Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_009883 | Rickettsia bellii OSU 85-389, complete genome | 1 crisprs | cas3,DEDDh,PD-DExK | 0 | 0 | 1 | 0 |
1. NC_009883
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_009883_1 | 1186249-1186502 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_009883_1
|
2 spacers
spacers of NC_009883_1
>1.1|1186299|52|NC_009883|CRISPRCasFinder CATGAAAATATCGAAGTTAATAAGAAAAACATCTATGGATTTACTATTTTAG >1.2|1186401|52|NC_009883|CRISPRCasFinder TGTAAAAGTCTTGAGATTAACCAAAAAAACCAGTATCAAACAACTCCTTTAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009883_1
The CRISPR arrays of NC_009883_1 >merge|NC_009883|1|1186249-1186502|CRISPRCasFinder ATTATGCTATTACGTTTAATAAACTAGATATAGTAAAAAAACTACTTTCTCATGAAAATATCGAAGTTAATAAGAAAAACATCTATGGATTTACTATTTTAGAGCAAGCTATTAATGATGATAAACTTGAAATAGTGAAATTATTGCTTTCTTGTAAAAGTCTTGAGATTAACCAAAAAAACCAGTATCAAACAACTCCTTTACAGCAAGCTATTAATGGTGATAAACTTGAAATAGTGAAATTATTGCTTTCT >NC_009883|1|1|1186249-1186502|CRISPRCasFinder ATTATGCTATTACGTTTAATAAACTAGATATAGTAAAAAAACTACTTTCT CATGAAAATATCGAAGTTAATAAGAAAAACATCTATGGATTTACTATTTTAG AGCAAGCTATTAATGATGATAAACTTGAAATAGTGAAATTATTGCTTTCT TGTAAAAGTCTTGAGATTAACCAAAAAAACCAGTATCAAACAACTCCTTTAC AGCAAGCTATTAATGGTGATAAACTTGAAATAGTGAAATTATTGCTTTCT
>NC_009883.1|WP_011477012.1|1184018_1184597_+|16S-rRNA-(guanine(966)-N(2))-methyltransferase-RsmD MLKIISGKFQNQKIPIAKNIKYRPSTGKLKEAIFSILTSGEFIGNKLFNENIKVLDLFAGSGSLAFESLSRGAGFATLIDIDAFSLKIAEEFAKTLNIHNKVNLVNINALNLPKANTAFDLVFVDPPYHNKIVTKVMKLLIKNNWLNTDAIIVVEMAKTDDYVLDENIEIIREKLYGNTKLLVLKYNCYLAA >NC_009883.1|WP_011477013.1|1183335_1184025_+|RNA-pseudouridine-synthase MQRLAKLISNAGICSRRDAEKLILDGQVKVNGIIVTSPATNVDTDNQVEVSGSLITSSQKSRLWIYYKPVGLITTHKDPLSRKTVFEQLTGLPRVISIGRLDLNSEGLLLLTNNGDLARQFELPSSKLKRVYHVRAYGNPDPLLKSNYKNLEIDGIFYNPQSIKLLRKNSTNSWLEVILFEGKNREIRRIFEHFGLKVNKLIRTEYGDFKLDNLKPNEYREVTKKLYKC >NC_009883.1|WP_012152113.1|1182606_1183287_+|septal-ring-lytic-transglycosylase-RlpA-family-protein MNHKFVLLILLIFYCFFLSGCNNSKKTPCSRKHSHKELSKDDPHNLVYKGYYKVGSQYKIKGKTYKPNAPKSFTETGYASWYGGGGDKFHGKKTANGDMFNKNLLTAAHKTLPLPCLVKVTNKTNNKSVILMVNDRGPFKPNRIIDVSAKAAEVLAFKKQGLAKVKIEYLHAETEKFLKNIKVNKSSNKTLAKSSKKPSSTKVANNKCSINCHIKLVNLKYKLAVN >NC_009883.1|WP_011477015.1|1182005_1182617_+|BON-domain-containing-protein MLRILVFIALAFNLSGCLPAIFTAATTTGIVASKDQPISGTLNDSRISAGIKADLVKNNFKELGAKIKVEVSERRVLLTGNIQKEEDALKAVEIAWNQKGVTEVINELKVSKNSNHFDLAQYTRDSMITAQIKAKNLVRKDIKFANYTVLTVDNVVYLFGVARSEEELENFADLASKIKGVEKVVCYAKIVDNFNSNTEGDES >NC_009883.1|WP_012152112.1|1181413_1181956_+|septation-protein-A MFKLLSEIGPVVAFFAGFFYGGGIQSATLYMLITSVICITLCYIIDKKVSRLSIISTAVLLVSGIITLISGDSMYIKIKPTILYVIFGIIFLTSGIKKNPFIKYALESIIRLKEESWITLSYRTATFFFFMAIVNEIVWRNFPDETWVKFKVFGVVPTTFVFILLQLPLLLKNKLPDSKI >NC_009883.1|WP_012152111.1|1180542_1181400_+|hypothetical-protein MFKIALIVFRECLEISLLIGIILAVTKHIEKSRIYIIAGGMLGVVSASIFAFFTRKLSLSFGGMGDELFDSGIMILITILLSWTIIWMQGYGTKVKQHINNISTKIHEGNSSYLMLVFLVASTILREGTEIIILVYSISSVETITSSNYIQGLIIGATSGFLLGLIICFGLIKIANQKYIFKISTILLMLIAGGFAASAAGILTSSGLVMFLSDQVWDSSWLVADRSMIGKILHIVTGYIARPNGLQVLAYFTTILLINIFIQVRLRYSKNILAPLPKENTQQIR >NC_009883.1|WP_011477018.1|1180150_1180534_+|cupredoxin-domain-containing-protein MQTNQKNKNIIILASLIFLLIAGISLFISANKNSNNNEEILEIKIVIKDHKFVPDIVEVPKSTKIRLVIHNEDDTVEEFESHDLHREKIVMPHDSIKIILAPLKPGKYDFFGDFHQDTAQGFLIVKD >NC_009883.1|WP_011477019.1|1178937_1179924_+|peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase MQKLLSLIIVALVLYNIAKLKISSDDNNATIIEQASVNNSANNENQVSINNDPPVSLNGNLFERTISKIVINALKTEEGKAFFENILQPLNKPIDTKDYTIPVHKDLITSLFKINTIGTGNVGPASCGHVVTVFYQISDMSNNLISEDTKTFTIGSGAVMLGLDNVIVGMNVGQAREAIIPAKYAASVGANNDNADSAYRVNVMLKSILPQNFINSNEVKIYDNEIAYRIPLLCGEKIAFNAKITRLANGEVLYDSKAKGQKVDMKIGDITYPLIFSYALQGKVPVGTRTVIAKGQTFKALGSNINKIISQESLPLNEYLMLEINDFK >NC_009883.1|WP_012152108.1|1176660_1177287_-|dioxygenase MKKFIFCFLCFWTLNIFAASKGYPNKLNRCKITRNIFNDYEPKVFEPTNNLLRKTGQISRFYGEKVIIKGIVLDQNCVPVADAKVYLWQAGSGGKYPYEPLKTRVDKRRFTGKKDSSFTGSGTATTNNKGEYYFVSMLPYKSAGNLKSVNIRVEHADLKTLETRLDLSNKNICSNECGEINPALIEPQQHLRSYCFDLVLQGATLKRY >NC_009883.1|WP_041808549.1|1175661_1176252_-|TlpA-family-protein-disulfide-reductase MGLSNYNKYFFTITVFLLLIIVFTPKIYANPKNGSNVPDDIIFFDEEKNQYSLDQFEGKTILLVFWATWSANCVKEMPDLDTLQKDFRKLPFSVIPVSEDYQDVKVIIEYYKSYQIRYLPIYQDYRNQIFKALGVISLPTSILIDPNGKIVTSFIGNTNWYDEKIRETILSAIPGNYPEPKNSYNGQSLNKPAKPL >NC_009883.1|WP_012152114.1|1187479_1188490_+|hypothetical-protein MGAKVNLLPAKELYSIIEGNLESIIQDIYPLEYDKQKEAIKHIAEQISSNDSIQTKDNYPEIDEEITEINQLLAEQKKRQAFNQEEQKKICKQTAELIESEILENIGSSTELEKKYLNKLNQITSIEEKKALINEYKTSLQDLNKQNFQNLQKQQSNLRGRKEVTNVEEHKLVKEGIVTKEEIEPYLSNYDLLCTLAEHSHMTDDDGVSLVKKLFEAARNFYPDKPLQGLKDLMDIPDEKSVDLLKDNILKLLSDKQISFIDINYIESRELYKINEIDIKSNFKLIECVIAGICPLTLRKLIELGKIDNFDKKELELIAAFFEKDTKNLSNYQGIK >NC_009883.1|WP_049753059.1|1188497_1189625_+|hypothetical-protein MGLHESQDSTIYELIEFILDDLIQFINVTELGKEIFPIATFFDKNDIIRTLMEEKIDFYSRSVDNKVIVNFDEDIFRYLINLEEFDINAEDKNGNTLLHAAIDQGKSEVVKFLTSYKNLEVNTKDLGGNSPLHLAIKSNNPEIVEMLLSYENINVNEKDKYGDTTLHKAIRSYNHKIIEMLLLREEIDVNEKDNQGETPLYGAVKSNRPEIVKMLLLREEIDVNEKDNQGETPLYGAVKSNRPEIVKMLLLRKETDVNEKDNQGKTPLHKAVDNDKPEIVKVLLSREDIKINELNKGKETALLIAFSNEKINIVKMLLSHKNMDTKQKEIFSFLEISREDEAKTPINDGVSILGASEAESYGESLHNKDASSYSL >NC_009883.1|WP_011477008.1|1189776_1191123_+|DNA-repair-protein-RadA MTKEKKHYICSNCGNTSPKWSGQCFDCGVWGSIIEEKVISNKNIAKIGSKQDFEQLSSNVTDQVRISTPIGELDRVLGGGLVLGSAILIGGDPGIGKSTLLLQLVAGSFASKVKCLYITGEESLDQIKLRALRLDLVNDKTNILAANNLEDIIASLEANKGNIDLVVIDSIQTIATRELTSPPGTVSQIRTCAHELVNYAKQNNIIILLSCHVTKDGQLAGPKLLEHLVDTVLYFEGDHNNHFRILRSYKNRFGGVGEIGVFEMSSSGLIEVTNPSELFLMKREQNVIGTAIFAGIEGSRPLLMEVQALIVPSNMVTPRRSAVGWDVNRLSMILAVLSSRIGLNLANYEVYLSIAGGLKINEPASDLAVAASLISAATNKPLPEHSVFFGEISLSGEIRKTAKAEARIKEALKLGFNNIICSKSENLTHDFISSIAHLKDLKLLLGSS >NC_009883.1|WP_041808551.1|1192083_1192920_+|hypothetical-protein MNKQDYTTLLAHEHLHNWIGKKIRNTSDLNYWWSEGFTDYYSRVLTLRSGVITVEEFVEEFNQFFKDYYLSPVINEPNSKIEEDSWRNYAVSKLPYYRGFVFAVYLNNLIKENNKSKSLDNVMLDLFKTAKQKEFSIDYFKQIIKNYIPKGIDKGIDEYIEQGNTIDLSDLMNVLPIEKIKIPFCDLGFDIKTSFDEGIIKGIDIESNAYKAGLRNGNKLIEVSLPKGFDYSDQIATVKTTKGEFKYKPESSNKKDIYRFKPDLSKEDKLKIKRFFNS >NC_009883.1|WP_012152118.1|1193175_1194936_-|hypothetical-protein MKKQTPNLLLVFTFSLFLTNCSEPTRDANGLLTDNQSTVIRNYIISQNAKNLKVNLKGQFGSNLRGLKLIGVKLIDEDLSEVDLTSCEILRADFTGANLQKAILTNAIIQESNFANGTIQNVSGYNCDFQGSIFDNITLQDINFVQANFSNTAFSKTTIKNVNFENAKLENILWNNNTLDGVNFQKAVLKSNSFKNTNIENSIFYGADLEGSIINNTNFTNNYFESSDLSRAKLTAVIIKDSNFTQSIFNEINFNNVQANNSIFSYTTFQGSTLQNISIVKCDLQSSVISGSTLTQFKVDTSLLNNVSLNDIKFNNLSIKNSNANFARLNKMAGVNITFNNLSWTNNIFSNNDVKQFTVINTDLNNSELSNSNISNSQFSNVNFSKTLMQNVNFSDVKITSGNLNQIALIGSNLTNITFNNSSFYNSQINNSHYMNSTFVNTNFASNIILNSEDFSKFPSNTVITSVKDLQKTTNLANMNLANFDLSNLIFNAVNFSGAIFKNANLTNTAIQNSTMEKADFSNAIVNKTDFSNSTLTDSIFKSAKIDQANFTGSNLTNTDFTEAEIKNTQLDKATTTGVKGIDNSN >NC_009883.1|WP_011477004.1|1194916_1196353_-|sigma-54-dependent-Fis-family-transcriptional-regulator MSLIDVLIVDDEEDIRNIIAAILKDEGFNPKVAANSTQALKILAEKPVSAVILDIWLQGSEMDGLGILEVIKKRYPLMPVIIISGHGTIETAVNAIKMGAYDYIEKPFNNDKLVILLKRACEVTKLKRENIDLKSKVIDKTELVGNSTITLKYKAEIDKAASSSSRIMIHGKVGSGKELTARLIHKKSKRVNNLFIIFSPTCMTLEKINQELFGEAEKQESNNNSNKRPTILEFANNGTLYIDEVSNIPVPIQIKLLKFLKDHTIKKPCGKIVKVDIKIITGTSKNIQEEVNNGRFLEDLYYRLNVSSLKVPSLFERKEDIPLLVKYFVKQLSKFSGLKERVFADETIAALQSYEWPGNIRQLRNVVEWTLIMNPITSGNNEIIKPYMIPSEILANSVNLTKLEDSFDMLSMPLREAREVFERQYLSAQMSRFNNNILKTSSFVGMERSALHRKLKLLSLHIPPTGRINEEEYEEANA >NC_009883.1|WP_143549752.1|1198998_1199199_-|palindromic-element-RPE4-domain-containing-protein MIYSRDPVKNTNKISIFYYFLDTVDKPRYDIEAFFDPHRMTYIPKEIKKHEYRTEMATNLARRKSL >NC_009883.1|WP_011477002.1|1199225_1199738_-|DUF3576-domain-containing-protein MNKNIKLFFAAIFIVFSVGNNIILADDYPKSEQEQKWDEVGSIAGEEGLVFRPGRIKNESTKAAGCSINKYLWQASINTLSFIPLASADSNGGVIITEWYSPPATPNFRFKINIFIKDDVIHPDAIEVKVFEEVLKNKQWVMNENTSNLAITLEDKILRKAREIYINSAK >NC_009883.1|WP_012152120.1|1199941_1201432_+|phage-major-capsid-protein MKKIIYSNQTFDNIEIKSSTNSEVVITGYASVYNIADHHNDLIVKGAFANVVYQNIKFLWQHDSKKPIGIISHLIEDDHGLKMEAVINNKVKAGREAIELIKQGAIDGLSIGFYIKNSVFNDAKQRVITEADLLEISIVTFPANQSAKILYITKGQEVESNTEYSNQITELQEKVHNIQNILERPNNINIEDQEQKTAFINYVRKGEENSFTQKSSLNSGAEAGGFLILQTLYNSIITEVNARSPMRQLASIETISTNALDIISEDGKFNSGWIGEVEARDETNAAKLKQQRIFVHELYAQPKASQALLDDATIKIETWLSERLRDSFVKAENEAFINGDGVKKSRGILSPDHDKIEKVKMGNKITTDNLLDFINSLKEEYLANATLLMNRATLSEVQKLKDNQGRFIWQQSLSESFKQTIFGIPVVCSSNMKPVDKDTAAIAIGDFKSGYKIVDRSGINIMRDPYTEKPFVKFYAVKRVGGDVVNPEAIKIGVFN >NC_009883.1|WP_012152121.1|1201457_1201988_+|phage-gp6-like-head-tail-connector-protein MFKKNNFQITKIFPQEVWSLEQVKNYMRVEANYDDDLILGLIDAAITAAENFTKLNFISKQIKFVCNIYGKREFLLKYNPVLRILKVTKKFKDQENEITLDDYVIDQNILALTKSLNNEELTVEYISGYDKDNIPHAIKHGIMLHIAEMYDRQAQNCVGLSKEVKNLYLPYRNIRM |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
871593 : 881966
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_009883|871593:881966|DBSCAN-SWA GCTAAAATCTTCTATGTTTCTTAAACCATCTCTTTATTTTAGATATAGTTGCACGCACTCCATCTTCTTTTAAAGAAGCAATAGTTAATAAAATTAATATTTTTGCAATAAAATAATATGATTTTAATTTTATTTTAAGATAACTAATAAAATAATTATTTTCTTCTTTTTTTTTATTTTCTAACAATTTTTTAACGTAATATTTTCTTACTTTCTGTTTTATTATAGGATAATTATATTGAGTAAAGTAATTATTATTTTTTTCTACATTTTTTTCTTTTTTTTCATTCTCTAATGATTCTGACTTATCTTCATTCTCTAATGATTCTGACTTATCTTCATTCTCTAATGATTCTGACTTATCTTCATTCTCTAATGATTCTGACTTATCTTCATTCTCTAATAATTCTGACTCATCTTCATTTTTTAATAATTCTAATTCATTTTTACTTTCTAATATCTTCAATTGTGTAACAGCTGTTAATAATAAATTAATAGTAAAAGGGGCAAATTTAGCTAAATAAGCGTTATTTAACACATAAGAAGTAATATTTATTAAACCTTGTGAATATTTATTTGGATTCATGAATGTAGTATTATCACCTCTAATTCTTACCTTAGATAATTCTTTACTAATTCCTCCTAATAAATTCCTACTAGAAATAGAAATCCATAAGCAACAATCTTCACCACTTCTTATATTTTCAGGAAATAAATTTTCTTGAAATAAAGCTAAAGTTCCCATAACTGTTGGCATTGCTATTGGGCAAGTTTGTATAATTTTTGGAAAAACATTCCCACTAAAAGAACCAGAATTGATTGACTCTAAATATTTCCCTTCTTCATCTATTCTTTGATATGAAGTGTGAGAAAATATAAAATTATTTTCTTCCATAAACTTTAATTGTAATTCTAATTTATTATGAAAGAATAAATCATCCGAATCAAGAAAAGCAATATATTTTCCTGAGGATTTTTTGATTCCTAGGTTACGTGCTGATGCAGGTCCTTCATTTTTTTTATGGAAATATTGTATTCTTTTATCTTTTTTGCAAAATTTAATTAATTCCGATATATCTTCAGTTGATCCATCATTTATAACAATTACTTCAAAATTTTCATGAGTTTGATTAAGCACACTTTCTATAGATTGAATAGTCCAATTAATTCTATTATATACAGGGATAATAACGCTAACTTTAGCATCTCGTAATATTTGCTTAGCCATATTATTGGCTAAAGCATAGGCTTCTTGATAAGGAGTGCTTGACAAAAAATTAGCTGTACGAGTTAAAAACAAATAAGCTGATCCTTCCATTTTTATCATTTCTTCTTCGGTTAATTTTTGAAGAAAAGATGACCATAAAGCATTACATTCTTCATTATGAGCTGATATCTTTTTGCTACCTTGTTCTGAATGAAAACGAGATTTAATTAAGATCAATTTATCAAAATAAATAGAAGCAACACGAAAAATTTTAAACCATAAATCATAATCTTGTGTAGATGGTAATGTTTCATCAAACATATCAACTTCATGAAAATATTTTACGGGTATTAACAAAGAACAACCATGTATTAAACCACGTAATAAGGGCAACAGAGAGATATTAAGTTTATCTGTAGTTAATACACTATCTGGTCTTATATGATATAAAAATTTCCCATTTTTATCAACTAACTCATAACCACCATAAATTATAGTATTTTTATTGTTTAATTTATTTAATATATTAATTTGATGCTCAACTTTATTAGGATAATATAAATCATCATGGCTTAGCCATGAAAAATATTTTCCTTTCATATTTTTGATTCCATAATTTAAAGCTGAGCCGCACCCACCATTCTCTTTATGGAAATAGCGTATTTTATCACCATATGATAATGCAATGGCTTCTGTCTCTCCGCTATCTTTTGACCCATCATTAACTACTATAACTTCAATATTTTTATAAGTCTGTGCTAAAGCACTATCTATCGCTTCACGCATATAATTTGCACCATTATATACAGGTATAATAATGGATACTAAAGGATAAAAAGTGCTTAGTTTGTCTTGTTTAATTATCATAGATTTTTAAAAATGATTATCGATTTTTTTAATACTTATTATTTTCTTGGGGTTCTAGACTCAAATAAAACATGAATTTAAATATTTAATAAATACTCAGCAATAAATGCTACAAACTCTCTTCGTAACCATTTACTTATAACTTTTATTATAAGTAAAAACATTATTCCCATCATATTGCTTCAATTTATTTAATATTTCTTTATTTTAAGATAAATTTTTATTATTACTTTCTAGTGCTTGTTCCTTAATTTTCAATTGTCCTTTAAGTACTTCTAATTGATTTGTAGTAGATTTCAATAGTTCTTGTAAATGATTTATTTGTGCATTAGCAGAATTTAATAGGCATTGCAAGTCATTTAAATCCTTAAATTGCGAAGCAAAATTATTTATCTTCAATAAACATTCCTGTACTGCATTAATAAAAAAATTTACCTTTTCATTATGTACCATTTCTAAAATTTCTTTTATAGGCGTTGTCTTTCCTTTTGTAACTAGTAATTCTGTTGTTCGTTGACACACCGATAATGCAGATTTCAAAGTACTTCTCATAAGCTCATTATATATAGTTTGATTTATAAATTGAGGAAAAATAGCTTTTAAACTTTCTAAGTTACTTGTTGCATTTAATAAAATTTCTTTAGCATATACATCATTAAAACAATTTTCAAAATGTGTAACATTTTTTATTGCATAGAATCCTCCATAAGGAGTGGAAAGAGCTTGACCTTTAAAATCATGAGTATGTAAATTTTTACAACCTATTATATTCCAGTCAGGAAAATCATTTGGATACCAACCTGACTTATGTTCTTGCCACTCTCCTCCATGTAAATTCCATCCATCAGTATCATGTACTTCCTGAGGCATAAATCCTAAAGGAGTAAATATTATAATCTGTTTACGAGCCACACGTTCACATTCAACTAATATTTCTTTTCCCATTTCTTTAGGCATATGTTCTATAACATCCATTAAAAATATTGAATCAACAGATTTATCAAGAAATGTTTCAAGAACGACTTTTGCCTCAAAAGGAATTATTATCGAATTAGTACCTGATAGGTTCTTTTTTAATATTTCAACATATTCCTGATGCGGTTCTACACAAATAAGTAAATCAGGAATTATATATTGTTGTGGACGAATACCGCACCCAATATCCATAATACTAAAAGCAGGATTTATAAACTCTTTTATTTTGGTATAAAATATATCTGCAGAATACCATTTTTCAATTATTTTATTTTTCTCTACCATTTAAACCAGACTGTGCGATTAATATAATCCACATAACTTAAAACTATACGCAATATTTTTTTCGATACAAGCCCTGCTTCGTTATAATCAGGAACTAAGCCTTGAGTACGTTTGTTGTTATCATGCTCCTCAGTAATAGTCTTTACCGCTTGTAATACCCGTTCAGCCTTAAAACCGGACATAATTAACGTGCCGGCATCCATACCTTCAGGACGCTCGTGAGCCTCTCTAATATTTAAGGCAGGCAAATTAAGTATTGATGCTTCTTCAGTGATAGTACCGCTATCCGATAAAATACAAAAAGCATTCATTTGTAATTTTACATAATCGGTAAAACTAAAAGCCGGTAAAAATCTTATTTTATCTCCAAGCTCTTTAAACCCTTCTAAATCTTCAAGCCTTTTTTTAGTTCTCGGATGCGTAGAAAAGATTATCAAAAAATTATACTCTTTAATAAGCATTTGTAAACTATTTAATAATTCTTTTAGATTATTTTTGACGTCTACATTTTCTTCACGATGTGAGCTAATTAAGAAATATTGTTTTGGTGTGAGTGATAATTTATCTAGAATATCTGACTTTAATATTTTAGGCATGAAGCGATCAAGTACTTCTGGCACATGTGAACCTGATTTAAAGGTAAGCTCCGCCGGTAGTCCTTCAGCAATTAAATAACGTCTTGCATGCTCGGTTAATGTAATATTAACATCGCTAATGTGATCAATGATTTTGCGGTTTATTTCTTCTGGTACTCTTTGGTCAAAGCAGCGATTTCCTGCTTCCATATGAAAAATTGGAATCTTACGACGTTTAGCAGCAATTGCAGAAAGACAAGAATTAGTATCACCGTAAAATAGCACAGCATCAGGTTTTTCTTTTTCAAGAACTTCATCTACTTTTTCAATAACAAGTCCGATAGATTTTGCTGTATTATCTGCTGCAACCTCTAAAAAATAATCTGGTTTTCTGATTCCCATATCATCAAAAAAAACCTGATTTAATTCGTACGCATAATTTTGACCGGTATGAACTAGAATATGTTTGGTATGTTTATCAAACTCAGAAATCACACAACACAGCTTAATAAGCTCTGGGCGAGTACCGACAATAGTCATTACCTTAAGCATTTTTTAGCTCCTCTTGTACATAATCAAGATTTAGTAACAATTCTTTAACTTCTTCTAGATTTAAACGCTTTGTATTATGTGAGGTATAATCCTCTAGAAGTGCTATTTTCTTTTCACCCTCAACAAAGTATTTCGCATAATTAAGATCACGACCATCCATAGGAATGCGGTAATAATTGCCTAAATCTTCAGCTTTCGCCATTTCTTCCGAAGATACTAATGATTCATAATGTTTTTCACCATGACGTGTGCCGATAAAACGTATTTTATTTTTACTGTTAAATATCCCTTGTAATGCTTTAGCTAACACCTCAATAGTACTAGCTGGAGATTTTTGTACGAAAATATCACCTTGGTGACCGTACTCAAATGCATATAAAACTAAATCTACAGAATCAACTAACGACATTAAAAAACGCGTCATTGAAGGTTCTGTAATAGTTAAATCCTTATTTTGCTTAATTTGATTGATAAATAAAGGAATTACCGACCCTCTTGATGCCATAACATTACCGTATCTAGTAACACAAAATACTGTCTTATCTCTTACGTTCATACGTGCTTTTGCTATTGCTAACTTCTCCATTAATGCTTTAGATAGTCCCATTGCATTAATTGGATATACAGCTTTATCAGTGCTAAGTACTATAACTTTTGCAACTTTATTAATTGTTGCTGCTCTTAAAACATTTTCAGCACCTAAAATATTAGTATTTATTGCTTCCATCGGATAAAATTCACATGTTGGTACTTGCTTTAAAGCAGCAGCATGGAATACGTAATCTACATCCTTCATTGCGTCATCAATGCTGTTATAATTACGCACATCCCCGATATAGAATTTAATTTTTGGATTATTCAAAGCAATACGCATATCTTCTTGCTTTTTTTCATCTCTACTAAAAATTCTGATTTCTTTGATATCTTTAATAATATCATTTTTAAGAAAACGAGAAAGTACTGCATTACCAAATGAACCGGTACCTCCGGTAATCAACAAAGTTTTATCTACAAACATTATTTATAAATACCTATTTTTTAAGTTAATTGTCACCCCGTGACTTGATCACGGGGTCTTGTATCACAGACTGTATCCTAAGATCCCGTGGCGGGGCCACGGGATGACACACATCACCCAAAATCACACATACGCTTCACAAGCTCTTTCCACTCAGGAGGATTATAACCTGTTATCTCATTAAAATGCGTAGCGTCTAGCGAGCGATCTATTACTAACTCATCTGACGGAATAATATCGATTTTTTTATTATATATTTCTGCTATTAGCTTTAATAATTCTAACTTATTAATTGGCTTTGATGCGACATGGTAAAGACCGTGAAGCTTTTTATTAGGTAGCACAAAATTCTTTATTATTCTTGCAAGCTCTACAGTCGGAAAACCTGAATATATAGCTTTTTCAAAACCTTTTACTGACCCTTCTGAACTTAAAAACCGGTTAGTAAAGCTTCTATTTCCTGAAAGTTCATGACCTATAATTGAAGTACGAAGCGTAATAGCATGTGGATAATCCACCTCACCAAGAAATTTAGAACGACCATATAAATCATAACAATCCGGAAAATCACTTTCCTTGTAATTGCCTTTTTTCCCTGAAAATACACAATCAGTACTAATATGGATTAACCTGCTACCGACAAGTTCACATAAACCAGCAAGCCTATGTGGCAGTAAGCTATTAATCGGTAATGCTTTCAAAGGATCATTTGCATCAGCGAGCTGTTTTACCAGCCCTATACAATTTATTACTATATTAGGCTTTATTTTATTTAGTACTTCAACTAACGAATCGTAATTCTCAACATCTACATTTGGAACTATTTTATTTGCTAAATCTTTAGAAAAATAAGAATGAGCTGAGCTGCTCCGACTGGTCGCATAAACATCAAGATCTTTGTCAGTGCTCAAAAACCTAACCATACTATTACCAAGCATGCCGGTCGCACCTAAAATCAATATTTTCATAATAAAATTATTTTATTTTTATGGCATCGTTTTTACCATAAATGTATTATTCTTGCAATAGATTTTGTAATAGACACGTCATTGCGAGGAGATACAGAGCAGAGGGCGGAAGCAATCTCATGAGGCAATACAATATTCCTGAGATTGCTTCGTCGCTTTGCTCCTCGCAATGACGTTATTTTAAGTCAACCTCTTGACTATCTCTTCTCTTTTTATCAAAGGTAGCACTTTCGATATTTCCGGTCCTGATTCCTTACCGGTTAAAGCAAGACGCAATGGTAAAAACAACTCTTTTCCTTTTCGATTTGTTATTGCTGCGAGTTTTTTAGTCCATATCCCCCACGTCTCGGTGGTAATTTCTTCTTCAGGTAATAACTCTGCTGCTTGTTTTAGATATTCTTTATCTAAATTCAAATCTTGTATGTTTGGAGTTTTATGACAAATCTCCCACCAATCTTTTGCATCAAATAATTTTTTTAAGTTAGGTCTTACTGATAGCCAAAAATTTTCATCAATATATTCAGCATCTATTTCTTTAAGACGATCTTTTACCTCGTTAAATTCTAGACTTATTAATAATTTATGATTTAATCTTTCTAGATCTTCCGGCTGGTAAATAGTTGGGCTTTTAGAAAAACTACTTATCTCAAAATGTTTTACTAACTCATCCATCTTTTTATGAGGGATAATTTGTGCTGATGATCCAAGCAAACTAAAGAAGCTTGCAATTGCCATCGCTTCTAATCCGACTTCTTCCCTTAAGGTTGCAATCTCAAACCCTCCTACTCTTTTTGAAATTTTTTCATCTTTATTAATGATTAAGCTTAGATGCCCAAAAGTTGGTGGATACTTATCTAAAGCTTCAAACATTTGAATTTGAATAGCAGTATTACTAACATGATCTTCGCCTCTAATAATGTGAGTGATCTCATAATCAACATCGTCAATAACCGAGCATAACATATAAGTCATACTTCCATCTGCCCTTATTACTATCGGGTCACTCAAAGCTTTGCCCTCATACTTAACTTCGCCTTTGATCATATCATGCCAAGTAATCGGCTCATGATTTACTAAAAATCTATAATGCGGCTTTCGTCCTTGTTCTATATATTTTTGTATCTGATCTTCTGTTAGATTTAGGGCTGCTCGATCATAAATAGGAGGCAACCCTTTAGAAAGCTGAAATTTACGCTTTAACTCAAGCTCTTCTGGCGTTTCATAGCAAGCATATAATCTTTTTTTATCCAATAATAGTTTTTTGATCTCATCATATCTACTTAAACGACTTAATTGATTAAATGTTTGATCCCAGTTAAGGTTTAAAAACTTCAAGTCTGCTCTAATAGCGTCTTTATATTCTTGTTTGCTACGCTCTAAATCCGTATCATCAAATCTTAAAATAAACTGTCCATCATGCTTCTTCGCATATAGCCAATTAAGTAGTGCTGCTCTTATATTACCGACATGTAACATACCTGTCGGTGATGGAGCAAATCGTGTTATAACTTTTGTCATTTTTACTTATTTTTTTGTCTTTTTAACTTTTATCTTTTTATCGACAAGATTAGTTACCTCATCCATATTTAGAGGATTTGGTTGTTTAGCAGCAATTGCATTTAGTTTTTCTTCAATTAACTTCATTGCATCATCTAAGCTTAAATTTAAGAAATCATATTTTTTAGGTATCGAAATAAATTTACCCATATATTTTATGTATGGACCAAACTTACCATACCCGACTAAAACTTCTTCACCACTCTCTTTATGATTACCGATTTTAAGCGGTAAACTCAAAAGCTTTAATGCCATATCAAGAGTGATATCGTTTTGATTTAAACCAGCAGGCAAAGGTGAGCGTTTTGGCTTTATTTTGCTATCAACTTGCTCACCATATTGGATATAAGGTCCATAAGGTCCTTTTTTCAAATATATCTCTATTCCCTCTTTATCCTTGCCTAAAACCTTGTTTTCATTAACAATATCTTTAGCCTCCCCATCAGCTTCATTATTATCATTACCACTAACAATAGATTTTCTAAAATTACATTCAGGGTAATTGCTGCATGCTAAAAATGCTCCAAATTTACCAAGCTTTAAGCTTAGCTCACCAGTTTTGCATGATGGGCAAACTTTAGAGTCTTTATTTTCTCCAAATATATGATAATCAAGAGCTTGCTGTACATAGCTAATAATTTCTGTAATGTTTTGCTTATTTACAGATTCTATATTGTGGTTAAAGCCATTCCAAAAATTACCTAAAGCAGATTTCCATTCAAGCTTGCCAGCAGCTATTTCATCTAGCTCATTTTCAAGCCCTGCTGTAAAATCATATTCAACATATTTTTTGAAAAAACCAACTAAAAATACTGTGACTAAACGCCCTAGCTCTTCAGGTATAAAACGTTTTTTCTCTAACGTCACATATTTACGATCTTGTAAAACTGATAAAATAGTAGCATAAGTTGATGGACGACCAATTCCAAGCTCTTCAAGTTTCTTTACTAAGCTAGCTTCTGAATATCGTGGCGGTGGTTCGGTGAAATGCTGATTTGGAATGATCTCTTTAGTTTTTAAATGCTCTTGTTCCTTTAAAGGCGGCAACATCTTATTTTCTTCTTCAGCCTCATCATCTATACTTTCGCAATAGACTTTATAAAACCCATCAAAAGCTATAGTTGATCCGTTCGCTCTTGCCAAATATTCCTTATTTTCTGAAGCTAAAGTTGCATTTACTAAATCCATTATGACATTTTCCATTTGGCAGGCTATAGTCCTTTTCCAAATTAATTCATAAAGTTTATAATAATCTTTCTCTAGCTTTTCCTTTAAATCATTAGGGATATAGTTAATATTTGTCGGTCTTATAGCTTCGTGAGCTTCTTGAGCATTTTTTACTTTCGATTTATAAATACGAGGACTGCTTGGTAAATATTTATCGCCATAGTCTTTATTTATTAATTTACGTATTTCATCTACTGCATCGTTTGATAAGGTAACGCCATCAGTTCTCATATAAGTAATAAGCCCAATAGTTTCCTTACCGATATCTACACCCTCATATAGCTTTTGGGCTATTTGCATGGTCTTTTTAGCACTAAAACCTAATTTTCGTGCAGCTTCTTGTTGCAGGGATGAAGTAATGAAAGGCGGTTGCGGCTGACGTTTTTGTTGCTTCTTTTCTATCTTATCAACATGAAAATTTTGAGATTTAAGCTTTTCGGTTAAATCTTTTGCTTCTTTATCATTAGTAATCGAAAACTTTTCTAGCTTCTGATCATTTATATGGGTTAATTTAGCGGTAAATAGCTCATTATTACTATTTAGCATTTTAAGGCTAATATCCCAGTATTCTTCCGACTTAAATCGCTCTATCTCATCTTCACGTTCACATATTAAACGAAGTGCCACAGACTGTACACGCCCCGCTGATTTACACCCAGGAAGCTTACGCCATAAAAGCGGTGACAGTGTAAAGCCAACTAAATAGTCTAAAGCTCTTCGTGCTTGCTGAGCATTTACTAAATTATTATCAAGTTTTCTAGGATTTTCTATAGCATGAGTAATTGCTTTTTTGGTAATTTCGTTAAACGCTACTCGCTTAAAAAAATCATCGGATTTGACTTTGTTTTTTTCTTTAATTACCTCTGCAATATGCCATGAGATGGACTCACCCTCACGATCTGGATCGGTTGCAAGATATACTGATTCAGCTTTTTTTGCATCTTTAATTATTGCATCCACATATTTACCTGCTTTCTCTGAAATATCATATTTCATTGAAAAATTTTCATCAGGTATTACAGAACCTTTTTTAGATGGAAGATCTCTAATATGACCAAATGAGGCAATAACTTTAAATTCATCACCTAAATATTTATTTATTGTTTTTGCCTTTGCTGGCGATTCTACTATTACTAATTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_009883|871593:881966|874919_876053_-|WP_012151937.1|DBSCAN-SWA MLKVMTIVGTRPELIKLCCVISEFDKHTKHILVHTGQNYAYELNQVFFDDMGIRKPDYFLEVAADNTAKSIGLVIEKVDEVLEKEKPDAVLFYGDTNSCLSAIAAKRRKIPIFHMEAGNRCFDQRVPEEINRKIIDHISDVNITLTEHARRYLIAEGLPAELTFKSGSHVPEVLDRFMPKILKSDILDKLSLTPKQYFLISSHREENVDVKNNLKELLNSLQMLIKEYNFLIIFSTHPRTKKRLEDLEGFKELGDKIRFLPAFSFTDYVKLQMNAFCILSDSGTITEEASILNLPALNIREAHERPEGMDAGTLIMSGFKAERVLQAVKTITEEHDNNKRTQGLVPDYNEAGLVSKKILRIVLSYVDYINRTVWFKW >NC_009883|871593:881966|877184_878039_-|WP_012151939.1|DBSCAN-SWA MKILILGATGMLGNSMVRFLSTDKDLDVYATSRSSSAHSYFSKDLANKIVPNVDVENYDSLVEVLNKIKPNIVINCIGLVKQLADANDPLKALPINSLLPHRLAGLCELVGSRLIHISTDCVFSGKKGNYKESDFPDCYDLYGRSKFLGEVDYPHAITLRTSIIGHELSGNRSFTNRFLSSEGSVKGFEKAIYSGFPTVELARIIKNFVLPNKKLHGLYHVASKPINKLELLKLIAEIYNKKIDIIPSDELVIDRSLDATHFNEITGYNPPEWKELVKRMCDFG >NC_009883|871593:881966|879563_881966_-|WP_012151940.1|DBSCAN-SWA MKLVIVESPAKAKTINKYLGDEFKVIASFGHIRDLPSKKGSVIPDENFSMKYDISEKAGKYVDAIIKDAKKAESVYLATDPDREGESISWHIAEVIKEKNKVKSDDFFKRVAFNEITKKAITHAIENPRKLDNNLVNAQQARRALDYLVGFTLSPLLWRKLPGCKSAGRVQSVALRLICEREDEIERFKSEEYWDISLKMLNSNNELFTAKLTHINDQKLEKFSITNDKEAKDLTEKLKSQNFHVDKIEKKQQKRQPQPPFITSSLQQEAARKLGFSAKKTMQIAQKLYEGVDIGKETIGLITYMRTDGVTLSNDAVDEIRKLINKDYGDKYLPSSPRIYKSKVKNAQEAHEAIRPTNINYIPNDLKEKLEKDYYKLYELIWKRTIACQMENVIMDLVNATLASENKEYLARANGSTIAFDGFYKVYCESIDDEAEEENKMLPPLKEQEHLKTKEIIPNQHFTEPPPRYSEASLVKKLEELGIGRPSTYATILSVLQDRKYVTLEKKRFIPEELGRLVTVFLVGFFKKYVEYDFTAGLENELDEIAAGKLEWKSALGNFWNGFNHNIESVNKQNITEIISYVQQALDYHIFGENKDSKVCPSCKTGELSLKLGKFGAFLACSNYPECNFRKSIVSGNDNNEADGEAKDIVNENKVLGKDKEGIEIYLKKGPYGPYIQYGEQVDSKIKPKRSPLPAGLNQNDITLDMALKLLSLPLKIGNHKESGEEVLVGYGKFGPYIKYMGKFISIPKKYDFLNLSLDDAMKLIEEKLNAIAAKQPNPLNMDEVTNLVDKKIKVKKTKK >NC_009883|871593:881966|878219_879557_-|WP_011477379.1|tRNA|DBSCAN-SWA MTKVITRFAPSPTGMLHVGNIRAALLNWLYAKKHDGQFILRFDDTDLERSKQEYKDAIRADLKFLNLNWDQTFNQLSRLSRYDEIKKLLLDKKRLYACYETPEELELKRKFQLSKGLPPIYDRAALNLTEDQIQKYIEQGRKPHYRFLVNHEPITWHDMIKGEVKYEGKALSDPIVIRADGSMTYMLCSVIDDVDYEITHIIRGEDHVSNTAIQIQMFEALDKYPPTFGHLSLIINKDEKISKRVGGFEIATLREEVGLEAMAIASFFSLLGSSAQIIPHKKMDELVKHFEISSFSKSPTIYQPEDLERLNHKLLISLEFNEVKDRLKEIDAEYIDENFWLSVRPNLKKLFDAKDWWEICHKTPNIQDLNLDKEYLKQAAELLPEEEITTETWGIWTKKLAAITNRKGKELFLPLRLALTGKESGPEISKVLPLIKREEIVKRLT >NC_009883|871593:881966|871593_873666_-|WP_011477374.1|DBSCAN-SWA MIIKQDKLSTFYPLVSIIIPVYNGANYMREAIDSALAQTYKNIEVIVVNDGSKDSGETEAIALSYGDKIRYFHKENGGCGSALNYGIKNMKGKYFSWLSHDDLYYPNKVEHQINILNKLNNKNTIIYGGYELVDKNGKFLYHIRPDSVLTTDKLNISLLPLLRGLIHGCSLLIPVKYFHEVDMFDETLPSTQDYDLWFKIFRVASIYFDKLILIKSRFHSEQGSKKISAHNEECNALWSSFLQKLTEEEMIKMEGSAYLFLTRTANFLSSTPYQEAYALANNMAKQILRDAKVSVIIPVYNRINWTIQSIESVLNQTHENFEVIVINDGSTEDISELIKFCKKDKRIQYFHKKNEGPASARNLGIKKSSGKYIAFLDSDDLFFHNKLELQLKFMEENNFIFSHTSYQRIDEEGKYLESINSGSFSGNVFPKIIQTCPIAMPTVMGTLALFQENLFPENIRSGEDCCLWISISSRNLLGGISKELSKVRIRGDNTTFMNPNKYSQGLINITSYVLNNAYLAKFAPFTINLLLTAVTQLKILESKNELELLKNEDESELLENEDKSESLENEDKSESLENEDKSESLENEDKSESLENEKKEKNVEKNNNYFTQYNYPIIKQKVRKYYVKKLLENKKKEENNYFISYLKIKLKSYYFIAKILILLTIASLKEDGVRATISKIKRWFKKHRRF >NC_009883|871593:881966|876045_877071_-|WP_012151938.1|DBSCAN-SWA MFVDKTLLITGGTGSFGNAVLSRFLKNDIIKDIKEIRIFSRDEKKQEDMRIALNNPKIKFYIGDVRNYNSIDDAMKDVDYVFHAAALKQVPTCEFYPMEAINTNILGAENVLRAATINKVAKVIVLSTDKAVYPINAMGLSKALMEKLAIAKARMNVRDKTVFCVTRYGNVMASRGSVIPLFINQIKQNKDLTITEPSMTRFLMSLVDSVDLVLYAFEYGHQGDIFVQKSPASTIEVLAKALQGIFNSKNKIRFIGTRHGEKHYESLVSSEEMAKAEDLGNYYRIPMDGRDLNYAKYFVEGEKKIALLEDYTSHNTKRLNLEEVKELLLNLDYVQEELKNA >NC_009883|871593:881966|873873_874926_-|WP_012151936.1|DBSCAN-SWA MVEKNKIIEKWYSADIFYTKIKEFINPAFSIMDIGCGIRPQQYIIPDLLICVEPHQEYVEILKKNLSGTNSIIIPFEAKVVLETFLDKSVDSIFLMDVIEHMPKEMGKEILVECERVARKQIIIFTPLGFMPQEVHDTDGWNLHGGEWQEHKSGWYPNDFPDWNIIGCKNLHTHDFKGQALSTPYGGFYAIKNVTHFENCFNDVYAKEILLNATSNLESLKAIFPQFINQTIYNELMRSTLKSALSVCQRTTELLVTKGKTTPIKEILEMVHNEKVNFFINAVQECLLKINNFASQFKDLNDLQCLLNSANAQINHLQELLKSTTNQLEVLKGQLKIKEQALESNNKNLS |
7 | Catovirus(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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