Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LR216067 | Streptococcus pneumoniae isolate b04a6400-1f66-11e7-b93e-3c4a9275d6c8 genome assembly, chromosome: 1 | 1 crisprs | DEDDh,cas3,DinG,RT | 0 | 0 | 15 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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LR216067_1 | 91261-91356 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LR216067_1
|
1 spacers
spacers of LR216067_1
>1.1|91285|48|LR216067|CRISPRCasFinder TTTTTCTACACATACATTGTACATCTAAAAGAAAGCCCTGTCAAGAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LR216067_1
The CRISPR arrays of LR216067_1 >merge|LR216067|1|91261-91356|CRISPRCasFinder AATGTGTAAGATTTTTATATATAATTTTTCTACACATACATTGTACATCTAAAAGAAAGCCCTGTCAAGAGAAATGTGTAAAATTTTTATATATAA >LR216067|1|1|91261-91356|CRISPRCasFinder AATGTGTAAGATTTTTATATATAA TTTTTCTACACATACATTGTACATCTAAAAGAAAGCCCTGTCAAGAGA AATGTGTAAAATTTTTATATATAA
>LR216067.1|VFI50125.1|90916_91243_-|transcriptional-regulator MYFPTSSALIEFLILAVLEQGDSYGYEISQTIKLIANIKESTLYPILKKLEGNSFLTTYSREFQGRMRKYYSLTNGGIEQLLTLKDEWALYTDTINGIIEGSIRHDKN >LR216067.1|VFI50124.1|90336_90930_-|membrane-protein MTRTEYLTQLELYLKKLPEADRIEAMDYFRELFDDAGVEGEEELIASLGTPKAAAHEVLSNLLDKKINEAPAQKNNRQILHIALLALLAAPIGIPLGIAILVTLFAILVAALTVILAFFAVSILGIIGGFLFLVESFTILAQAKSAFILIFGSGLLAIGASSLVLLGISYVARFFGLLIVRLVQFVLKKGKRGNQHA >LR216067.1|VFI50123.1|89432_90344_-|Uncharacterised-protein MRKWTKGFLIFGVVTTVIGFILLFVGIQSDGIKSLLSMSKEPVYDSRTEKLTFGKEVENLEITLHQHALTITDSFDDQIHISYHPSLSAHHDLITNQNDRTLSLTDKKLSETPFLSSGIGGILHIASSYSSRFEEVILQLPKGRTLKGINISANRGQTTIINASLENATLNTNSYILRIEGSRIKNSKLTTPNIVNIFDTVLTDSQLESTENHFHAENIQVHGKVELTAKDYLRIILDQKESQRINWDISSNYGSIFQFTREKPESRGTELSNPYKTEKTDVKDQLIARSDDNIDLISTPSRR >LR216067.1|VFI50122.1|88305_89370_-|Uncharacterised-protein MKQEWFESNDFVKTTSKNKPEEQAQEVADKAEETIADFDTPIGKNTQVEEEVSQAEVELESQQEEKIETPEVGEARTEIEEKKASNSTEEESDLSKETEKVTIAEESQEALPQQKATTKEPLLISKSLESPYIPDQAPKSRDKWKEQVLDFWSWLVEAIKSPTSKFETSITHSYTAFLLLILFSASSFFFSIYHIKHAYYGHIASINSRFPEQLAPLTLFSIISILVATTLFFFSFLLGSFVVRRFIHQEKDWTLDKVLQQYSQLLAIPIFLTAIASFFAFFDSLRFTALLCVISIGIILLASLHIITRPSQASETDSFYQLFLSVLVNGVIILLFFVAEVALIGDYLRILAFL >LR216067.1|VFI50121.1|87373_88234_+|Uncharacterised-protein MAKTFFIPNKQSILGEQEILNAKSILALLDGLESHSYDVVYLRQPLNRLEYIECAIVGQSQFLFKVSYADGQKAYRVDLPDLLTETDWRIIKSFLDALLAYTGTDIEGLDGFDFEAYFQASIQAYLADPVARFTICQGIFNPIFFSRENLKSFLEADGLAQFEARVRAVQETDAYFARVSFYQDGEGKVHGVYHLAQGVKTVLPREPFVPAAYIEQLVDKEVQWEIDLVQITGDGSKPEDYEAIARLDYAKFLESLPSAFYHQLDANQLEVQPILGQDFKTLAQEK >LR216067.1|VFI50120.1|86265_87252_+|rhodanese-related-sulfurtransferase MAKDIRVLLYYLYTPIENAEQFAADHLAFCKSIGLKGRILVADEGINGTVSGDYETTQKYMDYVHSLPGMEELWFKIDEESEQAFKKMFVRYKKEIVHLGLEDNDFDNDINPLETTGAYLSPKEFKEALLDKDTVVLDTRNDYEYDLGHFRGAIRPDIRNFRELPQWVRDNKEKFMDKRVVVYCTGGVRCEKFSGWMVREGYKDVGQLHGGIATYGKDPEVQGELWDGKMYVFDERIAVDVNHVNPTIVGKDWFDGTPCERYVNCGNPFCNRRILTSEENEDKYLRGCSHECRVHPRNRYVSKNELTQAEVIERLAAIGESLDQAATV >LR216067.1|VFI50119.1|84518_85994_+|extracellular-solute-binding-protein MKNWKKYAFASASVVALAAGLAACGNLTGNSKKAADSGDKPVIKMYQIGDKPDNLDELLANANKIIEEKVGAKLDIQYLGWGDYGKKMSVITSSGENYDIAFADNYIVNAQKGAYADLTELYKKEGKDLYKALDPAYIKGNTVNGKIYAVPVAANVASSQNFAFNGTLLAKYGIDISGVTSYETLEPVLKQIKEKAPDVVPFAIGKVFIPSDNFDYPVANGLPFVIDLEGDTTKVVNRYEVPRFKEHLKTLHKFYEAGYIPKDVATSDTSFDLQQDTWFVREETVGPADYGNSLLSRVANKDIQIKPITNFIKKNQTTQVANFVISNNSKNKEKSMEILNLLNTNPELLNGLVYGPEGKNWEKIEGKENRVRVLDGYKGNTHMGGWNTGNNWILYINENVTDQQIENSKKELAEAKESPALGFIFNTDNVKSEISAIANTMQQFDTAINTGTVDPDKAIPELMEKLKSEGAYEKVLNEMQKQYDEFLKNKK >LR216067.1|VFI50118.1|83385_84309_+|ABC-transporter-permease MAKKKIKKEKIDNVGIHSFSKKADIFFSIISGLIALSCILPFVFVIIISVTDEKSLLQYGYSFFPSQFGLDGFEFLAQFKDKILQALFISVFVTVVGTLTNVFITTTYAYAISRTTFKYRRFFTIFVLLSMLFNAGLVPGYIMVTRVLQLGDTVWALIVPMLLSPFNIILMRSFFKKTIPEAILESARIDGASEARIFFQICLPLSLPGIATITLLTALGFWNDWFNALLYIKSDNLYPLQYLLMQIQQNMDYIAKAVGLTGQLGVALPKETGRMAMVVVATLPIAILYPFFQRYFVKGLTIGGVKE >LR216067.1|VFI50117.1|82442_83372_+|ABC-transporter-permease MKKFSKTLRDNWIFLLMVLPGALWLILFFYIPVFGNVVAFKDYHMTSNGFIDSIINSKWVGLDNFRFLFSSRDAFIITRNTVLYNLGFIFLGLVVSVGIAIILSELRSKRMVKIFQTSMLFPYFLSWVIISFFTDAFLNIDKGVFNHLLESLGLKEVNFYADLGIWPYLLLFLGIWKGFGYSSVMYYATIMGIDPTYYEAATVDGASKWQRIRNVTIPQLTPLVTVLTILAVGNIFRADFGLFYQIPHNAGQLYNVTNVLDVYVFNGLTQTADIGMAAAAGLYQSVVGLILVILSNLLARRVDPNSALF >LR216067.1|VFI50116.1|81902_82124_+|surface-anchored-protein MSLQIKLKKLAKELSKLLKDSNLETVDKDVLENSQKELQKAVLFLADEKGSEHTEAEVIDNLKEVIAKLKANA >LR216067.1|VFI50126.1|91381_92548_-|cyanate-permease MKKQSLFFVPGIILIGVSLRTPFTVLPIILGNISQGLEVEVSSLGVLTSLPLLMFTLFSPFSTQLAQKIGLEHLFTYSLFFLTIGSLIRLINLPLLYLGTLMVGASVAVINVLLPSLIQANQPKKIGFLTTLYVTSMGIATALASYLAVPITQASSWKGLILLLTLLCLATFLVWLPNHRYNHRLAPQTKQKSQIKVMRNKQVWAIIIFSGFQSLIFYTVMTWLPTMSIHAGLSSHEAGLLTSILSLISIPFSMTIPSLTTSLSTRNRQLMLTLVSLAGVVGISMLFFPINNFIYWLAIHLLIGTATSALFPYLMVNFSLKTSAPEKTAQLSGLSQTGGYILAAFGPTLFGYSFDLFHSWVPSVAALLLIDILMTVALFTVDRADKIL >LR216067.1|VFI50127.1|92698_93763_+|glycosyl-transferase MTQNVESLLVSIVISAYNEEKYLPGLIEDLKNQTYPKENIEILFINAMSTDGTTAIIQQFIKEDTEFNSIRLYNNPKKNQASGFNLGVKHSVGDLILKIDAHSKVTETFVMNNVAIIQQGEFVCGGPRPTIVEGKGKWAETLHLVEENMFGSSIANYRNSSEDRYVSSIFHGMYKREVFQKVGLVNEQLGRTEDNDIHYRIREYGYKIRYSPSILSYQYIRPTFKKMLHQKYLNGLWIGLTSHVQFKCLSLFHYVPCLFVLSLVFSLALLPITFVFITLLLGAYFLLLSLLTLLTLLKHKNGFLIVMPFLLFSIHFAYGFGTIVGLIRGFKWKKEYKRTIIYLDKISQINKNML >LR216067.1|VFI50128.1|93804_95655_+|nucleoside-diphosphate-sugar-isomerase MNKKLTDYVIDLVEILNKQQKQVFWGIFDIFSMVVSIIVSYILFYGLINPAPVDYIIYTSLAFLFYQLMIGFWGLNASISRYSKITDFMKIFFGVTASSVLSYSICYAFLPLFSIRFIILFILLSTFLILLPRITWQLIYSRRKKGSGDGEHRRTFLIGAGDGGALFMDSYQHPTSELELVGILDKDSKKKGQKLGGIPVLGSYDNLPELAKRHQIERVIVAIPSLDPSEYERILQMCNKLGVKCYKMPKVETVVQGLHQAGTGFQKIDITDLLGRQEIRLDESRLGAELTGKTILVTGAGGSIGSEICRQVSRFNPERIVLLGHGENSIYLVYHELIRKFQGIDYVPVIADIQDYDRLLQVFEQYKPAIVYHAAAHKHVPMMERNPKEAFKNNIRGTYNVARAVDEAKVPKMVMISTDKAVNPPNVMGATKRVAELIVTGFNQRSQSTYCAVRFGNVLGSRGSVIPVFERQIAEGGPVTVTDFRMTRYFMTIPEASRLVIHAGAYAKDGEVFILDMGKPVKIYDLAKKMVLLSGHTESEIPIVEVGIRPGEKLYEELLVSTELVDNQVMDKIFVGKVNVMPLESINQKIGEFRTLSGDELKQAIIAFANQTTHIE >LR216067.1|VFI50129.1|95679_96000_-|chlorohydrolase MKIKEQTRKLAAGCSKHCFEVADRTDEVSSKHCFKVVDGTDEVSSKHCFKVVDGTDEVSSKHCFEVVDRTDEVSNHTYGKATLTWFEEIFEEYKSLHNKTHITKVV >LR216067.1|VFI50130.1|96049_96682_-|phosphatase MTSITAIFFDLDGTLVDSSIGIHNAFTYTFKELGVPSPDAKTIRGFMGPPLESSFATCLSKDQISEAVQIYRSYYKAKGIYEAQLFPQIIDLLEELSSSYPLYITTTKDTSTAQDMAKNLEIHHFFDGIYGSSPEAPHKADVIHQALQTHQLAPEQAIIIGDTKFDMLGARETGIQKLAITWGFGEQADLLNYQPDYIAHKPLEVLAYFQ >LR216067.1|VFI50131.1|96703_97576_-|L-serine-dehydratase,-alpha-subunit MFYSIKELVEQADLDFQGNVAELMITTEFELTGREREEVFLLMERNLEVMKASVQLGLNENKSRSGLTGGDAAKLDHYIENGKTLSDYTILSAARNAIAVNEHNAKMGLVCATPTAGSAGCLPSVLTAAIEKLDLSHEQQLDFLFAAGAFGLVIANNASISGAEGGCQAEVGSASAMSAAALTLAAGGTPYQASQAIAFVIKNMLGLICDPVAGLVEVPCVKRNAMGASFAFIAADMALAGIESKIPVDEVIDAMYQVGASMPTAFRETAEGGLATTPTGRRLQKEIFGE >LR216067.1|VFI50132.1|97584_98256_-|putative-L-serine-dehydratase-beta-subunit MKSLRFQSVFDIIGPVMIGPSSSHTAGAVRIGKIVSSIFDDTPTEVEFQLFNSFAKTYRGHGTDLALVAGILGMDTDDPEIPNSLEIAHKRGIKIVWTIQKESNAPHPNTTKITVKNAHKTISVTGISIGGGNIQVTELNGFAVSLNMNTPTIIIVHQDIPGMIALVTEALSRYGINIAQMNVTREKAGEKAIMIIEVDSRNCDEAIEEIRKIPHLHNVNFFK >LR216067.1|VFI50133.1|98497_99085_+|LysM-domain-protein MKSITKKIKATLAGVAALFAVFAPSFVSAQESSTYTVKEGDTLSEIAETHNTTVEKLAENNHIDNIHLIYVGQELVIDGPVAPVATPAPATYAAPAAQDETVSAPVAETPVVSETVVSTVSGSEAEAKEWIAQKESGGSYTATNGRYIGRYQLTDSYLNGDYSAENQERVADAYVAGRYGSWTAAKNFWLNNGWY >LR216067.1|VFI50134.1|99882_100170_+|bacteriocin,-putative MRKLVKIGVASLMVCGILATTNALAVWVEGGQWNYGVGWTGTFGYSDYLHSTRYHTATVRHGGRTSKDYAKPEAWARASLTKIPPTGMEYFYGFE >LR216067.1|VFI50135.1|100221_102330_+|bacteriocin-immunity-protein MKKISNFCMLLLLLCTTFFVFNVNYTREVVRIQEMGKTVDSLDLYLKDINEPAASVLRFFEDVSKEYKVSIIKTDSGDEVVKSGVFDKDTFPYQEFGISSLDFTTDGEGVYSNKEISNKLGTIPTFLKAKPIQLMTFQTYIKDTSRSLNGRYTITSTQEMDKDRIVQKWSDFFKIDQATLLEPTYKSAVEVINRDLLLSAIVFVLAILLLVLVTVYQPMMEMKRVGVQKLLGFQDRAVLADVVKGNLYLLLGGALVINLGVFFLLDYKPKDLFPMLWLSHFLLLQLYLFISWLTYLLIQKMTISSLLKGFSSFKFGLIFNYVMKIGTTILLTALLIGVGRSLEQENKELAYQQQWVSQGNYLTLETFKLNDNLWQEELAGSGKSTDYFYRFYQDLVEKTQAGYVQSSSLPVKNFVQSEQIQQYQLTDTVDVYYANRNFLKSKGFKLPDTGIKKVILMPASTKGEEDKNQLLGKLIAFHSMKYEEQQKRTIEEMDVEIAYYEGDWSFFPYSDKRKENLSNPIISLVNDSDMMWDEKASLSTTGLNNPIKIENTVQHQKEITELVEKLSDGNYLKFSSIQAIQQEKVDSYRDAVRNFNLLFALFGLLSMMISYFLLVTTFLLKRRDIITKKFMGWKLVDRYRPLLVLLLLGYSFPLLVLIFFAHAFLPLLLFAGFTCLDILFVLGLASRMEKRSLVELLKGGIL |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1590 : 49295
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LR216067|1590:49295|DBSCAN-SWA TATGAAACATCTAAAAACATTTTACAAAAAATGGTTTCAATTATTAGTCGTTATCGTCATTAGCTTTTTTAGTGGAGCCTTGGGTAGTTTTTCAATAACTCAACTAACTCAAAAAAGTAGTGTAAACAACTCTAACAACAATAGTACTATTACACAAACTGCCTATAAGAACGAAAATTCAACAACACAGGCTGTTAACAAAGTAAAAGATGCTGTTGTTTCTGTTATTACTTATTCGGCAAACAGACAAAATAGCGTATTTGGCAATGATGATACTGACACAGATTCTCAGCGAATCTCTAGTGAAGGATCTGGAGTTATTTATAAAAAGAATGATAAAGAAGCTTACATCGTCACCAACAATCACGTTATAAATGGCGCCAGCAAAGTAGATATTAGATTGTCAGATGGGACTAAAGTACCTGGAGAAATTGTCGGAGCTGACACTTTCTCTGATATTGCTGTCGTCAAAATCTCTTCAGAAAAAGTGACAACAGTAGCTGAGTTTGGTGATTCTAGTAAGTTAACTGTAGGAGAAACTGCTATTGCCATCGGTAGCCCGTTAGGTTCTGAATATGCAAATACTGTCACTCAAGGTATCGTATCCAGTCTCAATAGAAATGTATCCTTAAGATCGGAAGATGGACAAGCTATTTCTACAAAAGCCATCCAAACTGATACTGCTATTAACCCAGGTAACTCTGGCGGCCCACTGATCAATATTCAAGGGCAGGTTATCGGAATTACCTCAAGTAAAATTGCTACAAATGGAGGAACATCTGTAGAAGGTCTTGGTTTCGCAATTCCTGCAAATGATGCTATCAATATTATTGAACAGTTAGAAAAAAACGGAAAAGTGACGCGTCCAGCTTTGGGAATCCAGATGGTTAATTTATCTAATGTGAGTACAAGCGACATCAGAAGACTCAATATTCCAAGTAATGTTACATCTGGTGTAGTTGTTCGTTCGGTACAAAGTAATATGCCTGCCAATGGTCACCTTGAAAAATACGATGTAATTACAAAAGTAGATGACAAAGAGATTGCTTCATCAACAGACTTACAAAGTGCTCTTTACAACCATTCTATCGGAGACACCATTAAGATAACCTACTATCGTAACGGGAAAGAAGAAACTACCTCTATCAAACTTAACAAGAGTTCAGGTGATTTAGAATCTTGATTGACATCTATGTAAAGAAAGCTTTACATAAGAGAAAAGATGTGTTAGTGTAGAATCATGGAAAAATTTGAAATGATTTCTATCACAGATATACAAAAAAATCCCTATCAACCCCGAAAAGAATTTGATAGAGAAAAACTAGATGAACTAGCACAGTCTATCAAAGAAAATGGGGTCATTCAACCGATTATTGTTCGTCAATCTCCTGTTATTGGTTATGAAATCCTTGCAGGAGAGAGACGCTATCGGGCTTCACTTTTAGCTGGTCTACGGTCTATCCCAGCTGTTGTTAAACAGATTTCAGACCAAGAGATGATGGTCCAGTCCATTATTGAAAATTTACAGAGAGAAAATTTAAACCCAATAGAAGAAGCACGCGCCTATGAATCTCTCGTAGAGAAAGGATTCACCCATGCTGAAATTGCAGATAAGATGGGCAAGTCTCGTCCATATATCAGCAACTCCATTCGTTTACTTTCCTTGCCAGAACAGATTCTTTCAGAAGTAGAAAATGGCAAACTATCACAAGCCCATGCGCGTTCCCTAGTTGGGTTAAATAAGGAACAACAAGACTATTTCTTTCAACGGATTATAGAAGAAGATATTTCTGTAAGGAAATTAGAAGCTCTTCTGACAGAGAAAAAACAAAAGAAACAGCAAAAAACTAATCATTTCATACAAAATGAAGAAAAACAGTTAAGAAAACTACTCGGATTAGATGTAGAAATTAAACTATCTAAAAAAGACAGTGGAAAAATCATTATTTCTTTTTCAAATCAAGAAGAATATAGTAGAATTATCAACAGCCTGAAATAAGGCTGTTCTTTTATTTTTTTATCTCACAAGGTTATCCACTATGTTTTTCGATAAAAAGCTTAATAAATCAATAATTTCTTCTTTTATCCCCAACCTGTGGATAAAGTTTGGTAACATTGTGGATTATTTTTCACAGCTTGTGGAAAATTCTTGCTATCTATGGTAAAATATCTCTAGTATTAAACTTTTAAATAGTAAAGGAGGAGAAAGGATTGAAAGAAAAACAATTTTGGAATCGTATATTAGAATTTGCACAAGAAAGACTGACTCGATCCATGTATGATTTCTATGCTATTCAAGCTGAACTCATCAAGGTAGAGGAAAATGTTGCCACTATATTTCTACCTCGCTCTGAAATGGAAATGGTCTGGGAAAAACAACTAAAAGATATTATTGTAGTAGCTGGTTTTGAAATTTATGACGCTGAAATAACTCCCCACTATATTTTCACCAAACCTCAAGATACGACTAGCTCACAAGTTGAAGAAGCTACAAATTTAACTCTTTATGACTATAGTCCAAAGTTAGTATCTATTCCTTATTCAGATACGGGATTAAAAGAAAAGTATACCTTTGATAACTTTATTCAAGGGGATGGAAATGTTTGGGCTGTATCAGCCGCTTTAGCTGTCTCTGAAGATTTGGCTCTGACCTATAACCCTCTTTTTATCTATGGAGGACCAGGCCTTGGTAAGACTCACTTATTAAACGCTATTGGAAATGAAATTCTAAAAAATATTCCTAATGCGCGTGTTAAATATATCCCTGCCGAAAGCTTTATTAATGACTTTCTTGATCACCTAAGACTTGGGGAAATGGAAAAGTTTAAAAAGACCTATCGTAGTCTTGATCTTTTGTTAATCGATGATATACAGTCACTCAGCGGAAAAAAAGTCGCAACTCAGGAAGAATTTTTCAATACCTTTAACGCCCTTCATGACAAGCAAAAACAGATTGTCCTAACGAGTGATCGTAGTCCAAAACATCTAGAAGGGCTCGAGGAGAGGCTTGTCACGCGTTTTAGTTGGGGATTGACACAAACTATCACACCCCCTGACTTTGAAACACGTATTGCCATTTTACAAAGTAAGACGGAACATTTAGGCTACAATTTCCAAAGTGATACTCTAGAATACCTAGCTGGGCAATTTGATTCAAATGTTCGAGATCTTGAGGGAGCCATCAACGACATCACTTTAATTGCCAGAGTAAAAAAAATCAAGGATATCACTATTGATATTGCTGCAGAAGCCATTAGAGCCCGCAAACAAGATGTTAGCCAAATGCTCGTCATCCCAATTGATAAAATCCAAACTGAAGTTGGTAACTTTTATGGTGTTAGTATCAAAGAAATGAAGGGAAGTAGACGCCTTCAAAATATTGTTTTGGCCCGTCAAGTAGCCATGTATTTATCTAGAGAACTAACAGATAATAGTCTTCCAAAAATTGGGAAGGAATTTGGGGGAAAAGATCATACCACAGTCATTCATGCCCATGCCAAAATAAAATCTTTGATTGATCAAGACGATAATTTACGTTTAGAAATTGAATCAATCAAAAAGAAAATCAAATAATTTGTGGATAACTTTTAGTTTTTTATCTTTTTTATCCACATTTTTTAAACAAGCTAAAAAACTTGATATGACTTGTTTAAAGGCTGTTTTCCACAGATTTCACAGACTCTATTATTACTATTATCTTTCTAATACTAAAAATAAATAAAGGAGAATCCATGATTCATTTTTCAATTAATAAAAATTTATTTCTACAAGCATTAAATACTACTAAGAGAGCTATTAGTTCTAAAAATGCCATTCCTATTTTATCAACAGTAAAAATTGACGTGACCAATGAAGGTATTACTTTAATTGGTTCAAATGGTCAAATTTCAATTGAAAATTTTATTTCTCAAAAAAATGAAGATGCTGGTTTGTTAATTACTTCTTTAGGTTCGATCCTTCTTGAAGCTTCTTTCTTTATCAATGTAGTATCTAGTTTACCTGATGTAACTCTTGATTTTAAAGAAATTGAACAAAATCAAATTGTTTTAACCAGTGGCAAATCAGAAATTACCCTAAAAGGAAAAGATAGCGAACAATATCCACGAATCCAAGAAATTTCAGCAAGCACTCCTTTAATACTTGAAACAAAATTACTCAAGAAAATTATTAATGAAACAGCCTTTGCTGCAAGTACACAAGAGAGTCGTCCGATTTTAACAGGTGTCCACTTCGTATTGAGTCAACACAAAGAGTTAAAAACAGTTGCAACAGACTCTCATCGCCTAAGCCAGAAAAAATTGACTCTTGAAAAAAATAGTGATGATTTTGATGTCGTAATTCCTAGCCGTTCTCTACGCGAATTTTCAGCGGTATTTACAGATGATATCGAAACTGTAGAGATTTTCTTTGCCAATAACCAAATCCTCTTTAGAAGCGAAAATATTAGCTTCTATACTCGTCTCCTAGAAGGAAACTATCCTGATACAGATCGCTTGATTCCAACAGACTTTAACACTACTATTACTTTTAATGTGGTAAACTTACGCCAGTCAATGGAGCGTGCCCGTCTTTTATCAAGTGCGACTCAAAATGGTACTGTGAAACTTGAAATTAAGGATGGGGTTGTTAGCGCCCATGTTCACTCTCCAGAAGTTGGTAAAGTAAACGAAGAAATCGATACTGATCAGGTTACTGGTGAAGATTTGACCATTAGTTTCAACCCAACTTACTTGATTGATTCTCTTAAAGCTTTAAATAGCGAAAAGGTGACTATTAGCTTTATCTCAGCTGTTCGTCCATTTACTCTTGTGCCAGCAGATACTGACGAAGACTTCATGCAGCTCATTACACCAGTTCGTACAAATTAAGTGAAAGAGGTTGAGCCTGGCTCGCCTCTTTTATGATATAATCGAAAAAGAAAAGGAGAGTAGTATGTATCAAGTTGGAAATTTTGTTGAGATGAAAAAATCACACGCTTGTACAATCAAGTCGACTGGTAA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46 | uncultured_virus(11.11%) | transposase,bacteriocin,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
99882 : 190636
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LR216067|99882:190636|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >LR216067|99882:190636|149329_150160_+|VFI50187.1|DBSCAN-SWA MKKIVKYSSLAALGLVAAGVLAACSGGAKKEGEAASKKEIIVATNGSPRPFIYEENGELTGYEIEVVRAIFKDSDKYDVKFEKTEWSGVFAGLDADRYNMAVNNLSYTKERAEKYLYAAPIAQNPNVLVVKKDDSSIKSLDDIGGKSTEVVQATTSAKQLEAYNAEHTDNPTILNYTKADFQQIMVRLSDGQFDYKIFDKIGVETVIKNQGLDNLKVIELPSDQQPYVYPLLAQGQDELKSFVDKRIKELYKDGTLEKLSKQFFGDTYLPAEADIK >LR216067|99882:190636|111833_112214_+|VFI50144.1|DBSCAN-SWA MELVLPNNYVALEQEEMMYLDGGGVGRNWWNSRGSFATVLDVGLAIYSGGATIYSAYAIKKAISANRGAITRTLRSLIIKHVGSAAGHLVNTALNVALTVTGFSLGGAIAYGADWADGSLDGYIFA >LR216067|99882:190636|131507_131660_-|VFI50164.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MMKDLNNCREISNKELQEIKGGFGVGVGIALFMAGYTIGKDLRKKFGKSC >LR216067|99882:190636|132704_133142_+|VFI50167.1|DBSCAN-SWA MIEIKRIQQQPDLAQAIYAVMAAVYLVSPWTLEQIQADLSQDQTWYALAYDGAEVIGFLAVQENLFEAEVLQIAVKGAYQGQGIASALFAQLPTDKEIFLEVRKSNQRAQAFYKKEKMAVIAERKAYYHDPVEDAIIMKREIDEG >LR216067|99882:190636|186193_186394_+|VFI50227.1|DBSCAN-SWA 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>LR216067|99882:190636|154418_154988_-|VFI50192.1|DBSCAN-SWA MKKSILTTLLFAVLYFLCMGIGVLLGNLFDQTGNMFYAPAFTALVGGSVYMILVAKVPRFGAITTIGLVIAFFFLGTKHGAGSFLPGIICGLLADEVAHLGKYKDKTKNFLSFIIFAFSTTGPILLMWIAPKAYMATLLARGKSQEYIDRIMVTPNPGTVLLFIASTVIGALVGALIGQALSKKFAQKI >LR216067|99882:190636|114757_114856_+|VFI50148.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MATITNALNIATTVAEVFSLGGAIAYGLDIIK >LR216067|99882:190636|113461_113626_+|VFI50145.1|DBSCAN-SWA MLRVIVVIQSLVIILLAVALLLSRKNFDSLNVVLIMMIVSQLLLLVYLIKSGNQ >LR216067|99882:190636|182139_183105_-|VFI50220.1|DBSCAN-SWA MQKPFKTIPEQIELLHKRGLIITDYKRAKKYLLTNNYYSIINGYSKYFEQSPNKYRPGTNFSEITYSYFYDKEIKYSFLKAILEAEKHIKSAIAYVFSERFASTPYFYLDINNYNKSNSDNVRKIKFVIRQMVKIIDKHKSSRQANSIQHYFSKHLEIPFWVIIDYLTFGDMLAILQTLPISLQDKISKKFYSFICEHIKININFTPAILVSFVENIGEVRNVCAHDNRLFSFKCKKSVKYYSDLHSNYGISNSCAKSSPYHVFIVLQCFLSSIEYAKLHNTLLSRFKTFEKHLLTVSIDKFLTELGFPANWHRTMPKLPQ >LR216067|99882:190636|130458_130692_-|VFI50162.1|DBSCAN-SWA MIYKVFYQETKERSPRRETTRALYLDIDASSELEGRITARQLVEENRPEYNIEYIELLSDKLLDYEKETGAFEITEF >LR216067|99882:190636|140899_141310_+|VFI50176.1|DBSCAN-SWA MSKKISNLNDKKEFHKKNCELRFQDSVLDNINSVPGTTHLFSCLNIQTLVKIILYIFRYNSCMKIFNFRDKELIFFNKIVNGLIQNIEENLEDDIERILKYLYICLFNEIFIIKNKVNFFDDVEFNQTLSEFLDKL >LR216067|99882:190636|113793_114165_+|VFI50146.1|DBSCAN-SWA MELVLPNNYVVIDEEEMMYLDGGAIYIPRWAITGAITGAAYAALAAAGGGGLQLVLASYGLRSALVAGIVKGLGVLGIHIGNAFANTVIRSIASAGIGAGADWIFTNIIDGWDGRRDNQLRIG >LR216067|99882:190636|178940_179624_-|VFI50217.1|DBSCAN-SWA MSQIDLQKLTKKNQEFVHIATQQFIKDGKTDAEIQTIFEEVIPQILEEQSKGTTARSLYGAPTHWAHSFTVKEQYEKEHPKENDDPKLMIMDSALFITSLFALVSALTTFFAADQAFGYGLITLLLVGLVGGFAFYLMYYFVYQYYGPDMDRSQRPPFWKSVLVILASMFLWLLVFFATSFLPASLNPVLDPLPLAIIGAALLALRFYLKKRLNIRSASAGPTRYQE >LR216067|99882:190636|117937_118312_+|VFI50151.1|DBSCAN-SWA MELVLPNNYVVLEQEEMMYLDGGFSIPRWPVATAINIAFNGVLGGGAISLVRNYIRNYGLRRVTSAIAGAAARYVGVRVANRVAGFALSAINGFAAWMSIGDAITTIWANNDVNRRDPNLNALW >LR216067|99882:190636|183798_184314_-|VFI50222.1|DBSCAN-SWA 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100 | Streptococcus_phage(40.91%) | tRNA,integrase,bacteriocin,transposase,protease | attL 180624:180648|attR 193623:193647 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
313822 : 409695
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LR216067|313822:409695|DBSCAN-SWA 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91 | Streptococcus_phage(17.65%) | transposase,tRNA,protease,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
444919 : 547921
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >LR216067|444919:547921|DBSCAN-SWA 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103 | Bacillus_phage(22.22%) | tRNA,integrase,bacteriocin,transposase,protease | attL 480020:480079|attR 559012:559045 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
588899 : 632318
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >LR216067|588899:632318|DBSCAN-SWA 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30 | Staphylococcus_prophage(28.57%) | transposase,tRNA,protease,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
748181 : 795043
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >LR216067|748181:795043|DBSCAN-SWA 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46 | Mycobacterium_phage(16.67%) | transposase,integrase,protease | attL 792642:792701|attR 795047:795589 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
811190 : 848669
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >LR216067|811190:848669|DBSCAN-SWA 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43 | Streptococcus_phage(57.14%) | transposase,tRNA,protease,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1014566 : 1121629
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >LR216067|1014566:1121629|DBSCAN-SWA 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110 | Bacillus_phage(21.74%) | transposase,protease,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1137054 : 1190728
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >LR216067|1137054:1190728|DBSCAN-SWA 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57 | Bacillus_virus(20.0%) | transposase,tRNA,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1199253 : 1205032
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >LR216067|1199253:1205032|DBSCAN-SWA AATGTCTGCAATAGAACGTATTACAAAAGCTGCTCACTTAATTGATATGAACGATATTATCCGTGAAGGGAATCCTACTCTACGCGCGATTGCTGAGGAAGTCACTTTCCCCCTATCTGACCAGGAAATCATCCTAGGCGAAAAGATGATGCAATTCCTTAAACATTCCCAAGACCCTGTCATGGCTGAAAAAATGGGACTCCGCGGTGGTGTTGGACTGGCTGCTCCCCAGTTAGATATCTCAAAACGCATTATCGCTGTTTTGGTACCTAATATTGTTGAAGAAGGCGAAACTCCACAGGAAGCCTACGATTTGGAAGCCATTATGTACAATCCAAAAATCGTCTCTCACTCTGTTCAAGATGCTGCTCTTGGCGAAGGAGAAGGTTGCCTGTCTGTTGACCGTAACGTGCCTGGCTATGTTGTTCGCCATGCCCGCGTTACTGTTGACTACTTTGACAAAGATGGAGAAAAACACCGTATCAAACTCAAAGGCTACAACTCCATTGTTGTTCAGCATGAAATTGACCACATTAACGGTATCATGTTTTACGATCGCATCAATGAAAAAGACCCATTTGCAGTTAAAGATGGTTTACTGATTCTTGAATAAAGAAAATCCCGTTGCAAGACGGGGTTTTGTGTTATAATAGAGGCATGAAAACAAATGATATTGTCTATGGCGTCCACGCCGTTACCGAAGCCCTCCTTGCAAATACAGGAAACAAACTCTACCTCCAAGAAGATCTCCGAGGTAAGAATGTTGAGAAAGTCAAGGAACTAGCTACAGAAAAGAAGGTGTCCATTTCTTGGACATCAAAAAAATCTCTCTCTGAGATTACTGAAGGTGCTGTTCATCAAGGTTTTGTTCTACGAGTGTCTGAATTTGCCTATAGCGAGCTAGATTACATCCTTGCAAAAACACGCCAAGAAGAAAATCCACTTCTATTGATTCTAGATGGTCTAACCGATCCCCATAATCTGGGTTCTATCTTGCGAACAGCAGATGCGACCAATGTTTCAGGTGTCATCATTCCCAAGCACCGTGCTGTCGGAGTAACTCCTGTCGTTGCCAAAACAGCCACAGGTGCTATTGAACACGTTCCAATTGCCCGAGTGACAAACCTCAGTCAAACCTTAGATAAACTCAAGGATGAAGGCTTCTGGACCTTTGGAACGGATATGAACGGTACTCCTTGCCACAAGTGGAATACAAAAGGGAAAATCGCCCTCATCATCGGAAATGAAGGAAAAGGCATCTCTAGCAACATCAAAAAACAGGTCGATGAAATGATTACCATTCCGATGAATGGACATGTTCAAAGCCTCAATGCCAGTGTTGCTGCGGCCATTCTCATGTACGAAGTTTTTCTAAATAGACTATAAAAAAGTTTCCAGCCATCTGATTGGAAACTTTTTTATGATTAACTATGTTCTGTGATAAACTTGTAGGCTTCTTGACCAGCGATAGCTCCATCTCCAACTGCTGTTGTTACTTGGCGAAGGTCTTTCAAGCGAACATCTCCAACTGCAAAGATACCGTCGACTGCAGTCTTCATGTGGCTATCTGTCACAATCCAGCCTGCCTGATCTTGGATATTCAATTCTTTAACAAAATCGCTAAGAGGGTCCAAACCAACATAGATAAAGACACCACCGAAGGCTTGCTCTGTCACTTGACCTGTTTTCACATTTTCAAAAACGACAGATTCTACTCTGTTTTCACCCTTGATTTCCTTCACTACAGAATCCCAGATAAAGCTGATTTTTTCATTCGCAAAGGCGCGATCTTGTAAAACCTTTTGGGCACGAAGTTGGTCACGACGGTGAACAATGGTAACAGTCTTAGCAAAACGAGTCAAGAAGAGGGCTTCTTCAACAGCTGAATCTCCACCACCAACTACCAATAAATCTTGGTCACGGAAGAAAGCACCATCACACACAGCACAGTAAGAAACACCACGACTGTTCAGTTCTTCTTCTCCAGGCACTCCCAAAGGACGGTGTTTAGAACCAGTTGCTACGATAACTGTACGTGTTTCATATGTTTGGTCATCAGTCATCACTTTCTTAAAATCACCATGGTCTTCGACATTTTCAACATAACCATAAATGTGCTCAACACCAAGATTTTCAAGTGGTTCAAACATCTTTTCAGCCAATTCAGGTCCACTAATATTAGCGTATCCTGGGTAATTTTCGATATCAGATGTATTATTCATCTGACCACCTGGCAGACCACCTTCAATCAAAGCTACTTTTAGATTGCTTCGAGCAGCATACAAGGCCGCAGTCATCCCTGCAGGTCCAGCACCGATAATAATAGTATCGTACATATAGATTCCTTCTTTCTTGTTGTAACTATCTTTATTCTAACTCTTTCTTGTCAATCACGCAAGGATTATGCCTTGAAAACAAGAATTAAACTCATAACCGCAAAGGATAATACTGGGACAACCAAGACTCCAATCATAATCATATCATAGAGATGGGCTTGGCGAGCCCTGGCTGTCTTATCAACTCCCGACATGGCTCTCAGACCAATCCAAATCCCTAAAAAAATCAGAACAAGGATGGTGGTCAAGATCAAACTCTCGAAATATAAAGAAAATAGTTGCAGTAGCATGATTTCTCTCATTTCTATCTTTTTTAAAGAGTAAACTCAGCTAGTCCAACTAACTGAGTTTTCCTTTATCTATTATATCAAATATAAGTCCGTTTGTAACTAGCGAAGAATTCTTTTGTCCGCTCTTCTTTAGGGGTGTGGATAATCTCATCCGGAGTTCCAGACTCGATGATTTTCCCCTTATCTAAGAAGAGAATTTTATCCGCAACTTGGGCTACAAAGGACATGTCATGACTGACCAAAATCATGGTCTGACCTGACTTAGCAGCATCTGCAATAGACTTTTCTACTTCACCGACCAATTCTGGGTCAAGGGCTGAAGTTGGTTCGTCTAAGAGCAAAACATCTGGTTTCATAGCAAGCGCACGCGCTAGGGCAACCCGTTGCTTCTGTCCACCTGATAAATGGCGAGGATAATGGTTTTCACGGTCCGAAAGCCCAACCTTAGCCAACTCTTCCTTGGCAATCTTAGTCGCTTCTTGGTCAGATAATTTCTTGACAACAACCAAGCCTTCTTTCACATTATCAAGTGCTGTTCGACGTTCAAATAAATTAAACTGTTGGAAAACCATAGACAACTTACGGCGTAGGGCAAGGATTTCTTCTTGAGTGATTTTAGAAAAATCAACTGAAAAACCATCAATCTGAATAGAGCCACTGTCAGGTGTTTCAAGATAATTGAGACTGCGAAGAAAGGTTGATTTTCCAGCTCCTGAAGAACCAATCAAGGCTACAACTTCCCCTTTTTGAATATCCAAGTTCAGATGATCCAAGACAGTCTGTCCTGAAAAGGATTTGCTTAAATTCGAAATCTTAATCATTAACGAAGGTCTCCTTTCACATCTGTTTGCACTGTATCAGGTGCAGAAATAGCCATTTTTCTCTCGATGAAACGACCGAGGCTTTCAATTCCGATATTGACTACCCAATAAACAAGGGCAACAGAGATGAAGCGTTCAAAATAGCGATAATCAGCTCCACCTAGAATCTGAGCTTGGGCAAAGACTTCCACAACACCCGCACTAAAAGCTAGAGATGTTCCCTTGGTCAAACCGATGAGGGAATTAATCAAGGTTGGAGTAGCTACCACCGCTGCATTAGGAATAATCACTCGTCGATAAACTTGCGCTCGGGTCATACCCAGACTGCGCGCCGCCTCAATCTCACCAGGATTAACTGAGAGAATGGCTGCACGAATGGTTTCACTAGCATAAGCTGCCTCATTAAAGGCAAAGGCGACAATCGCAAAAGCTGCAGCTGGAATCGCATTGATATTGAGACCAGTTCCCCATTGCTGATTGAGGGCTTTCAAAGCCAAAGGAATTCCGTAGTAGGTCAACATGAGTTGCACCAAAATCGGTGTCCCTTTTAAGAAACTAACAAAGAAGGCCTGCAAGGGATATAAAATCTTGACACGATTGATCTTCACAATGGCAAAAAGAAGCGCCAAAACCAAGCCAAAAAGGGCACCACCAATTGTCAACATAATTGTTGTTGGAAGTTGTTGGACAATTCTAGGGATTCCATCAAAGACCGAACGTAGGCTAAACAGCTTGCCATCCGGAATCAATTGCATCAAGTTTTGGTACCAATCTGATGCTAAAATCGTTGTAACATTCATAAAAACATCCTCTTCTGATAATGATTCATTCTACCATGCTTCTGCCGTCAATAAAATTATTTGCTACGGTCAGATACAGACTTTGTCTACCTACTAGTTTATCATACTTTGAAACAGGGAAGTTATATATTTTATCTATCAAAGAGATAGATAAAAACTATTTCAGTCCCAGTTCTTCATAAGATTTTCGATAACCGATTTGCTTAACAGTTCCATTTTCTACTAAAATGGGCCGTTTTAACAACATACCGTCACTTGCTAGCAACTCAGCCGCTTCTTGGTTTGACAAACTTCCTACCTTATCTTTTAGCCCTAATTCACGGTATTTGATACCACTGGTGTTGAAAAATTGCTTCAATTCAAATCCTGAGGTTTCTAGCCAATTCAAAATGACTTCTTGGCTAGGTGTTTCTTCCACGATATGGACGGCTTTATAGTCCACACCTAATTGATTTAATTCTTGTTTTGCTTTTTTACAAGTTGAACATTTGGGGTATTCGATAAATTCTAACATGTGCTTCTCCTTCTATTTGTTTATATCTTTAAAATCTACGCCTTCATGCTCCAAGAGCCAAGCTTTCTTTTCCACTCCTGCAGCATAGCCTGTCAGACGCTTGCCTGCTCCCAACACACGATGACAAGGTACTAGGATAGACCAAGGATTGCGTCCCACTGCTCCACCAATTGCTTGAGCAGAAGCCACTTGCAGGTCTTGAGCAATTTGTCCATAGGTCACTGTCTGACCATAAGGAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >LR216067|1199253:1205032|1202698_1203499_-|VFI52042.1|DBSCAN-SWA MNVTTILASDWYQNLMQLIPDGKLFSLRSVFDGIPRIVQQLPTTIMLTIGGALFGLVLALLFAIVKINRVKILYPLQAFFVSFLKGTPILVQLMLTYYGIPLALKALNQQWGTGLNINAIPAAAFAIVAFAFNEAAYASETIRAAILSVNPGEIEAARSLGMTRAQVYRRVIIPNAAVVATPTLINSLIGLTKGTSLAFSAGVVEVFAQAQILGGADYRYFERFISVALVYWVVNIGIESLGRFIERKMAISAPDTVQTDVKGDLR >LR216067|1199253:1205032|1203656_1204013_-|VFI52044.1|DBSCAN-SWA MLEFIEYPKCSTCKKAKQELNQLGVDYKAVHIVEETPSQEVILNWLETSGFELKQFFNTSGIKYRELGLKDKVGSLSNQEAAELLASDGMLLKRPILVENGTVKQIGYRKSYEELGLK >LR216067|1199253:1205032|1204537_1205032_-|VFI52047.1|DBSCAN-SWA MEIRLAFPNEVDAIMQVIEDAKKCLADAGSNQWQNGYPNADVIIDDIISGQAYVALEEGELLAYAAVTKSPEEAYEAIYEGNWQAGESEYLVFHRIAVAADVQGKGVAQTFLEGLIEGFDYLDFRSDTHAENKVMQYIFEKLGFKQVGKVPVDGERLAYQKLKK >LR216067|1199253:1205032|1201653_1201878_-|VFI52038.1|DBSCAN-SWA MLLQLFSLYFESLILTTILVLIFLGIWIGLRAMSGVDKTARARQAHLYDMIMIGVLVVPVLSFAVMSLILVFKA >LR216067|1199253:1205032|1199909_1200638_+|VFI52034.1|DBSCAN-SWA MKTNDIVYGVHAVTEALLANTGNKLYLQEDLRGKNVEKVKELATEKKVSISWTSKKSLSEITEGAVHQGFVLRVSEFAYSELDYILAKTRQEENPLLLILDGLTDPHNLGSILRTADATNVSGVIIPKHRAVGVTPVVAKTATGAIEHVPIARVTNLSQTLDKLKDEGFWTFGTDMNGTPCHKWNTKGKIALIIGNEGKGISSNIKKQVDEMITIPMNGHVQSLNASVAAAILMYEVFLNRL >LR216067|1199253:1205032|1199253_1199865_+|VFI52032.1|DBSCAN-SWA MSAIERITKAAHLIDMNDIIREGNPTLRAIAEEVTFPLSDQEIILGEKMMQFLKHSQDPVMAEKMGLRGGVGLAAPQLDISKRIIAVLVPNIVEEGETPQEAYDLEAIMYNPKIVSHSVQDAALGEGEGCLSVDRNVPGYVVRHARVTVDYFDKDGEKHRIKLKGYNSIVVQHEIDHINGIMFYDRINEKDPFAVKDGLLILE >LR216067|1199253:1205032|1201955_1202699_-|VFI52040.1|DBSCAN-SWA MIKISNLSKSFSGQTVLDHLNLDIQKGEVVALIGSSGAGKSTFLRSLNYLETPDSGSIQIDGFSVDFSKITQEEILALRRKLSMVFQQFNLFERRTALDNVKEGLVVVKKLSDQEATKIAKEELAKVGLSDRENHYPRHLSGGQKQRVALARALAMKPDVLLLDEPTSALDPELVGEVEKSIADAAKSGQTMILVSHDMSFVAQVADKILFLDKGKIIESGTPDEIIHTPKEERTKEFFASYKRTYI >LR216067|1199253:1205032|1200676_1201588_-|VFI52036.1|DBSCAN-SWA MYDTIIIGAGPAGMTAALYAARSNLKVALIEGGLPGGQMNNTSDIENYPGYANISGPELAEKMFEPLENLGVEHIYGYVENVEDHGDFKKVMTDDQTYETRTVIVATGSKHRPLGVPGEEELNSRGVSYCAVCDGAFFRDQDLLVVGGGDSAVEEALFLTRFAKTVTIVHRRDQLRAQKVLQDRAFANEKISFIWDSVVKEIKGENRVESVVFENVKTGQVTEQAFGGVFIYVGLDPLSDFVKELNIQDQAGWIVTDSHMKTAVDGIFAVGDVRLKDLRQVTTAVGDGAIAGQEAYKFITEHS >LR216067|1199253:1205032|1204025_1204538_-|VFI52045.1|DBSCAN-SWA MQKKYVKILYSSPIGILSLVADDHYLYGIWVQEQKHFERGLGDETIEEVVSHPILDPVIACLDDYFKGKPQDLSNLLLAPIGTNFEKRVWDYLQGIPYGQTVTYGQIAQDLQVASAQAIGGAVGRNPWSILVPCHRVLGAGKRLTGYAAGVEKKAWLLEHEGVDFKDINK |
9 | Streptococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1212933 : 1247997
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >LR216067|1212933:1247997|DBSCAN-SWA TTTATTTAGTGTTAATTTGGTTAAAACAAGCAAACTTAGCTGCTTTCTTGGTTAGTTGTGACAAGATTGCCAAACGATTTTGACGGACAGCCTGATCTTCAGCCATTACCATAGTATTTTCAAAGAAAGCATCAATGACTGGGCTAAGCGCAAAGAGTTGTTTCAATTGCTGACTTGCAGGTCCTGATAAAACGAGTGTTTCTACTGCTTCTGCCAAAGCTTTTTCTTGGTCATTCTCAAATAGTGCTGAATCAACTGTAGCAACCCCTTCTGCCTTCTCAGCCAGGTTAAAGGCACGAGAAAGTGATTCAACAGATGGTTTAAAATCTTCTTCCTTGCTTACTTCTACGAGAGCACTTGCTGCTTCCAACATATCTGCCACAACAAAGTTTGAACCTGCAAGAACTGCTTCCTTGATATCTTTTGGAGTAGAGCCCATCATCTTATCAACACGAGCCTTGATAAAGTCCATAACCTCTGCTTTATTTTCATAAGTCAAACTGTCAAATTTCAATGCATAAAGGCTATCAATCAGCTCATCCATAGCAATGTGCCAACCAAAGGCATCCAAGATACGAACCACACCTTGAGTTGCACGACGAAGGGCATAAGGGTCATTAGAACCTGATGGAATCAATCCTACTGAGAAGAAACTCAAAATCGTATCCAATTTGTCTGCAATGGCTAGAACTGCGCCGACCTTGCTCTCTGGAAGTTCTCCTTCAGCTGATGTAGGCATGTAGTGTTCACGAATAGCAGCTGCCACCGCTGGAGTTTCACCAGCAAGAAGGGTGTATTTTTCACCCATAATTCCTTGGAGTTCGTCAAATTCACCAACCATACCTGTCAACAAGTCAAACTTGTAAATGGCTGCTGCACGAGCAAGGTCAACTGTTTCATCCACTGACAAACCAGCTTTTTCTGCCAAAAGTACAGTGATTTGACCCGTACGAATCATGTGTTCACGAAGGGAACCAATCTTCTCATGGAAGGTGACATTGTTTAATTTTTCAACAAGATCTGAAATCACCAATTTTTGGTCTTCACGCCAGAAGAATTCTCCGTCTTCCAAGCGGGCTACCAAGACTTTTTCATTTCCTTTGATGACATTTTTCAAACGCTCTGCGTTTCCGTTACGAACAGAAATGAAGTTTGGCAAGAGTTTTCCATCTTGATCACGAACAACAAAGTAACGCTGGTGTTCCTTCATAGAAGTCACCAAGACTTCTTCTGGAACTTCAAGGTATTTAGCATCAAAACTTCCCATGAAGGCAGTTGGGTATTCAACCAAATTCAAGACTTCATTCAGCAAATCCGCATCAATTTCGATACGTACACCATGTTTTGCCTCAATTTCCTTGATTTGGTCAACAATCATTTGCTCACGTTCACATGGATCTGCGATTACAAACTGCTTACGAAGGTCTTCTTCATAGCTCAATGCTGACTGAATTTTGGTTTCTTTCCCCAAGAAACGATGGCCACGGCTCACACGACTTCCCTTGATATCAAGGAAATCCAAGTCAAACTCTTGCTCATCCAAGAGAACAGTTAAAGTGTGAACAGGGCGGATGTATTCAAAGCTATTTCCAGCCCAGTGCATGCTGACAGGGAAAGTCAATGACTTCAAGACATCTACAACACCAGGAACAATGGCTTCAACTGCTTGACCAACTTCTTCCTTAGTGACATAGACATATTCTTCACCCTTGATTTCACAGAATTCGATATCTTCAACAGTCAAGCCTTTTCCACGGACAAATCCTTGAGCTGCTTTGGTGAAGTTTCCATCACTATCTAAGGCAATTTTCTTTGCTGGACCCCTGAAATCTTCTGTCAAATCAGACTGTTTGTCTGCAAGACCAGTTACACGAACAGCCAAACGACGTGGTGTTGAGAAGGTTTGAATGGCTTCAAAAGACAGGCGTTTTCCCTTGAGGAAGGCTGCCATTTTTTCGCCTAGTTGTTTTTCACTTGGCGTAACAACATAGGCTGGTAATTCTTCAAGACCGAGTTCTACTAATAAGTTTTTTGTCATGTTTTTTCTCCGAAAAGTATCTTTTTATTTTCCAGTTTGCCTTATGTGATTGGCACGCAAGCAACCAACTTCGTTGTTTCATTGCTAAAATTGGAGCCAAAAGTCTCCAATTTTGCCTAGTATCCTTAGTTTCACTAAGGATACCTTCATCACTGCGGCAACTGGCTCAGGGCTCACTCTGTTCGCCCATTTTCGTAATTTGTCACTCTCTTTATTCTGCGTCTTCTGCTAGGAGTTTAGCTCTTGTTTCTTCATCCAAAAGTGGGTAGCCTAGGCGTTTGCGTTCTGCGACAAAGGTTTTGGCTACGACACGGGCCAAGTTACGGATACGAGCGATATAGCCTGCACGCTCTGTTACAGATACGGCACCACGCGCGTCAAGCAGATTAAAGGTATGTGAACATTTGAGAACATAGTCATAGGCAGGGTGTACCAAGCCTTCTTCTAATGCACGACCAGCTTCTTTTTCAAACTTATCAAAGTTTTCAAGCAACATTTCTTGGTCCGAAATTTCAAATGAATATTTTGAGTGCTCATACTCAGGCTGGATAAAGATTTCTCCGTATTTTACACCATCAGCCCACTCGATATCATAGACAGAGTCTACTTCTTGAATGTAAGAAGCCAAGCGCTCCAAACCATAGGTAACTTCCGCAGTCACAGGGCCAGTTGCCAATCCACCGACTTGTTGGAAATAAGTGAACTGAGTGATTTCCATTCCGTCAAGCCAAACTTCCCAACCAAGACCAGCTGAACCAGTTGATGGGTTTTCCCAGTTGTCCTCAACAAAACGAATATCGTGCTCCAAAGGATTGATTCCCAATTTTTCCAAAGACTCAAGGTAAAGTTCTTGGATATTTGATGGAGAAGGCTTCATGACCACCTGGAATTGGTGGTGTTGGTAGAGACGGTTAGGGTTTTCCCCATAACGACCGTCAGCAGGACGACGTGATGGCTCTACATAAGCTGCATTCCATGGCTCAGGTCCGATAGCACGAAGGAAAGTGTAAGGACTCATTGTCCCCGCACCTTTTTCATTATCATAAGCCTGCATAAGCATACAATCTTGGTCATTCCAAAATTGTTGCAAAGTCAAAATAATTTCTTGAAATGTTAATTTCTTAGACATTGAATACTCCTTAATAAAAAATAATTTCTTGCGACACGAGTCTGCCTCGTCGATTATACGAGGCAAGACGAGTTAGTACTGCGTCTAGCTCAGGCACTCTAGTGCTGAGCGTAGGGCAGTCCGACTGTAAGGAGGTTTCTGCCACTGACGCAGTGAAATGTTAATTTCTTAGACATTGAATACTCCTTAATAAAAAATAATTACTTGCGACACGAGTCTGCCTCGTCGATCATACGAGGCAAGACGAGTTAGTACTGCGTCTAGCTCAGGCACTCTAGTGCTGAGCGTGGAGCAGCCCGACTGTAAGGAGGTCTCTGCCACTGATGCAGTGAAATGTTAATTTCTTAGACATTGTTTACTCCTTTAGTTTTTATATTTCTTTTTCAATTAATTTCTGCTGAACAAACCAATCTAACAAGGGAAAAGTTTTTTCTGTATTTGCCCATAAATGATAAGAATCTAAGACCGCTTGTACACTACCTAAATTTTCTACCAACTTATCTACTGTCAAAAAGCTGCGCCAGTATTCATAAAAAATACTTGCATAGTTCTTATCATAAGTCGAAGAACCAAAATCATTCAATGAATGCCAACTATACTTCTTCTGAAAAAGTTCTACGAGAGATTGATTACAAATTTTTTCCGCTTGAAATTCCTCTTCTGTCAAGAAATACTTGCGACTAATATATTCAACCATCCCCTCTTCGAACCAGATATAAGAGTCATAACCATCAAAATCATCTAAAAAATGTCCGACCAATGAGCTAACTCATGTCCTACAATCTGTAAGAGGAAATTTTCAGATAAAGAATGATAGTGACTTTCTATTGCTTGAGTTTGCTCAGAACACTCGTAGTCCATCAACTGATACAAATACAATTCTTTCCAAACAGCTAAATCAGGCGTCATAACCACTCGTCTATTATTTGTATAGGTTGGAACAGCACTTTCCCTAATAATCTGTGTAGCAGCATTAAAATCTGACCAAATAACAGCTTGCGGTAAATCACAGACTGCAAGTTCATTCTTTAAAAAAGATTGATAATCTTTCAACTTTTCAGTATTTCTTACTACAAAATCACGAAATGTAGCTAGTTGACTATCGTCTTTTACAAGATAAAGGTTGTCCACGGCTCTCCTTTCTTTCACACAATAGACTGAATAAGCAAAAGAACCACATCTGACAATCCTAGGTTGATTTAACCTAGGGGCGTCAGAAACGCGGTTCCACCCTAATTTATTACTTCATTGTTTTTGAAAATACTACAGAAAGCGCCAGCCCTTTATTTTGCCCTACTTGGCTCCCACTATCCCAAGCTCGCTTGAAGAACGCCATAAGACTTTCTTTCCTGCTGACTATTATATCAAAAATTAGAATAATGTACAATTCTTTTTATGATTTTCTAGAAATCCACATCATCAACTCGTGGAGCACCCGATTGAACAGCAATCGTTTTTAAGGTTTCTCTCTCCTCATGACTCAGTTCAATTCCAAAGCAATCAAGATTAGCTTGAATACGAGAGGTTGTGACAGATTTTGGAAGTGGTAAAAATCCTTCTGCCAAGCTCCAGGCCAAGGCTATCTGAGCAACCGATTTTCCGTGATTTGCTGCTATTTCTTGGACTTGCTTGCTATCAAACAGTTCTCCTTGTCCAAAAGGCCCCCAAGCTTCCAATAAAATTCCCTTTTCACGACAGTAAGCTACGACTTGATCTTGATACACACCTGGCGCCAAGCGAACTTGATTGACCGCAGGAACGATAGTTGCAGTTTCAAGCAAGGCATCCAAATGATGGGGAAGAAAATTGCTAACGCCGATAGCACGGATTTTC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36 | Staphylococcus_phage(16.67%) | transposase,bacteriocin,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1298166 : 1345020
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >LR216067|1298166:1345020|DBSCAN-SWA 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52 | Streptococcus_phage(31.58%) | transposase,integrase,tRNA,protease | attL 1288920:1288936|attR 1356342:1356358 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1565655 : 1601525
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >LR216067|1565655:1601525|DBSCAN-SWA 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39 | Streptococcus_phage(21.43%) | transposase,integrase,holin | attL 1600757:1600771|attR 1602530:1602544 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1690017 : 1797700
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >LR216067|1690017:1797700|DBSCAN-SWA ACTAGAATCCTAGTTCATGATTGATAATACCAGCACTCAAATTCATTCGTAATCCGAAGCGTTTACGATGATTTCGATAGGTTGTTGAAATTATTTTAAACGTTTTTACTTTGGCAAAGATGTTCTCAACCTTGCTTCTCTCCTTGGATAGCGCATGGTTACAGGCTTTATCTTCAACTGTTAGCGGCTTGAGTTTGCTGGATTTACGTGGAGTTTGTGCTTGAGGATATATCTTCATGAGCCCTTGATAACCACTGTCAGCCAAGATTTTACCAGCTTGTCCGATATTTCTGCGACTCATTTTGAACAACTTCATATCATGACAATAGTTCACAGCGATATCCAAAGAAACAATTCTCCCTTGACTTGTGACAATCGCTTGAGGTTCCATAGAATGACATTTCTATTTTACCAGAATAATTGGCTAGTTGATTTTTTTAGGACGATTTATTTTTACCTCTGTTGCATCCACAATCACCGTATTCTCAGCACTAAGATGAGTTTTTGAAATCGTAACACCACTTTGAACAAGAGTTACTTCAACCCATTGGCTCCGACGGATTAAGTTGCTTTCGTGGATACCAAAATCAGCCGTAATTTCTTCATAAGTTCGATATTCTCGCACATATTGAAGAGTGGCCATAAGAAGGTCTTCTAGGCTTAATTTAGGTTTTCGTCCACCTTTTGCGTGTTTAAGTTGATAAGCTGTTTTTAATACAGCTAATATCTCTTCAAAAGTCGTGCGTTGAACACCAACAAGACGCTTAAATCGTGCATCAGTTAGTTGTTTACTTGCTTCATAATTCATGGAACTACTATACCATATTTTGTTTCGCAGGAAGTCTAATATTGTCAAATACTGGAACGCTCATTGCTGGGATACAGAATAAGATTGGCCCAGCTTCGATAACTGGGATACCTGGTTCAAAACCAAGGTCTGTTGCAGCGATTGGTGTAAAGATATCGTAACCTTTCATAAGGTCTTCGTTTACATCTTTCACCATGACTGCATCACAGTGAACATCATAACCACGGTTTGAAAGTTCTTCTTCTAGAGCACTTTTAATTTGGTGACTTGAGTTAACACCTGCACCGCAGGCAGCAAGAATTTTAATCATTTGGATTTCCTCCGATTTTATTTTTTAATAGACAAGATTAAGCGGTTGCTTCAGCAATGTAAGCATAAAGTTTTTCTGGTTCGGAAATTTTTGATAGGTCTTCAAGATGTCCATTTCCTGTGAAAAAGTCCATCAACTGAGCCAGAATATTTGTTTGACTTGAACTTGAATTGTTAATGATAAAGAAGAGTAGGGATACTTCTACTTCCTTATCAGAAGCTATCATATTGTGAAAAGTTACTGGTTTTTCTAATCGAACAACCACCACTTTCTCAGCTAGATTATGAACAATATCTGTATGAGGAATCGCTACATTTGGCAAGTCCTTTCCTAGAAATTCCATATCTAAACCAGTTGGAAATGACTTTTCACGCGTGATCAAGGCTTCACGATAAGTTGGAGTGACAATTTCTCGTTCTTCCAACAAGCTTGCTACCTAATCAAAAAGTTATTCTTGATTATCCGCTTCTAAGCAAAACACAAGGTTTTTGTCAAAGAAATAATCTAATACCATAAGGTTTTCCCTTCTTTCCATTAACTTTATGCTATAAGTATAACACTATATGAAATCGTTGTTAATTACTTTCTATTCTTTTTTGTCTCTTTTTTTATATTTTTGTTTTGTTTATAGTTTGTTATATAAAAATAAACACACAAACAAATACTCCAAGCATTTTTCTGTTCTAATACTCAATGAAAATCAAAGAGCAAACTAGGAAGCTAGCCGCAGGTTACTCAAAACACAGTTTTGAGGTTGTAGATGAAACTGACGAAGTCAGCTCAAAACATGGTTTTGAGGTTGTAGATGAAACTGACGAAGTCAGTAACCATACATACGGTAAGGCGACGATGACGTGGTTTGAAGAGATTTTCGAAGAGTATAAAAACTAAAAAAGCAGACCATCTAAGCCTGCTTTACTATTGATTCTTATATAAATTTCCTGTGAACAAGGAAAGGCATTTCTGATAACTTATTCTTCATCCATACTCAAGACGCTGAGGAAGGCTTCTTGCGGAACTTCAACTGATCCGATGGATTTCATGCGTTTCTTACCAGCTTTTTGTTTTTCAAGGAGTTTACGCTTACGAGAAACGTCACCACCATAACATTTAGCAAGTACGTTCTTACGAAGGGCCTTGATATCAGTACGAGCGACAATCTTGTGTCCAATAGCCGCTTGGATTGGAACTTCAAATTGTTGGCGAGGGATGATTTTCTTGAGTTTATCAACGATGAGTTTCCCACGTTCGTAGGCAAAGTCCTTGTGAACGATAAAGCTGAGAGCATCCACCTTATCTCCATTGAGAAGGATATCCATTTTCACCAGCTTAGATGGGCGATATTCTGACAATTCGTAGTCAAAGCTTGCATAACCACGTGTTGAAGACTTAAGTTTATCAAAGAAGTCAAAGACAATTTCAGCAAGAGGAATTTGATAGATAACATTGACACGGTTATCATCAATATAGTCCATAGTCACAAAGTCCCCACGCTTACGCTGAGCTAGCTCCATTACTGCTCCGACGAACTCCTGTGGTACCATGATTTGCGCCTTGACATAAGGCTCTTCAATGGTCGCAATCTTAGTTGGGTCTGGAAACTCAGATGGGTTAGACACATCCATAGACTCACCGTCGGTCAAATTAACTTTGTAAATAACAGACGGAGCTGTCATGATGAGGTCAATATTGAACTCACGCTCTAAACGTTCCTGGATAACATCCATATGGAGAAGTCCAAGAAATCCACAACGAAAACCAAATCCAAGTGCCTGAGATGTTTCTGGTTCAAACTGAAGACTAGCATCATTCAGTTGCAATTTTTCAAGCGCTTCACGCAGGTCATTGTACTTGTTTGATTCGATTGGGTAGAGACCCGCAAAGACCATAGGATTCATCTGCTTATAACCATGTAATGGTTCTGCCGCAGGATTGGTTGCCAAGGTAACGGTATCACCCACACGAGTATCCTGAACCGTCTTGATAGACGCCGCAATGTAACCAACATCACCAGTCGCAAGGAAATCACGACCAACCGCTTTTGGTGTAAAAATACCGACTTCGGCCACATCAAAGGTCTTACTATTGCTCATGAGCTGAATCTTATCACCAGGTTTGACCACTCCGTCCATGACACGCACTTGGAGGATAACCCCACGGTAAGCATCGTAAACAGAGTCGAAAATCAAGGCCTTAAGTGGCGCCGTCACATCACCCGTTGGTGCTGGTACTTTTTCTACAATTTGCTCGAGGATTTCTTCAATCCCAATCCCAGCCTTGGCAGAAGCCAAAACTGCTTCACTGGCATCCAAACCAATCACATCTTCAATCTCTGTACGCACGCGCTCCGGATCTGCAGCCGGCAGGTCAATTTTATTAATGATAGGCATGATTTCCAAATCATTATCCAAAGCCAGATAAACGTTGGCAAGAGTTTGAGCCTCAATTCCTTGAGCCGCATCGACCACCAAAATAGCACCCTCACAGGCAGCTAGCGAACGTGAAACTTCATAGGTAAAGTCAACGTGCCCTGGTGTGTCAATCAAGTGGAAAATATAAGTTTCTCCATCTTTTGCAGTGTAATTCAACTCGATGGCATTCAACTTAATAGTAATTCCACGTTCCCGCTCTAGATCCATGCTATCCAAAAGCTGGGCCTGCATTTCACGACTTGAAACCGTCTCTGTTTTTTCCAAAATGCGGTCTGCTAGAGTTGATTTTCCGTGGTCAATATGGGCGATAATAGAGAAGTTACGGATCTTCTCCTGTCGTTTTTTCAATTCTTCTAAGTTCATGATTCTCTTCCTTTCAGGGTATCTATTTATTATAAATTGTTTTTGATATTTTGACAAGACCATACCCTGCTAGGAGTACTAATCTTCAGCGACAAAGCCGTCATTTTCGATAAAGTGGTGTTCTGTCATTCCTTGGTCTGTAAAGACAATCCCGTGAAGGACACCACCATAAACAGCTCCTCCATCCATTCCAATCTTGCCATCTTCTGTAGTCCAAAGCTCAGATGTACCGCGTTCTTGCTGTAACAAACCATAGACCGGTGTATGACCGAAGACAATGGTTTTTCCAGTATGATTTTCAGCTCCGTGGAATGGTTTTCTAAGCCATACTTTTTTATAATCTGTTGTTTCATGCCAGTCATCCAAGGTCAAATCAATACCTGCGTGAACAAAGATATACTTGTCTGTCTCTACTACAAATGGCATTTGACGAATGAATTCGACCAAGTCTGCCGCTTCAGCGGCAACCCGCTTGGCATCTTCTACTCCATCAACTGGTGCATCCAAGGGACGACCTAGGATAGAGTTAATGGTTGTATCTCCACCATTGCGACGATAATGGTCATAACTTTCTTCTGGGTCATCTAGCCAAGTCAAAAACATATACTCGTGGTTTCCAGACAAACAGATAGCCCCTTGATTGTCCACCAAGTCCTTGACCATTTCAAGAACACGGTGACTATCCTCACCTCTGTCAATCAAATCACCTAGAAAGAGCAACTGGGTCTGACCATCCCAGGTTTTAAGAAGGTCTTCCAGCATCCCAGCTTTTCCGTGAACATCTCCAATTACATAATAATCTGTCATCTTATTTCTCCCTGTTTCTCAACAATTCTCTGGCTTGCGTCAGGGCTGCTTCTGTCACATCATCACCTGCCAACATCTTGGCAACTTCCTCCACTCGCTCTTCGACCGTCAAGAGACGAACAGTCGAAACCGTTGAATGGTCATTACTAATCTTCTCAATAAAGAATTGATAATCTGCAATCGCAATTACTTGTGGCAAATGGGAGATAGCCAAAACCTGACCATGCTGACCAATTTTATGAATTTTCTGAGCAATAGCTTGAGCAACACGACCTGAAAC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108 | Bacillus_phage(17.86%) | transposase,tRNA,bacteriocin,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
2057001 : 2065755
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >LR216067|2057001:2065755|DBSCAN-SWA ACTATCCATTTAGCGACTCCTTGAACTCCTCTATCTTAATCGGTAATCGTTTAAATGACACGCCTCTATCAGCCAATCGTTTACAAAAGGCCGTAATTTTAGGTACTCCCAACTGAACTTCTTCCATAAAAACAACGTCTTGAAAGACATCACTTGGTTTGCCCCCCTTTACTAAACGTCCCTTTTCCATTACATAGACTTGATTTGCATATTCAGCAACATCATCCATCAAATGCGTTACCAAGACGATGGTCATCCCTGACTGGTGGAGTTTTTTGAACAGGGTCATCAACTCTTTTCTCCCTAGAGGATCTAGACCAGCTGTTGGCTCATCTAAGACTAATATAGCTGGCTCCATGGCAAGTATGCCTGCAATGGCAACACGTCTCATTTGTCCCCCTGACAGCTCAAACGGACTACGATCAAAAAGTGATTCATCAATTCCAACCAGAGCCAGTTTCTCACGCGCAGTCTTCACAGCATCTTCTTCAGAAACTCCAAAATTTTGCGGTCCAAAAGCAACGTCCTTCAAAACCGTTTCTTCAAAAATCTGATTTTCAGCAAACTGAAATACCAAGCCAACCTGTTTTCTAATTTGACGAATATCTTTATTTTTAGAAGTCGAGGTGATTAAGGTATCAAAAACCCTCACACTCCCTTGACTTGGCACCAATAAACCATTTAAGAGTTGTAAAATAGTTGATTTACCACTACCTGTGTGCCCAATTAAAGCTGTATAAGAGCCATCTTCAATCGTCAAAGAAACATCCGACAAAGCTGCTAAAGCTAAGGGAGTACCTTCTTGATATGTAAAATTCACATTTTCTAGAGCAATTCCCATAGCTTATCCTCTAGCTCACTTTCTGTCAAATAATTTTCAGGTAAATCATAGCCATTCTGGCTCAAAGATTTTTTTAATTGATTAGCAAAAGGATCGTCTAATCCAATTTGATCTAAATCATTTCGAGAGAAAAGCTCCCTTGGACTACTAGTTGATTCAATTTCCCCTTTTTTCATGACCAATACGCGATCACTCATGGCGACTTCTTCCAAATCATGGGTAATAGAAATGACCGTCATATCATAGTCTTTTCGAATTCCTTTTACTGTCCCAATAAGTTCTCTACGCCCCTCAGGATCCAACATACTCGTTGCTTCATCTAAGATTAAAATAGCTGGTCTTAGGGCTACAACACCTGCAATGGCCACACGTTGCTTTTGGCCACCTGATAGACGCGCTGGCTCTCTCTTTTTAAAGTCCAACATGCCAACTAAAGCCAGAGCTTCTTCCACTCTCTTTTTCATTTCTTGACGAGAAAGTCCCTGATTTTCCAAACCAAAAGCAACATCATCTTCAACAGTCGCTCCAACAAATTGATTGTCTGGATTTTGAAAAACCATACCGATTTGACGACGTATATTCCAAACATTTTCCTCAGTCAAACGTTGGCCATCAATTACAATCTCTCCGGATTCTGCTTCCAGTAAGCCATCAATTAATCGAACCGTAGTTGATTTACCACTACCATTATGCCCTACAATCGAAAGCCATTCTCCACGTTTCACGTGAAACGTAATATCCTTCACATCGTAGTAGTTCTGATTTTCTTTATAGCGAAAAGAAAGATTTTTTACATCAATTATTGATTTCATTTCGAACCAAATGTCCCTTTAAATACATAGGCACTACCCTTGAAATAGTCATAGCCAGAGTAGATAGTGAAAAATAAGGCTACATAAAGTAGAACTTGACCAAGCAAAGTCCAATGTAATAGCAAGAAAATAATAGCAAACATCTGACTAAAAGTTTTAATTTTTCCAGGCATTGCTGCTGCTAAAATTGTTCCACCAGTTTCAACCAATAAAAGCCTTAAACCTGTCACAGCTAACTCACGACAGATAATCACTGCAACAATCCAAGCCGGAGCCATACCTAACTCAATCAAGATAATAAAAGCCGACATAACTAGTAACTTATCCGCCATAGGATCTGCAAATTTACCAAAATTACTGACCACATTCCATTTACGAGCTAAATATCCATCTAAATAGTCGGTAATACTGGCAACAGCAAAGATAATAGCTGCAACTATATGACTCTCTATCGAATTTCCTATCGTTAAAATAAAGATAAAAATAGGTATAAAGAGAATTCGACCTATTGTTAAGAGATTGGGAATTTGTTCTTTTTTCATTCGTTTTTCCTTAATTTTTAGTAAAGGTTACAGTGATTTGTCCAGTCTGAGCTGTTAATTTCGATAAATCAACAGTCTGATTATCTACTGTCAAATCAACACCTTTTACAACACCTAACGTAATTGTTACAGGACTTTTAGTTGCAACTGTTGCTTCTGCACTTTTCTTCTTTGGCGATAAGGTTACACCGCCCTCAAGTTCGCTTTCTGAAACACTGACCCAACTTGTAACATCTGAAACTGCCAATTGCAATTTAACTGTTTCCTTACTTGTCTTATAAGCGATTTCTACATGATTTCCTTCGCCTGATACACTTATAGCTGATTCTATACTAGAAGAACTACTACTTGAGGAGTGGGGAACAGAGCTAGTTGAACTTGTTGATTGAACCACACTGTAATTAGAAAGAGAAGGCTCCTCTGGTTGAGTTTGAATATAGTTCCAAACATAATAAGTCACAAAAATTAAAATCGATAAAGCAAAAAGGATAAAATAAAATAAAGGTAAAAATGATGTTTTTTTCTTCTTTTTCTTACTTGAACGTCTACGACCTGTCAACTCATCTTCATCAACATCTACTTCCTCATAAGTAATCATACTCCCAGAATCATAAGCATCCAAAACAATTTGGTCATCTAACTCAACAGCCCATGCATATTTTTTCAAGAAAGAACGCGTGTAAAAAGGACTTGGAAGTTGATCGAAATCGTCTGCTTCCATTGCTTCCAACATATCTAACTGGATTTCTGTCTTTTTCTGCAATTCATCTAAACTCAATCCCTGATTGATTCTAGCTAATCGTAAAACCTCTCCAATTGTTTTTTTTCTCATACTTGTCATCCCTTCTTTCTAGTGTCTATTATGATAGGTTACTACGATGGGAATATTGTAAAATCAACTATGTCACCATCATCTATTAAATGATGTCCAGCATCAAGGACATCCTCTAAAGTAATTTCCTGTAAAATTTTCGGCAAATCAAAAATTGTCTCACCATTTTCAAAAGCATCATATTGCGTTGCAATAAATTCAAGAGAGTTCATGCTACTGAAAAATTCGCCAAACATCTCTCTTTTGATAATATCTAAATGTTCCTCTGTAATATCTAAATCCTTTGTAAAATTACGAATAGCCTTCCTAAATTGATGAGACAAAGCAACTGGCTCTTTCGTATCCATTGTCAACATGACAAAATGAAAGCGACTTGTTATTTCAACTTCCAGAGATAAGGACGCATCAATTTTACCTGATTCATAACATTTTTGAAAACGATCCGAAGTCCAACCAAACATCATTGCAAACAATAATTTTAATAAAATATGATGTCGATAGCAATCCGCTTCAGAAACTTCTCGCTTACCTCTAACTCCAATCGCTAGTTTGGGAGAAGATACTTCCATTCTCATACTATCTGTTGGCTTTACAGGCTGTAAAAACAACTTTTCTCTTGCTACTTCCTGAAAATCTGAATCTTTCAGTTCTTTGCTTTCAAAATAGTCCTGTACTCGCTCCACATCAAAATTACCAACTAAAAACAGAGACATGTTTACAGGTTTGTAAAACTTTGTAAAATTTTCTTGCAAATTAGTTAGATTGATTTGGGAAATGGACTCCTCACTTCCAACTATATCAGTTGCTAAAGGTGTACCAGGATACAAATTCGCTAAAGTTGAAAAGAATAAACACGAATCTGGATCATCTTGGTACATTTCTCGTTCTTGCTGAATAATATCCTGCTCTGTCAGAATGGAAGCTTCAGTAAAGTGTGCTGATGTTACCAATTCATCAAGTAAATCTAAATTTTCTAAAAAATAATCCGTTGCTGAAAAAAGATAGTTTGTTTTTGTAAAGCTTGTAAAGGCATTACTATCTGCACCTATACTCGTAAAAGCCGACATCAAATCACTAGAATCTTCTCTCTCAAATAATTTATGTTCAAGAAAATGAGCAATTCCTCCAGGATATTGTTTTACATCTCCGTCAACTTCTGTGACAAACGTATCTACCGAACCAAACTGTACAGTGACACTCCCGTAAACCTCTTTAAATTCCTTTTTAGGCAAAAGAGCAACTGTCAATCCGTTGGCCAAACGAGTTCGATAAACCTTTTCTTTTACAGCTGGATAGTATTTTTCTTCAAAAACAACCTTTGTCATTCTATTCCTTCCATAAAGTAAATCGCTTGTAGTTTCACATTATTAGCTACTCTACAAATAGCATCTTTGTCAATTTGTTCAAGCTTTGCAATCCAACTTTTAAAGTCTGCTGAAGATTTTCCAAATAAGGCATTTTGATAAGCACGTTCAATCAATGAAGATTGATTATCTTGAGAAAGTAACAACGACCAACGAATCATTTCCTTGGTCTGATTTAACTCAAACTCTGTAAAATAACCTTTTTTTAAATCAAGCAGTTGATTATTCATCATTTTACGAGCCTGGTTACGATTTTCTCGATTGATACCAGCATACATCCTCAAGAATCCACTAAATAAATCAAGCTCACTTGAAATGGTATAAGCTAATCCAGCATTTTCACGGACATTTGTAAAGAGCTTAGAGTGAGCAAATCCACCAAGTAAACCATTCATTACAATCATGGGTAAATGTTGTTCATCACCATATTTAGAACGGTAATGATAACCTAATTCCAAAATGGATTGTCCCACATTTTTCCGAACCATACCTTCCTGAAGGATATTAGAATAAGGTTGACAATACTGAACCTTCACATCTCCTTTTCGACCTTTAAAGCCAAATGATTCTAATACATTTTGAATTTCAACCTCATTAAAATCACCTAGG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_15 >LR216067|2057001:2065755|2064276_2065755_-|VFI54482.1|DBSCAN-SWA MSNWDTKFLKKGFTFDDVLLIPAESHVLPNDADLTTKLADNLTLNIPIITAAMDTVTESQMAIAIARAGGLGVIHKNMSIAQQADEVRKVKRSENGVIIDPFFLTPEHTIAEADELMGRYRISGVPVVETLENRKLVGILTNRDLRFISDYNQPISNHMTSENLVTAPVGTDLATAESILQEHRIEKLPLVDEEGSLSGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEFGRLLVAGAVGVTSDTFERAEALFEAGADAIVIDTAHGHSAGVLRKIAEIRAHFPDRTLIAGNIATAEGARALYEAGVDVVKVGIGPGSICTTRVIAGVGVPQVTAIYDAAAVAREYGKTIIADGGIKYSGDIVKALAAGGNAVMLGSMFAGTDEAPGETEIFQGRKFKTYRGMGSIAAMKKGSSDRYFQGSVNEANKLVPEGIEGRVAYKGAAADIVFQMIGGIRSGMGYCGAANLKELHDNAQFIEMSGAGLKESHPHDVQITNEAPNYSM >LR216067|2057001:2065755|2057825_2058653_-|VFI54462.1|DBSCAN-SWA MKSIIDVKNLSFRYKENQNYYDVKDITFHVKRGEWLSIVGHNGSGKSTTVRLIDGLLEAESGEIVIDGQRLTEENVWNIRRQIGMVFQNPDNQFVGATVEDDVAFGLENQGLSRQEMKKRVEEALALVGMLDFKKREPARLSGGQKQRVAIAGVVALRPAILILDEATSMLDPEGRRELIGTVKGIRKDYDMTVISITHDLEEVAMSDRVLVMKKGEIESTSSPRELFSRNDLDQIGLDDPFANQLKKSLSQNGYDLPENYLTESELEDKLWELL >LR216067|2057001:2065755|2060068_2061352_-|VFI54471.1|protease|DBSCAN-SWA MTKVVFEEKYYPAVKEKVYRTRLANGLTVALLPKKEFKEVYGSVTVQFGSVDTFVTEVDGDVKQYPGGIAHFLEHKLFEREDSSDLMSAFTSIGADSNAFTSFTKTNYLFSATDYFLENLDLLDELVTSAHFTEASILTEQDIIQQEREMYQDDPDSCLFFSTLANLYPGTPLATDIVGSEESISQINLTNLQENFTKFYKPVNMSLFLVGNFDVERVQDYFESKELKDSDFQEVAREKLFLQPVKPTDSMRMEVSSPKLAIGVRGKREVSEADCYRHHILLKLLFAMMFGWTSDRFQKCYESGKIDASLSLEVEITSRFHFVMLTMDTKEPVALSHQFRKAIRNFTKDLDITEEHLDIIKREMFGEFFSSMNSLEFIATQYDAFENGETIFDLPKILQEITLEDVLDAGHHLIDDGDIVDFTIFPS >LR216067|2057001:2065755|2061348_2062599_-|VFI54473.1|protease|DBSCAN-SWA MELVHGISTHFIQSKKFKTNKITVRFTAPLSLDTIAGHMLSASMLETANQMYPTSQDLRRHLASLYGTDMSTNCFRRGQSHIIELTFTYVRDEFLSRKNVLTSQILKLVKETLFSPVVVDNGFDPALFEIEKKQLLASLAADMDDSFYFAHKELDKLFFHDERLQLEYSDLRNRILAETPQSSYSCFQEFLANDRIDFFFLGDFNEVEIQNVLESFGFKGRKGDVKVQYCQPYSNILQEGMVRKNVGQSILELGYHYRSKYGDEQHLPMIVMNGLLGGFAHSKLFTNVRENAGLAYTISSELDLFSGFLRMYAGINRENRNQARKMMNNQLLDLKKGYFTEFELNQTKEMIRWSLLLSQDNQSSLIERAYQNALFGKSSADFKSWIAKLEQIDKDAICRVANNVKLQAIYFMEGIE >LR216067|2057001:2065755|2059205_2060027_-|VFI54468.1|DBSCAN-SWA MRKKTIGEVLRLARINQGLSLDELQKKTEIQLDMLEAMEADDFDQLPSPFYTRSFLKKYAWAVELDDQIVLDAYDSGSMITYEEVDVDEDELTGRRRSSKKKKKKTSFLPLFYFILFALSILIFVTYYVWNYIQTQPEEPSLSNYSVVQSTSSTSSVPHSSSSSSSSIESAISVSGEGNHVEIAYKTSKETVKLQLAVSDVTSWVSVSESELEGGVTLSPKKKSAEATVATKSPVTITLGVVKGVDLTVDNQTVDLSKLTAQTGQITVTFTKN >LR216067|2057001:2065755|2063128_2064226_+|VFI54479.1|DBSCAN-SWA MWLQHLSLKTFRNYKETKIDFNPKLNVFLGRNAQGKTNMLEAIYFLALTRSHRTRTDKNLIHFDEEQLHLSGLVQKKTGSIPLEIELTQKGRVTKVNHLKQARLSDYVGHMNVVLFAPEDLQLIKGAPSIRRKFIDMELGQIKPIYLSDLTNYNHILKQRNTYLKSVQKIDETFLSVLDDQLVDYGCRVMNHRLDFIKKLESFGRKKHFELSNQIEKLSISYQSSVNITDKQNLSESFKIALEKSRSRDLFKKNTGVGPHRDDISFYINGMDASFGSQGQHRSLVLSIKLAEIELMESITTESPILLLDDVMSELDNTRQLKLLETISQSIQTFITTTSLDHLQNLPENLSIFTIQDGKAAVNRN >LR216067|2057001:2065755|2058649_2059195_-|VFI54465.1|DBSCAN-SWA MKKEQIPNLLTIGRILFIPIFIFILTIGNSIESHIVAAIIFAVASITDYLDGYLARKWNVVSNFGKFADPMADKLLVMSAFIILIELGMAPAWIVAVIICRELAVTGLRLLLVETGGTILAAAMPGKIKTFSQMFAIIFLLLHWTLLGQVLLYVALFFTIYSGYDYFKGSAYVFKGTFGSK >LR216067|2057001:2065755|2057001_2057841_-|VFI54459.1|DBSCAN-SWA MGIALENVNFTYQEGTPLALAALSDVSLTIEDGSYTALIGHTGSGKSTILQLLNGLLVPSQGSVRVFDTLITSTSKNKDIRQIRKQVGLVFQFAENQIFEETVLKDVAFGPQNFGVSEEDAVKTAREKLALVGIDESLFDRSPFELSGGQMRRVAIAGILAMEPAILVLDEPTAGLDPLGRKELMTLFKKLHQSGMTIVLVTHLMDDVAEYANQVYVMEKGRLVKGGKPSDVFQDVVFMEEVQLGVPKITAFCKRLADRGVSFKRLPIKIEEFKESLNG >LR216067|2057001:2065755|2062757_2063126_+|VFI54476.1|DBSCAN-SWA MEYKLFEEFITLQALLKELGITHSGGAIKSFLSEHSVYFNRELESRRGKKLRIGDKVDIPDMNIDILLTQPTSEEQDEYQADKVEKERIAKLVKKMNKGVKKDKSKPASSPKSQQAPRFPGR |
9 | Streptococcus_phage(33.33%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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