Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NC_002942 | Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1, complete sequence | 0 crisprs | RT,PD-DExK,DEDDh,DinG,cas3,WYL,csa3 | 0 | 0 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
913514 : 920354
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_002942|913514:920354|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NC_002942|913514:920354|916629_917139_-|WP_010946573.1|DBSCAN-SWA MTQLKVKYIILLLLMLCSISGNALPFDKEKMVQVVSDSADLNQKNHQGVYIGNVEFVQGSTNLRAEKAITQGDAKNQLTLAVAEGSKDKQAHYWTTTAPDKPPFHAYADTIKYYPLKHLIELIGNARIEQGPNSLSAAKISYDTQEQHVLSHSDEKTRTTIIIYPEKKS >NC_002942|913514:920354|914283_915318_-|WP_010946570.1|DBSCAN-SWA MKPKLLFEQLLSRQDLSSDQMQEVIHACMTGEFSDVQIATFLALMRMKGETVNELTAAAQVMRQLAHKIDLGNPLIDIVGTGGDGRNTFNVSTACSFVVAAAGIKVAKHGNRSVSSRSGSADLLEQAGFILNLSDSQVQNCINQCQLAFLFAPHYHPAMQHARAARQQLGIRTLFNLLGPLINPAQVKRQVVGVFSTNWLKTIATVLANLGSERSLVISSQDGLDEISIAAKSEVVEYRDGNFKQWFISPEDYGLKHSSLDAIIVDSPEQSLHLIQSVLSGDSGPARDIVLLNSAAAIYCAKDGISFDAAIEEARIAIDSGKANLCFNKLRLLTQTLNKESNHE >NC_002942|913514:920354|919556_920354_+|WP_010946577.1|DBSCAN-SWA MPDNWVEIKNLFFSLDDRCIFDGIDMVVKQGKITAIMGPSGSGKTTLLRLIGAQLRPDSGQIYVNGQNIHQLSRKSLYETRRNMGLLFQSSALFTHLSVFENVAFPLREHTELNASMIRNIVLMKLEAVGLRGAAHLMPAQLSGGMCRRVALARTIALDPVLMMYDEPFTGQDPISMGVLVRLIQRLNQLLHTTTIIVSHDVEETCSIADYIYLISGGKIIGQGTPDELKRSIEPQIRQFMHGEADGVVPFHYPAKPYTEELLNA >NC_002942|913514:920354|917685_918213_-|WP_011213328.1|DBSCAN-SWA MNELLEKAKKIKCLICDVDGVLSDGLLHIDNHGNELKSFHVQDGMGLKLLMAAGIQVAIITTAQNAVVDHRMEQLGITHYYKGQVDKRSAYQHLKKTLGLNDDEFAYIGDDLPDLPLIQQVGLGVAVSNAVPQVLEFADWRTERTGGRGAVRELCDLILNAQNKAELAITGYLKQ >NC_002942|913514:920354|915295_915874_-|WP_010946571.1|DBSCAN-SWA MLLIIDNYDSFTYNLVQYFQSLNQKVEVFKNDEIQIDTIRQSAPQYLVISPGPNSPDESGISIEVIKEFHKHIPILGICLGHQCIAQAFGGKIIPAPEIMHGKTSEITHHYQGLFTGIPNHFQATRYHSLAVDIMSLPNCFSIDAWADDTIMAISHRQFPLFGLQFHPEAILSQFGLQILENFLRYETQTSI >NC_002942|913514:920354|913514_914291_-|WP_010946569.1|DBSCAN-SWA MNSILERIAKHKLEEVAVAKKNKPLHVLSKQQPGEMRDFITALKSNTSPAVIAEIKKASPSKGLIRKDFNVAEIAKIYTQNGARCLSVLTDIEFFQGHPDYLALAKSKTTLPVLRKDFIIDSYQIYESLVLGADCILLIVALLDDVQLMDFCQLAQELKMSVLVESHTQDELERALRLPTPLIGINNRSLHNFKTDIQLSIQLKQFVPKDKIIITESGINTREDIKLMQSHGINAFLIGESLMRADNIGKALQKLMTD >NC_002942|913514:920354|917119_917689_-|WP_010946574.1|DBSCAN-SWA MNITKQAIWLFLTLLILAGSGWYYAHFNQAIINKKSLSNEVDTTISQLTVKQFNSEGVLINLLTTPQVEYIPNNNLHLLKNPHIIIKQDNQPAWEINSLRAKSFDGGKQITFIEQVVVHQNPGESTRESTLKTEEITYYPKEKKATTSLFVTFEQPGNIIQSTGMNAYLDEKRVELLHKARGSYDPAKG >NC_002942|913514:920354|918226_919189_-|WP_010946576.1|DBSCAN-SWA MNFCTLGLAVIETEAQAVFELTQRIDEHFEKACELLLSCKGRIVVTGMGKSGHIANKLASTFSSTGSPAFFMHPGEASHGDLGMITRQDIVVAISNSGNTHEIVTLLPLLKRLEVPLITLTGNKQSTLAKSADVNLDVSIKQEACPLGLAPTTSTTVSLVMGDALAISLLQARGFSAEDFALSHPGGALGKKLLLKIDDLCHTGEQLPLANENATVSDALIEVTNKKLGMTCVVDNHGYLVGVYTDGDIRRTLTRQFNINTTLIKDVMTKNCRTISKGMLAAEALAIMQKYSITSLVVVENDNRPYAVLHLHDLLKAGVF >NC_002942|913514:920354|915907_916633_-|WP_010946572.1|DBSCAN-SWA MSLLEAKQLKKSFKGRTVVNGVSIHIKQGECVGLLGPNGAGKTTCFYMIVGLQSCDEGHIILNGTDITQDAMHLRARHGISYLPQEASVFRKLTVAENIMAILELRKDLDDQKREEKLDLLLQEFHISHIENSLGMALSGGERRRVEIARALAIEPSFILLDEPFAGVDPISVIDIKKIILHLCDKGIGVLITDHNVRETLDICERAYIVSQGKILCEGTPKAILANQQVRQVYLGEEFAL |
9 | Acinetobacter_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1302986 : 1308923
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_002942|1302986:1308923|DBSCAN-SWA TATGCACGAACAGTTTCTGCTTGCAGCACTTGAACAAGCCAAACTGGGGAGAGGCTTTTGTGCCCCCAATCCCAGCGTTGGGGCGGTTGCTGTGCAAAATGGTAATATTATAGCACAGGCATGGCATAGAGGTGCAGGTACACCGCATGCAGAACAATTATTGTTATCACAAATTCCACCCCAAACGCCAGGGGTTACGCTTTATGTCACGCTGGAGCCTTGTAATCATTGGGGCAAAACTCCCCCTTGTGTTGATGCTATTATCAATCATGGTATAGAGGAGGTTGTTTTTTCCTATTTTGATCCAAACCCCATTGTTGCCAAAAGTAACTCCTCAGAAAAATTACGTGAACATGGAATACAAGTCAGGCATATTCCTGTAAAGGCAATTGATGTGTTCTATAAAAGCTATGCTTATTGGACTATGACCCATAAACCAAGAGTCACTGTTAAAATAGCACAAACTTTTGATGGTAAAATTGGAAAGTCTGAGGGAGCTCGAGTGGTTTTGTCCAATGCTTTATGCGAACAGTTCACTCATCAAATGCGTGCTGCCAGTGATGTCATATTAACCAGTGCCAAGACAGTTCAAATGGATAATCCAAGAATGAACGCCAGATTAGATAGTGGATTGGTAGCAAAGCCAGTTGCCATTGTTGACCGCAATTTAAGTTTGTCTGATGACACAATCATTTTTTCGACAGCAAAACATTGCCACATTTATCATCAACCACAAGCAAATCAGGCAAAGACTTATCCTAATAGCACTCATTATGCGATGCCTTTGCAAAATGGGTTGATGGACCTGGAGGCAATAATAACTCATCTTGGTCAACTGGGATATCATGACGTATGGGTTGAGGCGGGCGGAGCTATTTTTTCTGCGTTACATAGTAAGGGATTGGTGCATAGAACCTATTTGTATTTAGTTCCCGGCAGTTTAGGGCATCAAGCGATTTCAGCTTATCAACAACAGGGGATTTTTGAAAAAGCTCATACGGTGAGTTGGCAAGCTATGGGTGACAATATGATAGCATGTTTGGATTGGCAGGAGGATGAGTGTTTACCGGATTGATAGAAAATACAGGCAAAGTATTAATGAATAGGCAAGGAGAAAATTCTAGTCGTTTAGTCGTATCTTCAAGCTATCAGGATTTGAAACCTGGTGAGAGTATCGCTGTAAATGGGGTTTGTTTAACCCTTTTGCCAGCAGATTTTCCTGAACTGTGTTTTGATATTTCACCTGAAACTCTGCATGTTACCACATTGTCAAAATTATCATCTGGCGACATGGTTAATCTTGAAAGAGCTATGCTGGCATCAACCCGCTTTGGTGGTCATTATGTATCGGGTCATGTAGACACCAGGGCCAAAGTGAAATCCATTCGTGCTGTTAATGAATTTATCGCGATGGATTTGGATGGTTTTATCCCAGAACATAATCATTATTTAATACCCAAAGGTAGCATTACAGTAGATGGAGTTAGCTTGACTATTAATACTGTATCAGAACAAACCGTCGGACTCATGCTGGTGCCACATACATTATCAATGACCAATCTCGGTTCATTGAGAGTGGGCCAGCAAGTCAATATTGAATTTGATTATCTTACCCGTATTGTGGCTCATCAGCTTCAAATTATCGGGAAATTGAACCTAGAGGAAGTGTCATGAAACATTCATTAGCAACAATAGAAGAGGCTGTGGCGACACTTAAAGCCGGTAAAATGATTATTCTAATGGATGATGAAGATAGAGAGAATGAAGGTGATTTGGTGATTGCTGCTGAGCACGCTACTCCTGAAGCCATTAATTTTATGTCTCGTCTTGGTTGCGGTTTAATTTGTTTGCCTATGGCTGAAGAATTGATAGACAAACTCCAACTGCCCATGATGGCTCGGCATAACAAATCGCCGTATGGAACGGCGTTTACGGTTTCGATTGAAGCAGCTAACGGTGTCTCCACAGGCATCTCAGCAAGAGACAGAGCTCGAACAATTCAAGTGGCTATTGATCCAAAAAGCGGGCCATCTGATATCATTTCACCTGGACATGTTTTTCCTTTACGGGCTAGAAAGAGAGGAGTTTTAGAAAGACCAGGTCAAACAGAAGGCAGTGTTGACTTGGTAAAACTTGCCGGATTGACCCCGGCCGCAGTGATTTGTGAAATCATTAATGAAGATGGAACAATGAGCAGACGTGATGAATTAGCTCTTTTTTCAAAAAAACATCAAATCCCTTTAGTCACCATTAAAGATTTAATTCAGTACAGAGTACGGCATGAAAATCTGATTCATCCCGTTGCAACCACACAAATTCCTCTGGAGGAGAACGGTGTTTTTACTATGACTGTTTTTGAGAATCAGATAGATTCCTGTGAACATTTTGTCTTGGTTAAACCCCCTTTGTATGGTAATCAAGTGCCTTTGGTTCGAATTCATTCTGAGTGCATAACAGGTGATGTTTTTGGCTCCAGAAAATGTGATTGTGGAAAGCAACTGGAGTTGTCTTTATCCCAGATCGGAGCGGAAGGCGGTATATTAATTTATTTGCGTCAGGAAGGCCGCGGAATAGGTTTGGCAAACAAATTAAAGGCGTATGCTTTGCAAGAGCAGGGGTTTGATACAGTCGATGCTAATCTGGAATTAGGATTGCCCGCTGACGATAGAGATTATGCCGTAGCATACCAAATACTGAAATATTTAGGGGTTGAAGCATTAAGGTTGCTGACAAATAATCCTTTAAAAATCGCTTCTCTTGAGCGTTATGGAATGAAGATTACTCAACGCATTCCTTTGGAAATTGAGCCCTCCAGAGAAAATCACAGTTATTTAAAAACCAAAAAAATAAAACTGGGGCATTTATTAGCCATTGATTAGGATAAACATGAGAGAGATAAAAACAATTGTTAGTGATGGTGTCACGTTTCCAATAGCGCTAGTTGTAAGTACTTTTAATGAACTGATAACCTCTGCATTAAAAAAAGGGGCGTTAGATAGATTGACTGAACTGGGTTTTAAATCGGAGGACATTACCTTAGTTGAGGTTCCTGGCGCAGTAGAGATTCCGTTTGTTGCACAGTTGCTAGCGAAAAAACAAAAAGTAGAAGTCATAGTGGCACTTGGAGCAGTTATCCGTGGTGAAACCTCTCATTATGATTACGTTTGTGATCAGGTCAGCCAGGGATGCCAAAGGGTTATGTTAGATTATAATATTCCGGTTATCTTTGGTGTATTAACTACTGAAAATGATGAGCAGGCTTTGGCAAGAGTGGGAGGAACTCACGGCCATAAAGGGAGAGATGCGATAGATTGTGCGGTTTCCATGCGTTCTATTAAACAACAATTGCAATAGTTCTATTAATTTTGCTCAAATTTCTGTTATTTATATCTTCATTTTGATAGAATTGAATCCCGTTTACATGCAAATTAAATTGAACACCAAATTGGTGGATTCGGCATTTTGAGCGGGGTCAAAAAATGACAAAATATATTTTTATTACTGGCGGGGTTGTGTCTTCTTTAGGAAAAGGCATAGCAGCCGCATCTCTTGCAGCTATTCTTGAAGCTCGTGGTCTTCGCGTTACGTTGATAAAGCTTGATCCCTACATTAACGTTGATCCTGGTACTATGAGTCCCTTTCAGCATGGCGAGGTTTTCGTAACGAATGACGGGGCGGAGACCGATTTGGATTTGGGACATTATGAGCGCTTTGTTAAAACAACAATGACCAAGCGTAATAATTTCACATCGGGAAAAATTTACGAAAATGTAATTAAGAAAGAAAGACGTGGTGATTATTTAGGAGGGACAGTTCAGGTTATTCCTCATATTACTAATGAAATCAAACGCTGTATCAAACTCGGTGCGGATGCATTCGATGTGGCTATGGTTGAAATAGGAGGAACTGTTGGTGATATTGAATCATTACCCTTTCTTGAAGCAATTAGGCAGATGCGTATTGAGTTAGGTTCACAACGAGCGATATTTATTCATCTTACTTTGGTTCCTTATATTGCTACTTCTGGGGAAACCAAAACCAAACCAACTCAACACTCGGTAAAGGAATTGCGTTCTATTGGTATCCAGCCAGATGTATTGATTTGCCGTTCAGAAAAACCATTATCCATGGCAGACAGGGCTAAAATCGCACTATTCACTAATGTTGAAAAAGAAGCTGTGATTTCTCTTGAGGATGCGAATAGTATTTATCAAATACCTATGATTCTACATGCGCAGCATTTAGACGAAATTGTTGTTAAGAAACTAAGCCTGGAAGCTAAGCAGGCTGATTTGAGCGAGTGGCAACGAGTAGTTGATATGCAAGCAGTTCAAACGATGACAGTGAAAATCGCTATGGTAGGTAAATATACGGAGCTGAATGATGCCTACAAGTCGATTAATGAAGCTTTATTGCATGCTGGAATTCATACTGAAACAAAAGTAGAAATTATCTATTTTGATGCTGAGATGATAGAAAAGCATGGCGCTTTATTGCTTGAATCCATTGATGCTATTTTGGTACCTGGTGGTTTTGGTGAGAGAGGAGTCGAAGGCAAAATTAAGGCTATCCAATATGCTCGGGAGCATAAAGTTCCTTTTTTAGGGATATGTTTGGGTATGCAAACAGCTGTTATTGAATTTGCGAGAAATGTAGTCGGTTTGACAGGAGCTAATTCGACCGAGTTCAATAAAGAAACATTGTATCCAGTGCTTGGTTTAATTAGTGAATGGATGGATGCCGATGGCAGCAAGCAGATCAGGGACGAAAATACTGACTTGGGTGGAACCATGCGTTTGGGCGGACAATACTGTCATCTTGCTGAAGGCACTCTGGCAAGAAAAGTTTATGGCAAACCACAAATTATAGAGCGCCATCGCCATCGATATGAAGTCAATAACAAGTATGTGGATAGTTTGGTAAAACATGGCTTAATTATTTCAGGGCGATCAGCAGATAATTCACTGGTTGAGATGATAGAATTAGCGGACCACCCCTGGTTTTTAGCTTGTCAGTTTCATCCTGAATTCACATCAAATCCAAGAGATAGTCATCCTCTATTTAAGGAGTTTGTACTTGCAGCTCGTATTCACCATCAAGAGAAGGACAAAAAATGAGATTATGTGGTTTTGAAGCAGGCTTGGATAAGCCATTGTTTTTGATTGCCGGCCCTTGTGTTATTGAAAGTGAAGAATTGGCTTTAGAGACCGCAGGATATTTAAAGGAAATGTGCAGTCAGTTGAATATCCCTTTCATCTATAAGTCTTCTTTTGATAAAGCAAACCGTTCATCTATTTCCAGTTACAGGGGGCCTGGCTTTGAAAAAGGGTTATCGATTCTGGAAAAGGTTAAATCACAAATAGGTGTTCCTGTTTTGACTGATGTTCATGAAGACACGCCCTTATTTGAAGTCTCCAGTGTGGTAGATGTATTACAAACGCCAGCCTTCCTATGCAGACAAACCAATTTTATCCAAAAAGTTGCTGCCATGAATAAGCCGGTTAATATTAAAAAAGGACAGTTTCTTGCTCCCTGGGAAATGAAACATGTTATTGCGAAGGCAAAGGCGCAAGGTAATGAGCAAATTATGGCTTGTGAGCGAGGAGTGAGCTTCGGCTACAATAATTTGGTTTCTGATATGCGTTCCCTCGTTATCATGCGTGAAACCGGCTGTCCAGTGGTTTATGATGCAACACATTCGGTTCAATTGCCCGGGGGCAATAATGGTGTATCCGGGGGGCAGAGAGAATTTATTCCGGCTCTTGCAAGAGCAGCTGTAGCTGTTGGAATATCAGGGTTATTTATGGAAACTCACCCTGATCCGGATAAGGCACTAAGTGATGGTCCCAATAGTTGGCCTCTAGATAAAATGAAACAACTTTTGGAATCATTGAAAGCAGCGGATGAAGTATATAAAAAGTACAGTACTGATTTCTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NC_002942|1302986:1308923|1304655_1305864_+|WP_010946913.1|DBSCAN-SWA MKHSLATIEEAVATLKAGKMIILMDDEDRENEGDLVIAAEHATPEAINFMSRLGCGLICLPMAEELIDKLQLPMMARHNKSPYGTAFTVSIEAANGVSTGISARDRARTIQVAIDPKSGPSDIISPGHVFPLRARKRGVLERPGQTEGSVDLVKLAGLTPAAVICEIINEDGTMSRRDELALFSKKHQIPLVTIKDLIQYRVRHENLIHPVATTQIPLEENGVFTMTVFENQIDSCEHFVLVKPPLYGNQVPLVRIHSECITGDVFGSRKCDCGKQLELSLSQIGAEGGILIYLRQEGRGIGLANKLKAYALQEQGFDTVDANLELGLPADDRDYAVAYQILKYLGVEALRLLTNNPLKIASLERYGMKITQRIPLEIEPSRENHSYLKTKKIKLGHLLAID >NC_002942|1302986:1308923|1306464_1308102_+|WP_010946915.1|DBSCAN-SWA MTKYIFITGGVVSSLGKGIAAASLAAILEARGLRVTLIKLDPYINVDPGTMSPFQHGEVFVTNDGAETDLDLGHYERFVKTTMTKRNNFTSGKIYENVIKKERRGDYLGGTVQVIPHITNEIKRCIKLGADAFDVAMVEIGGTVGDIESLPFLEAIRQMRIELGSQRAIFIHLTLVPYIATSGETKTKPTQHSVKELRSIGIQPDVLICRSEKPLSMADRAKIALFTNVEKEAVISLEDANSIYQIPMILHAQHLDEIVVKKLSLEAKQADLSEWQRVVDMQAVQTMTVKIAMVGKYTELNDAYKSINEALLHAGIHTETKVEIIYFDAEMIEKHGALLLESIDAILVPGGFGERGVEGKIKAIQYAREHKVPFLGICLGMQTAVIEFARNVVGLTGANSTEFNKETLYPVLGLISEWMDADGSKQIRDENTDLGGTMRLGGQYCHLAEGTLARKVYGKPQIIERHRHRYEVNNKYVDSLVKHGLIISGRSADNSLVEMIELADHPWFLACQFHPEFTSNPRDSHPLFKEFVLAARIHHQEKDKK >NC_002942|1302986:1308923|1302986_1304060_+|WP_010946911.1|DBSCAN-SWA MHEQFLLAALEQAKLGRGFCAPNPSVGAVAVQNGNIIAQAWHRGAGTPHAEQLLLSQIPPQTPGVTLYVTLEPCNHWGKTPPCVDAIINHGIEEVVFSYFDPNPIVAKSNSSEKLREHGIQVRHIPVKAIDVFYKSYAYWTMTHKPRVTVKIAQTFDGKIGKSEGARVVLSNALCEQFTHQMRAASDVILTSAKTVQMDNPRMNARLDSGLVAKPVAIVDRNLSLSDDTIIFSTAKHCHIYHQPQANQAKTYPNSTHYAMPLQNGLMDLEAIITHLGQLGYHDVWVEAGGAIFSALHSKGLVHRTYLYLVPGSLGHQAISAYQQQGIFEKAHTVSWQAMGDNMIACLDWQEDECLPD >NC_002942|1302986:1308923|1304044_1304659_+|WP_010946912.1|DBSCAN-SWA MFTGLIENTGKVLMNRQGENSSRLVVSSSYQDLKPGESIAVNGVCLTLLPADFPELCFDISPETLHVTTLSKLSSGDMVNLERAMLASTRFGGHYVSGHVDTRAKVKSIRAVNEFIAMDLDGFIPEHNHYLIPKGSITVDGVSLTINTVSEQTVGLMLVPHTLSMTNLGSLRVGQQVNIEFDYLTRIVAHQLQIIGKLNLEEVS >NC_002942|1302986:1308923|1308098_1308923_+|WP_010946916.1|DBSCAN-SWA MRLCGFEAGLDKPLFLIAGPCVIESEELALETAGYLKEMCSQLNIPFIYKSSFDKANRSSISSYRGPGFEKGLSILEKVKSQIGVPVLTDVHEDTPLFEVSSVVDVLQTPAFLCRQTNFIQKVAAMNKPVNIKKGQFLAPWEMKHVIAKAKAQGNEQIMACERGVSFGYNNLVSDMRSLVIMRETGCPVVYDATHSVQLPGGNNGVSGGQREFIPALARAAVAVGISGLFMETHPDPDKALSDGPNSWPLDKMKQLLESLKAADEVYKKYSTDF >NC_002942|1302986:1308923|1305871_1306339_+|WP_010946914.1|DBSCAN-SWA MREIKTIVSDGVTFPIALVVSTFNELITSALKKGALDRLTELGFKSEDITLVEVPGAVEIPFVAQLLAKKQKVEVIVALGAVIRGETSHYDYVCDQVSQGCQRVMLDYNIPVIFGVLTTENDEQALARVGGTHGHKGRDAIDCAVSMRSIKQQLQ |
6 | Staphylococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2257929 : 2268053
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_002942|2257929:2268053|DBSCAN-SWA ATTATAAGTAACAGCCTACGCCATCATATCCAACGACACGACATTCTTTATAAGCCGATTGATCCAATTCATAGCTTACGGAACCATAATAAGCATAAATCTTTCCATCCTTGGCTTTTTCAATACGTGGCTTCTGATAGCTTACACCAGTTTCACAGCTTGACTTAGCTTGAATCCAGGTCGCAGTACTGTCATTAATGATGTTTTTACCAGGTTTTAATCTATTCTCTCCACATTCATGCGTTGCCAGAGCAATCATTTTAGGCGCTGAGAATAAGACATCATAAGCATTTAATGCTGCCTGCACAGCATTATCCGCATCCAATATTCCATGTCCACAAGGTTTTTTGCCGACACAAGATTTATTGGTGTCGTTGCTTTGCCCAAACTCATGCGTAGTAACATATAAAATTTGTTCAACTTGTTCAGGTTTCAAAGCCTTATTACTGACAGCAAAAATTAAACCTGCTACCCCGGCTACATGAGGCGAAGCCATACTCGTCCCTTGATAAAAATCAAAGCCTGATGAATTGTATCCACCTCCCGGGTTTACGGTAGATAAAATACCTCCCGAAGTGCCATAACGCTTATCACCTCCCGGTGCTGCAAGGGTTATACTGGGCCCATAATTTGAAAAGTACGAACGCAATCCTTCTGGTCCGGTGGAAGCAACCTTGATCGTTCCATTGCACACTGCAGGAGCATTATAGTGTTCCCAAACATTATCATTTCCGGCAGCAACCGCGACTACAGCCCCTTTCTTGCGAGCAAAGAATAAAGCCTCTTGTAAAGCTTCGTCGCAATAATCAATTTCTTTTCCAGGCTCTAAATCGACACCAAAACTCATATTTAATACCTTGGCTGGATGTATATTTTTAGGAACTCCCGGAACATCACCTCCAACAGCCCAATAGATACTATTCACCACAGCACTTTCATAAAACATACCATTTTCGGCAGGAATTTTAACAGTCAGAATTTTTAAATCCTCACCAACTCCGTTCATGACATCGCCATAACCGGCAATGGTACCGGCAACATGGGTGCCATGGTAAGATCTGGTTTCATCAGATAAATCATTGTTATTCCCGGCAAAATTCCATCCAAATACATTACCTTCGTTATCTTTTACAAGGTTATTCACCAAACTGTCATTCAATGCAATCCCAGTATCTAAAACCGCAACAACTATCGGCTTCCTAGACTTTCCTGTAGTATATGCCCATGCGCCATCTCTTAAACCAGGCCTGGACTCCAAACGAATTCCCGCTGGCCTTTCGAATTCATCCCATTGACTCTCATGGGATAACAATTGACTTAACTCCTGGTTTATTACTGGATCAGGGAGAGGCTTAAAATGTCCTATTCTGTCTTTAACTGCATAAAGTACATTGGGATTTTTGCGCAAACGTTCTAAAACTTTGGCTGTAACATCTTCTTCTTTAGACTTGACAATAGCATGGGAATTCGATGTATCAAAAATAAGCGAATAAGCGCCATTGGCCATAGGCTTCATTTCTTTAACGGGTATTTGAACAGATTTAATGACTTGTGATTTCAGTGAAGCAATAGTGGCGGGTTGCTGTTTATATTTAATGATAACCCTGATTGTTTCAGTTTCAGTCATAGCAAAACTGCCACAAGCAAGCGATAAAAGACTTAATCCCAATATTCCTGATTTCAAACCCATACTTCAATCTCCTTTTTAAAGTCAATCCGTAGCCTTGACCAATTTTTAAAAATAAAACCACCTCAGTATGCAGGAGAATAAATATCAACTCAAGAATCAATAAGCCATGAGATTAAATTAAAATCGAGCAATCATTGGACTTCATGTTTTTCCCTATATTCTGTGGGAGTGATTCCTGTCCATCGTTTGAATGCTTTTGAAAAATTGGATGTATCTTGAAAACCCAATAAAAAACAGATCTCGGTCATGGAAATATTATTATTGAGCAAAAATGTCTTTGCTTTTTGTTCTCTTACCTCATCAAGCAACTCTTGGTAAGTCACATCCAATCTCTGCAAATGACGTCTTAGAGTACGAGAAGTCATACATAATCGACTGGCTATCTCATCCATGCTGACGTGATTTAAATTCTGATTGATTAAAATAGATTTAATCTTGCTTGCCATATCCTCTTTTAATGACATTTTTTTTTCAAGTTCTTGCAATTGCCTTTTTGCCAGTTGATAACTGACATCGTCAGCAAAATGGATGGGATAATTCAGTTCCTCCGCTTTAAACCAAACGCGAGTAGCCTCTGTATTAAAAATAATTTTAGTCTGAAAAATTGTTTGATAATATTTTGCATAAGGAGGTTCATCGTAATTTAACTCAATCTTGAGCAATGGGTCATTACAACTAATCAAAAAATTTCTCATTTTAATAAGATGAGTAATTGCCAATTCAGTTATAAAACGTGATAAAACCATTTCTTTTGTGTGTGGTAATAACTTGATATAAGCACTGTTTTCAGTATTAAACTGGCGTAACTCCAGAGACAACAAATTGGTTCGTGTATTAAGGTAACTGAGCACAGTTTGTATAGCAGTTCCAAATGTAGGACTGCTCATTGCTGCATACCCAAGAAAACCGTGATTGACTATAGATAAGTTTTGACCAAAAACCAAACCCAATTCCGGACAATTGCTTAATTTATAAGCTTCCAAAATAACCTGGTTAAATTCATCCTGAGTTAAGTAGGCATCAGGATCATGTACTCTTATCAGATCAAAGCCAATTTTTTCTAAAAAATGGTTAATCCCAAATTGTTCAAGACATTTTTCCAGAGTAGAAAGATAATTTGCCGCTATAACCAGATCCATCAACAGGCTTTTCTTTTTTAAGTGATAAGTGAATTAATTCTAATCTATATTAGAGTATAAGATCCAATAATGTATAAAAATTCAAGATTTAGTTATCTTGACTAAATCTTGAATAAAATTAGTTTAATAACGATAATGATCCGGCTTGTAAGGTCCATTTTTATCAACGCCGATATAATCAGCCTGCTCATTACTTAATTGAGTTAATTTTGCACCAATACGTCCCAAATGCAAACGGGCTACTTTTTCATCCAAAACTTTTGGAAGTACATATACTTGATTCTGGTATTGGCTAGAGTTTTGGAACAGCTCAATCTGCGCTAATACTTGATTGGTAAAGGAAGCAGACATGACAAAGCTCGGATGGCCTGTAGCGCAGCCCAAATTCACTAAACGCCCTTCAGCCAGGATAATAATCCGCTTTCCATCAGGAAAAATCACATGATCAACCTGCGGCTTGATATTTTCCCATTGATACTGTTTTAAGCTTTGAATATCAATTTCGGAATCAAAATGGCCTATGTTGCACAATATCGCCTGATTACGCATACGTTTCATGTGATCGTGAGTTACAACATGGTAATTGCCAGTAGCTGTAACTACGATATCCACTTGTTCAGCAACATCATCCAGAGTGACTACTCTGTAGCCTTCCATTGCTGCCTGAAGTGCGCAAATAGGATCAATTTCTGCGACAAGTACAGTGGCTCCCTGTCCGCGCAAGGCCTGAGCGCAACCTTTCCCTACGTCACCATAGCCTAGAATCAAGGCAACCTTACCAGCTATCATAACATCTGTTGCACGTTTTAACCCATCAAGCAGGGATTCCCGACATCCATACAAATTATCAAATTTGGATTTGGTCACCGCATTATTAACATTAATGGCTGGAATTTTTAATTGTCCATGTTTCGCCATTTCGTACAGCCTGGCTACACCTGTAGTGGTTTCCTCAGATACTCCCTTAATTGCAGTCAGTAATTTGGGATGTTTCTGGTGAACAACTTGTGTCAGATCCCCGCCATCATCTAATAATAAATTAGGTGTCCAACCATTGGGGCCACTTAAAGTTTGCTCAACACACCACCAATATTCTTCTTCTGTTTCGCCCTTCCAGGCAAAAACAGGGATTCCTTTTGCAGCAATAGCGGAAGCTGCATGATCCTGAGTAGAAAAAATATTGCAGGAAGACCAGCGTACTTCAGCACCCAATGCAACCAGGGTCTCAATCAATACTGCGGTTTGAATCGTCATATGCAGACAACCTGCAATCCGAGCGCCTTGAAGTGGTTTTTTCGCAGAAAATTCCTCGCGTAAAGCCATTAAACCCGGCATTTCGGTTTCAGCTATCGCTATTTCTTTTCGCCCCCAGTCCGCTAATGAAATCTCTGCTACTTTATAATCTTGTAATGTATTGATTTTCTGTACTCCTTCTTCTACCAGTTCCATTAGAGTATCCTTAAAAAATTATAATGCCTTGCTTAATTCAGCTACTTTGTCCAATCGCTCCCATGGAAAACTCTCCCTGCCATAGTGCCCATAAGTTGCCGTCTGCCTATAAATAGGACGAAGCAAATCGTGTTGGTCGATAATACCTTGCGGTGTTAAATCAAAATGCGTATGAATTAAATCAATTATTTCGCTGTTTTTTAGTCGTCCAGTACCAAAAGTATCAACAAAAATAGATGTAGGTTCAGCAACACCAATAGCATAGGAAATCTGTAACTCGCATTTATCCGCCAAACCAGCCGCCACAATATTCTTGGCAACATGTCTTGCGGCGTATGCTGCGGAGCGATCTACCTTCGAAGGATCTTTACCTGAAAAACAGCCTCCGCCATGTCTTGCCATACCACCATAAGTATCAACAATGATTTTACGGCCGGTTAAGCCACAATCGCCCAAAGGACCACCAATTACGAAGCGTCCTGTCGGATTAATGAAATACCGGGTCTTATCATTGAGCCATTCAGCAGGAAGAACTGATTTAATAATTTCTTCACGGATCGCCTCAACCAAATCTTTATGCTCAATATCAGGTGAATGCTGCGTAGAAAAAACAACAGTATCCACTTCAACCGGCATCCCTTGTTCATATTTCAAAGTAAGTTGACATTTTGCATCAGGTCTTAACCAGGGTAATTGGCCTGATTTACGAGCTTTAGCTAATT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AATGCTACGATAGAAGGAGTTGTTCTGTGACCTTCACTATTTTCAATTACCTTCGGTTTGTCACCTTCCATGACAGCAACACAAGAGTTCGTAGTACCCAGGTCTATACCTATTATTTTAGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NC_002942|2257929:2268053|2259749_2260757_-|WP_015444337.1|DBSCAN-SWA MDLVIAANYLSTLEKCLEQFGINHFLEKIGFDLIRVHDPDAYLTQDEFNQVILEAYKLSNCPELGLVFGQNLSIVNHGFLGYAAMSSPTFGTAIQTVLSYLNTRTNLLSLELRQFNTENSAYIKLLPHTKEMVLSRFITELAITHLIKMRNFLISCNDPLLKIELNYDEPPYAKYYQTIFQTKIIFNTEATRVWFKAEELNYPIHFADDVSYQLAKRQLQELEKKMSLKEDMASKIKSILINQNLNHVSMDEIASRLCMTSRTLRRHLQRLDVTYQELLDEVREQKAKTFLLNNNISMTEICFLLGFQDTSNFSKAFKRWTGITPTEYREKHEVQ >NC_002942|2257929:2268053|2266118_2268053_-|WP_015444335.1|DBSCAN-SWA MAKIIGIDLGTTNSCVAVMEGDKPKVIENSEGHRTTPSIVAFTDDNEILVGQSAKRQSVTNPEKTLFAIKRLIGRRFDDPIVQKDIKMVPYKIMKADNGDAWVRVKDQDKAPPQISAEVLRKMKKTAEDYLGEEVKEAVITVPAYFNDSQRQATKDAGRIAGLEVKRIINEPTAAALAYGMDKKRGDSVIAVYDLGGGTFDISIIEIAEVDGEHQFEVLATNGDTFLGGEDFDLALIEYLASEFKKDTGIDLHNDPLALQRLKEAAEKAKIELSSAQQTDVNLPYITADASGPKHLNIKLTRAKLESLVEKLVERTIEPCKTALKDAGLTVSQINEVILVGGQTRMPLVQKTVEEFFGKEPRKDVNPDEAVAVGAAIQAAVLSGEVKDILLLDVTPLSLGIETMGGVMTKLIEKNTTIPTKATQVFSTADDNQTAVTVHVLQGEREQASANKSLGRFDLRDIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAKDKATGKAQSIVIKASSGLSEEEVAAMVKDAQSHAEEDKKFKEMAELRNQADSLIHSCEKSMKDLADELSEDEKRGIETAISELKEAVQGTDKARIEDKLKVLTDASAKMAERIYAKKSSEGQAAQGQTQSQESTKPAEEGVVDAEFEEVKEEDKK >NC_002942|2257929:2268053|2263581_2264694_-|WP_015444336.1|DBSCAN-SWA MINKSAILALADGTVYEGLSVGASGDSVGELVFNTSMTGYQEMLTDPSYARQIITLTTAHVGNTGCNMEDMESTKVWAAGLVMRNCTAIPSNYRAEQSFPDWLSKNGVVAISGIDTRALTLKLREKGSIGACISTNVEKPEIVVAKAKSFAGLQGADLALEVTRQTIERWHEGRGMWSLDKQPQQLHVVAYDFGVKHNILRILHDKGCHITIVPAKTSAEEVLAMNPNGVFLSNGPGDPQACDYAIKATQVFLDNNIPLFGICLGFQILALACGGITKKMKFGHHGSNHPVVETTGKKRVFITSQNHGFAVDEDSLPNCLEVTHRSLFDNSLQGIRHKTKPAFGFQGHPEASPGPHDIDILFNEFLNLMK >NC_002942|2257929:2268053|2264789_2265929_-|WP_010947740.1|DBSCAN-SWA MEQRDYYELLEVSRNASDAEIKKAYRRLAMKYHPDRNPGDTSAEEKFKEIQKAYNILSDKQKRAAYDQFGHAGVDPSMGGGPGGFGGFGGFGDVFEDIFENIFSGGRGHGRQSRGQRGADLQFNVQLTLEEAAIGKEVEITVPRHGTCTVCEGSGAKKGTSPKTCETCQGMGQVRIQQGFFSIQQTCPTCHGEGKIISDPCASCHGQGRVRESKKINVKIPAGVDNGDRVRLSGEGEAGVHGGGSGDLYVQISLKKHAIFERHENDLHCEVPISFATAALGGSIEVPTLEGRVTLKIPAETQTGKVFRLRSKGMKSVRGYGQGDLLCKVVVETPVNLSREQKELLNKLQDSLENAKGTHSPKTSSWFAGVKKFFEDMKF >NC_002942|2257929:2268053|2260880_2262206_-|WP_010947737.1|DBSCAN-SWA MELVEEGVQKINTLQDYKVAEISLADWGRKEIAIAETEMPGLMALREEFSAKKPLQGARIAGCLHMTIQTAVLIETLVALGAEVRWSSCNIFSTQDHAASAIAAKGIPVFAWKGETEEEYWWCVEQTLSGPNGWTPNLLLDDGGDLTQVVHQKHPKLLTAIKGVSEETTTGVARLYEMAKHGQLKIPAINVNNAVTKSKFDNLYGCRESLLDGLKRATDVMIAGKVALILGYGDVGKGCAQALRGQGATVLVAEIDPICALQAAMEGYRVVTLDDVAEQVDIVVTATGNYHVVTHDHMKRMRNQAILCNIGHFDSEIDIQSLKQYQWENIKPQVDHVIFPDGKRIIILAEGRLVNLGCATGHPSFVMSASFTNQVLAQIELFQNSSQYQNQVYVLPKVLDEKVARLHLGRIGAKLTQLSNEQADYIGVDKNGPYKPDHYRY >NC_002942|2257929:2268053|2262224_2263373_-|WP_010947738.1|DBSCAN-SWA MNEVYVFTSESVSEGHPDKIADQISDAILDAILAQDPKARVACEVLVKTGMVLVGGEITTKAWVDVEEITRHVIKDIGYNSSQMGFDWESCAVLSAIGKQSPDIAQGVDNQQTKILGAGDQGLMFGYASRETDVFMPAPIAYAHRLMEKLAKARKSGQLPWLRPDAKCQLTLKYEQGMPVEVDTVVFSTQHSPDIEHKDLVEAIREEIIKSVLPAEWLNDKTRYFINPTGRFVIGGPLGDCGLTGRKIIVDTYGGMARHGGGCFSGKDPSKVDRSAAYAARHVAKNIVAAGLADKCELQISYAIGVAEPTSIFVDTFGTGRLKNSEIIDLIHTHFDLTPQGIIDQHDLLRPIYRQTATYGHYGRESFPWERLDKVAELSKAL >NC_002942|2257929:2268053|2257929_2259618_-|WP_010947735.1|DBSCAN-SWA MGLKSGILGLSLLSLACGSFAMTETETIRVIIKYKQQPATIASLKSQVIKSVQIPVKEMKPMANGAYSLIFDTSNSHAIVKSKEEDVTAKVLERLRKNPNVLYAVKDRIGHFKPLPDPVINQELSQLLSHESQWDEFERPAGIRLESRPGLRDGAWAYTTGKSRKPIVVAVLDTGIALNDSLVNNLVKDNEGNVFGWNFAGNNNDLSDETRSYHGTHVAGTIAGYGDVMNGVGEDLKILTVKIPAENGMFYESAVVNSIYWAVGGDVPGVPKNIHPAKVLNMSFGVDLEPGKEIDYCDEALQEALFFARKKGAVVAVAAGNDNVWEHYNAPAVCNGTIKVASTGPEGLRSYFSNYGPSITLAAPGGDKRYGTSGGILSTVNPGGGYNSSGFDFYQGTSMASPHVAGVAGLIFAVSNKALKPEQVEQILYVTTHEFGQSNDTNKSCVGKKPCGHGILDADNAVQAALNAYDVLFSAPKMIALATHECGENRLKPGKNIINDSTATWIQAKSSCETGVSYQKPRIEKAKDGKIYAYYGSVSYELDQSAYKECRVVGYDGVGCYL |
7 | Bacillus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2309881 : 2366483
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NC_002942|2309881:2366483|DBSCAN-SWA 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54 | Wolbachia_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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