| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_009700 | Clostridium botulinum F str. Langeland plasmid pCLI, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
| NC_009699 | Clostridium botulinum F str. Langeland, complete genome | 14 crisprs | DEDDh,csa3,DinG,c2c9_V-U4,WYL,cas3,cmr6gr7,cmr5gr11,cmr4gr7,csx1,cmr3gr5,cas10,cmr1gr7,cas6,casR,cas3HD | 3 | 17 | 6 | 0 |
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_009699_1 | 1045803-1046090 | Orphan |
III-B
Consensus repeat of NC_009699_1
|
4 spacers
spacers of NC_009699_1
>1.1|1045831|38|NC_009699|CRISPRCasFinder TCTTGAGTAAAAAATAAAACCTCATGTCCTTCTAGGGC >1.2|1045897|37|NC_009699|CRISPRCasFinder GATACCTGTTGTGTAAGTTTAGCTATCTCTGGATTGT >1.3|1045962|37|NC_009699|CRISPRCasFinder ATATATGCACTACGGTGTTTTACATTATTCGGACTAT >1.4|1046027|36|NC_009699|CRISPRCasFinder AAGGTAGATATGGCCATATCTACTTGCGGAGCCTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009699_1
The CRISPR arrays of NC_009699_1 >merge|NC_009699|1|1045803-1046090|CRISPRCasFinder TGAACATTAACATGAGATGTATTTAAATTCTTGAGTAAAAAATAAAACCTCATGTCCTTCTAGGGCTGAACATTAACATGAGATGTATTTAAATGATACCTGTTGTGTAAGTTTAGCTATCTCTGGATTGTTGAACAATAACATGATATGTATTTAAATATATATGCACTACGGTGTTTTACATTATTCGGACTATTGAACATTAACATAGGATGTATTTAAACAAGGTAGATATGGCCATATCTACTTGCGGAGCCTATTGAACAATAACATAAGATGTATTTAAAT >NC_009699|1|1|1045803-1046090|CRISPRCasFinder TGAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TCTTGAGTAAAAAATAAAACCTCATGTCCTTCTAGGGC TGAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT GATACCTGTTGTGTAAGTTTAGCTATCTCTGGATTGT TGAACAATAACATGATATGTATTTAAAT ATATATGCACTACGGTGTTTTACATTATTCGGACTAT TGAACATTAACATAGGATGTATTTAAAC AAGGTAGATATGGCCATATCTACTTGCGGAGCCTAT TGAACAATAACATAAGATGTATTTAAAT
>NC_009699.1|WP_134865364.1|1045588_1045741_-|hypothetical-protein MLKNFFQPFAIFYKDRDKAYLKAYISMPRIYFKIKCGLKILLLIIRLISY >NC_009699.1|WP_003401789.1|1045022_1045580_+|bifunctional-adenosylcobinamide-kinase/adenosylcobinamide-phosphate-guanylyltransferase MSDKNKVALITGGVRSGKSEFAESLLQNEKSVLYIATAKITDKEMEHRVEKHKERRNSTWKTYEGYKDLGKIIKYYDEKNILLDCVTVMTTNLMFHKKIDYENIKEEQLDEILEGIKKEFYDLIISVKEENKNIILVTNEVGYSIVPAYKLGRIFRDFQGIINKFIASLSDEVYLVTCGIPLKIK >NC_009699.1|WP_011987836.1|1043148_1044744_+|LexA-family-transcriptional-regulator MKLESGQNRIVKSKHLGYGLLRGSLGTGKTTAAIYRGIYLKNQYCMYDKDKVLILSKHEENLNYIKNIYDEAEKTGVQYITLFSYIEDKLYFSVIYKIINKYFWEYIENNNLQCKIASEEEKRAIIEECINDIKNEYKKLKYIDIKYSKFFLEEIQWMKDCMYYELEEYKKADRIGRKTKKGEGPQRIIKNSKIREAVFKIMLLYNEKLKDKNLLDYSDVVSMALKEASKNKENKFNHIIVDEAQNFTKLELKFIEALGRKNIYSSILFIADKEKNSNPKGWITKGRKLNNLQLGFEFKRFNLNKKVSINLKKNIDDCNLKRKVSNIDTKNEAVSNIDNANLEDKVLDKNIKNEWHKDRVNYDMDKFEYVDMKHRRSYEFSRGLGSNEEFIVEDQGSKEEYKEDELTKLPVFNDIAAGEPILMNPCVEGEFNIPKYWVRGMKNCFILKVKGDSMIGANIEDGDHVVIKRQQMAENKDIVAVNLEGSATLKRLLIKKSGAVLMPENKKYKPIEIREEGASIIGIAVGIIKGK >NC_009699.1|WP_011987835.1|1042523_1043069_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MGKIKQAKYNINGKTIIIRHAEVQDAEQLINVTKKVNQETDFLLKDPEEVCLTIKEEKEFIQSQIDSQVDLLIVPEIDGRIVGICSLNGNTNKRIRHCAQFGLAVEKEYCGMGIGKNLMKSGIEWAKENGIFRITLEVDINNYRAISLYLKLGFEIEGTLRNDKMLLDGSYTSGYAMALLL >NC_009699.1|WP_011987834.1|1040474_1042181_+|hypothetical-protein MDRFSFLKIEWPEIYQIICNVEEKSKEDSNTTLIKLAQIAELITKYILKENHIEKNTELLDEINLLRDCYNLNDNIADFFYKIIIVSNKAIYENYSDSIIAKSFLDKMFEILVWFAIEYGKTDYRKVDLSNMIPEDKDIFNKYIKSKSYNDTEKNIENETMIQPFTIDNEEFFKEENNDDINRYEQDIFETKEEFHKRIKDHEIFTLGRIFIKKSNINGTDEIVAFPFSVYKSIQIKIPIIDMLYIERAEFENLSIEEEEYTVFSKLDIINDKICIDINNIYIGVNNNKCKVHAVVLDVSYYESYEKYRNIIYSKKSIPIGMIKLNKNKYDINKNEMPVTINYYDWIQKYILNTKAYIEIDRYEAKTLCKENLYYILNGKLDIFDKKLLIREYYIQSKSLDKNFRINLHSSDTMNKLRCLVDKEEILAMNIIGEMYYKEQNYKEAMYWYKKASEKGNSTSMNKIGVMYYEGKGVEQDYKKAMYWYKKSSQEGNFTAMSNIGFMYYSGQGVTQDYKKAMYWYKKSYKEGNSGVMRDIGSMYYEGKGVIKDYKKAMQCYKKASQIDNFIK >NC_009699.1|WP_041173203.1|1039521_1040070_+|biotin-transporter-BioY MDKKLKVRDMIYSALFATIIGVSSYIIIPLPISPVPITAQSLAVMLAGCVLTPIQVVLSMITFLLMGIIGIPVFSGGTAGFGIIVGKTGGYLIGFLVGAIIISLLVRKNKSLVNMMIACFIGGIVVVHILGSAWLGQVTSIGIKKAFLLGSAPFIPGDLIKAVVAVLIGRKLSKEMKRIGTQ >NC_009699.1|WP_079992165.1|1038138_1039170_+|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MMNNKISVKMVVAFSLIVFFIVTSAVVISALVVVFLSRFNVFTQPNPLILLGWLGIISIMVSTAIAQIIGKKVLSPISDLNKATKEVAKGNFNTRLSENSWTDEIREMAHSFNIMTHELGNIETLRDDFISNVSHEFKTPISAIEGYATLLQDDELSDEERKEYIHKILISTKRLSSLSGNILQITELENQKILPLKQKYYLDEQIRQTILLFEYQWTKKNITLDINLDNITYIGSKELLAQVWQNILGNAIKFSHQNGTIQVTLTQTNEEVLITIKDNGIGMSEEVKDRVFEKFYQGDSSHYSDGNGLGLALVKRIIDICEGTIKISSHEEVGTEFTVKLPK >NC_009699.1|WP_011987831.1|1037470_1038142_+|response-regulator-transcription-factor MFRVLVVEDDPALRKLFCTVLNKNGYKSIEAKDGDSALDILYREYIDLIISDIMMPNMDGYTLTKLIRESNNNVPILMITAKETFSDKQEGFRVGTDDYMVKPIDVNEMILRVGALLRRSQIINERKIVIGETTFLYDFLSVKYNNKELVLPQKEFYLIYKLVSTPNKIFTRQQLMDEIWGIESETDPRTVDVHINRLRDRFKDNKDFNIITIRGLGYKVVKQ >NC_009699.1|WP_011987830.1|1034950_1037311_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein/permease MLQIKDLKKVYTTGEFKQTALDGVSIDFRQSEFVAILGPSGSGKTTLLNMLGGLDQYDSGDMIINGLSTKKFGESDWDTYRNNSVGFIFQSYNLIPHLSIVDNVEMGMTLSGVPKSEKRQKATYVLEKVGLGNHIHKKPNQLSGGQMQRVAIARALANDPEIILADEPTGALDTQTSQQIMDLIKEIAKDKLVIMVTHNPELAEEYADRIVSFSDGKIVSDTNPFVSENNSNDYKPKKTSMNFLTALKLSGNNIVTKKWRTALTAFASSIGIIGVALVLSLSNGFNKQINEFEKDSLSNYPISIEQNSMSLGMSPSSKSKDKEKTEFPNKSMIYPYDSSKNATVHANAISTEYVDYIKKIDSSLINGISYTRNVNMNILKKQDGKVVSMNTSAAAFSTYPSKGDSFKTDYLKSYYDVLAGSYPKNEKELVLVVDKYNQVDTNILEALGFSANSKNINFDSMIGTEYKLIYNDDYYTQSGKYFTVNGDTTNLENLYNNKNAVTLKISGIIRIKEDANVSNLSTGIVYSDQLAQDFIENAKNSKIVLAQKEAKYNVMNGNLLTEKTSTTTAAVHGAPNMTTNITSNVETKDDVLASLGATSSPTSISIYPVNFEAKDNITNYLDDWNKKLKEEDQIVYTDMASMITSLTGNIMDGITIVLVAFAGISLVVSMIMIGIIIYISVLERTKEIGVLRALGARKKDITRVFNAETFIIGFCSGGLGIAITYLLTIPVNSILYKFTDLNNVAQLNPLHAIALVITSIVLTMIGGAIPSKMAAKKDPVIALRSE >NC_009699.1|WP_011987829.1|1032979_1034587_+|hypothetical-protein MKKKIYSSFIVLSLIISMALIYFLMPVFSVKFYSFYIVFIIIALLLSINVSLNKGKESSKIYGIPVILIGLFIVMFIISLPIFRASSYKKLLPTPKYEEFSKNITPIDIKEIPTVNQKYAELLADKKLGEETSLGSKVELGTLTLQNVNGKLYYVAPLVHSGFMKWLLNDSTPGYITVSATDDKDVKLVTKLNGKDIKIRYQPKGFLNDDLKRHIYLKGTMNKGITDLTFELDDKGNPYYTATIYENKVGMSGQKAVGTAIVNPETGEVKKYTVENTPKWVDRIQPQSFVENNLKKWGKYIKGFFNFSGQDKLKATEGTGVIYNNDRCYYYTGLTSVGKDESSIGFALVDTRTQQTRIFKIAGATETASMKSAEGKVQNLGYTSTFPILINVDNIPTYFTTLNDKNDLTKMFAMISVTDYNIIGTGENITECKSNYIKNLASKGNLINVGSTGKEENITDTIERINSYVVGNSTIYTFILKDHKDKIFNAGISISNELPITKEGDKVNIRYVDTKQDTINITSFDNIEFKQQSIK >NC_009699.1|WP_011987837.1|1046201_1046966_-|MerR-family-transcriptional-regulator MHYKIKEVADMAGISVRMLHHYDKIGLLHPESVSAAGYRLYSDENLDRLQQILFFKELNFPLQEIKIILDSPNFDKKEALKVHRQLLLEKKIRLEKIIQSVDKTISNMEGEFKMDKKETLNVFSMTEIEEHQRKYSEEIKEKYGNTSAYKESNKKTSKYTKEDWSNIMKGWDEIFKKLANLMDKNPDDKEVQESVHQFREHISKNFYDCTPEIFRGLGELYVNDERFTTNIDKYKTGLSKFLKEAINVYCDNIK >NC_009699.1|WP_011987838.1|1047671_1049153_+|cobyric-acid-synthase MAKIMIQGTASSVGKSLIVAALCRIFKQDGYSVCPFKSQNMSLNSYITLDGKEMGRAQVVQAYAAGLEPEAYMNPILLKPTSDKKCQIIVNGKVYGNSTAMGYHNLKLRFKDMLKEHFNKLEEDFDIVVMEGAGSPAEINLRDRDIVNMGMAELVDAPVLLVGDIDKGGVFASLAGTMLLLKDGEKERVKGTIINKFRGDVEILKPGLDMLEDIVHIPCLGVVPYTRLQLEDEDGAVEFNKKAYAPIDIAVIKMPHISNFTDLDALKSEEDVSIRFITSKEEFKEPDLLVIPGSKNTIEDLLYLRKCGLEESIKEYSKDGKIVGICGGYQVLGSKIKDPYKVETDLGEIDGLNLLDMETTFEKEKVTTRVSAKLIDEKIENTVYGYEIHMGISEYSENVKPLFKIYDKNGEKVDYFDGAINEKGNVMGTYIHGVFDGVSFREKIINELRVKKGLKKKKSQVYEHMREKELDKLADIVRQSLDMKKIYSIIGMK >NC_009699.1|WP_011987839.1|1049154_1050117_+|cobalamin-biosynthesis-protein MYLNVTGNFIDIIIAIFIDWIIGDPYWFPHPVIYIGKLINFLEKKFRARVKNEENLKIYGEVIVMIVCFASFLIPFMILQAFKFNFYIYHGLNILIIWTTLAAKCLHEEAIKIYYALYKENIEEARLKLSYIVGRETKDLIGNEIMRADIETVAENASDGVIAPLFYAIIGGAPLAMMYKGINTMDSMLGYLNDKYRYIGFFPAKVDDIFNFIPARLTGILMCISAPIVGGNPFKSFKIMIRDRKNHKSPNCAYPEGATAAALKIQLGGTNVYFGQVVEKPTIGDKIKELAPIHIKESIKLMYASEALMIVMCAIIFKLF >NC_009699.1|WP_011987840.1|1050335_1051424_+|aminotransferase-class-I/II-fold-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MHGGDIYTEGILKGKELIDFSSNINPLGLSDSFKDNLEEALSWVQVYPDIQYRNLKRNLIDYLSFSLGYFYKEKVEKPNIKEENLVLGNGAVEIIDLAISNLKSISILVPSFVEYELCAKKWNVQIDYCNLNEDMTYNYENIKKSLEKTEGIILGNPNNPNGSVIDKESFIYILDYCEKNNKIVILDEAFIEFTGKNSFSFLNLYKRYKCIFIIRALTKFFSMPGIRFGYGISFNNEFLNKIREKQNPWNINCFAEIAVKYVLKDEEFIEKSINYIEKERTFMYENLKKSHLFHDVYSTYSNFILCKLKRITGEELKEKLLDKGFVLRICKDFKTLNDDYVRFAIKTRELNKNLIHVLKEIN >NC_009699.1|WP_011987841.1|1051608_1052328_+|energy-coupling-factor-ABC-transporter-permease MKKKYLFLLTTALVLALSQSAYAMHIAEGFLPPKWAALYFVLSAPFIVIGIKHIRQKTKKNKDLKMLLAVVAAYAFILSAMKIPSVTGSCSHPTGTGLAAIIFGPFVASVVGVIVLLFQAILLAHGGITTLGANTFSMGIVGPIVSYLIYKGLKNKNQKLAVFLAASLGDLATYTVTSLQLALSFPAKTGGAMAAFAKFATIFSLTQIPLAIIEGLITIMIFDFMMKYSKEELKTLSEV >NC_009699.1|WP_011987842.1|1052331_1052631_+|energy-coupling-factor-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKQNIIITIVSVVVILASLFIGGARGGEFAGADDQAEGIIEEMNKNYEPWFESIWEPPSGEIESLLFASQAALGAGVIGYYIGKKKNAKNNNASIKNQ >NC_009699.1|WP_011987843.1|1052593_1053292_+|cobalt-ECF-transporter-T-component-CbiQ MLRTIMLLSKTSKLSNIHPLEKAILSIIPIVILGFTQNYIIVFCNILFFLFMNFISKNNKKIFTKITLEVTAFAAISSITFVFDYGIVYTLTLIFKSVSAGLCLSFFSLTTPIDDMLYCLGKKEYLKDMCDIAKGMERFLVVINDEYNILYSSIKSRGGFDSFKLKIRNTGKMAALLFINTLSRWKIIKEGLDSRGYVGYVPYLDRDFDFSYIRFFSILSYIILMLLLVIFF >NC_009699.1|WP_079992166.1|1053724_1054387_+|NAD(P)-dependent-oxidoreductase MEWINLQEKYNFIALKSKRIRILIVGGGRAAFIKGKSFLDRGCSLYMLAPKFSKGVLDLKNYDNVEFIKNNYDEKYILDKHLVVIATEDEEVNNEIRNNCDALSKLYIDCSDKDKSLCFNSFQRESKTMVLALNNKIGCPKATSFIGEKIKRDLEKYDNYIEYVTYIRSITKNNTMKDEIIDFICSNDFHFFFEKGYGNLILSMFYGGMDFEFYNSHKKK >NC_009699.1|WP_011987845.1|1054355_1055228_+|hydroxymethylbilane-synthase MNFIIATRRSKLAQVQTEIIIDLLNKKHDIECEKLLIETVGDKILEVSLDKIGGKGLFVKDIEVAMLEQRADAAVHSMKDVPYEMPKGFEIIAIPKREDVRDAFISLDNIKFKDLRKGAKIGTSSRRRAAQLKLLRPDLDIVPIRGNVQTRIEKIKKENLDGIILAVAGLKRVNLEHLITDYFDTKEMVPAIGQGALGIEVMEEHPKKELFKDLDHYNSKICVLAERAFMRELDGDCHSTIGAYASIKDNIMHIIGIFERKNKIIKKEITGTKDQYEKLGIALAEHILKD >NC_009699.1|WP_011987846.1|1055363_1056824_+|uroporphyrinogen-III-C-methyltransferase MSKVYLIGAGPGDEELITLKAIGALKKCTAVMYDRLANGELLKYLAPNCEIYYCGKEPGCHYKSQDEINKMLVKLAKQGHIVGRIKGGDPYVFGRGGEEALDILEENIEFEVIPGVTSPVSVLNYAGIPITHRGISRGFHIFTAMTKDKLDIDWKSVVNIGGTLVFLMGLGRLELITKGLIENGMDKESKVAVVMKGTTSKQKKVIGNLENIVEKVKEAKLESPVIIVVGEVVSFSDKLNWYEKKPLFGRNICITRTKEQAKELKVQLLDLGAEVTEINSIEIKNAEENLKPYLNRLKEYDYIALTSVNAVKIFFDYLIKENIDIRNINAKFAAIGPATSEAIRMRGIMPSIKSKHFVAESLFEEMKNHIQKGDKILVPRSKDARPFLVDALRKEGCAVDEVHIYETLCGQCTYTERFENADTVLFTSPSTVRNMISMVGIDSIKEKNIIAIGPITAAELDKNNIECSICDEYSINGIIDKLLALN |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_009699_2 | 1109191-1109283 | Orphan |
III-B
Consensus repeat of NC_009699_2
|
1 spacers
spacers of NC_009699_2
>2.1|1109217|41|NC_009699|CRISPRCasFinder AAATTCTATTTTACGAATTATTTTATTTGTCATCTTAAAAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009699_2
The CRISPR arrays of NC_009699_2 >merge|NC_009699|2|1109191-1109283|CRISPRCasFinder GTTGAACATTAACATGAGATGTATTTAAATTCTATTTTACGAATTATTTTATTTGTCATCTTAAAAGGTTGAACATTAACATGAGATGTATTT >NC_009699|2|2|1109191-1109283|CRISPRCasFinder GTTGAACATTAACATGAGATGTATTT AAATTCTATTTTACGAATTATTTTATTTGTCATCTTAAAAG GTTGAACATTAACATGAGATGTATTT
>NC_009699.1|WP_011987905.1|1108474_1108966_+|hypothetical-protein MKKRGNLVILCLVVITIAGSGILYKNYFANIDSNNYLSSRDESERSVFRHENDKSSKNTHSFDFKKFDGKWSLMEFTSSKGNKININDNTKINKGKFYIVILDSQYNIIAKKNESNQNGNINFTTPKDGKYLTRIVGAKASGKFDVSVNSDRNIDISHIDFFD >NC_009699.1|WP_011987904.1|1107395_1108250_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MFIYDTLENIGIETLHETFLNAFSDYQVKMDLPLFKFQHMLQRRGYVSKVSIGAFNNETLVGFVLNGVRNWDGKLTAYDTGTGIIEAYRKQGITSNMLLNVRRLFQQMGVEQYLLEVIQSNTSALQLYKKQGFKILRDFECFHLDKNKYNPITTYKVEHVDMINPNDWRELTEFWDFVPSWQNSIDSINAVSDSFIYSIVRFDDNIVGYGVIDKKTGDIPQIAVNKNYRRKGIARSILTDLIKNTESYNINVINVDGRSKSMKDFLLKLGFECGVSQYEMILKL >NC_009699.1|WP_011987903.1|1107026_1107350_+|TfoX/Sxy-family-protein MASNIEFVEYVCDQISGAGDITYKKMFGDYGVYCNEKIIGLICDNQFFLKITKAGKDLLHEAIEAPAYKGAKPSFLIESLDNREYLAKIVSATYKELPMPKSKKTKK >NC_009699.1|WP_011987902.1|1106080_1106926_+|aldo/keto-reductase MQDIKSYTILNNGVKMPWLGFGTYKVENGDTVIQSVKEALKIGYGHIDTASYYGNEEGVGTAIKESRIPREDIFLVSKVWNSEQGYDKTLKSFEDSIKRLGTDYLDLYLIHWPQPLSKETWKALEKLYKEGRVKAIGVSNFLVNHLKWLLEDAEIMPMVNQVEFHPQLIQKDLIEFCSKNNIQLEAWSPLMRGKVFQIELLQELAQKYGKTISQIVLRWDLQMGVVTIPKSINPSRIKENADIFDFEISKEDMDKIQQLDKGLRVGSDPNKVYPCQSISNK >NC_009699.1|WP_011987901.1|1105758_1105959_+|DUF3788-family-protein MYGKKEIEQFESRIDEFSDYMKQIFNETKHYHDGKWLLIRIQDDKYINELIEMIKIKKKPKKKHIA >NC_009699.1|WP_011987900.1|1105101_1105695_+|DUF1349-domain-containing-protein MFRFNTKECEWFFEPKNYLIEEDKVEIITEPNTDFWQRTYYGFRNDNAHVLYVTTDEKYFSFTVKTDFNSTALFDQCGLAIYQNSENWAKACIEFHDNNTSWLGSVVTNHGYSDWATMDIGSSVKSMWYRLSRRGSDYCFENSFDGVNFKQMRIFHLFEGAKEINFGLLACSPSKNSFKATFTEMKITDCLWEEHKA >NC_009699.1|WP_011948662.1|1104505_1104949_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MEIKIIEENKRSFLDLLLLADEQESMIDKYLNRGEMFALYDGDLKSICVVTNEEEGIYEIKNLATYEKYQGQGYGSRLIKFIFEYYKDNCKTMLVGTGDSPLTIPFYKHCGFKISHRIKNFFIDNYDHPIYESGVQLIDMVYLKKDF >NC_009699.1|WP_011987899.1|1103939_1104404_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MNIRMYQLEDCREIVELFYNTVHSINSRDYNSAQLDVWAPKEIDIDSWYKSFSQHYSIVAEESDVIIGFGDLDETGYLDKLYVHKDYQGIGVATTIASELENYAQENHISIVTTNASITAKPFFKKRGYEVVKEQFVERNGQFLKNFIMKKVLG >NC_009699.1|WP_011987898.1|1102560_1103598_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MIKENLNLDKVIDFKKWIKLQESLALVTKAAIIVVDYKGNPVTEHSRCNRFCKAVRSNPDLVKYCHKCDSRGGLEAVRLNKPYIYLCHYNIVDIAIPIIIDGKYIGAIMAGQIKLSDNKDSDFLEQIVITPKNSTARHALKEFKEYYDEIPVLSLKEVQEIANMLFSLCNYLVEEALDKNLISEIYKKTVTPKSEIDSNTLTGYTMKNIENAKKEMSNVLLNSYVKENLSSDSLDISVSNTLKPAIEYIYNHKSENITAKKLAEVCHISPSYFSRLFAKETGKSFSSFISNLKVDWAKSLLEETDMPINEISDELGFNETGYFIKIFKKYESVTPFVYRKYCKKN >NC_009699.1|WP_011987897.1|1101113_1102244_-|glycerol-dehydrogenase MRKAFICPTKYVQGEDELLNLGYFVKSFGESALLIAHKDDIKRVKDKLDSTAKKFGITFVESSFCGECSREEVARLQEIAKNNKCACTIGLGGGKAIDTAKCVAKGNSLIIVPTIAATDAPTSHSAVLYTPDGSFDDYAYFWQSPTVILIDTTVIANAPTRFLVSGMGDALSTYFEARATSNSFSNVNAGLPCGVREGLCAPAKGTNTALTLAKACYKTLLEDGVKAKIASDCNLVTQALENIIETNILLSGLGFESAGLAAAHAIHDGLTILEGTHKYFHGEKVAFGTIAQLVLENAPKEEIDEVINFCLEIGLPVCLEDIGVDSITDEELMEVAKKSCIEEESIHSMPFKVTPEAVAAAIITADTLGKKYKSNK >NC_009699.1|WP_011987906.1|1109647_1110655_-|adenosine-deaminase MNFKKLPKIELHCHLDGSLRVDTILDIAKKDNIPLPSYNKKELINYVSIMDDCNSLDEYLNKFFIPNKVMQTKENLKRIAFELLEDVAADNVKYIEVRFAPLLHVEKGLNIEEIIESVLEGIKEAEKLYDIKGNLILGCMRNMDIPSAFEVVKKGAKFIGKGVVAIDLCAGEEPHFPGKYIEVLKLAKECGYRITIHAGEAGVGENVLEAINLLNAERIGHGIYIKDCAEAYKLVKEKNIPLEVCPTSNLHTKAFESYETHPFMDFLKDGIKVTINTDNMTVSNTTITKELEMLNKFCGLSIGDYKILYLNAVEASFASSETKKMLKSYVKEITG >NC_009699.1|WP_011987907.1|1111549_1113718_+|YhgE/Pip-domain-containing-protein MNRFKNIIKVYKRDIKSLNKNFIAIIIILGVCVLPSLYAWVNIKACWDPYENTSTVPIAVINNDKGTDFGGKELNVGNEMVKKLKSNDKIGWKFTNKKEADMGVVDGTYYASIEIPADFSADIVSVLSDNPKHPEIIYKVDTKENPVAAKITGMAKNTLINEITTTFITTVNKTVFSSINEIGRNLEKNKNEIIKLKESIISMNRNMDLILAGLESVNTNSKNLNGYLSVVRTTFPEITKGLENINSKSSNTNETINQTNNIFNNSLNNINVILKQAISTNNRVQSVLDNLIVLNNESSSNEANSSIANLIMDIDSANKNIDSMIEFLEKINNTKPNTEVSKFIVSLNNVKGALNEEKQKLIKIQEIASNSSKVNENSINELKRNISNTNKQIESVMNVFNSNTRQELSTIINNFKNSIQDASKLIKAGNGLNTQIENLLATSTKGADLSAKLSKELIDKLTEYKGIIGQLSKKLELVSNDDLIQIISILQNNPMLMSQTAAYPFNIKEEAVYDIPNYGSAMTPVYSVLALWVGTLILVSLLKTEVVDFEGSENITIRQKYFGKMLTFTTLAAMQGLVVAVGNKAILGVYTVSFPLMIAFSVVSSITFAIITYTLVAIFGKFGNALAIVFMIIQLAGSGGTYPIQVDPLIFRILQPFFPFTYSIGGFREAIGGPLVSSVILDFIMLILMGSIFVLIGFFLKSPLHHKVSKFDEDFKASGISE >NC_009699.1|WP_011987908.1|1113744_1115904_+|YhgE/Pip-domain-containing-protein MKKAFRIFSRDLKNIVKHPAAIIVVLGLSFIPSLYAWINIKACWDPYANTGNLPIAIVNRDEGMMLRGKYTNVGNGIVENLKGNKNMGWVFVDEWQANYGLNEGKYYALIEIPSNFTRGLASLKTTDPQKPNIIYRANEKSNAIATKITNAAKGSLAKQIQTNFVYTVNKEAFKLLNNTGGQLEKNKSKILGIKSTLELGNKSIGEVKNIIDDASKDSESLKQYFNDTKDKLPLITDQINNLQKATEASKNLVNETERDLNGIAKNINNDMIYRESTNSKINSILTNLKEYNNVSNNSEMIKLVDEASKLCDSINSNIDGTIKSLEVVNILKPNKIIEELISSLKNLQEKVNGEKNKLAELKNKISTSNNNKQNINQVVESILLLNDEINKNMRNTSNIFYNQTTMIIENTAKGLNNRLDTANDILDTTKLVIPQLKALGDFGVGTSDAALKDGKKINNKLAEFKKTINKLEEKTSSLTEDNLDKIINLTQKNPEQMASFISSPINIKEEEIYNTGIFGVGLTPFYTVLAIWVGVLLMSSLISVEAEEFEGEKKLTHLQVYFGKLLLFLSIAIIQGIIVTLGDVFILGIEPASMGLLMVFTIVTAITFTFIIYTLVSIFGNLGKAIAVVIMVFQIAGAGGIYPIQTNPKIFGVLQPLWPFTYAIAGFREAIAGPVRAAVIKNLGALFIFSIGSLLLVVLKKPLHKVTEYMNDKFIETGL >NC_009699.1|WP_011987909.1|1116377_1116680_-|hypothetical-protein MEKKPSVKSSANLLAIVSLIMSIIVILPILNWLFKITPWQKLEGLPLFFGLLISPFGFLLGILSIKIQSNKLGKIGVIINTLLFLLPFIYMTLGVLIFGP >NC_009699.1|WP_011987910.1|1116885_1117641_+|DUF4184-family-protein MPFTFSHPAIVLPLEKKWNKYFSFTALILGSMSPDFEYFIRFKPMATIGHGLIGFFLYNLPLCFILAYLFHKIIKKPLIAHMPKPIDSWYYNTALKPWRINSLTQVLVFSYSAIIGMITHVLWDSFTHKGGKFVILFEGLRKNIEILNYDIPVYKTLQHGSTLLGVIFIILYIYSKRNKHINWKRINRIPAINNKEKVSYFTTIFCTGLIVLFVYIFLLNVSFSIKNVGSFVVTFINGLFIGTIITSIKCR >NC_009699.1|WP_011987911.1|1117908_1120038_+|DNA-helicase-RecQ MLESAKNLLKKHFGYNEFRKAQEKVIESILKKEDTVAIMPTGAGKSICYQIPALIFEGVTVVISPLISLMKDQVDSLKEVGIEATYINSSLNNLEIEERIFNAREGLYKLIYIAPERLESDNFVRSLNNLNIALVAVDEAHCVSQWGHDFRPSYTKISNFIRKLSKRPIVTAFTATATETVRRDILKSLELQNPKVFVTGFDRENLSFSVIKGEDKEKFIFDYLENNIGKVGIIYTSTRKEAESLYNKINKKGYTVGVYHAGLSDEERKKTQEDFSFDNIEIIVATNAFGMGIDKSNVRFVIHHNIPKNMEAYYQEAGRAGRDGEESECILLFSPNDIRLQKYFIDESFLSPERKNNEYNKLRAMVDYCYTSKCLRSYILEYFGEDALEEKCNNCSTCNDNREEKDITLEAQKIFSCVYRMKERFGVNMVADVLRGSKNKKLLSLDLDGLSTYGIMEEFTQKDIVALMNKLIADDYMVTTDDKFPVVRLRSKSHDVLKGKEIVSIKVSKIEKKVKADNELFEILKQLRKAISQEESVPPFMIFPDATLKELSEYMPTKEEDLLKIKGIGERKAEVYGERFIEAITEYMNEKGIDINNMDNYESTKSNKESKIKTHVLSYNLYKEGKTIKEISEERNLKAITIQEHLFKCLSEGMEVDLDNFIKKDYEKLILDTIKKVGGTKLKPVKDELPLEVDYMCIKSVWYKYKDII >NC_009699.1|WP_011948678.1|1120209_1120641_+|ferritin MDELDIINENQLGIAANNEKIKTDLEGQFRAETGEVGLYIAMARVAQRQGFPEIAEVLKVIATEEAEHAARYAELNGKVSDCTKENLQKMLQGEIGSNKMKKSLAVKAKEENIDEVHDFIDEASRDEARHAKMLKGLLDRYFG >NC_009699.1|WP_011987912.1|1120922_1121468_-|phosphodiesterase MKLFFMSDIHGSAYYLEKALHIFEKEKADYLIILGDELYHGARNPLPKGYDPKKVTEILNSYKDKIIAVRGNCESEVDQMVLNYPIMSDYSIVLYNGKRLFLTHGHIFNKDNMPNISDGDALIYGHTHIPLAEKINNIFVINPGSITFPKENTPHCYGILSDNLFKIKTLEGNTFKEISLI >NC_009699.1|WP_003355968.1|1122104_1122488_+|response-regulator MSSSQKNILVIDDSASIRSFVRNILEKANYKVYEACDGEEGIEVYKKCGNIDLVMTDIYMPKKSGLEVVVELQNKYKGTQIIVFSDGGKENFTNDSGVCEALGAAYFIRKDLIKDKLLDLVNIIFSK >NC_009699.1|WP_011987913.1|1122602_1125077_+|DUF3298-domain-containing-protein MIERNLFNIINKYLPMGSQIIVEEDNNNEPLIIKADLNGYGLGEIIIAYRWQEENYIMVLERYCNQWSVIDNIRGKGYDISYLKVAPITDNAMDNLIIGWRRGAIWSELDILQWTPYGFKRVIDEGIYYSKIEVENMKSVKAMNDKNEIALWLHDTAEAYKVEIYRWSLGKLVKAEDVYPYYFKKVIDFYKTKLQEEPDLPVYWYYLADAQIKGEMYEDALKSIDKALELPKAYPSKKELIKLRDYILSHKKCKNINLYLAPMNTIKGVRWGYINEKGEFLIKPLYNLALEFQCNGLAVVEIDNLYGIIDENQDYIVKHKYGFISDFSEGRAIVIDNERFNIINEEGEELIAKTENYSYIGNFKEGRAQYGVIDSNKGYLYGYLDREGKVIIPAQYEYGNDFYKGKAVVRIKENEYALININGEILNKYEYASVGNLREGLLSFKKDMGEKYGFIDEDGNVVIKLQFTYAQDFSEGRSVVNVSGNIMNNYGVIDKEGNYIITPKYNDIILLGENRVAVGVAIDKTSPFIGSKYAIADTEGNILTDFIYYEVSNYKSGIASAYDDKNTFFIDKEGNKIENLPIVEGSGTLTVENELIKAYVDYKISYFDKEGNLIWEENSVISLNNQYKVIEGKYKPNKDYLVYYPKVQGMVDKALEDGVNNRLKILSEVKPIEENVQLEYNYLGDFKIEFFNKNLLELELDGYNFHFGAAHGMPSKIYTKIDLTTGEFYELKDLFKEDSDYVKALSDIIGEQIKNNPEYSYIFPDTYNGIKEDQPFYVSQDTLYIYFYPYEIAPYAAGFPTFKIPYKDIIDIINEAGAFWISFN |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_009699_3 | 1903316-1903533 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NC_009699_3
|
3 spacers
spacers of NC_009699_3
>3.1|1903339|43|NC_009699|CRISPRCasFinder CCTATTAATAATATGGAAAAACTAAAGGATATAAATTTATCTA >3.2|1903405|40|NC_009699|CRISPRCasFinder TATTTAAAGGATTTAAACTTACATCATTTAGATTTAAGAG >3.3|1903468|43|NC_009699|CRISPRCasFinder GTCTTAAAAGATAAAACATCCTTGCAACATTTGTATTTAGCTA |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009699_3
The CRISPR arrays of NC_009699_3 >merge|NC_009699|3|1903316-1903533|CRISPRCasFinder ATAATAATATAGAAGATATATCTCCTATTAATAATATGGAAAAACTAAAGGATATAAATTTATCTAAAAATAAAGTAAAAGACATATCTTATTTAAAGGATTTAAACTTACATCATTTAGATTTAAGAGATAATAAAATAGAAAATATAGAAGTCTTAAAAGATAAAACATCCTTGCAACATTTGTATTTAGCTAATAATAGTATTAAGGATTTTTTA >NC_009699|3|3|1903316-1903533|CRISPRCasFinder ATAATAATATAGAAGATATATCT CCTATTAATAATATGGAAAAACTAAAGGATATAAATTTATCTA AAAATAAAGTAAAAGACATATCT TATTTAAAGGATTTAAACTTACATCATTTAGATTTAAGAG ATAATAAAATAGAAAATATAGAA GTCTTAAAAGATAAAACATCCTTGCAACATTTGTATTTAGCTA ATAATAGTATTAAGGATTTTTTA
>NC_009699.1|WP_012099780.1|1897826_1902284_+|DUF5050-domain-containing-protein MIRGVFAIFSKKFVAKLLLYSSIAIIPMFNHNYVQAASSKQYETKYNVSLDKVWKIRFSREVDKATLNPENIKILDNQGKEMPINLSLDVDKHYVKIALKSGTYNGVHYSGKYEKDKKYSLIVKEGLMSEPSKNKKSKNLAYETMMDFNTIGDNEYPGLPIEDGLIVIGDKAYSVGYLSKHSSIANEITSNGNYYIAYISKEYGEKIKQVLGNNTTKGNQERANKILYYAPNGNQYEYEWNEAFGEYKIVLPKAYVDVTPGVINGVVNLAVKQVKAVPGAKYFKLAHSNTIKPIGESISYSMTYPTEKLTILSADETPLATALVDVYLPKTGYVSLSSVNETLGNTAGNISNNGSAAMDLDFYVYYVNSADKNSLYRKTLTGRMDTQISLDKAQYINVIGDWIYYSNYNDNGKIYKMKKDGTKKQILCDDTATYITVSGGVVYYANQSDKGRLYKINTDGTIDGGTSNRDPAGKVHGMPVMDDYGNYNKATDQANFINVVGDWIYYSNFSDGHKIYTVNKDGNIRRKVNDEWADGIQIVGAWAYYCSGSGAISKVRVDGTGSVIPLRGTTRKVDKGYHLNIVDGWLYYSNAEDGGKLYRIKEDGSGEKKKLADLATDYINIVGDTMYLISAGKTYTLPLNTDGTIKPTLVTKDNNGNTVVDVKDLNITVAYEDANKTIGELEAKYLPQKVAVFMKDDTVQQLPVDWDIKNRKYNGQGIYTYTGTVLGHGKQIKCTLTIPSEMLNATSIIEVYNNGPKNGSIMIKERSFGPSKQDQELKEKLKLAKRVEIGDVIKVYDNPNSEKPLGNIKVDANNANGPLVKSLDLDMYGRSFWITITRKNKAESKPTEVRQLGAAVLSGDVLDEDGEALGVDGRDFTVKGWNNPSIRDDGFISDTTEIAAQGTKSIYVIPGTGKLNMENQGVIPAGITSANYWNGGNARALLTNYDLLTNDSLKNKLKEGNYSIYVVVGYDGKAEEDVNGFGSPLVIGKTASIPKAMKATEEKIPKAPSVTKQYVKAGDTVKISGVTKEDEIYLAPEGASYIAKDITNKPYKSHDNLFFEDQSKSKEEREKEYEKSGKPSIEDGYQCKLVDGKIPQGVRSGKYKVYMVNAIGSSSPASGEIVIDNEDPVVRLDSAKQEDVIKTVTQNGTTTQETTGQKFKVNFAAFDNSFDNSIKEGITVSMARLDSPKSAIKAQEIKDKGNKTFEVIINDPHANLNDYAIYAEDKAGNIGQVNLKVQDPPVNINNISLAIRTSNEGVDLVKSRLVGRTKYMTKDLTRVSDNYEVTVDGVKYVLQEEALRNLGASPSIDAFMNALMQAKQWDIANNKPMEDKPKLSSKVSIYKVNDIIYIEGNDNTPIQIEDRTKIDADTAIVSNMIGLNSNENSTGENSKNQQYIINVTGTAQKNGKLKVCLAGKCFDIDILSTDDATKIARKIKDVINDNTILDSYQYPGTNVESSGSEVKLTRKSPGAVVPTFTVEYFNYDN >NC_009699.1|WP_012099779.1|1896224_1897670_+|DEAD/DEAH-box-helicase MNKLTFENYKLSDEILKSLGKLGYKNPSEVQKQVIPLILKDKDIIVKSETGSGKTAAFSIPVCEKLELEEKDPQVLVLTPTRELALQIKEEISSIALYKRLRCTAIFGKQPMSLQKRELKQRVHLVVGTPGRTLDHIERENLDLKKIKYFVLDEADEMLNMGFIDQVEAVIKRLPKNRVTMLFSATIPEKIENLCKKYMNNPQNININPENITTDTINQCYYEVEDKDKFSLLQKIIYKEVVDNSIIFCNTREKVDEVLKNMKKKGLNAVGLHGGMEQKDRLETMKKFKEGEFQFLVCTDVAARGIHIENISHVINYEMPYEKESYVHRIGRTGRAGKEGVAITFIEPNKVRFLRDIEDYIEKEIPKRKEPSLEEVDKGKKIFEENIKNRIKTKVPKNNKKQKDITKIYISAGRKKKIRPGDIVGAITSIEGINVDNIGIIDIQDNHSYVDILEGKGDIVLKASEDMKIKGKKVRIQRAVK >NC_009699.1|WP_012099777.1|1895209_1896046_+|S1-RNA-binding-domain-containing-protein MIKLGEIQKLEIIREAPMGVYLNSKEDKSENDILLPGKQVPKDAKIGDEVEVFVYRDSEDRMIATINRPKITIGEIAPLKVIEKTKMGAFLDWGLERDLFLPFKEQTYGIQEGMECLVYLYIDKSDRLCASMNVYRVLSTESPYKEDDEVKGFIYDIKREIGAFVAVDNEYHGLIPKNELYGKFRYGDIVEARVTKVKEDGKLDLSIRKKAYKQMDEDVDTILEKLNSNGGKLYLNDNSDPRAIKELLSMSKNAFKRAVGRLLKEGKIEFIEKGIKLK >NC_009699.1|WP_012099776.1|1893621_1894887_+|DEAD/DEAH-box-helicase MNNSFDTLNLNPKLVQGLKKLNINIPTEIQAEAIPLAMENKDIIGQSETGTGKTLAYLLPIFEKITTEKREMQAIILAPTHELAMQINNEIKNISSNSNMDVKSMAIIGEANIKRQIEKLKEKPHIIVGSPGRILELIKKKKITAHTVKTIVIDEGDKLLDKNNLKVVKEVIKTTLRERQLMLFSATITESTLNIAKDLMKDSEVVKVKEKNTVNENIKHLYITGEHRERIEILRKLIAATNPKRAIVFINRNEEIELTTLKLQYHKIKAYGIYGAAEKEQRKKALEDFRSGKVQILVSSDLSARGLDVKDVTHIFNLDLPENPKEYLHRVGRTGRASKEGIAISIITEKEKALIRKYEKEFNINIEEKKIYKGTLISSKGERSSQPKSKNKSTSAHKDNNKKKRSSSINKSKNNHKKKKY >NC_009699.1|WP_012099775.1|1892359_1893253_-|chemotaxis-protein-CheV METNILLESGTGEVEIIEFLVNNKHYAINVIKVKEVIEVDNVTKVPQSDPAIEGLILCREKIFPLIDLSYILGQKNTSKKRFKTIICEFNRVSVAFKIDEIVAVHRIGWDKILKPDDIAANPLVIGNILLKDKIILLLDFEKIVTDINPSTGISEERIVNVDYKDRSHIKVFLADDSSLIRKLLKDTLTKAGFKKLTIFDDGKQVLDKLLELVEKKGEDFTEDVQILITDIEMPQMDGHTLTRKVKEHPILKRLPVIIFSSLITKDLKHKGTSVGADEQLSKPDIGELVNIIDNYIE >NC_009699.1|WP_012099774.1|1891304_1892159_+|4Fe-4S-dicluster-domain-containing-protein MKMISKNEIAKLKGEGFLAQKQEGYFSVRILSRAGNFTSKQIIKLAEIADNYGKGYLGVTTRLATEIPWIRYEDIEAVKKEIVSSGMAHGGTGKRVRPLVSCKGTVCVHGLYDTQKLCGELHDKYFGYELPSKFKITLVGCPNNCAKASINDIGIMGQAYVEFDEEKCKTCGICTKSCRQKAVTVENKKIVYKKDLCVNCGKCATVCPFEAMTIKEQGLQVYLGGRFGREYRIGNRLKGLYKEEEIPALVQKIFDVYSEMGNPGERLAKMIERVGFDKVEEAIL >NC_009699.1|WP_041173147.1|1890275_1890734_+|YbaK/EbsC-family-protein MSLEGVKKQFTDENLNLKILEFDKSTATVELAAKALGVEPGQIAKTLAFHVKGENMLIVAKGDARIDNKKFKAYFNGKGKMMAPEVVLEVTGHAIGGVCPFGLENPINIYLDQSLKEFEKVYPAAGNANTAVEVTLDELEGITKGLWIDVCK >NC_009699.1|WP_012099772.1|1888373_1889954_-|ABC-F-family-ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MITVTNLSLRYGDKKLFEDVNLKFTPGNCYGVIGANGAGKSTFLKILSGEIEANTGDVSIQPGVRMSILKQDHFKYDEFPVLETVIMGNERLYQIMKEKDAIYAKTPFTDEDGIKASELEGEFADLNGWEAEAEASSLLQGLGIGTELHEKNMKDLSGSEKVKVLLAQALFGNPGVLILDEPTNHLDIKSVNWLEEFLINFEGTVIVVSHDRHFLNKVCTHMADVDFGKIKLYVGNYDFWYESSQLALQMAKDQNKKKEEKIKELQEFIARFSANASKSKQATSRKKLLDKIDLDNIQPSSRKYPYIAFKPEREVGNDILRVEGLTKTIDGTKVLDNISFIIGKDDKIAFVGDELSITTLFKIISGELKPDSGEYKWGITITNAYFPKDNSEYFNDVDLNLVDWLRQYSEEKSESYLRGFLGRMLFSGEEALKEVKVLSGGEKVRCMLSKMMLNNANVIILDQPTNHLDLESITALNNGLMDYKSNILFTSHDHQFIQTIANRIIEVSEAKFVDKKVTYDEYLESK >NC_009699.1|WP_012099771.1|1886089_1888093_+|methyl-accepting-chemotaxis-protein MKFKTMKGKMLTYFLSLFLIICIAISFMAYFMSKRMIERKASSLMSEVSRQAVQNIEARLNGTLDSIETVANMPTIKDPKLGWDKKKTILDEEIKLHGHVKMGIVGKDGQSIQTDGTTVNIKDRNYFKETMEGKRTISEPIVSKVDGKVVIIYTVPIKNGNTIMGALTAVREGNDISNISNSIKVGESGGAYLIDSTGTVIAHKNKESVIKRENSIKDAQSNEELKPIAAIEKSMIEGKEGIGQYKYKGAEKYISYSPMKSTGWSLAIYAPKNEILKEVSEITRNIIIVSILGIGIALVCIWFISTQISNNLISMRDSLNIVATGDLTTNVDSKIEKEKDEIGHMARALSKTVLSIGNMINSLKGSSFNIDDKANNLAAISEEFTATTENVSTAIQEVATGATNQAQALTEIVSMLNDFSDKINSTVNNIEEIDGMSKEIDEKANVSNKDMKELLNSIENLTKVFENFETKIWTMESNVQKINEITNLINDIAEKTNLLALNAAIEAARAGESGKGFAVVAEEIRKLAEMSRKSSEDIYTIVNGVLEDTKDMVKSSNEVNEKLNGQRSTADEAMNSFMEISKSVTNMIPKIRNINNSANIIEKNKNEILNKSETIASISQEISASAEEISASSEEMSASSEEVANTAQSLNDMTQDMLNEMNKFKTE >NC_009699.1|WP_012099770.1|1885511_1885721_+|cold-shock-domain-containing-protein MSMHTGTVKWFDNERGYGFIAGNNGKDVYVHYMQIKEKTHNKDLHEGEEVLFDIVEKEKGPIAINVQKL >NC_009699.1|WP_012099782.1|1907162_1908092_+|mannosyl-glycoprotein-endo-beta-N-acetylglucosamidase MKKATGLILKLMILVLLAFTIFIMFNSLILNKKNERFLPENAMNIYIKAADEVSENKLQVNWKYIAALDGVKNKKDFSKANIENSKVLGKKFLEISKSTKFKNTNYRLLTLDEVISKMSFTEEEKKNVHKYLDKLNNIYPITPDEYKRQFIDELIPISKELYDEYGILPSVTIGQAILESDWGRSELSKKGNNLFGIKATPSWQGKVLNMETSENYNDKIKDNFRYYSSKEDSIKDYANFLVKNKRYRENKVFRATEYKTQAKAIEKAGYSTKKDKDGNLLYSSLLGKIIREYNLQLIDSKTQEEISKK >NC_009699.1|WP_003403076.1|1908217_1908733_-|ferritin MLSEKLLEALNNQINFEFYSSYIYLAMASYAESEDLAGFANFFRVQAQEEIFHAMKFYDYVNQMGGRVILEKIDQPKAEYKNILECFEDGFNHEKIVTSRIYNLTDIATEEKEHATISLLKWFIDEQVEEENNFNTIIRKLRRAESNPAVLYMLDDELSARVFTPPTNTGA >NC_009699.1|WP_011986372.1|1908894_1909077_+|hypothetical-protein MYSIKYYLRYIKSKVLWETIYDKFFIQETIKKFFINLKKLIILMKKIHINCLNFKKNILK >NC_009699.1|WP_012099784.1|1909137_1909992_+|response-regulator MKDTKVVIVDDSPFSISIIKDILEENGLTVVGEAGNLEEVINVVKDKKPDIVTMDMTLPGTDGIECIKAINKINKNVKVIVISSMMDEEIVKKANKNKVCGYIQKPIDPEELIETIEKVVMKEELFLQLENDYFQIFKESFKDALNKFTKTTAEFSEDTKCTISETSRGMVVVIGIIGNFSGRMILDLSQETANSMVNFMLKREPKDMNEVLNVIGEFSNIVAGNACSMLNRKSKVFGLRIAPPSIFYGKSLNISQSLIESLSVESNTEFGQIYMNVGFKRGES >NC_009699.1|WP_012099785.1|1909991_1910453_+|chemotaxis-protein-CheX MDAKYINPFIDSFYNVLPQIGFSNVTREDVAIKNNVESLGILINLGIVGDIKGNIVYNIQGENGKKIASKMMMGLPVEELNEMAQSALSELSNMLTANASINFSNIGVNVNISTPTLMYGQDIKIKLNTDKILNIKIVADDIPIDVNIAFEKI >NC_009699.1|WP_012099786.1|1910635_1911994_-|YjiH-family-protein METQKNNKYSFSELFKFICPSLIGFILFIIPISYDGEITIPIAVLSKIVLAGLGSILPQLMGIIICITFICTAITKIFKPKAILENKFFNNLFNVSPVWVLARVLGFIFIISTFFKIGPEWIWSENTGGLLLYDLLPILFSVFIFAGMLLPLLLDFGLLEFVGALLTKVMRPIFNLPGRSSIDCMASWLGDGTIGVLLTSKQYEEGYYSEREAAIIGTTFSAVSITFSLVVISQVKLAHMFVPFYLTVCLSGIIAAILIPRIPPLSRKPDTYLNGGESKNSEALPEGYTPFTWGLEKAVAKAGSNDDPLNFIRQGLQNVLDMLLGVTPVVMAMGTSALILAEYTPLFKWLGLPFIPLLNLLKIPEAALASQTIVVGFADMFLPSVIAATIQSEMTRFIIACLSVTQLIYMSEVGGLLLGSKIPVSLKDLVIIFLERTLVTLPIITLVAHILF >NC_009699.1|WP_003403080.1|1912732_1912936_+|alpha/beta-type-small-acid-soluble-spore-protein MPSNKNSNNLVVPEAQQGLNQLKMEVANEVGIANYDSMDKGNLTSRQNGYVGGNMVKKMVEAYERNL >NC_009699.1|WP_003363259.1|1912996_1913197_+|alpha/beta-type-small-acid-soluble-spore-protein MANRNSNNLVVPEAKHGLNQLKMEVANEVGIANYDAVDKGNLTSRQNGYVGGNMVRKMVEAYERNL >NC_009699.1|WP_012099787.1|1913396_1913726_-|HesB-like-protein MTPVNMSDLAYKEFKNFIKENNVNSNIFRIFLAGNGUGGPVFNIVLDEQTSEDLLSPIGELSFLVHKDLFSEFGGFIIKCAEENGKGSFTIDPIIQSENISCSTCSSCS >NC_009699.1|WP_077272268.1|1914243_1914456_-|hypothetical-protein MKHAKLLIIVYLRRYSLASDLYYGRNRILKLPSLSSLIAYQLIMNINYLAMHNSIFIHSNLSTACVKKWY |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_009699_4 | 2351669-2351765 | TypeIII-C |
III-B
Consensus repeat of NC_009699_4
|
1 spacers
spacers of NC_009699_4
>4.1|2351699|36|NC_009699|CRISPRCasFinder ATTGATTTACGAAGGAGTAAAAGGAACTAATCACGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009699_4
The CRISPR arrays of NC_009699_4 >merge|NC_009699|4|2351669-2351765|CRISPRCasFinder GCTTAAATACATCCTATGTTAATGTTGAATATTGATTTACGAAGGAGTAAAAGGAACTAATCACGCATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAATC >NC_009699|4|4|2351669-2351765|CRISPRCasFinder GCTTAAATACATCCTATGTTAATGTTGAAT ATTGATTTACGAAGGAGTAAAAGGAACTAATCACGC ATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAATC
>NC_009699.1|WP_012100137.1|2350450_2351185_-|hypothetical-protein MDKFRNMKKSHIALLAVMYIVLMGSLPRFTGWATIFSAIVVGGYFLKNKKDLKELTRKKKNFIFTGIIILAIIGSLNVAVGNNIQNEKLMAEKAKQEQEIKQEEQKKIEEKKLAEEQKRIQEEEAKKKAAEEKRKQEEEAKKKAAEEQKKQEELKRKQEEENKVKAENEQAQAAFAQSTGKGNSNSQSNESQNADDNQNYTVYKTRTGSKYHSSGCRYLKKSCYETTVSQARNEDLTPCSVCNP >NC_009699.1|WP_012100136.1|2349708_2350113_-|membrane-protein MNILISTCNIGIPVLMIFIGILYKCNSYKKIDKTLDLIVPIAMFFTGFSERDREHLYKNTNNLASVNRKCSLIWSISGVCTLLLTIISLILNKSDIYNTSVILLEPELLILVIVFITVEYILKRNFNKKISEQY >NC_009699.1|WP_012100135.1|2348757_2349474_-|transaldolase MKYNDLKIKIFADGADLNGMLDAYDKGIVKGFTTNPSLMKKAGITDYKEFAKEVLAKIKDMPVSFEVFSDDLETMEKEAEVLGNLGENVYIKIPVTNTKGESTAPLIKKLSEKGYHLNVTAIFTIDQVKEVVGALKSGVDSIVSVFAGRIADTGEDPVTIMKEASKICKTKEGVELLWASCREFYSIVEADKCGCEIITVTNDILKKMPNMGKDLKEYSIETVRGFYKDASSLGFSIL >NC_009699.1|WP_012100134.1|2348296_2348734_-|PTS-transporter-subunit-EIIA MLKNYINDQVVEVNVEVKNWEEAVRLGGKLLEEDGAVEHSYIDAMVDTVKNMGPYIVIAPGIAMPHARPEAGAKNIRIGLLKLKNPINFGNEEHDPVDIVIFLCAVDNKAHIEVLGELVQLIEDDDFLKIVRNASTKKEILDYIK >NC_009699.1|WP_003361919.1|2347983_2348268_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIB MNILTVCGNGIGSSLMLAMKIEEICKENGIAANVESTDFNSAQGKKADLIVTVKELAEQFEGRDVAVVRSYINKKKITEDVLEIIKQKDEELKK >NC_009699.1|WP_003358211.1|2346606_2347971_-|PTS-ascorbate-transporter-subunit-IIC MLGLLQFLRDVLKQPALLMGIMALVGLVALKKPGHKVLTGTLKPILGYLMLGAGADFIVANLEPLGGMIQTGFNITGVVPNNEAIVAVAQKVLGVETMSILVVGLLINLVIARFTKYKYVFLTGHHSFFMACLLSAVLGTSGMKGTELILFGGFLLGAWSAISPAIGQKYTLKVTDGDEIAMGHFGSLAYYVSAWVGSKVGKPEESTENIEIPEKWGFLRDTTISTAITMMVFYIVAAVAAGPEYVSKLSDGMSPILFAIMSSLKFAVGVTIVYNGVRMILGDLIPAFQGIATKIIPDAIPAVDCAVFFPYAPTAVIIGFVSSFIGGIIGMVLLGVAGGVLIIPGLVPHFFCGSTAGIFGNATGGKKGAVIGSFVNGLLITFAPALLLPVLSTLGFKNTTFGDFDFGVLGIIIGKTSNLAGKTGIIIIAMLMLVALIVPNFIKTKSKALNNIEE >NC_009699.1|WP_012100133.1|2344301_2346395_-|transcription-antiterminator MLNKRCSNILQMIVNNEKPITIKEISKKVNKSPRTVRYDLDKIDDYLTEIEFPKLERKSNLGISLDLKDEEIKKLFKVIGKINNYDYVLSQKERVFYIIYELLNKSEFVTINMLSDRMMVSRSTIINDLIEVKKWLLENKITLESSKGQGIKILGRERDLRRAAVKLFFQSMDSINFFNVTTLKLFNDIDIDFIRNTIKIAEEQMETSFSDDAFNNLVIHIAIAIKRIELSKDIIMDREELKNLRKTAEYAIASGIAKMLEDRFKISIPEDEIGYITIHILGSNTSTLENIVKDDWIYLHLIVFKLIENVENITGINFSKDNKLFDSLAQHIRPAIYRLKHDIKVKNPLIEEIKEKYSYIFESIEEGVKFIEEDIGDSVNQEEIGYLTLHFMASIERSKNKKHRKPNVLIVCATGIGTSKFISNKLKSIFDINIIDTISSHTMEKILKYNKNIDLIITTIPLKVKGIRCIEVNTFLTEKNISELGLYFAKFIRNNSEECNGSCKYEERDKVQEILNIVKENCTIHDYYKLRNKLALYLNIKDPTLTEDHKPSLKELLKPDFIRLNEEAKDWEDAVRKSGEILMNNGCVKESYIDAMVNTVKNMGPYIVIAPGIAMPHAAPEDGVLKTGISMLTLKDPISFGNSEHDPVSVIISICSIDKVNHMKALKELMSIMDQEDFISKVKNIKASSEIDSILYS >NC_009699.1|WP_003358205.1|2343623_2343977_-|zinc-ribbon-domain-containing-protein MIIWGWGKVTKKIIGAVFERTCNYCNTDEVWNLCVVRTWFTLFFIPIIPYKKQYCIACPKCWSYIELTQEEFEKIKIDITSSSNNINEKVVTDNIKYAGKTETQINYLKQMEEYANK >NC_009699.1|WP_012100132.1|2342068_2342836_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MQNILSVEKIEKYYGNKDNVTKAIDNISFKVDEGEFVGIMGPSGSGKTTLLNCISTIDNVTTGKIMINNNDITRLKSKSLDKFRQNELGFIFQDFNLLDTLTAYENIALALTIQGEKTSKIDEKVKSVAKYLEIEKVLDKYPYQMSGGQKQRVASARAIVTNPSLILADEPTGALDSKSARLLLERFEKLNKELKATILMVTHDAFAASYAHRILFIKDGKIFNELVRGKDTRKEFFNKIIEVTSLLGGDDNNVF >NC_009699.1|WP_079992183.1|2340087_2342088_-|ABC-transporter-permease MIIMYSKIALKNIKKSYKDYTIYFLTLILAVCIFYSFNSIDSQKALTDIKSSGGSYVSRLMEFMSAVSVFVSIILGSLILYANNFLIKKRKKELGIYMILGMGKRKISKILVTETSIVGVISLIAGLIIGMGVSQGLSVFALKLFEVSINEYRFAVSTRAISKTILYFGIMFLLVMIFNIFVISKYKIIDLLISGRKNENIKFKNTFIYLLSFVLCVVLLGFAYKSILKTGLKLREPMFKPSIAFVIVGTVLFFFSLAGVILYVVNKNKKIYFKGLNMFVVKQINSKVNTNFLSMSLICLMLFITILVLSTGISFKNGLEEGVRIRAPFDASIIISNNSKKDNLEDVLDKINFKKSKNEKYATCNEYISGVKLESLLSITDKDYKDAEVFFVKISDYNKILKLKGKKEINLNKDEILVMSTNNAVVKQANEKLKNSKKFNIKGKEYLVKNDTIIEENLATYLLADNVFTIVISDEFLYDYNKIVYSILNVTYSDKNREENNKKYSEINKNFVGGKYKSLNISYMGAFSKDDIYSGSKGGTTSILFVGIYLGLVFLITSMAVLALQQLSEASDSIERYKALKRIGASSKMIEKTIFLQTLIYFALPMILALVHSMIGIKVISDYIEVFTKIDISFSALITSLIFIVVYAGYFYTTYIGYKNIVESNI >NC_009699.1|WP_012100139.1|2353052_2353547_-|hypothetical-protein MILAIECFIACVLFTLMILPSLYKEPIKHIMSYPTDIRKRVENLPQYKDVIQKKEKKHLTVKIIAVFMFAIIFAVVAYFSGAKSFSKAYIHVFTLFFVVNIYDMIVLDIGLFCHSKKTRIPGTEDMDKEYRNPWHHIKGAGIGTIIGAVVALLSRGMVHFISII >NC_009699.1|WP_012100140.1|2353589_2354204_-|sugar-O-acetyltransferase MNQKDRMLAGLPYKACLDGLPEERMENKKKIYEYNHCFPDEHEKIHKLIRDILRKAGADVHIEAPFYCDYGKNIQVGDNFFANYNCTILDVGKVIIGNNVQFAPNVSLYTAGHPIHPDSRNSGYEYGIGITIGDNVWLGGNVVVNPGVHIGNNVVIGSGSVVTKDIPDNVIAIGNPCKIIREITEKDRKYYYKNYEFDIDDYKE >NC_009699.1|WP_012100141.1|2355194_2356586_+|peptide-MFS-transporter 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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_009699_6 | 2352564-2352791 | TypeIII |
III-B
Consensus repeat of NC_009699_6
|
3 spacers
spacers of NC_009699_6
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009699_6
The CRISPR arrays of NC_009699_6 >merge|NC_009699|6|2352564-2352791|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAACACATAATCAGATGTTAGAAGTACTTCACGAATTAAGATTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAACTAGATAAAGATAGGACAATAGAATATTTTACATTAGAATTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAACGCGGCTATGGGAAACATAGAAGCTGAATCCGAATTATTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAAC >NC_009699|6|6|2352564-2352791|CRISPRCasFinder GCTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAAC ACATAATCAGATGTTAGAAGTACTTCACGAATTAAG ATTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAAC TAGATAAAGATAGGACAATAGAATATTTTACATTAGA ATTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAAC GCGGCTATGGGAAACATAGAAGCTGAATCCGAATT ATTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAAC >NC_009699|6|1|2352564-2352791|CRT GCTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAAC ACATAATCAGATGTTAGAAGTACTTCACGAATTAAG ATTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAAC TAGATAAAGATAGGACAATAGAATATTTTACATTAGA ATTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAAC GCGGCTATGGGAAACATAGAAGCTGAATCCGAATT ATTTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAAC >NC_009699|6|1|2352566-2352791|PILER-CR TTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAACAC ATAATCAGATGTTAGAAGTACTTCACGAATTAAGAT TTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAACTA GATAAAGATAGGACAATAGAATATTTTACATTAGAAT TTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAACGC GGCTATGGGAAACATAGAAGCTGAATCCGAATTAT TTAAATACATCTTATGTTACTGTTCAAC
>NC_009699.1|WP_012100137.1|2350450_2351185_-|hypothetical-protein MDKFRNMKKSHIALLAVMYIVLMGSLPRFTGWATIFSAIVVGGYFLKNKKDLKELTRKKKNFIFTGIIILAIIGSLNVAVGNNIQNEKLMAEKAKQEQEIKQEEQKKIEEKKLAEEQKRIQEEEAKKKAAEEKRKQEEEAKKKAAEEQKKQEELKRKQEEENKVKAENEQAQAAFAQSTGKGNSNSQSNESQNADDNQNYTVYKTRTGSKYHSSGCRYLKKSCYETTVSQARNEDLTPCSVCNP >NC_009699.1|WP_012100136.1|2349708_2350113_-|membrane-protein MNILISTCNIGIPVLMIFIGILYKCNSYKKIDKTLDLIVPIAMFFTGFSERDREHLYKNTNNLASVNRKCSLIWSISGVCTLLLTIISLILNKSDIYNTSVILLEPELLILVIVFITVEYILKRNFNKKISEQY >NC_009699.1|WP_012100135.1|2348757_2349474_-|transaldolase MKYNDLKIKIFADGADLNGMLDAYDKGIVKGFTTNPSLMKKAGITDYKEFAKEVLAKIKDMPVSFEVFSDDLETMEKEAEVLGNLGENVYIKIPVTNTKGESTAPLIKKLSEKGYHLNVTAIFTIDQVKEVVGALKSGVDSIVSVFAGRIADTGEDPVTIMKEASKICKTKEGVELLWASCREFYSIVEADKCGCEIITVTNDILKKMPNMGKDLKEYSIETVRGFYKDASSLGFSIL >NC_009699.1|WP_012100134.1|2348296_2348734_-|PTS-transporter-subunit-EIIA 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MLNKRCSNILQMIVNNEKPITIKEISKKVNKSPRTVRYDLDKIDDYLTEIEFPKLERKSNLGISLDLKDEEIKKLFKVIGKINNYDYVLSQKERVFYIIYELLNKSEFVTINMLSDRMMVSRSTIINDLIEVKKWLLENKITLESSKGQGIKILGRERDLRRAAVKLFFQSMDSINFFNVTTLKLFNDIDIDFIRNTIKIAEEQMETSFSDDAFNNLVIHIAIAIKRIELSKDIIMDREELKNLRKTAEYAIASGIAKMLEDRFKISIPEDEIGYITIHILGSNTSTLENIVKDDWIYLHLIVFKLIENVENITGINFSKDNKLFDSLAQHIRPAIYRLKHDIKVKNPLIEEIKEKYSYIFESIEEGVKFIEEDIGDSVNQEEIGYLTLHFMASIERSKNKKHRKPNVLIVCATGIGTSKFISNKLKSIFDINIIDTISSHTMEKILKYNKNIDLIITTIPLKVKGIRCIEVNTFLTEKNISELGLYFAKFIRNNSEECNGSCKYEERDKVQEILNIVKENCTIHDYYKLRNKLALYLNIKDPTLTEDHKPSLKELLKPDFIRLNEEAKDWEDAVRKSGEILMNNGCVKESYIDAMVNTVKNMGPYIVIAPGIAMPHAAPEDGVLKTGISMLTLKDPISFGNSEHDPVSVIISICSIDKVNHMKALKELMSIMDQEDFISKVKNIKASSEIDSILYS >NC_009699.1|WP_003358205.1|2343623_2343977_-|zinc-ribbon-domain-containing-protein MIIWGWGKVTKKIIGAVFERTCNYCNTDEVWNLCVVRTWFTLFFIPIIPYKKQYCIACPKCWSYIELTQEEFEKIKIDITSSSNNINEKVVTDNIKYAGKTETQINYLKQMEEYANK >NC_009699.1|WP_012100132.1|2342068_2342836_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein 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You can click texts colored in the table to view more detailed information
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| NC_009699_5 | 2352017-2352309 | TypeIII |
III-B
Consensus repeat of NC_009699_5
|
4 spacers
spacers of NC_009699_5
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009699_5
The CRISPR arrays of NC_009699_5 >merge|NC_009699|5|2352017-2352309|CRISPRCasFinder GCTTAAATACATCTCATGTTATTGCTCAATGTATCTTCTAAGTTTTCTGTATTAGATATTTATGGATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAACGAGAATGTATTTAAGAATACAATAAATGAATACAAATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAACTAAAAAAGATCTACGGACAATTAGTAAAGCAATAAAATTTAAATACATCTCATGTTAAAGTTCAACTCTTACTTTATTTATAGATAAAACAAAAGAAAGGACATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAATA >NC_009699|5|5|2352017-2352309|CRISPRCasFinder GCTTAAATACATCTCATGTTATTGCTCAAT GTATCTTCTAAGTTTTCTGTATTAGATATTTATGG ATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAAC GAGAATGTATTTAAGAATACAATAAATGAATACAA ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC TAAAAAAGATCTACGGACAATTAGTAAAGCAATAAA ATTTAAATACATCTCATGTTAAAGTTCAAC TCTTACTTTATTTATAGATAAAACAAAAGAAAGGAC ATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAATA
>NC_009699.1|WP_012100137.1|2350450_2351185_-|hypothetical-protein MDKFRNMKKSHIALLAVMYIVLMGSLPRFTGWATIFSAIVVGGYFLKNKKDLKELTRKKKNFIFTGIIILAIIGSLNVAVGNNIQNEKLMAEKAKQEQEIKQEEQKKIEEKKLAEEQKRIQEEEAKKKAAEEKRKQEEEAKKKAAEEQKKQEELKRKQEEENKVKAENEQAQAAFAQSTGKGNSNSQSNESQNADDNQNYTVYKTRTGSKYHSSGCRYLKKSCYETTVSQARNEDLTPCSVCNP >NC_009699.1|WP_012100136.1|2349708_2350113_-|membrane-protein MNILISTCNIGIPVLMIFIGILYKCNSYKKIDKTLDLIVPIAMFFTGFSERDREHLYKNTNNLASVNRKCSLIWSISGVCTLLLTIISLILNKSDIYNTSVILLEPELLILVIVFITVEYILKRNFNKKISEQY >NC_009699.1|WP_012100135.1|2348757_2349474_-|transaldolase MKYNDLKIKIFADGADLNGMLDAYDKGIVKGFTTNPSLMKKAGITDYKEFAKEVLAKIKDMPVSFEVFSDDLETMEKEAEVLGNLGENVYIKIPVTNTKGESTAPLIKKLSEKGYHLNVTAIFTIDQVKEVVGALKSGVDSIVSVFAGRIADTGEDPVTIMKEASKICKTKEGVELLWASCREFYSIVEADKCGCEIITVTNDILKKMPNMGKDLKEYSIETVRGFYKDASSLGFSIL >NC_009699.1|WP_012100134.1|2348296_2348734_-|PTS-transporter-subunit-EIIA 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CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009699_7
The CRISPR arrays of NC_009699_7 >merge|NC_009699|7|2359371-2359661|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR GCTCAAATACATCTTATGTTATTGTTCAACATAGATGAAATAGAAATAGTTATAGATTTAATTGAATTTAAATACATCTTATGTTATTGTTCAACGTTAAAGAAGATGAAAAAAGTAAATAGGTGATATTAATTTAAATACATCTTATGTTATTGTTCAACGGACATGAAGATATACTAGCCACACCGTTAGACTAATTTAAATACATCTTATGTTATTGTTCAACATAATAAATATGCATGTGAATATGTACTTAGCTTATTTAAATACATCTCATGTTATTGTTCAACC >NC_009699|7|2|2359371-2359660|CRT GCTCAAATACATCTTATGTTATTGTTCAAC ATAGATGAAATAGAAATAGTTATAGATTTAATTGA ATTTAAATACATCTTATGTTATTGTTCAAC GTTAAAGAAGATGAAAAAAGTAAATAGGTGATATTA ATTTAAATACATCTTATGTTATTGTTCAAC GGACATGAAGATATACTAGCCACACCGTTAGACTA ATTTAAATACATCTTATGTTATTGTTCAAC ATAATAAATATGCATGTGAATATGTACTTAGCTT ATTTAAATACATCTCATGTTATTGTTCAAC >NC_009699|7|7|2359373-2359661|CRISPRCasFinder TCAAATACATCTTATGTTATTGTTCAAC ATAGATGAAATAGAAATAGTTATAGATTTAATTGAAT TTAAATACATCTTATGTTATTGTTCAAC GTTAAAGAAGATGAAAAAAGTAAATAGGTGATATTAAT TTAAATACATCTTATGTTATTGTTCAAC GGACATGAAGATATACTAGCCACACCGTTAGACTAAT TTAAATACATCTTATGTTATTGTTCAAC ATAATAAATATGCATGTGAATATGTACTTAGCTTAT TTAAATACATCTCATGTTATTGTTCAACC >NC_009699|7|2|2359435-2359660|PILER-CR AATTTAAATACATCTTATGTTATTGTTCAACG TTAAAGAAGATGAAAAAAGTAAATAGGTGATATT AATTTAAATACATCTTATGTTATTGTTCAACG GACATGAAGATATACTAGCCACACCGTTAGACT AATTTAAATACATCTTATGTTATTGTTCAACA TAATAAATATGCATGTGAATATGTACTTAGCT TATTTAAATACATCTCATGTTATTGTTCAAC
>NC_009699.1|WP_012100144.1|2358627_2359149_+|DUF4825-domain-containing-protein MKNKLKILIPLIIILSLNLVGCGMNSEKKSKENIKNSSKVETYDLIKYKGTYVGDNSSVGSIIKNLPANKYSAGFSLQTSKEPYEITVNYKANENLGEENYNKFWSDKKADKLLEKNAVVLLSLIPNAEIIKFNVDNIGEESYKYDRKNLEQKYGNLKDLSKDNDSLKKFLNN >NC_009699.1|WP_012100143.1|2357436_2358327_-|AraC-family-transcriptional-regulator MNYRKDIENCIDYIEEHIKEPLTLKEITQEIGYSSYHFCRVFSFLKGMPLMEYVRKRRLSLSTIDLLEGKKIIDVAFKWGFETPSSFARAFRKEFECSPSQYIKKMKSYYKSENNLILGKFMNDPYIVKKHGFKVAGYGIKTNVADSKYTKDVASFWSNYNGENLESKLYKILSPLKHGEVGLCIPCSDSGDITYLLGVIVEDFSKVTSDMITVEVPKAQYAVFTTNPVNTVDSKDQREFAKIIKQSWKYIFDEWFKNNDYEYDEEKLDFEFYDERCHLRPDTVMDIYVPIKKVKR >NC_009699.1|WP_012100142.1|2356689_2357430_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MINYYGSLCTVMYELLHPHAPEDELQFYLQYAKKEMKILEPLCGSGRFLVPFLERGFNITGFDMSEEMLKELYKKAPKAKVFQSSIEKFSPKEKYDYIFITSGSFSLFLDEDIAFNVLVKMKEALAPKGKFVFAAETTANIIHDREKYLKNCAVKTKEGYDIIFKSKSFYDKHKKILSTPSLYELYDGDKLLGKEEMDFRIKLYDFGELDKLILKAGFKGSHVFSDFNRRESIDKNTETFLYECYI >NC_009699.1|WP_012100141.1|2355194_2356586_+|peptide-MFS-transporter MSEKKQKHPIGLWLVNISIALQSYAAYAVVSILILFLTADVSKNGLGLSVPKAAAIIGLYQGINYMGSLVGGYITDKWLGIQKSLILGCFLTACGYLALFFAKPNIGSVWLGLIILIVAGAFFKAQISSLVGELYGKNELSKKDAAYSIFYMFINIGAFFGPIIAGLISDKWFAKVAADGEIAAYGYKYIFLMCTLIMIFIGIFIWIVSPKWLGEIGKYPVSKDKKTSTKSIEKAKAQPLTQLEKNRIKAMIVMFVFVIIFWSAWDQTATSFSLLANKLVNRTIGEFTMPVPWLTSINAIFCVVLSPIIANIWLKLGNSKKGDLSVPTKMGLGMILTGIAFLTLILGISTLGGVLDGSKQMNILFIIVAYFLLTVGELCLSPIGMAMFNKLAPAKYGSLAMGAWYLSFFFSSIISGKLAGFTDTLGYTQIFGLISGIVIVFGVILILLRNGLLKLMSLDELDK >NC_009699.1|WP_012100140.1|2353589_2354204_-|sugar-O-acetyltransferase MNQKDRMLAGLPYKACLDGLPEERMENKKKIYEYNHCFPDEHEKIHKLIRDILRKAGADVHIEAPFYCDYGKNIQVGDNFFANYNCTILDVGKVIIGNNVQFAPNVSLYTAGHPIHPDSRNSGYEYGIGITIGDNVWLGGNVVVNPGVHIGNNVVIGSGSVVTKDIPDNVIAIGNPCKIIREITEKDRKYYYKNYEFDIDDYKE >NC_009699.1|WP_012100139.1|2353052_2353547_-|hypothetical-protein 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>NC_009699.1|WP_012100151.1|2366315_2366795_-|type-III-B-CRISPR-module-associated-protein-Cmr5 MGDLKNVNLQVAQFALEKVKEVLNYYEKEILKCKEEEREQIEKKQKMLSSKYKTLSKKMTVLIQKNGLIGTLVFILSKVKKEKANELVLQHIINWCEEDCKLDFLRVDKENTNPNEAFIENITKLSNQEYRLVTKEIMNLFGWIKRFTDGMIEGEVQND >NC_009699.1|WP_012100152.1|2366794_2367658_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr4 MYKDKETIYIKAISPIHAGSGQSLTSVDMPIQRESHSNIPKIEGSSLKGSVKHNVYHKLRVNKDNKKEEHKLFEKMFGSEDGNDCASAISITDAKLLLFPMRSAIDIYKLITCPYVLKRWKEETNQSFEDSILENIEDGHCVINQNSPLLSNDKVMLEEYIFEARKEDLSILFNGSFENLQINKVVILSDSDFIDMVTMYTEVITRNKINVETGTAQGTGLFSEEYLPAETVMYFSVLESAFYKGEEEVLKYFNENIGGIFQVGGNETIGKGIVKVINHDLLKGVTE >NC_009699.1|WP_012100153.1|2367671_2368943_-|hypothetical-protein 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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_009699_8 | 2359915-2360074 | TypeIII |
III-B
Consensus repeat of NC_009699_8
|
2 spacers
spacers of NC_009699_8
>8.1|2359943|38|NC_009699|CRISPRCasFinder AAATAGTATAGAGCTACAAATAGAAAAGGCAAGAATAT >8.2|2360009|37|NC_009699|CRISPRCasFinder AGAGGAGCCAATAGACATTGCAAGATATTAGATACAT |
cmr6gr7,cmr5gr11,cmr4gr7,csx1,cmr3gr5,cas10 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009699_8
The CRISPR arrays of NC_009699_8 >merge|NC_009699|8|2359915-2360074|CRISPRCasFinder TTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACAAATAGTATAGAGCTACAAATAGAAAAGGCAAGAATATTTAAATACATCCCATGTTAATGTTCAAGAGAGGAGCCAATAGACATTGCAAGATATTAGATACATTTAAATACATCTCATGTTACTGCTCAACC >NC_009699|8|8|2359915-2360074|CRISPRCasFinder TTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC AAATAGTATAGAGCTACAAATAGAAAAGGCAAGAATAT TTAAATACATCCCATGTTAATGTTCAAG AGAGGAGCCAATAGACATTGCAAGATATTAGATACAT TTAAATACATCTCATGTTACTGCTCAACC
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MKDKYKVLYDPIKIGKLEIKNRYVLAPMGPGGMCNADGSFNKRGIEFYVERAKGGTGLIMTGVTMVENNIEKCALPSMPCPTINPLNFITTGNEMTERIHAYGSKIFLQLSAGFGRVSIPSIVGKVAVAPSKIPHRFLPGVTCRELTTEEVKEYVKAFGESAEIAKKAGFDGIEIHAVHEGYLLDQFAISFFNHRTDEYGGSLENRLRFACEVVQEIKKRCGQDFPVSLRYSIKSFIKDWCKGGLPDEEFEEKGRDIPEGIEAAKILVAAGYDALNGDVGSYDSWYWSHPPMYQKKGLYLPYNEILKKVVDVPIITAGRMEDPELSSDAILSGKTDMIALGRPLLADAEIPNKIFEDKYDKVRPCLSCQEGCMGRLQNFATVSCAVNPACGREKEYGLKKAEQIKKVLVVGGGVAGMEAARVAAIRGHKVTLLEKNGYLGGNIVPGGVPDFKDDDRALVKWYEGILKDLGVEIKLNVDASKENIKGFGADEVLLATGSSPRTLTIEGADNVYSAEDVLMERKNVGEKVIVIGGGLVGCETVLWLKQQGKEVTIVEMQNDILQVGGPLCHANHDMLIDLIKFNKIDVKTSSYISKKADEGFVLNTNGEESIINADSAVVAIGYLSQNDLYNQVRFDIPNARLIGDANKVQNIMYAIWSAYEVAKNI >NC_009699.1|WP_012100148.1|2363451_2364249_-|MerR-family-transcriptional-regulator 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>NC_009699.1|WP_012100151.1|2366315_2366795_-|type-III-B-CRISPR-module-associated-protein-Cmr5 MGDLKNVNLQVAQFALEKVKEVLNYYEKEILKCKEEEREQIEKKQKMLSSKYKTLSKKMTVLIQKNGLIGTLVFILSKVKKEKANELVLQHIINWCEEDCKLDFLRVDKENTNPNEAFIENITKLSNQEYRLVTKEIMNLFGWIKRFTDGMIEGEVQND >NC_009699.1|WP_012100152.1|2366794_2367658_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr4 MYKDKETIYIKAISPIHAGSGQSLTSVDMPIQRESHSNIPKIEGSSLKGSVKHNVYHKLRVNKDNKKEEHKLFEKMFGSEDGNDCASAISITDAKLLLFPMRSAIDIYKLITCPYVLKRWKEETNQSFEDSILENIEDGHCVINQNSPLLSNDKVMLEEYIFEARKEDLSILFNGSFENLQINKVVILSDSDFIDMVTMYTEVITRNKINVETGTAQGTGLFSEEYLPAETVMYFSVLESAFYKGEEEVLKYFNENIGGIFQVGGNETIGKGIVKVINHDLLKGVTE >NC_009699.1|WP_012100153.1|2367671_2368943_-|hypothetical-protein MEHKNVEHLVIFSTLNQITNYIAIKNLKPKNIYNITFDQGFADTLKQGIDPKKWDDNLKNVLNDENIKPKRKNIEIKQCMYIDLEKFKEELEKNIEYVDEDTPIYWHITGGQRIFAIAIHDIVKKRPNDIIFYLEGNSEKIIYIGKEKTKFEYELKDLDFSTAFKLMGYNTEDLDSTRILKGKIKKNDKNEKLKYDKNEMKFYHRLYDWIINNDGEKTKSHIAFSIGDKKFEGTFKKLLLESNSINRTIRQEFLKKLFEELEKKSPSLKKIEYNFINSDEMKMEFPAGYIFEKLTGYQIYKVVEDNTRILGMAMSLKVYNEEGGHSTDELDIALLTNTGRIINFECKSGSLKGDNAKSHKFTTYSLSGVFGAPIFLTPLTYKGEKLEKELDKKLHSACKAADRANLEKIYLKDIKEKVKKLIG >NC_009699.1|WP_012100154.1|2368945_2370049_-|CRISPR-associated-protein-Cmr3 MKFLKIKPYDNTFFRLGNNFEFKISNVIQTKNVAYPSTFFGAIFTAILANNDEFRESFLNIPGNTDHLEILNIKQIYLYAEKQGMIYIKAPKDIFVNNNEVKFGNFKEIKDGESSIKYDYYLEEPDGNELERADNYFVSIKEFYDKYRYKVLDNIDLKQEDEIFAKNIKTGIALDKSTGIVKESLLYTIEQTEFKNITEDYYSNDWSFVVEYAIDNDFLKKQGYPKVKNLDKGELKLGGETKVCTYEIIENSDINEFKSKTSQGFLKPGEKLKVILTSDSYFTKSFAELFNDEMKILALVNDKPIYIGGFDVAKNEEKAMYKGYSAGTVLLLQNESGKDINLQKYLDMKLRNKLKNGFNEYICVKGE >NC_009699.1|WP_012100155.1|2370029_2371775_-|type-III-B-CRISPR-associated-protein-Cas10/Cmr2 MSYLLGVTVGPIQTNIQKSRKLRELYNSSKIVSDMMKKVIEYLKIRDETLKIIYPSIKDVNDTKTDITNYLICEINNIDDLKDMRERVFDELKISVLEEIYFMFWAVEPLEEYSKTYKKLTKKLRSIKNTYEFKNYEKDVRIKKKCSLCGERIREDASELCEVCNRKRNYDQTSNWKNNNKGEKYKSVYDISIDAWKEKYNEDLLSLNKNLEDLFNNTSRYYSLDTVSNIIKCLKIDPKKVRKEKEIDEDLENPKMEALELIAELKNIRFELESIYLRGEKPVSKPHYKYCFIQIDVDDLGKWISGVYNYEEENLKENQIQISKALCSFAYKLKEEFKNSKTKVIYAGGDDFLAVLPVECLLNTLKIIEEIFKSTVQNNIDNSLNYSQKISYSASVTIANCKDEMSLALRKNREALEKVKNRYYSKNGICINYIINTSKIINMFLLKDYFNEYVDNLRYFKKVEKYMSFTYIDAIENEFSKMKFEDLETDDFLNIKDMLLLEFERHLNLNKNKVPKDSEEGNENFLEYFKIHTRLFENIINDNEIDKKIDFINIINCFRIYKKLTDFQFKEEAKWDEVSKN |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_009699_9 | 2360354-2360647 | TypeIII |
III-B
Consensus repeat of NC_009699_9
|
4 spacers
spacers of NC_009699_9
>9.1|2360384|36|NC_009699|CRT TTTAGAAAAAAATAACGCTTTTGATGATTTATATAA >9.2|2360450|36|NC_009699|CRT GAACACCAGTTACAATAGATGGAAAAGAATATACAA >9.3|2360516|35|NC_009699|CRT CTTATCGCTATCATAAACTATATCACCATCATAAT >9.4|2360581|36|NC_009699|CRT AGGTGAAGAAATTGGAGATACTTTAGAAGCAGTTTG >9.5|2360386|36|NC_009699|PILER-CR TTTAGAAAAAAATAACGCTTTTGATGATTTATATAA >9.6|2360452|36|NC_009699|PILER-CR GAACACCAGTTACAATAGATGGAAAAGAATATACAA >9.7|2360518|35|NC_009699|PILER-CR CTTATCGCTATCATAAACTATATCACCATCATAAT >9.8|2360384|38|NC_009699|CRISPRCasFinder TTTAGAAAAAAATAACGCTTTTGATGATTTATATAAAT >9.9|2360450|38|NC_009699|CRISPRCasFinder GAACACCAGTTACAATAGATGGAAAAGAATATACAAAT >9.10|2360516|37|NC_009699|CRISPRCasFinder CTTATCGCTATCATAAACTATATCACCATCATAATAT >9.11|2360581|38|NC_009699|CRISPRCasFinder AGGTGAAGAAATTGGAGATACTTTAGAAGCAGTTTGAT |
cmr6gr7,cmr5gr11,cmr4gr7,csx1,cmr3gr5,cas10,cmr1gr7 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009699_9
The CRISPR arrays of NC_009699_9 >merge|NC_009699|9|2360354-2360647|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GCTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAACTTTAGAAAAAAATAACGCTTTTGATGATTTATATAAATTTAAATACATCTTATGTTAAGGTTCAACGAACACCAGTTACAATAGATGGAAAAGAATATACAAATTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAACCTTATCGCTATCATAAACTATATCACCATCATAATATTTAAATACATCTTATGTTAATATTCAACAGGTGAAGAAATTGGAGATACTTTAGAAGCAGTTTGATTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAACC >NC_009699|9|3|2360354-2360646|CRT GCTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAAC TTTAGAAAAAAATAACGCTTTTGATGATTTATATAA ATTTAAATACATCTTATGTTAAGGTTCAAC GAACACCAGTTACAATAGATGGAAAAGAATATACAA ATTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAAC CTTATCGCTATCATAAACTATATCACCATCATAAT ATTTAAATACATCTTATGTTAATATTCAAC AGGTGAAGAAATTGGAGATACTTTAGAAGCAGTTTG ATTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAAC >NC_009699|9|3|2360356-2360580|PILER-CR TTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAACTT TAGAAAAAAATAACGCTTTTGATGATTTATATAAAT TTAAATACATCTTATGTTAAGGTTCAACGA ACACCAGTTACAATAGATGGAAAAGAATATACAAAT TTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAACCT TATCGCTATCATAAACTATATCACCATCATAATAT TTAAATACATCTTATGTTAATATTCAAC >NC_009699|9|9|2360356-2360647|CRISPRCasFinder TTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAAC TTTAGAAAAAAATAACGCTTTTGATGATTTATATAAAT TTAAATACATCTTATGTTAAGGTTCAAC GAACACCAGTTACAATAGATGGAAAAGAATATACAAAT TTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAAC CTTATCGCTATCATAAACTATATCACCATCATAATAT TTAAATACATCTTATGTTAATATTCAAC AGGTGAAGAAATTGGAGATACTTTAGAAGCAGTTTGAT TTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAACC
>NC_009699.1|WP_012100144.1|2358627_2359149_+|DUF4825-domain-containing-protein MKNKLKILIPLIIILSLNLVGCGMNSEKKSKENIKNSSKVETYDLIKYKGTYVGDNSSVGSIIKNLPANKYSAGFSLQTSKEPYEITVNYKANENLGEENYNKFWSDKKADKLLEKNAVVLLSLIPNAEIIKFNVDNIGEESYKYDRKNLEQKYGNLKDLSKDNDSLKKFLNN >NC_009699.1|WP_012100143.1|2357436_2358327_-|AraC-family-transcriptional-regulator MNYRKDIENCIDYIEEHIKEPLTLKEITQEIGYSSYHFCRVFSFLKGMPLMEYVRKRRLSLSTIDLLEGKKIIDVAFKWGFETPSSFARAFRKEFECSPSQYIKKMKSYYKSENNLILGKFMNDPYIVKKHGFKVAGYGIKTNVADSKYTKDVASFWSNYNGENLESKLYKILSPLKHGEVGLCIPCSDSGDITYLLGVIVEDFSKVTSDMITVEVPKAQYAVFTTNPVNTVDSKDQREFAKIIKQSWKYIFDEWFKNNDYEYDEEKLDFEFYDERCHLRPDTVMDIYVPIKKVKR >NC_009699.1|WP_012100142.1|2356689_2357430_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MINYYGSLCTVMYELLHPHAPEDELQFYLQYAKKEMKILEPLCGSGRFLVPFLERGFNITGFDMSEEMLKELYKKAPKAKVFQSSIEKFSPKEKYDYIFITSGSFSLFLDEDIAFNVLVKMKEALAPKGKFVFAAETTANIIHDREKYLKNCAVKTKEGYDIIFKSKSFYDKHKKILSTPSLYELYDGDKLLGKEEMDFRIKLYDFGELDKLILKAGFKGSHVFSDFNRRESIDKNTETFLYECYI >NC_009699.1|WP_012100141.1|2355194_2356586_+|peptide-MFS-transporter MSEKKQKHPIGLWLVNISIALQSYAAYAVVSILILFLTADVSKNGLGLSVPKAAAIIGLYQGINYMGSLVGGYITDKWLGIQKSLILGCFLTACGYLALFFAKPNIGSVWLGLIILIVAGAFFKAQISSLVGELYGKNELSKKDAAYSIFYMFINIGAFFGPIIAGLISDKWFAKVAADGEIAAYGYKYIFLMCTLIMIFIGIFIWIVSPKWLGEIGKYPVSKDKKTSTKSIEKAKAQPLTQLEKNRIKAMIVMFVFVIIFWSAWDQTATSFSLLANKLVNRTIGEFTMPVPWLTSINAIFCVVLSPIIANIWLKLGNSKKGDLSVPTKMGLGMILTGIAFLTLILGISTLGGVLDGSKQMNILFIIVAYFLLTVGELCLSPIGMAMFNKLAPAKYGSLAMGAWYLSFFFSSIISGKLAGFTDTLGYTQIFGLISGIVIVFGVILILLRNGLLKLMSLDELDK >NC_009699.1|WP_012100140.1|2353589_2354204_-|sugar-O-acetyltransferase MNQKDRMLAGLPYKACLDGLPEERMENKKKIYEYNHCFPDEHEKIHKLIRDILRKAGADVHIEAPFYCDYGKNIQVGDNFFANYNCTILDVGKVIIGNNVQFAPNVSLYTAGHPIHPDSRNSGYEYGIGITIGDNVWLGGNVVVNPGVHIGNNVVIGSGSVVTKDIPDNVIAIGNPCKIIREITEKDRKYYYKNYEFDIDDYKE >NC_009699.1|WP_012100139.1|2353052_2353547_-|hypothetical-protein MILAIECFIACVLFTLMILPSLYKEPIKHIMSYPTDIRKRVENLPQYKDVIQKKEKKHLTVKIIAVFMFAIIFAVVAYFSGAKSFSKAYIHVFTLFFVVNIYDMIVLDIGLFCHSKKTRIPGTEDMDKEYRNPWHHIKGAGIGTIIGAVVALLSRGMVHFISII >NC_009699.1|WP_012100137.1|2350450_2351185_-|hypothetical-protein MDKFRNMKKSHIALLAVMYIVLMGSLPRFTGWATIFSAIVVGGYFLKNKKDLKELTRKKKNFIFTGIIILAIIGSLNVAVGNNIQNEKLMAEKAKQEQEIKQEEQKKIEEKKLAEEQKRIQEEEAKKKAAEEKRKQEEEAKKKAAEEQKKQEELKRKQEEENKVKAENEQAQAAFAQSTGKGNSNSQSNESQNADDNQNYTVYKTRTGSKYHSSGCRYLKKSCYETTVSQARNEDLTPCSVCNP >NC_009699.1|WP_012100136.1|2349708_2350113_-|membrane-protein MNILISTCNIGIPVLMIFIGILYKCNSYKKIDKTLDLIVPIAMFFTGFSERDREHLYKNTNNLASVNRKCSLIWSISGVCTLLLTIISLILNKSDIYNTSVILLEPELLILVIVFITVEYILKRNFNKKISEQY >NC_009699.1|WP_012100135.1|2348757_2349474_-|transaldolase MKYNDLKIKIFADGADLNGMLDAYDKGIVKGFTTNPSLMKKAGITDYKEFAKEVLAKIKDMPVSFEVFSDDLETMEKEAEVLGNLGENVYIKIPVTNTKGESTAPLIKKLSEKGYHLNVTAIFTIDQVKEVVGALKSGVDSIVSVFAGRIADTGEDPVTIMKEASKICKTKEGVELLWASCREFYSIVEADKCGCEIITVTNDILKKMPNMGKDLKEYSIETVRGFYKDASSLGFSIL >NC_009699.1|WP_012100134.1|2348296_2348734_-|PTS-transporter-subunit-EIIA MLKNYINDQVVEVNVEVKNWEEAVRLGGKLLEEDGAVEHSYIDAMVDTVKNMGPYIVIAPGIAMPHARPEAGAKNIRIGLLKLKNPINFGNEEHDPVDIVIFLCAVDNKAHIEVLGELVQLIEDDDFLKIVRNASTKKEILDYIK >NC_009699.1|WP_012100147.1|2361357_2363355_-|FAD-dependent-oxidoreductase MKDKYKVLYDPIKIGKLEIKNRYVLAPMGPGGMCNADGSFNKRGIEFYVERAKGGTGLIMTGVTMVENNIEKCALPSMPCPTINPLNFITTGNEMTERIHAYGSKIFLQLSAGFGRVSIPSIVGKVAVAPSKIPHRFLPGVTCRELTTEEVKEYVKAFGESAEIAKKAGFDGIEIHAVHEGYLLDQFAISFFNHRTDEYGGSLENRLRFACEVVQEIKKRCGQDFPVSLRYSIKSFIKDWCKGGLPDEEFEEKGRDIPEGIEAAKILVAAGYDALNGDVGSYDSWYWSHPPMYQKKGLYLPYNEILKKVVDVPIITAGRMEDPELSSDAILSGKTDMIALGRPLLADAEIPNKIFEDKYDKVRPCLSCQEGCMGRLQNFATVSCAVNPACGREKEYGLKKAEQIKKVLVVGGGVAGMEAARVAAIRGHKVTLLEKNGYLGGNIVPGGVPDFKDDDRALVKWYEGILKDLGVEIKLNVDASKENIKGFGADEVLLATGSSPRTLTIEGADNVYSAEDVLMERKNVGEKVIVIGGGLVGCETVLWLKQQGKEVTIVEMQNDILQVGGPLCHANHDMLIDLIKFNKIDVKTSSYISKKADEGFVLNTNGEESIINADSAVVAIGYLSQNDLYNQVRFDIPNARLIGDANKVQNIMYAIWSAYEVAKNI >NC_009699.1|WP_012100148.1|2363451_2364249_-|MerR-family-transcriptional-regulator MRYSITDLAEILGCTTSAIHYFEKEHLIEVEKGKNGHRYYNVVDVFRLLSYTKYRSMEIPMKTIIAQFGGEENNYKLIEEREAMYQLEALKRAQYYMNLADAIGEHLVSVRRIEELLDKYEFAKSPEVTIMCDDECGWLSKKRSSQRIIHEWVKAMPTVQLGVFDSRMGISNFGYLVKTKKREELELPLGLHTKQLKSTSCIHTIVMADEDFTQHPQKVFKKASEFAIKKGLEIGEIAWGKILLVEVEKGAKLHPYIELWISIKI >NC_009699.1|WP_012100149.1|2364297_2364591_-|hypothetical-protein MNFFTLNILIGAMAFIINKINNMSQDIDPFEAFNDIEENLDEIDNEKVTNFVNGLINASMSNPSIGYFFMFLVYMTPVLNLLLLIKGIINYFNRAVG >NC_009699.1|WP_012100150.1|2365024_2366323_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr6 MIKLLKVKSFSTKRGAEFENKETFNKLKQEFYKNPKIGDYVFCSIEEDKLRGLEWRLYQDIDNTNVYEQWQKWKKDSCHYGLKLDKFTNVFNGREESVNKKIDQSIHLNIDDYLKEDKNLYENIDFNVKVFDKLVVGLGEHSVFETDIKLHHTYGVPYIPASAVKGCFRSHIIQKYFQSKEKKAEEDKNFIEIFGGEYKDKTYSGNVIFIDLFPKNSFEIKKDVMTPHYQNGYTDDGNITPIEFLTVENTLFRFILRISNKCLLQDNNSKIKLKENQDVRDLIVEELVEMIATHGIGAKTSVGYGYFEEVTKEECLEQTENNEKRREEEILEAKEKKKLMKMNDSEKKLYLVEKISDCEKRKEGLRKLFTNRKQEELEQTEIEKLAKLIKRDLEDSGKWRYKIGKKGKKNKELERIEKICEILNIDLPKNSN >NC_009699.1|WP_012100151.1|2366315_2366795_-|type-III-B-CRISPR-module-associated-protein-Cmr5 MGDLKNVNLQVAQFALEKVKEVLNYYEKEILKCKEEEREQIEKKQKMLSSKYKTLSKKMTVLIQKNGLIGTLVFILSKVKKEKANELVLQHIINWCEEDCKLDFLRVDKENTNPNEAFIENITKLSNQEYRLVTKEIMNLFGWIKRFTDGMIEGEVQND >NC_009699.1|WP_012100152.1|2366794_2367658_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr4 MYKDKETIYIKAISPIHAGSGQSLTSVDMPIQRESHSNIPKIEGSSLKGSVKHNVYHKLRVNKDNKKEEHKLFEKMFGSEDGNDCASAISITDAKLLLFPMRSAIDIYKLITCPYVLKRWKEETNQSFEDSILENIEDGHCVINQNSPLLSNDKVMLEEYIFEARKEDLSILFNGSFENLQINKVVILSDSDFIDMVTMYTEVITRNKINVETGTAQGTGLFSEEYLPAETVMYFSVLESAFYKGEEEVLKYFNENIGGIFQVGGNETIGKGIVKVINHDLLKGVTE >NC_009699.1|WP_012100153.1|2367671_2368943_-|hypothetical-protein MEHKNVEHLVIFSTLNQITNYIAIKNLKPKNIYNITFDQGFADTLKQGIDPKKWDDNLKNVLNDENIKPKRKNIEIKQCMYIDLEKFKEELEKNIEYVDEDTPIYWHITGGQRIFAIAIHDIVKKRPNDIIFYLEGNSEKIIYIGKEKTKFEYELKDLDFSTAFKLMGYNTEDLDSTRILKGKIKKNDKNEKLKYDKNEMKFYHRLYDWIINNDGEKTKSHIAFSIGDKKFEGTFKKLLLESNSINRTIRQEFLKKLFEELEKKSPSLKKIEYNFINSDEMKMEFPAGYIFEKLTGYQIYKVVEDNTRILGMAMSLKVYNEEGGHSTDELDIALLTNTGRIINFECKSGSLKGDNAKSHKFTTYSLSGVFGAPIFLTPLTYKGEKLEKELDKKLHSACKAADRANLEKIYLKDIKEKVKKLIG >NC_009699.1|WP_012100154.1|2368945_2370049_-|CRISPR-associated-protein-Cmr3 MKFLKIKPYDNTFFRLGNNFEFKISNVIQTKNVAYPSTFFGAIFTAILANNDEFRESFLNIPGNTDHLEILNIKQIYLYAEKQGMIYIKAPKDIFVNNNEVKFGNFKEIKDGESSIKYDYYLEEPDGNELERADNYFVSIKEFYDKYRYKVLDNIDLKQEDEIFAKNIKTGIALDKSTGIVKESLLYTIEQTEFKNITEDYYSNDWSFVVEYAIDNDFLKKQGYPKVKNLDKGELKLGGETKVCTYEIIENSDINEFKSKTSQGFLKPGEKLKVILTSDSYFTKSFAELFNDEMKILALVNDKPIYIGGFDVAKNEEKAMYKGYSAGTVLLLQNESGKDINLQKYLDMKLRNKLKNGFNEYICVKGE >NC_009699.1|WP_012100155.1|2370029_2371775_-|type-III-B-CRISPR-associated-protein-Cas10/Cmr2 MSYLLGVTVGPIQTNIQKSRKLRELYNSSKIVSDMMKKVIEYLKIRDETLKIIYPSIKDVNDTKTDITNYLICEINNIDDLKDMRERVFDELKISVLEEIYFMFWAVEPLEEYSKTYKKLTKKLRSIKNTYEFKNYEKDVRIKKKCSLCGERIREDASELCEVCNRKRNYDQTSNWKNNNKGEKYKSVYDISIDAWKEKYNEDLLSLNKNLEDLFNNTSRYYSLDTVSNIIKCLKIDPKKVRKEKEIDEDLENPKMEALELIAELKNIRFELESIYLRGEKPVSKPHYKYCFIQIDVDDLGKWISGVYNYEEENLKENQIQISKALCSFAYKLKEEFKNSKTKVIYAGGDDFLAVLPVECLLNTLKIIEEIFKSTVQNNIDNSLNYSQKISYSASVTIANCKDEMSLALRKNREALEKVKNRYYSKNGICINYIINTSKIINMFLLKDYFNEYVDNLRYFKKVEKYMSFTYIDAIENEFSKMKFEDLETDDFLNIKDMLLLEFERHLNLNKNKVPKDSEEGNENFLEYFKIHTRLFENIINDNEIDKKIDFINIINCFRIYKKLTDFQFKEEAKWDEVSKN >NC_009699.1|WP_012100156.1|2371777_2372959_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr1 MERVKVTLGVVTDMFSEGVNSNKEAEFRITELKALLRSTFREFFYYTSLDDLKEKEELLFGSTNRKSPVIIKFGRNNKIRFKDKKKLVLHKNMFKEAIPSGTTINIIFQSRYEKYLKTYVYTLKLASIMGALGKRSRKGMGAFKIIKIDDNEIIDINKSVEDLLCGYEEQFKINEKIYLIKTRKLLKEKQYKDNCTKYKIECDANMPKNVNYVKNIYKIYLGNLTEEKSRNKIDCTLRNFSWLNHYRLSDLNKIFSNETIKKIEKETGKRIDNEISLENLFNKEILGNYNYKYKEKEVTKKNILTRFACPVYVTIYQKSRGELIENYLIIKELNYDYVYKKILDKKVSNKKVTEQKKEEIRTDIKSELKEMKPIDKYYVEEFVKKIIECCEVK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_009699_10 | 2360922-2361081 | TypeIII |
III-B
Consensus repeat of NC_009699_10
|
2 spacers
spacers of NC_009699_10
>10.1|2360950|38|NC_009699|CRISPRCasFinder ATCCTTCCTTATTTCTACATATGGTCGTCAAATGAATT >10.2|2361016|38|NC_009699|CRISPRCasFinder AAAAATATCCTTCTTGATTTACCCTCCTTATCTTTTAT |
cmr6gr7,cmr5gr11,cmr4gr7,csx1,cmr3gr5,cas10,cmr1gr7 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009699_10
The CRISPR arrays of NC_009699_10 >merge|NC_009699|10|2360922-2361081|CRISPRCasFinder TTAAATACCTCATATGTTATTGTTCAACATCCTTCCTTATTTCTACATATGGTCGTCAAATGAATTTTAAATACATCTTATGTTATTGTTCAATAAAAATATCCTTCTTGATTTACCCTCCTTATCTTTTATTTAAATACATCTTATGTTATTGTTCAAT >NC_009699|10|10|2360922-2361081|CRISPRCasFinder TTAAATACCTCATATGTTATTGTTCAAC ATCCTTCCTTATTTCTACATATGGTCGTCAAATGAATT TTAAATACATCTTATGTTATTGTTCAAT AAAAATATCCTTCTTGATTTACCCTCCTTATCTTTTAT TTAAATACATCTTATGTTATTGTTCAAT
>NC_009699.1|WP_154018626.1|2360406_2360556_+|hypothetical-protein MIYINLNTSYVKVQRTPVTIDGKEYTNLNTSYVNVQPYRYHKLYHHHNI >NC_009699.1|WP_012100144.1|2358627_2359149_+|DUF4825-domain-containing-protein MKNKLKILIPLIIILSLNLVGCGMNSEKKSKENIKNSSKVETYDLIKYKGTYVGDNSSVGSIIKNLPANKYSAGFSLQTSKEPYEITVNYKANENLGEENYNKFWSDKKADKLLEKNAVVLLSLIPNAEIIKFNVDNIGEESYKYDRKNLEQKYGNLKDLSKDNDSLKKFLNN >NC_009699.1|WP_012100143.1|2357436_2358327_-|AraC-family-transcriptional-regulator MNYRKDIENCIDYIEEHIKEPLTLKEITQEIGYSSYHFCRVFSFLKGMPLMEYVRKRRLSLSTIDLLEGKKIIDVAFKWGFETPSSFARAFRKEFECSPSQYIKKMKSYYKSENNLILGKFMNDPYIVKKHGFKVAGYGIKTNVADSKYTKDVASFWSNYNGENLESKLYKILSPLKHGEVGLCIPCSDSGDITYLLGVIVEDFSKVTSDMITVEVPKAQYAVFTTNPVNTVDSKDQREFAKIIKQSWKYIFDEWFKNNDYEYDEEKLDFEFYDERCHLRPDTVMDIYVPIKKVKR >NC_009699.1|WP_012100142.1|2356689_2357430_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MINYYGSLCTVMYELLHPHAPEDELQFYLQYAKKEMKILEPLCGSGRFLVPFLERGFNITGFDMSEEMLKELYKKAPKAKVFQSSIEKFSPKEKYDYIFITSGSFSLFLDEDIAFNVLVKMKEALAPKGKFVFAAETTANIIHDREKYLKNCAVKTKEGYDIIFKSKSFYDKHKKILSTPSLYELYDGDKLLGKEEMDFRIKLYDFGELDKLILKAGFKGSHVFSDFNRRESIDKNTETFLYECYI >NC_009699.1|WP_012100141.1|2355194_2356586_+|peptide-MFS-transporter MSEKKQKHPIGLWLVNISIALQSYAAYAVVSILILFLTADVSKNGLGLSVPKAAAIIGLYQGINYMGSLVGGYITDKWLGIQKSLILGCFLTACGYLALFFAKPNIGSVWLGLIILIVAGAFFKAQISSLVGELYGKNELSKKDAAYSIFYMFINIGAFFGPIIAGLISDKWFAKVAADGEIAAYGYKYIFLMCTLIMIFIGIFIWIVSPKWLGEIGKYPVSKDKKTSTKSIEKAKAQPLTQLEKNRIKAMIVMFVFVIIFWSAWDQTATSFSLLANKLVNRTIGEFTMPVPWLTSINAIFCVVLSPIIANIWLKLGNSKKGDLSVPTKMGLGMILTGIAFLTLILGISTLGGVLDGSKQMNILFIIVAYFLLTVGELCLSPIGMAMFNKLAPAKYGSLAMGAWYLSFFFSSIISGKLAGFTDTLGYTQIFGLISGIVIVFGVILILLRNGLLKLMSLDELDK >NC_009699.1|WP_012100140.1|2353589_2354204_-|sugar-O-acetyltransferase MNQKDRMLAGLPYKACLDGLPEERMENKKKIYEYNHCFPDEHEKIHKLIRDILRKAGADVHIEAPFYCDYGKNIQVGDNFFANYNCTILDVGKVIIGNNVQFAPNVSLYTAGHPIHPDSRNSGYEYGIGITIGDNVWLGGNVVVNPGVHIGNNVVIGSGSVVTKDIPDNVIAIGNPCKIIREITEKDRKYYYKNYEFDIDDYKE >NC_009699.1|WP_012100139.1|2353052_2353547_-|hypothetical-protein MILAIECFIACVLFTLMILPSLYKEPIKHIMSYPTDIRKRVENLPQYKDVIQKKEKKHLTVKIIAVFMFAIIFAVVAYFSGAKSFSKAYIHVFTLFFVVNIYDMIVLDIGLFCHSKKTRIPGTEDMDKEYRNPWHHIKGAGIGTIIGAVVALLSRGMVHFISII >NC_009699.1|WP_012100137.1|2350450_2351185_-|hypothetical-protein MDKFRNMKKSHIALLAVMYIVLMGSLPRFTGWATIFSAIVVGGYFLKNKKDLKELTRKKKNFIFTGIIILAIIGSLNVAVGNNIQNEKLMAEKAKQEQEIKQEEQKKIEEKKLAEEQKRIQEEEAKKKAAEEKRKQEEEAKKKAAEEQKKQEELKRKQEEENKVKAENEQAQAAFAQSTGKGNSNSQSNESQNADDNQNYTVYKTRTGSKYHSSGCRYLKKSCYETTVSQARNEDLTPCSVCNP >NC_009699.1|WP_012100136.1|2349708_2350113_-|membrane-protein MNILISTCNIGIPVLMIFIGILYKCNSYKKIDKTLDLIVPIAMFFTGFSERDREHLYKNTNNLASVNRKCSLIWSISGVCTLLLTIISLILNKSDIYNTSVILLEPELLILVIVFITVEYILKRNFNKKISEQY >NC_009699.1|WP_012100135.1|2348757_2349474_-|transaldolase MKYNDLKIKIFADGADLNGMLDAYDKGIVKGFTTNPSLMKKAGITDYKEFAKEVLAKIKDMPVSFEVFSDDLETMEKEAEVLGNLGENVYIKIPVTNTKGESTAPLIKKLSEKGYHLNVTAIFTIDQVKEVVGALKSGVDSIVSVFAGRIADTGEDPVTIMKEASKICKTKEGVELLWASCREFYSIVEADKCGCEIITVTNDILKKMPNMGKDLKEYSIETVRGFYKDASSLGFSIL >NC_009699.1|WP_012100147.1|2361357_2363355_-|FAD-dependent-oxidoreductase MKDKYKVLYDPIKIGKLEIKNRYVLAPMGPGGMCNADGSFNKRGIEFYVERAKGGTGLIMTGVTMVENNIEKCALPSMPCPTINPLNFITTGNEMTERIHAYGSKIFLQLSAGFGRVSIPSIVGKVAVAPSKIPHRFLPGVTCRELTTEEVKEYVKAFGESAEIAKKAGFDGIEIHAVHEGYLLDQFAISFFNHRTDEYGGSLENRLRFACEVVQEIKKRCGQDFPVSLRYSIKSFIKDWCKGGLPDEEFEEKGRDIPEGIEAAKILVAAGYDALNGDVGSYDSWYWSHPPMYQKKGLYLPYNEILKKVVDVPIITAGRMEDPELSSDAILSGKTDMIALGRPLLADAEIPNKIFEDKYDKVRPCLSCQEGCMGRLQNFATVSCAVNPACGREKEYGLKKAEQIKKVLVVGGGVAGMEAARVAAIRGHKVTLLEKNGYLGGNIVPGGVPDFKDDDRALVKWYEGILKDLGVEIKLNVDASKENIKGFGADEVLLATGSSPRTLTIEGADNVYSAEDVLMERKNVGEKVIVIGGGLVGCETVLWLKQQGKEVTIVEMQNDILQVGGPLCHANHDMLIDLIKFNKIDVKTSSYISKKADEGFVLNTNGEESIINADSAVVAIGYLSQNDLYNQVRFDIPNARLIGDANKVQNIMYAIWSAYEVAKNI >NC_009699.1|WP_012100148.1|2363451_2364249_-|MerR-family-transcriptional-regulator MRYSITDLAEILGCTTSAIHYFEKEHLIEVEKGKNGHRYYNVVDVFRLLSYTKYRSMEIPMKTIIAQFGGEENNYKLIEEREAMYQLEALKRAQYYMNLADAIGEHLVSVRRIEELLDKYEFAKSPEVTIMCDDECGWLSKKRSSQRIIHEWVKAMPTVQLGVFDSRMGISNFGYLVKTKKREELELPLGLHTKQLKSTSCIHTIVMADEDFTQHPQKVFKKASEFAIKKGLEIGEIAWGKILLVEVEKGAKLHPYIELWISIKI >NC_009699.1|WP_012100149.1|2364297_2364591_-|hypothetical-protein MNFFTLNILIGAMAFIINKINNMSQDIDPFEAFNDIEENLDEIDNEKVTNFVNGLINASMSNPSIGYFFMFLVYMTPVLNLLLLIKGIINYFNRAVG >NC_009699.1|WP_012100150.1|2365024_2366323_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr6 MIKLLKVKSFSTKRGAEFENKETFNKLKQEFYKNPKIGDYVFCSIEEDKLRGLEWRLYQDIDNTNVYEQWQKWKKDSCHYGLKLDKFTNVFNGREESVNKKIDQSIHLNIDDYLKEDKNLYENIDFNVKVFDKLVVGLGEHSVFETDIKLHHTYGVPYIPASAVKGCFRSHIIQKYFQSKEKKAEEDKNFIEIFGGEYKDKTYSGNVIFIDLFPKNSFEIKKDVMTPHYQNGYTDDGNITPIEFLTVENTLFRFILRISNKCLLQDNNSKIKLKENQDVRDLIVEELVEMIATHGIGAKTSVGYGYFEEVTKEECLEQTENNEKRREEEILEAKEKKKLMKMNDSEKKLYLVEKISDCEKRKEGLRKLFTNRKQEELEQTEIEKLAKLIKRDLEDSGKWRYKIGKKGKKNKELERIEKICEILNIDLPKNSN >NC_009699.1|WP_012100151.1|2366315_2366795_-|type-III-B-CRISPR-module-associated-protein-Cmr5 MGDLKNVNLQVAQFALEKVKEVLNYYEKEILKCKEEEREQIEKKQKMLSSKYKTLSKKMTVLIQKNGLIGTLVFILSKVKKEKANELVLQHIINWCEEDCKLDFLRVDKENTNPNEAFIENITKLSNQEYRLVTKEIMNLFGWIKRFTDGMIEGEVQND >NC_009699.1|WP_012100152.1|2366794_2367658_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr4 MYKDKETIYIKAISPIHAGSGQSLTSVDMPIQRESHSNIPKIEGSSLKGSVKHNVYHKLRVNKDNKKEEHKLFEKMFGSEDGNDCASAISITDAKLLLFPMRSAIDIYKLITCPYVLKRWKEETNQSFEDSILENIEDGHCVINQNSPLLSNDKVMLEEYIFEARKEDLSILFNGSFENLQINKVVILSDSDFIDMVTMYTEVITRNKINVETGTAQGTGLFSEEYLPAETVMYFSVLESAFYKGEEEVLKYFNENIGGIFQVGGNETIGKGIVKVINHDLLKGVTE >NC_009699.1|WP_012100153.1|2367671_2368943_-|hypothetical-protein MEHKNVEHLVIFSTLNQITNYIAIKNLKPKNIYNITFDQGFADTLKQGIDPKKWDDNLKNVLNDENIKPKRKNIEIKQCMYIDLEKFKEELEKNIEYVDEDTPIYWHITGGQRIFAIAIHDIVKKRPNDIIFYLEGNSEKIIYIGKEKTKFEYELKDLDFSTAFKLMGYNTEDLDSTRILKGKIKKNDKNEKLKYDKNEMKFYHRLYDWIINNDGEKTKSHIAFSIGDKKFEGTFKKLLLESNSINRTIRQEFLKKLFEELEKKSPSLKKIEYNFINSDEMKMEFPAGYIFEKLTGYQIYKVVEDNTRILGMAMSLKVYNEEGGHSTDELDIALLTNTGRIINFECKSGSLKGDNAKSHKFTTYSLSGVFGAPIFLTPLTYKGEKLEKELDKKLHSACKAADRANLEKIYLKDIKEKVKKLIG >NC_009699.1|WP_012100154.1|2368945_2370049_-|CRISPR-associated-protein-Cmr3 MKFLKIKPYDNTFFRLGNNFEFKISNVIQTKNVAYPSTFFGAIFTAILANNDEFRESFLNIPGNTDHLEILNIKQIYLYAEKQGMIYIKAPKDIFVNNNEVKFGNFKEIKDGESSIKYDYYLEEPDGNELERADNYFVSIKEFYDKYRYKVLDNIDLKQEDEIFAKNIKTGIALDKSTGIVKESLLYTIEQTEFKNITEDYYSNDWSFVVEYAIDNDFLKKQGYPKVKNLDKGELKLGGETKVCTYEIIENSDINEFKSKTSQGFLKPGEKLKVILTSDSYFTKSFAELFNDEMKILALVNDKPIYIGGFDVAKNEEKAMYKGYSAGTVLLLQNESGKDINLQKYLDMKLRNKLKNGFNEYICVKGE >NC_009699.1|WP_012100155.1|2370029_2371775_-|type-III-B-CRISPR-associated-protein-Cas10/Cmr2 MSYLLGVTVGPIQTNIQKSRKLRELYNSSKIVSDMMKKVIEYLKIRDETLKIIYPSIKDVNDTKTDITNYLICEINNIDDLKDMRERVFDELKISVLEEIYFMFWAVEPLEEYSKTYKKLTKKLRSIKNTYEFKNYEKDVRIKKKCSLCGERIREDASELCEVCNRKRNYDQTSNWKNNNKGEKYKSVYDISIDAWKEKYNEDLLSLNKNLEDLFNNTSRYYSLDTVSNIIKCLKIDPKKVRKEKEIDEDLENPKMEALELIAELKNIRFELESIYLRGEKPVSKPHYKYCFIQIDVDDLGKWISGVYNYEEENLKENQIQISKALCSFAYKLKEEFKNSKTKVIYAGGDDFLAVLPVECLLNTLKIIEEIFKSTVQNNIDNSLNYSQKISYSASVTIANCKDEMSLALRKNREALEKVKNRYYSKNGICINYIINTSKIINMFLLKDYFNEYVDNLRYFKKVEKYMSFTYIDAIENEFSKMKFEDLETDDFLNIKDMLLLEFERHLNLNKNKVPKDSEEGNENFLEYFKIHTRLFENIINDNEIDKKIDFINIINCFRIYKKLTDFQFKEEAKWDEVSKN >NC_009699.1|WP_012100156.1|2371777_2372959_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr1 MERVKVTLGVVTDMFSEGVNSNKEAEFRITELKALLRSTFREFFYYTSLDDLKEKEELLFGSTNRKSPVIIKFGRNNKIRFKDKKKLVLHKNMFKEAIPSGTTINIIFQSRYEKYLKTYVYTLKLASIMGALGKRSRKGMGAFKIIKIDDNEIIDINKSVEDLLCGYEEQFKINEKIYLIKTRKLLKEKQYKDNCTKYKIECDANMPKNVNYVKNIYKIYLGNLTEEKSRNKIDCTLRNFSWLNHYRLSDLNKIFSNETIKKIEKETGKRIDNEISLENLFNKEILGNYNYKYKEKEVTKKNILTRFACPVYVTIYQKSRGELIENYLIIKELNYDYVYKKILDKKVSNKKVTEQKKEEIRTDIKSELKEMKPIDKYYVEEFVKKIIECCEVK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_009699_11 | 2373882-2374197 | TypeIII |
NA:III-B
Consensus repeat of NC_009699_11
|
4 spacers
spacers of NC_009699_11
>11.1|2373908|62|NC_009699|CRISPRCasFinder TAATATATTATGTTATTGCATTCAACAACAGTTTGATATCAGTCCCCTTATGGGACGTGCAA >11.2|2373996|41|NC_009699|CRISPRCasFinder CAACGACTTAGTGAATTTGAAGGATCTGGCAGAGAATTTGG >11.3|2374063|40|NC_009699|CRISPRCasFinder CAACCCCGGGGGTGTATAAGATATTCTTTTTCCTTATTTG >11.4|2374129|39|NC_009699|CRISPRCasFinder CAACGGTATTTCTTGATTAGTTGCAAGTATATTTTCCCA >11.5|2373912|58|NC_009699|CRT ATATTATGTTATTGCATTCAACAACAGTTTGATATCAGTCCCCTTATGGGACGTGCAA >11.6|2374000|37|NC_009699|CRT GACTTAGTGAATTTGAAGGATCTGGCAGAGAATTTGG >11.7|2374067|36|NC_009699|CRT CCCGGGGGTGTATAAGATATTCTTTTTCCTTATTTG >11.8|2374133|35|NC_009699|CRT GGTATTTCTTGATTAGTTGCAAGTATATTTTCCCA |
cas6,cmr1gr7,cas10,cmr3gr5,csx1,cmr4gr7,cmr5gr11,cmr6gr7 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009699_11
The CRISPR arrays of NC_009699_11 >merge|NC_009699|11|2373882-2374197|CRISPRCasFinder,CRT TTCTTATTATATATCATATTAATTTTTAATATATTATGTTATTGCATTCAACAACAGTTTGATATCAGTCCCCTTATGGGACGTGCAAATTTAAATATATCTTATATTAATGTTCAACGACTTAGTGAATTTGAAGGATCTGGCAGAGAATTTGGATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACCCCGGGGGTGTATAAGATATTCTTTTTCCTTATTTGATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACGGTATTTCTTGATTAGTTGCAAGTATATTTTCCCAATTTAAATACATATCATGTTAATGTTTAAC >NC_009699|11|11|2373882-2374193|CRISPRCasFinder TTCTTATTATATATCATATTAATTTT TAATATATTATGTTATTGCATTCAACAACAGTTTGATATCAGTCCCCTTATGGGACGTGCAA ATTTAAATATATCTTATATTAATGTT CAACGACTTAGTGAATTTGAAGGATCTGGCAGAGAATTTGG ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTT CAACCCCGGGGGTGTATAAGATATTCTTTTTCCTTATTTG ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTT CAACGGTATTTCTTGATTAGTTGCAAGTATATTTTCCCA ATTTAAATACATATCATGTTAATGTT >NC_009699|11|4|2373882-2374197|CRT TTCTTATTATATATCATATTAATTTTTAAT ATATTATGTTATTGCATTCAACAACAGTTTGATATCAGTCCCCTTATGGGACGTGCAA ATTTAAATATATCTTATATTAATGTTCAAC GACTTAGTGAATTTGAAGGATCTGGCAGAGAATTTGG ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC CCCGGGGGTGTATAAGATATTCTTTTTCCTTATTTG ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC GGTATTTCTTGATTAGTTGCAAGTATATTTTCCCA ATTTAAATACATATCATGTTAATGTTTAAC
>NC_009699.1|WP_012100157.1|2373004_2373694_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MEFWELIVTAMLKKDIYFEDCGYIIGKNINKSMLWDKDLKEVHPKKQYKNYVFNSFYPIERDKFYKKDRLYIFNIRGLSKEFIDKIETCLCNLESNDFNVISTSKKEIKQRYIKELYTQTPLIITVDDKPWLQNDGDLDLFKQRLEDNLEKKYKSFFNEDIDVKGKFIKSIEFKNRKPMHYNYKNGKKLLANKVSIQIEDNEEAQKVAFLARAIGLGEKNPSIGAGFCK >NC_009699.1|WP_012100156.1|2371777_2372959_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr1 MERVKVTLGVVTDMFSEGVNSNKEAEFRITELKALLRSTFREFFYYTSLDDLKEKEELLFGSTNRKSPVIIKFGRNNKIRFKDKKKLVLHKNMFKEAIPSGTTINIIFQSRYEKYLKTYVYTLKLASIMGALGKRSRKGMGAFKIIKIDDNEIIDINKSVEDLLCGYEEQFKINEKIYLIKTRKLLKEKQYKDNCTKYKIECDANMPKNVNYVKNIYKIYLGNLTEEKSRNKIDCTLRNFSWLNHYRLSDLNKIFSNETIKKIEKETGKRIDNEISLENLFNKEILGNYNYKYKEKEVTKKNILTRFACPVYVTIYQKSRGELIENYLIIKELNYDYVYKKILDKKVSNKKVTEQKKEEIRTDIKSELKEMKPIDKYYVEEFVKKIIECCEVK >NC_009699.1|WP_012100155.1|2370029_2371775_-|type-III-B-CRISPR-associated-protein-Cas10/Cmr2 MSYLLGVTVGPIQTNIQKSRKLRELYNSSKIVSDMMKKVIEYLKIRDETLKIIYPSIKDVNDTKTDITNYLICEINNIDDLKDMRERVFDELKISVLEEIYFMFWAVEPLEEYSKTYKKLTKKLRSIKNTYEFKNYEKDVRIKKKCSLCGERIREDASELCEVCNRKRNYDQTSNWKNNNKGEKYKSVYDISIDAWKEKYNEDLLSLNKNLEDLFNNTSRYYSLDTVSNIIKCLKIDPKKVRKEKEIDEDLENPKMEALELIAELKNIRFELESIYLRGEKPVSKPHYKYCFIQIDVDDLGKWISGVYNYEEENLKENQIQISKALCSFAYKLKEEFKNSKTKVIYAGGDDFLAVLPVECLLNTLKIIEEIFKSTVQNNIDNSLNYSQKISYSASVTIANCKDEMSLALRKNREALEKVKNRYYSKNGICINYIINTSKIINMFLLKDYFNEYVDNLRYFKKVEKYMSFTYIDAIENEFSKMKFEDLETDDFLNIKDMLLLEFERHLNLNKNKVPKDSEEGNENFLEYFKIHTRLFENIINDNEIDKKIDFINIINCFRIYKKLTDFQFKEEAKWDEVSKN >NC_009699.1|WP_012100154.1|2368945_2370049_-|CRISPR-associated-protein-Cmr3 MKFLKIKPYDNTFFRLGNNFEFKISNVIQTKNVAYPSTFFGAIFTAILANNDEFRESFLNIPGNTDHLEILNIKQIYLYAEKQGMIYIKAPKDIFVNNNEVKFGNFKEIKDGESSIKYDYYLEEPDGNELERADNYFVSIKEFYDKYRYKVLDNIDLKQEDEIFAKNIKTGIALDKSTGIVKESLLYTIEQTEFKNITEDYYSNDWSFVVEYAIDNDFLKKQGYPKVKNLDKGELKLGGETKVCTYEIIENSDINEFKSKTSQGFLKPGEKLKVILTSDSYFTKSFAELFNDEMKILALVNDKPIYIGGFDVAKNEEKAMYKGYSAGTVLLLQNESGKDINLQKYLDMKLRNKLKNGFNEYICVKGE >NC_009699.1|WP_012100153.1|2367671_2368943_-|hypothetical-protein MEHKNVEHLVIFSTLNQITNYIAIKNLKPKNIYNITFDQGFADTLKQGIDPKKWDDNLKNVLNDENIKPKRKNIEIKQCMYIDLEKFKEELEKNIEYVDEDTPIYWHITGGQRIFAIAIHDIVKKRPNDIIFYLEGNSEKIIYIGKEKTKFEYELKDLDFSTAFKLMGYNTEDLDSTRILKGKIKKNDKNEKLKYDKNEMKFYHRLYDWIINNDGEKTKSHIAFSIGDKKFEGTFKKLLLESNSINRTIRQEFLKKLFEELEKKSPSLKKIEYNFINSDEMKMEFPAGYIFEKLTGYQIYKVVEDNTRILGMAMSLKVYNEEGGHSTDELDIALLTNTGRIINFECKSGSLKGDNAKSHKFTTYSLSGVFGAPIFLTPLTYKGEKLEKELDKKLHSACKAADRANLEKIYLKDIKEKVKKLIG >NC_009699.1|WP_012100152.1|2366794_2367658_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr4 MYKDKETIYIKAISPIHAGSGQSLTSVDMPIQRESHSNIPKIEGSSLKGSVKHNVYHKLRVNKDNKKEEHKLFEKMFGSEDGNDCASAISITDAKLLLFPMRSAIDIYKLITCPYVLKRWKEETNQSFEDSILENIEDGHCVINQNSPLLSNDKVMLEEYIFEARKEDLSILFNGSFENLQINKVVILSDSDFIDMVTMYTEVITRNKINVETGTAQGTGLFSEEYLPAETVMYFSVLESAFYKGEEEVLKYFNENIGGIFQVGGNETIGKGIVKVINHDLLKGVTE >NC_009699.1|WP_012100151.1|2366315_2366795_-|type-III-B-CRISPR-module-associated-protein-Cmr5 MGDLKNVNLQVAQFALEKVKEVLNYYEKEILKCKEEEREQIEKKQKMLSSKYKTLSKKMTVLIQKNGLIGTLVFILSKVKKEKANELVLQHIINWCEEDCKLDFLRVDKENTNPNEAFIENITKLSNQEYRLVTKEIMNLFGWIKRFTDGMIEGEVQND >NC_009699.1|WP_012100150.1|2365024_2366323_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr6 MIKLLKVKSFSTKRGAEFENKETFNKLKQEFYKNPKIGDYVFCSIEEDKLRGLEWRLYQDIDNTNVYEQWQKWKKDSCHYGLKLDKFTNVFNGREESVNKKIDQSIHLNIDDYLKEDKNLYENIDFNVKVFDKLVVGLGEHSVFETDIKLHHTYGVPYIPASAVKGCFRSHIIQKYFQSKEKKAEEDKNFIEIFGGEYKDKTYSGNVIFIDLFPKNSFEIKKDVMTPHYQNGYTDDGNITPIEFLTVENTLFRFILRISNKCLLQDNNSKIKLKENQDVRDLIVEELVEMIATHGIGAKTSVGYGYFEEVTKEECLEQTENNEKRREEEILEAKEKKKLMKMNDSEKKLYLVEKISDCEKRKEGLRKLFTNRKQEELEQTEIEKLAKLIKRDLEDSGKWRYKIGKKGKKNKELERIEKICEILNIDLPKNSN >NC_009699.1|WP_012100149.1|2364297_2364591_-|hypothetical-protein MNFFTLNILIGAMAFIINKINNMSQDIDPFEAFNDIEENLDEIDNEKVTNFVNGLINASMSNPSIGYFFMFLVYMTPVLNLLLLIKGIINYFNRAVG >NC_009699.1|WP_012100148.1|2363451_2364249_-|MerR-family-transcriptional-regulator MRYSITDLAEILGCTTSAIHYFEKEHLIEVEKGKNGHRYYNVVDVFRLLSYTKYRSMEIPMKTIIAQFGGEENNYKLIEEREAMYQLEALKRAQYYMNLADAIGEHLVSVRRIEELLDKYEFAKSPEVTIMCDDECGWLSKKRSSQRIIHEWVKAMPTVQLGVFDSRMGISNFGYLVKTKKREELELPLGLHTKQLKSTSCIHTIVMADEDFTQHPQKVFKKASEFAIKKGLEIGEIAWGKILLVEVEKGAKLHPYIELWISIKI 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| NC_009699_12 | 2376403-2376495 | TypeIII |
III-B
Consensus repeat of NC_009699_12
|
1 spacers
spacers of NC_009699_12
>12.1|2376430|39|NC_009699|CRISPRCasFinder TTATTGCCTATATGATAGACGAAGATTATAGATTCTTAT |
cas6,cmr1gr7,cas10,cmr3gr5,csx1,cmr4gr7,cmr5gr11,cmr6gr7 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009699_12
The CRISPR arrays of NC_009699_12 >merge|NC_009699|12|2376403-2376495|CRISPRCasFinder TTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAATTATTGCCTATATGATAGACGAAGATTATAGATTCTTATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAA >NC_009699|12|12|2376403-2376495|CRISPRCasFinder TTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAA TTATTGCCTATATGATAGACGAAGATTATAGATTCTTAT TTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAA
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cas6,cmr1gr7,cas10,cmr3gr5 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009699_13
The CRISPR arrays of NC_009699_13 >merge|NC_009699|13|2382632-2382729|CRISPRCasFinder CAAATTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAACTAATTATCATTATAAAAACCCTCATCCATATGCAAATTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAAC >NC_009699|13|13|2382632-2382729|CRISPRCasFinder CAAATTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAAC TAATTATCATTATAAAAACCCTCATCCATATG CAAATTTAAATACATCTTATGTTAATGTTCAAC
>NC_009699.1|WP_012100163.1|2382198_2382420_-|hypothetical-protein MNQGQEKFLGFILERVEEDKVEEAKALLADNFKKQAEGNFTTQFIPKMAMLLKPDKIEEVQTVMKQFAENFSH >NC_009699.1|WP_012100162.1|2381709_2382075_-|glyoxalase/bleomycin-resistance/dioxygenase-family-protein MNFCWITLNVSNMEESLNFYHKIIGLKISERFNVGEDIEIAMLGETDGTKVELIYNKKQSVLSRSEGLSIGFEVKLLDEAMELLKNKNIPIKRGPISPLPSSRFFFIDDPNGIEIQIVQHN >NC_009699.1|WP_012100161.1|2379144_2380638_+|PLP-dependent-aminotransferase-family-protein MNIKIDKNSIITITQQLVHYFSDRIMSGFIKAGQKLPSIRSLAKELGISPMTIIKAYNNLKQNGLVTTIQGKGTYVNERNSTVKSNNITEKDSFQWQMSVPDYLSRSQFRYNPNLSYSNDYYNLSVASLNHKLLPTKTILKDSLGLIQNDIKLLSEYPPAQGDYEFRNIMSQYLRSKEIATSPENILVTSGSQQGISLIASTFIGPGDIVVMETPTYPGAIDLFKCRGAVILTVPVDSEGMRTDILMNLCDKHSPKLIYTIPNFHNPTGYSMSSKRKAELLDIAIYNDILIVEDDPWNEISYKREKIKTIKSMDTDGHVVYIKSLSKILGPSYRLAVIISESSILSRLIAAKANHDLGTSVLIQKTIINFIQSNKITYYIESLNKQLVKRRDKVISLLKSHSPSGMKWAIPEGGINIWVTLPKNFNVEKLLSYSITTKNISFLPGTICYPNEVEFNNLRICFTYLDEEFIEDTIIELCNLIKLLYTTKNITDYRPII >NC_009699.1|WP_012100160.1|2377899_2378820_-|PhzF-family-phenazine-biosynthesis-protein MRKFEYTLVDVFTNQVFGGNQLAVFKDAEKLSSEEMQSIARELNFSETTFVTDIGPNHKKLRIFTPKTELPMAGHPTIGTAFVLADEGAVETREGINKLIFEEGVGEIAVSIHVEGGRIRSIEMEQPMPVFGQVFGDIRTAAELLSLDIDDIDTTSPIQTVSTGVPFLYIPLKSLDVISKIKLRLDTWEKFFSASEDTKHIFAFTRETLHAGSTIHSRMFAPAMGIAEDPATGGASGPLGAYLVEHGLVAHGYDGKYMIINEQGIEMGRPSFINITVSKTYNNFSEIKIGGTCVKFGAGLIELPTL >NC_009699.1|WP_004451526.1|2376760_2377609_-|PhzF-family-phenazine-biosynthesis-protein MEYFHVDVFSNEILYGNGLTVVFCNEELEDNLMLKLTQEFKQFETIFVRRIDNSIFNARIFTVDEELDFAGHPILGAAATIHSNIFRNEEDIAITFQLNQKTIIVNSKKIEEYYEVQMNQGKAEFLCEVSKEKRNKYVHALNLSEENLSEEFPMEVVSTGLPYLLVPLTSGIENAKIISSKFEEMLKEVGAKFAYIFDVNYIEGRTWDNQGNVEDVATGSAAGPLGAYLYKHNIFNVGHEIIINQGRFVGRPSKIKVSMSISEKEILVSGEVAILAKGTILL >NC_009699.1|WP_041926442.1|2374408_2376064_-|ATPase-AAA MKKRFNVTGTCIPEKHYMVDISKKLDSILKLIDNEEYFIINRPRQYGKTTTLYMLEKRLNKMEEYLPIKISFEAIDTEGYSEAKKFLSSIMMQIINYFRFSTKKEIYKFVKRHENKVNTMNEFNRFITDLIEFTEKKVVLIIDEVDKSSNNQLFLDFLGMLRSKYLLRNEGKDYTFHSVILARVHDVKQASKIYDFDMIAYSCEEMSRRFLTKDLKIRSDEEHKYNSPWNIASDFDVDMSFSRSEIKTMLDYYVKNKKVALDKEYFAEKLYFYISGYPFLVSKLCKIIDEKTMDENKLEWKKEYLEIAVKELLKDSNTNFDSLIKNIENNEGLSRLVDNLLIKGVRINFNIHNPDINLGCLYGIFKDDKGNLKINNRIYEQLIYDYRISKIQTSSNFYNYNSKENFIDTYGDLNIRKVLLKFQEFMQHEYSKKRKGFLEEDGRLVFLAFLSPIINGSGFAFKEVKGGEEKRFDIVITYNKKMYILELKIWRGEEYHKKGLIQLAEYLEQYKLDKGYLLIFDLRKSTNLIVEVEENYIGIENNSKKIIQVYC >NC_009699.1|WP_012100157.1|2373004_2373694_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MEFWELIVTAMLKKDIYFEDCGYIIGKNINKSMLWDKDLKEVHPKKQYKNYVFNSFYPIERDKFYKKDRLYIFNIRGLSKEFIDKIETCLCNLESNDFNVISTSKKEIKQRYIKELYTQTPLIITVDDKPWLQNDGDLDLFKQRLEDNLEKKYKSFFNEDIDVKGKFIKSIEFKNRKPMHYNYKNGKKLLANKVSIQIEDNEEAQKVAFLARAIGLGEKNPSIGAGFCK >NC_009699.1|WP_012100156.1|2371777_2372959_-|type-III-B-CRISPR-module-RAMP-protein-Cmr1 MERVKVTLGVVTDMFSEGVNSNKEAEFRITELKALLRSTFREFFYYTSLDDLKEKEELLFGSTNRKSPVIIKFGRNNKIRFKDKKKLVLHKNMFKEAIPSGTTINIIFQSRYEKYLKTYVYTLKLASIMGALGKRSRKGMGAFKIIKIDDNEIIDINKSVEDLLCGYEEQFKINEKIYLIKTRKLLKEKQYKDNCTKYKIECDANMPKNVNYVKNIYKIYLGNLTEEKSRNKIDCTLRNFSWLNHYRLSDLNKIFSNETIKKIEKETGKRIDNEISLENLFNKEILGNYNYKYKEKEVTKKNILTRFACPVYVTIYQKSRGELIENYLIIKELNYDYVYKKILDKKVSNKKVTEQKKEEIRTDIKSELKEMKPIDKYYVEEFVKKIIECCEVK >NC_009699.1|WP_012100155.1|2370029_2371775_-|type-III-B-CRISPR-associated-protein-Cas10/Cmr2 MSYLLGVTVGPIQTNIQKSRKLRELYNSSKIVSDMMKKVIEYLKIRDETLKIIYPSIKDVNDTKTDITNYLICEINNIDDLKDMRERVFDELKISVLEEIYFMFWAVEPLEEYSKTYKKLTKKLRSIKNTYEFKNYEKDVRIKKKCSLCGERIREDASELCEVCNRKRNYDQTSNWKNNNKGEKYKSVYDISIDAWKEKYNEDLLSLNKNLEDLFNNTSRYYSLDTVSNIIKCLKIDPKKVRKEKEIDEDLENPKMEALELIAELKNIRFELESIYLRGEKPVSKPHYKYCFIQIDVDDLGKWISGVYNYEEENLKENQIQISKALCSFAYKLKEEFKNSKTKVIYAGGDDFLAVLPVECLLNTLKIIEEIFKSTVQNNIDNSLNYSQKISYSASVTIANCKDEMSLALRKNREALEKVKNRYYSKNGICINYIINTSKIINMFLLKDYFNEYVDNLRYFKKVEKYMSFTYIDAIENEFSKMKFEDLETDDFLNIKDMLLLEFERHLNLNKNKVPKDSEEGNENFLEYFKIHTRLFENIINDNEIDKKIDFINIINCFRIYKKLTDFQFKEEAKWDEVSKN >NC_009699.1|WP_012100154.1|2368945_2370049_-|CRISPR-associated-protein-Cmr3 MKFLKIKPYDNTFFRLGNNFEFKISNVIQTKNVAYPSTFFGAIFTAILANNDEFRESFLNIPGNTDHLEILNIKQIYLYAEKQGMIYIKAPKDIFVNNNEVKFGNFKEIKDGESSIKYDYYLEEPDGNELERADNYFVSIKEFYDKYRYKVLDNIDLKQEDEIFAKNIKTGIALDKSTGIVKESLLYTIEQTEFKNITEDYYSNDWSFVVEYAIDNDFLKKQGYPKVKNLDKGELKLGGETKVCTYEIIENSDINEFKSKTSQGFLKPGEKLKVILTSDSYFTKSFAELFNDEMKILALVNDKPIYIGGFDVAKNEEKAMYKGYSAGTVLLLQNESGKDINLQKYLDMKLRNKLKNGFNEYICVKGE >NC_009699.1|WP_012100164.1|2383087_2383534_+|hypothetical-protein MNKFNTDKLSVEFRNGVTSTEPTLGRRYTLTHSDITAELFLTIGSAYAYDKINATRDEVLGEWIGKQKNYLFHVYLHIDGNNPIVTGVRNHIFRLELPLALKAIRYVDRKFFSAHSKLDNSPIIVHFMSSYPSFNRTEKWGTFSDYKT >NC_009699.1|WP_079992184.1|2383765_2384812_-|alpha/beta-hydrolase MEVNEVKKVIKIVSVILVILVISGFFIIKNLTETKDGKLNMYVAANLQLYKILNLKSINSKSIEEIRGNLNKQSTKWSNKPILFFNIKNLDIKMNNEKIPVRIYTPENGSNFPIIIYSHGGFWIGGNVDTSDRVCRKLSQNTKAIVISVNYRLAPENPFPAGLNDVYNVLQWTYKNAKSINGDEKHIAVVGDSAGGNLSAAVSSMSRDKNGPPITCQVLIYPSTNIFELNSKSWSYFSNSVNVSREDMEKYISIYAPKKEDRKNPYASPLLSKDFSKLPDTLVVTAEIDPLRDEGEAYANKLKESGVKVEVARYKGITHGFITMDKITNKADEALNQISLYIQKEFQK >NC_009699.1|WP_012100166.1|2385227_2386127_+|hypothetical-protein MSNKRNLQSLRSFYICILIFNMVSNSIFHLNNNGFNIKLFKNFTIRSVILLDLNILLFLIIVIAFEKKINIDEEANTQLNTRIRPLYLVNIFFIAYILVCIFLLKDIDVILSSFIMEIIYIGIIILSKKIITLELTNRQLQWQKACGYIDEDCEESSFLWRFKLWWSPHVNVPFKNRWKGSSRLLYDLALVYGIIISKGNLFSLILLILLLPDVISWLEGLLGLQTSLTGICTGITEHHSKNSHVLYHKVYVTDYKNKREITFYVDGPLFIHENSHMTVVHGTFSKRVLYVEGLNLDIR >NC_009699.1|WP_012100167.1|2386466_2387789_+|APC-family-permease MLEKKYGLWTTVSMVIGIVIGSGVFFKADNILMASGGNVKTALLAWLVGAISMIFGALVFAECANRFERSNGIVDYAEGMLSEKFAYLIGWFNGIIYYPAIAAVLAWAAGNYTAILFNKDGNFVWIMAAIYMIGIYILNYISPILSGKFQIASTAIKLVPLMIIAIFGIFQGVNNGILIENFSKVSIISDSGSGFAAAVLGAAFAYEGWIIATTINGEIKDAKNTLPKALVFGSLVIVIIYILYFLGIVGMIPTETILKQGDNTVNVAARTVFGNFGASILTIFIIVSCLGTLNGLILGGSRSFYSLAIRGQGIKPDAFSKLNSKTNIPTNSTIANFILICIYLVVWYMNFKGLFPNKMFVDISELPIALIYGIYIIIYIAYMMKMKDLSFIKRFVIPSLALMGALIVVYGGLSKPSVIIDLGISVFVFLSGLLFYNKKK >NC_009699.1|WP_012100169.1|2387856_2388591_-|protein-kinase-family-protein MVIKFLKRDTKYLPEQKIHEYTVLKVLGEGRFGICYLVQSNNKQYILKQLKTKMLKKVGSKVIYEQEILKNINHNCIPKFVKTLQFEKIFGYVLKYKEGKTFEEIICEDEYVFKREEIYDICIQIIEILKYLHKNGIVHRDIRIPNTIYYKKKVNLVDFGLARWINNKRYTENVDFSYLGDFLLHLYYTSFQCKTFKGKPWYEELDLFSEEMNFLKRLLGIEKKYKNIEEVERDFLLLKSNYNK >NC_009699.1|WP_012100170.1|2389093_2389867_-|2-hydroxyglutaryl-CoA-dehydratase MYTMGLDIGSTTSKGVIMKDGKEIVASVLVPVGTGTSGPLKLIKELKEKSNLTEKDIEKTVVTGYGRIQYKDADKQISELSCHAKGVAFLIPGARTIIDIGGQDAKAMKLNDKGKLINFIMNDKCAAGTGRFLDVMAGVLETDVSKLGEISEKSTKEVSISSTCTVFAESEVISHLSANAKKEDIIAGIHTSVVRRVSTLAMRVGIEDQVVMVGGVARNKGIVKAMEKELGHDIKVPELAQLTGALGAAIYAFEETK >NC_009699.1|WP_012100171.1|2389960_2391526_-|membrane-protein MSENSKSKVGFLTAFQVAAVWFGAHVGGGFATGNQTMNFFVKHGWHSIWLPAVIIIIIGLTYKESLILAKNYGTYDYKSWSKKMYEPYDKVFSFIFEIGYLMIVLLGTGGSIAGSASLMETYGVNYLVGVLITGGIFYILTIYGSELIRKASTIITVLILIFLTIIVIVGIVNNSGNLSHLVSTKYSPSSFGTVLYSGLRYAGYQAFVVAIVLSASDTLKSDKAINKSILLGVILNGAMITLSCIMLLAWMPGAQKETIPILYICKRLNDGFLLFSYSVVLFLAFVSTGIGCVFGAVARFEHVFKKPENIKKRRGLISLVCMILSMAISLFGLTKIVVIGYGYVGIIGIFVVVIPCIVVGRIKNNKFKKEQQSILIENKDDTSSKEDNDNVLIGDQDDMLEENKDSILQDQDDISKEDEENMPVEEQDDASKENKESVSVEDQVDVLKGEQDSVPEGEDDTLKEDGENAPVEGQDDASKGNKKSVLVEGQDDMPKEDKESASIEEQKSTSTQEDGNASKEE >NC_009699.1|WP_004451547.1|2391825_2392875_-|electron-transfer-flavoprotein-subunit-alpha/FixB-family-protein MDIKKDLSSYKNVWVIAEQRQGKITPVVIELLGEGRKIANDIGVELCAVLLGYNVDNLADELIKFGADKVYYANDPLLEKYTTDGYAKVIVDAVNDIKPEIVLIGATHIGRDLAPRIASNLDTGLTADCTKLEVDPEDKKLKQTRPAFGGNIMATIICPDNRPQMSTVRPGVMDKAVKDESRKGQILKLSADLIKDDIRTEVIEIVKSKKELVSLTDANFIVSGGLGLGNPDGFKLLKQLADRLGGVVGSSRAAVDAGWIENSHQVGQTGTTVKPTVYIACGISGAIQHLAGMQESDIIIAINKNESAPIFEVADYGIVGDLYDVVPKLLELLDDDDRINRLFEESKIV >NC_009699.1|WP_012100172.1|2392893_2393679_-|electron-transfer-flavoprotein-subunit-beta/FixA-family-protein MRIIVCVKQVPDTTEVKIDPKTGTLIREGVPSILNPDDANALEEALKMKDKDENVTVSVVSMGPPQADVMLRECLAMGADEAYLVSDRAFAGSDTWATSKVIASAIRKIGNYDIIFAGRQAIDGDTAQVGPQISEKLGIPQVTYVQDFRMEDDKITVQRQLEDGYEIIRVKKPALLTAVSSLNEPRYMAVDKIFDAYKKEIKVLTIDDLDIEKEGVGLKASPTKVFRSFTPAPKGKGVMLEGSTEEMVEKLVVSLKQKHII >NC_009699.1|WP_012100173.1|2393717_2394851_-|acyl-CoA-dehydrogenase MLFKKEHELLRKSVRDFVDRELKDIPEEVDTEGKLPKELLQKLAKYKFISPVIPKEYGGAGADYVSYCIIMEEISKRCASTGTFITAGASLVALPLLNFGTDKQKEKYLKPLAKGEYIGSFGLTEPGAGSDAGAGETTAVLEGDYYILNGRKTFITNAPICDFAIVTAMTEKGKGSRGISAFIVESKWDGFSTGAHENKMGIRGTETADLIFENVKVPKENLIGKEGKGFKIALNTLDVGRIGVAAQALGIAQGALDEAIKYVKERVQFGRPLAKFQNTQFTIADMETKVQAARWLVYDAAEKKDNGINPGVESAMAKYYAAEIANEVAYKALQLHGGYGFMKDYPIERMYRDARITSIYEGTSQVQQMVIAAKALK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NC_009699_14 | 2476029-2476274 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NC_009699_14
|
5 spacers
spacers of NC_009699_14
>14.1|2476047|30|NC_009699|CRT TCTGCATCTTCTTTCACATTCTCTTCTGCA >14.2|2476095|30|NC_009699|CRT TCTACATCTTCTTTCACATTCTCTTCTGCA >14.3|2476143|18|NC_009699|CRT ATCGCGATCTCTTTCGCA >14.4|2476179|18|NC_009699|CRT TCTACATCTTCTTCTGCA >14.5|2476215|42|NC_009699|CRT TTCGCACTCTCTTTCACACTCTCTTCTGCATCTTCTTCTGCA |
casR |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_009699_14
The CRISPR arrays of NC_009699_14 >merge|NC_009699|14|2476029-2476274|CRT TCTTCTTTCACATTCTCTTCTGCATCTTCTTTCACATTCTCTTCTGCATCTTCTTTCGCATTCTCTTCTACATCTTCTTTCACATTCTCTTCTGCATCTTCTTTCGCACTCTCTATCGCGATCTCTTTCGCACTCTCTTTCGCACTCTCTTCTACATCTTCTTCTGCATCTTCTTTCGCACTCTCTTTCGCACTCTCTTTCACACTCTCTTCTGCATCTTCTTCTGCATCTTCTTTCGCACTCTCT >NC_009699|14|5|2476029-2476274|CRT TCTTCTTTCACATTCTCT TCTGCATCTTCTTTCACATTCTCTTCTGCA TCTTCTTTCGCATTCTCT TCTACATCTTCTTTCACATTCTCTTCTGCA TCTTCTTTCGCACTCTCT ATCGCGATCTCTTTCGCA CTCTCTTTCGCACTCTCT TCTACATCTTCTTCTGCA TCTTCTTTCGCACTCTCT TTCGCACTCTCTTTCACACTCTCTTCTGCATCTTCTTCTGCA TCTTCTTTCGCACTCTCT
>NC_009699.1|WP_012100240.1|2474959_2475541_-|flavodoxin-family-protein MKYCILMGSPRKNGNTFKLLKPFIEELELQQVQYDLIWLYDKHIEPCTACRNCQKDWTIFGCRYSDDVQEIFDKVYDSDVIILATPIYSWYCTPPMKSLLDRLVYGMNKYYGDEKGPSLWSGKKLAIITTCGYRPENGADLFEEGIKRYCKHSKLKYIGMLAERDFGYKSVFITDDKIEHSRSFARKLISDKV >NC_009699.1|WP_101502759.1|2474838_2474946_-|hypothetical-protein MIYNFLVTCNNYIITLDRIIQYEYAVFLFTNLNSC >NC_009699.1|WP_012100239.1|2473760_2474762_-|linear-amide-C-N-hydrolase MYHSRWKGSHYEAGLHYGNILHKNGVNPMSSIPISDERKEFSVKCLPIYEKFYPEIVEEIKGMANGLKIGYMDIASFIFTMYCFVFDNKCSCLAISNKGKTLFARNSDFVVSIEKLCDSAYYKLNNVYSFVGNTTAWTEMEDGINEHKLAVGLTFIYPIKIKPGFNAGMLVRYILEKCKTTDEAILALKKLPIASPQTITLADKSGNIAVVECNCDKVVVLNPQQGKNYVFTTNHFISEEMQEYQFNGVDDVHSHERYETLVNAFGNSKDYSLDFIKNLLSGKMGFMCQYDRKQGLDTVWSSIYDLTEGTIFRVEGNPSRKVFKKDKRLIFAK >NC_009699.1|WP_012100238.1|2473257_2473596_+|hypothetical-protein MCNCEKRERQTHVHEFLGSTRLAEIQTEPHNHRFAGVSGQAIRSGNSHVHRITTNTDFFDHFHMINVLSGPAIPVGNGRHVHFVSGVTSVNDGHRHEFIFATLIEAPIFEED >NC_009699.1|WP_012100237.1|2472792_2473062_-|DUF1599-domain-containing-protein MMDKANKHKIICEELNKIYKVKNHDYGDSFGETYKKLGIISAVTRITDKVNRLQSLCIKDALVDESIKDTLIDLANYSIMTLIELEEEE >NC_009699.1|WP_012100236.1|2472223_2472472_-|hypothetical-protein MAEQIKTNSTPIRIQRNANDVAMELLDIYLKDQYETDKPMQADYLRNLYLKFYATAEMAERIHFKYLKEYLPEGLKEMAEKF >NC_009699.1|WP_012100234.1|2470336_2471734_+|peptide-MFS-transporter MSQEKQKHPIGLSLVNISIALQSYAGYAVSSVLILFFTADINRNGLGLSVPKAASIIGLYQGVNYMGSLVGGYITDKWLGIQKSLALGSFLTACGYMVLFFAKPNIGSIWLGLIVLIIAGAFFKGQISTLVGSLYDKNELSKKDAAYSIFYMFINIGSFFGPIIAGLISDKWFAKVAADGEIAAYGYKYIFLMCAIVMIIVCALILILSPKWLGDVGKYPASKTEAKKASLKSEEKVTNKPLTHTEKNRIKAMLIMFLFVIIFWSAWYQTATSFSLLADKLVDRKLGGFTMPVPWLTSVNAIFCVGFSPILANIWVKLGNSKKGDLSVPTKMGLGLILAGASFITLILGISTLGGVTDGSRQMNILFIIVAYFLLTLGELCLSPIGMAMFNKLAPAKFGSLAMGAWYLSFFFSNLISGKLAGFTDTMGYTEIFGFIAGVVIIFGLILILLRKGLLRLMSLDEFNK >NC_009699.1|WP_012100233.1|2468512_2470306_+|M24-family-metallopeptidase MKVSERLIKLRNLMTEKNIDMYIVPTADFHQSEYVGEHFKARKYITGFSGSAGTAVITKGNAGLWTDGRYFLQAGNQLKGTTVELFKMGEPGVPTIEEYIMNTLSDKGTLGFDGRVVSMVDGQTYEKILSSKNANINYDCDLINDIWEDRPSLSEEPAFELDIKYTGESTASKLKRVRKAMTDAGTNVHVITSLDDIAWILNIRGNDIEFFPLVLSYLIITMDEAHLFINEDKLSDEIKSNLKKNGVSFIHPYNEIYKAVKKFNTSDIVLVDPARMNYALYNNIPKDVKKVENRNPSVLFKAMKNPIEIENIKKAQIKDGVAHTKFMYWLKHNIGKETITEISASNKLDEFRAEQGGFIRPSFEPISSFAEHAAIVHYAPTPETDVELKEGSLFLTDTGAGFYEGSTDITRTYALGEVPQIMKDHFTLTVNSNMHLAHARFLYGCNGMNLDILARAPFWNRGLNFNHGTGHGVGYLMNIHEAPTGFRWQYRANETHPFEEGMVITDEPGIYIAGSYGVRIENELLVCKGEQNEYGQFMYFEPISYVPIDLDAINPDLMTAEEKAWLDEYHESVYNKISPYLTEEEKNWLKEYTRKIS >NC_009699.1|WP_004451638.1|2467738_2468335_-|DUF3862-domain-containing-protein MLEKKEEPFYKKIWFWIIAIVIVCGVASYGDSKKINITDTKNSAKTETKKDDTRKVTYEKFCKIKIGSTYEEVKSILGEYKESKESEINGMKVVIYSWYNDDNSNMEVIVKNNKVIGKAQAGLSMGKADVNLIKYAKITTGMDYSKVEEILGDGKLMSISKTNGSTKSIYLWANPNGTNMNVTFQNGKVTAKNRLGLN >NC_009699.1|WP_012100232.1|2467168_2467597_-|MarR-family-transcriptional-regulator MMKLENRIRIINEEWTDIYYLLHYIDKENLTHQAIRLLQYIDKNKETTIGDLAKHISTSSNTASEHIKRLIKKGLVTKQRSEVDERKVIVKITEEGKHTLHRHINLDEAKLKKVLGSLTDSELEVIQKGFLILSEGAKKCLP >NC_009699.1|WP_134865116.1|2476529_2476628_-|hypothetical-protein MKLTQKQKVFDDYYIETGNVKKQLLKLDIVKK >NC_009699.1|WP_003400697.1|2476685_2476889_-|hypothetical-protein MGVENPTCHVKILNNETKESVYHWRKEINIVEIEAIKISKKVYCNNQYYDIKTLVFNYDNLTLEIII >NC_009699.1|WP_012100242.1|2477700_2478033_+|hypothetical-protein MSYCEEMQTHVHEFLGSTRLAEIQTEPHNHRFAGVSGQAIRRGNSHVHRITTNTDFFDHFHMINVITGPAIPVGDGRHVHFVSGVTSVNDGHRHEFIFATLIDSPIFQEA >NC_009699.1|WP_012100243.1|2478371_2479355_+|sulfide/dihydroorotate-dehydrogenase-like-FAD/NAD-binding-protein MEYEIKDCIDAGSEYCPCHLAETGDCILCSQLSGKKFCDCINWKGVCIYQEFIWNRKKAKEERETYLGKIIKKDNIEDKTIVLTISLSHKLCQQLVYPGSFVFLRNKNDSGFYDAPISIMDVDTEENFIKVAIEIRGVKTKTIASLNKNDDIWVRGPFWNGVLGLKNVYMTKDGTSLLISRGIGQAPLVPVMKKLYSNGNKIIAIIDNSGYENILIKNYLELYNAEVIELNTLKAGELTEELKNKLKEILDKEDINIIHCSTQDIIIYKLVEFLDGKVPISSSNNAKMCCGEGVCGTCTVRYKGHIVKRLCKVQTEPKYVFRERRLI >NC_009699.1|WP_003392410.1|2479449_2479617_-|aspartyl-phosphate-phosphatase-Spo0E-family-protein MSKEQLLLEKIEEARTLMNQLISEKSQLIDEELVLLSQKLDDLLNEYNKFLRQNH >NC_009699.1|WP_012100244.1|2479917_2480325_-|hypothetical-protein MQIITGAVVNILGVVIIYLSTVVVQYFKQKRQASINQMGNEQYNMHYNIAKSIFYAIEQEYRLVSKSGEQKAEKFNKMLMEKIPSLKQEDLDHFREAIVGEINTQIKQSKLLEPADSITNEKKQLLDSKENKIEN >NC_009699.1|WP_012100245.1|2480405_2480999_-|hypothetical-protein MKSIFKKLMPIIFIAILSISLTGCSSKPDETVKGFFGALKQQDIKKASTFINANSFYKELKVDEFDSKEQEKIVKAVLSKFDYSLGDVEKNGNTATAKVSVTSIDLGKITIKTIDKVLPNLIDEAFSKGKIDEKKQQAVIIQHMLNSINDPNAPKIKTNINVKLVKGDKGWLIEPDEELANALSGNLYSVAKKFQSK >NC_009699.1|WP_012100246.1|2481171_2481621_-|peptide-methionine-(R)-S-oxide-reductase-MsrB MNKNYSKKSKEELKKILTPEEYYVTQENGTEAPYKNEYWDLNEEGIYVDITNGEPLFTSKDKFNSSCGWAAFSKPIDRKIIKESIDKSHGMTRTEVRSKNADSHLGHVFCDGPEKLGGLRYCINSASLKFIPKNELEEEGYGEYLKLFK >NC_009699.1|WP_012100247.1|2481852_2482449_-|superoxide-dismutase MAHTLPNLNYDYNALEPHYDEQTLKIHHDIHHKVYVDGLNKAEQKLQEARESGDFALIKHWEKEIAFHGSGHILHTLFWENMVPNGNLNPEGSAIERIKQDFGDYEKFKKQFTEAAIAVEGSGWTILAWNPMFQKLVILQAEKHQNLTQWGVVPLLILDLWEHAYYLKYQNRRAEFINAWWNIVNWDIVNTRYDNAIK >NC_009699.1|WP_012100248.1|2482569_2484327_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MKEKNWLITVLSFAKECKMKMIISVLCAIISVIGGLLPYVGVYQIIILFFNGRQTVKDILFWSVICLAGYVVKLVFYAISTTLAHFSAYTILENMRLKIADRLMKAPLGTVLNQPIGKIKNIIVDRVETIELPLAHMIPEGISNLLLPIGVFIYIIMIDWRMALASMITIPIAIIAYGFMMKTFSKQYKNYMESSNYVNSVIVEYVEGIEVIKAFNRSSSSYEKFEKAVEDFKVYTLNWFKSTWKLMNFGGAVLPSTLLGTMPIGMYLYINGSLTPADLTMCLILSLGIVAPLTSFTVFINDAKAIEFAVKDAYEFLNLKELENPLEPVNICRYDIELKDVFFSYNTYEDDNLNRENNYVLNNINLKFPEGKFTALVGPSGGGKSTVARLITRFWDVSKGEIKIGDTNIKKFPLSQLADTVSFVTQDNFLFNYSIMENIRLGNPGASDEEVINAAKKACCHEFIKNLDNGYDTNAGEAGGKLSGGEKQRISIAREMLKNAPIVILDEATASVDPENEHAIQKAISALVHGKTIIIIAHRLATIENADQILVVDGGCVVQRGAHKELINQKGVYKRFLDIRKTAEE |
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|---|---|---|---|---|---|---|---|
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1. spacer 14.1|2476047|30|NC_009699|CRT matches to position: 2476023-2476052, mismatch: 0, identity: 1.0
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| NC_009699_7 | 7.11|2359598|32|NC_009699|PILER-CR | 2359598-2359629 | 32 | NZ_KY853650 | Escherichia coli strain 347-43491A plasmid p977565, complete sequence | 10035-10066 | 8 | 0.75 |
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| NC_009699_14 | 14.2|2476095|30|NC_009699|CRT | 2476095-2476124 | 30 | NZ_KT601170 | Staphylococcus sciuri strain wo28-3 plasmid pwo28-3, complete sequence | 25244-25273 | 8 | 0.733 |
| NC_009699_14 | 14.2|2476095|30|NC_009699|CRT | 2476095-2476124 | 30 | NZ_KX982169 | Staphylococcus sciuri strain wo27-9 plasmid pWo27-9, complete sequence | 34158-34187 | 8 | 0.733 |
| NC_009699_14 | 14.2|2476095|30|NC_009699|CRT | 2476095-2476124 | 30 | NZ_KX982171 | Staphylococcus sciuri strain wo28-1 plasmid pWo28-1, complete sequence | 38466-38495 | 8 | 0.733 |
| NC_009699_7 | 7.4|2359597|34|NC_009699|CRT | 2359597-2359630 | 34 | NZ_CP050860 | Klebsiella pneumoniae strain SCH6109 plasmid pSCH6109-Vir, complete sequence | 223011-223044 | 9 | 0.735 |
| NC_009699_7 | 7.4|2359597|34|NC_009699|CRT | 2359597-2359630 | 34 | NZ_CP035776 | Klebsiella pneumoniae strain R46 plasmid pR46-270, complete sequence | 48806-48839 | 9 | 0.735 |
| NC_009699_7 | 7.4|2359597|34|NC_009699|CRT | 2359597-2359630 | 34 | NZ_CP041094 | Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain KPCTRSRTH01 plasmid unnamed2, complete sequence | 21221-21254 | 9 | 0.735 |
| NC_009699_7 | 7.4|2359597|34|NC_009699|CRT | 2359597-2359630 | 34 | NZ_CP024459 | Klebsiella pneumoniae strain QS17-0161 plasmid pMR0617aac, complete sequence | 204868-204901 | 9 | 0.735 |
| NC_009699_7 | 7.4|2359597|34|NC_009699|CRT | 2359597-2359630 | 34 | MN824002 | Klebsiella pneumoniae strain N201205880 plasmid p205880-2FIIK, complete sequence | 137673-137706 | 9 | 0.735 |
| NC_009699_7 | 7.4|2359597|34|NC_009699|CRT | 2359597-2359630 | 34 | MK649826 | Klebsiella pneumoniae strain 130411-38618 plasmid p130411-38618_1, complete sequence | 22415-22448 | 9 | 0.735 |
| NC_009699_7 | 7.4|2359597|34|NC_009699|CRT | 2359597-2359630 | 34 | MK649827 | Klebsiella pneumoniae strain 1675474 plasmid p1675474_1, complete sequence | 116257-116290 | 9 | 0.735 |
| NC_009699_7 | 7.4|2359597|34|NC_009699|CRT | 2359597-2359630 | 34 | MK649828 | Klebsiella pneumoniae strain 1675479 plasmid p1675479_1, complete sequence | 21813-21846 | 9 | 0.735 |
| NC_009699_7 | 7.4|2359597|34|NC_009699|CRT | 2359597-2359630 | 34 | MK649829 | Klebsiella pneumoniae strain 16114547 plasmid p16114547_1, complete sequence | 21813-21846 | 9 | 0.735 |
| NC_009699_7 | 7.4|2359597|34|NC_009699|CRT | 2359597-2359630 | 34 | NZ_CP047635 | Klebsiella pneumoniae strain K2606 plasmid unnamed2, complete sequence | 22415-22448 | 9 | 0.735 |
| NC_009699_7 | 7.9|2359467|34|NC_009699|PILER-CR | 2359467-2359500 | 34 | AP013386 | Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G15, isolate: uvMED-CGR-C23-MedDCM-OCT-S37-C51 | 34426-34459 | 9 | 0.735 |
| NC_009699_7 | 7.9|2359467|34|NC_009699|PILER-CR | 2359467-2359500 | 34 | GU943014 | Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C1161 genomic sequence | 18218-18251 | 9 | 0.735 |
| NC_009699_7 | 7.9|2359467|34|NC_009699|PILER-CR | 2359467-2359500 | 34 | GU943013 | Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C1035 genomic sequence | 11891-11924 | 9 | 0.735 |
| NC_009699_7 | 7.9|2359467|34|NC_009699|PILER-CR | 2359467-2359500 | 34 | GU943017 | Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C1227 genomic sequence | 7844-7877 | 9 | 0.735 |
| NC_009699_7 | 7.9|2359467|34|NC_009699|PILER-CR | 2359467-2359500 | 34 | GU943022 | Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C890 genomic sequence | 7790-7823 | 9 | 0.735 |
| NC_009699_7 | 7.9|2359467|34|NC_009699|PILER-CR | 2359467-2359500 | 34 | CP013001 | Bacillus thuringiensis strain XL6 plasmid, complete sequence | 131053-131086 | 9 | 0.735 |
| NC_009699_14 | 14.1|2476047|30|NC_009699|CRT | 2476047-2476076 | 30 | NZ_KT601170 | Staphylococcus sciuri strain wo28-3 plasmid pwo28-3, complete sequence | 25244-25273 | 9 | 0.7 |
| NC_009699_14 | 14.1|2476047|30|NC_009699|CRT | 2476047-2476076 | 30 | NZ_KX982169 | Staphylococcus sciuri strain wo27-9 plasmid pWo27-9, complete sequence | 34158-34187 | 9 | 0.7 |
| NC_009699_14 | 14.1|2476047|30|NC_009699|CRT | 2476047-2476076 | 30 | NZ_KX982171 | Staphylococcus sciuri strain wo28-1 plasmid pWo28-1, complete sequence | 38466-38495 | 9 | 0.7 |
| NC_009699_3 | 3.2|1903405|40|NC_009699|CRISPRCasFinder | 1903405-1903444 | 40 | NC_018689 | Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC429, complete sequence | 417214-417253 | 10 | 0.75 |
| NC_009699_5 | 5.1|2352047|35|NC_009699|CRISPRCasFinder | 2352047-2352081 | 35 | NC_008259 | Enterococcus faecium plasmid pCIZ2, complete sequence | 1636-1670 | 10 | 0.714 |
| NC_009699_7 | 7.2|2359466|36|NC_009699|CRT | 2359466-2359501 | 36 | AP013386 | Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G15, isolate: uvMED-CGR-C23-MedDCM-OCT-S37-C51 | 34426-34461 | 10 | 0.722 |
| NC_009699_7 | 7.2|2359466|36|NC_009699|CRT | 2359466-2359501 | 36 | GU943014 | Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C1161 genomic sequence | 18218-18253 | 10 | 0.722 |
| NC_009699_7 | 7.2|2359466|36|NC_009699|CRT | 2359466-2359501 | 36 | GU943013 | Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C1035 genomic sequence | 11891-11926 | 10 | 0.722 |
| NC_009699_7 | 7.2|2359466|36|NC_009699|CRT | 2359466-2359501 | 36 | GU943017 | Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C1227 genomic sequence | 7842-7877 | 10 | 0.722 |
| NC_009699_7 | 7.2|2359466|36|NC_009699|CRT | 2359466-2359501 | 36 | GU943022 | Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C890 genomic sequence | 7788-7823 | 10 | 0.722 |
| NC_009699_7 | 7.4|2359597|34|NC_009699|CRT | 2359597-2359630 | 34 | NZ_KY565557 | Escherichia coli strain Mcp0221 plasmid pMcp0221, complete sequence | 10287-10320 | 10 | 0.706 |
| NC_009699_7 | 7.4|2359597|34|NC_009699|CRT | 2359597-2359630 | 34 | CP043017 | Escherichia coli strain 388808_gen plasmid unnamed2, complete sequence | 11824-11857 | 10 | 0.706 |
| NC_009699_7 | 7.4|2359597|34|NC_009699|CRT | 2359597-2359630 | 34 | NZ_CP038334 | Escherichia coli O157:H7 strain N8B7-2 plasmid pN8B7-2 | 39352-39385 | 10 | 0.706 |
| NC_009699_7 | 7.4|2359597|34|NC_009699|CRT | 2359597-2359630 | 34 | CP019690 | Shigella sonnei strain 75/02 plasmid p75-02_2, complete sequence | 33637-33670 | 10 | 0.706 |
| NC_009699_7 | 7.4|2359597|34|NC_009699|CRT | 2359597-2359630 | 34 | NZ_KY853650 | Escherichia coli strain 347-43491A plasmid p977565, complete sequence | 10033-10066 | 10 | 0.706 |
| NC_009699_7 | 7.9|2359467|34|NC_009699|PILER-CR | 2359467-2359500 | 34 | KC821626 | Cellulophaga phage phi39:1, complete genome | 23600-23633 | 10 | 0.706 |
| NC_009699_7 | 7.9|2359467|34|NC_009699|PILER-CR | 2359467-2359500 | 34 | MG543995 | Staphylococcus phage UPMK_1, partial genome | 138793-138826 | 10 | 0.706 |
| NC_009699_13 | 13.1|2382665|32|NC_009699|CRISPRCasFinder | 2382665-2382696 | 32 | MF979562 | Pectobacterium phage DU_PP_III, complete genome | 7298-7329 | 10 | 0.688 |
1. spacer 6.1|2352594|36|NC_009699|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013848 (Clostridium botulinum strain Af650 plasmid pRSJ14_1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
acataatcagatgttagaagtacttcacgaattaag CRISPR spacer acataatcagatgttagaagtacttcaggaattaag Protospacer *************************** ********
2. spacer 6.4|2352596|36|NC_009699|PILER-CR matches to NZ_CP013848 (Clostridium botulinum strain Af650 plasmid pRSJ14_1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
acataatcagatgttagaagtacttcacgaattaag CRISPR spacer acataatcagatgttagaagtacttcaggaattaag Protospacer *************************** ********
3. spacer 13.1|2382665|32|NC_009699|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013709 (Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.969
taattatcattataaaaaccctcatccatatg CRISPR spacer taattatcattataaaaatcctcatccatatg Protospacer ******************.*************
4. spacer 13.1|2382665|32|NC_009699|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013682 (Clostridium botulinum strain 1169 plasmid pRSJ8_1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.969
taattatcattataaaaaccctcatccatatg CRISPR spacer taattatcattataaaaatcctcatccatatg Protospacer ******************.*************
5. spacer 13.1|2382665|32|NC_009699|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013295 (Clostridium botulinum strain CDC_54064 plasmid pNPD1_1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.969
taattatcattataaaaaccctcatccatatg CRISPR spacer taattatcattataaaaatcctcatccatatg Protospacer ******************.*************
6. spacer 13.1|2382665|32|NC_009699|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013844 (Clostridium botulinum strain A634 plasmid pRSJ19_2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.969
taattatcattataaaaaccctcatccatatg CRISPR spacer taattatcattataaaaatcctcatccatatg Protospacer ******************.*************
7. spacer 7.1|2359401|35|NC_009699|CRT matches to NZ_CP013709 (Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
atagatgaaatagaaatagttatagatttaattga CRISPR spacer atagatgaaattcaaatagttatagatttaattga Protospacer *********** **********************
8. spacer 7.1|2359401|35|NC_009699|CRT matches to NZ_CP013682 (Clostridium botulinum strain 1169 plasmid pRSJ8_1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
atagatgaaatagaaatagttatagatttaattga CRISPR spacer atagatgaaattcaaatagttatagatttaattga Protospacer *********** **********************
9. spacer 7.1|2359401|35|NC_009699|CRT matches to NZ_CP013295 (Clostridium botulinum strain CDC_54064 plasmid pNPD1_1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
atagatgaaatagaaatagttatagatttaattga CRISPR spacer atagatgaaattcaaatagttatagatttaattga Protospacer *********** **********************
10. spacer 7.1|2359401|35|NC_009699|CRT matches to NZ_CP013844 (Clostridium botulinum strain A634 plasmid pRSJ19_2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
atagatgaaatagaaatagttatagatttaattga CRISPR spacer atagatgaaattcaaatagttatagatttaattga Protospacer *********** **********************
11. spacer 7.5|2359401|37|NC_009699|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013709 (Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
atagatgaaatagaaatagttatagatttaattgaat CRISPR spacer atagatgaaattcaaatagttatagatttaattgaag Protospacer *********** ***********************
12. spacer 7.5|2359401|37|NC_009699|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013682 (Clostridium botulinum strain 1169 plasmid pRSJ8_1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
atagatgaaatagaaatagttatagatttaattgaat CRISPR spacer atagatgaaattcaaatagttatagatttaattgaag Protospacer *********** ***********************
13. spacer 7.5|2359401|37|NC_009699|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013295 (Clostridium botulinum strain CDC_54064 plasmid pNPD1_1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
atagatgaaatagaaatagttatagatttaattgaat CRISPR spacer atagatgaaattcaaatagttatagatttaattgaag Protospacer *********** ***********************
14. spacer 7.5|2359401|37|NC_009699|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013844 (Clostridium botulinum strain A634 plasmid pRSJ19_2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.919
atagatgaaatagaaatagttatagatttaattgaat CRISPR spacer atagatgaaattcaaatagttatagatttaattgaag Protospacer *********** ***********************
15. spacer 12.1|2376430|39|NC_009699|CRISPRCasFinder matches to NC_010379 (Clostridium botulinum B1 str. Okra plasmid pCLD, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
ttattgcctatatgatagacgaagattatagattcttat CRISPR spacer atattgcctatatgatagacgaagattatagattctttg Protospacer ************************************
16. spacer 12.1|2376430|39|NC_009699|CRISPRCasFinder matches to NC_010418 (Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree plasmid pCLK, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
ttattgcctatatgatagacgaagattatagattcttat CRISPR spacer atattgcctatatgatagacgaagattatagattctttg Protospacer ************************************
17. spacer 12.1|2376430|39|NC_009699|CRISPRCasFinder matches to NC_012654 (Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
ttattgcctatatgatagacgaagattatagattcttat CRISPR spacer atattgcctatatgatagacgaagattatagattctttg Protospacer ************************************
18. spacer 12.1|2376430|39|NC_009699|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP006909 (Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
ttattgcctatatgatagacgaagattatagattcttat CRISPR spacer atattgcctatatgatagacgaagattatagattctttg Protospacer ************************************
19. spacer 12.1|2376430|39|NC_009699|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP031095 (Clostridium botulinum strain CFSAN034200 plasmid p1_CDC51232, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
ttattgcctatatgatagacgaagattatagattcttat CRISPR spacer atattgcctatatgatagacgaagattatagattctttg Protospacer ************************************
20. spacer 9.4|2360581|36|NC_009699|CRT matches to NZ_CP013709 (Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
aggtgaagaaattggagatactttagaagcagtttg CRISPR spacer tagcgaagaaattggagatactttagaagcagcttg Protospacer .*.****************************.***
21. spacer 9.4|2360581|36|NC_009699|CRT matches to NZ_CP013682 (Clostridium botulinum strain 1169 plasmid pRSJ8_1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
aggtgaagaaattggagatactttagaagcagtttg CRISPR spacer tagcgaagaaattggagatactttagaagcagcttg Protospacer .*.****************************.***
22. spacer 9.4|2360581|36|NC_009699|CRT matches to NZ_CP013295 (Clostridium botulinum strain CDC_54064 plasmid pNPD1_1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
aggtgaagaaattggagatactttagaagcagtttg CRISPR spacer tagcgaagaaattggagatactttagaagcagcttg Protospacer .*.****************************.***
23. spacer 9.4|2360581|36|NC_009699|CRT matches to NZ_CP013844 (Clostridium botulinum strain A634 plasmid pRSJ19_2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
aggtgaagaaattggagatactttagaagcagtttg CRISPR spacer tagcgaagaaattggagatactttagaagcagcttg Protospacer .*.****************************.***
24. spacer 12.1|2376430|39|NC_009699|CRISPRCasFinder matches to NC_025146 (Clostridium botulinum plasmid pCB111 DNA, complete sequence, strain: 111) position: , mismatch: 4, identity: 0.897
ttattgcctatatgatagacgaagattatagattcttat CRISPR spacer atattgcttatatgatagacgaagattatagattctttg Protospacer ******.*****************************
25. spacer 14.1|2476047|30|NC_009699|CRT matches to NZ_CP010418 (Azotobacter chroococcum NCIMB 8003 plasmid pAcX50c, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
tctgcatcttctttcacattctctt-ctgca CRISPR spacer acggcatcttctttcatattctcttgctgc- Protospacer * *************.******** ****
26. spacer 14.2|2476095|30|NC_009699|CRT matches to NZ_CP010418 (Azotobacter chroococcum NCIMB 8003 plasmid pAcX50c, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
tctacatcttctttcacattctctt-ctgca CRISPR spacer acggcatcttctttcatattctcttgctgc- Protospacer * .************.******** ****
27. spacer 9.11|2360581|38|NC_009699|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013709 (Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.842
aggtgaagaaattggagatactttagaagcagtttgat CRISPR spacer tagcgaagaaattggagatactttagaagcagcttgtg Protospacer .*.****************************.***
28. spacer 9.11|2360581|38|NC_009699|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013682 (Clostridium botulinum strain 1169 plasmid pRSJ8_1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.842
aggtgaagaaattggagatactttagaagcagtttgat CRISPR spacer tagcgaagaaattggagatactttagaagcagcttgtg Protospacer .*.****************************.***
29. spacer 9.11|2360581|38|NC_009699|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013295 (Clostridium botulinum strain CDC_54064 plasmid pNPD1_1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.842
aggtgaagaaattggagatactttagaagcagtttgat CRISPR spacer tagcgaagaaattggagatactttagaagcagcttgtg Protospacer .*.****************************.***
30. spacer 9.11|2360581|38|NC_009699|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013844 (Clostridium botulinum strain A634 plasmid pRSJ19_2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.842
aggtgaagaaattggagatactttagaagcagtttgat CRISPR spacer tagcgaagaaattggagatactttagaagcagcttgtg Protospacer .*.****************************.***
31. spacer 5.2|2352112|35|NC_009699|CRISPRCasFinder matches to NZ_MK275623 (Clostridium perfringens strain JXJA17 plasmid p5, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
gagaatgtatttaagaatacaataaatgaatacaa CRISPR spacer atggaagaagttaataatacaataaataaatacaa Protospacer . *.* * * **** ************.*******
32. spacer 7.11|2359598|32|NC_009699|PILER-CR matches to NZ_CP050860 (Klebsiella pneumoniae strain SCH6109 plasmid pSCH6109-Vir, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagc CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaaca Protospacer *** **************** *** * *
33. spacer 7.11|2359598|32|NC_009699|PILER-CR matches to NZ_KY565557 (Escherichia coli strain Mcp0221 plasmid pMcp0221, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagc CRISPR spacer atgataaatatgaatgtgaatatgaatatgat Protospacer **.********* *********** *. *...
34. spacer 7.11|2359598|32|NC_009699|PILER-CR matches to CP043017 (Escherichia coli strain 388808_gen plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagc CRISPR spacer atgataaatatgaatgtgaatatgaatatgat Protospacer **.********* *********** *. *...
35. spacer 7.11|2359598|32|NC_009699|PILER-CR matches to NZ_CP035776 (Klebsiella pneumoniae strain R46 plasmid pR46-270, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagc CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaaca Protospacer *** **************** *** * *
36. spacer 7.11|2359598|32|NC_009699|PILER-CR matches to NZ_CP038334 (Escherichia coli O157:H7 strain N8B7-2 plasmid pN8B7-2) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagc CRISPR spacer atgataaatatgaatgtgaatatgaatatgat Protospacer **.********* *********** *. *...
37. spacer 7.11|2359598|32|NC_009699|PILER-CR matches to CP019690 (Shigella sonnei strain 75/02 plasmid p75-02_2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagc CRISPR spacer atgataaatatgaatgtgaatatgaatatgat Protospacer **.********* *********** *. *...
38. spacer 7.11|2359598|32|NC_009699|PILER-CR matches to NZ_CP041094 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain KPCTRSRTH01 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagc CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaaca Protospacer *** **************** *** * *
39. spacer 7.11|2359598|32|NC_009699|PILER-CR matches to NZ_CP024459 (Klebsiella pneumoniae strain QS17-0161 plasmid pMR0617aac, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagc CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaaca Protospacer *** **************** *** * *
40. spacer 7.11|2359598|32|NC_009699|PILER-CR matches to MN824002 (Klebsiella pneumoniae strain N201205880 plasmid p205880-2FIIK, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagc CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaaca Protospacer *** **************** *** * *
41. spacer 7.11|2359598|32|NC_009699|PILER-CR matches to MK649826 (Klebsiella pneumoniae strain 130411-38618 plasmid p130411-38618_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagc CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaaca Protospacer *** **************** *** * *
42. spacer 7.11|2359598|32|NC_009699|PILER-CR matches to MK649827 (Klebsiella pneumoniae strain 1675474 plasmid p1675474_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagc CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaaca Protospacer *** **************** *** * *
43. spacer 7.11|2359598|32|NC_009699|PILER-CR matches to MK649828 (Klebsiella pneumoniae strain 1675479 plasmid p1675479_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagc CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaaca Protospacer *** **************** *** * *
44. spacer 7.11|2359598|32|NC_009699|PILER-CR matches to MK649829 (Klebsiella pneumoniae strain 16114547 plasmid p16114547_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagc CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaaca Protospacer *** **************** *** * *
45. spacer 7.11|2359598|32|NC_009699|PILER-CR matches to NZ_CP047635 (Klebsiella pneumoniae strain K2606 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagc CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaaca Protospacer *** **************** *** * *
46. spacer 7.11|2359598|32|NC_009699|PILER-CR matches to NZ_KY853650 (Escherichia coli strain 347-43491A plasmid p977565, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagc CRISPR spacer atgataaatatgaatgtgaatatgaatatgat Protospacer **.********* *********** *. *...
47. spacer 14.1|2476047|30|NC_009699|CRT matches to NC_021536 (Synechococcus phage S-IOM18 genomic sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tctgcatcttctttcacattctcttctgca CRISPR spacer actgcatcttctttcacaatttctaccagt Protospacer ***************** *.*** *..
48. spacer 14.2|2476095|30|NC_009699|CRT matches to NZ_KT601170 (Staphylococcus sciuri strain wo28-3 plasmid pwo28-3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tctacatcttctttcacattctcttctgca CRISPR spacer gtaacatcttctttcacattttctttatta Protospacer . *****************.****. .*
49. spacer 14.2|2476095|30|NC_009699|CRT matches to NZ_KX982169 (Staphylococcus sciuri strain wo27-9 plasmid pWo27-9, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tctacatcttctttcacattctcttctgca CRISPR spacer gtaacatcttctttcacattttctttatta Protospacer . *****************.****. .*
50. spacer 14.2|2476095|30|NC_009699|CRT matches to NZ_KX982171 (Staphylococcus sciuri strain wo28-1 plasmid pWo28-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tctacatcttctttcacattctcttctgca CRISPR spacer gtaacatcttctttcacattttctttatta Protospacer . *****************.****. .*
51. spacer 7.4|2359597|34|NC_009699|CRT matches to NZ_CP050860 (Klebsiella pneumoniae strain SCH6109 plasmid pSCH6109-Vir, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagctt CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaacact Protospacer *** **************** *** * * .*
52. spacer 7.4|2359597|34|NC_009699|CRT matches to NZ_CP035776 (Klebsiella pneumoniae strain R46 plasmid pR46-270, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagctt CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaacact Protospacer *** **************** *** * * .*
53. spacer 7.4|2359597|34|NC_009699|CRT matches to NZ_CP041094 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain KPCTRSRTH01 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagctt CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaacact Protospacer *** **************** *** * * .*
54. spacer 7.4|2359597|34|NC_009699|CRT matches to NZ_CP024459 (Klebsiella pneumoniae strain QS17-0161 plasmid pMR0617aac, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagctt CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaacact Protospacer *** **************** *** * * .*
55. spacer 7.4|2359597|34|NC_009699|CRT matches to MN824002 (Klebsiella pneumoniae strain N201205880 plasmid p205880-2FIIK, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagctt CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaacact Protospacer *** **************** *** * * .*
56. spacer 7.4|2359597|34|NC_009699|CRT matches to MK649826 (Klebsiella pneumoniae strain 130411-38618 plasmid p130411-38618_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagctt CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaacact Protospacer *** **************** *** * * .*
57. spacer 7.4|2359597|34|NC_009699|CRT matches to MK649827 (Klebsiella pneumoniae strain 1675474 plasmid p1675474_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagctt CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaacact Protospacer *** **************** *** * * .*
58. spacer 7.4|2359597|34|NC_009699|CRT matches to MK649828 (Klebsiella pneumoniae strain 1675479 plasmid p1675479_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagctt CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaacact Protospacer *** **************** *** * * .*
59. spacer 7.4|2359597|34|NC_009699|CRT matches to MK649829 (Klebsiella pneumoniae strain 16114547 plasmid p16114547_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagctt CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaacact Protospacer *** **************** *** * * .*
60. spacer 7.4|2359597|34|NC_009699|CRT matches to NZ_CP047635 (Klebsiella pneumoniae strain K2606 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagctt CRISPR spacer atactaaatatgcatgtgaagatggaaaaacact Protospacer *** **************** *** * * .*
61. spacer 7.9|2359467|34|NC_009699|PILER-CR matches to AP013386 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G15, isolate: uvMED-CGR-C23-MedDCM-OCT-S37-C51) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gttaaagaagatgaaaaaagtaaataggtgatat CRISPR spacer aaaaaagaagttgaaaaaagtaaataagtatgac Protospacer . ******* ***************.**. *.
62. spacer 7.9|2359467|34|NC_009699|PILER-CR matches to GU943014 (Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C1161 genomic sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gttaaagaagatgaaaaaagtaaataggtgatat CRISPR spacer aaaaaagaagttgaaaaaagtaaataagtatgac Protospacer . ******* ***************.**. *.
63. spacer 7.9|2359467|34|NC_009699|PILER-CR matches to GU943013 (Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C1035 genomic sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gttaaagaagatgaaaaaagtaaataggtgatat CRISPR spacer aaaaaagaagttgaaaaaagtaaataagtatgac Protospacer . ******* ***************.**. *.
64. spacer 7.9|2359467|34|NC_009699|PILER-CR matches to GU943017 (Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C1227 genomic sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gttaaagaagatgaaaaaagtaaataggtgatat CRISPR spacer aaaaaagaagttgaaaaaagtaaataagtatgac Protospacer . ******* ***************.**. *.
65. spacer 7.9|2359467|34|NC_009699|PILER-CR matches to GU943022 (Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C890 genomic sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gttaaagaagatgaaaaaagtaaataggtgatat CRISPR spacer aaaaaagaagttgaaaaaagtaaataagtatgac Protospacer . ******* ***************.**. *.
66. spacer 7.9|2359467|34|NC_009699|PILER-CR matches to CP013001 (Bacillus thuringiensis strain XL6 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gttaaagaagatgaaaaaagtaaataggtgatat CRISPR spacer tttaaagtagatgaaaaaggtaaattaattaaaa Protospacer ****** **********.****** ..* * *
67. spacer 14.1|2476047|30|NC_009699|CRT matches to NZ_KT601170 (Staphylococcus sciuri strain wo28-3 plasmid pwo28-3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tctgcatcttctttcacattctcttctgca CRISPR spacer gtaacatcttctttcacattttctttatta Protospacer . .****************.****. .*
68. spacer 14.1|2476047|30|NC_009699|CRT matches to NZ_KX982169 (Staphylococcus sciuri strain wo27-9 plasmid pWo27-9, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tctgcatcttctttcacattctcttctgca CRISPR spacer gtaacatcttctttcacattttctttatta Protospacer . .****************.****. .*
69. spacer 14.1|2476047|30|NC_009699|CRT matches to NZ_KX982171 (Staphylococcus sciuri strain wo28-1 plasmid pWo28-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tctgcatcttctttcacattctcttctgca CRISPR spacer gtaacatcttctttcacattttctttatta Protospacer . .****************.****. .*
70. spacer 3.2|1903405|40|NC_009699|CRISPRCasFinder matches to NC_018689 (Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC429, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.75
tatttaaaggatttaaactta---catcatttagatttaagag CRISPR spacer tatttaaaggatttaaacttagttcattacataggttatc--- Protospacer ********************* ***.*. ***.**
71. spacer 5.1|2352047|35|NC_009699|CRISPRCasFinder matches to NC_008259 (Enterococcus faecium plasmid pCIZ2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
gtatcttctaagttttctgtattagatatttatgg CRISPR spacer attgcttccaagatttctgtattagatatgctttc Protospacer .* ****.*** **************** . *
72. spacer 7.2|2359466|36|NC_009699|CRT matches to AP013386 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G15, isolate: uvMED-CGR-C23-MedDCM-OCT-S37-C51) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
gttaaagaagatgaaaaaagtaaataggtgatatta CRISPR spacer aaaaaagaagttgaaaaaagtaaataagtatgacaa Protospacer . ******* ***************.**. *. *
73. spacer 7.2|2359466|36|NC_009699|CRT matches to GU943014 (Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C1161 genomic sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
gttaaagaagatgaaaaaagtaaataggtgatatta CRISPR spacer aaaaaagaagttgaaaaaagtaaataagtatgacaa Protospacer . ******* ***************.**. *. *
74. spacer 7.2|2359466|36|NC_009699|CRT matches to GU943013 (Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C1035 genomic sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
gttaaagaagatgaaaaaagtaaataggtgatatta CRISPR spacer aaaaaagaagttgaaaaaagtaaataagtatgacaa Protospacer . ******* ***************.**. *. *
75. spacer 7.2|2359466|36|NC_009699|CRT matches to GU943017 (Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C1227 genomic sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
gttaaagaagatgaaaaaagtaaataggtgatatta CRISPR spacer aaaaaagaagttgaaaaaagtaaataagtatgacaa Protospacer . ******* ***************.**. *. *
76. spacer 7.2|2359466|36|NC_009699|CRT matches to GU943022 (Uncultured phage MedDCM-OCT-S04-C890 genomic sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
gttaaagaagatgaaaaaagtaaataggtgatatta CRISPR spacer aaaaaagaagttgaaaaaagtaaataagtatgacaa Protospacer . ******* ***************.**. *. *
77. spacer 7.4|2359597|34|NC_009699|CRT matches to NZ_KY565557 (Escherichia coli strain Mcp0221 plasmid pMcp0221, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagctt CRISPR spacer atgataaatatgaatgtgaatatgaatatgatga Protospacer **.********* *********** *. *...
78. spacer 7.4|2359597|34|NC_009699|CRT matches to CP043017 (Escherichia coli strain 388808_gen plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagctt CRISPR spacer atgataaatatgaatgtgaatatgaatatgatga Protospacer **.********* *********** *. *...
79. spacer 7.4|2359597|34|NC_009699|CRT matches to NZ_CP038334 (Escherichia coli O157:H7 strain N8B7-2 plasmid pN8B7-2) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagctt CRISPR spacer atgataaatatgaatgtgaatatgaatatgatga Protospacer **.********* *********** *. *...
80. spacer 7.4|2359597|34|NC_009699|CRT matches to CP019690 (Shigella sonnei strain 75/02 plasmid p75-02_2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagctt CRISPR spacer atgataaatatgaatgtgaatatgaatatgatga Protospacer **.********* *********** *. *...
81. spacer 7.4|2359597|34|NC_009699|CRT matches to NZ_KY853650 (Escherichia coli strain 347-43491A plasmid p977565, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ataataaatatgcatgtgaatatgtacttagctt CRISPR spacer atgataaatatgaatgtgaatatgaatatgatga Protospacer **.********* *********** *. *...
82. spacer 7.9|2359467|34|NC_009699|PILER-CR matches to KC821626 (Cellulophaga phage phi39:1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gttaaagaagatgaaaaaagtaaataggtgatat CRISPR spacer attaaacaagatggaaaaagtaaatttaagttta Protospacer .***** ******.*********** . * *
83. spacer 7.9|2359467|34|NC_009699|PILER-CR matches to MG543995 (Staphylococcus phage UPMK_1, partial genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gttaaagaagatgaaaaaagtaaataggtgatat CRISPR spacer gacaaagaagatgaaaaaaataaagagaaaaatg Protospacer * .****************.**** **. .*
84. spacer 13.1|2382665|32|NC_009699|CRISPRCasFinder matches to MF979562 (Pectobacterium phage DU_PP_III, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
taattatcattataaaaaccctcatccatatg CRISPR spacer gcgaggtcattataataacccgcatccatttt Protospacer . .********* ***** ******* *
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
1732926 : 1741138
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_009699|1732926:1741138|DBSCAN-SWA ACTATGTCATATTTGAATATATATCATTAATTTTTTTACATTTATTTTTTATAATTTCTCTAATATGATTGGGTTCAAGTACTTCCACATATTCTCCGTAACTTAATATCATGGAATATACCCAGTCATCTTCTAATAAATATGTATCTACAATTACACTACCATCTTCTTGAAACTTCATTTCATCTTTATCAAAAGAATCGTCTATTCTATATCTAACTCTTTCAGAAAACTTTAGTACAACTCTTGTAGGTACTTGTTCACTCTCACTAATATTTATATATTCTTTATAGGAAATTCTATTTTCATTAATTTTTTCATGTAAAACAGTTAAACTTTCCATTCTTGATAATTTGAAAAATCGGTAATCATTTTTTAATTTGCAAAAGGAAAATAAATACCATGAAAAACCTTTAAAAACAAGAGTTAATGGTTCTACCTGTCTCCAATTATATTCACCTTTTGAGTTTCTATAATCAAAGGCTATACAGTTTTTGTTATCTACAGCATCATATATAATTTTGTATTTTAAGTTTTCTTCTTCACATTTTTTAAAGCCCCAAGGTAATGTATCTATACACATTTGCTCAAAATGCAAATCAAATACTTCTTTTTTTTCTTTAGGAACAATATTTTTTACCTTTTCAATGGCCATTTCAACATTTTTATTATCTAAAAATTTATTCATATTTTTTAGAGCTTCTATAATTGAAATCATATCTTCTAATGTTAAAAGTTGATGATTGATTTTATAGTTATCTATAATATAAAATCCTCCATTATTTCCAATTTGAGAAACTATAGGAATTCCAGCAAGATTAATTGCTTCAATATCTCTATAAATTGTTCTTACAGAAACCTCAAATTTTTCAGCTAATTCTGATGCAGATATTTTTTCTTTATTTAAAAGCATTACAATAATTGCCAATAATCTATTAATTTTCATGAATCTATAAACCTCCCATAATTTGAAATGACTATTTTATTATATCAAATTAATAACTTGTAAAATTGGTTAGAGAGAAATTGCTGGGAGAACTGTATAAGAAAGTTTTAAAAAAATAAATTCCGGCATGGTAATTTTTGGGCTGTTTATGGGTATGAACTTGACTTAACAAATGTACTATAGTAAACTTATATCGTAAAAAAGAATAAAGACAGTTCGTAACCATCCTGTCTATAAATAAAACTAGGACGTAGCTACCGCCTTAGGTAGTTTTTTTGTTGATGGGCATTTAATGCCCTTTTTTATTTGCAAAAAATTTACAAATAGGATTTTTGTTTTAGGTGAAATTTTTAATTTATATAAAGTTTAGAAATTGTTATTCAAGGACGCAGAGGTCTTATCCAATGAATTTTTTAACTTAAATATAACAGTAACAATATAAGGCTGTTTTTTATAAAGATTGTCCAAATATAACTTAAAAACCTTACAAGGTAGGAAACTTTAAATAGTTGTAAAATATCCTAATAAATAATAATTTATCATAACCATTATAACTATTTGATGTTTTCAAGTCTAAGTGAGTGTAATAGATTGAAAAATCTATAGCACAAGGAGGAATGAAAATGAAAAAAATAGGACTAACAACTACAGTGCCAGTGGAAGTTATTGTTGCAGCAGGATATACACCAGTAGATTTAAATAATATGTTTATAACTTCAGAGAATTATTTAAAATATATAGACATAGCTGAAAGAGATGGTTTCCCCAAAAGCTTATGTGCTTGGATAAAGGGGATTTATGGAGCATGTCTAGAAAATAATATTAAAGAAATAGTTGGAGTTATGGAGGGGGATTGTTCTAATACTAAAGCTCTTATTGAGGTTTTTAAACTAAGAGGAATAAAAATTTATCCATTTTCATTTCCCCATAGCCATAGTTTAAAGGATGTAGAAATTGAAATAAGAAAGTTCATGGATATCTTCAATGTTAACGAGGATAAGGTAGAACAGGTTAGAAAAATATTAAATAGAGTTAGAAAGCTAGCAAAAAAAATAGATGAAATGACTTATATAGATAATAAGGTTAATGGTTTTGAAAACCATCTATATCAGGTGAGCTTAAGTGACTTTAATGGAAACATAGATGAATTTGAAGAACACCTTAAAAAAGTCATTGATGGTATGGAGAAAAGAGAGCCAATAAATAAAAAGTTAAGATTAGGCTATATAGGAGTTCCTCCAATGACTGGAGATATATATGAGTTTAGTGAAAAATTAAATGCTCATTTTGTATATAACGAAGTTCAAAGAGAATTTGCTTTTCCTAGGGGGATAGAAGCTGCAAATATATTTGAACAGTATTATAATTACACTTATCCTTATGATAATGAGTTTAGAATTAAGGAATTGAAAAAGCAAATAGAAAAGAGAAAGATAGATGCTATAATTCACTACACTCAGGCTTTTTGCCATAGAGCTGTTGAAGATATAGTATTAAAAGAAGAATTAAATATTCCTATGTTAAATATTGAAGGTGATAAGTTAAATACATTAGATGCAAGAACTAAACTAAGATTAGAAGCCTTTCTGGATATGTTGCTGGACTTAAAGCAGAAGTAATAGGTGATCTAGTAAGAATTTTTATCTTAATATATTGTTGGATTTAAAGCAAAAGTAATAGACGGTATATAAAAGAAGTTCATGTTTTCTTTATATTTAATGAAGGAGGGGAATTAATGAGATTGTTAGGAATAGACCTTGGAAGTAGAGAAGTTAAGATTGTTTTAATGGAAAACAATCTTATAGTTAAAAAGAAAAAAGTAAGTACCATGAAATTTTATAGAGATTACTGTAGCTTTCATGGCAAGATTGTAGTAGGTTTAGAAAAACTTAATATAGAAGGAATAGATAAAGCGATATCAACGGGTTATGGGAAAAATAATACGGATTTAGAATTTTTTACACCTATAAATGAGATAAAAGCCCATGTTTATGGTGGGATCTATCAAAGTAATTTAAAGGATTTTATACTTTTAGATGTAGGTGGTCAGGACGTTAAGGTGGTAAAGGTAGAAAAGGGCGTTGCAACAGATTTGGAGCTTAATGAAAAATGTGCTGCTTCCTGTGGAAGATACTTGGAGAATATGGCAAATGTACTTGAAATATCCCTAGATGAAATGAGTCAGTACTCGGAAAATCCTGTGGATTTAAATTCCACCTGTGCAGTATTTTCTGAATCAGAATTAATTGGAAAAATAGCCGAAGGGGTACACATAGAAAGGTTATGTGCTGGGGTTAATTACTCTTTGTATAAAAGGCTACAACCTCTTTTAAGTAAGTTTAGGGGGAAGAAATTAGTTATAACCGGTGGTGTTGCAAATAACCATTCAATAAAAAAATATTTAAATAATGATTATGAAGAAATAGTATCCGTAAAAGATCCTCAGTTTAATGGGGCTATTGGATGTTGTTATTACGGAAGCAAATTTTTAAAATAAACTTAGGAGGAAAAAACATGTATACTTTAAAAGTAGAACATAATTTTGATAGCGCTCATTTTCTTGCAGGTTATGAAGGTAAATGTGGAAATATTCATGGACACAGATGGAAGGTTGAAATTCAGGTTCAGGCAGAATCATTAGTACAAGGCGGTCAACTTGACGGGATGATAATAGACTTTGGAGACTTAAAAAAAGATGTTAAATCTATGGTAGATTATTATGATCATGCACTTATAATAGAGAAAGGAACTATGAGGGGGCAATCATTAAGCTCATTAAAGGAGGATGGATTTCGTATAATAGAAGTTAATTTTAGACCAACAGCGGAAAATTTTGCAGCTTTTTTCTATAAAATTATGAAGGATAGAGGATATAATGTAAAAAGTACTACAGTTTATGAAACACCTAATAATAGTGCTACCTATGAAGAAAGTGGGGTAATTTAAAATGGATTTTAAGGTGGTTGAAAGTTTTATAAGCATAAATGGAGAAGGAAGGCGTTGTGGACAACTGGCTATATTCATAAGATTCGCGGGTTGTAATTTAAACTGTAGCTATTGTGATACACTTTGGGCAAATGAAAAGGATGTACCCTATGAAGTATTAAGTTCCAAAGATATATATGAATATATTAAGTCCAAAGAGGTTAAAAATGTAACTTTAACAGGAGGAGAACCTCTTTTGCAAAAGGGAATAATGGAGTTATTAAAACTTTTGTCTAAGGATAAAGAGCTTTATGTGGAAATTGAGACAAATGGCAGCATATTATTAGATGAATTTTTGAATATAGAAAATTCACCAAGCTTTACTATGGATTATAAACTTCCTTTAAGTAATATGGAAAATAAAATGGCATTAGATAACTTTAAATATTTAACTAAGAAGGATACAGTAAAATTTGTATCAGGTAGTATAGAGGATTTAGAAAAAGCTAGAGAAATAATAAATAAGTATAACTTAGTAGATAAAACTAATGTGTATATAAGTCCTGTTTTTGGAAAAATTAATTTAGATACTATTGTAGAATTTATGAAAAATAATAGAATGAATGGAGTTAATTTACAACTGCAGCTTCACAAGATTATATGGGAGCCTAGTAAGAGAGGAGTATAGTATATGGCAATTGATGTTAAAGCAATTGAAGAACACATAAGGGGGATTTTGATAGCTTTAGGAGACAACCCAGAAAGAGAAGGTCTAAAGAACACACCAAAACGTGTAGCTAAAATGTATGAAGAAGTATTCAAAGGTATGTGTTATAGCAATGATGAAATTGCAGAAATGTTTAATGTAACCTTTGAAGATGATTTATGTATAAATGATAATGAAAATGACATGGTTTTTATGAAGGAAATAGAGATATTTAGTCATTGTGAACATCATTTAGCACTTATGTACAATATGAAAGTAGCCATAGCATATATACCTAAGAAAAAAATTATTGGTTTAAGCAAAATAGCACGAATAGCAGATATGGTAGGACGTAGACTACAGCTTCAAGAGAGGATTGGAAGTGATATAGCAGAAATACTTCAGAAGGTAACTGACTCAGAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_009699|1732926:1741138|1734494_1735490_+|WP_012099657.1|DBSCAN-SWA MKKIGLTTTVPVEVIVAAGYTPVDLNNMFITSENYLKYIDIAERDGFPKSLCAWIKGIYGACLENNIKEIVGVMEGDCSNTKALIEVFKLRGIKIYPFSFPHSHSLKDVEIEIRKFMDIFNVNEDKVEQVRKILNRVRKLAKKIDEMTYIDNKVNGFENHLYQVSLSDFNGNIDEFEEHLKKVIDGMEKREPINKKLRLGYIGVPPMTGDIYEFSEKLNAHFVYNEVQREFAFPRGIEAANIFEQYYNYTYPYDNEFRIKELKKQIEKRKIDAIIHYTQAFCHRAVEDIVLKEELNIPMLNIEGDKLNTLDARTKLRLEAFLDMLLDLKQK >NC_009699|1732926:1741138|1735606_1736368_+|WP_012099658.1|DBSCAN-SWA MRLLGIDLGSREVKIVLMENNLIVKKKKVSTMKFYRDYCSFHGKIVVGLEKLNIEGIDKAISTGYGKNNTDLEFFTPINEIKAHVYGGIYQSNLKDFILLDVGGQDVKVVKVEKGVATDLELNEKCAASCGRYLENMANVLEISLDEMSQYSENPVDLNSTCAVFSESELIGKIAEGVHIERLCAGVNYSLYKRLQPLLSKFRGKKLVITGGVANNHSIKKYLNNDYEEIVSVKDPQFNGAIGCCYYGSKFLK >NC_009699|1732926:1741138|1739214_1740033_+|WP_012099662.1|protease|DBSCAN-SWA MEKFNENRGISIKESIKLFFEINIWLIIYGIPFTILAIYFKEHGLEVTYESIEQLGEIVAYIFIIKKIYKRFKLQENFRFKIKYKPTLKEGIFIIIATIAYIFVYDNTLGILLQKIPEADWVKNAFIEIESEPLLLQFSSLCLIAPIFEEIICRGIILEQLNKRCGATKAILISSLFFGIMHFNLHQGVNAFFIGVVMGVIYVKTDSLLLTILLHFVNNLYCLIAQYIPYLDQIESNFSVVRLICGSILLFISYRFFNGIKIHLNRELNLRS >NC_009699|1732926:1741138|1740181_1741138_+|WP_012099663.1|DBSCAN-SWA MINIFSKKDSKKDNKNDTIEQEVIVEEKHEVETIDTMKFLKEMTIQIEGIIQQHNKVNGEHEVLEKLAKQIENHMVTVSNLTERTNESTDKLFSQGESLLEITKDTVNKSLEGKKSIEGMVKVIENLDIETKDTYENINALGEKLKEIGEIAQLISGIASKTNLLALNAAIEAARAGEQGKGFAVVADEVRKLAEMTGESSSNITNLISGIDSQTKNVLNSVEKSTLVVTEGVKSSKGALEKIEEVLDSFNRVEDDTDSLIKTINTQKEDISKIFNGINGVDKILTETNEQIIKHIDEAHKVDEKLEKSVYHIAQYVK >NC_009699|1732926:1741138|1732926_1733871_-|WP_012099656.1|DBSCAN-SWA MKINRLLAIIVMLLNKEKISASELAEKFEVSVRTIYRDIEAINLAGIPIVSQIGNNGGFYIIDNYKINHQLLTLEDMISIIEALKNMNKFLDNKNVEMAIEKVKNIVPKEKKEVFDLHFEQMCIDTLPWGFKKCEEENLKYKIIYDAVDNKNCIAFDYRNSKGEYNWRQVEPLTLVFKGFSWYLFSFCKLKNDYRFFKLSRMESLTVLHEKINENRISYKEYINISESEQVPTRVVLKFSERVRYRIDDSFDKDEMKFQEDGSVIVDTYLLEDDWVYSMILSYGEYVEVLEPNHIREIIKNKCKKINDIYSNMT >NC_009699|1732926:1741138|1737487_1738078_+|WP_012099660.1|DBSCAN-SWA MAIDVKAIEEHIRGILIALGDNPEREGLKNTPKRVAKMYEEVFKGMCYSNDEIAEMFNVTFEDDLCINDNENDMVFMKEIEIFSHCEHHLALMYNMKVAIAYIPKKKIIGLSKIARIADMVGRRLQLQERIGSDIAEILQKVTDSEDVAVIIEGEHGCMTTRGIKKPGTKTITTTLRGKFNTDPIVSNKLMMLYTK >NC_009699|1732926:1741138|1736818_1737484_+|WP_012099659.1|DBSCAN-SWA MDFKVVESFISINGEGRRCGQLAIFIRFAGCNLNCSYCDTLWANEKDVPYEVLSSKDIYEYIKSKEVKNVTLTGGEPLLQKGIMELLKLLSKDKELYVEIETNGSILLDEFLNIENSPSFTMDYKLPLSNMENKMALDNFKYLTKKDTVKFVSGSIEDLEKAREIINKYNLVDKTNVYISPVFGKINLDTIVEFMKNNRMNGVNLQLQLHKIIWEPSKRGV >NC_009699|1732926:1741138|1736385_1736817_+|WP_011949100.1|DBSCAN-SWA MYTLKVEHNFDSAHFLAGYEGKCGNIHGHRWKVEIQVQAESLVQGGQLDGMIIDFGDLKKDVKSMVDYYDHALIIEKGTMRGQSLSSLKEDGFRIIEVNFRPTAENFAAFFYKIMKDRGYNVKSTTVYETPNNSATYEESGVI >NC_009699|1732926:1741138|1738261_1738921_+|WP_012099661.1|DBSCAN-SWA MNKEKAIVVFSGGQDSTTCLFWAKKKYKEVIAVSFDYNQKHKLELDCAKDICKKYNIEHHILDLNLLNQLAPNSLTRQDITVDKSAPKEGVPNSFVDGRNLLFLSFVAVFAKQKGINTIITGVSQSDFSGYPDCRDVFIKSLNVTLNLAMDYEFEIITPLMWINKAETWKMAYDLGVLDIVKEETLTCYNGIKADGCGECPACKLRKKGYLEFEKYLMN |
9 | uncultured_phage(33.33%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
1966489 : 2055434
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_009699|1966489:2055434|DBSCAN-SWA 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90 | Clostridium_phage(50.0%) | capsid,terminase,integrase,tail,protease,portal,head | attL 1980470:1980486|attR 2056697:2056713 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
2528316 : 2571561
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_009699|2528316:2571561|DBSCAN-SWA 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57 | Clostridium_phage(70.83%) | plate,tail,terminase,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
3093138 : 3102740
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_009699|3093138:3102740|DBSCAN-SWA TCTAGTGTTTAAAATGTCTTATTCCTGTAAATACCATAGAAATCCCTTTTTCATTACATACCTTTATAGATTCTTCATCTCTTATAGAACCGCCTGGTTGAATTATGGCTTTTATTCCCCATTTTGCAGCTTCTTCTGCTACATCTCCAAATGGGAAAAAAGCATCTGAAGCTAAAACTACGCCATCTCCAGCTCTATCTAATGCTTCCTTTGCTGCCCATATTCTATTTACTTGGCCTCCCCCAATACCTTTTGCCATACCATCTTTAACTACTACAATAGCGTTGGATTTCACATATTTAACTACTTTCATACCAAATATAAGATCTTTCATTTCTTGCTCTGTTGGGGATTTTTCTGTAACTACTTTTGTATCTTCTAATAATTTATTATCACTCTTTTGTACTAATATTCCTCCATCTACCTTTGCCATATCTTTTCCTTCTGTAGATTTCTCTTCACATTTTATAACCCTTAAATTTTTCTTGTTTTTTAAGACTTCTAAAGCATCTTCATCAAAATCTGGTGCTACAACTATTTCTAAAAATATTTTTGCAAGATTTTCTGCTGTTTCCTTATCTACTTTTCTATTAAAAGCAACTATGCCACCAAATATAGATATAAGATCACATTCATAGGCCTTAGTATAAACTTCCTGTACAGTATCCCCTATAGCCACACCACAAGGTGTATTATGTTTTAATGCACAACAAGCCACCTCTTCAAATTCACAAACGGTTTTCCACGCTATATCCATATCCTTTATGTTATTGTAGGATAATTCTTTTCCATTTAACTTTTCAAAATTTTTCATAGGATATTTTCCAACAGTAGATGTGTAATAAGCTGCTGTTTGATGAGGGTTTTCTCCATATCTTAAATCTATGTTCTTTTTATAGGATAAAGTTAAGTATTCTGGATATTCCTCTTCCAATAAGAAATTACTTATAGCTGCATCATAGGCTGACATTAGATTGAAAACTTTTCCTGCTAATTTTTTTCTAGTTTTTATATTAACCTGATCATTTTCTTTTATTTCATCTATGACATTTTCATAATCCTTAGTATCTGTTAGTACTACTACATCTTTAAAATTTTTAGCTGCTGCTCTTATCATAGTAGGTCCACCGATGTCTATAAATTCTACTTTTTCATCAAAACTTAAATTTTCTTCTACTTTGTTAAAGAAAGGATATAAATTCACTACTACCATATCTATAGGGTTTATGCCCTTTTCTTCTATTACCTTCATATGCTCTTCATTATCTCTTATAGCTAATATGCCTCCATGAATTAAAGGATTTAATGTTTTTACTCTTCCATCTAACATTTCTGGAAAACCTGTTACCTCTTCTATATCTATTACTTTTACTCCATTTTCTTTTAAATGTTTATAAGTTCCACCTGTAGATATTATTTCTACATCTCTACTTTCTAAAAACTTTGCCAAATCTAAAATTCCTGTTTTATCAAATACACTTATTAATGCTCTTTTTATCACTTAAACTCCCCCAGTTTCAATATTTTTTATTATCTTATTTATCTGTCATAAGTAACTGCCACCAATATACCTTCTTTCAAAGAAAACATATAAGTGGCACTATTTCAATTTACAAACTACAATTTTTTATATTTCAATAAATTTAATCTACTCTAAACACATTTTTCTATTAGTTTCATTTATATTAATAGTAATTTTTTCATTATTATAAATTTAGTATGTTTTAATAAAAACTTTTCTTCCTTGTAATTTTACTTTTCCTTCACTTATAAGTTTTATAGCTTCTGGTAATGCCTCATGTTCTTTTTCTAGAACTCTTTTTTGCAATATTTCTGCTGTATCTTCTGCAAAAACTGGTACAGATTTTTGTATTATTATAGGTCCACTGTCCGTACCCTCATCTACAAAATGCACAGTACACCCAGATACTTTTACTCCGTATTCTAATGCTTTTCGGTGCACTTTTATACCATACATTCCATCTCCGCAAAAGCTTGGTATTAATGAAGGATGTATGTTTATTATCCTATTTTCAAATTTATTTACCAAATCCCCATTTAATATAGAAAGCCATCCTGCTAAAACTATTAAATCTACGTTTCCATATAAACACTCACATATTTTATTAGACAGATTGCTTTTATATATTTTTCTATCTAGAGTTAAAGTTTTAATTCCCTTTTTTTCTGCTCTTTCTATACCATAAATATTAGATCTATCCCCTATAACCATTTCTATCCTGCAATTTTTTATATATCCTTCTTCTATTTTATCTATTATAGATTGAAGATTGCTTCCTCCCCCTGAAACAAGTACTGCAATTTTAAACATCCTATTCTCCTTTAATTTAAAGAAAATTTTTCATATATACTCTATAAATAATTAATTTCCCAATCAATTATTTTAAAGATCTAACCTATGAACTAATTTTTATTATAAATTTATTTAATACTCTTTTTTAAATTAGTTCAACAGACTTATTTCCTTTTTTAACATATCCTATTTTATAACCCTTTTCTCCCATTTCTATCAGGTCTTTTATTATATTTTCCCCATCTTTTTCATTTACACATAATACAAAACCAATCCCCATATTAAAAGTATTGTACATATGATCTTCTTCTATCCCTAAACTCATTAAATGGCTAAATATATTTGGTAATGGATAAGATTTTTTATTTATAACTGCTGTAAAATCCTCTTTAAACATTCTAGGAATATTTTCATAAAAACCTCCTCCAGTTACATGAGCCATACCTTTTATATTATATTTTTCTAAAAGTTTCATTACAGGTTTTACATATATTTTTGTAGGAGTTAAAAGAGTATTTCCTATTTTATTTCCTTCAAAATCTTTATGTAAATCTTCTACTAATTTTCTTATAAGAGAATATCCGTTGCTATGAGGTCCTGAAGATGCTATACCTATTAATATATCCCCATCTTCTATTTTACTTCCATCTATTATTTCATCTTTTTCTGCTATACCTACAGCAAAACCAGCTATATCATATTCCCCATCTCTATAAAAGCCTGGCATTTCTGCTGTTTCTCCACCTATTAGAGCACATTCACTTTGGATACAACCATTGCTAACCCCTTCTACAAGCTGAGCTGCAATCTCTGATTCCAATTTCCCGCAAGCTATATAATCTAAGAAAAATAACGGCTTAGCACCATGACATAATATATCATTTATGCACATAGCTACGCAATCTATTCCTACTGTATTATATTTTTTCATTCTAAAGGCTATATCTAATTTAGTTCCAACTCCATCTGTACCTGATACTAATACAGGATTTTTATATTTAGGAAGTTCAAACATTCCTGCAAAACTTCCTAAATTATTTAATACTCCCTTTGTAAAAGTTTTGGAAGCATATTTTTTTATAAGATCTACAGATTTGTAACCTTCCTCTATGTTAACCCCAGCTTCTTTGTAAGATACCATGAATAACATTCCCTTCTTTAAATTATTAGTTATTCTACCAATAAAAAAACTATATTAAGTTATTTTAACTTTAGGATCATGAAAAAATAATCGATTAAATATGAATCGTATATTTAGTGTCAAACAAAGAAATAAATTTTTTCTACCTAAAGCTAGAACAACTTAAATCCTCTATTCCAAACTATCTTTAGGCATTTCTATAGGTGCAGATATAGGATATATACCATTAAAACATCCCAAGCAAAAGCCTTTATCTTTATTAAGTGTTTCTACTAAGCCTTCCATACTTATATAAGCTAGACTATCTGCTCCTATTTTTTCTCTTATTTCTTCTACTTCTGAGTGAGCACCTATTAAATCTTTTCTATAAGGAGTGTCTATTCCAAAATAGCAAGGATATTTAACCACTGGAGATGATACTCTAAAATGAACTTCCTTAGCTCCAGCTTTTCTTAATATTTGTACTAATCTTTTACTAGTAGTTCCTCTTACTATGGAATCATCTATTATTACTACTCTTTTTCCTTCTACATTTATTTTAAGTGGATTTAGTTTTACAGATACAGCTTTTTCTCTTAATTCTTGAGAAGGTGCTATAAAAGTTCTTCCCACATATTTATTTTTTATAAATCCTATACCATAAGGTATTCCTGAAGCTTCAGCATATCCTACCGCAGCTGGTATACCTGAGTCTGGGACTCCTATAACTATATCTGCCTCTACTGGGTATTCTTCATAAAGTTTTCTTCCCGCTCTAACCCTTGATTCATAAACATTTATACCATCCATAGTACTATCTGGTCTTGCAAAATATATATATTCAAAAGCACAGGTATGACATTTTGTTTTTTCTGTAAACTTAATTGAATTTATTCCACTTTCGTCTATAATAACTATTTCTCCAGGCTCTATATCCCTTATAAACTCTCCACCTACACAATCAAAAGCACAACTTTCCGAGCTTAATAAATAATCATCCCCAATTTTTCCTAGGCACATAGGCCTTATACCATGAGGATCACGTGCTCCTATTAACTTATCTTCTGTAAGTATAACTATAGCATAGGAACCTTTAATTGCTTGTATTGCATCTACTACTGCTTTATCTATACCTTTTTTAGCGCTTCTTGCTATTAAGTTTAATAATACCTCTGTGTCTATAGAAGTTTGAAAAATACATCCGCCATCTTCTAAAAGTTCTCTTATAACTGCTGCATTAACTAAATTACCATTATGGGCTATAGCAATAGAACCTAACTTATAAGTACCTACTATAGGTTGTGCATTATCTGATTTACTCGCTCCTGTAGTTGAATATCTAACATGTCCTATAGCAGAATTTCCTATTAATCCTTCTATAGTTTCTTTGCTAAAAACATCTGATACAAGACCCATACCCTTATGATATTTAAACTTTTCTCCATCAGATACTACTATTCCTGCACTTTCTTGTCCCCTATGTTGAAGAGCATATAATCCGTAATAAGTTATTTCTGCTGACTTTGATTCATTATCTTTAGAAAATACTCCAAATACCCCACATTC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_009699|3093138:3102740|3095596_3096592_-|WP_012100667.1|DBSCAN-SWA MVSYKEAGVNIEEGYKSVDLIKKYASKTFTKGVLNNLGSFAGMFELPKYKNPVLVSGTDGVGTKLDIAFRMKKYNTVGIDCVAMCINDILCHGAKPLFFLDYIACGKLESEIAAQLVEGVSNGCIQSECALIGGETAEMPGFYRDGEYDIAGFAVGIAEKDEIIDGSKIEDGDILIGIASSGPHSNGYSLIRKLVEDLHKDFEGNKIGNTLLTPTKIYVKPVMKLLEKYNIKGMAHVTGGGFYENIPRMFKEDFTAVINKKSYPLPNIFSHLMSLGIEEDHMYNTFNMGIGFVLCVNEKDGENIIKDLIEMGEKGYKIGYVKKGNKSVELI >NC_009699|3093138:3102740|3093138_3094638_-|WP_012100665.1|DBSCAN-SWA MIKRALISVFDKTGILDLAKFLESRDVEIISTGGTYKHLKENGVKVIDIEEVTGFPEMLDGRVKTLNPLIHGGILAIRDNEEHMKVIEEKGINPIDMVVVNLYPFFNKVEENLSFDEKVEFIDIGGPTMIRAAAKNFKDVVVLTDTKDYENVIDEIKENDQVNIKTRKKLAGKVFNLMSAYDAAISNFLLEEEYPEYLTLSYKKNIDLRYGENPHQTAAYYTSTVGKYPMKNFEKLNGKELSYNNIKDMDIAWKTVCEFEEVACCALKHNTPCGVAIGDTVQEVYTKAYECDLISIFGGIVAFNRKVDKETAENLAKIFLEIVVAPDFDEDALEVLKNKKNLRVIKCEEKSTEGKDMAKVDGGILVQKSDNKLLEDTKVVTEKSPTEQEMKDLIFGMKVVKYVKSNAIVVVKDGMAKGIGGGQVNRIWAAKEALDRAGDGVVLASDAFFPFGDVAEEAAKWGIKAIIQPGGSIRDEESIKVCNEKGISMVFTGIRHFKH >NC_009699|3093138:3102740|3100014_3100149_+|WP_041173178.1|DBSCAN-SWA MAKPHIAFPSGKKFLMKKFDTPSQVSYLSIRVFFIFAWLKLSLF >NC_009699|3093138:3102740|3094851_3095469_-|WP_012100666.1|DBSCAN-SWA MFKIAVLVSGGGSNLQSIIDKIEEGYIKNCRIEMVIGDRSNIYGIERAEKKGIKTLTLDRKIYKSNLSNKICECLYGNVDLIVLAGWLSILNGDLVNKFENRIINIHPSLIPSFCGDGMYGIKVHRKALEYGVKVSGCTVHFVDEGTDSGPIIIQKSVPVFAEDTAEILQKRVLEKEHEALPEAIKLISEGKVKLQGRKVFIKTY >NC_009699|3093138:3102740|3098303_3099008_-|WP_012100669.1|DBSCAN-SWA MEKKDMLYEGKAKKIFRTDDKDTVVVYYKDDATAFNGEKKGTIEDKGVMNNSITAMLFELLEKKGVKTHFIEKINEREQLCKKVEIVPLEVIVRNIAAGSMAKILGLSEGRKLDTTVFEISYKNDDLNDPLINDYHAVAIGLTNFEELKEMYSIAEKVNNTLKEFFDEQGINLVDFKIEIGRFNGELLLADEISPDTCRLWDKKTGEKLDKDRFRRDMGNVKEAYMEILKRVNK >NC_009699|3093138:3102740|3099007_3099487_-|WP_012100670.1|DBSCAN-SWA MKVAIIFGSKSDTDKMKGAAKALKEFSIEYKAYILSAHRVPEKLMETIEDLEKEGYECIIAGAGLAAHLPGVIASHTILPVIGVPIEAAVGGMDSLLSIVQMPKSIPVATVGINNSYNAGMLAVQILSLKYEKLREKLIEYRKDMKEKFINDNKEGVEL >NC_009699|3093138:3102740|3096763_3098212_-|WP_012100668.1|DBSCAN-SWA MSMCYMLDDLNENMPFDLEGDKFKEECGVFGVFSKDNESKSAEITYYGLYALQHRGQESAGIVVSDGEKFKYHKGMGLVSDVFSKETIEGLIGNSAIGHVRYSTTGASKSDNAQPIVGTYKLGSIAIAHNGNLVNAAVIRELLEDGGCIFQTSIDTEVLLNLIARSAKKGIDKAVVDAIQAIKGSYAIVILTEDKLIGARDPHGIRPMCLGKIGDDYLLSSESCAFDCVGGEFIRDIEPGEIVIIDESGINSIKFTEKTKCHTCAFEYIYFARPDSTMDGINVYESRVRAGRKLYEEYPVEADIVIGVPDSGIPAAVGYAEASGIPYGIGFIKNKYVGRTFIAPSQELREKAVSVKLNPLKINVEGKRVVIIDDSIVRGTTSKRLVQILRKAGAKEVHFRVSSPVVKYPCYFGIDTPYRKDLIGAHSEVEEIREKIGADSLAYISMEGLVETLNKDKGFCLGCFNGIYPISAPIEMPKDSLE >NC_009699|3093138:3102740|3100169_3102740_-|WP_079992192.1|DBSCAN-SWA MGVINVYEFILNERNVSVSEDINLLEYLRDNEDLTSVKNGCAEGACGACMILVNGKALRACICTTAKVNGKDVKTVEGLTEFEKDVFTWAFSKAGAVQCGYCIPGMIISAKSLLDKNLNPNKKEIKTAIRGNVCRCTGYVKIIKAIEMAAEAFRNGKLPFAKEYKGKIGENIPRIDAKDKILGIGKYVDDMKIEGMVYGSALRSKYPRALVKSIDISVALKHPEVEAILTAEDVPGNRLIGHIVKDWPAMIAVGEETRYVGDAVALVAAKSKKALKEILNLIKVEYEELEPISNPNIAIAEDAPKIHPKGNILTVEKVNRGDVDEAIANSKYVVTNHYSTPFTEHAFLEPESALAMPDGDGVIIYTGSQGIYDEQREISELLGLPKEKVRTISKYVGGGFGGKEDMSVQHHAALLAWTIKKPVKITLSRKESIKIHPKRHAMEMTITTACDEKGNLTAFKADIISDTGAYASLGGPVLQRACTHAAGPYKCPNVKIKGTAVYTNNPPGGAFRGFGVTQSVFGSECNLNLLAEKVGISPWEIRFKNAVEPGDALPNGQIADKGTAIKETILAVKDVYKKSKCAGIACCMKNSGVGVGIPDIGRCNLIVIDGKVHIRTSAACIGQGLGTILTQIICETIGLLPEQIILDLPDTKFAPDSGTTTASRQTVFTGEATRMASLKLKEKLLTTSLEECEGEEFYGEYQSITDPINSDKKNPVSHVAYGYATQVVILDDDGKIERVVAAHDVGKAINLTNVEGQIEGGIVMGLGYAFTEDYPLNKSIPTAKFGTLGLFRATDIPEIETTIIEKNTNDLAYGAKGIGEITTIPTAPASQGAYYKFDGEFRKKLPLEDTAYRRKK |
8 | Synechococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
3253807 : 3275408
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_009699|3253807:3275408|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_009699|3253807:3275408|3255914_3256169_-|WP_003360052.1|DBSCAN-SWA MLTSTIDFKKTRQKMWGILKNKTLAQLPYGHETDKNGSEITSYATNCYEDALEEAHTLLANGIGTKDIQIVEFVPYDYIMQPRV >NC_009699|3253807:3275408|3271302_3271536_-|WP_072570747.1|DBSCAN-SWA MLRRNPQVAVIKTKEYRRIRNLSISKLSYKSKIARSYITELEEGKYENPGLKVICNLCKTLKITPNELIDQELWRWW >NC_009699|3253807:3275408|3253807_3254893_-|WP_012100764.1|DBSCAN-SWA MSEFFNVTLDKDIILDDSVISNKTGWSSEKIQKEIINKRITKFEELEDVDVTNKKNKQLVAYSEETGKFTTIDGIDAGEIVGAGMKQISKMGIVGSAETPRIVNIPVNTVDFKVPRVNVLRYDTENTQDLISVKNEFTNDESNDFIDDKMMTFDGKAHLETNHISDFEVVQDTESFIEYSVNVDKTLFKKIGGFETFEDGVIQKLKTKAIPFDRLLIPKGDMNLSNVDHIDYFRLTANGNNIRIVCSVDSGNTWKTFSGEKWVNVNLTVDDVRKNGMNIATFNAINDVFWNELVTTKKIRFAYLFSMDSITDIEEIDKLDLQYDGVGRWKQVKEDLYEVIYASNTLLQVECKFSGDIKINY >NC_009699|3253807:3275408|3261694_3262036_-|WP_012100770.1|DBSCAN-SWA MAHMGYKNFRKPVVYILDQELRKRNFKNQINTNEDSKYTGELPEYPCRIIRDSNNKAYKFIYASGTDMQWQEELIRNAEGKVYRIKTTYPNNTNKTIQLIKDNHGKLETIDYV 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27 | Clostridium_phage(85.71%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
3380306 : 3465762
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_009699|3380306:3465762|DBSCAN-SWA 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>NC_009699|3380306:3465762|3455754_3455976_-|WP_012100917.1|DBSCAN-SWA MKRQCSNCRFWIPTIDNGFCEKEISKRCEFDDTCNKYKPKLLLDKMGIDSVEFAGISLTIVVIVLILYGAGLI |
94 | Clostridium_phage(51.22%) | capsid,terminase,integrase,tail,protease,bacteriocin,tRNA,portal,head,holin | attL 3417909:3417928|attR 3453160:3453179 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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