Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_011660 | Listeria monocytogenes HCC23, complete sequence | 4 crisprs | WYL,RT,DinG,cas3,DEDDh,cas2,cas5,cas7,cas8b2,cas6,casR,csa3 | 3 | 10 | 6 | 8 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_011660_1 | 2094578-2096358 | Unclear |
I-A
Consensus repeat of NC_011660_1
|
27 spacers
spacers of NC_011660_1
>1.1|2094607|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT TCCGATTGCATTAGCTTTTACAGGTGCTTTGTTAGT >1.2|2094672|35|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGACGCTAATTTTGTAAATCCGTTTTTCATTGTTA >1.3|2094736|37|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGATGGCGCTAAAAAAGCATGGGGAGCGGTTCAAGAT >1.4|2094802|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGGAATTTCCAGAGGAGCATACTCGCACATTGAAAA >1.5|2094867|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAAAGTAATCCAAGAGAGACTGGGGCACGCAGACAT >1.6|2094932|34|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAGTTACCATACTACCGCCAACTTTAAAAGAATA >1.7|2094995|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCAAAAAATGCACAAAATAACCTAGAAGTTAAAACC >1.8|2095060|37|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACCGGAAAACAAATTTAGGCTTGATTTCTTTACTTTC >1.9|2095126|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATGAAGATGATTTCAAACTAGCTACAGATAAAGATA >1.10|2095191|35|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCACTGTCTTTCACTTTAAAAGTTGCTCCAGAAAG >1.11|2095255|34|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCCATCCAAAAACACTCCTTATCCTTAATTTATA >1.12|2095318|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGTTTTAAATTTAGAACGACGGAAGACGGCGTTTCC >1.13|2095383|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AACTTGATGTTGCTAGTTTACCTGATGATCAATTTT >1.14|2095448|38|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTAGAAATTTTCGATACGGATTTCGATACACTAATGTA >1.15|2095515|37|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTTGGCAGAGGAAGTTGGTCATCATCATTTGACTGT >1.16|2095581|37|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GATAATTAAGTAAGTCGCCTGCAGTTTCCGGTCCAAT >1.17|2095647|37|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATCACGGAAGTGCAAGAGTCGGAGAGTTCTGTAGAT >1.18|2095713|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGCGCAGGGTGATGCTAGTCTTGTAGGTGCTAAGTA >1.19|2095778|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GACAACCCCACTTTAACCAAAAGCAGGCTAAAAGAC >1.20|2095843|37|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATGAAATCTTAAAAAAGAGAAAGAACAGCAAGAAGCA >1.21|2095909|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATGTCATATAGTATCATATCAATAAAAAGCGTTG >1.22|2095974|34|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGGGCTAACGCGCTTAATTGTTCGCGACTAGCTT >1.23|2096037|35|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATACATGCAGTTTATTATTCGTTTTATTCAACCGT >1.24|2096101|37|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATGAAACGTCCGAAGCTAGTAGGACATGAATTGGTGA >1.25|2096167|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGGGAACCATTTTGCAAAGCTCATTATAAGAATACA >1.26|2096232|35|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAAAAGAAGGCTGGCGCGCACGTTTTCCAAACAA >1.27|2096296|34|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAGTTAAAAGTGTCTAAAGAAAAAGCCAAAAAAA |
cas2,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_011660_1
The CRISPR arrays of NC_011660_1 >merge|NC_011660|1|2094578-2096358|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTATGATTTCATAATAAGTAGTTAAAACTCCGATTGCATTAGCTTTTACAGGTGCTTTGTTAGTATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAACGGACGCTAATTTTGTAAATCCGTTTTTCATTGTTAATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAACTGATGGCGCTAAAAAAGCATGGGGAGCGGTTCAAGATATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAACAGGAATTTCCAGAGGAGCATACTCGCACATTGAAAAATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAACCAAAGTAATCCAAGAGAGACTGGGGCACGCAGACATATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAACTAGTTACCATACTACCGCCAACTTTAAAAGAATAATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAACCCAAAAAATGCACAAAATAACCTAGAAGTTAAAACCATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAACACCGGAAAACAAATTTAGGCTTGATTTCTTTACTTTCATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAACATGAAGATGATTTCAAACTAGCTACAGATAAAGATAATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAACTCACTGTCTTTCACTTTAAAAGTTGCTCCAGAAAGATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAACGCCATCCAAAAACACTCCTTATCCTTAATTTATAATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAACAGTTTTAAATTTAGAACGACGGAAGACGGCGTTTCCATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAACAACTTGATGTTGCTAGTTTACCTGATGATCAATTTTATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAACGTAGAAATTTTCGATACGGATTTCGATACACTAATGTAATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAACCTTTGGCAGAGGAAGTTGGTCATCATCATTTGACTGTATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAACGATAATTAAGTAAGTCGCCTGCAGTTTCCGGTCCAATATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAACTATCACGGAAGTGCAAGAGTCGGAGAGTTCTGTAGATATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAACTGCGCAGGGTGATGCTAGTCTTGTAGGTGCTAAGTAATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAACGACAACCCCACTTTAACCAAAAGCAGGCTAAAAGACATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAACATGAAATCTTAAAAAAGAGAAAGAACAGCAAGAAGCAATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAACTAATGTCATATAGTATCATATCAATAAAAAGCGTTGATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAACGGGGCTAACGCGCTTAATTGTTCGCGACTAGCTTATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAACATACATGCAGTTTATTATTCGTTTTATTCAACCGTATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAACATGAAACGTCCGAAGCTAGTAGGACATGAATTGGTGAATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAACGGGGAACCATTTTGCAAAGCTCATTATAAGAATACAATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAACAAAAAAGAAGGCTGGCGCGCACGTTTTCCAAACAAATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAACAAGTTAAAAGTGTCTAAAGAAAAAGCCAAAAAAAATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC >NC_011660|1|1|2094578-2096358|CRISPRCasFinder TTTATGATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC TCCGATTGCATTAGCTTTTACAGGTGCTTTGTTAGT ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC GGACGCTAATTTTGTAAATCCGTTTTTCATTGTTA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC TGATGGCGCTAAAAAAGCATGGGGAGCGGTTCAAGAT ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC AGGAATTTCCAGAGGAGCATACTCGCACATTGAAAA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC CAAAGTAATCCAAGAGAGACTGGGGCACGCAGACAT ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC TAGTTACCATACTACCGCCAACTTTAAAAGAATA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC CCAAAAAATGCACAAAATAACCTAGAAGTTAAAACC ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC ACCGGAAAACAAATTTAGGCTTGATTTCTTTACTTTC ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC ATGAAGATGATTTCAAACTAGCTACAGATAAAGATA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC TCACTGTCTTTCACTTTAAAAGTTGCTCCAGAAAG ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC GCCATCCAAAAACACTCCTTATCCTTAATTTATA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC AGTTTTAAATTTAGAACGACGGAAGACGGCGTTTCC ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC AACTTGATGTTGCTAGTTTACCTGATGATCAATTTT ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC GTAGAAATTTTCGATACGGATTTCGATACACTAATGTA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC CTTTGGCAGAGGAAGTTGGTCATCATCATTTGACTGT ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC GATAATTAAGTAAGTCGCCTGCAGTTTCCGGTCCAAT ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC TATCACGGAAGTGCAAGAGTCGGAGAGTTCTGTAGAT ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC TGCGCAGGGTGATGCTAGTCTTGTAGGTGCTAAGTA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC GACAACCCCACTTTAACCAAAAGCAGGCTAAAAGAC ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC ATGAAATCTTAAAAAAGAGAAAGAACAGCAAGAAGCA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC TAATGTCATATAGTATCATATCAATAAAAAGCGTTG ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC GGGGCTAACGCGCTTAATTGTTCGCGACTAGCTT ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC ATACATGCAGTTTATTATTCGTTTTATTCAACCGT ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC ATGAAACGTCCGAAGCTAGTAGGACATGAATTGGTGA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC GGGGAACCATTTTGCAAAGCTCATTATAAGAATACA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC AAAAAAGAAGGCTGGCGCGCACGTTTTCCAAACAA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC AAGTTAAAAGTGTCTAAAGAAAAAGCCAAAAAAA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC >NC_011660|1|1|2094578-2096358|CRT TTTATGATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC TCCGATTGCATTAGCTTTTACAGGTGCTTTGTTAGT ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC GGACGCTAATTTTGTAAATCCGTTTTTCATTGTTA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC TGATGGCGCTAAAAAAGCATGGGGAGCGGTTCAAGAT ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC AGGAATTTCCAGAGGAGCATACTCGCACATTGAAAA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC CAAAGTAATCCAAGAGAGACTGGGGCACGCAGACAT ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC TAGTTACCATACTACCGCCAACTTTAAAAGAATA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC CCAAAAAATGCACAAAATAACCTAGAAGTTAAAACC ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC ACCGGAAAACAAATTTAGGCTTGATTTCTTTACTTTC ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC ATGAAGATGATTTCAAACTAGCTACAGATAAAGATA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC TCACTGTCTTTCACTTTAAAAGTTGCTCCAGAAAG ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC GCCATCCAAAAACACTCCTTATCCTTAATTTATA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC AGTTTTAAATTTAGAACGACGGAAGACGGCGTTTCC ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC AACTTGATGTTGCTAGTTTACCTGATGATCAATTTT ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC GTAGAAATTTTCGATACGGATTTCGATACACTAATGTA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC CTTTGGCAGAGGAAGTTGGTCATCATCATTTGACTGT ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC GATAATTAAGTAAGTCGCCTGCAGTTTCCGGTCCAAT ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC TATCACGGAAGTGCAAGAGTCGGAGAGTTCTGTAGAT ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC TGCGCAGGGTGATGCTAGTCTTGTAGGTGCTAAGTA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC GACAACCCCACTTTAACCAAAAGCAGGCTAAAAGAC ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC ATGAAATCTTAAAAAAGAGAAAGAACAGCAAGAAGCA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC TAATGTCATATAGTATCATATCAATAAAAAGCGTTG ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC GGGGCTAACGCGCTTAATTGTTCGCGACTAGCTT ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC ATACATGCAGTTTATTATTCGTTTTATTCAACCGT ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC ATGAAACGTCCGAAGCTAGTAGGACATGAATTGGTGA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC GGGGAACCATTTTGCAAAGCTCATTATAAGAATACA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC AAAAAAGAAGGCTGGCGCGCACGTTTTCCAAACAA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC AAGTTAAAAGTGTCTAAAGAAAAAGCCAAAAAAA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC >NC_011660|1|1|2094643-2096358|PILER-CR ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC GGACGCTAATTTTGTAAATCCGTTTTTCATTGTTA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC TGATGGCGCTAAAAAAGCATGGGGAGCGGTTCAAGAT ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC AGGAATTTCCAGAGGAGCATACTCGCACATTGAAAA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC CAAAGTAATCCAAGAGAGACTGGGGCACGCAGACAT ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC TAGTTACCATACTACCGCCAACTTTAAAAGAATA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC CCAAAAAATGCACAAAATAACCTAGAAGTTAAAACC ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC ACCGGAAAACAAATTTAGGCTTGATTTCTTTACTTTC ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC ATGAAGATGATTTCAAACTAGCTACAGATAAAGATA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC TCACTGTCTTTCACTTTAAAAGTTGCTCCAGAAAG ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC GCCATCCAAAAACACTCCTTATCCTTAATTTATA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC AGTTTTAAATTTAGAACGACGGAAGACGGCGTTTCC ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC AACTTGATGTTGCTAGTTTACCTGATGATCAATTTT ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC GTAGAAATTTTCGATACGGATTTCGATACACTAATGTA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC CTTTGGCAGAGGAAGTTGGTCATCATCATTTGACTGT ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC GATAATTAAGTAAGTCGCCTGCAGTTTCCGGTCCAAT ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC TATCACGGAAGTGCAAGAGTCGGAGAGTTCTGTAGAT ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC TGCGCAGGGTGATGCTAGTCTTGTAGGTGCTAAGTA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC GACAACCCCACTTTAACCAAAAGCAGGCTAAAAGAC ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC ATGAAATCTTAAAAAAGAGAAAGAACAGCAAGAAGCA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC TAATGTCATATAGTATCATATCAATAAAAAGCGTTG ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC GGGGCTAACGCGCTTAATTGTTCGCGACTAGCTT ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC ATACATGCAGTTTATTATTCGTTTTATTCAACCGT ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC ATGAAACGTCCGAAGCTAGTAGGACATGAATTGGTGA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC GGGGAACCATTTTGCAAAGCTCATTATAAGAATACA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC AAAAAAGAAGGCTGGCGCGCACGTTTTCCAAACAA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC AAGTTAAAAGTGTCTAAAGAAAAAGCCAAAAAAA ATTTACATTTCATAATAAGTAGTTAAAAC
>NC_011660.1|WP_012581880.1|2094136_2094505_+|DUF1304-domain-containing-protein MAILAFILTFIVMIEHIYIMILEMFFANTKLAAKTFGVEKELLANKKVQTLFANQGLYNGFLAAGLVWGLFFAGAEFAETVQIFFLSCVVVAALFGGATSSKGILVKQGLPAVLALVAVLLV >NC_011660.1|WP_003730181.1|2092574_2093990_-|multidrug-efflux-MFS-transporter MQQEATGGQKIRPIPIIASFLMAGFIGLFSETALNMALSDLIQVFDISSATVQWLTTGYLLTLGILVPISGLLLQWFTTRGLFFTAVSFSIAGTLIAALSPTFAMLMIGRVVQAVGTALLLPLMFNTILLIFPEHKRGSAMGMIGLVIMFAPAVGPTISGLILENLTWNWIFWISLPFLIIALLFGMKFMQNVSVVTKPKIDILSIILSTLGFGGVVFAFSSAGENGWGSATVLVSIIVGGLALGLFVWRQLTMEKPLMDLKVFKYPMFTLGLILVFISFMMILSTMILLPLYLQNSLALAAFSAGLVLLPGGVLNGLMSPFTGRLFDAYGPRALVIPGFIVAVVALFFLTRIEVGTSALTIIVLHSVLMIGISMVMMPAQTNGLNQLPPKLYPDGTAIMNTLQQVSGAIGTAVAITIMSAGQKAYMETAQGVGPEQMVASLTAGIQNAFVFGLIMACIGLLCSLFIRKAK >NC_011660.1|WP_003740448.1|2091438_2092443_-|ROK-family-transcriptional-regulator MAIPRDLKELNKKNIKSILRQQGAMTKAEIAEVTGLSVVTVNKLIRDLVENEEILEQDNSVATGGRRAVSYEINPNFQQVLVISLQEKWKKITYSFSVYNLLGEPEFVEDMSGEDLDITALKRNTKDLVCAFPKISCVVIGVPGIEIGGKLRAMDFPLLLNVQLRETLEAEVNLPVLVETDTNAAILGYKNRPVKEENIVGLYYPERFPPGAGLLMNGEILKGQNGLAGEIKHMPLQVDWDNFDFSVDEIKAHIRKMVLLTMSFYDPETIVLYTNFYFGQKDFTEELTEELKQVYPYAVLPEIVLSRKFTTDYRIGLLAFGIDYLENNMTDWRI >NC_011660.1|WP_003730183.1|2090090_2091407_+|6-phospho-beta-glucosidase MTKGIKIATIGGGSSYTPELIEGFIKRQDELPVRELWLVDVEAGREKLEIVGNLAKRMVEKAGVDMEVHLTLDREEALKGADFVTTQLRVGLLDARVKDERIPNSYGVVGQETNGPGGMFKGLRTIPVILDICKDMERLCPDAWLINFANPAGMVTEAVLRYSNQKKVVGLCNGPIGIERNIAETLGVDVSEIYVEFVGLNHMVFAKTVYHNGKDVTKDVVFKMTEDEAGSSLKNINATGWDKTFLRTLNMIPIDYLRYYWQTKQQLEDQARAYAEHGTRAEVVKKVEAELFELYKQEELAEKPKQLEQRGGAYYSEAACNLINSIYNDKRDIQIVNTRNNGAILDIDPDSAVETNCVITRQGPIPLASGRLPIAINGIIQEIKTFERLTAEAAVTGDYDKALLAMTINPLTPSESVAREMLDELLEAHKEYLPNFFK >NC_011660.1|WP_003721316.1|2089136_2089889_-|MurR/RpiR-family-transcriptional-regulator MLFLDKNLELNDTELDIYNYIVANLDKVVYMRIRDLATEAHVSTTTILRFCRKFGCNGFSEFRVKLQLYLEEQKLAQIDMADETTYIDFLKRTAQPEFKAQIQNAVEILRDRELVLFAGVGSSGVIAEYGAIYFSSLFTLALHIEDPLNHPFYHLSSKLSDKICMIAISVEGENEDIIRYIHQLKAQNCKVISITNSAKSTIARLSDANIAYYINKEMYQEANITSQLPALYTIENIAREIRTQLDKEKM >NC_011660.1|WP_003730185.1|2088585_2089029_-|hypothetical-protein MYSNMKEKVVFTLIMCSLMILCMSSYNIFLENGIGTDSLLIVLKAFVPFLFIGFLLDFFVVGKIVYRLHALLVSEDASKFKKIIMMQLLMVTFMCVLMSTLSLIVNQGEWSHLGFLILRNYFVALFLQIFIVSPFVRLISPRIFALL >NC_011660.1|WP_012581879.1|2086878_2088540_+|SulP-family-inorganic-anion-transporter MFKHILLSLNGYKISYLRNDVISGVGVAALTIPVAMGYAQVAGLPPIYGLYASFLPVIAYVIFASSPQLIFGIDATASAITGSIILGTAGLAAGSKEAIALAPILAFFCAIFLVLFSVLKLGRFAKYISAPVLSGFISGLSVSIIMGQIPKIMGLKESGDSFFSSLGIIFGQFFQSNWISFAMGVVTVIIVITCKKVIPKIPMSLVVLILGTMAAYFFRLDQYNVDIVGKIPVGFPSLALPDFGASSWALAIGGGLVCAIATFAGSLLPSESFAMRNKYTIDDNRELFAYGISNFVAAFSGCSPASASVSRTAANEQFRGKTQMVSIVAATIIALIVAFLSGLLYYMPQPVLSGIVFAALVGIIDVDVLKGLFKVSRREATVWIVAALGTLLVGVIFGVLLGIFLSFINVVSRSMKSPIAILGVIEGRHGYFDLKRKPEAKPIPNVVIYRYSASLFFGNFNKFADGLKEAVQDDTKLVIFEASAIINIDTTATESMKDLLKWLDDKGIEYYFADLIDHLKTSFRKHDLGYIIDNGYTKKTVEDALDAYHAEHK >NC_011660.1|WP_012581878.1|2085999_2086740_+|MerR-family-transcriptional-regulator MQIKDLAELTGVSVRTLHHYDKIGLLVPQKDDWNGYRIYSENDVDKLQQILFFKELDFPLKKIKQILDDPFFDKNVALDLQRHLLIEKKQRIETMLATLDQTIRNEKGEITMTNKEKFTGFDFSTNPYEEEAKKRWGDKVVEKANEKVNNMSEKEKLTLKESFDAEFRHLASVRELAPESEEAQLAIDHFFHYLNDTHGNIYSLEAFAGLGEMYVADERFTKNIDQFGDGLSHFLKEAMNIYAKTK >NC_011660.1|WP_012581877.1|2084284_2085760_-|hypothetical-protein MKGKIKSSSMWLWHHLTPQIFAVICVFIITLIALFVPPYIGMADNGDFFRIFSSNGLFVNNTNYDALQFGHFVKEFGIYQYFNENQVAIYSSQSIFIQMALLLNKLFWSTTVFDVRFLGGLQLALLLPAIYLLVAGLTAKMKGWPGYVVAALTVFIFADTAYTAYFNSFFSEGLILIMMLYISAGFLLLYQHKYNDYAMLGLIFVASLILITAKQQNAPIAVVIAVCGILVFFIRKNRAFRISAAATFFVIFLSGVVMYAFIPGEFVTINQYQTMTRGVLLDSENPEKSLEEMGMNSEFALLKGTNFYQKYKMIDLDSKLMEKEFYPNYNFVTVLSYYLENPKQFGKMLDLSAQNSFSIRPFEMGNFEKATGYKFKEKTHFFSIYSDVKEKLAPAKFTFLILWALVFLICYGVSAFKHFREKNIRGMLLFDLVVLLIGSGFAVILVTIVGDGEADLTKHNFLFNVCFDLTMLIGAASLLEVYLKKRGERNA >NC_011660.1|WP_012581876.1|2082795_2084292_-|hypothetical-protein MRKKMIVSILLAFVIFVVGEHSVIAKSDDGVVVFYDSLATGTENEGNMDALLRMLNSLGKRVTIYSWEENPDLSQTSEIIVLQNKKDGLSNEWTNKLAKSKAKIAYIGGNPPTFITDKLELKTKVMTDASITIQTAAGLSGKPQLVNETNLITSYKGTSFGEMDAAENGQAAYGIQAGNYAYAPIFQADNTSEFALMDVLKALFDIKTTTNQYAFITGVNPFIDFDLLKKTADTFYEKGIPFIVSAGPVFYNQDFQAAKNYAEILRYVQAKNGTIMMNVPAVTYGDSPAGELERIMQKSVHFFAENDVAPLGVTAELYWNFDKVYGVEGFAPFNTGILLPNQKIIHTTKVNNGSAFEKSPYSVANDLYATTTEGRNFPIDIAITYSFFDNEKELKAAAEELANDNISDFRFQDHEVKTNKDTIESSAGSLYINNQSVTLDDDLNYIKTKNKTVKQAGSLEGFFGYQNTFFTIVIVLSLGIIGVLFVFGYRLYMKKYMK >NC_011660.1|WP_003721310.1|2096555_2096834_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYVILIYDISIENGGAKVWRNVFKICKKYLTHVQKSVFEGEITPALLVKLRMELDKYIRDDQDSVIVFSSRQQRWLEKEFWGLTDEKTSNFF >NC_011660.1|WP_012581882.1|2097136_2099320_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MHKYLAKSNPEETIQEHTDNLLKNYQRLKKLYPAVEIDWYLLELVCLLHDLGKMNLLFQTKLGNASGKGKEIPHGYLSVAFVPDSKLEEMGYSEDEIKVVYQAVARHHERKYDFSDSEWKNEIIRLEEQWEGFNYSQLGENAEYSSEVEMLYFYPGSRIFEGNSVADTETFKKYVLLKGLLNRIDFAASGGIDVELENDFLIDSMDVQLAHFKAENPEADWNALQKYMMQHQNENIVVIAETGMGKTEAGLLWLGNNKGFFTLPLRAAINAIYERITKNIVTTNQAERVGLLHSETYSQYLLHEGNAEMDIDEYYTRTRQMSLPITICTLDQLFDFVFRYAGFEHKLATLSYSKVIIDEIQMYSPDLLAYLILGLSYIDKFGGKFCIMTATLPGIVTDLLLENGVDFVQPEEKFVSSRIRHSMEMVHTEIESEFIKPFFNNNRILVICNTISKAKKIYSELKDHFQGEEIHLIHSQFIKRDRSAKEKAIFKDGQKDSTKKCIWVATQVVEASLDIDFDLLFTELSDVNGLFQRMGRCYRNRALDVDTNVYVFDGGAKVCSGVGIFIDKLIFENSKAILNEHAGVLTEEKKMELVEQVYSAEALRGSEFYNDLIGTINYVKAFDSYELDKAEVRMRFRNINSVSVIPEEVWQDNVEEINSYFVTLRKTSKEISTKEKMIARTNLAEFMVSVPDYLYKKGESVVREINRYESVIEFKCGYSSDVGVFMR >NC_011660.1|WP_012581883.1|2099537_2100161_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKAIRVKLWQDLVNFKKPTSFQLKETYPLPPYSTVIGMVHTLCGFTSYHEMKISIQGKYFSKVNDLATRYEFKNGMTYDASRHQIKVDKYGVSRGVSTVELIVDLELLLHIIPEDSSLVPIIEKAFSEPIEFPSLGRREDIATIQKVDIVDVEKRQPSKSTEISDGYNAYVPISLTENNSIHFKSHESSVGRDKLLGTRYLLTEKYE >NC_011660.1|WP_012581884.1|2100147_2101017_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MKNKGLAMTIIFQAESANYGESLGNISSLKKISRNNGDQYTYISRQAIRYNLMDQIGEKEAPVKAEGGGDKKVIQFLSEATITDFPELDFFGYLKTEKGSGGQKRSAKVRLSNAISLETFKGDLDFLTNKGQADKLNENMNIAQAEIHKSYYRYTITIDLDQIGIDGEIALDNKEKARRVKKLMDTVAFLYRDIRGRREDLKPLFVIGGVYDVKNPVFQNIVDVADNNIVIKNIKDLLTYEDIKENTRVGIIDGQFANSDEVKAELKAESVPAFFNDIKGKIDAYYESN >NC_011660.1|WP_012581885.1|2101006_2102695_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MQTEIELRADDWLINAGLVGFLNIVGKENVRINGQSIYFKADLLVGFEDKYFNFFIQEYKETLAWFKIVSYKDTMERFRAEDFASFDEKALNDLNKYMKDVVKFYLKKSNYIKVFSLIDAKANVTKWLENLNAINLTKKQQWEDVKVDIVEKVKRNYIQLDFIIDFCLGEKGLKYLGAKNLIYSVINKGWTGTSFLYTKTKFADPYLDYKTSFLDPVLDYVDSDLSKAKYNCFNCNLPIKNLKTGLSFMNDIGFDIEKKTSHVWDFNNDVATCPICRLIYSCVPAGFTYVYGEGMFVNDSYGVEELHRVNERMRNSILRFNQDGINSTNTYRALVESITMEHENNRRYELADIQLVRYENEHYRFNLLSKKMLHIVNDSKGILKSLIRCGYKEGNLNVNLYKEVIQHLMNNENLFTLIHKLIYYKQTSVNGLYYNMGHVSGILDINTKFLKEMEVMTNISQNQLWFVQNCGKEFKEGYVKKKSENKISGITYKLLNSLKVNDKDGFMDTLLNSYSYLSMPIPDVFIKMFSNNEAFKSVGYAFMLGVGGEKTKKENGGNTDEK >NC_011660.1|WP_012581886.1|2102710_2103433_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRLKINCDFDSKIIPKDFQSKVVSLFKAGIMKSSPERYENLFGGNKHKQYTFSVYLPKPQNKGAEIQLNEANCIINFSTGDAETGIIFYNALMSLRGSKVLFGAGNHITVKNIQIVPEKKIIGKRTVLRTLSPVVSRDHNRETFKNWFYSFEDEEFEPTLKRNMLPYLIDAFGEQARYDLEKLKITPISMKKVVVYCHEIHIESSVGIFELEAEAYLQKYLVENGLGTMTGSGFGMIEQL >NC_011660.1|WP_012581887.1|2103785_2104601_+|histidine-phosphatase-family-protein MKKNIFKLLMALCAVLLIAGCGNSTSADKKETKETKEDGTVTFYVVRHGKTMLNTTDRVQGWSDAVLTPAGEEVVKSAGKGLKDVDFSAAYSSDSGRAIQTANLILKESDKSADKEVQTDQRFREFNFGSYEGDLNENMWTDIAKSQGKTLEEWQKAGISPKGFADSVAALDKTRVKEGENWPAEDYATIQARLKEGLTDVAKKESKNGDSNVLLVSHGLSIGALLDTIEPGYKLPAEGIKNASVTKITYKDGKFTIGDVNDLSYVEKGSK >NC_011660.1|WP_012581888.1|2104721_2106152_+|CapA-family-protein MKKLTYIIITGLVLVFIVGAFWITNSTNKTEQKATPTETPKKAKPANVKTISSQAKKTLNSLASSGADKASISDLNQLIKELKSYQVEKNDSGTYLQNLTACLEAVKSYTTGKADEKALGKVYPDFLASEQKLSAIEKTSQYDWFYAAAATNQQGLKEKGVVTLTMVGDNSFGTYPETPEHLKFDNVFKKNNGNNTYVFKNCLPWFKSDDYTVINAESAFTNATKAENKMWRIKSDPAHVAFLPASGVDAANLANNHTMDYFQVGYDETLKAFKDNNIPVFNADAPLETTIKGMKTVLLGYDCRMSQQSPAYLERIVKDVKKYKKEDTLVIVNMHWGVEYRETPTDYQTQFGHAILDAGADIIMGSHPHRLESVEKYKDKYIVYSMGDFAFGADPTLLSRMTSMFQLRFTQEDNKIVLKDISIVPTYENSDGSTTENNYQPLPVFGDDAKKIVDELNRISKPIEGGVTEYTYFDPF >NC_011660.1|WP_003721301.1|2106198_2106630_-|universal-stress-protein MEKYHRILVAVDGSEPAKLAFEKGLELALKLDGVLGIASIVDLRAFSPNVSYDGSLEEKAELELKTSVNEYAEKARTAGVKQVETFVAKGNPKILLSTDIPAEFQADLIICGATGMNRVEKLVLGSVSSYIMAHAICDTLIAR >NC_011660.1|WP_012581889.1|2106730_2108572_-|LapB-repeat-containing-protein MKKVLKIFLVTICMFIMIYPSTAAHAEETSDVVNIPDDNLKAYLNGQLKQSGVAPITKKQLATITNVTLSGTSYTDLTGLEEADNLVTLSLNNTNIKTLEPIKNQTSLTYITVSGDNVKDSLFVDLNGLVNLQSLSISGSEVTHNVFKMFNKLPKLTYLYAQNSMKITDISELASLPALTTLFLQFDGIDDFRPLNDFESFKNGNLKALAAFGQNTGRTNPRITLKSGKLDYNEANQTLYLPFSMMPKPLTSFDGTVAPFSKSTSASNTYLGFNDVALPSSRLSITDDGITVSGVTKEEFDNLNEIEYNARYDFPTGSYPTPPSMNSYTISSGTYDQYFDISHTLDLTADESFDYNQYDATSEEQFLKDIHAETDDGTAVQSDFDQVVKLDVPGEYTVTLNAENAAGLKATPVTVKVTVHEKPVITADSQISYKKESTKSVDEFLQEIHSSVTGNAVLTSDFDKVVDLNTPGEYTVTLHATNDRGQQADPVTVIVTVTASDGGHVNPIPPTPEVKPTPQEETDPTIIPEPQSENSEDQVKENNTKTEEKANKTSLTTKENKVEKADKAEKAEKANQAKTKALPQTGDTNKNGLPIAGVMLSLAALLIIRKSKS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_011660_2 | 2111971-2112389 | Unclear |
I-A
Consensus repeat of NC_011660_2
|
6 spacers
spacers of NC_011660_2
>2.1|2112000|37|NC_011660|CRT GTGGCGCGCTATCAACGACTTTCCCATCGTGACGATT >2.2|2112066|36|NC_011660|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTCAAACGGAAATGGATCCACTGCTAAATCTTCCGG >2.3|2112131|37|NC_011660|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GAGGCAATGAACATAGGACTGAAAAATAAATGAACAG >2.4|2112197|35|NC_011660|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTGATGGGATTATATGCCGAAAATTAAATATACG >2.5|2112261|37|NC_011660|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GATAGTCAGAAACATCAAGATAAACTTGCCAGTATAT >2.6|2112327|34|NC_011660|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GTTAAGCAATTAAAACAGGGCGCAGTTGGGGAAA |
cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_011660_2
The CRISPR arrays of NC_011660_2 >merge|NC_011660|2|2111971-2112389|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GATTTATATTTATGATAAGTAATTAAAACGTGGCGCGCTATCAACGACTTTCCCATCGTGACGATTATTTACATTTCACATTAAGTAACTAAAACTTCAAACGGAAATGGATCCACTGCTAAATCTTCCGGATTTACATTTCACATTAAGTAACTAAAACGAGGCAATGAACATAGGACTGAAAAATAAATGAACAGATTTACATTTCACATTAAGTAACTAAAACATTGATGGGATTATATGCCGAAAATTAAATATACGATTTACATTTCACATTAAGTAACTAAAACGATAGTCAGAAACATCAAGATAAACTTGCCAGTATATATTTACATTTCACATTAAGTAACTAAAACGTTAAGCAATTAAAACAGGGCGCAGTTGGGGAAAATTTACATTTCACATTAAGTAACTAAAAC >NC_011660|2|2|2111971-2112389|CRT GATTTATATTTATGATAAGTAATTAAAAC GTGGCGCGCTATCAACGACTTTCCCATCGTGACGATT ATTTACATTTCACATTAAGTAACTAAAAC TTCAAACGGAAATGGATCCACTGCTAAATCTTCCGG ATTTACATTTCACATTAAGTAACTAAAAC GAGGCAATGAACATAGGACTGAAAAATAAATGAACAG ATTTACATTTCACATTAAGTAACTAAAAC ATTGATGGGATTATATGCCGAAAATTAAATATACG ATTTACATTTCACATTAAGTAACTAAAAC GATAGTCAGAAACATCAAGATAAACTTGCCAGTATAT ATTTACATTTCACATTAAGTAACTAAAAC GTTAAGCAATTAAAACAGGGCGCAGTTGGGGAAA ATTTACATTTCACATTAAGTAACTAAAAC >NC_011660|2|2|2112037-2112389|PILER-CR ATTTACATTTCACATTAAGTAACTAAAAC TTCAAACGGAAATGGATCCACTGCTAAATCTTCCGG ATTTACATTTCACATTAAGTAACTAAAAC GAGGCAATGAACATAGGACTGAAAAATAAATGAACAG ATTTACATTTCACATTAAGTAACTAAAAC ATTGATGGGATTATATGCCGAAAATTAAATATACG ATTTACATTTCACATTAAGTAACTAAAAC GATAGTCAGAAACATCAAGATAAACTTGCCAGTATAT ATTTACATTTCACATTAAGTAACTAAAAC GTTAAGCAATTAAAACAGGGCGCAGTTGGGGAAA ATTTACATTTCACATTAAGTAACTAAAAC >NC_011660|2|2|2112037-2112389|CRISPRCasFinder ATTTACATTTCACATTAAGTAACTAAAAC TTCAAACGGAAATGGATCCACTGCTAAATCTTCCGG ATTTACATTTCACATTAAGTAACTAAAAC GAGGCAATGAACATAGGACTGAAAAATAAATGAACAG ATTTACATTTCACATTAAGTAACTAAAAC ATTGATGGGATTATATGCCGAAAATTAAATATACG ATTTACATTTCACATTAAGTAACTAAAAC GATAGTCAGAAACATCAAGATAAACTTGCCAGTATAT ATTTACATTTCACATTAAGTAACTAAAAC GTTAAGCAATTAAAACAGGGCGCAGTTGGGGAAA ATTTACATTTCACATTAAGTAACTAAAAC
>NC_011660.1|WP_012581893.1|2111252_2111894_+|hypothetical-protein MKKFVTAMLFLTFLLLVGCSAQNEKAAPPSEKEVKVTKETKISKNGSIDADYDIPEDSKELENKSEDIVKVKLVKNKKIGDYDKEKMEYSSTISEVEVLETYKGTFKKGDKIDVSEPWYLNEGAYESIENYIALEQEQEYTLFLRGGHDSEKLSSIISMGYGKFNEDLKETDATLTDFENLGEVEAYNFISEEQEEVTNYTEIKEDVLKEFND >NC_011660.1|WP_012581892.1|2110705_2111242_+|hypothetical-protein MKQSKKSWKVMAAIVIILSITFTTTLTSNAADLRNGSAFSFKLSDPKGKFNNGATISAHKKAFDTAYAKINASSSRIKLVRSGSGPTIRTRSTNKRDEWYGQMSGNSKGSTITINKYTTTRDKFNQANYNKTALHEMGHAFGMKHQSSSSITVMKQGKYAYNDYTTLDKNNIKYKYGK >NC_011660.1|WP_012581891.1|2109801_2110482_-|type-1-glutamine-amidotransferase MIIDVLQHVPHEGPGLIANWARENQHQLKIHSLFEENAHVPNDSDFLIVLGGPMGINDTAEFPWLKDERKLIKRLSEQHKPVFGVCLGAQQIAATFGSEITVNKEKEVGWFPVKSTSDKLSFFPESLNVFHWHQDTFALPAGATRLFASEGCLNQAFLYGENIIGLQFHFEMEKAGIETILQIDEAFITSGKYVQSVEVMREKDVPEDNKQMLEAILDYLINPKTI >NC_011660.1|WP_041176481.1|2109417_2109777_+|Lin0512-family-protein MEQILFIQTGFGVDVHGQNITKAAERAVRNAIFTNSMPGIQGLLPDGDLQNMVVNIKLALPCDADKLDEDAIRAIIPYGTVTIEKIAGGMMTTSGIFLEDKEDKNDLMYIVNASVETGY >NC_011660.1|WP_003725724.1|2108952_2109411_+|winged-helix-turn-helix-transcriptional-regulator MNNEQNMNQQIALFYFGYKAFTETADLIIAKHSLKRLHHRILFFTARMPGLTINELLTFLEISKQALHQPLAELKERELLTIEQGRRDKRQRCIFLTTAGKELENELGAAQRKQMAEIFANSSDTDGLHFTEVMEGYAKNRPGAALIKDFKE >NC_011660.1|WP_012581889.1|2106730_2108572_-|LapB-repeat-containing-protein MKKVLKIFLVTICMFIMIYPSTAAHAEETSDVVNIPDDNLKAYLNGQLKQSGVAPITKKQLATITNVTLSGTSYTDLTGLEEADNLVTLSLNNTNIKTLEPIKNQTSLTYITVSGDNVKDSLFVDLNGLVNLQSLSISGSEVTHNVFKMFNKLPKLTYLYAQNSMKITDISELASLPALTTLFLQFDGIDDFRPLNDFESFKNGNLKALAAFGQNTGRTNPRITLKSGKLDYNEANQTLYLPFSMMPKPLTSFDGTVAPFSKSTSASNTYLGFNDVALPSSRLSITDDGITVSGVTKEEFDNLNEIEYNARYDFPTGSYPTPPSMNSYTISSGTYDQYFDISHTLDLTADESFDYNQYDATSEEQFLKDIHAETDDGTAVQSDFDQVVKLDVPGEYTVTLNAENAAGLKATPVTVKVTVHEKPVITADSQISYKKESTKSVDEFLQEIHSSVTGNAVLTSDFDKVVDLNTPGEYTVTLHATNDRGQQADPVTVIVTVTASDGGHVNPIPPTPEVKPTPQEETDPTIIPEPQSENSEDQVKENNTKTEEKANKTSLTTKENKVEKADKAEKAEKANQAKTKALPQTGDTNKNGLPIAGVMLSLAALLIIRKSKS >NC_011660.1|WP_003721301.1|2106198_2106630_-|universal-stress-protein MEKYHRILVAVDGSEPAKLAFEKGLELALKLDGVLGIASIVDLRAFSPNVSYDGSLEEKAELELKTSVNEYAEKARTAGVKQVETFVAKGNPKILLSTDIPAEFQADLIICGATGMNRVEKLVLGSVSSYIMAHAICDTLIAR >NC_011660.1|WP_012581888.1|2104721_2106152_+|CapA-family-protein MKKLTYIIITGLVLVFIVGAFWITNSTNKTEQKATPTETPKKAKPANVKTISSQAKKTLNSLASSGADKASISDLNQLIKELKSYQVEKNDSGTYLQNLTACLEAVKSYTTGKADEKALGKVYPDFLASEQKLSAIEKTSQYDWFYAAAATNQQGLKEKGVVTLTMVGDNSFGTYPETPEHLKFDNVFKKNNGNNTYVFKNCLPWFKSDDYTVINAESAFTNATKAENKMWRIKSDPAHVAFLPASGVDAANLANNHTMDYFQVGYDETLKAFKDNNIPVFNADAPLETTIKGMKTVLLGYDCRMSQQSPAYLERIVKDVKKYKKEDTLVIVNMHWGVEYRETPTDYQTQFGHAILDAGADIIMGSHPHRLESVEKYKDKYIVYSMGDFAFGADPTLLSRMTSMFQLRFTQEDNKIVLKDISIVPTYENSDGSTTENNYQPLPVFGDDAKKIVDELNRISKPIEGGVTEYTYFDPF >NC_011660.1|WP_012581887.1|2103785_2104601_+|histidine-phosphatase-family-protein MKKNIFKLLMALCAVLLIAGCGNSTSADKKETKETKEDGTVTFYVVRHGKTMLNTTDRVQGWSDAVLTPAGEEVVKSAGKGLKDVDFSAAYSSDSGRAIQTANLILKESDKSADKEVQTDQRFREFNFGSYEGDLNENMWTDIAKSQGKTLEEWQKAGISPKGFADSVAALDKTRVKEGENWPAEDYATIQARLKEGLTDVAKKESKNGDSNVLLVSHGLSIGALLDTIEPGYKLPAEGIKNASVTKITYKDGKFTIGDVNDLSYVEKGSK >NC_011660.1|WP_012581886.1|2102710_2103433_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRLKINCDFDSKIIPKDFQSKVVSLFKAGIMKSSPERYENLFGGNKHKQYTFSVYLPKPQNKGAEIQLNEANCIINFSTGDAETGIIFYNALMSLRGSKVLFGAGNHITVKNIQIVPEKKIIGKRTVLRTLSPVVSRDHNRETFKNWFYSFEDEEFEPTLKRNMLPYLIDAFGEQARYDLEKLKITPISMKKVVVYCHEIHIESSVGIFELEAEAYLQKYLVENGLGTMTGSGFGMIEQL >NC_011660.1|WP_003725720.1|2112625_2113561_-|ribose-phosphate-pyrophosphokinase MAGKMKLFSVTSERPLATKIADYLDIPLCEVELQKFSDGEVKINIEESIRGTNAYVVQSMNSNVNERLMELLIMVDALKRASVHSINIIMPYYGYARQDRKARSREPITAKLMANLIQRAGADRLITVDLHAAQIQGFFNIPIDHLSAIPLIGDYLIENYGEKDVVVVAPDHSGVVRARRIADRLNAPIAILNRKPRPHEDEIMSVIGDVKGKVAIVVDDIIDTGVRATTSADILLEKGAVEVIACATHSVMAGNATERLQNSNIKEVITSDSIDLPEDKQFDKLTTISIGRILGRAIEGVQENRSLHPLF >NC_011660.1|WP_003725719.1|2113700_2114972_-|PTS-galactitol-transporter-subunit-IIC MDIILDFFKYIIGLGVTVMMPIIITILGVIFRKKISVAFKAGLTVGVGFVGLGVITSLMLTTITPVTKALVENYNFKLTATDIGWGVGSSLAWGTEVVPFVFVAIIATNILMIAFKWTKTMDVDIWNYWQPLFIASALYLTTGSMIIAILSSIINMAIIFKIADWTQKDVENVLGLEGISLPQIQTTGWALVGYPMNWLLGKIPGVRKINWSTEKVQSRLGIFGEPMLMGLIIGGGLAAIAQMPLSQVLQTGVTIAASLVLIPRMVSLLMDGLTVISEAAHEFMEKRFPGRELFIGLDSAVGIGHPFVLSLGLLMIPITLILAFILPGNKVLPLADLTALPFYMIFAIVPSKGNLFRGIFTGIVIVIITLYLSGAAAPLMTELAGQIGYNIPKDAVEVTSLAVGTQWYTWIVYYGLHWFGGIL >NC_011660.1|WP_003727301.1|2114986_2115280_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIB MKKKKIYVCCGTGIATSTVISKKVRAVLDEKRIPYEISQCTVQEVASKVSTSKPDIIVSSTTVTGDVGDVPVVIGRSFLTGLKKQETIDEILAILQD >NC_011660.1|WP_003730559.1|2115295_2116342_-|galactitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKALKLYGKRDLRYEEADMPTIEQPDDVILKVKTVGICGSDISRYSKLGPYVPGMVWGHEFSGEVIEVGSEVTDIEIGDRAAGCPALYCGECEYCKKGEFARCRKLTVIGARHPGAYAEYIKLPAENVVKIPDELDYEAAALVEPSAVVVHGFYHTKLQAGDDVVVVGSGNIGLLAIQWAKVFGARRVIAIDVDDKKLALAKEVGADVVINSLKEDPLEVVAAHTDGLNADLVVEAAGSPITSAQVFAYAKKGGGVVFLGIPYADVTIERFYFEKIVRSELTVWGSWNAISAPFPGKEWQTTIHFLANKQINIEPMITHRLSLAEGPEVFERIYERNEFFGKVLFFPE >NC_011660.1|WP_003725716.1|2116338_2116989_-|ribulose-phosphate-3-epimerase MAKIVPSVFGADIGRINEQLEVLEKNGIDLLHVDMMDGSFVPNIAFGPDQIKMMKKGTKLQFDVHMMVYEPDRYIPRLVEAGAHMITVHQEATTHLHRTIQLIKSYGVRAGVVLNPGTPPSTLEYVLDDIDCILLMTVNPGLGGQKFFQSSLEKIRKTKAYIGNRPIQIEVDGGVNAELAKECTLAGADLIVVGSYLFEGDIEANLEKLSKGVLTE >NC_011660.1|WP_003725715.1|2116999_2117398_-|hypothetical-protein MGSFFASFVDWLIGSPGRFVVNLIEDNMLIFMFVVMIYATTILYAKWTLAYYLPKKMNQLAEMKTWELDELYAAWQTEKKALPWYILVPSRNEFWVKSARNAPESTKLLHFSQQKLKLSDKEKLQKIIEIQS >NC_011660.1|WP_003721289.1|2117414_2117882_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MDVLEYFKEEMVRFSNEQDKEKLLTEMAEQLCEVGAVKPSYKDAVIKREKVFPTGLLTAHAGVAIPHTDSEHVIRPVVAVRILKKPVSFIEMASDNEAIDVRIVFMMALRSADEQLDMLQTLIQLIQDEEVMTTLLKAQETGDVLSAIEHFSKNN >NC_011660.1|WP_012581894.1|2117909_2118512_-|SIS-domain-containing-protein MDKQAILDNIHQTWQEEANAISRLPEVTSEEALVKTVETIAECTGKIVVAGCGTSGVAAKKLVHSFNCIERPAVFLTPSDAVHGTLGVLQKEDILILISKGGNTGELLNLIPACKTKGSTLIGATENPDSVIAKEADIFFPVSVSKEPDPFNMLATASTMAVIASFDAVIVCLMTYMNYTKEQFSVIHPGGAVGNKLLNK >NC_011660.1|WP_012581895.1|2118515_2120576_-|BglG-family-transcription-antiterminator MYLDNRSKTLFQEVIKNPNITNKQLEVKYKLSRYQISYSFQKVNEWLKWKNYPEVKRSKNGRFILEPELTALFSEKETRDPSVEYLPSENERANLILLMLLTAKEELSLAHFTTKIQVSKNTILRDLKVAQKLLPKETTVTYSRASGYQLAGSEWELRKVLTQVVSSVKEMFRGEHYFLSYSGIEKVQLMEIRRTLEEAEAMMQIKFTYEQIELLPYLLSVMFLRIRDRRLIDTAFHIDEKSLSDTREYHITDILLEKTGPVPEQERLFITLQLLTTNIFSGEILTEKLTEDLEKVVLTCLDLFEKKALVSLKNKHILIEKLLLHLKPAYYRIKYQMNLEDTLYEKFNQEFEALNFIVKEAFDPLAKFIGREIPAGEIFFISLFIGSDMIPQNDIYHKQKRAIVLCPSGVTFSKIMENILVKLFPEIHFYPTISVREYTFFKAEVDIVFSSIPLKDGENVFVVQPFMNDIEKTQLRQHVLQNLFGMGNQLTSIDKIMEVVERNADINDSNAIRDGIIDILSANTATDENKRVKKVYLHDLITEDNIMICEDVKNYQEAIRLASQPLLLQQAITANYVKTMIDNHKFHDPYIIIGEDIAIPHAMPNAGVNRLAMSLLVVKNGVYFSETEQVHFVIVIAPVDKEQHIEALYQIVHLAENHQILDDLLENVTKEKIMQTINQLVIREDE >NC_011660.1|WP_012581896.1|2120684_2121335_-|transaldolase MHLDSANLEDVKKIQTSSIFKGITTNPTILVKEKCNRQTAIKRILEHTDKQVFVQTVGFSYEEILADARMLLAMFGKEKIAIKIPAHEAGINVIDTLKKEDKTIQILGTAIYSADQAIAAALAGADFVAPYVNRMSAANIDPFKEIAGMRHFFDKKALKTQIMAASFKHSGQVMQAYESGADTVTIPYEIYLQMTNKVLAVEAIRVFNKDATLYEK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_011660_3 | 2143264-2143848 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_011660_3
|
7 spacers
spacers of NC_011660_3
>3.1|2143303|39|NC_011660|CRT AAGCTTCTCCAGTTTTTCATTATCAGAAAACATGGCAGC >3.2|2143381|39|NC_011660|CRT TAACGCTTCAAGACTAGTACAACCAGCAAACATGGCACG >3.3|2143459|39|NC_011660|CRT CAACTTCTCAAGGGCGCTACAATTTCTAAACATTTGAAC >3.4|2143537|39|NC_011660|CRT TAGTTTCTTCAGTTTTTCACAGCCATTAAACACTCTATA >3.5|2143615|39|NC_011660|CRT CAGCTCTTCAAGACTAGTACAATCTTCAAACATGGCATA >3.6|2143693|39|NC_011660|CRT CAGCACCTCAAGGTTTCTATTATCATAAAACATGTAAGA >3.7|2143771|39|NC_011660|CRT CAGTTCCTCAAGTGCCCTACAGCTGTTAAACATATCCCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_011660_3
The CRISPR arrays of NC_011660_3 >merge|NC_011660|3|2143264-2143848|CRT CATGTTAGTCACTGAACTGGTATCAAAGGTACTTAAATCAAGCTTCTCCAGTTTTTCATTATCAGAAAACATGGCAGCCATATTAGTTACTGAACTCGTATCAAAATTACTTACATCTAACGCTTCAAGACTAGTACAACCAGCAAACATGGCACGCATATCAGTTACTAAGCTCGTATTAAAATTACTTACATCCAACTTCTCAAGGGCGCTACAATTTCTAAACATTTGAACCATTGCAGTAGCGGAACTGGTATCGAAATTACTTACATCTAGTTTCTTCAGTTTTTCACAGCCATTAAACACTCTATACATATCAGTTACTGAACTCGTATCAAAATTACTTACATCCAGCTCTTCAAGACTAGTACAATCTTCAAACATGGCATACATATTAGTTACTGAACTCGTATCAAGGTTGCTTACATCCAGCACCTCAAGGTTTCTATTATCATAAAACATGTAAGACATATTAGTTACTGAACTCGTATCAAAATGACTTACATCCAGTTCCTCAAGTGCCCTACAGCTGTTAAACATATCCCACATAGTAGTTACCGCACTAGTATCAAGACCACTCAAATC >NC_011660|3|3|2143264-2143848|CRT CATGTTAGTCACTGAACTGGTATCAAAGGTACTTAAATC AAGCTTCTCCAGTTTTTCATTATCAGAAAACATGGCAGC CATATTAGTTACTGAACTCGTATCAAAATTACTTACATC TAACGCTTCAAGACTAGTACAACCAGCAAACATGGCACG CATATCAGTTACTAAGCTCGTATTAAAATTACTTACATC CAACTTCTCAAGGGCGCTACAATTTCTAAACATTTGAAC CATTGCAGTAGCGGAACTGGTATCGAAATTACTTACATC TAGTTTCTTCAGTTTTTCACAGCCATTAAACACTCTATA CATATCAGTTACTGAACTCGTATCAAAATTACTTACATC CAGCTCTTCAAGACTAGTACAATCTTCAAACATGGCATA CATATTAGTTACTGAACTCGTATCAAGGTTGCTTACATC CAGCACCTCAAGGTTTCTATTATCATAAAACATGTAAGA CATATTAGTTACTGAACTCGTATCAAAATGACTTACATC CAGTTCCTCAAGTGCCCTACAGCTGTTAAACATATCCCA CATAGTAGTTACCGCACTAGTATCAAGACCACTCAAATC
>NC_011660.1|WP_012581914.1|2141896_2142370_-|hypothetical-protein MKKKKVVVISLLLLLVSVIGISSYFLFKDKINLLDVDPSAVEWNGKKQKDTSGEENTIAIPGFEKVTLYANETKQAVNFHNPEINDCYFKISLIHPDGSVLWISDLIEPGKGMYSIELEKPLAVGEYENAVLKYECFSLNDQSPLNGSEINLKLVVV >NC_011660.1|WP_012581913.1|2141391_2141877_-|hypothetical-protein MNKLVLSTLSVAAMGMVFFSGGTAYAADKEGNTVVEYSVEGDYTLVVPEKVNLSNDNATEMSVKTINRNLEPGKEVEVTLSSGLSADGEIELQRVGATSDVITSSFKSNNSVVTMANPVIGSFSGYAMDETEVSKIQIGSPQGDKKAGAYQTTLTFTAAFK >NC_011660.1|WP_012581912.1|2141058_2141364_-|LPXTG-cell-wall-anchor-domain-containing-protein MKRKLVLAMVLISFCGMFFLSPDRVQASHTVVEVLISEDDLDVSEENVQEIPKKELAASSDKDNKQHTLPKAGDTVTNYTLLGLVLILIWLIMQRKRKKKE >NC_011660.1|WP_003733328.1|2140716_2140983_-|hypothetical-protein MARIEYGEEIQKSLLVLYSRGSTIDSICKEYGIPRYEFHKWMKLHDSDKLETKEVETFLQIRELKQQKNKLEEEILFLNEAINLLESP >NC_011660.1|WP_012581910.1|2139674_2140637_+|HD-domain-containing-protein MKMTDPLYGTFEIEPVLAELIQSPLVSRLAHVHQGGSSYLVNPLWDLSRLDHSIGVMLFIRKFGGSLEEQIAGLLHDVSHTAFSHVVDYALDFEEEDYHEQIFEDFVKTSTIPAILEKYGYSFEGIFDDISKWKILEQEAPELCADRIDYTLQDLYRHGKISLAEVEEFLQALVMVDGRLYLANIALAEWFVAQYYSEVIDYFYDPLNVYSYEILAEAMRIAFQQETITNADLRLTDAELLAKLNANSDAWEKIQLLESPHLEENEVDFTYHHKKKMRLINPSVLVDGRLIPADELSGKVREMNDWASEKSKHGSYIKVT >NC_011660.1|WP_003735640.1|2138993_2139554_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MAESLITKKAIAGGLMELCQHKRFEKISIADITNICGLNRQTFYYHFTDKYDLLTWTYENDFFHCLADGITLENWDKHVLKMLESIKENADFYKNTVSADASILSFCFSKLTNSLFMDLFEKIDTNGAVNEADRVFYAEFFSYGCSGVLIKWITRGFKEAPETIANQLFRLAKDTEFLANSMYREN >NC_011660.1|WP_003728986.1|2137183_2138884_-|oleate-hydratase MKNKKRTLVALTGAAIGTGIAAKKISEQKAAEKERAVDEAIKARYYGDKQVYFVGGGIASLAGAVYLIRDANFDGKNIHIIEGMHILGGSNDGAGSVEHGFVCRGGRMLNEETYENFWDLFSSIPSLDMPNFSVTEEILNFDHLHPTHAQARLVDKDRNILDAHSMGFNNNDRMLMTKLLATPEEKLDNLTIRDWFDEHFFETNFWYMWQTTFAFQKWSSLFEFRRYMNRMMLEFSRIDTLEGVTRTPLNQYESLILPLKTFLDKHHVDFTINQTVEDIDFKDAPGITATALHLSDGSTIELGPDDDVIMTNACMTDSATLGDMNTPAPKPEEKPISGELWYKVAQKKPNLGNPEPFFGHEEETNWQSFTVTCHGDKLLKRIERFTGNIPGSGALMTFKDSNWLMSTVVAAQPHFKAQDANTTIFWGYGLYPDRVGDFVKKPMKECTGEEILYELMCHLNWQDDFEEIKADIINVIPCYMPYIDAQFEPRAMSDRPAVVPEGSTNFAMISQFVEIPKDMVFTEEYSVRAARIAVYTLLDIDKKICPVTPHNRDPKVLAKATQTMFR >NC_011660.1|WP_003725208.1|2135929_2137033_-|23S-rRNA-(adenine(2503)-C(2))-methyltransferase-RlmN MEKSSIYGLTWTKLTEWLEAHGQKKFRATQVWDWLYRKRVKTFEEMSNVPKETIELLTANFVMNTLEEQVVQESTDGTTKYLFKLSDGNLIETVMMKQEYGLSVCVTTQVGCNIGCTFCASGLLKKSRDLTAGEIVEQIMNVQHYLDGRNLEERVSHVVVMGIGEPFDNYDNVMDFLRVINHDKGLAIGARHITVSTSGLAPRIIDFANEDFQVNLAISLHAPNNELRTSIMRINKTYSIEKLMEAIHYYVNKTNRRITFEYIMLKGVNDHKKEALELAALLGEHRHLAYVNLIPYNPVDEHIDYERSTKEDVLAFYDTLKKNGINCVIRREHGTDIDAACGQLRSKQIKRVGVRERMKQKQAAAEE >NC_011660.1|WP_012581909.1|2135360_2135840_-|AraC-family-transcriptional-regulator MEVEIVERNAFTAVGKKRTFSVENDAQKEKISQFWQEANTNGDAERINELAEFATIDGILGVCQMNGDKMDYYIAIESELTPPEDMEKLTIPASKWAIFKSVGPLPNAIQKVWEYIYGEWFQTSNYTHGNAPELEVYTEGDTTAADYYSEVWIPVVEKD >NC_011660.1|WP_003721271.1|2134837_2135203_-|heme-oxygenase-IsdG MIIVTNTIKVEKGAAEHVIRQFTGANGDGHPTKDIAEVEGFLGFELWHSKPEDKDYEEVVVTSKWESEEAQRNWVKSDSFKKAHGRTKDTREQREDRKGIVGNAIARFEVVHVQNPVIVEK >NC_011660.1|WP_012581916.1|2144756_2146295_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MREYLDSKSQKKVALLEKIFYAENHTCTQEELLNELNITYPTLISTIKTINFDIERFGYKEFSIVHSAPNLSYTLKISDNCSIQLIINAYIRESPKFQILETLLLSSFPNLQALAKKVHVSYSGIKKEIKELNEELSERNLYISTGNQVEITGDEFSLRIFYAFLFLVAYSGDRWPFSFVRYDEITDLLESCPKEIYRADSIDKAMMIHYYVAMHLLRDRMNCHIDTTRQFKVALYKACTEESKKSESAFIKKVAKQLPNRNYKEMTYTTQIILSTIVAFGSYSSIEKMPSFFYMDEQLEEMGFMKLVDFASERVNDNLSIPFSEKEMELLRYSFASINYRYFLLDNLINKFNNIVPGYTDLDRNIRKIHKVNHLEPLISQLVNLKEMDPLKPFEERLASDYLIILDKRIDFSIHTLPIKVTILSTISNETAVFDFMRYFSSYYNLEIINQVDPVVDLYISDFSVSPEVLTSLRINQPIVYVNTRWLESDYVKINDNLAKIARKKFIANKKD >NC_011660.1|WP_012581917.1|2146922_2148473_-|hydantoinase/oxoprolinase-family-protein MYKIGIDVGGTNTDAVILDENQQLIHSVKMPTSEDIETGITESLHRVLSETGIDRSKVTHAMLGTTQCTNAIVERKKLAKVGVLRLGYPATASVLPYTAWPEDMVGFLSGKYKLTGGGYEYDGQVLSEINEAEIRETLASWKGEVESVAVVGVFSSLKNDQELAVQKIIEEELGADIPVSISSSVGSVGLIERENATILNAALFKVIAATSDGFEKALEQEGIEHAEIYLCQNDGTLMSLNYARQFPILTIACGPTNSIRGASYLAGLKDAMVLDVGGTTSDIGVLTDGFPRESSLAVDVGGVRTNFRMPDIISIGLGGGSIVREKDGDITIGPDSVGYRISEEALVFGGKTMTTTDIAVRLGMAEIGNPELVAHIPTDFAEKAYKKIADMTEDAIDKMKTSSGSVSLVLVGGGSVIIPDEISGVAQIFRDKNGPVANAIGASISQISGQYEQIYIYSQIEREEALQDADQKAREQATLAGAVTDSIEVVEVEEIPLAYHPGNATRLRVKVVGNLV >NC_011660.1|WP_012581918.1|2148465_2149566_-|DUF917-domain-containing-protein MRYLDEQAIENIAIGAAFLGTGGGGDPYIGKMMALTAIKKHGPIKLLSPDEIADDDYFIPAAMMGAPSVLIEKFPKGDEFVRVFEKLGRYVGKEVKGTFPMEAGGVNSMIPIVVAAQLGLPMVDCDGMGRAFPELQMVTFHLDGISATPMAITDEKGNIGIMETIDNKWTERLARVTTVEMGASSLVSLYPCNGAQIKQSSIKNIVTLSEEIGKVIRETSMDEAEKLQKLLDVTHGYHLFEGKITDVVRETRAGFNFGRVKIDGLNKDTDSEVIVHFQNENLVAEKNGEPIAITPDLICMVDLETLMPVTTEALKYGKRVRVMALPADDAWRTDKGIETVGPRYFGYDVDFEPLEELVKKEERRHV >NC_011660.1|WP_012581919.1|2149566_2150850_-|cytosine-permease MTEKKSVEQTQSWQSLAFVWTGAMICVPSLLVGGTLISGMPLWEAILIALLGYGVIVLFMIYQGIQSSDLGIPAVSVASQVFGEQGSKKIISILLAIACLGWFGIQANVCGAAFSQFLGIYGINLPVPVSSLIWGVIMLLSAIYGIRILSILNYIAVPVLLFVCIYGLVVSLNDGGLAIVENYKPAGSMSFMTGLAITIGSFALGAVIAGDYSQYTKSRKDVVKAAIVGILPSGVLMITVGAVLALTAGTADISVVFTNLGLPVLGIIGLILAAWTTNAVNAFSGGIAIINVFNISEKYHKVAVAVAGGLGTILAVIGILNHFVPIMSVLSAMVPPVAGVMIASYWIVQKGDKSKWAPVSGVNWLGVSSWLVGAVIAGIPVILTFFPELPQLPNQPLIGIILSLAVYLIGAKVLSGKTNNVENLEGK >NC_011660.1|WP_012581920.1|2150984_2152580_-|PucR-family-transcriptional-regulator MSVKLADLMKLPSLKEAKVVSGKSGLSKLVSSISVLEYTEVALLEDDLFDNDEFYGSEIVVSAFVNIRDDVEAQCRTIERLHKVGEVALILYYVGIFVPKIDQKLIDFANELDFTIIVMPENEMSLRYSEVIYEVVEAIVKQEMTDTNFVTESLEQISSVRPPQRNIDTTLKILSDRTHTSLVLTDNSFQVINSITWPRTRHWDFERVIEASKQMGEHELVQLHLDERDFYTARKPIFQDGMQAMHLFMMKEKGALTADVAMQVTEVVQVFMNLWGRNYVEISTAELMKAILNDESVKMRRLGKILNVDVSSIKWMWLVKTEEIRDNEQVLAELKSFVASHFQVSLIDLFEDNIVVLLDNSVAQRDRTHTANEFALMMKEHGIDLKITVCQGMEQTSDVQSAYSLVNEYKNAANAIYANKSIYSLQEIDFAAKCVEIVDRGELAIAEQMRPLKSLEDNDELIETLSVFLLEGESNYNQAAELLFLHKNTIKYRIQRINELLQYPATKIPESYNLYLAVAIRRILGGNNNNK >NC_011660.1|WP_012581921.1|2152736_2153684_+|MoxR-family-ATPase MSIEPSIKINEIINEVEKVIVGKRHVVKLSLTALLAGGHVLLEDVPGVGKTMMVRTLSKTIGVSFKRIQFTPDLLPADVTGVSIFNPETRDFEFRPGPVMGNIVLADEINRTAPRTQAALLEGMAENSVTVDGITRKLANPFFVMATQNPIEYEGTYALPEAQLDRFLLKINIGYPTVEEEMQLLTLKQYQDPLDQTQQVVTLSELLDLKNKAKQVFIDDVLKNYIIRLVDATRKHPSVALGISPRGSLAFMQAAQAFALIEGRDYVIPDDIQYLAPYIFTHRLILKSEAYYNEETAESIIASILKNTSVPVEKR >NC_011660.1|WP_012581922.1|2153688_2154837_+|DUF58-domain-containing-protein MLKKRLLLAFRWIIMLIIYAGLWTYTLFQGDTASWFLTYFFSFILLLLFLSSIYPLKAWKVNRSFVKNTYHDGDLIDMQVSFTRKSRYPVGYLLFQQKIPASFGNVSARQQVVYPLFKKHFTVTLAGFVGVRGIHSFPPVDVETSDAFGLLERSRQLSSEKTLTIYPTYFPDVLEKISESSPENERNAAYWTLKKNSNLHSLREFSSGDRISLIDWKSSAKSDQLMTREFENSATSRLSVIFYGASHPNFELSLRAAYSFIRKISEDNGEIRVTLLGDQTSKFAPAKGTSRLQDISTAFAEIAPVDSLTLQESLDSNLHSGEKILLFTPCIDTMLMQKVTRLTDNKQLQIITFQSEHSKAMDAPAIFLEPASLLSRWEREAK >NC_011660.1|WP_012581923.1|2154833_2156993_+|transglutaminase MKRYLTLVMLFILSVLLISEWIYPFAELTELSTANWIILFITLSLGSFFLRLKYYWTIPLHVVMIIIVSGIYYAKGGILAGNWLGSFFQITFNGFRDMVQFRSSDISMDFILIVFLIALWLLSYITTYSILRKQRVMSVLVLTVAYLAVINTFTDYNSNWAIVRTVLEGFLLLHLALASRIAAPNRISADSLKRNGLFYHILVILLLAVFVFSSLMLPKKAPIFPDPIPTIKNALGINTTRTVGYSEDDTTLGGALKKDNATVFTARAEKGHYWRVESKTVYTGTGWANANSADVISFSSGDKFPIQLTEQTTGVTNTAEISFASSSDYMPYPYGTQTVNGAVDSFSANLTIERVGPVDTIKNYTVQLKTPVYNIEKMQNADFSTLSNAFVSQYTQTPKDLPDRVAKLANKVTKDADSIYDKTKAIERYLSASGTFTYSTEDAKETPRGADYVDQFLFETQIGYCDNFSTSMVVMLRSLGIPARWAKGYTPGEGEKKENDTKTTYTITNNNAHSWPEVFFPGTGWVPFEPTATFSNPENFQEPTTETANKPETPNDSTSTPETPNTPENTPEQNNGSSSTGETPKKEEPKTETAASNFEIPSWVWWIPAGLVVALLALAIIFRRRIRSYLLLRSLKNSPEFGKTYHRLMKLLASYGYVRESSETLRHFGTRVDAELTTTEFSRLTKMYEAQVYSNNLTEKVITAEETQLVQQVIARLTK >NC_011660.1|WP_012581924.1|2157109_2157865_+|DUF4866-family-protein MTTIFPKEQNVTPLFEQILANPTACRRFKDVFLDNLESYQETRGFEKDDTLFAKIILSAYRQSDVSALLLGVCGRTLFELLRQAFLIPKKLTVDNPFFLTDKEGNFIAKKDDISNREQEKFQEIYQSDLHHSETAIFLVDDDDIIHSYEPDFSISTKRINKKRGILVLYSLPDTLKLGMTESEVYAFIWKTFLHIQEIIPSSRIFYGQETSENADELGVFLPIHHFEKKMLQNIEQVNELVDALREQMVNK >NC_011660.1|WP_012581925.1|2157885_2158572_+|DUF1275-domain-containing-protein MARSRQISESIGLGLLLALAGGFMDAYSYIERGQVFANAQTGNILLFGINLSEGNWAIAIQYFWPVVSFTVGIAISEVIHRRDIRRLHWRQLSVLIEVVILIGVAFIPLDHNLIANSLISFVCGIQVESFRKMHGRGIATTMCIGNLRSATQNLCDYFEYKEKQYLRNSLLYFTVILSFIIGAVVGNFFIQLFAQYAILVCAFIQFIAFMMMFIDRESKIIIKKLPTK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_011660_4 | 2275647-2275851 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_011660_4
|
3 spacers
spacers of NC_011660_4
>4.1|2275663|47|NC_011660|PILER-CR CCTTGCTCTAGAAGAATTGACTTGTGAAAACAATGAGTTAACACAAC >4.2|2275726|53|NC_011660|PILER-CR CCAAAATACAGCTTTAGAGTATTTGTATTGCCCTAGAAATCAGTTAACAAAGC >4.3|2275795|47|NC_011660|PILER-CR CTCCGCTTTACGTTATTTGGCTTGCGATGTCAATCAGTTAACCAATT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_011660_4
The CRISPR arrays of NC_011660_4 >merge|NC_011660|4|2275647-2275851|PILER-CR TAGATGTTAGTAAAAACCTTGCTCTAGAAGAATTGACTTGTGAAAACAATGAGTTAACACAACTAGATGTTAGCCAAAATACAGCTTTAGAGTATTTGTATTGCCCTAGAAATCAGTTAACAAAGCTAGATGTTAGTAAAAACTCCGCTTTACGTTATTTGGCTTGCGATGTCAATCAGTTAACCAATTTAGATGTTAGTAAAAA >NC_011660|4|3|2275647-2275851|PILER-CR TAGATGTTAGTAAAAA CCTTGCTCTAGAAGAATTGACTTGTGAAAACAATGAGTTAACACAAC TAGATGTTAGCCAAAA TACAGCTTTAGAGTATTTGTATTGCCCTAGAAATCAGTTAACAAAGCTAGATG TTAGTAAAAACTCCGC TTTACGTTATTTGGCTTGCGATGTCAATCAGTTAACCAATTTAGATG TTAGTAAAAA
>NC_011660.1|WP_012582010.1|2270862_2271501_-|hypothetical-protein MGCDIHLMVEVRDKKLDQWKEYDIADELLKNIGRNYNLFSILANVRNGVGFANSDTGNAFIPIDNPRGVPNDASEKYIAYVENWGLDGHSHSFLDLAELKKYDWRGQKNKHRGFMNQKDYAEYKRTGKITRYATNVSGESVKKIANEAMDVVISGKVIPDKEADYYTLVEWEESYYESAVNFVDKVLPALEKIANDCNCENEDVRLLFFFDD >NC_011660.1|WP_012582009.1|2270225_2270510_-|DUF3130-domain-containing-protein MREIKVDERTFQQHATKLASESTRSYLPLKNGNMAYSRANSIDQLRSALIELVDVVEDFQHVTNQDASRLKKMGIAYAKQDQLMGQKINQLEVR >NC_011660.1|WP_012582008.1|2269856_2270225_-|hypothetical-protein MDSAHSQLEQQLQQIKKAKITAETDVDQTRRKQNEQDWLEEDSDQLTQEKLVLLDLLRSGWQGEEASGFHRYLEERQHEESQAWRRDLQDKRTDLDKELQENKNKLHTLETKHATLQKEWSK >NC_011660.1|WP_012582007.1|2268330_2269860_-|LXG-domain-containing-protein MSRIDIAELNDFLHGLRSSNAEAKAMIRQIKEAAMDYSQDDRLKGEAVTTSKRYFSSTYTSICQSIIEALDESEERLAQYIREFGSQVDSSPSARIDAEILQEAMTKVSQLQRKEEDLHRQLTAPNTKPDMQQVYAVKSRSVHTQLLKAIEQENILEKYLAFEQSHGQFFSALAELIQATGCAVQELLHHVTFNDKTGTYSVPKSAANSLLLMKRALDNARTENDKDPFPKAFEDYTVLAYTYVNDQGETVTMWLLEKDGKRVENKELQDFLEKHGQELDPLLYTNLSGEELERKVNDSWKEGINYLNGQKVSGFSGATLRSSAYVASMKDWTDDAGLTDMALSLGFGIAAARNKAIMTKKVNEPEAGEIAKRTSEIEKRIRENIEASKKTRKASGMKEYLKREKEVLERIKKANSKKTVTSSLGNEIDVTPRDNHTIVDKNPGPFGNPDSSVDILDSKGNLTTRRYYDRDGRAIRDVDMTDHGNAKKHPEYPHEHFWTYDSKGNPSRN >NC_011660.1|WP_009911295.1|2268086_2268314_-|hypothetical-protein MEYEQMADSLAYGEEYNFYYKNEEYWLSKNQEGHYLTKVSDGETQEFRTSEDLLGTARINGKLIIEIWEDIQSQF >NC_011660.1|WP_012582006.1|2267537_2267918_-|hypothetical-protein MKKLTTEQSFEYYLSSLCMLGMHTINLSDEEIEYEIFEELAIDYPAALSPYTRELLVDNDIIDRELSLLSKQLQTKLFELDGGILWNVKALRTTPEWKEVLRLSDEIKGLIHQQWTDEELDYLLGK >NC_011660.1|WP_012582005.1|2266585_2267413_-|hypothetical-protein MVKTGYFKVNGKYSFVEYYEEVLLEEIFKYMQQSRLALHRLKEIKRIAELLSWHDNDKSQKYLRETKKLETRMKELEKFWGIEDEISEKSFDDGTTIEVLDVIEEMVESIYKYLVLKQDAEKLTIEWLDELISSTMGILSSLQKKIGRTAEIGKHALKINEIQRTFKILQPAVSPKIFYHIKTNDAQMKKALSSLSKKKCQYLYFGLIDFSDVVDQMYNRLEGYEKLIYTASDDLLKYESFDEEKKRNRIIFGLTIVATIATILQVWDFVLGILT >NC_011660.1|WP_012582004.1|2266089_2266458_-|inorganic-diphosphatase MTSKQSIQKTQLSKTKKHTLKVTIDRPIGYTDKFGNVYPLNYGFVEGVIGGDGEEQDVYVLSRKISEPIDTFQGDLIAVITRNDDVEDKWVVAAPNENFTIEEIREKVHFIEQYFDSEIKLI >NC_011660.1|WP_012582003.1|2265858_2266047_-|hypothetical-protein MEERFEKIYTQGKLNIMEIWVDKETGVQYVYHLSGYAGGMSPLLDVDGKPLLADLSKLNGAE >NC_011660.1|WP_012582002.1|2263741_2265739_+|transketolase MSRIDEQMVNSIRVLSMDMIEKANSGHPGLPMGAAPMAFSLWKNHLKFNPEHPTWFNRDRFVLSAGHGSAMLYSLLHLFGYDLPMSELKNFRQTGSKTPGHPEFGHTVGVDATTGPLGQGFAMGVGMAMAEAHLGAKFNQPEFPVVDHNTYVLCGDGCLMEGISYEAASLAGHLKLGKLVVLYDSNDISLDGDLNESFSEDIELRFRAAGWQTLRVDDGNDLDALDAAIHLAKTEKSRPTLIEVKTVIGYGSPGKAGKSAAHGSPLGEKELKLAKEAYDWQMPPFELPKTVENQKEFYHSKGRASESSWLRTFNAYKQKYPALAESLQQLMDDNLDTDWDAELPVFDENADKPVATREVSGIVLQELEKKLPNLFGGAADLASSNKTHLKASERFAPSNYAAKNISFGVREFAMGAAVNGMTLHGGVQAFGATFFVFSDYLRSAIRSAALMGIPSTFIMTHDSIAVGEDGPTHEPIEHLASFRAMPGLHVIRPADGNETVEAYRYAFTQKEQPTMLVLSRQNLPILPNSAAKAKTGLAKGAYILADSPLDKLDIILLASGSEVHLMTAVRDNLAKKGFGARVVSMPSFDLFDKQSPEYKESILPKAVKKRFAAEMGASYGWHKYLGDTGEILAIDSFGMSGPGDELAERFGFTVENLTELALKQL >NC_011660.1|WP_003760263.1|2277254_2277935_-|hypothetical-protein MLEKKYQIHLQNHYDATSRQVQKKEIKVLKKRKNLLIGEVFPYQICLESTMEYSRFMLWFEKEVQKIVKELWNQHFIIKLTLSQLHFRETILFLEHLKDFSKRITIEFIGEDTPEIKKHFSVQEQEAFFIGKLRMLKKWKFIISKHIEGCSVEQTLAFTPCLHEIKYTMSQQARMEENIIDLHMFIDFWEYWATHKKLKFVVEVKEADFITKSLMHKKVHVQFENA >NC_011660.1|WP_077904905.1|2278072_2282119_-|MucBP-domain-containing-protein MLKKIFIALIALVVIINTVSFTAVSASTPTWLEQTMNSNEPFIKEIEKETGKTRANITQTDLEAITALRVTGASDIPTNIDMLTHLTTLEVKNGTLSSVSNSVGNLKELKILVLNDNNLSTFPMIAFQLPKLEELQVSGGTIEEIPATITNMASHLKFLGILNNHLVKVPDAIFTTNWTNATGGDLDLMAAGNQIVTNIPANYISQFNNGDNLLEFYDNNYQKQDQLTTTPGYTIDVPVGTDFNQLTPDKTKLALTSGRTLLAQHEFEYYDDGSSSLIHNGVAAAPGQATIFIKSKFSTQSNKFARTQVTVNITALNGGPITVKHEDTKGQELAPPVILNGKDGDPYTTTQKTFPGYTLVATPANQNGTFTMNPATVNYVYSANDYKLTSTFKDAQGQELKAPVVDTKDYHIQDNYTTTAATIPGYSLVSTPANQNGTFGAGNVTVNYVYKKDDYTLTSTYKDTNGQELKAPVVDATTYHYQDTYTTTAAVFPGYTLVATPTNATGTFGSSNITVNYVYQANGYQLTSTFKDQQGKTIAPDDVDTKTYHVNDPYTTTAKTIPGYTLVTTPANDQGNFGTSDITVDYVYKAEDYTLTSTYKDAQGKELKQPVVDSKKYHIQDNYSTSAATIPGYTLVATPANETGTFHTSDVTVNYVYKLTDLKLTSTYKDAQGTELKPPVVDSKTYHIQDNYATTAAVIPGYTLVATPANQSGTFGSTDIQVNYVYQAVAYKLTSTYKDQQGNDLALPKVDSKTYHIQDGYTTSDIAIPGYTLVAAPTNQTGTFGASDVTVNYVYKANDYTLTSTYKDAQGKELKTPVIDSQKYHINDTYTTTGATIPGYTLVAAPANQSGTFGAANVTVNYVYKADDYTLTSTYKDANGKELKAPVVDSKTYHTKDNYSTSAATIPGYTLVAAPANQTGTFNTSNVTVNYVYKANEYTLTSTFKNVQGTELKPAVVKKGFIIKDGYATSGVTIPGYTLVATPSNKKGTFGASNVTVNYVYKANGYALITTYKDTQGKDLKPLAIDTKTYNINDPYTATALNIPGYTLTTTPANEKGVFGASDETVNYVYKANDYTLTTTYKDANGKELQAPKVDAKTYHIQDTYKTTAAVIPGYTLVATPKNDQGTFGANNVTVNYVYQTNDYTLTSTFKDAQGNELKAAEIDAQKYHIHDTYTTKAAVIPGYTLEKTPTNETGTFNASDIQVNYVYKANDYQLTSTFKDQQGNEIALPTVDAKTYHIHDAYTTKARLIPGYSLVAAPTNQIGAFGTSDVTVNYVYKKDAIIKPITPAKPTILTIKTPASKVIKTKVVKQTLPKTGDDDAGLLNLLRLIGLVLILGVFLAVGSKKLR >NC_011660.1|WP_012582015.1|2282320_2283193_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MISYGELIRQIRQSKKISQKEVYTGVISKSYAIEFEKGTHAISSLLLEKIVAKLMVSMEEFFLMYHQEELPEKEDFWETYARTCKTDEASAWESLYQKISLEKGKVNQVKSAAIKLELDHIKGKQVADKKAVQILENYLIEAVFWTLQDIFLFTRMMHYLPLKSRVPFYYKLLNTLDRYRHFERGRSILQSALASIMDDFIERNEIEHMELMIKSLEKISEDCDGTYFKILCMYYRGIVRWGEGEEREGGEEIDQAVAILRALGYENKAAEYETMYRQFARENNDIKTME >NC_011660.1|WP_012582016.1|2283355_2284258_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MGSYGELIREIRLSKGLTQKEVYTGIISRSYAIGFEKGKHEITLSLFEEILKRIMVPLDEFFFIYRDFSSTEDDSFWIDFVELSGKNDVVGMQALLDKITLERTEQSEVRKAILHTRIQTINHYLRTNVFDESNISDEYKKIIHDYLWKMQTWTLEEVRIFSNGISFFEEEVQIHFYQIMLKSYEKYRYYDRGRLLFCHLFANLTDELIIQNKINYANLVLEKLKEASETSGSFNSAFYRIVANYYQGAIWMKEGEVEKGYHQAKRAIQTWKELHYEAIADLYSVVLKQFLEKENIQVED >NC_011660.1|WP_077904933.1|2284518_2284998_-|superoxide-dismutase MRKGRWLLILLLLIVLVALSACEDSGNGDVSGVPAKKEKQHFPPNDTKKGWIELLATDGISSQGNLPCVYEEAESVEKLEIHMKELSTASLTYIYIDGYIVQMEQGGNELSFQIQLSKTELRKGIHELAVVQYQENNPETKKVEFLKRAKYEVKQIKND >NC_011660.1|WP_012582018.1|2285154_2285925_+|endonuclease/exonuclease/phosphatase-family-protein MFSVTTFNIRFDDTSERKKSWELRKTLTKSLLDKYQWDFMGVEEPLLPQMLDMKAMLDWDYFGVGRDDGLEKGEFTAVFYNSTRFTLLQEGHFWLSDTPDVPSIHSTAMFPRICVWGKFADSDGKQFYLFNTHLDHISEEARLFASQLLLKKAAIIAENSPVIVLGDFNTQPNTPTYNYITEKYQDAQLISQKPAKGPTGCFHDFHPLRPENELEKIDYIFVSNEFQVNTYETIVDEVDGFSASDHFPVTANLDWK >NC_011660.1|WP_012582019.1|2285970_2286363_-|PH-domain-containing-protein MFDKLMGKAAIVTESSYGIERFLDEDEQIIQIFKFIRDEVIITSKGIFNIDAQGITGKKVEYKFFPKKALKYVSIETAGTLDRDFDLKIGVEGNTVVTQNTSFSAPIALKVHKNDTEMGFALYKMIKGML >NC_011660.1|WP_009924137.1|2286546_2287206_-|GAP-family-protein MGSAFSAILSPAVGILISPFPIVGLILILLSNKARINSIFYTVGWIVGNIAIFFIGLFLMSSAVSSSGDQSTLVKVVLIVLGVLLILLGAHDFTKRPKNGEKAATPKWFEKMSNIKPGGAMIFAFVLSAVNPKNMLLSLTAGVSVGALNLSGGQETTATIIFGIIACCSIYIPTIAFLLAGSRLNNALDSTRKWLIQNNSVIMAVLFLFIGLSVISKAF >NC_011660.1|WP_003732872.1|2287481_2288897_+|glycoside-hydrolase-family-1-protein MHTNTGFPADFLWGGAAAANQFEGAYNVDGKGLSVQDVTPKGGFGHITDGPTPDNLKLEGIDFYHRYKDDVKLFAEMGFKVFRTSIAWSRIFPNGDETEPNEAGLQFYDDLFDELLAHNIEPLITLSHYETPLHLSKTYDGWVNRKMIDFYENYVRTVFNRYKGKVKYWLTFNEINSILHAPFMSGGISTSPDKLSQKDLYQAVHHELVASALATKIGHEIMPEAQIGCMVLAMPTYPLTSNPDDIIAVMEAERKNYFFSDVHVRGTYPGYMKRYFRENNIELDVTEEDLEILKNTVDFISFSYYMSTTETADESKRKAGAGNILGGVQNPYLEASEWGWQIDPQGLRVVLNEFWDRYQKPLFIVENGLGAIDQLEKDENGNYTVNDDYRINYLSAHLSQVKEAIKDGVDLMGYTSWGCIDLVSASTAEMKKRYGFIYVDRNNDGTGTLNRYKKKSFDWYKNVIATNGEDL >NC_011660.1|WP_012582020.1|2288923_2289568_-|thiamine-phosphate-synthase MRAELAVYFIAGTQDIVRGTLPGVLEEALKAGITCFQYREKGVGSLQTASERKEMALECQQLCAKYQVPFIINDDVALALEIGADGIHVGQNDEGIRQVIASCAGKMKIGLSVHSVSEAAEAERLGAVDYIGVGPIFPTISKADAEPVSGTAILEEIRRAGIKLPIVGIGGINEKNSAEVLTAGADGVSVISAITRSDDCYSVIKQLKNPGSPS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_011660_1 | 1.17|2095647|37|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2095647-2095683 | 37 | NC_011660.1 | 2573205-2573241 | 0 | 1.0 |
NC_011660_1 | 1.4|2094802|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2094802-2094837 | 36 | NC_011660.1 | 2926687-2926722 | 2 | 0.944 |
NC_011660_1 | 1.9|2095126|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2095126-2095161 | 36 | NC_011660.1 | 1388852-1388887 | 2 | 0.944 |
1. spacer 1.17|2095647|37|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to position: 2573205-2573241, mismatch: 0, identity: 1.0
tatcacggaagtgcaagagtcggagagttctgtagat CRISPR spacer tatcacggaagtgcaagagtcggagagttctgtagat Protospacer *************************************
2. spacer 1.4|2094802|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to position: 2926687-2926722, mismatch: 2, identity: 0.944
aggaatttccagaggagcatactcgcacattgaaaa CRISPR spacer aggaatttccagaggagcttactcgcatattgaaaa Protospacer ****************** ********.********
3. spacer 1.9|2095126|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to position: 1388852-1388887, mismatch: 2, identity: 0.944
atgaagatgatttcaaactagctacagataaagata CRISPR spacer atgaagatgattttaaactagctacagatgaagata Protospacer *************.***************.******
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_011660_1 | 1.15|2095515|37|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2095515-2095551 | 37 | AJ312240 | Bacteriophage PSA complete genome | 21457-21493 | 0 | 1.0 |
NC_011660_1 | 1.21|2095909|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2095909-2095944 | 36 | NC_009813 | Listeria phage B054, complete genome | 25999-26034 | 0 | 1.0 |
NC_011660_1 | 1.7|2094995|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2094995-2095030 | 36 | DQ003637 | Listeria phage A500, complete genome | 25196-25231 | 1 | 0.972 |
NC_011660_1 | 1.21|2095909|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2095909-2095944 | 36 | MH341453 | Listeria phage PSU-VKH-LP041, complete genome | 26472-26507 | 1 | 0.972 |
NC_011660_1 | 1.4|2094802|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2094802-2094837 | 36 | MH341452 | Listeria phage PSU-VKH-LP040, complete genome | 25212-25247 | 2 | 0.944 |
NC_011660_1 | 1.4|2094802|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2094802-2094837 | 36 | DQ003637 | Listeria phage A500, complete genome | 26746-26781 | 2 | 0.944 |
NC_011660_1 | 1.7|2094995|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2094995-2095030 | 36 | KJ094022 | Listeria phage LP-030-3, complete genome | 32172-32207 | 2 | 0.944 |
NC_011660_1 | 1.7|2094995|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2094995-2095030 | 36 | MH341452 | Listeria phage PSU-VKH-LP040, complete genome | 23234-23269 | 2 | 0.944 |
NC_011660_1 | 1.7|2094995|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2094995-2095030 | 36 | KP399678 | Listeria phage vB_LmoS_293, complete genome | 23735-23770 | 2 | 0.944 |
NC_011660_1 | 1.8|2095060|37|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2095060-2095096 | 37 | KJ094022 | Listeria phage LP-030-3, complete genome | 24012-24048 | 2 | 0.946 |
NC_011660_1 | 1.9|2095126|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2095126-2095161 | 36 | NZ_LR134403 | Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence | 231210-231245 | 2 | 0.944 |
NC_011660_1 | 1.9|2095126|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2095126-2095161 | 36 | NC_003216 | Listeria phage A118, complete genome | 22480-22515 | 2 | 0.944 |
NC_011660_1 | 1.9|2095126|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2095126-2095161 | 36 | AJ242593 | Bacteriophage A118 complete genome | 22480-22515 | 2 | 0.944 |
NC_011660_1 | 1.15|2095515|37|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2095515-2095551 | 37 | NC_009812 | Listeria phage B025, complete genome | 26375-26411 | 2 | 0.946 |
NC_011660_1 | 1.15|2095515|37|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2095515-2095551 | 37 | KJ094023 | Listeria phage LP-101, complete genome | 25873-25909 | 2 | 0.946 |
NC_011660_1 | 1.20|2095843|37|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2095843-2095879 | 37 | KJ094023 | Listeria phage LP-101, complete genome | 20315-20351 | 2 | 0.946 |
NC_011660_1 | 1.15|2095515|37|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2095515-2095551 | 37 | MT500540 | Listeria phage LP-HM00113468, complete genome | 20325-20361 | 3 | 0.919 |
NC_011660_1 | 1.1|2094607|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT | 2094607-2094642 | 36 | JB137888 | Sequence 7 from Patent WO2012159774 | 48410-48445 | 4 | 0.889 |
NC_011660_1 | 1.1|2094607|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT | 2094607-2094642 | 36 | KJ094025 | Listeria phage LP-032 contig 2, partial genome | 37781-37816 | 4 | 0.889 |
NC_011660_1 | 1.1|2094607|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT | 2094607-2094642 | 36 | MH299806 | Listeria phage LP-KV022, complete genome | 5235-5270 | 4 | 0.889 |
NC_011660_1 | 1.1|2094607|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT | 2094607-2094642 | 36 | MN114083 | Listeria phage LP-013, complete genome | 65380-65415 | 4 | 0.889 |
NC_011660_1 | 1.1|2094607|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT | 2094607-2094642 | 36 | NC_021785 | Listeria phage LP-110, complete genome | 28081-28116 | 4 | 0.889 |
NC_011660_1 | 1.1|2094607|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT | 2094607-2094642 | 36 | MN128593 | Listeria phage LP-031, complete genome | 65188-65223 | 4 | 0.889 |
NC_011660_1 | 1.1|2094607|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT | 2094607-2094642 | 36 | NC_021787 | Listeria phage LP-037, complete genome | 22112-22147 | 4 | 0.889 |
NC_011660_1 | 1.1|2094607|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT | 2094607-2094642 | 36 | MN904502 | Listeria phage LP-018, complete genome | 65004-65039 | 4 | 0.889 |
NC_011660_1 | 1.1|2094607|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT | 2094607-2094642 | 36 | KJ094020 | Listeria phage LP-026, complete genome | 49282-49317 | 4 | 0.889 |
NC_011660_1 | 1.1|2094607|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT | 2094607-2094642 | 36 | KJ094021 | Listeria phage LP-114, complete genome | 55231-55266 | 4 | 0.889 |
NC_011660_1 | 1.1|2094607|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT | 2094607-2094642 | 36 | MN114082 | Listeria phage LP-010, complete genome | 64349-64384 | 4 | 0.889 |
NC_011660_1 | 1.1|2094607|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT | 2094607-2094642 | 36 | JX442241 | Listeria phage P70, complete genome | 5235-5270 | 4 | 0.889 |
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NC_011660_1 | 1.20|2095843|37|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2095843-2095879 | 37 | MK075006 | Staphylococcus phage phiSP119-3, complete genome | 26312-26348 | 7 | 0.811 |
NC_011660_1 | 1.20|2095843|37|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2095843-2095879 | 37 | AP019562 | Staphylococcus phage SP276 DNA, complete genome | 35339-35375 | 7 | 0.811 |
NC_011660_1 | 1.20|2095843|37|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2095843-2095879 | 37 | MK075003 | Staphylococcus phage phiSP44-1, complete genome | 22926-22962 | 7 | 0.811 |
NC_011660_1 | 1.27|2096296|34|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2096296-2096329 | 34 | LC557520 | Staphylococcus phage vB_SsapH-Golestan101-M DNA, complete genome | 116646-116679 | 8 | 0.765 |
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NC_011660_1 | 1.2|2094672|35|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2094672-2094706 | 35 | HC318804 | Sequence 59 from Patent WO2010000854 | 1722-1756 | 9 | 0.743 |
NC_011660_1 | 1.2|2094672|35|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2094672-2094706 | 35 | HC318806 | Sequence 61 from Patent WO2010000854 | 1722-1756 | 9 | 0.743 |
NC_011660_1 | 1.2|2094672|35|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2094672-2094706 | 35 | JQ011317 | Escherichia phage TL-2011b, complete genome | 37437-37471 | 9 | 0.743 |
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NC_011660_1 | 1.27|2096296|34|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2096296-2096329 | 34 | KY065482 | Streptococcus phage IPP42, complete genome | 14204-14237 | 9 | 0.735 |
NC_011660_1 | 1.27|2096296|34|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2096296-2096329 | 34 | KY065483 | Streptococcus phage IPP43, complete genome | 14644-14677 | 9 | 0.735 |
NC_011660_1 | 1.27|2096296|34|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2096296-2096329 | 34 | KY065489 | Streptococcus phage IPP51, complete genome | 14642-14675 | 9 | 0.735 |
NC_011660_1 | 1.27|2096296|34|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2096296-2096329 | 34 | KY065484 | Streptococcus phage IPP44, complete genome | 14361-14394 | 9 | 0.735 |
NC_011660_1 | 1.27|2096296|34|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2096296-2096329 | 34 | KY065481 | Streptococcus phage IPP41, complete genome | 14025-14058 | 9 | 0.735 |
NC_011660_1 | 1.27|2096296|34|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2096296-2096329 | 34 | NC_027396 | Streptococcus phage SpSL1, complete genome | 2030-2063 | 9 | 0.735 |
NC_011660_1 | 1.27|2096296|34|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2096296-2096329 | 34 | KY065449 | Streptococcus phage IPP5, complete genome | 15402-15435 | 9 | 0.735 |
NC_011660_1 | 1.27|2096296|34|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2096296-2096329 | 34 | MN694145 | Marine virus AFVG_250M840, complete genome | 29048-29081 | 9 | 0.735 |
1. spacer 1.15|2095515|37|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AJ312240 (Bacteriophage PSA complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctttggcagaggaagttggtcatcatcatttgactgt CRISPR spacer ctttggcagaggaagttggtcatcatcatttgactgt Protospacer *************************************
2. spacer 1.21|2095909|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_009813 (Listeria phage B054, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
taatgtcatatagtatcatatcaataaaaagcgttg CRISPR spacer taatgtcatatagtatcatatcaataaaaagcgttg Protospacer ************************************
3. spacer 1.7|2094995|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to DQ003637 (Listeria phage A500, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
ccaaaaaatgcacaaaataacctagaagttaaaacc CRISPR spacer ccaaaacatgcacaaaataacctagaagttaaaacc Protospacer ****** *****************************
4. spacer 1.21|2095909|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH341453 (Listeria phage PSU-VKH-LP041, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
taatgtcatatagtatcatatcaataaaaagcgttg CRISPR spacer tgatgtcatatagtatcatatcaataaaaagcgttg Protospacer *.**********************************
5. spacer 1.4|2094802|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH341452 (Listeria phage PSU-VKH-LP040, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
aggaatttccagaggagcatactcgcacattgaaaa CRISPR spacer aggaatttccagaggagcttactcgcatattgaaaa Protospacer ****************** ********.********
6. spacer 1.4|2094802|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to DQ003637 (Listeria phage A500, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
aggaatttccagaggagcatactcgcacattgaaaa CRISPR spacer aggaatttctagaggagcatactcacacattgaaaa Protospacer *********.**************.***********
7. spacer 1.7|2094995|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ094022 (Listeria phage LP-030-3, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
ccaaaaaatgcacaaaataacctagaagttaaaacc CRISPR spacer ccaaaacatgcacaaaataacctagaagttaaaaca Protospacer ****** ****************************
8. spacer 1.7|2094995|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH341452 (Listeria phage PSU-VKH-LP040, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
ccaaaaaatgcacaaaataacctagaagttaaaacc CRISPR spacer ccgaaacatgcacaaaataacctagaagttaaaacc Protospacer **.*** *****************************
9. spacer 1.7|2094995|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KP399678 (Listeria phage vB_LmoS_293, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
ccaaaaaatgcacaaaataacctagaagttaaaacc CRISPR spacer ccgaaacatgcacaaaataacctagaagttaaaacc Protospacer **.*** *****************************
10. spacer 1.8|2095060|37|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ094022 (Listeria phage LP-030-3, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
accggaaaacaaatttaggcttgatttctttactttc CRISPR spacer gtcggaaaacaaatttaggcttgatttctttactttc Protospacer ..***********************************
11. spacer 1.9|2095126|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_LR134403 (Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
atgaagatgatttcaaactagctacagataaagata CRISPR spacer atgaagatgattttaaactagctacagatgaagata Protospacer *************.***************.******
12. spacer 1.9|2095126|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_003216 (Listeria phage A118, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
atgaagatgatttcaaactagctacagataaagata CRISPR spacer atgaagatgattttaaactagctacagatgaagata Protospacer *************.***************.******
13. spacer 1.9|2095126|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AJ242593 (Bacteriophage A118 complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
atgaagatgatttcaaactagctacagataaagata CRISPR spacer atgaagatgattttaaactagctacagatgaagata Protospacer *************.***************.******
14. spacer 1.15|2095515|37|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_009812 (Listeria phage B025, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
ctttggcagaggaagttggtcatcatcatttgactgt CRISPR spacer cattggcagaggaacttggtcatcatcatttgactgt Protospacer * ************ **********************
15. spacer 1.15|2095515|37|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ094023 (Listeria phage LP-101, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
ctttggcagaggaagttggtcatcatcatttgactgt CRISPR spacer cattggcagaggaacttggtcatcatcatttgactgt Protospacer * ************ **********************
16. spacer 1.20|2095843|37|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ094023 (Listeria phage LP-101, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.946
atgaaatcttaaaaaagagaaagaacagcaagaagca CRISPR spacer attgaatcttaaaaaagagaaagaacagcaagaagca Protospacer ** .*********************************
17. spacer 1.15|2095515|37|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT500540 (Listeria phage LP-HM00113468, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
ctttggcagaggaagttggtcatcatcatttgactgt CRISPR spacer cattagcagaggaagttggacatcatcatttgactgt Protospacer * **.************** *****************
18. spacer 1.1|2094607|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT matches to JB137888 (Sequence 7 from Patent WO2012159774) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
tccgattgcattagcttttacaggtgctttgttagt CRISPR spacer tccgattgcattagcttttacaggtgctttatttaa Protospacer ******************************.** .
19. spacer 1.1|2094607|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ094025 (Listeria phage LP-032 contig 2, partial genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
tccgattgcattagcttttacaggtgctttgttagt CRISPR spacer tccgattgcattagcttttacaggtgctttatttaa Protospacer ******************************.** .
20. spacer 1.1|2094607|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH299806 (Listeria phage LP-KV022, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
tccgattgcattagcttttacaggtgctttgttagt CRISPR spacer tccgattgcattagcttttacaggtgctttatttaa Protospacer ******************************.** .
21. spacer 1.1|2094607|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN114083 (Listeria phage LP-013, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
tccgattgcattagcttttacaggtgctttgttagt CRISPR spacer tccgattgcattagcttttacaggtgctttatttaa Protospacer ******************************.** .
22. spacer 1.1|2094607|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_021785 (Listeria phage LP-110, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
tccgattgcattagcttttacaggtgctttgttagt CRISPR spacer tccgattgcattagcttttacaggtgctttatttaa Protospacer ******************************.** .
23. spacer 1.1|2094607|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN128593 (Listeria phage LP-031, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
tccgattgcattagcttttacaggtgctttgttagt CRISPR spacer tccgattgcattagcttttacaggtgctttatttaa Protospacer ******************************.** .
24. spacer 1.1|2094607|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_021787 (Listeria phage LP-037, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
tccgattgcattagcttttacaggtgctttgttagt CRISPR spacer tccgattgcattagcttttacaggtgctttatttaa Protospacer ******************************.** .
25. spacer 1.1|2094607|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN904502 (Listeria phage LP-018, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
tccgattgcattagcttttacaggtgctttgttagt CRISPR spacer tccgattgcattagcttttacaggtgctttatttaa Protospacer ******************************.** .
26. spacer 1.1|2094607|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ094020 (Listeria phage LP-026, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
tccgattgcattagcttttacaggtgctttgttagt CRISPR spacer tccgattgcattagcttttacaggtgctttatttaa Protospacer ******************************.** .
27. spacer 1.1|2094607|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ094021 (Listeria phage LP-114, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
tccgattgcattagcttttacaggtgctttgttagt CRISPR spacer tccgattgcattagcttttacaggtgctttatttaa Protospacer ******************************.** .
28. spacer 1.1|2094607|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN114082 (Listeria phage LP-010, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
tccgattgcattagcttttacaggtgctttgttagt CRISPR spacer tccgattgcattagcttttacaggtgctttatttaa Protospacer ******************************.** .
29. spacer 1.1|2094607|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT matches to JX442241 (Listeria phage P70, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
tccgattgcattagcttttacaggtgctttgttagt CRISPR spacer tccgattgcattagctttcacaggtgctttatttat Protospacer ******************.***********.** .*
30. spacer 1.20|2095843|37|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_LR134403 (Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.892
atgaaatcttaaaaaagagaaagaacagcaagaagca CRISPR spacer attgaatcttaaaaaagagaaagaacggcaagaagcg Protospacer ** .**********************.*********.
31. spacer 1.20|2095843|37|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK075006 (Staphylococcus phage phiSP119-3, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
----atgaaatcttaaaaaagagaaagaacagcaagaagca CRISPR spacer tcgaatgaagc----aaaaagagaaagaaaagcaagaagca Protospacer *****.. ************** ***********
32. spacer 1.20|2095843|37|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AP019562 (Staphylococcus phage SP276 DNA, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
----atgaaatcttaaaaaagagaaagaacagcaagaagca CRISPR spacer tcgaatgaagc----aaaaagagaaagaaaagcaagaagca Protospacer *****.. ************** ***********
33. spacer 1.20|2095843|37|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK075003 (Staphylococcus phage phiSP44-1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
----atgaaatcttaaaaaagagaaagaacagcaagaagca CRISPR spacer tcgaatgaagc----aaaaagagaaagaaaagcaagaagca Protospacer *****.. ************** ***********
34. spacer 1.27|2096296|34|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LC557520 (Staphylococcus phage vB_SsapH-Golestan101-M DNA, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
aagttaaaagtgtctaaagaaaaagccaaaaaaa CRISPR spacer aggaaatgtgtatctaaagaaaaagctaaaaaaa Protospacer *.* * . **.**************.*******
35. spacer 1.2|2094672|35|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to HC318808 (Sequence 63 from Patent WO2010000854) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ggacgctaattttgtaaatccgtttttcattgtta CRISPR spacer cgcatttgattttgtaaatccgtattgcattgtca Protospacer * .*.*************** ** ******.*
36. spacer 1.2|2094672|35|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to HC318804 (Sequence 59 from Patent WO2010000854) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ggacgctaattttgtaaatccgtttttcattgtta CRISPR spacer cgcatttgattttgtaaatccgtattgcattgtca Protospacer * .*.*************** ** ******.*
37. spacer 1.2|2094672|35|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to HC318806 (Sequence 61 from Patent WO2010000854) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ggacgctaattttgtaaatccgtttttcattgtta CRISPR spacer cgcatttgattttgtaaatccgtattgcattgtca Protospacer * .*.*************** ** ******.*
38. spacer 1.2|2094672|35|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JQ011317 (Escherichia phage TL-2011b, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ggacgctaattttgtaaatccgtttttcattgtta CRISPR spacer cgcatttgattttgtaaatccgtattgcattgtca Protospacer * .*.*************** ** ******.*
39. spacer 1.27|2096296|34|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_030946 (Streptococcus phage phiARI0923, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
aagttaaaagtgtctaaagaaaaagccaaaaaaa CRISPR spacer cctttaaaagtgtataaagaaaaagctaagatgg Protospacer ********** ************.**.* ..
40. spacer 1.27|2096296|34|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY065482 (Streptococcus phage IPP42, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
aagttaaaagtgtctaaagaaaaagccaaaaaaa CRISPR spacer cctttaaaagtgtataaagaaaaagctaagatgg Protospacer ********** ************.**.* ..
41. spacer 1.27|2096296|34|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY065483 (Streptococcus phage IPP43, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
aagttaaaagtgtctaaagaaaaagccaaaaaaa CRISPR spacer cctttaaaagtgtataaagaaaaagctaagatgg Protospacer ********** ************.**.* ..
42. spacer 1.27|2096296|34|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY065489 (Streptococcus phage IPP51, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
aagttaaaagtgtctaaagaaaaagccaaaaaaa CRISPR spacer cctttaaaagtgtataaagaaaaagctaagatgg Protospacer ********** ************.**.* ..
43. spacer 1.27|2096296|34|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY065484 (Streptococcus phage IPP44, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
aagttaaaagtgtctaaagaaaaagccaaaaaaa CRISPR spacer cctttaaaagtgtataaagaaaaagctaagatgg Protospacer ********** ************.**.* ..
44. spacer 1.27|2096296|34|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY065481 (Streptococcus phage IPP41, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
aagttaaaagtgtctaaagaaaaagccaaaaaaa CRISPR spacer cctttaaaagtgtataaagaaaaagctaagatgg Protospacer ********** ************.**.* ..
45. spacer 1.27|2096296|34|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_027396 (Streptococcus phage SpSL1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
aagttaaaagtgtctaaagaaaaagccaaaaaaa CRISPR spacer cctttaaaagtgtataaagaaaaagctaagatgg Protospacer ********** ************.**.* ..
46. spacer 1.27|2096296|34|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY065449 (Streptococcus phage IPP5, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
aagttaaaagtgtctaaagaaaaagccaaaaaaa CRISPR spacer cctttaaaagtgtataaagaaaaagctaagatgg Protospacer ********** ************.**.* ..
47. spacer 1.27|2096296|34|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN694145 (Marine virus AFVG_250M840, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
aagttaaaagtgtctaaagaaaaagccaaaaaaa CRISPR spacer aaaaatggagtgtctaaagaagaagccgaaaata Protospacer **. ..*************.*****.**** *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
116605 : 124433
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_011660|116605:124433|DBSCAN-SWA AATGGCTAGTGAAGAAAAAATTTATGATGTGATTATTATTGGAGCGGGACCAGCTGGAATGACAGCTGCTTTATATACTTCCCGTGCAGATTTAGATACGTTAATGATTGAGCGCGGAGTACCCGGCGGACAAATGGTTAATACAGCAGAGGTAGAAAATTACCCTGGATTTGATAGCATTTTAGGACCAGATTTATCCGACAAGATGCTTAGTGGTGCGAAACAATTCGGTGCTGAGTATGCTTATGGCGATATTAAAGAAGTCGTTGATGGCAAAGAATTTAAAACTGTAACGGCTGGATCGAAAACCTATAAAGCTCGGGCGATTATTATTGCGACTGGTGCTGAACACCGCAAACTTGGTGCAGCTGGCGAAGAAGAGCTTAGTGGACGCGGCGTTTCTTATTGTGCTGTTTGTGATGGAGCGTTCTTCAAAAATCGCGAATTAATCGTGGTTGGCGGCGGAGACTCTGCAGTTGAAGAAGGAACTTATTTGACTCGTTATGCAGATAAAGTAACGATAGTACACCGTCGTGATAAATTGCGGGCACAACAAATTTTACAAGATCGTGCTTTCAAAGATGAAAAAGTTGATTTCATTTGGAATAGTACAGTAGAAGAAATTGTTGGCGATGGCAAAAAAGTAACTGGAGCAAAAATTGTTTCCACAGTGGATGGTTCAGAATCTATTATGCCAGTGGATGGTGTTTTCATTTATGTTGGTCTTGTGCCACTTACGAAAGCATTCTTAAATCTAGGTATTACAGATGATGAGGGCTATATCGTAACAGATGAGGAAATGCGTACAAACCTTCCTGGTATTTTTGCAGCTGGTGATGTTCGTGCGAAAAGCTTACGCCAAATTGTAACAGCAACAGGCGATGGCGGACTTGCTGGACAAAACGCTCAAAAATATGTAGAAGAATTAAAAGAGTCATTAGAAGCTGAAGCAGCTAAATAATAGTAAAAAGTGCAAATGGGTCTAGGATTATTTATCTTAGACCCATTTTTGCGTGACTATATAGACTTGAGTAGTGTAAAATGGAAGACAAAGACTATTGTTAGGAGAGAGATAATAATGAGTATTGTTGTACTTGGTGGTGCTGGCTATATCGGTTCGCATGCAGTAGATGAGTTAATTACTCGCGGATATGAAGTAGTAGTTATTGATAATTTAAGAACAGGACATAAAGAATCTATTCATAAAAAGGCGAAATTTTATGAAGGAGATATTCGTGATAAGGCATTTTTAAGTTCGGTTTTTGAAAAAGAAACAGTAGACGGTGTGATTCATTTTGCTGCTAGTTCACTTGTGGGAGAATCAATGGAAGTGCCGCTTGTTTATTTAAATAATAATGTTTATGGTACGCAAATTGTTTTAGAAGTGATGGAGCAATTTGGTGTGAAGCATATTGTCTTTTCTTCTAGCGCTGCAACATATGGTGAGCCAGAACGAGTACCGATTACGGAAGATATGCCAACAAATCCGGAAAGTACTTACGGTGAAACGAAGCTAATCATGGAAAAAATGATGAAATGGTGCGATAAAGCGTATGATATGAAATATGTTGCACTCCGGTATTTTAATGTTGCTGGTGCCAAAGCGGATGGCTCGATTGGGGAAGATCACAAACCAGAATCGCACTTAGTTCCAATTATTTTACAAGTTGCGCTTGGTCAACGAGAAAAATTAGCGATTTACGGTGATGACTACAATACGCCTGATGGCACTTGTATTCGTGATTATGTACAAGTAGAAGATTTAATTGATGCGCATATTAAAGCGCTAGAATACTTGAAGAATGGCGGGGAAAGTAATATTTTCAACCTTGGTAGCAGTAACGGTTTTTCAGTGAAAGAAATGCTTGAAGCAGCTCGTAGTGTAACAGGTAAAGAAATTCCAGCTGAAGTTGTACCACGTCGTGCAGGAGATCCAGGAACATTAATTGCTTCTAGTGATAAAGCGCGTGAAATTCTTGGTTGGGAGCCGACTTATACAGACGTAAAAGATATTATTGCAACTGCTTGGAAATGGCACGTAGCTCATCCCAACGGCTATTAATAACTATGAAGGAAAGTGGTTTTCATCGAAGTAATCCAGGAACAATTTGGTGAATTTGAAGGAAAAACGGTCTGGCAATGGACGATGGTAAATGACCATGGTATGCGCATGAGCGTATTAAATTACGGAGCGATTGTTACTTCCCTAGAAACGAAAGATAAATTTGGCAATTTGGCGAATATTAGTCTTGGTTTTACGAATCTAGATGATTATTTAGCACATTCGCCATACTTTGGTGCGACGCTTGGTCCAGTTGCTGGTCGTATTAGTAATGGGCAATTTAAGCTAGACGGGAAACAGTTCCAACTGACTCAAAATGAAGGGACTAACCACCGGCATGGAGGCAAACTTAATTTTAGTAAGAAGATTTGGAATGTAACTGTGGAAAAAGAGCTTGATCAAATTGTGATGACTTTTGACTATTGCTGGGCTGACGGAGAAAATGGCTATCCGGGGAATATCAATGCTAGAATGACTTATACTTTAAATAATAAAAATGAATGGCTAATTGATTATGAAGCAAAAAGCGACAAGCCGACTATTTATAATCCAAGCAATCATATTTATTTTAATTTGAGTGGAGAGACTGGTTCGACAGTGTTACAGCATCAGCTCTGGATTAATAGCGATAGATTCCTGCCTATAGATGGGGAGTCTATTCCAATAGGTGAAAAACGTTCAGTGGAAAATACTATTTTTGATTTGCGTGCAGGTCGTGAATTAGCGGAGATTACGCAAAGTCAGGACCAGCAAATAAAATTAGTTGGTGCGGGGCTAGATCATGCATTTATTTTAAAACACGAAAATGGTCGTCCGGATGCAGTTTTATTTGATCCACAGTCAGGACGGCGCTTGGAAATGGAAACGGAATCGGACTCTGTATTAGTATATACAGCGAATAGTTTGGATAGTACATTCGAGATAGACGGGCGGGCTGGGCCAAAATATGCTGGTATAACGATGGAGACGCAAGGTTTGGTGGATGCGATTAATCAAGATGGATTTGGAGATATTGTACTGCGACCAGAAAAACCTTTCACATCTAGGACGGCTTTTCGTTTCACTGCGGAGAGCTGATAAATTTTGAATGAAGGAGTGTAGAGAATGAATTGGCAAGAAGAATATCAAAAATGGGTTGCTAATGACAAATTAGATAGCGCATTACGAAAACAATTAACGAATATGGAAGCTAATGAAAAAGAACTGGAAGATAGTTTTTATCGTAATATGGAATTTGGAACGGCTGGAATGCGCGGAGTACTAGGCGTTGGAACGAACCGTATGAATATCTATACTATTCGTAAAGCTTCTCTTGGTTTAGCGCAATTTGTGGCGGAGAACGGGGAAGAGGCTAAAAAACGTGGGATAGTTATTGCGTATGATCCTCGTCATATGTCGCGTGAATTTGCTTTTGAATCGGCGGCAGTTTTAGGGCATCATGGTGTGAAAAGCTATGTTTTTGATGCGCTTCGACCAACACCGGAACTTTCTTTTGCCGTGCGTCATTTAAATGCATTTGGTGGGATTGTTATTACAGCTAGTCATAATCCGCCAGAATATAACGGCTACAAAATTTACGGCGAAGATGGCGGACAAATGCCTCCGACTGGCGCAAGTGCCGTAATTGATTACATAAACGCAGTAGAAGATATTTTTTCTGTAGAAGTTGCGAACCAAGAAGTATTAATCGAAAATGGTTTGCTAGAGGTAATTAGTGAAAAAGTAGACCGTCCATATTTGGAAAAATTAAAAGAGGTCATTGTTAATAAGGAGCTTGTTCAAGAACGCGGGGAGGATTTGAAAATTGTTTTCACGCCGCTTCATGGTACTGGTGGAATTCTTGGCGTTCCAGCGCTTGAAAGTGTTGGCTTTACAAATATTGTTAAGGTAGACGAGCAATTCGTGAATGATCCTGATTTTGGGACGGTAAAATCACCTAATCCGGAAAATCGCGAAGCCTTTTTACTGGCGATTGAATATGGTAAGAAGTTTGGTGGCGACATTTTAGTCGGAACAGATCCGGATGCTGACCGTTTAGGCGTGGCAGTCCGTAATCTTGACGGCGAATATGAAGTGTTATCTGGAAACCAAATTGGCGCGATTATTTTACATTATTTATTAAAACAAAAGAAAGCGCAAAATGAATTGCCAGCTAATGCGGCGGTATTAAAATCCATTGTAACAAGTAATCTTGGAACGGAAATCGCGAAGCATTATGGCGCGGAAATGATCGAAGTATTAACTGGCTTTAAATTTATCGCAGAGCAAATCAAACATTTTGAAGAAACTGGTAAGCATACGTTTGAATTTGGTTATGAAGAAAGTAACGGCTATATGGTTAAGCCATTTACGCGTGATAAAGATGCGATTCAAGCGGTTCTTGCAATTGCGGAAGTTGCACTCGTTAGCAAAGTAGAAGGCAGAACCTTACTAGAAGATTTAGATCAAATTTACGATGAATTTGGTTATTACAACGAAGACCTAGTTTCCTTAACTTTAAGTGGTAAAGACGGTTCTCAGCGTATCAAAGAAATTACAAGTGGTTTCCGCGAACAACTGCCGACAAGTATGGGTGGATTCCTTGTGGAACGTGTGGAAGATTATTTAAGAAGCGAAACAACTTGGGTTGCGACTGGAAAAACCGAAGCAATCCATTTGCCAACAGCGGATGTTATTAAATGTTATTTTGAAGATGGTTCATGGTTCTGTTTACGCCCATCAGGCACAGAGCCGAAAATCAAATTCTACTTTAGTATTCGCGGTGAAAGTAAGGAAGAAAGTACCACAAAATTAGAAAAAGTAAAAGCTGATTTGATGCAACATATCGAAGCTTAAAAAGAAAAATCCCGGAAACTCTATTTAGAGACTTTTCCGGGATTTTCTAGTGTGAAGTGTGCTAAAATGGAAGGTAGATATTATTTGTGCGAAAGGATGAGAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_011660|116605:124433|121608_122484_+|WP_003729205.1|DBSCAN-SWA MTSKQLKLVIITGMSGAGKTVAMQSLEDLGYFCVDNLPPSLLPKFWELMKESDKMDKIALVMDLRGREFFDSIEPALDELDNTNFITTKILFLEADDKVLVSRYKETRRHHPLEPNGSVLDGINAERELLSDLKGRSQLVINTSNMAPRELRERINNEFQTEDKDVFNVQLMSFGFKYGIPIDADLVFDVRFLPNPHYIDKMRPLTGLDEDVYEYVMKWPETQTFLDKLVDLLMFTLPFYKREGKTQLVIAIGCTGGQHRSVALTEFVGKAIQQKYETTISHRDMKRRKGR >NC_011660|116605:124433|116605_117565_+|WP_003739737.1|DBSCAN-SWA MASEEKIYDVIIIGAGPAGMTAALYTSRADLDTLMIERGVPGGQMVNTAEVENYPGFDSILGPDLSDKMLSGAKQFGAEYAYGDIKEVVDGKEFKTVTAGSKTYKARAIIIATGAEHRKLGAAGEEELSGRGVSYCAVCDGAFFKNRELIVVGGGDSAVEEGTYLTRYADKVTIVHRRDKLRAQQILQDRAFKDEKVDFIWNSTVEEIVGDGKKVTGAKIVSTVDGSESIMPVDGVFIYVGLVPLTKAFLNLGITDDEGYIVTDEEMRTNLPGIFAAGDVRAKSLRQIVTATGDGGLAGQNAQKYVEELKESLEAEAAK >NC_011660|116605:124433|119770_121501_+|WP_012580770.1|DBSCAN-SWA MNWQEEYQKWVANDKLDSALRKQLTNMEANEKELEDSFYRNMEFGTAGMRGVLGVGTNRMNIYTIRKASLGLAQFVAENGEEAKKRGIVIAYDPRHMSREFAFESAAVLGHHGVKSYVFDALRPTPELSFAVRHLNAFGGIVITASHNPPEYNGYKIYGEDGGQMPPTGASAVIDYINAVEDIFSVEVANQEVLIENGLLEVISEKVDRPYLEKLKEVIVNKELVQERGEDLKIVFTPLHGTGGILGVPALESVGFTNIVKVDEQFVNDPDFGTVKSPNPENREAFLLAIEYGKKFGGDILVGTDPDADRLGVAVRNLDGEYEVLSGNQIGAIILHYLLKQKKAQNELPANAAVLKSIVTSNLGTEIAKHYGAEMIEVLTGFKFIAEQIKHFEETGKHTFEFGYEESNGYMVKPFTRDKDAIQAVLAIAEVALVSKVEGRTLLEDLDQIYDEFGYYNEDLVSLTLSGKDGSQRIKEITSGFREQLPTSMGGFLVERVEDYLRSETTWVATGKTEAIHLPTADVIKCYFEDGSWFCLRPSGTEPKIKFYFSIRGESKEESTTKLEKVKADLMQHIEA >NC_011660|116605:124433|122485_123454_+|WP_012580771.1|DBSCAN-SWA MKKETKPRVVVIGGGTGLPVILKGLKKKDIHLTAIVTVADDGGSSGKIREQMDVLPPGDIRNVMLALSNVDPRVVDLFQYRFAVDGDLSGHVIGNLILTALSQLNDSYVDAINVLATVLKIRGKVIPATDQPLILNAEMEDGSIVHGESLIPLQGKHINRVYIEPENVKPYPTAVEAVKEADLIVIGPGSLYTSILPNLLLTELADEIIASEAPKVYITNILTQIGETDFFSDADHIKVIHEHVGKSFIDKTLINTTTVPKELLFPEDVAQVEHNAKGMEELGVEAIYQDFLSTEDGLVRHAAEKVADALLAMLPDQTNEKE >NC_011660|116605:124433|117682_118666_+|WP_003729208.1|DBSCAN-SWA MSIVVLGGAGYIGSHAVDELITRGYEVVVIDNLRTGHKESIHKKAKFYEGDIRDKAFLSSVFEKETVDGVIHFAASSLVGESMEVPLVYLNNNVYGTQIVLEVMEQFGVKHIVFSSSAATYGEPERVPITEDMPTNPESTYGETKLIMEKMMKWCDKAYDMKYVALRYFNVAGAKADGSIGEDHKPESHLVPIILQVALGQREKLAIYGDDYNTPDGTCIRDYVQVEDLIDAHIKALEYLKNGGESNIFNLGSSNGFSVKEMLEAARSVTGKEIPAEVVPRRAGDPGTLIASSDKAREILGWEPTYTDVKDIIATAWKWHVAHPNGY >NC_011660|116605:124433|118681_119743_+|WP_012580769.1|DBSCAN-SWA MVFIEVIQEQFGEFEGKTVWQWTMVNDHGMRMSVLNYGAIVTSLETKDKFGNLANISLGFTNLDDYLAHSPYFGATLGPVAGRISNGQFKLDGKQFQLTQNEGTNHRHGGKLNFSKKIWNVTVEKELDQIVMTFDYCWADGENGYPGNINARMTYTLNNKNEWLIDYEAKSDKPTIYNPSNHIYFNLSGETGSTVLQHQLWINSDRFLPIDGESIPIGEKRSVENTIFDLRAGRELAEITQSQDQQIKLVGAGLDHAFILKHENGRPDAVLFDPQSGRRLEMETESDSVLVYTANSLDSTFEIDGRAGPKYAGITMETQGLVDAINQDGFGDIVLRPEKPFTSRTAFRFTAES >NC_011660|116605:124433|123461_124433_+|WP_003722604.1|DBSCAN-SWA MSFASETKKELTHMDVSDSDAKVELAAFIRMNGAISFSSQLVIMDVQTENAAIARRMYQLLKDLYEVPIELLVRRKMKLKKNNVYIVRLKSGTRGILEDLRILEPPMTFTKSIDRGFVKKRSAKRAYLRGAFLASGSVNNPETSSYHLEIFSVYEEHNEAICALMNQFDLNARTLERKNGFITYLKEAEKITEFLSIIGATSALLHFEDVRIMRDMRNSVNRLVNCETANLNKTINAAVRQIDNIKYIQSTVGLEALPERLREIAALRIANEDVTLKELGEMLTTGQVSKSGINHRLRKLDQIAERLRSGETPAQVGLKISNS |
7 | Streptococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
799030 : 807316
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_011660|799030:807316|DBSCAN-SWA GATGTTAGAACGTTATACTCGTAAAGAAATGGGCAACATTTGGACAGAACAAAACCGTTACCAAGCTTGGTTGGAAGTAGAGATTTTAGCTTGTGAAGCTTGGGCAGAGCTTGGCGACATTCCGAAAGAAGACGTTGCGAAGATTCGCGCTAATGCGAAGTTTGATGTGGATCGTATTCATGAGATTGAACTAGAAACTAGACATGATGTAGTAGCATTTACACGTTCGGTTTCGGAATCGCTTGGTGCGGAACGTAAATGGGTTCATTATGGCTTAACTTCAACAGACGTAGTGGATACAGCGAATTCTTATCTGCTAAAACAAGCGAATGAGATTTTGCGCAAAGACTTGGAAAATTTCATTGCGATTATTGGCGAAAAAGCAAAAGAACATAAATATACCGTAACAATGGGACGTACACATGGTGTTCATGCGGAGCCAACTACTTTTGGTCTGAAACTTGCTTTATGGTACGAGGAAATGAAACGTAATTTAGAACGTTTTAACTTTGCTGCTGACGGCGTTGAATTTGGAAAAATTTCAGGTGCGGTTGGTACGTATGCGAATATTGATCCTTTTGTGGAAGCTTACGTATGTGAAAAATTAGGAACAACTCCTGCGCCGATTTCTACACAAACGTTGCAACGTGATCGCCATGCAGAATATTTGGCAACGCTAGCTTTAATTGCAACTTCTGTAGAAAAATTTGCGGTAGAAGTACGTGCACTGCAAAAAAGTGAAGTGCGTGAAGTAGAAGAATTCTTTGCAAAAGGGCAAAAAGGTTCCTCTGCAATGCCGCATAAACGTAATCCAATTGGTTCTGAAAATGTAACGGGGTTAGCGCGCGTTATTCGCGGTCATATGGTTACTGCTTATGAAAATGTGCCACTTTGGCATGAACGTGATATTTCTCATAGCTCAGCGGAACGAATTATTCTGCCAGATTCCACTATTTTACTTGATTATATTTTGAATCGTTTTGGAAATATCGTGAAAAACTTGACGGTGTTCCCAGAAAATATGAAACGCAATATGGATAGAACACTGGGACTTATTTATTCACAGCGTGTATTACTTGCGCTTATTGATAAAGGTTTAGCTCGTGAGGCGGCGTATGATGTCGTGCAACCAAGAGCAATGGAAGCCTGGGAAAAACAAGTACCTTTCCGTGAATTAGTAGAACAAGATGCAACCATTACTGAAAACCTATCTGCGGAAGAAATTGCAGATTGCTTTGATTACAACTATCACCTGAAGAATGTCGACTTAATTTTTGATCGTTTAGGATTATAATTACGGGCAGAATACAACCTAACCTCTTTGATATTTATTTTTTCAAAGAGGTTAAGTAATTTATAAGGAGATAAATTATTGTGACTAATGAACTGGTTTATGAAGGAAAGGCAAAACGACTTTTTAAAACAGAAGAAGCAGGTGTCTTGCGTGTTGCCTATAAGGACGATGCGACAGCGCTAAATGGGGTACGAAAGGAATCTTTTGCTGGGAAGGGTGAGCTTAATAACCAAATTACATCGCTTATTTTTTCTCATTTAGCAGAAGCGGGAATAGAGAGTCATTTTATCCGGGCGATTTCGGAAACGGAACAATTGGTGAAAGAGGTATCGATTATTCCGCTTGAAGTAGTTGTTCGTAATGTGATGGCTGGGAGTCTTGCGAAGCGGCTTGGGAAAGAAGAAGGCGAGCCAATTCCAAATGCGATAGTGGAATTTTATTTTAAAGAGGATGCGTTAGATGACCCGTTTATTAATGATGATCATGTGCTTTATTTAGAGATTGCGACAACGAATGAAATGGACGAGATTCGCCAGGCTGCTCGTTCGATTAATAAGGTGCTACAAGAATTATTCACTCAAATGAATATTACGCTAATTGATTTTAAGTTAGAATTTGGTCGGGATGCGGCTGGAAATATTTTATTAGCAGATGAGATTTCGCCTGATACATGCAGACTTTGGGACAAGGAAACAAATCAAAAGCTCGATAAGGATGTGTTTCGTCGGAATATTGGCAATTTAACAGATGTGTATACAGAAGTATTGAATAGATTAAAGCAAGTTCAAAACTAGGAGGCCACAAAATGTATAATGTCAAAGTTTATGTCACTTTAAAGAAAAGCGTATTAGATCCACAAGGTGTTGCAGTAAAAGATGCAGCGAAAAGCATGGGTTACGAGGAAGTAGAAGATGTTCGTATTGGTAAATTTATGGAACTAAAAGTTGCAAAATCAGATCGAGATATTCATGAAGTATTAAATGAAATGTGCGACAAACTGTTAACTAACCCGGTGATGGAAGATTACCGATATGAAATTGAGGAGGCGTAAACGATGAAATTTGCTGTCATTCAGTTCCCAGGTTCTAATTGTGATCTTGATATGCTACATGCGATTCGCGATTCTATTGGCGAGGAGGCGGAATATGTATGGCATGCGGAAACAAGTCTTGCAGGCTTTGACGCGGTGTTACTTCCAGGTGGATTTTCTTACGGAGATTACTTGCGAACTGGTGCGATTGCAAAATTTTCAAGTATTATGCCAGAAGTTTTGCGCTTTGCTGAAATGGGAAAACCAGTGCTTGGTGTGTGTAACGGATTCCAAATTTTAACTGAAATTGGTTTACTGCCAGGTGCTTTAATTAGAAATAATAATTTGCATTTTATTTGTAAAACAGTGCCGCTTCGTGTGGCAAATGCAAGTACGATGTTTACGGAGCTTTATGAAGAAGGCGAAATTATCCAAGTTCCCGTTGCTCACGGAGAAGGTAATTATTACTGTGACGACGAAACACTTTTAAAATTAAAAGAAAATAACCAAATTGTTTTTACATATGATAGCGTTAATCCGAATGGTAGTCGTGCGGATATTGCGGGTATCGTAAATGAGCGCGGTAATGTGCTTGGAATGATGCCACATCCAGAACGCGCGGTAGAAGAAATTATTGGCGGTACTGATGGTTTAAGACTTTTCGAGTCCGTTGTAAAAGCTTGGAAGGAGGAACAAGTAAATGCCTAACATGGAGCCAACGACAAAAGAAATTAAAGAACAAAAGATTTATCAAGAAATGGGCTTAACTGATAGCGAATATGAGCTTGTTTGTTCGATTCTTGGACGCGAGCCTAATTATACAGAAACTGGACTTTTCTCCGTTATGTGGTCCGAACATTGTAGCTATAAAAATTCTAAACCAGTACTTCGGAAATTTCCTACAGAAGGAAAACAAGTGTTGCAAGGACCGGGTGAAGGTGCTGGGATTGTTGATATTGGCGATGGTCTAGGTGTTGCTTTTAAAGTGGAGAGTCATAATCATCCATCCTACGTGGAGCCGTATCAAGGTGCTGCAACTGGGGTCGGTGGGATTATCCGTGATGTGTTTTCGATGGGAGCTAGACCGATTGCGATGCTTAACTCGCTTCGCTTCGGCGAATTAGATACACCTCATGCGAAATACTTAGTTAGTGAAGTCGTGGCGGGAATCGCAGGATACGGTAACTCCATTGGGATTCCAACGGTTGGCGGCGAAATCCAATTTGATCCTTGTTATACGAAAAATCCATTAGTTAATGCAATGTGTGTAGGCTTAATTGAAGCGAAAGACATTCAAAAAGGGCAAGCTAAAGGAATTGGCAACCCGGTGATGTATGTTGGTGCTAAAACTGGTCGTGACGGAATTCATGGTGCCACTTTTGCTTCTGTAGAGTTTAGTGAAGAAGGCGAACAACAACGTTCTGCTGTACAAGTGGGCGATCCTTTTATGGAGAAATTGTTGCTTGAAGCTTGTTTAGATGTGATTCGTGATCATTCGGATATTTTAGTGGGAATTCAAGATATGGGAGCTGCTGGACTCGTTAGTTCAAGTTCTGAAATGGCCTCAAAAGCGGGCGCGGGGCTAGAATTAATTATGGATGATGTGCCGCAACGTGAACTAAATATGACGCCATATGAAATGTTGCTTTCTGAATCGCAAGAACGGATGCTTCTATGTGTGAAAAAAGGGCATGTGGAAGAAATCCAAGCGTTATTTGAACGTTATGGTTTAGAGGCTGTTGTGATTGGTCAAGTAACGGATGATAAAATGTACAAAATTATTCATCATGGTGAAGTAGTTGCGAATGTGCCTGTTGATGCACTTGCAGAAGACGCGCCAGTTTATCATAAGCCTTCAAAAGAACCAGCTCGTTATCAAGCATTCCAAGAAGAGAAAGCGTTTGTGCCAGCTATGGATGACGTGGTGGGAGTTTGGAAAGAACTGCTTGCTCAGCCAACGATTGCTAGTAAGCGCCATATTTATGAGCAATATGATTACCAAGTTCGGACGGATACAGCTGTTGTACCTGGTTCAGATGCGGCGATTGTTCGTGTGCGTGGAACAGAGAAGGCAATTGCGATGACGACAGATTGTAACTCACGCTATTTGTATCTTGATCCAGAAGTAGGCGGAGCGATAGCGGTTGCGGAAGCGGCGCGCAATATCGTTTGTTCTGGGGGGAAACCACTAGCGATTACAGATGGACTGAATTTTGGTAATCCTGAAAAACCAGAAATTTTTTGGGAAATTGAAAAAGCGGCTGACGGTATTAGTGCAGCTTGTTTAGAACTTGATACGCCTGTTATCTCAGGGAATGTATCGCTTTATAATGAAACAGATGGTACCGGAATTTATCCAACGCCAGTTATTGGAATGGTTGGTTTAGTAGAAGATTTGGCACATATTACGACACAAGATTTTAAAAATAGTGGCGATGTGATTTTCTTAATTGGTGAAACAAAAGCTGAATATAGTGGTTCGGAATTGCAGAAATTACAACAAGGGAAAATTAGCGGACGTGCGCCGGAATTAGATTTAGCGACAGAGAAAAAATACCAACAATTACTTCTAACGGCGATTCAGGAAGGTCTAGTTGCTTCTAGTCACGATTTGGCAGAAGGCGGATTTGGTGTTGCCCTTGCGGAAGCGACTTTTAAAGCAGGGCTTGGTGCGGATGTAGAAGTACCATTTGCGTTGAATCAACTATTCAGTGAATCGCAATCACGTTTCTTAGTATCGGTAAAACCGGAAAACGAAGCAGCTTTTGCGCAATTAATGGAACTGGAAAAAGTATACCGCCTTGGTGTGGTAACCGAGGATGATACGATTCGTGTGAAACATAAGGAAGACCAAGTTACAGCGAAAACAACGGAATTACGATCCATTTGGGAAGGGGCTATTCCATGCTTGCTGAAGTAAAAGGACTTAACGAAGAATGTGGTATTTTTGGTATTTGGGATCATCCTAATGCAGCGGAAATCACCTATTATGGGTTGCATAGTTTACAACATCGCGGTCAAGAAGGTGCCGGAATTGTTTCGACAGACGGTGAAACACTAAAAGGTCACCGAAATCTCGGCCTTTTAGCAGACGTATTTAAACATGGTGAACTAGACGATTTAAAAGGTAAAGCAGCCATTGGCCATGTTCGATACGCGACAGCTGGTCAAAAAAACTTAGGGAACGTACAACCATTTTTATTTCACTTTCATAGTTCTTCTTTAGCACTTGCGCATAATGGGAATTTGGTTAATGCGAAAAGTTTACGCCGTGAACTAGAAGAAGAAGGCGCTATTTTTCAAACGAGTTCGGATACAGAAGTGTTAGCGCATTTAATTAAACGTAGCCATACAGGTGATTTTGTGGAAGATTTAAAAGTGGCTTTGAACAAGGTTAAGGGTGGCTTTGCGTACATGCTTCTGACGGAAGACACGATGTATGCGGCGCTTGACCCGAATGGTTTTAGACCGCTTTCGATAGGTCGCATTGGTGATTCTTACGTAGTTGCTTCGGAAACATGTGCCTTTGAAACGGTTGGCGCTGAGTTTGTCCGTGATGTAGAGCCAGGCGAACTAATTATTATTAATGATGACGGGCTTCGAATTGAAAAATTCACGGAAAATGTGACGCATTCGATTTGCAGTATGGAATACATTTATTTTGCGCGACCAGACTCTAATATTGCTGGAATTAATGTCCACTCGGCAAGAAAACGTTCTGGGAAAAGGTTAGCAAAAGAGGCTTTTATTGATGCAGATGTAGTTACAGGTGTACCAGATTCCAGTATTTCTGCGGCGATTGGTTATGCGGAGGAAGCTGGTCTTCCTTACGAACTTGGTCTCATCAAAAATAGATATGTGGCAAGAACTTTTATCCAGCCATCACAAGAACTCAGGGAGCAAGGCGTTAGAATGAAACTTTCTGCCGTGCGCGGGGTTGTGGAAGGGAAACGCGTTGTCATGATTGATGATTCGATTGTTCGCGGGACGACAAGTAAACGCATTGTCCAGCTTTTACGTGAAGCAGGAGCGGCGGAAGTTCACGTGAGAATCGCTTCTCCACCACTTGCTTATCCTTGTTTTTATGGAATTGATATCCAAACGCGAAATGAATTAATCGCTTCTAATTATTCTGTTGATGAAATTTGTCGGATTATTGGGGCTGATTCTTTAGAGTATTTGAGTGAAGAAGGTTTAGTAGATTCCATTGGCAGACCTTATCCGAATGAACCTTACGGGGGACTTTGTATGGCTTATTTCAACGGCGATTACCCAACCCCTTTATATGATTATGAAGCGGAATATTTAGCGAGCTTAGAAGCAGAAAAATAATGAGGAGTGACAAATCGAATGGCAGAAAATGCATATAGTAAAGCAGGCGTGGACGTAGAAGCTGGCTATCAAGTTGTAGAACGTATCAAAAAACATGTGGCTAGAACAGAGCGATTAGGCGCTATGGGGGCACTTGGTTCATTTGGTGGAATGTTTGACTTAAGTAGTTTGCATTTAAAAGAACCTGTCCTTGTTTCTGGTACGGATGGTGTTGGTACAAAATTACTTTTGGCAATTGAAGCAGATAAGCATGATACCATTGGGATTGACTGCGTGGCAATGTGTGTGAATGACATTTTAGCTCAAGGCGCCGAGCCATTATTTTTCTTAGATTATATCGCTACTGGAAAAACAGATCCAGTGAAAATGGAACAAATTGTTAAAGGCGTGGCTGACGGCTGTGAACAAGCTGGTGCGGCTTTAATTGGCGGCGAAACTGCTGAAATGCCCGATATGTACGGGTCAGACGACTATGATTTAGCAGGTTTTACTGTTGGGGCTGTCGAGAAACAGAAACTAATTACAGAAGGCGCAGTCAAAGAAGGAGATACACTCATTGGAATTCCATCTAGCGGGATTCATAGTAATGGTTACTCCCTAGTGCGCAAAATTTTCTTTAAAGATAACGAATTGACACTCGATGCGGAAATCAGTGAACTAGATGTGCCACTTGTGGAAGAGCTACTTAAACCAACACGTATTTATGTCAAACCAGTTTTAGAAGTATTGAAAGAGGTAGATGTGCACGGAATTACGCATGTGACGGGTGGCGGATTTGTAGAGAATTTACCACGGATGTTAACGAATGATTTAGCTGTGAAAGTGGAACTAGGTTCATGGCCAGTGTTGCCGATTTTTGACGTTATGAAGAAATACGGCCAATTAAACGAAATGGAAATGTATGAAATTTTCAATATGGGTATTGGTATGGTGTTGGCAGTTGCGAAAGCGGATGTGGAAAGAACATTAGAAGTACTCGTCCAAAACGGAGAAGCGGCTTATGTAATTGGCGAAGTTACGACACGTGAAAATGATGCGGTTATTTTCACAGGAGGAACAAAAGGATGAATATAGCCATTTTTGCTTCGGGTAACGGTTCGAATTTTCAAGCTTTAGTGGATGATGAGTTTATTAAGCCTCATGTGAAATTACTGGTATGTGATAAACCGAATGCTTATGTTTTAGAGCGGGCAAACAAACAGGATATTCCAGTTTTTCTTTTTGAAGCGAAAAATTATCCGGATAAAGAAGCTTTTGAAACAGAAATTTTACTAGAACTTCGCGGGTTGGAAATTGATTTGTTAGTGCTAGCAGGATATATGCGTTTGATTGGACCAACCTTATTAGCGGAATTCCCTGAGCAAATTGTGAACCTGCACCCGTCGTTGTTGCCTGAATTCAAAGGAAAAGATGCAATTGGTCAAGCGATTCAAGCGAATGTTTCAGAAACTGGTGTCACCGCGCACTTTGTGGATGCGGGAATGGATACTGGACCAATTATTGATCAAGTGAAAGTACCGATTGAACATGCGGAAACTGTAGATACTTTGGCTGGAAAAATTCATCAAGTAGAACATATTTTTTATCCAAAAGTGATTCGAGGATTAATTCAAAATGGAGGGAACGATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_011660|799030:807316|800403_801117_+|WP_012581147.1|DBSCAN-SWA MTNELVYEGKAKRLFKTEEAGVLRVAYKDDATALNGVRKESFAGKGELNNQITSLIFSHLAEAGIESHFIRAISETEQLVKEVSIIPLEVVVRNVMAGSLAKRLGKEEGEPIPNAIVEFYFKEDALDDPFINDDHVLYLEIATTNEMDEIRQAARSINKVLQELFTQMNITLIDFKLEFGRDAAGNILLADEISPDTCRLWDKETNQKLDKDVFRRNIGNLTDVYTEVLNRLKQVQN >NC_011660|799030:807316|802053_804273_+|WP_012581149.1|DBSCAN-SWA MPNMEPTTKEIKEQKIYQEMGLTDSEYELVCSILGREPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTEGKQVLQGPGEGAGIVDIGDGLGVAFKVESHNHPSYVEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPIAMLNSLRFGELDTPHAKYLVSEVVAGIAGYGNSIGIPTVGGEIQFDPCYTKNPLVNAMCVGLIEAKDIQKGQAKGIGNPVMYVGAKTGRDGIHGATFASVEFSEEGEQQRSAVQVGDPFMEKLLLEACLDVIRDHSDILVGIQDMGAAGLVSSSSEMASKAGAGLELIMDDVPQRELNMTPYEMLLSESQERMLLCVKKGHVEEIQALFERYGLEAVVIGQVTDDKMYKIIHHGEVVANVPVDALAEDAPVYHKPSKEPARYQAFQEEKAFVPAMDDVVGVWKELLAQPTIASKRHIYEQYDYQVRTDTAVVPGSDAAIVRVRGTEKAIAMTTDCNSRYLYLDPEVGGAIAVAEAARNIVCSGGKPLAITDGLNFGNPEKPEIFWEIEKAADGISAACLELDTPVISGNVSLYNETDGTGIYPTPVIGMVGLVEDLAHITTQDFKNSGDVIFLIGETKAEYSGSELQKLQQGKISGRAPELDLATEKKYQQLLLTAIQEGLVASSHDLAEGGFGVALAEATFKAGLGADVEVPFALNQLFSESQSRFLVSVKPENEAAFAQLMELEKVYRLGVVTEDDTIRVKHKEDQVTAKTTELRSIWEGAIPCLLK >NC_011660|799030:807316|801128_801374_+|WP_003722248.1|DBSCAN-SWA MYNVKVYVTLKKSVLDPQGVAVKDAAKSMGYEEVEDVRIGKFMELKVAKSDRDIHEVLNEMCDKLLTNPVMEDYRYEIEEA >NC_011660|799030:807316|801377_802061_+|WP_012581148.1|DBSCAN-SWA MKFAVIQFPGSNCDLDMLHAIRDSIGEEAEYVWHAETSLAGFDAVLLPGGFSYGDYLRTGAIAKFSSIMPEVLRFAEMGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALIRNNNLHFICKTVPLRVANASTMFTELYEEGEIIQVPVAHGEGNYYCDDETLLKLKENNQIVFTYDSVNPNGSRADIAGIVNERGNVLGMMPHPERAVEEIIGGTDGLRLFESVVKAWKEEQVNA >NC_011660|799030:807316|804257_805685_+|WP_003722245.1|DBSCAN-SWA MLAEVKGLNEECGIFGIWDHPNAAEITYYGLHSLQHRGQEGAGIVSTDGETLKGHRNLGLLADVFKHGELDDLKGKAAIGHVRYATAGQKNLGNVQPFLFHFHSSSLALAHNGNLVNAKSLRRELEEEGAIFQTSSDTEVLAHLIKRSHTGDFVEDLKVALNKVKGGFAYMLLTEDTMYAALDPNGFRPLSIGRIGDSYVVASETCAFETVGAEFVRDVEPGELIIINDDGLRIEKFTENVTHSICSMEYIYFARPDSNIAGINVHSARKRSGKRLAKEAFIDADVVTGVPDSSISAAIGYAEEAGLPYELGLIKNRYVARTFIQPSQELREQGVRMKLSAVRGVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSKRIVQLLREAGAAEVHVRIASPPLAYPCFYGIDIQTRNELIASNYSVDEICRIIGADSLEYLSEEGLVDSIGRPYPNEPYGGLCMAYFNGDYPTPLYDYEAEYLASLEAEK >NC_011660|799030:807316|806749_807316_+|WP_012581151.1|DBSCAN-SWA MNIAIFASGNGSNFQALVDDEFIKPHVKLLVCDKPNAYVLERANKQDIPVFLFEAKNYPDKEAFETEILLELRGLEIDLLVLAGYMRLIGPTLLAEFPEQIVNLHPSLLPEFKGKDAIGQAIQANVSETGVTAHFVDAGMDTGPIIDQVKVPIEHAETVDTLAGKIHQVEHIFYPKVIRGLIQNGGND >NC_011660|799030:807316|799030_800323_+|WP_003729814.1|DBSCAN-SWA MLERYTRKEMGNIWTEQNRYQAWLEVEILACEAWAELGDIPKEDVAKIRANAKFDVDRIHEIELETRHDVVAFTRSVSESLGAERKWVHYGLTSTDVVDTANSYLLKQANEILRKDLENFIAIIGEKAKEHKYTVTMGRTHGVHAEPTTFGLKLALWYEEMKRNLERFNFAADGVEFGKISGAVGTYANIDPFVEAYVCEKLGTTPAPISTQTLQRDRHAEYLATLALIATSVEKFAVEVRALQKSEVREVEEFFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENVTGLARVIRGHMVTAYENVPLWHERDISHSSAERIILPDSTILLDYILNRFGNIVKNLTVFPENMKRNMDRTLGLIYSQRVLLALIDKGLAREAAYDVVQPRAMEAWEKQVPFRELVEQDATITENLSAEEIADCFDYNYHLKNVDLIFDRLGL >NC_011660|799030:807316|805703_806753_+|WP_012581150.1|DBSCAN-SWA MAENAYSKAGVDVEAGYQVVERIKKHVARTERLGAMGALGSFGGMFDLSSLHLKEPVLVSGTDGVGTKLLLAIEADKHDTIGIDCVAMCVNDILAQGAEPLFFLDYIATGKTDPVKMEQIVKGVADGCEQAGAALIGGETAEMPDMYGSDDYDLAGFTVGAVEKQKLITEGAVKEGDTLIGIPSSGIHSNGYSLVRKIFFKDNELTLDAEISELDVPLVEELLKPTRIYVKPVLEVLKEVDVHGITHVTGGGFVENLPRMLTNDLAVKVELGSWPVLPIFDVMKKYGQLNEMEMYEIFNMGIGMVLAVAKADVERTLEVLVQNGEAAYVIGEVTTRENDAVIFTGGTKG |
8 | Prochlorococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1351756 : 1399268
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_011660|1351756:1399268|DBSCAN-SWA 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55 | Listeria_phage(71.43%) | protease,holin,plate,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1404200 : 1431218
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_011660|1404200:1431218|DBSCAN-SWA 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MNDKKTDYKVYKITYKQRFMGEVIVDSYERTVKDDNELRSAINALYDDPHVFSVSSEEVAE >NC_011660|1404200:1431218|1424184_1424373_-|WP_010991288.1|DBSCAN-SWA MSKNLYAIKQDGLYKHFPHSWYDANLSKDCLFVNRETAENNCALNGSDEIVEISLVEVEAEA >NC_011660|1404200:1431218|1420992_1421472_-|WP_012581469.1|DBSCAN-SWA MTTLYSIQEKYQQLLNLAEQLDPEILKDTLESIEDELETKAENVAFVIKELEGQSLILDVEIKRLSERENTINNNVKRLKQSLHDAMLVANKQKIKTNLFTLDIRKNPHSVLVEDERKLINYLVEQPKKLDKAKLKDDLKKGIDVPGAVLVQTERLQIK >NC_011660|1404200:1431218|1429317_1429932_+|WP_003730990.1|DBSCAN-SWA MKKLLLLAGLLIVFSFGLTACGNSSDSAKEESKEESTSTTNESEDLTEDETTMEEETDSGIIDSEDYATSWSEDWKGLQTKISSVSVFKVDPAKLEEDGEEGEGLVIVNYEINNTSKIDFNTYPEQGVLVTNGEQIEASMFESDDVGGEIMQGVSKDGAVVYVLPTLNDVSDIKDIRLTWSASYETDNYEEDSFKDYDARITLK |
45 | Listeria_phage(95.12%) | integrase,tail,terminase,portal,protease,capsid | attL 1427594:1427609|attR 1432676:1432691 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2543216 : 2583809
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_011660|2543216:2583809|DBSCAN-SWA 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60 | Listeria_phage(89.13%) | holin,tail,integrase,terminase,portal,protease,capsid | attL 2544289:2544333|attR 2582691:2582735 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2919585 : 2967797
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_011660|2919585:2967797|DBSCAN-SWA 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>NC_011660|2919585:2967797|2966945_2967797_+|WP_012582425.1|DBSCAN-SWA MKTVKLNNGVEVPILGFGTYQITDAAEAEQAVKDAIKTGYRHIDTAQSYMNEEAVGRGIAASGVDRKELFITTKIWVENVSYKGVMSSFDRSLKRLGLDYIDLLLIHQPFNDVYRAWIAMEELQASGKIRAIGVSNFSPDRVVDLAAFNEVTPQVNQIEVNPFQQQTANLAILRKEGVAIEAWAPFAEGKNDIFNNPVLTKIGAKYGKSAAQVILRWLVEQDIIVLAKSVKPERMAQNLAIFDFELTEADKEEIAGIDQGESQFFSHADPEMVKWMASRKLNV >NC_011660|2919585:2967797|2941912_2942212_+|WP_012582399.1|DBSCAN-SWA MAIPKQVKIGAVNYDVQEKTLVDNDADSWGVCVFYDNHIEILEGLSEERKEQILVHEIVHAIFYESGFEEQDEDVVNRVGITLHQFLKDNNLFHKQDVD >NC_011660|2919585:2967797|2937592_2937793_+|WP_012582389.1|DBSCAN-SWA MKKVGFYFSREPDEARSSCPECGWMNTTSNAIAIFESIKINRPVYVQCTACKTWYNIGGGDWMAGK >NC_011660|2919585:2967797|2922198_2922636_+|WP_003727703.1|DBSCAN-SWA MRTTYMAKPGEVERKWYVIDATGVSLGRLSSEVASILRGKNKPQFTPHIDTGDFVIIINAGKIGLTGKKATDKIYYRHSQYPGGLKSRTAGEMRTNNPEKLLELSIKGMLPKNSLGRQLFKKLHVYGGSEHEHAAQQPEVYELRG >NC_011660|2919585:2967797|2928214_2928490_+|WP_012582377.1|DBSCAN-SWA 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MKFLDLFAGIGGFRLGMERAGHECVGYVEIDKFARKSYQAIHDTEGEWTREDITKVTDEEWRTLRGTVDIICGGFPCQSFSIAGKRLGFEETRGTLFFEIARAAKQIQPRYLFLENVKGLLSHNKGETFATILTALHELGYDAEWQILNSKDFGVPQNRERVFIIGHLRGAGGREIFPLAEASRTADESRVIANTLTARYPYSQREGTYIETTRKSEQVMPVLTPDRIIKRQNGRRFKTLGEPAFTLTAQDQHGIIVFGELEGSGREQSNRIYSEKGLAPTLTTMQGGGQEPKIAIVGNVNPSKRGMNGEVYSSEGLAPTLTTNKGEGQKVAIIQKARGYNKGGKHDIAPTLSSSSWQENNLLQKGNFRIRKLTPRECWRLQGFPDWAFDRAAEVNSNSQLYKQSGNSVTENVIWKIAKLFKEEQA >NC_011660|2919585:2967797|2949098_2949461_+|WP_012582406.1|DBSCAN-SWA MKVVKPITNAPPLPLDWLIHNISYEAYKEEGRHNEVGYEKGIEIEHVRVDFSKSNQIAGLSDSDRYDAVIFIDAVNSMNVPYDFISRSRIFFSGKAYKIVKVIPCYATSNSVHHWEIEVV >NC_011660|2919585:2967797|2939801_2940206_+|WP_014589139.1|DBSCAN-SWA MRRNIRRSSLTRRTSTRSKYNAKKVVIDNIKFDSKAEAAYYQQLKLLKMTGEVVSFDLQPEFVLQESFRKNGKLYRAIKYKADFLVRYSDGHEELIDIKGMLTKEFRIKQKLFELRYMQSIKCLKLKGRNFVEV >NC_011660|2919585:2967797|2950668_2950908_+|WP_012582410.1|DBSCAN-SWA MDSETITIKVGETVALTASVLPTNASQEVTFTSSNPPKAKVNASGVIEGMAEGTATITVASKEKTSIKKTVEVTVEAAE >NC_011660|2919585:2967797|2926954_2927188_+|WP_012582375.1|DBSCAN-SWA MRLSFKEKRNKAGLTQKELGIAVGLAEISIRKLENGERDPSINTAVKISKALNSNMEEIFPDIFLDINDTKCILIKN >NC_011660|2919585:2967797|2949460_2949799_+|WP_012582407.1|capsid|DBSCAN-SWA MPIKVRVDLSKAKGSVKKAKERGQFALINQAAADIALYVPFLEGDLSNQYVIMNDKEIMWTSIYARRLYNGINFNFTLSHHPLAGPKWDQRAKVDKLESWIEVAQKAVEEGL >NC_011660|2919585:2967797|2921257_2922004_+|WP_012582370.1|tRNA|DBSCAN-SWA MTRYKAIISYDGSGFYGYQVQPNTRTVQAEIEKALTKMHKGKTVRITASGRTDTGVHAKGQVIHFDSELDITAEKFQKALQVMTPFDISFLTVEEVPDDFHARFGTVGKEYRYVVKRTKIFDPFSRDFALHYPYELDISKMKLASKRLIGEHDFTSFCSARTERDSKVRTLYSIDFYEEDDETLVIAFQGNGFLYNMVRILTGTLLDAGQGRISPDDISKALLARDRQKLISKTAPPQGLYLWRVDYE >NC_011660|2919585:2967797|2925333_2925939_-|WP_012582372.1|DBSCAN-SWA MSKYSYLLKKWWFWVIFLLVIIGIVSLFWYTQVYTSEWGKGLSKEDKEVLEKANKSTNEFNKFAKEANSGIKSFNNDVTIDPQIVINPFTKMGDNITERSDDFIKHYDEYSISIQNILKDDYNNIKKLRDDVVAQQEEIKSIYSNAHNYNRELSTVESKIVENIYQEMHKEQKESLGLKNHEFKKNAEFSDKAIKLMSGVD >NC_011660|2919585:2967797|2958205_2959228_+|WP_012582413.1|tail|DBSCAN-SWA MDIFVSDYEKQYKEILTGFDPTSFSETWVENQQWQLDFYVEKTRNNQDVFDLLNHESSVYLDGQEFVVKQLKRGAVGKIVYSEVIATHIYFTMQDDYQYNAISGSKSAKDCLTHIFAADKQGFSFELIDKNKVLENITQENFGNGNLLKLVQEVLEDYKLVMLADNKRLTFIPSEDYGEHTENEIRYNKHTNEVDFDIDTLSLKTQIRGYGKVDSNGNNYFPPVTYTSPESAKWGVRIQEPLSDERYTTSSSMLRRLKLELQDYPATTGNISLKLKYECGKGDYVMFVYEPLGLLYEVQIVAYKKYIFTNKPPELTLSNNKKTMVSIMVQLAKAIKKGAK >NC_011660|2919585:2967797|2962232_2962637_+|WP_012582418.1|DBSCAN-SWA MEAEKQLGYVTRLELLEHESKLKTEVSKDIEKIENKVDGLGDDLNDLKDIVVPLSLSLDQIAKNTERTATTLDRFASDTTIHLHDHDIELTEIKAKSENEEKAKTSDVGVTVAIIGLIGAVITTIITLAPMLWK >NC_011660|2919585:2967797|2929973_2930264_+|WP_003734955.1|DBSCAN-SWA MDISLAKKDAEMLMPIFKAVADKAYKEGVADGRKSFMEYPELLTNKHLAEIFSCTTSYVSSTIVKKEGFPKFKHLQSRYPRNLVFTWIEENTKNMA >NC_011660|2919585:2967797|2942250_2942793_+|WP_012582400.1|terminase|DBSCAN-SWA MKLTEKQKRFADEYIKCGNATEAARLAGYSSKTANRIATENLSKPVIKGYIDKVLSELEEKRVMGYTEAMQLFTEIARGEMEEEVIVSNGDGFSVVTKSADINQRVSALKEIVKRHVAGGRDKLQEELIQAQINKLRADTKQESNQGTTTIIMSNVDEMQAYLDKKAGGTDERDDTQTTN >NC_011660|2919585:2967797|2930279_2930468_+|WP_003731815.1|DBSCAN-SWA MTERVFRKTTNFGDSEIHTNSRTKMIANPAFQQKIPLNETGCDNMADYIEELKLKGYEEVTR >NC_011660|2919585:2967797|2948703_2949099_+|WP_010990219.1|DBSCAN-SWA MPYTTLEFYTNEYAGEHLEQDEFDKLLKHAERKIDSVTFYRIRKSGIESFSEFIQHQIQLATCNQIEYFKEAGGTSELAVSKPDNVSIGRTSISDSNFASTATSLNSGLVGSDVRSYLAHTGLLYNGVGVR >NC_011660|2919585:2967797|2966017_2966380_+|WP_012582423.1|DBSCAN-SWA MKKTSIIFIFCALLLTACSTTTKETPRQTTEATGTIEQVETESILIKNFKIKNDNNTPELSVRFHISEKYHDETGNKIKRTELNKNDNIKIILTKDFQIQETSPAQIDPKYVQKILLLNK >NC_011660|2919585:2967797|2951390_2951990_+|WP_003735024.1|DBSCAN-SWA MLSLADGIDDIYVYKNEKYQLDLSFDNVLRVIELTENNQLTNDFRVNLAVDVLFENVMPWNPYDEDNPFSNIEEKSIVLLDIFENYIVKDNDEGIQCDIDGNPMPSATNEDGEEPAYYSLTQDSDYIFASFLQDYNIDLIEVRGKLHWYKFRALFESLRDDTAIKSIMSIRQAELPSGKGTEKERDALIKLKNHYKLKD >NC_011660|2919585:2967797|2925993_2926161_-|WP_012582373.1|DBSCAN-SWA MKKLDELNMQHDVVILEHEFTSCSFTLKKEVFIVIDSRLSQSEKLEDVARLLNKI >NC_011660|2919585:2967797|2927698_2927893_+|WP_003735007.1|DBSCAN-SWA MKKIAFTNSFLTKRNRKESVLTIELSITGEDFSDLSILPELYSEINSLASRLSEKTNGDLGKRK >NC_011660|2919585:2967797|2930700_2931660_+|WP_010991174.1|DBSCAN-SWA MAIAKEKTMNILASVKDMDRTQWLLTRRLGIGGSDAGIIMGLNQYKTAFELWLDKTDQVLPDESAGEAAYWGNQMEEVVAKEFEKRTGKKVRRSNMMYQHPEHDFMLANVDRFVVGEDAILECKTASAYLAKEWEADEVPATYLVQIQHYLAVTGKSKAYVAVLIGGNKFIWKEIERDDELINQIIAFELDFWETNVKGHVAPALDGSSAAEKYLKDRFAKSEAKQVILSKKYNEFLAERANLERDIKLLETRKKEIDNNIKNDLKEAETAIADEFTITWKPVITSRVDTKRLKEEHPDIYKKLRKETSYRKFAVKENK >NC_011660|2919585:2967797|2961332_2961611_+|WP_012582416.1|DBSCAN-SWA MNIHYVTVGNDGYIDGWSNSKEENTIDVLADESTVNKLFCVKVINKKAILDQEQYEKLQDEIHPEQTEIEKIREELLLTQEALAALFESNLG >NC_011660|2919585:2967797|2960250_2961336_+|WP_012582415.1|plate|DBSCAN-SWA MTETENAIHKNGIYDFNVTTEEDKPLQKAVFYTRDTGGTARLIFNIDKDNQDLGLSSAAELELAMILAKGTESESKYLVKPTITDGVRGIAEYALTDSQISHAGTAIAELYIKYKNSQAMRVYKFSFEIKKALIDSDFFPVAEFYVERWDDYEKIFDESFERLNAKLDDVDKKADDLKTQFDAMQPSQFAQKTDLNAHVNNADIHVSSADKTNWNAKETVSSAQAKADKALSDAKTDASLKAAQALADAKAYTDSKITQTVWTGSFYMSASQTVTPSIPLNQCKAWIIYWSKYSAGAARDYYWCTQIVTKETYGGHNFDAMMDNSPVHKYLYVSATQLTGSDDNSTGTNNQAVMRKVVALL >NC_011660|2919585:2967797|2938221_2938623_+|WP_012582392.1|DBSCAN-SWA MTNTIKISEIDKVFQIATKSGWVAKTGTQVTIDGIDFAIYPERALTQVFLHVNEISSGASLLNYPIDLIDFLDVSTRNTAIEFYKYKVIPLIQKKIEANGLDKFRKEVEKTKKYMVETHGERPEIKDFEGEGK |
73 | Listeria_phage(90.32%) | integrase,tail,holin,tRNA,terminase,portal,capsid,plate | attL 2918452:2918466|attR 2926923:2926937 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_011660.1|WP_012582157.1|2545309_2545573_+|AcrIIA4-family-anti-CRISPR-protein |
2545309_2545573_+
Protein sequences of NC_011660.1|WP_012582157.1|2545309_2545573_+|AcrIIA4-family-anti-CRISPR-protein>NC_011660.1|WP_012582157.1|2545309_2545573_+|AcrIIA4-family-anti-CRISPR-protein MNISELIREIKNKDYAVRLEGTDDNSITKLIIDVDNDGNEYVISESKNESIAEKFASTFKNGWNKEYEDEEEFYNDMQSIILKSELN |
87 aa aa |
14
gnl|BL_ORD_ID|14 information
|
NA | NA | 2543216-2583809 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.17|2095647|37|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_011660 position: 2573241-2573205, mismatch: 0 tatcacggaagtgcaagagtcggagagttctgtagat CRISPR spacer tatcacggaagtgcaagagtcggagagttctgtagat Protospacer ************************************* |
||||||||||||||||||||||
NC_011660.1|WP_003723553.1|1366511_1366649_+|hypothetical-protein |
1366511_1366649_+
Protein sequences of NC_011660.1|WP_003723553.1|1366511_1366649_+|hypothetical-protein>NC_011660.1|WP_003723553.1|1366511_1366649_+|hypothetical-protein MTKVILTIFAIIVPAFLGFILAYQIYKKKTATYMPLKNEFVHWAK |
45 aa aa | NA | NA | NA | 1351756-1399268 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.9|2095126|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_011660 position: 1388852-1388887, mismatch: 2 atgaagatgatttcaaactagctacagataaagata CRISPR spacer atgaagatgattttaaactagctacagatgaagata Protospacer *************.***************.****** |
||||||||||||||||||||||
NC_011660.1|WP_003726053.1|1367894_1368089_+|hypothetical-protein |
1367894_1368089_+
Protein sequences of NC_011660.1|WP_003726053.1|1367894_1368089_+|hypothetical-protein>NC_011660.1|WP_003726053.1|1367894_1368089_+|hypothetical-protein MKISKPAYLVLLVVGLVFVFLGLSNIGISIFWDFSDLENLMVGSLLIIIGLITLRIRYSFKKRG |
64 aa aa | NA | NA | NA | 1351756-1399268 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.9|2095126|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_011660 position: 1388852-1388887, mismatch: 2 atgaagatgatttcaaactagctacagataaagata CRISPR spacer atgaagatgattttaaactagctacagatgaagata Protospacer *************.***************.****** |
||||||||||||||||||||||
NC_011660.1|WP_012581432.1|1385685_1386096_-|Cys-Gln-thioester-bond-forming-surface-protein |
1385685_1386096_-
Protein sequences of NC_011660.1|WP_012581432.1|1385685_1386096_-|Cys-Gln-thioester-bond-forming-surface-protein>NC_011660.1|WP_012581432.1|1385685_1386096_-|Cys-Gln-thioester-bond-forming-surface-protein MNSQKKKAKKGKIIAMVIVVLILINQFQPFNAIAAALRLDETGYFYTGISFTNGQKLENKDIWNMKMDGKDVFCIDSAAPANTEDGYSAETYTGEKKDLLSKVAYYGFTQSEQSYKDFATTQLLIWEVLGEQLEWT |
136 aa aa | NA | NA | NA | 1351756-1399268 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.9|2095126|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_011660 position: 1388852-1388887, mismatch: 2 atgaagatgatttcaaactagctacagataaagata CRISPR spacer atgaagatgattttaaactagctacagatgaagata Protospacer *************.***************.****** |
||||||||||||||||||||||
NC_011660.1|WP_003727743.1|2927208_2927475_+|hypothetical-protein |
2927208_2927475_+
Protein sequences of NC_011660.1|WP_003727743.1|2927208_2927475_+|hypothetical-protein>NC_011660.1|WP_003727743.1|2927208_2927475_+|hypothetical-protein MKVGDILEIAGRVVGRIEETTEGTLLVRKGYVTYQGGQKVIVLTKQAVYLDSETIKNAYWIKTIDSSIISETVNLIACDNLIREFLDM |
88 aa aa | NA | NA | NA | 2919585-2967797 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.4|2094802|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_011660 position: 2926722-2926687, mismatch: 2 aggaatttccagaggagcatactcgcacattgaaaa CRISPR spacer aggaatttccagaggagcttactcgcatattgaaaa Protospacer ****************** ********.******** |
||||||||||||||||||||||
NC_011660.1|WP_003735007.1|2927698_2927893_+|hypothetical-protein |
2927698_2927893_+
Protein sequences of NC_011660.1|WP_003735007.1|2927698_2927893_+|hypothetical-protein>NC_011660.1|WP_003735007.1|2927698_2927893_+|hypothetical-protein MKKIAFTNSFLTKRNRKESVLTIELSITGEDFSDLSILPELYSEINSLASRLSEKTNGDLGKRK |
64 aa aa | NA | NA | NA | 2919585-2967797 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.4|2094802|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_011660 position: 2926722-2926687, mismatch: 2 aggaatttccagaggagcatactcgcacattgaaaa CRISPR spacer aggaatttccagaggagcttactcgcatattgaaaa Protospacer ****************** ********.******** |
||||||||||||||||||||||
NC_011660.1|WP_012582372.1|2925333_2925939_-|hypothetical-protein |
2925333_2925939_-
Protein sequences of NC_011660.1|WP_012582372.1|2925333_2925939_-|hypothetical-protein>NC_011660.1|WP_012582372.1|2925333_2925939_-|hypothetical-protein MSKYSYLLKKWWFWVIFLLVIIGIVSLFWYTQVYTSEWGKGLSKEDKEVLEKANKSTNEFNKFAKEANSGIKSFNNDVTIDPQIVINPFTKMGDNITERSDDFIKHYDEYSISIQNILKDDYNNIKKLRDDVVAQQEEIKSIYSNAHNYNRELSTVESKIVENIYQEMHKEQKESLGLKNHEFKKNAEFSDKAIKLMSGVD |
201 aa aa | NA | NA | NA | 2919585-2967797 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.4|2094802|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_011660 position: 2926722-2926687, mismatch: 2 aggaatttccagaggagcatactcgcacattgaaaa CRISPR spacer aggaatttccagaggagcttactcgcatattgaaaa Protospacer ****************** ********.******** |
||||||||||||||||||||||
NC_011660.1|WP_012582373.1|2925993_2926161_-|hypothetical-protein |
2925993_2926161_-
Protein sequences of NC_011660.1|WP_012582373.1|2925993_2926161_-|hypothetical-protein>NC_011660.1|WP_012582373.1|2925993_2926161_-|hypothetical-protein MKKLDELNMQHDVVILEHEFTSCSFTLKKEVFIVIDSRLSQSEKLEDVARLLNKI |
55 aa aa | NA | NA | NA | 2919585-2967797 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.4|2094802|36|NC_011660|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_011660 position: 2926722-2926687, mismatch: 2 aggaatttccagaggagcatactcgcacattgaaaa CRISPR spacer aggaatttccagaggagcttactcgcatattgaaaa Protospacer ****************** ********.******** |