Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_010321 | Thermoanaerobacter pseudethanolicus ATCC 33223, complete sequence | 8 crisprs | RT,cas6,cas8b1,cas7,cas5,cas3,cas4,cas1,cas2,csa3,Cas14b_CAS-V-F,csx20,csx1,cas10,csm3gr7,csx19,DEDDh,cmr1gr7,cas14k,cas14j,casR | 0 | 13 | 8 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_010321_1 | 121655-124892 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NC_010321_1
|
48 spacers
spacers of NC_010321_1
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cas3,cas5,cas7,cas8b1,cas6,cas4,cas1,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_010321_1
The CRISPR arrays of NC_010321_1 >merge|NC_010321|1|121655-124892|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT 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TGTAAACGAGGGAAAGGATGAAAAAAAAATGATAAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGATATTTAAGCGCGCGATGTGGAGGGGTCTCGTGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CGTGCCTGCAGACTGCAATGCCTACGACGTCATGGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGTACTAAAGATTGAGGAGGTATAAACATGGAAGAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CAGCCTGTTGCTTATAATTAAGGTAACAGCAGGTTAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGCTGTTCCTGCAAGGATGCGATGGTTGCAGTTTTTT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCACCTTTTTTACCTCAATTAGTTCTATAGTATTAAAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAACTAGTGATGGATATGTTGATTGGCTAAGTATTGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTGCTTTAGCAAGATTGTTATTTTTTAACATATTAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GAAAAGCAGTTGGAGGAGGCAAAAGAACATGAAAAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CAGTATTGAAACATTAAAAAATAATGCAGAGCTGAAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCTGTAGCACCTTTGTAGTTATCTAAAACCTCAATGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAATATCCTGAAACAAAGAAAAAACGCTGAATCTCAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAGAGCCTTTTAATATTGCAAAGGAAAAGGTGCTTTCG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATCGCTTAAATTGTTCTTCTGTTAATTCATTCTCTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGTATTAAAAATTAAGGAGGTTTAAAAAATGGAAAA GTTTTTAGCCTACCTATCCTGAAAATAGTG
>NC_010321.1|WP_012268883.1|119117_121472_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MSSFSELYSHPDKFLEDHLINTSKIIRSYFNEKKVAIIDKETFLKTATIISLCHDFGKATNYFQKYLFTENEKERNKLKTMEEMHHSLLSAVVAFYLVKNEINAQDRKGILFPFIAFLIVKNHHGDLKNVFNEVILDDKELEVLKKQLNSIDDEKLQVLNGKLRNAGLNENLTKSAINDYIDSINSELRKIKRELRRLKEEQDVSIYLLLNFLFSLLVDADKTEVVVGIDNIKRPEIKFEEQLVKEYKASFPDKESKINLLREEAYKEVLEKDIDIKQKIMSINLPTGLGKTLTTIAFAMKLWAKLYKETGVKYRIIYSLPFLSIIEQNSNVLEDLLRYNGIQPDTEIILKHHHLSDIRYTKNNTEFEDEQAKILIEGWNSEIIITTFVQFFHTLVSEKNKTLRKFHRLANSIIILDEVQSIPFKYWLLTKELLKAVANELNSYIIFVTATQPLIFREEEIYPLVAKTKYFTQMDRVEIIPKLSRDITLEELSEMFDLNDGKSYLFILNTIKSAQQFYNILRAKIPNDEIIYMSTHVVPMERMERIEKIKEGKIRFAVTTQLVEAGVDIDFDVVVRDIAPLDSINQSAGRCNRNWRGKGEVYVVSLIDEKGQKYSKYVYDKILLGITREILSKYDTIKEQELLKIIEKYYQEVSERMSSNEGRELLDAIYTLRYDSEDGNMCISKFELIEDDYYKVDAFIELNDEAKELWHKYVELKDIKNLFERRNIFNRFKADFYKYVISIPATVENMPPDIWGFKYVNYDSLNDYYDKETGFITKGVTSIW >NC_010321.1|WP_003871404.1|118420_119134_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKTLVFDVFGDYGHFRKYYTTSSPLTFSFPPPPTVKGMLGAIAGIDKKEYLKVFSEENCKVAIRILNPIKKIRLGLNLINTKGNYWIPYKAKNHEARTQVKTEFVKDAAYRIYFMHKDNDLFEDIVEKIKNRRNVYTLSLGLSEMIADYKFIGVYEAEEIENAEVDILSVLPFQSIVEDKIYFENGKKYFKEKIPAGMNEDRVVLSYEDVLYEVNGQSIKCHVKKCWEVKGEHVIFF >NC_010321.1|WP_012268882.1|117496_118408_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csh2 MENVIKNRAEILFLYDVSFANPNGDPVDENKPRIDEETGINIVTDVRLKRTIRDYLAYYKGKEVFIIETRKDNGELRTKKDRIEDFGTNEDIIAKCIDVRLFGATTAVKDKMMILTGPVQFKYGKSLHRVNLMYVKGTTVMPSGEGREQGTFTEKYILPYSLIAFYGIVNENAAINQNIPLTDEDVDLMLEGMWNGTKNLMSGSKIGHMPRLLIEVVYQENNYQIGELEKRIKFVHEMEDEEIRDIQDGKLDITELVAVLKQNQEKIKLIKYIYDDRVTFTCNGEECTLEKALKGLNIQKLQY >NC_010321.1|WP_012268881.1|115732_117496_+|TIGR02556-family-CRISPR-associated-protein MITAIKELGEMVLKSQNKTLLDVLIENPNQDGRYSKIIAINFIVKEDEIEYEGIRLEEYDDSKISRYLFTDTGGNAPGYTPAAKITEVPKTFNGKIKNWFNKVLKDKSIKIDEKDRAFLERIKDILEEKSDEIIKEAEKIRGDFPKKEGLSLILKFNVDGEYKYIGDFNVFRDLMLQLDSQKYQKIYAEDKVCSICGQKKDIVFGTVDTYKFYTIDKPGYIAGGFNEKESWKNYPVCAECRLALEEGKRYLENELTFRFYGLEYQLIPNFIIGKEFVRKEVREIFESSERLLSLKREVKKRFIGDEDEILDYLADAEDSMTVNLLFLRKSNSAERILLLIEDVFPSHLREIFNAKEQVDKIFGNSFTFKNIRSFMSKSDSNKRDNDLDGYFLDITDRIFRGRPVDLGFLYNLIMKKIREEFVKDGYYKAATADGLMTIAFLEKMKLIKMEVIPMEERIFDSFFAKYGPTFEMPLKRGLVLLGALTELLLRKQYSDREAKPFMKNLKGLKMDEKDIKGLLPKVQNKLEEYDSFEKGKRLLAKEASNYLLLAGDNWNMSVDEINFYFACGINLADELTSIIYKKEGEEK >NC_010321.1|WP_004399630.1|114957_115713_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRITLEFVGEKNLVLPIHYNYIVQGFLYDLMGDSEFAAFLHDEGFQYEKRKFKLFTFSRIEGEFKILTDSKGQKKISIKPPFKFTVASPLDEFIFDISKNALKKEYCHFNGQKFILNSLNIDNPPVFKNKARIKFISPVVMYTTLKDGDIKYTYYYSPWDEKFSPLLLNNLLKKYELVYKIKAEDPYFKLYPLSEKEDRRYSKMIKYKNVYVKGWMGIYDVESSPELLELAYYTGLGAKNSQGFGCFEIIG >NC_010321.1|WP_003868738.1|114355_114769_+|SUF-system-NifU-family-Fe-S-cluster-assembly-protein MSDLNQLYSEVIMEHYENSPHRRELKDATHKERGHNPLCGDDITLYLKMNGDIIEDASFTGHGCAISQASTSMMIDLIKGKDKKEALRLVQEFIDMIHKKDVNLDELGDAQVLHGVSDFPARVKCALLAWKTLQEIL >NC_010321.1|WP_012268880.1|113129_114359_+|cysteine-desulfurase MKNIDIERIKKDFPILSVKPHGKRLVYLDNAATTQKPIEVIKAMDKYYEELNANVYRSPHYLSVLSTQAYEEARERVKKFINAKKEESIVFTRNTTESINFIAYTWGMKHINEGDEILLTIAEHHSNILPWQMVAEAKGAKLKYVYLDENFRLSMKDFKEKMSEKVKLVAVQHMSNVLGIINPVEEITHIAHKYGAKVLIDGAQSVPHMPVDVQKIDCDFFAFSGHKMLGPMGIGVLYIKEDLLKEVPPFLRGGEMIDEVYEDHSTFAPSPLKFEAGTPNIEGAYVLISAIDYIEKIGLTNIYKHEGELLEYGLQKMRELDFVKLYGPKDAKERGGIISFNVEGVHPHDVATILDEEGVAVRSGHHCCQPLMRYLGVPATVRASFYLYNDFEDIDALVEGLKKVRKWFK >NC_010321.1|WP_012268879.1|112083_113133_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD MWKRVSMEEIQQPSYKEYTSAVIKNLSHDTVKIKETKKLAGLPTEILALRDKAFGIEGKFINMVRDFYNAGFHIEISQNSNVEKPIVIDYITNEQNDTLIDYNIIEAEANSQVTIVFDYNSGTKGFHNGITQVIAKEGSTVNIVKIQRLGDEFNDFDNNLVIVGKNAMVNWSNVVIGSKVSAFDVAVYLDEVGGTFTSKSIFLGVDSQKYDMAYKVYHQAPKTTSSVDLKGALKGSAKATFIGNIDIKKGAKKAKAEENETVLLLDKTVKSVAIPALYCGEDDVQANHSASAGQIDEDKLYYVMSRGFSLEEARLLMVQAILNPVIDLIPYDPVREIIIKGHIGRRIIK >NC_010321.1|WP_012268878.1|110669_112073_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufB MKKPDIKEIDFSIYDVKDNVKYEYQTGKGLSKEVVLEISEQKNEPSWMRDFRLKALEIYQKMPMPTWGVDLSQLDIDSIIAYIRPSAKMQRSWDEVPEEIRRTFERLGIPEAERKALAGVGAQYDSEVVYHNIKESLTQQGVIFEDMDTAVKKYPDIIKEYFMTKNVTPYDHKFVALHAAIWSGGTFVYVPEGVKVEVPLQAYFRMNAPGSGQFEHTLIIADKGSEVHFIEGCSAPQYTVSNLHAGCVELFVNEGARIIYSTIENWSKNTYNLNTKRAIVEKDGIIEWISGSFGSHKTMLYPASILKGEGAKAEYTGVTFAAKGQHLDTGSKMIHLAPHTSSKVLAKSISKDGGISSYRGLLKIGPNAEGAKASVQCEGLMLDDISRSDTMPVIEIENDNVDIGHEAKVGRISDEQIFYLMSRGLSEDDARAMIVRGFVEPIAKALPLEYAVEMNRLIKLELEGAIG >NC_010321.1|WP_012268877.1|109903_110650_+|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC MRETLLEIKDLHIEVEGKYILKGLNLTIKKGEIHAIMGPNGGGKSTLCNSIMGNPKYKVTSGQILFEGEDITNLKVNERAKKGIFLSFQYPEEIPGITVDNFIRTSVNIVTGQNVSMLQFAKEMKNTLELLDMNSEYRSRYLNVGFSGGEKKKAEILQMAFLKPKLVMLDEIDSGLDIDALKVVAEAVKKLKSEDMSILIVTHYNRILDYLEPDVISVLMDGKIVKSGDKDLAKILEEKGYDFVRNGV >NC_010321.1|WP_003869923.1|124977_126198_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_003869923.1|128110_129331_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_003869923.1|129769_130990_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_003869923.1|135695_136916_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_003869923.1|138221_139442_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_012268884.1|141548_142769_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKSVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_009052111.1|142907_143636_+|peptidase-E MKKVVAIGGGEISKFETFKIDEEIVKLTDKAKPKALFVPTASGEPEAYCDNFDFVYGKMLGCETDILFLIKDDPDSSQIEKKISWADLIYVGGGNTKRMMEIWRSKGVDKMLIDAYQRGTVLSGLSAGAICWFKYGFSDSQRFENQENWHYTKVEGLGLFDAILCPHLNEENRRELFEKFMIDFEGVGIGLENGCAIEIVDDTFKIINSFENAHAYVFRRSENKLFVDEIRHRDYIPFNLLI >NC_010321.1|WP_003867574.1|143964_144462_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MEFEVTGALMQSYTICKRQVWLMAHQIVPDQEHPYIEIGRLIDENSYQRDRKKIHFENVVLDLVRMEKDNILIGEVKKSSKAEDSAKMQLLFYLYKLKQSGITAKGQLFFPEERKREVVELTPEFEREVIKAIEEIKDIVYKEKPPAFIKIPYCKNCGYKEFCMS >NC_010321.1|WP_004399636.1|144458_145451_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKTIYIFSDGELKRKDNTLFFEGENGRKFIPVENTSEIMVFGEVSLNKRLLEFLTQSEIILHFFNHYGYYVGSYYPREHLNSGYMILRQAEHYNDESKRLYLAQKFVEGAYKNIRQVLKYYSNRGKDLEDVIYSIEKLGESVDSTSTINELMAIEGNIREYYYKAFDEIIQNPDFKFDFRSKRPPQNFLNTLISFGNSLMYTTTLSEIYKTHLDPRIGFLHATNFRRFSLNLDVSEIFKPIIVDRTIFTLLSKKMVTKEDFEEDAEGLLLKEKGKKVFVQEFEDKLATTIKHRNLSNNVSYRRLIRLELYKLEKHLIEEEQYKPFIAQW >NC_010321.1|WP_003871087.1|145467_145731_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFLILVYDVNEKRVNKVLKTCRKYLHWVQNSVLEGEISEANLKKLKIELSRIIDKDEDSVIFYILRTTKYSEREILGLRKGGEDIII |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_010321_2 | 126456-128025 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NC_010321_2
|
23 spacers
spacers of NC_010321_2
>2.1|126486|39|NC_010321|CRT CTAATTTGCTTTAAGCTTGTTGCTACAAGATAGACCTTG >2.2|126555|38|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CGCCGAGGTCTTCTCCTGTCGCGATATAATGCGACAGG >2.3|126623|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GGCAATAGTTTTATTACGTCCAAAACAAACTAAAAG >2.4|126689|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAAGGGCGGTTAAACTGCCTGAAAACGGCATAGTGGG >2.5|126756|38|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CATGGAAGCAGCAGCCGAGGCCACAGGTGGAGTTTATG >2.6|126824|38|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATGCACCTTGCTTTAGGAGTGCATAAGCCTCTCTCCCG >2.7|126892|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAAAGCAAAAAACCAGTGGCTTTGCTGCAAGGGTTGA >2.8|126959|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGCTGTTGTTTTGACATATTCATCATCCTTTCTGAA >2.9|127025|39|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGACATTGTCTTCTTTAATTACCTTTCTTATGAAATCCG >2.10|127094|35|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GCAGGCAACCCAAAGCGGATGCATTTATGGATTGG >2.11|127159|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTAAGTTGTTGGGCCATGATATCAGGGGCAATAAC >2.12|127225|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAAGAACCTGTCATAATCTTTTCATTCTTATTTCTA >2.13|127291|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAGGAATTTTGGCTAATAAGCTTGAAAACTTCCATC >2.14|127357|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CAAAAATTCTGTACTTTATACCGTTGATTTTTTTATG >2.15|127424|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TACGCAGTACATACAGCAAAGAAGCAGATATTACAGG >2.16|127491|38|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAGCACCGGCATCCAGTAATCATCATGGAAATTATGAG >2.17|127559|38|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CCATGACGTGGCGGCATCATTACAATAAGACGATTAAG >2.18|127627|38|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCTACCGTGACGGGTCGGTGGTCCAGCCGACCGAATAG >2.19|127695|38|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GTCCATCTTTTTATATTAGCCATCATTATCACCTCAAC >2.20|127763|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGGATTACGTGGGCATAGAGAACAAGGTTGACGCCA >2.21|127829|35|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CATAGGCCGTGGCTGGGCCGGTATCGGGTATAACG >2.22|127894|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GGTATATAAACGTCTACGACAATGATGAAGATGTAT >2.23|127960|36|NC_010321|CRT,CRISPRCasFinder AGAGGAACAATTGGAATGTATGAAATAGGACAAAGA |
cas3,cas5,cas7,cas8b1,cas6,cas4,cas1,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_010321_2
The CRISPR arrays of NC_010321_2 >merge|NC_010321|2|126456-128025|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GCGGCATGGGAGTCTATAAGGAATTGAAACCTAATTTGCTTTAAGCTTGTTGCTACAAGATAGACCTTGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCGCCGAGGTCTTCTCCTGTCGCGATATAATGCGACAGGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGGCAATAGTTTTATTACGTCCAAAACAAACTAAAAGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAAAGGGCGGTTAAACTGCCTGAAAACGGCATAGTGGGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCATGGAAGCAGCAGCCGAGGCCACAGGTGGAGTTTATGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATGCACCTTGCTTTAGGAGTGCATAAGCCTCTCTCCCGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTAAAGCAAAAAACCAGTGGCTTTGCTGCAAGGGTTGAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAGCTGTTGTTTTGACATATTCATCATCCTTTCTGAAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTGACATTGTCTTCTTTAATTACCTTTCTTATGAAATCCGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGCAGGCAACCCAAAGCGGATGCATTTATGGATTGGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATTAAGTTGTTGGGCCATGATATCAGGGGCAATAACGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTAAGAACCTGTCATAATCTTTTCATTCTTATTTCTAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAAGGAATTTTGGCTAATAAGCTTGAAAACTTCCATCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCAAAAATTCTGTACTTTATACCGTTGATTTTTTTATGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTACGCAGTACATACAGCAAAGAAGCAGATATTACAGGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTAGCACCGGCATCCAGTAATCATCATGGAAATTATGAGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCCATGACGTGGCGGCATCATTACAATAAGACGATTAAGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTCTACCGTGACGGGTCGGTGGTCCAGCCGACCGAATAGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGTCCATCTTTTTATATTAGCCATCATTATCACCTCAACGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTGGATTACGTGGGCATAGAGAACAAGGTTGACGCCAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCATAGGCCGTGGCTGGGCCGGTATCGGGTATAACGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGGTATATAAACGTCTACGACAATGATGAAGATGTATGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAGAGGAACAATTGGAATGTATGAAATAGGACAAAGAGTTTTTAGCCTACCTATCCTGAAAATAGTG >NC_010321|2|2|126456-128025|CRT GCGGCATGGGAGTCTATAAGGAATTGAAAC CTAATTTGCTTTAAGCTTGTTGCTACAAGATAGACCTTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CGCCGAGGTCTTCTCCTGTCGCGATATAATGCGACAGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GGCAATAGTTTTATTACGTCCAAAACAAACTAAAAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAAGGGCGGTTAAACTGCCTGAAAACGGCATAGTGGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CATGGAAGCAGCAGCCGAGGCCACAGGTGGAGTTTATG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGCACCTTGCTTTAGGAGTGCATAAGCCTCTCTCCCG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAAAGCAAAAAACCAGTGGCTTTGCTGCAAGGGTTGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGCTGTTGTTTTGACATATTCATCATCCTTTCTGAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGACATTGTCTTCTTTAATTACCTTTCTTATGAAATCCG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GCAGGCAACCCAAAGCGGATGCATTTATGGATTGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATTAAGTTGTTGGGCCATGATATCAGGGGCAATAAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAAGAACCTGTCATAATCTTTTCATTCTTATTTCTA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAGGAATTTTGGCTAATAAGCTTGAAAACTTCCATC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CAAAAATTCTGTACTTTATACCGTTGATTTTTTTATG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TACGCAGTACATACAGCAAAGAAGCAGATATTACAGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAGCACCGGCATCCAGTAATCATCATGGAAATTATGAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCATGACGTGGCGGCATCATTACAATAAGACGATTAAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCTACCGTGACGGGTCGGTGGTCCAGCCGACCGAATAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GTCCATCTTTTTATATTAGCCATCATTATCACCTCAAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGGATTACGTGGGCATAGAGAACAAGGTTGACGCCA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CATAGGCCGTGGCTGGGCCGGTATCGGGTATAACG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GGTATATAAACGTCTACGACAATGATGAAGATGTAT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGAGGAACAATTGGAATGTATGAAATAGGACAAAGA GTTTTTAGCCTACCTATCCTGAAAATAGTG >NC_010321|2|2|126525-127959|PILER-CR GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CGCCGAGGTCTTCTCCTGTCGCGATATAATGCGACAGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GGCAATAGTTTTATTACGTCCAAAACAAACTAAAAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAAGGGCGGTTAAACTGCCTGAAAACGGCATAGTGGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CATGGAAGCAGCAGCCGAGGCCACAGGTGGAGTTTATG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGCACCTTGCTTTAGGAGTGCATAAGCCTCTCTCCCG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAAAGCAAAAAACCAGTGGCTTTGCTGCAAGGGTTGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGCTGTTGTTTTGACATATTCATCATCCTTTCTGAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGACATTGTCTTCTTTAATTACCTTTCTTATGAAATCCG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GCAGGCAACCCAAAGCGGATGCATTTATGGATTGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATTAAGTTGTTGGGCCATGATATCAGGGGCAATAAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAAGAACCTGTCATAATCTTTTCATTCTTATTTCTA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAGGAATTTTGGCTAATAAGCTTGAAAACTTCCATC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CAAAAATTCTGTACTTTATACCGTTGATTTTTTTATG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TACGCAGTACATACAGCAAAGAAGCAGATATTACAGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAGCACCGGCATCCAGTAATCATCATGGAAATTATGAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCATGACGTGGCGGCATCATTACAATAAGACGATTAAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCTACCGTGACGGGTCGGTGGTCCAGCCGACCGAATAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GTCCATCTTTTTATATTAGCCATCATTATCACCTCAAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGGATTACGTGGGCATAGAGAACAAGGTTGACGCCA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CATAGGCCGTGGCTGGGCCGGTATCGGGTATAACG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GGTATATAAACGTCTACGACAATGATGAAGATGTAT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC >NC_010321|2|2|126525-128025|CRISPRCasFinder GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CGCCGAGGTCTTCTCCTGTCGCGATATAATGCGACAGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GGCAATAGTTTTATTACGTCCAAAACAAACTAAAAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAAGGGCGGTTAAACTGCCTGAAAACGGCATAGTGGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CATGGAAGCAGCAGCCGAGGCCACAGGTGGAGTTTATG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGCACCTTGCTTTAGGAGTGCATAAGCCTCTCTCCCG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAAAGCAAAAAACCAGTGGCTTTGCTGCAAGGGTTGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGCTGTTGTTTTGACATATTCATCATCCTTTCTGAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGACATTGTCTTCTTTAATTACCTTTCTTATGAAATCCG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GCAGGCAACCCAAAGCGGATGCATTTATGGATTGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATTAAGTTGTTGGGCCATGATATCAGGGGCAATAAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAAGAACCTGTCATAATCTTTTCATTCTTATTTCTA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAGGAATTTTGGCTAATAAGCTTGAAAACTTCCATC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CAAAAATTCTGTACTTTATACCGTTGATTTTTTTATG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TACGCAGTACATACAGCAAAGAAGCAGATATTACAGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAGCACCGGCATCCAGTAATCATCATGGAAATTATGAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCATGACGTGGCGGCATCATTACAATAAGACGATTAAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCTACCGTGACGGGTCGGTGGTCCAGCCGACCGAATAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GTCCATCTTTTTATATTAGCCATCATTATCACCTCAAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGGATTACGTGGGCATAGAGAACAAGGTTGACGCCA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CATAGGCCGTGGCTGGGCCGGTATCGGGTATAACG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GGTATATAAACGTCTACGACAATGATGAAGATGTAT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGAGGAACAATTGGAATGTATGAAATAGGACAAAGA GTTTTTAGCCTACCTATCCTGAAAATAGTG
>NC_010321.1|WP_003869923.1|124977_126198_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_012268883.1|119117_121472_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MSSFSELYSHPDKFLEDHLINTSKIIRSYFNEKKVAIIDKETFLKTATIISLCHDFGKATNYFQKYLFTENEKERNKLKTMEEMHHSLLSAVVAFYLVKNEINAQDRKGILFPFIAFLIVKNHHGDLKNVFNEVILDDKELEVLKKQLNSIDDEKLQVLNGKLRNAGLNENLTKSAINDYIDSINSELRKIKRELRRLKEEQDVSIYLLLNFLFSLLVDADKTEVVVGIDNIKRPEIKFEEQLVKEYKASFPDKESKINLLREEAYKEVLEKDIDIKQKIMSINLPTGLGKTLTTIAFAMKLWAKLYKETGVKYRIIYSLPFLSIIEQNSNVLEDLLRYNGIQPDTEIILKHHHLSDIRYTKNNTEFEDEQAKILIEGWNSEIIITTFVQFFHTLVSEKNKTLRKFHRLANSIIILDEVQSIPFKYWLLTKELLKAVANELNSYIIFVTATQPLIFREEEIYPLVAKTKYFTQMDRVEIIPKLSRDITLEELSEMFDLNDGKSYLFILNTIKSAQQFYNILRAKIPNDEIIYMSTHVVPMERMERIEKIKEGKIRFAVTTQLVEAGVDIDFDVVVRDIAPLDSINQSAGRCNRNWRGKGEVYVVSLIDEKGQKYSKYVYDKILLGITREILSKYDTIKEQELLKIIEKYYQEVSERMSSNEGRELLDAIYTLRYDSEDGNMCISKFELIEDDYYKVDAFIELNDEAKELWHKYVELKDIKNLFERRNIFNRFKADFYKYVISIPATVENMPPDIWGFKYVNYDSLNDYYDKETGFITKGVTSIW >NC_010321.1|WP_003871404.1|118420_119134_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKTLVFDVFGDYGHFRKYYTTSSPLTFSFPPPPTVKGMLGAIAGIDKKEYLKVFSEENCKVAIRILNPIKKIRLGLNLINTKGNYWIPYKAKNHEARTQVKTEFVKDAAYRIYFMHKDNDLFEDIVEKIKNRRNVYTLSLGLSEMIADYKFIGVYEAEEIENAEVDILSVLPFQSIVEDKIYFENGKKYFKEKIPAGMNEDRVVLSYEDVLYEVNGQSIKCHVKKCWEVKGEHVIFF >NC_010321.1|WP_012268882.1|117496_118408_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csh2 MENVIKNRAEILFLYDVSFANPNGDPVDENKPRIDEETGINIVTDVRLKRTIRDYLAYYKGKEVFIIETRKDNGELRTKKDRIEDFGTNEDIIAKCIDVRLFGATTAVKDKMMILTGPVQFKYGKSLHRVNLMYVKGTTVMPSGEGREQGTFTEKYILPYSLIAFYGIVNENAAINQNIPLTDEDVDLMLEGMWNGTKNLMSGSKIGHMPRLLIEVVYQENNYQIGELEKRIKFVHEMEDEEIRDIQDGKLDITELVAVLKQNQEKIKLIKYIYDDRVTFTCNGEECTLEKALKGLNIQKLQY >NC_010321.1|WP_012268881.1|115732_117496_+|TIGR02556-family-CRISPR-associated-protein MITAIKELGEMVLKSQNKTLLDVLIENPNQDGRYSKIIAINFIVKEDEIEYEGIRLEEYDDSKISRYLFTDTGGNAPGYTPAAKITEVPKTFNGKIKNWFNKVLKDKSIKIDEKDRAFLERIKDILEEKSDEIIKEAEKIRGDFPKKEGLSLILKFNVDGEYKYIGDFNVFRDLMLQLDSQKYQKIYAEDKVCSICGQKKDIVFGTVDTYKFYTIDKPGYIAGGFNEKESWKNYPVCAECRLALEEGKRYLENELTFRFYGLEYQLIPNFIIGKEFVRKEVREIFESSERLLSLKREVKKRFIGDEDEILDYLADAEDSMTVNLLFLRKSNSAERILLLIEDVFPSHLREIFNAKEQVDKIFGNSFTFKNIRSFMSKSDSNKRDNDLDGYFLDITDRIFRGRPVDLGFLYNLIMKKIREEFVKDGYYKAATADGLMTIAFLEKMKLIKMEVIPMEERIFDSFFAKYGPTFEMPLKRGLVLLGALTELLLRKQYSDREAKPFMKNLKGLKMDEKDIKGLLPKVQNKLEEYDSFEKGKRLLAKEASNYLLLAGDNWNMSVDEINFYFACGINLADELTSIIYKKEGEEK >NC_010321.1|WP_004399630.1|114957_115713_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRITLEFVGEKNLVLPIHYNYIVQGFLYDLMGDSEFAAFLHDEGFQYEKRKFKLFTFSRIEGEFKILTDSKGQKKISIKPPFKFTVASPLDEFIFDISKNALKKEYCHFNGQKFILNSLNIDNPPVFKNKARIKFISPVVMYTTLKDGDIKYTYYYSPWDEKFSPLLLNNLLKKYELVYKIKAEDPYFKLYPLSEKEDRRYSKMIKYKNVYVKGWMGIYDVESSPELLELAYYTGLGAKNSQGFGCFEIIG >NC_010321.1|WP_003868738.1|114355_114769_+|SUF-system-NifU-family-Fe-S-cluster-assembly-protein MSDLNQLYSEVIMEHYENSPHRRELKDATHKERGHNPLCGDDITLYLKMNGDIIEDASFTGHGCAISQASTSMMIDLIKGKDKKEALRLVQEFIDMIHKKDVNLDELGDAQVLHGVSDFPARVKCALLAWKTLQEIL >NC_010321.1|WP_012268880.1|113129_114359_+|cysteine-desulfurase MKNIDIERIKKDFPILSVKPHGKRLVYLDNAATTQKPIEVIKAMDKYYEELNANVYRSPHYLSVLSTQAYEEARERVKKFINAKKEESIVFTRNTTESINFIAYTWGMKHINEGDEILLTIAEHHSNILPWQMVAEAKGAKLKYVYLDENFRLSMKDFKEKMSEKVKLVAVQHMSNVLGIINPVEEITHIAHKYGAKVLIDGAQSVPHMPVDVQKIDCDFFAFSGHKMLGPMGIGVLYIKEDLLKEVPPFLRGGEMIDEVYEDHSTFAPSPLKFEAGTPNIEGAYVLISAIDYIEKIGLTNIYKHEGELLEYGLQKMRELDFVKLYGPKDAKERGGIISFNVEGVHPHDVATILDEEGVAVRSGHHCCQPLMRYLGVPATVRASFYLYNDFEDIDALVEGLKKVRKWFK >NC_010321.1|WP_012268879.1|112083_113133_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD MWKRVSMEEIQQPSYKEYTSAVIKNLSHDTVKIKETKKLAGLPTEILALRDKAFGIEGKFINMVRDFYNAGFHIEISQNSNVEKPIVIDYITNEQNDTLIDYNIIEAEANSQVTIVFDYNSGTKGFHNGITQVIAKEGSTVNIVKIQRLGDEFNDFDNNLVIVGKNAMVNWSNVVIGSKVSAFDVAVYLDEVGGTFTSKSIFLGVDSQKYDMAYKVYHQAPKTTSSVDLKGALKGSAKATFIGNIDIKKGAKKAKAEENETVLLLDKTVKSVAIPALYCGEDDVQANHSASAGQIDEDKLYYVMSRGFSLEEARLLMVQAILNPVIDLIPYDPVREIIIKGHIGRRIIK >NC_010321.1|WP_012268878.1|110669_112073_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufB MKKPDIKEIDFSIYDVKDNVKYEYQTGKGLSKEVVLEISEQKNEPSWMRDFRLKALEIYQKMPMPTWGVDLSQLDIDSIIAYIRPSAKMQRSWDEVPEEIRRTFERLGIPEAERKALAGVGAQYDSEVVYHNIKESLTQQGVIFEDMDTAVKKYPDIIKEYFMTKNVTPYDHKFVALHAAIWSGGTFVYVPEGVKVEVPLQAYFRMNAPGSGQFEHTLIIADKGSEVHFIEGCSAPQYTVSNLHAGCVELFVNEGARIIYSTIENWSKNTYNLNTKRAIVEKDGIIEWISGSFGSHKTMLYPASILKGEGAKAEYTGVTFAAKGQHLDTGSKMIHLAPHTSSKVLAKSISKDGGISSYRGLLKIGPNAEGAKASVQCEGLMLDDISRSDTMPVIEIENDNVDIGHEAKVGRISDEQIFYLMSRGLSEDDARAMIVRGFVEPIAKALPLEYAVEMNRLIKLELEGAIG >NC_010321.1|WP_003869923.1|128110_129331_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_003869923.1|129769_130990_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_003869923.1|135695_136916_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_003869923.1|138221_139442_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_012268884.1|141548_142769_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKSVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_009052111.1|142907_143636_+|peptidase-E MKKVVAIGGGEISKFETFKIDEEIVKLTDKAKPKALFVPTASGEPEAYCDNFDFVYGKMLGCETDILFLIKDDPDSSQIEKKISWADLIYVGGGNTKRMMEIWRSKGVDKMLIDAYQRGTVLSGLSAGAICWFKYGFSDSQRFENQENWHYTKVEGLGLFDAILCPHLNEENRRELFEKFMIDFEGVGIGLENGCAIEIVDDTFKIINSFENAHAYVFRRSENKLFVDEIRHRDYIPFNLLI >NC_010321.1|WP_003867574.1|143964_144462_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MEFEVTGALMQSYTICKRQVWLMAHQIVPDQEHPYIEIGRLIDENSYQRDRKKIHFENVVLDLVRMEKDNILIGEVKKSSKAEDSAKMQLLFYLYKLKQSGITAKGQLFFPEERKREVVELTPEFEREVIKAIEEIKDIVYKEKPPAFIKIPYCKNCGYKEFCMS >NC_010321.1|WP_004399636.1|144458_145451_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKTIYIFSDGELKRKDNTLFFEGENGRKFIPVENTSEIMVFGEVSLNKRLLEFLTQSEIILHFFNHYGYYVGSYYPREHLNSGYMILRQAEHYNDESKRLYLAQKFVEGAYKNIRQVLKYYSNRGKDLEDVIYSIEKLGESVDSTSTINELMAIEGNIREYYYKAFDEIIQNPDFKFDFRSKRPPQNFLNTLISFGNSLMYTTTLSEIYKTHLDPRIGFLHATNFRRFSLNLDVSEIFKPIIVDRTIFTLLSKKMVTKEDFEEDAEGLLLKEKGKKVFVQEFEDKLATTIKHRNLSNNVSYRRLIRLELYKLEKHLIEEEQYKPFIAQW >NC_010321.1|WP_003871087.1|145467_145731_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFLILVYDVNEKRVNKVLKTCRKYLHWVQNSVLEGEISEANLKKLKIELSRIIDKDEDSVIFYILRTTKYSEREILGLRKGGEDIII >NC_010321.1|WP_012268885.1|145851_147777_+|FAD-dependent-oxidoreductase MELTKPIKIGNLSLKNRVVMAPVKTGYATPEGQVTEELIQYYVNRAKGGVGLIVLESAYVDLSGKEIPRQLGIYDDSMVEGLRRLITPLQEAGSKVAVYINHAGRIANPMVTKLPLIAPSSIACPTIGVEPQGIPHEDIKKWQNTYVKAAVRAYEAGADALEIQFGHGYLIHQFLSPHTNKREDEYGGSFENRIRFGMEILDEIKKEIGADFPIIVRISADEFVPGGWALEDAIRLAKILEDKGVAAIDVSLGSSCESGAITLQTLGTQKGLAWEFASKIKKQVNIPVIAVGRINTPELAEEILVSGKADLVALGRPLVADPLFVEKATSGRSKEIRRCAACHQGCLDELRAGRRFGCNFNPSVGKEEEIEIQKAPQPGKKVFIIGAGLAGLEAAYTAAARGHKVYIYEEKGEIGGQVLPGSVPPHKEELKGIVEYYKEVLPKVGVTLNLNHKVTAEEIAKWEADEVVFATGGQPIVPPIPGLKEYGFLTAVEVLRGEKQAGDKVAIIGGGLIGMETADYLSEQGKKVMVIELLEEVARDMGVFEKILIMKRLKERGVEIYVKTRLKEVGKALLVETPEGEKELPLPDTIVLAVGLKPDPSLYEEVSKILPQEKLHVIGDAKEVRKIVHAISEGRNLGLSL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_010321_3 | 131248-134493 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NC_010321_3
|
48 spacers
spacers of NC_010321_3
>3.1|131278|35|NC_010321|CRT AGGTCAAACCTGGGGCAAAGACTTACGACGGGAAA >3.2|131343|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGCCATCACCTATCATACTATCTCCATCCACTCTTA >3.3|131409|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CCATCTCAGACCGTGCAGAAAGCAACTTGTCTAATTG >3.4|131476|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AACTATGACATATAAAATTTAATGTGCCTTGTGGAG >3.5|131542|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CCAGTACCGTAGCTTCCTACAAATATGATGCCTACTC >3.6|131609|38|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTCCCTCTATATATTCAACAGGTTCAGGATATTTACG >3.7|131677|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTGAAAGTAAATTAGGAGAAAGATTTCGTGCAAGAAG >3.8|131744|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CGTGTTCCCAAAAAAGTGGACATGGTTCTTGTTCTTC >3.9|131811|39|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTATTTGCTCAATAGCCGAGCAGAGAACGGATTTGCCT >3.10|131880|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTCCTCTCGGACCGCCCCATCCATTACAGCAGCCG >3.11|131946|38|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CATGCTCTCTCTGTAGTTGTGCGGCTGTTCCCGGTGGG >3.12|132014|35|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCTACCAATGCATGGACGATATGCAGGACACCTGG >3.13|132079|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GCGAACCCATACTGCAAAGCCTCTTCTGCTGTCATC >3.14|132145|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATGCTTCCATCTTTTTTCGCCTCCTCAGTATCTTTCC >3.15|132212|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ACAATAAGGCGATCCCGGCGCTGATTGATTTAAACGG >3.16|132279|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GTTAATACGGCCGGCATGTTTGTCTTGCGAAGCACG >3.17|132345|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CCTCGGACGATGCTAAAGCAACTCTTTCACCTTGCAG >3.18|132412|40|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CAGAAAAGTGTATCATTGTGTATCATGTTTCTTGAGTTTG >3.19|132482|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CACATTTCAGCAATTCTCGATACTATTGCATCGCCTG >3.20|132549|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GAAGAAGAGGAATAGAGAGGGTTTACTCCCTCTCTTC >3.21|132616|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTTGTCCGAGGGACTTGGTCTAAACGTGGACAGCGA >3.22|132683|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGATCTTTTTGAGGACAATTACCTTTCCGTCTATAT >3.23|132749|38|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGTGTATTACATTGCCTTGTTTATCAAGTGGTTGTATA >3.24|132817|38|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTACGTGCGCAAAGATGGCAGCATCTTCCGAGGCAGAG >3.25|132885|35|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTTATTTCCTCCTCCTTAATTTTTTTATTTTCCC >3.26|132950|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTTCTATTGCCCACTCCGAAAGCATTGCTTTTCCCG >3.27|133017|38|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTTATCGGACTTTGTGATATAATATAAGTATGATATG >3.28|133085|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCCAACCATCCGTTGTGTAACGGATTGGATAACCTTC >3.29|133152|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATCCTTTGAGGAAAGTTGTTGAGCTATTGACTTATAG >3.30|133219|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TATAGCTGCTCTTGTTTTAAACGTTCTTCCTAACAGT >3.31|133286|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CCCCATTTAATGTAGTATCCGTTTTTGTAAATCTTC >3.32|133352|38|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGAAATTTCTCATCTTCTCTGGAACATCCAAAGCTGCG >3.33|133420|38|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAGGCAAATACAGGATTGCTTATGGAAAGATTGAGCAG >3.34|133488|39|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAGAAAGAGCAGAGGGCTAATGCCCTCTCTCTAAAAAAG >3.35|133557|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTTTAAGATTTTCTGTTTTATCTTTTATCTTGTCTA >3.36|133624|38|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GCCGCTAATTTGTGCTCTTCAGCTTTGAGCTCATTAAG >3.37|133692|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAAAGTCGCGATACTATAGCCTCTGCTGTTTCAACGT >3.38|133759|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAAGCCTCTAATGCACCTTTGAATCCCTTCATTTTG >3.39|133825|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTGTGATACTGTTGCCGCTTACTGCGGTTATGGTCA >3.40|133891|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGTATATAAAGAAGGTTTTGGAAGTTTCTAATTTAGG >3.41|133958|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTGGTTGTGATAATTCAGCTAACTTCTTTTTTGCTG >3.42|134024|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGCAGCCTGTGAAGCTCTGATATAAATTTGTCTTGT >3.43|134090|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGCTAAAACTACCCGATATGCTAAAATGCGGTAATG >3.44|134156|35|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGCTTTGTTGAAAATTCTTGTACCAATGCTGGAAG >3.45|134221|38|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CGCAAGATGTGGAAGATTTAGAGGATATCGAAGGAACA >3.46|134289|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CAGAGCCAGGGAAATTGGATGTAGGCAGGATGCCTGC >3.47|134356|37|NC_010321|CRT,CRISPRCasFinder CACTTACGCGCATGCGGTAGCTCCTGATCATGTTCCG >3.48|134423|40|NC_010321|CRT,CRISPRCasFinder ATATCTTTTCAGCTTCAGCAACAGGATCGAAAGCATAAGG |
cas3,cas5,cas7,cas8b1,cas6,cas4,cas1,cas2,RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_010321_3
The CRISPR arrays of NC_010321_3 >merge|NC_010321|3|131248-134493|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder 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GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ACAATAAGGCGATCCCGGCGCTGATTGATTTAAACGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GTTAATACGGCCGGCATGTTTGTCTTGCGAAGCACG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCTCGGACGATGCTAAAGCAACTCTTTCACCTTGCAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CAGAAAAGTGTATCATTGTGTATCATGTTTCTTGAGTTTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CACATTTCAGCAATTCTCGATACTATTGCATCGCCTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GAAGAAGAGGAATAGAGAGGGTTTACTCCCTCTCTTC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTTGTCCGAGGGACTTGGTCTAAACGTGGACAGCGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGATCTTTTTGAGGACAATTACCTTTCCGTCTATAT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGTGTATTACATTGCCTTGTTTATCAAGTGGTTGTATA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTACGTGCGCAAAGATGGCAGCATCTTCCGAGGCAGAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTTATTTCCTCCTCCTTAATTTTTTTATTTTCCC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTTCTATTGCCCACTCCGAAAGCATTGCTTTTCCCG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTTATCGGACTTTGTGATATAATATAAGTATGATATG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TCCAACCATCCGTTGTGTAACGGATTGGATAACCTTC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC 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CACTTACGCGCATGCGGTAGCTCCTGATCATGTTCCG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATATCTTTTCAGCTTCAGCAACAGGATCGAAAGCATAAGG GTTTTTAGCCTCCTTTTTTAAAATTTGAACG
>NC_010321.1|WP_003869923.1|129769_130990_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_003869923.1|128110_129331_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_003869923.1|124977_126198_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_012268883.1|119117_121472_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MSSFSELYSHPDKFLEDHLINTSKIIRSYFNEKKVAIIDKETFLKTATIISLCHDFGKATNYFQKYLFTENEKERNKLKTMEEMHHSLLSAVVAFYLVKNEINAQDRKGILFPFIAFLIVKNHHGDLKNVFNEVILDDKELEVLKKQLNSIDDEKLQVLNGKLRNAGLNENLTKSAINDYIDSINSELRKIKRELRRLKEEQDVSIYLLLNFLFSLLVDADKTEVVVGIDNIKRPEIKFEEQLVKEYKASFPDKESKINLLREEAYKEVLEKDIDIKQKIMSINLPTGLGKTLTTIAFAMKLWAKLYKETGVKYRIIYSLPFLSIIEQNSNVLEDLLRYNGIQPDTEIILKHHHLSDIRYTKNNTEFEDEQAKILIEGWNSEIIITTFVQFFHTLVSEKNKTLRKFHRLANSIIILDEVQSIPFKYWLLTKELLKAVANELNSYIIFVTATQPLIFREEEIYPLVAKTKYFTQMDRVEIIPKLSRDITLEELSEMFDLNDGKSYLFILNTIKSAQQFYNILRAKIPNDEIIYMSTHVVPMERMERIEKIKEGKIRFAVTTQLVEAGVDIDFDVVVRDIAPLDSINQSAGRCNRNWRGKGEVYVVSLIDEKGQKYSKYVYDKILLGITREILSKYDTIKEQELLKIIEKYYQEVSERMSSNEGRELLDAIYTLRYDSEDGNMCISKFELIEDDYYKVDAFIELNDEAKELWHKYVELKDIKNLFERRNIFNRFKADFYKYVISIPATVENMPPDIWGFKYVNYDSLNDYYDKETGFITKGVTSIW >NC_010321.1|WP_003871404.1|118420_119134_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKTLVFDVFGDYGHFRKYYTTSSPLTFSFPPPPTVKGMLGAIAGIDKKEYLKVFSEENCKVAIRILNPIKKIRLGLNLINTKGNYWIPYKAKNHEARTQVKTEFVKDAAYRIYFMHKDNDLFEDIVEKIKNRRNVYTLSLGLSEMIADYKFIGVYEAEEIENAEVDILSVLPFQSIVEDKIYFENGKKYFKEKIPAGMNEDRVVLSYEDVLYEVNGQSIKCHVKKCWEVKGEHVIFF >NC_010321.1|WP_012268882.1|117496_118408_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csh2 MENVIKNRAEILFLYDVSFANPNGDPVDENKPRIDEETGINIVTDVRLKRTIRDYLAYYKGKEVFIIETRKDNGELRTKKDRIEDFGTNEDIIAKCIDVRLFGATTAVKDKMMILTGPVQFKYGKSLHRVNLMYVKGTTVMPSGEGREQGTFTEKYILPYSLIAFYGIVNENAAINQNIPLTDEDVDLMLEGMWNGTKNLMSGSKIGHMPRLLIEVVYQENNYQIGELEKRIKFVHEMEDEEIRDIQDGKLDITELVAVLKQNQEKIKLIKYIYDDRVTFTCNGEECTLEKALKGLNIQKLQY >NC_010321.1|WP_012268881.1|115732_117496_+|TIGR02556-family-CRISPR-associated-protein MITAIKELGEMVLKSQNKTLLDVLIENPNQDGRYSKIIAINFIVKEDEIEYEGIRLEEYDDSKISRYLFTDTGGNAPGYTPAAKITEVPKTFNGKIKNWFNKVLKDKSIKIDEKDRAFLERIKDILEEKSDEIIKEAEKIRGDFPKKEGLSLILKFNVDGEYKYIGDFNVFRDLMLQLDSQKYQKIYAEDKVCSICGQKKDIVFGTVDTYKFYTIDKPGYIAGGFNEKESWKNYPVCAECRLALEEGKRYLENELTFRFYGLEYQLIPNFIIGKEFVRKEVREIFESSERLLSLKREVKKRFIGDEDEILDYLADAEDSMTVNLLFLRKSNSAERILLLIEDVFPSHLREIFNAKEQVDKIFGNSFTFKNIRSFMSKSDSNKRDNDLDGYFLDITDRIFRGRPVDLGFLYNLIMKKIREEFVKDGYYKAATADGLMTIAFLEKMKLIKMEVIPMEERIFDSFFAKYGPTFEMPLKRGLVLLGALTELLLRKQYSDREAKPFMKNLKGLKMDEKDIKGLLPKVQNKLEEYDSFEKGKRLLAKEASNYLLLAGDNWNMSVDEINFYFACGINLADELTSIIYKKEGEEK >NC_010321.1|WP_004399630.1|114957_115713_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRITLEFVGEKNLVLPIHYNYIVQGFLYDLMGDSEFAAFLHDEGFQYEKRKFKLFTFSRIEGEFKILTDSKGQKKISIKPPFKFTVASPLDEFIFDISKNALKKEYCHFNGQKFILNSLNIDNPPVFKNKARIKFISPVVMYTTLKDGDIKYTYYYSPWDEKFSPLLLNNLLKKYELVYKIKAEDPYFKLYPLSEKEDRRYSKMIKYKNVYVKGWMGIYDVESSPELLELAYYTGLGAKNSQGFGCFEIIG >NC_010321.1|WP_003868738.1|114355_114769_+|SUF-system-NifU-family-Fe-S-cluster-assembly-protein MSDLNQLYSEVIMEHYENSPHRRELKDATHKERGHNPLCGDDITLYLKMNGDIIEDASFTGHGCAISQASTSMMIDLIKGKDKKEALRLVQEFIDMIHKKDVNLDELGDAQVLHGVSDFPARVKCALLAWKTLQEIL >NC_010321.1|WP_012268880.1|113129_114359_+|cysteine-desulfurase MKNIDIERIKKDFPILSVKPHGKRLVYLDNAATTQKPIEVIKAMDKYYEELNANVYRSPHYLSVLSTQAYEEARERVKKFINAKKEESIVFTRNTTESINFIAYTWGMKHINEGDEILLTIAEHHSNILPWQMVAEAKGAKLKYVYLDENFRLSMKDFKEKMSEKVKLVAVQHMSNVLGIINPVEEITHIAHKYGAKVLIDGAQSVPHMPVDVQKIDCDFFAFSGHKMLGPMGIGVLYIKEDLLKEVPPFLRGGEMIDEVYEDHSTFAPSPLKFEAGTPNIEGAYVLISAIDYIEKIGLTNIYKHEGELLEYGLQKMRELDFVKLYGPKDAKERGGIISFNVEGVHPHDVATILDEEGVAVRSGHHCCQPLMRYLGVPATVRASFYLYNDFEDIDALVEGLKKVRKWFK >NC_010321.1|WP_003869923.1|135695_136916_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_003869923.1|138221_139442_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_012268884.1|141548_142769_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKSVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_009052111.1|142907_143636_+|peptidase-E MKKVVAIGGGEISKFETFKIDEEIVKLTDKAKPKALFVPTASGEPEAYCDNFDFVYGKMLGCETDILFLIKDDPDSSQIEKKISWADLIYVGGGNTKRMMEIWRSKGVDKMLIDAYQRGTVLSGLSAGAICWFKYGFSDSQRFENQENWHYTKVEGLGLFDAILCPHLNEENRRELFEKFMIDFEGVGIGLENGCAIEIVDDTFKIINSFENAHAYVFRRSENKLFVDEIRHRDYIPFNLLI >NC_010321.1|WP_003867574.1|143964_144462_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MEFEVTGALMQSYTICKRQVWLMAHQIVPDQEHPYIEIGRLIDENSYQRDRKKIHFENVVLDLVRMEKDNILIGEVKKSSKAEDSAKMQLLFYLYKLKQSGITAKGQLFFPEERKREVVELTPEFEREVIKAIEEIKDIVYKEKPPAFIKIPYCKNCGYKEFCMS >NC_010321.1|WP_004399636.1|144458_145451_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKTIYIFSDGELKRKDNTLFFEGENGRKFIPVENTSEIMVFGEVSLNKRLLEFLTQSEIILHFFNHYGYYVGSYYPREHLNSGYMILRQAEHYNDESKRLYLAQKFVEGAYKNIRQVLKYYSNRGKDLEDVIYSIEKLGESVDSTSTINELMAIEGNIREYYYKAFDEIIQNPDFKFDFRSKRPPQNFLNTLISFGNSLMYTTTLSEIYKTHLDPRIGFLHATNFRRFSLNLDVSEIFKPIIVDRTIFTLLSKKMVTKEDFEEDAEGLLLKEKGKKVFVQEFEDKLATTIKHRNLSNNVSYRRLIRLELYKLEKHLIEEEQYKPFIAQW >NC_010321.1|WP_003871087.1|145467_145731_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFLILVYDVNEKRVNKVLKTCRKYLHWVQNSVLEGEISEANLKKLKIELSRIIDKDEDSVIFYILRTTKYSEREILGLRKGGEDIII >NC_010321.1|WP_012268885.1|145851_147777_+|FAD-dependent-oxidoreductase MELTKPIKIGNLSLKNRVVMAPVKTGYATPEGQVTEELIQYYVNRAKGGVGLIVLESAYVDLSGKEIPRQLGIYDDSMVEGLRRLITPLQEAGSKVAVYINHAGRIANPMVTKLPLIAPSSIACPTIGVEPQGIPHEDIKKWQNTYVKAAVRAYEAGADALEIQFGHGYLIHQFLSPHTNKREDEYGGSFENRIRFGMEILDEIKKEIGADFPIIVRISADEFVPGGWALEDAIRLAKILEDKGVAAIDVSLGSSCESGAITLQTLGTQKGLAWEFASKIKKQVNIPVIAVGRINTPELAEEILVSGKADLVALGRPLVADPLFVEKATSGRSKEIRRCAACHQGCLDELRAGRRFGCNFNPSVGKEEEIEIQKAPQPGKKVFIIGAGLAGLEAAYTAAARGHKVYIYEEKGEIGGQVLPGSVPPHKEELKGIVEYYKEVLPKVGVTLNLNHKVTAEEIAKWEADEVVFATGGQPIVPPIPGLKEYGFLTAVEVLRGEKQAGDKVAIIGGGLIGMETADYLSEQGKKVMVIELLEEVARDMGVFEKILIMKRLKERGVEIYVKTRLKEVGKALLVETPEGEKELPLPDTIVLAVGLKPDPSLYEEVSKILPQEKLHVIGDAKEVRKIVHAISEGRNLGLSL >NC_010321.1|WP_003871085.1|148037_148817_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MKFCSLRSGSSGNAIYINHKDVHILVDAGLSGRTIEKALLNIGINPKSLSAILITHEHKDHIIGAGVLSRRYNIPIYANKATWEVMEKDIKEISEKNKLYFTTGEEFEIGDVKIMPFKKSHDAVEPVGFSFKCGDKKISIATDLGYMTRGVANHLIGSDIVLLEANHDIEMLINGSYPWPLKKRILSNLGHLSNDAAADTLMKLFKMKAIGIAFLGHLSQNNNRPELAFATVTNVLKKSGVKFEVRMALRNIESDLVEI >NC_010321.1|WP_012268886.1|149271_150684_+|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase MDSKDMQRLQTTQQRGYPLNREMEFQKTTEVHSISSASEDGRNEVQRYTSKMLEMIVERGNMEAAYKRVVANKGSHGVDGMEVDELLPYLKENWATIKQQLLEGKYKPQPVRRVEISKPDGGVRLLGIPTALDRLIQQAIAQILNRVYNHTFSDSSYGFRPGRSAKDAIKAAEAYINEGYTWVVDMDLEKFFDRVNHDIIMSKLEKRIGDKRVLKLIRRYLESGVMINGIKVSTEEGTPQGGPLSPLLANIMLDELDKELEKRGHKFCRYADDCNIYVKSRSAGNRVMKSIKKFIESKLKLKINEAKSAVDRPWRRKFLGFSFYTKENEVRIRIHEKSIKRFKEKVREITNRNKGISMENRIKRLNQITTGWVNYFGLADAKSIMKTLDEWIRRRLRACIWKQWKKIKTKHDNLVKLGVEEQKAWEYANTRKGYWRISNSPILNKTLTNKYFESIGYKSLSQRYLIVHNS |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_010321_4 | 134718-135610 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NC_010321_4
|
13 spacers
spacers of NC_010321_4
>4.1|134748|36|NC_010321|CRT GTTTTTTGTACATTTCACTATCAAGGATTTTTCTAT >4.2|134814|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGCCGTCTGTGCCTTGCGAATATTCTACGTCGCCGA >4.3|134880|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGTTGAAGACATATATCTGAAAGTTGTATCAAAAAA >4.4|134946|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGCTCTTCTACTGCTCTTCTTCCTCTGCGATAAACA >4.5|135012|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ACAAAACAACTCGCTGGGATAGAACAATTAGAAGAAA >4.6|135079|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAGGCTTCTAGCGTTACACCAATAGGCTCTGTCGGGT >4.7|135146|38|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGGAGTTAATACTGCGACTGCACTTAAAACAGCCATAA >4.8|135214|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTTAGCAGCGTTGATACATGCCTAATACCATCAAGG >4.9|135280|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGTCCATATCGCCATTTACATAGTAGACTACTTCTTT >4.10|135347|35|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GAGCAGAAATGGAATTGCATGGCTATGCAGCAGAA >4.11|135412|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTAAAAAGCCTGCCCTTTTGCAGTTAATAGTCTCTTA >4.12|135479|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAGGCAATGTTTATGCATCCGAGCTAGGGCTATCCT >4.13|135545|36|NC_010321|CRT,CRISPRCasFinder CCGCCACATACATCCAAACAGGAAGTACCAGCATGG |
cas3,cas5,cas7,cas8b1,cas6,cas4,cas1,cas2,RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_010321_4
The CRISPR arrays of NC_010321_4 >merge|NC_010321|4|134718-135610|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GCGGCATGGGAGTCTATAAGGAATTGAAACGTTTTTTGTACATTTCACTATCAAGGATTTTTCTATGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTGCCGTCTGTGCCTTGCGAATATTCTACGTCGCCGAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTGTTGAAGACATATATCTGAAAGTTGTATCAAAAAAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAGCTCTTCTACTGCTCTTCTTCCTCTGCGATAAACAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACACAAAACAACTCGCTGGGATAGAACAATTAGAAGAAAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTAGGCTTCTAGCGTTACACCAATAGGCTCTGTCGGGTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAGGAGTTAATACTGCGACTGCACTTAAAACAGCCATAAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCTTAGCAGCGTTGATACATGCCTAATACCATCAAGGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAGTCCATATCGCCATTTACATAGTAGACTACTTCTTTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGAGCAGAAATGGAATTGCATGGCTATGCAGCAGAAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTAAAAAGCCTGCCCTTTTGCAGTTAATAGTCTCTTAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTAGGCAATGTTTATGCATCCGAGCTAGGGCTATCCTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCCGCCACATACATCCAAACAGGAAGTACCAGCATGGGTTTTTAGCCTACCTATCCTGAAAATAGTG >NC_010321|4|4|134718-135610|CRT GCGGCATGGGAGTCTATAAGGAATTGAAAC GTTTTTTGTACATTTCACTATCAAGGATTTTTCTAT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGCCGTCTGTGCCTTGCGAATATTCTACGTCGCCGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGTTGAAGACATATATCTGAAAGTTGTATCAAAAAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGCTCTTCTACTGCTCTTCTTCCTCTGCGATAAACA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ACAAAACAACTCGCTGGGATAGAACAATTAGAAGAAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAGGCTTCTAGCGTTACACCAATAGGCTCTGTCGGGT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGGAGTTAATACTGCGACTGCACTTAAAACAGCCATAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CTTAGCAGCGTTGATACATGCCTAATACCATCAAGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGTCCATATCGCCATTTACATAGTAGACTACTTCTTT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GAGCAGAAATGGAATTGCATGGCTATGCAGCAGAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTAAAAAGCCTGCCCTTTTGCAGTTAATAGTCTCTTA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAGGCAATGTTTATGCATCCGAGCTAGGGCTATCCT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCGCCACATACATCCAAACAGGAAGTACCAGCATGG GTTTTTAGCCTACCTATCCTGAAAATAGTG >NC_010321|4|4|134784-135544|PILER-CR GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGCCGTCTGTGCCTTGCGAATATTCTACGTCGCCGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGTTGAAGACATATATCTGAAAGTTGTATCAAAAAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGCTCTTCTACTGCTCTTCTTCCTCTGCGATAAACA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ACAAAACAACTCGCTGGGATAGAACAATTAGAAGAAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAGGCTTCTAGCGTTACACCAATAGGCTCTGTCGGGT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGGAGTTAATACTGCGACTGCACTTAAAACAGCCATAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CTTAGCAGCGTTGATACATGCCTAATACCATCAAGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGTCCATATCGCCATTTACATAGTAGACTACTTCTTT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GAGCAGAAATGGAATTGCATGGCTATGCAGCAGAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTAAAAAGCCTGCCCTTTTGCAGTTAATAGTCTCTTA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAGGCAATGTTTATGCATCCGAGCTAGGGCTATCCT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC >NC_010321|4|4|134784-135610|CRISPRCasFinder GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGCCGTCTGTGCCTTGCGAATATTCTACGTCGCCGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGTTGAAGACATATATCTGAAAGTTGTATCAAAAAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGCTCTTCTACTGCTCTTCTTCCTCTGCGATAAACA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ACAAAACAACTCGCTGGGATAGAACAATTAGAAGAAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAGGCTTCTAGCGTTACACCAATAGGCTCTGTCGGGT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGGAGTTAATACTGCGACTGCACTTAAAACAGCCATAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CTTAGCAGCGTTGATACATGCCTAATACCATCAAGG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGTCCATATCGCCATTTACATAGTAGACTACTTCTTT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GAGCAGAAATGGAATTGCATGGCTATGCAGCAGAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTAAAAAGCCTGCCCTTTTGCAGTTAATAGTCTCTTA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAGGCAATGTTTATGCATCCGAGCTAGGGCTATCCT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCGCCACATACATCCAAACAGGAAGTACCAGCATGG GTTTTTAGCCTACCTATCCTGAAAATAGTG
>NC_010321.1|WP_003869923.1|129769_130990_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_003869923.1|128110_129331_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_003869923.1|124977_126198_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_012268883.1|119117_121472_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MSSFSELYSHPDKFLEDHLINTSKIIRSYFNEKKVAIIDKETFLKTATIISLCHDFGKATNYFQKYLFTENEKERNKLKTMEEMHHSLLSAVVAFYLVKNEINAQDRKGILFPFIAFLIVKNHHGDLKNVFNEVILDDKELEVLKKQLNSIDDEKLQVLNGKLRNAGLNENLTKSAINDYIDSINSELRKIKRELRRLKEEQDVSIYLLLNFLFSLLVDADKTEVVVGIDNIKRPEIKFEEQLVKEYKASFPDKESKINLLREEAYKEVLEKDIDIKQKIMSINLPTGLGKTLTTIAFAMKLWAKLYKETGVKYRIIYSLPFLSIIEQNSNVLEDLLRYNGIQPDTEIILKHHHLSDIRYTKNNTEFEDEQAKILIEGWNSEIIITTFVQFFHTLVSEKNKTLRKFHRLANSIIILDEVQSIPFKYWLLTKELLKAVANELNSYIIFVTATQPLIFREEEIYPLVAKTKYFTQMDRVEIIPKLSRDITLEELSEMFDLNDGKSYLFILNTIKSAQQFYNILRAKIPNDEIIYMSTHVVPMERMERIEKIKEGKIRFAVTTQLVEAGVDIDFDVVVRDIAPLDSINQSAGRCNRNWRGKGEVYVVSLIDEKGQKYSKYVYDKILLGITREILSKYDTIKEQELLKIIEKYYQEVSERMSSNEGRELLDAIYTLRYDSEDGNMCISKFELIEDDYYKVDAFIELNDEAKELWHKYVELKDIKNLFERRNIFNRFKADFYKYVISIPATVENMPPDIWGFKYVNYDSLNDYYDKETGFITKGVTSIW >NC_010321.1|WP_003871404.1|118420_119134_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKTLVFDVFGDYGHFRKYYTTSSPLTFSFPPPPTVKGMLGAIAGIDKKEYLKVFSEENCKVAIRILNPIKKIRLGLNLINTKGNYWIPYKAKNHEARTQVKTEFVKDAAYRIYFMHKDNDLFEDIVEKIKNRRNVYTLSLGLSEMIADYKFIGVYEAEEIENAEVDILSVLPFQSIVEDKIYFENGKKYFKEKIPAGMNEDRVVLSYEDVLYEVNGQSIKCHVKKCWEVKGEHVIFF >NC_010321.1|WP_012268882.1|117496_118408_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csh2 MENVIKNRAEILFLYDVSFANPNGDPVDENKPRIDEETGINIVTDVRLKRTIRDYLAYYKGKEVFIIETRKDNGELRTKKDRIEDFGTNEDIIAKCIDVRLFGATTAVKDKMMILTGPVQFKYGKSLHRVNLMYVKGTTVMPSGEGREQGTFTEKYILPYSLIAFYGIVNENAAINQNIPLTDEDVDLMLEGMWNGTKNLMSGSKIGHMPRLLIEVVYQENNYQIGELEKRIKFVHEMEDEEIRDIQDGKLDITELVAVLKQNQEKIKLIKYIYDDRVTFTCNGEECTLEKALKGLNIQKLQY >NC_010321.1|WP_012268881.1|115732_117496_+|TIGR02556-family-CRISPR-associated-protein MITAIKELGEMVLKSQNKTLLDVLIENPNQDGRYSKIIAINFIVKEDEIEYEGIRLEEYDDSKISRYLFTDTGGNAPGYTPAAKITEVPKTFNGKIKNWFNKVLKDKSIKIDEKDRAFLERIKDILEEKSDEIIKEAEKIRGDFPKKEGLSLILKFNVDGEYKYIGDFNVFRDLMLQLDSQKYQKIYAEDKVCSICGQKKDIVFGTVDTYKFYTIDKPGYIAGGFNEKESWKNYPVCAECRLALEEGKRYLENELTFRFYGLEYQLIPNFIIGKEFVRKEVREIFESSERLLSLKREVKKRFIGDEDEILDYLADAEDSMTVNLLFLRKSNSAERILLLIEDVFPSHLREIFNAKEQVDKIFGNSFTFKNIRSFMSKSDSNKRDNDLDGYFLDITDRIFRGRPVDLGFLYNLIMKKIREEFVKDGYYKAATADGLMTIAFLEKMKLIKMEVIPMEERIFDSFFAKYGPTFEMPLKRGLVLLGALTELLLRKQYSDREAKPFMKNLKGLKMDEKDIKGLLPKVQNKLEEYDSFEKGKRLLAKEASNYLLLAGDNWNMSVDEINFYFACGINLADELTSIIYKKEGEEK >NC_010321.1|WP_004399630.1|114957_115713_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRITLEFVGEKNLVLPIHYNYIVQGFLYDLMGDSEFAAFLHDEGFQYEKRKFKLFTFSRIEGEFKILTDSKGQKKISIKPPFKFTVASPLDEFIFDISKNALKKEYCHFNGQKFILNSLNIDNPPVFKNKARIKFISPVVMYTTLKDGDIKYTYYYSPWDEKFSPLLLNNLLKKYELVYKIKAEDPYFKLYPLSEKEDRRYSKMIKYKNVYVKGWMGIYDVESSPELLELAYYTGLGAKNSQGFGCFEIIG >NC_010321.1|WP_003868738.1|114355_114769_+|SUF-system-NifU-family-Fe-S-cluster-assembly-protein MSDLNQLYSEVIMEHYENSPHRRELKDATHKERGHNPLCGDDITLYLKMNGDIIEDASFTGHGCAISQASTSMMIDLIKGKDKKEALRLVQEFIDMIHKKDVNLDELGDAQVLHGVSDFPARVKCALLAWKTLQEIL >NC_010321.1|WP_012268880.1|113129_114359_+|cysteine-desulfurase MKNIDIERIKKDFPILSVKPHGKRLVYLDNAATTQKPIEVIKAMDKYYEELNANVYRSPHYLSVLSTQAYEEARERVKKFINAKKEESIVFTRNTTESINFIAYTWGMKHINEGDEILLTIAEHHSNILPWQMVAEAKGAKLKYVYLDENFRLSMKDFKEKMSEKVKLVAVQHMSNVLGIINPVEEITHIAHKYGAKVLIDGAQSVPHMPVDVQKIDCDFFAFSGHKMLGPMGIGVLYIKEDLLKEVPPFLRGGEMIDEVYEDHSTFAPSPLKFEAGTPNIEGAYVLISAIDYIEKIGLTNIYKHEGELLEYGLQKMRELDFVKLYGPKDAKERGGIISFNVEGVHPHDVATILDEEGVAVRSGHHCCQPLMRYLGVPATVRASFYLYNDFEDIDALVEGLKKVRKWFK >NC_010321.1|WP_003869923.1|135695_136916_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_003869923.1|138221_139442_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_012268884.1|141548_142769_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKSVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_009052111.1|142907_143636_+|peptidase-E MKKVVAIGGGEISKFETFKIDEEIVKLTDKAKPKALFVPTASGEPEAYCDNFDFVYGKMLGCETDILFLIKDDPDSSQIEKKISWADLIYVGGGNTKRMMEIWRSKGVDKMLIDAYQRGTVLSGLSAGAICWFKYGFSDSQRFENQENWHYTKVEGLGLFDAILCPHLNEENRRELFEKFMIDFEGVGIGLENGCAIEIVDDTFKIINSFENAHAYVFRRSENKLFVDEIRHRDYIPFNLLI >NC_010321.1|WP_003867574.1|143964_144462_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MEFEVTGALMQSYTICKRQVWLMAHQIVPDQEHPYIEIGRLIDENSYQRDRKKIHFENVVLDLVRMEKDNILIGEVKKSSKAEDSAKMQLLFYLYKLKQSGITAKGQLFFPEERKREVVELTPEFEREVIKAIEEIKDIVYKEKPPAFIKIPYCKNCGYKEFCMS >NC_010321.1|WP_004399636.1|144458_145451_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKTIYIFSDGELKRKDNTLFFEGENGRKFIPVENTSEIMVFGEVSLNKRLLEFLTQSEIILHFFNHYGYYVGSYYPREHLNSGYMILRQAEHYNDESKRLYLAQKFVEGAYKNIRQVLKYYSNRGKDLEDVIYSIEKLGESVDSTSTINELMAIEGNIREYYYKAFDEIIQNPDFKFDFRSKRPPQNFLNTLISFGNSLMYTTTLSEIYKTHLDPRIGFLHATNFRRFSLNLDVSEIFKPIIVDRTIFTLLSKKMVTKEDFEEDAEGLLLKEKGKKVFVQEFEDKLATTIKHRNLSNNVSYRRLIRLELYKLEKHLIEEEQYKPFIAQW >NC_010321.1|WP_003871087.1|145467_145731_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFLILVYDVNEKRVNKVLKTCRKYLHWVQNSVLEGEISEANLKKLKIELSRIIDKDEDSVIFYILRTTKYSEREILGLRKGGEDIII >NC_010321.1|WP_012268885.1|145851_147777_+|FAD-dependent-oxidoreductase MELTKPIKIGNLSLKNRVVMAPVKTGYATPEGQVTEELIQYYVNRAKGGVGLIVLESAYVDLSGKEIPRQLGIYDDSMVEGLRRLITPLQEAGSKVAVYINHAGRIANPMVTKLPLIAPSSIACPTIGVEPQGIPHEDIKKWQNTYVKAAVRAYEAGADALEIQFGHGYLIHQFLSPHTNKREDEYGGSFENRIRFGMEILDEIKKEIGADFPIIVRISADEFVPGGWALEDAIRLAKILEDKGVAAIDVSLGSSCESGAITLQTLGTQKGLAWEFASKIKKQVNIPVIAVGRINTPELAEEILVSGKADLVALGRPLVADPLFVEKATSGRSKEIRRCAACHQGCLDELRAGRRFGCNFNPSVGKEEEIEIQKAPQPGKKVFIIGAGLAGLEAAYTAAARGHKVYIYEEKGEIGGQVLPGSVPPHKEELKGIVEYYKEVLPKVGVTLNLNHKVTAEEIAKWEADEVVFATGGQPIVPPIPGLKEYGFLTAVEVLRGEKQAGDKVAIIGGGLIGMETADYLSEQGKKVMVIELLEEVARDMGVFEKILIMKRLKERGVEIYVKTRLKEVGKALLVETPEGEKELPLPDTIVLAVGLKPDPSLYEEVSKILPQEKLHVIGDAKEVRKIVHAISEGRNLGLSL >NC_010321.1|WP_003871085.1|148037_148817_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MKFCSLRSGSSGNAIYINHKDVHILVDAGLSGRTIEKALLNIGINPKSLSAILITHEHKDHIIGAGVLSRRYNIPIYANKATWEVMEKDIKEISEKNKLYFTTGEEFEIGDVKIMPFKKSHDAVEPVGFSFKCGDKKISIATDLGYMTRGVANHLIGSDIVLLEANHDIEMLINGSYPWPLKKRILSNLGHLSNDAAADTLMKLFKMKAIGIAFLGHLSQNNNRPELAFATVTNVLKKSGVKFEVRMALRNIESDLVEI >NC_010321.1|WP_012268886.1|149271_150684_+|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase MDSKDMQRLQTTQQRGYPLNREMEFQKTTEVHSISSASEDGRNEVQRYTSKMLEMIVERGNMEAAYKRVVANKGSHGVDGMEVDELLPYLKENWATIKQQLLEGKYKPQPVRRVEISKPDGGVRLLGIPTALDRLIQQAIAQILNRVYNHTFSDSSYGFRPGRSAKDAIKAAEAYINEGYTWVVDMDLEKFFDRVNHDIIMSKLEKRIGDKRVLKLIRRYLESGVMINGIKVSTEEGTPQGGPLSPLLANIMLDELDKELEKRGHKFCRYADDCNIYVKSRSAGNRVMKSIKKFIESKLKLKINEAKSAVDRPWRRKFLGFSFYTKENEVRIRIHEKSIKRFKEKVREITNRNKGISMENRIKRLNQITTGWVNYFGLADAKSIMKTLDEWIRRRLRACIWKQWKKIKTKHDNLVKLGVEEQKAWEYANTRKGYWRISNSPILNKTLTNKYFESIGYKSLSQRYLIVHNS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_010321_5 | 137174-138136 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NC_010321_5
|
14 spacers
spacers of NC_010321_5
>5.1|137204|37|NC_010321|CRT AGAAGAATATTGACAGTTTAACTGCTCAAAAGATAGC >5.2|137271|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ACTGTCCCTCAATTTCCTTGTTTTCCTCCTTAAGCTT >5.3|137338|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAAACCGCCAGAATGCTGAAGCCATATTCCTCGCAC >5.4|137404|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATAACTCCGTTTGGTTTTTCGGGGTTTTGCTGAATA >5.5|137470|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTATCTCTTGAAGCGCCTTTGCAGTGTCGAATTTTT >5.6|137537|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTGGAATTCCTTTAGGCGCTCGAACTCACCCATCTG >5.7|137604|38|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAATACTCGCCGGCGCGAACCTTAATCTTCACCGGCCA >5.8|137672|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CCCATAACCTTGGGAACACAAATTATATGGTGAACAT >5.9|137739|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGAAACTCGCAGAACCCGGCCAACCTGCTGGCTATAG >5.10|137806|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATAAAAAAGTTCCCCGTTGTTACCTCATGTTGCTGT >5.11|137872|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CAAGATAAATGGGATAGCCTTGTTGAGGCAGCAAAAA >5.12|137939|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CCAACGCTCCCGGTGGTCTTGCGCTGTTCTGGAGTA >5.13|138005|35|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATGTCTAACCTATCAAGTACGTCTTTTATTGCTTG >5.14|138070|37|NC_010321|CRT,CRISPRCasFinder TGGATAGCAAAGGCAAGTGCAGAACTGGATAAAAAGA |
cas3,cas5,cas7,cas8b1,cas6,cas4,cas1,cas2,RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_010321_5
The CRISPR arrays of NC_010321_5 >merge|NC_010321|5|137174-138136|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GCGGCATGGGAGTCTATAAGGAATTGAAACAGAAGAATATTGACAGTTTAACTGCTCAAAAGATAGCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACACTGTCCCTCAATTTCCTTGTTTTCCTCCTTAAGCTTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTAAACCGCCAGAATGCTGAAGCCATATTCCTCGCACGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATAACTCCGTTTGGTTTTTCGGGGTTTTGCTGAATAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATTATCTCTTGAAGCGCCTTTGCAGTGTCGAATTTTTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTTGGAATTCCTTTAGGCGCTCGAACTCACCCATCTGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAAATACTCGCCGGCGCGAACCTTAATCTTCACCGGCCAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCCCATAACCTTGGGAACACAAATTATATGGTGAACATGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAGAAACTCGCAGAACCCGGCCAACCTGCTGGCTATAGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATAAAAAAGTTCCCCGTTGTTACCTCATGTTGCTGTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCAAGATAAATGGGATAGCCTTGTTGAGGCAGCAAAAAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCCAACGCTCCCGGTGGTCTTGCGCTGTTCTGGAGTAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATGTCTAACCTATCAAGTACGTCTTTTATTGCTTGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTGGATAGCAAAGGCAAGTGCAGAACTGGATAAAAAGAGTTTTTAGCCTACCTATCCTGAAAATAGTG >NC_010321|5|5|137174-138136|CRT GCGGCATGGGAGTCTATAAGGAATTGAAAC AGAAGAATATTGACAGTTTAACTGCTCAAAAGATAGC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ACTGTCCCTCAATTTCCTTGTTTTCCTCCTTAAGCTT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAAACCGCCAGAATGCTGAAGCCATATTCCTCGCAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATAACTCCGTTTGGTTTTTCGGGGTTTTGCTGAATA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATTATCTCTTGAAGCGCCTTTGCAGTGTCGAATTTTT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTGGAATTCCTTTAGGCGCTCGAACTCACCCATCTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAATACTCGCCGGCGCGAACCTTAATCTTCACCGGCCA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCCATAACCTTGGGAACACAAATTATATGGTGAACAT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGAAACTCGCAGAACCCGGCCAACCTGCTGGCTATAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATAAAAAAGTTCCCCGTTGTTACCTCATGTTGCTGT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CAAGATAAATGGGATAGCCTTGTTGAGGCAGCAAAAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCAACGCTCCCGGTGGTCTTGCGCTGTTCTGGAGTA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGTCTAACCTATCAAGTACGTCTTTTATTGCTTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGGATAGCAAAGGCAAGTGCAGAACTGGATAAAAAGA GTTTTTAGCCTACCTATCCTGAAAATAGTG >NC_010321|5|5|137241-138069|PILER-CR GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ACTGTCCCTCAATTTCCTTGTTTTCCTCCTTAAGCTT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAAACCGCCAGAATGCTGAAGCCATATTCCTCGCAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATAACTCCGTTTGGTTTTTCGGGGTTTTGCTGAATA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATTATCTCTTGAAGCGCCTTTGCAGTGTCGAATTTTT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTGGAATTCCTTTAGGCGCTCGAACTCACCCATCTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAATACTCGCCGGCGCGAACCTTAATCTTCACCGGCCA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCCATAACCTTGGGAACACAAATTATATGGTGAACAT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGAAACTCGCAGAACCCGGCCAACCTGCTGGCTATAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATAAAAAAGTTCCCCGTTGTTACCTCATGTTGCTGT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CAAGATAAATGGGATAGCCTTGTTGAGGCAGCAAAAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCAACGCTCCCGGTGGTCTTGCGCTGTTCTGGAGTA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGTCTAACCTATCAAGTACGTCTTTTATTGCTTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC >NC_010321|5|5|137241-138136|CRISPRCasFinder GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ACTGTCCCTCAATTTCCTTGTTTTCCTCCTTAAGCTT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TAAACCGCCAGAATGCTGAAGCCATATTCCTCGCAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATAACTCCGTTTGGTTTTTCGGGGTTTTGCTGAATA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATTATCTCTTGAAGCGCCTTTGCAGTGTCGAATTTTT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTGGAATTCCTTTAGGCGCTCGAACTCACCCATCTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAATACTCGCCGGCGCGAACCTTAATCTTCACCGGCCA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCCATAACCTTGGGAACACAAATTATATGGTGAACAT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGAAACTCGCAGAACCCGGCCAACCTGCTGGCTATAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATAAAAAAGTTCCCCGTTGTTACCTCATGTTGCTGT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CAAGATAAATGGGATAGCCTTGTTGAGGCAGCAAAAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCAACGCTCCCGGTGGTCTTGCGCTGTTCTGGAGTA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGTCTAACCTATCAAGTACGTCTTTTATTGCTTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGGATAGCAAAGGCAAGTGCAGAACTGGATAAAAAGA GTTTTTAGCCTACCTATCCTGAAAATAGTG
>NC_010321.1|WP_003869923.1|135695_136916_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_003869923.1|129769_130990_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_003869923.1|128110_129331_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_003869923.1|124977_126198_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_012268883.1|119117_121472_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MSSFSELYSHPDKFLEDHLINTSKIIRSYFNEKKVAIIDKETFLKTATIISLCHDFGKATNYFQKYLFTENEKERNKLKTMEEMHHSLLSAVVAFYLVKNEINAQDRKGILFPFIAFLIVKNHHGDLKNVFNEVILDDKELEVLKKQLNSIDDEKLQVLNGKLRNAGLNENLTKSAINDYIDSINSELRKIKRELRRLKEEQDVSIYLLLNFLFSLLVDADKTEVVVGIDNIKRPEIKFEEQLVKEYKASFPDKESKINLLREEAYKEVLEKDIDIKQKIMSINLPTGLGKTLTTIAFAMKLWAKLYKETGVKYRIIYSLPFLSIIEQNSNVLEDLLRYNGIQPDTEIILKHHHLSDIRYTKNNTEFEDEQAKILIEGWNSEIIITTFVQFFHTLVSEKNKTLRKFHRLANSIIILDEVQSIPFKYWLLTKELLKAVANELNSYIIFVTATQPLIFREEEIYPLVAKTKYFTQMDRVEIIPKLSRDITLEELSEMFDLNDGKSYLFILNTIKSAQQFYNILRAKIPNDEIIYMSTHVVPMERMERIEKIKEGKIRFAVTTQLVEAGVDIDFDVVVRDIAPLDSINQSAGRCNRNWRGKGEVYVVSLIDEKGQKYSKYVYDKILLGITREILSKYDTIKEQELLKIIEKYYQEVSERMSSNEGRELLDAIYTLRYDSEDGNMCISKFELIEDDYYKVDAFIELNDEAKELWHKYVELKDIKNLFERRNIFNRFKADFYKYVISIPATVENMPPDIWGFKYVNYDSLNDYYDKETGFITKGVTSIW >NC_010321.1|WP_003871404.1|118420_119134_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKTLVFDVFGDYGHFRKYYTTSSPLTFSFPPPPTVKGMLGAIAGIDKKEYLKVFSEENCKVAIRILNPIKKIRLGLNLINTKGNYWIPYKAKNHEARTQVKTEFVKDAAYRIYFMHKDNDLFEDIVEKIKNRRNVYTLSLGLSEMIADYKFIGVYEAEEIENAEVDILSVLPFQSIVEDKIYFENGKKYFKEKIPAGMNEDRVVLSYEDVLYEVNGQSIKCHVKKCWEVKGEHVIFF >NC_010321.1|WP_012268882.1|117496_118408_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csh2 MENVIKNRAEILFLYDVSFANPNGDPVDENKPRIDEETGINIVTDVRLKRTIRDYLAYYKGKEVFIIETRKDNGELRTKKDRIEDFGTNEDIIAKCIDVRLFGATTAVKDKMMILTGPVQFKYGKSLHRVNLMYVKGTTVMPSGEGREQGTFTEKYILPYSLIAFYGIVNENAAINQNIPLTDEDVDLMLEGMWNGTKNLMSGSKIGHMPRLLIEVVYQENNYQIGELEKRIKFVHEMEDEEIRDIQDGKLDITELVAVLKQNQEKIKLIKYIYDDRVTFTCNGEECTLEKALKGLNIQKLQY >NC_010321.1|WP_012268881.1|115732_117496_+|TIGR02556-family-CRISPR-associated-protein MITAIKELGEMVLKSQNKTLLDVLIENPNQDGRYSKIIAINFIVKEDEIEYEGIRLEEYDDSKISRYLFTDTGGNAPGYTPAAKITEVPKTFNGKIKNWFNKVLKDKSIKIDEKDRAFLERIKDILEEKSDEIIKEAEKIRGDFPKKEGLSLILKFNVDGEYKYIGDFNVFRDLMLQLDSQKYQKIYAEDKVCSICGQKKDIVFGTVDTYKFYTIDKPGYIAGGFNEKESWKNYPVCAECRLALEEGKRYLENELTFRFYGLEYQLIPNFIIGKEFVRKEVREIFESSERLLSLKREVKKRFIGDEDEILDYLADAEDSMTVNLLFLRKSNSAERILLLIEDVFPSHLREIFNAKEQVDKIFGNSFTFKNIRSFMSKSDSNKRDNDLDGYFLDITDRIFRGRPVDLGFLYNLIMKKIREEFVKDGYYKAATADGLMTIAFLEKMKLIKMEVIPMEERIFDSFFAKYGPTFEMPLKRGLVLLGALTELLLRKQYSDREAKPFMKNLKGLKMDEKDIKGLLPKVQNKLEEYDSFEKGKRLLAKEASNYLLLAGDNWNMSVDEINFYFACGINLADELTSIIYKKEGEEK >NC_010321.1|WP_004399630.1|114957_115713_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRITLEFVGEKNLVLPIHYNYIVQGFLYDLMGDSEFAAFLHDEGFQYEKRKFKLFTFSRIEGEFKILTDSKGQKKISIKPPFKFTVASPLDEFIFDISKNALKKEYCHFNGQKFILNSLNIDNPPVFKNKARIKFISPVVMYTTLKDGDIKYTYYYSPWDEKFSPLLLNNLLKKYELVYKIKAEDPYFKLYPLSEKEDRRYSKMIKYKNVYVKGWMGIYDVESSPELLELAYYTGLGAKNSQGFGCFEIIG >NC_010321.1|WP_003868738.1|114355_114769_+|SUF-system-NifU-family-Fe-S-cluster-assembly-protein MSDLNQLYSEVIMEHYENSPHRRELKDATHKERGHNPLCGDDITLYLKMNGDIIEDASFTGHGCAISQASTSMMIDLIKGKDKKEALRLVQEFIDMIHKKDVNLDELGDAQVLHGVSDFPARVKCALLAWKTLQEIL >NC_010321.1|WP_003869923.1|138221_139442_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_012268884.1|141548_142769_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKSVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_009052111.1|142907_143636_+|peptidase-E MKKVVAIGGGEISKFETFKIDEEIVKLTDKAKPKALFVPTASGEPEAYCDNFDFVYGKMLGCETDILFLIKDDPDSSQIEKKISWADLIYVGGGNTKRMMEIWRSKGVDKMLIDAYQRGTVLSGLSAGAICWFKYGFSDSQRFENQENWHYTKVEGLGLFDAILCPHLNEENRRELFEKFMIDFEGVGIGLENGCAIEIVDDTFKIINSFENAHAYVFRRSENKLFVDEIRHRDYIPFNLLI >NC_010321.1|WP_003867574.1|143964_144462_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MEFEVTGALMQSYTICKRQVWLMAHQIVPDQEHPYIEIGRLIDENSYQRDRKKIHFENVVLDLVRMEKDNILIGEVKKSSKAEDSAKMQLLFYLYKLKQSGITAKGQLFFPEERKREVVELTPEFEREVIKAIEEIKDIVYKEKPPAFIKIPYCKNCGYKEFCMS >NC_010321.1|WP_004399636.1|144458_145451_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKTIYIFSDGELKRKDNTLFFEGENGRKFIPVENTSEIMVFGEVSLNKRLLEFLTQSEIILHFFNHYGYYVGSYYPREHLNSGYMILRQAEHYNDESKRLYLAQKFVEGAYKNIRQVLKYYSNRGKDLEDVIYSIEKLGESVDSTSTINELMAIEGNIREYYYKAFDEIIQNPDFKFDFRSKRPPQNFLNTLISFGNSLMYTTTLSEIYKTHLDPRIGFLHATNFRRFSLNLDVSEIFKPIIVDRTIFTLLSKKMVTKEDFEEDAEGLLLKEKGKKVFVQEFEDKLATTIKHRNLSNNVSYRRLIRLELYKLEKHLIEEEQYKPFIAQW >NC_010321.1|WP_003871087.1|145467_145731_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFLILVYDVNEKRVNKVLKTCRKYLHWVQNSVLEGEISEANLKKLKIELSRIIDKDEDSVIFYILRTTKYSEREILGLRKGGEDIII >NC_010321.1|WP_012268885.1|145851_147777_+|FAD-dependent-oxidoreductase MELTKPIKIGNLSLKNRVVMAPVKTGYATPEGQVTEELIQYYVNRAKGGVGLIVLESAYVDLSGKEIPRQLGIYDDSMVEGLRRLITPLQEAGSKVAVYINHAGRIANPMVTKLPLIAPSSIACPTIGVEPQGIPHEDIKKWQNTYVKAAVRAYEAGADALEIQFGHGYLIHQFLSPHTNKREDEYGGSFENRIRFGMEILDEIKKEIGADFPIIVRISADEFVPGGWALEDAIRLAKILEDKGVAAIDVSLGSSCESGAITLQTLGTQKGLAWEFASKIKKQVNIPVIAVGRINTPELAEEILVSGKADLVALGRPLVADPLFVEKATSGRSKEIRRCAACHQGCLDELRAGRRFGCNFNPSVGKEEEIEIQKAPQPGKKVFIIGAGLAGLEAAYTAAARGHKVYIYEEKGEIGGQVLPGSVPPHKEELKGIVEYYKEVLPKVGVTLNLNHKVTAEEIAKWEADEVVFATGGQPIVPPIPGLKEYGFLTAVEVLRGEKQAGDKVAIIGGGLIGMETADYLSEQGKKVMVIELLEEVARDMGVFEKILIMKRLKERGVEIYVKTRLKEVGKALLVETPEGEKELPLPDTIVLAVGLKPDPSLYEEVSKILPQEKLHVIGDAKEVRKIVHAISEGRNLGLSL >NC_010321.1|WP_003871085.1|148037_148817_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MKFCSLRSGSSGNAIYINHKDVHILVDAGLSGRTIEKALLNIGINPKSLSAILITHEHKDHIIGAGVLSRRYNIPIYANKATWEVMEKDIKEISEKNKLYFTTGEEFEIGDVKIMPFKKSHDAVEPVGFSFKCGDKKISIATDLGYMTRGVANHLIGSDIVLLEANHDIEMLINGSYPWPLKKRILSNLGHLSNDAAADTLMKLFKMKAIGIAFLGHLSQNNNRPELAFATVTNVLKKSGVKFEVRMALRNIESDLVEI >NC_010321.1|WP_012268886.1|149271_150684_+|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase MDSKDMQRLQTTQQRGYPLNREMEFQKTTEVHSISSASEDGRNEVQRYTSKMLEMIVERGNMEAAYKRVVANKGSHGVDGMEVDELLPYLKENWATIKQQLLEGKYKPQPVRRVEISKPDGGVRLLGIPTALDRLIQQAIAQILNRVYNHTFSDSSYGFRPGRSAKDAIKAAEAYINEGYTWVVDMDLEKFFDRVNHDIIMSKLEKRIGDKRVLKLIRRYLESGVMINGIKVSTEEGTPQGGPLSPLLANIMLDELDKELEKRGHKFCRYADDCNIYVKSRSAGNRVMKSIKKFIESKLKLKINEAKSAVDRPWRRKFLGFSFYTKENEVRIRIHEKSIKRFKEKVREITNRNKGISMENRIKRLNQITTGWVNYFGLADAKSIMKTLDEWIRRRLRACIWKQWKKIKTKHDNLVKLGVEEQKAWEYANTRKGYWRISNSPILNKTLTNKYFESIGYKSLSQRYLIVHNS >NC_010321.1|WP_003867580.1|150923_151364_+|ACT-domain-containing-protein MGEDGKLYIIREEILSDSLKKTLKVKELLESGKVKTINEAVKQVGISRSAFYKYRDYVFPFSKFSKGKIITLSMVLDHMPGVLSSILDVVANARGNVVTINQSMPSMGVASVTISIDTQYMEMSLENFLEKLSSQNGVRKIEILGE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_010321_6 | 139700-141463 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NC_010321_6
|
26 spacers
spacers of NC_010321_6
>6.1|139730|35|NC_010321|CRT CCTATCAGCTCCGGTGGCACCCCAAACGCAATAGC >6.2|139795|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GATAGCCTTCAGCTATTAACTTTGCCGCTTCCAATTG >6.3|139862|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GCTGGTGCTTATTATTGGAAAGGATATAAACAAGCA >6.4|139928|35|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CGCTGTCGTCTTTGTTAAAGGACCTGTACCCTGCA >6.5|139993|38|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGATATTGTTCAATATTGCATTTATCTCCGCTTCGCTT >6.6|140061|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGTAGAAAATGTCAAAAAACATCAAAAAGGAGGTGTG >6.7|140128|35|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGTAAATACGGGAACAGAAGCAGCACCCGTGTGGA >6.8|140193|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CATTGCCACTACTTGCAGCAGCAGGAGCATCTATAA >6.9|140259|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CGTAGAAATAGACCCACCATTTCATCCAGACACACAC >6.10|140326|35|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTGATTGAGTACTAGGGAGGGAGAGAGATGTATCC >6.11|140391|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGCGCTTGAGGATGCATACATGAATAATACAATTTTA >6.12|140458|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CGCCCAAAATGGCGCTTAAAACGGCTGCAAATTTGTC >6.13|140525|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CCAGCCTGTAATGCAGGGTCGCCTACAAATCCGACGT >6.14|140592|38|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTCTTTAGATATACTTAAAAGCAATGTAGAGAAAGGTG >6.15|140660|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CGAGTGAAAAGATGATACCATGTCGCTTTGAAATGAG >6.16|140727|35|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCCCTAGTAGTTTAGCCATATCAGCTTGTTTTAAA >6.17|140792|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGCTCTTTCATTAATTTTGCAGCTTTGTCTGTCGGA >6.18|140858|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTGCCAAGCTGTTTTGCTAATTTGCTCATTTTTGCC >6.19|140924|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCGATATAATAGCTCTAAACGTTTGGCTTTGCTTTGT >6.20|140991|40|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATATCCTCGCCAGATACACATTGCTCGCTAACATACAGGC >6.21|141061|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAACGCAGACGTGGGAGGTTGCCGTGGATTCGGTTG >6.22|141127|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCATAATCTATCAAACCGCTTGCTATTGCAAGCATGA >6.23|141194|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ACATTGTTTGTAGTTTTGGTATGTTCTGTTGTATAC >6.24|141260|39|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TATCATTCCAACTACCAACTTTTGTTAAATAATATTCTC >6.25|141329|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TATGCTGCATACGTCGAATACGGCACAAAAAAGATGG >6.26|141396|38|NC_010321|CRT,CRISPRCasFinder CCATGTTGGTTTTACGCTCAATCTCGGTTACGTAGAAA |
cas3,cas5,cas7,cas8b1,cas6,cas4,cas1,cas2,RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_010321_6
The CRISPR arrays of NC_010321_6 >merge|NC_010321|6|139700-141463|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GCGGCATGGGAGTCTATAAGGAATTGAAACCCTATCAGCTCCGGTGGCACCCCAAACGCAATAGCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGATAGCCTTCAGCTATTAACTTTGCCGCTTCCAATTGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGCTGGTGCTTATTATTGGAAAGGATATAAACAAGCAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCGCTGTCGTCTTTGTTAAAGGACCTGTACCCTGCAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAGATATTGTTCAATATTGCATTTATCTCCGCTTCGCTTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTGTAGAAAATGTCAAAAAACATCAAAAAGGAGGTGTGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAGTAAATACGGGAACAGAAGCAGCACCCGTGTGGAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCATTGCCACTACTTGCAGCAGCAGGAGCATCTATAAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCGTAGAAATAGACCCACCATTTCATCCAGACACACACGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCTGATTGAGTACTAGGGAGGGAGAGAGATGTATCCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAGCGCTTGAGGATGCATACATGAATAATACAATTTTAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCGCCCAAAATGGCGCTTAAAACGGCTGCAAATTTGTCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCCAGCCTGTAATGCAGGGTCGCCTACAAATCCGACGTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTCTTTAGATATACTTAAAAGCAATGTAGAGAAAGGTGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCGAGTGAAAAGATGATACCATGTCGCTTTGAAATGAGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTCCCTAGTAGTTTAGCCATATCAGCTTGTTTTAAAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAGCTCTTTCATTAATTTTGCAGCTTTGTCTGTCGGAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTGCCAAGCTGTTTTGCTAATTTGCTCATTTTTGCCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTCGATATAATAGCTCTAAACGTTTGGCTTTGCTTTGTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATATCCTCGCCAGATACACATTGCTCGCTAACATACAGGCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTAACGCAGACGTGGGAGGTTGCCGTGGATTCGGTTGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTCATAATCTATCAAACCGCTTGCTATTGCAAGCATGAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACACATTGTTTGTAGTTTTGGTATGTTCTGTTGTATACGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTATCATTCCAACTACCAACTTTTGTTAAATAATATTCTCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTATGCTGCATACGTCGAATACGGCACAAAAAAGATGGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCCATGTTGGTTTTACGCTCAATCTCGGTTACGTAGAAAGTTTTTAGCCTACCTATCCTGAAAATAGTG >NC_010321|6|6|139700-141463|CRT GCGGCATGGGAGTCTATAAGGAATTGAAAC CCTATCAGCTCCGGTGGCACCCCAAACGCAATAGC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GATAGCCTTCAGCTATTAACTTTGCCGCTTCCAATTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GCTGGTGCTTATTATTGGAAAGGATATAAACAAGCA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CGCTGTCGTCTTTGTTAAAGGACCTGTACCCTGCA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGATATTGTTCAATATTGCATTTATCTCCGCTTCGCTT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGTAGAAAATGTCAAAAAACATCAAAAAGGAGGTGTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGTAAATACGGGAACAGAAGCAGCACCCGTGTGGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CATTGCCACTACTTGCAGCAGCAGGAGCATCTATAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CGTAGAAATAGACCCACCATTTCATCCAGACACACAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CTGATTGAGTACTAGGGAGGGAGAGAGATGTATCC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGCGCTTGAGGATGCATACATGAATAATACAATTTTA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CGCCCAAAATGGCGCTTAAAACGGCTGCAAATTTGTC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCAGCCTGTAATGCAGGGTCGCCTACAAATCCGACGT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTCTTTAGATATACTTAAAAGCAATGTAGAGAAAGGTG 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>NC_010321.1|WP_003869923.1|138221_139442_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_003869923.1|135695_136916_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_003869923.1|129769_130990_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_003869923.1|128110_129331_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_003869923.1|124977_126198_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_012268883.1|119117_121472_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 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MITAIKELGEMVLKSQNKTLLDVLIENPNQDGRYSKIIAINFIVKEDEIEYEGIRLEEYDDSKISRYLFTDTGGNAPGYTPAAKITEVPKTFNGKIKNWFNKVLKDKSIKIDEKDRAFLERIKDILEEKSDEIIKEAEKIRGDFPKKEGLSLILKFNVDGEYKYIGDFNVFRDLMLQLDSQKYQKIYAEDKVCSICGQKKDIVFGTVDTYKFYTIDKPGYIAGGFNEKESWKNYPVCAECRLALEEGKRYLENELTFRFYGLEYQLIPNFIIGKEFVRKEVREIFESSERLLSLKREVKKRFIGDEDEILDYLADAEDSMTVNLLFLRKSNSAERILLLIEDVFPSHLREIFNAKEQVDKIFGNSFTFKNIRSFMSKSDSNKRDNDLDGYFLDITDRIFRGRPVDLGFLYNLIMKKIREEFVKDGYYKAATADGLMTIAFLEKMKLIKMEVIPMEERIFDSFFAKYGPTFEMPLKRGLVLLGALTELLLRKQYSDREAKPFMKNLKGLKMDEKDIKGLLPKVQNKLEEYDSFEKGKRLLAKEASNYLLLAGDNWNMSVDEINFYFACGINLADELTSIIYKKEGEEK >NC_010321.1|WP_004399630.1|114957_115713_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRITLEFVGEKNLVLPIHYNYIVQGFLYDLMGDSEFAAFLHDEGFQYEKRKFKLFTFSRIEGEFKILTDSKGQKKISIKPPFKFTVASPLDEFIFDISKNALKKEYCHFNGQKFILNSLNIDNPPVFKNKARIKFISPVVMYTTLKDGDIKYTYYYSPWDEKFSPLLLNNLLKKYELVYKIKAEDPYFKLYPLSEKEDRRYSKMIKYKNVYVKGWMGIYDVESSPELLELAYYTGLGAKNSQGFGCFEIIG >NC_010321.1|WP_012268884.1|141548_142769_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKSVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_009052111.1|142907_143636_+|peptidase-E MKKVVAIGGGEISKFETFKIDEEIVKLTDKAKPKALFVPTASGEPEAYCDNFDFVYGKMLGCETDILFLIKDDPDSSQIEKKISWADLIYVGGGNTKRMMEIWRSKGVDKMLIDAYQRGTVLSGLSAGAICWFKYGFSDSQRFENQENWHYTKVEGLGLFDAILCPHLNEENRRELFEKFMIDFEGVGIGLENGCAIEIVDDTFKIINSFENAHAYVFRRSENKLFVDEIRHRDYIPFNLLI >NC_010321.1|WP_003867574.1|143964_144462_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MEFEVTGALMQSYTICKRQVWLMAHQIVPDQEHPYIEIGRLIDENSYQRDRKKIHFENVVLDLVRMEKDNILIGEVKKSSKAEDSAKMQLLFYLYKLKQSGITAKGQLFFPEERKREVVELTPEFEREVIKAIEEIKDIVYKEKPPAFIKIPYCKNCGYKEFCMS >NC_010321.1|WP_004399636.1|144458_145451_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKTIYIFSDGELKRKDNTLFFEGENGRKFIPVENTSEIMVFGEVSLNKRLLEFLTQSEIILHFFNHYGYYVGSYYPREHLNSGYMILRQAEHYNDESKRLYLAQKFVEGAYKNIRQVLKYYSNRGKDLEDVIYSIEKLGESVDSTSTINELMAIEGNIREYYYKAFDEIIQNPDFKFDFRSKRPPQNFLNTLISFGNSLMYTTTLSEIYKTHLDPRIGFLHATNFRRFSLNLDVSEIFKPIIVDRTIFTLLSKKMVTKEDFEEDAEGLLLKEKGKKVFVQEFEDKLATTIKHRNLSNNVSYRRLIRLELYKLEKHLIEEEQYKPFIAQW >NC_010321.1|WP_003871087.1|145467_145731_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFLILVYDVNEKRVNKVLKTCRKYLHWVQNSVLEGEISEANLKKLKIELSRIIDKDEDSVIFYILRTTKYSEREILGLRKGGEDIII >NC_010321.1|WP_012268885.1|145851_147777_+|FAD-dependent-oxidoreductase MELTKPIKIGNLSLKNRVVMAPVKTGYATPEGQVTEELIQYYVNRAKGGVGLIVLESAYVDLSGKEIPRQLGIYDDSMVEGLRRLITPLQEAGSKVAVYINHAGRIANPMVTKLPLIAPSSIACPTIGVEPQGIPHEDIKKWQNTYVKAAVRAYEAGADALEIQFGHGYLIHQFLSPHTNKREDEYGGSFENRIRFGMEILDEIKKEIGADFPIIVRISADEFVPGGWALEDAIRLAKILEDKGVAAIDVSLGSSCESGAITLQTLGTQKGLAWEFASKIKKQVNIPVIAVGRINTPELAEEILVSGKADLVALGRPLVADPLFVEKATSGRSKEIRRCAACHQGCLDELRAGRRFGCNFNPSVGKEEEIEIQKAPQPGKKVFIIGAGLAGLEAAYTAAARGHKVYIYEEKGEIGGQVLPGSVPPHKEELKGIVEYYKEVLPKVGVTLNLNHKVTAEEIAKWEADEVVFATGGQPIVPPIPGLKEYGFLTAVEVLRGEKQAGDKVAIIGGGLIGMETADYLSEQGKKVMVIELLEEVARDMGVFEKILIMKRLKERGVEIYVKTRLKEVGKALLVETPEGEKELPLPDTIVLAVGLKPDPSLYEEVSKILPQEKLHVIGDAKEVRKIVHAISEGRNLGLSL >NC_010321.1|WP_003871085.1|148037_148817_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MKFCSLRSGSSGNAIYINHKDVHILVDAGLSGRTIEKALLNIGINPKSLSAILITHEHKDHIIGAGVLSRRYNIPIYANKATWEVMEKDIKEISEKNKLYFTTGEEFEIGDVKIMPFKKSHDAVEPVGFSFKCGDKKISIATDLGYMTRGVANHLIGSDIVLLEANHDIEMLINGSYPWPLKKRILSNLGHLSNDAAADTLMKLFKMKAIGIAFLGHLSQNNNRPELAFATVTNVLKKSGVKFEVRMALRNIESDLVEI >NC_010321.1|WP_012268886.1|149271_150684_+|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase MDSKDMQRLQTTQQRGYPLNREMEFQKTTEVHSISSASEDGRNEVQRYTSKMLEMIVERGNMEAAYKRVVANKGSHGVDGMEVDELLPYLKENWATIKQQLLEGKYKPQPVRRVEISKPDGGVRLLGIPTALDRLIQQAIAQILNRVYNHTFSDSSYGFRPGRSAKDAIKAAEAYINEGYTWVVDMDLEKFFDRVNHDIIMSKLEKRIGDKRVLKLIRRYLESGVMINGIKVSTEEGTPQGGPLSPLLANIMLDELDKELEKRGHKFCRYADDCNIYVKSRSAGNRVMKSIKKFIESKLKLKINEAKSAVDRPWRRKFLGFSFYTKENEVRIRIHEKSIKRFKEKVREITNRNKGISMENRIKRLNQITTGWVNYFGLADAKSIMKTLDEWIRRRLRACIWKQWKKIKTKHDNLVKLGVEEQKAWEYANTRKGYWRISNSPILNKTLTNKYFESIGYKSLSQRYLIVHNS >NC_010321.1|WP_003867580.1|150923_151364_+|ACT-domain-containing-protein MGEDGKLYIIREEILSDSLKKTLKVKELLESGKVKTINEAVKQVGISRSAFYKYRDYVFPFSKFSKGKIITLSMVLDHMPGVLSSILDVVANARGNVVTINQSMPSMGVASVTISIDTQYMEMSLENFLEKLSSQNGVRKIEILGE >NC_010321.1|WP_012268887.1|151376_152633_+|homoserine-dehydrogenase MKIGLMGLGTVGTGVVHLINQNGKNIEKKIGEKIEIKKILVKDPNKKRTPLAEGKITFDANDILEDEEIDVVVEVMGKEHPALEYIIKALKKGKHVVTANKEVIAVHGKELIKLATENKVSLLYEASVGGGIPIIRPLKQCLAANKIYEIKGILNGTTNYILTEMKEKGFDFEEVLKEAQQKGYAEADPTDDVEGFDAARKLAILSTLAFNKFILPEKIYTKGIKSISKSDIKYAEELGYNVKLIAYAKIDEEDRLEAWVHPVMIKKDNPLNGVNGVFNAILVDGNAVGEVMFYGQGAGMMPTASAVVADIMDVKNHIVIQNGCEDGDLLPIVDTVSKYYIRLIAFDKPGVMSKITGILGDKGISLLSVVQKGVLGDTAEIVLITHIANTGKVFEALEEIQNLKEVECIESVIRVEGE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_010321_7 | 809146-809344 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_010321_7
|
2 spacers
spacers of NC_010321_7
>7.1|809183|45|NC_010321|PILER-CR GAGGTCGAGGGTTCAAGTCCCTTTTGGGTCGCCAGTTATGCCTCG >7.2|809265|60|NC_010321|PILER-CR GGGACTGAAAATCCCTGTGTCAGTGGTTCGATTCCACTTCGAGGCACCATTTGTGCGGAC |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_010321_7
The CRISPR arrays of NC_010321_7 >merge|NC_010321|7|809146-809344|PILER-CR ATAGCTCAGTTGGTTAGAGCGCCAGCCTGTCACGCTGGAGGTCGAGGGTTCAAGTCCCTTTTGGGTCGCCAGTTATGCCTCGATAGCTCAGTAGGTAGAGCAAGGGACTGAAAATCCCTGTGTCAGTGGTTCGATTCCACTTCGAGGCACCATTTGTGCGGACATAGCTCAGTTGGTAGAGCATCACCTTGCCAAGGTG >NC_010321|7|7|809146-809344|PILER-CR ATAGCTCAGTTGGTTAGAGCGCCAGCCTGTCACGCTG GAGGTCGAGGGTTCAAGTCCCTTTTGGGTCGCCAGTTATGCCTCG ATAGCTCAGTAGGTAGAGCAAGGGACTGAAAATCCCT GTGTCAGTGGTTCGATTCCACTTCGAGGCACCATTTGTGCGGACATAGCTCAGTTGGTAG AGCATCACCTTGCCAAGGTG
>NC_010321.1|WP_009052585.1|808052_808937_+|Hsp33-family-molecular-chaperone-HslO MRDYIVRATAYNNKILAIAAFSTQTAQKAKEIHNLTPTTCAALGRALTAVAMMRVMMKGEKDKVTLVIKGDGPIGNIVVVSNYPGIVKGYVGNPTVDLPLSEKGKLDVGKAVGKNGYVTVIKDIGLKEPYVGTVELQTGEIGEDIAYYFYTSEQVPSAVGVGVLVGKEGNVLASGGFIIQLLPNIEEEVVAKVEEALKNISSVTELLRKGYLPEDILNHILGEMGLNILERVDLKYECDCSQERFETAIIALGKEEIKKLIAEGQSVEAVCHFCGKKYLIEESRLKELLRIAEE >NC_010321.1|WP_009052586.1|807788_807992_+|cold-shock-protein MVRGKVKWFNAEKGYGFIEREDGTDVFVHYSAIEGDGFKTLEEGQKVEFEVVEATKGPQASKVRKVN >NC_010321.1|WP_009052587.1|806966_807713_+|NAD-dependent-protein-deacylase MGDKNLFEKAARLIKQSRKTIVLTGAGISTESGIPDFRSPGRGLWENLDPMEVLSTGVLYNFPEEFYKVGFKILSSMRNAEPNEAHYILSEMEKEGIIFGVITQNIDNLHQKAGSKNVFEVHGNTREGSCLRCGKKVSFEVLEEKVSKKQIPPRCDDCNGVLRPDVVLFGDPMPYAFDLAVKEVKSSDLLIVIGSSLAVSPVNFLPDTVRHLIIINATETPYDYKADVVIREKASYALRNIWDIIKFQ >NC_010321.1|WP_003867226.1|806770_806941_+|small,-acid-soluble-spore-protein,-alpha/beta-type MDNEILKLEAAEELGLLEKVKKVGWSKLSAQETGKIGSIVKKKMKLQQEVGKKEKL >NC_010321.1|WP_157748019.1|806286_806430_+|transposase MYVCQNCGIVVNGDVNGAVNILRRVSPNLKKDRGRGFLDNPVRIKVS >NC_010321.1|WP_003867225.1|805959_806181_+|NifU-family-protein MRERVEEVLELLRPSLQADGGDVELIDVTEDGIVKVRLTGACGGCPFATLTLKEGIERAIKEEIPEVKEVIAV >NC_010321.1|WP_012269161.1|805441_805906_+|GAF-domain-containing-protein MEKRKVFDDLLVRIDQMAREIDDMDEFYGEVVKILADNVPYYNWTGFYFMKDGELVIGPYIGRPTEHVRIKVGQGVCGRAVAEKNTIIVDDVTKEDNYLACSLETKSEIVVPIWANGDIIGEIDIDSDDLAAFDEEDKRFLEKVAEIISRKLKK >NC_010321.1|WP_003867223.1|804238_805012_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MYIPTISPYAFKIGPIDVHWYGIFMAISIAIGGYYLYRQAMKLNYDEDFLLNLLMIVVISGVVGARLMFVLANYPEWFIKDPVQVLKIYEGGLSWHGAVLGGFLAGLYYCRKKGVRINPLEDFAVLGLSIGNILVRIGNIFNQEVLGRPTEFAFGRWPAQLVGVAMGIILLIRYFYIQKKHMPDGYQFWSFIFYYQLMRGLIEETVRDNPLIWPVYLNEKWGIGFFTLTQLVTPFILILAYWMIRRVLNDPNKQFYN >NC_010321.1|WP_003867222.1|802271_803666_+|dipeptidase-PepV MDLNSYIDNMRDDIIKSVQELVRIKSVQDEPKPGMPYGEGIAKALDKALEIAQSLGLKTKNVDGYVGYAEYGEGEEMIGVLGHLDVVPEGDGWTYPPYGAEIHDGKIYGRGTVDDKGPIIAALYGLKAIKDAGLELSRRVRILFGTNEETGSHEIPYYLKHDEAPTMGFTPDAQYPIIYAEKGITMFNVVKDFNKKPSNIVIKYIKGGERPNVVPGFCEAGLKVKEANKKKEIQDKLEAFVKETGYNLKAEEKDEMLVIKSVGVSAHGSLPHLGKNAIMQLFLFLDRIDLEDSDVKDFIHFFATNIGIETNGKTFGIYLKDETGELTFNVGTIQLDESKGVLGLNIRYPVKYKYEDWMNIFENKIKTNGMRIEDMLHQPPLYFPPAHPLIKTLSKVYEEQTGQKAELLAIGGGTYAKEMPNTVAFGPVFPGKPELAHQADEYIEIEDLILNAKIYAHAIYELAK >NC_010321.1|WP_003867221.1|801595_801931_-|winged-helix-turn-helix-transcriptional-regulator MAENIYELRAEFFKALSHPTRLKILDVILNEKEICVCEIVNKIGVDQSTISKHLNILKKAGILESKKEGLSVFYKVRFPCMKDYFICIDKTIKCDLVTKVSFIDSSKEKVE >NC_010321.1|WP_003867230.1|809568_809904_+|thioredoxin-family-protein MEKIIDIENIEQIIKENDMVFLYFSTQDCGICTSLLPKLEGMLVNYPKIKSFHIPIDEIPLASGKFSVFTVPTVIVYVDGKEAIREARFISMDTLEEKISKYYSLFFEETA >NC_010321.1|WP_003867231.1|810026_810959_+|response-regulator MKGRNILIVDDNKLTRKILKDILENAGYGVLEAKDGEEALQIYRNKLPDMVILDIVMPGMNGFDLLRILRKEEENLMLPIILLTSQDNFEEKIKGLELGADDYLVKPFNDKELLFKVNNLFQRIEHNRMANPLTGLRGNIDIKEEIKRRIKENKPYAILYIDLDNFKSYNDYYGFLRGDNVIKLTAKILSDAVNLIGNERDFLGHIGGDDFVIITTPDKAEEMCKYIISRFDEEIKYLYDDEDRKRGYIETIGRTGEKMMFPLVSISIAIVTNEFRDFKNDLEISAVAAELKKKLKTMDGSCYLKDRRKG >NC_010321.1|WP_003867232.1|811017_811752_+|hypothetical-protein MSNPFVPHGNFKWVVIDGREREIGDSLSKLGIKVLYTEKCADLYDAISFHPDILLHPLGDREIIVAPNVTPEFIRKLKLIGLKVKIGQTFLKRNYPYDIAYNVARLGNTAFHNFKYTDPVLRESLEKKGVKFLNVKQGYTKCNMAIIDDNSFITSDKGIFEVAVSNGFEALLIEPGGVFLKGFEYGFIGGAMGLIGEKKLAVTGVFNSHKNYEKIIEFLNKKGIEIVYLTFKQIKDIGSIIPLI >NC_010321.1|WP_012269163.1|811807_812686_+|putative-sporulation-protein-YtxC MQLFSIGVSKDLKLDAENLKHGLKNLAENGIKIAINSNVCGSVTYYSLKVEDKQGFSNVARIRNYIAEAISDIIVNQIDKRIIKKLINKYYHYFSEDEKEEIEKIAYNILEDDVNKETFKLAKKEQIFVLVRDFLKESDYIDLEGFVNFRLRDFIGELSEVTDKAVDEFLMKKEYNEFIGLLKYFVELQDSKVEILNIIVDKNGKFKLYDENDKPISNDFINEIVAELKDGVISDEDALISTLITIAPKKIFFHSINNMRDNEILETVKKVFNDKVEICYGCELCSKIKCEK >NC_010321.1|WP_012269164.1|812768_813368_+|DUF445-family-protein MQFLTRMLFLAFVGAAIGWLTNFVAVKMLFKPLKPVKIFGITLQGLIPKRKYEIAKSIGEIVERELLSFNDLWDRLLTEENRKFLLSNLDLKVKEVTENKLPSFLPKAIKEMISNYIGDIINREVEVFLNSPSNEVVEIISTKLKISEIVEEKIKSFKLEKLEDVVIKIAHSELYMIEIMGGVLGFLIGVLQAIVIQFL >NC_010321.1|WP_012269165.1|813665_815570_+|threonine--tRNA-ligase MIIILKDGTQREFEKGMTVYEIAKSISERLAKEAVGGKFNGKVVELNTKIEEDGKLEILTFDDEEGKKIYWHTSSHILAQAVKRLFKDVKLAIGPAIDNGFYYDFDTDRPFTTEDFEAIEQEMNKIIKEDYKLERFVLPKDKAIKLMEGKGEPYKVELIKEIPEGEEISFYKQGEFTDLCAGPHLMSTGMVKTIKLLSVAGAYWKGDEKNKMLQRIYGISFPKKSMLDEYLHMLEEAKKRDHRKLGKELDLFSIHPEGPGFPFFHPKGMIIRNILEDFWRKEHMKHGYQEIKTPIILNEELWRRSGHWDHYKENMYFTEIDGETYAIKPMNCPGAMLVYKSTMHSYRDLPLRLCELGLVHRHELSGVLHGLMRVRSFTQDDAHLFMTPEQVEDEILGVINLVDYFYKIFGFEYFVELSTRPENSMGSDEDWELATNALISALNRVNLPYKVNEGDGAFYGPKIDFHLKDSIGRTWQCGTIQLDFQMPERFELEYIGPDGEKHRPIMLHRVIYGSIERFIGILTEHFAGAFPTWLAPVQVRVLPISDKHYAYAQNVYGRLLENDIRAELDDRNEKVGYKIREAQLQKIPYMLIVGDKEVEQGTVSLRSRKEGDLGAISLSEFIEKILKEIATKAL >NC_010321.1|WP_012269166.1|815672_816917_+|MFS-transporter MKKNLEVYKHLKYNIKMNMINGLAWAIGFNMVNPFIGIYAIKLGADDFQVSLLNSLPALMVVIGVIPVTYLINSLKNVHKFAYIVLYIARAFYFLLALAPFFDKEFQPWIVVILVGVMNLPSMAVGMCWQSFMSELIPPEYRSKVFADRNFWTTIVATITVLVTGWLLDKIVFPINYQVIFTVAFIFGLIESYYFSRFHVVKRDLDEAKPGSFYEAFRNMFESKKFIYFNVTSFIYYFAWMMAWPIFTIYKVNFLHANNAWMSIFTIVSSIGSILAFYKWADLSNKRGNGFAVALSALLLGFIPLMWATAKNLYVGAIFDFLGGIAVGGYNMLLLNWLLELLPPTSEKMNYIAVFTLITQISAFIAPMFGMWLYTQMGYVAFMILTGIARIVVSILYFLVANYEDEIKEIEAKQ >NC_010321.1|WP_012269167.1|816928_817981_+|chorismate-synthase MRYITAGESHGEALIAVIEGLPSNLLIDEEFINKELKRRQGGYGRGGRMAIEEDKVHVLSGIRNGKTIGSPLTLEIINKDYENWKNKKTPEVTRPRPGHADLAGAIKYNQRDLRNILERSSARETAARVAVGSVAKLLLKELDIYVKSKVLEIGGVKAEEKWRRTIDEAKSKGDTLGGIIEIVIEGVPVGLGSHVQWDRKLDALLAYHVMSVQAIKAVEIGLGFEAARKPGSLVHDEIYYDEERGFYRKTNNAGGIEGGISNGSPIVIKAAMKPIPTLLKPLTSIDINTKEEVKAAYERSDVTAVEAAACVLEAVCAWVIADECLKKFGGDSIEELKKNYDAYLVYVKNF >NC_010321.1|WP_004401900.1|818177_818729_+|translation-initiation-factor-IF-3 MRFYFFIIFRRCVFINKELQVNEEIRDKEVRLIDQDGKQIGIMSAKEAYKIAQERHLDLVKIAPQANPPVCKLMDFGKYRYELSKREKEAKKKQKIINVKEIRMSPTIEDHDFGVKLKSAIKFLKEGNKVKVTIRFRGREAAHTSLAEDLLKRFANELSEYGVIEKAPNIEGRNLMMVLTPKS >NC_010321.1|WP_004401892.1|818756_818954_+|50S-ribosomal-protein-L35 MPKMKTHRGAAKRFKVLKSGKVKRSRAYKSHLLTHKNAKRKRRLRKATYLVGADAKNIKRLLPYS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_010321_8 | 962976-964275 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NC_010321_8
|
19 spacers
spacers of NC_010321_8
>8.1|963006|36|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATAAAGATTGGCAAATAACTGTGATGTAAGGTTAC >8.2|963072|37|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCACAAGAAAAACCTGTACAAGCAGGTAACTGGATTG >8.3|963139|36|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGACGTTGTTTCTTGCTCCACTTCTTCTTTTTGC >8.4|963205|39|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGGCTGAACTTGAACAATCTGAAGTGAAGTTGGTACAA >8.5|963274|39|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTATATTGAAATTGACTGGAATTTTAGAGAATTTTACCT >8.6|963343|37|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATATGCTTGTACAACTTTATTGATGAGTTCTTGAC >8.7|963410|36|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAATTGGACAGCACAAGGACTAAAAACGAGAGAA >8.8|963476|36|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAAACTTTTTTACGTCTTGCAGTTTCATTTTTACC >8.9|963542|36|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGCAATTGTACAGAGCACACTCAAAGAAAAAAAAGA >8.10|963608|39|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTCCGCTTCTCTTAAAAAACTTTTGTGCGGAAAAATGT >8.11|963677|37|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCGGCATCCGGGCCACCTCCCTGTTACTGTTACTCTC >8.12|963744|36|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGGACCACTACTATGAGCTGATAGAATACGACAAA >8.13|963810|36|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGGGAAGCATTCGTATATTTCGTAGGTTTTGCAAT >8.14|963876|35|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGGTGGGAGAAAGACAACAAAAGCAATGCACTTGC >8.15|963941|36|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCATTAAAAATTGCCAAACTGTTGAATGAATATGAG >8.16|964007|37|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACACGCCACCCAAAACACAGTAACCACAATTGCAAAC >8.17|964074|38|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGTACTTAGGCTAACAAAAATGCCGGCCGTATTAACA >8.18|964142|36|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTATTGCAGAGGCAATGGCAAAAGGCTTAAGCAA >8.19|964208|38|NC_010321|CRISPRCasFinder,CRT ATGCGGTGATGGCTTATGAGGATACGTATATTGCGTAG |
csx20,csx1,cas10,csm3gr7,csx19 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_010321_8
The CRISPR arrays of NC_010321_8 >merge|NC_010321|8|962976-964275|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGATAAAGATTGGCAAATAACTGTGATGTAAGGTTACGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGCACAAGAAAAACCTGTACAAGCAGGTAACTGGATTGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTTGACGTTGTTTCTTGCTCCACTTCTTCTTTTTGCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAAGGCTGAACTTGAACAATCTGAAGTGAAGTTGGTACAAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTATATTGAAATTGACTGGAATTTTAGAGAATTTTACCTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAAATATGCTTGTACAACTTTATTGATGAGTTCTTGACGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAAAAATTGGACAGCACAAGGACTAAAAACGAGAGAAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATAAACTTTTTTACGTCTTGCAGTTTCATTTTTACCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAGCAATTGTACAGAGCACACTCAAAGAAAAAAAAGAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATTCCGCTTCTCTTAAAAAACTTTTGTGCGGAAAAATGTGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCCGGCATCCGGGCCACCTCCCTGTTACTGTTACTCTCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTGGGACCACTACTATGAGCTGATAGAATACGACAAAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATGGGAAGCATTCGTATATTTCGTAGGTTTTGCAATGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAGGTGGGAGAAAGACAACAAAAGCAATGCACTTGCGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGCATTAAAAATTGCCAAACTGTTGAATGAATATGAGGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACACACGCCACCCAAAACACAGTAACCACAATTGCAAACGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTGGTACTTAGGCTAACAAAAATGCCGGCCGTATTAACAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAATTATTGCAGAGGCAATGGCAAAAGGCTTAAGCAAGTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATGCGGTGATGGCTTATGAGGATACGTATATTGCGTAGGTTTTTAGCCTACCTATCCTGAAAATAGTG >NC_010321|8|8|962976-964207|PILER-CR GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GATAAAGATTGGCAAATAACTGTGATGTAAGGTTAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GCACAAGAAAAACCTGTACAAGCAGGTAACTGGATTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTGACGTTGTTTCTTGCTCCACTTCTTCTTTTTGC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAGGCTGAACTTGAACAATCTGAAGTGAAGTTGGTACAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTATATTGAAATTGACTGGAATTTTAGAGAATTTTACCT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAATATGCTTGTACAACTTTATTGATGAGTTCTTGAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAAAATTGGACAGCACAAGGACTAAAAACGAGAGAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATAAACTTTTTTACGTCTTGCAGTTTCATTTTTACC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGCAATTGTACAGAGCACACTCAAAGAAAAAAAAGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATTCCGCTTCTCTTAAAAAACTTTTGTGCGGAAAAATGT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCGGCATCCGGGCCACCTCCCTGTTACTGTTACTCTC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGGGACCACTACTATGAGCTGATAGAATACGACAAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGGGAAGCATTCGTATATTTCGTAGGTTTTGCAAT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGGTGGGAGAAAGACAACAAAAGCAATGCACTTGC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GCATTAAAAATTGCCAAACTGTTGAATGAATATGAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ACACGCCACCCAAAACACAGTAACCACAATTGCAAAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGGTACTTAGGCTAACAAAAATGCCGGCCGTATTAACA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AATTATTGCAGAGGCAATGGCAAAAGGCTTAAGCAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC >NC_010321|8|7|962976-964275|CRISPRCasFinder GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GATAAAGATTGGCAAATAACTGTGATGTAAGGTTAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GCACAAGAAAAACCTGTACAAGCAGGTAACTGGATTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTGACGTTGTTTCTTGCTCCACTTCTTCTTTTTGC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAGGCTGAACTTGAACAATCTGAAGTGAAGTTGGTACAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTATATTGAAATTGACTGGAATTTTAGAGAATTTTACCT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAATATGCTTGTACAACTTTATTGATGAGTTCTTGAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAAAATTGGACAGCACAAGGACTAAAAACGAGAGAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATAAACTTTTTTACGTCTTGCAGTTTCATTTTTACC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGCAATTGTACAGAGCACACTCAAAGAAAAAAAAGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATTCCGCTTCTCTTAAAAAACTTTTGTGCGGAAAAATGT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCGGCATCCGGGCCACCTCCCTGTTACTGTTACTCTC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGGGACCACTACTATGAGCTGATAGAATACGACAAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGGGAAGCATTCGTATATTTCGTAGGTTTTGCAAT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGGTGGGAGAAAGACAACAAAAGCAATGCACTTGC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GCATTAAAAATTGCCAAACTGTTGAATGAATATGAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ACACGCCACCCAAAACACAGTAACCACAATTGCAAAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGGTACTTAGGCTAACAAAAATGCCGGCCGTATTAACA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AATTATTGCAGAGGCAATGGCAAAAGGCTTAAGCAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGCGGTGATGGCTTATGAGGATACGTATATTGCGTAG GTTTTTAGCCTACCTATCCTGAAAATAGTG >NC_010321|8|7|962976-964275|CRT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GATAAAGATTGGCAAATAACTGTGATGTAAGGTTAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GCACAAGAAAAACCTGTACAAGCAGGTAACTGGATTG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTTGACGTTGTTTCTTGCTCCACTTCTTCTTTTTGC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAGGCTGAACTTGAACAATCTGAAGTGAAGTTGGTACAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TTATATTGAAATTGACTGGAATTTTAGAGAATTTTACCT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAATATGCTTGTACAACTTTATTGATGAGTTCTTGAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AAAAATTGGACAGCACAAGGACTAAAAACGAGAGAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATAAACTTTTTTACGTCTTGCAGTTTCATTTTTACC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGCAATTGTACAGAGCACACTCAAAGAAAAAAAAGA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATTCCGCTTCTCTTAAAAAACTTTTGTGCGGAAAAATGT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC CCGGCATCCGGGCCACCTCCCTGTTACTGTTACTCTC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGGGACCACTACTATGAGCTGATAGAATACGACAAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGGGAAGCATTCGTATATTTCGTAGGTTTTGCAAT GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AGGTGGGAGAAAGACAACAAAAGCAATGCACTTGC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC GCATTAAAAATTGCCAAACTGTTGAATGAATATGAG GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ACACGCCACCCAAAACACAGTAACCACAATTGCAAAC GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC TGGTACTTAGGCTAACAAAAATGCCGGCCGTATTAACA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC AATTATTGCAGAGGCAATGGCAAAAGGCTTAAGCAA GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC ATGCGGTGATGGCTTATGAGGATACGTATATTGCGTAG GTTTTTAGCCTACCTATCCTGAAAATAGTG
>NC_010321.1|WP_012269222.1|962409_962778_+|large-conductance-mechanosensitive-channel-protein-MscL MLKGFKEFIMRGNVLDLAVAVIIGSTFNKVVNSLVVDVLTPLIGAIFGAPDFSAIKLGPIAIGNFLNAVVNFVIVAAAIYFFIVAPMNAIKRRKPKEKEQTPPEPSEEVKILREILEVLKEK >NC_010321.1|WP_012269221.1|961527_962283_+|sulfite-exporter-TauE/SafE-family-protein MKNYILILMASILAGATNSIAGGGTLITFPALVWVGINPLAANMTNTVALWTGSVTGAWGFKERLSQTKELLKFLTLPSLLGGILGAYLLMITPHKVFNFVVPFLVLFATVILALNDRINKFNLDSEEGREKKSLVFVFILQFLTSLYGGYFAAGIGILMLATLGIAGITDIHTANGIKNVLSLFINITSGLVLLFSGKVVWPFAIILMIGFALGGYLGAKISQKFDSKKVKSFVILWGIILAIVFWIRGV >NC_010321.1|WP_012269220.1|960907_961528_+|nitroreductase-family-protein MKECQKLITERRSITFFDPTKEISDDFIKEVLEVAATAPSANNLQPWEVIVVKDKEKKKILKEICFNQQKVEDASAVIVLIANPKAAFEHIDRVLDSSIELGYIPKERRESAKERVLEVWKDMEQAKRKSIRDTALFAMNIMIVARVYGLETHPMDGFNEEKMKEFLGIDAEKIVPMIIAIGYKDPSKELLPRAYRFKFEEFGEIV >NC_010321.1|WP_012269219.1|960181_960646_-|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MWQDLYKAAFYYLLKLGVPQADAEDIAQEALLSTYLNLDGIQEGKLKAYVLTAARNKYTDYLRKTKKDMTVSIIDVFPQSTFSEFQQIENKEVIKKAVNRLTLNEQKLFYLKFILEMSNEEISSYLKTNSNTEKTMVWRLRKKLKEYLKEEEKS >NC_010321.1|WP_012269218.1|959221_960181_-|hypothetical-protein MGSDLNKPISDISFDEKAFLRKARFKSILRIIIISLIIAIGVFVLTFIIPEMMLQNQENRIDSFYPDIVKFTEPNTFAISGESYNVRLFGRQKEYYLLRLIGNKPYPAGIVTVDFDIWGGEQFQGNKSFCVVETDHIIPYSEISTVIPEGTKEYLAPYAVPKLKFYNPVVKYDKVIREFDVLKNIPNDNLVEMALSFYRPLTFIEIKTIIPEDLKLMWGAVLVFEENDYKEKNYLAERLVGNPYIDSHDGEKEFLKQLEQLSNLQSYSSTNLKRTVNFLKEKGIKYYGVVVVGHPESLQKLSSNSIIRGAVLGIVTTPY >NC_010321.1|WP_012268741.1|958896_959118_+|hypothetical-protein MKRGYIHATDRLGNESDFPIMGISIAVVNNSNRKFSDIDEISRIASQIKMECKKYEKSHYIIESLEKGKQAVI >NC_010321.1|WP_012269217.1|957595_958711_+|sodium-ion-translocating-decarboxylase-subunit-beta MFEAIINFLKTTGYFNVTLSQLIMIIIAFVLMYLAIVKKYEPLLLVPISFGMLLANIPEAGLMEEGGFLYWIYQGVKLGIYPPLIFMGVGAMTDFGPLISNPKSLLLGAAAQLGIFITFLGARLLGFDAKEASSIGIIGGADGPTAIFVTSKLAPHLLGAVAVAAYSYMALVPIIQPSIMRLLTTKKERTVVMEQLRPVSKTEKIIFPIIITVLASFLVPPATPLIGSLMLGNLFRESGVVDRLSKAVQNELMNILTIFIGLSVGATASGDNFLRLETIEIIILGLIAFAGGTAGGVLFGKLMYLLSGGKVNPLIGSAGVSAVPMAARMSQKVAQEEMPGNFVLMHAMGPNVAGVIGSAIAAGVLLSLYGG >NC_010321.1|WP_003867702.1|957189_957549_+|sodium-pump-decarboxylase-subunit-gamma MIEALSTTVLGFGITLIFLYLLSLILDLMRVVFYKKDKKEPKILPSREQEKTKFQEDETEEDEGELIAVITSAILACSQKPADEIKIRLIRRINQRTPIWAMESRLNLMKHQQHLRSLR >NC_010321.1|WP_003867701.1|956751_957153_+|methylmalonyl-CoA-epimerase MNILKIDHIGIAVNSIEEASKIYTELLGLEMHGVEEVAEQKVKVAFIPVGESEVELLESTDPEGPIARFIEKNGEGVQHIAFRVEDIEKALEELKQKGVRLIDEKPRYGAGGAKIAFIHPKATKGVLIELCER >NC_010321.1|WP_003867700.1|955808_956738_+|methylmalonyl-Co-A-mutase-associated-GTPase-MeaB MDLADRVLKKDKRAVARLITLIERESPEATEALKQLYKYTGNSFVIGITGPPGAGKSSLVNELAKKIRAKGKTVGIIAVDPTSPFTGGALLGDRIRMQDLTLDDGIFIRSMGSRGSLGGIAKAAYDAVKVLDAFGMDYIIIETVGVGQSEIDIVKLADTVVLVLVPGLGDDVQAIKAGIMEIADIFAVNKSDREGADRLVTEIEMMLDLSQKQFDFRPPVVKTVAVTGEGIDTLERRIREHLDYLSKNGILEQKRRAKVREEFMELLKDHITRLILQKNSPKIDMLLQDISKKAVDPYTALDILTREIL >NC_010321.1|WP_003869923.1|964360_965581_-|IS110-family-transposase MDLVYSHVCGLDVHKKNVVACIITPEGKEIRTFSTMTDDLIALKEFIKAKGCSVVAMESTGSYWKPIYNLLELESIKILLVNAKHIKNVPGRKTDVKDAEWIASLLQHGLLQGSFVPDREQRELRELVRYRKSLIEEKSRELNRIQKVLEGANIKLSSVVSDINGASSRSILEAIINGEENPETLAELSQGKLKNKMDELKRALKGLINHHQRMLLEIQLRHIDYLDEEIAKLDEEIKNRMLPFEKDLALLDTIPGVGRRTAEQIIAEIGTNMEQFPSAAHLCSWAGLCPGHNESAGKQKSARTRKGNQKLRSSLIEAARAASRAKDTYLSSQYHRIAARRGANRAAVAVAHSILIIVYHILKQKQPYIELGPTYYEEKKRNMIIRQSLKKLESLGLKVTVESAVS >NC_010321.1|WP_012269223.1|966521_966878_+|hypothetical-protein MIALLNLCNFETPIQSLEEIKNNIELLEENVNDANYEIVKQLQEFVNGQIDLGEKIVDAYIAFKENRNNANAQRINELINQFNEKTAKKNNIIVEILKKANMPYTIDDNGTIHYQYIP >NC_010321.1|WP_012269224.1|967184_967595_+|hypothetical-protein MKQIDLKKMFLVFSHQLTDFQKEDARLNLGVNEFIYLPDNLKIQWLDISPYDDSLTFHLQDLINWLKINARKGDYVLVQGDFGATFLIVDFCLKNDLIPVYSTTKREIISEIKNGENIKVSRLFTHVRFRKYERWI >NC_010321.1|WP_012269225.1|967597_968887_+|TIGR02221-family-CRISPR-associated-protein MAIKFFSFLGTGAYTKCKYKFDNIESDSSCYVQEALIDNLLKKGVNLESVFIFKTEEATIANWSKNKKYPSDPGLKQVLDKYNGKPSINYVDIPSGQNENELWEIFDKVLEQIDKGDEIIFDITHSFRSIPMLALIILNYAKFIKKCEIRGIYYGAIEAVGKEIKDIEESDIAPIFDLTPFVRLLDWTVGIDRFIETGDARYINYLMKLGTKELHLKGMKDERNILSNFAQKLENYTRNVATCRGKEISKGGLELKNILGDAVSIADKTYIKPMKPVIDRLNDRFINFSNDENKNMIEIVKWCSEHNLIQQGFTILEEGIVNFFCEKFGFDKNNIKEREIIENATYIKHYSLPKDRWKKTAFENEAVIYNLLSKLNEENYKNLIKVLYEEIKPLRNDINHAGYKENDMKAEKFEDKLNELIDKVEKYIV >NC_010321.1|WP_012269226.1|968940_970254_+|DUF1887-family-protein MNEKVLVLIVGTNPLPNYVVGSHLKEKYDKFVLIYSEKNDKINQNSTYDYAKKLKEHLNLNDKCIFLPLSDVSNSEKIINDLREKFPSEDFVEVHLNYTGGTKTMVVHIYNFLKEKFKNNKIKFEGSYLDARDYKLVYDYSEEAISLKDTIKIDINTLLSIHLYEDIHFEFYDTYSYKQKFVDSFDKISQEIEKAIKDDKGEDFVKWLEDPFRKIFKGENKLLEKTAKFKKHIEKLLKDNDSSPIVKFNEKTPQFIWDILNAFPEGKKLNDGQKLWIPDDKITNDNLSSRVKDTVEFLNGKWFEWYVYSQIKSELLDRKLKEGEHFGISLKAQKKDSPYFELDIFLINGYQLIGISLTTSSTRELCKLKGFEVIHRVRQIGGDESKAILITGMDKSKTEDLQKDLAYETGSTQKRFVVFGIDDWADIGSKICEEVFK >NC_010321.1|WP_012269227.1|970250_971783_+|hypothetical-protein MTLSAVLIDTVSIQEYIFLSNKLKENIGASYIVKKIYEDVLEETLKIAFKGSNVDIKAWEKETKKIKINDPKEKFEIGYIGGGNALILFKDKHEATKFIQNYTKLLLKKTPGLKTAFGIIHDFNLGDFKNSMQRLHESLRENKNKYFPNVTLPKYGFTLDCPRTNESAEHFKDDDEKFISSVAWAKLKFSDKARDEMVVILGDILKDNYTLTNDIEKLGQTEGKDYIAIVHIDGNKMGEKFAKCTNLTEYRNLSISVRNATETAFKKMIEILIEKIENDKIFDSKNEEFKLRKEEDKIILPIRPIILGGDDITFISDGRLGVWLAETFIKEFIKQSINSESLSACGGVSIVKTKYPFYRAYIVAEDLTDRAKQISRKENGSYIDFFISSSGWSGSLEDIFNKHLSTVNGKLHFGPYRIDSINDEKTIENLKNIIKEFKNIPKNKVMKLREILFKVTDKDNGKIFVEELKVKGINLPQIKGMYYHEQIWQNRETPYFDAIELIDFYPEGLL >NC_010321.1|WP_012269228.1|971779_973963_+|hypothetical-protein MKIKIDLLSYTLTGSGEGAGIIDSDVVLDDFGFPYIPSRRIKGVLRESAQEVCDILGINDYKIVNSIFGKDGFTEGKLHIGNLYINDYKEIKEEIENLKNDNDSLYKNFVNSLKITSYYTTIRQQTSIEEDNGIAKKGSLRTFRVLKPGLKFEGELYEINPLTKKEKAILYLAVINLKRIGTSRNRGFGEIRCSIEGIEFDNLDKAIQDLKNGIDKTEEIKYSDLKFQGNKSKNIKILPYKITALSPILIAKEIGEQNTIYTEKYIPSTTIRGLFANKFINELGLGKIAHKNNDFYNMFLRGDIIVTPAYPLKNHRIYYPALYLHKEKGKDSNPVYNILEEVPNDIKTKPLNRMIYYIDDKIYTYDISTTFYFHNTRDRVKGHSTGEDIFYYEAINEGEEFKGFIIGDEGYLEGIKNLFKEKFNSFIGRSKSAQYGLVKIEFGDLKDTDMLEIEDKEFIIVAISPIILHNDWGFSEVSEKTLKNYLKKHFNDCDIIVEKIIARTEYVENFVGIWGMKNTRELAYSPGSAFKIIVKGCDNLEEKLNNLLIYGFGEKTDLGFGRVKIYWDLNEEYDMDGEKEKFRHIYPQKSYLIISDIVNREIKEFIKYKGFERAGKFKDQKKISNNLIGRIEGILSETSNFDDWRRKLSKLDKKPAGETLKDTNLWDDLYELDVFNNKSNKIIFDNRLSEVIKDLSLDLDHFELSKTYWVSFLRYLRLFKKTGGEEK >NC_010321.1|WP_012269229.1|973959_975369_+|hypothetical-protein MIDNSKLISTIIIKGVLENTSPFVIGTGKGDIIDIEIIKDEIGNPYIPATSFVGALRHHISKNFKEEDKEIWEYFWGSKNRNQENTFDVQSHFMVSDLKIMDNPKEDLITVRDGVAIDEKKGIAKEKAKYDYEIVNKDLEFEFKAEIKIRENFKDKEIEILKILKTILTELEAGKAQFGAFTTKGFGRFNLKNVRILKFDFPKDGVNYLKFLQHEYLPEDKLDLSKIDILPKKDNTDCIINAYFSIKSSLIISSYTTDPDEPDKVHIKYNGKEVLTGTSLKGAIRSRAFKIVNTLCKNNQEENDDLKKLFGWADTENKEKTKYKSRIIIDESKVKNVIEKEQTRIKIDRFTGGTISGALFQSKPLWHNDENVQLKIKIKDAKDWEIGLLLLVLKDLWNEDLPIGGEKNIGRGILKGKNIEIEYKGKKHIIGKSTNDDETNKIVVNDSDKQILEGFVEEFSKKVRDWDVR >NC_010321.1|WP_012269230.1|975358_975943_+|TIGR03984-family-CRISPR-associated-protein MLDDIYKIEVTFSKVKARDMDNNDLNYDAFIKEIGEIQNGYVVCWLDYAVLFGIIRNGEIKFYNNESPDFNRYLQKLRIFNENEELYIWRSGNKFKFRYREDLDSNKNGEMVEYIDADQVMYGSKFEIKDEFIEVYEKRGIRYIVPKEFIGNNLIDDINNNKKRLVLHTRNYIGYNEIGQAGFVDSRFLKISII >NC_010321.1|WP_012269231.1|975961_978136_+|TIGR03986-family-CRISPR-associated-RAMP-protein MEKAKISIQKTKKGYDYILTFDDGKPLKVHGFNLPQDINGKECEVERINGLPSKIIIDGIEYTKTTTQSNIQENKQTAQQKIKNEPKHNSQIKLFAKAPYNFIPLNECVVKAQDIPEFNKYHKDRYSGYIDLFLTTKTPIYIRRDKEESDFFSIKNGLPIIPGSSLRGMVRNLVEIVSFGKFEFFDKDKRLYYRDVAGKKSNLKDIYSSKISKDRIKAGYLIYDQRKYKIIPSEYDRFQDTSKEFMIEKYNNDYKVWSGRMQKKRKNWIMKSISNSGDFIELTENDIKDYKSDINRNIPEYYDILKMAKDKKVTLPNKIVELPNGVPVFYVEYNDKKGNKKIAFGHTGFFRLPYELTIGDHVPENLKSDDITDFAEAIFGKESKWASRVFFEDAVLDKGQGDIFVEEASPKILASPKPTAFQLYLEQPDGENTKLTDIKHWDNEDTLIRGYKLYWHRNTPDGDSKYSWKASKIEINYDDFIKFLKKANISLDKSVILNSKNIVKDNKKIIINCLYEKLTIEEKKELKEYLLWEKTKAQYTIIKPIKRNIKFKSRIRFENLTKEELGALLFVLDLPENHYHKIGMGKPLGLGSIEIKPSLFIVDRKKRYTSLFNNDTWNLGDEDKTGEINDFKEVFEKYILRNISYNDKGNASSLWETPRLKQLKIMLNWNNTEITDWLKKTRYLMIECPHKDIDYDCICSDSNKDVCNEYRDRPVLPKPEKMIQ |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_010321_1 | 1.18|122820|38|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 122820-122857 | 38 | CP003186 | Thermoanaerobacterium phage THSA-485A, complete genome | 27908-27945 | 1 | 0.974 |
NC_010321_1 | 1.39|124225|38|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 124225-124262 | 38 | NC_004979 | Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum plasmid pNB2, complete sequence | 252-289 | 1 | 0.974 |
NC_010321_8 | 8.3|963139|36|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 963139-963174 | 36 | NZ_KT897276 | Clostridium botulinum strain INGR16-02E1 plasmid pINGR16-02E1, complete sequence | 11053-11088 | 6 | 0.833 |
NC_010321_8 | 8.3|963139|36|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 963139-963174 | 36 | NZ_KT897280 | Clostridium botulinum strain FI1111E1 plasmid pFI1111E1, complete sequence | 10971-11006 | 6 | 0.833 |
NC_010321_8 | 8.3|963139|36|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 963139-963174 | 36 | NZ_KT897275 | Clostridium botulinum strain IFR 12/29 plasmid p12/29, complete sequence | 11042-11077 | 6 | 0.833 |
NC_010321_8 | 8.3|963139|36|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 963139-963174 | 36 | NZ_KT897277 | Clostridium botulinum strain ST0210E1 plasmid pST0210E1, complete sequence | 11053-11088 | 6 | 0.833 |
NC_010321_8 | 8.3|963139|36|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 963139-963174 | 36 | NZ_KT897278 | Clostridium botulinum strain FWSKR40E1 plasmid pFWSKR40E1, complete sequence | 10971-11006 | 6 | 0.833 |
NC_010321_8 | 8.3|963139|36|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 963139-963174 | 36 | NZ_KT897279 | Clostridium botulinum strain SWKR38E2 plasmid pSWKR38E2, complete sequence | 10971-11006 | 6 | 0.833 |
NC_010321_6 | 6.3|139862|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 139862-139897 | 36 | NZ_CP015333 | Borrelia hermsii HS1 isolate Browne Mountain plasmid lpV47, complete sequence | 19023-19058 | 7 | 0.806 |
NC_010321_1 | 1.7|122084|37|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 122084-122120 | 37 | NZ_CP019190 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Poona str. ATCC BAA-1673 plasmid pATCCBAA1673_01, complete sequence | 128113-128149 | 8 | 0.784 |
NC_010321_1 | 1.20|122955|36|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 122955-122990 | 36 | MN694760 | Marine virus AFVG_250M661, complete genome | 46244-46279 | 8 | 0.778 |
NC_010321_2 | 2.8|126959|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 126959-126994 | 36 | NZ_CP021437 | Bacillus thuringiensis strain C15 plasmid pBMB240, complete sequence | 123645-123680 | 8 | 0.778 |
NC_010321_2 | 2.8|126959|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 126959-126994 | 36 | NZ_CP021437 | Bacillus thuringiensis strain C15 plasmid pBMB240, complete sequence | 33833-33868 | 8 | 0.778 |
NC_010321_2 | 2.8|126959|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 126959-126994 | 36 | NZ_CP015351 | Bacillus thuringiensis strain MYBT18246 plasmid p150790, complete sequence | 7249-7284 | 8 | 0.778 |
NC_010321_2 | 2.8|126959|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 126959-126994 | 36 | NZ_CP015352 | Bacillus thuringiensis strain MYBT18246 plasmid p142098, complete sequence | 106305-106340 | 8 | 0.778 |
NC_010321_3 | 3.35|133557|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 133557-133593 | 37 | MN694172 | Marine virus AFVG_250M818, complete genome | 14504-14540 | 8 | 0.784 |
NC_010321_8 | 8.18|964142|36|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 964142-964177 | 36 | NZ_LR699117 | Aquicella lusitana strain SGT-39 plasmid 4 | 49039-49074 | 8 | 0.778 |
NC_010321_1 | 1.20|122955|36|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 122955-122990 | 36 | NZ_CP011133 | Citrobacter amalonaticus Y19 plasmid unnamed, complete sequence | 61910-61945 | 9 | 0.75 |
NC_010321_1 | 1.48|124827|36|NC_010321|CRISPRCasFinder,CRT | 124827-124862 | 36 | NZ_CP031100 | Clostridium botulinum strain CFSAN034202 plasmid p1_CFSAN034202, complete sequence | 29453-29488 | 9 | 0.75 |
NC_010321_1 | 1.48|124827|36|NC_010321|CRISPRCasFinder,CRT | 124827-124862 | 36 | NZ_CP014147 | Clostridium botulinum strain CDC_67190 plasmid pNPD12_2, complete sequence | 6019-6054 | 9 | 0.75 |
NC_010321_3 | 3.25|132885|35|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 132885-132919 | 35 | MN334766 | Serratia phage PCH45, complete genome | 117345-117379 | 10 | 0.714 |
NC_010321_1 | 1.36|124025|36|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 124025-124060 | 36 | NC_019924 | Clostridium phage phi8074-B1, complete genome | 44692-44727 | 11 | 0.694 |
NC_010321_5 | 5.7|137604|38|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 137604-137641 | 38 | NC_010507 | Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 plasmid pMRAD08, complete sequence | 1319-1356 | 11 | 0.711 |
1. spacer 1.18|122820|38|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP003186 (Thermoanaerobacterium phage THSA-485A, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
tgcaaaatttcagaaaatttcaggaaaggaggtatgcg CRISPR spacer tgcaaaatttcagaaaatttcaggaaaggaggtatgct Protospacer *************************************
2. spacer 1.39|124225|38|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004979 (Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum plasmid pNB2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
ccaccttttttacctcaattagttctatagtattaaag CRISPR spacer ccaccttttttacctcaattagttctatagtattaaaa Protospacer *************************************.
3. spacer 8.3|963139|36|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KT897276 (Clostridium botulinum strain INGR16-02E1 plasmid pINGR16-02E1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
-tttgacgttgtttcttgctccacttcttctttttgc CRISPR spacer atttcatgat-tttgtttctccacttcttctttttgc Protospacer *** *.* * *** ** *******************
4. spacer 8.3|963139|36|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KT897280 (Clostridium botulinum strain FI1111E1 plasmid pFI1111E1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
-tttgacgttgtttcttgctccacttcttctttttgc CRISPR spacer atttcatgat-tttgtttctccacttcttctttttgc Protospacer *** *.* * *** ** *******************
5. spacer 8.3|963139|36|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KT897275 (Clostridium botulinum strain IFR 12/29 plasmid p12/29, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
-tttgacgttgtttcttgctccacttcttctttttgc CRISPR spacer atttcatgat-tttgtttctccacttcttctttttgc Protospacer *** *.* * *** ** *******************
6. spacer 8.3|963139|36|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KT897277 (Clostridium botulinum strain ST0210E1 plasmid pST0210E1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
-tttgacgttgtttcttgctccacttcttctttttgc CRISPR spacer atttcatgat-tttgtttctccacttcttctttttgc Protospacer *** *.* * *** ** *******************
7. spacer 8.3|963139|36|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KT897278 (Clostridium botulinum strain FWSKR40E1 plasmid pFWSKR40E1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
-tttgacgttgtttcttgctccacttcttctttttgc CRISPR spacer atttcatgat-tttgtttctccacttcttctttttgc Protospacer *** *.* * *** ** *******************
8. spacer 8.3|963139|36|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KT897279 (Clostridium botulinum strain SWKR38E2 plasmid pSWKR38E2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
-tttgacgttgtttcttgctccacttcttctttttgc CRISPR spacer atttcatgat-tttgtttctccacttcttctttttgc Protospacer *** *.* * *** ** *******************
9. spacer 6.3|139862|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP015333 (Borrelia hermsii HS1 isolate Browne Mountain plasmid lpV47, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
gctggtgct--tattattggaaaggatataaacaagca CRISPR spacer --ttattcttgtattattgcaaaggatataaataagca Protospacer * .* ** ******** ************.*****
10. spacer 1.7|122084|37|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP019190 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Poona str. ATCC BAA-1673 plasmid pATCCBAA1673_01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
tgcatttccccaccttcgcggtaaagctccacgaacg CRISPR spacer tacctctccccaccttcgcgataaagatccacatccg Protospacer *.* *.**************.***** *****. **
11. spacer 1.20|122955|36|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694760 (Marine virus AFVG_250M661, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
agatactttttaacttctttatatatttaataaaaa CRISPR spacer aaaaactttttaaattctttatatattaaaaagtta Protospacer *.* ********* ************* ** *. *
12. spacer 2.8|126959|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021437 (Bacillus thuringiensis strain C15 plasmid pBMB240, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
agctgttgt------tttgacatattcatcatcctttctgaa CRISPR spacer ------tgtaaagcgtttgacatatttgtcatcctttctgaa Protospacer *** ***********..**************
13. spacer 2.8|126959|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021437 (Bacillus thuringiensis strain C15 plasmid pBMB240, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
agctgttgt------tttgacatattcatcatcctttctgaa CRISPR spacer ------tgtaaagcgtttgacatatttgtcatcctttctgaa Protospacer *** ***********..**************
14. spacer 2.8|126959|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP015351 (Bacillus thuringiensis strain MYBT18246 plasmid p150790, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
agctgttgt------tttgacatattcatcatcctttctgaa CRISPR spacer ------tgtaaagcgtttgacatatttgtcatcctttctgaa Protospacer *** ***********..**************
15. spacer 2.8|126959|36|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP015352 (Bacillus thuringiensis strain MYBT18246 plasmid p142098, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
agctgttgt------tttgacatattcatcatcctttctgaa CRISPR spacer ------tgtaaagcgtttgacatatttgtcatcctttctgaa Protospacer *** ***********..**************
16. spacer 3.35|133557|37|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MN694172 (Marine virus AFVG_250M818, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
tttttaagattttctgttttatcttttatcttgtcta CRISPR spacer tttttaagattttctaatttatcttttaaatctttca Protospacer ***************. *********** *. *..*
17. spacer 8.18|964142|36|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR699117 (Aquicella lusitana strain SGT-39 plasmid 4) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
aattattgcagaggcaatggcaaaaggcttaagcaa--- CRISPR spacer aattattgcagatgcaatggccaaag---tgggtaaaga Protospacer ************ ******** **** *..*.**
18. spacer 1.20|122955|36|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP011133 (Citrobacter amalonaticus Y19 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
agatactttttaacttctttatatatttaataaaaa CRISPR spacer ttcttctttttaactttttaatatatttaatttaat Protospacer * ***********.** *********** **
19. spacer 1.48|124827|36|NC_010321|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031100 (Clostridium botulinum strain CFSAN034202 plasmid p1_CFSAN034202, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
agtattaaaaattaaggaggtttaaaaaatggaaaa CRISPR spacer tttattaaaaatttaggaggtataaaaatgaataaa Protospacer *********** ******* ****** .. ***
20. spacer 1.48|124827|36|NC_010321|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014147 (Clostridium botulinum strain CDC_67190 plasmid pNPD12_2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
agtattaaaaattaaggaggtttaaaaaatggaaaa CRISPR spacer tttattaaaaatttaggaggtataaaaatgaataaa Protospacer *********** ******* ****** .. ***
21. spacer 3.25|132885|35|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MN334766 (Serratia phage PCH45, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
ttttatttcctcctccttaatttttttattttccc CRISPR spacer ctcggttccctcctcctttatttttttatttgttg Protospacer .*. .**.********** ************ ..
22. spacer 1.36|124025|36|NC_010321|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019924 (Clostridium phage phi8074-B1, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
agtactaaagattgaggaggtataaacatggaagag CRISPR spacer aacactaaagttttaggaggtataaacatatggata Protospacer *..******* ** ***************. ... .
23. spacer 5.7|137604|38|NC_010321|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_010507 (Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 plasmid pMRAD08, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.711
aaatactcgccggcgcgaaccttaatcttcaccggcca CRISPR spacer tcatactcgccggcgcggaccttgatcttcgagaggtc Protospacer ***************.*****.******. .* .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
86984 : 130990
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_010321|86984:130990|DBSCAN-SWA TATGGCAAGACAAAGAGGGTCAGTGAAAGAAATAATTAAGGGAAAGAAGTATAAGATAAGCTTTTATATTGGTACTGATGGTAATGGAAAAAGGAAATACTATATTGAAACAATCGAATGTAAAAACAAAGCAGAAGCACAAAAATATTTAGCCAAAAAAATAGTAGAGTATGATACAGGGACATTGCCAATAGATGAAACTAATATTACGGTTAAGGATTATCTTAAAAAATGGCTTGAGACAAAAAAATCCTCTTTAGCACTCAAAACTTACAACGATTATGAACAAAAGATAAGATTGTATATCAATCCTGCTATTGGGAACTATAAGCTTTTAAAATTAACACCTTTAATAATACAAAATATGTACAATAATATGTTAGAGCAGGGCCTATCAGCAAGAACTATAAGATATACACATACAGTTTTAAATGAAGCATTAAAGCAAGCTATTAAGTGGCAGATGTTAAGATATAACCCGTGTGATGGAACTACATTGCCGAAGCAGGCAAAAAAAGAGATGAAAGTTTTAACGCCAGAACAGGCTAAAAAGTTTTTAGAAGCTTGTGTTTATAACAGATGGGGGATATTATTTGAATTGCTACTTATAAGTGGTATGAGACCAAGTGAAGCCTTAGGCCTTAAATGGGAAGATATAGACTGGAAAAATAATCGTATTGCAGTACAAAGGACTTTGACCAGAGTAAAAAACAATTGGCAATTAAAAGAACCAAAGACACCACAAAGCAGAAGAACAATTCCTTTACCAAGAGAAGTTATGAATGACTTAAAGGAGCATAGGAAACAACAGTCAAAGGAAAAGCTTAAGGCAAAAGAATATATCAATTATGATAAGGATAAGAATAAATTTAAACCAGAAGAATGGGAAGAAAAATTGAAAGACCCAAAGGTATATGTCGATTATGGACTTGTATTTGCTACTGAAACAGGAAGACCTCTTGACCTTGCAAATATTAATTATCAATATTTTAAACCTCTTCTAAAAAACGCAGGATTACCAAATATAAGACTTTATGATTTAAGGCATACATGCGCTACACTTCTTTTATTAGCAGGTGAAAATCCTAAAGTAGTAAGTGAAAGATTGGGACATGCGAATATAACATTAACACTTGATACTTATAGCCATGTTTTACCTACTATGCAGGAAGAGGCTACACAAAAGTTAAAACAAATGCTATTTGGAAGTTAATTTTTTTTGATTGCGAGTTGATTGCGAACTGAAAAAAACTTAATGAATCTCAAGCAATTTAACATAATATTACAAATGGCTGAAATCCTTAATACATGCAGGTTGTAAGGACTTGTAACACCTAAAAGAACATCAACAAAAGTAGCTGTTATGGGACTTGTAATCAGCAGGTTGAAGGTTCAAGTCCTTTCGCCAGCTCCATTTTTTTGTCAAAAGTCAAGGTTTTTAAGTACCTTGCTTTTTTATTTTAGTGTTGGTGACAACAAAATGACAACATCTGATCTTTTCGATCTGTGAAGAGCTTATTTGGTTTTTCAGCTGCTTCTCTTTGTATTTGATTTAGTATCATTTTCGGTGTTTTGGTATCTGGTGCTTCAAATATAGCTCTTACCTTCCATGTATTTTATCTTGACACTATCGGTTTGATGCTTAATAATACTAAAGGTAAATCAATTGTGGTAAGTCTTGTCACCCATAGGCACTAAAATAATTGATAGTACCAATGCTAGTGATAGGAACAGACTAAGTATTCGCTTGTTTCTAAAATTCATTCGATGGAGTAGTAACCGATGGCCTTAAACCTTAACTGGAAATTTTATATACAATGATATTATACGAGAGGTGATAATAATGCCTAAAAAAAATGAAATTTGTGTTATAGATAGATTTGAAGGAGATTGGGCGGTCATAGAATGGAAAGATAAGATTTTTAATTTCCCCCGGGAATTACTTCCTAAGAAGGTAAATGAAGGAGACGTACTGATATTTAATGTGGATGTAGATAAAAGCGAAACAGAAAAGCGCAAAAAGGCTATTGAAGATTTGGCGAAGGACCTATTTAAAGATGAATAAAGATGGATAAATGTTAAAAAGGTGCATAATTTGAAGGAGAGGTTTTAGCTATGTACAAGAAGAGATTACTGTTGCCCTTTATATTAATACTATTTGCATTTATATTGACAAATTATACAATATTTGACAATACCCTTACTCATGAAGTTCAACAGGTTTTACAGGATGAAGGAATAAAAAAACAGCACGAAGCAGTTAAAAAATCCGCAACAGACAGTTTAACAGTAAATTATATAGACGTAGGACAAGGAGACAGTATATTTATACAAACTCCATCAGGCAAGACGATGTTAATAGATGCAGGAACACCTGAAATGGGTAGCAAAGTTATAAAGTACATAAAAAGCCAGGGAATTAATAAAATTGACGTACTTATAGGTACCCACCCTCATAATGACCACATAGGAGGTATAGTGGAGATTATAAAAACCTTCAAAATAGGAAAGTTTTATATGCCTAAAGTAACCACTACAACGAGGACATTTGAAGAAGTTCTAAAGGCAGCAAAATCAAAAGGACTTTCGATAAACGTTGCAAAAACAGGAGTAGTAATTGACCTTGGAGATGGTATAATTGCAAAAATGCTTGCGCCAAATAGTTCCCATTACGAGGACTTAAATAATTATAGTGCGGTAATAAAAATTACGTATGGTAATACCTCTTTTTTGTTTACAGGAGATGCTAGTGAACAATCTGAAAAGGAAATGCTAAGTAAAGGATATAATTTAAAAGCCGACGTCTTAAAAATTGGACATCATGGCAGTTCTTCATCTTCTACTTGGGCATTTTTAAAGGCAGTACATCCTAAATATGCTGTTATATCTTGCGGTAAATACAATGACTATGGTCATCCCCACAAAGAAACAATGAAAAAGCTTAGGTCATTAGGAATAATAGTATATAGAACAGATGAATGTGGGACTGTAATTGCAGTAAGTGATGGCAAAACTATAAATTTTAATGTAGAACCAGGTGATAATTTGTCGGGAAGTGAGATTAAAAGATAATTTACTTTAATACATTGCATTTATAAAGTGATATGATATAATAAAAGCATTGAAACCAGTTGAAATAAATTTTTAGGAGGATTATTATGGCTACAGTAAAACCCTTTAAGGCAATAAGGCCTGTACCAGGATTGGCAGATAAAATAGCGTCCTTGCCTTATGACGTCGTAAATACCGAAGAAGCGAGGAATTTGGCGAAAGATAATCCTTATTCATTTCTTCATGTGGATAGAGCAGAAATAGATTTAGCTCCATCTATAAATCCTTACGATGAAATAGTTTATGAAAAAGCGAGAGAAAATTTTGACAGAATGCTTAAAAAAGGACTGTTAATAAAAGATAATGAGGAGAACTGTTACATCTATAGAGAAATAATGAACGGCAGGAGTCAAGTGGGATTGGTAGCGACTGTTTCGATTGATGAGTATTTAGAAGGAATAATTAAAAAGCATGAGCTTACTCTGCCGGAGAAAGAACAGGATAGAATAAATCACATGGATTACTGTGATGCTCACACGAGTCCAGTTTTTTTAACGTACAAAGCCAATCAAGAGCTTAAAAAGTTGTTAAATAGCTGGATGGAGAGCAAAAATCCTATATATGATTTTACATCAGAGGATGAAATAAGACATACAGTATGGATTATAGATGACAAATCCTTAATAAATAAAATTACTTCTGTTTTTAAGGCAATAGACTATCTTTACATTGCAGATGGACATCATCGGGCTGCTGCTTCTGTAAAAGTAGGCTTAAAGAGGCGAGAACAAAATCCTGATTATAAAGGAGATGAGGAGTTTAACTATTTTTTAGCAGTGTTAGTGCCCCATGATGAAGTTTATATCATGCCTTATAATAGGGTGGTAAAAGATTTAAACGGCTATTCTGAAAGTGAATTTATTGAGAAGATAAAAGAGAAATTTGAAGTAGAGAAATGTAATGAAGGCCAGCCTTTCAATCCTTCGCAAAAGCACACTTTTGGCATGTATCTATCAGGGAAGTGGTACAAACTTACTGCCAAAGGAGGTACTTTTAACCCATCGGATCCGATAGAAAGTTTGGATGTGTCCATCTTACAAAAAAATCTGTTAGATCCTATTTTGGGGATAAAAGATCCGAGAACTGATAAAAGGATTGATTTTGTAGGAGGAATTAGAGGCTTAGAAGAATTAGAAAGAAGAGTTAAGGAAGACATGAAAGTGGCTTTTTCTATGCATCCGACAACAGTTGAAGATTTAATTGCTGTTGCCGATGCGAGAATGATAATGCCTCCTAAGTCTACCTGGTTTGAGCCTAAACTAAGAAGCGGATTATTTATTCATGAATTGAGATAAAAGCACCTTTTCTTTTTTAAGGTGCTTTTTATGTGCGCCCGGCATGGGCGATAGCTAGGCGGTGAAAGTCCGCTGTGGGCTTGGTAGTGGGAACCACTAGCCAAAAGCAAGGGTGTCCATCGTGAGGTGGAATCTGAAGGAAGCTTAAGGCAAAATCTCGGTCTGATGAACAAGAACCAGATAAGAGGCTGAATTGGGATGGATGAGTTTGCGTAACAAAACGAAGTCCAACACTACCCGAATCCCATACAGTAAATCTGGCAGATATATGAGATGAAAGTTATCGTTCTTACCCGGGGAGGTCTCAAGGACAAGTCACTAAAGTGAACTCTGAAGTGACAACCCATACAGTGATGTATGGTTGAACCTTGAGAAGTCAGCAGAGGTCATAGTACTTATCTAGTCATGAATAGATAAGGAAGGGCCGAACGTTAGGAGGTTTTGGAAATCTTATGGACTCGAAAGATATGCAGAGACTGCAGACAACTCAACAAAGAGGCTATCCGTTGAATAGAGAAATGGAATTTCAAAAGACAACGGAAGTGCATAGTATATCATCGGCGTCAAAAGATAGAAGAAACGATGTACAAAGAT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34 | Wolbachia_phage(17.65%) | integrase,transposase,tRNA,protease | attL 80557:80602|attR 88352:88397 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
135695 : 195524
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_010321|135695:195524|DBSCAN-SWA 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45 | Wolbachia_phage(19.05%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
308502 : 316439
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_010321|308502:316439|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_010321|308502:316439|314269_315208_+|WP_009053004.1|DBSCAN-SWA MSEREDKIYEDITQLIGNTPMIRLNKIVPENAAEVIVKLESFNPGGSVKDRIALNMIKRAEEEGRLKPGGTIVEATSGNTGIGLAMVSAVKGYKLILVMPDTMSIERRNLLLSYGAELVLTPGAEGMKGAIKKAQEILELNPDYIILDQFKNSANPEIHELTTAKEILKDTNGIVDAFVAGVGTGGTISGVGKVLKQYNKDIKIFAVEPEESPVLSGGKPGPHKIQGIGAGFIPDTLNLDVIDEIIKVKERDAFEMSMKLAKQEGILCGISSGANVFAAIEVANRIGKGKRVVTVLPDTGERYLSMHKFFEY >NC_010321|308502:316439|315284_316439_+|WP_009053003.1|DBSCAN-SWA MSTIYLDNAATTPVDKRVLEAMLPYYSDVFGNPSSLHSHGQEAKKAIEEAREKVAKALGADSEEIYFTSGGSESDNWALKGVAYALKEKGNHIITTEIEHHAVLHTCRYLEKEGFKVTYLPVDEYGLVKPEDLKKAITDKTILVSIMFANNEIGTIEPIEELVKIAHEKNIYFHTDAVQAVGNVPIDVKKLDVDLLSLSAHKIYGPKGVGALYIKKGVKIHSLIQGGTQEKNRRAGTENVPGIVGLGEAIELITKNLDSHINKLTFLRDKLINGILEKIPYTRLNGHPTKRLPGNVNVSFEFIDGESLILNLDMAGICASSGSACTSGSLEPSHVLLAIGLSKELARGSLRLTIGKDNTEEDIDKVLEALPQIVKRLRSISQIV >NC_010321|308502:316439|308502_309198_+|WP_012268958.1|DBSCAN-SWA MGKKIFVVDDEIKILEVVKSYLEHEGFSVITETNGNNVLNTFKKEKPDLVILDLMLPGISGEELCKRIRQFSNVPILMLTAKVQESDKINGFSIGADDYLTKPFSPRELVMRVKAILRRTSDDVPLAEVMSFNNDDLVVDFKAHTVKKKGVVVNLTPNEFKILKFLIRNPNRVFTREELIEKVMGFDYEGYDRTIDAHIKNLRQKIEDDTKNPVYIKTVYGVGYKFGDGNV >NC_010321|308502:316439|309190_310546_+|WP_012268959.1|DBSCAN-SWA MFRNNLRTRTAIVFISIALISIVIVSITTNILIINSFGNYVTKSTDKEFSNIANTLAAVYKSEGGWKSTTGREIGHAAMMEGYGLRLRDKDGKIIWDFSSMSYMMNMMGKWNKKNISEKTLPIIVDEKTVGYVDIIYYGPIMMSDLDFKFLYDISRYNVIATVIAIFIALIISIYVSNYITRPLINITEVAKKLEKGDFTAKVYDIPKEEELFKLTAAINHLGESLKYQEILRKQMTSDIAHELRTPLTTLHSHIEAMLDGVWEPTYERLKSLNEEVLRLINIVKDLETLNKFESDMLKLNKIKFDASELVKSILTNFEASFAEKEQEVVKNIEDNIMLFGDKDRIAQVFVNLISNSNKYTPVGGKIKIDFYKDGDYAVFIVEDNGMGISKDDIPFIFERFYRGEKSRNRETGGSGIGLSIAKAIVLAHGGKINVESEINKGSKFIVKIPL >NC_010321|308502:316439|310620_310869_+|WP_009053008.1|DBSCAN-SWA MMRMMYGWGWGYGIGGFIWSIVWMAIEIGLIVAAIYLIISLFRGTKNRNKERDAIEILKERYARGEISEEEYLERKKRLEEK >NC_010321|308502:316439|311999_314099_+|WP_012268960.1|DBSCAN-SWA MQNNNKSFILKGLDCASCAAKIEEGVKRIEGVTYANCDFVNSKLSVEIDDSYELEKTIKELKKLVKNIEPNVEIIEYENEKIKDDNELLRRGIRYGISAILFTVALIFNLSVYVKFTLFFISYIIVGGEVILTAGKKILKGQVFDEHFLMSIATIGAFVIGEYPESVAVMLFYQIGELLQDIAVDRSKRSIKELMNIRPDYANLKIGYEIKRVSPQEVRPGDVIIVKPGEKIPLDGKVIEGESMVDTSALTGESVLKEVYKGADVLSGFINKNGLLTIEVTREFAESTVSKILGLIEEASSKKAPTEKFMTKFAKYYTPIVVFLALIIAVIPPLIIPAATFKEFIYRALIFLVISCPCALVLSIPLTFFAGIGAASKNGILVKGSNYLEALSNVETVVFDKTGTLTKGVFKVTKIKSVNGMSRDALLEYAAYAESFSNHPIAESILKAYGKEVDRSKIKKYEEISGNGVRANIEGKEVLVGNAKLMKMGNIDCVTGDSTGTIIHVAIDNKYCGYILISDEVKEDSPKAIESLRKMGIKRIVMLTGDNKAISDKIAASLRIDEVYSELFPNEKVGILEKLYANNKKGKLIFVGDGINDAPVLARADVGVAMGGIGSDVAIEAADVVLMTDEPSKLVTAIKISKKTKLIVWENILLALGVKIVVLALGALGVPTMWEAVFADVGVALLAVLNALRVLTGAV >NC_010321|308502:316439|311100_311196_-|WP_081448161.1|DBSCAN-SWA MKCHAPSIEVSSKVMPAKTSAETECTTFKPR >NC_010321|308502:316439|311613_311979_+|WP_009053006.1|DBSCAN-SWA MKEKGNKAEACEVTIIHEDIVNKVKEIMPEETKLYDLAELFKVFGDTTRIKILCALFESEMCVCDIAALLGMSQSAVSHQLRVLKQNKLVKFKKEGKVVYYSLADDHVKKIFEQGFNHINE |
8 | Streptococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
436461 : 484793
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_010321|436461:484793|DBSCAN-SWA 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41 | Bacillus_phage(25.0%) | coat,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
873302 : 881590
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_010321|873302:881590|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_010321|873302:881590|877934_878819_+|WP_012269191.1|DBSCAN-SWA MLKSRFAKVVIAVLLIASFFTFAACGSKQPQSNNSTTTTDNLSGKITIAGSTALQPLAEQAAKMFMEKYPNVVITVQGGGSGTGLTQVVQGAIDIGNSDIFAEEKLDANTAKSLVDHKVAIVGFAVVVNKDVTVDNLTQQQLIDIFTGKITNWKDVGGSDEKITVILRPASSGTRATFKKIVLKGQEEAEGLALTEDSNGAVKKAVADTKGAISYIGLAYIDDTVKVLKYDGVEPTAQNIIDGKYPIWSYEHMYTKGEPTGAVKAFLDFMMSDEVQKELVPKVGFIPVSEMKTK >NC_010321|873302:881590|875778_876483_+|WP_003867940.1|DBSCAN-SWA MAHTVLVIEDEIHILELLRYNLEAAGYKVITSENGKEGLDKAFEGKPDLVILDLMLPDVDGLEICKILKKNDETKNIPIIMLTAKSEEFDKVLGLELGADDYITKPFSVRELLARIKAVLRRTQQPEEEKEEIIKFGDIVIDTGKHLVYKKGKVLELTLKEFELLKLLSQNMGKVLTRDYLLDKVWGYEYAGETRTVDVHIRHLRKKIEDDDKSPVYIETVRGIGYKLNDKGEA >NC_010321|873302:881590|876482_877853_+|WP_012269190.1|DBSCAN-SWA MLKKSYCKLFFINLLGILIVAIFFLGYVPMTKFIFAILLGILVTFFLSYRFIKNIVEPIKEITEITKDIAKGIYSHRLESDSIDEIKELSLAVDSMSYKLKETIEELNDRNAKLEAILKSIVNGVIAFDNNEKILLINDAARKILNIKEKDLIGRHILEIVRNSKLHDFFEDVKKNKNSPSKSLELNVFNKHLKVYTSPILHPISHQNLGFVLIIDDITEMRRLEKIRSEFVANVSHELRTPLTSIRGFIETLRNGAIDNPQARDKFLDIIDFESERLTRLINDILTLSEIENVKEGYPKEEIELDNEIEDILYIMDKVARNKNITLKKDLNCTDLVIKTNKDRFHQMMINLIDNGIKYTPEGGFVKVSTREEGDKIIVTVEDNGIGISKENIPRLFERFYRVDKSRSRKLGGTGLGLAIVKHIVESMKGEIFVESEVGRGTKFIIKFNKTDLTKT >NC_010321|873302:881590|879911_880799_+|WP_003867944.1|DBSCAN-SWA MKSKLYDKIANIYFYVVAVFLILLLVSLISYILYQGRTKLNIDFLTSPPKFMEAGGGIGPQLFNSLQLLIITLIISVPIGLGAGIYMAEYAKPGLLTEIIRLSAETLSSMPSIVVGLFGLLVFVTMTGWGYSLVAGALTLTVLNLPVMTRVSEDSIRSVPNSLREASYALGATKWQTIVKVVVPAAMPGIITGIILTAGRIFGEAAALLYTAGMSSPALNFSNLNPSSPTSPLNIFRPAETLAVYIWKVNSEGLAPDARQIADGAAAVLLLMVLIFNILARWLGNTLYKRMTGEK >NC_010321|873302:881590|874936_875182_+|WP_003867938.1|DBSCAN-SWA MIKASELRDKDVIDINTGEKLGNIIDIEVNLEEGRVEGIVIPKETSFFRFFNKDIEIYLPWESIKKIGTDVILVDFKDREA >NC_010321|873302:881590|880840_881590_+|WP_012269192.1|DBSCAN-SWA MKKIQVKDLDLFYGDVQALKKINLDVEANSVLALIGPSGCGKSTFIRTLNRMNDLIEGVKISGTVLLDGQDVYKEVDVIELRKRVGMVFQKPNPFPMTVYDNVAYGPRIHGIKDKKKLNEIVEKSLKAAALWDEVKDRLDKSALSLSGGQQQRLCIARTLAVEPEVILMDEPTSALDPISTMKIEELINELKNKYTIIIVTHNMQQAGRVSDYTAFFLNGELIESGPTDRVFYNPKDKRTEDYITGRFG >NC_010321|873302:881590|879015_879915_+|WP_003867943.1|DBSCAN-SWA MTVDKNYERKRKLVNSFGKAIVFISALLLIIITVSLFLFVASKGLSTFIKDGISIKEFLFSTTWKPDREVPAVGALQFILGSIYVSVFAIMISAPIGVSSAIFMVEIAKKLGQKILQPAIEIFVGIPSVVYGWVGLTVLVPFISKHFGGLGFSLLAGILVLTIMTLPTITSVSTDAIKSLPTEIREASYALGATRWQTIRHVILPAAKPGILTAIVLGLARAFGEALAVQMVIGNRPVIPKSFLEPMSTITSIITMDMGNTVMGTVWNDALWSLALLLLMISFTFIIVIKLVGRRGMYK >NC_010321|873302:881590|874097_874868_+|WP_004402381.1|DBSCAN-SWA MNNKVEICGVNTSKLPVLKPSKQKELLQRMKNGDKKAREEFINGNLRLVLSVIQRFNNRGEYVDDLFQVGCIGLIKAIDNFDLNQNVKFSTYAVPMIIGEIRRYLRDNTPIRVSRSLRDIAYKALQVRDKLVSENSKEPTVGEIAKELDLPREEVVMALDAIQEPVSLFEPIYHDGGDAIYVMDQVSDDKNMDEVWLEKIALKEAIQKLSEREKMILTMRFFEGKTQMEVAKEIGISQAQVSRLEKAALNHMRKYI >NC_010321|873302:881590|873302_874028_+|WP_003871580.1|DBSCAN-SWA MQLKTKVKIEMLLLWKKILDFLDLSEGIFYIGGSEALPPPLSVEEEIYLISKMEKGDNEAKTVLIERNLRLVVYIAKKFENTGVGIEDLISIGTIGLIKAINTFNPKKKIKLATYASRCIENEILMYLRRNSKTKLEVSFDEPLNVDWDGNELLLSDILGTDNETVYKYIEDEVEKELLTSALKKLPDREKKIIGLRFGLEGGVEKTQKEVADMLGISQSYISRLEKKILKRLKKEMNRLV >NC_010321|873302:881590|875249_875726_+|WP_003867939.1|DBSCAN-SWA MKCPYCGYPDSKVIDSRPTDDNTSIRRRRECLKCGKRFTTYEKVEQLPILVIKKDNRREVYDRDKILKGMIKACEKRPVPIKVLEEITDEIDKRIINSMEREITSTEIGEMVMEKLKNVDEVAYVRFASVYRQFKDINTFMDELKKLLKENETKKEKT |
10 | Bacillus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1374998 : 1429535
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_010321|1374998:1429535|DBSCAN-SWA 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53 | Pseudomonas_phage(13.33%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1748214 : 1756992
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_010321|1748214:1756992|DBSCAN-SWA TTTAAAACTTTAATATTTTCACTTTTCTACCTTCGACTTTTAACTTCCCCTCTGTAAAAAGCTTAACTGCATAAGGTAAAACTTTGTGTTCTACTTCCAGTACTTTTTTTGCAATGGCCTCTGGCGTATCCTCTTCATCAATTTTCACAACTTCTTGAAGAATAATAGGTCCGGTATCAGCACCACTGTCCACAAAGTGAACAGTACAGCCGGTGTATTTTACTCCGTATTCATAGACCGCCTGATGTACCTTCATTCCATAAAATCCTTTGCCACAAAAGGCAGGGATAAGTGAGGGATGTATATTTATTATCTTGTTTTCAAATCTTTCTACAATTTCTCCACTGAGAATTGTCAAAAAACCTGCAAGAATTATTCCATCCGGATTCAATTTTTCAAGAAGTTTTAATAACTCTCTTTGGAAATTTTCTTTCAATTCTTTTTTGGGAAGGCAGTAAGTAGCAATTCCGTGTTTTTTTGCCCTTTCAAGAGCATAAGCTCCTTTTTTATCGCTAATGACGGCAATTATCCTGGCATTTATATATCCTTCTTCAATGGCATCAATTATTGACTGCAAATCAGTCCCGTTACCTGATGCCATCACCACAAGGTTCATAAAATTACACCGCCTTCGCTTTCTACTATCTCCCCTATTACATAAGCTTTTTCACCTATGCCATTTAATTTTTCTAAAGCCTTATCTACATCAGAAGGGTCTACTATAACTACCATGCCAATCCCCATATTAAAAGTGCGATACATTTCTCTTTCTTCAATATCTCCCAATCTTTGAATCAAGTTAAAAATGGTTGGAATTTTCCAACTTCCTTTATTTATTTTTGCAGCTATACTTTTTCTTAGTATTCTTGGAATATTGTCAATAAAACCTCCTCCGGTAATATGAGCCATTCCTTTAATTTTTAACTCTTTTAAAGCCTCTATTGACTTGACATATATTTTTGTAGGGGTAAGGAGTGCATCTCCTAAATTCATGCCAAGCTCTGGTATAAAGTCTTTTACTGAAAAATTGTTTTTCTCAAAAAAGACTTTCCTCACTAAAGAATAGCCATTGCTGTGAATTCCAGAAGAGGCAAGCCCAATTATGGCATCTCCTTCTTTTATTGATTTTGTATCAATCAGCTCTTCTTTTTCTACAATTCCTACACAAAAGCCTGCTAAATCGTACTCTCCTTCTTTATAAAAACCTGGAAGTTCTGCTGTTTCTCCTCCTATCAAAGCACAACCGGCTATTTTACAACCCTCTGCTATTCCTTTGATTACTTCTACTGCCACTTCACTTTTTAACTTTCCAGTAGCAAAATAGTCAAGAAAAAACAAAGGCTTAGCACCAGTTACAATAATGTCATTTACACACATAGCTACAAGGTCTATTCCTACAGTATCGTGTTTGTCCATCATAAAGGCTATTTTAAGTTTTGTCCCAACTCCATCAGTGCTTGACACGATTACAGGGTTTTTGTAATTTTTTATCTCAAAAAGAGCTGCAAATCCCCCAATGCCTTCCAAAACATTGTCTGTCAAAGTCTTTTTTGCAATAGGTTTTATCATTTCCACCAGTTTATTGCCTTCATCTATATTTACCCCAGCATCCTTATAATTCATAATCATACACCTACTTTTTATTTTTTCTCAAAAAGATACTTGCTTCCTTCTTTTAGAACATACATAGGATAGTTGCCATCAAAGCAACCTGTGCAAATAGATTTAAGTCCTACACTTTTTATAAGCCCTTCAATACTTAAAAACTGTAGGCTGTCAGCTCCTATTAATTTGCATATCTCTTCAACTGACATCCTCGTCGCTATCAATTCTTTTTTTGTCGGAGTATCAATTCCAAAGTAGCAGGAATATTTAACAGGAGGTGAACTTATCCTCACATGAACCTCTTTTGCTCCCCCACTTTTTAATAAACTCACCAATCTCTTCATAGTAGTACCTCTAACAATTGAATCATCTATTAAAACTATCCTCTTGCCTTGAACCAATTCTTTTAAGACATTTAGCTTTATCCTCACACCTGTCTCTCTATCCCTTTGGTCGGGAGCAATAAAAGTCCTTCCAATGTATTTATTTTTTATAAGTCCTTCACCCATTGGTATACCTGTTTTGAGAGAGTAACCTCTTGCAGCGGCAATGCCTGAATCTGGAACTGGTACTACCAAGTCTGCATCTACAGGTGCTTCTTCAGCTAATCTTTTCCCCATCTCCAATCGTGTAAAATAAACACTTTTTCCATCTATGACACTGTCAGGTCTAGCAAAATAGATGTATTCAAAAACACAAGGCTTCTTTTTTTCTTCTACTTCTAACTTAACAGAATCTATTCCTTTTCCATCAATTATAACTATTTCTCCTGCTTCTACATCTCGTATCAACTCTGCTCCTATTACGTCAAAGGCACAAGACTCAGAAGATAAGAAATAAGTGTCATCTTTTTTACCTATACAAAGAGGCCTTATACTGTTTACATCTCTTATCCCTATTAATTTATTGTCTGTTAAAATCACCAAAGCGTATGAACCTTTTATTTGTTTTATTGTTTCCAAAAGGGCTTCTATTAAGCCCTTTTGGAAATTCTTTGCAATTAAATGAAGAATTATTTCACTATCAGTTGTAGTTTGAAATATTCTGCCGTCCTCCTCCAATTGGCCTCTTAGCTCTTCTGCGTTTATCAAATTGCCATTATGGGCAAGAGCCATATATTCATTTTTAAAATTAGCAACGAGGGGTTGAGCATTTATAATGTCATTGCTGCCTGTAGTAGAATACCTTACATGGCCTATCCCCATTTTTCCCTCTAATGTCTTTAAATTTTCCTTATTAAAGACCTCGCTGACAAGTCCCAACCCCTTAATACAATTTATTTTTTCGCCATCATAAATAGCTATACCTGAACTTTCCTGCCCTCTGTGCTGCAAGGCTTGTAAGCCATAATAGATATAAGAAGTAACTGAAGTGGACAAACTAAAGGCACCAAAAACACCACATTCCTCTTTTAATTTCTCTCCATTTCCCATTTTATTCTCCCTCTCCAGCTTTCCTCTAAGACTTCTAAAGGAAGGTCTATTATTTTTTTACCATTTACCTCAATTGCAATCTTTTTGCCTTCTACAACTCCTACCTTTTGAGCTGGAACTTGGTATTCATAAGCTATTTTTAATACTTCCTCTACTTTTTCAGGACTTACAGTAATTAATGCTCTTGGTGGAGATTCAGAGAACAACTCTATATCCTCTCTAAGAGAAGTTTGTAGCGAAATTTTTGCACCTTTTTTGCCTGAAATTGCACTTTCAACCAAAGCAGCCGCAAAACCGCCCTCTGATATGTCATGAGAAGAATTAATTAAACCTTTATCAATAAGTTTTAACACCAATTCTTGCAATCTTTTTTCCTCTTCCAAGTCTATTTGAGGTGGTTGCCCTTTTACCATTCCAAAGCAAACTTTAAGATACTCACTTCCTCCAATCTCTCCTTTATTCTCACCTAAAATTATAATTACATCTCTTTCTTTTTTAAAGTCCATTGTACAAATTTTTGATACATCCTCTATAAGGCCTGCCATTCCTATTACAGGAGTAGGATAAATGGCTCCTTCCTCATTTTCATTGTAAAGACTGACATTTCCGCTTACCACAGGGATTTGAAGTGTTTCACAGGCTTTAGCTATTCCAAATATAGAATTTTTTAACTGCCAATATATTTCTTTCTTTTCCGGATTGCCAAAATTCAAACAATCCGTAACCCCTATAGGCTTAGCACCAACCATGCAAAGATTTCGAGCTGCCTCTGCTACAGCAATTTGAGAACCTATATAGGGATCTAAATAACAATATCTACCATTGCAATCCGTTGTCAATGCAATAGCTTTTTTTGTACCTTTTATCCTCACAACAGCTGCATCCATTCCTGGAGTTATTGCTGTGTCTGTCCTCACCATATAATCATATTGACTGTATATCCATTCTTTACTCGCAATATTTAAAGAAGAAATTACATCTTTTAGAGCTTTATTCATATCCTCCGGAGGTTTTACTTCATTTATATTCAACTTATTGACATCTTCTTGCCATTTAGGCACTTCTTCTTCTCTAATATATTGTGGAGCATCCTCTGCTAAAGACTTAGCTGGAACTTCCGCAACTATTTTTCCCTCTTTAATCACTCTTATCATTCCATCATCAGTGATTTTCCCTATTGTGGCGGCATTCAGTCCCCATTTTTTAAATACCTTTTGTACATCTTCTTCCTTACCTTTCTCTACAACAACCAACATCCTCTCTTGAGATTCAGAAAGCATTATTTCATAAGGTGTCATTCCCTTTTCTCTCAAAGGCACTTTATCAAGGTCAAGCTCCATCCCAACTCCACCGCGGGAAGCCATCTCGCAAGAAGAAGAGGTAAGACCTGCCGCTCCCATATCTTGTATAGCAACTACGGCATCTGTTTCAAAAAGTTCTAAACATGCTTCCAAAAGCAGTTTTTCCATAAAAGGGTCGCCAACCTGAACAGAAGGTCTTTTTTCTTCTGATTCCTCGCTTAATTCCTGAGAAGCAAAACTTGCACCTCCAATACCGTCTCTCCCCGTAGTAGCACCTACTATCATAACAGGGTTACCTATACCTTTTGCTATCCCTTTTTTTATCTTGTCTTTTTCTACTATTCCTACACACATCGCATTTACTAAAGGATTTCCTTTGTAACTTTCTTCAAAATAGGTATCCCCACCTACTGTAGGAATTCCTATGCAATTTCCATAATCCGCTATACCGGCTACTACGTTTTCGATGAGATATTTAGTCCTTTTATCATCAGGAATTCCAAATCTCAAAGAATCTAAAAGAGCAATTGGCCTTGCCCCCATTGTGAATATATCTCTTATTATTCCCCCGACACCTGTGGCTGCTCCTTGATAGGGTTCAATCGCAGAAGGGTGGTTATGGCTTTCTATCTTCATCACAACTGCCAAATTATCTCCAATA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_010321|1748214:1756992|1748214_1748829_-|WP_003866805.1|DBSCAN-SWA MNLVVMASGNGTDLQSIIDAIEEGYINARIIAVISDKKGAYALERAKKHGIATYCLPKKELKENFQRELLKLLEKLNPDGIILAGFLTILSGEIVERFENKIINIHPSLIPAFCGKGFYGMKVHQAVYEYGVKYTGCTVHFVDSGADTGPIILQEVVKIDEEDTPEAIAKKVLEVEHKVLPYAVKLFTEGKLKVEGRKVKILKF >NC_010321|1748214:1756992|1748825_1749836_-|WP_003866806.1|DBSCAN-SWA MNYKDAGVNIDEGNKLVEMIKPIAKKTLTDNVLEGIGGFAALFEIKNYKNPVIVSSTDGVGTKLKIAFMMDKHDTVGIDLVAMCVNDIIVTGAKPLFFLDYFATGKLKSEVAVEVIKGIAEGCKIAGCALIGGETAELPGFYKEGEYDLAGFCVGIVEKEELIDTKSIKEGDAIIGLASSGIHSNGYSLVRKVFFEKNNFSVKDFIPELGMNLGDALLTPTKIYVKSIEALKELKIKGMAHITGGGFIDNIPRILRKSIAAKINKGSWKIPTIFNLIQRLGDIEEREMYRTFNMGIGMVVIVDPSDVDKALEKLNGIGEKAYVIGEIVESEGGVIL >NC_010321|1748214:1756992|1751229_1753431_-|WP_012269567.1|DBSCAN-SWA MDKIWRELGLTDEEYEKIISILGREPNITEIGMYSVMWSEHCAYKNSKPLLKYLPTKGERVIQGPGENAGVLDIGDNLAVVMKIESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIFTMGARPIALLDSLRFGIPDDKRTKYLIENVVAGIADYGNCIGIPTVGGDTYFEESYKGNPLVNAMCVGIVEKDKIKKGIAKGIGNPVMIVGATTGRDGIGGASFASQELSEESEEKRPSVQVGDPFMEKLLLEACLELFETDAVVAIQDMGAAGLTSSSCEMASRGGVGMELDLDKVPLREKGMTPYEIMLSESQERMLVVVEKGKEEDVQKVFKKWGLNAATIGKITDDGMIRVIKEGKIVAEVPAKSLAEDAPQYIREEEVPKWQEDVNKLNINEVKPPEDMNKALKDVISSLNIASKEWIYSQYDYMVRTDTAITPGMDAAVVRIKGTKKAIALTTDCNGRYCYLDPYIGSQIAVAEAARNLCMVGAKPIGVTDCLNFGNPEKKEIYWQLKNSIFGIAKACETLQIPVVSGNVSLYNENEEGAIYPTPVIGMAGLIEDVSKICTMDFKKERDVIIILGENKGEIGGSEYLKVCFGMVKGQPPQIDLEEEKRLQELVLKLIDKGLINSSHDISEGGFAAALVESAISGKKGAKISLQTSLREDIELFSESPPRALITVSPEKVEEVLKIAYEYQVPAQKVGVVEGKKIAIEVNGKKIIDLPLEVLEESWRGRIKWEMERN >NC_010321|1748214:1756992|1753433_1754108_-|WP_003866809.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDVDCYYAVKDGLGEEVEYVWHQEKNLSKYDVIMLPGGFSYGDYLRAGAIARFSPVMEAVREEAEKGKFIIGICNGFQILTEAGLLPGALRKNEGLKFICNTVSIIVENDKTPFTTRLKKGQEILLPIAHGEGNYYVDDKTLKELKENNQIVFRYKENINGSVERIAGVINKKGNVLGMMPHPERAYAPLLGNTDGLYILGSIMDNFVKGGV >NC_010321|1748214:1756992|1755609_1756992_-|WP_003866813.1|DBSCAN-SWA MEKVSKVRNKNSLENLANRIWRLENYNTNVKTEILAGITTFITMAYIMFVNPIILKEAGMDAGAVFVATCLSAAIGTFMMAFYANYPFAQAPGMGLNAFFTYTVVLTMGYTWQQALAAVFFSGIIFILITLFGIREMIVDAIPMSLKYAVSGGIGLFIAFIGLKNAGIIVANQATYIGFGDLTNPGTLLAIAGLFITAILMSRNIKGSILLGILITTVLGLFTGIVKLPSDFSVIKMPPSLAPTFLKLDIKGLLGIGENIGFISLVTSVLYVVLSFAFVDLFDTIGTFIGTGSKAGMLDENGKMPNMKKGLMSDAIATTIGSLLGTSTVTTYVESAAGIAEGGRTGLTAFVTGILFLVALFFSPIALLVPTEATAPALIIVGVLMMGSIKKINFEDFTEAMPAFLTIIAMPFTFSIANGIAAGLIAYPIVKIASGKAKEIHPMVYFLAILFILRFITLSE >NC_010321|1748214:1756992|1749853_1751251_-|WP_012269566.1|DBSCAN-SWA MGNGEKLKEECGVFGAFSLSTSVTSYIYYGLQALQHRGQESSGIAIYDGEKINCIKGLGLVSEVFNKENLKTLEGKMGIGHVRYSTTGSNDIINAQPLVANFKNEYMALAHNGNLINAEELRGQLEEDGRIFQTTTDSEIILHLIAKNFQKGLIEALLETIKQIKGSYALVILTDNKLIGIRDVNSIRPLCIGKKDDTYFLSSESCAFDVIGAELIRDVEAGEIVIIDGKGIDSVKLEVEEKKKPCVFEYIYFARPDSVIDGKSVYFTRLEMGKRLAEEAPVDADLVVPVPDSGIAAARGYSLKTGIPMGEGLIKNKYIGRTFIAPDQRDRETGVRIKLNVLKELVQGKRIVLIDDSIVRGTTMKRLVSLLKSGGAKEVHVRISSPPVKYSCYFGIDTPTKKELIATRMSVEEICKLIGADSLQFLSIEGLIKSVGLKSICTGCFDGNYPMYVLKEGSKYLFEKK >NC_010321|1748214:1756992|1754110_1754359_-|WP_003866810.1|DBSCAN-SWA MLIAKVYITLKKGILDPQGKAVKGALYSLGYEEVKEVRVGKYIELTFEDGDLSLLKDKVDEMCKRILTNPIIEDYTFEIVEG >NC_010321|1748214:1756992|1755087_1755549_-|WP_003866812.1|DBSCAN-SWA MPKVAIVVGSKSDLPVVERCTKILEELEIPYDVKVLSAHRTPFETQEFAVNADKYYDIIIAGAGKAAHLPGVIASYTLLPVIGLPIKSSILDGLDSLLSIVQMPKGVPVATVAIDGAENAALLACHILSLKYTYLKKTLADYREKMAEEVLNN >NC_010321|1748214:1756992|1754360_1755068_-|WP_003866811.1|DBSCAN-SWA MEKRELLYEGKAKKVYKTDEENLYIIEYKDDATAFNGLKKGTIAEKGIVNNKVSAILFALLDKNNVPTHYVKRLSDREMLVKKVEIFPLEVIVRNYAAGSICKRLGLEEGLKFKTPVLEFSYKNDELKDPMINEYHIQALELATKEEIEIMTGMTFKVNEILSEYFLSKDIILVDFKLEFGKSSEGILLADEISPDTCRFWDKNTMEKLDKDRFRKDLGKVEEAYLEILKRLGGM |
9 | Synechococcus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2079923 : 2114923
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_010321|2079923:2114923|DBSCAN-SWA 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30 | Staphylococcus_phage(25.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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