Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_012466 | Streptococcus pneumoniae JJA, complete genome | 4 crisprs | DEDDh,cas3,DinG,RT | 0 | 0 | 10 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_012466_1 | 108337-108432 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_012466_1
|
1 spacers
spacers of NC_012466_1
>1.1|108361|48|NC_012466|CRISPRCasFinder TTTTTCTACACATACATTGTACATCTAAAAGAAAGCCCTGTCAAGAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_012466_1
The CRISPR arrays of NC_012466_1 >merge|NC_012466|1|108337-108432|CRISPRCasFinder AATGTGTAAGATTTTTATATATAATTTTTCTACACATACATTGTACATCTAAAAGAAAGCCCTGTCAAGAGAAATGTGTAAAATTTTTATATATAA >NC_012466|1|1|108337-108432|CRISPRCasFinder AATGTGTAAGATTTTTATATATAA TTTTTCTACACATACATTGTACATCTAAAAGAAAGCCCTGTCAAGAGA AATGTGTAAAATTTTTATATATAA
>NC_012466.1|WP_000273864.1|107992_108319_-|PadR-family-transcriptional-regulator MYFPTSSALIEFLILAVLEQGDSYGYEISQTIKLIANIKESTLYPILKKLEGNSFLTTYSREFQGRMRKYYSLTNGGIEQLLTLKDEWTLYTDTINGIIEGSIRHDKN >NC_012466.1|WP_000198694.1|107412_108006_-|DUF1700-domain-containing-protein MTRTEYLTQLELYLKKLPEADRIEAMDYFRELFDDAGVEGEEELIASLGTPKEAAHEVLSNLLDKKINEAPAQKNNRQILHIALLALLAAPIGIPLGIAILVTLFAILVAALTVILAFFAVSILGIIGGFLFLVESFTVLAQAKSAFILIFGSGLLAIGASSLVLLGISYVTRFFGLLIVRLVQFVLKKGKRGNQHA >NC_012466.1|WP_001233696.1|106508_107420_-|DUF4097-domain-containing-protein MRKWTKGFLIFGVVTTVIGFILLFVGIQSDGIKSLLSMSKEPVYDSRTEKLTFGKEVENLEITLHQHTLTITDSFDDQIHISYHPSLSAHHDLITNQNDRTLSLTDKKLSETPFLSSGIGGILHIASSYSSRFEEVILRLPKGRTLKGINISANRGQTTIINASLENATLNTNSYILRIEGSRIKNSKLTTPNIVNIFDTVLTDSQLESTENHFHAENIQVHGKVELTAKDYLRIILDQKESQRINWDISSNYGSIFQFTREKPESRGTELSNPYKTEKTDVKDQLIARSDDNIDLISTPSRR >NC_012466.1|WP_000808476.1|105381_106446_-|hypothetical-protein MKQEWFESNNFVKTTSKNKPEEQAQEVADKAEETIADFDTPIEKNTQLEEEVSQAEVELESQQEEKIETPEGGEARTEIEEKKASNSTEEEPDLSKETEKVTIAEESQEALPQQKATTKEPLLISKSLESPYIPDQAPKSRDKWKEQVLDFWSWLVEAIKSPTSKLETSITHSYTAFLLLILFSASSFFFSIYHIKHAYYGHIASINSRFPEQLAPLTLFSIISILVATTLFFFSFLLGSFVVRRFIHQEKDWTLDKVLQQYSQLLAIPIFLTAIASFFAFFDSLRFTALLCVISIGIILLASLHIITRPSQASETDSFYQLFLSVLVNGVIILLFFVAEVALIGDYLRILAFL >NC_012466.1|WP_078153199.1|104296_105310_+|DUF4299-domain-containing-protein MKAWIRQLLYKIKQSSGAVFLCFVLKNLKFVFVSFRKIRYTVCKRFQRSPVMAKTFFIPNKQSILGEQEILNAKSILALLDGLESHSYDVVYLRQPLNRLEYIECAIVGQSQFLFKVSYADGQKAYRVDLPDLLTKTDWQIIKSFLDALLAYTGTDIEGLDGFDFEAYFQASIQAYLADPVARFTICQGIFNPIFFSRENLKSFLEADGLAQFEARVRAVQETDAYFARVSFYQDGEGKVHGVYHLAQGVKTVLPREPFVPAAYIEQLVDKEVQWEIDLVQITGDDSKPEDYESIARLDYAKFLEVLPPSFYHQLDANQIEIQPILVQDFKTLAQEK >NC_012466.1|WP_001030031.1|103341_104328_+|rhodanese-related-sulfurtransferase MAKDIRVLLYYLYTPIENAEQFAADHLAFCKSIGLKGRILVADEGINGTVSGDYETTQKYMDYVHSLPGMEELWFKIDEENEQAFKKMFVRYKKEIVHLGLEDNDFDNDINPLETTGAYLSPKEFKEALLDKDTVVLDTRNDYEYDLGHFRGAIRPDIRNFRELPQWVRDNKEKFMDKRVVVYCTGGVRCEKFSGWMVREGYKDVGQLHGGIATYGKDPEVQGELWDGKMYVFDERIAVDVNHVNPTIVGKDWFDGTPCERYVNCGNPFCNRRILTSEENEDKYLRGCSHECRVHPRNRYVSKNELTQAEVIERLAAIGESLDQAATV >NC_012466.1|WP_000800407.1|101594_103070_+|DUF3502-domain-containing-protein MKNWKKYAFASASVVALAAGLAACGNLTGNSKKAADSGDKPVIKMYQIGDKPDNLDELLANANKIIEEKVGAKLDIQYLGWGDYGKKMSVITSSGENYDIAFADNYIVNAQKGAYADLTELYKKEGKDLYKALDPAYIKGNTVNGKIYAVPVAANVASSQNFAFNGTLLAKYGIDISGVTSYETLEPVLKQIKEKAPDVVPFAIGKVFIPSDNFDYPVANGLPFVIDLEGDTTKVVNRYEVPRFKEHLKTLHKFYEAGYIPKDVATSDTSFDLQQDTWFVREETVGPADYGNSLLSRVANKDIQIKPITNFIKKNQTTQVANFVISNNSKNKEKSMEILNLLNTNPELLNGLVYGPEGKNWEKIEGKENRVRVLDGYKGNTHMGGWNTGNNWILYINENVTDQQIENSKKELAEAKESPALGFIFNTDNVKSEISAIANTMQQFDTAINTGTVDPDKAIPELMEKLKSEGAYEKVLNEMQKQYDEFLKNKK >NC_012466.1|WP_153228097.1|101410_101551_-|hypothetical-protein MILYSMKIKEQTRKLAAGCSKHCFEVVDKTDEVSYIYLRQGDVDAV >NC_012466.1|WP_001075102.1|100413_101337_+|carbohydrate-ABC-transporter-permease MAKKKIKKEKIDNVGIHSFSKKADIFFSIISGLIALSCILPFVFVIIISVTDEKSLLQYGYSFFPSQFGLDGFEFLAQFKDKILQALFISVFVTVVGTLTNVFITTTYAYAISRTTFKYRRFFTIFVLLSMLFNAGLVPGYIMVTRVLQLGDTVWALIVPMLLSPFNIILMRSFFKKTIPEAILESARIDGASEARIFFQICLPLSLPGIATITLLTALGFWNDWFNALLYIKSDNLYPLQYLLMQIQQNMDYIAKAVGLTGQLGVALPKETGRMAMVVVATLPIAILYPFFQRYFVKGLTIGGVKE >NC_012466.1|WP_000714582.1|99470_100400_+|sugar-ABC-transporter-permease MKKFSKTLRDNWIFLLMVLPGALWLILFFYIPVFGNVVAFKDYHMTSNGFIDSIINSKWVGLDNFRFLFSSRDAFIITRNTVLYNLGFIFLGLVVSVGIAIILSELRSKRMVKIFQTSMLFPYFLSWVIISFFTDAFLNIDKGVFNHLLESLGLKEVNFYADLGIWPYLLLFLGIWKGFGYSSVMYYATIMGIDPTYYEAATVDGASKWQRIRNVTIPQLTPLVTVLTILAVGNIFRADFGLFYQIPHNAGQLYNVTNVLDVYVFNGLTQTADIGMAAAAGLYQSVVGLILVILSNLLARRVDPNSALF >NC_012466.1|WP_000744908.1|108457_109624_-|CynX/NimT-family-MFS-transporter MKKQSLFFVPGIILIGVSLRTPFTVLPIILGNISQGLEVEVSSLGVLTSLPLLMFTLFSPFSTRLAQKIGLEHLFTYSLFFLTIGSLIRLINLPLLYLGTLMVGASVAVINVLLPSLIQANQPKKIGFLTTLYVTSMGIATALASYLAVPITQASSWKGLILLLTLLCLATFLVWLPNHRYNHRLAPQTKQKSQIKVMRNKQVWAIIIFSGFQSLIFYTVMTWLPTMSIHAGLSSHEAGLLTSILSLISIPFSMTIPSLTTSLSTRNRQLMLTLVSLAGVVGISMLFFPINNFIYWLTIHLLIGTATSALFPYLMVNFSLKTSAPEKTAQLSGLSQTGGYILAAFGPTLFGYSFDLFHSWVPAVAALLLIYILMTVALFTVDRADKIL >NC_012466.1|WP_000096208.1|109681_110839_+|glycosyltransferase-family-2-protein MSSKVSGFQDKNGKVLKIMIEWWKEKFRRVVVTQNVESLLVSIVISAYNEEKYLPGLIEDLKNQTYPKENVEILFINAMSTDGTTAIIQQFIKEDTEFNSIRLYNNPKKNQASGFNLGVKHSVGDLILKIDAHSKVTESFVMNNVAIIQQGEFVCGGPRPTIVEGKGKWAETLHLVEENMFGSSIANYRNSSEDRYVSSIFHGMYKREVFQKVGLVNEQLGRTEDNDIHYRIREHGYKIRYSPSILSYQYIRPTFKKMLHQKYSNGLWIGLTSHVQFKCLSLFHYVPCLFVLSLVFSLALLPITFVFITLLLGAYFLLLSLLTLLTLLKHKNGFLIVMPFLLFSIHFAYGLGTIVGLIRGFKWKKEYKRTIIYLDKISQINKNML >NC_012466.1|WP_001035700.1|110880_112731_+|polysaccharide-biosynthesis-protein MNKKLTDYVIDLVEILNKQQKQVFWGIFDIFSMVVSIIVSYILFYGLINPAPVDYIIYTSLAFLFYQLMIGFWGLNASISRYSKITDFMKIFFGVTASSVLSYSICYAFLPLFSIRFIILFILLSTFLILLPRITWQLIYSRRKKGSGDGEHRRTFLIGAGDGGALFMDSYQHPTSELELVGILDKDSKKKGQKLGGIPVLGSYDNLPELAKRHQIERVIVAIPSLDPSEYERILQMCNKLGVKCYKMPKVETVVQGLHQAGTGFQKIDITDLLGRQEIRLDESRLGAELTGKTILVTGAGGSIGSEICRQVSRFNPERIVLLGHGENSIYLVYHELIRKFQGIDYVPVIADIQDYDRLLQVFEQYKPAIVYHAAAHKHVPMMERNPKEAFKNNIRGTYNVAKAVDEAKVSKMVMISTDKAVNPPNVMGATKRVAELIVTGFNQRSQSTYCAVRFGNVLGSRGSVIPVFERQIAEGGPVTVTDFRMTRYFMTIPEASRLVIHAGAYAKDGEVFILDMGKPVKIYDLAKKMVLLSGHTESEIPIVEVGIRPGEKLYEELLVSTELVDNQVMDKIFVGKVNVMPLESINQKIGEFRTLSGDELKQAIIAFANQTTHIE >NC_012466.1|WP_000200890.1|113036_113669_-|HAD-family-hydrolase MTSITAIFFDLDGTLVDSSIGIHNAFTYTFKELGVPSPDAKTIRGFMGPPLESSFATCLSKDQISEAMQIYRSYYKAKGIYEAQLFPQIIDLLEELSSSYPLYITTTKNTSTAQDMAKNLEIHHFFDGIYGSSPEAPHKADVIHQALQTHQLAPEQAIIIGDTKFDMLGARETGIQKLAVTWGFGEQADLLNYQPDYIAHKPLEVLAYFQ >NC_012466.1|WP_000500038.1|113690_114563_-|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-alpha MFYSIKELVEQADLDFQGNVAELMITTEFELTGREREEVFLLMERNLEVMKASVQLGLNENKSRSGLTGGDAAKLDHYIENGKTLSDYTILSAARNAIAVNEHNAKMGLVCATPTAGSAGCLPSVLTAAIEKLDLSHEQQLDFLFAAGAFGLVIANNASISGAEGGCQAEVGSASAMSAAALTLAAGGTPYQASQAIAFVIKNMLGLICDPVAGLVEVPCVKRNAMGASFAFIAADMALAGIESKIPVDEVIDAMYQVGASMPTAFRETAEGGLATTPTGRRLQKEIFGE >NC_012466.1|WP_000838912.1|114571_115243_-|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-beta MKSLRFQSVFDIIGPVMIGPSSSHTAGAVRIGKIVSSIFDDTPTEVEFQLFNSFAKTYRGHGTDLALVAGILGMDTDDPEIPNSLEIAHKRGIKIVWTIQKDSNAPHPNTTKITVKNAHKTISVTGISIGGGNIQVTELNGFAVSLNMNTPTIIIVHQDIPGMIALVTEALSRYGINIAQMNVTREKAGEKAIMIIEVDSRNCDEAIEEIRKIPHLHNVNFFK >NC_012466.1|WP_000836450.1|115484_116072_+|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MKSITKKIKATLAGVAALFAVFAPSFVSAQESSTYTVKEGDTLSEIAETHNTTVEKLAENNHIDNIHLIYVGQELVIDGPVAPVATPAPATYAAPAAQDETVSAPVAETPVVSETVVSTVSGSEAEAKEWIAQKESGGSYTATNGRYIGRYQLTDSYLNGDYSAENQERVADAYVAGRYGSWTAAKNFWLNNGWY >NC_012466.1|WP_001189279.1|116123_116444_-|hypothetical-protein MQRLEVYKNYQHLYDLRIAILLNLSTLYLYNQDKNMCKQICYTLLEDAKNKKSYDRLAICYVRIGICTDDSKLIQKGFSLLELTEETSMLSHLKKEVEIYYQAKER >NC_012466.1|WP_000227119.1|116894_117143_+|lactococcin-972-family-bacteriocin MVCSILASTSVLAVWVDGGQWNYGVGWSGNFGYSDYLHSTRSHTATVKDGNKFSKDRAEAEAWARASIFKFPPTGMEYFYGF >NC_012466.1|WP_032495971.1|117197_119306_+|bacteriocin-associated-integral-membrane-family-protein MKKISHLCMLLLLLCTTFFVLNVNVTREIVRIQEMGKTTYSFDLYLKDVTKPTETILQFFEEVASQDKVSIIKVDNGDEVVKSGVFDKDTFPYQEFGISSLDFTTDGEGVYSNKEISNKLGTIPTFLKAKPIQLMTFQTYIKDTSRSLNGRYTITSTQEMDKDRIVQKWSDFFKIDQATLLEPTYKSAVEVINRDLLLSAIVFVLAILLLVLVTVYQPMMEMKRVGVQKLLGFQDRAVLADVVKGNLYLLLGGALVINLGVFFLLDYKPKDLFPMLWLSHFLLLQLYLFISWLTYLLIQKMTISSLLKGFSSFKFGLLFNYLMKIGTTILLTVLLVGVGKSLEQENKELDYQKQWISQGNYLTLETFQLNDNLWQEQLAGSGKALDYFYRFYQDLVEKTQAGYVQSSSLPVKNFVQSEQIQQYQLTDTVDVYYANRNFLKSKGFKLPDTGIKKVILMPASTKGEEDKNQLLGKLIAFHSMKYEEQQKRTIEEMDVEIAYYEGDWSFFPYSDKRKENLSNPIISLVNDSDMMWDEKASLSTTGLNNPIKIENTVQHQKEITELVEKLSDGNYLKFSSIQAIQQEKVDSYRDAVRNFNLLFALFGLFSMMISYFLLVITFLLKRRDIITKKFMGWKLVDRYRPLLVLLLLGYSLPLLVLIFFAHAFLPLLLFAGFTCLDILFVLALASRMEKRSLVELLKGGIL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_012466_2 | 1033713-1033825 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_012466_2
|
1 spacers
spacers of NC_012466_2
>2.1|1033748|43|NC_012466|CRISPRCasFinder ACCACCTGTTAACGACATCCCAGAATATACTGAGCCAGTAGGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_012466_2
The CRISPR arrays of NC_012466_2 >merge|NC_012466|2|1033713-1033825|CRISPRCasFinder ACAACAGGAGTAGATGAAAATGGAAACTTGATTGAACCACCTGTTAACGACATCCCAGAATATACTGAGCCAGTAGGTACAACAGGAGTGGATGAAAATGGAAACTTGATTGA >NC_012466|2|2|1033713-1033825|CRISPRCasFinder ACAACAGGAGTAGATGAAAATGGAAACTTGATTGA ACCACCTGTTAACGACATCCCAGAATATACTGAGCCAGTAGGT ACAACAGGAGTGGATGAAAATGGAAACTTGATTGA
>NC_012466.1|WP_000417163.1|1026535_1033015_+|YSIRK-type-signal-peptide-containing-protein MEKYFGEKQERFSFRKLSVGLVSATISSLFFMSVLASSSVDAQETAGVHYKYVADSELSSEEKKQLVYDIPTYVENDDETYYLVYKLNSQNQLAELPNTGSKNERQALVAGASLAALGILIFAVSKKKVKNKTVLHLVLVAGMGNGVLVSVHALENHLLLNYNTDYELTSGEKLPLPKEISGYTYIGYIKEGKTTSDFEVSNQEKSAATPTKQQKVDYNVTPNFVDHPSTVQAIQEQTPVSSTKPTEVQVVEKPFSTELINPRKEEKQSSDSQEQLAEHKNLETKKEEKISPKEKTGVNTLNPQDEVLSGQLNKPELLYRDETIETKIDFQEEIQENPDLAEGTVRVKQEGALGKKVEIVRIFSVNNEEVSREIISTSTTAPVSRIVEKGTKKAQVIKEQAETGAEHKEVQSGAIVEPAIQPELPAAVLTDKGESAVQPELPEAVVSDKGVPEVQPALPEAVMTDKGDPEQVEPLPEYTGVQAGAIVEPEKVEPEYAGVQAGAIVEPEQVAPLPEYTGVQAGAIVEPEKVEAPKEYTGVQAGAIVEPEKVEAPKEYTGVQAGAIVEPEKVEPSKEYTGVQAGAIVEPEQIAPLPEYTGVQAGAIVEPEKVEALKEYTGKIEQPSAEDTKPNNENTNTPEEMSIQKKSSALINMNFITDSSKVTGVGSATFIAPNVLLTVAHNFINNSTDNTTGEFRGDKSKNVYEWVTPDGQKGTFTANNIHFYNKKDYPKGFIYDLAVIKLPETTGREHVELVKNYSKVNLNDKLNVHGYPARKYTHLKDATVEMEQEYANNTYGVQYQGGNPGMSGGGIFNANGEVIGVHQNGAQNRSGGLILSPTQLAWIKSIIAGNEIPPVYDELYRHKDEKKDDAKDEKEVIKKLELRNISSVELYSKDGNKYRHVTSLASLPSNAENYFMKVKSENFKDVMLPVTSITNDTKDNRDVYKIVASANSLIQHENNNVLENYTYYLPKTQQSETGVYTSFKNLVDAMNSNPNGTFRLGATMDAREVELPDGQESYVNNVFHGILVGTNNEKYYAIYNLKKPLFGELNGATVEKLSLKDVNISAKDDTATLAKEANNNTHIDNVHADGAIAGERSIGGLVSQVNNSTISNSSYTGRITNTYKTVASYQIGGLVGKLSGPRGLIDKSFASIDLSSNATQGDQSIGGIVGAVENSALISNSYAEGNLNNVQRFANVGGVVGNLWDPVGGLEKSGRLSNVLSDVNVTNGNAIAGYNFNGIKANGTYSNKNNKVVNVVQEDDEILTKDSTVQRGEVLEDAQIKEKKATFVSKNTIKTEDFNFSSRYVTDYKNLENADSSKEKVYKNIEKLLPFYNRETIVKYGNLVETSSNLYNKELLSVVPMKDKEVISDINKNKSSINKLLLYYADNTSETLNVNYQTDFSNVAEYRIGGTNLIYTPNTLLRNYQNILDEVLPALNSVEYKSEAIRKVLDVSKDVSLTELYLEEQFNTTKTNLKDSLTKLLTADAAIAENNNKVIDNYVIEKIKNNKEALLLGLTYLERWYDFKYRDTKAKDLVMYHLDFFGKSNSSALDNVIELGKSGYNNLLAKNNVITYNVLLAKNYKTNNLFDALEKYRKAFVPDKTNNEWFKEQTKAYIVEEKSTIKEVSDKQSIAGSPYSIGVYDRLTSPSWKYPSMVLPLLTLPEKSVFIIANISTIGFGAYDRYRSKEHPAGTDLNDYVEKKAKEAAVRFRDHYDYWYRILDDKNKEKLYRSVLVYDAFRFGTDEKEDKDTYQATFETNHPAIKHFFGPAGNNVVHNSNGAYATGDAFYYMAYRMLDKDGAVTYTHEMTHNSDREIYLGGYGRRNGLGPEFYAKGLLQAPDHPNDPTVTINSILKYDQSEESTRLQVADPTQRFGSVDDLNKYMHNMFDVIYMLEILEGKAVAKLDTNQKYDLLRKIENEYKPDPDGNSVYATNVVRRLKPEELTKLTTFNSLIEHDIITRRGYVDEATYKRNGYYTINLFSPIYSALSSKIGTPGDLMGRRIAFELLAAKGYKDGMVPYISNQYEKEAKAQGKVITSYGKQIGLVTDEIVLSKVFNNQYNSWIDFKKDMYKEREDKFGKLNKVSFIDPNGSWARQQKVTIDNINRLEKMIEDAVKFDAEDEVAKLYPETNSRVLKLKKAIFKAYLDQTGDFRSSIFENKK >NC_012466.1|WP_000174775.1|1025148_1026327_+|hypothetical-protein MTLPVRKSLHDAVLQASKADTWEQATKEWNEVSLIFNGIGRSNCVCGNAIKYAYELFNGVTGQRLFPIGSDCVRHFHRLSLDQQLEEEEKLLRKVENLTRKAQKKEKIKVNKSDFDERLLKWLWEKGVFKPNRGNQFAPERDYQLFLEVFQGGSWTKAEPKKKARMEEVLEKCIKPFLLGKSDDQLYLVKLGKEKIDYEQELRIQAEKERKKRDKIAKQYADNLVLAMGPAERAYQDYFGFTETLTQEERKWEKILFGKNRAERAIKAKQYQKELEKDQRIASQDPIERKQKQTWLLNSYFRELPEEKARFSRLLLEYRKSGEVPFSTEYLSDHLIDFFYKMKAFEFEIAPEQVRDFLKKSLQEDHRSSAQGSWIEGILLNCLKPFLERLVI >NC_012466.1|WP_000767229.1|1021283_1024934_+|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddA MKLIPFLSEEEIQKLQEAEANSSKEQKKTAEQIEAIYTSGQNILVSASAGSGKTFVMAERILDQLARGVEISQLFISTFTVKAATELKERLEKKISKKIQETDDVDLKQHLGRQLADLPNAAIGTMDSFTQKFLGKHGYLLDIAPNFRILQNQSEQLLLENEVFHEVFEAHYQGKQKESFSHLLKNFAGRGKDERGLRQQVYKIYDFLQSTSNPQKWLSESFLKGFEKADFTSEKEKLTEQIKQALWDLESFFRYHLDNDAKEFAKAAYLENVQLILDEIGSLNQEFDSQAYQAVLARVVAISKEKNGRALTNASRKADLKPLADAYNEERKTQFTKLGQLSDQIAILDYQERYHGDTWKLAKTFQSFMSDFVEAYRQRKRQENAFEFADISHYTIEILENFPQVRESYQERFHEVMVDEYQDTNHIQERMLELLSNGHNRFMVGDIKQSIYRFRQADPQIFNEKFQRYAQNPQEGKLILLKANFRSSSEVLSATNDVFERLMDQEVGEINYDNKHQLVFANTKLTPNPDNKAEFLLYDKDDTGEEEESQTETKLTGEMRLVIKEILKLHQEKGVAFKEIALLTSSRSRNDQILLALSEYGIPVKTDGEQNNYLQSLEVQVMLDTLRVIHNPLQDYALVALMKSPMFGFDEDELARLSLQKAEDKVHENLYEKLVNAQKMASSQKGLIHTALAEKLKQFMDILASWRLYAKTHSLYDLIWKIYNDRFYYDYVGALPNGPARQANLYALALRADQFEKSNFKGLSRFIRMIDQVLEAQHDLASVAVAPPKDAVELMTIHKSKGLEFPYVFILNMDQDFNKQDSMSEVILSRQNGLGVKYIAKMETGAVEDHYPKTIKLSIPSLTYRQNEEELQLASYSEQMRLLYVAMTRAEKKLYLVGKGSREKLEVKQYPAAKNGKLNSNTRLQARNFQDWLWAISKVFTKDKLNFSYRFIGEDQLTREAIGELETKSPLQDSSQADNRQSDTIKEALEMLKEVEVYNTLHRAAIELPSVQTPSQIKKFYEPVMDMEGVEIAGQGQSVGKKISFDLPDFSTKEKVTGAEIGSATHELMQRIDLSQQLTLASLTETLKQVQTSQAVRDKINLDKILAFFDTVLGQEILANTDHLYREQPFSMLKRDQKSQEDFVVRGILDGYLLYENKIVLFDYKTDRYDEPSQLVDRYRGQLALYEEALSRAYSIENIEKYLILLGKDEVQVVKV >NC_012466.1|WP_000772338.1|1018011_1021287_+|ATP-dependent-nuclease-subunit-B MKLLYTDIRTSLTEILTREAEELVAAGKRVFYIAPNSLSFEKERAVLECLSQQASFSITVTRFAQMARYLVLNDLPAKTTLDDIGLGLAFYKCLAELDPKDLRVYGAIKQDPQLIQQLIELYHEMTKSQMSFLDLENLTDEDKRADLLLIFEKVTAYLNQGQLAQGSQLSHLIEAIENDKVSSDFNQITLVIDGFTRFSAEEERVVDLLHGKGVEIVIGAYASKKAYTSPFSEGNLYQASVKFLHHLASKYQTPAQDCSQTHEKMDSFDKASRLLESSYDFSELALDVDEKDRENLQIWSCLTQKEELELVARSIRQKLHENSDLSYKHFRILLGDVASYQLSLKTIFDQYQIPFYLGRSEAMAHHPLTQFVESILALKRYRFRQEDLINLLRTDLYTDLSQSDIDAFEQYIRYLGINGLPAFQQIFTKSHHGKFNLERLNVLRLRILAPLETLFASRKQKAENLLQKWSVFLKEGAVTKQLQDLTTTLEAVEQERQAEVWKAFCHVLEQFATVFAGSQVSLEDFLALLHSGMSLSQYRTIPATVDTVLVQSYDLIAPLTADFVYAIGLTQDNLPKISQNTSLLTDEERQNLNQATEEGVQLLIASSENLKKNRYTMLSLVNSARKQLFLSAPSLFNESESKESAYLQELIHFGFRRREKRMNHKGLSKEDMGSYHSLLSSLVAYHQQGEMSDTEQDLTFVKVLSRVIGKKLDLQGLENPAIPTSPSSKTLAKDTLQALYPAKQEFYLSTSGLTEFYRNEYSYFLRYVLGLQEELRLRPDARSHGNFLHRIFERALQLPNEDSFDQRLEQAIQETSQEREFEAIYQESLEAQFTKEVLLDVARTTGHILRHNPAIETIKEEANFGGKDQAFIQLDNGRSVFVRGKVDRIDRLKANGAIGVVDYKSSLTQFQFPHFFNGLNSQLPTYLAALKREGKQNFFGAMYLEMAEPVQSLMAVKSLAGAVVEASKSMKYQGLFLEKESSYLGEFYNKNKANQLTDEEFQLLLDYNAYLYKKAAEKILAGRFAINPYTENGRSIAPYVQQHQAITGFEANYHLGQARFLEKLDLADGKRLVGEKLKQAWFEKIREELNR >NC_012466.1|WP_044811956.1|1016306_1016753_-|tyrosine-type-recombinase/integrase MRKHGLISKSTSKGYYQVAIPFMRLFCLVLVSIDYINCLSETTDKNWHKSDRIFVTNTGKPVHSSILSKSLQRANERLKKPIPKHLSPHIFRHTTISILSENKIPLKTITDRVGHSDSEVTTSIYTHVTKNMKDEAINVLDKVMKKIF >NC_012466.1|WP_000022813.1|1014864_1016169_+|phosphopyruvate-hydratase MSIITDVYAREVLDSRGNPTLEVEVYTESGAFGRGMVPSGASTGEHEAVELRDGDKSRYGGLGTQKAVDNVNNIIAEAIIGYDVRDQQAIDRAMIALDGTPNKGKLGANAILGVSIAVARAAADYLEIPLYSYLGGFNTKVLPTPMMNIINGGSHSDAPIAFQEFMILPVGAPTFKEALRYGAEIFHALKKILKSRGLETAVGDEGGFAPRFEGTEDGVETILAAIEAAGYVPGKDVFIGFDCASSEFYDKERKVYDYTKFEGEGAAVRTSAEQIDYLEELVNKYPIITIEDGMDENDWDGWKALTERLGKKVQLVGDDFFVTNTDYLARGIQEGAANSILIKVNQIGTLTETFEAIEMAKEAGYTAVVSHRSGETEDSTIADIAVATNAGQIKTGSLSRTDRIAKYNQLLRIEDQLGEVAEYRGLKSFYNLKK >NC_012466.1|WP_000131080.1|1014254_1014701_-|YueI-family-protein MTDLSKQLLEKAHGGLKINPDEQRRYLGTFEERVLGYVDIDTANSPQLEKGFLFILENLQEKAKPLFVKISPTIEFDKQVFYLKEAKETDSQATIVSEEHITSPFGLVIHSNAPVQVEEKDLRLAFPKLWEVKKEEPAKTSLWKKWFS >NC_012466.1|WP_078101594.1|1013442_1014258_+|glycerate-kinase MRENMKIVIAPDSFKESLTAQQVAEAIKRGFQQSIADVECLLCPVGDGGEGTVDAIRHSLDLKEKWIQVTDPFGQKEAMRYFQKGELALFEVADLVGLGKIPLEKRNPLQIQTCGIGELILHLISKGIKDIYIGVGGTASNDGGLGIAAGLCAFAQASIVSGIDTCLDLINFDKKVSDADLVVVGEGRLDSQSFAGKAPIGVAKRTPVGVPVIAICGSLAEDLPPLPFENIQAVFSILEKSEPLEDSLKNASLYLERTAANIGHLLNMCKI >NC_012466.1|WP_000697290.1|1011308_1012742_+|glycogen-synthase-GlgA MKILFVAAEGAPFSKTGGLGDVIGALPKSLVKAGHEVAVILPYYDMVEAKFGNQIEDVLHFEVSVGWRRQYCGIKKTVLNGVTFYFIDNQYYFFRGHVYGDFDDGERFAFFQLAAIEAMERIDFIPDLLHVHDYHTAMIPFLLKEKYCWIQAYEDIETVLTIHNLEFQGQFSEGMLGDLFGVGLERYADGTLRWNNCLNWMKAGILYANRVSTVSPSYAHEIMTSQFGCNLDQILKMESGKVSGIVNGIDADLYNPQTDALLDYHFNQEDLSGKAKNKAKLQERVGLPVRADVPLVGIVSRLTRQKGFDVVVESLHHILQEDVQIVLLGTGDPAFEGAFSWFAQIYPDKLSANITFDVKLAQEIYAACDLFLMPSRFEPCGLSQMMAMRYGTLPLVHEVGGLRDTVRAFNPIEGSGTGFSFDNLSPYWLNWTFQTALDLYRNHPDIWRNLQKQAMESDFSWDTACKSYLDLYHSLVN >NC_012466.1|WP_000687033.1|1010172_1011312_+|glucose-1-phosphate-adenylyltransferase-subunit-GlgD MKIDKYSAILGNTVGFHDMSTLTDHRPVASLPFGGKYRLIDFPLSSLANAGVRSVFGIFQQDNISSVFDHIRSGREWGLSTLLSHYYLGIYNTRVESSTVGKEYYQQLLTYLKRSGSNQTVALNCDVLINIDLNQVFHLHSTTKEPITVVYKKLAKKDISEVNAILDVDETDHVLSHKLFDSKSTAETFNMSTDIFVVDTPWLIEHLEEEAKKEHPEKLRYVLRDLAVKEGAFAYEYTGYLANIHSVKSYYQANIDMLESQKFYSLFSPNQKIYTKVKNEEPTYYANTSKVSTSQFASGSIIEGQVANSVLSRNIHVHKDSLVKDSLLFPRVVIGEGAQVEYAILDKGVEVELGVVIRGTAEHPVVVKKGAKVTEDIHS >NC_012466.1|WP_000201315.1|1038525_1039377_+|ribosome-biogenesis-GTPase-YlqF MATIQWFPGHMSKARRQVQENLKFVDFVTILVDARLPLSSQNPMLTKIVGDKPKLLILNKADLADPAMTKEWRQYFESQGIQTLAINSKEQVTVKVVTDAAKKLMADKIARQKERGIQIETLRTMIIGIPNAGKSTLMNRLAGKKIAVVGNKPGVTKGQQWLKTNKDLEILDTPGILWPKFEDETVALKLALTGAIKDQLLPMDEVTIFGINYFKEHYPEKLAERFKQMKIEEEAPVIIMDMTRALGFRDDYDRFYSLFVKEVRDGKLGNYTLDTLEDLDGND >NC_012466.1|WP_000201099.1|1039363_1040143_+|ribonuclease-HII MATIKEIKEFLVTVKELESPIFLELEKDNRSGVQKEISKRKRAIQAELDENLRLESMLSYEKELYKQGLTLIVGIDEVGRGPLAGPVVAAAVILPKNCKIKGLNDSKKIPKKKHLEIFQAVQDQALSIGIGIIDNQVIDQVNIYEATKLAMQEAISQLSPQPEHLLIDAMKLDLPISQTSIIKGDANSLSIAAASIVAKVTRDELMKEYDQQFPGYDFATNAGYGTAKHLEGLTKLGVTPIHRTSFEPVKSLVLGKKES >NC_012466.1|WP_000392550.1|1040158_1041709_+|ClC-family-H(+)/Cl(-)-exchange-transporter MEEQSEIVRSKKEFAFASSTILSQVGRGIIVGLIVGIIVGSFRFLIEKGFHLIQGVYQDQGYLVRNLFVLVLFYILICWLSAKLTRSEKDIKGSGIPQVEAELKGLMSLNWWGILWKKYVLGILAIASGLMLGREGPSIQLGAVGGKGIAKWLKSSPVEERSLIASGAAAGLAAVFNAPIAALLFVVEEVYHHFSRFFWVSTLAASIVANFVSLLMFGLTPVLDMPDNIPPMTLDQYWIYLVMGIFLGFSGFLYEKAVLNVGRVYDLIGQKIHLDRAYYPILAFILIIPVGIFLPQIIGGGNQLVLSLTEQNFSFQVLLAYFLIRFIWSMISYGSGLPGGIFLPILALGSLLGALVGVICVNLGLVSQEQFPIFVILGMSGYFGAISKAPLTAMILVTEMVGDIRNLMPLGLVTLVSYIIMDLLKGTPVYEAMLEKMLPEEVSSEGEVTLIEIPVSDKIAGKQVHELNLPHNVLITTQVHNGKSQTVNGSTRMYLGDMIHLVIPKSEIGKVKDLLL >NC_012466.1|WP_000817882.1|1042292_1043363_+|tyrosine-recombinase-XerS MKREILLERIDKLKQLMPWYVLEYYQSKLAVPYSFTTLYEYLKEYDRFFSWVLESGISNADKISDIPLSVLENMSKKDMESFILYLRERPLLNANTTKQGVSQTTINRTLSALSSLYKYLTEEVENDQGEPYFYRNVMKKVSTKKKKETLAARAENIKQKLFLGDETEGFLTYIDQEHPQQLSNRALSSFNKNKERDLAIIALLLASGVRLSEAVNLDLRDLNLKMMVIDVTRKGGKRDSVNVAAFAKPYLENYLAIRNQRYKTEKTDTALFLTLYRGVPNRIDASSVEKMVAKYSEDFKVRVTPHKLRHTLATRLYDATKSQVLVSHQLGHASTQVTDLYTHIVNDEQKNALDSL >NC_012466.1|WP_000873990.1|1043435_1044425_-|lipoate--protein-ligase MKYIINHSNDTAFNIALEEYAFKHLLDEDQIFLLWINKPSIIVGRHQNTIEEINRDYVRENGIEVVRRISGGGAVYHDLNNLNYTIISKEDENKAFDFKSFSTPVINTLAQLGVKAEFTGRNDLEIDGKKFCGNAQAYINGRIMHHGCLLFDVDLSVLANALKVSKDKFESKGVKSVRARVTNIINELPKKITVEKFRDLLLEYMKKEYPEMTEYVFSEEELAEINRIKDTKFGTWDWNYGKSPEFNVRRGIKFTSGKVEVFANVTESKIQDIKIYGDFFGIEDVAAVEDVLRGVKYEREDVLKALKTIDITRYFAGISREEIAEAVVG >NC_012466.1|WP_001162945.1|1044488_1046192_-|dihydrolipoyl-dehydrogenase MALEVIMPKAGVDMTEGQIVQWNKKVGEFVKEGEILLEIMTDKVSMELEAEEDGYLIAILKGDGETVPVTEVIGYLGEERENIPTAGAASPEASSVPVASTSNDDDKSDDAFDIVVIGGGPAGYVAAIKAAQFGGKVALVEKSELGGTCLNRGCIPTKTYLHNAEIIENIGHAANRGIVIENPNFTVDMEKLLETKSKVVNTLVGGVAGLLRSYGVTVHKGIGTITKDKNVLVNGSELLETKKIILAGGSKVSKINVPGMESPLVMTSDDILEMNEVPESLVIIGGGVVGIELGQAFMTFGSKVTVIEMMDRIVPAMDVEVSKNLRLILERKGMTILTGTKLQEIIEENGQLRIKVEGKDDIIASKALLSIGRMPDLEGIGEVEFELDRGCIKVNEYMETSVPGIYAPGDINGTKMLAHAAFRMGEVSAENALKGNHAVAKLNLTPAAIYTLPEVAAVGLTEEQAREKYDVAIGKFNFAANGRAIASDAAQGFVKVIADKKYGEILGVHIIGPAAAELINEASSIIEMEITVEEMLKTIHGHPTYSEVMYEAFADVLGMAIHSPKKK >NC_012466.1|WP_000752705.1|1046237_1047281_-|dihydrolipoamide-acetyltransferase MADDKLRATPAARKLADDLGINLYDVSGSGANGRVHKEDVETYKDTNVVRISPLAKRIALEHNIAWQEIQGTGHRGKIMKKDVLALLPENIENDSIKSPAQIEKVEEVPDNVTPYGKIERIPMTPMRKVIAQRMVESYLTAPTFTLNYEVDMTEMLALRKKVLEPIMEATGKKTTVTDLLSLAVVKTLMKHPYINASLTEDGKTIITHNYVNLAMAVGMDNGLMTPVVYNAEKMSLSELVVAFKDVIGRTLDGKLAPSELQNSTFTISNLGMFGVQSFGPIINQPNSAILGVSSTIEKPVVVNGEIVIRPIMSLGLTIDHRVVDGMAGAKFMKDLKELIETPISMLI >NC_012466.1|WP_000448728.1|1047498_1048491_-|alpha-ketoacid-dehydrogenase-subunit-beta METKTMSFRDTIILAMSEEMRRDENVFLMGEDVGVFGGDFGTSVGMLEEFGPERVRDCPISEAAISGAAAGAAMTGLRPIVDMTFMDFSVIAMDNIVNQAAKTRYMFGGKGQVPMTVRCAAGNGVGSAAQHSQSLESWFTHIPGLKVVAPGTPADMKGLLKSSIRDNNSVIILEYKSEFNQKGEVPVDPDYTIPLGVGEIKRQGTDVTVVTYGKMLRRVVQAAEELAEEGISVEIVDPRTLVPLDKDIIINSVKKTGKVVLVNDAHKTSGYIGEISAIISESEAFDYLDAPIRRCAGEDVPMPYAQNLENAMIPTVESIKDAIRKTYNKE >NC_012466.1|WP_000105360.1|1048506_1049475_-|thiamine-pyrophosphate-dependent-dehydrogenase-E1-component-subunit-alpha MSTLDKNLLLEMFRKMEEIRRMDLKIAQLVKKGKVPGMTHFSVGEEAANVGAMLALNPDDLITSNHRGHGQAIAKGIDLNGMMAEILGKYTGTCKGKGGSMHIADLDAGNLGANGIVGGGMGIAVGAALSQQMQNTGKIVVCFFGDGATNEGVFHEAVNMASIWNLPVIFYCINNGYGISADIKKMTNIEHIHQRSAAYGIPGMFIEDGNNVIDVYEGFQKAVDHVRSGNGPVLIESVTYRWLGHSSSDPGKYRTREEVELWKQKDPIENLRNYLIENNIASAEELEEIQAQVKEAVEASVKFAEESPFPPLESAFEDIYAD >NC_012466.1|WP_000278527.1|1049628_1050990_-|sodium-coupled-multidrug-efflux-MATE-transporter-PdrM MYKTKCLREKLVLFLKIFFPILIYQFANYSASFVDTAMTGQYNTMDLAGVSMATSIWNPFFTFLTGIVSALVPIIGHHLGRGKKEEVASDFYQFIYLALGLSVVLLGMVLFLAPIILNHIGLEAAVAAVAVRYLWFLSIGIIPLLLFSVIRSLLDSLGLTKLSMYLMLLLLPLNSGFNYLLIYGAFGVPELGGAGAGLGTSLAYWVLLGISVLVLFKQEKLKALHLEKRIPLNMDNIKEGVRLGLPIGGTVFAEVAIFSVVGLIMAKFSSLIIASHQSAMNFSSLMYAFPMSISSAMAIVVSYEVGAKRFDDAKTYIGLGRWTALIFAAFTLTFLYIFRGNVASLYGNDPKFIDLTVRFLTYSLFFQLADTFAAPLQGILRGYKDTVIPFYLGLLGYWGVAIPVATLFDSLTDFGAYSYWIGLIISLIVSGALYRWRLTVIMKRFESLAKSKC |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_012466_3 | 1374709-1374830 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_012466_3
|
1 spacers
spacers of NC_012466_3
>3.1|1374738|64|NC_012466|CRISPRCasFinder TTGTACTGGCACTTCTGGTGTCGGTACATTTGGTGTTGGTTGCGCTGGCACAGGTTTAACCGGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_012466_3
The CRISPR arrays of NC_012466_3 >merge|NC_012466|3|1374709-1374830|CRISPRCasFinder ACTTCTGGTGTTGAAACAGCTGGAGTTGGTTGTACTGGCACTTCTGGTGTCGGTACATTTGGTGTTGGTTGCGCTGGCACAGGTTTAACCGGTACTTCTGGTGTCGGCACATTTGGTGTTGG >NC_012466|3|3|1374709-1374830|CRISPRCasFinder ACTTCTGGTGTTGAAACAGCTGGAGTTGG TTGTACTGGCACTTCTGGTGTCGGTACATTTGGTGTTGGTTGCGCTGGCACAGGTTTAACCGGT ACTTCTGGTGTCGGCACATTTGGTGTTGG
>NC_012466.1|WP_000039652.1|1373702_1374251_+|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase MSKKVLFIVGSLRQGSLNHQMALEAEKALAGKVEVSYLDYSALPLFSQDLEVPTHPAVAAAREAVLVADAIWIFSPVYNFSIPGTVKNLLDWLSRALDLSDTRGVSALQDKFVTVSSVANAGHDQLFAIYKDLLPFIRTQGVGDFTAARVNDSAWADGKLVLEETVLNSLEKQAQDLVEAIQ >NC_012466.1|WP_000153793.1|1372893_1373325_-|hypothetical-protein MTILFVVISGSFLYMVSLSMKPYQTAKSEGEKLAQQYAGLEQADQVDLYNGLESYYSVLGRNKQQEALAVLIGKDDHKIYVYQLNQGVSQEKAETVSKEKGAGEIDKITFGRYQDKPIWEVKSGSDFYLVDFETGALVNKEGL >NC_012466.1|WP_000777787.1|1371709_1372897_-|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase MKLSNRVLEMEESVTLAAGARAKALKAEGRDILSLTLGEPDFTTPKNIQDAAIASIRDGRASFYTVTSGLPELKAVVNSYFERFYGYSVASNQVTVAAGAKYSLYSFFMAVVNPGDEVIIPTPYWVSYGDQVKMAEGVPVFVSAKEDNHFKVTVEQLEAARTDKTKVLVLNSPSNPTGMIYTREELLAIGNWAVENDILILADDIYGRLVYNGHEFTPISSLSEAIRKQTVVINGVSKTYAMTGWRIGYAVGEADIIAAMSKIAGQTTSNPSAVAQYAAVEALSGEQDTVESMRQAFEERLNTIYPLLAEVPGFEVVKPQGAFYLFPNVKKAMEMKGYTDVTDFTTVILEEAEVALVTGAGFGAPENVRLSYATDLDTLKEAVERLKAFMGSEND >NC_012466.1|WP_000565233.1|1371351_1371717_-|VOC-family-protein MIDHFEIKVKDLQISEGFYRSFLVPLDYKLAFKTSSLISFLSPNSPHPGGDFWLTQGTQDPVHFAFLAENKEEVQACYEAGIEAGGRDNGVPGYRSEHPIYYAAFMIDLDGNNIEVVCHKE >NC_012466.1|WP_000167151.1|1369989_1371333_-|asparagine--tRNA-ligase MTKRVTIIDVKDYVGQEVTIGAWVANKSGKGKIAFLQLRDGTAFFQGVAFKPNFVEKFGEEVGLEKFDVIKRLSQETSVYVTGIVKEDERSKFGYELDITDIEVIGESQDYPITPKEHGTDFLMDNRHLWLRSRKQVAVLQIRNAIIYATYEFFDKNGFMKFDSPILSGNAAEDSTELFETDYFGTPAYLSQSGQLYLEAGAMALGRVFDFGPVFRAEKSKTRRHLTEFWMMDAEYSYLTHDESLDLQEAYVKALLQGVLDRAPQALETLERDTELLKRYIAEPFKRITYDQAIDLLQEHENDEDADYEHLEHGDDFGSPHETWISNHFGVPTFVMNYPAAIKAFYMKPVPGNPERVLCADLLAPEGYGEIIGGSMREEDYDALVAKMDELGMDRTEYEFYLDLRKYGTVPHGGFGIGIERMVTFAAGTKHIREAIPFPRMLHRIKP >NC_012466.1|WP_001151785.1|1369546_1369837_-|30S-ribosomal-protein-S6 MAKYEILYIIRPNIEEEAKNALVARFDSILTDNGATVVESKTWEKRRLAYEIQDFREGLYHIVNVEANDDAALKEFDRLSKINADILRHMIVKIDA >NC_012466.1|WP_000609607.1|1369064_1369535_-|single-stranded-DNA-binding-protein MINNVVLVGRMTRDAELRYTPSNVAVATFTLAVNRTFKSQNGEREADFINVVMWRQQAENLANWAKKGSLIGVTGRIQTRSYDNQQGQRVYVTEVVAENFQMLESRSVREGHTGGAYSAPTANYSAPTNSVPDFSRNENPFGATNPLDISDDDLPF >NC_012466.1|WP_000068664.1|1368793_1369033_-|30S-ribosomal-protein-S18 MAQQRRGGFKRRKKVDYIAANKIEYVDYKDTELLSRFVSERGKILPRRVTGTSAKNQRKVTTAIKRARVMALMPFVNED >NC_012466.1|WP_000339024.1|1367098_1368499_-|bifunctional-Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase/peptidylprolyl-isomerase MDAKLRYKAKKIKIVFFDIDDTLRNSKTGFIPTTIPTVFKQLREKGILTGIASGRGIFGVVPEIRDLKPDFFVTLNGAYIEDKKGQVIYQHQIEKSDVEEYISWAKQEGIEYGLVGSHDAKLSTRTDMMSEAINPIYPDLDVDPDFHEKEDIYQMWTFEDKGDDLHLPDSLSDKLRMVRWHQHSSDIVPISGSKATGVEKVVEHLGLKPEKVMVFGDGLNDLELFDYAGISVAMGISHDKIKEKADYITKTLEEDGIFDALEVFGMVEKELHFPQVDIETVEGPLATIKTNHGDLRIKLFPEHAPKTVANFVSLSKDGYYDGVIFHRIIKDFMIQGGDPTGTGMGGESIYGESFEDEFSEELYNIRGALSMANAGPNTNGSQFFIVQNQHLPYSKKEITRGGWPEPIAEIYANQGGTPHLDRRHTVFGQLADEASYAVLDAIAAVETGAMDKPVEDVVIETIEIED >NC_012466.1|WP_000689596.1|1366737_1367097_-|S1-RNA-binding-domain-containing-protein MKIGDKLKGRITGIQPYGAFVELETGDTGLIHISEIRTGFIENIHETLKVDEEVQVQVVDLDEFTGKASLSIRTLEEEKYQFPRRRRFSSDRFNYGFAPFRRMLPIWTGEALHHLKKKK >NC_012466.1|WP_001106144.1|1380997_1382506_+|HTH-domain-containing-protein MNYGGNTRMRNLLSTKVQRQLRLMETLIQNRNWMKLHELAEKLGCTERILKSDLNELRIAFPSINIQSSVNGIMIDLEVNTSVEDIYQYFLANSQSFQLLEYMFFNEGLPIYRTIENLYFSSANLYRLGRNITKVLSSQFQIELSFTPSEIRGNEIDIRYFFAQYFSERYYFLDWPFPDLPEEDLTEFADFFYKITNYPMRFSIYRMYKLMIAISIHRVKNGHFIDLPNHFYKEYYPLLKSIPNFQETLAYFSKHFGLEMTPDTIAQIFISFLQNDIFLDPQEFFNSLEDNSQARYSYQLLSQILERLSKQYKITFTNHDELIWHLHNTAFFERQEIFSTPILFEQKALTIKKFEVYFPDFMGSARQELAQYRQAIGQHDHPEQLEHLMYTILTHAENLSTQLLENRPPIKVLIISNFDHAISLTFVDMLSYYCNNRFTFDIWDELKTSPEILNQTDYDIIVSNFYISGITKKFICRNHLSIMNLVNHLNTLSNEIHLSNTL >NC_012466.1|WP_000697794.1|1382556_1383285_-|peroxide-stress-protein-YaaA MKILIPTAKEMNTDLPSIETTLLRSESQAVLDALALYSASQLESFYKVSAEKAAEECQNIQALKRQTAQHYPALKLFDGLMYRHIKRDKLTEVEQAYLENHVFITSALYGVVPALSPMAPHRLDFLMKLKVAGKTLKSHWKAAYDEAVKQEEVIFSLLSSEFETVFSKEIRAKMVTFKFMEDRGGQLKIHSTISKKARGAFLTALIENQVQTVGEARRLNFAGFVYREDLSQPQGLVFVKEV >NC_012466.1|WP_001833291.1|1383363_1383543_-|YczI-family-protein MEDKEMGFYLMVASMLLGLLALKIGFSQFKENKDKFLSILTSLAGLALVLVAVWLGWPK >NC_012466.1|WP_000822856.1|1383706_1385302_-|hypothetical-protein MKRIVFELIFIATTWYIFLPPLNLTSWEFLFFLCGHLLVVAILFGFGKGINLVKTVHVRHGKAEAALNLEGFKINRLGKILLASIGGILLLAALVSLVTSSMFQAKNYANVVTVTEKDFTEFPKSDTSKVPILDRSTAEKIGDRYLGSLTDKVSQYVAADTYTQLTIDGKPYRVTPLEYADPIKWFNNQAKGIGEYIKVDMVTGNADLVDLKTPIKYSDSEYFNRDVKRHLRLKYPTKIFKTPSFEVDDEGNPFYVATVYQKQFGLAVPRPASVIILDATNGETKEYSLSDVPEWVDRIYPAEETIEQINYNGKYKDGFLNAMISKKNVTQTTKGYNYLSIGNDIYLYTGVTSANADESNLGFILENMRTGEITKYSLASATEESARESAEGAVQEKSYKATFPILINLNDKPLYIMGLKDNAGLVKEYALVDAVEYQNVIVATTVEEMLSKYANKNDLEIDNATTESIKGVVADLKSAVIKGDTVYFFKVDGKIYKVKASVSDDLPYLENGRTFEGQVGKDSYLKTFKVQ >NC_012466.1|WP_000412220.1|1385313_1385724_-|peptide-deformylase MEKKIVKDILFLSQVSQPASQEDLYLARDLQDTLLANRDTCVGLAANMIGVQKRVIIFNLGLVPVVMFNPVLLSFEGSYEAEEGCLSLVGVRSTKRYETIRLAYRDSKWQEQTITLTGFPAQICQHELDHLEGRII >NC_012466.1|WP_001277407.1|1385839_1386631_-|glutathione-dependent-disulfide-bond-oxidoreductase MSAYQLPTVWQDEASNQGAFTGLNRPTAGARFEQNLPKGEQAFQLYSLRTPNGVKVTILLEELLEAGFKEAAYDLYKIAIMDGDQFGSDFVKLNPNSKIPALLDQSGTEDVRVFESAHILLYLAEKFGAFLPSNPVEKVEVLNWLFWQAGAAPFLGGGFGHFFNYAPEKLEYPINRFTMEVKRQLDLLDKELAQKPYIAGNDYTIADIAIWSWYGQLVQGNLYQGSAKFLDASSYQNLVKWAEKIANRPAVKRGLEVTYTEIK >NC_012466.1|WP_000032458.1|1386643_1389340_-|cation-translocating-P-type-ATPase MSKEQKRQAFYTQSPEEVLQAVDATEQGLSSSEAEKRLAEFGHNELEEGEKRSILVKFIEQFKDLMIIILVAAAILSVVTSGGEDIADAIIILAVVIINAAFGVYQEGKAEEAIEALKSMSSPVARVLRDGHMAEIDSKELVPGDIVALEAGDVVPADLRLIEANSLKIEEAALTGESVPVEKDLSVELATDAGIGDRVNMAFQNSNVTYGRGMGVVVNTGMYTEVGHIAGMLQDADETDTPLKQNLNNLSKVLTYAILVIALVTFVVGVFIQGKNPLGELLTSVALAVAAIPEGLPAIVTIVLSLGTQVLAKRHSIVRKLPAVETLGSTEIIASDKTGTLTMNKMTVEKVFYDAVLHDSADDIELGLEMPLLRSVVLANDTKIDVEGNLIGDPTETAFIQYALDKGYDVKGFLEKYPRVAELPFDSDRKLMSTVHPLPDGRFLVAVKGAPDQLLKRCLLRDKAGDIAPIDEKVTNLIHTNNSEMAHQALRVLAGAYKIIDSIPENLTSEELENDLIFTGLIGMIDPERPEAAEAVRVAKEAGIRPIMITGDHQDTAEAIAKRLGIIDANDTEGHVLTGAELNELSDEEFEKVVGQYSVYARVSPEHKVRIVKAWQKQGKVVAMTGDGVNDAPALKTADIGIGMGITGTEVSKGASDMILADDNFATIIVAVEEGRKVFSNIQKTIQYLLSANTAEVLTIFLSTLFGWDVLQPVHLLWINLVTDTFPAIALGVEPAEPGVMNHKPRGRKASFFSGGVLSSIIYQGVLQAALVMSVYGLAIAYPVHVGDNHAIHADALTMAFATLGLIQLFHAYNVKSVYQSILTVGPFKSKTFNWSILVSFILLMATIVVEPLEGIFHVTKLDLSQWGIVMAGSFSMIIIVEIVKFIQRKLGFDKNAI >NC_012466.1|WP_000813916.1|1389643_1390828_+|CDF-family-manganese-efflux-transporter-MntE MKQSISNLKLAERGAIISISTYLILSAAKLAAGHLLHSSSLVADGFNNVSDIIGNVALLIGIRMARQPADRDHRFGHWKIEDLASLITSIIMFYVGFDVLRDTIQKILSREETVIDPLGATLGIISAAIMFVVYLYNTRLSKKSNSKALKAAAKDNLSDAVTSLGTAIAILASSFNYPIVDKLVAIIITFFILKTAYDIFIESSFSLSDGFDDRLLEDYQKAIMEIPKISKVKSQRGRTYGSNIYLDITLEMNPDLSVFESHEIADQVESMLEERFGVFDTDVHIEPAPIPEDEILDNVYKKLLMREQLIDQGNQLEELLTDDFVYIRQDGEQMDKEAYKTKKELNSAIKDIQITSISQKTKLICYELDGIIHTSIWRRHETWQNIFHQETKKE >NC_012466.1|WP_001279160.1|1390970_1392842_-|ABC-F-family-ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MSDFIVEKLSKSVGDKTVFRDISFIIHDLDRIGLIGVNGTGKTTLLDVLSGVSGFDGDVSPFSAKNDYQIGYLTQDPDFDDRKTVLDTVLSSELKEIQLIREYELIMLDYSEDKQARLERVMAEMDSLQAWKIESQVKTVLSKLGIQDLSTPVGELSGGLRRRVQLAQVLLGNHDLLLLDEPTNHLDIAIIEWLTLFLKNSKKTVLFITHDRYFLDALSTRIFELERAGLTEYQGNYQDYVRLKAEQDERDAALLHKKEQLYKQELAWMRRQPQARATKQQARINRFHDLKKEVSGSSAETDLTMNFETSRIGKKVIEFQDVSFAYENKPILQNFNLLVQAQDRIGIVGDNGVGKSTLLNLIAGSLEPTAGQVVIGETVRIAYFSQQIEGLDESKRVINYLQEVAEEVKTSGGSTTSIAELLEQFLFPRSTHGTLIEKLSGGEKKRLYLLKLLLEKPNVLLLDEPTNDLDIATLTVLENFLQGFAGPVLTVSHDRYFLDKVATKILAFEDGKIRPFFGHYTDYLDEKAFETDMANQVQKAEKEKVVKVREDKKRMTYQEKQEWASIEGDIETLEKRIAAIEEEMQANGSDFGKLATLQKELDEKNEALLEKYERYEYLSEFDS >NC_012466.1|WP_078134417.1|1392838_1394038_-|CCA-tRNA-nucleotidyltransferase MRLMQMPSEFQKALPVLEKIKEAGFEAYFVGGSVRDALLHSPIHDVDIATSSYPEETKQIFPRTADIGIEHGTVLVLDGDEEYEVTTFRTEDVYVDYRRPSAVSFVRSLEEDLKRRDFTVNAFALDETGEIVDLFHGLEDLEKQVLRAVGVASERFNEDALRIMRGFRFQASLGFALEPETFKAMKTLTPLLEKISVERTFVEFDKLLLAPFWRRGLASMIESQAYDYLPDMASSQDKLNRLFDLETDFTFESSEQAWAALLWALEIENAQSFLKSWKTSRQFAKQVQDLLIILALRENGELSKRDCYRFDLDLLLQAENLRQAQGKEVNPQVIKETYQSLTIHDKKEIQINGGILIKEYGYQPGPDLGEILTEIEFAIVDGELENNREAIHAYLREKK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_012466_4 | 1624596-1624678 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_012466_4
|
1 spacers
spacers of NC_012466_4
>4.1|1624619|37|NC_012466|CRISPRCasFinder TCTATAAAAGATAGCGCTTGGCGCTGTCTTTTTATTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_012466_4
The CRISPR arrays of NC_012466_4 >merge|NC_012466|4|1624596-1624678|CRISPRCasFinder CTTTTTTGAAACGTTTCATTTTTTCTATAAAAGATAGCGCTTGGCGCTGTCTTTTTATTTCTTTTTTGAAACGTTTCATTTTT >NC_012466|4|4|1624596-1624678|CRISPRCasFinder CTTTTTTGAAACGTTTCATTTTT TCTATAAAAGATAGCGCTTGGCGCTGTCTTTTTATTT CTTTTTTGAAACGTTTCATTTTT
>NC_012466.1|WP_001084979.1|1623668_1624586_-|sugar-ABC-transporter-permease MNSKAKQVSLWERIKKQKLLLLMTVPGLVLTFIFKYIPMYGVLIAFKDYNPLKGILGSDWIGFSEFTKFISSPNFGILLANTLKLSIYGLLLGFLPPIILAIMLNQLLSEKVKKRIQLILYAPNFISVVVIVGMIFLFFSVGGPINNFLSMFGMKADFLTNPDFFRPLYIFSGIWQGMGWASTLYTATLVNVDPALVEAARLDGANIFQRIWHIDIPALKPIMVIQFVLAAGGIMNVGYEKAFLMQTSLNLPTSEIISTYVYKVGLVSGDYSYSTAVGLFNAVINVVLLVAVNQIVKRMNNGEGI >NC_012466.1|WP_000797955.1|1622767_1623658_-|carbohydrate-ABC-transporter-permease MKNSIMDTKFDRRILLLNKIIIIFIVLMTLLPLLYIVVASFMDPKVLVSRGISFNPADWTVEGYQRVFSDQSILRGFINSLLYSFGFAALTVLLSVFTAYPLSKKDLVGRRWINYFLIVTMFFGGGLVPTYLLVKELGMLNTPWAIIVPGAVNVWNIILARAYFQGLPEELVEAAVIDGANDLQIFFKIMLPLAKPIMFVLFLYAFVGQWNSYFDAMIYIKDPNLEPLQLVLRKILIQSQPGQDMIGAQAAMNEMKRLAELIKYATIVISSLPLIVMYPFFQKYFDKGIMAGSLKG >NC_012466.1|WP_000669745.1|1621122_1622739_-|extracellular-solute-binding-protein MKFKTFSKSAVLLTASLAVLAACGSKNTASSPDYKLEGVTFPLQEKKTLKFMTASSPLSPKDPNEKLILQRLEKETGVHIDWTNYQSDFAEKRNLDISSGDLPDAIHNDGASDVDLMNWAKKGVIIPVEDLIDKYMPNLKKILDEKPEYKALMTAPDGHIYSFPWIEELGDGKESIHSVNDMAWINKDWLKKLGLEMPKTTDDLIKVLEAFKNGDPNGNGEADEIPFSFISGNGNEDFKFLFAAFGIGDNDDHLVVGNDGKVDFTADNDNYKEGVKFIRQLQEKGLIDKEAFEHDWNSYIAKGHDQKFGVYFTWDKNNVTGSNESYDVLPVLAGPSGQKHVARTNGMGFARDKMVITSVNKNLELTAKWIDAQYAPLQSVQNNWGTYGDDKQQNIFELDQASNSLKHLPLNGTAPAELRQKTEVGGPLAILDSYYGKVTTMPDDAKWRLDLIKEYYVPYMSNDNNYPRVFMTQEDLDKIAHIEADMNDYIYRKRAEWIVNGNIDTEWDDYKKELEKYGLSDYLAIKQKYYDQYQANKN >NC_012466.1|WP_000502538.1|1619793_1621113_-|glycoside-hydrolase-family-32-protein MGDKKYTVEKANRFIAENKHLVNTQYKPEEHFSAEIGWINDPNGFVYFRGEYHLFYQFYPYDSVWGPMHWGHAKSKDLVTWEHLPVALAPDQDYDRNGCFSGSAIVKDDRLWLMYTGHIEEETGVRQVQNMAFSDDGIHFEKIEQNPVATGSDLPDELIAADFRDPKLFEKDGRYYSVVAAKHKNNVGCIVLLGSDNLVEWQFESIFLKGVEHQGFMWECPDYFELDGKDCLIMSPMRYQREGDSYHNINSSLLFTGKVDWGEKCFIPESVQEIDHGQDFYAPQTLLDDQNRRILIAWMQTWGRTLPTHDQEHKWACAMTLPRILRLEDGKLRQFPVKKGQYQIQIDKDCHYHLGNDIDYLEFGYDSNVQQVYIDRSHLIQKILGEEEQDTSRRYVDIEAKELEVVLDKNSIEIFVNQGEASLTATYYLTVPAELSRID >NC_012466.1|WP_001113214.1|1617975_1619247_+|replication-associated-recombination-protein-A MPDNLALRMRPKTIDQVIGQEHLVGPGKIIRRMVEANRLSSMILYGPPGIGKTSIASAIAGTTKYAFRTFNATVDSKKRLQEISEEAKFSGGLVLLLDEIHRLDKTKQDFLLPLLESGLVIMIGATTENPFFSVTPAIRSRVQIFELEPLSNQDVKEALQIALSNPERGFDFPIELDEDALDFIATSTNGDLRSAFNSLDLAVLSTPENDEGIRHITLDIMENSLQRSYITMDKDGDGHYDVLSALQKSIRGSDVDASLHYTARLIEAGDLPSLARRLTVIAYEDIGLANPEAQIHTVTALDAAQKIGFPEARILIANVVIDLALSPKSNSAYVAMDKALADLKTSGHLPIPRHLRDGHYSGSKELGNAQDYLYPHNYPGNWVKQDYLPEKIRNHHYFQAEDTGKYERALAQRKEAIDRLRKI >NC_012466.1|WP_001048906.1|1617122_1617302_-|hypothetical-protein MNLIFEEYQFVKIGDKKYRVRSVPMIHSTPPQSVLDRDTFTIDYTDDELLDKEAVFTTH >NC_012466.1|WP_023932632.1|1616806_1617013_-|type-II-toxin-antitoxin-system-HicA-family-toxin MVLSGGKSAMPMTQKEMVKLLTAHGWIKTRGGKGSHIKMEKQGERPITIPHGELNKYTERGIRKQAGL >NC_012466.1|WP_000961810.1|1616317_1616770_-|type-II-toxin-antitoxin-system-HicB-family-antitoxin MLVTYPALFYYDDTDGTEATYFVHFPDFEYSATQGEGISEALAMGSEWLGITVADLIESDGELPQPSDINSLSLIDNDPFKDDEDFVSTYDLDKSFISMVSVDVSEYLGSQEPIKKTLTIPKWADKLGREMGLNFSQTLTDAIADKKVQA >NC_012466.1|WP_000257103.1|1615556_1616027_-|DUF3013-family-protein MATYGFLDVLEEELDKNFPFDFEISWDKRNHAVEVSFLLEAQNAAGVEMVDEDGEVSSDDILFEEAVLFYNPAKSTVNEEDYLTVIPYLPKKGFSREFLAYFALFLKDTAEVGLDVLMDFLEDPEAEEFVMEWNQEVFEEGKIGLEEGEFYPYPKY >NC_012466.1|WP_001808682.1|1614449_1615553_-|site-2-protease-family-protein MVGGVMKKIGTYLVYVLAVVFIMLAFACGTIAFAELGYSAVLAFTFGYAFALLSMYLIFILHELGHAFCGYLTGYRLVAFGLGHFILTKKSGRFHLSRTAILKNVGAQYIGLKEDESDQRIILMLSGGLMVHLGLILLAILFGFLTRSWYFAGTWIFLNLSFFLNNILPVDITDGAKIWELLQHPENTKYAYLVLRHSAQTLLAPQEYDLKDFVQAVPEDARGSFADGVLGMQGEVSILEGKEEVAKQQFQALLERTTTPMMQTVAQLSLLHIALLEGDFEQAEQYASIRQVKSFLSLKLSNLQVIQAWYQLKVKKDVDRTRKALKIARQKMDSSRMLRDEKRYYENWLAELEKEMLEGTEDGTRNF >NC_012466.1|WP_000230202.1|1624734_1625736_-|LacI-family-transcriptional-regulator MVEQRKSITMKDVALEAGVSVGTVSRVINKEKGIKEVTLKKVEQAIKTLNYIPDYYARGMKKNRTETIAIIVPSIWHPFFSEFAMHVENEVYKRNNKLLLCSINGTNREQDYLEMLRHNKVDGVVAITYSPIEHYLTSGIPFVSIDRTYSDIAIPCVSSDNDAGGREAAKQLISKGCQHLAFVGGHNTTINETKRRRISFEKYVQEHKIPLSIFDLDETVTDYYGKLESFLEENSSIDGIFTINDFTALDVIEILEKNGKRIPHDVQIIGYDGIKMAGDRDYLLSTIEQPLEEMAKEAVRILFDIIDGKTVNLQTILPVKFVEGKTTKNENKS >NC_012466.1|WP_001205280.1|1626097_1627579_-|aspartate-aminotransferase MRDLLSKKSHRQLELLELLFEHKRWFHRSELAELLNCTERAVKDDLSHVKSAFPDLIFHSSTNGIRIINTDDSDIEMVYHHFFKHSTHFSILEFIFFNEGCQAESICKEFYISSSSLYRIISQINKVIKRQFQFEVSLTPVQIIGNERDIRYFFAQYFSEKYYFLEWPFENFSSEPLSQLLELVYKETSFPMNLSTHRMLKLLLVTNLYRIKFGHFMEVDKDSFNDQSLDFLMQAEGIEGVAQSFESEYNISLDEEVVCQLFVSYFQKMFFIDESLFMKCVKKDSYVEKSYHLLSDFIDQISVKYQIEMENKDNLIWHLHNTAHLYRQELFTEFILFDQKGNTIRNFQNIFPKFVSDIKKELSHYLETLEVCSSSMMVNHLSYTFITHTKHLVINLLQNQPKLKVLVMSNFDQYHAKFVAETLSYYCSNNFELEVWTELELSKESLEDSPYDIIISNFIIPPIENKRLIYSNNINTVSLIYLLNAMMFIRLDE >NC_012466.1|WP_001809002.1|1628021_1628186_+|GlsB/YeaQ/YmgE-family-stress-response-membrane-protein MGIIANVFAGLVGAYAGQSLLGSWGPSIAGMALLPSIVGAAIVITVVSFFTGRK >NC_012466.1|WP_000030213.1|1628269_1628836_+|alkaline-shock-response-membrane-anchor-protein-AmaP MSKAKKICFIIFCILILTIFLPVLIDYHQVSDLGIHLLSWRQNSVVEFYLARYVFWGTVVLSTLVLLSILVVMFYPKRYLEIQLETKNDTLKLKNSAIEGFVRSLVSDHRLIKNPTVHVNLRKNKCFVHVEGKILPSDNIADRCQIIQNEITNGLKQFFGIERQVKLEVAVKNYQPKPQNKKTVSRVK >NC_012466.1|WP_000455066.1|1628847_1629018_+|DUF2273-domain-containing-protein MEWLKQYRYPIIAGLIGVFLACLIVSFGFFKTIFVLILGALGVAAGLYIEKNYIDK >NC_012466.1|WP_000064115.1|1629056_1629665_+|Asp23/Gls24-family-envelope-stress-response-protein MSNEKNTNTNVEKKDATVVAHEIKGELTYEDKVIQKIIGLSLENVSGLLGIDGGFFSNLKEKIVNSDDVTSGVNVEVGKTQVAVDLNVIVEYQKNVPALYSEIREIVSSEVAKMTDLEIVEINVNVVDIKTKEQHEADSVSLQDRVSDVAESTGEFTSEQFEKAKSGLGSGFSTVQEKVSEGVEAVKGAANGVVSHENTRVN >NC_012466.1|WP_000109957.1|1629695_1629899_+|CsbD-family-protein MSVEEKLNQAKGSIKEGVGKAIGDEKMEKEGAAEKVVSKVKEVAEDAKDAVEGAVEGVKNMLSGDDK >NC_012466.1|WP_000229339.1|1631050_1631821_-|sulfite-exporter-TauE/SafE-family-protein MVEIIYFLIIIIASGLGSISGMGGGIIIKPLMDSFGYHSVSDIAFYSSFSVFIMAIISTTKRFSQSKEIKWRLIFTVSFSSVLGGFLGHLIFQVLLSQLSVRLVSIVQMILLFVMLLVSFVLTDFKKTYQFDKIGFYMICGLLLGLISSFLGIGGGPLNVSLLMVFFSISIKEATMYSLAIIFFSQLSHLATIVVVTGLNQYHLAPVPVIFLASICGGVLGTVVSKVLPENWVRYCFKGMLFFVMGMTLYNLFHIL >NC_012466.1|WP_000782422.1|1631835_1632684_-|formylglycine-generating-enzyme-family-protein MKMKKIKGGTFMMGTNSEEGFLDDFEDPQVAVSVKDFSIADTPVTNQEFAQFVKETGYKTLAERQEWSFVFILFVPEAEREGYPHPAGAPWWLQVPNACWKHPYGENSNLVGLEDHPVVHVALEDALAFCNWSGMSLPTEAQWEYAARGGRQSEYPWGDTLLEGGYYHANTWQGRFPYENTGLDGFIGTAPVYEFLPNDFGLYQMIGNVWEWCRNPRYTLLASFNEDDYELPKYGIQDEEYAIRGGSFLCHCSYCNRYRVAARNGCISTSTSSHLGFRCLKE >NC_012466.1|WP_000250873.1|1632680_1634156_-|arylsulfatase MVQTKQPNIILIVVDQMRADALSLNSKDKLVSTPTLDMMASVGYNFENAYSPVPSCVPARAALLTGLDQDKSGRVGYQDEVPWNFTNTLPKVFKDMGYQTECIGKMHVFPSRQRLGFDHVLLHDGYLHVDRKYDKAYGSQFDYASDYLAFLKGKVGYDVDLIDDGMDCNSWEARPWDKDEKLHPTNWVVSESISFLQRRDPTVPFFLKMSFEKPHAPLNPPKYYFDMYMERLPQFLDLHIGNWEVLEKQIPSIYALRGKLKEDDQRRMVAAYFGLITHIDHQISRFLTALKEFRHDKDTIIWFVSDHGDQLGEHYLFRKGYPYQGSIHIPSFIYDPAGLIAGNRGTIKQLVKIQDIFPSLVDLAGGTTTDELDGRSVKNLLFGQYEGWRTEFHGEHALGKDSSQYILTDQWKFIWFPVLNHYQLFDMKKDPHEMNDLYPSEKYQPIVRQMKKKLVNFLRYREEGFVVDEELVPVELSKITPTLTKTGDSQS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
22832 : 31670
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_012466|22832:31670|DBSCAN-SWA TATGACTTCAGTTGTTGTTGTAGGTACCCAATGGGGTGATGAAGGTAAAGGGAAGATTACAGACTTCCTTTCAGCGAATGCAGAAGTGATTGCACGTTACCAAGGTGGTGATAATGCTGGTCACACGATTGTGATTGACGGTAAGAAATTTAAGTTGCACTTGATTCCATCTGGGATTTTCTTCCCTGAAAAAATATCTGTCATTGGGAATGGTATGGTTGTAAATCCTAAATCTCTTGTAAAAGAGTTGAGCTATCTTCATGAGGAAGGTGTAACAACTGATAACTTGCGTATTTCTGATCGTGCGCATGTTATTTTGCCTTATCATATCGAGTTGGATCGCTTGCAAGAAGAAGCTAAGGGCGACAATAAGATTGGTACGACAATTAAGGGAATTGGTCCAGCTTATATGGACAAGGCTGCTCGTGTTGGAATTCGTATTGCAGATCTTTTAGATAAAGATATTTTCCGTGAGCGTTTAGAACGTAACCTTGCTGAAAAGAATCGTCTTTTTGAAAAATTGTATGACAGTAAAGCGATTGTTTTCGATGATATTTTTGAAGAATATTACGAATATGGTCAACAAATCAAGAAATACGTGATAGATACATCTGTTATCTTGAATGATGCGCTTGATAATGGCAAACGTGTGCTTTTTGAAGGTGCACAAGGTGTTATGCTAGATATCGACCAAGGTACTTATCCATTTGTTACGTCATCAAACCCTGTAGCTGGTGGTGTGACAATTGGTTCTGGTGTCGGTCCAAGCAAGATTGACAAGGTTGTAGGTGTATGTAAAGCTTATACGAGTCGTGTAGGAGATGGTCCTTTCCCAACTGAGTTGTTTGATGAAGTGGGAGAACGTATCCGTGAAGTGGGTCATGAGTATGGTACAACAACTGGTCGTCCACGTCGTGTAGGTTGGTTTGACTCAGTTGTGATGCGTCATAGCCGTCGTGTTTCTGGTATTACTAACCTTTCTTTGAACTCTATTGATGTTTTGAGCGGTTTGGATACTGTGAAAATCTGTGTGGCCTATGATCTTGACGGTCAACGTATTGACTACTATCCAGCTAGTCTTGAGCAATTGAAACGTTGCAAGCCTATCTATGAAGAGTTGCCAGGTTGGTCAGAAGATATTACCGGAGTTCGCAATTTGGAAGATCTTCCTGAGAATGCGCGTAACTATGTTCGTCGTGTGAGTGAATTGGTTGGCGTTCGTATTTCTACTTTCTCAGTAGGTCCTGGTCGTGAACAAACAAATATTTTAGAAAGTGTTTGGTCCTAAGAGATTTTTAAGATTTGTTTAAGATAGGTCGGGTATACTATAGACAGTTACAAGAAGACCTCCTAACTTGTTGTAACAAATATCCTAAACTTTTCTTTTTCATAATAATCTCCCTATAGAGTCACCGCATTCGGTGGCTTCTTTTGTGTTGGGATTCATGATATAATAATAAAATCGATAAGTAGGAAAAGAGAAAAGAGATGTATTATACGCTTGAAGAAAAAGAAGTCTTTATGAGGGAGGCTTTGAGAGAGGCTGAGATTGCTCTTGAACACGATGAAATTCCAATTGGTTGTGTGATTGTCAAAGATGGGGAAATCATTGGTCGTGGGCATAATGCGCGTGAGGAATTACAGCGAGCGGTTATGCATGCGGAAATTATGGCTATAGAGGATGCGAACTTGAGTGAGGAGAGCTGGCGCTTGCTGGATTGCACACTTTTTGTGACCATTGAACCTTGTGTCATGTGTAGTGGGGCGATTGGGCTTGCCCGCATTCCAAATGTGGTCTATGGGGCTAAAAACCAGAAATTTGGCGCTGCTGGGAGTTTGTACGATATCTTGACAGATGAGCGTCTCAATCATCGTGTGGAGGTTGAAATAGGAATTTTGGAAGATGAATGCGCAGCTATCATGCAGGATTTTTTTAGAAATAGACGGAAAAAATAATTTTGCTTTTAAAATGAATAGGAATGTGATATAATAAATAGTGGAGCAACAGTTCTGCGTGAAGCGGGTCAGGGGAGGAATCCAGCAGCCCTAAGCGATTTGAATTGTGTGCTCTTTTTTCGTGCACTTTAAAAACCCTTTAAAATCAACACTTTAAGGGGTTTTTGTTTGTCTTGTATAAGAAAAAGGGGCAGACGAGGGGCACAATTTAAAATTTTATCTTGTCTAACTTGCTAGATATGTCTGATACCATTTTTTGAGTAACGTGAGAATAAATCTCTAGTGTGGTCTTTGAGTCACTATGCCCTACTCTGTCCATGATGGCAGTCAAGGGAATGCCCAGCTCAGCAAGTAGGGATATGTGAGAATGTCTAAATGTATGTGTAGTTATGTTTTTTTCTATGCCGATTTTTTGACCATGTCTTTTCAATGCACAAATAACCCTGGCATTTGTTATTGGTTCTCCTAGAGTATTGATGAAAATAAAATCTGTATCAAATCCATTTGTCGCATTCTCTATTATTTGCTCTTTGATAATATCTAACACTTTTTGAGGTGCTGTTATAACCCTATCGGACTTGATTGTCTTTGGTGTAGTTCTCTCTTTTTGTCTGAAATCGTATGTATGCTTGATGTGAATAGTCTTTTTAGAAAAATCTATATCTTCCTTGTAGTTTAAGGCTGCCAGCTCTCCATACCTCATGCCAGTAAGAAAAAGAACTTTAGCTATTCGGATATACTTTGTAATTCGATAATCACATAGGGCCTCGTCTTTTAAATTTTGGATGAATAACTTAAACTCTTTTTGGTCTAAGTATTTTGTATTTTTCTTTCTGAGTTCGTCGGATGTAATTACTTTTCTAGGCGTTTCAACAAATAGCATTTCATTTGTATCAATATAATTCATTCTGATAGCAAATTTCATTATCTGATTGAGCTTGAATTTGATTTTAGAAACATAGTTATGAGATCTCCCATCTTGTAATAGTTGATCTATTACTTTTTGTAATAAACGTCTATCAAATTTCTAACTAGGTAGTCGCCCTCTATCTGCTTTAAAATCTCTTTTTTTACATTCTTTGAAGCGTAGACGGTTGAGTTTTTTACGCCGTGTTTCCAATTCTCCTCAAATTCTTCATATAGTTTTTCAAAAGTTATATTAGAAACAGAATGTTGTTTTTCTCCTAACTTTTGTTTTATCTTTTCCTGAAGTAAAATCGCAGCTTGATTTCTTGCTTGGGGAGTTTTTTTCTCCATCGTTACTGAGACTTTTTTTAATTTCTCAGTATATGGATCTTTGTATCTCTCAAAAAATTTATATTTGCCGTTTGGCAATTCTTCCATCCACATTGATTTTACCTCACTTTTTTGATAAAATGGGTATAGTAAAGAGGGCTTTTTTTATTATGAGAATTTCTTGATTACTTCTAAAATTTCATTGGCATAATTTGCGACTTCGAGAGGGGTAGACACCGGGAAGATGCCTTTATCACGGATTTCGATAGTGCTTTTTTTTGAATTTGAACGATAACGTAATACCCATTTTTTGATGTTATCGTCAACCAAAACATTGAAATAGCTACGGTTATCTCTGTAAAATACACGTTCTGGAGAAACTACATCCCTAGCAAGCATTTTAACAACAGTATAAACTTCTAATTCAGCAGGAGTTGTGATAATTTCGTCAGTTACTTCGACAATCTCTTCAGCTTCAGCTTCAACTTTTGGAATATCGGTTGTTACTTTGGTTTCAACGCTTGTATTAAGTGCAGCACTTAATTTTTCATTAACTCGCTCTGTGATGAATTGATTAAACCCTTTCACAATAATGGGAGAAAATGTCGTTAAGATATTTTGAGTAACACGCCCTTCATAGATTTCAGAAGTTAGATATCTGAGGAAGCTATCTGACGGTGTAGTGATATTTTCAGTAAGGAACGCTTTAAGATTGTTGAGGTATTTCAATTCAGAAGCTGATGAAACAATATTATCAATATCAAAATTCTCTTTGTGGAATTTGATGATTTCAGTAAATTGATTTTCTTTGATATCAGTCACATCGATTGTTAAGAATGGAGTTGTGTCCATTTTATTTGGCTCATCTAAATCAGTAAAGAATTTATATTCTCTACCATTTGTCAAGATACCGAATTTTGATTTAGTAGTTACGAAATATCTGAATAGTTGAGAGTCGTGCTTAGTAAGGTTTTCTGTAATTGATTTACATTCAATTAGGATTTGAGGCTCGCCATCCAAAATGATCGCATAGTCGACTTTTTCGCCTTTTTTAATGCCCACGTCGGCAGTAAATTCCGGGACAAATTCAAGTGGATTGAAGATATCATATCCAAGCGCTTGGAAGAACGGCATAATGAAGGCATTCTTTGTTTGTTCTTCATTCGTAATGCTTTGGCTGAGGTCTGCTACACGTTTGCCGACTTGTTTTAAATCGGCTTTTACTTTATCAATTTCCATATTGATACTCCTTTTTTTAATTTACTAATGCTAAATACTCTTCTTTAACCATGATTTCATTTGTCATGGTTTTTAGATTGTAGTAAGACATGAATTTGAGGTAATCAAACTCTGTGGGGTCGTCTAAGTTTTCTAGAGCGTCTTTTACGAGATGATGGATCATATTCCTATCAGCTTCGTTTTCACAGCGTAGACGGGCGTTCTGGTGCTCTGAGCGTGTGTGGTCTTTGTGTCCAAGTTCGTGTAGGGCGACTTGGATTTGTTGTTCAGGAGTCAAGTTGTGGTCAATAGCGAGCACGTTTGTGTCTGGATTGTAGAAACCGCTATTGTGCCAGTTTGAACCGTCGAAGAGACAAAGTTCTACTTGATATTCTTCGCAGAGTTTAGCGAGTGTCATAGTTCTCCTTCGTTATTTATAGACATCTCTGCGGTGGGCGATTTCCACGGCTAGGACGACTAGTTTATCGTCTTGGATATCACAGATGATGCGGTAATTCTCTACTCTGTATCGCCAGTAACCTGCAAGGTTGGCTTTTAGTGCTTTTCCGTGTTGTCGTGGATTGGTCGTGTTTTCAATGTTTTTAGCAAGCCAGGATAGGATTTGTTTTCTGGTTGGGGTATCTAGTTTTTTAAGTTGCTTGAGAGCTTTTTTATCAATATCTAGCCGATACATTAAGCAATATCCTCTCGAGTTAGTCCTAGTTCATCCAAGACCTCATCCATGGTATAAGTAGCTGGGTCGGCTAAATACTCCATATAGGCTTGGTCGGCTGCTCGTGCGTCTTCGATATCTTCCATGAGTGCCATGAAGTCGTCAAAATCCATGGTCGTTGTGTCGATACCGTGTTTGTTTAGGTAGTCCGTAATGTAGGAATTTTTTTCTGTGAAGTTGATAGTGATAGTCATTAGCGTTCTCCTTTGCTTTTGAAGTGGGCGGATAGGACGGATGTAATGAAGTCGATATCATCTTCATTTAGTGGTTTCCCGTCAAATAACATGGTGTTGGCTGCTGCTTTGCGTAAGTCTATGATTTGTCCGTTTACTTGGGCAAATTCATCACTCCCAGCGATAGCAGGGTTATCTGTTCGTCCGAGCAGGTAGTCGGTGGATACGTTGAAATAATTAGCAATTTCTGCGATACGTTCAGCGTTTGGCGTAGAATTTTTTATCTTATAGAGTGTATTTCTACCATAACCTAAGTCTTCTTCTACTTGTCCAAGAGCTTTTCCACGCTTTTTTGCCAATTCTTTTATTTTTTCAAATGTCTCAAACATTGTTAAATCAACCTTTCTAAGACATCACAAAAAAAATTTAACAAATTTGGTGTAAAAAGGTTGACTAATTATCCCAAAAGGTGTAAAATGTTTTTTGTAAGTGATAAACAACTAAAAAAACAACTAAGAAATAAATTATAAAAATGTTTTGGCGAACGGTATTTATAGATTTATTGGTGTTTTTATTATGCTTTAATTTTAGCCGATTTGGTGTAAGTTGTCAAGTATAATGCAGAAAAATAGTTACATTTTTAGTTGTTTCTTATTTACAAATAAGTAAAGAGGAGGAACGTGCTGATGGTAAGTATTCTTAAAAATTTAGAACAAGAAAAAGACCACCTTGAAAAAGTCATTAAGGTAGTCAGCGCTGGTGGTAAATTTCTGAGATTGCCATATCAAAAAAGTCACGCTCGATTAGTGAGAATCTGAAATTGATTTCTCAAAATCTTTACCATCATCGTAGATGTCGCGTTTGCTTGCTTTGAGTAAATATTCTTTAAAAGTCATAAGGTTAACTCCTTTCTGCTTATATTATAGCAGAAAAAGAAGAAAGAAAAAGAAAGGAGAAAATATGCCAGATATCGCAAACGGTCGCGAAAGAGTTATTGCTTTCTTGAAAGAGAAAGGCATTAAAAAAGCAACTCTAGCGGTTGCTTACGGCTTTAAACGACAGGAAGTGACAAACATTCTAAGTGGAACGACTAAAGGTCCACGAGCGAACAGTTTCATTCTTCAGGTTATTGAAGATTATGGGATTGAGTAGGAAAGATTTGAGGAGTAGGAAAATGAGACCAAAACGATATCCGTATAGTGGACAAAAAGAGTCCACCTTTGTAAAGGCAGACCCTGAGTTAGTTGAAAAACTTTTAAGAAACACTAGTTTTCTTGAGTGTTTACAAAAAAAGCCTATCAATTTTCAGATAGACTCAGAAGAATTTAAGCGTCTTAGCTATGAAGCCATTCATGATACTTCTCAAGTAACTCAATAGGAGGAAGGAATAAAATGATTCACCATTATATAACTCACTATGCCAGCAATGGGAAAGATTACGCCGAAGCATGGATTCAAATTGATTTTTTGGGAATGTGCTTTTGTGTATGGAAAAAGCGTACAACCATTGAACGATTGTACGCAAACGAAGATTAGACTTTTTTCCAACCGTTGCCTTTAGCAGATGTCGGAGGGAGCCGATCACCTTTTCCGATAGTTGCGGTATGACCATTAGTAACTTTTCCGCCACGAGGTCCTACCTCTACATAGCGACCAGGTTTCTGATTATCTGTTCCAGGTTTTATTGGAGTATTTGCCATACTATCTCCTCCTTTCTATAAGTTTGAGAAAATCAACGGTATCTGGTATTATTTCGATGGCTCAGGCTATATGCTTTCAGACCGCTGGAAGAAGCACACAGACGGTAATTGGTACTACTTTGACCAATCAGGCGAAATGGCCACAGGCTGGAAGAAAATCGCTGACAAGTGGTACTATTTTGATGTAGAAGGTGCCATGAAGACAGGCTGGGTCAAGTACAAGGACACTTGGTACTACTTAGACGCTAAAGAAGGCGCCATGGTATCAAATGCCTTTATCCAGTCAGCGGACGGAACAGGCTGGTACTACCTCAAACCAGACGGAACACTGGCAGACAAGCCAGAGTTCACAGTAGAGCCAGATGGCTTGATTACAGTTAAATAAATAGAAAGGAAACTTTCTAAATTGTTCTTTCACCGCAGGCTCAGGCTTGCGGTTTTTTATTTGCTCTGATTCTTCAAAAAAGCGTTTTCTTGAAGAATAGGGAGGAGGAATGGCAGGGTATTATTGCCAAAAACGCCATTTTGTTAATAATAGCTCCTTTTTATTTTTTGATTATTGTCAAAAACGGTGTTTTGTCAAAAATAAAAACAGTGACCGAAATCACTGCTTATCAGTTGTAGCAAATTCATAAAGTTTTTCTGCTGTGAGAAGTGCCATTTTGTCCATGCTTGTTTTTCCTTTTCTGAGGTCAGAAACAGTAGTCCATGGAACTCCAGCACCTTGGGAAATAGCAGATGTAGACATCGAACTGTCTAACAATTCTTGAATAACTTCTCTCATCTTATTTGTCCTTTTTATTTTTTAGATAAATATATACATTGACCGCAATTATAAAAATAGCTATTGCACTAACCATTGCTTTTCCTCTTTTCATTTGATAAAATAGAGGTGTGAGGGGCTTTCGCCCCAACCTCTTAGCGTTCACCTTTTTCTTTGACGGGATTTCGGTTTACGCTTTTTGTTTTGCCTTGCGACCGTTATTGCAGTCACCAGACTTGCTATAGCAGTTACCGTTTCAGGGATATTATCTATCGCCTTTTCCAGTAACCTAAGCCAATCTTCTTTGTTCAACTTCCTCACCTCCTTTCCTTATCTTGATTATATTATATCACGGTAAACCGTGAAAGTCAAGCGATTTGATGAAGTTTTTTTGAAAAACAAAGGGGCAAAAAAGGGGCAAAAGTGTCGTAAACCTCTGTAAAACGATGTAAAAAATCAACTTTGCCCTCGCTTTAAAGCTCTAAATTTCAACGTATTGTGAAACAGTGTAAATTATCGTATCGCCTATAATTGTTGTGTGCTCTTTTTTTCGTGCTTTTTCCGAATAAATAAGATAGAATAATCTAGAATAAATGATAATAGAAAAGAGAAAATTATGAAAATTCGTGGTTTTGAATTGGTTTCGAGTTTTACAGATGAAAATTTATTGCCCAAGCGTGAGACAGCGCATGCGGCTGGTTACGACTTAAAGGTTGCTGTGCGTACAGTTGTTGCGCCAGGAGAGATTGTCTTGGTTCCGACAGGGGTTAAGGCTTATATGCAGCCGACTGAGGTTCTCTACCTCTATGATCGTTCTTCAAATCCTCGTAAGAAGGGCTTGGTTTTAATTAACTCAGTTGGGGTCATTGATGGGGATTATTATGGAAATCCTGGAAATGAAGGGCATATTTTTGCGCAGATGAAGAATATCACAGATCAAGAGGTTGTTCTTGAAGTTGGGGAACGTATTGTCCAGGCTGTTTTTGCTACTTTCTTAATTGCAGATGGAGATGCAGCTGATGGCGTTCGAACTGGTGGATTTGGATCGACAGGGCACTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_012466|22832:31670|24319_24787_+|WP_000291870.1|DBSCAN-SWA MYYTLEEKEVFMREALREAEIALEHDEIPIGCVIVKDGEIIGRGHNAREELQRAVMHAEIMAIEDANLSEESWRLLDCTLFVTIEPCVMCSGAIGLARIPNVVYGAKNQKFGAAGSLYDILTDERLNHRVEVEIGILEDECAAIMQDFFRNRRKK >NC_012466|22832:31670|29107_29299_+|WP_001112859.1|DBSCAN-SWA MPDIANGRERVIAFLKEKGIKKATLAVAYGFKRQEVTNILSGTTKGPRANSFILQVIEDYGIE >NC_012466|22832:31670|24995_25694_-|WP_001106362.1|integrase|DBSCAN-SWA MNYIDTNEMLFVETPRKVITSDELRKKNTKYLDQKEFKLFIQNLKDEALCDYRITKYIRIAKVLFLTGMRYGELAALNYKEDIDFSKKTIHIKHTYDFRQKERTTPKTIKSDRVITAPQKVLDIIKEQIIENATNGFDTDFIFINTLGEPITNARVICALKRHGQKIGIEKNITTHTFRHSHISLLAELGIPLTAIMDRVGHSDSKTTLEIYSHVTQKMVSDISSKLDKIKF >NC_012466|22832:31670|31226_31670_+|WP_000701992.1|DBSCAN-SWA MKIRGFELVSSFTDENLLPKRETAHAAGYDLKVAVRTVVAPGEIVLVPTGVKAYMQPTEVLYLYDRSSNPRKKGLVLINSVGVIDGDYYGNPGNEGHIFAQMKNITDQEVVLEVGERIVQAVFATFLIADGDAADGVRTGGFGSTGH >NC_012466|22832:31670|27278_27659_-|WP_000170931.1|DBSCAN-SWA MTLAKLCEEYQVELCLFDGSNWHNSGFYNPDTNVLAIDHNLTPEQQIQVALHELGHKDHTRSEHQNARLRCENEADRNMIHHLVKDALENLDDPTEFDYLKFMSYYNLKTMTNEIMVKEEYLALVN >NC_012466|22832:31670|26191_27262_-|WP_000401841.1|DBSCAN-SWA MEIDKVKADLKQVGKRVADLSQSITNEEQTKNAFIMPFFQALGYDIFNPLEFVPEFTADVGIKKGEKVDYAIILDGEPQILIECKSITENLTKHDSQLFRYFVTTKSKFGILTNGREYKFFTDLDEPNKMDTTPFLTIDVTDIKENQFTEIIKFHKENFDIDNIVSSASELKYLNNLKAFLTENITTPSDSFLRYLTSEIYEGRVTQNILTTFSPIIVKGFNQFITERVNEKLSAALNTSVETKVTTDIPKVEAEAEEIVEVTDEIITTPAELEVYTVVKMLARDVVSPERVFYRDNRSYFNVLVDDNIKKWVLRYRSNSKKSTIEIRDKGIFPVSTPLEVANYANEILEVIKKFS >NC_012466|22832:31670|27671_27935_-|WP_000285962.1|DBSCAN-SWA MYRLDIDKKALKQLKKLDTPTRKQILSWLAKNIENTTNPRQHGKALKANLAGYWRYRVENYRIICDIQDDKLVVLAVEIAHRRDVYK >NC_012466|22832:31670|29321_29525_+|WP_001247549.1|DBSCAN-SWA MRPKRYPYSGQKESTFVKADPELVEKLLRNTSFLECLQKKPINFQIDSEEFKRLSYEAIHDTSQVTQ >NC_012466|22832:31670|25783_26137_-|WP_001814135.1|DBSCAN-SWA MWMEELPNGKYKFFERYKDPYTEKLKKVSVTMEKKTPQARNQAAILLQEKIKQKLGEKQHSVSNITFEKLYEEFEENWKHGVKNSTVYASKNVKKEILKQIEGDYLVRNLIDVYYKK >NC_012466|22832:31670|28167_28536_-|WP_000464160.1|DBSCAN-SWA MFETFEKIKELAKKRGKALGQVEEDLGYGRNTLYKIKNSTPNAERIAEIANYFNVSTDYLLGRTDNPAIAGSDEFAQVNGQIIDLRKAAANTMLFDGKPLNEDDIDFITSVLSAHFKSKGER >NC_012466|22832:31670|27934_28168_-|WP_000156419.1|DBSCAN-SWA MTITINFTEKNSYITDYLNKHGIDTTTMDFDDFMALMEDIEDARAADQAYMEYLADPATYTMDEVLDELGLTREDIA >NC_012466|22832:31670|29679_29847_-|WP_000024181.1|DBSCAN-SWA MANTPIKPGTDNQKPGRYVEVGPRGGKVTNGHTATIGKGDRLPPTSAKGNGWKKV >NC_012466|22832:31670|30451_30631_-|WP_001209433.1|DBSCAN-SWA MREVIQELLDSSMSTSAISQGAGVPWTTVSDLRKGKTSMDKMALLTAEKLYEFATTDKQ >NC_012466|22832:31670|22832_24119_+|WP_000205044.1|DBSCAN-SWA MTSVVVVGTQWGDEGKGKITDFLSANAEVIARYQGGDNAGHTIVIDGKKFKLHLIPSGIFFPEKISVIGNGMVVNPKSLVKELSYLHEEGVTTDNLRISDRAHVILPYHIELDRLQEEAKGDNKIGTTIKGIGPAYMDKAARVGIRIADLLDKDIFRERLERNLAEKNRLFEKLYDSKAIVFDDIFEEYYEYGQQIKKYVIDTSVILNDALDNGKRVLFEGAQGVMLDIDQGTYPFVTSSNPVAGGVTIGSGVGPSKIDKVVGVCKAYTSRVGDGPFPTELFDEVGERIREVGHEYGTTTGRPRRVGWFDSVVMRHSRRVSGITNLSLNSIDVLSGLDTVKICVAYDLDGQRIDYYPASLEQLKRCKPIYEELPGWSEDITGVRNLEDLPENARNYVRRVSELVGVRISTFSVGPGREQTNILESVWS |
14 | Streptococcus_phage(75.0%) | integrase | attL 24892:24907|attR 31145:31160 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
116894 : 181508
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_012466|116894:181508|DBSCAN-SWA AATGGTATGTAGTATACTTGCTTCTACAAGTGTTTTGGCAGTATGGGTTGATGGTGGTCAATGGAACTATGGAGTAGGATGGTCAGGAAATTTTGGTTATTCTGATTATTTACATTCTACTCGCTCTCATACAGCAACTGTTAAAGATGGAAATAAATTCTCTAAGGATCGTGCAGAAGCTGAGGCGTGGGCTCGGGCTTCAATCTTCAAATTCCCACCAACGGGAATGGAATATTTCTATGGATTTTAATTAAAATTCTCCCTCCCCTTTTGGAGAGGGAGTTTCTTCACGGGAGGTATCTCTATGAAAAAAATCAGTCATCTTTGTATGCTCCTGCTCTTGCTGTGTACTACGTTTTTTGTCCTGAATGTAAATGTTACACGAGAAATAGTGCGGATTCAGGAGATGGGCAAGACAACTTATTCATTTGACTTGTACTTGAAAGATGTCACTAAACCGACAGAAACGATTCTCCAGTTTTTTGAAGAGGTTGCAAGCCAAGACAAGGTCTCTATTATCAAAGTAGATAATGGCGATGAGGTGGTCAAGTCTGGTGTTTTTGATAAAGATACCTTCCCCTACCAAGAGTTTGGGATTTCTTCTCTTGATTTTACCACAGATGGTGAAGGAGTCTATAGTAATAAAGAAATTTCCAATAAACTTGGTACGATTCCGACCTTTCTAAAAGCCAAACCTATTCAGCTTATGACTTTTCAAACCTATATCAAGGATACATCTCGTAGTTTAAATGGTCGCTATACGATAACTTCTACACAAGAGATGGACAAGGATAGGATTGTACAGAAATGGAGCGATTTTTTCAAGATAGACCAGGCTACCTTGCTAGAGCCGACCTACAAAAGTGCAGTGGAAGTCATAAATCGAGATTTGCTTTTATCTGCCATTGTTTTTGTCTTGGCTATTTTGCTTCTTGTGTTAGTGACAGTGTATCAACCGATGATGGAGATGAAACGAGTTGGGGTACAAAAATTACTTGGTTTTCAAGATAGGGCTGTTTTAGCTGATGTTGTAAAAGGCAACCTTTACCTCCTCCTAGGTGGGGCTCTTGTGATCAATCTAGGCGTGTTTTTCTTGCTTGATTATAAGCCAAAAGATTTGTTTCCTATGCTGTGGTTGTCTCATTTTTTGCTGTTGCAGCTTTATCTCTTTATCAGTTGGTTGACTTACCTCTTAATCCAAAAAATGACAATCAGCTCTCTGCTGAAAGGTTTTTCATCTTTCAAATTTGGTCTACTCTTTAATTATTTGATGAAAATTGGAACTACCATTTTACTGACAGTCTTGCTAGTTGGGGTAGGAAAAAGTTTGGAGCAAGAAAACAAAGAGTTGGATTACCAGAAACAGTGGATCAGCCAAGGAAATTATCTGACCTTAGAAACTTTCCAACTCAATGACAACTTGTGGCAAGAGCAGTTGGCAGGCTCAGGGAAGGCATTGGATTATTTCTATCGATTTTATCAGGATTTAGTAGAAAAAACGCAGGCGGGCTATGTGCAGAGTAGCAGTCTTCCTGTAAAAAATTTTGTCCAATCAGAACAGATTCAGCAATATCAGTTAACAGATACGGTGGATGTTTACTATGCCAATCGCAATTTTCTAAAGAGCAAGGGATTCAAGCTACCAGATACTGGTATTAAAAAAGTTATTTTGATGCCAGCAAGTACGAAAGGTGAAGAAGATAAAAATCAGCTCTTGGGGAAGTTAATTGCCTTTCATTCGATGAAGTATGAAGAGCAGCAAAAACGAACGATAGAGGAGATGGATGTCGAGATTGCCTATTATGAAGGAGATTGGTCATTTTTCCCATATAGTGATAAGCGAAAGGAAAATCTCTCCAATCCAATTATTAGCTTGGTCAATGATTCTGATATGATGTGGGATGAGAAAGCCTCCCTGTCAACAACTGGCTTAAATAATCCGATTAAAATTGAAAATACGGTTCAACATCAAAAAGAGATTACAGAGTTAGTTGAGAAATTGTCAGATGGAAATTATTTAAAATTTTCATCTATTCAAGCCATTCAACAAGAGAAAGTGGATTCTTATCGAGATGCTGTTCGGAATTTTAACCTACTCTTTGCTTTGTTTGGTCTCTTTAGCATGATGATTTCCTACTTCTTACTAGTAATAACTTTCTTATTGAAGCGCAGGGATATTATTACCAAGAAGTTTATGGGGTGGAAACTGGTCGATCGCTACCGTCCTCTCCTCGTTCTGCTCTTGCTGGGCTATAGTCTCCCTCTTCTAGTCTTGATTTTCTTTGCCCATGCGTTCTTGCCACTCCTGCTGTTTGCAGGCTTTACATGTTTGGATATACTATTTGTGCTAGCCTTGGCTTCTAGGATGGAGAAAAGAAGTCTAGTAGAGTTATTGAAAGGGGGCATCTTATGATTGAGTTGGAAAATATTACCAAAACCATTGGGGGGAAAGTGATTTTGGATCGCTTGTCTCTCAGGATTGATCAGGGGGATTTGGTTGCCATTGTTGGTAAGAGTGGTAGTGGGAAGTCGACCTTGTTAAATTTATTGGGTTTGATAGATGGTGATTATAGCGGACGGTATGAGATTTTTGGTCAGACAAATCTAGCGGTCAATTCTGCTAAGTCGCAAACAATAATCCGTGAACATATCTCTTATCTGTTTCAAAATTTTGCCCTGATTGATGATGAAACGGTCGAGTACAATCTTATGCTGGCGCTGAAATATGTAAAATTGTCTAAGAAAGATAAGCTCAAAAAGGTGGAAGAGATTTTAGAGAGAGTAGGTTTGTCAGCTACTTTGCATCAAAAGGTCTCCGAGTTGTCTGGTGGCGAACAACAACGAATTGCAGTTGCTAGAGCCATCTTAAAACCCAGCCAGCTGATTTTAGCCGATGAACCTACAGGTTCGCTGGATCCTGAAAATAGAGATTTGGTCTTGAAGTTTCTCTTAGAGATGAATCGAGAAGGGAAAACAGTCATTATTGTGACCCACGATGCTTATGTAGCCCAACAATGTCATCGGATTATTGAATTGGGCGAGGGAAAATGAGTTCGTTCAGCTTCTTTTGACTGACTGAATACTCATATTTTCCAGAGAGGAATAGCATAAATACGCCTAGGAATGACATTTTTATGTAATTTTCCTAGGTTTTTCTGTTTTAAATTGAAAAAAATTACAATTTAGGCTTGACAAAGGATGAAGATAGGTGTATTATTTATACAAACAAAAGGAATAAACATAAAGGAGGCTTTGTTATGAATAAGATGAAGAAGGTGTTGATGACGATGTTTGGTTTAGTGATGCTCCCCCTACTATTTGCTTGTAGTAACAATCAATCGGCTGGAATTGAAGCCATCAAGTCCAAAGGAAAATTGGTTGTAGCCCTCAATCCAGATTTTGCTCCATTTGAATACCAAAAAGTGGTTGATGGGAAAAATCAGATTGTGGGTTCAGATATCGAATTAGCCAAGGCTATCGCAACAGAACTAGGTGTCGAATTGGAACTATCTCCCATGAGTTTTGACAATGTACTGGCTAGTGTTCAATCAGGAAAAGCTGATCTTGCCATATCAGGTGTTTCTAAGACAGATGAACGGAGCAAGGTGTTTGACTTTTCCATTCCCTACTATACTGCAAAAAATAAACTCATTGTCAAAAAATCTGATTTAGTCACTTATCAGTCTGTCAACGACTTAGCGCAGAAGAAGGTCGGAGCCCAGAAAGGTTCGATTCAAGAGACGATGGCGAAAGATTTGCTACAAAATTCTTCCCTCGTATCTCTGCCTAAAAATGGGAATTTAATCACAGATTTAAAATCAGGACAAGTGGATGCCGTTATCTTTGAAGAACCAGTTGCCAAGGGCTTTGTGGAAAATAATCCTGATTTAGCAATCGCAGACCTCAATTTTGAAAAAGAGCAAGATGATTCCTACTCGGTAGCCATGAAAAAAGATAGTAAGGAATTGAAAGAGGCAGTCGATAAAACTATTCAAAAGTTGAAGGAGTCTGGGGAATTAGACAAACTCATTGAGGATGCCTTTAAAGCATCCATTGAAAAATAGAAAGAAGGAAAAGAACATGAGTAAAGAAAAAGTAATTTTGGCCTATTCTGGCGGTTTGGACACATCAGTTGCTATTACCTGGTTAAAGAAAGACTATGATGTTGTTTCAGTTTGTATGGATGTGGGTGAAGGGAAAGACTTAGATTTCATCCATGATAAGGCTCTTAAGGTTGGGGCAGTAGAATCTTATGTCATTGATGTTAAGGACGAATTTGCTACAGATTATGTGCTAGTGGCTCATCAGTCACATGCCTATTATGAACAAAAGTATCCCTTGGTATCTGCCTTGAGCCGCCCTCTGATTTCTAAAAAATTGGTTGAAATAGCGCATCAGATAGGAGCGACTACAATTGCTCATGGTTGTACCGGTAAGGGGAATGACCAAGTACGTTTTGAAGTATCGATTGCAGCCTTGGATCCCAATTTAAAAGTGATTGCTCCAGTTCGTGAATGGAAATGGTCTCGGGAGGAAGAAATTTATTATGCCAAGAAAAATGGGGTGCCTGTTCCTGCTGACCTTGACAATCCCTACTCTGTCGACCAAAATCTTTGGGGACGTGCCAATGAGTGTGGTATTTTGGAAAATCCATGGAATCAGGCTCCAGAAGAAGCCTTTGGCATCACAACTTCTCCAGAGCAAGCTCCAGATATGCCAGAATACATTGAGATTGAGTTTAGTGAAGGTGTTCCAGTTTCCCTCAATGGAGAAGTGTTAAAATTGGCAGATTTGATTCAAAAACTCAATGAAATAGCTGGAAAACATGGGGTTGGACGGATTGACCACGTGGAAAATCGCTTGGTTGGGATTAAATCAAGAGAAATCTATGAGTGTCCAGGTGCAGTGACCCTGCTGACAGCTCATAAGGAAATTGAGGACTTGACGCTTGTGAGAGAAGTGGCTCATTTTAAACCAATCATAGAAAATGAATTATCAAA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60 | Staphylococcus_phage(30.0%) | bacteriocin,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
305485 : 364379
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_012466|305485:364379|DBSCAN-SWA 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45 | Streptococcus_phage(37.5%) | holin,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
420925 : 481760
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_012466|420925:481760|DBSCAN-SWA 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55 | Klosneuvirus(18.18%) | tRNA,bacteriocin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
787403 : 847912
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_012466|787403:847912|DBSCAN-SWA 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54 | Streptococcus_phage(45.0%) | tRNA,bacteriocin,protease,transposase,integrase | attL 791009:791053|attR 842739:842783 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1110567 : 1177306
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_012466|1110567:1177306|DBSCAN-SWA 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60 | Indivirus(16.67%) | holin,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1282617 : 1326212
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_012466|1282617:1326212|DBSCAN-SWA 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51 | Streptococcus_phage(20.0%) | tRNA,holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1399511 : 1406265
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_012466|1399511:1406265|DBSCAN-SWA TATGTCTCAACTCTATGATATTACCATTGTGGGTGGTGGTCCTGTCGGGCTTTTTGCAGCCTTTTATGCCCACCTACGCCAAGCCAAGGTTCAAATCATCGACTCTCTTCCCCAGCTAGGTGGACAACCTGCTATTCTCTACCCTGAAAAGGAAATCCTAGACGTACCAGGCTTCCCAAACCTGACTGGAGAAGAGTTGACTAACCGCTTGATTGAACAGCTAAATGGATTTGATACCCCTATTCATCTCAATGAAACGGTTCTTGAGATTGACAAACAAGAAGAAGAATTTGCCATCACAACTTCCAAAGGAAGTCACCTGACTAAAACAGTTATCATCGCTATGGGTGGCGGTGCCTTCAAACCACGTCCGCTGGAACTTGAAGGGGTTGAGGACTATGAAAATATCCACTACCACGTTTCTAACATTCAGCAATACGCTGGTAAGAAAGTGACGATTCTTGGTGGGGGAGACTCGGCTGTGGATTGGGCTTTGGCTTTTGAAAAAATCGCACCAACTACCCTTGTTCACCGCAGAGATAATTTCCGTGCCTTGGAACACAGTGTTCAAACCTTGCAAGAATCATCTGTAACCATCAAGACACCATTCGCCCCTAGCCAACTCCTTGGAAATGGAAAAACACTTGATAAACTTGAAATCACAAAAGTCAAATCTGATGAAACTGAAACCATTGACCTAGACCACCTCTTTGTCAACTATGGTTTCAAATCTTCTGTCGGTAACCTTAAAAACTGGGGGCTCGACCTCAACCGTCACAAGATTATCGTCAACAGCAAACAGGAATCCAGCCAAGCAGGTATCTATGCTATCGGTGACTGCTGCTACTATGACGGAAAAATTGATCTGATTGCGACAGGCCTCGGAGAAGCTCCAACTGCTGTCAACAACGCTATCAACTACATTGACCCTGAACAAAAAGTACAACCAAAACACTCTACCAGTTTATAAAAAAGAACCACGAGTCACATAGGATTCGTGGTTTTATAATTCATCCGCTATCTTATTGATTTTTCTGAGTCTGTGATTGACACCACTTTTGGTCAGAGGGGTGCTGAGACTATCTGCTAACTGCTGGATAGAGTAGTCTGGGTGCTGAATCCTCAGTTGCGCCACTTCCTGCAAATCTACTGGCAAATTTTCTAAGCCCATGATATCTTTGATTTTACTGATATTGTTAATGGTCTTCATGCTGGCAGAAACTGTCCGAGCGATATTAGCTGTCTCGGCATTATTAGCCCGATTGAGGTCGTTACGGGTTTCTCGCAAAATCTTAACCCGCTCAAAATCATCACGTGCCTGCATGGCTCCTATTACTATCAAGAAGTCCATAATGTCTTCTGCTCGCTGGAGATAGGTCACAGCCCCCTTCTTGCGCTCAAGCACCTTGGCATCCAGTAAAAACTGTTGGAGAAGGGAGGCAATTCCTTGCGCGTGGTCCAGATAAACAGAACTGATTTCCAACTGGTACTTGCCTGACTCAGGGTCACGAATGCTCCCATTTGCCAAGAAAGCGCCACAGAGATAGGCACGACCTGCTTCCTCGTCCGATAAAATCGCCTCATCAATACCTGTTTCCAGGCCAAAGAAAGAGTCTGCCAAGTGCAAATCACTTAACAAATCCTGCACCTTTTCATCTGTAAAAACGGTATAGACGCGATTCTTGCGAAGATTGCTCCGTTGGTGGTGACGAATTTCAGATTTGATTTCATAGAAATGGAGAAAGGACTCATAGAGGTGACGGGCCAGTTTGGCATTTTCTGTCACAACTGACAAAGTCAAGCCCGAAGTCGAGAGACCGATGCTACCAGACATTTTGATAATGGCAGATAATTCATGCCGGCTCAGATGGTGTTGGCCCAGGATTTCTTCTTTTACTGCTACTGTGAAACTCATTTTTTCACCTGTATAATGCGCATCAACTCGTCCACAATCAAATCTCCATCGTGGAAGGCACCGCCATTTTCCAGACGAAGGAAGTTAGATGAAATCACGCGCGAAACTTGCTTACAAAGACCTACAAAATCGTGTTCCACTTGCACTAAGTATTCATCAAAACGGTTGGAATTCATGTATTCCTGAGGCACTTTTTCAATATTCACCAAGACAGTGTCGATAAAAGGGCGACCAAGGTGACGATGCAAGACTTCCACGTGGTCGCTATCTGTAAAGTGTTCCGTCTCCCCACGTTGGGTCATGATATTGCAGACATAGGCAATTTCTGCCTTAGTTTCCAAAAGAGCCCGCCCAATTTCCTTAATCACGATATTGGGCAAAATAGAGGTAAAGAGGGAACCTGGCCCTAGGACAATCATGTCACTTTCAAGGATGGTCTGCACTACTCGACGGCTGGCCAGAGGCGTATCATCGTTTAGGGCATTGGTCACATAGACATTGTCAATTATGCCTCGATGGTCTACAATATGACTCTCTCCAGCCACTTCTGTCCCATCCTGAAAGACTGCATGAAGGGTCAAAGGATGGTCACTGGAAGGATAAATTTTCCCTGTTGTATGGAAAAATTTGCTCAATAACTGCATGGCATTATAGGTTGAACCCTGCATTTCTGACAAGCCAGCAATGATGAGATTTCCCAATGGATGGCCAGCAAAGGCTCCGGCATCCTCAGAGAACCGATACTGAAAGACCTTCTCATAAAACTTAGGCATATCCGACATGGCCACAAGGACATTACGAAGATCACCTGGCGGTGTCAACTGTTGCATATTTTTTCGGAGTTCACCTGAAGAACCACCATCATCTGCCACCGTCACGATAGCTGCGATTTCCACATCTTTTTCCCGCAGACTTTTTAGAATGACGGGAATTCCAGTCCCTCCACCAATCACCGTTATCTTTGGTTTTCTCATGAACGGTTTACCGTTTCCTTTCTGCGGTCTTTGTCGCGATGCCCTTCATTAACAGACCAATTCTTGGATAAGTCCTGCACCAAGCGTTTAGCAAATGCCACACTACGGTGTTGTCCACCCGTACATCCCATAGCAATGGTCAAAACGGACTTACCTTCCTTTTGGTAACTTGGCAGAATCGGCTCAATCAAGGCCAATAAATGTTGATAAAAGTCTTCTGACTCAGGATGGTTCATGACATAATCATAAACAGGTTCATCCACACCCGTTTGGTTTCTCAGTTCTGGTAGATAATAGGGATTTGGCAAGAAACGGACATCAAAGACCAAGTCCGCATCAATCGGGATTCCATATTTAAATCCGAAAGACATGACTTCGATACGGAAAGACTGGGCTTGTTCTTGGTCTGAAAACTGCTCTGCAAGGGTTTTACGCAGCTCACGTGGAGTGAGTTCAGTCGTATCCACCACATTTTGGCTCATATTTTTCAAAGGTGCCAAGAGTTCACGTTCCAACTTGATTCCATCTAAAATACGACCGTCTGCTGCTAGTGGGTGACTCCGTCTGGTTTCCTTGTAACGAGCGACCAATTCCTTATCAGCCGCATCCAAAAAGAGGATTTTGAAATCCAAACCATCTTGATTTTCCAACTCATCCAAAACAGCTTGAATCTCTGAAAAGAAAGAACGGCTACGCATATCCACTACCAAGGCCAACTTAGGATTGTCTTCCTTAATTTCAACCAGCTGCAAAAACTTAGGCAAGAGAGCTGGCGGCATATTATCAATGGTGAAACAACCTAGATCCTCGAAGGACTGAATGGCTACAGTTTTCCCTGCGCCACTCATCCCTGTCACAATCACCAAGTGAAGTTGTTTCTTTGTCATCTTTTTCTCCTTATATCAAAAGAAGTTTGGCAACACCAAACTTCAACTAGCTTATCCAATCTCTGCGATGACTTCAATTTCGACTTTTACATCACGAGGAAGACGAGCTACCTCCACAGCTGAACGAGCTGGGAATTCCTCTTTGAAGGCCGTTTGGTAAACCTCATTAAAAGGAACAAAGTCGTTCATATCGCTCAAGAAGCAAGTTGTTTTGACAACATGGTCAAAGTCTGTTCCTGCTTCTGCCAAAATAGCACCGATGTTTTTCAAGACTTGCTCTGTCTGTTCTTGGATATTCTCTCCTACAATTTCCCCAGTTTCAGGGGATAGGGGAACTTGACCGCTAGCAAACAAAAGGTTGCCAACGATTTTTCCTTGAACATAGGGTCCGATAGCCTTTGGGGCCTTATCTGTATGAATTGTTTTTGCCATTTTCTTTTCCTCACAATTTTTCTAAGATTGCATCCCAAGCCTCATCCATCCCTGCCTTACTGACAGATGAAAAGAGGATGAAATCGTCACTCGGGTCAAAGTTTAATTTCTTTTTGATTGCTGATTCATGCTTGTTCCATTTACCACGAGGAATCTTGTCCGCCTTGGTCGCCACAATGATGACTGGAATCTCATAATACTTGAGAAATTCGTACATCTGCACATCATCTGCTGACGGGGCATGACGAAGGTCAACTAGACTGACAACCGCACGGAGATTTTCCCGAGTCGTTAAGTACTCCTCAATCATGCACCCCCACTTTTCACGTTCCTTTTTAGAAACACGGGCATAGCCATAACCAGGCACATCCACAAAGCGCATCTTGTCATCAATGTTAAAAAAGTTCAGGAGCTGGGTTTTACCAGGTTTTCCTGATGTACGGGCGAGATTCTTACGGTTCAACATAGTGTTGATAAAGCTGGATTTACCAACATTTGAACGCCCTGCTAGGGCAATCTCTGGCAGTTCATCCTGCGGATAGTGGGACTTATTAGCTGCACTGAGCAAGATTTCAGCATTGTGTGTATTAAGTTCCATAGTCACCTCTAGGCTGTTTCTAGGATCGGTTTATCCGTTCCATCGACAGTTTCTTTAGTGATGCGAACCAATTTCACATTTTCCTGACTCGGCACCTCAAACATAACATCTAGCATGGTTTCTTCGATGATGGAGCGAAGTCCACGCGCCCCTGTCTTCCGTTCGATTGCTTTATTAGCAATCTCTTGAAGGGCTTCGTCGTCAAATTCCAACTCAACATCATCATAAGAAAGCAAGGTTTGGTATTGTTTCACCAAGGCATTTCTTGGCTCTTTCAAGATGCGAACCAAGTCATCAACGGTCAATTGCTCAAGAGCCGCAAAAACAGGCAAGCGTCCAATCAACTCAGGGATAATACCAAATTTTTGAATGTCTTCAGCGATGATTTCTTGCATGTATGAGCTGTTTTCGTCAATCGCCTTATTGTTTTGACCAAATCCGATGACTTTTTCACCCAGACGTTGTTTGACAATTTCTTCAATACCATCAAAAGCACCACCCACGATGAAGAGGATATTTTTTGTATCCACTTGAATCATCTCTTGTTGTGGATGTTTGCGTCCACCTTGAGGCGGTACGCTAGCAACAGTTCCCTCGATAATCTTGAGAAGGGCTTGTTGCACCCCTTCACCAGAAACATCACGTGTGATAGACACATTCTCACTCTTCTTGGCAATCTTGTCAATTTCATCCACATAGATAATGCCACGCTCTGCACGTTCGATGTTAAAGTCAGCAACCTGCAAGAGTTTGAGGAGTATATTTTCCACATCCTCACCCACATAACCAGCCTCCGTCAGAGCTGTCGCATCCGCAATAGCAAAAGGTACATTCAAGCTCTTAGCCAAGGTCTGGGCAAGGAAAGTTTTCCCTGAACCAGTTGGGCCAATCATCAAAATGTTTGACTTCTGCAAATCCACATCTTCTGACTCTTCGCGTGTATCGTGGAAATTGATGCGTTTGTAGTGGTTATAAACCGCCACTGCCAAGGCACGCTTGGCACGATCTTGACCAATTACATAGTGGTTCAAGATATGGAGGAGTTCAATTGGTTTTGGCACCTCAGACAAGTCTGCCAAGACTTCCTCAACCAATTCTTCTCGAATGATTTCCTGAGCTAACTCCACGCATTCATTACAAATAAAAGCATTGTTGCCAGCAATTATTTTTTGTACTTCTTCTTGGTTTTTGCCACAAAATGAGCAATAAACCATCATATCATTTTTTCTATTTGTAGACATGATTTCCTTCCATTCTATACTGTCATTCTATCTAAAATAAGGTCATGTAAAAAGCATGAATACTATTGACCAGATTGGTAAAGGCATTTAACCAAAGGAGGATAGAAAGCCCGTAACGCTTTTTACGAAAAGCTTGTGCTCCTGCCAGAAAGCAGACCAAACACAGCATGGCTGTGAAAAAACCAAATATACTACGTTCCATTAGACTTCCTTTCTCTTGCGGTATTGGATGGTAAAATCATAAGGATTTTTCTCATCTTTGGTATAGGATTTGCTTGAAACCGTCTCAAAAAGAGACAAGTCAAACTCCTCAGGGAAATAGGTATCTCCCTCTACCCGAGCATGAATTTGAGTCACAATCACTTCATCAAGGTAGGGTTCAAAAGCCTGAAAAATTTGCTTCCCACCGAGAATATAAAGATTCTTGTCTTGATCCTGATACCAATCTAGAACAGACTGGATATTGTGAAAAGTAGCAACCCCATCTATCTTTTCTTCCGGATTACGCGTCAAAATCAGGGTCTCCCGTTTTGGAAGCAAGCGACGCCCCATTCCATCAAAGGTTACCCGCCCCATCAAGATAGCATGATTCAGAGTTGTTTCTTTAAAGTGCTGCAATTCTGCTGGCAAATGCCAAGGCAGACGATTGTCCTTACCAATCACACCCTCTTCATCCTGGGCCCAAATAGCTACGATTTTCTTAGTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NC_012466|1399511:1406265|1399511_1400480_+|WP_000080998.1|DBSCAN-SWA MSQLYDITIVGGGPVGLFAAFYAHLRQAKVQIIDSLPQLGGQPAILYPEKEILDVPGFPNLTGEELTNRLIEQLNGFDTPIHLNETVLEIDKQEEEFAITTSKGSHLTKTVIIAMGGGAFKPRPLELEGVEDYENIHYHVSNIQQYAGKKVTILGGGDSAVDWALAFEKIAPTTLVHRRDNFRALEHSVQTLQESSVTIKTPFAPSQLLGNGKTLDKLEITKVKSDETETIDLDHLFVNYGFKSSVGNLKNWGLDLNRHKIIVNSKQESSQAGIYAIGDCCYYDGKIDLIATGLGEAPTAVNNAINYIDPEQKVQPKHSTSL >NC_012466|1399511:1406265|1401421_1402399_-|WP_001231086.1|DBSCAN-SWA MRKPKITVIGGGTGIPVILKSLREKDVEIAAIVTVADDGGSSGELRKNMQQLTPPGDLRNVLVAMSDMPKFYEKVFQYRFSEDAGAFAGHPLGNLIIAGLSEMQGSTYNAMQLLSKFFHTTGKIYPSSDHPLTLHAVFQDGTEVAGESHIVDHRGIIDNVYVTNALNDDTPLASRRVVQTILESDMIVLGPGSLFTSILPNIVIKEIGRALLETKAEIAYVCNIMTQRGETEHFTDSDHVEVLHRHLGRPFIDTVLVNIEKVPQEYMNSNRFDEYLVQVEHDFVGLCKQVSRVISSNFLRLENGGAFHDGDLIVDELMRIIQVKK >NC_012466|1399511:1406265|1402395_1403286_-|WP_000163026.1|DBSCAN-SWA MTKKQLHLVIVTGMSGAGKTVAIQSFEDLGCFTIDNMPPALLPKFLQLVEIKEDNPKLALVVDMRSRSFFSEIQAVLDELENQDGLDFKILFLDAADKELVARYKETRRSHPLAADGRILDGIKLERELLAPLKNMSQNVVDTTELTPRELRKTLAEQFSDQEQAQSFRIEVMSFGFKYGIPIDADLVFDVRFLPNPYYLPELRNQTGVDEPVYDYVMNHPESEDFYQHLLALIEPILPSYQKEGKSVLTIAMGCTGGQHRSVAFAKRLVQDLSKNWSVNEGHRDKDRRKETVNRS >NC_012466|1399511:1406265|1405588_1405759_-|WP_000442257.1|DBSCAN-SWA MERSIFGFFTAMLCLVCFLAGAQAFRKKRYGLSILLWLNAFTNLVNSIHAFYMTLF >NC_012466|1399511:1406265|1403728_1404316_-|WP_000422597.1|DBSCAN-SWA MELNTHNAEILLSAANKSHYPQDELPEIALAGRSNVGKSSFINTMLNRKNLARTSGKPGKTQLLNFFNIDDKMRFVDVPGYGYARVSKKEREKWGCMIEEYLTTRENLRAVVSLVDLRHAPSADDVQMYEFLKYYEIPVIIVATKADKIPRGKWNKHESAIKKKLNFDPSDDFILFSSVSKAGMDEAWDAILEKL >NC_012466|1399511:1406265|1403337_1403718_-|WP_001140412.1|DBSCAN-SWA MAKTIHTDKAPKAIGPYVQGKIVGNLLFASGQVPLSPETGEIVGENIQEQTEQVLKNIGAILAEAGTDFDHVVKTTCFLSDMNDFVPFNEVYQTAFKEEFPARSAVEVARLPRDVKVEIEVIAEIG >NC_012466|1399511:1406265|1404324_1405557_-|WP_000106346.1|protease|DBSCAN-SWA MSTNRKNDMMVYCSFCGKNQEEVQKIIAGNNAFICNECVELAQEIIREELVEEVLADLSEVPKPIELLHILNHYVIGQDRAKRALAVAVYNHYKRINFHDTREESEDVDLQKSNILMIGPTGSGKTFLAQTLAKSLNVPFAIADATALTEAGYVGEDVENILLKLLQVADFNIERAERGIIYVDEIDKIAKKSENVSITRDVSGEGVQQALLKIIEGTVASVPPQGGRKHPQQEMIQVDTKNILFIVGGAFDGIEEIVKQRLGEKVIGFGQNNKAIDENSSYMQEIIAEDIQKFGIIPELIGRLPVFAALEQLTVDDLVRILKEPRNALVKQYQTLLSYDDVELEFDDEALQEIANKAIERKTGARGLRSIIEETMLDVMFEVPSQENVKLVRITKETVDGTDKPILETA >NC_012466|1399511:1406265|1400513_1401425_-|WP_000011276.1|DBSCAN-SWA MSFTVAVKEEILGQHHLSRHELSAIIKMSGSIGLSTSGLTLSVVTENAKLARHLYESFLHFYEIKSEIRHHQRSNLRKNRVYTVFTDEKVQDLLSDLHLADSFFGLETGIDEAILSDEEAGRAYLCGAFLANGSIRDPESGKYQLEISSVYLDHAQGIASLLQQFLLDAKVLERKKGAVTYLQRAEDIMDFLIVIGAMQARDDFERVKILRETRNDLNRANNAETANIARTVSASMKTINNISKIKDIMGLENLPVDLQEVAQLRIQHPDYSIQQLADSLSTPLTKSGVNHRLRKINKIADEL >NC_012466|1399511:1406265|1405758_1406265_-|WP_000162448.1|DBSCAN-SWA MTKKIVAIWAQDEEGVIGKDNRLPWHLPAELQHFKETTLNHAILMGRVTFDGMGRRLLPKRETLILTRNPEEKIDGVATFHNIQSVLDWYQDQDKNLYILGGKQIFQAFEPYLDEVIVTQIHARVEGDTYFPEEFDLSLFETVSSKSYTKDEKNPYDFTIQYRKRKEV |
9 | Streptococcus_phage(50.0%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1742846 : 1784816
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NC_012466|1742846:1784816|DBSCAN-SWA CTTACATCATCCCGCCCATCATACTTGGATCCATTGCTGGAGCTGGGGCTACTGGTTCTGGTTTATTGGCTACGACTGCTTCTGTTGTCAAAATCAAGCTGGCTACAGATGCTGCATTTTGTAGGGCTGAACGACTCACTTTAACTGGATCAATGATACCTTGATCAATCATGTTAACCCACTCGCCAGTTGCTGCGTTAAATCCTATACCAAGCTCAGCATTTTTCAAACGATCGATAACGATAGATCCTTCAAATCCTGCATTGTGAGCAATTTGACGAACGGGTTCTTCCAAAGCACGGAGAACAATATTACGTCCTGTTGCTTCATCTCCTGTCAATTCCAAGGTAGCAACAGCTGGAATCACATTGGCAAGAGCTGTTCCACCGCCTGCAACAATACCTTCTTCAACAGCTGCACGAGTAGCGTTGAGGGCATCTTCAATGCGGAGTTTCATTTCTTTCAACTCAGTTTCAGTTGCGGCTCCGACCTTAATAACCGCTACACCACCTGACAATTTGGCCAAGCGTTCTTGCAATTTTTCACGGTCAAATTCAGAAGTTGTAGTTTCGATTTGAGACTTGATAACCGCAACACGGTGAGAAATCGCTTCAGGATTTCCTGCACCTTCTACAATAACCGTGCTATCTTTGTCCACGGTCACTCTCGCTGCTTGACCAAGAGCTTCAATTGTCGCATCTTTCAACTCAAGACCAAGGTCTTCTGTGATAACTGTTCCGCCTGTTAAGATGGCGATATCTTCAAGCATGGCTTTGCGACGGTCACCAAAACCAGGTGCCTTGACTGCTACTACGTTGAAGGTTCCACGAATCTTGTTCAAAACAAGAGTTGGAAGAGCCTCGCCATCCACATCATCCGCAATAATCAAGAGTGGACGATTGCTTTGGAGAATGCTTTCCAAAAGTGGCAAGATCTCTTGGATATTGGAAATTTTCTTGTCTGTAATCAAAATGTACGGATTTTCAAGGTCAGCCACCATTTTTTCGCTATCTGTCACCATGTACTGTGAAAGGTAACCACGGTCAAACTGCATTCCTTCTACGACTTCAAGCTCTGTTTCCATACCACGTGACTCTTCGATGGTGATGACACCGTCTTTGCCAACTTTTTCCATTGCTTCAGAGATGTACTCACCAACTTTTTCAGAACGAGAAGATACGGCTGCAACTTGAGCGATAGCTTCTTTATTGGCAACAGGGATGGCGTTGTTTTTCAAAGCTTCAACTGCTGCGGCAACTGCTGTTTCAATCCCACGACGAATACCGATTGGATTTGCACCTGCTGTGACGTTTTTGATTCCTTCACGGACGATAGCTTGGGTCAAGACTGTTGCAGTCGTAGTCCCGTCACCTGCGATATCATTGGTTTTAGAAGCTACTTCTGATACCAATTTGGCACCCATATTTTCAAAATGGTCTTCTAATTCAATTTCTTTGGCAATAGTCACACCGTCATTGGTAATCAATGGTGAGCCAAATGATTTTTCAAGAACGACATTGCGACCTTTTGGTCCCAAGGTTACTTTAACAGTATCTGCAAGGATATCGACACCACGGACCATAGCTGAACGGGCATCTGATGAAAATTTAATTTCTTTTGACATACTTACTTTCTCCTTCTATTCTTCAATGATTGCCAAGATGTTAGCTTCGCCTACGATGATATACTTTTCATCGCCATCTTTGACATCAAGACCTGCGTGGGCTTCAACTAAGACACGGTCTCCAGTTTTAACACTTGGAGCAACCAAGTCACCGTTCAAGGTACGAACACCTTGTCCAGTAGCCACAACTTGGGCTGTTTTGGTTTTTTCTTGGGCTGAACCTGCGAGAACAAAGCCTCCAACAGTTTGTTCTTTTTCTTCTACTTTTAAGACCAAACGGTCCCCTAATGGTTTCAACATCTGATTTCCTCCATAATGAGATAGATATTATTAGCACTCTTTATACCTGAGTGCTAATTCATAGTTCTATTGTATCACTTAGTCAGAAATAATCAAGAAAAAAGTCTGACTTTCTCAAGATAAAAAGCCTGAGACCAACTCAGACTTTTTAATTCTTAAAATGGCAATTCTTCCTCTTCCAAGACCAAATCTGCCAAATCTTGGCCTGCATTATTTTCACGCATAGCACGTTGGGCACGACTTTCCAAGAGTTGGAATCCTGTCACAAGGACTTCGGTTACATAATTCATCTGACCATTTTTCTCAAAGCGACGGGTACGCAATTCTCCATCAACGGAAATGAGACTACCTTTGGTTGCGTAGCTTGCCAAAGTTTCTGCTAGTCTGCCCCATAGGACCATATTGACAAAATCAACTTCACGTTCACCGTTTTGGTCTTTGTAACGACGGTTGACAGCGATAGTTGCTCGCGCTACTGACTTGTCATTGTTGGTTTTGTGCAATTCTGGTGTAGACGTTAAACGTCCAATCAAGATAAGTTAGAGTTAGTAACAGTATTTTAACTTGCTTCTCTCTCCATATCATACATCCTCACAGAATGTAAGACCAGCTCACGATATTTCCAAGCGTTGACCAGGTATTCAATCACTTCAGGATCTTCAATTTCAAAACCAAAGAGCAGCAACAATCTAACCGTGTATTCGTTTTTCAAAATTGGGACGTTGTAAGTCACATCCACCCAATGCTCAAAGCCTGAATCTGTCTGCTCTACATTTGCTAGTTTAATATTTAAAATCTTCATTTTTATTCCTCCTACTTATCTATTCGTAAAAGAAGATAAAAAGTTATGAAAAAATCATTACTTTTTTAATTCAGACAGTACTTTCAGAGCAATTTTGTTAATGTCAACAAAATTGGCAACCAAGCGATTTAATACTATTTGTTGACGCCAACAAGTCAATTTTCAGACAAACAAAAAAACCGCAAGCCTGAGCCTGCGGTGAAAGAACAATTTAGAAAGTTTCCTTTCTATTTATTTAACTGTAATCAAGCCATCTGGCTCTACTGTGAAGTCTGGCTTATCTGCCAGTGTTCCGTCTGGTTTGAGATAGTACCAGCCTGTTCCGTCTGCGGACTGGATAAAGGCATTTGATACCATAGCGCCTTCTTTAGCGTCTAAGTAGTACCAAGTGTCCTTGTACTTGACCCAGCCTGTCTTCATGGCACCTTCTTCGTTGAAATAGTACCACTTCTCAGCAATTTTCTTCCAGCCTGTAGCCATTTCGCCTGAGTTGTCAAACCAGTACCAGTTGCCGTCTGTGTACTTCTTCCAGCGGTCTGCAAGCATATAGCCTGAGCCATCGAAATAATACCAGGTACCGTTGATTTTCTCAAACTTATCTTTTGGATAAGAGCCGTCTGAATGTACGTACCAGTAGCCAGTGTCATTCTTCTGCCAGCCTGTTTCAATCGTCAAGCCGTTCTCAATATCATGCTTAAACTGCTCACGGCTAATGCCCCAACTTGCAAGATATGGATATGGATCCACATGGTCTGAGTGGTTGTTTGGTTGGTTATTCGTGCAATACTCGTGCGTTTTAATTCCAGCTAAACTCCCTGTATCAAGCGTTTTCGGCAAACCTGCTTCATCTGCTAGATTGCGTAAGAGTTCGATATAAAGGCGGTAGTCCGTCATGAACTCTTCTTTAGTTGAATGGCTTTCAATCAGTTCAACCGCTGCGTAACTCTCAGTATTCCAACCGCCCCCAACATCCCAACTTCCGTTGTTCACAGGACCTACTTGCATGACACGGCCATTTCCGACAACATGTGAAAAGAACCCTAGTTCAGGGTCCTTTCTATAGTGGTAATCAGCCTCATTTTGAGCTGTTGAGTTACGGTTGCCTGTTGAGTGGGCGTGTACTTGTCGATAAGGCTGCACACCGACCTGAGGCAAGCCTGTACGTAGTCTGCTTGTATCGATATCCATTACTCTTATCCTTTCCAAGCGTCGTTCATCTGTTTCACTGCGGACTCTACGAAGGTGTCTAAGTCTTTGTCAGTCATGCTAATATTGTATTTTGTAAGCTCAGCACGGACTTTAGCGCGAGCCTGTGCCAGTTTTTCATCTCCCTTGTAGCCAGTTTCAGCAGCTACTTGCTCAACGGCATTAACTGCGTTCTTAGCCAAGATTTCAACAATCTTGATAGTCTTTTCTCCACCTTTTTGAACCAGGTAGTCCTTGACTGCCTTGACTGCGATACCAGCCAAAATAACAAGGATGCTGATTGCTCCATTAGTAATGATTTCAGTAATTTGTTGCATTTGTTATTCTCCTTTTTCGATTTCTTCCATGCGGTCGTTCATGCGAACCATTTCTTTTTGAATGTCTCCGACCGCGTGAGTGATTGTGGTTAATTCTGTAGTGGTCTTTTCTAGGTGAGTCATCAAACGCTCTTCTCGTCTATTAGAGTCGGCCTTTGATTGCTCGTGCAAATCCATAATCTTCTTCTCTCGCTTGTCCGAAGTCTTGATAAGATATCGAATGATAATAAAGAAAAGCAAGATAAACAAAATCGCCCAAGCTACCTGACTTTGAGCGATTTTTTCAGCTTCTTCAATTGGCATACACACCTCCTATTCTTTAGGTTCTACCGTTGGAACCGTCCAGTCAGGATTGCCCTCTGCATCAAATTTCATGATATAGAATTCATGATTCAACAGAACGGCTACGTTGATTGTTGCGATTGTACCACCCCACTGATTGAACGCCCAAACGGTTTCAACATCCTTGAATTGGCGACGGCCATTTACGATCACAGGACGTTTTTGAACGTCACGATACATATAGAAGTCATCGCTTACATTCTTGCAACGAATGAACTCTCCATTTTCTTTCATGTAGCGCAAAGCACTCGCAAGATCAAATGGTTCTGTGATTTTTGTAAGGTCTAGTAAGTTATTTGTGTTTTGAATTGTTTCTGCCATGTCTATTCTCCTTTGTCTGCTGGTTTAGTTTGTTCATCAAGCAGAGCTTCCAGCTCATCCACTCGTGCTTGAAGTCTTTGATTCTCTT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61 | Streptococcus_phage(98.31%) | portal,capsid,terminase,holin,integrase,tail,head | attL 1777478:1777493|attR 1791060:1791075 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2098087 : 2106841
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_012466|2098087:2106841|DBSCAN-SWA ACTATCCATTTAGCGACTCCTTGAACTCCTCTATCTTAATCGGTAATCGTTTAAATGACACGCCTCTATCAGCCAATCGTTTACAAAAGGCCGTAATTTTAGGTACTCCCAACTGAACTTCTTCCATAAAAACAACGTCTTGAAAGACATCACTTGGTTTGCCCCCCTTTACTAAACGTCCCTTTTCCATTACATAGACTTGATTCGCATATTCAGCAACATCATCCATCAAATGCGTTACCAAGACGATGGTCATCCCTGACTGGTGGAGTTTTTTGAACAGGGTCATCAACTCTTTTCTCCCTAGAGGATCTAGACCAGCTGTTGGCTCATCTAAGACTAATATAGCTGGCTCCATGGCAAGTATGCCTGCAATGGCAACACGTCTCATTTGTCCCCCTGACAGCTCAAACGGACTACGATCAAAAAGTGATTCATCAATTCCAACCAGAGCCAGTTTCTCACGCGCAGTCTTCACAGCATCTTCTTCAGAAACTCCAAAATTTTGCGGTCCAAAAGCAACGTCCTTCAAAACCGTTTCTTCAAAAATCTGATTTTCAGCAAACTGAAATACCAAGCCAACCTGTTTTCTAATTTGACGAATATCTTTATTTTTAGAAGTCGAGGTGATTAAGGTATCAAAAACCCTCACACTCCCTTGACTTGGCACCAATAAACCATTTAAGAGTTGTAAAATAGTTGATTTACCACTACCTGTGTGCCCAATTAAAGCTGTATAAGAGCCATCTTCAATCGTCAAAGAAACATCCGACAAAGCTGCTGAAGCTAAGGGAGTACCTTCTTGATATGTAAAATTCACATTTTCTAGAGCAATTCCCATAGCTTATCCTCTAGCTCACTTTCTGTCAAATAATTTTCAGGTAAATCATAGCCATTCTGGCTCAAAGATTTTTTTAATTGATTAGCAAAAGGATCGTCTAATCCAATTTGATCTAAATCATTTCGAGAGAAAAGCTCCCTTGGACTACTAGTTGATTCAATTTCCCCTTTTTTCATGACCAATACGCGATCACTCATGGCGACTTCTTCCAAATCATGGGTAATAGAAATGACCGTCATATCATAGTCTTTTCGAATTCCTTTTACTGTCCCAATAAGTTCTCTACGCCCCTCAGGATCCAACATACTCGTTGCTTCATCTAAGATTAAAATAGCTGGTCTTAGGGCTACAACACCTGCAATGGCCACACGTTGCTTTTGGCCACCTGATAGACGCGCTGGCTCTCTCTTTTTAAAGTCCAACATGCCAACTAAAGCCAGAGCTTCTTCCACTCTCTTTTTCATTTCTTGACGAGAAAGTCCCTGATTTTCCAAACCAAAAGCAACATCATCTTCAACAGTCGCTCCAACAAATTGATTGTCTGGATTTTGAAAAACCATACCGATTTGACGACGTATATTCCAAACATTTTCCTCAGTCAAACGTTGGCCATCAATTACAATCTCTCCGGATTCTGCTTCCAGTAAGCCATCAATTAATCGAACCGTCGTTGATTTACCACTACCATTATGCCCTACAATCGAAAGCCATTCTCCACGTTTCACGTGAAACGTAATATCCTTCACATCGTAGTAGTTCTGATTTTCTTTATAGCGAAAAGAAAGATTTTTTACATCAATTATTGATTTCATTTCGAACCAAATGTCCCTTTAAATACATAGGCACTACCCTTGAAATAGTCATAGCCAGAGTAGATAGTGAAAAATAAGGCTACATAAAGTAGAACTTGACCAAGCAAAGTCCAATGTAATAGCAAGAAAATAATGGCAAACATCTGACTAAAAGTTTTAATTTTTCCAGGCATTGCTGCTGCTAAAATTGTTCCACCAGTTTCAACCAATAAAAGCCTTAAACCTGTCACAGCTAACTCACGACAGATAATCACTGCAACAATCCAAGCCGGAGCCATACCTAACTCAATCAACATAATAAAAGCCGACATAACTAGTAACTTATCCGCCATAGGATCTGCAAATTTACCAAAATTACTGACCACATTCCATTTACGAGCTAAATATCCATCTAAATAGTCGGTAATACTGGCAACAGCAAAGATAATAGCTGCAACTATATGACTCTCTATCGAATTTCCTATCGTTAAAATAAAGATAAAAATAGGTATAAAGAGAATTCGACCTATTGTTAAGAGATTGGGAATTTGTTCTTTTTTCATTCGTTTTTCCTTAATTTTTAGTAAAGGTTACAGTGATTTGTCCAGTCTGAGCTGTTAATTTCGATAAATCAACAGTCTGATTATCTACTGTCAAATCAACACCTTTTACAACACCTAACGTAATTGTTACAGGACTTTTAGTTGCAACTGTTGCTTCTGCACTTTTCTTCTTTGGCGATAAGGTTACACCGCCCTCAAGTTCGCTTTCTGAAACACTGACCCAACTTGTAACATCTGAAACTGCCAATTGCAATTTAACTGTTTCCTTACTTGTCTTATAAGCGATTTCTACATGATTTCCTTCGCCTGATACACTTATAGCTGATTCTATACTAGAAGAACTACTACTTGAGGAGTGGGGAACAGAGCTAGTTGAACTTGTTGATTGAACCACACTGTAATTAGAAAGAGAAGGCTCCTCTGGTTGAGTTTGAATATAGTTCCAAACATAATAAGTCACAAAAATTAAAATCGATAAAGCAAAAAAGATAAAATAAAATAAAGGTAAAAATGATATTTTTTTCTTCTTTTTCTTACTTGAACGTCTACGACCTGTCAACTCATCTTCATCAACATCTACTTCCTCATAAGTAATCATACTCCCAGAATCATAAGCATCCAAAACAATTTGGTCATCTAACTCAACAGCCCATGCATATTTTTTCAAGAAAGAACGCGTGTAAAAAGGACTTGGAAGTTGATCGAAATCGTCTGCTTCCATTGCTTCCAACATATCTAACTGGATTTCTGTCTTTTTCTGCAATTCATCTAAACTCAATCCCTGATTGATTCTAGCTAATCGTAAAACCTCTCCAATTGTTTTTTTTCTCATACTTGTCATCCCTTCTTTCTAGTGTCTATTATAATAGGTTACTACGATGGGAATATTGTAAAATCAACTATGTCACCATCATCTATTAAATGATGTCCAGCATCAAGGACATCCTCTAAAGTAATTTCCTGTAAAATTTTCGGCAAATCAAAAATTGTCTCACCATTTTCAAAAGCATCATATTGCGTTGCAATAAATTCAAGAGAGTTCATGCTACTGAAAAATTCGCCAAACATCTCTCTTTTGATAATATCTAAATGTTCCTCTGTAATATCTAAATCCTTTGTAAAATTACGAATAGCCTTCCTAAATTGATGAGACAAAGCAACTGGCTCTTTCGTATCCATTGTCAACATGACAAAATGAAAGCGACTTGTTATTTCAACTTCCAGAGATAAGGACGCATCAATTTTACCTGATTCATAACATTTTTGAAAACGATCCGAAGTCCAACCAAACATCATTGCAAACAATAATTTTAATAAAATATGATGTCGATAGCAATCCGCTTCAGAAACTTCTCGCTTACCTCTAACTCCAATCGCTAGTTTGGGAGAAGATACTTCCATTCTCATACTATCTGTTGGCTTTACAGGCTGTAAAAACAACTTTTCTCTTGCTACTTCCTGAAAATCTGAATCTTTCAGTTCTTTGCTTTCAAAATAGTCCTGTACTCGCTCCACATCAAAATTACCAACTAAAAACAGAGACATGTTTACAGGTTTGTAAAACTTTGTAAAATTTTCTTGCAAATTAGTTAGATTGATTTGGGAAATGGACTCCTCACTTCCAACTATATCAGTTGCTAAAGGTGTACCAGGATACAAATTCGCTAAAGTTGAAAAGAATAAACACGAATCTGGATCATCTTGGTACATTTCTCGTTCTTGCTGAATAATATCCTGCTCTGTCAGAATGGAAGCTTCAGTAAAGTGTGCTGATGTTACCAATTCATCAAGTAAATATAAATTTTCTAAAAAATAATCCGTTGCTGAAAAAAGATAGTTTGTTTTTGTAAAGCTTGTAAAGGCATTACTATCTGCACCTAGACTCGTAAAAGCCGACATCAAATCACTAGAATCTTCTCTCTCAAATAATTTATGTTCAAGAAAATGAGCAATTCCTCCAGGATATTGTTTTACATCTCCGTCAACTTCTGTGACAAGCGTATCTATCGAACCAAACTGTACAGTTACACTCCCGTAAACCTCTTTAAATTCCTTTTTAGGCAAAAGAGCAACTGTCAATCCGTTGGCCAAACGAGTTCGATAAACCTTTTCTTTTACAGCTGGATAGTATTTTTCTTCAAAAACAACCTTTGTCATTCTATTCCTTCCATAAAGTAAATCGCTTGTAGTTTCACATTATTAGCTACTCTACAAATAGCATCTTTGTCAATCTGTTCAAGCTTTGCAATCCAACTTTTAAAGTCTGCTGAAGATTTTCCAAATAAGGCATTTTGATAAGCACGTTCAATCAATGAAGATTGATTATCTTGAGAAAGTAACAACGACCAACGAATCATTTCCTTGGTCTGATTTAACTCAAACTCTGTAAAATAACCTTTTTTTAAATCAAGCAGTTGATTATTCATCATTTTACGAGCCTGGTTACGATTTTCTCGATTGATACCAGCATACATCCTCAAGAATCCACTAAATAAATCAAGCTCACTTGAAATGGTATAAGCTAATCCAGCATTTTCACGGACATTTGTAAAGAGCTTAGAGTGAGCAAATCCACCAAGTAAACCATTCATTACAATCATGGGTAAATGTTGCTCATCACCATATTTAGAACAGTAATGATAACCTAATTCCAAAATGGATTGTCCCACATTTTTCCGAACCATACCTTCCTGAAGGATATTAGAATAAGGTTGACAATACTGAACCTTCACATCTCCTTTTCGACCTTTAAAGCCAAATGATTCTAATACATTTTGAATTTCAACCTCATTAAAATCACCTAGGAAAAAGAAATCTATTCGATCATTGGCTAAAAATTCTTGGAAACAAGAATAAGAACTTTGTGGAGTTTCAGCTAAAACACGATTTCGTAAATCACTATATTCCAATTGAAGACGTTCATCATGAAAAAACAATTTATCCAATTCTTTATGTGCAAAATAAAAAGAATCATCCATATCAGCTGCTAAACTTGCTAGCAATTGTTTTTTCTCAATTTCAAATAAGGCCGGATCAAACCCATTATCAACTACTACGGGTGAAAAAAGAGTTTCTTTTACAAGTTCCAAAATCTGAGAGGTTAGCACGTTTTTCCTACTTAAAAACTCATCACGAACATAGGTAAATGTCAATTCTATAATGTGGCTTTGCCCTCTTCTGAAACAATTGGTTGACATATCTGTACCGTATAGACTGGCCAAGTGTCTCCTCAAATCTTGAGAAGTGGGGTACATCTGATTAGCAGTCTCTAGCATACTTGCACTCAACATGTGACCTGCAATCGTATCAAGGGATAATGGAGCGGTAAAACGCACGGTAATTTTGTTTGTTTTAAACTTTTTTGATTGGATAAAATGTGTTGAAATTCCATGCACTAACTCCATGATTTACCTCCTTATATACAGACTTCTATTATATCACGAAAACCTGAAATTTTCTTGTTCCCTGTAACACTTTTGAAATAAAAATCGCTTACATTTCTCGCTGTCTCTCTCACTATTTTTAGGAAAATATGGTATAATACCAAAGATTGAGGTGAATTATGGAATACAAATTATTTGAAGAATTTATTACCCTCCAAGCACTACTCAAAGAACTTGGAATTACACATAGCGGAGGAGCTATTAAATCATTTCTCTCTGAACATTCTGTTTACTTTAATAGGGAATTAGAGAGTCGTCGTGGAAAAAAACTTCGTATTGGCGATAAAGTTGACATCCCTGACATGAACATTGACATCTTGTTGACACAACCTACTTCTGAAGAACAAGATGAATACCAAGCTGATAAAGTTGAAAAAGAACGGATCGCTAAACTTGTCAAAAAGATGAATAAGGGAGTTAAAAAAGACAAATCGAAACCTGCTTCATCACCTAAAAGCCAACAAGCTCCACGATTCCCTGGTAGATAATCATGTGGCTACAACATCTATCTCTCAAGACTTTTCGTAATTACAAAGAAACGAAAATAGACTTTAATCCTAAATTGAATGTCTTTTTGGGACGTAATGCACAAGGAAAAACAAACATGTTAGAGGCTATCTATTTTTTAGCCTTAACGCGTAGTCATCGAACTCGAACAGATAAAAATCTCATTCATTTTGATGAGGAACAACTTCATCTTTCAGGTCTCGTTCAGAAAAAAACTGGATCCATTCCCCTAGAAATCGAACTAACACAAAAAGGCCGTGTAACAAAAGTTAATCACTTAAAACAGGCACGCCTTTCAGATTATGTAGGACACATGAATGTTGTCTTATTTGCTCCTGAAGATTTACAACTAATTAAAGGAGCACCTTCGATTCGACGAAAATTCATTGATATGGAACTTGGGCAAATTAAGCCAATCTACTTATCTGACTTAACCAATTATAACCACATCCTAAAGCAAAGAAACACTTACCTAAAATCAGATCAAAAAATAGATGAAACATTCCTTTCTGTGTTAGATGATCAGCTAGTTGATTATGGATGTCGTGTAATGAATCACCGCTTAGATTTCATAAAAAAACTAGAATCATTTGGGCGTAAGAAACATTTTGAACTCTCTAATCAGATCGAAGAGTTGTCAATATCCTATCAATCTTCTGTCAATATAACTGACAAACAAAACTTATCCGAATCTTTCAAAATTGCTTTAGAAAAAAGTAGATCCAGAGATTTATTTAAAAAGAATACTGGTGTCGGTCCTCATCGAGATGACATTTCTTTTTATATAAATGGGATGGATGCTAGTTTCGGAAGCCAAGGTCAACATCGTAGTCTCGTCCTCTCGATAAAATTAGCAGAAATCGAATTAATGGAAAGCATTACCACAGAATCTCCGATATTACTGCTTGACGATGTGATGAGTGAACTTGACAACACTAGACAGTTAAAATTATTAGAAACGATTTCTCAATCAATCCAAACCTTTATCACAACAACAAGCTTAGACCATCTTCAAAATCTGCCAGAAAATCTAAGTATCTTCACTATTCAGGATGGTAAAGCTTCTGTAAATGGAAATTGACAACATTGTAAAAGAACTCCTGTTTTCACTGGAGTTCTTTTCATTGTTTTTTACATAGAATAATTTGGTGCCTCATTAGTAATTTGCACATCATGAGGATGGCTTTCTTTCAAACCAGCACCAGACATTTCAATAAATTGAGCATTATCGTGTAGTTCTTTAAGGTTAGCTGCACCACAGTAACCCATACCAGAGCGAATACCACCAATCATTTGGAAAACAATATCAGCTGCCGCTCCTTTATAAGCAACACGACCTTCAATTCCTTCTGGAACAAGCTTGTTTGCTTCATTGACAGAACCTTGGAAATAACGGTCGCTTGAACCTTTCTTCATAGCAGCAATTGATCCCATACCACGGTAAGTCTTGAATTTACGTCCTTGGAAGATTTCAGTTTCGCCTGGAGCTTCATCAGTTCCAGCAAACATAGATCCAAGCATAACAGCATTTCCACCTGCAGCAAGTGCTTTTACAATATCTCCAGAATACTTGATCCCACCGTCAGCAATAATCGTTTTACCATATTCGCGCGCAACAGCTGCAGCATCGTAGATAGCTGTTACTTGCGGAACACCAACACCAGCAATCACACGAGTAGTACAGATAGAACCTGGTCCAATACCAACCTTAACAACGTCTACACCCGCTTCATAAAGGGCACGTGCACCTTCAGCAGTAGCAATATTTCCAGCAATCAAAGTCCGATCTGGGAAATGAGCACGAATCTCGGCAATTTTACGCAAGACACCTGCAGAATGACCATGTGCAGTATCAATAACAATCGCATCCGCTCCTGCCTCAAAAAGAGCCTCTGCACGTTCAAATGTATCTGAAGTAACACCTACTGCACCTGCAACTAGAAGACGACCAAACTCATCTTTAGCCGCATTTGGAAACTCAATAACTTTTTCAATATCTTTGATAGTGATCAAACCAGAAAGACTGCCTTCTTCATCGACCAACGGAAGTTTTTCAATACGATGCTCTTGAAGAATACTCTCAGCCGTTGCAAGATCCGTACCCACAGGAGCAGTAACAAGATTTTCACTAGTCATATGGTTTGAAATTGGTTGATTATAATCTGAAATAAAACGAAGATCTCGGTTTGTCAAAATACCAACCAATTTACGATTTTCAAGTGTTTCAACAACTGGAACACCACTGATGCGGTAACGACCCATAAGCTCATCTGCTTCAGCAATTGTATGTTCAGGCGTCAAGAAGAACGGATCAATAATAACTCCATTTTCAGAACGTTTTACCTTACGAACCTCGTCTGCTTGTTGAGCAATTGACATGTTTTTATGGATAACTCCGAGACCGCCTGCACGAGCAATAGCAATGGCCATTTGACTCTCTGTAACTGTGTCCATGGCAGCGGTAATAATTGGGATATTTAAAGTCAAATTATCTGCCAATTTAGTTGTTAAATCTGCATCGTTAGGCAACACATGACTTTCAGCTGGAATAAGCAATACATCATCAAAGGTAAAACCTTTTTTCAAAAATTTAGTGTCCCAATTAGACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NC_012466|2098087:2106841|2098911_2099739_-|WP_000835715.1|DBSCAN-SWA MKSIIDVKNLSFRYKENQNYYDVKDITFHVKRGEWLSIVGHNGSGKSTTVRLIDGLLEAESGEIVIDGQRLTEENVWNIRRQIGMVFQNPDNQFVGATVEDDVAFGLENQGLSRQEMKKRVEEALALVGMLDFKKREPARLSGGQKQRVAIAGVVALRPAILILDEATSMLDPEGRRELIGTVKGIRKDYDMTVISITHDLEEVAMSDRVLVMKKGEIESTSSPRELFSRNDLDQIGLDDPFANQLKKSLSQNGYDLPENYLTESELEDKLWELL >NC_012466|2098087:2106841|2103843_2104212_+|WP_000455903.1|DBSCAN-SWA MEYKLFEEFITLQALLKELGITHSGGAIKSFLSEHSVYFNRELESRRGKKLRIGDKVDIPDMNIDILLTQPTSEEQDEYQADKVEKERIAKLVKKMNKGVKKDKSKPASSPKSQQAPRFPGR >NC_012466|2098087:2106841|2100291_2101122_-|WP_078139991.1|DBSCAN-SWA MTSMRKKTIGEVLRLARINQGLSLDELQKKTEIQLDMLEAMEADDFDQLPSPFYTRSFLKKYAWAVELDDQIVLDAYDSGSMITYEEVDVDEDELTGRRRSSKKKKKKISFLPLFYFIFFALSILIFVTYYVWNYIQTQPEEPSLSNYSVVQSTSSTSSVPHSSSSSSSSIESAISVSGEGNHVEIAYKTSKETVKLQLAVSDVTSWVSVSESELEGGVTLSPKKKSAEATVATKSPVTITLGVVKGVDLTVDNQTVDLSKLTAQTGQITVTFTKN >NC_012466|2098087:2106841|2104214_2105312_+|WP_000266669.1|DBSCAN-SWA MWLQHLSLKTFRNYKETKIDFNPKLNVFLGRNAQGKTNMLEAIYFLALTRSHRTRTDKNLIHFDEEQLHLSGLVQKKTGSIPLEIELTQKGRVTKVNHLKQARLSDYVGHMNVVLFAPEDLQLIKGAPSIRRKFIDMELGQIKPIYLSDLTNYNHILKQRNTYLKSDQKIDETFLSVLDDQLVDYGCRVMNHRLDFIKKLESFGRKKHFELSNQIEELSISYQSSVNITDKQNLSESFKIALEKSRSRDLFKKNTGVGPHRDDISFYINGMDASFGSQGQHRSLVLSIKLAEIELMESITTESPILLLDDVMSELDNTRQLKLLETISQSIQTFITTTSLDHLQNLPENLSIFTIQDGKASVNGN >NC_012466|2098087:2106841|2105362_2106841_-|WP_000073428.1|DBSCAN-SWA MSNWDTKFLKKGFTFDDVLLIPAESHVLPNDADLTTKLADNLTLNIPIITAAMDTVTESQMAIAIARAGGLGVIHKNMSIAQQADEVRKVKRSENGVIIDPFFLTPEHTIAEADELMGRYRISGVPVVETLENRKLVGILTNRDLRFISDYNQPISNHMTSENLVTAPVGTDLATAESILQEHRIEKLPLVDEEGSLSGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEFGRLLVAGAVGVTSDTFERAEALFEAGADAIVIDTAHGHSAGVLRKIAEIRAHFPDRTLIAGNIATAEGARALYEAGVDVVKVGIGPGSICTTRVIAGVGVPQVTAIYDAAAVAREYGKTIIADGGIKYSGDIVKALAAGGNAVMLGSMFAGTDEAPGETEIFQGRKFKTYRGMGSIAAMKKGSSDRYFQGSVNEANKLVPEGIEGRVAYKGAAADIVFQMIGGIRSGMGYCGAANLKELHDNAQFIEMSGAGLKESHPHDVQITNEAPNYSM >NC_012466|2098087:2106841|2102434_2103685_-|WP_000424277.1|DBSCAN-SWA MELVHGISTHFIQSKKFKTNKITVRFTAPLSLDTIAGHMLSASMLETANQMYPTSQDLRRHLASLYGTDMSTNCFRRGQSHIIELTFTYVRDEFLSRKNVLTSQILELVKETLFSPVVVDNGFDPALFEIEKKQLLASLAADMDDSFYFAHKELDKLFFHDERLQLEYSDLRNRVLAETPQSSYSCFQEFLANDRIDFFFLGDFNEVEIQNVLESFGFKGRKGDVKVQYCQPYSNILQEGMVRKNVGQSILELGYHYCSKYGDEQHLPMIVMNGLLGGFAHSKLFTNVRENAGLAYTISSELDLFSGFLRMYAGINRENRNQARKMMNNQLLDLKKGYFTEFELNQTKEMIRWSLLLSQDNQSSLIERAYQNALFGKSSADFKSWIAKLEQIDKDAICRVANNVKLQAIYFMEGIE >NC_012466|2098087:2106841|2099735_2100281_-|WP_000712132.1|DBSCAN-SWA MKKEQIPNLLTIGRILFIPIFIFILTIGNSIESHIVAAIIFAVASITDYLDGYLARKWNVVSNFGKFADPMADKLLVMSAFIMLIELGMAPAWIVAVIICRELAVTGLRLLLVETGGTILAAAMPGKIKTFSQMFAIIFLLLHWTLLGQVLLYVALFFTIYSGYDYFKGSAYVFKGTFGSK >NC_012466|2098087:2106841|2101154_2102438_-|WP_000170184.1|DBSCAN-SWA MTKVVFEEKYYPAVKEKVYRTRLANGLTVALLPKKEFKEVYGSVTVQFGSIDTLVTEVDGDVKQYPGGIAHFLEHKLFEREDSSDLMSAFTSLGADSNAFTSFTKTNYLFSATDYFLENLYLLDELVTSAHFTEASILTEQDIIQQEREMYQDDPDSCLFFSTLANLYPGTPLATDIVGSEESISQINLTNLQENFTKFYKPVNMSLFLVGNFDVERVQDYFESKELKDSDFQEVAREKLFLQPVKPTDSMRMEVSSPKLAIGVRGKREVSEADCYRHHILLKLLFAMMFGWTSDRFQKCYESGKIDASLSLEVEITSRFHFVMLTMDTKEPVALSHQFRKAIRNFTKDLDITEEHLDIIKREMFGEFFSSMNSLEFIATQYDAFENGETIFDLPKILQEITLEDVLDAGHHLIDDGDIVDFTIFPS >NC_012466|2098087:2106841|2098087_2098927_-|WP_000510412.1|DBSCAN-SWA MGIALENVNFTYQEGTPLASAALSDVSLTIEDGSYTALIGHTGSGKSTILQLLNGLLVPSQGSVRVFDTLITSTSKNKDIRQIRKQVGLVFQFAENQIFEETVLKDVAFGPQNFGVSEEDAVKTAREKLALVGIDESLFDRSPFELSGGQMRRVAIAGILAMEPAILVLDEPTAGLDPLGRKELMTLFKKLHQSGMTIVLVTHLMDDVAEYANQVYVMEKGRLVKGGKPSDVFQDVVFMEEVQLGVPKITAFCKRLADRGVSFKRLPIKIEEFKESLNG |
9 | Streptococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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