Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_012470 | Streptococcus equi subsp. zooepidemicus, complete genome | 4 crisprs | DEDDh,cas3,csm6,DinG,WYL,cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,RT | 0 | 10 | 6 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_012470_1 | 1263308-1263424 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_012470_1
|
1 spacers
spacers of NC_012470_1
>1.1|1263342|49|NC_012470|CRISPRCasFinder GTAATGATCTATCATCTTATTATTGACTCAAACGACAAATTATATTGCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_012470_1
The CRISPR arrays of NC_012470_1 >merge|NC_012470|1|1263308-1263424|CRISPRCasFinder TTTTAGTATAAGCTGTCATCAAGTCAGGTAAATAGTAATGATCTATCATCTTATTATTGACTCAAACGACAAATTATATTGCATTTTAGTATAAGCTGTCATCAAGTCAGGTAAATA >NC_012470|1|1|1263308-1263424|CRISPRCasFinder TTTTAGTATAAGCTGTCATCAAGTCAGGTAAATA GTAATGATCTATCATCTTATTATTGACTCAAACGACAAATTATATTGCA TTTTAGTATAAGCTGTCATCAAGTCAGGTAAATA
>NC_012470.1|WP_012515454.1|1262727_1263267_-|RNA-polymerase-sigma-factor MIKGVLRGDKLLEFEDIYLEYKDDVYRFVNKLCCYQNSLSDDITQETFLKAYRNIAKFRGDSSIKTWLFTIAKNTFFSEIKKKKYENMSMESLEIVDAKGHDEPLDKIARRELLEITLTIIFNLPEKMQAVFLARIYSGDSYEKIAKDIGITVSSAKVLVFRARKHIKRQLREEYGYEV >NC_012470.1|WP_012678091.1|1262102_1262738_-|zf-HC2-domain-containing-protein MRYDCELIQDLLPLYVDDTLSDYSRAIVEAHLTSCKDCQADLDDIRQDYGKAEEELQEYQAEVCAFSRFIRKQRQQMIVATIGICLATGIMSSILTAHRIRAPYDYVAIDVGEHTQLNKEGLLSTARTTAKDHVALVYKHKAQKVNGSFKLSELQARKIQQQLKQAMLNKTNTSDASSRQLDQSQKRLSCNQADQLVYVVSTDGRIYYFGR >NC_012470.1|WP_024273168.1|1261279_1261975_-|polyphosphate-polymerase-domain-containing-protein MNEVLRQEKKYLITIEDYYRLSHEFSKLLRLDAHSSSEGYVIRSLYFDSLEDVDWQEKEDGIELRRKIRLRNYGSQSSFAKLEMKQKQGSHQKKRSLRLTRADAQLLIKGDRSILLAYPDRFAAECYSRMSMQLYQPKTVIEYQRKAFVAKENNIRITFDHHIIGSETNVDIFSDHLPQNYLLDPYLVILEVKYNGFLLSYIKKLLESVNGSELSASKYCMGRAISKHYRF >NC_012470.1|WP_012678089.1|1260588_1261266_-|DUF4956-domain-containing-protein MKQLLRHVFEQRGTLSFQDVLLHIVAAALLSIVIYMSYAYTHTGTAYSKKFNVSLMTLTVLTATVMTVIGNNVALSLGMVGALSVVRFRTAIKDSRDTVYIFWTIVVGICCGVGDYTVAATGSSVIFMLLLLMGAVRNDNRLLLIVRCDKQMEIELERLVFNYFSGKAIQRVKNTTSDDIEMIFELSRKDYDSTYQQDNPLTEAVYQLGRVDYFNIVSQSDDITG >NC_012470.1|WP_012678088.1|1259149_1260583_-|CotH-kinase-family-protein MKEKTIYMIVLVCLLLAAICGIGFPKTSAKRIHHHLQTVKKSSRSTGEFSSHLPIISIDTHHQQIPEQREYEGETKRQKTIKTTVSLRDQLDREHSLSESPRLSLTALIAYRGNSSRHFDKKSLKLRFINKSAKPKAVSLAGMSKESEWVLHGPFLDRTLVRNYLSYNIAGEIMTYAPNVRYCELVVDHQYCGLYLAVESIEQGRHRVNIEKSDRKSDKTPYILVWDRRHKAKQALDHYVSYTNQAGLSSLDIKYPSLHRLTPKQKQFIEKDISHIEKLLYSYDLKQYTDYLDQESFADYFIINEFFRNIDAGKFSTYLYKDLRDKLKLVVWDFNNAFDNQIEAPYDEADFTLSDAPWFCMLLKDPNFVKLVVTRYHQLRQNVLSTDYLIKYIDATVAFLGPAIQRNYHKWGYVFTVPSRSDATNYLVPVSRNYRSYEASVKQLKDFIRRRGRWLDKHIETLYQYSAPSKNTNTLLE >NC_012470.1|WP_012678087.1|1257004_1259143_-|hypothetical-protein MKKYLIFVGLLLSVIGLSYYCCDIDGRLYLPVSNQSVIRTVFYTKDKRIYDQKGSPYLIKGVDVESSIAGYRQRDLSVDEKTYYRWFKQIAAMGANTIRVRVIMPVTFYHALSRYNDRASHPLYLLQGFRIDAYHDNSSISALDKAYLGTLLREARASVDVIHGRKRIWHSDLGLQHYDQDMSKWLLGYIVGDDWHSGTIAYTNHQNQSKPVGFKGRYYATTPQANRFEAVLAEIMEEITSYESHKYGWQHLVSFSNAPQSDPFVYQESFASQAAKYVQLTIENIRPSAKVKAGLFASYKLLDCHPAYRDYLLFDRLGLDDRLVGDIKRMPLYQGYVKLLTSYHRVPVVVTGYGYSTARGVDQMTSTSRPLTEKDQGEHLMADYTAFVASGCCGVTIHSWQDDWTARSWNTSFATNKHQSFLWGDVQSKAQGYGLLTFEHAPRTHAIDGQKAAAEWSKALIYRKNGQQLLVDQDEKYLYIAIEATQKPLQRQWLIPLDITPKTGSRVIEGLSARFDRFADFALVIDDSKDSRLLVQERYHATDANYLRQINGKDFYVFPPNKHTPRFTTVDMVVRNDNIFAAIDQVPIAKRGLKRYPTGQLKKGNGNRGSAHFDSQTDISFGERLIELRIPWQLLNFSDPASNKIHDDYFEHYGVEELAIEAIAIGFAPLKESKVIAMVEYPLLSWERPRVREVLKTSYQQVQAVWQEKRRR >NC_012470.1|WP_162465563.1|1255462_1256863_-|glycosyltransferase 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MKLLYTEISYSMTEILVKEARAYADKGYRVFYIAPNSLSFEKERSVLALLPEQGSFAITVTRFEQMARYFTLAKAANRQALDDNGLAMIFYRVLMQLQEDELKVFHRLRTDQAFIAQLVELYKELQAANLTAFDLTTLDRPEKQEDLITIMTKAEQLIAQGDYDQSSRLAQLAEAIKSKSLDDELRQTVLVIDGFTRFSAEEEQLLALLNEACEEIVIGAYISQKAYRLAFTKGNLYEASLAFIQQLAQQFQTKPIYTTSEKVFDVSFSRLTQLLEANHDYSKLDWQLSAKDKSKVVIWQALNQKEELEYVAKAIREKLYQGYRYKDMLVLLGDVASYQLQIGPIFEKFEIPYYIGKQEPMSAHPLVQFVESLERGRRYNWRREDIVNLLKSGLFGRFQEGELDQLEQYLVFADIQGFTKFSRPFTLNSSRQYPLPLLNQLRLAVVTPLQQLFKSQKQLGASLLDKLMTFFKTIQLADNFEALAGSRREADREKDEEVWKAFTGILETFYQVFGQEKMTLADCLALIKMGMQTAHYRTVPATLDVVSIKSYDLVEPHSKPFVFAIGLSRSHFPKQTKNTSLISDQERASINEQTASYQRLDVPSFENIKKNHQTALSLFNAATQELVLSLPTSLTNSSDDVSPYLKELIALGVPVIEKGKNRLSHSAADIGNYKALLSRLVAINRQGIADDMTSEDRNFWTVALRYLKRRLADEQLSLPAFEHHLTTKPVAPEVIETRFPSHQPLSLSSSALTVFYNNQYKYFLKYVLGLQEPESIHPDARIHGQYLHRIFELVTKDRTDAAFDQKLGAAIAAVNQQSAFQQVYQADAEGRYSLEVLKGIAYSTAPVLNLNQGMQVAKQEEAFELALGHQALIRGVIDRIDQLADGRLGIVDYKSSARVFDIGAFYNGLSPQLVTYLAALKNKGQGLFGAMYLHMQEPRLSLSDFKVLDDQLVAAAYKELTYKGIFLAQAKEYLANGSYHLNNTLYETDELETLLAYNEQLYLSAVKQIKTGHFLINPYTADGKSVQGDQLKAITRFEADLDLGYARRLVVLPVKERRQAFLTRMNEEIKHED >NC_012470.1|WP_012678084.1|1248396_1252041_-|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddA MRIDEGFLTPEAIARLQQEEALSDKTHKRTAQQIEAIYSSGQNILVSASAGSGKTFVMVERILDKILRGIPVDRLFISTFTVKAATELIERIEKKLHTAIAETQDYQLKAYLNDQLQALSQADIGTMDAFAQKLVHQHGYVLGISPHFRIIQDKAEQDILKREVFRQVFEDYMSQTDNKAFIQLVQNFSGRRKDSSAFREIVDSIYAFSQSTANPSSWLAEVFLRGSKTYTSFADIPDQAVDTLLACMQDTADQLRDLTDMEGYAQTTKAGKLTAKYTKHLKMIDSLYEWALHFDSLYGKARLGQLAQELTALLPSGADITVAGHKYPIFKSLQEQLVGFRHLETILAYQQESLPLLEVLQAFVISFSEAYLAAKMQENAFEFSDIAHFAIEILQQAPDIRQAYQGHYHEVMVDEYQDNNHMQERLLELLSNGHNRFMVGDIKQSIYRFRQADPQIFNQKFKDYQSNPEHGKLILLKENFRSQSEVLNVTNAVFSRLMDESLGEITYDDKHQLVAGSEAQKQLHPENRAQLLLYNTDQAQEGTEEASTNDGISAGEVTLVAKEIIRLYNEEKVAFEDITLLVSSRTRNDTIFQVFNQYGIPLVADGGQENYLKSVEVMVMLDTLRSINNPLNDYALVALMRSPMFSFDEDQLARISLQSSSQDQPQAFYDKLSNSLRGQGEHPGLIGQELMTKLVDFDRTLSDWRQFAKLHSLYELIWKVFNDRFYFDFVASQPKAEQAQANLYALAIRADQFEQSGYKGLSRFIGMIDKVLETQNDLADVEVERPKHAVNLMTIHKSKGLEFHYVFILNCDKRFAMADLQAPIILNRDEGIGIKYVANVKELLRDEKLASLKVTMETLPYQLNKQQLRLATLSEQMRLLYVAMTRAEKKVYLVGKASKEKIQAKTADNSSEGRLALASRERLLSFQDWLLAITATFSKEDLFIDVRFVDDSDLTAEAVGQLRSSGLLQADDLKDNRQTEDIARALDMLDKVSKLNASYQAAIELPTVRTPSQLKTLYEPLMDTDGVDIIDQPYHRPKSFDLPDFSKKKAVEPSQIGSSLHELMQRIPMSDQVTAGDIEQALQFVSADAEVKARIDIKKVTSFFATTELGQLLQEHHQCLHREAPFAMLKKDSLSQEQYVVRGIIDGYLLFEDRIVLFDYKTDHYQHSAELKQRYQQQMDLYAEALSQSYGIARIEKYLVLMGGSQLEVVRLDE >NC_012470.1|WP_012678083.1|1247017_1248133_-|aminotransferase MKLPVFGVEEWLNQHEKRAVYDIAGSSIASLTLEELFDLTQEQPQAFYQQLHQKPLDYGWIEGSPDFKQAVAGLYQQQKARNILQTNGATGANFLVIYALLEAGDHVIAHYPSYQQLYDIPASLGVEVDYWQIREEQAWLPDLNELVAMIRSNTKMIMINNANNPTGAYMTKPYLEELINIAREHDIYLLSDEVYHSFASDHLLAVADLYDKGITVNSMSKTFSIPGIRVGWVAASETICDQLRLYRDYTMICAGVFDDMVASLALKHADKLLQRNQAIIRTNLAILEDWITGEAKASYIRPREVSTAFVRLDIDEDIEAFALRLLEDYGTLVVPGNRFNQANHVRIGYCCQPQVLQAGLSRLSQCLKNIQ >NC_012470.1|WP_012678092.1|1263555_1267272_-|pullulanase MMKRLRENQALFEERQLFGIRKLKLGVASVAIATAFSLGTVSGQITAAAESLTSVEPIDGAVMVKSEAADHDSKELPEATDISDIAGISDVTKVSAAVNADTVKEVQPVAVPLVEDQAQAEATDQSQPSSSIVPVTTDSSLETPEATSSEEPIAEQTLRLHFKTLPAQDLSSLGLWVWDDVETPSDQLGGWPTGATNFSLAKTDDYGYYMDVKLSAEQAHKVSFLINNTKGDNITGDRTVELISPKVNEVWIDGQELSYYPPLAQGYIRINYYRSDGHYDNKSLWLWGSADASMTSQQGAWPDGIDFKQVGRYGAYIDVKLADFNELGFLLLDERQTGDAVKIQPNDYIFKDLKNHTQIFLKDEDPTIYTNPYFVNHVRLIGAKQVSPSSIEASFTTLADVDKESLLKELKISTDSKEAVAITDITLDEKTHKAVITGDFSQAVATYTVTFHHESFQARPNWQYKDSLYAYDGELGARVREAGAKVDLTIWSPSADKVSLVLYDKADQTKVIGNLALAKGDKGEWSITLSADSGLGISDYRGYFYHYEITRNGKSVLVLDPYAKSLAAWNSELAKTDPSYKVAKAAIVDPAAIGDKELAFADIKGFHKREDAIIYEAHVRDFTSDQAIANDLKAQFGTFAAFVEKLDYLKELGITHVQLLPVMSYYFVNELANKERMLTYSSSDNNYNWGYDPQSYFALTGMYSTDPTDPAKRIEEFKQLVNEIHKRGMGVILDVVYNHTANVDIFEDLEPNYYHFMNADGTARTSFGGGRLGTTHYMSRRVLVDSITYLVDEYKVDGFRFDMMGDHDAAAIEKAFLAAKALNPNIIMLGEGWVTYQGDEHMPEQPADQSWMSQTDTVASFSDDFRNQLKSGFPNEGSPAFITGGARDIMTIFHNIKAQPTNFLADDPGDVIQYIAAHDNLTLFDIIAQSIKKDPSVAANAAEIHRRLRLGNLLVLTSQGTPFLHAGQEYGRTKQFKDEAYKGKVADDKVPNKSHLLVNEDGTPFEYPYFIHDSYDSTDAINHFDWAKATDTERYPESTTSQAFTKGLIALRRSTDAFRLASKAEIDQKVKLITVPNEHGIKAQDLVIAYQTTASNGDVYAVFVNADSNDRTIRLTGEFQALLAGEVIVDAKQAGTEALASPEGVVLTKDGVKLSGLTATIIRLRASQSDKGTLGAMTDQAAHHQEKLVAAQTAGEVSQFSSKTLPKTGTSQLDSLLALAGSGILAGLGGLVSKSKRR 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_012470_2 | 1550682-1550794 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_012470_2
|
1 spacers
spacers of NC_012470_2
>2.1|1550723|31|NC_012470|CRISPRCasFinder CGAACAAGGGCCTGCTGGGCCTATGGGACCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_012470_2
The CRISPR arrays of NC_012470_2 >merge|NC_012470|2|1550682-1550794|CRISPRCasFinder CGTGGAGATAAAGGTGAAACCGGAGAAGCCGGTCCTAAAGGCGAACAAGGGCCTGCTGGGCCTATGGGACCACGTGGAGATAAAGGCGAAACCGGAGAAGCCGGTCCTAAAGG >NC_012470|2|2|1550682-1550794|CRISPRCasFinder CGTGGAGATAAAGGTGAAACCGGAGAAGCCGGTCCTAAAGG CGAACAAGGGCCTGCTGGGCCTATGGGACCA CGTGGAGATAAAGGCGAAACCGGAGAAGCCGGTCCTAAAGG
>NC_012470.1|WP_012678295.1|1549214_1549898_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MDFTFLPKYWAYFNYGVLVTMMISACVVFFGTIIGLLVTLIKRSHIKPLSWLVSLYVWIFRGTPMVVQIMIAFAWLHFNDLPIVGFGVLDLDFSRLLPGIIIISLNSGAYISEIVRAGIEAVPKGQLEAAYSLGIRPKHAMRYVVLPQALRTILPALGNELITIIKDSALLQTIGVMELWNGAQSVVAATYLPITPLLFAAFYYLMVTTLLSYLLGALERKLAQGGK >NC_012470.1|WP_012678294.1|1548475_1549213_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MTKTMIAISQLYKSFGQHEVLKGIDLTINQGEVVVIIGPSGSGKSTLLRTMNLLEVPTKGHISFEGVDITDRANDIFKMREKMGMVFQQFNLFPNMTVLENITLSPIKTKGMSKADAEQKAYQLLERVGLLDKAAVYPASLSGGQQQRIAIARGLAMDPDVLLFDEPTSALDPEMVGEVLAVMQDLAKSGMTMVIVTHEMGFAKEVADRVIFMDGGLVIEEGSPAQVFEAPKEERTKDFLSKVLS >NC_012470.1|WP_012678293.1|1546334_1548029_-|phospho-sugar-mutase MDYKAVYQEWLHNDFFNEEIKADLEAIKHDEAEIQDRFYKVLEFGTAGLRGKLGAGTNRMNIYMVGKAAQALANTIIDHGPEAVSRGIAISYDVRYKSKEFAELTCSIMAANGIKSYIYKGIRPTPMCSYAIRALNCISGVMITASHNPQAYNGYKAYWEEGSQILDDIANQIAAHMDAIERFEDVKQIPFEEALASGLTSYIDDSIEEAYKKEVLGLTINDTDIDKSVRVVYTPLNGVGNLPVREVLKRRGFDHVFVVPEQEMPDPDFTTVGYPNPEVPKAFAYSERLGQEVGADILIATDPDCDRVALEVRAADGSYVFLNGNKIGALLSYYIFSQRHARHNLPDNPVLVKSIVTGDLSKAIAAKYGIETVETLTGFKNICGKANDYDITKEKTYVFGYEESIGFCYGTFVRDKDAVSASMMVVEMAAYYKQRGQSLLDVLQDIYKEFGYYNERQVALELEGVEGQKRIARIMEDFRNKLIERAGAMSLKTVVDFKDGYLDFPKQNCLKYYFDDGSWYALRPSGTEPKIKLYIYTIGETEADSIAKLDAIESACQAKMDSVS >NC_012470.1|WP_012678292.1|1545368_1546223_-|bifunctional-methylenetetrahydrofolate-dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate-cyclohydrolase MVQIIDGKALAQKMQAALAKKVESLKAEKGIVPGLVVILVGDNPASQVYVRNKERAALAAGFKSETVRLSDSVCQEELIELIEQYNQDDTIHGILVQLPLPHHINDKSIILAIDPKKDVDGFHPMNTGHLWSGRPNMVPCTPAGIMEMFHDYGIELEGKNAVIVGRSNIVGKPMAQLLLDKNATVTLTHSRTRQLAAICRRADILIVAIGQGHFITKDFVKEGAVVIDVGMNRDVNGRLIGDVAFDEVSELASMITPVPGGVGPMTITMLLEQTYQAALRRVSQ >NC_012470.1|WP_012678291.1|1544517_1545372_-|NAD(P)H-hydrate-dehydratase MIIDQSFVARVVVPRQTESHKGSYGRVLLVGGLYPYGGAIIMAALACVHSGAGLVTVATDRENIAALHSHLPEAMAIAVDDEDLLLSQLDAADLVLIGPGLSENSRAARLFELVFAHVADHQVLVIDGSALRLLAKRTTDIKQLRCPLVLTPHQKEWEALSGLAIDQQHDSANQAALKHFPRATILVAKSSATKIYHGNQIYRLRVGGPYQATGGMGDTLAGMIAGIAVQFPESSLVAKVACATYLHSAIADELAKTAYVVLPTAISYELPRWLKAISTGQKLG >NC_012470.1|WP_041790527.1|1542893_1544234_-|exodeoxyribonuclease-VII-large-subunit MADYLSVTQLTKYLKLKFDRDPYLERVYLTGQVSNFRKRPNHQYFSLKDEGAVIQATMWAGAYKKLGFDLEEGMKLNVVGRIQLYEPNGSYSIIIEKAEPDGIGALALQFEQLRQKLAGEGFFDERHKQALPQFVTKVGVVTSPSGAVIRDIITTISRRFPGVSILLFPTKVQGEGAAQEVAANIARANQREDLDLLIVGRGGGSIEDLWAFNEEIVVQAIFESRLPVISSVGHETDTTLADFVADRRAATPTAAAELATPITKTDIVSWIAEQQNRSYQACLRYIRQGQERVDKLSYSVMFRQPERLYDAYSQRLDRLTTSLMTTFKETLSEAKQEHLILEHRLASVNVQARLERYQDRLATAHRLLIANMTNQYDSKLAGFERAQAALLSLDTSRIIARGYALLKKDGVVAACVKDIKKGDHLSIIMRDGQLEVEVEDVNEKNI >NC_012470.1|WP_012515261.1|1542700_1542916_-|exodeoxyribonuclease-VII-small-subunit MSTKKTFEERLQELEAIVTRLENGDVPLEEAISEFQKGMVLSKDLQKTLQSAEKTLVKVMQADGTELEMDA >NC_012470.1|WP_012678289.1|1541831_1542701_-|polyprenyl-synthetase-family-protein MDKLTRIDATIHQYYDRQSTVSADLEEAILYSVDGGGKRLRPLILLELLEGFGLALTDAHYAIAAAIEMIHTGSLIHDDLPAMDNDDYRRGRLTSHKQFDEATAILAGDSLFLDPFALIAGADLPADLLVQLIQQFSLASGTFGMVGGQLLDMKGEQQLLDIQELSDIHANKTGKLLTLPFVAAGIIAEQSADVLSCLWEAGRLVGQAFQIRDDILDVTASFDELGKTPQKDLAADKSTYPSLLGLERSRAILEESLSQALAIFSRLEREEGFESQAIIKRIEGLRLNG >NC_012470.1|WP_012678288.1|1541011_1541839_-|TlyA-family-RNA-methyltransferase MAKERVDVLAYRQGLFETREQAKRGVMAGLVISAISGLRFDKPGEKIDEEIELRLKGEKLKYVSRGGLKLEKALQVFGISVQDKVTIDIGASTGGFTDVMLQAGARLVYAVDVGTNQLVWKLRQDSRVRSMEQYNFRYAKLADFSEGQPAFASIDVSFISLSLILPALCSLLQEGAEAVALIKPQFEAGREQIGKKGIVKDRLIHEKVIKQVTDTALNCGFIVKGLDFSPIQGGHGNIEFLAHLVKGKDSKAIDDQLIQSLVSSAHKEFKQHEKE >NC_012470.1|WP_012678287.1|1540554_1541025_-|ArgR-family-transcriptional-regulator MKKSERLDLIKKMVLSHEIETQHELLKLLADYGLELTQATISRDMNEIGIVKIPSGTGRYIYGLSQDSGKRVVQRPASIKKTILEMSEKIAGLEQHIHLNVVPGNSKLIKRYLMTDFSGQLFSLIADDDSLLLIAKSEADADHIRQELSLWMQGLV >NC_012470.1|WP_012515249.1|1551708_1551939_-|DUF1797-family-protein MESHLVRIINRLELMVTDGGNLKRNFERDGVVVAEVAFVNDPENGPVFILRDIEARESYSFDSIDLIAMEIYDLLY >NC_012470.1|WP_012678297.1|1552221_1554477_+|ATP-dependent-Clp-protease-ATP-binding-subunit MLCQNCNLNESTIHLYTSINGKQRQIDLCQNCYQIMKTDPKNPILGGYNGNQKAQQPSQNPFFDDFFGDLNNFRAFGQLPNTPPTQSGGQHGGGHNGGYRPNQTQPTQEASKGLLEEFGINITEMAKRGDIDPVIGRDDEIIRVIEILNRRTKNNPVLIGEPGVGKTAVVEGLAQKIVDGDVPQKLQSKQVIRLDVVSLVQGTGIRGQFEERMQKLMEEIRKRHDVILFIDEIHEIVGAGAVGDGSMDAGNILKPALARGELQLVGATTLNEYRIIEKDAALERRMQPVKVDEPSVEETITILKGIQAKYEDYHHVKYSQSAIEAAANLSNRYIQDRFLPDKAIDLLDEAGSKMNLTLNFVDPKDIDKRLIEAENLKTQATRDEDYERAAYFRDQIAKYKEMQAQKLDEQDIPIITDKTIEAIVEQKTNIPVGDLKEKEQSQLVNLAADLKKHVIGQDDAVDKIAKAIRRNRVGLGAPNRPIGSFLFVGPTGVGKTELSKQLAIELFGSADNMIRFDMSEYMEKHAVAKLVGAPPGYVGYEEAGQLTEQVRRNPYSLILLDEIEKAHPDVMHMFLQVLDDGRLTDGQGRTVSFKDTIIIMTSNAGTGKTEASVGFGAAREGRTNSVLGELSHFFSPEFMNRFDGIIEFQPLSKDNLLHIVHLMLDDVNHRLAHNNIRLDVTQKVKEKLVELGYDPKMGARPLRRTIQDYIEDAITDFYLEHPAEKDLRAVLTSNGHIIIKPVVKSQAKQAD >NC_012470.1|WP_012515247.1|1554623_1555070_+|NUDIX-hydrolase MTVPIFGDKIDDQHYTARYGVYAVIPNSAKTEIILVQAPNGAWFLPGGEIETGESQLQALERELVEELGFAADIGYYYGQADEYFYSRHRDTYYYNPAYLYEVTSFQAISKPLEDFNHLAWFPIADAITVLKRDSHRWGVEEWQKKHH >NC_012470.1|WP_012678298.1|1555131_1555434_+|DUF1827-family-protein MRLINTTSSHPELVRNQLQNTDAHLVEVYSAGNTDVIFTQAPKHYELLISNKYRAIKEDELDVIREFFLKRKIDQSIVIPGHSKTLHTNNLIEISFQTSV >NC_012470.1|WP_012678299.1|1555904_1558703_-|isoleucine--tRNA-ligase MKLKETLNLGKTAFPMRAGLPNKEPQWQKAWDEAEIYKKRQALNEGKPVFHLHDGPPYANGNIHVGHALNKISKDIIVRAKSMSGYQAPFVPGWDTHGLPIEQVLAKKGVKRKEMDLADYLEMCRQYALSQVDKQRDDFKRLGVSADWDNPYVTLDPSFEADQIRVFGAMADKGYIYRGAKPVYWSWSSESALAEAEIEYHDIDSTSLYYANRVKDGKGLLDTDTYIVVWTTTPFTVTASRGLTVGPDMDYVVVRPAGSDRNYVVAEGLLDSLAAKFAWESFEILANHKGSDLEYIVTEHPWDSEIDELVILGDHVTLDSGTGIVHTAPGFGEDDYNVGMTYGLEVAVTVDERGLMMENAGPDFHGQFYDKVTPIVIEKLGDLLLAQEVINHSYPFDWRTKKPIIWRAVPQWFASVSDFRQDILDEIDKTTFHPTWGKTRLYNMIRDRGDWVISRQRAWGVPLPIFYAEDGTAIMTKEVTDHVADLFQKYGSIIWWQKEAKELLPEGFTHPGSPNGVFTKETDIMDVWFDSGSSWNGVMNARDHLAYPADLYLEGSDQYRGWFNSSLITSVAVNGHAPYKAILSQGFVLDGKGEKMSKSKGNIISPNDVAKQYGADILRLWVASVDTDNDVRVSMDILGQVSETYRKIRNTLRFLLANTSDFNPHTDKVAYAELAAVDKYMTIKFNKLVGAINAAYERYDFMTIYKAVVNFVTVDLSAFYLDFAKDVVYIEAANSLARRRMQTVFYDILVNITKLLTPILPHTAEEIWSYLEHEPEDFVQLSELPQAQTFDNQDTILEEWEAFMTLRAQAQKALEEARHDKIIGKSLEAHLTIYASPEVKTLLTALDSDIALLLIVSQLTISEEPAPESAVSFDDVAFTVARAQGEVCERSRRIDPTTRMRSYNAFVCDHSAKIIEENFPEAVAEGFDSAAN >NC_012470.1|WP_012678300.1|1558973_1559729_-|DivIVA-domain-containing-protein MALTALEIKDKTFKTKFRGYSEEEVNEFLEIVVDDYEALVRKNRDNEAKIRELEEKLSYFDEMKESLSQSVILAQETAEKVKSSANAEATNLVSKATYDAQHLLDESKAKANQLLRDATDEAKRVAIETEELKRQTRVFHQRLVSAIESQLSLSNSPEWDELLQPTAVYLQNSDAAFKEVVKTVLNEDIPEADDSNSFDATRQFTPEELEELQRRVEESNKELEAYQMQREEQTSEPEVNLSETQTFKLNI >NC_012470.1|WP_012678301.1|1559738_1560533_-|RNA-binding-protein MTVQTMLYQHFQPDEHPFIERMLDLIARVEANYLLEVTDFLNPREVTILKGLVAATNLQCFSSTDYYPSEYGRVIVAPDYYCLDKSDFDLALIEVTYNAKFNQLTHAQILGTLINELGIKRALLGDIFVEIGHAQVMINRQLLSYCLGTIAKIARARVKLKEIDLDQLLNLTTNQQVLADIMVSSLRVDRLIATVLKQSRNQAIRLVEAGKVKVNYQLVTKASQPVAIGDLISIRGYGRFSILTDNGFTKNGKYKLTLSKMMRK >NC_012470.1|WP_014622505.1|1560529_1560787_-|YggT-family-protein MIFILLILLKLIKVYSYLLLAYALLSWFPGAYDSWLGRLVSDIVEPILKPFRSLNLQFAGLDFTIYLVMIGLNVLSEILIRVLIS >NC_012470.1|WP_012678303.1|1560791_1561454_-|cell-division-protein-SepF MAIKDAFNKMISYFDTDGVSEVEEELSSKKQEEPVTKSQQTSRPNQQQQAARASQPQQPKQARPQMQAQQRPQSQSRAAYAERPYQGQSQARVSHDYNDRRATSAPSASSRREQYQHAAHQEQTTIALKYPRKYEDAQEIVDLLIVNECVLIDFQYMLDAQARRCLDFIDGASKVLYGTLQRVGSSMYLLTPSNVSVNIEEMNIPNNGQDIGFDFDMKRR >NC_012470.1|WP_012678304.1|1561466_1562138_-|YggS-family-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MDLQKNKDIVFENIRLATQAANRPENSVSVIAVTKYVDKAVAGQLIDMGIEHIAENRIDKFLDKYEALKDRQVTWHFIGTLQRRKVKEVINKVDYFHALDSVKLALEIEKRADHPVKCFLQVNISEEESKHGFKIAELDAAIEEISKVEKLHLVGIMTMAPIDASQQELRSIFQKANQLRKNLQSKKRKNMPFTELSMGMSNDYPIAIQEGSTFVRIGTSFFH |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_012470_3 | 1604884-1606107 | TypeI |
I-C
Consensus repeat of NC_012470_3
|
18 spacers
spacers of NC_012470_3
>3.1|1604916|35|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT GAAAGGAGTCACAAATGATTAGTTCGCAGTGTCGG >3.2|1604983|35|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT ATGCTAGACATGAGTCTGATGTGAGGCATGCCAAA >3.3|1605050|35|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT CTAACTCCTCCTTACGCTTTGTAGCAGCTTCATCA >3.4|1605117|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAGACCACCATTGATTGAATGTATTTGATCTTTT >3.5|1605183|37|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCCCATCCTCGAAGTAATTCTCCACCTGTTTCATCAA >3.6|1605252|35|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATCCCTACAACGCAAGCCGTTTTTCCACCGTCTCC >3.7|1605319|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTGGGGACTTGGATAAAGGTATCCATATCAAGTC >3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGATAATACTAGATTGCTCATTCAAGTACCCCAC >3.9|1605451|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT GCTCTGTTTGAGTTTGGTGGTAATGGATTATCG >3.10|1605516|35|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATATAAAGCGTTGGGGTTTGTACCCTACCAACAGA >3.11|1605583|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATCTTTAAAAGTAGTTGGAACGACAGGGCTAAA >3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAGCAGCTAAACTCGCTTTTCAAACGGAACAC >3.13|1605714|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATGTTGGTTGGACTGTTCGTCAATGTTTGATTTG >3.14|1605780|36|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGCTCCAAGTAAACCAACTAAGAGAATCGAGAAGAG >3.15|1605848|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAATATCAATCTTGTAATTTGCAAAAAATAGCT >3.16|1605913|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GATATCTTGCAATAGAGCAAGCACCTTAACAAA >3.17|1605978|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAGACGATGCTTATATCGCAGATTACATCAAA >3.18|1606043|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATATGATTGACGGTCAAAAAACGATTGGTTATG |
cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_012470_3
The CRISPR arrays of NC_012470_3 >merge|NC_012470|3|1604884-1606107|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR,PILER-CR ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGACGAAAGGAGTCACAAATGATTAGTTCGCAGTGTCGGATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGACATGCTAGACATGAGTCTGATGTGAGGCATGCCAAAATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGACCTAACTCCTCCTTACGCTTTGTAGCAGCTTCATCAATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGACGAGACCACCATTGATTGAATGTATTTGATCTTTTATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGACCCCCATCCTCGAAGTAATTCTCCACCTGTTTCATCAAATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGACATCCCTACAACGCAAGCCGTTTTTCCACCGTCTCCATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGACCTGGGGACTTGGATAAAGGTATCCATATCAAGTCATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGACCGATAATACTAGATTGCTCATTCAAGTACCCCACATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGACGCTCTGTTTGAGTTTGGTGGTAATGGATTATCGATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGACATATAAAGCGTTGGGGTTTGTACCCTACCAACAGAATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGACTATCTTTAAAAGTAGTTGGAACGACAGGGCTAAAATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGACAAAGCAGCTAAACTCGCTTTTCAAACGGAACACATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGACATGTTGGTTGGACTGTTCGTCAATGTTTGATTTGATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGACTGCTCCAAGTAAACCAACTAAGAGAATCGAGAAGAGATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGACCAATATCAATCTTGTAATTTGCAAAAAATAGCTATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGACGATATCTTGCAATAGAGCAAGCACCTTAACAAAATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGACAAAGACGATGCTTATATCGCAGATTACATCAAAATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGACATATGATTGACGGTCAAAAAACGATTGGTTATGATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC >NC_012470|3|3|1604884-1606107|CRISPRCasFinder ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC GAAAGGAGTCACAAATGATTAGTTCGCAGTGTCGG ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC ATGCTAGACATGAGTCTGATGTGAGGCATGCCAAA ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC CTAACTCCTCCTTACGCTTTGTAGCAGCTTCATCA ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC GAGACCACCATTGATTGAATGTATTTGATCTTTT ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC CCCCATCCTCGAAGTAATTCTCCACCTGTTTCATCAA ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC ATCCCTACAACGCAAGCCGTTTTTCCACCGTCTCC ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC CTGGGGACTTGGATAAAGGTATCCATATCAAGTC ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC CGATAATACTAGATTGCTCATTCAAGTACCCCAC ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC GCTCTGTTTGAGTTTGGTGGTAATGGATTATCG ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC ATATAAAGCGTTGGGGTTTGTACCCTACCAACAGA ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC TATCTTTAAAAGTAGTTGGAACGACAGGGCTAAA ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC AAAGCAGCTAAACTCGCTTTTCAAACGGAACAC ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC ATGTTGGTTGGACTGTTCGTCAATGTTTGATTTG ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC 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ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC ATATAAAGCGTTGGGGTTTGTACCCTACCAACAGA ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC TATCTTTAAAAGTAGTTGGAACGACAGGGCTAAA ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC AAAGCAGCTAAACTCGCTTTTCAAACGGAACAC ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC ATGTTGGTTGGACTGTTCGTCAATGTTTGATTTG ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC TGCTCCAAGTAAACCAACTAAGAGAATCGAGAAGAG ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC CAATATCAATCTTGTAATTTGCAAAAAATAGCT ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC GATATCTTGCAATAGAGCAAGCACCTTAACAAA ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC AAAGACGATGCTTATATCGCAGATTACATCAAA ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC ATATGATTGACGGTCAAAAAACGATTGGTTATG ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC >NC_012470|3|1|1605085-1605450|PILER-CR ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC GAGACCACCATTGATTGAATGTATTTGATCTTTT ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC CCCCATCCTCGAAGTAATTCTCCACCTGTTTCATCAA ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC ATCCCTACAACGCAAGCCGTTTTTCCACCGTCTCC ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC CTGGGGACTTGGATAAAGGTATCCATATCAAGTC ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC CGATAATACTAGATTGCTCATTCAAGTACCCCAC ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGACGCTCTGTTTGAGTTTGGTGGTAATGGATTATCGATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC ATATAAAGCGTTGGGGTTTGTACCCTACCAACAGA ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC TATCTTTAAAAGTAGTTGGAACGACAGGGCTAAA ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC AAAGCAGCTAAACTCGCTTTTCAAACGGAACAC ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC ATGTTGGTTGGACTGTTCGTCAATGTTTGATTTG ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC TGCTCCAAGTAAACCAACTAAGAGAATCGAGAAGAG ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC CAATATCAATCTTGTAATTTGCAAAAAATAGCT ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC GATATCTTGCAATAGAGCAAGCACCTTAACAAA ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC AAAGACGATGCTTATATCGCAGATTACATCAAA ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC ATATGATTGACGGTCAAAAAACGATTGGTTATG >NC_012470|3|2|1605484-1606107|PILER-CR GAGACCACCATTGATTGAATGTATTTGATCTTTT ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC CCCCATCCTCGAAGTAATTCTCCACCTGTTTCATCAA ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC ATCCCTACAACGCAAGCCGTTTTTCCACCGTCTCC ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC CTGGGGACTTGGATAAAGGTATCCATATCAAGTC ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC CGATAATACTAGATTGCTCATTCAAGTACCCCAC ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGACGCTCTGTTTGAGTTTGGTGGTAATGGATTATCGATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC ATATAAAGCGTTGGGGTTTGTACCCTACCAACAGA ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC TATCTTTAAAAGTAGTTGGAACGACAGGGCTAAA ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC AAAGCAGCTAAACTCGCTTTTCAAACGGAACAC ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC ATGTTGGTTGGACTGTTCGTCAATGTTTGATTTG ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC TGCTCCAAGTAAACCAACTAAGAGAATCGAGAAGAG ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC CAATATCAATCTTGTAATTTGCAAAAAATAGCT ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC GATATCTTGCAATAGAGCAAGCACCTTAACAAA ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC AAAGACGATGCTTATATCGCAGATTACATCAAA ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC ATATGATTGACGGTCAAAAAACGATTGGTTATG ATTTCAATCCACTCGCCCGCAAAGGGCGAGAC
>NC_012470.1|WP_012678335.1|1602302_1603013_-|thiol-disulfide-oxidoreductase-associated-membrane-protein-CcdA2 MELTMLLMVSVFIAGLLSFFSPCIFPVLPVYLGILLDSDDSRSITIFGKKLYWYGIVKTLAFISGLSTIFVILGYGAGLLGNILYAAWFRYLLGAFVILLGIHQMEIVTIKKLQFQKSVAFQNKKDRNAVLNAFLLGITFSFGWTPCVGPVLSSVLALAASGGSGAWQGGFLMIIYTLGLGLPFLLLSFASGIVLKHFNKLKPHIPLLKKLGGLLIVVMGLLLMTGNLNSLSGLFE >NC_012470.1|WP_012678334.1|1601638_1602289_-|TlpA-family-protein-disulfide-reductase MKKTTLLTTGLACLALLTACSAKDKMAMNDNKKDHMTMTDDKSKMKKDQKDMMSDKKDMMSDDKHMSDADKASKNDGQMAPDFELKSIDGKTYRLSDFKGKKVYLKFWASWCSICLSTLGDTQSLATMKDKDFEVLTIVSPGHQGEKSEADFKKWFEGTDFKDLPVLLDPDGKLLEAYGVRSYPTEIFVGSDGVLAKKHIGYAKKSEIEKNLKEIK >NC_012470.1|WP_012678333.1|1600508_1601621_-|peptide-methionine-(R)-S-oxide-reductase-MsrB MEHKWKLLLLVFGALVFLGGVLMVFQRGYATSYHNNQVKLPAKGTSQLKKTANAKLPEKKKEIYLAGGCFWGVEEYFSNVDGVLDAVSGYANGRGDTTSYQLLHQTGHAETVQVVYDANRISLKELLLHYFRIIDPTSLNKQGNDRGSQYRTGVYYTDPSDLTTIDMVFQEKASDYKKKIVVEKAPLKSFTKAEEYHQDYLKKNPNGYCHINVNEASYPVIDKTKYPKPSKEEIKKKLSKDEYRVTQNNETEKAFSNRYWDSFEAGIYVDVVTGEPLFSSKDKFESGCGWPSFSRPISPDVLRYKTDKSFNMNRTEVRSRSGNSHLGHVFTDGPKDQGGLRYCINSLSIRFIPKAEMEAKGYGYLLTAVD >NC_012470.1|WP_012678332.1|1599500_1600241_-|response-regulator MYSLLIVEDEYLVRQGIRSLVDFDQFAIDRIAEAENGQVAWELFQENPYDIVLTDINMPKLNGIQLAELIKTRAPKTHLVFLTGYDDFNYALSALKLGADDYLLKPFSKSDVEEMLKKLKQKLEKLKKTEALQKLVDKPQQEGSEIKLAIQERLADSSLTLKSLSSQLGFSPNYLSVLIKKDLGLPFQDYLIQERLKKAKLLLLTTDLKVYEIAEQVGFEDINYFSQRFKQLVGMTPRQYKKGDGQ >NC_012470.1|WP_012678331.1|1597785_1599504_-|sensor-histidine-kinase MKRYPLLVQLVSYFFLIVISLITILGLIYYQTSSHNIRQLIERETRQSIRQSSQFIDAYIKPLKETTSALASHAEIQSFAKAANSSHQEQVLALMTTVLSTNSDLLSAVLVTKDGRMVTTNPKLIMTTSHDMMAEPWYKSAIDRKAMPVLTPARQLSSHSKKDWVVSVTQEVVDQAGNNLGVLRLDIGYNTIKSSLDQLQLGRKGFAFIVNDKHEFVYHPKNTVYSSAKEMAAMKPYLAVTDGYTRPKDYFVYQRVIPDSQWTLVGVASLDQLYHVQRQIFWSFLGTGLLATVICGLGTVFVLRSWIGPIRRLQALILAIQKGNRQLRAEEIGSPELADLARQFNAMLDQIDSLMVSVADKEKAIGQYRLQALASQINPHFLYNTLDTIIWMAEFNDSQRVVEVTKSLAKYFRLALNQGNELISLADELDHVRQYLFIQKQRYGEKLHYEIKGLEKYQDFMIPKLILQPLVENAIYHGIKEVDRPGVIRVTVSETDQHVVLSVWDNGKGMSLTDDSSQALLERGGVGLKNVDQRLRLQYGHLYRMAITSEQAVFTEIKLYLPKALDSLDEAP >NC_012470.1|WP_012678330.1|1596657_1597746_-|MmcQ/YjbR-family-DNA-binding-protein MSLESDYFKRKSPVFEALIPYGFTQEGDTYCYQESFMEGNFKALITIKSSGQLSARVIDTDLGEDYLPLRNDRQQGVYVGQVRQAYLELLGRLSAACFRSTPFQTRQANQVATSISQQWNDPLDYPFEKFPNIATYRVSGKWYAMVLPLLADKLGQVPKVLQGQMVEVLTVRIAPNQLTHLLQQRGVYPAYHMSKKTWISLLLDGTLADDQLWELVTKSRQLANPNGLANPDGPDYWVIPANLSYYDIDAEFAANPDILWTQKASIKAGDYVFIYITAPTRSIRYACQVLRSDIPNQGYRKNAKIKTLMSLRLLHCYEDGLISLDLMKQYGVNAVRGPRRLSPQLVAFLKEKEYFKDVKQKE >NC_012470.1|WP_012678329.1|1595938_1596643_-|B3/4-domain-containing-protein MTQFIADQSFWELFPDAKLGVLLLKDYDNQEKSPQEVKQLLADSHDMAKQYLTEESFSDNEIIQVYRQAYQRFKTKKGARSSIEALLKRVANGQVLSSINPLVDIYNAASLRFGLPVGAEDSDCFVGDLRLTLTEGGDEFYLIGDSKNSPTLPNELCYKDDAGAVCRCLNWRDGERTMITDRTKNAFLIIEALDSKTQARLQDALKFIEDKAKCYLKAETALYTLDQASPSITL >NC_012470.1|WP_012678328.1|1595190_1595679_-|prolyl-tRNA-synthetase-associated-domain-containing-protein MELFDKVDDTLKALAIDYQLVEHEPALTTEQADQFIEGIEGVRTKTMFLTTRKKNHFYLVIMDDTKRLDMNRFKELVGEKQIKMASAECLLAKMQLPPGVVSPFGLLNNEDKDIQVYVDKAIAHEARMSFHPNTNDKTIFIQTDDLFKFLAAIGYAVNIVDL >NC_012470.1|WP_041790542.1|1594209_1594680_+|arginine-repressor MKKETRHQLIRSLISETTIHTQQELQERLRKNGISITQATLSRDMKELNLVKVTTGNDTHYEALAISQTRWEHRLRFYMEDALVMLRVVQHQIILKTLPGLAQSFGSILDAMQISEIVATICGDDTCLIICEDNEQAKACFEILSHYTPPFFFSNK >NC_012470.1|WP_012678327.1|1593384_1594065_-|Crp/Fnr-family-transcriptional-regulator MIRREDYQYLRKLDDFCHFSIEQFDKIVGQMEFRQAKKDHMLFFEGDKRDRLFLVTSGYFKIEQSDRTGTFTYTDFIRHGTIFPYGGLFTDDYYHFSVVAMTDVTYFYFPTDLFEDYSLHNQQQMKHLYSKMSSLLELHELKVRNLITSSASSRVIQSLAILLVEMGKDSDTLPFQLTTTDIAQMSGTTRETVSHVFRDLKKSGLIAVKGKYLTYLDKNYFLQYTT >NC_012470.1|WP_012515202.1|1606254_1606548_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MMVLVTYDVNTETASGRKRLRQVAKLCVDYGQRVQHSVFECSVTPAEFVEIKHKLTTIIDTEVDSIRFYLLGKHWQNRVETLGRSDSYDPDIGVLLL >NC_012470.1|WP_012678338.1|1606558_1607584_-|type-I-C-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKLLNTLYLTQEDYYITKEGDNIVIKQDGKTVSRFPFRIIDGVVCFSYLGASPALIKLCTENQINLSFHTPQGRFCGRYVGATNGNVLLRREHYRLADRDESLEYAKRFILAKISNARKYLLRFRRDHRDQIDGKLFEEVNGELIWALEMVQATDNKDSLRGIEGQAANQYFRIFNDLVLTDKKAFTFGGRSKRPPLDRVNALLSFGYSLLTFECQSALEAVGLDSYVGFFHTDRPGRASLALDLVEEFRSYIVDRFVFSMINKGQLTKKHFDVKENGSILLTEKGRVTFIELWQKRKHMEVEHPFTKEKVKLMLLPYVQAQLLAKAIRGDIDSYPPFMI >NC_012470.1|WP_012678339.1|1607580_1608252_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MVYVEDDYLMLSGIQHFQFCKRQWALIHIDQQWADNEATVHGQILHTRADNPYIREKRKDFFLSRAMHISSACLGLYGIMDVVEFYKDDLGVTVKGKRGRWLPRVVEYKRGKPKKDRRDIVQLVAQTMCLEETLNCQIAEGSLYYHSVNKKVQIAITDELRREVQELANQMHRFYGAKELPKAEYFKNCQLCSLVEVCKPRISKKVRNVDHYIAAAMVSEEII >NC_012470.1|WP_012678340.1|1608253_1609102_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csd2 MLEHKIDFMVTVEVKEANANGDPLSGNMPRTNAKGYGLMSDVSIKRKIRNRLQDMGQSIFVQANERIEDEFRSLENRFSAQFDKNDKDDDIERRANELWLDVRSFGQVFTYLKKSIGVRGPVSISMAKSLEPVVISSLQITRSTNGMEPKGDSSRSSDTMGTKHFVDYGIYVIKGSINAHFAEKTGFSEEDADIIKQALVSLFENDASSARPEGSMRVREVFWFTHSSKLGNVSSARVFDLLVFDMETPDKDCYEAYGIHLDEEKLAAYQAKGLTVEVLEGL >NC_012470.1|WP_012678341.1|1609102_1610986_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1 MDFFTSLLRAYEHAEDIGLVDNQEQSGTILLPIYHTNRRSNGKDTIVVQLDKTGQFMKAEYLADGETIIFPVTAESVARSGKNPAPHPLVDKLTYFVSEHNQEQYESYHQQLEGWINACQDKQVMSYLSLIQQFILKEDFLDLICQSLFGKRLSRNGLKVTYALSEEKEKTVDLSACFLTFQIAQFIGFKTVSVTNFTALHKDYIAYLMSKQTANTICNISGQKEVLATKHRGLLGNAKLISVSNHAEAYKGRFRERDDVFRVGNQTSEKLHLMAKYFLEHEQTHVWLGSGQHMINWFSDDLANDSQLNITQALLLDPFDDEETFLSTPMISEENKSINRSFITGQRQFSDSASYYIAILNKTNDGRIALKYFRQLQASSLLKNLAVWQENYSWELQRKGNQFVQKLPSFKEIILAAYGVDRDRSLELDNDNFRSDQYQRLVTSLIDGKPLPDTIVKKLEANIKQRQKYRKHWHQVEHISLAILHKQNGEEFTPMLDRDNTNRSYLFGRLLGIYELIEKSRNNSKGRAKDELKRITNAERYWTAYANRPASLMRNLEDKIYPYSEYLKINEAGLWSKLEKEREEIIALLTSSLETTDFNKPLDYRFIFGYYAEKKYFYTPKDESEDA >NC_012470.1|WP_080332787.1|1610985_1611705_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas5 MRVRGELALFTNPATKGSSERSSYSVPTRQALQGIVDAVYHKPTITNVVTEVKVINQIQTELHGTRALLKDYGADLSYVSYLSDVEYLIKYHFVWNENRPDLVKDRLPNKHEAIMERSLRKGGRRDVFLGTRECLGLVEAISQEEYETAQIASEHANQEIDLGIMFHSFAYPTDRKEPLRSYFTRTVMTNGTIHFKEQAECEIVNTLSSYTFKAAGPIKPVEEEFEGYQLDTIREAGGQ >NC_012470.1|WP_012678343.1|1612459_1614913_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MILAHYQGKTDLEPAKEQSLEEHSFQVAELARTAATSIKQGDLVFLLGLFHDLGKAEYRFQEKLLKKPNSHVDHAYAGARYLYDEIGRVLSDYIRQYPDHKPLVLYFRDIISYVISAHHGMYDLRMTEPAEEASRFAYNKLLHRMFQERPGYHYQKDVFTFVEVLEQSLPRYGYDHLADLITRAFYNFQLAWDKLDMADTSEQDYYSGCFVRLYLSLLKNADVLDTINAYETVIEPLTEEKQEELRISYLEAVESLYASLGQSRLRLNAIRNKLAERVKGRGREDSTGIYRLNLPTGAGKTNLSLRYATHQMVYQQKKHFFYVTPFLSVLEQNALAMKQVIGEEGVLEHHSNVVREIDNANQNNDDTDEDRDSLQREYLIDSWDSPVVLTSMVQFFQTLFKTRSAHLRRFSSLMDSVVILDEVQSLPIEVTTLFNLTMTFLSRVMQTTLVLCTATQPAYDSESITHTLTYGGSKAEEADIVTVTDEEQLVFARTELCKLSDSDEKTSLVELAQTILEQEMSTLVILNTKPAVERLYQLLRDQTERPLYQLSTNMCPKHRLDVIAEIKSRLPNNVPLICVSTQLIEAGVDIDFERVIRSYAGIDSIVQAAGRCNREGRCPIGQVLLVNLTDDEENLSYLKEIKHKKDATETILYQKTSPIDIAALNEAFFNCYYENNKKRLDYPLGDNESVYQYLSSNAPSNIKKGKLRQAFKTAGQKMDLIQDQSIGVFVYYDDGVGRERLEALEEQLLKSSYPSSEELKAIKAELKALQPYTITLRDNHELLKATRSYLSGQILILQEHYYNQTFGLTKEADSFIL >NC_012470.1|WP_086934940.1|1615369_1615963_-|hypothetical-protein MIYKENYIHWLTNFLGASLVSKGDNVSVSDGVDIIYCMEKREDKYDISISERGKVITQYRVLNSKLARLYYILLVKKALTTIEYPLLNSIGDIDSEELLRAQLNSEGLENYYSINKNGIGKVNFQNIGKDRLYYLDNKNNAYDIFFVSSKVLSVFYTSIVRLKWYEKWIEQLSSIEDISSDLYPVLLGFSHEGIEIL >NC_012470.1|WP_012678345.1|1615963_1616335_-|TNT-domain-containing-protein MARDNGDPNLDRFLNGEFNNTKLQSGKKIDRFGSNYGSFFGEVGDSRALRAMSPNSDFSNYNQYEVLEELPVREGKIAPWFDEPGGGRQYKLDSDFVNQRQPLLQDGTPLIDKLIELGYLRRI >NC_012470.1|WP_154231321.1|1616411_1616561_-|hypothetical-protein MNELPTSKSFIDGMSPEDSQRYIQWHKYAKAGIEPVDRLRLMGWDRPPH |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_012470_4 | 1734698-1734768 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_012470_4
|
1 spacers
spacers of NC_012470_4
>4.1|1734721|25|NC_012470|CRISPRCasFinder GGTGGTTATCACAGATGGCTGGCAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_012470_4
The CRISPR arrays of NC_012470_4 >merge|NC_012470|4|1734698-1734768|CRISPRCasFinder ACTATCTTTGAAAAGCCACAGGAGGTGGTTATCACAGATGGCTGGCAAACTATCTCTGAAAAGCCACAGGA >NC_012470|4|4|1734698-1734768|CRISPRCasFinder ACTATCTTTGAAAAGCCACAGGA GGTGGTTATCACAGATGGCTGGCAA ACTATCTCTGAAAAGCCACAGGA
>NC_012470.1|WP_012678429.1|1733336_1734062_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLNIENVTGGYLNIPVLKDISFSVGNGELVGLIGLNGAGKSTTINEIIGFLKPYKGRISIDGLTLAEHEADYRKKIGFIPETPSLYEELTLAEHINTVAMAYDIDVELAHKRAEPFLELFRLTDKLDWFPVHFSKGMKQKVMIICAFVIDPSLFILDEPFLGLDPLAIADLIKALEVEKAKGKSILMSTHVLDSAEKMCDRFVILHQGQVRAQGTLADLQAVFGDASASLNDIYLALTKEG >NC_012470.1|WP_012678428.1|1732298_1733333_-|ABC-transporter-permease MKALFRKRRQEFQHKHTKYLPYVFNDHFVLVLLFLLGFILFQYSQLLKHFPVNPLPIQLGLLIAVLFLLNLGSVATYLERADQHFLLTKEAEVIAHIRSAERLSFILWSSLQTVLLLLLFPLFQRLGVSLLAFVLMLGILVLVKRLLLKRKVASFLSSKGLDWEKAIAFEADRQQAILKFYALFTNVKGISTKVKERPYLNPILKLVKADSKKVWTNLYLRAFLRSSDYLGLFLRLLLLSSLALAFISNPYLAVGLALVFHYLSLFQLLSLYHHYDYHYMSGLYPTKPQHKQRNLLSLLRQLSGLMLIVNLVLCRSWQNALVLIVAMGLLNLLYLPYKLKKMID >NC_012470.1|WP_012515084.1|1731444_1732236_-|phosphotransferase-family-protein MTTTEQDLVLTPLRGKSGKAYKGTYPNGESVFIKLNTTPILPALAKEQIAPQLLWAKRMGNGDMMSAQEWLNGRTLTREDMNSKQIVHILLRLHKSKQLVNQLLQLNYKIENPYDLLVDFEQNAPLQIQQNSYLQAIVKELKRSLPEFRSEVATIVHGDIKHSNWVITTSGMIFLVDWDCVRLTDRMYDVAYLLSHYIPRSRWADWLSYYGYKNNDKVMQKIIWYAQFSYLTQILRCFDKRDMEHVNQEIYALRKFREMFRKK >NC_012470.1|WP_012678427.1|1730809_1731445_-|tRNA-(guanosine(46)-N7)-methyltransferase-TrmB MRVRKRKGAQEHLENNPHYVILEPEAAKGRWCEVFGNDHPIHIEVGSGKGAFITGMALKNPEINYIGIDIQLSVLSYALDKVLASQAPNVRLLRVDGSSLTNYFDAGEIDMMYLNFSDPWPKSRHEKRRLTHRSFLDTYKQILPENGEIHFKTDNRGLFEYSLASFSQYGMTLKQVWLDLHASDYQGNVMTEYEARFAKKGQVIYRLEATF >NC_012470.1|WP_042670147.1|1728983_1729466_-|ribosome-maturation-factor-RimP MNIANTAIIDIVTQTVEPVIKAPYELVDIEYDKMGSDYVLSILVDKASGITVEDTAELTELISPLLDTISPDPFPDQYMLEVSSPGLERPLKTAESLKAAVGSYINVSLYRAIDKVKVFQGDLVAFDGDTLTIDYLDKTRHKTVEIPYQAVAKARLAVKL >NC_012470.1|WP_012515088.1|1727719_1728874_-|transcription-termination/antitermination-protein-NusA MSKEMLEAFRILEEEKHIDKADIIEAVTESLKSAYKRRYGQAESCVIEFNDKTADFQVFTVREVVEEVFDSRLEISLNDALAISSAYELGDKIRFEESVSEFGRVAAQSAKQTIMERMRRQMREITFNEYKQHEGEIMTGTVERFDQRFIYVNLGSLEAQLSHQDQIPGETFKSHDRIDVYVYKVENNPKGVNVFVSRSHPEFIKRIMEQEIPEVFDGTVEIMSVSREAGDRTKVAVRSHNPNVDAIGTIVGRGGSNIKKVISKFHPKRYDAKTGLEIPVEENIDVIQWVDDPAEFIYNAIAPAEVDMVLFDDDDLKRATVVVPDNKLSLAIGRRGQNVRLAAHLTGYRIDIKSASEYERLEAEKEAAMTEAVATEELLTNEEV >NC_012470.1|WP_012678426.1|1727407_1727704_-|YlxR-family-protein MPKVKKIPLRKSLVSGEIIDKRDLLRIVKNKEGQIFIDPTGKQNGRGAYIKLDNQEALMAKKKQVFNRSFSMEVPESFYDEVIAYVDHKVKRRELGLE >NC_012470.1|WP_012678425.1|1727112_1727415_-|YlxQ-related-RNA-binding-protein MNSLNRLSHLIGLAQRAKKVISGEELVIKAIRHQEVNLVFLANDAGPNITKKVTDKSNYYNVEVSTVFSALELSAALGKPRKVVAIADAGFSKKMRTLMK >NC_012470.1|WP_012678424.1|1724213_1727093_-|translation-initiation-factor-IF-2 MSKKRLHEIAKEIGKSSKEVVERAKSLGLDVKSHASSVEEADANKIASSFSAGVTKNVQAGSAKDKQVAEQKAKAAKATTPQPAASKAAEKPAAATQEASQPVAVKPKSRNFKAEREARAKEQVARRQAGQNRSNDRKSDYRQLGRSQGQQTERAGHKSQNQQRDRRFDNRPSSGNNRNDGHRQAGNRDKNRSFNANSRQQDIGRQGQTQAGAPKIDFKARAAALKAEQNAEYARQRESRFREQEEAKRLEQQARQEAKAAALKAQTEDKKHREAPAKATEPAEPVASMAAAPVAKPVDKRRKKQNRPDKAHDRDHGLEDGQKKNKKSWNSQNQVRNQKNSNWNNNKKNKKGKHHKNSNTAPKPVTERKFHELPKEFEYSEGMTVAEIAKRIKREPAEIVKKLFMMGVMATQNQSLDGDTIELLMVDYGIEAKAKVEVDEADIERFFTDDNYLNPDNIVERAPVVTIMGHVDHGKTTLLDTLRNSRVATGEAGGITQHIGAYQIEEAGKKITFLDTPGHAAFTSMRARGASVTDITILIVAADDGVMPQTIEAINHSKAAGVPIIVAINKIDKPGANPERVISELAEHGIISTTWGGECEFVEISAKFNKNIDELLETVLLVAEVEELKADPTVRAIGTVIEARLDKGKGAVATLLVQQGTLHVQDPIVVGNTFGRVRAMTNDLGRRVKSAEPSTPVSITGLNETPMAGDHFAVYADEKAARAAGEERAKRALLKQRQNTQRVSLDNLFDTLKAGEIKTVNVIIKADVQGSVEALAASLLKIDVEGVRVNVVHSAVGAINESDVTLAEASNAVIIGFNVRPTPQARQQADADDVEIRLHSIIYKVIEEVEEAMKGKLDPEYQEKVLGEAIIRETFKVSKVGTIGGFMVVNGKVTRDSSVRVIRDSVVIFDGKLASLKHYKDDVKEIGNAQEGGLMIEGFNDIKVDDTIEAYVMEEIIRK >NC_012470.1|WP_012515093.1|1723673_1724024_-|30S-ribosome-binding-factor-RbfA MTNHRIDRVGMEIKREVNEILHKKVRDPRVQGVTITEVQMLGDLSVAKVYYTIMSDLASDNQKAEIGLKKATGTIKRELGKQLTMYKIPDLVFEKDNSIAYGNKIDQLLRELEKKQ >NC_012470.1|WP_012678431.1|1735453_1735873_+|HIT-family-protein MENCIFCSIISGEIPSSKVYEDEQVLAFLDISQTTVGHTLLIPKKHVRNILAMDAETAGQTFERLPKIARAIQRATGATAMNIINNNEELAGQTVFHAHVHLVPRYSQEDGIAIQYTTHEPDFPALAALAQHISQEISQ >NC_012470.1|WP_012678432.1|1735869_1736166_+|hypothetical-protein MTLKTMATIGLTSVLAYQVYRKRHQIKETLVAMKTSKKAIQADVDRIKANIAIIQKEARTLQAAGTELAYKWQAFNQEAQAHLTEIQKHMSKYQQETP >NC_012470.1|WP_012678433.1|1736335_1737598_-|LCP-family-protein MKIGKKIFLMLTAIVLLTLGAMGVYLTNAYTFSTGELSKTFKDFTTSSKKSDAIQQTEPFSILLMGVDTGSSHRTSTWQGNSDSMILVTINPKTKKTTMTSLERDILITLSGPNDNEMNGAEAKLNAAYAAGGAQMAIMTVQDLLNITIDKYVQINMQGLIDLVNAVGGITVTNEFDFPISIADNEPEYQATVAPGTHKINGEQALVYARMRYDDPEGDYGRQKRQREVIQKVLKKILALNSISSYRKILSAVSGNMQTNIEISSRTIPNLLGYTDALKNIKTYQLKGEGATLSDGGSYQIVTSDHLLEIQNRIRAELGLEKLSQLKTTATVYENLYGSLKTQSTQDSSYYYNSGSLPAYTDSSPQYSTYSSETSSSSTYQDTTAGTQESGAANVTPSPQADSPAEQQSSGTTSGTSAAP >NC_012470.1|WP_012678434.1|1737598_1738126_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MSEQVVTIEEAKASEASALITLIKEAADETDFIIGTEDIIAATIEELECFLEASQESLTDICLLLRVGDTLAGLLNIAGKAYRETSYVGDCFMLVLKPYRNHGLGQLLMETALDWARETKQLCALELEVQARNTCAYHIYEKYGFRIEGVKRKDVKSRNGDYQDVYLMCKYLERE >NC_012470.1|WP_012678435.1|1738118_1738562_-|tRNA-(adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase-complex-ATPase-subunit-type-1-TsaE MFYSKNENELIAYGQGIGRQLKAGDVLVLTGDLGAGKTTLTKGIAKGLGIDQMIKSPTYTIAREYEGRLPLYHLDVYRIGDDPDSIDLDDFIFGSGVTVIEWGELLAKGTLHDYLEILITKTAAGRQVDYLAHGYRSEALLEELKHV >NC_012470.1|WP_012678436.1|1738927_1740388_-|NCS2-family-permease MEKFFKLKENGTTVSTELMAGVTTFFAMSYILFVNPSILSAAGMPSQAVFLATIIAAAISTLIMGLFANVPYALAPGMGLNAFFTYTVVFSLGFSWQEALAIVFLCGLFNIFITVTKLRKSIIKAIPVSLQHAIGGGIGVFVAYLGFKNANLITFSLSSAEIVTVNGVEPAKATAETFANGVFSVNANGGVVPAISTFTDPSVLLAVFGLLLTAVLVLKNVRGAILIGITVTTLAGIPIGVVDLSAVNFADNHISSAFAELGTTFLAAFGGMASLFSDSSRLPLVLMTIFAFSLSDTFDTIGTFVGTGRRTGIFSEEDERALENSSGFSSKMDRALFADAIGTSIGALFGTSNTTTYVESAAGIAEGGRTGLTAVSTAVCFVLSVLLLPIVGIVPAAATAPALIIVGVMMVSSFLDVDWSDFDVALPSFFAAFFMALCYSISYGVAGSFIFYCLVKLVKGKTKEIHPILWGATFLFVLNFIILALL >NC_012470.1|WP_012678437.1|1740646_1741459_+|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MTKKLIAIDLDGTLLHHDNTISTYTQKTIKAVQAKGHEVIISTGRPYRMAIDYYLQLELKTPMISFNGSLTHLPEQRWKYEHNVTLDKAYLLKLLAVQEDFQMDFIASEYRKAFYITMNRPESIDPNLFGVEAITPDMALQIDKITQDPNALLMQTHHEDKYALAKAMRAFFKDEIEVDSWGGPLNILEMSPKNINKAYALKYLLSIYNKEPKDLIAFGDEHNDTEMLAFAGTGYAMKNASPVLLPFADQQLAYSNEEDGVARKLEELFL >NC_012470.1|WP_012678438.1|1741810_1742803_+|PTS-mannose-transporter-subunit-IIAB 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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NC_012470_3 | 3.4|1605117|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1605117-1605150 | 34 | MK448957 | Streptococcus phage Javan484, complete genome | 46074-46107 | 0 | 1.0 |
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NC_012470_3 | 3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1605385-1605418 | 34 | MK448969 | Streptococcus phage Javan514, complete genome | 10927-10960 | 3 | 0.912 |
NC_012470_3 | 3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1605385-1605418 | 34 | MK448972 | Streptococcus phage Javan520, complete genome | 7981-8014 | 3 | 0.912 |
NC_012470_3 | 3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1605385-1605418 | 34 | MK448763 | Streptococcus phage Javan451, complete genome | 9174-9207 | 3 | 0.912 |
NC_012470_3 | 3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1605385-1605418 | 34 | MK448774 | Streptococcus phage Javan487, complete genome | 8041-8074 | 3 | 0.912 |
NC_012470_3 | 3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1605385-1605418 | 34 | MK448778 | Streptococcus phage Javan493, complete genome | 9976-10009 | 3 | 0.912 |
NC_012470_3 | 3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1605385-1605418 | 34 | MK448773 | Streptococcus phage Javan485, complete genome | 10927-10960 | 3 | 0.912 |
NC_012470_3 | 3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1605385-1605418 | 34 | MK448777 | Streptococcus phage Javan491, complete genome | 8272-8305 | 3 | 0.912 |
NC_012470_3 | 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1605649-1605681 | 33 | MK448709 | Streptococcus phage Javan231, complete genome | 25718-25750 | 4 | 0.879 |
NC_012470_3 | 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1605649-1605681 | 33 | MK448710 | Streptococcus phage Javan233, complete genome | 25718-25750 | 4 | 0.879 |
NC_012470_3 | 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1605649-1605681 | 33 | MK448707 | Streptococcus phage Javan227, complete genome | 27915-27947 | 4 | 0.879 |
NC_012470_3 | 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1605649-1605681 | 33 | KX879641 | Streptococcus phage CHPC577, complete genome | 7481-7513 | 6 | 0.818 |
NC_012470_3 | 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1605649-1605681 | 33 | MH892371 | Streptococcus phage SW25, complete genome | 7718-7750 | 6 | 0.818 |
NC_012470_3 | 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1605649-1605681 | 33 | MH892372 | Streptococcus phage SW26, complete genome | 7718-7750 | 6 | 0.818 |
NC_012470_3 | 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1605649-1605681 | 33 | KX879642 | Streptococcus phage CHPC926, complete genome | 7104-7136 | 6 | 0.818 |
NC_012470_3 | 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1605649-1605681 | 33 | MH892368 | Streptococcus phage SW20, complete genome | 7718-7750 | 6 | 0.818 |
NC_012470_3 | 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1605649-1605681 | 33 | KU678389 | Streptococcus virus 9871, complete genome | 7659-7691 | 6 | 0.818 |
NC_012470_3 | 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1605649-1605681 | 33 | MH892350 | Streptococcus phage SW16, complete genome | 7484-7516 | 6 | 0.818 |
NC_012470_3 | 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1605649-1605681 | 33 | MH892374 | Streptococcus phage SW28, complete genome | 7715-7747 | 6 | 0.818 |
NC_012470_3 | 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1605649-1605681 | 33 | KU678391 | Streptococcus virus 9873, complete genome | 7659-7691 | 6 | 0.818 |
NC_012470_3 | 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1605649-1605681 | 33 | MH892369 | Streptococcus phage SW22, complete genome | 7715-7747 | 6 | 0.818 |
NC_012470_3 | 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1605649-1605681 | 33 | NC_031023 | Streptococcus virus 9874, complete genome | 7684-7716 | 6 | 0.818 |
NC_012470_3 | 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1605649-1605681 | 33 | NC_031094 | Streptococcus virus 9872, complete genome | 7660-7692 | 6 | 0.818 |
NC_012470_3 | 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1605649-1605681 | 33 | MH892370 | Streptococcus phage SW23, complete genome | 7715-7747 | 6 | 0.818 |
NC_012470_3 | 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1605649-1605681 | 33 | MH892365 | Streptococcus phage SW17, complete genome | 7718-7750 | 6 | 0.818 |
NC_012470_3 | 3.9|1605451|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT | 1605451-1605483 | 33 | NZ_CP049914 | Vibrio sp. HDW18 plasmid p_unnamed1, complete sequence | 594371-594403 | 7 | 0.788 |
NC_012470_3 | 3.15|1605848|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1605848-1605880 | 33 | NC_047897 | Lactobacillus phage Lenus, complete genome | 31307-31339 | 7 | 0.788 |
1. spacer 3.4|1605117|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448864 (Streptococcus phage Javan180, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gagaccaccattgattgaatgtatttgatctttt CRISPR spacer gagaccaccattgattgaatgtatttgatctttt Protospacer **********************************
2. spacer 3.4|1605117|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448941 (Streptococcus phage Javan446, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gagaccaccattgattgaatgtatttgatctttt CRISPR spacer gagaccaccattgattgaatgtatttgatctttt Protospacer **********************************
3. spacer 3.4|1605117|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448957 (Streptococcus phage Javan484, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gagaccaccattgattgaatgtatttgatctttt CRISPR spacer gagaccaccattgattgaatgtatttgatctttt Protospacer **********************************
4. spacer 3.7|1605319|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448701 (Streptococcus phage Javan197, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctggggacttggataaaggtatccatatcaagtc CRISPR spacer ctggggacttggataaaggtatccatatcaagtc Protospacer **********************************
5. spacer 3.7|1605319|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448869 (Streptococcus phage Javan190, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctggggacttggataaaggtatccatatcaagtc CRISPR spacer ctggggacttggataaaggtatccatatcaagtc Protospacer **********************************
6. spacer 3.7|1605319|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448870 (Streptococcus phage Javan192, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctggggacttggataaaggtatccatatcaagtc CRISPR spacer ctggggacttggataaaggtatccatatcaagtc Protospacer **********************************
7. spacer 3.11|1605583|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448864 (Streptococcus phage Javan180, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tatctttaaaagtagttggaacgacagggctaaa CRISPR spacer tatctttaaaagtagttggaacgacagggctaaa Protospacer **********************************
8. spacer 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448864 (Streptococcus phage Javan180, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aaagcagctaaactcgcttttcaaacggaacac CRISPR spacer aaagcagctaaactcgcttttcaaacggaacac Protospacer *********************************
9. spacer 3.13|1605714|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448862 (Streptococcus phage Javan178, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atgttggttggactgttcgtcaatgtttgatttg CRISPR spacer atgttggttggactgttcgtcaatgtttgatttg Protospacer **********************************
10. spacer 3.16|1605913|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448701 (Streptococcus phage Javan197, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gatatcttgcaatagagcaagcaccttaacaaa CRISPR spacer gatatcttgcaatagagcaagcaccttaacaaa Protospacer *********************************
11. spacer 3.16|1605913|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448869 (Streptococcus phage Javan190, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gatatcttgcaatagagcaagcaccttaacaaa CRISPR spacer gatatcttgcaatagagcaagcaccttaacaaa Protospacer *********************************
12. spacer 3.16|1605913|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448870 (Streptococcus phage Javan192, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gatatcttgcaatagagcaagcaccttaacaaa CRISPR spacer gatatcttgcaatagagcaagcaccttaacaaa Protospacer *********************************
13. spacer 3.1|1604916|35|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448862 (Streptococcus phage Javan178, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
gaaaggagtcacaaatgattagttcgcagtgtcgg CRISPR spacer gaaaggagtcacaaatgattagttcgcagtgtcga Protospacer **********************************.
14. spacer 3.1|1604916|35|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448865 (Streptococcus phage Javan182, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
gaaaggagtcacaaatgattagttcgcagtgtcgg CRISPR spacer gaaaggagtcacaaatgattagttcgcagtgtcga Protospacer **********************************.
15. spacer 3.1|1604916|35|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448864 (Streptococcus phage Javan180, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
gaaaggagtcacaaatgattagttcgcagtgtcgg CRISPR spacer gaaaggagtcacaaatgattagttcgcagtgtcga Protospacer **********************************.
16. spacer 3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448862 (Streptococcus phage Javan178, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cgataatactagattgctcattcaagtaccccac CRISPR spacer cgataatactagattgctcattcaagcaccccac Protospacer **************************.*******
17. spacer 3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK449010 (Streptococcus phage Javan90, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cgataatactagattgctcattcaagtaccccac CRISPR spacer cgataatactagattgctcattcaagcaccccac Protospacer **************************.*******
18. spacer 3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448845 (Streptococcus phage Javan118, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cgataatactagattgctcattcaagtaccccac CRISPR spacer cgataatactagattgctcattcaagcaccccac Protospacer **************************.*******
19. spacer 3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448833 (Streptococcus phage Javan87, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cgataatactagattgctcattcaagtaccccac CRISPR spacer cgataatactagattgctcattcaagcaccccac Protospacer **************************.*******
20. spacer 3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448673 (Streptococcus phage Javan119, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cgataatactagattgctcattcaagtaccccac CRISPR spacer cgataatactagattgctcattcaagcaccccac Protospacer **************************.*******
21. spacer 3.16|1605913|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448767 (Streptococcus phage Javan467, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gatatcttgcaatagagcaagcaccttaacaaa CRISPR spacer gatatcttgcaacagagcaagcaccttaacaaa Protospacer ************.********************
22. spacer 3.16|1605913|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448685 (Streptococcus phage Javan155, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gatatcttgcaatagagcaagcaccttaacaaa CRISPR spacer gatatcttgcaacagagcaagcaccttaacaaa Protospacer ************.********************
23. spacer 3.16|1605913|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448771 (Streptococcus phage Javan481, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gatatcttgcaatagagcaagcaccttaacaaa CRISPR spacer gatatcttgcaacagagcaagcaccttaacaaa Protospacer ************.********************
24. spacer 3.16|1605913|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448942 (Streptococcus phage Javan448, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gatatcttgcaatagagcaagcaccttaacaaa CRISPR spacer gatatcttgcaacagagcaagcaccttaacaaa Protospacer ************.********************
25. spacer 3.16|1605913|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK449012 (Streptococcus phage Javan94, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gatatcttgcaatagagcaagcaccttaacaaa CRISPR spacer gatatcttgcaacagagcaagcaccttaacaaa Protospacer ************.********************
26. spacer 3.16|1605913|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_004586 (Streptococcus pyogenes phage 315.3, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gatatcttgcaatagagcaagcaccttaacaaa CRISPR spacer gatatcttgcaacagagcaagcaccttaacaaa Protospacer ************.********************
27. spacer 3.16|1605913|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448969 (Streptococcus phage Javan514, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gatatcttgcaatagagcaagcaccttaacaaa CRISPR spacer gatatcttgcaacagagcaagcaccttaacaaa Protospacer ************.********************
28. spacer 3.16|1605913|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448964 (Streptococcus phage Javan502, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gatatcttgcaatagagcaagcaccttaacaaa CRISPR spacer gatatcttgcaacagagcaagcaccttaacaaa Protospacer ************.********************
29. spacer 3.16|1605913|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448943 (Streptococcus phage Javan450, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gatatcttgcaatagagcaagcaccttaacaaa CRISPR spacer gatatcttgcaacagagcaagcaccttaacaaa Protospacer ************.********************
30. spacer 3.16|1605913|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448972 (Streptococcus phage Javan520, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gatatcttgcaatagagcaagcaccttaacaaa CRISPR spacer gatatcttgcaacagagcaagcaccttaacaaa Protospacer ************.********************
31. spacer 3.16|1605913|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448865 (Streptococcus phage Javan182, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gatatcttgcaatagagcaagcaccttaacaaa CRISPR spacer gatatcttgcaatagagcaagcaccttagcaaa Protospacer ****************************.****
32. spacer 3.16|1605913|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448855 (Streptococcus phage Javan150, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gatatcttgcaatagagcaagcaccttaacaaa CRISPR spacer gatatcttgcaacagagcaagcaccttaacaaa Protospacer ************.********************
33. spacer 3.16|1605913|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448786 (Streptococcus phage Javan509, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gatatcttgcaatagagcaagcaccttaacaaa CRISPR spacer gatatcttgcaacagagcaagcaccttaacaaa Protospacer ************.********************
34. spacer 3.16|1605913|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448774 (Streptococcus phage Javan487, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gatatcttgcaatagagcaagcaccttaacaaa CRISPR spacer gatatcttgcaacagagcaagcaccttaacaaa Protospacer ************.********************
35. spacer 3.16|1605913|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448963 (Streptococcus phage Javan498, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gatatcttgcaatagagcaagcaccttaacaaa CRISPR spacer gatatcttgcaacagagcaagcaccttaacaaa Protospacer ************.********************
36. spacer 3.16|1605913|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448773 (Streptococcus phage Javan485, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gatatcttgcaatagagcaagcaccttaacaaa CRISPR spacer gatatcttgcaacagagcaagcaccttaacaaa Protospacer ************.********************
37. spacer 3.16|1605913|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448777 (Streptococcus phage Javan491, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gatatcttgcaatagagcaagcaccttaacaaa CRISPR spacer gatatcttgcaatagagcaagcaccttgacaaa Protospacer ***************************.*****
38. spacer 3.16|1605913|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448845 (Streptococcus phage Javan118, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gatatcttgcaatagagcaagcaccttaacaaa CRISPR spacer gatatcttgcaacagagcaagcaccttaacaaa Protospacer ************.********************
39. spacer 3.16|1605913|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448853 (Streptococcus phage Javan144, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gatatcttgcaatagagcaagcaccttaacaaa CRISPR spacer gatatcttgcaacagagcaagcaccttaacaaa Protospacer ************.********************
40. spacer 3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK449012 (Streptococcus phage Javan94, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
cgataatactagattgctcattcaagtaccccac CRISPR spacer tgataatactagattgctcattcaagcaccccac Protospacer .*************************.*******
41. spacer 3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448775 (Streptococcus phage Javan489, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
cgataatactagattgctcattcaagtaccccac CRISPR spacer cgataaaactagattgctcattcaagcaccccac Protospacer ****** *******************.*******
42. spacer 3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448794 (Streptococcus phage Javan525, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
cgataatactagattgctcattcaagtaccccac CRISPR spacer cgataaaactagattgctcattcaagcaccccac Protospacer ****** *******************.*******
43. spacer 3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448944 (Streptococcus phage Javan452, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
cgataatactagattgctcattcaagtaccccac CRISPR spacer cgataaaactagattgctcattcaagcaccccac Protospacer ****** *******************.*******
44. spacer 3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448672 (Streptococcus phage Javan117, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
cgataatactagattgctcattcaagtaccccac CRISPR spacer cgataaaactagattgctcattcaagcaccccac Protospacer ****** *******************.*******
45. spacer 3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448849 (Streptococcus phage Javan128, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
cgataatactagattgctcattcaagtaccccac CRISPR spacer cgataaaactagattgctcattcaagcaccccac Protospacer ****** *******************.*******
46. spacer 3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448958 (Streptococcus phage Javan486, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
cgataatactagattgctcattcaagtaccccac CRISPR spacer cgataaaactagattgctcattcaagcaccccac Protospacer ****** *******************.*******
47. spacer 3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448850 (Streptococcus phage Javan132, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
cgataatactagattgctcattcaagtaccccac CRISPR spacer cgataaaactagattgctcattcaagcaccccac Protospacer ****** *******************.*******
48. spacer 3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448765 (Streptococcus phage Javan459, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
cgataatactagattgctcattcaagtaccccac CRISPR spacer cgataaaactagattgctcattcaagcaccccac Protospacer ****** *******************.*******
49. spacer 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448858 (Streptococcus phage Javan166, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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50. spacer 3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448675 (Streptococcus phage Javan129, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
cgataatactagattgctcattcaagtaccccac CRISPR spacer tgataatactagattgctcattcaagcaccccgc Protospacer .*************************.*****.*
51. spacer 3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448771 (Streptococcus phage Javan481, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
cgataatactagattgctcattcaagtaccccac CRISPR spacer cgataaaactagattgctcattcaagcaccccgc Protospacer ****** *******************.*****.*
52. spacer 3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448973 (Streptococcus phage Javan522, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
cgataatactagattgctcattcaagtaccccac CRISPR spacer cgataaaactagattgctcattcaagcaccccgc Protospacer ****** *******************.*****.*
53. spacer 3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448969 (Streptococcus phage Javan514, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
cgataatactagattgctcattcaagtaccccac CRISPR spacer cgataaaactagattgctcattcaagcaccccgc Protospacer ****** *******************.*****.*
54. spacer 3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448972 (Streptococcus phage Javan520, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
cgataatactagattgctcattcaagtaccccac CRISPR spacer cgataaaactagattgctcattcaagcaccccgc Protospacer ****** *******************.*****.*
55. spacer 3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448763 (Streptococcus phage Javan451, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
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56. spacer 3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448774 (Streptococcus phage Javan487, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
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57. spacer 3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448778 (Streptococcus phage Javan493, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
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58. spacer 3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448773 (Streptococcus phage Javan485, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
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59. spacer 3.8|1605385|34|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448777 (Streptococcus phage Javan491, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
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60. spacer 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448709 (Streptococcus phage Javan231, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.879
aaagcagctaaactcgcttttcaaacggaacac CRISPR spacer gcagcagctaaactcgctttgcaaacggaacat Protospacer . ****************** ***********.
61. spacer 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448710 (Streptococcus phage Javan233, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.879
aaagcagctaaactcgcttttcaaacggaacac CRISPR spacer gcagcagctaaactcgctttgcaaacggaacat Protospacer . ****************** ***********.
62. spacer 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448707 (Streptococcus phage Javan227, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.879
aaagcagctaaactcgcttttcaaacggaacac CRISPR spacer gcagcagctaaactcgctttgcaaacggaacat Protospacer . ****************** ***********.
63. spacer 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KX879641 (Streptococcus phage CHPC577, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.818
aaagcagct---aaactcgcttttcaaacggaacac CRISPR spacer ---gccgcttggaaactcgctttccaaacagaacac Protospacer ** *** ***********.*****.******
64. spacer 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH892371 (Streptococcus phage SW25, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.818
aaagcagct---aaactcgcttttcaaacggaacac CRISPR spacer ---gccgcttggaaactcgctttccaaacagaacac Protospacer ** *** ***********.*****.******
65. spacer 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH892372 (Streptococcus phage SW26, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.818
aaagcagct---aaactcgcttttcaaacggaacac CRISPR spacer ---gccgcttggaaactcgctttccaaacagaacac Protospacer ** *** ***********.*****.******
66. spacer 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KX879642 (Streptococcus phage CHPC926, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.818
aaagcagct---aaactcgcttttcaaacggaacac CRISPR spacer ---gccgcttggaaactcgctttccaaacagaacac Protospacer ** *** ***********.*****.******
67. spacer 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH892368 (Streptococcus phage SW20, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.818
aaagcagct---aaactcgcttttcaaacggaacac CRISPR spacer ---gccgcttggaaactcgctttccaaacagaacac Protospacer ** *** ***********.*****.******
68. spacer 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KU678389 (Streptococcus virus 9871, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.818
aaagcagct---aaactcgcttttcaaacggaacac CRISPR spacer ---gccgcttggaaactcgctttccaaacagaacac Protospacer ** *** ***********.*****.******
69. spacer 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH892350 (Streptococcus phage SW16, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.818
aaagcagct---aaactcgcttttcaaacggaacac CRISPR spacer ---gccgcttggaaactcgctttccaaacagaacac Protospacer ** *** ***********.*****.******
70. spacer 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH892374 (Streptococcus phage SW28, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.818
aaagcagct---aaactcgcttttcaaacggaacac CRISPR spacer ---gccgcttggaaactcgctttccaaacagaacac Protospacer ** *** ***********.*****.******
71. spacer 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KU678391 (Streptococcus virus 9873, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.818
aaagcagct---aaactcgcttttcaaacggaacac CRISPR spacer ---gccgcttggaaactcgctttccaaacagaacac Protospacer ** *** ***********.*****.******
72. spacer 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH892369 (Streptococcus phage SW22, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.818
aaagcagct---aaactcgcttttcaaacggaacac CRISPR spacer ---gccgcttggaaactcgctttccaaacagaacac Protospacer ** *** ***********.*****.******
73. spacer 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_031023 (Streptococcus virus 9874, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.818
aaagcagct---aaactcgcttttcaaacggaacac CRISPR spacer ---gccgcttggaaactcgctttccaaacagaacac Protospacer ** *** ***********.*****.******
74. spacer 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_031094 (Streptococcus virus 9872, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.818
aaagcagct---aaactcgcttttcaaacggaacac CRISPR spacer ---gccgcttggaaactcgctttccaaacagaacac Protospacer ** *** ***********.*****.******
75. spacer 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH892370 (Streptococcus phage SW23, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.818
aaagcagct---aaactcgcttttcaaacggaacac CRISPR spacer ---gccgcttggaaactcgctttccaaacagaacac Protospacer ** *** ***********.*****.******
76. spacer 3.12|1605649|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH892365 (Streptococcus phage SW17, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.818
aaagcagct---aaactcgcttttcaaacggaacac CRISPR spacer ---gccgcttggaaactcgctttccaaacagaacac Protospacer ** *** ***********.*****.******
77. spacer 3.9|1605451|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP049914 (Vibrio sp. HDW18 plasmid p_unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
gctctgtttgagtttggtggtaatggattatcg CRISPR spacer gctgtgtttgagtttagtggtaatgcgttgcca Protospacer *** ***********.********* .**..*.
78. spacer 3.15|1605848|33|NC_012470|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_047897 (Lactobacillus phage Lenus, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
caatatcaatcttgtaatttgcaaaaaatagct CRISPR spacer aatcttcaatgttgtaatttccaaaaaatagtt Protospacer * . ***** ********* **********.*
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
33262 : 43415
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_012470|33262:43415|DBSCAN-SWA TATGAATAAACGTATTTTTGTTGAAAAGAAGGCTGATTTTCAGATTAAGGCACAGGTCCTGTTAAAGGAATTGAAACATCAGCTGCAGTTAAAGACACTGGTTGATTTGCGTATTGTGCAGGTTTATGATGTGTTTCATTTGGATCAGGAGCTGCTTTTAACAGCTATAAAGCATGTTTTCTCTGAGCAGGTCACTGATCAGGTATTGTCAGAAGAAGCTTTACAAGCAGATTTAAAAAGGTATGCCTTTTTTGCGATTGAAGCTCTGCCTGGACAGTTTGATCAGCGTGCGGCAAGCTCTCAGGAAGCCTTATTGTTGTTAGGAGCCTCAACTGATGTGACTGTTTTGACCTCACAGCTTTATTTGGTCAATCAAGACATTGCTGCTGAAGAATTAGAAGCCTTAAAGCAGTACTTGTTAAATCCAGTGGATTCTAGGTTTAAGGACATATTAGCCGGTCTTGATGATCAGGATTTTTCAGTAGCAGATAAAGTGATTCCAACGCTTGATGTTTTTAATGATTATACAGCGGAAGATCTTGCTCGTTACAGGTCTGAGCAGGGCCTAGCAATGGAAGTGGAGGATCTGCTGTTTATTCAAGATTATTTCAAGACAAAGGGGCGAGTGCCAACAGAGACTGAACTAAGGGTTTTGGATACGTATTGGTCTGATCATTGTCGCCACACAACCTTTGAAACAGAGCTAAAAACGCTTGATTTTTCAGCTTCTCATTTTGAAAAGCAGCTCCAAGCTACCTATGAGACCTACCTTGCTATGCGTGATGAGCTAGGTCGATCTGAAAGGCCTCAAACGCTTATGGATATGGCTACCATTTTTGGACGTTATGAAAGAGCTAATGGTCGTTTAGAGGATTTGGAGGTTTCAGATGAAATCAATGCCTGCTCAGTGGAAATTGAGGTAGATGTTGATGGTGTCAAGGAACCTTGGCTGCTCATGTTTAAAAATGAAACACATAATCACCCAACGGAAATTGAACCCTTTGGGGGTGCTGCAACCTGTATTGGTGGAGCTATTCGTGATCCTCTGTCAGGCCGTTCCTACGTTTATCAAGCCATGCGGCTTTCTGGTGCAGGGGACATTACAAGCCCGCTGTCAGAGACTCGTAAGGGCAAATTACCACAGCAGGTTATTTCGAGGCGAGCAGCACATGGTTATTCGTCATATGGCAATCAAATTGGGCTAGCGACTACTTATGTTCGTGAGTATTTTCACCCAGGCTTTGTTGCCAAACGTATGGAGCTTGGTGCGGTAGTTGGTGCTGCACCCAAGGAAAATGTGGTTCGTGAAAAGCCAAGGACAGGTGACGTGGTGGTTTTGCTTGGTGGGAAAACAGGACGTGATGGTATTGGTGGTGCGACAGGATCATCTAAGGTTCAGACAGTTGAGTCTGTAGAAACAGCTGGTGCAGAGGTCCAAAAAGGAAATGCCATTGAGGAGCGTAAAATCCAACGTCTTTTTCGTCGTGGCGATGTGACACGCCTCATCAAGAAGTCAAATGATTTTGGTGCTGGTGGTGTTTGTGTAGCCATTGGCGAGCTTGCTGCTGGTCTTAACATTAACTTAGATAAGATTCCTTTAAAATATGCTGGGCTAAATGGAACAGAAATTGCCATTTCAGAATCCCAAGAGCGTATGGCTGTCGTGATTTGTCCAAAGGATCTAGAGGCCTTTATGAGCGCCTGCCATAAGGAAAATATCCATGCTGCTGTTGTGGCAACTGTGACAGAAAAAACGAATCTTGTCATGACCTGGAATGGGCAGACGATTGTTGATATTGAACGCTCATTTTTAGAGACAAATGGTGTGCGCGTGTCTGTTGCTGCTAAGGTTGTTGACAGTGGTGCGCCAATACCAGAAGCCCGTCAAACTACTGCTGAGACACTTGAAGCAGATACCATTGCTGTCTTATCAGACCTGAACCATGCTAGTCAAAAGGGCTTGCAAACACTTTTTGATAGCTCAGTGGGTCGCTCCACAGTAATACACCCGCTTGGTGGGCGCTATCAAATGACGCCTGTTGAAGGCTCTGCTCAGAAATTACCAGTTCAACATGGAGTGACAAAGACAGCCTCTGTCATTGCTCAAGGCTATCACCCTTATATAGCCGAATGGTCACCTTATCATGGTGCCGCTTATGCTGTGATTGAAGCAACTGCTCGTCTGGTCGCAACAGGTAGCCATTGGCATAAGGCTCGCTTTTCATATCAGGAATATTTCCAAAGAATGGATAAGCAGGCAGAGCGCTTTGGTCAGCCGGTGGCAGCTTTGCTTGGGGCAATTGAAGCACAGGTGCAGCTTGGCTTGCCTTCTATTGGAGGTAAGGATTCGATGTCTGGTAGCTTTGAGGAATTGACAGTGCCGCCGACCTTGGTTGCCTTTGGTGTGACGACTGCTCATGTAGATCATATCCTTTCACCAGAATTTAAAGCTGCTGGCGAGAATATTTACTATATTCCAGGACAGGCTATTTCGGAAGTGATTGATTTTGAGTTGATAAAATCTAATTTTATGACTTTTGAGGCTATTCAGAAAAAGCATAATATTAGCTCAGCTTCGGCTGTTAAATATGGTGGTGTTGTTGAAGCACTGGCTCTTGCTGCCTTTGGTAATCGGTTAGGGGCTTGTGTGACATTACCAGAGCTTGACAGGAGCTTAACAGCTCAGCTTGGTGGCTTTGTCTTTACATCAAAAGAGGAGATTGCAGGTGCTATCAGGCTTGGTCAGACCACTAGTGACTTTACATTGATGGTCAATGATGTCAAGCTATCTGGAGATCGTCTCTTAAAGGCTTTTGAGGGGAGCCTGGAGCAGGTTTACCCAACGGTATTTCAGCAGGCAGGTGACTTACAGCCTGTTCCTGTAATGACAACAGCACTTGCTACTCAGTTTAAGGAAAAAATAGCTCAGCCAGTTGTCTATATTCCAGTTTTTCCAGGAACTAACTCAGAATATGATTCGGCTAAGGCCTTTGAAAGAGAGGGTGCAAGGGTGAACTTGGTGCCTTTTGTTACCTTGAATGAGGCAGCTATTGACGTTTCAGTTGACACGATGGTTGACCATATTCATCAAGCTCATATTATCTTCCTTGCAGGTGGTTTTTCAGCGGCAGATGAGCCAGATGGTTCAGCTAAATTTATTGTTAATATCTTGCTGAATGAGAAGGTTCGAGCGGCGATTGATGCCTTTATTGAAAAGGGTGGTCTGATTATCGGTATTTGTAATGGCTTTCAAGCTTTGGTCAAATCAGGGCTGCTGCCATATGGACGTTTTGAGGCGGTACATGAGGCTAGTCCAACTCTGTTTTATAATGATGCCAATCAGCATGTGGCTAAAATGGTAGAAACGCGCATTGCCAATACCAATTCTCCTTGGCTAGCAGGTGTCAAGGTGGGTGATATTCATGCTGTTGCAGTGTCGCATGGAGAGGGCAAGCTTGTGGTAACAGAAAGAGAATTAGCAGAGCTTTGTGAAAATGGTCAGATTTTCAGCCAGTATGTTGACCTTGATGGCAAACCAAGCATGGATAGCAGGTATAATCCAAATGGCTCTGTCAATGCTATTGAAGGTCTTACCAGCAAAAATGGTCAGATTATCGGTAAGATGGGACATTCAGAGCGCTTCGAAGAGGGACTTTTCCAAAATATTCCGGGCAATAAGGACCAATGGTTATTCCGAAGTGCGGTGCATTATTTTAGAGGAGACCATGTGGATATTGACTGATCTTGGATATAGCCTTGTAATAGCTAAGATAGCTGTTAGTTCTAGCCTAGTTAATGACACAATCATAATTAAAGGGGCATTGGCCCAGAGGTAAAGATGATATATGACGTAAAATCTCTTAATGAGGAGTGTGGTGTTTTTGGGATTTGGGGGCACCCACATGCCGCTCAAGTGACTTATTTTGGGCTTCATAGCCTACAGCACCGCGGCCAAGAGGGAGCAGGTATTATTTCAAATGATAATGGGGAGCTTCATCAGCATCGTGATGTAGGTCTCTTGTCAGAGGTGTTTAAGGATTCATCTGATCTGGACAAGCTAAAGGGACATGCTGCCATTGGTCATGTGCGGTATGCGACTGCTGGGGCAGCTTCCATTAATAATATTCAGCCCTTTTTATACCGCTTTACAGACGCTCAATTTGGCTTGTGCCACAATGGTAATTTGACCAACGCTATTTCATTGAAAAAAGCGTTAGAGAGTGAGGGAGCTATTTTTAATGCCTCTTCTGATACAGAAATTCTAATGCATTTGATTCGTCGTAGTCATCACCCAGAATTTTTAGGAAAGGTAAAAGAGGCGCTCAACACTGTTAAAGGGGGCTTTGCTTACCTGCTGATGACAGAGCACCAGCTGATAGCAGCGCTTGATCCCAATGGCTTTAGGCCATTATCTATAGGCCGTATGAAAAATGGTGCCTGGGTGGTTTCGAGTGAAACCTGTGCCTTTGAAGTGGTTGGTGCTGAGTGGGTTCGCGATGTGATGCCAGGTGAGGTCATTATCATTGATGATCAGGGGATCACCTATGACTGCTATACGACGGACACGCAGCTGGCAATTTGTTCTATGGAATATATTTACTTTGCGCGTCCTGATTCAACCATTGCTGGGGTCAATGTTCACACCGCTCGCAAGCGAATGGGAAAGAGACTGGCTCAGGAATTTCAGCATGAGGCTGATATTGTGGTTGGTGTGCCCAATTCCTCATTATCAGCAGCTATGGGCTTTGCAGAAGCCTCAGGCCTGCCAAATGAAATGGGATTGGTCAAGAATCAATATACCCAACGAACCTTTATCCAACCAACTCAGGAGCTTCGTGAGCAGGGAGTTCGAATGAAACTTTCAGCTGTTTCAGGTGTTGTCAAGGGCAAAAGGGTTGTGATGGTAGATGATTCTATTGTCAGAGGGACAACCTCACGACGCATTGTTAATTTGCTGCGTGAAGCAGGAGCTACAGAGGTTCATGTAGCAATTGGTAGCC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_012470|33262:43415|37099_38557_+|WP_012677194.1|DBSCAN-SWA MIYDVKSLNEECGVFGIWGHPHAAQVTYFGLHSLQHRGQEGAGIISNDNGELHQHRDVGLLSEVFKDSSDLDKLKGHAAIGHVRYATAGAASINNIQPFLYRFTDAQFGLCHNGNLTNAISLKKALESEGAIFNASSDTEILMHLIRRSHHPEFLGKVKEALNTVKGGFAYLLMTEHQLIAALDPNGFRPLSIGRMKNGAWVVSSETCAFEVVGAEWVRDVMPGEVIIIDDQGITYDCYTTDTQLAICSMEYIYFARPDSTIAGVNVHTARKRMGKRLAQEFQHEADIVVGVPNSSLSAAMGFAEASGLPNEMGLVKNQYTQRTFIQPTQELREQGVRMKLSAVSGVVKGKRVVMVDDSIVRGTTSRRIVNLLREAGATEVHVAIGSPELKYPCFYGIDIQTRRELISANHTAAEVCDIIGADSLTYLSLDGLIEAIGLDTKAPNGGLCVAYFDGQYPTPLYDYEEAYLKSLEEKVSFHIDQVTK >NC_012470|33262:43415|42260_43415_-|WP_012677198.1|DBSCAN-SWA MKKVYQLLTSGAILLGVNGAISSTTTAISQGQSGIVHAAVLGDNYPSKWKQGFGADPWNMYLRQCTSFVAFRLHSANGFSLPRGYGNAESWGHIAKHQGYLVDHTPRVGAVAWWDKGFNQSHALYGHVAWVAEVNGDTVIIEEYNYNAGQGPEKYHKRQIHKHQVSGYIHFKDLDHNSTSHTQMLHASQAGPARLAKSGTYYFSSQSPIKAEATLASPDLAYYHTGQLVHYDQTLVADGYEWLSYIGHSGNRRYIPIHKLPVQPQQHSQGAIDKPKPVATTPIKVGDTVAFPGVFRVDQVAQNMIASSELAGGEPTSLNWIDPAPLHETDHKGRIAGNQILQVGDYFVISGTYKVLKVDQPSKGIYVQMGSRGTWLTIDKAKKV >NC_012470|33262:43415|39632_40190_+|WP_012677196.1|DBSCAN-SWA MTRIAVFASGNGSNFQTIAEQFPVAFVFSDHCDAHVLSRACALGVLSYSFELKDFENKQAYEQTLVALLQRHQIDLIVLAGYMKIVSTTLLDAYEGKIINIHPAYLPEFPGAHGILDAWQAGVRQSGVTVHWVDSGIDTGKIIKQVRVPRLSDDTLESFEARIHEAEYQLYPEVLDSLGVERLNR >NC_012470|33262:43415|38613_39636_+|WP_012677195.1|DBSCAN-SWA MSKNAYAQSGVDVEAGYELVERIKKHAERSKRLGVMGGLGGFGGLFDLSKTGVKEPVLVSGTDGVGTKLMLAIQYDKHDTIGQDCVAMCVNDIIAAGAEPLYFLDYLAAGKNEPAKLEQVVAGIAEGCVQAGTALIGGETAEMPGMYGQDDYDLAGFAVGIAEKSQLIDGSRVAEGDHLLGLASSGIHSNGYSLVRRIFADYTGDEVLPELDGKKLKEVLLEPTRIYVKAVLPLIKSGLVAGIAHITGGGFIENLPRMFSKELAAEIEEASLPVLPIFKVLETYGKINHEEMFEIFNMGIGMVLAVKPEHVEQVKACLDEPVYDIGRVVTRTVASVVMKP >NC_012470|33262:43415|33262_37003_+|WP_041790645.1|DBSCAN-SWA MNKRIFVEKKADFQIKAQVLLKELKHQLQLKTLVDLRIVQVYDVFHLDQELLLTAIKHVFSEQVTDQVLSEEALQADLKRYAFFAIEALPGQFDQRAASSQEALLLLGASTDVTVLTSQLYLVNQDIAAEELEALKQYLLNPVDSRFKDILAGLDDQDFSVADKVIPTLDVFNDYTAEDLARYRSEQGLAMEVEDLLFIQDYFKTKGRVPTETELRVLDTYWSDHCRHTTFETELKTLDFSASHFEKQLQATYETYLAMRDELGRSERPQTLMDMATIFGRYERANGRLEDLEVSDEINACSVEIEVDVDGVKEPWLLMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCIGGAIRDPLSGRSYVYQAMRLSGAGDITSPLSETRKGKLPQQVISRRAAHGYSSYGNQIGLATTYVREYFHPGFVAKRMELGAVVGAAPKENVVREKPRTGDVVVLLGGKTGRDGIGGATGSSKVQTVESVETAGAEVQKGNAIEERKIQRLFRRGDVTRLIKKSNDFGAGGVCVAIGELAAGLNINLDKIPLKYAGLNGTEIAISESQERMAVVICPKDLEAFMSACHKENIHAAVVATVTEKTNLVMTWNGQTIVDIERSFLETNGVRVSVAAKVVDSGAPIPEARQTTAETLEADTIAVLSDLNHASQKGLQTLFDSSVGRSTVIHPLGGRYQMTPVEGSAQKLPVQHGVTKTASVIAQGYHPYIAEWSPYHGAAYAVIEATARLVATGSHWHKARFSYQEYFQRMDKQAERFGQPVAALLGAIEAQVQLGLPSIGGKDSMSGSFEELTVPPTLVAFGVTTAHVDHILSPEFKAAGENIYYIPGQAISEVIDFELIKSNFMTFEAIQKKHNISSASAVKYGGVVEALALAAFGNRLGACVTLPELDRSLTAQLGGFVFTSKEEIAGAIRLGQTTSDFTLMVNDVKLSGDRLLKAFEGSLEQVYPTVFQQAGDLQPVPVMTTALATQFKEKIAQPVVYIPVFPGTNSEYDSAKAFEREGARVNLVPFVTLNEAAIDVSVDTMVDHIHQAHIIFLAGGFSAADEPDGSAKFIVNILLNEKVRAAIDAFIEKGGLIIGICNGFQALVKSGLLPYGRFEAVHEASPTLFYNDANQHVAKMVETRIANTNSPWLAGVKVGDIHAVAVSHGEGKLVVTERELAELCENGQIFSQYVDLDGKPSMDSRYNPNGSVNAIEGLTSKNGQIIGKMGHSERFEEGLFQNIPGNKDQWLFRSAVHYFRGDHVDID >NC_012470|33262:43415|40336_41884_+|WP_012677197.1|DBSCAN-SWA MTKRALISVSDKRGIVDLARELKHLGWDIISTGGTRLALEEAGVVTVAIDDVTGFPEMMDGRVKTLHPLIHGGLLARRDIEHHLQAAKQNRIELIDLVVVNLYPFKETICRSDITYDVAVDMVDIGGPSLLRSAAKNHASVTVVVDPTDYPLVLGELASTGSTSYQTRQSLAAKAFRHTAAYDAVIADYFTRQAGETKPEKLTLTYDLKQSMRYGENPQQAADFYQRALPITYSIASAKQLNGKELSFNNIRDADAAIRIIRDFKERPTVVALKHMNPCGIGQADDIETAWDFAYAADPVSIFGGIVVLNREVDLATAEKLHAIFLELIIAPSYSKEALAVLTHKKKHLRILELPFAAQEASEIEAEYTGVLGGLLVQNQDVVTESPADWIVVTKRQPNEQEMAALAFAWKTIKYVKSNAIIIANDHMTLGVGPGQTNRIASVRIAIAQATGQLEGAVLASDAFFPFADSIEEIAAAGIKAIIQPGGSIRDSESIAAADQHGITMIFTGVRHFRH |
6 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
98916 : 151460
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_012470|98916:151460|DBSCAN-SWA 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42 | Cronobacter_phage(10.0%) | tRNA,protease,transposase,bacteriocin,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
239848 : 309611
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_012470|239848:309611|DBSCAN-SWA 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54 | Clostridium_phage(12.5%) | tRNA,integrase,protease,transposase | attL 247736:247753|attR 284431:284448 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
466726 : 510086
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_012470|466726:510086|DBSCAN-SWA 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34 | Streptococcus_phage(33.33%) | tRNA,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_5 |
872833 : 935672
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_012470|872833:935672|DBSCAN-SWA 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56 | Bacillus_phage(22.22%) | transposase,bacteriocin,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1995193 : 2004099
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_012470|1995193:2004099|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_012470|1995193:2004099|1998829_1999300_-|WP_012516370.1|DBSCAN-SWA MAKYGFLSVLEEEMDKHFHYDYAMDWDKKNHAVEITLVLEAQNQSAVETIDDQGQLSKEDIVFEDYVLFYNPEKSQFQAADYLVAIPFEPKKGFSREFLGYFAQFLNDVAIEGHSDLMDFLADDSQLDFSLEWNAEAFEEGQIGLEEGARFPYPRY >NC_012470|1995193:2004099|1996703_1997498_-|WP_012678634.1|DBSCAN-SWA MKRITANHYQTSERYYKLPKLLFESDRYKGMKLEVKVAYAVLKARLELSLSKGWIDEDGAIYLIYSNSKLMALLGCSKSKLLTIKKTLKEYGLIDEVQQSSSEKGRLANKIYLGELEHNTTPVLNSDGGSVKNTLGGSQNQPGPVLTSAPSETEESDLVIEDEEEKGKSSNSEKNDQILNRKIDPVTIYDRDYIWGLVHSQLRQEGFSEASSDYAMVYFDDRYQYALEHMRFAWSSEVIAEYVFNGILSEWTKHQRLQELKGGA >NC_012470|1995193:2004099|2003583_2004099_+|WP_012678640.1|DBSCAN-SWA MKVVIIGHSGSGKSTLANVLSQHYNCAVLHLDKIHFESNWQERTVSQMVSDISAVMLQNHWIIEGNYPSCLYEERMREADHIIYFNFNRFNCFYRAFKRYLKYRGQTRPDMAENCNEKFDVEFMKWILLDGRSKNKLNNYKAVIKQYPHKTIVLKNQKQLNHYMNSIQHNS >NC_012470|1995193:2004099|1999450_2001187_+|WP_012678637.1|DBSCAN-SWA MHIKTIIDFKELGQRYIFQAPIVELVAKQIDQVGQVLEQVNQFQDLGYYVVGYLSYEAAACFDKKLTTHNKRLGQEYFAYFTVHDSCQLEDFPLYHDSMTIPNSWTSATQEEAYQEAIAQIHQEMRQGNTYQVNYTIQLSQRLNAKDSLAIYHQLVIEQAAGYNAYIAHDDFAVISASPELFFKQEKNQITTRPMKGTTKRGYNLELDQQEHDWLQADPKNRSENMMIVDLLRNDMNKICQTGSVTVTQLCQLEQYSTVWQMTSTIVGTLQDQCRLYDILQALFPCGSITGAPKVSTMAIINRLEPKPRGAYCGSIGICLPDGRRVFNVAIRTIQLSYDQAIYGVGGGITWESRWQDEFEEIKQKSSFLHRQSIDFTIKTTAKVEQQSLIYLDQHLNRLREAARYFAYPYDEELLTDRLQAYLKGKDSSPYRLTIAIAKDGQISLTDQSLEPLQKDFLKARLVRQSSDVKKLPFTYFKTSHRPYLSVKPYEQVFVAADGTLLETSIGNLFVQIEQTLYTPPVSAGILPGIFRQELLRQGLAQEKELKLSHLDKAEAIFGGNAVRGLYSLTIEDTTLPQ >NC_012470|1995193:2004099|1997478_1997667_-|WP_012678635.1|DBSCAN-SWA MQKKEESSRQIVMCHLMTIMGIDVDKATQLVTEMEKLGIIQFDELGNVILLLLEGNHETNNC >NC_012470|1995193:2004099|2001828_2003100_+|WP_012678639.1|DBSCAN-SWA MPDNLAIRMRPRTITEVIGQQHLVGEGKIIDRMVKANRLSSMILYGPPGIGKTSIASAIAGTTKYAFRTFNATIDNKKRLQEIAEEAKFSGGLVLLLDEIHRLDKSKQDFLLPLLEHGHIIMIGATTENPFFSVTPAIRSRVQIFELKPLSYEEIKQALRLVITDKERGFAFDVTLDEAAFDFIATATNGDLRAAYQSLDLAVMSTQPDNEGIRHISLDIVENSLQRSYITMDKDGDGHYDILSALQKSIRGSDVNASLHYAARLIEAGDLPSLARRLTIIAYEDIGLANPEAQIHTVTALEAAQKIGFPEARILIANVVIDLALSPKSNSAYMAMDAALADLRQHGHLPIPRHLRDGHYAGSKELGNAQHYLYPHAYPEKWVKQQYLPDHLVKKNYFNPNETGKYERALAANKTRIDKLSSS >NC_012470|1995193:2004099|1995193_1996549_-|WP_012678633.1|DBSCAN-SWA MKFLDLFAGIGGFRLGLTRQGHKCIGFCEIDKFARKSYKAIYETKGEIEFHDIRQVTDQDFRQLRGQMDIICGGFPCQAFSLAGRRLGFEDTRGTWFFEIARAAKQIQPRFLFLENVKGLLSHDKGETFRTILTTLDELGYDVEWQVLNSKDFQVPQNRERIFIIGHSRRYRPRFLFPLRGENSSAGLERLGNVNPSGKGMNGEVYLSRGIAPTLTRGKGEGTKIAIPVLTPDRLEKRQHGRRFKDNQDPMFTLTGQDRHGVVVAGTLPTSFIQTGRVYDLSGLSPTLTTMQGGDKVPKILCREEAPHLKIREATKLGYVKAIVGDSVNLAYPESTKRRGRVGKGISNTLITSDNMGVVVAALEYRKDKWYEVTGIILDGKLYRLRIRRLTPRECFRLQGFPDWAYERAERVSSKSQLYKQAGNSVTVTVIEAIAKVFRKIEEEEKHEIIT >NC_012470|1995193:2004099|2001227_2001836_+|WP_012678638.1|DBSCAN-SWA MILLIDNYDSFTYNLAQYLSAFDQTIILTNQDPKLFDLAKQADAIVLSPGPGWPKAANQMPSLIRAFYDQKPMLGVCLGHQAIAEALGGRLRLAKRVMHGKQSILERQAPAKLFQQLPKQLTVMRYHSIVVDDLPADFVITARDFEDNEIMAFEHRQLPLFGLQFHPESIGTADGMAMIANFMAVVKKHHSQQNQGKEEHNA >NC_012470|1995193:2004099|1998299_1998464_-|WP_080004905.1|DBSCAN-SWA MKLLDKTVNFSGAKLALISNGKILTILRDAIPTIPYPNMWDLPGGDCVIIMTGA >NC_012470|1995193:2004099|1998483_1998828_-|WP_012678636.1|DBSCAN-SWA MLHEMMLTPRPFAMIEAGVKTIELRLNDEKRQAIKVGDWICFYCTEDHSQILQAEVVGLHYFDDFRQLYQQLPLEKCGYRQEELSQAKPEDMELYYSKDRQAKYGVVGIELKLL |
10 | Streptococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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