Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_009840 | Prochlorococcus marinus str. MIT 9215, complete sequence | 1 crisprs | DEDDh,cas3,DinG | 0 | 0 | 2 | 0 |
1. NC_009840
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_009840_1 | 1171924-1172022 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_009840_1
|
1 spacers
spacers of NC_009840_1
>1.1|1171950|47|NC_009840|CRISPRCasFinder TATTTTTTTCAACTTATTAAATTAAGTAAAAAAAAACCACTTGATTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009840_1
The CRISPR arrays of NC_009840_1 >merge|NC_009840|1|1171924-1172022|CRISPRCasFinder ATCAAGTGGTTTTTTAGTGTTCTAAATATTTTTTTCAACTTATTAAATTAAGTAAAAAAAAACCACTTGATTTATCAAGTGGTTTTTTTGTGTTCTAAA >NC_009840|1|1|1171924-1172022|CRISPRCasFinder ATCAAGTGGTTTTTTAGTGTTCTAAA TATTTTTTTCAACTTATTAAATTAAGTAAAAAAAAACCACTTGATTT ATCAAGTGGTTTTTTTGTGTTCTAAA
>NC_009840.1|WP_041484401.1|1171648_1171870_+|hypothetical-protein MPKKSSIAIFLAATSALTITTNAGENDLGGLKEWNTDMPVDADFVLDAEAQKIADEAAKSSMCIPIGEGENCW >NC_009840.1|WP_012008043.1|1170911_1171577_+|Fe2+-dependent-dioxygenase MNYLTHQLLNPKEINLLKKNLTLQDISWEDGKKTAGNHAAKVKNNLQLDRSSNISKKCTGLIEKKILSDVLIKSFALPKRIHGTMFTKTLKGMKYGRHIDNAFMSSGRADLSFTIFLNEKDKYSGGELLIEGLNSEDKFKLDSGGIIIYPSTYLHSVLEVFSGERFVVVGWIESYVKSIEEREYLFDLDAGARSLLAKHGRSDELDLIFKSYSNLLRTLGE >NC_009840.1|WP_041484400.1|1169785_1170808_-|extracellular-solute-binding-protein MQKLKKLFYTALTCTFLMNVNIPVNSTEKEVKVYSGRHYNTDRSVFKKFAEETGIKVRLIEAAGISLIERLKREGKNSQADIILLVDAARITNAAKAGLLQPIQSSSLENDVPVGLKDPNKEWYALTRRVRVMVANPRVVDVSKINDYSDLADPSLKGKVCLRNRKSPYNQSLVANQIINKGESATKSWLSGMISNVSQPFFPGDIAIVRAVSKKKCGVGIVNHYYVARMLAGVNGRRDSLYAKKTKVLTPNPAHVNISAGGVAKYATNRNEAIKLLEFLASPEGSKGLAAPTFEHPLKQVNQNEIVKNFGEFLPDSVTVEDLGEKNSLAIKLMKDAGWN >NC_009840.1|WP_012008041.1|1168250_1169282_+|hypothetical-protein MKKNASNILIGYKTRSGLVFRLEGNEEIIVDSFNFRSVNNNVSYIGFISNKRFIFKQTKWVSFSGSGSSEMISSEIKYIYWKDIKGIVFGNIWNSNLRILGKVIDFSPEKKKVDWEMGKLFRGFGGLSYKNKKELEEILLPTLRDLCLENKIPFGTTKKYNKFSTIPFKETRSIIKEIRNKWQKNTLAILAVLFGITVALLGMATIWSILSRNKTPDSYDYSTEITPKKKQLYSQQNRYDLMLIEFQNSYFDYCKKTSLYYLFGNYISNLNWEAYKQNNFEFIKVTGNITYNYQQTPVALYFNIENYTPEKSLRFNLVDSYLNNQRMSYELEDALLTSICNEY >NC_009840.1|WP_049750968.1|1167871_1168162_-|superinfection-immunity-protein MKTLLNFLIGFLAIAILISILSGDIATGFSVTFIIGIYMLPSWLASSRGHPNQGSISTLNLFLGWTFIGWVAALIWANSYIDKDKKQKTAIDYLKE >NC_009840.1|WP_012008039.1|1166897_1167056_-|hypothetical-protein MRLTTPFTALRNATLDIWRMHDFNYQLPKDHRQDYWEKECIDHPTSSHCKVY >NC_009840.1|WP_041484399.1|1166205_1166808_-|rhomboid-family-intramembrane-serine-protease MLFKYSISKYDWQYMVTGFFLISVFIFTDLIGVIDKEHLYFVPRLISDQPYRIFTSILTHGDLNHLLSNLGGIIISRYFLMRLGIKSRFFYLKFILICSFLNFFIIWIYEKFLSFFIIYPNYAALGFSGIIYALFGFLLLTSFYGKKYFLGKEICFKSNYEVHKMLKTICLIGLIFSFLPRVSLLGHLSGFISGCFLFLI >NC_009840.1|WP_012008037.1|1163927_1165754_-|hypothetical-protein MRLIFYIFLISQLLNFLGVFAEKVKEDLYGSNSVKWEKVEENKSKSLKKIIWKSYKNDEFYFGNEKQQQGSITNRTNSSKEERISESLKNLGSSITEIEPYLPLNNFLEKGNFQTSVRWKSSFEGGASGGTGQQIPSFIFDYGISDSSLITINFSEADDKLYNKINGQKVDYHWQNYAFSFKKKILNNNENSFVISIVPTLEYWRHASGSKDSKSIYNQKDSLESRDRFDNLIGSLSLPISKKLNDNFTALIVPGVIFLPEKLGSKGIGKNAYGNNFYIGSGIVLDIAKDFNFLASYTSPLGPGNNYFDKDLNYSRKPIYSIGLGWDVNSKIGIEGKITNSFGASPSTGLLTIPSDNKPLYSANISYKPHGEDTYLNPLNERDKLISNGGITVNNALIPRFGTSQIKFNYDSKGNLFSSYGYSLSNIFKLELINIGSFNEVNISGNKNSNLYSTYLDDSNLNFRLGGKLLIFSPQKNDLYWVSLRSSVGRNNDTNQGYLFSEFINTFRVNNWLTLNVSPKYFFSGVESFGGIGFSSYINLFDNLMLIPEINTSFKNDSDMNSTLALRYSFTPEKSLDLYYSNAVGVQDIGQFLKDKDYRLGIKLNFLL >NC_009840.1|WP_002805708.1|1163662_1163914_+|2Fe-2S-iron-sulfur-cluster-binding-domain-containing-protein MKETNIKVIWPNNKETFVSKGDDWFSSAEKAGLEIPTGCLTGSCGACEIDVNGETVRACISEIKNNQECPLRVSLTTDPFWEN >NC_009840.1|WP_041484398.1|1162136_1163666_+|cobyric-acid-synthase MDLEAKLHEIRKPIMVLGTSSGAGKSLTVTAICRILKNLGEEPIPFKGQNMSNNAWIDWEGGEMAYSQALQAFACGINPSAEMNPILLKPQGNSTSEVIHLGKSIGTTTAQNYYKDWFIPGWEVIKKSLKSIYELNPNCRLIIEGAGSPVEMNLIHRDLTNLRVAKYLNANCLLVTDIERGGVFAQIIGTLELMKPEERKLIKGIIINRFRGDLSLFEDGKKWIENKTQIPVIGIIPWLNDSFPPEDSLDLIEKKSLSKNHEIKVGIIKLPSISNFSDFDPLENEETILIEWIRKSKNLSTYDFIILPGSKQTIKDQKFLENSGLSQDIRDYSNNEGNIIGICGGLQMLGTTLEDPYFKEGAKNYSEQKINGIGLLPLKTTFFKKKLTRQINTKSIWPCQSQINGFEIHNGQTILDDSQSSLKINPIFEDLDLGWFKENNKGGTIAGTYIHGIFENDSWREQYINLIRKSKNLPILNKKSISYKKKRESIIDNLANEFHKHLNLTSFLS >NC_009840.1|WP_012008045.1|1172036_1173314_-|carbohydrate-porin MKLFQKMLVAGSALSLIAPVASQASETINLEEMNGFVRSEQASSRLDSTTFINNVSEEIADLKGRVDGLEAKQNDFEAGSFSDTTTLDGKAVFALAAADHNGNYATNGESLQMQYSYTMNLNSSFTGDDNLYVRIKTGNGKGWTATTTQGGYLVSNNSNGDTLKVDKIWYSFPVGERNTFWIGPEVENYYMHATTPSIYSPTLKQFTLGGNASAYGASTNSGFGWAYNADNGFAVSSNFVSQQTNVATAGLLTNEAKTSWATQVGYTKPQYSVSAILNLKYNGWADSYFGTSNGNSRGTALNSTNVGLRAWWRPQETGTATPSISVGYDVSSIDGAASSADSTDMIFVGLNWSDMITADDKIGLAFGQPQTNENDTVDPFAYEAYYEYTVNDATKLRTTVFGNSDRDGTAGNDNTGVVVETSFKF >NC_009840.1|WP_012008046.1|1173431_1174319_-|glycine--tRNA-ligase-subunit-alpha MFFQDIIKNLNNFWSEEGCLIMQPYDTEKGAGTMNPHTFLRAIGPEPWSVAYTEPCRRPADGRFGDNPNRAQHYFQYQVIIKPSPEGIQEKYLTSLDSLGINPRNHDIRFVEDNWESPTLGAWGVGWEVWLDGMEVTQFTYFQQCGGIDCKPIPIEITYGLERIAMFLQDKESIWDLNWNRDLKYSDIWLQFEKSQCSYNFKESSADNLRKLFEIYQSEAISLIEKKLTYPALDFVLKCSHNFNLLDARGVISVTDRAQYIEKIRKLAREVASSWIDERESLHFPLMKNSKEIFL >NC_009840.1|WP_041484463.1|1174476_1174863_-|DUF1824-family-protein MEINKLVDLNNCRTAPQLSNSQEKKLLEELELILFNTDWITIGIMAPSDNRAIEALQSISKKYSSIKFRDLSSLHADGYVFLKANQKTGNVFVRSENGLGEGILITCQYNEDNKDSNTFGPLPLDFFR >NC_009840.1|WP_012008048.1|1174885_1175218_-|hypothetical-protein MPFINISTSAKIEDKKKLLEEISILVSSLTNKSKRFVMAKLADNYEMYFEDESPCCFLEIKSIGSLNPSEMAKPISEFVHERMGIPKDRIYISFEDVPASFWAWNGRTFG >NC_009840.1|WP_002806550.1|1175220_1175391_-|hypothetical-protein MIEFRRSKKSRSKNALFNPYKNGISQYDMAYLSSKKVLKNKTFNLVNDFQKDNLAA >NC_009840.1|WP_012008049.1|1175541_1176180_+|methyltransferase-domain-containing-protein MEVLNNYQRKKLDETNDEEFYSDPKFVYHLDANFRQYLSDLYESEISNNSIVLDLMSSWDSYLPKGKNYKKVIGHGLNKQELKKNKIFDSYWIQNFNLNQEIPLDQESVDYCLMVAAWQYLQYPEKITKEISRILSCQGKFIIAFSNRAFWHKAPNIWTESSEEERVQYVRKVLILNGFHEPKIIKKFNEPSLNLFNFLNKDPFYCLIATKK >NC_009840.1|WP_002807817.1|1176288_1176534_+|hypothetical-protein MGSKREKYPEKCPWDLGPNQHLAKEENWTLRLGEANVCFSKNKLDNNYFHVISNENEEQILAFRARLLYQKLLDKGFRLVE >NC_009840.1|WP_012008050.1|1176540_1177194_-|DUF3386-domain-containing-protein MDNLKEINCKEIFRKAYERRYTWRNDFKGYQGKCIFLRNNIIHKGSFALGKDFKPNIQKIEDENIVKSIASQLFEVCIHRVKREFESVHSENNFNLLKNSESGILMNVSGKNQGDKYRVKNDCINMVYRTIHGSIIEIFVEEFLDTGKGFLSKKYSSQQIDPNTLKAKSQKLEYEDEFVNIDKKDYWILSSRTIKYLNQNKEEETQKFVFDDIRLLN >NC_009840.1|WP_002808252.1|1177269_1178328_-|chlorophyll-a/b-binding-light-harvesting-protein MLQTYGKSDVTYDWYAGNSGVVGRSGKFIAAHAAHAGLMMFWAGAFGLFELARYDASIPMGAQKAIVLPHLAGIGIGGVENGVITEPYGIVVICTLHLIFSAVLGAGGLLHSNKFAGDLGDYPENSKPQKFDFEWDDPDKLTFILGHHLIFLGLGAIMFVEWARIHGIYDPAIGSTRQVVYNLDIAAIWNHQFDFLKIDSLEDVMGGHAFLAFLEIIGGVFHICTKQFGEYTEFKGKGLLGAEAILSYSVVGVSYMAFVAAFWCASNTTIYPVDLYGEPLKLQFEFAPYFTDTVDLGSGAYSSRAWLANTHFYLGFFFLQGHLWHALRAMGFDFKKIGQAFDNIENTKITQN >NC_009840.1|WP_002807605.1|1178471_1178996_-|flavodoxin-FldA MTVGIYYATTTGKTEDVADRLHNFISSAESPKDVSDVDDLSEFEGLDGIICGIPTWNTGADEERSGTAWDSILEDIGELSLSGKKVAIFGLGDSSTYTENYCDAMEELHSYFIKAGAEMVGYVDKSTYTFDESKSVIGESFCGLPLDEDSESDLTDSRLETWASQLKGEIPALA |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
478891 : 484225
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_009840|478891:484225|DBSCAN-SWA CTTAATGAGAAGATGAAAGAGTTTTTGACTTGAGATTTTCTGATAAGTAAGTTAATCCAGTACCCACAAAAAATAAAAACACAATCGATATAGATAGCAATGACATAGTCAATGGGTCTGTTGAAGGGGTAATCACAGCAGATAATATTGCTGAGGAAATTACAACTATCTTCCAATTCGAAATCATTTTTTCTGTTGTAATTATTCCAAGAGAACCAAGAATAAATTGTAATACTGGCAATTGAAAAGCTATTGCTGTGCTAGACATTAGTAAGAGAACAAAATCAAAATATCTTTCTATAGACCAAGTTGGTTCAACAATATCAGCACCGAAACTAATGAAGAAATTTATTGCTGCAGGGACTAATATCCACCAGGAAAAAATTAATCCTAAAAAAAACAGAAGACCTGAACCAAAAACTGCGGGCAAGATAAGGCTTTTTTCTTGTTTTGTTAAACCAGGAGAAATAAATAATATTATTTGATAAAAAATATAAGGCATAGAAACTATTAATCCGCTGTAACCTGCAACTTTAATAGCGACAAATAAAAACTCTCCTGGAGCAAGTTGTAGTAAATGAATATCGCCAGCTGGGATTTCTAAAAAAGATATTAATGGCTTTATGATGAGAAAACTAAAGAATATTGAAATAAGTATTGAGTAAATTGAGTTTAGTATCCTCTGACGAAGCTCCTCTAAATGATCACTAAAAGTCATTGAATCTGATAATTTATTTTCACTTTGACCTGGACCTCTCATTATTTTTTGATAAAGATTTTGTAAGAAAAAGGTTTAAAACTACTATTGTCAAAGTCCAAGTTGTTTCTTGATAAATTTAATTATTTGCTTAATTTAGGATTCGTTGGATCTGGTAATAAGAAAGGAGGAGCGTCATTTAGGGATGATTCACCGTAAGTTTCATATTCTCTATACCCACCCATTTTCCCATTAGTTTTCATTAAAGCGCTTACGAAGGCAAGTAGTAAGAAAACGGTAGGAGCTCCAATTATTAATGCAGCACCAAATAGATATCCAATAATAAATTCTGGAAAACTATGATTTCCTAAAAATTCATGAGTGCCCAAAAGAAAATCAAACATTTAGTTTTAAAAATTTTTTTTATTATAAACTAAATTACTGTTTTAAGATTTTTTTTAATGTAATCTTCTCCTCTTGTAGGATTTCCCCAAATAATTTCTCCATTTTTAAAGGAAACGCAACCCGGCCCTCCTTTTTTGATTTTTTGTAAATCTTTAATCTTTACTAAATTAATTGGAACTTTAATGTTCCTTTTTGCCTTACTAAATAAAGCAGCTAAGTCTGCAGCTATTTGAAGATCTTGCTCAGATGCCTCTTGAGATGAAGACTTCAAAACTACATGGCTCCCTGGAGATTCCTGAGCATGAAACCATAAATCGCCTTTTTTTGAGAACTTAAAGCTTATTAAGTCATTTTGCCTCATATTTCGCCCTACCTGAAGCTTCAACCCTGTGGGAGTATCAACTTGAATTGGCGAAGATTCTATCTCATATGAACTTTTCTTATCTTCTTTTTGCCTCTTTATATTGATATTAAACTCGTCACAAATTTCTTCCATAATTTCTTCTAGTAGTTTGATTCGCATAAAAAGTTTTTCATGATTTAAAGAATTTAGATTTTCTAAAAGCGTAGTGAATTCATCTAATCTTTCTATATTTGTTTTGTAAATACTTAATCTTTCTTTTATTAATTCTCTAGATCTTTTAAGTTTTTTTGACTTTTTATATAGTTTTTGTCCTTTAATAATATCTCGTTTTTTAATTTCATTTGAAGTGAATATATTATCAGCTTTTTTTTTATATATCTCGTAGTTTTCTGATTTTGTCAGAAGATCATATTGAATTTTTAAATTCTTTTTCTCAATATTGATCTGTTTAAAAATTATTCCTTCAATTTTCTTTCCCAATAATTCAAGTTTTTTTTGCTTCAGATGATAATCATAATAATGCTCTATACCCGTGCATAAATCTATTTTTTTTTCGCAATTAATTTCTTTATCGAAAAACCAAACGCAATAAAAATCTTTATTAAATATTGAAAAATTAAAGTTATTATTTTTAAACCTATTTATCCAAATCTTCCAATTTTTAAATATCTCCTTTAAGTCTGAATCGCCAATGAAATCGATATTTTTTTCCATTATTTCCGAATTGCAAGTTTTGCTAATAACTTCTAATTGTTTTGTGAGGATAGGACTCACACCTTGATAGGTATTTATTAAACAGTTTTTCAAAGACTCAGGTACTATTGAAATTGAGTCTTTCCATGCTTGAAAAGACTCATCTTCTCTAGGTTTTTTTTTGAGATTTACTGGAGGGCCAGAGTAGATTGATCCTGTTGAAATTGTTCTAAAACTAGATTGACTTGATTTAATTTGTTTACCAACTGCAATTATTTTATGTTTATTATCCAAATAAAAAATATTACTATGTTTCCCCATTAACTCAAAAATTAAATACTTACTAATTTCATCTCTAGGTTTTTTTGCAAAACCAAATTTTATAACTCTCTCGAAATCATCTTGATCAATTGAAATTAAAGCCATATACTTTAATCCGTATCTTATTTGTTTAGAAAGTGTGCTTTCTCTCCCAATCTTTTCTGGTTTATTTATCTTTAGTATTCTAGGCGAGTCTCCATTCCATGAAACTTCTAACCACGTTTGAGAATAAACTCCTCTGAAACATAATTGAACTGTATTAGGATCAGGTTGTTGGGCAGTTTCAAACTTTGTAGGTAAAATGTTCCTTGTTAAATAGTGCAAGACAGATCTCATAGATGTAATATCCATTATCTGTGGAACACCTTTTTGCATTATTCCTTTTTAGTTCACAAGATGTTTATCTTACTGTAAAAAATTTAATATGAAAAATCAAAAAAAACTTATTATCCTTACTGGACCCAGTGGGGTTGGTAAAGGAACAGTTGTTAAAGAAATATTAGGTAAAGAAAAAAATTTTTGGCTATCAATATCTGCAACTACTAGAGAACCTAGAGAGGGAGAAAAGGACGGAGAAAATTACTACTTTTTAAATCGGGAAAAGTTTAAAGAAATGATTGAACAAAACCTGTTCCTTGAATGGGCTCAATTCGCTGGGAACTATTATGGAACCCCATTGTCTTCTGTAAATGAGAAAATAAAAAAGGGATTTATCGTACTACTTGAAATTGAAGTAGAGGGTGCAAGGCAAATAAAAAATAAGTTTCCTAATTCACTTTCTATATTTTTACTTCCACCGGATAAAGAAGAGTTAGAGAGAAGAATAAGAAATAGAGGTACGGAAAAAGAAGAGGCAATTAAAAAAAGACTCTCAAGGGCTAATTATGAGATTTCAGTATCAAATCAATTTGATTTTGCATTAACAAATCACAATGTTTATGAAACAGCAAAAAAAATAATCAAGTTAATAAAAACTTGATTATTGTTTCTTTATCAACTCATTGGATGGAATAATAAATCTGGGAAAAACCTATTAAATTCAATAATTATTCCAGCTGTAAGGCTTAGCCAAATTGCTGCTACCACTGGAGCAGATCTGACAAATTTTGTGTTTAGAATTTTGAACATTTGTTTTGTGAAAGTTTTTAAAGATGTTTAGCGAGGACCATTAAGTGTAATATTGTTATCTTTCTCTCTTAAATCTCCATTTCTGCCCTGTTTATTGGCAAGAAGAGGCCATTGCGCTCCTTTTACAAGACATTTTCTGGCTAAATCTAGGTCTATAATTATTTCAAGATCTGCTGGATTCTTAGTCTTTTTTGATTCAATTAGATACTCTCTTCCTGACCAACCTATAATTCCAGCAATGTAAATGAACAAAACTCCGGGAATAAGTAAATCTCCTTCATGACCTCTATTTAAAAAGGCTCCCCATGGCTCAAGAGGAGGTCCAATTATTAAATGTGGAAGACCGTCATCTCCGCATGATGCTTTTCCGTATCTTTCAAATCTTGCGATGTCTTTTTGAGTAGTTGCAGAATTTGCTCTCTCAATGAATTTAGGATTTTCAGAACATTTTGTTAGGGCTGATGCAGTATATTCAGTACTAGCTCGGTCTGCATTTAAGGCTGGCCCATTAGCAGCTAGAGCAATTGGAGTAATTCCTAGGAACAGAAAAACAGAGGTTATGATTGAAAAAAAGAATTTCATAAGTTGCAATCTTTAATTCCTTATAGTGTGTTAAGTAAGAAATTAATATTAAAATAGGACAAGTTGAATCAAATATGCGCAAAGTTTTAGCTATTGAAACAAGTTGTGATGAGACGTCTGTCTCAATTGTTTCTAATATTGGCGATAATTTCAAAATACATTCAAATATAATTGCCTCTCAAATAGAGGATCATGCAAAATGGGGAGGAGTTGTTCCTGAACTTGCTGCTAGAAAGCATTTAGAGTTATTACCTTTTGTTTTGGAAAAGGCTTTAGCAGAATCAGAAATTAAAATTGAGGAAATTGATTATATTGCATCAACTGTAGCTCCTGGATTAGCTGGTTGTTTAAGAGTAGGTTCTATAACTGCAAGATCACTTTGCATGTTACATTCAAAGCCATTTCTGGGGATTCATCATTTGGAGGGTCATTTATCTTCAATTTTATTTTCAGAAAATTATCCAAAAAAATCTTTTCTTACATTACTTGTTAGCGGTGGACATACTGAATTGATAAAAGTTGATGATAGAAGGAGAATGCAGAGACTTGGTAAAAGTTTTGATGATGCTGCTGGTGAAGCTTTTGATAAAGTTGGAAGATTATTAGGTCTTAGTTATCCTGGAGGACCGGCAATTGAAAAGATTGCTAAAAATGGGGACCCTATGAAATTTAATTTACCAAAATGTAAGATTTCTGATAAAAAAGGTGGGTTTCTTAAATATGATTTCTCTTTTAGTGGTTTAAAAACTGCCGTATTGAGATTAGTTGAGAGAATCAATTTGGATGGTAAGGATGTTCCAATTCCTGATATTGCTGCAAGTTTTGAAAGAGTAGTAGCAGAGGTTTTGGTAGAGAGAACAATAAAATGTGCAAAAGATCATAGATTGGAAAATGTTGTTTTAGTTGGGGGAGTGGCTGCTAACAATACATTAAGAAAAATGATGATTAATGAAGCTAGTAAAAAATCTATTAAAGTTCATTTAGCTCCCCTTAATCTTTGTACAGATAATGCTGCAATGATTGGAGCGGCGGCGCTGTTCAGGATCAAATTTAAGGATCATTTAAGTTCCCTTAAATTAGGTGTCGCAGGAAGACTATCAATTGAACAAGCGAATACCCTCTATGAAGAAAACCCTCCTTTCTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_009840|478891:484225|478891_479650_-|WP_012007291.1|DBSCAN-SWA MRGPGQSENKLSDSMTFSDHLEELRQRILNSIYSILISIFFSFLIIKPLISFLEIPAGDIHLLQLAPGEFLFVAIKVAGYSGLIVSMPYIFYQIILFISPGLTKQEKSLILPAVFGSGLLFFLGLIFSWWILVPAAINFFISFGADIVEPTWSIERYFDFVLLLMSSTAIAFQLPVLQFILGSLGIITTEKMISNWKIVVISSAILSAVITPSTDPLTMSLLSISIVFLFFVGTGLTYLSENLKSKTLSSSH >NC_009840|478891:484225|482363_482498_-|WP_011862490.1|DBSCAN-SWA MFKILNTKFVRSAPVVAAIWLSLTAGIIIEFNRFFPDLLFHPMS >NC_009840|478891:484225|483154_484225_+|WP_012007295.1|tRNA|DBSCAN-SWA MRKVLAIETSCDETSVSIVSNIGDNFKIHSNIIASQIEDHAKWGGVVPELAARKHLELLPFVLEKALAESEIKIEEIDYIASTVAPGLAGCLRVGSITARSLCMLHSKPFLGIHHLEGHLSSILFSENYPKKSFLTLLVSGGHTELIKVDDRRRMQRLGKSFDDAAGEAFDKVGRLLGLSYPGGPAIEKIAKNGDPMKFNLPKCKISDKKGGFLKYDFSFSGLKTAVLRLVERINLDGKDVPIPDIAASFERVVAEVLVERTIKCAKDHRLENVVLVGGVAANNTLRKMMINEASKKSIKVHLAPLNLCTDNAAMIGAAALFRIKFKDHLSSLKLGVAGRLSIEQANTLYEENPPF >NC_009840|478891:484225|479730_479991_-|WP_002807054.1|DBSCAN-SWA MFDFLLGTHEFLGNHSFPEFIIGYLFGAALIIGAPTVFLLLAFVSALMKTNGKMGGYREYETYGESSLNDAPPFLLPDPTNPKLSK >NC_009840|478891:484225|481794_482349_+|WP_012007293.1|DBSCAN-SWA MKNQKKLIILTGPSGVGKGTVVKEILGKEKNFWLSISATTREPREGEKDGENYYFLNREKFKEMIEQNLFLEWAQFAGNYYGTPLSSVNEKIKKGFIVLLEIEVEGARQIKNKFPNSLSIFLLPPDKEELERRIRNRGTEKEEAIKKRLSRANYEISVSNQFDFALTNHNVYETAKKIIKLIKT >NC_009840|478891:484225|482525_483080_-|WP_002806688.1|DBSCAN-SWA MKFFFSIITSVFLFLGITPIALAANGPALNADRASTEYTASALTKCSENPKFIERANSATTQKDIARFERYGKASCGDDGLPHLIIGPPLEPWGAFLNRGHEGDLLIPGVLFIYIAGIIGWSGREYLIESKKTKNPADLEIIIDLDLARKCLVKGAQWPLLANKQGRNGDLREKDNNITLNGPR >NC_009840|478891:484225|480020_481721_-|WP_012007292.1|DBSCAN-SWA MDITSMRSVLHYLTRNILPTKFETAQQPDPNTVQLCFRGVYSQTWLEVSWNGDSPRILKINKPEKIGRESTLSKQIRYGLKYMALISIDQDDFERVIKFGFAKKPRDEISKYLIFELMGKHSNIFYLDNKHKIIAVGKQIKSSQSSFRTISTGSIYSGPPVNLKKKPREDESFQAWKDSISIVPESLKNCLINTYQGVSPILTKQLEVISKTCNSEIMEKNIDFIGDSDLKEIFKNWKIWINRFKNNNFNFSIFNKDFYCVWFFDKEINCEKKIDLCTGIEHYYDYHLKQKKLELLGKKIEGIIFKQINIEKKNLKIQYDLLTKSENYEIYKKKADNIFTSNEIKKRDIIKGQKLYKKSKKLKRSRELIKERLSIYKTNIERLDEFTTLLENLNSLNHEKLFMRIKLLEEIMEEICDEFNINIKRQKEDKKSSYEIESSPIQVDTPTGLKLQVGRNMRQNDLISFKFSKKGDLWFHAQESPGSHVVLKSSSQEASEQDLQIAADLAALFSKAKRNIKVPINLVKIKDLQKIKKGGPGCVSFKNGEIIWGNPTRGEDYIKKNLKTVI |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DBSCAN-SWA_2 |
1235414 : 1244958
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_009840|1235414:1244958|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_009840|1235414:1244958|1241241_1242357_+|WP_012008111.1|DBSCAN-SWA MKKFTIFTGTRAEYGLLKYLIKALTIEKDFETNLIVAASHLSPKFGETINEIKVDGIEPSFYIPLRIDSEENGMCLQTADIMIEVSKVLKELNPDYLILLGDRFETFGTAAAGHLLGIKIIHIHGGESTLGAIDDKLRHAISQLSTLHFTSAKVHKERVEKMGFPQDKVFNVGPMAIDGILNTIELNKKEFSRKTNFIFGQNNFLVTFHPETLSSDLGMEGLDNLLKVLKEIDCNILFTSPNADKGFELILKKIKAFVIETKPKSIFIPSLGQELYLNALRLLDCVIGNSSSGIVEAPLIGANIINIGNRQEGRFRFGKVINVNKNYYSIKNAINNSVSKSRTIDNKNNFSEYKKLRSPSKAILDVLRNYD >NC_009840|1235414:1244958|1238973_1239975_+|WP_012008109.1|DBSCAN-SWA MNNTVLVTGADGFIGSHLVETLVRDGYKVKAFCLYNSLGSWGWLDHSSPEIIQNVEIILGDVRDQFCVENSLVGVDIVFHLASLIAIPHSYKAPQSYVETNINGTLNILQSSKKLGIEKIIHTSTSETYGTAQYVPIDEKHHLVAQSPYAATKIAADQLAMSFFKSFNTPVTILRPFNTYGPRQSARAVIPTIISQLASGKNKVSLGKLSPTRDFNYVQDTVNAFKAVAFSKNTTGKIINCASNFEISIEDTAYLIADIMNKKIEISSESERERPENSEVNRLFGDNNLIKEITNWHPKYSGKKGFREGLKLTIDWFSKKENLSFYRPDIYSV >NC_009840|1235414:1244958|1236479_1237481_+|WP_012008106.1|DBSCAN-SWA MVIKPKLTKKILICGLGSIGKRHLKIIKDNWPNIKVACLRNKNPDYYPSSINDFLIEEFFYNINEAKEWNPDAVIISNPAKYHLKYALFFAELSKPLFIEKPIGIGNESNKYREKLSEYSKKSLILCGYVFRFDEGINLLKEKAQKIGKLVTAEFYCGSWLPNWRDGIDYRKSVSASKDLGGGVLLELSHELDLANWLIGPYEINYSYLKNTGLLDLDVEDCAMINAVSVTGCAININLNFCTKTEKRTIKIIGSEGNLEYDLIKNQLLICISNKEESYQLNQNKNQKYINQMEHFLECIENSEDPTCTVKDGFQVLNHVSKAKSFDNIKENL >NC_009840|1235414:1244958|1243920_1244958_+|WP_012008114.1|DBSCAN-SWA MENNIKVLITGGAGFIGGALIRKLLKESNYNIFNLDNLSYSSDLKSIDSLIQSLGKNTQKRYKFIKGDISNKETVENVIQETKPELIFHLAAETHVDKSIIYPENFILSNILGTFNLLESSLNYYKKIDPEKQKKFKFIHISTDEVFGSLPQNGFFNENTKYDPRSPYSASKASSDHLVKAWFHTYDLPCIITNCSNNYGPWQYPEKLIPNIISKAIQQKNISIYGSGKNIRDWLYVEDHIDAILLIADKGLPGKNYCIGGNNEKTNLDVAEKICNYLDEINPQINSHKSLIKFVKDRAGHDFRYAIDASLIKQELNWSPKHNFEDGLKNTIDWYLNNKSWLYKI >NC_009840|1235414:1244958|1239977_1241171_+|WP_012008110.1|DBSCAN-SWA MIEISSEIIKSIKKVIGPFQENENINLHEPDLIDTNANSYLKNCVDTNWVSSAGEWVKEFEKYLSAYTGAKYVIAVSNGTVALRLALHGMGVKAEEEVLIPPLSFVATANAVSHLGATPHFIDIESETLGMCPQALERRLKEIAIKKGKFLFNKLTDKRISAVMPVHVYGLPAKMIEIKKICLEWGIPLVEDAAEALGSWIVDNDNSFKHCGCFGDVGTISFNGNKIITTGGGGALLTNNEQIATHCRHISTTAKIKHPWDFYHDQIGWNDRMPNLNAALGVAQMEILETIVEKKRRLYKCYKKNFQDIEIAEIIGESKNSKSNYWLVTLRLKGNLDDNLKSNILQQAHDLKILLRPSWRLLSELPMYSNSPFGDLSESFNQSKRLINLPSSPKLIK >NC_009840|1235414:1244958|1242968_1243913_+|WP_012008113.1|DBSCAN-SWA MKILITGSKGQLGRTLIKLKPTKAKIFAMNRNNFNMLDIPNCLKVIRSINPDWIVNCGAFTNVDLAESNKEVAMEVNYHAPKAFAKEMKDLGGRFLQISTDYVFDGLRPNMKPYTTNDKKSPLGIYGISKAKAEDFIEDIFLGTNKGIILRTSWILAPFGSNFLLKILNLLLKNKEIKVVNDQIGSPTNIYSLAEVCWKIIELNNLEIIFNENKNGILHWQDNGQTNWYEIALKIRNFGKEIDLINYNTQVTPISTFDYPTPAKRPAFSVLDCNSAKRVLDHKGIDWRCGLEKIMKQIHLDKNNKFYINPNYKI >NC_009840|1235414:1244958|1242402_1242972_+|WP_041484471.1|DBSCAN-SWA MNLKTNKGNSINEVILIKPDIFSDKRGFFYESWNSNSFKKIIGNTNFCQDNHSNSIKGVLRGIHYQLNPTAQGKLVRCTKGEIYDVAVDLRKRSNTYKEWIGVKLNELNKNLFWIPEGFGHGFLTLSDIAEVQYKVTKPWDKLSEKSLLWNDSDLNIDWPLNKISPIISKKDALGITIKEAENMDFVFQ >NC_009840|1235414:1244958|1235414_1236473_+|WP_012008105.1|DBSCAN-SWA MEFVKDPLSTSVNENADLRKALEILTSTQVGIALIINHKYKLMGTLTDGDIRRGLLNGFNLESKVSDVMNKNYTFIYEKEVTDIAIALKKFSKKGVRHLPVLNNEGILKNLLLNYNDGSEKIMNNPVIIMAGGLGSRLRPHTDKCPKPMLKINGKPILEIIIKNCIDSGFREFFISVNYLKNIIKDYFGDGSKWGIKISYLEENEPLGTGGSLILLPKDLKNPFLVLNGDVLTKFNPSKLLEFHNKNNATATLSVREYILEVPFGVVETDGLQVTDLLEKPSYPKLVNAGVYVLNPNVISLIKNEEKLDMPELLLRVQQRSQKVIAFPIHEYWLDIGRLESLKKAFSTWDKN >NC_009840|1235414:1244958|1238193_1238967_+|WP_012008108.1|DBSCAN-SWA MFLSEQFILITGASGRIGSSVALDVAKYGGIPIIADVDLLGLEKLKEQILKKYKVESFIVEGNITTQEGIENILKKSISFKGLIHGAVQCAYPRSKGWGTKFEYIKEDYLKEDLSNQLGSAILFSQQILEIFKKQGFGNLINISSIQGINAPKFEHYSGTEMISPIEYSAIKAGVISLTKWLAKYYFNNNIRINCISPGGILDKQPTSFLNKYRESCSNIGMLNSNEHISPVVIFLLSELSIAITGQNIIIDDGWSL >NC_009840|1235414:1244958|1237477_1238182_+|WP_012008107.1|DBSCAN-SWA MNNKIYAFVFARGGSKGIPKKNLIKISGIPLLGHSINIAKEIEGVNKIFVSTDCDEIANVGKFFGAEIIKRPYYLSQDDSPEWSAWQHAVKEVNERYGLFDTFLSLPTTSPLRSKSDILKCIEASVDPNFQSVITICELSRNPWFNMVTSKEGKVELINKTQSIYRRQDAPKTFGITTVAYVLKPGFILSSKSIWEGNVKGVEIPTERSIDIDNFLDYKIAKYLFEEKINGTGI |
10 | Escherichia_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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