENFENSIKALRDSAFEEAINCEIDENRRIYTLCLPTGLGKTIISFAFALKLRELAQKRFGSKFRIIYSLPFLSIIEQNYDVISKILSFCGLDITSDILLKHHHLSDIVYKTKDGLQNNQEEIFDTDIAKLLIEGWNSNIIVTTFVQFLESIMTNKNSNMRKFHRIANSIIILDEVQAINSEYWFLCKNLFEKMCSSLNCFIILSTATMPFIVDKKTAVEIVKPEKYFDKLCRTVLHFDNNFSKIGLEEFVAKFEFEKEKTYLFVMNTVSSAKKLYELINQRFPDMQDEITILTTHIIPKERLRRIEQIKNKKYKIVVSTQLVEAGVDVDFDHVVRDIAPLDSIIQAAGRANREGKKGKSKVTVIELVSDRGRLFATEVYDSLLIDATKKILSQFQKVDESKFAELIFEYYKELARRGVIETSSDDKGTSQKFLEAIYRLLYTSSDSETDAIGSFKLIEDEPYKVDVFVEADEEAKIIWQRFEEICEIKDFFERKKKFLEIRKSFYDYIISVPKTTNLPVNFENLIFRIPHSQLSDFYDPITGFKTKGESYLSF >NC_014721.1|WP_013433716.1|2728203_2728935_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKVAVFDIKADFGFFGKFYSTSSPITYPFPPFPTIQGMVGAILGLDKKEYLDILEYGKFRAGIRILNPVKKIRMGINHIDTKEGRWQPIKTKNRQPRTQMRFELLKDPRFRIYATLATESLFSRLVEFLQQHRSYFTLSMGLSEFLADFEFAGVFEAVEKGMPDDYVSLCTPIPLSYLDSKAEIPLRIEAGKSYFKERMPLYMLSTREVVKYEDVIFEPTGKELLARPSSYVEVQNGENILLF >NC_014721.1|WP_013433715.1|2727200_2728181_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csh2 MENAKEIIKNRSEVLFLYDVTDANPNGDPLDENKPRIDPETDTCIVTDVRLKRTCRDYWAEYKNLPVFILREISEDGKLMTKSDKFSKYNLSKEKLKDYIDIRLFGGTTTLKSKDEKKKSKSDEDLSEETGAITFTGPVQFKFGRSLHKVEYMLVKGTTVMPSGEGKDQGTFTECYILPYALIAFYGVVNENAALCQELPVTEEDIQLLLEALWCGTKNLISRSKFGQMPRLLVRVEYNQSGFYIGELDKLVKLISQKSDTAIRSPEDFQLDITRLVEKLTKHQDKIQKVQVSVDHSISFVCEGKFVHLKDALSFLGDRVKLLQFE >NC_014721.1|WP_013433714.1|2725213_2727136_+|TIGR02556-family-CRISPR-associated-protein MIEAVAEIGKFLIEKKSKASGKSCADDQSNNLSSFLTPVESEKVILICLKQKQTEFEYCGLDLQNPLVSRAQLYLFSQGAKGGGTNYSPVCILTKPKTPKTMTEEQVKQATKEQVEKVFKQKVENWFLNKALPLAKKFSKQGDISKEDAYFIQCISQAVSENREKIIEDISELLFEVEFEKQKSSALLTFSIDGKYIGEYEIFKSFLLELIKEKAERSSSQDKTCSICKQKRENVSGTVNVFKFYTIDKPGFIRGGFSSENAWKNFPVCSSCQIHLSEGRKYLEKELQFKFYNFKYLLIPQLIFSTSSAYSEVLDILQNTKKEISLGEKALERITDDENEILDVISTFNDSISVTFLFMVPQMGAERIVLMIEDVLPSHLKNIFDAKRHTERKYRTVFNNPDINFTFQQIKHFFSKSNRLKKKSDLDSYFLEITESIFKKKPIDFQFLAAHFCRRLQDSIANKDFFDFYTSCSYAIEVLEFLNKLEILKLKGDEFGMSYETPFDEILNEFPVASANPAVKGIILVGALCDILMRIQSTALSKTPGKMPPFAKNLKGLRLKQSDIVSLLPKIENKLMEYSSFGKANRLIASSASELLLKSPVDWKLSADEVSFYFACGMNLGQKIREHAKKLTGDTDEQEA >NC_014721.1|WP_013433713.1|2724873_2725137_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYTILVYDVNEKRVAKALKVCRKYLNWVQNSVFEGEISEAKLKKLKFELSQKLNLHEDSVIIYNFQSLLYSQREILGVEKNNLDRFI >NC_014721.1|WP_013433712.1|2723862_2724858_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKRPIYIFSDGVLKRKNNTLYFESEGVQKFIPVENTSEIYIFGEVELNKRFLEFLTQSEIILHFFNRYGYYVGSFYPREYLNSGYMILKQAEHYLDTQKRLSLARTFVEGSYKNMRQVLKYYQSRGIDELERYIQQMENLFGSISNINDINTLMAIEGNIRQTYYSAFDLIIDKDDFKFEKRSKRPPKNALNALISFGNSMMYTIVLSEIYRTHLDPRIGYLHTTNFRRFTLNLDVAEIFKPIIVDRLIFSIISKNMLKPEHFEQNLEGIVITDSAKKLFIDELEQRLSTTISVKNIGNYVSYRQLIRIELYKIEKHLMGEKEYQPYVSQW >NC_014721.1|WP_013433711.1|2723362_2723866_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MERFLDIKGHIVQAYVVCKRQAWLLSRNISPVQDNPFLEIGKLISQQFYKHDKKEVYFDGVVLDLIRKEDEVLVVGEIKKSSKKVAAAILQLKFYLYKLLKHNIKARGKLLIPEEKKTYDVELTFEDIETIESLLSEITEVLSSFLPPLPQKIKACAKCSYKEFCWA >NC_014721.1|WP_013433710.1|2722834_2723215_+|hypothetical-protein MSYLPKSPKEVYEQILLEYQAYSEFKKRIEGKCYLPHDPENVLYLYCNSTFNEEYEEMLKSKQIENYVEPQTEEEWEYYAEEDEYCKEEFENDFEFFDADYEMSSEMDDIVDDPDFWDSFDYEWGD >NC_014721.1|WP_041736916.1|2719682_2720081_-|hypothetical-protein MNKLFLIFNHQLSEEQEKEAREVLKVEEIVSLPPQLQDFWSSIPPDVELTEEMFEGITAFLLQNKGEKENFCLVQGDFGATVYIVSWCFKNGFVPIYATTKRVAKEVVRPDGSVELHKVFRHERFRKYILCR >NC_014721.1|WP_013433707.1|2719282_2719636_+|stage-V-sporulation-protein-AE MEYLKAFLVGGLICVVGQILIDKTKLTSARVLVLFVTLGAVLQGLGIYQKLVEFAGAGATVPLPGFGYSLAKGAIEEVNRIGLVGAFTGGVSKTAGGISAAVFFGYVISLIFNPRSK >NC_014721.1|WP_148222733.1|2732622_2733876_-|TIGR01897-family-CRISPR-associated-protein MYFIGSLVSESSKIDEKCKKEIENIWDNENVYLENPYNFFNNGFPYAAEKDELKVIHSIGSYIYGKKGEEPKEIQFDSAYSDIVLEIFLDMLERYLKKEEPVSEVYVDISSGHNIYVSALLEALRHFATFMNLSCWLVKSKRPKLFAAICAPILPGNKNVYNIYIEDQQFIVFFESPIKLSDIENIKEKITAEFTDYLKEVLERFLLVFSAIKNNIPLYLFDRYTEIDSLNSVYNLLLEIIKYLNARISKNYKSSPKLDRRMWVKIINSLGFYIGIIENLRAYKIFPVVSEKGVMVKDIEKKIKNIYEKFGLTNIFDILEVELNKLGRPKESKGGGNRIEDLIENSALENIFQQKKRSILKTYQDDKERLQRNFFAHCGLEENFIEVEKKNNDIYVKYSDGIPEIRDIIKEFLLNRV >NC_014721.1|WP_013433719.1|2733988_2734552_-|hypothetical-protein MDTSSQLAKIVENFEGLYKEISNMVASLGRFNEVLDKFNETINKVKLYSETADVLKQLQRHQEQLLELENKLNTEYTKLYAKNLKILRDLEQWIDKEVEQKIDDLVSSMEELHEHMREETEKMQKKLSFLIKMNEEDFESLSNIIEDLLNQRKSIIVAEKSFFSLLKKKIEGRPTIKPRNIKRKRLE >NC_014721.1|WP_041736924.1|2734526_2737082_-|UvrD-helicase-domain-containing-protein MFLIREQMLKELKKENNKEKIKKIFQFADEIEKSELETLRNSLYIRPIKSSRNKIYKYRISSGERVLFMFTSDIEGIRPEYSNKIVLLAYCKHDNQIRDAKNMNSINIVPFEDEEEIDMKIEEEVSKKMHWFDYDFNIIVSENLIKSLVEENSEDYLYYLSEQQFRCLESENTTIIKGSAGSGKTSILLHKLGSMQGENVRIVYFTYTDYLRDRAKTIFKNYWGRRNVNVEFYSVLDFFIENTSIGIDRVVLFKKFYDWYTSGFYQKRFNFDPVDVWTEIKGIIKGCMGINWIRNRDVIFRNIDKNVIKALEEKEVVKKSNNGFVFNIKNSVIEYEKKLYKEGYKGSDEIKALQYLKEYFYIHHNLIDTTCSALDREYYLELPLDYSIFSRQERENIYYLYTKYEEWLKNKGFFDENDLARIVIDNIKNGKLKAKYDFLLIDEIQDLSEIQLYAIINLVEDKRNIMVAGDVHQIVNPTFFNFGRFKNYFVCINKDFNEFSLSKNYRSQEKIVSLANTLSEMRKKFIGGTSEDIIEKSIRDGGHPLLIPETEENLSKIFEFVNKTIGAAVIVENDEDKNYIANRYPISGRIFTVREAKGLEFNCVFCYNLLSNHEKEWNEIVDGAAKRLSKYRYYFNLFYVAITRAKDLLVVIEKNPDMKVLKMLKEHFLCENVFEIDIEKIRISSPEEKYQYARRLEKRGYIEHALWEYIQLELEKDVERCRIKLEVNKIGSEKVGDKLMEMGEYEDAKEFYQKALCYPKMLKAMLLSNSLKDDFDDFEHEFRKHGVEWGSFISLLNENEFLKFYEEYILRKKDDIILNLLEIEELFEKINGQQNRNELGRSLNGYKQSVS >NC_014721.1|WP_013433721.1|2737176_2738010_-|hypothetical-protein MNYDTILSDDLFEKLYKEPLIKHVGEHLRTFMSLRELLKDEPGNFKRPKEYMYFKQCPGWLGICPYGKKERNEKCDPTKCWNIKYGDVKDKIPDFKNWNYDKILIKVLSPAICPDCGSKELKIVWGKRINVKVAGHTVTFDDVAYLKCQECGKINMSNQDKKAIEVIKERIREYDPYAYVIEDPDEELIELGYNPEDDVREFPETATIHLTKDKVALDLFMDEVEKYSTSLDGVISPVDYKESEVMTDLFSIRYYGDKEDMDPIASEEDDGEDVFEE >NC_014721.1|WP_013433722.1|2738084_2739626_-|IS200/IS605-family-element-transposase-accessory-protein-TnpB MITIQSKLIFDSSEDKQTVFDLMRRWSDCMRYAYKRLLEGHKRNELKKQLQGIFNLNSRYVDDAIMKANSVLKSCKERGENPRKVIFGGRELFEKLQKRHINGRAYRKLQCEWQEKRKGNLYSRGDKNKKGNLNTRIEIDGSLTKLRINVGERDYVYATIQPGWKVKGGTYTDRNMLLQAISTSGEPYSVELKLKNGAVYAYFTVEEVFPKPKITRANGVIGIDTNAYPRQVAWAVTDENGQLLSYGEIPMPELESGSSSKREYHRWQYAQMIVAIAKEKQKAIVIEKLDIQDRGRRGDFSGRKSRRIRHYFGYRSLLEKVRLLAKREGVEVIEVDPAYTSVIGMLKYAPQFMVSKDVAAAYVIARRGLDLKEKVPHNYMELLSRLDANSLEELKEHVKKTVKNPNVRKKQLREIDWAIKILQSSGSEPGRLSEPLDGTSEDGRRKDTCNLWRVLRAAVVTPLSPDRVLRDMSVLKSLLVSGQVGRPRFGASSCFLGQGLKASQIPPAGAGKS >NC_014721.1|WP_013433723.1|2739917_2740055_-|hypothetical-protein MGVIFGIVILIILAPILLPLVVISIGILFFMLKFIIGIFRGFFRI >NC_014721.1|WP_013433724.1|2741021_2742413_-|ATP-binding-protein MKKFINRKHELDFLEKQYQEQKSSLVVIYGRRRIGKTALIKKFIEDKPTIYFLASEEVESQNIEYFKRTVSGFLKNPLIEKLSGISWDDIFDILVKTKSDKKIVIVLDEFQNLCKTNPAFASILQRIWDEKLKNGNFMLILCGSLISMMQEYALSYSSPLYGRRTGQIKLKQFSFKEAKEFFPDASDDEFIWIYSVVGGVPKYLEMFKYEGDIYKAIEENILSRQSFLYEEPLFLLEKEVHEIGSYFSIIKSIALGNHKLSQIAQSLSVPQTKLTKYLNALIELDIIRREVPITEEYPEKSKRGLYFINDNFINFWFKFVYPYREQLELDNIEYVIENIKSKIVASHISYVYEEVCKQILSDLIRSEKIDVQVDKIGKWWDGKSEIDIVGIGRSMRHVVFGECKYSQNMIDIDVFFDLKKKAENVKVFPDQKEFYILFSKAGFSERLLEYAAEEKNIVLIKFP >NC_014721.1|WP_013433725.1|2743212_2744418_-|putative-CRISPR-associated-protein MPKYSNIVMTGGISAFNSSNVFYQYFAEFIENKSSYAGQNLEKVLEEICKEKGLTDKEIERLVKERPNQISAEFSMLKGLKEKDLLDDIINISVIHSDTPDGIMAALINKKVIELVFKDSTVSLVKVGDVDISNEVKLQRSLGYFMQIVADKLFNGSKETTFFAPIGGYKYMAYLGYVAGALFGYSSGYMYEKGQKLLTIPPIPIEINFDLITKNKNFIRNLLTEGQLNYQSLSPDEKEIVDTMPYFFEKVEIDGQEIVSANAFAEFIFGDYISTAVKVSPEVSDLISKNEQYRNFILNQLMGLIKKANSFFKDYRNYQGLRGELMHNENWGIDRPYLYKGSSNGNKLVFRCAYDFDYKSRILYIYKIWLNHDKYEREAEAIKNGKITIDMDKNKMFELEY >NC_014721.1|WP_013433726.1|2744437_2744803_-|hypothetical-protein MKDKKELLEIAKKIKSELSSSNSSFISDIVSFIIASKIEKNSKEEQLKRFLEFLWFCTKNPNVLGGGNTKKNGFKKFIEDYLKLKKENGNFILGNGDFSCLDIDDLFFVFAWAKRVVKSSR >NC_014721.1|WP_013433727.1|2744830_2745703_-|hypothetical-protein MSKSYSFIAFLETKENYNNSYTAKLSADLLKYEKLRLQIETLSYLHIWSGMYSEKNGLIYRTFIKSNGKYIIPGSSLKGCVRTVAEMVSYSCMGVATNEQTKVKIPVKKWHSDKRKRCIVCDMFGAPGNKSKLIFHDFAVVSVEDYSKITELICIPPSFEPHPHECDDYKDENGKFKGYKIYNHGEFKSASPDNGIWIEAVKPGVRFEGEIWLRADLKQEQKELLCFSLGLSGFDLKIGYGKNHYLGSIRISAVNGSSELIELAKKYEAKADDKVKNNIMKIKEIWQFKK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_014721_11 | 2740675-2740907 | TypeI |
NA
Consensus repeat of NC_014721_11
|
3 spacers
spacers of NC_014721_11
>11.1|2740707|34|NC_014721|PILER-CR,CRT TAGTATACCACTTTGCTGTTTTGGGACCAGGTCC >11.2|2740773|35|NC_014721|PILER-CR,CRT GGGATTGAATGATGAACAACTCAAAACAGTGCTTG >11.3|2740840|36|NC_014721|PILER-CR,CRT TTTCTTCTACCACTGGTGTTTTTGTTTTTTTAGTTG >11.4|2740707|35|NC_014721|CRISPRCasFinder TAGTATACCACTTTGCTGTTTTGGGACCAGGTCCT >11.5|2740773|36|NC_014721|CRISPRCasFinder GGGATTGAATGATGAACAACTCAAAACAGTGCTTGA >11.6|2740840|37|NC_014721|CRISPRCasFinder TTTCTTCTACCACTGGTGTTTTTGTTTTTTTAGTTGT |
Cas14b_CAS-V-F,csx1,cas3,cas5,cas7,cas8b1,csm6,csm2gr11,csm3gr7,csx10gr5,cas10 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014721_11
The CRISPR arrays of NC_014721_11 >merge|NC_014721|11|2740675-2740907|PILER-CR,CRT,CRISPRCasFinder TGTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAGGTATAGTATACCACTTTGCTGTTTTGGGACCAGGTCCTGTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAGGTGGGGATTGAATGATGAACAACTCAAAACAGTGCTTGAGTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAGGTGTTTCTTCTACCACTGGTGTTTTTGTTTTTTTAGTTGTGTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAGGTG >NC_014721|11|13|2740675-2740907|PILER-CR TGTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAGGTA TAGTATACCACTTTGCTGTTTTGGGACCAGGTCC TGTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAGGTG GGGATTGAATGATGAACAACTCAAAACAGTGCTTG AGTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAGGTG TTTCTTCTACCACTGGTGTTTTTGTTTTTTTAGTTG TGTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAGGTG >NC_014721|11|10|2740675-2740907|CRT TGTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAGGTA TAGTATACCACTTTGCTGTTTTGGGACCAGGTCC TGTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAGGTG GGGATTGAATGATGAACAACTCAAAACAGTGCTTG AGTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAGGTG TTTCTTCTACCACTGGTGTTTTTGTTTTTTTAGTTG TGTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAGGTG >NC_014721|11|10|2740676-2740907|CRISPRCasFinder GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAGGTA TAGTATACCACTTTGCTGTTTTGGGACCAGGTCCT GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAGGTG GGGATTGAATGATGAACAACTCAAAACAGTGCTTGA GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAGGTG TTTCTTCTACCACTGGTGTTTTTGTTTTTTTAGTTGT GTTTGTAGCCTTCCCTTTGGGGATTGAGGTG
>NC_014721.1|WP_013433723.1|2739917_2740055_-|hypothetical-protein MGVIFGIVILIILAPILLPLVVISIGILFFMLKFIIGIFRGFFRI >NC_014721.1|WP_013433722.1|2738084_2739626_-|IS200/IS605-family-element-transposase-accessory-protein-TnpB MITIQSKLIFDSSEDKQTVFDLMRRWSDCMRYAYKRLLEGHKRNELKKQLQGIFNLNSRYVDDAIMKANSVLKSCKERGENPRKVIFGGRELFEKLQKRHINGRAYRKLQCEWQEKRKGNLYSRGDKNKKGNLNTRIEIDGSLTKLRINVGERDYVYATIQPGWKVKGGTYTDRNMLLQAISTSGEPYSVELKLKNGAVYAYFTVEEVFPKPKITRANGVIGIDTNAYPRQVAWAVTDENGQLLSYGEIPMPELESGSSSKREYHRWQYAQMIVAIAKEKQKAIVIEKLDIQDRGRRGDFSGRKSRRIRHYFGYRSLLEKVRLLAKREGVEVIEVDPAYTSVIGMLKYAPQFMVSKDVAAAYVIARRGLDLKEKVPHNYMELLSRLDANSLEELKEHVKKTVKNPNVRKKQLREIDWAIKILQSSGSEPGRLSEPLDGTSEDGRRKDTCNLWRVLRAAVVTPLSPDRVLRDMSVLKSLLVSGQVGRPRFGASSCFLGQGLKASQIPPAGAGKS >NC_014721.1|WP_013433721.1|2737176_2738010_-|hypothetical-protein MNYDTILSDDLFEKLYKEPLIKHVGEHLRTFMSLRELLKDEPGNFKRPKEYMYFKQCPGWLGICPYGKKERNEKCDPTKCWNIKYGDVKDKIPDFKNWNYDKILIKVLSPAICPDCGSKELKIVWGKRINVKVAGHTVTFDDVAYLKCQECGKINMSNQDKKAIEVIKERIREYDPYAYVIEDPDEELIELGYNPEDDVREFPETATIHLTKDKVALDLFMDEVEKYSTSLDGVISPVDYKESEVMTDLFSIRYYGDKEDMDPIASEEDDGEDVFEE >NC_014721.1|WP_041736924.1|2734526_2737082_-|UvrD-helicase-domain-containing-protein MFLIREQMLKELKKENNKEKIKKIFQFADEIEKSELETLRNSLYIRPIKSSRNKIYKYRISSGERVLFMFTSDIEGIRPEYSNKIVLLAYCKHDNQIRDAKNMNSINIVPFEDEEEIDMKIEEEVSKKMHWFDYDFNIIVSENLIKSLVEENSEDYLYYLSEQQFRCLESENTTIIKGSAGSGKTSILLHKLGSMQGENVRIVYFTYTDYLRDRAKTIFKNYWGRRNVNVEFYSVLDFFIENTSIGIDRVVLFKKFYDWYTSGFYQKRFNFDPVDVWTEIKGIIKGCMGINWIRNRDVIFRNIDKNVIKALEEKEVVKKSNNGFVFNIKNSVIEYEKKLYKEGYKGSDEIKALQYLKEYFYIHHNLIDTTCSALDREYYLELPLDYSIFSRQERENIYYLYTKYEEWLKNKGFFDENDLARIVIDNIKNGKLKAKYDFLLIDEIQDLSEIQLYAIINLVEDKRNIMVAGDVHQIVNPTFFNFGRFKNYFVCINKDFNEFSLSKNYRSQEKIVSLANTLSEMRKKFIGGTSEDIIEKSIRDGGHPLLIPETEENLSKIFEFVNKTIGAAVIVENDEDKNYIANRYPISGRIFTVREAKGLEFNCVFCYNLLSNHEKEWNEIVDGAAKRLSKYRYYFNLFYVAITRAKDLLVVIEKNPDMKVLKMLKEHFLCENVFEIDIEKIRISSPEEKYQYARRLEKRGYIEHALWEYIQLELEKDVERCRIKLEVNKIGSEKVGDKLMEMGEYEDAKEFYQKALCYPKMLKAMLLSNSLKDDFDDFEHEFRKHGVEWGSFISLLNENEFLKFYEEYILRKKDDIILNLLEIEELFEKINGQQNRNELGRSLNGYKQSVS >NC_014721.1|WP_013433719.1|2733988_2734552_-|hypothetical-protein MDTSSQLAKIVENFEGLYKEISNMVASLGRFNEVLDKFNETINKVKLYSETADVLKQLQRHQEQLLELENKLNTEYTKLYAKNLKILRDLEQWIDKEVEQKIDDLVSSMEELHEHMREETEKMQKKLSFLIKMNEEDFESLSNIIEDLLNQRKSIIVAEKSFFSLLKKKIEGRPTIKPRNIKRKRLE >NC_014721.1|WP_148222733.1|2732622_2733876_-|TIGR01897-family-CRISPR-associated-protein MYFIGSLVSESSKIDEKCKKEIENIWDNENVYLENPYNFFNNGFPYAAEKDELKVIHSIGSYIYGKKGEEPKEIQFDSAYSDIVLEIFLDMLERYLKKEEPVSEVYVDISSGHNIYVSALLEALRHFATFMNLSCWLVKSKRPKLFAAICAPILPGNKNVYNIYIEDQQFIVFFESPIKLSDIENIKEKITAEFTDYLKEVLERFLLVFSAIKNNIPLYLFDRYTEIDSLNSVYNLLLEIIKYLNARISKNYKSSPKLDRRMWVKIINSLGFYIGIIENLRAYKIFPVVSEKGVMVKDIEKKIKNIYEKFGLTNIFDILEVELNKLGRPKESKGGGNRIEDLIENSALENIFQQKKRSILKTYQDDKERLQRNFFAHCGLEENFIEVEKKNNDIYVKYSDGIPEIRDIIKEFLLNRV >NC_014721.1|WP_013433717.1|2728909_2731378_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 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MKVAVFDIKADFGFFGKFYSTSSPITYPFPPFPTIQGMVGAILGLDKKEYLDILEYGKFRAGIRILNPVKKIRMGINHIDTKEGRWQPIKTKNRQPRTQMRFELLKDPRFRIYATLATESLFSRLVEFLQQHRSYFTLSMGLSEFLADFEFAGVFEAVEKGMPDDYVSLCTPIPLSYLDSKAEIPLRIEAGKSYFKERMPLYMLSTREVVKYEDVIFEPTGKELLARPSSYVEVQNGENILLF >NC_014721.1|WP_013433715.1|2727200_2728181_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csh2 MENAKEIIKNRSEVLFLYDVTDANPNGDPLDENKPRIDPETDTCIVTDVRLKRTCRDYWAEYKNLPVFILREISEDGKLMTKSDKFSKYNLSKEKLKDYIDIRLFGGTTTLKSKDEKKKSKSDEDLSEETGAITFTGPVQFKFGRSLHKVEYMLVKGTTVMPSGEGKDQGTFTECYILPYALIAFYGVVNENAALCQELPVTEEDIQLLLEALWCGTKNLISRSKFGQMPRLLVRVEYNQSGFYIGELDKLVKLISQKSDTAIRSPEDFQLDITRLVEKLTKHQDKIQKVQVSVDHSISFVCEGKFVHLKDALSFLGDRVKLLQFE >NC_014721.1|WP_013433714.1|2725213_2727136_+|TIGR02556-family-CRISPR-associated-protein MIEAVAEIGKFLIEKKSKASGKSCADDQSNNLSSFLTPVESEKVILICLKQKQTEFEYCGLDLQNPLVSRAQLYLFSQGAKGGGTNYSPVCILTKPKTPKTMTEEQVKQATKEQVEKVFKQKVENWFLNKALPLAKKFSKQGDISKEDAYFIQCISQAVSENREKIIEDISELLFEVEFEKQKSSALLTFSIDGKYIGEYEIFKSFLLELIKEKAERSSSQDKTCSICKQKRENVSGTVNVFKFYTIDKPGFIRGGFSSENAWKNFPVCSSCQIHLSEGRKYLEKELQFKFYNFKYLLIPQLIFSTSSAYSEVLDILQNTKKEISLGEKALERITDDENEILDVISTFNDSISVTFLFMVPQMGAERIVLMIEDVLPSHLKNIFDAKRHTERKYRTVFNNPDINFTFQQIKHFFSKSNRLKKKSDLDSYFLEITESIFKKKPIDFQFLAAHFCRRLQDSIANKDFFDFYTSCSYAIEVLEFLNKLEILKLKGDEFGMSYETPFDEILNEFPVASANPAVKGIILVGALCDILMRIQSTALSKTPGKMPPFAKNLKGLRLKQSDIVSLLPKIENKLMEYSSFGKANRLIASSASELLLKSPVDWKLSADEVSFYFACGMNLGQKIREHAKKLTGDTDEQEA >NC_014721.1|WP_013433724.1|2741021_2742413_-|ATP-binding-protein MKKFINRKHELDFLEKQYQEQKSSLVVIYGRRRIGKTALIKKFIEDKPTIYFLASEEVESQNIEYFKRTVSGFLKNPLIEKLSGISWDDIFDILVKTKSDKKIVIVLDEFQNLCKTNPAFASILQRIWDEKLKNGNFMLILCGSLISMMQEYALSYSSPLYGRRTGQIKLKQFSFKEAKEFFPDASDDEFIWIYSVVGGVPKYLEMFKYEGDIYKAIEENILSRQSFLYEEPLFLLEKEVHEIGSYFSIIKSIALGNHKLSQIAQSLSVPQTKLTKYLNALIELDIIRREVPITEEYPEKSKRGLYFINDNFINFWFKFVYPYREQLELDNIEYVIENIKSKIVASHISYVYEEVCKQILSDLIRSEKIDVQVDKIGKWWDGKSEIDIVGIGRSMRHVVFGECKYSQNMIDIDVFFDLKKKAENVKVFPDQKEFYILFSKAGFSERLLEYAAEEKNIVLIKFP >NC_014721.1|WP_013433725.1|2743212_2744418_-|putative-CRISPR-associated-protein MPKYSNIVMTGGISAFNSSNVFYQYFAEFIENKSSYAGQNLEKVLEEICKEKGLTDKEIERLVKERPNQISAEFSMLKGLKEKDLLDDIINISVIHSDTPDGIMAALINKKVIELVFKDSTVSLVKVGDVDISNEVKLQRSLGYFMQIVADKLFNGSKETTFFAPIGGYKYMAYLGYVAGALFGYSSGYMYEKGQKLLTIPPIPIEINFDLITKNKNFIRNLLTEGQLNYQSLSPDEKEIVDTMPYFFEKVEIDGQEIVSANAFAEFIFGDYISTAVKVSPEVSDLISKNEQYRNFILNQLMGLIKKANSFFKDYRNYQGLRGELMHNENWGIDRPYLYKGSSNGNKLVFRCAYDFDYKSRILYIYKIWLNHDKYEREAEAIKNGKITIDMDKNKMFELEY >NC_014721.1|WP_013433726.1|2744437_2744803_-|hypothetical-protein MKDKKELLEIAKKIKSELSSSNSSFISDIVSFIIASKIEKNSKEEQLKRFLEFLWFCTKNPNVLGGGNTKKNGFKKFIEDYLKLKKENGNFILGNGDFSCLDIDDLFFVFAWAKRVVKSSR >NC_014721.1|WP_013433727.1|2744830_2745703_-|hypothetical-protein MSKSYSFIAFLETKENYNNSYTAKLSADLLKYEKLRLQIETLSYLHIWSGMYSEKNGLIYRTFIKSNGKYIIPGSSLKGCVRTVAEMVSYSCMGVATNEQTKVKIPVKKWHSDKRKRCIVCDMFGAPGNKSKLIFHDFAVVSVEDYSKITELICIPPSFEPHPHECDDYKDENGKFKGYKIYNHGEFKSASPDNGIWIEAVKPGVRFEGEIWLRADLKQEQKELLCFSLGLSGFDLKIGYGKNHYLGSIRISAVNGSSELIELAKKYEAKADDKVKNNIMKIKEIWQFKK >NC_014721.1|WP_013433728.1|2745686_2746577_-|hypothetical-protein MFKKLLNQAIVNFELVTQSPLYIKQNTSLLDPTAFDGTYISCYLDDQRIPIIPGTSMKGVFRSFFEKMLGEEACDILDTRQDSNKCLKTIKEYEEKLKSSNKKDKTNNFDEELEKLKDFSRGKLNYYLSCPACKVFGSQRLKSRMLFDDAKAKEGFKISSRSSTPIDRISGAAKEKGLNTFEYVDWGVFEAKVTLVNFFNWQLKLLLEIFERIDEGILTFGGYSSKGFGRMKVENVTIKVRYYGEMKGKAKDGYSQNALFAERVFNNKEVKEKLQSIDFLDKNQWAKVELKDEQIL >NC_014721.1|WP_013433729.1|2746618_2747401_-|CRISPR-associated-RAMP-protein MLLFDKFENRYIIKGIITNLNPIHIGAGGSSFNPLEVDNRIVRYASTNEPYIPGSSLKGVLRSFFEQIYPKEHCWATINPCSKKKEGEIEDKRKKYSENPEGYAKEVYSLLCDICKVFGSQETASKIYISDLKVREENGKKLYKLGVRDGVGIDRDTGTAANRMKYDFEVIEPGAKFDLYMVFENLENECVKSFLIPIVEVLKSGELKIGGKTSRGLGRIKLLEDFKIYKITKDNIKNYLEKGLNEIEPLSWADFKKQFE >NC_014721.1|WP_013433730.1|2747433_2747928_-|hypothetical-protein MKEEARKEIIKMLVQWADEIGENKNFWKQNRELGKTNIRTTATAILQASCYDEVKLFLEYKGSRKNTGWDKPFNNNTTFANYIINKIEDLRKKVDEKYKEDPTFDKEKEVIELAARFLGYIYWKIYGLVNQKENEERQPQNSNQSPQMKGTNYQGRSDSRQSRS >NC_014721.1|WP_013433731.1|2747940_2749080_-|hypothetical-protein MKVYLNFKSPVLVGGRKSATNFIESINYIPGSVVRAALAKFVVLNCKAQRDVYGESSEKRFWVEFKNKEECQRCEFTNLCKNFNEIKISFFYPKGAKPNPLCDMICKNNEDHGFYSELLYGSEDKEAKCLKCPEGNNRVEKYAGLVADGRPYSEIERMYMGKTAINHFTKTALKGSLFTLAPVVKTCAEGIVFEGFIEGISKEDIEKIKKLRIGKYTSSGFGIACLSFGNSMENEKEDELREKAKQFSEKYKKIVKKDDFNFIALYFTSDILFKVDNLPAGYIPTQEYLKIFKNAIGIPEGFDIHRIFSQISLFRGVDTSKSDFTPKQIMYIAQAGTVLVLKTQKTIDEAVAELVKFKGFGEKIEDGYGWFEFYELKNS >NC_014721.1|WP_013433732.1|2749076_2749619_-|hypothetical-protein MKKITYKIEISLKSPLIVSSGETNSIMRSMIIGIDGKPIIPATTLKGIVRSNYIYLHHCQHKIFKCNCETCMLFGSQNNRSSLVFFEDLKPSEEYYVSIRTQTAIDRYRRAVHLNNLFSQKTIENTTFCGEISIYLPPDLEKQNVKEKFEQAVKFIEMIGSGKSRGLGHVKVCIEEVGDR >NC_014721.1|WP_013433733.1|2749638_2751645_-|hypothetical-protein MKIVSRENSKPVYSDNEKKSKKYLDQLYPVDGNYISSEELCKLKQLIEEMKDNQTLEELAEKNMSKKETELFDKRFEFSKSLDKNETAYLPALIDAAKIYVLVDFLTSVKESNIEQSTISFSRKDSYLKFLNPDSDDIIKQLLIEVLIETQKENNLSKQDYNQIKEKFKHHDKIMEILEIKIEVVKGGISKIKEYITEADKLAQMRGATELIKEANIERTREIINKAGLIPECLIYGSGGNSFIVVPKNKGQEICEKIEKEYSQLLLGGRFAFEFLEAELGEFLFDYSRLSTKITQKLTTRHIVRLPMLQSTSCQHETPNSVVPQDVKLCTTCWLRDPKIEIKIADEQHWVCDICYSKFAKSKNIRSSYHEEYCKFIGRNISDFKLPESLSEIDDYIALIYGDGNNLGNVIMNIRNVFELMYLSRRLDKITVSAVYEALKNAIEKESEGEENATAEKESKPLLKFEIIILGGEDILMIVPAKWALEVAKQIIEKFDTAFSNTITLSVGILITKSTMPMSAAYDFTVGLLKNAKKYVKKKKLEMGSVDVEVLTGSSILSKKGNKVIFPCEVERLEKILKAFKTIKEKLAKAKIYLFKEAAETLLPEEFELFYVFHKAREENIDAVEKAIQEMLDEDVKFVGGFVKKKDVDGKEQVISPWVEIAKLRDFI |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_014721_12 | 2742876-2742973 | TypeI |
NA
Consensus repeat of NC_014721_12
|
1 spacers
spacers of NC_014721_12
>12.1|2742903|44|NC_014721|CRISPRCasFinder AACCTCTGGGTCTGTATCTGATGCTCTCTACATTCTCTGTGCTC |
Cas14b_CAS-V-F,csx1,cas3,cas5,cas7,csm6,csm2gr11,csm3gr7,csx10gr5,cas10,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014721_12
The CRISPR arrays of NC_014721_12 >merge|NC_014721|12|2742876-2742973|CRISPRCasFinder GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGAAACCTCTGGGTCTGTATCTGATGCTCTCTACATTCTCTGTGCTCGTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGA >NC_014721|12|11|2742876-2742973|CRISPRCasFinder GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGA AACCTCTGGGTCTGTATCTGATGCTCTCTACATTCTCTGTGCTC GTTTGTAGCCTCCCCTTTGGGGATTGA
>NC_014721.1|WP_013433724.1|2741021_2742413_-|ATP-binding-protein MKKFINRKHELDFLEKQYQEQKSSLVVIYGRRRIGKTALIKKFIEDKPTIYFLASEEVESQNIEYFKRTVSGFLKNPLIEKLSGISWDDIFDILVKTKSDKKIVIVLDEFQNLCKTNPAFASILQRIWDEKLKNGNFMLILCGSLISMMQEYALSYSSPLYGRRTGQIKLKQFSFKEAKEFFPDASDDEFIWIYSVVGGVPKYLEMFKYEGDIYKAIEENILSRQSFLYEEPLFLLEKEVHEIGSYFSIIKSIALGNHKLSQIAQSLSVPQTKLTKYLNALIELDIIRREVPITEEYPEKSKRGLYFINDNFINFWFKFVYPYREQLELDNIEYVIENIKSKIVASHISYVYEEVCKQILSDLIRSEKIDVQVDKIGKWWDGKSEIDIVGIGRSMRHVVFGECKYSQNMIDIDVFFDLKKKAENVKVFPDQKEFYILFSKAGFSERLLEYAAEEKNIVLIKFP >NC_014721.1|WP_013433723.1|2739917_2740055_-|hypothetical-protein MGVIFGIVILIILAPILLPLVVISIGILFFMLKFIIGIFRGFFRI >NC_014721.1|WP_013433722.1|2738084_2739626_-|IS200/IS605-family-element-transposase-accessory-protein-TnpB MITIQSKLIFDSSEDKQTVFDLMRRWSDCMRYAYKRLLEGHKRNELKKQLQGIFNLNSRYVDDAIMKANSVLKSCKERGENPRKVIFGGRELFEKLQKRHINGRAYRKLQCEWQEKRKGNLYSRGDKNKKGNLNTRIEIDGSLTKLRINVGERDYVYATIQPGWKVKGGTYTDRNMLLQAISTSGEPYSVELKLKNGAVYAYFTVEEVFPKPKITRANGVIGIDTNAYPRQVAWAVTDENGQLLSYGEIPMPELESGSSSKREYHRWQYAQMIVAIAKEKQKAIVIEKLDIQDRGRRGDFSGRKSRRIRHYFGYRSLLEKVRLLAKREGVEVIEVDPAYTSVIGMLKYAPQFMVSKDVAAAYVIARRGLDLKEKVPHNYMELLSRLDANSLEELKEHVKKTVKNPNVRKKQLREIDWAIKILQSSGSEPGRLSEPLDGTSEDGRRKDTCNLWRVLRAAVVTPLSPDRVLRDMSVLKSLLVSGQVGRPRFGASSCFLGQGLKASQIPPAGAGKS >NC_014721.1|WP_013433721.1|2737176_2738010_-|hypothetical-protein MNYDTILSDDLFEKLYKEPLIKHVGEHLRTFMSLRELLKDEPGNFKRPKEYMYFKQCPGWLGICPYGKKERNEKCDPTKCWNIKYGDVKDKIPDFKNWNYDKILIKVLSPAICPDCGSKELKIVWGKRINVKVAGHTVTFDDVAYLKCQECGKINMSNQDKKAIEVIKERIREYDPYAYVIEDPDEELIELGYNPEDDVREFPETATIHLTKDKVALDLFMDEVEKYSTSLDGVISPVDYKESEVMTDLFSIRYYGDKEDMDPIASEEDDGEDVFEE >NC_014721.1|WP_041736924.1|2734526_2737082_-|UvrD-helicase-domain-containing-protein MFLIREQMLKELKKENNKEKIKKIFQFADEIEKSELETLRNSLYIRPIKSSRNKIYKYRISSGERVLFMFTSDIEGIRPEYSNKIVLLAYCKHDNQIRDAKNMNSINIVPFEDEEEIDMKIEEEVSKKMHWFDYDFNIIVSENLIKSLVEENSEDYLYYLSEQQFRCLESENTTIIKGSAGSGKTSILLHKLGSMQGENVRIVYFTYTDYLRDRAKTIFKNYWGRRNVNVEFYSVLDFFIENTSIGIDRVVLFKKFYDWYTSGFYQKRFNFDPVDVWTEIKGIIKGCMGINWIRNRDVIFRNIDKNVIKALEEKEVVKKSNNGFVFNIKNSVIEYEKKLYKEGYKGSDEIKALQYLKEYFYIHHNLIDTTCSALDREYYLELPLDYSIFSRQERENIYYLYTKYEEWLKNKGFFDENDLARIVIDNIKNGKLKAKYDFLLIDEIQDLSEIQLYAIINLVEDKRNIMVAGDVHQIVNPTFFNFGRFKNYFVCINKDFNEFSLSKNYRSQEKIVSLANTLSEMRKKFIGGTSEDIIEKSIRDGGHPLLIPETEENLSKIFEFVNKTIGAAVIVENDEDKNYIANRYPISGRIFTVREAKGLEFNCVFCYNLLSNHEKEWNEIVDGAAKRLSKYRYYFNLFYVAITRAKDLLVVIEKNPDMKVLKMLKEHFLCENVFEIDIEKIRISSPEEKYQYARRLEKRGYIEHALWEYIQLELEKDVERCRIKLEVNKIGSEKVGDKLMEMGEYEDAKEFYQKALCYPKMLKAMLLSNSLKDDFDDFEHEFRKHGVEWGSFISLLNENEFLKFYEEYILRKKDDIILNLLEIEELFEKINGQQNRNELGRSLNGYKQSVS >NC_014721.1|WP_013433719.1|2733988_2734552_-|hypothetical-protein MDTSSQLAKIVENFEGLYKEISNMVASLGRFNEVLDKFNETINKVKLYSETADVLKQLQRHQEQLLELENKLNTEYTKLYAKNLKILRDLEQWIDKEVEQKIDDLVSSMEELHEHMREETEKMQKKLSFLIKMNEEDFESLSNIIEDLLNQRKSIIVAEKSFFSLLKKKIEGRPTIKPRNIKRKRLE >NC_014721.1|WP_148222733.1|2732622_2733876_-|TIGR01897-family-CRISPR-associated-protein MYFIGSLVSESSKIDEKCKKEIENIWDNENVYLENPYNFFNNGFPYAAEKDELKVIHSIGSYIYGKKGEEPKEIQFDSAYSDIVLEIFLDMLERYLKKEEPVSEVYVDISSGHNIYVSALLEALRHFATFMNLSCWLVKSKRPKLFAAICAPILPGNKNVYNIYIEDQQFIVFFESPIKLSDIENIKEKITAEFTDYLKEVLERFLLVFSAIKNNIPLYLFDRYTEIDSLNSVYNLLLEIIKYLNARISKNYKSSPKLDRRMWVKIINSLGFYIGIIENLRAYKIFPVVSEKGVMVKDIEKKIKNIYEKFGLTNIFDILEVELNKLGRPKESKGGGNRIEDLIENSALENIFQQKKRSILKTYQDDKERLQRNFFAHCGLEENFIEVEKKNNDIYVKYSDGIPEIRDIIKEFLLNRV >NC_014721.1|WP_013433717.1|2728909_2731378_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MEKTSFCFDSKNLSGLFSHPGKDGGIEGAKPLEVHLANTSILANSFASEKNIALCSTKFLSQIAKITALLHDIGKATSFFQKYLFDKKKTKSRHTRHSLISAICVWGTLNRLIEEKKIQEDKTFEGFTAILAFFATLKHHGDLEATSDMLLLSEDDIELCYEQIENIDKEKFNTLILNISCLCPEIGFLTIDSLREFVDHAKVSIKLFKRAFRKLFDTEMKFFFMLNLLYSILLDADKTEAIFGTLVDIPELNLSYTDVDSFRRRIFKPENFENSIKALRDSAFEEAINCEIDENRRIYTLCLPTGLGKTIISFAFALKLRELAQKRFGSKFRIIYSLPFLSIIEQNYDVISKILSFCGLDITSDILLKHHHLSDIVYKTKDGLQNNQEEIFDTDIAKLLIEGWNSNIIVTTFVQFLESIMTNKNSNMRKFHRIANSIIILDEVQAINSEYWFLCKNLFEKMCSSLNCFIILSTATMPFIVDKKTAVEIVKPEKYFDKLCRTVLHFDNNFSKIGLEEFVAKFEFEKEKTYLFVMNTVSSAKKLYELINQRFPDMQDEITILTTHIIPKERLRRIEQIKNKKYKIVVSTQLVEAGVDVDFDHVVRDIAPLDSIIQAAGRANREGKKGKSKVTVIELVSDRGRLFATEVYDSLLIDATKKILSQFQKVDESKFAELIFEYYKELARRGVIETSSDDKGTSQKFLEAIYRLLYTSSDSETDAIGSFKLIEDEPYKVDVFVEADEEAKIIWQRFEEICEIKDFFERKKKFLEIRKSFYDYIISVPKTTNLPVNFENLIFRIPHSQLSDFYDPITGFKTKGESYLSF >NC_014721.1|WP_013433716.1|2728203_2728935_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKVAVFDIKADFGFFGKFYSTSSPITYPFPPFPTIQGMVGAILGLDKKEYLDILEYGKFRAGIRILNPVKKIRMGINHIDTKEGRWQPIKTKNRQPRTQMRFELLKDPRFRIYATLATESLFSRLVEFLQQHRSYFTLSMGLSEFLADFEFAGVFEAVEKGMPDDYVSLCTPIPLSYLDSKAEIPLRIEAGKSYFKERMPLYMLSTREVVKYEDVIFEPTGKELLARPSSYVEVQNGENILLF >NC_014721.1|WP_013433715.1|2727200_2728181_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csh2 MENAKEIIKNRSEVLFLYDVTDANPNGDPLDENKPRIDPETDTCIVTDVRLKRTCRDYWAEYKNLPVFILREISEDGKLMTKSDKFSKYNLSKEKLKDYIDIRLFGGTTTLKSKDEKKKSKSDEDLSEETGAITFTGPVQFKFGRSLHKVEYMLVKGTTVMPSGEGKDQGTFTECYILPYALIAFYGVVNENAALCQELPVTEEDIQLLLEALWCGTKNLISRSKFGQMPRLLVRVEYNQSGFYIGELDKLVKLISQKSDTAIRSPEDFQLDITRLVEKLTKHQDKIQKVQVSVDHSISFVCEGKFVHLKDALSFLGDRVKLLQFE >NC_014721.1|WP_013433725.1|2743212_2744418_-|putative-CRISPR-associated-protein MPKYSNIVMTGGISAFNSSNVFYQYFAEFIENKSSYAGQNLEKVLEEICKEKGLTDKEIERLVKERPNQISAEFSMLKGLKEKDLLDDIINISVIHSDTPDGIMAALINKKVIELVFKDSTVSLVKVGDVDISNEVKLQRSLGYFMQIVADKLFNGSKETTFFAPIGGYKYMAYLGYVAGALFGYSSGYMYEKGQKLLTIPPIPIEINFDLITKNKNFIRNLLTEGQLNYQSLSPDEKEIVDTMPYFFEKVEIDGQEIVSANAFAEFIFGDYISTAVKVSPEVSDLISKNEQYRNFILNQLMGLIKKANSFFKDYRNYQGLRGELMHNENWGIDRPYLYKGSSNGNKLVFRCAYDFDYKSRILYIYKIWLNHDKYEREAEAIKNGKITIDMDKNKMFELEY >NC_014721.1|WP_013433726.1|2744437_2744803_-|hypothetical-protein MKDKKELLEIAKKIKSELSSSNSSFISDIVSFIIASKIEKNSKEEQLKRFLEFLWFCTKNPNVLGGGNTKKNGFKKFIEDYLKLKKENGNFILGNGDFSCLDIDDLFFVFAWAKRVVKSSR >NC_014721.1|WP_013433727.1|2744830_2745703_-|hypothetical-protein MSKSYSFIAFLETKENYNNSYTAKLSADLLKYEKLRLQIETLSYLHIWSGMYSEKNGLIYRTFIKSNGKYIIPGSSLKGCVRTVAEMVSYSCMGVATNEQTKVKIPVKKWHSDKRKRCIVCDMFGAPGNKSKLIFHDFAVVSVEDYSKITELICIPPSFEPHPHECDDYKDENGKFKGYKIYNHGEFKSASPDNGIWIEAVKPGVRFEGEIWLRADLKQEQKELLCFSLGLSGFDLKIGYGKNHYLGSIRISAVNGSSELIELAKKYEAKADDKVKNNIMKIKEIWQFKK >NC_014721.1|WP_013433728.1|2745686_2746577_-|hypothetical-protein MFKKLLNQAIVNFELVTQSPLYIKQNTSLLDPTAFDGTYISCYLDDQRIPIIPGTSMKGVFRSFFEKMLGEEACDILDTRQDSNKCLKTIKEYEEKLKSSNKKDKTNNFDEELEKLKDFSRGKLNYYLSCPACKVFGSQRLKSRMLFDDAKAKEGFKISSRSSTPIDRISGAAKEKGLNTFEYVDWGVFEAKVTLVNFFNWQLKLLLEIFERIDEGILTFGGYSSKGFGRMKVENVTIKVRYYGEMKGKAKDGYSQNALFAERVFNNKEVKEKLQSIDFLDKNQWAKVELKDEQIL >NC_014721.1|WP_013433729.1|2746618_2747401_-|CRISPR-associated-RAMP-protein MLLFDKFENRYIIKGIITNLNPIHIGAGGSSFNPLEVDNRIVRYASTNEPYIPGSSLKGVLRSFFEQIYPKEHCWATINPCSKKKEGEIEDKRKKYSENPEGYAKEVYSLLCDICKVFGSQETASKIYISDLKVREENGKKLYKLGVRDGVGIDRDTGTAANRMKYDFEVIEPGAKFDLYMVFENLENECVKSFLIPIVEVLKSGELKIGGKTSRGLGRIKLLEDFKIYKITKDNIKNYLEKGLNEIEPLSWADFKKQFE >NC_014721.1|WP_013433730.1|2747433_2747928_-|hypothetical-protein MKEEARKEIIKMLVQWADEIGENKNFWKQNRELGKTNIRTTATAILQASCYDEVKLFLEYKGSRKNTGWDKPFNNNTTFANYIINKIEDLRKKVDEKYKEDPTFDKEKEVIELAARFLGYIYWKIYGLVNQKENEERQPQNSNQSPQMKGTNYQGRSDSRQSRS >NC_014721.1|WP_013433731.1|2747940_2749080_-|hypothetical-protein MKVYLNFKSPVLVGGRKSATNFIESINYIPGSVVRAALAKFVVLNCKAQRDVYGESSEKRFWVEFKNKEECQRCEFTNLCKNFNEIKISFFYPKGAKPNPLCDMICKNNEDHGFYSELLYGSEDKEAKCLKCPEGNNRVEKYAGLVADGRPYSEIERMYMGKTAINHFTKTALKGSLFTLAPVVKTCAEGIVFEGFIEGISKEDIEKIKKLRIGKYTSSGFGIACLSFGNSMENEKEDELREKAKQFSEKYKKIVKKDDFNFIALYFTSDILFKVDNLPAGYIPTQEYLKIFKNAIGIPEGFDIHRIFSQISLFRGVDTSKSDFTPKQIMYIAQAGTVLVLKTQKTIDEAVAELVKFKGFGEKIEDGYGWFEFYELKNS >NC_014721.1|WP_013433732.1|2749076_2749619_-|hypothetical-protein MKKITYKIEISLKSPLIVSSGETNSIMRSMIIGIDGKPIIPATTLKGIVRSNYIYLHHCQHKIFKCNCETCMLFGSQNNRSSLVFFEDLKPSEEYYVSIRTQTAIDRYRRAVHLNNLFSQKTIENTTFCGEISIYLPPDLEKQNVKEKFEQAVKFIEMIGSGKSRGLGHVKVCIEEVGDR >NC_014721.1|WP_013433733.1|2749638_2751645_-|hypothetical-protein MKIVSRENSKPVYSDNEKKSKKYLDQLYPVDGNYISSEELCKLKQLIEEMKDNQTLEELAEKNMSKKETELFDKRFEFSKSLDKNETAYLPALIDAAKIYVLVDFLTSVKESNIEQSTISFSRKDSYLKFLNPDSDDIIKQLLIEVLIETQKENNLSKQDYNQIKEKFKHHDKIMEILEIKIEVVKGGISKIKEYITEADKLAQMRGATELIKEANIERTREIINKAGLIPECLIYGSGGNSFIVVPKNKGQEICEKIEKEYSQLLLGGRFAFEFLEAELGEFLFDYSRLSTKITQKLTTRHIVRLPMLQSTSCQHETPNSVVPQDVKLCTTCWLRDPKIEIKIADEQHWVCDICYSKFAKSKNIRSSYHEEYCKFIGRNISDFKLPESLSEIDDYIALIYGDGNNLGNVIMNIRNVFELMYLSRRLDKITVSAVYEALKNAIEKESEGEENATAEKESKPLLKFEIIILGGEDILMIVPAKWALEVAKQIIEKFDTAFSNTITLSVGILITKSTMPMSAAYDFTVGLLKNAKKYVKKKKLEMGSVDVEVLTGSSILSKKGNKVIFPCEVERLEKILKAFKTIKEKLAKAKIYLFKEAAETLLPEEFELFYVFHKAREENIDAVEKAIQEMLDEDVKFVGGFVKKKDVDGKEQVISPWVEIAKLRDFI >NC_014721.1|WP_013433734.1|2751757_2752513_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_014721_13 | 2753369-2753468 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_014721_13
|
1 spacers
spacers of NC_014721_13
>13.1|2753401|36|NC_014721|CRISPRCasFinder TCCATCGTTCTTGATACTTATCCCCTGCTTTTCTGA |
cas6,cas10,csm3gr7,csx10gr5,csm2gr11,csm6,WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_014721_13
The CRISPR arrays of NC_014721_13 >merge|NC_014721|13|2753369-2753468|CRISPRCasFinder GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAGGTGTTCCATCGTTCTTGATACTTATCCCCTGCTTTTCTGAGTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAGGTGT >NC_014721|13|12|2753369-2753468|CRISPRCasFinder GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAGGTGT TCCATCGTTCTTGATACTTATCCCCTGCTTTTCTGA GTTTGTAGCCTGCCCTTTGGGGATTGAGGTGT
>NC_014721.1|WP_013433734.1|2751757_2752513_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRFKLKLTNEKETIIKVDYCIELASSINMLLDSNYLRYIENGAYLLNRKIYKPWTFSRLFFEKYSFANKEIRVLPGDSYLIVSTIDDNFAYFFLKGILKEKCLRVGEAIFEVRSVSVLNQPQRKQIVCRTLSPIIIKEIQRIENSCPEFAASFVEGIKKNLVSKAKAFRNINISPEKIEIQIVNNEKIKRKTLRIKNEFYVGYELLLKIKSLPEIIEIAYNCGLGVKNALGFGCVEIIPPPSERVLISFEK >NC_014721.1|WP_013433733.1|2749638_2751645_-|hypothetical-protein MKIVSRENSKPVYSDNEKKSKKYLDQLYPVDGNYISSEELCKLKQLIEEMKDNQTLEELAEKNMSKKETELFDKRFEFSKSLDKNETAYLPALIDAAKIYVLVDFLTSVKESNIEQSTISFSRKDSYLKFLNPDSDDIIKQLLIEVLIETQKENNLSKQDYNQIKEKFKHHDKIMEILEIKIEVVKGGISKIKEYITEADKLAQMRGATELIKEANIERTREIINKAGLIPECLIYGSGGNSFIVVPKNKGQEICEKIEKEYSQLLLGGRFAFEFLEAELGEFLFDYSRLSTKITQKLTTRHIVRLPMLQSTSCQHETPNSVVPQDVKLCTTCWLRDPKIEIKIADEQHWVCDICYSKFAKSKNIRSSYHEEYCKFIGRNISDFKLPESLSEIDDYIALIYGDGNNLGNVIMNIRNVFELMYLSRRLDKITVSAVYEALKNAIEKESEGEENATAEKESKPLLKFEIIILGGEDILMIVPAKWALEVAKQIIEKFDTAFSNTITLSVGILITKSTMPMSAAYDFTVGLLKNAKKYVKKKKLEMGSVDVEVLTGSSILSKKGNKVIFPCEVERLEKILKAFKTIKEKLAKAKIYLFKEAAETLLPEEFELFYVFHKAREENIDAVEKAIQEMLDEDVKFVGGFVKKKDVDGKEQVISPWVEIAKLRDFI >NC_014721.1|WP_013433732.1|2749076_2749619_-|hypothetical-protein MKKITYKIEISLKSPLIVSSGETNSIMRSMIIGIDGKPIIPATTLKGIVRSNYIYLHHCQHKIFKCNCETCMLFGSQNNRSSLVFFEDLKPSEEYYVSIRTQTAIDRYRRAVHLNNLFSQKTIENTTFCGEISIYLPPDLEKQNVKEKFEQAVKFIEMIGSGKSRGLGHVKVCIEEVGDR >NC_014721.1|WP_013433731.1|2747940_2749080_-|hypothetical-protein MKVYLNFKSPVLVGGRKSATNFIESINYIPGSVVRAALAKFVVLNCKAQRDVYGESSEKRFWVEFKNKEECQRCEFTNLCKNFNEIKISFFYPKGAKPNPLCDMICKNNEDHGFYSELLYGSEDKEAKCLKCPEGNNRVEKYAGLVADGRPYSEIERMYMGKTAINHFTKTALKGSLFTLAPVVKTCAEGIVFEGFIEGISKEDIEKIKKLRIGKYTSSGFGIACLSFGNSMENEKEDELREKAKQFSEKYKKIVKKDDFNFIALYFTSDILFKVDNLPAGYIPTQEYLKIFKNAIGIPEGFDIHRIFSQISLFRGVDTSKSDFTPKQIMYIAQAGTVLVLKTQKTIDEAVAELVKFKGFGEKIEDGYGWFEFYELKNS >NC_014721.1|WP_013433730.1|2747433_2747928_-|hypothetical-protein MKEEARKEIIKMLVQWADEIGENKNFWKQNRELGKTNIRTTATAILQASCYDEVKLFLEYKGSRKNTGWDKPFNNNTTFANYIINKIEDLRKKVDEKYKEDPTFDKEKEVIELAARFLGYIYWKIYGLVNQKENEERQPQNSNQSPQMKGTNYQGRSDSRQSRS >NC_014721.1|WP_013433729.1|2746618_2747401_-|CRISPR-associated-RAMP-protein MLLFDKFENRYIIKGIITNLNPIHIGAGGSSFNPLEVDNRIVRYASTNEPYIPGSSLKGVLRSFFEQIYPKEHCWATINPCSKKKEGEIEDKRKKYSENPEGYAKEVYSLLCDICKVFGSQETASKIYISDLKVREENGKKLYKLGVRDGVGIDRDTGTAANRMKYDFEVIEPGAKFDLYMVFENLENECVKSFLIPIVEVLKSGELKIGGKTSRGLGRIKLLEDFKIYKITKDNIKNYLEKGLNEIEPLSWADFKKQFE >NC_014721.1|WP_013433728.1|2745686_2746577_-|hypothetical-protein MFKKLLNQAIVNFELVTQSPLYIKQNTSLLDPTAFDGTYISCYLDDQRIPIIPGTSMKGVFRSFFEKMLGEEACDILDTRQDSNKCLKTIKEYEEKLKSSNKKDKTNNFDEELEKLKDFSRGKLNYYLSCPACKVFGSQRLKSRMLFDDAKAKEGFKISSRSSTPIDRISGAAKEKGLNTFEYVDWGVFEAKVTLVNFFNWQLKLLLEIFERIDEGILTFGGYSSKGFGRMKVENVTIKVRYYGEMKGKAKDGYSQNALFAERVFNNKEVKEKLQSIDFLDKNQWAKVELKDEQIL >NC_014721.1|WP_013433727.1|2744830_2745703_-|hypothetical-protein MSKSYSFIAFLETKENYNNSYTAKLSADLLKYEKLRLQIETLSYLHIWSGMYSEKNGLIYRTFIKSNGKYIIPGSSLKGCVRTVAEMVSYSCMGVATNEQTKVKIPVKKWHSDKRKRCIVCDMFGAPGNKSKLIFHDFAVVSVEDYSKITELICIPPSFEPHPHECDDYKDENGKFKGYKIYNHGEFKSASPDNGIWIEAVKPGVRFEGEIWLRADLKQEQKELLCFSLGLSGFDLKIGYGKNHYLGSIRISAVNGSSELIELAKKYEAKADDKVKNNIMKIKEIWQFKK >NC_014721.1|WP_013433726.1|2744437_2744803_-|hypothetical-protein MKDKKELLEIAKKIKSELSSSNSSFISDIVSFIIASKIEKNSKEEQLKRFLEFLWFCTKNPNVLGGGNTKKNGFKKFIEDYLKLKKENGNFILGNGDFSCLDIDDLFFVFAWAKRVVKSSR >NC_014721.1|WP_013433725.1|2743212_2744418_-|putative-CRISPR-associated-protein MPKYSNIVMTGGISAFNSSNVFYQYFAEFIENKSSYAGQNLEKVLEEICKEKGLTDKEIERLVKERPNQISAEFSMLKGLKEKDLLDDIINISVIHSDTPDGIMAALINKKVIELVFKDSTVSLVKVGDVDISNEVKLQRSLGYFMQIVADKLFNGSKETTFFAPIGGYKYMAYLGYVAGALFGYSSGYMYEKGQKLLTIPPIPIEINFDLITKNKNFIRNLLTEGQLNYQSLSPDEKEIVDTMPYFFEKVEIDGQEIVSANAFAEFIFGDYISTAVKVSPEVSDLISKNEQYRNFILNQLMGLIKKANSFFKDYRNYQGLRGELMHNENWGIDRPYLYKGSSNGNKLVFRCAYDFDYKSRILYIYKIWLNHDKYEREAEAIKNGKITIDMDKNKMFELEY >NC_014721.1|WP_013433736.1|2753625_2754555_+|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MCEKLPPKEHDTTFKFLFADKEEILLLVKDILHYTWADNIEEDTIELVKTNYVTQQFSQVEADVVAKAKLKDKEVYFYILIENQSKVKREMQQKILKYMISLWAEEIRKGVQILPAIIPIAVYNGIGERWNVSTDLMEAFDIFKDDVFRYRVVDIIELDVKKLLEREEDVLTPIVFYLEQAREDRSELIGRLLEVEKNLKKLSKKNVDRFLEWSYHIIRPRLAEEQKSEYDGIAKRVKQEGVEAMGEFISNVARLLDEAKTKDFLAGKFEATIEFAKRLIQKGFSDEEVAELTELEIEKVKELRKSMVN >NC_014721.1|WP_041737093.1|2754628_2755456_-|hypothetical-protein MKNKDYKNKNLIKPAEEQTILDFVEKKLSENAAVRELMKDEYISFGGIRDFLYFKFCPLYFGLCPHKKDKKDEACNANLCWLEKLSDIHPSGVENDHQFFHNLVKDTVQPSICPECGEDELELKWQEEGYLAKLGLINFADVAYLECRNCKKRFVTHADRMAVEFLLKVFLAKPSKKSPVKAGQTIVLALDKVGLEIFIDHLDKEKDIKTLWKRLDPFSISDQIGELDLNIAVADFMCEYYNIEYEEKNEVDTFFEEEDTEKFDISDLFDDFDEK >NC_014721.1|WP_174256040.1|2755535_2755946_-|hypothetical-protein MSPVFEIFIDRIVQTLKSMNLNVQKDIVDDIIIEIKEFKVHYAHSSKDVTEALSELILLSQREFLECKIKCNVFLKSKIGTSLTARNVEVLYSPIEEEKDETAKLLRDYLLDIQPLKSMAEKDVGFVKKAIETIFE >NC_014721.1|WP_013433739.1|2756072_2756771_-|hypothetical-protein MFKGVSSILTFSEFLNTVIQENKWIYTHELLEKIKVPLPSQNQLKSFEVANSFYKEFLHVVYAVDILSMLNSLKIWAANNNLEIFALLTTDMIPIVWLGEGYYGIIAKYKEKMIIPCALYQHFEDLYINFPMSDFVPFDICDAYRKLMENEENVAMNIVYARSIDELKREFKKNFKEFEIIFKGPDYYDLYVSPIGKKYIVAPLREILKDFFQNQIIYFSQLLSVQENLNKK >NC_014721.1|WP_013404418.1|2756964_2757225_+|stage-V-sporulation-protein-S MEVLKVAATSMPQKVANALAAIVKEQGEAELQAVGASAVNQAVKAIAIARGKVAPNGIDLYVIPAFADIVIDGEKKTAIKFIVKSR >NC_014721.1|WP_013433740.1|2757327_2757723_-|hypothetical-protein MGFIALEVKELVDILLKNVDMPEIITKVEVNKNEVVVGVKPAAFLPQMSLKFTITSMQNKLSILFDPSKNLIVYGFLLGKLKDEKIEGLQLFKDRLEIDLQKILAGNVKGVKVNRVEVDSGGKIEIDFCCG >NC_014721.1|WP_013433741.1|2757887_2760938_-|EAL-domain-containing-protein MKRIRMLVNTVLAVIIIFFLSPAYASHTPVKFEVDKSYPPFSYTSGGRIYGFTIDLANLVFEPDKFKLELSSDTWNQVYKKLVEGKIDVAAPVAIVEERKKEVYFSKPIFTRHVGLYTSKGFSKNISLKNLEDFMVGVMKSDYTETLLKEKLGVNKYYTYPTIEDLIYALVDGKIDAALMSQEIANYFLVKNGLRDRAELKIKNIFTVKSAFAVSKKRPELVAYINQRLNFLTNKGIFDELYYNYFSTYSPEYYERKNRQIVISTLYLLLIILFAASVAIFVMARINRRLEHGKQTYEKYAQLLAENANAIVLTLNLNGEIIYFNKFAQELTGYKSEEVVGKKWVDIFIPPHRREYIENLFKRIAEEKILNNHENEIVTKNGDIKWILWNNTLIESPYLNEPMIISTGLDITQIKTTQQLLQQSYKKIERTNQELLNTLEILNRQSKALEEEKEKYKFLIENGSDCIWEIDFKEKNIEFYGRLKDLFDIKAVKSKNDFSAWLDFFHPDDRSTVFKKLQDAILLHEENLEFEARIRDKNGNWHWMSAHVQIFYNEEGKPEKIIAVNIDWTAKKEYEQKIEYIAYYDALTSLPNRKLFEEALEDFIKKAEEEKAQGAVILIDIDNFKDINDLYGHEAGDEYLKAVGQKVLEYLKNLNLNTFFARVGGDEFAVVLHGLAKKEEVIEVCTQLLSIFEREIYIQKLERHLFASASMGISFYPDDGRSVKEIFRNVDMALSSAKENGKNDFQIFLPFMLMKNLKKIEIEKGLKKAIETDQFELYYQPVINLKDMEIHSVEALLRWISPEKGMISPLEFIPVAEEIGLIIKIGEMVIEKAFSDLKEWEKKGIDYLHMAINLSARQFKIKFFENMVQKLIERYSIDPKKISFEITETGAVENFDVSLKILSFLCQMGIKFLIDDFGTGYSSLVYLKRLPIGGVKIDRSFISELEVSKENKAIVEGIILMAHKLDLKVVAEGVETKRQLEILKEVGCDFAQGYLFSKPLPKTEVEKLLIARKITV >NC_014721.1|WP_013433742.1|2761011_2762019_-|WYL-domain-containing-protein MEIFLEAKSTFYKALEEIINNAYDKGTISQKEIYDILTRYNCNFPVIEDRLFAKNAQYQKNIYVLKQQDNKTYSLRIDSKIEPYVTNLEIMWLKFIMSSRYAELFLDKNTIEKIKKLKSSYVPSIDTNLIVPKNYSKILKRESAKDLSPKLKMITKSILEKRLLRYTYTTRQGETLKDVVGIPVKIQYSLKDDMFYVIFYSIEHRNFAKCIIQNLEDVRYEEGSFNREDVLKEYELYLRNAKAKQPIIIEVMNTRNALERAFCLFSSFEKSARFLKEKNKHEMKIYYYEFEEAEIISRILYLGRDVVVTQPQHIRESIISRVKNALKMYCDNEIV >NC_014721.1|WP_013433743.1|2762002_2763316_-|WYL-domain-containing-protein MPPFNPFVNDFNKLRNFSRIVYLYGCYSREDAENFNIAKRTFDDELRRMRIFLGEEKYLIDEKDGKRKLPCIVEDFFKDVENPLVNIYFSKTSTALQTTLFFMTLQVLNAEHDKKASAGQILDKISQVLDRDVADADLESSLKRILKQMQQLGIIKYLKDEKVYLLCSQAKEVFKDFSIDEIKNIYISVLFFINSHVPSVPGWYLKESLEKYLLELGEKEFIENASSMFWFTYVPHHYILEEELVWKFLEAASNNKKLKVWYWLRKKNKKTEFVCLPVRIVYDVKLGRWYFLVAKEEEVLALPAWRVEKIEILQESFNPKQILPLANLIEKCFFVSVPKRKKGFEKITIRFKNPSNSSYNFVLARVKRELKNARINKVDEETFEVEYDLSNIKEFKGWLRSFGERALVLGTTEASRKLREEMINEWKEILKNYGDIS >NC_014721.1|WP_013433744.1|2763599_2764589_+|CAP-domain-containing-protein MRILIKRHYFLKSVVIFLVIIFLINCSFAFATTQQKRNVYMFCSKSYFDKIYSDAEIQTFKSPFDFPFYVSKNPSDFFIAGFENDRLVFYYTNSKMFAGFSNIKIGSTVENVKKSKLSFIDRFVIFKGISTYSYTDNNLGENFDVAVIKNSYYLFIFYDRIAKPNVVCGIFMVKKSLWDEFLLNEHPISSKKDTMQSLLLSFEKIHLLHLNSIRAYLQKPYFVFSDNISKVARAHSQNMAKYNFFSHTDSLGKTPQDRFKAAGILYLKLGENIAMGTKLLPFFANHLLLNSKGHRQNIEESFSVVGAGCAVDPNYENVYYTQNFAVLRN |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_014721_9 | 9.1|2720606|26|NC_014721|CRT | 2720606-2720631 | 26 | MK448795 | Streptococcus phage Javan527, complete genome | 4637-4662 | 3 | 0.885 |
NC_014721_8 | 8.37|2711251|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2711251-2711286 | 36 | MF360958 | Salicola phage SCTP-2, complete genome | 246064-246099 | 6 | 0.833 |
NC_014721_9 | 9.1|2720606|26|NC_014721|CRT | 2720606-2720631 | 26 | NZ_CP020859 | Lactobacillus salivarius strain ZLS006 plasmid unnamed1, complete sequence | 116181-116206 | 6 | 0.769 |
NC_014721_9 | 9.1|2720606|26|NC_014721|CRT | 2720606-2720631 | 26 | NZ_AP014865 | Bacillus thuringiensis serovar tolworthi strain Pasteur Institute Standard strain plasmid pKK1, complete sequence | 105729-105754 | 6 | 0.769 |
NC_014721_9 | 9.1|2720606|26|NC_014721|CRT | 2720606-2720631 | 26 | NZ_CP050184 | Bacillus thuringiensis strain HER1410 plasmid pLUSID1, complete sequence | 178972-178997 | 6 | 0.769 |
NC_014721_9 | 9.1|2720606|26|NC_014721|CRT | 2720606-2720631 | 26 | LT960552 | Yersinia phage fHe-Yen9-03 genome assembly, complete genome: monopartite | 301828-301853 | 6 | 0.769 |
NC_014721_9 | 9.1|2720606|26|NC_014721|CRT | 2720606-2720631 | 26 | LR596615 | Yersinia phage fHe-Yen9-04 genome assembly, chromosome: I | 304084-304109 | 6 | 0.769 |
NC_014721_9 | 9.1|2720606|26|NC_014721|CRT | 2720606-2720631 | 26 | NC_042116 | Yersinia phage fHe-Yen9-04 genome assembly, complete genome: monopartite | 304084-304109 | 6 | 0.769 |
NC_014721_9 | 9.6|2720931|37|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2720931-2720967 | 37 | KY794642 | Staphylococcus phage vB_Sau_Clo6, complete genome | 53571-53607 | 6 | 0.838 |
NC_014721_9 | 9.6|2720931|37|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2720931-2720967 | 37 | NC_023573 | Staphylococcus phage phiSA012 DNA, complete genome | 89272-89308 | 6 | 0.838 |
NC_014721_3 | 3.18|2653881|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2653881-2653916 | 36 | MT074146 | Bacteroides phage SJC03, complete genome | 93559-93594 | 7 | 0.806 |
NC_014721_3 | 3.18|2653881|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2653881-2653916 | 36 | MT074139 | Bacteroides phage DAC19, complete genome | 104517-104552 | 7 | 0.806 |
NC_014721_3 | 3.18|2653881|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2653881-2653916 | 36 | JN800508 | Clostridium phage phi24R, complete genome | 17005-17040 | 7 | 0.806 |
NC_014721_3 | 3.18|2653881|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2653881-2653916 | 36 | MT074140 | Bacteroides phage DAC20, complete genome | 104516-104551 | 7 | 0.806 |
NC_014721_3 | 3.18|2653881|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2653881-2653916 | 36 | MH999279 | Clostridium phage CPD2, complete genome | 15483-15518 | 7 | 0.806 |
NC_014721_8 | 8.30|2710794|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2710794-2710830 | 37 | MT684590 | Streptomyces phage LilMartin, complete genome | 50061-50097 | 7 | 0.811 |
NC_014721_8 | 8.30|2710794|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2710794-2710830 | 37 | MT897905 | Streptomyces phage MulchMansion, complete genome | 50061-50097 | 7 | 0.811 |
NC_014721_9 | 9.21|2721948|37|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2721948-2721984 | 37 | JX094431 | Bacillus cereus bacteriophage vB_BceM_Bc431v3, complete genome | 101344-101380 | 7 | 0.811 |
NC_014721_5 | 5.8|2670119|34|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2670119-2670152 | 34 | NZ_CP009332 | Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 3, complete sequence | 13625-13658 | 8 | 0.765 |
NC_014721_5 | 5.8|2670119|34|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2670119-2670152 | 34 | NZ_CP053977 | Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_795 plasmid unnamed1, complete sequence | 16794-16827 | 8 | 0.765 |
NC_014721_5 | 5.21|2670979|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2670979-2671015 | 37 | NC_015695 | Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL05, complete sequence | 28693-28729 | 8 | 0.784 |
NC_014721_6 | 6.1|2689704|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2689704-2689738 | 35 | MK250021 | Prevotella phage Lak-B2, complete genome | 483215-483249 | 8 | 0.771 |
NC_014721_6 | 6.1|2689704|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2689704-2689738 | 35 | MK250023 | Prevotella phage Lak-B4, complete genome | 482446-482480 | 8 | 0.771 |
NC_014721_6 | 6.1|2689704|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2689704-2689738 | 35 | MK250027 | Prevotella phage Lak-B8, complete genome | 482977-483011 | 8 | 0.771 |
NC_014721_6 | 6.1|2689704|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2689704-2689738 | 35 | MK250026 | Prevotella phage Lak-B7, complete genome | 482014-482048 | 8 | 0.771 |
NC_014721_2 | 2.33|2499118|38|NC_014721|CRISPRCasFinder | 2499118-2499155 | 38 | NC_012036 | Caldicellulosiruptor bescii DSM 6725 plasmid pATHE01, complete sequence | 1950-1987 | 9 | 0.763 |
NC_014721_2 | 2.126|2505240|38|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 2505240-2505277 | 38 | KX827371 | Staphylococcus phage SpT99F3, complete genome | 40048-40085 | 9 | 0.763 |
NC_014721_2 | 2.126|2505240|38|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 2505240-2505277 | 38 | NC_007051 | Staphylococcus phage 2638A, complete genome | 22391-22428 | 9 | 0.763 |
NC_014721_2 | 2.126|2505240|38|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 2505240-2505277 | 38 | MK450538 | Staphylococcus phage vB_SpsS_QT1, complete genome | 23956-23993 | 9 | 0.763 |
NC_014721_2 | 2.126|2505240|38|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 2505240-2505277 | 38 | MK075004 | Staphylococcus phage phiSP119-1, complete genome | 48825-48862 | 9 | 0.763 |
NC_014721_2 | 2.126|2505240|38|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 2505240-2505277 | 38 | AY954954 | Bacteriophage 2638A, complete genome | 22391-22428 | 9 | 0.763 |
NC_014721_5 | 5.7|2670054|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2670054-2670088 | 35 | MT345684 | Alteromonas phage vB_AcoS-R7M, complete genome | 17913-17947 | 9 | 0.743 |
NC_014721_5 | 5.55|2673225|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2673225-2673260 | 36 | NZ_CP047429 | Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-1, complete sequence | 74254-74289 | 9 | 0.75 |
NC_014721_5 | 5.55|2673225|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2673225-2673260 | 36 | NZ_CP047434 | Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-6 | 66101-66136 | 9 | 0.75 |
NC_014721_5 | 5.55|2673225|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2673225-2673260 | 36 | NZ_CP047434 | Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-6 | 81223-81258 | 9 | 0.75 |
NC_014721_5 | 5.55|2673225|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2673225-2673260 | 36 | NZ_CP047434 | Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-6 | 84391-84426 | 9 | 0.75 |
NC_014721_5 | 5.55|2673225|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2673225-2673260 | 36 | NZ_CP047434 | Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-6 | 93715-93750 | 9 | 0.75 |
NC_014721_5 | 5.55|2673225|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2673225-2673260 | 36 | NZ_CP013198 | Spiroplasma citri strain R8-A2 plasmid pSCI26, complete sequence | 20855-20890 | 9 | 0.75 |
NC_014721_5 | 5.55|2673225|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2673225-2673260 | 36 | NZ_CP013199 | Spiroplasma citri strain R8-A2 plasmid pSCI15, complete sequence | 1815-1850 | 9 | 0.75 |
NC_014721_5 | 5.55|2673225|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2673225-2673260 | 36 | NZ_CP047445 | Spiroplasma citri strain BLH-MB plasmid pSciBLHMB-8 | 27224-27259 | 9 | 0.75 |
NC_014721_5 | 5.55|2673225|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2673225-2673260 | 36 | X51344 | Spiroplasma phage 1-R8A2B complete genome | 7116-7151 | 9 | 0.75 |
NC_014721_6 | 6.1|2689704|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2689704-2689738 | 35 | MK250024 | Prevotella phage Lak-B5, complete genome | 475822-475856 | 9 | 0.743 |
NC_014721_6 | 6.1|2689704|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2689704-2689738 | 35 | MK250028 | Prevotella phage Lak-B9, complete genome | 480253-480287 | 9 | 0.743 |
NC_014721_6 | 6.1|2689704|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2689704-2689738 | 35 | MK250025 | Prevotella phage Lak-B6, complete genome | 478915-478949 | 9 | 0.743 |
NC_014721_6 | 6.1|2689704|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2689704-2689738 | 35 | MK250022 | Prevotella phage Lak-B3, complete genome | 479005-479039 | 9 | 0.743 |
NC_014721_6 | 6.1|2689704|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2689704-2689738 | 35 | MK250020 | Prevotella phage Lak-B1, complete genome | 480236-480270 | 9 | 0.743 |
NC_014721_9 | 9.6|2720931|37|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2720931-2720967 | 37 | MK798156 | Enterococcus hirae strain fas4 plasmid pfas4-2, complete sequence | 796-832 | 9 | 0.757 |
NC_014721_2 | 2.134|2505770|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 2505770-2505806 | 37 | NZ_CP024793 | Nostoc flagelliforme CCNUN1 plasmid pNFSY08, complete sequence | 31208-31244 | 10 | 0.73 |
NC_014721_2 | 2.180|2499118|39|NC_014721|CRT | 2499118-2499156 | 39 | NC_012036 | Caldicellulosiruptor bescii DSM 6725 plasmid pATHE01, complete sequence | 1950-1988 | 10 | 0.744 |
NC_014721_3 | 3.5|2653024|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2653024-2653060 | 37 | NZ_CP045273 | Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301A, complete sequence | 197444-197480 | 10 | 0.73 |
NC_014721_3 | 3.18|2653881|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2653881-2653916 | 36 | NZ_CP024398 | Borrelia miyamotoi strain Izh-4 plasmid pIzh4-lp27, complete sequence | 17969-18004 | 10 | 0.722 |
NC_014721_3 | 3.18|2653881|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2653881-2653916 | 36 | NZ_CP024214 | Borrelia miyamotoi strain Izh-5 plasmid pIzh5-7 | 8652-8687 | 10 | 0.722 |
NC_014721_3 | 3.18|2653881|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2653881-2653916 | 36 | NZ_CP024360 | Borrelia miyamotoi strain Izh-16 plasmid pIzh16-6 | 17967-18002 | 10 | 0.722 |
NC_014721_5 | 5.1|2669653|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2669653-2669689 | 37 | NZ_CP016275 | Yersinia pestis strain Cadman plasmid pMT1, complete sequence | 46903-46939 | 10 | 0.73 |
NC_014721_5 | 5.1|2669653|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2669653-2669689 | 37 | NZ_CP009490 | Yersinia pestis strain PBM19 plasmid pMT1, complete sequence | 23891-23927 | 10 | 0.73 |
NC_014721_5 | 5.1|2669653|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2669653-2669689 | 37 | NZ_CP009784 | Yersinia pestis strain El Dorado plasmid pMT, complete sequence | 44600-44636 | 10 | 0.73 |
NC_014721_5 | 5.1|2669653|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2669653-2669689 | 37 | NZ_CP009722 | Yersinia pestis strain Shasta plasmid pMT, complete sequence | 10272-10308 | 10 | 0.73 |
NC_014721_5 | 5.1|2669653|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2669653-2669689 | 37 | NC_003134 | Yersinia pestis CO92 plasmid pMT1, complete sequence | 35157-35193 | 10 | 0.73 |
NC_014721_5 | 5.1|2669653|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2669653-2669689 | 37 | NC_017158 | Yersinia pestis D182038 plasmid pMT1, complete sequence | 35157-35193 | 10 | 0.73 |
NC_014721_5 | 5.1|2669653|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2669653-2669689 | 37 | NZ_CP009841 | Yersinia pestis A1122 plasmid pMT, complete sequence | 72724-72760 | 10 | 0.73 |
NC_014721_5 | 5.8|2670119|34|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2670119-2670152 | 34 | NC_014533 | Gloeothece verrucosa PCC 7822 plasmid Cy782201, complete sequence | 304317-304350 | 10 | 0.706 |
NC_014721_5 | 5.14|2670516|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2670516-2670552 | 37 | NZ_CP046163 | Vibrio sp. THAF191c plasmid pTHAF191c_b, complete sequence | 1271903-1271939 | 10 | 0.73 |
NC_014721_5 | 5.14|2670516|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2670516-2670552 | 37 | NZ_CP046066 | Vibrio sp. THAF191d plasmid pTHAF191d_b, complete sequence | 1455295-1455331 | 10 | 0.73 |
NC_014721_5 | 5.14|2670516|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2670516-2670552 | 37 | NZ_CP045356 | Vibrio sp. THAF64 plasmid pTHAF64_a, complete sequence | 304609-304645 | 10 | 0.73 |
NC_014721_8 | 8.30|2710794|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2710794-2710830 | 37 | NZ_CP017242 | Rhizobium etli 8C-3 plasmid pRsp8C3a, complete sequence | 87455-87491 | 10 | 0.73 |
NC_014721_2 | 2.19|2498196|36|NC_014721|CRISPRCasFinder | 2498196-2498231 | 36 | NC_024210 | Escherichia phage e4/1c, complete genome | 27612-27647 | 11 | 0.694 |
NC_014721_3 | 3.15|2653684|38|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2653684-2653721 | 38 | LR215718 | Staphylococcus phage Stab20 genome assembly, chromosome: I | 5886-5923 | 11 | 0.711 |
NC_014721_3 | 3.15|2653684|38|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2653684-2653721 | 38 | LR215718 | Staphylococcus phage Stab20 genome assembly, chromosome: I | 148410-148447 | 11 | 0.711 |
NC_014721_6 | 6.19|2690885|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2690885-2690921 | 37 | NC_012036 | Caldicellulosiruptor bescii DSM 6725 plasmid pATHE01, complete sequence | 837-873 | 11 | 0.703 |
NC_014721_2 | 2.166|2498196|37|NC_014721|CRT | 2498196-2498232 | 37 | NC_024210 | Escherichia phage e4/1c, complete genome | 27612-27648 | 12 | 0.676 |
1. spacer 9.1|2720606|26|NC_014721|CRT matches to MK448795 (Streptococcus phage Javan527, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.885
ctataatgcatttgatatcaattatt CRISPR spacer cgataatgcattttatatcaataatt Protospacer * *********** ******** ***
2. spacer 8.37|2711251|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF360958 (Salicola phage SCTP-2, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
attaatatga----gtattcaaatcttctaatgttttact CRISPR spacer ----atatgaggatgtattcaaatcttcaaatgctttact Protospacer ****** ************** ****.******
3. spacer 9.1|2720606|26|NC_014721|CRT matches to NZ_CP020859 (Lactobacillus salivarius strain ZLS006 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.769
ctataatgcatttgatatcaattatt CRISPR spacer gtataatgcatttgatatcattagaa Protospacer ******************* * .
4. spacer 9.1|2720606|26|NC_014721|CRT matches to NZ_AP014865 (Bacillus thuringiensis serovar tolworthi strain Pasteur Institute Standard strain plasmid pKK1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.769
ctataatgcatttgatatcaattatt CRISPR spacer atataatacatttgatatcaatggaa Protospacer ******.************** .
5. spacer 9.1|2720606|26|NC_014721|CRT matches to NZ_CP050184 (Bacillus thuringiensis strain HER1410 plasmid pLUSID1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.769
ctataatgcatttgatatcaattatt CRISPR spacer atataatacatttgatatcaatggaa Protospacer ******.************** .
6. spacer 9.1|2720606|26|NC_014721|CRT matches to LT960552 (Yersinia phage fHe-Yen9-03 genome assembly, complete genome: monopartite) position: , mismatch: 6, identity: 0.769
ctataatgcatttgatatcaattatt CRISPR spacer gtataatgcatttgatatcacccaaa Protospacer ******************* ..*
7. spacer 9.1|2720606|26|NC_014721|CRT matches to LR596615 (Yersinia phage fHe-Yen9-04 genome assembly, chromosome: I) position: , mismatch: 6, identity: 0.769
ctataatgcatttgatatcaattatt CRISPR spacer gtataatgcatttgatatcacccaaa Protospacer ******************* ..*
8. spacer 9.1|2720606|26|NC_014721|CRT matches to NC_042116 (Yersinia phage fHe-Yen9-04 genome assembly, complete genome: monopartite) position: , mismatch: 6, identity: 0.769
ctataatgcatttgatatcaattatt CRISPR spacer gtataatgcatttgatatcacccaaa Protospacer ******************* ..*
9. spacer 9.6|2720931|37|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to KY794642 (Staphylococcus phage vB_Sau_Clo6, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.838
--ttttttataacctcctttttgttttacaattataatt CRISPR spacer cagttttgata--ctcctttttcttttacaattttaatt Protospacer **** *** ********* ********** *****
10. spacer 9.6|2720931|37|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_023573 (Staphylococcus phage phiSA012 DNA, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.838
--ttttttataacctcctttttgttttacaattataatt CRISPR spacer cagttttgata--ctcctttttcttttacaattttaatt Protospacer **** *** ********* ********** *****
11. spacer 3.18|2653881|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT074146 (Bacteroides phage SJC03, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
ataatttagatgaatttaaaaaatatttaatgacta CRISPR spacer aaaatttagatgaaataaaaaaatatttaaaaaatt Protospacer * ************ * ************* .* *
12. spacer 3.18|2653881|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT074139 (Bacteroides phage DAC19, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
ataatttagatgaatttaaaaaatatttaatgacta CRISPR spacer aaaatttagatgaaataaaaaaatatttaaaaaatt Protospacer * ************ * ************* .* *
13. spacer 3.18|2653881|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JN800508 (Clostridium phage phi24R, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
ataatttagatgaatttaaaaaatattt-aatgacta CRISPR spacer caaaattagatgaatataaaaaatatttaaataagt- Protospacer ** ********** ************ ***.* *
14. spacer 3.18|2653881|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT074140 (Bacteroides phage DAC20, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
ataatttagatgaatttaaaaaatatttaatgacta CRISPR spacer aaaatttagatgaaataaaaaaatatttaaaaaatt Protospacer * ************ * ************* .* *
15. spacer 3.18|2653881|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH999279 (Clostridium phage CPD2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
ataatttagatgaatttaaaaaatattt-aatgacta CRISPR spacer caaaattagatgaatataaaaaatatttaaataagt- Protospacer ** ********** ************ ***.* *
16. spacer 8.30|2710794|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT684590 (Streptomyces phage LilMartin, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
---taagcttctggttctcctcttcaagcttcttgatata CRISPR spacer tgatgagctt---gttctcatcttcaagcttcttgatacg Protospacer *.***** ****** ******************..
17. spacer 8.30|2710794|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT897905 (Streptomyces phage MulchMansion, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
---taagcttctggttctcctcttcaagcttcttgatata CRISPR spacer tgatgagctt---gttctcatcttcaagcttcttgatacg Protospacer *.***** ****** ******************..
18. spacer 9.21|2721948|37|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to JX094431 (Bacillus cereus bacteriophage vB_BceM_Bc431v3, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
tcttgtagtttagctaattcttcttcatt--tgtgctgg CRISPR spacer tcttgaagttcagctaattcttcttctgtagcgtgct-- Protospacer ***** ****.*************** * .*****
19. spacer 5.8|2670119|34|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009332 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
taattaaaactagcaatttaataatcccccgcaa CRISPR spacer taatgaaaactagcaattaaataaaatcgcccta Protospacer **** ************* ***** .* * * *
20. spacer 5.8|2670119|34|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053977 (Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_795 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
taattaaaactagcaatttaataatcccccgcaa CRISPR spacer taatgaaaactagcaattaaataaaatcgcccta Protospacer **** ************* ***** .* * * *
21. spacer 5.21|2670979|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_015695 (Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL05, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
gaccctctaattgtttttgttttgactgataaaattt CRISPR spacer aattctgacattgtttttgttttgacagaaaaaattt Protospacer .*..** ***************** ** *******
22. spacer 6.1|2689704|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK250021 (Prevotella phage Lak-B2, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tttttatcattgttatttttttaacaatgcattga CRISPR spacer atctcttcattgttattttattaacaatacaaaga Protospacer *.*. ************* ********.** **
23. spacer 6.1|2689704|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK250023 (Prevotella phage Lak-B4, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tttttatcattgttatttttttaacaatgcattga CRISPR spacer atctcttcattgttattttattaacaatacaaaga Protospacer *.*. ************* ********.** **
24. spacer 6.1|2689704|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK250027 (Prevotella phage Lak-B8, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tttttatcattgttatttttttaacaatgcattga CRISPR spacer atctcttcattgttattttattaacaatacaaaga Protospacer *.*. ************* ********.** **
25. spacer 6.1|2689704|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK250026 (Prevotella phage Lak-B7, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tttttatcattgttatttttttaacaatgcattga CRISPR spacer atctcttcattgttattttattaacaatacaaaga Protospacer *.*. ************* ********.** **
26. spacer 2.33|2499118|38|NC_014721|CRISPRCasFinder matches to NC_012036 (Caldicellulosiruptor bescii DSM 6725 plasmid pATHE01, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
tatcgatgactttccaagttagaaagtcacctttgcaa CRISPR spacer ttaaaatgactttccaagttaggaagtcaccttttagg Protospacer * .*****************.*********** ..
27. spacer 2.126|2505240|38|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KX827371 (Staphylococcus phage SpT99F3, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gtgatataatataattagaaagttgaaaataaaaaacg CRISPR spacer gtgatataatatatatagaaagttgaagggaggaaaaa Protospacer ************* ************.. *..*** .
28. spacer 2.126|2505240|38|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_007051 (Staphylococcus phage 2638A, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gtgatataatataattagaaagttgaaaataaaaaacg CRISPR spacer gtgatataatatatatagaaagttgaagggaggaaaaa Protospacer ************* ************.. *..*** .
29. spacer 2.126|2505240|38|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MK450538 (Staphylococcus phage vB_SpsS_QT1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gtgatataatataattagaaagttgaaaataaaaaacg CRISPR spacer gtgatataatatatatagaaagttgaagggaggaaaaa Protospacer ************* ************.. *..*** .
30. spacer 2.126|2505240|38|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MK075004 (Staphylococcus phage phiSP119-1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gtgatataatataattagaaagttgaaaataaaaaacg CRISPR spacer gtgatataatatatatagaaagttgaagggaggaaaaa Protospacer ************* ************.. *..*** .
31. spacer 2.126|2505240|38|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to AY954954 (Bacteriophage 2638A, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.763
gtgatataatataattagaaagttgaaaataaaaaacg CRISPR spacer gtgatataatatatatagaaagttgaagggaggaaaaa Protospacer ************* ************.. *..*** .
32. spacer 5.7|2670054|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT345684 (Alteromonas phage vB_AcoS-R7M, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tacttcttaatgcgttgcttttattccagcggaaa CRISPR spacer tgtggcatagtgcgttgcttgtattccagcgggga Protospacer *.. * **.********** ***********..*
33. spacer 5.55|2673225|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP047429 (Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ctgagataaaatcatttaatttaagtcttacattag CRISPR spacer atcatataaactcatttaatttaagtctttcaaatc Protospacer * * ***** ****************** **
34. spacer 5.55|2673225|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP047434 (Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-6) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ctgagataaaatcatttaatttaagtcttacattag CRISPR spacer atcatataaactcatttaatttaagtctttcaaatc Protospacer * * ***** ****************** **
35. spacer 5.55|2673225|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP047434 (Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-6) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ctgagataaaatcatttaatttaagtcttacattag CRISPR spacer atcatataaactcatttaatttaagtctttcaaatc Protospacer * * ***** ****************** **
36. spacer 5.55|2673225|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP047434 (Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-6) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ctgagataaaatcatttaatttaagtcttacattag CRISPR spacer atcatataaactcatttaatttaagtctttcaaatc Protospacer * * ***** ****************** **
37. spacer 5.55|2673225|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP047434 (Spiroplasma citri strain BLH-13 plasmid pSciBLH13-6) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ctgagataaaatcatttaatttaagtcttacattag CRISPR spacer atcatataaactcatttaatttaagtctttcaaatc Protospacer * * ***** ****************** **
38. spacer 5.55|2673225|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP013198 (Spiroplasma citri strain R8-A2 plasmid pSCI26, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ctgagataaaatcatttaatttaagtcttacattag CRISPR spacer atcatataaactcatttaatttaagtctttcaaatc Protospacer * * ***** ****************** **
39. spacer 5.55|2673225|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP013199 (Spiroplasma citri strain R8-A2 plasmid pSCI15, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ctgagataaaatcatttaatttaagtcttacattag CRISPR spacer atcatataaactcatttaatttaagtctttcaaatc Protospacer * * ***** ****************** **
40. spacer 5.55|2673225|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP047445 (Spiroplasma citri strain BLH-MB plasmid pSciBLHMB-8) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ctgagataaaatcatttaatttaagtcttacattag CRISPR spacer atcatataaactcatttaatttaagtctttcaaatc Protospacer * * ***** ****************** **
41. spacer 5.55|2673225|36|NC_014721|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to X51344 (Spiroplasma phage 1-R8A2B complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ctgagataaaatcatttaatttaagtcttacattag CRISPR spacer atcatataaactcatttaatttaagtctttcaaatc Protospacer * * ***** ****************** **
42. spacer 6.1|2689704|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK250024 (Prevotella phage Lak-B5, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tttttatcattgttatttttttaacaatgcattga CRISPR spacer aactcttcattgttattttattaacaatacaaaga Protospacer .*. ************* ********.** **
43. spacer 6.1|2689704|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK250028 (Prevotella phage Lak-B9, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tttttatcattgttatttttttaacaatgcattga CRISPR spacer aactcttcattgttattttattaacaatacaaaga Protospacer .*. ************* ********.** **
44. spacer 6.1|2689704|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK250025 (Prevotella phage Lak-B6, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tttttatcattgttatttttttaacaatgcattga CRISPR spacer aactcttcattgttattttattaacaatacaaaga Protospacer .*. ************* ********.** **
45. spacer 6.1|2689704|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK250022 (Prevotella phage Lak-B3, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tttttatcattgttatttttttaacaatgcattga CRISPR spacer aactcttcattgttattttattaacaatacaaaga Protospacer .*. ************* ********.** **
46. spacer 6.1|2689704|35|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK250020 (Prevotella phage Lak-B1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tttttatcattgttatttttttaacaatgcattga CRISPR spacer aactcttcattgttattttattaacaatacaaaga Protospacer .*. ************* ********.** **
47. spacer 9.6|2720931|37|NC_014721|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MK798156 (Enterococcus hirae strain fas4 plasmid pfas4-2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
ttttttataacctcctttttgttttacaattataatt CRISPR spacer gcctttataaactcctttttgttttgcaattgctata Protospacer ..******* **************.*****.. **
48. spacer 2.134|2505770|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP024793 (Nostoc flagelliforme CCNUN1 plasmid pNFSY08, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
gtacagacaaaaataaaaaatgagcacgcttttttta CRISPR spacer ggtgaaacaaaaataacaaatgagcaagctttatcct Protospacer * *.********** ********* ***** *..
49. spacer 2.180|2499118|39|NC_014721|CRT matches to NC_012036 (Caldicellulosiruptor bescii DSM 6725 plasmid pATHE01, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.744
tatcgatgactttccaagttagaaagtcacctttgcaag CRISPR spacer ttaaaatgactttccaagttaggaagtcaccttttagga Protospacer * .*****************.*********** ...
50. spacer 3.5|2653024|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045273 (Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301A, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
gcataataagaaggtttaaaaaaattgaatatactat------ CRISPR spacer gcataataagaagcttaaaaaaaat------ttttatttaaaa Protospacer ************* ** ******** * .***
51. spacer 3.18|2653881|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024398 (Borrelia miyamotoi strain Izh-4 plasmid pIzh4-lp27, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
ataatttagatgaatttaaaaaatatttaatgacta CRISPR spacer aatttttatatgaatttaaaaaagatttaaaaaaat Protospacer * **** ************** ****** .*
52. spacer 3.18|2653881|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024214 (Borrelia miyamotoi strain Izh-5 plasmid pIzh5-7) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
ataatttagatgaatttaaaaaatatttaatgacta CRISPR spacer aatttttatatgaatttaaaaaagatttaaaaaaat Protospacer * **** ************** ****** .*
53. spacer 3.18|2653881|36|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024360 (Borrelia miyamotoi strain Izh-16 plasmid pIzh16-6) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
ataatttagatgaatttaaaaaatatttaatgacta CRISPR spacer aatttttatatgaatttaaaaaagatttaaaaaaat Protospacer * **** ************** ****** .*
54. spacer 5.1|2669653|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016275 (Yersinia pestis strain Cadman plasmid pMT1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
acaattaaaaaattttcttcaatacaaacatcatcag----- CRISPR spacer ggaataaaaaaattttcttcaataaaa-----atcaaagtct Protospacer . *** ****************** ** ****.
55. spacer 5.1|2669653|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009490 (Yersinia pestis strain PBM19 plasmid pMT1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
acaattaaaaaattttcttcaatacaaacatcatcag----- CRISPR spacer ggaataaaaaaattttcttcaataaaa-----atcaaagtct Protospacer . *** ****************** ** ****.
56. spacer 5.1|2669653|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009784 (Yersinia pestis strain El Dorado plasmid pMT, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
acaattaaaaaattttcttcaatacaaacatcatcag----- CRISPR spacer ggaataaaaaaattttcttcaataaaa-----atcaaagtct Protospacer . *** ****************** ** ****.
57. spacer 5.1|2669653|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009722 (Yersinia pestis strain Shasta plasmid pMT, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
acaattaaaaaattttcttcaatacaaacatcatcag----- CRISPR spacer ggaataaaaaaattttcttcaataaaa-----atcaaagtct Protospacer . *** ****************** ** ****.
58. spacer 5.1|2669653|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_003134 (Yersinia pestis CO92 plasmid pMT1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
acaattaaaaaattttcttcaatacaaacatcatcag----- CRISPR spacer ggaataaaaaaattttcttcaataaaa-----atcaaagtct Protospacer . *** ****************** ** ****.
59. spacer 5.1|2669653|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_017158 (Yersinia pestis D182038 plasmid pMT1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
acaattaaaaaattttcttcaatacaaacatcatcag----- CRISPR spacer ggaataaaaaaattttcttcaataaaa-----atcaaagtct Protospacer . *** ****************** ** ****.
60. spacer 5.1|2669653|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009841 (Yersinia pestis A1122 plasmid pMT, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
acaattaaaaaattttcttcaatacaaacatcatcag----- CRISPR spacer ggaataaaaaaattttcttcaataaaa-----atcaaagtct Protospacer . *** ****************** ** ****.
61. spacer 5.8|2670119|34|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_014533 (Gloeothece verrucosa PCC 7822 plasmid Cy782201, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
taattaaaactagcaatttaataatcccccgcaa CRISPR spacer taattaaaactagaaatttgataattttttttga Protospacer ************* *****.*****..... ..*
62. spacer 5.14|2670516|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP046163 (Vibrio sp. THAF191c plasmid pTHAF191c_b, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
attgtaaaagatattcgatattgccta-----aatcattcat CRISPR spacer attgtaaaacatcttcgatattgcctagtgcgagttg----- Protospacer ********* ** ************** *.*..
63. spacer 5.14|2670516|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP046066 (Vibrio sp. THAF191d plasmid pTHAF191d_b, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
attgtaaaagatattcgatattgccta-----aatcattcat CRISPR spacer attgtaaaacatcttcgatattgcctagtgcgagttg----- Protospacer ********* ** ************** *.*..
64. spacer 5.14|2670516|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045356 (Vibrio sp. THAF64 plasmid pTHAF64_a, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
attgtaaaagatattcgatattgccta-----aatcattcat CRISPR spacer attgtaaaacatcttcgatattgcctagtgcgagttg----- Protospacer ********* ** ************** *.*..
65. spacer 8.30|2710794|37|NC_014721|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP017242 (Rhizobium etli 8C-3 plasmid pRsp8C3a, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
taagcttctggttctcctcttcaagcttcttgatata CRISPR spacer gaagcttctcgttctcctcttcgagctgaacaagatc Protospacer ******** ************.**** ..* **
66. spacer 2.19|2498196|36|NC_014721|CRISPRCasFinder matches to NC_024210 (Escherichia phage e4/1c, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
tcaacaaattaacaccacagcagcaacaacagattg CRISPR spacer gcggggaattagcaccacagcaacaacaacagcaac Protospacer *.. .*****.**********.*********
67. spacer 3.15|2653684|38|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LR215718 (Staphylococcus phage Stab20 genome assembly, chromosome: I) position: , mismatch: 11, identity: 0.711
tttatgtatgtcaatagttttttaaactttctctacaa CRISPR spacer caagtgactgtcaatagttttttaaactttttttattt Protospacer . .** **********************.*.**.
68. spacer 3.15|2653684|38|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LR215718 (Staphylococcus phage Stab20 genome assembly, chromosome: I) position: , mismatch: 11, identity: 0.711
tttatgtatgtcaatagttttttaaactttctctacaa CRISPR spacer caagtgactgtcaatagttttttaaactttttttattt Protospacer . .** **********************.*.**.
69. spacer 6.19|2690885|37|NC_014721|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_012036 (Caldicellulosiruptor bescii DSM 6725 plasmid pATHE01, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
cacaaaattatagtttggcgcaatcacggtctcctaa CRISPR spacer cacaaaattatatttttgcgcaatcaaaaaatgtttg Protospacer ************ *** ********* .. * .* .
70. spacer 2.166|2498196|37|NC_014721|CRT matches to NC_024210 (Escherichia phage e4/1c, complete genome) position: , mismatch: 12, identity: 0.676
tcaacaaattaacaccacagcagcaacaacagattgg CRISPR spacer gcggggaattagcaccacagcaacaacaacagcaacc Protospacer *.. .*****.**********.*********
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
33870 : 108146
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_014721|33870:108146|DBSCAN-SWA AATGGATAAAAATACCTATTATGAAACTGTAAAAAATATGGCCGTTGAAAAAGTGTTAAACAAATACTGTTCTGAACAAGACCCTGCTCGTCCAGCGCTAAAAAAGTTGTTAGAAGATTTACTTGATTGGTTCATGCTGTCTGAGCGTGAAATATATCTTTCAAAAAATGATAATGACAAAGGTAATGGGTTCTATGAAAGAAAACTTGCAACACCTATAGGCAACCTTGAAATATCTGTCCCAAGAACTCGAACAGGTGGTTTTAGACCTCATATTCTACCTGAACCATATAAAAGAGTCGATGAATCTTATACAGAACTTCTTATGTCTTTGGTCATCAACGGTTATTCCGAAACAACACTTTTGAATACTCTCAAAAGTCTTGATTTACCCTACTCTGAAGACGAGCTCAGTAGAATCAAGAATAATCTCAAAAACGAACTAGACCTTTTTAAACAAAGAGAGTTACCTCAAGAAGCATTTGCTCTGATAATAGATGCATATCACTCTGAAATCAAAGATGGTTCAAAGGTTAAAAAGGCTGCATGTTATATCATCCTTGGTATTGACATGGATGGCAAAAAAGATATCTTTGGCATATACACTTTCTTTGGTAAAGAAAACAGAGCAGATTGGAATAAAGTCTTTGAAGATTTAATAAATCGTGGTCTTAAAAAAGTTTTAGTAATTGTTAGTGACGACTTCCCAGGAATAATTGAAACAATTAAAGCTGTATATCCATATGCCGATCATCAACTTTGTCTTGTCCATCTTCAAAGAAATGTCCGAAAACATATGGCTAAAATTGATGCAGCAAAGTTTAACAAAGAATTAGACAAAATCAAGCTTGCTTCCTCTTTTGATGAAGCTACAGAAAAATTCGAGCAACTATGTAATGAATTTAAAGATAAATATCCTCGGTTTATAAATGCTATCTTACAAAAATCAGAGCATTACTTTGCTTTTACAAAATACCCCGATGAGGTAAGAAAACATATTTATACCACAAATGCTGTAGAAAGTGTTAACAGCCTAATTGAAAAAATTAGAATAAAATTGGGCGGATACTTTAACTCAGTGGATGTTTTAGAAATCAATATATACCTGCAACGCGAAAATCTAAAGCAAACCAAATGGAAGAATCCTGTTCCAATGATAAAGGCTCACATTTATGATATTCACCAACTTTTCCAGTTACGCTACTTTACCCAGACACAAAATTCTTGACAAGTCTCAAGAAGCCTCAAATAACTAAAGAAAATGCGAGCGAATTTTTTGAACTTGTTGTTGATAAAGAGGAAGTAGGTATAATAGAAAAGGCGAAGCTCACACTAAAGAGCAAAGTAAAGGGTGTCAAGTTTACAGCAGAGTGGAAGGCAAGTGGTGGTAAACTTGAGGTAGCTAAAGATAATCAGAGTGCGATTTGGAGCCCGACAGATGCAGAAGAGGGTAAGAATTATATTGTGACTGTTGAAGTAACCATCCTGACAGATAATGGGGAAAAGATAAAAATACAAAAGGTTGCAAGGATACGAGTGAACGAGGGCGTCCAACTGACAAAGAATGAAAACATAGAAGAACCGGTGAATAAAATAGATCCGTTATTTACCCAAAGAGAATCAAACAATTTAGTTCAAGAAAATTCTAGTTATAGCCCATTAGAAGAAAAACTTGCAGCACCAATATTGAAAATAGCAAAAAAAGGTGAATATGTAGAGCTTACTTGGAATGAGGTAAAAGGTGCAAGGAGTTACATTGTAAAAAGAGGGAAGGTAAGCGGGGAGTATGAGGTATTGGCAAGCGGAGTTATTACCACGGCTTATATTGATGGCCCTATGGATGGAAAAACAACGTATTACTATGTGGTTGCAGCAGTGGGAGCAAATGGTACGACCAGTATGAATTCAAATGAGGTAGTGTACAAAGCACTACCACAATCACCAAAGTTATTTGGGACATACAATGGGACAAGTGCACGTCTTACATGGACGAAAGCCAATGGAGCAGAGAGGTATACTCTTTACAGGAGCACAGTCAGTGGAGGACCATACTATGCAATTGCAGAAAACTTACTTACCAATGTGTTTGAAGATACTAATTTGACATCAGGTACAGTGTATTACTATGTAGTAAAAGCCATTAACGAATTAGGAGAAAGTGAATACTCAAATGAGGTAGCGATGGGGGAAGGAGTGACAGTTGCAGCTAAATTTAATCCTGATGACGACGAGGATGGAGATGGGTTGACAAATGTAGATGAGTTAAAATATGCAACAAGTTTGAAGAAGAATGATAGTGATGGAGATGGGTTGAGTGACGGTTATGAAGTAAAGAAAGGAACAAATCCATTAGTACCGGATACAGATAATGACGGGATATATGATGGAGCAGAGGTTGTGATGGGAACAGACCCATTGACAAAGAATCCTTTGACAAGTGCCGAGAAATATGCGGTATCGGAAGATGGTAAAGTTTTTGTAAGAGCACTTTCTGATGCAAATATTTTAATAGCTCCCTTACAGGTAAAGAGGTCTGACAATGTGTTTATTAACTCATTGAAAGGAATAGTAGGTAAAGCGATAGAGATAACTGCAGGGGGATTTGATATAAAGAAGGCAGAGATAGTAGTGAACTATGATGAAGCAGAACTTAATGGTGTAGAAGAGAATAATTTAATGCTGTATTATGTCAATTATGACAAGAAGATATTAGAGCCGTTAGAAGATGTTGTAGTAGATACAGTGTATAATCGAGTTTCGGGTAAGACAGAGCATTTTAGTACATTTTTACTTGGCGATAAGAATATGCCAGTTGATCTTTCCAAAGTAGATATTGTGTTTGTATTTGACAACTCAGGTAGTATGTTGTCTAATGACCCAAATTATTACAGAATAGAAGCAACAAAGAAATTTATACAAAATATAGATGAACTTAACAATAGAGTTGGGTTAGTAGATTTCGATAGCTCTGTAAGTGTTAGATCAAATTTGACATCTGACAAGAGCAAATTGTTACAAGCCCTAAATGCGATGAGATGGACAGGTGGTTCTACGAATATAGGAGGAGGATTAAAAGCTGCACTGGGATTATTCGACCAAGAGCAATCTAAAAAGATAATAGTACTTTTATCAGACGGATATCACAACACAGGAATTCATCCAAACGATGTACTACCAGAATTAATAAAACAAGAAATAGTAGTAAATACCATTGCATTGGGTAAAGATTGTGATAGGGAGTTATTACATGATATAGCTGATAAGACAAAAGGAGGCTATTTTTACATTGATAATACAGGAGGACTTTCTCAAGAAGATGTAGACAAGCAAATAGAGCTAATATACGAGAAACTAACTAAATGGATAACCCTTCAAAAGGAAGCAGAAAAGAATCTCAAACCTCAAGAAGTGTTAAGTATAGAGTACAATGATGTAGGTTTAGACAATGAAGAGTTTCATAAATGGATAACCACAGCTATGACTAATTTACTTACGGGAAATTATATGGAAGAGTTTGAGGATATTAGCATAGAGGGGAATGGTCCTGAGTTTAAATTTGTGAGGTATTACAATTCTTTTGCTAATCAACAAAAGACGATAATAGGTAAAGGTTTTAGAACCAATTTTGACAGCAAGCTTACAAAGGTAGCGGGAGTCGGAATAGTCCAAGCAGGGGTATTGAATGTAAGAGAAGGACCGAATGTAAATACCAAAAAGATAGGGTATTTGACTAAGGGGACAAAGGTGCAAATTGAAGAGGATGGCAACAAGAGCGGCAGTGGTTGGCACAGAATCGTATATAAAGGTAAATCTGCATATATTTGTGCAGCATATGTCAAAGAACTAAACAATGGAATTGAAGTAACATATCCAAGTGGTAGTATGATAGTATTTGTGGATGATAATGGAGATGGGATTTACTTGTCAGACAGTAACAAAGCTGACAAGGTAGTTTTGTCAGGTAATGAATATGTATTGATACAAAGAGATTTGACGAGATATGTTTTTGACAAGAGTGGAAAGCTTGTCAAAATTGGTGATAGGAATGAGAATTACATTACTATTGAGTATTCTGGTGACAAGATATTTACGGCAAGGGATGTATTCGGCAGGAAGTTAGAATTTATCTTTCAAGGAGATAACCTGGTATGTATAAGAGAGAACATCAAAGGTAAAATAGGTAGGAAAGTAGAATTTGTATATGATAACAAGGATAGACTAATAAAAGTAATTGGGGTTGATGGCACAGAGACAAGATATGAATATGATGAGAAAGACAGGCTCAAGAGGATAATTGATGCGAACGGGCACCAAGTGGTAAGGAATGAATATGATATTTTAGGTAGGATAGTAAGGCAATATGATGGGGAAGATATAATCAGATTTTTCATATACGATGATGAAGACAGAGTAAGATATTATATAGACGAAAATGGTAATGAGAGTATGATAGTATTCAATGAAGAACTAAAACCAATAAAAGAGAGAAATGCATTGGGTGGGGGTTGTGACTACAAGTATGAGATTTATGACGGTTCAAAGTGGATAGACGTGACAACTCCTGATTTGGATAAGGATGTGGTTGTGAGCGGTCTTACACGGGAAAAATATCAAGAGCTGAAAGAGAAAGGTAGCATGACAAAGCAGGTCACAATTCAGATAATAAAGACTTCTCCTAGTTTAGAAACAGCAAAGACTACACAAATATACGATGGACGTGGCAATATTATCCAGGTGATAGATGCTTATGGTAATTCAATAAAAATGAAATATGATAACAATAATAATTTAATTGAGCAAACAGACAGGATTGGTGCTACTACCAAATATGTTTATGATGCCGAGGGTATAAATTTAATTGAGAAAATTGATCCACTTGGAAACAAGGAAAGATATGAATATTATTCTATAAATTCGGGCATAAAACTCAAAGGTTTACTTGCAAAGTATATAGATAAAAATGGTAATGAGACGAGATACTATTATGAAGATGAATATAA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54 | Bacillus_phage(20.0%) | transposase,tRNA,integrase | attL 40151:40210|attR 113267:113669 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
572503 : 636432
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_014721|572503:636432|DBSCAN-SWA ATTGAATTTGGTAAAACTTGCAAAACAGCAGATTCAAGATGTAGTTCAAAATGCCATAAAAAACTGTATTGATAAAGGAATATTTGAGCTTGACAGCATTCCAGATATAATGATTGAAAAGCCGAAAGAGAAATCTCACGGCGATTTTGCAACAAACATAGCAATGGAGCTTACAAGAAAACTAAAGAAAAATCCCCGGGAGATAGCCCAGAGCATTTTAAGCTCAGTTGATTTATCAAATACTTTCATTGAAAAGGTTGAAGTTGCAGGGCCAGGATTTATAAATTTCTTTTTCAAAAAAGACTGGCTTTACAAAGTTGTGGATGTGATTTTGTCTGAAGGCGACGACTATGGAAAGGTAAATATTGGAAATAGCAAAAAAGTGATGGTTGAGTTTGTCTCGGCAAATCCGACTGGTCCTATGCACATGGGGAATGCCCGCGGAGGTGCGCTTGGGGACTGCCTTGCAAACCTTTTAAAATGGGCAGGATACAATGTCACAAAAGAGTTTTATGTCAATGATGCTGGAAACCAGATAGAAAAGTTTGGACAGAGCCTTGAGATTAGATACAGACAGCTCAAGGGCGAAAATATAGAGCTTCCTGAAGATTGCTATCATGGTGAGGATATAATCGAAAGGGTAAAAGAATATTTAGATGAGCACGGGGATGATTTAGAGAACTTGTCCTCAGATGAGAGAAGGGAAAAACTTGTTGACTTTGCCCTAAAGAGAAATATTTCGCTTATGAAAGAGCACTTGAGAAAATATGGCATAGAATATGATGTATGGTTTCATGAAAGTAGCCTTTATGAAAGTGGAGAAGTTTTTGAGACAATTGAGGATTTAAAATCAAGAGGATACACGTACGAAAAAGACGGGGCGCTGTGGTTTGCAGCATCAAAGATAGATGAGAACTTGAAAGATGAGGTTTTGATAAGAGCAAATGGGATTCCAACCTATTTTGCAGCTGATATTGCTTATCACAGAAACAAGTTTGAAAAAAGAGGCTTTGACATTGTGATAGACATCTGGGGTGCTGACCATCACGGGCATGTTGCAAGAATGAAAGCTGCAATGAAGGCGCTTGGGATTGACCCAGAAAGGCTCATAGTTATTCTTATGCAGCTTGTAAGGCTGGTAAGAGGCAAAGAAATTGTCAGAATGTCAAAGAGAACTGGCAAGGCAATAACCCTTATTGACCTTATTGACGAAATAGGCAAAGACGCTGCAAGGTTTATGTTCAATACAAAATCAGCAGACACCCACATTGAGATAGATTTAGACCTTGTGAGCCAGCAGACACTTGACAACCCTGTGTTTTATGTCCAATACGCTCATGCAAGAACATGCGGAATCCTTAGAGCTCTTTCAGAAGAGGGAATAGTGTTAGATAAAAGTAGAATAAAAGTAGAACTTTTGCAGCAAGAAGAAGAGCTTGAACTTTTGAAAAAGCTTTTAGAGCTTCCTGAAGAAATAGAGATAGCTGCAAAGAACTTAGACGTTAGCAGAGTGACAAAGTATCTTTTAGATTTGGCATCTATGTTCCATGCCTTTTATAACGCGTGCAGAGTTAAAAATGAAAATGAAGAACTGATGTTTACAAGGCTTTCTCTTGTTGAGTGTGTGAGAATTGTCATAAAGAATATGCTAAGACTACTTGGAGTTGATGCTCCAGAGAAGATGTAATTGTAAGTAAAGTCTCTTGCCCATTTTTTACAAAGGGGTGAGAGACTTTTTTATTTATTTTTCACGAAAATCTGATTAAAATTATTTAATCTATTGTTTGTTTTTTGAAGCATGTGGTATAATTTGAATAGTAAATTAAAAAAGTTCGATTGGGAGTTTAGGATATGGATTTTATTGGATTGCTTATAAGAAACGTATTCTTTTCTTTAATGGAAATTTTTAAAGGAAACACAATAAGAAAGAAACTAAGGATTTTGTCACAAAATAGCAGAGCTTCTCAAGAAAAAATTGAAGATGTTCAAAGAGAAGAGCTCAAAAAGCTGTTGTTGTATTGTATTGAACACGTCCCAGCATATAAAAAGTACGACTATCTCAAAAAAGATATAGAAGCTTGTCCAGAAATGGCTTTAAAAGAATTTCCCATCTTGGAGAAAAAAGAGTTTTCGGAAAACAGAGATTTTTACTTATCAGAAAAAGCAGATCTTTCAAAGTGCATCTTAAATAGAACAGGCGGGTCTACAGGCGAGCCAGTGAAGTTTTACATGGACAGAGAAACTGTTGAGTGGTACGAAGCAGCAAGGTATTTGGGACTTTCGTGGTGGGGGATAAACATTGGTGATAGGTGTCTGATGCTTTGGGCATCAAGAAATGACATGGGTTATGTTAAGGATTTGAAAGGAAAAATTAAAGAGCGAGTGCTGAAAAATAGGCTTATAATTTCTTCATGGGATATAAACGAGAAAACCATAAAGGAGATTGCAAAAAGAATCAAGAGATTTAAGCCTTTATATATATACGCATATCCTTCTGCAGCATATAAACTTGCATATCTTTTAAAAGAAAATGGTATAGACTTGAAGCTAAAGCTCAAGGGAGTTGTCACCACAGCTGAAAATTTATATGAATACCAAAAGGATTTAATTCAAGAAATATTTAAATGCCCTGTGATAAACGAATACGGTGCGAGGGATGGTGGAATAATTGCATATCAATGTCCAAAAGGTAAGATGCATTTGATGACCTTGACAGGATTTTATGAGTTTGTAGATATCGAAGGATTAGAGAATGAAAAGAGAAAGTCAATCTTGGTAACAGATCTTCATAATTATGTAATGCCAAGACTAAGATATAGACTTGGCGATGTGGTGACTCTTGATGATGAAAGCTGTGACTGCGGTATAGGATTTCCAACTATTAAGGAAATAGATGGTAGGATTGATGAGATATTTGTCACAAAGAATGGAGAGGTTTATGACAGCCACTTTTTCAATATATTAGCAAGAGAGATGGAAGGAGTGCTGCAGTATCAGCTTGTTCAGCATGATTTGGAGAATATGACGCTCAGGATTGTAAAAGGTAAGGGATTTGATGAAAGTGAGGTTACCAGATTTGTAGAAAGTATTAAGAGCAAATTTGGTGATATTTCTATAAAGATTGATTATGTCAATGAAATTGAATGTGGTCCTTCTGGAAAGGTTAGATATATAGTGAGAGAATACAAAATTCCAGCGATGAGGGCTTTACTCTCGTTTTTAAAGATAGCAGTTTCTGTACTTACAGTATTCACTTTTGATTTGTAATTAATTTTGGTTGCTATATTTTCAATTTTAATAAAAATTATGTAGCAAGGGAGGATGGTTGTAAGATGAATTTAAGAAGACCAAATGCAAATGAAGCAACAGGCACTTTTAACCGTTCAAAAGATGTTGTGCCAATGTCAGGAATTTGTACAAGGTGTGTGGATGGGTGTCAGGGAAACTGTGAAATCTTTTTGGCCTCTTTTAGAGGAAGAGAGGTTTTGTATCCAGGACCATTTGGAGAAGTTACTGCAGGTGCTGACAAGAATTACCCTGTTGATTATTCGCATCTCAATATTCAGGGTTATGCTGTTGGAGCAAAAGGACTTCCTGAAGGTATTGAGCCAAATCCAGACACAGCTATATTCCCCAATGTTGACACAACAACCGAGTATGGCTGGGAAAAGAAGGTTAAAATGAAGGTACCCATATTCACTGGTGCTCTTGGTTCAACAGAGATTGCACGCAAAAACTGGGAACATTTTGCTGTTGGTGCTGCTATTTCAGGCATTACACTTGTTTGTGGTGAGAATGTGTGTGGGGTCGATCCAGAACTTGAGCTCACATCAGATGGCAAGGTCAAAAAGTCTCCTGAGATGGACAGGAGAATAAATACATATAAGAGATTCTATGAAGGCTGGGGCGAGATTTTGGTCCAGATGAATGTTGAGGATACTCGCCTTGGGGTTGCAGAGTATGTAATTGAAAAGCACGGGCTTGACACAATTGAGCTCAAGTGGGGTCAGGGTGCAAAGTGTATAGGTGGTGAGATAAAAGTAAAGAGCTTAGAGAGGGCTTTAGAGCTCAAAAAGAGAGGATATGTTGTTTTGCCAGACCCAACACAAAAAGATGTTCAGGAAGCGTTCAAAAAAGGAGCTATTAGAGAGTTTGAAAGACATTCAAGGCTTGGATTTGTTGAAAAGGAAAGCTTTTTGAAAGAAGTTGAACGGCTCAGAAGTCTTGGATTTAAGAGAATAACACTCAAAACTGGAGCATATTCAGCTGTTGAGCTTGCAATGGCACTGAGGTTTGGCGCTGAGGCAAAACTTGATTTGATAACAATTGATGGTGCACCAGGTGGAACAGGCATGAGTCCGTGGCCAATGATGAACGAGTGGGGAATTCCAACATTCTACTTAGAAGCTCTGGCATATCAGTTTGCTGAAAAGCTTACAAAGAAAGGCTTTAGAGTTCCTGACCTTGCAATTGCAGGTGGTTTTTCAACTGAGGATGGTGTGTTCAAGGCAATTGCAATGGGTGCACCATATGTAAAAGCTGTTTGTATGGGAAGAGCTTTGATGATACCAGGCATGGTAGGCAAGAATATTGAAAAGTGGCTAAAAGAAGGCAATCTTCCAAAGACAGTATCCAAGTATGGTTCAACACCCGAAGAAATATTCATAACATATGAAGAGCTGCGTGAAAAGTATGGTGATGAGATAAAGAACATACCTCTTGGCGCAATTGGTATCTATACGTTTGTACAAAAGTTCAAAACAGGTTTGCAGCAGCTCATGGCAGGGTCAAGAAACTTCAGAATCTCTACAATTTCAAGAAAAGACCTTATTGCCCTCACTGAAGATGCGGCTAAAATATCAGGTATTCCGTATGTGATGGATGCATACAGAGAAGAGGCAGAAAGAATTTTAGAAGAATAAATAAAAACTAAAAGGAAGCGTCTAAAAACAAAATTCTGAATCCATTATTTTCCAATATATAGCCAAAACTAGACAAAT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51 | Staphylococcus_prophage(25.0%) | transposase,coat,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_3 |
731323 : 792050
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_014721|731323:792050|DBSCAN-SWA 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60 | Clostridium_phage(11.11%) | integrase,coat,transposase | attL 716410:716469|attR 776549:778453 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_4 |
1486016 : 1498258
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_014721|1486016:1498258|DBSCAN-SWA 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GGCTGTAAGATGGCTGATAGTTTGGAGTTTCAAAATCAAATTTATCTGTCATCTTTGTTCACCTCTCACTTTGTTTTTTCACTTATAATTCTACCCCTTGTTTTTGAAAAAATTATTAACGAATTGTTAACAAATAATAAAAATTATTTTAAATCAAGCGTAAATGTAAACTTTGAGCCAACACCTTCCTCACTTTCAACCCAGATGTTCTGTTTATGAAGCTTTATAATCTCTTTTACAATTGAAAGCCCTAACCCAACCCCATTTTCAAGGCTTCTTGACTCATCAACCTTATAAAACCTTTCCCAGATAAGCTTTTGTAACTTTTCAGGAATACCCACGCCTGTATCCTGTATTGTTATATAAGCTTTACCATTTACTACTTCAGAATATATATAAATCTTCCCGCCAACCTTGTTATACTTTATAGCATTGTCAAGAAGATTGTGAACAACCCTGCTTATCAAATCCCTATCTGCCTTGACAACAAGTTCTTCGTCCACTTGTAGAGTTACATCTATTTCTTTTTCTTCTATCCGCTTTTCAAACTTAATTAGCTCCTCCGCAATCACAGAATAAATCTTAAATTCGCTTAAATTAAGATTTATTTTCCCCCACTCAAGTCTTGACAATTCTAAAAGTTGATTAATCAAATTGTTAAGCTTTATAACTTCCTCTTTTACAAGGGTCAGATAAAAATCTCTTTTGTCATCTGGAATGGTCTTATCCAATATACCTTCCACAAATCCTCTTATAGAGGTAAGAGGAGACCTGAGCTCATGTGACACATTGAAGATAAAACTTTTTCGCATCATTTCCAAGTTTTCTAATTTTTCGGTCATATAATTAAAAGATGAGATAAGTTCGCTAATCTCGTCATCACTATTGTTTGGAATAGGAATTTTTTGTGAAAAATCACCTTCAGCTATCTTTCTTGAAGCCTGTGCAAGCTTTTTAATGGGAGTGATAATCCTTTGAGTCAGTGCATATGTTATTATCAAAACAACTAAAACTTCGAACAATGTAATAAGCCAAATTATCCTGTTGTACATCTTTAACGTCTGCCTTATTTCATCAGTTGAGGTGATAAGAAGTAGCCCTGACACAACATGGTTATTTATCACTACTGGATACCCTATCACAAGATATTCTCTTTTTATCATATCACCTATAAGAAGCTTTTTTACAGCAATCTCGCCTTCAAAGACCTTGTCTCTTATCTTTCTTAGATTTAAATCATCTATATACACCTGTTCATCCGAGTTTAATATTACATTTGCATTTTTGTTTATCAATAGGATTGAAGCATTCAGATAATCTCGTAAAAATCTAATCTCGAACCTAAGTCTATCCTGTTCCAAAAACCCTGTTATATACCAAAGAGCAAGTCCAGTTGCTATCTTTTCAGCTTCACGAACAAGCTGAGTCTGTTTTTGAGATACAAAATAGTTTTCTGTCAGGTTATTGAGCACTGTCCCAAAAATTAAAAATCCAACTGCAATTATGATTGTATATGTCACCACAAATTTAAAATATATAGATTTCAATTCTTTTCACTTCCTCAACAAAGCCTAAATTTCAAACTTATAACCCACACCCCATACAGTCTTTATCTTCCAAGGATATTTGTCCTTTTCAATCTTTTCTCTTATTCTCTTGATGTGTACATCAACTGTTCGAGTGTCTCCAACAAAGTTGTAACCCCATATATGGTCAAGAAGCTGCTCTCTTGTGAACACTTTGTTGGGATGTGATGCTAAGAAATACAAAAGCTCTATCTCTTTCGGCGGCATATCTATTACTTTATCTTCAAGTTTCACCTCATATGTAGTGAGATTTACTGTCAGATTTGGATATATAACAACCTTTTCATCATTGACTTCACCCTGTGTTCTTCGCAGCACCGCTTTTATTCGTGCAATTAGTTCTTTTGGATCAAACGGTTTTACAATGTAGTCATCTGCTCCCAACTCTAATCCAAGTACCTTATCAAATGTCTCGCCCTTTGCAGTGAGCATTATAATTGGAATGTTACTAATCTTTCTAAGTTCTCTACAGACTTCATATCCATCCTTTTTGGGCAGCATAATGTCTAGTATTACAAGGTCGGGCATTTCATTTTTGAACATAGCAATTCCATCCATACCATTGTGAGCAACTACTACTTCAAACCCTTCTTTTTCTAAGTAGAGCTTTATTACCTCACATATCTTTACATCATCATCAATGACAAGGATTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_014721|1486016:1498258|1493230_1494619_-|WP_013432719.1|DBSCAN-SWA MLENIFKLKERKTDVKTEVLAGFTTFITMAYIIFVNPSILSTTGLDKHAVFFATCIGAAVGTLIMALYANLPFALAPGMGLNAFFTYTVCLQMKYTPQQALAAVFISGIIFVIITAVGLRQAIVRSIPQSLKHAMTAGIGLFIAFIGFINSGIVVIDPGSKLPKFGDFTSAFKSLTNDPNINSAIISSRGAIVALIGLLIIGILIAKRVKGAIIIGIIIATVISFPLKIVDLSKFKFSLESFKVSAFNFDFAGLFAAHGQGGGIGAVLLSLFAVILTFTLIDMFDSIGTFVGLADKAGMLDEKGDIPNMDRALMSDAVATVVGSIFGTSTVTTYIESAAGIEEGGRTGLTSLVTGILFILALVIAPFIGLVPSQATAPALIAVGVMMISSIKKIDFNDFEEALPAFLTIVIMPFTYSIANGISAGIIFYVLVKLLRGKAKEIHPVTYILAILFILRFMVIAH >NC_014721|1486016:1498258|1494837_1496067_-|WP_013432720.1|DBSCAN-SWA MTDKFDFETPNYQPSYSPINFEIPKTIRKKKSAKEYIVAGLIGGLIGALLISIFFMAYFGVNFNNFKNDINSTLNSFNLNNSTTTEPITKTVVLNSGDSSFVTDVAQKVGPAIVGIKNKGTAYNWWTDEEQEITMGEGSGVIISKDGYVVTNNHVVSGAKSVTVILSGKKEVPATIVGTDALSDIALLKIDPKYVKAVAPLGDSSKVKVGEFVVAIGNPLGQEFAGTVTFGVVSAVNRKLDMGNGIQIPLIQTDAAINPGNSGGALVNSSGEVIGINTAKISQTGVEGMGFAIPINYVKPIINDLMKYKKVLRPTIGISVMEYYDRSGNVMGMYISRVYPGTGAAKAGLKEGDIILQIDGKKVTTFSDIQSILSNHKIGDVITIRVLRDGQTKDFKVTLGTPIDTTTND >NC_014721|1486016:1498258|1497586_1498258_-|WP_013432722.1|DBSCAN-SWA MKILVIDDDVKICEVIKLYLEKEGFEVVVAHNGMDGIAMFKNEMPDLVILDIMLPKKDGYEVCRELRKISNIPIIMLTAKGETFDKVLGLELGADDYIVKPFDPKELIARIKAVLRRTQGEVNDEKVVIYPNLTVNLTTYEVKLEDKVIDMPPKEIELLYFLASHPNKVFTREQLLDHIWGYNFVGDTRTVDVHIKRIREKIEKDKYPWKIKTVWGVGYKFEI >NC_014721|1486016:1498258|1496158_1497562_-|WP_013432721.1|DBSCAN-SWA MKSIYFKFVVTYTIIIAVGFLIFGTVLNNLTENYFVSQKQTQLVREAEKIATGLALWYITGFLEQDRLRFEIRFLRDYLNASILLINKNANVILNSDEQVYIDDLNLRKIRDKVFEGEIAVKKLLIGDMIKREYLVIGYPVVINNHVVSGLLLITSTDEIRQTLKMYNRIIWLITLFEVLVVLIITYALTQRIITPIKKLAQASRKIAEGDFSQKIPIPNNSDDEISELISSFNYMTEKLENLEMMRKSFIFNVSHELRSPLTSIRGFVEGILDKTIPDDKRDFYLTLVKEEVIKLNNLINQLLELSRLEWGKINLNLSEFKIYSVIAEELIKFEKRIEEKEIDVTLQVDEELVVKADRDLISRVVHNLLDNAIKYNKVGGKIYIYSEVVNGKAYITIQDTGVGIPEKLQKLIWERFYKVDESRSLENGVGLGLSIVKEIIKLHKQNIWVESEEGVGSKFTFTLDLK >NC_014721|1486016:1498258|1492291_1493011_-|WP_013432718.1|DBSCAN-SWA MSYVITKLLYEGKAKKVYETDNPDVVVIEYKDDATAFDGTKRGIINNKGVVNNLVSNHFFKILESNEIPTHFIEQIDERKTAVKRVQIIPVEVIVRNIAAGSLSKRLGLEEGAILKRPILEFCYKNDALHDPQVNQYHILALELATEEEIRKIEEYSFKINDVLRNYLKQVNIDLVDFKLEFGRYKGEVILADEISPDTCRFWDTTTKEKLDKDRFRRDLGNVEEAYMEILRRLGLDEK >NC_014721|1486016:1498258|1489104_1491297_-|WP_013432715.1|DBSCAN-SWA MKKHLYEEVGLTYDEYKMIVEILGREPNELELNLFGVMWSEHCGYKNSKAFLKNLPTKGEHILQGPGENAGIVDIGDGYAVCFKVESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFTMGARPIALLDSLKFGSLNDSRTKYLFEGVVAGIAGYGNCVGIPTVGGETTFDPVYKNNILVNVMCVGIMKKDKIFRGVAQGVGNSVFYVGHTTGRDGMGGATFASTDLTAESEEKRSAVQVGDPFMEKLLLEACLELFQTDAVVGIQDMGAAGLTSSTCETAARAGTGIEIDVALVPKREEGMNPIEVMLSESQERMLVIVKKEREEEVYKIFEKWGLHAVKIGRVTDDGMLRVLENGKTLAEVPAKALAHAPAYVREIKEPVIIKEAEKFDIYSIPQPNDLNEVIYKMISNPNLASKEYIYRQYDHMVRTDTVIRPGHDASLLRIKGTKKGIAVTIDSNGRYCYLNPYEGVQLVLAESYRNIVAVGAKPLAITDGLNFGNPHYPEIYYQFVKTIEGMKVACEYFETPVTGGNVSFYNQSEEGPIYPTPVIGMIGVIDDIEKAVNISFKNEGDLIAVIGKTSDDIGASEYLSFYHGIVSGRVPKLDLKLHKKVCDKVLECINKGLFSSVHDISDGGFAIALIESAIRGSKGAELQIKTELREDFYLFSETPGRFVVTFKEENLRKIQDILDDIEFTVVGRVKDEYIINGKINDKDIHLDLKEVERIYQEAIPCALKS >NC_014721|1486016:1498258|1486669_1487695_-|WP_013432713.1|DBSCAN-SWA MTTYKDAGVNIEEGYKAVNLIKGLARETFDSNVITDIGSFGSMYLLNVGSSEYILVSGTDGVGTKLKIAFYLDKHDTVGIDCVAMCVNDILCHGAKPLFFLDYVACGKLNSSKVASIVKGIAEGCKIAGCSLVGGETAEMPGFYKEDEYDLAGFAVGIVERQKAVYGKDVNTGDVLIGLASSGVHSNGYSLVRKVFGIDENPKVLEKTYEELGLSLGEELLKPTRIYVKPVLKVLEKVNVKGIAHITGGGFFENIPRAFPKGYSAVIEKGSWEEPAIFGLIQEHGKVEEREMFSTFNMGIGMVLIVSKEDVDLTLEILEQEKVNAWVIGTIQKGEDGVVLK >NC_014721|1486016:1498258|1486016_1486673_-|WP_013432712.1|DBSCAN-SWA MKKLAVFVSGSGSNLQAIIDQIKIGEIPATISCVISNKKDAYALERARKNDIQAIYISRRDFSSSLEYEKYLVNFLKIQKIDYVILAGFLYIFSEYFVEEFKNRIVNIHPSLLPAFGGKGMYGINVHRSVLEYGMKVTGATVHFVDAVPDGGPIILQKAIYVREDDTPETLQKRVLEEVEWKIYPLAIKLLCEDKIEVVGRKVIIKDKEILKKVGIEI >NC_014721|1486016:1498258|1487698_1489123_-|WP_013432714.1|DBSCAN-SWA MCFKELEENFKDHCGIFGIYCPDGKLDVAKITYFGLYALQHRGQESSGIAVNDAGNIIYHKDNGLVNEVFNEVVLNHLKGYSAIGHVRYSTTGKSDRENAQPLVIKYRKGHMALAHNGNLVNAHIIREKLEQEGAIFQTTIDSEVIASLISRNRIKSENIEEAILKTMNEIKGAYSLLILTPNKLIAVRDPYGLRPLVMGKINNSICFASETCALDTIGAEYIRDVEPGEIISVSRNGIRSIKYENGTKHLCVFEFIYFARADSYLEGISVYEIRKRLGKQLCKESYVDCDIVIGVPDSGTTAAIGFAEEAGIPFSEGFIKNRYIGRTFIKPEQTQREIAVKIKLNVLKSNVAGKRVVLIDDSIVRGTTSRKIIKMLRDAGASEVHLRISSPPVVFPCYYGIDTPDRKELIAANYSTEEIARILGADSLEYLSLNGLNEVFEGRIHQFCTACFSGEYVTEIPENFNKYILEEGV >NC_014721|1486016:1498258|1491303_1492002_-|WP_013432716.1|DBSCAN-SWA MKFGVVVFPGSNCDSDCFHVIKDVINEDVEYIWHDSDEKLTGFDCIILPGGFSYGDYLRAGAIARFSRVMPRIEEFAQNGGLVIGICNGFQILTESHLLPGALIRNKNLKFICSDQYVKVVNTNTPFTNLYKEGEVINLPIAHGEGNYVVDDETLKQMIQNQQIMLQYCDKYGNVNDETNPNGSILNIAGICNKEKNVFGLMPHPERSSEKILGCEDGKRVFLSIVNYLKSR >NC_014721|1486016:1498258|1492005_1492254_-|WP_013432717.1|DBSCAN-SWA MLKAEIFVYLKKSISDPPGIAVLNSLKSLGFNNVEKVRMGKYIVVYLNENDIEKAKQQVKLMCEKLLCNPVMEEYKFNISEE |
11 | Synechococcus_phage(22.22%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2101154 : 2109402
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_014721|2101154:2109402|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_014721|2101154:2109402|2103767_2104346_+|WP_013433227.1|DBSCAN-SWA MFSGIVEEVGRVVLVRKIEDIVKLSIEVKKIDAKIGDSIAVDGVCLTVTNISNGKFDFDLSPETVERTTLKFLKEGMPVNLQPALKMGDRIGGHIVLGHVDCIGTICMQKIQGKSRIIGIKPCEDFKGLVVRKGSVAIDGISLTVVDSFDTYFTISLIPHTIENTTLKYKKVGDYVNIEFDYIAKIVKENLR >NC_014721|2101154:2109402|2106171_2107698_+|WP_013433230.1|DBSCAN-SWA MKSLLRFWLFVVTIIILSLVIVSPSFASDIQKEEALFFDANGNPSYITIINKSSAAYLSPYELSRILGGSFAFDPKDYNFLQSKLIVDQNELIFKLDSNVVTFNGKNLYMDGPMQIIQNRICVPYSSTFKTYLNLFEFRYFPSGKRMIFKPNGNYIVYSVQSGDSLWILSQMFGTSIEIIKSLNNLTSDTLYVGQKLIVKKVSLNPVQITGTIKWWTYVKAAPSSSSQNLFYLTQGQTVNVIGKQADFYKISTPKGTGYVSIWAVDIKQDIVDNSKPSSSFYSFIPVDTSGDYVTYTYYKVQSGDTIWSIAVKFGIPDYELMSANNLNQNSYLYVGQTLKVPVHTVAVHSNEYGVEMLDWFSQGNYVFPIGSVGKFIDIQTGKYFFAKRTMGASHADVETLSFKDTQIMKEIFGGSFSWERRPFILEVNGRRIAVSVSGMPHAGVDGVPYNQNVANRSGGYGYGPNLDTIVNGMDGHFDVYTFNGLRHKDNQIDPQHQLAVSIAAGLR >NC_014721|2101154:2109402|2102659_2103775_+|WP_013433226.1|DBSCAN-SWA MRCLSHSYYMNMALELAKKASPLVLPNPRVGCVIVKNGTIIGKGYHQKYGEKHAEVLAIEDAIKNGYLLKNATMYVSLEPCCHFGKQPPCTEAIIKSGIKKVVVATRDPNPLVNGNGIQILKQHGIEVVEGVLQKEAESINKDFFKYMKKGIPYTAIKVAQSIDGKIATPSNKRFLFSTEEENLFVHSLRQKYMATLVSVNTVISDNPILNARYGEIVRQPIRVVLDTKLRIPLECNIVKTSDEYSTYIVCSENVNDTQKIDLLSQKGIKIIFAKSSEDGHLDLSDAFSKLAQQKIVSVLVEGGSLLNFSLLKQRIADYWYSLIFNVFIGGQHTKGAVGGEGFEEFFPKLVNTKVTTFKNSTIIEGDISYV >NC_014721|2101154:2109402|2105546_2106014_+|WP_013433229.1|DBSCAN-SWA MRTFEGSFQGKDLKFAIVISRFNSFITDELLKGCLDGLKRHDVDSENIDVYYVPGAFEIPLVCKKLAKSKKYNAIIALGAVIRGSTPHFEYVSAEVSKGIANVSLEQEIPVIFGVLTCDTVDQAIERAGTKAGNKGFDTALSALEMANLMKNISF >NC_014721|2101154:2109402|2101974_2102337_+|WP_013433225.1|DBSCAN-SWA MNEKLLRIYRIFFYMFIILATIGSVISSILEKNAFYIVGTIVLGVFLILIVEFILFPFVFGTKSVKNFKKFLGLFLAFGIILSIIVFLIVGITNKKFEIIYFGVPLLVLSLAVVYKVWIR >NC_014721|2101154:2109402|2101154_2101412_+|WP_041737034.1|DBSCAN-SWA MQVKNEWLPIGSVVILKGGNKPLMIYGRKQFNSRTGHEFDYVACFYPEGNLSADYNIFFNKEDIDKVLFKGYECELEFELRKMLK >NC_014721|2101154:2109402|2107689_2109402_-|WP_013433231.1|transposase|DBSCAN-SWA MARKHDKVVFKNYNPYQYLMPIDPEAFIPQNHLVRVIDKIIDKIDISTVMEKYKGGGTSSYHPLMLLKVLIYAYIQGIYSSRKIARALRENITFMWLSKYQAPDFRTINRFRKEILGDAIENIFAEVVKLLIELGYVNFDYYYLDGTKVEANANKYSFVWAKSTKTFEKKLREKVKNTLGEIERINEEEDKALGDLDVKLEADYDSKQLEEKIEQINQRLEEAEFKSKRKEKRVKKLVKVLKNDCVFRLKKYENYETILNGRNSFSKTDNDATFMRMKDDHMKNGMLRPGYNVQIGTQNRFVIGFSIHQSPTDTVCLKEHLEAVKKMTGFTPKNVIADSGYGSEENYLHLKECGINSYIKYNTFDLEQTRRFKKDIFNVKNWEYIAEEDAYICPAGKKVKYLYPKISVNERGFVSYEKVYQCEEICNGCEHREKCYKGRRWKKRFSVRPRLEKLKEEVRQRILSEEGKEIYNKRKVEVETVFGIIKNNKGFRRFLLRGLKGVKLEWGLVCIAYNIEKLAKIMIEGWGKTVAQPSFCLFYNLILVFNTTKRSFLVIRNYCFGTATAYFTLP >NC_014721|2101154:2109402|2101425_2101947_+|WP_013433224.1|DBSCAN-SWA MYAIQAYCGSSNKNSLLSIGASSLGVNKQGQIMAYGEASINIGKAEINKPNTLTLNSKSAQAGVSLKAVELSAHGSVGFFNSNTNISFGKAEIGGTASFSKGINIGGKAMVSAIEIKQSFGFSIGGITVEVGGKGYAGAWGAEGKLKFSSSGISIGGGLAAKVGAGVFINIRW >NC_014721|2101154:2109402|2104351_2105560_+|WP_013433228.1|DBSCAN-SWA MYDLKDVIQKFKSGEFVIVFDSQNREDEADLILPAQFSTPEKISFVLNHAKGMFCVAIDKEIQRRLNLYVPYNTQDSCTFTVTVDHKDTKTGITAKERSKTSKELANPNAMASDFKIPGHVSPVVAHEGGVLTRKGHTEAAVELCRISELFPAAVMIEILDEKGDSHNKEYVKSLAKRFSIPVTTIDEIEKHILLNRPTVQKEAEADLPTQYGKFKIFAFKNHFLQKEHAVLINETFNPSQPVNVRIHSSCKTGDVFHSLRCDCHQQLEFFLQFMAENKNCMLIYLDQEGRGIGFANKIKAYAYQEQGFDTYEANNLLGFDDDLRDYFDALHILRFFGIKRINLATSNPEKVSFLQNCGIEILKRISIPIVVNPYNKKYIHSKILKKKHEILIKGEDKVENF |
9 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2158216 : 2165456
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_014721|2158216:2165456|DBSCAN-SWA CTTACAGGCCAAGTGCGTATTTTTCTTTTTGATGTAGTTCTTCCAGTTTATAATTGGTTATAAAAAGTTCCTTTCCTTTTTCGGCTTTTGGTTGTTTGTAGTTATTCATTCCATATTGGAGTTCCCATTCATAAATATTAGCAAATCTAAACAACTTTCGAACTTCTGATGAGTCATCATAAGTTATCATCCAGAGGTGAGGACATTTTTTCATGTTGAAAGCAAATCTTTCGTGGTCGAAATTTAAATGCAAATCCCCATTTTTTCCATACAGGCGAGATTCAGTGGTGCTGAAGTAAGGTGGGTCTAAAAAAATAAAGACTTTATCACCTGGTTCAAATAAAAGTTTTTCGTAATCTCCGTGGGATATTTCGAAATCCTTGATAATTTCTGCTGCCTGTTTAAGTTTATTTATTGCACTCCATGTAAAGCGATTTTCAAAGGACTGCTGGGAATACCCGCCTGAGTCTCCTGTACCCGAGAATGTTATACGATTGAGAACGTAAAATCTTACTGCTCTTTCGAATTCACTATCACTGTTTTGAGCTGTGAGGAACTCATACAATTTTCGTCCGTCTTTATAATTTTCCTTTATTCTACTAACTTCCTCAATCAGCTGTACCGGATTATCTCTTAATTGTTTCCAGAAGCAAATCAAGTCATAGTTGAGATCATTGATTTTTACTTTGACGTTGGTGTACAGTTGTTTTACAGCAAGAGCGACTGCACCACCACCAACCATTGGTTCTCTGTATTCTTTAAAACTTACAGGTAAGTTGGGCAATATGTACTTTAGTGCCTTTGATTTTCCTCCTGGATAACGTAAAACGTTTTTAAGCATTGTCTAAATCACCTTCCTTTTTTTATTATACCACAGTTTGACTAATCCCACCGTTCAAAATGAGAAAATAGTTCTTGAGGATGACCTATTAACTGTATGTCAAATTTCAAGGAAGATTCTATTTTAGAACTTGCGTTATGTATTCTAAATGACACAGTCCATCCATTATTGCAGATTACCTCAGCGGTGTTTCGAGAATTTTCTTTCAATCCAATATGTACAAATTTGGTAGGCAATTTTAACTTTGCACCTATTCTAATTTTAGGTTTATTGTGGCAACACGGTAAATTCAAAGAACCATTCAAATTAAAAGCTTGAACTTGAGTGTTTCGAATTTTTCTAATTGAAATAACTTTATAAAAATCATGGCGTCCAATTAAGTACCTAATTAGACGTGCAGGAACAGGTTCTTCTTCATCTTTACATTTCTCTGCTATTCTTTTTAATTCATCAATAAAGGCTCTCAGAAGGGGAAGATAAATTTCTTCTTCCTTTTCTTTTTTCTCTATGTTGCGCCACAACCTTTTTTCCTTTTTATATTCTTCTATTCTTGAAAACACACGTTGAATTTCAGAGAAATACTGCTGAGAGCATGGAATATCCAACCATTCTTTCCCAAAATCCAGTCGATGTGATAAACGAGAATGTTTAACAGCGGAATGATTATGTTTGCAACTCACTCCTATTTCCCATTTTGTTTCGGGATCTAAAATTCTTATAGCCAACATATCTCTTACATCACCATGTTGCCCGGCTGCATCTTCCTGAAGTGTGAGTATTATTTCACTCTTATGATTCTTGCATACCAGGTGCGGTTCACAATCTGTGATAATTTTAGCAGCAGCAAGTCCAGCTTTTTTCATGTACACCTGTTCATTGCTGTTAAGGTTTTCAAAAACTTGCTTGGCAACCTGGAAAGCAGAATTATCCTCAACTATGACGCTCTGAGACAGATAATTTTTCAGGTAATCTTCAAATGCCGAAAGACAAGCATACTCAAAAGCTTTTCCTTTTTCAGTTTGTTTCATATCGAAACTCCTTTTCAGATAAAGTTTAAAACTATTTTATCATCCTTGTCAGCGATTTAAAAGTACTGCTAGTAAATCTAACAAATCCATCTAATAGCTTCTTAGATGGTCATATTCTCACCCTGTCCCAAACCCAAACCCGCATTTTTCCGTTCTGTATCCTATAAAAAATTGTCCATCTAATGATTTTTCCCCTTAGAAAAGCAATTGCAATGTCCCCCTATTTTGAGATAAAATAAAATTGCTTCAATAAATCCAAACCCTTGTCCTCTTCTAAATCCATGGAGAAGGCTGGGACAGGTACCGTTGCCTGGTGTCGCACCGTCCCGGCCTTCTCCATTTTTGTATTCTCTCCTACATTACTGTTGGCACAATAGTTCTGGGCTTTCTCTTTTCTTTTGTGATATACCCTTTCTTTTCTAATCTTTGGAGATGTCCATGAAGTGTAGATGATGACTTAACCCCGACTATATCTGCAAGTTCCCGAATAGTGGGTGGATAACCTTTTTCATTAATGTAACCTATGACAGCATTCAGTATCTGTTGCTGCCTTTCTGTTAATCCCTGCATGAGCAGACGCTCCTTTCTGCAAACAATTGTTTGCTATTTCTATTATAACTCAGAAATATACCGAACGCAAGTTTGATTTTTAACGGGCTGCAGTACATAACTTCTGCAGCCCTACTGGAGATTGCCAAGTATACTGAGCGGGTCTACCGGTGTACCATTTATTCTTATTTCGAAGTGCAGATGGTTGCCTGTGGAATTGCCCGTTGAGTCAGCACCACCTAATACATCACCCTTCTTGACTATTTGACCTTGCTGAACGTTTATTTCTGCTAAGTGTGCATAGTAGAATTCATAGTTACCTGCCTGTAAAACAATAACCTTACCATAACCACTCATCCACCCTGCGTATTTGACAACTGCGTCCTTGACTGCAAAAACAGGTTGACCATAGGTTGTAGCAATGTCAATCCCGGTGTGCATTTTCCATGTGTGGTAAATCGGGTGGTATCGCATACCAAACGGGCTTGTAATATTCATTTCACCTGCAACAGGTTTAGCAATTTCTGGGTTTGCGAGCATTTCACCTATAGACTTATATAACTGTGCCTGTGCTATCAGTGATGGTGCGTATTCACTTCTTGTCTTCGCATAATTGTTTGGGACATCATTCTTTTTAGCACCACTTATTCCCATCCAGTAGCCTGCAAGAGCGGGGATTGTTTGCTCTTTCCATTTATCACCCTGCCAGTCCACTGTTTTTGGGTCTATCCCCATACCTTTGAATGCATTGTATAGCGTCCATGTACCAATTAGTATCTGGTCTCTTGGATTGGTTATGTCGCCTGTGATGGTTACATCAGGGAATGCATTTTTGAAAGCTTCAACTCTGCTGTTCCAGTATTTTTGCTGTACCTGCATAATTCCAACTGCATACCCTTCATAGTTTTGAACCTTTGCGTTTGGGTTAAATGAGCTTTCTCTGTACGATACTGCTGCTAAAAACCAGTAAGGTATTCCCATAAGTTTTTCAGCTTCTTTGAACATAGGCAGAAACTGTGCGGGGATGTACGAACAGTTCACATAGCCGCCAGCATTCATGTAGTCATTTATCTGCGAGAATACCCAGCTCATATCTTTTGTACCCTTCATAAAACTCGTTGCAGTGTTTATAATCATTGATTTTGCAAGTTCGATGTCCTCATTGGGATTGTCTTCTTTTATCATTTCTTCAAGTCTTTCATACTCTTTTCCGACAGGGTTTTGACCGCTCAGTTCGGGTACTGTTTCGACTACCTGCAGTATTTCCTCTTTGTCGAGTTTTTTCTCACCGTTAGTTGAAGTTACATTGGTTGCACCACTTTCAGGACTGAAGGGTGGTTCTTCTGTTTGTGGTGAAGTTTCAACTGTTTTACTGCTGGTGGAAGGTTCCAGGTCTTTTTCAGCTTTATCAAAGTTGGTTTTGAGTTCGAATGTGGATTTGATGCCAGGGTCAGATGCATGCAGGCAGTCTTTTTTCTCAATGAACCTTTTCGGGTCAAAATTGAGTTTTAAGTCCTGGCTTTTTGTTTTTTGCGTCTTCTGGGGTGTGTTATTCTGGTATGTGCGTTTGTACTCGTTTATATCGTAGCTGAATGTATATCGCTGTTTGATTGTATCAGCAGCAACTATCAGCCAGATAGGTTGTGTTTCGGTAATTTCGATTTTTTCAGTCCATTTCACTGTGACAGTTTGGCTTTTGTTTTCTGTCTGAGTTTCATACTTTCCTGTTTCAGAGTTGTAGACTTCTCTGGAGACTGTGTAGGAATATGTTCTGGGCATTGAGTAGTGTAAAAGTTTTGTTGTAATAGTTTTGCGTTCCGTTTTGATGTACAGAAATCTCGGTTTCATTCGCTCAGCCAGGTCAGCAAGTTCGCCTTTTACTTTCCTGTAGATGTACCACTGTGGCAGAATCTGATTGACAGCGCTTTTAATGCCCTGTTTGGCCATTTCCTTTGCGACCTCGTCAAAGTCTTTGGCGTCTACTATGTCTGCTTTGTTCATAAACTGCAGGTACTTGTAATAGCTCAGTATCCATGCAGCATTCAAAGCCAGATCTTCGTCTGTGCCATAGTAATCTAAAAGAGTCCCTGATTTTTCCCGTGCAATATCAATTACGTCTTTTTGCAGTTTTTGATTGTGCTCATCGTCAAGTCGATTGGATATTTCCCCGGCTTCAATGAAAGCCTGTATGGAACCCAGAATCAACAGAATCAGTAAAAGCACGCCGGCTATTATTAATCCAGGTTTGCTCATTAAAAATTTTATCAATGCAGACTTTGCCTTTTGTTTGACATATGCCTTTGCTACCTGTTTTGCTACCTGTTTTGTTTTCTGCCTGTCAAAACCATACACAGTTCATCACCCCTTCAAACTTCTCAACCAGCTGAAAACATCCCGGTTTTCTTCTGTCTCAACGCAGAGTTGAATGATGTCTGCCACAACATCGGTGTATTTGAAACACTCTCTGTACTGCGGGAACTGAACAACAAAAAAGTGGGGATACTTTGCAATCACTTTTCCTGTTCTTGTTCTGTGCTCATAATCAGATTTACCCTGACCGGATGTCCACGGCACTCTGTTTGTTTTGACTTTTTGACCTATTCTGAGATCCCTGCGGATTTGCTCAGCAATACCAAGGGTGCCAGAATAGATGTTAGTGTTCCTGCTCACCTGTTTTGCCTCCCTTCAGGATTTCTTTAACCTGCTCAACTTTCTTGAAATAGAAGCATTTGATTGGTATCTTGAACTTTTTTGCAAACTCTATCTCCCTTCTCATACCTTCCGTTACTTCTGGTCCAAACACCCACATCTCCTGGCATTCCAAGAGCAGTTGCAAAGCCATTTCGAGTCCCTGCTCTCTTTCTGTGGTCTCGTTCAAAAACTGTGGGAAATACACGTGCGGGGCTATGGGAAGATATCCTTCATCGTAGGCTTTTCTGCAATACTGCAGTGCTTTCTTGCGGTTTTCTGCAGGGCTGTCTCTGTATGGAGAGCAAATGTAGACCTTTAGCCTGAGTTTTTGCACTTTTGAACACTCCTTGTTTCTTTAATACTGATGACAATCTTTTCACAATCAACGGGTGGCAACTTTCTGATTCGCAGTTCAACCACCTGCCTGTCATCCAGGAAAGCAACACCATTTAACCCATCCAAAATTGCTTTCGCAATGTTGTCTATATCTGCTCTGCTTTTTGTGAAAACATCGATATTGACTTTAACCGGCTTTTCGACCGGCTTTTTAACAACGCTTCTAGTGCACCAGCCAACAAGTTCTTCGAATTCTTTTGTCTCTTTTGGCGTGTACATTCTGCCGTTTGCGCCCAGTCTTGGTCTTGCTTTTGGAACCGGTCTTGCCACAATTTCTATTTTGTAATAACCCACTACAATACCCCCTTGAAATCGGTTTATTTTGTCTTAAAAAACGCACCAAAAACTTTGGACAATAAAAAACACGTCCCTGCTTAGAGGACGTGCTCTAAATTAACGGTATAAATGGAATTTCAGGCATGTTTTGTTATGAGAAAACTCAAAATGAGCAAACAAGCAATAAAGATTGCAGTATCCACTACTCCGCCTGTTCTAACAAGCCTGAAGCCAATTGTCGAATCCTGTCGAAAAATGGAGAGTTTGATACCATTGAGTGTTAGGCTATCTAACAACAGGTGAGATACATACCCCAGTGCAAACATCCACGCCCAGTAGCTGAAGTTTGAGCTTAAAAGTACAACCGGACAAAGTCCAACTGCAAAATCAAGACTGTGTGTAATTGTCCTGTGCCCGGGCAGTTTGTTTATAAACCACGAGACCGGCTTAACTTTTCTACCAATCATAGAGTCAGGATGGTCTATATCGGGCATAAGCGCTGATATTCCTGCCACTGCTACTGGCAGGGTGATGATGTTTCTGTGTTGCAGAGTTTCTATACTGCTTGCAACTGCAAGTGCAAAGGCTAAGTGGGTATATCCTCTCATGCTCATCACTTCCATTAGGTCAAACTTTCTTTTCTATCGAAAACTCTGCCCGGGCAACTGTAAGAGCTTCTATGACTGTTGGTTTGAATATTCCCATATTCCATAGTTCATCAATTGCTTCCTTGTGAAAAACTGGCTTTTTGTACTGTCTCCACAAAGAAGTCATAGCTTCGAATTTATCAGCAACAGTTACAATTTGTACAGACAAAGGCAAATCAGATGTATCCTGGTGGTGGAGCAGTGCTATCACTGAAAACTCATTCAATCCCAGTATTCTTAGAAGCTCAGCTCCCCATTTGCTGTGGTTTTTGAGAATTTCCTGTTCTTCTGCACTCCCTTCAAAAAAGTTGACAGTAAAAAAGCAGGGCTTTTGACCCTGCTTTAGAATGGTATGTCTTCTTCGGATGTGATAATGCCATTTTCTGCTGGTGGTTCGAAACTTTCATCTTCTTCAAAAAACTCTTCCAGTTCCTTTTCAAGTTCATCTTCAGGGATTTCGGGTTCTGCTTCAGAAGCAGTTGCAGTCTGCTCTTTTTGCTGTTCTTTCTTAGAGCCTGCAAACCAGAAACGCTCAATCACAAATCTAAAAGTGGGATACTCAATACCTTCCTTTGTTTTTCCTCTTGCATTTTCAGCTCTGGCTTTAACTAAAATTTCACGTCCTTTGGTATAGTGCTGTTCAATTAACTCTGCATTTCTCCCGAATGCTATGCATGGAATAAACTCTGCTTTTTTTTCACCCTTGACTGTCCTGTCCATGGCAATTGTTATTCTGACAAGTTTGTTACCACTCTGTGTCGTAAATACTTCCGGGTCTTTAGTGAGACGACCGAAAAATGTGCATTCGTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_014721|2158216:2165456|2164985_2165456_-|WP_013433285.1|DBSCAN-SWA MNECTFFGRLTKDPEVFTTQSGNKLVRITIAMDRTVKGEKKAEFIPCIAFGRNAELIEQHYTKGREILVKARAENARGKTKEGIEYPTFRFVIERFWFAGSKKEQQKEQTATASEAEPEIPEDELEKELEEFFEEDESFEPPAENGIITSEEDIPF >NC_014721|2158216:2165456|2162991_2163303_-|WP_013433281.1|DBSCAN-SWA MSRNTNIYSGTLGIAEQIRRDLRIGQKVKTNRVPWTSGQGKSDYEHRTRTGKVIAKYPHFFVVQFPQYRECFKYTDVVADIIQLCVETEENRDVFSWLRSLKG >NC_014721|2158216:2165456|2164133_2164604_-|WP_013433284.1|DBSCAN-SWA MRGYTHLAFALAVASSIETLQHRNIITLPVAVAGISALMPDIDHPDSMIGRKVKPVSWFINKLPGHRTITHSLDFAVGLCPVVLLSSNFSYWAWMFALGYVSHLLLDSLTLNGIKLSIFRQDSTIGFRLVRTGGVVDTAIFIACLLILSFLITKHA >NC_014721|2158216:2165456|2159097_2160084_-|WP_013433278.1|DBSCAN-SWA MKQTEKGKAFEYACLSAFEDYLKNYLSQSVIVEDNSAFQVAKQVFENLNSNEQVYMKKAGLAAAKIITDCEPHLVCKNHKSEIILTLQEDAAGQHGDVRDMLAIRILDPETKWEIGVSCKHNHSAVKHSRLSHRLDFGKEWLDIPCSQQYFSEIQRVFSRIEEYKKEKRLWRNIEKKEKEEEIYLPLLRAFIDELKRIAEKCKDEEEPVPARLIRYLIGRHDFYKVISIRKIRNTQVQAFNLNGSLNLPCCHNKPKIRIGAKLKLPTKFVHIGLKENSRNTAEVICNNGWTVSFRIHNASSKIESSLKFDIQLIGHPQELFSHFERWD >NC_014721|2158216:2165456|2160438_2160654_-|WP_013433279.1|DBSCAN-SWA MQGLTERQQQILNAVIGYINEKGYPPTIRELADIVGVKSSSTLHGHLQRLEKKGYITKEKRKPRTIVPTVM >NC_014721|2158216:2165456|2160765_2162985_-|WP_013433280.1|DBSCAN-SWA MYGFDRQKTKQVAKQVAKAYVKQKAKSALIKFLMSKPGLIIAGVLLLILLILGSIQAFIEAGEISNRLDDEHNQKLQKDVIDIAREKSGTLLDYYGTDEDLALNAAWILSYYKYLQFMNKADIVDAKDFDEVAKEMAKQGIKSAVNQILPQWYIYRKVKGELADLAERMKPRFLYIKTERKTITTKLLHYSMPRTYSYTVSREVYNSETGKYETQTENKSQTVTVKWTEKIEITETQPIWLIVAADTIKQRYTFSYDINEYKRTYQNNTPQKTQKTKSQDLKLNFDPKRFIEKKDCLHASDPGIKSTFELKTNFDKAEKDLEPSTSSKTVETSPQTEEPPFSPESGATNVTSTNGEKKLDKEEILQVVETVPELSGQNPVGKEYERLEEMIKEDNPNEDIELAKSMIINTATSFMKGTKDMSWVFSQINDYMNAGGYVNCSYIPAQFLPMFKEAEKLMGIPYWFLAAVSYRESSFNPNAKVQNYEGYAVGIMQVQQKYWNSRVEAFKNAFPDVTITGDITNPRDQILIGTWTLYNAFKGMGIDPKTVDWQGDKWKEQTIPALAGYWMGISGAKKNDVPNNYAKTRSEYAPSLIAQAQLYKSIGEMLANPEIAKPVAGEMNITSPFGMRYHPIYHTWKMHTGIDIATTYGQPVFAVKDAVVKYAGWMSGYGKVIVLQAGNYEFYYAHLAEINVQQGQIVKKGDVLGGADSTGNSTGNHLHFEIRINGTPVDPLSILGNLQ >NC_014721|2158216:2165456|2158216_2159056_-|WP_013433277.1|DBSCAN-SWA MLKNVLRYPGGKSKALKYILPNLPVSFKEYREPMVGGGAVALAVKQLYTNVKVKINDLNYDLICFWKQLRDNPVQLIEEVSRIKENYKDGRKLYEFLTAQNSDSEFERAVRFYVLNRITFSGTGDSGGYSQQSFENRFTWSAINKLKQAAEIIKDFEISHGDYEKLLFEPGDKVFIFLDPPYFSTTESRLYGKNGDLHLNFDHERFAFNMKKCPHLWMITYDDSSEVRKLFRFANIYEWELQYGMNNYKQPKAEKGKELFITNYKLEELHQKEKYALGL >NC_014721|2158216:2165456|2163639_2164014_-|WP_013433283.1|DBSCAN-SWA MGYYKIEIVARPVPKARPRLGANGRMYTPKETKEFEELVGWCTRSVVKKPVEKPVKVNIDVFTKSRADIDNIAKAILDGLNGVAFLDDRQVVELRIRKLPPVDCEKIVISIKETRSVQKCKNSG >NC_014721|2158216:2165456|2163286_2163658_-|WP_013433282.1|DBSCAN-SWA MQKLRLKVYICSPYRDSPAENRKKALQYCRKAYDEGYLPIAPHVYFPQFLNETTEREQGLEMALQLLLECQEMWVFGPEVTEGMRREIEFAKKFKIPIKCFYFKKVEQVKEILKGGKTGEQEH |
9 | Clostridium_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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