Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_008593 | Clostridium novyi NT, complete sequence | 5 crisprs | cas3,csa3,DEDDh,DinG,cas2,cas1,cas4,cas5,cas7b,cas8b1,cas6 | 2 | 17 | 7 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_008593_1 | 152250-152357 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NC_008593_1
|
1 spacers
spacers of NC_008593_1
>1.1|152276|56|NC_008593|CRISPRCasFinder GCCCCCGCAACCAAACGTGGCGGAATAGCTCAGCTGGCTAGAGCATTCGGTTCATA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_008593_1
The CRISPR arrays of NC_008593_1 >merge|NC_008593|1|152250-152357|CRISPRCasFinder ACCCGAAGGTCGTAGGTTCAAGTCCTGCCCCCGCAACCAAACGTGGCGGAATAGCTCAGCTGGCTAGAGCATTCGGTTCATACCCGAAGTGTCGTAGGTTCAAGTCCT >NC_008593|1|1|152250-152357|CRISPRCasFinder ACCCGAAGGTCGTAGGTTCAAGTCCT GCCCCCGCAACCAAACGTGGCGGAATAGCTCAGCTGGCTAGAGCATTCGGTTCATA CCCGAAGTGTCGTAGGTTCAAGTCCT
>NC_008593.1|WP_011721147.1|151552_151960_+|RNA-binding-protein-S1 MALKLGSILEGTVVNITKFGAFIEVEGKTGLVHISEVADTYVKDIREHIKEQDKVKVKVISVDDNGRLSLSIKQAMPTRKSVKPVEIDWEKEKKKATPNVNFEDAISRFLKDSEERFQDIRKHQNLKGNKYSKKS >NC_008593.1|WP_011721146.1|151225_151498_+|septum-formation-initiator-family-protein MKKKRKIKNVILTVMVIYACYIAVHQQITIKNKKIQLENCKVELQKVDDQHQKLVDTIKMSETNRYVEELARERLGFVKHGESAVVQKKD >NC_008593.1|WP_011721145.1|150751_151189_+|spore-cortex-biosynthesis-protein-YabQ MLIPIRSQFNLIAYSVLAGVLTGVLFDIYRIIRGMENPNKVLTFIEDILFWIFAAISVFAFLLYTGHVYVGIYLYLYIAFGLYIYIRLISIHFLRIQYKIINSILKFLRILKNIFFYFIETFFCKITGKNKLKNSLNKTQKKTKI >NC_008593.1|WP_011721144.1|150452_150746_+|sporulation-protein-YabP MEVKKETSLEEKKSNLILENRNKLQITGVVEVICFDEKLIILDTKLGTLTIKGEGLKVQKLDVQNGEVAIIGRINSCVYTTTESKKDKDSIIARLFR >NC_008593.1|WP_011721143.1|150067_150337_+|RNA-binding-S4-domain-containing-protein MRLDKYLKVSRIIKRRTIAKEACESGRVFINDKVAKPSTEVNENDIIEVKFANSSLKAKVVNIAHHVAKADAKTMYEIILDNTVANKED >NC_008593.1|WP_011721142.1|149699_149978_+|HU-family-DNA-binding-protein MNKSELITSMAEKSQLTKKDVEVALKAFIESVEEALMDGDKVQLVGFGTFETRERAERKGRNPRTKEEITIPAATVPVFKAGKEFKEIVNNK >NC_008593.1|WP_011721141.1|148146_149592_+|nucleoside-triphosphate-pyrophosphohydrolase MIKIVGLGPGSKDAITIGTLDMLKNSQNVYFRTEIHPNVNYLKELGVKFESYDNKYESSHAFDEVYESIAKDLVEKHKENEDLVYAVPGHPLVAEKSVNILLKLCEERNIETHIYPAISFIDAMMESLKLDPVNGIKVIDAFDIKNQILDKRVGTVITQVYNKFIASEVKLALLEYYKDDMEIYFVRAAGVKELEIIRKIPLYELDRQEDIDYLTSIYIPKDLKAAIDFQDLLDIMETLRGENGCPWDREQDHKSLKRSLIEECYEAIDAIEKDDDENLVEELGDILLQVVFHAQIGKEDGFFNINDIIKGICEKLINRHPHVFGDVLIDSSKEVSKTWEEIKHEEYGFESYTDELKHISKTLPALIRADKVQKKAAKVGFDWDDIEPALDKVIEEYNEIKSVYKSHNKSKITEELGDLIFSTVNVARFLDIDPEYALNYTIDKFISRFYYIETKVKELGKDITEMTLQELDEFWKMSKEQ >NC_008593.1|WP_011721140.1|146585_148115_+|polysaccharide-biosynthesis-protein MKKQSLIKGTFILGFAGIFARCIGMFFRIPLTILVGDEGLGYYQMAYPLYMLFIAIASGVPLAMSKMISEQNALGNKKGVIQVLKQALLLMIILGTGTSVIMLLFSGKLITFFKWDRKAYYSLIALGIAPFFISIISVFRGFFQGLQTMTPTAISQILEQVARVVVGIGLAILLLPKGVEYAAGGATLGAAAGGILAGIYLIFKYKKVTKNFDTRKVKLDSNIMDKLLKTAIPISLGAAVGTIMNVIDSIMVPQRLLQAGFSSREAAVLYGQLTGKAAVLVNVPLTLSAAICASVVPIISEAYFLNKRNQLNKNVLSSIKISTVIALPSLCGLYFLSSQVLNLIFRDQASGAMILKYSSLAIPFIILAQTTTVILQATSSKKMPIVNLLIGCIVKVIITSALVPIPNINVYGAIVGTISAYLVAVILNIRLIKKTLHIKIDLNKVFIKPAYASMAMILSVVFIYIKVYNYTMSNSIACIVAIFLGIVLYGMLMLLFGVIDYSELRSTKN >NC_008593.1|WP_011721139.1|145936_146488_+|stage-V-sporulation-protein-T MKATGIVRRIDDLGRVVIPKEIRRTLRIREGDPLEIFTDRDGGVILKKYSPIEELSNFSKEYAEALQSTIGNIILICDKDNIISVSGATKKEYMDRKISIELERLMEERSSAIMGEDNEKPIPITDDEETGEEYYSQVIAPIIAEGDAIGAVIIASKEEETSFGDVEIKLAEAAASFLGKQME >NC_008593.1|WP_011721138.1|144479_145526_+|peptidylprolyl-isomerase MKNIRKLVATVAVCVFSMSAVGCSMIEKTPEAINKTVVAKVGDKKITKGELDSNFAVKRYEEQFKAQYGDKYAENPQVKEQLKQVKVATVQQMAAQEALKQEAEKLGLVPKEAELKKETDKKIQEMKKEQNIKSNEEFEKMLKASGFTKEGFESLVRDNIILEKLQNELTKNVKVDEKEMQKYYETHKDKYPKDVKNPTKVHLAHIILQPKSQEDLAKCESEIKSIKEELNKGAEFSVLAKKYSQDGSKEKGGDLGTVPTVDSGFDEQFMEAALPLKDGQISEPVKTQFGYHIIKMIKKEVKPCKTFAEVKNEINKFLLEEKKGKIIKDKFKQIQDNAKVKVFEDKIS >NC_008593.1|WP_011721148.1|153013_155410_+|stage-II-sporulation-protein-E MQCNSEILPYKRVKGVSKEEKEKKQLQRIIILKNLVYCISALLVSRVLLLSEDNTTAPFGIALLIASVMQAERAVFPVSMGCIIGYISLSNKLTNLPQYLIVTGTIFILSYLLNKKSKIKSLVVMFSITSIEILLSEFFIRHITMNVAFLTMFLQVICIIPLYFILERSLICLKSLKTKHLFTSEEVISISILISLILAGTWGMQILGVSIRNILALNFILMISYINGSNVGAASGIAIGSIIGISSKNILIFMSVYGLCGLIAGIFRESGKILTSTSYVITFLILKLYSNIDVEFKLIEMIIATGIFLIIPGRVYEKINLELDWEKKQEYINKNYINRIKDMLFQRLYGFSDVLTNISGNLNNLADNDKLVMKNKSSALIQNLADRVCSGCEMHYNCWKKEAYITYEAFGELIQNHQEGKKNKLPKEINRKCVKRTILLNNTKDIVNNYIINEMWRKRLSEGREIVAGQIKNMASSLKEVIEEFNSDVKFNSEAEKRIRKIFENKTFKYNDIFCYDDKNKRLVVKLYLKSCGGAQICSKKVLPLINEAVGKNMCISDEGCIIDPKTGMCTITFEQTAKFHVASYVGRQCKNGEKHNGDSYSFGKTNDGDYMCIISDGMGSGPEASEESRVAVDLIEKFTHFGISKETAINTVNSIMSLKFSENEKFSTLDLSSLDLYNGEIDFMKVGAVPSFIKSGDKVEVVTSNTLPIGVLDKVDLEVTHKKLKSGDMIIMLSDGVLDYNNNNVGKVDWVVDYLKNSNINSPKELVDGLISTAKMLSGGKAKDDMTAIVSKVYSLY >NC_008593.1|WP_039243092.1|155530_156940_+|tRNA-lysidine(34)-synthetase-TilS MGGFILIEKVINTIKCNNMFEVNDKVVVALSGGPDSICLLHILHTLKDEINISIVAAHVNHCLRGEAADNDEMYVKKICEELGIQCFVKREDVHRISKERGISCEMAGREVRYQFFEEVLHKINGNKIAIAHNANDQAETVLMRILRGTGLEGLVGIRPVRDNIFVRPIINLTRDEIENYCDINKLNPRIDKTNFENIYTRNKIRLELIPYIQKNFNSDVIEVLNRFSDTVKVDNEYINNVAKEKYNEYSEISEEKIILKGQLFKEHEAILTRVIRIAIKNIKGNLNNLEKNHIYDIIDIQKKSTGKYIMLPSGIRVTNNYGDIYVYKEEKKHKVQKINKEVELNLLEENVLTNHKLKITLDIIKSKEDIKFDKNPLIKYFDYDKIKGVIKLRYRKNGDKFMPFGMSGSKKLKDLFIDLKIPKERRDSIPLITFGDDIAWIVGYRISDKFKINKDTKSILKIKIEREEE >NC_008593.1|WP_011721150.1|156941_157481_+|hypoxanthine-phosphoribosyltransferase MTNDIKEVLFSEEKLKAKVQEIGKKITEDYKGKQLILVGILKGSVPFMADLMKCVEMPCQIDFMDVSSYGNSTESSGVVRILKDLEFEVEGKDILIVEDIVDTGTTLEYLKRYLKAKKPNSVEVACLLNKPDRRKVEVEVKYEGFKVPDEFLVGYGLDYAEKYRNLPYIGILKESVYTK >NC_008593.1|WP_011721151.1|157551_159582_+|ATP-dependent-zinc-metalloprotease-FtsH MGGINVKKRLSSATIWIVLLIVLFFAAITVLESSKTSGAISYNEFKKYWIENKVSRVEIKQDGRTVAGELNDKAKTQFQVVVPQSLLVQDILVNNPKSSVNVKFEPASSMPMWISWIPTIILILVMVGFWVMFMQQSQGGGGGNRGVMNFGKSRAKLATPDSQKVTFKDVAGADEEKGELEEIVDFLKEPKKYLDMGARIPKGILLVGPPGTGKTLLAKAVAGEAGVPFFSISGSDFVEMFVGVGASRVRDLFEQAKKNSPCIIFIDEIDAVGRQRGAGLGGGHDEREQTLNQLLVEMDGFGVNEGIILVAATNRPDILDKALLRPGRFDRQILVGAPDAKGREEVLKVHVRNKRLSDDVDLKVLAKRTPGFVGADLENLMNEAALLAVRANKKQIGMEELEEAITRVIAGPEKKSRVIHEEDRKITAYHEAGHAIVMKFSPHSDPVHEISIIPRGMAGGYTMHLPERDTSYMSKSKLKDEMVGLLGGRVAEQIIIGDISTGASNDIQRVSNIARKMVMEYGMSEKLGTITFGSDHDEVFIGREIGKSKNYSEEVAFEIDNEVKALVDEAYKKAEKILTEHIDKLHAVAKVLLDKEKVTGEEFNAIVEGRPLEELNKKENAIDLEKHDNVEEVHDDVEGVHDDVEGVNIKDTSEDNIETTDAFANNTDLEEDKKEI >NC_008593.1|WP_011721152.1|159724_160111_+|thioesterase-family-protein MEFNVHEGTKGIMEMVVEDQHSAKRVGSGLVDVFATPSMIALMENTSQASVKDSLPEGYATVGIDISVKHMKATPIGMKVRCETKLIKVDRKKLVFEVEAYDEDGKIGEGTHTRYIVNSEEFVKNVQK >NC_008593.1|WP_011721153.1|160212_161883_+|formate--tetrahydrofolate-ligase MKSDIEIAQSANMKKIADIAKELGLGEDDIELYGKYKCKISLDVLKNKHNEADGKLILVTAINPTPAGEGKSTITVGLGQALCKLHKKAVIALREPSLGPVFGIKGGAAGGGYSQVVPMEDINLHFTGDMHAITSANNLLAAAIDNHIHQGNTLKIDSRRILFKRVMDMNDRALRHIVVGMGGKVNGFLREDGFTITVASEIMAILCLSNSLMDLKERFGNILVAYNLDGEPIYCKDLNVHGAMAMLMKDAIKPNLVQTLENTPAIIHGGPFANIAHGCNSILATKMAMKLGDYAITEAGFGADLGAEKFLDIKCRYGNLKPDCIVVVATIRALKHHGGVSKDELSTPDIEALSKGVSNLQKQIENMKKYGVPVVVAINKFITDSDEEVEFIKEFCDKQGVEVALAEVWEKGGEGGIALAEKVINVLDTQKSNFKCLYDEKLSIKEKMDIIAREIYGASGVDYDKSAEKDIKDIEKLGLDKLPICVAKTQYSLSDNPSLLGKPEDFRVNVREVKVSNGAGFIVVLTGNIMTMPGLPKVPAANKMDILEGGTIQGLF >NC_008593.1|WP_011721154.1|162006_162786_+|type-III-pantothenate-kinase MLFVLDAGNTNIVLGIYKGKELVLECRLGTDAKRTADEYGIQVLKLLSHNNIDPKDIEGVIISSVVPNIMYSIEHMIRKYFKIDPIVVGPGVKTGINIKYDNPKSVGADRIVNAVAAHALFEKPLVIIDFGTATTYCAVTKKGDYLGGAICPGIKISAAALFEKAAKLPRIELIKPPHVICKNTVSSMQAGIVYGYIGQVDYIVSKIKEEMIALGEGEPYVIATGGFAGLISEESKTIDEVCPFLTLEGLRVIYEKNKE >NC_008593.1|WP_011721155.1|162794_163760_+|tRNA-dihydrouridine-synthase-DusB MKIGKLSFNNNVFLAPMAGVTDIAYRGLCKEMGCGLVYTEMISAKGMYYDNENTKKLLKLSEEEKPVAAQIFGSDPKVMARACEILNEDDGVGIVDINMGCPAPKIVKNGEGSALMKNPKLAGEIVREMKKVSNKPVTVKFRKGFDNDNINAVDFAMAMEQAGADAVAIHGRTRAQMYEGKADWDIIRKVKESVSIPVIGNGDVFSAEDAFALKNSTNCDGIMVARGAMGNPWIFKQIQQAINEEEVIYPTPIEKIDLCIRHLNLAVHYHGELKGVREMRKHIAWYIKGIKKCTEIKNKINVEKDFNNVVKILTDYKEQLI >NC_008593.1|WP_011721156.1|163988_164468_+|transcription-elongation-factor-GreA MSDSKQYIMTAEGVKKLEEELEYLKTVKRREITEKIKVALSYGDLSENSEYDEAKNEQAFVEGRIVQLENMLRNANVVDESEISLDAVSVGSIVKVKDYDFDEIIDFHIVGSAEADPMENKISNESPVGSALIGKKVGDVINVPVPDGISKFEILEIRV >NC_008593.1|WP_141639411.1|164562_166050_+|lysine--tRNA-ligase MEAKKEAEFNALVKERMQKLENLQEQGKDPFDVYKVERTHTSQQVKDNYDELEGKNVTVAGRLMSKRVHGKAGFSDIRDRYGKIQLYIKINDVGEEKLKEYKTFDIGDFVSITGTVFKTKTGEITLHILDFQLLSKSLKPLPEKFHGLKDPDLRYRQRYVDLIMNEDVKETFMKRTAIIKAIREFLDNRDFLEVETPILSPIAGGAAARPFITHHNALDIDMYLRIATELYLKRLIVGGFEKVYEIGKNFRNEGIDVRHNPEFTAIELYEAYADYNDMMEITENMVAYVCEKVNGTTKVMYEGTEIDFKPPWRRITMVDAVKEYAGVDFNEVKTDEEAREIAKSKELELKKELKDCTKGDILVALFEEFGEEKLMQPTFVCDYPKENSPLTKKKRGNDELTERFEGFVYGREICNAYSELNDPIVQKERFMQQLKERELGDDEAYMMDDDFINALEIGMPPTGGLGIGIDRLIMFLTDSSSIRDVILFPTMKPTK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_008593_2 | 1853852-1855193 | TypeI-B |
III-B
Consensus repeat of NC_008593_2
|
20 spacers
spacers of NC_008593_2
>2.1|1853882|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT CAAATTTGAAAAAACTTGAAACTTTTTTAAATATAT >2.2|1853948|35|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT TCTCACTCTCAAGCAAATAAATTATTTAATTATGC >2.3|1854013|35|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT CAATTATGTCCACACTCAATATTATAAAGTCGATT >2.4|1854078|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT AATATTAAAGAAATTTAAAAAGAAGAAACATTTATG >2.5|1854144|37|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT AAAGATTGTCGAAAAACTAAAAGCGAACACTTGTAAA >2.6|1854211|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT AATTGGTGTTGAGCACCAATCTTTAGTTGTTATAGA >2.7|1854277|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT ATTGCCTCAATTACTTCGGGGGTTGCTAAATAAGTA >2.8|1854343|35|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT CTGTGTCAATTCTAAAATCTGATTTATCCATTCTT >2.9|1854408|35|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT ACAAACTAGACAATATAAACAAGAAATTTCAAGTA >2.10|1854473|35|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT TATTGGTGGGATAGTGAAGATGCATGTATTAGTGC >2.11|1854538|34|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT AATTCAAAATATTAGACCTGTAAATTTCTTTTCC >2.12|1854602|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT TGTAACAAAATTATATTTTTTTCTTCCTGGGAGTTA >2.13|1854668|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT AATGGCTACTAATAAAAAATTTAACTTTACAATCGA >2.14|1854734|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT TAATTTTACGATTGATGATGATAAGAGGTCTATAAT >2.15|1854800|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT TTCTATTTTTTCTTTTACCTCGTTAGGTGTTTCGTC >2.16|1854866|34|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT AAGATAAAACCGCAAGTAGGTGATTATGTAATAT >2.17|1854930|37|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT TTTCCAATGTTAAAGAGGAAGGAGGACAGAAGATGGG >2.18|1854997|38|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT GAAGTCCAGTAGACAAATGGGGGTGTACTGTGTGACGT >2.19|1855065|35|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT AAATATGTTCCAATCGAAATTGGAACAGATGAAGT >2.20|1855130|34|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT GGAAATTAAGTAACGAAGAAAGTGTCCAAATAGC >2.21|1853884|36|NC_008593|PILER-CR CAAATTTGAAAAAACTTGAAACTTTTTTAAATATAT >2.22|1853950|35|NC_008593|PILER-CR TCTCACTCTCAAGCAAATAAATTATTTAATTATGC >2.23|1854015|35|NC_008593|PILER-CR CAATTATGTCCACACTCAATATTATAAAGTCGATT >2.24|1854080|36|NC_008593|PILER-CR AATATTAAAGAAATTTAAAAAGAAGAAACATTTATG >2.25|1854146|37|NC_008593|PILER-CR AAAGATTGTCGAAAAACTAAAAGCGAACACTTGTAAA >2.26|1854213|36|NC_008593|PILER-CR AATTGGTGTTGAGCACCAATCTTTAGTTGTTATAGA >2.27|1854279|36|NC_008593|PILER-CR ATTGCCTCAATTACTTCGGGGGTTGCTAAATAAGTA >2.28|1854345|35|NC_008593|PILER-CR CTGTGTCAATTCTAAAATCTGATTTATCCATTCTT >2.29|1854410|35|NC_008593|PILER-CR ACAAACTAGACAATATAAACAAGAAATTTCAAGTA >2.30|1854475|35|NC_008593|PILER-CR TATTGGTGGGATAGTGAAGATGCATGTATTAGTGC >2.31|1854540|34|NC_008593|PILER-CR AATTCAAAATATTAGACCTGTAAATTTCTTTTCC >2.32|1854604|36|NC_008593|PILER-CR TGTAACAAAATTATATTTTTTTCTTCCTGGGAGTTA >2.33|1854670|36|NC_008593|PILER-CR AATGGCTACTAATAAAAAATTTAACTTTACAATCGA >2.34|1854736|36|NC_008593|PILER-CR TAATTTTACGATTGATGATGATAAGAGGTCTATAAT >2.35|1854802|36|NC_008593|PILER-CR TTCTATTTTTTCTTTTACCTCGTTAGGTGTTTCGTC >2.36|1854868|34|NC_008593|PILER-CR AAGATAAAACCGCAAGTAGGTGATTATGTAATAT >2.37|1854932|37|NC_008593|PILER-CR TTTCCAATGTTAAAGAGGAAGGAGGACAGAAGATGGG >2.38|1854999|38|NC_008593|PILER-CR GAAGTCCAGTAGACAAATGGGGGTGTACTGTGTGACGT >2.39|1855067|35|NC_008593|PILER-CR AAATATGTTCCAATCGAAATTGGAACAGATGAAGT >2.40|1855132|34|NC_008593|PILER-CR GGAAATTAAGTAACGAAGAAAGTGTCCAAATAGC |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7b,cas8b1,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_008593_2
The CRISPR arrays of NC_008593_2 >merge|NC_008593|2|1853852-1855193|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCTTGAATACATCTAATGTTAATGTTCAACCAAATTTGAAAAAACTTGAAACTTTTTTAAATATATATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACTCTCACTCTCAAGCAAATAAATTATTTAATTATGCATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACCAATTATGTCCACACTCAATATTATAAAGTCGATTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACAATATTAAAGAAATTTAAAAAGAAGAAACATTTATGATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACAAAGATTGTCGAAAAACTAAAAGCGAACACTTGTAAAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACAATTGGTGTTGAGCACCAATCTTTAGTTGTTATAGAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACATTGCCTCAATTACTTCGGGGGTTGCTAAATAAGTAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACCTGTGTCAATTCTAAAATCTGATTTATCCATTCTTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACACAAACTAGACAATATAAACAAGAAATTTCAAGTAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACTATTGGTGGGATAGTGAAGATGCATGTATTAGTGCATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACAATTCAAAATATTAGACCTGTAAATTTCTTTTCCATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACTGTAACAAAATTATATTTTTTTCTTCCTGGGAGTTAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACAATGGCTACTAATAAAAAATTTAACTTTACAATCGAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACTAATTTTACGATTGATGATGATAAGAGGTCTATAATATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACTTCTATTTTTTCTTTTACCTCGTTAGGTGTTTCGTCATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACAAGATAAAACCGCAAGTAGGTGATTATGTAATATATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACTTTCCAATGTTAAAGAGGAAGGAGGACAGAAGATGGGATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACGAAGTCCAGTAGACAAATGGGGGTGTACTGTGTGACGTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACAAATATGTTCCAATCGAAATTGGAACAGATGAAGTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACGGAAATTAAGTAACGAAGAAAGTGTCCAAATAGCATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC >NC_008593|2|2|1853852-1855193|CRISPRCasFinder TCTTGAATACATCTAATGTTAATGTTCAAC CAAATTTGAAAAAACTTGAAACTTTTTTAAATATAT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC TCTCACTCTCAAGCAAATAAATTATTTAATTATGC ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC CAATTATGTCCACACTCAATATTATAAAGTCGATT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC AATATTAAAGAAATTTAAAAAGAAGAAACATTTATG ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC AAAGATTGTCGAAAAACTAAAAGCGAACACTTGTAAA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC AATTGGTGTTGAGCACCAATCTTTAGTTGTTATAGA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC ATTGCCTCAATTACTTCGGGGGTTGCTAAATAAGTA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC CTGTGTCAATTCTAAAATCTGATTTATCCATTCTT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC ACAAACTAGACAATATAAACAAGAAATTTCAAGTA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC TATTGGTGGGATAGTGAAGATGCATGTATTAGTGC ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC AATTCAAAATATTAGACCTGTAAATTTCTTTTCC ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC TGTAACAAAATTATATTTTTTTCTTCCTGGGAGTTA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC AATGGCTACTAATAAAAAATTTAACTTTACAATCGA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC TAATTTTACGATTGATGATGATAAGAGGTCTATAAT 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>NC_008593.1|WP_011722690.1|1852647_1853601_-|MBL-fold-metallo-hydrolase MKRFSEYKIKFIESLILCFMLMLGIRFTSFADTKTFSSEIVDTQKTKDKVMITNGNENIKIHYIDVGQGDSALVQQDGYTMLIDAGPNSAENILVNYIRGLGIKRLDYVIGTHPHEDHIGGLDKVIDNFEIGTLLMPKKIANTKTFKDVLLAAKHKGLNITQPIIGTNYNLGKATFRILAPKDHAYKSTNNYSIVQKLRFGNRSFIFTGDAEKFSESEILQLGYDIKADVLKVGHHGSKTSSTNSFLDKVNPKYAVISCEKGNCYGHPHKVIMDKLKSRNIKVYRTDECGTIIATSNGEDISFNCKEGTYNNGQTNP >NC_008593.1|WP_011722689.1|1851189_1852560_+|sodium:alanine-symporter-family-protein MDNLEKILSLVNSWIWGKWLVFILLGLGVLYTIANGFIQIRHFKFIMKKTLIDSFKARNVEKGQGSISSFKAMMVTLAGNVGGGNVVGVATAIVAGGLGSIFWMWFAAFFGMALKYGEIILSQLYRGKDSEGNLLSGPMYYIKDGLKLPWLGVVIAIFMCIKMMGANLVQSNTISGILNSNYKIPTWITGILLITFLMTITLGGLKRVVDIATALVPIMSIFYIITGILVILLNIQNVPHVFATIFTEAFSFKAVGGGVGGIVIAKAMQFGITRGMYSNEAGEGTAPFAHGSTIVSHPVEEGILGVTEVFLDTIVVCTITALVIGVTNAHTSGLPATVMAISAFGTIWAPLKHAATFALLLFCFTTLIGQWFNAAKSFTYAFGPKVTSTCRYIFPFLCIIGALTKISLVWTIQDLAMGLVVIPNMIALIALFPRVREQTKDYFSKQKDVSVNSENF >NC_008593.1|WP_011722688.1|1850434_1851160_+|glycerophosphodiester-phosphodiesterase MIKNFAHRGFSSKYPENTLLAFEKAIELGVDGIELDVHLSKDNEMVIIHDENVSRTTNGEGYIKDLTYEEISKLDASYIYTGQYGFNKIPTLREYFELVKDKDVITNIELKTNIFEYPGIEQKVWELIQEYHLESKVIISSFNHFSVMRMRKIAPMLEYGLLSETWLIDAGNYVNNLGIKYYHPIFRNLTDEIVKEIHQYGIKINTYTVNTEEDIKDMISKDINIVISNFPDLVKEIMKTY >NC_008593.1|WP_039243185.1|1848456_1850058_-|ClC-family-H(+)/Cl(-)-exchange-transporter MEGENKNGTYNTLMHWHDFRLKLVLEGAAVGFFAGLIVVLYRFGVETIWNFTRKHFVENVHTMTTVVLWFFIFIVIALIIGQIVKKEPMISGSGIPQVEGILLRKLKMNWFTVIIGKFLGGILAIGGGLSLGREGPSIQIGASVGQGFSRIFKRINVEEKYLITSGASAGLAAAFNAPLAGVMFALEEIHKNFSPLILISAMSASLTADCVSKKFFGLRPVFDFHLISPIPLKYYLYLIILGIITGVFGVAFNKMILKTQDIYGKAKWLKPEFRAIVPFGVAIILALVYPNGLGSGHGLIMHLFHENWTLKMLLVILIVKFFFTMICYGSGVPGGIFLPLLIIGAITGNIYGEILVKLINLDPMYIRNFIVLAMAAYFTAIVRAPITGSILITEMTGSFSNLLSLSVVSIVAYVVADALKSSPIYESLLERFISKNNSGENKFIGNSSNKVLLEVAVCLGTSLEQKKIKDIKWPESCLLVAIKRGQKEIIPRGNTTIFAGDYIIVLVDEDKASDIREVLVDMAAEPLIEKSNS >NC_008593.1|WP_187146710.1|1847799_1848396_+|superoxide-dismutase MMFKLPNLPYDYNALEPYYDEETVRIHHDKHHQAYVDGLNKAETKLMEARESGDFSTIKHWERELAFNGAGNILHTLFWENMIPGGSEPTGEIINRINKDFGNFDNFKNQFSAAAAAVEGSGWCALVWIPRFEKLEILQIEKHQDLAILGATPLLLLDLWEHAYYLKYQNRRADFIKAWWNIVNWNIVNERYLNSINK >NC_008593.1|WP_011722685.1|1847332_1847632_-|hypothetical-protein MGKFNSVKRKIYFKIYKRRENTNITKIIKNSMYVKQNINNESVIGYIKFINEIDIPSRNLCKNIIIETYKEIKKNINVKDSIKSDLRILLECKGVSFIY >NC_008593.1|WP_011722684.1|1845782_1847054_-|uracil-xanthine-permease MSENTILKENVQIKGTSKTLQVGKKMILALQHLIAMFGATVLVPILTGFDPSIALLSAGIGTLIFHLCTKRKVPVFLGSSFAFIGSIIMVRDKFNGDLAYAQGGIMIAGFIYIIMSLIVKKIGVDKIRKVLPNHVVGPMIIVIGLTLIPTAFDMASNSFVVAGLTLAIALIITLKGKGFLKQLSILIAVIVGYLVSLKLGIVDTNIIANAPLVSMPNFRLPKFNMGAICIIAPVVLAVFMEHIGDITTNGEVVGKNFIEDPGLHRTLLGDGLATSVAALIGGPANTTYGENTGVLAITKNYNPQILRITAVFAICLGFIAKIGGFLRSIPVPVMGGISLMLFSMISIIGFKTLGKGKVEFNVKNIIVIATIIIVGLGTSYVEKFTGVTLGIPVTAGVKITGLSLAAIVGVILNIIINKQSKVN >NC_008593.1|WP_011722683.1|1844110_1845601_-|spore-germination-protein 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>NC_008593.1|WP_011722681.1|1841881_1843009_-|germination-protein MKYSLIKKVYLVIGFLIFIISYVTNINKFVAIENLDIPIAIGYDLKGGSTKNPIYSVSIAVYQFLTGNQQLDTIVIGGDAESITNTREDRQTKSNKKFILGSEKVLLINKEVAEKSIYPIANTLFNNTYANDTARVAIFNGDTEDALNFKVRGYNSAADYIRGMIDSSVNYNFFSDNYKMIDIYTRLVGEGRNVILPYIEIKDGIFQMTGVAIFNKDKLEYVVSIGEAQVINLLRENRVSGIVHIEDKDGHNTNLDGISRKKVTCKKEGDKYKFDINILLESDIIENEIYKGVTNNPNITKKIEKDAEEVVKRASEKFITKMKQEIKVDCLELGKVAAAKYGRKTDIDWNKVVCESEINVNVKVKLRRVGRGMLR >NC_008593.1|WP_011722691.1|1855377_1855665_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MSKNMNYNYAFLFYDVKEKRVNKVFKVCKKYLTHYQRSVFRGEITPSKIIKLREDLKKVIDEREDFICIIKLLNNKVFGEEVLGIDIETAEDLIL >NC_008593.1|WP_011722692.1|1855664_1856663_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGSTKYLMSMGELSRKDNSLCFRKNNKNTYIPIENVKEIYCLSEISLNTKLLDFIAHNNIVMHFFNYYGGYSGTFYPKESLVSGRLLVKQVEAYKNRRIEIAKEVVRGIGENIHEVMYHYYKHDIFEVKELLDWIKGEFQSKLDNVQDIKSLLQIEGEVWQRFYSNFKYILPEDFIMNKRVKRPPDNPINAMISFGNSMLYSKTVAVIYNTHLDQKISFLHEPSEGRFSLSLDLSEVFKPIITFKTIFELVNRKKIQVSKHFDKNLNYCIMNEAGKKIFITAFEERLESIFEHPKLKRKLTYKTAIKLDCYKLIKTILEEKEFKPFRLKEKM >NC_008593.1|WP_011722693.1|1856675_1857170_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKVNGTLVNYYIHCKRQCYLHGNRINMESNSEDVKIGKAIHKIKEEHSKNTEVAIENIKIDKITKEYLVEVKKSDADIEAVRWQVLFYLKVLKDKGINKKGKIEVVEKKKGTNKIIYEELTDEKEEQLKNIISDIEKLIESENPPKVEFDNKCKKCAYYEYCYI >NC_008593.1|WP_011722694.1|1857178_1859800_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_008593_3 | 1864520-1866264 | TypeI-B |
III-B
Consensus repeat of NC_008593_3
|
26 spacers
spacers of NC_008593_3
>3.1|1864550|26|NC_008593|CRISPRCasFinder ATTTTTAAAATTCAAAAGTTAATTAC >3.2|1864606|53|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT AAATAATTTTTTCTCTTTTATTATAACATAATTGCACCTCATACGAATATTAA >3.3|1864689|35|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGAATTTACAATAGAACAAATAAAGTTTGTAGCTT >3.4|1864754|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTAATTAAAAAAGATTATTCAAATATTTATAAATC >3.5|1864820|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAGCCCCGTTATAACTTGAATAAGCGTTATTAAAG >3.6|1864886|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTCAGGCGGAAACATGAACAAAACAGTAAACATAA >3.7|1864952|37|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGCAATTCTTTATTAGTTAAAGCAATTCTTTTCGCC >3.8|1865019|35|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACAAACCTCACCGATATATTATAGTGGTCAGATGA >3.9|1865084|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAACAAGCTGGTAAAAAGAAGAATGATAGTATAAG >3.10|1865150|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTATGTCAACAACCTGTCCTATTAAAGCGTCCAA >3.11|1865216|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATTGCTCTTCTTTACTTTGAACCTTTTTATCTTTG >3.12|1865282|35|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTAATAAATTCAAGGAAATCATTATTTCCTTTAC >3.13|1865347|34|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTGAAGAAACAACAAATTTAACTGCAGCTGAAAA >3.14|1865411|37|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGCAAATTGTATAAGCAAGTGTGAATTTCTTACTTT >3.15|1865478|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTACAAGAAATGGTTAAGGAAATAAAAGAAAATAT >3.16|1865544|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTAATTTTTAAAATATTTTTATCTTTACAATTCTA >3.17|1865610|35|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAAAATAATAAAGCATTACTAAGTACAACAATTAG >3.18|1865675|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTCTACTCAAATGGGATTCGACAAATCAGAATCGG >3.19|1865741|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGAAACTTTTCCAAATGGAAATTACAAGTATAGAGA >3.20|1865807|35|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACATTTAGCAAGAAAGATGATATAACTGTAAAAGT >3.21|1865872|35|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAAATTGCCAACACTAAACTATTCTATTCTACGGA >3.22|1865937|34|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATCTAACGATTAGTGAGATAGACAAAATGAGCG >3.23|1866001|35|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAGAATTTTTTACTCAGCATAGGCATTTAGGCTT >3.24|1866066|35|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTGATAATAATTCTTATAATAGGAATTTAATTTT >3.25|1866131|38|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGACCGACTGATTCTTCATATACTTCATAATCACCATG >3.26|1866199|35|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGTTAAATGCTCCTGTTTTGTCGTTTGTAGCTTTG |
cas6,cas8b1,cas7b,cas5,cas3,cas4,cas1,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_008593_3
The CRISPR arrays of NC_008593_3 >merge|NC_008593|3|1864520-1866264|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTAGTATTACATCTCATGTTAATATTCATTATTTTTAAAATTCAAAAGTTAATTACATTTAAATACATCTTATGTTAGTTGTTCAAAAATAATTTTTTCTCTTTTATTATAACATAATTGCACCTCATACGAATATTAAATTTAAATACGTCTCATGTTATTGTTCAACTGAATTTACAATAGAACAAATAAAGTTTGTAGCTTATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAACTTTAATTAAAAAAGATTATTCAAATATTTATAAATCATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAACAAAGCCCCGTTATAACTTGAATAAGCGTTATTAAAGATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAACTTTCAGGCGGAAACATGAACAAAACAGTAAACATAAATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAACTTGCAATTCTTTATTAGTTAAAGCAATTCTTTTCGCCATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAACACAAACCTCACCGATATATTATAGTGGTCAGATGAATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAACAAAACAAGCTGGTAAAAAGAAGAATGATAGTATAAGATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAACATTTATGTCAACAACCTGTCCTATTAAAGCGTCCAAATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAACAATTGCTCTTCTTTACTTTGAACCTTTTTATCTTTGATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAACCTTAATAAATTCAAGGAAATCATTATTTCCTTTACATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAACGTGAAGAAACAACAAATTTAACTGCAGCTGAAAAATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAACTTGCAAATTGTATAAGCAAGTGTGAATTTCTTACTTTATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAACATTACAAGAAATGGTTAAGGAAATAAAAGAAAATATATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAACTTTAATTTTTAAAATATTTTTATCTTTACAATTCTAATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAACCAAAATAATAAAGCATTACTAAGTACAACAATTAGATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAACTTTCTACTCAAATGGGATTCGACAAATCAGAATCGGATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAACCGAAACTTTTCCAAATGGAAATTACAAGTATAGAGAATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAACACATTTAGCAAGAAAGATGATATAACTGTAAAAGTATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAACGAAATTGCCAACACTAAACTATTCTATTCTACGGAATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAACAATCTAACGATTAGTGAGATAGACAAAATGAGCGATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAACTTAGAATTTTTTACTCAGCATAGGCATTTAGGCTTATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAACGTTGATAATAATTCTTATAATAGGAATTTAATTTTATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAACTGACCGACTGATTCTTCATATACTTCATAATCACCATGATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAACCGTTAAATGCTCCTGTTTTGTCGTTTGTAGCTTTGATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAACC >NC_008593|3|3|1864520-1866264|CRISPRCasFinder GTAGTATTACATCTCATGTTAATATTCATT ATTTTTAAAATTCAAAAGTTAATTAC ATTTAAATACATCTTATGTTAGTTGTTCAA AAATAATTTTTTCTCTTTTATTATAACATAATTGCACCTCATACGAATATTAA ATTTAAATACGTCTCATGTTATTGTTCAAC TGAATTTACAATAGAACAAATAAAGTTTGTAGCTT ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC TTTAATTAAAAAAGATTATTCAAATATTTATAAATC ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC AAAGCCCCGTTATAACTTGAATAAGCGTTATTAAAG ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC TTTCAGGCGGAAACATGAACAAAACAGTAAACATAA ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC TTGCAATTCTTTATTAGTTAAAGCAATTCTTTTCGCC ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC ACAAACCTCACCGATATATTATAGTGGTCAGATGA ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC AAAACAAGCTGGTAAAAAGAAGAATGATAGTATAAG ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC ATTTATGTCAACAACCTGTCCTATTAAAGCGTCCAA ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC AATTGCTCTTCTTTACTTTGAACCTTTTTATCTTTG ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC CTTAATAAATTCAAGGAAATCATTATTTCCTTTAC ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC GTGAAGAAACAACAAATTTAACTGCAGCTGAAAA ATTTAAATACATCCCATGTTATTGTTCAAC 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>NC_008593.1|WP_187146694.1|1864256_1864415_-|hypothetical-protein MKNIRSFLANISLIKILIIKIYYYILLIDKRLYKNKERQFKLNIDIEVYNLK >NC_008593.1|WP_011722698.1|1863436_1864129_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MEVFEEKVKVYLLNDVRREYMSVKIAQIIDKILCKSEEFSKFHEENKFKMYCFNGFYPIEKSEVYKKGKIYDFSIRTVDESLAKFIKENLVNEYTECIKVLTIQEKIIHERYIEKIYSIMPVILKTTQGYWRKNLRLEDFERLIKENLIKKYNQYYNTKIDENFSLYDNLIFNNNKPVPMKCKNITLLGDKITLFISSNETAQKLAHFALGVALGENSARGAGFCNYKWL >NC_008593.1|WP_011722697.1|1861639_1863424_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b/Csh1 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NC_008593_4 | 1867121-1870431 | TypeI-B |
III-B
Consensus repeat of NC_008593_4
|
50 spacers
spacers of NC_008593_4
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cas6,cas8b1,cas7b,cas5,cas3,cas4,cas1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_008593_4
The CRISPR arrays of NC_008593_4 >merge|NC_008593|4|1867121-1870431|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT 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>NC_008593.1|WP_011722700.1|1866811_1867072_-|DUF4160-domain-containing-protein MPEISLFFGIRVTINYNDHVPPHFHAEYNGNKVLVDIINCKVIKGFFPKRQLKLILAWAEIHKDELMQNWELARSHQPLYRIAPLS >NC_008593.1|WP_011722699.1|1866485_1866800_-|DUF2442-domain-containing-protein MEYMPEVIQVIPTDNFKVYVYFDDGSIHLYDASYLIKNGVFKVLQDINLFKEKCTVLNGTLAWSLDDSYDESTCLDIDPFVIYEEYPEVDEPEFIFNISDKLKL >NC_008593.1|WP_187146694.1|1864256_1864415_-|hypothetical-protein MKNIRSFLANISLIKILIIKIYYYILLIDKRLYKNKERQFKLNIDIEVYNLK >NC_008593.1|WP_011722698.1|1863436_1864129_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MEVFEEKVKVYLLNDVRREYMSVKIAQIIDKILCKSEEFSKFHEENKFKMYCFNGFYPIEKSEVYKKGKIYDFSIRTVDESLAKFIKENLVNEYTECIKVLTIQEKIIHERYIEKIYSIMPVILKTTQGYWRKNLRLEDFERLIKENLIKKYNQYYNTKIDENFSLYDNLIFNNNKPVPMKCKNITLLGDKITLFISSNETAQKLAHFALGVALGENSARGAGFCNYKWL >NC_008593.1|WP_011722697.1|1861639_1863424_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b/Csh1 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MNTMTREENMNKFRSEVAKGNILVGVGAGTGITAKSSEAGGADMLIIYNSGRFRMAGRGSLSGLLSYGDANQIVVEMGAEVLPVVKNIPVLAGVCGTDPFRVMDVYLKQLKDQGFNGVQNFPTVGLIDGVFRQNLEETGMGYGLEVEMIRKAHELDMLTCPYVFNPEQAKAMAEAGADILVAHMGLTTKGTIGAKTAVTLDDCIVRIKEIIKAGKAVNPDIMVICHGGPIAEPDDAKYVIDAIPEIDGFFGASSIERFAAERGIKEQAASFKAIKK >NC_008593.1|WP_011722707.1|1879709_1880921_-|Tm-1-like-ATP-binding-domain-containing-protein MKTVAIAGTFDTKGEEFLYVKNLFEEIGINTLTINTGVFKPTFEADISNEEVIKAVGYDLKEIVEKKDRALATECLSKGMEILVPKLYKQGKFDGIISFGGSGGTSLVTPAMRALPIGVPKIMVSTMASGNTEQYVGTSDVILIPSIVDVAGLNAISTKIFKNAVFAMAGMLKHDTKEVRNNKPLIAATMFGVTTPCIDKAKEYMEDRGYEVLVFHATGTGGKTMESLIDGGYFKGVLDLTTTEWCDEIVGGVLNAGPNRCEAAIKNNIPQVVSVGACDMVNFGPYDTIPEKFKGRKFYKHNPTVTLMRTSIDECKKIGDKLAEKWNKSNGNTTVMLPLNGVSMIDYSGQPFYDKEADSALFNTLRNKLDKSKVNIIELENGINDEEFAKQAAQKLIDMIENK >NC_008593.1|WP_011722708.1|1881112_1882288_-|phosphoenolpyruvate-hydrolase-family-protein MNDILDKLKKRIKSNGHIIGIASGSGLTSKYSTMSGADIVLALSAGIFRKMGRSSLASYMCYSNSNEVVMNFGTRELMPLIKNTPIFFGINATDPTIKLKEYIMEIKEQGFAGINNFPTVGLIDGFFREKLEEEGISYKKEIEAIKIASELGLMSIAFVFNEEQAREMINAGAEIICVHLGLTCGGFMGAAKVLSLEVAKQLANRVFEVCDKMNPNIIKLVFGGPIKTPIDAQFFYQNTSCQGFIGGSCFERIPVEKAIIDTTKAFDNVGKYDEDKAILKELNNGSEEDCVEYVKKYIHDFYMKPIYIRELSESIHISSSYLSTKFKKKVGISFTEYLVTFRINKACEILLNKSIPIKTVANMVAYDDYSQFSKIFKKYTGKTPKEYREQF >NC_008593.1|WP_011722709.1|1882488_1883487_-|GGGtGRT-protein MALFEGYERRIDGINTVLKKYGMNSIEDAKKVCDEKGINVYDIVRSIQPICFENACWAYTLGAAIAIKNGCTSASDAAKNIGEGLQAFCIPGSVADDRKVGLGHGNLGAMLLSEDAKCFAFLAGHESFAAAEGAIGIAKSANKVRKEPLRVILNGLGKDAAQIISRINGFTYVQTQFDYYTGELKIVKETAYSKGERAEVRCFGADDVREGVAIMHHEGVDVSITGNSTNPTRFQHPVAGTYKKECFEMGKKYFSVASGGGTGRTLHPDNMAAGPASYGMTDTMGRMHSDAQFAGSSSVPAHVDMMGLIGMGNNPMVGATVAVAVAIEEAMK >NC_008593.1|WP_011722710.1|1883504_1884197_-|iron-sulfur-cluster-assembly-scaffold-protein MNYTNEVAKMTCVAKGPNHGPAPIPEEGKWVSAKEIKDISGLTHGVGRCAPQQGACKLTLNVKEGIIQEALVETIGCSGMTHSAAMAAEILSGKTILEALNTDLVCDAINTAMRELFLQIVYGRTQTAFSEGGLPVGAGLEDLGKGHRSQVGTMYSSAAKGPRYLEMVEGYVTKTGLDENNEIIGYEFINFGKMMDMIKQGMDANEAMKKATGNYGRFADAVKVIDPREE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_008593_5 | 2514547-2514651 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NC_008593_5
|
1 spacers
spacers of NC_008593_5
>5.1|2514572|55|NC_008593|CRISPRCasFinder TATCAATGTGTACTGATGTGTACTTAAATCCCCTCAAACCCTTGATATAAGTGGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NC_008593_5
The CRISPR arrays of NC_008593_5 >merge|NC_008593|5|2514547-2514651|CRISPRCasFinder TTAGTACACATTTTTTATCTGTACTTATCAATGTGTACTGATGTGTACTTAAATCCCCTCAAACCCTTGATATAAGTGGATTAGTACACATTTTTCATCTGTACT >NC_008593|5|5|2514547-2514651|CRISPRCasFinder TTAGTACACATTTTTTATCTGTACT TATCAATGTGTACTGATGTGTACTTAAATCCCCTCAAACCCTTGATATAAGTGGA TTAGTACACATTTTTCATCTGTACT
>NC_008593.1|WP_039243293.1|2512288_2514109_-|glycerophosphodiester-phosphodiesterase MKHFVNELKGMVDDFKYGWSEFFKYEIVTKLILTILIIPIFSFLINVLMKNKGFSVISNNQILKFGMSKQGVLAIFIFYIMAVFVILIEIGGLIVIGNQILTKKKKYKFYSILGFCLKKSPKFIGIGGVYAVFFYLVFANLIGIESYSVFGIPLKVPGFIQSYIDENLWMFITEIIILVLILMIFISWIFTFHFIILENKSAKNAQRESWRLIKNNFRIFIKHFLIIAIFTGFIFLISYVTWMIILHQLMYRVNYNVYLGKVFIIAIILIRKFLGILVFFILTPIQIHWITRLFYILRNKEDKNIINIDLKVKERPSLLDKIFLRKKIFIFILSLVLIILSLSIGLVIDSALDMMYDVKVTSHRGNVERAPENTLASVREAIKANADFAEIDVVESKDGEIFLCHDINLKKNIGIDKEAWQLNYDDIKDYNNKVNPTRTYEDKKMPLLTHCIDLAKGKIKLNIEIKASPNEKDIVKKVVDIIKEHNFEKGCVITSLDYETIQEVKRLDPKIKVGYIMFLAKGDIEKLNVDFYSMEESLVSPDTVYIAHSMGREVHVWTVNNINNMKRFIDMGVDNIITDKSEELIYLLKELKSDSPHEKFFKMITK >NC_008593.1|WP_011723244.1|2511322_2512054_-|MBL-fold-metallo-hydrolase MKITVVGYWGAFPEKDEATSGYLLQSGDHNILIDCGSGVLSKVQNYLPLSKIDAVILSHYHGDHAADIKALQYSAQIDIKNGTRQNELQIYSHDLSDDYKSLTLEGISKWHKIDDATEIQIGDLNVSFKWGKHPVPSLAMRFEENGKLFVYSGDTEWCNGILDISKDADLFICETNFLNKDTGRGKGHLTSGEVGKIANMNNVGKLVLSHLPHNTDLNELLNEAKEEFSGQIYKAYSGEVFEL >NC_008593.1|WP_011723243.1|2510440_2511328_+|phosphatidylserine-decarboxylase MIKVFNRKEKIYDIEKVAGDNYLKWIYSSPVGLNFLELMIKKKFFSKLYGKYCDSKHSAKKVSKFIDDFNINEKEFTLKKSDFKSFNDFFYRKLNNDARPIINDENILISPADGRLFAYENIDIHNLIQVKGLTYSLDELLKNIELAEKYIGGTCLLFRLAPVDYHRFHFIDDGICEEAVKISGSYYSVNPIALEKVPKLFCENKREYSIFHSKHFGDVLYVDVGATCVGSIIQTYTPNEYVVKGDEKGYFKFGGSTIILFFEKDKIIVDKDIVEQTQKGFECKVLMGEKIGTKL >NC_008593.1|WP_011723242.1|2509639_2510374_+|TIGR02206-family-membrane-protein MTCLKNLYVFWKALDESKSISLFSHAHVISLIIITLLCIFIYIYRNSLVEHSKEKFISHAIAYILILHQVSIYAWYISNNKLVLQECLPLYPCRISIILSIIMLFNKSKNLFDILYFWGLGGASIALIFHDTTLYPFPHYIFIQFFISHGGIVISVLFMIFVHKYRPNLNSLKKTLIYTSLYFAVTIKVNYLTNSNYCYLRENPNLYSFNFIPKNELFICISTLLSFFFFFYILYIPFKNKYRT >NC_008593.1|WP_011723241.1|2508908_2509352_-|nucleoside-deaminase MDKKFMEIALDEAKIAALKDEVPVGAVIVKNGEVIASAHNLRETLNDPTAHAEILAIKKASSILKNWRLNECEMYVTLEPCPMCSGAILQSRIRKLYIGTIDPSMGCCGSVVDLVQNRYLKTALDIKWFNDDRCSSILTNFFRSKRK >NC_008593.1|WP_011723240.1|2508130_2508847_-|hypothetical-protein MKKVISVLITLCITAVALVGCGNKENHKNKDLDIVKRKIEQNASNSGNSASTGGGVSTSIVTSNNSNSEAVKKLNDFENTIKQNNELLKSAYKDKIEAEKSSMELRLNEKLQLDLQKLKLGMDKSLKKDATLEDKNKKQIELKDKYKEELDKQRKLYEDKKNNLKKIFDDYDNKIKDAEGKRDSVIQAMNSEEKTSKENADVNSQNKEKEASVAEFKKYKDSINEVVKWRNGELKKIK >NC_008593.1|WP_011723239.1|2505872_2507492_-|DNA-polymerase-III-subunit-gamma/tau MGYTALYREWRPQTFDEVVGQEHITLTLKNQMKNNRIAHAYLFCGTRGTGKTSTAKIFSKAVNCLNPQDGEPCNECEMCKKISAGLSIDVSEMDAASHNKVDDIRDLIEEVKYPPQEGRYKVYIMDEAHMLTQGAVNAFLKTLEEPPENVIFILATTDPQKLPITILSRCQRFDFKRIKSDDILGRLIKITKEQGIFGDNKSLKLIARMSDGAMRDALSILDQAISMGNGKVDYEQVINMLGLVTNENLIKLTNTIIDKDVENSIRIIDDVVYAGKDINLFIKDMIHHMRNLMMAKVTQKPEDVLDMSEENINFLKEQANKIRIEEIMRCIRILQECEEQSKWSKQGRIYLELAVIKMCKIEYDTSKEVLLSRINNLEKAIKEGNITVNTKTTSSVEKPKLNSQSKTIQHKNQVIKDTNVEEGNEDSKTTLDDVKKSWKDILEIFKARRHMVLYASLVTGKVEDCSRGIITIKYDPQYSFNIRRLEKEENRKVIEEIFSEELKDNIRIKYIVDKKEEKKSPEDILKEAFGEDLVEIIDE >NC_008593.1|WP_011723238.1|2505446_2505791_-|YbaB/EbfC-family-nucleoid-associated-protein MARGGFPGMGGGMNINNLMKQAQKMQQQMQKVQGELEEKEFVASAGGGAVTVKANGKKEILSINIEPDVVDPDDVEMLQDLILAACNQALKTADEETANEMKKLTGGLNMPGMF >NC_008593.1|WP_039226842.1|2504834_2505431_-|recombination-protein-RecR MDFYPVAIEKLIEEFAKLPGIGYKTAQRLTLHVLNLPSDEVREFANALVKARGTIKYCSICGNYTDSDPCAICSNPNRDESIICVIEQPKDIMSLEKIREYNGTYHVLHGVISPMSGKGPEDINLKGLIRRINENVKEVIVATNPNVEGEATAMYISKILKPLGVKVTRIAHGVPVGGDLEYADEVTLSKALEGRVEL >NC_008593.1|WP_011723236.1|2504455_2504710_-|pro-sigmaK-processing-inhibitor-BofA-family-protein MEYIGSFIVGIILLYLVVKLLSWPIKVLYKLIVNGVLGAVLLFVVNLIGSQIGISIAINAWSALIAGFFGIPGVIFLVIFKMYL >NC_008593.1|WP_141640116.1|2514694_2515963_-|PBSX-family-phage-terminase-large-subunit MILPVYRPYFKDYSTRINVFYGGAGSGKSKFVVQKMLYKLLNEKRKCLVTRKVGSTIRESIFQEFKTLIGDLGIYNQCNINKTDMTIELPNGSTFIFKGLDDSEKIKSISDISDIVIEEATELTLLDFTQLNLRMRTKQKNQQIHLMFNPVNKVNWVYKTFFEQKYDGALIVKTTYKNNPYLPKDYVKEIKQLKETNYTLYKIYAEGEFSSLDKRIFTNWQPLDFDILDIKYEKVKNKLKEMGIDDNILKYVSSPIFQKLLKERECYFGLDFGYTNDPSAFIAFMVDKKTKEIWVFDEFYLSGLTNEDIFKEIKYKGYSKEIITADSSEPKSIEELKRLGLTRIKAAKKGKDSILNGIQYLQSYKIYIHPKCKNTIMEFENYTWQKDKKTGEYINRPIDKYNHLIDAFRYGIEQAKRNKWLV >NC_008593.1|WP_011723247.1|2515991_2516360_-|terminase-small-subunit MLTDKQKLFCKNYLKTGNATEAYMRAYKCTSKTANSNGSKLLSNDKIKAYIDEIERTGGYEEATEKEIRQFFTETMRDKKAPLHLRMKSAEILGKNFGLTVEQKPQKTQVIRVVEGGDIINE >NC_008593.1|WP_011723248.1|2516434_2517322_-|phage-major-capsid-protein MSGQVLKADKDFIMNNLMGTIPTEIANDVIKGIVKESTAFRICKHIPMQSNKKTLQLLTDTGTAYWTEESERIGTSVMNWEYPKLQAKKLAVIVPTTKEKIKDSVINVMSEIKDGIKDAFTRAIDSAILFGTKSPFDTNIYDAAKSNNVKQTGKIDLDISNAMALVENSDISVNAIITHNGIKNSLRTLRDSNGNALIIPGGLSGTQIYQTPIYIPSTKSFDKEKATFLIGNFDNALIGTREDMEYEVLTEATLFDEKGVPVLNLAQNDMLAIKVTMRFGFNVITNKAFSCITAK >NC_008593.1|WP_011723249.1|2517321_2517690_-|hypothetical-protein MENVENQQVEEVQQEIDYKAEYERMIAEREESKLNSLINDFNAQLNDTFTDEFLKMVTEDLKTKDYDSAEKTINLIKEASDLKNHKTKLRIVPNRLNDGEALEPNEERKTFQDIILMERKNR >NC_008593.1|WP_011723250.1|2517708_2518248_-|ERCC4-domain-containing-protein MVSLYKYTDKELKEILDSMVVLIDTREQQNSHIISYLEKQKIKYKILKLDHGDYTFYIPKNIELGIHRDLYFNDIVTIERKGSLEELSNNFTVGRANIEEEFTRKKGKMYLMIEDANYDSIVKHLYNTKYNPKSFVATLKTFEARYNINTCFISKVGAGNWIYYTFLYHLREFLKQGLF >NC_008593.1|WP_011723251.1|2518260_2518569_-|hypothetical-protein MNKKIKNIVNKTIENEFHHVTGKIDELNKFEDYKELDYKNGEIQNKVFEVIPEQYHDLINELIESFTLLSGTESKFAFKKGVIAALTNLKYLEEIGEEIILI >NC_008593.1|WP_011723252.1|2518665_2520840_-|bifunctional-DNA-primase/polymerase MGNEFNIMKNLFPRVPLVNYSKIPIIPWKDENNWVNNIDAVQSLGSIYKKEINGETKGGQLTGYSLLCGKTSNIIVIDIDVNHGDSSIDGIQNFKEFIKEFSNEDKKRILNTFVVITPRGGMHLYFKYKEGLKNKANYIPGVDVRTDGGLIVLPGSQVKVDGEILEYKANGKDIQYMPQVLFDKLLKLDKPSQKKETSKKIQKDFKADKYYKPVKEGEGRDNTLISWLGYMIKNNPNMRTKEALLPQAVMYNRCWFEPPLSFEIVEKKIESVIKYALPSYCDEKGHINNWALVQYIIKEQPSYTKGNLWFIYDTEKGFYKYMELREVQKMYFKYALNDKDKTVTRSKNFAELLMLNSSDARDIHDEKKYINCLNGIIDIESDELLPHDPKYKTEIQFQANYISEWKDKFNNSEFKKFLDTTLDEGSITTLQESWGLMLSPHSREVQNCFIYKGEGSNGKSATFDIQEALIKDNKYICSIGLGDFGEPFVISMAEGKHVNIVRDDELSGKTVNKFFKSMVCGEPILVNRKNKDLVRLGFNMTMFFGLNRLPSAADKSTGFFRRPIIIPFNVSFGTEKEVKEGTRDKLKDTQLADRIIQNELDLVFMWAYEGLKRVKSNKWKVTVSESSEQEMEEYRQEVDSSYAFFKEKLKIEPKSGEKILKDNVYNRYLQWCSESDITPMNKVQFGRQFKSFGVKEKVSNSRRYWIDICFIDLEEVQDGKYPFK >NC_008593.1|WP_039243296.1|2520848_2521037_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MGNNDSILISPTQGMKVLGVGRNMMYGDLLKRKDFPCIRIGKKHFINRELLQEWANKQCNKK >NC_008593.1|WP_011723253.1|2521272_2521716_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MNVGENIRKYRKEKGLTQSELAEKTHLATNTIQRYEKGHRQPTMQVLEKIADALGIPVYRLTFNDEESLKAIEKAENILKNFKFVPNDDSEKALNCFKYLLDYLFINWRQNSTDESLINIMNGKMLHDFLTNMLILYNNDTNSNRDI >NC_008593.1|WP_011723255.1|2521850_2523014_+|site-specific-integrase MAKTTYRKKTVNNKEYYFYRLRHKNLKKPKDIYAKTVKELDSKIKMIIKELDNNITNNKEYFGAFFKDWLYNTHMINKKPSTIERYDSIFRNYIEDSIIYDIKLKELNPSDIQNYYNVLVTRGKSISSIKNLHKLIAPSIRYAYDSNRIMKDFSRAIIIPKDKEDTKLKKSSDVKPFTLEEQLKFIEAIKGHELEMLFLTALDTGLRQGELFALTWNDIDLDTRHISVNKSFKSIRNISTGKYENIIQTPKTSNSIRLVPIPVHLIDKLKQHKLLQKTLKLKLANLYEDNTLIFCNKFGKYLDSGNVLKKFKKILNDNNLNDRKFHDLRHTYATRLFELGEEAKTVQTLLGHSNISITLDTYTHVLDSLKEKAVSKLDTLYVNVGVK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_008593_2 | 2.1|1853882|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT | 1853882-1853917 | 36 | NC_008593.1 | 1361923-1361958 | 2 | 0.944 |
NC_008593_2 | 2.21|1853884|36|NC_008593|PILER-CR | 1853884-1853919 | 36 | NC_008593.1 | 1361923-1361958 | 2 | 0.944 |
1. spacer 2.1|1853882|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 1361923-1361958, mismatch: 2, identity: 0.944
caaatttgaaaaaacttgaaacttttttaaatatat CRISPR spacer caaatttgaaaaaacttgaaacttttttagaaatat Protospacer *****************************.* ****
2. spacer 2.21|1853884|36|NC_008593|PILER-CR matches to position: 1361923-1361958, mismatch: 2, identity: 0.944
caaatttgaaaaaacttgaaacttttttaaatatat CRISPR spacer caaatttgaaaaaacttgaaacttttttagaaatat Protospacer *****************************.* ****
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_008593_4 | 4.1|1867151|35|NC_008593|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1867151-1867185 | 35 | NC_015426 | Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p2BKT015925, complete sequence | 28500-28534 | 1 | 0.971 |
NC_008593_3 | 3.1|1864550|26|NC_008593|CRISPRCasFinder | 1864550-1864575 | 26 | MK448910 | Streptococcus phage Javan336, complete genome | 6346-6371 | 4 | 0.846 |
NC_008593_3 | 3.1|1864550|26|NC_008593|CRISPRCasFinder | 1864550-1864575 | 26 | MT366947 | Bacillus phage Hyb2phi3Ts-SPbeta, complete genome | 67684-67709 | 4 | 0.846 |
NC_008593_3 | 3.1|1864550|26|NC_008593|CRISPRCasFinder | 1864550-1864575 | 26 | KY030782 | Bacillus phage phi3T, complete genome | 67684-67709 | 4 | 0.846 |
NC_008593_3 | 3.1|1864550|26|NC_008593|CRISPRCasFinder | 1864550-1864575 | 26 | MT366946 | Bacillus phage Hyb1phi3Ts-SPbeta, complete genome | 70283-70308 | 4 | 0.846 |
NC_008593_3 | 3.1|1864550|26|NC_008593|CRISPRCasFinder | 1864550-1864575 | 26 | MT366948 | Bacillus phage Hyb3phi3Ts-SPbeta, complete genome | 66431-66456 | 4 | 0.846 |
NC_008593_3 | 3.1|1864550|26|NC_008593|CRISPRCasFinder | 1864550-1864575 | 26 | MT366945 | Bacillus phage phi3Ts, complete genome | 67684-67709 | 4 | 0.846 |
NC_008593_3 | 3.9|1865084|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1865084-1865119 | 36 | NC_015427 | Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p4BKT015925, complete sequence | 29495-29530 | 4 | 0.889 |
NC_008593_3 | 3.1|1864550|26|NC_008593|CRISPRCasFinder | 1864550-1864575 | 26 | NZ_KY000025 | Agrobacterium genomosp. 6 strain AR125 plasmid pTi_AR125, complete sequence | 39856-39881 | 5 | 0.808 |
NC_008593_3 | 3.1|1864550|26|NC_008593|CRISPRCasFinder | 1864550-1864575 | 26 | NZ_KY000029 | Agrobacterium genomosp. 6 strain CFBP5499 plasmid pTi_CFBP5499, complete sequence | 39856-39881 | 5 | 0.808 |
NC_008593_3 | 3.1|1864550|26|NC_008593|CRISPRCasFinder | 1864550-1864575 | 26 | NZ_CP039902 | Agrobacterium tumefaciens strain CFBP5877 plasmid pTiCFBP5877, complete sequence | 201192-201217 | 5 | 0.808 |
NC_008593_3 | 3.1|1864550|26|NC_008593|CRISPRCasFinder | 1864550-1864575 | 26 | NC_010929 | Agrobacterium tumefaciens Ti plasmid pTiBo542, complete sequence | 13678-13703 | 5 | 0.808 |
NC_008593_3 | 3.1|1864550|26|NC_008593|CRISPRCasFinder | 1864550-1864575 | 26 | NZ_CP039893 | Agrobacterium tumefaciens strain CFBP5499 plasmid pTiCFBP5499, complete sequence | 165991-166016 | 5 | 0.808 |
NC_008593_3 | 3.1|1864550|26|NC_008593|CRISPRCasFinder | 1864550-1864575 | 26 | NZ_KY000026 | Agrobacterium genomosp. 6 strain CFBP1873 plasmid pTi_CFBP1873, complete sequence | 13680-13705 | 5 | 0.808 |
NC_008593_3 | 3.1|1864550|26|NC_008593|CRISPRCasFinder | 1864550-1864575 | 26 | NC_015912 | Lactococcus lactis subsp. lactis bv. diacetylactis plasmid pVF21, complete sequence | 26-51 | 6 | 0.769 |
NC_008593_3 | 3.4|1864754|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1864754-1864789 | 36 | NZ_CP040376 | Lactobacillus plantarum subsp. plantarum strain BNH17 plasmid unnamed2, complete sequence | 48209-48244 | 6 | 0.833 |
NC_008593_2 | 2.4|1854078|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT | 1854078-1854113 | 36 | NZ_CP036355 | Bacillus sp. SYJ plasmid unnamed1, complete sequence | 121684-121719 | 7 | 0.806 |
NC_008593_2 | 2.4|1854078|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT | 1854078-1854113 | 36 | NZ_CP053290 | Bacillus cereus strain WPySW2 plasmid unnamed, complete sequence | 309876-309911 | 7 | 0.806 |
NC_008593_2 | 2.4|1854078|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT | 1854078-1854113 | 36 | NZ_CP014284 | Bacillus thuringiensis strain Bt185 plasmid pBT1850294, complete sequence | 249682-249717 | 7 | 0.806 |
NC_008593_2 | 2.4|1854078|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT | 1854078-1854113 | 36 | NZ_CP016317 | Bacillus cereus strain M3 plasmid pBCM301, complete sequence | 183547-183582 | 7 | 0.806 |
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NC_008593_4 | 4.3|1867282|34|NC_008593|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1867282-1867315 | 34 | AP014138 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C47-MedDCM-OCT-S36-C43, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 23157-23190 | 8 | 0.765 |
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NC_008593_3 | 3.16|1865544|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1865544-1865579 | 36 | MT074141 | Bacteroides phage DAC22, complete genome | 103890-103925 | 9 | 0.75 |
NC_008593_3 | 3.16|1865544|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1865544-1865579 | 36 | MT074139 | Bacteroides phage DAC19, complete genome | 103662-103697 | 9 | 0.75 |
NC_008593_3 | 3.16|1865544|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1865544-1865579 | 36 | MT074140 | Bacteroides phage DAC20, complete genome | 103661-103696 | 9 | 0.75 |
NC_008593_4 | 4.46|1870099|36|NC_008593|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1870099-1870134 | 36 | MN693076 | Marine virus AFVG_25M561, complete genome | 9756-9791 | 9 | 0.75 |
NC_008593_2 | 2.4|1854078|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT | 1854078-1854113 | 36 | CP024688 | Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-4-144K, complete sequence | 63561-63596 | 10 | 0.722 |
NC_008593_2 | 2.24|1854080|36|NC_008593|PILER-CR | 1854080-1854115 | 36 | CP024688 | Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-4-144K, complete sequence | 63561-63596 | 10 | 0.722 |
NC_008593_3 | 3.13|1865347|34|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1865347-1865380 | 34 | AP014291 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S25-C40, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 31062-31095 | 10 | 0.706 |
NC_008593_3 | 3.15|1865478|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1865478-1865513 | 36 | AJ609634 | Bacteriophage EJ-1 proviral DNA, complete genome | 24705-24740 | 10 | 0.722 |
NC_008593_3 | 3.15|1865478|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1865478-1865513 | 36 | NC_005294 | Streptococcus prophage EJ-1, complete genome | 24705-24740 | 10 | 0.722 |
NC_008593_4 | 4.30|1869046|37|NC_008593|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1869046-1869082 | 37 | NZ_CP016589 | Bacillus thuringiensis strain KNU-07 plasmid pBTKNU07-01, complete sequence | 404733-404769 | 10 | 0.73 |
NC_008593_4 | 4.34|1869311|37|NC_008593|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1869311-1869347 | 37 | JX878496 | Serratia phage phiMAM1, complete genome | 122233-122269 | 10 | 0.73 |
NC_008593_4 | 4.14|1868001|36|NC_008593|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1868001-1868036 | 36 | CP020757 | Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid pLDW-18, complete sequence | 25647-25682 | 12 | 0.667 |
NC_008593_4 | 4.14|1868001|36|NC_008593|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1868001-1868036 | 36 | CP020757 | Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid pLDW-18, complete sequence | 84985-85020 | 12 | 0.667 |
NC_008593_4 | 4.14|1868001|36|NC_008593|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1868001-1868036 | 36 | NC_020381 | Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-39, complete sequence | 11397-11432 | 12 | 0.667 |
NC_008593_4 | 4.14|1868001|36|NC_008593|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1868001-1868036 | 36 | NZ_CP021064 | Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh3, complete sequence | 32917-32952 | 12 | 0.667 |
NC_008593_4 | 4.14|1868001|36|NC_008593|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1868001-1868036 | 36 | NZ_CP021064 | Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh3, complete sequence | 92594-92629 | 12 | 0.667 |
NC_008593_4 | 4.14|1868001|36|NC_008593|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1868001-1868036 | 36 | NC_017204 | Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT51, complete sequence | 32564-32599 | 12 | 0.667 |
NC_008593_4 | 4.14|1868001|36|NC_008593|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1868001-1868036 | 36 | NZ_CP014852 | Bacillus thuringiensis strain HD12 plasmid pHD120161, complete sequence | 47148-47183 | 12 | 0.667 |
1. spacer 4.1|1867151|35|NC_008593|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_015426 (Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p2BKT015925, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
aagcttgtattaccaaacttaagtttttgaactat CRISPR spacer aagcttgtattaccaaatttaagtttttgaactat Protospacer *****************.*****************
2. spacer 3.1|1864550|26|NC_008593|CRISPRCasFinder matches to MK448910 (Streptococcus phage Javan336, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
atttttaaaattcaaaagttaattac CRISPR spacer atttttaaaattcagaagtcaattta Protospacer **************.****.****
3. spacer 3.1|1864550|26|NC_008593|CRISPRCasFinder matches to MT366947 (Bacillus phage Hyb2phi3Ts-SPbeta, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
atttttaaaattcaaaagttaattac CRISPR spacer ttattaaaaattcaaaagttaatgac Protospacer * ** ***************** **
4. spacer 3.1|1864550|26|NC_008593|CRISPRCasFinder matches to KY030782 (Bacillus phage phi3T, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
atttttaaaattcaaaagttaattac CRISPR spacer ttattaaaaattcaaaagttaatgac Protospacer * ** ***************** **
5. spacer 3.1|1864550|26|NC_008593|CRISPRCasFinder matches to MT366946 (Bacillus phage Hyb1phi3Ts-SPbeta, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
atttttaaaattcaaaagttaattac CRISPR spacer ttattaaaaattcaaaagttaatgac Protospacer * ** ***************** **
6. spacer 3.1|1864550|26|NC_008593|CRISPRCasFinder matches to MT366948 (Bacillus phage Hyb3phi3Ts-SPbeta, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
atttttaaaattcaaaagttaattac CRISPR spacer ttattaaaaattcaaaagttaatgac Protospacer * ** ***************** **
7. spacer 3.1|1864550|26|NC_008593|CRISPRCasFinder matches to MT366945 (Bacillus phage phi3Ts, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
atttttaaaattcaaaagttaattac CRISPR spacer ttattaaaaattcaaaagttaatgac Protospacer * ** ***************** **
8. spacer 3.9|1865084|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_015427 (Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p4BKT015925, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.889
aaaacaagctggtaaaaagaagaatgatagtataag CRISPR spacer aaaacaggctggtaaaaagaaaaatgatagtatacc Protospacer ******.**************.************
9. spacer 3.1|1864550|26|NC_008593|CRISPRCasFinder matches to NZ_KY000025 (Agrobacterium genomosp. 6 strain AR125 plasmid pTi_AR125, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
atttttaaaattcaaaagttaattac CRISPR spacer atttttaaaattcaaaaggtactgct Protospacer ****************** ** * .
10. spacer 3.1|1864550|26|NC_008593|CRISPRCasFinder matches to NZ_KY000029 (Agrobacterium genomosp. 6 strain CFBP5499 plasmid pTi_CFBP5499, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
atttttaaaattcaaaagttaattac CRISPR spacer atttttaaaattcaaaaggtactgct Protospacer ****************** ** * .
11. spacer 3.1|1864550|26|NC_008593|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039902 (Agrobacterium tumefaciens strain CFBP5877 plasmid pTiCFBP5877, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
atttttaaaattcaaaagttaattac CRISPR spacer atttttaaaattcaaaaggtactgct Protospacer ****************** ** * .
12. spacer 3.1|1864550|26|NC_008593|CRISPRCasFinder matches to NC_010929 (Agrobacterium tumefaciens Ti plasmid pTiBo542, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
atttttaaaattcaaaagttaattac CRISPR spacer atttttaaaattcaaaaggtactgct Protospacer ****************** ** * .
13. spacer 3.1|1864550|26|NC_008593|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039893 (Agrobacterium tumefaciens strain CFBP5499 plasmid pTiCFBP5499, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
atttttaaaattcaaaagttaattac CRISPR spacer atttttaaaattcaaaaggtactgct Protospacer ****************** ** * .
14. spacer 3.1|1864550|26|NC_008593|CRISPRCasFinder matches to NZ_KY000026 (Agrobacterium genomosp. 6 strain CFBP1873 plasmid pTi_CFBP1873, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
atttttaaaattcaaaagttaattac CRISPR spacer atttttaaaattcaaaaggtactgct Protospacer ****************** ** * .
15. spacer 3.1|1864550|26|NC_008593|CRISPRCasFinder matches to NC_015912 (Lactococcus lactis subsp. lactis bv. diacetylactis plasmid pVF21, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.769
atttttaaaattcaaaagttaattac CRISPR spacer tataaagaaattcaaaagttaattac Protospacer * .*******************
16. spacer 3.4|1864754|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP040376 (Lactobacillus plantarum subsp. plantarum strain BNH17 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
tttaattaaaaaagattattcaaatatttataaatc CRISPR spacer tttgggtaaaaaagttaattcaaatatttataaata Protospacer ***.. ******** * ******************
17. spacer 2.4|1854078|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP036355 (Bacillus sp. SYJ plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer *********** **** ********* *** * *
18. spacer 2.4|1854078|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053290 (Bacillus cereus strain WPySW2 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
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19. spacer 2.4|1854078|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014284 (Bacillus thuringiensis strain Bt185 plasmid pBT1850294, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatataaaagaaatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer ***** ********** ********* *** * *
20. spacer 2.4|1854078|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016317 (Bacillus cereus strain M3 plasmid pBCM301, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
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21. spacer 2.4|1854078|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011655 (Bacillus cereus AH187 plasmid pAH187_270, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
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22. spacer 2.4|1854078|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045534 (Bacillaceae bacterium C02 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
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23. spacer 2.4|1854078|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032609 (Bacillus thuringiensis strain QZL38 plasmid p.2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
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24. spacer 2.4|1854078|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010924 (Bacillus cereus strain AH187 plasmid pCER270, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
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25. spacer 2.4|1854078|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011777 (Bacillus cereus AH820 plasmid pAH820_272, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer *********** **** ********* *** * *
26. spacer 2.4|1854078|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP045776 (Bacillus paranthracis strain CFSAN068816 plasmid p1CFSAN068816, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer *********** **** ********* *** * *
27. spacer 2.4|1854078|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP042928 (Bacillus cereus strain G1-1 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer *********** **** ********* *** * *
28. spacer 2.4|1854078|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053953 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_798 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer *********** **** ********* *** * *
29. spacer 2.4|1854078|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_016792 (Bacillus cereus NC7401 plasmid pNCcld, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer *********** **** ********* *** * *
30. spacer 2.4|1854078|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009299 (Bacillus cereus D17 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer *********** **** ********* *** * *
31. spacer 2.4|1854078|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053950 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_799 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer *********** **** ********* *** * *
32. spacer 2.4|1854078|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011973 (Bacillus cereus Q1 plasmid pBc239, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer *********** **** ********* *** * *
33. spacer 2.4|1854078|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053930 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_797 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer *********** **** ********* *** * *
34. spacer 2.4|1854078|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022346 (Bacillus thuringiensis strain c25 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer *********** **** ********* *** * *
35. spacer 2.4|1854078|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040343 (Bacillus cereus strain DLOU-Weihai plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer *********** **** ********* *** * *
36. spacer 2.4|1854078|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040345 (Bacillus albus strain DLOU-Yingkou plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer *********** **** ********* *** * *
37. spacer 2.4|1854078|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040341 (Bacillus cereus strain DLOU-Tangshan plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer *********** **** ********* *** * *
38. spacer 2.4|1854078|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_018492 (Bacillus cereus FRI-35 plasmid p01, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer *********** **** ********* *** * *
39. spacer 2.4|1854078|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP033789 (Bacillus sp. FDAARGOS_527 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer *********** **** ********* *** * *
40. spacer 2.24|1854080|36|NC_008593|PILER-CR matches to NZ_CP036355 (Bacillus sp. SYJ plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer *********** **** ********* *** * *
41. spacer 2.24|1854080|36|NC_008593|PILER-CR matches to NZ_CP053290 (Bacillus cereus strain WPySW2 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer *********** **** ********* *** * *
42. spacer 2.24|1854080|36|NC_008593|PILER-CR matches to NZ_CP014284 (Bacillus thuringiensis strain Bt185 plasmid pBT1850294, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatataaaagaaatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer ***** ********** ********* *** * *
43. spacer 2.24|1854080|36|NC_008593|PILER-CR matches to NZ_CP016317 (Bacillus cereus strain M3 plasmid pBCM301, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer *********** **** ********* *** * *
44. spacer 2.24|1854080|36|NC_008593|PILER-CR matches to NC_011655 (Bacillus cereus AH187 plasmid pAH187_270, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer *********** **** ********* *** * *
45. spacer 2.24|1854080|36|NC_008593|PILER-CR matches to NZ_CP045534 (Bacillaceae bacterium C02 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer *********** **** ********* *** * *
46. spacer 2.24|1854080|36|NC_008593|PILER-CR matches to NZ_CP032609 (Bacillus thuringiensis strain QZL38 plasmid p.2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatataaaagaaatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer ***** ********** ********* *** * *
47. spacer 2.24|1854080|36|NC_008593|PILER-CR matches to NC_010924 (Bacillus cereus strain AH187 plasmid pCER270, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
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48. spacer 2.24|1854080|36|NC_008593|PILER-CR matches to NC_011777 (Bacillus cereus AH820 plasmid pAH820_272, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer *********** **** ********* *** * *
49. spacer 2.24|1854080|36|NC_008593|PILER-CR matches to CP045776 (Bacillus paranthracis strain CFSAN068816 plasmid p1CFSAN068816, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
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50. spacer 2.24|1854080|36|NC_008593|PILER-CR matches to NZ_CP042928 (Bacillus cereus strain G1-1 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
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51. spacer 2.24|1854080|36|NC_008593|PILER-CR matches to NZ_CP053953 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_798 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
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52. spacer 2.24|1854080|36|NC_008593|PILER-CR matches to NC_016792 (Bacillus cereus NC7401 plasmid pNCcld, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
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53. spacer 2.24|1854080|36|NC_008593|PILER-CR matches to NZ_CP009299 (Bacillus cereus D17 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
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54. spacer 2.24|1854080|36|NC_008593|PILER-CR matches to NZ_CP053950 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_799 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer *********** **** ********* *** * *
55. spacer 2.24|1854080|36|NC_008593|PILER-CR matches to NC_011973 (Bacillus cereus Q1 plasmid pBc239, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer *********** **** ********* *** * *
56. spacer 2.24|1854080|36|NC_008593|PILER-CR matches to NZ_CP053930 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_797 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer *********** **** ********* *** * *
57. spacer 2.24|1854080|36|NC_008593|PILER-CR matches to NZ_CP022346 (Bacillus thuringiensis strain c25 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer *********** **** ********* *** * *
58. spacer 2.24|1854080|36|NC_008593|PILER-CR matches to NZ_CP040343 (Bacillus cereus strain DLOU-Weihai plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer *********** **** ********* *** * *
59. spacer 2.24|1854080|36|NC_008593|PILER-CR matches to NZ_CP040345 (Bacillus albus strain DLOU-Yingkou plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer *********** **** ********* *** * *
60. spacer 2.24|1854080|36|NC_008593|PILER-CR matches to NZ_CP040341 (Bacillus cereus strain DLOU-Tangshan plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer *********** **** ********* *** * *
61. spacer 2.24|1854080|36|NC_008593|PILER-CR matches to NC_018492 (Bacillus cereus FRI-35 plasmid p01, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer *********** **** ********* *** * *
62. spacer 2.24|1854080|36|NC_008593|PILER-CR matches to NZ_CP033789 (Bacillus sp. FDAARGOS_527 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg--- CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaaga---attaaagcaa Protospacer *********** **** ********* *** * *
63. spacer 3.16|1865544|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP028886 (Borrelia turcica IST7 plasmid lp32-A, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
tttaatttttaaaatatttttatctttac---aattcta CRISPR spacer taaaatctttaaaatatttttatctttactaaaact--- Protospacer * ***.********************** **.*
64. spacer 3.13|1865347|34|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_022874 (Bacillus thuringiensis YBT-1518 plasmid pBMB0229, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
gtgaagaaacaacaaatttaactgcagctgaaaa CRISPR spacer ccattggaacaactgatttaactgcagctgaaaa Protospacer .. *.****** .*******************
65. spacer 3.13|1865347|34|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_LR214939 (Mycoplasma salivarium strain NCTC10113 plasmid 2) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
gtgaagaaacaacaaatttaactgcagctgaaaa CRISPR spacer tttatacaacaactaaattaactgcagctgaaat Protospacer * * . ****** ** ****************
66. spacer 4.3|1867282|34|NC_008593|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP014139 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C47-MedDCM-OCT-S39-C56, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tatatttggtgtaggtacaaatgtaccgatttgt CRISPR spacer aatatttggattaggtacaaatgtactattatct Protospacer ******** ***************.. * * *
67. spacer 4.3|1867282|34|NC_008593|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP014138 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C47-MedDCM-OCT-S36-C43, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
tatatttggtgtaggtacaaatgtaccgatttgt CRISPR spacer aatatttggattaggtacaaatgtactattatct Protospacer ******** ***************.. * * *
68. spacer 4.48|1870233|37|NC_008593|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_016982 (Lactococcus garvieae 21881 plasmid pGL5 complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
tataattaatatataaagaaaacaggaggtaacaaaa CRISPR spacer tataattaatatataaagaaaaacggatagaggagaa Protospacer ********************** *** . *. *.**
69. spacer 2.11|1854538|34|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN657105 (Psychrobacter sp. strain ANT_P48 plasmid pA48P2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
aattcaaaatattagacctgtaaatttcttttcc CRISPR spacer gagtgaaaatattagaagtgtaaatttctatcaa Protospacer .* * *********** *********** *.
70. spacer 2.31|1854540|34|NC_008593|PILER-CR matches to MN657105 (Psychrobacter sp. strain ANT_P48 plasmid pA48P2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
aattcaaaatattagacctgtaaatttcttttcc CRISPR spacer gagtgaaaatattagaagtgtaaatttctatcaa Protospacer .* * *********** *********** *.
71. spacer 3.4|1864754|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693310 (Marine virus AFVG_25M374, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tttaattaaaaaagattattcaaatatttataaatc CRISPR spacer aaaatcaaaaaaagattattcaaatattcataaaga Protospacer * . *********************.*****
72. spacer 3.15|1865478|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448902 (Streptococcus phage Javan308, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
attacaagaaatggttaaggaaataaaagaaaatat CRISPR spacer cttcaatcaaatggctaaagaaataaaagaaaatta Protospacer ** * ******.***.***************
73. spacer 3.16|1865544|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT074137 (Bacteroides phage DAC16, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tttaatttttaaaatatttttatctttacaattcta CRISPR spacer aacagtttttaaattatttttatcattacaaaactt Protospacer .*.******** ********** ****** **
74. spacer 3.16|1865544|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT074142 (Bacteroides phage DAC23, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tttaatttttaaaatatttttatctttacaattcta CRISPR spacer aacagtttttaaattatttttatcattacaaaactt Protospacer .*.******** ********** ****** **
75. spacer 3.16|1865544|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT074141 (Bacteroides phage DAC22, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tttaatttttaaaatatttttatctttacaattcta CRISPR spacer aacagtttttaaattatttttatcattacaaaactt Protospacer .*.******** ********** ****** **
76. spacer 3.16|1865544|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT074139 (Bacteroides phage DAC19, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tttaatttttaaaatatttttatctttacaattcta CRISPR spacer aacagtttttaaattatttttatcattacaaaactt Protospacer .*.******** ********** ****** **
77. spacer 3.16|1865544|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT074140 (Bacteroides phage DAC20, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tttaatttttaaaatatttttatctttacaattcta CRISPR spacer aacagtttttaaattatttttatcattacaaaactt Protospacer .*.******** ********** ****** **
78. spacer 4.46|1870099|36|NC_008593|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693076 (Marine virus AFVG_25M561, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
aaggtacacaagcaaagaaacctaaaaaggcgaaaa CRISPR spacer tgaagaaaaaagcaaagaaagctaaaaaggctaaaa Protospacer ... * * *********** ********** ****
79. spacer 2.4|1854078|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP024688 (Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-4-144K, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaagaattaaaggaa Protospacer *********** **** ********** .* . .
80. spacer 2.24|1854080|36|NC_008593|PILER-CR matches to CP024688 (Bacillus wiedmannii bv. thuringiensis strain FCC41 plasmid pFCC41-4-144K, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
aatattaaagaaatttaaaaagaagaaacatttatg CRISPR spacer aatattaaagatatttcaaaagaagaattaaaggaa Protospacer *********** **** ********** .* . .
81. spacer 3.13|1865347|34|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AP014291 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S25-C40, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gtgaagaaacaacaaatttaactgcagctgaaaa---- CRISPR spacer acgaagaaacaacaaatttaccagcaat----aacttt Protospacer ..****************** * ***.. **
82. spacer 3.15|1865478|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AJ609634 (Bacteriophage EJ-1 proviral DNA, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
attacaagaaatggttaaggaaataaaagaaaatat CRISPR spacer tttcgctcaaatggctaaagaaataaaagaaaatta Protospacer ** ******.***.***************
83. spacer 3.15|1865478|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_005294 (Streptococcus prophage EJ-1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
attacaagaaatggttaaggaaataaaagaaaatat CRISPR spacer tttcgctcaaatggctaaagaaataaaagaaaatta Protospacer ** ******.***.***************
84. spacer 4.30|1869046|37|NC_008593|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016589 (Bacillus thuringiensis strain KNU-07 plasmid pBTKNU07-01, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
ttttttctttttcttttaccttgttaggtgtttcgtc CRISPR spacer atttttctttttcttttagcttattagttagttgtga Protospacer ***************** ***.**** *. **
85. spacer 4.34|1869311|37|NC_008593|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JX878496 (Serratia phage phiMAM1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.73
ttaaaggattttgaggcggaatctgtggctttcaaaa CRISPR spacer gaacaactctttgtggcggactctgtggctttcaata Protospacer * *. .**** ****** ************** *
86. spacer 4.14|1868001|36|NC_008593|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP020757 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid pLDW-18, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.667
tcccattgctaatattgcaatgggaattataacgga CRISPR spacer aattattgctagtattgcaatgagaattattggaag Protospacer ..*******.**********.******* . ...
87. spacer 4.14|1868001|36|NC_008593|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP020757 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid pLDW-18, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.667
tcccattgctaatattgcaatgggaattataacgga CRISPR spacer aattattgctagtattgcaatgagaattattggaag Protospacer ..*******.**********.******* . ...
88. spacer 4.14|1868001|36|NC_008593|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_020381 (Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-39, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.667
tcccattgctaatattgcaatgggaattataacgga CRISPR spacer aattattgctagtattgcaatgagaattattggaag Protospacer ..*******.**********.******* . ...
89. spacer 4.14|1868001|36|NC_008593|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021064 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh3, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.667
tcccattgctaatattgcaatgggaattataacgga CRISPR spacer aattattgctagtattgcaatgagaattattggaag Protospacer ..*******.**********.******* . ...
90. spacer 4.14|1868001|36|NC_008593|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021064 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh3, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.667
tcccattgctaatattgcaatgggaattataacgga CRISPR spacer aattattgctagtattgcaatgagaattattggaag Protospacer ..*******.**********.******* . ...
91. spacer 4.14|1868001|36|NC_008593|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_017204 (Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT51, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.667
tcccattgctaatattgcaatgggaattataacgga CRISPR spacer aattattgctagtattgcaatgagaattattggaag Protospacer ..*******.**********.******* . ...
92. spacer 4.14|1868001|36|NC_008593|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014852 (Bacillus thuringiensis strain HD12 plasmid pHD120161, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.667
tcccattgctaatattgcaatgggaattataacgga CRISPR spacer aattattgctagtattgcaatgagaattattggaag Protospacer ..*******.**********.******* . ...
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
26979 : 36700
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_008593|26979:36700|DBSCAN-SWA TATGTTTGGGACAATAGATAGATTTGAAGAGGAATTTGCAGTAGTAGAATTTGATGATAGAAAAGTAGTAAATATATTAAAAAATAAACTCCCAAAAGAAGCAAAAGAGGGAGACGTGTTAAAATTTCATCATGACATAATAACTATAGACTACAAAGAAACTGAAAAAAGAAAAAGAGAGATAGAAGATCTTACAAAAGATTTATTTGAATAAATAGGGGAGCATTTGAATTATTACAAATGCTCCTTTAATTATAAATTTTTATAATAAGTTAAAACATTTTTATAAAAATCTATTGAAAATAACTTTTAATAGAAAATAATGTATTATATAATAAATTCGTACATGCCATTGTAAACGTTTTAGACGCCGTTTATACAATGAATAAAACAGGGGGGAGGGTTATGGAAAAACAGATAAAAGTATTTAGCTCTATAGTTATATTATCAATATTTAATATATTTTCTGCTAAGATTGCCGAAAGATTAATAGTTTTTAAAAATAATTCTATTGATGAAGTTGACTATAGTGCTTTTATAAGTGCATTTTCAAGGTGCGTAAACTTTATGTATATTGTTATATGCATAGTTATACTTGTAATTTTTTATGAGGGAAAGAAGGATAACGATAAACTTAAATAATAGTAAAAAGACAGGTATAACGTTGTGTATCTGTCTTTTTGCTATTATGTTTATAATTTTAAAATTATATAATTTTAAAGATAAAACTTAAATAAAAATAGTGCTGATAAAAAATTATCCGCACTATTTTAGTTTCTTAGTTGTTATCTAATTTGACCTTCTCCGTAAATTATGTATTTTGAAGAAGTAAGTTCTTTAAGTCCCATAGGTCCTCTTGCATGAAGTTTTTGTGTGCTTATTCCGATTTCAGCACCAAATCCAAATTCTGACCCGTCAGTGAAACGTGAAGAGGCATTTACATATACAGCAGCAGCATCAACTTCAGCTAAAAATCTTTGAGAGTTTTCATAGTTATTTGTAACTATTACTTCTGAGTGTTTTGTGCTGTATTTATATATGTGATCTAGTGCTTCATCTAATGAGTCAACAACTTTACTTGCAAATTTGAAGTCTAAATATTCCTTTGCCCAGTCTTCTTCTGTTGCCTCTGTTGCTCCCTCAACTAGAGATTGAGTTCTTATGCATCCTTTTATTTCTACATTTAAAGGTTTTAATTTTTCAGCAAGGTATGGAAGGAATTTATCAGCTATATCTTTGTGTACAAGTAAGCTTTCCATTGCATTACATACTGCTGGTCTTTGAGTTTTAGCATTTATAACTATGTTTGCAGCCATTTCAAGGTCAGCAGATGCGTCTACAAATACGTGACAGTTTCCAACACCAGTTTGAATTACTGGAACAGTTGCGTTTTTAACTACTGCATTTATAAGTCCAGCTCCACCTCTTGGAATTAAAACATCTATATAATCATTTAATTTCATCATTACATTTACTGCATCTCTACTTGGGTTTTCGATAAGGTTTATAGCACCTTCTGGAAGACCAGCTTTTGTAGCAGCCTCTGAAATTATTCTAGCTACAGTTGTGTTTGAGTTTATAGCTTCAGAACCACCTCTTAGAATAACTGCATTACCTGATTTTACGCAAAGGGCAGCAGCGTCAACAGTAACGTTAGGACGAGCTTCATATATTATACCGATAACACCTAGAGGAACACGAATTTGACCAATTTTTAAATTGTTAGGTCTTCTCCACATTCTTATTACTTCTCCAATTGGATCTTCTAGTGATGCAACGTCTCTTAAACCTTGAGCCATTGATTTAATTCTTGCCTCATCAAGTAGAAGTCTATCAAGTAAAGATTCAGTAAGGCCCTTTTCTCTACCGTTTTCCATATCTTTTTTATTAGCTTCAATTATAGCATTAGTATTTTCAATCAAAGCATCTGCCATAGCGTTTAAAGCATTATTCTTAGTAACTGTGCTTACAATAGACATTTTTCTTGCAGCGGATTTTGCAAGACTTGCTGTTTCAATTACGTAATTTTCTATGTTCATTTTAGTTCCTCCTTATAGGTTTTCTAATATTACTAAGTTGTTTTTGTGAATTACTTCATCATAGTTTTTATAACCTAGTTTATCTTCTATTATATTAGAATCTAATCCCTTTATTAAATCAATTTCCATAGAGTTATAATTTGTAATTCCATGTGCTATTTCTTCTTTTTTAGAATTTAAAATTGACACAACTTCTCCTTCTTGAAAAGTACCATCAATAGATATTATACCCTTTGGAAGTAAGCTTTTATTATGGTTTACTAGTGCTTTTTCTGCACCATCATCTACTATTATAGAACCCGTTGGCTTAGTTGCAAAAGCCATCCAATGTTTTTTTGCTTTAACATGATCCTCTTGTCCTAGGAATAATGTACCTATTTCTTTTCCATCAAGGATGTCTGTTAGGAAATTACGATTGTCTCCATTTACGATAACCATTGATGAACCTGATGATGTTGCGATTTTACCTGCATTTATTTTAGTTGCCATTCCACCAGTACCAAGTGAACTTCCAGCACCACCTGCAGCAGCTACAATATCCTCTGTAATCTCATCAACTACAGGAATAAATTTAGCATCAGGATTTGTTTTTGGATTTGAATCATATAGTCCATCTATATCTGTAACTAAAATCAATAAATCAGCGTCAACAAGACTTGCTACCATAGCTGATAGAGTGTCGTTATCACCAAATTTAATTTCATCTACTACTATAGCGTCATTTTCATTTACAATAGGAATTACGCCTTGTTCAAGTAGTGAGTAGAAAGTGTTACTAGCATTTAAAAATCTAGTTCTATGAGATAAGTCCTCGCGAGTTAAAAGTATTTGTCCTACTGGTTTTCCGTATTCTGAAAAAATCTTTTCATACATATGTAAAAGTATACCTTGACCTACAGCAGCAGCTGCTTGTTTTTCAGGAATAGTTTTAGGTCTCTCTTTAAGTCCAAGTTTTCCAATACCTGCTCCTATTGCACCAGATGATACAAGAATAACTTCAATTCCACGATTTTGGGCATCGGAAAGCTGTCTAACTAGGTTTTCTATTTTATTTAAGTTAAGTAGTCCTGTGGGATAAGTTAATGTTGATGTACCGACCTTTACTACGATTCTTTTTACGTCTTTTATGTAGGTTTCTCTTAAATTGTTCATATTTTATAACTGTAAAACAGTTTTACCTCCCTTAAATTTATTTAATAATTAGGTTGTTTTTTATAAAAAGTGTATAATAAAATTATTATTATCAATTTAGCAAATTATATCATATAATAAACATTTAATTCAATTTTACAGGAGGTCAATATGAACAAGAAAATAGGATTTATCGGATGTGGCAACATGGGAAGTGCCATGATTAAGGGAATTGTTAAATCTAACTTAGTTGATTCTAAAAATATAATGGCAAGTGATTATTTTTTAGAAAAATTAGAGGCTATGAAAGATGAAATAGGAATTTTAACAACAAATAATAATAATGAAGTTGCAGAGTTTGCAGATGTTTTATTTTTATCAGTTAAACCTAACATGTACAAAGCTGTAATTGATGAAATAAAGGATAAAGTTAAAAAAGAAACTATTATAGTTACAATAGCAGCTGGAGTTGATATTAAAACAACTGAAACTAATTTTGGTAGAGAAATAAAGGTTGTTAGAGTAATGCCAAATACACCAGCTTTAGTTGGAGAAGGTATGAGTGCATTATGTCCTAATGCGAATATAAATGATGCAGAGCTTGAAGAAATAGTTAATTTATTTAAATGTTTTAGTAAAGTAGAAGTAGTTGAAGAAAAGTACATTAACGTAGTTACAGCATTAACGGGTTCATCACCAGCTTACGTTTATATGTTTATAGAAGCTTTAGCAGATGGAGCTGTTCTTGAAGGACTTCCAAGAGATAAGGCATACAAAATGGCTGCACAAGCAGTTTTAGGTTCTGCAAAAATGGTTTTAGAAACAGGAAAACATCCAGGAGCTTTAAAGGATGATGTTTGTTCACCAGGAGGCACAACAATAGAAGCTGTTTACTCATTAGAAAAGAGCGGATTTAGAGCAGCTGTAATTGAATCTATTGAAAAGTGTGTAAGAAAAGCTGAAAATATGAGTAAATAACATTAAATAATATATTAAACTGAACAAATATTATAATATAGAGTAATTAATTAAGTTAAAATCTAATTAAAAAACATTAACCTATGAAATAAAAATTTTATTTCATAGGTTTTTTATATTTTATATAAAATAGGAGAATATTAAATATATATAAATGTTCCTTACGTATATTGTGAACAAAAAACCCTTATTTATTATATTTTGTATACATAAGTAGTTTTTGGGTGTAAAAAATAAAAAATTACGAATATTATTTTAATAAACATATTAATAATTCGCAATTTGTATTGACTAACCAACACACCTTTGCTACTATAGGTAAGGGGGGATTTAGCCATGAAAAAAAGTTATGATGTTATAATAATTGGAGCAGGTCCAGCAGGTATATTTACGGCTTTAGAAGTAACAAGATTAAACTCTGAATTAAGTGTTTTGATAATTGACAAAGGAAGAAATATAGAAAAAAGAACTTGTCCTGTAAGAAAGACAGGTAAGTGTGTTAATTGCAATCCGTGTGCAATAACATTCGGATGGTCAGGTGCAGGTGCTTTTTCAGATGGAAAACTTTCATTAAGTCCAGAAGTTGGTGGAAGAATACTTGAATATTATTCAGAAGAAGAATGTAAAGATCTTATAAATTATTGTGATAATATATATTTGAAGTTTGGTGCAAATAAGGTAGTTCATGGTTTAAATAATGAAAGAGTTGAAGAAATTAAATACGAAGCAAGTAAACATAATATTCGTTTAGTGGAGTGTCCTGTAAGACATCTTGGAACGGAACTTGCTTATAACGTGTTAAGGGATATGTATCATCATCTTATAGACAATACCAATACAGACTTTAGCGAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_008593|26979:36700|27383_27620_+|WP_011721026.1|DBSCAN-SWA MEKQIKVFSSIVILSIFNIFSAKIAERLIVFKNNSIDEVDYSAFISAFSRCVNFMYIVICIVILVIFYEGKKDNDKLK >NC_008593|26979:36700|29029_30169_-|WP_011721028.1|DBSCAN-SWA MNNLRETYIKDVKRIVVKVGTSTLTYPTGLLNLNKIENLVRQLSDAQNRGIEVILVSSGAIGAGIGKLGLKERPKTIPEKQAAAAVGQGILLHMYEKIFSEYGKPVGQILLTREDLSHRTRFLNASNTFYSLLEQGVIPIVNENDAIVVDEIKFGDNDTLSAMVASLVDADLLILVTDIDGLYDSNPKTNPDAKFIPVVDEITEDIVAAAGGAGSSLGTGGMATKINAGKIATSSGSSMVIVNGDNRNFLTDILDGKEIGTLFLGQEDHVKAKKHWMAFATKPTGSIIVDDGAEKALVNHNKSLLPKGIISIDGTFQEGEVVSILNSKKEEIAHGITNYNSMEIDLIKGLDSNIIEDKLGYKNYDEVIHKNNLVILENL >NC_008593|26979:36700|35455_36700_-|WP_011721034.1|DBSCAN-SWA MKHDVIIVGGGASGIIAAINAKNLGLDVAIIESNNRIAKKLLTTGNGRCNITNENITLDRYHSENKSFFKTILSKFTVDKIEEFFKTIGIYLTTLENGKMYPMSLQASSVIDVLKSTLEEREIPIYLETKVKDIIHSKKGFKIFTSSNDDLTKEFNCNKLILCCGGKSAPKTGSDGSGFTLAKKLGHSIIEPIPALVQLKLDYKKLKSISGVKFDGSAKIFIDNEFVQEELGEILFTDYGISGPPILQLSRNASYSTSKGKNVTMSVDMMNNFSKEELIHFLENHWGVFGYKSVYDSLIGIINKKIIPILLKEANIESIHKPCWELTWKEKNNIFDLLKDWRFNVTGTNGFNNAQVTAGGVNTKEVDESTLESKIVPNLYFCGEILDVDGDCGGFNLQWAWASALAVSNVLYEF >NC_008593|26979:36700|32962_34246_+|WP_011721031.1|DBSCAN-SWA MSAFVVLGAQWGDEGKGKMTDYLAETADVVVRFQGGNNAGHTVVVGDKEYKLHLVPSGILYEDKINVLGNGVVIDPKALFEEINYLEDLGVKVTKEKLKVSDRAQLIMPYHRILDGLKEKARGKNDIGTTGKGIGPAYTDKAERSGIRVCDLMHKDVFEEKLRQNINDKNELIRLYGGEELDFDKIFEEYNAYADRMRPYVTDISVIIYDEMKKNKNVLFEGAQGSLLDIDYGTYPYVTSSSTVAGGVCTGAGVGPTAITGAVGIAKAYTTRVGKGPFPTELLDEMGEKLREKGHEYGVTTGRARRCGWLDLVILKSTARISGLTSFVVTKIDTLAGFDKIKVCTGYEFDGKVIDYFPASLEDLAKCKPVYEEFDGWDDSIADARSYEELPENAKIYLKKIEEFTDTKISIVSVGPKRDQTIVVGEI >NC_008593|26979:36700|27763_29017_-|WP_011721027.1|DBSCAN-SWA MNIENYVIETASLAKSAARKMSIVSTVTKNNALNAMADALIENTNAIIEANKKDMENGREKGLTESLLDRLLLDEARIKSMAQGLRDVASLEDPIGEVIRMWRRPNNLKIGQIRVPLGVIGIIYEARPNVTVDAAALCVKSGNAVILRGGSEAINSNTTVARIISEAATKAGLPEGAINLIENPSRDAVNVMMKLNDYIDVLIPRGGAGLINAVVKNATVPVIQTGVGNCHVFVDASADLEMAANIVINAKTQRPAVCNAMESLLVHKDIADKFLPYLAEKLKPLNVEIKGCIRTQSLVEGATEATEEDWAKEYLDFKFASKVVDSLDEALDHIYKYSTKHSEVIVTNNYENSQRFLAEVDAAAVYVNASSRFTDGSEFGFGAEIGISTQKLHARGPMGLKELTSSKYIIYGEGQIR >NC_008593|26979:36700|26979_27192_+|WP_011721025.1|DBSCAN-SWA MFGTIDRFEEEFAVVEFDDRKVVNILKNKLPKEAKEGDVLKFHHDIITIDYKETEKRKREIEDLTKDLFE >NC_008593|26979:36700|30319_31126_+|WP_011721029.1|DBSCAN-SWA MNKKIGFIGCGNMGSAMIKGIVKSNLVDSKNIMASDYFLEKLEAMKDEIGILTTNNNNEVAEFADVLFLSVKPNMYKAVIDEIKDKVKKETIIVTIAAGVDIKTTETNFGREIKVVRVMPNTPALVGEGMSALCPNANINDAELEEIVNLFKCFSKVEVVEEKYINVVTALTGSSPAYVYMFIEALADGAVLEGLPRDKAYKMAAQAVLGSAKMVLETGKHPGALKDDVCSPGGTTIEAVYSLEKSGFRAAVIESIEKCVRKAENMSK >NC_008593|26979:36700|31462_32875_+|WP_011721030.1|DBSCAN-SWA MKKSYDVIIIGAGPAGIFTALEVTRLNSELSVLIIDKGRNIEKRTCPVRKTGKCVNCNPCAITFGWSGAGAFSDGKLSLSPEVGGRILEYYSEEECKDLINYCDNIYLKFGANKVVHGLNNERVEEIKYEASKHNIRLVECPVRHLGTELAYNVLRDMYHHLIDNTNTDFSELTEAEELIVEDNKVTGIIVNSKYGRCEIKGRYVVVAPGRGGAEWLSKEAERLNIKTKNNAVDIGVRVEVPNSIMDHLTKDLYEAKLVYYSDTFDNKVRTFCMNPGGVVSEEHYDNNIAVVNGHSYSEEKLRTNNTNFAMLVSTSFTEPFNQPIDYGKYIAQLGNMLTGGPIMVQRLGDLLKGRRTDESRLKKSTTIPTLKSAVPGDLSFVLPQRHLTSIIEALKAFDKVAPGLYSKNTLLYGVEVKFYSSKFETNNKFETDINNLYTIGDGAGITRGLMQASSTGVIVARDIVKKIKK >NC_008593|26979:36700|34608_35361_+|WP_011721033.1|DBSCAN-SWA MSGIITEKQYEIHYYEAHLKQQATITNIIDFFTDVSTFQSEELGVGINYMMENNMAWILYKWDINVERYPRYREKILAVTEPYSIKKFYAYRKFYILDENRNIIASAKSTWLLIDTKKRRPLRISKEMVKAFGLENKEETLEIENVHKLPEENTEINFKVRYSDIDTNGHVNNEKYVAWMIESIPRDIILNYTLKNTKITYKKETMYGESIKVITGKIKEDEDKVKFVHNILRENGELLTEGETLWEKNK >NC_008593|26979:36700|34313_34505_+|WP_011721032.1|DBSCAN-SWA MQITKDMTIGEIVRNFPSSIEILMSFGMGCVGCPSAQGESLEQAAMVHGMDIEKLLEALNKAI |
10 | Streptococcus_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
384576 : 392439
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_008593|384576:392439|DBSCAN-SWA AATGTTTAAACATTTAAGACCAGTTTGGGCAGAGATAAATTTAGATAATCTTGCTTCAAATATGAAACATATAAAAGAGCTATCAAATACTAAGGAAATAATAGGAATAGTAAAAGCTGATGCATATGGGCATGGAGCTTTAGATATAGTTCCTACACTTATAGAAAATGGAGCAACAGCACTTGCTGTAGCTGTTGTTAGTGAAGGAGTAGAATTAAGACGTGGAGGAATAGAATGTCCTATAATGGTTTTAGGGTTTACTCCACCAAGCTTAATTGACATGTTATTAAAACATGATATAGAACAAACAGTATTTTCTTTGGATTATGCAAAGGAACTTTCAAAAGCTGCTGAAAAAATGCATAAAGTTGCTAAAATTCATATAGCAGTTGATACAGGTATGGGGAGAATAGGATTCTTACCTAACGAACAAAGCATACAAGATGTTAAAGCAATAAGTATGCTTCCTAACATAAAAATAAAGGGTATGTTTTCACATTTCTCAACAGCAGATGAGAAAAATAAAGAATATAGTGCTTATCAATTAAACCAATTCAACAAGTTTTATGAAGGTTTAAAAAGAGAAAATGTAAATATAGAAACTAGACACATATCAAATAGTGCTGCAATAATGGACTTACCAGAAACTATATTTGAAGGGGTAAGACCAGGCATAATATTATATGGATATTATCCATCAAATGAAGTAGATAAAACTAAACTAGAATTAAAACCAGTTATGCAATTAAAAACTAATGTGGTTCACATAAAAAAGATACCTTCTGGAGAATATATAAGTTATGGAAGAAAGTTTAAGACAGATAGAGAAAGTTTGATCGCAACATTGCCAGTTGGGTATGCTGATGGATACACTAGATTATTGTTTGGTAAAGCAAAAGTTATAATAAATGGACAGTTAGCACCAGTAGTGGGAAGAATATGCATGGATCAATGTATGGTTGATATAACTGATATAAAAGGTGATATAAAAGTAGGAGAGGAAGTAATCCTAATAGGAGAAAAAAATGGAGTAAAGATAGATGCAGATGATATTGCAGAAATGCTAGGTACTATAAATTATGAAGTTATTTGCATGATTAGTAAAAGAGTTCCAAGAGTGTACATAAAAAATGGAGAAGTGATAAAAGTTAGAAATTATATTTAAGATTACGTTACTTCGGTAAGTAAAATACAACAGGTTACTAGATTGAAAACTCTCATCTTTCTTTGACAGTTTGACAAATCTTAAAGTATAATATGGAACATAGTTTATATTTTCTTTATGTTAAATTAGGAGGTATAGTAACTCTATGTCAAGTTCAAAGAAATTTAAAATTACTTTATCCAAAGCACAGAAGAAAGATTTGATAAATATTATAATTAATAGAAAAAGTATAAAAAAGTATAAAAAAAATAGTAAATTAATTAAGGTTTCTTTAATACAATATATTAAGGTTAAAAATAAATTAGATAAATTTAAACAAGGCTATTTAGAAATGTCTCAAATTAATTTAAATATTTGCGAAATGGGCTTTGCAGAGGATATGGTAGTATTAAAAGAATATGAAGCTAAGCTTGCGGAGAGTGATTTACCCGATGACAATTGTAGTAAAAAGAGGAGATATATTTTATGCTGATCTAAGCCCAGTTGTGGGTTCGGAACAAGGCGGAATAAGACCGGTGCTTATTATTCAGAATAATGTTGGCAATAAGTACAGTCCTACTGTAATAATAGCTGCGATTACATCTCAAATAAATAAAGCCAAACTTCCAACTCATGTTGAAATTTCTTCAGAAGAGTATGGATTAAATAAAGATTCAGTAGTTTTATTGGAACAGATTAGGACTTTAGACAAAAAACGACTCAAAGAAAAAATTGGACATATGTCTGATAAAGACATGCGAAAAGTAGATGAAGCTTTATTAATAAGCGTTGGTTTATAAAAAAAAAGAGCAGAGATGCTCTTTTTTGAGTTTTTTAGTGTAATTTTTTTAATATATTGATATAATAATTAAAAAGGATAAAAAACTAGGAGGAGTTAGAACAATGACAAAAGATATTCTTGAGCTAAAGCAAATTGCTAAGCAAATAAGAAAAGATATTGTACAAATGCTTACAGAATCAGGCTCTGGTCATCCAGGTGGATCACTTTCAATAGTAGAAATTTTAACTGCATTATACTTCAAAGAAATGAACATAAACCCTGAAGATCCTACAAATCAAGATAGAGATAGATTTGTATTATCAAAAGGACATGCAGCTCCAGTGCTATACAGCGCTCTTGCAAGAAGAGGATTCTTTAATCCAGATGAATTAATGAAATTAAGAAAATTTGGATCAATACTTCAAGGACATCCTAACATGAATTATGTTCCAGGAGTTGATATGTCAACAGGTTCATTAGGTCAAGGAATTTCTGTAGCAGTAGGAATGGCTATGGCAGGAAAGATAGACCAAAAGGACTTTAGAGTTTACTCAGTACTTGGAGATGGAGAATTAGCAGAAGGTCAAGTATGGGAAGCTGCAATGGCTGCTGCACACTACAAATTAGACAATCTAACAGCTTTTGTTGATTACAATGGATTACAAATAGATGGTAAGACAAAAGACGTTATGGGTTCTGATCCAATAGATGCAAAATTTGAAGCGTTTGGATGGCATGTTATAAATATCAATGGAAACGATATTGAAGAAGTTATAAAAGCTATAGAAGAAGCTAAAAATATAAAAGGAAAGCCAACAATGATAGTTGCTAAAACAGTAAAAGGTAAAGGCGTATCATTCATGGAAAACGTTGCTAGCTGGCACGGAACAGCTCCTAGTAAGGAACAATGCGAACAAGCGATAAAGGAAATTGGAGGTGAAGAATAATGGGAAATAAAATGGCTACAAGAGAAGCTTATGGAAAGGCACTTGCAAAATTAGGAATGGAAAATCCTAATGTTGTAGTATTTGATGCGGATTTATCTAAATCAACAAAAACTGCTGATTTTAAAAATGTTTGTCCAGAAAGACACTTTAACATGGGAATTGCAGAAGCTAATATGATGAACGTTGCAGCTGGATTTGCAACTTGTGGCAAAATCCCATTTGCTAGTACATTTGCTGTATTTGCATCAGGAAGAGCTTTTGAACAAATAAGAAATACTATTTGTTATCCAAAGTTAAACGTAAAAGTATGTGCAACTCATGCTGGTATAACAGTTGGTGAAGATGGAGCGTCACACCAATCAGTAGAAGATATTTCACTTATGAGAAGCATACCTAACATGACAGTTATAAATCCAAGTGATGCAGTTGAAACAGAAGCTGTAATAAGAGCTATTGCTGAGTTCAATGGCCCTTGCTACGTAAGACTTGGAAGAGCTGCAGTTGAAACAATAAATGATAATCCAGAATACAAGTTTGAAATTGGAAAAGGTATAACATTAAGAGAAGGTAAAGATGCTACTATAATAGCTACAGGAATAATGGTAGAAGCTGCTCTTGAAGCATACAATATGTTAGCAGAAGAAGGAATAAAGGTTAAAGTTGTTAATATACATACAATAAAACCTATTGATACTGAATTAATAGTTAAATCTGCTGAAGAAACAGGAGTATTAATTACTGCTGAAGAACATAGTGTAATAGGCGGATTAGGTTCTGCTGTATGCGAAGTTGTATCAGAAAATCACCCAGTTCCAGTAATGAGAGTTGGAGTAAAAGATACATTCGGTGAAAGTGGTAAGCCAGCTGAATTATTAAAAGCATATGGATTAACAGCAGAAGATATAGTTAAAGCTGTTAAAAAAGGAATATCACTTAAATAGTAAGTTTTAATAAGAAGAGAGGGAGGTTTAACTCCTTCTCTTTTTTTAAATAAAGCGATAAAGTAAAAAAATAAGGATAATAATAAATGATTTGAGGAAAAATATTTATATGAAAATGGGGGTTATTTAATTATGAGGAATAAGTTAAATGATACTGTAAAGGATTATATAGTAATAACACTAGGCTTTATAATAATAGCTATATCTATAAAGTTTTTTTTAGCACCTAATAAAATAGCCAATGGAGGAATTACTGGAGTTGCAATTATAATAAATTATTTTATTCCAAAATTAAGCGTTGGATTATTAATGGTTATATTAAATGGTGTCTTATTTGTGTTGGCCTTTTCAGTTATAGATGGCACATTTGGTGCAAGAACAGTTTATGCTTCAATGGGATTATCAGTGTTACTTACTATTTTAGATAAGTTTATACCACCTACAGTTGCAGCAACTCATGATCTTCTTTTAGCTACATTGTTTGGAACAGTAATAATAGGTATTGGAATGGGAATTGTATTCAACAGAAATGCATCAACAGGCGGTACAGATATTTTCGCTAAAATGTTAACTAAATTTAAAAATTTAGATATAGGTAAGGCACTTTTAATTGTAGATCTTATAATAGCAGTTATTTCTGGATTTACTTTTTCAGCTGAAATTGGAATGTATGGAATATTATCTGTAATATTAATGGGAGTAATAATAGATTTTGTTATTGAAGGATTAAATGCATGTAAATCAATAATTGTTATAACATCAAAAAATGATGAGGTAAATAAATTTATAATTGAAGAACTTAATAGAGGATGCACAATGATACAGGGAAAAGGTGCATACAGTGGACAAAATAAGGAAATATTGTACACTGTTCTAGATAGAAAACAATTTATAACTTTAAAAACTTATATAAAGGAAATTGATCCTAAAGCCTTTATAATCGTAAGTGAAGCACGTGAAGTATTAGGTGAAGGATTTAAGAATATATTTGAATAATAAAATTTAATAATATGTTAATTAAATATCCACTAGTTTATGTTATAATATTAAATGAATGTGGTATATAATACAAACTAGAATAGGAGTTATATTATGATAGAGTTTAAGAATACAACTAAAATATATGACAATAATATTTTTGCACTTTCTAATATTAATTTAGATATTGACAGAGGGGAATTTGTTTTCCTTGTAGGTCCAAGTGGTGCTGGAAAGTCCACATTTATAAAATTACTTTATAAAGAAGTTGAGCCTACAACAGGAAGATTAATTGTTAATGGACAAGACGTAACTAAGATTCCAAGAAAACAAGTACCTTATTATAGAAGAAAAATAGGTATGGTGTTCCAAGATTTTAGACTAATACCTACTTTAAATGTTTATGAAAATGTTGCTTTTGCAATGAGAGTTGTAGAAACACCATACAGAGAAATTAAAAAGAGAGTACCAATAGTACTATCTATGGTTGGATTATCACATAAGTTCAAATGTTTCCCACATGAATTATCAGGAGGAGAACAACAAAGAGCTGCTCTTGCAAGAGCAATAGTAAATAATCCAGCTATACTAATTGCGGACGAGCCTACTGGTAACCTAGATCCAGATACATCTGGTGAAATTGTAAAAATACTAAATGATATAAACCATGCTGGAACAACTATTCTTATGGCAACTCATGACAAAGGAATAGTAGATAGCATGAAGAAAAGGGTTATTGCAATAGAAAAAGGTATAATAGTAAGAGATGAACAAAGGGGGAAATACGGATATGAAGATTAGTACTATAAAGTATTTTTCCATGGACTCCTTAATAAGTTTAAGAAGAAATAAAACATTAAGTATAGCATCAATAATCACTGTTTCATTAACATTATTTTTGTTTGGAATATTTTTAATAACTATGCTTAATGCTAATCAACTTTTAAAAAATTTAGAATCTAAATTAGAGGTTTCTGTATTTTTAAAAGATAATGTTGCTGTAGCTGAAAAGCAAAAAGTAGCAAGTACATTAAAAAACATAAAAGGTGTATCAGGAATTAAATACATAACTAAAACAGAAGCATTAGAAAAATGGAAAAATCAATTAGGTGAAGAAAATAAAGATTTAGTAAAAGGATTTGATAAGAAAAATCCACTTCCAGAATCTTTTATTGTAAAGGTAGACGATGCCTCAATAATTAAAGAGGTAGTAAATAAAACTAAAGATATTAAAACTGTAGAAAAAACAGTTGCAAATGAAGATTTAGTAAATCAAATTTCTAAAATAACAAGAGGAGTAAAATGGATAGGTGTTGTATCATTATTTATAATGATTCCTATTTGCTTGTTCCTTATAGGCAATACAATTAAATTAGCAGTTTATGCAAGAAAAAGAGAAATAAATATAATGAAATACGTTGGAGCTACTGATTGGTTTATAAGATGGCCATTTATCATAGAAGGAGTAATTATTGGAGTAATAGGTTCACTAATATCCAGTGGATGCTTGTACTATGTATATAGAGCTGTTTATCATAAACTTACAGGTATAATAATGTTATTAAATATACTAACTCCTAGATATTTTGCTATGAATATTGTTTGGGTATTCATATTATCAGGAATTATAATTGGTGGACTTGGAAGTATAATTTCAATTAGAAAATTCTTAGAAGTATAAACAAAGTGTTCATTAAATATTAAGGTTGACTATTTAGTCAGCCTTAATATTTATTAATTTTAATATAAAAAGGTATAAATACTATCATATTAACGTAAAAATATAACTAGTATATATACAAGAGGTGATAAATAATTGGGACAAAAGGATATAAAAGATAGTGATAAAATTTTAAATAACAAAAAAAGTAAACGAGGTTGGTTACTGATTGTAGTTCTTCTTTTAGTTTTAACCAATTTTGTTACTTATATTGTTGGTACTAGATTACCTGTAAAAGGTACTAGAAGAATAAGTGAAAAAACCTATGATGAAGTATCTAAATTTCAAAAGTTATTTATAGTAAAAAAGAATTTAGAAAGCTTTTATGATGGTACAATAGATGAAAAAGCTCTAGTTGATGGAGCGGTAAAAGGCATGACAGAAAGCCTAAAAGATCCTTATACAGTTTACATGAATGAAAAAGATTATAAAGAATTTTCAAACCAAACTGAAGGAAATTATGTGGGGCTTGGAATTCAGATAGGTGTAAAGGATGACAAGGTAGTTGTTATTGCTGTATTTGATGATTCACCAGCTAAAAAAGCAGGAGTATTACCAAAAGATATAATAGAAAAAGTAGATGGTGAAAGGGTTATTGCTAAGGAATACGATAAAGCAGTAAACAAGATGAAAGGTAAAAAGGGTACTTATGCTACTTTAACTTTAAGTAGAGAAGGGAAAGGTACTTTTGATTTAAAAGTAAAGAGAGATGAGATTATATTAACTTCATCTAAGGGAGAAATGATAAATGATAAAATAGGATATGTTCAAATAAGCGTTTTTGATGAACATACTTATGATCAATTTAGTAAAACTGTAAAGAACTTATCTAACAGTGGAATGAAGGGCATGATTTTAGATTTAAGACAAAATCCAGGTGGATGGTTAACTCAAGCAGTTGATATTACATCACAATTTGTTCCAAAGAATAAAGTTTTAGTATCTACAGAAGATAAATATAAAAATAAAGAAGAATACAAATCAAAGGGTGGAAATCTCATAGGAATGCCTCTTGTTGTTTTAATAGATGGAGGGACAGCTAGTGCTTCAGAAGTTTTCTCAGGAGCTATTAGAGACTATAAATTAGGAACCCTAATTGGAGAAAAAACCTTTGGAAAAGGAATAGTTCAGAGTGTTTTATATCAAAGAAAGTTAGGATTTGGTGATGGTACTGCACTTAAAGTTACTACATCAAAATATTATACTCCTAAAGGGGAAAACATACATCATAAGGGTATTAATCCTGATATAGAAGTAAAATATCCAGAGGAATTATTGAAAAAACCTTATGATAGAAAAAATGATCCACAACTAAAAAAAGCTATGGAAGTAATAAGTGAAAAAGTAAAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_008593|384576:392439|385885_386212_+|WP_011721356.1|DBSCAN-SWA MSSSKKFKITLSKAQKKDLINIIINRKSIKKYKKNSKLIKVSLIQYIKVKNKLDKFKQGYLEMSQINLNICEMGFAEDMVVLKEYEAKLAESDLPDDNCSKKRRYILC >NC_008593|384576:392439|386622_387447_+|WP_011721358.1|DBSCAN-SWA MTKDILELKQIAKQIRKDIVQMLTESGSGHPGGSLSIVEILTALYFKEMNINPEDPTNQDRDRFVLSKGHAAPVLYSALARRGFFNPDELMKLRKFGSILQGHPNMNYVPGVDMSTGSLGQGISVAVGMAMAGKIDQKDFRVYSVLGDGELAEGQVWEAAMAAAHYKLDNLTAFVDYNGLQIDGKTKDVMGSDPIDAKFEAFGWHVININGNDIEEVIKAIEEAKNIKGKPTMIVAKTVKGKGVSFMENVASWHGTAPSKEQCEQAIKEIGGEE >NC_008593|384576:392439|391182_392439_+|WP_011721363.1|DBSCAN-SWA MGQKDIKDSDKILNNKKSKRGWLLIVVLLLVLTNFVTYIVGTRLPVKGTRRISEKTYDEVSKFQKLFIVKKNLESFYDGTIDEKALVDGAVKGMTESLKDPYTVYMNEKDYKEFSNQTEGNYVGLGIQIGVKDDKVVVIAVFDDSPAKKAGVLPKDIIEKVDGERVIAKEYDKAVNKMKGKKGTYATLTLSREGKGTFDLKVKRDEIILTSSKGEMINDKIGYVQISVFDEHTYDQFSKTVKNLSNSGMKGMILDLRQNPGGWLTQAVDITSQFVPKNKVLVSTEDKYKNKEEYKSKGGNLIGMPLVVLIDGGTASASEVFSGAIRDYKLGTLIGEKTFGKGIVQSVLYQRKLGFGDGTALKVTTSKYYTPKGENIHHKGINPDIEVKYPEELLKKPYDRKNDPQLKKAMEVISEKVK >NC_008593|384576:392439|387446_388388_+|WP_011721359.1|DBSCAN-SWA MGNKMATREAYGKALAKLGMENPNVVVFDADLSKSTKTADFKNVCPERHFNMGIAEANMMNVAAGFATCGKIPFASTFAVFASGRAFEQIRNTICYPKLNVKVCATHAGITVGEDGASHQSVEDISLMRSIPNMTVINPSDAVETEAVIRAIAEFNGPCYVRLGRAAVETINDNPEYKFEIGKGITLREGKDATIIATGIMVEAALEAYNMLAEEGIKVKVVNIHTIKPIDTELIVKSAEETGVLITAEEHSVIGGLGSAVCEVVSENHPVPVMRVGVKDTFGESGKPAELLKAYGLTAEDIVKAVKKGISLK >NC_008593|384576:392439|384576_385740_+|WP_011721355.1|DBSCAN-SWA MFKHLRPVWAEINLDNLASNMKHIKELSNTKEIIGIVKADAYGHGALDIVPTLIENGATALAVAVVSEGVELRRGGIECPIMVLGFTPPSLIDMLLKHDIEQTVFSLDYAKELSKAAEKMHKVAKIHIAVDTGMGRIGFLPNEQSIQDVKAISMLPNIKIKGMFSHFSTADEKNKEYSAYQLNQFNKFYEGLKRENVNIETRHISNSAAIMDLPETIFEGVRPGIILYGYYPSNEVDKTKLELKPVMQLKTNVVHIKKIPSGEYISYGRKFKTDRESLIATLPVGYADGYTRLLFGKAKVIINGQLAPVVGRICMDQCMVDITDIKGDIKVGEEVILIGEKNGVKIDADDIAEMLGTINYEVICMISKRVPRVYIKNGEVIKVRNYI >NC_008593|384576:392439|389480_390167_+|WP_011721361.1|DBSCAN-SWA MIEFKNTTKIYDNNIFALSNINLDIDRGEFVFLVGPSGAGKSTFIKLLYKEVEPTTGRLIVNGQDVTKIPRKQVPYYRRKIGMVFQDFRLIPTLNVYENVAFAMRVVETPYREIKKRVPIVLSMVGLSHKFKCFPHELSGGEQQRAALARAIVNNPAILIADEPTGNLDPDTSGEIVKILNDINHAGTTILMATHDKGIVDSMKKRVIAIEKGIIVRDEQRGKYGYED >NC_008593|384576:392439|388520_389384_+|WP_011721360.1|DBSCAN-SWA MRNKLNDTVKDYIVITLGFIIIAISIKFFLAPNKIANGGITGVAIIINYFIPKLSVGLLMVILNGVLFVLAFSVIDGTFGARTVYASMGLSVLLTILDKFIPPTVAATHDLLLATLFGTVIIGIGMGIVFNRNASTGGTDIFAKMLTKFKNLDIGKALLIVDLIIAVISGFTFSAEIGMYGILSVILMGVIIDFVIEGLNACKSIIVITSKNDEVNKFIIEELNRGCTMIQGKGAYSGQNKEILYTVLDRKQFITLKTYIKEIDPKAFIIVSEAREVLGEGFKNIFE >NC_008593|384576:392439|390156_391047_+|WP_011721362.1|DBSCAN-SWA MKISTIKYFSMDSLISLRRNKTLSIASIITVSLTLFLFGIFLITMLNANQLLKNLESKLEVSVFLKDNVAVAEKQKVASTLKNIKGVSGIKYITKTEALEKWKNQLGEENKDLVKGFDKKNPLPESFIVKVDDASIIKEVVNKTKDIKTVEKTVANEDLVNQISKITRGVKWIGVVSLFIMIPICLFLIGNTIKLAVYARKREINIMKYVGATDWFIRWPFIIEGVIIGVIGSLISSGCLYYVYRAVYHKLTGIIMLLNILTPRYFAMNIVWVFILSGIIIGGLGSIISIRKFLEV >NC_008593|384576:392439|386177_386519_+|WP_181951654.1|DBSCAN-SWA MVVKRGDIFYADLSPVVGSEQGGIRPVLIIQNNVGNKYSPTVIIAAITSQINKAKLPTHVEISSEEYGLNKDSVVLLEQIRTLDKKRLKEKIGHMSDKDMRKVDEALLISVGL |
9 | Yellowstone_lake_mimivirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1044219 : 1053905
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_008593|1044219:1053905|DBSCAN-SWA AGTGTTCAAAGTACATAAAAAGGACGGAAATGCTAGAAGAGGGGAATTTATAACACCTCATGGAGTAATCCAAACTCCAGTATTTATGAATGTAGGTACACTTGCTGCAATTAAGGGAGCAGTATCTACTATGGATTTAAAGGATATAAGATGTCAAGTAGAGCTATCTAACACATATCATCTTCATTTAAGACCAGGTGATAAAGTTATAAAACAATTAGGTGGACTTCATAAATTTATGAATTGGGATAGACCAATACTTACAGACTCAGGTGGATTCCAAGTGTTCTCACTGGCAAAGATGAGAAAAATTAAAGAAGAAGGAGTATATTTCAGATCTCATATAGATGGTAGAAAAATATTTATGGGACCAGAAGAAAGTATGCAAATTCAAAGCAATTTAGCTTCAACTATTGCTATGGCATTTGATGAATGTGTTGAAAATCCAGCACCAAGAGAATATGTAGAAAAGTCGGTAGCAAGAACTACAAGATGGCTTGAAAGATGTAAAAAAGAAATGGATAGATTAAATTCATTAGATGATACAATAAATAAAAAACAAATGTTATTTGGAATAAATCAAGGTGGAGTTTATGATGATATAAGAATAGCTCATGCAAAAGAAATTGCGAAACTAGATTTAGATGGATATGCAATTGGTGGTCTTGCAGTTGGAGAAACTCACGAAGAAATGTATAGAGTTATAGAATCTGTAGAGCCATACCTTCCACAAGATAAACCAAGATATTTAATGGGAGTTGGTATTCCAAGTAATATATTAGAGGCAGTTTCAAGGGGAGTAGATTTCTTTGATTGTGTACTTCCAGCTAGAAACGGAAGACATGGTCATGTGTTTACTAAATATGGTAAAATAAATTTATTAAATGCTAAATTTGAATTAGACACAAAACCAATTGATGAGGGTTGTGATTGTCCAGCATGCAGACATTATTCAAGGGCTTATATAAGACATTTATTTAAAGCTAAAGAAATGCTTGCTATGCGTCTTTGTGTATTACATAATTTATATTTCTATAATAAACTTATGGAAGATATAAGAGATGCAATAGATGGTGGATATTTTAACGACTTTAAAGAACAAAAATTAGAAGAATGGGGAGGAAGAGCTTAGGACTTTTTCTCACAATATAAGAGTGAATTATATAAGTTAAGGAGGTGTAAGTATGCCAAAGGGTCTTGGTACTATAATACCGTTTATATTTATGATAGTTATACTTTATGCAGTTATTTTAATTCCAGAAAAGAAGAGAAAAACAAAGTACAAATCAATGTTAGATAATCTAAAAGTAAATGATGAGATTATAACTAGAGGTGGAATTGTAGGGAAGATTGAAAGAATTCATGAAGATTTCTTTATAATTTCAACAGGTCCAGATAAGGTTAAATTAAAGTTAACTAGAAATGGCGTAGGAATGGTTTTAGAGAAAAAGGAAGAAATAATATAAGTAATAAAATACCTCCTAAAAACATAAATATTAGTTAAATGGGAGGTGTTTTAATTGGAAAGCAGGGGTAATGCGGTTTACATTGGACAAGGAGTTTTAAGAAGTTTCTTTTTAACACTGACAATGCTAATAGTTTACTCTATAGTAACATATTTTACTAAGTTTAATCCTAAAGTAGATTCTGTATTTTTTGTAGTTGTAACAGCTTTTAGTGTTATGTATGGTACTTTATATGCTGTAAAGAAAATAAAGAAAAAAGGATGGATAACTGGACTTTTAGTTTCTATATTTTATATACTTATAGTATTTTTAGTATCAGCTATAAATGGTAGAGGATTTGCAATATCAAGTCTTACAATATTAAGAATGTTTCTTGCTATTTTTGTAGGAACTTTATCAGGAATGCTTGGAGTAAATATATAAATTGGCTTTATTTAATAAGTAAACTATGATATAATCTTACAGGATAATTTTATAATGGGAATGGAGGAAGTGCTATGAAACATATAAAGACAGTAAACAAAAAAAACATAAAAGAAAGTTTAAATAGACCAGGATGTAAAGAATGTGCTAACTCATGTCAATCAGCATGTAAAACATCTTGCACAGTTGCTAATTTAGCTTGTGAAAACTAATAAAAACTAGCATTAACTAAGCAGTAACTAAGGTTACTGCTTTACGTTTATATAAGGAGGAAAAAAAATTGGCTTTAATTCATAAATTTATTCAAGATGGACAATATTTCGTTTTAGATGTAAATACAGGTGCTGTACATATAGTGGACGAGCTAGTTTATGATTTACTAGATGATGAAGCTTTAAAATCACAAGAAGAACTTATAAAGGAATTTAAAAATAAATATTCAGAAGAAGAAATAAAAGAGGTTTATTCTGAAATAGTAGAACTTAAAAAAGAAGGATACTTATATTCAGAAGATACTTATGAAGAAATCGCAAGAAATAGTATGAAGTCTAAGGACTTTATAAAGGCACTATGTCTTAATGTAACACATGATTGTAATTTAAGATGTAAATATTGCTTTGCTGATGAAGGAAAGTATCATGGTGCAAGAAAAGTTATGTCACCTGAAGTTGGAAAAAAAGCCATAGACTTTGTAATAGCTCACAGTGGTCCAAGAAAAAATATAGAAGTTGACTTATTTGGTGGAGAACCTTTAATTGCTATAAAAGAAATAAAAGAAATAATAGCATATGCTAGAGAACAAGAAAAAATTCATAATAAAGTTATAAGATTTACAATGACAACTAATGCTCTTCTATTAAATGATGAAATAATGGAATATATGGATAAAGAAATGGGAAATATAGTATTGAGCATAGATGGAAGAAAAGAAGTTAATGACAATACTAGAATCAGAGTAAATGGAAGCGGAACATATGATGCTATACTTCCAAAGATAAAAGAAATGGTAGATAAAAGAGATAAATCTAAACAGTATTATGTAAGAGGAACATTTACAAGAGATAATACTGATTTTTATTATGACGTAAAACACTTAGCAGATTTAGGTTTTGAAGAAGTATCAGTTGAACCAGTTGTACTTCCAGATGAACATGAACTTTCTCTAAGAGAAGAAGATTTACCTACAATATTTGAAAACTATGATTTACTATATAAAGATATGCTTAAAAGATATGAAGAAAATAGAGAGTTTAAATTCTATCACTTTAACATAGATCTTCAAGGAGGACCATGTGTATATAAGAGAATATCTGGATGTGGAGCAGGTCACGAATATATAGCTGTAACTCCAGATGGAGAAATATATCCATGTCATCAGTTTGTTGGAAATGAAGACTTCAAAATAGGAACAATCTATGATGAAGATGAAAAATTAAACTTTGACATTGCAAAACAATTTAAAGAAGCTCATATTTACAATAAACCACAATGTAGAGATTGCTGGGCTAAATTCTATTGCAGTGGTGGATGTCAAGCAAATAATTACAATTTCAATGGAGATATACATAAACCATATGAAATTGGATGTAAGATGCAGAAAAAAAGGATAGAATGTGCTATTGCCCTAAAAGCAACTAAAATGGATAAATAGTTCAAAAAATGCCTGTTATTGACTATAGCATCTAAAAGTAATATAATAATGTATTATGCGTGAAAAAGATGCTTTCAAAGGGGGATAAACATGAGAAACGGAAGAAACGCTAAATCCCAAAAAAACAAAAGCATAGCACTTTTTGTTGCGGTGGTAGTTGCCATAGGTATATTAGCATATGGCGGTTTTTTTGGAATAAAAAATATTTGTGGCTACAGAGTAAAACCCTTTAGTGAGTCTATAAATAAAGGACTTGACCTTCAAGGGGGTATATCTGTATTAGAAGAAGTCAAAGGTAAAGATGTTAGTAATGAAACTATAGAAAGAACCATAGAATTACTTTCTATGAGAGTTAACCCTGAAGGGGTTAAGGAAACTTCCGTTCAAAGGGAAGGAAAAAACAGAATTAGAATTGAAATTCCAGGAGAATTTGATTCTAAAAAGGTGCTAGAAAGCATAGGTAAAACTGGTAAACTTGAATTTAAAGGTCCAGATGGTAAGGTTATTTTAACAGGAGCAGATGTTAAAGACGCAACAGCATATTATGATGATATGCAAAAACCTACAATAGGACTAGAACTTAAAGCTGACGGGGCTAAAAAGTTTGCAGAAGCAACTCAAAAATTCTTAGGAAAAAGAATAACAATTTACATGGATGGAGAAGTTCTAACTAGTCCTAATGTTCAATCAGTAATTACTGGTGGAAAAGCTACAATTACTGGAAGTTCTTCTTTAGAAGAAGCAAAGCATCAAGCAAGTGTAATAAAATCAGGAGCTCTTCCTGTAAGCCTAGAAGCAGTTGAATTTAAAACTGTAGGTGCAACTTTAGGTGCAAATGCATTACCTTTAAGCATAAAAGCAGGAGCCATTGGTATAGGATTAGTATTAATATTTATGCTTTTATACTACAGGGGACCAGGACTTATGGCAGATATCGCTTTAATATTCTATGTATTAATTGTACTTGGAACATTTGTTGCGGTTAAAGCTACATTAACTTTATCAGGAATCGCAGGATTCTTGCTTACTGTTGGTATGGCAGTAGATGCCAATGTTCTTATATTTGAAAGAATAAAAGAAGAATTAAAGCTTGGAAAAAGTTTGAAAGTAGCAGTAGATGCTGGATTTAATAGAGCACTATCATCTATTTTAGATTCTAATATAACAACAATAATAGCAGGTGTTGTACTTTATTATTTAGGATCAGGTGCTGTTAAAGGATTTGCCCTTACTCTTATGATAGGTATAGTATTAAGTATATTTACCGCTCTTACAGTAACAAGAATGTTAATAAAATTAGGTATGAATATGGGATTATTAAGCAAAGCTTCCCATTTTGGCGTTAAAAGGGGGTAAGGTAAATGCTTAAAATTATAGAGAAAACTAAAATATGGTTTGCTATATCCTTAACAGTAATAATACTTGGTATGGTTTGTTTAGGAGTAAAGGGATTAAATTAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_008593|1044219:1053905|1051096_1051615_+|WP_011721920.1|DBSCAN-SWA MNLKEKIRVIEGFPKEGISFKDITTVLNDKEALKYTVDAIVEHLKDKNVDVVVGPEARGFLFGTPVAYALGAAFVPVRKKGKLPCETISSEYDLEYGSDVLQIHKDAIKKGQKVAIVDDLLATGGTMNSVIEMIEKLGGEVVSVDFLIELTDLKGREKIGNYDIMSLVQYDI >NC_008593|1044219:1053905|1050178_1051057_+|WP_011721919.1|DBSCAN-SWA MKNDYSCKNFLNLININNSFPLIKVNEASKRISRAVNKREKIVICGSYDLDGITSVSLLILILKYLNADVEYYIPDTLQKGDTFNCDIIENHIKLLGASLIITVGCGINSIEEVELCRSLGIDIIITDYHRPKGNIPNTIVVDPNDGLSKYSFKNFNAVGIAYKLAESIAEHYHVKCIEKYLDLVALGIASSDVPLVGENLDMLKKGMSYITDSNNHGIKALTEINNIEYIDFLTLKKMCKMVMPKVNAVGRMDDARIVVELFTTADSERARRIAKYINKKNEFELKKVMIK >NC_008593|1044219:1053905|1045402_1045684_+|WP_011721914.1|DBSCAN-SWA MPKGLGTIIPFIFMIVILYAVILIPEKKRKTKYKSMLDNLKVNDEIITRGGIVGKIERIHEDFFIISTGPDKVKLKLTRNGVGMVLEKKEEII >NC_008593|1044219:1053905|1047848_1049114_+|WP_011721917.1|DBSCAN-SWA MRNGRNAKSQKNKSIALFVAVVVAIGILAYGGFFGIKNICGYRVKPFSESINKGLDLQGGISVLEEVKGKDVSNETIERTIELLSMRVNPEGVKETSVQREGKNRIRIEIPGEFDSKKVLESIGKTGKLEFKGPDGKVILTGADVKDATAYYDDMQKPTIGLELKADGAKKFAEATQKFLGKRITIYMDGEVLTSPNVQSVITGGKATITGSSSLEEAKHQASVIKSGALPVSLEAVEFKTVGATLGANALPLSIKAGAIGIGLVLIFMLLYYRGPGLMADIALIFYVLIVLGTFVAVKATLTLSGIAGFLLTVGMAVDANVLIFERIKEELKLGKSLKVAVDAGFNRALSSILDSNITTIIAGVVLYYLGSGAVKGFALTLMIGIVLSIFTALTVTRMLIKLGMNMGLLSKASHFGVKRG >NC_008593|1044219:1053905|1049119_1049989_+|WP_011721918.1|DBSCAN-SWA MLKIIEKTKIWFAISLTVIILGMVCLGVKGLNYGIDFKGGTVVTIEMGKNFNQKTKEEADKIIKKYDPAASSYIANETQLEIKSNNLESNSINKMFGELKTKYKLKDTALVSQNNVGPSVGNELKKKAAGALVIATIAMLIYIGFRFEIKFGIAAILALLHDILITLGVYAFTQIPINTPFIAGMLTIVGYSINDTIVIFDRIRENRRKLRGRNIIEIVNVSITQTMSRSINTVLTTLFTIVSVYIFVPSVRDFTFPLIIGIVSGAYSSIFIASPIWVLLRKFGNKKEE >NC_008593|1044219:1053905|1046181_1046319_+|WP_003368166.1|DBSCAN-SWA MKHIKTVNKKNIKESLNRPGCKECANSCQSACKTSCTVANLACEN >NC_008593|1044219:1053905|1044219_1045350_+|WP_039242961.1|tRNA|DBSCAN-SWA MFKVHKKDGNARRGEFITPHGVIQTPVFMNVGTLAAIKGAVSTMDLKDIRCQVELSNTYHLHLRPGDKVIKQLGGLHKFMNWDRPILTDSGGFQVFSLAKMRKIKEEGVYFRSHIDGRKIFMGPEESMQIQSNLASTIAMAFDECVENPAPREYVEKSVARTTRWLERCKKEMDRLNSLDDTINKKQMLFGINQGGVYDDIRIAHAKEIAKLDLDGYAIGGLAVGETHEEMYRVIESVEPYLPQDKPRYLMGVGIPSNILEAVSRGVDFFDCVLPARNGRHGHVFTKYGKINLLNAKFELDTKPIDEGCDCPACRHYSRAYIRHLFKAKEMLAMRLCVLHNLYFYNKLMEDIRDAIDGGYFNDFKEQKLEEWGGRA >NC_008593|1044219:1053905|1045738_1046107_+|WP_011721915.1|DBSCAN-SWA MESRGNAVYIGQGVLRSFFLTLTMLIVYSIVTYFTKFNPKVDSVFFVVVTAFSVMYGTLYAVKKIKKKGWITGLLVSIFYILIVFLVSAINGRGFAISSLTILRMFLAIFVGTLSGMLGVNI >NC_008593|1044219:1053905|1046387_1047758_+|WP_039224172.1|DBSCAN-SWA MALIHKFIQDGQYFVLDVNTGAVHIVDELVYDLLDDEALKSQEELIKEFKNKYSEEEIKEVYSEIVELKKEGYLYSEDTYEEIARNSMKSKDFIKALCLNVTHDCNLRCKYCFADEGKYHGARKVMSPEVGKKAIDFVIAHSGPRKNIEVDLFGGEPLIAIKEIKEIIAYAREQEKIHNKVIRFTMTTNALLLNDEIMEYMDKEMGNIVLSIDGRKEVNDNTRIRVNGSGTYDAILPKIKEMVDKRDKSKQYYVRGTFTRDNTDFYYDVKHLADLGFEEVSVEPVVLPDEHELSLREEDLPTIFENYDLLYKDMLKRYEENREFKFYHFNIDLQGGPCVYKRISGCGAGHEYIAVTPDGEIYPCHQFVGNEDFKIGTIYDEDEKLNFDIAKQFKEAHIYNKPQCRDCWAKFYCSGGCQANNYNFNGDIHKPYEIGCKMQKKRIECAIALKATKMDK >NC_008593|1044219:1053905|1051715_1053905_+|WP_011721921.1|DBSCAN-SWA MLEDLLQKIDENCNNVNKDIIIKAYNYAKDAHKAQKRISGEPYIIHPVEVACILAEMGLDENTIAASLLHDVIEDTDYTYEDVEKEFNREVANLVEGVTKLGKIKFKTKEEQQSENVRKMLLAMTKDIRVILIKLADRLHNMRTLKYMTVEKQKEKAKETLDIYAPLAHRLGISKVKWELEDLALRYLNPNEYYDLVRKVAEKRKEREEYIERIIHELKEKLDEAGIKSEIEGRPKHFYSIYRKMVVKNKTIDQIFDLTAVRILVEDVKDCYAVLGMVHTMYKPIPGRFKDYIAMPKPNMYQSLHSTVIGPQGKPFEIQIRTYEMHYTSEYGIAAHWKYKEGGKNSDSDFEAKLAWLREVLEWQRETSNPEEFMEDFKIDMFSDEVFVFTPKGDVINLPSDSTPIDFAYRIHTDIGHRCIGGKVNGRIVPLDYHLKTGEIVEVLTSPTPKGPSISWLNLTKSNQAKSKIKSWFKKEKRHDNIEKGKELVEKEAKRQGINFGKIAKGNNLESIFKKYNFHNLDDLYVAVSIGGITAAAIVNKLIGHIKSQEREEHKENETIEDIKEQLKNTTVKKKKKSSPGIKVKGIDNVMIRFSKCCNPVPGDPIIGYITKGRGVSVHRQDCKNVKSLIVNDGNRIVDVAWEDENTRKSEYITEIEVKSEDRTGLLAELMEAIIQTKIDLYAINAQPTKADMVIITIKFRISDVNKLKEVMRKIRKLQGVIAVYRTKS |
10 | uncultured_Mediterranean_phage(83.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1224672 : 1234030
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_008593|1224672:1234030|DBSCAN-SWA AATGGGGGGCTTTAATGATAAATTAAATGGGGCAAAAATACTAATAAAGTGTTTAAAGGAACTGAATGTAGATACTATTTTTGGTTATCCGGGAGGGGCTGTACTTCCTATATATGATGCCTTATATTGCGAAAAAGATATAAATCATATATTAACTGCACATGAGCAAGGGGCTGCTCATGCTGCAGATGGATATGCAAGGGTAACAGGTAAAGTTGGGGTTGTACTTGTTACATCTGGACCAGGGGCTACAAATACTGTTACAGGAATTGCAAACGCATATAGGGATTCAATACCAATGGTAGTATTTACAGGACAAGTGCCAAAAAGACAAATGGGTAAGGCAGCTTTTCAAGAAGTTGATATATTGAGTATTACAAAATCTATAACTAAAAAGAATTTTTTAGTTAAGAGTATTGAGGCACTTCCAACAATAGTATATAAAGCTTTTAAAATTGCTACAGAAGGAAGAAAAGGTCCTGTAGTTGTGGATATTCCAAAGGATATTCAAGATACATTAGTAAATGATGACTTTTATTATAAAAATATTTATGAGGTATTTACTGAAATAAATTGCGTAGAGAATGAAAATTTATATAAAAACATAAAAAAAGCGTCGTTATTAATTAATAAATGCAGGAAACCTATAATATATTCTGGTGGAGGAATAGTAAGTTCTAATGCAAATAAAGAATTGATGGAATTTTCCGAAAAAATAAAATCTCCAGTAATATGCACATTAATGGGGCTTGGAAGTTTTCCAGGAGATCACAAATATTTTATGGGCCTTGGGGGTATGCATGGAAATGTCTATTCAAATTATGCCATAACAGAAAGTGATCTTTTAATAGCAATAGGAATGAGATTTAGTGATAGAGTAACAAGTAAGATAGAAGGATTTGCACCAAATGCAAAAATAATTCACATTGATATTGATGAAAAAGAACTAGGGAAAAATGTAAATGTGGATGTACCTATAAATGGTGATATAAAAGAAATACTAAATTTATTAATAAAATGTGTTGAAGTAAAAGAAGAAGGAAAATGGAATTATAAAATAGAGAGTTTGAAAAGAAAATACTCACTTAATTTTGATAAAAAAGATGAATTAAGTGGAGAATATATTATAGAAAAGTTAAATGAAATAACAGAAGGTAATTGTACAATTTGTACAGAAGTGGGACAAAATCAAATTTGGGCAGCACAATATTATAAATATTTAAAACCCAGAACATTTGTATCATCAGGTGGACTTGGCACAATGGGGTTTGGGCTTGGGGCAGCAATTGGAGCGTATTTTGGAAATCCTAAAAGAAGGGTTATAAATATAGCTGGTGATGGAAGTTTTAAGATGAATTGTGCAGAACTTGATACTATATCAAGATACAATATACCAATAATACAAATAGTTTTAAACAATAGATGCTTAGGAATGGTTCGACAATGGCAAGAAATGTTTTATGATAAGAGATTTTCACATTCTATTTTTCATAAAGAAGTTGATTTCACAAAACTTGGTATGGCATATGAAATTAAAAGTTTTAAAGTAAATGAAAAAGAAGAATTTGAAGATGTATTAAAAAAAGCATTAAAGCTAAATGAACCTGTTATTATAGAATGTTTAATAGATACAAATGAAAATGTGTTTCCTATAGTTCCACCAGGAGAAACTATAGACAATATGCTAACAGAAAAAATTTAAATAATTAGGGGGCAAAACAATGGAAAAATCATATGTATTCTTTGATGGAAAAATAATGGATGAAAAGGATGTTAATTTAAGTATTAGAAATAAAGCTTTTAACTATGGGCTTGCTTGTTTTGAAGGAATTAGAGCTTACTATGATGAAAACACAAAACAGCTATATGGATTTAGATTAAAAGAACATTATGAAAGATTACTTCAATCATGTAAGGCACTATATCTTGATATACCATACACTGTAGACGAACTTGTAGATATTACAGTAGAATTATTAAGAAAAAATAATTTTAAAACTACTACTTATATAAGACCTATGGCTTATAAAGGCTCAAATAATATAGCGCCTACACTAATGGATGATGACAATAGACTACTTATATATTGTATGCCTATGGGAAGTTATACAGGTAAAAAAGCATTAAAGGTAGCAGTAAGTTCTTGGTCAAGAATTGAAGATAATATGATACCAGCAAGAACAAAACCTTCAGCAGCATATTTAAATTCAGGACTTGCATCACTTGAAGTACTTAGAAAAGGATATGATGAGGCTATATTCTTAACAAGAAATGGTCACGTTTGTGAAGGACCAGGAGAAAATATCTTTATGGTTAGAAAAGGAAAACTTGTAACACCACCTGCATCAGACAATATATTAGAAGGAATTACTAGAGATACTGTTATGCAACTTGCAAAAGAAGAGCTTGGAATGGAAGTTGTTGAAAGAAGCATTACAAGAACAGAGCTTTATGCAGCAGATGAATTATTCTTTAGTGGTACTGCAATGGAAGTTACTCCTATTTGTGAAGTTGATGATAGAAAAGTTGGAAATGGGGTAGAATCAAATGTATGTAGTAAATTACAGGAATTGTTCTCAAAACTTACAGTAGGAAAACTTAAAAAATACTCTAATTTTTGTACAAAAATATATTAAATAGTAACAAAATAAAAGTTCTAGCAAATAATATTGCTGGAGCTTTTTGTTTTATACTATAATTATATAATAATGATTATATAAATAAGGATGTAGAAAATGAATATTTTAGATAATTTTGATTTTAAGGAATTAGAGGCTATAAATTTAATAAAGGAAACTTGCTCTAAATTCAATGCAAATGCCTATATAGTAGGAGGAGCTATTAGAGATTCTATTTTAAATGTAAAACCTAAAGATATAGACATATGTATTGAATCAAATTCAATAAATATAATAAGTAAATTGAATTTTGTAAAAGAATACAAATACTATGAAAAGTTTCAAACAAGCACCATAGTATTTGAAAATGAAGTGGAAATTGATTTAATAAGATGTAGAAAAGAGAAATATGAGTTTAATGGAGCTTTACCTAAAGTGATACCTTCAAATATAATGGATGATTTATTTAGAAGAGATTTTACATGTAATGCTATAGCATATAATTTGGTAAATGATACTATTATAGACCCATTTAACGGAAGAGATGATATTAACAAAGGAATTCTTAGAAAAATACATGAAAATAGCTATATGGAAGATCCAACTAGAATATTTAGAGCTATAAAATATGCCAATAGATATGATTTTAAAATACATGATAAAGATGAAATAAAGGAATCATTGTTAAAAAAATCTATGAACAATATAAGTAATGATAGAATTATAAGGGAAATAGTATCTTTATGTAAGGAAGAAAAATGGATTCATAACATATTTTCATGTAATGAGCTTAACATTTTAAATATAGAAAAGAGTATGTTTTTAGAAGATAATTTTCTTTTTAATTATAAAGACTATAATGATAGAATTTTAAATGTATTTTTATCATCAAAAGGTAACAGAGGTATATTTATAAAAAATTCAGTGTTATGCAAAGATATTAAAAAAGCTTTTGAAAATTATAATAATGGTATAACAAATAAAAACTATATATTAAATGAAAAAGATAACTTTAGTATATACAATAAACTTAAAAACTTTAGCACTTATGATATTAAAATTCTTGCTCATTTTAAAGAAAACAAATATAAATTATTAAACTACATACACAATTTAAAAAATATAAAATTAAATGTAAATGGTAAATATCTTAGCCAATTAAATTTAAATAATAAAAAGAAATATAAAGATATTCTAAATTATTTATATATGATAAAATTAAATACTGGAATAAGAGATGATGAGAAATATTTATTTGGAAATTTAGGAGAGATACTTAATGTCGTTAAATATAAAAATTGAAAATTTTGAAGGTCCCTTTGATTTATTACTACACTTAATTAAAAAAAATGAAATGGACATATATGATATAAAAATATATGAAATAACTACACAGTATTTAAATTACATAAATAATATGAAGGAACTTGATCTTGAAGTTACATCAGAGTTTATAGTAATTGCTGCAACACTTTTAGAGATAAAGTCAAAGATGCTTCTTCCAAAACAAGTTGTAGAAGAAAATGAAGAAGATACAGAAGATCCAAGACAAGAACTAATAAACAAACTTTTAGAATATAAAAAGTTTAAACAAGTAGCTGATTATTTAATGAAGAGAGAGGCAACTGTAGGATTTATGTATTCTAAAAAGCCTGAAATAATTGAGGATATACATAAAGATGATAATGTTGATATACTAAAAGACATAACTATATTAAAGCTATTTAACATATATAATGATTTAATTAATACATATAAAAATAAAATGAATACTGAGAATGTTATTCCAAAAGAAATAGCTCTTGATAAATTTAAAATAGAAGATAAAATGGTAGAAATAAGTGAAATACTGAAAAATGGTTCTACAATTGGTTTTTCTAAATTAGTCAATAGTTGTGAAGATAAAATAGAAGCTATAGTTACATTTCTTGCACTATTAGAATTAATCAAATTAAGAGTTATATCAGCTATTCAAGAGGGGAATTTTAAAGAAATATATTTAGAAGGAGTAAAATCTTATGATGGACAATAATATAAATCAAATGGAGATAGACGAAATATCTACGAAGAATAGATATTTTTCTATTATAGAATCTGTTTTATTTGCCAGTGGAAATCCACTTAATATAAAAGAAATTGCACACATAATAGAATGTGGCGAGGAATATACATATAGTTTATTAGAAGAAATGAAAAAAACATATAATGAAAATAGTAGAGGATTACTATTAATAAATATGAAAGAAGAATACACTCTAGTTACTAAGCCAGAAAATAGCGTATTTTTGCAAAAACTATTAAAGACAAATAATAGACAATCCTTATCTAGAGCTTCCCTAGAGGCACTTGCAATTATAGTGTACAAGCAACCAATAACTAGAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_008593|1224672:1234030|1228568_1229321_+|WP_011722107.1|DBSCAN-SWA MSLNIKIENFEGPFDLLLHLIKKNEMDIYDIKIYEITTQYLNYINNMKELDLEVTSEFIVIAATLLEIKSKMLLPKQVVEENEEDTEDPRQELINKLLEYKKFKQVADYLMKREATVGFMYSKKPEIIEDIHKDDNVDILKDITILKLFNIYNDLINTYKNKMNTENVIPKEIALDKFKIEDKMVEISEILKNGSTIGFSKLVNSCEDKIEAIVTFLALLELIKLRVISAIQEGNFKEIYLEGVKSYDGQ >NC_008593|1224672:1234030|1230290_1230824_-|WP_011722110.1|DBSCAN-SWA MICIIAFFFIFLIPLPLTLKVTYENNKLYIYIYKFKVYPSKKTIKSMPEPKPKGIFPKLVYVKTTKYIYTKCRRLIYNSKLKIDLNVLYGSENAAITGIFYGLIHSSFSYIYGLLRSIFNIKHFNCNVVPKFNNSIFKIEFKSIIFINLGKIIYITILIFLSFKKSSRQYLKPKEEY >NC_008593|1224672:1234030|1232295_1232505_+|WP_011722112.1|DBSCAN-SWA MKLAFNFKTGKKEVIDEEDTKKLIDSINFLKVAKYLMGPKKTNKIGDMSFVLSGERIKVSDLKSVELIL >NC_008593|1224672:1234030|1232590_1234030_-|WP_011721434.1|transposase|DBSCAN-SWA MLTNNERKQNQLELVYIENLVPENHILRKIDKYIDFSFIRDLTKDLYCPDNGRPSVDPVVLFKMLFIGYLFGIRSERQLVKEIQVNVAYRWFLGYGLTDKIPSHSTISQNRTKRFSNTNIHQEIFDNIVFQAINRNLVDGKILYTDSTHLKANANKHKFIKKEITKSTKEYFDELENDINKDRINHNKKPLKKKTKIAETKEIKVSTTDPDSGYMVRDGKPKGFFYLDHRTVDGKYNIITDVHVTPGNINDVDPYVKRIETQIEKFNFNTKYLVADAGYSTNPICKQISDKNYQGVFGFRLGPHVKGKYTKYRFQYVKELDGYVCINNCFLKYRTTTREGYKEYVSNAEHCASCKYKNNCLTSDKSINRTIRRHVWEDYKDQIFRFTKTEKGKNIYKRRKEKIERSFADSKELHGLRYCRMRGIKNVSEQCLLTAAVQNMKKIAMVLSHYFLCTLIQIYSKLTYIINIFRMLSHKRILA >NC_008593|1224672:1234030|1224672_1226373_+|WP_011722104.1|DBSCAN-SWA MGGFNDKLNGAKILIKCLKELNVDTIFGYPGGAVLPIYDALYCEKDINHILTAHEQGAAHAADGYARVTGKVGVVLVTSGPGATNTVTGIANAYRDSIPMVVFTGQVPKRQMGKAAFQEVDILSITKSITKKNFLVKSIEALPTIVYKAFKIATEGRKGPVVVDIPKDIQDTLVNDDFYYKNIYEVFTEINCVENENLYKNIKKASLLINKCRKPIIYSGGGIVSSNANKELMEFSEKIKSPVICTLMGLGSFPGDHKYFMGLGGMHGNVYSNYAITESDLLIAIGMRFSDRVTSKIEGFAPNAKIIHIDIDEKELGKNVNVDVPINGDIKEILNLLIKCVEVKEEGKWNYKIESLKRKYSLNFDKKDELSGEYIIEKLNEITEGNCTICTEVGQNQIWAAQYYKYLKPRTFVSSGGLGTMGFGLGAAIGAYFGNPKRRVINIAGDGSFKMNCAELDTISRYNIPIIQIVLNNRCLGMVRQWQEMFYDKRFSHSIFHKEVDFTKLGMAYEIKSFKVNEKEEFEDVLKKALKLNEPVIIECLIDTNENVFPIVPPGETIDNMLTEKI >NC_008593|1224672:1234030|1231036_1232164_+|WP_011722111.1|DBSCAN-SWA MKKLRTISIILNICLIFNIAFVPSIEATEPKNNSIYVDARCAIAMDSKSKCVLYEKNAEMLVPIASTTKIMTTLVALKYGNLDTKYEVSPKAASIRGSKVGYKKGEQISLKELLYGLMLRSGNDAAITIAEGISGSVEKFCELMNEYAIEIGAFNSHFESPHGLDSQNHYSTAYDLARITAKAKENKLFNEIVGVKDIDEKQHGFTRSYHNINKILYQIPNANGVKTGYTGGAGKCLVTSVKEDDDDVIIVVLNCTPRWKETKKIYDFVKENYDFKKLVSKDQVLDNIEDNKGNKVKLVCNNDLVIPVGKQEKCEYKIIKPTKLPSRVYKGINLGKINIYKDGKLVSSNVLKSGDNLNGIEIKGFFKKIKSIFNK >NC_008593|1224672:1234030|1229884_1230289_-|WP_011722109.1|DBSCAN-SWA METHPIESLMKSTLENLKDMIDVNTVVGDSIKTIDGTIIVPISKVTFGFASGGSEFYNKNSKEEVSKYPFGGGSGSGVSVKPIAFLVIKDKLVRLLPMEQNNITIVDKLLDQIPELIDILKGNNKEKDKQKEEE >NC_008593|1224672:1234030|1227406_1228591_+|WP_011722106.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNILDNFDFKELEAINLIKETCSKFNANAYIVGGAIRDSILNVKPKDIDICIESNSINIISKLNFVKEYKYYEKFQTSTIVFENEVEIDLIRCRKEKYEFNGALPKVIPSNIMDDLFRRDFTCNAIAYNLVNDTIIDPFNGRDDINKGILRKIHENSYMEDPTRIFRAIKYANRYDFKIHDKDEIKESLLKKSMNNISNDRIIREIVSLCKEEKWIHNIFSCNELNILNIEKSMFLEDNFLFNYKDYNDRILNVFLSSKGNRGIFIKNSVLCKDIKKAFENYNNGITNKNYILNEKDNFSIYNKLKNFSTYDIKILAHFKENKYKLLNYIHNLKNIKLNVNGKYLSQLNLNNKKKYKDILNYLYMIKLNTGIRDDEKYLFGNLGEILNVVKYKN >NC_008593|1224672:1234030|1226392_1227307_+|WP_011722105.1|DBSCAN-SWA MEKSYVFFDGKIMDEKDVNLSIRNKAFNYGLACFEGIRAYYDENTKQLYGFRLKEHYERLLQSCKALYLDIPYTVDELVDITVELLRKNNFKTTTYIRPMAYKGSNNIAPTLMDDDNRLLIYCMPMGSYTGKKALKVAVSSWSRIEDNMIPARTKPSAAYLNSGLASLEVLRKGYDEAIFLTRNGHVCEGPGENIFMVRKGKLVTPPASDNILEGITRDTVMQLAKEELGMEVVERSITRTELYAADELFFSGTAMEVTPICEVDDRKVGNGVESNVCSKLQELFSKLTVGKLKKYSNFCTKIY >NC_008593|1224672:1234030|1229307_1229880_+|WP_011722108.1|DBSCAN-SWA MMDNNINQMEIDEISTKNRYFSIIESVLFASGNPLNIKEIAHIIECGEEYTYSLLEEMKKTYNENSRGLLLINMKEEYTLVTKPENSVFLQKLLKTNNRQSLSRASLEALAIIVYKQPITRIEIDEIRGVKSDKAIQTLLEKDIIKEAGRKKVPGRPIMYVTTGEFLKYFGLEDLNQMPILDEFIQKEEE |
10 | uncultured_Mediterranean_phage(33.33%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1300821 : 1403154
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NC_008593|1300821:1403154|DBSCAN-SWA 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101 | Clostridium_phage(32.56%) | plate,tRNA,protease,terminase,head,coat,integrase,tail,portal | attL 1298477:1298494|attR 1352863:1352880 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1631437 : 1644989
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_008593|1631437:1644989|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NC_008593|1631437:1644989|1640794_1641415_-|WP_011722487.1|DBSCAN-SWA MLKIAVLISGGGSNLQSIIDNIESKKLNCSIEYVISDKEGAFGIDRAKKHNIKTFVFDRKIYKDTLSEKILEVLDGKVDLIVLAGYLSIIKGDILKKFKNQIINIHPSLIPSFCGKGMYGIKVHEKALEYGVKVTGCTVHFVDEGTDTGSIIIQKTVNVEDDDTPETLQKRVLVEEHKALPEAIGLIANGKVKIHNRKVIIKAGVN >NC_008593|1631437:1644989|1641402_1642398_-|WP_011722488.1|DBSCAN-SWA MATYKDAGVNIEEGYKAVSLMKNYAAKTFTKGVINDLGSFAGMFELSGYKTPVLVSGTDGVGTKLKIAFDMKKYDTVGIDCVAMCVNDILCHGAKPLFFLDYIACGKLEAENAADLVRGVSDGCIDAGCSLIGGETAEMPGFYKEGEYDVAGFCVGVVEKDEIIDGSKIENGDVLIGIESTGIHSNGYSLVRKLIKDFNEDFNGEKIGNVLLTPTKIYVKTVLELIKKYNIHGMAHITGGGFYENIPRMFKGDFTAVINKGSFKVPEIFNHIMSLGVEEEHMYNTFNMGIGYVLCVKEEDAENIIRYIEKMGSKAYKIGHVEAGGHGVCLK >NC_008593|1631437:1644989|1631437_1632130_-|WP_011722483.1|DBSCAN-SWA MKIAIFSDVHGNLEALKAVLSDIKSKNVDRVVCLGDLVGYGPFPNEVIDIIRNENILNIIGNYDTAVVNNDIKYIQDNLLNREFALPWSVKEVSDANKKYLKRLPQDIIIVEHGKVIKFVHGSTRTVNEYLLEDSKEANEVMIQLKEDVLVCGHTHLPYVKEYENKIIINDGSVGKSKIGTPNITYIILDIEDEVKAEIVEVPYNYEKTVKAMEERKFPQQLIENIKYGK >NC_008593|1631437:1644989|1634242_1639237_-|WP_011722485.1|DBSCAN-SWA MKVLVIGSGGREHAIVWKVSQSALVDKIYCAPGNGGTAKEDKCENISLEGIDSLLNFAKKENIDLTIVGPEAPLVEGIVDKFKESDLKIFGPSKEAAKLEGSKSFSKEFMKKYGVKTAQYEVFEDIKSATEYLETCNYPTVIKADGLAAGKGVVICKTRDEAKKALEDFMLHDIFKGAGLKVVIEEFLEGVEASILSVTDGETIIPFISSKDHKQIFDGDKGPNTGGMGVIVPNFYCTDEVLNEFNEEILKPTLEGIKKENMDYTGTIFFGIMITKNGVYLLEYNVRMGDPETQGVLTLMESDYTELMLKAIDRKLCDYEIKWKDGHVCCVTAVSKGYPGSYEKGFEIKGLEKSDSKVFIAGAKEENGKLLTNGGRVLNVVAFGKTLNDAKKKAYKDIEKIDFEGMYYRHDIGNKKVKRIFVEKKPTFNVEAEGLLKEIKENLNIKNIDNLRILNRYDVSGISDKEYDEAKKIIFAEPVVDFVYDEDMEVKNDDKIFAVEYLPGQYDQRADSAAQCIQILTQNEKPIVKCAKVIIINGNVSEDEINRIKEYYINSVDSRETSLKKPITINMEWEKPKDVEVLHGFIDKNEEELKCFWKTQGLAMSFEDLKFCREYFKNTEKRNPTITEIKVIDTYWSDHCRHTTFETKIEDVKFEEGEYILPIKKAYDKYLNSRKYVYENREKDISLMDLAVIGMKELRKEGLLDDLEVSDEINACSIECDVDVDGKDEKYLIMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCLGGAIRDPLSGRSYVYGAMRITGSADPRKKISETLNGKLPQRQITIKAANGYSSYGNQIGLATGYVKEVYDEDFVAKRMEIGAVLGATPKENVRREKPVEGDSIILVGGRTGRDGCGGATGSSKEHDENSILTCGAEVQKGNPPTERKLQRLFRNPKASKLIKKCNDFGAGGVSVAIGELSDGLLINLDLVSKKYEGLDGTELAISESQERMAVLVKNKDAEKFIKLAQEENLEAIEVAKVTSNNRLTMSWRGKNIVDISRDFLDTNGVKQRIDIVVKNPDSHGYFKEKKCENIKTKWIETLKDLNVCSQRGLMEKFDSSIGAGTVFMPYGGKYYKSPIESMCFKVPVLNGETKTGTIMAYGYNPKIGKWSPFHGAMYAVIESVTKVVAAGGNYKNIRLTFQEYFEKLGQDSAKWGKPFAALLGAFLVQKELKIPAIGGKDSMSGTFKDINVPPTLVSFAVDTVNTDKVISPEFKKKGSRVVLIKTPKDKYNIPNFEELKKNYEVVHKLINEGMVYASHTVTNGGIIEAVSKMTFGNKIGINFSQNVKYEELLNEDYGSIILEIDNKVKLKEEFKDVNYTLIGFTQGASLIKIGDEEIEIDELIKVWENPLEKVFPTKVEAIDKKIPLKLYDNKSILSPSIKIPKPNVYIPVFPGTNCEYDLKKAFERAGAMTNLNVFRNLTPKDVEESVDAMVENINKSQIVMLPGGFSAGDEPDGSGKFIQAVFRNPKVKEAVMELLNKRDGLILGICNGFQVLIKLGLLPYGEIRDLDENSPTLTYNSIGRHMSKMVETKIVSNKSPWFNNVNLGDIHSIAVSHGEGRFACSDEVARRLMQNGQIATQYVDFNGNPTYDIEFNPNGSVYAVEGITSPDGRILGKMGHSERIGNNVYKNILGEKDQKLFEAGVRYFK >NC_008593|1631437:1644989|1642406_1643783_-|WP_011722489.1|DBSCAN-SWA MNKIEIDKFKDECGVFGIYSKSKLNVASVTYYGLYALQHRGEESAGIVVSDGEKLTCIKDMGLVSDVFNEEIINNMKGKMAIGHVRYSTFGESTISNAQPLLSSFKLGSIAIAHNGTLINAEKIKQELEEKGVLFQTSIDSEVILNLIARSLKSDIEESIKDAMKEVKGSYGIVILTKDKLIGVRDPNGIRPLCIGKMEDDYVICSESCALNCIGAEFIRDVEPGEMVIVDENGLRSFKFEENIKHKTCAFEYIYFARPDSKMDGIEVYNSRVAAGEQLFKEAPADADIVIGVPDSGIPAAVGYAKASGIPYGIGLVKNKYVGRTFIAPSQDLRERAVSVKLSPLKVNVEGKRVVLIDDSIVRGTTSRRLVEVLKRAGAKEIHFRLSSPVVTDPCYFGIATPYKKDLIGANMSVDEICKEIGADSLGYLSIEGLLKVLKDGKDEFCLGCFNGQYPVER >NC_008593|1631437:1644989|1632387_1633815_-|WP_011722484.1|DBSCAN-SWA MENSKKRKDNLKESFLDKYFKLSENGTSVRTEILAGLTAFITMAYALLVIPNMLKFSGMNSLGVKGDAAASLTVLNDPVISSAFAGMCIASCIGTLIMALYANLPFALAPGMGLTAFFTYSVCLTLGYTWQQALTAVFISGILFIIITVTSIREKIVEALPQNLKLAITGGIGLFVSLIGLKSGHIVVSDPGTLVKFGDLTSKSTVLTVIGIIVMAILMARNVRGGMLISIILTTIIGIPMGITKISGLKFFSVPKFGATFFAFDFKGLLHHGGSGFVGALTSIVMVILTFSLVDLFDTIGTLVGTAHKADMIQPDGKVKNMRKALLSDAVATTISSMMGTPTMATVVESTAGIAEGGRTGLTNVVVGILFALSLFFGGIVGIVPSEATAPALIIVGILMVGAVKEIDFEDFTEALPAFFTMAMMPFTYSIANGIAAGIIFYTVIKLGTGKQKQIHPIMYILSLLFILRFVLLPQ >NC_008593|1631437:1644989|1639265_1640768_-|WP_011722486.1|DBSCAN-SWA MLKRALISVFNKEGIVDFAKFLVNKGVEIISTGGTYKHLKENNIPVTEVNEVTGFDEILDGRVKTLHPAIHGGILAIRDNKEHMSIIENKGIKPIDMVVVNLYPFFEKVKEDLEFQEKIEFIDIGGPTMIRAAAKNFKDVVVLTDTKDYSDVMDQIEKNNEVNYDTRKRLAGKVFNLMASYDAAISNFLLEDTEYPENLALSYTKSMDLRYGENSHQSAACYTANNGKGIMNNIEILNGKQLSYNNIKDMDIAWKVVWEFDDIACCGLKHNTPCGVALGENVHDAYLKAYSCDPVSIFGGIVAFNRKVDKKTAEEMVKIFLEIVIAPDFDSDALEVLKTKKNLRVIKCNTKPEDNFNIAKVDGAILVQSEDKLFAEKMEVVTDKKPTEEELKELTFAMKVCKYTKSNAIVVSKGCVAVGIGGGQVNRIWAAEEALERGEGATVLASDAFFPFDDVVKTAAKHGIKAIIQPGGSIRDKDSIKACNENDISMVFTGIRHFKH >NC_008593|1631437:1644989|1643800_1644508_-|WP_011722490.1|DBSCAN-SWA MEKKMLYEGKAKKVYEAEDKDHVIIYYKDDATAFNGAKKSQIDHKGILNNNITSAIFEMLHEKGIETHFEKKLNEREQLCKKVEIVPLEVIVRNVAAGSMAKRLGVSEGKELNTTIFEICYKNDELGDPLINDYHAVALGLATFDELKEIYNITSNVNNILKEFFLKQNIKLIDFKLEFGRFNGKIILADEISPDTCRFWDATTNEKLDKDRFRRDMGNVEEAYIEILNRISNAK >NC_008593|1631437:1644989|1644509_1644989_-|WP_011722491.1|DBSCAN-SWA MKVAIIFGSKSDIAKMKGAAQILKEFGIEYNSYILSAHRIPEELSKVVKKLEKEDYECIIAGAGLAAHLPGVIASQTILPVIGVPIEAAVSGLDSLLSMVQMPKPIPVATVGLNNSFNAGMLVIEILALKYPELREKLKNYRKNMKEKFIKENSKGVEL |
9 | Prochlorococcus_phage(22.22%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2459695 : 2525043
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NC_008593|2459695:2525043|DBSCAN-SWA 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MDNKELLKKLTLAHAPSSREDKLYSLIKDNFSEFGKVTIDEMNNIIVHKKGTKKGSIMIMAHADEIFLIVNDILENGTLKFKGVGVDPKAIVGREVTIHGKEDILGVINTSKDTDKAVTADDLAIETGYSKENIEKIVRIGDFVTINGKFVELLNNEIACKTIDNRGSIVSMYQCAKELQNIEHDLDVYFVCSCQEEVGHRGAKMVTYNLNPDIGIAIDTTFDSGALGTHDRENVIGNGPVICHGPNLHHKLNKKIIEIGDKYKIPYGVEVEPGNTGTDAWDIQVTREGVPSMLVSIPIKYMHTPVELVSMDDINNTGKIIAKLIENLKSDDLEELLCF >NC_008593|2459695:2525043|2496669_2497359_-|WP_011723234.1|DBSCAN-SWA MKINNVLTAKFIKRPNRFVAYVYLNNEEVKVHVPNTGRCREILIPDTTVVLREGTNPNRKTKYDLIAAYKNDKLINIDSQVPNAVVEEALKNKKIQPLVKFNNIKREQTFGNSRFDFKLWDDSNNKYYLEVKGVTLEDKGNCMFPDAPTERGTKHILELIEIKESHMGAGILFLVQLSGAKTFSPHKEMDKKFSEALTLAHKKGVDIFCYDCNVGEDYIEIKDPVEIIL |
46 | Bacillus_phage(20.0%) | tRNA,terminase,protease,capsid,transposase,integrase | attL 2501422:2501481|attR 2533304:2533380 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||
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NC_008593.1|WP_011722271.1|1394024_1394162_-|hypothetical-protein |
1394024_1394162_-
Protein sequences of NC_008593.1|WP_011722271.1|1394024_1394162_-|hypothetical-protein>NC_008593.1|WP_011722271.1|1394024_1394162_-|hypothetical-protein MAYRTDCYVVNKSYKLDKEKVKKAFQIILNAKIKEELEKDKSTSK |
45 aa aa | NA | NA | NA | 1300821-1403154 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.1|1853882|36|NC_008593|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_008593 position: 1361923-1361958, mismatch: 2 caaatttgaaaaaacttgaaacttttttaaatatat CRISPR spacer caaatttgaaaaaacttgaaacttttttagaaatat Protospacer *****************************.* **** 2. spacer 2.21|1853884|36|NC_008593|PILER-CR matches to NC_008593 position: 1361923-1361958, mismatch: 2 caaatttgaaaaaacttgaaacttttttaaatatat CRISPR spacer caaatttgaaaaaacttgaaacttttttagaaatat Protospacer *****************************.* **** |