CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NC_017949	Lactococcus lactis subsp. cremoris NZ9000, complete sequence	1 crisprs	WYL,cas3,csa3,RT,DEDDh,DinG	0	0	12	0

1. NC_017949

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NC_017949_1

• CRISPR_ID: NC_017949_1
• CRISPR_location: 1485244-1485341
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NC_017949_1

Consensus_repeat	Method
CCTTTGGTCGTATTGAACTGACAGAA	CRISPRCasFinder

spacers of NC_017949_1

>1.1|1485270|46|NC_017949|CRISPRCasFinder
CTATCAGCAAAGCTGATTGTTCATTTAGCTACCGATTCAATAACTC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_017949_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NC_017949_1

>merge|NC_017949|1|1485244-1485341|CRISPRCasFinder
CCTTTGGTCGTATTGAACTGACAGAACTATCAGCAAAGCTGATTGTTCATTTAGCTACCGATTCAATAACTCCCTTTGGTCGCATTGAACTGACAGAA

>NC_017949|1|1|1485244-1485341|CRISPRCasFinder
CCTTTGGTCGTATTGAACTGACAGAA	CTATCAGCAAAGCTGATTGTTCATTTAGCTACCGATTCAATAACTC
CCTTTGGTCGCATTGAACTGACAGAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NC_017949.1|WP_011835358.1|1489993_1491811_-|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing)	unknown	unknown	gnl|CDD|234729
NC_017949.1|WP_011835359.1|1491992_1492649_-|phosphatase-PAP2-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|239486
NC_017949.1|WP_011835346.1|1472142_1472799_-|endonuclease-III	unknown	unknown	gnl|CDD|223255
NC_017949.1|WP_011835351.1|1477808_1481612_-|bacterial-Ig-like-domain-containing-protein	unknown	unknown	unknown
NC_017949.1|WP_011835344.1|1470690_1471464_-|Nif3-like-dinuclear-metal-center-hexameric-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|376614
NC_017949.1|WP_153951976.1|1485357_1485498_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NC_017949.1|WP_011835350.1|1476674_1477601_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NC_017949.1|WP_011835362.1|1494523_1495210_-|response-regulator-transcription-factor	unknown	unknown	gnl|CDD|223816
NC_017949.1|WP_011676069.1|1487740_1488133_-|transcriptional-regulator-Spx	unknown	unknown	gnl|CDD|239330
NC_017949.1|WP_011835352.1|1481790_1482858_-|SEL1-like-repeat-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|276807
NC_017949.1|WP_011835345.1|1471460_1472150_-|tRNA-(adenine-N(1))-methyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|225258
NC_017949.1|WP_011835347.1|1472820_1473489_-|DnaD-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226445
NC_017949.1|WP_011835355.1|1485660_1487568_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223562
NC_017949.1|WP_011835354.1|1484538_1485168_-|orotate-phosphoribosyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|234771
NC_017949.1|WP_011835360.1|1492658_1493984_-|HAMP-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223715
NC_017949.1|WP_011835353.1|1483115_1484387_-|dihydroorotase	unknown	unknown	gnl|CDD|236479
NC_017949.1|WP_011835356.1|1488355_1489006_+|redox-sensing-transcriptional-repressor-Rex	unknown	unknown	gnl|CDD|225221
NC_017949.1|WP_011835357.1|1489192_1489876_-|DNA-repair-protein-RadC	unknown	unknown	gnl|CDD|178801
NC_017949.1|WP_011835361.1|1493987_1494503_-|DUF2127-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226781
NC_017949.1|WP_011835348.1|1473754_1475947_-|BspA-family-leucine-rich-repeat-surface-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|308794

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NC_017949.1|WP_011835359.1|1491992_1492649_-|phosphatase-PAP2-family-protein	gnl|CDD|239486	cd03392, PAP2_like_2, PAP2_like_2 proteins. PAP2 is a super-family of phosphatases and haloperoxidases. This subgroup, which is specific to bacteria, lacks functional characterization and may act as a membrane-associated lipid phosphatase.	8.58999e-45
NC_017949.1|WP_011835346.1|1472142_1472799_-|endonuclease-III	gnl|CDD|223255	COG0177, Nth, Predicted EndoIII-related endonuclease [DNA replication, recombination, and repair].	1.30673e-108
NC_017949.1|WP_011835344.1|1470690_1471464_-|Nif3-like-dinuclear-metal-center-hexameric-protein	gnl|CDD|376614	pfam01784, NIF3, NIF3 (NGG1p interacting factor 3). This family contains several NIF3 (NGG1p interacting factor 3) protein homologs. NIF3 interacts with the yeast transcriptional coactivator NGG1p which is part of the ADA complex, the exact function of this interaction is unknown.	5.01288e-88
NC_017949.1|WP_011835358.1|1489993_1491811_-|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing)	gnl|CDD|234729	PRK00331, PRK00331, isomerizing glutamine--fructose-6-phosphate transaminase.	0
NC_017949.1|WP_011835362.1|1494523_1495210_-|response-regulator-transcription-factor	gnl|CDD|223816	COG0745, OmpR, Response regulators consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain [Signal transduction mechanisms / Transcription].	1.83306e-81
NC_017949.1|WP_011676069.1|1487740_1488133_-|transcriptional-regulator-Spx	gnl|CDD|239330	cd03032, ArsC_Spx, Arsenate Reductase (ArsC) family, Spx subfamily; Spx is a unique RNA polymerase (RNAP)-binding protein present in bacilli and some mollicutes. It inhibits transcription by binding to the C-terminal domain of the alpha subunit of RNAP, disrupting complex formation between RNAP and certain transcriptional activator proteins like ResD and ComA. In response to oxidative stress, Spx can also activate transcription, making it a general regulator that exerts both positive and negative control over transcription initiation. Spx has been shown to exert redox-sensitive transcriptional control over genes like trxA (TRX) and trxB (TRX reductase), genes that function in thiol homeostasis. This redox-sensitive activity is dependent on the presence of a CXXC motif, present in some members of the Spx subfamily, that acts as a thiol/disulfide switch. Spx has also been shown to repress genes in a sulfate-dependent manner independent of the presence of the CXXC motif.	2.21314e-55
NC_017949.1|WP_011835352.1|1481790_1482858_-|SEL1-like-repeat-protein	gnl|CDD|276807	sd00010, SLR, Sel1-like repeat. Sel1-like repeats (SLRs) share similar alpha-helical conformations with Tetratricopeptide repeats (TPRs), but with different consensus sequence lengths and superhelical topologies. SLRs contain 36 to 44 amino acids and are present in bacteria and eukaryotes but not in archaea. SLR proteins are involved in a variety of functions, and many serve as adaptor proteins for the assembly of macromolecular complexes. The SLR family was named after the Caenorhabditis elegans Sel1 protein which is predicted to fold into 11 SLRs, a transmembrane domain, and an N-terminal signal sequence. The human Sel1L protein contains an additional fibronectin type-II domain and an N-terminal PEST sequence. Its downregulation is associated with the development of breast and pancreatic carcinomas.	1.63546e-30
NC_017949.1|WP_011835345.1|1471460_1472150_-|tRNA-(adenine-N(1))-methyltransferase	gnl|CDD|225258	COG2384, COG2384, Predicted SAM-dependent methyltransferase [General function prediction only].	1.37364e-100
NC_017949.1|WP_011835347.1|1472820_1473489_-|DnaD-domain-containing-protein	gnl|CDD|226445	COG3935, DnaD, Putative primosome component and related proteins [DNA replication, recombination, and repair].	1.85483e-64
NC_017949.1|WP_011835355.1|1485660_1487568_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein	gnl|CDD|223562	COG0488, Uup, ATPase components of ABC transporters with duplicated ATPase domains [General function prediction only].	0
NC_017949.1|WP_011835348.1|1473754_1475947_-|BspA-family-leucine-rich-repeat-surface-protein	gnl|CDD|308794	pfam03382, DUF285, Mycoplasma protein of unknown function, DUF285. This region appears distantly related to leucine rich repeats.	3.65234e-32
NC_017949.1|WP_011835360.1|1492658_1493984_-|HAMP-domain-containing-protein	gnl|CDD|223715	COG0642, BaeS, Signal transduction histidine kinase [Signal transduction mechanisms].	2.7038e-48
NC_017949.1|WP_011835353.1|1483115_1484387_-|dihydroorotase	gnl|CDD|236479	PRK09357, pyrC, dihydroorotase; Validated.	0
NC_017949.1|WP_011835356.1|1488355_1489006_+|redox-sensing-transcriptional-repressor-Rex	gnl|CDD|225221	COG2344, COG2344, AT-rich DNA-binding protein [General function prediction only].	1.73114e-111
NC_017949.1|WP_011835357.1|1489192_1489876_-|DNA-repair-protein-RadC	gnl|CDD|178801	PRK00024, PRK00024, DNA repair protein RadC.	5.84967e-97
NC_017949.1|WP_011835361.1|1493987_1494503_-|DUF2127-domain-containing-protein	gnl|CDD|226781	COG4331, COG4331, Predicted membrane protein [Function unknown].	1.23826e-54
NC_017949.1|WP_011835354.1|1484538_1485168_-|orotate-phosphoribosyltransferase	gnl|CDD|234771	PRK00455, pyrE, orotate phosphoribosyltransferase; Validated.	9.16895e-74

Protein sequences

>NC_017949.1|WP_011835354.1|1484538_1485168_-|orotate-phosphoribosyltransferase
MSISKAIAADLLEIKAVSLSPSQPFTWASGIKSPIYTDNRVTLAYPEVRSQIEGAFAELIKTEFPEVEVIAGTATAGIPHGAIIADYLKLPFAYIRSKPKDHGAGNQVEGRVAKGQKMVVVEDLISTGGSVLEAVAAAEREGADVLGVVAIFTYELEKANSKFADADVKLATLTNYSELIEIAKETGYVTKEELELLKKFKENQETWQA
>NC_017949.1|WP_011835353.1|1483115_1484387_-|dihydroorotase
MTLLIKNGRLIDPKSNRDEILDILIEENKIAKIGTNLSEENTEIIDASGLVIAPGLIDVHVHFREPGQTHKETIHSGAKSAAAGGFTTVVMMANTKPILSTPKVLTETLAIAKKEAIKIKAVASITQDFDGENLTDFAELIKAGAIGFSDDGIPLTDAGVLREALQKSKLTDSLLSIHEEDPNLIGTLGVNDGEVAHKCGFTGAPTVSEYSMMARDTMIAYETGARLHLQHLSAGESVEVVRFAKNLGAKITAEVTPQHFSITEQMIFEQGTNAKLNPPLRRDADISKIIAGLKDGTIDVIATDHAPHTHEEKNVSIDKAPSGMIGLETSLQLGLTNLVAKGHLTLLELLTKMTLNPAKLYDFDAGYLAEAGPADLVIFDAENTYQVGETFDSKATNSPFIYQKVQGQIKYTICDGNIVYQAK
>NC_017949.1|WP_011835352.1|1481790_1482858_-|SEL1-like-repeat-protein
MDKKNKHLNYEDRRKIEKLFNSNVTITEIAKEISHSRVAITNEVRRGLKKMRTSKGNIVERYYAEYAQQLYESTQSNKEKKPRFSETIKSKVKEKHQQGDSDKVIVVDIQEEFGTLAPAESTIRRWLKAFRDGQTSTIDRSYSRLGDEAYFNDDLDKATKYYEKGVQLGDTYAMTALADFYQNGKIVPQDWRKAYNLYEKAASLGDTKAMYMLSIYLDNGLGCEADSNQATFNLIKAANAGNSTGMVILASSLEHGSNLIKDLRKAVYWYRRAEEAGNVYAKKWLENHQEEVIKHLQDGVGFTDEEYLSYTWSKAHEEFGHLDKEITDKELQDLRDSGVISEISSQKPKKKKKDS
>NC_017949.1|WP_011835351.1|1477808_1481612_-|bacterial-Ig-like-domain-containing-protein
MGKYQSSHEEKQRGFRTWKSGKSWLYAASILVALAGVVGVTGASVKADSTPAPVTTSPVSTVTPFTTAPSASPAVTASTPTTDTDKGNVTNNTPTADTSASPEVTVSTPTADTDKASTTQQHVTMATPLQHKLLRATTPETSADAPSASSNLSTIYQATANITGAVSGTNLVISLSSDDGGINEPLTFTDSKSGDYSITLAKNNSSEVSNTTDIIWKDNKTGVTGTATAATDYQTNAVNIVTMRDGAPAALSYKDQTNLDVCDFYYTIGDKFDASKGFGGGTDASGNPIDFSSVKVDTSKVDLKTVGTYPVSYSVVDNTTEKTQTLVANVIVRSDPTLINLTGNNVNTNNNVNINQGATFDASQYLAYVRNLSGDSVDFSQVTVDTSHLNTAKAGVYPVYYSLPDSLITGGKYTAVLNVTVGSPLTGDASTFGVGGATVTEGDTNWAEEGSEKLLGSFWDSTGVSSATGVNSSGTKIILSGQNDKSTATYDSKAVDVNILGTYQVPITVIDPIGNSQTMYATVVVKPHDLLDGVWPDQSIQVSVPIGSNYNPMYGYPIYDDSEQQYTAVTNVNTNQEGYYQTVYAITNNSTGTDSNYKITANVRVYDDNTDGVTEQTAINAPMSSTGTVGQQWVVTDYGGNMNSISVTPSYPGESLSGFLSKYLTVSLTSKPEGSKAIAGIQAAYGDSNYGVMDCFFTPDASGSYTMTYIYTDPVSQKKVSASTVVTVPSTTTGSIDNMSISTNDVTVNQGKGLDFSNIVNSFVGADGKTVSGKDAWIWTGDDKGNIVTGDSENKVWNLTSWDPHAGAGVEDIIIDSSAVDTDKAGTYQIKYTASYDGSSKVLGTSTVTVVARDSQATLEAPKTATTAVNQPYDLTTGLMATDSTGKTINLTSGVSVAVNGKVISGTSYTPNTSGTYKIVYTNGTLSATTELIATDQSSLSAPTHHDMRTGQTYNIFTDVKALNAAGQEFSPTYQLTGQDVNGQSIDMTGLLTSANFVPKVAGIYMVTLTNGKKKATIKIAVAPSQVNSVVDEVTDNTDSAELISSTDRVLIGTVTVKKVGDTFNAYDEYVAGAAVDNNRPATTGVQATMASAIQDLLIKQYPDLATQIKSGYLNSTGILTNLVGVHIISNNVNMKKAGTYFVNYLIDSATMTFTTGDPLPAQIYDLKNMIVMRTVIVEADAVSTPNQNGGQTSKPGGGSTTTNTNSNGKTQVSMLATTYSRAKTITSASMLPITGENKSVSIVEMLLGASFISLTGLFIEMKRRKF
>NC_017949.1|WP_011835350.1|1476674_1477601_-|hypothetical-protein
MGEISSFTGVFTSMKNYIEKVIKIPFSCIVFLISIFLMFNPKLLSLIGINKWFPNQIKEIVLKIGQLFYSNMFFVSIGFVLFVLVLFGITYLPTEKIFPKDVELVNGKIKSWNSFSAFSTGINLFVLYLTTWWTYYFFINVLFNKNGFNHNFFISDKSNALYLNMTNSIIHSGYISSLNLLFMNIIFYLNIFITAYFIVQRLYQDIYILPKNSIKYNSIDTYFEYNSKVLTNSSDEETKIAILRYKHWDEAKYLLVKIPLTKNTFEWERWQQKEVWKLRKIPPAKKSIYIVLEDKELTNVIYAFDNFK
>NC_017949.1|WP_011835348.1|1473754_1475947_-|BspA-family-leucine-rich-repeat-surface-protein
MKKKLSKIQMLLLVTTLTAFSVGVVTYGPTVLNTQSITVSADTRASSGKWGEANWFLANDGELIFLGGDIGHPSQSLPEALREANVDPAAVKSIEFTTKTSANNISRAFVDLPELQKVLKLGNLNYSGSAESMFLSAANLEEIDLDGFDTSKITTMEYMFLGIKASTLDVSKFDTSNVTNMRGMFDGASNLTSLDLSSFDTSKVVDMSYLFVGLSKITELDVSSFNTSNVTNMRGMFDGVSNITSLDLSNFDTTKANDMNYMFLGAEKLEQLDISSFNTASVKSMKNMFSSMKALEKLDLTSFIISENTNSQAMFSGTNNLKNLKLGLKSQLNTGMNLENVPVTDGYTGKWQNVGSGTEDKPAGEHIWNSSEFMENFNAATMADTYVWQSLSGSEMELGEVTDYSNDKPLSDFISTATTPLNPYRYNVVLNNDHQFYSKLENGQLDTENIISLGSITGKTLYNKETVPVTYTTGDKKGQTTNFVNVSLEGDNWYWVDEHALNLDLAATYPSVNSDGIKLPDGMFLGSTITFGNNPAVSNSQMVSNAYNSQGKIIYESRAKLEDFATEAAPEAALAAFNKEIDRAVESWNAAINPNEPTIIKSSESTDSVTLVISPNPEGGGSATSIGNTGIESTLVNWALDPAAPDYDVNLLFITIRHELGHSLGLDHTSGGLYYGMPDGYRMNIDDDVMNAILSHTTGGYPWTQKTITQESIDTIHLILKNQNFSNPQH
>NC_017949.1|WP_011835347.1|1472820_1473489_-|DnaD-domain-containing-protein
MDYYDEYSKGHLVLPTVILSHFSELFPSAFDFLVWLYFFENREIAPSEIADKTGKKMSEVNQAIDSLSKFGAMKVTLIEIDGEMETFFDISPAFKHLDELVGSPALNLKAEDKKVQDEGQLKELISMFEAEMGMISPVQMEELRAWLFEDGYDLSLIKQALREAVLNRKVSLNYIKAILRNWKNDGVNSVQAIESRQMEREEAKRKKPQEDFYIPLDGPWNG
>NC_017949.1|WP_011835346.1|1472142_1472799_-|endonuclease-III
MLSKKRYLEALAIIEEMFPQAHGELVWETPFQLLIATILSAQATDKGVNKATPALFAAFPDAQAMSQAKVEEIEALIRTIGLYKTKAKNILRTSQMLVADFGGILPDLPKDKKLLQTLPGVGRKTANVVLAEAYGIPGIAVDTHVERVSKRLDIVAQKATVLEVEEKLMKLIPEDKWVQSHHHLIFFGRYHCTAKKPKCAGCPVLDYCKFGKKYLENE
>NC_017949.1|WP_011835345.1|1471460_1472150_-|tRNA-(adenine-N(1))-methyltransferase
MNEIKLSKRLKAVADYVDKGARLADIGSDHAYLPTYLVQKNEVEFAVAGEVVKGPFEIAKNHVAQANLKENIQVRLANGLAAIENVDKIDTIVIAGMGGILISEILEAGKGKLSSVKRLILQANNHGDTLRQWLIEHQFVIKAEQILLEAGKFYEIIVAEPTTNENPVLSANDLLFGPFLSKEKSVIFQQKWQKELNTLNKIIDRLPDEQTEKREEVLTEIAKIKEVLQ
>NC_017949.1|WP_011835344.1|1470690_1471464_-|Nif3-like-dinuclear-metal-center-hexameric-protein
MKISEFMSKYESFCPKELAVEGDPVGLQVGNPEQELTKVLVTLDIREQTVAEAKSLGVDLIIAKHPLIFRPLTALTSMDNQEKLVLDLAQAGIAVYTSHTNIDVVKGGLNDYFAQLLGLTDVEVLDDDEGLGRVGNIEGTDLSVLTEKVKEVFELDRLRLVTYNHDLTQKIERVAICGGSGGKLWPKALAKGADVYLTGDIYYHIGHDMLSAGLIGIDPGHYIEQKFIGLVADKLRSFGTDVKIYESQEKTNPFYDI
>NC_017949.1|WP_153951976.1|1485357_1485498_+|hypothetical-protein
MTNVTVVVVDSNKKHLPRDLASVKSIKTSSFLLTENPVSKNKISFS
>NC_017949.1|WP_011835355.1|1485660_1487568_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein
MILLQGNGIARTFGGDVLFENISFSLQDQSRIALVGRNGAGKSTLLKIIAGVEEASRGTISKTKDLSMNYLAQDTGLNSQRTIFAEMLSVFDQLRQMEKQLRQMELQMGELGADELTLLMKRYDSLSEEFRMKNGFTYESEIKSVLNGFRFDESMWEREISSLSGGQKTRLALAKMLLEKPQLLILDEPTNHLDIETLAWLENYLKNYDGSLLIVSHDRYFLDKVVNEVLELSRGELTRFSGNYSRYVEQREQKLLLELKNFEKQQKEIAKLEDYVAKNLVRASTTKMAQSRRKKLEKMDRLDAPTSDDKSAHVTFTPEKTSGNVVLTVSEATVGYSDNRLSGPINIDERKGESLAIVGPNGVGKTTLIKSIVGQIPFLAGQAKLGANVTLGYYDQEQGRLTTSNTVLDELWNEHRLLNEVEIRNMLGAFLFSGDDVKKTVGMLSGGEKARLLLAKLAMNHDNFLVLDEPTNHLDIDSREVLENALIDFPGTILFVSHDRYFINRVATKVLEIAPEGSTEFLGDYDYYVEKKEEQLAQTDESDNGGLVESLAQQDFTAQKEAQKNRRKVEREITSCEEKLAELEIKIETLMLQMQENTSDFVKLGELQAEIDLLNDEKDETEMTLLEAMEELESL
>NC_017949.1|WP_011676069.1|1487740_1488133_-|transcriptional-regulator-Spx
MIKIYLSGSCSSCRKAKKWLRKRHIEFEEINLTKDIMEKDDLIKILSLTENGLEDVIATRGKTYSGLNHNFDELGLEEAYRLIQENPRLLKRPLIFDEQRLLIGFNEDGIRAFIPPEVRRVELRERLILI
>NC_017949.1|WP_011835356.1|1488355_1489006_+|redox-sensing-transcriptional-repressor-Rex
MTDHKPSKSLPKATAKRLPQYYRLFKSLVEENVTRTNSQLISEKIGVDAATIRRDFSLFGELGRRGYGYETKVLRDFFGELLGQDQETHIALIGVGNLGRALLHYQFQDRNKMRITQAYDISGNPLVGTQTDDGIPIYNISDLEKNVKKSDIKTAILSVRKENAQEVVDTLVKAGIKGFLNFAPIRLKVPSDVVVQSIDLTKELQTLLFFMGAQEE
>NC_017949.1|WP_011835357.1|1489192_1489876_-|DNA-repair-protein-RadC
MYELKEKSYPMQPRERLELLGEEYLSDVELLAILLRTGRKKYSSLNLALELLQHFGTLDNFRKASISELKEISGIGQTKAIELRAMIELGKRIQTTTRKRYGQVLSSKEYGMSLAFEMQNFEQEHLTATYLDGQNQIIEKKTIFIGAFNHATASPREILYHAVKNLSVGLLVAHNHPSGNLQPSQADKIFTKKIKNACDNIGINFIDHIIVGAGNYYSFRERDSNLF
>NC_017949.1|WP_011835358.1|1489993_1491811_-|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing)
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>NC_017949.1|WP_011835359.1|1491992_1492649_-|phosphatase-PAP2-family-protein
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Prophage detection

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DBSCAN-SWA_7	1027015 : 1035810	8	Bacillus_phage(33.33%)	transposase	NA
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DBSCAN-SWA_11	2213441 : 2228382	21	Lactococcus_phage(87.5%)	terminase,integrase	attL 2210232:2210247|attR 2228468:2228483
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Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NC_017949|14435:59877|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_003132167.1|14435_15002_+|tRNA	aminoacyl-tRNA hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_011834129.1|15002_18545_+	transcription-repair coupling factor	NA	NA	NA	NA
WP_011675089.1|18861_19131_+	RNA-binding S4 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_011675090.1|19161_19536_+	septum formation initiator family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011675091.1|19535_19859_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_014734879.1|19999_21337_+	serine hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_011834131.1|21333_22602_+|tRNA	tRNA lysidine(34) synthetase TilS	NA	NA	NA	NA
WP_011834132.1|22582_23134_+	hypoxanthine phosphoribosyltransferase	A0A1V0SEQ1	Hokovirus	1.4e-09	29.7
WP_011834133.1|23339_25427_+|protease	ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH	G8DDJ2	Micromonas_pusilla_virus	1.6e-106	49.2
WP_011834134.1|26493_28317_+	PTS transporter subunit EIIC	NA	NA	NA	NA
WP_011834135.1|28376_30311_+	transcription antiterminator	NA	NA	NA	NA
WP_011834136.1|30357_30789_+	PTS sugar transporter subunit IIA	NA	NA	NA	NA
WP_011834137.1|30937_32104_+	mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_011834138.1|32973_33297_-	sigma-70 family RNA polymerase sigma factor	Q9AZI1	Lactococcus_phage	1.2e-42	82.2
WP_041931235.1|33397_33730_-	hypothetical protein	Q9AZE0	Lactococcus_phage	3.4e-40	75.0
WP_011834140.1|33805_34108_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011834141.1|34424_35006_-	hypothetical protein	Q9AZI4	Lactococcus_phage	7.0e-89	89.6
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WP_011834146.1|38254_38494_-	hypothetical protein	Q9AZJ0	Lactococcus_phage	2.2e-36	92.4
WP_011834147.1|38535_38817_-	hypothetical protein	Q9AZJ1	Lactococcus_phage	1.2e-46	95.7
WP_011834148.1|38828_39254_-	hypothetical protein	Q9AZF1	Lactococcus_phage	2.8e-71	92.2
WP_011834149.1|39258_39453_-	DUF1655 domain-containing protein	Q9AZF2	Lactococcus_phage	5.7e-27	93.8
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WP_011834154.1|41311_41866_+	hypothetical protein	Q9AZJ8	Lactococcus_phage	2.4e-102	92.4
WP_011834155.1|41976_42207_+	hypothetical protein	Q9AZK0	Lactococcus_phage	1.2e-15	85.5
WP_011834156.1|42279_42474_+	hypothetical protein	Q9AZK1	Lactococcus_phage	1.0e-28	98.4
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Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NC_017949|401441:413597|DBSCAN-SWA
AATGATTATTCCAGAAAATATTGAAAATTTAGCTGAGCTTGTCAAAGGCCCAGAAAAAACAGTCTTCTTTTTCACAGCTGGTTGGTGTGGAGATTGTAATTTTATCAAACCTAAAATGCCAGAAATTGAAACAGAGAATCCAGAATTTAGATTTGTTGAAGTAGACCGTGATGAGTACATGGATCTTGCTATCGAGTGGGGAATTATGGGAATTCCAAGTTTTGTTGTTATTGAAGATGGACAAGAAAAAGCTCGTCTAGTCAATAAATTACGCAAAACCAAAGAAGAAGTGAATACTTTCTTAGCAAGTGCAAAATAAGACTGATTTCTTGAGGTAAAATGGAGTCAAATACTGACCATTGATAAATCCAGAAATATATTCTATAATAATCACTGTTAAGAAATTAAAAGGGAAAATTTAAAAATGATTGCAACATATAACACAAACGTCGGCGATGTTTTAATGCTTATCACGGCAAATGATAGAGGTGAAAAGGTAAACTTTGAACGTAAGGGAAAAGTAGCACGTATCTTTATCGAAGAAACTGGAGCAACAGTCGCTTGGAATATTTTTGAAGCCAAGTCATTACTGACAGACTTGTCAGGAAATGGACAAGTCAAATTATCATCTGATGATGTTGAAATCTTGAACAAAGAGCTTGGAAAATCAGGATTTAGCGATGTTCTTGTGCATGATTCGCAACCAAAATTTGTTGTCGCTGAGATTGTAGAAATGGAAGATCACCCAGACTCAGATCATCTTCATATCTGTAAAGTTAATGTTGGTTTTGCTGATCCAGTACAAATTGTTTGTGGTGCACCAAACGCGTCACTCGGATTAAAAACAGTCGCAGCACTTCCAGGCGCAATGATGCCTAATGGAGCATTGATTTTTCCAGGAGCTCTTCGAGGTGTTCAATCTTATGGAATGCTTTGTTCAGCGCGTGAACTTGAATTACCCGATGCTCCCGATGTTCGTGGAATCATTGAACTTTCATCAGCTTTGGCTGCGGGTACAGCTTTTGATTCAGAAACTATGTGGCAAGCTTAATAATAAATCTGTCAAAATAATTTATTTTGACAGATTTTTTTATCTAATAATTAAAATAATTATTTCACAATGTTCACAAGCGCTTACAAAAGAAAATAGATTGACTTATGCTAAACTGAATAATGTAAAAAGAATTTTACATTTAAAGGAGACCTATTAGTATGAAAATCGTAGTTATCGGTACAAACCACGCAGGCATTGCTACAGCGAATACATTACTTGAACAATATCCCGGGCATGAAATTGTCATGATTGACCGTAATAGCAACATGAGTTATCTAGGTTGTGGCACAGCAATTTGGGTTGGAAGACAAATTGAAAAACCAGATGAATTATTTTATGCCAAAGCAGAGGATTTTGAGGCAAAAGGGGTAAAAATTTTGACTGAAACAGAAGTTTCAGAAATTGATTTTGCTAATAAGAAAGTTTATGCAAAAACTAAATCTGATGATGAAATAATTGAAGCTTACGACAAGCTTGTTTTAGCAACAGGTTCACGTCCAATTATTCCTAATCTACCAGGCAAAGACCTTAAGGGAATTCATTTTCTGAAACTTTTTCAAGAAGGTCAAGCAATTGACGCAGAATTTGCCAAAGAAAAAGTCAAGCGTATCGCAGTCATTGGTGCAGGATATATCGGTACAGAGATTGCGGAAGCAGCTAAACGTCGGGGTAAAGAAGTTCTTCTCTTTGACGCTGAAAATACTTCACTTGCATCATATTATGATGAAGAATTTGCCAAAGGAATGGATGAAAACCTTGCTCAACATGGAATTGAACTTCATTTTGGAGAACTGGCCAAAGAATTTAAAGCGAATGAGGAAGGTTATGTATCACAAATCGTAACCAACAAGGCGACTTATGATGTTGATCTTGTCATCAATTGTATTGGTTTTACTGCCAACAGTGCCTTGGCAAGTGATAAGTTAGCTACCTTCAAAAATGGCGCAATCAAGGTGGATAAGCATCAACAAAGTAGTGATCCAGATGTTTACGCGGTAGGTGATGTTGCGACAATTTATTCTAATGCCTTGCAAGATTTTACTTATATCGCTCTTGCCTCAAACGCTGTTCGGTCAGGAATTGTCGCAGGACACAATATTGGTGGAAAAGAATTAGAATCTGTTGGTGTTCAAGGTTCTAATGGTATTTCGATTTTTGGTTACAATATGACTTCTACAGGACTTTCTGTTAAAGCTGCTAAAAAATTAGGTTTAGAAGTTTCATTTAGTGATTTTGAAGATAAACAAAAAGCTTGGTTTCTTCATGAAAACAACGATAGTGTGAAAATTCGTATCGTATATGAGACAAAAAGTCGCAGAATTATTGGAGCACAACTTGCTAGTAAAAGTGAGATAATTGCAGGAAATATAAATATGTTCAGTTTAGCGATTCAAGAGAAAAAAACAATTGATGAACTAGCTTTGCTTGATTTATTCTTTCTCCCCCACTTCAACAGTCCATATAATTATATGACAGTTGCAGCTTTGAATGCCAAATAAACAATAGAAATCTATCTGCTTGATAGATTTTTTTATTTTTTAGTGACAAATGCTCAAACTTTACGTATAGAAAGTTAGGAGGATTTTATAATGAATAAAACCATGTTGATTGGTCGTTTAACAAACGCACCTGAAATTTCGAAAACAACGAACAATAAATCTTATGTCCGTGTGACTCTGGCAGTCAATCGCCGCTTCAAAAATGAAAAAGGAGAGCGAGAAGCAGACTTTATCTCGATAATTATATGGGGAAAATCAGCAGAAACATTGGTTTCCTATGCTAAAAAAGGAAGTCTTATTTCTGTAGAGGGAGAGATTAGAACTAGAAATTATACTGATAAAAATGAACAGAAACACTATATTACAGAAATCTTAGGTTTGAGCTATGATTTATTGGAAAGTCGTGCGACTCTTGCCTTGAGAGAAAGCGCTGTAAAGACTGAGGAACTCTTACTTGAAGCTGATGAGCTCCCTTTCTGATTTATTTGATTAAATCTAAATGTTTTCTCTTGACTAAATCTGACCATTGAGATAAAATAAGAATATGTTAGCACTCAACTATTAAGAGTGCTAAAAATAAAAAATGGAGGAAAGTATAATGTTGAAACCTTTAGAGAATCGCGTAGTTTTACGTGTAAAAGAAGAAGAGGAAAAATCTATGGGCGGAATCGTATTAACGAGCGCTTCCCAAGAAAAACCTCAAACAGCTGAAGTTATTGCTGTCGGTGAAGGGAAAACAACTAATCATGGGACACTGATTTCTCCACTCGTAAAAGTTGGAGATACAGTAATTTTTGAGAAATTTGCCGGAACGACTGTCAAAATGGACGGTGAAGAATTCTTGATTCTCAAAGACTCAGACCTTCTTGCAATTGTAGAGTAAAAATATAAAAGCAATCAATTTTTGATTGTCTTTTGTCTATCTTAAAATCTATTAATTAAAAATATATTCTTAAAAAAGGAGCGAAAATGTCAAAAGAAATTAAATTTTCAAGTGATGCTAGAACAGCGATGATGCGCGGAATTGATATTCTTGCCGATACAGTAAAAACAACCCTTGGGCCAAAAGGGCGTAATGTTGTTCTTGAAAAATCATATGGTTCACCTTTAATTACAAATGATGGTGTTACAATTGCCAAAGAGATTGAACTTGAAGACCATTTTGAAAATATGGGAGCTAAACTTGTTTCGGAAGTTGCTTCAAAAACAAATGATATTGCAGGTGATGGAACAACAACAGCGACAGTTTTGACACAAGCTATTGTTCGTGAAGGATTGAAAAATGTTACTGCAGGTGCAAATCCAGTTGGTATTCGCCGAGGAATTGAACTCGCAGCTGAAACAGCAGTTGCTTCAATTAAAGAAATGGCAATTCCTGTTCACGATAAATCAGCAATCGCTCAAGTTGCTACCGTTTCATCACGTAGTGAAAAAGTTGGGGAATATATTTCTGACGCAATGGAGCGTGTAGGTTCTGACGGAGTTATCACAATCGAAGAATCAAAAGGAATGCAAACAGAGCTTGATGTTGTTGAAGGAATGCAATTTGACCGTGGATACTTGAGTCAATATATGGTTTCTAATACAGAGAAAATGGTTGCTGAGTTAGATAATCCTTATATTCTGATTACGGATAAAAAAATCTCAAATATTCAAGAAATTTTACCGCTTCTTGAACAAATTTTGAAAACAAATCGTCCACTTTTAATTGTTGCTGATGATGTTGATGGAGAAGCATTGCCAACTCTTGTTCTTAATAAGATTAAAGGGGTCTTCAACGTAGTCGCTGTAAAAGCACCGGGATTTGGTGACCGCCGTAAAGCTCAATTGGAAGATTTAGCTATCTTGACAGGTGGTACAGTAATTACTGAAGAACTTGGCCTTGATCTTAAAGATGCTACACTAGAAGCTTTAGGACAAGCTGCTAAAGCAACTGTTGATAAAGACCATACAACAATTGTTGAAGGTGCTGGTTCTGTTGGTGCCATTTCTGATCGTGTGGCTATCATCAAAGCACAAATCGAAAAAATAACTTCTGATTTTGACCGTGAAAAATTGCAAGAGCGCTTAGCGAAATTAGCTGGCGGAGTTGCGGTAGTTAAAGTAGGAGCCGCAACAGAAACAGAACTTAAAGCAATGAAACTTTTGATTGAAGACGCACTTAATGCAACACGTGCTGCTGTTGAAGAAGGTATCGTTTCTGGTGGTGGTACAGCTCTTGTTAATGCCATCGCAGCTTTGGATAAACTTTCAGAAGAAGGCGACATTCAAACAGGAATTAACATCGTTCGCCGTGCCCTTGAAGAACCAGTTCGTCAAATCGCGGCCAATGCAGGATATGAAGGTTCAGTTATCATTGATAAACTTCGTTCAGAAAAAGTTGGTACAGGATTTAATGCAGCGACAGGTCAATGGGTAAATATGATTGAAGAAGGAATCGTTGACCC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

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MTEQNGFKYSILASGSTGNSFYLETPKKKILVDAGLSGKKIESLLSEIDRDIHDIDALLITHEHSDHIKGIGVLARKYGINLYANEDTWSELDGKNALGKIPLEQKHLFEMGKTMTFGDIDIESFGVSHDAIAPQFYRFMKDDKSFVMLTDTGYVSDRMRGTIENADAYLMESNHDIEILRMGAYPWRTKQRILSDQGHLSNEDGAEAAFNIHGNKTKKIFLGHLSLNNNIKELAHLTMDGYLQQHDVDTKNELKILDTSHEHASPLYDI
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MKIVVIGTNHAGIATANTLLEQYPGHEIVMIDRNSNMSYLGCGTAIWVGRQIEKPDELFYAKAEDFEAKGVKILTETEVSEIDFANKKVYAKTKSDDEIIEAYDKLVLATGSRPIIPNLPGKDLKGIHFLKLFQEGQAIDAEFAKEKVKRIAVIGAGYIGTEIAEAAKRRGKEVLLFDAENTSLASYYDEEFAKGMDENLAQHGIELHFGELAKEFKANEEGYVSQIVTNKATYDVDLVINCIGFTANSALASDKLATFKNGAIKVDKHQQSSDPDVYAVGDVATIYSNALQDFTYIALASNAVRSGIVAGHNIGGKELESVGVQGSNGISIFGYNMTSTGLSVKAAKKLGLEVSFSDFEDKQKAWFLHENNDSVKIRIVYETKSRRIIGAQLASKSEIIAGNINMFSLAIQEKKTIDELALLDLFFLPHFNSPYNYMTVAALNAK
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MIYEIKFAHGESNIFATSEAELVPQSEVIIRSEKGTFYGKIIRSFSDDANLETHHTIEREVTDEDLEVILKLEELSKKAKDKVRQLVVEQELEMKIIDVAYTFDQMQLFISFTAENRVDFRLLLRELATTFRIRIELRQIGPRDAAKIHGGLGPCGRPLCCSEFVYEFPNVSIKMAKNQNLSLKQNKLNGLCGRLMCCLTYEDSFYKEAQQLFPDFGEFVTTSEGKGKVVGLNVLKNRVKIRFGEYSKDFELAEIEVNHG
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MEIVDIQPQLYKQFSTILQHGKLSHAYLFSGGFGSFELAIWLSQALFCENPENSLPCGHCRSCRLVAQQEFADLHIVEPDGQTIKTAQIRDLTQVFSESGYEGKQQVLLIREAEKMHPNAANALLKSIEEPETEIVVFLLTDNENMILQTIKSRTQIINFRKNVQFLQDFLEKNGILKTQAELLAEICNSTDRALELAQQSWFNEGLQRIQHFVKLLKKSADEAFLYLKDLVEIFDDKEKQNQAFELLLQLFNQERMSQELLKTFQAIKMWKSNVRFESSLTFIVL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_011834456.1|401864_402491_+|tRNA	DUF4479 and tRNA-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_011834457.1|402652_403993_+	FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_011834458.1|404083_404473_+	single-stranded DNA-binding protein	A0A2I2MUI5	uncultured_Caudovirales_phage	2.0e-23	42.3
WP_011834459.1|404591_404876_+	co-chaperone GroES	A0A221S386	uncultured_virus	1.1e-13	44.1
WP_011834460.1|404962_406591_+	chaperonin GroEL	A0A219YK78	uncultured_virus	5.5e-155	56.4
WP_011675466.1|406640_407453_-	MBL fold metallo-hydrolase	A0A0C5AJ83	Bacteriophage	1.5e-33	38.1
WP_173249647.1|407643_408999_-	PAS domain-containing protein	W8CYF6	Bacillus_phage	1.4e-31	32.9
WP_003131580.1|409063_409765_-	response regulator transcription factor	W8CYM9	Bacillus_phage	1.2e-42	39.7
WP_011834462.1|409942_410578_+	dTMP kinase	M1PSC7	Streptococcus_phage	4.5e-73	65.5
WP_011834463.1|410710_411571_+	DNA polymerase III subunit delta'	M1NSC1	Streptococcus_phage	1.1e-64	45.2
WP_011834464.1|411620_412403_+	stage 0 sporulation family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011834465.1|412395_412722_+	DNA replication initiation control protein YabA	NA	NA	NA	NA
WP_011834466.1|412721_413597_+	16S rRNA (cytidine(1402)-2'-O)-methyltransferase	M1PLC5	Streptococcus_phage	7.1e-101	66.4

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NC_017949|580465:634879|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

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MSRLSIIVPAYNEEETLEIFLNEVNKQTIELPLEKTYFFINDGSTDNTLEVIKELSNKYDNVKYISFSRNFGKEAALIAGLEVSDGEFITVMDADLQDPPEMLNEMFAKITEGYDVVGTRRVSRIGEPPIRSFFAKTFYKLINKISDTEMVDGVRDFRLMTRQVVDSILKLKENNRFSKGIFSWVGFKTTYLPYENRERVAGNTSWNFFSLLKYSIDGIVNFSEAPLNIATFVGFVSFLTSCLLSLFYLLKTLIFGDAVQGFPTLIVLILLLGGLQLLSIGIIGKYIAKIFLETKKRPNYIIKESNIKSN
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MLQKNSQVAASDTEIKLSNGFKIGDDNILLYKYFDNYIEVFKKDKITTRTFNKYLNSSKDLKKYFPKETLKSLTKTRYQKYLNGYTKTHADHSVRQFNTHIRAAVQNALDEQIIATDFTKKAVVKGQGAKKSEEEKYINYADFVRLLRLSSEKIDSFYSTRLMIYLAGTTGMRFGELIGLKWSEVDFENEIINIKLEYNYVTKIFTEPKGYKIRKITINSKTAKILLDLKDNQINHELDNPDNLVFFNPTYGIVSNNAANSVLRRMQKNLEIYPTITMHGLRHTHGSVLLMKGINILAVSKRLGHASVDITLGVYAHLLKELEDRENDKIKSELDKII
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MGNILSGIIGLIGAILGVLGAYLVMKKQLKAQNEQYRKDKIDNTFFNLLGLFQNVREELDSSEIISDIKYLRGLKIGKDPYSIFKSIDVNNIINKQDDIVEIINEVFKSSTGYSGNYFRALYRCLKYIMDSDLKMEDKKFYSGVLRGVLSSKEMLLVFYNCMYFEKGEKFKELLEREENGKRIDFFGDEEDLKNLDKGYDLPFFSKEDLLFSEKDMQKLEELIKGN
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MTIIGVKIDQKFMRDLLILIIGVGLYVLSVQLFVIPNRLASNGVAGFSVLMDFVFGINPALTFFLVNVPLFIFGGRLLPRRILLLSIPGALAMSLWLMIYEALGVTGFQFSHVIFAGIFDGILSGIGAGLVIISEGTFGGSILLSRILEEQWDFKIDKVLFLVDVVVLSVSLLTFLSLPNFAVTLLSCYIFSKMTLIVGREDYRKSLMSRGKKIYQKVFAA
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MVDKETTEFSRGSFKEKILRQLEENAAKQAETKFPDPEDFERPKGSEPVTSERKIEPRKVELEPFKLPVFKFPEADEEEDFQAQVDENTSQETGSLRQKLEEIVSDENQEQTFPPPFSRSESAVQEEPIEQENISEKRESEKMVKHQPSRRTTAPSKKNSSGKKNKNKKKKKVTAGKIITVIVVLLILVVGGTGWYGYNFVKSGIQPLDSKNTAVKSISIPAGSSSKQIGEILQRQSIIKNGMIFQYYTKFKNYSEFKSGYYNLSPNMSLSTIASKLEEGGTEKPVAPTLGKILIPEGYTLTQIAKAVTVNSNSQEKNAKTPFSEADFMKTVQDPTFIAKMVKAYPKLFASLPTKDSGIKYQLEGYLFPATYDYTKSSSVESVIENMIEAMNAQLTPYYDTMTQKNLTVNDVLSLAALVEKEANNDDDRRNVAATFYNRMNQGMTLGSNLSILYAEGKLGEKTSLAEDANIDTNLDSPYNLYANTGFGPGPVDSPSLSSIKAVLNPAQNDYLYFVADVTTGKVYFAKTLEEQNANVQKYVNDKLSK
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MKKFLLLGATALSLFSLAACSSSNSTTTSTDVSKSVSSSISKSKSTSLSISESQRKSQEAESQSIAESQSIAKESESISLSESHAASESVAASIANTTTQEAPASIDTTTEDNNNTTVYVVDNGTTKVYWYSASAIKPTPKNPVISMTESQALAQGLHHSERE
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MSIITDIYAREVLDSRGNPTLEVEVYTEDGAFGRGMVPSGASTGEHEAVELRDGDKSRYNGLGTQKAVDNVNNIIAEAIIGYEVTDQQAIDRAMIALDGTENKGKLGANAILGVSIAAARAAADELGVPLYNYLGGFNAKVLPTPMMNIINGGSHSDAPIAFQEFMIVPVGAPTFKEALRWGAEIFHALKKILKARGLETAVGDEGGFAPKFDGTEDGVETILKAIEAAGYKAGEDGVMIGFDCASSEFYENGVYDYTKFEGEGGKKLSASEQVDYLEELVSKYPIITIEDGMDENDWDGWKILTERLGKKVQLVGDDFFVTNTKYLERGIRENASNAILIKVNQIGTLTETFEAIEMAKEAGFTAIVSHRSGETEDSTISDIAVATNAGQIKTGSLSRTDRMAKYNQLLRIEDQLAEVAQYKGLKAFYNLKK
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MEIQFLGTGAGQPSKSRNTQAIALKMLDERNEIWLFDCGEASQHQILNTAIKPRKITKIFITHLHGDHIFGLPGFLSSRSFQSSDEQTDLDLYGPVGIKEFVLAGLRISGSHLGYRINFHEIDSAGKIFEDDSFEVYTDLLDHTIFCLGYRVVEKNRVGELDANALKEAGLPFGPLFGKIKKGEVVDYDGKTFDPKDYIGADKVGKIVTILGDTRKTNTAVRLAWQADLLVHEATYEAAESKMARAHGHSTTKQAADVAKEAGVNRLLLTHISARYVGPLVGQLVREAQDVHANTFVAKDLYEEKIG
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MKIEMKNGKLIVPDYPTIGYIRGDGVGEDIFPQAKRVFDAAVLKIFGEKKKIDWQKLLAGGEAFASRGEYLPDETLEQIKENLIAIKGPLMTPVGESFRSINVTLRQKLDLYACVRPVEYFTGIKSPVRAPEKVNMTIFRENTEDIYAGIEFSSSSKESKKLINFLERELSVHSIRFPETSAIGIKPVSPDGSKRLVSAAFDYAIKMNKKRVTFVHKGNIMKFTEGGFRKWGYEVAKNYPTFTKLEYDKIKEEKGTEQSEKEKNIALKSGKIYVDDAIADNFLQQIILNPDNFEVVATLNLNGDYISDALAAQVGGIGIAPGANINYESGHAIFEATHGTAPDIAGKNIANPSSLILSGVMMFEYLGWQEVAELIKIALSASFHSGALTADLGGKLSTSEFTDTLVQYIKNY
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MNDKKWIDLGMKYGGFMAQDQIFLENRLATLSDVADKRLLVTPPASVLNAYFAELYQKRSPKDATDYFFELSKAFDIFEENPDFQLEGKVGSEHFRFIRLNLSGKSFGFSYKNEEEEALIFSEFPVKITAELMFEIAQIFPHYLLIEEDGKLQMKPAQFQSEFEKVKDVTALTEQAENEEYIRLSGYNIEDLLEQAQEIGFLSPLCYGRDGRKHLVYIIKGF
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MIKFNIRGENVEVTDAIRAYVEDKIGKLDKYFNDGHEVTAYVNLKVYTEKRAKVEVTLPAKNVTLRAEDTSQDMYSSIDFVEEKLERQIRKYKTRMNRKPRNAVPTGQVFGDEFAPLDTTDEVAEDHVDIVRTKHVALKPMDAEEAVLQMDMLGHDFYVFTDADSNGTHVVYRRTDGRYGLIETE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_011675765.1|580465_581131_+	YitT family protein	M1Q1P6	Streptococcus_phage	2.3e-19	29.8
WP_011834608.1|581261_582146_+|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase MiaA	NA	NA	NA	NA
WP_011834609.1|582291_582960_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011675768.1|583124_584027_+	SPFH domain-containing protein	A0A1V0SL90	Klosneuvirus	1.8e-35	35.2
WP_011834610.1|584275_585292_-|integrase	site-specific integrase	Q9AZR0	Lactococcus_phage	4.0e-71	42.9
WP_011834611.1|585512_586004_-	hypothetical protein	Q9AZF8	Lactococcus_phage	3.6e-78	93.3
WP_011834612.1|586279_586489_-	hypothetical protein	Q9AZF6	Lactococcus_phage	2.3e-26	83.6
WP_011834613.1|586556_586808_-	hypothetical protein	Q9AZW4	Lactococcus_phage	3.8e-23	69.6
WP_162467000.1|586773_587064_-	hypothetical protein	Q9G0E8	Lactococcus_phage	1.2e-12	81.8
WP_014734944.1|587044_587221_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011834615.1|587514_589122_+	glycosyltransferase family 39 protein	NA	NA	NA	NA
WP_161769936.1|589045_589978_+	glycosyltransferase family 2 protein	V9QJB1	Oenococcus_phage	6.6e-81	49.7
WP_011834617.1|590244_590736_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011834618.1|590748_591123_-	PH domain-containing protein	A5GYQ0	Lactococcus_phage	7.1e-50	80.6
WP_011834619.1|591467_591815_-	XRE family transcriptional regulator	A0A182BQC8	Lactococcus_phage	3.1e-44	76.3
WP_011834620.1|592580_593504_+	ribonuclease Z	NA	NA	NA	NA
WP_014734945.1|593496_594198_+	SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_014734946.1|594370_596599_+	single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ	A7KV88	Bacillus_phage	2.3e-79	31.3
WP_011834623.1|596722_597235_+	adenine phosphoribosyltransferase	A0A1V0SKE5	Klosneuvirus	5.3e-32	44.0
WP_011834624.1|597450_598017_+	DNA-directed RNA polymerase subunit delta	NA	NA	NA	NA
WP_041931175.1|598152_599793_+	endolytic transglycosylase MltG	NA	NA	NA	NA
WP_011834626.1|599853_600324_+	transcription elongation factor GreA	NA	NA	NA	NA
WP_101928132.1|601863_603010_+|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	2.3e-46	41.0
WP_011834627.1|603241_603697_+	CtsR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_011834628.1|603686_606137_+|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit	A0A223W0B1	Agrobacterium_phage	2.4e-122	33.9
WP_011834629.1|606271_606829_+	ribosome-associated translation inhibitor RaiA	NA	NA	NA	NA
WP_010905473.1|607016_608318_+	phosphopyruvate hydratase	A0A1X9I5Z8	Streptococcus_phage	4.0e-217	87.6
608217:608276	attL	NA	NA	NA	NA
WP_011834630.1|608406_609342_+|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	A0A142F1N9	Bacillus_phage	4.0e-25	27.5
WP_011834631.1|609468_610101_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_102032783.1|611480_612592_-|transposase	IS3-like element IS981 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	4.7e-49	41.4
WP_011834633.1|612671_613352_+	abortive infection protein	NA	NA	NA	NA
WP_011834634.1|613885_614557_-	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	1.9e-29	36.8
613681:613788	attR	NA	NA	NA	NA
WP_011834635.1|614558_615632_-	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_011834636.1|615643_616213_-	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_011834637.1|616402_617926_-	acyl-CoA synthetase	NA	NA	NA	NA
WP_011834638.1|618119_619037_+	magnesium transporter CorA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011834639.1|619296_621660_+	formate C-acetyltransferase	A0A2P0VNR5	Tetraselmis_virus	4.7e-107	31.6
WP_011834640.1|621788_622448_+	dephospho-CoA kinase	NA	NA	NA	NA
WP_011834641.1|622450_623668_+	multidrug efflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_003129585.1|623664_623811_+	50S ribosomal protein L33	NA	NA	NA	NA
WP_011834642.1|624187_625450_+	FtsW/RodA/SpoVE family cell cycle protein	NA	NA	NA	NA
WP_011834643.1|625554_628968_+	pyruvate carboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_011834644.1|629093_630419_+	citrate/2-methylcitrate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_011834645.1|630415_632962_+	aconitate hydratase AcnA	NA	NA	NA	NA
WP_011834646.1|632981_634220_+	NADP-dependent isocitrate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_011834647.1|634279_634879_-|protease	ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit	A0A223W000	Agrobacterium_phage	7.1e-52	52.6

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NC_017949|643981:700633|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_003140250.1|687295_688180_+	murein tripeptide/oligopeptide ABC transporter permease OppC	NA	NA	NA	NA
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WP_011834694.1|690216_692100_+	endopeptidase PepO	E3T4I7	Cafeteria_roenbergensis_virus	1.8e-72	31.1
WP_011834695.1|692402_693722_+|transposase	IS4-like element IS1675 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_011834698.1|695077_695359_+|bacteriocin	bacteriocin immunity protein	NA	NA	NA	NA
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WP_011834703.1|697732_698287_+	recombinase family protein	A0A286S1P7	Klebsiella_phage	1.8e-41	49.7
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WP_011834705.1|699248_699428_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_102032785.1|699524_700633_-|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	3.3e-34	36.5

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NC_017949|776264:822742|DBSCAN-SWA
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MVNKMGFELSDKTIEKLNIIGEDFAKLLTERAAKEQNELTEAFRATAINGKSLYDECLKQGFDKDEAIKFSVEFLVGLSK
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MEKFAISNDQEFLEILYNYALNPNIKDRERKIVQLGRKELENKVYSLSVANRMVASFQREAISSRLSKDTSVLYNSLKDYISKNIPLGTPRVAGINAGYDL
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MKLMCKLFGHKWSEQRYMYGPFVDGIKTRPYKKCLRCNEFAWDFNRSDLDESENVFG
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MRLMKRDLTTVYLKRIDPNNTQDEEGNDQVNYLAPIALEMNVQSASGAVNATIYGSKLSSMKSCKYQGDELKEGRDENSGVCVYVDKDGNPDYKINSIQPYSTHINVMLERNDDIGS
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MTITEQQFYDMLNVDEHMNFTNRIQELVFDKKGREEFYYKILNINHDMGVDFFRDYFMAHSAVSAKGQHYTPDELGKLTSLLVGGSGGADLTGAGTGTLIIQKWQDDRMNADFFNYLPSNYWYQALELSDEAISFLIHAFAIRGMNGVIIHGDALEMAVKQVYFIQNSANNPIGFSEINVIPHSKDAMEFLGIHEWTEQAIEHIESKFPDWIPLTEEKKGQMSLFE

Homologous phage analysis in the prophage region

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767234:767250	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_011834814.1|818134_818440_+	hypothetical protein	A0A059NT81	Lactococcus_phage	2.8e-52	100.0
WP_011834815.1|818426_818651_+|holin	holin	A0A059NT58	Lactococcus_phage	1.1e-34	100.0
WP_011834816.1|818647_819937_+	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	A0A059NT93	Lactococcus_phage	3.3e-248	100.0
WP_011834817.1|820118_821078_+	Abi family protein	A0A059NT88	Lactococcus_phage	2.2e-180	100.0
WP_173249648.1|821349_821505_+|holin	bacteriophage holin	A0A059NTA2	Lactococcus_phage	2.2e-21	98.0
WP_011834819.1|822009_822432_+|bacteriocin	garvicin Q family class II bacteriocin	NA	NA	NA	NA
821775:821791	attR	NA	NA	NA	NA
WP_011834820.1|822436_822742_+|bacteriocin	bacteriocin immunity protein	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NC_017949|946657:955598|DBSCAN-SWA
TATGACAAAATATTCATTTGAACTAAAACTAAAAGTGGTTCAGGATTATGATAACGGTGTAGGGGGGTGTGATTATTTAGCCAAAAAGTACCATGTCACGAACGAAGCGATTGTCAGGCGTTGGGTCAAAGCTTATAAAGAATTAGGGGCGGTTGGAATTCAGCGTAAAAGACAAAATACAGTTTATTCAACACAATTCAAACTTAATGCGGTAAACTTATATCTAACAAGTGAAAAGTCATATAGAGAACTAGCTCATGAATTGGGAATGAATAATCCGCCACTTCTTACACGATGGGTATCAAATTATCGCAAAAAAGGGGAATTTGCCTTTTCTAATGTTCAGGGGCGACCTAGAAAAGAGTCTGAATTGCTTGAAATAAGTATTAAGAAAGCGAAAGATGTGGTGAATGAAACAGAGCAAGAACTTGCTAGGCTTCAAAACGACAATCTTAATTTAAGAATGGAAGTTGAATATTTAAAAGGGCTGAGGAGATTACGGCAGGAACAACACAAGAGGGAAAATCCCGAGTGGTCTGTGAACTCCGACGAGAATTCAAGTTCCCACTTAAGCAACTCTTAGCCATTTCTGAACTTTCTAAAGCAACTTATTACTACTGGGTCAATCGTTTTGAACGTCCTAATAAAGACGAAATGATTGAGCAAGTCATGCTTGAAATACGTCAAGAACACACTAATGCAGGGTATCGTCCAATGGTTGAGCTATTAAAACAACGTGGAATTTATGTTAATCACAAGAAAGTTCAGCGCTTGATGAAAAAACTTGGGCTTCGTGTGACTACTTTTTGGCATAAATCTCGTAAATATAACTCTTACAAAGGTAAAGTTGGGACTGTGGCTAAGAACAAGCTCCACAGACGATTTAACACTTCTATACCACATCAGAAGATAACGACAGACACCACTGAGTTCAAATATTACGATAAAGGGGTTCAAAAGAAGCTTTATCTCAACCCCTATCTTGACCTTTTCAACAACGAAGTGATTAGCTATGAAATCTCTAAACAACCAACCTATCAAGCTATTGCGACAGCACTTCAGGAGGCTTTAGAATTGACTTCTGATTGTCTCTATCGTCGTACTTTCCACTCTGACCAAGGGTGGGCATATCAGATGAAAAACTATGTCTTTAAGCTCAAATCACAAAAAATAATCCAATCTATGAGTCGCAAAGGTAACTGTCATGATAATTCAGTCATGGAGAACTTCTTTGGCTTGCTTAAACAAGAAATCTACTATGGTCATGTTTTCAATTCATTTGAAGAACTTGAACAAGCGATTACTAAATGGATTCACTATTACAACACGAAACGAATTAAGAAAAAATTGAACTGGATGAGTCCAATCCAATATCGTTTAACTTATTCAAAATAACAAAAAAAAGACAAGAAATTATTCTTGTCTAAAAAGTCTAGCTTTTGGGGTTCACATCAAAGTGAGGTTCCTTTGGCAATTTGAATAAAAATCATGAATGGAAGAACAATAATCGTATTACTTAGTATTAAGAGGGCAGACTTTCCCAAAGAATTTAGTTGTTGAGTCATTTTTCTCCTATCTTTTCTTTGTTAAATATGACATCTAAGTCCATTATAGGGCAAAATGTATTAAAAAGACAGCTTCACTTTTTTTATATAAAAAAATAAGTGACGTCTTCCAGTTTTTTGTAAAATAAAAAAATTAAATTGACAAAAAATTTATAAAAGAATATAATATTAGCAACATAATAAAAGCGCTTTCTAAGGAGGAAGTAGATTATGAAAAAAATATTATTGACTTTATTAATAGTTGGAACCACCCTCGCAGTAGGATTTCGAGTGAGTGCCGATAGTATGGTCTATCGTCTCTATAATCATAATACCGGAGAGCATTTTTATACTACGAGTGCAACTGAGCGAGCGGTTGATATTAGTGCTGGTTGGACTGATGAAGGATTGGGTTGGGTAGCACCAGATAAAGGGATAACCGTTTATCGCCTTTATAACCCCAATGCTGCGGGTGGAGACCATTACTACACTAAAAGTAAGTATGAAGCGCAGTCTTTAGTAAATAAAGGCTGGAAGTGGGATAATCAAGGAAAAGCAGTTTTTTATTCAGGCGGAAATTTGCCGATATATGTTGCTTACAACCCCAATGCTCAATCTGGAGCTCATAATTACACGGGAAATTTATATGAAGAAAATAACTTAATTAATATTGGTTGGAAATATAAAGCAGTCGCTTGGAATGCTGTCAGTTTGTCAGTAAATCCTTCAAAAAATTCTTTGCAGGAAATTGCTGATGCACTGAACACAGCAAGTTCAAACATTGTGAATGAAAGTGGGGGAATATTTAACAAGGTGAATGTTAGCGCTAGCGGTAACGTGCTTGTTGTCGATTTTACTTTTTCTCGAAATCATGGTTCACTCAGTCCTGATAAAATTCAAGATTTGAAAAAACAATTAACCCCTTTACTTACTGAAAATCAATCAATTTTCCAAAATGCGGGGATTTCCAATTTATCAATTAAGTATAATTTCAGAAACCCTGATGGAAGCCTTGTTGCAAGCATTGTTTATCCTTAAAACAACTTATTTTACTTATAAATATTAAAACTACTGACAAAAATTCTGTCAGTAGTTTTTGTATATAATAAAAGTCAAAAAACGAATCAAAAAGTTTGACTATTACTGACCAATGTATTATAATTAGAATGTAGTGAGAAAAAGATAACAATCACTACCAACTATGAAATCGAAATGAGGTGTTTTTATGGACATCGAAAAAATGACAACAACGATGCAAGAAGCACTTGGTTCAGCGCAACAAATTGCGCAAGTTCGTCATCACCAAGTGATTGAAGTTCCACATTTATGGCGAATTTTTGTTCAACCTAATAGTTTTGGGGCGAACTTTTATAAAGATTTAGGGATTGACCTAGATGACTTTACAAATTTAATTGAAAAAGAAATTGACAAAATTAATTCGGTAGAAGGTTCAAATATTACTTATGGTCAAAACCTAAGTCCAGATTTGTTCCAAGTATTTACTGAAGCAGACAAAATTGCGCAAAAAATGGGCGATGAATACCTATCAACTGAGATTATTCTCCTTGCTCTCTTTGAATTAAAACAAAATCCATTGACCGAGTATTTGGTCAGCCATGGACTAACAAAAGCAAAAGCGCAAGCTGCGATTGAAAAATTACGTGGAGGTGATAAAGTGACCAGTCAAAATGCAGAAGAAACATACAAAGCACTTGAAAAATATGGGGTGGATCTCGTTGCTCAAGTTAAATCAGGCAATCAAGATCCCGTCATTGGACGTGATGAAGAAATTCGTGATGTCATTCGAGTGCTTTCTCGTAAAACAAAAAACAATCCCGTTCTTATTGGTGAACCTGGGGTTGGTAAAACAGCCATTGTCGAAGGATTGGCACAAAGGATTGTCAGAAAAGACGTTCCTGAAAATCTAAAAGATAAAACAATCTTTTCACTGGATATGGGTGCCTTGATTGCAGGAGCGAAATATCGTGGTGAATTTGAAGAACGTTTGAAAGCAGTCCTTAATGAAGTTAAAAAAGCTGATGGACAAATTATCCTTTTCATTGATGAACTTCATACCATTGTTGGTGCAGGTAAAACAGAAGGTTCAATGGATGCTGGTAACCTTTTGAAACCAATGCTTGCACGTGGTGAACTCCATTTGATTGGGGCAACGACCTTGGATGAATATCGTAAATACATGGAAACAGATAAAGCACTTGAACGTCGTTTCCAAAAAGTATTGGTCACTGAGCCTACCGTTGAAGATACGATTTCAATCTTGCGTGGTCTAAAAGAACGTTTTGAAATTCACCATGGGGTGACCATTCATGATAATGCTTTAGTTGCAGCAGCCACATTGTCAAATCGTTATATTACAGACCGTTTCTTACCAGATAAAGCGATCGACTTAATTGATGAAGCCAGTGCAACGATTCGGGTGGAAATGAATTCACTCCCAACTGAACTTGACCAAGCCAATCGTCGCTTGATGCAATTAGAAATTGAAGAAGCAGCCCTCAAAAAAGAACGGGATGATGCTTCTAAGAAACGTCTTGAAATTATACGTGGTGAAATTGCTGAACTTCGAGAAGAAAATAATCAACTCAAAGCCCAATGGGAAGCTGAGAAAAAAGAAGTGGGCAATATTTCTGAAAAACGTAATGAATTAGAACATGCTCGCCACGAATTGGAAGAAGCCCAAAATGAAGGAAACTTAGAAAAAGCAGCAGCCCTTCGTTATGGTAAAATTCCTGAAATTGAAAAAGAACTCAAAGCTATTGAAGAAAAAGCAAAATCAGATGATTTATCTTTAGTTCAAGAATCAGTCACTGAAGAACAAATCGCCGAAGTGGTTGGACGGATGACTGGTATTCCAATTACCAAATTGGTTGAAGGTGAACGTGAAAAATTACTTCATTTGCCAGAAACACTTCATCAAAGAGTTGTCGGACAAGATGAAGCTGTTGAAGCCGTATCTGATGCCATTATTCGTGCGCGTGCAGGAATTCAAGACCCTAACCGTCCACTTGGCTCATTCCTCTTCCTTGGACCAACTGGGGTAGGTAAGACCGAACTTGCGAAAGCATTGGCTGAAAATCTCTTTGATTCAGAAGAACATATGGTTCGGATTGACATGAGTGAATATATGGAAAAACACAGCGTGTCACGTTTAGTCGGAGCTCCTCCAGGATATGTCGGTTACGATGAAGGAGGCCAATTGACCGAAGCCGTTCGCCGTAATCCTTATACCATCATCTTGCTTGATGAAATCGAAAAAGCACATCCAGATGTCTTCAATATCTTGTTGCAAGTTTTAGATGACGGACGTTTGACCGACTCTAAAGGTGTTCTCGTCGACTTTAAGAATACAGTATTGATTATGACTTCAAATGTCGGTTCTCAATATCTGCTCGATAATGTTGGAGAAAATGGTGAAATTTCTGAAGAAACAACAGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6

>NC_017949|946657:955598|949425_952029_+|WP_011834922.1|DBSCAN-SWA
MDIEKMTTTMQEALGSAQQIAQVRHHQVIEVPHLWRIFVQPNSFGANFYKDLGIDLDDFTNLIEKEIDKINSVEGSNITYGQNLSPDLFQVFTEADKIAQKMGDEYLSTEIILLALFELKQNPLTEYLVSHGLTKAKAQAAIEKLRGGDKVTSQNAEETYKALEKYGVDLVAQVKSGNQDPVIGRDEEIRDVIRVLSRKTKNNPVLIGEPGVGKTAIVEGLAQRIVRKDVPENLKDKTIFSLDMGALIAGAKYRGEFEERLKAVLNEVKKADGQIILFIDELHTIVGAGKTEGSMDAGNLLKPMLARGELHLIGATTLDEYRKYMETDKALERRFQKVLVTEPTVEDTISILRGLKERFEIHHGVTIHDNALVAAATLSNRYITDRFLPDKAIDLIDEASATIRVEMNSLPTELDQANRRLMQLEIEEAALKKERDDASKKRLEIIRGEIAELREENNQLKAQWEAEKKEVGNISEKRNELEHARHELEEAQNEGNLEKAAALRYGKIPEIEKELKAIEEKAKSDDLSLVQESVTEEQIAEVVGRMTGIPITKLVEGEREKLLHLPETLHQRVVGQDEAVEAVSDAIIRARAGIQDPNRPLGSFLFLGPTGVGKTELAKALAENLFDSEEHMVRIDMSEYMEKHSVSRLVGAPPGYVGYDEGGQLTEAVRRNPYTIILLDEIEKAHPDVFNILLQVLDDGRLTDSKGVLVDFKNTVLIMTSNVGSQYLLDNVGENGEISEETTENVMSQLRAHFKPEFLNRIDDTILFKPLALEDIKNIILKMTSQLAHRLEEMEVELELSEEVKVWIAENAYEPAYGARPLKRYLTKVIENPLAKLIIGGKIPPKSKVIVRLIDNKVDFDVQSIAE
>NC_017949|946657:955598|953263_953812_+|WP_011676469.1|DBSCAN-SWA
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>NC_017949|946657:955598|948431_949238_+|WP_011834921.1|DBSCAN-SWA
MKKILLTLLIVGTTLAVGFRVSADSMVYRLYNHNTGEHFYTTSATERAVDISAGWTDEGLGWVAPDKGITVYRLYNPNAAGGDHYYTKSKYEAQSLVNKGWKWDNQGKAVFYSGGNLPIYVAYNPNAQSGAHNYTGNLYEENNLINIGWKYKAVAWNAVSLSVNPSKNSLQEIADALNTASSNIVNESGGIFNKVNVSASGNVLVVDFTFSRNHGSLSPDKIQDLKKQLTPLLTENQSIFQNAGISNLSIKYNFRNPDGSLVASIVYP
>NC_017949|946657:955598|952212_953235_+|WP_011834923.1|DBSCAN-SWA
MTVSENAYAKSGVDVEAGYEVVSRIKKHVAKTERLGVLGALGGFGGSFDLSVLDVKEPVLISGTDGVGTKLMLAIRADKHDTIGIDCVAMCVNDIIAAGAEPLYFLDYIATGKNIPEKLEQVVAGVAEGCLQAGAALIGGETAEMPGMYDEDDYDLAGFAVGVAEKSQLIDGEKDVEAGDVLLGLASSGIHSNGYSLVRKVFADFDLNESLPELDQSLIDTLLTPTKIYVKELLPLIKQNKIKGIAHITGGGFHENLPRMFGNSLSAEIVEGSWDVLPIFKALEKYGSIKHEEMYEIFNMGIGMVIAVAPENAAALKKELNAFEIGQMVNRQEAPVVIKK
>NC_017949|946657:955598|954002_955598_+|WP_014734995.1|DBSCAN-SWA
MVKYLKEFKFENFMVFLLITIDIALAVLSSVFLANVLNSLIAREMNQFFLWLAIDIVLWVVDSFVQGARDVWKEIAIQKQLNAVRRDIIEPLTEISYSDFEKNSKEDYNSWLNNDTKLLYDNGFHQIYFVYTGIVAMLFSGIAIIFFHWVLLLTTLLVGAILFYFPKIFKKSVERDTEQVSDVANDALATSTDYLRGYEVLYHNKQLGLMQERTMGKFNQLATANVKLIFTRAWMQYSLLGASMLGQFLILAVAGFLIMNGQIGIGVVMSVGNLSGTVTNYSKSVANSLILLNATGKLLEKYGKIADESKVTDGEEVTDFESKLELKNLSVAFPDGQKIEYPEIVIEKGKKYAIIGDSGSGKSTLINLLVGNKRDYEGEILLDGKDYKGINRKSLPHVMSVIMQFPYLFRETVEENLTLGRKISPDIFDKSIRIACADDFVFNKLDTIYDKNLSGGQQERLSVARELMGTKPILVMDESTASVDKKTALAVEKNILENPDLTVIMITHHLYDETQNYLDEVIHLDTVNNYV
>NC_017949|946657:955598|946657_948050_+|WP_102032788.1|transposase|DBSCAN-SWA
MTKYSFELKLKVVQDYDNGVGGCDYLAKKYHVTNEAIVRRWVKAYKELGAVGIQRKRQNTVYSTQFKLNAVNLYLTSEKSYRELAHELGMNNPPLLTRWVSNYRKKGEFAFSNVQGRPRKESELLEISIKKAKDVVNETEQELARLQNDNLNLRMEVEYFKRAEEITAGTTQEGKSRVVCELRREFKFPLKQLLAISELSKATYYYWVNRFERPNKDEMIEQVMLEIRQEHTNAGYRPMVELLKQRGIYVNHKKVQRLMKKLGLRVTTFWHKSRKYNSYKGKVGTVAKNKLHRRFNTSIPHQKITTDTTEFKYYDKGVQKKLYLNPYLDLFNNEVISYEISKQPTYQAIATALQEALELTSDCLYRRTFHSDQGWAYQMKNYVFKLKSQKIIQSMSRKGNCHDNSVMENFFGLLKQEIYYGHVFNSFEELEQAITKWIHYYNTKRIKKKLNWMSPIQYRLTYSK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_102032788.1|946657_948050_+|transposase	IS3 family transposase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	5.9e-57	45.0
WP_011834921.1|948431_949238_+	hypothetical protein	A0A1P8BMN5	Lactococcus_phage	2.2e-11	47.6
WP_011834922.1|949425_952029_+	ATP-dependent chaperone ClpB	K4FB40	Cronobacter_phage	1.4e-123	32.7
WP_011834923.1|952212_953235_+	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	A0A0E3F760	Synechococcus_phage	2.4e-60	41.5
WP_011676469.1|953263_953812_+	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	1.5e-19	32.0
WP_014734995.1|954002_955598_+	ABC transporter ATP-binding protein	F2Y1V6	Organic_Lake_phycodnavirus	6.6e-12	34.1

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NC_017949|1027015:1035810|DBSCAN-SWA
CTCAAAGATTAACGGTAAAGGTGGTTCCTTTTCCAAGAATAGATACCACATCAATTGTGCCATGAAGTTCTTGGACATTCTTTTCAACAATGGCGAGTCCTAATCCTGTTCCGCTGACCTCTGCTCGGCTCTCATCAGCACGATAGAAGCGATCAAAGATTCTTTCTTTTTGAATTTCACTTAAACCAGGACCATTGTCAGTAACACTGAAGATAATTTTATCTTGTTCATGGTGTAAGCTGACAAAAATTTGACCCTGAGCAGGAGTATATTTGATGGCATTTTCAATCAGATTTTCAAAAATACTGTGTACCATTTGTTCATTTGTTTTGAAAGTAATCTCTTCAATTTGTGTTTCTAAACGAAGAGATTTTTCAGAAATTTGGGGACTTGAGCTTTGTAAAATATTTTGAATTAGAGCAGAAAGGCTGAGTTTCTTTTTCTCAATACGTTGATTTTGCTTAGTTAGTAGTAGAGTATCCTGAACAAGGCTCATCAAACGAGAACTTTCTTTATGGATAATTGAAGCAAAGTTTTTGGTTTCAGAAGGAGAAACAGTGTCTGTTTCAAGTAATTCGGCAAAGCCCTTTATTGAAGTGAGCGGTGTTTTCAATTCATGAGAAACGTTGGCAATAAAGGCATTATGAGCATCAACTGTTCGACGATAAGAACTTACATCATTCATGGTTACCATGAAGCGACTATCAAGATCGGGCAGTGGAGTGATGCGGACTTGATAATAAGCGCCAAGCTTTTCAAAGAAGAAAAGTTTTTCTTGTATATCTGGATGTAAAATTTTGTCAACTAGAAAATTTAAGAAATCGGCATAAGGACTGAAAATATCAAGATTCTCGGTGTCTGAAAACTCATTTTTGAAAGAAGCATTTGTTCGACGAATTTTTCCCTTATTATTATAAATAAAAATGGGAAATTGGAAAAACTCGATGAATTCGTAGAGATTTTCTTTCTTTTCAGTGTGTGATAAGGCTTGCTTTTGGATTTTTTCGCCTAATTTATTGAGCTCAGTTGTAATTTTGTCATCATTTTCATTCATCAGATAACTTTGCGTTAAAGGACTTCGCTCAATATTTTTAATCTTAGCCACAGTATTTTCGCGAAAAACATAAGCTCTCTGAGCAGATTTCAAAACCTGTATGGCAACTGCCAAGTAAAATATAATAGCAAAAATGATAATTGCAAAATCGGTAAAGAAAGTAGACGTGCGATTTTCTGTAACTTTCAAATAGCCATCGATTTGTCCTTCACTAAAGATAGGGCTGGTAACAGTAATATCTTTAGAATCTAAACTTCGAGCATAGGCAGCGCCATTTTTAATTTTTTTAGTATCTGAATTTACCGTATTTTTTGAAAGATGTTCAAAGTTAGCGGGTAAGGGATTATCAGGATGTTTTTCTAAAAAAAGCTGTATTTGATCTATTGTTTTTAATACCCTATTTGTATCATTTTCTAAGATATTTTGGTTCGATAGAATCACCAAGCTTAGTGTTGCAATGATGTACAGCACTGTCATCAGCATGATGTGTTTAAGTTTCATTTTCTTCAAAATAGTAACCGAATCCTCGTTTTGTTTTGATATAATGATTATTTAGTTTTTTACGGATTTTTGAGATGAGGACATCAATTGTCCGTGTTTCTGCTGTATCCGAAATTCCCCAAAAATGTTGAAGAAGTTCTTCACGGCTGATGATTTCGCCTTGTCTTTTTGCTAAGAGTTCTAGAATTTCAAATTCTCTTTTGGTTAAGTCTAAAACTTTTGCATCAAAAGTGACTTCTTTTTTTGTAAAATCAATGACCAGTCTGTCAGTAACAAGTGTTGCAGGACTTTCGTCCAAAGATTCACTGACAGAATCAGAAGCTGTTTGATTATACATTTGATTTCTACGAATGAGCCCTTCAGCTCTGACAATGATTTCTTTCATTGGAGTCGTTTTATCTAAATACTCATCAGAACCTGCTGACAGACCTGTCAGTTTCATTTCATCATCATCGCGAGCAGTTAAAATTAAAATTGGTGTAAAATTACCTTCTTTACGAAGCTTTTTAGTGACTTCAATTCCGGAAAATTCAGGCATCATTAAATCAAGAAGAAGCAAATCAAAGGGATTTTTTCGAGCTTTATCATAAGCTTTTTTTCCGTCTGATACGATGGTTACTTCGTAATCATTTTGCCGAAAATTATAAGATAATAGGGTCAAAATTGCCCGATCATCATCAGCAATTAAAATTTTTTTCATACTTTTAATTATAACGAAAACAGGGAGCTTTGTATAGAATAAATTATTATTTTTGAATAAAAAAATGAAGGGGTAATGGCAGCAGAAACGAGTTAAAAAAATTACATTTTTAAAAACTTAAATGATAAGTTAAAACTAAGAATAAAACTAAAAAATCACTTAATTTCTGCTATAATAGACATTATGGAAATCGAAAAAACCAATCGAATGAATACGCTTTTTGAGTTTTATGCGACACTTTTAACTGACAAGCAAATGAACTACATTGAACTTTATTATGCTGACGATTACAGTTTGGCTGAAATAGCAGAAGAATTTAATATCAGCCGTCAAGCAGTTTATGATAATATTAAACGGACCGAAAAAGTGCTCGAAAGCTACGAAGAAAAATTGCATCTTTTTAGTAATTATGTGGTGCGTAATCAATTGCTTGAAGAACTGATGAAAAAGTATCCTTCTGACCAATACTTAATCAGTAAACTTCAGGAAATACAGCAGATTGATGAAGAAGAATTTTAGTAGTTAGAGATAATGAATTTACTGACAGAAATGCTAAAATATGCTATAATTAAACTTCAAGGTTCATAAAAGTTACTGACAGACTGCCAGTAAGAATTCCCTGAATTTGGGGGCGTTACGGATTCGACAGGCATTGTCGCGCATGAACTGCAACTGCTGAGGGATCAGGATAATCATCCGCAGATAAATATAACTGCTAAAAATAATACACAAACTTACGCAATGGCAGCCTAAACAGCACCATGCGTGCCTGATTTTTGCTCACTGATGGCAATTTGACGGCCTAAACTTTTAGTCAGATACGTTGTTGTGGAGACTTGACGCAGCAAAAGAGATTTAAAGTCCCGCAAAATGTCGCTGTTTGAGACTGGCTTTGGCATTTTGTTAAATTTGAGAAAGTCCTATGGTTGTAGACGTTGATGTAGCAAGGTGTTTGGACAGGGGTTCGACTCCCCTCGCCTCCATTATCCAGTTTATATAGAATCTTATAGACTAAGAAATCGCTCAATGGAGCGGTTTTTCTTTTTGAATTCTTTATACTGTATTTGAGATTAAGTTCGTCCCTAGCCACCAAATTTGTAAATTTATTACTTTAGACGTTTATTATGTACAAGTTTTATCTATGTGTGCACTTGTAGAGCTACACAATCGATTTATTTTTGTAATATTTAATATAAAATGATAGACTCGAAGCGTTGAATTATCAAGAGGCCCAAAATATATTTGATAGCTTATTGTTTATTATATATGAATATGTGTGTTTAGGAGAATATCTAGGAGAATATTATGAAAAAAATAGTTTTAGTTGCTTTAGCAGCAATGGCATTTATAATGGGAGGGGTTATTAATGCACACCAAGTTTCTGAAGATACTGAGCCACCTCACGAAAAATTATACAGAATTTATAATCCAAATTCAGGTGAACATTTACTTACACCTGCTGGTTGGGAGGTTCTAATTTTAGAAAAAGCGGGATGGAAATCTGAAGGAGTCGCATTTTATATCCCATTAACTGAACCTCCATACTCAGGATATCCAGTTGTGCAACGTTTATATAATCCAAATGCAGGTGATCACCATTATACAACAAGTGATTTTGAAGCTACGACTCTTATTTCAGTTGGGTGGACTAATGATGGAACATCATTTAGATTCCCAGTTGCTAAAGAGAATACTGGAGTCCCTGTTTATCGTCTTTATAATCCAAATGCAAAAGTTGGATCACATCACTTTACAATGAGTTCTTATGAAAGAGATTCATTAATTCAAGCTGGATGGAAAAATGAAGGAATAGCATTTAACGCTTATTCTAAATAATAATTACAAAGTCAACTAAATACGAATAAATTAGAAAATTAACCCTGACTAAATGATATGACCCCCATAAGTTAGACTAAAAAGTCTAGTTAATGGAGGTCAATTTTTTTATGACAAAATATACATTTGAATTTAAACTAAAGATTGTTAAAGAGTATCTTGACAAGAGAACTGGTTATCATTCCTTATCAAAAAAATATGGTTTTAAAGATACCCAACAAATCAGAAGATGGATTTTTGCTTATGAAATAGCTGGTGAAGAAGGTTTGAAAACTGGTAAAAATAGAGCATATTCAACCGAAGTGAAGTTAGATGCGGTAAACTTATATTTAACAAGTAACTGGTCTGCTAGAGATATTGCTAAAGACTTAGGTATAATTGATTATTCAAGAATACTTGATTGGGTAAGACGTTATAGATCTGACAATTTTGAGGCTTTTAAACAATCTCGTGGGAGACCTAAGACAGGACAAGAGATCATTAATAAGAAGACAGAGTTAAGTCTAGATGAAAAGGACTTTCGTATAAGGGAATTAGAGCGGGAGTTGGAAAACACTAAAATTGAACTTAAATATTTAAAAGGATTGAGGAGGCTGAGAATGGAACAACAAGCGAAGGAAAAGCACGTCTTGTTCAAACCCTCCACAGAGAATTCAAGTTCCCAATCAAACAACTGTTAATTATTTCAGGACTACCTAAGGCAACGTATTATTATTGGGTTAATTGTTTCGGACGCCCAAATAAAGACGAAGAAATCGAAAAAGTATTGATTAAGCTTAGAAAATTACACCCTAATGCAGGTTATCGCCCCATGGTAGAACTTTTAAAGCGTGAAGGATATATTGTTAACCATAAAAAAGTTCAACGTTTAATGCGAAAGCTAGGACTTTGTATTACTTCTTTTTGGAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7

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>NC_017949|1027015:1035810|1032673_1033775_+|WP_102032790.1|transposase|DBSCAN-SWA
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MEIEKTNRMNTLFEFYATLLTDKQMNYIELYYADDYSLAEIAEEFNISRQAVYDNIKRTEKVLESYEEKLHLFSNYVVRNQLLEELMKKYPSDQYLISKLQEIQQIDEEEF
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MTKYTFEFKLKIVKEYLDKRTGYHSLSKKYGFKDTQQIRRWIFAYEIAGEEGLKTGKNRAYSTEVKLDAVNLYLTSNWSARDIAKDLGIIDYSRILDWVRRYRSDNFEAFKQSRGRPKTGQEIINKKTELSLDEKDFRIRELERELENTKIELKYFKRIEEAENGTTSEGKARLVQTLHREFKFPIKQLLIISGLPKATYYYWVNCFGRPNKDEEIEKVLIKLRKLHPNAGYRPMVELLKREGYIVNHKKVQRLMRKLGLCITSFWRKTRKYSSYRGKVGKVAKNLLNRRFNSKVVHQKLVTDTTEFKYYDNGQVKKAYLNPYMDLFNREVVSFEISKQPNFIAISNALSKAIEITSDCPYRRTFHSDQGWAYQTPYYRQKLQEHNIYQSMSRKGNCHDNSVVENFFGILKQEVYYGKRFDSFESLEMTISNYIHYYNNLRIKKNLSWLSPIEYRKSFKNK
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>NC_017949|1027015:1035810|1034586_1035810_-|WP_011834984.1|transposase|DBSCAN-SWA
MRKDILESITEHLMTGIKPNFADIARRYNCDYRTVKRYYDLGKEKTLEEASKRRVPPSLIENYKSIIEDKLKLGCSVRSIYYFIQLKGYQGSYTTVKRYARLIRESCKHKATIRIETTPGLSAQVDWKENLKLISRNGEVFTINIFLYILGYSRMKYLQLTVDRLQPTLFECLNHAFEKFGGVPEEIWFDNMKTVVDHSKSQFSNVVFNERFRQYAKDAGFKPIACRPFRPQTKGKVEALARIVDRLLVFNNEFEDLEELQALVQQLMEDLNHKEISQAIGTSPSERLDQEALNLKAFDLELLKVYSQLSVPLTRKVSKEALVIFEGRKYSVPVKYIGQTVTCEKEQEDLKVYCDQRLIARHPLSDRPFNYRREDYVEILKSDVFKHLEEDELEAYVDENLQAYDLL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_011676390.1|1028558_1029269_-	response regulator transcription factor	A0A1V0SGR9	Hokovirus	5.3e-06	30.1
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WP_011834982.1|1030574_1031105_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_164845598.1|1031215_1032599_+|transposase	IS3 family transposase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	1.1e-55	41.8
WP_102032790.1|1032673_1033775_+|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	1.7e-38	40.4
WP_003331414.1|1033816_1034575_-	ATP-binding protein	A0A059NT77	Lactococcus_phage	5.3e-137	100.0
WP_011834984.1|1034586_1035810_-|transposase	IS21-like element IS712 family transposase	A0A059NT83	Lactococcus_phage	2.4e-232	99.8

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NC_017949|1225797:1232278|DBSCAN-SWA
AATGAAAACATTTAAATTAAACAATGGGGTAGAAATTCCTGTATTGGGTTTTGGAGTCTTCCAAATTCCACAGGAACAAACGAAACAAGCTGTATTAGATGCAATTGAGGTAGGTTATAGACACTTTGATACAGCTCAATCTTATTTTAATGAAGAAGAAGTTGGTGATGCTATTGCCGAAACCATTATTCCTCGAGAAAACTTATTTATCACCACTAAAGTATGGCTCAGTAACTATGGATATGAGAATACGAAAACTTCTATTAAAATATCACTAGAAAAAATGAAACTTGATTATCTTGATTTAGTATTACTTCATCAACCTTTTGGGGATGTATTTGGGAGCTATAAAGCACTTGTAGATTTGCAAAAAGAAGGTAAAATACGAGCTATTGGTGTATCTAATTTTAATGAACTACGTTTAGCAGATATTATTTCTTTTCAAGATACTGTACCACAGATAAATCAAATTGAAATCAATCCGTTTCATCAAAGAGAGGAGGATTTGCAAAACGCTTTATCACGTGGGAATGTACAATTAGAGGCATGGGCACCATTTGCAGAGGGGAAAAATGGTATTTTTGAAAATGAAATTTTATCAGTTATTGGCAAAAAATACGGCAAAAGTCCAGCACAAGTCATTTTACGTTGGTTATATGAACGAGGGATTGTCAGTCTTGCTAAATCAGTAAAGAAAGATCGCATGAAACAAAATATTGATATCTTTAATTTCAGCTTAACATCAGAAGATAAGGAACAAATTGGTACTTTACAAACATCTGGTAGCCAGTTCTTTGATCATGATGATCCCAAGACTGTAGACTTTTTCGAAAAACTTGTTAAAGAACGAGAAATTTGATATATAAATCAATATAAAAATATATTTTTTACACTCATCGAACTTATTGGAAGCATTGTCTCCAATATTATTGCAGTAGTTAGTCTTGTAGTTGTACTCATTAATAAACTAATAGTTAGTATTAACTTTTATATGGTGCTATACTTAAATTTATGAGATCACAGTCTCTGTTGTGGAATAGAAACCAAAATTGGTTTCTATTTTTGATTACTATTGTAATTTCGAATTAAAGTGATATACTTAGCTCATGGGTGGTTTAGCGAAAGCACCACACCTTCATCTTTAGCTGCTCAATTGTGAGTAGCTTTTTTAAAATAATGTGTAGTGATAAAGAATTAAGTCGCTAATAAGAGTGAGGAATGTCTAACGAATAAAAATAAAGAGAAAAAAGCGATTATAAGCTTACTATTTTTTGGGTTTGTAGTAAGCATATTAGTTATATACCTAGTAATAAGTTTTCTGATGTGAGAAAAATTTTGAGTTCTGTTCATAAAAATCCTTTTTAGTTAAATAATTATTGAACTTTTAGGGTTAAATTGACTTTAACTGATATTAGTGTTATACTTGCGAAGCGGGATGGAGCAGTTAGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAGGTCATAGGTTCAAATCCTGTTCCCGCAATATTTTAAGGGCTTTAGGGAGCCCTTATTTTTCTTATATAGAACTCACCCTTAAGTAGTAAAATTTTTCGTTAAATAGGCAAAGTCTAGATTGGAAGTGAAAAATGAAAACAGGAGATAAAATTACATTATCTAATGGGGAACAAGCAACAGTCGTTTCTGGAGATGTTAATCTCTATAAGAATGCATTAATTGTAGAATTAGAAAACCATGATGTCAGAGTTGTGGATAGAGAAACCTTGACACTTGCTAAAGCAAATCCTCATGAAAATCTTGGGAATCATAAGAAGATCAATAAGTTTTAAATAGACCAATTTGACTTTGGTAAGAATAGGTGTTACTATTAAGAGGTAGGTTTTGTCTCGAGTTTAAATGTTTTAGGAATGCACTTTTTCGCAAAATAGGATTTACAGATGATGCGAAAGGATGTATTATATGAATAAAGGAACAATAAATTGGTTTAACGCCGATAAAGGCTATGGTTTTATTATGGCAGATGATATGCAAGATGTGTTTGCTTACCTCTTGTCTATTCAAGGAAATGATTTTAAAAAATACGATGAAGGTCAAAAGGTTACTTTTGATATCAAAATGACGTCTCGTGGGCGTTATGCTTCAAACGTACATAAAAGATAAATGATCTAAAGCATGGGATGTCCTGTGCTTTTTATTTATTGCTATTGCAAAAATGAATGAAAATGTTATACTAAGTGAGGGAAAGATTAGTTGCTTTCCCTACAGTTCATAAAATCCATGTCATTACGATATGGATTTTATTAATGAGTGAGTAGTTTGACATTGAGTATAATTAGTGTTACTATGAAGAAGTAGATTTTGTCATGAGTAAAATGTTTTATAGATTCACTTTTCGCAAAATGAGATTTACAATTTTTGTCGAAAGGAAATAAATATTATGGCAAATGGAACAGTAAAATGGTTTAACGCTACTAAAGGATTTGGTTTTATTACTTCTGAAGATGGTCAAGATTTGTTCGCTCACTTCTCAGCAATCCAATCTGATGGATTCAAATCACTTGACGAAGGTCAAAAAGTTGAATTTGATGTTGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTATATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTAAATTCAGTTGCAATTATGAGAGAATATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCGTGCATAAATTAGGACCACTCTAATATAGAGTGGTTTTTTCAATGTCTGTTAATTAAAATTAATATTTAAAAGATTTATAAAAAACTACCTATCACAGCACATAATGATAGGTAGTTTTTTTGATGCATTTTCATAGATTAAGAAGTTAATATTTAAAACATACAAATTAATAATACCATACAGATATTCTTAAGGTCAAAGGTAGAGAGATGTGTTATAATAAGATACCTTAAACATAAGTGCCAGCAAATGCTGGCTTTTTTTATTTTCTTAGTTATTTAAAGTGCCACAATTATTGGTATTAGTAAATTAAAAAAACAAATCACATCTCTTGAATACGCGTTCTGAAAGTGCTAAATTAAAGTAAGAAAAATATTATAATCTTTAGAAAGAGGTGGCTTATGATTTGGTCATTAATTGTTGGTGCATTAATCGGATTAATCGCTGGTGCGATTACAAAAAAGGGAAGTTCAATGGGATGGATTGCTAATATCTTAGCGGGGTTAGTTGGATCTTTTGTAGGTCAAGCCTTACTTGGAACTTGGGGACCTTCGCTTGCTGGCATGGCGTTAATACCATCCATTGTTGGTGCAGTGATTGTGGTTGCTGTTGTATCTTTCGTCCTATCTAAAATGAATTAGTAGATCTTAGGATCTAGAAAGGAGGAGCTTTGGCAACTGGAAAGAAAATAATACTCATTATTCTTGATCTCCTTTTACTTACACTTGTTCTACCAATGACTTGGGATTACTACAATTTCATGGAATATGATTGGATGACAATGACCTCTAGTAACATTCCCTTCATAGGCAAATATATGGCAGACTATTTGTTTTGGGGGAACATCGTTATAATAGTCATATTAATTCTCGCCTTGATTGTAATCCTTTTTTATCCTCGAACCTATATGGATGTACAACTCACTTCAAATAATGGAGATTTAACTTTGAAGAAGTCTGCCATTGAAGGTTTTGTAGGTGAAAAAGTAAAAGAAAATGATTACCTTAAAAACTCAAAAATCGCTGTTTCACTTTTTAAAAATAAGATAAAAATTGATATAAAAGGTGAAATTATTCCTCGAGTTGAAGTGGCACAAAAAGCCCAAGTTCTGGAACAGGAAATCATTGAAGGGTTAAAAAAATTCTTTGGATTGGAACATAAGGTTAAACTTAAAGTAAAAGTCAATACATTAAGTAAAGACGATAACCCTAAACGCCAACGTGTTATGTAGGAGGGATCAATGGATTATTTCGAAAAAAATCGATACCCGATTATAGGGGGAATCGTAGGTGCACTCATTGCTGTGTGTATCTTCACTATTGGATTTTGGAAAATGATTCTGGTTTTATTTTTAATTGGATTAGGAATTTATATTGGTCTATTTTTAAAAAAATCAGGAATCATTGATCAATTTATAGATCGTAAATAACATTATAAAAGGAGAATATTATGGTACAAGAAAACATGAAAGCATTTGGAACAATGGCAGAAAAAGAAACTCCTAAAACAAAGGAAACCCAACCAGAAATTAAGGGTGCTTTAACTTATGAAGATAAAGTTGTGCAAAAGATTGTAGGACTAGCATTAGAATCAGTGGATGGACTTCTTTCCGTAGAAGGCGGATTCTTCTCAAACCTAACAGGAAAACTTATTAATACTGATGATGTTACTGTCAAGGGCCATCTAAAAATGTTGGTTTTGGGTCATTGAAAATGTAGGAAATGGGCCACCCAAATTGTTGGTTTTGGGCCCATCACTTTATTTACTTTTTGGGGTTTTGGTTTTCTTCTCACTATAGTCTTTCATTCTATAAGATTTTCCAGTAATAGAAATGACTTTAGAATGATGAACCAAGCGGTCCAATAAAGCATTCGTTAATTTCTTATCTTGAAGAAACTCAGACCATTGAGAAAGTGGGATATTCGTAGTAATCAACGTGGATTTCTTTTCATATCTCATATTAATCAGTTGAAAGAGAAGACTCGCTCCATCTCTTGAAAAGGGCAGATAACCCACTTCATCAATAACAAGTACATCATAATTGGCATACTGTTTTAATACTCGCTCTAAAGTTCCTTTTTGATTGGCTCTTAATAAACGGTCCACTAATTCAGTACTCATACAAAAGTAAGAGCTATAACCTTTCTCTAGGGCTTCTAAAGTGATAGAAATAGCTAAATGTGTCTTACCTACGCCACTATTGCCAATGAAGAGAAGATTCTCATGCTTATCTAAAAAACGTAAGGTATGTAAATCTAAAATCTCTGCTTTATTAATTTTCGGTTGAAACTGAAAATCAAAGTCCATCACACGCTTTTCATAAGGCAGATGGGCTTTTTTTAATCGTCTTTCCTGAAGGAGCGCTTCTCGTTCACGAAGTTCTTCACTCAAGAGTTCATGAAGGCCCTCTACTAAGGAAATATCCGCATGCTCATCTAAGAACTCTGGTAAGAGCTGACGCACACGATCGAGTTTTAAATGGTCCAATTGGTTGAGTAATTGATGATAAGTTGTCATAAGCGCTCCCTTCACAATAAATCGTAGGCTTGAAGATTCTCATCCACATAAGCCTCTAGTTCGTCTTCTTCAAGATGTTTGAAGACATCTGATTTAAGAATTTCAACGTAATCTTCACGGCGATAATTAAAGGGACGGTCGCTTAAAGGATGACGAGCAATCAAGCGTTGGTCACAATAGACTTTAAGGTCCTCTTGTTCTTTTTCACAGGTTACGGTCTGTCCAATATATTTAACCGGCACTGAATATTTACGCCCTTCAAAGATCACAAGTGCCTCTTTAGAGACTTTTCGAGTCAAAGGAACACTCAATTGACTATAAACTTTGAGAAGCTCTAAATCAAAAGCCTTGAGATTCAACGCCTCTTGGTCAAGACGTTCAGAAGGTGAGGTTCCAATCGCTTGAGAGATTTCTTTATGATTCAAATCTTCCATCAATTGTTGGACCAGTGCTTGTAATTCTTCAAGGTCTTCAAACTCATTGTTAAAGACAAGCAGGCGGTCAACAGTTCTCGCAAGCGCTTCTACTTTACCTTTGGTTTGAGGTCTGAATGGCCGACAAGCAATGGGTTTAAATCCAGCATCTTTTGCATACTGCCTGAATCGTTCATTGAAAACAACATTTGAGAATTGACTTTTAGAATGGTCCACCACTGTTTTCATATTGTCAAACCAAATTTCTTCAGGGACACCTCCGAATTTCTCAAAAGCGTGATTGAGACACTCAAAGAGTGTGGGTTGGAGACGGTCGACGGTCAATTGAAGATACTTCATCCGAGAGTAGCCAAGAATATACAGAAAGATATTAATCGTAAACACTTCACCATTGCGTGAGATCAGTTTTAAATTTTCTTTCCAGTCGACTTGAGCAGAAAGTCCAGGCGTTGTTTCAATTCGAATCGTTGCTTTATGTTTGCAGGATTCTCGAATCAATCTGGCATAGCGTTTGACGGTCGTATATGAGCCTTGATAGCCTTTTAGTTGGATGAAGTAGTAAATTGAGCGCACAGAGCAGCCAAGCTTGAGTTTATCTTCAATGATTGATTTATAGTTCTCAATAAGTGACGGTGGGACCCTTCGTTTTGAAGCTTCTTCAAGGGTCTTTTCTTTTCCGAGGTCATAATAACGTTTGACCGTCCGATAGTCACAATTATAGCGTCTGGCAATATCAGCGAAATTAGGTTTAATTCCAGTCATAAGATGTTCGGTTATACTTTCTAGGATGTCTTTTCTCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_8

>NC_017949|1225797:1232278|1225797_1226655_+|WP_011835138.1|DBSCAN-SWA
MKTFKLNNGVEIPVLGFGVFQIPQEQTKQAVLDAIEVGYRHFDTAQSYFNEEEVGDAIAETIIPRENLFITTKVWLSNYGYENTKTSIKISLEKMKLDYLDLVLLHQPFGDVFGSYKALVDLQKEGKIRAIGVSNFNELRLADIISFQDTVPQINQIEINPFHQREEDLQNALSRGNVQLEAWAPFAEGKNGIFENEILSVIGKKYGKSPAQVILRWLYERGIVSLAKSVKKDRMKQNIDIFNFSLTSEDKEQIGTLQTSGSQFFDHDDPKTVDFFEKLVKEREI
>NC_017949|1225797:1232278|1227402_1227603_+|WP_011835139.1|DBSCAN-SWA
MKTGDKITLSNGEQATVVSGDVNLYKNALIVELENHDVRVVDRETLTLAKANPHENLGNHKKINKF
>NC_017949|1225797:1232278|1229766_1229955_+|WP_011835142.1|DBSCAN-SWA
MDYFEKNRYPIIGGIVGALIAVCIFTIGFWKMILVLFLIGLGIYIGLFLKKSGIIDQFIDRK
>NC_017949|1225797:1232278|1227733_1227934_+|WP_003132324.1|DBSCAN-SWA
MNKGTINWFNADKGYGFIMADDMQDVFAYLLSIQGNDFKKYDEGQKVTFDIKMTSRGRYASNVHKR
>NC_017949|1225797:1232278|1228211_1228412_+|WP_011835124.1|DBSCAN-SWA
MANGTVKWFNATKGFGFITSEDGQDLFAHFSAIQSDGFKSLDEGQKVEFDVEEGQRGPQAVNITKA
>NC_017949|1225797:1232278|1229196_1229757_+|WP_011835141.1|DBSCAN-SWA
MATGKKIILIILDLLLLTLVLPMTWDYYNFMEYDWMTMTSSNIPFIGKYMADYLFWGNIVIIVILILALIVILFYPRTYMDVQLTSNNGDLTLKKSAIEGFVGEKVKENDYLKNSKIAVSLFKNKIKIDIKGEIIPRVEVAQKAQVLEQEIIEGLKKFFGLEHKVKLKVKVNTLSKDDNPKRQRVM
>NC_017949|1225797:1232278|1230284_1231043_-|WP_003331414.1|DBSCAN-SWA
MTTYHQLLNQLDHLKLDRVRQLLPEFLDEHADISLVEGLHELLSEELREREALLQERRLKKAHLPYEKRVMDFDFQFQPKINKAEILDLHTLRFLDKHENLLFIGNSGVGKTHLAISITLEALEKGYSSYFCMSTELVDRLLRANQKGTLERVLKQYANYDVLVIDEVGYLPFSRDGASLLFQLINMRYEKKSTLITTNIPLSQWSEFLQDKKLTNALLDRLVHHSKVISITGKSYRMKDYSEKKTKTPKSK
>NC_017949|1225797:1232278|1229975_1230236_+|WP_011835143.1|DBSCAN-SWA
MVQENMKAFGTMAEKETPKTKETQPEIKGALTYEDKVVQKIVGLALESVDGLLSVEGGFFSNLTGKLINTDDVTVKGHLKMLVLGH
>NC_017949|1225797:1232278|1231054_1232278_-|WP_003331415.1|transposase|DBSCAN-SWA
MRKDILESITEHLMTGIKPNFADIARRYNCDYRTVKRYYDLGKEKTLEEASKRRVPPSLIENYKSIIEDKLKLGCSVRSIYYFIQLKGYQGSYTTVKRYARLIRESCKHKATIRIETTPGLSAQVDWKENLKLISRNGEVFTINIFLYILGYSRMKYLQLTVDRLQPTLFECLNHAFEKFGGVPEEIWFDNMKTVVDHSKSQFSNVVFNERFRQYAKDAGFKPIACRPFRPQTKGKVEALARTVDRLLVFNNEFEDLEELQALVQQLMEDLNHKEISQAIGTSPSERLDQEALNLKAFDLELLKVYSQLSVPLTRKVSKEALVIFEGRKYSVPVKYIGQTVTCEKEQEDLKVYCDQRLIARHPLSDRPFNYRREDYVEILKSDVFKHLEEDELEAYVDENLQAYDLL
>NC_017949|1225797:1232278|1228927_1229167_+|WP_011835140.1|DBSCAN-SWA
MIWSLIVGALIGLIAGAITKKGSSMGWIANILAGLVGSFVGQALLGTWGPSLAGMALIPSIVGAVIVVAVVSFVLSKMN

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_011835138.1|1225797_1226655_+	aldo/keto reductase	A0A1V0SKP9	Klosneuvirus	1.2e-28	30.6
WP_011835139.1|1227402_1227603_+	hypothetical protein	Q9AZK6	Lactococcus_phage	2.6e-06	55.8
WP_003132324.1|1227733_1227934_+	cold shock domain-containing protein	Q9AZD3	Lactococcus_phage	8.2e-13	50.8
WP_011835124.1|1228211_1228412_+	cold-shock protein	Q9AZD3	Lactococcus_phage	2.4e-28	93.9
WP_011835140.1|1228927_1229167_+	GlsB/YeaQ/YmgE family stress response membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_011835141.1|1229196_1229757_+	alkaline shock response membrane anchor protein AmaP	NA	NA	NA	NA
WP_011835142.1|1229766_1229955_+	DUF2273 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_011835143.1|1229975_1230236_+	Asp23/Gls24 family envelope stress response protein	NA	NA	NA	NA
WP_003331414.1|1230284_1231043_-	ATP-binding protein	A0A059NT77	Lactococcus_phage	5.3e-137	100.0
WP_003331415.1|1231054_1232278_-|transposase	IS21-like element IS712 family transposase	A0A059NT83	Lactococcus_phage	4.9e-233	100.0

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

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MVIDINNYDDSAIQVLEGLDAVRKRPGMYIGSTDGTGLHHLVWEIVDNAVDEALSGFGNKITVTINADGSLSVEDEGRGMPVGKHAMGIPTVEVIFTILHAGGKFGQGGYKTSGGLHGVGSSVVNALSTWLEVEITRDGTVYRQRFENGGHPATTLEKIGKAPKSKTGTKVTFMPDSTIFSTTEFKYNIISERLNESAFLLKEVTISLEDKRTDEKEEFHYENGVQDFVAYLNEDKDSLTPVLYFEGKQDGFEVEVALQYNDGYSENILSFVNNVRTKDGGTHEAGLKTAITKAMNEYARKVNLLKDKDKNLEGSDYREGLTAVLSVLIPEEHLQFEGQTKDKLGSPLARPVVDSLVSEKLSFYLMENGELAQNLIRKAIKAREAREAARKAREDSRNGKKSKKDKGLLSGKLTPAQTKNPNKNELYLVEGDSAGGSAKQGRDRKFQAILPLRGKVINTEKAKMQDILKNEEINTMIYTIGAGVGADFTLADRNYDKVIIMTDADTDGAHIQTLLLTFFYRYMKPLVEAGHVYIALPPLYKMSEGKGKKEKIEYAWTDGELAELRKQFGKNANLQRYKGLGEMNADQLWETTMDPETRTLIQVTIDDVAQAEKRVSVLMGDKVEPRRKWIENNVKFTMEEDTAF
>NC_017949|1506723:1520405|1509522_1509972_-|WP_011835377.1|DBSCAN-SWA
MTAIWKLKKFNQLTTDEMYQLLSLRTAVFVVEQNCPYQELDGKDQVAQHLWLENDKGELMALCRLLPQGISFNEASIGRVLVNPEFRGQNLGRGLIDKALEVLKENGEAAVTIEAQYYLRDFYASFGFVENSEPFYEDDIKHVNMILNF
>NC_017949|1506723:1520405|1517697_1518675_+|WP_011675984.1|DBSCAN-SWA
MSETENLTVPTYYSAIDWNSIEDSIDKYTWEKLTSQFWLDTRVPVSNDLDDWRKLPQLERDTFAKAFAGLTLLDTLQSVDGAEVLKHDARTPQEIACFNNIQFMESVHAKSYSTIFSTLNTKKEIEELFNWVDTNVYMQTKAEIINKIYESGTALQKKVASVFLETCLFYSGFYTPLLYLGNNKMINSAEIIKLIIRDESVHGTYIGYKFQLGFNELSEDEQSEFRDWMYELLYKLYENEENYSHLLYDKVGWTDEVLTFLRYNANKALMNLGQDPLFPDTAADVNPVVMNGISTSSSNHDFFSQVGNSYLLGEVEAMSDEDYDI

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_011835376.1|1506723_1509198_-	DNA topoisomerase IV subunit A	G3M9Z5	Bacillus_virus	1.8e-96	31.8
WP_011835377.1|1509522_1509972_-	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_011835378.1|1509968_1510802_-	3'-5' exonuclease	A0A0K2SUJ2	Clostridium_phage	1.2e-20	39.4
WP_014735065.1|1510794_1511331_-	cysteine hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_011835380.1|1511437_1513372_-	DNA topoisomerase IV subunit B	G3M9Z3	Bacillus_virus	5.4e-125	43.2
WP_011835381.1|1513650_1514292_+	glycerol-3-phosphate 1-O-acyltransferase PlsY	NA	NA	NA	NA
WP_011675987.1|1514465_1514684_+	redoxin NrdH	C3U2K9	Lactococcus_phage	5.8e-12	47.6
WP_011835382.1|1514685_1515108_+	class Ib ribonucleoside-diphosphate reductase assembly flavoprotein NrdI	A0A142F1R4	Bacillus_phage	2.3e-12	36.4
WP_011835383.1|1515244_1517413_+	class 1b ribonucleoside-diphosphate reductase subunit alpha	A8E2R1	Enterococcus_phage	5.6e-256	60.7
WP_011675984.1|1517697_1518675_+	class 1b ribonucleoside-diphosphate reductase subunit beta	A0A096XT60	Enterococcus_phage	6.0e-117	65.7
WP_011835384.1|1518784_1519720_-	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_011835385.1|1519712_1520405_-	cell division ATP-binding protein FtsE	G9BWD6	Planktothrix_phage	1.2e-31	34.8

Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>NC_017949|2019552:2111342|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_011676959.1|2109305_2109866_-	alkaline shock response membrane anchor protein AmaP	NA	NA	NA	NA
WP_011676960.1|2109893_2110136_-	GlsB/YeaQ/YmgE family stress response membrane protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

>NC_017949|2213441:2228382|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_011835938.1|2215105_2216734_-	DNA primase	Q9AZI5	Lactococcus_phage	1.4e-296	91.9
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WP_011835941.1|2217940_2218180_-	hypothetical protein	Q9AZJ0	Lactococcus_phage	5.3e-35	87.3
WP_011835942.1|2218217_2218499_-	hypothetical protein	Q9AZJ1	Lactococcus_phage	2.5e-44	93.5
WP_011835945.1|2218720_2218924_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011835946.1|2218920_2219442_-	hypothetical protein	Q9AZJ3	Lactococcus_phage	7.0e-72	78.9
WP_011835947.1|2219700_2220366_-	Rha family transcriptional regulator	R9QNB1	Lactococcus_phage	1.2e-47	48.7
WP_014735153.1|2220528_2220750_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_011835948.1|2220920_2221463_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A0P0IV68	Lactobacillus_phage	3.3e-08	50.8
WP_014735154.1|2221684_2221915_+	hypothetical protein	Q9AZK0	Lactococcus_phage	3.5e-15	84.2
WP_014735155.1|2221987_2222182_+	hypothetical protein	Q9AZK1	Lactococcus_phage	2.5e-27	93.8
WP_011835949.1|2222363_2223098_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011835950.1|2223303_2223489_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011835951.1|2223675_2224740_+	hypothetical protein	A0A141E0C6	Streptococcus_phage	1.6e-102	54.6
WP_011835952.1|2225391_2225706_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011835953.1|2226509_2226704_+	hypothetical protein	Q9AZK6	Lactococcus_phage	3.7e-10	62.3
WP_011835954.1|2227200_2228382_+|integrase	site-specific integrase	Q9AZK8	Lactococcus_phage	3.1e-91	46.2
2228468:2228483	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

>NC_017949|2480188:2492765|DBSCAN-SWA
ATCAGTCAAATCCACCCTCAACGTTCACTTGCGCAATCAAATCAGGAAACTCGTCTGCCTTTTTAAAAATTTCAACTGCTTCTTGTCTGGCTACTTCTAAAATATTATAATCATTGACCAAATCTGCCGCAATAAATTCTGGAAGTCCTGATTGACGAAGTCCAAAAATTTCCCCAGAACCACGCATTTTCAAATCTTCTTCGGCTAAAACGAAACCATTTTGCGTCTCTGTCATAATTTTCATCCGTTGTTTTCCTGAATCCGACTTAGGATTTGCCACTAAAATGGCGTAAGATTTTTTTGTTCCCCGACCAACACGTCCCCGTAACTGATGAAGTTGTGAAAGTCCAAAACGGTCAGCATCCATAATGACCATGATGGTGGCATTAGGCACGTCAACCCCTACTTCGATTACAGTAGTTGACACTAAAACATCCAATTTTTTAGCCTTAAATTCTTGCATAATTTGGTCTTTTTCATCATTTTTCATTTTTCCATGTAAAAGCCCAATTTTGGCAAATAAACCAAAGTAGTCATTTAATTCCGCAAATAAGGCTTCTGCATTTTTCAGGTCTAGGCTTTCGCTCTCCTCAATCAATGGTGAAATAAAATAGACTTGAGAATCATTGGCAACCTCACCTTTTACCCAACTTAAAACTTCAGAAAACTGTTCATGTTTGACCCATCTTGTGGTAATGGGTTGACGTCCCTTTGGCAGTTCATCAATAATTGAAACATCCATATCTCCAAAAGCCGTAATCGCAAGCGTTCTTGGAATTGGCGTTGCCGTCATCATTAATACATCTGGATTTTGCCCTTTTTCCCGCAAAATTTTCCGCTGATTTACCCCAAAACGGTGTTGTTCATCTGTAATCACTAGACCTAAGTTATAAAAATCAACTCCTTCTTGAATCAATGCATGCGTTCCCACTACCATGTGCGTATGCCCACTAGCTAAATCAGCTAATATTTCCCGTCTTTCAGCTGCTTTTAAGCCTGAAACTAATAGTGAGATTTGCAACTCAGGAAAGAGCGCCTGTAAATTTGCAAAATGCTGACGAGCCAAAATTTCCGTTGGAACCATGATTGCTGCTTGAAAATTTGCCAGACAAGCCGCATACATTGAAAGCGAAGCGACAACTGTCTTACCAGATCCCACATCACCTTGCAAAAGCCGATTCATGTGGTAAGGAGATTTCATGTCATCCAGAATTTCGGTCAAAGCCCGGGATTGGCCACCAGTCAATTCAAAAGGTAAGTCCGAAATTTTTTTATCAATTTCTTCTTGCTCAAATATAACTTGTAAACCTGCTCGTCCTGATTTTTCTTTATTTTTCAGTGCCTGCAATTTCAACTGAAACATGAATAATTCTTCAAATTTTACACGTCGCAATGCCTGTTTATGAGCCGCCATATCTTCAGGAAAATGCATGGCCAAAACGGCTTCTTGCCGGTTCATCAGACGATATTTTTCTATCAAAAATTCTGGTAAGTTCTCAGGTAATTCTGACAGAAGCCCTGATTCAAAAACTTGATGAATCACTTTGACCAATTGACTTTGTTTCATACCCGCTGTCAAATGATAAACAGGTTCTAATCCATCGTCCACCTGAGCCACAACTTTCATTCCCATCAGTTGTTGCTTTGTCTGTTCCCATTTTCCATAAACAGCAATTTCTTTTCCAACCTCCACTTTATCAGCCAAATAGGGTTGATTAAAAAAGCTGACAGCAACGACGGCTTCACCTTCTTTAATTTTAAATGAAAGTCGATTACGTTTAAATCCGTAATACTGAACATTAGCTGGGGTCACTACCGTTCCAATAATCGTTGCTTTTTCTCCGTCAGTAAGTTCAAAAACCGAGCGACTTGCGAAATCTTCATAACGAAAAGGGAAATAAAGCAGTAAATCTTGAACTGTGAAAATTCCTAACTTATGGAAATTTTCCACAGACTTTGGCCCCACACCTTTTAAAAATTGCACTGAATCTGTTAATTTCATACTTTTATTATACCAAGATATAAGGCTAAATGCTTCAAAAATCAAATATAATTTACTGACAGAGTATTTTATCAGTAAATTTTGCTGATAGATACTCTGTCAGTAAAAAAAATAATCAGAAAATTTTCTGATTACTTTTTATGCTTTTTTAACAACCGAACCCTTCAGACTAATCGCTCCAAATCCTGGAATTTTTGAATCAATAAAATGTTCATTTTTTCCTTCTGGATTGATACGAATGTTTTTCACTTTTGTACCCTGTTTAATTGGTTTTGGCATTCCTTTAACCGGCAAATCTTGTACAATGACAAGATCATCCCCAGTTTCTAACTCATTTCCTAGACTATCAAGGACAATAAATTTTCCAGCTGCTTCAATTTCTTCAAGCGTAAATTCATTCCCACATTCAGAACAGCCAAAGCTCGTATCTGATAATTCATAAGTATATTCACTTGAGCAATGAATATATAAAGAGCTTAGACCCTTGATATATAAGCACTCCACAGAAAACAACGCTATTTTTTTACGCTTTTTAATACGTTCGACCAAAAAATCATAATGCTTTTAAGATGTCGCCGAACTTTTCAGCGGTCTCTTTTTCTTTACTTTTGGATAAGTGGCTGTATGTGTTCATTGTGATAGCATAGTCGGCATGTCCTAGCCGTCTTTGTATCTCTTTGGGATTTACATCATTGTTCATTAAAAGGCTGGCATGAGTATGACGGAAACCGTGAAAGCCAATGTTAGGAACGTTGGCACGCGCAAAATGTTTTTTTAGTTGAGTTACTTCATTTATATAAGTGTATGTCTTTCCATTATAAGAGAATATCGGCGAATCTATAAGCCTAACAGTATTATTATTTTGGCACTTCTTCCACTCTTTCAGCATTTTAATAGTGTCATTGTCCAAAGCGATCGCCCTATTACTCTCTTTCGTTTTGGGCATGTTTTGCACTCCCCGCGCTTGTATCATTGTTTTGCTCACAGATACAGACTTATCAAAAAAATCAATATCAGACCATGACAGCGCCAAAGCCTCCCCGATACGTAAACCAGTAGCAAGTAAAAAGCGGTATAAAGTTATACGCCTTTTATTTGTTGGCGTTGTTTCCAAAGTGTCTAAGTATGTTAGAAATTGTTTAAGTTCTTCATTATCAAAGTATTTTATTTTTGAAACTTCTCTAATTTTGAGTTTTGGCGGAAAAACTTTAGTAGCTGGATTCTCTTCAATAGCCCCTAACTGTATACCATAGTCAAGAATACGCTTGATGATATTAAGCATAACTTTATAGTCCTTACACTTACCGCGTTCGCGCTTGCCGTTTACTATTTTGGCCGTGTTCGCATTCTTTGCCCATTTATTAACGATTGTTTGTAATAACACGGGATTAATTCTATCAACTCTATACGCGCCAAGTTCGGGCAATATATAAACTTTCAAGTTATTGTTTACTATCCTTATGCTGTTAGCTTTAACTGTCAGCTTATAACTTTCAAACCAGCTCAAAGTCAAAGATTCAAAGCTATCAAAAGAAACTTTTTTTCTTGCAATTGTTTGACCGTTATTGATAAAATCATTTATAACTTGATGTGCTTTAGTTTCACACATCTTTTTACTTTTTGCGGTTACGCTTGTCCGCACTTGCTTACCAGTCAGGACGTCCACACCTATATAAACATTAGCGCGGTACACCTTTGTGCCGTCTTTTTTTGTATATTCTTTAATATTCATAATTTTTTCCTTTCCTTTTTGTACTAATGTCAGGCAAGGCATGTACGAGGATTGAGAAATATTTTTATTAGAGCTTATACGATTAATTAGTTAACTGGTTTATTAGTTTATAGAGTTATTAAATTCTATACTAATATAGTATTATTTACGGTAACAAGGTAACAAAGTATTATAAAGCTATATATATCAACACTTTAAGCTGTTACCGTTCTTTATATTAAGAGTAACAACAAGGTAACAAGGTAACAACTATAAGAAAAGAGATTGATAGAAAACAAACTAAAAACAGCTTAATAGAGCCTTTTTATTTGGCAGAACTACCAACATAATGGCGCCAGCTTTTAACGTGGTTCAGGCTTGCACGTATTGGCATGATTCACGCGCTTCATCGTAAGAATTGTGATGATATCCGTAGAAGTCTAAGAAGTTGTATATATTTAACGTGTCGCGCGTGATAATGTCAAAATGGCTTATGTAATCAATGGCATATCCTTTAAATTTTTCAATATGACATTATAATAAATATATTAAAATATTAAACCTTCTGAAAACGATAAATTCATTTCTCCGAAATCATCAATTTTAAAGTAATATTCAGGGTCCCCAGTAGCTCTCAAAATAGCATTTTCTAAATATTTATCAATAGCTAGATTGATTTCTTTTTTAGCTTCACGCAAAAGGATTGTGCTTTTCGCAATATCACTTGTCATTTTTAAATATGCTGATTCATTATTTTTCCAAGTTTCTTGGTTGTCGAAATCTACATCACAGCGTTTTAAGCCTTCTTCGCTAGCTTTCCAAGTCAAACTACCTGTATATTCTAAAGTTTCAACTTCTTTTTTATAACTTAAAATTTTCACAAATAAAATAATCTGTGCTTCAAGTCTATTTGTTTCTACTTCTTCAATAATTGCATTCATAGTAAAATCAAGCGGAGAATACTCGAAAAATTCAGCAGGAGTAATCCTTAGATAAATGCATATAGTATTCAGTGTATCATTATCAATTCTTTTACTTTCATTTTGGGAAAGAGCTGTAAGAGTTGTCCTAGATATTCCTGTATCAAAAGACATTCTTGAAATTTTTATATTTTTTTGGGTTAGAATAACGGCTAATTTGTTAAGTAGCATAATGTTCTACCTTTCTTTTTGTCCACCTAATTGTACAATAGGCTGACCATTTTGTCAAATTGTCCATTTAGATGTTTACAACAATCAAAAAATAGTGTAGAATATCCTTGTTGAATGTTCAACTAGCAGTACAAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12

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MTNIIRACAYVAGIDSVGMQNLKAYHSELTDKQIEKLDPLNANTGTVDYSFKVRKYKHGIRFEGEKEGGEISLFDEVAK
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MHCSSEYTYELSDTSFGCSECGNEFTLEEIEAAGKFIVLDSLGNELETGDDLVIVQDLPVKGMPKPIKQGTKVKNIRINPEGKNEHFIDSKIPGFGAISLKGSVVKKA
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MTPKEQALNCINRGFSVIAGYPAGKSERAVIRGTSSGTLDEITVSAWFDEIPNRNIMINLRNSGLICIDLDQHQNGQNGRTVFSRLWNEHSEGEILSTYVEKTPTGNGLHVFFKVPKELFSQPIVSELADGVEIKTHFTPIYPSKRTDGDYIPLNDTETNKPLTFDSLCDCPDWLLEMIQRPQARATTGTSSRTYGAEMWELFNQGARKGNRNNDTNRILHYWRKIGIDNNHCMDLLRTFNNRTSPPLPDDELATIWKSVFKMK
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MNDDTLINLVARGLVDKIIHLFNKYLGTQLKIRNEKRVLPYISKKRVMEDLDISDGTLDNWEKHGLNRYKPKYKTSLIYYLIDDICKFIIIDT
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MNIKEYTKKDGTKVYRANVYIGVDVLTGKQVRTSVTAKSKKMCETKAHQVINDFINNGQTIARKKVSFDSFESLTLSWFESYKLTVKANSIRIVNNNLKVYILPELGAYRVDRINPVLLQTIVNKWAKNANTAKIVNGKRERGKCKDYKVMLNIIKRILDYGIQLGAIEENPATKVFPPKLKIREVSKIKYFDNEELKQFLTYLDTLETTPTNKRRITLYRFLLATGLRIGEALALSWSDIDFFDKSVSVSKTMIQARGVQNMPKTKESNRAIALDNDTIKMLKEWKKCQNNNTVRLIDSPIFSYNGKTYTYINEVTQLKKHFARANVPNIGFHGFRHTHASLLMNNDVNPKEIQRRLGHADYAITMNTYSHLSKSKEKETAEKFGDILKAL
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MSKTLITDKEHRRFEDIIFKVWRVYEFGENEFTQAETKHINKVFEQLNAEHPREYKIIVRHHLKRTYYTTIAREQGVSEGYIRKLAKNGAYYFLQLYDDE
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MKLSELQTIDQNIIKFLAEHRGIDRAVKGKILAQALDIDFRTLQSRIEYLHKQGCAIGSIDNGYFIPTNEDERRAGIIKKQRTGIAINNAVNGYTLAELDWIDQLFKED
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MLLNKLAVILTQKNIKISRMSFDTGISRTTLTALSQNESKRIDNDTLNTICIYLRITPAEFFEYSPLDFTMNAIIEEVETNRLEAQIILFVKILSYKKEVETLEYTGSLTWKASEEGLKRCDVDFDNQETWKNNESAYLKMTSDIAKSTILLREAKKEINLAIDKYLENAILRATGDPEYYFKIDDFGEMNLSFSEGLIF
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MNLQLVNQELFNGITCDVWRNDNHEIFMTTEQLAQCIGYQTRYGITKLVQKNKYLKNREFSVSAKLAHGDGKQYDTRVFTFEGIKEILFLAPKSETARKFREWTRSVLNAYFKGELVKAKEMAKATITRRDLSTAIKESPHFEPNYHVIFANMLTALVTNGEYKSVQGMRKALGRPNAKLKQMLDSPKELQLLQTYESSITNLLDLGFDRHQIKAFLTKEKAQPLPTKKA
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MKNNLSKIMGERRITAVTIAKDTKISRTTIRAIYYEEAENVKLSTLTKICDYLNCPLSELIEYNPCA
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MKLTDSVQFLKGVGPKSVENFHKLGIFTVQDLLLYFPFRYEDFASRSVFELTDGEKATIIGTVVTPANVQYYGFKRNRLSFKIKEGEAVVAVSFFNQPYLADKVEVGKEIAVYGKWEQTKQQLMGMKVVAQVDDGLEPVYHLTAGMKQSQLVKVIHQVFESGLLSELPENLPEFLIEKYRLMNRQEAVLAMHFPEDMAAHKQALRRVKFEELFMFQLKLQALKNKEKSGRAGLQVIFEQEEIDKKISDLPFELTGGQSRALTEILDDMKSPYHMNRLLQGDVGSGKTVVASLSMYAACLANFQAAIMVPTEILARQHFANLQALFPELQISLLVSGLKAAERREILADLASGHTHMVVGTHALIQEGVDFYNLGLVITDEQHRFGVNQRKILREKGQNPDVLMMTATPIPRTLAITAFGDMDVSIIDELPKGRQPITTRWVKHEQFSEVLSWVKGEVANDSQVYFISPLIEESESLDLKNAEALFAELNDYFGLFAKIGLLHGKMKNDEKDQIMQEFKAKKLDVLVSTTVIEVGVDVPNATIMVIMDADRFGLSQLHQLRGRVGRGTKKSYAILVANPKSDSGKQRMKIMTETQNGFVLAEEDLKMRGSGEIFGLRQSGLPEFIAADLVNDYNILEVARQEAVEIFKKADEFPDLIAQVNVEGGFD
>NC_017949|2480188:2492765|2486380_2486914_+|WP_011836148.1|DBSCAN-SWA
MKFKTFDLNAYKSRAGITLSFDKKDRALGIITSKLFYLDSKHPLKLKITNNQAERYRIKQEIKQTDYKGFVTEGVAQLADIIEKKIILMDYHNANKENWQGWMRTFVYEYLYDVAFNRGIRHERQRRKTKHKAMTAFDIISSEDVSELSNELGISEDKLTYAVLEVISKRKNGGKNE
>NC_017949|2480188:2492765|2492441_2492765_+|WP_011836158.1|DBSCAN-SWA
MNKTEFNIRLYLSGVMEPWTDRIDSTGKETPQRFILNAMTELFDSLSDEDKELIKLRYVERMTLSEVASRYLLNERTIRNHTNPAIKQVKEIIKQGTEQAQHAREVD
>NC_017949|2480188:2492765|2490816_2491359_+|WP_011836155.1|DBSCAN-SWA
MTNEITEHLNKAKALLIEKYSNSIDEQASQEALKNIKKDFEAIEIYANESDTEPQEYEPQETVKSIIKEMQELTFAPHEISGNDTQVFADLLTDSVERLIKALGLNEMSLSAESENKPQELALKAQLQDLHALNHSMFKEDINEVPRFTDGTIITAKDLADMNINALDNIAELIGFELEE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_011836143.1|2480188_2482189_-	ATP-dependent DNA helicase RecG	B2CRJ8	Acidianus_filamentous_virus	2.1e-07	24.0
2480846:2480861	attL	NA	NA	NA	NA
WP_041931367.1|2482327_2482654_-	alkylphosphonate utilization protein	NA	NA	NA	NA
WP_011836145.1|2482742_2483921_-|integrase	site-specific integrase	Q9AZK8	Lactococcus_phage	3.6e-92	46.8
WP_011836146.1|2484448_2485051_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A1P8BMN9	Lactococcus_phage	1.5e-12	59.1
WP_014735188.1|2485212_2485416_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_011836147.1|2485434_2486127_+	Bro-N domain-containing protein	Q9AZJ5	Lactococcus_phage	1.1e-19	47.8
WP_011836148.1|2486380_2486914_+	hypothetical protein	Q9AZJ3	Lactococcus_phage	2.0e-50	62.1
WP_011836149.1|2486906_2487188_+	hypothetical protein	Q9AZJ1	Lactococcus_phage	6.1e-46	94.6
WP_011836150.1|2487230_2487470_+	hypothetical protein	Q9AZJ0	Lactococcus_phage	6.3e-36	91.1
WP_011836152.1|2487717_2488047_+	hypothetical protein	Q9AZI7	Lactococcus_phage	2.9e-55	95.4
WP_011836153.1|2488155_2488950_+	bifunctional DNA primase/polymerase	Q9AZI6	Lactococcus_phage	1.5e-150	94.7
WP_011836154.1|2488960_2490589_+	DNA primase	Q9AZI5	Lactococcus_phage	3.4e-298	92.3
2489836:2489851	attR	NA	NA	NA	NA
WP_011836155.1|2490816_2491359_+	hypothetical protein	Q9AZI4	Lactococcus_phage	4.2e-59	71.4
WP_011836156.1|2491631_2491934_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011836157.1|2492007_2492418_+	DUF722 domain-containing protein	Q9AZI2	Lactococcus_phage	8.2e-68	94.9
WP_011836158.1|2492441_2492765_+	sigma-70 family RNA polymerase sigma factor	Q9AZI1	Lactococcus_phage	7.4e-48	89.7